MicrobesOnline Operon Predictions for Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2202265 2202266 RL0001 RL0002     TRUE 0.631 34.000 0.135 NA   NA
 2202266 2202267 RL0002 RL0003     TRUE 0.939 -7.000 0.169 NA N NA
 2202267 2202268 RL0003 RL0004     TRUE 0.940 0.000 0.078 1.000 N NA
 2202268 2202269 RL0004 RL0005     TRUE 0.929 -7.000 0.092 1.000 N NA
 2202270 2202271 RL0006 RL0007 secB   FALSE 0.344 102.000 0.122 NA   NA
 2202272 2202273 RL0008 RL0009   mltA TRUE 0.975 -7.000 0.324 1.000   NA
 2202273 2202274 RL0009 RL0010 mltA   TRUE 0.978 0.000 0.332 NA   NA
 2202274 2202275 RL0010 RL0011     TRUE 0.971 -3.000 0.183 NA   NA
 2202275 2202276 RL0011 RL0012   gyrB FALSE 0.125 136.000 0.008 1.000 N NA
 2202277 2202278 RL0013 RL0014     FALSE 0.404 46.000 0.025 NA   NA
 2202279 2202280 RL0015 RL0016     FALSE 0.285 144.000 0.214 NA N NA
 2202280 2202281 RL0016 RL0017     FALSE 0.025 206.000 0.000 1.000 N NA
 2202281 2202282 RL0017 RL0018     FALSE 0.227 146.000 0.118 NA   NA
 2202282 2202283 RL0018 RL0019     FALSE 0.213 108.000 0.034 NA   NA
 2202283 2202284 RL0019 RL0020     FALSE 0.087 167.000 0.017 NA   NA
 2202284 2202285 RL0020 RL0021   trpB TRUE 0.997 3.000 0.375 0.001 Y NA
 2202285 2202286 RL0021 RL0022 trpB trpA TRUE 0.996 4.000 0.344 0.000 Y NA
 2202286 2202287 RL0022 RL0023 trpA   FALSE 0.338 142.000 0.232 1.000 N NA
 2202287 2202288 RL0023 RL0024   folC TRUE 0.844 28.000 0.383 1.000 N NA
 2202289 2202290 RL0025 RL0026     TRUE 0.544 76.000 0.173 1.000   NA
 2202290 2202291 RL0026 RL0027     TRUE 0.999 -7.000 0.863 0.060 Y NA
 2202291 2202292 RL0027 RL0028     TRUE 0.941 4.000 0.196 1.000 N NA
 2202292 2202293 RL0028 RL0029     TRUE 0.958 14.000 0.642 NA   NA
 2202293 2202294 RL0029 RL0030     TRUE 0.955 -3.000 0.085 NA   NA
 2202294 2202295 RL0030 RL0031     FALSE 0.047 204.000 0.018 1.000 N NA
 2202295 2202296 RL0031 RL0032     FALSE 0.101 157.000 0.012 1.000 N NA
 2202296 2202297 RL0032 RL0033     TRUE 0.994 10.000 0.420 0.002 Y NA
 2202297 2202298 RL0033 RL0034     FALSE 0.266 151.000 0.145 1.000   NA
 2202298 2202299 RL0034 RL0035     TRUE 0.993 -3.000 0.304 0.013   NA
 2202299 2202300 RL0035 RL0036     TRUE 0.824 185.000 0.829 1.000 Y NA
 2202301 2202302 RL0037 RL0038 pckA   FALSE 0.243 107.000 0.025 1.000   NA
 2202302 2202303 RL0038 RL0039     TRUE 0.874 2.000 0.016 NA   NA
 2202304 2202305 RL0040 RL0041 coaA   TRUE 0.957 -3.000 0.086 1.000 N NA
 2202305 2202306 RL0041 RL0042   hisF TRUE 0.970 18.000 0.105 0.003 Y NA
 2202306 2202307 RL0042 RL0043 hisF hisA TRUE 0.998 1.000 0.433 0.003 Y NA
 2202307 2202308 RL0043 RL0044 hisA   TRUE 0.767 7.000 0.007 NA   NA
 2202308 2202309 RL0044 RL0045     TRUE 0.992 -3.000 0.571 NA   NA
 2202309 2202310 RL0045 RL0046   hisH FALSE 0.030 245.000 0.042 NA   NA
 2202310 2202311 RL0046 RL0047 hisH   TRUE 0.977 3.000 0.417 NA   NA
 2202311 2202312 RL0047 RL0048   hisB TRUE 0.568 23.000 0.041 NA   NA
 2202313 2202314 RL0049 RL0050 hslV   TRUE 0.753 -13.000 0.000 1.000 N NA
 2202314 2202315 RL0050 RL0051   hslU TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2202315 2202316 RL0051 RL0052 hslU   FALSE 0.013 293.000 0.021 NA   NA
 2202316 2202317 RL0052 RL0053     TRUE 0.713 49.000 0.286 NA   NA
 2202317 2202318 RL0053 RL0054   glcB FALSE 0.280 87.000 0.030 1.000 N NA
 2202321 2202322 RL0057 RL0058     TRUE 0.947 69.000 0.560 1.000 Y NA
 2202322 2202323 RL0058 RL0059     TRUE 0.581 23.000 0.042 1.000 N NA
 2202323 2202324 RL0059 RL0060     TRUE 0.932 -3.000 0.021 1.000 N NA
 1570635 1570636 RLr01 RLt31 16S rRNA tRNA-Ile FALSE 0.003 369.000 0.000 NA   NA
 1570636 1570637 RLt31 RLt10 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.126 94.000 0.000 NA   NA
 1570637 1570638 RLt10 RLr04 tRNA-Ala 23S rRNA FALSE 0.001 842.000 0.000 NA   NA
 1570638 1570639 RLr04 RLr07 23S rRNA 5S rRNA FALSE 0.017 223.000 0.000 NA   NA
 1570639 1570640 RLr07 RLt41 5S rRNA tRNA-Met FALSE 0.020 213.000 0.000 NA   NA
 2202325 2202326 RL0061 RL0062     TRUE 0.982 -3.000 0.038 0.036   NA
 2202326 2202327 RL0062 RL0063     FALSE 0.007 320.000 0.000 1.000   NA
 2202327 2202328 RL0063 RL0064     FALSE 0.001 904.000 0.000 1.000   NA
 2202328 2202329 RL0064 RL0065     TRUE 0.967 6.000 0.400 1.000   NA
 2202329 2202330 RL0065 RL0066     TRUE 0.851 31.000 0.000 1.000 Y NA
 2202330 2202331 RL0066 RL0067     FALSE 0.004 377.000 0.000 1.000   NA
 2202331 2202332 RL0067 RL0068     FALSE 0.138 113.000 0.000 1.000   NA
 2202332 2202333 RL0068 RL0069     FALSE 0.120 123.000 0.000 1.000   NA
 2202333 2202334 RL0069 RL0070     FALSE 0.012 243.000 0.000 NA   NA
 2202334 2202335 RL0070 RL0071     FALSE 0.354 118.000 0.200 NA   NA
 2202335 2202336 RL0071 RL0072     TRUE 0.995 6.000 1.000 0.005   NA
 2202336 2202337 RL0072 RL0073     TRUE 0.955 26.000 0.933 NA   NA
 2202337 2202338 RL0073 RL0074     TRUE 0.584 142.000 0.533 NA   NA
 2202341 2202342 RL0077 RL0078   exoB TRUE 0.996 2.000 0.238 0.013 Y NA
 2202342 2202343 RL0078 RL0079 exoB acsAB TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 2202343 2202344 RL0079 RL0080 acsAB   TRUE 0.977 -3.000 0.238 NA   NA
 2202344 2202345 RL0080 RL0081     TRUE 0.950 4.000 0.238 NA   NA
 2202347 2202348 RL0083 RL0084     FALSE 0.078 128.000 0.000 NA   NA
 2202348 2202349 RL0084 RL0085     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2202350 2202351 RL0086 RL0087     FALSE 0.335 101.000 0.111 NA   NA
 2202351 2202352 RL0087 RL0088     TRUE 0.547 138.000 0.476 NA   NA
 2202352 2202353 RL0088 RL0089     TRUE 0.940 4.000 0.150 1.000   NA
 2202353 2202354 RL0089 RL0090     TRUE 0.701 132.000 0.667 1.000   NA
 2202355 2202356 RL0091 RL0092     TRUE 0.994 7.000 0.643 NA Y NA
 2202356 2202357 RL0092 RL0093     TRUE 0.997 2.000 0.714 NA Y NA
 2202357 2202358 RL0093 RL0094     TRUE 0.857 24.000 0.385 NA   NA
 2202358 2202359 RL0094 RL0095     TRUE 0.787 32.000 0.273 1.000   NA
 2202359 2202360 RL0095 RL0096     FALSE 0.069 269.000 0.286 1.000 N NA
 2202360 2202361 RL0096 RL0097     TRUE 0.993 1.000 0.786 1.000 N NA
 2202362 2202363 RL0098 RL0099     TRUE 0.992 -3.000 0.066 1.000 Y NA
 2202365 2202366 RL0101 RL0102 gabD gabT FALSE 0.492 168.000 0.556 1.000 N NA
 2202367 2202368 RL0103 RL0104     FALSE 0.036 240.000 0.030 1.000   NA
 2202368 2202369 RL0104 RL0105     FALSE 0.015 232.000 0.000 NA   NA
 2202370 2202371 RL0106 RL0107 rpsA   FALSE 0.257 177.000 0.281 1.000 N NA
 2202371 2202372 RL0107 RL0108   aroA TRUE 0.566 73.000 0.209 1.000 N NA
 2202373 1570690 RL0109 RLt11   tRNA-Ala FALSE 0.061 152.000 0.000 NA   NA
 1570690 2202374 RLt11 RL0110 tRNA-Ala   FALSE 0.084 122.000 0.000 NA   NA
 2202374 2202375 RL0110 RL0111     FALSE 0.304 101.000 0.087 NA   NA
 2202375 2202376 RL0111 RL0112     FALSE 0.352 69.000 0.036 NA   NA
 2202376 2202377 RL0112 RL0113     FALSE 0.059 154.000 0.000 NA   NA
 2202377 2202378 RL0113 RL0114     FALSE 0.140 88.000 0.000 NA   NA
 2202380 2202381 RL0116 RL0117 fabA fabB TRUE 0.918 79.000 0.451 1.000 Y NA
 2202381 2202382 RL0117 RL0118 fabB fabI TRUE 0.985 8.000 0.265 1.000 Y NA
 2202383 2202384 RL0119 RL0120   pnp TRUE 0.775 76.000 0.021 1.000 Y NA
 2202384 2202385 RL0120 RL0121 pnp rpsO FALSE 0.140 349.000 0.335 1.000 Y NA
 2202385 2202386 RL0121 RL0122 rpsO   FALSE 0.120 154.000 0.005 1.000   NA
 2202386 2202387 RL0122 RL0123   truB FALSE 0.494 30.000 0.008 1.000   NA
 2202387 2202388 RL0123 RL0124 truB rbfA TRUE 0.975 14.000 0.318 1.000 Y NA
 2202388 2202389 RL0124 RL0125 rbfA infB TRUE 0.830 151.000 0.530 1.000 Y NA
 2202389 2202390 RL0125 RL0126 infB   FALSE 0.355 102.000 0.171 NA N NA
 2202390 2202391 RL0126 RL0127   nusA TRUE 0.996 -3.000 0.323 NA Y NA
 2202391 2202392 RL0127 RL0128 nusA   TRUE 0.891 60.000 0.759 NA   NA
 2202393 2202394 RL0129 RL0130     TRUE 0.955 -3.000 0.049 1.000   NA
 2202395 2202396 RL0131 RL0131A   recR TRUE 0.899 -3.000 0.014 NA N NA
 2202398 2202399 RL0133 RL0134   dnaX TRUE 0.871 23.000 0.411 NA   NA
 2202400 2202401 RL0135 RL0136     TRUE 0.962 -3.000 0.108 1.000 N NA
 2202401 2202402 RL0136 RL0137     TRUE 0.808 5.000 0.028 NA N NA
 2202402 2202403 RL0137 RL0138     FALSE 0.007 527.000 0.167 NA   NA
 2202404 2202405 RL0139 RL0140   kdsB TRUE 0.824 11.000 0.083 1.000 N NA
 2202411 2202412 RL0146 RL0147     TRUE 0.976 -3.000 0.196 1.000   NA
 2202412 2202413 RL0147 RL0148   recF TRUE 0.931 -3.000 0.019 1.000 N NA
 2202415 2202416 RL0150 RL0151   dnaJ FALSE 0.005 312.000 0.000 NA   NA
 2202416 2202417 RL0151 RL0152 dnaJ dnaK TRUE 0.919 86.000 0.236 0.003 Y NA
 2202417 2202418 RL0152 RL0153 dnaK   FALSE 0.004 337.000 0.000 1.000 N NA
 2202418 2202419 RL0153 RL0154     FALSE 0.021 211.000 0.000 NA   NA
 2202419 2202420 RL0154 RL0155     FALSE 0.001 604.000 0.000 NA   NA
 2202420 2202421 RL0155 RL0156     TRUE 0.680 6.000 0.000 NA   NA
 2202421 2202422 RL0156 RL0157     FALSE 0.047 166.000 0.000 NA   NA
 2202425 2202426 RL0160 RL0161 polA   FALSE 0.042 275.000 0.003 0.060 N NA
 2202427 2202428 RL0162 RL0163   phnN FALSE 0.374 20.000 0.000 NA   NA
 2202428 2202429 RL0163 RL0164 phnN phnM TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2202429 2202430 RL0164 RL0165 phnM   TRUE 0.938 -19.000 0.205 NA   NA
 2202430 2202431 RL0165 RL0166   phoT FALSE 0.225 122.000 0.075 NA   NA
 2202431 2202432 RL0166 RL0167 phoT phoE TRUE 0.998 0.000 0.491 0.000 Y NA
 2202432 2202433 RL0167 RL0168 phoE phoD TRUE 0.974 69.000 0.568 0.001 Y NA
 2202433 2202434 RL0168 RL0169 phoD   FALSE 0.011 259.000 0.000 1.000 N NA
 2202434 2202435 RL0169 RL0170   phoC FALSE 0.026 203.000 0.000 1.000 N NA
 2202435 2202436 RL0170 RL0171 phoC   FALSE 0.388 116.000 0.189 1.000   NA
 2202436 2202437 RL0171 RL0172     TRUE 0.966 -3.000 0.104 1.000   NA
 2202437 2202438 RL0172 RL0173   phnK TRUE 0.992 27.000 0.859 0.043 Y NA
 2202438 2202439 RL0173 RL0174 phnK phnJ TRUE 0.999 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 2202439 2202440 RL0174 RL0175 phnJ phnI TRUE 0.999 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 2202440 2202441 RL0175 RL0176 phnI phnH TRUE 0.999 5.000 0.960 0.001 Y NA
 2202441 2202442 RL0176 RL0177 phnH phnG TRUE 0.999 0.000 0.967 0.001 Y NA
 2202444 2202445 RL0179 RL0180 gpmA dapB TRUE 0.584 22.000 0.038 1.000 N NA
 2202445 2202446 RL0180 RL0181 dapB   TRUE 0.616 16.000 0.017 1.000 N NA
 2202446 2202447 RL0181 RL0182   glk FALSE 0.139 148.000 0.027 1.000 N NA
 2202447 2202448 RL0182 RL0183 glk   TRUE 0.924 18.000 0.035 1.000 Y NA
 2202448 2202449 RL0183 RL0184     FALSE 0.293 86.000 0.035 1.000 N NA
 2202450 2202451 RL0185 RL0186     FALSE 0.270 151.000 0.197 NA   NA
 2202451 2202452 RL0186 RL0187     TRUE 0.995 0.000 0.882 NA   NA
 2202452 2202453 RL0187 RL0188     TRUE 0.995 -3.000 0.744 NA   NA
 2202453 2202454 RL0188 RL0189     TRUE 0.910 9.000 0.179 1.000   NA
 2202454 2202455 RL0189 RL0190     FALSE 0.489 89.000 0.211 NA   NA
 2202455 2202456 RL0190 RL0191     FALSE 0.058 188.000 0.014 NA   NA
 2202457 2202458 RL0192 RL0193     FALSE 0.240 46.000 0.000 NA   NA
 2202460 2202461 RL0195 RL0196     FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 2202461 2202462 RL0196 RL0197     TRUE 0.824 77.000 0.586 1.000   NA
 2202462 2202463 RL0197 RL0198     TRUE 0.904 8.000 0.184 NA   NA
 2202463 2202464 RL0198 RL0199     TRUE 0.976 11.000 0.720 NA   NA
 2202464 2202465 RL0199 RL0200   cdd TRUE 0.913 2.000 0.060 NA   NA
 2202465 2202466 RL0200 RL0201 cdd punA TRUE 0.995 -3.000 0.242 1.000 Y NA
 2202466 2202467 RL0201 RL0202 punA deoC TRUE 0.684 116.000 0.083 1.000 Y NA
 2202467 2202468 RL0202 RL0203 deoC deoA TRUE 0.996 2.000 0.286 0.031 Y NA
 2202469 2202470 RL0204 RL0205   upp FALSE 0.115 162.000 0.014 1.000   NA
 2202470 2202471 RL0205 RL0206 upp   TRUE 0.560 147.000 0.030 1.000 Y NA
 2202471 2202472 RL0206 RL0207   deoB TRUE 0.957 -3.000 0.086 1.000 N NA
 2202472 2202473 RL0207 RL0208 deoB   FALSE 0.112 160.000 0.055 NA N NA
 2202473 2202474 RL0208 RL0209     TRUE 0.998 0.000 0.857 NA Y NA
 2202474 2202475 RL0209 RL0210   pilQ TRUE 0.539 116.000 0.381 NA   NA
 2202476 2202477 RL0211 RL0212 pilA cpaA TRUE 0.831 125.000 0.467 NA Y NA
 2202477 2202478 RL0212 RL0213 cpaA cpaB TRUE 0.899 111.000 0.611 NA Y NA
 2202478 2202479 RL0213 RL0214 cpaB rcpA TRUE 0.984 6.000 0.222 NA Y NA
 2202479 2202480 RL0214 RL0215 rcpA cpaD TRUE 0.965 -3.000 0.167 NA N NA
 2202480 2202481 RL0215 RL0216 cpaD cpaE TRUE 0.921 15.000 0.467 NA N NA
 2202481 2202482 RL0216 RL0217 cpaE cpaF TRUE 0.979 34.000 0.765 1.000 Y NA
 2202482 2202483 RL0217 RL0218 cpaF   TRUE 0.997 6.000 0.882 1.000 Y NA
 2202483 2202484 RL0218 RL0219   tadC TRUE 0.996 16.000 0.941 0.008 Y NA
 2202484 2202485 RL0219 RL0220 tadC   FALSE 0.086 203.000 0.103 1.000 N NA
 2202487 2202488 RL0222 RL0223     FALSE 0.289 179.000 0.130 0.072 N NA
 2202488 2202489 RL0223 RL0224     TRUE 0.829 12.000 0.150 NA N NA
 2202490 2202491 RL0225 RL0226     FALSE 0.467 37.000 0.061 NA N NA
 2202491 2202492 RL0226 RL0227     TRUE 0.997 4.000 0.829 NA Y NA
 2202492 2202493 RL0227 RL0228     TRUE 0.568 112.000 0.000 NA Y NA
 2202493 2202494 RL0228 RL0229     FALSE 0.269 151.000 0.222 NA N NA
 2202494 2202495 RL0229 RL0230     FALSE 0.269 57.000 0.013 NA N NA
 2202495 2202496 RL0230 RL0231     FALSE 0.030 233.000 0.027 NA   NA
 2202496 2202497 RL0231 RL0232     FALSE 0.002 441.000 0.000 NA   NA
 2202497 2202498 RL0232 RL0233   purU FALSE 0.103 114.000 0.000 1.000 N NA
 2202498 2202499 RL0233 RL0234 purU exoZ FALSE 0.020 217.000 0.000 1.000 N NA
 2202499 2202500 RL0234 RL0235 exoZ   FALSE 0.261 160.000 0.227 NA   NA
 2202500 2202501 RL0235 RL0236     TRUE 0.624 105.000 0.438 NA   NA
 2202502 2202503 RL0237 RL0238     FALSE 0.424 159.000 0.417 NA   NA
 2202504 2202505 RL0239 RL0240     TRUE 0.615 33.000 0.107 1.000 N NA
 2202506 2202507 RL0241 pRL0241A   wbbJ FALSE 0.211 83.000 0.000 1.000   NA
 2202508 2202509 RL0242 RL0243     TRUE 0.990 -3.000 0.033 NA Y NA
 2202509 2202510 RL0243 RL0244     TRUE 0.860 36.000 0.457 1.000   NA
 2202510 2202511 RL0244 RL0245     TRUE 0.969 -3.000 0.119 1.000   NA
 2202511 2202512 RL0245 RL0246   ddhA TRUE 0.996 -18.000 0.624 1.000 Y NA
 2202512 2202513 RL0246 RL0247 ddhA   FALSE 0.143 86.000 0.000 NA   NA
 2202513 2202514 RL0247 RL0248     FALSE 0.156 80.000 0.000 NA   NA
 2202514 1570833 RL0248 RLt38   tRNA-Leu FALSE 0.013 240.000 0.000 NA   NA
 2202517 2202518 RL0251 RL0252   nodL TRUE 0.864 12.000 0.138 1.000   NA
 2202518 2202519 RL0252 RL0253 nodL gfa TRUE 0.974 0.000 0.241 1.000   NA
 2202520 2202521 RL0254 RL0255 lepA   FALSE 0.253 77.000 0.005 1.000 N NA
 2202522 2202523 RL0256 RL0257     TRUE 0.770 25.000 0.205 1.000   NA
 2202525 2202526 RL0259 RL0260     TRUE 0.720 10.000 0.007 NA   NA
 2202526 2202527 RL0260 RL0261     FALSE 0.260 73.000 0.006 NA   NA
 2202530 2202531 RL0264 RL0265     FALSE 0.083 166.000 0.014 NA   NA
 2202532 2202533 RL0266 RL0267 infC rpmI FALSE 0.329 312.000 0.652 1.000 Y NA
 2202533 2202534 RL0267 RL0268 rpmI rplT TRUE 0.990 39.000 0.928 0.009 Y NA
 2202534 2202535 RL0268 RL0269 rplT pheS TRUE 0.666 151.000 0.202 1.000 Y NA
 2202535 2202536 RL0269 RL0270 pheS pheT TRUE 0.992 17.000 0.574 0.000 Y NA
 2202537 2202538 RL0271 RL0272     FALSE 0.392 108.000 0.154 1.000   NA
 2202542 2202543 RL0276 RL0277     TRUE 0.758 15.000 0.065 1.000   NA
 2202545 2202546 RL0279 RL0280     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2202547 2202548 RL0281 RL0282   xseA FALSE 0.001 689.000 0.000 NA   NA
 2202548 2202549 RL0282 RL0283 xseA   TRUE 0.878 3.000 0.007 1.000   NA
 2202552 2202553 RL0286 RL0287     FALSE 0.274 127.000 0.127 1.000 N NA
 2202555 2202556 RL0289 RL0290     FALSE 0.440 33.000 0.018 NA   NA
 2202556 2202557 RL0290 RL0291     FALSE 0.181 122.000 0.014 1.000   NA
 2202557 2202558 RL0291 RL0292     FALSE 0.215 102.000 0.005 1.000   NA
 2202560 2202561 RL0294 RL0295     FALSE 0.068 145.000 0.000 NA   NA
 2202563 2202564 RL0297 RL0298     FALSE 0.032 188.000 0.000 NA   NA
 2202569 2202570 RL0303 RL0304     FALSE 0.325 29.000 0.000 1.000 N NA
 2202570 2202571 RL0304 RL0305     FALSE 0.027 201.000 0.000 1.000 N NA
 2202575 2202576 RL0309 RL0310     TRUE 0.545 12.000 0.000 NA   NA
 2202576 2202577 RL0310 RL0311     FALSE 0.084 122.000 0.000 NA   NA
 2202577 2202578 RL0311 RL0312     FALSE 0.101 110.000 0.000 NA   NA
 2202578 2202579 RL0312 RL0313     TRUE 0.717 26.000 0.000 0.062   NA
 2202579 2202580 RL0313 RL0314     FALSE 0.229 56.000 0.000 1.000 N NA
 2202581 2202582 RL0315 RL0316 guaA   TRUE 0.707 93.000 0.012 1.000 Y NA
 2202582 2202583 RL0316 RL0317     TRUE 0.931 -3.000 0.048 NA N NA
 2202585 2202586 RL0319 RL0320     TRUE 0.983 5.000 0.620 NA   NA
 2202586 2202587 RL0320 RL0321     TRUE 0.995 -3.000 0.713 NA   NA
 2202587 2202588 RL0321 RL0322     TRUE 0.793 48.000 0.436 NA N NA
 2202588 2202589 RL0322 RL0323     FALSE 0.012 290.000 0.029 NA N NA
 2202589 2202590 RL0323 RL0324     FALSE 0.129 145.000 0.020 NA   NA
 2202590 2202591 RL0324 RL0325     FALSE 0.002 410.000 0.000 NA   NA
 2202591 2202592 RL0325 RL0326     TRUE 0.931 0.000 0.055 1.000 N NA
 2202592 2202593 RL0326 RL0327     TRUE 0.868 13.000 0.213 1.000 N NA
 2202595 2202596 RL0329 RL0330     FALSE 0.191 113.000 0.028 NA   NA
 2202596 2202597 RL0330 RL0331   pyrF FALSE 0.522 30.000 0.044 NA   NA
 2202597 2202598 RL0331 RL0332 pyrF   TRUE 0.749 7.000 0.018 NA N NA
 2202598 2202599 RL0332 RL0333   pmtA TRUE 0.960 2.000 0.256 NA N NA
 2202599 2202600 RL0333 RL0334 pmtA dnaN FALSE 0.035 211.000 0.002 1.000 N NA
 2202601 2202602 RL0335 RL0336     TRUE 0.946 -10.000 0.165 1.000   NA
 2202602 2202603 RL0336 RL0337     FALSE 0.124 128.000 0.006 NA   NA
 2202603 2202604 RL0337 RL0338     FALSE 0.211 95.000 0.015 NA   NA
 2202604 2202605 RL0338 RL0339     FALSE 0.101 175.000 0.041 1.000 N NA
 2202606 2202607 RL0340 RL0341 cysK   TRUE 0.643 146.000 0.132 1.000 Y NA
 2202611 2202612 RL0345 RL0346   dut TRUE 0.875 0.000 0.000 1.000   NA
 2202618 2202619 RL0351 RL0352     FALSE 0.516 67.000 0.104 1.000   NA
 2202619 2202620 RL0352 RL0353     FALSE 0.290 101.000 0.104 NA N NA
 2202620 2202621 RL0353 RL0354     FALSE 0.454 99.000 0.250 NA N NA
 2202621 2202622 RL0354 RL0355     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 2202624 2202625 RL0357 RL0358 coaBC fabG FALSE 0.044 176.000 0.000 1.000 N NA
 2202625 2202626 RL0358 RL0359 fabG   TRUE 0.694 136.000 0.000 0.008 Y NA
 2202629 2202630 RL0362 RL0363     TRUE 0.936 -3.000 0.028 1.000 N NA
 2202631 2202632 RL0364 RL0365 hutU   TRUE 0.578 19.000 0.027 NA   NA
 2202632 2202633 RL0365 RL0366     TRUE 0.887 4.000 0.055 NA   NA
 2202633 2202634 RL0366 RL0367   amaB TRUE 0.939 -19.000 0.209 NA   NA
 2202634 2202635 RL0367 RL0368 amaB pucH TRUE 0.973 -3.000 0.191 1.000 N NA
 2202635 2202636 RL0368 RL0369 pucH hutH TRUE 0.625 24.000 0.074 1.000 N NA
 2202636 2202637 RL0369 RL0370 hutH ubiB FALSE 0.064 193.000 0.010 1.000   NA
 2202637 2202638 RL0370 RL0371 ubiB ubiE TRUE 0.542 63.000 0.115 1.000   NA
 2202639 2202640 RL0372 RL0373 mutM   FALSE 0.370 40.000 0.004 1.000 N NA
 2202640 2202641 RL0373 RL0374   rpsT FALSE 0.047 193.000 0.003 1.000 N NA
 2202641 2202642 RL0374 RL0375 rpsT dnaA FALSE 0.001 960.000 0.000 1.000 N NA
 2202642 2202643 RL0375 RL0376 dnaA   FALSE 0.119 138.000 0.005 1.000 N NA
 2202644 2202645 RL0377 RL0378 hemN   TRUE 0.906 10.000 0.218 1.000 N NA
 2202645 2202646 RL0378 RL0379     TRUE 0.847 1.000 0.013 NA N NA
 2202646 2202647 RL0379 RL0380   rph TRUE 0.908 -3.000 0.019 NA N NA
 2202648 2202649 RL0381 RL0382 hrcA   FALSE 0.281 111.000 0.120 NA N NA
 2202651 2202652 RL0384 RL0385 hspH   TRUE 0.933 48.000 0.955 NA   NA
 2202655 2202656 RL0388 RL0389   metK TRUE 0.888 9.000 0.112 1.000   NA
 2202656 2202657 RL0389 RL0390 metK   FALSE 0.141 179.000 0.113 1.000 N NA
 2202657 2202658 RL0390 RL0391     FALSE 0.303 153.000 0.231 1.000 N NA
 2202658 2202659 RL0391 RL0392     TRUE 0.632 54.000 0.213 NA   NA
 2202659 2202660 RL0392 RL0393     TRUE 0.975 -3.000 0.222 NA   NA
 2202660 2202661 RL0393 RL0394   phoH TRUE 0.986 0.000 0.457 NA   NA
 2202661 2202662 RL0394 RL0395 phoH miaB TRUE 0.800 19.000 0.220 1.000 N NA
 2202662 2202663 RL0395 RL0396 miaB   FALSE 0.005 404.000 0.030 1.000 N NA
 2202663 2202664 RL0396 RL0397   fur TRUE 0.570 28.000 0.091 NA N NA
 2202664 2202665 RL0397 RL0398 fur   FALSE 0.342 83.000 0.061 NA   NA
 2202665 2202666 RL0398 RL0399     TRUE 0.978 -3.000 0.209 1.000   NA
 2202666 2202667 RL0399 RL0400     TRUE 0.762 89.000 0.061 1.000 Y NA
 2202667 2202668 RL0400 RL0401     FALSE 0.090 220.000 0.151 1.000   NA
 2202668 2202669 RL0401 RL0402   trpS FALSE 0.206 131.000 0.042 1.000   NA
 2202669 2202670 RL0402 RL0403 trpS   FALSE 0.144 131.000 0.016 1.000 N NA
 2202670 2202671 RL0403 RL0404   mviN FALSE 0.003 595.000 0.008 1.000   NA
 2202671 2202672 RL0404 RL0405 mviN glnD FALSE 0.533 53.000 0.081 1.000   NA
 2202672 2202673 RL0405 RL0406 glnD mutS FALSE 0.004 443.000 0.021 1.000 N NA
 2202675 2202676 RL0408 RL0409     FALSE 0.328 109.000 0.130 NA   NA
 2202676 2202677 RL0409 RL0410   lspA FALSE 0.339 86.000 0.062 1.000 N NA
 2202677 2202678 RL0410 RL0411 lspA   TRUE 0.961 -3.000 0.104 1.000 N NA
 2202678 2202679 RL0411 RL0412     TRUE 0.671 42.000 0.213 NA   NA
 2202679 2202680 RL0412 RL0413     FALSE 0.064 187.000 0.021 NA   NA
 2202681 2202682 RL0414 RL0415     TRUE 0.766 38.000 0.312 NA   NA
 2202683 2202684 RL0416 RL0417   ihfB FALSE 0.178 153.000 0.085 NA   NA
 2202684 2202685 RL0417 RL0418 ihfB   TRUE 0.666 30.000 0.142 1.000 N NA
 2202686 2202687 RL0419 RL0420     TRUE 0.781 16.000 0.144 NA   NA
 2202687 2202688 RL0420 RL0421     TRUE 0.932 17.000 0.543 NA   NA
 2202688 2202689 RL0421 RL0422   rpoN FALSE 0.092 174.000 0.009 1.000   NA
 2202689 2202690 RL0422 RL0423 rpoN   FALSE 0.483 89.000 0.235 NA N NA
 2202690 2202691 RL0423 RL0424     FALSE 0.004 293.000 0.000 NA N NA
 2202691 2202692 RL0424 RL0425   ptsN TRUE 0.677 71.000 0.353 NA N NA
 2202693 2202694 RL0426 RL0427   rbsK FALSE 0.008 280.000 0.000 1.000 N NA
 2202694 2202695 RL0427 RL0428 rbsK   FALSE 0.056 195.000 0.024 NA   NA
 2202696 2202697 RL0429 RL0430   def FALSE 0.518 97.000 0.032 0.010 N NA
 2202697 2202698 RL0430 RL0431 def   FALSE 0.447 66.000 0.053 1.000   NA
 2202698 2202699 RL0431 RL0432     TRUE 0.993 -3.000 0.625 NA   NA
 2202699 2202700 RL0432 RL0433   fmt TRUE 0.913 -3.000 0.006 NA   NA
 2202700 2202701 RL0433 RL0434 fmt truA TRUE 0.990 0.000 0.069 1.000 Y NA
 2202702 2202703 RL0435 RL0436   dapE TRUE 0.882 -13.000 0.050 NA   NA
 2202703 2202704 RL0436 RL0437 dapE dapD TRUE 0.868 102.000 0.109 0.001 Y NA
 2202706 2202707 RL0439 RL0440     FALSE 0.213 105.000 0.007 1.000   NA
 2202708 2202709 RL0441 RL0442   ada FALSE 0.437 56.000 0.053 1.000 N NA
 2202709 2202710 RL0442 RL0443 ada   TRUE 0.969 -3.000 0.160 1.000 N NA
 2202711 2202712 RL0444 RL0445 lldD argB FALSE 0.202 68.000 0.000 1.000 N NA
 2202713 2202714 RL0446 RL0447     FALSE 0.439 125.000 0.304 NA   NA
 2202715 2202716 RL0448 RL0449     FALSE 0.075 134.000 0.000 NA   NA
 2202716 2202717 RL0449 RL0450     TRUE 0.848 88.000 0.800 NA   NA
 2202717 2202718 RL0450 RL0451   cspA TRUE 0.700 134.000 0.714 NA   NA
 2202718 2202719 RL0451 RL0452 cspA engB FALSE 0.013 268.000 0.000 1.000   NA
 2202719 2202720 RL0452 RL0453 engB oxaA FALSE 0.379 153.000 0.082 0.060   NA
 2202720 2202721 RL0453 RL0454 oxaA   TRUE 0.962 -3.000 0.105 1.000 N NA
 2202722 2202723 RL0455 RL0456     FALSE 0.384 225.000 0.047 0.009 Y NA
 1571044 2202725 RLt14 RL0456B tRNA-Arg   FALSE 0.002 466.000 0.000 NA   NA
 2202725 2202726 RL0456B RL0457     TRUE 0.982 18.000 0.615 NA Y NA
 2202726 2202727 RL0457 RL0458     FALSE 0.144 91.000 0.000 1.000 N NA
 2202727 2202728 RL0458 RL0459     FALSE 0.028 679.000 0.000 0.015 Y NA
 2202728 2202729 RL0459 RL0460     TRUE 0.954 29.000 1.000 NA   NA
 2202731 2202732 RL0462 RL0463     TRUE 0.583 131.000 0.500 NA   NA
 2202733 2202734 RL0464 RL0465     FALSE 0.018 217.000 0.000 NA   NA
 2202734 2202735 RL0465 RL0466     FALSE 0.180 71.000 0.000 NA   NA
 2202735 2202736 RL0466 RL0467     FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 2202737 2202738 RL0468 RL0469     FALSE 0.438 192.000 0.667 NA   NA
 2202738 2202739 RL0469 RL0470     FALSE 0.524 152.000 0.500 NA   NA
 2202739 2202740 RL0470 RL0471     FALSE 0.013 240.000 0.000 NA   NA
 2202740 2202741 RL0471 RL0472     TRUE 0.814 20.000 0.250 1.000 N NA
 2202741 2202742 RL0472 RL0473     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2202742 2202743 RL0473 RL0474     FALSE 0.330 25.000 0.000 NA   NA
 2202745 2202746 RL0476 RL0477   dadA FALSE 0.337 164.000 0.333 NA   NA
 2202746 2202747 RL0477 RL0478 dadA nodG TRUE 0.790 10.000 0.034 1.000 N NA
 2202747 2202748 RL0478 RL0479 nodG prdF TRUE 0.658 16.000 0.034 1.000 N NA
 2202752 2202753 RL0482A RL0484     TRUE 0.890 46.000 0.000 0.061 Y NA
 2202754 2202755 RL0485 RL0486     FALSE 0.003 374.000 0.000 NA   NA
 2202755 2202756 RL0486 RL0487   fucU FALSE 0.014 235.000 0.000 NA   NA
 2202756 2202757 RL0487 RL0488 fucU   TRUE 0.987 -16.000 0.188 1.000 Y NA
 2202758 2202759 RL0489 RL0490     TRUE 0.974 33.000 0.676 NA Y NA
 2202759 2202760 RL0490 RL0491     TRUE 0.991 3.000 0.797 NA   NA
 2202760 2202761 RL0491 RL0492     TRUE 0.969 -3.000 0.121 1.000   NA
 2202761 2202762 RL0492 RL0493   pyrC FALSE 0.279 73.000 0.009 1.000 N NA
 2202762 2202763 RL0493 RL0494 pyrC   FALSE 0.195 100.000 0.011 1.000 N NA
 2202763 2202764 RL0494 RL0495     FALSE 0.006 386.000 0.028 NA   NA
 2202764 2202765 RL0495 RL0496     FALSE 0.330 25.000 0.000 NA   NA
 2202766 2202767 RL0497 RL0498     FALSE 0.001 576.000 0.000 NA   NA
 2202767 2202768 RL0498 RL0499     TRUE 0.962 3.000 0.279 NA   NA
 2202769 2202770 RL0500 RL0501     FALSE 0.291 72.000 0.012 1.000 N NA
 2202770 2202771 RL0501 RL0502   frk FALSE 0.388 63.000 0.039 1.000 N NA
 2202772 2202773 RL0503 RL0504 otsA pgi FALSE 0.017 551.000 0.000 1.000 Y NA
 2202773 2202774 RL0504 RL0505 pgi fadD FALSE 0.227 95.000 0.018 1.000 N NA
 2202776 2202777 RL0507 RL0508 manB   FALSE 0.359 62.000 0.025 1.000 N NA
 2202777 2202778 RL0508 RL0509     TRUE 0.831 48.000 0.031 NA Y NA
 2202778 2202779 RL0509 RL0510     TRUE 0.998 -3.000 0.542 NA Y NA
 2202779 2202780 RL0510 RL0511     TRUE 0.998 -3.000 0.489 1.000 Y NA
 2202780 2202781 RL0511 RL0512     TRUE 0.739 92.000 0.521 1.000 N NA
 2202782 2202783 RL0513 RL0514   cutC TRUE 0.913 -3.000 0.024 NA N NA
 2202784 2202785 RL0515 RL0516     FALSE 0.441 64.000 0.080 NA   NA
 2202785 2202786 RL0516 RL0517     TRUE 0.713 28.000 0.195 NA   NA
 2202786 2202787 RL0517 RL0518     TRUE 0.736 109.000 0.171 NA Y NA
 2202787 2202788 RL0518 RL0519   fucU2 FALSE 0.214 209.000 0.000 NA Y NA
 2202788 2202789 RL0519 RL0520 fucU2   TRUE 0.892 10.000 0.182 1.000 N NA
 2202789 2202790 RL0520 RL0521     FALSE 0.195 151.000 0.091 1.000 N NA
 2202795 2202796 RL0526 RL0527     FALSE 0.207 58.000 0.000 NA   NA
 2202796 2202797 RL0527 RL0528     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 2202798 2202799 RL0529 RL0530     FALSE 0.010 260.000 0.000 NA   NA
 2202799 2202800 RL0530 RL0531     FALSE 0.087 119.000 0.000 NA   NA
 2202800 2202801 RL0531 RL0532   fixI FALSE 0.108 104.000 0.000 NA   NA
 2202801 2202802 RL0532 RL0533 fixI   TRUE 0.652 14.000 0.020 NA   NA
 2202802 2202803 RL0533 RL0534   fixP FALSE 0.093 192.000 0.087 NA   NA
 2202803 2202804 RL0534 RL0533A fixP fixQ TRUE 0.988 -9.000 0.357 0.004 N NA
 2202804 2202805 RL0533A RL0535 fixQ fixO TRUE 0.945 19.000 0.393 0.004 N NA
 2202805 2202806 RL0535 RL0536 fixO fixN TRUE 0.983 4.000 0.297 0.004 N NA
 2202806 1571127 RL0536 RLt56 fixN tRNA-Thr FALSE 0.005 312.000 0.000 NA   NA
 1571127 2202807 RLt56 RL0537 tRNA-Thr   FALSE 0.100 111.000 0.000 NA   NA
 2202810 2202811 RL0540 RL0541     FALSE 0.193 89.000 0.000 1.000   NA
 2202811 2202812 RL0541 RL0542     FALSE 0.002 472.000 0.000 NA   NA
 2202812 2202813 RL0542 RL0543     FALSE 0.509 166.000 0.107 NA Y NA
 2202813 2202814 RL0543 RL0544     TRUE 0.999 -3.000 0.485 0.002 Y NA
 2202814 2202815 RL0544 RL0545     TRUE 0.988 16.000 0.402 0.002 Y NA
 2202815 2202816 RL0545 RL0546   phoU TRUE 0.897 45.000 0.203 NA Y NA
 2202816 2202817 RL0546 RL0547 phoU phoB FALSE 0.228 134.000 0.128 NA N NA
 2202819 2202820 RL0549 RL0550   argF TRUE 0.868 43.000 0.058 1.000 Y NA
 2202820 2202821 RL0550 RL0551 argF   FALSE 0.300 92.000 0.052 1.000 N NA
 2202821 2202822 RL0551 RL0552     FALSE 0.067 174.000 0.005 NA   NA
 2202823 2202824 RL0553 RL0554 apaG metZ FALSE 0.047 215.000 0.066 NA N NA
 2202825 1571147 RL0555 RLt27   tRNA-Gly FALSE 0.205 59.000 0.000 NA   NA
 2202826 2202827 RL0556 RL0558     FALSE 0.001 977.000 0.000 NA   NA
 2202827 2202828 RL0558 RL0559     TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 2202828 2202829 RL0559 RL0560     TRUE 0.998 0.000 0.333 0.004 Y NA
 2202835 2202836 RL0566 RL0567     FALSE 0.359 103.000 0.143 NA   NA
 2202836 2202837 RL0567 RL0568     TRUE 0.864 12.000 0.185 NA   NA
 2202837 2202838 RL0568 RL0569     TRUE 0.645 122.000 0.092 NA Y NA
 2202838 2202839 RL0569 RL0570     TRUE 0.625 92.000 0.367 NA   NA
 2202840 2202841 RL0571 RL0572     TRUE 0.961 -3.000 0.108 NA   NA
 2202842 2202843 RL0573 RL0574 dinF   FALSE 0.274 86.000 0.030 NA   NA
 2202843 2202844 RL0574 RL0575     TRUE 0.967 2.000 0.275 NA   NA
 2202845 2202846 RL0576 RL0577     FALSE 0.152 182.000 0.162 NA   NA
 2202847 2202848 RL0578 RL0579     FALSE 0.178 72.000 0.000 NA   NA
 2202848 2202849 RL0579 RL0580     TRUE 0.800 23.000 0.262 NA   NA
 2202850 2202851 RL0581 RL0582     FALSE 0.111 152.000 0.016 NA   NA
 2202851 2202852 RL0582 RL0583     TRUE 0.903 22.000 0.460 1.000   NA
 2202853 2202854 RL0584 RL0585     FALSE 0.136 144.000 0.025 NA   NA
 2202854 2202855 RL0585 RL0586     FALSE 0.099 202.000 0.138 NA   NA
 2202855 2202856 RL0586 RL0587     TRUE 0.981 -3.000 0.274 NA   NA
 2202856 2202857 RL0587 RL0588     FALSE 0.013 313.000 0.019 1.000   NA
 2202857 2202858 RL0588 RL0589     FALSE 0.006 328.000 0.000 1.000   NA
 2202858 2202859 RL0589 RL0590     FALSE 0.079 216.000 0.100 1.000   NA
 2202860 2202861 RL0591 RL0592     TRUE 0.717 142.000 0.247 1.000 Y NA
 2202861 2202862 RL0592 RL0593     TRUE 0.839 3.000 0.023 NA N NA
 2202862 2202863 RL0593 RL0594     TRUE 0.540 17.000 0.023 NA N NA
 2202863 2202864 RL0594 RL0595   cspA FALSE 0.010 265.000 0.000 1.000 N NA
 2202866 2202867 RL0597 RL0598     FALSE 0.356 94.000 0.106 NA   NA
 2202871 2202872 RL0602 RL0603     FALSE 0.146 123.000 0.012 1.000 N NA
 2202872 2202873 RL0603 RL0604   exoB FALSE 0.013 339.000 0.080 1.000 N NA
 2202873 2202874 RL0604 RL0605 exoB   FALSE 0.485 107.000 0.273 1.000 N NA
 2202874 2202875 RL0605 RL0606     FALSE 0.316 84.000 0.043 1.000 N NA
 2202876 2202877 RL0607 RL0608 uvrD   FALSE 0.216 108.000 0.036 NA   NA
 2202878 2202879 RL0609 RL0610     FALSE 0.053 159.000 0.000 NA   NA
 2202880 1571203 RL0610A RLt57   tRNA-Thr FALSE 0.001 583.000 0.000 NA   NA
 2202881 2202882 RL0611 RL0612 murA   FALSE 0.208 157.000 0.138 NA   NA
 2202882 2202883 RL0612 RL0613   hisD FALSE 0.494 56.000 0.096 NA   NA
 2202883 2202884 RL0613 RL0614 hisD   TRUE 0.920 5.000 0.157 NA   NA
 2202884 2202885 RL0614 RL0615     TRUE 0.995 -3.000 0.768 NA   NA
 2202885 2202886 RL0615 RL0616   infA FALSE 0.436 124.000 0.293 1.000 N NA
 2202886 2202887 RL0616 RL0617 infA   TRUE 0.572 59.000 0.207 NA N NA
 2202887 2202888 RL0617 RL0618     FALSE 0.238 130.000 0.102 NA   NA
 2202888 1571212 RL0618 RLt46   tRNA-Phe FALSE 0.037 180.000 0.000 NA   NA
 1571212 2202889 RLt46 RL0619 tRNA-Phe   FALSE 0.065 149.000 0.000 NA   NA
 2202889 2202890 RL0619 RL0620     TRUE 0.866 10.000 0.125 NA   NA
 2202891 2202892 RL0621 RL0622     TRUE 0.958 5.000 0.286 1.000   NA
 2202892 2202893 RL0622 RL0623     TRUE 0.986 15.000 0.833 0.005   NA
 2202893 2202894 RL0623 RL0624     FALSE 0.133 91.000 0.000 NA   NA
 2202895 2202896 RL0625 RL0626     FALSE 0.003 393.000 0.000 NA   NA
 2202896 2202897 RL0626 RL0627     FALSE 0.119 98.000 0.000 NA   NA
 2202899 2202900 RL0629 RL0630     TRUE 0.951 23.000 0.308 NA Y NA
 2202900 2202901 RL0630 RL0631     TRUE 0.996 -3.000 0.308 NA Y NA
 2202901 2202902 RL0631 RL0632   araA TRUE 0.842 29.000 0.000 NA Y NA
 2202903 2202904 RL0633 RL0634     FALSE 0.106 106.000 0.000 NA   NA
 2202904 2202905 RL0634 RL0635     TRUE 0.860 12.000 0.167 1.000 N NA
 2202905 2202906 RL0635 RL0636     TRUE 0.650 58.000 0.250 NA   NA
 2202906 2202907 RL0636 RL0637     TRUE 0.986 5.000 0.727 NA   NA
 2202907 2202908 RL0637 RL0638     TRUE 0.997 5.000 0.818 NA Y NA
 2202908 2202909 RL0638 RL0639     TRUE 0.942 98.000 0.818 NA Y NA
 2202910 2202911 RL0640 RL0641     TRUE 0.975 63.000 1.000 NA Y NA
 2202911 2202912 RL0641 RL0642     TRUE 0.949 31.000 0.375 NA Y NA
 2202912 2202913 RL0642 RL0643   agaZ TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 2202913 2202914 RL0643 RL0644 agaZ rbtD TRUE 0.807 31.000 0.300 1.000   NA
 2202914 2202915 RL0644 RL0645 rbtD   TRUE 0.957 12.000 0.286 0.060   NA
 2202915 2202916 RL0645 RL0646     FALSE 0.474 138.000 0.222 0.098 N NA
 2202916 2202917 RL0646 RL0647     TRUE 0.863 23.000 0.353 1.000   NA
 2202917 2202918 RL0647 RL0648     TRUE 0.910 0.000 0.027 NA   NA
 2202918 2202919 RL0648 RL0649     TRUE 0.934 0.000 0.068 NA   NA
 2202919 2202920 RL0649 RL0650     FALSE 0.141 136.000 0.044 NA N NA
 2202920 2202921 RL0650 RL0651     TRUE 0.660 57.000 0.044 0.060 N NA
 2202922 2202923 RL0652 RL0653     FALSE 0.037 180.000 0.000 NA   NA
 2202923 2202924 RL0653 RL0654     TRUE 0.956 3.000 0.240 NA   NA
 2202924 2202925 RL0654 RL0655     TRUE 0.956 12.000 0.520 NA   NA
 2202925 2202926 RL0655 RL0656     TRUE 0.938 -7.000 0.128 NA   NA
 2202926 2202927 RL0656 RL0657     TRUE 0.971 -3.000 0.139 1.000   NA
 2202927 2202928 RL0657 RL0658     TRUE 0.994 3.000 0.944 1.000   NA
 2202928 2202929 RL0658 RL0659     TRUE 0.996 -3.000 0.623 0.098   NA
 2202929 2202930 RL0659 RL0660     TRUE 0.984 -73.000 0.660 1.000   NA
 2202930 2202931 RL0660 RL0661     TRUE 0.870 76.000 0.791 NA   NA
 2202932 2202933 RL0662 RL0663     FALSE 0.330 75.000 0.038 NA   NA
 2202934 2202935 RL0664 RL0665     TRUE 0.603 5.000 0.000 NA N NA
 2202935 2202936 RL0665 RL0666     FALSE 0.246 44.000 0.000 NA   NA
 2202936 2202937 RL0666 RL0667     FALSE 0.002 433.000 0.000 NA   NA
 2202937 2202938 RL0667 RL0668     TRUE 0.900 47.000 0.714 NA   NA
 2202939 2202940 RL0669 RL0670     TRUE 0.733 55.000 0.333 NA   NA
 2202940 2202941 RL0670 RL0671     FALSE 0.080 216.000 0.143 NA   NA
 2202942 2202943 RL0672 RL0673     TRUE 0.584 85.000 0.250 1.000   NA
 2202943 2202944 RL0673 RL0674     TRUE 0.994 5.000 0.250 0.018 Y NA
 2202944 2202945 RL0674 RL0675     TRUE 0.990 -13.000 0.273 1.000 Y NA
 2202946 2202947 RL0676 RL0677     FALSE 0.002 481.000 0.000 1.000 N NA
 2202947 2202948 RL0677 RL0678     TRUE 0.925 31.000 0.714 1.000 N NA
 2202949 2202950 RL0679 RL0680     FALSE 0.171 182.000 0.192 1.000 N NA
 2202950 2202951 RL0680 RL0681     FALSE 0.532 84.000 0.231 NA   NA
 2202951 2202952 RL0681 RL0682     TRUE 0.704 16.000 0.067 NA   NA
 2202955 2202956 RL0685 RL0686   cheX TRUE 0.892 64.000 0.278 NA Y NA
 2202956 2202957 RL0686 RL0687 cheX cheY TRUE 0.994 -3.000 0.200 NA Y NA
 2202957 2202958 RL0687 RL0688 cheY cheA TRUE 0.986 18.000 0.711 1.000 Y NA
 2202958 2202959 RL0688 RL0689 cheA cheW TRUE 0.989 5.000 0.044 0.008 Y NA
 2202959 2202960 RL0689 RL0690 cheW cheR TRUE 0.991 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 2202960 2202961 RL0690 RL0691 cheR cheB TRUE 0.997 -3.000 0.439 1.000 Y NA
 2202961 2202962 RL0691 RL0692 cheB cheY TRUE 0.996 1.000 0.258 0.018 Y NA
 2202962 2202963 RL0692 RL0693 cheY cheD TRUE 0.996 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 2202963 2202964 RL0693 RL0694 cheD   TRUE 0.802 17.000 0.200 NA   NA
 2202964 2202965 RL0694 RL0695   fliF FALSE 0.023 315.000 0.158 NA   NA
 2202965 2202966 RL0695 RL0696 fliF   FALSE 0.004 361.000 0.000 1.000 N NA
 2202966 2202967 RL0696 RL0697   luxR TRUE 0.997 9.000 0.667 0.033 Y NA
 2202968 2202969 RL0698 RL0699   flhB TRUE 0.979 6.000 0.595 NA   NA
 2202969 2202970 RL0699 RL0700 flhB fliG TRUE 0.608 216.000 0.571 1.000 Y NA
 2202970 2202971 RL0700 RL0701 fliG fliN TRUE 0.992 32.000 0.875 0.003 Y NA
 2202971 2202972 RL0701 RL0702 fliN fliM TRUE 0.933 66.000 0.485 NA Y NA
 2202972 2202973 RL0702 RL0703 fliM motA TRUE 0.998 1.000 0.879 NA Y NA
 2202974 2202975 RL0704 RL0705 flgF fliI TRUE 0.884 114.000 0.529 1.000 Y NA
 2202975 2202976 RL0705 RL0706 fliI   TRUE 0.962 3.000 0.275 NA   NA
 2202976 2202977 RL0706 RL0707   flgB FALSE 0.025 255.000 0.040 NA   NA
 2202977 2202978 RL0707 RL0708 flgB flgC TRUE 0.996 5.000 0.804 NA Y NA
 2202978 2202979 RL0708 RL0709 flgC fliE TRUE 0.947 39.000 0.115 0.002 Y NA
 2202979 2202980 RL0709 RL0710 fliE flgG TRUE 0.993 20.000 0.771 0.003 Y NA
 2202980 2202981 RL0710 RL0711 flgG flgA TRUE 0.958 17.000 0.252 NA Y NA
 2202981 2202982 RL0711 RL0712 flgA flgI TRUE 0.995 -3.000 0.261 NA Y NA
 2202982 2202983 RL0712 RL0713 flgI   TRUE 0.992 -3.000 0.531 NA   NA
 2202983 2202984 RL0713 RL0714   flgH TRUE 0.993 -3.000 0.592 NA   NA
 2202984 2202985 RL0714 RL0715 flgH fliL TRUE 0.981 13.000 0.576 0.005   NA
 2202985 2202986 RL0715 RL0716 fliL fliP TRUE 0.994 -3.000 0.605 1.000   NA
 2202988 2202989 RL0718 RL0719 flaA1 flaB FALSE 0.182 283.000 0.000 0.002 Y NA
 2202989 2202990 RL0719 RL0720 flaB flaA2 FALSE 0.278 245.000 0.000 0.002 Y NA
 2202990 2202991 RL0720 RL0721 flaA2 flaC FALSE 0.154 301.000 0.000 0.002 Y NA
 2202991 2202992 RL0721 RL0722 flaC   FALSE 0.095 202.000 0.125 NA   NA
 2202992 2202993 RL0722 RL0723   motB TRUE 0.988 -3.000 0.421 NA   NA
 2202993 2202994 RL0723 RL0724 motB motC TRUE 0.987 5.000 0.737 NA   NA
 2202994 2202995 RL0724 RL0725 motC motD TRUE 0.987 -3.000 0.379 NA   NA
 2202995 2202996 RL0725 RL0726 motD   TRUE 0.934 -73.000 0.229 NA   NA
 2202996 2202997 RL0726 RL0727     FALSE 0.005 281.000 0.000 NA N NA
 2202997 2202998 RL0727 RL0728   flgE FALSE 0.268 126.000 0.118 1.000 N NA
 2202998 2202999 RL0728 RL0729 flgE flgK TRUE 0.979 20.000 0.286 0.003 Y NA
 2202999 2203000 RL0729 RL0730 flgK flgL TRUE 0.998 4.000 0.571 0.004 Y NA
 2203000 2203001 RL0730 RL0731 flgL flaF TRUE 0.912 35.000 0.171 1.000 Y NA
 2203001 2203002 RL0731 RL0732 flaF flbT TRUE 0.999 -3.000 0.829 1.000 Y NA
 2203002 2203003 RL0732 RL0733 flbT flgD TRUE 0.995 -9.000 0.528 NA Y NA
 2203003 2203004 RL0733 RL0734 flgD fliQ TRUE 0.894 100.000 0.509 NA Y NA
 2203004 2203005 RL0734 RL0735 fliQ flhA TRUE 0.748 192.000 0.349 0.001 Y NA
 2203005 2203006 RL0735 RL0736 flhA fliR TRUE 0.997 -3.000 0.442 1.000 Y NA
 2203006 2203007 RL0736 RL0737 fliR   TRUE 0.918 8.000 0.222 NA   NA
 2203007 2203008 RL0737 RL0738     TRUE 0.812 33.000 0.360 NA   NA
 2203008 2203009 RL0738 RL0739     TRUE 0.791 56.000 0.440 NA   NA
 2203009 2203010 RL0739 RL0740     TRUE 0.985 0.000 0.438 NA   NA
 2203010 2203011 RL0740 RL0741     FALSE 0.197 118.000 0.043 NA   NA
 2203011 2203012 RL0741 RL0742     FALSE 0.117 300.000 0.130 NA Y NA
 2203012 2203013 RL0742 RL0743     FALSE 0.508 121.000 0.400 NA N NA
 2203015 2203016 RL0745 RL0746 aglE aglF TRUE 0.747 190.000 0.670 NA Y NA
 2203016 2203017 RL0746 RL0747 aglF aglG TRUE 0.997 2.000 0.693 NA Y NA
 2203017 2203018 RL0747 RL0748 aglG aglA TRUE 0.945 35.000 0.387 NA Y NA
 2203018 2203019 RL0748 RL0749 aglA aglK TRUE 0.984 20.000 0.697 1.000 Y NA
 2203019 2203020 RL0749 RL0750 aglK   FALSE 0.467 117.000 0.303 NA   NA
 2203021 2203022 RL0751 RL0752 edd pgl TRUE 0.855 77.000 0.202 1.000 Y NA
 2203022 2203023 RL0752 RL0753 pgl zwf TRUE 0.949 11.000 0.000 1.000 Y NA
 2203023 2203024 RL0753 RL0754 zwf ordL FALSE 0.081 135.000 0.000 1.000 N NA
 2203024 2203025 RL0754 RL0755 ordL glnA TRUE 0.993 11.000 0.706 1.000 Y NA
 2203026 2203027 RL0756 RL0757     FALSE 0.002 669.000 0.000 1.000   NA
 2203027 2203028 RL0757 RL0758     FALSE 0.476 232.000 0.222 0.008 Y NA
 2203028 2203029 RL0758 RL0759     FALSE 0.004 300.000 0.000 NA N NA
 2203030 2203031 RL0760 RL0761     TRUE 0.588 24.000 0.056 NA   NA
 2203032 2203033 RL0762 RL0763     FALSE 0.330 127.000 0.164 1.000   NA
 2203033 2203034 RL0763 RL0764     TRUE 0.921 90.000 0.541 1.000 Y NA
 2203034 2203035 RL0764 RL0765     TRUE 0.994 5.000 0.545 NA Y NA
 2203035 2203036 RL0765 RL0766     TRUE 0.997 4.000 0.758 NA Y NA
 2203040 1571365 RL0770 RLt30   tRNA-His FALSE 0.076 131.000 0.000 NA   NA
 2203042 2203043 RL0772 RL0773 traA   FALSE 0.005 312.000 0.000 NA   NA
 2203044 2203045 RL0774 RL0775     TRUE 0.969 -3.000 0.167 NA   NA
 2203046 2203047 RL0776 RL0777 iolA   FALSE 0.002 345.000 0.000 NA N NA
 2203047 2203048 RL0777 RL0778   dppA FALSE 0.002 340.000 0.000 NA N NA
 2203048 2203049 RL0778 RL0779 dppA dppB TRUE 0.766 88.000 0.097 NA Y NA
 2203049 2203050 RL0779 RL0780 dppB dppC TRUE 0.994 10.000 0.779 NA Y NA
 2203050 2203051 RL0780 RL0781 dppC dppD TRUE 0.998 -3.000 0.560 NA Y NA
 2203051 2203052 RL0781 RL0782 dppD dppF TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.004 Y NA
 2203052 2203053 RL0782 RL0783 dppF idnK TRUE 0.580 29.000 0.065 1.000 N NA
 2203054 2203055 RL0784 RL0785     FALSE 0.451 77.000 0.088 1.000   NA
 2203055 2203056 RL0785 RL0786     TRUE 0.961 -3.000 0.074 1.000   NA
 2203057 2203058 RL0787 RL0788     TRUE 0.691 49.000 0.227 1.000   NA
 2203058 2203059 RL0788 RL0789     TRUE 0.987 -3.000 0.000 NA Y NA
 2203059 2203060 RL0789 RL0790     FALSE 0.001 579.000 0.000 NA   NA
 2203060 1571386 RL0790 RL0791     FALSE 0.018 219.000 0.000 NA   NA
 2203061 2203062 RL0792 RL0793     TRUE 0.733 24.000 0.000 0.058   NA
 2203062 2203063 RL0793 RL0794     FALSE 0.047 188.000 0.000 1.000   NA
 2203063 2203064 RL0794 RL0795     TRUE 0.899 23.000 0.018 1.000 Y NA
 2203064 2203065 RL0795 RL0795A     FALSE 0.182 93.000 0.000 1.000   NA
 2203065 2203066 RL0795A RL0797     TRUE 0.978 -3.000 0.211 1.000   NA
 2203066 2203067 RL0797 RL0798     TRUE 0.872 8.000 0.105 NA   NA
 2203067 2203068 RL0798 RL0799     TRUE 0.977 -3.000 0.240 NA   NA
 2203068 2203069 RL0799 RL0800     TRUE 0.828 3.000 0.000 1.000   NA
 2203069 2203070 RL0800 RL0801     FALSE 0.027 195.000 0.000 NA   NA
 2203070 2203071 RL0801 RL0802     TRUE 0.965 -3.000 0.167 NA N NA
 2203071 2203072 RL0802 RL0803     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2203072 2203073 RL0803 RL0804     FALSE 0.015 230.000 0.000 NA   NA
 2203073 2203074 RL0804 RL0805     FALSE 0.001 606.000 0.000 NA   NA
 2203074 2203075 RL0805 RL0806     FALSE 0.040 177.000 0.000 NA   NA
 2203075 2203076 RL0806 RL0807     FALSE 0.141 87.000 0.000 NA   NA
 2203076 2203077 RL0807 RL0808     FALSE 0.110 103.000 0.000 NA   NA
 2203078 2203079 RL0809 RL0810     FALSE 0.044 170.000 0.000 NA   NA
 2203079 2203080 RL0810 RL0810A     FALSE 0.008 305.000 0.000 1.000   NA
 2203081 2203082 RL0811 RL0811A     FALSE 0.516 63.000 0.130 NA   NA
 2203082 2203083 RL0811A RL0813     TRUE 0.997 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 2203083 2203084 RL0813 RL0814     TRUE 0.961 10.000 0.444 1.000   NA
