MicrobesOnline Operon Predictions for Archaeoglobus fulgidus DSM 4304

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 21874 21875 AF0001 AF0002     FALSE 0.009 2436.000 0.000 NA   NA
 21876 21877 AF0003 AF0004     FALSE 0.012 267.000 0.000 NA   NA
 21877 21878 AF0004 AF0005     FALSE 0.042 39.000 0.000 1.000   NA
 21878 21879 AF0005 AF0006   mtaC-1 FALSE 0.025 105.000 0.000 1.000   NA
 21879 21880 AF0006 AF0007 mtaC-1   TRUE 0.998 1.000 0.400 1.000   NA
 21880 21881 AF0007 AF0008   oxlT-1 FALSE 0.032 74.000 0.000 1.000   NA
 21881 21882 AF0008 AF0009 oxlT-1 mtr TRUE 0.820 -31.000 0.000 1.000   NA
 21882 21883 AF0009 AF0010 mtr   TRUE 0.998 2.000 0.750 1.000   NA
 21883 21884 AF0010 AF0011   mtaC-2 TRUE 0.998 0.000 0.600 1.000   NA
 21884 21885 AF0011 AF0012 mtaC-2   TRUE 0.998 1.000 0.400 1.000   NA
 21885 21886 AF0012 AF0013   exuT FALSE 0.319 20.000 0.000 1.000   NA
 21886 21887 AF0013 AF0014 exuT   FALSE 0.024 96.000 0.000 NA   NA
 21887 21888 AF0014 AF0015   putP-1 TRUE 0.995 2.000 0.087 NA   NA
 21888 21889 AF0015 AF0016 putP-1   FALSE 0.031 55.000 0.000 NA   NA
 21889 21890 AF0016 AF0017   hbd-1 TRUE 0.910 4.000 0.000 NA   NA
 21890 21891 AF0017 AF0018 hbd-1 acaB-1 TRUE 0.946 23.000 1.000 1.000 Y NA
 21891 21892 AF0018 AF0019 acaB-1   TRUE 0.996 5.000 0.667 NA   NA
 21892 21893 AF0019 AF0020   caiB-1 TRUE 0.919 3.000 0.000 NA   NA
 21893 21894 AF0020 AF0021 caiB-1   FALSE 0.037 39.000 0.000 1.000 N NA
 21895 21896 AF0022 AF0023   aor-1 TRUE 0.821 7.000 0.000 1.000 N NA
 21896 21897 AF0023 AF0024 aor-1   TRUE 0.999 3.000 0.667 1.000 Y NA
 21897 21898 AF0024 AF0025   cynX TRUE 0.881 5.000 0.000 1.000 N NA
 21899 21900 AF0026 AF0027     FALSE 0.031 56.000 0.000 NA   NA
 21901 21902 AF0028 AF0029     FALSE 0.087 32.000 0.000 NA   NA
 21903 21904 AF0030 AF0031     FALSE 0.030 64.000 0.000 NA   NA
 21906 21907 AF0033 AF0034 acaA-1 acaB-2 TRUE 0.975 -97.000 0.024 NA Y NA
 21909 21910 AF0036 AF0037 pcm-1 cobS-1 TRUE 0.748 -145.000 0.000 1.000 N NA
 21910 21911 AF0037 AF0038 cobS-1   FALSE 0.028 70.000 0.000 1.000 N NA
 21911 21912 AF0038 AF0039     TRUE 0.985 -43.000 0.051 1.000 Y NA
 21912 21913 AF0039 AF0040     TRUE 0.994 1.000 0.051 1.000   NA
 21914 21915 AF0041 AF0042 rfbB-1 rfbA-1 TRUE 0.997 -3.000 0.188 1.000 Y NA
 21916 21917 AF0043 AF0044m wbaZ-1 gmd-1 TRUE 0.993 9.000 0.222 1.000 Y NA
 21917 21918 AF0044m AF0045 gmd-1 mtfA TRUE 0.961 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 21921 21922 AF0048 AF0049     FALSE 0.035 43.000 0.000 NA   NA
 21926 21927 AF0053 AF0054     FALSE 0.343 18.000 0.000 NA   NA
 21927 21928 AF0054 AF0055     TRUE 0.919 3.000 0.000 NA   NA
 21928 21929 AF0055 AF0056     FALSE 0.293 21.000 0.000 1.000   NA
 21929 21930 AF0056 AF0057   rpl37AE TRUE 0.996 4.000 0.234 1.000 N NA
 21930 21931 AF0057 AF0058 rpl37AE   FALSE 0.095 39.000 0.000 1.000 Y NA
 21931 21932 AF0058 AF0059     TRUE 0.973 -33.000 0.039 NA   NA
 21933 21934 AF0060 AF0061   tmk TRUE 0.940 0.000 0.000 1.000   NA
 21935 21936 AF0062 AF0063     FALSE 0.032 53.000 0.000 NA   NA
 21938 21939 AF0065 AF0066     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 21939 21940 AF0066 AF0067     FALSE 0.020 126.000 0.000 NA   NA
 21940 21941 AF0067 AF0068     TRUE 0.975 12.000 0.364 NA   NA
 21941 21942 AF0068 AF0069     TRUE 0.936 1.000 0.000 NA   NA
 21942 21943 AF0069 AF0070     TRUE 0.857 -13.000 0.000 NA   NA
 21943 21944 AF0070 AF0071     TRUE 0.806 -31.000 0.000 NA   NA
 21944 21945 AF0071 AF0072     FALSE 0.017 157.000 0.000 NA   NA
 21945 21946 AF0072 AF0073     FALSE 0.009 1057.000 0.000 NA   NA
 21946 401729 AF0073 AFtRNA-Ile-1   tRNA-Ile FALSE 0.019 134.000 0.000 NA   NA
 21947 21948 AF0074 AF0075 birA   FALSE 0.139 27.000 0.000 1.000 N NA
 21948 21949 AF0075 AF0076     TRUE 0.834 -19.000 0.000 1.000 N NA
 21949 21950 AF0076 AF0077   aor-2 TRUE 0.999 -3.000 0.443 0.052 Y NA
 21952 21953 AF0079 AF0080   argD-1 FALSE 0.133 28.000 0.000 NA   NA
 2209625 21954 AFrRNA03 AF0081     FALSE 0.221 23.000 0.000 NA   NA
 401684 21955 AFtRNA-Gln-1 AF0082 tRNA-Gln   FALSE 0.033 48.000 0.000 NA   NA
 21956 21957 AF0083 AF0084     TRUE 0.812 -28.000 0.000 NA   NA
 21959 21960 AF0086 AF0087 nrtB-1 nrtC-1 TRUE 0.996 -36.000 0.778 1.000 Y NA
 21960 21961 AF0087 AF0088 nrtC-1   TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 21962 21963 AF0089 AF0090 fadD-1   FALSE 0.036 48.000 0.000 1.000   NA
 21963 21964 AF0090 AF0091   hpcE-1 TRUE 0.994 -3.000 0.118 1.000   NA
 21965 21966 AF0092 AF0093 cysA cysT TRUE 0.991 -22.000 0.211 1.000 N NA
 21966 21967 AF0093 AF0094 cysT   TRUE 0.957 -3.000 0.000 0.027 N NA
 21967 21968 AF0094 AF0095     FALSE 0.010 627.000 0.000 NA   NA
 21968 21969 AF0095 AF0096     TRUE 0.635 11.000 0.000 NA   NA
 21969 21970 AF0096 AF0097     FALSE 0.011 302.000 0.000 NA   NA
 21970 21971 AF0097 AF0098     FALSE 0.033 50.000 0.000 NA   NA
 21971 21972 AF0098 AF0099     FALSE 0.012 282.000 0.000 NA   NA
 21972 21973 AF0099 AF0100     TRUE 0.994 -9.000 0.214 NA   NA
 21973 21974 AF0100 AF0101     FALSE 0.010 625.000 0.000 NA   NA
 21974 21975 AF0101 AF0102     TRUE 0.910 4.000 0.000 NA   NA
 21977 21978 AF0104 AF0105     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 21979 21980 AF0106 AF0107 pyrB pyrI TRUE 0.999 -3.000 0.197 0.001 Y NA
 21981 21982 AF0108 AF0109     FALSE 0.170 25.000 0.000 1.000 N NA
 21984 21985 AF0111 AF0112     FALSE 0.054 116.000 0.000 1.000 Y NA
 21985 21986 AF0112 AF0113     FALSE 0.035 52.000 0.000 1.000   NA
 21987 21988 AF0114 AF0115     TRUE 0.995 -13.000 0.500 1.000   NA
 21988 21989 AF0115 AF0116   hemD TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 21990 21991 AF0117 AF0118 act-1   TRUE 0.806 -31.000 0.000 NA   NA
 21994 21995 AF0123 AF0124     TRUE 0.935 0.000 0.000 NA   NA
 21997 21998 AF0126 AF0127     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 401728 22000 AFtRNA-Met-1 AF0129 tRNA-Met   FALSE 0.198 24.000 0.000 NA   NA
 22000 22001 AF0129 AF0130   aphA TRUE 0.857 -12.000 0.000 1.000 N NA
 22003 22004 AF0132 AF0133   acaB-3 FALSE 0.031 56.000 0.000 NA   NA
 22004 22005 AF0133 AF0134 acaB-3 acaB-4 TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 22005 22006 AF0134 AF0135 acaB-4   TRUE 0.773 -60.000 0.000 NA   NA
 22006 22007 AF0135 AF0136     FALSE 0.030 60.000 0.000 NA   NA
 22008 22009 AF0137 AF0138     FALSE 0.024 97.000 0.000 NA   NA
 22011 22012 AF0140 AF0141 ubiE   TRUE 0.827 7.000 0.000 NA   NA
 22012 22013 AF0141 AF0142     FALSE 0.343 18.000 0.000 NA   NA
 22013 22014 AF0142 AF0143     TRUE 0.935 0.000 0.000 NA   NA
 22014 22015 AF0143 AF0144   cbaB TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 22016 22017 AF0145 AF0146     FALSE 0.014 211.000 0.000 NA   NA
 22017 22018 AF0146 AF0147     FALSE 0.030 63.000 0.000 NA   NA
 22019 22020 AF0148 AF0149     FALSE 0.018 145.000 0.000 NA   NA
 22021 22022 AF0150 AF0151     FALSE 0.014 212.000 0.000 NA   NA
 22025 22026 AF0154 AF0155     FALSE 0.030 63.000 0.000 NA   NA
 22026 22027 AF0155 AF0156   fdx-1 TRUE 0.483 14.000 0.000 NA   NA
 22027 22028 AF0156 AF0157 fdx-1   FALSE 0.105 100.000 0.000 0.039 Y NA
 22028 22029 AF0157 AF0158     TRUE 0.998 1.000 0.364 NA   NA
 22029 22030 AF0158 AF0159     TRUE 0.994 -10.000 0.273 NA   NA
 22030 22031 AF0159 AF0160     TRUE 0.986 10.000 0.250 1.000   NA
 22031 22032 AF0160 AF0161   moeA-3 TRUE 0.820 -31.000 0.000 1.000   NA
 22032 22033 AF0161 AF0162 moeA-3   FALSE 0.013 242.000 0.000 NA   NA
 22033 22034 AF0162 AF0163     FALSE 0.017 158.000 0.000 NA   NA
 22034 22035 AF0163 AF0164   nirA FALSE 0.030 61.000 0.000 NA   NA
 22035 22036 AF0164 AF0165 nirA   TRUE 0.992 -19.000 0.222 1.000 N NA
 22037 22038 AF0166 AF0167 fdx-2 fprA-1 TRUE 0.961 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 22038 22039 AF0167 AF0168 fprA-1   FALSE 0.022 124.000 0.000 1.000   NA
 22039 22040 AF0168 AF0169     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 22041 22042 AF0170 AF0171     TRUE 0.910 4.000 0.000 NA   NA
 22042 22043 AF0171 AF0172     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22044 22045 AF0173 AF0174     TRUE 0.996 -3.000 0.143 NA Y NA
 22045 22046 AF0174 AF0175     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA Y NA
 22046 22047 AF0175 AF0176     TRUE 0.999 5.000 1.000 0.087 Y NA
 22047 22048 AF0176 AF0177   fwdE FALSE 0.074 59.000 0.000 1.000 Y NA
 22049 22050 AF0178 AF0179     TRUE 0.784 -45.000 0.000 NA   NA
 22051 22052 AF0180 AF0181     FALSE 0.036 42.000 0.000 NA   NA
 22052 22053 AF0181 AF0182     TRUE 0.570 12.000 0.000 NA   NA
 22053 22054 AF0182 AF0183     TRUE 0.828 -22.000 0.000 NA   NA
 22054 22055 AF0183 AF0184     FALSE 0.014 216.000 0.000 NA   NA
 22055 22056 AF0184 AF0185   nifU-1 TRUE 0.917 4.000 0.000 1.000   NA
 22056 22057 AF0185 AF0186 nifU-1 nifS-1 TRUE 0.844 6.000 0.000 1.000 N NA
 22057 22058 AF0186 AF0187 nifS-1   TRUE 0.990 -19.000 0.133 NA   NA
 22058 22059 AF0187 AF0188     TRUE 0.996 1.000 0.133 NA   NA
 22059 22060 AF0188 AF0189     FALSE 0.011 353.000 0.000 NA   NA
 22060 22061 AF0189 AF0190     FALSE 0.014 211.000 0.000 NA   NA
 22061 22062 AF0190 AF0191     FALSE 0.019 136.000 0.000 NA   NA
 22062 22063 AF0191 AF0192     FALSE 0.198 24.000 0.000 NA   NA
 2209627 22064 AF0193 AF0194     FALSE 0.031 55.000 0.000 NA   NA
 22064 22065 AF0194 AF0195     FALSE 0.221 23.000 0.000 NA   NA
 22065 22066 AF0195 AF0196   alkK-1 FALSE 0.021 132.000 0.000 1.000   NA
 22066 22067 AF0196 AF0197 alkK-1 acs-1 FALSE 0.108 87.000 0.000 0.073 Y NA
 22067 22068 AF0197 AF0198 acs-1   TRUE 0.985 0.000 0.000 0.073 Y NA
 22068 22069 AF0198 AF0199   acd-1 TRUE 0.744 13.000 0.000 1.000 Y NA
 22069 22070 AF0199 AF0200 acd-1 fadD-2 TRUE 0.968 3.000 0.000 1.000 Y NA
 22070 22071 AF0200 AF0201 fadD-2 acaB-5 TRUE 0.907 -34.000 0.000 NA Y NA
 22071 22072 AF0201 AF0202 acaB-5 acaB-6 TRUE 0.970 2.000 0.000 NA Y NA
 22072 22073 AF0202 AF0203 acaB-6   TRUE 0.983 11.000 0.500 NA   NA
 22073 22074 AF0203 AF0204     FALSE 0.029 73.000 0.000 NA   NA
 22074 22075 AF0204 AF0205     TRUE 0.790 -40.000 0.000 NA   NA
 22075 22076 AF0205 AF0206     TRUE 0.992 -25.000 0.101 1.000 Y NA
 22076 22077 AF0206 AF0207   rpoL TRUE 0.995 2.000 0.109 1.000 N NA
 22079 22080 AF0209 AF0210     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22080 22081 AF0210 AF0211     TRUE 0.827 7.000 0.000 NA   NA
 22082 22083 AF0212 AF0213 hisD   FALSE 0.139 26.000 0.000 NA N NA
 22084 22085 AF0214 AF0215     FALSE 0.054 34.000 0.000 NA N NA
 22085 22086 AF0215 AF0216     TRUE 0.996 -3.000 0.306 NA N NA
 22087 22088 AF0217 AF0218 napA-1 trkA-1 TRUE 0.991 -3.000 0.023 1.000 Y NA
 22088 22089 AF0218 AF0219 trkA-1 leuA-2 TRUE 0.932 0.000 0.000 1.000 N NA
 22091 22092 AF0221 AF0222 braG-1 braF-1 TRUE 0.997 -13.000 0.148 0.021 Y NA
 22093 22094 AF0223 AF0224 braC-1 braD-1 TRUE 0.980 12.000 0.200 NA Y NA
 22094 22095 AF0224 AF0225 braD-1 braE-1 TRUE 0.997 -81.000 0.650 0.026 Y NA
 22095 22096 AF0225 AF0226 braE-1 noxC TRUE 0.624 11.000 0.000 1.000 N NA
 22097 22098 AF0227 AF0228 pheA aroD TRUE 0.989 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 22098 22099 AF0228 AF0229 aroD   TRUE 0.997 2.000 0.075 1.000 Y NA
 22099 22100 AF0229 AF0230     TRUE 0.811 -25.000 0.000 1.000 N NA
 22101 22102 AF0231 AF0232 glnH glnP TRUE 0.755 40.000 0.400 0.040 Y NA
 22102 22103 AF0232 AF0233 glnP   FALSE 0.014 220.000 0.000 NA   NA
 22104 22105 AF0234 AF0235   htpX FALSE 0.045 38.000 0.000 1.000   NA
 22106 22107 AF0236 AF0237   panF-3 TRUE 0.993 -6.000 0.154 NA   NA
 22109 22110 AF0239 AF0240 gptA-1 adeC TRUE 0.966 -19.000 0.009 1.000   NA
 22112 22113 AF0242 AF0243 graD-1   TRUE 0.987 -3.000 0.032 1.000 N NA
 22113 22114 AF0243 AF0244     FALSE 0.020 116.000 0.000 1.000 N NA
 22115 22116 AF0245 AF0246 desR feoB-1 FALSE 0.299 51.000 0.071 1.000 N NA
 22119 22120 AF0249 AF0250     TRUE 0.867 -10.000 0.000 NA   NA
 22122 22123 AF0252 AF0253 pyrG guaA-1 TRUE 0.994 0.000 0.024 1.000 Y NA
 22124 401727 AF0254 AFtRNA-Ser-1 noxA-1 tRNA-Ser FALSE 0.026 86.000 0.000 NA   NA
 22126 22127 AF0256 AF0257     FALSE 0.010 487.000 0.000 NA   NA
 22127 22128 AF0257 AF0258     TRUE 0.775 -58.000 0.000 NA   NA
 401726 401725 AFtRNA-Val-1 AFtRNA-Asp-1 tRNA-Val tRNA-Asp FALSE 0.016 178.000 0.000 NA   NA
 401725 22130 AFtRNA-Asp-1 AF0260 tRNA-Asp gltX FALSE 0.033 48.000 0.000 NA   NA
 22134 22135 AF0264 AF0265 rad2 moaB TRUE 0.973 -9.000 0.012 1.000 N NA
 22136 22137 AF0266 AF0267     FALSE 0.095 32.000 0.000 1.000   NA
 22137 22138 AF0267 AF0268     FALSE 0.030 66.000 0.000 NA   NA
 22138 22139 AF0268 AF0269     FALSE 0.032 52.000 0.000 NA   NA
 22139 22140 AF0269 AF0270     TRUE 0.827 7.000 0.000 NA   NA
 22140 22141 AF0270 AF0271     FALSE 0.016 159.000 0.000 1.000 N NA
 22141 22142 AF0271 AF0272     FALSE 0.024 102.000 0.000 NA   NA
 22143 22144 AF0273 AF0274 soxA soxB FALSE 0.034 763.000 0.000 0.001   NA
 22144 22145 AF0274 AF0275 soxB slgB-1 FALSE 0.013 267.000 0.000 1.000   NA
 22145 22146 AF0275 AF0276 slgB-1   FALSE 0.034 54.000 0.000 1.000   NA
 22146 22147 AF0276 AF0277     FALSE 0.028 76.000 0.000 1.000 N NA
 22149 22150 AF0279 AF0280     FALSE 0.027 82.000 0.000 NA   NA
 22151 22152 AF0281 AF0282     FALSE 0.030 67.000 0.000 NA   NA
 22153 22154 AF0283 AF0284 acaB-7   TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 22154 22155 AF0284 AF0285   hbd-2 TRUE 0.981 10.000 0.154 NA   NA
 22155 22156 AF0285 AF0286 hbd-2 etfB FALSE 0.269 76.000 0.069 1.000 N NA
 22156 22157 AF0286 AF0287 etfB etfA TRUE 0.999 0.000 0.800 0.038 Y NA
 22157 22158 AF0287 AF0288 etfA cysC FALSE 0.010 411.000 0.000 1.000 N NA
 22158 22159 AF0288 AF0289 cysC rfbA-2 FALSE 0.024 93.000 0.000 1.000 N NA
 22159 22160 AF0289 AF0290 rfbA-2 rfbB-2 TRUE 0.997 -3.000 0.188 1.000 Y NA
