MicrobesOnline Operon Predictions for Vibrio vulnificus CMCP6

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 311228 311229 VV20001 VV20002     TRUE 0.996 3.000 0.844 1.000 Y NA
 311233 311234 VV20006 VV20007     FALSE 0.298 45.000 0.000 NA   NA
 311235 311236 VV20008 VV20009     TRUE 0.928 48.000 0.700 NA   NA
 311237 311238 VV20010 VV20011     TRUE 0.997 -6.000 0.650 0.001 N NA
 311238 311239 VV20011 VV20012     TRUE 0.995 -3.000 0.547 0.050 N NA
 311241 311242 VV20014 VV20015     FALSE 0.535 -13.000 0.000 NA N NA
 311246 311247 VV2_0020 VV20021     FALSE 0.206 86.000 0.000 NA   NA
 311249 311250 VV20023 VV20024     FALSE 0.180 104.000 0.000 NA   NA
 311250 311251 VV20024 VV20025     FALSE 0.481 24.000 0.000 NA   NA
 311251 311252 VV20025 VV20026     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 311252 311253 VV20026 VV20027     FALSE 0.040 190.000 0.000 NA   NA
 311253 311254 VV20027 VV20028     TRUE 0.964 0.000 0.227 NA   NA
 311254 311255 VV20028 VV20029     TRUE 0.637 -148.000 0.000 NA   NA
 311255 311256 VV20029 VV20030     FALSE 0.398 32.000 0.000 NA   NA
 311256 311257 VV20030 VV20031     FALSE 0.075 156.000 0.000 NA   NA
 311259 311260 VV20033 VV20034     FALSE 0.030 207.000 0.000 NA   NA
 311261 311262 VV20035 VV20037     FALSE 0.004 411.000 0.000 NA   NA
 311263 311264 VV20038 VV20040     FALSE 0.018 238.000 0.000 1.000   NA
 311264 311265 VV20040 VV20041     TRUE 0.826 33.000 0.000 0.080   NA
 311265 311266 VV20041 VV20042     FALSE 0.037 195.000 0.000 1.000   NA
 311266 311267 VV20042 VV20043     FALSE 0.139 63.000 0.000 1.000 N NA
 311271 311272 VV20047 VV20048     FALSE 0.009 293.000 0.000 NA   NA
 311273 311274 VV20049 VV20050     FALSE 0.566 157.000 0.400 1.000   NA
 311276 311277 VV20052 VV20053     FALSE 0.185 73.000 0.041 1.000 N NA
 311277 311278 VV20053 VV20054     FALSE 0.338 19.000 0.025 1.000 N NA
 311279 311280 VV20055 VV20056     TRUE 0.842 10.000 0.082 NA   NA
 311280 311281 VV20056 VV20057     FALSE 0.131 126.000 0.000 NA   NA
 311281 311282 VV20057 VV20058     FALSE 0.274 37.000 0.017 NA   NA
 311284 311285 VV20061 VV20062     TRUE 0.931 44.000 0.337 1.000 Y NA
 311285 311286 VV20062 VV20063     TRUE 0.999 -3.000 0.504 0.001 Y NA
 311286 311287 VV20063 VV20064     TRUE 0.962 76.000 0.847 NA Y NA
 311287 311288 VV20064 VV20065     TRUE 0.722 156.000 0.347 NA Y NA
 311288 311289 VV20065 VV20066     TRUE 0.953 21.000 0.500 1.000 N NA
 311289 311290 VV20066 VV20067     FALSE 0.025 231.000 0.037 NA   NA
 311290 311291 VV20067 VV20068     FALSE 0.004 433.000 0.000 NA   NA
 311294 311295 VV20071 VV20072     FALSE 0.014 261.000 0.000 1.000   NA
 311296 311297 VV20073 VV20074     TRUE 0.883 3.000 0.082 1.000   NA
 311297 311298 VV20074 VV20075     TRUE 0.915 26.000 0.320 NA   NA
 311298 311299 VV20075 VV20076     TRUE 0.843 3.000 0.058 NA   NA
 311299 311300 VV20076 VV20077     TRUE 0.721 -7.000 0.000 1.000   NA
 311300 311301 VV20077 VV20078     TRUE 0.980 -16.000 0.000 0.027 Y NA
 311301 311302 VV20078 VV20079     FALSE 0.049 147.000 0.000 1.000 N NA
 311302 311303 VV20079 VV20080     TRUE 0.999 9.000 0.669 0.001 Y NA
 311303 311304 VV20080 VV20082     FALSE 0.003 535.000 0.000 1.000   NA
 311304 311305 VV20082 VV20083     FALSE 0.003 539.000 0.000 1.000   NA
 311305 311306 VV20083 VV20084     FALSE 0.002 644.000 0.000 NA   NA
 311306 311307 VV20084 VV20085     TRUE 0.886 126.000 1.000 NA   NA
 311307 311308 VV20085 VV20086     TRUE 0.985 18.000 1.000 NA   NA
 311308 311309 VV20086 VV20087     TRUE 0.935 78.000 1.000 NA   NA
 311309 311310 VV20087 VV20088     TRUE 0.991 0.000 0.667 NA   NA
 311310 311311 VV20088 VV20089     TRUE 0.995 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 311311 311312 VV20089 VV20090     TRUE 0.997 0.000 1.000 1.000 Y NA
 311312 311313 VV20090 VV20091     FALSE 0.385 465.000 1.000 0.015   NA
 311313 311314 VV20091 VV20092     TRUE 0.972 32.000 1.000 1.000   NA
 311314 311315 VV20092 VV20093     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 311315 311316 VV20093 VV20094     TRUE 0.992 -10.000 1.000 NA   NA
 311316 311317 VV20094 VV20095     TRUE 0.994 2.000 1.000 NA   NA
 311317 311318 VV20095 VV20096     TRUE 0.994 2.000 1.000 1.000   NA
 311320 2208493 VV20099 VV2_tRNALeu11     FALSE 0.038 193.000 0.000 NA   NA
 2208493 2208494 VV2_tRNALeu11 VV2_tRNACys2     FALSE 0.360 36.000 0.000 NA   NA
 2208494 311321 VV2_tRNACys2 VV20100     FALSE 0.024 223.000 0.000 NA   NA
 311322 311323 VV20101 VV20102     FALSE 0.097 109.000 0.000 1.000 N NA
 311324 311325 VV20103 VV20104     TRUE 0.997 3.000 1.000 1.000 Y NA
 311325 311326 VV20104 VV20105     FALSE 0.066 161.000 0.000 1.000   NA
 311327 311328 VV20106 VV20107     TRUE 0.593 16.000 0.000 NA   NA
 311329 311330 VV20108 VV20109     FALSE 0.007 327.000 0.000 NA   NA
 311330 311331 VV20109 VV20110     FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 311331 311332 VV20110 VV20111     TRUE 0.998 11.000 0.870 0.062 Y NA
 311332 311333 VV20111 VV20112     TRUE 0.996 8.000 0.870 1.000 Y NA
 311334 311335 VV20113 VV20115     FALSE 0.019 240.000 0.033 NA   NA
 311337 311338 VV20117 VV20118     FALSE 0.216 80.000 0.000 NA   NA
 311338 311339 VV20118 VV20119     FALSE 0.190 96.000 0.000 NA   NA
 311343 311344 VV20123 VV20124     TRUE 0.696 57.000 0.049 NA Y NA
 311346 311347 VV20126 VV20127     TRUE 0.826 27.000 0.176 NA   NA
 311347 311348 VV20127 VV20128     TRUE 0.693 -51.000 0.039 NA   NA
 311349 311350 VV20129 VV20130     FALSE 0.217 79.000 0.000 NA   NA
 311351 311352 VV20131 VV20132     TRUE 0.946 27.000 0.000 0.049 Y NA
 311353 311354 VV20133 VV20134     TRUE 0.905 54.000 0.600 NA   NA
 311354 311355 VV20134 VV20135     TRUE 0.987 11.000 0.750 NA   NA
 311357 311358 VV20137 VV20138     TRUE 0.986 4.000 0.000 0.026 Y NA
 311358 311359 VV20138 VV20139     TRUE 0.987 2.000 0.000 0.026 Y NA
 311359 311360 VV20139 VV20140     FALSE 0.073 157.000 0.000 NA   NA
 311365 311366 VV20145 VV20146     FALSE 0.158 217.000 0.053 1.000 Y NA
 311367 311368 VV20147 VV20148     FALSE 0.003 342.000 0.000 1.000 N NA
 311369 311370 VV20149 VV20150     FALSE 0.006 272.000 0.000 1.000 N NA
 311371 311372 VV20151 VV20152     TRUE 0.920 97.000 0.429 0.070   NA
 311372 311373 VV20152 VV20153     TRUE 0.821 106.000 0.500 NA   NA
 311373 311374 VV20153 VV20154     TRUE 0.733 -6.000 0.000 NA   NA
 311374 311375 VV20154 VV20155     TRUE 0.988 12.000 0.875 NA   NA
 311375 311376 VV20155 VV20156     TRUE 0.990 1.000 0.636 NA   NA
 311376 311377 VV20156 VV20157     TRUE 0.980 14.000 0.636 NA   NA
 311377 311378 VV20157 VV20158     TRUE 0.989 -7.000 0.714 NA   NA
 311378 311379 VV20158 VV20159     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 311379 311380 VV20159 VV20160     FALSE 0.175 235.000 0.286 NA   NA
 311381 311382 VV20161 VV20162     TRUE 0.892 25.000 0.250 NA   NA
 311383 311384 VV20163 VV20164     TRUE 0.908 21.000 0.250 1.000   NA
 311385 311386 VV20165 VV20166     FALSE 0.287 68.000 0.045 1.000   NA
 311387 311388 VV20167 VV20168     FALSE 0.002 936.000 0.000 NA   NA
 311389 311390 VV20169 VV20170     TRUE 0.982 11.000 0.600 1.000   NA
 311390 311391 VV20170 VV20171     FALSE 0.016 247.000 0.000 NA   NA
 311394 311395 VV20174 VV20175     FALSE 0.025 220.000 0.000 NA   NA
 311395 311396 VV20175 VV20176     FALSE 0.139 123.000 0.000 NA   NA
 311396 311397 VV20176 VV20177     FALSE 0.040 190.000 0.000 NA   NA
 311397 311398 VV20177 VV20178     FALSE 0.003 500.000 0.000 1.000   NA
 311400 311401 VV20180 VV20181     TRUE 0.964 2.000 0.231 NA   NA
 311402 311403 VV20182 VV20183     FALSE 0.250 58.000 0.000 NA   NA
 311404 311405 VV20184 VV20185     FALSE 0.010 288.000 0.000 NA   NA
 311406 311407 VV20186 VV20187     TRUE 0.826 105.000 0.249 1.000 Y NA
 311407 311408 VV20187 VV20188     TRUE 0.755 43.000 0.054 1.000 Y NA
 311409 311410 VV20189 VV20190     FALSE 0.001 278.000 0.006 1.000 N NA
 311410 311411 VV20190 VV20191     FALSE 0.046 150.000 0.000 1.000 N NA
 311413 311414 VV20193 VV20194     TRUE 0.999 0.000 1.000 0.015 Y NA
 311414 311415 VV20194 VV20195     TRUE 0.992 -3.000 0.833 NA N NA
 311416 311417 VV20196 VV20198     FALSE 0.078 277.000 0.000 0.078   NA
 311417 311418 VV20198 VV20199     TRUE 0.984 20.000 0.562 1.000 Y NA
 311418 311419 VV20199 VV20200     TRUE 0.964 10.000 0.130 1.000 Y NA
 311421 311422 VV20202 VV20203     TRUE 0.638 13.000 0.000 NA   NA
 311424 311425 VV20205 VV20206     FALSE 0.004 323.000 0.000 NA N NA
 311425 311426 VV20206 VV20207     TRUE 0.615 77.000 0.000 1.000 Y NA
 311427 311428 VV20208 VV20209     TRUE 0.636 1.000 0.000 NA N NA
 311428 311429 VV20209 VV20210     TRUE 0.930 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 311431 311432 VV20212 VV20213     FALSE 0.003 339.000 0.000 1.000 N NA
 311433 311434 VV20214 VV20216     FALSE 0.002 444.000 0.000 1.000 N NA
 311434 311435 VV20216 VV20217     TRUE 0.973 -31.000 0.000 0.001   NA
 311435 311436 VV20217 VV20218     FALSE 0.046 182.000 0.000 1.000   NA
 311436 311437 VV20218 VV20219     FALSE 0.215 125.000 0.060 NA   NA
 311438 311439 VV20220 VV20221     TRUE 0.809 91.000 0.412 NA   NA
 311439 311440 VV20221 VV20222     FALSE 0.288 241.000 0.176 0.034   NA
 311442 311443 VV20226 VV20227     FALSE 0.393 56.000 0.064 1.000   NA
 311444 311445 VV20228 VV20229     FALSE 0.009 297.000 0.000 NA   NA
 311446 311447 VV20230 VV20231     TRUE 0.990 -3.000 0.676 NA   NA
 311449 311450 VV20234 VV20235     FALSE 0.111 197.000 0.109 NA   NA
 311452 311453 VV20237 VV20239     FALSE 0.001 574.000 0.000 1.000 N NA
 311453 311454 VV20239 VV20240     FALSE 0.011 275.000 0.000 NA   NA
 311454 311455 VV20240 VV20241     FALSE 0.035 199.000 0.000 NA   NA
 311455 311456 VV20241 VV20243     FALSE 0.041 188.000 0.000 NA   NA
 311456 311457 VV20243 VV20244     FALSE 0.386 33.000 0.000 NA   NA
 311458 311459 VV20245 VV20246     FALSE 0.026 217.000 0.000 NA   NA
 311459 311460 VV20246 VV20247     FALSE 0.318 41.000 0.000 NA   NA
 311460 311461 VV20247 VV20248     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 311461 311462 VV20248 VV20249     TRUE 0.740 23.000 0.098 1.000   NA
 311465 311466 VV20252 VV20253     TRUE 0.983 2.000 0.414 NA   NA
 311466 311467 VV20253 VV20254     TRUE 0.830 74.000 0.414 NA   NA
 311467 311468 VV20254 VV20255     TRUE 0.967 0.000 0.240 NA   NA
 311470 311471 VV20257 VV20258     TRUE 0.578 -7.000 0.000 1.000 N NA
 311473 311474 VV20260 VV20261     FALSE 0.094 160.000 0.046 NA   NA
 311475 311476 VV20262 VV20263     FALSE 0.208 85.000 0.000 1.000   NA
 311476 311477 VV20263 VV20264     FALSE 0.325 119.000 0.092 1.000   NA
 311477 311478 VV20264 VV20265     FALSE 0.477 173.000 0.385 NA   NA
 311478 311479 VV20265 VV20266     FALSE 0.248 79.000 0.037 NA   NA
 311480 311481 VV20267 VV20268     TRUE 0.931 83.000 0.535 NA Y NA
 311481 311482 VV20268 VV20270     FALSE 0.007 320.000 0.000 NA   NA
 311483 311484 VV20271 VV20272     TRUE 0.997 -3.000 0.909 NA Y NA
 311484 311485 VV20272 VV2_0273     TRUE 0.941 58.000 0.909 1.000   NA
 311486 311487 VV20274 VV20275     TRUE 0.690 -12.000 0.000 NA   NA
 311491 311492 VV20279 VV20280     FALSE 0.039 167.000 0.013 NA   NA
 311492 311493 VV20280 VV20281     FALSE 0.006 297.000 0.015 NA   NA
 311493 311494 VV20281 VV20282     TRUE 0.800 3.000 0.041 NA   NA
 311494 311495 VV20282 VV20283     FALSE 0.003 592.000 0.000 NA   NA
 311496 311497 VV20284 VV20286     FALSE 0.037 196.000 0.000 NA   NA
 311497 311498 VV20286 VV20287     TRUE 0.744 4.000 0.000 NA   NA
 311498 311499 VV20287 VV20289     TRUE 0.837 95.000 0.500 NA   NA
 311499 311500 VV20289 VV20290     TRUE 0.674 -16.000 0.000 NA   NA
 311500 311501 VV20290 VV20291     TRUE 0.744 4.000 0.000 NA   NA
 311501 311502 VV20291 VV20292     TRUE 0.744 4.000 0.000 NA   NA
 311502 311503 VV20292 VV20293     TRUE 0.972 23.000 0.750 NA   NA
 311503 311504 VV20293 VV20294     TRUE 0.983 5.000 0.500 NA   NA
 311504 311505 VV20294 VV20295     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 311505 311506 VV20295 VV20297     FALSE 0.068 160.000 0.000 NA   NA
 311506 311507 VV20297 VV20298     TRUE 0.690 10.000 0.000 NA   NA
 311507 311508 VV20298 VV20300     FALSE 0.016 248.000 0.000 NA   NA
 311508 311509 VV20300 VV20301     TRUE 0.904 38.000 0.429 NA   NA
 311509 311510 VV20301 VV20302     TRUE 0.988 -7.000 0.667 NA   NA
 311510 311511 VV20302 VV20303     TRUE 0.721 -7.000 0.000 NA   NA
 311511 311512 VV20303 VV20304     FALSE 0.398 32.000 0.000 NA   NA
 311512 311513 VV20304 VV20305     TRUE 0.767 1.000 0.000 NA   NA
 311513 311514 VV20305 VV20306     FALSE 0.049 178.000 0.000 NA   NA
 311514 311515 VV20306 VV20307     TRUE 0.764 2.000 0.000 NA   NA
 311517 311518 VV20310 VV2_0311     TRUE 0.912 20.000 0.250 NA   NA
 311518 311519 VV2_0311 VV20312     TRUE 0.856 64.000 0.462 NA   NA
 311519 311520 VV20312 VV20313     TRUE 0.980 0.000 0.353 NA   NA
 311520 311521 VV20313 VV20314     TRUE 0.995 -25.000 0.944 1.000 Y NA
 311521 311522 VV20314 VV20315     FALSE 0.085 182.000 0.066 1.000   NA
 311522 311523 VV20315 VV20316     TRUE 0.951 21.000 0.018 0.001   NA
 311523 311524 VV20316 VV20317     TRUE 0.980 135.000 0.745 0.001 Y NA
 311524 311525 VV20317 VV20318     FALSE 0.008 306.000 0.000 NA   NA
 311525 311526 VV20318 VV20319     TRUE 0.945 7.000 0.196 NA   NA
 311528 311529 VV20321 VV20322     TRUE 0.976 3.000 0.333 NA   NA
 311530 311531 VV20323 VV20324     TRUE 0.639 -79.000 0.000 NA   NA
 311534 311535 VV20327 VV20328     TRUE 0.999 0.000 0.537 0.001 Y NA
 311535 311536 VV20328 VV20329     TRUE 0.999 -3.000 0.627 0.001 Y NA
 311536 311537 VV20329 VV20330     FALSE 0.300 11.000 0.014 1.000 N NA
 311538 311539 VV20331 VV20332     TRUE 0.720 145.000 0.571 NA   NA
 311540 311541 VV20333 VV20334     TRUE 0.939 14.000 0.288 1.000 N NA
 311541 311542 VV20334 VV20335     FALSE 0.015 211.000 0.000 1.000 N NA
 311542 311543 VV20335 VV20336     FALSE 0.179 215.000 0.000 0.046 N NA
 311543 311544 VV20336 VV20337     TRUE 0.832 75.000 0.464 1.000 N NA
 311546 311547 VV20340 VV20341     TRUE 0.964 2.000 0.259 NA N NA
 311547 311548 VV20341 VV20342     TRUE 0.717 39.000 0.159 NA   NA
 311548 311549 VV20342 VV20343     TRUE 0.703 51.000 0.188 NA   NA
 311549 311550 VV20343 VV20344     TRUE 0.836 16.000 0.115 NA   NA
 311551 311552 VV20345 VV20346     FALSE 0.182 86.000 0.023 NA   NA
 311552 311553 VV20346 VV20347     FALSE 0.006 345.000 0.000 NA   NA
 311553 311554 VV20347 VV20348     TRUE 0.988 11.000 0.800 NA   NA
 311556 311557 VV20350 VV20351     FALSE 0.014 283.000 0.047 1.000   NA
 311564 311565 VV20359 VV20360     TRUE 0.769 0.000 0.000 1.000   NA
 311565 311566 VV20360 VV20361     TRUE 0.638 0.000 0.000 1.000 N NA
 311566 311567 VV20361 VV20362     TRUE 0.995 -3.000 0.300 0.078 Y NA
 311567 311568 VV20362 VV20363     TRUE 0.994 6.000 0.200 0.018 Y NA
 311568 311569 VV20363 VV20364     TRUE 0.767 1.000 0.000 1.000   NA
 311569 311570 VV20364 VV20365     FALSE 0.013 263.000 0.000 NA   NA
 311572 311573 VV20367 VV20368     FALSE 0.070 168.000 0.059 1.000 N NA
 311573 311574 VV20368 VV20369     FALSE 0.400 153.000 0.069 1.000 Y NA
 311574 311575 VV20369 VV20370     TRUE 0.997 15.000 0.829 0.001 N NA
 311577 2208495 VV20373 VV2_tRNACys3     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 2208495 311578 VV2_tRNACys3 VV20374     FALSE 0.012 270.000 0.000 NA   NA
 311578 311579 VV20374 VV20375     FALSE 0.022 228.000 0.000 NA   NA
 311580 311581 VV20376 VV20377     TRUE 0.948 2.000 0.026 1.000 Y NA
 311581 311582 VV20377 VV20378     TRUE 0.794 3.000 0.039 1.000   NA
 311582 311583 VV20378 VV20379     TRUE 0.991 3.000 0.750 1.000   NA
 311583 311584 VV20379 VV20380     FALSE 0.012 226.000 0.000 1.000 N NA
 311584 311585 VV20380 VV20381     TRUE 0.970 8.000 0.324 1.000   NA
 311592 311593 VV20389 VV20390     TRUE 0.998 4.000 0.656 0.001 N NA
 311593 311594 VV20390 VV20391     TRUE 0.682 11.000 0.052 1.000 N NA
 311594 311595 VV20391 VV20392     TRUE 0.973 12.000 0.219 1.000 Y NA
 311595 311596 VV20392 VV20393     TRUE 0.984 28.000 0.767 NA Y NA
 311596 311597 VV20393 VV20394     FALSE 0.063 164.000 0.000 NA   NA
 311597 311598 VV20394 VV20395     FALSE 0.038 186.000 0.025 NA   NA
 311598 311599 VV20395 VV20396     FALSE 0.020 130.000 0.010 1.000 N NA
 311599 311600 VV20396 VV20397     FALSE 0.209 67.000 0.046 1.000 N NA
 311600 311601 VV20397 VV20398     FALSE 0.380 27.000 0.039 1.000 N NA
 311601 311602 VV20398 VV20399     FALSE 0.026 218.000 0.000 1.000   NA
 311604 311605 VV20401 VV20402     FALSE 0.377 221.000 0.000 0.023 Y NA
 311606 311607 VV20403 VV20404     TRUE 0.671 11.000 0.000 NA   NA
 311607 311608 VV20404 VV20405     FALSE 0.004 444.000 0.000 1.000   NA
 311608 311609 VV20405 VV20407     FALSE 0.184 250.000 0.396 1.000 N NA
 311609 311610 VV20407 VV20408     FALSE 0.012 269.000 0.000 NA   NA
 311610 311611 VV20408 VV20409     TRUE 0.921 0.000 0.114 NA   NA
 311611 311612 VV20409 VV20410     FALSE 0.017 240.000 0.000 NA   NA
 311612 311613 VV20410 VV20411     FALSE 0.003 335.000 0.000 NA N NA
 311613 311614 VV20411 VV20412     FALSE 0.031 205.000 0.000 NA   NA
 311614 311615 VV20412 VV20413     TRUE 0.975 0.000 0.307 NA   NA
 311615 311616 VV20413 VV20414     FALSE 0.006 344.000 0.000 NA   NA
 311617 311618 VV20415 VV20416     FALSE 0.003 547.000 0.000 NA   NA
 311620 311621 VV20419 VV20420     FALSE 0.024 224.000 0.000 NA   NA
 311621 311622 VV20420 VV20421     FALSE 0.173 107.000 0.000 NA   NA
 311622 311623 VV20421 VV20422     FALSE 0.111 135.000 0.000 NA   NA
 311623 311624 VV20422 VV20423     TRUE 0.985 -3.000 0.500 NA   NA
 311624 311625 VV20423 VV20424     TRUE 0.724 6.000 0.000 NA   NA
 311625 311626 VV20424 VV20425     FALSE 0.281 48.000 0.000 NA   NA
 311626 311627 VV20425 VV20426     TRUE 0.972 1.000 0.286 NA   NA
 311627 311628 VV20426 VV20427     TRUE 0.767 1.000 0.000 NA   NA
 311628 311629 VV20427 VV20428     TRUE 0.852 10.000 0.087 NA   NA
 311629 311630 VV20428 VV20429     TRUE 0.579 151.000 0.368 NA   NA
 311630 311631 VV20429 VV20430     FALSE 0.027 216.000 0.000 NA   NA
 311631 311632 VV20430 VV20431     TRUE 0.978 14.000 0.600 NA   NA
 311632 311633 VV20431 VV20432     TRUE 0.963 -3.000 0.233 NA   NA
 311633 311634 VV20432 VV20433     TRUE 0.973 -3.000 0.300 NA   NA
 311634 311635 VV20433 VV20434     TRUE 0.966 -3.000 0.250 NA   NA
 311635 311636 VV20434 VV20435     TRUE 0.987 11.000 0.750 NA   NA
 311636 311637 VV20435 VV20436     FALSE 0.298 45.000 0.000 NA   NA
 311637 311638 VV20436 VV20437     TRUE 0.655 12.000 0.000 NA   NA
 311638 311639 VV20437 VV20438     TRUE 0.915 17.000 0.221 NA   NA
 311639 311640 VV20438 VV20439     TRUE 0.898 0.000 0.088 NA   NA
 311640 311641 VV20439 VV20440     TRUE 0.965 -28.000 0.359 NA   NA
 311641 311642 VV20440 VV20441     TRUE 0.935 -18.000 0.205 NA   NA
 311642 311643 VV20441 VV20442     TRUE 0.919 -13.000 0.163 NA   NA
 311643 311644 VV20442 VV20443     TRUE 0.916 9.000 0.143 NA   NA
 311644 311645 VV20443 VV20444     TRUE 0.944 60.000 1.000 NA   NA
 311645 311646 VV20444 VV20445     TRUE 0.978 1.000 0.333 NA   NA
 311649 311650 VV20448 VV20449     TRUE 0.936 -3.000 0.147 NA   NA
 311651 311652 VV20450 VV20451     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 311652 311653 VV20451 VV20452     FALSE 0.127 128.000 0.000 NA   NA
 311655 311656 VV20454 VV20455     TRUE 0.939 -7.000 0.203 1.000 N NA
 311659 311660 VV20458 VV20459     FALSE 0.556 175.000 0.581 1.000 N NA
 311665 311666 VV20465 VV20466     FALSE 0.111 96.000 0.000 NA N NA
 311667 311668 VV20467 VV20468     FALSE 0.287 47.000 0.000 NA   NA
 311668 311669 VV20468 VV20469     FALSE 0.002 456.000 0.000 1.000 N NA
 311669 311670 VV20469 VV20470     TRUE 0.998 -7.000 0.458 0.001 Y NA
 311670 311671 VV20470 VV20471     TRUE 0.998 -3.000 0.556 0.068 Y NA
 311672 311673 VV20473 VV20474     TRUE 0.990 32.000 0.500 0.018 Y NA
 311674 311675 VV20476 VV20477     FALSE 0.002 402.000 0.000 1.000 N NA
 311675 311676 VV20477 VV20478     TRUE 0.943 48.000 0.909 1.000 N NA
 311677 311678 VV20479 VV20480     TRUE 0.796 23.000 0.154 1.000 N NA
 311678 311679 VV20480 VV20481     TRUE 0.974 26.000 0.846 NA   NA
 311680 311681 VV20482 VV20483     TRUE 0.995 -3.000 0.277 0.076 Y NA
 311681 311682 VV20483 VV20484     TRUE 0.989 3.000 0.000 0.008 Y NA
 311684 311685 VV20486 VV20487     FALSE 0.008 310.000 0.000 NA   NA
 311686 311687 VV20488 VV20489     TRUE 0.911 48.000 0.293 1.000 Y NA
 311687 311688 VV20489 VV20490     TRUE 0.975 36.000 0.687 1.000 Y NA
 311688 311689 VV20490 VV20491     TRUE 0.996 22.000 0.627 0.002 Y NA
 311689 311690 VV20491 VV20492     TRUE 0.946 27.000 0.242 1.000 Y NA
 311690 311691 VV20492 VV20493     TRUE 0.729 38.000 0.185 1.000 N NA
 311691 311692 VV20493 VV20494     FALSE 0.548 107.000 0.200 1.000 N NA
 311693 311694 VV20495 VV20496     FALSE 0.562 66.000 0.166 1.000 N NA
 311694 311695 VV20496 VV20497     TRUE 0.934 39.000 0.316 1.000 Y NA
 311695 311696 VV20497 VV20498     TRUE 0.931 27.000 0.189 1.000 Y NA
 311696 311697 VV20498 VV20499     TRUE 0.967 -3.000 0.056 0.068   NA
 311697 311698 VV20499 VV20500     TRUE 0.972 -43.000 0.000 0.001   NA
 311698 311699 VV20500 VV20501     FALSE 0.014 259.000 0.000 1.000   NA
 311699 311700 VV20501 VV20502     TRUE 0.864 137.000 0.551 1.000 Y NA
 311700 311701 VV20502 VV20503     FALSE 0.004 304.000 0.000 1.000 N NA
 311703 311704 VV20506 VV20507     FALSE 0.472 88.000 0.115 1.000   NA
 311704 311705 VV20507 VV20508     TRUE 0.887 10.000 0.115 NA   NA
 311705 311706 VV20508 VV20509     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 311706 311707 VV20509 VV2_0510   uhpT FALSE 0.021 233.000 0.000 NA   NA
 311707 311708 VV2_0510 VV20511 uhpT   FALSE 0.529 134.000 0.273 1.000 N NA
 311708 311709 VV20511 VV20512     TRUE 0.998 0.000 0.444 0.029 Y NA
 311709 311710 VV20512 VV20513     TRUE 0.997 6.000 0.929 0.060 N NA
 311710 311711 VV20513 VV20514     FALSE 0.442 144.000 0.214 1.000   NA
 311711 311712 VV20514 VV20515     TRUE 0.984 -3.000 0.000 0.001   NA
 2208496 311713 VV2_tRNAGly9 VV20516     FALSE 0.156 115.000 0.000 NA   NA
 311716 311717 VV20519 VV20520     TRUE 0.716 75.000 0.039 0.055   NA
 311717 311718 VV20520 VV20521     TRUE 0.763 -7.000 0.039 NA   NA
 311718 311719 VV20521 VV20522     FALSE 0.383 69.000 0.075 NA   NA
 311720 311721 VV20523 VV20524     FALSE 0.360 36.000 0.000 NA   NA
 311722 311723 VV20525 VV20526     TRUE 0.681 66.000 0.209 1.000   NA
 311726 311727 VV20529 VV20530     TRUE 0.989 10.000 0.889 1.000 N NA
 311729 311730 VV20532 VV20533     FALSE 0.005 318.000 0.019 NA   NA
 311730 311731 VV20533 VV20534     FALSE 0.032 203.000 0.000 NA   NA
 311733 311734 VV20536 VV20537     FALSE 0.028 214.000 0.000 NA   NA
 311735 311736 VV20538 VV20540     FALSE 0.005 367.000 0.000 1.000   NA
 311736 311737 VV20540 VV20541     FALSE 0.031 355.000 0.000 1.000 Y NA
 311738 311739 VV20542 VV20543     FALSE 0.007 266.000 0.000 1.000 N NA
 311740 311741 VV20544 VV20545     TRUE 0.987 34.000 0.323 0.003 Y NA
 311741 311742 VV20545 VV20546     FALSE 0.053 147.000 0.010 NA   NA
 311742 311743 VV20546 VV20547     TRUE 0.878 13.000 0.128 NA   NA
 311743 311744 VV20547 VV20548     TRUE 0.579 30.000 0.085 1.000 N NA
 311745 311746 VV20549 VV20550     FALSE 0.177 142.000 0.087 1.000 N NA
 311747 311748 VV20552 VV20553     TRUE 0.833 82.000 0.211 1.000 Y NA
 311748 311749 VV20553 VV20555     FALSE 0.007 312.000 0.000 NA   NA
 311749 311750 VV20555 VV20556     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 311751 311752 VV20557 VV20558     FALSE 0.004 311.000 0.000 1.000 N NA
 311754 311755 VV20560 VV20561     TRUE 0.987 -7.000 0.321 1.000 Y NA
 311755 311756 VV20561 VV20562     TRUE 0.863 32.000 0.255 NA   NA
 311756 311757 VV20562 VV20563     TRUE 0.986 -19.000 0.722 NA   NA
 311757 311758 VV20563 VV20565     FALSE 0.024 237.000 0.041 NA   NA
 311758 311759 VV20565 VV20566     TRUE 0.985 -3.000 0.536 1.000 N NA
 311759 311760 VV20566 VV20567     TRUE 0.750 55.000 0.268 1.000 N NA
 311760 311761 VV20567 VV20568     TRUE 0.999 -3.000 0.741 0.002 Y NA
 311763 311764 VV20570 VV20571     FALSE 0.153 168.000 0.097 1.000   NA
 311765 311766 VV20572 VV20573     TRUE 0.867 70.000 0.581 NA N NA
 311766 311767 VV20573 VV20574     TRUE 0.989 -3.000 0.651 NA   NA
 311768 311769 VV20575 VV20576     FALSE 0.129 103.000 0.036 1.000 N NA
 311772 311773 VV20579 VV20580     FALSE 0.043 153.000 0.000 1.000 N NA
 311773 311774 VV20580 VV20581     FALSE 0.002 410.000 0.000 1.000 N NA
 311774 311775 VV20581 VV20582     FALSE 0.006 338.000 0.000 NA   NA
 311775 311776 VV20582 VV20583     FALSE 0.233 65.000 0.030 NA   NA
 311777 311778 VV20584 VV20585     FALSE 0.446 194.000 0.471 NA   NA
 311778 311779 VV20585 VV20586     TRUE 0.787 59.000 0.294 NA   NA
 311780 311781 VV20587 VV20588     FALSE 0.122 192.000 0.130 1.000 N NA
 311782 311783 VV20589 VV20590     TRUE 0.722 27.000 0.125 NA N NA
 311783 311784 VV20590 VV20591     FALSE 0.534 79.000 0.129 NA   NA
 311784 311785 VV20591 VV20592     FALSE 0.215 80.000 0.000 1.000   NA
 311785 311786 VV20592 VV20593     FALSE 0.047 229.000 0.095 NA N NA
 311786 311787 VV20593 VV20594     TRUE 0.884 76.000 0.654 NA N NA
 311788 311789 VV20595 VV20596     TRUE 0.736 97.000 0.337 NA N NA
 311789 311790 VV20596 VV20597     FALSE 0.009 246.000 0.000 1.000 N NA
 311790 311791 VV20597 VV20598     TRUE 0.996 4.000 0.752 1.000 Y NA
 311791 311792 VV20598 VV20599     TRUE 0.989 -3.000 0.671 1.000 N NA
 311792 311793 VV20599 VV20600     FALSE 0.214 81.000 0.000 1.000   NA
 311795 311796 VV20602 VV20603     FALSE 0.002 1300.000 0.000 NA   NA
 311796 311797 VV20603 VV20605     TRUE 0.957 0.000 0.221 1.000 N NA
 311798 311799 VV20606 VV20607     FALSE 0.418 30.000 0.000 NA   NA
 311801 311802 VV20609 VV20610     FALSE 0.349 37.000 0.000 NA   NA
 311802 311803 VV20610 VV20611     TRUE 0.671 11.000 0.000 NA   NA
 311804 311805 VV20612 VV20613     FALSE 0.022 229.000 0.000 NA   NA
 311805 311806 VV20613 VV20614     TRUE 0.993 -3.000 0.889 NA   NA
 311808 311809 VV20616 VV20617     FALSE 0.007 264.000 0.000 1.000 N NA
 311814 311815 VV20623 VV20624     TRUE 0.907 11.000 0.150 NA   NA
 311815 311816 VV20624 VV20625     FALSE 0.107 109.000 0.011 NA   NA
 311816 311817 VV20625 VV20626     FALSE 0.447 17.000 0.011 NA   NA
 311817 311818 VV20626 VV20627     FALSE 0.318 41.000 0.000 NA   NA
 311818 311819 VV20627 VV20629     FALSE 0.004 474.000 0.000 NA   NA
 311820 311821 VV20630 VV20631     FALSE 0.208 85.000 0.000 NA   NA
 311821 311822 VV20631 VV20632     TRUE 0.996 18.000 0.800 0.002   NA
 311822 311823 VV20632 VV20633     TRUE 0.997 14.000 0.800 0.002   NA
 311823 311824 VV20633 VV20634     TRUE 0.996 -3.000 0.400 0.002   NA
 311824 311825 VV20634 VV20635     TRUE 0.700 -10.000 0.000 1.000   NA
 311825 311826 VV20635 VV20636     TRUE 0.937 31.000 0.500 NA   NA
 311826 311827 VV20636 VV20637     TRUE 0.756 3.000 0.000 NA   NA
 311827 311828 VV20637 VV20638     FALSE 0.386 33.000 0.000 NA   NA
 311828 311829 VV20638 VV20639     TRUE 0.981 -3.000 0.400 NA   NA
 311829 311830 VV20639 VV20640     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 311830 311831 VV20640 VV20641     FALSE 0.139 123.000 0.000 NA   NA
 311831 311832 VV20641 VV20642     FALSE 0.005 405.000 0.000 NA   NA
 311832 311833 VV20642 VV20643     FALSE 0.266 53.000 0.000 NA   NA
 311833 311834 VV20643 VV20644     FALSE 0.544 19.000 0.000 NA   NA
 311834 311835 VV20644 VV20645     TRUE 0.981 -3.000 0.400 NA   NA
 311835 311836 VV20645 VV20646     TRUE 0.700 -10.000 0.000 NA   NA
 311836 311837 VV20646 VV20647     FALSE 0.503 22.000 0.000 NA   NA
 311837 311838 VV20647 VV20648     FALSE 0.263 284.000 0.750 NA   NA
 311838 311839 VV20648 VV20649     TRUE 0.991 4.000 0.750 NA   NA
 311840 311841 VV20650 VV20651     FALSE 0.029 211.000 0.000 NA   NA
 311841 311842 VV20651 VV20652     TRUE 0.767 1.000 0.000 NA   NA
 311843 311844 VV20654 VV20655     FALSE 0.082 328.000 0.000 0.007   NA
 311845 311846 VV20656 VV20657     TRUE 0.638 13.000 0.000 NA   NA
 311847 311848 VV20658 VV20659     FALSE 0.019 236.000 0.000 NA   NA
 311848 311849 VV20659 VV20660     FALSE 0.018 239.000 0.000 1.000   NA
 311849 311850 VV20660 VV20661     TRUE 0.799 91.000 0.000 0.002   NA
 311850 311851 VV20661 VV20662     FALSE 0.077 154.000 0.000 NA   NA
 311851 311852 VV20662 VV20663     FALSE 0.180 104.000 0.000 NA   NA
 311853 311854 VV20664 VV20665     FALSE 0.002 1468.000 0.000 NA   NA
 311854 311855 VV20665 VV20666     TRUE 0.993 4.000 1.000 NA   NA
 311856 311857 VV20667 VV20669     FALSE 0.003 481.000 0.000 NA   NA
 311857 311858 VV20669 VV20670     FALSE 0.002 741.000 0.000 NA   NA
 311858 311859 VV20670 VV20671     TRUE 0.999 -3.000 0.947 0.010 Y NA