 2203084 2203085 RL0814 RL0815     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2203085 2203086 RL0815 RL0816     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2203086 2203087 RL0816 RL0817     TRUE 0.624 9.000 0.000 NA   NA
 2203087 2203088 RL0817 RL0818     TRUE 0.754 -10.000 0.000 NA   NA
 2203088 2203089 RL0818 RL0819     TRUE 0.954 -7.000 0.167 1.000   NA
 2203089 2203090 RL0819 RL0820   hisH2 TRUE 0.999 -3.000 0.517 0.003 Y NA
 2203090 2203091 RL0820 RL0821 hisH2   TRUE 0.938 1.000 0.069 1.000   NA
 2203091 2203092 RL0821 RL0822     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2203092 2203093 RL0822 RL0823     FALSE 0.031 211.000 0.000 1.000   NA
 2203093 2203094 RL0823 RL0824     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2203094 2203095 RL0824 RL0825   gmd TRUE 0.755 21.000 0.000 0.060   NA
 2203095 2203096 RL0825 RL0826 gmd fcl TRUE 0.994 0.000 0.042 0.012 Y NA
 2203097 2203098 RL0827 RL0828     FALSE 0.013 238.000 0.000 NA   NA
 2203099 2203100 RL0829 RL0830     FALSE 0.167 76.000 0.000 NA   NA
 2203100 2203101 RL0830 RL0831     FALSE 0.020 213.000 0.000 NA   NA
 2203102 2203103 RL0832 RL0833     FALSE 0.002 401.000 0.000 NA   NA
 2203105 2203106 RL0835 RL0836     TRUE 0.992 -3.000 0.545 NA   NA
 2203107 2203108 RL0836A RL0837     FALSE 0.512 13.000 0.000 NA   NA
 2203108 2203109 RL0837 RL0838     TRUE 0.761 34.000 0.286 NA   NA
 2203109 2203110 RL0838 RL0839     FALSE 0.203 60.000 0.000 NA   NA
 2203111 2203112 RL0840 RL0841     FALSE 0.306 29.000 0.000 NA   NA
 2203113 2203114 RL0842 RL0843     TRUE 0.964 3.000 0.316 NA N NA
 2203114 2203115 RL0843 RL0844     FALSE 0.109 159.000 0.026 NA   NA
 2203117 2203118 RL0846 RL0847   guaB FALSE 0.015 280.000 0.002 1.000   NA
 2203118 2203119 RL0847 RL0848 guaB   TRUE 0.839 3.000 0.005 NA   NA
 2203119 2203120 RL0848 RL0849     FALSE 0.135 165.000 0.070 NA   NA
 2203120 2203121 RL0849 RL0850     FALSE 0.007 278.000 0.000 NA   NA
 2203126 2203127 RL0855 RL0856     FALSE 0.194 148.000 0.087 NA   NA
 2203127 2203128 RL0856 RL0857   pit TRUE 0.571 18.000 0.019 NA   NA
 2203128 2203129 RL0857 RL0858 pit   FALSE 0.483 63.000 0.069 1.000   NA
 2203130 2203131 RL0859 RL0860     FALSE 0.272 99.000 0.086 NA N NA
 2203135 2203136 RL0864 RL0865 glcD glcE TRUE 0.998 -3.000 0.266 0.001 Y NA
 2203136 2203137 RL0865 RL0866 glcE glcF TRUE 0.949 57.000 0.227 0.001 Y NA
 2203137 2203138 RL0866 RL0867 glcF   FALSE 0.328 66.000 0.022 NA   NA
 2203139 2203140 RL0868 RL0869     FALSE 0.425 120.000 0.273 NA   NA
 2203140 2203141 RL0869 RL0870     FALSE 0.063 239.000 0.172 NA   NA
 2203142 2203143 RL0871 RL0872 tag   TRUE 0.685 12.000 0.013 NA   NA
 2203146 10691947 RL0875 RL0875A     FALSE 0.365 21.000 0.000 NA   NA
 10691947 2203148 RL0875A RL0876     FALSE 0.225 52.000 0.000 NA   NA
 2203149 2203150 RL0877 RL0878   hisZ FALSE 0.323 181.000 0.097 0.000 N NA
 2203150 2203151 RL0878 RL0879 hisZ hisG TRUE 0.995 -3.000 0.239 1.000 Y NA
 2203154 2203155 RL0882 RL0883   groL FALSE 0.001 735.000 0.000 NA   NA
 2203155 2203156 RL0883 RL0884 groL groS TRUE 0.970 73.000 0.565 0.006 Y NA
 2203157 2203158 RL0885 RL0886   ribF TRUE 0.537 31.000 0.049 1.000 N NA
 2203159 2203160 RL0887 RL0888     TRUE 0.992 -3.000 0.545 NA   NA
 2203161 2203162 RL0889 RL0890 ileS   TRUE 0.796 7.000 0.019 NA   NA
 2203164 2203165 RL0892 RL0893     TRUE 0.897 -19.000 0.079 1.000 N NA
 2203165 2203166 RL0893 RL0894     TRUE 0.715 13.000 0.013 1.000   NA
 2203167 2203168 RL0895 RL0896     FALSE 0.481 14.000 0.000 NA   NA
 2203168 2203169 RL0896 RL0897     FALSE 0.469 90.000 0.200 NA   NA
 2203169 2203170 RL0897 RL0898     FALSE 0.131 92.000 0.000 NA   NA
 2203171 2203172 RL0899 RL0900     TRUE 0.791 17.000 0.182 NA   NA
 2203174 2203175 RL0902 RL0903   gph TRUE 0.847 10.000 0.062 1.000   NA
 2203175 2203176 RL0903 RL0904 gph lpxK FALSE 0.082 183.000 0.015 1.000   NA
 2203178 2203179 RL0906 RL0907     TRUE 0.995 -3.000 0.797 NA   NA
 2203179 2203180 RL0907 RL0908     FALSE 0.299 79.000 0.030 NA   NA
 2203181 2203182 RL0909 RL0910   mutL FALSE 0.534 21.000 0.019 NA   NA
 2203183 2203184 RL0911 RL0912     TRUE 0.824 154.000 0.538 1.000 Y NA
 2203185 2203186 RL0913 RL0914     FALSE 0.014 235.000 0.000 NA   NA
 2203186 2203187 RL0914 RL0915   dgoA TRUE 0.996 -3.000 0.253 1.000 Y NA
 2203187 2203188 RL0915 RL0916 dgoA dgoK TRUE 0.965 14.000 0.205 1.000 Y NA
 2203188 2203189 RL0916 RL0917 dgoK   TRUE 0.981 0.000 0.367 1.000 N NA
 2203190 2203191 RL0918 RL0919     FALSE 0.132 250.000 0.000 1.000 Y NA
 2203191 2203192 RL0919 RL0920     FALSE 0.001 535.000 0.000 1.000 N NA
 2203192 2203193 RL0920 RL0921     FALSE 0.002 426.000 0.000 1.000 N NA
 2203193 2203194 RL0921 RL0922   kup TRUE 0.949 19.000 0.200 1.000 Y NA
 2203194 2203195 RL0922 RL0923 kup   FALSE 0.006 300.000 0.000 1.000 N NA
 2203195 2203196 RL0923 RL0924   atpI FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 2203196 2203197 RL0924 RL0925 atpI atpB TRUE 0.575 63.000 0.195 NA   NA
 2203197 2203198 RL0925 RL0926 atpB atpC TRUE 0.930 68.000 0.628 0.002   NA
 2203198 2203199 RL0926 RL0927 atpC atpG TRUE 0.813 78.000 0.278 0.002   NA
 2203199 2203200 RL0927 RL0928 atpG atpF TRUE 0.999 4.000 0.863 0.002 Y NA
 2203201 2203202 RL0929 RL0930     FALSE 0.255 40.000 0.000 NA   NA
 2203202 2203203 RL0930 RL0931     FALSE 0.109 283.000 0.022 1.000 Y NA
 2203204 2203205 RL0932 RL0933     FALSE 0.175 185.000 0.214 NA   NA
 2203206 2203207 RL0934 RL0935 moaB   TRUE 0.906 0.000 0.018 1.000 N NA
 2203207 2203208 RL0935 RL0936     FALSE 0.510 58.000 0.107 1.000 N NA
 2203208 2203209 RL0936 RL0937   ispB FALSE 0.156 135.000 0.028 1.000 N NA
 2203210 2203211 RL0938 RL0939     TRUE 0.976 7.000 0.525 1.000   NA
 2203213 2203214 RL0941 RL0942     TRUE 0.557 19.000 0.019 NA   NA
 2203214 2203215 RL0942 RL0943   glyQ FALSE 0.013 273.000 0.006 NA   NA
 2203215 2203216 RL0943 RL0944 glyQ   FALSE 0.108 140.000 0.003 NA   NA
 2203216 2203217 RL0944 RL0945   aroA FALSE 0.210 89.000 0.007 NA   NA
 2203217 2203218 RL0945 RL0946 aroA   FALSE 0.374 37.000 0.006 NA   NA
 2203218 2203219 RL0946 RL0947   purD FALSE 0.276 66.000 0.004 NA   NA
 2203219 2203220 RL0947 RL0948 purD   FALSE 0.193 97.000 0.010 NA   NA
 2203220 2203221 RL0948 RL0949     FALSE 0.002 414.000 0.000 NA   NA
 2203222 2203223 RL0950 RL0951   glyS FALSE 0.300 59.000 0.006 NA   NA
 2203224 2203225 RL0952 RL0953   cfa FALSE 0.141 134.000 0.017 1.000 N NA
 2203225 2203226 RL0953 RL0954 cfa gpmB TRUE 0.721 68.000 0.364 1.000 N NA
 2203226 2203227 RL0954 RL0955 gpmB   FALSE 0.003 402.000 0.000 1.000 N NA
 2203227 2203228 RL0955 RL0956     FALSE 0.057 160.000 0.000 1.000 N NA
 2203231 2203232 RL0959 RL0960     TRUE 0.623 33.000 0.158 NA N NA
 2203232 2203233 RL0960 RL0961     FALSE 0.172 141.000 0.053 NA   NA
 2203234 2203235 RL0962 RL0963     FALSE 0.023 227.000 0.000 1.000   NA
 2203237 2203238 RL0965 RL0966     TRUE 0.945 30.000 0.303 1.000 Y NA
 2203241 2203242 RL0969 RL0970 rumA   TRUE 0.991 -3.000 0.062 NA Y NA
 2203243 2203244 RL0971 RL0972     FALSE 0.106 106.000 0.000 NA   NA
 2203245 2203246 RL0973 RL0974 dxs   FALSE 0.023 246.000 0.017 NA   NA
 2203246 2203247 RL0974 RL0975     FALSE 0.348 87.000 0.080 NA   NA
 2203247 2203248 RL0975 RL0976   xseB FALSE 0.183 99.000 0.003 1.000 N NA
 2203248 2203249 RL0976 RL0977 xseB   TRUE 0.930 -3.000 0.019 1.000 N NA
 2203251 2203252 RL0979 RL0980     TRUE 0.972 2.000 0.294 1.000   NA
 2203252 2203253 RL0980 RL0981     TRUE 0.919 45.000 0.294 NA Y NA
 2203253 2203254 RL0981 RL0982     TRUE 0.998 -7.000 0.833 NA Y NA
 2203254 2203255 RL0982 RL0983     TRUE 0.995 7.000 0.714 NA Y NA
 2203255 2203256 RL0983 RL0984     TRUE 0.997 -3.000 0.467 NA Y NA
 2203257 2203258 RL0985 RL0986     TRUE 0.996 6.000 0.714 1.000 Y NA
 2203258 2203259 RL0986 RL0987     TRUE 0.858 89.000 0.833 1.000 N NA
 2203259 2203260 RL0987 RL0988     FALSE 0.171 164.000 0.108 1.000 N NA
 2203262 2203263 RL0990 RL0991 matA matB TRUE 0.974 -3.000 0.174 1.000   NA
 2203263 2203264 RL0991 RL0992 matB matC FALSE 0.290 97.000 0.058 1.000 N NA
 1571592 2203265 RL0993 RL0994     FALSE 0.306 29.000 0.000 NA   NA
 2203265 2203266 RL0994 RL0995     TRUE 0.843 12.000 0.130 1.000 N NA
 2203266 2203267 RL0995 RL0996     TRUE 0.663 29.000 0.130 1.000 N NA
 2203268 2203269 RL0997 RL0998     FALSE 0.005 274.000 0.000 NA N NA
 2203270 2203271 RL0999 RL1000     TRUE 0.953 -3.000 0.075 NA   NA
 2203271 2203272 RL1000 RL1001     FALSE 0.075 133.000 0.000 NA   NA
 2203272 2203273 RL1001 RL1002   bioY FALSE 0.095 114.000 0.000 NA   NA
 2203273 2203274 RL1002 RL1003 bioY   TRUE 0.769 22.000 0.211 NA   NA
 2203274 2203275 RL1003 RL1004     TRUE 0.998 0.000 0.729 1.000 Y NA
 2203277 2203278 RL1006 RL1007 ribA aroC TRUE 0.696 13.000 0.023 1.000 N NA
 2203278 2203279 RL1007 RL1008 aroC   FALSE 0.023 233.000 0.002 1.000 N NA
 2203281 2203282 RL1010 RL1011 gpmB fabI TRUE 0.913 24.000 0.397 0.096 N NA
 2203282 2203283 RL1011 RL1012 fabI cbpA TRUE 0.566 122.000 0.404 1.000   NA
 2203283 2203284 RL1012 RL1013 cbpA   FALSE 0.019 301.000 0.087 NA   NA
 2203287 2203288 RL1016 RL1017     FALSE 0.311 99.000 0.088 NA   NA
 2203289 2203290 RL1018 RL1019   tldD TRUE 0.551 18.000 0.014 NA   NA
 2203290 2203291 RL1019 RL1020 tldD   FALSE 0.007 367.000 0.037 NA   NA
 2203292 2203293 RL1021 RL1022 coxB coxA TRUE 0.993 18.000 0.741 0.004 Y NA
 2203293 2203294 RL1022 RL1023 coxA coxX TRUE 0.718 68.000 0.153 0.057 N NA
 2203294 2203295 RL1023 RL1024 coxX coxF TRUE 0.918 0.000 0.038 NA   NA
 2203295 2203296 RL1024 RL1025 coxF coxZ TRUE 0.944 -3.000 0.050 NA   NA
 2203296 2203297 RL1025 RL1026 coxZ ctaE TRUE 0.827 62.000 0.536 1.000 N NA
 2203299 2203300 RL1028 RL1029     TRUE 0.973 -7.000 0.340 NA   NA
 2203300 2203301 RL1029 RL1030   ispH FALSE 0.480 64.000 0.105 NA   NA
 2203301 2203302 RL1030 RL1031 ispH thrB TRUE 0.650 71.000 0.251 1.000   NA
 2203302 2203303 RL1031 RL1032 thrB rnhA TRUE 0.967 -3.000 0.104 1.000   NA
 2203304 2203305 RL1033 RL1034     TRUE 0.580 96.000 0.333 NA   NA
 2203305 2203306 RL1034 RL1035     FALSE 0.158 116.000 0.014 NA   NA
 2203307 2203308 RL1036 RL1037     TRUE 0.713 157.000 0.357 NA Y NA
 2203309 2203310 RL1038 RL1039     TRUE 0.993 -3.000 0.588 NA   NA
 2203311 2203312 RL1040 RL1041     TRUE 0.989 -3.000 0.471 NA N NA
 2203312 2203313 RL1041 RL1042     TRUE 0.938 -7.000 0.118 1.000 N NA
 2203313 2203314 RL1042 RL1043     TRUE 0.953 17.000 0.182 1.000 Y NA
 2203314 2203315 RL1043 RL1044     TRUE 0.888 54.000 0.182 1.000 Y NA
 2203315 2203316 RL1044 RL1045     TRUE 0.987 20.000 0.500 0.012 Y NA
 2203318 2203319 RL1047 RL1048     TRUE 0.997 -3.000 0.465 1.000 Y NA
 2203319 2203320 RL1048 RL1049     TRUE 0.974 17.000 0.400 1.000 Y NA
 2203321 2203322 RL1050 RL1051     FALSE 0.276 129.000 0.143 NA   NA
 2203327 2203328 RL1056 RL1057     FALSE 0.101 110.000 0.000 NA   NA
 2203329 2203330 RL1058 RL1059 argS   FALSE 0.006 309.000 0.000 1.000 N NA
 2203330 2203331 RL1059 RL1060     TRUE 0.976 0.000 0.293 1.000 N NA
 2203331 2203332 RL1060 RL1061     TRUE 0.859 75.000 0.674 1.000   NA
 2203332 2203333 RL1061 RL1062   thrC TRUE 0.935 4.000 0.129 1.000   NA
 2203335 2203336 RL1064 RL1065     FALSE 0.037 200.000 0.000 1.000   NA
 2203338 2203339 RL1067 RL1068     FALSE 0.159 79.000 0.000 NA   NA
 2203341 2203342 RL1070 RL1071     FALSE 0.011 248.000 0.000 NA   NA
 2203342 2203343 RL1071 RL1072     FALSE 0.153 82.000 0.000 NA   NA
 2203344 2203345 RL1073 RL1074     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 2203345 2203346 RL1074 RL1075     FALSE 0.117 179.000 0.050 1.000   NA
 2203347 2203348 RL1076 RL1077     TRUE 0.885 4.000 0.052 NA   NA
 2203348 2203349 RL1077 RL1078   mutY TRUE 0.888 3.000 0.016 1.000   NA
 2203350 2203351 RL1079 RL1080     FALSE 0.157 118.000 0.017 NA   NA
 2203351 1571680 RL1080 RL1081     TRUE 0.738 4.000 0.000 NA   NA
 1571680 2203352 RL1081 RL1082     FALSE 0.049 164.000 0.000 NA   NA
 2203352 2203353 RL1082 RL1083     FALSE 0.006 335.000 0.000 1.000   NA
 2203353 2203354 RL1083 RL1084   smc FALSE 0.260 97.000 0.039 1.000 N NA
 2203357 2203358 RL1087 RL1088     FALSE 0.009 266.000 0.000 NA   NA
 2203358 2203359 RL1088 RL1089     FALSE 0.065 149.000 0.000 NA   NA
 2203361 2203362 RL1091 RL1092     TRUE 0.939 -3.000 0.038 NA   NA
 2203362 2203363 RL1092 RL1093     FALSE 0.449 34.000 0.024 NA   NA
 1571693 2203364 RLt22 RL1094 tRNA-Gln   FALSE 0.053 159.000 0.000 NA   NA
 2203364 2203365 RL1094 RL1095     TRUE 0.700 -31.000 0.000 NA   NA
 2203366 2203367 RL1096 RL1097   hsdS TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2203367 2203368 RL1097 RL1098 hsdS hsdM2 TRUE 0.962 -3.000 0.081 1.000   NA
 2203368 2203369 RL1098 RL1099 hsdM2 hsdM1 TRUE 0.961 -30.000 0.033 0.001   NA
 2203369 2203370 RL1099 RL1100 hsdM1 hsdR TRUE 0.970 66.000 0.567 0.056 Y NA
 2203371 2203372 RL1101 RL1102     FALSE 0.232 49.000 0.000 NA   NA
 2203372 2203373 RL1102 RL1103     TRUE 0.780 -7.000 0.000 NA   NA
 2203374 2203375 RL1104 RL1105     FALSE 0.004 387.000 0.000 1.000   NA
 2203376 2203377 RL1106 RL1107     TRUE 0.759 50.000 0.355 NA   NA
 2203377 2203378 RL1107 RL1108     FALSE 0.264 93.000 0.038 NA   NA
 2203380 2203381 RL1110 RL1111     TRUE 0.965 -3.000 0.133 NA   NA
 2203381 2203382 RL1111 RL1112     FALSE 0.269 36.000 0.000 NA   NA
 2203382 2203383 RL1112 RL1113     FALSE 0.076 132.000 0.000 NA   NA
 2203383 2203384 RL1113 RL1114     FALSE 0.001 869.000 0.000 NA   NA
 2203384 2203385 RL1114 RL1115     TRUE 0.545 12.000 0.000 NA   NA
 2203385 2203386 RL1115 RL1116     FALSE 0.001 846.000 0.000 NA   NA
 2203387 2203388 RL1117 RL1118     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2203388 2203389 RL1118 RL1119     FALSE 0.077 130.000 0.000 NA   NA
 2203389 2203390 RL1119 RL1120     TRUE 0.992 -3.000 0.571 NA   NA
 2203390 2203391 RL1120 RL1121     TRUE 0.979 -34.000 0.571 NA   NA
 2203391 2203392 RL1121 RL1122     TRUE 0.577 11.000 0.000 NA   NA
 2203392 2203393 RL1122 RL1123     TRUE 0.948 14.000 0.556 NA   NA
 2203393 2203394 RL1123 RL1124     FALSE 0.016 224.000 0.000 NA   NA
 2203394 2203395 RL1124 RL1125     FALSE 0.001 501.000 0.000 NA   NA
 2203397 2203398 RL1127 RL1128     FALSE 0.374 20.000 0.000 NA   NA
 2203398 2203399 RL1128 RL1129     FALSE 0.248 43.000 0.000 NA   NA
 2203400 2203401 RL1130 RL1131     FALSE 0.002 408.000 0.000 NA   NA
 2203401 2203402 RL1131 RL1132     FALSE 0.002 425.000 0.000 NA   NA
 2203402 2203403 RL1132 RL1133     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2203403 2203404 RL1133 RL1134     TRUE 0.994 -9.000 1.000 1.000   NA
 2203405 2203406 RL1135 RL1136     FALSE 0.258 39.000 0.000 NA   NA
 2203406 2203407 RL1136 RL1137     FALSE 0.401 18.000 0.000 NA   NA
 2203407 2203408 RL1137 RL1138     TRUE 0.560 52.000 0.098 1.000   NA
 2203408 2203409 RL1138 RL1139     TRUE 0.999 -3.000 0.857 NA Y NA
 1571741 2203410 RL1140 RL1141     FALSE 0.009 262.000 0.000 NA   NA
 2203410 2203411 RL1141 RL1142     FALSE 0.064 150.000 0.000 NA   NA
 2203411 1571744 RL1142 RL1143     FALSE 0.151 83.000 0.000 NA   NA
 2203412 2203413 RL1144 RL1145     FALSE 0.002 486.000 0.000 NA   NA
 2203414 2203415 RL1146 RL1147     TRUE 0.736 -13.000 0.000 NA   NA
 2203416 2203417 RL1148 RL1149     FALSE 0.002 473.000 0.000 NA   NA
 2203417 2203418 RL1149 RL1150     TRUE 0.604 10.000 0.000 NA   NA
 2203418 2203419 RL1150 RL1151     FALSE 0.217 55.000 0.000 NA   NA
 2203419 2203420 RL1151 RL1152     TRUE 0.583 131.000 0.500 NA   NA
 1571754 2203421 RL1153 RL1154     TRUE 0.801 1.000 0.000 NA   NA
 2203423 2203424 RL1156 RL1157     TRUE 0.992 -13.000 0.316 1.000 Y NA
 2203424 1571759 RL1157 RL1158     FALSE 0.059 154.000 0.000 NA   NA
 2203426 2203427 RL1160 RL1161     FALSE 0.084 129.000 0.000 1.000 N NA
 2203427 2203428 RL1161 RL1162     FALSE 0.011 255.000 0.000 1.000 N NA
 2203428 2203429 RL1162 RL1163     TRUE 0.764 66.000 0.000 1.000 Y NA
 2203429 2203430 RL1163 RL1164     FALSE 0.002 425.000 0.000 NA   NA
 2203430 2203431 RL1164 RL1165     FALSE 0.401 18.000 0.000 NA   NA
 2203431 2203432 RL1165 RL1166     FALSE 0.004 346.000 0.000 NA   NA
 2203433 2203434 RL1167 RL1168     TRUE 0.733 103.000 0.000 0.099 Y NA
 2203434 2203435 RL1168 RL1169     TRUE 0.995 -3.000 0.727 NA   NA
 2203435 2203436 RL1169 RL1170   clpP FALSE 0.406 47.000 0.028 NA   NA
 2203436 2203437 RL1170 RL1171 clpP   FALSE 0.003 386.000 0.000 NA   NA
 2203437 2203438 RL1171 RL1172     FALSE 0.237 47.000 0.000 NA   NA
 2203439 2203440 RL1173 RL1174     FALSE 0.078 129.000 0.000 NA   NA
 2203441 2203442 RL1175 RL1176     FALSE 0.487 65.000 0.111 NA   NA
 2203442 2203443 RL1176 RL1177     TRUE 0.821 5.000 0.016 NA   NA
 2203443 2203444 RL1177 RL1178     TRUE 0.898 0.000 0.016 NA   NA
 2203444 2203445 RL1178 RL1179     TRUE 0.978 -3.000 0.250 NA   NA
 2203445 2203446 RL1179 RL1180     FALSE 0.008 270.000 0.000 NA   NA
 2203446 2203447 RL1180 RL1181     FALSE 0.052 160.000 0.000 NA   NA
 2203450 2203451 RL1184 RL1185     FALSE 0.271 96.000 0.022 1.000   NA
 2203452 2203453 RL1186 RL1187   cya3 FALSE 0.007 296.000 0.000 1.000 N NA
 2203456 2203457 RL1190 RL1191     FALSE 0.519 17.000 0.000 1.000   NA
 2203457 2203458 RL1191 RL1192     FALSE 0.005 360.000 0.000 1.000   NA
 2203460 2203461 RL1194 RL1196     FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 2203461 2203462 RL1196 RL1197     FALSE 0.006 304.000 0.000 1.000 N NA
 2203462 2203463 RL1197 RL1198     FALSE 0.324 124.000 0.000 0.058   NA
 2203463 2203464 RL1198 RL1199     TRUE 0.646 93.000 0.400 NA   NA
 2203466 2203467 RL1201 RL1202     FALSE 0.010 289.000 0.000 1.000   NA
 2203470 2203471 RL1205 RL1206     FALSE 0.467 35.000 0.033 NA   NA
 2203472 2203473 RL1207 RL1208     FALSE 0.002 410.000 0.000 NA   NA
 2203474 2203475 RL1209 RL1210     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2203476 2203477 RL1211 RL1212     FALSE 0.148 108.000 0.000 1.000   NA
 2203477 2203478 RL1212 RL1213     TRUE 0.935 -7.000 0.118 NA   NA
 2203478 2203479 RL1213 RL1214     TRUE 0.969 -7.000 0.300 NA   NA
 2203479 2203480 RL1214 RL1215     FALSE 0.071 140.000 0.000 NA   NA
 2203480 2203481 RL1215 RL1216     TRUE 0.785 2.000 0.000 NA   NA
 2203483 2203484 RL1218 RL1219     TRUE 0.887 -25.000 0.079 NA   NA
 2203485 2203486 RL1220 RL1221     FALSE 0.261 67.000 0.000 1.000   NA
 2203486 2203487 RL1221 RL1222     TRUE 0.981 -10.000 0.500 NA   NA
 2203488 2203489 RL1223 RL1224   cya1 FALSE 0.090 117.000 0.000 NA   NA
 2203489 2203490 RL1224 RL1225 cya1   FALSE 0.004 343.000 0.000 NA   NA
 2203490 2203491 RL1225 RL1226     FALSE 0.115 100.000 0.000 NA   NA
 2203491 2203492 RL1226 RL1227     FALSE 0.027 195.000 0.000 NA   NA
 2203492 2203493 RL1227 RL1228     FALSE 0.178 72.000 0.000 NA   NA
 2203494 2203495 RL1229 RL1230     TRUE 0.841 75.000 0.667 NA   NA
 2203499 2203500 RL1234 RL1235     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2203500 2203501 RL1235 RL1236     FALSE 0.001 760.000 0.000 NA   NA
 2203501 2203502 RL1236 RL1237     TRUE 0.839 70.000 0.000 0.094 Y NA
 2203502 2203503 RL1237 RL1238     TRUE 0.670 154.000 0.000 0.001 Y NA
 2203503 2203504 RL1238 RL1239     FALSE 0.001 806.000 0.000 NA   NA
 2203506 2203507 RL1241 RL1242     TRUE 0.764 23.000 0.217 NA   NA
 2203507 2203508 RL1242 RL1243     TRUE 0.885 -34.000 0.083 NA   NA
 2203508 2203509 RL1243 RL1244     FALSE 0.418 17.000 0.000 NA   NA
 2203510 2203511 RL1245 RL1246     FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 2203511 2203512 RL1246 RL1247     FALSE 0.007 282.000 0.000 NA   NA
 2203512 2203513 RL1247 RL1248     FALSE 0.180 71.000 0.000 NA   NA
 2203513 2203514 RL1248 RL1249     TRUE 0.563 140.000 0.500 NA   NA
 2203519 2203520 RL1254 RL1255     FALSE 0.168 98.000 0.000 1.000   NA
 2203521 2203522 RL1256 RL1257   qor FALSE 0.007 297.000 0.000 1.000 N NA
 2203524 2203525 RL1259 RL1260   cysN FALSE 0.009 301.000 0.000 1.000   NA
 2203525 2203526 RL1260 RL1261 cysN cysD TRUE 0.979 2.000 0.100 0.000 N NA
 2203526 2203527 RL1261 RL1262 cysD   TRUE 0.589 128.000 0.017 1.000 Y NA
 2203530 2203531 RL1265 RL1266     TRUE 0.545 12.000 0.000 NA   NA
 2203531 2203532 RL1266 RL1267     TRUE 0.877 20.000 0.393 NA   NA
 2203532 2203533 RL1267 RL1268     FALSE 0.324 118.000 0.167 NA   NA
 2203533 2203534 RL1268 RL1269     TRUE 0.978 -3.000 0.250 NA   NA
 2203535 2203536 RL1270 RL1271 betA betB FALSE 0.305 220.000 0.634 1.000 N NA
 2203536 2203537 RL1271 RL1272 betB   TRUE 0.990 -3.000 0.459 1.000 N NA
 2203538 2203539 RL1273 RL1274     FALSE 0.027 219.000 0.000 1.000   NA
 2203539 2203540 RL1274 RL1275     FALSE 0.294 114.000 0.107 1.000 N NA
 2203540 2203541 RL1275 RL1276     FALSE 0.535 81.000 0.214 1.000 N NA
 2203545 2203546 RL1280 RL1281 ansA   FALSE 0.079 127.000 0.000 NA   NA
 2203548 2203549 RL1283 RL1284   gstB FALSE 0.007 362.000 0.028 NA   NA
 2203550 2203551 RL1285 RL1286     TRUE 0.712 39.000 0.250 NA   NA
 2203553 2203554 RL1288 RL1289 gst2b   FALSE 0.219 102.000 0.029 NA   NA
 2203557 2203558 RL1292 RL1293     FALSE 0.233 89.000 0.035 NA N NA
 2203558 2203559 RL1293 RL1294   lig FALSE 0.410 205.000 0.751 NA N NA
 2203559 2203560 RL1294 RL1295 lig   TRUE 0.951 -3.000 0.037 1.000   NA
 2203560 2203561 RL1295 RL1296     FALSE 0.031 190.000 0.000 NA   NA
 2203561 2203562 RL1296 RL1297     FALSE 0.413 177.000 0.500 NA   NA
 2203562 2203563 RL1297 RL1298     FALSE 0.004 329.000 0.000 NA   NA
 2203563 2203564 RL1298 RL1299     FALSE 0.134 252.000 0.444 NA   NA
 2203564 2203565 RL1299 RL1300   rpsU TRUE 0.887 79.000 0.889 NA   NA
 2203565 2203566 RL1300 RL1301 rpsU   FALSE 0.211 227.000 0.500 NA   NA
 2203570 2203571 RL1304 RL1305     TRUE 0.651 35.000 0.167 NA   NA
 2203571 2203572 RL1305 RL1306     FALSE 0.437 80.000 0.123 NA   NA
 2203573 2203574 RL1307 RL1308     FALSE 0.126 164.000 0.028 1.000   NA
 2203576 2203577 RL1310 RL1311     FALSE 0.005 368.000 0.000 1.000   NA
 2203578 2203579 RL1312 RL1313     FALSE 0.298 98.000 0.075 NA   NA
 2203579 2203580 RL1313 RL1314     FALSE 0.416 78.000 0.100 NA   NA
 2203581 2203582 RL1315 RL1316 zwf tam FALSE 0.007 315.000 0.000 1.000   NA
 2203582 2203583 RL1316 RL1317 tam   FALSE 0.209 105.000 0.028 NA   NA
 2203584 2203585 RL1318 RL1319     FALSE 0.036 157.000 0.000 NA N NA
 2203585 2203586 RL1319 RL1320     FALSE 0.291 32.000 0.000 NA   NA
 2203586 2203587 RL1320 RL1320A     FALSE 0.258 68.000 0.000 1.000   NA
 2203588 2203589 RL1322 RL1323     FALSE 0.078 129.000 0.000 NA   NA
 2203593 2203594 RL1327 RL1328     FALSE 0.014 319.000 0.074 NA   NA
 2203595 2203596 RL1329 RL1330     TRUE 0.815 120.000 0.900 1.000   NA
 2203596 2203597 RL1330 RL1331   cyaA TRUE 0.912 31.000 0.600 1.000   NA
 2203597 2203598 RL1331 RL1332 cyaA nadE FALSE 0.114 146.000 0.007 1.000 N NA
 2203603 2203604 RL1337 RL1338   pmtA FALSE 0.155 159.000 0.045 1.000   NA
 2203604 10691948 RL1338 RL1339 pmtA   FALSE 0.102 109.000 0.000 NA   NA
 2203606 2203607 RL1340 RL1341 sodB   FALSE 0.154 138.000 0.011 1.000   NA
 2203611 2203612 RL1345 RL1346   cycP FALSE 0.128 192.000 0.154 1.000 N NA
 2203612 2203613 RL1346 RL1347 cycP cycG TRUE 0.746 195.000 0.424 0.009 Y NA
 2203614 2203615 RL1348 RL1349 gstA   FALSE 0.106 187.000 0.057 1.000   NA
 2203616 2203617 RL1350 RL1351     FALSE 0.271 140.000 0.163 NA   NA
 2203617 2203618 RL1351 RL1352     FALSE 0.175 147.000 0.058 1.000 N NA
 2203619 2203620 RL1353 RL1354   gcd FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 2203620 2203621 RL1354 RL1355 gcd   FALSE 0.047 198.000 0.014 NA   NA
 2203625 2203626 RL1359 RL1360   ptrB TRUE 0.695 16.000 0.061 NA   NA
 2203627 2203628 RL1361 RL1362     FALSE 0.194 115.000 0.034 NA   NA
 2203629 2203630 RL1363 RL1364     TRUE 0.717 19.000 0.116 NA   NA
 2203630 2203631 RL1364 RL1365     FALSE 0.091 177.000 0.037 NA   NA
 2203632 2203633 RL1366 RL1367 uspF   FALSE 0.383 105.000 0.133 1.000   NA
 2203633 2203634 RL1367 RL1368   pat FALSE 0.438 67.000 0.049 1.000   NA
 2203634 2203635 RL1368 RL1369 pat   FALSE 0.072 200.000 0.035 1.000   NA
 2203637 2203638 RL1371 RL1372     FALSE 0.036 231.000 0.041 NA   NA
 2203638 2203639 RL1372 RL1373   mrpB TRUE 0.975 5.000 0.493 NA   NA
 2203639 2203640 RL1373 RL1374 mrpB mrpC TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 2203640 2203641 RL1374 RL1375 mrpC mrpD TRUE 0.986 68.000 0.896 0.005 Y NA
 2203641 2203642 RL1375 RL1376 mrpD mrpE TRUE 0.999 -3.000 0.810 1.000 Y NA
 2203642 2203643 RL1376 RL1377 mrpE mrpF TRUE 0.999 -3.000 0.644 0.056 Y NA
 2203643 2203644 RL1377 RL1378 mrpF mrpG TRUE 0.998 -3.000 0.614 1.000 Y NA
 2203644 2203645 RL1378 RL1379 mrpG rosR FALSE 0.002 441.000 0.000 1.000 N NA
 2203646 2203647 RL1380 RL1381     FALSE 0.042 233.000 0.069 NA   NA
 2203648 2203649 RL1382 RL1383     TRUE 0.953 -28.000 0.259 1.000   NA
 2203651 2203652 RL1385 RL1386     FALSE 0.106 136.000 0.000 1.000   NA
 2203652 2203653 RL1386 RL1387     FALSE 0.379 63.000 0.041 NA   NA
 2203654 2203655 RL1388 RL1389     FALSE 0.012 247.000 0.000 NA   NA
 2203657 2203658 RL1391 RL1392     TRUE 0.994 -7.000 0.941 NA   NA
 2203658 2203659 RL1392 RL1393   pbpF FALSE 0.266 223.000 0.582 NA   NA
 2203660 2203661 RL1394 RL1395     FALSE 0.016 226.000 0.000 NA   NA
 2203661 2203662 RL1395 RL1396     FALSE 0.394 46.000 0.022 NA   NA
 2203662 2203663 RL1396 RL1397     TRUE 0.728 30.000 0.222 NA   NA
 2203666 2203667 RL1400 RL1401     FALSE 0.001 913.000 0.000 1.000   NA
 2203667 2203668 RL1401 RL1402     FALSE 0.025 201.000 0.000 NA   NA
 2203668 2203669 RL1402 RL1403     FALSE 0.350 95.000 0.105 NA   NA
 2203671 2203672 RL1405 RL1406     FALSE 0.034 184.000 0.000 NA   NA
 2203672 2203673 RL1406 RL1407     FALSE 0.006 294.000 0.000 NA   NA
 2203673 2203674 RL1407 RL1408     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 2203674 2203675 RL1408 RL1409     TRUE 0.981 -3.000 0.286 NA   NA
 2203676 2203677 RL1410 RL1412 groS5 groL5 TRUE 0.984 52.000 0.714 0.005 Y NA
 2203677 2203678 RL1412 RL1413 groL5   TRUE 0.890 67.000 0.800 NA   NA
 2203679 2203680 RL1415 RL1416     TRUE 0.963 8.000 0.412 1.000   NA
 2203680 2203681 RL1416 RL1417     TRUE 0.868 42.000 0.088 NA Y NA
 2203683 2203684 RL1419 RL1420     FALSE 0.197 70.000 0.000 1.000 N NA
 2203685 2203686 RL1421 RL1422     FALSE 0.006 304.000 0.000 1.000 N NA
 2203686 2203687 RL1422 RL1423     FALSE 0.018 336.000 0.148 NA   NA
 2203689 2203690 RL1425 RL1426     TRUE 0.819 47.000 0.415 1.000   NA
 2203690 2203691 RL1426 RL1427     FALSE 0.431 86.000 0.143 NA   NA
 2203691 2203692 RL1427 RL1428     TRUE 0.822 21.000 0.278 NA   NA
 2203692 2203693 RL1428 RL1429     FALSE 0.003 420.000 0.000 1.000   NA
 2203693 2203694 RL1429 RL1430     FALSE 0.420 51.000 0.040 NA   NA
 2203696 2203697 RL1432 RL1433   feuP TRUE 0.631 56.000 0.223 NA   NA
 2203697 2203698 RL1433 RL1434 feuP feuQ TRUE 0.997 -10.000 0.713 1.000 Y NA
 2203698 2203699 RL1434 RL1435 feuQ lipA FALSE 0.196 119.000 0.069 NA N NA
 2203699 2203700 RL1435 RL1436 lipA cycH FALSE 0.436 81.000 0.163 NA N NA
 2203700 2203701 RL1436 RL1437 cycH cycJ TRUE 0.993 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 2203701 2203702 RL1437 RL1438 cycJ ccmF TRUE 0.997 -3.000 0.125 0.002 Y NA
 2203702 2203703 RL1438 RL1439 ccmF ccmH TRUE 0.998 -3.000 0.644 NA Y NA
 2203703 2203704 RL1439 RL1440 ccmH degP FALSE 0.342 215.000 0.200 NA Y NA
 2203704 2203705 RL1440 RL1441 degP   TRUE 0.559 77.000 0.222 1.000 N NA
 2203705 2203706 RL1441 RL1442     TRUE 0.999 -3.000 0.733 1.000 Y NA
 2203706 2203707 RL1442 RL1443   glnE TRUE 0.633 134.000 0.081 1.000 Y NA
 2203707 2203708 RL1443 RL1444 glnE   TRUE 0.636 101.000 0.000 1.000 Y NA
 2203709 2203710 RL1445 RL1446   pepN FALSE 0.062 193.000 0.025 1.000 N NA
 2203710 2203711 RL1446 RL1447 pepN   FALSE 0.070 189.000 0.009 1.000   NA
 2203712 2203713 RL1448 RL1449     FALSE 0.145 168.000 0.094 NA   NA
 2203713 2203714 RL1449 RL1450     FALSE 0.090 117.000 0.000 NA   NA
 2203715 2203716 RL1451 RL1452   dnaK FALSE 0.295 70.000 0.034 NA N NA
 2203716 2203717 RL1452 RL1453 dnaK   FALSE 0.011 221.000 0.000 NA N NA
 2203717 2203718 RL1453 RL1454     TRUE 0.800 -3.000 0.000 NA N NA
 2203721 2203722 RL1457 RL1458     FALSE 0.124 137.000 0.013 NA   NA
 2203725 2203726 RL1461 RL1462     FALSE 0.005 316.000 0.000 1.000 N NA
 2203732 2203733 RL1468 RL1469     TRUE 0.998 2.000 0.800 NA Y NA
 2203733 2203734 RL1469 RL1470     TRUE 0.946 13.000 0.039 NA Y NA
 2203734 2203735 RL1470 RL1471     TRUE 0.562 138.000 0.039 NA Y NA
 2203737 2203738 RL1473 RL1474     TRUE 0.874 10.000 0.143 NA   NA
 2203738 2203739 RL1474 RL1475     TRUE 0.992 3.000 0.833 NA   NA
 2203739 2203740 RL1475 RL1476     TRUE 0.985 11.000 1.000 NA   NA
 2203742 2203743 RL1478 RL1479 amn   FALSE 0.001 624.000 0.000 NA   NA
 2203745 2203746 RL1481 RL1482   hisC FALSE 0.002 433.000 0.000 NA   NA
 2203746 2203747 RL1482 RL1483 hisC   FALSE 0.247 114.000 0.073 NA   NA
 2203747 2203748 RL1483 RL1484     FALSE 0.038 243.000 0.071 NA   NA
 2203750 2203751 RL1486 RL1487     FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 2203752 2203753 RL1488 RL1489     TRUE 0.607 86.000 0.312 NA   NA
 2203754 2203755 RL1490 RL1491     TRUE 0.866 52.000 0.600 NA   NA
 2203755 2203756 RL1491 RL1492   iolB FALSE 0.220 90.000 0.013 NA   NA
 2203756 2203757 RL1492 RL1493 iolB iolE FALSE 0.183 246.000 0.038 1.000 Y NA
 2203757 2203758 RL1493 RL1494 iolE iolD FALSE 0.216 61.000 0.000 1.000 N NA
 2203758 2203759 RL1494 RL1495 iolD iolC FALSE 0.048 170.000 0.000 1.000 N NA
 2203759 2203760 RL1495 RL1496 iolC   FALSE 0.225 93.000 0.014 1.000 N NA
 2203761 2203762 RL1497 RL1498     TRUE 0.621 88.000 0.088 0.048   NA
 2203762 1572098 RL1498 RLt50   tRNA-Ser FALSE 0.044 170.000 0.000 NA   NA
 1572098 2203763 RLt50 RL1499 tRNA-Ser ropA FALSE 0.001 559.000 0.000 NA   NA
 2203764 2203765 RL1500 RL1501     FALSE 0.439 66.000 0.082 NA   NA
 2203766 2203767 RL1502 RL1503 mosA   FALSE 0.205 126.000 0.058 1.000 N NA
 2203769 2203770 RL1505 RL1506   relA TRUE 0.583 183.000 0.291 1.000 Y NA
 2203770 2203771 RL1506 RL1507 relA   FALSE 0.065 185.000 0.018 NA   NA
 2203771 2203772 RL1507 RL1508     FALSE 0.099 162.000 0.022 NA   NA
 2203772 2203773 RL1508 RL1509   acpS FALSE 0.443 39.000 0.032 NA   NA
 2203773 2203774 RL1509 RL1510 acpS sipS FALSE 0.016 271.000 0.012 1.000 N NA
 2203774 2203775 RL1510 RL1511 sipS rnc TRUE 0.921 -3.000 0.010 1.000 N NA
 2203775 2203776 RL1511 RL1512 rnc   TRUE 0.948 8.000 0.098 0.065   NA
 2203776 2203777 RL1512 RL1513     FALSE 0.458 114.000 0.042 0.065   NA
 2203777 2203778 RL1513 RL1514     FALSE 0.096 209.000 0.111 1.000   NA
 2203778 2203779 RL1514 RL1515   recO FALSE 0.170 120.000 0.004 1.000   NA
 2203779 2203780 RL1515 RL1516 recO   FALSE 0.177 103.000 0.006 1.000 N NA
 2203781 2203782 RL1517 RL1518     TRUE 0.948 10.000 0.123 0.033   NA
 2203782 2203783 RL1518 RL1519     FALSE 0.039 250.000 0.062 1.000   NA
 2203784 2203785 RL1520 RL1521   sodC FALSE 0.045 224.000 0.058 NA   NA
 2203786 2203787 RL1522 RL1523     FALSE 0.415 59.000 0.053 NA   NA
 2203787 2203788 RL1523 RL1524     TRUE 0.979 -3.000 0.258 NA   NA
 2203788 2203789 RL1524 RL1525     TRUE 0.940 -3.000 0.039 NA   NA
 2203789 2203790 RL1525 RL1526     FALSE 0.211 99.000 0.021 NA   NA
 2203790 2203791 RL1526 RL1527     TRUE 0.984 1.000 0.484 NA   NA
 2203791 2203792 RL1527 RL1528     TRUE 0.647 104.000 0.462 NA   NA
 2203792 2203793 RL1528 RL1529     TRUE 0.737 35.000 0.259 NA   NA
 2203794 2203795 RL1530 RL1531     TRUE 0.557 42.000 0.103 NA   NA
 2203796 2203797 RL1532 RL1533   psd TRUE 0.935 68.000 0.466 1.000 Y NA
 2203797 2203798 RL1533 RL1534 psd   FALSE 0.209 135.000 0.075 1.000 N NA
 2203798 2203799 RL1534 RL1535     FALSE 0.167 212.000 0.290 1.000   NA
 2203801 2203802 RL1537 RL1538   leuA FALSE 0.047 207.000 0.026 NA   NA
 2203802 2203803 RL1538 RL1539 leuA pip FALSE 0.096 183.000 0.032 1.000   NA
 2203803 2203804 RL1539 RL1540 pip   TRUE 0.969 -3.000 0.121 1.000   NA
 2203804 2203805 RL1540 RL1541     TRUE 0.997 -3.000 0.600 0.002   NA
 2203805 2203806 RL1541 RL1542     TRUE 0.994 -3.000 0.316 0.002   NA
 2203806 2203807 RL1542 RL1543   cysS TRUE 0.933 -3.000 0.005 1.000   NA
 2203809 2203810 RL1545 RL1546   purF FALSE 0.418 79.000 0.100 1.000 N NA
 2203810 2203811 RL1546 RL1547 purF cvpA FALSE 0.237 149.000 0.101 1.000   NA
 2203811 2203812 RL1547 RL1548 cvpA radA FALSE 0.402 90.000 0.094 1.000   NA
 2203814 2203815 RL1550 RL1551   dnaC FALSE 0.148 89.000 0.000 1.000 N NA
 2203815 2203816 RL1551 RL1552 dnaC rplI FALSE 0.011 337.000 0.048 1.000 N NA
 2203816 2203817 RL1552 RL1553 rplI   TRUE 0.571 23.000 0.043 NA   NA
 2203817 2203818 RL1553 RL1554   rpsR FALSE 0.121 157.000 0.033 NA   NA
 2203818 2203819 RL1554 RL1555 rpsR rpsF TRUE 0.986 15.000 0.319 0.008 Y NA
 2203819 2203820 RL1555 RL1556 rpsF   FALSE 0.005 316.000 0.000 1.000 N NA
 2203821 2203822 RL1557 RL1558 fabD fabG TRUE 0.971 52.000 0.432 0.002 Y NA
 2203822 2203823 RL1558 RL1559 fabG acpP FALSE 0.381 287.000 0.321 0.002 Y NA
 2203823 2203824 RL1559 RL1560 acpP fabF TRUE 0.775 93.000 0.106 1.000 Y NA
 2203824 2203825 RL1560 RL1561 fabF pabC FALSE 0.135 184.000 0.134 NA   NA
 2203825 2203826 RL1561 RL1562 pabC   TRUE 0.646 19.000 0.060 NA   NA
 2203826 2203827 RL1562 RL1563   gmk TRUE 0.957 4.000 0.276 NA   NA
 2203828 2203829 RL1564 RL1565 ksgA pdxA TRUE 0.964 0.000 0.197 1.000 N NA
 2203829 2203830 RL1565 RL1566 pdxA   TRUE 0.976 7.000 0.561 1.000 N NA
 2203830 2203831 RL1566 RL1567     FALSE 0.128 184.000 0.112 1.000 N NA
 2203831 2203832 RL1567 RL1568     TRUE 0.963 0.000 0.153 1.000   NA
 2203832 2203833 RL1568 RL1569     TRUE 0.997 -3.000 0.631 0.055   NA
 2203833 2203834 RL1569 RL1570     FALSE 0.233 101.000 0.012 1.000   NA
 2203835 2203836 RL1571 RL1572 pepA   TRUE 0.969 0.000 0.230 1.000 N NA
 2203837 2203838 RL1573 RL1574     FALSE 0.280 34.000 0.000 NA   NA
 2203838 2203839 RL1574 RL1575     FALSE 0.305 107.000 0.068 1.000   NA
 2203839 2203840 RL1575 RL1576     FALSE 0.024 224.000 0.000 1.000   NA
 2203840 2203841 RL1576 RL1577     FALSE 0.177 158.000 0.067 1.000   NA
 2203841 2203842 RL1577 RL1578   dinB FALSE 0.158 176.000 0.136 NA   NA
 2203843 2203844 RL1579 RL1580   ndk FALSE 0.250 82.000 0.010 1.000 N NA
 2203845 2203846 RL1581 RL1582     TRUE 0.995 -3.000 0.714 NA   NA
 2203848 2203849 RL1584 RL1585 moaE moaD TRUE 0.798 197.000 0.501 0.002 Y NA
 2203849 2203850 RL1585 RL1586 moaD pgsA TRUE 0.956 -3.000 0.082 1.000 N NA
 2203850 2203851 RL1586 RL1587 pgsA uvrC FALSE 0.161 193.000 0.227 1.000 N NA
 2203851 2203852 RL1587 RL1588 uvrC fabG TRUE 0.926 -3.000 0.014 1.000 N NA
 2203854 2203855 RL1590 RL1591     FALSE 0.407 61.000 0.024 1.000   NA
 2203856 2203857 RL1592 RL1593   nudF TRUE 0.965 -3.000 0.123 1.000 N NA
 2203857 2203858 RL1593 RL1594 nudF phnM FALSE 0.214 145.000 0.096 1.000 N NA
 2203859 2203860 RL1595 RL1596 purN purM TRUE 0.998 -3.000 0.230 0.001 Y NA
 2203861 2203862 RL1597 RL1598     TRUE 0.975 -7.000 0.362 NA   NA
 2203862 2203863 RL1598 RL1599   ppk FALSE 0.470 67.000 0.134 NA N NA
 2203863 2203864 RL1599 RL1600 ppk ppx TRUE 0.965 13.000 0.149 1.000 Y NA
 2203865 2203866 RL1601 RL1602   cya FALSE 0.392 107.000 0.195 NA   NA
 2203866 2203867 RL1602 RL1603 cya rnd FALSE 0.077 177.000 0.015 1.000 N NA
 2203867 2203868 RL1603 RL1604 rnd cumA FALSE 0.094 165.000 0.017 1.000 N NA
 2203873 2203874 RL1609 RL1610 parC   FALSE 0.021 212.000 0.000 NA   NA
 2203875 2203876 RL1611 RL1612 doc   TRUE 0.917 0.000 0.035 NA   NA
 2203876 2203877 RL1612 RL1613A     TRUE 0.608 58.000 0.208 NA   NA
 2203877 2203878 RL1613A RL1614     TRUE 0.895 1.000 0.024 NA   NA
 2203878 2203879 RL1614 RL1615     FALSE 0.094 203.000 0.128 NA   NA
 2203879 2203880 RL1615 RL1616   hemB FALSE 0.259 102.000 0.055 NA   NA
 2203881 2203882 RL1617 RL1618     FALSE 0.313 129.000 0.192 NA   NA
 2203882 2203883 RL1618 RL1618A     FALSE 0.003 447.000 0.000 1.000   NA
 2203883 2203884 RL1618A RL1620   glyA FALSE 0.135 191.000 0.123 1.000   NA
 2203884 2203885 RL1620 RL1621 glyA ribD FALSE 0.003 490.000 0.002 1.000 N NA
 2203885 2203886 RL1621 RL1622 ribD ribC TRUE 0.997 -3.000 0.456 1.000 Y NA
 2203887 2203888 RL1623 RL1624 rfbA rfbD TRUE 0.995 5.000 0.333 0.004 Y NA
 2203888 2203889 RL1624 RL1625 rfbD rfbB TRUE 0.991 4.000 0.034 0.004 Y NA
 2203889 2203890 RL1625 RL1626 rfbB rfbC TRUE 0.989 7.000 0.337 1.000 Y NA
 2203890 2203891 RL1626 RL1627 rfbC   TRUE 0.564 25.000 0.048 NA   NA
 2203891 2203892 RL1627 RL1628     FALSE 0.003 362.000 0.000 NA   NA
 2203892 2203893 RL1628 RL1629     FALSE 0.002 441.000 0.000 NA   NA
 2203893 2203894 RL1629 RL1630     TRUE 0.644 27.000 0.110 NA   NA
 2203894 2203895 RL1630 RL1631     FALSE 0.051 220.000 0.067 NA   NA
 2203896 2203897 RL1632 RL1633 ribH nusB TRUE 0.968 4.000 0.347 1.000 N NA
 2203897 2203898 RL1633 RL1634 nusB hppA FALSE 0.040 181.000 0.000 1.000 N NA
 2203900 2203901 RL1636 RL1637     TRUE 0.789 12.000 0.071 NA   NA
 2203901 2203902 RL1637 RL1638   plsX FALSE 0.252 99.000 0.044 NA   NA
 2203902 2203903 RL1638 RL1639 plsX fabH TRUE 0.983 21.000 0.380 0.002 Y NA
 2203903 2203904 RL1639 RL1640 fabH ihfA FALSE 0.409 109.000 0.207 1.000 N NA
 2203904 2203905 RL1640 RL1641 ihfA   FALSE 0.525 158.000 0.535 1.000 N NA
 2203909 2203910 RL1645 RL1646   bcsA TRUE 0.615 139.000 0.571 NA   NA
 2203910 2203911 RL1646 RL1647 bcsA celB TRUE 0.990 -3.000 0.143 0.001   NA
 2203911 2203912 RL1647 RL1648 celB celY TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2203912 2203913 RL1648 RL1649 celY   FALSE 0.115 126.000 0.000 1.000   NA
 2203913 2203914 RL1649 RL1650     FALSE 0.453 116.000 0.250 1.000   NA
 2203914 1572251 RL1650 RLt48   tRNA-Pro FALSE 0.116 99.000 0.000 NA   NA
 2203916 2203917 RL1652 RL1653     FALSE 0.002 434.000 0.000 NA   NA
 2203918 2203919 RL1654 RL1655     TRUE 0.612 74.000 0.231 1.000   NA
 2203919 2203920 RL1655 RL1656     FALSE 0.003 411.000 0.000 1.000   NA
 2203921 2203922 RL1657 RL1658     TRUE 0.901 127.000 0.750 NA Y NA
 2203922 2203923 RL1658 RL1659     TRUE 0.999 -3.000 0.905 NA Y NA
 2203924 2203925 RL1660 RL1661   cpsA TRUE 0.985 -3.000 0.357 NA   NA
 2203925 2203926 RL1661 RL1662 cpsA   TRUE 0.933 75.000 0.500 1.000 Y NA
 2203926 2203927 RL1662 RL1663     TRUE 0.996 4.000 0.571 1.000 Y NA
 2203931 2203932 RL1667 RL1668   argC FALSE 0.103 184.000 0.046 1.000   NA
 2203932 2203933 RL1668 RL1669 argC speB TRUE 0.861 61.000 0.124 1.000 Y NA
 2203933 2203934 RL1669 RL1670 speB   FALSE 0.055 193.000 0.015 1.000 N NA
 2203934 2203935 RL1670 RL1671     FALSE 0.330 25.000 0.000 NA   NA
 2203935 2203936 RL1671 RL1672   rpsI FALSE 0.156 80.000 0.000 NA   NA
 2203936 2203937 RL1672 RL1673 rpsI rplM TRUE 0.996 2.000 0.231 0.008 Y NA
 2203937 2203938 RL1673 RL1674 rplM   FALSE 0.005 315.000 0.000 1.000 N NA
 2203940 2203941 RL1676 RL1677     FALSE 0.002 476.000 0.000 NA   NA
 2203942 2203943 RL1678 RL1679   cysD FALSE 0.193 118.000 0.040 NA   NA
 2203943 2203944 RL1679 RL1680 cysD   TRUE 0.695 24.000 0.140 NA   NA
 2203944 2203945 RL1680 RL1681     FALSE 0.015 232.000 0.000 NA   NA
 2203945 2203946 RL1681 RL1682     FALSE 0.010 266.000 0.000 1.000 N NA
 2203946 2203947 RL1682 RL1683     FALSE 0.450 199.000 0.000 0.002 Y NA
 2203947 2203948 RL1683 RL1684     TRUE 0.998 3.000 0.537 0.002 Y NA
 2203948 2203949 RL1684 RL1685     TRUE 0.999 -3.000 0.526 0.002 Y NA
 2203950 2203951 RL1686 RL1687     TRUE 0.802 12.000 0.080 1.000 N NA
 2203952 2203953 RL1688 RL1689 clpP clpX FALSE 0.206 304.000 0.352 1.000 Y NA
 2203953 2203954 RL1689 RL1690 clpX lon FALSE 0.064 404.000 0.201 1.000 Y NA
 2203954 2203955 RL1690 RL1691 lon hu FALSE 0.058 207.000 0.043 1.000 N NA
 2203955 2203956 RL1691 RL1692 hu   FALSE 0.002 426.000 0.000 NA   NA
 2203956 2203957 RL1692 RL1693     FALSE 0.245 96.000 0.033 NA   NA
 2203961 2203962 RL1697 RL1698     FALSE 0.154 134.000 0.030 NA   NA
 2203963 1572301 RL1699 RLt61   tRNA-Val FALSE 0.033 186.000 0.000 NA   NA
 1572302 1572303 RLt19 RLt20 tRNA-Asp tRNA-Asp FALSE 0.146 85.000 0.000 NA   NA
 1572303 2203964 RLt20 RL1700 tRNA-Asp nqo1 FALSE 0.012 244.000 0.000 NA   NA
 2203964 2203965 RL1700 RL1701 nqo1 nqo6 TRUE 0.997 -9.000 0.396 0.002 Y NA
 2203965 2203966 RL1701 RL1702 nqo6 nqo5 TRUE 0.979 19.000 0.262 0.002 Y NA
 2203966 2203967 RL1702 RL1703 nqo5 nqo4 TRUE 0.967 68.000 0.483 0.005 Y NA
 2203967 2203968 RL1703 RL1704 nqo4 nqo2 FALSE 0.385 289.000 0.355 0.005 Y NA
 2203968 2203969 RL1704 RL1705 nqo2 nqo1 TRUE 0.992 11.000 0.343 0.005 Y NA
 2203969 2203970 RL1705 RL1706 nqo1   TRUE 0.611 84.000 0.024 0.005   NA
 2203970 2203971 RL1706 RL1707   nqo3 FALSE 0.128 219.000 0.006 0.005   NA
 2203971 2203972 RL1707 RL1708 nqo3 nuoH TRUE 0.993 13.000 0.515 0.005 Y NA
 2203972 2203973 RL1708 RL1709 nuoH nuoI TRUE 0.978 41.000 0.500 0.005 Y NA
 2203973 2203974 RL1709 RL1710 nuoI nqo10 TRUE 0.893 145.000 0.442 0.005 Y NA
 2203974 2203975 RL1710 RL1711 nqo10 nuoK TRUE 0.985 24.000 0.484 0.002 Y NA
 2203975 2203976 RL1711 RL1712 nuoK nqo14 TRUE 0.995 8.000 0.451 0.005 Y NA
 2203976 2203977 RL1712 RL1713 nqo14 nuoM TRUE 0.997 0.000 0.251 0.001 Y NA
 2203977 2203978 RL1713 RL1714 nuoM nuoN TRUE 0.988 19.000 0.453 0.001 Y NA
 2203978 2203979 RL1714 RL1715 nuoN birA TRUE 0.982 0.000 0.372 1.000 N NA
 2203979 2203980 RL1715 RL1716 birA   TRUE 0.873 18.000 0.307 1.000   NA
 2203980 2203981 RL1716 RL1717     TRUE 0.936 3.000 0.105 1.000   NA
 2203981 2203982 RL1717 RL1718     FALSE 0.328 118.000 0.172 NA   NA
 2203982 2203983 RL1718 RL1719   proS FALSE 0.002 591.000 0.006 NA   NA
 2203983 2203984 RL1719 RL1720 proS   TRUE 0.721 16.000 0.076 1.000 N NA
 2203984 2203985 RL1720 RL1721     TRUE 0.953 15.000 0.620 1.000 N NA
 2203988 2203989 RL1724 RL1725     FALSE 0.434 74.000 0.063 1.000   NA
 2203991 2203992 RL1727 RL1728     TRUE 0.959 3.000 0.256 NA   NA
 2203993 2203994 RL1729 RL1730     TRUE 0.986 19.000 0.461 0.017 Y NA
 2203995 2203996 RL1731 RL1732 rpmG   FALSE 0.255 93.000 0.028 1.000 N NA
 2203996 2203997 RL1732 RL1733     FALSE 0.010 255.000 0.000 NA   NA
 2203997 2203998 RL1733 RL1734   rnr FALSE 0.193 124.000 0.050 NA   NA
 2203998 2203999 RL1734 RL1735 rnr topA TRUE 0.908 2.000 0.045 1.000 N NA
 2203999 2204000 RL1735 RL1736 topA smf FALSE 0.273 249.000 0.238 1.000 Y NA
 2204000 2204001 RL1736 RL1737 smf   TRUE 0.947 0.000 0.070 1.000   NA
 2204001 2204002 RL1737 RL1738   pyrC FALSE 0.477 77.000 0.108 1.000   NA
 2204002 2204003 RL1738 RL1739 pyrC pyrB TRUE 0.997 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 2204006 2204007 RL1742 RL1743     FALSE 0.129 376.000 0.396 1.000 Y NA
 2204007 2204008 RL1743 RL1744   prfB FALSE 0.011 332.000 0.041 1.000 N NA
 2204008 2204009 RL1744 RL1745 prfB   FALSE 0.005 324.000 0.000 1.000 N NA
 2204009 2204010 RL1745 RL1746     TRUE 0.880 44.000 0.133 NA Y NA
 2204010 2204011 RL1746 RL1747     TRUE 0.798 89.000 0.174 NA Y NA
 2204011 2204012 RL1747 RL1748     TRUE 0.550 59.000 0.192 NA N NA
 2204012 2204013 RL1748 RL1749   dhaK TRUE 0.638 23.000 0.077 1.000 N NA