 22160 22161 AF0290 AF0291 rfbB-2   FALSE 0.009 663.000 0.000 1.000 N NA
 22162 22163 AF0292 AF0293     FALSE 0.039 39.000 0.000 NA   NA
 22163 10692136 AF0293 AF0294     FALSE 0.010 397.000 0.000 NA   NA
 22164 22165 AF0295 AF0296     TRUE 0.852 -15.000 0.000 NA   NA
 22166 22167 AF0297 AF0298     FALSE 0.026 89.000 0.000 NA   NA
 22167 22168 AF0298 AF0299     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 22168 22169 AF0299 AF0300     FALSE 0.014 209.000 0.000 NA   NA
 22169 22170 AF0300 AF0301     FALSE 0.013 239.000 0.000 NA   NA
 22171 22172 AF0302 AF0303 ugd-1   TRUE 0.806 -31.000 0.000 NA   NA
 22173 22174 AF0304 AF0305     FALSE 0.033 47.000 0.000 NA   NA
 22176 22177 AF0307 AF0308     FALSE 0.024 98.000 0.000 NA   NA
 22179 10692137 AF0310 AF0311     TRUE 0.775 -58.000 0.000 NA   NA
 10692137 22180 AF0311 AF0312     FALSE 0.030 67.000 0.000 NA   NA
 22181 22182 AF0313 AF0314     FALSE 0.020 132.000 0.000 NA   NA
 22182 22183 AF0314 AF0315     TRUE 0.828 -22.000 0.000 NA   NA
 22183 22184 AF0315 AF0316     TRUE 0.409 16.000 0.000 NA   NA
 22184 22185 AF0316 AF0317     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22185 22186 AF0317 AF0318     FALSE 0.013 240.000 0.000 NA   NA
 22186 22187 AF0318 AF0319     FALSE 0.033 48.000 0.000 NA   NA
 22187 22188 AF0319 AF0320     FALSE 0.024 102.000 0.000 NA   NA
 22189 22190 AF0321 AF0322   rfbQ TRUE 0.982 -6.000 0.028 NA   NA
 22190 22191 AF0322 AF0323b rfbQ   TRUE 0.985 -3.000 0.025 NA   NA
 22191 22192 AF0323b AF0323a     TRUE 0.776 12.000 0.000 1.000 Y NA
 22192 22193 AF0323a AF0324   rfbB TRUE 0.988 2.000 0.000 0.002 Y NA
 22193 22194 AF0324 AF0325 rfbB graD-2 TRUE 0.990 9.000 0.087 1.000 Y NA
 22194 10692138 AF0325 AF0326 graD-2   FALSE 0.034 46.000 0.000 NA   NA
 22195 22196 AF0327 AF0328     TRUE 0.922 -25.000 0.000 1.000 Y NA
 22196 22197 AF0328 AF0329     TRUE 0.656 11.000 0.000 1.000   NA
 22198 22199 AF0330 AF0331   traB TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22199 22200 AF0331 AF0332 traB   TRUE 0.971 -24.000 0.024 NA   NA
 22201 22202 AF0333 AF0334 hpaA-1   TRUE 0.982 -16.000 0.049 NA   NA
 22202 22203 AF0334 AF0335   pol30 FALSE 0.025 92.000 0.000 NA   NA
 22203 22204 AF0335 AF0336 pol30   TRUE 0.991 4.000 0.018 1.000 Y NA
 22205 22206 AF0337 AF0338 hpyA1-1 gspE-1 FALSE 0.027 277.000 0.000 0.034 N NA
 22207 22208 AF0339 AF0340   aor-3 TRUE 0.994 10.000 1.000 1.000 Y NA
 22209 22210 AF0341 AF0342     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.012 Y NA
 22210 22211 AF0342 AF0343   wrbA FALSE 0.041 138.000 0.000 0.084   NA
 22211 22212 AF0343 AF0344 wrbA   TRUE 0.945 5.000 0.000 0.084   NA
 22212 22213 AF0344 AF0345     FALSE 0.013 240.000 0.000 NA   NA
 22213 22214 AF0345 AF0346   merP FALSE 0.021 121.000 0.000 NA   NA
 22215 22216 AF0347 AF0348 mae1   FALSE 0.019 136.000 0.000 NA   NA
 22216 22217 AF0348 AF0349     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22217 22218 AF0349 AF0350     TRUE 0.936 2.000 0.000 1.000   NA
 401724 22219 AFtRNA-Leu-1 AF0351 tRNA-Leu   FALSE 0.035 43.000 0.000 NA   NA
 22219 22220 AF0351 AF0352     TRUE 0.988 10.000 0.368 NA   NA
 22220 22221 AF0352 AF0353     FALSE 0.030 62.000 0.000 NA   NA
 22221 22222 AF0353 AF0354     TRUE 0.818 -25.000 0.000 NA   NA
 22223 22224 AF0355 AF0356 fdx-3   FALSE 0.019 128.000 0.000 1.000 N NA
 22225 22226 AF0357 AF0358     TRUE 0.994 -22.000 0.842 NA   NA
 22227 22228 AF0359 AF0360     TRUE 0.993 -3.000 0.080 NA   NA
 22230 22231 AF0362 AF0363   cinR TRUE 0.996 -3.000 0.117 1.000 Y NA
 22231 22232 AF0363 AF0364 cinR lon FALSE 0.116 35.000 0.000 0.034 N NA
 22234 22235 AF0366 AF0367 acs-2 oxlT-2 TRUE 0.398 16.000 0.000 1.000 N NA
 22235 22236 AF0367 AF0368 oxlT-2   FALSE 0.023 105.000 0.000 NA   NA
 22237 22238 AF0369 AF0370   eif2BD FALSE 0.130 30.000 0.000 1.000   NA
 22238 22239 AF0370 AF0371 eif2BD   TRUE 0.717 10.000 0.000 1.000 N NA
 22239 22240 AF0371 AF0372     TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000 N NA
 22241 22242 AF0373 AF0374   pho2 TRUE 0.927 2.000 0.000 1.000 N NA
 22242 22243 AF0374 AF0375 pho2   TRUE 0.930 2.000 0.000 NA   NA
 22244 22245 AF0376 AF0377 cdhE cdhD TRUE 0.999 4.000 0.355 0.004 Y NA
 22245 22246 AF0377 AF0378 cdhD cooC-1 TRUE 0.993 6.000 0.293 1.000 N NA
 22246 22247 AF0378 AF0379 cooC-1 cdhC FALSE 0.365 83.000 0.172 1.000 N NA
 22247 22248 AF0379 AF0380 cdhC   FALSE 0.014 247.000 0.000 1.000   NA
 22249 22250 AF0381 AF0382 dph5   FALSE 0.319 20.000 0.000 1.000   NA
 22252 22253 AF0384 AF0385     FALSE 0.126 29.000 0.000 NA   NA
 22253 22254 AF0385 AF0386     TRUE 0.977 -25.000 0.041 NA   NA
 22254 22255 AF0386 AF0387     TRUE 0.991 0.000 0.029 1.000 N NA
 22255 22256 AF0387 AF0388     FALSE 0.165 62.000 0.021 1.000 N NA
 22256 22257 AF0388 AF0389     TRUE 0.993 -12.000 0.205 NA   NA
 22257 22258 AF0389 AF0390     TRUE 0.987 -43.000 0.170 NA   NA
 22258 22259 AF0390 AF0391     TRUE 0.870 -9.000 0.000 NA   NA
 22260 22261 AF0392 AF0393     TRUE 0.993 -34.000 0.615 1.000   NA
 22261 22262 AF0393 AF0394   dld FALSE 0.170 25.000 0.000 1.000 N NA
 22262 22263 AF0394 AF0395 dld noxA-2 TRUE 0.737 13.000 0.000 0.033   NA
 22263 22264 AF0395 AF0396 noxA-2   FALSE 0.319 20.000 0.000 1.000   NA
 22265 22266 AF0397 AF0398     FALSE 0.013 223.000 0.000 NA   NA
 22266 22267 AF0398 AF0399     TRUE 0.847 -16.000 0.000 NA   NA
 22269 22270 AF0401 AF0402     FALSE 0.319 19.000 0.000 NA   NA
 22270 22271 AF0402 AF0403     FALSE 0.037 40.000 0.000 NA   NA
 22271 22272 AF0403 AF0404     TRUE 0.947 -40.000 0.003 1.000   NA
 22272 401686 AF0404 AFtRNA-Arg-1   tRNA-Arg FALSE 0.039 39.000 0.000 NA   NA
 401686 22273 AFtRNA-Arg-1 AF0405 tRNA-Arg   FALSE 0.027 83.000 0.000 NA   NA
 22274 22275 AF0406 AF0407     TRUE 0.992 -12.000 0.148 NA   NA
 22275 22276 AF0407 AF0408     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22277 22278 AF0409 AF0410 aspB-4   FALSE 0.029 57.000 0.000 1.000 N NA
 22278 22279 AF0410 AF0411   cysS FALSE 0.102 31.000 0.000 1.000 N NA
 22279 22280 AF0411 AF0412 cysS   TRUE 0.852 -15.000 0.000 NA   NA
 22280 22281 AF0412 AF0413     FALSE 0.017 163.000 0.000 NA   NA
 22282 22283 AF0414 AF0415     FALSE 0.027 83.000 0.000 NA   NA
 22283 22284 AF0415 AF0416     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22284 22285 AF0416 AF0417     TRUE 0.483 14.000 0.000 NA   NA
 22285 22286 AF0417 AF0418     FALSE 0.030 59.000 0.000 NA   NA
 22286 22287 AF0418 AF0419     TRUE 0.786 -43.000 0.000 NA   NA
 22287 22288 AF0419 AF0420     TRUE 0.852 -15.000 0.000 NA   NA
 22288 22289 AF0420 AF0421     TRUE 0.915 14.000 0.060 NA   NA
 22289 22290 AF0421 AF0422   cysG-1 FALSE 0.158 26.000 0.000 NA   NA
 22291 22292 AF0423 AF0424 dsrA dsrB TRUE 0.999 -6.000 0.879 0.002 Y NA
 22292 22293 AF0424 AF0425 dsrB dsrD TRUE 0.578 42.000 0.129 0.002   NA
 22293 22294 AF0425 AF0426 dsrD   TRUE 0.409 16.000 0.000 NA   NA
 22294 22295 AF0426 AF0427   fdx-4 FALSE 0.029 73.000 0.000 NA   NA
 22296 22297 AF0428 AF0429     FALSE 0.237 23.000 0.000 1.000   NA
 22297 22298 AF0429 AF0430   hemV-1 FALSE 0.019 158.000 0.000 1.000   NA
 22298 22299 AF0430 AF0431 hemV-1 hemU-1 TRUE 0.998 5.000 0.640 1.000 Y NA
 22299 22300 AF0431 AF0432 hemU-1 hemV-2 TRUE 0.998 -3.000 0.302 1.000 Y NA
 22300 22301 AF0432 AF0433 hemV-2   TRUE 0.996 1.000 0.147 NA N NA
 22301 22302 AF0433 AF0434   hbd-3 FALSE 0.018 123.000 0.000 NA N NA
 22302 22303 AF0434 AF0435 hbd-3 fad-1 TRUE 0.953 5.000 0.000 1.000 Y NA
 22303 22304 AF0435 AF0436 fad-1 acd-2 TRUE 0.874 10.000 0.000 1.000 Y NA
 22304 22305 AF0436 AF0437 acd-2   TRUE 0.936 1.000 0.000 NA   NA
 22305 22306 AF0437 AF0438   acaB-8 TRUE 0.995 5.000 0.286 NA   NA
 22306 22307 AF0438 AF0439 acaB-8   FALSE 0.027 80.000 0.000 1.000 N NA
 22307 22308 AF0439 AF0440     FALSE 0.026 83.000 0.000 1.000 N NA
 22308 22309 AF0440 AF0441     TRUE 0.993 0.000 0.046 1.000 N NA
 22309 22310 AF0441 AF0442   exsB TRUE 0.964 -19.000 0.005 1.000   NA
 401687 22311 AFtRNA-Leu-2 AF0443 tRNA-Leu   FALSE 0.009 2462.000 0.000 NA   NA
 11473482 22312   AF0444     FALSE NA 1985.000 0.000 NA   NA
 11615845 22312   AF0444     FALSE NA 1985.000 0.000 NA   NA
 11758237 22312   AF0444     FALSE NA 1985.000 0.000 NA   NA
 11473483 22312   AF0444     FALSE NA 1944.000 0.000 NA   NA
 11615846 22312   AF0444     FALSE NA 1944.000 0.000 NA   NA
 11758238 22312   AF0444     FALSE NA 1944.000 0.000 NA   NA
 11473484 22312   AF0444     FALSE NA 1914.000 0.000 NA   NA
 11615847 22312   AF0444     FALSE NA 1914.000 0.000 NA   NA
 11758239 22312   AF0444     FALSE NA 1914.000 0.000 NA   NA
 11473485 22312   AF0444     FALSE NA 1877.000 0.000 NA   NA
 11615848 22312   AF0444     FALSE NA 1877.000 0.000 NA   NA
 11758240 22312   AF0444     FALSE NA 1877.000 0.000 NA   NA
 11473486 22312   AF0444     FALSE NA 1847.000 0.000 NA   NA
 11615849 22312   AF0444     FALSE NA 1847.000 0.000 NA   NA
 11758241 22312   AF0444     FALSE NA 1847.000 0.000 NA   NA
 11473487 22312   AF0444     FALSE NA 1807.000 0.000 NA   NA
 11615850 22312   AF0444     FALSE NA 1807.000 0.000 NA   NA
 11758242 22312   AF0444     FALSE NA 1807.000 0.000 NA   NA
 11473488 22312   AF0444     FALSE NA 1777.000 0.000 NA   NA
 11615851 22312   AF0444     FALSE NA 1777.000 0.000 NA   NA
 11758243 22312   AF0444     FALSE NA 1777.000 0.000 NA   NA
 11473489 22312   AF0444     FALSE NA 1739.000 0.000 NA   NA
 11615852 22312   AF0444     FALSE NA 1739.000 0.000 NA   NA
 11758244 22312   AF0444     FALSE NA 1739.000 0.000 NA   NA
 11473490 22312   AF0444     FALSE NA 1709.000 0.000 NA   NA
 11615853 22312   AF0444     FALSE NA 1709.000 0.000 NA   NA
 11758245 22312   AF0444     FALSE NA 1709.000 0.000 NA   NA
 11473491 22312   AF0444     FALSE NA 1668.000 0.000 NA   NA
 11615854 22312   AF0444     FALSE NA 1668.000 0.000 NA   NA
 11758246 22312   AF0444     FALSE NA 1668.000 0.000 NA   NA
 11473492 22312   AF0444     FALSE NA 1638.000 0.000 NA   NA
 11615855 22312   AF0444     FALSE NA 1638.000 0.000 NA   NA
 11758247 22312   AF0444     FALSE NA 1638.000 0.000 NA   NA
 11473493 22312   AF0444     FALSE NA 1594.000 0.000 NA   NA
 11615856 22312   AF0444     FALSE NA 1594.000 0.000 NA   NA
 11758248 22312   AF0444     FALSE NA 1594.000 0.000 NA   NA
 11473494 22312   AF0444     FALSE NA 1564.000 0.000 NA   NA
 11615857 22312   AF0444     FALSE NA 1564.000 0.000 NA   NA
 11758249 22312   AF0444     FALSE NA 1564.000 0.000 NA   NA
 11473495 22312   AF0444     FALSE NA 1527.000 0.000 NA   NA
 11615858 22312   AF0444     FALSE NA 1527.000 0.000 NA   NA
 11758250 22312   AF0444     FALSE NA 1527.000 0.000 NA   NA
 11473496 22312   AF0444     FALSE NA 1497.000 0.000 NA   NA
 11615859 22312   AF0444     FALSE NA 1497.000 0.000 NA   NA
 11758251 22312   AF0444     FALSE NA 1497.000 0.000 NA   NA
 11473497 22312   AF0444     FALSE NA 1461.000 0.000 NA   NA
 11615860 22312   AF0444     FALSE NA 1461.000 0.000 NA   NA
 11758252 22312   AF0444     FALSE NA 1461.000 0.000 NA   NA
 11473498 22312   AF0444     FALSE NA 1431.000 0.000 NA   NA
 11615861 22312   AF0444     FALSE NA 1431.000 0.000 NA   NA
 11758253 22312   AF0444     FALSE NA 1431.000 0.000 NA   NA
 11473499 22312   AF0444     FALSE NA 1389.000 0.000 NA   NA
 11615862 22312   AF0444     FALSE NA 1389.000 0.000 NA   NA
 11758254 22312   AF0444     FALSE NA 1389.000 0.000 NA   NA
 11473500 22312   AF0444     FALSE NA 1359.000 0.000 NA   NA
 11615863 22312   AF0444     FALSE NA 1359.000 0.000 NA   NA
 11758255 22312   AF0444     FALSE NA 1359.000 0.000 NA   NA
 11473501 22312   AF0444     FALSE NA 1321.000 0.000 NA   NA
 11615864 22312   AF0444     FALSE NA 1321.000 0.000 NA   NA
 11758256 22312   AF0444     FALSE NA 1321.000 0.000 NA   NA
 11473502 22312   AF0444     FALSE NA 1291.000 0.000 NA   NA
 11615865 22312   AF0444     FALSE NA 1291.000 0.000 NA   NA
 11758257 22312   AF0444     FALSE NA 1291.000 0.000 NA   NA
 11473503 22312   AF0444     FALSE NA 1256.000 0.000 NA   NA
 11615866 22312   AF0444     FALSE NA 1256.000 0.000 NA   NA
 11758258 22312   AF0444     FALSE NA 1256.000 0.000 NA   NA
 22311 22312 AF0443 AF0444     FALSE 0.009 931.000 0.000 NA   NA
 11473504 22312   AF0444     FALSE NA 1226.000 0.000 NA   NA
 11615867 22312   AF0444     FALSE NA 1226.000 0.000 NA   NA
 11758259 22312   AF0444     FALSE NA 1226.000 0.000 NA   NA
 11473505 22312   AF0444     FALSE NA 1190.000 0.000 NA   NA
 11615868 22312   AF0444     FALSE NA 1190.000 0.000 NA   NA
 11758260 22312   AF0444     FALSE NA 1190.000 0.000 NA   NA
 11473506 22312   AF0444     FALSE NA 1160.000 0.000 NA   NA
 11615869 22312   AF0444     FALSE NA 1160.000 0.000 NA   NA
 11758261 22312   AF0444     FALSE NA 1160.000 0.000 NA   NA
 11473507 22312   AF0444     FALSE NA 1124.000 0.000 NA   NA
 11615870 22312   AF0444     FALSE NA 1124.000 0.000 NA   NA
 11758262 22312   AF0444     FALSE NA 1124.000 0.000 NA   NA
 11473508 22312   AF0444     FALSE NA 1094.000 0.000 NA   NA
 11615871 22312   AF0444     FALSE NA 1094.000 0.000 NA   NA
 11758263 22312   AF0444     FALSE NA 1094.000 0.000 NA   NA
 11473509 22312   AF0444     FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11615872 22312   AF0444     FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11758264 22312   AF0444     FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11473510 22312   AF0444     FALSE NA 1028.000 0.000 NA   NA
 11615873 22312   AF0444     FALSE NA 1028.000 0.000 NA   NA
 11758265 22312   AF0444     FALSE NA 1028.000 0.000 NA   NA
 11473511 22312   AF0444     FALSE NA 991.000 0.000 NA   NA
 11615874 22312   AF0444     FALSE NA 991.000 0.000 NA   NA
 11758266 22312   AF0444     FALSE NA 991.000 0.000 NA   NA
 11473512 22312   AF0444     FALSE NA 961.000 0.000 NA   NA