 311859 311860 VV20671 VV20672     TRUE 0.944 -3.000 0.005 0.074 N NA
 311861 311862 VV20673 VV20675     FALSE 0.003 513.000 0.000 NA   NA
 311862 311863 VV20675 VV20676     FALSE 0.442 195.000 0.471 NA   NA
 311863 311864 VV20676 VV20678     FALSE 0.004 478.000 0.000 NA   NA
 311865 311866 VV20680 VV20681     TRUE 0.767 1.000 0.000 NA   NA
 311867 311868 VV20682 VV20683     FALSE 0.002 720.000 0.000 NA   NA
 311869 311870 VV20684 VV20685     FALSE 0.063 164.000 0.000 NA   NA
 311870 311871 VV20685 VV20686     TRUE 0.981 1.000 0.015 0.001 N NA
 311871 311872 VV20686 VV20687     TRUE 0.999 -3.000 0.935 0.001 N NA
 311872 311873 VV20687 VV20688     TRUE 0.983 22.000 0.587 1.000 Y NA
 311873 311874 VV20688 VV20689     FALSE 0.156 115.000 0.000 NA   NA
 311874 311875 VV20689 VV20691     FALSE 0.011 280.000 0.000 NA   NA
 311875 311876 VV20691 VV20692     FALSE 0.003 486.000 0.000 NA   NA
 311878 311879 VV20694 VV20695     FALSE 0.031 206.000 0.000 NA   NA
 311879 311880 VV20695 VV20697     FALSE 0.068 160.000 0.000 NA   NA
 311880 311881 VV20697 VV20698     FALSE 0.002 650.000 0.000 NA   NA
 311881 311882 VV20698 VV20699     FALSE 0.234 63.000 0.000 NA   NA
 311882 311883 VV20699 VV20700     FALSE 0.092 145.000 0.000 NA   NA
 311883 311884 VV20700 VV20701     TRUE 0.952 41.000 0.000 0.001 Y NA
 311885 311886 VV20702 VV20703     FALSE 0.241 61.000 0.000 NA   NA
 311886 311887 VV20703 VV20704     TRUE 0.640 202.000 1.000 NA   NA
 311887 311888 VV20704 VV20706     FALSE 0.003 591.000 0.000 1.000   NA
 311888 311889 VV20706 VV20707     FALSE 0.008 302.000 0.000 NA   NA
 311889 311890 VV20707 VV20708     TRUE 0.848 24.000 0.182 NA   NA
 311890 311891 VV20708 VV20709     TRUE 0.611 113.000 0.231 NA   NA
 311892 311893 VV20710 VV20711     FALSE 0.018 752.000 0.000 0.054   NA
 311896 311897 VV20714 VV20715     FALSE 0.108 112.000 0.013 1.000   NA
 311897 311898 VV20715 VV20716     TRUE 0.994 0.000 0.902 1.000   NA
 311898 311899 VV20716 VV20717     FALSE 0.031 283.000 0.105 NA   NA
 311899 311900 VV20717 VV20718     FALSE 0.091 146.000 0.000 NA   NA
 311900 311901 VV20718 VV20719     TRUE 0.980 15.000 0.085 0.029 Y NA
 311902 311903 VV20720 VV20721     TRUE 0.975 -3.000 0.348 NA N NA
 311903 311904 VV20721 VV20722     TRUE 0.938 93.000 0.643 NA Y NA
 311904 311905 VV20722 VV20723     TRUE 0.937 31.000 0.245 NA Y NA
 311906 311907 VV20726 VV20727     TRUE 0.690 -12.000 0.000 NA   NA
 311907 311908 VV20727 VV20729     FALSE 0.237 186.000 0.200 NA   NA
 311908 311909 VV20729 VV20730     FALSE 0.238 150.000 0.130 1.000 N NA
 311909 311910 VV20730 VV20731     TRUE 0.879 35.000 0.348 1.000 N NA
 311910 311911 VV20731 VV20732     TRUE 0.991 10.000 0.524 NA Y NA
 311911 311912 VV20732 VV20733     TRUE 0.968 63.000 0.909 NA Y NA
 311913 311914 VV20734 VV20735     TRUE 0.919 -19.000 0.000 NA Y NA
 311914 311915 VV20735 VV20736     TRUE 0.982 -3.000 0.200 NA Y NA
 311916 311917 VV20738 VV20739     FALSE 0.003 572.000 0.000 1.000   NA
 311917 311918 VV20739 VV20740     TRUE 0.663 62.000 0.187 NA   NA
 311918 311919 VV20740 VV20741     TRUE 0.934 41.000 0.652 NA   NA
 311919 311920 VV20741 VV20742     TRUE 0.993 13.000 0.812 1.000 Y NA
 311920 311921 VV20742 VV20743     FALSE 0.001 782.000 0.000 1.000 N NA
 311921 311922 VV20743 VV20744     TRUE 0.995 3.000 0.366 0.006   NA
 311922 311923 VV20744 VV20745     TRUE 0.970 -9.000 0.000 0.006   NA
 311923 311924 VV20745 VV20746     TRUE 0.585 70.000 0.155 NA   NA
 311924 311925 VV20746 VV20747     TRUE 0.684 136.000 0.417 NA   NA
 311928 311929 VV20750 VV20751     FALSE 0.207 142.000 0.082 NA   NA
 311930 311931 VV20752 VV20753     TRUE 0.978 -3.000 0.389 NA N NA
 311931 311932 VV20753 VV20754     FALSE 0.042 187.000 0.000 NA   NA
 311932 311933 VV20754 VV20755     FALSE 0.096 150.000 0.036 NA   NA
 311933 311934 VV20755 VV20756     FALSE 0.345 105.000 0.082 NA   NA
 311934 311935 VV20756 VV20757     FALSE 0.438 66.000 0.089 NA   NA
 311936 311937 VV20759 VV20760     FALSE 0.064 214.000 0.082 NA   NA
 311939 311940 VV20762 VV20763     TRUE 0.993 1.000 0.818 NA   NA
 311940 311941 VV20763 VV20764     FALSE 0.006 335.000 0.000 1.000   NA
 311941 311942 VV20764 VV20766     FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 311944 311945 VV20768 VV20770     FALSE 0.019 198.000 0.000 1.000 N NA
 311946 311947 VV20771 VV20772     TRUE 0.586 109.000 0.229 1.000 N NA
 311947 311948 VV20772 VV20773     TRUE 0.990 3.000 0.115 0.069 Y NA
 311950 311951 VV20775 VV20776     TRUE 0.638 13.000 0.000 1.000   NA
 311953 311954 VV20778 VV20779     TRUE 0.993 0.000 0.455 1.000 Y NA
 311954 311955 VV20779 VV20780     FALSE 0.010 283.000 0.000 NA   NA
 311958 311959 VV20783 VV20784     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 311959 311960 VV20784 VV20785     FALSE 0.055 142.000 0.000 1.000 N NA
 311960 311961 VV20785 VV20787     FALSE 0.002 568.000 0.000 1.000 N NA
 311961 311962 VV20787 VV20788     FALSE 0.005 289.000 0.000 1.000 N NA
 311962 311963 VV20788 VV20789     TRUE 0.980 10.000 0.250 1.000 Y NA
 311964 311965 VV20791 VV20792     TRUE 0.811 -3.000 0.044 NA   NA
 311966 311967 VV20793 VV20794     TRUE 0.985 15.000 0.818 NA   NA
 311968 311969 VV20795 VV20796     FALSE 0.010 235.000 0.028 1.000 N NA
 311970 311971 VV20797 VV20798     FALSE 0.409 148.000 0.060 1.000 Y NA
 311971 311972 VV20798 VV20799     TRUE 0.995 0.000 0.657 1.000 Y NA
 311972 311973 VV20799 VV20800     TRUE 0.998 -3.000 0.639 0.001   NA
 311973 311974 VV20800 VV20801     FALSE 0.296 170.000 0.203 1.000   NA
 311974 311975 VV20801 VV20802     FALSE 0.130 126.000 0.000 1.000   NA
 311975 311976 VV20802 VV20803     FALSE 0.338 126.000 0.111 NA   NA
 311976 311977 VV20803 VV20804     FALSE 0.023 226.000 0.000 NA   NA
 311977 311978 VV20804 VV20805     FALSE 0.215 80.000 0.000 1.000   NA
 311978 311979 VV20805 VV20807     FALSE 0.008 310.000 0.000 1.000   NA
 311979 2208497 VV20807 VV2_tRNASer6     FALSE 0.038 194.000 0.000 NA   NA
 2208497 2208498 VV2_tRNASer6 VV2_tRNAPhe4     FALSE 0.360 36.000 0.000 NA   NA
 2208498 2208499 VV2_tRNAPhe4 VV2_tRNAAsn5     FALSE 0.324 40.000 0.000 NA   NA
 311981 311982 VV20809 VV20810     FALSE 0.362 177.000 0.000 0.016   NA
 311982 311983 VV20810 VV20811     FALSE 0.058 168.000 0.000 1.000   NA
 311983 311984 VV20811 VV20812     FALSE 0.002 417.000 0.000 NA N NA
 311984 311985 VV20812 VV20813     FALSE 0.022 212.000 0.020 NA   NA
 311985 311986 VV20813 VV20814     FALSE 0.014 255.000 0.000 NA   NA
 311987 311988 VV20815 VV20816     TRUE 0.831 124.000 0.339 1.000 Y NA
 311988 311989 VV20816 VV20817     TRUE 0.995 2.000 0.273 0.058 Y NA
 311989 311990 VV20817 VV20818     TRUE 0.999 -3.000 0.714 0.015 Y NA
 311990 311991 VV20818 VV20819     FALSE 0.030 208.000 0.000 1.000   NA
 311992 311993 VV20820 VV20821     FALSE 0.003 583.000 0.000 NA   NA
 311996 311997 VV20825 VV20826     TRUE 0.617 74.000 0.000 1.000 Y NA
 312000 312001 VV20829 VV20830     TRUE 0.733 5.000 0.000 1.000   NA
 312001 312002 VV20830 VV20831     TRUE 0.873 70.000 0.095 0.002   NA
 312005 312006 VV20835 VV20836     TRUE 0.981 10.000 0.255 1.000 Y NA
 312007 312008 VV20837 VV20838     FALSE 0.397 64.000 0.095 NA N NA
 312008 312009 VV20838 VV20839     FALSE 0.110 103.000 0.030 1.000 N NA
 312009 312010 VV20839 VV20840     FALSE 0.012 229.000 0.000 1.000 N NA
 312011 312012 VV20841 VV20842     FALSE 0.128 77.000 0.000 1.000 N NA
 312013 312014 VV20843 VV20844     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 312015 312016 VV20845 VV20846     FALSE 0.013 268.000 0.000 NA   NA
 312016 312017 VV20846 VV20847     FALSE 0.248 64.000 0.055 1.000 N NA
 312019 312020 VV20849 VV20850     TRUE 0.833 91.000 0.467 NA   NA
 312020 312021 VV20850 VV20851     TRUE 0.866 20.000 0.000 1.000 Y NA
 312021 312022 VV20851 VV20852     TRUE 0.638 0.000 0.000 1.000 N NA
 312022 312023 VV20852 VV20853     TRUE 0.589 89.000 0.000 NA Y NA
 312023 312024 VV20853 VV20854     FALSE 0.002 542.000 0.000 NA N NA
 312024 312025 VV20854 VV20855     TRUE 0.569 98.000 0.000 1.000 Y NA
 312028 312029 VV20858 VV20859     FALSE 0.107 100.000 0.000 1.000 N NA
 312030 312031 VV20860 VV20861     TRUE 0.918 50.000 0.026 0.007 Y NA
 312031 312032 VV20861 VV2_0862   ulaA TRUE 0.993 10.000 0.377 0.010   NA
 312033 312034 VV20863 VV20864     FALSE 0.152 209.000 0.179 NA   NA
 312034 312035 VV20864 VV20865     FALSE 0.178 105.000 0.000 NA   NA
 312036 312037 VV20867 VV20868     FALSE 0.152 117.000 0.000 NA   NA
 312040 312041 VV20871 VV20872     FALSE 0.146 60.000 0.000 NA N NA
 312041 312042 VV20872 VV20873     FALSE 0.003 377.000 0.000 NA N NA
 312043 312044 VV20874 VV20875     FALSE 0.051 176.000 0.000 1.000   NA
 312044 312045 VV20875 VV20877     FALSE 0.108 137.000 0.000 1.000   NA
 312045 312046 VV20877 VV20878     FALSE 0.085 103.000 0.025 1.000 N NA
 312047 312048 VV20879 VV20881     FALSE 0.146 120.000 0.000 1.000   NA
 312050 312051 VV20883 VV20884     TRUE 0.993 4.000 1.000 NA   NA
 312051 312052 VV20884 VV20885     FALSE 0.017 241.000 0.000 NA   NA
 312052 312053 VV20885 VV20887     FALSE 0.081 152.000 0.000 1.000   NA
 312055 312056 VV20889 VV20890     TRUE 0.587 115.000 0.000 0.073   NA
 312056 312057 VV20890 VV20891     TRUE 0.985 -7.000 0.562 NA   NA
 312059 312060 VV20893 VV20894     TRUE 0.702 33.000 0.143 1.000 N NA
 312062 312063 VV20897 VV20898     FALSE 0.277 49.000 0.000 NA   NA
 312063 312064 VV20898 VV20899     TRUE 0.837 13.000 0.097 1.000   NA
 312064 312065 VV20899 VV20900     TRUE 0.990 -3.000 0.159 0.002   NA
 312067 312068 VV20903 VV20904     FALSE 0.039 320.000 0.000 1.000 Y NA
 312068 312069 VV20904 VV20905     TRUE 0.985 13.000 0.400 1.000 Y NA
 312072 312073 VV20908 VV20909     FALSE 0.005 365.000 0.000 NA   NA
 312074 312075 VV20910 VV20911     FALSE 0.006 348.000 0.000 NA   NA
 312075 312076 VV20911 VV20912     TRUE 0.760 41.000 0.050 1.000 Y NA
 312076 312077 VV20912 VV20913     FALSE 0.430 21.000 0.017 NA   NA
 312077 312078 VV20913 VV20914     TRUE 0.979 16.000 0.667 NA   NA
 312079 312080 VV20915 VV20916     TRUE 0.789 81.000 0.375 1.000 N NA
 312080 312081 VV20916 VV20917     TRUE 0.993 1.000 1.000 1.000 N NA
 312081 312082 VV20917 VV20918     FALSE 0.003 639.000 0.000 1.000   NA
 312082 312083 VV20918 VV20919     FALSE 0.058 168.000 0.000 NA   NA
 312083 312084 VV20919 VV20920     FALSE 0.075 156.000 0.000 NA   NA
 312084 312085 VV20920 VV20921     FALSE 0.198 90.000 0.000 NA   NA
 312086 312087 VV20922 VV20924     FALSE 0.101 141.000 0.000 NA   NA
 312087 312088 VV20924 VV20925     FALSE 0.298 45.000 0.000 NA   NA
 312088 312089 VV20925 VV20926     FALSE 0.003 521.000 0.000 NA   NA
 312089 312090 VV20926 VV20928     FALSE 0.006 348.000 0.000 NA   NA
 312090 312091 VV20928 VV20929     FALSE 0.501 12.000 0.000 NA N NA
 312092 312093 VV20930 VV20931     TRUE 0.704 9.000 0.000 1.000   NA
 312093 312094 VV20931 VV20932     FALSE 0.108 99.000 0.000 1.000 N NA
 312094 312095 VV20932 VV20933     FALSE 0.041 189.000 0.000 NA   NA
 312095 312096 VV20933 VV20934     FALSE 0.453 30.000 0.036 NA   NA
 312096 312097 VV20934 VV20935     FALSE 0.200 89.000 0.000 1.000   NA
 312099 312100 VV20937 VV20939     FALSE 0.003 539.000 0.000 NA   NA
 312100 312101 VV20939 VV20940     TRUE 0.989 -3.000 0.667 1.000 N NA
 312101 312102 VV20940 VV20941     TRUE 0.674 -16.000 0.000 1.000   NA
 312102 312103 VV20941 VV20942     FALSE 0.008 310.000 0.000 1.000   NA
 312104 312105 VV20944 VV20945     TRUE 0.975 2.000 0.314 NA   NA
 312105 312106 VV20945 VV20946     TRUE 0.963 -3.000 0.233 NA   NA
 312106 312107 VV20946 VV20947     FALSE 0.104 139.000 0.000 NA   NA
 312107 312108 VV20947 VV20949     FALSE 0.028 212.000 0.000 NA   NA
 312108 312109 VV20949 VV2_0950     FALSE 0.010 281.000 0.000 NA   NA
 312109 312110 VV2_0950 VV20951     FALSE 0.123 130.000 0.000 NA   NA
 312112 312113 VV20953 VV20954     FALSE 0.014 262.000 0.000 NA   NA
 312116 312117 VV20957 VV20958     FALSE 0.010 1481.000 0.000 NA Y NA
 312117 312118 VV20958 VV20959     FALSE 0.085 149.000 0.000 NA   NA
 312118 312119 VV20959 VV20960     FALSE 0.071 158.000 0.000 NA   NA
 312119 312120 VV20960 VV20961     FALSE 0.015 254.000 0.000 NA   NA
 312122 312123 VV20963 VV20964     FALSE 0.014 256.000 0.000 NA   NA
 312124 312125 VV20965 VV20966     TRUE 0.942 14.000 0.000 0.024   NA
 312126 312127 VV20967 VV20968     FALSE 0.212 82.000 0.000 1.000   NA
 312130 312131 VV20971 VV20972     FALSE 0.003 553.000 0.000 NA   NA
 312134 312135 VV20975 VV20976     FALSE 0.104 104.000 0.000 NA N NA
 312135 312136 VV20976 VV20977     FALSE 0.022 227.000 0.000 NA   NA
 312136 312137 VV20977 VV20978     TRUE 0.620 14.000 0.000 NA   NA
 312138 312139 VV20979 VV20980     FALSE 0.527 112.000 0.000 1.000 Y NA
 312140 312141 VV20981 VV20982     FALSE 0.035 199.000 0.000 NA   NA
 312142 312143 VV20983 VV20984     FALSE 0.502 66.000 0.114 NA   NA
 312143 312144 VV20984 VV20985     TRUE 0.828 74.000 0.409 NA   NA
 312144 312145 VV20985 VV20986     FALSE 0.004 454.000 0.000 NA   NA
 312147 312148 VV20988 VV20989     TRUE 0.877 59.000 0.500 NA   NA
 312149 312150 VV20990 VV20991     FALSE 0.204 87.000 0.000 NA   NA
 312150 312151 VV20991 VV20992     TRUE 0.999 -10.000 1.000 0.001 Y NA
 312153 312154 VV20994 VV20995     TRUE 0.989 10.000 0.818 NA   NA
 312155 312156 VV20996 VV20997     TRUE 0.971 25.000 0.775 NA   NA
 312160 312161 VV21004 VV21005     TRUE 0.989 23.000 0.895 NA Y NA
 312161 312162 VV21005 VV21006     TRUE 0.997 3.000 0.889 NA Y NA
 312162 312163 VV21006 VV21007     TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA N NA
 312163 312164 VV21007 VV21008     TRUE 0.974 -7.000 0.167 1.000 Y NA
 312165 312166 VV21009 VV21010     FALSE 0.038 193.000 0.000 NA   NA
 312166 312167 VV21010 VV21011     FALSE 0.101 141.000 0.000 NA   NA
 312167 312168 VV21011 VV21012     TRUE 0.867 36.000 0.125 1.000 Y NA
 312168 312169 VV21012 VV21013     TRUE 0.996 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 312169 312170 VV21013 VV21014     FALSE 0.035 163.000 0.000 1.000 N NA
 312170 312171 VV21014 VV21016     FALSE 0.003 338.000 0.000 1.000 N NA
 312172 312173 VV21017 VV21018     TRUE 0.952 -9.000 0.075 1.000 Y NA
 312173 312174 VV21018 VV21019     TRUE 0.944 -10.000 0.060 1.000 Y NA
 312174 312175 VV21019 VV21020     TRUE 0.966 81.000 0.308 0.010 Y NA
 312175 312176 VV21020 VV21021     TRUE 0.998 -10.000 0.619 0.010 Y NA
 312176 312177 VV21021 VV21022     TRUE 0.998 17.000 0.905 0.010 Y NA
 312177 312178 VV21022 VV21023     TRUE 0.946 12.000 0.286 1.000 N NA
 312178 312179 VV21023 VV21024     TRUE 0.964 0.000 0.250 1.000 N NA
 312179 312180 VV21024 VV21025     TRUE 0.988 9.000 0.364 1.000 Y NA
 312180 312181 VV21025 VV21026     FALSE 0.121 332.000 0.000 0.053 Y NA
 312181 312182 VV21026 VV21027     FALSE 0.200 89.000 0.000 NA   NA
 312182 312183 VV21027 VV21028     TRUE 0.719 102.000 0.300 NA   NA
 312186 312187 VV21031 VV21032     FALSE 0.346 144.000 0.182 1.000 N NA
 312189 312190 VV21034 VV21035     FALSE 0.193 94.000 0.000 NA   NA
 312192 312193 VV21037 VV21038     TRUE 0.993 -3.000 0.032 0.001 Y NA
 312193 312194 VV21038 VV21039     FALSE 0.079 153.000 0.000 NA   NA
 312194 312195 VV21039 VV21040     FALSE 0.042 187.000 0.000 NA   NA
 312196 312197 VV21041 VV21042     TRUE 0.909 9.000 0.158 1.000 N NA
 312199 312200 VV21044 VV21045     FALSE 0.473 45.000 0.071 NA   NA
 312201 312202 VV21046 VV21047     FALSE 0.090 263.000 0.000 0.052 N NA
 312202 312203 VV21047 VV21048     FALSE 0.065 162.000 0.000 NA   NA
 312209 312210 VV21054 VV21055     TRUE 0.811 46.000 0.280 NA   NA
 312214 312215 VV21060 VV21061     TRUE 0.625 138.000 0.385 1.000 N NA
 312215 312216 VV21061 VV21062     TRUE 0.744 13.000 0.077 1.000 N NA
 312217 312218 VV21063 VV21064     FALSE 0.016 208.000 0.000 1.000 N NA
 312218 312219 VV21064 VV21065     FALSE 0.286 130.000 0.116 1.000 N NA
 312219 312220 VV21065 VV21066     TRUE 0.839 108.000 0.625 1.000 N NA
 312221 312222 VV21067 VV21068     TRUE 0.991 12.000 0.588 NA Y NA
 312222 312223 VV21068 VV21069     TRUE 0.942 52.000 0.471 1.000 Y NA
 312223 312224 VV21069 VV21070     TRUE 0.991 13.000 0.647 1.000 Y NA
 312224 312225 VV21070 VV21071     TRUE 0.984 4.000 0.235 1.000 Y NA
 312225 312226 VV21071 VV21072     TRUE 0.996 10.000 1.000 1.000 Y NA
 312226 312227 VV21072 VV21073     FALSE 0.380 95.000 0.087 NA   NA
 312229 312230 VV21075 VV21076     TRUE 0.747 35.000 0.182 1.000 N NA
 312230 312231 VV21076 VV21077     TRUE 0.955 11.000 0.310 1.000 N NA
 312232 312233 VV2_1078 VV21079     TRUE 0.606 124.000 0.262 1.000   NA
 312234 312235 VV21080 VV21081     TRUE 0.607 140.000 0.033 0.007   NA
 312235 312236 VV21081 VV21082     TRUE 0.927 10.000 0.000 1.000 Y NA
 312236 312237 VV21082 VV21083     TRUE 0.733 5.000 0.000 1.000   NA
 312237 312238 VV21083 VV21084     TRUE 0.724 6.000 0.000 1.000   NA
 312238 312239 VV21084 VV21085     TRUE 0.932 9.000 0.000 1.000 Y NA
 312239 312240 VV21085 VV21086     FALSE 0.042 187.000 0.000 NA   NA
 312243 312244 VV21090 VV21091     FALSE 0.222 69.000 0.000 1.000   NA
 312244 312245 VV21091 VV21092     FALSE 0.224 67.000 0.000 1.000   NA
 312245 312246 VV21092 VV21093     FALSE 0.047 180.000 0.000 1.000   NA
 312246 312247 VV21093 VV21094     FALSE 0.067 131.000 0.000 1.000 N NA
 312247 312248 VV21094 VV21095     TRUE 0.951 17.000 0.000 0.002 N NA
 312248 312249 VV21095 VV21096     TRUE 0.621 3.000 0.000 1.000 N NA
 312250 312251 VV21097 VV21098     FALSE 0.060 167.000 0.000 NA   NA
 312252 312253 VV21099 VV21100     FALSE 0.195 92.000 0.000 1.000   NA
 312253 312254 VV21100 VV21101     TRUE 0.756 3.000 0.000 1.000   NA
 312254 312255 VV21101 VV21102     TRUE 0.995 3.000 0.500 0.057   NA
 312255 312256 VV21102 VV21104     FALSE 0.040 990.000 0.000 0.057 Y NA
 312256 312257 VV21104 VV21105     FALSE 0.223 68.000 0.000 NA   NA
 312260 312261 VV21108 VV21109     TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 312264 312265 VV21112 VV21116     FALSE 0.001 1119.000 0.000 1.000 N NA
 312265 312266 VV21116 VV21117     FALSE 0.428 124.000 0.149 1.000   NA
 312266 312267 VV21117 VV21118     TRUE 0.814 12.000 0.079 1.000   NA
 312267 312268 VV21118 VV21119     FALSE 0.025 184.000 0.030 1.000 N NA
 312271 312272 VV21123 VV21124     TRUE 0.992 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 312272 312273 VV21124 VV21125     FALSE 0.283 103.000 0.082 1.000 N NA
 312273 312274 VV21125 VV21126     TRUE 0.944 8.000 0.200 NA   NA
 312274 312275 VV21126 VV21127     TRUE 0.987 0.000 0.514 NA   NA
 312275 312276 VV21127 VV21128     TRUE 0.927 13.000 0.234 1.000 N NA
 312276 312277 VV21128 VV21129     FALSE 0.061 166.000 0.000 1.000   NA
 312278 312279 VV21130 VV21131     TRUE 0.740 10.000 0.062 1.000 N NA
 312281 312282 VV21133 VV21134     FALSE 0.208 49.000 0.015 NA   NA
 312282 312283 VV21134 VV21135     TRUE 0.956 35.000 0.069 0.008 Y NA
 312283 312284 VV21135 VV21136     FALSE 0.060 167.000 0.000 1.000   NA
 312285 312286 VV21137 VV21138     FALSE 0.045 184.000 0.000 NA   NA
 312287 312288 VV21139 VV21140     FALSE 0.029 173.000 0.000 NA N NA
 312289 312290 VV21141 VV2_1142   murP TRUE 0.960 26.000 0.609 1.000   NA
 312290 312291 VV2_1142 VV21143 murP   FALSE 0.349 167.000 0.261 1.000 N NA
 312292 312293 VV21144 VV21145     FALSE 0.011 234.000 0.000 NA N NA
 312296 312297 VV21148 VV21149     FALSE 0.163 112.000 0.000 NA   NA
 312297 312298 VV21149 VV21150     FALSE 0.004 456.000 0.000 NA   NA
 312300 312301 VV21153 VV21154     TRUE 0.964 -7.000 0.281 1.000   NA
 312302 312303 VV21156 VV21157     FALSE 0.017 240.000 0.000 NA   NA
 312303 312304 VV21157 VV21158     FALSE 0.013 222.000 0.000 1.000 N NA
 312304 312305 VV21158 VV21159     TRUE 0.975 15.000 0.286 NA Y NA
 312305 312306 VV21159 VV21160     TRUE 0.742 41.000 0.184 NA   NA
 312306 312307 VV21160 VV21161     TRUE 0.920 52.000 0.227 0.021   NA
 312307 312308 VV21161 VV21162     TRUE 0.987 0.000 0.267 1.000 Y NA
 312308 312309 VV21162 VV21163     TRUE 0.923 16.000 0.078 1.000 Y NA
 312309 312310 VV21163 VV21165     TRUE 0.990 -15.000 0.500 1.000 Y NA
 312310 312311 VV21165 VV21166     TRUE 0.995 9.000 0.304 0.021 Y NA
 312311 312312 VV21166 VV21167     TRUE 0.997 0.000 0.304 0.021 Y NA
 312312 312313 VV21167 VV21168     TRUE 0.994 10.000 0.280 0.021 Y NA
 312313 312314 VV21168 VV21169     TRUE 0.971 35.000 0.595 1.000 Y NA
 312314 312315 VV21169 VV21170     TRUE 0.926 32.000 0.216 NA Y NA
 312315 312316 VV21170 VV21171     FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 312316 312317 VV21171 VV21172     FALSE 0.310 99.000 0.067 1.000   NA
 312317 312318 VV21172 VV21173     TRUE 0.989 8.000 0.800 1.000 N NA
 312320 312321 VV21176 VV21177     TRUE 0.982 0.000 0.400 NA   NA
 312321 312322 VV21177 VV21178     TRUE 0.997 -31.000 0.857 0.005   NA
 312323 312324 VV21179 VV21180     FALSE 0.022 194.000 0.010 NA   NA
 312326 312327 VV21182 VV21183     FALSE 0.360 160.000 0.217 NA   NA
 312327 312328 VV21183 VV2_1184     FALSE 0.459 131.000 0.184 NA   NA
 312330 312331 VV21186 VV21187     FALSE 0.519 124.000 0.200 NA   NA
 312331 312332 VV21187 VV21188     TRUE 0.989 11.000 0.882 NA   NA
 312332 312333 VV21188 VV21189     TRUE 0.988 -12.000 0.824 NA N NA
 312333 312334 VV21189 VV21190     TRUE 0.971 23.000 0.737 NA   NA
 312334 312335 VV21190 VV21191     TRUE 0.967 20.000 0.579 NA   NA
 312335 312336 VV21191 VV21192     TRUE 0.974 1.000 0.293 NA   NA
 312336 312337 VV21192 VV21193     TRUE 0.997 0.000 0.317 0.028 Y NA
 312337 312338 VV21193 VV21194     TRUE 0.655 12.000 0.000 NA   NA
 312339 312340 VV21195 VV21196     FALSE 0.010 283.000 0.000 NA   NA
 312341 312342 VV21197 VV21198     FALSE 0.137 461.000 0.000 0.001 Y NA
 312342 312343 VV21198 VV21199     FALSE 0.075 156.000 0.000 NA   NA
 312346 312347 VV21202 VV21203     FALSE 0.349 37.000 0.000 NA   NA
 312347 312348 VV21203 VV21204     TRUE 0.662 20.000 0.059 1.000   NA
 312348 312349 VV21204 VV21205     TRUE 0.625 0.000 0.005 NA   NA
 312352 312353 VV21208 VV21209     TRUE 0.997 2.000 0.217 0.001 Y NA
 312353 312354 VV21209 VV21210     FALSE 0.109 185.000 0.089 NA   NA
 312357 312358 VV21213 VV21214     FALSE 0.004 420.000 0.000 1.000   NA
 312359 312360 VV21215 VV21216     TRUE 0.924 77.000 0.846 NA   NA
 312361 312362 VV21217 VV21218     FALSE 0.007 320.000 0.000 NA   NA
 312367 312368 VV21223 VV21224     FALSE 0.194 93.000 0.000 NA   NA
 312369 312370 VV21225 VV21226     FALSE 0.014 218.000 0.000 1.000 N NA
 312371 312372 VV21227 VV21228     TRUE 0.926 76.000 0.857 1.000   NA
 312373 312374 VV21229 VV21230     TRUE 0.634 62.000 0.025 1.000 Y NA
 312374 312375 VV21230 VV21231     FALSE 0.062 275.000 0.000 1.000 Y NA
 312378 312379 VV21234 VV21235     FALSE 0.004 413.000 0.000 1.000   NA
 312379 312380 VV21235 VV21236     TRUE 0.922 66.000 0.429 1.000 Y NA
 312380 312381 VV21236 VV21237     FALSE 0.003 368.000 0.000 1.000 N NA
 312382 312383 VV21238 VV21239     FALSE 0.010 283.000 0.000 1.000   NA
 312383 312384 VV21239 VV21240     FALSE 0.007 318.000 0.000 NA   NA
 312384 312385 VV21240 VV21241     TRUE 0.955 2.000 0.194 NA   NA
 312385 312386 VV21241 VV21242     TRUE 0.989 -3.000 0.615 NA   NA
 312386 312387 VV21242 VV21243     FALSE 0.270 137.000 0.101 NA   NA
 312387 312388 VV21243 VV21244     FALSE 0.004 477.000 0.000 NA   NA
 312388 312389 VV21244 VV21245     FALSE 0.189 97.000 0.000 NA   NA
 312389 312390 VV21245 VV21247     FALSE 0.005 363.000 0.000 NA   NA
 312391 312392 VV21250 VV21251     TRUE 0.946 113.000 0.314 0.020 Y NA
 312392 312393 VV21251 VV21252     FALSE 0.516 268.000 0.235 0.007 Y NA
 312393 312394 VV21252 VV21253     FALSE 0.069 130.000 0.000 1.000 N NA
 312394 312395 VV21253 VV21254     FALSE 0.008 254.000 0.000 1.000 N NA
 312404 312405 VV21263 VV21264     FALSE 0.149 119.000 0.000 NA   NA
 312406 312407 VV21266 VV21267     FALSE 0.042 154.000 0.000 1.000 N NA
 312408 312409 VV21268 VV21269     FALSE 0.095 144.000 0.000 1.000   NA
 312413 312414 VV21273 VV21274     FALSE 0.002 446.000 0.000 1.000 N NA
 312414 312415 VV21274 VV21275     FALSE 0.443 34.000 0.042 NA   NA
 312417 312418 VV21277 VV21278     TRUE 0.966 68.000 0.917 1.000 Y NA
 312418 312419 VV21278 VV21279     FALSE 0.500 119.000 0.000 1.000 Y NA
 312419 312420 VV21279 VV21280     TRUE 0.920 84.000 0.846 1.000   NA
 312421 312422 VV21281 VV21282     FALSE 0.003 333.000 0.000 1.000 N NA
 312422 312423 VV21282 VV21283     FALSE 0.360 21.000 0.000 1.000 N NA
 312423 312424 VV21283 VV21284     TRUE 0.868 60.000 0.000 0.056 Y NA
 312424 312425 VV21284 VV21286     TRUE 0.999 2.000 0.952 0.056 Y NA
 312425 312426 VV21286 VV21287     TRUE 0.916 33.000 0.200 1.000 Y NA
 312426 312427 VV21287 VV21288     TRUE 0.979 0.000 0.160 1.000 Y NA
 312427 312428 VV21288 VV21289     FALSE 0.338 167.000 0.250 1.000 N NA
 312430 312431 VV21291 VV21292     TRUE 0.988 68.000 1.000 0.056 Y NA
 312431 312432 VV21292 VV21293     TRUE 0.998 9.000 0.833 0.056 Y NA
 312432 312433 VV21293 VV21294     TRUE 0.997 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 312433 312434 VV21294 VV21295     TRUE 0.994 12.000 0.217 0.002 Y NA
 312434 312435 VV21295 VV21296     FALSE 0.562 63.000 0.130 NA   NA
 312437 312438 VV21298 VV21300     TRUE 0.873 105.000 0.000 0.004 Y NA
 312438 312439 VV21300 VV21301     FALSE 0.027 379.000 0.000 1.000 Y NA
 312441 312442 VV21303 VV21304     FALSE 0.481 24.000 0.000 NA   NA
 312442 312443 VV21304 VV21306     FALSE 0.010 262.000 0.017 1.000   NA
 312443 312444 VV21306 VV21307     FALSE 0.066 161.000 0.000 1.000   NA
 312444 312445 VV21307 VV21308     TRUE 0.670 11.000 0.000 1.000   NA
 312445 312446 VV21308 VV21309     TRUE 0.992 -10.000 1.000 NA   NA
 312446 312447 VV21309 VV21310     FALSE 0.013 267.000 0.000 NA   NA
 312447 312448 VV21310 VV21311     TRUE 0.658 -24.000 0.000 1.000   NA
 312450 312451 VV21314 VV21315     FALSE 0.018 238.000 0.000 NA   NA
 312451 312452 VV21315 VV21316     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 312453 312454 VV21318 VV21319     FALSE 0.119 87.000 0.000 1.000 N NA
 312454 312455 VV21319 VV21320     FALSE 0.066 132.000 0.000 NA N NA
 312455 312456 VV21320 VV21321     TRUE 0.982 -3.000 0.465 NA N NA
 312456 312457 VV21321 VV21322     TRUE 0.956 -13.000 0.302 1.000 N NA
 312457 312458 VV21322 VV21323     TRUE 0.754 124.000 0.000 0.066 Y NA
 312458 312459 VV21323 VV21324     FALSE 0.025 182.000 0.000 1.000 N NA
 312459 312460 VV21324 VV21325     TRUE 0.995 11.000 0.905 1.000 Y NA
 312460 312461 VV21325 VV21326     FALSE 0.119 226.000 0.000 NA Y NA
 312461 312462 VV21326 VV2_1327   lacZ FALSE 0.030 359.000 0.000 NA Y NA
 312462 312463 VV2_1327 VV21328 lacZ   FALSE 0.473 91.000 0.118 1.000   NA
 312463 312464 VV21328 VV21329     FALSE 0.018 238.000 0.000 1.000   NA
 312465 312466 VV21330 VV21332     FALSE 0.030 364.000 0.000 1.000 Y NA
 312466 312467 VV21332 VV21333     FALSE 0.349 37.000 0.000 NA   NA
 312467 312468 VV21333 VV21334     FALSE 0.002 1122.000 0.000 NA   NA
 312471 312472 VV21337 VV21338     FALSE 0.437 144.000 0.211 1.000   NA
 312473 312474 VV21339 VV21340     FALSE 0.003 611.000 0.000 NA   NA
 312474 312475 VV21340 VV21341     TRUE 0.671 11.000 0.000 NA   NA
 312477 312478 VV21343 VV21344     TRUE 0.985 11.000 0.250 0.044   NA
 312478 312479 VV21344 VV21345     TRUE 0.827 38.000 0.250 NA   NA
 312482 312483 VV21348 VV21349     TRUE 0.730 109.000 0.333 1.000   NA
 312485 312486 VV21351 VV21352     TRUE 0.998 9.000 0.679 0.007 Y NA
 312490 312491 VV21356 VV21357     TRUE 0.991 75.000 1.000 0.007 Y NA
 312491 312492 VV21357 VV21358     FALSE 0.007 268.000 0.000 1.000 N NA
 312493 312494 VV21359 VV21360     FALSE 0.009 294.000 0.000 NA   NA
 312494 312495 VV21360 VV21361     FALSE 0.060 167.000 0.000 1.000   NA
 312495 312496 VV21361 VV21363     FALSE 0.003 515.000 0.000 1.000   NA
 312502 312503 VV21371 VV21372     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 312503 312504 VV21372 VV21373     TRUE 0.955 -3.000 0.227 1.000 N NA
 312506 312507 VV21376 VV21377     FALSE 0.003 372.000 0.000 NA N NA
 312508 312509 VV21378 VV21379     TRUE 0.700 -10.000 0.000 NA   NA
 312509 312510 VV21379 VV21380     TRUE 0.764 2.000 0.000 NA   NA
 312510 312511 VV21380 VV21381     FALSE 0.561 18.000 0.000 NA   NA
 312513 312514 VV21383 VV21385     FALSE 0.008 301.000 0.000 NA   NA
 312514 312515 VV21385 VV21386     TRUE 0.988 7.000 0.679 NA   NA
 312515 312516 VV21386 VV21387     TRUE 0.978 4.000 0.364 1.000   NA
 312519 312520 VV21391 VV21392     TRUE 0.758 133.000 0.547 1.000   NA
 312524 312525 VV21396 VV21397     FALSE 0.049 178.000 0.000 NA   NA
 312525 312526 VV21397 VV21398     FALSE 0.031 205.000 0.000 NA   NA
 312527 312528 VV21399 VV21400     FALSE 0.008 305.000 0.000 1.000   NA
 312528 312529 VV21400 VV21401     FALSE 0.434 132.000 0.000 1.000 Y NA
