MicrobesOnline Operon Predictions for Lactobacillus plantarum WCFS1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 329225 329226 lp_0001 lp_0002 dnaA dnaN FALSE 0.482 178.000 0.328 1.000 Y 0.233
 329226 329227 lp_0002 lp_0004 dnaN   FALSE 0.009 525.000 0.103 1.000   -0.179
 329227 329228 lp_0004 lp_0005   recF TRUE 0.993 1.000 0.209 1.000   0.805
 329228 329229 lp_0005 lp_0006 recF gyrB TRUE 0.993 -3.000 0.249 0.004 Y 0.546
 329229 329230 lp_0006 lp_0007 gyrB gyrA TRUE 0.905 165.000 0.306 0.002 Y 0.628
 329230 329231 lp_0007 lp_0009 gyrA rpsF FALSE 0.014 623.000 0.003 1.000 N 0.190
 329231 329232 lp_0009 lp_0010 rpsF ssb TRUE 0.979 37.000 0.003 1.000 N 0.908
 329232 329233 lp_0010 lp_0011 ssb rpsR TRUE 0.970 39.000 0.003 1.000 N 0.738
 329233 329234 lp_0011 lp_0012 rpsR   FALSE 0.110 181.000 0.016 1.000 N 0.231
 329234 329235 lp_0012 lp_0013   rplI TRUE 0.990 13.000 0.119 1.000 N 0.738
 329235 329236 lp_0013 lp_0014 rplI dnaC TRUE 0.989 16.000 0.100 1.000 N 0.704
 329236 329237 lp_0014 lp_0015 dnaC   FALSE 0.003 222.000 0.000 1.000 N -0.250
 329237 329238 lp_0015 lp_0016   proB FALSE 0.084 13.000 0.000 1.000 N 0.158
 329238 329239 lp_0016 lp_0017 proB proA TRUE 0.942 19.000 0.281 0.002 Y 0.114
 329239 329240 lp_0017 lp_0018 proA   FALSE 0.013 461.000 0.000 1.000 Y 0.119
 329242 329243 lp_0020 lp_0021 glgB glgC TRUE 0.979 -10.000 0.317 0.001 Y 0.324
 329243 329244 lp_0021 lp_0022 glgC glgD TRUE 0.997 -3.000 0.810 0.001 Y 0.566
 329244 329245 lp_0022 lp_0023 glgD glgA TRUE 0.996 -7.000 0.395 1.000 Y 0.607
 329245 329246 lp_0023 lp_0024 glgA glgP TRUE 0.960 20.000 0.171 1.000 Y 0.305
 329246 329247 lp_0024 lp_0025 glgP amy1 TRUE 0.993 18.000 0.186 0.031 Y 0.619
 329247 329248 lp_0025 lp_0026 amy1   FALSE 0.001 333.000 0.000 1.000   0.180
 329249 329250 lp_0027 lp_0028 pgmB1 map1 TRUE 0.755 18.000 0.038 1.000   0.226
 329250 329251 lp_0028 lp_0030 map1   FALSE 0.007 388.000 0.000 1.000   0.250
 329252 329253 lp_0031 lp_0032 cspL   TRUE 0.840 83.000 0.000 1.000   0.628
 329254 329255 lp_0036 lp_0037 rrp1 hpk1 TRUE 0.996 14.000 0.597 1.000 Y 0.633
 329255 329256 lp_0037 lp_0038 hpk1   TRUE 0.996 -19.000 0.575 NA   0.777
 329256 329257 lp_0038 lp_0039     TRUE 0.990 12.000 0.890 NA   0.498
 329257 329258 lp_0039 lp_0041     FALSE 0.054 358.000 0.176 NA   0.119
 329258 329259 lp_0041 lp_0043   htrA FALSE 0.698 111.000 0.030 1.000   0.478
 329259 329260 lp_0043 lp_0045 htrA   FALSE 0.001 555.000 0.000 NA   0.078
 329260 329261 lp_0045 lp_0046     FALSE 0.001 483.000 0.000 NA   0.230
 329261 329262 lp_0046 lp_0047   aldH FALSE 0.029 64.000 0.000 1.000 N 0.035
 329262 329263 lp_0047 lp_0048 aldH   FALSE 0.003 208.000 0.000 NA N 0.068
 329263 329264 lp_0048 lp_0050   pnb FALSE 0.002 249.000 0.000 NA N -0.310
 329264 329265 lp_0050 lp_0052 pnb   FALSE 0.011 116.000 0.000 1.000 N -0.066
 329266 329267 lp_0053 lp_0054     TRUE 0.863 17.000 0.000 NA   0.420
 329267 329268 lp_0054 lp_0055     FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   -0.106
 329269 329270 lp_0056 lp_0057     FALSE 0.016 92.000 0.000 1.000 N 0.088
 329272 329273 lp_0059 lp_0060 arsC   FALSE 0.266 320.000 0.000 1.000   0.584
 329273 329274 lp_0060 lp_0061     TRUE 0.981 32.000 0.273 1.000   0.571
 329274 329275 lp_0061 lp_0062     TRUE 0.965 28.000 0.273 1.000   0.436
 329275 329276 lp_0062 lp_0063     FALSE 0.261 169.000 0.000 NA N 0.412
 329280 329281 lp_0068 lp_0069   ptp1 FALSE 0.645 149.000 0.000 NA   0.629
 329282 329283 lp_0070 lp_0071     TRUE 0.898 76.000 0.000 NA   0.746
 329283 329284 lp_0071 lp_0072     TRUE 0.860 83.000 0.000 NA   0.679
 329287 329288 lp_0075 lp_0076   fusA1 FALSE 0.033 262.000 0.000 1.000 N 0.258
 329288 329289 lp_0076 lp_0077 fusA1   FALSE 0.092 18.000 0.000 NA   0.206
 329289 329290 lp_0077 lp_0078     TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   0.401
 329290 329291 lp_0078 lp_0080     FALSE 0.331 188.000 0.000 1.000   0.504
 329292 329293 lp_0081 lp_0082     FALSE 0.577 46.000 0.000 NA   0.357
 329300 329301 lp_0096 lp_0098     FALSE 0.460 258.000 0.000 NA   0.722
 329302 329303 lp_0099 lp_0100     FALSE 0.093 21.000 0.000 NA   0.181
 329303 329304 lp_0100 lp_0101     TRUE 0.996 2.000 0.682 0.028 Y 0.587
 329304 329305 lp_0101 lp_0102   cbiM TRUE 0.996 -25.000 0.115 0.007 Y 0.851
 329305 329306 lp_0102 lp_0103 cbiM   TRUE 0.988 15.000 0.010 1.000 N 0.870
 329307 329308 lp_0104 lp_0105     TRUE 0.982 2.000 0.026 NA   0.678
 329308 5937118 lp_0105 lp_0106     TRUE 0.942 31.000 0.000 NA   0.583
 5937118 5937119 lp_0106 lp_0107     TRUE 0.953 39.000 0.000 NA   0.738
 5937119 329309 lp_0107 lp_0108   glpF1 FALSE 0.087 5.000 0.000 NA   0.006
 329309 329310 lp_0108 lp_0109 glpF1   FALSE 0.081 25.000 0.017 1.000   -0.107
 329312 329313 lp_0113 lp_0114 thiM thiD TRUE 0.989 26.000 0.020 0.004 Y 0.725
 329313 329314 lp_0114 lp_0115 thiD thiE TRUE 0.993 -10.000 0.063 0.004 Y 0.682
 329314 329315 lp_0115 lp_0116 thiE   TRUE 0.983 0.000 0.016 1.000 N 0.665
 329315 329316 lp_0116 lp_0117     FALSE 0.206 82.000 0.000 1.000   0.285
 329316 329317 lp_0117 lp_0118     FALSE 0.070 243.000 0.000 NA   0.351
 329319 329320 lp_0120 lp_0121     TRUE 0.933 28.000 0.333 1.000   0.300
 329320 329321 lp_0121 lp_0122   hpo FALSE 0.700 25.000 0.000 NA   0.338
 329324 329325 lp_0126 lp_0127     FALSE 0.028 66.000 0.000 NA   -0.086
 329326 329327 lp_0128 lp_0129   hsp1 FALSE 0.007 146.000 0.000 NA   0.129
 329328 329329 lp_0130 lp_0131     TRUE 0.968 -3.000 0.000 NA   0.617
 329330 329331 lp_0132 lp_0133     FALSE 0.659 25.000 0.000 1.000 N 0.282
 329331 329332 lp_0133 lp_0134     TRUE 0.807 65.000 0.100 1.000 N 0.353
 329332 329333 lp_0134 lp_0135     FALSE 0.008 132.000 0.000 NA   -0.021
 329333 329334 lp_0135 lp_0136     TRUE 0.892 2.000 0.000 NA   0.441
 329334 329335 lp_0136 lp_0137     FALSE 0.487 77.000 0.000 0.049   0.369
 329335 329336 lp_0137 lp_0138     FALSE 0.086 100.000 0.000 NA N 0.222
 329336 329337 lp_0138 lp_0139     FALSE 0.002 305.000 0.000 NA   0.024
 329340 329341 lp_0146 lp_0148     FALSE 0.003 233.000 0.000 1.000 N -0.120
 329341 329342 lp_0148 lp_0149     TRUE 0.995 2.000 0.530 1.000   0.749
 329342 329343 lp_0149 lp_0150     TRUE 0.992 5.000 0.435 NA   0.644
 329343 329344 lp_0150 lp_0151     FALSE 0.020 79.000 0.000 NA   0.207
 329345 329346 lp_0152 lp_0154     FALSE 0.007 145.000 0.000 NA   0.166
 329346 329347 lp_0154 lp_0155     TRUE 0.975 29.000 0.000 NA   0.846
 329347 329348 lp_0155 lp_0156     TRUE 0.980 10.000 0.000 NA   0.926
 329348 329349 lp_0156 lp_0158     FALSE 0.002 323.000 0.000 NA   -0.009
 329349 329350 lp_0158 lp_0159     FALSE 0.005 169.000 0.000 NA   -0.007
 329350 329351 lp_0159 lp_0160     FALSE 0.002 263.000 0.000 1.000 N -0.050
 329351 329352 lp_0160 lp_0161     TRUE 0.992 6.000 0.821 NA N 0.507
 329352 329353 lp_0161 lp_0162     TRUE 0.905 19.000 0.160 NA N 0.237
 329353 329354 lp_0162 lp_0163     FALSE 0.103 168.000 0.000 1.000 N 0.294
 329358 329359 lp_0168 lp_0169 dak1B dak2 TRUE 0.997 14.000 0.316 0.002 Y 0.918
 329359 329360 lp_0169 lp_0170 dak2   TRUE 0.994 -3.000 0.169 1.000   0.932
 329360 329361 lp_0170 lp_0171   gplF2 TRUE 0.992 15.000 0.143 1.000   0.903
 329361 329362 lp_0171 lp_0172 gplF2   FALSE 0.006 151.000 0.000 1.000 N 0.124
 329362 329363 lp_0172 lp_0173     TRUE 0.994 24.000 0.074 0.059 Y 0.834
 329363 329364 lp_0173 lp_0174   agl1 TRUE 0.992 17.000 0.082 1.000 N 0.903
 329364 329365 lp_0174 lp_0175 agl1 malE FALSE 0.602 256.000 0.000 1.000 Y 0.715
 329365 329366 lp_0175 lp_0176 malE malF TRUE 0.983 110.000 0.621 1.000 Y 0.918
 329366 329367 lp_0176 lp_0177 malF malG TRUE 0.998 5.000 0.714 0.051 Y 0.905
 329367 329368 lp_0177 lp_0178 malG malA TRUE 0.978 28.000 0.000 NA   0.926
 329368 329369 lp_0178 lp_0179 malA amy2 TRUE 0.973 34.000 0.000 NA   0.939
 329369 329370 lp_0179 lp_0180 amy2 msmK1 TRUE 0.930 102.000 0.000 1.000 Y 0.941
 329370 329371 lp_0180 lp_0181 msmK1 map2 TRUE 0.988 27.000 0.000 1.000 Y 0.931
 329374 329375 lp_0184 lp_0185 sacK1 pts1BCA TRUE 0.820 134.000 0.000 NA Y 0.657
 329376 329377 lp_0187 lp_0188 sacA sacR TRUE 0.989 -19.000 0.222 1.000 N 0.550
 329377 329378 lp_0188 lp_0189 sacR agl2 TRUE 0.991 21.000 0.222 1.000 N 0.661
 329379 329380 lp_0190 lp_0192   nha1 FALSE 0.034 221.000 0.000 1.000 Y 0.114
 329384 329385 lp_0199 lp_0200     FALSE 0.004 188.000 0.000 1.000   0.015
 329385 329386 lp_0200 lp_0201     FALSE 0.018 206.000 0.000 0.051 Y -0.023
 329386 329387 lp_0201 lp_0202     FALSE 0.422 153.000 0.000 1.000   0.488
 329387 329388 lp_0202 lp_0203   serA1 TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.069   0.669
 329388 329389 lp_0203 lp_0204 serA1 serC TRUE 0.996 16.000 0.238 1.000 Y 0.845
 329390 329391 lp_0205 lp_0206 pgm1   FALSE 0.011 258.000 0.000 1.000   0.246
 329391 329392 lp_0206 lp_0207     FALSE 0.001 501.000 0.000 NA   0.045
 329393 5937120 lp_0208 lp_0209     TRUE 0.885 -13.000 0.000 NA   0.419
 329395 329396 lp_0211 lp_0213     FALSE 0.048 143.000 0.000 NA   0.258
 329396 329397 lp_0213 lp_0214     TRUE 0.993 0.000 0.160 0.094 Y 0.615
 329398 329399 lp_0215 lp_0216   ISP2 FALSE 0.003 210.000 0.000 1.000   -0.121
 329400 329401 lp_0217 lp_0218     TRUE 0.977 9.000 0.122 1.000   0.553
 329401 329402 lp_0218 lp_0219     TRUE 0.981 29.000 0.250 NA   0.550
 329403 329404 lp_0220 lp_0221 gpo   TRUE 0.951 51.000 0.000 1.000   0.846
 329405 329406 lp_0223 lp_0224 greA1   FALSE 0.673 86.000 0.000 NA   0.485
 329406 329407 lp_0224 lp_0225     FALSE 0.084 13.000 0.000 NA   0.210
 329410 329411 lp_0230 lp_0231 pts2CB mtlR TRUE 0.992 37.000 0.336 0.027 N 0.819
 329411 329412 lp_0231 lp_0232 mtlR pts2A TRUE 0.991 15.000 0.066 0.027 N 0.838
 329412 329413 lp_0232 lp_0233 pts2A mtlD TRUE 0.993 2.000 0.031 1.000 Y 0.842
 329418 329419 lp_0240 lp_0242   ndk FALSE 0.542 242.000 0.000 NA   0.828
 329420 329421 lp_0243 lp_0244     FALSE 0.019 300.000 0.000 NA   0.277
 329421 329422 lp_0244 lp_0245     FALSE 0.002 269.000 0.000 NA   0.128
 329422 329423 lp_0245 lp_0247   pts3C FALSE 0.001 521.000 0.000 1.000 N 0.055
 329423 329424 lp_0247 lp_0248 pts3C   TRUE 0.951 10.000 0.000 NA   0.574
 329424 329425 lp_0248 lp_0249     TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   0.519
 329425 329426 lp_0249 lp_0250     TRUE 0.963 -7.000 0.050 1.000   0.474
 329426 329427 lp_0250 lp_0251   selA TRUE 0.934 70.000 0.750 1.000   0.403
 329427 329428 lp_0251 lp_0252 selA   TRUE 0.989 -9.000 0.679 NA   0.464
 329428 329429 lp_0252 lp_0253   kdgK TRUE 0.986 14.000 0.283 NA   0.570
 329430 329431 lp_0254 lp_0255 cysE metC1 TRUE 0.994 5.000 0.076 1.000 Y 0.818
 329431 329432 lp_0255 lp_0256 metC1 cysK TRUE 0.998 12.000 0.690 0.016 Y 0.875
 329432 329433 lp_0256 lp_0257 cysK pepM FALSE 0.001 613.000 0.000 1.000 N -0.052
 329433 329434 lp_0257 lp_0258 pepM   FALSE 0.513 36.000 0.000 NA   0.306
 329435 329436 lp_0259 lp_0260     FALSE 0.071 199.000 0.000 NA   0.328
 329436 329437 lp_0260 lp_0261     TRUE 0.966 -7.000 0.065 NA   0.477
 329437 329438 lp_0261 lp_0262   treR FALSE 0.002 316.000 0.000 NA   -0.113
 329438 329439 lp_0262 lp_0263 treR treA TRUE 0.995 25.000 0.336 1.000 N 0.910
 329439 329440 lp_0263 lp_0264 treA pts4ABC TRUE 0.991 17.000 0.042 1.000 Y 0.711
 329440 329441 lp_0264 lp_0265 pts4ABC pts5ABC TRUE 0.836 220.000 0.188 0.027 Y 0.689
 329443 329444 lp_0267 lp_0268 tagD1 tagF1 TRUE 0.988 25.000 0.000 0.004 Y 0.835
 329444 329445 lp_0268 lp_0269 tagF1 tagF2 TRUE 0.976 41.000 0.000 0.002 Y 0.781
 329445 329446 lp_0269 lp_0271 tagF2 vdcB FALSE 0.377 288.000 0.000 1.000 N 0.622
 329446 329447 lp_0271 lp_0272 vdcB   TRUE 0.989 3.000 0.500 NA   0.534
 329449 329450 lp_0274 lp_0275   mntH1 FALSE 0.519 171.000 0.000 1.000 N 0.565
 329451 329452 lp_0276 lp_0277     FALSE 0.207 56.000 0.000 NA   0.260
 329452 329453 lp_0277 lp_0279     FALSE 0.656 41.000 0.000 NA   0.371
 329453 329454 lp_0279 lp_0280     FALSE 0.096 301.000 0.000 NA   0.414
 329456 329457 lp_0282 lp_0283 hpk2 rrp2 TRUE 0.979 -13.000 0.450 0.094 Y 0.276
 329458 329459 lp_0284 lp_0285     FALSE 0.529 81.000 0.000 NA   0.409
 329459 329460 lp_0285 lp_0286   pts6C FALSE 0.037 302.000 0.000 1.000 N 0.284
 329464 329465 lp_0291 lp_0292     FALSE 0.264 147.000 0.000 NA   0.400
 329465 329466 lp_0292 lp_0293     TRUE 0.932 45.000 0.000 NA   0.675
 329468 329469 lp_0295 lp_0296   tag1 FALSE 0.004 180.000 0.000 1.000   -0.177
 329469 329470 lp_0296 lp_0297 tag1   FALSE 0.002 241.000 0.000 NA   0.135
 329470 329471 lp_0297 lp_0298     FALSE 0.055 323.000 0.000 NA   0.367
 329471 329472 lp_0298 lp_0299     TRUE 0.986 12.000 0.667 1.000 Y 0.387
 329473 329474 lp_0300 lp_0301     TRUE 0.750 96.000 0.000 NA   0.563
 329474 329475 lp_0301 lp_0302     FALSE 0.010 122.000 0.000 NA   -0.097
 329475 329476 lp_0302 lp_0304     FALSE 0.259 1051.000 0.000 0.007   0.760
 329476 329477 lp_0304 lp_0305   gcsH1 FALSE 0.001 405.000 0.000 1.000   0.196
 329477 329478 lp_0305 lp_0306 gcsH1   TRUE 0.869 85.000 0.000 NA   0.716
 329478 329479 lp_0306 lp_0307     TRUE 0.994 -3.000 0.238 NA   0.796
 329479 329480 lp_0307 lp_0308     TRUE 0.985 0.000 0.033 NA   0.713
 329480 329481 lp_0308 lp_0309     FALSE 0.001 420.000 0.000 NA   -0.011
 329484 329485 lp_0312 lp_0313   ndh1 FALSE 0.004 189.000 0.000 1.000 N -0.037
 329485 329486 lp_0313 lp_0314 ndh1   FALSE 0.288 132.000 0.000 NA   0.392
 329487 329488 lp_0315 lp_0316 potD potC TRUE 0.988 -3.000 0.253 0.050 Y 0.460
 329488 329489 lp_0316 lp_0317 potC potB TRUE 0.997 0.000 0.492 0.050 Y 0.694
 329489 329490 lp_0317 lp_0318 potB potA TRUE 0.998 12.000 0.928 0.050 Y 0.703
 329490 329491 lp_0318 lp_0319 potA   TRUE 0.894 71.000 0.326 1.000 N 0.394
 329491 329492 lp_0319 lp_0320     FALSE 0.001 469.000 0.000 NA   -0.188
 329493 329494 lp_0321 lp_0322     TRUE 0.830 4.000 0.000 0.012   0.378
 329494 329495 lp_0322 lp_0324     FALSE 0.449 94.000 0.000 NA   0.400
 329495 329496 lp_0324 lp_0325     FALSE 0.002 261.000 0.000 NA   0.220
 329496 329497 lp_0325 lp_0326     TRUE 0.975 0.000 0.000 1.000 N 0.647
 329497 329498 lp_0326 lp_0327     TRUE 0.917 13.000 0.000 NA   0.487
 329501 329502 lp_0331 lp_0332     FALSE 0.164 170.000 0.000 0.093 N 0.339
 329502 329503 lp_0332 lp_0333     FALSE 0.692 13.000 0.000 NA   0.331
 329504 329505 lp_0334 lp_0335 pepD2   FALSE 0.028 66.000 0.000 NA   0.118
 329505 329506 lp_0335 lp_0336     FALSE 0.009 129.000 0.000 NA   0.159
 329506 329507 lp_0336 lp_0337   birA1 FALSE 0.204 38.000 0.017 1.000   0.122
 329507 329508 lp_0337 lp_0338 birA1   TRUE 0.800 -3.000 0.034 1.000   0.246
 329508 329509 lp_0338 lp_0339     FALSE 0.011 161.000 0.000 1.000   0.233
 329511 329512 lp_0343 lp_0344 tagG tagH TRUE 0.998 13.000 0.808 1.000 Y 0.768
 329512 329513 lp_0344 lp_0346 tagH   FALSE 0.001 379.000 0.000 NA   -0.242
 329513 329514 lp_0346 lp_0347     FALSE 0.003 227.000 0.000 NA   -0.230
 329514 329515 lp_0347 lp_0348     TRUE 0.760 -3.000 0.027 NA   0.238