 11615875 22312   AF0444     FALSE NA 961.000 0.000 NA   NA
 11758267 22312   AF0444     FALSE NA 961.000 0.000 NA   NA
 11473513 22312   AF0444     FALSE NA 924.000 0.000 NA   NA
 11615876 22312   AF0444     FALSE NA 924.000 0.000 NA   NA
 11758268 22312   AF0444     FALSE NA 924.000 0.000 NA   NA
 11473514 22312   AF0444     FALSE NA 894.000 0.000 NA   NA
 11615877 22312   AF0444     FALSE NA 894.000 0.000 NA   NA
 11758269 22312   AF0444     FALSE NA 894.000 0.000 NA   NA
 11473515 22312   AF0444     FALSE NA 858.000 0.000 NA   NA
 11615878 22312   AF0444     FALSE NA 858.000 0.000 NA   NA
 11758270 22312   AF0444     FALSE NA 858.000 0.000 NA   NA
 11473516 22312   AF0444     FALSE NA 828.000 0.000 NA   NA
 11615879 22312   AF0444     FALSE NA 828.000 0.000 NA   NA
 11758271 22312   AF0444     FALSE NA 828.000 0.000 NA   NA
 11473517 22312   AF0444     FALSE NA 792.000 0.000 NA   NA
 11615880 22312   AF0444     FALSE NA 792.000 0.000 NA   NA
 11758272 22312   AF0444     FALSE NA 792.000 0.000 NA   NA
 11473518 22312   AF0444     FALSE NA 762.000 0.000 NA   NA
 11615881 22312   AF0444     FALSE NA 762.000 0.000 NA   NA
 11758273 22312   AF0444     FALSE NA 762.000 0.000 NA   NA
 11473519 22312   AF0444     FALSE NA 725.000 0.000 NA   NA
 11615882 22312   AF0444     FALSE NA 725.000 0.000 NA   NA
 11758274 22312   AF0444     FALSE NA 725.000 0.000 NA   NA
 11473520 22312   AF0444     FALSE NA 695.000 0.000 NA   NA
 11615883 22312   AF0444     FALSE NA 695.000 0.000 NA   NA
 11758275 22312   AF0444     FALSE NA 695.000 0.000 NA   NA
 11473521 22312   AF0444     FALSE NA 657.000 0.000 NA   NA
 11615884 22312   AF0444     FALSE NA 657.000 0.000 NA   NA
 11758276 22312   AF0444     FALSE NA 657.000 0.000 NA   NA
 11473522 22312   AF0444     FALSE NA 627.000 0.000 NA   NA
 11615885 22312   AF0444     FALSE NA 627.000 0.000 NA   NA
 11758277 22312   AF0444     FALSE NA 627.000 0.000 NA   NA
 11473523 22312   AF0444     FALSE NA 589.000 0.000 NA   NA
 11615886 22312   AF0444     FALSE NA 589.000 0.000 NA   NA
 11758278 22312   AF0444     FALSE NA 589.000 0.000 NA   NA
 11473524 22312   AF0444     FALSE NA 559.000 0.000 NA   NA
 11615887 22312   AF0444     FALSE NA 559.000 0.000 NA   NA
 11758279 22312   AF0444     FALSE NA 559.000 0.000 NA   NA
 11473525 22312   AF0444     FALSE NA 522.000 0.000 NA   NA
 11615888 22312   AF0444     FALSE NA 522.000 0.000 NA   NA
 11758280 22312   AF0444     FALSE NA 522.000 0.000 NA   NA
 11473526 22312   AF0444     FALSE NA 492.000 0.000 NA   NA
 11615889 22312   AF0444     FALSE NA 492.000 0.000 NA   NA
 11758281 22312   AF0444     FALSE NA 492.000 0.000 NA   NA
 11473527 22312   AF0444     FALSE NA 456.000 0.000 NA   NA
 11615890 22312   AF0444     FALSE NA 456.000 0.000 NA   NA
 11758282 22312   AF0444     FALSE NA 456.000 0.000 NA   NA
 11473528 22312   AF0444     FALSE NA 426.000 0.000 NA   NA
 11615891 22312   AF0444     FALSE NA 426.000 0.000 NA   NA
 11758283 22312   AF0444     FALSE NA 426.000 0.000 NA   NA
 22313 22314 AF0445 AF0446     FALSE 0.015 206.000 0.000 NA   NA
 22314 22315 AF0446 AF0447     TRUE 0.938 -33.000 0.000 0.001   NA
 22316 22317 AF0448 AF0449     TRUE 0.969 -16.000 0.000 0.010 Y NA
 22317 22318 AF0449 AF0450     TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.041 Y NA
 22318 22319 AF0450 AF0451     FALSE 0.032 53.000 0.000 NA   NA
 22319 22320 AF0451 AF0452     TRUE 0.818 -25.000 0.000 NA   NA
 22320 22321 AF0452 AF0453     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22321 22322 AF0453 AF0454     FALSE 0.072 33.000 0.000 NA   NA
 22324 22325 AF0456 AF0457     FALSE 0.016 191.000 0.000 NA   NA
 22328 22329 AF0460 AF0461     TRUE 0.988 1.000 0.014 NA   NA
 22329 22330 AF0461 AF0462     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22331 22332 AF0463m AF0464 mvhB chlP-1 FALSE 0.039 156.000 0.000 0.073   NA
 22334 22335 AF0466 AF0467   bcsp31-1 FALSE 0.087 32.000 0.000 NA   NA
 22335 22336 AF0467 AF0468 bcsp31-1 korB TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 22336 22337 AF0468 AF0469 korB korA TRUE 0.997 -3.000 0.057 0.003 Y NA
 22337 22338 AF0469 AF0470 korA korD TRUE 0.963 -28.000 0.000 0.003 Y NA
 22338 22339 AF0470 AF0471 korD korG TRUE 0.951 15.000 0.024 0.003 Y NA
 22343 22344 AF0475 AF0476     TRUE 0.995 -3.000 0.200 NA   NA
 22345 22346 AF0477 AF0478   phnP TRUE 0.992 3.000 0.056 1.000   NA
 22346 22347 AF0478 AF0479 phnP   TRUE 0.967 -139.000 0.008 0.023   NA
 22349 22350 AF0481 AF0482 psmB   TRUE 0.997 3.000 0.309 1.000   NA
 22350 22351 AF0482 AF0483     FALSE 0.026 102.000 0.000 1.000   NA
 22351 22352 AF0483 AF0484   ribA-1 TRUE 0.617 34.000 0.211 1.000   NA
 22352 22353 AF0484 AF0485 ribA-1   TRUE 0.852 -15.000 0.000 NA   NA
 22353 22354 AF0485 AF0486     TRUE 0.828 -22.000 0.000 NA   NA
 22354 22355 AF0486 AF0487     FALSE 0.033 58.000 0.000 1.000   NA
 22355 22356 AF0487 AF0488     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22356 22357 AF0488 AF0489     TRUE 0.769 -72.000 0.000 NA   NA
 22357 22358 AF0489 AF0490   psmA TRUE 0.997 3.000 0.339 1.000 N NA
 22358 22359 AF0490 AF0491 psmA   TRUE 0.996 4.000 0.274 NA N NA
 22359 22360 AF0491 AF0492     TRUE 0.999 0.000 0.335 NA Y NA
 22360 22361 AF0492 AF0493   rph TRUE 0.998 -16.000 0.484 0.014 Y NA
 22361 22362 AF0493 AF0494 rph   TRUE 0.998 -7.000 0.270 0.001 Y NA
 22362 22363 AF0494 AF0495     FALSE 0.012 266.000 0.000 NA   NA
 22363 22364 AF0495 AF0496     FALSE 0.030 58.000 0.000 NA   NA
 22364 22365 AF0496 AF0497   polB FALSE 0.019 133.000 0.000 NA   NA
 22365 22366 AF0497 AF0498 polB acd-3 FALSE 0.014 198.000 0.000 1.000 N NA
 22366 22367 AF0498 AF0499 acd-3   FALSE 0.022 386.000 0.000 0.072 N NA
 22367 22368 AF0499 AF0500     TRUE 0.998 1.000 0.258 NA Y NA
 22368 22369 AF0500 AF0501     TRUE 0.994 -3.000 0.047 NA Y NA
 22369 22370 AF0501 AF0502     TRUE 0.994 11.000 0.766 0.072 Y NA
 22370 22371 AF0502 AF0503     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 22374 22375 AF0506 AF0507     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.028 Y NA
 22376 22377 AF0508 AF0509     TRUE 0.992 -3.000 0.030 NA Y NA
 22377 22378 AF0509 AF0510     TRUE 0.926 0.000 0.000 NA N NA
 22378 22379 AF0510 AF0511   rps6E FALSE 0.070 33.000 0.000 1.000 N NA
 22379 22380 AF0511 AF0512 rps6E   TRUE 0.901 12.000 0.024 1.000 N NA
 22380 22381 AF0512 AF0513     FALSE 0.041 38.000 0.000 NA   NA
 22382 22383 AF0514 AF0515     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 22384 22385 AF0516 AF0517   cdc21 FALSE 0.048 36.000 0.000 NA   NA
 22385 22386 AF0517 AF0518 cdc21   FALSE 0.099 43.000 0.000 0.003 N NA
 22386 22387 AF0518 AF0519     TRUE 0.986 -3.000 0.030 NA   NA
 22387 22388 AF0519 AF0520     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22390 22391 AF0522 AF0523 argE   FALSE 0.275 21.000 0.000 NA   NA
 22392 22393 AF0524 AF0525     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22393 22394 AF0525 AF0526     TRUE 0.995 5.000 0.305 NA   NA
 22394 22395 AF0526 AF0527   eif2A TRUE 0.998 -3.000 0.519 NA Y NA
 22395 22396 AF0527 AF0528 eif2A   FALSE 0.042 37.000 0.000 1.000 N NA
 22397 22398 AF0529 AF0530   gyrB FALSE 0.010 989.000 0.000 1.000   NA
 22398 22399 AF0530 AF0531 gyrB moeB FALSE 0.290 20.000 0.000 1.000 N NA
 22399 22400 AF0531 AF0532 moeB   FALSE 0.029 69.000 0.000 1.000 N NA
 22400 22401 AF0532 AF0533     TRUE 0.990 -3.000 0.017 0.023   NA
 22403 22404 AF0535 AF0536 ftsZ-1 secE TRUE 0.931 18.000 0.272 1.000 N NA
 22404 22405 AF0536 AF0537 secE rpl24A TRUE 0.983 -3.000 0.019 1.000 N NA
 22405 22406 AF0537 AF0538 rpl24A rpl11P TRUE 0.989 3.000 0.004 0.022 N NA
 22407 22408 AF0539 AF0540     TRUE 0.930 2.000 0.000 NA   NA
 22408 22409 AF0540 AF0541     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22411 22412 AF0543 AF0544     TRUE 0.868 12.000 0.000 0.028 Y NA
 22412 22413 AF0544 AF0545     TRUE 0.982 17.000 1.000 0.072 Y NA
 22414 22415 AF0546 AF0547 narI   TRUE 0.963 6.000 0.000 0.072 Y NA
 22415 22416 AF0547 AF0548   thrS FALSE 0.028 60.000 0.000 1.000 N NA
 22416 22417 AF0548 AF0549 thrS   TRUE 0.985 6.000 0.060 NA   NA
 22419 22420 AF0551 AF0552 thrC-1   TRUE 0.980 5.000 0.021 1.000 N NA
 22420 22421 AF0552 AF0553   thiF TRUE 0.999 1.000 0.667 1.000 Y NA
 22421 22422 AF0553 AF0554 thiF   TRUE 0.991 -40.000 0.154 0.032 N NA
 22422 22423 AF0554 AF0555     FALSE 0.020 131.000 0.000 NA   NA
 22423 22424 AF0555 AF0556     TRUE 0.926 21.000 0.478 NA   NA
 22424 22425 AF0556 AF0557     TRUE 0.996 2.000 0.179 1.000 N NA
 22425 22426 AF0557 AF0558     TRUE 0.959 10.000 0.038 NA   NA
 22426 22427 AF0558 AF0559     FALSE 0.030 60.000 0.000 NA   NA
 10692139 22428 AF0560 AF0562     FALSE 0.009 1951.000 0.000 NA   NA
 22429 22430 AF0563 AF0564   nifS-2 TRUE 0.980 10.000 0.133 NA   NA
 22430 22431 AF0564 AF0565 nifS-2 nifU-2 TRUE 0.844 6.000 0.000 1.000 N NA
 22431 22432 AF0565 AF0566 nifU-2   TRUE 0.917 4.000 0.000 1.000   NA
 22433 22434 AF0567 AF0568     FALSE 0.016 177.000 0.000 NA   NA
 401689 22435 AFtRNA-Leu-3 AF0569 tRNA-Leu   FALSE 0.010 408.000 0.000 NA   NA
 22435 22436 AF0569 AF0570   ftsZ-2 TRUE 0.951 13.000 0.125 1.000 N NA
 22436 22437 AF0570 AF0571 ftsZ-2   TRUE 0.527 25.000 0.009 NA   NA
 22437 22438 AF0571 AF0572     FALSE 0.054 35.000 0.000 NA   NA
 22438 22439 AF0572 AF0573     TRUE 0.992 -3.000 0.072 NA   NA
 22439 22440 AF0573 AF0574     TRUE 0.984 13.000 0.511 NA Y NA
 22440 22441 AF0574 AF0575     TRUE 0.985 -3.000 0.022 1.000   NA
 22441 22442 AF0575 AF0576     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22442 22443 AF0576 AF0577     TRUE 0.935 0.000 0.000 NA   NA
 22445 22446 AF0579 AF0580   xthA FALSE 0.130 30.000 0.000 1.000   NA
 22446 22447 AF0580 AF0581 xthA   TRUE 0.759 -121.000 0.000 NA   NA
 22447 22448 AF0581 AF0582     TRUE 0.930 2.000 0.000 NA   NA
 22448 22449 AF0582 AF0583     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22449 22450 AF0583 AF0584     FALSE 0.319 19.000 0.000 NA   NA
 22450 22451 AF0584 AF0585     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 22451 22452 AF0585 AF0586     TRUE 0.910 4.000 0.000 NA   NA
 22453 22454 AF0587 AF0588   tgtA TRUE 0.997 -13.000 0.122 0.001 Y NA
 22455 22456 AF0589 AF0590 prsA-1 hisG FALSE 0.040 186.000 0.000 1.000 Y NA
 22457 22458 AF0591 AF0592   eif2G TRUE 0.993 -33.000 0.511 NA   NA
 22459 22460 AF0593 AF0594     FALSE 0.031 56.000 0.000 NA   NA
 22460 22461 AF0594 AF0595     FALSE 0.014 256.000 0.000 1.000   NA
 22461 22462 AF0595 AF0596   ugd-2 FALSE 0.013 259.000 0.000 1.000   NA
 22462 22463 AF0596 AF0597 ugd-2   FALSE 0.010 378.000 0.000 NA   NA
 22463 22464 AF0597 AF0598     TRUE 0.996 -3.000 0.333 NA   NA
 22465 22466 AF0599 AF0600     FALSE 0.072 33.000 0.000 NA   NA
 22466 22467 AF0600 AF0601     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22467 22468 AF0601 AF0602     FALSE 0.018 169.000 0.000 1.000   NA
 22468 22469 AF0602 AF0603     FALSE 0.016 180.000 0.000 NA   NA
 22469 22470 AF0603 AF0604     TRUE 0.818 -25.000 0.000 NA   NA
 22470 22471 AF0604 AF0605     FALSE 0.009 827.000 0.000 NA   NA
 22471 22472 AF0605 AF0606   wbaZ-2 TRUE 0.812 -28.000 0.000 NA   NA
 22472 22473 AF0606 AF0607 wbaZ-2   TRUE 0.987 2.000 0.000 0.009 Y NA
 22473 22474 AF0607 AF0608     FALSE 0.010 553.000 0.000 NA   NA
 22478 22479 AF0612 AF0613     TRUE 0.867 -10.000 0.000 NA   NA
 22479 22480 AF0613 AF0614     FALSE 0.011 346.000 0.000 NA   NA
 22480 22481 AF0614 AF0615     FALSE 0.025 105.000 0.000 1.000   NA
 22481 22482 AF0615 AF0616     TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 22482 22483 AF0616 AF0617     TRUE 0.392 24.000 0.000 1.000 Y NA
 22483 22484 AF0617 AF0618     FALSE 0.023 107.000 0.000 NA   NA
 22484 22485 AF0618 AF0619     FALSE 0.025 90.000 0.000 NA   NA
 401723 22487 AFtRNA-Gln-2 AF0621 tRNA-Gln rnhB FALSE 0.037 40.000 0.000 NA   NA
 22487 22488 AF0621 AF0622 rnhB srp54 TRUE 0.984 0.000 0.003 1.000 N NA
 22489 22490 AF0623 AF0624 lig   TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22490 22491 AF0624 AF0625     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22492 22493 AF0626 AF0627     FALSE 0.010 386.000 0.000 NA   NA
 22493 22494 AF0627 AF0628   leuB FALSE 0.079 33.000 0.000 1.000   NA
 22494 22495 AF0628 AF0629 leuB leuD-1 TRUE 0.995 -3.000 0.013 0.002 Y NA
 22495 22496 AF0629 AF0630 leuD-1   FALSE 0.087 32.000 0.000 NA   NA
 22496 22497 AF0630 AF0631     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22497 22498 AF0631 AF0632   nifU-3 TRUE 0.985 3.000 0.014 NA   NA
 22498 22499 AF0632 AF0633 nifU-3 ileS FALSE 0.026 81.000 0.000 1.000 N NA
 22501 22502 AF0635 AF0636 bcsp31-2   TRUE 0.988 -3.000 0.033 1.000   NA
 22502 22503 AF0636 AF0637     TRUE 0.993 -9.000 0.154 NA   NA
 22503 22504 AF0637 AF0638   nrtC-2 TRUE 0.919 3.000 0.000 NA   NA
 22504 22505 AF0638 AF0639 nrtC-2 nrtB-2 TRUE 0.997 -21.000 0.667 1.000 Y NA
 22505 22506 AF0639 AF0640 nrtB-2   TRUE 0.995 -3.000 0.071 0.021   NA
 22506 22507 AF0640 AF0641     TRUE 0.802 -33.000 0.000 NA   NA
 22508 22509 AF0642 AF0643     FALSE 0.021 97.000 0.000 NA N NA
 22511 22512 AF0645 AF0646 eif5A speB TRUE 0.988 0.000 0.018 1.000 N NA
 22512 22513 AF0646 AF0647 speB icd FALSE 0.019 133.000 0.000 1.000 N NA
 22513 22514 AF0647 AF0648 icd   TRUE 0.958 -3.000 0.000 NA Y NA
 22514 22515 AF0648 AF0649     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22515 22516 AF0649 AF0650     FALSE 0.019 136.000 0.000 NA   NA
 22516 22517 AF0650 AF0651     FALSE 0.033 48.000 0.000 NA   NA
 22517 22518 AF0651 AF0652   top6B TRUE 0.991 -3.000 0.058 1.000   NA
 22520 22521 AF0654 AF0655     TRUE 0.936 1.000 0.000 NA   NA
 22521 22522 AF0655 AF0656   pmbA TRUE 0.994 0.000 0.067 NA   NA
 22523 22524 AF0657 AF0658     TRUE 0.812 -28.000 0.000 NA   NA