 312532 312533 VV21404 VV21405     FALSE 0.146 120.000 0.000 NA   NA
 312536 312537 VV21408 VV2_1409     FALSE 0.016 245.000 0.000 NA   NA
 312537 312538 VV2_1409 VV21410     FALSE 0.106 138.000 0.000 NA   NA
 312538 312539 VV21410 VV21411     TRUE 0.967 11.000 0.000 0.003   NA
 312539 312540 VV21411 VV21412     TRUE 0.991 6.000 0.833 1.000   NA
 312540 312541 VV21412 VV21413     FALSE 0.003 332.000 0.000 1.000 N NA
 312541 312542 VV21413 VV21414     TRUE 0.965 10.000 0.135 1.000 Y NA
 312542 312543 VV21414 VV21416     FALSE 0.011 278.000 0.000 1.000   NA
 312547 312548 VV21420 VV21421     FALSE 0.123 130.000 0.000 NA   NA
 312549 312550 VV21423 VV21424     TRUE 0.922 46.000 0.625 NA   NA
 312550 312551 VV21424 VV21425     FALSE 0.115 133.000 0.000 1.000   NA
 312553 312554 VV21427 VV21428     FALSE 0.038 193.000 0.000 NA   NA
 312554 312555 VV21428 VV21429     TRUE 0.649 97.000 0.000 0.063   NA
 312555 312556 VV21429 VV21430     FALSE 0.081 152.000 0.000 NA   NA
 312556 312557 VV21430 VV21431     FALSE 0.005 385.000 0.000 NA   NA
 312558 312559 VV21432 VV21433     FALSE 0.063 163.000 0.000 1.000   NA
 312559 312560 VV21433 VV21434     FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 312561 3829839 VV21435 VV2_r01     FALSE 0.004 450.000 0.000 NA   NA
 3829839 2208500 VV2_r01 VV2_tRNAGlu5     FALSE 0.223 68.000 0.000 NA   NA
 2208500 2208501 VV2_tRNAGlu5 VV2_tRNALys4     TRUE 0.733 5.000 0.000 NA   NA
 2208501 2208502 VV2_tRNALys4 VV2_tRNAAla6     FALSE 0.561 18.000 0.000 NA   NA
 2208502 2208503 VV2_tRNAAla6 VV2_tRNAVal6     FALSE 0.561 18.000 0.000 NA   NA
 2208503 3829840 VV2_tRNAVal6 VV2_r02     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 3829840 3829841 VV2_r02 VV2_r03     FALSE 0.208 85.000 0.000 NA   NA
 3829841 2208504 VV2_r03 VV2_tRNASer7     FALSE 0.183 101.000 0.000 NA   NA
 312569 312570 VV21451 VV21452     FALSE 0.175 106.000 0.000 NA   NA
 312573 312574 VV21455 VV21456     FALSE 0.016 249.000 0.000 NA   NA
 312574 312575 VV21456 VV21457     FALSE 0.070 159.000 0.000 NA   NA
 312575 312576 VV21457 VV21458     FALSE 0.023 186.000 0.000 1.000 N NA
 312576 312577 VV21458 VV21460     FALSE 0.034 377.000 0.000 0.055 N NA
 312577 312578 VV21460 VV21461     FALSE 0.262 54.000 0.000 NA   NA
 312578 312579 VV21461 VV21462     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 312579 312580 VV21462 VV21463     FALSE 0.173 107.000 0.000 NA   NA
 312581 312582 VV21464 VV21465     FALSE 0.208 103.000 0.037 NA   NA
 312585 312586 VV21468 VV21469     TRUE 0.712 83.000 0.250 NA   NA
 312586 312587 VV21469 VV21470     TRUE 0.668 86.000 0.245 1.000 N NA
 312588 312589 VV21471 VV21472     FALSE 0.546 33.000 0.065 NA   NA
 312589 312590 VV21472 VV21473     TRUE 0.881 92.000 0.652 NA   NA
 312591 312592 VV21475 VV21476     TRUE 0.689 108.000 0.286 NA   NA
 312593 312594 VV21477 VV21478     TRUE 0.798 0.000 0.058 NA N NA
 312595 312596 VV21479 VV21480     FALSE 0.049 177.000 0.000 1.000   NA
 312597 312598 VV21481 VV21482     TRUE 0.921 7.000 0.143 NA   NA
 312599 312600 VV21483 VV21484     FALSE 0.006 275.000 0.000 1.000 N NA
 312600 312601 VV21484 VV21485     TRUE 0.886 52.000 0.547 1.000 N NA
 312602 312603 VV21486 VV21487     FALSE 0.191 95.000 0.000 NA   NA
 312603 312604 VV21487 VV21488     FALSE 0.005 392.000 0.000 NA   NA
 312604 312605 VV21488 VV21489     FALSE 0.218 77.000 0.000 NA   NA
 312605 312606 VV21489 VV21491     FALSE 0.018 238.000 0.000 NA   NA
 312607 312608 VV21492 VV21493     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 312609 312610 VV21495 VV21496     TRUE 0.739 10.000 0.040 NA   NA
 312610 312611 VV21496 VV21497     FALSE 0.003 524.000 0.000 NA   NA
 312611 312612 VV21497 VV21500     FALSE 0.002 891.000 0.000 NA   NA
 312612 312613 VV21500 VV21501     FALSE 0.065 272.000 0.000 NA Y NA
 312613 312614 VV21501 VV21502     FALSE 0.012 227.000 0.000 NA N NA
 312616 312617 VV21504 VV21505     TRUE 0.965 -7.000 0.286 NA   NA
 312617 312618 VV21505 VV21506     FALSE 0.019 235.000 0.000 NA   NA
 312620 312621 VV21509 VV21510     TRUE 0.955 35.000 0.750 1.000   NA
 312621 312622 VV21510 VV21511     TRUE 0.917 136.000 0.750 0.095   NA
 312622 312623 VV21511 VV21512     TRUE 0.998 -7.000 0.600 0.023 Y NA
 312623 312624 VV21512 VV21513     FALSE 0.005 361.000 0.000 NA   NA
 312625 312626 VV21514 VV21515     TRUE 0.654 12.000 0.000 1.000   NA
 312626 312627 VV21515 VV21516     TRUE 0.989 -3.000 0.273 0.069   NA
 312627 312628 VV21516 VV21517     TRUE 0.982 18.000 0.242 0.007   NA
 312628 312629 VV21517 VV21518     TRUE 0.709 38.000 0.149 1.000   NA
 312629 312630 VV21518 VV21519     TRUE 0.613 28.000 0.069 NA   NA
 312630 312631 VV21519 VV21520     FALSE 0.108 233.000 0.000 NA Y NA
 312633 312634 VV21522 VV21523     FALSE 0.013 263.000 0.000 1.000   NA
 312634 312635 VV21523 VV21524     TRUE 0.969 -3.000 0.000 0.025   NA
 312636 312637 VV21525 VV21526     FALSE 0.206 86.000 0.000 NA   NA
 312640 312641 VV21529 VV21530     FALSE 0.529 20.000 0.000 NA   NA
 312641 312642 VV21530 VV21531     FALSE 0.081 152.000 0.000 NA   NA
 312643 312644 VV21532 VV21533     TRUE 0.986 -3.000 0.530 1.000   NA
 312644 312645 VV21533 VV21534     FALSE 0.436 190.000 0.435 NA   NA
 312645 312646 VV21534 VV21535     FALSE 0.020 234.000 0.000 NA   NA
 312646 312647 VV21535 VV21536     TRUE 0.966 0.000 0.238 NA   NA
 312647 312648 VV21536 VV21537     FALSE 0.205 207.000 0.231 NA   NA
 312648 312649 VV21537 VV21538     TRUE 0.980 -19.000 0.154 0.013   NA
 312649 312650 VV21538 VV21539     FALSE 0.364 161.000 0.227 1.000   NA
 312650 312651 VV21539 VV21540     TRUE 0.990 0.000 0.636 1.000   NA
 312652 312653 VV21541 VV21542     TRUE 0.896 -10.000 0.119 NA   NA
 312653 312654 VV21542 VV21543     TRUE 0.573 3.000 0.025 1.000 N NA
 312654 312655 VV21543 VV21544     TRUE 0.738 1.000 0.023 1.000   NA
 312657 312658 VV21546 VV21548     FALSE 0.008 254.000 0.000 1.000 N NA
 312658 312659 VV21548 VV21549     TRUE 0.987 1.000 0.600 1.000 N NA
 312659 312660 VV21549 VV21550     TRUE 0.577 17.000 0.000 1.000   NA
 312660 312661 VV21550 VV21551     TRUE 0.593 16.000 0.000 NA   NA
 312661 312662 VV21551 VV21552     TRUE 0.992 2.000 0.750 NA   NA
 312663 312664 VV21553 VV21554     TRUE 0.661 -22.000 0.000 NA   NA
 312664 312665 VV21554 VV21555     FALSE 0.007 313.000 0.000 NA   NA
 312666 312667 VV21556 VV21557     TRUE 0.610 89.000 0.040 1.000 Y NA
 312667 312668 VV21557 VV21558     TRUE 0.990 22.000 0.219 0.002 Y NA
 312668 312669 VV21558 VV21559     TRUE 0.983 59.000 0.428 0.002 Y NA
 312669 312670 VV21559 VV21560     FALSE 0.007 267.000 0.000 1.000 N NA
 312671 312672 VV21561 VV21562     FALSE 0.370 20.000 0.006 NA   NA
 312672 312673 VV21562 VV21563     TRUE 0.574 -7.000 0.006 1.000   NA
 312673 312674 VV21563 VV21564     TRUE 0.975 -7.000 0.370 NA   NA
 312674 312675 VV21564 VV21565     TRUE 0.989 6.000 0.738 NA   NA
 312675 312676 VV21565 VV21566     TRUE 0.984 4.000 0.500 NA   NA
 312677 312678 VV21567 VV21568     TRUE 0.807 48.000 0.286 NA   NA
 312678 312679 VV21568 VV21569     FALSE 0.051 176.000 0.000 NA   NA
 312679 312680 VV21569 VV21570     FALSE 0.374 222.000 0.000 0.022 Y NA
 312680 312681 VV21570 VV21571     FALSE 0.010 287.000 0.000 1.000   NA
 312681 312682 VV21571 VV21572     FALSE 0.003 495.000 0.000 1.000   NA
 312682 312683 VV21572 VV21573     TRUE 0.953 -7.000 0.000 0.069   NA
 312684 312685 VV21574 VV21575     FALSE 0.369 74.000 0.070 NA   NA
 312685 312686 VV21575 VV21576     TRUE 0.809 11.000 0.070 1.000   NA
 312686 312687 VV21576 VV21577     TRUE 0.903 -3.000 0.100 NA   NA
 312687 312688 VV21577 VV21578     FALSE 0.079 153.000 0.000 NA   NA
 312688 312689 VV21578 VV21579     TRUE 0.842 24.000 0.000 1.000 Y NA
 312689 312690 VV21579 VV21580     TRUE 0.941 20.000 0.161 1.000 Y NA
 312690 312691 VV21580 VV21581     TRUE 0.595 56.000 0.132 1.000   NA
 312691 312692 VV21581 VV21582     TRUE 0.924 29.000 0.395 NA   NA
 312692 312693 VV21582 VV21584     FALSE 0.002 415.000 0.000 NA N NA
 312694 312695 VV21585 VV21586     TRUE 0.617 75.000 0.000 1.000 Y NA
 312695 312696 VV21586 VV21587     TRUE 0.996 19.000 0.814 0.055 Y NA
 312697 312698 VV21588 VV21589     FALSE 0.016 219.000 0.013 NA   NA
 312698 312699 VV21589 VV21590     FALSE 0.035 114.000 0.013 NA N NA
 312703 312704 VV21595 VV21596     FALSE 0.067 131.000 0.000 1.000 N NA
 312707 312708 VV21600 VV21601     FALSE 0.171 57.000 0.011 NA   NA
 312715 312716 VV21609 VV21610     TRUE 0.947 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 312716 312717 VV21610 VV21611     TRUE 0.995 10.000 0.852 1.000 Y NA
 312717 312718 VV21611 VV21612     TRUE 0.845 12.000 0.117 1.000 N NA
 312718 312719 VV21612 VV21613     TRUE 0.997 -7.000 0.551 0.070 Y NA
 312719 312720 VV21613 VV21614     TRUE 0.995 3.000 0.473 0.016 N NA
 312721 312722 VV21615 VV21616     TRUE 0.626 72.000 0.203 1.000 N NA
 312722 312723 VV21616 VV21617     TRUE 0.942 39.000 0.355 1.000 Y NA
 312723 312724 VV21617 VV21618     FALSE 0.166 106.000 0.026 1.000   NA
 312726 312727 VV21620 VV21621     FALSE 0.021 233.000 0.000 1.000   NA
 312727 312728 VV21621 VV21622     FALSE 0.002 439.000 0.000 1.000 N NA
 312729 312730 VV21623 VV21624     TRUE 0.727 142.000 0.000 0.021 Y NA
 312731 312732 VV21626 VV21627     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 312733 312734 VV21628 VV21629     TRUE 0.748 -37.000 0.054 NA   NA
 312734 312735 VV21629 VV21630     FALSE 0.009 296.000 0.000 NA   NA
 312735 312736 VV21630 VV21631     FALSE 0.166 158.000 0.087 NA   NA
 312737 312738 VV21632 VV21633     TRUE 0.683 105.000 0.267 NA   NA
 312739 312740 VV21634 VV21635     FALSE 0.165 111.000 0.000 1.000   NA
 312740 312741 VV21635 VV21636     TRUE 0.981 -10.000 0.500 NA   NA
 312743 312744 VV21638 VV21639     FALSE 0.053 174.000 0.000 1.000   NA
 312744 312745 VV21639 VV21640     FALSE 0.234 63.000 0.000 NA   NA
 312745 2208505 VV21640 VV2_tRNALeu12     FALSE 0.428 29.000 0.000 NA   NA
 312747 312748 VV21642 VV21643     TRUE 0.707 71.000 0.235 NA   NA
 312750 312751 VV21645 VV21646     FALSE 0.004 441.000 0.000 1.000   NA
 312753 312754 VV21648 VV21649     FALSE 0.002 410.000 0.000 1.000 N NA
 312755 312756 VV21650 VV21651     FALSE 0.097 124.000 0.015 1.000   NA
 312757 312758 VV21652 VV21653     TRUE 0.869 45.000 0.375 NA   NA
 312758 312759 VV21653 VV21654     TRUE 0.614 53.000 0.136 NA   NA
 312762 312763 VV21657 VV21658     TRUE 0.733 5.000 0.000 NA   NA
 312764 312765 VV21659 VV21660     FALSE 0.154 56.000 0.000 1.000 N NA
 312767 312768 VV21662 VV21663     FALSE 0.367 48.000 0.048 1.000   NA
 312768 312769 VV21663 VV21664     TRUE 0.970 27.000 0.099 0.014 Y NA
 312770 312771 VV21665 VV21666     FALSE 0.515 21.000 0.000 NA   NA
 312773 312774 VV21669 VV21670     TRUE 0.985 30.000 0.762 0.054 N NA
 312774 312775 VV21670 VV21671     TRUE 0.982 10.000 0.609 1.000 N NA
 312775 312776 VV21671 VV21672     TRUE 0.780 120.000 0.478 NA   NA
 312776 312777 VV21672 VV21673     FALSE 0.359 119.000 0.105 NA   NA
 312777 312778 VV21673 VV21674     FALSE 0.315 116.000 0.105 1.000 N NA
 312778 312779 VV21674 VV21675     FALSE 0.156 115.000 0.000 NA   NA
 312780 312781 VV21676 VV21677     FALSE 0.025 408.000 0.000 NA Y NA
 312782 312783 VV21678 VV21679     FALSE 0.061 166.000 0.000 NA   NA
 312783 312784 VV21679 VV21680     FALSE 0.196 86.000 0.026 NA   NA
 312784 312785 VV21680 VV21681     FALSE 0.011 234.000 0.000 1.000 N NA
 312789 312790 VV21686 VV21687     TRUE 0.954 19.000 0.459 1.000 N NA
 312790 312791 VV21687 VV21688     TRUE 0.959 25.000 0.634 1.000 N NA
 312791 312792 VV21688 VV21689     TRUE 0.679 87.000 0.078 1.000 Y NA
 312792 311228 VV21689 VV20001     TRUE 0.950 98.000 0.328 0.054 Y NA
 308256 308257 VV1_0001 VV1_0002     FALSE 0.125 129.000 0.000 NA   NA
 308257 308258 VV1_0002 VV1_0003     FALSE 0.234 63.000 0.000 NA   NA
 308258 308259 VV1_0003 VV1_0004     FALSE 0.002 646.000 0.000 NA   NA
 308259 308260 VV1_0004 VV1_0005     FALSE 0.220 73.000 0.000 NA   NA
 308260 308261 VV1_0005 VV1_0006     FALSE 0.084 150.000 0.000 NA   NA
 308261 308262 VV1_0006 VV1_0007     FALSE 0.002 690.000 0.000 NA   NA
 308262 308263 VV1_0007 VV1_0008     FALSE 0.472 100.000 0.125 NA   NA
 308263 308264 VV1_0008 VV1_0009     FALSE 0.376 100.000 0.089 NA   NA
 308264 308265 VV1_0009 VV1_0010     TRUE 0.996 -7.000 0.854 NA Y NA
 308265 308266 VV1_0010 VV1_0011     TRUE 0.995 10.000 0.875 NA Y NA
 308267 308268 VV1_0013 VV1_0014     TRUE 0.920 6.000 0.137 1.000   NA
 308271 308272 VV1_0017 VV1_0018     FALSE 0.074 160.000 0.033 1.000   NA
 308272 308273 VV1_0018 VV1_0019     FALSE 0.052 177.000 0.051 1.000 N NA
 308273 308274 VV1_0019 VV1_0020     FALSE 0.056 173.000 0.030 1.000   NA
 308274 308275 VV1_0020 VV1_0021     TRUE 0.976 -15.000 0.025 0.001   NA
 308275 308276 VV1_0021 VV1_0022     TRUE 0.754 119.000 0.201 1.000 Y NA
 308276 308277 VV1_0022 VV1_0023     TRUE 0.902 71.000 0.352 1.000 Y NA
 308277 308278 VV1_0023 VV1_0024   tig TRUE 0.874 106.000 0.351 1.000 Y NA
 308279 308280 VV1_0025 VV1_0026     TRUE 0.990 2.000 0.344 1.000 Y NA
 308281 308282 VV1_0027 VV1_0028     FALSE 0.037 195.000 0.000 NA   NA
 308282 308283 VV1_0028 VV1_0029     TRUE 0.996 4.000 0.882 NA Y NA
 308283 308284 VV1_0029 VV1_0030     TRUE 0.917 51.000 0.328 NA Y NA
 308284 308285 VV1_0030 VV1_0032     FALSE 0.052 570.000 0.000 0.070 Y NA
 308285 308286 VV1_0032 VV1_0033     TRUE 0.998 6.000 0.723 0.054 Y NA
 308286 308287 VV1_0033 VV1_0034     TRUE 0.999 -3.000 0.816 0.054 Y NA
 308287 308288 VV1_0034 VV1_0035     TRUE 0.952 106.000 0.367 0.054 Y NA
 308288 308289 VV1_0035 VV1_0036     TRUE 0.695 120.000 0.367 1.000 N NA
 308289 308290 VV1_0036 VV1_0037     TRUE 0.995 12.000 0.909 1.000 Y NA
 308290 308291 VV1_0037 VV1_0039     FALSE 0.006 268.000 0.006 NA   NA
 308291 308292 VV1_0039 VV1_0040     FALSE 0.217 78.000 0.000 NA   NA
 308292 308293 VV1_0040 VV1_0041     FALSE 0.008 307.000 0.000 1.000   NA
 308293 308294 VV1_0041 VV1_0042     FALSE 0.010 283.000 0.000 1.000   NA
 308294 308295 VV1_0042 VV1_0043     TRUE 0.678 25.000 0.081 1.000   NA
 308295 308296 VV1_0043 VV1_0044     TRUE 0.845 31.000 0.222 NA   NA
 308297 308298 VV1_0045 VV1_0046     TRUE 0.989 -3.000 0.636 NA   NA
 308298 308299 VV1_0046 VV1_0047     TRUE 0.681 95.000 0.245 1.000   NA
 308299 308300 VV1_0047 VV1_0048     TRUE 0.980 17.000 0.169 0.002   NA
 308300 308301 VV1_0048 VV1_0049     TRUE 0.981 4.000 0.422 1.000   NA
 308301 308302 VV1_0049 VV1_0050     TRUE 0.989 8.000 0.758 1.000   NA
 308302 308303 VV1_0050 VV1_0051     TRUE 0.964 13.000 0.368 NA   NA
 308303 308304 VV1_0051 VV1_0052     TRUE 0.967 -7.000 0.297 NA   NA
 308304 308305 VV1_0052 VV1_0053     TRUE 0.965 -16.000 0.333 1.000   NA
 308305 308306 VV1_0053 VV1_0054     TRUE 0.976 9.000 0.413 NA   NA
 308306 308307 VV1_0054 VV1_0055     TRUE 0.987 0.000 0.532 NA   NA
 308307 308308 VV1_0055 VV1_0056     TRUE 0.963 29.000 0.732 NA   NA
 308308 308309 VV1_0056 VV1_0057     TRUE 0.806 54.000 0.305 NA   NA
 308309 308310 VV1_0057 VV1_0058     TRUE 0.975 10.000 0.422 NA   NA
 308310 308311 VV1_0058 VV1_0059     TRUE 0.992 -7.000 0.514 NA Y NA
 308311 308312 VV1_0059 VV1_0060   fabG TRUE 0.991 -3.000 0.397 NA Y NA
 308312 308313 VV1_0060 VV1_0061 fabG   TRUE 0.993 -3.000 0.486 1.000 Y NA
 308313 2208369 VV1_0061 VV1_tRNAPro1     FALSE 0.070 159.000 0.000 NA   NA
 308314 308315 VV1_0063 VV1_0064     TRUE 0.966 1.000 0.000 0.050   NA
 308315 308316 VV1_0064 VV1_0065     FALSE 0.004 407.000 0.000 NA   NA
 308316 308317 VV1_0065 VV1_0066     FALSE 0.311 42.000 0.000 NA   NA
 308317 308318 VV1_0066 VV1_0067     TRUE 0.976 -7.000 0.375 NA   NA
 308318 308319 VV1_0067 VV1_0068     FALSE 0.375 34.000 0.000 NA   NA
 308319 308320 VV1_0068 VV1_0069     FALSE 0.369 35.000 0.000 NA   NA
 308320 308321 VV1_0069 VV1_0070     TRUE 0.721 -7.000 0.000 NA   NA
 308321 308322 VV1_0070 VV1_0071     TRUE 0.744 4.000 0.000 NA   NA
 308322 308323 VV1_0071 VV1_0072     FALSE 0.481 24.000 0.000 1.000   NA
 308323 308324 VV1_0072 VV1_0074     TRUE 0.648 -34.000 0.000 NA   NA
 308324 308325 VV1_0074 VV1_0075     FALSE 0.238 62.000 0.000 NA   NA
 308325 308326 VV1_0075 VV1_0076     TRUE 0.721 -7.000 0.000 NA   NA
 308326 308327 VV1_0076 VV1_0077     TRUE 0.671 11.000 0.000 NA   NA
 308327 308328 VV1_0077 VV1_0078     TRUE 0.690 -12.000 0.000 NA   NA
 308328 308329 VV1_0078 VV1_0079     FALSE 0.418 30.000 0.000 NA   NA
 308329 308330 VV1_0079 VV1_0080     FALSE 0.039 192.000 0.000 NA   NA
 308331 308332 VV1_0081 VV1_0083     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 308333 308334 VV1_0084 VV1_0085     FALSE 0.220 73.000 0.000 NA   NA
 308334 308335 VV1_0085 VV1_0086     TRUE 0.708 -9.000 0.000 NA   NA
 308335 308336 VV1_0086 VV1_0087     TRUE 0.909 -3.000 0.105 NA   NA
 308336 308337 VV1_0087 VV1_0088     TRUE 0.704 9.000 0.000 NA   NA
 308337 308338 VV1_0088 VV1_0089     FALSE 0.318 41.000 0.000 NA   NA
 308338 308339 VV1_0089 VV1_0090     TRUE 0.690 10.000 0.000 NA   NA
 308339 308340 VV1_0090 VV1_0091     FALSE 0.386 33.000 0.000 NA   NA
 308340 308341 VV1_0091 VV1_0092     FALSE 0.224 67.000 0.000 NA   NA
 308341 308342 VV1_0092 VV1_0093     FALSE 0.202 88.000 0.000 NA   NA
 308342 308343 VV1_0093 VV1_0094     TRUE 0.733 5.000 0.000 NA   NA
 308343 308344 VV1_0094 VV1_0095     TRUE 0.972 -3.000 0.292 NA   NA
 308344 308345 VV1_0095 VV1_0096     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 308347 308348 VV1_0098 VV1_0099     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 308348 308349 VV1_0099 VV1_0100     TRUE 0.764 2.000 0.000 NA   NA
 308349 308350 VV1_0100 VV1_0101     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 308350 308351 VV1_0101 VV1_0102     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 308351 308352 VV1_0102 VV1_0103     TRUE 0.721 -7.000 0.000 NA   NA
 308352 308353 VV1_0103 VV1_0104     TRUE 0.704 9.000 0.000 NA   NA
 308353 308354 VV1_0104 VV1_0105     TRUE 0.700 -10.000 0.000 NA   NA
 308354 308355 VV1_0105 VV1_0106     FALSE 0.274 50.000 0.000 NA   NA
 308355 308356 VV1_0106 VV1_0107     FALSE 0.219 75.000 0.000 NA   NA
 308356 308357 VV1_0107 VV1_0108     FALSE 0.166 110.000 0.000 NA   NA
 308357 308358 VV1_0108 VV1_0109     TRUE 0.724 6.000 0.000 NA   NA
 308358 308359 VV1_0109 VV1_0110     FALSE 0.030 208.000 0.000 NA   NA
 308359 308360 VV1_0110 VV1_0111     TRUE 0.872 32.000 0.278 NA   NA
 308362 308363 VV1_0113 VV1_0114     FALSE 0.189 97.000 0.000 NA   NA
 308363 308364 VV1_0114 VV1_0115     TRUE 0.724 6.000 0.000 NA   NA
 308364 308365 VV1_0115 VV1_0116     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 308365 308366 VV1_0116 VV1_0117     TRUE 0.661 -22.000 0.000 NA   NA
 308366 308367 VV1_0117 VV1_0119     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 308367 308368 VV1_0119 VV1_0120     FALSE 0.008 301.000 0.000 NA   NA
 308371 308372 VV1_0123 VV1_0124     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 308373 308374 VV1_0125 VV1_0126     TRUE 0.995 -28.000 0.923 1.000 Y NA
 308376 308377 VV1_0128 VV1_0129     FALSE 0.012 225.000 0.000 1.000 N NA
 308377 308378 VV1_0129 VV1_0130     TRUE 0.630 46.000 0.156 NA N NA
 308378 308379 VV1_0130 VV1_0131     TRUE 0.829 60.000 0.363 NA   NA
 308380 308381 VV1_0132 VV1_0133 minC   TRUE 0.720 172.000 0.466 1.000 Y NA
 308381 308382 VV1_0133 VV1_0134     TRUE 0.995 3.000 0.618 NA Y NA
 308383 308384 VV1_0135 VV1_0136     TRUE 0.660 31.000 0.115 1.000 N NA
 308384 308385 VV1_0136 VV1_0137     FALSE 0.505 122.000 0.184 1.000   NA
 308385 308386 VV1_0137 VV1_0138     TRUE 0.797 0.000 0.037 1.000   NA
 308386 308387 VV1_0138 VV1_0139     TRUE 0.823 42.000 0.278 NA   NA
 308387 308388 VV1_0139 VV1_0140     FALSE 0.386 26.000 0.018 NA   NA
 308388 308389 VV1_0140 VV1_0141     TRUE 0.857 1.000 0.082 1.000 N NA
 308389 308390 VV1_0141 VV1_0142     FALSE 0.171 98.000 0.025 NA   NA
 308393 308394 VV1_0145 VV1_0146     FALSE 0.025 127.000 0.012 1.000 N NA
 308395 308396 VV1_0147 VV1_0148     TRUE 0.913 -3.000 0.111 NA   NA
 308396 308397 VV1_0148 VV1_0149     TRUE 0.996 0.000 0.778 1.000 Y NA
 308397 308398 VV1_0149 VV1_0150     FALSE 0.001 787.000 0.000 1.000 N NA
 308398 308399 VV1_0150 VV1_0151     FALSE 0.043 172.000 0.040 1.000 N NA
 308400 308401 VV1_0152 VV1_0153     TRUE 0.994 -19.000 0.755 1.000 Y NA
 308402 308403 VV1_0154 VV1_0155     TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 308403 308404 VV1_0155 VV1_0156     FALSE 0.339 191.000 0.136 1.000 Y NA
 308404 308405 VV1_0156 VV1_0157     TRUE 0.980 29.000 0.667 1.000 Y NA
 308405 308406 VV1_0157 VV1_0158   sdhB TRUE 0.632 102.000 0.067 1.000 Y NA
 308406 308407 VV1_0158 VV1_0159 sdhB sdhA TRUE 0.998 14.000 0.604 0.002 Y NA
 308407 308408 VV1_0159 VV1_0160 sdhA   TRUE 0.999 1.000 0.705 0.002 Y NA
 308408 308409 VV1_0160 VV1_0161   sdhC TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 308413 308414 VV1_0165 VV1_0166     FALSE 0.416 76.000 0.085 1.000   NA
 308414 308415 VV1_0166 VV1_0167     FALSE 0.257 40.000 0.017 NA   NA
 308415 308416 VV1_0167 VV1_0168     TRUE 0.968 23.000 0.667 NA   NA
 308416 308417 VV1_0168 VV1_0169     FALSE 0.004 410.000 0.000 NA   NA
 308417 308418 VV1_0169 VV1_0170     FALSE 0.494 91.000 0.151 1.000 N NA
 308419 308420 VV1_0171 VV1_0172     FALSE 0.528 114.000 0.179 NA   NA
 308420 308421 VV1_0172 VV1_0173     TRUE 0.701 49.000 0.183 NA   NA
 308424 308425 VV1_0176 VV1_0177     TRUE 0.878 45.000 0.006 0.001   NA
 308425 308426 VV1_0177 VV1_0179     FALSE 0.012 226.000 0.006 1.000   NA
 308427 308428 VV1_0180 VV1_0181     TRUE 0.994 3.000 0.571 1.000 Y NA
 308428 308429 VV1_0181 VV1_0182     TRUE 0.589 90.000 0.200 1.000 N NA
 308429 308430 VV1_0182 VV1_0183   asnB FALSE 0.013 217.000 0.027 1.000 N NA
 308433 308434 VV1_0186 VV1_0187     FALSE 0.005 283.000 0.000 1.000 N NA
 308434 308435 VV1_0187 VV1_0188   adk FALSE 0.241 139.000 0.113 1.000 N NA
 308435 308436 VV1_0188 VV1_0189 adk   FALSE 0.005 306.000 0.035 1.000 N NA
 308437 308438 VV1_0190 VV1_0191     TRUE 0.962 13.000 0.353 NA   NA
 308438 308439 VV1_0191 VV1_0192     TRUE 0.592 52.000 0.125 NA   NA
 308439 308440 VV1_0192 VV1_0193     TRUE 0.706 10.000 0.032 1.000   NA
 308441 308442 VV1_0194 VV1_0195     FALSE 0.328 41.000 0.031 1.000   NA
 308442 308443 VV1_0195 VV1_0196     TRUE 0.960 33.000 0.774 1.000   NA
 308443 308444 VV1_0196 VV1_0197     TRUE 0.987 -16.000 0.769 NA   NA
 308444 308445 VV1_0197 VV1_0198     TRUE 0.991 -3.000 0.744 NA   NA
 308446 308447 VV1_0199 VV1_0200     FALSE 0.534 41.000 0.083 1.000   NA
 308447 308448 VV1_0200 VV1_0201     FALSE 0.034 289.000 0.118 1.000   NA
 308448 308449 VV1_0201 VV1_0202     FALSE 0.352 164.000 0.075 NA Y NA
 308449 308450 VV1_0202 VV1_0203     TRUE 0.984 10.000 0.313 NA Y NA
 308451 308452 VV1_0204 VV1_0205     TRUE 0.824 138.000 0.800 NA   NA
 308452 308453 VV1_0205 VV1_0206     FALSE 0.003 495.000 0.000 NA   NA
 308453 308454 VV1_0206 VV1_0207     FALSE 0.430 65.000 0.106 1.000 N NA
 308455 308456 VV1_0208 VV1_0209     FALSE 0.217 223.000 0.122 1.000 Y NA
 308456 308457 VV1_0209 VV1_0210     FALSE 0.003 295.000 0.019 1.000 N NA
 308457 308458 VV1_0210 VV1_0211     TRUE 0.781 137.000 0.000 0.009 Y NA
 308458 308459 VV1_0211 VV1_0212     TRUE 0.832 121.000 0.000 0.009 Y NA
 308460 308461 VV1_0213 VV1_0214     TRUE 0.945 161.000 0.571 0.002 Y NA
 308461 308462 VV1_0214 VV1_0215     FALSE 0.092 589.000 0.000 0.002 Y NA
 308462 308463 VV1_0215 VV1_0216     FALSE 0.121 456.000 0.000 0.002 Y NA
 308463 308464 VV1_0216 VV1_0217     TRUE 0.993 14.000 0.182 0.001 Y NA
 308464 308465 VV1_0217 VV1_0218     TRUE 0.961 157.000 0.705 0.002 Y NA
 308465 308466 VV1_0218 VV1_0219   flgI TRUE 0.995 17.000 0.405 0.008 Y NA
 308466 308467 VV1_0219 VV1_0220 flgI   TRUE 0.981 60.000 0.457 0.008 Y NA
 308467 308468 VV1_0220 VV1_0221     TRUE 0.995 38.000 0.909 0.005 Y NA
 308468 308469 VV1_0221 VV1_0222     TRUE 0.995 22.000 0.446 0.002 Y NA
 308469 308470 VV1_0222 VV1_0223     TRUE 0.788 242.000 0.594 0.005 Y NA
 308470 308471 VV1_0223 VV1_0224     TRUE 0.985 31.000 0.875 NA Y NA
 308471 308472 VV1_0224 VV1_0225     TRUE 0.983 18.000 0.478 NA Y NA
 308472 308473 VV1_0225 VV1_0226     TRUE 0.996 5.000 0.889 1.000 Y NA
 308473 308474 VV1_0226 VV1_0227     FALSE 0.135 349.000 0.309 1.000 Y NA
 308474 308475 VV1_0227 VV1_0228     TRUE 0.993 14.000 0.838 1.000 Y NA
 308476 308477 VV1_0229 VV1_0230     TRUE 0.771 147.000 0.371 NA Y NA
 308477 308478 VV1_0230 VV1_0231     TRUE 0.994 21.000 0.361 0.002 Y NA
 308479 308480 VV1_0232 VV1_0233     TRUE 0.804 45.000 0.260 NA   NA
 308481 2208370 VV1_0234 VV1_tRNAArg1     FALSE 0.262 54.000 0.000 NA   NA
 2208370 308482 VV1_tRNAArg1 VV1_0235     FALSE 0.070 159.000 0.000 NA   NA
 308483 308484 VV1_0236 VV1_0237 gltX   FALSE 0.031 205.000 0.000 NA   NA
 308484 308485 VV1_0237 VV1_0238     TRUE 0.743 62.000 0.250 NA   NA
 308486 308487 VV1_0239 VV1_0240     FALSE 0.386 33.000 0.000 NA   NA
 308490 308491 VV1_0244 VV1_0245     FALSE 0.356 150.000 0.182 NA   NA
 308491 308492 VV1_0245 VV1_0246     FALSE 0.463 98.000 0.120 NA   NA
 308493 308494 VV1_0247 VV1_0248     FALSE 0.255 100.000 0.049 1.000   NA
 308494 308495 VV1_0248 VV1_0249     FALSE 0.002 399.000 0.000 1.000 N NA
 308495 308496 VV1_0249 VV1_0250     TRUE 0.785 17.000 0.089 1.000   NA
 308496 308497 VV1_0250 VV1_0251     TRUE 0.766 39.000 0.195 NA   NA
 308497 308498 VV1_0251 VV1_0252     TRUE 0.757 24.000 0.109 NA   NA
 308498 308499 VV1_0252 VV1_0253     TRUE 0.994 5.000 0.229 0.040 Y NA
 308499 308500 VV1_0253 VV1_0254     TRUE 0.944 26.000 0.171 0.040 N NA
 308501 308502 VV1_0255 VV1_0256 lolB   TRUE 0.933 0.000 0.157 1.000 N NA
 308502 308503 VV1_0256 VV1_0257     FALSE 0.345 39.000 0.053 1.000 N NA
 308503 308504 VV1_0257 VV1_0258     FALSE 0.052 61.000 0.011 1.000 N NA
 308504 308505 VV1_0258 VV1_0259     TRUE 0.926 11.000 0.184 1.000   NA
 308505 308506 VV1_0259 VV1_0260     TRUE 0.955 -18.000 0.007 0.012   NA
 308506 308507 VV1_0260 VV1_0261     TRUE 0.970 -3.000 0.007 0.012   NA
 308507 2208372 VV1_0261 VV1_tRNAMet1     FALSE 0.010 283.000 0.000 NA   NA
 2208372 2208373 VV1_tRNAMet1 VV1_tRNALeu1     FALSE 0.311 42.000 0.000 NA   NA
 2208373 2208374 VV1_tRNALeu1 VV1_tRNAGln1     TRUE 0.620 14.000 0.000 NA   NA
 2208374 2208375 VV1_tRNAGln1 VV1_tRNAMet2     FALSE 0.214 81.000 0.000 NA   NA
 2208375 2208376 VV1_tRNAMet2 VV1_tRNALeu2     FALSE 0.292 46.000 0.000 NA   NA
 2208376 2208377 VV1_tRNALeu2 VV1_tRNAGln2     FALSE 0.250 58.000 0.000 NA   NA
 2208377 2208378 VV1_tRNAGln2 VV1_tRNALeu3     FALSE 0.277 49.000 0.000 NA   NA
 2208378 2208379 VV1_tRNALeu3 VV1_tRNAMet3     TRUE 0.606 15.000 0.000 NA   NA
 2208379 2208380 VV1_tRNAMet3 VV1_tRNALeu4     FALSE 0.281 48.000 0.000 NA   NA
 2208380 2208381 VV1_tRNALeu4 VV1_tRNAPseudo1     FALSE 0.250 58.000 0.000 NA   NA
 2208381 2208382 VV1_tRNAPseudo1 VV1_tRNALeu5     FALSE 0.274 50.000 0.000 NA   NA
 2208382 2208383 VV1_tRNALeu5 VV1_tRNAGln3     FALSE 0.247 59.000 0.000 NA   NA
 2208383 2208384 VV1_tRNAGln3 VV1_tRNALeu6     FALSE 0.277 49.000 0.000 NA   NA
 2208384 2208385 VV1_tRNALeu6 VV1_tRNAGln4     FALSE 0.244 60.000 0.000 NA   NA
 2208385 2208386 VV1_tRNAGln4 VV1_tRNALeu7     FALSE 0.281 48.000 0.000 NA   NA
 308510 308511 VV1_0266 VV1_0267     TRUE 0.653 74.000 0.220 1.000 N NA
 308511 308512 VV1_0267 VV1_0268     TRUE 0.979 -10.000 0.457 NA   NA
 308512 308513 VV1_0268 VV1_0269     TRUE 0.568 79.000 0.150 NA   NA
 308513 308514 VV1_0269 VV1_0270     TRUE 0.906 43.000 0.557 1.000 N NA
 308516 308517 VV1_0272 VV1_0274 leuS   FALSE 0.089 237.000 0.182 NA N NA
 308517 308518 VV1_0274 VV1_0275     TRUE 0.947 3.000 0.199 NA N NA
 308518 308519 VV1_0275 VV1_0276     FALSE 0.177 57.000 0.013 NA   NA
 308519 308520 VV1_0276 VV1_0277     TRUE 0.970 5.000 0.307 NA   NA
 308520 308521 VV1_0277 VV1_0278     FALSE 0.005 327.000 0.015 NA   NA
 308521 308522 VV1_0278 VV1_0279     FALSE 0.430 0.000 0.014 1.000 N NA
 308522 308523 VV1_0279 VV1_0280     TRUE 0.739 0.000 0.043 NA N NA
 308523 308524 VV1_0280 VV1_0281     TRUE 0.633 93.000 0.057 NA Y NA
 308524 308525 VV1_0281 VV1_0282     FALSE 0.103 123.000 0.017 NA   NA
 308525 308526 VV1_0282 VV1_0283   lipB FALSE 0.281 179.000 0.219 NA   NA
 308526 308527 VV1_0283 VV1_0284 lipB   TRUE 0.998 -3.000 0.319 0.001 Y NA
 308527 308528 VV1_0284 VV1_0285     FALSE 0.019 200.000 0.008 NA   NA
 308531 308532 VV1_0288 VV1_0289     TRUE 0.949 67.000 0.650 1.000 Y NA
 308532 308533 VV1_0289 VV1_0290   treR FALSE 0.216 170.000 0.168 1.000 N NA
 308533 308534 VV1_0290 VV1_0291 treR   FALSE 0.305 39.000 0.045 1.000 N NA
 308535 308536 VV1_0292 VV1_0293     TRUE 0.992 -10.000 0.584 1.000 Y NA