 329517 329518 lp_0350 lp_0351 hicD1   FALSE 0.399 103.000 0.000 NA   0.395
 329520 329521 lp_0354 lp_0355 rpiA2 sufI FALSE 0.109 150.000 0.000 1.000 N 0.270
 329521 329522 lp_0355 lp_0357 sufI   FALSE 0.195 265.000 0.000 NA   0.479
 329523 329524 lp_0358 lp_0359     FALSE 0.185 31.000 0.000 NA   0.240
 329525 329526 lp_0360 lp_0361     TRUE 0.856 19.000 0.000 NA   0.409
 329526 329527 lp_0361 lp_0362   accB3 FALSE 0.675 104.000 0.000 NA   0.531
 329529 329530 lp_0364 lp_0365     FALSE 0.001 440.000 0.000 NA   -0.063
 329532 329533 lp_0367 lp_0368 choS choQ TRUE 0.911 1.000 0.382 1.000 N 0.082
 329533 329534 lp_0368 lp_0369 choQ gshR1 FALSE 0.486 78.000 0.123 1.000 N 0.127
 329534 329535 lp_0369 lp_0370 gshR1 glpK1 FALSE 0.001 466.000 0.000 1.000 Y -0.469
 329535 329536 lp_0370 lp_0371 glpK1 glpD TRUE 0.994 15.000 0.100 0.001 Y 0.729
 329536 329537 lp_0371 lp_0372 glpD glpF3 TRUE 0.995 15.000 0.350 1.000 N 0.853
 329537 329538 lp_0372 lp_0373 glpF3   FALSE 0.002 587.000 0.000 1.000   0.236
 329538 329539 lp_0373 lp_0374     FALSE 0.093 2.000 0.000 NA   0.174
 329539 329540 lp_0374 lp_0375     TRUE 0.913 15.000 0.000 NA   0.477
 329540 329541 lp_0375 lp_0376     FALSE 0.038 49.000 0.000 NA   0.227
 329541 329542 lp_0376 lp_0377     FALSE 0.013 102.000 0.000 NA   0.070
 329542 329543 lp_0377 lp_0379     FALSE 0.002 304.000 0.000 NA   0.080
 329543 329544 lp_0379 lp_0381     FALSE 0.034 725.000 0.000 NA   0.382
 329544 329545 lp_0381 lp_0382     TRUE 0.753 15.000 0.000 NA   0.355
 329545 329546 lp_0382 lp_0383     FALSE 0.181 117.000 0.000 NA   0.318
 329546 329547 lp_0383 lp_0384     TRUE 0.839 89.000 0.000 NA   0.659
 329547 329548 lp_0384 lp_0385     TRUE 0.960 18.000 0.000 NA   0.595
 329548 329549 lp_0385 lp_0387     FALSE 0.021 450.000 0.000 NA   0.317
 329549 329550 lp_0387 lp_0388     FALSE 0.001 426.000 0.000 NA   0.161
 329550 329551 lp_0388 lp_0391     FALSE 0.001 1271.000 0.000 NA   -0.175
 329552 329553 lp_0393 lp_0394 thgA1   TRUE 0.867 4.000 0.000 1.000   0.422
 329553 329554 lp_0394 lp_0395     TRUE 0.978 4.000 0.000 1.000   0.791
 329554 329555 lp_0395 lp_0396     TRUE 0.926 71.000 0.000 1.000   0.844
 329556 329557 lp_0397 lp_0399   brnQ1 FALSE 0.001 526.000 0.000 1.000   -0.087
 329557 329558 lp_0399 lp_0400 brnQ1 napA1 FALSE 0.715 45.000 0.000 0.092 N 0.373
 329558 329559 lp_0400 lp_0402 napA1   FALSE 0.001 385.000 0.000 NA   -0.040
 329560 329561 lp_0403 lp_0404 plnR plnL FALSE 0.626 25.000 0.000 NA   0.310
 329561 329562 lp_0404 lp_0405 plnL plnK FALSE 0.322 -3.000 0.000 NA   0.245
 329562 329563 lp_0405 lp_0406 plnK plnJ FALSE 0.728 31.000 0.000 NA   0.367
 329564 329565 lp_0409 lp_0410 plnM plnN TRUE 0.764 128.000 0.000 NA   0.713
 329565 329566 lp_0410 lp_0411 plnN plnO FALSE 0.740 118.000 0.000 NA   0.625
 329566 329567 lp_0411 lp_0412 plnO plnP TRUE 0.948 31.000 0.000 NA   0.607
 329567 329568 lp_0412 lp_0413 plnP plnQ FALSE 0.147 354.000 0.000 NA   0.499
 329568 329569 lp_0413 lp_0415 plnQ plnA FALSE 0.035 336.000 0.000 NA   0.336
 329569 329570 lp_0415 lp_0416 plnA plnB FALSE 0.544 191.000 0.000 NA   0.689
 329570 329571 lp_0416 lp_0417 plnB plnC TRUE 0.996 1.000 0.333 NA Y 0.751
 329571 329572 lp_0417 lp_0418 plnC plnD TRUE 0.855 119.000 0.000 0.007 Y 0.639
 329573 329574 lp_0419 lp_0421 plnI plnF FALSE 0.739 99.000 0.000 NA   0.562
 329574 329575 lp_0421 lp_0422 plnF plnE TRUE 0.959 25.000 0.000 NA   0.615
 329576 329577 lp_0423 lp_0424 plnG plnH TRUE 0.868 16.000 0.000 0.065   0.416
 329577 329578 lp_0424 lp_0424a plnH plnS FALSE 0.738 90.000 0.000 NA   0.538
 329578 329579 lp_0424a lp_0425 plnS plnT TRUE 0.962 -154.000 0.000 NA   0.566
 329579 329580 lp_0425 lp_0426 plnT plnU TRUE 0.892 67.000 0.000 NA   0.640
 329580 329581 lp_0426 lp_0428 plnU plnV TRUE 0.805 87.000 0.000 NA   0.596
 329581 329582 lp_0428 lp_0429 plnV plnW TRUE 0.865 94.000 0.000 NA   0.754
 329582 329583 lp_0429 lp_0430 plnW plnX FALSE 0.034 176.000 0.000 NA   0.264
 329583 329584 lp_0430 lp_0431 plnX plnY TRUE 0.896 12.000 0.098 NA   0.325
 329586 329587 lp_0433 lp_0434   trpS FALSE 0.001 440.000 0.000 1.000   0.029
 329587 329588 lp_0434 lp_0435 trpS   FALSE 0.001 408.000 0.000 1.000 N 0.129
 329588 329589 lp_0435 lp_0436   pts7C TRUE 0.887 73.000 0.000 1.000 N 0.635
 329589 329590 lp_0436 lp_0438 pts7C   FALSE 0.585 185.000 0.000 NA   0.721
 329590 329591 lp_0438 lp_0439   pts8C FALSE 0.368 223.000 0.000 NA   0.573
 329591 329592 lp_0439 lp_0440 pts8C pbg1 TRUE 0.981 18.000 0.000 1.000 Y 0.635
 329592 329593 lp_0440 lp_0441 pbg1   TRUE 0.762 121.000 0.000 NA Y 0.538
 329593 329594 lp_0441 lp_0442     FALSE 0.016 150.000 0.000 NA Y -0.020
 329594 329595 lp_0442 lp_0443     FALSE 0.233 113.000 0.000 1.000 N 0.303
 329595 329596 lp_0443 lp_0444     FALSE 0.001 356.000 0.000 NA   -0.019
 329596 329597 lp_0444 lp_0445     TRUE 0.949 5.000 0.000 NA   0.559
 329597 329598 lp_0445 lp_0446   ppx1 FALSE 0.005 170.000 0.000 NA   -0.352
 329598 329599 lp_0446 lp_0447 ppx1 mvaA FALSE 0.711 46.000 0.059 1.000 N 0.248
 329599 329600 lp_0447 lp_0448 mvaA   TRUE 0.966 -7.000 0.065 1.000   0.476
 329600 329601 lp_0448 lp_0449     TRUE 0.989 22.000 0.242 1.000   0.620
 329601 329602 lp_0449 lp_0450     TRUE 0.972 0.000 0.000 NA   0.677
 329602 329603 lp_0450 lp_0452     FALSE 0.001 558.000 0.000 NA   -0.264
 329603 329604 lp_0452 lp_0454   metS FALSE 0.037 322.000 0.000 1.000 N 0.298
 329604 329605 lp_0454 lp_0455 metS   FALSE 0.003 232.000 0.000 1.000 N -0.347
 329605 329606 lp_0455 lp_0456     FALSE 0.010 123.000 0.000 NA N -0.340
 329606 329607 lp_0456 lp_0457     TRUE 0.993 -13.000 0.058 NA Y 0.698
 329607 329608 lp_0457 lp_0458     TRUE 0.989 -3.000 0.093 1.000 N 0.661
 329608 329609 lp_0458 lp_0459     FALSE 0.158 105.000 0.035 NA   0.154
 329609 329610 lp_0459 lp_0460   ispE FALSE 0.471 133.000 0.046 NA   0.384
 329610 329611 lp_0460 lp_0461 ispE   FALSE 0.002 310.000 0.000 NA   -0.025
 329611 329612 lp_0461 lp_0463     FALSE 0.002 268.000 0.000 NA   -0.127
 329612 329613 lp_0463 lp_0464     TRUE 0.983 -13.000 0.379 1.000 Y 0.366
 329613 329614 lp_0464 lp_0466   purR FALSE 0.001 356.000 0.017 1.000 N -0.140
 329614 329615 lp_0466 lp_0467 purR glmU TRUE 0.955 69.000 0.021 1.000 N 0.799
 329615 329616 lp_0467 lp_0469 glmU bla1 FALSE 0.056 236.000 0.000 1.000 N 0.292
 329616 329617 lp_0469 lp_0471 bla1 prs1 FALSE 0.142 366.000 0.000 1.000 N 0.467
 329617 329618 lp_0471 lp_0472 prs1   FALSE 0.002 288.000 0.000 NA   -0.028
 329618 329619 lp_0472 lp_0473     TRUE 0.782 83.000 0.000 NA   0.557
 329620 329621 lp_0475 lp_0476     TRUE 0.987 20.000 0.011 1.000   0.887
 329621 329622 lp_0476 lp_0477     TRUE 0.868 15.000 0.082 0.033   0.265
 329623 329624 lp_0479 lp_0480   rpoE TRUE 0.787 45.000 0.122 NA   0.296
 329624 329625 lp_0480 lp_0481 rpoE pyrG FALSE 0.366 173.000 0.029 1.000 N 0.404
 329627 329628 lp_0483 lp_0484   rimK TRUE 0.802 3.000 0.000 1.000   0.371
 329628 329629 lp_0484 lp_0485 rimK   TRUE 0.979 -16.000 0.000 0.033   0.699
 329629 329630 lp_0485 lp_0486     TRUE 0.967 0.000 0.000 0.015   0.604
 329630 329631 lp_0486 lp_0487   argC1 TRUE 0.975 -3.000 0.000 1.000 N 0.635
 329631 329632 lp_0487 lp_0488 argC1   TRUE 0.986 0.000 0.000 0.054 Y 0.695
 329632 5937121 lp_0488 lp_0489   tkt1-N TRUE 0.977 -10.000 0.000 NA   0.704
 5937121 329633 lp_0489 lp_0490 tkt1-N   TRUE 0.963 -4.000 0.000 NA   0.582
 329633 5937122 lp_0490 lp_0491   tkt1-C TRUE 0.947 -22.000 0.000 NA   0.513
 5937122 329634 lp_0491 lp_0492 tkt1-C   TRUE 0.870 8.000 0.000 NA   0.433
 329634 329635 lp_0492 lp_0493     FALSE 0.176 -3.000 0.000 1.000   0.232
 329637 329638 lp_0496 lp_0497   deoC FALSE 0.064 32.000 0.000 NA   0.027
 329638 329639 lp_0497 lp_0498 deoC   TRUE 0.938 69.000 0.000 1.000 N 0.828
 329639 329640 lp_0498 lp_0499     TRUE 0.995 -3.000 0.464 1.000   0.742
 329640 329641 lp_0499 lp_0500   rbsK1 TRUE 0.986 13.000 0.060 1.000   0.743
 329641 329642 lp_0500 lp_0501 rbsK1 serS1 FALSE 0.204 696.000 0.000 1.000 N 0.618
 329642 329643 lp_0501 lp_0502 serS1 sdaC FALSE 0.001 352.000 0.000 1.000 N 0.091
 329643 329644 lp_0502 lp_0505 sdaC sdhB FALSE 0.272 370.000 0.000 1.000   0.637
 329644 329645 lp_0505 lp_0506 sdhB sdhA TRUE 0.994 19.000 0.324 0.001   0.710
 329645 329646 lp_0506 lp_0507 sdhA   FALSE 0.510 151.000 0.000 NA   0.535
 329646 329647 lp_0507 lp_0509     FALSE 0.001 579.000 0.000 NA   -0.015
 329647 329648 lp_0509 lp_0510   murA1 FALSE 0.001 543.000 0.000 NA   -0.169
 329648 329649 lp_0510 lp_0511 murA1 rho TRUE 0.934 30.000 0.022 1.000 N 0.450
 329649 329650 lp_0511 lp_0512 rho rpmE TRUE 0.859 127.000 0.049 1.000 N 0.667
 329652 329653 lp_0514 lp_0515 srtA   FALSE 0.476 109.000 0.008 NA   0.385
 329653 329654 lp_0515 lp_0516   htpX TRUE 0.983 12.000 0.222 NA   0.565
 329654 329655 lp_0516 lp_0517 htpX   TRUE 0.830 61.000 0.049 NA   0.430
 329655 329656 lp_0517 lp_0518   murF FALSE 0.322 222.000 0.078 NA   0.424
 329656 329657 lp_0518 lp_0520 murF rhe1 FALSE 0.402 255.000 0.021 1.000 N 0.521
 329657 329658 lp_0520 lp_0522 rhe1 acpS FALSE 0.177 1025.000 0.025 1.000 N 0.512
 329658 329659 lp_0522 lp_0523 acpS alr TRUE 0.833 0.000 0.093 1.000 N 0.165
 329659 329660 lp_0523 lp_0524 alr   FALSE 0.008 409.000 0.052 1.000 N -0.242
 329660 329661 lp_0524 lp_0525   kup1 FALSE 0.091 292.000 0.000 1.000 N 0.374
 329662 329663 lp_0526 lp_0527 carB carA TRUE 0.983 -7.000 0.017 0.002 Y 0.526
 329664 329665 lp_0528 lp_0529 argC2 argJ TRUE 0.991 25.000 0.303 0.004 Y 0.535
 329665 329666 lp_0529 lp_0530 argJ argB TRUE 0.983 16.000 0.067 0.004 Y 0.518
 329666 329667 lp_0530 lp_0531 argB argD TRUE 0.991 -3.000 0.322 1.000 Y 0.503
 329667 329668 lp_0531 lp_0532 argD argF TRUE 0.969 -7.000 0.000 1.000 Y 0.505
 329668 329669 lp_0532 lp_0533 argF   FALSE 0.012 109.000 0.000 NA   -0.012
 329670 329671 lp_0535 lp_0536     FALSE 0.009 155.000 0.059 NA   -0.162
 329671 329672 lp_0536 lp_0537   ldhL1 FALSE 0.003 218.000 0.000 NA   -0.148
 329673 329674 lp_0538 lp_0539 pth mfd TRUE 0.962 20.000 0.137 1.000 N 0.416
 329674 329675 lp_0539 lp_0540 mfd   TRUE 0.764 175.000 0.033 1.000   0.817
 329675 329676 lp_0540 lp_0541     TRUE 0.990 -3.000 0.034 1.000   0.860
 329676 329677 lp_0541 lp_0542     TRUE 0.842 121.000 0.053 1.000 N 0.595
 329677 329678 lp_0542 lp_0543     TRUE 0.891 125.000 0.134 1.000 N 0.651
 329678 329679 lp_0543 lp_0545   mesJ FALSE 0.015 284.000 0.031 1.000 N 0.011
 329679 329680 lp_0545 lp_0546 mesJ hprT TRUE 0.919 20.000 0.000 0.054 N 0.440
 329680 329681 lp_0546 lp_0547 hprT ftsH FALSE 0.664 79.000 0.000 1.000 N 0.437
 329681 329682 lp_0547 lp_0548 ftsH hsp33 FALSE 0.419 149.000 0.041 1.000 Y 0.270
 329682 329683 lp_0548 lp_0549 hsp33   TRUE 0.985 0.000 0.034 1.000 N 0.657
 329683 329684 lp_0549 lp_0550   lysS FALSE 0.496 104.000 0.032 1.000 Y 0.225
 329684 2208811 lp_0550 lp_rRNA01 lysS   FALSE 0.040 598.000 0.000 NA   NA
 2208811 401548 lp_rRNA01 lp_tRNA02   tRNA-Ile FALSE 0.470 85.000 0.000 NA   NA
 401548 401549 lp_tRNA02 lp_tRNA03 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.698 42.000 0.000 NA   NA
 401549 2208812 lp_tRNA03 lp_rRNA02 tRNA-Ala   FALSE 0.201 162.000 0.000 NA   NA
 2208812 2208813 lp_rRNA02 lp_rRNA03     FALSE 0.552 71.000 0.000 NA   NA
 2208813 401550 lp_rRNA03 lp_tRNA04   tRNA-Asn TRUE 0.825 5.000 0.000 NA   NA
 401550 401551 lp_tRNA04 lp_tRNA05 tRNA-Asn tRNA-Thr FALSE 0.671 46.000 0.000 NA   NA
 401551 329685 lp_tRNA05 lp_0551 tRNA-Thr dtpT FALSE 0.039 642.000 0.000 NA   NA
 329685 329686 lp_0551 lp_0552 dtpT   TRUE 0.843 55.000 0.250 1.000   0.303
 329686 401552 lp_0552 lp_tRNA06   tRNA-Tyr FALSE 0.521 76.000 0.000 NA   NA
 401552 401553 lp_tRNA06 lp_tRNA07 tRNA-Tyr tRNA-Gln TRUE 0.816 10.000 0.000 NA   NA
 401553 329687 lp_tRNA07 lp_0554 tRNA-Gln   FALSE 0.072 321.000 0.000 NA   NA
 329687 329688 lp_0554 lp_0555     FALSE 0.468 174.000 0.000 NA   0.568
 329688 329689 lp_0555 lp_0556     TRUE 0.941 31.000 0.000 NA   0.581
 329689 329690 lp_0556 lp_0557     TRUE 0.905 35.000 0.000 NA   0.525
 329691 329692 lp_0558 lp_0559     FALSE 0.183 193.000 0.014 1.000 N 0.322
 329693 329694 lp_0561 lp_0562 proC nagA FALSE 0.642 79.000 0.026 1.000 N 0.351
 329694 329695 lp_0562 lp_0563 nagA   TRUE 0.990 15.000 0.125 1.000 N 0.708
 329697 329698 lp_0565 lp_0566 nadC1 nadE TRUE 0.942 0.000 0.194 0.003 Y 0.174
 329698 329699 lp_0566 lp_0567 nadE pacL2 FALSE 0.001 456.000 0.013 1.000 N -0.111
 329699 329700 lp_0567 lp_0568 pacL2   TRUE 0.825 55.000 0.159 NA   0.336
 329700 329701 lp_0568 lp_0569   tex FALSE 0.002 294.000 0.009 NA   -0.104
 329701 329702 lp_0569 lp_0570 tex   TRUE 0.991 0.000 0.215 NA   0.706
 329702 329703 lp_0570 lp_0571   hom2 TRUE 0.764 66.000 0.000 NA   0.478
 329703 329704 lp_0571 lp_0572 hom2 thrB TRUE 0.975 9.000 0.036 1.000 Y 0.496
 329704 401554 lp_0572 lp_tRNA08 thrB tRNA-Leu FALSE 0.034 56.000 0.000 NA   -0.122
 401554 329705 lp_tRNA08 lp_0574 tRNA-Leu   FALSE 0.101 229.000 0.000 NA   0.379
 329705 329706 lp_0574 lp_0575   pts9AB FALSE 0.002 291.000 0.000 NA   0.067
 329706 329707 lp_0575 lp_0576 pts9AB pts9C TRUE 0.998 38.000 0.943 0.028 Y 0.976
 329707 329708 lp_0576 lp_0577 pts9C pts9D TRUE 0.999 18.000 0.812 0.028 Y 0.958
 329708 329709 lp_0577 lp_0578 pts9D npsA FALSE 0.072 128.000 0.000 1.000 N 0.231
 329709 329710 lp_0578 lp_0579 npsA panD TRUE 0.966 23.000 0.000 1.000 N 0.603
 329710 329711 lp_0579 lp_0580 panD   TRUE 0.791 -3.000 0.000 1.000 Y 0.227
 329711 329712 lp_0580 lp_0581   npsB TRUE 0.933 -7.000 0.000 0.032 N 0.445
 329712 329713 lp_0581 lp_0582 npsB npsC TRUE 0.940 -3.000 0.000 1.000 N 0.478
 329713 329714 lp_0582 lp_0583 npsC   FALSE 0.017 87.000 0.000 NA   -0.040
 329714 329715 lp_0583 lp_0584     FALSE 0.010 123.000 0.000 NA   0.130
 329715 329716 lp_0584 lp_0585     FALSE 0.023 72.000 0.000 0.089   0.044
 329716 329717 lp_0585 lp_0586   pts10A TRUE 0.893 71.000 0.000 0.035 N 0.616
 329717 329718 lp_0586 lp_0587 pts10A pts10B TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.028 Y 0.772
 329718 329719 lp_0587 lp_0588 pts10B fabH1 FALSE 0.237 164.000 0.000 1.000 N 0.390
 329719 329720 lp_0588 lp_0589 fabH1 accB1 TRUE 0.982 11.000 0.000 NA Y 0.702
 329720 329721 lp_0589 lp_0590 accB1 accC1 TRUE 0.986 3.000 0.000 NA Y 0.752
 329721 329722 lp_0590 lp_0591 accC1 accD1 TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.003 Y 0.655
 329722 329723 lp_0591 lp_0592 accD1 accA1 TRUE 0.997 -7.000 0.234 0.003 Y 0.747
 329725 329726 lp_0594 lp_0595 mleP1   FALSE 0.118 433.000 0.000 1.000   0.490
 329726 329727 lp_0595 lp_0597   pgm2 FALSE 0.006 150.000 0.000 1.000   0.114
 329727 329728 lp_0597 lp_0600 pgm2 zmp2 FALSE 0.001 420.000 0.000 1.000   0.197
 329729 329730 lp_0601 lp_0602 pepC1 rpiA1 FALSE 0.472 76.000 0.008 1.000 N 0.268
 329730 329731 lp_0602 lp_0603 rpiA1   TRUE 0.978 9.000 0.000 1.000   0.832
 329732 329733 lp_0604 lp_0606 dut radA FALSE 0.003 889.000 0.028 1.000 N -0.046