 2204013 2204014 RL1749 RL1750 dhaK dhaL1 TRUE 0.983 16.000 0.263 0.002 Y NA
 2204014 2204015 RL1750 RL1751 dhaL1   TRUE 0.814 158.000 0.263 0.002 Y NA
 2204015 2204016 RL1751 RL1752   dhaL2 TRUE 0.989 59.000 1.000 0.002 Y NA
 2204017 2204018 RL1753 RL1754     TRUE 0.664 35.000 0.182 NA   NA
 2204018 2204019 RL1754 RL1755   ppnK TRUE 0.888 5.000 0.080 NA   NA
 1572362 1572363 RLt59 RLt28 tRNA-Tyr tRNA-Gly FALSE 0.322 26.000 0.000 NA   NA
 1572363 2204021 RLt28 RL1757 tRNA-Gly tufB1 FALSE 0.005 320.000 0.000 NA   NA
 2204021 2204022 RL1757 RL1758 tufB1   FALSE 0.002 509.000 0.000 1.000 N NA
 2204022 1572366 RL1758 RLt58   tRNA-Trp FALSE 0.045 169.000 0.000 NA   NA
 1572366 2204023 RLt58 RL1759 tRNA-Trp secE FALSE 0.036 181.000 0.000 NA   NA
 2204023 2204024 RL1759 RL1760 secE nusG TRUE 0.963 18.000 0.843 1.000 N NA
 2204024 2204025 RL1760 RL1761 nusG rplK FALSE 0.530 178.000 0.681 1.000 N NA
 2204025 2204026 RL1761 RL1762 rplK rplA TRUE 0.998 5.000 0.838 0.010 Y NA
 2204026 2204027 RL1762 RL1763 rplA   FALSE 0.035 183.000 0.000 NA   NA
 2204027 2204028 RL1763 RL1764   rplJ TRUE 0.738 4.000 0.000 NA   NA
 2204028 2204029 RL1764 RL1765 rplJ rplL TRUE 0.975 59.000 0.884 1.000 Y NA
 2204029 2204030 RL1765 RL1766 rplL rpoB FALSE 0.064 264.000 0.223 1.000   NA
 2204030 2204031 RL1766 RL1767 rpoB rpoC TRUE 0.748 191.000 0.851 0.000   NA
 2204033 2204034 RL1769 RL1770 rpsL rpsG TRUE 0.973 78.000 0.620 0.001 Y NA
 2204034 2204035 RL1770 RL1771 rpsG fus TRUE 0.911 30.000 0.114 1.000 Y NA
 2204035 2204036 RL1771 RL1772 fus tufB2 TRUE 0.921 69.000 0.102 0.001 Y NA
 2204036 2204037 RL1772 RL1773 tufB2 rpsJ TRUE 0.722 155.000 0.318 1.000 Y NA
 2204037 2204038 RL1773 RL1774 rpsJ rplC TRUE 0.964 40.000 0.307 0.010 Y NA
 2204038 2204039 RL1774 RL1775 rplC rplD TRUE 0.991 14.000 0.486 0.008 Y NA
 2204039 2204040 RL1775 RL1776 rplD rplW TRUE 0.998 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 2204040 2204041 RL1776 RL1777 rplW rplB TRUE 0.994 12.000 0.849 1.000 Y NA
 2204041 2204042 RL1777 RL1778 rplB rpsS TRUE 0.995 16.000 0.820 0.010 Y NA
 2204042 2204043 RL1778 RL1779 rpsS rplV TRUE 0.993 3.000 0.119 0.010 Y NA
 2204043 2204044 RL1779 RL1780 rplV rpsC TRUE 0.995 0.000 0.109 0.010 Y NA
 2204044 2204045 RL1780 RL1781 rpsC rplP TRUE 0.989 37.000 0.828 0.010 Y NA
 2204045 2204046 RL1781 RL1782 rplP rpmC TRUE 0.997 12.000 0.802 0.008 Y NA
 2204046 2204047 RL1782 RL1783 rpmC rpsQ TRUE 0.996 13.000 0.828 0.008 Y NA
 2204047 2204048 RL1783 RL1784 rpsQ rplN TRUE 0.696 259.000 0.791 0.010 Y NA
 2204048 2204049 RL1784 RL1785 rplN rplX TRUE 0.997 12.000 0.810 0.010 Y NA
 2204049 2204050 RL1785 RL1786 rplX rplE TRUE 0.999 -7.000 0.758 0.008 Y NA
 2204050 2204051 RL1786 RL1787 rplE rpsN TRUE 0.970 33.000 0.309 0.008 Y NA
 2204051 2204052 RL1787 RL1788 rpsN rpsH TRUE 0.988 13.000 0.295 0.008 Y NA
 2204052 2204053 RL1788 RL1789 rpsH rplF TRUE 0.988 43.000 0.808 0.008 Y NA
 2204053 2204054 RL1789 RL1790 rplF rplR TRUE 0.996 13.000 0.815 0.008 Y NA
 2204054 2204055 RL1790 RL1791 rplR rpsE TRUE 0.952 132.000 0.814 0.010 Y NA
 2204055 2204056 RL1791 RL1792 rpsE rpmD TRUE 0.995 15.000 0.789 0.010 Y NA
 2204056 2204057 RL1792 RL1793 rpmD rplO TRUE 0.993 17.000 0.653 0.001 Y NA
 2204057 2204058 RL1793 RL1794 rplO secY FALSE 0.297 235.000 0.730 1.000 N NA
 2204058 2204059 RL1794 RL1795 secY adk TRUE 0.921 -3.000 0.010 1.000 N NA
 2204059 2204060 RL1795 RL1796 adk rpsM FALSE 0.018 223.000 0.000 1.000 N NA
 2204060 2204061 RL1796 RL1797 rpsM rpsK TRUE 0.952 134.000 0.810 0.008 Y NA
 2204061 2204062 RL1797 RL1798 rpsK rpoA TRUE 0.557 98.000 0.308 1.000 N NA
 2204062 2204063 RL1798 RL1799 rpoA rplQ TRUE 0.787 124.000 0.873 1.000 N NA
 2204063 2204064 RL1799 RL1800 rplQ   FALSE 0.216 84.000 0.003 NA   NA
 2204065 2204066 RL1801 RL1802     TRUE 0.997 0.000 0.790 0.048   NA
 2204068 2204069 RL1804 RL1805     TRUE 0.711 24.000 0.161 NA   NA
 2204070 2204071 RL1806 RL1807 degQ   TRUE 0.947 -3.000 0.051 1.000 N NA
 2204072 2204073 RL1808 RL1809     FALSE 0.194 133.000 0.062 NA   NA
 2204073 2204074 RL1809 RL1810     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2204074 2204075 RL1810 RL1811   dapA FALSE 0.126 94.000 0.000 NA   NA
 2204077 2204078 RL1813 RL1814     FALSE 0.267 104.000 0.034 1.000   NA
 2204082 2204083 RL1818 RL1819     TRUE 0.598 64.000 0.214 NA   NA
 2204084 2204085 RL1820 RL1821     TRUE 0.963 0.000 0.192 1.000 N NA
 2204085 2204086 RL1821 RL1822     TRUE 0.999 -7.000 0.909 0.091 Y NA
 2204086 2204087 RL1822 RL1823     TRUE 0.993 -6.000 0.562 0.091 N NA
 2204087 2204088 RL1823 RL1824     FALSE 0.165 191.000 0.250 NA N NA
 2204088 2204089 RL1824 RL1825     TRUE 0.713 129.000 0.235 NA Y NA
 2204089 2204090 RL1825 RL1826     TRUE 0.987 -3.000 0.000 NA Y NA
 2204090 2204091 RL1826 RL1827     TRUE 0.971 4.000 0.000 NA Y NA
 2204091 2204092 RL1827 RL1828     TRUE 0.925 16.000 0.474 1.000 N NA
 2204092 2204093 RL1828 RL1829     TRUE 0.963 43.000 0.263 0.001 Y NA
 2204093 2204094 RL1829 RL1830     TRUE 0.858 25.000 0.147 0.048   NA
 2204094 2204095 RL1830 RL1831     TRUE 0.963 7.000 0.176 0.048   NA
 2204096 2204097 RL1832 RL1833 exoA   FALSE 0.126 169.000 0.068 NA   NA
 2204099 2204100 RL1835 RL1836     TRUE 0.994 3.000 0.182 0.020 Y NA
 2204100 2204101 RL1836 RL1837     TRUE 0.563 63.000 0.182 NA   NA
 2204104 2204105 RL1840 RL1841     TRUE 0.556 144.000 0.500 NA   NA
 2204105 2204106 RL1841 RL1842     FALSE 0.020 214.000 0.000 NA   NA
 2204106 2204107 RL1842 RL1843     TRUE 0.805 111.000 0.833 NA   NA
 2204112 2204113 RL1848 RL1849     FALSE 0.002 483.000 0.000 NA   NA
 2204113 2204114 RL1849 RL1850     FALSE 0.007 290.000 0.000 NA   NA
 2204114 2204115 RL1850 RL1851     TRUE 0.868 34.000 0.500 NA   NA
 2204115 2204116 RL1851 RL1852     FALSE 0.059 154.000 0.000 NA   NA
 2204116 2204117 RL1852 RL1853     TRUE 0.800 -3.000 0.000 NA N NA
 2204117 2204118 RL1853 RL1854     TRUE 0.991 -6.000 0.750 NA N NA
 2204119 2204120 RL1855 RL1856     FALSE 0.279 81.000 0.024 NA   NA
 2204126 2204127 RL1863 RL1864   hmgA FALSE 0.454 62.000 0.077 1.000 N NA
 2204127 2204128 RL1864 RL1865 hmgA   TRUE 0.872 41.000 0.060 1.000 Y NA
 2204128 2204129 RL1865 RL1866     TRUE 0.984 -3.000 0.310 1.000 N NA
 2204129 2204130 RL1866 RL1867     FALSE 0.003 358.000 0.000 NA   NA
 2204131 2204132 RL1868 RL1869     FALSE 0.205 67.000 0.000 1.000 N NA
 2204133 2204134 RL1870 RL1871 dksA   FALSE 0.325 29.000 0.000 1.000 N NA
 2204136 2204137 RL1873 RL1874     TRUE 0.907 47.000 0.750 NA   NA
 2204137 2204138 RL1874 RL1875     FALSE 0.004 345.000 0.000 NA   NA
 2204138 2204139 RL1875 RL1876   adh FALSE 0.153 82.000 0.000 NA   NA
 2204139 2204140 RL1876 RL1877 adh   FALSE 0.146 109.000 0.000 1.000   NA
 2204140 2204141 RL1877 RL1878     FALSE 0.418 125.000 0.250 1.000   NA
 2204142 2204143 RL1879 RL1880     TRUE 0.971 -22.000 0.000 1.000 Y NA
 2204148 2204149 RL1885 RL1886   pduW FALSE 0.005 327.000 0.000 1.000 N NA
 2204149 2204150 RL1886 RL1887 pduW   FALSE 0.002 479.000 0.000 NA   NA
 2204150 2204151 RL1887 RL1888     FALSE 0.355 22.000 0.000 NA   NA
 2204151 2204152 RL1888 RL1889     FALSE 0.098 112.000 0.000 NA   NA
 2204152 2204153 RL1889 RL1890     FALSE 0.210 57.000 0.000 NA   NA
 2204153 2204154 RL1890 RL1891     TRUE 0.780 -7.000 0.000 NA   NA
 2204154 2204155 RL1891 RL1892     TRUE 0.944 -7.000 0.000 0.054 N NA
 2204155 2204156 RL1892 RL1893     TRUE 0.643 12.000 0.000 1.000   NA
 2204156 2204157 RL1893 RL1894     TRUE 0.566 99.000 0.333 NA   NA
 2204157 2204158 RL1894 RL1895     FALSE 0.074 135.000 0.000 NA   NA
 2204158 2204159 RL1895 RL1896     FALSE 0.002 458.000 0.000 NA   NA
 2204160 2204161 RL1897 RL1898     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2204161 2204162 RL1898 RL1899     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2204162 2204163 RL1899 RL1900     TRUE 0.708 5.000 0.000 NA   NA
 2204163 2204164 RL1900 RL1901     FALSE 0.481 14.000 0.000 NA   NA
 2204164 2204165 RL1901 RL1902     FALSE 0.119 98.000 0.000 NA   NA
 2204165 2204166 RL1902 RL1904     FALSE 0.001 772.000 0.000 NA   NA
 2204166 2204167 RL1904 RL1905     FALSE 0.156 80.000 0.000 NA   NA
 2204169 2204170 RL1907 RL1908     TRUE 0.978 2.000 0.400 NA   NA
 2204170 2204171 RL1908 RL1909     TRUE 0.661 7.000 0.000 NA   NA
 2204171 2204172 RL1909 RL1910     TRUE 0.960 -3.000 0.105 NA   NA
 2204172 2204173 RL1910 RL1911     FALSE 0.306 29.000 0.000 NA   NA
 2204173 2204174 RL1911 RL1912     FALSE 0.012 243.000 0.000 NA   NA
 2204174 2204175 RL1912 RL1913     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2204175 2204176 RL1913 RL1914     TRUE 0.934 -3.000 0.029 NA   NA
 2204176 2204177 RL1914 RL1915     TRUE 0.883 -13.000 0.051 NA   NA
 2204177 2204178 RL1915 RL1916     TRUE 0.952 0.000 0.128 NA   NA
 2204178 2204179 RL1916 RL1917     TRUE 0.993 -3.000 0.609 NA   NA
 2204179 2204180 RL1917 RL1918     TRUE 0.577 57.000 0.130 1.000   NA
 2204180 2204181 RL1918 RL1919     FALSE 0.143 167.000 0.087 NA   NA
 2204181 2204182 RL1919 RL1920     TRUE 0.801 1.000 0.000 NA   NA
 2204182 2204183 RL1920 RL1921     FALSE 0.355 22.000 0.000 NA   NA
 2204183 2204184 RL1921 RL1922     FALSE 0.208 84.000 0.000 1.000   NA
 2204184 2204185 RL1922 RL1923     FALSE 0.131 92.000 0.000 NA   NA
 2204186 2204187 RL1924 RL1925     FALSE 0.050 163.000 0.000 NA   NA
 2204187 2204188 RL1925 RL1926     FALSE 0.198 63.000 0.000 NA   NA
 2204188 2204189 RL1926 RL1927     FALSE 0.001 527.000 0.000 NA   NA
 2204189 2204190 RL1927 RL1928     FALSE 0.167 76.000 0.000 NA   NA
 2204190 2204191 RL1928 RL1929     FALSE 0.077 130.000 0.000 NA   NA
 2204191 2204192 RL1929 RL1930     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 2204192 2204193 RL1930 RL1931     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2204196 2204197 RL1934 RL1935     FALSE 0.097 113.000 0.000 NA   NA
 2204197 2204198 RL1935 RL1936     TRUE 0.736 -13.000 0.000 NA   NA
 2204198 2204199 RL1936 RL1937     FALSE 0.005 310.000 0.000 NA   NA
 2204199 2204200 RL1937 RL1938     FALSE 0.194 65.000 0.000 NA   NA
 2204204 2204205 RL1942 RL1943     TRUE 0.765 67.000 0.438 NA   NA
 2204205 2204206 RL1943 RL1944     TRUE 0.773 11.000 0.042 NA   NA
 2204206 2204207 RL1944 RL1945     FALSE 0.003 356.000 0.000 NA   NA
 2204209 2204210 RL1947 RL1948   gpt FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 2204210 2204211 RL1948 RL1949 gpt   FALSE 0.084 182.000 0.016 1.000   NA
 2204211 2204212 RL1949 RL1950     FALSE 0.222 109.000 0.016 1.000   NA
 2204213 1572558 RL1951 RLt34 wrbA tRNA-Leu FALSE 0.018 218.000 0.000 NA   NA
 2204215 2204216 RL1953 RL1954 ilvA   FALSE 0.498 38.000 0.056 NA   NA
 2204216 2204217 RL1954 RL1955     FALSE 0.013 236.000 0.000 NA   NA
 2204217 2204218 RL1955 RL1956     FALSE 0.259 170.000 0.231 1.000   NA
 2204225 2204226 RL1963 RL1964     FALSE 0.458 86.000 0.172 NA   NA
 2204226 2204227 RL1964 RL1965     FALSE 0.130 180.000 0.138 NA N NA
 2204228 2204229 RL1966 RL1967 ald   FALSE 0.083 131.000 0.000 1.000 N NA
 2204229 2204230 RL1967 RL1968     FALSE 0.306 29.000 0.000 NA   NA
 2204230 2204231 RL1968 RL1969     TRUE 0.738 4.000 0.000 NA   NA
 2204231 2204232 RL1969 RL1970     TRUE 0.656 67.000 0.040 0.055   NA
 2204232 2204233 RL1970 RL1971     FALSE 0.375 64.000 0.040 NA   NA
 2204234 2204235 RL1972 RL1973     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 2204236 2204237 RL1974 RL1975     FALSE 0.330 25.000 0.000 NA   NA
 2204238 2204239 RL1976 RL1977   sseA TRUE 0.923 6.000 0.200 NA   NA
 2204239 1572585 RL1977 RL1978 sseA   FALSE 0.355 22.000 0.000 NA   NA
 1572585 2204240 RL1978 RL1979   cysB TRUE 0.661 7.000 0.000 NA   NA
 2204241 2204242 RL1980 RL1981     FALSE 0.263 100.000 0.053 NA   NA
 2204243 2204244 RL1982 RL1983 cfa   FALSE 0.013 326.000 0.062 NA   NA
 2204244 2204245 RL1983 RL1984     TRUE 0.995 -3.000 0.722 NA   NA
 2204245 2204246 RL1984 RL1985   phr TRUE 0.945 -3.000 0.023 1.000   NA
 2204246 2204247 RL1985 RL1986 phr   FALSE 0.102 151.000 0.008 NA   NA
 2204248 2204249 RL1987 RL1988     TRUE 0.585 114.000 0.429 NA   NA
 2204250 2204251 RL1989 RL1990 nasA nirD TRUE 0.986 1.000 0.294 0.047 N NA
 2204251 2204252 RL1990 RL1991 nirD nasD TRUE 0.991 5.000 0.539 0.000 N NA
 2204252 2204253 RL1991 RL1992 nasD narK TRUE 0.621 18.000 0.033 1.000 N NA
 2204253 2204254 RL1992 RL1993 narK   FALSE 0.019 482.000 0.000 NA Y NA
 2204254 2204255 RL1993 RL1994   nasT TRUE 0.839 35.000 0.466 NA N NA
 2204255 2204256 RL1994 RL1995 nasT   FALSE 0.293 74.000 0.015 1.000 N NA
 2204257 2204258 RL1996 RL1997     TRUE 0.968 63.000 0.833 NA Y NA
 2204258 2204259 RL1997 RL1998     TRUE 0.999 -3.000 0.909 1.000 Y NA
 2204259 2204260 RL1998 RL1999     TRUE 0.991 18.000 1.000 NA Y NA
 2204260 2204261 RL1999 RL2000     FALSE 0.535 119.000 0.000 NA Y NA
 2204261 2204262 RL2000 RL2001   dctP TRUE 0.994 14.000 1.000 1.000 Y NA
 2204262 2204263 RL2001 RL2002 dctP   FALSE 0.103 114.000 0.000 1.000 N NA
 2204263 2204264 RL2002 RL2003     FALSE 0.004 361.000 0.000 1.000 N NA
 2204264 2204265 RL2003 RL2004     FALSE 0.151 83.000 0.000 NA   NA
 2204267 2204268 RL2006 RL2007     FALSE 0.279 98.000 0.059 NA   NA
 2204269 2204270 RL2008 RL2009     FALSE 0.155 86.000 0.000 1.000 N NA
 2204270 2204271 RL2009 RL2010     TRUE 0.901 18.000 0.000 1.000 Y NA
 2204271 2204272 RL2010 RL2011     TRUE 0.988 8.000 0.400 NA Y NA
 2204272 2204273 RL2011 RL2012     TRUE 0.995 -3.000 0.250 NA Y NA
 2204273 2204274 RL2012 RL2013     TRUE 0.860 102.000 0.409 NA Y NA
 2204275 2204276 RL2014 RL2015     FALSE 0.101 110.000 0.000 NA   NA
 2204277 2204278 RL2016 RL2017     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2204278 2204279 RL2017 RL2018     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 2204279 2204280 RL2018 RL2019     TRUE 0.956 -3.000 0.087 NA   NA
 2204280 1572627 RL2019 RL2020     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 1572627 10691949 RL2020 RL2021     TRUE 0.686 -128.000 0.000 NA   NA
 10691949 2204281 RL2021 RL2022     FALSE 0.194 65.000 0.000 NA   NA
 2204281 2204282 RL2022 RL2023   phaZ FALSE 0.233 55.000 0.000 1.000 N NA
 2204282 2204283 RL2023 RL2024 phaZ katE FALSE 0.008 286.000 0.000 1.000 N NA
 2204283 2204284 RL2024 RL2025 katE   FALSE 0.023 207.000 0.000 NA   NA
 2204284 2204285 RL2025 RL2026     FALSE 0.001 879.000 0.000 NA   NA
 2204285 1572633 RL2026 RLt18   tRNA-Asn FALSE 0.001 827.000 0.000 NA   NA
 2204286 2204287 RL2027 RL2028     TRUE 0.600 97.000 0.364 NA   NA
 1572639 2204290 RLt21 RL2032 tRNA-Cys   FALSE 0.322 26.000 0.000 NA   NA
 2204290 2204291 RL2032 RL2033     FALSE 0.009 263.000 0.000 NA   NA
 2204291 2204292 RL2033 RL2034     FALSE 0.004 335.000 0.000 NA   NA
 2204292 2204293 RL2034 RL2035   valS FALSE 0.191 116.000 0.033 NA   NA
 2204293 2204294 RL2035 RL2036 valS   FALSE 0.002 398.000 0.000 NA N NA
 2204294 2204295 RL2036 RL2037   exoR FALSE 0.001 721.000 0.000 NA   NA
 2204296 2204297 RL2038 RL2039 xthA   FALSE 0.182 122.000 0.038 NA   NA
 2204298 2204299 RL2040 RL2041 dgt argS FALSE 0.423 66.000 0.062 1.000 N NA
 2204299 2204300 RL2041 RL2042 argS   FALSE 0.411 45.000 0.027 NA   NA
 2204300 2204301 RL2042 RL2043   nagZ FALSE 0.217 117.000 0.056 NA   NA
 2204301 2204302 RL2043 RL2044 nagZ scpA FALSE 0.258 121.000 0.103 NA   NA
 2204302 2204303 RL2044 RL2045 scpA scpB TRUE 0.992 -3.000 0.570 NA   NA
 2204303 2204304 RL2045 RL2046 scpB tatA FALSE 0.093 184.000 0.060 NA   NA
 2204304 2204305 RL2046 RL2047 tatA tatB TRUE 0.888 51.000 0.353 0.004   NA
 2204305 2204306 RL2047 RL2048 tatB tatC TRUE 0.998 -3.000 0.535 NA Y NA
 2204306 2204307 RL2048 RL2049 tatC serS FALSE 0.059 201.000 0.065 NA N NA
 2204307 2204308 RL2049 RL2050 serS surE TRUE 0.895 5.000 0.058 1.000   NA
 2204308 2204309 RL2050 RL2051 surE pcm TRUE 0.972 -3.000 0.147 1.000   NA
 2204309 2204310 RL2051 RL2052 pcm   FALSE 0.066 215.000 0.089 1.000 N NA
 2204312 2204313 RL2054 RL2055   secD TRUE 0.865 46.000 0.099 NA Y NA
 2204313 2204314 RL2055 RL2056 secD   TRUE 0.876 5.000 0.060 NA   NA
 2204314 2204315 RL2056 RL2057     TRUE 0.766 18.000 0.165 NA   NA
 2204315 2204316 RL2057 RL2058     FALSE 0.384 72.000 0.059 NA   NA
 2204318 2204319 RL2060 RL2061     TRUE 0.993 -3.000 0.589 NA   NA
 2204319 1572670 RL2061 RLt35   tRNA-Leu FALSE 0.059 154.000 0.000 NA   NA
 1572670 2204320 RLt35 RL2062 tRNA-Leu tig FALSE 0.025 201.000 0.000 NA   NA
 2204320 2204321 RL2062 RL2063 tig   FALSE 0.063 177.000 0.004 NA   NA
 2204322 2204323 RL2064 RL2065     FALSE 0.291 158.000 0.214 1.000   NA
 2204323 2204324 RL2065 RL2066   sthA FALSE 0.420 65.000 0.035 1.000   NA
 2204324 2204325 RL2066 RL2067 sthA lldD FALSE 0.318 220.000 0.000 0.047 Y NA
 2204325 2204326 RL2067 RL2068 lldD radC FALSE 0.126 187.000 0.120 1.000 N NA
 2204326 2204327 RL2068 RL2069 radC map TRUE 0.902 8.000 0.169 1.000 N NA
 2204328 2204329 RL2070 RL2071     FALSE 0.475 122.000 0.333 NA   NA
 2204329 2204330 RL2071 RL2072     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 2204332 2204333 RL2074 RL2075   gatC FALSE 0.378 70.000 0.024 1.000   NA
 2204333 2204334 RL2075 RL2076 gatC gatA TRUE 0.981 57.000 0.643 0.001 Y NA
 2204334 2204335 RL2076 RL2077 gatA   TRUE 0.846 -9.000 0.002 1.000 N NA
 2204335 2204336 RL2077 RL2078     TRUE 0.591 23.000 0.053 NA   NA
 2204340 2204341 RL2082 RL2083 gatB   TRUE 0.846 4.000 0.014 1.000 N NA
 2204341 2204342 RL2083 RL2084     TRUE 0.959 5.000 0.085 0.011 N NA
 2204342 2204343 RL2084 RL2085     FALSE 0.253 104.000 0.050 1.000 N NA
 2204343 2204344 RL2085 RL2086     FALSE 0.430 116.000 0.260 NA   NA
 2204345 2204346 RL2087 RL2088 aat accC TRUE 0.881 8.000 0.114 1.000 N NA
 2204346 2204347 RL2088 RL2089 accC accB TRUE 0.993 5.000 0.153 0.001 Y NA
 2204347 2204348 RL2089 RL2090 accB   FALSE 0.527 21.000 0.014 1.000 N NA
 2204348 2204349 RL2090 RL2091     FALSE 0.177 162.000 0.110 1.000 N NA
 2204351 2204352 RL2093 RL2094   phaC FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 2204353 2204354 RL2095 RL2096     FALSE 0.037 210.000 0.009 NA   NA
 2204354 2204355 RL2096 RL2097   hom TRUE 0.875 67.000 0.202 1.000 Y NA
 2204355 2204356 RL2097 RL2098 hom   FALSE 0.081 160.000 0.004 NA   NA
 2204356 2204357 RL2098 RL2099   recJ FALSE 0.128 123.000 0.005 NA   NA
 1572709 1572710 RLt24 RLt25 tRNA-Glu tRNA-Glu FALSE 0.011 254.000 0.000 NA   NA
 1572710 1572711 RLt25 RLt26 tRNA-Glu tRNA-Glu FALSE 0.170 75.000 0.000 NA   NA
 1572711 2204358 RLt26 RL2100 tRNA-Glu   FALSE 0.026 198.000 0.000 NA   NA
 2204358 2204359 RL2100 RL2101     FALSE 0.101 168.000 0.034 NA   NA
 2204360 2204361 RL2102 RL2103 cspA   TRUE 0.953 3.000 0.226 NA   NA
 2204362 2204363 RL2103A RL2104     FALSE 0.004 322.000 0.000 NA   NA
 2204363 1572719 RL2104 RLt15   tRNA-Arg FALSE 0.207 58.000 0.000 NA   NA
 1572719 2204364 RLt15 RL2105 tRNA-Arg   FALSE 0.003 364.000 0.000 NA   NA
 2204365 2204366 RL2105A RL2107     FALSE 0.047 166.000 0.000 NA   NA
 2204367 2204368 RL2108 RL2109     FALSE 0.001 1013.000 0.000 NA   NA
 2204368 2204369 RL2109 RL2110     FALSE 0.100 111.000 0.000 NA   NA
 1572726 2204370 RL2111 RL2113     FALSE 0.090 117.000 0.000 NA   NA
 2204370 2204371 RL2113 RL2114     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2204372 2204373 RL2115 RL2116     FALSE 0.185 92.000 0.000 1.000   NA
 2204373 2204374 RL2116 RL2117   dnaE TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2204376 2204377 RL2118 RL2119     FALSE 0.004 346.000 0.000 NA   NA
 2204377 2204378 RL2119 RL2120     FALSE 0.001 568.000 0.000 NA   NA
 2204378 2204379 RL2120 RL2121     FALSE 0.003 388.000 0.000 NA   NA
 2204379 2204380 RL2121 RL2122     FALSE 0.143 86.000 0.000 NA   NA
 2204380 2204381 RL2122 RL2123     FALSE 0.365 21.000 0.000 NA   NA
 2204381 2204382 RL2123 RL2124     FALSE 0.140 88.000 0.000 NA   NA
 2204382 2204383 RL2124 RL2125     FALSE 0.055 158.000 0.000 NA   NA
 2204383 2204384 RL2125 RL2126     FALSE 0.025 200.000 0.000 NA   NA
 2204386 2204387 RL2128 RL2129     FALSE 0.015 229.000 0.000 NA   NA
 2204387 2204388 RL2129 RL2130     TRUE 0.983 12.000 1.000 NA   NA
 2204388 2204389 RL2130 RL2131     FALSE 0.007 279.000 0.000 NA   NA
 2204389 2204390 RL2131 RL2132     FALSE 0.075 134.000 0.000 NA   NA
 2204390 2204391 RL2132 RL2133     FALSE 0.074 135.000 0.000 NA   NA
 2204393 2204394 RL2135 RL2136     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 2204394 1572752 RL2136 RL2137     FALSE 0.183 70.000 0.000 NA   NA
 2204395 2204396 RL2138 RL2139     TRUE 0.992 -3.000 0.545 NA   NA
 2204398 2204399 RL2141 RL2142     TRUE 0.989 12.000 0.750 0.001   NA
 2204400 2204401 RL2144 RL2145     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2204404 2204405 RL2148 RL2149     FALSE 0.029 192.000 0.000 NA   NA
 2204405 2204406 RL2149 RL2150     FALSE 0.001 618.000 0.000 NA   NA
 2204407 2204408 RL2151 RL2152     FALSE 0.063 151.000 0.000 NA   NA
 2204408 2204409 RL2152 RL2153     FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 2204410 2204411 RL2154 RL2155     TRUE 0.690 -52.000 0.000 NA   NA
 2204411 2204412 RL2155 RL2156     FALSE 0.003 374.000 0.000 NA   NA
 2204412 2204413 RL2156 RL2157     FALSE 0.027 217.000 0.000 1.000   NA
 2204413 2204414 RL2157 RL2158     FALSE 0.085 121.000 0.000 NA   NA
 2204414 2204415 RL2158 RL2159     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2204415 2204416 RL2159 RL2160     FALSE 0.156 80.000 0.000 NA   NA
 2204420 2204421 RL2164 RL2165     FALSE 0.087 119.000 0.000 NA   NA
 2204421 2204422 RL2165 RL2166     FALSE 0.034 184.000 0.000 NA   NA
 2204423 2204424 RL2167 RL2168     FALSE 0.097 113.000 0.000 NA   NA
 2204424 2204425 RL2168 RL2169     FALSE 0.002 440.000 0.000 NA   NA
 2204426 1572785 RL2170 RL2171     FALSE 0.274 35.000 0.000 NA   NA
 1572785 2204427 RL2171 RL2172     FALSE 0.044 171.000 0.000 NA   NA
 2204427 2204428 RL2172 RL2173     TRUE 0.714 -22.000 0.000 NA   NA
 2204428 2204429 RL2173 RL2174     FALSE 0.386 19.000 0.000 NA   NA
 2204429 2204430 RL2174 RL2175     FALSE 0.001 1368.000 0.000 NA   NA
 2204430 2204431 RL2175 RL2176     FALSE 0.008 274.000 0.000 NA   NA
 2204431 2204432 RL2176 RL2177     FALSE 0.002 401.000 0.000 NA   NA
 2204433 2204434 RL2178 RL2179     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2204434 2204435 RL2179 RL2180     FALSE 0.077 160.000 0.000 1.000   NA
 2204435 2204436 RL2180 RL2181     TRUE 0.992 -3.000 0.520 1.000   NA
 2204437 2204438 RL2182 RL2183     FALSE 0.330 25.000 0.000 NA   NA
 2204438 2204439 RL2183 RL2184     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2204439 2204440 RL2184 RL2185     TRUE 0.992 2.000 0.778 NA   NA
 2204440 2204441 RL2185 RL2186     TRUE 0.968 -3.000 0.159 NA   NA
 2204441 2204442 RL2186 RL2187     FALSE 0.002 410.000 0.000 NA   NA
 2204442 2204443 RL2187 RL2188     FALSE 0.001 737.000 0.000 NA   NA
 2204443 2204444 RL2188 RL2189     FALSE 0.002 395.000 0.000 NA   NA
 2204445 2204446 RL2190 RL2191     FALSE 0.262 38.000 0.000 NA   NA
 2204446 2204447 RL2191 RL2192     FALSE 0.244 45.000 0.000 NA   NA
 2204447 2204448 RL2192 RL2193     TRUE 0.762 3.000 0.000 NA   NA
 2204448 2204449 RL2193 RL2194     TRUE 0.701 -30.000 0.000 NA   NA
 2204449 2204450 RL2194 RL2195     FALSE 0.002 432.000 0.000 NA   NA
 2204452 2204453 RL2198 RL2199     FALSE 0.219 147.000 0.111 NA   NA
 2204455 2204456 RL2201 RL2202 aapP aapM FALSE 0.437 36.000 0.019 1.000 N NA
 2204456 2204457 RL2202 RL2203 aapM aapQ TRUE 0.963 2.000 0.016 0.011 N NA
 2204457 2204458 RL2203 RL2204 aapQ aapJ TRUE 0.905 103.000 0.548 1.000 Y NA
 2204460 2204461 RL2206 RL2207     TRUE 0.932 28.000 0.745 NA   NA
 2204462 2204463 RL2208 RL2209   cysE FALSE 0.357 129.000 0.200 1.000   NA
 2204463 2204464 RL2209 RL2210 cysE   FALSE 0.472 141.000 0.386 NA   NA
 2204464 2204465 RL2210 RL2211     FALSE 0.047 166.000 0.000 NA   NA
 2204465 2204466 RL2211 RL2212   clpS FALSE 0.011 298.000 0.011 NA   NA
 2204466 2204467 RL2212 RL2213 clpS clpA TRUE 0.967 11.000 0.596 NA   NA
 2204468 2204469 RL2214 RL2215     FALSE 0.207 58.000 0.000 NA   NA
 2204469 2204470 RL2215 RL2216     FALSE 0.221 152.000 0.131 NA   NA
 2204470 2204471 RL2216 RL2217     FALSE 0.238 180.000 0.280 NA   NA
 2204471 2204472 RL2217 RL2218     TRUE 0.994 -3.000 0.696 NA N NA
 2204473 2204474 RL2219 RL2220     TRUE 0.661 7.000 0.000 NA   NA
 2204474 2204475 RL2220 RL2221   rpsB TRUE 0.661 7.000 0.000 NA   NA
 2204475 2204476 RL2221 RL2222 rpsB tsf TRUE 0.594 242.000 0.748 1.000 Y NA
 2204476 2204477 RL2222 RL2223 tsf pyrH TRUE 0.645 97.000 0.416 1.000 N NA
 2204477 2204478 RL2223 RL2224 pyrH frr TRUE 0.551 165.000 0.626 1.000 N NA
 2204478 2204479 RL2224 RL2225 frr uppS TRUE 0.823 38.000 0.409 1.000 N NA
 2204479 2204480 RL2225 RL2226 uppS cdsA TRUE 0.996 0.000 0.400 1.000 Y NA
 2204480 2204481 RL2226 RL2227 cdsA ecfE TRUE 0.597 29.000 0.080 1.000 N NA
 2204481 2204482 RL2227 RL2228 ecfE   FALSE 0.484 191.000 0.204 1.000 Y NA
 2204482 2204483 RL2228 RL2229   lpxD TRUE 0.857 51.000 0.063 1.000 Y NA
 2204483 2204484 RL2229 RL2230 lpxD fabZ TRUE 0.957 -7.000 0.212 1.000 N NA
 2204484 2204485 RL2230 RL2231 fabZ lpxA TRUE 0.980 -3.000 0.264 1.000 N NA
 2204485 2204486 RL2231 RL2232 lpxA   TRUE 0.982 4.000 0.552 NA   NA
 2204486 2204487 RL2232 RL2233   lpxB TRUE 0.970 -3.000 0.173 NA   NA
 2204491 2204492 RL2237 RL2238   kdsA TRUE 0.930 -3.000 0.023 NA   NA
 2204492 2204493 RL2238 RL2239 kdsA eno FALSE 0.168 138.000 0.041 1.000 N NA
 2204493 2204494 RL2239 RL2240 eno   FALSE 0.158 138.000 0.032 1.000 N NA
 2204494 2204495 RL2240 RL2241   pdhA FALSE 0.221 146.000 0.104 1.000 N NA
 2204495 2204496 RL2241 RL2242 pdhA pdhB TRUE 0.990 16.000 0.456 0.000 Y NA
 2204496 2204497 RL2242 RL2243 pdhB pdhC TRUE 0.965 16.000 0.254 1.000 Y NA
 2204497 2204498 RL2243 RL2244 pdhC ada TRUE 0.611 19.000 0.036 1.000 N NA
 2204498 2204499 RL2244 RL2245 ada   TRUE 0.966 3.000 0.273 1.000   NA
 2204499 2204500 RL2245 RL2246     TRUE 0.669 17.000 0.028 1.000   NA
 2204500 2204501 RL2246 RL2247     FALSE 0.346 76.000 0.021 1.000   NA
 2204501 2204502 RL2247 RL2248     TRUE 0.956 38.000 0.750 0.052   NA
 2204502 2204503 RL2248 RL2249     FALSE 0.416 47.000 0.009 1.000   NA
 2204503 2204504 RL2249 RL2250   flaR1 FALSE 0.295 18.000 0.000 NA N NA
 2204504 2204505 RL2250 RL2251 flaR1 flaR2 TRUE 0.800 43.000 0.000 NA Y NA
 2204505 2204506 RL2251 RL2252 flaR2   FALSE 0.489 10.000 0.000 NA N NA
 2204507 2204508 RL2253 RL2254   ispDF TRUE 0.949 -3.000 0.061 NA   NA
 2204509 2204510 RL2255 RL2256 dus ntrB TRUE 0.959 -3.000 0.094 1.000 N NA
 2204510 2204511 RL2256 RL2257 ntrB glnG TRUE 0.997 -3.000 0.297 0.096 Y NA
 2204512 2204513 RL2258 RL2259     FALSE 0.269 36.000 0.000 NA   NA
 2204513 2204514 RL2259 RL2260     FALSE 0.013 240.000 0.000 NA   NA
 2204514 2204515 RL2260 RL2261     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2204515 2204516 RL2261 RL2262   cya3 FALSE 0.053 159.000 0.000 NA   NA
 2204516 2204517 RL2262 RL2263 cya3   FALSE 0.010 261.000 0.000 NA   NA
 2204517 2204518 RL2263 RL2264     FALSE 0.246 44.000 0.000 NA   NA
 2204518 2204519 RL2264 RL2265     FALSE 0.001 683.000 0.000 NA   NA
 2204519 2204520 RL2265 RL2266     FALSE 0.011 254.000 0.000 NA   NA
 2204521 2204522 RL2267 RL2268     FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 2204525 2204526 RL2271 RL2272     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2204526 2204527 RL2272 RL2273   apbE FALSE 0.318 47.000 0.000 1.000   NA
 2204527 2204528 RL2273 RL2274 apbE   TRUE 0.975 2.000 0.316 1.000   NA
 2204528 2204529 RL2274 RL2275     TRUE 0.866 19.000 0.340 NA   NA
 2204529 2204530 RL2275 RL2276     TRUE 0.579 26.000 0.060 NA   NA
 2204531 2204532 RL2277 RL2278     TRUE 0.998 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 2204532 2204533 RL2278 RL2279     TRUE 0.695 -40.000 0.000 NA   NA
 2204533 2204534 RL2279 RL2280     FALSE 0.001 576.000 0.000 NA   NA
 2204534 2204535 RL2280 RL2281   ntrY FALSE 0.016 232.000 0.000 1.000 N NA
 2204535 2204536 RL2281 RL2282 ntrY ntrX TRUE 0.997 -10.000 0.533 0.096 Y NA
 2204536 2204537 RL2282 RL2283 ntrX   FALSE 0.454 66.000 0.085 1.000 N NA
 2204537 2204538 RL2283 RL2284   hfq FALSE 0.459 113.000 0.243 1.000   NA
 2204538 2204539 RL2284 RL2285 hfq hflX FALSE 0.481 78.000 0.115 1.000   NA
 2204540 2204541 RL2286 RL2287     FALSE 0.422 51.000 0.015 1.000   NA
 2204542 2204543 RL2288 RL2289 cysG2   TRUE 0.945 3.000 0.188 NA   NA
 2204543 2204544 RL2289 RL2290   cysI TRUE 0.986 9.000 0.919 NA   NA
 2204544 2204545 RL2290 RL2291 cysI   TRUE 0.926 11.000 0.309 NA   NA
 2204545 2204546 RL2291 RL2292   ubiF FALSE 0.435 39.000 0.029 NA   NA
 2204547 2204548 RL2293 RL2294     FALSE 0.024 225.000 0.000 1.000   NA
 2204548 2204549 RL2294 RL2295     FALSE 0.012 271.000 0.000 1.000   NA
 2204549 2204550 RL2295 RL2296   aldH FALSE 0.016 355.000 0.000 0.054 N NA
 2204550 2204551 RL2296 RL2297 aldH   FALSE 0.073 136.000 0.000 NA   NA
 2204553 2204554 RL2299 RL2300     FALSE 0.003 388.000 0.000 NA   NA
 2204554 2204555 RL2300 RL2301     FALSE 0.002 578.000 0.000 1.000   NA
 2204555 2204556 RL2301 RL2302     FALSE 0.141 112.000 0.000 1.000   NA
 2204556 2204557 RL2302 RL2303   ccdA FALSE 0.155 86.000 0.000 1.000 N NA
 2204561 2204562 RL2307 RL2308     FALSE 0.003 376.000 0.000 NA   NA
 2204562 2204563 RL2308 RL2309     FALSE 0.001 503.000 0.000 NA   NA
 2204563 1572925 RL2309 RL2311     FALSE 0.010 260.000 0.000 NA   NA
 2204565 2204566 RL2314 RL2315     FALSE 0.001 847.000 0.000 NA   NA
 2204568 2204569 RL2317 RL2318     FALSE 0.007 278.000 0.000 NA   NA
 2204571 2204572 RL2320 RL2321     FALSE 0.098 112.000 0.000 NA   NA
 2204573 2204574 RL2322 RL2323     TRUE 0.945 19.000 0.692 NA   NA
 2204574 2204575 RL2323 RL2324     TRUE 0.702 46.000 0.229 1.000   NA
 2204576 2204577 RL2325 RL2326     TRUE 0.700 78.000 0.000 NA Y NA
 2204577 2204578 RL2326 RL2327     TRUE 0.998 2.000 0.833 NA Y NA
 2204578 2204579 RL2327 RL2328     TRUE 0.929 24.000 0.190 NA Y NA
 2204579 2204580 RL2328 RL2329     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 2204580 2204581 RL2329 RL2330     FALSE 0.001 757.000 0.000 NA   NA
 2204581 2204582 RL2330 RL2331   attS FALSE 0.135 90.000 0.000 NA   NA
 2204582 2204583 RL2331 RL2332 attS   FALSE 0.193 89.000 0.000 1.000   NA
 2204586 2204587 RL2335 RL2336 kdgD uxuA TRUE 0.573 33.000 0.078 1.000 N NA
 2204587 2204588 RL2336 RL2337 uxuA   TRUE 0.766 66.000 0.429 1.000 N NA
 2204589 2204590 RL2338 RL2339     TRUE 0.983 22.000 0.750 NA Y NA
 2204590 2204591 RL2339 RL2340     TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA Y NA
 2204591 2204592 RL2340 RL2341     TRUE 0.993 -43.000 0.500 NA Y NA
 2204592 2204593 RL2341 RL2342     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.037 Y NA
 2204595 2204596 RL2344 RL2345     TRUE 0.677 65.000 0.300 NA   NA
 2204596 2204597 RL2345 RL2346     TRUE 0.991 12.000 0.700 NA Y NA
 2204597 2204598 RL2346 RL2347     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA Y NA
 2204598 2204599 RL2347 RL2348     TRUE 0.983 32.000 0.889 NA Y NA
 1572962 2204600 RL2349 RL2350     FALSE 0.011 254.000 0.000 NA   NA
 2204600 2204601 RL2350 RL2351     FALSE 0.418 17.000 0.000 NA   NA
 2204601 2204602 RL2351 RL2352     FALSE 0.198 149.000 0.095 NA   NA
 2204604 2204605 RL2354 RL2355     FALSE 0.102 142.000 0.000 1.000   NA
 2204605 2204606 RL2355 RL2356     FALSE 0.152 105.000 0.000 1.000   NA
 2204606 2204607 RL2356 RL2357     FALSE 0.385 93.000 0.125 NA   NA
 2204608 2204609 RL2358 RL2359     FALSE 0.018 344.000 0.000 0.053 N NA
 2204609 2204610 RL2359 RL2360     TRUE 0.983 -3.000 0.333 NA N NA
 2204610 2204611 RL2360 RL2361   nccN FALSE 0.085 93.000 0.000 NA N NA
 2204611 2204612 RL2361 RL2362 nccN   FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 2204612 2204613 RL2362 RL2363     TRUE 0.981 10.000 0.800 NA   NA
 2204613 2204614 RL2363 RL2364     FALSE 0.146 163.000 0.048 1.000   NA
 2204614 2204615 RL2364 RL2365     TRUE 0.979 13.000 0.929 1.000 N NA
 2204615 2204616 RL2365 RL2366     TRUE 0.994 -10.000 0.459 NA Y NA
 2204616 2204617 RL2366 RL2367     FALSE 0.173 74.000 0.000 NA   NA
 2204617 2204618 RL2367 RL2368     FALSE 0.003 364.000 0.000 NA   NA
 2204620 2204621 RL2370 RL2371 pcs qor TRUE 0.860 10.000 0.108 1.000 N NA
 2204621 2204622 RL2371 RL2372 qor   TRUE 0.678 40.000 0.182 1.000   NA
 2204622 2204623 RL2372 RL2373     TRUE 0.976 -10.000 0.418 NA   NA
 2204623 2204624 RL2373 RL2374     TRUE 0.996 -3.000 0.923 NA   NA
 2204624 2204625 RL2374 RL2375   bmpA TRUE 0.735 51.000 0.318 NA   NA
 2204625 2204626 RL2375 RL2376 bmpA   FALSE 0.187 146.000 0.076 NA   NA
 2204626 2204627 RL2376 RL2377     TRUE 0.639 231.000 0.804 NA Y NA
 2204627 2204628 RL2377 RL2378     TRUE 0.991 -3.000 0.506 NA   NA
 2204628 2204629 RL2378 RL2379     TRUE 0.996 -3.000 0.865 NA   NA
 2204629 2204630 RL2379 RL2380     TRUE 0.644 17.000 0.067 NA N NA
 2204630 2204631 RL2380 RL2381     FALSE 0.081 165.000 0.006 1.000 N NA
 2204631 2204632 RL2381 RL2382   glmS TRUE 0.707 110.000 0.083 1.000 Y NA
 2204632 2204633 RL2382 RL2383 glmS   FALSE 0.186 136.000 0.059 NA   NA
 2204635 2204636 RL2385 RL2386   mfd TRUE 0.953 -3.000 0.078 NA   NA
 2204636 2204637 RL2386 RL2387 mfd   FALSE 0.295 65.000 0.005 1.000 N NA
 2204638 2204639 RL2388 RL2389     FALSE 0.529 67.000 0.147 1.000 N NA
 2204641 2204642 RL2391 RL2392   glnA FALSE 0.017 260.000 0.012 NA   NA
 2204642 2204643 RL2392 RL2393 glnA glnB TRUE 0.829 79.000 0.145 1.000 Y NA
 2204644 2204645 RL2394 RL2395     FALSE 0.005 314.000 0.000 NA   NA
 2204646 2204647 RL2396 RL2397     TRUE 0.618 25.000 0.082 NA   NA
 2204647 2204648 RL2397 RL2398   uvrA TRUE 0.933 -3.000 0.005 1.000   NA
 2204653 2204654 RL2403 RL2404     FALSE 0.423 43.000 0.024 1.000 N NA
 2204654 2204655 RL2404 RL2405     TRUE 0.980 30.000 0.420 0.001 Y NA
 2204655 2204656 RL2405 RL2406   queA FALSE 0.324 76.000 0.031 1.000 N NA
 2204656 2204657 RL2406 RL2407 queA tgt TRUE 0.998 -3.000 0.360 0.000 Y NA
 2204658 2204659 RL2408 RL2409   fabF FALSE 0.405 82.000 0.104 NA   NA
 2204659 2204660 RL2409 RL2410 fabF   TRUE 0.880 14.000 0.302 NA N NA
 2204660 2204661 RL2410 RL2411     FALSE 0.159 79.000 0.000 NA   NA
 2204661 2204662 RL2411 RL2412     FALSE 0.077 130.000 0.000 NA   NA
 2204664 2204665 RL2414 RL2415     FALSE 0.083 123.000 0.000 NA   NA
 2204666 2204667 RL2416 RL2417     FALSE 0.017 221.000 0.000 NA   NA
 2204667 2204668 RL2417 RL2418     TRUE 0.988 -3.000 0.381 1.000   NA
 2204668 2204669 RL2418 RL2419     TRUE 0.994 -7.000 0.381 NA Y NA
 2204669 2204670 RL2419 RL2420     TRUE 0.996 -3.000 0.333 NA Y NA
 2204670 2204671 RL2420 RL2421     TRUE 0.953 27.000 0.375 NA Y NA
 2204674 2204675 RL2424 RL2425     TRUE 0.956 -3.000 0.052 1.000   NA
 2204675 2204676 RL2425 RL2426     FALSE 0.365 117.000 0.200 1.000 N NA
 2204680 2204681 RL2430 RL2430A     FALSE 0.163 191.000 0.222 NA   NA
 2204681 2204682 RL2430A RL2431     FALSE 0.009 263.000 0.000 NA   NA
 2204682 2204683 RL2431 RL2432     TRUE 0.875 56.000 0.667 NA   NA
 2204683 2204684 RL2432 RL2433   copC TRUE 0.857 23.000 0.375 NA   NA
 2204684 2204685 RL2433 RL2434 copC copA TRUE 0.939 33.000 0.500 0.002 N NA
 2204685 2204686 RL2434 RL2435 copA   TRUE 0.967 14.000 0.800 NA N NA
 2204686 2204687 RL2435 RL2436     FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 2204687 2204688 RL2436 RL2437     TRUE 0.815 34.000 0.375 NA   NA
 2204688 2204689 RL2437 RL2438     FALSE 0.137 89.000 0.000 NA   NA
 2204690 2204691 RL2440 RL2441     TRUE 0.829 75.000 0.583 1.000   NA
 2204691 2204692 RL2441 RL2442   ilvI FALSE 0.005 363.000 0.000 1.000   NA
 2204692 2204693 RL2442 RL2443 ilvI   FALSE 0.007 292.000 0.000 1.000 N NA
 2204694 2204695 RL2444 RL2445     FALSE 0.135 150.000 0.032 NA   NA
 2204695 2204696 RL2445 RL2446   hyuA FALSE 0.289 93.000 0.048 1.000 N NA
 2204698 2204699 RL2448 RL2449     TRUE 0.909 80.000 0.450 NA Y NA
 2204699 2204700 RL2449 RL2450     TRUE 0.933 41.000 0.344 NA Y NA
 2204702 2204703 RL2453 RL2454     FALSE 0.002 350.000 0.000 NA N NA
 2204703 2204704 RL2454 RL2455     FALSE 0.530 122.000 0.400 NA   NA
 2204704 2204705 RL2455 RL2456     FALSE 0.188 68.000 0.000 NA   NA
 2204707 2204708 RL2458 RL2459     FALSE 0.253 161.000 0.222 NA   NA
 2204708 2204709 RL2459 RL2460     FALSE 0.085 121.000 0.000 NA   NA
 2204709 2204710 RL2460 RL2461     TRUE 0.998 -12.000 0.518 0.002 Y NA
 2204710 2204711 RL2461 RL2462     FALSE 0.247 112.000 0.036 1.000   NA
 2204713 2204714 RL2463B RL2467     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2204716 2204717 RL2471 RL2472     TRUE 0.915 5.000 0.139 NA   NA
 2204717 2204718 RL2472 RL2473   metG TRUE 0.930 5.000 0.221 NA N NA
 2204720 2204721 RL2475 RL2476 holB tmk TRUE 0.926 9.000 0.254 1.000 N NA
 2204721 2204722 RL2476 RL2477 tmk dacF FALSE 0.239 131.000 0.099 1.000 N NA
 2204722 2204723 RL2477 RL2478 dacF   TRUE 0.850 72.000 0.198 NA Y NA
 2204726 1573094 RL2481 RLt51   tRNA-Ser FALSE 0.026 197.000 0.000 NA   NA
 2204730 2204731 RL2486 RL2487     FALSE 0.302 64.000 0.007 1.000 N NA
 2204732 2204733 RL2488 RL2489     TRUE 0.699 139.000 0.241 NA Y NA
 2204736 2204737 RL2492 RL2493 ppiD trpD TRUE 0.764 9.000 0.014 1.000 N NA
 2204737 2204738 RL2493 RL2494 trpD trpC TRUE 0.983 10.000 0.293 1.000 Y NA
 2204738 2204739 RL2494 RL2495 trpC moaC TRUE 0.938 2.000 0.113 1.000 N NA
 2204739 2204740 RL2495 RL2496 moaC moeA TRUE 0.997 -3.000 0.093 0.002 Y NA
 2204742 2204743 RL2498 RL2499   iorA FALSE 0.096 344.000 0.000 0.011 Y NA
 2204743 2204744 RL2499 RL2500 iorA iorB TRUE 0.992 13.000 0.400 0.000 Y NA
 2204746 2204747 RL2502 RL2503     TRUE 0.633 37.000 0.000 0.053 N NA
 2204748 2204749 RL2504 RL2505   deaD FALSE 0.245 72.000 0.000 1.000   NA
 2204749 2204750 RL2505 RL2506 deaD cya FALSE 0.244 100.000 0.035 1.000 N NA
 2204750 2204751 RL2506 RL2507 cya   TRUE 0.819 111.000 0.875 NA   NA
 2204751 2204752 RL2507 RL2508   gltA FALSE 0.266 153.000 0.200 NA   NA
 2204754 2204755 RL2510 RL2511   pyrG FALSE 0.246 74.000 0.002 NA   NA
 2204755 2204756 RL2511 RL2512 pyrG   FALSE 0.205 144.000 0.083 1.000 N NA
 2204756 2204757 RL2512 RL2513   tpiA FALSE 0.309 132.000 0.184 1.000 N NA
 2204757 2204758 RL2513 RL2514 tpiA   FALSE 0.050 197.000 0.016 NA   NA
 2204761 2204762 RL2517 RL2518     TRUE 0.857 10.000 0.111 NA   NA
 2204762 2204763 RL2518 RL2519     FALSE 0.002 525.000 0.000 1.000   NA
 2204763 2204764 RL2519 RL2520     FALSE 0.233 117.000 0.069 NA   NA
 2204767 2204768 RL2523 RL2524     FALSE 0.073 136.000 0.000 NA   NA
 2204768 2204769 RL2524 RL2525     FALSE 0.370 109.000 0.179 NA   NA
 2204769 2204770 RL2525 RL2526     TRUE 0.974 0.000 0.033 0.045   NA
 2204772 2204773 RL2528 RL2529 thrS   FALSE 0.152 126.000 0.023 NA   NA
 2204773 2204774 RL2529 RL2530     FALSE 0.003 365.000 0.000 NA   NA
 2204775 2204776 RL2531 RL2532 folE hisI TRUE 0.547 26.000 0.038 1.000 N NA
 2204776 2204777 RL2532 RL2533 hisI   FALSE 0.197 118.000 0.017 1.000   NA
 2204778 2204779 RL2534 RL2535     FALSE 0.504 94.000 0.211 1.000   NA
 2204780 2204781 RL2536 RL2537     FALSE 0.453 125.000 0.320 NA   NA
 2204781 2204782 RL2537 RL2538   pip FALSE 0.003 373.000 0.000 NA   NA
 2204782 2204783 RL2538 RL2539 pip   FALSE 0.003 376.000 0.000 NA   NA
 2204783 2204784 RL2539 RL2540     FALSE 0.012 243.000 0.000 NA   NA
 2204784 2204785 RL2540 RL2541     FALSE 0.269 135.000 0.146 NA   NA
 2204785 2204786 RL2541 RL2542     FALSE 0.448 114.000 0.271 NA   NA
 2204787 2204788 RL2543 RL2544   sdaA FALSE 0.528 62.000 0.140 NA   NA
 2204791 2204792 RL2547 RL2548 rpiB   FALSE 0.012 246.000 0.000 NA   NA
 2204792 2204793 RL2548 RL2549     TRUE 0.950 0.000 0.118 NA   NA
 2204794 2204795 RL2550 RL2551     FALSE 0.504 65.000 0.118 1.000 N NA
 2204796 2204797 RL2552 RL2553 def   FALSE 0.512 85.000 0.217 NA   NA
 2204797 2204798 RL2553 RL2554     FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   NA
 1573168 2204800 RLt36 RL2556 tRNA-Leu   FALSE 0.119 98.000 0.000 NA   NA
 2204800 2204801 RL2556 RL2557     TRUE 0.588 65.000 0.208 NA   NA
 2204801 2204802 RL2557 RL2558   pccA FALSE 0.374 76.000 0.064 NA   NA
 2204802 2204803 RL2558 RL2559 pccA   FALSE 0.207 163.000 0.000 0.086   NA
 2204803 2204804 RL2559 RL2560     TRUE 0.710 11.000 0.012 NA   NA
 2204804 2204805 RL2560 RL2561     FALSE 0.076 169.000 0.010 NA   NA
 2204806 2204807 RL2562 RL2563   pccB FALSE 0.146 140.000 0.029 NA   NA
 2204807 2204808 RL2563 RL2564 pccB   FALSE 0.205 104.000 0.025 NA   NA
 2204808 2204809 RL2564 RL2565     FALSE 0.355 68.000 0.036 NA   NA
 2204809 2204810 RL2565 RL2566     TRUE 0.922 10.000 0.269 NA   NA
 2204810 2204811 RL2566 RL2567   rLuC TRUE 0.988 -3.000 0.389 1.000   NA
 2204811 2204812 RL2567 RL2568 rLuC   FALSE 0.282 95.000 0.083 NA N NA
 2204814 2204815 RL2570 RL2571     TRUE 0.823 74.000 0.600 NA   NA
 2204816 2204817 RL2572 RL2573 gcvT gcvP FALSE 0.099 386.000 0.032 0.001 Y NA
 2204817 2204818 RL2573 RL2574 gcvP   FALSE 0.007 290.000 0.000 1.000 N NA
 2204818 2204819 RL2574 RL2575     FALSE 0.054 163.000 0.000 1.000 N NA
 2204820 2204821 RL2576 RL2577 sufA   FALSE 0.324 94.000 0.083 NA   NA
 2204821 2204822 RL2577 RL2578   sufS TRUE 0.906 13.000 0.309 NA   NA
 2204822 2204823 RL2578 RL2579 sufS sufD TRUE 0.855 13.000 0.193 1.000 N NA
 2204823 2204824 RL2579 RL2580 sufD   TRUE 0.993 -28.000 0.482 1.000 Y NA
 2204824 2204825 RL2580 RL2581     FALSE 0.219 84.000 0.004 NA   NA
 2204825 2204826 RL2581 RL2582   sufB TRUE 0.854 2.000 0.004 NA   NA
 2204826 2204827 RL2582 RL2583 sufB nifS FALSE 0.228 145.000 0.109 1.000 N NA
 2204828 2204829 RL2584 RL2585   nodX FALSE 0.151 144.000 0.013 1.000   NA
 2204830 2204831 RL2586 RL2587     TRUE 0.895 -3.000 0.011 NA N NA
 2204833 2204834 RL2589 RL2590     FALSE 0.011 253.000 0.000 NA   NA
 2204835 2204836 RL2591 RL2592     TRUE 0.982 -3.000 0.052 0.053   NA
 2204836 2204837 RL2592 RL2593     FALSE 0.291 105.000 0.054 1.000   NA
 2204837 2204838 RL2593 RL2594   deaD FALSE 0.186 139.000 0.058 1.000 N NA
 2204838 2204839 RL2594 RL2595 deaD   TRUE 0.863 8.000 0.087 1.000 N NA
 2204841 2204842 RL2597 RL2598   rpe FALSE 0.249 61.000 0.010 NA N NA
 2204842 2204843 RL2598 RL2599 rpe   TRUE 0.923 -3.000 0.015 NA   NA
 2204843 2204844 RL2599 RL2600     TRUE 0.951 3.000 0.212 NA   NA
 2204844 2204845 RL2600 RL2601   purB FALSE 0.140 119.000 0.008 NA   NA
 2204846 2204847 RL2602 RL2603     TRUE 0.673 160.000 0.833 NA   NA
 2204848 2204849 RL2604 RL2605     FALSE 0.345 97.000 0.107 NA   NA
 2204849 2204850 RL2605 RL2606   purC FALSE 0.009 272.000 0.000 1.000 N NA
 2204850 2204851 RL2606 RL2607 purC kptA FALSE 0.006 303.000 0.000 1.000 N NA
 2204851 2204852 RL2607 RL2608 kptA purQ TRUE 0.920 -3.000 0.008 1.000 N NA
 2204852 2204853 RL2608 RL2609 purQ   FALSE 0.394 45.000 0.020 NA   NA
 2204853 2204854 RL2609 RL2610     FALSE 0.002 465.000 0.000 NA   NA
 2204858 2204859 RL2614 RL2615     FALSE 0.371 145.000 0.018 0.011   NA
 2204859 2204860 RL2615 RL2616     FALSE 0.399 96.000 0.147 1.000 N NA