 308536 308537 VV1_0293 VV1_0294     TRUE 0.942 36.000 0.321 NA Y NA
 308538 308539 VV1_0295 VV1_0296     TRUE 0.982 4.000 0.443 NA   NA
 308540 308541 VV1_0297 VV1_0298     FALSE 0.474 71.000 0.104 1.000   NA
 308541 308542 VV1_0298 VV1_0299     TRUE 0.813 100.000 0.450 1.000   NA
 308542 308543 VV1_0299 VV1_0300     FALSE 0.041 240.000 0.082 NA   NA
 308543 308544 VV1_0300 VV1_0301   xni TRUE 0.651 61.000 0.178 NA   NA
 308544 308545 VV1_0301 VV1_0302 xni   FALSE 0.010 237.000 0.000 1.000 N NA
 308546 308547 VV1_0303 VV1_0304     TRUE 0.935 -3.000 0.144 NA   NA
 308547 308548 VV1_0304 VV1_0305     TRUE 0.703 -10.000 0.029 NA   NA
 308548 308549 VV1_0305 VV1_0306     TRUE 0.892 -22.000 0.131 1.000   NA
 308549 308550 VV1_0306 VV1_0310     FALSE 0.001 1015.000 0.000 1.000 N NA
 308550 308551 VV1_0310 VV1_0311     FALSE 0.053 145.000 0.029 1.000 N NA
 308551 308552 VV1_0311 VV1_0312     TRUE 0.939 67.000 0.566 1.000 Y NA
 308553 308554 VV1_0313 VV1_0314     TRUE 0.921 9.000 0.177 1.000 N NA
 308554 308555 VV1_0314 VV1_0315     TRUE 0.959 21.000 0.246 1.000 Y NA
 308556 308557 VV1_0316 VV1_0317     TRUE 0.941 6.000 0.206 1.000 N NA
 308557 308558 VV1_0317 VV1_0318   nusB TRUE 0.663 67.000 0.225 1.000 N NA
 308558 308559 VV1_0318 VV1_0319 nusB ribH TRUE 0.976 0.000 0.347 1.000 N NA
 308559 308560 VV1_0319 VV1_0321 ribH   TRUE 0.678 177.000 0.049 0.002 Y NA
 308560 308561 VV1_0321 VV1_0322     TRUE 0.635 98.000 0.065 1.000 Y NA
 308561 308562 VV1_0322 VV1_0323     TRUE 0.993 2.000 0.456 1.000 Y NA
 308562 308563 VV1_0323 VV1_0324     TRUE 0.909 20.000 0.277 NA N NA
 308563 308564 VV1_0324 VV1_0325     FALSE 0.006 201.000 0.011 NA N NA
 308564 308565 VV1_0325 VV1_0326     TRUE 0.963 31.000 0.006 0.001 Y NA
 308565 308566 VV1_0326 VV1_0327     FALSE 0.369 124.000 0.119 NA   NA
 308566 308567 VV1_0327 VV1_0328     TRUE 0.791 94.000 0.381 NA   NA
 308567 308568 VV1_0328 VV1_0329     FALSE 0.080 163.000 0.040 NA   NA
 308568 308569 VV1_0329 VV1_0330     FALSE 0.081 145.000 0.024 1.000   NA
 308569 308570 VV1_0330 VV1_0331     TRUE 0.934 -40.000 0.017 0.052   NA
 308570 308571 VV1_0331 VV1_0332     TRUE 0.831 33.000 0.017 0.052   NA
 308574 308575 VV1_0336 VV1_0337     FALSE 0.127 131.000 0.031 NA   NA
 308576 308577 VV1_0338 VV1_0340     FALSE 0.037 160.000 0.007 NA   NA
 308579 308580 VV1_0342 VV1_0343     FALSE 0.060 37.000 0.008 1.000 N NA
 308581 308582 VV1_0344 VV1_0345     FALSE 0.416 137.000 0.179 1.000   NA
 308583 308584 VV1_0346 VV1_0347     TRUE 0.778 -64.000 0.067 NA   NA
 308586 308587 VV1_0349 VV1_0350     TRUE 0.976 -10.000 0.410 NA   NA
 308587 308588 VV1_0350 VV1_0351     TRUE 0.992 -3.000 0.824 NA   NA
 308588 308589 VV1_0351 VV1_0352     TRUE 0.984 -19.000 0.652 NA   NA
 308591 308592 VV1_0354 VV1_0357   dnaK TRUE 0.732 210.000 0.236 0.003 Y NA
 308592 308593 VV1_0357 VV1_0358 dnaK   FALSE 0.111 241.000 0.000 0.099   NA
 308593 308594 VV1_0358 VV1_0359     TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 308594 308595 VV1_0359 VV1_0360     TRUE 0.972 29.000 0.887 NA   NA
 308596 308597 VV1_0361 VV1_0362     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 308598 308599 VV1_0363 VV1_0365     FALSE 0.004 326.000 0.000 1.000 N NA
 308600 308601 VV1_0366 VV1_0367 ppnK   FALSE 0.069 248.000 0.170 1.000 N NA
 308601 308602 VV1_0367 VV1_0368     FALSE 0.047 179.000 0.049 1.000 N NA
 308603 308604 VV1_0369 VV1_0370     TRUE 0.923 -3.000 0.124 NA   NA
 308605 308606 VV1_0371 VV1_0372     FALSE 0.002 663.000 0.000 1.000   NA
 308606 308607 VV1_0372 VV1_0373     FALSE 0.004 465.000 0.000 NA   NA
 308609 308610 VV1_0375 VV1_0376     TRUE 0.888 88.000 0.667 NA   NA
 308610 308611 VV1_0376 VV1_0377     FALSE 0.009 296.000 0.000 NA   NA
 308611 308612 VV1_0377 VV1_0378     FALSE 0.150 118.000 0.000 NA   NA
 308612 308613 VV1_0378 VV1_0379     FALSE 0.007 323.000 0.000 NA   NA
 308613 308614 VV1_0379 VV1_0380     FALSE 0.529 20.000 0.000 NA   NA
 308614 308615 VV1_0380 VV1_0381     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 308616 308617 VV1_0382 VV1_0383     FALSE 0.022 227.000 0.000 NA   NA
 308617 308618 VV1_0383 VV1_0385     FALSE 0.011 275.000 0.000 NA   NA
 308618 308619 VV1_0385 VV1_0386     TRUE 0.897 74.000 0.250 0.048   NA
 308620 308621 VV1_0387 VV1_0388     FALSE 0.292 46.000 0.000 NA   NA
 308623 308624 VV1_0390 VV1_0391     TRUE 0.985 0.000 0.462 NA   NA
 308624 308625 VV1_0391 VV1_0392     FALSE 0.011 278.000 0.000 NA   NA
 308625 308626 VV1_0392 VV1_0393     TRUE 0.781 1.000 0.032 NA   NA
 308626 308627 VV1_0393 VV1_0394     FALSE 0.070 159.000 0.000 NA   NA
 308627 308628 VV1_0394 VV1_0395     TRUE 0.646 -37.000 0.000 NA   NA
 308631 308632 VV1_0398 VV1_0399     FALSE 0.262 54.000 0.000 NA   NA
 308632 308633 VV1_0399 VV1_0400     FALSE 0.003 624.000 0.000 NA   NA
 308634 308635 VV1_0401 VV1_0402     TRUE 0.960 -3.000 0.219 NA   NA
 308636 308637 VV1_0403 VV1_0404     FALSE 0.307 43.000 0.000 NA   NA
 308637 308638 VV1_0404 VV1_0405     TRUE 0.845 42.000 0.312 NA   NA
 308638 308639 VV1_0405 VV1_0406     TRUE 0.985 2.000 0.488 NA   NA
 308639 308640 VV1_0406 VV1_0407     TRUE 0.928 24.000 0.341 NA   NA
 308640 308641 VV1_0407 VV1_0408     TRUE 0.982 -3.000 0.421 NA   NA
 308642 308643 VV1_0409 VV1_0410     FALSE 0.009 293.000 0.000 NA   NA
 308643 308644 VV1_0410 VV1_0411     FALSE 0.023 225.000 0.000 NA   NA
 308645 308646 VV1_0412 VV1_0413     FALSE 0.198 90.000 0.000 NA   NA
 308647 308648 VV1_0414 VV1_0415     FALSE 0.035 335.000 0.000 1.000 Y NA
 308649 308650 VV1_0416 VV1_0417     FALSE 0.245 161.000 0.143 NA   NA
 308650 308651 VV1_0417 VV1_0418   guaA FALSE 0.013 262.000 0.000 1.000   NA
 308651 308652 VV1_0418 VV1_0419 guaA   TRUE 0.963 83.000 0.190 0.001 Y NA
 308654 308655 VV1_0421 VV1_0422     FALSE 0.007 320.000 0.000 1.000   NA
 308655 308656 VV1_0422 VV1_0423     FALSE 0.103 122.000 0.016 1.000   NA
 308656 308657 VV1_0423 VV1_0424     FALSE 0.193 202.000 0.203 1.000   NA
 308657 308658 VV1_0424 VV1_0425     TRUE 0.974 13.000 0.492 1.000   NA
 308658 308659 VV1_0425 VV1_0426   hisS TRUE 0.732 70.000 0.259 1.000   NA
 308659 308660 VV1_0426 VV1_0427 hisS   TRUE 0.776 36.000 0.207 1.000 N NA
 308660 308661 VV1_0427 VV1_0428     TRUE 0.956 6.000 0.233 1.000   NA
 308661 308662 VV1_0428 VV1_0429     FALSE 0.004 366.000 0.020 1.000   NA
 308662 308663 VV1_0429 VV1_0430     FALSE 0.157 197.000 0.156 1.000   NA
 308663 308664 VV1_0430 VV1_0431     FALSE 0.075 64.000 0.017 1.000 N NA
 308664 308665 VV1_0431 VV1_0432     FALSE 0.324 153.000 0.171 1.000   NA
 308665 308666 VV1_0432 VV1_0433     TRUE 0.885 82.000 0.625 1.000   NA
 308666 308667 VV1_0433 VV1_0434   hscA TRUE 0.985 12.000 0.794 1.000 N NA
 308667 308668 VV1_0434 VV1_0435 hscA hscB TRUE 0.984 22.000 0.634 1.000 Y NA
 308668 308669 VV1_0435 VV1_0436 hscB   FALSE 0.172 61.000 0.014 1.000   NA
 308669 308670 VV1_0436 VV1_0437     TRUE 0.830 73.000 0.010 0.001   NA
 308670 308671 VV1_0437 VV1_0438     TRUE 0.880 44.000 0.448 1.000 N NA
 308671 308672 VV1_0438 VV1_0439     TRUE 0.916 31.000 0.424 1.000 N NA
 308672 308673 VV1_0439 VV1_0440     FALSE 0.366 118.000 0.126 1.000 N NA
 308675 308676 VV1_0442 VV1_0443   secD TRUE 0.987 15.000 0.080 0.002 Y NA
 308676 308677 VV1_0443 VV1_0444 secD yajC TRUE 0.841 22.000 0.018 NA Y NA
 308677 308678 VV1_0444 VV1_0445 yajC   TRUE 0.665 118.000 0.325 NA N NA
 308678 308679 VV1_0445 VV1_0446     TRUE 0.971 114.000 0.360 0.001 Y NA
 308679 308680 VV1_0446 VV1_0447     FALSE 0.026 217.000 0.000 1.000   NA
 308682 308683 VV1_0449 VV1_0450     TRUE 0.636 128.000 0.129 1.000 Y NA
 308683 308684 VV1_0450 VV1_0451     FALSE 0.001 605.000 0.000 1.000 N NA
 308685 308686 VV1_0453 VV1_0454     FALSE 0.007 262.000 0.000 1.000 N NA
 308686 308687 VV1_0454 VV1_0455     FALSE 0.233 54.000 0.024 1.000   NA
 308687 308688 VV1_0455 VV1_0456     TRUE 0.575 11.000 0.015 1.000   NA
 308688 308689 VV1_0456 VV1_0457     FALSE 0.123 130.000 0.000 NA   NA
 308689 308690 VV1_0457 VV1_0458     TRUE 0.945 59.000 1.000 NA   NA
 308690 308691 VV1_0458 VV1_0459     FALSE 0.104 139.000 0.000 NA   NA
 308692 308693 VV1_0460 VV1_0461     TRUE 0.964 25.000 0.330 NA Y NA
 308693 308694 VV1_0461 VV1_0462     TRUE 0.999 2.000 0.511 0.002 Y NA
 308694 308695 VV1_0462 VV1_0463     TRUE 0.942 28.000 0.489 1.000   NA
 308696 308697 VV1_0464 VV1_0465     TRUE 0.952 44.000 0.486 1.000 Y NA
 308698 308699 VV1_0466 VV1_0467     TRUE 0.934 -3.000 0.168 1.000 N NA
 308699 308700 VV1_0467 VV1_0468     TRUE 0.962 111.000 0.453 0.025 Y NA
 308701 308702 VV1_0469 VV1_0470 rdgC   FALSE 0.014 203.000 0.025 1.000 N NA
 308702 308703 VV1_0470 VV1_0471     TRUE 0.890 4.000 0.093 1.000   NA
 308704 2208387 VV1_0472 VV1_tRNATrp2 mepA   FALSE 0.012 273.000 0.000 NA   NA
 2208387 2208388 VV1_tRNATrp2 VV1_tRNAAsp6     FALSE 0.220 73.000 0.000 NA   NA
 2208388 2208389 VV1_tRNAAsp6 VV1_r01     FALSE 0.428 29.000 0.000 NA   NA
 2208389 2208390 VV1_r01 VV1_r02     FALSE 0.163 112.000 0.000 NA   NA
 2208390 2208391 VV1_r02 VV1_tRNAAla5     FALSE 0.011 280.000 0.000 NA   NA
 2208391 2208392 VV1_tRNAAla5 VV1_r03     FALSE 0.226 66.000 0.000 NA   NA
 2208392 308711 VV1_r03 VV1_0482     FALSE 0.003 479.000 0.000 NA   NA
 308711 308712 VV1_0482 VV1_0483     FALSE 0.371 117.000 0.108 NA   NA
 308712 308713 VV1_0483 VV1_0484     TRUE 0.941 4.000 0.168 NA   NA
 308714 308715 VV1_0485 VV1_0486     FALSE 0.003 353.000 0.004 NA   NA
 308715 308716 VV1_0486 VV1_0487     FALSE 0.004 244.000 0.015 NA N NA
 308716 308717 VV1_0487 VV1_0488     TRUE 0.712 10.000 0.034 NA   NA
 308718 308719 VV1_0489 VV1_0490     TRUE 0.868 16.000 0.167 1.000 N NA
 308720 308721 VV1_0491 VV1_0492     FALSE 0.096 147.000 0.033 NA   NA
 308721 308722 VV1_0492 VV1_0493     FALSE 0.513 47.000 0.088 NA   NA
 308723 308724 VV1_0494 VV1_0495     TRUE 0.866 20.000 0.000 1.000 Y NA
 308724 308725 VV1_0495 VV1_0496     FALSE 0.020 196.000 0.000 1.000 N NA
 308727 308728 VV1_0498 VV1_0499     FALSE 0.481 27.000 0.034 NA   NA
 308728 308729 VV1_0499 VV1_0500     TRUE 0.690 10.000 0.000 NA   NA
 308730 308731 VV1_0501 VV1_0502     FALSE 0.365 169.000 0.095 1.000 Y NA
 308731 308732 VV1_0502 VV1_0503     TRUE 0.997 20.000 0.877 0.025 Y NA
 308733 308734 VV1_0504 VV1_0505 ispH   TRUE 0.941 33.000 0.626 1.000 N NA
 308734 308735 VV1_0505 VV1_0506   lspA FALSE 0.123 293.000 0.417 1.000 N NA
 308735 308736 VV1_0506 VV1_0507 lspA   FALSE 0.517 79.000 0.147 1.000 N NA
 308736 308737 VV1_0507 VV1_0508     TRUE 0.706 65.000 0.254 1.000 N NA
 308737 308738 VV1_0508 VV1_0509     TRUE 0.610 72.000 0.169 1.000   NA
 308740 308741 VV1_0512 VV1_0513   nhaR TRUE 0.880 129.000 0.210 0.061 Y NA
 308742 308743 VV1_0514 VV1_0515     FALSE 0.130 123.000 0.026 NA   NA
 308744 308745 VV1_0516 VV1_0517     TRUE 0.907 10.000 0.164 1.000 N NA
 308745 308746 VV1_0517 VV1_0518     FALSE 0.368 40.000 0.038 1.000   NA
 308746 308747 VV1_0518 VV1_0519     TRUE 0.718 7.000 0.000 1.000   NA
 308747 308748 VV1_0519 VV1_0520     FALSE 0.038 159.000 0.000 1.000 N NA
 308752 308753 VV1_0524 VV1_0525     FALSE 0.003 512.000 0.000 NA   NA
 308753 308754 VV1_0525 VV1_0526   lysS FALSE 0.180 199.000 0.000 0.098 N NA
 308754 308755 VV1_0526 VV1_0527 lysS   TRUE 0.967 33.000 0.162 0.039 Y NA
 308755 308756 VV1_0527 VV1_0528     FALSE 0.003 373.000 0.028 1.000 N NA
 308756 308757 VV1_0528 VV1_0529     FALSE 0.399 52.000 0.082 1.000 N NA
 308757 308758 VV1_0529 VV1_0530     FALSE 0.327 72.000 0.079 1.000 N NA
 308761 308762 VV1_0533 VV1_0534     TRUE 0.912 109.000 0.333 0.014   NA
 308763 308764 VV1_0535 VV1_0536     FALSE 0.106 105.000 0.009 1.000   NA
 308766 308767 VV1_0539 VV1_0540     FALSE 0.559 112.000 0.190 NA   NA
 308767 308768 VV1_0540 VV1_0541     FALSE 0.039 302.000 0.012 1.000 Y NA
 308770 308771 VV1_0543 VV1_0544     TRUE 0.984 -3.000 0.233 1.000 Y NA
 308771 308772 VV1_0544 VV1_0545   thrA TRUE 0.937 19.000 0.133 1.000 Y NA
 308776 308777 VV1_0549 VV1_0550     TRUE 0.975 5.000 0.350 NA   NA
 308777 308778 VV1_0550 VV1_0551     FALSE 0.365 231.000 0.000 0.014 Y NA
 308778 308779 VV1_0551 VV1_0552     FALSE 0.301 42.000 0.027 1.000   NA
 308780 308781 VV1_0553 VV1_0554     TRUE 0.993 0.000 0.000 0.001 Y NA
 308781 308782 VV1_0554 VV1_0555     FALSE 0.150 430.000 0.000 0.001 Y NA
 308782 308783 VV1_0555 VV1_0556     TRUE 0.992 13.000 0.118 0.001 Y NA
 308783 308784 VV1_0556 VV1_0557     TRUE 0.819 113.000 0.545 NA   NA
 308784 308785 VV1_0557 VV1_0558     FALSE 0.221 97.000 0.038 NA   NA
 308785 308786 VV1_0558 VV1_0559     TRUE 0.846 12.000 0.117 1.000 N NA
 308786 308787 VV1_0559 VV1_0560     TRUE 0.923 -3.000 0.148 1.000 N NA
 308787 308788 VV1_0560 VV1_0561     TRUE 0.681 72.000 0.213 NA   NA
 308788 308789 VV1_0561 VV1_0562     FALSE 0.308 113.000 0.080 NA   NA
 308792 308793 VV1_0565 VV1_0566 carB   TRUE 0.996 17.000 0.345 0.001 Y NA
 308793 308794 VV1_0566 VV1_0567     FALSE 0.020 482.000 0.034 1.000 Y NA
 308794 308795 VV1_0567 VV1_0568     FALSE 0.041 93.000 0.012 1.000 N NA
 308795 308796 VV1_0568 VV1_0569     TRUE 0.580 63.000 0.168 1.000 N NA
 308798 308799 VV1_0571 VV1_0572     FALSE 0.448 99.000 0.134 1.000 N NA
 308799 308800 VV1_0572 VV1_0573     FALSE 0.497 -25.000 0.006 NA   NA
 308800 308801 VV1_0573 VV1_0574   ftsA TRUE 0.846 79.000 0.460 NA   NA
 308801 308802 VV1_0574 VV1_0575 ftsA   TRUE 0.967 11.000 0.389 NA N NA
 308802 308803 VV1_0575 VV1_0577     FALSE 0.077 330.000 0.134 NA Y NA
 308803 308804 VV1_0577 VV1_0578   murG TRUE 0.976 14.000 0.283 1.000 Y NA
 308804 308805 VV1_0578 VV1_0579 murG   TRUE 0.985 8.000 0.647 1.000 N NA
 308805 308806 VV1_0579 VV1_0580   murD TRUE 0.958 45.000 0.297 0.002 N NA
 308806 308807 VV1_0580 VV1_0581 murD   TRUE 0.994 34.000 0.647 0.003 Y NA
 308807 308808 VV1_0581 VV1_0582     TRUE 0.997 -3.000 0.309 0.003 Y NA
 308808 308809 VV1_0582 VV1_0583   murE TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 308809 308810 VV1_0583 VV1_0584 murE   TRUE 0.960 5.000 0.083 1.000 Y NA
 308810 308811 VV1_0584 VV1_0585     TRUE 0.940 0.000 0.173 1.000 N NA
 308811 308812 VV1_0585 VV1_0586   mraW TRUE 0.939 10.000 0.227 1.000 N NA
 308815 308816 VV1_0589 VV1_0590     TRUE 0.924 -13.000 0.172 NA   NA
 308816 308817 VV1_0590 VV1_0591     TRUE 0.939 4.000 0.187 1.000 N NA
 308817 308818 VV1_0591 VV1_0592     TRUE 0.989 3.000 0.613 NA   NA
 308819 308820 VV1_0593 VV1_0594   sspA TRUE 0.992 4.000 0.831 NA   NA
 308820 308821 VV1_0594 VV1_0595 sspA   TRUE 0.756 98.000 0.370 NA N NA
 308821 308822 VV1_0595 VV1_0596     TRUE 0.999 -3.000 0.630 0.001 Y NA
 308822 308823 VV1_0596 VV1_0597     TRUE 0.997 0.000 0.233 0.001 Y NA
 308823 308824 VV1_0597 VV1_0598     FALSE 0.001 331.000 0.006 1.000 N NA
 308824 308825 VV1_0598 VV1_0599     TRUE 0.997 16.000 0.601 0.012 Y NA
 308825 308826 VV1_0599 VV1_0600     FALSE 0.007 252.000 0.002 NA   NA
 308827 308828 VV1_0601 VV1_0603     FALSE 0.213 187.000 0.183 1.000   NA
 308828 308829 VV1_0603 VV1_0604     TRUE 0.920 147.000 0.310 0.003 Y NA
 308830 308831 VV1_0605 VV1_0606     TRUE 0.994 4.000 0.106 0.002 Y NA
 308831 308832 VV1_0606 VV1_0607     FALSE 0.128 237.000 0.217 NA   NA
 308832 308833 VV1_0607 VV1_0608     TRUE 0.983 2.000 0.427 NA   NA
 308833 308834 VV1_0608 VV1_0609     TRUE 0.957 19.000 0.433 NA   NA
 308834 308835 VV1_0609 VV1_0610     TRUE 0.984 0.000 0.443 NA   NA
 308837 308838 VV1_0613 VV1_0614     FALSE 0.395 54.000 0.083 1.000 N NA
 308838 308839 VV1_0614 VV1_0615     FALSE 0.540 106.000 0.025 1.000 Y NA
 308842 308843 VV1_0618 VV1_0619     TRUE 0.860 135.000 0.937 NA   NA
 308843 308844 VV1_0619 VV1_0620     FALSE 0.281 184.000 0.233 NA   NA
 308847 308848 VV1_0623 VV1_0624 uppP   TRUE 0.825 16.000 0.125 1.000 N NA
 308848 308849 VV1_0624 VV1_0625     TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 308851 308852 VV1_0627 VV1_0628     FALSE 0.092 121.000 0.012 1.000   NA
 308853 308854 VV1_0629 VV1_0630     TRUE 0.948 29.000 0.173 0.019   NA
 308854 308855 VV1_0630 VV1_0631     FALSE 0.532 87.000 0.137 1.000   NA
 308855 308856 VV1_0631 VV1_0632     TRUE 0.692 100.000 0.299 1.000 N NA
 308856 2208393 VV1_0632 VV1_tRNAMet4     FALSE 0.091 146.000 0.000 NA   NA
 308857 308858 VV1_0633 VV1_0634     TRUE 0.695 8.000 0.026 NA   NA
 308859 308860 VV1_0636 VV1_0637     FALSE 0.013 263.000 0.000 1.000   NA
 308860 308861 VV1_0637 VV1_0638     FALSE 0.002 536.000 0.000 1.000 N NA
 308861 308862 VV1_0638 VV1_0639     TRUE 0.846 106.000 0.292 1.000 Y NA
 308862 308863 VV1_0639 VV1_0640     TRUE 0.704 57.000 0.230 NA N NA
 308864 308865 VV1_0641 VV1_0642     TRUE 0.813 69.000 0.412 1.000 N NA
 308866 308867 VV1_0644 VV1_0645     FALSE 0.100 204.000 0.130 1.000 N NA
 308868 308869 VV1_0646 VV1_0647   ilvH FALSE 0.040 153.000 0.026 1.000 N NA
 308869 308870 VV1_0647 VV1_0648 ilvH   TRUE 0.998 2.000 0.371 0.001 Y NA
 308870 308871 VV1_0648 VV1_0649     FALSE 0.002 460.000 0.000 1.000 N NA
 308871 308872 VV1_0649 VV1_0650   leuO FALSE 0.042 188.000 0.050 1.000 N NA
 308872 308873 VV1_0650 VV1_0651 leuO   FALSE 0.003 374.000 0.000 NA N NA
 308873 308874 VV1_0651 VV1_0652     TRUE 0.974 5.000 0.336 NA   NA
 308874 308875 VV1_0652 VV1_0653     FALSE 0.026 217.000 0.000 NA   NA
 308876 308877 VV1_0654 VV1_0655     TRUE 0.949 87.000 0.126 0.001 Y NA
 308877 308878 VV1_0655 VV1_0656     TRUE 0.993 20.000 0.275 0.001 Y NA
 308878 308879 VV1_0656 VV1_0657   leuD TRUE 0.996 12.000 0.309 0.001 Y NA
 308879 308880 VV1_0657 VV1_0658 leuD   FALSE 0.445 134.000 0.186 NA   NA
 308882 308883 VV1_0660 VV1_0661     TRUE 0.934 9.000 0.182 1.000   NA
 308883 308884 VV1_0661 VV1_0662     TRUE 0.985 -7.000 0.561 1.000   NA
 308884 308885 VV1_0662 VV1_0663   ksgA TRUE 0.946 -3.000 0.197 1.000 N NA
 308885 308886 VV1_0663 VV1_0664 ksgA   FALSE 0.351 60.000 0.078 NA N NA
 308886 308887 VV1_0664 VV1_0665     TRUE 0.930 15.000 0.267 NA N NA
 308888 308889 VV1_0666 VV1_0667     TRUE 0.876 10.000 0.104 NA   NA
 308889 308890 VV1_0667 VV1_0668     TRUE 0.991 0.000 0.704 NA   NA
 308890 308891 VV1_0668 VV1_0669     FALSE 0.028 212.000 0.027 NA   NA
 308891 308892 VV1_0669 VV1_0670     FALSE 0.523 156.000 0.335 1.000   NA
 308892 308893 VV1_0670 VV1_0671     TRUE 0.996 21.000 0.667 0.012 Y NA
 308896 308897 VV1_0674 VV1_0675     FALSE 0.005 366.000 0.000 NA   NA
 308897 308898 VV1_0675 VV1_0676     FALSE 0.076 196.000 0.073 NA   NA
 308898 308899 VV1_0676 VV1_0677     TRUE 0.576 79.000 0.154 NA   NA
 308900 308901 VV1_0678 VV1_0679     FALSE 0.065 140.000 0.033 1.000 N NA
 308901 308902 VV1_0679 VV1_0680     TRUE 0.948 10.000 0.258 NA N NA
 308902 308903 VV1_0680 VV1_0681     TRUE 0.983 4.000 0.453 NA   NA
 308903 308904 VV1_0681 VV1_0682     TRUE 0.975 0.000 0.308 NA   NA
 308904 308905 VV1_0682 VV1_0683     TRUE 0.749 41.000 0.188 NA   NA
 308905 308906 VV1_0683 VV1_0684     TRUE 0.987 3.000 0.562 NA   NA
 308906 308907 VV1_0684 VV1_0685     TRUE 0.992 -7.000 0.530 NA Y NA
 308908 308909 VV1_0686 VV1_0687     TRUE 0.874 22.000 0.226 1.000 N NA
 308909 308910 VV1_0687 VV1_0688     TRUE 0.989 0.000 0.598 1.000   NA
 308910 308911 VV1_0688 VV1_0689     TRUE 0.989 -3.000 0.617 NA   NA
 308911 308912 VV1_0689 VV1_0690     TRUE 0.970 14.000 0.459 NA   NA
 308912 308913 VV1_0690 VV1_0691     TRUE 0.987 0.000 0.543 NA   NA
 308913 308914 VV1_0691 VV1_0692     TRUE 0.650 54.000 0.163 1.000   NA
 308914 308915 VV1_0692 VV1_0693     TRUE 0.972 24.000 0.820 NA N NA
 308915 308916 VV1_0693 VV1_0694     TRUE 0.990 3.000 0.728 NA N NA
 308916 308917 VV1_0694 VV1_0695     TRUE 0.917 13.000 0.186 NA   NA
 308917 308918 VV1_0695 VV1_0697     TRUE 0.950 3.000 0.182 NA   NA
 308918 308919 VV1_0697 VV1_0698     FALSE 0.093 215.000 0.140 1.000 N NA
 308922 308923 VV1_0701 VV1_0702   thiP TRUE 0.995 -6.000 0.522 0.014 N NA
 308923 308924 VV1_0702 VV1_0703 thiP tbpA TRUE 0.984 28.000 0.697 0.066 N NA
 308924 308925 VV1_0703 VV1_0705 tbpA   FALSE 0.125 222.000 0.000 1.000 Y NA
 308925 308926 VV1_0705 VV1_0706     TRUE 0.908 17.000 0.235 1.000 N NA
 308927 308928 VV1_0707 VV1_0708     FALSE 0.089 140.000 0.043 1.000 N NA
 308929 308930 VV1_0709 VV1_0710     FALSE 0.148 101.000 0.020 NA   NA
 308930 308931 VV1_0710 VV1_0711     TRUE 0.742 37.000 0.167 NA   NA
 308931 308932 VV1_0711 VV1_0712     TRUE 0.987 -3.000 0.575 NA   NA
 308937 308938 VV1_0717 VV1_0719     TRUE 0.798 67.000 0.336 NA   NA
 308938 308939 VV1_0719 VV1_0720     TRUE 0.995 -3.000 0.605 NA Y NA
 308939 308940 VV1_0720 VV1_0721     TRUE 0.959 5.000 0.238 NA   NA
 308940 308941 VV1_0721 VV1_0722     FALSE 0.006 349.000 0.000 NA   NA
 308942 308943 VV1_0723 VV1_0724     TRUE 0.977 14.000 0.291 1.000 Y NA
 308943 308944 VV1_0724 VV1_0725   cysN TRUE 0.815 88.000 0.200 1.000 Y NA
 308944 308945 VV1_0725 VV1_0726 cysN   TRUE 0.994 18.000 0.574 0.001 N NA
 308945 308946 VV1_0726 VV1_0727     TRUE 0.929 58.000 0.417 1.000 Y NA
 308947 308948 VV1_0728 VV1_0729 cpdB   FALSE 0.409 72.000 0.104 NA N NA
 308948 308949 VV1_0729 VV1_0730     FALSE 0.304 100.000 0.066 NA   NA
 308949 308950 VV1_0730 VV1_0731     TRUE 0.934 1.000 0.132 NA   NA
 308952 308953 VV1_0733 VV1_0734     FALSE 0.367 134.000 0.141 NA   NA
 308954 308955 VV1_0735 VV1_0736     TRUE 0.971 27.000 0.873 1.000 N NA
 308955 308956 VV1_0736 VV1_0737     TRUE 0.952 24.000 0.549 1.000 N NA
 308956 308957 VV1_0737 VV1_0738     TRUE 0.992 28.000 0.509 0.015 Y NA
 308957 308958 VV1_0738 VV1_0739     TRUE 0.997 19.000 0.810 0.012 Y NA
 308958 308959 VV1_0739 VV1_0740     FALSE 0.001 299.000 0.011 1.000 N NA
 308959 308960 VV1_0740 VV1_0741     TRUE 0.971 21.000 0.730 1.000 N NA
 308960 308961 VV1_0741 VV1_0742     TRUE 0.999 7.000 0.653 0.002 Y NA
 308961 308962 VV1_0742 VV1_0743   rpsE TRUE 0.998 8.000 0.789 0.015 Y NA
 308962 308963 VV1_0743 VV1_0744 rpsE   TRUE 0.998 15.000 0.814 0.015 Y NA
 308963 308964 VV1_0744 VV1_0745     TRUE 0.998 10.000 0.815 0.012 Y NA
 308964 308965 VV1_0745 VV1_0746     TRUE 0.998 13.000 0.808 0.012 Y NA
 308965 308966 VV1_0746 VV1_0747     TRUE 0.991 31.000 0.473 0.012 Y NA
 308966 308967 VV1_0747 VV1_0748     TRUE 0.990 18.000 0.496 0.012   NA
 308967 308968 VV1_0748 VV1_0749     TRUE 0.909 23.000 0.004 0.012   NA
 308968 308969 VV1_0749 VV1_0750     TRUE 0.991 27.000 0.758 0.012   NA
 308969 308970 VV1_0750 VV1_0751     TRUE 0.998 14.000 0.810 0.015 Y NA
 308970 308971 VV1_0751 VV1_0753     TRUE 0.947 163.000 0.791 0.015 Y NA
 308971 308972 VV1_0753 VV1_0754   rpmC TRUE 0.989 0.000 0.029 0.012 Y NA
 308972 308973 VV1_0754 VV1_0755 rpmC   TRUE 0.989 0.000 0.029 0.012 Y NA
 308973 308974 VV1_0755 VV1_0756   rpsC TRUE 0.998 12.000 0.828 0.015 Y NA
 308974 308975 VV1_0756 VV1_0757 rpsC   TRUE 0.996 19.000 0.719 0.015 Y NA
 308975 308976 VV1_0757 VV1_0758   rpsS TRUE 0.998 11.000 0.769 0.015 Y NA
 308976 308977 VV1_0758 VV1_0759 rpsS   TRUE 0.996 22.000 0.820 0.015 Y NA
 308977 308978 VV1_0759 VV1_0760     TRUE 0.998 17.000 0.849 0.014 Y NA
 308978 308979 VV1_0760 VV1_0761     TRUE 0.998 -3.000 0.513 0.012 Y NA
 308979 308980 VV1_0761 VV1_0762     TRUE 0.995 17.000 0.486 0.012 Y NA
 308980 308981 VV1_0762 VV1_0763     TRUE 0.993 15.000 0.307 0.015 Y NA
 308981 308982 VV1_0763 VV1_0766     FALSE 0.002 1019.000 0.000 NA   NA
 308982 308983 VV1_0766 VV1_0767     FALSE 0.031 205.000 0.000 NA   NA
 308983 308984 VV1_0767 VV1_0768     FALSE 0.102 140.000 0.000 NA   NA
 308984 308985 VV1_0768 VV1_0769     FALSE 0.005 398.000 0.000 NA   NA
 308985 308986 VV1_0769 VV1_0770     FALSE 0.136 64.000 0.000 1.000 N NA
 308988 308989 VV1_0774 VV1_0775     FALSE 0.235 176.000 0.000 1.000 Y NA
 308989 308990 VV1_0775 VV1_0776     FALSE 0.561 25.000 0.046 NA   NA
 308990 308991 VV1_0776 VV1_0777     FALSE 0.400 172.000 0.297 NA   NA
 308991 308992 VV1_0777 VV1_0778     TRUE 0.671 -3.000 0.014 1.000   NA
 308992 308993 VV1_0778 VV1_0779     FALSE 0.002 8517.000 0.000 1.000   NA
 308993 308994 VV1_0779 VV1_0780     FALSE 0.279 189.000 0.091 1.000 Y NA
 308994 308995 VV1_0780 VV1_0781     TRUE 0.852 138.000 0.100 0.003 Y NA
 308995 308996 VV1_0781 VV1_0782     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 308996 308997 VV1_0782 VV1_0783     FALSE 0.318 41.000 0.000 NA   NA
 308997 308998 VV1_0783 VV1_0784     FALSE 0.561 18.000 0.000 NA   NA
 308998 308999 VV1_0784 VV1_0785     FALSE 0.561 18.000 0.000 NA   NA
 308999 309000 VV1_0785 VV1_0786     FALSE 0.008 304.000 0.000 NA   NA
 309001 309002 VV1_0787 VV1_0788     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 309002 309003 VV1_0788 VV1_0789     FALSE 0.287 47.000 0.000 NA   NA
 309003 309004 VV1_0789 VV1_0790     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 309004 309005 VV1_0790 VV1_0791     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 309005 309006 VV1_0791 VV1_0792     TRUE 0.638 13.000 0.000 NA   NA
 309006 309007 VV1_0792 VV1_0793     FALSE 0.114 134.000 0.000 NA   NA
 309007 309008 VV1_0793 VV1_0794     TRUE 0.983 -3.000 0.429 NA   NA
 309008 309009 VV1_0794 VV1_0795     TRUE 0.980 3.000 0.380 NA   NA
 309009 309010 VV1_0795 VV1_0796     FALSE 0.007 275.000 0.012 NA   NA
 309010 309011 VV1_0796 VV1_0797     FALSE 0.243 172.000 0.025 1.000 Y NA
 309011 309012 VV1_0797 VV1_0798     TRUE 0.943 3.000 0.021 1.000 Y NA
 309012 309013 VV1_0798 VV1_0799     TRUE 0.945 -6.000 0.040 1.000 Y NA
 309013 309014 VV1_0799 VV1_0800     FALSE 0.489 13.000 0.008 NA   NA
 309015 309016 VV1_0801 VV1_0802     TRUE 0.947 16.000 0.057 0.021   NA
 309016 309017 VV1_0802 VV1_0803     TRUE 0.706 -7.000 0.026 1.000   NA
 309017 309018 VV1_0803 VV1_0804     TRUE 0.984 4.000 0.235 1.000 Y NA
 309018 309019 VV1_0804 VV1_0805     TRUE 0.872 18.000 0.020 1.000 Y NA
 309019 309020 VV1_0805 VV1_0806     TRUE 0.876 -10.000 0.100 1.000   NA
 309020 309021 VV1_0806 VV1_0807     TRUE 0.731 -13.000 0.039 1.000   NA
 309021 309022 VV1_0807 VV1_0808     TRUE 0.994 0.000 0.549 1.000 Y NA
 309022 309023 VV1_0808 VV1_0809     TRUE 0.788 9.000 0.051 1.000   NA
 309023 309024 VV1_0809 VV1_0810     TRUE 0.828 10.000 0.074 1.000   NA
 309024 309025 VV1_0810 VV1_0811     TRUE 0.984 13.000 0.383 1.000 Y NA
 309027 309028 VV1_0813 VV1_0814     FALSE 0.278 45.000 0.025 1.000   NA
 309028 309029 VV1_0814 VV1_0815     FALSE 0.205 44.000 0.032 1.000 N NA
 309030 309031 VV1_0816 VV1_0817     TRUE 0.902 18.000 0.058 NA Y NA
 309034 309035 VV1_0820 VV1_0821     FALSE 0.007 147.000 0.004 1.000 N NA
 309035 309036 VV1_0821 VV1_0822     FALSE 0.371 30.000 0.022 NA   NA
 309036 309037 VV1_0822 VV1_0823   rpmG FALSE 0.005 282.000 0.004 NA   NA
 309037 309038 VV1_0823 VV1_0824 rpmG   TRUE 0.994 16.000 0.332 0.012 Y NA
 309038 309039 VV1_0824 VV1_0825     FALSE 0.001 312.000 0.006 1.000 N NA
 309039 309040 VV1_0825 VV1_0826     FALSE 0.197 144.000 0.100 1.000 N NA
 309041 309042 VV1_0828 VV1_0829   slmA FALSE 0.059 151.000 0.016 1.000   NA
 309042 309043 VV1_0829 VV1_0830 slmA   TRUE 0.668 4.000 0.016 1.000   NA
 309044 309045 VV1_0831 VV1_0832 pyrE rph FALSE 0.056 227.000 0.108 1.000 N NA
 309047 309048 VV1_0834 VV1_0835     FALSE 0.349 205.000 0.400 NA   NA
 309048 309049 VV1_0835 VV1_0836     FALSE 0.092 158.000 0.042 NA   NA
 309049 309050 VV1_0836 VV1_0837     FALSE 0.142 135.000 0.042 1.000   NA
 309050 309051 VV1_0837 VV1_0838     TRUE 0.992 11.000 0.152 0.004 Y NA
 309051 309052 VV1_0838 VV1_0839     TRUE 0.922 27.000 0.167 1.000 Y NA
 309052 309053 VV1_0839 VV1_0840     TRUE 0.907 39.000 0.161 0.050   NA
 309053 309054 VV1_0840 VV1_0841     TRUE 0.960 92.000 0.742 0.050   NA
 309055 309056 VV1_0842 VV1_0843     TRUE 0.751 36.000 0.167 NA   NA
 309056 309057 VV1_0843 VV1_0844     TRUE 0.985 3.000 0.500 NA   NA
 309057 309058 VV1_0844 VV1_0845     TRUE 0.988 10.000 0.242 0.015   NA
 309058 309059 VV1_0845 VV1_0846     TRUE 0.912 82.000 0.333 0.065   NA
 309059 309060 VV1_0846 VV1_0847     TRUE 0.985 5.000 0.588 1.000 N NA
 309060 309061 VV1_0847 VV1_0848     TRUE 0.958 11.000 0.294 1.000   NA
 309063 309064 VV1_0850 VV1_0851   rpoZ TRUE 0.725 128.000 0.471 1.000 N NA
 309064 309065 VV1_0851 VV1_0852 rpoZ   TRUE 0.938 35.000 0.291 1.000 Y NA
 309065 309066 VV1_0852 VV1_0853     FALSE 0.360 88.000 0.095 1.000 N NA
 309066 309067 VV1_0853 VV1_0854     FALSE 0.301 112.000 0.076 1.000   NA
 309067 309068 VV1_0854 VV1_0855     TRUE 0.957 -52.000 0.013 0.005   NA
 309068 309069 VV1_0855 VV1_0856     FALSE 0.008 256.000 0.009 1.000   NA
 309070 309071 VV1_0857 VV1_0858 envZ ompR TRUE 0.930 93.000 0.584 1.000 Y NA
 309071 309072 VV1_0858 VV1_0859 ompR greB FALSE 0.486 201.000 0.067 0.046 Y NA
 309074 309075 VV1_0861 VV1_0862     FALSE 0.159 138.000 0.053 NA   NA
 309076 309077 VV1_0863 VV1_0864     FALSE 0.321 92.000 0.066 1.000   NA
 309077 309078 VV1_0864 VV1_0865     FALSE 0.242 116.000 0.059 1.000   NA