 329733 329734 lp_0606 lp_0607 radA   TRUE 0.792 16.000 0.056 NA   0.238
 329734 329735 lp_0607 lp_0609   gltX FALSE 0.154 326.000 0.021 NA   0.423
 329735 329736 lp_0609 lp_0610 gltX cysS FALSE 0.083 278.000 0.013 1.000 Y 0.163
 329736 329737 lp_0610 lp_0611 cysS   TRUE 0.992 2.000 0.129 1.000   0.848
 329737 329738 lp_0611 lp_0612   trmH TRUE 0.993 -10.000 0.150 0.004   0.771
 329738 329739 lp_0612 lp_0613 trmH   TRUE 0.989 2.000 0.109 NA   0.739
 329739 329740 lp_0613 lp_0614   sigH FALSE 0.346 507.000 0.021 NA   0.722
 329740 329741 lp_0614 lp_0615 sigH rpmG TRUE 0.880 62.000 0.049 1.000 N 0.459
 329741 329742 lp_0615 lp_0616 rpmG secE TRUE 0.913 12.000 0.080 1.000 N 0.337
 329742 329743 lp_0616 lp_0617 secE nusG TRUE 0.762 105.000 0.843 1.000 N 0.179
 329743 329744 lp_0617 lp_0618 nusG   TRUE 0.976 28.000 0.000 NA   0.850
 329744 329745 lp_0618 lp_0619   rplK FALSE 0.151 109.000 0.000 NA   0.298
 329745 329746 lp_0619 lp_0620 rplK rplA TRUE 0.931 101.000 0.838 0.026 Y 0.377
 329746 329747 lp_0620 lp_0621 rplA rplJ TRUE 0.908 199.000 0.302 0.026 Y 0.809
 329747 329748 lp_0621 lp_0622 rplJ rplL TRUE 0.994 62.000 0.884 0.020 Y 0.737
 329749 401618 lp_0624 lp_tRNA09   tRNA-Gly FALSE 0.497 80.000 0.000 NA   NA
 401618 329750 lp_tRNA09 lp_0625 tRNA-Gly   TRUE 0.789 30.000 0.000 NA   NA
 329750 329751 lp_0625 lp_0627     FALSE 0.045 490.000 0.000 NA   NA
 329751 401616 lp_0627 lp_tRNA10   tRNA-Ile TRUE 0.809 26.000 0.000 NA   NA
 401616 329752 lp_tRNA10 lp_0628 tRNA-Ile   TRUE 0.780 31.000 0.000 NA   NA
 329752 329753 lp_0628 lp_0629     FALSE 0.070 30.000 0.000 NA   0.013
 329753 329754 lp_0629 lp_0630     FALSE 0.023 73.000 0.000 NA   -0.042
 329754 329755 lp_0630 lp_0631     TRUE 0.924 12.000 0.000 1.000   0.503
 329757 329758 lp_0633 lp_0634     TRUE 0.933 38.000 0.000 NA   0.614
 329759 329760 lp_0635 lp_0636     FALSE 0.459 159.000 0.000 NA   0.527
 329760 329761 lp_0636 lp_0637     TRUE 0.848 61.000 0.000 NA   0.540
 329761 329762 lp_0637 lp_0638     TRUE 0.948 6.000 0.000 NA   0.559
 329762 329763 lp_0638 lp_0640     FALSE 0.308 321.000 0.000 NA   0.634
 329763 329764 lp_0640 lp_0641     TRUE 0.961 -3.000 0.000 NA   0.574
 329764 329765 lp_0641 lp_0642     TRUE 0.983 -76.000 0.500 0.056   0.419
 329765 329766 lp_0642 lp_0643     TRUE 0.938 82.000 0.154 NA   0.642
 329766 329767 lp_0643 lp_0644     TRUE 0.978 -3.000 0.000 NA   0.739
 329767 329768 lp_0644 lp_0645     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 329768 329769 lp_0645 lp_0646     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   0.524
 329769 329770 lp_0646 lp_0647     TRUE 0.927 -7.000 0.000 NA   0.470
 329770 329771 lp_0647 lp_0648     TRUE 0.892 -3.000 0.000 NA   0.432
 329771 329772 lp_0648 lp_0649     TRUE 0.961 3.000 0.000 NA   0.600
 329772 329773 lp_0649 lp_0650     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   0.552
 329773 329774 lp_0650 lp_0651     TRUE 0.912 0.000 0.000 NA   0.461
 329774 329775 lp_0651 lp_0652     TRUE 0.758 14.000 0.000 NA   0.357
 329775 329776 lp_0652 lp_0653     FALSE 0.685 -7.000 0.000 NA   0.307
 329776 329777 lp_0653 lp_0654     TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA   0.528
 329777 329778 lp_0654 lp_0655     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   0.483
 329778 329779 lp_0655 lp_0656     FALSE 0.040 128.000 0.000 NA   0.247
 329779 401555 lp_0656 lp_tRNA11   tRNA-Asn FALSE 0.319 124.000 0.000 NA   NA
 401555 329780 lp_tRNA11 lp_0658 tRNA-Asn   FALSE 0.169 176.000 0.000 NA   NA
 329780 329781 lp_0658 lp_0659     FALSE 0.026 68.000 0.000 NA   -0.011
 329781 329782 lp_0659 lp_0660     TRUE 0.850 40.000 0.000 NA   0.481
 329782 329783 lp_0660 lp_0661     TRUE 0.973 -16.000 0.000 0.002   0.618
 329783 329784 lp_0661 lp_0662     TRUE 0.993 -10.000 0.429 NA   0.602
 329784 329785 lp_0662 lp_0663     TRUE 0.993 0.000 0.571 NA   0.606
 329785 329786 lp_0663 lp_0664     FALSE 0.662 108.000 0.000 NA   0.532
 329786 329787 lp_0664 lp_0665     TRUE 0.954 14.000 0.115 NA   0.436
 329787 329788 lp_0665 lp_0666     TRUE 0.992 15.000 0.750 NA   0.540
 329788 329789 lp_0666 lp_0667     TRUE 0.993 5.000 0.750 NA   0.578
 329789 329790 lp_0667 lp_0668     TRUE 0.994 -10.000 0.500 NA   0.619
 329790 329791 lp_0668 lp_0669     TRUE 0.985 1.000 0.333 NA   0.520
 329791 329792 lp_0669 lp_0670     TRUE 0.992 12.000 0.500 NA   0.635
 329792 329793 lp_0670 lp_0671     TRUE 0.988 18.000 0.235 NA   0.596
 329793 329794 lp_0671 lp_0672     FALSE 0.691 69.000 0.000 NA   0.444
 329794 329795 lp_0672 lp_0673     TRUE 0.940 0.000 0.000 NA   0.514
 329795 329796 lp_0673 lp_0674     TRUE 0.934 -6.000 0.000 NA   0.490
 329796 329797 lp_0674 lp_0675     FALSE 0.350 0.000 0.000 1.000   0.246
 329797 329798 lp_0675 lp_0676     TRUE 0.963 5.000 0.000 1.000 N 0.588
 329798 329799 lp_0676 lp_0677     TRUE 0.961 15.000 0.000 NA   0.614
 329799 329800 lp_0677 lp_0678     TRUE 0.918 6.000 0.000 NA   0.489
 329800 329801 lp_0678 lp_0679     TRUE 0.961 1.000 0.000 NA   0.590
 329801 329802 lp_0679 lp_0680     TRUE 0.972 0.000 0.000 NA   0.671
 329802 329803 lp_0680 lp_0681     TRUE 0.952 -22.000 0.000 NA   0.529
 329803 329804 lp_0681 lp_0682     TRUE 0.877 1.000 0.000 NA   0.424
 329804 329805 lp_0682 lp_0683     TRUE 0.802 -13.000 0.000 NA   0.357
 5937123 5937124 lp_0686 lp_0687     TRUE 0.941 57.000 0.000 NA   0.809
 329807 329808 lp_0688 lp_0689     TRUE 0.962 13.000 0.000 1.000   0.624
 329810 329811 lp_0691 lp_0692   nrdF TRUE 0.903 82.000 0.000 NA   0.833
 329811 329812 lp_0692 lp_0693 nrdF nrdE TRUE 0.997 28.000 0.500 0.001 Y 0.805
 329812 329813 lp_0693 lp_0694 nrdE nrdH TRUE 0.913 139.000 0.562 1.000 N 0.574
 329814 329815 lp_0695 lp_0696 rsmc   TRUE 0.976 3.000 0.015 1.000 Y 0.513
 329815 329816 lp_0696 lp_0698   dnaX FALSE 0.013 527.000 0.018 1.000 N 0.130
 329816 329817 lp_0698 lp_0699 dnaX   TRUE 0.975 22.000 0.100 NA   0.530
 329817 329818 lp_0699 lp_0700   recR TRUE 0.995 16.000 0.604 NA   0.750
 329818 329819 lp_0700 lp_0701 recR   TRUE 0.981 15.000 0.071 NA   0.618
 329819 329820 lp_0701 lp_0703   tmk FALSE 0.001 398.000 0.016 NA   -0.219
 329820 329821 lp_0703 lp_0704 tmk   TRUE 0.977 -3.000 0.033 NA   0.575
 329821 329822 lp_0704 lp_0705   holB TRUE 0.962 17.000 0.040 NA   0.507
 329822 329823 lp_0705 lp_0706 holB   TRUE 0.913 25.000 0.038 NA   0.403
 329823 329824 lp_0706 lp_0707     TRUE 0.853 99.000 0.043 NA   0.585
 329824 329825 lp_0707 lp_0708   fat TRUE 0.971 4.000 0.021 1.000   0.576
 329825 329826 lp_0708 lp_0709 fat galE1 FALSE 0.097 139.000 0.000 1.000 N 0.251
 329827 329828 lp_0710 lp_0711 phnW phnX TRUE 0.906 22.000 0.315 0.064   0.174
 329828 329829 lp_0711 lp_0712 phnX phnE1 TRUE 0.970 25.000 0.012 1.000   0.605
 329829 329830 lp_0712 lp_0713 phnE1 phnE2 TRUE 0.997 -3.000 0.800 1.000 Y 0.572
 329830 329831 lp_0713 lp_0714 phnE2 phnC TRUE 0.992 5.000 0.217 0.001 Y 0.566
 329831 329832 lp_0714 lp_0715 phnC phnD TRUE 0.966 38.000 0.117 0.001 Y 0.456
 329833 329834 lp_0717 lp_0718 gpp rimI1 TRUE 0.906 81.000 0.026 1.000   0.653
 329834 329835 lp_0718 lp_0720 rimI1 rimI2 TRUE 0.898 -7.000 0.013 0.001   0.354
 329835 329836 lp_0720 lp_0721 rimI2 gcp FALSE 0.627 5.000 0.030 1.000   0.181
 329840 329841 lp_0727 lp_0728 groES groEL TRUE 0.989 56.000 0.160 0.007 Y 0.861
 329841 329842 lp_0728 lp_0729 groEL   FALSE 0.006 250.000 0.000 1.000 N 0.189
 329842 329843 lp_0729 lp_0730   tagO FALSE 0.267 216.000 0.019 1.000 N 0.407
 329843 329844 lp_0730 lp_0733 tagO pstF FALSE 0.008 325.000 0.000 1.000 N 0.206
 329846 329847 lp_0735 lp_0736 comFA comFC TRUE 0.983 -40.000 0.130 1.000   0.541
 329847 329848 lp_0736 lp_0737 comFC   FALSE 0.136 134.000 0.080 NA   0.101
 329848 329849 lp_0737 lp_0739   secA FALSE 0.006 387.000 0.041 NA N -0.136
 329849 329850 lp_0739 lp_0740 secA prfB-N FALSE 0.707 106.000 0.000 NA   0.560
 329850 329851 lp_0740 lp_0741 prfB-N prfB-C TRUE 0.985 -31.000 0.000 NA   0.884
 329851 329852 lp_0741 lp_0742 prfB-C   FALSE 0.254 184.000 0.002 1.000   0.410
 329852 329853 lp_0742 lp_0743   rrp3 TRUE 0.988 0.000 0.188 1.000   0.603
 329853 329854 lp_0743 lp_0744 rrp3 hpk3 TRUE 0.991 -7.000 0.164 1.000 Y 0.548
 329854 329855 lp_0744 lp_0746 hpk3 pstE FALSE 0.107 344.000 0.217 1.000 N 0.183
 329855 329856 lp_0746 lp_0747 pstE pstD TRUE 0.995 11.000 0.206 1.000 Y 0.744
 329856 329857 lp_0747 lp_0748 pstD pstC TRUE 0.999 -10.000 0.907 0.003 Y 0.882
 329857 329858 lp_0748 lp_0749 pstC pstB TRUE 0.980 15.000 0.490 0.003 Y 0.336
 329858 329859 lp_0749 lp_0750 pstB pstA TRUE 0.990 12.000 0.542 0.001 Y 0.447
 329859 329860 lp_0750 lp_0751 pstA phoU TRUE 0.974 13.000 0.413 NA Y 0.313
 329860 329861 lp_0751 lp_0752 phoU   FALSE 0.309 100.000 0.027 NA N 0.211
 329861 329862 lp_0752 lp_0753     TRUE 0.906 22.000 0.103 NA   0.323
 329862 329863 lp_0753 lp_0754   hprK FALSE 0.614 146.000 0.215 NA   0.400
 329863 329864 lp_0754 lp_0755 hprK lgt TRUE 0.994 19.000 0.494 1.000 N 0.623
 329864 329865 lp_0755 lp_0756 lgt gspA TRUE 0.991 18.000 0.067 1.000 N 0.844
 329865 329866 lp_0756 lp_0757 gspA galU TRUE 0.857 44.000 0.035 1.000 N 0.400
 329868 329869 lp_0760 lp_0761 nox1 trxB1 FALSE 0.003 193.000 0.000 0.029   0.093
 329870 329871 lp_0762 lp_0763     TRUE 0.985 1.000 0.083 NA   0.642
 329876 329877 lp_0770 lp_0771     FALSE 0.012 106.000 0.000 1.000   0.178
 329877 329878 lp_0771 lp_0772   uvrB FALSE 0.232 149.000 0.002 1.000   0.334
 329878 329879 lp_0772 lp_0773 uvrB uvrA1 TRUE 0.990 35.000 0.154 0.001 Y 0.655
 329879 329880 lp_0773 lp_0774 uvrA1 luxS TRUE 0.848 61.000 0.002 1.000 N 0.466
 329880 329881 lp_0774 lp_0775 luxS argG FALSE 0.011 338.000 0.000 1.000 N 0.225
 329881 329882 lp_0775 lp_0776 argG argH TRUE 0.996 0.000 0.278 1.000 Y 0.796
 329882 329883 lp_0776 lp_0778 argH   FALSE 0.003 202.000 0.000 NA   0.077
 329883 329884 lp_0778 lp_0779     FALSE 0.023 197.000 0.081 NA   -0.108
 329884 329885 lp_0779 lp_0780     TRUE 0.992 -3.000 0.214 NA   0.735
 329885 329886 lp_0780 lp_0781     TRUE 0.949 13.000 0.470 NA   0.283
 329886 329887 lp_0781 lp_0783     FALSE 0.017 425.000 0.000 NA   0.299
 329888 329889 lp_0785 lp_0786 serA2 clpP FALSE 0.005 159.000 0.000 1.000 N 0.179
 329889 401615 lp_0786 lp_tRNA12 clpP tRNA-Arg FALSE 0.001 816.000 0.000 NA   0.031
 329890 329891 lp_0787 lp_0788 rpoN cggR FALSE 0.089 217.000 0.050 1.000 Y -0.095
 329891 329892 lp_0788 lp_0789 cggR gapB FALSE 0.430 67.000 0.109 1.000 N 0.005
 329892 329893 lp_0789 lp_0790 gapB pgk TRUE 0.905 121.000 0.013 0.006 Y 0.695
 329893 329894 lp_0790 lp_0791 pgk tpiA TRUE 0.994 27.000 0.141 1.000 Y 0.817
 329894 329895 lp_0791 lp_0792 tpiA enoA1 TRUE 0.961 82.000 0.018 1.000 Y 0.837
 329895 329896 lp_0792 lp_0793 enoA1   FALSE 0.002 291.000 0.000 NA   0.082
 329896 329897 lp_0793 lp_0794   eriC FALSE 0.089 17.000 0.000 NA   0.142
 329897 329898 lp_0794 lp_0795 eriC secG FALSE 0.525 100.000 0.002 1.000 N 0.367
 329898 329899 lp_0795 lp_0796 secG   TRUE 0.889 49.000 0.007 1.000   0.505
 329899 329900 lp_0796 lp_0797     TRUE 0.852 9.000 0.015 1.000   0.351
 329900 329901 lp_0797 lp_0799   smpB TRUE 0.966 26.000 0.143 0.022 N 0.444
 329901 329902 lp_0799 lp_0800 smpB   FALSE 0.001 460.000 0.000 1.000   -0.299
 329902 329903 lp_0800 lp_0802   glnPH1 FALSE 0.001 393.000 0.000 1.000   -0.047
 329903 329904 lp_0802 lp_0803 glnPH1 glnQ1 TRUE 0.985 3.000 0.000 1.000 Y 0.710
 329905 329906 lp_0804 lp_0805     TRUE 0.991 24.000 0.182 NA   0.798
 329907 329908 lp_0806 lp_0807 ung pta TRUE 0.951 24.000 0.092 1.000 N 0.416
 329908 329909 lp_0807 lp_0809 pta   FALSE 0.011 110.000 0.023 NA   -0.179
 329909 329910 lp_0809 lp_0810     TRUE 0.975 6.000 0.033 NA   0.600
 329911 329912 lp_0811 lp_0812   exoA FALSE 0.390 78.000 0.011 0.054 Y 0.045
 329913 329914 lp_0813 lp_0814   murB FALSE 0.072 172.000 0.009 1.000   0.227
 329914 329915 lp_0814 lp_0815 murB   TRUE 0.976 34.000 0.014 1.000 N 0.720
 329915 329916 lp_0815 lp_0816     FALSE 0.008 139.000 0.000 1.000 N -0.357
 329918 329919 lp_0818 lp_0819     TRUE 0.995 -3.000 0.502 NA   0.709
 329919 329920 lp_0819 lp_0820   glmM TRUE 0.966 32.000 0.150 NA   0.513
 329920 329921 lp_0820 lp_0822 glmM glmS1 FALSE 0.006 538.000 0.030 1.000 N 0.006
 329921 329922 lp_0822 lp_0823 glmS1   FALSE 0.384 194.000 0.000 NA N 0.521
 329922 329923 lp_0823 lp_0824     FALSE 0.066 131.000 0.000 NA   0.263
 329924 329925 lp_0825 lp_0826   galM1 FALSE 0.118 336.000 0.000 1.000   0.456
 329926 329927 lp_0827 lp_0828     FALSE 0.025 246.000 0.000 NA   0.273
 329927 329928 lp_0828 lp_0829     FALSE 0.124 1.000 0.000 NA   0.232
 329928 5937125 lp_0829 lp_0830     FALSE 0.002 294.000 0.000 NA   0.034
 5937125 5937126 lp_0830 lp_0831     TRUE 0.953 13.000 0.000 NA   0.577
 329930 401556 lp_0835 lp_tRNA13   tRNA-Asn FALSE 0.705 98.000 0.000 NA   0.533
 401556 329931 lp_tRNA13 lp_0836 tRNA-Asn nrpR1 FALSE 0.062 225.000 0.000 NA   0.331
 329931 329932 lp_0836 lp_0837 nrpR1   FALSE 0.002 269.000 0.000 NA   0.082
 329933 329934 lp_0838 lp_0840     FALSE 0.011 116.000 0.000 NA   -0.233
 329934 329935 lp_0840 lp_0841   ppx2 FALSE 0.006 149.000 0.000 1.000   -0.105
 329935 329936 lp_0841 lp_0842 ppx2 ppk TRUE 0.990 3.000 0.015 1.000 Y 0.740
 329936 329937 lp_0842 lp_0843 ppk ppx3 TRUE 0.993 1.000 0.093 1.000 Y 0.693
 329937 329938 lp_0843 lp_0844 ppx3 licD FALSE 0.002 325.000 0.000 NA N -0.100
 329941 329942 lp_0848 lp_0849   pox1 FALSE 0.001 618.000 0.000 1.000   -0.608
 329942 329943 lp_0849 lp_0850 pox1 ribC1 TRUE 0.859 141.000 0.000 1.000 Y 0.812
 329943 329944 lp_0850 lp_0852 ribC1 pox2 FALSE 0.009 329.000 0.000 1.000 Y 0.037
 329946 329947 lp_0854 lp_0856 birA2   FALSE 0.056 422.000 0.000 1.000 N 0.371
 329950 329951 lp_0860 lp_0861     FALSE 0.006 151.000 0.000 NA   -0.022
 329952 329953 lp_0862 lp_0863   pdx FALSE 0.139 364.000 0.000 1.000   0.493
 329953 329954 lp_0863 lp_0864 pdx   TRUE 0.775 54.000 0.000 1.000 N 0.434
 329956 329957 lp_0866 lp_0868 gmk2   FALSE 0.241 111.000 0.003 1.000 N 0.237
 329957 329958 lp_0868 lp_0869     FALSE 0.588 133.000 0.071 NA   0.427
 329958 329959 lp_0869 lp_0871     TRUE 0.973 4.000 0.667 NA   0.351
 329963 329964 lp_0878 lp_0881 glnQ2 glnH1 TRUE 0.984 21.000 0.111 0.061 Y 0.496
 329964 329965 lp_0881 lp_0882 glnH1 glnM TRUE 0.989 0.000 0.080 0.061 Y 0.574
 329965 329966 lp_0882 lp_0883 glnM glnP TRUE 0.998 17.000 0.947 0.008 Y 0.706
 329966 329967 lp_0883 lp_0884 glnP pts11A FALSE 0.002 261.000 0.000 1.000 N -0.304
 329967 329968 lp_0884 lp_0885 pts11A bglG1 TRUE 0.877 26.000 0.250 1.000   0.190
 329968 329969 lp_0885 lp_0886 bglG1 pts11BC TRUE 0.961 28.000 0.375 1.000   0.386
 329969 329970 lp_0886 lp_0887 pts11BC   TRUE 0.986 7.000 0.500 1.000   0.505
 329971 329972 lp_0888 lp_0889     FALSE 0.002 271.000 0.000 1.000 N 0.110
 329973 329974 lp_0891 lp_0892     FALSE 0.195 137.000 0.000 1.000   0.348
 329974 329975 lp_0892 lp_0893     TRUE 0.966 -3.000 0.000 1.000 N 0.571