 22524 22525 AF0658 AF0659   gspE-2 TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 22525 22526 AF0659 AF0660 gspE-2   FALSE 0.034 46.000 0.000 NA   NA
 22526 22527 AF0660 AF0661     TRUE 0.827 7.000 0.000 NA   NA
 22527 22528 AF0661 AF0662     TRUE 0.991 9.000 0.084 0.003 N NA
 22528 22529 AF0662 AF0663   hdrA-1 TRUE 0.998 2.000 0.286 0.003 N NA
 22530 22531 AF0664 AF0665     FALSE 0.177 25.000 0.000 NA   NA
 22533 22534 AF0667 AF0668     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22534 22535 AF0668 AF0669     FALSE 0.048 36.000 0.000 NA   NA
 22535 22536 AF0669 AF0670   aroC TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 22537 22538 AF0671 AF0672 acd-4 alkK-3 TRUE 0.937 6.000 0.000 1.000 Y NA
 22538 22539 AF0672 AF0673 alkK-3 merR FALSE 0.128 28.000 0.000 1.000 N NA
 22540 22541 AF0674 AF0675   todF TRUE 0.996 1.000 0.167 NA N NA
 22542 22543 AF0676 AF0677 adk acs-3 FALSE 0.028 73.000 0.000 1.000 N NA
 22544 22545 AF0678 AF0679     TRUE 0.436 107.000 0.167 NA Y NA
 22547 22548 AF0681 AF0682 sdhA sdhB TRUE 0.996 10.000 0.470 0.002 Y NA
 22548 22549 AF0682 AF0683 sdhB sdhC TRUE 0.988 2.000 0.000 0.002 Y NA
 22549 22550 AF0683 AF0684 sdhC sdhD TRUE 0.993 -7.000 0.010 0.001 Y NA
 22550 401690 AF0684 AFtRNA-Arg-2 sdhD tRNA-Arg FALSE 0.033 48.000 0.000 NA   NA
 401690 22551 AFtRNA-Arg-2 AF0685 tRNA-Arg fad-2 FALSE 0.248 22.000 0.000 NA   NA
 22551 22552 AF0685 AF0686 fad-2   TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 22554 22555 AF0688 AF0689     FALSE 0.029 73.000 0.000 NA   NA
 22557 22558 AF0691 AF0692     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22559 22560 AF0693m AF0694 boxA   FALSE 0.014 215.000 0.000 NA   NA
 22561 22562 AF0695 AF0696   minD-1 FALSE 0.022 91.000 0.000 NA N NA
 22562 22563 AF0696 AF0697 minD-1   TRUE 0.850 6.000 0.000 NA   NA
 22564 22565 AF0698 AF0699     TRUE 0.987 -21.000 0.080 NA   NA
 22565 22566 AF0699 AF0700   lysC TRUE 0.821 -22.000 0.000 1.000 N NA
 22566 22567 AF0700 AF0701 lysC   FALSE 0.036 42.000 0.000 NA   NA
 22567 22568 AF0701 AF0702   thi1 TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22568 22569 AF0702 AF0703 thi1   TRUE 0.726 10.000 0.000 NA   NA
 22570 22571 AF0704 AF0705     FALSE 0.034 46.000 0.000 NA   NA
 22573 22574 AF0707 AF0708     TRUE 0.987 -10.000 0.067 1.000 N NA
 22574 22575 AF0708 AF0709     TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 22577 22578 AF0711 AF0712 trx-1   TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22580 22581 AF0714 AF0715 mtd   TRUE 0.993 -3.000 0.083 NA   NA
 22581 22582 AF0715 AF0716     FALSE 0.025 90.000 0.000 NA   NA
 22582 22583 AF0716 AF0717     TRUE 0.914 -28.000 0.000 NA Y NA
 22583 22584 AF0717 AF0718     FALSE 0.177 25.000 0.000 NA   NA
 22584 22585 AF0718 AF0719     FALSE 0.027 82.000 0.000 NA   NA
 22586 22587 AF0720 AF0721     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22587 22588 AF0721 AF0722   cbiE TRUE 0.965 -3.000 0.000 0.011   NA
 22588 22589 AF0722 AF0723 cbiE cbiD TRUE 0.991 -46.000 0.043 0.011 Y NA
 22589 22590 AF0723 AF0724 cbiD cbiH TRUE 0.994 -19.000 0.045 0.011 Y NA
 22590 22591 AF0724 AF0725 cbiH cbiG TRUE 0.997 -25.000 0.352 0.011 Y NA
 22591 22592 AF0725 AF0726 cbiG cbiF TRUE 0.994 -52.000 0.397 1.000 Y NA
 22592 22593 AF0726 AF0727 cbiF cbiL TRUE 0.998 -3.000 0.291 1.000 Y NA
 22594 22595 AF0728 AF0729 cbiM-1 cbiN TRUE 0.999 -3.000 0.861 0.011 Y NA
 22595 22596 AF0729 AF0730 cbiN cbiQ-1 TRUE 0.998 -16.000 0.804 0.002 Y NA
 22596 22597 AF0730 AF0731 cbiQ-1 cbiO-1 TRUE 0.982 -102.000 0.032 0.002 N NA
 22597 22598 AF0731 AF0732 cbiO-1 cbiT TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000 N NA
 22599 22600 AF0733 AF0734 thiL   TRUE 0.944 -46.000 0.003 1.000   NA
 22601 22602 AF0735 AF0736     FALSE 0.032 64.000 0.000 1.000   NA
 22602 22603 AF0736 AF0737     FALSE 0.014 219.000 0.000 NA   NA
 22603 22604 AF0737 AF0738     FALSE 0.019 138.000 0.000 NA   NA
 22606 22607 AF0740a AF0741     FALSE 0.054 35.000 0.000 NA   NA
 22607 22608 AF0741 AF0742     TRUE 0.765 -81.000 0.000 NA   NA
 22609 22610 AF0743 AF0744     FALSE 0.013 284.000 0.000 1.000   NA
 22612 22613 AF0746 AF0747   dapF TRUE 0.965 -10.000 0.002 1.000 N NA
 22614 22615 AF0748 AF0749   orA TRUE 0.656 11.000 0.000 1.000   NA
 22615 22616 AF0749 AF0750 orA orB TRUE 0.998 -12.000 0.214 0.003 Y NA
 22616 22617 AF0750 AF0751 orB   TRUE 0.843 -18.000 0.000 NA   NA
 22618 22619 AF0752 AF0753     FALSE 0.054 35.000 0.000 NA   NA
 22619 22620 AF0753 AF0754     FALSE 0.013 248.000 0.000 NA   NA
 22620 22621 AF0754 AF0755     FALSE 0.030 66.000 0.000 NA   NA
 22622 22623 AF0756 AF0757 ppx1   FALSE 0.027 78.000 0.000 1.000 N NA
 22624 22625 AF0758 AF0759     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22625 22626 AF0759 AF0760     TRUE 0.840 -19.000 0.000 NA   NA
 22626 22627 AF0760 AF0761     TRUE 0.995 -19.000 0.667 NA   NA
 22627 22628 AF0761 AF0762     TRUE 0.862 -12.000 0.000 NA   NA
 22628 22629 AF0762 AF0763     TRUE 0.795 -36.000 0.000 NA   NA
 22630 22631 AF0764 AF0765 rpl7AE rps28E TRUE 0.989 14.000 0.602 0.021 Y NA
 22631 22632 AF0765 AF0766 rps28E rpl24E TRUE 0.999 5.000 0.761 0.021 Y NA
 22632 22633 AF0766 AF0767 rpl24E ndk TRUE 0.988 5.000 0.054 1.000 N NA
 22633 22634 AF0767 AF0768 ndk infB TRUE 0.987 -3.000 0.037 1.000 N NA
 22634 22635 AF0768 AF0769 infB trx-2 TRUE 0.801 9.000 0.000 1.000   NA
 22638 22639 AF0772 AF0773     TRUE 0.834 -21.000 0.000 NA   NA
 22639 22640 AF0773 AF0774     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 22640 22641 AF0774 AF0775     TRUE 0.995 -3.000 0.182 NA   NA
 22642 22643 AF0776 AF0777 tyrS eif1A TRUE 0.693 24.000 0.007 1.000 Y NA
 22643 22644 AF0777 AF0778 eif1A   TRUE 0.930 2.000 0.000 NA   NA
 22645 22646 AF0779 AF0780     TRUE 0.935 0.000 0.000 NA   NA
 22647 22648 AF0781 AF0782     FALSE 0.030 69.000 0.000 NA   NA
 22648 22649 AF0782 AF0783     TRUE 0.995 -3.000 0.156 NA   NA
 22650 22651 AF0784 AF0785     FALSE 0.030 72.000 0.000 NA   NA
 22651 22652 AF0785 AF0786   corA TRUE 0.762 -90.000 0.000 NA   NA
 22652 401722 AF0786 AFtRNA-Ser-2 corA tRNA-Ser FALSE 0.012 262.000 0.000 NA   NA
 22653 22654 AF0787 AF0788     TRUE 0.769 -72.000 0.000 NA   NA
 22654 22655 AF0788 AF0789     FALSE 0.029 77.000 0.000 NA   NA
 22661 22662 AF0795 AF0796     TRUE 0.990 7.000 0.179 NA N NA
 22662 22663 AF0796 AF0797     FALSE 0.042 36.000 0.000 NA N NA
 22663 22664 AF0797 AF0798     TRUE 0.990 -25.000 0.028 0.037 Y NA
 22665 22666 AF0799 AF0800   lysA TRUE 0.873 -12.000 0.000 1.000   NA
 22666 22667 AF0800 AF0801 lysA rps15P FALSE 0.083 32.000 0.000 1.000 N NA
 22668 401691 AF0802 AFtRNA-His-1   tRNA-His FALSE 0.022 114.000 0.000 NA   NA
 401691 22669 AFtRNA-His-1 AF0803 tRNA-His   FALSE 0.013 234.000 0.000 NA   NA
 22669 22670 AF0803 AF0804     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22674 22675 AF0808 AF0809 glcD   FALSE 0.028 288.000 0.000 NA Y NA
 22675 22676 AF0809 AF0810     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22676 22677 AF0810 AF0811     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.001   NA
 22677 22678 AF0811 AF0812     FALSE 0.033 47.000 0.000 NA   NA
 22680 22681 AF0814 AF0815   trm1 TRUE 0.992 2.000 0.050 1.000 N NA
 22682 22683 AF0816 AF0817     FALSE 0.025 90.000 0.000 NA   NA
 22684 22685 AF0818 AF0819 acyP hisF TRUE 0.932 0.000 0.000 1.000 N NA
 22685 22686 AF0819 AF0820 hisF   TRUE 0.980 -3.000 0.010 NA   NA
 22686 22687 AF0820 AF0821     TRUE 0.984 -3.000 0.022 NA   NA
 22688 22689 AF0822 AF0823 braF-2 braG-2 TRUE 0.965 -19.000 0.000 0.017 Y NA
 22689 22690 AF0823 AF0824 braG-2 braE-2 TRUE 0.987 12.000 0.513 1.000 Y NA
 22690 22691 AF0824 AF0825 braE-2 braD-2 TRUE 0.999 -3.000 0.590 0.021 Y NA
 22691 22692 AF0825 AF0826 braD-2   FALSE 0.017 149.000 0.000 1.000 N NA
 22692 22693 AF0826 AF0827   braC-2 FALSE 0.288 19.000 0.000 NA N NA
 22695 22696 AF0829 AF0830     TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 22696 22697 AF0830 AF0831   rr2 TRUE 0.617 16.000 0.000 0.069   NA
 22697 22698 AF0831 AF0832 rr2 rr1 TRUE 0.994 12.000 1.000 0.002 Y NA
 22698 22699 AF0832 AF0833 rr1 dfx TRUE 0.972 5.000 0.000 0.069 Y NA
 22699 22700 AF0833 AF0834 dfx   TRUE 0.901 13.000 0.033 1.000 N NA
 22700 22701 AF0834 AF0835     FALSE 0.343 18.000 0.000 NA   NA
 22702 22703 AF0836 AF0837   pelA FALSE 0.030 64.000 0.000 NA   NA
 22703 22704 AF0837 AF0838 pelA trkA-2 FALSE 0.144 28.000 0.000 1.000   NA
 22704 22705 AF0838 AF0839 trkA-2 trkH TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 22705 22706 AF0839 AF0840 trkH fadD-4 FALSE 0.019 126.000 0.000 1.000 N NA
 22707 22708 AF0841 AF0842 purA   FALSE 0.028 81.000 0.000 NA   NA
 22710 22711 AF0844 AF0845   acd-5 FALSE 0.059 35.000 0.000 1.000   NA
 22711 22712 AF0845 AF0846 acd-5 nhe2 FALSE 0.028 74.000 0.000 1.000 N NA
 22713 22714 AF0847 AF0848 guaB-1   TRUE 0.762 25.000 0.038 0.037   NA
 22714 22715 AF0848 AF0849     TRUE 0.990 -3.000 0.055 1.000 N NA
 22715 22716 AF0849 AF0850     TRUE 0.991 2.000 0.041 NA N NA
 22718 22719 AF0852 AF0853 glyA   TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA N NA
 22719 22720 AF0853 AF0854     TRUE 0.994 -3.000 0.152 NA   NA
 22720 22721 AF0854 AF0855   mdhA FALSE 0.054 35.000 0.000 NA   NA
 22721 22722 AF0855 AF0856 mdhA   FALSE 0.222 22.000 0.000 NA N NA
 22725 22726 AF0859 AF0860     TRUE 0.983 -3.000 0.018 NA   NA
 401721 22728 AFtRNA-Leu-4 AF0862 tRNA-Leu   FALSE 0.030 62.000 0.000 NA   NA
 22728 22729 AF0862 AF0863     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22729 22730 AF0863 AF0864     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 22730 22731 AF0864 AF0865   est-1 TRUE 0.827 7.000 0.000 NA   NA
 22731 22732 AF0865 AF0866 est-1 glpK FALSE 0.035 52.000 0.000 1.000   NA
 22732 22733 AF0866 AF0867 glpK   TRUE 0.961 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 22733 22734 AF0867 AF0868     TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.027 Y NA
 22734 22735 AF0868 AF0869     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22735 22736 AF0869 AF0870     TRUE 0.989 0.000 0.019 NA   NA
 22736 22737 AF0870 AF0871   gpsA FALSE 0.275 21.000 0.000 NA   NA
 22739 22740 AF0873 AF0874 purF rpl37E TRUE 0.997 1.000 0.169 1.000 N NA
 22740 22741 AF0874 AF0875 rpl37E   TRUE 0.998 0.000 0.439 1.000 N NA
 401692 22742 AFtRNA-Gly-1 AF0876 tRNA-Gly nt5 FALSE 0.022 112.000 0.000 NA   NA
 22742 22743 AF0876 AF0877 nt5   FALSE 0.025 94.000 0.000 NA   NA
 401720 22744 AFtRNA-Arg-3 AF0878 tRNA-Arg   TRUE 0.854 -14.000 0.000 NA   NA
 22744 22745 AF0878 AF0879     TRUE 0.443 15.000 0.000 NA   NA
 22746 10692140 AF0880 AF0881 rd-1   TRUE 0.792 -39.000 0.000 NA   NA
 22747 22748 AF0882 AF0883 asnA argH TRUE 0.990 -37.000 0.086 1.000 Y NA
 22749 401693 AF0884 AFtRNA-Glu-1   tRNA-Glu FALSE 0.036 42.000 0.000 NA   NA
 22750 22751 AF0885 AF0886 hpaA-2 ahcY-1 FALSE 0.031 49.000 0.000 1.000 N NA
 22752 22753 AF0887 AF0888 rbsA-1 rbsC-1 TRUE 0.994 -3.000 0.133 1.000   NA
 22753 22754 AF0888 AF0889 rbsC-1 rbsC-2 TRUE 0.996 2.000 0.047 0.020   NA
 22754 22755 AF0889 AF0890 rbsC-2   TRUE 0.985 -22.000 0.070 1.000   NA
 22759 22760 AF0894 AF0895 argS   FALSE 0.010 596.000 0.000 NA   NA
 22760 22761 AF0895 AF0896     FALSE 0.012 286.000 0.000 NA   NA
 22761 22762 AF0896 AF0897     TRUE 0.994 7.000 0.500 NA   NA
 22764 22765 AF0899 AF0900   endA TRUE 0.726 10.000 0.000 NA   NA
 22765 22766 AF0900 AF0901 endA   FALSE 0.299 20.000 0.000 NA   NA
 22766 22767 AF0901 AF0902     TRUE 0.982 -3.000 0.017 NA   NA
 22767 22768 AF0902 AF0903     FALSE 0.275 21.000 0.000 NA   NA
 22768 22769 AF0903 AF0904   dapE-2 TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22770 22771 AF0905 AF0906   hyuA TRUE 0.852 -13.000 0.000 1.000 N NA
 22771 22772 AF0906 AF0907 hyuA   FALSE 0.070 33.000 0.000 1.000 N NA
 22774 22775 AF0909 AF0910 dapB dapA TRUE 0.659 32.000 0.062 1.000 Y NA
 22775 22776 AF0910 AF0911 dapA rps17E TRUE 0.993 -7.000 0.186 1.000 N NA
 22776 22777 AF0911 AF0912 rps17E   FALSE 0.177 25.000 0.000 NA   NA
 22777 22778 AF0912 AF0913     FALSE 0.032 52.000 0.000 NA   NA
 22781 22782 AF0916 AF0917 glyS   TRUE 0.958 4.000 0.000 0.079   NA
 22782 22783 AF0917 AF0918   act-2 TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 22783 22784 AF0918 AF0919 act-2   FALSE 0.115 31.000 0.000 1.000   NA
 22784 22785 AF0919 AF0920   aspS FALSE 0.048 37.000 0.000 1.000   NA
 22786 22787 AF0921 AF0922     TRUE 0.431 16.000 0.000 1.000   NA
 22789 22790 AF0924 AF0925     FALSE 0.158 26.000 0.000 NA   NA
 22792 22793 AF0927 AF0928     FALSE 0.016 193.000 0.000 NA   NA
 22793 22794 AF0928 AF0929     TRUE 0.791 -58.000 0.000 1.000   NA
 22795 22796 AF0930 AF0931 moeA-2 moeA-1 TRUE 0.999 -3.000 0.250 0.004 Y NA
 22796 22797 AF0931 AF0932 moeA-1   FALSE 0.034 42.000 0.000 1.000 N NA
 22797 22798 AF0932 AF0933   ilvE FALSE 0.213 23.000 0.000 1.000 N NA
 22798 22799 AF0933 AF0934 ilvE   TRUE 0.994 -7.000 0.082 1.000 Y NA
 22799 22800 AF0934 AF0935   hom TRUE 0.998 -3.000 0.615 1.000 Y NA
 22800 22801 AF0935 AF0936 hom   TRUE 0.841 -16.000 0.000 1.000 N NA
 22801 22802 AF0936 AF0937   tuf FALSE 0.029 58.000 0.000 1.000 N NA
 22802 22803 AF0937 AF0938 tuf rps10P TRUE 0.933 22.000 0.249 1.000 Y NA
 22803 22804 AF0938 AF0939 rps10P   TRUE 0.987 1.000 0.007 1.000   NA
 22806 22807 AF0941 AF0942   surE TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22807 22808 AF0942 AF0943 surE rpi TRUE 0.964 -22.000 0.011 1.000   NA
 22809 22810 AF0944 AF0945     TRUE 0.806 -31.000 0.000 NA   NA
 22810 22811 AF0945 AF0946     FALSE 0.030 67.000 0.000 NA   NA
 22811 22812 AF0946 AF0947     FALSE 0.012 281.000 0.000 NA   NA
 22812 22813 AF0947 AF0948     TRUE 0.992 -31.000 0.400 NA   NA