 2204860 2204861 RL2616 RL2617     TRUE 0.936 36.000 0.083 0.051 Y NA
 2204861 2204862 RL2617 RL2618     FALSE 0.162 78.000 0.000 NA   NA
 2204862 2204863 RL2618 RL2619     FALSE 0.170 75.000 0.000 NA   NA
 2204864 2204865 RL2620 RL2621     TRUE 0.916 41.000 0.000 0.001 Y NA
 2204865 2204866 RL2621 RL2622     FALSE 0.161 48.000 0.000 NA N NA
 2204866 2204867 RL2622 RL2623   glsA FALSE 0.296 61.000 0.025 NA N NA
 2204867 2204868 RL2623 RL2624 glsA rpsD FALSE 0.189 103.000 0.011 1.000 N NA
 2204868 2204869 RL2624 RL2625 rpsD   FALSE 0.024 225.000 0.000 1.000   NA
 2204869 2204870 RL2625 RL2626     FALSE 0.032 210.000 0.000 1.000   NA
 2204870 2204871 RL2626 RL2627   murI FALSE 0.350 25.000 0.000 1.000 N NA
 2204871 2204872 RL2627 RL2628 murI   TRUE 0.853 -19.000 0.025 1.000 N NA
 2204872 2204873 RL2628 RL2629     TRUE 0.819 5.000 0.014 NA   NA
 2204873 2204874 RL2629 RL2630     TRUE 0.702 96.000 0.500 NA   NA
 2204875 2204876 RL2631 RL2632 icd   TRUE 0.580 72.000 0.012 0.086   NA
 2204876 2204877 RL2632 RL2633   gstA FALSE 0.452 78.000 0.093 1.000   NA
 2204880 2204881 RL2636 RL2637 alaS recA FALSE 0.296 154.000 0.054 0.094 N NA
 2204882 2204883 RL2638 RL2639 rbsK   FALSE 0.485 61.000 0.131 NA N NA
 2204885 2204886 RL2641 RL2642     FALSE 0.007 292.000 0.000 NA   NA
 2204888 2204889 RL2644 RL2645     FALSE 0.381 77.000 0.072 NA   NA
 2204889 2204890 RL2645 RL2646     TRUE 0.995 -3.000 0.791 NA   NA
 2204890 2204891 RL2646 RL2647     FALSE 0.058 211.000 0.059 NA   NA
 2204892 2204893 RL2648 RL2649   folB TRUE 0.989 -7.000 0.142 1.000 Y NA
 2204893 2204894 RL2649 RL2650 folB folC TRUE 0.993 -3.000 0.094 1.000 Y NA
 2204896 2204897 RL2652 RL2653 fdxB   FALSE 0.122 262.000 0.451 NA   NA
 2204901 2204902 RL2657 RL2658     FALSE 0.126 148.000 0.022 NA   NA
 2204902 2204903 RL2658 RL2659     TRUE 0.656 25.000 0.109 NA   NA
 2204903 2204904 RL2659 RL2660     TRUE 0.995 10.000 0.850 NA Y NA
 2204904 2204905 RL2660 RL2661     TRUE 0.998 2.000 0.889 1.000 Y NA
 2204907 2204908 RL2663 RL2664   lpxH FALSE 0.157 152.000 0.029 1.000   NA
 2204910 2204911 RL2666 RL2667     TRUE 0.989 6.000 0.909 1.000 N NA
 2204913 2204914 RL2668 RL2669     FALSE 0.029 196.000 0.000 1.000 N NA
 2204915 2204916 RL2670 RL2671   maeB FALSE 0.084 155.000 0.000 1.000   NA
 2204923 2204924 RL2678 RL2679     FALSE 0.002 416.000 0.000 NA   NA
 2204924 2204925 RL2679 RL2680     TRUE 0.956 7.000 0.116 0.051   NA
 2204925 2204926 RL2680 RL2681     FALSE 0.028 198.000 0.000 1.000 N NA
 2204927 2204928 RL2682 RL2683     FALSE 0.011 282.000 0.000 1.000   NA
 2204928 2204929 RL2683 RL2684     TRUE 0.813 59.000 0.500 NA   NA
 2204929 2204930 RL2684 RL2685     FALSE 0.039 178.000 0.000 NA   NA
 2204930 2204931 RL2685 RL2686   aroG FALSE 0.006 343.000 0.000 1.000   NA
 2204932 2204933 RL2687 RL2688   nadE FALSE 0.317 63.000 0.034 NA N NA
 2204941 2204942 RL2696 RL2697     FALSE 0.199 98.000 0.014 NA   NA
 2204942 2204943 RL2697 RL2698   rpiA TRUE 0.700 16.000 0.065 NA   NA
 2204951 2204952 RL2706 RL2707     TRUE 0.583 38.000 0.111 NA   NA
 2204954 2204955 RL2709 RL2710     FALSE 0.375 63.000 0.038 NA   NA
 2204958 2204959 RL2713 RL2714     TRUE 0.973 7.000 0.070 NA Y NA
 2204959 2204960 RL2714 RL2715     TRUE 0.998 -6.000 0.833 NA Y NA
 2204961 2204962 RL2716 RL2717   glpK TRUE 0.763 22.000 0.200 1.000 N NA
 2204962 2204963 RL2717 RL2718 glpK   TRUE 0.836 69.000 0.596 1.000 N NA
 2204963 2204964 RL2718 RL2719     TRUE 0.999 0.000 0.860 0.001 Y NA
 2204965 2204966 RL2720 RL2721 rbsC rbsB FALSE 0.421 118.000 0.261 NA   NA
 2204966 2204967 RL2721 RL2722 rbsB rbsA TRUE 0.986 14.000 0.600 NA Y NA
 2204967 2204968 RL2722 RL2723 rbsA   TRUE 0.901 23.000 0.500 1.000 N NA
 2204968 1573338 RL2723 RL2724     TRUE 0.714 -22.000 0.000 NA   NA
 1573338 2204969 RL2724 RL2725     FALSE 0.207 58.000 0.000 NA   NA
 2204969 2204970 RL2725 RL2726   ribA FALSE 0.002 471.000 0.000 1.000 N NA
 2204972 2204973 RL2728 RL2729   mobA TRUE 0.746 10.000 0.016 NA   NA
 2204973 2204974 RL2729 RL2730 mobA mobB TRUE 0.996 -3.000 0.056 0.002 Y NA
 2204975 2204976 RL2731 RL2732     TRUE 0.994 -25.000 0.304 0.093 Y NA
 2204976 2204977 RL2732 RL2733     FALSE 0.244 146.000 0.130 1.000 N NA
 2204978 2204979 RL2734 RL2735     TRUE 0.769 15.000 0.111 NA   NA
 2204980 2204981 RL2736 RL2737 maiA ohr FALSE 0.198 248.000 0.080 1.000 Y NA
 2204981 2204982 RL2737 RL2738 ohr   FALSE 0.159 191.000 0.207 1.000 N NA
 2204982 2204983 RL2738 RL2739     TRUE 0.992 15.000 0.897 1.000 Y NA
 2204983 2204984 RL2739 RL2740     FALSE 0.312 127.000 0.138 1.000   NA
 2204985 2204986 RL2741 RL2742     FALSE 0.482 55.000 0.085 NA   NA
 2204986 2204987 RL2742 RL2743     FALSE 0.002 399.000 0.000 NA   NA
 2204987 2204988 RL2743 RL2744   deoC FALSE 0.012 296.000 0.014 1.000 N NA
 2204988 2204989 RL2744 RL2745 deoC   TRUE 0.946 6.000 0.277 1.000 N NA
 2204989 2204990 RL2745 RL2746     FALSE 0.177 148.000 0.061 1.000 N NA
 2204990 2204991 RL2746 RL2747   rbsK TRUE 0.964 13.000 0.134 1.000 Y NA
 2204991 2204992 RL2747 RL2748 rbsK   TRUE 0.991 -3.000 0.045 NA Y NA
 2204992 2204993 RL2748 RL2749     TRUE 0.997 -3.000 0.425 NA Y NA
 2204993 2204994 RL2749 RL2750     TRUE 0.795 45.000 0.000 NA Y NA
 2204994 2204995 RL2750 RL2751     FALSE 0.175 221.000 0.000 NA Y NA
 2204997 2204998 RL2753 RL2754     TRUE 0.788 114.000 0.259 1.000 Y NA
 2204998 2204999 RL2754 RL2755     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.010 Y NA
 2204999 2205000 RL2755 RL2756     FALSE 0.367 222.000 0.273 NA Y NA
 2205002 2205003 RL2758 RL2759     FALSE 0.259 128.000 0.086 1.000   NA
 2205003 2205004 RL2759 RL2760     TRUE 0.964 -3.000 0.114 1.000 N NA
 2205004 2205005 RL2760 RL2761     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 2205006 2205007 RL2762 RL2763     TRUE 0.647 47.000 0.208 NA   NA
 2205007 2205008 RL2763 RL2764     TRUE 0.868 12.000 0.194 NA   NA
 2205008 2205009 RL2764 RL2765     TRUE 0.844 37.000 0.458 NA   NA
 2205009 2205010 RL2765 RL2766     TRUE 0.996 -3.000 0.833 NA   NA
 2205010 2205011 RL2766 RL2767   ssuB FALSE 0.012 249.000 0.000 1.000 N NA
 2205011 2205012 RL2767 RL2768 ssuB ssuC TRUE 0.989 10.000 0.472 NA Y NA
 2205012 2205013 RL2768 RL2769 ssuC ssuD FALSE 0.259 154.000 0.226 NA N NA
 2205013 2205014 RL2769 RL2770 ssuD ssuA FALSE 0.009 365.000 0.049 1.000 N NA
 2205014 2205015 RL2770 RL2771 ssuA   FALSE 0.037 180.000 0.000 NA   NA
 2205016 2205017 RL2772 RL2773     TRUE 0.939 -3.000 0.061 NA N NA
 2205018 2205019 RL2774 RL2775   ropA FALSE 0.003 448.000 0.000 1.000   NA
 2205019 2205020 RL2775 RL2776 ropA   FALSE 0.002 720.000 0.000 1.000   NA
 2205020 2205021 RL2776 RL2777     FALSE 0.379 70.000 0.081 NA N NA
 2205021 2205022 RL2777 RL2778     TRUE 0.977 5.000 0.050 NA Y NA
 2205024 2205025 RL2780 RL2781 dgkA cobT FALSE 0.167 140.000 0.042 1.000 N NA
 2205026 2205027 RL2781A RL2782 cobS   FALSE 0.021 234.000 0.000 1.000   NA
 2205027 2205028 RL2782 RL2783     FALSE 0.009 266.000 0.000 NA   NA
 2205028 2205029 RL2783 RL2784     FALSE 0.249 129.000 0.111 NA   NA
 2205030 2205031 RL2785 RL2786     FALSE 0.180 114.000 0.018 1.000 N NA
 2205031 2205032 RL2786 RL2787     TRUE 0.998 -3.000 0.303 0.093 Y NA
 2205032 2205033 RL2787 RL2788     FALSE 0.002 459.000 0.000 1.000 N NA
 2205033 2205034 RL2788 RL2789     FALSE 0.299 98.000 0.067 1.000 N NA
 2205034 2205035 RL2789 RL2790     FALSE 0.326 154.000 0.029 0.052   NA
 2205035 2205036 RL2790 RL2791     TRUE 0.978 10.000 0.722 NA   NA
 2205036 2205037 RL2791 RL2792     TRUE 0.937 38.000 0.357 NA Y NA
 2205037 2205038 RL2792 RL2793     TRUE 0.751 125.000 0.250 1.000 Y NA
 2205038 2205039 RL2793 RL2794     TRUE 0.997 5.000 0.889 NA Y NA
 2205039 2205040 RL2794 RL2795     TRUE 0.995 -7.000 0.500 NA Y NA
 2205040 2205041 RL2795 RL2796     TRUE 0.618 178.000 0.333 NA Y NA
 2205043 2205044 RL2798 RL2799 leuS   FALSE 0.003 387.000 0.000 1.000 N NA
 2205045 2205046 RL2800 RL2801   ddlA FALSE 0.400 35.000 0.011 NA   NA
 2205046 2205047 RL2801 RL2802 ddlA   TRUE 0.556 16.000 0.004 NA   NA
 2205048 2205049 RL2803 RL2804     FALSE 0.534 58.000 0.098 1.000   NA
 2205049 2205050 RL2804 RL2805     TRUE 0.691 57.000 0.027 0.011   NA
 2205050 2205051 RL2805 RL2806     TRUE 0.721 14.000 0.027 1.000   NA
 2205051 2205052 RL2806 RL2807   gnd FALSE 0.271 85.000 0.005 1.000   NA
 2205053 2205054 RL2808 RL2809     TRUE 0.707 71.000 0.098 0.028   NA
 2205054 2205055 RL2809 RL2810     TRUE 0.957 1.000 0.195 NA   NA
 2205056 2205057 RL2811 RL2812     FALSE 0.226 113.000 0.025 1.000   NA
 2205057 2205058 RL2812 RL2813     TRUE 0.945 5.000 0.248 1.000 N NA
 2205058 2205059 RL2813 RL2814   fabF1 TRUE 0.798 57.000 0.453 1.000 N NA
 2205059 2205060 RL2814 RL2815 fabF1 fabF2 TRUE 0.996 13.000 0.784 0.001 Y NA
 2205060 2205061 RL2815 RL2816 fabF2 fabZ TRUE 0.997 -3.000 0.490 NA Y NA
 2205061 2205062 RL2816 RL2817 fabZ acpXL FALSE 0.522 205.000 0.394 NA Y NA
 2205064 2205065 RL2819 RL2820     FALSE 0.121 97.000 0.000 NA   NA
 2205065 2205066 RL2820 RL2821   cobD FALSE 0.225 52.000 0.000 NA   NA
 2205066 2205067 RL2821 RL2822 cobD cobC TRUE 0.987 -3.000 0.128 0.006 N NA
 2205067 2205068 RL2822 RL2823 cobC cobB TRUE 0.980 -3.000 0.018 0.006 N NA
 2205068 2205069 RL2823 RL2824 cobB cobA TRUE 0.994 -3.000 0.139 1.000 Y NA
 2205069 2205070 RL2824 RL2825 cobA   FALSE 0.005 324.000 0.000 1.000 N NA
 2205070 2205071 RL2825 RL2826   cobE FALSE 0.249 71.000 0.000 1.000   NA
 2205072 2205073 RL2827 RL2828     TRUE 0.960 0.000 0.174 NA   NA
 2205074 2205075 RL2829 RL2830 cobO cobN TRUE 0.956 -3.000 0.054 1.000   NA
 2205075 2205076 RL2830 RL2831 cobN cobW TRUE 0.957 5.000 0.274 1.000   NA
 2205076 2205077 RL2831 RL2832 cobW cobP TRUE 0.899 5.000 0.063 1.000   NA
 2205079 2205080 RL2834 RL2835 cya   FALSE 0.265 142.000 0.000 0.052 N NA
 2205080 2205081 RL2835 RL2836   cobQ FALSE 0.131 124.000 0.003 1.000 N NA
 2205082 2205083 RL2837 RL2838     TRUE 0.851 21.000 0.333 NA   NA
 2205084 2205085 RL2839 RL2840     FALSE 0.002 410.000 0.000 1.000 N NA
 2205085 2205086 RL2840 RL2841     TRUE 0.998 3.000 0.667 0.036 Y NA
 2205086 2205087 RL2841 RL2842     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA Y NA
 2205087 2205088 RL2842 RL2843     TRUE 0.999 -3.000 0.833 NA Y NA
 2205088 2205089 RL2843 RL2844     TRUE 0.783 50.000 0.000 NA Y NA
 2205089 2205090 RL2844 RL2845   aroE FALSE 0.491 135.000 0.000 NA Y NA
 2205090 2205091 RL2845 RL2846 aroE   TRUE 0.673 92.000 0.000 1.000 Y NA
 2205091 2205092 RL2846 RL2847     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2205092 2205093 RL2847 RL2848     FALSE 0.074 145.000 0.000 1.000 N NA
 2205093 2205094 RL2848 RL2849     FALSE 0.006 343.000 0.000 1.000   NA
 2205094 2205095 RL2849 RL2850     FALSE 0.133 91.000 0.000 NA   NA
 2205095 2205096 RL2850 RL2851     TRUE 0.970 -7.000 0.309 NA   NA
 2205096 2205097 RL2851 RL2852     TRUE 0.911 3.000 0.044 1.000   NA
 2205097 2205098 RL2852 RL2853     FALSE 0.522 34.000 0.057 NA   NA
 2205099 2205100 RL2854 RL2855     TRUE 0.947 -3.000 0.050 1.000 N NA
 2205103 2205104 RL2858 RL2859   greA FALSE 0.200 116.000 0.041 NA   NA
 2205104 2205105 RL2859 RL2860 greA   FALSE 0.009 266.000 0.000 NA   NA
 2205105 2205106 RL2860 RL2861     FALSE 0.003 364.000 0.000 NA   NA
 2205106 2205107 RL2861 RL2862     FALSE 0.153 82.000 0.000 NA   NA
 2205107 2205108 RL2862 RL2863     FALSE 0.365 21.000 0.000 NA   NA
 2205108 2205109 RL2863 RL2864     FALSE 0.119 98.000 0.000 NA   NA
 2205110 2205111 RL2865 RL2866     FALSE 0.025 199.000 0.000 NA   NA
 2205111 2205112 RL2866 RL2867     TRUE 0.895 7.000 0.098 1.000   NA
 2205112 2205113 RL2867 RL2868     FALSE 0.002 619.000 0.000 1.000   NA
 2205114 2205115 RL2869 RL2870     FALSE 0.306 29.000 0.000 NA   NA
 2205115 2205116 RL2870 RL2871     TRUE 0.906 -10.000 0.074 NA   NA
 2205116 2205117 RL2871 RL2872     FALSE 0.170 152.000 0.074 NA   NA
 2205118 2205119 RL2873 RL2874 cya3   FALSE 0.069 144.000 0.000 NA   NA
 2205119 2205120 RL2874 RL2875     FALSE 0.232 49.000 0.000 NA   NA
 2205120 2205121 RL2875 RL2876     FALSE 0.232 49.000 0.000 NA   NA
 2205121 2205122 RL2876 RL2877     FALSE 0.101 110.000 0.000 NA   NA
 2205122 2205123 RL2877 RL2878     FALSE 0.006 300.000 0.000 NA   NA
 2205123 2205124 RL2878 RL2879     FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 2205125 2205126 RL2880 RL2881     FALSE 0.316 187.000 0.167 0.015   NA
 2205129 2205130 RL2884 RL2885 arsC1   TRUE 0.836 0.000 0.000 1.000 N NA
 2205130 2205131 RL2885 RL2886     TRUE 0.800 -3.000 0.000 NA N NA
 2205131 2205132 RL2886 RL2887   arsC2 TRUE 0.959 -3.000 0.127 NA N NA
 2205132 2205133 RL2887 RL2888 arsC2 arsH TRUE 0.944 -25.000 0.211 1.000   NA
 2205133 2205134 RL2888 RL2889 arsH   TRUE 0.987 -3.000 0.400 NA   NA
 2205134 2205135 RL2889 RL2890     FALSE 0.322 26.000 0.000 NA   NA
 2205136 2205137 RL2891 RL2892     FALSE 0.289 93.000 0.053 NA   NA
 2205137 2205138 RL2892 RL2893     FALSE 0.124 120.000 0.000 1.000   NA
 2205138 2205139 RL2893 RL2894     FALSE 0.011 280.000 0.000 1.000   NA
 2205140 2205141 RL2895 RL2896     TRUE 0.925 124.000 0.889 NA Y NA
 2205141 2205142 RL2896 RL2897     TRUE 0.999 -3.000 0.882 NA Y NA
 2205142 2205143 RL2897 RL2898     FALSE 0.199 213.000 0.000 NA Y NA
 2205143 2205144 RL2898 RL2899     TRUE 0.999 -7.000 0.889 0.010 Y NA
 2205144 2205145 RL2899 RL2900   dhaK TRUE 0.794 54.000 0.000 1.000 Y NA
 2205145 2205146 RL2900 RL2901 dhaK   TRUE 0.907 47.000 0.000 0.002 Y NA
 2205146 2205147 RL2901 RL2902     TRUE 0.970 -3.000 0.128 1.000   NA
 2205147 2205148 RL2902 RL2903     TRUE 0.978 0.000 0.026 0.002   NA
 2205148 2205149 RL2903 RL2904   ptsI TRUE 0.990 -16.000 0.013 0.001 Y NA
 2205149 2205150 RL2904 RL2905 ptsI   TRUE 0.984 2.000 0.500 NA   NA
 2205150 2205151 RL2905 RL2906   dhaK FALSE 0.358 59.000 0.026 NA   NA
 2205152 2205153 RL2907 RL2908     TRUE 0.988 -3.000 0.421 NA   NA
 2205153 2205154 RL2908 RL2909     FALSE 0.190 90.000 0.000 1.000   NA
 2205155 2205156 RL2910 RL2911     FALSE 0.022 232.000 0.000 1.000   NA
 2205159 2205160 RL2914 RL2915     FALSE 0.085 121.000 0.000 NA   NA
 2205162 2205163 RL2917 RL2918 dadA   TRUE 0.921 2.000 0.044 1.000   NA
 2205163 2205164 RL2918 RL2919     TRUE 0.621 24.000 0.044 1.000   NA
 2205164 2205165 RL2919 RL2920     TRUE 0.997 -3.000 0.125 0.010 Y NA
 2205165 2205166 RL2920 RL2921     TRUE 0.978 8.000 0.125 1.000 Y NA
 2205166 2205167 RL2921 RL2922     TRUE 0.706 184.000 0.500 1.000 Y NA
 2205168 2205169 RL2923 RL2924     TRUE 0.635 150.000 0.000 0.060 Y NA
 2205169 2205170 RL2924 RL2925   mutT TRUE 0.692 45.000 0.240 1.000 N NA
 2205171 2205172 RL2926 RL2927   ohrB TRUE 0.783 118.000 0.833 NA   NA
 2205174 2205175 RL2929 RL2930     TRUE 0.761 34.000 0.286 NA   NA
 2205175 2205176 RL2930 RL2931     FALSE 0.043 308.000 0.286 NA   NA
 2205177 2205178 RL2932 RL2933     TRUE 0.758 20.000 0.182 NA   NA
 2205179 2205180 RL2934 RL2935     TRUE 0.537 116.000 0.378 NA   NA
 2205180 2205181 RL2935 RL2936     FALSE 0.036 212.000 0.011 NA   NA
 2205183 2205184 RL2938 RL2939     FALSE 0.002 418.000 0.000 1.000 N NA
 2205184 2205185 RL2939 RL2940     FALSE 0.165 82.000 0.000 1.000 N NA
 2205189 2205190 RL2944 RL2945     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 2205190 2205191 RL2945 RL2946     TRUE 0.829 79.000 0.667 NA   NA
 2205191 2205192 RL2946 RL2947     FALSE 0.004 377.000 0.000 1.000   NA
 2205192 2205193 RL2947 RL2948     FALSE 0.013 236.000 0.000 NA   NA
 2205194 2205195 RL2949 RL2950     TRUE 0.783 96.000 0.667 NA   NA
 2205196 2205197 RL2951 RL2952 cya   FALSE 0.079 234.000 0.000 0.013   NA
 2205199 2205200 RL2954 RL2955     FALSE 0.258 39.000 0.000 NA   NA
 2205201 2205202 RL2956 RL2957   uvrB FALSE 0.041 180.000 0.000 1.000 N NA
 2205204 2205205 RL2959 RL2960     FALSE 0.309 70.000 0.019 NA   NA
 2205205 2205206 RL2960 RL2961     FALSE 0.004 379.000 0.000 1.000   NA
 2205208 2205209 RL2963 RL2964   cspA FALSE 0.001 768.000 0.000 NA   NA
 2205209 2205210 RL2964 RL2965 cspA dusA FALSE 0.066 185.000 0.017 1.000 N NA
 2205212 2205213 RL2967 RL2968 cpo   FALSE 0.065 149.000 0.000 NA   NA
 2205213 2205214 RL2968 RL2969     FALSE 0.001 868.000 0.000 NA   NA
 2205215 2205216 RL2971 RL2972     FALSE 0.329 205.000 0.571 NA   NA
 2205216 2205217 RL2972 RL2973     TRUE 0.998 0.000 0.714 1.000 Y NA
 2205217 2205218 RL2973 RL2974     FALSE 0.006 302.000 0.000 NA   NA
 2205219 2205220 RL2975 RL2976     TRUE 0.960 -3.000 0.103 NA   NA
 2205220 2205221 RL2976 RL2977     TRUE 0.975 -42.000 0.500 NA   NA
 2205233 2205234 RL2990 RL2991 ubiA   FALSE 0.363 38.000 0.004 NA   NA
 2205234 2205235 RL2991 RL2992     FALSE 0.010 259.000 0.000 NA   NA
 2205236 2205237 RL2993 RL2994 gstA   FALSE 0.148 89.000 0.000 1.000 N NA
 2205241 2205242 RL2998 RL2999     FALSE 0.016 224.000 0.000 NA   NA
 2205243 2205244 RL3000 RL3001     TRUE 0.637 63.000 0.250 NA   NA
 2205244 2205245 RL3001 RL3002   dapB FALSE 0.313 52.000 0.002 NA   NA
 2205246 2205247 RL3003 RL3004 arcB   FALSE 0.515 94.000 0.250 1.000 N NA
 2205247 2205248 RL3004 RL3005     FALSE 0.072 137.000 0.000 NA   NA
 2205249 2205250 RL3006 RL3007 rhbB   FALSE 0.362 35.000 0.000 1.000   NA
 2205253 2205254 RL3010 RL3011     FALSE 0.001 503.000 0.000 NA   NA
 2205260 2205261 RL3017 RL3018     TRUE 0.998 -3.000 0.920 0.044   NA
 2205261 2205262 RL3018 RL3019     FALSE 0.466 87.000 0.186 NA   NA
 2205263 2205264 RL3020 RL3021     TRUE 0.996 -3.000 0.812 NA   NA
 2205264 2205265 RL3021 RL3022     FALSE 0.002 397.000 0.000 NA   NA
 2205266 2205267 RL3023 RL3024     FALSE 0.002 464.000 0.000 NA   NA
 2205267 2205268 RL3024 RL3025     FALSE 0.038 179.000 0.000 NA   NA
 2205268 2205269 RL3025 RL3026     FALSE 0.082 124.000 0.000 NA   NA
 2205269 2205270 RL3026 RL3027     FALSE 0.059 154.000 0.000 NA   NA
 2205270 2205271 RL3027 RL3028     TRUE 0.988 5.000 0.820 NA N NA
 2205271 2205272 RL3028 RL3029     TRUE 0.996 -3.000 0.839 NA N NA
 2205272 2205273 RL3029 RL3030     TRUE 0.996 -3.000 0.810 1.000 N NA
 2205273 2205274 RL3030 RL3031     FALSE 0.100 170.000 0.032 1.000 N NA
 2205274 2205275 RL3031 RL3032     FALSE 0.012 250.000 0.000 1.000 N NA
 2205277 1573648 RL3034 RL3035 glyA   TRUE 0.797 -4.000 0.000 NA   NA
 1573648 2205278 RL3035 RL3036     FALSE 0.002 412.000 0.000 NA   NA
 2205278 2205279 RL3036 RL3037     FALSE 0.165 77.000 0.000 NA   NA
 2205279 2205280 RL3037 RL3038     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2205282 2205283 RL3040 RL3041     TRUE 0.746 7.000 0.000 1.000   NA
 2205283 2205284 RL3041 RL3042   ctaE2 TRUE 0.948 26.000 0.488 0.003   NA
 2205284 2205285 RL3042 RL3043 ctaE2 ctaE1 TRUE 0.993 12.000 0.440 0.003 Y NA
 2205285 2205286 RL3043 RL3044 ctaE1 ctaD TRUE 0.999 -3.000 0.786 0.003 Y NA
 2205286 2205287 RL3044 RL3045 ctaD ctaC TRUE 0.966 47.000 0.344 0.003 Y NA
 2205287 2205288 RL3045 RL3046 ctaC   TRUE 0.685 166.000 0.086 0.008 Y NA
 2205292 2205293 RL3050 RL3051     TRUE 0.993 -3.000 0.130 NA Y NA
 2205293 2205294 RL3051 RL3052     TRUE 0.997 6.000 0.958 NA Y NA
 2205295 2205296 RL3053 RL3054     TRUE 0.988 -3.000 0.429 NA   NA
 2205297 2205298 RL3055 RL3056     FALSE 0.183 157.000 0.105 NA   NA
 2205299 2205300 RL3057 RL3058     FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   NA
 2205301 2205302 RL3059 RL3060     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2205302 2205303 RL3060 RL3061     FALSE 0.051 161.000 0.000 NA   NA
 2205304 2205305 RL3062 RL3063 cya3   FALSE 0.146 109.000 0.000 1.000   NA
 2205305 2205306 RL3063 RL3064     FALSE 0.046 190.000 0.000 1.000   NA
 2205307 2205308 RL3065 RL3066     TRUE 0.618 69.000 0.250 NA   NA
 2205309 2205310 RL3067 RL3068     TRUE 0.992 -3.000 0.047 1.000 Y NA
 2205310 2205311 RL3068 RL3069     FALSE 0.002 439.000 0.000 NA   NA
 2205311 2205312 RL3069 RL3070     FALSE 0.025 200.000 0.000 NA   NA
 2205312 2205313 RL3070 RL3071   ftsZ FALSE 0.036 182.000 0.000 NA   NA
 2205314 2205315 RL3072 RL3073     FALSE 0.010 259.000 0.000 NA   NA
 2205315 2205316 RL3073 RL3074   rap1A FALSE 0.180 71.000 0.000 NA   NA
 2205316 2205317 RL3074 RL3075 rap1A   FALSE 0.016 224.000 0.000 NA   NA
 2205317 2205318 RL3075 RL3076     TRUE 0.754 -10.000 0.000 NA   NA
 2205320 2205321 RL3078 RL3079     FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 2205323 2205324 RL3081 RL3083     FALSE 0.001 697.000 0.000 NA   NA
 2205325 2205326 RL3084 RL3085     FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 2205328 2205329 RL3087 RL3088     FALSE 0.018 224.000 0.000 1.000 N NA
 2205329 2205330 RL3088 RL3089     TRUE 0.892 34.000 0.583 NA   NA
 2205330 2205331 RL3089 RL3090     TRUE 0.995 -3.000 0.769 NA   NA
 2205331 2205332 RL3090 RL3091     TRUE 0.992 -3.000 0.538 1.000 N NA
 2205332 2205333 RL3091 RL3092     TRUE 0.989 4.000 0.700 1.000   NA
 2205333 2205334 RL3092 RL3093     TRUE 0.980 8.000 0.692 NA   NA
 2205336 1573708 RL3095 RL3096 arcB   TRUE 0.577 11.000 0.000 NA   NA
 1573708 10691950 RL3096 RL3097     TRUE 0.684 -365.000 0.000 NA   NA
 10691950 2205337 RL3097 RL3098     FALSE 0.001 550.000 0.000 NA   NA
 2205338 2205339 RL3099 RL3100     FALSE 0.255 40.000 0.000 NA   NA
 2205339 2205340 RL3100 RL3101     TRUE 0.857 34.000 0.474 NA   NA
 2205340 2205341 RL3101 RL3102     TRUE 0.990 -3.000 0.478 NA   NA
 2205343 2205344 RL3104 RL3105     FALSE 0.410 27.000 0.000 1.000   NA
 2205346 2205347 RL3107 RL3108 bgaB   TRUE 0.920 15.000 0.000 1.000 Y NA
 2205347 2205348 RL3108 RL3109     TRUE 0.790 47.000 0.000 NA Y NA
 2205348 2205349 RL3109 RL3110     TRUE 0.993 0.000 0.250 NA Y NA
 2205349 2205350 RL3110 RL3111     FALSE 0.445 219.000 0.375 NA Y NA
 2205351 2205352 RL3112 RL3112A     TRUE 0.708 5.000 0.000 NA   NA
 2205352 2205353 RL3112A RL3113     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2205353 2205354 RL3113 RL3114     FALSE 0.010 255.000 0.000 NA   NA
 2205359 2205360 RL3119 RL3120     TRUE 0.982 11.000 0.300 1.000 Y NA
 2205361 2205362 RL3121 RL3122   gst FALSE 0.009 300.000 0.000 1.000   NA
 2205362 2205363 RL3122 RL3123 gst   TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2205364 2205365 RL3124 RL3125     FALSE 0.004 334.000 0.000 NA   NA
 2205365 2205366 RL3125 RL3126     FALSE 0.426 57.000 0.055 NA   NA
 2205367 2205368 RL3127 RL3128     TRUE 0.949 6.000 0.300 NA   NA
 2205369 2205370 RL3129 RL3130     FALSE 0.083 156.000 0.000 1.000   NA
 2205370 2205371 RL3130 RL3131     TRUE 0.981 -3.000 0.250 1.000   NA
 2205371 2205372 RL3131 RL3132   ugpC TRUE 0.946 11.000 0.375 1.000   NA
 2205372 2205373 RL3132 RL3133 ugpC ugpE TRUE 0.996 3.000 0.600 NA Y NA
 2205373 2205374 RL3133 RL3134 ugpE ugpA TRUE 0.997 4.000 0.833 NA Y NA
 2205374 2205375 RL3134 RL3135 ugpA ugpB TRUE 0.922 78.000 0.500 NA Y NA
 2205376 2205377 RL3136 RL3138     FALSE 0.008 310.000 0.000 1.000   NA
 2205377 2205378 RL3138 RL3139     FALSE 0.151 83.000 0.000 NA   NA
 2205381 2205382 RL3142 RL3143     TRUE 0.958 -3.000 0.095 NA   NA
 2205382 2205383 RL3143 RL3144     FALSE 0.032 189.000 0.000 NA   NA
 2205384 2205385 RL3145 RL3146     FALSE 0.007 299.000 0.000 1.000 N NA
 2205386 2205387 RL3147 RL3148     TRUE 0.991 -3.000 0.455 1.000   NA
 2205387 2205388 RL3148 RL3149     FALSE 0.530 85.000 0.200 1.000   NA
 2205388 10691951 RL3149 RL3149a     TRUE 0.785 2.000 0.000 NA   NA
 2205391 2205392 RL3151 RL3152     FALSE 0.254 186.000 0.333 NA   NA
 2205393 2205394 RL3153 RL3154 ribH   FALSE 0.024 228.000 0.004 NA   NA
 2205395 2205396 RL3155 RL3156     TRUE 0.925 -19.000 0.147 1.000 N NA
 2205400 2205401 RL3160 RL3161     TRUE 0.730 114.000 0.667 NA   NA
 2205402 2205403 RL3163 RL3162     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.051   NA
 2205403 2205404 RL3162 RL3164     TRUE 0.993 -6.000 0.833 NA   NA
 2205404 2205405 RL3164 RL3165     FALSE 0.001 795.000 0.000 NA N NA
 2205405 2205406 RL3165 RL3166     TRUE 0.966 0.000 0.208 1.000 N NA
 2205407 2205408 RL3167 RL3168     FALSE 0.326 45.000 0.000 1.000   NA
 2205409 2205410 RL3169 RL3170     TRUE 0.878 -27.000 0.035 1.000   NA
 2205411 2205412 RL3171 RL3172     FALSE 0.178 72.000 0.000 NA   NA
 2205414 2205415 RL3174 RL3175   zur FALSE 0.012 271.000 0.000 1.000   NA
 2205415 2205416 RL3175 RL3176 zur znuB TRUE 0.993 -3.000 0.086 1.000 Y NA
 2205416 2205417 RL3176 RL3177 znuB znuC TRUE 0.999 -7.000 0.755 0.091 Y NA
 2205418 2205419 RL3178 RL3179 znuA   FALSE 0.155 147.000 0.045 NA   NA
 2205419 2205420 RL3179 RL3180     TRUE 0.962 -3.000 0.111 NA   NA
 2205422 2205423 RL3182 RL3183     FALSE 0.044 243.000 0.100 NA   NA
 2205424 2205425 RL3184 RL3185 chrA chrB TRUE 0.936 2.000 0.114 NA   NA
 2205427 2205428 RL3187 RL3188     TRUE 0.964 12.000 0.600 NA   NA
 2205428 1573801 RL3188 RLt40   tRNA-Lys FALSE 0.068 145.000 0.000 NA   NA
 1573801 2205429 RLt40 RL3189 tRNA-Lys   FALSE 0.015 228.000 0.000 NA   NA
 2205429 2205430 RL3189 RL3190     FALSE 0.443 166.000 0.444 1.000   NA
 2205430 2205431 RL3190 RL3191     TRUE 0.981 -3.000 0.250 1.000   NA
 2205431 2205432 RL3191 RL3192     FALSE 0.006 526.000 0.107 1.000   NA
 2205432 2205433 RL3192 RL3193     TRUE 0.983 -12.000 0.590 NA N NA
 2205433 2205434 RL3193 RL3194     TRUE 0.993 8.000 0.607 NA Y NA
 2205434 2205435 RL3194 RL3195     FALSE 0.095 192.000 0.089 NA   NA
 2205436 2205437 RL3196 RL3197     FALSE 0.017 225.000 0.000 1.000 N NA
 2205437 2205438 RL3197 RL3198     FALSE 0.070 205.000 0.077 NA   NA
 2205440 2205441 RL3200 RL3201 ilvE   FALSE 0.223 85.000 0.007 NA   NA
 2205441 2205442 RL3201 RL3202     TRUE 0.641 8.000 0.000 NA   NA
 2205442 2205443 RL3202 RL3203     TRUE 0.867 -16.000 0.038 NA   NA
 2205443 2205444 RL3203 RL3204     TRUE 0.865 -10.000 0.023 NA   NA
 2205445 2205446 RL3205 RL3206 ilvC   FALSE 0.385 50.000 0.019 1.000 N NA
 2205447 2205448 RL3207 RL3208     FALSE 0.355 22.000 0.000 NA   NA
 2205449 2205450 RL3209 RL3210     TRUE 0.968 0.000 0.227 NA   NA
 2205450 2205451 RL3210 RL3211     FALSE 0.410 93.000 0.143 1.000 N NA
 2205453 2205454 RL3213 RL3214     FALSE 0.023 211.000 0.000 1.000 N NA
 2205454 2205455 RL3214 RL3215     FALSE 0.111 109.000 0.000 1.000 N NA
 2205456 2205457 RL3216 RL3217 asr   FALSE 0.075 175.000 0.011 1.000 N NA
 2205457 2205458 RL3217 RL3218     TRUE 0.897 62.000 0.059 0.087 Y NA
 2205458 2205459 RL3218 RL3219     TRUE 0.675 111.000 0.522 1.000 N NA
 2205464 2205465 RL3224 RL3225     FALSE 0.439 74.000 0.068 1.000   NA
 2205466 2205467 RL3226 RL3227     TRUE 0.543 69.000 0.182 NA   NA
 2205467 2205468 RL3227 RL3228     TRUE 0.794 69.000 0.500 NA   NA
 2205468 2205469 RL3228 RL3229     FALSE 0.478 193.000 0.750 NA   NA
 2205470 2205471 RL3230 RL3231 rrf2   FALSE 0.494 134.000 0.000 NA Y NA
 2205472 2205473 RL3232 RL3233     FALSE 0.213 56.000 0.000 NA   NA
 2205473 2205474 RL3233 RL3234     FALSE 0.069 144.000 0.000 NA   NA
 2205474 2205475 RL3234 RL3235     TRUE 0.931 35.000 0.818 NA   NA
 2205475 2205476 RL3235 RL3236     TRUE 0.999 -3.000 0.909 NA Y NA
 2205477 2205478 RL3237 RL3238   nhb2 TRUE 0.995 -13.000 0.761 0.001   NA
 2205478 2205479 RL3238 RL3239 nhb2 nha1 TRUE 0.998 -3.000 0.761 0.001   NA
 2205480 2205481 RL3240 RL3241     TRUE 0.994 0.000 0.800 NA   NA
 2205484 2205485 RL3244 RL3245 ilvH ilvI TRUE 0.968 23.000 0.146 0.001 Y NA
 2205487 2205488 RL3247 RL3247A dapA   TRUE 0.926 22.000 0.099 1.000 Y NA
 2205491 2205492 RL3250 RL3251 serB   FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 2205493 2205494 RL3252 RL3253   hflC FALSE 0.344 247.000 0.084 0.006 Y NA
 2205494 2205495 RL3253 RL3254 hflC hflK TRUE 0.999 4.000 0.947 0.006 Y NA
 2205495 2205496 RL3254 RL3255 hflK folA FALSE 0.156 149.000 0.044 1.000 N NA
 2205496 2205497 RL3255 RL3256 folA thyA TRUE 0.890 14.000 0.295 1.000 N NA
 2205498 2205499 RL3257 RL3258     TRUE 0.550 50.000 0.118 NA   NA
 2205499 2205500 RL3258 RL3259     FALSE 0.434 158.000 0.425 NA   NA
 2205501 2205502 RL3260 RL3261     FALSE 0.103 203.000 0.156 NA   NA
 2205502 2205503 RL3261 RL3262   mocA FALSE 0.499 162.000 0.042 1.000 Y NA
 2205504 2205505 RL3263 RL3264     FALSE 0.004 328.000 0.000 NA   NA
 2205508 2205509 RL3267 RL3268   flaB FALSE 0.013 413.000 0.000 0.002 N NA
 2205509 2205510 RL3268 RL3269 flaB   FALSE 0.006 259.000 0.000 NA N NA
 2205510 2205511 RL3269 RL3270     TRUE 0.988 -3.000 0.442 NA N NA
 2205511 2205512 RL3270 RL3271   cya3 FALSE 0.009 269.000 0.000 1.000 N NA
 2205512 2205513 RL3271 RL3272 cya3   FALSE 0.091 157.000 0.007 NA   NA
 2205513 2205514 RL3272 RL3273     TRUE 0.995 -3.000 0.761 NA   NA
 2205514 2205515 RL3273 RL3274   prkA TRUE 0.966 13.000 0.683 NA   NA
 2205515 2205516 RL3274 RL3275 prkA   FALSE 0.002 412.000 0.000 NA   NA
 2205519 2205520 RL3278 RL3279   pncA FALSE 0.006 331.000 0.000 1.000   NA
 2205520 2205521 RL3279 RL3280 pncA   FALSE 0.174 103.000 0.004 1.000 N NA
 2205523 2205524 RL3282 RL3283     TRUE 0.993 4.000 1.000 NA   NA
 2205526 2205527 RL3287 RL3288     FALSE 0.384 69.000 0.025 1.000   NA
 2205529 2205530 RL3290 RL3291     FALSE 0.304 79.000 0.033 NA   NA
 2205532 2205533 RL3293 RL3294 ligA   FALSE 0.145 113.000 0.003 NA   NA
 2205533 2205534 RL3294 RL3295   recN FALSE 0.191 95.000 0.006 NA   NA
 2205534 2205535 RL3295 RL3296 recN comL TRUE 0.912 6.000 0.117 1.000   NA
 2205535 2205536 RL3296 RL3297 comL lpxC FALSE 0.035 260.000 0.064 1.000   NA
 2205536 2205537 RL3297 RL3298 lpxC ftsZ FALSE 0.042 262.000 0.134 1.000 N NA
 2205537 2205538 RL3298 RL3299 ftsZ ftsA TRUE 0.864 57.000 0.114 1.000 Y NA
 2205538 2205539 RL3299 RL3300 ftsA ftsQ TRUE 0.960 -3.000 0.137 NA N NA
 2205539 2205540 RL3300 RL3301 ftsQ ddlB TRUE 0.996 -3.000 0.372 NA Y NA
 2205540 2205541 RL3301 RL3302 ddlB aqpZ FALSE 0.008 274.000 0.000 1.000 N NA
 2205542 2205543 RL3303 RL3304   galE TRUE 0.588 114.000 0.000 1.000 Y NA
 2205544 2205545 RL3305 RL3306   murC TRUE 0.997 -3.000 0.108 0.003 Y NA
 2205545 2205546 RL3306 RL3307 murC murG TRUE 0.996 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 2205546 2205547 RL3307 RL3308 murG ftsW TRUE 0.980 7.000 0.647 1.000 N NA
 2205547 2205548 RL3308 RL3309 ftsW murD TRUE 0.988 2.000 0.297 0.001 N NA
 2205548 2205549 RL3309 RL3310 murD mraY TRUE 0.997 8.000 0.647 0.003 Y NA
 2205549 2205550 RL3310 RL3311 mraY murF TRUE 0.978 23.000 0.309 0.003 Y NA
 2205550 2205551 RL3311 RL3312 murF murE TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.001 Y NA
 2205551 2205552 RL3312 RL3313 murE   TRUE 0.809 58.000 0.010 1.000 Y NA
 2205552 2205553 RL3313 RL3314     TRUE 0.928 0.000 0.054 NA   NA
 2205553 2205554 RL3314 RL3315   mraW TRUE 0.926 2.000 0.089 NA   NA
 2205554 2205555 RL3315 RL3316 mraW mraZ TRUE 0.942 18.000 0.635 NA   NA
 2205555 2205556 RL3316 RL3317 mraZ   FALSE 0.001 959.000 0.000 NA   NA
 2205556 2205557 RL3317 RL3318     TRUE 0.963 88.000 0.556 0.002 Y NA
 2205557 2205558 RL3318 RL3319     FALSE 0.476 82.000 0.171 NA   NA
 2205558 2205559 RL3319 RL3320     FALSE 0.020 263.000 0.026 NA   NA
 2205559 2205560 RL3320 RL3321     TRUE 0.960 -3.000 0.098 1.000 N NA
 2205561 2205562 RL3322 RL3323 pfp   TRUE 0.564 58.000 0.158 1.000 N NA
 2205562 2205563 RL3323 RL3324     FALSE 0.134 182.000 0.123 NA   NA
 2205565 2205566 RL3326 RL3327 btaA btaB TRUE 0.984 -3.000 0.347 NA N NA
 2205566 2205567 RL3327 RL3328 btaB   FALSE 0.205 126.000 0.058 1.000 N NA
 2205567 2205568 RL3328 RL3329     TRUE 0.855 82.000 0.235 1.000 Y NA
 2205568 2205569 RL3329 RL3330     FALSE 0.346 105.000 0.137 NA   NA
 2205570 2205571 RL3331 RL3332 metF   TRUE 0.891 2.000 0.007 1.000   NA
 2205571 2205572 RL3332 RL3333     FALSE 0.073 163.000 0.000 1.000   NA
 2205572 2205573 RL3333 RL3334   rna FALSE 0.252 98.000 0.016 1.000   NA
 2205574 2205575 RL3335 RL3336     TRUE 0.719 33.000 0.227 NA   NA
 2205575 2205576 RL3336 RL3337     TRUE 0.628 27.000 0.098 NA   NA
 2205576 2205577 RL3337 RL3338   ilvG TRUE 0.971 -3.000 0.176 1.000 N NA
 2205578 2205579 RL3339 RL3340     TRUE 0.555 69.000 0.194 NA   NA
 2205579 2205580 RL3340 RL3341     FALSE 0.178 72.000 0.000 NA   NA
 2205582 2205583 RL3343 RL3344 parA   FALSE 0.003 501.000 0.029 1.000 N NA
 2205583 2205584 RL3344 RL3345     TRUE 0.999 -3.000 0.706 0.051 Y NA
 2205584 2205585 RL3345 RL3346   glnA FALSE 0.221 200.000 0.361 1.000 N NA
 2205585 2205586 RL3346 RL3347 glnA   TRUE 0.628 146.000 0.108 1.000 Y NA
 2205586 2205587 RL3347 RL3348     TRUE 0.811 120.000 0.346 1.000 Y NA
 2205588 2205589 RL3349 RL3350     FALSE 0.101 192.000 0.132 NA N NA
 2205589 2205590 RL3350 RL3351     TRUE 0.656 72.000 0.301 NA   NA
 2205590 2205591 RL3351 RL3352     TRUE 0.989 -12.000 0.774 NA   NA
 2205591 2205592 RL3352 RL3353     TRUE 0.983 13.000 0.461 NA Y NA
 2205592 2205593 RL3353 RL3354     FALSE 0.026 197.000 0.000 NA   NA
 2205594 2205595 RL3355 RL3356     TRUE 0.958 11.000 0.463 1.000   NA
 2205595 2205596 RL3356 RL3357     TRUE 0.988 -3.000 0.415 NA   NA
 2205596 2205597 RL3357 RL3358     TRUE 0.993 10.000 0.708 NA Y NA
 2205597 2205598 RL3358 RL3359     FALSE 0.478 224.000 0.456 NA Y NA
 2205599 2205600 RL3360 RL3361     TRUE 0.995 -3.000 0.704 1.000 N NA
 2205603 2205604 RL3364 RL3365     TRUE 0.785 2.000 0.000 NA   NA
 2205604 2205605 RL3365 RL3366     FALSE 0.137 171.000 0.091 NA   NA
 2205605 2205606 RL3366 RL3367   hyuE TRUE 0.939 5.000 0.194 1.000   NA
 2205606 2205607 RL3367 RL3368 hyuE   TRUE 0.996 3.000 0.613 NA Y NA
 2205607 2205608 RL3368 RL3369     TRUE 0.996 2.000 0.571 NA Y NA
 2205608 2205609 RL3369 RL3370     FALSE 0.090 315.000 0.094 NA Y NA
 2205609 2205610 RL3370 RL3371     TRUE 0.966 55.000 0.737 NA Y NA
 2205611 2205612 RL3372 RL3373     FALSE 0.080 205.000 0.100 NA   NA
 2205614 2205615 RL3374A RL3375     TRUE 0.754 -10.000 0.000 NA   NA
 2205617 2205618 RL3377 RL3378 bisR cinI TRUE 0.598 159.000 0.154 1.000 Y NA
 2205620 2205621 RL3380 RL3381     FALSE 0.001 2138.000 0.000 NA   NA
 2205623 2205624 RL3383 RL3384     FALSE 0.038 179.000 0.000 NA   NA
 2205624 2205625 RL3384 RL3385     FALSE 0.127 124.000 0.005 NA   NA
 2205625 2205626 RL3385 RL3386     FALSE 0.240 81.000 0.009 NA   NA
 10691952 2205629 RL3388 RL3389     FALSE 0.251 42.000 0.000 NA   NA
 2205629 2205630 RL3389 RL3390   fnrL FALSE 0.157 136.000 0.011 1.000   NA
 2205632 2205633 RL3392 RL3393     FALSE 0.151 83.000 0.000 NA   NA
 2205633 2205634 RL3393 RL3394     FALSE 0.311 98.000 0.085 NA   NA
 2205634 2205635 RL3394 RL3395     TRUE 0.941 4.000 0.200 NA   NA
 2205635 2205636 RL3395 RL3396     TRUE 0.585 84.000 0.281 NA   NA
 2205636 2205637 RL3396 RL3397   neo FALSE 0.480 79.000 0.156 1.000 N NA
 2205637 2205638 RL3397 RL3398 neo   FALSE 0.457 106.000 0.250 NA   NA
 2205638 2205639 RL3398 RL3399     TRUE 0.708 107.000 0.571 NA   NA
 2205639 2205640 RL3399 RL3400     TRUE 0.651 79.000 0.333 NA   NA
 2205640 2205641 RL3400 RL3401     FALSE 0.003 527.000 0.039 NA   NA
 2205641 2205642 RL3401 RL3402   rpoD FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   NA
 2205642 2205643 RL3402 RL3403 rpoD   FALSE 0.003 469.000 0.000 1.000   NA
 2205643 2205644 RL3403 RL3404   tdh TRUE 0.794 10.000 0.017 1.000   NA
 2205644 2205645 RL3404 RL3405 tdh kbl FALSE 0.390 190.000 0.547 1.000 N NA
 2205645 2205646 RL3405 RL3406 kbl   FALSE 0.263 66.000 0.000 1.000   NA
 2205646 2205647 RL3406 RL3407   recQ FALSE 0.252 70.000 0.000 1.000   NA
 2205647 2205648 RL3407 RL3408 recQ dnaG TRUE 0.987 0.000 0.008 1.000 Y NA
 2205651 2205652 RL3411 RL3412 carA   FALSE 0.011 275.000 0.000 1.000   NA
 2205653 2205654 RL3413 RL3414 norM tetA FALSE 0.161 143.000 0.039 1.000 N NA
 2205656 2205657 RL3416 RL3417     FALSE 0.402 77.000 0.087 NA   NA
 2205658 2205659 RL3418 RL3419   carB FALSE 0.010 270.000 0.003 NA N NA
 2205660 2205661 RL3420 RL3421     TRUE 0.994 0.000 0.748 1.000   NA
 2205662 2205663 RL3422 RL3423 greA   FALSE 0.530 28.000 0.036 1.000 N NA
 2205665 2205666 RL3425 RL3426 dctB dctD TRUE 0.997 5.000 0.615 0.090 Y NA
 2205668 2205669 RL3428 RL3429 trxB   TRUE 0.848 8.000 0.065 1.000 N NA
 2205669 2205670 RL3429 RL3430     FALSE 0.031 555.000 0.000 0.086 Y NA
 2205670 2205671 RL3430 RL3431     TRUE 0.956 2.000 0.204 1.000 N NA
 2205671 2205672 RL3431 RL3432     TRUE 0.618 26.000 0.081 1.000 N NA
 2205672 2205673 RL3432 RL3433   str FALSE 0.526 76.000 0.189 1.000 N NA
 2205675 2205676 RL3435 RL3436     TRUE 0.888 -22.000 0.075 NA   NA
 2205679 2205680 RL3439 RL3440 lpcB gspA TRUE 0.840 47.000 0.500 NA   NA
 2205680 2205681 RL3440 RL3441 gspA   TRUE 0.740 101.000 0.600 NA   NA
 2205681 2205682 RL3441 RL3442     TRUE 0.977 3.000 0.429 NA   NA
 2205682 2205683 RL3442 RL3443     FALSE 0.180 101.000 0.027 NA N NA
 2205684 2205685 RL3444 RL3445     TRUE 0.875 68.000 0.741 NA   NA
 2205685 2205686 RL3445 RL3446     FALSE 0.409 61.000 0.082 NA N NA
 2205688 2205689 RL3448 RL3449   cspA FALSE 0.002 488.000 0.000 NA   NA
 2205689 2205690 RL3449 RL3450 cspA   FALSE 0.511 142.000 0.438 NA   NA
 2205693 2205694 RL3453 RL3454     TRUE 0.976 25.000 0.592 1.000 Y NA
 2205694 2205695 RL3454 RL3455     TRUE 0.995 1.000 0.392 1.000 Y NA
 2205695 2205696 RL3455 RL3456     FALSE 0.001 618.000 0.000 NA   NA
 2205696 2205697 RL3456 RL3457     FALSE 0.126 184.000 0.118 NA   NA
 2205699 2205700 RL3459 RL3460 csaA proC TRUE 0.886 11.000 0.163 1.000   NA
 2205700 2205701 RL3460 RL3461 proC   TRUE 0.971 2.000 0.308 NA   NA
 2205702 2205703 RL3462 RL3463   lgt FALSE 0.064 175.000 0.003 NA   NA
 2205703 2205704 RL3463 RL3464 lgt   TRUE 0.759 19.000 0.170 NA   NA
 2205704 2205705 RL3464 RL3465     FALSE 0.294 112.000 0.107 NA   NA
 2205705 2205706 RL3465 RL3466     TRUE 0.816 6.000 0.023 NA   NA
 2205706 2205707 RL3466 RL3467     TRUE 0.705 92.000 0.485 NA   NA
 2205707 2205708 RL3467 RL3468   prs FALSE 0.414 106.000 0.209 NA   NA
 2205709 2205710 RL3469 RL3470     FALSE 0.280 34.000 0.000 NA   NA
 2205711 2205712 RL3471 RL3472     FALSE 0.058 185.000 0.006 1.000 N NA
 2205712 2205713 RL3472 RL3473     TRUE 0.984 17.000 0.600 1.000 Y NA
 2205713 2205714 RL3473 RL3474   pth FALSE 0.053 191.000 0.007 1.000 N NA
 2205714 2205715 RL3474 RL3475 pth   TRUE 0.932 -3.000 0.004 1.000   NA
 2205716 2205717 RL3476 RL3477 clpS   FALSE 0.122 96.000 0.000 NA   NA
 2205717 2205718 RL3477 RL3478     TRUE 0.754 -10.000 0.000 NA   NA
 2205721 2205722 RL3481 RL3482     TRUE 0.986 17.000 0.433 0.050 Y NA
 2205723 2205724 RL3483 RL3484 apt petC FALSE 0.166 116.000 0.015 1.000 N NA
 2205724 2205725 RL3484 RL3485 petC petB TRUE 0.989 26.000 0.630 0.000 Y NA
 2205725 2205726 RL3485 RL3486 petB petA TRUE 0.973 15.000 0.029 0.000 Y NA
 2205731 2205732 RL3491 RL3492     FALSE 0.033 216.000 0.007 1.000 N NA
 2205734 2205735 RL3494 RL3495 hemF   FALSE 0.290 71.000 0.014 NA   NA
 2205736 2205737 RL3496 RL3497 papS   TRUE 0.970 -3.000 0.163 1.000 N NA
 2205737 2205738 RL3497 RL3498     TRUE 0.985 -3.000 0.346 NA   NA
 2205739 2205740 RL3499 RL3500     TRUE 0.962 14.000 0.697 NA   NA
 2205740 2205741 RL3500 RL3501     TRUE 0.996 -3.000 0.816 NA   NA
 2205741 2205742 RL3501 RL3502     TRUE 0.993 2.000 0.876 NA   NA
 2205742 2205743 RL3502 RL3503     FALSE 0.437 53.000 0.052 NA   NA
 2205747 2205748 RL3507 RL3508     FALSE 0.124 160.000 0.018 1.000   NA
 2205748 2205749 RL3508 RL3509     FALSE 0.045 191.000 0.000 1.000   NA
 2205749 2205750 RL3509 RL3510     TRUE 0.998 3.000 0.909 NA Y NA
 2205753 2205754 RL3513 RL3514 leuA   FALSE 0.002 499.000 0.000 1.000 N NA
 2205754 2205755 RL3514 RL3515   clpP FALSE 0.134 162.000 0.055 1.000 N NA
 2205757 2205758 RL3517 RL3518     TRUE 0.946 -3.000 0.025 1.000   NA
 2205758 2205759 RL3518 RL3519     FALSE 0.100 154.000 0.011 NA   NA
 2205759 2205760 RL3519 RL3520     TRUE 0.715 16.000 0.078 NA   NA
 2205760 2205761 RL3520 RL3521   trpE FALSE 0.210 128.000 0.071 NA   NA
 2205761 2205762 RL3521 RL3522 trpE   FALSE 0.010 266.000 0.000 1.000 N NA
 2205763 2205764 RL3523 RL3524     FALSE 0.133 91.000 0.000 NA   NA
 2205768 2205769 RL3528 RL3529     TRUE 0.730 47.000 0.300 NA   NA
 2205770 2205771 RL3530 RL3531     FALSE 0.149 150.000 0.045 NA   NA
 2205771 2205772 RL3531 RL3532   tdk FALSE 0.266 74.000 0.010 NA   NA
 2205773 2205774 RL3533 RL3534     TRUE 0.997 -3.000 0.469 NA Y NA
 2205774 2205775 RL3534 RL3535     TRUE 0.999 -3.000 0.844 NA Y NA
 2205775 2205776 RL3535 RL3536     TRUE 0.543 32.000 0.054 1.000 N NA
 2205776 2205777 RL3536 RL3537   nolR FALSE 0.226 116.000 0.054 1.000 N NA
 2205777 2205778 RL3537 RL3538 nolR   FALSE 0.006 307.000 0.000 1.000 N NA
 2205780 2205781 RL3540 RL3541   ade FALSE 0.182 108.000 0.013 1.000 N NA
 2205783 2205784 RL3543 RL3544     TRUE 0.886 49.000 0.192 NA Y NA
 2205784 2205785 RL3544 RL3545     TRUE 0.999 -3.000 0.870 NA Y NA
 2205785 2205786 RL3545 RL3546     TRUE 0.982 3.000 0.043 NA Y NA
 2205786 2205787 RL3546 RL3547     TRUE 0.994 -7.000 0.079 0.004 Y NA
 2205787 2205788 RL3547 RL3548   kdgK FALSE 0.016 232.000 0.000 1.000 N NA
 2205788 2205789 RL3548 RL3549 kdgK glnII FALSE 0.001 862.000 0.000 1.000 N NA
 2205789 2205790 RL3549 RL3550 glnII   FALSE 0.012 249.000 0.000 1.000 N NA
 2205793 2205794 RL3553 RL3554     TRUE 0.635 19.000 0.026 1.000   NA
 2205794 2205795 RL3554 RL3555     FALSE 0.022 308.000 0.123 NA   NA
 2205797 2205798 RL3557 RL3558 bacA   FALSE 0.450 125.000 0.068 0.049   NA
 2205800 2205801 RL3560 RL3561 map   FALSE 0.225 148.000 0.112 1.000 N NA
 2205801 2205802 RL3561 RL3562     FALSE 0.012 247.000 0.000 NA   NA
 2205802 2205803 RL3562 RL3563     FALSE 0.371 102.000 0.152 NA   NA
 2205803 2205804 RL3563 RL3564     TRUE 0.996 -3.000 0.867 1.000   NA
 2205804 2205805 RL3564 RL3565     FALSE 0.106 136.000 0.000 1.000   NA
 2205806 2205807 RL3566 RL3567     FALSE 0.106 136.000 0.000 1.000   NA
 2205809 2205810 RL3569 RL3570 bdhA xdhA TRUE 0.685 28.000 0.149 1.000 N NA
 2205810 2205811 RL3570 RL3571 xdhA xdhB TRUE 0.546 215.000 0.164 0.000 Y NA
 2205811 2205812 RL3571 RL3572 xdhB xdhC FALSE 0.018 297.000 0.090 NA N NA
 2205812 2205813 RL3572 RL3573 xdhC   FALSE 0.005 269.000 0.000 NA N NA
 2205814 2205815 RL3573A RL3574     FALSE 0.055 158.000 0.000 NA   NA
 2205815 2205816 RL3574 RL3575     FALSE 0.126 94.000 0.000 NA   NA
 2205817 2205818 RL3576 RL3577   guaD TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2205818 2205819 RL3577 RL3578 guaD lldD FALSE 0.182 124.000 0.036 1.000 N NA
 2205819 2205820 RL3578 RL3579 lldD   FALSE 0.049 131.000 0.000 NA N NA
 2205820 2205821 RL3579 RL3580     TRUE 0.912 5.000 0.128 NA   NA
 2205821 2205822 RL3580 RL3581     TRUE 0.994 -3.000 0.641 NA   NA
 2205823 2205824 RL3582 RL3583     TRUE 0.936 4.000 0.133 1.000   NA
 2205824 2205825 RL3583 RL3584   allA TRUE 0.993 -3.000 0.571 1.000   NA
 2205825 2205826 RL3584 RL3585 allA   TRUE 0.968 -7.000 0.292 NA   NA
 2205826 2205827 RL3585 RL3586     TRUE 0.982 -3.000 0.292 NA   NA
 2205827 2205828 RL3586 RL3587     TRUE 0.919 3.000 0.058 1.000   NA
 2205828 2205829 RL3587 RL3588     FALSE 0.254 116.000 0.052 1.000   NA
 2205829 2205830 RL3588 RL3589   goxB FALSE 0.287 115.000 0.078 1.000   NA
 2205834 2205835 RL3593 RL3594   dapA FALSE 0.113 188.000 0.100 1.000 N NA
 2205836 2205837 RL3595 RL3596     FALSE 0.145 153.000 0.043 1.000 N NA