 329979 329980 lp_0897 lp_0898   sugE FALSE 0.007 142.000 0.000 1.000 N -0.115
 329980 329981 lp_0898 lp_0899 sugE   FALSE 0.002 306.000 0.000 NA   0.215
 329982 329983 lp_0900 lp_0901 pgm3 pgm4 TRUE 0.932 15.000 0.000 0.004 Y 0.409
 329983 329984 lp_0901 lp_0902 pgm4 napA2 TRUE 0.938 71.000 0.000 1.000 N 0.863
 329984 329985 lp_0902 lp_0903 napA2   TRUE 0.979 22.000 0.000 1.000   0.807
 329986 329987 lp_0904 lp_0905 bglG2 pts12BCA TRUE 0.986 12.000 0.409 1.000   0.530
 329987 329988 lp_0905 lp_0906 pts12BCA pbg2 TRUE 0.985 15.000 0.182 1.000 Y 0.492
 329990 329991 lp_0910 lp_0911   ISP2 FALSE 0.005 169.000 0.000 0.054   -0.436
 329991 329992 lp_0911 lp_0912 ISP2   FALSE 0.451 160.000 0.000 1.000   0.523
 329992 329993 lp_0912 lp_0913   coaA FALSE 0.005 169.000 0.000 1.000   0.055
 329993 329994 lp_0913 lp_0914 coaA guaA FALSE 0.558 94.000 0.006 0.051 N 0.354
 329995 329996 lp_0915 lp_0917     FALSE 0.003 234.000 0.000 1.000   -0.030
 329997 329998 lp_0918 lp_0919     FALSE 0.002 302.000 0.000 NA   0.202
 329998 329999 lp_0919 lp_0921     FALSE 0.003 220.000 0.000 NA   -0.121
 330001 330002 lp_0923 lp_0924     FALSE 0.001 485.000 0.000 NA   0.214
 330002 330003 lp_0924 lp_0925     TRUE 0.930 -10.000 0.351 NA   0.194
 330003 330004 lp_0925 lp_0926     FALSE 0.002 242.000 0.000 1.000   0.102
 330004 330005 lp_0926 lp_0927     TRUE 0.973 12.000 0.000 NA   0.739
 330005 330006 lp_0927 lp_0928     TRUE 0.980 13.000 0.000 NA   0.893
 330006 330007 lp_0928 lp_0929   asp1 TRUE 0.981 15.000 0.000 NA   0.940
 330007 330008 lp_0929 lp_0930 asp1 asp2 TRUE 0.997 22.000 0.667 NA   0.893
 330008 330009 lp_0930 lp_0931 asp2 hpaG FALSE 0.038 174.000 0.000 NA   0.267
 330009 330010 lp_0931 lp_0932 hpaG   FALSE 0.690 122.000 0.000 NA   0.584
 330010 330011 lp_0932 lp_0934     FALSE 0.002 316.000 0.000 NA   0.195
 330011 330012 lp_0934 lp_0935     FALSE 0.731 107.000 0.000 NA   0.583
 330012 330013 lp_0935 lp_0937   pepN FALSE 0.004 182.000 0.000 NA   0.164
 330013 330014 lp_0937 lp_0938 pepN hsdR FALSE 0.003 228.000 0.000 1.000 N 0.143
 330014 330015 lp_0938 lp_0939 hsdR hsdM TRUE 0.991 14.000 0.083 0.054 Y 0.635
 330015 330016 lp_0939 lp_0940 hsdM hsdS1 TRUE 0.990 -3.000 0.022 0.054 Y 0.635
 330016 330017 lp_0940 lp_0941 hsdS1   FALSE 0.465 152.000 0.125 0.054 N 0.325
 330018 330019 lp_0945 lp_0946     FALSE 0.355 124.000 0.000 NA   0.410
 330020 330021 lp_0947 lp_0948     FALSE 0.016 89.000 0.000 NA   0.196
 330021 330022 lp_0948 lp_0949     FALSE 0.475 69.000 0.000 1.000   0.357
 330022 330023 lp_0949 lp_0950     TRUE 0.861 100.000 0.000 0.025 Y 0.582
 330026 330027 lp_0954 lp_0955     FALSE 0.289 109.000 0.058 1.000   0.212
 330027 330028 lp_0955 lp_0956   asnS1 FALSE 0.004 171.000 0.000 1.000 N 0.118
 330028 330029 lp_0956 lp_0957 asnS1 asnA TRUE 0.932 77.000 0.021 0.051 N 0.682
 330029 330030 lp_0957 lp_0959 asnA pepD3 FALSE 0.086 453.000 0.000 1.000 Y 0.360
 330030 330031 lp_0959 lp_0960 pepD3   FALSE 0.545 36.000 0.000 1.000   0.312
 330032 330033 lp_0961 lp_0962   recQ1 FALSE 0.002 258.000 0.000 1.000   -0.083
 330033 330034 lp_0962 lp_0963 recQ1 rluE FALSE 0.043 43.000 0.000 1.000 N -0.066
 330036 330037 lp_0966 lp_0967     FALSE 0.001 420.000 0.000 NA   0.102
 330037 330038 lp_0967 lp_0968     FALSE 0.110 -36.000 0.000 NA   0.123
 330038 330039 lp_0968 lp_0969     TRUE 0.994 -3.000 0.957 NA   0.551
 330039 330040 lp_0969 lp_0970     FALSE 0.102 -3.000 0.000 NA   0.097
 330040 330041 lp_0970 lp_0971     FALSE 0.282 132.000 0.000 1.000   0.385
 330042 330043 lp_0972 lp_0973     FALSE 0.007 144.000 0.000 NA   -0.079
 330043 330044 lp_0973 lp_0975   xylP2 TRUE 0.905 -13.000 0.033 1.000 N 0.321
 330044 330045 lp_0975 lp_0977 xylP2 murE1 FALSE 0.001 329.000 0.000 1.000 N -0.363
 330045 330046 lp_0977 lp_0979 murE1 thrA1 TRUE 0.930 24.000 0.000 1.000 N 0.485
 330046 330047 lp_0979 lp_0980 thrA1 asnB1 FALSE 0.548 5.000 0.000 1.000 Y 0.115
 330047 330048 lp_0980 lp_0981 asnB1   FALSE 0.001 471.000 0.000 NA   0.210
 330048 330049 lp_0981 lp_0982     TRUE 0.972 -3.000 0.338 NA   0.394
 330050 330051 lp_0984 lp_0988     FALSE 0.031 985.000 0.000 NA   0.377
 330052 330053 lp_0989 lp_0990     FALSE 0.104 330.000 0.000 NA   0.439
 330053 330054 lp_0990 lp_0991     TRUE 0.997 0.000 0.600 NA   0.887
 330056 330057 lp_0994 lp_0995     FALSE 0.011 115.000 0.000 NA   0.035
 330058 330059 lp_0996 lp_0997   cspC FALSE 0.041 252.000 0.000 0.091 Y 0.130
 330059 330060 lp_0997 lp_0998 cspC   FALSE 0.005 169.000 0.000 NA   0.011
 330060 330061 lp_0998 lp_0999     TRUE 0.945 34.000 0.067 NA   0.494
 330065 330066 lp_1003 lp_1004     FALSE 0.082 12.000 0.000 NA N 0.013
 330066 330067 lp_1004 lp_1005   als FALSE 0.139 186.000 0.000 NA N 0.355
 330067 330068 lp_1005 lp_1008 als lysP FALSE 0.057 384.000 0.000 1.000 Y 0.270
 330068 330069 lp_1008 lp_1010 lysP dacB FALSE 0.082 346.000 0.000 1.000 N 0.394
 330069 330070 lp_1010 lp_1011 dacB dgk1 FALSE 0.378 396.000 0.043 1.000 N 0.599
 330070 330071 lp_1011 lp_1012 dgk1 serS2 FALSE 0.002 283.000 0.000 1.000 N -0.001
 330071 401557 lp_1012 lp_tRNA14 serS2 tRNA-Leu FALSE 0.054 417.000 0.000 NA   0.395
 401557 401558 lp_tRNA14 lp_tRNA15 tRNA-Leu tRNA-Thr TRUE 0.829 4.000 0.000 NA   NA
 401558 401559 lp_tRNA15 lp_tRNA16 tRNA-Thr tRNA-Gly TRUE 0.815 25.000 0.000 NA   NA
 401559 401560 lp_tRNA16 lp_tRNA17 tRNA-Gly tRNA-Leu TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 401560 401561 lp_tRNA17 lp_tRNA18 tRNA-Leu tRNA-Arg TRUE 0.816 11.000 0.000 NA   NA
 401561 401562 lp_tRNA18 lp_tRNA19 tRNA-Arg tRNA-Pro TRUE 0.818 8.000 0.000 NA   NA
 401562 401563 lp_tRNA19 lp_tRNA20 tRNA-Pro tRNA-Pro FALSE 0.655 51.000 0.000 NA   NA
 401563 330072 lp_tRNA20 lp_1018 tRNA-Pro ctsR FALSE 0.045 489.000 0.000 NA   NA
 330072 330073 lp_1018 lp_1019 ctsR clpC TRUE 0.985 19.000 0.188 NA N 0.539
 330073 330074 lp_1019 lp_1020 clpC   FALSE 0.155 169.000 0.000 1.000 N 0.340
 330074 330075 lp_1020 lp_1021   rpoB FALSE 0.002 247.000 0.000 1.000 Y -0.440
 330075 330076 lp_1021 lp_1022 rpoB rpoC TRUE 0.999 18.000 0.851 0.002 Y 0.849
 330078 330079 lp_1025 lp_1026 rpsL rpsG TRUE 0.996 17.000 0.224 0.003 Y 0.784
 330079 330080 lp_1026 lp_1027 rpsG fusA2 TRUE 0.969 142.000 0.579 1.000 Y 0.822
 330080 330081 lp_1027 lp_1032 fusA2 rpsJ FALSE 0.408 951.000 0.014 1.000 Y 0.696
 330081 330082 lp_1032 lp_1033 rpsJ rplC TRUE 0.996 38.000 0.467 0.025 Y 0.943
 330082 330083 lp_1033 lp_1034 rplC rplD TRUE 0.998 19.000 0.544 0.019 Y 0.963
 330083 330084 lp_1034 lp_1035 rplD rplW TRUE 0.997 0.000 0.307 0.019 Y 0.971
 330084 330085 lp_1035 lp_1036 rplW rplB TRUE 0.998 24.000 0.849 0.022 Y 0.937
 330085 330086 lp_1036 lp_1038 rplB rpsS TRUE 0.997 43.000 0.820 0.025 Y 0.915
 330086 330087 lp_1038 lp_1039 rpsS rplV TRUE 0.998 21.000 0.769 0.025 Y 0.919
 330087 330088 lp_1039 lp_1040 rplV rpsC TRUE 0.998 13.000 0.719 0.025 Y 0.803
 330088 330089 lp_1040 lp_1041 rpsC rplP TRUE 0.999 3.000 0.828 0.025 Y 0.957
 330089 330090 lp_1041 lp_1043 rplP rpmC TRUE 0.999 -10.000 0.802 0.019 Y 0.880
 330090 330091 lp_1043 lp_1044 rpmC rpsQ TRUE 0.998 23.000 0.828 0.019 Y 0.933
 330091 330092 lp_1044 lp_1045 rpsQ rplN TRUE 0.997 43.000 0.791 0.025 Y 0.930
 330092 330093 lp_1045 lp_1046 rplN rplX TRUE 0.998 34.000 0.810 0.025 Y 0.964
 330093 330094 lp_1046 lp_1047 rplX rplE TRUE 0.998 29.000 0.758 0.019 Y 0.964
 330094 330095 lp_1047 lp_1048 rplE rpsN TRUE 0.998 21.000 0.496 0.019 Y 0.952
 330095 330096 lp_1048 lp_1050 rpsN rpsH TRUE 0.996 34.000 0.473 0.019 Y 0.863
 330096 330097 lp_1050 lp_1051 rpsH rplF TRUE 0.998 30.000 0.808 0.019 Y 0.953
 330097 330098 lp_1051 lp_1052 rplF rplR TRUE 0.998 35.000 0.815 0.019 Y 0.952
 330098 330099 lp_1052 lp_1053 rplR rpsE TRUE 0.999 21.000 0.814 0.025 Y 0.921
 330099 330100 lp_1053 lp_1054 rpsE rpmD TRUE 0.998 15.000 0.789 0.025 Y 0.937
 330100 330101 lp_1054 lp_1055 rpmD rplO TRUE 0.996 32.000 0.653 0.003 Y 0.641
 330101 330102 lp_1055 lp_1056 rplO secY TRUE 0.997 2.000 0.730 1.000 N 0.915
 330102 330103 lp_1056 lp_1058 secY adk TRUE 0.983 64.000 0.241 1.000 N 0.870
 330103 330104 lp_1058 lp_1059 adk infA TRUE 0.755 175.000 0.059 1.000 N 0.681
 330104 330105 lp_1059 lp_1059a infA rpmJ TRUE 0.990 37.000 0.067 1.000 Y 0.914
 330105 330106 lp_1059a lp_1060 rpmJ rpsM TRUE 0.994 28.000 0.086 0.019 Y 0.849
 330106 330107 lp_1060 lp_1061 rpsM rpsK TRUE 0.998 25.000 0.810 0.019 Y 0.922
 330107 330108 lp_1061 lp_1062 rpsK rpoA TRUE 0.974 87.000 0.308 1.000 N 0.880
 330108 330109 lp_1062 lp_1063 rpoA rplQ TRUE 0.998 22.000 0.873 1.000 N 0.838
 330110 330111 lp_1064 lp_1066 ISP1 hepB1 FALSE 0.062 308.000 0.000 1.000 N 0.340
 330111 330112 lp_1066 lp_1067 hepB1   TRUE 0.990 6.000 0.118 NA   0.818
 330112 330113 lp_1067 lp_1068     TRUE 0.988 4.000 0.026 NA   0.890
 330113 330114 lp_1068 lp_1069   ndh2 FALSE 0.604 95.000 0.052 NA   0.370
 330115 330116 lp_1070 lp_1072   apbE1 FALSE 0.001 340.000 0.000 1.000   0.199
 330116 330117 lp_1072 lp_1073 apbE1   TRUE 0.799 83.000 0.000 1.000 N 0.545
 330117 330118 lp_1073 lp_1074     TRUE 0.998 -24.000 0.713 0.025 Y 0.715
 330118 330119 lp_1074 lp_1075     TRUE 0.993 -10.000 0.136 1.000 Y 0.602
 330119 330120 lp_1075 lp_1076   truA TRUE 0.968 65.000 0.085 1.000 N 0.767
 330120 330121 lp_1076 lp_1077 truA rplM TRUE 0.808 109.000 0.052 1.000 Y 0.450
 330121 330122 lp_1077 lp_1078 rplM rpsI TRUE 0.998 14.000 0.601 0.019 Y 0.920
 330123 330124 lp_1079 lp_1081     FALSE 0.001 417.000 0.000 NA   -0.234
 330125 330126 lp_1082 lp_1083   tkt2 FALSE 0.048 878.000 0.000 0.062 N 0.380
 330126 330127 lp_1083 lp_1084 tkt2 aroD1 TRUE 0.980 20.000 0.000 1.000 N 0.747
 330127 330128 lp_1084 lp_1085 aroD1 aroA TRUE 0.989 41.000 0.121 1.000 Y 0.792
 330128 330129 lp_1085 lp_1086 aroA aroB TRUE 0.988 4.000 0.007 0.003 Y 0.674
 330130 330131 lp_1087 lp_1088     FALSE 0.013 104.000 0.000 NA   0.160
 330131 330132 lp_1088 lp_1089   ttdB FALSE 0.185 64.000 0.000 NA   0.261
 330132 330133 lp_1089 lp_1090 ttdB ttdA TRUE 0.987 -3.000 0.667 1.000 Y 0.352
 330133 330134 lp_1090 lp_1092 ttdA   FALSE 0.047 266.000 0.000 1.000 N 0.289
 330135 330136 lp_1093 lp_1095 citG mtsC FALSE 0.002 313.000 0.000 1.000 N -0.200
 330136 330137 lp_1095 lp_1096 mtsC mtsB TRUE 0.995 -3.000 0.152 1.000 Y 0.763
 330137 330138 lp_1096 lp_1097 mtsB mtsA TRUE 0.995 -3.000 0.135 1.000 Y 0.768
 330140 330141 lp_1101 lp_1102 ldhL2   TRUE 0.978 32.000 0.000 1.000 N 0.917
 330143 330144 lp_1105 lp_1106 mae citC TRUE 0.994 18.000 0.038 1.000 Y 0.955
 330144 330145 lp_1106 lp_1107 citC citD TRUE 0.997 -10.000 0.231 1.000 Y 0.948
 330145 330146 lp_1107 lp_1108 citD citE TRUE 0.996 0.000 0.284 0.001 N 0.969
 330146 330147 lp_1108 lp_1109 citE citF TRUE 0.995 -10.000 0.119 0.001 N 0.941
 330147 330148 lp_1109 lp_1110 citF   FALSE 0.376 200.000 0.000 NA   0.552
 330150 330151 lp_1112 lp_1113 fum   TRUE 0.838 173.000 0.017 1.000 Y 0.808
 330151 330152 lp_1113 lp_1114   citX FALSE 0.206 156.000 0.000 1.000 N 0.356
 330152 330153 lp_1114 lp_1115 citX mleR2 TRUE 0.977 -3.000 0.000 1.000 N 0.666
 330155 330156 lp_1118 lp_1119 mleS mleP2 TRUE 0.975 42.000 0.302 1.000   0.573
 330156 330157 lp_1119 lp_1120 mleP2   FALSE 0.019 502.000 0.000 0.084   0.303
 330157 330158 lp_1120 lp_1121     FALSE 0.079 118.000 0.000 NA   0.263
 330160 330161 lp_1125 lp_1126 cydA cydB TRUE 0.999 -7.000 0.950 0.028 Y 0.831
 330161 330162 lp_1126 lp_1128 cydB cydC TRUE 0.908 129.000 0.061 1.000 Y 0.690
 330162 330163 lp_1128 lp_1129 cydC cydD TRUE 0.986 0.000 0.168 0.008 Y 0.466
 330164 330165 lp_1132 lp_1134   hepB2 FALSE 0.028 229.000 0.000 NA   0.276
 330168 330169 lp_1138 lp_1139 acm1 xpt TRUE 0.944 51.000 0.023 1.000 N 0.592
 330169 330170 lp_1139 lp_1140 xpt   TRUE 0.982 23.000 0.009 NA   0.754
 330170 330171 lp_1140 lp_1141   purK2 TRUE 0.814 113.000 0.000 NA   0.737
 330171 330172 lp_1141 lp_1144 purK2 pcrA FALSE 0.359 441.000 0.012 1.000 N 0.660
 330172 330173 lp_1144 lp_1145 pcrA ligA TRUE 0.995 17.000 0.103 0.014 Y 0.808
 330173 330174 lp_1145 lp_1146 ligA   TRUE 0.988 -3.000 0.030 1.000   0.805
 330174 330175 lp_1146 lp_1147   gatC TRUE 0.974 41.000 0.017 1.000   0.855
 330175 330176 lp_1147 lp_1148 gatC gatA TRUE 0.998 0.000 0.643 0.001 Y 0.832
 330176 330177 lp_1148 lp_1149 gatA gatB TRUE 0.998 0.000 0.492 0.001 Y 0.879
 330177 330178 lp_1149 lp_1150 gatB   TRUE 0.896 105.000 0.034 1.000 N 0.702
 330178 330179 lp_1150 lp_1151     FALSE 0.293 334.000 0.299 1.000 N 0.377
 330179 330180 lp_1151 lp_1153     FALSE 0.001 454.000 0.000 1.000 N -0.009
 330180 330181 lp_1153 lp_1154     FALSE 0.002 267.000 0.000 1.000 N 0.118
 330181 330182 lp_1154 lp_1155   pts13C FALSE 0.016 241.000 0.000 1.000 N 0.214
 330182 330183 lp_1155 lp_1156 pts13C   TRUE 0.943 -7.000 0.231 NA   0.305
 330183 330184 lp_1156 lp_1157     FALSE 0.009 125.000 0.000 NA   0.173
 330184 330185 lp_1157 lp_1158   lys TRUE 0.968 25.000 0.087 1.000 N 0.486
 330187 330188 lp_1160 lp_1161 cspP   FALSE 0.004 187.000 0.000 1.000   0.033
 330188 330189 lp_1161 lp_1162   rhe2 TRUE 0.908 13.000 0.200 1.000   0.270
 330189 401564 lp_1162 lp_tRNA21 rhe2 tRNA-Arg FALSE 0.039 48.000 0.000 NA   0.085
 330191 330192 lp_1164 lp_1165 pts14C   TRUE 0.964 -7.000 1.000 NA   0.150
 330192 330193 lp_1165 lp_1166     FALSE 0.001 550.000 0.000 NA   -0.160
 330193 330194 lp_1166 lp_1168     FALSE 0.001 434.000 0.000 NA   0.094
 330196 330197 lp_1171 lp_1173 pbpX1   FALSE 0.022 189.000 0.000 1.000 N 0.213
 330197 330198 lp_1173 lp_1174     FALSE 0.001 386.000 0.000 1.000   -0.119
 330198 330199 lp_1174 lp_1175   glpF4 FALSE 0.070 200.000 0.000 1.000   0.324
 330199 330200 lp_1175 lp_1176 glpF4 glf1 FALSE 0.586 154.000 0.000 1.000 N 0.562
 330200 330201 lp_1176 lp_1177 glf1 cps1A TRUE 0.966 4.000 0.008 NA   0.568
 330201 330202 lp_1177 lp_1178 cps1A cps1B TRUE 0.976 5.000 0.000 NA   0.760
 330202 330203 lp_1178 lp_1179 cps1B cps1C TRUE 0.977 27.000 0.000 1.000   0.862
 330203 330204 lp_1179 lp_1180 cps1C cps1D TRUE 0.979 12.000 0.000 NA   0.853
 330204 330205 lp_1180 lp_1181 cps1D cps1E TRUE 0.981 -7.000 0.000 NA   0.777
 330205 330206 lp_1181 lp_1182 cps1E cps1F TRUE 0.980 14.000 0.000 1.000   0.854
 330206 330207 lp_1182 lp_1183 cps1F cps1G TRUE 0.988 8.000 0.000 1.000 Y 0.846
 330207 330208 lp_1183 lp_1184 cps1G cps1H TRUE 0.981 1.000 0.000 NA   0.833
 330208 330209 lp_1184 lp_1185 cps1H cps1I TRUE 0.979 11.000 0.000 NA   0.862
 330209 330210 lp_1185 lp_1186 cps1I rfbA TRUE 0.980 6.000 0.000 NA   0.893
 330210 330211 lp_1186 lp_1187 rfbA   TRUE 0.974 23.000 0.000 1.000   0.737
 330211 330212 lp_1187 lp_1188   rfbC TRUE 0.932 60.000 0.000 1.000   0.759
 330212 330213 lp_1188 lp_1189 rfbC rfbB TRUE 0.966 44.000 0.000 1.000 Y 0.713
 330213 330214 lp_1189 lp_1190 rfbB rfbD TRUE 0.879 70.000 0.000 0.003 Y 0.501
 330215 330216 lp_1191 lp_1192     TRUE 0.951 -78.000 0.000 1.000   0.525
 330216 330217 lp_1192 lp_1193     FALSE 0.528 43.000 0.000 NA   0.333