 22813 22814 AF0948 AF0949   glnA FALSE 0.031 80.000 0.000 1.000   NA
 22815 22816 AF0950 AF0951 cooF noxA-4 TRUE 0.998 -3.000 0.788 0.068   NA
 22816 22817 AF0951 AF0952 noxA-4   TRUE 0.994 -3.000 0.122 1.000   NA
 22817 22818 AF0952 AF0953   gltB TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.001 Y NA
 22818 22819 AF0953 AF0954 gltB   TRUE 0.999 -3.000 0.381 0.001 Y NA
 22820 22821 AF0955 AF0956     TRUE 0.867 -10.000 0.000 NA   NA
 22823 22824 AF0958 AF0959 braG-3 braF-3 TRUE 0.955 -22.000 0.000 0.079 Y NA
 22824 22825 AF0959 AF0960 braF-3 braE-3 TRUE 0.979 -16.000 0.003 1.000 Y NA
 22825 22826 AF0960 AF0961 braE-3 braD-3 TRUE 0.998 -12.000 0.667 0.020 Y NA
 22826 22827 AF0961 AF0962 braD-3 braC-3 TRUE 0.997 -12.000 0.667 NA Y NA
 22827 22828 AF0962 AF0963 braC-3 fad-3 TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA N NA
 22828 22829 AF0963 AF0964 fad-3 acd-6 TRUE 0.953 5.000 0.000 1.000 Y NA
 22829 22830 AF0964 AF0965 acd-6   TRUE 0.907 18.000 0.143 NA   NA
 22830 22831 AF0965 AF0966     TRUE 0.998 3.000 0.933 NA   NA
 22831 22832 AF0966 AF0967   acaB-9 TRUE 0.996 5.000 0.867 NA   NA
 22832 22833 AF0967 AF0968 acaB-9 acaB-10 TRUE 0.995 11.000 0.933 0.003 Y NA
 22833 22834 AF0968 AF0969 acaB-10 putP-2 FALSE 0.016 206.000 0.000 1.000   NA
 22834 22835 AF0969 AF0970 putP-2   TRUE 0.998 0.000 0.667 NA   NA
 22836 22837 AF0971 AF0972   dnaQ TRUE 0.992 0.000 0.037 1.000 N NA
 22837 22838 AF0972 AF0973 dnaQ baiF-1 FALSE 0.021 109.000 0.000 1.000 N NA
 22838 22839 AF0973 AF0974 baiF-1 baiF-2 TRUE 0.996 10.000 0.600 0.036 Y NA
 22839 22840 AF0974 AF0975 baiF-2 acs-4 TRUE 0.634 15.000 0.000 0.056 N NA
 22840 22841 AF0975 AF0976 acs-4 acs-5 TRUE 0.979 5.000 0.000 0.003 Y NA
 22841 22842 AF0976 AF0977 acs-5 amt-1 FALSE 0.016 174.000 0.000 1.000 N NA
 22842 22843 AF0977 AF0978 amt-1 glnB-1 TRUE 0.989 -22.000 0.150 1.000 N NA
 22844 22845 AF0979 AF0980 proW-1 proW-2 TRUE 0.997 -7.000 0.074 0.001 Y NA
 22845 22846 AF0980 AF0981 proW-2 proV TRUE 0.999 -3.000 0.600 0.053 Y NA
 22846 22847 AF0981 AF0982 proV proX TRUE 0.994 -3.000 0.127 1.000 N NA
 22847 22848 AF0982 AF0983 proX   FALSE 0.009 541.000 0.000 1.000 N NA
 22848 22849 AF0983 AF0984     TRUE 0.762 -67.000 0.000 1.000 N NA
 22849 22850 AF0984 AF0985   hisB TRUE 0.778 9.000 0.000 1.000 N NA
 22850 22851 AF0985 AF0986 hisB hisA-2 TRUE 0.990 -13.000 0.003 0.005 Y NA
 22851 22852 AF0986 AF0987 hisA-2   FALSE 0.102 31.000 0.000 1.000 N NA
 22853 22854 AF0988 AF0989 bcsp31-3   TRUE 0.443 15.000 0.000 NA   NA
 22855 22856 AF0990 AF0991 caiB-2 gcdH FALSE 0.013 212.000 0.000 1.000 N NA
 22860 22861 AF0995 AF0996   gspE-3 TRUE 0.999 2.000 0.444 1.000 Y NA
 22861 22862 AF0996 AF0997 gspE-3 trzA-2 FALSE 0.028 61.000 0.000 1.000 N NA
 22864 22865 AF0999 AF1000   nadE TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 22865 22866 AF1000 AF1001 nadE   FALSE 0.030 58.000 0.000 NA   NA
 22866 22867 AF1001 AF1002     FALSE 0.030 70.000 0.000 NA   NA
 22869 22870 AF1004 AF1005     TRUE 0.994 -16.000 0.400 NA N NA
 22870 22871 AF1005 AF1006     TRUE 0.988 -7.000 0.030 0.079 N NA
 22872 22873 AF1007 AF1008     FALSE 0.011 357.000 0.000 NA   NA
 22873 22874 AF1008 AF1009     FALSE 0.012 264.000 0.000 NA   NA
 22874 22875 AF1009 AF1010   fdx-6 FALSE 0.087 32.000 0.000 NA   NA
 22875 22876 AF1010 AF1011 fdx-6   TRUE 0.466 15.000 0.000 1.000   NA
 22876 22877 AF1011 AF1012     TRUE 0.988 -16.000 0.075 1.000   NA
 22878 22879 AF1013 AF1014   ilvD TRUE 0.847 -16.000 0.000 NA   NA
 22880 22881 AF1015 AF1016     TRUE 0.994 -30.000 0.750 NA   NA
 22882 22883 AF1017 AF1018     TRUE 0.994 -19.000 0.500 1.000 N NA
 22883 22884 AF1018 AF1019     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA N NA
 22884 22885 AF1019 AF1020     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 22886 22887 AF1021 AF1022   mopB TRUE 0.506 14.000 0.000 1.000   NA
 22892 22893 AF1027 AF1028 hpaA-3 fadA-1 FALSE 0.032 46.000 0.000 1.000 N NA
 22893 22894 AF1028 AF1029 fadA-1 fadD-5 TRUE 0.953 5.000 0.000 1.000 Y NA
 22895 22896 AF1030 AF1031   rad32 TRUE 0.995 -3.000 0.207 NA   NA
 22896 22897 AF1031 AF1032 rad32   TRUE 0.998 -3.000 0.331 1.000 Y NA
 22897 22898 AF1032 AF1033     TRUE 0.994 -16.000 0.339 NA   NA
 22899 22900 AF1034 AF1035 tlpC-1   FALSE 0.072 90.000 0.000 0.010   NA
 22902 22903 AF1037 AF1038 cheR   TRUE 0.991 -9.000 0.042 1.000 Y NA
 22903 22904 AF1038 AF1039     TRUE 0.999 0.000 0.606 NA Y NA
 22904 22905 AF1039 AF1040   cheA TRUE 0.995 -16.000 0.176 NA Y NA
 22905 22906 AF1040 AF1041 cheA cheB TRUE 0.998 -10.000 0.390 0.002 Y NA
 22906 22907 AF1041 AF1042 cheB cheY TRUE 0.998 3.000 0.057 0.001 Y NA
 22907 22908 AF1042 AF1043 cheY   TRUE 0.996 5.000 1.000 NA   NA
 22908 22909 AF1043 AF1044   cheW TRUE 0.968 14.000 0.462 NA   NA
 22909 22910 AF1044 AF1045 cheW tlpC-2 TRUE 0.989 14.000 0.385 0.002 Y NA
 22910 22911 AF1045 AF1046 tlpC-2   FALSE 0.074 87.000 0.000 0.010   NA
 22911 22912 AF1046 AF1047     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22912 22913 AF1047 AF1048     TRUE 0.483 14.000 0.000 NA   NA
 22913 22914 AF1048 AF1049   gspE-4 TRUE 0.996 4.000 0.078 1.000 Y NA
 22914 22915 AF1049 AF1050 gspE-4   TRUE 0.446 103.000 0.072 0.078 Y NA
 22915 22916 AF1050 AF1051     TRUE 0.940 12.000 0.060 NA   NA
 22916 22917 AF1051 AF1052     TRUE 0.996 -6.000 0.833 NA   NA
 22917 22918 AF1052 AF1053     TRUE 0.708 33.000 0.400 NA   NA
 22918 22919 AF1053 AF1054   flaB1-1 TRUE 0.621 35.000 0.333 NA   NA
 22919 22920 AF1054 AF1055 flaB1-1 flaB1-2 TRUE 0.999 5.000 0.333 0.001 Y NA
 22920 22921 AF1055 AF1056 flaB1-2   FALSE 0.022 112.000 0.000 NA   NA
 22921 22922 AF1056 AF1057   ccdA TRUE 0.753 -285.000 0.000 NA   NA
 22922 22923 AF1057 AF1058 ccdA   FALSE 0.037 40.000 0.000 NA   NA
 401694 22924 AFtRNA-Ala-1 AF1059 tRNA-Ala   FALSE 0.027 83.000 0.000 NA   NA
 22924 22925 AF1059 AF1060     FALSE 0.010 582.000 0.000 NA   NA
 22926 22927 AF1061 AF1062     TRUE 0.991 -3.000 0.065 NA   NA
 22927 22928 AF1062 AF1063     FALSE 0.022 110.000 0.000 NA   NA
 22928 22929 AF1063 AF1064     FALSE 0.340 19.000 0.000 1.000   NA
 22930 22931 AF1065 AF1066   mer-1 FALSE 0.030 58.000 0.000 NA   NA
 22931 22932 AF1066 AF1067 mer-1   FALSE 0.013 233.000 0.000 1.000 N NA
 22932 22933 AF1067 AF1068     TRUE 0.409 16.000 0.000 NA   NA
 22934 22935 AF1069 AF1070 panF-1 ftsA-1 TRUE 0.419 91.000 0.105 1.000 Y NA
 22937 10692141 AF1072 AF1073     FALSE 0.018 153.000 0.000 NA   NA
 10692141 22938 AF1073 AF1074     TRUE 0.828 -22.000 0.000 NA   NA
 22938 22939 AF1074 AF1075     FALSE 0.025 94.000 0.000 NA   NA
 22939 22940 AF1075 AF1076     TRUE 0.852 -15.000 0.000 NA   NA
 22940 22941 AF1076 AF1077     FALSE 0.018 140.000 0.000 NA   NA
 22941 22942 AF1077 AF1078     TRUE 0.847 -16.000 0.000 NA   NA
 22942 22943 AF1078 AF1079     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22943 22944 AF1079 AF1080     FALSE 0.275 21.000 0.000 NA   NA
 22944 22945 AF1080 AF1081     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 22945 10692142 AF1081 AF1083     FALSE 0.022 111.000 0.000 NA   NA
 10692142 22946 AF1083 AF1084     TRUE 0.847 -16.000 0.000 NA   NA
 22946 22947 AF1084 AF1086m     FALSE 0.025 93.000 0.000 NA   NA
 22947 22948 AF1086m AF1087     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22948 22949 AF1087 AF1088     FALSE 0.011 326.000 0.000 NA   NA
 22949 22950 AF1088 AF1089     FALSE 0.018 152.000 0.000 NA   NA
 22950 22951 AF1089 AF1090     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22951 22952 AF1090 AF1091     FALSE 0.034 44.000 0.000 NA   NA
 22952 22953 AF1091 AF1092     TRUE 0.847 -16.000 0.000 NA   NA
 22953 22954 AF1092 AF1093     FALSE 0.030 59.000 0.000 NA   NA
 22954 22955 AF1093 AF1094     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 22955 22956 AF1094 AF1095     FALSE 0.011 304.000 0.000 NA   NA
 22956 22957 AF1095 AF1096     FALSE 0.010 513.000 0.000 NA   NA
 22957 22958 AF1096 AF1097   manC FALSE 0.021 134.000 0.000 1.000   NA
 22958 401719 AF1097 AFtRNA-Arg-4 manC tRNA-Arg FALSE 0.041 38.000 0.000 NA   NA
 401719 22959 AFtRNA-Arg-4 AF1098 tRNA-Arg fum-1 FALSE 0.087 32.000 0.000 NA   NA
 22959 22960 AF1098 AF1099 fum-1 fum-2 TRUE 0.999 0.000 0.667 0.001 Y NA
 22961 22962 AF1100 AF1101 cdhA-1 cdhB-1 TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.003 Y NA
 22962 22963 AF1101 AF1102 cdhB-1   FALSE 0.062 34.000 0.000 NA   NA
 22963 22964 AF1102 AF1103     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 22964 22965 AF1103 AF1104     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 22965 22966 AF1104 AF1105     TRUE 0.995 -3.000 0.211 NA   NA
 22966 22967 AF1105 AF1106     TRUE 0.862 -12.000 0.000 NA   NA
 22968 22969 AF1107 AF1108     FALSE 0.048 36.000 0.000 NA   NA
 22969 22970 AF1108 AF1109     FALSE 0.237 23.000 0.000 1.000   NA
 22970 22971 AF1109 AF1110     TRUE 0.986 -16.000 0.068 NA   NA
 22973 22974 AF1112 AF1113 gcp rps27AE TRUE 0.996 -3.000 0.364 1.000 N NA
 22974 22975 AF1113 AF1114 rps27AE rps24E TRUE 0.986 15.000 0.487 0.020 Y NA
 22975 22976 AF1114 AF1115 rps24E   TRUE 0.995 -7.000 0.362 NA   NA
 22976 22977 AF1115 AF1116   rpoE2 TRUE 0.997 -3.000 0.695 NA   NA
 22977 22978 AF1116 AF1117 rpoE2 rpoE1 TRUE 0.999 0.000 0.429 0.005 Y NA
 22978 22979 AF1117 AF1118 rpoE1   FALSE 0.030 63.000 0.000 NA   NA
 22980 22981 AF1119 AF1120     FALSE 0.319 19.000 0.000 NA   NA
 22981 22982 AF1120 AF1121     FALSE 0.054 35.000 0.000 NA   NA
 22982 22983 AF1121 AF1122   hbd-5 FALSE 0.021 112.000 0.000 1.000 N NA
 22983 22984 AF1122 AF1123 hbd-5   FALSE 0.029 78.000 0.000 NA   NA
 22984 22985 AF1123 AF1124     TRUE 0.822 -24.000 0.000 NA   NA
 22988 22989 AF1127 AF1128 rpl18E rpl13P TRUE 0.988 11.000 0.075 0.002 Y NA
 22989 22990 AF1128 AF1129 rpl13P rps9P TRUE 0.998 -7.000 0.515 0.024 Y NA
 22990 22991 AF1129 AF1130 rps9P rpoN TRUE 0.995 6.000 0.536 1.000 N NA
 22991 401695 AF1130 AFtRNA-Pro-1 rpoN tRNA-Pro TRUE 0.854 -14.000 0.000 NA   NA
 401695 22992 AFtRNA-Pro-1 AF1131 tRNA-Pro rpoK FALSE 0.374 17.000 0.000 NA   NA
 22992 22993 AF1131 AF1132 rpoK eno FALSE 0.110 109.000 0.014 1.000 N NA
 22993 22994 AF1132 AF1133 eno rps2P TRUE 0.978 -3.000 0.005 1.000 N NA
 22994 22995 AF1133 AF1134 rps2P   FALSE 0.029 75.000 0.000 NA   NA
 22995 22996 AF1134 AF1135     FALSE 0.024 100.000 0.000 NA   NA
 22996 22997 AF1135 AF1136     FALSE 0.023 104.000 0.000 NA   NA
 22997 22998 AF1136 AF1137     TRUE 0.997 -3.000 0.667 1.000   NA
 22998 22999 AF1137 AF1138     TRUE 0.990 -3.000 0.055 1.000   NA
 22999 23000 AF1138 AF1139     FALSE 0.036 48.000 0.000 1.000   NA
 23000 23001 AF1139 AF1140     FALSE 0.221 23.000 0.000 NA   NA
 23002 23003 AF1141 AF1142 acd-8 rfbF FALSE 0.046 36.000 0.000 1.000 N NA
 23005 23006 AF1144 AF1145   cat2-1 FALSE 0.083 32.000 0.000 1.000 N NA
 23006 23007 AF1145 AF1146 cat2-1 pgk FALSE 0.021 109.000 0.000 1.000 N NA
 23010 23011 AF1149 AF1149a lhr-1   FALSE 0.120 30.000 0.000 NA   NA
 23011 23012 AF1149a AF1150     TRUE 0.994 -7.000 0.216 NA   NA
 23015 23016 AF1153 AF1154     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23017 23018 AF1155 AF1156     FALSE 0.030 62.000 0.000 NA   NA
 23020 23021 AF1158 AF1159   atpI TRUE 0.996 -7.000 0.132 0.004   NA
 23021 23022 AF1159 AF1160 atpI atpK-1 TRUE 0.914 28.000 0.848 0.004   NA
 23022 23023 AF1160 AF1161 atpK-1   TRUE 0.987 2.000 0.015 NA   NA
 23023 23024 AF1161 AF1162   atpK-2 TRUE 0.955 9.000 0.015 NA   NA
 23024 23025 AF1162 AF1163 atpK-2 atpE TRUE 0.991 11.000 0.489 0.004   NA
 23025 23026 AF1163 AF1164 atpE atpC TRUE 0.997 8.000 0.236 0.004 Y NA
 23026 23027 AF1164 AF1165 atpC atpF TRUE 0.999 -3.000 0.462 0.004 Y NA
 23027 23028 AF1165 AF1166 atpF atpA TRUE 0.998 -9.000 0.437 0.004 Y NA
 23028 23029 AF1166 AF1167 atpA atpB TRUE 0.999 0.000 0.632 0.004 Y NA
 23029 23030 AF1167 AF1168 atpB atpD TRUE 0.910 26.000 0.119 0.004 Y NA
 23030 23031 AF1168 AF1169 atpD   FALSE 0.033 49.000 0.000 NA   NA
 23031 23032 AF1169 AF1170   rbsA-2 TRUE 0.977 -25.000 0.043 NA   NA
 23032 23033 AF1170 AF1171 rbsA-2   TRUE 0.997 -3.000 0.571 NA   NA
 23035 23036 AF1173 AF1174     FALSE 0.030 62.000 0.000 NA   NA
 23036 23037 AF1174 AF1175   acdS TRUE 0.776 12.000 0.000 1.000 Y NA
 23037 23038 AF1175 AF1176 acdS   TRUE 0.981 10.000 0.154 1.000 N NA
 23038 23039 AF1176 AF1177   hbd-6 FALSE 0.022 104.000 0.000 1.000 N NA
 23039 23040 AF1177 AF1178 hbd-6   FALSE 0.015 196.000 0.000 NA   NA
 23040 23041 AF1178 AF1179     FALSE 0.030 63.000 0.000 NA   NA
 23041 23042 AF1179 AF1180     TRUE 0.951 -43.000 0.010 NA   NA
 23042 23043 AF1180 AF1181     FALSE 0.048 36.000 0.000 NA   NA
 23043 23044 AF1181 AF1182     TRUE 0.994 -3.000 0.111 NA   NA
 23044 23045 AF1182 AF1183     TRUE 0.971 14.000 0.629 NA   NA
 23045 23046 AF1183 AF1184     FALSE 0.041 38.000 0.000 NA   NA
 23047 23048 AF1185 AF1186     TRUE 0.994 -3.000 0.107 1.000   NA
 23048 23049 AF1186 AF1187     FALSE 0.020 140.000 0.000 1.000   NA
 23049 23050 AF1187 AF1188     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 23050 23051 AF1188 AF1189     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23051 23052 AF1189 AF1190   hbd-7 FALSE 0.013 284.000 0.000 1.000   NA
 23052 23053 AF1190 AF1191 hbd-7 menB TRUE 0.933 1.000 0.000 1.000 N NA
 23053 23054 AF1191 AF1192 menB   FALSE 0.146 33.000 0.000 0.055 N NA
 23054 23055 AF1192 AF1193     FALSE 0.035 51.000 0.000 1.000   NA
 23055 23056 AF1193 AF1194     TRUE 0.992 2.000 0.042 NA   NA
 23056 23057 AF1194 AF1195     TRUE 0.526 13.000 0.000 NA   NA
 23057 23058 AF1195 AF1196   mer-2 FALSE 0.117 28.000 0.000 NA N NA
 23058 23059 AF1196 AF1197 mer-2 fadA-2 FALSE 0.026 66.000 0.000 NA N NA
 23059 10692143 AF1197 AF1198 fadA-2   TRUE 0.526 13.000 0.000 NA   NA