 309078 309079 VV1_0865 VV1_0866     TRUE 0.955 15.000 0.373 1.000 N NA
 309080 309081 VV1_0867 VV1_0868     TRUE 0.990 2.000 0.649 1.000   NA
 309081 309082 VV1_0868 VV1_0869     TRUE 0.986 26.000 0.811 1.000 Y NA
 309082 309083 VV1_0869 VV1_0870     TRUE 0.991 26.000 0.537 0.064 Y NA
 309083 309084 VV1_0870 VV1_0871     TRUE 0.991 -7.000 0.461 1.000 Y NA
 309084 309085 VV1_0871 VV1_0872     TRUE 0.996 -13.000 0.569 0.005   NA
 309085 309086 VV1_0872 VV1_0873     TRUE 0.997 -7.000 0.605 0.005   NA
 309086 309087 VV1_0873 VV1_0874     TRUE 0.983 29.000 0.425 0.005   NA
 309087 309088 VV1_0874 VV1_0875     TRUE 0.987 54.000 0.599 0.005 Y NA
 309088 309089 VV1_0875 VV1_0876     TRUE 0.999 0.000 0.653 0.005 Y NA
 309089 309090 VV1_0876 VV1_0877     TRUE 0.999 0.000 0.776 0.005 Y NA
 309090 309091 VV1_0877 VV1_0878     TRUE 0.991 37.000 0.575 0.005 Y NA
 309092 309093 VV1_0879 VV1_0880   hslO TRUE 0.707 32.000 0.140 1.000 N NA
 309093 309094 VV1_0880 VV1_0881 hslO   FALSE 0.006 334.000 0.048 1.000 N NA
 309094 309095 VV1_0881 VV1_0882     FALSE 0.131 124.000 0.027 NA   NA
 309096 309097 VV1_0883 VV1_0884     FALSE 0.456 43.000 0.065 1.000   NA
 309097 309098 VV1_0884 VV1_0885   rbn TRUE 0.793 -25.000 0.069 1.000   NA
 309100 309101 VV1_0887 VV1_0888     FALSE 0.151 77.000 0.013 1.000   NA
 309102 309103 VV1_0889 VV1_0890 glnA   FALSE 0.048 198.000 0.044 NA   NA
 309103 309104 VV1_0890 VV1_0891   glnL FALSE 0.477 129.000 0.188 NA   NA
 309104 309105 VV1_0891 VV1_0892 glnL   TRUE 0.994 19.000 0.587 0.087 Y NA
 309105 309106 VV1_0892 VV1_0893     FALSE 0.539 118.000 0.046 1.000 Y NA
 309107 309108 VV1_0894 VV1_0895     FALSE 0.477 145.000 0.244 NA   NA
 309108 309109 VV1_0895 VV1_0896     TRUE 0.987 9.000 0.679 NA   NA
 309109 309110 VV1_0896 VV1_0897     TRUE 0.978 0.000 0.333 NA   NA
 309110 309111 VV1_0897 VV1_0899     FALSE 0.006 572.000 0.069 NA   NA
 309113 309114 VV1_0901 VV1_0902     FALSE 0.001 818.000 0.000 1.000 N NA
 309116 309117 VV1_0904 VV1_0905     TRUE 0.898 67.000 0.333 NA Y NA
 309117 309118 VV1_0905 VV1_0906   tatA TRUE 0.990 4.000 0.043 0.007 Y NA
 309118 309119 VV1_0906 VV1_0907 tatA   FALSE 0.164 52.000 0.007 1.000   NA
 309119 309120 VV1_0907 VV1_0908     TRUE 0.983 -3.000 0.432 1.000   NA
 309120 309121 VV1_0908 VV1_0909     TRUE 0.917 9.000 0.145 1.000   NA
 309121 309122 VV1_0909 VV1_0910     TRUE 0.829 0.000 0.047 NA   NA
 309124 309125 VV1_0912 VV1_0914     FALSE 0.058 168.000 0.000 NA   NA
 309125 309126 VV1_0914 VV1_0915     TRUE 0.959 26.000 0.600 NA   NA
 309126 2208394 VV1_0915 VV1_tRNAAsp5     FALSE 0.005 355.000 0.000 NA   NA
 2208394 2208395 VV1_tRNAAsp5 VV1_r04     FALSE 0.418 30.000 0.000 NA   NA
 2208395 2208396 VV1_r04 VV1_r05     FALSE 0.163 112.000 0.000 NA   NA
 2208396 2208397 VV1_r05 VV1_tRNAVal5     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 2208397 2208398 VV1_tRNAVal5 VV1_tRNAAla4     FALSE 0.561 18.000 0.000 NA   NA
 2208398 2208399 VV1_tRNAAla4 VV1_tRNALys3     FALSE 0.561 18.000 0.000 NA   NA
 2208399 2208400 VV1_tRNALys3 VV1_tRNAGlu4     TRUE 0.733 5.000 0.000 NA   NA
 2208400 2208401 VV1_tRNAGlu4 VV1_r06     FALSE 0.223 68.000 0.000 NA   NA
 2208401 2208402 VV1_r06 VV1_r07     FALSE 0.007 330.000 0.000 NA   NA
 2208402 2208403 VV1_r07 VV1_r08     FALSE 0.163 112.000 0.000 NA   NA
 2208403 2208404 VV1_r08 VV1_tRNAAla3     FALSE 0.010 281.000 0.000 NA   NA
 2208404 2208405 VV1_tRNAAla3 VV1_tRNAIle3     TRUE 0.620 14.000 0.000 NA   NA
 2208405 2208406 VV1_tRNAIle3 VV1_r09     FALSE 0.234 63.000 0.000 NA   NA
 2208406 309140 VV1_r09 VV1_0933     FALSE 0.004 465.000 0.000 NA   NA
 309140 309141 VV1_0933 VV1_0934     TRUE 0.974 15.000 0.040 0.040 Y NA
 309141 309142 VV1_0934 VV1_0935     TRUE 0.717 -3.000 0.042 1.000 N NA
 309142 309143 VV1_0935 VV1_0936     FALSE 0.151 93.000 0.018 NA   NA
 309143 309144 VV1_0936 VV1_0937   rho FALSE 0.042 155.000 0.007 NA   NA
 309144 309145 VV1_0937 VV1_0938 rho   FALSE 0.085 199.000 0.087 1.000   NA
 309146 309147 VV1_0939 VV1_0940     TRUE 0.974 8.000 0.406 NA N NA
 309148 309149 VV1_0941 VV1_0942     FALSE 0.009 277.000 0.019 NA   NA
 309149 309150 VV1_0942 VV1_0943     TRUE 0.808 -7.000 0.054 NA   NA
 309151 309152 VV1_0944 VV1_0945     FALSE 0.191 74.000 0.023 NA   NA
 309152 309153 VV1_0945 VV1_0946     TRUE 0.842 88.000 0.545 1.000 N NA
 309155 309156 VV1_0950 VV1_0952     FALSE 0.035 274.000 0.100 NA   NA
 309156 309157 VV1_0952 VV1_0953     TRUE 0.815 12.000 0.080 NA   NA
 309157 309158 VV1_0953 VV1_0954     TRUE 0.970 -7.000 0.321 NA   NA
 309159 309160 VV1_0955 VV1_0956     TRUE 0.871 95.000 0.625 NA   NA
 309161 309162 VV1_0957 VV1_0958     FALSE 0.109 157.000 0.074 1.000 N NA
 309163 309164 VV1_0959 VV1_0960   thiG TRUE 0.982 37.000 0.277 0.003 Y NA
 309164 309165 VV1_0960 VV1_0961 thiG   TRUE 0.961 5.000 0.087 1.000 Y NA
 309165 309166 VV1_0961 VV1_0962     TRUE 0.990 -19.000 0.548 1.000 Y NA
 309166 309167 VV1_0962 VV1_0963     TRUE 0.980 -10.000 0.242 1.000 Y NA
 309167 309168 VV1_0963 VV1_0964     TRUE 0.992 3.000 0.063 0.003 Y NA
 309168 309169 VV1_0964 VV1_0965   ccrB FALSE 0.004 317.000 0.000 NA N NA
 309169 309170 VV1_0965 VV1_0966 ccrB   FALSE 0.071 124.000 0.027 NA N NA
 309171 309172 VV1_0968 VV1_0969     TRUE 0.959 26.000 0.600 NA   NA
 2208407 2208408 VV1_tRNAAsp4 VV1_r10     FALSE 0.418 30.000 0.000 NA   NA
 2208408 2208409 VV1_r10 VV1_r11     FALSE 0.163 112.000 0.000 NA   NA
 2208409 2208410 VV1_r11 VV1_tRNAAla2     FALSE 0.010 282.000 0.000 NA   NA
 2208410 2208411 VV1_tRNAAla2 VV1_tRNAIle2     TRUE 0.620 14.000 0.000 NA   NA
 2208411 2208412 VV1_tRNAIle2 VV1_r12     FALSE 0.234 63.000 0.000 NA   NA
 2208412 309178 VV1_r12 VV1_0978     FALSE 0.004 437.000 0.000 NA   NA
 309178 309179 VV1_0978 VV1_0979     TRUE 0.978 7.000 0.455 1.000 N NA
 309179 309180 VV1_0979 VV1_0980     TRUE 0.742 46.000 0.202 1.000   NA
 309181 309182 VV1_0981 VV1_0982     TRUE 0.991 13.000 0.607 1.000 Y NA
 309182 309183 VV1_0982 VV1_0983     FALSE 0.040 161.000 0.032 1.000 N NA
 309184 309185 VV1_0984 VV1_0985     TRUE 0.720 129.000 0.423 NA   NA
 309187 309188 VV1_0987 VV1_0988     FALSE 0.113 160.000 0.059 NA   NA
 309189 309190 VV1_0989 VV1_0990 glyQ glyS TRUE 0.998 14.000 0.651 0.001 Y NA
 309192 309193 VV1_0992 VV1_0993 avtA   FALSE 0.022 188.000 0.000 1.000 N NA
 309194 309195 VV1_0994 VV1_0996     FALSE 0.002 436.000 0.000 NA N NA
 309195 309196 VV1_0996 VV1_0997     TRUE 0.991 19.000 0.249 0.004 Y NA
 309196 309197 VV1_0997 VV1_0998     TRUE 0.985 10.000 0.318 1.000 Y NA
 309197 309198 VV1_0998 VV1_0999   dnaA TRUE 0.904 61.000 0.328 1.000 Y NA
 309198 309199 VV1_0999 VV1_1000 dnaA   FALSE 0.106 138.000 0.000 NA   NA
 309200 309201 VV1_1001 VV1_1002     TRUE 0.981 82.000 0.704 0.050 Y NA
 309201 309202 VV1_1002 VV1_1003     TRUE 0.992 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 309202 309203 VV1_1003 VV1_1004     FALSE 0.012 228.000 0.006 1.000   NA
 309203 309204 VV1_1004 VV1_1005   rnpA TRUE 0.984 14.000 0.787 1.000   NA
 309204 309205 VV1_1005 VV1_1007 rnpA   FALSE 0.054 227.000 0.105 1.000 N NA
 309205 309206 VV1_1007 VV1_1008     TRUE 0.582 118.000 0.221 1.000   NA
 309206 309207 VV1_1008 VV1_1009     FALSE 0.249 48.000 0.023 1.000   NA
 309207 309208 VV1_1009 VV1_1010     FALSE 0.002 469.000 0.000 1.000 N NA
 309208 309209 VV1_1010 VV1_1011     TRUE 0.982 -3.000 0.466 1.000 N NA
 309209 309210 VV1_1011 VV1_1012     TRUE 0.961 11.000 0.339 1.000 N NA
 309210 309211 VV1_1012 VV1_1013     TRUE 0.971 25.000 0.827 1.000 N NA
 309211 309212 VV1_1013 VV1_1014     FALSE 0.045 190.000 0.056 1.000 N NA
 309212 309213 VV1_1014 VV1_1015     TRUE 0.984 9.000 0.291 1.000 Y NA
 309213 309214 VV1_1015 VV1_1016     TRUE 0.988 53.000 0.557 0.002 Y NA
 309214 309215 VV1_1016 VV1_1017     TRUE 0.988 78.000 0.666 0.002 Y NA
 309215 309216 VV1_1017 VV1_1018     TRUE 0.994 15.000 0.242 0.002 Y NA
 309216 309217 VV1_1018 VV1_1019     TRUE 0.998 14.000 0.864 0.002 Y NA
 309217 309218 VV1_1019 VV1_1020     TRUE 0.994 44.000 0.846 0.002 Y NA
 309218 309219 VV1_1020 VV1_1021     TRUE 0.994 36.000 0.724 0.002 Y NA
 309219 309220 VV1_1021 VV1_1022   atpC TRUE 0.998 19.000 0.837 0.002 Y NA
 309220 309221 VV1_1022 VV1_1023 atpC glmU FALSE 0.106 154.000 0.067 1.000 N NA
 309226 309227 VV1_1028 VV1_1029     TRUE 0.968 4.000 0.106 1.000 Y NA
 309227 309228 VV1_1029 VV1_1030     TRUE 0.935 13.000 0.075 1.000 Y NA
 309228 309229 VV1_1030 VV1_1031     TRUE 0.931 12.000 0.205 1.000   NA
 309229 309230 VV1_1031 VV1_1032     TRUE 0.998 12.000 0.943 0.001   NA
 309234 309235 VV1_1036 VV1_1037     TRUE 0.600 33.000 0.082 NA   NA
 309235 309236 VV1_1037 VV1_1038     TRUE 0.592 52.000 0.125 NA   NA
 309236 309237 VV1_1038 VV1_1039     FALSE 0.013 276.000 0.036 NA   NA
 309237 309238 VV1_1039 VV1_1040     FALSE 0.538 119.000 0.196 NA   NA
 309239 309240 VV1_1041 VV1_1043     FALSE 0.079 153.000 0.000 NA   NA
 309241 309242 VV1_1044 VV1_1045   trkA TRUE 0.992 10.000 0.126 0.004 Y NA
 309242 309243 VV1_1045 VV1_1046 trkA   FALSE 0.507 57.000 0.122 1.000 N NA
 309243 309244 VV1_1046 VV1_1047     TRUE 0.878 84.000 0.305 1.000 Y NA
 309244 309245 VV1_1047 VV1_1048   def TRUE 0.951 32.000 0.058 0.018 Y NA
 309246 309247 VV1_1049 VV1_1050     TRUE 0.830 0.000 0.048 1.000   NA
 309247 309248 VV1_1050 VV1_1051     TRUE 0.923 3.000 0.124 NA   NA
 309248 309249 VV1_1051 VV1_1052     TRUE 0.924 24.000 0.331 NA   NA
 309250 309251 VV1_1053 VV1_1054     TRUE 0.995 4.000 0.136 0.001 Y NA
 309252 309253 VV1_1055 VV1_1056     FALSE 0.507 29.000 0.066 NA N NA
 309253 309254 VV1_1056 VV1_1057   aroE FALSE 0.207 136.000 0.093 1.000 N NA
 309254 309255 VV1_1057 VV1_1058 aroE   TRUE 0.869 4.000 0.078 NA   NA
 2208413 2208414 VV1_r13 VV1_tRNAGlu1     FALSE 0.223 68.000 0.000 NA   NA
 2208414 2208415 VV1_tRNAGlu1 VV1_tRNALys1     TRUE 0.733 5.000 0.000 NA   NA
 2208415 2208416 VV1_tRNALys1 VV1_tRNAVal1     FALSE 0.398 32.000 0.000 NA   NA
 2208416 2208417 VV1_tRNAVal1 VV1_r14     FALSE 0.011 280.000 0.000 NA   NA
 2208417 2208418 VV1_r14 VV1_r15     FALSE 0.163 112.000 0.000 NA   NA
 2208418 2208419 VV1_r15 VV1_tRNASer1     FALSE 0.183 101.000 0.000 NA   NA
 309262 309263 VV1_1074 VV1_1075     TRUE 0.959 26.000 0.600 NA   NA
 309263 309264 VV1_1075 VV1_1076     FALSE 0.011 234.000 0.000 NA N NA
 309266 309267 VV1_1078 VV1_1079     FALSE 0.061 146.000 0.014 NA   NA
 309267 309268 VV1_1079 VV1_1080     TRUE 0.941 12.000 0.261 NA N NA
 309268 309269 VV1_1080 VV1_1081     TRUE 0.866 39.000 0.362 1.000 N NA
 309270 309271 VV1_1082 VV1_1083     TRUE 0.978 -3.000 0.008 0.002   NA
 2208420 2208421 VV1_tRNAArg2 VV1_tRNAHis1     FALSE 0.311 42.000 0.000 NA   NA
 2208421 2208422 VV1_tRNAHis1 VV1_tRNAPro2     FALSE 0.418 30.000 0.000 NA   NA
 2208422 2208423 VV1_tRNAPro2 VV1_tRNAHis2     FALSE 0.217 78.000 0.000 NA   NA
 2208423 2208424 VV1_tRNAHis2 VV1_tRNAPro3     FALSE 0.438 28.000 0.000 NA   NA
 2208424 309273 VV1_tRNAPro3 VV1_1085     FALSE 0.002 1283.000 0.000 NA   NA
 309273 309274 VV1_1085 VV1_1086     TRUE 0.827 76.000 0.408 1.000   NA
 309274 309275 VV1_1086 VV1_1087     TRUE 0.956 152.000 0.848 0.049 Y NA
 309275 309276 VV1_1087 VV1_1088     TRUE 0.999 3.000 1.000 0.049 Y NA
 309276 309277 VV1_1088 VV1_1089     FALSE 0.278 187.000 0.239 NA   NA
 309280 309281 VV1_1092 VV1_1093     TRUE 0.975 9.000 0.385 NA   NA
 309281 309282 VV1_1093 VV1_1094     TRUE 0.985 1.000 0.462 NA   NA
 309282 309283 VV1_1094 VV1_1095     TRUE 0.831 29.000 0.194 NA   NA
 309283 309284 VV1_1095 VV1_1096     FALSE 0.079 153.000 0.000 NA   NA
 309285 309286 VV1_1097 VV1_1098     TRUE 0.637 76.000 0.000 0.086 N NA
 309287 309288 VV1_1099 VV1_1100     TRUE 0.959 -3.000 0.066 1.000 Y NA
 309289 309290 VV1_1101 VV1_1102     TRUE 0.974 10.000 0.192 1.000 Y NA
 309290 309291 VV1_1102 VV1_1103     FALSE 0.012 269.000 0.000 NA   NA
 309291 309292 VV1_1103 VV1_1104     FALSE 0.198 90.000 0.000 NA   NA
 309293 309294 VV1_1105 VV1_1106     FALSE 0.263 138.000 0.100 1.000   NA
 309297 309298 VV1_1110 VV1_1112     FALSE 0.250 110.000 0.055 NA   NA
 309298 309299 VV1_1112 VV1_1113     FALSE 0.102 160.000 0.051 NA   NA
 309300 309301 VV1_1114 VV1_1115     FALSE 0.226 66.000 0.000 1.000   NA
 309302 309303 VV1_1116 VV1_1117     TRUE 0.685 87.000 0.235 NA   NA
 309303 309304 VV1_1117 VV1_1118     FALSE 0.180 103.000 0.028 NA   NA
 309305 309306 VV1_1119 VV1_1120     TRUE 0.996 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 309306 309307 VV1_1120 VV1_1121     TRUE 0.989 15.000 0.600 1.000 Y NA
 309307 309308 VV1_1121 VV1_1122     TRUE 0.997 2.000 0.205 0.001 Y NA
 309311 309312 VV1_1126 VV1_1127   dapF TRUE 0.991 11.000 0.104 0.002 Y NA
 309312 309313 VV1_1127 VV1_1128 dapF   TRUE 0.717 43.000 0.175 NA   NA
 309313 309314 VV1_1128 VV1_1129     TRUE 0.984 -31.000 0.714 NA   NA
 309314 309315 VV1_1129 VV1_1130     TRUE 0.979 -3.000 0.367 1.000   NA
 309315 309316 VV1_1130 VV1_1132     FALSE 0.103 130.000 0.022 1.000   NA
 309317 309318 VV1_1133 VV1_1134     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 309320 309321 VV1_1136 VV1_1137     FALSE 0.047 181.000 0.000 1.000   NA
 309322 309323 VV1_1138 VV1_1139     TRUE 0.654 54.000 0.188 NA N NA
 309323 309324 VV1_1139 VV1_1140     TRUE 0.647 107.000 0.273 NA N NA
 309324 309325 VV1_1140 VV1_1141     TRUE 0.616 30.000 0.096 1.000 N NA
 309325 309326 VV1_1141 VV1_1142     TRUE 0.937 0.000 0.167 1.000 N NA
 309326 309327 VV1_1142 VV1_1143     FALSE 0.374 65.000 0.089 NA N NA
 309327 309328 VV1_1143 VV1_1144     FALSE 0.132 100.000 0.015 NA   NA
 309330 309331 VV1_1146 VV1_1147     FALSE 0.002 1065.000 0.000 NA   NA
 309334 309335 VV1_1152 VV1_1153     TRUE 0.691 19.000 0.063 NA   NA
 309336 309337 VV1_1154 VV1_1155     TRUE 0.925 21.000 0.117 0.094 N NA
 309337 309338 VV1_1155 VV1_1156     FALSE 0.503 -16.000 0.004 NA   NA
 309338 309339 VV1_1156 VV1_1157     TRUE 0.890 -13.000 0.121 NA   NA
 309339 309340 VV1_1157 VV1_1158     FALSE 0.052 177.000 0.051 NA N NA
 309340 309341 VV1_1158 VV1_1160     FALSE 0.002 437.000 0.000 1.000 N NA
 309341 309342 VV1_1160 VV1_1161     TRUE 0.817 85.000 0.405 1.000   NA
 309344 309345 VV1_1163 VV1_1164     TRUE 0.986 1.000 0.248 NA Y NA
 309347 309348 VV1_1166 VV1_1167     FALSE 0.075 188.000 0.083 NA N NA
 309350 309351 VV1_1169 VV1_1170     TRUE 0.987 0.000 0.508 NA   NA
 309352 309353 VV1_1171 VV1_1172     FALSE 0.064 141.000 0.012 NA   NA
 309354 309355 VV1_1173 VV1_1174     FALSE 0.288 115.000 0.075 NA   NA
 309355 309356 VV1_1174 VV1_1175     FALSE 0.253 34.000 0.009 NA   NA
 2208425 2208426 VV1_r16 VV1_tRNAGlu2     FALSE 0.223 68.000 0.000 NA   NA
 2208426 2208427 VV1_tRNAGlu2 VV1_tRNALys2     TRUE 0.733 5.000 0.000 NA   NA
 2208427 2208428 VV1_tRNALys2 VV1_tRNAVal2     FALSE 0.398 32.000 0.000 NA   NA
 2208428 2208429 VV1_tRNAVal2 VV1_r17     FALSE 0.011 279.000 0.000 NA   NA
 2208429 2208430 VV1_r17 VV1_r18     FALSE 0.163 112.000 0.000 NA   NA
 2208430 2208431 VV1_r18 VV1_tRNAAsp1     FALSE 0.418 30.000 0.000 NA   NA
 309364 309365 VV1_1193 VV1_1194     TRUE 0.959 26.000 0.600 NA   NA
 309365 309366 VV1_1194 VV1_1195   pssA FALSE 0.028 214.000 0.000 NA   NA
 309366 309367 VV1_1195 VV1_1196 pssA   TRUE 0.721 90.000 0.063 0.056   NA
 309368 309369 VV1_1197 VV1_1198 murB   TRUE 0.952 -3.000 0.211 1.000 N NA
 309369 309370 VV1_1198 VV1_1199     TRUE 0.979 6.000 0.011 0.001   NA
 2208432 2208433 VV1_tRNAThr1 VV1_tRNATyr1     FALSE 0.272 51.000 0.000 NA   NA
 2208433 2208434 VV1_tRNATyr1 VV1_tRNAGly1     FALSE 0.331 39.000 0.000 NA   NA
 2208434 2208435 VV1_tRNAGly1 VV1_tRNAThr2     FALSE 0.561 18.000 0.000 NA   NA
 2208435 309373 VV1_tRNAThr2 VV1_1203     FALSE 0.178 105.000 0.000 NA   NA
 309373 309374 VV1_1203 VV1_1204     TRUE 0.958 14.000 0.002 0.002   NA
 309374 309375 VV1_1204 VV1_1205     FALSE 0.002 233.000 0.002 1.000 N NA
 309375 309376 VV1_1205 VV1_1206   nusG FALSE 0.534 14.000 0.037 1.000 N NA
 309376 309377 VV1_1206 VV1_1207 nusG rplK TRUE 0.755 143.000 0.681 1.000 N NA
 309377 309378 VV1_1207 VV1_1208 rplK   TRUE 0.999 5.000 0.838 0.015 Y NA
 309378 309379 VV1_1208 VV1_1209   rplJ FALSE 0.463 291.000 0.302 0.015 Y NA
 309379 309380 VV1_1209 VV1_1210 rplJ   TRUE 0.991 61.000 0.884 0.011 Y NA
 309380 309381 VV1_1210 VV1_1211     FALSE 0.110 251.000 0.223 1.000   NA
 309381 309382 VV1_1211 VV1_1212     TRUE 0.985 76.000 0.851 0.001   NA
 309384 309385 VV1_1214 VV1_1215 nudC   FALSE 0.142 106.000 0.020 NA   NA
 309385 309386 VV1_1215 VV1_1216     TRUE 0.991 5.000 0.800 NA   NA
 309386 309387 VV1_1216 VV1_1218     FALSE 0.007 315.000 0.000 NA   NA
 309388 309389 VV1_1220 VV1_1221     TRUE 0.745 4.000 0.050 NA N NA
 309392 309393 VV1_1224 VV1_1225     TRUE 0.850 53.000 0.375 NA   NA
 309394 309395 VV1_1226 VV1_1227   purH TRUE 0.875 58.000 0.238 1.000 Y NA
 309397 309398 VV1_1230 VV1_1231     FALSE 0.008 255.000 0.000 1.000 N NA
 309398 309399 VV1_1231 VV1_1232     TRUE 0.799 24.000 0.161 1.000 N NA
 309399 309400 VV1_1232 VV1_1233     FALSE 0.216 188.000 0.042 1.000 Y NA
 309400 309401 VV1_1233 VV1_1234     FALSE 0.402 121.000 0.152 1.000 N NA
 309401 309402 VV1_1234 VV1_1235     TRUE 0.996 13.000 0.275 0.001 Y NA
 309402 309403 VV1_1235 VV1_1236     TRUE 0.721 61.000 0.254 1.000 N NA
 309403 309404 VV1_1236 VV1_1237     FALSE 0.008 258.000 0.000 1.000 N NA
 309404 309405 VV1_1237 VV1_1238     FALSE 0.028 175.000 0.000 1.000 N NA
 309405 309406 VV1_1238 VV1_1239     TRUE 0.870 67.000 0.588 1.000 N NA
 309407 309408 VV1_1241 VV1_1242     TRUE 0.725 93.000 0.076 0.063   NA
 309409 309410 VV1_1243 VV1_1244     TRUE 0.988 13.000 0.916 NA   NA
 309410 309411 VV1_1244 VV1_1245     FALSE 0.020 216.000 0.018 NA   NA
 309411 309412 VV1_1245 VV1_1246     FALSE 0.037 149.000 0.024 NA N NA
 309412 309413 VV1_1246 VV1_1247   dsbD FALSE 0.041 186.000 0.048 1.000 N NA
 309413 309414 VV1_1247 VV1_1248 dsbD   FALSE 0.135 143.000 0.048 1.000   NA
 309414 309415 VV1_1248 VV1_1249     FALSE 0.101 156.000 0.045 1.000   NA
 309417 309418 VV1_1251 VV1_1252     FALSE 0.154 108.000 0.045 1.000 N NA
 309418 309419 VV1_1252 VV1_1253   cpxA FALSE 0.546 77.000 0.162 1.000 N NA
 309419 309420 VV1_1253 VV1_1254 cpxA   TRUE 0.996 4.000 0.791 1.000 Y NA
 309421 309422 VV1_1255 VV1_1256 cpxP fieF FALSE 0.495 120.000 0.028 NA Y NA
 309422 309423 VV1_1256 VV1_1257 fieF pfkA FALSE 0.007 287.000 0.040 1.000 N NA
 309425 309426 VV1_1259 VV1_1260 groES groEL TRUE 0.985 74.000 0.631 0.007 Y NA
 309426 309427 VV1_1260 VV1_1261 groEL   FALSE 0.008 343.000 0.046 NA   NA
 309428 309429 VV1_1262 VV1_1263     FALSE 0.309 50.000 0.037 NA   NA
 309430 309431 VV1_1264 VV1_1265     FALSE 0.022 227.000 0.000 NA   NA
 309432 309433 VV1_1266 VV1_1267     TRUE 0.998 13.000 0.787 0.002 Y NA
 309433 309434 VV1_1267 VV1_1268     TRUE 0.998 3.000 0.454 0.002 Y NA
 309434 309435 VV1_1268 VV1_1269     TRUE 0.998 0.000 0.470 0.002 Y NA
 309436 309437 VV1_1270 VV1_1271     TRUE 0.704 9.000 0.000 NA   NA
 309437 309438 VV1_1271 VV1_1272     FALSE 0.139 123.000 0.000 NA   NA
 309438 309439 VV1_1272 VV1_1273     FALSE 0.519 134.000 0.234 1.000   NA
 309439 309440 VV1_1273 VV1_1274     FALSE 0.016 249.000 0.000 1.000   NA
 309441 309442 VV1_1275 VV1_1276     FALSE 0.071 57.000 0.014 1.000 N NA
 309442 309443 VV1_1276 VV1_1277   gpsA TRUE 0.885 40.000 0.429 1.000 N NA
 309443 309444 VV1_1277 VV1_1278 gpsA   FALSE 0.222 184.000 0.206 1.000 N NA
 309444 309445 VV1_1278 VV1_1280     FALSE 0.164 184.000 0.158 NA N NA
 309447 309448 VV1_1282 VV1_1283     FALSE 0.452 117.000 0.143 NA   NA
 309448 309449 VV1_1283 VV1_1284     FALSE 0.019 161.000 0.017 1.000 N NA
 309449 309450 VV1_1284 VV1_1285     FALSE 0.365 109.000 0.095 1.000   NA
 309451 2208436 VV1_1286 VV1_tRNAGly2     FALSE 0.073 157.000 0.000 NA   NA
 2208436 2208437 VV1_tRNAGly2 VV1_tRNAGly3     FALSE 0.349 37.000 0.000 NA   NA
 2208437 2208438 VV1_tRNAGly3 VV1_tRNAGly4     FALSE 0.349 37.000 0.000 NA   NA
 2208438 2208439 VV1_tRNAGly4 VV1_tRNAGly5     FALSE 0.349 37.000 0.000 NA   NA
 2208439 2208440 VV1_tRNAGly5 VV1_tRNAGly6     FALSE 0.340 38.000 0.000 NA   NA
 2208440 2208441 VV1_tRNAGly6 VV1_tRNAMet5     FALSE 0.244 60.000 0.000 NA   NA
 2208441 2208442 VV1_tRNAMet5 VV1_tRNAMet6     FALSE 0.292 46.000 0.000 NA   NA
 2208442 2208443 VV1_tRNAMet6 VV1_tRNAMet7     FALSE 0.298 45.000 0.000 NA   NA
 2208443 2208444 VV1_tRNAMet7 VV1_tRNAMet8     FALSE 0.292 46.000 0.000 NA   NA
 309455 309456 VV1_1290 VV1_1291     TRUE 0.901 -6.000 0.109 NA   NA
 309456 309457 VV1_1291 VV1_1292     TRUE 0.833 9.000 0.092 1.000 N NA
 309457 309458 VV1_1292 VV1_1293   miaA TRUE 0.980 5.000 0.188 0.093 N NA
 309458 309459 VV1_1293 VV1_1294 miaA   FALSE 0.540 178.000 0.531 1.000   NA
 309459 309460 VV1_1294 VV1_1295     TRUE 0.669 42.000 0.141 1.000   NA
 309460 309461 VV1_1295 VV1_1296     TRUE 0.896 46.000 0.184 0.062   NA
 309461 309462 VV1_1296 VV1_1297     TRUE 0.999 3.000 0.947 0.008 Y NA
 309464 309465 VV1_1299 VV1_1300     FALSE 0.012 235.000 0.013 1.000   NA
 309469 309470 VV1_1304 VV1_1305     TRUE 0.913 38.000 0.147 0.014 N NA
 309470 309471 VV1_1305 VV1_1306     FALSE 0.120 80.000 0.005 1.000   NA
 309471 309472 VV1_1306 VV1_1307     FALSE 0.311 136.000 0.118 1.000   NA
 309472 309473 VV1_1307 VV1_1308     FALSE 0.004 471.000 0.000 1.000   NA
 309473 309474 VV1_1308 VV1_1309     TRUE 0.967 36.000 1.000 NA   NA
 309474 309475 VV1_1309 VV1_1310     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 309475 309476 VV1_1310 VV1_1311     FALSE 0.097 143.000 0.000 NA   NA
 309476 309477 VV1_1311 VV1_1312     TRUE 0.636 -165.000 0.000 1.000   NA
 309477 309478 VV1_1312 VV1_1313   argD FALSE 0.006 351.000 0.000 1.000   NA
 309478 309479 VV1_1313 VV1_1314 argD   FALSE 0.550 236.000 0.640 1.000 Y NA
 309479 309480 VV1_1314 VV1_1315     TRUE 0.978 15.000 0.680 1.000 N NA
 309480 309481 VV1_1315 VV1_1317     FALSE 0.143 213.000 0.176 NA   NA
 309482 309483 VV1_1318 VV1_1319     FALSE 0.009 243.000 0.000 1.000 N NA
 309483 309484 VV1_1319 VV1_1320     TRUE 0.625 129.000 0.303 NA   NA
 309484 309485 VV1_1320 VV1_1321     TRUE 0.732 56.000 0.222 NA   NA
 309485 309486 VV1_1321 VV1_1322     FALSE 0.143 146.000 0.056 NA   NA
 309486 309487 VV1_1322 VV1_1323     TRUE 0.976 -3.000 0.333 NA   NA
 309488 309489 VV1_1324 VV1_1325     TRUE 0.990 -16.000 0.927 1.000   NA
 309489 309490 VV1_1325 VV1_1326     TRUE 0.981 3.000 0.400 NA   NA
 309490 309491 VV1_1326 VV1_1327     TRUE 0.783 96.000 0.370 NA   NA
 309491 309492 VV1_1327 VV1_1328     FALSE 0.267 112.000 0.083 1.000 N NA
 309493 309494 VV1_1329 VV1_1330     TRUE 0.812 3.000 0.044 NA   NA
 309495 309496 VV1_1331 VV1_1332     FALSE 0.239 182.000 0.190 NA   NA
 309496 309497 VV1_1332 VV1_1333     TRUE 0.960 -3.000 0.220 NA   NA
 309497 309498 VV1_1333 VV1_1334     TRUE 0.996 -3.000 0.790 NA Y NA
 309498 309499 VV1_1334 VV1_1335     TRUE 0.995 9.000 0.804 NA Y NA
 309499 309500 VV1_1335 VV1_1336     FALSE 0.065 172.000 0.058 NA N NA
 309500 309501 VV1_1336 VV1_1337     TRUE 0.979 118.000 0.620 0.002 Y NA
 309501 309502 VV1_1337 VV1_1338     TRUE 0.939 76.000 0.579 1.000 Y NA
 309502 309503 VV1_1338 VV1_1339   tuf TRUE 0.939 151.000 0.400 0.002 Y NA
 309503 309504 VV1_1339 VV1_1340 tuf   FALSE 0.016 208.000 0.000 NA N NA
 309504 309505 VV1_1340 VV1_1341     TRUE 0.876 74.000 0.286 NA Y NA
 309506 309507 VV1_1342 VV1_1343     FALSE 0.026 179.000 0.000 1.000 N NA
 309508 309509 VV1_1345 VV1_1346     TRUE 0.771 58.000 0.271 1.000   NA
 309512 309513 VV1_1349 VV1_1351 glpX   FALSE 0.037 217.000 0.046 1.000   NA
 309513 309514 VV1_1351 VV1_1352     FALSE 0.188 222.000 0.250 NA   NA
 309514 309515 VV1_1352 VV1_1353     TRUE 0.794 76.000 0.158 NA Y NA
 309515 309516 VV1_1353 VV1_1355     FALSE 0.063 166.000 0.051 1.000 N NA
 309516 309517 VV1_1355 VV1_1356     TRUE 0.984 28.000 0.752 1.000 Y NA
 309517 309518 VV1_1356 VV1_1357     FALSE 0.211 152.000 0.122 NA N NA
 309518 309519 VV1_1357 VV1_1358     FALSE 0.543 125.000 0.245 NA N NA
 309519 309520 VV1_1358 VV1_1359     FALSE 0.004 229.000 0.013 1.000 N NA
 309521 309522 VV1_1360 VV1_1361     FALSE 0.001 279.000 0.009 1.000 N NA
 309524 309525 VV1_1364 VV1_1365   metL TRUE 0.993 0.000 0.428 1.000 Y NA
 309525 309526 VV1_1365 VV1_1366 metL metF FALSE 0.153 201.000 0.017 1.000 Y NA
 309527 309528 VV1_1367 VV1_1369     FALSE 0.002 544.000 0.000 NA N NA
 309528 309529 VV1_1369 VV1_1370     FALSE 0.027 220.000 0.053 1.000 N NA
 309530 309531 VV1_1371 VV1_1372     TRUE 0.981 23.000 0.097 0.002 Y NA
 309531 309532 VV1_1372 VV1_1373     TRUE 0.907 83.000 0.029 0.002 Y NA
 309532 309533 VV1_1373 VV1_1374     FALSE 0.298 241.000 0.278 1.000 Y NA
 309533 309534 VV1_1374 VV1_1375     FALSE 0.000 708.000 0.002 1.000 N NA
 309536 309537 VV1_1377 VV1_1378     TRUE 0.993 -10.000 0.616 NA Y NA
 309537 309538 VV1_1378 VV1_1379     TRUE 0.995 -7.000 0.770 NA Y NA
 309538 309539 VV1_1379 VV1_1380     TRUE 0.994 -10.000 0.680 NA Y NA
 309539 309540 VV1_1380 VV1_1381     TRUE 0.981 29.000 0.668 NA Y NA
 309540 309541 VV1_1381 VV1_1382     FALSE 0.273 202.000 0.319 1.000 N NA
 309541 309542 VV1_1382 VV1_1383     TRUE 0.920 33.000 0.208 1.000 Y NA
 309542 309543 VV1_1383 VV1_1384     FALSE 0.240 51.000 0.023 NA   NA
 309543 309544 VV1_1384 VV1_1385     TRUE 0.642 80.000 0.191 NA   NA
 309544 309545 VV1_1385 VV1_1386     FALSE 0.150 122.000 0.053 1.000 N NA
 309545 309546 VV1_1386 VV1_1387   rpsF FALSE 0.003 347.000 0.000 1.000 N NA
 309546 309547 VV1_1387 VV1_1388 rpsF   TRUE 0.880 9.000 0.122 1.000 N NA
 309547 309548 VV1_1388 VV1_1389   rpsR TRUE 0.819 17.000 0.128 1.000 N NA
 309548 309549 VV1_1389 VV1_1390 rpsR   TRUE 0.990 34.000 0.499 0.011 Y NA
 309551 309552 VV1_1392 VV1_1393   alr TRUE 0.962 -10.000 0.317 1.000 N NA
 309552 309553 VV1_1393 VV1_1394 alr   TRUE 0.948 8.000 0.208 1.000   NA
 309557 309558 VV1_1398 VV1_1399   pspG FALSE 0.135 159.000 0.070 NA   NA
 309558 309559 VV1_1399 VV1_1400 pspG   FALSE 0.534 98.000 0.156 NA   NA
 309559 309560 VV1_1400 VV1_1401     FALSE 0.339 149.000 0.169 NA   NA
 309560 309561 VV1_1401 VV1_1402     FALSE 0.380 115.000 0.109 NA   NA
 309561 309562 VV1_1402 VV1_1403     TRUE 0.999 0.000 0.791 0.000 Y NA
 309562 309563 VV1_1403 VV1_1404     TRUE 0.880 -7.000 0.116 1.000 N NA
 309563 2208445 VV1_1404 VV1_r19     FALSE 0.003 520.000 0.000 NA   NA
 2208445 2208446 VV1_r19 VV1_tRNAGlu3     FALSE 0.223 68.000 0.000 NA   NA
 2208446 2208447 VV1_tRNAGlu3 VV1_r20     FALSE 0.011 279.000 0.000 NA   NA
 2208447 2208448 VV1_r20 VV1_r21     FALSE 0.163 112.000 0.000 NA   NA
 2208448 2208449 VV1_r21 VV1_tRNAAsp2     FALSE 0.428 29.000 0.000 NA   NA
 2208449 2208450 VV1_tRNAAsp2 VV1_tRNATrp1     FALSE 0.254 57.000 0.000 NA   NA
 2208450 309570 VV1_tRNATrp1 VV1_1420     FALSE 0.022 228.000 0.000 NA   NA
 309570 309571 VV1_1420 VV1_1421     TRUE 0.764 2.000 0.000 NA   NA
 309576 309577 VV1_1426 VV1_1427     FALSE 0.030 67.000 0.007 NA N NA
 309577 309578 VV1_1427 VV1_1428     FALSE 0.020 143.000 0.013 1.000 N NA
 309578 309579 VV1_1428 VV1_1429     FALSE 0.023 186.000 0.000 1.000 N NA
 309580 309581 VV1_1430 VV1_1431     FALSE 0.030 207.000 0.000 NA   NA
 309581 309582 VV1_1431 VV1_1432     TRUE 0.604 -22.000 0.020 NA   NA
 309582 309583 VV1_1432 VV1_1433     TRUE 0.638 13.000 0.000 NA   NA
 309583 309584 VV1_1433 VV1_1434     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 309584 309585 VV1_1434 VV1_1435     TRUE 0.973 -7.000 0.344 NA   NA
 309585 309586 VV1_1435 VV1_1436     TRUE 0.810 67.000 0.356 NA   NA
 309586 309587 VV1_1436 VV1_1437     TRUE 0.996 8.000 0.846 1.000 Y NA
 309587 309588 VV1_1437 VV1_1438     TRUE 0.967 -15.000 0.338 1.000   NA
 309588 309589 VV1_1438 VV1_1439     TRUE 0.976 -3.000 0.328 1.000   NA
 309589 309590 VV1_1439 VV1_1440     TRUE 0.994 10.000 0.740 1.000 Y NA
 309590 309591 VV1_1440 VV1_1441     FALSE 0.320 64.000 0.052 NA   NA
 309591 309592 VV1_1441 VV1_1442     TRUE 0.575 79.000 0.154 NA   NA
 309592 309593 VV1_1442 VV1_1443     TRUE 0.924 34.000 0.231 NA Y NA
 309593 309594 VV1_1443 VV1_1444     FALSE 0.266 53.000 0.000 NA   NA
 309594 309595 VV1_1444 VV1_1445     TRUE 0.910 0.000 0.100 NA   NA
 309595 309596 VV1_1445 VV1_1446     TRUE 0.993 0.000 0.871 NA   NA
 309596 309597 VV1_1446 VV1_1447     TRUE 0.932 -10.000 0.177 NA   NA
 309597 309598 VV1_1447 VV1_1448     FALSE 0.162 205.000 0.182 NA   NA
 309598 309599 VV1_1448 VV1_1449     FALSE 0.039 154.000 0.003 NA   NA
 309599 309600 VV1_1449 VV1_1450     TRUE 0.909 57.000 0.689 1.000 N NA
 309600 309601 VV1_1450 VV1_1451     TRUE 0.998 -10.000 0.550 0.002 Y NA
 309601 309602 VV1_1451 VV1_1452   maf TRUE 0.944 5.000 0.206 NA N NA
 309602 309603 VV1_1452 VV1_1453 maf   TRUE 0.938 23.000 0.417 NA N NA
 309603 309604 VV1_1453 VV1_1454     TRUE 0.959 11.000 0.296 NA   NA