 330217 330218 lp_1193 lp_1194     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   0.428
 330218 330219 lp_1194 lp_1195     FALSE 0.663 99.000 0.000 1.000   0.505
 330219 330220 lp_1195 lp_1196     FALSE 0.295 63.000 0.000 0.053   0.269
 330221 330222 lp_1197 lp_1198 cps2A cps2B TRUE 0.995 12.000 0.615 1.000 N 0.659
 330222 330223 lp_1198 lp_1199 cps2B cps2C TRUE 0.988 -13.000 0.080 1.000 N 0.618
 330223 330224 lp_1199 lp_1200 cps2C galE2 TRUE 0.981 18.000 0.000 1.000 Y 0.626
 330224 330225 lp_1200 lp_1201 galE2 cps2E TRUE 0.980 -19.000 0.015 NA Y 0.509
 330225 330226 lp_1201 lp_1202 cps2E cps2F TRUE 0.932 1.000 0.047 NA Y 0.303
 330226 330227 lp_1202 lp_1203 cps2F cps2G TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   0.411
 330227 330228 lp_1203 lp_1204 cps2G cps2H TRUE 0.876 38.000 0.000 NA   0.501
 330228 330229 lp_1204 lp_1205 cps2H cps2I TRUE 0.975 7.000 0.000 NA   0.761
 330229 330230 lp_1205 lp_1206 cps2I cps2J FALSE 0.719 140.000 0.000 1.000   0.687
 330230 330231 lp_1206 lp_1207 cps2J   TRUE 0.777 125.000 0.000 NA   0.721
 330233 330234 lp_1210 lp_1211     TRUE 0.742 37.000 0.000 NA   0.395
 330235 330236 lp_1212 lp_1213     FALSE 0.061 235.000 0.167 NA   -0.039
 330236 330237 lp_1213 lp_1214     FALSE 0.696 30.000 0.000 NA   0.349
 330238 330239 lp_1215 lp_1216 cps3A cps3B FALSE 0.108 83.000 0.000 NA   0.256
 330239 330240 lp_1216 lp_1219 cps3B glf2 FALSE 0.002 513.000 0.028 NA   0.064
 330240 330241 lp_1219 lp_1220 glf2 cps3D TRUE 0.958 16.000 0.000 NA   0.596
 330241 330242 lp_1220 lp_1221 cps3D cps3E TRUE 0.971 -3.000 0.000 NA   0.639
 330242 330243 lp_1221 lp_1222 cps3E cps3F TRUE 0.979 -13.000 0.000 NA   0.729
 330243 330244 lp_1222 lp_1224 cps3F cps3G FALSE 0.011 112.000 0.000 NA   0.196
 330244 330245 lp_1224 lp_1225 cps3G cps3H FALSE 0.102 -3.000 0.000 NA   0.168
 330245 330246 lp_1225 lp_1226 cps3H cps3I TRUE 0.976 -16.000 0.000 NA   0.687
 330246 330247 lp_1226 lp_1227 cps3I cps3J TRUE 0.772 136.000 0.000 NA   0.763
 330249 330250 lp_1229 lp_1230     TRUE 0.889 12.000 0.000 1.000   0.448
 330251 330252 lp_1231 lp_1233     FALSE 0.001 438.000 0.000 NA   0.190
 330254 330255 lp_1235 lp_1236     TRUE 0.884 30.000 0.000 NA   0.466
 330255 330256 lp_1236 lp_1237     FALSE 0.176 115.000 0.000 NA   0.312
 330256 330257 lp_1237 lp_1238     FALSE 0.617 36.000 0.000 NA   0.340
 330258 330259 lp_1239 lp_1240     FALSE 0.076 27.000 0.000 NA   -0.146
 330259 330260 lp_1240 lp_1241     FALSE 0.026 98.000 0.025 NA   0.068
 330262 330263 lp_1243 lp_1244     FALSE 0.653 103.000 0.000 NA   0.512
 330265 330266 lp_1247 lp_1248   tagD2 FALSE 0.633 53.000 0.057 NA   0.254
 330267 330268 lp_1249 lp_1250 gntP gntK TRUE 0.982 12.000 0.000 1.000 Y 0.687
 330268 330269 lp_1250 lp_1251 gntK gnd1 TRUE 0.975 16.000 0.000 1.000 Y 0.576
 330269 330270 lp_1251 lp_1253 gnd1 gshR2 FALSE 0.121 171.000 0.000 1.000 N 0.315
 330271 330272 lp_1255 lp_1256 prfC   FALSE 0.001 643.000 0.000 NA   -0.301
 330274 330275 lp_1258 lp_1259     FALSE 0.221 229.000 0.000 1.000   0.470
 330275 330276 lp_1259 lp_1260     TRUE 0.994 0.000 0.903 NA   0.558
 330276 330277 lp_1260 lp_1261   oppA FALSE 0.001 547.000 0.000 NA   0.187
 330277 330278 lp_1261 lp_1262 oppA oppB TRUE 0.881 158.000 0.031 0.045 Y 0.795
 330278 330279 lp_1262 lp_1263 oppB oppC TRUE 0.997 4.000 0.299 0.045 Y 0.864
 330279 330280 lp_1263 lp_1264 oppC oppD TRUE 0.998 16.000 0.595 1.000 Y 0.861
 330280 330281 lp_1264 lp_1265 oppD oppF TRUE 0.998 7.000 0.619 0.001 Y 0.775
 330281 330282 lp_1265 lp_1267 oppF   FALSE 0.001 539.000 0.000 1.000 N -0.064
 330282 330283 lp_1267 lp_1268     FALSE 0.098 185.000 0.000 1.000   0.343
 330285 330286 lp_1273 lp_1274 hpr ptsI TRUE 0.996 0.000 0.240 0.024 Y 0.728
 330286 330287 lp_1274 lp_1275 ptsI   FALSE 0.001 538.000 0.016 1.000 N -0.065
 330287 330288 lp_1275 lp_1276     TRUE 0.972 77.000 0.413 0.017 Y 0.551
 330288 330289 lp_1276 lp_1277     TRUE 0.973 67.000 0.336 NA   0.677
 330289 330290 lp_1277 lp_1278   dacA2 FALSE 0.478 64.000 0.000 NA   0.350
 330292 330293 lp_1281 lp_1283     TRUE 0.794 156.000 0.103 NA   0.644
 2208820 401565 lp_rRNA04 lp_tRNA22   tRNA-Ile FALSE 0.470 85.000 0.000 NA   NA
 401565 401566 lp_tRNA22 lp_tRNA23 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.698 42.000 0.000 NA   NA
 401566 2208821 lp_tRNA23 lp_rRNA05 tRNA-Ala   FALSE 0.201 162.000 0.000 NA   NA
 2208821 2208822 lp_rRNA05 lp_rRNA06     FALSE 0.552 71.000 0.000 NA   NA
 2208822 401567 lp_rRNA06 lp_tRNA24   tRNA-Asn TRUE 0.825 5.000 0.000 NA   NA
 401567 401568 lp_tRNA24 lp_tRNA25 tRNA-Asn tRNA-Ser TRUE 0.837 19.000 0.000 NA   NA
 401568 401569 lp_tRNA25 lp_tRNA26 tRNA-Ser tRNA-Glu TRUE 0.830 22.000 0.000 NA   NA
 401569 401570 lp_tRNA26 lp_tRNA27 tRNA-Glu tRNA-Val TRUE 0.825 5.000 0.000 NA   NA
 401570 401571 lp_tRNA27 lp_tRNA28 tRNA-Val tRNA-Phe FALSE 0.635 56.000 0.000 NA   NA
 401571 401572 lp_tRNA28 lp_tRNA29 tRNA-Phe tRNA-Tyr TRUE 0.821 6.000 0.000 NA   NA
 401572 401573 lp_tRNA29 lp_tRNA30 tRNA-Tyr tRNA-Trp TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 401573 401574 lp_tRNA30 lp_tRNA31 tRNA-Trp tRNA-His TRUE 0.821 6.000 0.000 NA   NA
 401574 401575 lp_tRNA31 lp_tRNA32 tRNA-His tRNA-Gln TRUE 0.818 8.000 0.000 NA   NA
 401575 401576 lp_tRNA32 lp_tRNA33 tRNA-Gln tRNA-Cys TRUE 0.825 23.000 0.000 NA   NA
 401576 401577 lp_tRNA33 lp_tRNA34 tRNA-Cys tRNA-Leu FALSE 0.635 56.000 0.000 NA   NA
 330295 330296 lp_1288 lp_1289     FALSE 0.070 409.000 0.000 1.000 N NA
 330296 330297 lp_1289 lp_1290     TRUE 0.993 3.000 0.182 1.000   0.894
 330299 330300 lp_1292 lp_1293     FALSE 0.011 115.000 0.000 1.000   0.224
 330300 330301 lp_1293 lp_1295   mntH3 FALSE 0.001 839.000 0.000 1.000   -0.055
 330301 330302 lp_1295 lp_1296 mntH3 hemH TRUE 0.985 -28.000 0.007 1.000 N 0.686
 330302 330303 lp_1296 lp_1297 hemH   FALSE 0.001 332.000 0.000 1.000 N -0.061
 330304 330305 lp_1298 lp_1299   tagE1 FALSE 0.032 421.000 0.000 1.000 N 0.310
 330307 330308 lp_1301 lp_1302 metK   FALSE 0.087 137.000 0.069 1.000 N -0.151
 330308 330309 lp_1302 lp_1303a   sdr FALSE 0.041 440.000 0.000 NA   0.373
 330309 330310 lp_1303a lp_1310 sdr   FALSE 0.009 127.000 0.000 NA   -0.235
 330310 330311 lp_1310 lp_1311   tagE2 TRUE 0.912 27.000 0.000 1.000   0.495
 330311 330312 lp_1311 lp_1312 tagE2 tagE3 TRUE 0.995 11.000 0.500 0.017   0.730
 330312 330313 lp_1312 lp_1313 tagE3   FALSE 0.070 30.000 0.000 NA   0.214
 330314 330315 lp_1314 lp_1315     TRUE 0.983 4.000 0.015 NA   0.752
 330316 330317 lp_1316 lp_1317 leuS   FALSE 0.094 596.000 0.006 1.000   0.440
 330317 330318 lp_1317 lp_1319   rsuA TRUE 0.989 8.000 0.128 1.000   0.760
 330320 330321 lp_1321 lp_1322 pepV   TRUE 0.988 27.000 0.154 1.000 N 0.668
 330321 330322 lp_1322 lp_1324     FALSE 0.022 336.000 0.000 1.000 N 0.261
 330322 330323 lp_1324 lp_1325     TRUE 0.983 50.000 0.391 0.044 Y 0.541
 330323 330324 lp_1325 lp_1326     TRUE 0.990 12.000 0.848 0.044 Y 0.407
 330324 330325 lp_1326 lp_1327     TRUE 0.985 -3.000 0.708 0.044 Y 0.302
 330325 330326 lp_1327 lp_1328   glpQ1 FALSE 0.438 21.000 0.042 1.000 N -0.064
 330327 330328 lp_1329 lp_1330 dgk2 mscL TRUE 0.825 105.000 0.007 1.000 N 0.584
 330328 330329 lp_1330 lp_1332 mscL   FALSE 0.001 504.000 0.000 NA   -0.164
 330329 330330 lp_1332 lp_1333     FALSE 0.009 398.000 0.000 NA   0.262
 330330 330331 lp_1333 lp_1334     FALSE 0.093 21.000 0.000 NA   0.206
 330331 330332 lp_1334 lp_1335     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   0.556
 330332 330333 lp_1335 lp_1336     FALSE 0.660 151.000 0.000 0.024 N 0.598
 330333 330334 lp_1336 lp_1339   mrsA1 FALSE 0.006 563.000 0.000 1.000 N 0.222
 330335 330336 lp_1341 lp_1342     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   0.469
 330336 330337 lp_1342 lp_1343     FALSE 0.404 16.000 0.000 NA   0.258
 330339 330340 lp_1346 lp_1347 asd1   FALSE 0.609 190.000 0.000 NA   0.779
 330340 330341 lp_1347 lp_1348     TRUE 0.979 2.000 0.062 NA   0.585
 330341 330342 lp_1348 lp_1350   nox6 FALSE 0.659 156.000 0.000 NA   0.688
 330342 330343 lp_1350 lp_1351 nox6   TRUE 0.922 26.000 0.000 NA   0.507
 330345 330346 lp_1353 lp_1354     FALSE 0.009 130.000 0.000 NA   0.163
 330346 330347 lp_1354 lp_1354a   pltA FALSE 0.007 140.000 0.000 NA   0.031
 330347 330348 lp_1354a lp_1355 pltA pltK TRUE 0.899 -27.000 0.000 NA   0.431
 330348 330349 lp_1355 lp_1356 pltK pltR TRUE 0.966 6.000 0.400 NA   0.380
 330349 330350 lp_1356 lp_1357 pltR   FALSE 0.040 168.000 0.000 NA   0.264
 330350 330351 lp_1357 lp_1358     FALSE 0.326 160.000 0.000 NA   0.452
 330352 330353 lp_1359 lp_1360     FALSE 0.001 693.000 0.000 NA   -0.246
 330353 330354 lp_1360 lp_1362     FALSE 0.717 114.000 0.000 NA   0.585
 330355 330356 lp_1363 lp_1364   uvrA2 TRUE 0.922 62.000 0.000 NA   0.721
 401614 401613 lp_tRNA35 lp_tRNA36 tRNA-His tRNA-Leu FALSE 0.056 389.000 0.000 NA   NA
 401613 330358 lp_tRNA36 lp_1369 tRNA-Leu   FALSE 0.105 249.000 0.000 NA   NA
 330358 330359 lp_1369 lp_1371     FALSE 0.005 165.000 0.000 NA   0.026
 330361 330362 lp_1373 lp_1374   metH FALSE 0.074 28.000 0.000 NA   -0.561
 330362 330363 lp_1374 lp_1375 metH metE TRUE 0.989 14.000 0.030 1.000 Y 0.684
 330364 330365 lp_1377 lp_1378   cysD FALSE 0.109 -22.000 0.000 NA   0.200
 330365 330366 lp_1378 lp_1379 cysD cysC TRUE 0.963 3.000 0.000 0.001 Y 0.488
 330366 330367 lp_1379 lp_1380 cysC   TRUE 0.893 -31.000 0.000 1.000   0.423
 330367 330368 lp_1380 lp_1381   astA FALSE 0.096 221.000 0.000 1.000   0.367
 330368 330369 lp_1381 lp_1385 astA   FALSE 0.131 506.000 0.000 1.000   0.529
 330369 330370 lp_1385 lp_1386     FALSE 0.002 276.000 0.000 1.000   -0.052
 330370 330371 lp_1386 lp_1388     FALSE 0.200 127.000 0.000 NA   0.341
 330371 401578 lp_1388 lp_tRNA37   tRNA-Gly FALSE 0.602 63.000 0.000 NA   NA
 401578 401579 lp_tRNA37 lp_tRNA38 tRNA-Gly tRNA-Asp FALSE 0.629 57.000 0.000 NA   NA
 401579 330372 lp_tRNA38 lp_1390 tRNA-Asp   FALSE 0.327 122.000 0.000 NA   NA
 330372 330373 lp_1390 lp_1391   argS FALSE 0.002 272.000 0.000 1.000   -0.150
 330375 330376 lp_1393 lp_1394     FALSE 0.001 684.000 0.000 NA   0.064
 330376 330377 lp_1394 lp_1395     TRUE 0.982 19.000 0.000 NA   0.866
 330377 330378 lp_1395 lp_1396     FALSE 0.078 135.000 0.000 NA   0.271
 330380 330381 lp_1398 lp_1399 pts15A pts15B TRUE 0.996 -3.000 0.500 0.023 Y 0.617
 330381 330382 lp_1399 lp_1400 pts15B pts15C TRUE 0.982 34.000 1.000 0.023 Y 0.325
 330382 330383 lp_1400 lp_1401 pts15C pbg3 TRUE 0.979 3.000 0.000 1.000 Y 0.615
 330384 330385 lp_1402 lp_1403     TRUE 0.898 0.000 0.000 NA   0.442
 330385 330386 lp_1403 lp_1406   dltC2 FALSE 0.163 270.000 0.000 NA   0.459
 330386 330387 lp_1406 lp_1407 dltC2   FALSE 0.013 103.000 0.000 1.000   -0.026
 330388 330389 lp_1409 lp_1410   arcT FALSE 0.028 66.000 0.000 1.000   0.019
 330389 330390 lp_1410 lp_1411 arcT argR1 FALSE 0.059 178.000 0.015 1.000 N 0.147
 330390 330391 lp_1411 lp_1412 argR1   TRUE 0.884 78.000 0.000 NA   0.711
 330391 330392 lp_1412 lp_1413   pbp2A FALSE 0.127 294.000 0.000 NA   0.441
 330392 330393 lp_1413 lp_1415 pbp2A   FALSE 0.502 91.000 0.168 NA   0.197
 330393 330394 lp_1415 lp_1416     FALSE 0.201 70.000 0.093 NA   -0.104
 330394 330395 lp_1416 lp_1417     TRUE 0.942 -13.000 0.330 1.000 Y 0.031
 330395 330396 lp_1417 lp_1418     TRUE 0.955 11.000 0.291 1.000   0.373
 330396 330397 lp_1418 lp_1419     FALSE 0.002 317.000 0.000 NA   -0.045
 330398 330399 lp_1420 lp_1422 nsr   FALSE 0.004 186.000 0.000 1.000   -0.038
 330400 330401 lp_1424 lp_1425     TRUE 0.985 3.000 0.312 NA   0.533
 330401 330402 lp_1425 lp_1426     FALSE 0.176 88.000 0.000 NA   0.283
 330404 330405 lp_1428 lp_1430     FALSE 0.001 627.000 0.000 NA   -0.012
 330405 330406 lp_1430 lp_1431     TRUE 0.972 -3.000 0.031 NA   0.544
 330406 330407 lp_1431 lp_1433     FALSE 0.585 120.000 0.000 NA   0.507
 5937129 330409 lp_1436 lp_1437 ribB ribA TRUE 0.975 2.000 0.000 NA   0.719
 330409 330410 lp_1437 lp_1438 ribA ribH TRUE 0.993 -3.000 0.010 0.002 Y 0.826
 330411 330412 lp_1439 lp_1440     FALSE 0.004 177.000 0.000 NA   0.108
 330416 330417 lp_1446 lp_1447     TRUE 0.968 6.000 0.000 NA   0.675
 330417 330418 lp_1447 lp_1448     TRUE 0.840 60.000 0.000 NA   0.529
 330418 330419 lp_1448 lp_1449     TRUE 0.955 10.000 0.000 NA   0.592
 330419 330420 lp_1449 lp_1450     TRUE 0.962 19.000 0.000 NA   0.601
 330420 330421 lp_1450 lp_1452   prtM1 FALSE 0.001 474.000 0.000 NA   -0.300
 330421 330422 lp_1452 lp_1453 prtM1   FALSE 0.138 233.000 0.000 NA   0.419
 330422 330423 lp_1453 lp_1454     TRUE 0.980 11.000 0.011 NA   0.721
 330424 330425 lp_1455 lp_1456 ecsA ecsB TRUE 0.962 -7.000 0.135 NA N 0.400
 330425 330426 lp_1456 lp_1457 ecsB   FALSE 0.609 119.000 0.049 NA N 0.406
 330426 330427 lp_1457 lp_1458     TRUE 0.858 86.000 0.154 NA   0.479
 330429 330430 lp_1460 lp_1461   ftsK1 TRUE 0.975 27.000 0.143 1.000   0.540
 330430 330431 lp_1461 lp_1462 ftsK1 murC TRUE 0.945 63.000 0.017 0.004 N 0.639
 330432 330433 lp_1463 lp_1466 ISP1 feoB FALSE 0.053 586.000 0.000 1.000 N NA
 330433 330434 lp_1466 lp_1467 feoB   TRUE 0.967 2.000 0.052 1.000   0.515
 330435 330436 lp_1468 lp_1469     TRUE 0.993 13.000 0.139 1.000 Y 0.710
 330436 330437 lp_1469 lp_1470   csd1 TRUE 0.997 -16.000 0.606 1.000 N 0.759
 330437 330438 lp_1470 lp_1471 csd1 nifU TRUE 0.996 -13.000 0.292 1.000 N 0.888
 330438 330439 lp_1471 lp_1472 nifU   TRUE 0.995 -3.000 0.152 0.001 N 0.868
 330439 330440 lp_1472 lp_1473   fecB TRUE 0.980 17.000 0.003 1.000 N 0.663
 330441 330442 lp_1475 lp_1476 fecE fecD TRUE 0.994 -3.000 0.400 1.000 Y 0.548
 330442 330443 lp_1476 lp_1477 fecD   TRUE 0.960 4.000 0.000 1.000 N 0.565
 330444 330445 lp_1478 lp_1479 moaE moaD TRUE 0.983 3.000 0.501 1.000 Y 0.362
 330445 330446 lp_1479 lp_1480 moaD moaA TRUE 0.933 44.000 0.006 1.000 Y 0.483
 330446 330447 lp_1480 lp_1481 moaA narK TRUE 0.976 5.000 0.011 1.000 N 0.603
 330447 330448 lp_1481 lp_1482 narK   FALSE 0.013 104.000 0.029 NA   -0.080
 330448 330449 lp_1482 lp_1483     TRUE 0.936 30.000 0.000 NA   0.557
 330450 330451 lp_1484 lp_1485     TRUE 0.982 15.000 0.500 NA   0.459
 330451 330452 lp_1485 lp_1486     TRUE 0.993 10.000 1.000 NA   0.549
 330452 330453 lp_1486 lp_1487   rrp4 FALSE 0.317 318.000 0.750 NA   0.281
 330453 330454 lp_1487 lp_1488 rrp4 hpk4 TRUE 0.996 33.000 0.400 0.008 Y 0.860
 330454 330455 lp_1488 lp_1489 hpk4   TRUE 0.993 24.000 0.200 NA   0.908
 330455 330456 lp_1489 lp_1490     TRUE 0.784 93.000 0.250 NA   0.382
 330456 330457 lp_1490 lp_1491   mobA TRUE 0.870 -10.000 0.009 NA   0.344
 330457 330458 lp_1491 lp_1492 mobA moaC TRUE 0.963 17.000 0.020 NA Y 0.442
 330458 330459 lp_1492 lp_1493 moaC mobB TRUE 0.890 -7.000 0.000 0.003 Y 0.300
 330459 330460 lp_1493 lp_1494 mobB moeA TRUE 0.959 -21.000 0.075 0.003 Y 0.318
 330460 330461 lp_1494 lp_1495 moeA moaB TRUE 0.990 15.000 0.012 0.003 Y 0.713
 330461 330462 lp_1495 lp_1496 moaB moeB TRUE 0.966 -3.000 0.044 1.000 Y 0.411