 10692143 23060 AF1198 AF1199   gctA TRUE 0.870 -9.000 0.000 NA   NA
 23060 23061 AF1199 AF1200 gctA   TRUE 0.754 -276.000 0.000 NA   NA
 23063 23064 AF1202 AF1203     TRUE 0.949 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 23064 23065 AF1203 AF1204     TRUE 0.409 16.000 0.000 NA   NA
 23065 23066 AF1204 AF1205   panF-2 TRUE 0.827 7.000 0.000 NA   NA
 23066 23067 AF1205 AF1206 panF-2 hbd-8 FALSE 0.030 54.000 0.000 1.000 N NA
 23067 23068 AF1206 AF1207 hbd-8 kduD TRUE 0.946 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 23068 23069 AF1207 AF1208 kduD   TRUE 0.600 11.000 0.000 NA N NA
 23069 23070 AF1208 AF1209     FALSE 0.016 166.000 0.000 NA   NA
 23070 23071 AF1209 AF1210     TRUE 0.396 17.000 0.000 1.000   NA
 23072 23073 AF1211 AF1212     TRUE 0.997 1.000 0.177 NA   NA
 23073 23074 AF1212 AF1213     TRUE 0.807 8.000 0.000 NA   NA
 23075 23076 AF1214 AF1215 pad1   TRUE 0.932 0.000 0.000 1.000 N NA
 23077 23078 AF1216 AF1217 lysS   TRUE 0.968 -33.000 0.025 1.000   NA
 23078 23079 AF1217 AF1218     TRUE 0.982 9.000 0.083 NA   NA
 23079 23080 AF1218 AF1219     TRUE 0.993 -3.000 0.095 NA   NA
 23080 23081 AF1219 AF1220     TRUE 0.991 0.000 0.029 1.000 N NA
 23081 23082 AF1220 AF1221     TRUE 0.807 8.000 0.000 NA   NA
 23082 23083 AF1221 AF1222   putP-3 FALSE 0.026 86.000 0.000 NA   NA
 23084 23085 AF1223 AF1224     TRUE 0.940 0.000 0.000 1.000   NA
 23085 23086 AF1224 AF1225     FALSE 0.032 52.000 0.000 NA   NA
 23086 23087 AF1225 AF1226     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23087 23088 AF1226 AF1227     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 23088 23089 AF1227 AF1228     TRUE 0.828 -22.000 0.000 NA   NA
 23089 23090 AF1228 AF1229     FALSE 0.033 49.000 0.000 NA   NA
 23090 23091 AF1229 AF1230     FALSE 0.374 17.000 0.000 NA   NA
 23091 23092 AF1230 AF1231     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 23093 23094 AF1232 AF1233     TRUE 0.943 -7.000 0.000 0.030 N NA
 23094 23095 AF1233 AF1234   mutT TRUE 0.986 -3.000 0.028 1.000 N NA
 23095 23096 AF1234 AF1235 mutT   TRUE 0.987 -22.000 0.103 1.000 N NA
 23096 23097 AF1235 AF1236     FALSE 0.016 175.000 0.000 NA   NA
 23100 23101 AF1239 AF1240 fdx-7 trpB-1 FALSE 0.033 66.000 0.000 1.000   NA
 23102 23103 AF1241 AF1242 hemL hemC TRUE 0.997 -3.000 0.041 0.002 Y NA
 23103 23104 AF1242 AF1243 hemC cysG-2 TRUE 0.982 -10.000 0.003 1.000 Y NA
 23104 23105 AF1243 AF1244 cysG-2   TRUE 0.398 16.000 0.000 1.000 N NA
 23105 23106 AF1244 AF1245   napA-2 TRUE 0.999 2.000 1.000 1.000 Y NA
 23109 23110 AF1248 AF1249     FALSE 0.041 38.000 0.000 NA   NA
 23110 23111 AF1249 AF1250     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 23111 23112 AF1250 AF1251     TRUE 0.996 5.000 0.925 NA   NA
 23112 23113 AF1251 AF1252m   oadA FALSE 0.158 26.000 0.000 NA   NA
 23114 23115 AF1253 AF1254     FALSE 0.027 83.000 0.000 NA   NA
 23116 23117 AF1255 AF1256 argF   FALSE 0.128 28.000 0.000 1.000 N NA
 23117 23118 AF1256 AF1257     FALSE 0.311 18.000 0.000 NA N NA
 23118 23119 AF1257 AF1258   srp19 TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA N NA
 23119 23120 AF1258 AF1259 srp19   TRUE 0.894 5.000 0.000 1.000   NA
 23120 23121 AF1259 AF1260   purQ FALSE 0.048 37.000 0.000 1.000   NA
 23121 23122 AF1260 AF1261 purQ alkK-4 FALSE 0.016 208.000 0.000 1.000   NA
 23122 23123 AF1261 AF1262 alkK-4 noxB-2 FALSE 0.045 134.000 0.000 0.054   NA
 23123 23124 AF1262 AF1263 noxB-2   TRUE 0.924 10.000 0.000 0.065 Y NA
 23127 23128 AF1266 AF1267     FALSE 0.010 481.000 0.000 NA   NA
 23128 23129 AF1267 AF1268     FALSE 0.011 330.000 0.000 NA   NA
 23129 23130 AF1268 AF1269     FALSE 0.010 523.000 0.000 NA   NA
 23130 23131 AF1269 AF1270     FALSE 0.062 34.000 0.000 NA   NA
 23131 23132 AF1270 AF1271   purE TRUE 0.939 -73.000 0.003 1.000   NA
 23132 23133 AF1271 AF1272 purE purC TRUE 0.993 5.000 0.006 0.001 Y NA
 23133 23134 AF1272 AF1273 purC carA TRUE 0.997 -3.000 0.068 0.075 Y NA
 23134 23135 AF1273 AF1274 carA carB TRUE 0.990 7.000 0.009 0.001 Y NA
 23135 23136 AF1274 AF1275 carB   TRUE 0.969 -13.000 0.006 1.000   NA
 23139 23140 AF1278 AF1279     TRUE 0.989 -3.000 0.041 NA   NA
 23140 23141 AF1279 AF1280   argB TRUE 0.692 18.000 0.004 NA N NA
 23141 401717 AF1280 AFtRNA-Arg-5 argB tRNA-Arg FALSE 0.016 169.000 0.000 NA   NA
 401717 23142 AFtRNA-Arg-5 AF1281 tRNA-Arg pfpI FALSE 0.120 30.000 0.000 NA   NA
 23143 23144 AF1282 AF1283     TRUE 0.919 3.000 0.000 NA   NA
 23144 23145 AF1283 AF1284   trx-3 FALSE 0.030 62.000 0.000 NA   NA
 23146 23147 AF1285 AF1286     FALSE 0.035 43.000 0.000 NA   NA
 23147 23148 AF1286 AF1287   acs-6 FALSE 0.012 258.000 0.000 NA   NA
 23149 10692144 AF1288a AF1288     TRUE 0.751 -1679.000 0.000 NA   NA
 10692144 23150 AF1288 AF1288b     TRUE 0.751 -416.000 0.000 NA   NA
 23150 23151 AF1288b AF1289     TRUE 0.977 -3.000 0.005 1.000 N NA
 23151 23152 AF1289 AF1290     TRUE 0.859 -16.000 0.000 1.000   NA
 23152 23153 AF1290 AF1291   acaB-11 FALSE 0.293 21.000 0.000 1.000   NA
 23153 23154 AF1291 AF1292 acaB-11   TRUE 0.996 5.000 0.429 NA   NA
 23154 23155 AF1292 AF1293   acd-9 TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23156 401716 AF1294 AFtRNA-Glu-2   tRNA-Glu FALSE 0.015 205.000 0.000 NA   NA
 401716 23157 AFtRNA-Glu-2 AF1295 tRNA-Glu   FALSE 0.030 59.000 0.000 NA   NA
 23157 23158 AF1295 AF1296   hsp20-1 FALSE 0.028 79.000 0.000 NA   NA
 23158 23159 AF1296 AF1297 hsp20-1 cdc48-1 TRUE 0.963 16.000 0.211 NA Y NA
 23159 23160 AF1297 AF1298 cdc48-1   TRUE 0.954 15.000 0.273 1.000 N NA
 23161 23162 AF1298a AF1299     TRUE 0.986 -82.000 0.188 1.000 N NA
 23162 23163 AF1299 AF1300     FALSE 0.025 86.000 0.000 1.000 N NA
 23163 23164 AF1300 AF1301     TRUE 0.794 -37.000 0.000 NA   NA
 23164 23165 AF1301 AF1302     FALSE 0.034 45.000 0.000 NA   NA
 23165 23166 AF1302 AF1303     FALSE 0.032 52.000 0.000 NA   NA
 23167 23168 AF1304 AF1305 tpiA hps-2 TRUE 0.997 2.000 0.096 1.000 Y NA
 23168 23169 AF1305 AF1306 hps-2   FALSE 0.029 73.000 0.000 NA   NA
 23171 23172 AF1308 AF1309     TRUE 0.934 -168.000 0.005 1.000 N NA
 23173 23174 AF1310 AF1311     FALSE 0.033 67.000 0.000 1.000   NA
 23177 23178 AF1314 AF1315   baiF-3 TRUE 0.936 2.000 0.000 1.000   NA
 23180 23181 AF1317 AF1318     TRUE 0.873 -12.000 0.000 1.000   NA
 23182 23183 AF1319 AF1320   guaA-2 FALSE 0.177 25.000 0.000 NA   NA
 23184 23185 AF1321 AF1322     TRUE 0.986 -3.000 0.029 1.000 N NA
 23189 23190 AF1326 AF1327     FALSE 0.044 37.000 0.000 NA   NA
 23191 23192 AF1328 AF1329 glpA   TRUE 0.994 -6.000 0.190 NA   NA
 23193 23194 AF1330 AF1331 act-3   TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000 N NA
 23195 23196 AF1332 AF1333   rpl44E TRUE 0.986 -22.000 0.077 NA   NA
 23196 23197 AF1333 AF1334 rpl44E rps27E TRUE 0.988 14.000 0.436 0.019 Y NA
 23199 23200 AF1336 AF1337 cbiB   TRUE 0.844 6.000 0.000 1.000 N NA
 23201 23202 AF1338 AF1339 cbiP   FALSE 0.052 35.000 0.000 1.000 N NA
 23202 23203 AF1339 AF1340   citZ FALSE 0.039 38.000 0.000 1.000 N NA
 23203 23204 AF1340 AF1341 citZ deoA-1 TRUE 0.986 2.000 0.013 1.000 N NA
 23204 23205 AF1341 AF1342 deoA-1 deoA-2 TRUE 0.984 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 23206 23207 AF1343 AF1344     FALSE 0.093 31.000 0.000 NA N NA
 23209 23210 AF1346m AF1347m     TRUE 0.784 -45.000 0.000 NA   NA
 23210 23211 AF1347m AF1348     FALSE 0.030 68.000 0.000 NA   NA
 23211 23212 AF1348 AF1349   rd-2 TRUE 0.778 -52.000 0.000 NA   NA
 23214 23215 AF1351 AF1352     TRUE 0.996 -7.000 0.167 NA Y NA
 23215 23216 AF1352 AF1353     TRUE 0.870 -9.000 0.000 NA   NA
 23216 23217 AF1353 AF1354     FALSE 0.030 69.000 0.000 NA   NA
 23219 23220 AF1356 AF1357 phoX pstC TRUE 0.941 11.000 0.007 1.000 Y NA
 23220 23221 AF1357 AF1358 pstC pstA TRUE 0.999 -3.000 0.485 0.002 Y NA
 23221 23222 AF1358 AF1359 pstA pstB TRUE 0.996 1.000 0.008 0.002 Y NA
 23222 23223 AF1359 AF1360 pstB phoU TRUE 0.958 -3.000 0.000 NA Y NA
 23223 23224 AF1360 AF1361 phoU arsC TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA N NA
 23224 23225 AF1361 AF1362 arsC   FALSE 0.033 59.000 0.000 1.000   NA
 23225 23226 AF1362 AF1363     TRUE 0.984 -40.000 0.097 NA   NA
 23226 23227 AF1363 AF1364     TRUE 0.994 -7.000 0.200 NA   NA
 23228 23229 AF1365 AF1366 hypE hypF TRUE 0.997 2.000 0.079 1.000 Y NA
 23230 23231 AF1367 AF1368 hypA hypB TRUE 0.998 3.000 0.162 0.002   NA
 23231 23232 AF1368 AF1369 hypB hypC TRUE 0.980 -28.000 0.020 NA Y NA
 23232 23233 AF1369 AF1370 hypC hypD TRUE 0.994 -73.000 0.363 NA Y NA
 23234 23235 AF1371 AF1372 vhtD-1 vhuA TRUE 0.993 -28.000 0.145 1.000 Y NA
 23235 23236 AF1372 AF1373 vhuA vhuG TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 23236 23237 AF1373 AF1374 vhuG vhuD TRUE 0.998 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 23237 23238 AF1374 AF1375 vhuD hdrB TRUE 0.997 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 23238 23239 AF1375 AF1376 hdrB hdrC TRUE 0.999 2.000 0.286 0.003 Y NA
 23239 23240 AF1376 AF1377 hdrC hdrA-2 TRUE 0.999 -3.000 0.286 0.003 Y NA
 23240 23241 AF1377 AF1378 hdrA-2 vhtD-2 FALSE 0.047 140.000 0.000 1.000 Y NA
 23241 23242 AF1378 AF1379 vhtD-2 hydC TRUE 0.990 -46.000 0.105 1.000 Y NA
 23242 23243 AF1379 AF1380 hydC vhtA TRUE 0.999 2.000 0.500 0.064 Y NA
 23243 23244 AF1380 AF1381 vhtA vhtG TRUE 0.998 -28.000 0.800 0.001 Y NA
 23244 23245 AF1381 AF1382 vhtG   FALSE 0.021 115.000 0.000 NA   NA
 23245 23246 AF1382 AF1383     FALSE 0.019 136.000 0.000 NA   NA
 23252 23253 AF1389 AF1390 braG-4 braF-4 TRUE 0.998 -34.000 0.682 0.015 Y NA
 23253 23254 AF1390 AF1391 braF-4 braC-4 TRUE 0.992 -54.000 0.182 NA Y NA
 23255 23256 AF1392 AF1393 braD-4 braE-4 TRUE 0.997 -330.000 0.792 0.019 Y NA
 23256 23257 AF1393 AF1394 braE-4   TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23257 23258 AF1394 AF1395     TRUE 0.790 -40.000 0.000 NA   NA
 23258 23259 AF1395 AF1396     TRUE 0.987 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 23260 23261 AF1397m AF1398 potD   TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 23261 23262 AF1398 AF1399     TRUE 0.940 0.000 0.000 1.000   NA
 23262 23263 AF1399 AF1400     FALSE 0.184 86.000 0.030 1.000   NA
 23263 23264 AF1400 AF1401   hemV-3 TRUE 0.978 -25.000 0.045 1.000   NA
 23264 23265 AF1401 AF1402 hemV-3 hemU-2 TRUE 0.993 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 23265 23266 AF1402 AF1403 hemU-2   FALSE 0.319 20.000 0.000 1.000   NA
 23266 23267 AF1403 AF1404     TRUE 0.996 0.000 0.091 1.000   NA
 23267 23268 AF1404 AF1405     FALSE 0.130 30.000 0.000 1.000   NA
 23268 23269 AF1405 AF1406     FALSE 0.079 33.000 0.000 1.000   NA
 23269 23270 AF1406 AF1407     FALSE 0.025 93.000 0.000 NA   NA
 23270 23271 AF1407 AF1408     TRUE 0.834 -21.000 0.000 NA   NA
 23271 23272 AF1408 AF1409     FALSE 0.374 17.000 0.000 NA   NA
 23272 23273 AF1409 AF1410     FALSE 0.114 89.000 0.000 0.030 Y NA
 23274 23275 AF1411 AF1412     FALSE 0.018 141.000 0.000 NA   NA
 23275 23276 AF1412 AF1413   slgB-2 TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23276 23277 AF1413 AF1414 slgB-2   FALSE 0.022 105.000 0.000 1.000 N NA
 23277 23278 AF1414 AF1415     TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000 N NA
 23278 23279 AF1415 AF1416   ribC FALSE 0.014 204.000 0.000 1.000 N NA
 23279 23280 AF1416 AF1417 ribC aspC TRUE 0.996 -3.000 0.270 1.000 N NA
 23280 23281 AF1417 AF1418 aspC taqD TRUE 0.932 0.000 0.000 1.000 N NA
 23281 23282 AF1418 AF1419 taqD prsA-2 FALSE 0.031 50.000 0.000 1.000 N NA
 23282 23283 AF1419 AF1420 prsA-2   FALSE 0.170 25.000 0.000 1.000 N NA
 23283 23284 AF1420 AF1421     FALSE 0.015 217.000 0.000 1.000   NA
 23284 23285 AF1421 AF1422     FALSE 0.036 50.000 0.000 1.000   NA
 23285 23286 AF1422 AF1423     FALSE 0.053 36.000 0.000 1.000   NA
 23287 23288 AF1424 AF1425 pheT bcpC-1 TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000 N NA
 23289 23290 AF1426 AF1427 glpF   TRUE 0.997 -3.000 0.538 1.000   NA
 23290 23291 AF1427 AF1428     TRUE 0.895 24.000 0.538 NA   NA
 23291 23292 AF1428 AF1429     FALSE 0.229 144.000 0.100 NA   NA
 23294 23295 AF1431 AF1432     TRUE 0.977 -12.000 0.024 NA   NA
 23296 23297 AF1433 AF1434     FALSE 0.034 45.000 0.000 NA   NA
 23297 23298 AF1434 AF1435     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 23299 23300 AF1436 AF1437 isf-1   TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 23300 23301 AF1437 AF1438     FALSE 0.248 22.000 0.000 NA   NA
 23301 23302 AF1438 AF1439   asnB TRUE 0.974 -9.000 0.014 NA   NA
 23302 23303 AF1439 AF1440 asnB gatB-1 FALSE 0.083 32.000 0.000 1.000 N NA
 23303 23304 AF1440 AF1441 gatB-1   TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23304 23305 AF1441 AF1442     TRUE 0.935 0.000 0.000 NA   NA
 23307 23308 AF1444 AF1445     TRUE 0.996 -25.000 0.645 NA Y NA
 23309 23310 AF1446 AF1447     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23310 23311 AF1447 AF1448     FALSE 0.021 115.000 0.000 NA   NA
 23311 23312 AF1448 AF1449   pflD FALSE 0.060 34.000 0.000 1.000 N NA
 23312 23313 AF1449 AF1450 pflD pflC TRUE 0.956 -12.000 0.000 0.001 N NA
 23313 23314 AF1450 AF1451 pflC thsB FALSE 0.064 89.000 0.000 1.000 Y NA
 23314 23315 AF1451 AF1452 thsB   FALSE 0.042 118.000 0.000 0.074 N NA
 23315 23316 AF1452 AF1453   metS FALSE 0.082 38.000 0.000 0.074 N NA
 23317 23318 AF1454 AF1455     FALSE 0.041 38.000 0.000 NA   NA
 23318 23319 AF1455 AF1456     FALSE 0.009 815.000 0.000 NA   NA
 23319 401715 AF1456 AFtRNA-Cys-1   tRNA-Cys FALSE 0.011 335.000 0.000 NA   NA
 401715 23320 AFtRNA-Cys-1 AF1457 tRNA-Cys   FALSE 0.026 88.000 0.000 NA   NA
 23321 401697 AF1458 AFtRNA-Thr-1   tRNA-Thr FALSE 0.145 27.000 0.000 NA   NA
 23322 23323 AF1459 AF1460     TRUE 0.726 10.000 0.000 NA   NA
 23324 23325 AF1461 AF1462     FALSE 0.043 137.000 0.000 0.063   NA