 309604 309605 VV1_1454 VV1_1455     TRUE 0.968 11.000 0.358 NA   NA
 309605 309606 VV1_1455 VV1_1456     TRUE 0.903 23.000 0.259 NA   NA
 309608 309609 VV1_1458 VV1_1459     FALSE 0.010 281.000 0.000 NA   NA
 309609 309610 VV1_1459 VV1_1461     FALSE 0.166 234.000 0.294 1.000 N NA
 309610 309611 VV1_1461 VV1_1462     TRUE 0.622 57.000 0.176 1.000 N NA
 309612 309613 VV1_1463 VV1_1464     FALSE 0.209 109.000 0.063 NA N NA
 309613 309614 VV1_1464 VV1_1465   pyrB TRUE 0.994 15.000 0.197 0.000 Y NA
 309614 309615 VV1_1465 VV1_1466 pyrB   FALSE 0.134 260.000 0.004 0.003 N NA
 309615 309616 VV1_1466 VV1_1467     TRUE 0.852 136.000 0.500 1.000 Y NA
 309617 309618 VV1_1468 VV1_1469     FALSE 0.280 156.000 0.151 NA   NA
 309619 309620 VV1_1470 VV1_1471     FALSE 0.394 47.000 0.054 NA   NA
 309621 309622 VV1_1472 VV1_1473     TRUE 0.990 0.000 0.637 NA   NA
 309623 309624 VV1_1474 VV1_1475     FALSE 0.343 86.000 0.089 1.000 N NA
 309624 309625 VV1_1475 VV1_1476     TRUE 0.847 64.000 0.494 1.000 N NA
 309626 309627 VV1_1477 VV1_1478     TRUE 0.996 4.000 0.631 0.061   NA
 309631 309632 VV1_1482 VV1_1483     TRUE 0.971 89.000 0.364 0.006 Y NA
 309632 309633 VV1_1483 VV1_1484     TRUE 0.979 54.000 0.364 0.006 Y NA
 309633 309634 VV1_1484 VV1_1485     TRUE 0.995 10.000 0.800 1.000 Y NA
 309634 309635 VV1_1485 VV1_1486     TRUE 0.998 8.000 1.000 0.017   NA
 309635 309636 VV1_1486 VV1_1487     TRUE 0.930 39.000 0.600 1.000   NA
 309636 309637 VV1_1487 VV1_1488     FALSE 0.222 70.000 0.000 NA   NA
 309637 309638 VV1_1488 VV1_1489     FALSE 0.346 95.000 0.077 NA   NA
 309638 2208452 VV1_1489 VV1_r22     FALSE 0.003 509.000 0.000 NA   NA
 2208452 2208453 VV1_r22 VV1_tRNAIle1     FALSE 0.234 63.000 0.000 NA   NA
 2208453 2208454 VV1_tRNAIle1 VV1_tRNAAla1     TRUE 0.620 14.000 0.000 NA   NA
 2208454 2208455 VV1_tRNAAla1 VV1_r23     FALSE 0.010 281.000 0.000 NA   NA
 2208455 2208456 VV1_r23 VV1_r24     FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 2208456 2208457 VV1_r24 VV1_tRNAThr3     FALSE 0.281 48.000 0.000 NA   NA
 2208457 2208458 VV1_tRNAThr3 VV1_r25     TRUE 0.704 9.000 0.000 NA   NA
 2208458 2208459 VV1_r25 VV1_tRNAAsp3     FALSE 0.234 63.000 0.000 NA   NA
 309645 309646 VV1_1506 VV1_1507     TRUE 0.873 18.000 0.167 NA   NA
 309646 2208460 VV1_1507 VV1_tRNAAsn4     FALSE 0.058 168.000 0.000 NA   NA
 2208460 2208461 VV1_tRNAAsn4 VV1_tRNAThr6     FALSE 0.303 44.000 0.000 NA   NA
 2208461 2208462 VV1_tRNAThr6 VV1_tRNAAsn3     FALSE 0.331 39.000 0.000 NA   NA
 2208462 2208463 VV1_tRNAAsn3 VV1_tRNAPhe3     FALSE 0.307 43.000 0.000 NA   NA
 2208463 2208464 VV1_tRNAPhe3 VV1_tRNAThr5     TRUE 0.671 11.000 0.000 NA   NA
 2208464 2208465 VV1_tRNAThr5 VV1_tRNAPhe2     FALSE 0.238 62.000 0.000 NA   NA
 2208465 309647 VV1_tRNAPhe2 VV1_1510     FALSE 0.020 234.000 0.000 NA   NA
 309647 309648 VV1_1510 VV1_1511     TRUE 0.950 -64.000 0.000 0.018   NA
 309648 2208466 VV1_1511 VV1_tRNAAsn2     FALSE 0.018 238.000 0.000 NA   NA
 2208466 2208467 VV1_tRNAAsn2 VV1_tRNAThr4     FALSE 0.561 18.000 0.000 NA   NA
 2208467 2208468 VV1_tRNAThr4 VV1_tRNAPhe1     FALSE 0.250 58.000 0.000 NA   NA
 2208468 309649 VV1_tRNAPhe1 VV1_1513     FALSE 0.183 101.000 0.000 NA   NA
 309649 309650 VV1_1513 VV1_1514     FALSE 0.252 80.000 0.060 NA N NA
 309650 309651 VV1_1514 VV1_1515     TRUE 0.800 22.000 0.150 NA N NA
 309652 309653 VV1_1516 VV1_1517     FALSE 0.119 127.000 0.026 1.000   NA
 309653 309654 VV1_1517 VV1_1518     FALSE 0.158 54.000 0.000 1.000 N NA
 309655 309656 VV1_1519 VV1_1520     TRUE 0.936 10.000 0.218 1.000 N NA
 309656 309657 VV1_1520 VV1_1521     TRUE 0.758 11.000 0.050 NA   NA
 309657 309658 VV1_1521 VV1_1522     FALSE 0.495 43.000 0.076 NA   NA
 309658 309659 VV1_1522 VV1_1523     TRUE 0.888 0.000 0.081 NA   NA
 309659 309660 VV1_1523 VV1_1524     TRUE 0.620 42.000 0.117 NA   NA
 309660 309661 VV1_1524 VV1_1525     TRUE 0.697 35.000 0.125 NA   NA
 309662 309663 VV1_1526 VV1_1527     TRUE 0.994 19.000 0.436 0.013 Y NA
 309664 309665 VV1_1528 VV1_1529     TRUE 0.896 22.000 0.263 NA N NA
 309665 309666 VV1_1529 VV1_1530     FALSE 0.510 55.000 0.120 NA N NA
 309666 309667 VV1_1530 VV1_1531     TRUE 0.898 15.000 0.173 NA   NA
 309669 309670 VV1_1533 VV1_1534     TRUE 0.620 103.000 0.210 1.000   NA
 309670 309671 VV1_1534 VV1_1535     TRUE 0.736 74.000 0.028 0.025   NA
 309671 309672 VV1_1535 VV1_1536     FALSE 0.015 253.000 0.000 1.000   NA
 309673 309674 VV1_1537 VV1_1539     FALSE 0.019 489.000 0.000 1.000 Y NA
 309674 309675 VV1_1539 VV1_1540     TRUE 0.782 151.000 0.070 0.004 Y NA
 309675 309676 VV1_1540 VV1_1541     TRUE 0.772 150.000 0.056 0.004 Y NA
 309676 309677 VV1_1541 VV1_1542     FALSE 0.005 297.000 0.000 NA N NA
 309679 309680 VV1_1544 VV1_1545     TRUE 0.642 129.000 0.319 NA   NA
 309681 309682 VV1_1546 VV1_1547     FALSE 0.007 260.000 0.029 1.000 N NA
 309682 309683 VV1_1547 VV1_1548     FALSE 0.164 47.000 0.027 1.000 N NA
 309683 309684 VV1_1548 VV1_1549     FALSE 0.042 195.000 0.034 NA   NA
 309685 309686 VV1_1551 VV1_1552     TRUE 0.885 15.000 0.156 NA   NA
 309686 309687 VV1_1552 VV1_1553     TRUE 0.997 14.000 0.474 0.001 Y NA
 309688 309689 VV1_1554 VV1_1555     FALSE 0.003 589.000 0.000 NA   NA
 309689 309690 VV1_1555 VV1_1556     TRUE 0.648 -10.000 0.021 NA   NA
 309693 309694 VV1_1559 VV1_1560     TRUE 0.959 28.000 0.705 NA N NA
 309694 309695 VV1_1560 VV1_1561   rseB TRUE 0.997 -3.000 0.856 NA Y NA
 309695 309696 VV1_1561 VV1_1562 rseB   TRUE 0.995 -3.000 0.609 NA Y NA
 309696 309697 VV1_1562 VV1_1563     FALSE 0.145 114.000 0.045 NA N NA
 309697 309698 VV1_1563 VV1_1564     TRUE 0.569 107.000 0.187 1.000   NA
 309698 309699 VV1_1564 VV1_1565   rncS TRUE 0.778 23.000 0.117 1.000   NA
 309699 309700 VV1_1565 VV1_1566 rncS era TRUE 0.978 -7.000 0.127 0.044   NA
 309700 309701 VV1_1566 VV1_1567 era recO FALSE 0.463 86.000 0.109 1.000   NA
 309701 309702 VV1_1567 VV1_1568 recO   TRUE 0.932 -3.000 0.166 1.000 N NA
 309702 309703 VV1_1568 VV1_1569     TRUE 0.974 1.000 0.326 1.000 N NA
 309703 309704 VV1_1569 VV1_1570     FALSE 0.009 292.000 0.000 NA   NA
 309704 309705 VV1_1570 VV1_1571     FALSE 0.277 49.000 0.000 NA   NA
 309705 309706 VV1_1571 VV1_1572     TRUE 0.957 -7.000 0.238 NA   NA
 309708 309709 VV1_1574 VV1_1575 rumA   FALSE 0.299 96.000 0.082 1.000 N NA
 309709 309710 VV1_1575 VV1_1576     TRUE 0.849 86.000 0.000 0.000   NA
 309710 309711 VV1_1576 VV1_1577     FALSE 0.021 233.000 0.000 1.000   NA
 309711 309712 VV1_1577 VV1_1578     FALSE 0.034 192.000 0.025 1.000   NA
 309712 309713 VV1_1578 VV1_1579   eno FALSE 0.285 78.000 0.068 1.000 N NA
 309713 309714 VV1_1579 VV1_1581 eno ftsB FALSE 0.111 245.000 0.241 1.000 N NA
 309714 309715 VV1_1581 VV1_1582 ftsB ispD TRUE 0.946 0.000 0.185 1.000 N NA
 309715 309716 VV1_1582 VV1_1583 ispD ispF TRUE 0.992 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 309716 309717 VV1_1583 VV1_1584 ispF   TRUE 0.761 36.000 0.173 1.000   NA
 309717 309718 VV1_1584 VV1_1585   surE TRUE 0.957 6.000 0.235 1.000   NA
 309718 309719 VV1_1585 VV1_1586 surE   TRUE 0.978 3.000 0.353 1.000   NA
 309719 309720 VV1_1586 VV1_1587     FALSE 0.230 44.000 0.037 1.000 N NA
 309720 309721 VV1_1587 VV1_1588     FALSE 0.432 81.000 0.115 1.000 N NA
 309723 309724 VV1_1590 VV1_1591   recA FALSE 0.236 134.000 0.082 NA   NA
 309724 309725 VV1_1591 VV1_1592 recA recX TRUE 0.713 104.000 0.296 1.000   NA
 309725 309726 VV1_1592 VV1_1593 recX   FALSE 0.112 180.000 0.085 1.000   NA
 309726 309727 VV1_1593 VV1_1594     FALSE 0.048 197.000 0.065 1.000 N NA
 309727 309728 VV1_1594 VV1_1595     FALSE 0.210 124.000 0.079 1.000 N NA
 309728 2208469 VV1_1595 VV1_tRNASer2     FALSE 0.005 381.000 0.000 NA   NA
 2208469 2208470 VV1_tRNASer2 VV1_tRNAArg3     FALSE 0.386 33.000 0.000 NA   NA
 2208470 2208471 VV1_tRNAArg3 VV1_tRNASer3     FALSE 0.449 27.000 0.000 NA   NA
 2208471 2208472 VV1_tRNASer3 VV1_tRNAArg4     FALSE 0.202 88.000 0.000 NA   NA
 2208472 2208473 VV1_tRNAArg4 VV1_tRNAArg5     FALSE 0.193 94.000 0.000 NA   NA
 2208473 2208474 VV1_tRNAArg5 VV1_tRNAArg6     FALSE 0.281 48.000 0.000 NA   NA
 2208474 2208475 VV1_tRNAArg6 VV1_tRNAArg7     FALSE 0.194 93.000 0.000 NA   NA
 2208475 2208476 VV1_tRNAArg7 VV1_tRNAArg8     FALSE 0.292 46.000 0.000 NA   NA
 2208476 309731 VV1_tRNAArg8 VV1_1600     FALSE 0.003 489.000 0.000 NA   NA
 309731 309732 VV1_1600 VV1_1601     TRUE 0.997 26.000 0.810 0.001 Y NA
 309732 309733 VV1_1601 VV1_1602     TRUE 0.999 10.000 0.976 0.001 Y NA
 309733 309734 VV1_1602 VV1_1603     TRUE 0.812 120.000 0.286 1.000 Y NA
 309734 309735 VV1_1603 VV1_1604     TRUE 0.810 -6.000 0.051 NA   NA
 309735 309736 VV1_1604 VV1_1605     TRUE 0.684 10.000 0.027 NA   NA
 309736 309737 VV1_1605 VV1_1606     FALSE 0.086 147.000 0.048 1.000 N NA
 309737 309738 VV1_1606 VV1_1607     TRUE 0.615 38.000 0.103 NA   NA
 309738 309739 VV1_1607 VV1_1608     FALSE 0.316 51.000 0.039 NA   NA
 309740 309741 VV1_1609 VV1_1610     TRUE 0.786 87.000 0.349 NA   NA
 309742 309743 VV1_1612 VV1_1613     TRUE 0.951 20.000 0.011 0.001   NA
 309743 309744 VV1_1613 VV1_1615     FALSE 0.148 275.000 0.361 1.000   NA
 309744 309745 VV1_1615 VV1_1616     TRUE 0.994 16.000 0.342 0.011 Y NA
 309745 309746 VV1_1616 VV1_1617   trmD TRUE 0.981 28.000 0.672 1.000 Y NA
 309746 309747 VV1_1617 VV1_1618 trmD   TRUE 0.960 42.000 0.567 1.000 Y NA
 309748 309749 VV1_1619 VV1_1620     FALSE 0.503 162.000 0.356 NA   NA
 309749 309750 VV1_1620 VV1_1621     TRUE 0.679 33.000 0.110 NA   NA
 309750 309751 VV1_1621 VV1_1622     TRUE 0.938 28.000 0.010 0.000   NA
 309751 309752 VV1_1622 VV1_1623     TRUE 0.909 2.000 0.122 1.000 N NA
 309752 309753 VV1_1623 VV1_1624     TRUE 0.910 94.000 0.454 1.000 Y NA
 309753 309754 VV1_1624 VV1_1625     TRUE 0.978 48.000 0.362 0.014 Y NA
 309754 309755 VV1_1625 VV1_1626     TRUE 0.995 0.000 0.169 0.014 Y NA
 309755 309756 VV1_1626 VV1_1627     FALSE 0.013 220.000 0.000 1.000 N NA
 309757 309758 VV1_1628 VV1_1629   pdhR FALSE 0.002 389.000 0.000 1.000 N NA
 309758 309759 VV1_1629 VV1_1630 pdhR   FALSE 0.100 54.000 0.019 1.000 N NA
 309759 309760 VV1_1630 VV1_1631     TRUE 0.845 20.000 0.009 1.000 Y NA
 309760 309761 VV1_1631 VV1_1632     FALSE 0.386 258.000 0.463 1.000 Y NA
 309763 309764 VV1_1635 VV1_1636     TRUE 0.971 13.000 0.006 0.000   NA
 309766 309767 VV1_1638 VV1_1640     FALSE 0.029 167.000 0.026 1.000 N NA
 309767 309768 VV1_1640 VV1_1641     TRUE 0.998 2.000 0.688 0.090 Y NA
 309769 309770 VV1_1642 VV1_1643     TRUE 0.997 13.000 0.395 0.000 Y NA
 309770 309771 VV1_1643 VV1_1644     TRUE 0.910 24.000 0.117 1.000 Y NA
 309771 309772 VV1_1644 VV1_1645     TRUE 0.957 -3.000 0.234 1.000 N NA
 309772 309773 VV1_1645 VV1_1646     FALSE 0.538 80.000 0.131 1.000   NA
 309773 309774 VV1_1646 VV1_1647     TRUE 0.884 42.000 0.006 0.001   NA
 309774 309775 VV1_1647 VV1_1648     TRUE 0.716 63.000 0.231 1.000   NA
 309775 309776 VV1_1648 VV1_1649     FALSE 0.386 133.000 0.151 NA   NA
 309777 309778 VV1_1650 VV1_1651     TRUE 0.928 -3.000 0.158 1.000 N NA
 309778 309779 VV1_1651 VV1_1652     TRUE 0.604 68.000 0.021 1.000 Y NA
 309779 309780 VV1_1652 VV1_1653     FALSE 0.006 271.000 0.000 1.000 N NA
 309781 309782 VV1_1654 VV1_1655     TRUE 0.889 63.000 0.295 1.000 Y NA
 309782 309783 VV1_1655 VV1_1656     TRUE 0.706 88.000 0.290 NA N NA
 309784 309785 VV1_1657 VV1_1658     FALSE 0.224 168.000 0.145 NA   NA
 309785 309786 VV1_1658 VV1_1659     TRUE 0.904 28.000 0.339 1.000 N NA
 309786 309787 VV1_1659 VV1_1660     TRUE 0.573 154.000 0.130 0.061   NA
 309787 309788 VV1_1660 VV1_1661     TRUE 0.945 -25.000 0.000 0.047   NA
 309788 309789 VV1_1661 VV1_1662     TRUE 0.916 100.000 0.374 0.047   NA
 309789 309790 VV1_1662 VV1_1663     TRUE 0.991 0.000 0.303 0.047 N NA
 309791 309792 VV1_1664 VV1_1665     TRUE 0.978 36.000 0.266 0.017 Y NA
 309792 309793 VV1_1665 VV1_1666     TRUE 0.981 91.000 0.654 0.017 Y NA
 309793 309794 VV1_1666 VV1_1667     TRUE 0.984 10.000 0.316 NA Y NA
 309794 309795 VV1_1667 VV1_1668     TRUE 0.976 2.000 0.316 NA   NA
 309795 309796 VV1_1668 VV1_1669     TRUE 0.821 76.000 0.395 1.000   NA
 309796 309797 VV1_1669 VV1_1670     TRUE 0.994 38.000 0.739 0.002 Y NA
 309797 309798 VV1_1670 VV1_1671     TRUE 0.997 3.000 0.895 1.000 Y NA
 309798 309799 VV1_1671 VV1_1672     TRUE 0.999 3.000 0.818 0.047 Y NA
 309799 309800 VV1_1672 VV1_1673     TRUE 0.874 202.000 0.727 0.047 Y NA
 309800 309801 VV1_1673 VV1_1674     FALSE 0.016 941.000 0.000 0.047 N NA
 309801 309802 VV1_1674 VV1_1675     FALSE 0.009 247.000 0.000 1.000 N NA
 309802 309803 VV1_1675 VV1_1676     FALSE 0.373 74.000 0.071 NA   NA
 309803 309804 VV1_1676 VV1_1678     FALSE 0.015 250.000 0.000 NA   NA
 309805 309806 VV1_1679 VV1_1680     FALSE 0.099 126.000 0.017 NA   NA
 309806 309807 VV1_1680 VV1_1681     TRUE 0.953 11.000 0.300 NA N NA
 309810 309811 VV1_1684 VV1_1685     FALSE 0.219 75.000 0.000 NA   NA
 309811 309812 VV1_1685 VV1_1686     FALSE 0.567 95.000 0.025 1.000 Y NA
 309815 309816 VV1_1689 VV1_1690     FALSE 0.452 108.000 0.152 NA N NA
 309816 309817 VV1_1690 VV1_1691     TRUE 0.705 106.000 0.325 1.000 N NA
 309817 309818 VV1_1691 VV1_1692     TRUE 0.862 29.000 0.260 1.000 N NA
 309818 309819 VV1_1692 VV1_1693     FALSE 0.003 262.000 0.016 1.000 N NA
 309819 2208477 VV1_1693 VV1_tRNALeu9     FALSE 0.561 18.000 0.000 NA   NA
 2208477 2208478 VV1_tRNALeu9 VV1_tRNAMet9     FALSE 0.241 61.000 0.000 NA   NA
 2208478 309820 VV1_tRNAMet9 VV1_1694     FALSE 0.028 214.000 0.000 NA   NA
 309820 309821 VV1_1694 VV1_1695     TRUE 0.954 36.000 0.759 NA   NA
 309821 309822 VV1_1695 VV1_1696   infB TRUE 0.916 25.000 0.342 1.000 N NA
 309822 309823 VV1_1696 VV1_1697 infB   TRUE 0.918 100.000 0.530 1.000 Y NA
 309823 309824 VV1_1697 VV1_1698   truB TRUE 0.990 0.000 0.318 1.000 Y NA
 309824 309825 VV1_1698 VV1_1699 truB   FALSE 0.118 132.000 0.000 NA   NA
 309825 309826 VV1_1699 VV1_1700     FALSE 0.287 47.000 0.000 NA   NA
 309826 309827 VV1_1700 VV1_1701     FALSE 0.102 140.000 0.000 1.000   NA
 309827 309828 VV1_1701 VV1_1702     FALSE 0.012 272.000 0.000 NA   NA
 309828 309829 VV1_1702 VV1_1703     FALSE 0.095 144.000 0.000 NA   NA
 309829 309830 VV1_1703 VV1_1704     FALSE 0.274 50.000 0.000 NA   NA
 309830 309831 VV1_1704 VV1_1705     FALSE 0.449 27.000 0.000 NA   NA
 309831 309832 VV1_1705 VV1_1706     FALSE 0.274 50.000 0.000 NA   NA
 309832 309833 VV1_1706 VV1_1708     FALSE 0.003 505.000 0.000 NA   NA
 309833 309834 VV1_1708 VV1_1709     FALSE 0.261 121.000 0.071 1.000   NA
 309834 309835 VV1_1709 VV1_1710     FALSE 0.121 176.000 0.087 1.000   NA
 309835 309836 VV1_1710 VV1_1711     TRUE 0.809 31.000 0.206 1.000 N NA
 309837 309838 VV1_1712 VV1_1713     TRUE 0.998 18.000 0.948 0.003 Y NA
 309838 309839 VV1_1713 VV1_1714     FALSE 0.286 127.000 0.112 1.000 N NA
 309840 309841 VV1_1715 VV1_1716     TRUE 0.959 -16.000 0.295 1.000   NA
 309841 309842 VV1_1716 VV1_1717     FALSE 0.318 142.000 0.132 1.000   NA
 309842 309843 VV1_1717 VV1_1718     TRUE 0.845 16.000 0.121 1.000   NA
 309845 309846 VV1_1720 VV1_1721     FALSE 0.010 133.000 0.003 1.000 N NA
 309846 309847 VV1_1721 VV1_1722     FALSE 0.004 255.000 0.015 NA N NA
 309847 309848 VV1_1722 VV1_1723     FALSE 0.013 218.000 0.027 NA N NA
 309848 309849 VV1_1723 VV1_1724     TRUE 0.762 122.000 0.000 0.001   NA
 309849 309850 VV1_1724 VV1_1725     FALSE 0.003 560.000 0.000 1.000   NA
 309850 309851 VV1_1725 VV1_1726     TRUE 0.863 89.000 0.286 1.000 Y NA
 309851 309852 VV1_1726 VV1_1727     TRUE 0.834 55.000 0.398 1.000 N NA
 309852 309853 VV1_1727 VV1_1728     TRUE 0.807 81.000 0.414 1.000 N NA
 309857 309858 VV1_1732 VV1_1733     FALSE 0.026 178.000 0.000 1.000 N NA
 309858 309859 VV1_1733 VV1_1734     TRUE 0.888 -10.000 0.111 NA   NA
 309859 309860 VV1_1734 VV1_1735     TRUE 0.767 1.000 0.000 NA   NA
 309860 309861 VV1_1735 VV1_1736     FALSE 0.227 65.000 0.000 NA   NA
 309861 309862 VV1_1736 VV1_1737     FALSE 0.133 125.000 0.000 NA   NA
 309862 309863 VV1_1737 VV1_1738     TRUE 0.966 -19.000 0.006 0.002   NA
 309864 309865 VV1_1740 VV1_1742     FALSE 0.003 381.000 0.000 1.000 N NA
 309865 309866 VV1_1742 VV1_1743     FALSE 0.353 120.000 0.125 1.000 N NA
 309867 309868 VV1_1745 VV1_1746     FALSE 0.016 248.000 0.000 NA   NA
 309868 309869 VV1_1746 VV1_1747     FALSE 0.438 28.000 0.000 1.000   NA
 309869 309870 VV1_1747 VV1_1748     TRUE 0.982 -3.000 0.426 NA   NA
 309870 309871 VV1_1748 VV1_1749     TRUE 0.994 11.000 0.794 NA Y NA
 309871 309872 VV1_1749 VV1_1750     FALSE 0.503 38.000 0.067 NA   NA
 309872 309873 VV1_1750 VV1_1751     TRUE 0.763 20.000 0.095 NA   NA
 309873 309874 VV1_1751 VV1_1752     TRUE 0.861 -13.000 0.095 NA   NA
 309874 309875 VV1_1752 VV1_1753     TRUE 0.984 0.000 0.444 NA   NA
 309875 309876 VV1_1753 VV1_1754     TRUE 0.984 11.000 0.643 NA   NA
 309876 309877 VV1_1754 VV1_1755     TRUE 0.913 36.000 0.212 1.000 Y NA
 309877 309878 VV1_1755 VV1_1756     TRUE 0.971 13.000 0.212 1.000 Y NA
 309878 309879 VV1_1756 VV1_1757     TRUE 0.996 2.000 0.205 0.012 Y NA
 309879 309880 VV1_1757 VV1_1758     TRUE 0.975 17.000 0.315 1.000 Y NA
 309883 309884 VV1_1761 VV1_1763     FALSE 0.102 140.000 0.000 NA   NA
 309884 309885 VV1_1763 VV1_1764     FALSE 0.194 93.000 0.000 1.000   NA
 309885 309886 VV1_1764 VV1_1765     TRUE 0.746 162.000 0.000 0.001 Y NA
 309886 309887 VV1_1765 VV1_1766     TRUE 0.758 108.000 0.412 NA N NA
 309887 309888 VV1_1766 VV1_1767   ebgA TRUE 0.995 4.000 0.682 NA Y NA
 309888 309889 VV1_1767 VV1_1768 ebgA   FALSE 0.003 348.000 0.000 1.000 N NA
 309889 309890 VV1_1768 VV1_1769     TRUE 0.621 -3.000 0.000 1.000 N NA
 309891 309892 VV1_1770 VV1_1771     TRUE 0.773 84.000 0.013 0.002 N NA
 309892 309893 VV1_1771 VV1_1772     TRUE 0.636 221.000 0.370 0.002 N NA
 309893 309894 VV1_1772 VV1_1773   galM TRUE 0.976 22.000 0.051 0.002 Y NA
 309894 309895 VV1_1773 VV1_1774 galM   FALSE 0.009 241.000 0.000 1.000 N NA
 309897 309898 VV1_1777 VV1_1779     FALSE 0.077 154.000 0.000 1.000   NA
 309903 309904 VV1_1784 VV1_1785     FALSE 0.109 98.000 0.000 1.000 N NA
 309904 309905 VV1_1785 VV1_1786     FALSE 0.126 172.000 0.104 1.000 N NA
 309905 309906 VV1_1786 VV1_1787     FALSE 0.030 217.000 0.055 1.000 N NA
 309906 309907 VV1_1787 VV1_1788     FALSE 0.148 68.000 0.032 1.000 N NA
 309907 309908 VV1_1788 VV1_1790     FALSE 0.002 496.000 0.000 1.000 N NA
 309908 309909 VV1_1790 VV1_1791     FALSE 0.017 242.000 0.000 NA   NA
 309909 309910 VV1_1791 VV1_1792     FALSE 0.552 105.000 0.173 NA   NA
 309913 309914 VV1_1795 VV1_1796     TRUE 0.665 312.000 0.542 0.001 Y NA
 309914 309915 VV1_1796 VV1_1797     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 309916 309917 VV1_1798 VV1_1799     FALSE 0.023 225.000 0.000 NA   NA
 309918 309919 VV1_1800 VV1_1801     FALSE 0.089 147.000 0.000 NA   NA
 309919 309920 VV1_1801 VV1_1802     FALSE 0.125 82.000 0.000 1.000 N NA
 309920 309921 VV1_1802 VV1_1803     FALSE 0.510 81.000 0.122 1.000   NA
 309921 309922 VV1_1803 VV1_1805     FALSE 0.002 649.000 0.000 1.000   NA
 309922 309923 VV1_1805 VV1_1806     TRUE 0.756 3.000 0.000 NA   NA
 309923 309924 VV1_1806 VV1_1807     FALSE 0.003 617.000 0.000 NA   NA
 309925 309926 VV1_1808 VV1_1809     TRUE 0.831 0.000 0.048 NA   NA
 309926 309927 VV1_1809 VV1_1810     TRUE 0.939 -3.000 0.155 NA   NA
 309927 309928 VV1_1810 VV1_1811     FALSE 0.060 108.000 0.019 1.000 N NA
 309929 309930 VV1_1813 VV1_1814     FALSE 0.346 94.000 0.077 1.000   NA
 309930 309931 VV1_1814 VV1_1815     TRUE 0.992 -3.000 0.898 NA N NA
 309932 309933 VV1_1816 VV1_1817     TRUE 0.730 132.000 0.467 1.000   NA
 309933 309934 VV1_1817 VV1_1818     TRUE 0.950 0.000 0.198 NA N NA
 309934 309935 VV1_1818 VV1_1819     TRUE 0.679 81.000 0.248 NA N NA
 309936 309937 VV1_1820 VV1_1821     FALSE 0.002 544.000 0.000 NA N NA
 309937 309938 VV1_1821 VV1_1822     TRUE 0.999 6.000 0.854 0.001 Y NA
 309938 309939 VV1_1822 VV1_1823     TRUE 0.999 -10.000 0.603 0.001 Y NA
 309939 309940 VV1_1823 VV1_1824     TRUE 0.998 0.000 0.312 0.001 Y NA
 309940 309941 VV1_1824 VV1_1825     TRUE 0.996 8.000 0.188 0.001 Y NA
 309941 309942 VV1_1825 VV1_1826     TRUE 0.994 34.000 0.551 0.001 Y NA
 309942 309943 VV1_1826 VV1_1827     FALSE 0.545 171.000 0.519 1.000 N NA
 309943 309944 VV1_1827 VV1_1828     TRUE 0.959 20.000 0.481 NA   NA
 309951 309952 VV1_1835 VV1_1836     TRUE 0.981 4.000 0.421 NA   NA
 309952 309953 VV1_1836 VV1_1837     FALSE 0.339 121.000 0.101 NA   NA
 309953 309954 VV1_1837 VV1_1838     FALSE 0.082 123.000 0.008 NA   NA
 309954 309955 VV1_1838 VV1_1839     FALSE 0.265 92.000 0.048 NA   NA
 309956 309957 VV1_1840 VV1_1841     FALSE 0.002 404.000 0.000 1.000 N NA
 309958 309959 VV1_1842 VV1_1843     TRUE 0.690 -12.000 0.000 NA   NA
 309959 309960 VV1_1843 VV1_1844     TRUE 0.601 168.000 0.550 NA   NA
 309960 309961 VV1_1844 VV1_1845     TRUE 0.785 -31.000 0.067 1.000   NA
 309961 309962 VV1_1845 VV1_1846     TRUE 0.862 -3.000 0.089 1.000 N NA
 309962 309963 VV1_1846 VV1_1847     FALSE 0.018 197.000 0.005 NA   NA
 309963 309964 VV1_1847 VV1_1848     TRUE 0.747 -3.000 0.027 NA   NA
 309967 309968 VV1_1854 VV1_1855     TRUE 0.987 0.000 0.518 NA   NA
 309969 309970 VV1_1856 VV1_1857     FALSE 0.048 184.000 0.031 NA   NA
 309970 309971 VV1_1857 VV1_1858     TRUE 0.605 110.000 0.243 1.000 N NA
 309972 309973 VV1_1859 VV1_1860 rpsB tsf TRUE 0.912 131.000 0.748 1.000 Y NA
 309973 309974 VV1_1860 VV1_1861 tsf   FALSE 0.302 215.000 0.416 1.000 N NA
 309974 309975 VV1_1861 VV1_1862     TRUE 0.875 92.000 0.626 1.000   NA
 309975 309976 VV1_1862 VV1_1864     FALSE 0.096 339.000 0.409 1.000   NA
 309976 309977 VV1_1864 VV1_1865     TRUE 0.990 7.000 0.400 1.000 Y NA
 309977 309978 VV1_1865 VV1_1866     TRUE 0.919 59.000 0.372 1.000 Y NA
 309978 309979 VV1_1866 VV1_1867     TRUE 0.986 -3.000 0.568 1.000 N NA
 309979 309980 VV1_1867 VV1_1868     TRUE 0.880 46.000 0.204 1.000 Y NA
 309980 309981 VV1_1868 VV1_1869     TRUE 0.966 26.000 0.354 1.000 Y NA
 309981 309982 VV1_1869 VV1_1870   lpxD TRUE 0.995 9.000 0.814 1.000 Y NA
 309982 309983 VV1_1870 VV1_1871 lpxD fabZ TRUE 0.868 114.000 0.796 1.000 N NA
 309983 309984 VV1_1871 VV1_1872 fabZ   TRUE 0.992 2.000 0.850 1.000 N NA
 309984 309985 VV1_1872 VV1_1873   lpxB TRUE 0.860 93.000 0.289 1.000 Y NA
 309985 309986 VV1_1873 VV1_1874 lpxB rnhB TRUE 0.939 4.000 0.186 1.000 N NA
 309986 309987 VV1_1874 VV1_1875 rnhB   FALSE 0.407 162.000 0.104 1.000 Y NA
 309987 309988 VV1_1875 VV1_1876     TRUE 0.611 38.000 0.122 1.000 N NA
 309988 309989 VV1_1876 VV1_1877     FALSE 0.449 85.000 0.123 1.000 N NA
 309989 309990 VV1_1877 VV1_1878     FALSE 0.063 64.000 0.015 1.000 N NA
 309990 309991 VV1_1878 VV1_1879     FALSE 0.133 132.000 0.056 1.000 N NA
 309991 309992 VV1_1879 VV1_1880     FALSE 0.481 64.000 0.103 NA   NA
 309993 309994 VV1_1881 VV1_1882     TRUE 0.807 -3.000 0.043 NA   NA
 309994 309995 VV1_1882 VV1_1883     TRUE 0.940 12.000 0.233 1.000   NA
 309996 309997 VV1_1884 VV1_1885     TRUE 0.648 -34.000 0.000 NA   NA
 309999 310000 VV1_1887 VV1_1888     FALSE 0.445 81.000 0.098 NA   NA
 310000 310001 VV1_1888 VV1_1889     FALSE 0.221 72.000 0.000 NA   NA
 310001 310002 VV1_1889 VV1_1890     TRUE 0.989 0.000 0.590 1.000   NA
 310003 310004 VV1_1891 VV1_1892     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 310004 310005 VV1_1892 VV1_1893     TRUE 0.764 2.000 0.000 NA   NA
 310005 310006 VV1_1893 VV1_1894     TRUE 0.721 -7.000 0.000 NA   NA
 310006 310007 VV1_1894 VV1_1896   fadE FALSE 0.006 345.000 0.000 NA   NA
 310008 310009 VV1_1897 VV1_1898     TRUE 0.766 47.000 0.229 1.000   NA
 310010 310011 VV1_1899 VV1_1900     TRUE 0.917 140.000 0.230 0.002 Y NA
 310015 310016 VV1_1904 VV1_1905     TRUE 0.990 1.000 0.657 NA   NA
 310016 310017 VV1_1905 VV1_1906     TRUE 0.991 1.000 0.253 0.037   NA
 310017 310018 VV1_1906 VV1_1907     TRUE 0.963 5.000 0.259 1.000   NA
 310019 310020 VV1_1908 VV1_1909     TRUE 0.944 -7.000 0.190 NA   NA
 310021 310022 VV1_1910 VV1_1911 bcp   TRUE 0.797 14.000 0.102 1.000 N NA
 310023 310024 VV1_1912 VV1_1913 dapA   TRUE 0.905 47.000 0.267 NA Y NA
 310025 310026 VV1_1914 VV1_1915     TRUE 0.679 -15.000 0.000 NA   NA
 310026 310027 VV1_1915 VV1_1916     TRUE 0.984 -3.000 0.163 0.025 N NA
 310027 310028 VV1_1916 VV1_1917     TRUE 0.929 17.000 0.292 1.000 N NA
 310030 310031 VV1_1919 VV1_1920     TRUE 0.854 2.000 0.061 NA   NA
 310032 310033 VV1_1921 VV1_1922     TRUE 0.728 63.000 0.241 NA   NA
 310033 310034 VV1_1922 VV1_1923     FALSE 0.486 134.000 0.238 NA N NA
 310034 310035 VV1_1923 VV1_1924     FALSE 0.223 308.000 0.000 0.002 Y NA
 310035 310036 VV1_1924 VV1_1926     FALSE 0.327 263.000 0.000 0.002 Y NA
 310036 310037 VV1_1926 VV1_1927     TRUE 0.645 71.000 0.043 NA Y NA
 310037 310038 VV1_1927 VV1_1928     TRUE 0.632 21.000 0.053 NA   NA
 310038 310039 VV1_1928 VV1_1929     TRUE 0.992 7.000 1.000 NA   NA
 310039 310040 VV1_1929 VV1_1930     TRUE 0.976 13.000 0.533 NA   NA
 310040 310041 VV1_1930 VV1_1931     FALSE 0.008 232.000 0.022 1.000 N NA
 310041 310042 VV1_1931 VV1_1932     TRUE 0.934 123.000 0.377 0.089 Y NA
 310042 310043 VV1_1932 VV1_1933     TRUE 0.993 27.000 0.679 0.089 Y NA
 310043 310044 VV1_1933 VV1_1934     TRUE 0.702 130.000 0.446 1.000 N NA
 310044 310045 VV1_1934 VV1_1935     TRUE 0.998 16.000 0.910 0.004 Y NA
 310045 310046 VV1_1935 VV1_1936     TRUE 0.995 -7.000 0.189 0.004 Y NA
 310046 310047 VV1_1936 VV1_1937     TRUE 0.966 97.000 0.320 0.003 Y NA
 310047 310048 VV1_1937 VV1_1938     TRUE 0.997 -3.000 0.248 0.003 Y NA
 310048 310049 VV1_1938 VV1_1939     TRUE 0.972 4.000 0.127 1.000 Y NA
 310049 310050 VV1_1939 VV1_1940     FALSE 0.111 102.000 0.010 1.000   NA
 310050 310051 VV1_1940 VV1_1941     TRUE 0.649 37.000 0.114 1.000   NA
 310051 310052 VV1_1941 VV1_1942     TRUE 0.997 8.000 0.241 0.001 Y NA
 310052 310053 VV1_1942 VV1_1943     TRUE 0.991 70.000 0.741 0.001 Y NA
 310053 310054 VV1_1943 VV1_1944     TRUE 0.993 0.000 0.443 1.000 Y NA
 310054 310055 VV1_1944 VV1_1945     TRUE 0.963 -10.000 0.122 1.000 Y NA
 310055 310056 VV1_1945 VV1_1946     TRUE 0.997 16.000 0.702 0.011 Y NA
 310056 310057 VV1_1946 VV1_1947     TRUE 0.998 13.000 0.719 0.002 Y NA
 310057 310058 VV1_1947 VV1_1948     TRUE 0.979 10.000 0.240 1.000 Y NA
 310058 310059 VV1_1948 VV1_1949     TRUE 0.833 161.000 0.205 0.011 Y NA
 310059 310060 VV1_1949 VV1_1950   flhF TRUE 0.854 50.000 0.178 1.000 Y NA
 310060 310061 VV1_1950 VV1_1951 flhF   TRUE 0.982 14.000 0.241 0.013 N NA
 310061 310062 VV1_1951 VV1_1952     TRUE 0.979 -7.000 0.482 1.000 N NA
 310062 310063 VV1_1952 VV1_1953     TRUE 0.919 45.000 0.283 0.081 N NA
 310063 310064 VV1_1953 VV1_1954     TRUE 0.889 122.000 0.516 1.000 Y NA
 310064 310065 VV1_1954 VV1_1955     TRUE 0.986 10.000 0.341 1.000 Y NA
 310065 310066 VV1_1955 VV1_1956     TRUE 0.985 31.000 0.327 0.018 Y NA
 310066 310067 VV1_1956 VV1_1957     TRUE 0.917 9.000 0.170 1.000 N NA
 310067 310068 VV1_1957 VV1_1958     TRUE 0.980 -7.000 0.454 1.000   NA
 310068 310069 VV1_1958 VV1_1959     TRUE 0.989 33.000 0.886 0.018   NA
 310069 310070 VV1_1959 VV1_1960     TRUE 0.992 0.000 0.743 NA   NA
 310070 310071 VV1_1960 VV1_1961     FALSE 0.007 293.000 0.021 NA   NA
 310071 310072 VV1_1961 VV1_1962     TRUE 0.992 -7.000 0.074 0.002 Y NA
 310072 310073 VV1_1962 VV1_1963     TRUE 0.893 120.000 0.054 0.001 Y NA
 310073 310074 VV1_1963 VV1_1964     TRUE 0.890 46.000 0.501 1.000 N NA
 310074 310075 VV1_1964 VV1_1965     TRUE 0.974 -3.000 0.344 1.000 N NA
 310075 310076 VV1_1965 VV1_1966     TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 310076 310077 VV1_1966 VV1_1967     TRUE 0.994 41.000 0.804 0.002 Y NA
 310077 310078 VV1_1967 VV1_1968     TRUE 0.994 -3.000 0.578 NA Y NA
 310078 310079 VV1_1968 VV1_1969     TRUE 0.996 0.000 0.727 NA Y NA
 310079 310080 VV1_1969 VV1_1970     TRUE 0.635 97.000 0.239 NA N NA
 310081 310082 VV1_1971 VV1_1972     FALSE 0.154 301.000 0.000 0.047 Y NA
 310082 310083 VV1_1972 VV1_1973     FALSE 0.010 288.000 0.000 NA   NA
 310083 310084 VV1_1973 VV1_1974     TRUE 0.992 -7.000 0.946 NA   NA
 310085 310086 VV1_1975 VV1_1976     TRUE 0.993 0.000 0.430 1.000 Y NA
 310090 310091 VV1_1980 VV1_1981     FALSE 0.058 200.000 0.081 1.000 N NA
 310093 310094 VV1_1983 VV1_1984     TRUE 0.965 15.000 0.425 NA   NA
 310096 310097 VV1_1986 VV1_1988     FALSE 0.034 223.000 0.069 1.000 N NA
 310097 310098 VV1_1988 VV1_1989     TRUE 0.993 -3.000 0.097 0.006 Y NA
 310098 310099 VV1_1989 VV1_1991     FALSE 0.028 214.000 0.000 NA   NA
 310099 310100 VV1_1991 VV1_1992   truA FALSE 0.082 126.000 0.011 NA   NA
 310100 310101 VV1_1992 VV1_1993 truA   FALSE 0.045 175.000 0.044 1.000 N NA
 310101 310102 VV1_1993 VV1_1994     TRUE 0.789 83.000 0.383 1.000 N NA