 330463 330464 lp_1497 lp_1498 narG narH TRUE 0.998 -10.000 0.429 0.001 Y 0.868
 330464 330465 lp_1498 lp_1499 narH narJ TRUE 0.997 -7.000 0.933 0.002 Y 0.554
 330465 330466 lp_1499 lp_1500 narJ narI TRUE 0.991 -3.000 0.206 0.002 Y 0.530
 330466 330467 lp_1500 lp_1502 narI   FALSE 0.256 213.000 0.000 NA   0.485
 330467 330468 lp_1502 lp_1503     TRUE 0.993 -3.000 0.714 NA   0.554
 330468 330469 lp_1503 lp_1505     FALSE 0.003 192.000 0.000 NA   -0.094
 330469 330470 lp_1505 lp_1506     TRUE 0.996 18.000 1.000 NA   0.675
 330470 330471 lp_1506 lp_1507     FALSE 0.052 256.000 0.000 NA   0.330
 330471 330472 lp_1507 lp_1508   polA FALSE 0.049 263.000 0.000 NA   0.329
 330472 330473 lp_1508 lp_1509 polA fpg TRUE 0.984 12.000 0.101 1.000 Y 0.527
 330473 330474 lp_1509 lp_1510 fpg coaE TRUE 0.989 1.000 0.066 1.000 N 0.736
 330474 330475 lp_1510 lp_1511 coaE   TRUE 0.926 42.000 0.024 NA N 0.505
 330475 330476 lp_1511 lp_1512   dnaB TRUE 0.990 22.000 0.109 NA N 0.709
 330476 330477 lp_1512 lp_1513 dnaB dnaI TRUE 0.997 4.000 0.817 NA Y 0.662
 330477 330478 lp_1513 lp_1514 dnaI thrS FALSE 0.179 333.000 0.000 NA N 0.496
 330478 330479 lp_1514 lp_1515 thrS infC FALSE 0.147 222.000 0.000 1.000 Y 0.306
 330479 330480 lp_1515 lp_1516 infC rpmI TRUE 0.998 22.000 0.652 1.000 Y 0.879
 330480 330481 lp_1516 lp_1517 rpmI rplT TRUE 0.997 37.000 0.928 0.018 Y 0.849
 330481 330482 lp_1517 lp_1518 rplT   FALSE 0.002 244.000 0.000 NA   0.082
 330483 330484 lp_1519 lp_1521 cshA1   FALSE 0.001 410.000 0.000 1.000 N 0.068
 330485 330486 lp_1522 lp_1523   racD FALSE 0.005 376.000 0.000 NA N 0.204
 330487 330488 lp_1524 lp_1525 ica1   TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   0.404
 330489 330490 lp_1527 lp_1528     TRUE 0.967 -3.000 0.555 1.000   0.306
 330490 330491 lp_1528 lp_1529     TRUE 0.888 71.000 0.068 NA   0.520
 330491 330492 lp_1529 lp_1530   nadD TRUE 0.976 13.000 0.150 NA N 0.501
 330492 330493 lp_1530 lp_1531 nadD   TRUE 0.996 -16.000 0.199 1.000 Y 0.731
 330493 330494 lp_1531 lp_1532     TRUE 0.983 18.000 0.149 NA   0.569
 330494 330495 lp_1532 lp_1533     TRUE 0.964 -3.000 0.085 NA   0.462
 330495 330496 lp_1533 lp_1534     TRUE 0.990 15.000 0.094 NA   0.829
 330496 330497 lp_1534 lp_1535     TRUE 0.762 125.000 0.070 NA   0.532
 330497 330498 lp_1535 lp_1535a   rpmF TRUE 0.897 60.000 0.599 NA   0.306
 330502 330503 lp_1541 lp_1543 gnd2 cshA2 FALSE 0.005 169.000 0.000 1.000 N 0.034
 330503 330504 lp_1543 lp_1544 cshA2 rrp5 FALSE 0.005 163.000 0.000 0.050 N 0.128
 330504 330505 lp_1544 lp_1545 rrp5 hpk5 TRUE 0.997 0.000 0.438 0.080 Y 0.683
 330505 330506 lp_1545 lp_1546 hpk5   FALSE 0.001 371.000 0.000 1.000 N 0.042
 330507 330508 lp_1548 lp_1549 sbcC sbcD TRUE 0.994 3.000 0.669 1.000 Y 0.502
 330510 330511 lp_1553 lp_1554     TRUE 0.847 64.000 0.000 1.000 N 0.521
 330512 330513 lp_1555 lp_1556     FALSE 0.046 101.000 0.005 NA   0.147
 330513 330514 lp_1556 lp_1557     TRUE 0.954 62.000 0.009 NA   0.820
 330514 330515 lp_1557 lp_1558   pheS FALSE 0.001 328.000 0.000 NA N 0.097
 330515 330516 lp_1558 lp_1559 pheS pheT TRUE 0.995 9.000 0.574 0.001 Y 0.565
 330516 330517 lp_1559 lp_1561 pheT   FALSE 0.156 147.000 0.007 NA   0.264
 330517 330518 lp_1561 lp_1562   udk TRUE 0.988 19.000 0.017 NA   0.868
 330518 330519 lp_1562 lp_1563 udk greA2 TRUE 0.923 111.000 0.095 1.000 N 0.751
 330520 330521 lp_1564 lp_1565     TRUE 0.985 1.000 0.714 NA   0.436
 330524 330525 lp_1568 lp_1570 pbp2B1 fthC FALSE 0.235 423.000 0.000 1.000 N 0.587
 330525 330526 lp_1570 lp_1571 fthC   TRUE 0.991 -13.000 0.037 1.000   0.891
 330526 330527 lp_1571 lp_1572     TRUE 0.992 19.000 0.347 NA   0.635
 330527 330528 lp_1572 lp_1573   glk TRUE 0.984 18.000 0.496 NA   0.474
 330528 330529 lp_1573 lp_1574 glk   FALSE 0.002 286.000 0.000 1.000 N 0.097
 330529 330530 lp_1574 lp_1576     FALSE 0.003 228.000 0.000 NA N 0.129
 330532 330533 lp_1578 lp_1579 glpQ2 miaA FALSE 0.464 5.000 0.018 1.000 N 0.086
 330533 330534 lp_1579 lp_1580 miaA glnR FALSE 0.053 112.000 0.004 1.000 N 0.096
 330534 330535 lp_1580 lp_1581 glnR glnA TRUE 0.940 44.000 0.090 1.000 N 0.499
 330535 330536 lp_1581 lp_1583 glnA   TRUE 0.785 135.000 0.118 NA   0.548
 330536 330537 lp_1583 lp_1584     TRUE 0.995 -10.000 0.786 NA   0.603
 330537 330538 lp_1584 lp_1585     TRUE 0.850 17.000 0.176 NA   0.179
 330539 330540 lp_1586 lp_1587     TRUE 0.897 58.000 0.000 NA   0.613
 330540 401612 lp_1587 lp_tRNA39   tRNA-Arg FALSE 0.051 431.000 0.000 NA   NA
 330541 330542 lp_1590 lp_1591     FALSE 0.001 379.000 0.000 NA   0.125
 330542 330543 lp_1591 lp_1592   rplU FALSE 0.089 158.000 0.005 1.000 N 0.188
 330543 330544 lp_1592 lp_1593 rplU   TRUE 0.976 22.000 0.208 NA Y 0.399
 330544 330545 lp_1593 lp_1594   rpmA TRUE 0.993 25.000 0.203 NA Y 0.685
 330545 330546 lp_1594 lp_1595 rpmA pepP FALSE 0.541 195.000 0.013 1.000 N 0.560
 330546 330547 lp_1595 lp_1596 pepP efp TRUE 0.917 71.000 0.160 1.000 N 0.495
 330547 330548 lp_1596 lp_1597 efp asp3 TRUE 0.910 50.000 0.031 NA   0.518
 330548 330549 lp_1597 lp_1598 asp3 nusB TRUE 0.993 -3.000 0.265 NA   0.741
 330549 330550 lp_1598 lp_1599 nusB folD FALSE 0.488 138.000 0.082 1.000 N 0.343
 330550 330551 lp_1599 lp_1600 folD xseA TRUE 0.981 -7.000 0.045 1.000 N 0.566
 330551 330552 lp_1600 lp_1601 xseA xseB TRUE 0.977 0.000 0.412 0.001 Y 0.294
 330552 330553 lp_1601 lp_1602 xseB ispA TRUE 0.989 -7.000 0.100 1.000 N 0.636
 330553 330554 lp_1602 lp_1603 ispA   TRUE 0.989 15.000 0.058 1.000 N 0.800
 330554 330555 lp_1603 lp_1604   argR2 TRUE 0.893 84.000 0.048 1.000 N 0.568
 330555 330556 lp_1604 lp_1605 argR2 recN TRUE 0.741 103.000 0.037 1.000 N 0.456
 330556 330557 lp_1605 lp_1607 recN opuA FALSE 0.019 366.000 0.000 1.000 N 0.256
 330557 330558 lp_1607 lp_1608 opuA opuB TRUE 0.998 -3.000 0.450 0.079 Y 0.810
 330558 330559 lp_1608 lp_1609 opuB opuC TRUE 0.997 13.000 0.650 0.043 N 0.860
 330559 330560 lp_1609 lp_1610 opuC opuD TRUE 0.997 0.000 0.619 0.043 N 0.845
 330562 330563 lp_1612 lp_1613 gmk1 rpoZ TRUE 0.963 -3.000 0.471 1.000 N 0.265
 330563 330564 lp_1613 lp_1614 rpoZ dfp FALSE 0.285 164.000 0.192 1.000 N 0.180
 330564 330565 lp_1614 lp_1615 dfp priA TRUE 0.974 23.000 0.099 1.000 N 0.507
 330565 330566 lp_1615 lp_1616 priA fmt TRUE 0.989 24.000 0.052 1.000 N 0.825
 330566 330567 lp_1616 lp_1617 fmt sunL TRUE 0.996 -3.000 0.305 1.000 Y 0.736
 330567 330568 lp_1617 lp_1618 sunL pppL TRUE 0.992 18.000 0.074 1.000 N 0.852
 330568 330569 lp_1618 lp_1619 pppL pkn1 TRUE 0.998 -3.000 0.704 1.000 Y 0.716
 330569 330570 lp_1619 lp_1620 pkn1   FALSE 0.609 85.000 0.196 1.000   0.239
 330570 330571 lp_1620 lp_1621   rpe TRUE 0.993 10.000 0.213 1.000   0.855
 330571 330572 lp_1621 lp_1622 rpe   TRUE 0.992 0.000 0.166 1.000 N 0.732
 330574 330575 lp_1625 lp_1626     TRUE 0.993 37.000 0.567 NA   0.850
 330575 330576 lp_1626 lp_1627   recG FALSE 0.679 143.000 0.074 1.000   0.502
 330576 330577 lp_1627 lp_1628 recG plsX TRUE 0.926 42.000 0.033 1.000 N 0.497
 330577 330578 lp_1628 lp_1629 plsX acpA1 TRUE 0.963 39.000 0.029 0.005 Y 0.520
 330578 330579 lp_1629 lp_1631 acpA1 rnc FALSE 0.054 416.000 0.009 1.000 N 0.300
 330579 330580 lp_1631 lp_1632 rnc smc TRUE 0.982 31.000 0.120 1.000 N 0.625
 330580 330581 lp_1632 lp_1633 smc ftsY TRUE 0.944 10.000 0.165 0.013 N 0.344
 330581 330582 lp_1633 lp_1634 ftsY   FALSE 0.201 178.000 0.081 1.000   0.267
 330582 330583 lp_1634 lp_1635   ffh TRUE 0.987 23.000 0.151 1.000   0.643
 330583 330584 lp_1635 lp_1636 ffh rpsP TRUE 0.895 97.000 0.361 1.000 N 0.463
 330584 330585 lp_1636 lp_1637 rpsP   TRUE 0.995 18.000 0.385 1.000   0.771
 330585 330586 lp_1637 lp_1638   rimM FALSE 0.295 161.000 0.324 1.000   0.136
 330586 330587 lp_1638 lp_1639 rimM trmD TRUE 0.998 0.000 0.672 1.000 Y 0.845
 330587 330588 lp_1639 lp_1640 trmD rplS TRUE 0.869 158.000 0.567 1.000 Y 0.476
 330588 330589 lp_1640 lp_1642 rplS   FALSE 0.001 436.000 0.000 NA   0.128
 330589 330590 lp_1642 lp_1643     FALSE 0.001 629.000 0.000 NA   -0.034
 330590 330591 lp_1643 lp_1645     FALSE 0.604 22.000 0.000 1.000   0.297
 330591 330592 lp_1645 lp_1648     FALSE 0.001 497.000 0.000 1.000   -0.146
 330592 330593 lp_1648 lp_1649     TRUE 0.984 -10.000 0.341 NA   0.468
 330593 330594 lp_1649 lp_1652   trpE FALSE 0.001 473.000 0.000 NA   0.140
 330594 330595 lp_1652 lp_1653 trpE trpG TRUE 0.995 -16.000 0.152 0.001 Y 0.644
 330595 330596 lp_1653 lp_1654 trpG trpD TRUE 0.985 25.000 0.053 1.000 Y 0.571
 330596 330597 lp_1654 lp_1655 trpD trpC TRUE 0.985 -3.000 0.022 1.000 Y 0.561
 330597 330598 lp_1655 lp_1656 trpC trpF TRUE 0.991 -3.000 0.020 0.002 Y 0.665
 330598 330599 lp_1656 lp_1657 trpF trpA TRUE 0.994 2.000 0.375 0.002 Y 0.543
 330599 330600 lp_1657 lp_1658 trpA trpB TRUE 0.982 -10.000 0.002 0.001 Y 0.528
 330600 330601 lp_1658 lp_1659 trpB   FALSE 0.005 161.000 0.000 1.000 N -0.232
 330601 330602 lp_1659 lp_1660     TRUE 0.905 1.000 0.000 1.000 N 0.431
 330602 330603 lp_1660 lp_1662     FALSE 0.003 215.000 0.000 NA   0.009
 330603 330604 lp_1662 lp_1663     FALSE 0.040 280.000 0.000 NA   0.320
 330604 330605 lp_1663 lp_1664     TRUE 0.953 13.000 0.000 NA   0.577
 330605 330606 lp_1664 lp_1665   adh1 FALSE 0.002 289.000 0.000 1.000   0.186
 330606 330607 lp_1665 lp_1667 adh1   FALSE 0.002 307.000 0.000 NA   -0.055
 330607 330608 lp_1667 lp_1668     FALSE 0.040 289.000 0.000 NA   0.323
 330608 330609 lp_1668 lp_1669     TRUE 0.931 15.000 0.000 1.000   0.508
 330609 330610 lp_1669 lp_1670   fabZ1 FALSE 0.125 462.000 0.000 1.000 N 0.482
 330610 330611 lp_1670 lp_1671 fabZ1 fabH2 TRUE 0.970 75.000 0.007 0.005 Y 0.958
 330611 330612 lp_1671 lp_1672 fabH2 acpA2 TRUE 0.982 57.000 0.019 0.005 Y 0.944
 330612 330613 lp_1672 lp_1673 acpA2 fabD TRUE 0.992 4.000 0.005 1.000 Y 0.951
 330613 330614 lp_1673 lp_1674 fabD fabG1 TRUE 0.998 -13.000 0.432 0.057 Y 0.965
 330614 330615 lp_1674 lp_1675 fabG1 fabF TRUE 0.995 19.000 0.056 1.000 Y 0.972
 330615 330616 lp_1675 lp_1676 fabF accB2 TRUE 0.995 -3.000 0.074 1.000 Y 0.964
 330616 330617 lp_1676 lp_1677 accB2 fabZ2 TRUE 0.991 0.000 0.000 NA Y 0.951
 330617 330618 lp_1677 lp_1678 fabZ2 accC2 TRUE 0.991 15.000 0.031 NA Y 0.783
 330618 330619 lp_1678 lp_1679 accC2 accD2 TRUE 0.995 -34.000 0.090 1.000 Y 0.822
 330619 330620 lp_1679 lp_1680 accD2 accA2 TRUE 0.997 -7.000 0.234 0.002 Y 0.974
 330620 330621 lp_1680 lp_1681 accA2 fabI TRUE 0.993 21.000 0.015 1.000 Y 0.969
 330621 330622 lp_1681 lp_1682 fabI   TRUE 0.986 0.000 0.000 1.000 N 0.978
 330624 330625 lp_1685 lp_1686     FALSE 0.655 207.000 0.000 NA N 0.888
 330625 330626 lp_1686 lp_1687     FALSE 0.494 265.000 0.000 NA   0.802
 330628 330629 lp_1689 lp_1690     FALSE 0.005 158.000 0.000 1.000   -0.013
 330631 330632 lp_1693 lp_1693a     FALSE 0.110 -76.000 0.000 NA   0.147
 330633 330634 lp_1694 lp_1695     FALSE 0.009 129.000 0.000 NA   0.209
 330635 330636 lp_1696 lp_1697 cfa1   FALSE 0.002 248.000 0.000 1.000   -0.081
 330639 330640 lp_1700 lp_1701 tspO   TRUE 0.959 28.000 0.000 1.000 Y 0.521
 330640 330641 lp_1701 lp_1702     FALSE 0.433 158.000 0.000 1.000   0.505
 330641 330642 lp_1702 lp_1703     FALSE 0.174 147.000 0.000 1.000   0.348
 330643 330644 lp_1704 lp_1705     TRUE 0.929 72.000 0.000 NA   0.933
 330644 330645 lp_1705 lp_1706     TRUE 0.978 16.000 0.000 NA   0.817
 330646 330647 lp_1708 lp_1709     FALSE 0.020 78.000 0.000 NA   0.180
 330647 330648 lp_1709 lp_1711   pepD4 FALSE 0.004 184.000 0.000 NA   0.217
 330649 330650 lp_1712 lp_1713 xylH lysA TRUE 0.935 73.000 0.002 1.000   0.807
 330650 330651 lp_1713 lp_1715 lysA   FALSE 0.254 406.000 0.000 1.000 N 0.600
 330651 330652 lp_1715 lp_1716     FALSE 0.139 99.000 0.000 1.000   0.273
 330652 330653 lp_1716 lp_1717     FALSE 0.015 93.000 0.000 NA   0.160
 330653 330654 lp_1717 lp_1718     FALSE 0.007 140.000 0.000 NA   0.201
 330654 330655 lp_1718 lp_1721     FALSE 0.001 438.000 0.000 NA   -0.288
 330655 330656 lp_1721 lp_1722     TRUE 0.973 17.000 0.462 1.000 Y 0.279
 330658 330659 lp_1724 lp_1726     FALSE 0.318 169.000 0.000 NA   0.464
 330659 330660 lp_1726 lp_1729     FALSE 0.033 495.000 0.000 NA   0.365
 330660 330661 lp_1729 lp_1730   map3 TRUE 0.989 14.000 0.000 NA Y 0.875
 330661 330662 lp_1730 lp_1731 map3 galM2 TRUE 0.989 25.000 0.000 0.009 Y 0.891
 330663 330664 lp_1732 lp_1733 idi1 mvaK2 TRUE 0.902 72.000 0.097 0.003 N 0.487
 330664 330665 lp_1733 lp_1734 mvaK2 mvaD TRUE 0.991 51.000 0.312 0.003 Y 0.756
 330665 330666 lp_1734 lp_1735 mvaD mvaK1 TRUE 0.995 26.000 0.281 0.003 Y 0.677
 330667 330668 lp_1736 lp_1737   dinG FALSE 0.001 329.000 0.000 NA   0.116
 330668 330669 lp_1737 lp_1738 dinG   TRUE 0.918 66.000 0.296 NA   0.447
 330669 330670 lp_1738 lp_1739   aspB TRUE 0.992 17.000 0.205 NA   0.786
 330670 330671 lp_1739 lp_1740 aspB asnS2 TRUE 0.989 18.000 0.068 1.000 N 0.717
 330671 330672 lp_1740 lp_1741 asnS2 dnaD TRUE 0.971 78.000 0.234 NA N 0.792
 330672 330673 lp_1741 lp_1742 dnaD   FALSE 0.034 56.000 0.000 NA   0.083
 330673 330674 lp_1742 lp_1744     FALSE 0.001 374.000 0.000 NA   -0.134
 330674 330675 lp_1744 lp_1745     TRUE 0.991 0.000 0.938 1.000 Y 0.393
 330675 330676 lp_1745 lp_1746     TRUE 0.895 19.000 0.042 NA Y 0.224
 330676 330677 lp_1746 lp_1747     FALSE 0.235 91.000 0.000 NA N 0.271
 330678 330679 lp_1748 lp_1749     TRUE 0.938 -3.000 0.000 0.042 N 0.463
 330679 330680 lp_1749 lp_1750     TRUE 0.857 13.000 0.000 0.042 N 0.381
 330680 330681 lp_1750 lp_1751   pbp1A FALSE 0.004 185.000 0.000 1.000 N -0.180
 330681 330682 lp_1751 lp_1752 pbp1A recU TRUE 0.955 12.000 0.319 1.000   0.366
 330683 330684 lp_1753 lp_1754     TRUE 0.958 75.000 0.579 NA   0.540
 330684 330685 lp_1754 lp_1756     FALSE 0.175 560.000 0.000 1.000   0.596
 330685 330686 lp_1756 lp_1757     FALSE 0.693 38.000 0.000 1.000 N 0.346
 330686 330687 lp_1757 lp_1759     FALSE 0.002 263.000 0.000 1.000 N 0.108
 330689 330690 lp_1762 lp_1763     FALSE 0.559 169.000 0.000 NA   0.622
 330690 330691 lp_1763 lp_1764     FALSE 0.037 154.000 0.000 NA N 0.219
 330691 330692 lp_1764 lp_1765     TRUE 0.979 -13.000 0.000 NA   0.733
 330692 330693 lp_1765 lp_1766     FALSE 0.285 145.000 0.000 NA   0.408
 330693 330694 lp_1766 lp_1767     FALSE 0.007 148.000 0.000 NA   0.205
 330694 330695 lp_1767 lp_1768     FALSE 0.374 82.000 0.000 NA N 0.319
 330695 330696 lp_1768 lp_1770     FALSE 0.007 145.000 0.000 NA   0.073
 330696 330697 lp_1770 lp_1771     TRUE 0.982 0.000 0.000 NA   0.868
 330699 330700 lp_1774 lp_1776     FALSE 0.005 158.000 0.000 1.000   -0.020
 330702 330703 lp_1778 lp_1779 esbA fhs TRUE 0.857 94.000 0.333 NA   0.436
 330703 330704 lp_1779 lp_1780 fhs lspA FALSE 0.006 333.000 0.030 1.000 N -0.055
 330704 330705 lp_1780 lp_1781 lspA rluD1 TRUE 0.974 20.000 0.082 1.000 N 0.501
 330705 330706 lp_1781 lp_1782 rluD1 pyrR2 FALSE 0.326 159.000 0.048 1.000 N 0.327
 330706 330707 lp_1782 lp_1783 pyrR2 pyrAA2 TRUE 0.987 35.000 0.007 1.000 Y 0.870