 2205837 2205838 RL3596 RL3597     FALSE 0.132 250.000 0.000 1.000 Y NA
 2205839 2205840 RL3598 RL3599     TRUE 0.980 42.000 0.857 1.000 Y NA
 2205841 2205842 RL3600 RL3601     FALSE 0.262 38.000 0.000 NA   NA
 2205842 2205843 RL3601 RL3602     TRUE 0.785 5.000 0.000 1.000   NA
 2205843 2205844 RL3602 RL3603     TRUE 0.996 -3.000 0.842 1.000 N NA
 2205847 2205848 RL3606 RL3607     FALSE 0.016 225.000 0.000 NA   NA
 2205849 2205850 RL3608 RL3609     TRUE 0.994 0.000 0.805 NA   NA
 2205850 2205851 RL3609 RL3610     TRUE 0.920 13.000 0.365 NA   NA
 2205851 2205852 RL3610 RL3611     FALSE 0.002 371.000 0.000 NA N NA
 2205853 2205854 RL3612 RL3613 ilvD   TRUE 0.792 62.000 0.261 0.082 N NA
 2205854 2205855 RL3613 RL3614     TRUE 0.711 69.000 0.122 0.082   NA
 2205855 2205856 RL3614 RL3615     FALSE 0.439 119.000 0.286 NA   NA
 2205856 2205857 RL3615 RL3616     TRUE 0.998 -3.000 0.680 NA Y NA
 2205857 2205858 RL3616 RL3617     TRUE 0.901 93.000 0.500 NA Y NA
 2205859 2205860 RL3618 RL3619     TRUE 0.710 63.000 0.333 NA   NA
 2205860 2205861 RL3619 RL3620     FALSE 0.005 309.000 0.000 NA   NA
 2205865 2205866 RL3624 RL3625     FALSE 0.196 267.000 0.208 NA Y NA
 2205866 2205867 RL3625 RL3626     TRUE 0.893 15.000 0.333 NA   NA
 2205867 1574243 RL3626 RLt16   tRNA-Arg FALSE 0.023 206.000 0.000 NA   NA
 1574243 2205868 RLt16 RL3627 tRNA-Arg   FALSE 0.001 976.000 0.000 NA   NA
 2205868 2205869 RL3627 RL3628     FALSE 0.001 788.000 0.000 NA   NA
 2205869 2205870 RL3628 RL3629     TRUE 0.956 32.000 0.444 NA Y NA
 2205870 2205871 RL3629 RL3630     TRUE 0.982 -6.000 0.444 NA   NA
 2205871 2205872 RL3630 RL3631     TRUE 0.968 8.000 0.500 NA   NA
 2205872 2205873 RL3631 RL3632     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 2205873 2205874 RL3632 RL3633   exoU TRUE 0.980 -3.000 0.267 NA   NA
 2205874 2205875 RL3633 RL3634 exoU   FALSE 0.001 1257.000 0.000 NA   NA
 2205876 2205877 RL3635 RL3636     TRUE 0.715 104.000 0.571 NA   NA
 2205877 2205878 RL3636 RL3637     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 2205878 2205879 RL3637 RL3638     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 2205879 2205880 RL3638 RL3639     TRUE 0.966 10.000 0.500 1.000   NA
 2205882 2205883 RL3642 RL3643     TRUE 0.567 32.000 0.068 1.000 N NA
 2205883 2205884 RL3643 RL3644     TRUE 0.928 0.000 0.025 1.000   NA
 2205884 2205885 RL3644 RL3645   exoV TRUE 0.917 -3.000 0.010 NA   NA
 2205885 2205886 RL3645 RL3646 exoV   FALSE 0.375 95.000 0.125 NA   NA
 2205886 2205887 RL3646 RL3647     TRUE 0.843 33.000 0.429 NA   NA
 2205887 2205888 RL3647 RL3648     TRUE 0.676 40.000 0.214 NA   NA
 2205888 2205889 RL3648 RL3649     FALSE 0.442 84.000 0.143 NA   NA
 2205889 2205890 RL3649 RL3650     FALSE 0.357 172.000 0.400 NA   NA
 2205890 2205891 RL3650 RL3651     TRUE 0.798 83.000 0.600 NA   NA
 2205891 2205892 RL3651 RL3652     TRUE 0.986 -3.000 0.375 NA   NA
 2205892 2205893 RL3652 RL3653   exoM TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 2205893 2205894 RL3653 RL3654 exoM   FALSE 0.022 210.000 0.000 NA   NA
 2205894 2205895 RL3654 RL3655     TRUE 0.987 -3.000 0.052 0.000   NA
 2205896 2205897 RL3656 RL3657   prsE TRUE 0.642 76.000 0.300 1.000 N NA
 2205897 2205898 RL3657 RL3658 prsE prsD TRUE 0.980 16.000 0.700 0.004   NA
 2205898 2205899 RL3658 RL3659 prsD   FALSE 0.002 466.000 0.000 NA   NA
 2205900 2205901 RL3661 RL3662   exoP TRUE 0.993 0.000 0.714 NA   NA
 2205901 2205902 RL3662 RL3663 exoP pssO TRUE 0.903 52.000 0.714 1.000   NA
 2205902 2205903 RL3663 RL3664 pssO pssN TRUE 0.593 75.000 0.217 1.000   NA
 2205903 2205904 RL3664 RL3665 pssN pssT FALSE 0.015 232.000 0.000 NA   NA
 2205904 2205905 RL3665 RL3666 pssT   FALSE 0.043 172.000 0.000 NA   NA
 2205907 2205908 RL3668 RL3669     TRUE 0.966 1.000 0.250 NA   NA
 2205910 2205911 RL3671 RL3672     TRUE 0.969 12.000 0.667 NA   NA
 2205911 2205912 RL3672 RL3673   ung FALSE 0.189 130.000 0.055 NA   NA
 2205913 2205914 RL3674 RL3675 noeK   FALSE 0.477 116.000 0.308 NA   NA
 2205918 2205919 RL3679 RL3680     TRUE 0.978 -3.000 0.236 1.000 N NA
 2205919 2205920 RL3680 RL3681     TRUE 0.993 -3.000 0.545 1.000   NA
 2205920 2205921 RL3681 RL3682     TRUE 0.996 -3.000 0.547 0.089   NA
 2205921 2205922 RL3682 RL3683     TRUE 0.994 2.000 0.609 0.005 N NA
 2205922 2205923 RL3683 RL3684     FALSE 0.201 121.000 0.052 NA   NA
 2205924 2205925 RL3685 RL3686     TRUE 0.975 10.000 0.667 NA   NA
 2205925 2205926 RL3686 RL3687     FALSE 0.019 192.000 0.000 NA N NA
 2205926 2205927 RL3687 RL3688     TRUE 0.704 19.000 0.098 1.000 N NA
 2205928 2205929 RL3689 RL3690     TRUE 0.932 -3.000 0.026 NA   NA
 2205930 2205931 RL3691 RL3692     TRUE 0.970 10.000 0.583 NA   NA
 2205931 2205932 RL3692 RL3693     TRUE 0.992 -3.000 0.571 NA   NA
 2205932 1574311 RL3693 RL3694     FALSE 0.100 111.000 0.000 NA   NA
 1574311 2205933 RL3694 RL3695     FALSE 0.481 14.000 0.000 NA   NA
 2205934 2205935 RL3696 RL3697 hmuP hmuS TRUE 0.969 9.000 0.077 NA Y NA
 2205935 2205936 RL3697 RL3698 hmuS hmuT TRUE 0.984 12.000 0.384 1.000 Y NA
 2205936 2205937 RL3698 RL3699 hmuT hmuU TRUE 0.998 3.000 0.852 1.000 Y NA
 2205937 2205938 RL3699 RL3700 hmuU hmuV TRUE 0.991 1.000 0.158 1.000 Y NA
 2205938 2205939 RL3700 RL3701 hmuV   FALSE 0.302 149.000 0.222 NA   NA
 2205939 2205940 RL3701 RL3702     TRUE 0.883 10.000 0.167 NA   NA
 2205941 2205942 RL3703 RL3704     TRUE 0.911 10.000 0.237 NA   NA
 2205943 2205944 RL3705 RL3706     FALSE 0.088 202.000 0.143 NA N NA
 2205944 2205945 RL3706 RL3707   gltB FALSE 0.001 408.000 0.000 NA N NA
 2205945 2205946 RL3707 RL3708 gltB pydA TRUE 0.941 16.000 0.301 0.007 N NA
 2205950 2205951 RL3712 RL3713     FALSE 0.198 105.000 0.044 NA N NA
 2205951 2205952 RL3713 RL3714     TRUE 0.980 -3.000 0.294 NA N NA
 2205954 2205955 RL3716 RL3717 atcC   TRUE 0.943 0.000 0.059 1.000   NA
 2205955 2205956 RL3717 RL3718   dht TRUE 0.892 3.000 0.019 1.000   NA
 2205958 2205959 RL3720 RL3721     TRUE 0.959 62.000 0.661 1.000 Y NA
 2205959 2205960 RL3721 RL3722     TRUE 0.999 -3.000 0.855 0.100 Y NA
 2205960 2205961 RL3722 RL3723     TRUE 0.966 60.000 0.539 0.100 Y NA
 2205961 2205962 RL3723 RL3724     FALSE 0.002 507.000 0.000 1.000 N NA
 2205962 2205963 RL3724 RL3725     FALSE 0.535 13.000 0.000 1.000 N NA
 2205963 2205964 RL3725 RL3726     FALSE 0.052 165.000 0.000 1.000 N NA
 2205965 2205966 RL3727 RL3727A ureG ureF TRUE 0.719 191.000 0.283 0.001 Y NA
 2205966 2205967 RL3727A RL3728 ureF ureE TRUE 0.994 7.000 0.330 0.001 Y NA
 2205967 2205968 RL3728 RL3729 ureE   FALSE 0.292 87.000 0.037 1.000 N NA
 2205968 2205969 RL3729 RL3730     FALSE 0.004 332.000 0.000 NA   NA
 2205969 2205970 RL3730 RL3731   ureC FALSE 0.459 32.000 0.023 NA   NA
 2205970 2205971 RL3731 RL3732 ureC ureY TRUE 0.863 4.000 0.029 NA   NA
 2205971 2205972 RL3732 RL3733 ureY   TRUE 0.752 17.000 0.125 NA   NA
 2205972 2205973 RL3733 RL3734   ureB TRUE 0.580 23.000 0.048 NA   NA
 2205973 2205974 RL3734 RL3735 ureB ureA TRUE 0.584 273.000 0.595 0.001 Y NA
 2205974 2205975 RL3735 RL3736 ureA ureD TRUE 0.860 112.000 0.664 0.001 N NA
 2205975 2205976 RL3736 RL3737 ureD   FALSE 0.257 161.000 0.221 1.000 N NA
 2205976 2205977 RL3737 RL3738     TRUE 0.616 199.000 0.731 0.035   NA
 2205977 2205978 RL3738 RL3739     TRUE 0.996 -3.000 0.823 1.000   NA
 2205978 2205979 RL3739 RL3740     TRUE 0.999 -3.000 0.758 0.100 Y NA
 2205979 2205980 RL3740 RL3741     TRUE 0.896 116.000 0.654 NA Y NA
 2205980 2205981 RL3741 RL3742     FALSE 0.056 196.000 0.026 NA   NA
 2205982 2205983 RL3743 RL3744     TRUE 0.986 -7.000 0.310 0.015 N NA
 2205984 2205985 RL3745 RL3746     FALSE 0.353 121.000 0.207 NA   NA
 2205985 2205986 RL3746 RL3747     TRUE 0.903 20.000 0.475 NA   NA
 2205986 2205987 RL3747 RL3748     TRUE 0.999 0.000 0.881 0.035 Y NA
 2205987 2205988 RL3748 RL3749     TRUE 0.997 -3.000 0.386 1.000 Y NA
 2205988 2205989 RL3749 RL3750     TRUE 0.995 5.000 0.406 0.100 Y NA
 2205990 2205991 RL3751 RL3752 pssB pssA FALSE 0.001 584.000 0.000 NA N NA
 2205998 2205999 RL3759 RL3760     FALSE 0.202 122.000 0.055 NA   NA
 2206000 2206001 RL3761 RL3762     FALSE 0.231 117.000 0.068 NA   NA
 2206002 2206003 RL3763 RL3764     FALSE 0.189 137.000 0.064 NA   NA
 2206004 2206005 RL3765 RL3766 rLuD rpoH FALSE 0.078 191.000 0.046 1.000 N NA
 2206006 2206007 RL3767 RL3768   purA FALSE 0.286 61.000 0.003 NA   NA
 2206009 2206010 RL3770 RL3771     FALSE 0.005 369.000 0.000 1.000   NA
 2206010 2206011 RL3771 RL3772   ilvD FALSE 0.182 132.000 0.047 1.000 N NA
 2206011 2206012 RL3772 RL3773 ilvD   TRUE 0.964 -3.000 0.116 1.000 N NA
 2206012 2206013 RL3773 RL3774     FALSE 0.109 162.000 0.028 1.000 N NA
 2206013 2206014 RL3774 RL3775     FALSE 0.510 120.000 0.361 1.000 N NA
 2206014 2206015 RL3775 RL3776     TRUE 0.733 47.000 0.298 1.000 N NA
 2206017 2206018 RL3778 RL3779     TRUE 0.906 87.000 0.250 0.081 Y NA
 2206019 2206020 RL3780 RL3781     TRUE 0.800 40.000 0.385 NA   NA
 2206020 2206021 RL3781 RL3782     FALSE 0.366 46.000 0.013 NA   NA
 2206022 2206023 RL3783 RL3784     TRUE 0.990 -7.000 0.700 1.000 N NA
 2206023 2206024 RL3784 RL3785     TRUE 0.550 128.000 0.441 1.000 N NA
 2206025 2206026 RL3786 RL3787     TRUE 0.995 -3.000 0.720 1.000 N NA
 2206029 2206030 RL3790 RL3791     FALSE 0.152 177.000 0.167 NA N NA
 2206033 2206034 RL3794 RL3795     FALSE 0.155 86.000 0.000 1.000 N NA
 2206034 2206035 RL3795 RL3796     FALSE 0.116 105.000 0.000 1.000 N NA
 2206035 2206036 RL3796 RL3797     TRUE 0.984 11.000 0.667 0.100   NA
 2206036 2206037 RL3797 RL3798     TRUE 0.975 11.000 0.667 1.000   NA
 2206037 2206038 RL3798 RL3799     TRUE 0.802 11.000 0.034 1.000   NA
 2206038 2206039 RL3799 RL3800     TRUE 0.947 -3.000 0.051 1.000 N NA
 2206039 2206040 RL3800 RL3801     FALSE 0.111 109.000 0.000 1.000 N NA
 2206043 2206044 RL3804 RL3805     TRUE 0.994 13.000 0.700 0.100 Y NA
 2206044 2206045 RL3805 RL3806     TRUE 0.997 11.000 0.900 0.100 Y NA
 2206045 2206046 RL3806 RL3807     TRUE 0.767 233.000 0.900 0.100 Y NA
 2206046 2206047 RL3807 RL3808     FALSE 0.043 362.000 0.000 1.000 Y NA
 2206048 2206049 RL3809 RL3810     TRUE 0.880 74.000 0.095 0.100 Y NA
 2206049 2206050 RL3810 RL3811     TRUE 0.999 0.000 0.810 0.100 Y NA
 2206050 2206051 RL3811 RL3812     TRUE 0.989 -3.000 0.444 1.000 N NA
 2206051 2206052 RL3812 RL3813     TRUE 0.991 1.000 0.727 NA N NA
 2206052 2206053 RL3813 RL3814     TRUE 0.995 -3.000 0.273 NA Y NA
 2206054 2206055 RL3815 RL3816     TRUE 0.988 -3.000 0.375 1.000   NA
 2206055 2206056 RL3816 RL3817     TRUE 0.542 69.000 0.133 1.000   NA
 2206056 2206057 RL3817 RL3818     TRUE 0.793 126.000 0.100 0.011 Y NA
 2206057 2206058 RL3818 RL3819     TRUE 0.988 -3.000 0.400 1.000 N NA
 2206059 2206060 RL3820 RL3821     FALSE 0.450 200.000 0.750 1.000 N NA
 2206060 2206061 RL3821 RL3822     FALSE 0.469 75.000 0.130 NA   NA
 2206061 2206062 RL3822 RL3823     TRUE 0.661 7.000 0.000 NA   NA
 2206062 2206063 RL3823 RL3824     FALSE 0.082 124.000 0.000 NA   NA
 2206065 2206066 RL3826 RL3827     TRUE 0.735 134.000 0.800 NA   NA
 2206069 2206070 RL3830 RL3831     FALSE 0.001 580.000 0.000 NA   NA
 2206073 2206074 RL3834 RL3835     FALSE 0.002 464.000 0.000 NA   NA
 2206074 2206075 RL3835 RL3836     FALSE 0.178 72.000 0.000 NA   NA
 2206075 2206076 RL3836 RL3837     TRUE 0.577 11.000 0.000 NA   NA
 2206076 2206077 RL3837 RL3838     TRUE 0.937 -3.000 0.033 NA   NA
 2206078 2206079 RL3839 RL3840     FALSE 0.060 195.000 0.054 NA N NA
 2206079 2206080 RL3840 RL3841     TRUE 0.841 49.000 0.054 NA Y NA
 2206081 2206082 RL3842 RL3843     TRUE 0.907 41.000 0.667 1.000   NA
 2206083 2206084 RL3844 RL3845     TRUE 0.954 14.000 0.000 0.099 Y NA
 2206084 2206085 RL3845 RL3846     TRUE 0.998 -3.000 0.474 0.099 Y NA
 2206085 2206086 RL3846 RL3847     TRUE 0.992 12.000 0.500 0.099 Y NA
 2206086 2206087 RL3847 RL3848     FALSE 0.137 94.000 0.000 1.000 N NA
 2206087 2206088 RL3848 RL3849     FALSE 0.304 33.000 0.000 1.000 N NA
 2206089 2206090 RL3850 RL3851 dgoD   FALSE 0.481 14.000 0.000 NA   NA
 2206090 2206091 RL3851 RL3852     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 2206092 2206093 RL3853 RL3854     FALSE 0.208 84.000 0.000 1.000   NA
 2206093 2206094 RL3854 RL3855     FALSE 0.007 317.000 0.000 1.000   NA
 2206094 1574474 RL3855 RL3856     FALSE 0.330 25.000 0.000 NA   NA
 1574474 2206095 RL3856 RL3857     TRUE 0.624 9.000 0.000 NA   NA
 2206095 2206096 RL3857 RL3858     TRUE 0.841 22.000 0.357 NA N NA
 2206096 2206097 RL3858 RL3859     TRUE 0.766 34.000 0.286 1.000 N NA
 2206097 2206098 RL3859 RL3860     TRUE 0.996 12.000 0.833 0.099 Y NA
 2206098 2206099 RL3860 RL3861     TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.099 Y NA
 2206099 2206100 RL3861 RL3862     TRUE 0.958 83.000 0.600 0.099 Y NA
 2206101 2206102 RL3863 RL3864     TRUE 0.760 54.000 0.364 1.000 N NA
 2206102 2206103 RL3864 RL3865     TRUE 0.972 64.000 0.571 0.029 Y NA
 2206103 2206104 RL3865 RL3866     TRUE 0.988 18.000 0.500 0.029 Y NA
 1574485 1574486 RLt43 RLr08 tRNA-Met 5S rRNA FALSE 0.020 213.000 0.000 NA   NA
 1574486 1574487 RLr08 RLr05 5S rRNA 23S rRNA FALSE 0.017 223.000 0.000 NA   NA
 1574487 1574488 RLr05 RLt12 23S rRNA tRNA-Ala FALSE 0.001 842.000 0.000 NA   NA
 1574488 1574489 RLt12 RLt32 tRNA-Ala tRNA-Ile FALSE 0.126 94.000 0.000 NA   NA
 1574489 1574490 RLt32 RLr02 tRNA-Ile 16S rRNA FALSE 0.003 372.000 0.000 NA   NA
 2206105 2206106 RL3867 RL3868     TRUE 0.703 141.000 0.750 NA   NA
 2206106 2206107 RL3868 RL3869   rLuB FALSE 0.228 159.000 0.182 NA   NA
 2206107 2206108 RL3869 RL3870 rLuB   TRUE 0.891 15.000 0.318 1.000 N NA
 2206108 2206109 RL3870 RL3871     TRUE 0.623 92.000 0.357 1.000 N NA
 2206109 2206110 RL3871 RL3872   purC FALSE 0.240 85.000 0.010 1.000 N NA
 2206110 2206111 RL3872 RL3873 purC rmeR FALSE 0.037 212.000 0.010 1.000 N NA
 2206111 2206112 RL3873 RL3874 rmeR rmeA TRUE 0.550 170.000 0.667 1.000 N NA
 2206112 2206113 RL3874 RL3875 rmeA rmeB TRUE 0.924 49.000 0.857 1.000 N NA
 2206113 2206114 RL3875 RL3876 rmeB nodT TRUE 0.733 151.000 0.667 0.099 N NA
 2206114 2206115 RL3876 RL3877 nodT   FALSE 0.366 175.000 0.417 1.000 N NA
 2206115 2206116 RL3877 RL3878     TRUE 0.972 2.000 0.318 1.000 N NA
 2206116 2206117 RL3878 RL3879     TRUE 0.949 69.000 0.409 0.099 Y NA
 2206117 2206118 RL3879 RL3880     TRUE 0.998 -3.000 0.350 0.099 Y NA
 2206118 2206119 RL3880 RL3881     TRUE 0.993 -7.000 0.316 1.000 Y NA
 2206119 2206120 RL3881 RL3882   iunH TRUE 0.919 -34.000 0.158 1.000 N NA
 2206120 2206121 RL3882 RL3883 iunH ade TRUE 0.994 -3.000 0.176 1.000 Y NA
 2206121 2206122 RL3883 RL3884 ade sitA FALSE 0.006 309.000 0.000 1.000 N NA
 2206122 2206123 RL3884 RL3885 sitA sitB TRUE 0.999 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 2206123 2206124 RL3885 RL3886 sitB sitC TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.088 Y NA
 2206124 2206125 RL3886 RL3887 sitC   TRUE 0.999 -3.000 0.525 0.005 Y NA
 2206126 2206127 RL3888 RL3889 hipO   FALSE 0.096 217.000 0.200 NA   NA
 2206127 2206128 RL3889 RL3890     TRUE 0.977 7.000 0.600 NA   NA
 2206128 2206129 RL3890 RL3891     FALSE 0.020 213.000 0.000 NA   NA
 2206129 2206130 RL3891 RL3892     FALSE 0.023 229.000 0.000 1.000   NA
 2206130 2206131 RL3892 RL3893   dctB TRUE 0.998 -3.000 0.375 0.088 Y NA
 2206133 2206134 RL3895 RL3896     TRUE 0.937 26.000 0.750 NA   NA
 2206134 2206135 RL3896 RL3897     TRUE 0.905 27.000 0.571 NA   NA
 2206136 2206137 RL3898 RL3899     FALSE 0.002 494.000 0.000 1.000 N NA
 2206137 2206138 RL3899 RL3900     FALSE 0.140 88.000 0.000 NA   NA
 2206138 2206139 RL3900 RL3901   ackA TRUE 0.680 6.000 0.000 NA   NA
 2206139 2206140 RL3901 RL3902 ackA xfp FALSE 0.442 71.000 0.089 1.000 N NA
 2206140 2206141 RL3902 RL3903 xfp   FALSE 0.230 50.000 0.000 NA   NA
 2206143 2206144 RL3905 RL3906 pobA   FALSE 0.054 210.000 0.039 1.000 N NA
 2206144 2206145 RL3906 RL3907     TRUE 0.985 28.000 0.867 1.000 Y NA
 2206145 2206146 RL3907 RL3908     TRUE 0.999 2.000 1.000 0.099 Y NA
 2206146 2206147 RL3908 RL3909     TRUE 0.999 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 2206147 2206148 RL3909 RL3910     TRUE 0.998 -19.000 0.824 0.034 Y NA
 2206148 10691953 RL3910 RL3911     FALSE 0.002 400.000 0.000 NA   NA
 2206151 2206152 RL3913 RL3914     FALSE 0.330 25.000 0.000 NA   NA
 2206155 2206156 RL3917 RL3918     FALSE 0.097 113.000 0.000 NA   NA
 2206156 2206157 RL3918 RL3919     FALSE 0.262 38.000 0.000 NA   NA
 2206157 2206158 RL3919 RL3920     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 2206158 2206159 RL3920 RL3921     TRUE 0.925 -25.000 0.176 NA   NA
 2206159 2206160 RL3921 RL3922     FALSE 0.316 27.000 0.000 NA   NA
 2206160 2206161 RL3922 RL3923     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2206161 2206162 RL3923 RL3924     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 2206164 2206165 RL3926 RL3927     TRUE 0.801 1.000 0.000 NA   NA
 2206165 2206166 RL3927 RL3928     FALSE 0.072 138.000 0.000 NA   NA
 2206166 2206167 RL3928 RL3929     TRUE 0.857 -16.000 0.029 NA   NA
 2206167 2206168 RL3929 RL3930     TRUE 0.922 -3.000 0.015 NA   NA
 2206168 2206169 RL3930 RL3931     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 2206169 2206170 RL3931 RL3932     TRUE 0.847 16.000 0.250 NA   NA
 2206170 2206171 RL3932 RL3933     FALSE 0.013 236.000 0.000 NA   NA
 2206171 2206172 RL3933 RL3934     TRUE 0.939 25.000 0.750 NA   NA
 2206172 2206173 RL3934 RL3935     TRUE 0.856 20.000 0.333 NA   NA
 2206173 2206174 RL3935 RL3936     TRUE 0.862 36.000 0.500 NA   NA
 2206174 2206175 RL3936 RL3937     TRUE 0.845 19.000 0.300 NA   NA
 2206175 2206176 RL3937 RL3938     TRUE 0.950 -3.000 0.062 NA   NA
 2206176 2206177 RL3938 RL3939     TRUE 0.885 -34.000 0.083 NA   NA
 2206177 2206178 RL3939 RL3940     FALSE 0.382 116.000 0.217 NA   NA
 2206181 2206182 RL3943 RL3944     FALSE 0.042 174.000 0.000 NA   NA
 2206183 2206184 RL3945 RL3946     FALSE 0.073 136.000 0.000 NA   NA
 2206184 2206185 RL3946 RL3947     TRUE 0.754 -10.000 0.000 NA   NA
 2206185 2206186 RL3947 RL3948     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2206187 2206188 RL3948A RL3950     FALSE 0.162 78.000 0.000 NA   NA
 2206190 2206191 RL3952 RL3953     FALSE 0.213 56.000 0.000 NA   NA
 2206191 2206192 RL3953 RL3954     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2206192 2206193 RL3954 RL3955     TRUE 0.780 -7.000 0.000 NA   NA
 2206193 2206194 RL3955 RL3956     FALSE 0.078 129.000 0.000 NA   NA
 1574581 2206195 RLt44 RL3957 tRNA-Met   FALSE 0.073 136.000 0.000 NA   NA
 2206195 2206196 RL3957 RL3958     FALSE 0.003 383.000 0.000 1.000 N NA
 2206198 2206199 RL3960 RL3961   serC TRUE 0.819 83.000 0.140 1.000 Y NA
 2206199 2206200 RL3961 RL3962 serC   FALSE 0.070 189.000 0.028 1.000 N NA
 2206200 2206201 RL3962 RL3963     FALSE 0.003 388.000 0.000 NA   NA
 2206201 2206202 RL3963 RL3964   glmM FALSE 0.077 130.000 0.000 NA   NA
 2206202 2206203 RL3964 RL3965 glmM ftsH FALSE 0.024 242.000 0.012 1.000 N NA
 2206203 2206204 RL3965 RL3966 ftsH tilS TRUE 0.583 97.000 0.145 0.087 N NA
 2206204 2206205 RL3966 RL3967 tilS   TRUE 0.831 12.000 0.085 1.000   NA
 2206205 2206206 RL3967 RL3968     FALSE 0.253 163.000 0.199 1.000   NA
 2206206 2206207 RL3968 RL3969   tolB TRUE 0.586 153.000 0.592 1.000 N NA
 2206207 1574595 RL3969 RL3970 tolB   FALSE 0.338 24.000 0.000 NA   NA
 1574595 2206208 RL3970 RL3971   tolA TRUE 0.801 1.000 0.000 NA   NA
 2206208 2206209 RL3971 RL3972 tolA exbD TRUE 0.829 9.000 0.061 NA   NA
 2206209 2206210 RL3972 RL3973 exbD tolQ TRUE 0.952 19.000 0.220 1.000 Y NA
 2206210 2206211 RL3973 RL3974 tolQ   FALSE 0.066 376.000 0.593 1.000   NA
 2206212 2206213 RL3975 RL3976 sqdB sqdD FALSE 0.110 304.000 0.086 1.000 Y NA
 2206213 2206214 RL3976 RL3977 sqdD sqdC TRUE 0.998 -3.000 0.696 1.000 Y NA
 2206214 2206215 RL3977 RL3978 sqdC   FALSE 0.205 59.000 0.000 NA   NA
 2206215 2206216 RL3978 RL3979     FALSE 0.088 118.000 0.000 NA   NA
 2206216 2206217 RL3979 RL3980     TRUE 0.917 4.000 0.077 1.000   NA
 2206217 2206218 RL3980 RL3981     FALSE 0.079 169.000 0.013 NA   NA
 2206221 2206222 RL3984 RL3985   mcpA FALSE 0.158 126.000 0.022 1.000 N NA
 2206223 2206224 RL3986 RL3987 ruvC   FALSE 0.307 55.000 0.004 NA   NA
 2206224 2206225 RL3987 RL3988     TRUE 0.939 -19.000 0.210 NA   NA
 2206225 2206226 RL3988 RL3989   ruvA TRUE 0.616 14.000 0.010 NA   NA
 2206226 2206227 RL3989 RL3990 ruvA ruvB TRUE 0.967 84.000 0.549 0.000 Y NA
 2206227 2206228 RL3990 RL3991 ruvB   TRUE 0.910 1.000 0.016 1.000   NA
 2206228 2206229 RL3991 RL3992     TRUE 0.977 8.000 0.333 0.013   NA
 2206229 2206230 RL3992 RL3993     FALSE 0.536 91.000 0.261 NA   NA
 2206231 2206232 RL3994 RL3995 atvA   TRUE 0.989 -3.000 0.176 0.029   NA
 2206234 2206235 RL3997 RL3998   gntZ FALSE 0.123 159.000 0.065 NA N NA
 2206235 2206236 RL3998 RL3999 gntZ   FALSE 0.202 138.000 0.081 NA   NA
 2206237 2206238 RL4000 RL4001     TRUE 0.606 76.000 0.235 1.000   NA
 2206238 2206239 RL4001 RL4002     FALSE 0.372 95.000 0.088 1.000   NA
 2206239 2206240 RL4002 RL4003     FALSE 0.012 247.000 0.000 NA   NA
 2206241 2206242 RL4004 RL4005     TRUE 0.705 16.000 0.068 NA   NA
 2206243 2206244 RL4006 RL4007 cbbT gap TRUE 0.912 82.000 0.439 1.000 Y NA
 2206244 2206245 RL4007 RL4008 gap   FALSE 0.036 253.000 0.088 NA   NA
 2206245 2206246 RL4008 RL4009     FALSE 0.157 205.000 0.273 NA   NA
 2206246 2206247 RL4009 RL4010   cvrA FALSE 0.002 489.000 0.000 NA   NA
 2206247 2206248 RL4010 RL4011 cvrA pgk FALSE 0.285 71.000 0.008 1.000 N NA
 2206248 2206249 RL4011 RL4012 pgk   FALSE 0.163 316.000 0.032 0.002 Y NA
 2206249 2206250 RL4012 RL4013     FALSE 0.128 157.000 0.016 1.000   NA
 2206250 2206251 RL4013 RL4014     FALSE 0.004 381.000 0.000 1.000   NA
 2206251 2206252 RL4014 RL4015     TRUE 0.797 22.000 0.250 NA   NA
 2206252 2206253 RL4015 RL4016     FALSE 0.010 407.000 0.141 NA   NA
 2206255 2206256 RL4018 RL4019     FALSE 0.163 144.000 0.020 1.000   NA
 2206256 2206257 RL4019 RL4020     FALSE 0.027 286.000 0.111 NA   NA
 2206257 2206258 RL4020 RL4021     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 2206258 2206259 RL4021 RL4022     TRUE 0.939 8.000 0.300 NA   NA
 2206260 2206261 RL4023 RL4024     TRUE 0.902 4.000 0.081 NA   NA
 2206261 2206262 RL4024 RL4025   suhB FALSE 0.168 112.000 0.014 NA   NA
 2206263 2206264 RL4026 RL4027     FALSE 0.239 74.000 0.000 1.000   NA
 2206265 2206266 RL4028 RL4029 cheB cheR TRUE 0.962 62.000 0.672 1.000 Y NA
 2206266 2206267 RL4029 RL4030 cheR cheW TRUE 0.947 30.000 0.310 1.000 Y NA
 2206267 2206268 RL4030 RL4031 cheW   TRUE 0.998 -3.000 0.261 0.006 Y NA
 2206268 2206269 RL4031 RL4032     TRUE 0.792 174.000 0.333 0.006 Y NA
 2206269 2206270 RL4032 RL4033   mcpB FALSE 0.201 270.000 0.000 0.006 Y NA
 2206270 2206271 RL4033 RL4034 mcpB cheW TRUE 0.961 61.000 0.381 0.006 Y NA
 2206271 2206272 RL4034 RL4035 cheW cheA TRUE 0.999 -3.000 0.808 0.006 Y NA
 2206272 2206273 RL4035 RL4036 cheA cheY TRUE 0.998 -3.000 0.615 1.000 Y NA
 2206273 2206274 RL4036 RL4037 cheY   TRUE 0.987 -3.000 0.381 NA   NA
 2206276 2206277 RL4039 RL4040   thiE TRUE 0.892 11.000 0.181 1.000   NA
 2206278 2206279 RL4041 RL4042     FALSE 0.324 97.000 0.056 1.000   NA
 2206279 2206280 RL4042 RL4043     FALSE 0.001 608.000 0.000 NA   NA
 2206280 2206281 RL4043 RL4044   purE TRUE 0.617 19.000 0.044 NA   NA
 2206281 2206282 RL4044 RL4045 purE purK TRUE 0.998 -3.000 0.201 0.000 Y NA
 2206282 2206283 RL4045 RL4046 purK   FALSE 0.005 357.000 0.000 1.000   NA
 2206283 2206284 RL4046 RL4047     TRUE 0.697 30.000 0.143 1.000   NA
 2206286 2206287 RL4049 RL4050   ggt FALSE 0.197 139.000 0.043 1.000   NA
 2206287 2206288 RL4050 RL4051 ggt tdcB TRUE 0.537 157.000 0.054 1.000 Y NA
 2206291 2206292 RL4054 RL4055     FALSE 0.015 232.000 0.000 NA   NA
 2206293 2206294 RL4056 RL4057     TRUE 0.983 -3.000 0.273 1.000   NA
 2206294 2206295 RL4057 RL4058     TRUE 0.965 -3.000 0.133 NA   NA
 2206296 2206297 RL4059 RL4060   pykA FALSE 0.245 124.000 0.092 1.000 N NA
 2206297 2206298 RL4060 RL4061 pykA   TRUE 0.987 0.000 0.487 NA   NA
 2206299 2206300 RL4062 RL4063     TRUE 0.687 50.000 0.254 NA   NA
 2206300 2206301 RL4063 RL4065     FALSE 0.280 92.000 0.045 NA   NA
 2206302 2206303 RL4066 RL4067     FALSE 0.087 179.000 0.037 NA   NA
 2206304 2206305 RL4068 RL4069   pabB TRUE 0.848 46.000 0.027 1.000 Y NA
 2206305 1574694 RL4069 RL4070 pabB   TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 1574694 2206306 RL4070 RL4071     TRUE 0.680 6.000 0.000 NA   NA
 2206306 2206307 RL4071 RL4072     TRUE 0.579 18.000 0.022 NA   NA
 2206307 2206308 RL4072 RL4073   hss FALSE 0.027 196.000 0.000 NA   NA
 2206308 2206309 RL4073 RL4074 hss   FALSE 0.345 172.000 0.385 NA   NA
 2206309 2206310 RL4074 RL4075     FALSE 0.002 527.000 0.011 NA   NA
 2206310 2206311 RL4075 RL4076   hemH FALSE 0.211 125.000 0.061 1.000 N NA
 2206311 2206312 RL4076 RL4077 hemH   FALSE 0.092 186.000 0.092 NA N NA
 2206312 2206313 RL4077 RL4078     TRUE 0.991 4.000 0.313 NA Y NA
 2206317 2206318 RL4082 RL4083     FALSE 0.239 198.000 0.346 1.000   NA
 2206319 2206320 RL4084 RL4085 gltB gltA TRUE 0.539 227.000 0.236 0.000 Y NA
 2206326 2206327 RL4091 RL4092     FALSE 0.009 272.000 0.000 1.000 N NA
 2206328 1574718 RL4093 RLt60   tRNA-Val FALSE 0.146 85.000 0.000 NA   NA
 2206333 2206334 RL4098 RL4099     TRUE 0.931 37.000 0.833 NA   NA
 2206336 2206337 RL4101 RL4102     TRUE 0.849 89.000 0.812 NA   NA
 2206337 2206338 RL4102 RL4103     TRUE 0.996 -3.000 0.938 NA   NA
 2206338 2206339 RL4103 RL4104     FALSE 0.004 383.000 0.000 1.000   NA
 2206339 2206340 RL4104 RL4105   argF FALSE 0.214 162.000 0.167 1.000 N NA
 2206341 2206342 RL4106 RL4107 cya   FALSE 0.161 199.000 0.250 1.000 N NA
 2206342 2206343 RL4107 RL4108     TRUE 0.998 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 2206343 2206344 RL4108 RL4109     FALSE 0.222 104.000 0.034 NA   NA
 2206344 2206345 RL4109 RL4110     TRUE 0.897 41.000 0.667 NA   NA
 2206345 2206346 RL4110 RL4111     TRUE 0.985 6.000 0.734 NA   NA
 2206346 2206347 RL4111 RL4112     FALSE 0.191 116.000 0.058 NA N NA
 2206347 2206348 RL4112 RL4113     TRUE 0.967 -3.000 0.143 NA   NA
 2206348 2206349 RL4113 RL4114   glgP FALSE 0.352 53.000 0.016 NA   NA
 2206349 2206350 RL4114 RL4115 glgP glgB TRUE 0.995 -3.000 0.189 1.000 Y NA
 2206350 2206351 RL4115 RL4116 glgB glgC TRUE 0.976 20.000 0.205 0.000 Y NA
 2206351 2206352 RL4116 RL4117 glgC glgA TRUE 0.986 4.000 0.134 1.000 Y NA
 2206352 2206353 RL4117 RL4118 glgA pgm TRUE 0.972 7.000 0.032 1.000 Y NA
 2206353 2206354 RL4118 RL4119 pgm glgX TRUE 0.950 13.000 0.034 1.000 Y NA
 2206354 2206355 RL4119 RL4120 glgX nodN FALSE 0.299 91.000 0.049 1.000 N NA
 2206356 2206357 RL4121 RL4122   soxG TRUE 0.726 45.000 0.250 1.000   NA
 2206357 2206358 RL4122 RL4123 soxG soxA TRUE 0.991 -7.000 0.407 0.002   NA
 2206358 2206359 RL4123 RL4124 soxA soxD TRUE 0.998 -3.000 0.867 0.001   NA
 2206359 2206360 RL4124 RL4125 soxD   TRUE 0.821 13.000 0.133 NA   NA
 2206360 2206361 RL4125 RL4126   soxB TRUE 0.979 0.000 0.333 NA   NA
 2206364 2206365 RL4129 RL4130 cyaB1 rpsU FALSE 0.124 180.000 0.062 1.000   NA
 2206365 2206366 RL4130 RL4131 rpsU   FALSE 0.293 136.000 0.136 1.000   NA
 2206366 2206367 RL4131 RL4132     FALSE 0.002 520.000 0.000 1.000   NA
 2206367 2206368 RL4132 RL4133     TRUE 0.572 115.000 0.417 NA   NA
 2206369 2206370 RL4134 RL4135 pntB pntAB TRUE 0.978 8.000 0.306 0.001   NA
 2206370 2206371 RL4135 RL4136 pntAB pntAA TRUE 0.982 0.000 0.058 0.001   NA
 2206371 2206372 RL4136 RL4137 pntAA   FALSE 0.127 156.000 0.038 NA   NA
 2206372 2206373 RL4137 RL4138     FALSE 0.239 145.000 0.129 NA   NA
 2206373 2206374 RL4138 RL4139     FALSE 0.266 143.000 0.161 NA   NA
 2206375 2206376 RL4140 RL4141     TRUE 0.949 22.000 0.283 NA Y NA
 2206379 2206380 RL4144 RL4145     TRUE 0.799 30.000 0.308 1.000 N NA
 2206380 2206381 RL4145 RL4146     TRUE 0.890 118.000 0.368 0.056 Y NA
 2206382 2206383 RL4147 RL4148     TRUE 0.583 149.000 0.565 NA   NA
 2206383 2206384 RL4148 RL4149     TRUE 0.968 0.000 0.231 NA   NA
 2206384 2206385 RL4149 RL4150     TRUE 0.807 7.000 0.026 NA   NA
 2206385 2206386 RL4150 RL4151     FALSE 0.100 144.000 0.000 1.000   NA
 2206386 2206387 RL4151 RL4152   cysE FALSE 0.007 291.000 0.000 1.000 N NA
 2206388 2206389 RL4153 RL4154     FALSE 0.169 156.000 0.080 1.000 N NA
 2206389 2206390 RL4154 RL4155     FALSE 0.036 201.000 0.000 1.000   NA
 2206390 2206391 RL4155 RL4156     TRUE 0.547 95.000 0.257 1.000   NA
 2206392 2206393 RL4157 RL4158     FALSE 0.326 223.000 0.706 NA   NA
 2206393 2206394 RL4158 RL4159     TRUE 0.961 -6.000 0.226 NA   NA
 2206395 2206396 RL4160 RL4161     FALSE 0.404 64.000 0.055 NA   NA
 2206396 2206397 RL4161 RL4162   eda FALSE 0.025 256.000 0.042 NA   NA
 2206398 2206399 RL4163 RL4164     TRUE 0.960 -22.000 0.032 0.004   NA
 2206399 2206400 RL4164 RL4165     FALSE 0.191 148.000 0.051 1.000   NA
 2206400 2206401 RL4165 RL4166     FALSE 0.268 72.000 0.008 NA   NA
 2206402 2206403 RL4167 RL4168   abg TRUE 0.549 114.000 0.375 1.000 N NA
 2206405 2206406 RL4170 RL4171     FALSE 0.201 226.000 0.481 NA   NA
 2206406 2206407 RL4171 RL4172     FALSE 0.158 250.000 0.043 NA Y NA
 2206407 2206408 RL4172 RL4173     TRUE 0.739 116.000 0.217 NA Y NA
 2206408 2206409 RL4173 RL4174     TRUE 0.953 78.000 0.700 1.000 Y NA
 2206411 2206412 RL4176 RL4177 xylA xylB TRUE 0.871 49.000 0.094 1.000 Y NA
 2206412 2206413 RL4177 RL4178 xylB   TRUE 0.956 22.000 0.300 1.000 Y NA
 2206413 2206414 RL4178 RL4179     FALSE 0.075 202.000 0.048 1.000   NA
 2206414 2206415 RL4179 RL4180     TRUE 0.915 28.000 0.586 1.000   NA
 2206416 2206417 RL4181 RL4182     TRUE 0.582 106.000 0.156 0.083   NA
 2206417 2206418 RL4182 RL4183     FALSE 0.058 231.000 0.083 1.000   NA
 2206418 2206419 RL4183 RL4184   gltX FALSE 0.013 246.000 0.000 1.000 N NA
 2206419 2206420 RL4184 RL4185 gltX lysS TRUE 0.939 23.000 0.014 0.087 Y NA
 2206424 2206425 RL4189 RL4190     FALSE 0.356 118.000 0.196 1.000 N NA
 2206425 2206426 RL4190 RL4191     TRUE 0.732 213.000 0.609 0.097 Y NA
 2206426 2206427 RL4191 RL4192     TRUE 0.999 -3.000 0.643 0.097 Y NA
 2206427 2206428 RL4192 RL4193     TRUE 0.998 -10.000 0.821 0.097 Y NA
 2206428 2206429 RL4193 RL4194     TRUE 0.923 14.000 0.405 1.000 N NA
 2206429 2206430 RL4194 RL4195     FALSE 0.215 112.000 0.042 NA   NA
 2206431 2206432 RL4196 RL4197     TRUE 0.808 124.000 1.000 NA   NA
 2206432 2206433 RL4197 RL4198     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 2206435 2206436 RL4200 RL4201     FALSE 0.413 127.000 0.286 NA   NA
 2206436 2206437 RL4201 RL4202     FALSE 0.404 50.000 0.031 NA   NA
 2206437 2206438 RL4202 RL4203   talB FALSE 0.236 94.000 0.025 NA   NA
 2206440 2206441 RL4205 RL4206     TRUE 0.806 14.000 0.142 NA   NA
 2206447 2206448 RL4212 RL4213 araB   TRUE 0.993 -3.000 0.562 1.000   NA
 2206448 2206449 RL4213 RL4214   mtlK TRUE 0.735 95.000 0.308 0.079   NA
 2206449 2206450 RL4214 RL4215 mtlK   TRUE 0.880 85.000 0.326 1.000 Y NA
 2206450 2206451 RL4215 RL4216   mtlG TRUE 0.977 21.000 0.373 0.097 Y NA
 2206451 2206452 RL4216 RL4217 mtlG mtlF TRUE 0.999 2.000 0.918 0.097 Y NA
 2206452 2206453 RL4217 RL4218 mtlF mtlE TRUE 0.946 55.000 0.306 0.097 Y NA
 2206453 2206454 RL4218 RL4219 mtlE   FALSE 0.329 147.000 0.236 1.000 N NA
 2206454 2206455 RL4219 RL4220   exoD FALSE 0.176 150.000 0.073 NA   NA
 2206457 2206458 RL4222 RL4223 exoI   FALSE 0.057 213.000 0.091 NA N NA
 2206458 2206459 RL4223 RL4224     TRUE 0.900 27.000 0.583 NA N NA
 2206459 2206460 RL4224 RL4225     TRUE 0.619 51.000 0.188 1.000 N NA
 2206460 2206461 RL4225 RL4226   osmC FALSE 0.009 273.000 0.000 1.000 N NA
 2206461 2206462 RL4226 RL4227 osmC   FALSE 0.046 209.000 0.021 1.000 N NA
 2206462 2206463 RL4227 RL4228     TRUE 0.942 1.000 0.109 1.000 N NA
 2206463 2206464 RL4228 RL4229     TRUE 0.993 -3.000 0.098 1.000 Y NA
 2206464 2206465 RL4229 RL4230     TRUE 0.979 18.000 0.510 1.000 Y NA
 2206465 2206466 RL4230 RL4231     TRUE 0.968 68.000 0.857 NA Y NA
 2206467 2206468 RL4232 RL4233     FALSE 0.520 67.000 0.138 1.000 N NA
 2206468 2206469 RL4233 RL4234     FALSE 0.190 154.000 0.103 NA   NA
 2206469 2206470 RL4234 RL4235     TRUE 0.720 82.000 0.444 NA   NA
 2206471 2206472 RL4236 RL4237 cyaB   TRUE 0.965 -3.000 0.125 1.000 N NA
 2206473 2206474 RL4238 RL4239     FALSE 0.303 203.000 0.059 NA Y NA
 2206474 2206475 RL4239 RL4240     TRUE 0.638 96.000 0.400 1.000 N NA
 2206476 2206477 RL4241 RL4242     TRUE 0.883 19.000 0.000 NA Y NA
 2206477 2206478 RL4242 RL4243     TRUE 0.931 20.000 0.000 0.097 Y NA
 2206478 2206479 RL4243 RL4244     TRUE 0.988 2.000 0.000 0.097 Y NA
 2206479 2206480 RL4244 RL4245     TRUE 0.732 104.000 0.000 0.097 Y NA
 2206481 2206482 RL4246 RL4247     TRUE 0.696 10.000 0.000 1.000   NA
 2206482 2206483 RL4247 RL4248   lacZ FALSE 0.026 203.000 0.000 1.000 N NA
 2206484 2206485 RL4249 RL4250     TRUE 0.984 4.000 0.000 0.097 Y NA
 2206485 2206486 RL4250 RL4251     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.097 Y NA
 2206486 2206487 RL4251 RL4252     TRUE 0.748 137.000 0.118 0.097 Y NA
 2206488 2206489 RL4253 RL4254     FALSE 0.060 180.000 0.005 NA   NA
 2206489 2206490 RL4254 RL4255   exsC TRUE 0.946 -3.000 0.055 NA   NA
 2206490 2206491 RL4255 RL4256 exsC exsD TRUE 0.973 -3.000 0.195 1.000 N NA
 2206492 2206493 RL4257 RL4258 cyaA nrdF FALSE 0.319 102.000 0.095 1.000 N NA
 2206493 2206494 RL4258 RL4259 nrdF nrdE FALSE 0.313 236.000 0.000 0.000 Y NA
 2206494 2206495 RL4259 RL4260 nrdE nrdI TRUE 0.755 60.000 0.000 NA Y NA
 2206495 2206496 RL4260 RL4261 nrdI nrdH TRUE 0.914 15.000 0.440 NA N NA
 2206496 2206497 RL4261 RL4262 nrdH   FALSE 0.001 671.000 0.000 1.000 N NA
 2206498 2206499 RL4263 RL4264     FALSE 0.317 70.000 0.023 NA   NA
 2206501 2206502 RL4266 RL4267   acoD FALSE 0.193 167.000 0.119 1.000   NA
 2206502 2206503 RL4267 RL4268 acoD   FALSE 0.028 228.000 0.014 NA   NA
 2206503 2206504 RL4268 RL4269     FALSE 0.192 107.000 0.021 NA   NA
 2206504 2206505 RL4269 RL4270     TRUE 0.725 25.000 0.188 NA   NA
 2206505 2206506 RL4270 RL4271     FALSE 0.046 167.000 0.000 NA   NA
 2206506 2206507 RL4271 RL4272     FALSE 0.015 233.000 0.000 1.000 N NA
 2206507 2206508 RL4272 RL4273     FALSE 0.275 92.000 0.042 NA   NA
 2206508 2206509 RL4273 RL4274     FALSE 0.015 232.000 0.000 NA   NA
 2206509 2206510 RL4274 RL4275     TRUE 0.747 144.000 0.854 1.000 N NA
 2206511 2206512 RL4276 RL4277     FALSE 0.009 266.000 0.000 NA   NA
 2206512 1574903 RL4277 RLt45   tRNA-Met FALSE 0.002 397.000 0.000 NA   NA
 1574903 1574904 RLt45 RLr09 tRNA-Met 5S rRNA FALSE 0.020 213.000 0.000 NA   NA
 1574904 1574905 RLr09 RLr06 5S rRNA 23S rRNA FALSE 0.017 223.000 0.000 NA   NA
 1574905 1574906 RLr06 RLt13 23S rRNA tRNA-Ala FALSE 0.001 842.000 0.000 NA   NA
 1574906 1574907 RLt13 RLt33 tRNA-Ala tRNA-Ile FALSE 0.126 94.000 0.000 NA   NA
 1574907 1574908 RLt33 RLr03 tRNA-Ile 16S rRNA FALSE 0.003 372.000 0.000 NA   NA
 2206514 2206515 RL4279 RL4280 clpB   FALSE 0.011 253.000 0.000 NA   NA
 2206515 2206516 RL4280 RL4281   hemK FALSE 0.004 343.000 0.000 NA   NA
 2206516 2206517 RL4281 RL4282 hemK prfA TRUE 0.995 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 2206517 2206518 RL4282 RL4283 prfA ptsP TRUE 0.766 30.000 0.034 0.024 N NA
 2206518 2206519 RL4283 RL4284 ptsP ask FALSE 0.339 89.000 0.069 1.000 N NA
 2206521 2206522 RL4287 RL4288     TRUE 0.958 -3.000 0.097 NA   NA
 2206522 2206523 RL4288 RL4289   grxC TRUE 0.871 11.000 0.121 1.000   NA
 2206523 2206524 RL4289 RL4290 grxC   TRUE 0.597 32.000 0.061 1.000   NA
 2206526 2206527 RL4292 RL4293     TRUE 0.616 75.000 0.273 NA   NA
 2206527 2206528 RL4293 RL4294     FALSE 0.079 127.000 0.000 NA   NA
 2206528 2206529 RL4294 RL4295     TRUE 0.962 -3.000 0.082 1.000   NA
 2206529 2206530 RL4295 RL4296   argJ TRUE 0.872 -19.000 0.020 1.000   NA
 2206530 2206531 RL4296 RL4297 argJ   FALSE 0.051 224.000 0.070 1.000 N NA
 2206532 2206533 RL4298 RL4299 secA   FALSE 0.098 173.000 0.014 1.000   NA
 2206533 2206534 RL4299 RL4300     TRUE 0.970 4.000 0.378 NA   NA
 2206538 1574935 RL4304 RLt37   tRNA-Leu FALSE 0.080 125.000 0.000 NA   NA
 2206539 2206540 RL4305 RL4306     FALSE 0.489 170.000 0.571 NA   NA
 2206543 2206544 RL4309 RL4310     TRUE 0.857 24.000 0.385 NA   NA
 2206545 2206546 RL4311 RL4312     FALSE 0.234 112.000 0.050 1.000 N NA
 2206548 2206549 RL4315 RL4316     TRUE 0.803 19.000 0.231 NA   NA
 2206549 2206550 RL4316 RL4317     TRUE 0.732 21.000 0.156 NA   NA
 2206550 2206551 RL4317 RL4318     FALSE 0.533 34.000 0.033 1.000   NA
 2206551 2206552 RL4318 RL4319   etfB FALSE 0.214 188.000 0.250 1.000   NA
 2206552 2206553 RL4319 RL4320 etfB etfA TRUE 0.930 26.000 0.000 0.010 Y NA
 2206553 2206554 RL4320 RL4321 etfA hbdA FALSE 0.070 149.000 0.000 1.000 N NA
 2206556 2206557 RL4323 RL4324 argH   FALSE 0.088 159.000 0.008 NA   NA
 2206557 2206558 RL4324 RL4325   lysA TRUE 0.684 12.000 0.013 NA   NA
 2206558 2206559 RL4325 RL4326 lysA   FALSE 0.128 166.000 0.062 NA   NA
 2206560 2206561 RL4327 RL4328   hprT FALSE 0.042 219.000 0.031 1.000 N NA
 2206561 2206562 RL4328 RL4329 hprT   FALSE 0.148 128.000 0.021 NA   NA
 2206563 2206564 RL4330 RL4331 ftsE ftsX TRUE 0.988 -7.000 0.139 NA Y NA
 2206564 2206565 RL4331 RL4332 ftsX   TRUE 0.731 74.000 0.417 NA   NA
 2206565 2206566 RL4332 RL4333     FALSE 0.350 141.000 0.250 NA   NA
 2206569 2206570 RL4336 RL4337   tyrC TRUE 0.784 9.000 0.005 1.000   NA
 2206570 2206571 RL4337 RL4338 tyrC hisC TRUE 0.995 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 2206571 2206572 RL4338 RL4339 hisC   FALSE 0.080 204.000 0.061 1.000   NA
 2206573 2206574 RL4340 RL4341 gloB   TRUE 0.935 0.000 0.071 NA   NA
 2206575 2206576 RL4342 RL4343     TRUE 0.572 31.000 0.076 NA   NA
 1574976 2206578 RL4345 RL4347     FALSE 0.156 80.000 0.000 NA   NA
 2206578 2206579 RL4347 RL4348   cobT TRUE 0.536 98.000 0.260 1.000   NA
 2206579 2206580 RL4348 RL4349 cobT cobS TRUE 0.975 13.000 0.433 0.000   NA
 2206580 2206581 RL4349 RL4350 cobS   FALSE 0.019 311.000 0.065 1.000   NA
 2206581 2206582 RL4350 RL4351     FALSE 0.001 436.000 0.000 NA N NA
 2206582 2206583 RL4351 RL4352   aroB TRUE 0.903 0.000 0.040 NA N NA
 2206583 2206584 RL4352 RL4353 aroB aroK TRUE 0.994 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 2206585 2206586 RL4354 RL4355 xerD accA FALSE 0.425 63.000 0.058 1.000 N NA
 2206586 2206587 RL4355 RL4356 accA   FALSE 0.136 130.000 0.015 NA   NA
 2206587 2206588 RL4356 RL4357   sirA TRUE 0.860 6.000 0.060 NA   NA
 2206588 2206589 RL4357 RL4358 sirA   FALSE 0.002 523.000 0.000 1.000 N NA
 2206589 2206590 RL4358 RL4359     TRUE 0.884 148.000 0.756 NA Y NA
 2206590 2206591 RL4359 RL4360     TRUE 0.991 5.000 0.390 NA Y NA
 2206591 2206592 RL4360 RL4361     TRUE 0.870 10.000 0.125 1.000 N NA
 2206593 2206594 RL4362 RL4363   dacC TRUE 0.899 20.000 0.458 NA   NA
 2206595 1574995 RL4364 RLt17   tRNA-Arg FALSE 0.217 55.000 0.000 NA   NA
 1574995 2206596 RLt17 RL4365 tRNA-Arg eutB FALSE 0.001 636.000 0.000 NA   NA
 2206596 2206597 RL4365 RL4366 eutB eutC TRUE 0.999 -3.000 0.859 0.000 Y NA
 2206597 2206598 RL4366 RL4367 eutC eutP TRUE 0.906 32.000 0.109 1.000 Y NA
 2206599 2206600 RL4368 RL4369     FALSE 0.004 348.000 0.000 NA   NA
 2206600 2206601 RL4369 RL4370     FALSE 0.258 39.000 0.000 NA   NA
 2206601 2206602 RL4370 RL4371     FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 2206604 2206605 RL4373 RL4374     TRUE 0.746 7.000 0.000 1.000   NA
 2206605 2206606 RL4374 RL4375     FALSE 0.464 21.000 0.000 1.000   NA
 2206606 2206607 RL4375 RL4376     TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.097 Y NA
 2206607 2206608 RL4376 RL4377     TRUE 0.976 73.000 0.800 0.097 Y NA
 2206608 2206609 RL4377 RL4378     TRUE 0.910 55.000 0.818 1.000 N NA
 2206609 2206610 RL4378 RL4379   hemA FALSE 0.006 313.000 0.000 1.000 N NA
 2206611 2206612 RL4380 RL4381     FALSE 0.290 170.000 0.010 0.002   NA
 2206612 2206613 RL4381 RL4382     TRUE 0.584 68.000 0.212 NA   NA
 2206615 2206616 RL4384 RL4385 arcA rocD TRUE 0.881 33.000 0.038 1.000 Y NA
 2206616 2206617 RL4385 RL4386 rocD cheW FALSE 0.012 297.000 0.015 1.000 N NA
 2206617 2206618 RL4386 RL4387 cheW mcpA FALSE 0.164 291.000 0.000 0.006 Y NA
 2206619 2206620 RL4388 RL4389     FALSE 0.287 108.000 0.057 1.000   NA
 2206620 2206621 RL4389 RL4390   fdhD TRUE 0.992 -10.000 0.458 0.001   NA
 2206621 2206622 RL4390 RL4391 fdhD fdsA TRUE 0.857 38.000 0.180 0.001   NA
 2206622 2206623 RL4391 RL4392 fdsA fdsB TRUE 0.912 58.000 0.466 0.001   NA
 2206623 2206624 RL4392 RL4393 fdsB fdsG TRUE 0.999 -3.000 0.870 0.001 Y NA
 2206624 2206625 RL4393 RL4394 fdsG   FALSE 0.358 136.000 0.243 1.000 N NA
 2206625 2206626 RL4394 RL4395     TRUE 0.575 192.000 0.146 0.082 Y NA
 2206626 2206627 RL4395 RL4396     FALSE 0.119 103.000 0.000 1.000 N NA
 2206627 2206628 RL4396 RL4397     FALSE 0.106 112.000 0.000 1.000 N NA
 2206629 2206630 RL4398 RL4399     FALSE 0.004 349.000 0.000 NA   NA
 2206630 2206631 RL4399 RL4400     FALSE 0.313 90.000 0.061 NA   NA
 2206631 2206632 RL4400 RL4401     TRUE 0.996 -3.000 0.253 1.000 Y NA
 2206632 2206633 RL4401 RL4402     TRUE 0.949 65.000 0.554 1.000 Y NA
 2206633 2206634 RL4402 RL4403     FALSE 0.097 184.000 0.059 1.000 N NA
 2206634 2206635 RL4403 RL4404   pss FALSE 0.382 168.000 0.444 NA N NA
 2206636 2206637 RL4405 RL4407 atpC atpD TRUE 0.788 239.000 0.837 0.002 Y NA
 2206637 2206638 RL4407 RL4408 atpD atpG TRUE 0.991 24.000 0.724 0.002 Y NA
 2206638 2206639 RL4408 RL4409 atpG atpA TRUE 0.992 29.000 0.846 0.002 Y NA
 2206639 2206640 RL4409 RL4410 atpA atpH TRUE 0.999 0.000 0.864 0.002 Y NA
 2206640 2206641 RL4410 RL4411 atpH   FALSE 0.010 256.000 0.000 NA   NA
 2206641 2206642 RL4411 RL4412   priA FALSE 0.251 81.000 0.014 NA   NA
 2206642 2206643 RL4412 RL4413 priA   FALSE 0.338 107.000 0.000 0.086 N NA
 2206643 2206644 RL4413 RL4414     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 2206644 2206645 RL4414 RL4415     TRUE 0.971 5.000 0.000 1.000 Y NA
 2206645 2206646 RL4415 RL4416     TRUE 0.984 4.000 0.000 0.097 Y NA
 2206646 2206647 RL4416 RL4417     TRUE 0.839 68.000 0.000 0.097 Y NA
 2206649 2206650 RL4419 RL4420     FALSE 0.233 133.000 0.067 1.000   NA
 2206651 2206652 RL4421 RL4422 ilvD   TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.078   NA
 2206652 2206653 RL4422 RL4423   dapA TRUE 0.814 15.000 0.000 0.078   NA
 2206654 2206655 RL4424 RL4425     TRUE 0.904 15.000 0.133 0.078   NA
 2206656 2206657 RL4426 RL4427 xerC   FALSE 0.034 229.000 0.030 NA   NA
 2206658 2206659 RL4428 RL4429   lpdA TRUE 0.796 102.000 0.010 0.041 Y NA
 2206659 2206660 RL4429 RL4430 lpdA   FALSE 0.212 98.000 0.015 1.000 N NA
 2206660 2206661 RL4430 RL4431     TRUE 0.988 -3.000 0.429 NA   NA
 2206661 2206662 RL4431 RL4432     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 2206662 2206663 RL4432 RL4433   citM FALSE 0.122 134.000 0.009 NA   NA