 310102 310103 VV1_1994 VV1_1995     TRUE 0.962 1.000 0.216 NA   NA
 310103 310104 VV1_1995 VV1_1996     FALSE 0.528 62.000 0.116 NA   NA
 310104 310105 VV1_1996 VV1_1997     TRUE 0.840 37.000 0.262 1.000   NA
 310107 310108 VV1_1999 VV1_2001     FALSE 0.002 677.000 0.000 NA   NA
 310108 310109 VV1_2001 VV1_2002     FALSE 0.081 166.000 0.043 NA   NA
 310109 310110 VV1_2002 VV1_2003     TRUE 0.825 9.000 0.088 1.000 N NA
 310110 310111 VV1_2003 VV1_2004     TRUE 0.826 79.000 0.411 NA   NA
 310111 310112 VV1_2004 VV1_2005   recR TRUE 0.976 16.000 0.604 NA   NA
 310113 310114 VV1_2006 VV1_2007     TRUE 0.593 16.000 0.000 NA   NA
 310114 310115 VV1_2007 VV1_2008     FALSE 0.224 67.000 0.000 NA   NA
 310115 310116 VV1_2008 VV1_2009     TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 310116 310117 VV1_2009 VV1_2010     FALSE 0.116 90.000 0.000 1.000 N NA
 310117 310118 VV1_2010 VV1_2012     FALSE 0.024 223.000 0.000 NA   NA
 310119 310120 VV1_2013 VV1_2014     TRUE 0.638 -118.000 0.000 NA   NA
 310121 310122 VV1_2015 VV1_2016     FALSE 0.044 177.000 0.025 1.000   NA
 310122 310123 VV1_2016 VV1_2017     FALSE 0.510 72.000 0.118 NA   NA
 310123 310124 VV1_2017 VV1_2018     FALSE 0.205 168.000 0.129 NA   NA
 310124 310125 VV1_2018 VV1_2019     FALSE 0.002 726.000 0.000 NA   NA
 310125 310126 VV1_2019 VV1_2020     FALSE 0.209 130.000 0.064 NA   NA
 310126 310127 VV1_2020 VV1_2021     FALSE 0.240 128.000 0.074 NA   NA
 310127 310128 VV1_2021 VV1_2022     FALSE 0.537 109.000 0.000 1.000 Y NA
 310129 310130 VV1_2024 VV1_2025     FALSE 0.020 234.000 0.000 NA   NA
 310130 310131 VV1_2025 VV1_2026     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 310131 310132 VV1_2026 VV1_2027     TRUE 0.984 1.000 0.438 NA   NA
 310134 310135 VV1_2030 VV1_2031     TRUE 0.995 0.000 0.239 0.043 Y NA
 310136 310137 VV1_2032 VV1_2034     FALSE 0.004 429.000 0.000 NA   NA
 310138 310139 VV1_2035 VV1_2036     TRUE 0.593 106.000 0.200 NA   NA
 310139 310140 VV1_2036 VV1_2037     FALSE 0.216 57.000 0.021 NA   NA
 310140 310141 VV1_2037 VV1_2038     FALSE 0.039 191.000 0.000 1.000   NA
 310143 310144 VV1_2040 VV1_2041     TRUE 0.620 14.000 0.000 NA   NA
 310146 310147 VV1_2044 VV1_2045     FALSE 0.002 828.000 0.000 NA   NA
 310148 310149 VV1_2046 VV1_2047     TRUE 0.807 -6.000 0.050 NA   NA
 310150 310151 VV1_2048 VV1_2049     FALSE 0.287 47.000 0.000 NA   NA
 310152 310153 VV1_2052 VV1_2053     FALSE 0.009 291.000 0.000 1.000   NA
 310153 310154 VV1_2053 VV1_2054     FALSE 0.032 203.000 0.000 NA   NA
 310154 310155 VV1_2054 VV1_2055     FALSE 0.025 220.000 0.000 NA   NA
 310155 310156 VV1_2055 VV1_2057     TRUE 0.584 131.000 0.000 0.021   NA
 310156 310157 VV1_2057 VV1_2058     FALSE 0.008 305.000 0.000 1.000   NA
 310157 310158 VV1_2058 VV1_2059     FALSE 0.001 806.000 0.000 1.000 N NA
 310158 310159 VV1_2059 VV1_2060     FALSE 0.519 114.000 0.000 1.000 Y NA
 310161 310162 VV1_2062 VV1_2063   zntA FALSE 0.526 148.000 0.075 0.052   NA
 310162 310163 VV1_2063 VV1_2064 zntA   FALSE 0.008 252.000 0.000 1.000 N NA
 310164 310165 VV1_2065 VV1_2066     TRUE 0.693 165.000 0.714 1.000   NA
 310166 310167 VV1_2067 VV1_2068     FALSE 0.136 114.000 0.022 1.000   NA
 310167 310168 VV1_2068 VV1_2069     TRUE 0.981 0.000 0.372 NA   NA
 310168 310169 VV1_2069 VV1_2070     TRUE 0.964 19.000 0.516 NA   NA
 310169 310170 VV1_2070 VV1_2071     TRUE 0.939 18.000 0.310 NA   NA
 310170 310171 VV1_2071 VV1_2072     FALSE 0.191 181.000 0.151 NA   NA
 310171 310172 VV1_2072 VV1_2074     FALSE 0.007 445.000 0.057 NA   NA
 310172 310173 VV1_2074 VV1_2075     TRUE 0.985 -3.000 0.029 0.000   NA
 310174 310175 VV1_2076 VV1_2077     FALSE 0.341 115.000 0.093 NA   NA
 310175 310176 VV1_2077 VV1_2078     FALSE 0.457 47.000 0.071 NA   NA
 310176 310177 VV1_2078 VV1_2079     TRUE 0.736 10.000 0.039 NA   NA
 310178 310179 VV1_2080 VV1_2081     TRUE 0.978 -7.000 0.175 0.060 N NA
 310179 310180 VV1_2081 VV1_2082     TRUE 0.963 12.000 0.125 0.060 N NA
 310182 310183 VV1_2084 VV1_2085     TRUE 0.876 33.000 0.075 0.058   NA
 310183 310184 VV1_2085 VV1_2086     TRUE 0.953 0.000 0.205 1.000 N NA
 310184 310185 VV1_2086 VV1_2087     TRUE 0.951 -19.000 0.263 NA   NA
 310185 310186 VV1_2087 VV1_2088     TRUE 0.971 0.000 0.265 NA   NA
 310186 310187 VV1_2088 VV1_2089     FALSE 0.030 172.000 0.000 1.000 N NA
 310188 310189 VV1_2090 VV1_2091     TRUE 0.947 40.000 0.761 NA   NA
 310189 310190 VV1_2091 VV1_2092     TRUE 0.934 44.000 0.683 NA   NA
 310190 310191 VV1_2092 VV1_2093     FALSE 0.005 365.000 0.000 NA   NA
 310191 310192 VV1_2093 VV1_2094     FALSE 0.354 127.000 0.120 NA   NA
 310192 310193 VV1_2094 VV1_2095     FALSE 0.313 57.000 0.043 NA   NA
 310195 310196 VV1_2097 VV1_2098     FALSE 0.078 270.000 0.200 NA   NA
 310196 310197 VV1_2098 VV1_2099     FALSE 0.022 289.000 0.080 NA   NA
 310198 310199 VV1_2100 VV1_2101     FALSE 0.021 231.000 0.000 NA   NA
 310199 310200 VV1_2101 VV1_2102     FALSE 0.517 232.000 0.533 1.000 Y NA
 310200 310201 VV1_2102 VV1_2103     TRUE 0.972 91.000 0.571 0.059 Y NA
 310201 310202 VV1_2103 VV1_2104     TRUE 0.999 1.000 0.903 0.012 Y NA
 310202 310203 VV1_2104 VV1_2105     FALSE 0.217 148.000 0.097 1.000   NA
 310205 310206 VV1_2107 VV1_2108     TRUE 0.674 -16.000 0.000 NA   NA
 310206 310207 VV1_2108 VV1_2109     TRUE 0.952 -25.000 0.000 0.021   NA
 310208 310209 VV1_2110 VV1_2111     TRUE 0.986 0.000 0.474 NA   NA
 310209 310210 VV1_2111 VV1_2112     TRUE 0.983 -3.000 0.434 NA   NA
 310210 310211 VV1_2112 VV1_2113   dinG TRUE 0.726 46.000 0.189 1.000   NA
 310212 310213 VV1_2114 VV1_2115     TRUE 0.790 74.000 0.333 NA   NA
 310217 310218 VV1_2120 VV1_2121 clpS   TRUE 0.659 160.000 0.596 NA   NA
 310218 310219 VV1_2121 VV1_2122     TRUE 0.671 0.000 0.012 NA   NA
 310220 310221 VV1_2123 VV1_2124     FALSE 0.315 80.000 0.078 1.000 N NA
 310221 2208480 VV1_2124 VV1_3222     TRUE 0.987 -3.000 0.285 1.000 Y NA
 310222 310223 VV1_2125 VV1_2126     FALSE 0.070 125.000 0.005 1.000   NA
 310223 310224 VV1_2126 VV1_2127     TRUE 0.955 21.000 0.017 0.000   NA
 310226 310227 VV1_2130 VV1_2131   glgC FALSE 0.002 483.000 0.000 1.000 N NA
 310227 310228 VV1_2131 VV1_2132 glgC   TRUE 0.951 5.000 0.055 1.000 Y NA
 310228 310229 VV1_2132 VV1_2133     FALSE 0.018 253.000 0.038 1.000   NA
 310230 310231 VV1_2134 VV1_2135     TRUE 0.943 14.000 0.270 NA   NA
 310231 310232 VV1_2135 VV1_2136     FALSE 0.500 125.000 0.190 NA   NA
 310232 310233 VV1_2136 VV1_2138     FALSE 0.026 401.000 0.000 NA Y NA
 310233 310234 VV1_2138 VV1_2139   torD FALSE 0.008 311.000 0.000 1.000   NA
 310237 310238 VV1_2142 VV1_2143     TRUE 0.972 3.000 0.325 NA N NA
 310238 310239 VV1_2143 VV1_2144     TRUE 0.958 8.000 0.089 NA Y NA
 310239 310240 VV1_2144 VV1_2145     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.000 Y NA
 310242 310243 VV1_2147 VV1_2148     FALSE 0.212 82.000 0.000 1.000   NA
 310243 310244 VV1_2148 VV1_2149     TRUE 0.980 -12.000 0.000 0.000   NA
 310245 310246 VV1_2150 VV1_2151     TRUE 0.963 37.000 0.923 NA   NA
 310246 310247 VV1_2151 VV1_2152     TRUE 0.942 8.000 0.192 NA   NA
 310247 310248 VV1_2152 VV1_2153     FALSE 0.053 145.000 0.030 NA N NA
 310248 310249 VV1_2153 VV1_2154     FALSE 0.432 168.000 0.315 NA   NA
 310249 310250 VV1_2154 VV1_2155     FALSE 0.279 96.000 0.055 NA   NA
 310251 310252 VV1_2156 VV1_2157   ruvC TRUE 0.726 67.000 0.015 0.013 N NA
 310252 310253 VV1_2157 VV1_2158 ruvC   FALSE 0.020 115.000 0.007 1.000 N NA
 310253 310254 VV1_2158 VV1_2159   ruvA FALSE 0.034 71.000 0.009 1.000 N NA
 310254 310255 VV1_2159 VV1_2160 ruvA   TRUE 0.996 22.000 0.549 0.001 Y NA
 310255 310256 VV1_2160 VV1_2161     TRUE 0.968 -40.000 0.005 0.001   NA
 310256 310257 VV1_2161 VV1_2162     FALSE 0.004 463.000 0.000 1.000   NA
 310257 310258 VV1_2162 VV1_2163     TRUE 0.992 17.000 0.333 0.036 Y NA
 310258 310259 VV1_2163 VV1_2164     TRUE 0.600 13.000 0.023 NA   NA
 310259 310260 VV1_2164 VV1_2165     TRUE 0.969 -7.000 0.310 NA   NA
 310260 310261 VV1_2165 VV1_2166     FALSE 0.118 184.000 0.095 NA   NA
 310261 310262 VV1_2166 VV1_2167     TRUE 0.984 -10.000 0.593 1.000   NA
 310262 310263 VV1_2167 VV1_2168     TRUE 0.998 0.000 0.556 0.059 Y NA
 310263 310264 VV1_2168 VV1_2169     FALSE 0.455 123.000 0.183 NA N NA
 310264 310265 VV1_2169 VV1_2170   tolB TRUE 0.586 31.000 0.089 NA N NA
 310265 310266 VV1_2170 VV1_2171 tolB   TRUE 0.939 32.000 0.592 1.000 N NA
 310266 310267 VV1_2171 VV1_2172     TRUE 0.937 16.000 0.278 1.000   NA
 310267 310268 VV1_2172 VV1_2173     FALSE 0.083 128.000 0.013 1.000   NA
 310268 310269 VV1_2173 VV1_2174     FALSE 0.106 106.000 0.009 NA   NA
 310269 310270 VV1_2174 VV1_2175     TRUE 0.901 0.000 0.091 NA   NA
 310270 310271 VV1_2175 VV1_2176     TRUE 0.840 9.000 0.076 NA   NA
 310271 310272 VV1_2176 VV1_2177     FALSE 0.543 77.000 0.132 NA   NA
 310274 310275 VV1_2179 VV1_2181     FALSE 0.016 247.000 0.000 NA   NA
 310275 2208481 VV1_2181 VV1_tRNASer4     FALSE 0.092 145.000 0.000 NA   NA
 2208481 310276 VV1_tRNASer4 VV1_2182     FALSE 0.003 519.000 0.000 NA   NA
 310278 310279 VV1_2184 VV1_2185     TRUE 0.989 -3.000 0.630 NA   NA
 310279 310280 VV1_2185 VV1_2186     TRUE 0.978 25.000 0.933 NA   NA
 310280 310281 VV1_2186 VV1_2187     TRUE 0.974 -3.000 0.310 NA   NA
 310282 310283 VV1_2188 VV1_2189     TRUE 0.811 15.000 0.093 1.000   NA
 310283 310284 VV1_2189 VV1_2190     FALSE 0.005 370.000 0.000 1.000   NA
 310284 310285 VV1_2190 VV1_2191     TRUE 0.931 0.000 0.128 1.000   NA
 310286 310287 VV1_2192 VV1_2193     FALSE 0.216 80.000 0.000 NA   NA
 310287 310288 VV1_2193 VV1_2194     FALSE 0.230 64.000 0.000 NA   NA
 310288 310289 VV1_2194 VV1_2195     FALSE 0.438 28.000 0.000 NA   NA
 310289 310290 VV1_2195 VV1_2196     FALSE 0.561 18.000 0.000 NA   NA
 310290 310291 VV1_2196 VV1_2197     FALSE 0.187 98.000 0.000 NA   NA
 310291 310292 VV1_2197 VV1_2198     FALSE 0.200 89.000 0.000 NA   NA
 310294 310295 VV1_2200 VV1_2201     FALSE 0.013 222.000 0.000 1.000 N NA
 310295 310296 VV1_2201 VV1_2203     FALSE 0.019 235.000 0.000 NA   NA
 310296 310297 VV1_2203 VV1_2204     FALSE 0.165 111.000 0.000 NA   NA
 310298 310299 VV1_2205 VV1_2207     FALSE 0.003 517.000 0.000 NA   NA
 310301 310302 VV1_2209 VV1_2210     FALSE 0.131 68.000 0.000 1.000 N NA
 310305 310306 VV1_2213 VV1_2214     TRUE 0.844 102.000 0.000 0.021 Y NA
 310306 310307 VV1_2214 VV1_2215     FALSE 0.444 96.000 0.111 NA   NA
 310307 310308 VV1_2215 VV1_2216     TRUE 0.864 74.000 0.516 NA   NA
 310311 310312 VV1_2220 VV1_2221     TRUE 0.710 154.000 0.634 1.000   NA
 310313 310314 VV1_2222 VV1_2224     FALSE 0.013 265.000 0.000 NA   NA
 310314 310315 VV1_2224 VV1_2225     TRUE 0.887 61.000 0.562 NA   NA
 310315 310316 VV1_2225 VV1_2226     TRUE 0.992 -3.000 0.771 1.000   NA
 310316 310317 VV1_2226 VV1_2227     FALSE 0.108 144.000 0.036 1.000   NA
 310317 310318 VV1_2227 VV1_2228     FALSE 0.065 189.000 0.077 1.000 N NA
 310321 310322 VV1_2231 VV1_2232     TRUE 0.886 88.000 0.723 1.000 N NA
 310323 310324 VV1_2233 VV1_2234   ribA FALSE 0.013 221.000 0.000 1.000 N NA
 310326 310327 VV1_2237 VV1_2238     TRUE 0.675 125.000 0.154 NA Y NA
 310327 310328 VV1_2238 VV1_2239     TRUE 0.994 11.000 0.827 NA Y NA
 310328 310329 VV1_2239 VV1_2240     TRUE 0.880 112.000 0.354 0.058 N NA
 310329 310330 VV1_2240 VV1_2241     TRUE 0.995 -7.000 0.263 0.022 Y NA
 310332 310333 VV1_2243 VV1_2244     FALSE 0.021 190.000 0.000 1.000 N NA
 310334 310335 VV1_2245 VV1_2246     TRUE 0.961 4.000 0.261 1.000 N NA
 310337 310338 VV1_2248 VV1_2249     FALSE 0.003 298.000 0.024 1.000 N NA
 310338 310339 VV1_2249 VV1_2250     FALSE 0.036 300.000 0.133 NA   NA
 310339 310340 VV1_2250 VV1_2251     TRUE 0.594 142.000 0.333 NA   NA
 310341 310342 VV1_2252 VV1_2253     TRUE 0.852 83.000 0.500 NA   NA
 310343 310344 VV1_2254 VV1_2255     FALSE 0.018 176.000 0.021 1.000 N NA
 310346 310347 VV1_2258 VV1_2259     FALSE 0.461 226.000 0.750 NA   NA
 310347 310348 VV1_2259 VV1_2260     FALSE 0.004 313.000 0.000 NA N NA
 310348 310349 VV1_2260 VV1_2261     TRUE 0.926 97.000 0.567 1.000 Y NA
 310349 310350 VV1_2261 VV1_2262     FALSE 0.009 291.000 0.049 1.000 N NA
 310351 310352 VV1_2263 VV1_2264     TRUE 0.761 -7.000 0.038 1.000   NA
 310354 310355 VV1_2266 VV1_2267     FALSE 0.086 147.000 0.027 NA   NA
 310355 310356 VV1_2267 VV1_2268     FALSE 0.034 197.000 0.026 NA   NA
 310356 310357 VV1_2268 VV1_2269     TRUE 0.992 -3.000 0.791 NA   NA
 310357 310358 VV1_2269 VV1_2270     FALSE 0.531 87.000 0.137 NA   NA
 310358 310359 VV1_2270 VV1_2271     TRUE 0.908 2.000 0.122 1.000 N NA
 310359 310360 VV1_2271 VV1_2272     TRUE 0.819 0.000 0.043 1.000   NA
 310360 310361 VV1_2272 VV1_2273     FALSE 0.282 67.000 0.043 NA   NA
 310361 310362 VV1_2273 VV1_2274     FALSE 0.016 244.000 0.000 NA   NA
 310362 310363 VV1_2274 VV1_2275     TRUE 0.980 5.000 0.464 1.000 N NA
 310363 310364 VV1_2275 VV1_2276     TRUE 0.968 -7.000 0.125 1.000 Y NA
 310365 310366 VV1_2277 VV1_2278     FALSE 0.279 254.000 0.000 0.015 Y NA
 310366 310367 VV1_2278 VV1_2279     FALSE 0.005 377.000 0.000 1.000   NA
 310368 310369 VV1_2280 VV1_2281     FALSE 0.208 185.000 0.000 1.000 Y NA
 310369 310370 VV1_2281 VV1_2282     FALSE 0.070 159.000 0.000 NA   NA
 310370 310371 VV1_2282 VV1_2283     TRUE 0.990 9.000 0.810 NA   NA
 310372 310373 VV1_2284 VV1_2286     FALSE 0.095 144.000 0.000 NA   NA
 310375 310376 VV1_2288 VV1_2289     FALSE 0.011 275.000 0.000 1.000   NA
 310376 310377 VV1_2289 VV1_2290     FALSE 0.081 152.000 0.000 1.000   NA
 310378 310379 VV1_2292 VV1_2293     FALSE 0.028 176.000 0.000 1.000 N NA
 310379 310380 VV1_2293 VV1_2294     TRUE 0.621 69.000 0.000 NA Y NA
 310380 310381 VV1_2294 VV1_2295     FALSE 0.008 250.000 0.000 NA N NA
 310381 310382 VV1_2295 VV1_2296     FALSE 0.062 135.000 0.000 1.000 N NA
 310382 310383 VV1_2296 VV1_2297     FALSE 0.102 140.000 0.000 NA   NA
 310384 310385 VV1_2298 VV1_2299     FALSE 0.008 309.000 0.000 NA   NA
 310385 310386 VV1_2299 VV1_2300     TRUE 0.999 0.000 0.911 0.004 Y NA
 310386 310387 VV1_2300 VV1_2301     FALSE 0.001 610.000 0.000 1.000 N NA
 310388 310389 VV1_2302 VV1_2303     TRUE 0.813 26.000 0.158 NA   NA
 310389 310390 VV1_2303 VV1_2304     TRUE 0.644 66.000 0.184 1.000   NA
 310390 310391 VV1_2304 VV1_2305     TRUE 0.982 2.000 0.194 1.000 Y NA
 310391 310392 VV1_2305 VV1_2306     TRUE 0.944 2.000 0.161 NA   NA
 310392 310393 VV1_2306 VV1_2307     TRUE 0.983 -13.000 0.600 NA   NA
 310393 310394 VV1_2307 VV1_2308     TRUE 0.888 45.000 0.438 NA   NA
 310394 310395 VV1_2308 VV1_2309     TRUE 0.981 -3.000 0.189 NA Y NA
 310395 310396 VV1_2309 VV1_2310     TRUE 0.998 6.000 0.459 0.012 Y NA
 310396 310397 VV1_2310 VV1_2311     TRUE 0.965 3.000 0.241 NA   NA
 310397 310398 VV1_2311 VV1_2312     TRUE 0.725 41.000 0.172 NA   NA
 310400 310401 VV1_2314 VV1_2315     FALSE 0.483 13.000 0.000 1.000 N NA
 310401 310402 VV1_2315 VV1_2316     TRUE 0.606 4.000 0.000 1.000 N NA
 310403 310404 VV1_2317 VV1_2318     FALSE 0.003 374.000 0.000 1.000 N NA
 310404 310405 VV1_2318 VV1_2319     TRUE 0.859 59.000 0.000 0.086 Y NA
 310405 310406 VV1_2319 VV1_2320     TRUE 0.992 0.000 0.800 NA   NA
 310407 310408 VV1_2321 VV1_2322     FALSE 0.313 90.000 0.063 1.000   NA
 310409 310410 VV1_2323 VV1_2324     FALSE 0.465 72.000 0.101 NA   NA
 310412 310413 VV1_2326 VV1_2327     TRUE 0.671 11.000 0.000 NA   NA
 310414 310415 VV1_2329 VV1_2330     TRUE 0.593 16.000 0.000 NA   NA
 310415 310416 VV1_2330 VV1_2331     TRUE 0.984 3.000 0.225 NA Y NA
 310416 310417 VV1_2331 VV1_2332     FALSE 0.487 44.000 0.075 NA   NA
 310417 310418 VV1_2332 VV1_2333     TRUE 0.835 11.000 0.083 NA   NA
 310418 310419 VV1_2333 VV1_2334     TRUE 0.937 0.000 0.167 1.000 N NA
 310419 310420 VV1_2334 VV1_2335     TRUE 0.989 10.000 0.429 1.000 Y NA
 310420 310421 VV1_2335 VV1_2336     TRUE 0.996 4.000 0.240 0.011 Y NA
 310421 310422 VV1_2336 VV1_2337     TRUE 0.959 48.000 0.607 1.000 Y NA
 310422 310423 VV1_2337 VV1_2338     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 310423 310424 VV1_2338 VV1_2339     TRUE 0.684 -13.000 0.000 NA   NA
 310424 310425 VV1_2339 VV1_2340     TRUE 0.764 2.000 0.000 NA   NA
 310426 310427 VV1_2341 VV1_2342 acpD   FALSE 0.040 189.000 0.000 1.000   NA
 310428 310429 VV1_2343 VV1_2344     FALSE 0.164 121.000 0.036 1.000   NA
 310431 310432 VV1_2347 VV1_2348     FALSE 0.303 44.000 0.000 NA   NA
 310432 310433 VV1_2348 VV1_2349     FALSE 0.025 220.000 0.000 1.000   NA
 310433 310434 VV1_2349 VV1_2350     TRUE 0.973 17.000 0.587 1.000   NA
 310435 310436 VV1_2351 VV1_2352     FALSE 0.005 385.000 0.000 NA   NA
 310436 310437 VV1_2352 VV1_2353     TRUE 0.978 11.000 0.500 NA   NA
 310437 310438 VV1_2353 VV1_2354     TRUE 0.917 106.000 1.000 1.000   NA
 310438 310439 VV1_2354 VV1_2355     FALSE 0.002 412.000 0.000 1.000 N NA
 310439 310440 VV1_2355 VV1_2356     TRUE 0.959 1.000 0.055 1.000 Y NA
 310440 310441 VV1_2356 VV1_2357     TRUE 0.949 26.000 0.000 0.000   NA
 310444 310445 VV1_2360 VV1_2361     FALSE 0.281 48.000 0.000 NA   NA
 310445 310446 VV1_2361 VV1_2362     FALSE 0.015 252.000 0.000 1.000   NA
 310447 310448 VV1_2363 VV1_2364     TRUE 0.910 41.000 0.500 NA   NA
 310449 310450 VV1_2365 VV1_2366     FALSE 0.360 172.000 0.259 1.000   NA
 310450 310451 VV1_2366 VV1_2367     TRUE 0.893 47.000 0.483 NA   NA
 310451 310452 VV1_2367 VV1_2368     TRUE 0.984 13.000 0.724 NA   NA
 310452 310453 VV1_2368 VV1_2369     FALSE 0.065 210.000 0.080 NA   NA
 310453 310454 VV1_2369 VV1_2370   pheS FALSE 0.003 335.000 0.000 1.000 N NA
 310454 310455 VV1_2370 VV1_2371 pheS pheT TRUE 0.997 19.000 0.574 0.000 Y NA
 310457 310458 VV1_2373 VV1_2374     FALSE 0.120 13.000 0.004 1.000 N NA
 310458 310459 VV1_2374 VV1_2375     FALSE 0.002 416.000 0.000 1.000 N NA
 310462 310463 VV1_2378 VV1_2379     FALSE 0.464 132.000 0.044 1.000 Y NA
 310463 310464 VV1_2379 VV1_2380     FALSE 0.005 362.000 0.000 NA   NA
 310464 310465 VV1_2380 VV1_2381     FALSE 0.026 217.000 0.000 NA   NA
 310465 310466 VV1_2381 VV1_2382     FALSE 0.130 126.000 0.000 1.000   NA
 310466 310467 VV1_2382 VV1_2383     FALSE 0.271 82.000 0.044 NA   NA
 310467 310468 VV1_2383 VV1_2384     FALSE 0.452 148.000 0.239 NA   NA
 310469 310470 VV1_2385 VV1_2386     FALSE 0.322 133.000 0.139 1.000 N NA
 310470 310471 VV1_2386 VV1_2387     FALSE 0.067 277.000 0.043 1.000 Y NA
 310472 310473 VV1_2388 VV1_2389   hutH FALSE 0.033 187.000 0.019 NA   NA
 310473 310474 VV1_2389 VV1_2390 hutH   TRUE 0.998 6.000 0.315 0.001 Y NA
 310474 310475 VV1_2390 VV1_2391     TRUE 0.953 63.000 0.114 0.001 Y NA
 310475 310476 VV1_2391 VV1_2392     TRUE 0.924 -7.000 0.171 1.000 N NA
 310476 310477 VV1_2392 VV1_2393     FALSE 0.257 121.000 0.090 1.000 N NA
 310478 310479 VV1_2394 VV1_2395     FALSE 0.077 154.000 0.000 NA   NA
 310481 310482 VV1_2397 VV1_2398     FALSE 0.515 166.000 0.186 1.000 Y NA
 310482 310483 VV1_2398 VV1_2399   rpmI TRUE 0.934 104.000 0.652 1.000 Y NA
 310483 310484 VV1_2399 VV1_2400 rpmI   TRUE 0.994 42.000 0.928 0.010 Y NA
 310486 310487 VV1_2402 VV1_2403     FALSE 0.002 765.000 0.000 NA   NA
 310487 310488 VV1_2403 VV1_2404     FALSE 0.002 1215.000 0.000 NA   NA
 310488 310489 VV1_2404 VV1_2405     FALSE 0.075 156.000 0.000 NA   NA
 310489 310490 VV1_2405 VV1_2406     FALSE 0.002 1771.000 0.000 NA   NA
 310490 310491 VV1_2406 VV1_2407     FALSE 0.002 723.000 0.000 NA   NA
 310491 310492 VV1_2407 VV1_2408     FALSE 0.002 1043.000 0.000 NA   NA
 310492 310493 VV1_2408 VV1_2409     FALSE 0.002 1245.000 0.000 NA   NA
 310493 310494 VV1_2409 VV1_2410     TRUE 0.991 -12.000 1.000 NA   NA
 310494 310495 VV1_2410 VV1_2411     FALSE 0.002 696.000 0.000 NA   NA
 310495 310496 VV1_2411 VV1_2412     FALSE 0.002 2763.000 0.000 NA   NA
 310496 310497 VV1_2412 VV1_2413     FALSE 0.073 157.000 0.000 NA   NA
 310497 310498 VV1_2413 VV1_2414     FALSE 0.002 1752.000 0.000 NA   NA
 310498 310499 VV1_2414 VV1_2415     FALSE 0.003 595.000 0.000 NA   NA
 310499 310500 VV1_2415 VV1_2416     FALSE 0.089 147.000 0.000 1.000   NA
 310500 310501 VV1_2416 VV1_2417     FALSE 0.004 460.000 0.000 NA   NA
 310501 310502 VV1_2417 VV1_2418     FALSE 0.002 707.000 0.000 NA   NA
 310502 310503 VV1_2418 VV1_2420     FALSE 0.002 1611.000 0.000 NA   NA
 310503 310504 VV1_2420 VV1_2421     FALSE 0.010 283.000 0.000 NA   NA
 310504 310505 VV1_2421 VV1_2422     FALSE 0.002 1130.000 0.000 NA   NA
 310505 310506 VV1_2422 VV1_2423     FALSE 0.099 142.000 0.000 NA   NA
 310506 310507 VV1_2423 VV1_2424     FALSE 0.108 137.000 0.000 NA   NA
 310507 310508 VV1_2424 VV1_2425     FALSE 0.099 142.000 0.000 NA   NA
 310508 310509 VV1_2425 VV1_2426     FALSE 0.038 194.000 0.000 NA   NA
 310509 310510 VV1_2426 VV1_2428     FALSE 0.002 654.000 0.000 NA   NA
 310510 310511 VV1_2428 VV1_2430     FALSE 0.002 1046.000 0.000 NA   NA
 310511 310512 VV1_2430 VV1_2431     FALSE 0.002 1410.000 0.000 NA   NA
 310512 310513 VV1_2431 VV1_2432     FALSE 0.002 681.000 0.000 NA   NA
 310513 310514 VV1_2432 VV1_2433     TRUE 0.991 -12.000 1.000 NA   NA
 310514 310515 VV1_2433 VV1_2435     FALSE 0.003 634.000 0.000 NA   NA
 310515 310516 VV1_2435 VV1_2436     FALSE 0.227 65.000 0.000 NA   NA
 310516 310517 VV1_2436 VV1_2438     FALSE 0.003 641.000 0.000 NA   NA
 310517 310518 VV1_2438 VV1_2439     TRUE 0.994 2.000 1.000 NA   NA
 310518 310519 VV1_2439 VV1_2440     FALSE 0.002 1684.000 0.000 NA   NA
 310519 310520 VV1_2440 VV1_2441     FALSE 0.003 606.000 0.000 NA   NA
 310520 310521 VV1_2441 VV1_2442     FALSE 0.081 152.000 0.000 NA   NA
 310521 310522 VV1_2442 VV1_2444     FALSE 0.010 283.000 0.000 NA   NA
 310522 310523 VV1_2444 VV1_2445     FALSE 0.095 144.000 0.000 NA   NA
 310523 310524 VV1_2445 VV1_2447     FALSE 0.002 1365.000 0.000 NA   NA
 310524 310525 VV1_2447 VV1_2448     FALSE 0.073 157.000 0.000 NA   NA
 310525 310526 VV1_2448 VV1_2450     FALSE 0.002 739.000 0.000 1.000   NA
 310528 310529 VV1_2453 VV1_2454     FALSE 0.002 1115.000 0.000 NA   NA
 310529 310530 VV1_2454 VV1_2455     FALSE 0.002 3402.000 0.000 NA   NA
 310532 310533 VV1_2457 VV1_2459     FALSE 0.003 621.000 0.000 NA   NA
 310533 310534 VV1_2459 VV1_2460     FALSE 0.002 672.000 0.000 NA   NA
 310534 310535 VV1_2460 VV1_2461     FALSE 0.019 235.000 0.000 NA   NA
 310535 310536 VV1_2461 VV1_2462     FALSE 0.009 293.000 0.000 NA   NA
 310536 310537 VV1_2462 VV1_2463     FALSE 0.011 275.000 0.000 NA   NA
 310537 310538 VV1_2463 VV1_2464     TRUE 0.977 -7.000 0.400 NA   NA
 310538 310539 VV1_2464 VV1_2465     TRUE 0.991 -3.000 0.750 NA   NA
 310539 310540 VV1_2465 VV1_2466     FALSE 0.055 172.000 0.000 NA   NA
 310540 310541 VV1_2466 VV1_2467     FALSE 0.002 1985.000 0.000 NA   NA
 310541 310542 VV1_2467 VV1_2468     FALSE 0.002 1024.000 0.000 NA   NA
 310542 310543 VV1_2468 VV1_2469     FALSE 0.036 197.000 0.000 NA   NA
 310543 310544 VV1_2469 VV1_2470     FALSE 0.002 3089.000 0.000 NA   NA
 310544 310545 VV1_2470 VV1_2471     FALSE 0.136 124.000 0.000 NA   NA
 310545 310546 VV1_2471 VV1_2472     FALSE 0.056 171.000 0.000 1.000   NA
 310546 310547 VV1_2472 VV1_2473     FALSE 0.001 898.000 0.000 NA N NA
 310551 310552 VV1_2477 VV1_2479     FALSE 0.002 1086.000 0.000 NA   NA
 310552 310553 VV1_2479 VV1_2480     TRUE 0.602 135.000 0.000 0.012   NA
 310553 310554 VV1_2480 VV1_2481     FALSE 0.014 261.000 0.000 NA   NA
 310554 310555 VV1_2481 VV1_2482     FALSE 0.110 136.000 0.000 NA   NA
 310555 310556 VV1_2482 VV1_2484     FALSE 0.002 700.000 0.000 NA   NA
 310556 310557 VV1_2484 VV1_2486     FALSE 0.002 2758.000 0.000 NA   NA
 310557 310558 VV1_2486 VV1_2487     FALSE 0.230 64.000 0.000 NA   NA
 310558 310559 VV1_2487 VV1_2489     FALSE 0.002 1956.000 0.000 NA   NA
 310559 310560 VV1_2489 VV1_2490     FALSE 0.156 115.000 0.000 NA   NA
 310560 310561 VV1_2490 VV1_2491     FALSE 0.065 162.000 0.000 NA   NA
 310561 310562 VV1_2491 VV1_2492     FALSE 0.003 521.000 0.000 NA   NA
 310562 310563 VV1_2492 VV1_2493     FALSE 0.190 96.000 0.000 NA   NA
 310563 310564 VV1_2493 VV1_2494     FALSE 0.002 2586.000 0.000 NA   NA
 310564 310565 VV1_2494 VV1_2495     FALSE 0.002 1207.000 0.000 NA   NA
 310565 310566 VV1_2495 VV1_2496     FALSE 0.004 420.000 0.000 NA   NA
 310566 310567 VV1_2496 VV1_2497     FALSE 0.029 210.000 0.000 1.000   NA
 310569 310570 VV1_2500 VV1_2501     FALSE 0.118 132.000 0.000 NA   NA
 310570 310571 VV1_2501 VV1_2502     FALSE 0.073 157.000 0.000 NA   NA
 310571 310572 VV1_2502 VV1_2503     FALSE 0.087 148.000 0.000 NA   NA
 310572 310573 VV1_2503 VV1_2504     FALSE 0.111 135.000 0.000 NA   NA
 310573 310574 VV1_2504 VV1_2505     FALSE 0.106 138.000 0.000 NA   NA
 310574 310575 VV1_2505 VV1_2506     FALSE 0.003 616.000 0.000 1.000   NA
 310575 310576 VV1_2506 VV1_2508     FALSE 0.001 1200.000 0.000 1.000 N NA
 310576 310577 VV1_2508 VV1_2509     FALSE 0.001 603.000 0.000 1.000 N NA
 310577 310578 VV1_2509 VV1_2510     FALSE 0.001 1087.000 0.000 1.000 N NA
 310578 310579 VV1_2510 VV1_2511     FALSE 0.003 605.000 0.000 1.000   NA
 310579 310580 VV1_2511 VV1_2512     FALSE 0.003 559.000 0.000 NA   NA
 310580 310581 VV1_2512 VV1_2513     FALSE 0.085 149.000 0.000 NA   NA
 310581 310582 VV1_2513 VV1_2514     FALSE 0.002 1460.000 0.000 NA   NA
 310582 310583 VV1_2514 VV1_2515     FALSE 0.079 153.000 0.000 NA   NA
 310583 310584 VV1_2515 VV1_2516     FALSE 0.073 157.000 0.000 NA   NA
 310585 310586 VV1_2517 VV1_2518     FALSE 0.002 1270.000 0.000 NA   NA
 310587 310588 VV1_2519 VV1_2520     FALSE 0.002 1584.000 0.000 NA   NA
 310588 310589 VV1_2520 VV1_2521     FALSE 0.101 141.000 0.000 NA   NA
 310589 310590 VV1_2521 VV1_2522     FALSE 0.032 203.000 0.000 NA   NA
 310590 310591 VV1_2522 VV1_2523     FALSE 0.041 188.000 0.000 NA   NA
 310591 310592 VV1_2523 VV1_2524     FALSE 0.020 2969.000 0.000 0.012   NA
 310593 310594 VV1_2525 VV1_2526     TRUE 0.792 -3.000 0.038 NA   NA
 310597 310598 VV1_2531 VV1_2532     FALSE 0.003 618.000 0.000 NA   NA
 310598 310599 VV1_2532 VV1_2533     FALSE 0.003 599.000 0.000 NA   NA
 310599 310600 VV1_2533 VV1_2534     FALSE 0.019 236.000 0.000 NA   NA
 310600 310601 VV1_2534 VV1_2535     FALSE 0.014 260.000 0.000 NA   NA
 310601 310602 VV1_2535 VV1_2536     FALSE 0.002 842.000 0.000 NA   NA
 310603 310604 VV1_2537 VV1_2538     TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 310604 310605 VV1_2538 VV1_2539     FALSE 0.026 1006.000 0.000 0.008   NA
 310606 310607 VV1_2540 VV1_2541     FALSE 0.002 798.000 0.000 NA   NA
 310607 310608 VV1_2541 VV1_2543     FALSE 0.007 325.000 0.000 NA   NA
 310608 310609 VV1_2543 VV1_2544     FALSE 0.097 143.000 0.000 NA   NA
 310609 310610 VV1_2544 VV1_2546     FALSE 0.002 669.000 0.000 NA   NA
 310610 310611 VV1_2546 VV1_2547     TRUE 0.985 -3.000 0.500 NA   NA
 310613 310614 VV1_2549 VV1_2550     FALSE 0.030 208.000 0.000 NA   NA
 310614 310615 VV1_2550 VV1_2551     TRUE 0.591 125.000 0.000 0.041   NA
 310615 310616 VV1_2551 VV1_2553     FALSE 0.002 781.000 0.000 NA   NA
 310618 310619 VV1_2557 VV1_2558     TRUE 0.713 8.000 0.000 NA   NA
 310622 310623 VV1_2561 VV1_2562     FALSE 0.022 234.000 0.033 NA   NA
 310624 310625 VV1_2563 VV1_2564     TRUE 0.959 -3.000 0.066 1.000 Y NA
 310625 310626 VV1_2564 VV1_2565     FALSE 0.155 158.000 0.082 NA   NA
 310630 310631 VV1_2569 VV1_2570     FALSE 0.223 176.000 0.167 NA   NA
 310632 310633 VV1_2571 VV1_2572     TRUE 0.739 64.000 0.256 NA   NA
 310633 310634 VV1_2572 VV1_2573   mobA TRUE 0.993 -3.000 0.073 0.002 Y NA
 310634 310635 VV1_2573 VV1_2574 mobA   TRUE 0.923 -22.000 0.038 1.000 Y NA
 310635 310636 VV1_2574 VV1_2575     TRUE 0.989 9.000 0.389 1.000 Y NA
 310636 310637 VV1_2575 VV1_2576     TRUE 0.992 7.000 0.524 NA Y NA
 310638 310639 VV1_2577 VV1_2578     TRUE 0.966 41.000 0.273 0.084 Y NA
 310640 310641 VV1_2579 VV1_2580     TRUE 0.927 2.000 0.125 NA   NA
 310642 310643 VV1_2581 VV1_2582     TRUE 0.764 71.000 0.028 0.014   NA
 310644 310645 VV1_2583 VV1_2584     FALSE 0.072 127.000 0.000 1.000 N NA
 310646 310647 VV1_2585 VV1_2586     TRUE 0.991 -10.000 0.901 NA   NA
 310647 310648 VV1_2586 VV1_2587     FALSE 0.126 230.000 0.195 NA   NA
 310648 310649 VV1_2587 VV1_2588     TRUE 0.990 10.000 0.347 0.035   NA
 310649 310650 VV1_2588 VV1_2589     TRUE 0.676 63.000 0.200 NA   NA
 310650 310651 VV1_2589 VV1_2590     TRUE 0.983 13.000 0.708 NA   NA
 310651 310652 VV1_2590 VV1_2591     TRUE 0.998 21.000 0.750 0.001 Y NA
 310652 310653 VV1_2591 VV1_2592     TRUE 0.994 15.000 0.217 0.001 Y NA
 310653 310654 VV1_2592 VV1_2593     TRUE 0.912 -16.000 0.157 NA   NA
 310655 310656 VV1_2594 VV1_2595     FALSE 0.114 134.000 0.000 NA   NA
 310656 310657 VV1_2595 VV1_2596     FALSE 0.083 151.000 0.000 NA   NA
 310658 310659 VV1_2598 VV1_2599     FALSE 0.013 175.000 0.015 1.000 N NA