 330707 5937130 lp_1783 lp_1784 pyrAA2 pyrAB2 TRUE 0.984 -3.000 0.000 NA   0.928
 5937130 330708 lp_1784 lp_1785 pyrAB2 pgm5 FALSE 0.358 179.000 0.000 NA   0.510
 330709 330710 lp_1786 lp_1787   cat FALSE 0.001 566.000 0.000 NA   -0.006
 330710 330711 lp_1787 lp_1788 cat   TRUE 0.988 1.000 0.037 1.000   0.794
 330711 330712 lp_1788 lp_1789     TRUE 0.980 4.000 0.074 NA   0.597
 330713 330714 lp_1790 lp_1791     FALSE 0.047 394.000 0.000 1.000 N 0.345
 330714 330715 lp_1791 lp_1792     FALSE 0.322 13.000 0.000 NA   0.248
 330717 330718 lp_1795 lp_1796     TRUE 0.953 85.000 0.176 NA   0.751
 330718 330719 lp_1796 lp_1797     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   0.377
 330719 330720 lp_1797 lp_1798     FALSE 0.503 115.000 0.000 NA   0.454
 330720 330721 lp_1798 lp_1799     FALSE 0.592 116.000 0.000 NA   0.504
 330721 330722 lp_1799 lp_1800     FALSE 0.601 92.000 0.000 NA   0.456
 330722 330723 lp_1800 lp_1801     TRUE 0.809 82.000 0.000 NA   0.580
 330725 330726 lp_1805 lp_1806     FALSE 0.594 7.000 0.000 NA   0.301
 330726 330727 lp_1806 lp_1807     FALSE 0.003 220.000 0.000 NA   0.194
 330729 330730 lp_1811 lp_1812     FALSE 0.012 193.000 0.000 NA   0.241
 330731 330732 lp_1813 lp_1814     FALSE 0.484 115.000 0.000 NA   0.446
 330732 330733 lp_1814 lp_1815     FALSE 0.076 27.000 0.000 NA   0.183
 330734 330735 lp_1816 lp_1817     TRUE 0.989 2.000 0.367 1.000 N 0.533
 330735 330736 lp_1817 lp_1818   tagB1 FALSE 0.108 -12.000 0.000 1.000 N 0.033
 330736 330737 lp_1818 lp_1819 tagB1 tagB2 FALSE 0.245 1.000 0.000 0.002 Y -0.191
 330737 330738 lp_1819 lp_1820 tagB2   FALSE 0.014 99.000 0.000 1.000   0.139
 330738 330739 lp_1820 lp_1821     FALSE 0.107 157.000 0.000 1.000   0.317
 330739 330740 lp_1821 lp_1822   gshR3 TRUE 0.770 66.000 0.400 1.000 N 0.128
 330742 330743 lp_1824 lp_1825     TRUE 0.873 12.000 0.000 NA   0.436
 330743 330744 lp_1825 lp_1833     FALSE 0.003 2226.000 0.000 NA   0.242
 330744 330745 lp_1833 lp_1834     FALSE 0.316 213.000 0.000 NA   0.526
 330746 330747 lp_1835 lp_1836 msrA2 msrA3 TRUE 0.992 28.000 0.048 0.002 Y 0.810
 330747 330748 lp_1836 lp_1837 msrA3   FALSE 0.093 128.000 0.000 1.000 N 0.242
 330748 330749 lp_1837 lp_1838     TRUE 0.801 23.000 0.028 1.000 N 0.243
 330749 330750 lp_1838 lp_1839   parC FALSE 0.219 184.000 0.053 1.000 N 0.287
 330750 330751 lp_1839 lp_1840 parC parE TRUE 0.987 14.000 0.552 0.002 Y 0.398
 330753 330754 lp_1843 lp_1845   hslU TRUE 0.927 27.000 0.020 1.000 N 0.431
 330754 330755 lp_1845 lp_1846 hslU hslV TRUE 0.997 18.000 0.752 1.000 Y 0.637
 330755 330756 lp_1846 lp_1847 hslV codV TRUE 0.991 -16.000 0.113 1.000 N 0.667
 330756 330757 lp_1847 lp_1848 codV gidC FALSE 0.526 80.000 0.105 1.000 N 0.188
 330757 330758 lp_1848 lp_1850 gidC topA FALSE 0.684 279.000 0.137 1.000 N 0.729
 330758 330759 lp_1850 lp_1852 topA dprA TRUE 0.965 89.000 0.238 1.000 Y 0.637
 330759 330760 lp_1852 lp_1853 dprA rnhB TRUE 0.923 79.000 0.037 1.000 Y 0.552
 330760 330761 lp_1853 lp_1854 rnhB   TRUE 0.993 -7.000 0.148 1.000   0.804
 330761 330762 lp_1854 lp_1855     FALSE 0.004 171.000 0.000 NA   0.018
 330762 330763 lp_1855 lp_1856     FALSE 0.044 163.000 0.000 NA   0.266
 330765 330766 lp_1858 lp_1859 mrr   FALSE 0.004 187.000 0.000 1.000   0.010
 330766 330767 lp_1859 lp_1860     TRUE 0.991 -3.000 0.258 NA   0.631
 330767 330768 lp_1860 lp_1863     FALSE 0.002 285.000 0.000 NA   -0.024
 330768 330769 lp_1863 lp_1864   ctpA FALSE 0.039 367.000 0.000 1.000   0.351
 330769 330770 lp_1864 lp_1865 ctpA   FALSE 0.692 30.000 0.080 NA   0.170
 330770 330771 lp_1865 lp_1866     TRUE 0.876 12.000 0.136 NA   0.263
 330771 330772 lp_1866 lp_1867     TRUE 0.992 13.000 0.828 1.000   0.534
 330772 330773 lp_1867 lp_1868     TRUE 0.862 150.000 0.136 NA   0.747
 330773 330774 lp_1868 lp_1869   dfrA TRUE 0.828 107.000 0.012 NA   0.625
 330774 330775 lp_1869 lp_1870 dfrA thyA TRUE 0.988 10.000 0.295 1.000 N 0.563
 330775 330776 lp_1870 lp_1871 thyA   TRUE 0.941 13.000 0.036 1.000   0.448
 330776 330777 lp_1871 lp_1872     FALSE 0.004 186.000 0.011 NA   0.028
 330777 330778 lp_1872 lp_1873   papL TRUE 0.763 57.000 0.014 NA   0.402
 330778 330779 lp_1873 lp_1874 papL dapB TRUE 0.989 -3.000 0.015 1.000 N 0.824
 330779 330780 lp_1874 lp_1876 dapB   FALSE 0.050 286.000 0.000 1.000   0.339
 330780 330781 lp_1876 lp_1877     FALSE 0.196 111.000 0.000 1.000   0.317
 330781 330782 lp_1877 lp_1879   hbsU FALSE 0.051 212.000 0.146 1.000   -0.155
 330782 330783 lp_1879 lp_1880 hbsU   TRUE 0.839 46.000 0.000 NA   0.497
 330783 330784 lp_1880 lp_1881     FALSE 0.014 98.000 0.000 NA   0.099
 330784 330785 lp_1881 lp_1882   rpsA FALSE 0.645 135.000 0.032 1.000   0.495
 330785 330786 lp_1882 lp_1883 rpsA cmk TRUE 0.897 90.000 0.047 1.000 N 0.603
 330786 330787 lp_1883 lp_1884 cmk   TRUE 0.975 35.000 0.005 1.000   0.817
 330787 330788 lp_1884 lp_1885   recQ2 TRUE 0.886 62.000 0.063 1.000   0.481
 330788 330789 lp_1885 lp_1886 recQ2   TRUE 0.994 -13.000 0.222 NA   0.776
 330789 330790 lp_1886 lp_1887     FALSE 0.189 336.000 0.033 NA   0.449
 330790 330791 lp_1887 lp_1888   rluB FALSE 0.002 300.000 0.000 NA   -0.025
 330791 330792 lp_1888 lp_1889 rluB   TRUE 0.989 0.000 0.224 NA N 0.586
 330792 330793 lp_1889 lp_1890     TRUE 0.996 -13.000 0.570 NA   0.744
 330793 330794 lp_1890 lp_1891     TRUE 0.983 -4.000 0.013 NA   0.688
 330794 330795 lp_1891 lp_1892     TRUE 0.944 39.000 0.013 NA   0.580
 330795 330796 lp_1892 lp_1893     TRUE 0.960 8.000 0.024 1.000   0.529
 330796 330797 lp_1893 lp_1894     TRUE 0.933 56.000 0.019 NA   0.612
 330797 330798 lp_1894 lp_1897   pyk FALSE 0.001 973.000 0.027 NA   -0.114
 330798 330799 lp_1897 lp_1898 pyk pfk TRUE 0.973 86.000 0.261 0.006 Y 0.666
 330799 330800 lp_1898 lp_1899 pfk dnaE FALSE 0.364 114.000 0.098 1.000 N 0.180
 330802 330803 lp_1901 lp_1903   clpB FALSE 0.022 357.000 0.000 NA   0.304
 330803 330804 lp_1903 lp_1904 clpB pepT FALSE 0.608 117.000 0.003 1.000 N 0.442
 330804 330805 lp_1904 lp_1905 pepT   TRUE 0.965 39.000 0.051 NA   0.639
 330805 330806 lp_1905 lp_1906     TRUE 0.992 -13.000 0.283 NA   0.628
 330808 330809 lp_1909 lp_1910 drrB drrA TRUE 0.988 15.000 0.920 1.000 N 0.422
 330811 330812 lp_1912 lp_1913 pps   FALSE 0.048 430.000 0.000 NA N 0.359
 330812 330813 lp_1913 lp_1914     TRUE 0.933 -7.000 0.154 NA N 0.281
 330815 330816 lp_1916 lp_1918     FALSE 0.022 331.000 0.000 NA   0.299
 330816 330817 lp_1918 lp_1919   mntA FALSE 0.011 111.000 0.000 1.000   0.099
 330817 330818 lp_1919 lp_1920 mntA enoA2 TRUE 0.895 68.000 0.006 1.000 N 0.552
 330818 330819 lp_1920 lp_1921 enoA2   FALSE 0.037 174.000 0.000 1.000 Y 0.078
 330821 330822 lp_1923 lp_1925 dapE1 nox3 FALSE 0.010 121.000 0.000 1.000   0.142
 330823 330824 lp_1926 lp_1927   mutT TRUE 0.931 16.000 0.000 1.000 N 0.482
 330825 330826 lp_1928 lp_1929 nrpR2   FALSE 0.323 166.000 0.000 NA   0.463
 330826 330827 lp_1929 lp_1930     FALSE 0.040 230.000 0.000 NA   0.301
 330827 330828 lp_1930 lp_1931     FALSE 0.040 436.000 0.000 1.000   0.367
 330828 330829 lp_1931 lp_1932   gph2 FALSE 0.112 160.000 0.000 1.000   0.327
 330829 330830 lp_1932 lp_1933 gph2 thgA2 TRUE 0.887 -7.000 0.000 1.000   0.421
 330830 330831 lp_1933 lp_1934 thgA2   FALSE 0.580 71.000 0.000 1.000   0.403
 330831 330832 lp_1934 lp_1935     FALSE 0.017 332.000 0.000 NA   0.280
 330832 330833 lp_1935 lp_1936     FALSE 0.697 139.000 0.000 NA   0.647
 330833 330834 lp_1936 lp_1937     TRUE 0.781 3.000 0.000 NA   0.364
 330835 330836 lp_1938 lp_1939     FALSE 0.005 164.000 0.000 1.000 N -0.036
 330837 330838 lp_1941 lp_1942 nox4 rrp6 FALSE 0.323 155.000 0.000 1.000   0.441
 330838 330839 lp_1942 lp_1943 rrp6 hpk6 TRUE 0.975 10.000 0.857 0.007 Y 0.177
 330839 330840 lp_1943 lp_1944 hpk6   TRUE 0.951 -16.000 0.167 NA   0.364
 330840 330841 lp_1944 lp_1945     TRUE 0.982 -3.000 0.080 NA   0.579
 330841 330842 lp_1945 lp_1946     FALSE 0.003 204.000 0.000 NA   0.205
 330843 330844 lp_1947 lp_1948     FALSE 0.734 29.000 0.000 1.000   0.361
 330844 330845 lp_1948 lp_1949     TRUE 0.969 -3.000 0.333 NA   0.381
 330847 330848 lp_1954 lp_1955     TRUE 0.983 14.000 0.368 NA   0.500
 330849 330850 lp_1956 lp_1957     FALSE 0.102 -3.000 0.000 NA   0.214
 330850 330851 lp_1957 lp_1958     FALSE 0.093 2.000 0.000 NA   -0.101
 330851 330852 lp_1958 lp_1959     TRUE 0.851 -16.000 0.027 1.000 N 0.256
 330854 330855 lp_1961 lp_1962   rpoD FALSE 0.006 149.000 0.000 NA   -0.118
 330855 330856 lp_1962 lp_1963 rpoD dnaG TRUE 0.960 82.000 0.209 1.000 N 0.708
 330856 330857 lp_1963 lp_1964 dnaG glyS FALSE 0.101 257.000 0.017 1.000 N 0.278
 330857 330858 lp_1964 lp_1965 glyS glyQ TRUE 0.998 0.000 0.651 0.001 Y 0.764
 330858 330859 lp_1965 lp_1966 glyQ recO FALSE 0.106 323.000 0.036 1.000 N 0.311
 330859 330860 lp_1966 lp_1967 recO   TRUE 0.938 31.000 0.108 1.000   0.433
 330860 330861 lp_1967 lp_1968   dgk TRUE 0.967 41.000 0.063 1.000   0.655
 330861 330862 lp_1968 lp_1969 dgk   TRUE 0.990 -16.000 0.035 NA   0.825
 330862 330863 lp_1969 lp_1970   phoH TRUE 0.992 10.000 0.457 NA   0.637
 330863 330864 lp_1970 lp_1972 phoH   FALSE 0.001 333.000 0.027 1.000   -0.090
 330864 330865 lp_1972 lp_1973   rpsU TRUE 0.983 42.000 0.150 0.026   0.800
 330867 330868 lp_1975 lp_1976   nfo FALSE 0.033 58.000 0.000 1.000 N 0.053
 330868 330869 lp_1976 lp_1977 nfo tagB3 TRUE 0.835 113.000 0.000 1.000 N 0.728
 330869 330870 lp_1977 lp_1978 tagB3   FALSE 0.001 373.000 0.000 NA   0.194
 330870 330871 lp_1978 lp_1979   msrA4 FALSE 0.025 203.000 0.062 NA   0.017
 330871 330872 lp_1979 lp_1980 msrA4 aspS FALSE 0.019 81.000 0.000 1.000 N -0.113
 330872 330873 lp_1980 lp_1981 aspS hisS TRUE 0.991 42.000 0.161 0.045 Y 0.867
 330874 330875 lp_1982 lp_1983 lytH   FALSE 0.034 269.000 0.038 1.000 N 0.091
 330876 330877 lp_1985 lp_1986     TRUE 0.845 73.000 0.009 1.000   0.529
 330877 330878 lp_1986 lp_1987   relA TRUE 0.987 10.000 0.177 1.000 N 0.602
 330878 330879 lp_1987 lp_1988 relA   FALSE 0.621 81.000 0.016 NA   0.383
 330879 330880 lp_1988 lp_1989     TRUE 0.912 71.000 0.006 NA   0.646
 330880 330881 lp_1989 lp_1990     TRUE 0.991 13.000 0.227 NA   0.740
 330881 330882 lp_1990 lp_1991     FALSE 0.473 109.000 0.000 1.000 N 0.411
 330882 330883 lp_1991 lp_1992     FALSE 0.705 67.000 0.000 NA   0.446
 330884 330885 lp_1994 lp_1995     FALSE 0.004 309.000 0.000 NA   0.237
 330885 330886 lp_1995 lp_1997     FALSE 0.206 294.000 0.000 NA   0.513
 330886 330887 lp_1997 lp_2000     FALSE 0.001 988.000 0.000 NA   0.174
 330889 330890 lp_2002 lp_2003     TRUE 0.988 -22.000 0.061 NA   0.708
 330890 330891 lp_2003 lp_2004     TRUE 0.973 30.000 0.000 NA   0.828
 330892 330893 lp_2005 lp_2006   ISP2 FALSE 0.010 122.000 0.000 NA   0.136
 330893 330894 lp_2006 lp_2007 ISP2   FALSE 0.300 141.000 0.000 0.008   NA
 330894 330895 lp_2007 lp_2009     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 330896 330897 lp_2010 lp_2011     TRUE 0.941 4.000 0.000 0.022   0.517
 330897 330898 lp_2011 lp_2013     FALSE 0.255 261.000 0.000 NA   0.524
 330898 330899 lp_2013 lp_2014     FALSE 0.352 178.000 0.000 NA   0.505
 330900 330901 lp_2015 lp_2016 lepA1 dltD FALSE 0.344 164.000 0.002 NA Y 0.330
 330901 330902 lp_2016 lp_2017 dltD dltC1 TRUE 0.995 -3.000 0.409 NA   0.778
 330902 330903 lp_2017 lp_2018 dltC1 dltB TRUE 0.995 24.000 0.387 NA   0.871
 330903 330904 lp_2018 lp_2019 dltB dltA TRUE 0.997 -3.000 0.435 NA N 0.938
 330904 330905 lp_2019 lp_2020 dltA dltX TRUE 0.990 43.000 0.549 NA   0.777
 330905 330906 lp_2020 lp_2021 dltX pbpX2 TRUE 0.971 32.000 0.000 NA   0.835
 330907 330908 lp_2022 lp_2023     FALSE 0.664 -3.000 0.000 NA   0.305
 330909 330910 lp_2026 lp_2027 dnaJ dnaK TRUE 0.923 102.000 0.196 0.003 Y 0.509
 330910 330911 lp_2027 lp_2028 dnaK grpE TRUE 0.985 44.000 0.026 0.006 Y 0.879
 330911 330912 lp_2028 lp_2029 grpE hrcA TRUE 0.992 21.000 0.051 1.000 N 0.928
 330912 330913 lp_2029 lp_2030 hrcA aldB FALSE 0.001 390.000 0.000 1.000 N 0.180
 330913 330914 lp_2030 lp_2031 aldB ribC2 TRUE 0.962 1.000 0.000 1.000 N 0.566
 330914 330915 lp_2031 lp_2032 ribC2 truB TRUE 0.993 13.000 0.308 1.000 N 0.707
 330915 330916 lp_2032 lp_2033 truB aroI FALSE 0.008 485.000 0.000 1.000 N 0.230
 330916 330917 lp_2033 lp_2034 aroI tyrA TRUE 0.989 3.000 0.000 1.000 Y 0.868
 330917 330918 lp_2034 lp_2035 tyrA aroE TRUE 0.994 3.000 0.069 1.000 Y 0.853
 330918 330919 lp_2035 lp_2036 aroE   TRUE 0.985 14.000 0.003 NA   0.897
 330919 330920 lp_2036 lp_2037   aroF TRUE 0.983 9.000 0.003 NA   0.839
 330920 330921 lp_2037 lp_2038 aroF   TRUE 0.987 -7.000 0.000 0.002 N 0.845
 330921 330922 lp_2038 lp_2039   rbfA FALSE 0.002 649.000 0.000 1.000 N 0.188
 330922 330923 lp_2039 lp_2040 rbfA infB TRUE 0.991 23.000 0.530 1.000 Y 0.475
 330923 330924 lp_2040 lp_2041 infB   TRUE 0.993 15.000 0.223 NA Y 0.625
 330924 330925 lp_2041 lp_2042     TRUE 0.996 -10.000 0.408 NA N 0.815
 330925 330926 lp_2042 lp_2043   nusA TRUE 0.992 45.000 0.323 NA Y 0.812
 330926 330927 lp_2043 lp_2044 nusA   TRUE 0.997 21.000 0.759 NA   0.828
 330927 330928 lp_2044 lp_2045   polC FALSE 0.441 296.000 0.059 NA   0.585
 330928 330929 lp_2045 lp_2048 polC proS FALSE 0.451 494.000 0.070 0.045 N 0.701
 330929 330930 lp_2048 lp_2049 proS   TRUE 0.981 40.000 0.095 1.000 N 0.745
 330930 330931 lp_2049 lp_2050   cdsA TRUE 0.981 38.000 0.040 1.000 N 0.822
 330931 330932 lp_2050 lp_2051 cdsA uppS TRUE 0.994 16.000 0.113 1.000 Y 0.800
 330932 330933 lp_2051 lp_2052 uppS frr FALSE 0.642 120.000 0.409 1.000 N 0.235
 330933 330934 lp_2052 lp_2053 frr pyrH TRUE 0.994 2.000 0.626 1.000 N 0.600
 330934 330935 lp_2053 lp_2054 pyrH tsf TRUE 0.786 201.000 0.416 1.000 N 0.567
 330935 330936 lp_2054 lp_2055 tsf rpsB TRUE 0.985 103.000 0.748 1.000 Y 0.833
 330938 330939 lp_2057 lp_2058 ldhD   FALSE 0.732 85.000 0.044 1.000 N 0.408
 330939 330940 lp_2058 lp_2059     TRUE 0.979 -16.000 0.209 1.000   0.468
 330942 330943 lp_2061 lp_2062     FALSE 0.704 98.000 0.145 NA   0.379
 330946 330947 lp_2067 lp_2068 mvaS   TRUE 0.746 36.000 0.000 NA   0.394
 330948 330949 lp_2069 lp_2071     FALSE 0.001 447.000 0.000 NA   -0.186
 330950 330951 lp_2074 lp_2075     FALSE 0.103 152.000 0.000 NA   0.310
 330951 330952 lp_2075 lp_2076     TRUE 0.995 -19.000 0.375 NA N 0.701
 330952 330953 lp_2076 lp_2077     TRUE 0.983 19.000 0.000 1.000 Y 0.655
 330953 330954 lp_2077 lp_2078   rodA1 FALSE 0.064 479.000 0.000 1.000 N 0.402
 330955 330956 lp_2081 lp_2082     FALSE 0.013 103.000 0.000 NA   0.028
 330960 330961 lp_2086 lp_2087 apt recJ TRUE 0.989 19.000 0.128 1.000 N 0.638
 330961 330962 lp_2087 lp_2088 recJ   TRUE 0.965 22.000 0.026 1.000   0.536
 330962 330963 lp_2088 lp_2089     TRUE 0.909 13.000 0.048 1.000   0.382
 330963 330964 lp_2089 lp_2090     TRUE 0.897 10.000 0.074 1.000   0.344
 330967 330968 lp_2095 lp_2096 fruR fruK TRUE 0.998 -3.000 0.721 1.000 Y 0.911
 330968 330969 lp_2096 lp_2097 fruK pts16ABC TRUE 0.998 22.000 0.816 1.000 Y 0.813