 23325 23326 AF1462 AF1463   fdrA TRUE 0.995 -48.000 0.500 0.063   NA
 23326 23327 AF1463 AF1464 fdrA   FALSE 0.020 130.000 0.000 NA   NA
 23327 23328 AF1464 AF1465     FALSE 0.062 34.000 0.000 NA   NA
 23328 23329 AF1465 AF1466     FALSE 0.009 727.000 0.000 NA   NA
 23329 23330 AF1466 AF1467     FALSE 0.030 71.000 0.000 NA   NA
 23330 23331 AF1467 AF1468     FALSE 0.013 232.000 0.000 1.000 N NA
 23331 23332 AF1468 AF1469     TRUE 0.821 -22.000 0.000 1.000 N NA
 23332 23333 AF1469 AF1470     TRUE 0.892 -112.000 0.000 1.000 Y NA
 23333 23334 AF1470 AF1471     FALSE 0.127 70.000 0.000 0.050 Y NA
 23335 23336 AF1472 AF1473     TRUE 0.969 -19.000 0.000 0.004 Y NA
 23336 23337 AF1473 AF1474     FALSE 0.026 99.000 0.000 1.000   NA
 23337 23338 AF1474 AF1475     TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 23339 23340 AF1476 AF1477     FALSE 0.072 33.000 0.000 NA   NA
 23340 23341 AF1477 AF1478     FALSE 0.032 52.000 0.000 NA   NA
 23341 23342 AF1478 AF1479     TRUE 0.994 -13.000 0.286 NA   NA
 23343 23344 AF1480 AF1481     TRUE 0.997 -3.000 0.600 NA   NA
 23344 23345 AF1481 AF1482     TRUE 0.910 4.000 0.000 NA   NA
 23345 23346 AF1482 AF1483     FALSE 0.015 195.000 0.000 NA   NA
 23346 23347 AF1483 AF1484     TRUE 0.820 -31.000 0.000 1.000   NA
 23349 23350 AF1486 AF1487     FALSE 0.011 355.000 0.000 NA   NA
 23350 401714 AF1487 AFtRNA-Thr-2   tRNA-Thr FALSE 0.033 47.000 0.000 NA   NA
 401714 23351 AFtRNA-Thr-2 AF1488 tRNA-Thr   FALSE 0.044 37.000 0.000 NA   NA
 23351 23352 AF1488 AF1489   iorA FALSE 0.266 21.000 0.000 1.000 N NA
 23353 23354 AF1490 AF1491 rpl1P rpl10E TRUE 0.998 1.000 0.076 0.019 Y NA
 23354 23355 AF1491 AF1492 rpl10E rpl12A TRUE 0.988 16.000 0.758 0.002 Y NA
 23355 23356 AF1492 AF1493 rpl12A hpyA1-2 FALSE 0.013 220.000 0.000 1.000 N NA
 23358 23359 AF1495 AF1496     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23359 23360 AF1496 AF1497   aroA TRUE 0.947 -31.000 0.002 NA   NA
 23362 23363 AF1499 AF1500     FALSE 0.034 46.000 0.000 NA   NA
 23363 23364 AF1500 AF1501     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 23365 23366 AF1502 AF1503     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23366 23367 AF1503 AF1504     TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 23367 23368 AF1504 AF1505     FALSE 0.037 45.000 0.000 1.000   NA
 23368 23369 AF1505 AF1506   asd FALSE 0.014 198.000 0.000 1.000 N NA
 23369 23370 AF1506 AF1507 asd   FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 23370 23371 AF1507 AF1508     FALSE 0.030 63.000 0.000 NA   NA
 23371 23372 AF1508 AF1509     FALSE 0.032 62.000 0.000 1.000   NA
 23372 23373 AF1509 AF1510   fadD-6 TRUE 0.941 1.000 0.000 1.000   NA
 23373 23374 AF1510 AF1511 fadD-6   FALSE 0.321 25.000 0.000 0.053 N NA
 23374 23375 AF1511 AF1512     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA N NA
 23375 23376 AF1512 AF1513     FALSE 0.030 72.000 0.000 NA   NA
 23376 401713 AF1513 AFtRNA-Ser-4   tRNA-Ser FALSE 0.018 150.000 0.000 NA   NA
 401713 23377 AFtRNA-Ser-4 AF1514 tRNA-Ser   FALSE 0.145 27.000 0.000 NA   NA
 23379 23380 AF1516 AF1517 sfsA   TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23380 23381 AF1517 AF1518     FALSE 0.191 25.000 0.000 1.000   NA
 23381 23382 AF1518 AF1519   isf-2 TRUE 0.996 -7.000 0.448 NA   NA
 23382 23383 AF1519 AF1520 isf-2 fprA-2 TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23384 23385 AF1521 AF1522     FALSE 0.030 71.000 0.000 NA   NA
 23385 23386 AF1522 AF1523     TRUE 0.984 -13.000 0.049 NA   NA
 23387 23388 AF1524 AF1525     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23388 23389 AF1525 AF1526     TRUE 0.989 2.000 0.019 1.000   NA
 23389 23390 AF1526 AF1527     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 23390 23391 AF1527 AF1528     FALSE 0.019 133.000 0.000 NA   NA
 23392 23393 AF1529 AF1530 rpl21E   TRUE 0.996 -7.000 0.479 1.000   NA
 23393 23394 AF1530 AF1531     TRUE 0.553 49.000 0.730 NA   NA
 23394 23395 AF1531 AF1532     FALSE 0.054 35.000 0.000 NA   NA
 23398 23399 AF1535 AF1536 ftrB grx-1 FALSE 0.070 46.000 0.000 0.062 N NA
 23399 23400 AF1536 AF1537 grx-1 est-2 FALSE 0.023 121.000 0.000 1.000   NA
 23400 23401 AF1537 AF1538 est-2   FALSE 0.068 34.000 0.000 1.000   NA
 23401 23402 AF1538 AF1539   sucD-1 FALSE 0.016 157.000 0.000 1.000 N NA
 23402 23403 AF1539 AF1540 sucD-1 sucC-1 TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.002 Y NA
 23403 23404 AF1540 AF1541 sucC-1   FALSE 0.020 144.000 0.000 1.000   NA
 23404 23405 AF1541 AF1542     TRUE 0.993 1.000 0.039 1.000   NA
 23406 23407 AF1543 AF1544     TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 23407 23408 AF1544 AF1545     FALSE 0.025 94.000 0.000 NA   NA
 23408 23409 AF1545 AF1546     TRUE 0.996 -12.000 0.818 NA   NA
 23409 23410 AF1546 AF1547     TRUE 0.798 -34.000 0.000 NA   NA
 23410 23411 AF1547 AF1548     FALSE 0.020 129.000 0.000 NA   NA
 23414 23415 AF1551 AF1552 ispB   FALSE 0.033 66.000 0.000 1.000   NA
 23416 23417 AF1553 AF1554   trxB FALSE 0.240 22.000 0.000 1.000 N NA
 23417 23418 AF1554 AF1555 trxB   FALSE 0.024 98.000 0.000 NA   NA
 23418 23419 AF1555 AF1556     FALSE 0.018 145.000 0.000 NA   NA
 23419 23420 AF1556 AF1557     FALSE 0.011 333.000 0.000 NA   NA
 23420 23421 AF1557 AF1558   smc1 TRUE 0.988 2.000 0.018 NA   NA
 23421 23422 AF1558 AF1559 smc1   TRUE 0.456 33.000 0.056 NA   NA
 23422 23423 AF1559 AF1560     FALSE 0.013 223.000 0.000 NA   NA
 23423 23424 AF1560 AF1561     FALSE 0.019 139.000 0.000 NA   NA
 23424 23425 AF1561 AF1562     TRUE 0.998 2.000 0.957 NA   NA
 23426 23427 AF1563 AF1564     TRUE 0.812 -28.000 0.000 NA   NA
 23427 23428 AF1564 AF1565     FALSE 0.120 30.000 0.000 NA   NA
 23429 23430 AF1566 AF1567     TRUE 0.996 5.000 0.750 NA   NA
 23430 23431 AF1567 AF1568     FALSE 0.030 66.000 0.000 NA   NA
 23431 23432 AF1568 AF1569     TRUE 0.880 -6.000 0.000 NA   NA
 23432 23433 AF1569 AF1570     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23433 23434 AF1570 AF1571     FALSE 0.015 196.000 0.000 NA   NA
 23434 23435 AF1571 AF1572     FALSE 0.013 221.000 0.000 NA   NA
 23435 23436 AF1572 AF1573     FALSE 0.015 201.000 0.000 NA   NA
 23436 23437 AF1573 AF1574     FALSE 0.029 78.000 0.000 NA   NA
 23437 23438 AF1574 AF1575     FALSE 0.037 40.000 0.000 NA   NA
 23438 23439 AF1575 AF1576     FALSE 0.027 84.000 0.000 NA   NA
 23439 23440 AF1576 AF1577     FALSE 0.026 88.000 0.000 NA   NA
 23440 23441 AF1577 AF1578     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 23441 23442 AF1578 AF1579     FALSE 0.017 160.000 0.000 NA   NA
 23445 23446 AF1582 AF1583     FALSE 0.014 215.000 0.000 NA   NA
 23446 23447 AF1583 AF1584     FALSE 0.030 71.000 0.000 NA   NA
 23448 23449 AF1585 AF1586     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 23450 23451 AF1587 AF1588 rbcL-1   TRUE 0.869 5.000 0.000 NA N NA
 23451 23452 AF1588 AF1589     FALSE 0.028 52.000 0.000 NA N NA
 23452 23453 AF1589 AF1590     TRUE 0.993 -15.000 0.272 NA   NA
 23454 23455 AF1591 AF1592     TRUE 0.809 -37.000 0.000 1.000   NA
 23455 23456 AF1592 AF1593m   nirD TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 23456 23457 AF1593m AF1594m nirD nirH TRUE 0.828 -22.000 0.000 NA   NA
 23457 23458 AF1594m AF1595 nirH   TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23459 23460 AF1596 AF1597     FALSE 0.015 198.000 0.000 NA   NA
 23460 23461 AF1597 AF1598     FALSE 0.028 81.000 0.000 NA   NA
 23461 23462 AF1598 AF1599   trpA FALSE 0.031 55.000 0.000 NA   NA
 23462 23463 AF1599 AF1600 trpA trpB-2 TRUE 0.996 -3.000 0.030 0.001 Y NA
 23463 23464 AF1600 AF1601 trpB-2 trpF TRUE 0.987 -52.000 0.014 0.001 Y NA
 23464 23465 AF1601 AF1602 trpF trpG TRUE 0.986 -10.000 0.016 1.000 Y NA
 23465 23466 AF1602 AF1603 trpG trpE TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.001 Y NA
 23466 23467 AF1603 AF1604 trpE trpD TRUE 0.991 -21.000 0.015 0.001 Y NA
 23467 23468 AF1604 AF1605m trpD potD FALSE 0.071 79.000 0.000 1.000 Y NA
 23468 23469 AF1605m AF1606 potD potC TRUE 0.604 32.000 0.007 0.019 Y NA
 23469 23470 AF1606 AF1607 potC potB TRUE 0.995 -3.000 0.027 0.019 Y NA
 23470 23471 AF1607 AF1608 potB potA TRUE 0.998 -3.000 0.143 0.019 Y NA
 23472 23473 AF1609 AF1610 proS   FALSE 0.011 327.000 0.000 1.000 N NA
 23473 23474 AF1610 AF1611     TRUE 0.975 -91.000 0.065 NA   NA
 23474 23475 AF1611 AF1612   cat-1 FALSE 0.030 64.000 0.000 NA   NA
 23476 23477 AF1613 AF1614     TRUE 0.996 -3.000 0.375 NA   NA
 23479 23480 AF1616 AF1617     TRUE 0.729 31.000 0.200 NA   NA
 23480 23481 AF1617 AF1618     TRUE 0.952 11.000 0.059 NA   NA
 23481 23482 AF1618 AF1619     TRUE 0.852 -15.000 0.000 NA   NA
 23482 23483 AF1619 AF1620     FALSE 0.023 107.000 0.000 NA   NA
 23483 23484 AF1620 AF1621     TRUE 0.755 -243.000 0.000 NA   NA
 23485 23486 AF1622 AF1623 lrp aspB-3 TRUE 0.993 -34.000 0.894 1.000 N NA
 23486 23487 AF1623 AF1624 aspB-3 moaD TRUE 0.852 -13.000 0.000 1.000 N NA
 23487 23488 AF1624 AF1625 moaD   FALSE 0.029 73.000 0.000 NA   NA
 23488 23489 AF1625 AF1626     FALSE 0.011 348.000 0.000 NA   NA
 23489 23490 AF1626 AF1627     TRUE 0.483 14.000 0.000 NA   NA
 23490 23491 AF1627 AF1628     FALSE 0.017 178.000 0.000 1.000   NA
 23491 23492 AF1628 AF1629     FALSE 0.033 47.000 0.000 NA   NA
 23493 23494 AF1630 AF1631     FALSE 0.087 32.000 0.000 NA   NA
 23495 23496 AF1632 AF1633     TRUE 0.992 5.000 0.087 NA   NA
 23497 23498 AF1634m AF1636     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23499 23500 AF1637 AF1638 chlP-3 rbcL-2 FALSE 0.076 32.000 0.000 NA N NA
 23500 23501 AF1638 AF1639 rbcL-2   FALSE 0.102 31.000 0.000 1.000 N NA
 23501 23502 AF1639 AF1640   rr3 FALSE 0.031 50.000 0.000 1.000 N NA
 23503 23504 AF1641 AF1642 fad-4 hisS FALSE 0.083 32.000 0.000 1.000 N NA
 23505 23506 AF1643 AF1644   fwdF FALSE 0.048 36.000 0.000 NA   NA
 23506 23507 AF1644 AF1645 fwdF dfp TRUE 0.941 -52.000 0.002 1.000   NA
 23507 23508 AF1645 AF1646 dfp   TRUE 0.984 -3.000 0.018 1.000   NA
 23508 23509 AF1646 AF1647     TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 23509 23510 AF1647 AF1648     TRUE 0.396 17.000 0.000 1.000   NA
 23510 23511 AF1648 AF1649   fwdG FALSE 0.036 50.000 0.000 1.000   NA
 23511 23512 AF1649 AF1650 fwdG fwdB-1 TRUE 0.998 -3.000 0.786 0.003   NA
 23512 23513 AF1650 AF1651 fwdB-1 fwdD-1 TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 23514 23515 AF1652 AF1653   aprM TRUE 0.938 -33.000 0.000 0.001   NA
 23515 23516 AF1653 AF1654 aprM   FALSE 0.018 152.000 0.000 NA   NA
 23516 23517 AF1654 AF1655     TRUE 0.726 10.000 0.000 NA   NA
 23517 23518 AF1655 AF1656     TRUE 0.930 2.000 0.000 NA   NA
 23518 23519 AF1656 AF1657   spc21 TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23519 23520 AF1657 AF1658 spc21   TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23520 23521 AF1658 AF1659     TRUE 0.935 0.000 0.000 NA   NA
 23521 23522 AF1659 AF1660     TRUE 0.984 11.000 0.750 NA   NA
 23522 23523 AF1660 AF1661     FALSE 0.319 19.000 0.000 NA   NA
 23523 23524 AF1661 AF1662     FALSE 0.019 134.000 0.000 NA   NA
 23524 23525 AF1662 AF1663     FALSE 0.030 65.000 0.000 NA   NA
 23525 23526 AF1663 AF1664   nrd FALSE 0.017 131.000 0.000 NA N NA
 23527 23528 AF1665 AF1666 arcB   TRUE 0.984 -3.000 0.019 1.000   NA
 23528 23529 AF1666 AF1667   sat FALSE 0.019 159.000 0.000 1.000   NA
 23529 23530 AF1667 AF1668 sat   TRUE 0.989 2.000 0.021 NA   NA
 23530 23531 AF1668 AF1669   aprB FALSE 0.283 49.000 0.060 NA   NA
 23531 23532 AF1669 AF1670 aprB aprA TRUE 0.987 17.000 0.925 0.001 Y NA
 23532 23533 AF1670 AF1671 aprA ftsA-2 FALSE 0.028 65.000 0.000 1.000 N NA
 23533 23534 AF1671 AF1672 ftsA-2   TRUE 0.993 10.000 0.700 0.051   NA
 23534 23535 AF1672 AF1673     TRUE 0.936 2.000 0.000 1.000   NA
 23536 23537 AF1674 AF1675 gldA   FALSE 0.030 64.000 0.000 NA   NA
 23539 23540 AF1677 AF1678     FALSE 0.032 64.000 0.000 1.000   NA
 23542 23543 AF1680 AF1681     TRUE 0.775 -58.000 0.000 NA   NA
 23544 23545 AF1682 AF1683     TRUE 0.847 -16.000 0.000 NA   NA
 23545 23546 AF1683 AF1684     FALSE 0.145 27.000 0.000 NA   NA
 23546 23547 AF1684 AF1685   cooC-2 FALSE 0.240 22.000 0.000 1.000 N NA
 23547 23548 AF1685 AF1686 cooC-2   FALSE 0.059 35.000 0.000 1.000   NA
 23548 23549 AF1686 AF1687     FALSE 0.030 58.000 0.000 NA   NA
 23551 23552 AF1689 AF1690   vapC-2 TRUE 0.994 -10.000 0.250 NA   NA
 23553 23554 AF1691 AF1692   nth TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 23557 23558 AF1695 AF1696 apbA qacE TRUE 0.457 29.000 0.015 NA   NA
 23558 23559 AF1696 AF1697 qacE   FALSE 0.033 50.000 0.000 NA   NA
 23559 23560 AF1697 AF1698     TRUE 0.753 -303.000 0.000 NA   NA
 23560 23561 AF1698 AF1699   porG FALSE 0.023 103.000 0.000 NA   NA
 23561 23562 AF1699 AF1700 porG porD TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 23562 23563 AF1700 AF1701 porD porA TRUE 0.944 10.000 0.000 0.002 Y NA
 23563 23564 AF1701 AF1702 porA porB TRUE 0.997 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 23564 23565 AF1702 AF1703 porB   TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000 N NA
 23568 23569 AF1706 AF1707 pcbD   FALSE 0.026 102.000 0.000 1.000   NA
 23569 23570 AF1707 AF1708     TRUE 0.994 -3.000 0.118 1.000   NA
 23570 23571 AF1708 AF1709     FALSE 0.020 122.000 0.000 NA   NA
 23571 23572 AF1709 AF1710     TRUE 0.977 -7.000 0.018 NA   NA
 23572 23573 AF1710 AF1711     FALSE 0.012 252.000 0.000 NA   NA
 23573 23574 AF1711 AF1712     TRUE 0.857 -13.000 0.000 NA   NA
 23574 23575 AF1712 AF1713     FALSE 0.021 118.000 0.000 NA   NA
 23575 23576 AF1713 AF1714     FALSE 0.023 103.000 0.000 NA   NA
 23576 23577 AF1714 AF1715m     FALSE 0.027 82.000 0.000 NA   NA
 23577 401712 AF1715m AFtRNA-Val-2   tRNA-Val FALSE 0.013 241.000 0.000 NA   NA