 310660 310661 VV1_2600 VV1_2601     TRUE 0.761 162.000 0.125 0.013 Y NA
 310661 310662 VV1_2601 VV1_2602   potC TRUE 0.842 104.000 0.047 0.044 Y NA
 310662 310663 VV1_2602 VV1_2603 potC potB TRUE 0.984 27.000 0.286 0.044 Y NA
 310663 310664 VV1_2603 VV1_2604 potB potA TRUE 0.994 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 310665 310666 VV1_2605 VV1_2606     TRUE 0.969 -7.000 0.313 NA   NA
 310666 310667 VV1_2606 VV1_2607     TRUE 0.958 19.000 0.448 NA   NA
 310668 310669 VV1_2608 VV1_2609     FALSE 0.277 115.000 0.091 NA N NA
 310669 310670 VV1_2609 VV1_2610     TRUE 0.791 132.000 0.619 1.000   NA
 310670 310671 VV1_2610 VV1_2611     FALSE 0.462 26.000 0.000 NA   NA
 310671 310672 VV1_2611 VV1_2612     FALSE 0.536 87.000 0.141 NA   NA
 310672 310673 VV1_2612 VV1_2613     TRUE 0.971 0.000 0.266 NA   NA
 310673 310674 VV1_2613 VV1_2614     TRUE 0.995 4.000 0.713 NA Y NA
 310674 310675 VV1_2614 VV1_2616     TRUE 0.949 5.000 0.197 NA   NA
 310675 310676 VV1_2616 VV1_2617     TRUE 0.813 87.000 0.404 NA   NA
 310676 310677 VV1_2617 VV1_2618     TRUE 0.998 0.000 0.636 0.002 N NA
 310677 310678 VV1_2618 VV1_2619     TRUE 0.996 12.000 0.667 0.002 N NA
 310678 310679 VV1_2619 VV1_2620     TRUE 0.996 13.000 0.700 0.002 N NA
 310680 310681 VV1_2621 VV1_2622     TRUE 0.981 -13.000 0.538 NA   NA
 310682 310683 VV1_2624 VV1_2625     FALSE 0.209 203.000 0.222 NA   NA
 310683 310684 VV1_2625 VV1_2626     TRUE 0.674 105.000 0.258 NA   NA
 310684 310685 VV1_2626 VV1_2627     TRUE 0.926 16.000 0.236 NA   NA
 310686 310687 VV1_2628 VV1_2629     TRUE 0.729 72.000 0.290 1.000 N NA
 310688 310689 VV1_2630 VV1_2631     FALSE 0.531 142.000 0.278 NA   NA
 310689 310690 VV1_2631 VV1_2632     TRUE 0.875 8.000 0.094 NA   NA
 310690 310691 VV1_2632 VV1_2633     TRUE 0.842 -22.000 0.092 NA   NA
 310691 310692 VV1_2633 VV1_2634     FALSE 0.224 54.000 0.022 NA   NA
 310692 310693 VV1_2634 VV1_2635     FALSE 0.198 90.000 0.000 NA   NA
 310693 310694 VV1_2635 VV1_2636     FALSE 0.002 701.000 0.000 NA   NA
 310694 310695 VV1_2636 VV1_2637     FALSE 0.161 156.000 0.081 NA   NA
 310695 310696 VV1_2637 VV1_2638     FALSE 0.012 298.000 0.045 1.000   NA
 310696 310697 VV1_2638 VV1_2639     TRUE 0.981 -15.000 0.050 0.000   NA
 310697 310698 VV1_2639 VV1_2640     FALSE 0.145 208.000 0.169 NA   NA
 310698 310699 VV1_2640 VV1_2641     FALSE 0.533 49.000 0.099 NA   NA
 310699 310700 VV1_2641 VV1_2642     FALSE 0.011 280.000 0.000 NA   NA
 310700 310701 VV1_2642 VV1_2643     FALSE 0.018 203.000 0.008 NA   NA
 310701 310702 VV1_2643 VV1_2644     TRUE 0.928 18.000 0.304 NA N NA
 310702 310703 VV1_2644 VV1_2645     TRUE 0.716 64.000 0.081 NA Y NA
 310704 310705 VV1_2646 VV1_2647     FALSE 0.471 40.000 0.063 NA   NA
 310705 310706 VV1_2647 VV1_2648     TRUE 0.923 77.000 0.840 NA   NA
 310706 310707 VV1_2648 VV1_2649     TRUE 0.802 99.000 0.420 NA   NA
 310711 310712 VV1_2654 VV1_2655     FALSE 0.512 26.000 0.038 NA   NA
 310713 310714 VV1_2656 VV1_2657     FALSE 0.004 309.000 0.000 1.000 N NA
 310715 310716 VV1_2658 VV1_2659     FALSE 0.349 32.000 0.041 NA N NA
 310716 310717 VV1_2659 VV1_2660     TRUE 0.983 -3.000 0.214 1.000 Y NA
 310717 310718 VV1_2660 VV1_2661     TRUE 0.939 -3.000 0.179 1.000 N NA
 310718 310719 VV1_2661 VV1_2662     FALSE 0.339 23.000 0.000 NA N NA
 310719 310720 VV1_2662 VV1_2663     FALSE 0.528 24.000 0.059 NA N NA
 310720 310721 VV1_2663 VV1_2664     TRUE 0.807 157.000 0.176 0.019 Y NA
 310721 310722 VV1_2664 VV1_2665     TRUE 0.923 -7.000 0.170 1.000 N NA
 310722 310723 VV1_2665 VV1_2666     TRUE 0.911 108.000 0.132 0.012 Y NA
 310723 310724 VV1_2666 VV1_2667     TRUE 0.998 -3.000 0.429 0.012 Y NA
 310724 310725 VV1_2667 VV1_2668     TRUE 0.916 -3.000 0.115 1.000   NA
 310725 310726 VV1_2668 VV1_2669     TRUE 0.823 -3.000 0.049 NA   NA
 310726 310727 VV1_2669 VV1_2670     TRUE 0.773 117.000 0.444 NA   NA
 310727 310728 VV1_2670 VV1_2671     TRUE 0.942 11.000 0.226 1.000   NA
 310728 310729 VV1_2671 VV1_2672     TRUE 0.990 0.000 0.323 1.000 Y NA
 310729 310730 VV1_2672 VV1_2673     FALSE 0.438 211.000 0.296 1.000 Y NA
 310730 310731 VV1_2673 VV1_2674     TRUE 0.974 -3.000 0.128 NA Y NA
 310731 310732 VV1_2674 VV1_2675     TRUE 0.963 -3.000 0.080 NA Y NA
 310739 310740 VV1_2682 VV1_2683     TRUE 0.964 34.000 0.039 0.001 Y NA
 310740 310741 VV1_2683 VV1_2684     TRUE 0.981 -3.000 0.188 1.000 Y NA
 310741 310742 VV1_2684 VV1_2685     FALSE 0.002 413.000 0.000 1.000 N NA
 310742 310743 VV1_2685 VV1_2686     TRUE 0.991 -3.000 0.130 0.076 Y NA
 310744 310745 VV1_2687 VV1_2688     FALSE 0.014 239.000 0.021 NA   NA
 310745 310746 VV1_2688 VV1_2689     TRUE 0.982 -3.000 0.464 1.000 N NA
 310746 310747 VV1_2689 VV1_2690     TRUE 0.986 11.000 0.729 NA   NA
 310747 310748 VV1_2690 VV1_2691     TRUE 0.987 -13.000 0.743 NA   NA
 310748 310749 VV1_2691 VV1_2692     FALSE 0.026 179.000 0.000 NA N NA
 310752 310753 VV1_2696 VV1_2697     TRUE 0.940 0.000 0.147 NA   NA
 310754 310755 VV1_2698 VV1_2699     FALSE 0.014 217.000 0.000 1.000 N NA
 310756 310757 VV1_2700 VV1_2701 napH napG TRUE 0.999 0.000 0.795 0.010 Y NA
 310757 310758 VV1_2701 VV1_2702 napG   FALSE 0.004 318.000 0.000 1.000 N NA
 310759 310760 VV1_2703 VV1_2704     TRUE 0.976 73.000 0.548 0.044 Y NA
 310760 310761 VV1_2704 VV1_2705     TRUE 0.999 2.000 0.815 0.012 Y NA
 310761 310762 VV1_2705 VV1_2706     TRUE 0.986 24.000 0.734 1.000 Y NA
 310762 310763 VV1_2706 VV1_2707     FALSE 0.032 203.000 0.000 1.000   NA
 310767 310768 VV1_2712 VV1_2713     FALSE 0.135 110.000 0.020 1.000   NA
 310768 310769 VV1_2713 VV1_2714     FALSE 0.438 28.000 0.000 NA   NA
 310771 310772 VV1_2716 VV1_2717     TRUE 0.949 2.000 0.000 1.000 Y NA
 310772 310773 VV1_2717 VV1_2718     FALSE 0.152 117.000 0.000 NA   NA
 310773 310774 VV1_2718 VV1_2719     FALSE 0.100 198.000 0.100 NA   NA
 310775 310776 VV1_2720 VV1_2721     TRUE 0.947 13.000 0.270 1.000   NA
 310777 310778 VV1_2722 VV1_2723     FALSE 0.021 233.000 0.000 1.000   NA
 310779 310780 VV1_2724 VV1_2725     FALSE 0.005 388.000 0.000 1.000   NA
 310780 310781 VV1_2725 VV1_2726     FALSE 0.013 224.000 0.000 1.000 N NA
 310783 310784 VV1_2728 VV1_2729     FALSE 0.350 66.000 0.063 NA   NA
 310784 310785 VV1_2729 VV1_2730     TRUE 0.923 57.000 0.733 NA   NA
 310785 310786 VV1_2730 VV1_2731     TRUE 0.900 54.000 0.289 1.000 Y NA
 310786 310787 VV1_2731 VV1_2732     FALSE 0.539 171.000 0.502 1.000 N NA
 310787 310788 VV1_2732 VV1_2733     TRUE 0.694 13.000 0.063 1.000 N NA
 310788 310789 VV1_2733 VV1_2734     FALSE 0.054 143.000 0.000 1.000 N NA
 310790 310791 VV1_2735 VV1_2737     FALSE 0.360 242.000 0.690 NA   NA
 310791 310792 VV1_2737 VV1_2738     TRUE 0.978 22.000 0.844 NA   NA
 310792 310793 VV1_2738 VV1_2739     TRUE 0.671 11.000 0.000 NA   NA
 310794 310795 VV1_2740 VV1_2741     TRUE 0.970 19.000 0.600 NA   NA
 310795 310796 VV1_2741 VV1_2742     TRUE 0.952 109.000 0.900 NA Y NA
 310796 310797 VV1_2742 VV1_2743     TRUE 0.758 122.000 0.444 NA   NA
 310797 310798 VV1_2743 VV1_2744     FALSE 0.167 273.000 0.400 NA   NA
 310798 310799 VV1_2744 VV1_2745     FALSE 0.003 380.000 0.000 1.000 N NA
 310800 310801 VV1_2746 VV1_2747     FALSE 0.071 169.000 0.039 1.000   NA
 310801 310802 VV1_2747 VV1_2748     FALSE 0.070 266.000 0.000 1.000 Y NA
 310802 310803 VV1_2748 VV1_2749     FALSE 0.017 203.000 0.000 1.000 N NA
 310803 310804 VV1_2749 VV1_2750     TRUE 0.986 62.000 0.760 0.044 Y NA
 310804 310805 VV1_2750 VV1_2751     TRUE 0.998 10.000 0.840 0.044 Y NA
 310805 310806 VV1_2751 VV1_2752     TRUE 0.941 53.000 0.160 0.044 Y NA
 310806 310807 VV1_2752 VV1_2753     TRUE 0.956 -3.000 0.056 1.000 Y NA
 310807 310808 VV1_2753 VV1_2754     FALSE 0.312 26.000 0.000 1.000 N NA
 310808 310809 VV1_2754 VV1_2755     FALSE 0.012 229.000 0.000 1.000 N NA
 310810 310811 VV1_2756 VV1_2757     FALSE 0.053 174.000 0.000 NA   NA
 310812 310813 VV1_2758 VV1_2759     TRUE 0.648 -34.000 0.000 NA   NA
 2208482 2208483 VV1_tRNAVal4 VV1_tRNAVal3     FALSE 0.331 39.000 0.000 NA   NA
 2208483 310814 VV1_tRNAVal3 VV1_2760     FALSE 0.087 148.000 0.000 NA   NA
 310814 310815 VV1_2760 VV1_2761     TRUE 0.572 66.000 0.143 NA   NA
 310817 310818 VV1_2764 VV1_2765     FALSE 0.117 89.000 0.000 1.000 N NA
 310818 310819 VV1_2765 VV1_2766     TRUE 0.979 8.000 0.495 1.000 N NA
 310819 310820 VV1_2766 VV1_2767     TRUE 0.888 41.000 0.195 1.000 Y NA
 310820 310821 VV1_2767 VV1_2768     TRUE 0.885 -7.000 0.119 1.000 N NA
 310822 310823 VV1_2769 VV1_2771     FALSE 0.003 351.000 0.000 1.000 N NA
 310823 310824 VV1_2771 VV1_2772     FALSE 0.036 161.000 0.000 1.000 N NA
 310824 310825 VV1_2772 VV1_2773     FALSE 0.008 175.000 0.011 1.000 N NA
 310826 310827 VV1_2774 VV1_2775     TRUE 0.859 0.000 0.062 NA   NA
 310830 310831 VV1_2778 VV1_2779     FALSE 0.303 73.000 0.050 NA   NA
 310831 310832 VV1_2779 VV1_2780     FALSE 0.109 149.000 0.041 NA   NA
 310833 310834 VV1_2781 VV1_2782     TRUE 0.912 62.000 0.356 1.000 Y NA
 310834 310835 VV1_2782 VV1_2783     TRUE 0.670 119.000 0.333 1.000 N NA
 310835 310836 VV1_2783 VV1_2784     FALSE 0.045 291.000 0.014 1.000 Y NA
 310836 310837 VV1_2784 VV1_2785     FALSE 0.311 25.000 0.028 1.000 N NA
 310837 310838 VV1_2785 VV1_2786     TRUE 0.900 10.000 0.155 1.000 N NA
 310838 310839 VV1_2786 VV1_2787     TRUE 0.952 3.000 0.043 1.000 Y NA
 310839 310840 VV1_2787 VV1_2788     TRUE 0.991 2.000 0.049 0.004 Y NA
 310841 310842 VV1_2791 VV1_2792     FALSE 0.129 74.000 0.000 1.000 N NA
 310842 310843 VV1_2792 VV1_2793     FALSE 0.127 173.000 0.086 1.000   NA
 310843 310844 VV1_2793 VV1_2794     TRUE 0.923 3.000 0.124 NA   NA
 310844 310845 VV1_2794 VV1_2796     FALSE 0.007 313.000 0.000 NA   NA
 310845 310846 VV1_2796 VV1_2797   hemH FALSE 0.120 203.000 0.128 NA   NA
 310847 310848 VV1_2798 VV1_2799     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 310848 310849 VV1_2799 VV1_2800     FALSE 0.099 202.000 0.105 1.000   NA
 310850 310851 VV1_2801 VV1_2802     FALSE 0.013 254.000 0.026 NA   NA
 310851 310852 VV1_2802 VV1_2803     TRUE 0.639 -111.000 0.000 NA   NA
 310852 310853 VV1_2803 VV1_2805     FALSE 0.031 206.000 0.000 NA   NA
 310856 310857 VV1_2808 VV1_2809     TRUE 0.949 -16.000 0.242 NA   NA
 310858 310859 VV1_2810 VV1_2811     TRUE 0.580 108.000 0.049 1.000 Y NA
 310859 310860 VV1_2811 VV1_2812     TRUE 0.998 -7.000 0.631 0.004 Y NA
 310861 310862 VV1_2813 VV1_2814     FALSE 0.094 124.000 0.014 NA   NA
 310863 310864 VV1_2815 VV1_2816     TRUE 0.588 62.000 0.143 NA   NA
 310864 310865 VV1_2816 VV1_2817     TRUE 0.991 -7.000 0.857 1.000   NA
 310865 310866 VV1_2817 VV1_2818     FALSE 0.095 341.000 0.412 NA   NA
 310868 310869 VV1_2821 VV1_2822     FALSE 0.020 347.000 0.113 NA   NA
 310869 310870 VV1_2822 VV1_2823     FALSE 0.072 198.000 0.071 NA   NA
 310870 310871 VV1_2823 VV1_2824     TRUE 0.577 116.000 0.212 NA   NA
 310871 310872 VV1_2824 VV1_2825     FALSE 0.004 311.000 0.000 1.000 N NA
 310874 310875 VV1_2827 VV1_2828     FALSE 0.012 273.000 0.000 1.000   NA
 310876 310877 VV1_2829 VV1_2830     FALSE 0.046 182.000 0.000 NA   NA
 310877 310878 VV1_2830 VV1_2831     TRUE 0.798 16.000 0.091 NA   NA
 310878 310879 VV1_2831 VV1_2832     TRUE 0.572 63.000 0.164 1.000 N NA
 310879 310880 VV1_2832 VV1_2833     FALSE 0.002 471.000 0.000 1.000 N NA
 310880 310881 VV1_2833 VV1_2834     FALSE 0.012 276.000 0.031 1.000   NA
 310881 310882 VV1_2834 VV1_2835     FALSE 0.210 84.000 0.000 NA   NA
 310882 310883 VV1_2835 VV1_2836     TRUE 0.767 1.000 0.000 NA   NA
 310883 310884 VV1_2836 VV1_2837     TRUE 0.764 2.000 0.000 NA   NA
 310884 310885 VV1_2837 VV1_2838     TRUE 0.988 -19.000 0.842 NA   NA
 310886 310887 VV1_2839 VV1_2840     FALSE 0.101 106.000 0.000 1.000 N NA
 310888 310889 VV1_2841 VV1_2842     TRUE 0.985 0.000 0.452 NA   NA
 310889 310890 VV1_2842 VV1_2843     FALSE 0.020 239.000 0.055 1.000 N NA
 310891 310892 VV1_2844 VV1_2845     TRUE 0.960 -9.000 0.069 0.082   NA
 310892 310893 VV1_2845 VV1_2846     FALSE 0.193 145.000 0.080 NA   NA
 310893 310894 VV1_2846 VV1_2847     TRUE 0.954 12.000 0.287 NA   NA
 310894 310895 VV1_2847 VV1_2848     TRUE 0.970 -10.000 0.160 1.000 Y NA
 310895 310896 VV1_2848 VV1_2850     FALSE 0.006 181.000 0.008 1.000 N NA
 310896 310897 VV1_2850 VV1_2851     FALSE 0.003 510.000 0.000 NA   NA
 310897 310898 VV1_2851 VV1_2852     TRUE 0.653 -28.000 0.000 NA   NA
 310898 310899 VV1_2852 VV1_2853     TRUE 0.733 -6.000 0.000 NA   NA
 310903 310904 VV1_2858 VV1_2859     FALSE 0.011 279.000 0.000 NA   NA
 310904 310905 VV1_2859 VV1_2860     TRUE 0.934 39.000 0.627 NA   NA
 310905 310906 VV1_2860 VV1_2861     TRUE 0.981 -34.000 0.602 1.000   NA
 310906 310907 VV1_2861 VV1_2862     TRUE 0.972 -10.000 0.359 1.000   NA
 310907 310908 VV1_2862 VV1_2863     FALSE 0.101 106.000 0.000 1.000 N NA
 310908 310909 VV1_2863 VV1_2864     FALSE 0.084 204.000 0.115 1.000 N NA
 310909 310910 VV1_2864 VV1_2865     TRUE 0.991 62.000 0.885 0.010 Y NA
 310911 310912 VV1_2866 VV1_2867     TRUE 0.808 21.000 0.125 NA   NA
 310912 310913 VV1_2867 VV1_2868     TRUE 0.610 21.000 0.069 1.000 N NA
 310913 310914 VV1_2868 VV1_2869     FALSE 0.379 140.000 0.167 1.000   NA
 310915 310916 VV1_2871 VV1_2872 cls   FALSE 0.290 125.000 0.110 1.000 N NA
 310917 310918 VV1_2873 VV1_2874     FALSE 0.059 61.000 0.013 1.000 N NA
 310918 310919 VV1_2874 VV1_2875     TRUE 0.970 -7.000 0.350 1.000 N NA
 310919 310920 VV1_2875 VV1_2876     TRUE 0.999 2.000 0.950 0.011 Y NA
 310920 310921 VV1_2876 VV1_2877     FALSE 0.191 164.000 0.133 NA N NA
 310921 310922 VV1_2877 VV1_2878   pspB TRUE 0.992 -7.000 0.913 NA   NA
 310922 310923 VV1_2878 VV1_2879 pspB   TRUE 0.981 16.000 0.739 NA   NA
 310924 310925 VV1_2880 VV1_2881     FALSE 0.437 177.000 0.402 1.000 N NA
 310925 310926 VV1_2881 VV1_2882     TRUE 0.986 0.000 0.195 0.043 N NA
 310926 310927 VV1_2882 VV1_2883     TRUE 0.942 74.000 0.210 0.043 Y NA
 310927 310928 VV1_2883 VV1_2884     TRUE 0.996 0.000 0.667 1.000 Y NA
 310928 310929 VV1_2884 VV1_2885     TRUE 0.999 -3.000 0.684 0.013 Y NA
 310929 310930 VV1_2885 VV1_2886     FALSE 0.538 53.000 0.105 NA   NA
 310931 310932 VV1_2887 VV1_2888     FALSE 0.116 132.000 0.028 NA   NA
 310936 310937 VV1_2892 VV1_2893     FALSE 0.004 413.000 0.000 NA   NA
 310937 310938 VV1_2893 VV1_2894     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 310938 310939 VV1_2894 VV1_2895     FALSE 0.050 177.000 0.000 NA   NA
 310939 310940 VV1_2895 VV1_2896     TRUE 0.839 100.000 0.000 0.034 Y NA
 310940 310941 VV1_2896 VV1_2897     TRUE 0.681 51.000 0.000 NA Y NA
 310943 310944 VV1_2900 VV1_2901     FALSE 0.008 301.000 0.000 NA   NA
 310947 310948 VV1_2904 VV1_2905     FALSE 0.335 3.000 0.011 1.000 N NA
 310948 310949 VV1_2905 VV1_2906     TRUE 0.745 -3.000 0.026 NA   NA
 310950 310951 VV1_2907 VV1_2908   cysS TRUE 0.570 90.000 0.008 0.082 N NA
 310952 310953 VV1_2909 VV1_2910     FALSE 0.513 136.000 0.237 1.000   NA
 310953 310954 VV1_2910 VV1_2911     FALSE 0.100 108.000 0.008 NA   NA
 310954 310955 VV1_2911 VV1_2912     FALSE 0.322 76.000 0.056 NA   NA
 310956 310957 VV1_2913 VV1_2914     TRUE 0.990 -3.000 0.006 0.002 Y NA
 310957 310958 VV1_2914 VV1_2915     TRUE 0.985 -18.000 0.006 0.002 Y NA
 310958 310959 VV1_2915 VV1_2916     TRUE 0.994 13.000 0.210 0.002 Y NA
 310959 310960 VV1_2916 VV1_2917     TRUE 0.981 27.000 0.128 0.002 Y NA
 310960 310961 VV1_2917 VV1_2918     TRUE 0.976 70.000 0.341 0.002 Y NA
 310961 310962 VV1_2918 VV1_2919     TRUE 0.995 14.000 0.294 0.002 Y NA
 310962 310963 VV1_2919 VV1_2920   hisG TRUE 0.995 6.000 0.171 0.002 Y NA
 310963 310964 VV1_2920 VV1_2922 hisG   FALSE 0.003 361.000 0.000 1.000 N NA
 310966 310967 VV1_2924 VV1_2925     FALSE 0.511 117.000 0.176 NA   NA
 310968 310969 VV1_2926 VV1_2927     TRUE 0.924 11.000 0.180 NA   NA
 310969 310970 VV1_2927 VV1_2928     FALSE 0.208 149.000 0.093 NA   NA
 310971 310972 VV1_2929 VV1_2930     TRUE 0.894 38.000 0.395 NA   NA
 310972 310973 VV1_2930 VV1_2931     TRUE 0.978 5.000 0.387 NA   NA
 310973 310974 VV1_2931 VV1_2932     TRUE 0.986 5.000 0.588 NA   NA
 310974 310975 VV1_2932 VV1_2933     TRUE 0.645 126.000 0.311 NA   NA
 310975 310976 VV1_2933 VV1_2934     TRUE 0.991 3.000 0.722 NA   NA
 310976 310977 VV1_2934 VV1_2935     TRUE 0.977 17.000 0.217 0.018   NA
 310977 310978 VV1_2935 VV1_2936     TRUE 0.986 -3.000 0.533 NA   NA
 310978 310979 VV1_2936 VV1_2938     FALSE 0.017 241.000 0.000 NA   NA
 310981 310982 VV1_2940 VV1_2941 bioD   TRUE 0.991 -3.000 0.028 0.002 Y NA
 310982 310983 VV1_2941 VV1_2942     TRUE 0.995 0.000 0.133 0.002 Y NA
 310983 310984 VV1_2942 VV1_2943     TRUE 0.993 -16.000 0.168 0.002 Y NA
 310985 310986 VV1_2944 VV1_2945     TRUE 0.983 -3.000 0.008 0.000   NA
 310987 310988 VV1_2946 VV1_2947     TRUE 0.687 92.000 0.078 0.082 N NA
 310988 310989 VV1_2947 VV1_2948     TRUE 0.933 7.000 0.167 1.000   NA
 310989 310990 VV1_2948 VV1_2949     TRUE 0.957 -37.000 0.014 0.006   NA
 310990 310991 VV1_2949 VV1_2950     TRUE 0.797 58.000 0.305 1.000   NA
 310991 310992 VV1_2950 VV1_2951     FALSE 0.556 145.000 0.345 1.000 N NA
 310994 310995 VV1_2953 VV1_2954   cysB FALSE 0.482 59.000 0.094 NA   NA
 310996 310997 VV1_2955 VV1_2956     FALSE 0.330 72.000 0.058 NA   NA
 310997 310998 VV1_2956 VV1_2957     FALSE 0.118 132.000 0.000 NA   NA
 310998 310999 VV1_2957 VV1_2958     TRUE 0.756 -3.000 0.000 NA   NA
 310999 311000 VV1_2958 VV1_2959     FALSE 0.244 60.000 0.000 NA   NA
 311003 311004 VV1_2962 VV1_2963     FALSE 0.433 70.000 0.089 NA   NA
 311004 311005 VV1_2963 VV1_2964     FALSE 0.354 200.000 0.372 NA   NA
 311005 311006 VV1_2964 VV1_2965     FALSE 0.356 83.000 0.070 NA   NA
 311006 311007 VV1_2965 VV1_2966     TRUE 0.985 -10.000 0.620 NA   NA
 311007 311008 VV1_2966 VV1_2967     TRUE 0.948 37.000 0.713 NA   NA
 311008 311009 VV1_2967 VV1_2968     TRUE 0.823 73.000 0.436 NA N NA
 311011 311012 VV1_2970 VV1_2971     TRUE 0.869 30.000 0.250 NA   NA
 311012 311013 VV1_2971 VV1_2972     FALSE 0.027 216.000 0.000 NA   NA
 311013 311014 VV1_2972 VV1_2973     TRUE 0.996 3.000 0.400 0.004   NA
 311014 311015 VV1_2973 VV1_2974     TRUE 0.921 19.000 0.100 1.000 Y NA
 311015 311016 VV1_2974 VV1_2975     TRUE 0.922 27.000 0.097 0.043   NA
 311016 311017 VV1_2975 VV1_2976     TRUE 0.997 0.000 0.742 0.043   NA
 311017 311018 VV1_2976 VV1_2977     FALSE 0.003 567.000 0.000 1.000   NA
 311018 311019 VV1_2977 VV1_2978     FALSE 0.460 85.000 0.125 1.000 N NA
 311019 311020 VV1_2978 VV1_2979     TRUE 0.974 16.000 0.576 NA   NA
 311020 311021 VV1_2979 VV1_2980     FALSE 0.458 139.000 0.208 NA   NA
 311021 311022 VV1_2980 VV1_2982     FALSE 0.130 251.000 0.292 1.000 N NA
 311022 311023 VV1_2982 VV1_2983     TRUE 0.643 110.000 0.281 1.000 N NA
 311023 311024 VV1_2983 VV1_2985     FALSE 0.021 193.000 0.000 1.000 N NA
 311025 311026 VV1_2986 VV1_2987     FALSE 0.069 129.000 0.006 NA   NA
 311026 311027 VV1_2987 VV1_2988     TRUE 0.776 51.000 0.250 NA   NA
 311027 311028 VV1_2988 VV1_2989     TRUE 0.985 16.000 0.864 1.000   NA
 311029 311030 VV1_2990 VV1_2991     FALSE 0.217 183.000 0.200 NA N NA
 311033 311034 VV1_2995 VV1_2996     FALSE 0.004 455.000 0.000 1.000   NA
 311035 311036 VV1_2998 VV1_2999     FALSE 0.005 370.000 0.000 NA   NA
 311036 311037 VV1_2999 VV1_3000     FALSE 0.000 444.000 0.004 NA N NA
 311037 311038 VV1_3000 VV1_3001     TRUE 0.572 134.000 0.110 NA Y NA
 311038 311039 VV1_3001 VV1_3002     TRUE 0.686 56.000 0.211 1.000 N NA
 311039 311040 VV1_3002 VV1_3003     TRUE 0.958 -3.000 0.209 NA   NA
 311040 311041 VV1_3003 VV1_3004     FALSE 0.565 -7.000 0.005 NA   NA
 311041 311042 VV1_3004 VV1_3005     TRUE 0.778 39.000 0.204 NA   NA
 311042 10691955 VV1_3005 VV1_3006     FALSE 0.224 67.000 0.000 NA   NA
 10691955 311045 VV1_3006 VV1_3008     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 311045 311046 VV1_3008 VV1_3009   fabG TRUE 0.889 166.000 0.321 0.003 Y NA
 311046 311047 VV1_3009 VV1_3010 fabG   TRUE 0.997 13.000 0.432 0.003 Y NA
 311047 311048 VV1_3010 VV1_3011     TRUE 0.953 75.000 0.182 0.003 Y NA
 311048 311049 VV1_3011 VV1_3012     TRUE 0.997 6.000 0.380 0.003 Y NA
 311049 311050 VV1_3012 VV1_3013     TRUE 0.969 11.000 0.418 1.000 N NA
 311050 311051 VV1_3013 VV1_3014     TRUE 0.937 36.000 0.599 NA   NA
 311054 311055 VV1_3018 VV1_3020     FALSE 0.009 261.000 0.034 1.000 N NA
 311058 311059 VV1_3023 VV1_3024     TRUE 0.641 -61.000 0.000 NA   NA
 311059 311060 VV1_3024 VV1_3025     FALSE 0.114 142.000 0.037 NA   NA
 311060 311061 VV1_3025 VV1_3027     FALSE 0.297 183.000 0.073 0.081 N NA
 311062 311063 VV1_3028 VV1_3029 metG   FALSE 0.007 316.000 0.000 NA   NA
 311064 311065 VV1_3030 VV1_3031     TRUE 0.997 -19.000 0.357 0.002 Y NA
 311065 311066 VV1_3031 VV1_3032     TRUE 0.960 14.000 0.400 1.000 N NA
 311066 311067 VV1_3032 VV1_3033     TRUE 0.999 2.000 0.927 0.001 N NA
 311067 311068 VV1_3033 VV1_3034     TRUE 0.995 2.000 0.244 0.001   NA
 311070 311071 VV1_3036 VV1_3037     FALSE 0.008 302.000 0.000 NA   NA
 311071 311072 VV1_3037 VV1_3038     FALSE 0.007 147.000 0.005 1.000 N NA
 311072 311073 VV1_3038 VV1_3039     TRUE 0.970 -28.000 0.011 0.001   NA
 311074 311075 VV1_3040 VV1_3041     FALSE 0.002 468.000 0.000 1.000 N NA
 311075 311076 VV1_3041 VV1_3042     TRUE 0.920 81.000 0.000 0.001 Y NA
 311076 311077 VV1_3042 VV1_3043     TRUE 0.752 0.000 0.046 1.000 N NA
 311079 311080 VV1_3045 VV1_3046     TRUE 0.733 5.000 0.000 NA   NA
 311080 311081 VV1_3046 VV1_3047     FALSE 0.035 198.000 0.000 NA   NA
 311082 311083 VV1_3048 VV1_3049     TRUE 0.920 79.000 0.444 NA Y NA
 311083 311084 VV1_3049 VV1_3050     TRUE 0.884 16.000 0.018 NA Y NA
 311084 2208484 VV1_3050 VV1_tRNAGly8     FALSE 0.003 592.000 0.000 NA   NA
 2208484 2208485 VV1_tRNAGly8 VV1_tRNALeu10     FALSE 0.428 29.000 0.000 NA   NA
 2208485 2208486 VV1_tRNALeu10 VV1_tRNAGly7     FALSE 0.230 64.000 0.000 NA   NA
 2208486 2208487 VV1_tRNAGly7 VV1_tRNACys1     TRUE 0.718 7.000 0.000 NA   NA
 2208487 311086 VV1_tRNACys1 VV1_3052     FALSE 0.013 267.000 0.000 NA   NA
 311086 311087 VV1_3052 VV1_3053   uvrC TRUE 0.654 80.000 0.227 1.000 N NA
 311087 311088 VV1_3053 VV1_3054 uvrC   TRUE 0.978 2.000 0.086 0.017 N NA
 311090 311091 VV1_3056 VV1_3057     FALSE 0.186 99.000 0.000 1.000   NA
 311092 311093 VV1_3058 VV1_3059     TRUE 0.956 3.000 0.203 NA   NA
 311096 311097 VV1_3062 VV1_3063     TRUE 0.878 31.000 0.281 NA   NA
 311098 311099 VV1_3064 VV1_3065     TRUE 0.999 3.000 0.703 0.000 Y NA
 311099 311100 VV1_3065 VV1_3066     TRUE 0.911 19.000 0.083 1.000 Y NA
 311100 311101 VV1_3066 VV1_3067     TRUE 0.986 6.000 0.293 1.000 Y NA
 311101 311102 VV1_3067 VV1_3068     TRUE 0.968 76.000 0.221 0.001 Y NA
 311102 311103 VV1_3068 VV1_3069   trpA TRUE 0.999 0.000 0.947 0.000 Y NA
 311103 311104 VV1_3069 VV1_3070 trpA   FALSE 0.006 341.000 0.000 1.000   NA
 311104 311105 VV1_3070 VV1_3071     TRUE 0.972 -13.000 0.000 0.002   NA
 311105 311106 VV1_3071 VV1_3072     FALSE 0.247 59.000 0.000 NA   NA
 311106 311107 VV1_3072 VV1_3073     FALSE 0.079 132.000 0.014 NA   NA
 311107 311108 VV1_3073 VV1_3074     FALSE 0.548 81.000 0.167 NA N NA
 311108 311109 VV1_3074 VV1_3075     FALSE 0.437 102.000 0.114 NA   NA
 311109 311110 VV1_3075 VV1_3076     TRUE 0.868 0.000 0.067 NA   NA
 311111 311112 VV1_3077 VV1_3078     FALSE 0.023 187.000 0.000 NA N NA
 311112 311113 VV1_3078 VV1_3079   oppD TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 311113 311114 VV1_3079 VV1_3080 oppD   TRUE 0.978 26.000 0.554 1.000 Y NA
 311114 311115 VV1_3080 VV1_3081   oppB TRUE 0.998 12.000 0.870 0.043 Y NA
 311115 311116 VV1_3081 VV1_3082 oppB   TRUE 0.877 104.000 0.096 0.043 Y NA
 311116 311117 VV1_3082 VV1_3084     FALSE 0.002 557.000 0.000 1.000 N NA
 311117 311118 VV1_3084 VV1_3085     TRUE 0.999 2.000 0.501 0.002 Y NA
 311118 311119 VV1_3085 VV1_3086   moaC TRUE 0.996 -3.000 0.175 0.002 Y NA
 311119 311120 VV1_3086 VV1_3087 moaC   TRUE 0.991 11.000 0.109 0.002 Y NA
 311120 311121 VV1_3087 VV1_3088     TRUE 0.938 81.000 0.108 0.002 Y NA
 311123 311124 VV1_3090 VV1_3091     TRUE 0.990 0.000 0.654 NA   NA
 311124 311125 VV1_3091 VV1_3092     FALSE 0.071 274.000 0.000 0.081 N NA
 2208488 311126 VV1_tRNAAsn1 VV1_3093     FALSE 0.035 199.000 0.000 NA   NA
 311126 311127 VV1_3093 VV1_3094     TRUE 0.998 2.000 0.564 0.034 Y NA
 311127 311128 VV1_3094 VV1_3095     TRUE 0.997 13.000 0.537 0.013 Y NA
 311128 311129 VV1_3095 VV1_3096   rnfD TRUE 0.999 0.000 0.814 0.034 Y NA
 311129 311130 VV1_3096 VV1_3097 rnfD   TRUE 0.987 88.000 0.924 0.034 Y NA
 311130 311131 VV1_3097 VV1_3098     TRUE 0.999 -7.000 0.908 0.034 Y NA
 311131 311132 VV1_3098 VV1_3099     FALSE 0.427 72.000 0.109 1.000 N NA
 311132 311133 VV1_3099 VV1_3100     FALSE 0.066 52.000 0.013 1.000 N NA
 311133 311134 VV1_3100 VV1_3101     FALSE 0.168 130.000 0.047 NA   NA
 311136 311137 VV1_3103 VV1_3104     FALSE 0.412 77.000 0.084 1.000   NA
 311138 311139 VV1_3105 VV1_3106     TRUE 0.859 109.000 0.019 0.004 Y NA
 311140 311141 VV1_3107 VV1_3108     FALSE 0.125 122.000 0.024 NA   NA
 311141 311142 VV1_3108 VV1_3109     FALSE 0.127 221.000 0.175 NA   NA
 311144 311145 VV1_3112 VV1_3113     FALSE 0.154 52.000 0.027 NA N NA
 311146 311147 VV1_3114 VV1_3115     FALSE 0.077 154.000 0.000 NA   NA
 311149 311150 VV1_3118 VV1_3119     FALSE 0.123 130.000 0.000 NA   NA
 311150 311151 VV1_3119 VV1_3120     FALSE 0.156 115.000 0.000 NA   NA
 311152 311153 VV1_3121 VV1_3122     TRUE 0.739 22.000 0.093 NA   NA
 311153 2208489 VV1_3122 VV1_tRNASer5     FALSE 0.206 86.000 0.000 NA   NA
 2208489 311154 VV1_tRNASer5 VV1_3123     FALSE 0.008 303.000 0.000 NA   NA
 311154 311155 VV1_3123 VV1_3124     TRUE 0.998 -3.000 0.524 0.003 Y NA
 311155 311156 VV1_3124 VV1_3125     FALSE 0.082 121.000 0.000 NA N NA
 311156 311157 VV1_3125 VV1_3126     FALSE 0.099 108.000 0.000 NA N NA
 311158 311159 VV1_3127 VV1_3128     TRUE 0.925 39.000 0.000 0.018 Y NA
 311159 311160 VV1_3128 VV1_3129     FALSE 0.009 246.000 0.000 NA N NA
 311160 311161 VV1_3129 VV1_3130     FALSE 0.484 6.000 0.021 NA N NA
 311161 311162 VV1_3130 VV1_3131     FALSE 0.139 86.000 0.033 1.000 N NA
 311162 311163 VV1_3131 VV1_3132     FALSE 0.552 174.000 0.022 0.034 Y NA
 311164 311165 VV1_3133 VV1_3134     TRUE 0.953 -10.000 0.006 0.023   NA
 311165 311166 VV1_3134 VV1_3135   ansA FALSE 0.426 105.000 0.113 1.000   NA
 311170 311171 VV1_3140 VV1_3141     FALSE 0.392 183.000 0.154 1.000 Y NA
 311171 311172 VV1_3141 VV1_3142     FALSE 0.016 210.000 0.000 1.000 N NA
 311173 311174 VV1_3143 VV1_3144     TRUE 0.671 11.000 0.000 NA   NA
 311176 311177 VV1_3146 VV1_3147     TRUE 0.779 125.000 0.529 NA   NA
 311181 311182 VV1_3151 VV1_3152     FALSE 0.007 331.000 0.000 NA   NA
 311186 311187 VV1_3156 VV1_3157     TRUE 0.848 0.000 0.078 NA N NA
 2208490 2208491 VV1_tRNATyr2 VV1_tRNATyr3     FALSE 0.193 94.000 0.000 NA   NA
 2208491 2208492 VV1_tRNATyr3 VV1_tRNATyr4     FALSE 0.193 94.000 0.000 NA   NA
 311189 311190 VV1_3162 VV1_3163     TRUE 0.974 -25.000 0.000 0.001   NA
 311191 311192 VV1_3164 VV1_3165     TRUE 0.662 15.000 0.062 1.000 N NA
 311192 311193 VV1_3165 VV1_3166     FALSE 0.059 174.000 0.034 NA   NA
 311194 311195 VV1_3168 VV1_3169     TRUE 0.995 0.000 0.283 0.001 N NA
 311195 311196 VV1_3169 VV1_3170     TRUE 0.909 140.000 0.171 0.001 Y NA
 311196 311197 VV1_3170 VV1_3171     TRUE 0.899 26.000 0.280 NA   NA
 311197 311198 VV1_3171 VV1_3172     TRUE 0.967 -19.000 0.355 NA   NA
 311198 311199 VV1_3172 VV1_3173     TRUE 0.987 -3.000 0.281 1.000 Y NA
 311200 311201 VV1_3174 VV1_3175     FALSE 0.361 117.000 0.104 1.000   NA
 311201 311202 VV1_3175 VV1_3176     FALSE 0.002 2279.000 0.000 NA   NA
 311202 311203 VV1_3176 VV1_3177     FALSE 0.002 4005.000 0.000 NA   NA
 311204 311205 VV1_3178 VV1_3180     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 311206 311207 VV1_3181 VV1_3182     FALSE 0.481 24.000 0.000 NA   NA
 311210 311211 VV1_3185 VV1_3186     TRUE 0.578 17.000 0.000 NA   NA
 311211 311212 VV1_3186 VV1_3187     TRUE 0.721 -7.000 0.000 NA   NA
 311212 311213 VV1_3187 VV1_3188     FALSE 0.292 46.000 0.000 NA   NA
 311213 311214 VV1_3188 VV1_3189     TRUE 0.739 2.000 0.025 NA   NA
 311216 311217 VV1_3192 VV1_3193     FALSE 0.481 24.000 0.000 NA   NA
 311217 311218 VV1_3193 VV1_3194     FALSE 0.005 377.000 0.000 NA   NA
 311219 311220 VV1_3195 VV1_3196     TRUE 0.992 -10.000 1.000 NA   NA
 311220 311221 VV1_3196 VV1_3197     FALSE 0.241 61.000 0.000 NA   NA
 311222 311223 VV1_3199 VV1_3200     FALSE 0.070 159.000 0.000 NA   NA
 311224 311225 VV1_3201 VV1_3202     TRUE 0.810 47.000 0.000 0.018   NA
 311225 311226 VV1_3202 VV1_3203     TRUE 0.868 85.000 0.000 0.018 Y NA
 311227 308256 VV1_3205 VV1_0001     TRUE 0.952 41.000 0.000 0.001 Y NA