 2206663 2206664 RL4433 RL4434 citM   FALSE 0.396 40.000 0.016 NA   NA
 2206664 2206665 RL4434 RL4435   odhA TRUE 0.591 16.000 0.014 NA   NA
 2206665 2206666 RL4435 RL4436 odhA sucD TRUE 0.822 74.000 0.092 1.000 Y NA
 2206666 2206667 RL4436 RL4437 sucD   TRUE 0.694 14.000 0.039 NA   NA
 2206667 2206668 RL4437 RL4438   sucC TRUE 0.852 3.000 0.013 NA   NA
 2206668 2206669 RL4438 RL4439 sucC mdh TRUE 0.896 37.000 0.113 1.000 Y NA
 2206669 2206670 RL4439 RL4440 mdh   FALSE 0.086 178.000 0.032 NA   NA
 2206670 2206671 RL4440 RL4441     TRUE 0.838 48.000 0.500 NA   NA
 2206671 2206672 RL4441 RL4442     FALSE 0.264 136.000 0.143 NA   NA
 2206672 2206673 RL4442 RL4443   sdhB TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2206673 2206674 RL4443 RL4444 sdhB sdhA TRUE 0.991 19.000 0.604 0.001 Y NA
 2206674 2206675 RL4444 RL4445 sdhA sdhD TRUE 0.998 7.000 0.705 0.001 Y NA
 2206675 2206676 RL4445 RL4446 sdhD sdhC TRUE 0.992 11.000 0.291 0.000 Y NA
 2206678 2206679 RL4448 RL4449     FALSE 0.025 178.000 0.000 NA N NA
 2206679 2206680 RL4449 RL4451     FALSE 0.081 134.000 0.000 1.000 N NA
 2206680 2206681 RL4451 RL4452     TRUE 0.981 -49.000 0.000 0.096 Y NA
 2206681 2206682 RL4452 RL4453     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.096 Y NA
 2206682 2206683 RL4453 RL4454     TRUE 0.636 94.000 0.000 NA Y NA
 2206684 2206685 RL4455 RL4456 speB   TRUE 0.700 85.000 0.000 1.000 Y NA
 2206685 2206686 RL4456 RL4457     TRUE 0.766 145.000 0.188 0.096 Y NA
 2206686 2206687 RL4457 RL4458     TRUE 0.997 -3.000 0.130 0.010 Y NA
 2206687 2206688 RL4458 RL4459   ocd FALSE 0.441 158.000 0.000 1.000 Y NA
 2206688 2206689 RL4459 RL4460 ocd   FALSE 0.058 159.000 0.000 1.000 N NA
 2206689 2206690 RL4460 RL4461   ubiD FALSE 0.012 216.000 0.000 NA N NA
 2206690 2206691 RL4461 RL4462 ubiD   TRUE 0.990 -3.000 0.031 NA Y NA
 2206691 2206692 RL4462 RL4463     FALSE 0.236 109.000 0.047 1.000 N NA
 2206692 2206693 RL4463 RL4464     FALSE 0.106 152.000 0.008 1.000 N NA
 2206693 2206694 RL4464 RL4465     FALSE 0.296 68.000 0.008 1.000 N NA
 2206694 2206695 RL4465 RL4466     TRUE 0.998 -3.000 0.429 0.096 Y NA
 2206695 2206696 RL4466 RL4467     TRUE 0.991 2.000 0.200 1.000 Y NA
 2206696 2206697 RL4467 RL4468     TRUE 0.910 87.000 0.200 0.003 Y NA
 2206697 2206698 RL4468 RL4469     TRUE 0.906 0.000 0.022 NA   NA
 2206698 2206699 RL4469 RL4470   hutH FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 2206699 2206700 RL4470 RL4471 hutH aspC TRUE 0.824 86.000 0.000 0.011 Y NA
 2206700 2206701 RL4471 RL4472 aspC ade FALSE 0.111 109.000 0.000 1.000 N NA
 2206703 1575104 RL4474 RL4475     FALSE 0.213 56.000 0.000 NA   NA
 1575104 2206704 RL4475 RL4476     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 2206704 2206705 RL4476 RL4477   hemL TRUE 0.984 -27.000 0.667 1.000 N NA
 2206706 1575108 RL4478 RL4479     FALSE 0.053 159.000 0.000 NA   NA
 1575108 2206707 RL4479 RL4480     FALSE 0.248 43.000 0.000 NA   NA
 2206708 2206709 RL4481 RL4482     FALSE 0.460 116.000 0.286 1.000 N NA
 2206709 2206710 RL4482 RL4483     TRUE 0.953 78.000 0.500 0.096 Y NA
 2206710 2206711 RL4483 RL4484   dapA TRUE 0.948 16.000 0.105 1.000 Y NA
 2206711 2206712 RL4484 RL4485 dapA   TRUE 0.978 -3.000 0.211 1.000   NA
 2206712 2206713 RL4485 RL4486     TRUE 0.990 -3.000 0.429 1.000   NA
 2206713 2206714 RL4486 RL4487     TRUE 0.835 12.000 0.118 1.000 N NA
 2206714 2206715 RL4487 RL4488     TRUE 0.946 -3.000 0.053 NA   NA
 2206716 2206717 RL4489 RL4490     FALSE 0.029 214.000 0.000 1.000   NA
 2206717 2206718 RL4490 RL4491     TRUE 0.935 -3.000 0.031 NA   NA
 2206718 2206719 RL4491 RL4492     TRUE 0.930 3.000 0.122 NA   NA
 2206719 2206720 RL4492 RL4493   gpsA TRUE 0.958 10.000 0.456 NA   NA
 2206720 2206721 RL4493 RL4494 gpsA gcp TRUE 0.954 -3.000 0.070 1.000 N NA
 2206722 2206723 RL4495 RL4496 hemC   TRUE 0.988 8.000 0.056 0.001 Y NA
 2206723 2206724 RL4496 RL4497     FALSE 0.344 69.000 0.032 NA   NA
 2206724 2206725 RL4497 RL4498     TRUE 0.874 5.000 0.058 NA   NA
 2206725 2206726 RL4498 RL4499     TRUE 0.722 18.000 0.108 NA   NA
 2206726 2206727 RL4499 RL4500     TRUE 0.978 -10.000 0.452 NA   NA
 2206729 2206730 RL4502 RL4503     TRUE 0.944 -3.000 0.048 NA   NA
 2206731 2206732 RL4504 RL4505 ppa   FALSE 0.075 202.000 0.048 1.000   NA
 2206732 2206733 RL4505 RL4506   typA FALSE 0.024 248.000 0.002 1.000   NA
 2206733 2206734 RL4506 RL4507 typA dcp FALSE 0.093 159.000 0.008 1.000 N NA
 2206738 2206739 RL4513 RL4514   arsA FALSE 0.003 386.000 0.000 1.000 N NA
 2206741 2206742 RL4516 RL4517     FALSE 0.534 86.000 0.207 1.000   NA
 2206742 2206743 RL4517 RL4518     FALSE 0.004 341.000 0.000 NA   NA
 2206744 2206745 RL4519 RL4520     TRUE 0.996 -3.000 0.771 1.000   NA
 2206745 2206746 RL4520 RL4521     TRUE 0.624 131.000 0.562 NA   NA
 2206746 2206747 RL4521 RL4522     FALSE 0.197 94.000 0.008 NA   NA
 2206747 2206748 RL4522 RL4523     FALSE 0.019 246.000 0.006 NA   NA
 2206750 2206751 RL4525 RL4526     FALSE 0.448 69.000 0.094 NA   NA
 2206753 2206754 RL4528 RL4529     FALSE 0.443 66.000 0.077 1.000 N NA
 2206755 2206756 RL4530 RL4531     TRUE 0.998 -3.000 0.626 NA Y NA
 2206756 2206757 RL4531 RL4532     FALSE 0.123 181.000 0.101 NA   NA
 2206757 2206758 RL4532 RL4533     FALSE 0.523 67.000 0.149 NA   NA
 2206759 2206760 RL4534 RL4535     FALSE 0.003 363.000 0.000 NA   NA
 2206760 2206761 RL4535 RL4536   acnA FALSE 0.032 235.000 0.038 NA   NA
 2206762 2206763 RL4537 RL4538 ccmA ccmB TRUE 0.977 53.000 0.503 0.002 Y NA
 2206763 2206764 RL4538 RL4539 ccmB ccmC TRUE 0.979 49.000 0.501 0.000 Y NA
 2206764 2206765 RL4539 RL4540 ccmC ccmG TRUE 0.579 181.000 0.010 0.002 Y NA
 2206766 2206767 RL4541 RL4542   ispZ TRUE 0.939 -3.000 0.037 NA   NA
 2206767 2206768 RL4542 RL4543 ispZ ftsY FALSE 0.359 76.000 0.050 1.000 N NA
 2206768 2206769 RL4543 RL4544 ftsY   TRUE 0.654 17.000 0.042 1.000 N NA
 2206769 2206770 RL4544 RL4545   dapF TRUE 0.962 -3.000 0.109 1.000 N NA
 2206770 2206771 RL4545 RL4546 dapF   FALSE 0.158 110.000 0.007 NA   NA
 2206772 2206773 RL4547 RL4548 ffh   TRUE 0.611 17.000 0.023 1.000 N NA
 2206773 2206774 RL4548 RL4549     FALSE 0.460 49.000 0.050 1.000 N NA
 2206774 2206775 RL4549 RL4550   rimM TRUE 0.917 102.000 0.342 0.007 Y NA
 2206775 2206776 RL4550 RL4551 rimM trmD TRUE 0.998 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 2206776 2206777 RL4551 RL4552 trmD   FALSE 0.354 287.000 0.567 1.000 Y NA
 2206777 2206778 RL4552 RL4553     FALSE 0.113 146.000 0.006 1.000 N NA
 2206778 2206779 RL4553 RL4554     TRUE 0.984 17.000 0.609 1.000 Y NA
 2206779 2206780 RL4554 RL4555     FALSE 0.087 286.000 0.000 1.000 Y NA
 2206780 2206781 RL4555 RL4556     FALSE 0.004 321.000 0.000 NA   NA
 2206782 2206783 RL4557 RL4558 dkgA   FALSE 0.105 172.000 0.047 NA   NA
 2206784 2206785 RL4559 RL4560     TRUE 0.712 140.000 0.261 NA Y NA
 2206786 2206787 RL4561 RL4562 xthA   FALSE 0.033 254.000 0.068 1.000 N NA
 2206787 2206788 RL4562 RL4563     FALSE 0.160 140.000 0.035 1.000 N NA
 2206788 2206789 RL4563 RL4564   amtB FALSE 0.012 251.000 0.000 1.000 N NA
 2206789 2206790 RL4564 RL4565 amtB glnB TRUE 0.721 28.000 0.197 1.000 N NA
 2206790 2206791 RL4565 RL4567 glnB tesB FALSE 0.018 224.000 0.000 1.000 N NA
 2206793 2206794 RL4569 RL4570     TRUE 0.876 10.000 0.148 NA   NA
 2206794 2206795 RL4570 RL4571     FALSE 0.261 167.000 0.222 1.000   NA
 2206795 2206796 RL4571 RL4572     FALSE 0.272 161.000 0.245 NA   NA
 1575200 2206797 RLt29 RL4573 tRNA-Gly   FALSE 0.001 910.000 0.000 NA   NA
 2206797 2206798 RL4573 RL4574     FALSE 0.021 211.000 0.000 NA   NA
 2206798 2206799 RL4574 RL4575     FALSE 0.425 93.000 0.160 1.000 N NA
 2206799 2206800 RL4575 RL4576     TRUE 0.852 99.000 0.176 0.096 Y NA
 2206800 2206801 RL4576 RL4577     TRUE 0.999 -3.000 0.762 0.096 Y NA
 2206801 2206802 RL4577 RL4578   ggt TRUE 0.883 22.000 0.000 1.000 Y NA
 2206802 2206803 RL4578 RL4579 ggt   TRUE 0.762 3.000 0.000 NA   NA
 2206803 2206804 RL4579 RL4580     TRUE 0.830 25.000 0.333 NA   NA
 2206804 2206805 RL4580 RL4581     FALSE 0.011 254.000 0.000 NA   NA
 2206806 2206807 RL4582 RL4583 fbpC fbpB TRUE 0.989 -3.000 0.275 0.096 N NA
 2206807 2206808 RL4583 RL4584 fbpB fbpA TRUE 0.931 151.000 0.824 0.096 Y NA
 2206808 2206809 RL4584 RL4585 fbpA pcd FALSE 0.052 210.000 0.034 1.000 N NA
 2206809 2206810 RL4585 RL4586 pcd   TRUE 0.713 26.000 0.172 1.000 N NA
 2206810 2206811 RL4586 RL4587     FALSE 0.450 69.000 0.096 NA   NA
 2206812 2206813 RL4588 RL4589     TRUE 0.995 -3.000 0.030 0.081 Y NA
 2206813 2206814 RL4589 RL4590   aceC FALSE 0.073 181.000 0.018 1.000 N NA
 2206815 2206816 RL4591 RL4592     TRUE 0.611 83.000 0.267 1.000   NA
 2206816 2206817 RL4592 RL4593     FALSE 0.257 46.000 0.000 1.000 N NA
 2206817 2206818 RL4593 RL4594     FALSE 0.418 17.000 0.000 NA   NA
 2206818 2206819 RL4594 RL4595     TRUE 0.741 9.000 0.008 NA   NA
 2206819 2206820 RL4595 RL4596     TRUE 0.927 -3.000 0.016 1.000 N NA
 2206820 2206821 RL4596 RL4597     TRUE 0.987 0.000 0.440 1.000   NA
 2206821 2206822 RL4597 RL4598     FALSE 0.014 265.000 0.000 1.000   NA
 2206822 2206823 RL4598 RL4599     TRUE 0.971 -3.000 0.174 1.000 N NA
 2206825 2206826 RL4601 RL4602   nagA TRUE 0.769 18.000 0.123 1.000   NA
 2206826 2206827 RL4602 RL4603 nagA   TRUE 0.982 0.000 0.369 1.000 N NA
 2206827 2206828 RL4603 RL4604     TRUE 0.981 -3.000 0.280 1.000 N NA
 2206828 2206829 RL4604 RL4605   galM FALSE 0.187 158.000 0.106 1.000 N NA
 2206829 2206830 RL4605 RL4606 galM metA FALSE 0.026 239.000 0.016 1.000 N NA
 2206832 2206833 RL4608 RL4609     FALSE 0.208 88.000 0.005 NA   NA
 2206833 2206834 RL4609 RL4610     TRUE 0.954 4.000 0.030 0.085   NA
 2206834 2206835 RL4610 RL4611     FALSE 0.339 58.000 0.014 1.000 N NA
 2206836 2206837 RL4612 RL4613     FALSE 0.002 488.000 0.000 1.000   NA
 2206838 2206839 RL4614 RL4615     FALSE 0.113 328.000 0.012 0.081 Y NA
 2206839 2206840 RL4615 RL4616   fdxA FALSE 0.003 394.000 0.000 1.000 N NA
 2206840 2206841 RL4616 RL4617 fdxA hslR FALSE 0.073 195.000 0.050 1.000 N NA
 2206841 2206842 RL4617 RL4618 hslR   TRUE 0.981 3.000 0.013 1.000 Y NA
 2206844 2206845 RL4620 RL4621 phaB phaA TRUE 0.902 72.000 0.319 1.000 Y NA
 2206847 2206848 RL4623 RL4624   rpmF FALSE 0.128 140.000 0.016 NA   NA
 2206848 2206849 RL4624 RL4625 rpmF   FALSE 0.100 156.000 0.009 1.000 N NA
 2206849 2206850 RL4625 RL4626     TRUE 0.738 14.000 0.037 1.000   NA
 2206850 2206851 RL4626 RL4627   mtgA FALSE 0.233 107.000 0.019 1.000   NA
 2206853 2206854 RL4629 RL4630 hisC   TRUE 0.562 17.000 0.007 1.000 N NA
 2206854 2206855 RL4630 RL4631     FALSE 0.204 97.000 0.011 1.000 N NA
 2206855 2206856 RL4631 RL4632     TRUE 0.933 64.000 0.438 1.000 Y NA
 2206857 2206858 RL4633 RL4634     FALSE 0.138 153.000 0.016 1.000   NA
 2206858 2206859 RL4634 RL4635     TRUE 0.720 214.000 0.594 0.096 Y NA
 2206859 2206860 RL4635 RL4636     TRUE 0.998 -3.000 0.481 1.000 Y NA
 2206861 2206862 RL4637 RL4638     FALSE 0.051 161.000 0.000 NA   NA
 2206862 2206863 RL4638 RL4639     FALSE 0.021 216.000 0.000 1.000 N NA
 2206864 1575269 RL4640 RL4641     FALSE 0.018 218.000 0.000 NA   NA
 1575269 2206865 RL4641 RL4642     FALSE 0.001 592.000 0.000 NA   NA
 2206866 2206867 RL4643 RL4644   ndvB FALSE 0.263 101.000 0.055 NA   NA
 2206869 2206870 RL4646 RL4647     FALSE 0.002 481.000 0.000 NA   NA
 2206870 2206871 RL4647 RL4648     TRUE 0.999 -3.000 0.875 0.033 Y NA
 2206871 2206872 RL4648 RL4649     TRUE 0.999 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 2206872 2206873 RL4649 RL4650     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.096 Y NA
 2206873 2206874 RL4650 RL4651     TRUE 0.989 19.000 0.667 0.096 Y NA
 2206874 2206875 RL4651 RL4652     TRUE 0.978 44.000 0.833 1.000 Y NA
 2206875 2206876 RL4652 RL4653     FALSE 0.052 251.000 0.121 1.000   NA
 2206876 2206877 RL4653 RL4654     TRUE 0.576 35.000 0.061 1.000   NA
 2206877 2206878 RL4654 RL4655     TRUE 0.730 70.000 0.000 NA Y NA
 2206880 2206881 RL4657 RL4658 pehA exoB TRUE 0.960 -22.000 0.312 1.000 N NA
 2206882 2206883 RL4659 RL4660     FALSE 0.473 162.000 0.500 NA   NA
 2206885 2206886 RL4662 RL4663     FALSE 0.266 37.000 0.000 NA   NA
 2206886 2206887 RL4663 RL4664     FALSE 0.003 370.000 0.000 NA   NA
 2206891 2206892 RL4668 RL4669     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 2206892 10691954 RL4669 RL4670     FALSE 0.001 702.000 0.000 NA   NA
 10691954 2206894 RL4670 RL4671   rci FALSE 0.056 157.000 0.000 NA   NA
 2206895 2206896 RL4672 RL4673     FALSE 0.007 292.000 0.000 NA   NA
 2206896 1575303 RL4673 RL4674     FALSE 0.183 70.000 0.000 NA   NA
 1575303 2206897 RL4674 RL4675     FALSE 0.003 370.000 0.000 NA   NA
 2206898 2206899 RL4676 RL4677 rplU rpmA TRUE 0.986 35.000 0.667 0.007 Y NA
 2206899 2206900 RL4677 RL4678 rpmA   TRUE 0.610 127.000 0.035 1.000 Y NA
 2206900 2206901 RL4678 RL4679     TRUE 0.993 -60.000 0.222 0.010 Y NA
 2206903 2206904 RL4681 RL4682   proB TRUE 0.903 -46.000 0.087 1.000   NA
 2206904 2206905 RL4682 RL4683 proB proA TRUE 0.994 -7.000 0.065 0.001 Y NA
 2206905 2206906 RL4683 RL4684 proA nadD TRUE 0.648 38.000 0.170 1.000 N NA
 2206906 2206907 RL4684 RL4685 nadD   FALSE 0.002 495.000 0.000 1.000 N NA
 2206907 2206908 RL4685 RL4686     TRUE 0.588 277.000 0.627 0.001 Y NA
 2206908 2206909 RL4686 RL4687     TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.001 Y NA
 2206911 2206912 RL4689 RL4690     FALSE 0.466 118.000 0.307 NA   NA
 2206912 2206913 RL4690 RL4691     FALSE 0.119 173.000 0.067 NA   NA
 2206913 2206914 RL4691 RL4692   ctpA TRUE 0.988 -10.000 0.408 0.019 N NA
 2206914 2206915 RL4692 RL4693 ctpA   FALSE 0.478 99.000 0.210 1.000   NA
 2206915 2206916 RL4693 RL4694     TRUE 0.619 39.000 0.109 1.000   NA
 2206917 2206918 RL4695 RL4696 bfr   TRUE 0.980 -34.000 0.588 NA   NA
 2206918 2206919 RL4696 RL4697   dnaE FALSE 0.059 211.000 0.060 NA   NA
 2206919 2206920 RL4697 RL4698 dnaE   TRUE 0.998 -3.000 0.366 0.003 Y NA
 2206920 2206921 RL4698 RL4699     TRUE 0.859 41.000 0.514 NA   NA
 2206923 2206924 RL4701 RL4702   citE TRUE 0.960 0.000 0.179 NA   NA
 2206925 2206926 RL4703 RL4704     FALSE 0.230 128.000 0.092 NA   NA
 2206926 2206927 RL4704 RL4705   leuD FALSE 0.212 135.000 0.051 1.000   NA
 2206929 2206930 RL4707 RL4708 leuB   FALSE 0.017 277.000 0.011 1.000   NA
 2206931 2206932 RL4709 RL4710     FALSE 0.011 249.000 0.000 NA   NA
 2206932 2206933 RL4710 RL4711     TRUE 0.937 -3.000 0.033 NA   NA
 2206933 2206934 RL4711 RL4712     TRUE 0.868 7.000 0.086 NA   NA
 2206934 2206935 RL4712 RL4713     FALSE 0.074 195.000 0.057 NA   NA
 2206936 2206937 RL4714 RL4715   asd FALSE 0.189 112.000 0.003 1.000   NA
 2206937 2206938 RL4715 RL4716 asd   FALSE 0.010 276.000 0.012 NA N NA
 2206939 2206940 RL4717 RL4718   cynT FALSE 0.266 91.000 0.030 1.000 N NA
 2206940 2206941 RL4718 RL4719 cynT pdxK FALSE 0.437 72.000 0.089 1.000 N NA
 2206942 2206943 RL4720 RL4721 gdhB   FALSE 0.427 28.000 0.006 NA   NA
 2206944 2206945 RL4722 RL4723 purH   FALSE 0.066 207.000 0.068 NA   NA
 2206945 2206946 RL4723 RL4724   rsmB FALSE 0.055 217.000 0.071 NA   NA
 2206946 2206947 RL4724 RL4725 rsmB   TRUE 0.954 -3.000 0.075 1.000 N NA
 2206951 2206952 RL4729 RL4730 flaC prpE FALSE 0.011 258.000 0.000 1.000 N NA
 2206952 2206953 RL4730 RL4731 prpE   FALSE 0.407 35.000 0.013 NA   NA
 2206954 2206955 RL4732 RL4733 leuS   TRUE 0.552 38.000 0.090 NA   NA
 2206955 2206956 RL4733 RL4734     TRUE 0.831 11.000 0.097 NA   NA
 2206957 2206958 RL4735 RL4736 parB parA TRUE 0.937 33.000 0.827 1.000 N NA
 2206958 2206959 RL4736 RL4737 parA gidB TRUE 0.863 20.000 0.339 1.000 N NA
 2206959 2206960 RL4737 RL4738 gidB gidA TRUE 0.884 25.000 0.466 1.000 N NA
 2206960 2206961 RL4738 RL4739 gidA trmE TRUE 0.652 73.000 0.266 1.000   NA
 2206961 2206962 RL4739 RL4740 trmE rho FALSE 0.292 103.000 0.050 1.000   NA
 2206962 2206963 RL4740 RL4741 rho   FALSE 0.053 198.000 0.024 NA   NA
 2206963 2202264 RL4741 RL4742   hemE TRUE 0.891 3.000 0.044 NA   NA
 2201179 2201180 pRL120001 pRL120002 repA repB TRUE 0.992 5.000 1.000 1.000 N NA
 2201180 2201181 pRL120002 pRL120003 repB repC FALSE 0.058 155.000 0.000 NA   NA
 2201181 2201182 pRL120003 pRL120004 repC   FALSE 0.095 114.000 0.000 NA   NA
 2201182 2201183 pRL120004 pRL120005     TRUE 0.977 8.000 0.615 1.000 N NA
 2201183 2201184 pRL120005 pRL120006     TRUE 0.840 56.000 0.538 1.000 N NA
 2201184 2201185 pRL120006 pRL120007     TRUE 0.995 0.000 0.154 0.095 Y NA
 2201185 2201186 pRL120007 pRL120008     TRUE 0.995 0.000 0.182 0.095 Y NA
 2201186 2201187 pRL120008 pRL120009   rbsK TRUE 0.967 19.000 0.364 1.000 Y NA
 2201187 2201188 pRL120009 pRL120010 rbsK   FALSE 0.003 377.000 0.000 NA   NA
 2201188 2201189 pRL120010 pRL120011     FALSE 0.017 221.000 0.000 NA   NA
 2201189 2201190 pRL120011 pRL120012     TRUE 0.979 66.000 0.793 0.095 Y NA
 2201190 2201191 pRL120012 pRL120013     TRUE 0.992 13.000 0.559 0.095 Y NA
 2201191 2201192 pRL120013 pRL120014     TRUE 0.997 2.000 0.464 0.095 Y NA
 2201192 2201193 pRL120014 pRL120015     FALSE 0.353 56.000 0.016 1.000 N NA
 2201193 2201194 pRL120015 pRL120016     TRUE 0.850 10.000 0.095 1.000 N NA
 2201194 2201195 pRL120016 pRL120017     TRUE 0.953 -3.000 0.042 1.000   NA
 2201196 2201197 pRL120018 pRL120019     TRUE 0.994 4.000 0.286 0.095 Y NA
 2201197 2201198 pRL120019 pRL120020     TRUE 0.944 89.000 0.500 0.095 Y NA
 2201198 2201199 pRL120020 pRL120021     FALSE 0.069 144.000 0.000 NA   NA
 2201201 2201202 pRL120023 pRL120024     TRUE 0.976 -3.000 0.190 1.000   NA
 2201205 2201206 pRL120027 pRL120028     TRUE 0.993 4.000 0.400 NA Y NA
 2201206 2201207 pRL120028 pRL120029     FALSE 0.151 302.000 0.250 NA Y NA
 2201207 2201208 pRL120029 pRL120030     FALSE 0.399 134.000 0.250 1.000   NA
 2201208 2201209 pRL120030 pRL120031     TRUE 0.995 0.000 0.889 NA   NA
 2201209 2201210 pRL120031 pRL120032     TRUE 0.992 -3.000 0.556 NA   NA
 2201210 2201211 pRL120032 pRL120033     TRUE 0.962 5.000 0.308 1.000   NA
 2201211 2201212 pRL120033 pRL120034     TRUE 0.965 15.000 0.231 1.000 Y NA
 2201212 2201213 pRL120034 pRL120035   thuE FALSE 0.046 354.000 0.000 1.000 Y NA
 2201213 2201214 pRL120035 pRL120036 thuE thuF TRUE 0.898 70.000 0.121 0.095 Y NA
 2201214 2201215 pRL120036 pRL120037 thuF thuG TRUE 0.999 0.000 0.723 0.095 Y NA
 2201215 2201216 pRL120037 pRL120038 thuG thuK TRUE 0.977 12.000 0.085 0.095 Y NA
 2201216 2201217 pRL120038 pRL120039 thuK thuA TRUE 0.877 64.000 0.231 NA Y NA
 2201217 2201218 pRL120039 pRL120040 thuA thuB FALSE 0.214 163.000 0.182 NA   NA
 2201219 2201220 pRL120041 pRL120042     FALSE 0.103 171.000 0.043 NA   NA
 2201220 2201221 pRL120042 pRL120043     TRUE 0.816 15.000 0.174 1.000 N NA
 2201221 2201222 pRL120043 pRL120044   gabD TRUE 0.967 12.000 0.640 1.000 N NA
 2201222 2201223 pRL120044 pRL120045 gabD   FALSE 0.092 121.000 0.000 1.000 N NA
 2201224 2201225 pRL120046 pRL120047     TRUE 0.712 123.000 0.172 1.000 Y NA
 2201225 2201226 pRL120047 pRL120048     TRUE 0.894 57.000 0.224 1.000 Y NA
 2201226 2201227 pRL120048 pRL120049     TRUE 0.774 175.000 0.389 0.095 Y NA
 2201227 2201228 pRL120049 pRL120050     TRUE 0.998 5.000 0.842 0.009 Y NA
 2201228 2201229 pRL120050 pRL120051     TRUE 0.965 3.000 0.289 1.000 N NA
 2201229 2201230 pRL120051 pRL120052   tdcB TRUE 0.955 5.000 0.293 1.000 N NA
 2201230 2201231 pRL120052 pRL120053 tdcB arcB TRUE 0.999 -3.000 0.780 1.000 Y NA
 2201231 2201232 pRL120053 pRL120054 arcB   TRUE 0.946 33.000 0.333 1.000 Y NA
 2201232 2201233 pRL120054 pRL120055     TRUE 0.966 8.000 0.444 1.000   NA
 2201236 2201237 pRL120058 pRL120059     TRUE 0.796 46.000 0.400 NA   NA
 2201237 2201238 pRL120059 pRL120060     TRUE 0.969 -3.000 0.167 NA   NA
 2201238 2201239 pRL120060 pRL120061     FALSE 0.203 156.000 0.125 NA   NA
 2201239 2201240 pRL120061 pRL120062   flgL TRUE 0.974 12.000 0.750 NA   NA
 2201240 2201241 pRL120062 pRL120063 flgL flgK TRUE 0.999 3.000 0.750 0.003 Y NA
 2201241 2201242 pRL120063 pRL120064 flgK flgE TRUE 0.995 14.000 0.750 0.003 Y NA
 2201242 2201243 pRL120064 pRL120065 flgE   FALSE 0.026 321.000 0.000 0.004 N NA
 2201244 2201245 pRL120066 pRL120067     FALSE 0.049 242.000 0.083 1.000   NA
 2201245 2201246 pRL120067 pRL120068   mcpA FALSE 0.030 213.000 0.000 1.000   NA
 2201248 2201249 pRL120070 pRL120071     FALSE 0.011 257.000 0.000 1.000 N NA
 2201249 2201250 pRL120071 pRL120072     TRUE 0.962 91.000 0.706 0.095 Y NA
 2201250 2201251 pRL120072 pRL120073     TRUE 0.991 6.000 0.148 0.009 Y NA
 2201251 2201252 pRL120073 pRL120074     TRUE 0.963 13.000 0.125 1.000 Y NA
 2201252 2201253 pRL120074 pRL120075   stbC FALSE 0.099 145.000 0.000 1.000   NA
 2201253 2201254 pRL120075 pRL120076 stbC stbB TRUE 0.986 -3.000 0.364 NA   NA
 2201254 2201255 pRL120076 pRL120077 stbB   FALSE 0.028 194.000 0.000 NA   NA
 2201255 2201256 pRL120077 pRL120078     TRUE 0.990 -6.000 0.667 1.000 N NA
 2201256 2201257 pRL120078 pRL120079     TRUE 0.903 78.000 0.205 0.095 Y NA
 2201257 2201258 pRL120079 pRL120080     TRUE 0.998 -3.000 0.308 0.009 Y NA
 2201258 2201259 pRL120080 pRL120081     TRUE 0.995 -22.000 0.532 1.000 Y NA
 2201260 2201261 pRL120082 pRL120083     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 2201261 2201262 pRL120083 pRL120084     FALSE 0.100 111.000 0.000 NA   NA
 2201262 2201263 pRL120084 pRL120085     TRUE 0.995 -3.000 0.727 NA   NA
 2201263 2201264 pRL120085 pRL120086     FALSE 0.008 274.000 0.000 NA   NA
 2201264 2201265 pRL120086 pRL120087     TRUE 0.996 -3.000 0.911 NA   NA
 2201266 2201267 pRL120088 pRL120089     TRUE 0.989 -3.000 0.455 NA   NA
 2201267 2201268 pRL120089 pRL120090     TRUE 0.813 35.000 0.379 NA   NA
 2201268 2201269 pRL120090 pRL120091     TRUE 0.942 13.000 0.470 NA   NA
 2201269 2201270 pRL120091 pRL120092     TRUE 0.785 2.000 0.000 NA   NA
 2201271 2201272 pRL120093 pRL120094   tfdB TRUE 0.954 8.000 0.375 1.000 N NA
 2201272 2201273 pRL120094 pRL120095 tfdB   TRUE 0.980 -7.000 0.429 1.000 N NA
 2201273 2201274 pRL120095 pRL120096     TRUE 0.997 10.000 0.857 0.095 Y NA
 2201274 2201275 pRL120096 pRL120097     TRUE 0.996 -13.000 0.667 1.000 Y NA
 2201275 2201276 pRL120097 pRL120098     TRUE 0.999 0.000 0.667 0.033 Y NA
 2201276 2201277 pRL120098 pRL120099     TRUE 0.997 4.000 0.833 1.000 Y NA
 2201277 2201278 pRL120099 pRL120100   tftE FALSE 0.229 56.000 0.000 1.000 N NA
 2201278 2201279 pRL120100 pRL120101 tftE   TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2201282 2201283 pRL120104 pRL120105     FALSE 0.093 120.000 0.000 1.000 N NA
 2201283 2201284 pRL120105 pRL120106     FALSE 0.239 53.000 0.000 1.000 N NA
 2201284 2201285 pRL120106 pRL120107     FALSE 0.266 65.000 0.000 1.000   NA
 2201285 2201286 pRL120107 pRL120108     FALSE 0.205 85.000 0.000 1.000   NA
 2201286 1569580 pRL120108 pRL120109     FALSE 0.135 90.000 0.000 NA   NA
 2201287 2201288 pRL120111 pRL120112     TRUE 0.993 0.000 0.042 0.095 Y NA
 2201288 2201289 pRL120112 pRL120113     TRUE 0.995 -3.000 0.042 0.095 Y NA
 2201289 2201290 pRL120113 pRL120114     TRUE 0.785 5.000 0.000 1.000   NA
 2201290 2201291 pRL120114 pRL120115     FALSE 0.102 141.000 0.000 1.000   NA
 2201291 2201292 pRL120115 pRL120116     FALSE 0.280 38.000 0.000 1.000 N NA
 2201292 2201293 pRL120116 pRL120117     TRUE 0.989 -3.000 0.400 1.000   NA
 2201293 2201294 pRL120117 pRL120118     FALSE 0.006 341.000 0.000 1.000   NA
 2201295 2201296 pRL120119 pRL120120     TRUE 0.885 48.000 0.000 0.077 Y NA
 2201296 2201297 pRL120120 pRL120121     TRUE 0.599 11.000 0.000 1.000 N NA
 2201297 2201298 pRL120121 pRL120122     FALSE 0.423 18.000 0.000 1.000 N NA
 2201298 2201299 pRL120122 pRL120123     TRUE 0.796 -7.000 0.000 1.000 N NA
 2201299 2201300 pRL120123 pRL120124     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2201300 2201301 pRL120124 pRL120125     FALSE 0.197 70.000 0.000 1.000 N NA
 2201301 2201302 pRL120125 pRL120126     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2201302 2201303 pRL120126 pRL120127     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2201303 2201304 pRL120127 pRL120128     TRUE 0.875 0.000 0.000 1.000   NA
 2201304 2201305 pRL120128 pRL120129     TRUE 0.845 33.000 0.000 1.000 Y NA
 2201305 2201306 pRL120129 pRL120130     TRUE 0.985 4.000 0.000 0.095 Y NA
 2201306 2201307 pRL120130 pRL120131     TRUE 0.837 70.000 0.000 0.095 Y NA
 2201307 2201308 pRL120131 pRL120132     FALSE 0.036 186.000 0.000 1.000 N NA
 2201308 2201309 pRL120132 pRL120133   stbB FALSE 0.002 412.000 0.000 NA   NA
 2201309 2201310 pRL120133 pRL120134 stbB stbC TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2201310 2201311 pRL120134 pRL120135 stbC   FALSE 0.018 217.000 0.000 NA   NA
 2201311 2201312 pRL120135 pRL120136     FALSE 0.225 52.000 0.000 NA   NA
 2201312 2201313 pRL120136 pRL120137     FALSE 0.273 20.000 0.000 NA N NA
 2201313 2201314 pRL120137 pRL120138     TRUE 0.983 -3.000 0.303 NA   NA
 2201314 2201315 pRL120138 pRL120139     TRUE 0.992 -7.000 0.788 NA   NA
 2201315 2201316 pRL120139 pRL120140     TRUE 0.955 13.000 0.517 1.000   NA
 2201316 2201317 pRL120140 pRL120141     TRUE 0.627 54.000 0.172 1.000   NA
 2201317 2201318 pRL120141 pRL120142     TRUE 0.928 99.000 0.714 NA Y NA
 2201318 2201319 pRL120142 pRL120143     TRUE 0.815 104.000 0.857 NA N NA
 2201319 2201320 pRL120143 pRL120144     TRUE 0.992 14.000 0.500 0.006 Y NA
 2201320 2201321 pRL120144 pRL120145     TRUE 0.988 -3.000 0.400 1.000 N NA
 2201321 2201322 pRL120145 pRL120146     TRUE 0.999 2.000 1.000 0.095 Y NA
 2201322 2201323 pRL120146 pRL120147     TRUE 0.989 39.000 1.000 0.095 Y NA
 2201324 2201325 pRL120148 pRL120149     FALSE 0.183 70.000 0.000 NA   NA
 2201326 2201327 pRL120150 pRL120151     TRUE 0.998 -10.000 0.886 NA Y NA
 2201327 2201328 pRL120151 pRL120152     TRUE 0.989 0.000 0.514 1.000 N NA
 2201328 1569624 pRL120152 pRL120153     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 1569624 2201329 pRL120153 pRL120154     TRUE 0.738 4.000 0.000 NA   NA
 2201331 2201332 pRL120157 pRL120158     TRUE 0.990 12.000 0.647 NA Y NA
 2201332 2201333 pRL120158 pRL120159     TRUE 0.965 13.000 0.714 NA N NA
 2201333 2201334 pRL120159 pRL120160     TRUE 0.977 -7.000 0.385 1.000 N NA
 2201334 2201335 pRL120160 pRL120161     TRUE 0.628 115.000 0.455 1.000   NA
 2201335 2201336 pRL120161 pRL120162     TRUE 0.994 -3.000 0.636 1.000   NA
 2201336 2201337 pRL120162 pRL120163     TRUE 0.996 -3.000 0.163 0.095 Y NA
 2201337 2201338 pRL120163 pRL120164     TRUE 0.780 131.000 0.163 0.095 Y NA
 2201339 2201340 pRL120166 pRL120167     FALSE 0.010 256.000 0.000 NA   NA
 2201342 2201343 pRL120169 pRL120170     TRUE 0.994 -12.000 0.273 0.095 Y NA
 2201343 2201344 pRL120170 pRL120171     TRUE 0.997 -3.000 0.182 0.095 Y NA
 2201344 2201345 pRL120171 pRL120172     TRUE 0.898 108.000 0.375 0.095 Y NA
 2201345 2201346 pRL120172 pRL120173     TRUE 0.801 25.000 0.250 1.000   NA
 2201347 2201348 pRL120174 pRL120175     TRUE 0.542 31.000 0.085 NA N NA
 2201348 2201349 pRL120175 pRL120176     FALSE 0.257 22.000 0.000 NA N NA
 2201349 2201350 pRL120176 pRL120177   pauA TRUE 0.909 11.000 0.250 1.000 N NA
 2201351 2201352 pRL120178 pRL120179     FALSE 0.336 27.000 0.000 1.000 N NA
 2201352 2201353 pRL120179 pRL120180     TRUE 0.994 1.000 0.286 1.000 Y NA
 2201354 2201355 pRL120181 pRL120182     TRUE 0.630 34.000 0.125 1.000 N NA
 2201356 2201357 pRL120183 pRL120184     FALSE 0.035 183.000 0.000 NA   NA
 2201359 2201360 pRL120186 pRL120187     FALSE 0.097 211.000 0.000 0.040 N NA
 2201363 2201364 pRL120191 pRL120192     TRUE 0.927 127.000 0.941 NA Y NA
 2201364 2201365 pRL120192 pRL120193     TRUE 0.998 -7.000 0.941 1.000 Y NA
 2201365 2201366 pRL120193 pRL120194     TRUE 0.999 0.000 0.938 0.095 Y NA
 2201366 2201367 pRL120194 pRL120195     TRUE 0.981 12.000 0.375 NA Y NA
 2201367 2201368 pRL120195 pRL120196     FALSE 0.061 310.000 0.000 NA Y NA
 2201369 2201370 pRL120197 pRL120198     TRUE 0.967 38.000 0.833 0.001 N NA
 2201370 2201371 pRL120198 pRL120199     TRUE 0.946 37.000 0.375 1.000 Y NA
 2201371 2201372 pRL120199 pRL120200     FALSE 0.522 150.000 0.008 1.000 Y NA
 2201372 2201373 pRL120200 pRL120201     TRUE 0.636 112.000 0.008 1.000 Y NA
 2201373 2201374 pRL120201 pRL120202     TRUE 0.990 22.000 1.000 1.000 Y NA
 2201374 2201375 pRL120202 pRL120203     TRUE 0.995 -3.000 0.786 NA   NA
 2201376 2201377 pRL120204 pRL120205 eryA eryB TRUE 0.811 33.000 0.350 1.000 N NA
 2201377 2201378 pRL120205 pRL120206 eryB eryC TRUE 0.934 12.000 0.389 NA   NA
 2201378 2201379 pRL120206 pRL120207 eryC eryD TRUE 0.686 71.000 0.333 NA   NA
 2201379 2201380 pRL120207 pRL120208 eryD   TRUE 0.833 101.000 0.294 1.000 Y NA
 2201380 2201381 pRL120208 pRL120209     TRUE 0.994 -3.000 0.188 1.000 Y NA
 2201381 2201382 pRL120209 pRL120210     TRUE 0.986 12.000 0.438 1.000 Y NA
 2201382 10691946 pRL120210 pRL120211     FALSE 0.203 60.000 0.000 NA   NA
 10691946 2201383 pRL120211 pRL120212     TRUE 0.762 3.000 0.000 NA   NA
 2201384 2201385 pRL120213 pRL120214     TRUE 0.981 -3.000 0.286 NA   NA
 2201385 2201386 pRL120214 pRL120215   tftE TRUE 0.829 21.000 0.286 1.000 N NA
 2201386 2201387 pRL120215 pRL120216 tftE   TRUE 0.980 2.000 0.200 0.077   NA
 2201387 2201388 pRL120216 pRL120217     TRUE 0.704 48.000 0.238 1.000   NA
 2201388 2201389 pRL120217 pRL120218     TRUE 0.964 11.000 0.286 0.040   NA
 2201390 2201391 pRL120219 pRL120220     TRUE 0.609 73.000 0.250 1.000 N NA
 2201391 2201392 pRL120220 pRL120221     FALSE 0.008 270.000 0.000 NA   NA
 2201392 2201393 pRL120221 pRL120222     FALSE 0.306 29.000 0.000 NA   NA
 2201394 2201395 pRL120223 pRL120224     TRUE 0.989 37.000 0.917 0.095 Y NA
 2201395 2201396 pRL120224 pRL120225     TRUE 0.947 79.000 0.458 0.095 Y NA
 2201396 2201397 pRL120225 pRL120226     TRUE 0.865 149.000 0.450 0.095 Y NA
 2201397 2201398 pRL120226 pRL120227     FALSE 0.486 167.000 0.051 1.000 Y NA
 2201398 2201399 pRL120227 pRL120228     TRUE 0.609 22.000 0.051 1.000 N NA
 2201399 2201400 pRL120228 pRL120229     FALSE 0.062 156.000 0.000 1.000 N NA
 2201402 2201403 pRL120231 pRL120232     TRUE 0.562 71.000 0.200 1.000 N NA
 2201403 2201404 pRL120232 pRL120233     FALSE 0.049 186.000 0.000 1.000   NA
 2201404 2201405 pRL120233 pRL120234     TRUE 0.825 20.000 0.000 0.000   NA
 2201405 2201406 pRL120234 pRL120235     TRUE 0.752 18.000 0.000 0.077 N NA
 2201406 2201407 pRL120235 pRL120236     TRUE 0.555 61.000 0.200 NA N NA
 2201407 2201408 pRL120236 pRL120237     TRUE 0.769 23.000 0.250 NA N NA
 2201408 2201409 pRL120237 pRL120238   ilvD TRUE 0.957 10.000 0.250 0.077 N NA
 2201411 2201412 pRL120240 pRL120241     TRUE 0.992 -3.000 0.500 1.000   NA
 2201412 2201413 pRL120241 pRL120242     TRUE 0.995 -7.000 1.000 1.000   NA
 2201413 2201414 pRL120242 pRL120243     TRUE 0.998 4.000 0.800 0.095 Y NA
 2201414 2201415 pRL120243 pRL120244     FALSE 0.127 160.000 0.048 NA   NA
 2201415 2201416 pRL120244 pRL120245     FALSE 0.003 385.000 0.000 NA   NA
 2201416 2201417 pRL120245 pRL120246     TRUE 0.934 -3.000 0.029 NA   NA
 2201419 2201420 pRL120248 pRL120249   agaZ TRUE 0.872 68.000 0.200 1.000 Y NA
 2201420 2201421 pRL120249 pRL120250 agaZ   TRUE 0.916 -3.000 0.005 1.000 N NA
 2201421 2201422 pRL120250 pRL120251     TRUE 0.673 12.000 0.005 1.000 N NA
 2201422 2201423 pRL120251 pRL120252     TRUE 0.998 0.000 0.556 0.095 Y NA
 2201423 2201424 pRL120252 pRL120253     TRUE 0.999 -3.000 0.556 0.095 Y NA
 2201424 2201425 pRL120253 pRL120254     TRUE 0.988 2.000 0.095 1.000 Y NA
 2201425 2201426 pRL120254 pRL120255     TRUE 0.993 -3.000 0.095 1.000 Y NA
 2201426 2201427 pRL120255 pRL120256   melA TRUE 0.629 189.000 0.400 1.000 Y NA
 2201429 2201430 pRL120258 pRL120259     TRUE 0.700 85.000 0.000 1.000 Y NA
 2201431 2201432 pRL120260 pRL120261     FALSE 0.064 150.000 0.000 NA   NA
 2201432 2201433 pRL120261 pRL120262     TRUE 0.842 7.000 0.047 1.000 N NA
 2201433 2201434 pRL120262 pRL120263     TRUE 0.971 73.000 0.674 0.095 Y NA
 2201434 2201435 pRL120263 pRL120264     TRUE 0.999 -3.000 0.897 0.095 Y NA
 2201435 2201436 pRL120264 pRL120265     TRUE 0.972 14.000 0.105 0.095 Y NA
 2201436 2201437 pRL120265 pRL120266     TRUE 0.673 20.000 0.054 1.000   NA
 2201437 2201438 pRL120266 pRL120267   kluA FALSE 0.116 125.000 0.000 1.000   NA
 2201438 2201439 pRL120267 pRL120268 kluA kluB TRUE 0.624 9.000 0.000 NA   NA
 2201440 2201441 pRL120269 pRL120270     TRUE 0.996 -3.000 0.312 NA Y NA
 2201441 2201442 pRL120270 pRL120271   budB FALSE 0.005 330.000 0.000 1.000 N NA
 2201442 2201443 pRL120271 pRL120272 budB   FALSE 0.090 117.000 0.000 NA   NA
 2201443 2201444 pRL120272 pRL120273   dctA FALSE 0.002 477.000 0.000 NA   NA
 2201444 1569742 pRL120273 pRL120274 dctA   FALSE 0.143 86.000 0.000 NA   NA
 2201445 2201446 pRL120275 pRL120276   ligJ FALSE 0.019 243.000 0.000 1.000   NA
 2201446 2201447 pRL120276 pRL120277 ligJ ligI TRUE 0.978 0.000 0.088 0.077   NA
 2201447 2201448 pRL120277 pRL120278 ligI   FALSE 0.115 126.000 0.000 1.000   NA
 2201449 2201450 pRL120279 pRL120280 prC   FALSE 0.066 148.000 0.000 NA   NA
 2201452 2201453 pRL120282 pRL120283     TRUE 0.995 11.000 0.529 0.017 Y NA
 2201454 2201455 pRL120284 pRL120285     TRUE 0.961 48.000 0.619 NA Y NA
 2201455 2201456 pRL120285 pRL120286     TRUE 0.999 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 2201456 2201457 pRL120286 pRL120287     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.095 Y NA
 2201457 2201458 pRL120287 pRL120288     TRUE 0.965 15.000 0.238 1.000 Y NA
 2201459 2201460 pRL120289 pRL120290     FALSE 0.251 187.000 0.300 1.000   NA
 2201462 2201463 pRL120292 pRL120293     TRUE 0.985 0.000 0.440 NA   NA
 2201466 2201467 pRL120296 pRL120297     FALSE 0.054 181.000 0.000 1.000   NA
 2201468 2201469 pRL120298 pRL120299     TRUE 0.688 -67.000 0.000 NA   NA
 2201469 2201470 pRL120299 pRL120300   yagR FALSE 0.477 56.000 0.111 NA N NA
 2201470 2201471 pRL120300 pRL120301 yagR yagS TRUE 0.999 4.000 0.917 0.001 Y NA
 2201471 2201472 pRL120301 pRL120302 yagS yagT TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.040 Y NA
 2201475 2201476 pRL120305 pRL120306     TRUE 0.951 75.000 0.702 NA Y NA
 2201476 2201477 pRL120306 pRL120307     TRUE 0.999 -3.000 0.769 1.000 Y NA
 2201477 2201478 pRL120307 pRL120308   codA TRUE 0.979 0.000 0.333 1.000 N NA
 2201478 2201479 pRL120308 pRL120309 codA   TRUE 0.950 2.000 0.174 1.000 N NA
 2201479 2201480 pRL120309 pRL120310     TRUE 0.990 -3.000 0.217 0.047   NA
 2201481 2201482 pRL120311 pRL120312   mcpA FALSE 0.021 186.000 0.000 NA N NA
 2201484 2201485 pRL120314 pRL120315     TRUE 0.995 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 2201486 2201487 pRL120316 pRL120317     TRUE 0.987 -3.000 0.364 1.000   NA
 2201487 2201488 pRL120317 pRL120318   metC TRUE 0.981 5.000 0.583 1.000 N NA
 2201491 2201492 pRL120321 pRL120322 fhuF fhuA TRUE 0.817 10.000 0.062 NA   NA
 2201493 2201494 pRL120324 pRL120325     FALSE 0.044 176.000 0.000 1.000 N NA
 2201494 2201495 pRL120325 pRL120326     TRUE 0.981 -16.000 0.533 1.000 N NA
 2201495 2201496 pRL120326 pRL120326A     TRUE 0.968 59.000 0.533 0.094 Y NA
 2201496 2201497 pRL120326A pRL120327     TRUE 0.998 3.000 0.778 0.094 Y NA
 2201497 2201498 pRL120327 pRL120328     TRUE 0.955 19.000 0.242 1.000 Y NA
 2201498 2201499 pRL120328 pRL120329     TRUE 0.975 9.000 0.109 1.000 Y NA
 2201499 2201500 pRL120329 pRL120330     TRUE 0.998 1.000 0.436 0.003 Y NA
 2201500 2201501 pRL120330 pRL120331     TRUE 0.921 27.000 0.133 1.000 Y NA
 2201503 2201504 pRL120333 pRL120334     FALSE 0.065 149.000 0.000 NA   NA
 2201504 2201505 pRL120334 pRL120335     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2201505 2201506 pRL120335 pRL120336     TRUE 0.670 131.000 0.125 1.000 Y NA
 2201506 2201507 pRL120336 pRL120337     TRUE 0.998 5.000 0.818 0.094 Y NA
 2201507 2201508 pRL120337 pRL120338     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2201508 2201509 pRL120338 pRL120339     TRUE 0.999 0.000 0.667 0.003 Y NA
 2201509 2201510 pRL120339 pRL120340     FALSE 0.020 214.000 0.000 NA   NA
 2201510 2201511 pRL120340 pRL120341     TRUE 0.975 -3.000 0.222 NA   NA
 2201521 2201522 pRL120351 pRL120352     TRUE 0.959 71.000 0.500 0.094 Y NA
 2201522 2201523 pRL120352 pRL120353     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.094 Y NA
 2201523 2201524 pRL120353 pRL120354     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 2201524 2201525 pRL120354 pRL120355     TRUE 0.992 -3.000 0.074 NA Y NA
 2201525 2201526 pRL120355 pRL120356     TRUE 0.913 23.000 0.093 NA Y NA
 2201527 2201528 pRL120357 pRL120358     FALSE 0.240 46.000 0.000 NA   NA
 2201529 2201530 pRL120359 pRL120360 panC panB TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.000 Y NA
 2201533 2201534 pRL120363 pRL120364     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 2201534 2201535 pRL120364 pRL120365     FALSE 0.439 136.000 0.333 NA   NA
 2201535 2201536 pRL120365 pRL120366     FALSE 0.100 111.000 0.000 NA   NA
 2201537 2201538 pRL120367 pRL120368     TRUE 0.647 24.000 0.061 1.000   NA
 2201538 2201539 pRL120368 pRL120369     TRUE 0.995 -22.000 0.576 1.000 Y NA
 2201539 2201540 pRL120369 pRL120370     FALSE 0.001 560.000 0.000 1.000 N NA
 2201540 2201541 pRL120370 pRL120371     FALSE 0.009 272.000 0.000 1.000 N NA
 2201541 2201542 pRL120371 pRL120372     TRUE 0.872 52.000 0.625 NA   NA
 2201543 2201544 pRL120373 pRL120374     FALSE 0.456 74.000 0.082 1.000   NA
 2201544 2201545 pRL120374 pRL120378     FALSE 0.001 3447.000 0.000 1.000   NA
 2201545 2201546 pRL120378 pRL120379     FALSE 0.008 270.000 0.000 NA   NA
 2201546 2201547 pRL120379 pRL120380     FALSE 0.015 228.000 0.000 NA   NA
 2201547 2201548 pRL120380 pRL120381     FALSE 0.324 124.000 0.182 1.000 N NA
 2201548 2201549 pRL120381 pRL120382     TRUE 0.956 21.000 0.800 1.000   NA
 2201549 2201550 pRL120382 pRL120383     TRUE 0.833 34.000 0.375 1.000   NA
 2201550 2201551 pRL120383 pRL120384     TRUE 0.999 -3.000 0.875 0.094 Y NA
 2201551 2201552 pRL120384 pRL120385     TRUE 0.971 94.000 0.875 0.094 Y NA
 2201552 2201553 pRL120385 pRL120386   dhaK2 TRUE 0.913 72.000 0.375 1.000 Y NA
 2201553 2201554 pRL120386 pRL120387 dhaK2 dhaK1 TRUE 0.999 4.000 0.857 0.001 Y NA
 2201554 2201555 pRL120387 pRL120388 dhaK1   TRUE 0.690 56.000 0.250 1.000   NA
 2201555 2201556 pRL120388 pRL120389     TRUE 0.990 -3.000 0.433 1.000   NA
 2201556 2201557 pRL120389 pRL120390     TRUE 0.976 2.000 0.333 1.000   NA
 2201557 2201558 pRL120390 pRL120391     TRUE 0.996 -3.000 0.793 1.000   NA
 2201558 2201559 pRL120391 pRL120392     TRUE 0.992 -3.000 0.542 NA   NA
 2201559 2201560 pRL120392 pRL120393     TRUE 0.792 74.000 0.520 NA   NA
 2201560 2201561 pRL120393 pRL120394     TRUE 0.655 76.000 0.320 NA   NA
 2201561 2201562 pRL120394 pRL120395     FALSE 0.281 134.000 0.162 NA   NA
 2201562 2201563 pRL120395 pRL120396   cbbl1 TRUE 0.976 6.000 0.541 NA   NA
 2201564 2201565 pRL120397 pRL120398     FALSE 0.128 194.000 0.176 NA   NA
 2201565 2201566 pRL120398 pRL120399     FALSE 0.029 192.000 0.000 NA   NA
 2201566 2201567 pRL120399 pRL120400     FALSE 0.358 24.000 0.000 1.000 N NA
 2201567 2201568 pRL120400 pRL120401   dctQ FALSE 0.157 229.000 0.000 NA Y NA
 2201568 2201569 pRL120401 pRL120402 dctQ dctM TRUE 0.997 5.000 0.824 NA Y NA
 2201569 2201570 pRL120402 pRL120403 dctM   TRUE 0.963 10.000 0.500 1.000 N NA
 2201570 2201571 pRL120403 pRL120404     FALSE 0.026 433.000 0.000 1.000 Y NA
 2201571 2201572 pRL120404 pRL120405     TRUE 0.977 22.000 0.556 1.000 Y NA
 2201572 2201573 pRL120405 pRL120406     TRUE 0.937 43.000 0.179 0.094 Y NA
 2201573 2201574 pRL120406 pRL120407     TRUE 0.994 -3.000 0.179 1.000 Y NA
 2201574 2201575 pRL120407 pRL120408     TRUE 0.998 11.000 1.000 0.033 Y NA
 2201575 2201576 pRL120408 pRL120409   aatA TRUE 0.920 42.000 0.250 1.000 Y NA
 2201576 2201577 pRL120409 pRL120410 aatA   FALSE 0.519 80.000 0.200 1.000 N NA
 2201577 2201578 pRL120410 pRL120411   hyuA FALSE 0.331 194.000 0.500 1.000 N NA
 2201578 2201579 pRL120411 pRL120412 hyuA hyuB TRUE 0.997 12.000 0.778 0.000 Y NA
 2201579 2201580 pRL120412 pRL120413 hyuB   TRUE 0.869 10.000 0.096 1.000   NA
 2201580 2201581 pRL120413 pRL120414     FALSE 0.519 17.000 0.000 1.000   NA
 2201583 2201584 pRL120416 pRL120417 dadX dadA TRUE 0.606 30.000 0.089 1.000 N NA
 2201584 2201585 pRL120417 pRL120418 dadA   FALSE 0.301 86.000 0.040 1.000 N NA
 2201590 2201591 pRL120423 pRL120424     TRUE 0.992 2.000 0.296 NA Y NA
 2201591 2201592 pRL120424 pRL120425     TRUE 0.997 -3.000 0.417 NA Y NA
 2201593 2201594 pRL120426 pRL120427     FALSE 0.102 109.000 0.000 NA   NA
 2201595 2201596 pRL120428 pRL120429     FALSE 0.298 96.000 0.097 NA N NA
 2201596 2201597 pRL120429 pRL120430     TRUE 0.820 62.000 0.065 NA Y NA
 2201597 2201598 pRL120430 pRL120431     TRUE 0.999 2.000 0.677 0.003 Y NA
 2201598 2201599 pRL120431 pRL120432     TRUE 0.999 -3.000 0.742 1.000 Y NA
 2201599 2201600 pRL120432 pRL120433     TRUE 0.998 4.000 0.871 0.094 Y NA
 2201600 2201601 pRL120433 pRL120434     TRUE 0.922 79.000 0.296 0.094 Y NA
 2201601 1569900 pRL120434 pRL120435     FALSE 0.001 1283.000 0.000 NA   NA
 2201602 2201603 pRL120436 pRL120437     FALSE 0.030 191.000 0.000 NA   NA
 2201604 2201605 pRL120438 pRL120439     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 2201605 2201606 pRL120439 pRL120440     TRUE 0.582 14.000 0.000 1.000   NA
 2201606 2201607 pRL120440 pRL120441     TRUE 0.613 29.000 0.061 1.000   NA
 2201607 2201608 pRL120441 pRL120442     TRUE 0.994 0.000 0.500 0.033   NA
 2201608 2201609 pRL120442 pRL120443     TRUE 0.982 2.000 0.429 1.000   NA
 2201609 2201610 pRL120443 pRL120444     TRUE 0.997 2.000 0.500 0.094 Y NA
 2201610 2201611 pRL120444 pRL120445     TRUE 0.886 151.000 0.750 1.000 Y NA
 2201611 2201612 pRL120445 pRL120446     FALSE 0.007 250.000 0.000 NA N NA
 2201612 2201613 pRL120446 pRL120447     TRUE 0.973 13.000 0.833 NA N NA
 2201613 2201614 pRL120447 pRL120448     FALSE 0.001 465.000 0.000 NA N NA
 2201616 2201617 pRL120450 pRL120451 cpO   FALSE 0.029 214.000 0.000 1.000   NA
 2201617 2201618 pRL120451 pRL120452     TRUE 0.990 -3.000 0.483 NA   NA
 2201618 2201619 pRL120452 pRL120453     TRUE 0.890 16.000 0.344 NA   NA
 2201619 2201620 pRL120453 pRL120454     FALSE 0.368 105.000 0.164 NA   NA
 2201620 2201621 pRL120454 pRL120455     TRUE 0.653 72.000 0.300 NA   NA
 2201621 2201622 pRL120455 pRL120456     FALSE 0.173 96.000 0.000 1.000   NA
 2201624 2201625 pRL120458 pRL120459     TRUE 0.988 3.000 0.673 NA   NA
 2201625 2201626 pRL120459 pRL120460     TRUE 0.757 8.000 0.010 NA   NA
 2201628 2201629 pRL120462 pRL120463 impN impM TRUE 0.983 -10.000 0.500 1.000   NA
 2201629 2201630 pRL120463 pRL120464 impM impL TRUE 0.931 11.000 0.333 NA   NA
 2201630 2201631 pRL120464 pRL120465 impL impK TRUE 0.987 -3.000 0.400 NA   NA
 2201631 2201632 pRL120465 pRL120466 impK impJ TRUE 0.987 -3.000 0.385 NA   NA
 2201632 2201633 pRL120466 pRL120467 impJ impI TRUE 0.952 -10.000 0.231 NA   NA