 23579 23580 AF1717 AF1718     FALSE 0.275 21.000 0.000 NA   NA
 23580 23581 AF1718 AF1719   ilvN FALSE 0.030 60.000 0.000 NA   NA
 23581 23582 AF1719 AF1720 ilvN ilvB-1 TRUE 0.996 10.000 0.249 0.001 Y NA
 23583 23584 AF1721 AF1722     FALSE 0.015 187.000 0.000 1.000 N NA
 23584 23585 AF1722 AF1723     FALSE 0.042 37.000 0.000 1.000 N NA
 23585 23586 AF1723 AF1724   draG FALSE 0.128 27.000 0.000 NA N NA
 23587 23588 AF1725 AF1726     TRUE 0.995 -3.000 0.190 1.000   NA
 23589 23590 AF1727 AF1728 mae   FALSE 0.027 78.000 0.000 1.000 N NA
 23590 23591 AF1728 AF1729     FALSE 0.033 43.000 0.000 1.000 N NA
 23592 23593 AF1730 AF1731 truA   TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23593 23594 AF1731 AF1732   gap FALSE 0.248 22.000 0.000 NA   NA
 23594 23595 AF1732 AF1733 gap   TRUE 0.991 -3.000 0.062 NA   NA
 23596 23597 AF1734 AF1735     TRUE 0.917 26.000 0.950 NA Y NA
 23598 23599 AF1736 AF1737 mvaA   TRUE 0.765 -60.000 0.000 1.000 N NA
 23602 23603 AF1740 AF1741   pyrE TRUE 0.981 -6.000 0.024 1.000 N NA
 23605 23606 AF1743 AF1744   pgsA-2 FALSE 0.293 47.000 0.067 1.000 N NA
 23608 23609 AF1746 AF1747 amt-2 glnB-2 TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000 N NA
 23609 23610 AF1747 AF1748 glnB-2   TRUE 0.840 7.000 0.000 1.000   NA
 23610 23611 AF1748 AF1749   amt-3 FALSE 0.027 96.000 0.000 1.000   NA
 23611 23612 AF1749 AF1750 amt-3 glnB-3 TRUE 0.989 -22.000 0.150 1.000 N NA
 23613 23614 AF1751 AF1752 bcpC-2   TRUE 0.874 10.000 0.000 1.000 Y NA
 23614 23615 AF1752 AF1753     TRUE 0.828 -21.000 0.000 1.000 N NA
 23615 23616 AF1753 AF1754     FALSE 0.037 40.000 0.000 NA   NA
 23616 23617 AF1754 AF1755     TRUE 0.996 -10.000 0.915 NA   NA
 23617 23618 AF1755 AF1756     FALSE 0.021 116.000 0.000 NA   NA
 23618 23619 AF1756 AF1757     FALSE 0.017 163.000 0.000 NA   NA
 23619 23620 AF1757 AF1758     TRUE 0.726 10.000 0.000 NA   NA
 23620 23621 AF1758 AF1759     FALSE 0.010 550.000 0.000 NA   NA
 23622 23623 AF1760 AF1761   leuD-2 TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000 N NA
 23626 23627 AF1764 AF1765     TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 23630 23631 AF1768 AF1769 dppB dppC TRUE 0.996 10.000 0.435 0.028 Y NA
 23631 23632 AF1769 AF1770 dppC dppD TRUE 0.997 -3.000 0.228 1.000 Y NA
 23632 23633 AF1770 AF1771 dppD dppF TRUE 0.999 5.000 0.875 0.001 Y NA
 23633 23634 AF1771 AF1772 dppF fadD-7 FALSE 0.026 83.000 0.000 1.000 N NA
 23634 23635 AF1772 AF1773 fadD-7   FALSE 0.025 84.000 0.000 1.000 N NA
 23635 23636 AF1773 AF1774   cat-2 FALSE 0.102 31.000 0.000 1.000 N NA
 23640 23641 AF1778 AF1779 spoVG   FALSE 0.029 58.000 0.000 1.000 N NA
 23641 23642 AF1779 AF1780   ilvB-2 TRUE 0.996 5.000 0.114 1.000 Y NA
 23642 23643 AF1780 AF1781 ilvB-2 nfeD TRUE 0.472 14.000 0.000 1.000 N NA
 23643 23644 AF1781 AF1782 nfeD   TRUE 0.977 -49.000 0.062 NA   NA
 23644 23645 AF1782 AF1783   ksgA TRUE 0.857 -13.000 0.000 NA   NA
 23645 23646 AF1783 AF1784 ksgA hemK TRUE 0.992 -3.000 0.028 1.000 Y NA
 23647 23648 AF1785 AF1786     FALSE 0.034 54.000 0.000 1.000   NA
 23648 23649 AF1786 AF1787     TRUE 0.877 -10.000 0.000 1.000   NA
 23649 23650 AF1787 AF1788   mtaP FALSE 0.060 34.000 0.000 1.000 N NA
 23650 23651 AF1788 AF1789 mtaP gptA-2 TRUE 0.995 -3.000 0.044 0.003   NA
 23651 23652 AF1789 AF1790 gptA-2   TRUE 0.936 2.000 0.000 1.000   NA
 23653 23654 AF1791 AF1792 sec11   FALSE 0.039 39.000 0.000 NA   NA
 23654 23655 AF1792 AF1793     FALSE 0.221 23.000 0.000 NA   NA
 23656 23657 AF1794 AF1795 ino1 celM FALSE 0.028 72.000 0.000 1.000 N NA
 23657 23658 AF1795 AF1796 celM   FALSE 0.188 130.000 0.060 1.000 N NA
 23658 23659 AF1796 AF1797     FALSE 0.027 54.000 0.000 NA N NA
 23660 23661 AF1798 AF1799     TRUE 0.995 -72.000 0.937 NA Y NA
 23662 23663 AF1800 AF1801     TRUE 0.988 3.000 0.024 NA   NA
 23663 10692145 AF1801 AF1802     FALSE 0.032 51.000 0.000 NA   NA
 10692145 23664 AF1802 AF1803     FALSE 0.031 56.000 0.000 NA   NA
 23665 23666 AF1804 AF1805     TRUE 0.996 -7.000 0.387 1.000   NA
 23666 23667 AF1805 AF1806   topA TRUE 0.880 -9.000 0.000 1.000   NA
 23671 23672 AF1810 AF1811     TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 23672 23673 AF1811 AF1812     TRUE 0.857 -13.000 0.000 NA   NA
 23675 23676 AF1814 AF1815   argD-2 FALSE 0.044 37.000 0.000 NA   NA
 23676 23677 AF1815 AF1816 argD-2   TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23677 23678 AF1816 AF1817     FALSE 0.018 140.000 0.000 NA   NA
 23678 23679 AF1817 AF1818     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23679 23680 AF1818 AF1819     TRUE 0.926 1.000 0.000 NA N NA
 23680 23681 AF1819 AF1820     TRUE 0.992 -64.000 0.849 1.000 N NA
 23683 23684 AF1822 AF1823 ppa   FALSE 0.032 74.000 0.000 1.000   NA
 23684 23685 AF1823 AF1824     TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.005   NA
 23685 23686 AF1824 AF1825   nuoM TRUE 0.998 -3.000 0.333 0.005   NA
 23686 23687 AF1825 AF1826 nuoM nuoL TRUE 0.999 -3.000 0.600 0.001 Y NA
 23687 23688 AF1826 AF1827 nuoL   TRUE 0.999 -12.000 0.500 0.001 Y NA
 23688 23689 AF1827 AF1828     TRUE 0.999 4.000 0.667 0.002 Y NA
 23689 23690 AF1828 AF1829     TRUE 0.998 -16.000 0.375 0.002 Y NA
 23690 23691 AF1829 AF1830   nuoD TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.005 Y NA
 23691 23692 AF1830 AF1831 nuoD   TRUE 0.999 2.000 0.667 0.005 Y NA
 23692 23693 AF1831 AF1832a     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.005 Y NA
 23693 23694 AF1832a AF1833     FALSE 0.066 209.000 0.000 0.035 Y NA
 23695 23696 AF1834 AF1835     TRUE 0.996 -3.000 0.288 1.000   NA
 23696 10692146 AF1835 AF1836     FALSE 0.026 85.000 0.000 NA   NA
 23697 23698 AF1837m AF1838 nadA   TRUE 0.982 -6.000 0.024 1.000   NA
 23698 23699 AF1838 AF1839   nadC FALSE 0.175 45.000 0.015 1.000   NA
 23699 23700 AF1839 AF1840 nadC map FALSE 0.102 31.000 0.000 1.000 N NA
 23701 23702 AF1841 AF1842 cbiO-2 cbiQ-2 TRUE 0.997 -15.000 0.682 1.000 Y NA
 23702 23703 AF1842 AF1843 cbiQ-2 cbiM-2 TRUE 0.997 -16.000 0.115 0.009 Y NA
 23703 23704 AF1843 AF1844 cbiM-2   FALSE 0.017 164.000 0.000 NA   NA
 23704 23705 AF1844 AF1845     TRUE 0.792 -39.000 0.000 NA   NA
 23705 23706 AF1845 AF1846     FALSE 0.025 95.000 0.000 NA   NA
 23706 23707 AF1846 AF1847     FALSE 0.015 194.000 0.000 NA   NA
 23707 23708 AF1847 AF1848     FALSE 0.032 51.000 0.000 NA   NA
 23709 23710 AF1849 AF1850 cooS   FALSE 0.037 46.000 0.000 1.000   NA
 23710 23711 AF1850 AF1851     TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 23715 23716 AF1855 AF1856 entE   FALSE 0.021 136.000 0.000 1.000   NA
 23716 10692147 AF1856 AF1857     TRUE 0.827 7.000 0.000 NA   NA
 23717 23718 AF1858 AF1859 noxA-5   FALSE 0.018 146.000 0.000 NA   NA
 23718 23719 AF1859 AF1860     TRUE 0.807 8.000 0.000 NA   NA
 23719 23720 AF1860 AF1861     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 23720 23721 AF1861 AF1862     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23721 23722 AF1862 AF1863     TRUE 0.995 -19.000 0.256 NA Y NA
 23722 23723 AF1863 AF1864     TRUE 0.847 -16.000 0.000 NA   NA
 23723 23724 AF1864 AF1865     TRUE 0.840 -19.000 0.000 NA   NA
 23724 23725 AF1865 AF1866     TRUE 0.936 1.000 0.000 NA   NA
 23725 23726 AF1866 AF1867     TRUE 0.992 -3.000 0.068 NA   NA
 23726 23727 AF1867 AF1868     TRUE 0.991 -63.000 0.411 NA   NA
 23727 23728 AF1868 AF1869     FALSE 0.032 52.000 0.000 NA   NA
 23729 23730 AF1870 AF1871     TRUE 0.994 -16.000 0.300 NA   NA
 23730 23731 AF1871 AF1872     TRUE 0.998 -3.000 0.400 NA Y NA
 23731 23732 AF1872 AF1873     TRUE 0.995 -12.000 0.600 NA   NA
 23732 23733 AF1873 AF1874     TRUE 0.994 -6.000 0.222 NA   NA
 23733 23734 AF1874 AF1875     TRUE 0.996 -3.000 0.222 NA   NA
 23734 23735 AF1875 AF1876     FALSE 0.251 30.000 0.000 NA Y NA
 23736 23737 AF1877 AF1878     TRUE 0.917 -25.000 0.000 NA Y NA
 23737 23738 AF1878 AF1879     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23740 23741 AF1881 AF1882     FALSE 0.009 835.000 0.000 NA   NA
 23741 401711 AF1882 AFtRNA-Thr-3   tRNA-Thr FALSE 0.017 154.000 0.000 NA   NA
 401711 23742 AFtRNA-Thr-3 AF1883 tRNA-Thr drrB FALSE 0.048 36.000 0.000 NA   NA
 23742 23743 AF1883 AF1884 drrB drrA TRUE 0.998 3.000 0.273 0.064 N NA
 401698 23744 AFtRNA-Lys-1 AF1885 tRNA-Lys rpoH FALSE 0.198 24.000 0.000 NA   NA
 23744 23745 AF1885 AF1886 rpoH rpoB2 TRUE 0.807 33.000 0.292 0.003   NA
 23745 23746 AF1886 AF1887 rpoB2 rpoB1 TRUE 0.999 1.000 0.909 0.003   NA
 23746 23747 AF1887 AF1888 rpoB1 rpoA1 TRUE 0.987 12.000 0.333 0.003   NA
 23747 23748 AF1888 AF1889 rpoA1 rpoA2 TRUE 0.998 -3.000 0.366 0.003   NA
 23748 23749 AF1889 AF1890 rpoA2 rpl30E TRUE 0.993 -3.000 0.074 1.000   NA
 23749 23750 AF1890 AF1891 rpl30E   TRUE 0.894 16.000 0.068 1.000 N NA
 23750 23751 AF1891 AF1892   rps12P TRUE 0.994 0.000 0.057 1.000 N NA
 23751 23752 AF1892 AF1893 rps12P rps7P TRUE 0.999 5.000 0.410 0.003 Y NA
 23752 23753 AF1893 AF1894 rps7P fus TRUE 0.996 6.000 0.211 1.000 Y NA
 23753 23754 AF1894 AF1895 fus   FALSE 0.374 17.000 0.000 NA   NA
 23754 23755 AF1895 AF1896   isf-3 FALSE 0.062 34.000 0.000 NA   NA
 23757 23758 AF1898 AF1899     FALSE 0.033 43.000 0.000 1.000 N NA
 23759 23760 AF1900 AF1901 cmk   TRUE 0.936 2.000 0.000 1.000   NA
 23760 23761 AF1901 AF1902   secY TRUE 0.993 -3.000 0.082 1.000   NA
 23761 23762 AF1902 AF1903 secY rpl15P TRUE 0.953 15.000 0.261 1.000 N NA
 23762 23763 AF1903 AF1904 rpl15P rpl30P TRUE 0.999 -3.000 0.471 0.020 Y NA
 23763 23764 AF1904 AF1905 rpl30P rps5P TRUE 0.998 6.000 0.475 0.020 Y NA
 23764 23765 AF1905 AF1906 rps5P rpl18P TRUE 0.997 -3.000 0.072 0.020 Y NA
 23765 23766 AF1906 AF1907 rpl18P rpl19E TRUE 0.996 6.000 0.079 0.016 Y NA
 23766 23767 AF1907 AF1908 rpl19E rpl32E TRUE 0.999 -3.000 0.529 0.016 Y NA
 23767 23768 AF1908 AF1909 rpl32E rpl6P TRUE 0.996 10.000 0.465 0.016 Y NA
 23768 23769 AF1909 AF1910 rpl6P rps8E TRUE 0.992 -49.000 0.068 0.016 Y NA
 23769 23770 AF1910 AF1911 rps8E rps14P TRUE 0.999 0.000 0.473 0.016 Y NA
 23770 23771 AF1911 AF1912 rps14P rpl5P TRUE 0.999 -3.000 0.496 0.016 Y NA
 23771 23772 AF1912 AF1913 rpl5P rps4E TRUE 0.998 4.000 0.073 0.016 Y NA
 23772 23773 AF1913 AF1914 rps4E rpl24P TRUE 0.999 -3.000 0.478 0.020 Y NA
 23773 23774 AF1914 AF1915 rpl24P rpl14P TRUE 0.994 11.000 0.472 0.020 Y NA
 23774 23775 AF1915 AF1916 rpl14P rps17P TRUE 0.998 -19.000 0.506 0.016 Y NA
 23775 23776 AF1916 AF1917 rps17P   TRUE 0.998 -3.000 0.468 1.000 Y NA
 23776 23777 AF1917 AF1918   rpl29P TRUE 0.979 -24.000 0.046 1.000   NA
 23777 23778 AF1918 AF1919 rpl29P rps3P TRUE 0.987 -79.000 0.074 0.020   NA
 23778 23779 AF1919 AF1920 rps3P rpl22P TRUE 0.998 0.000 0.074 0.020 Y NA
 23779 23780 AF1920 AF1921 rpl22P rps19P TRUE 0.999 0.000 0.355 0.020 Y NA
 23780 23781 AF1921 AF1922 rps19P rpl2P TRUE 0.996 5.000 0.051 0.020 Y NA
 23781 23782 AF1922 AF1923 rpl2P rpl23P TRUE 0.993 12.000 0.849 0.016 Y NA
 23782 23783 AF1923 AF1924 rpl23P rpl4P TRUE 0.996 -12.000 0.075 0.016 Y NA
 23783 23784 AF1924 AF1925 rpl4P rpl3P TRUE 0.999 3.000 0.885 0.016 Y NA
 23784 23785 AF1925 AF1926 rpl3P   TRUE 0.996 -3.000 0.359 NA   NA
 23785 23786 AF1926 AF1927     FALSE 0.030 58.000 0.000 NA   NA
 23787 23788 AF1928 AF1929 fwdD-2 fwdB-2 TRUE 0.999 1.000 0.875 1.000 Y NA
 23788 23789 AF1929 AF1930 fwdB-2 fwdA TRUE 0.998 4.000 0.429 1.000 Y NA
 23789 23790 AF1930 AF1931 fwdA fwdC TRUE 0.999 5.000 1.000 0.003 Y NA
 23790 23791 AF1931 AF1932 fwdC fadD-8 FALSE 0.057 85.000 0.000 0.046 N NA
 23792 23793 AF1933 AF1934     FALSE 0.032 48.000 0.000 1.000 N NA
 23793 23794 AF1934 AF1935   mch FALSE 0.027 79.000 0.000 1.000 N NA
 23794 23795 AF1935 AF1936 mch   FALSE 0.033 50.000 0.000 NA   NA
 23795 23796 AF1936 AF1937   minD-2 FALSE 0.048 36.000 0.000 NA   NA
 23798 23799 AF1939 AF1940   purL FALSE 0.017 159.000 0.000 NA   NA
 23799 23800 AF1940 AF1941 purL   TRUE 0.995 5.000 0.019 0.001 Y NA
 23801 23802 AF1942m AF1944     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23802 23803 AF1944 AF1945     TRUE 0.857 -13.000 0.000 NA   NA
 23803 23804 AF1945 AF1946     FALSE 0.019 137.000 0.000 NA   NA
 23804 23805 AF1946 AF1947     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 23805 23806 AF1947 AF1948     FALSE 0.018 153.000 0.000 NA   NA
 23806 23807 AF1948 AF1949     TRUE 0.880 -6.000 0.000 NA   NA
 23807 23808 AF1949 AF1950   hisIE FALSE 0.031 55.000 0.000 NA   NA
 23808 23809 AF1950 AF1951 hisIE   TRUE 0.963 -67.000 0.026 1.000   NA
 23809 23810 AF1951 AF1952     FALSE 0.216 54.000 0.031 1.000   NA
 23810 23811 AF1952 AF1953     FALSE 0.027 82.000 0.000 NA   NA
 23813 23814 AF1955 AF1956 pheS   FALSE 0.028 73.000 0.000 1.000 N NA
 23814 23815 AF1956 AF1957   hgdB FALSE 0.029 47.000 0.000 NA N NA
 23815 23816 AF1957 AF1958 hgdB hgdA TRUE 0.998 -3.000 0.800 NA Y NA
 23816 23817 AF1958 AF1959 hgdA hgdC TRUE 0.994 5.000 0.222 NA N NA
 23818 23819 AF1960 AF1961   pflX FALSE 0.014 243.000 0.000 1.000   NA
 23823 23824 AF1965 AF1966     FALSE 0.158 26.000 0.000 NA   NA
 23824 23825 AF1966 AF1967     TRUE 0.987 -13.000 0.070 NA   NA
 23828 23829 AF1970 AF1971   hsp20-2 FALSE 0.020 107.000 0.000 NA N NA
 23830 23831 AF1972 AF1973     TRUE 0.980 -49.000 0.073 NA   NA
 23832 23833 AF1974 AF1975 hemB hemA TRUE 0.990 -85.000 0.036 0.002 Y NA
 23833 23834 AF1975 AF1976 hemA   FALSE 0.055 100.000 0.000 0.024 N NA
 23835 23836 AF1977 AF1978   cutA FALSE 0.128 28.000 0.000 1.000 N NA
 23836 23837 AF1978 AF1979 cutA   TRUE 0.951 -66.000 0.012 1.000   NA
 23838 23839 AF1980 AF1981 helC   FALSE 0.094 37.000 0.000 0.043 N NA
 23839 23840 AF1981 AF1982     TRUE 0.998 -16.000 0.440 0.063 Y NA
 23840 23841 AF1982 AF1983     TRUE 0.993 -3.000 0.041 1.000 Y NA
 23841 23842 AF1983 AF1984   troR TRUE 0.973 -33.000 0.041