 330969 330970 lp_2097 lp_2098 pts16ABC   FALSE 0.207 140.000 0.000 1.000   0.359
 330971 330972 lp_2099 lp_2100 cps4J cps4I FALSE 0.493 80.000 0.000 NA   0.393
 330972 330973 lp_2100 lp_2101 cps4I cps4H TRUE 0.810 -15.000 0.000 NA   0.362
 330973 330974 lp_2101 lp_2102 cps4H cps4G TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   0.521
 330974 330975 lp_2102 lp_2103 cps4G cps4F TRUE 0.962 10.000 0.000 0.016 Y 0.504
 330975 330976 lp_2103 lp_2104 cps4F cps4E TRUE 0.990 0.000 0.047 NA Y 0.656
 330976 330977 lp_2104 lp_2105 cps4E galE3 TRUE 0.941 -19.000 0.015 NA Y 0.340
 330977 330978 lp_2105 lp_2106 galE3 cps4C FALSE 0.528 16.000 0.000 1.000 Y 0.102
 330978 330979 lp_2106 lp_2107 cps4C cps4B TRUE 0.913 -19.000 0.080 1.000 N 0.281
 330979 330980 lp_2107 lp_2108 cps4B cps4A TRUE 0.958 18.000 0.615 1.000 N 0.226
 330980 330981 lp_2108 lp_2109 cps4A uvrC FALSE 0.001 423.000 0.000 1.000 N -0.161
 330981 330982 lp_2109 lp_2110 uvrC glnQ3 FALSE 0.004 183.000 0.004 1.000 N -0.255
 330982 330983 lp_2110 lp_2111 glnQ3 glnPH2 TRUE 0.996 -7.000 0.410 1.000 Y 0.590
 330985 330986 lp_2113 lp_2114     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   0.190
 330986 330987 lp_2114 lp_2115     TRUE 0.936 2.000 0.011 NA   0.453
 330987 330988 lp_2115 lp_2116   clpX FALSE 0.239 159.000 0.043 1.000   0.302
 330988 330989 lp_2116 lp_2118 clpX tig FALSE 0.066 295.000 0.033 0.001 Y -0.015
 330989 330990 lp_2118 lp_2119 tig tuf FALSE 0.003 204.000 0.011 1.000 N -0.134
 330990 330991 lp_2119 lp_2121 tuf   FALSE 0.003 215.000 0.006 NA   -0.236
 330991 330992 lp_2121 lp_2122     TRUE 0.745 63.000 0.182 NA   0.263
 330992 330993 lp_2122 lp_2123   dapA1 TRUE 0.838 20.000 0.035 1.000   0.287
 330993 330994 lp_2123 lp_2124 dapA1   FALSE 0.010 118.000 0.000 1.000 N -0.080
 330994 330995 lp_2124 lp_2125   rpsO FALSE 0.008 137.000 0.000 1.000 N 0.133
 330997 330998 lp_2128 lp_2129 holA comEC TRUE 0.902 -49.000 0.163 1.000   0.233
 330998 330999 lp_2129 lp_2130 comEC comEB FALSE 0.401 1.000 0.055 1.000   0.006
 330999 331000 lp_2130 lp_2131 comEB comEA TRUE 0.957 52.000 0.095 0.047 N 0.565
 331000 331001 lp_2131 lp_2132 comEA lon FALSE 0.253 103.000 0.035 1.000 N 0.162
 331001 331002 lp_2132 lp_2133 lon kdtB TRUE 0.990 -7.000 0.052 1.000 N 0.720
 331002 331003 lp_2133 lp_2134 kdtB   TRUE 0.992 4.000 0.367 1.000 N 0.616
 331003 331004 lp_2134 lp_2135     TRUE 0.971 16.000 0.048 NA   0.554
 331004 331005 lp_2135 lp_2136   pycA FALSE 0.366 161.000 0.014 NA   0.423
 331005 331006 lp_2136 lp_2137 pycA ftsW FALSE 0.686 28.000 0.035 1.000 N 0.168
 331006 331007 lp_2137 lp_2141 ftsW   FALSE 0.001 463.000 0.000 NA   0.083
 331007 331008 lp_2141 lp_2142   ica2 TRUE 0.790 102.000 0.000 NA   0.626
 331008 331009 lp_2142 lp_2143 ica2   TRUE 0.994 -3.000 0.400 NA   0.699
 331009 331010 lp_2143 lp_2145     FALSE 0.480 932.000 0.400 NA   0.620
 331010 331011 lp_2145 lp_2146   typA FALSE 0.002 268.000 0.000 1.000   0.131
 331011 331012 lp_2146 lp_2147 typA suhB FALSE 0.375 190.000 0.024 1.000 N 0.439
 331012 331013 lp_2147 lp_2149 suhB   TRUE 0.993 11.000 0.337 NA   0.748
 331013 5937132 lp_2149 lp_2150     TRUE 0.957 -13.000 0.000 NA   0.549
 5937132 331014 lp_2150 lp_2151   pdhD FALSE 0.086 273.000 0.000 NA   0.387
 331014 331015 lp_2151 lp_2152 pdhD pdhC TRUE 0.998 8.000 0.948 1.000 Y 0.927
 331015 331016 lp_2152 lp_2153 pdhC pdhB TRUE 0.996 58.000 0.883 0.055 Y 0.907
 331016 331017 lp_2153 lp_2154 pdhB pdhA TRUE 0.998 2.000 0.484 0.001 Y 0.923
 331020 331021 lp_2157 lp_2158     TRUE 0.939 -3.000 0.576 NA   0.147
 331021 331022 lp_2158 lp_2159     TRUE 0.955 63.000 0.045 1.000   0.740
 331023 331024 lp_2160 lp_2162     FALSE 0.004 174.000 0.000 NA   0.219
 331026 331027 lp_2166 lp_2168 prs2 recD FALSE 0.686 155.000 0.066 1.000 N 0.521
 331027 331028 lp_2168 lp_2169 recD   TRUE 0.994 16.000 0.281 1.000   0.849
 331028 331029 lp_2169 lp_2170   pgm6 TRUE 0.989 21.000 0.183 1.000   0.664
 331029 331030 lp_2170 lp_2173 pgm6   FALSE 0.001 524.000 0.000 NA   -0.053
 331030 331031 lp_2173 lp_2174     TRUE 0.930 7.000 0.000 NA   0.514
 331031 331032 lp_2174 lp_2175     TRUE 0.788 44.000 0.000 NA   0.446
 331032 331033 lp_2175 lp_2176   ktrA FALSE 0.002 282.000 0.000 1.000   -0.169
 331033 331034 lp_2176 lp_2177 ktrA ntpJ TRUE 0.889 10.000 0.176 0.003 Y -0.034
 331034 331035 lp_2177 lp_2178 ntpJ trmU FALSE 0.004 190.000 0.000 1.000 N -0.165
 331035 331036 lp_2178 lp_2179 trmU   FALSE 0.736 117.000 0.021 NA   0.533
 331036 331037 lp_2179 lp_2180   csd2 TRUE 0.992 3.000 0.166 NA   0.834
 331037 331038 lp_2180 lp_2181 csd2 mtn TRUE 0.936 59.000 0.029 1.000 N 0.584
 331038 331039 lp_2181 lp_2182 mtn   TRUE 0.987 21.000 0.016 NA   0.835
 331039 331040 lp_2182 lp_2183     TRUE 0.987 0.000 0.010 NA   0.838
 331040 331041 lp_2183 lp_2185   dapF FALSE 0.110 195.000 0.002 1.000 N 0.265
 331041 331042 lp_2185 lp_2187 dapF ileS FALSE 0.003 334.000 0.010 1.000 N 0.031
 331042 331043 lp_2187 lp_2189 ileS divIVA FALSE 0.479 315.000 0.012 NA N 0.687
 331043 331044 lp_2189 lp_2190 divIVA   TRUE 0.983 18.000 0.579 NA   0.439
 331044 331045 lp_2190 lp_2191     TRUE 0.986 24.000 0.287 1.000   0.566
 331045 331046 lp_2191 lp_2192     TRUE 0.995 13.000 0.370 NA   0.847
 331046 331047 lp_2192 lp_2193   ftsZ TRUE 0.987 24.000 0.020 NA   0.884
 331047 331048 lp_2193 lp_2194 ftsZ ftsA TRUE 0.996 30.000 0.460 1.000 Y 0.803
 331048 331049 lp_2194 lp_2195 ftsA ftsQ TRUE 0.955 117.000 0.389 NA N 0.755
 331049 331050 lp_2195 lp_2196 ftsQ murG TRUE 0.994 22.000 0.072 NA Y 0.802
 331050 331051 lp_2196 lp_2197 murG murD TRUE 0.993 0.000 0.060 1.000 Y 0.732
 331051 331052 lp_2197 lp_2199 murD mraY FALSE 0.580 292.000 0.647 0.004 Y 0.368
 331052 331053 lp_2199 lp_2200 mraY pbp2B2 TRUE 0.985 29.000 0.038 1.000 Y 0.630
 331053 331054 lp_2200 lp_2201 pbp2B2 ftsL TRUE 0.993 -3.000 0.167 1.000 N 0.733
 331054 331055 lp_2201 lp_2202 ftsL mraW TRUE 0.987 22.000 0.009 1.000 N 0.805
 331055 331056 lp_2202 lp_2203 mraW mraZ TRUE 0.994 34.000 0.635 NA   0.798
 331056 331057 lp_2203 lp_2205 mraZ   FALSE 0.262 170.000 0.008 NA   0.386
 331059 331060 lp_2210 lp_2211 ftsK2 cspR FALSE 0.016 92.000 0.009 1.000 N -0.011
 331061 331062 lp_2212 lp_2213   brnQ2 FALSE 0.015 335.000 0.000 1.000   0.271
 331065 331066 lp_2217 lp_2218   pts17A TRUE 0.983 15.000 0.324 NA   0.517
 331067 331068 lp_2219 lp_2220   cutC TRUE 0.980 16.000 0.000 1.000 N 0.764
 331069 331070 lp_2221 lp_2222 rluD2 ppnK TRUE 0.981 -3.000 0.080 1.000 N 0.539
 331070 331071 lp_2222 lp_2223 ppnK   TRUE 0.997 -3.000 0.725 1.000   0.848
 331073 331074 lp_2225 lp_2226 pepF1 coiA TRUE 0.814 78.000 0.204 NA   0.392
 331074 331075 lp_2226 lp_2227 coiA mecA FALSE 0.279 185.000 0.178 NA   0.281
 331075 331076 lp_2227 lp_2228 mecA nrpR3 FALSE 0.432 136.000 0.000 NA N 0.436
 331076 331077 lp_2228 lp_2229 nrpR3   FALSE 0.002 287.000 0.000 1.000   -0.028
 401611 401610 lp_tRNA41 lp_tRNA42 tRNA-Asp tRNA-Met TRUE 0.832 3.000 0.000 NA   NA
 401610 401609 lp_tRNA42 lp_tRNA43 tRNA-Met tRNA-Glu TRUE 0.816 10.000 0.000 NA   NA
 401609 401608 lp_tRNA43 lp_tRNA44 tRNA-Glu tRNA-Ser TRUE 0.837 20.000 0.000 NA   NA
 401608 401607 lp_tRNA44 lp_tRNA45 tRNA-Ser tRNA-Ile TRUE 0.825 5.000 0.000 NA   NA
 401607 401606 lp_tRNA45 lp_tRNA46 tRNA-Ile tRNA-Gly TRUE 0.819 7.000 0.000 NA   NA
 401606 401605 lp_tRNA46 lp_tRNA47 tRNA-Gly tRNA-Phe TRUE 0.821 13.000 0.000 NA   NA
 401605 401604 lp_tRNA47 lp_tRNA48 tRNA-Phe tRNA-Asp TRUE 0.789 30.000 0.000 NA   NA
 401604 401603 lp_tRNA48 lp_tRNA49 tRNA-Asp tRNA-Met TRUE 0.829 4.000 0.000 NA   NA
 401603 401602 lp_tRNA49 lp_tRNA50 tRNA-Met tRNA-Ser TRUE 0.819 7.000 0.000 NA   NA
 401602 401601 lp_tRNA50 lp_tRNA51 tRNA-Ser tRNA-Met FALSE 0.711 40.000 0.000 NA   NA
 401601 401600 lp_tRNA51 lp_tRNA52 tRNA-Met tRNA-Met TRUE 0.826 16.000 0.000 NA   NA
 401600 401599 lp_tRNA52 lp_tRNA53 tRNA-Met tRNA-Pro TRUE 0.772 32.000 0.000 NA   NA
 401599 401598 lp_tRNA53 lp_tRNA54 tRNA-Pro tRNA-Arg TRUE 0.821 6.000 0.000 NA   NA
 401598 401597 lp_tRNA54 lp_tRNA55 tRNA-Arg tRNA-Leu TRUE 0.816 11.000 0.000 NA   NA
 401597 401596 lp_tRNA55 lp_tRNA56 tRNA-Leu tRNA-Gly TRUE 0.826 16.000 0.000 NA   NA
 401596 401595 lp_tRNA56 lp_tRNA57 tRNA-Gly tRNA-Thr TRUE 0.830 17.000 0.000 NA   NA
 401595 401594 lp_tRNA57 lp_tRNA58 tRNA-Thr tRNA-Lys FALSE 0.430 95.000 0.000 NA   NA
 401594 401593 lp_tRNA58 lp_tRNA59 tRNA-Lys tRNA-Val TRUE 0.835 2.000 0.000 NA   NA
 401593 3829844 lp_tRNA59 lp_rRNA16 tRNA-Val   TRUE 0.825 5.000 0.000 NA   NA
 3829844 401592 lp_rRNA16 lp_tRNA60   tRNA-Lys FALSE 0.640 55.000 0.000 NA   NA
 401592 401591 lp_tRNA60 lp_tRNA61 tRNA-Lys tRNA-Val TRUE 0.835 2.000 0.000 NA   NA
 401591 2208827 lp_tRNA61 lp_rRNA07 tRNA-Val   TRUE 0.825 5.000 0.000 NA   NA
 2208827 2208828 lp_rRNA07 lp_rRNA08     FALSE 0.552 71.000 0.000 NA   NA
 2208828 2208829 lp_rRNA08 lp_rRNA09     FALSE 0.133 206.000 0.000 NA   NA
 2208829 331079 lp_rRNA09 lp_2231a     FALSE 0.045 497.000 0.000 NA   NA
 331079 331080 lp_2231a lp_2231b     TRUE 0.970 0.000 0.041 NA   0.535
 331080 331081 lp_2231b lp_2231c   ppiB FALSE 0.211 130.000 0.110 1.000 N 0.046
 331083 331084 lp_2234 lp_2235     TRUE 0.995 -16.000 0.330 NA   0.777
 331084 331085 lp_2235 lp_2236     TRUE 0.994 22.000 0.320 NA   0.846
 331085 331086 lp_2236 lp_2237     TRUE 0.993 19.000 0.347 NA   0.673
 331086 331087 lp_2237 lp_2238     TRUE 0.972 45.000 0.069 1.000   0.752
 331089 331090 lp_2240 lp_2242   ack3 FALSE 0.204 320.000 0.000 1.000 N 0.502
 331090 331091 lp_2242 lp_2243 ack3   TRUE 0.985 12.000 0.052 1.000 N 0.684
 331091 331092 lp_2243 lp_2244     FALSE 0.003 212.000 0.000 NA   -0.362
 331092 331093 lp_2244 lp_2246     FALSE 0.479 75.000 0.000 NA   0.375
 331093 331094 lp_2246 lp_2247   comGC TRUE 0.970 -10.000 0.320 NA   0.386
 331094 331095 lp_2247 lp_2248 comGC comGB TRUE 0.969 -3.000 0.861 NA Y -0.013
 331095 331096 lp_2248 lp_2249 comGB comGA TRUE 0.938 -64.000 0.639 1.000   0.078
 331096 331097 lp_2249 lp_2251 comGA rbsK2 FALSE 0.003 200.000 0.015 1.000   -0.217
 331097 331098 lp_2251 lp_2253 rbsK2   FALSE 0.673 137.000 0.002 NA   0.556
 331098 331099 lp_2253 lp_2254     FALSE 0.011 218.000 0.000 NA   0.243
 331099 331100 lp_2254 lp_2255     TRUE 0.960 -7.000 0.000 NA   0.565
 331100 331101 lp_2255 lp_2256   ccpA FALSE 0.010 123.000 0.000 NA N -0.013
 331103 331104 lp_2259 lp_2260     TRUE 0.836 70.000 0.000 NA   0.560
 331104 331105 lp_2260 lp_2261     TRUE 0.976 3.000 0.000 NA   0.744
 331107 331108 lp_2263 lp_2264   dapD TRUE 0.993 18.000 0.372 1.000   0.707
 331108 331109 lp_2264 lp_2265 dapD   TRUE 0.977 19.000 0.000 NA   0.751
 331109 331110 lp_2265 lp_2266     TRUE 0.892 88.000 0.000 NA   0.830
 331110 331111 lp_2266 lp_2267   xtp1 TRUE 0.987 -3.000 0.085 1.000   0.646
 331111 331112 lp_2267 lp_2268 xtp1 murI TRUE 0.989 -7.000 0.034 1.000 N 0.738
 331114 331115 lp_2270 lp_2271 trxA2 mutS FALSE 0.013 156.000 0.005 1.000 N 0.053
 331115 331116 lp_2271 lp_2272 mutS   TRUE 0.784 60.000 0.005 NA   0.433
 331116 331117 lp_2272 lp_2273     FALSE 0.294 105.000 0.007 NA   0.289
 331117 331118 lp_2273 lp_2274     TRUE 0.995 13.000 0.651 NA   0.733
 331118 331119 lp_2274 lp_2275     TRUE 0.996 -3.000 0.537 NA   0.781
 331119 331120 lp_2275 lp_2276     FALSE 0.061 34.000 0.000 NA   0.089
 331120 331121 lp_2276 lp_2277   alaS FALSE 0.084 7.000 0.000 NA   0.203
 331121 331122 lp_2277 lp_2278 alaS rhe3 FALSE 0.204 328.000 0.000 0.014 Y 0.431
 331122 331123 lp_2278 lp_2279 rhe3   TRUE 0.987 3.000 0.182 0.014   0.592
 331123 331124 lp_2279 lp_2280   dinP FALSE 0.555 93.000 0.054 1.000   0.332
 331124 331125 lp_2280 lp_2281 dinP   FALSE 0.006 152.000 0.002 NA N -0.314
 331125 331126 lp_2281 lp_2282   tgt TRUE 0.951 78.000 0.325 NA N 0.562
 331126 331127 lp_2282 lp_2285 tgt queA TRUE 0.842 310.000 0.360 0.001 Y 0.767
 331127 331128 lp_2285 lp_2286 queA ruvB TRUE 0.974 18.000 0.069 1.000 N 0.515
 331128 331129 lp_2286 lp_2287 ruvB ruvA TRUE 0.997 18.000 0.549 0.002 Y 0.646
 331131 331132 lp_2290 lp_2292     FALSE 0.409 154.000 0.000 NA   0.484
 331132 331133 lp_2292 lp_2297   hexB FALSE 0.001 1039.000 0.000 NA   0.213
 331133 331134 lp_2297 lp_2298 hexB hexA TRUE 0.899 171.000 0.220 0.001 Y 0.699
 331134 331135 lp_2298 lp_2299 hexA   TRUE 0.849 28.000 0.005 1.000   0.375
 331135 331136 lp_2299 lp_2300     TRUE 0.863 125.000 0.245 1.000   0.556
 331136 331137 lp_2300 lp_2301   recA FALSE 0.072 231.000 0.018 1.000   0.254
 331137 331138 lp_2301 lp_2302 recA cinA TRUE 0.881 92.000 0.083 1.000   0.569
 331138 331139 lp_2302 lp_2303 cinA pgsA FALSE 0.036 268.000 0.151 1.000   -0.279
 331139 331140 lp_2303 lp_2304 pgsA   TRUE 0.988 23.000 0.077 1.000   0.767
 331140 331141 lp_2304 lp_2305     TRUE 0.922 89.000 0.156 1.000   0.613
 331141 331142 lp_2305 lp_2306     TRUE 0.998 -3.000 0.872 0.004   0.808
 331144 331145 lp_2312 lp_2313 glnH2 glnQ4 TRUE 0.992 12.000 0.131 1.000 Y 0.667
 331145 331146 lp_2313 lp_2314 glnQ4 glnP2 TRUE 0.993 13.000 0.136 1.000 Y 0.731
 331146 331147 lp_2314 lp_2315 glnP2 minD FALSE 0.063 480.000 0.000 1.000 N 0.401
 331147 331148 lp_2315 lp_2316 minD minC TRUE 0.997 0.000 0.368 1.000 Y 0.894
 331148 331149 lp_2316 lp_2317 minC mreD TRUE 0.992 22.000 0.106 1.000   0.902
 331149 331150 lp_2317 lp_2318 mreD mreC TRUE 0.996 13.000 0.550 0.002   0.822
 331150 331151 lp_2318 lp_2319 mreC mreB1 TRUE 0.957 71.000 0.024 1.000 N 0.845
 331151 331152 lp_2319 lp_2320 mreB1   FALSE 0.449 227.000 0.130 1.000   0.472
 331152 331153 lp_2320 lp_2321   folC1 FALSE 0.740 172.000 0.074 1.000   0.666
 331153 331154 lp_2321 lp_2322 folC1 valS FALSE 0.578 174.000 0.007 0.097 N 0.548
 331154 331155 lp_2322 lp_2323 valS tpx FALSE 0.028 324.000 0.000 1.000 N 0.269
 331155 331156 lp_2323 lp_2324 tpx gshA FALSE 0.002 240.000 0.000 1.000 N 0.006
 331156 331157 lp_2324 lp_2325 gshA thiI FALSE 0.003 205.000 0.000 1.000 Y -0.405
 331157 331158 lp_2325 lp_2326 thiI csd3 TRUE 0.993 18.000 0.349 1.000 N 0.664
 331158 331159 lp_2326 lp_2328 csd3 ezrA FALSE 0.425 312.000 0.201 1.000 N 0.477
 331160 331161 lp_2330 lp_2331   rpsD FALSE 0.508 202.000 0.005 NA N 0.561
 331164 331165 lp_2334 lp_2335     TRUE 0.982 0.000 0.000 NA   0.858
 331165 331166 lp_2335 lp_2336     FALSE 0.005 167.000 0.000 1.000 N -0.705
 331167 331168 lp_2337 lp_2339 cshA3   FALSE 0.001 631.000 0.000 NA   0.182
 331168 331169 lp_2339 lp_2340     FALSE 0.251 67.000 0.083 NA   -0.001
 331170 331171 lp_2341 lp_2342 bla2   FALSE 0.010 117.000 0.000 1.000 N -0.052
 331171 331172 lp_2342 lp_2344   glpQ3 FALSE 0.006 450.000 0.000 1.000 N 0.207
 331172 331173 lp_2344 lp_2345 glpQ3 ddl FALSE 0.656 76.000 0.000 1.000 N 0.424
 331173 331174 lp_2345 lp_2346 ddl   FALSE 0.458 102.000 0.000 1.000 N 0.389
 331174 331175 lp_2346 lp_2347     TRUE 0.974 22.000 0.000 NA   0.731
 331175 331176 lp_2347 lp_2349   hicD3 FALSE 0.315 199.000 0.000 NA   0.508
 331176 331177 lp_2349 lp_2350 hicD3