 2201633 2201634 pRL120467 pRL120468 impI impH TRUE 0.860 12.000 0.176 NA   NA
 2201634 2201635 pRL120468 pRL120469 impH impG TRUE 0.834 21.000 0.300 NA   NA
 2201635 2201636 pRL120469 pRL120470 impG impF TRUE 0.969 -7.000 0.300 NA   NA
 2201636 2201637 pRL120470 pRL120471 impF impE TRUE 0.962 -7.000 0.250 NA   NA
 2201637 2201638 pRL120471 pRL120472 impE impD TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 2201638 2201639 pRL120472 pRL120473 impD impC TRUE 0.616 76.000 0.278 NA   NA
 2201639 2201640 pRL120473 pRL120474 impC impB FALSE 0.142 131.000 0.019 NA   NA
 2201640 2201641 pRL120474 pRL120475 impB impA FALSE 0.420 37.000 0.019 NA   NA
 1569941 2201642 pRL120476 pRL120477     FALSE 0.244 45.000 0.000 NA   NA
 2201642 2201643 pRL120477 pRL120478     FALSE 0.064 150.000 0.000 NA   NA
 2201643 2201644 pRL120478 pRL120479     FALSE 0.240 46.000 0.000 NA   NA
 2201644 2201645 pRL120479 pRL120480     FALSE 0.291 32.000 0.000 NA   NA
 2201645 2201646 pRL120480 pRL120481     TRUE 0.940 14.000 0.500 NA   NA
 2201646 2201647 pRL120481 pRL120482     TRUE 0.975 -3.000 0.222 NA   NA
 2201647 2201648 pRL120482 pRL120483     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2201648 2201649 pRL120483 pRL120484     FALSE 0.010 256.000 0.000 NA   NA
 2201649 2201650 pRL120484 pRL120485     FALSE 0.269 36.000 0.000 NA   NA
 2201650 2201651 pRL120485 pRL120486     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2201652 2201653 pRL120487 pRL120488     TRUE 0.879 24.000 0.227 0.047 N NA
 2201653 2201654 pRL120488 pRL120489     TRUE 0.740 23.000 0.182 1.000 N NA
 2201654 2201655 pRL120489 pRL120490     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.094 Y NA
 2201655 2201656 pRL120490 pRL120491     TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 2201656 2201657 pRL120491 pRL120492     TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.032 Y NA
 2201657 2201658 pRL120492 pRL120493     TRUE 0.997 7.000 1.000 NA Y NA
 2201658 2201659 pRL120493 pRL120494     TRUE 0.825 68.000 0.600 NA N NA
 2201661 2201662 pRL120496 pRL120497     FALSE 0.113 101.000 0.000 NA   NA
 2201662 2201663 pRL120497 pRL120498     TRUE 0.708 5.000 0.000 NA   NA
 2201663 2201664 pRL120498 pRL120499     TRUE 0.874 81.000 0.314 NA Y NA
 2201664 2201665 pRL120499 pRL120500     TRUE 0.964 60.000 0.743 NA Y NA
 2201667 2201668 pRL120502 pRL120503     FALSE 0.267 124.000 0.111 1.000 N NA
 2201669 2201670 pRL120504 pRL120505 fcS ech TRUE 0.923 43.000 0.062 0.076 Y NA
 2201670 2201671 pRL120505 pRL120506 ech xylB TRUE 0.786 57.000 0.429 1.000 N NA
 2201671 2201672 pRL120506 pRL120507 xylB calB TRUE 0.969 22.000 0.429 1.000 Y NA
 2201672 2201673 pRL120507 pRL120508 calB   FALSE 0.027 200.000 0.000 1.000 N NA
 2201673 2201674 pRL120508 pRL120509     FALSE 0.163 83.000 0.000 1.000 N NA
 2201674 2201675 pRL120509 pRL120510     TRUE 0.995 -3.000 0.769 NA   NA
 2201676 2201677 pRL120511 pRL120512     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2201677 2201678 pRL120512 pRL120513     FALSE 0.001 630.000 0.000 NA   NA
 2201678 2201679 pRL120513 pRL120514     FALSE 0.046 173.000 0.000 1.000 N NA
 2201679 2201680 pRL120514 pRL120515     TRUE 0.997 -7.000 0.500 0.100 Y NA
 2201680 2201681 pRL120515 pRL120516     TRUE 0.733 209.000 0.556 0.094 Y NA
 2201681 2201682 pRL120516 pRL120517     TRUE 0.875 68.000 0.207 1.000 Y NA
 2201682 2201683 pRL120517 pRL120518     TRUE 0.871 12.000 0.194 1.000 N NA
 2201684 2201685 pRL120519 pRL120520     TRUE 0.603 49.000 0.171 NA   NA
 2201685 2201686 pRL120520 pRL120521   etfB TRUE 0.853 19.000 0.312 NA   NA
 2201686 2201687 pRL120521 pRL120522 etfB etfA TRUE 0.960 25.000 0.125 0.009 Y NA
 2201687 2201688 pRL120522 pRL120523 etfA   FALSE 0.075 133.000 0.000 NA   NA
 2201688 2201689 pRL120523 pRL120524   adhI FALSE 0.468 152.000 0.429 NA   NA
 2201689 2201690 pRL120524 pRL120525 adhI esd TRUE 0.890 4.000 0.029 1.000   NA
 2201690 2201691 pRL120525 pRL120526 esd gfA FALSE 0.461 55.000 0.039 1.000   NA
 2201691 2201692 pRL120526 pRL120527 gfA   FALSE 0.003 404.000 0.000 1.000   NA
 2201692 2201693 pRL120527 pRL120528     TRUE 0.970 -3.000 0.167 1.000 N NA
 2201693 2201694 pRL120528 pRL120529     TRUE 0.994 -7.000 0.690 0.076 N NA
 2201694 2201695 pRL120529 pRL120530     TRUE 0.993 -3.000 0.345 0.046 N NA
 2201695 2201696 pRL120530 pRL120531     TRUE 0.947 78.000 0.636 1.000 Y NA
 2201696 2201697 pRL120531 pRL120532     TRUE 0.959 74.000 0.727 1.000 Y NA
 2201697 2201698 pRL120532 pRL120533     TRUE 0.979 6.000 0.000 0.100 Y NA
 2201698 2201699 pRL120533 pRL120534     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.094 Y NA
 2201699 2201700 pRL120534 pRL120535     TRUE 0.942 17.000 0.100 1.000 Y NA
 2201700 2201701 pRL120535 pRL120536     FALSE 0.469 56.000 0.071 1.000 N NA
 2201702 2201703 pRL120537 pRL120538     TRUE 0.977 11.000 0.417 0.001 N NA
 2201705 2201706 pRL120540 pRL120541     FALSE 0.009 299.000 0.000 1.000   NA
 2201710 2201711 pRL120545 pRL120546     TRUE 0.764 14.000 0.091 NA   NA
 2201711 2201712 pRL120546 pRL120547     FALSE 0.369 34.000 0.000 1.000   NA
 2201714 2201715 pRL120549 pRL120550     FALSE 0.053 259.000 0.200 NA   NA
 2201718 2201719 pRL120553 pRL120554   putA TRUE 0.576 43.000 0.120 NA   NA
 2201719 2201720 pRL120554 pRL120555 putA   FALSE 0.002 431.000 0.000 1.000 N NA
 2201720 2201721 pRL120555 pRL120556     TRUE 0.630 48.000 0.190 1.000 N NA
 2201721 2201722 pRL120556 pRL120557     TRUE 0.948 75.000 0.429 0.093 Y NA
 2201722 2201723 pRL120557 pRL120558     TRUE 0.996 8.000 0.636 0.093 Y NA
 2201723 2201724 pRL120558 pRL120559     TRUE 0.995 3.000 0.455 1.000 Y NA
 2201724 2201725 pRL120559 pRL120560     TRUE 0.963 14.000 0.182 1.000 Y NA
 2201726 2201727 pRL120561 pRL120561A     FALSE 0.002 520.000 0.000 1.000   NA
 2201728 2201729 pRL120562 pRL120563   ardC FALSE 0.005 270.000 0.000 NA N NA
 2201730 2201731 pRL120564 pRL120565     FALSE 0.131 92.000 0.000 NA   NA
 2201731 2201732 pRL120565 pRL120566   mobC TRUE 0.984 -3.000 0.300 1.000   NA
 2201733 2201734 pRL120567 pRL120568 traA   FALSE 0.001 1162.000 0.000 NA   NA
 2201735 2201736 pRL120569 pRL120570     FALSE 0.275 61.000 0.000 1.000   NA
 2201736 2201737 pRL120570 pRL120571     FALSE 0.015 236.000 0.000 1.000 N NA
 2201737 2201738 pRL120571 pRL120572     FALSE 0.209 65.000 0.000 1.000 N NA
 2201738 2201739 pRL120572 pRL120573     TRUE 0.973 -3.000 0.200 NA   NA
 2201739 2201740 pRL120573 pRL120574     TRUE 0.934 -3.000 0.029 NA   NA
 2201740 2201741 pRL120574 pRL120575     TRUE 0.986 -3.000 0.324 1.000   NA
 2201742 2201743 pRL120576 pRL120577     FALSE 0.054 181.000 0.000 1.000   NA
 2201743 2201744 pRL120577 pRL120578     FALSE 0.036 181.000 0.000 NA   NA
 2201744 2201745 pRL120578 pRL120579     TRUE 0.709 16.000 0.071 NA   NA
 2201745 2201746 pRL120579 pRL120580     FALSE 0.021 212.000 0.000 NA   NA
 2201746 2201747 pRL120580 pRL120581     TRUE 0.996 -3.000 0.898 NA N NA
 2201751 2201752 pRL120585 pRL120586     TRUE 0.953 -3.000 0.102 NA N NA
 2201752 2201753 pRL120586 pRL120587     TRUE 0.964 -3.000 0.118 1.000 N NA
 2201753 2201754 pRL120587 pRL120588     TRUE 0.774 22.000 0.211 1.000 N NA
 2201755 2201756 pRL120589 pRL120590     TRUE 0.999 0.000 0.600 0.009 Y NA
 2201756 2201757 pRL120590 pRL120591     TRUE 0.879 197.000 1.000 0.093 Y NA
 2201757 2201758 pRL120591 pRL120592     TRUE 0.999 2.000 1.000 0.093 Y NA
 2201758 2201759 pRL120592 pRL120593     TRUE 0.914 158.000 0.750 0.093 Y NA
 2201759 2201760 pRL120593 pRL120594     FALSE 0.005 369.000 0.000 1.000   NA
 2201761 2201762 pRL120595 pRL120596     TRUE 0.766 12.000 0.053 NA   NA
 2201762 2201763 pRL120596 pRL120597     TRUE 0.600 26.000 0.042 1.000   NA
 2201763 2201764 pRL120597 pRL120598     TRUE 0.763 33.000 0.273 1.000 N NA
 2201765 2201766 pRL120599 pRL120600     FALSE 0.400 53.000 0.010 1.000   NA
 2201767 2201768 pRL120601 pRL120602     TRUE 0.997 -3.000 0.194 0.076 Y NA
 2201768 2201769 pRL120602 pRL120603   gabD TRUE 0.986 15.000 0.381 0.076 Y NA
 2201769 2201770 pRL120603 pRL120604 gabD   TRUE 0.935 12.000 0.190 0.076 N NA
 2201773 2201774 pRL120607 pRL120608     TRUE 0.997 -3.000 0.900 1.000   NA
 2201774 2201775 pRL120608 pRL120609     TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.093 Y NA
 2201775 2201776 pRL120609 pRL120610     TRUE 0.936 90.000 0.450 0.093 Y NA
 2201776 2201777 pRL120610 pRL120611     TRUE 0.770 58.000 0.375 1.000   NA
 2201777 2201778 pRL120611 pRL120612     FALSE 0.142 224.000 0.300 1.000   NA
 2201778 2201779 pRL120612 pRL120613     TRUE 0.837 14.000 0.150 1.000   NA
 2201779 2201780 pRL120613 pRL120614     FALSE 0.071 140.000 0.000 NA   NA
 2201780 2201781 pRL120614 pRL120615     TRUE 0.939 4.000 0.194 NA   NA
 2201781 2201782 pRL120615 pRL120616     TRUE 0.826 15.000 0.194 1.000 N NA
 2201782 2201783 pRL120616 pRL120617     TRUE 0.650 69.000 0.276 1.000 N NA
 2201784 2201785 pRL120618 pRL120619     TRUE 0.710 19.000 0.103 1.000 N NA
 2201785 2201786 pRL120619 pRL120620     FALSE 0.128 164.000 0.029 1.000   NA
 2201786 2201787 pRL120620 pRL120621     TRUE 0.928 14.000 0.400 1.000   NA
 2201788 2201789 pRL120622 pRL120623     FALSE 0.004 343.000 0.000 NA   NA
 2201789 2201790 pRL120623 pRL120624     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2201790 2201791 pRL120624 pRL120625     FALSE 0.107 105.000 0.000 NA   NA
 2201791 2201792 pRL120625 pRL120626     TRUE 0.953 34.000 1.000 1.000   NA
 2201792 2201793 pRL120626 pRL120627     FALSE 0.119 261.000 0.400 1.000   NA
 2201793 2201794 pRL120627 pRL120628   gabD FALSE 0.017 227.000 0.000 1.000 N NA
 2201794 2201795 pRL120628 pRL120629 gabD   TRUE 0.997 4.000 0.481 0.076 Y NA
 2201795 2201796 pRL120629 pRL120630     TRUE 0.993 10.000 0.412 0.076 Y NA
 2201796 2201797 pRL120630 pRL120631     FALSE 0.371 124.000 0.235 NA   NA
 2201797 2201798 pRL120631 pRL120632     TRUE 0.878 27.000 0.476 NA   NA
 2201798 2201799 pRL120632 pRL120633     TRUE 0.967 25.000 0.455 1.000 Y NA
 2201801 2201802 pRL120635 pRL120636     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2201802 2201803 pRL120636 pRL120637     FALSE 0.269 36.000 0.000 NA   NA
 2201804 2201805 pRL120638 pRL120639     FALSE 0.229 56.000 0.000 1.000 N NA
 2201805 2201806 pRL120639 pRL120640     FALSE 0.269 36.000 0.000 NA   NA
 2201807 2201808 pRL120641 pRL120642   groL FALSE 0.217 55.000 0.000 NA   NA
 2201808 2201809 pRL120642 pRL120643 groL groS TRUE 0.654 154.000 0.000 0.004 Y NA
 2201809 2201810 pRL120643 pRL120644 groS   FALSE 0.019 215.000 0.000 NA   NA
 2201811 2201812 pRL120646 pRL120647     TRUE 0.982 -3.000 0.300 NA   NA
 2201812 1570113 pRL120647 pRL120648     FALSE 0.240 46.000 0.000 NA   NA
 2201813 2201814 pRL120649 pRL120650     TRUE 0.992 -3.000 0.545 NA   NA
 2201815 2201816 pRL120651 pRL120652     FALSE 0.032 188.000 0.000 NA   NA
 2201816 2201817 pRL120652 pRL120653     TRUE 0.792 54.000 0.429 NA   NA
 2201817 2201818 pRL120653 pRL120654     TRUE 0.854 6.000 0.053 NA   NA
 2201819 2201820 pRL120655 pRL120656     TRUE 0.914 19.000 0.500 NA   NA
 2201822 2201823 pRL120658 pRL120659     TRUE 0.811 78.000 0.600 NA   NA
 2201823 2201824 pRL120659 pRL120660     TRUE 0.924 17.000 0.500 NA   NA
 2201824 2201825 pRL120660 pRL120661     TRUE 0.931 21.000 0.625 NA   NA
 2201825 2201826 pRL120661 pRL120662   ugl TRUE 0.964 16.000 0.750 1.000   NA
 2201826 2201827 pRL120662 pRL120663 ugl   TRUE 0.987 5.000 0.700 1.000   NA
 2201827 2201828 pRL120663 pRL120664     TRUE 0.999 -3.000 0.625 0.093 Y NA
 2201829 2201830 pRL120665 pRL120666     FALSE 0.370 125.000 0.238 NA   NA
 2201830 2201831 pRL120666 pRL120667     FALSE 0.387 96.000 0.143 NA   NA
 2201831 2201832 pRL120667 pRL120668     TRUE 0.974 14.000 0.300 1.000 Y NA
 2201833 2201834 pRL120669 pRL120670     TRUE 0.995 12.000 0.914 1.000 Y NA
 2201834 2201835 pRL120670 pRL120671     TRUE 0.921 51.000 0.333 NA Y NA
 2201835 2201836 pRL120671 pRL120672     FALSE 0.002 345.000 0.000 NA N NA
 2201836 2201837 pRL120672 pRL120673     TRUE 0.993 -3.000 0.596 1.000 N NA
 2201837 2201838 pRL120673 pRL120674     FALSE 0.030 194.000 0.000 1.000 N NA
 2201839 2201840 pRL120675 pRL120676     TRUE 0.995 -3.000 0.800 NA   NA
 2201842 2201843 pRL120678 pRL120679     TRUE 0.945 51.000 0.444 1.000 Y NA
 2201843 2201844 pRL120679 pRL120680     TRUE 0.792 119.000 0.120 0.093 Y NA
 2201844 2201845 pRL120680 pRL120681     TRUE 0.993 -10.000 0.160 0.093 Y NA
 2201845 2201846 pRL120681 pRL120682     FALSE 0.471 178.000 0.121 NA Y NA
 2201846 2201847 pRL120682 pRL120683     TRUE 0.969 14.000 0.833 NA N NA
 2201848 2201849 pRL120684 pRL120685     FALSE 0.003 372.000 0.000 NA   NA
 2201850 2201851 pRL120686 pRL120687     TRUE 0.877 18.000 0.357 NA   NA
 2201851 2201852 pRL120687 pRL120688     TRUE 0.978 -3.000 0.211 1.000   NA
 2201852 2201853 pRL120688 pRL120689     TRUE 0.940 -12.000 0.184 1.000 N NA
 2201853 2201854 pRL120689 pRL120690     TRUE 0.998 3.000 0.667 0.093 Y NA
 2201854 2201855 pRL120690 pRL120691     TRUE 0.999 2.000 0.750 0.093 Y NA
 2201858 2201859 pRL120694 pRL120695     TRUE 0.971 43.000 0.455 0.079 Y NA
 2201860 2201861 pRL120696 pRL120697     TRUE 0.999 -3.000 0.826 0.005 Y NA
 2201861 2201862 pRL120697 pRL120698     TRUE 0.994 -3.000 0.739 NA N NA
 2201862 2201863 pRL120698 pRL120699     TRUE 0.541 74.000 0.200 NA   NA
 2201863 2201864 pRL120699 pRL120700     FALSE 0.001 515.000 0.000 NA   NA
 2201864 2201865 pRL120700 pRL120701     FALSE 0.208 147.000 0.100 NA   NA
 2201865 2201866 pRL120701 pRL120702     FALSE 0.067 146.000 0.000 NA   NA
 1570168 2201867 pRL120703 pRL120704     FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 2201867 2201868 pRL120704 pRL120705     FALSE 0.066 148.000 0.000 NA   NA
 2201868 2201869 pRL120705 pRL120706     FALSE 0.355 22.000 0.000 NA   NA
 2201869 2201870 pRL120706 pRL120707     TRUE 0.682 72.000 0.333 NA   NA
 2201871 2201872 pRL120708 pRL120709   treS TRUE 0.998 1.000 0.544 0.006 Y NA
 2201872 2201873 pRL120709 pRL120710 treS glgB TRUE 0.997 -3.000 0.115 0.006 Y NA
 2201874 2201875 pRL120711 pRL120712     TRUE 0.995 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 2201875 2201876 pRL120712 pRL120713     TRUE 0.999 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 2201876 2201877 pRL120713 pRL120714     FALSE 0.056 157.000 0.000 NA   NA
 2201877 2201878 pRL120714 pRL120715     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 2201878 2201879 pRL120715 pRL120716     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 2201879 2201880 pRL120716 pRL120717     TRUE 0.673 79.000 0.364 NA   NA
 2201881 2201882 pRL120718 pRL120719     TRUE 0.987 11.000 0.182 0.008 Y NA
 2201883 2201884 pRL120720 pRL120721     TRUE 0.990 0.000 0.591 NA   NA
 2201885 2201886 pRL120722 pRL120723   malQ TRUE 0.926 30.000 0.000 0.006 Y NA
 2201886 2201887 pRL120723 pRL120724 malQ   FALSE 0.295 31.000 0.000 NA   NA
 2201889 2201890 pRL120726 pRL120727     TRUE 0.676 134.000 0.667 NA   NA
 2201892 2201893 pRL120729 pRL120730     TRUE 0.728 137.000 0.800 NA   NA
 2201894 2201895 pRL120731 pRL120732     FALSE 0.513 178.000 0.000 0.053 Y NA
 2201896 2201897 pRL120733 pRL120734     TRUE 0.948 91.000 0.538 0.093 Y NA
 2201897 2201898 pRL120734 pRL120735     TRUE 0.808 97.000 0.211 1.000 Y NA
 2201898 2201899 pRL120735 pRL120736     TRUE 0.612 75.000 0.267 NA   NA
 2201904 2201905 pRL120741 pRL120742     FALSE 0.141 189.000 0.125 1.000   NA
 2201905 2201906 pRL120742 pRL120743     FALSE 0.185 92.000 0.000 1.000   NA
 2201907 2201908 pRL120744 pRL120745   pct FALSE 0.113 101.000 0.000 NA   NA
 2201908 2201909 pRL120745 pRL120746 pct   TRUE 0.996 -3.000 0.087 0.075 Y NA
 2201909 2201910 pRL120746 pRL120747     TRUE 0.996 -3.000 0.087 0.046 Y NA
 2201910 2201911 pRL120747 pRL120748     TRUE 0.943 -3.000 0.040 1.000 N NA
 2201911 2201912 pRL120748 pRL120749     TRUE 0.943 -3.000 0.040 1.000 N NA
 2201912 2201913 pRL120749 pRL120750     TRUE 0.877 70.000 0.750 1.000 N NA
 2201913 2201914 pRL120750 pRL120751     FALSE 0.260 118.000 0.091 1.000 N NA
 2201914 2201915 pRL120751 pRL120752     FALSE 0.407 39.000 0.039 NA N NA
 2201915 2201916 pRL120752 pRL120753     FALSE 0.191 35.000 0.000 NA N NA
 2201916 2201917 pRL120753 pRL120754     TRUE 0.997 -3.000 0.261 0.093 Y NA
 2201917 2201918 pRL120754 pRL120755     TRUE 0.943 23.000 0.217 1.000 Y NA
 2201918 2201919 pRL120755 pRL120756     FALSE 0.004 300.000 0.000 NA N NA
 2201919 2201920 pRL120756 pRL120757     TRUE 0.876 67.000 0.239 NA Y NA
 2201920 2201921 pRL120757 pRL120758     TRUE 0.990 29.000 0.727 0.005 Y NA
 2201921 2201922 pRL120758 pRL120759     TRUE 0.971 2.000 0.303 1.000 N NA
 2201922 2201923 pRL120759 pRL120760     TRUE 0.986 -3.000 0.364 1.000 N NA
 2201923 2201924 pRL120760 pRL120761     TRUE 0.981 13.000 0.385 1.000 Y NA
 2201924 2201925 pRL120761 pRL120762     TRUE 0.993 -3.000 0.588 1.000 N NA
 2201925 2201926 pRL120762 pRL120763     TRUE 0.845 33.000 0.000 1.000 Y NA
 2201926 2201927 pRL120763 pRL120764     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2201928 2201929 pRL120765 pRL120766 cspA   FALSE 0.097 113.000 0.000 NA   NA
 2201931 2201932 pRL120768 pRL120769     FALSE 0.235 152.000 0.154 NA   NA
 2201934 2201935 pRL120771 pRL120772     TRUE 0.999 -3.000 0.733 0.032 Y NA
 2201935 2201936 pRL120772 pRL120773     TRUE 0.995 -3.000 0.231 1.000 Y NA
 2201936 2201937 pRL120773 pRL120774     TRUE 0.991 5.000 0.200 0.093 Y NA
 2201937 2201938 pRL120774 pRL120775     TRUE 0.989 7.000 0.200 0.093 Y NA
 2201938 2201939 pRL120775 pRL120776     TRUE 0.910 43.000 0.211 1.000 Y NA
 2201939 2201940 pRL120776 pRL120777     FALSE 0.425 85.000 0.122 1.000 N NA
 2201940 2201941 pRL120777 pRL120778     TRUE 0.965 -3.000 0.098 1.000   NA
 2201941 2201942 pRL120778 pRL120779     TRUE 0.876 19.000 0.333 1.000   NA
 2201943 2201944 pRL120780 pRL120781     TRUE 0.905 124.000 0.500 0.093 Y NA
 2201944 2201945 pRL120781 pRL120782     TRUE 0.976 10.000 0.444 0.093   NA
 2201945 2201946 pRL120782 pRL120783     TRUE 0.981 8.000 0.667 1.000   NA
 2201946 2201947 pRL120783 pRL120784     TRUE 0.993 -3.000 0.571 1.000   NA
 2201947 2201948 pRL120784 pRL120785     TRUE 0.988 13.000 0.308 0.027 Y NA
 2201949 2201950 pRL120786 pRL120787     FALSE 0.501 39.000 0.060 NA   NA
 2201950 2201951 pRL120787 pRL120789   nolR FALSE 0.003 391.000 0.000 1.000 N NA
 2201951 2201952 pRL120789 pRL120790 nolR   FALSE 0.112 198.000 0.000 0.053 N NA
 2201952 2201953 pRL120790 pRL120791     TRUE 0.999 2.000 0.727 0.014 Y NA
 2201953 2201954 pRL120791 pRL120792     TRUE 0.998 4.000 0.700 0.014 Y NA
 2201954 2201955 pRL120792 pRL120793     TRUE 0.999 -3.000 0.571 0.016 Y NA
 2201956 2201957 pRL120794 pRL120795     FALSE 0.036 181.000 0.000 NA   NA
 2201957 2201958 pRL120795 pRL120796     FALSE 0.004 327.000 0.000 NA   NA
 2201958 2201179 pRL120796 pRL120001   repA FALSE 0.008 271.000 0.000 NA   NA
 2201959 2201960 pRL90001 pRL90002 repA repB FALSE 0.180 76.000 0.000 1.000 N NA
 2201960 2201961 pRL90002 pRL90003 repB repC FALSE 0.057 156.000 0.000 NA   NA
 2201962 2201963 pRL90004 pRL90006     FALSE 0.001 519.000 0.000 NA   NA
 2201963 2201964 pRL90006 pRL90008   hemA FALSE 0.004 348.000 0.000 NA   NA
 2201964 2201965 pRL90008 pRL90009 hemA   FALSE 0.001 847.000 0.000 1.000 N NA
 2201965 1570268 pRL90009 pRL90010     FALSE 0.162 78.000 0.000 NA   NA
 1570268 2201966 pRL90010 pRL90011   ccmE TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2201966 2201967 pRL90011 pRL90012 ccmE   FALSE 0.080 136.000 0.000 1.000 N NA
 2201967 2201968 pRL90012 pRL90012A   fixS FALSE 0.320 35.000 0.007 NA N NA
 2201968 2201969 pRL90012A pRL90013 fixS fixI TRUE 0.998 -3.000 0.713 NA Y NA
 2201969 2201970 pRL90013 pRL90014 fixI fixH TRUE 0.994 -3.000 0.206 NA Y NA
 2201970 2201971 pRL90014 pRL90015 fixH fixG TRUE 0.990 -3.000 0.506 NA N NA
 2201971 2201972 pRL90015 pRL90016 fixG fixP FALSE 0.126 396.000 0.203 0.009 Y NA
 2201972 2201973 pRL90016 pRL90016A fixP fixQ TRUE 0.969 2.000 0.029 0.003 N NA
 2201973 2201974 pRL90016A pRL90017 fixQ fixO TRUE 0.911 9.000 0.000 0.003 N NA
 2201974 2201975 pRL90017 pRL90018 fixO fixN TRUE 0.911 9.000 0.000 0.003 N NA
 2201976 2201977 pRL90019 pRL90020 fixK fixL TRUE 0.985 28.000 0.667 0.097 Y NA
 2201977 2201978 pRL90020 pRL90021 fixL azuP FALSE 0.032 192.000 0.000 1.000 N NA
 2201979 2201980 pRL90022 pRL90023   hemN FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 2201983 2201984 pRL90026 pRL90027   adhA FALSE 0.012 274.000 0.000 1.000   NA
 2201984 2201985 pRL90027 pRL90028 adhA   FALSE 0.004 400.000 0.000 1.000   NA
 2201985 2201986 pRL90028 pRL90029     FALSE 0.438 16.000 0.000 NA   NA
 2201987 2201988 pRL90030 pRL90031     TRUE 0.612 13.000 0.000 1.000   NA
 2201988 2201989 pRL90031 pRL90032     TRUE 0.624 9.000 0.000 NA   NA
 2201989 2201990 pRL90032 pRL90033     FALSE 0.001 593.000 0.000 NA   NA
 2201990 2201991 pRL90033 pRL90034     FALSE 0.355 22.000 0.000 NA   NA
 2201991 2201992 pRL90034 pRL90035     TRUE 0.762 3.000 0.000 NA   NA
 2201992 2201993 pRL90035 pRL90036     FALSE 0.306 29.000 0.000 NA   NA
 2201993 1570297 pRL90036 pRL90037   amtA FALSE 0.002 452.000 0.000 NA   NA
 1570299 2201995 pRL90040 pRL90041   groEL FALSE 0.001 577.000 0.000 NA   NA
 1570301 2201996 pRL90042 pRL90043     FALSE 0.002 442.000 0.000 NA   NA
 2201996 2201997 pRL90043 pRL90044     TRUE 0.994 -3.000 0.464 0.098   NA
 2201997 2201998 pRL90044 pRL90045     TRUE 0.984 2.000 0.208 0.005   NA
 2202002 2202003 pRL90049 pRL90050     FALSE 0.076 132.000 0.000 NA   NA
 2202003 2202004 pRL90050 pRL90051     FALSE 0.004 352.000 0.000 NA   NA
 2202004 2202005 pRL90051 pRL90052     FALSE 0.455 172.000 0.069 NA Y NA
 2202006 2202007 pRL90053 pRL90054     FALSE 0.006 300.000 0.000 NA   NA
 2202007 2202008 pRL90054 pRL90055     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 2202009 2202010 pRL90056 pRL90057   uxuA TRUE 0.675 45.000 0.222 1.000 N NA
 2202012 2202013 pRL90059 pRL90060 rmrA rmrB TRUE 0.947 26.000 0.833 1.000 N NA
 2202014 2202015 pRL90061 pRL90062     TRUE 0.679 62.000 0.294 NA   NA
 2202016 2202017 pRL90063 pRL90064     FALSE 0.204 103.000 0.023 NA   NA
 2202017 2202018 pRL90064 pRL90065     FALSE 0.469 57.000 0.083 NA   NA
 2202018 2202019 pRL90065 pRL90066     FALSE 0.282 100.000 0.067 NA   NA
 2202020 2202021 pRL90067 pRL90068     FALSE 0.464 21.000 0.000 1.000   NA
 2202022 2202023 pRL90069 pRL90070     FALSE 0.320 99.000 0.095 NA   NA
 2202025 2202026 pRL90072 pRL90073     FALSE 0.315 98.000 0.054 1.000   NA
 2202026 2202027 pRL90073 pRL90074   glpD FALSE 0.373 81.000 0.071 1.000 N NA
 2202027 2202028 pRL90074 pRL90075 glpD   FALSE 0.499 42.000 0.058 1.000 N NA
 2202028 2202029 pRL90075 pRL90076     TRUE 0.998 10.000 0.865 0.009 Y NA
 2202029 2202030 pRL90076 pRL90077     TRUE 0.998 4.000 0.847 0.092 Y NA
 2202030 2202031 pRL90077 pRL90078     TRUE 0.995 16.000 0.922 0.092 Y NA
 2202031 2202032 pRL90078 pRL90079     TRUE 0.973 14.000 0.854 NA   NA
 2202032 2202033 pRL90079 pRL90080     TRUE 0.824 78.000 0.640 NA   NA
 2202033 2202034 pRL90080 pRL90081   glpK FALSE 0.142 151.000 0.034 1.000 N NA
 2202035 2202036 pRL90082 pRL90083     TRUE 0.982 3.000 0.286 0.092   NA
 2202036 2202037 pRL90083 pRL90084   rbsA TRUE 0.991 -10.000 0.778 1.000   NA
 2202037 2202038 pRL90084 pRL90085 rbsA   TRUE 0.928 65.000 0.444 NA Y NA
 2202039 2202040 pRL90087 pRL90088     FALSE 0.067 108.000 0.000 NA N NA
 2202040 2202041 pRL90088 pRL90089     FALSE 0.209 78.000 0.012 NA N NA
 2202041 2202042 pRL90089 pRL90090     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA Y NA
 2202042 2202043 pRL90090 pRL90091     TRUE 0.996 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 2202045 2202046 pRL90093 pRL90094     TRUE 0.991 -3.000 0.515 NA   NA
 2202047 2202048 pRL90095 pRL90096     TRUE 0.983 0.000 0.400 NA   NA
 2202048 2202049 pRL90096 pRL90097   pdxA FALSE 0.046 168.000 0.000 NA   NA
 2202049 2202050 pRL90097 pRL90098 pdxA   TRUE 0.682 31.000 0.167 1.000 N NA
 2202050 2202051 pRL90098 pRL90099     FALSE 0.009 358.000 0.046 1.000 N NA
 2202051 2202052 pRL90099 pRL90100     TRUE 0.828 12.000 0.108 1.000 N NA
 2202053 2202054 pRL90101 pRL90102     TRUE 0.870 120.000 0.333 0.092 Y NA
 2202054 2202055 pRL90102 pRL90103     TRUE 0.996 3.000 0.400 0.092 Y NA
 2202055 2202056 pRL90103 pRL90104     TRUE 0.999 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 2202056 2202057 pRL90104 pRL90105     TRUE 0.998 -3.000 0.273 0.003 Y NA
 2202057 2202058 pRL90105 pRL90106     TRUE 0.969 -3.000 0.118 1.000   NA
 2202058 2202059 pRL90106 pRL90107     TRUE 0.790 25.000 0.235 1.000   NA
 2202060 2202061 pRL90108 pRL90109     FALSE 0.053 164.000 0.000 1.000 N NA
 2202061 2202062 pRL90109 pRL90110     FALSE 0.258 90.000 0.024 1.000 N NA
 2202063 2202064 pRL90111 pRL90112     TRUE 0.902 74.000 0.160 0.092 Y NA
 2202064 2202065 pRL90112 pRL90113     TRUE 0.993 3.000 0.160 0.092 Y NA
 2202065 2202066 pRL90113 pRL90114     FALSE 0.502 29.000 0.027 1.000 N NA
 2202066 2202067 pRL90114 pRL90115     TRUE 0.881 4.000 0.020 1.000   NA
 2202067 2202068 pRL90115 pRL90116     FALSE 0.350 115.000 0.000 0.075   NA
 2202068 2202069 pRL90116 pRL90117     TRUE 0.740 55.000 0.306 1.000   NA
 2202070 2202071 pRL90118 pRL90119     FALSE 0.041 175.000 0.000 NA   NA
 2202073 2202074 pRL90121 pRL90122     FALSE 0.070 165.000 0.000 1.000   NA
 2202075 2202076 pRL90123 pRL90124     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.092 Y NA
 2202076 2202077 pRL90124 pRL90125     TRUE 0.996 -3.000 0.125 0.092 Y NA
 2202077 2202078 pRL90125 pRL90126     TRUE 0.919 63.000 0.182 0.092 Y NA
 2202078 2202079 pRL90126 pRL90127     TRUE 0.617 106.000 0.000 1.000 Y NA
 2202079 2202080 pRL90127 pRL90128     FALSE 0.012 272.000 0.000 1.000   NA
 2202080 2202081 pRL90128 pRL90129     FALSE 0.375 33.000 0.000 1.000   NA
 2202081 2202082 pRL90129 pRL90129A     FALSE 0.037 180.000 0.000 NA   NA
 2202083 2202084 pRL90132 pRL90133 fcl   TRUE 0.885 56.000 0.000 0.009 Y NA
 2202084 2202085 pRL90133 pRL90134     TRUE 0.796 53.000 0.000 1.000 Y NA
 2202085 2202086 pRL90134 pRL90135     TRUE 0.992 -3.000 0.045 1.000 Y NA
 2202086 2202087 pRL90135 pRL90136     TRUE 0.995 0.000 0.067 0.011 Y NA
 2202087 2202088 pRL90136 pRL90137     TRUE 0.991 -3.000 0.045 NA Y NA
 2202089 2202090 pRL90138 pRL90139 exoQ   TRUE 0.989 -3.000 0.444 NA   NA
 2202094 2202095 pRL90144 pRL90146     TRUE 0.977 8.000 0.114 1.000 Y NA
 2202095 2202096 pRL90146 pRL90147     TRUE 0.882 46.000 0.111 1.000 Y NA
 2202096 2202097 pRL90147 pRL90148     TRUE 0.920 5.000 0.111 1.000   NA
 2202099 2202100 pRL90150 pRL90151     TRUE 0.953 0.000 0.094 1.000   NA
 2202100 2202101 pRL90151 pRL90152     TRUE 0.972 -3.000 0.153 1.000   NA
 2202101 2202102 pRL90152 pRL90153     TRUE 0.812 23.000 0.250 1.000   NA
 2202102 2202103 pRL90153 pRL90154     TRUE 0.979 -3.000 0.226 1.000   NA
 2202103 2202104 pRL90154 pRL90155     TRUE 0.994 -42.000 0.511 1.000 Y NA
 2202105 2202106 pRL90156 pRL90157     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 2202106 2202107 pRL90157 pRL90158     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2202108 2202109 pRL90159 pRL90160     TRUE 0.895 51.000 0.714 NA   NA
 2202109 2202110 pRL90160 pRL90161     FALSE 0.018 217.000 0.000 NA   NA
 2202110 2202111 pRL90161 pRL90162     TRUE 0.884 40.000 0.600 NA   NA
 2202111 2202112 pRL90162 pRL90163     TRUE 0.695 74.000 0.364 NA   NA
 2202112 2202113 pRL90163 pRL90164     TRUE 0.863 44.000 0.545 NA   NA
 2202113 2202114 pRL90164 pRL90165     TRUE 0.999 -3.000 0.700 0.044 Y NA
 2202114 2202115 pRL90165 pRL90166     FALSE 0.041 194.000 0.000 1.000   NA
 2202115 2202116 pRL90166 pRL90167     FALSE 0.345 23.000 0.000 NA   NA
 2202119 2202120 pRL90170 pRL90171     FALSE 0.042 179.000 0.000 1.000 N NA
 2202120 2202121 pRL90171 pRL90172     FALSE 0.072 246.000 0.000 0.007   NA
 2202122 2202123 pRL90173 pRL90174   adc TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2202123 2202124 pRL90174 pRL90175 adc bdhA TRUE 0.942 12.000 0.000 1.000 Y NA
 2202126 2202127 pRL90179 pRL90180 pepI   TRUE 0.829 66.000 0.520 1.000   NA
 2202128 2202129 pRL90181 pRL90182 pip   TRUE 0.784 52.000 0.368 1.000   NA
 2202129 2202130 pRL90182 pRL90183     TRUE 0.996 -3.000 0.158 0.092 Y NA
 2202130 2202131 pRL90183 pRL90184     TRUE 0.974 -3.000 0.174 1.000   NA
 2202131 2202132 pRL90184 pRL90185     TRUE 0.879 20.000 0.357 1.000   NA
 2202133 2202134 pRL90186 pRL90187     FALSE 0.062 156.000 0.000 1.000 N NA
 2202134 2202135 pRL90187 pRL90188     TRUE 0.851 31.000 0.000 1.000 Y NA
 2202135 2202136 pRL90188 pRL90189     TRUE 0.643 17.000 0.016 1.000   NA
 2202136 2202137 pRL90189 pRL90190     TRUE 0.889 3.000 0.016 1.000   NA
 2202137 2202138 pRL90190 pRL90191     TRUE 0.996 -3.000 0.111 0.092 Y NA
 2202138 2202139 pRL90191 pRL90192     TRUE 0.910 60.000 0.111 0.092 Y NA
 2202139 2202140 pRL90192 pRL90193     TRUE 0.710 95.000 0.500 1.000 N NA
 2202141 2202142 pRL90194 pRL90195     TRUE 0.891 -7.000 0.032 NA   NA
 2202144 2202145 pRL90197 pRL90198 uspF   TRUE 0.571 148.000 0.500 1.000   NA
 2202145 2202146 pRL90198 pRL90199     TRUE 0.995 -3.000 0.750 1.000   NA
 2202147 2202148 pRL90200 pRL90201     TRUE 0.994 -3.000 0.595 1.000   NA
 2202148 2202149 pRL90201 pRL90202     TRUE 0.995 -3.000 0.246 1.000 Y NA
 2202150 2202151 pRL90203 pRL90204     TRUE 0.912 9.000 0.188 1.000   NA
 2202151 2202152 pRL90204 pRL90205     TRUE 0.978 -3.000 0.208 1.000   NA
 2202152 2202153 pRL90205 pRL90206     TRUE 0.993 -10.000 0.864 1.000   NA
 2202153 2202154 pRL90206 pRL90207     TRUE 0.997 0.000 0.976 0.092   NA
 2202154 2202155 pRL90207 pRL90208   codA TRUE 0.731 25.000 0.151 1.000   NA
 2202156 2202157 pRL90209 pRL90210     FALSE 0.221 28.000 0.000 NA N NA
 2202160 2202161 pRL90213 pRL90214     TRUE 0.995 0.000 0.143 0.092 Y NA
 2202161 2202162 pRL90214 pRL90215     TRUE 0.999 -3.000 0.560 0.092 Y NA
 2202162 2202163 pRL90215 pRL90216     TRUE 0.812 26.000 0.120 0.092 N NA
 2202164 2202165 pRL90217 pRL90218     TRUE 0.620 105.000 0.000 1.000 Y NA
 2202165 2202166 pRL90218 pRL90219     FALSE 0.350 25.000 0.000 1.000 N NA
 2202166 2202167 pRL90219 pRL90220     TRUE 0.911 3.000 0.043 1.000   NA
 2202167 2202168 pRL90220 pRL90221     FALSE 0.269 36.000 0.000 NA   NA
 2202168 2202169 pRL90221 pRL90222     TRUE 0.916 37.000 0.733 NA   NA
 2202169 2202170 pRL90222 pRL90223     TRUE 0.980 5.000 0.526 1.000   NA
 2202170 2202171 pRL90223 pRL90224     TRUE 0.994 -3.000 0.632 1.000   NA
 2202171 2202172 pRL90224 pRL90225     TRUE 0.984 -3.000 0.323 NA   NA
 2202172 2202173 pRL90225 pRL90226     TRUE 0.629 38.000 0.194 NA N NA
 2202173 2202174 pRL90226 pRL90227     FALSE 0.081 134.000 0.000 1.000 N NA
 2202174 2202175 pRL90227 pRL90228     TRUE 0.994 12.000 0.571 0.092 Y NA
 2202175 2202176 pRL90228 pRL90229     TRUE 0.997 4.000 0.692 1.000 Y NA
 2202176 2202177 pRL90229 pRL90230     TRUE 0.997 -3.000 0.180 0.003 Y NA
 2202177 2202178 pRL90230 pRL90231     TRUE 0.783 100.000 0.180 1.000 Y NA
 2202178 2202179 pRL90231 pRL90232     TRUE 0.646 34.000 0.143 1.000 N NA
 2202179 2202180 pRL90232 pRL90233     FALSE 0.006 307.000 0.000 1.000 N NA
 2202180 2202181 pRL90233 pRL90234     TRUE 0.999 -3.000 0.818 0.092 Y NA
 2202181 2202182 pRL90234 pRL90235     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.092 Y NA
 2202182 2202183 pRL90235 pRL90237     FALSE 0.452 315.000 0.700 0.092 Y NA
 2202183 2202184 pRL90237 pRL90238     TRUE 0.938 63.000 0.500 NA Y NA
 2202184 2202185 pRL90238 pRL90239     TRUE 0.956 12.000 0.520 NA   NA
 2202186 2202187 pRL90240 pRL90241     TRUE 0.722 -19.000 0.000 NA   NA
 2202190 2202191 pRL90244 pRL90245     FALSE 0.318 79.000 0.065 NA N NA
 2202192 2202193 pRL90246 pRL90247     TRUE 0.999 -3.000 0.952 1.000 Y NA
 2202193 2202194 pRL90247 pRL90248     TRUE 0.693 17.000 0.066 1.000 N NA
 2202194 2202195 pRL90248 pRL90249     FALSE 0.243 168.000 0.231 1.000 N NA
 2202195 2202196 pRL90249 pRL90250     TRUE 0.976 41.000 0.545 0.092 Y NA
 2202196 2202197 pRL90250 pRL90251     TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.092 Y NA
 2202197 2202198 pRL90251 pRL90252     TRUE 0.999 -3.000 0.778 1.000 Y NA
 2202198 2202199 pRL90252 pRL90253     TRUE 0.999 -3.000 0.556 0.032 Y NA
 2202199 2202200 pRL90253 pRL90254     TRUE 0.988 -6.000 0.075 1.000 Y NA
 2202201 2202202 pRL90255 pRL90256     TRUE 0.853 53.000 0.062 1.000 Y NA
 2202203 2202204 pRL90257 pRL90258     FALSE 0.332 115.000 0.150 1.000 N NA
 2202204 2202205 pRL90258 pRL90259     TRUE 0.929 64.000 0.409 1.000 Y NA
 2202205 2202206 pRL90259 pRL90260     TRUE 0.999 -3.000 0.913 0.092 Y NA
 2202206 2202207 pRL90260 pRL90261     TRUE 0.999 -3.000 0.913 1.000 Y NA
 2202207 2202208 pRL90261 pRL90262     TRUE 0.999 -3.000 0.913 0.032 Y NA
 2202208 2202209 pRL90262 pRL90263     FALSE 0.029 197.000 0.000 1.000 N NA
 2202210 2202211 pRL90264 pRL90265     TRUE 0.981 0.000 0.364 1.000 N NA
 2202211 2202212 pRL90265 pRL90266     TRUE 0.968 -16.000 0.364 1.000 N NA
 2202212 2202213 pRL90266 pRL90267     TRUE 0.949 0.000 0.105 1.000 N NA
 2202213 2202214 pRL90267 pRL90268     TRUE 0.996 0.000 0.789 0.092 N NA
 2202214 2202215 pRL90268 pRL90269     TRUE 0.999 -3.000 0.775 0.092 Y NA
 2202215 2202216 pRL90269 pRL90270     TRUE 0.917 60.000 0.150 0.092 Y NA
 2202217 2202218 pRL90271 pRL90272     FALSE 0.249 85.000 0.017 NA   NA
 2202220 2202221 pRL90274 pRL90275     FALSE 0.018 194.000 0.000 NA N NA
 2202221 2202222 pRL90275 pRL90276     TRUE 0.845 5.000 0.025 1.000 N NA
 2202222 2202223 pRL90276 pRL90277     TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.005 Y NA
 2202223 2202224 pRL90277 pRL90278     TRUE 0.800 76.000 0.059 1.000 Y NA
 2202224 2202225 pRL90278 pRL90279   appB TRUE 0.998 7.000 0.953 0.039 Y NA
 2202225 2202226 pRL90279 pRL90280 appB   FALSE 0.002 408.000 0.000 1.000 N NA
 2202226 2202227 pRL90280 pRL90281     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 2202228 2202229 pRL90282 pRL90283     TRUE 0.770 39.000 0.292 1.000   NA
 2202229 2202230 pRL90283 pRL90284     TRUE 0.978 13.000 0.148 0.092 Y NA
 2202230 2202231 pRL90284 pRL90285     TRUE 0.999 -3.000 0.926 0.092 Y NA
 2202231 2202232 pRL90285 pRL90286     TRUE 0.924 90.000 0.370 0.092 Y NA
 2202233 2202234 pRL90287 pRL90288     FALSE 0.003 394.000 0.000 1.000 N NA
 2202234 2202235 pRL90288 pRL90289     TRUE 0.976 66.000 0.719 0.092 Y NA
 2202235 2202236 pRL90289 pRL90290     TRUE 0.999 -3.000 0.797 1.000 Y NA
 2202236 2202237 pRL90290 pRL90291     TRUE 0.983 -3.000 0.314 NA   NA
 2202237 2202238 pRL90291 pRL90292     TRUE 0.982 12.000 0.931 NA   NA
 2202238 2202239 pRL90292 pRL90293     TRUE 0.991 4.000 0.835 NA   NA
 2202239 2202240 pRL90293 pRL90294     TRUE 0.992 2.000 0.437 0.000 N NA
 2202241 2202242 pRL90295 pRL90296     TRUE 0.758 46.000 0.333 NA   NA
 2202242 2202243 pRL90296 pRL90297     TRUE 0.957 11.000 0.238 0.046   NA
 2202247 2202248 pRL90301 pRL90302     TRUE 0.995 -25.000 0.565 1.000 Y NA
 2202248 2202249 pRL90302 pRL90303     TRUE 0.998 -3.000 0.560 NA Y NA
 2202249 2202250 pRL90303 pRL90304     FALSE 0.012 245.000 0.000 NA   NA
 2202250 2202251 pRL90304 pRL90305     FALSE 0.026 220.000 0.000 1.000   NA
 1570560 2202253 pRL90309 pRL90310     FALSE 0.060 153.000 0.000 NA   NA
 2202253 2202254 pRL90310 pRL90311     TRUE 0.988 -10.000 0.627 1.000   NA
 2202254 2202255 pRL90311 pRL90312     TRUE 0.994 -3.000 0.680 1.000 N NA
 2202256 2202257 pRL90314 pRL90315     FALSE 0.029 214.000 0.000 1.000   NA
 2202258 2202259 pRL90316 pRL90317     FALSE 0.126 94.000 0.000 NA   NA
 2202259 2202260 pRL90317 pRL90318   ohr TRUE 0.624 9.000 0.000 NA   NA
 2202260 2202261 pRL90318 pRL90319 ohr   FALSE 0.001 716.000 0.000 NA   NA
 2202261 2202262 pRL90319 pRL90320     FALSE 0.004 353.000 0.000 NA   NA
 2202263 1570573 pRL90321 pRL90322 cspA   FALSE 0.056 157.000 0.000 NA   NA
 2206964 2206965 pRL100001 pRL100002 repA repB TRUE 0.992 -3.000 0.556 1.000 N NA
 2206965 2206966 pRL100002 pRL100003 repB repC FALSE 0.257 200.000 0.429 NA   NA
 2206966 1575375 pRL100003 pRL100004 repC   FALSE 0.291 32.000 0.000 NA   NA
 2206967 2206968 pRL100005 pRL100006     TRUE 0.971 -3.000 0.182 NA   NA
 2206968 2206969 pRL100006 pRL100007     FALSE 0.087 119.000 0.000 NA   NA
 2206969 2206970 pRL100007 pRL100008     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2206970 2206971 pRL100008 pRL100009     TRUE 0.974 12.000 0.750 NA   NA
 2206971 2206972 pRL100009 pRL100010     TRUE 0.986 -3.000 0.375 NA   NA
 2206973 2206974 pRL100011 pRL100012     FALSE 0.079 127.000 0.000 NA   NA
 2206974 2206975 pRL100012 pRL100013     TRUE 0.948 -13.000 0.231 NA   NA
 2206977 2206978 pRL100015 pRL100016     FALSE 0.086 120.000 0.000 NA   NA
 2206979 2206980 pRL100017 pRL100018   tniB TRUE 0.996 -3.000 0.833 NA   NA
 2206980 2206981 pRL100018 pRL100019 tniB tniA TRUE 0.795 -6.000 0.000 NA   NA
 2206983 2206984 pRL100022 pRL100022A     FALSE 0.075 133.000 0.000 NA   NA
 2206984 2206985 pRL100022A pRL100023     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 2206985 2206986 pRL100023 pRL100024     TRUE 0.732 -15.000 0.000 NA   NA
 2206986 2206987 pRL100024 pRL100025     FALSE 0.095 114.000 0.000 NA   NA
 2206987 2206988 pRL100025 pRL100026     FALSE 0.244 45.000 0.000 NA   NA
 2206989 2206990 pRL100027 pRL100028     TRUE 0.875 0.000 0.000 1.000   NA
 2206990 2206991 pRL100028 pRL100029     TRUE 0.981 -3.000 0.286 NA   NA
 2206991 2206992 pRL100029 pRL100030     TRUE 0.987 4.000 0.700 NA   NA
 2206992 2206993 pRL100030 pRL100031     TRUE 0.986 3.000 0.600 NA   NA
 1575405 2206995 pRL100033 pRL100035     FALSE 0.126 94.000 0.000 NA   NA
 2206995 2206996 pRL100035 pRL100036     TRUE 0.946 16.000 0.565 1.000   NA
 2206996 2206997 pRL100036 pRL100037     FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 2206999 2207000 pRL100039 pRL100040     FALSE 0.235 48.000 0.000 NA   NA
 2207000 2207001 pRL100040 pRL100041     FALSE 0.162 78.000 0.000 NA   NA
 2207002 1575414 pRL100042 pRL100043     TRUE 0.577 11.000 0.000 NA   NA
 1575414 1575415 pRL100043 pRL100044     TRUE 0.762 3.000 0.000 NA   NA
 2207003 2207004 pRL100046 pRL100047     TRUE 0.957 7.000 0.116 0.044   NA
 2207005 2207006 pRL100048 pRL100049     TRUE 0.993 0.000 0.000 0.007 Y NA
 2207006 2207007 pRL100049 pRL100050     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 2207008 2207009 pRL100051 pRL100052   cspA FALSE 0.006 299.000 0.000 NA   NA
 2207012 2207013 pRL100054 pRL100055     FALSE 0.434 24.000 0.000 1.000   NA
 2207013 2207014 pRL100055 pRL100056     TRUE 0.951 20.000 0.231 1.000 Y NA
 2207016 2207017 pRL100058 pRL100059     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 2207018 2207019 pRL100062 pRL100063     TRUE 0.990 -18.000 0.077 0.091 Y NA
 2207020 2207021 pRL100064 pRL100065     FALSE 0.401 18.000 0.000 NA   NA
 2207021 2207022 pRL100065 pRL100066     FALSE 0.280 38.000 0.000 1.000 N NA
 2207022 2207023 pRL100066 pRL100067     TRUE 0.756 4.000 0.000 1.000 N NA
 2207023 2207024 pRL100067 pRL100068     FALSE 0.358 24.000 0.000 1.000 N NA
 2207024 2207025 pRL100068 pRL100069     TRUE 0.745 0.000 0.000 NA N NA
 2207025 2207026 pRL100069 pRL100070     FALSE 0.310 17.000 0.000 NA N NA
 2207026 2207027 pRL100070 pRL100071     TRUE 0.980 2.000 0.000 1.000 Y NA
 2207027 2207028 pRL100071 pRL100072     TRUE 0.791 55.000 0.000 1.000 Y NA
 2207028 2207029 pRL100072 pRL100074     FALSE 0.002 594.000 0.000 1.000   NA
 2207030 2207031 pRL100075 pRL100076     FALSE 0.017 249.000 0.000 1.000   NA
 2207031 2207032 pRL100076 pRL100077     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 2207034 2207035 pRL100079 pRL100080 proV proW TRUE 0.943 23.000 0.055 0.097 Y NA
 2207035 2207036 pRL100080 pRL100081 proW otaC TRUE 0.909 65.000 0.125 0.091 Y NA
 2207036 2207037 pRL100081 pRL100082 otaC   FALSE 0.249 71.000 0.000 1.000   NA
 2207037 2207038 pRL100082 pRL100083     FALSE 0.230 50.000 0.000 NA   NA
 2207038 1575455 pRL100083 pRL100084     FALSE 0.006 307.000 0.000 NA   NA
 2207039 2207040 pRL100086 pRL100087   acdS FALSE 0.009 269.000 0.000 NA   NA
 2207041 2207042 pRL100088 pRL100089     TRUE 0.982 -28.000 0.615 NA   NA
 2207042 1575460 pRL100089 pRL100090     FALSE 0.009 263.000 0.000 NA   NA
 2207043 1575463 pRL100093 pRL100093A     FALSE 0.159 79.000 0.000 NA   NA
 1575463 1575464 pRL100093A pRL100094     FALSE 0.090 117.000 0.000 NA   NA
 1575464 2207044 pRL100094 pRL100095     FALSE 0.330 25.000 0.000 NA   NA
 2207044 1575466 pRL100095 pRL100096     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207045 2207046 pRL100097 pRL100098     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207046 2207047 pRL100098 pRL100099     TRUE 0.888 38.000 0.600 NA   NA
 2207047 1575470 pRL100099 pRL100100     FALSE 0.076 131.000 0.000 NA   NA
 1575471 1575472 pRL100100A pRL100101     FALSE 0.001 547.000 0.000 NA   NA
 1575472 2207048 pRL100101 pRL100103     FALSE 0.201 61.000 0.000 NA   NA
 2207048 2207049 pRL100103 pRL100104     TRUE 0.947 -3.000 0.057 NA   NA
 2207049 2207050 pRL100104 pRL100105     TRUE 0.954 4.000 0.258 NA   NA
 2207050 2207051 pRL100105 pRL100106     FALSE 0.067 147.000 0.000 NA   NA
 2207051 2207052 pRL100106 pRL100107     FALSE 0.274 35.000 0.000 NA   NA
 2207052 2207053 pRL100107 pRL100108     FALSE 0.155 81.000 0.000 NA   NA
 2207053 2207054 pRL100108 pRL100109   repA FALSE 0.003 380.000 0.000 NA   NA
 2207054 2207055 pRL100109 pRL100110 repA   FALSE 0.082 124.000 0.000 NA   NA
 2207056 2207057 pRL100111 pRL100112     FALSE 0.299 101.000 0.083 NA   NA
 2207058 2207059 pRL100113 pRL100114     FALSE 0.438 16.000 0.000 NA   NA
 2207059 1575485 pRL100114 pRL100115     FALSE 0.237 47.000 0.000 NA   NA
 1575485 1575486 pRL100115 pRL100117     FALSE 0.080 125.000 0.000 NA   NA
 1575486 2207060 pRL100117 pRL100119     FALSE 0.009 267.000 0.000 NA   NA
 2207060 2207061 pRL100119 pRL100120     FALSE 0.244 45.000 0.000 NA   NA
 2207061 2207062 pRL100120 pRL100121   acsA FALSE 0.112 102.000 0.000 NA   NA
 2207062 2207063 pRL100121 pRL100122 acsA adk FALSE 0.113 107.000 0.000 1.000 N NA
 2207063 2207064 pRL100122 pRL100123 adk   FALSE 0.001 716.000 0.000 NA   NA
 2207065 2207066 pRL100124 pRL100125     TRUE 0.869 22.000 0.000 NA Y NA
 2207066 2207067 pRL100125 pRL100126     TRUE 0.969 -19.000 0.000 NA Y NA
 2207067 2207068 pRL100126 pRL100126A     FALSE 0.028 193.000 0.000 NA   NA
 2207068 2207069 pRL100126A pRL100127     TRUE 0.661 7.000 0.000 NA   NA
 2207069 2207070 pRL100127 pRL100128     TRUE 0.990 -43.000 0.123 0.031 Y NA
 2207070 2207071 pRL100128 pRL100129     TRUE 0.999 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 2207071 2207072 pRL100129 pRL100130     TRUE 0.996 -3.000 0.104 0.091 Y NA
 2207072 2207073 pRL100130 pRL100131     TRUE 0.716 104.000 0.104 NA Y NA
 2207076 2207077 pRL100134 pRL100135 gabD   TRUE 0.984 11.000 0.151 0.074 Y NA
 2207077 2207078 pRL100135 pRL100136     TRUE 0.540 49.000 0.075 1.000   NA
 2207078 2207079 pRL100136 pRL100137   metX FALSE 0.067 168.000 0.000 1.000   NA
 2207079 2207080 pRL100137 pRL100138 metX   FALSE 0.003 384.000 0.000 1.000 N NA
 2207081 2207082 pRL100139 pRL100140     TRUE 0.754 -10.000 0.000 NA   NA
 1575510 1575511 pRL100141 pRL100142     FALSE 0.002 430.000 0.000 NA   NA
 1575511 1575512 pRL100142 pRL100143     FALSE 0.050 162.000 0.000 NA   NA
 1575512 2207083 pRL100143 pRL100144     FALSE 0.003 374.000 0.000 NA   NA
 2207083 2207084 pRL100144 pRL100145     TRUE 0.987 0.000 0.440 1.000   NA
 2207084 2207085 pRL100145 pRL100146     FALSE 0.001 927.000 0.000 NA   NA
 2207085 2207086 pRL100146 pRL100147     FALSE 0.077 130.000 0.000 NA   NA
 2207087 2207088 pRL100148 pRL100149 thiC   FALSE 0.002 406.000 0.000 NA   NA
 2207088 2207089 pRL100149 pRL100150     FALSE 0.005 312.000 0.000 NA   NA
 2207091 2207092 pRL100152 pRL100153     TRUE 0.913 14.000 0.116 0.043   NA
 2207092 2207093 pRL100153 pRL100154     FALSE 0.067 147.000 0.000 NA   NA
 2207095 1575526 pRL100156 pRL100157 fdxB   FALSE 0.192 66.000 0.000 NA   NA
 1575526 2207096 pRL100157 pRL100158   nifN FALSE 0.173 74.000 0.000 NA   NA
 2207096 2207097 pRL100158 pRL100159 nifN nifE TRUE 0.974 55.000 0.475 0.001 Y NA
 2207097 2207098 pRL100159 pRL100160 nifE nifK TRUE 0.968 54.000 0.380 0.001 Y NA
 2207098 2207099 pRL100160 pRL100161 nifK nifD TRUE 0.981 91.000 0.902 0.000 Y NA
 2207099 2207100 pRL100161 pRL100162 nifD nifH TRUE 0.549 103.000 0.033 0.000 N NA
 2207100 2207101 pRL100162 pRL100162A nifH   FALSE 0.001 715.000 0.000 NA   NA
 2207101 2207102 pRL100162A pRL100163     TRUE 0.801 1.000 0.000 NA   NA
 2207102 2207103 pRL100163 pRL100164     FALSE 0.002 591.000 0.000 1.000   NA
 2207104 2207105 pRL100165 pRL100166     TRUE 0.913 14.000 0.116 0.043   NA
 2207105 2207106 pRL100166 pRL100167     FALSE 0.002 400.000 0.000 NA   NA
 2207106 2207107 pRL100167 pRL100168     TRUE 0.982 -24.000 0.136 NA Y NA
 2207107 2207108 pRL100168 pRL100169   rhiA FALSE 0.001 514.000 0.000 NA   NA
 2207108 2207109 pRL100169 pRL100170 rhiA rhiB FALSE 0.230 50.000 0.000 NA   NA
 2207109 2207110 pRL100170 pRL100171 rhiB rhiC FALSE 0.137 89.000 0.000 NA   NA
 2207111 2207112 pRL100172 pRL100173 rhiR   FALSE 0.002 498.000 0.000 1.000 N NA
 2207112 2207113 pRL100173 pRL100174     FALSE 0.002 438.000 0.000 NA   NA
 2207114 1575546 pRL100175 pRL100176 nodO   FALSE 0.014 234.000 0.000 NA   NA
 1575546 2207115 pRL100176 pRL100177     FALSE 0.002 474.000 0.000 NA   NA
 2207116 2207117 pRL100178 pRL100179 nodT nodN FALSE 0.050 168.000 0.000 1.000 N NA
 2207117 2207118 pRL100179 pRL100180 nodN nodM FALSE 0.287 78.000 0.018 1.000 N NA
 2207118 2207119 pRL100180 pRL100181 nodM nodL FALSE 0.002 572.000 0.000 1.000   NA
 2207119 2207120 pRL100181 pRL100182 nodL nodE FALSE 0.002 594.000 0.000 1.000   NA
 2207120 2207121 pRL100182 pRL100183 nodE nodF TRUE 0.993 1.000 0.800 1.000   NA
 2207121 2207122 pRL100183 pRL100184 nodF nodD FALSE 0.002 645.000 0.000 1.000   NA
 2207123 2207124 pRL100185 pRL100186 nodA nodB TRUE 0.964 -3.000 0.091 1.000   NA
 2207124 2207125 pRL100186 pRL100187 nodB nodC TRUE 0.693 23.000 0.120 1.000 N NA
 2207125 2207126 pRL100187 pRL100188 nodC nodI TRUE 0.571 38.000 0.096 1.000 N NA
 2207126 2207127 pRL100188 pRL100189 nodI nodJ TRUE 0.993 4.000 0.082 0.001 Y NA
 2207128 2207129 pRL100190 pRL100191     TRUE 0.783 50.000 0.000 NA Y NA
 2207129 2207130 pRL100191 pRL100192     FALSE 0.049 164.000 0.000 NA   NA
 2207130 2207131 pRL100192 pRL100193     FALSE 0.417 146.000 0.333 NA   NA
 2207131 2207132 pRL100193 pRL100194     FALSE 0.006 299.000 0.000 NA   NA
 2207132 2207133 pRL100194 pRL100195   nifB FALSE 0.001 556.000 0.000 NA   NA
 2207133 2207134 pRL100195 pRL100196 nifB nifA FALSE 0.253 196.000 0.071 0.001   NA
 2207134 2207135 pRL100196 pRL100197 nifA fixX FALSE 0.066 196.000 0.039 1.000 N NA
 2207135 2207136 pRL100197 pRL100198 fixX fixC TRUE 0.992 12.000 0.461 0.038 Y NA
 2207136 2207137 pRL100198 pRL100199 fixC fixB TRUE 0.997 -13.000 0.491 0.038 Y NA
 2207137 2207138 pRL100199 pRL100200 fixB fixA TRUE 0.982 18.000 0.330 0.009 Y NA
 2207139 2207140 pRL100201 pRL100202     TRUE 0.979 4.000 0.500 NA   NA
 1575574 2207142 pRL100204 pRL100205   fixN FALSE 0.005 313.000 0.000 NA   NA
 2207142 2207143 pRL100205 pRL100206 fixN fixO TRUE 0.911 9.000 0.000 0.003 N NA
 2207143 2207144 pRL100206 pRL100206A fixO fixQ TRUE 0.911 9.000 0.000 0.003 N NA
 2207144 2207145 pRL100206A pRL100207 fixQ fixP TRUE 0.969 2.000 0.029 0.003 N NA
 2207145 2207146 pRL100207 pRL100208 fixP fixG FALSE 0.147 374.000 0.203 0.009 Y NA
 2207146 2207147 pRL100208 pRL100209 fixG fixH TRUE 0.990 -3.000 0.506 NA N NA
 2207147 2207148 pRL100209 pRL100210 fixH fixI TRUE 0.994 -3.000 0.206 NA Y NA
 2207148 2207149 pRL100210 pRL100210A fixI fixS TRUE 0.998 -3.000 0.713 NA Y NA
 2207149 2207150 pRL100210A pRL100211 fixS   FALSE 0.333 33.000 0.007 NA N NA
 2207151 2207152 pRL100211A pRL100212     TRUE 0.922 -713.000 0.000 0.052   NA
 2207152 2207153 pRL100212 pRL100213     FALSE 0.002 438.000 0.000 NA   NA
 2207154 2207155 pRL100214 pRL100215     FALSE 0.005 269.000 0.000 NA N NA
 2207156 2207157 pRL100216 pRL100217     FALSE 0.080 125.000 0.000 NA   NA
 2207157 2207158 pRL100217 pRL100218     TRUE 0.982 -3.000 0.300 NA   NA
 2207159 2207160 pRL100219 pRL100220 traA   FALSE 0.002 483.000 0.000 NA   NA
 2207160 2207161 pRL100220 pRL100221     TRUE 0.854 -136.000 0.050 NA   NA
 2207163 2207164 pRL100223 pRL100224     TRUE 0.969 26.000 0.526 NA Y NA
 2207164 2207165 pRL100224 pRL100225     TRUE 0.908 18.000 0.421 1.000   NA
 2207165 2207166 pRL100225 pRL100226     TRUE 0.992 -3.000 0.500 1.000   NA
 2207166 2207167 pRL100226 pRL100227     FALSE 0.348 38.000 0.000 1.000   NA
 2207167 2207168 pRL100227 pRL100228     TRUE 0.829 93.000 0.045 0.090 Y NA
 2207168 2207169 pRL100228 pRL100229     TRUE 0.931 68.000 0.211 0.011 Y NA
 2207169 2207170 pRL100229 pRL100230     TRUE 0.829 17.000 0.263 NA N NA
 2207170 2207171 pRL100230 pRL100231     TRUE 0.778 56.000 0.444 NA N NA
 2207171 2207172 pRL100231 pRL100232     FALSE 0.315 178.000 0.333 1.000   NA
 2207174 2207175 pRL100234 pRL100235     TRUE 0.993 -3.000 0.600 NA   NA
 2207175 2207176 pRL100235 pRL100236     TRUE 0.979 4.000 0.500 NA   NA
 2207177 2207178 pRL100237 pRL100238     TRUE 0.999 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 2207178 2207179 pRL100238 pRL100239     TRUE 0.915 57.000 0.302 1.000 Y NA
 2207180 2207181 pRL100240 pRL100241     FALSE 0.191 198.000 0.267 1.000   NA
 2207181 2207182 pRL100241 pRL100242     FALSE 0.002 417.000 0.000 NA   NA
 2207182 2207183 pRL100242 pRL100243     TRUE 0.943 16.000 0.582 NA   NA
 2207183 2207184 pRL100243 pRL100244     TRUE 0.983 -3.000 0.273 1.000   NA
 2207184 2207185 pRL100244 pRL100245     TRUE 0.990 -3.000 0.452 1.000   NA
 2207185 2207186 pRL100245 pRL100246     TRUE 0.995 5.000 0.548 1.000 Y NA
 2207186 2207187 pRL100246 pRL100247     TRUE 0.955 6.000 0.333 NA   NA
 2207187 2207188 pRL100247 pRL100248     FALSE 0.244 45.000 0.000 NA   NA
 2207188 2207189 pRL100248 pRL100249     TRUE 0.717 114.000 0.000 0.090 Y NA
 2207189 2207190 pRL100249 pRL100250     TRUE 0.999 2.000 0.852 0.090 Y NA
 2207190 2207191 pRL100250 pRL100251     TRUE 0.999 -3.000 0.815 0.090 Y NA
 2207191 2207192 pRL100251 pRL100252   gabD TRUE 0.874 11.000 0.167 1.000 N NA
 2207192 2207193 pRL100252 pRL100253 gabD   FALSE 0.005 356.000 0.000 1.000   NA
 2207193 2207194 pRL100253 pRL100255     FALSE 0.001 527.000 0.000 NA   NA
 2207195 2207196 pRL100256 pRL100257     TRUE 0.995 5.000 0.389 0.090 Y NA
 2207196 2207197 pRL100257 pRL100258     TRUE 0.998 -3.000 0.389 0.090 Y NA
 2207197 2207198 pRL100258 pRL100259     TRUE 0.976 75.000 0.778 0.090 Y NA
 2207198 2207199 pRL100259 pRL100260     TRUE 0.870 38.000 0.500 1.000   NA
 2207202 2207203 pRL100263 pRL100264     TRUE 0.979 85.000 1.000 0.090 Y NA
 2207203 2207204 pRL100264 pRL100265     TRUE 0.999 0.000 1.000 0.090 Y NA
 2207204 2207205 pRL100265 pRL100266     TRUE 0.930 27.000 0.667 1.000   NA
 2207205 2207206 pRL100266 pRL100267     TRUE 0.926 10.000 0.250 1.000   NA
 2207210 2207211 pRL100271 pRL100273     FALSE 0.003 361.000 0.000 NA   NA
 2207212 2207213 pRL100274 pRL100275     FALSE 0.144 91.000 0.000 1.000 N NA
 2207214 2207215 pRL100276 pRL100277     TRUE 0.749 103.000 0.000 0.090 Y NA
 2207215 2207216 pRL100277 pRL100278     TRUE 0.962 13.000 0.000 0.090 Y NA
 2207216 2207217 pRL100278 pRL100279     TRUE 0.977 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 2207217 2207218 pRL100279 pRL100280     TRUE 0.998 0.000 0.500 0.003 Y NA
 2207218 2207219 pRL100280 pRL100281     TRUE 0.938 0.000 0.071 1.000 N NA
 2207219 2207220 pRL100281 pRL100282     FALSE 0.508 70.000 0.107 1.000   NA
 2207220 2207221 pRL100282 pRL100283     TRUE 0.689 -58.000 0.000 NA   NA
 2207221 2207222 pRL100283 pRL100284     TRUE 0.894 5.000 0.118 NA N NA
 2207222 2207223 pRL100284 pRL100285     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2207224 2207225 pRL100286 pRL100287     TRUE 0.745 0.000 0.000 NA N NA
 2207226 2207227 pRL100288 pRL100289     TRUE 0.988 3.000 0.162 1.000 Y NA
 2207227 2207228 pRL100289 pRL100290     FALSE 0.008 276.000 0.000 1.000 N NA
 2207228 2207229 pRL100290 pRL100291     FALSE 0.002 470.000 0.000 1.000 N NA
 2207230 2207231 pRL100292 pRL100293     TRUE 0.964 -3.000 0.120 1.000 N NA
 2207231 2207232 pRL100293 pRL100294   mccc1 TRUE 0.994 0.000 0.060 0.073 Y NA
 2207232 2207233 pRL100294 pRL100295 mccc1 mccc2 TRUE 0.997 -3.000 0.158 0.000 Y NA
 2207233 2207234 pRL100295 pRL100296 mccc2 ivdH TRUE 0.996 -3.000 0.316 1.000 Y NA
 2207235 2207236 pRL100297 pRL100298     TRUE 0.754 -10.000 0.000 NA   NA
 2207238 2207239 pRL100300 pRL100301     TRUE 0.977 24.000 0.575 1.000 Y NA
 2207239 2207240 pRL100301 pRL100302     TRUE 0.981 17.000 0.529 1.000 Y NA
 2207240 2207241 pRL100302 pRL100303     FALSE 0.358 66.000 0.029 1.000 N NA
 2207241 2207242 pRL100303 pRL100304     TRUE 0.998 2.000 0.558 0.000 Y NA
 2207242 2207243 pRL100304 pRL100305     TRUE 0.992 4.000 0.152 0.073 Y NA
 2207243 2207244 pRL100305 pRL100306   lpdV TRUE 0.992 6.000 0.457 1.000 Y NA
 2207244 1575678 pRL100306 pRL100307 lpdV   FALSE 0.051 161.000 0.000 NA   NA
 1575678 1575679 pRL100307 pRL100308     TRUE 0.795 -6.000 0.000 NA   NA
 1575679 2207245 pRL100308 pRL100309     FALSE 0.001 516.000 0.000 NA   NA
 1575681 2207246 pRL100310 pRL100311     FALSE 0.080 125.000 0.000 NA   NA
 2207246 2207247 pRL100311 pRL100312     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2207247 2207248 pRL100312 pRL100313     TRUE 0.940 -3.000 0.015 1.000   NA
 2207248 2207249 pRL100313 pRL100313A     TRUE 0.722 -19.000 0.000 NA   NA
 2207249 2207250 pRL100313A pRL100314     FALSE 0.077 130.000 0.000 NA   NA
 2207251 2207252 pRL100314A pRL100316     FALSE 0.251 42.000 0.000 NA   NA
 2207254 2207255 pRL100318 pRL100319     TRUE 0.975 0.000 0.286 NA   NA
 2207256 2207257 pRL100320 pRL100321 phnA   FALSE 0.022 210.000 0.000 NA   NA
 2207257 2207258 pRL100321 pRL100322     TRUE 0.977 -3.000 0.241 NA   NA
 2207259 2207260 pRL100323 pRL100324     FALSE 0.006 299.000 0.000 NA   NA
 2207260 2207261 pRL100324 pRL100325     FALSE 0.010 291.000 0.000 1.000   NA
 2207262 2207263 pRL100326 pRL100327 fhuB fhuD TRUE 0.995 0.000 0.304 1.000 Y NA
 2207263 2207264 pRL100327 pRL100328 fhuD fhuC TRUE 0.946 14.000 0.047 1.000 Y NA
 2207264 2207265 pRL100328 pRL100329 fhuC   FALSE 0.003 455.000 0.000 1.000   NA
 2207265 2207266 pRL100329 pRL100330     FALSE 0.496 86.000 0.169 1.000   NA
 2207269 2207270 pRL100333 pRL100334     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.038 Y NA
 2207270 2207271 pRL100334 pRL100335     TRUE 0.982 -3.000 0.286 1.000 N NA
 2207271 2207272 pRL100335 pRL100336   atzB TRUE 0.964 2.000 0.250 1.000 N NA
 2207272 2207273 pRL100336 pRL100337 atzB   TRUE 0.871 27.000 0.417 1.000   NA
 2207273 2207274 pRL100337 pRL100338     TRUE 0.934 4.000 0.125 1.000   NA
 2207274 2207275 pRL100338 pRL100339     TRUE 0.993 -3.000 0.590 1.000   NA
 2207275 2207276 pRL100339 pRL100340     TRUE 0.993 -3.000 0.346 0.090   NA
 2207278 2207279 pRL100342 pRL100343 pitX pit TRUE 0.995 0.000 0.396 NA Y NA
 2207279 2207280 pRL100343 pRL100344 pit   FALSE 0.023 435.000 0.000 NA Y NA
 2207280 2207281 pRL100344 pRL100345     TRUE 0.975 56.000 0.915 NA Y NA
 2207281 2207282 pRL100345 pRL100346     TRUE 0.991 12.000 0.323 0.000 Y NA
 2207284 2207285 pRL100348 pRL100349     TRUE 0.966 21.000 0.929 1.000   NA
 2207285 2207286 pRL100349 pRL100350     TRUE 0.997 0.000 0.966 0.090   NA
 2207286 2207287 pRL100350 pRL100351   amiF TRUE 0.868 13.000 0.189 1.000   NA
 2207287 2207288 pRL100351 pRL100352 amiF   TRUE 0.882 12.000 0.184 1.000   NA
 2207288 2207289 pRL100352 pRL100353   atzD TRUE 0.941 0.000 0.053 1.000   NA
 2207289 2207290 pRL100353 pRL100354 atzD   TRUE 0.926 2.000 0.054 1.000   NA
 2207290 2207291 pRL100354 pRL100355     TRUE 0.986 0.000 0.429 1.000   NA
 2207291 2207292 pRL100355 pRL100356     TRUE 0.946 -7.000 0.167 NA   NA
 2207293 2207294 pRL100357 pRL100358     TRUE 0.996 -3.000 0.312 1.000 Y NA
 2207294 2207295 pRL100358 pRL100359     TRUE 0.999 -3.000 0.812 0.009 Y NA
 2207295 2207296 pRL100359 pRL100360     TRUE 0.985 54.000 0.846 0.090 Y NA
 2207297 2207298 pRL100361 pRL100362     TRUE 0.951 30.000 0.143 0.076 Y NA
 2207298 2207299 pRL100362 pRL100363   ntaA FALSE 0.359 114.000 0.214 NA N NA
 2207299 2207300 pRL100363 pRL100364 ntaA   TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 2207303 2207304 pRL100367 pRL100368     TRUE 0.779 75.000 0.500 1.000 N NA
 2207306 2207307 pRL100370 pRL100371 fdhA   FALSE 0.002 596.000 0.000 1.000   NA
 2207310 2207311 pRL100374 pRL100375     TRUE 0.978 8.000 0.608 1.000   NA
 2207311 2207312 pRL100375 pRL100376     TRUE 0.967 11.000 0.081 1.000 Y NA
 2207312 2207313 pRL100376 pRL100377     TRUE 0.947 5.000 0.250 1.000 N NA
 2207313 2207314 pRL100377 pRL100378     TRUE 0.910 7.000 0.000 0.026 N NA
 2207314 2207315 pRL100378 pRL100379     FALSE 0.302 120.000 0.138 1.000 N NA
 2207315 2207316 pRL100379 pRL100380     TRUE 0.878 98.000 0.227 0.090 Y NA
 2207316 2207317 pRL100380 pRL100381     TRUE 0.998 -3.000 0.318 0.090 Y NA
 2207317 2207318 pRL100381 pRL100382     TRUE 0.842 -7.000 0.000 1.000   NA
 2207318 2207319 pRL100382 pRL100383     FALSE 0.304 52.000 0.000 1.000   NA
 2207321 2207322 pRL100385 pRL100386     FALSE 0.151 189.000 0.147 1.000   NA
 2207325 2207326 pRL100389 pRL100390 idnD   TRUE 0.924 11.000 0.300 1.000 N NA
 2207327 2207328 pRL100391 pRL100392 gno idnK FALSE 0.503 14.000 0.000 1.000 N NA
 2207328 2207329 pRL100392 pRL100393 idnK   TRUE 0.771 -10.000 0.000 1.000 N NA
 2207329 2207330 pRL100393 pRL100394     FALSE 0.414 108.000 0.208 1.000 N NA
 2207330 2207331 pRL100394 pRL100395     TRUE 0.989 19.000 0.852 1.000 Y NA
 2207331 2207332 pRL100395 pRL100396     TRUE 0.968 52.000 0.741 NA Y NA
 2207332 2207333 pRL100396 pRL100397     FALSE 0.436 93.000 0.182 NA   NA
 2207333 2207334 pRL100397 pRL100398     FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 2207334 2207335 pRL100398 pRL100399     TRUE 0.891 95.000 0.478 NA Y NA
 2207335 2207336 pRL100399 pRL100400     TRUE 0.995 -24.000 0.550 1.000 Y NA
 2207336 2207337 pRL100400 pRL100401   ntaA FALSE 0.526 38.000 0.100 NA N NA
 2207337 2207338 pRL100401 pRL100402 ntaA   TRUE 0.847 63.000 0.133 NA Y NA
 2207338 2207339 pRL100402 pRL100403     FALSE 0.002 501.000 0.000 1.000 N NA
 2207340 2207341 pRL100404 pRL100405     TRUE 0.993 -10.000 0.947 NA   NA
 2207341 2207342 pRL100405 pRL100406     FALSE 0.009 331.000 0.025 NA   NA
 2207342 2207343 pRL100406 pRL100407     TRUE 0.998 -3.000 0.312 0.016 Y NA
 2207343 2207344 pRL100407 pRL100408     FALSE 0.442 88.000 0.154 1.000 N NA
 2207345 2207346 pRL100409 pRL100410     TRUE 0.996 0.000 0.429 1.000 Y NA
 2207346 2207347 pRL100410 pRL100411     TRUE 0.995 13.000 0.714 0.090 Y NA
 2207347 2207348 pRL100411 pRL100412     TRUE 0.996 13.000 0.833 0.009 Y NA
 2207348 2207349 pRL100412 pRL100413     TRUE 0.679 121.000 0.100 1.000 Y NA
 2207351 2207352 pRL100415 pRL100416     TRUE 0.983 35.000 1.000 NA Y NA
 2207352 2207353 pRL100416 pRL100417     TRUE 0.999 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 2207353 2207354 pRL100417 pRL100418     TRUE 0.997 -3.000 0.250 0.090 Y NA
 2207354 2207355 pRL100418 pRL100419     TRUE 0.974 -3.000 0.167 1.000   NA
 2207355 2207356 pRL100419 pRL100420     TRUE 0.985 -7.000 0.500 1.000   NA
 2207356 2207357 pRL100420 pRL100421     FALSE 0.363 35.000 0.018 NA N NA
 2207357 2207358 pRL100421 pRL100422     FALSE 0.511 32.000 0.044 NA   NA
 2207359 2207360 pRL100423 pRL100424     FALSE 0.171 171.000 0.143 NA   NA
 2207360 2207361 pRL100424 pRL100425     TRUE 0.619 85.000 0.353 NA N NA
 2207361 2207362 pRL100425 pRL100426     TRUE 0.974 32.000 0.632 1.000 Y NA
 2207362 2207363 pRL100426 pRL100427     TRUE 0.999 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 2207363 2207364 pRL100427 pRL100428     TRUE 0.999 -3.000 0.810 0.009 Y NA
 2207364 2207365 pRL100428 pRL100429     TRUE 0.994 -3.000 0.640 1.000   NA
 2207367 2207368 pRL100431 pRL100432 aatA   TRUE 0.752 60.000 0.348 1.000   NA
 2207368 2207369 pRL100432 pRL100433     TRUE 0.858 38.000 0.464 1.000   NA
 2207369 2207370 pRL100433 pRL100434     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.001 Y NA
 2207370 2207371 pRL100434 pRL100435     TRUE 0.976 -3.000 0.227 NA   NA
 2207371 2207372 pRL100435 pRL100436   accC TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207372 2207373 pRL100436 pRL100437 accC accB TRUE 0.996 0.000 0.097 0.001 Y NA
 2207373 2207374 pRL100437 pRL100438 accB   FALSE 0.078 189.000 0.040 1.000 N NA
 2207375 2207376 pRL100439 pRL100440     TRUE 0.893 61.000 0.267 NA Y NA
 2207376 2207377 pRL100440 pRL100441     TRUE 0.993 25.000 1.000 0.090 Y NA
 2207377 2207378 pRL100441 pRL100442     TRUE 0.996 0.000 0.267 0.090 Y NA
 2207378 2207379 pRL100442 pRL100443     TRUE 0.997 8.000 0.833 0.090 Y NA
 2207379 2207380 pRL100443 pRL100444     FALSE 0.456 84.000 0.148 1.000 N NA
 2207380 2207381 pRL100444 pRL100445     FALSE 0.143 111.000 0.000 1.000   NA
 2207387 2207388 pRL100451 pRL100452     FALSE 0.043 172.000 0.000 NA   NA
 2207392 2207393 pRL100457 pRL100458     FALSE 0.146 85.000 0.000 NA   NA
 2207395 2207396 pRL100460 pRL100461   rbtD TRUE 0.826 55.000 0.250 0.044   NA
 2207396 2207397 pRL100461 pRL100462 rbtD   TRUE 0.813 27.000 0.286 1.000   NA
 2207397 2207398 pRL100462 pRL100463     TRUE 0.993 -3.000 0.565 1.000   NA
 2207398 2207399 pRL100463 pRL100464     TRUE 0.811 73.000 0.565 NA   NA
 2207399 2207400 pRL100464 pRL100465     FALSE 0.012 216.000 0.000 NA N NA
 2207400 2207401 pRL100465 pRL100466   otsB FALSE 0.056 161.000 0.000 1.000 N NA
 2207404 2207405 pRL100469 pRL100470     FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 2207405 2206964 pRL100470 pRL100001   repA FALSE 0.003 383.000 0.000 NA   NA
 2207406 2207407 pRL70001 pRL70002 repA repB TRUE 0.894 84.000 1.000 1.000 N NA
 2207407 2207408 pRL70002 pRL70003 repB repC TRUE 0.539 156.000 0.545 NA   NA
 2207409 2207410 pRL70004 pRL70005     TRUE 0.908 -10.000 0.078 NA   NA
 2207410 2207411 pRL70005 pRL70006     FALSE 0.059 154.000 0.000 NA   NA
 2207412 2207413 pRL70007 pRL70008     FALSE 0.108 104.000 0.000 NA   NA
 2207413 2207414 pRL70008 pRL70009     FALSE 0.016 225.000 0.000 NA   NA
 2207414 2207415 pRL70009 pRL70010     FALSE 0.427 99.000 0.200 NA   NA
 2207415 2207416 pRL70010 pRL70011     FALSE 0.367 115.000 0.200 NA   NA
 2207416 2207417 pRL70011 pRL70012     TRUE 0.922 13.000 0.375 NA   NA
 2207417 2207418 pRL70012 pRL70013     FALSE 0.003 380.000 0.000 NA   NA
 2207418 2207419 pRL70013 pRL70014     TRUE 0.636 73.000 0.286 NA   NA
 2207419 2207420 pRL70014 pRL70015     TRUE 0.993 -10.000 1.000 NA   NA
 2207420 2207421 pRL70015 pRL70017     FALSE 0.003 389.000 0.000 NA   NA
 2207421 2207422 pRL70017 pRL70018     TRUE 0.818 57.000 0.500 NA   NA
 2207423 2207424 pRL70019 pRL70020 hupA   TRUE 0.766 57.000 0.400 NA   NA
 2207424 2207425 pRL70020 pRL70021     FALSE 0.013 242.000 0.000 NA   NA
 2207426 2207427 pRL70022 pRL70023     TRUE 0.696 -39.000 0.000 NA   NA
 2207427 2207428 pRL70023 pRL70024     FALSE 0.050 162.000 0.000 NA   NA
 2207429 2207430 pRL70025 pRL70026     FALSE 0.020 214.000 0.000 NA   NA
 2207431 2207432 pRL70027 pRL70028     FALSE 0.274 35.000 0.000 NA   NA
 2207432 2207433 pRL70028 pRL70029     FALSE 0.116 99.000 0.000 NA   NA
 2207433 2207434 pRL70029 pRL70030     FALSE 0.003 367.000 0.000 NA   NA
 2207435 2207436 pRL70031 pRL70032     TRUE 0.992 -6.000 0.444 0.043   NA
 2207437 1575875 pRL70033 pRL70034     FALSE 0.022 209.000 0.000 NA   NA
 1575875 2207438 pRL70034 pRL70036     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 2207438 2207439 pRL70036 pRL70037     FALSE 0.012 247.000 0.000 NA   NA
 2207439 2207440 pRL70037 pRL70038   repA FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 2207440 2207441 pRL70038 pRL70039 repA repC TRUE 0.754 -10.000 0.000 NA   NA
 2207441 2207442 pRL70039 pRL70040 repC   TRUE 0.577 11.000 0.000 NA   NA
 2207442 2207443 pRL70040 pRL70041     FALSE 0.131 92.000 0.000 NA   NA
 2207443 2207444 pRL70041 pRL70042     FALSE 0.369 123.000 0.000 0.007   NA
 2207444 1575883 pRL70042 pRL70043     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207445 2207446 pRL70044 pRL70045     TRUE 0.997 -3.000 0.583 0.007   NA
 2207446 2207447 pRL70045 pRL70046     TRUE 0.992 21.000 0.750 0.007 Y NA
 2207448 1575889 pRL70047 pRL70047D     FALSE 0.162 78.000 0.000 NA   NA
 2207449 2207450 pRL70047A pRL70047B     TRUE 0.996 -3.000 0.364 NA Y NA
 2207450 2207451 pRL70047B pRL70047C   tnpC TRUE 0.944 75.000 0.625 NA Y NA
 1575896 2207455 pRL70051 pRL70052     FALSE 0.071 140.000 0.000 NA   NA
 2207455 2207456 pRL70052 pRL70053     FALSE 0.248 43.000 0.000 NA   NA
 2207457 2207458 pRL70054 pRL70055     FALSE 0.178 72.000 0.000 NA   NA
 2207458 2207459 pRL70055 pRL70056     FALSE 0.085 121.000 0.000 NA   NA
 2207459 2207460 pRL70056 pRL70057     FALSE 0.043 172.000 0.000 NA   NA
 1575905 2207462 pRL70060 pRL70061     FALSE 0.512 13.000 0.000 NA   NA
 1575907 1575908 pRL70062 pRL70063     FALSE 0.217 55.000 0.000 NA   NA
 1575908 1575909 pRL70063 pRL70064     FALSE 0.082 124.000 0.000 NA   NA
 2207464 2207465 pRL70067 pRL70068     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207466 2207467 pRL70070 pRL70071     FALSE 0.078 129.000 0.000 NA   NA
 2207468 2207469 pRL70074 pRL70075     FALSE 0.281 194.000 0.000 1.000 Y NA
 2207469 2207470 pRL70075 pRL70076     TRUE 0.929 -31.000 0.000 0.043   NA
 2207470 2207471 pRL70076 pRL70077     FALSE 0.028 321.000 0.000 0.007   NA
 2207474 2207475 pRL70080 pRL70082     FALSE 0.001 585.000 0.000 NA   NA
 2207475 2207476 pRL70082 pRL70083     FALSE 0.253 41.000 0.000 NA   NA
 2207476 2207477 pRL70083 pRL70084   traD FALSE 0.304 52.000 0.000 1.000   NA
 2207477 2207478 pRL70084 pRL70085 traD traC TRUE 0.991 5.000 1.000 NA   NA
 2207479 2207480 pRL70086 pRL70087 traA traF TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 2207480 2207481 pRL70087 pRL70088 traF traB TRUE 0.754 -10.000 0.000 NA   NA
 2207481 2207482 pRL70088 pRL70089 traB traH FALSE 0.418 17.000 0.000 NA   NA
 2207482 2207483 pRL70089 pRL70090 traH   FALSE 0.100 111.000 0.000 NA   NA
 2207485 2207486 pRL70092 pRL70093 repA repB TRUE 0.714 85.000 0.444 1.000 N NA
 2207486 2207487 pRL70093 pRL70094 repB repC FALSE 0.374 156.000 0.333 NA   NA
 2207487 2207488 pRL70094 pRL70095 repC   FALSE 0.203 60.000 0.000 NA   NA
 2207489 2207490 pRL70096 pRL70097     FALSE 0.248 43.000 0.000 NA   NA
 2207492 2207493 pRL70098 pRL70099     FALSE 0.037 180.000 0.000 NA   NA
 2207495 2207496 pRL70101 pRL70102     FALSE 0.070 143.000 0.000 NA   NA
 2207496 2207497 pRL70102 pRL70103     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207497 2207498 pRL70103 pRL70104     TRUE 0.914 14.000 0.116 0.042   NA
 2207498 2207499 pRL70104 pRL70105     FALSE 0.014 395.000 0.000 0.042   NA
 2207499 2207500 pRL70105 pRL70106     TRUE 0.930 21.000 0.615 NA   NA
 2207501 2207502 pRL70107 pRL70108     FALSE 0.041 175.000 0.000 NA   NA
 2207502 2207503 pRL70108 pRL70109     FALSE 0.248 43.000 0.000 NA   NA
 2207503 2207504 pRL70109 pRL70110     TRUE 0.992 -6.000 0.444 0.042   NA
 2207505 2207506 pRL70112 pRL70113     FALSE 0.246 44.000 0.000 NA   NA
 2207506 1575958 pRL70113 pRL70114     FALSE 0.311 28.000 0.000 NA   NA
 1575959 2207507 pRL70115 pRL70116     FALSE 0.085 121.000 0.000 NA   NA
 2207507 2207508 pRL70116 pRL70117     TRUE 0.618 176.000 0.800 1.000   NA
 2207509 2207510 pRL70118 pRL70119     TRUE 0.975 2.000 0.357 NA   NA
 1575964 2207511 pRL7011A pRL70121     FALSE 0.190 67.000 0.000 NA   NA
 2207513 2207514 pRL70123 pRL70124     TRUE 0.966 -21.000 0.375 NA   NA
 2207515 1575970 pRL70125 pRL70126     FALSE 0.251 42.000 0.000 NA   NA
 2207516 1575972 pRL70127 pRL70128 tiorf133   FALSE 0.004 350.000 0.000 NA   NA
 1575972 2207517 pRL70128 pRL70129     FALSE 0.311 28.000 0.000 NA   NA
 2207518 1575975 pRL70130 pRL70131     FALSE 0.007 292.000 0.000 NA   NA
 1575975 1575976 pRL70131 pRL70132     FALSE 0.207 58.000 0.000 NA   NA
 2207519 2207520 pRL70133 pRL70134     FALSE 0.257 46.000 0.000 1.000 N NA
 2207520 2207521 pRL70134 pRL70135     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207523 2207524 pRL70137 pRL70138     FALSE 0.258 39.000 0.000 NA   NA
 2207524 2207525 pRL70138 pRL70139     FALSE 0.129 252.000 0.000 1.000 Y NA
 2207526 1575985 pRL70140 pRL70141     FALSE 0.365 21.000 0.000 NA   NA
 1575985 1575986 pRL70141 pRL70141A     FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 2207527 1575988 pRL70142 pRL70143     FALSE 0.162 78.000 0.000 NA   NA
 2207528 2207529 pRL70144 pRL70145     TRUE 0.996 -3.000 0.364 NA Y NA
 2207529 2207530 pRL70145 pRL70146   tnpC TRUE 0.944 75.000 0.625 NA Y NA
 2207530 2207531 pRL70146 pRL70149 tnpC   FALSE 0.001 829.000 0.000 NA   NA
 2207531 2207532 pRL70149 pRL70150     FALSE 0.418 17.000 0.000 NA   NA
 2207532 2207533 pRL70150 pRL70151     TRUE 0.685 82.000 0.000 NA Y NA
 2207533 2207534 pRL70151 pRL70152     TRUE 0.997 -28.000 1.000 NA Y NA
 2207534 2207535 pRL70152 pRL70153     FALSE 0.519 125.000 0.400 NA   NA
 2207535 2207536 pRL70153 pRL70154     TRUE 0.708 5.000 0.000 NA   NA
 2207536 2207537 pRL70154 pRL70155   traJ TRUE 0.615 187.000 1.000 NA   NA
 2207537 2207538 pRL70155 pRL70156 traJ trbG TRUE 0.976 28.000 0.667 NA Y NA
 2207538 2207539 pRL70156 pRL70157 trbG trbI TRUE 0.992 11.000 0.667 NA Y NA
 2207539 2207540 pRL70157 pRL70158 trbI   TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2207541 2207542 pRL70160 pRL70161     TRUE 0.959 -3.000 0.100 NA   NA
 2207542 2207543 pRL70161 pRL70162     FALSE 0.203 60.000 0.000 NA   NA
 2207543 1576006 pRL70162 pRL70163     FALSE 0.438 16.000 0.000 NA   NA
 2207544 1576008 pRL70164 pRL70165     FALSE 0.232 49.000 0.000 NA   NA
 2207545 2207546 pRL70166 pRL70167     TRUE 0.993 -3.000 0.615 NA   NA
 2207547 2207548 pRL70168 pRL70169     TRUE 0.998 -3.000 0.262 0.042 Y NA
 2207549 2207550 pRL70170 pRL70171     FALSE 0.005 311.000 0.000 NA   NA
 1576015 2207551 pRL70172 pRL70173     FALSE 0.244 45.000 0.000 NA   NA
 2207552 2207553 pRL70175 pRL70176     FALSE 0.002 378.000 0.000 NA N NA
 2207554 2207555 pRL70177 pRL70178     FALSE 0.139 93.000 0.000 1.000 N NA
 2207555 2207556 pRL70178 pRL70179     TRUE 0.921 29.000 0.000 0.042 Y NA
 2207556 2207557 pRL70179 pRL70180     TRUE 0.998 -3.000 0.262 0.042 Y NA
 2207557 1576024 pRL70180 pRL70181     FALSE 0.269 36.000 0.000 NA   NA
 2207558 2207559 pRL70182 pRL70183     FALSE 0.512 13.000 0.000 NA   NA
 2207559 2207560 pRL70183 pRL70184     FALSE 0.135 90.000 0.000 NA   NA
 1576028 1576029 pRL70185 pRL70186     FALSE 0.205 59.000 0.000 NA   NA
 2207562 2207563 pRL80001 pRL80002 repA repB TRUE 0.701 124.000 0.667 1.000 N NA
 2207563 2207564 pRL80002 pRL80003 repB repC FALSE 0.041 175.000 0.000 NA   NA
 2207564 2207565 pRL80003 pRL80004 repC   FALSE 0.072 139.000 0.000 NA   NA
 2207567 2207568 pRL80006 pRL80007     FALSE 0.185 69.000 0.000 NA   NA
 2207571 2207572 pRL80010 pRL80011     FALSE 0.386 19.000 0.000 NA   NA
 2207573 2207574 pRL80012 pRL80013     TRUE 0.972 5.000 0.410 1.000   NA
 2207574 2207575 pRL80013 pRL80014     FALSE 0.005 308.000 0.000 NA   NA
 1576046 2207577 pRL80017 pRL80018     FALSE 0.217 55.000 0.000 NA   NA
 2207577 2207578 pRL80018 pRL80019     FALSE 0.316 27.000 0.000 NA   NA
 2207578 2207579 pRL80019 pRL80020     FALSE 0.003 383.000 0.000 NA   NA
 2207579 2207580 pRL80020 pRL80021   coxG FALSE 0.010 257.000 0.000 NA   NA
 2207580 2207581 pRL80021 pRL80022 coxG   FALSE 0.294 55.000 0.000 1.000   NA
 2207581 2207582 pRL80022 pRL80023   coxL TRUE 0.540 16.000 0.000 1.000   NA
 2207582 2207583 pRL80023 pRL80024 coxL coxS TRUE 0.943 24.000 0.000 0.001 Y NA
 2207583 2207584 pRL80024 pRL80025 coxS   TRUE 0.990 -7.000 0.000 0.037 Y NA
 2207584 2207585 pRL80025 pRL80026   livJ FALSE 0.407 19.000 0.000 1.000 N NA
 2207585 2207586 pRL80026 pRL80027 livJ livM TRUE 0.967 22.000 0.403 1.000 Y NA
 2207586 2207587 pRL80027 pRL80028 livM livH TRUE 0.997 -3.000 0.278 0.088 Y NA
 2207587 2207588 pRL80028 pRL80029 livH livG TRUE 0.980 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 2207588 2207589 pRL80029 pRL80030 livG livF TRUE 0.985 5.000 0.000 0.030 Y NA
 2207589 2207590 pRL80030 pRL80031 livF   FALSE 0.171 79.000 0.000 1.000 N NA
 2207591 2207592 pRL80032 pRL80033     FALSE 0.018 218.000 0.000 NA   NA
 2207592 2207593 pRL80033 pRL80034   moaA FALSE 0.401 18.000 0.000 NA   NA
 2207593 2207594 pRL80034 pRL80035 moaA   FALSE 0.001 840.000 0.000 1.000 N NA
 2207595 2207596 pRL80036 pRL80037     TRUE 0.641 8.000 0.000 NA   NA
 2207596 2207597 pRL80037 pRL80038     FALSE 0.006 265.000 0.000 NA N NA
 2207597 1576068 pRL80038 pRL80039     FALSE 0.002 413.000 0.000 NA   NA
 1576069 2207598 pRL80039A pRL80040     FALSE 0.037 180.000 0.000 NA   NA
 2207599 2207600 pRL80041 pRL80042 hisD pntA FALSE 0.053 164.000 0.000 1.000 N NA
 2207600 2207601 pRL80042 pRL80043 pntA pntB TRUE 0.992 22.000 0.745 0.001 Y NA
 2207601 2207602 pRL80043 pRL80044 pntB acsA FALSE 0.067 152.000 0.000 1.000 N NA
 2207603 2207604 pRL80045 pRL80046     FALSE 0.241 52.000 0.000 1.000 N NA
 2207605 2207606 pRL80047 pRL80048     TRUE 0.800 2.000 0.000 1.000 N NA
 2207606 2207607 pRL80048 pRL80049     FALSE 0.461 16.000 0.000 1.000 N NA
 2207607 1576080 pRL80049 pRL80050     FALSE 0.001 958.000 0.000 NA   NA
 1576080 1576081 pRL80050 pRL80051     FALSE 0.044 170.000 0.000 NA   NA
 2207608 2207609 pRL80052 pRL80053     FALSE 0.255 40.000 0.000 NA   NA
 2207609 2207610 pRL80053 pRL80054     FALSE 0.011 249.000 0.000 NA   NA
 2207610 1576085 pRL80054 pRL80055     FALSE 0.046 167.000 0.000 NA   NA
 2207613 1576089 pRL80057 pRL80058     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207614 2207615 pRL80059 pRL80060     TRUE 0.541 126.000 0.000 1.000 Y NA
 2207617 2207618 pRL80062 pRL80063     FALSE 0.119 72.000 0.000 NA N NA
 2207618 2207619 pRL80063 pRL80064     TRUE 0.994 -3.000 0.182 1.000 Y NA
 2207621 2207622 pRL80066 pRL80067     FALSE 0.010 256.000 0.000 NA   NA
 2207622 2207623 pRL80067 pRL80068     TRUE 0.922 -3.000 0.014 NA   NA
 2207623 2207624 pRL80068 pRL80069     TRUE 0.823 -16.000 0.009 NA   NA
 2207624 2207625 pRL80069 pRL80070     TRUE 0.824 46.000 0.222 0.071   NA
 2207625 2207626 pRL80070 pRL80071   hom TRUE 0.950 0.000 0.111 1.000 N NA
 2207626 2207627 pRL80071 pRL80072 hom   FALSE 0.098 112.000 0.000 NA   NA
 2207627 2207628 pRL80072 pRL80073     FALSE 0.001 703.000 0.000 NA   NA
 2207628 2207629 pRL80073 pRL80074     FALSE 0.116 163.000 0.037 1.000 N NA
 2207630 2207631 pRL80075 pRL80076     FALSE 0.392 64.000 0.049 NA   NA
 2207631 2207632 pRL80076 pRL80077     TRUE 0.891 3.000 0.018 1.000   NA
 2207632 2207633 pRL80077 pRL80078     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 2207634 2207635 pRL80079 pRL80080     FALSE 0.039 182.000 0.000 1.000 N NA
 2207635 2207636 pRL80080 pRL80081     TRUE 0.785 5.000 0.000 1.000   NA
 2207636 2207637 pRL80081 pRL80082     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207637 2207638 pRL80082 pRL80083     TRUE 0.917 30.000 0.667 NA   NA
 2207639 2207640 pRL80084 pRL80085     TRUE 0.695 79.000 0.000 NA Y NA
 2207640 2207641 pRL80085 pRL80086     TRUE 0.965 83.000 1.000 NA Y NA
 2207641 2207642 pRL80086 pRL80087     TRUE 0.998 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 2207642 2207643 pRL80087 pRL80088     TRUE 0.958 14.000 0.000 0.088 Y NA
 2207643 1576120 pRL80088 pRL80089     FALSE 0.050 162.000 0.000 NA   NA
 1576120 2207644 pRL80089 pRL80090     FALSE 0.051 161.000 0.000 NA   NA
 2207644 1576122 pRL80090 pRL80091     FALSE 0.512 13.000 0.000 NA   NA
 1576122 2207645 pRL80091 pRL80092     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 2207645 2207646 pRL80092 pRL80093     TRUE 0.998 -3.000 0.425 0.088 Y NA
 2207646 2207647 pRL80093 pRL80094     TRUE 0.929 45.000 0.111 0.088 Y NA
 2207647 2207648 pRL80094 pRL80095     TRUE 0.880 116.000 0.333 0.088 Y NA
 2207648 2207649 pRL80095 pRL80096     FALSE 0.048 170.000 0.000 1.000 N NA
 2207652 2207653 pRL80099 pRL80100     FALSE 0.002 478.000 0.000 NA   NA
 2207654 2207655 pRL80101 pRL80102     FALSE 0.236 191.000 0.333 NA   NA
 2207655 2207656 pRL80102 pRL80103     TRUE 0.755 117.000 0.750 NA   NA
 2207656 2207657 pRL80103 pRL80104     TRUE 0.722 91.000 0.500 NA   NA
 2207657 2207658 pRL80104 pRL80105     FALSE 0.001 585.000 0.000 NA   NA
 2207658 1576137 pRL80105 pRL80106     FALSE 0.042 174.000 0.000 NA   NA
 1576137 2207659 pRL80106 pRL80107     FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 2207659 2207660 pRL80107 pRL80108     TRUE 0.948 -21.000 0.250 NA   NA
 2207660 2207661 pRL80108 pRL80109     TRUE 0.945 5.000 0.250 NA   NA
 2207661 2207662 pRL80109 pRL80110     FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 2207662 2207663 pRL80110 pRL80111   ardC FALSE 0.007 289.000 0.000 NA   NA
 2207667 2207668 pRL80115 pRL80116     TRUE 0.754 -10.000 0.000 NA   NA
 2207668 2207669 pRL80116 pRL80117     FALSE 0.107 105.000 0.000 NA   NA
 2207670 2207671 pRL80118 pRL80119     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207671 2207672 pRL80119 pRL80120   traG FALSE 0.076 131.000 0.000 NA   NA
 2207672 2207673 pRL80120 pRL80120A traG traD TRUE 0.822 -10.000 0.000 1.000   NA
 2207673 2207674 pRL80120A pRL80121 traD traC TRUE 0.708 5.000 0.000 NA   NA
 2207675 2207676 pRL80122 pRL80123 traA traF TRUE 0.800 -3.000 0.000 NA N NA
 2207676 2207677 pRL80123 pRL80124 traF traB TRUE 0.754 -10.000 0.000 NA   NA
 2207677 2207678 pRL80124 pRL80125 traB traH TRUE 0.540 16.000 0.000 1.000   NA
 2207679 2207680 pRL80126 pRL80128     FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   NA
 2207680 2207681 pRL80128 pRL80130     TRUE 0.988 -10.000 0.667 NA   NA
 2207683 2207684 pRL80132 pRL80133 traM trbI FALSE 0.024 202.000 0.000 NA   NA
 2207684 2207685 pRL80133 pRL80134 trbI trbH TRUE 0.974 16.000 1.000 NA   NA
 2207685 2207686 pRL80134 pRL80135 trbH trbG TRUE 0.993 4.000 1.000 NA   NA
 2207686 2207687 pRL80135 pRL80136 trbG trbF TRUE 0.992 16.000 1.000 NA Y NA
 2207687 2207688 pRL80136 pRL80137 trbF trbL TRUE 0.990 22.000 1.000 1.000 Y NA
 2207688 2207689 pRL80137 pRL80138 trbL trbJ FALSE 0.274 191.000 0.000 NA Y NA
 2207689 2207690 pRL80138 pRL80139 trbJ trbE TRUE 0.977 -7.000 0.000 NA Y NA
 2207690 2207691 pRL80139 pRL80140 trbE trbD TRUE 0.995 11.000 1.000 NA Y NA
 2207691 2207692 pRL80140 pRL80141 trbD trbC TRUE 0.997 -7.000 0.750 NA Y NA
 2207692 2207693 pRL80141 pRL80142 trbC trbB TRUE 0.974 -10.000 0.000 NA Y NA
 2207694 2207695 pRL110001 pRL110002 repA repB TRUE 0.995 -3.000 0.750 1.000 N NA
 2207695 2207696 pRL110002 pRL110003 repB repC TRUE 0.613 155.000 0.667 NA   NA
 2207696 2207697 pRL110003 pRL110004 repC   FALSE 0.390 181.000 0.500 NA   NA
 2207698 2207699 pRL110005 pRL110006     TRUE 0.856 21.000 0.343 NA   NA
 2207699 2207700 pRL110006 pRL110007     TRUE 0.994 -13.000 0.475 NA Y NA
 2207702 2207703 pRL110009 pRL110010     TRUE 0.968 10.000 0.545 1.000 N NA
 2207703 2207704 pRL110010 pRL110011     FALSE 0.187 108.000 0.015 1.000 N NA
 2207704 2207705 pRL110011 pRL110012     FALSE 0.133 139.000 0.015 1.000 N NA
 2207705 2207706 pRL110012 pRL110013     TRUE 0.991 -3.000 0.473 1.000   NA
 2207708 2207709 pRL110015 pRL110016     FALSE 0.219 166.000 0.200 NA   NA
 2207709 2207710 pRL110016 pRL110017     FALSE 0.026 198.000 0.000 NA   NA
 2207711 2207712 pRL110018 pRL110019     TRUE 0.801 136.000 0.179 0.042 Y NA
 2207712 2207713 pRL110019 pRL110020     FALSE 0.001 428.000 0.000 NA N NA
 2207713 2207714 pRL110020 pRL110021     TRUE 0.996 7.000 0.833 NA Y NA
 2207714 2207715 pRL110021 pRL110022     TRUE 0.989 6.000 0.333 1.000 Y NA
 2207715 2207716 pRL110022 pRL110023     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 2207716 2207717 pRL110023 pRL110024     TRUE 0.997 -3.000 0.909 1.000   NA
 2207717 2207718 pRL110024 pRL110025   caiD TRUE 0.997 -3.000 0.667 0.071 N NA
 2207718 2207719 pRL110025 pRL110026 caiD   FALSE 0.287 36.000 0.000 1.000 N NA
 2207719 2207720 pRL110026 pRL110027     TRUE 0.726 5.000 0.000 1.000 N NA
 2207721 2207722 pRL110028 pRL110029     TRUE 0.992 0.000 0.667 1.000 N NA
 2207722 2207723 pRL110029 pRL110030     FALSE 0.009 271.000 0.000 1.000 N NA
 2207723 2207724 pRL110030 pRL110031     TRUE 0.820 132.000 0.214 0.050 Y NA
 2207724 2207725 pRL110031 pRL110032     FALSE 0.009 263.000 0.000 NA   NA
 2207725 2207726 pRL110032 pRL110033     FALSE 0.331 170.000 0.357 NA   NA
 2207726 2207727 pRL110033 pRL110034     TRUE 0.976 48.000 0.500 0.005 Y NA
 2207728 2207729 pRL110035 pRL110036     FALSE 0.004 351.000 0.000 NA   NA
 2207729 2207730 pRL110036 pRL110037     TRUE 0.673 69.000 0.308 NA   NA
 2207731 2207732 pRL110038 pRL110039   cyoD TRUE 0.996 -3.000 0.849 NA   NA
 2207732 2207733 pRL110039 pRL110040 cyoD cyoC TRUE 0.999 -3.000 0.906 0.037 Y NA
 2207733 2207734 pRL110040 pRL110041 cyoC cyoB TRUE 0.999 -3.000 0.847 0.037 Y NA
 2207734 2207735 pRL110041 pRL110042 cyoB cyoA TRUE 0.990 43.000 0.915 0.007 Y NA
 2207736 2207737 pRL110043 pRL110044     FALSE 0.061 152.000 0.000 NA   NA
 2207737 2207738 pRL110044 pRL110045     TRUE 0.977 -3.000 0.238 NA   NA
 2207739 2207740 pRL110046 pRL110047     FALSE 0.404 103.000 0.186 1.000 N NA
 2207740 2207741 pRL110047 pRL110048     FALSE 0.120 183.000 0.068 1.000   NA
 2207741 2207742 pRL110048 pRL110049     TRUE 0.986 -3.000 0.318 1.000   NA
 2207742 2207743 pRL110049 pRL110050     TRUE 0.975 10.000 0.614 1.000   NA
 2207743 2207744 pRL110050 pRL110051     FALSE 0.436 97.000 0.158 1.000   NA
 2207744 2207745 pRL110051 pRL110052     TRUE 0.997 0.000 0.929 0.087   NA
 2207745 2207746 pRL110052 pRL110053     TRUE 0.998 4.000 0.821 0.087 Y NA
 2207746 2207747 pRL110053 pRL110054     TRUE 0.994 0.000 0.741 1.000   NA
 2207747 2207748 pRL110054 pRL110055     FALSE 0.371 155.000 0.292 1.000   NA
 2207749 2207750 pRL110056 pRL110057     FALSE 0.060 176.000 0.000 1.000   NA
 2207753 2207754 pRL110060 pRL110061     FALSE 0.004 346.000 0.000 1.000 N NA
 2207756 2207757 pRL110063 pRL110064     TRUE 0.928 -6.000 0.083 NA   NA
 2207757 2207758 pRL110064 pRL110065     FALSE 0.002 459.000 0.000 NA   NA
 2207758 2207759 pRL110065 pRL110066     TRUE 0.966 0.000 0.211 NA   NA
 2207760 2207761 pRL110067 pRL110068     TRUE 0.957 0.000 0.111 1.000   NA
 2207762 2207763 pRL110069 pRL110070     TRUE 0.993 -3.000 0.545 1.000   NA
 2207763 2207764 pRL110070 pRL110071     FALSE 0.388 155.000 0.308 1.000   NA
 2207765 2207766 pRL110072 pRL110073     TRUE 0.955 74.000 0.400 0.006 Y NA
 2207768 2207769 pRL110075 pRL110076     FALSE 0.167 232.000 0.000 1.000 Y NA
 2207769 2207770 pRL110076 pRL110077     TRUE 0.866 32.000 0.004 1.000 Y NA
 2207770 2207771 pRL110077 pRL110078     TRUE 0.998 11.000 1.000 0.009 Y NA
 2207771 2207772 pRL110078 pRL110079     TRUE 0.950 54.000 0.500 1.000 Y NA
 2207772 2207773 pRL110079 pRL110080     TRUE 0.859 45.000 0.500 1.000   NA
 2207773 2207774 pRL110080 pRL110081     TRUE 0.924 5.000 0.125 1.000   NA
 2207777 2207778 pRL110084 pRL110085 gno   FALSE 0.287 36.000 0.000 1.000 N NA
 2207778 2207779 pRL110085 pRL110086   pcaG FALSE 0.280 178.000 0.314 1.000 N NA
 2207779 2207780 pRL110086 pRL110087 pcaG pcaH TRUE 0.999 3.000 0.782 0.000 Y NA
 2207780 2207781 pRL110087 pRL110088 pcaH pcaC TRUE 0.858 10.000 0.080 1.000   NA
 2207781 2207782 pRL110088 pRL110089 pcaC   TRUE 0.994 -3.000 0.636 1.000   NA
 2207783 2207784 pRL110090 pRL110091 pcaQ   FALSE 0.305 112.000 0.116 NA   NA
 2207784 2207785 pRL110091 pRL110092     TRUE 0.971 -3.000 0.186 NA   NA
 2207786 1576266 pRL110093 pRL11093A     TRUE 0.797 -4.000 0.000 NA   NA
 1576267 1576268 pRL11093B pRL110094     FALSE 0.153 82.000 0.000 NA   NA
 2207787 2207788 pRL110095 pRL110096     FALSE 0.059 154.000 0.000 NA   NA
 2207789 2207790 pRL110097 pRL110098   hsdM FALSE 0.046 168.000 0.000 NA   NA
 2207790 2207791 pRL110098 pRL110099 hsdM hsdS TRUE 0.993 -7.000 0.061 0.042 Y NA
 2207791 2207792 pRL110099 pRL110100 hsdS   TRUE 0.931 0.000 0.061 NA   NA
 2207792 2207793 pRL110100 pRL110101   hsdR FALSE 0.258 39.000 0.000 NA   NA
 2207794 2207795 pRL110102 pRL110103     FALSE 0.012 247.000 0.000 NA   NA
 2207795 2207796 pRL110103 pRL110104     FALSE 0.002 445.000 0.000 NA   NA
 2207798 2207799 pRL110106 pRL110107     TRUE 0.577 11.000 0.000 NA   NA
 2207799 2207800 pRL110107 pRL110108     TRUE 0.989 12.000 0.750 0.001   NA
 2207801 2207802 pRL110108A pRL110109     TRUE 0.641 149.000 0.667 NA   NA
 2207802 2207803 pRL110109 pRL110110     FALSE 0.076 131.000 0.000 NA   NA
 2207803 2207804 pRL110110 pRL110111     FALSE 0.183 70.000 0.000 NA   NA
 2207804 2207805 pRL110111 pRL110112     TRUE 0.729 -16.000 0.000 NA   NA
 2207805 2207806 pRL110112 pRL110113     FALSE 0.051 161.000 0.000 NA   NA
 2207806 2207807 pRL110113 pRL110113A     FALSE 0.001 612.000 0.000 NA   NA
 2207810 2207811 pRL110116 pRL110117     TRUE 0.971 1.000 0.286 NA   NA
 2207811 2207812 pRL110117 pRL110118     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207812 2207813 pRL110118 pRL110119     FALSE 0.039 178.000 0.000 NA   NA
 2207813 2207814 pRL110119 pRL110120     TRUE 0.599 99.000 0.375 NA   NA
 2207814 2207815 pRL110120 pRL110121     TRUE 0.953 -3.000 0.075 NA   NA
 2207815 2207816 pRL110121 pRL110122     TRUE 0.970 12.000 0.684 NA   NA
 2207816 2207817 pRL110122 pRL110123     FALSE 0.475 43.000 0.053 NA   NA
 2207817 2207818 pRL110123 pRL110124     TRUE 0.986 11.000 0.583 0.001   NA
 2207818 2207819 pRL110124 pRL110125     TRUE 0.979 29.000 0.917 0.001   NA
 2207819 2207820 pRL110125 pRL110126     TRUE 0.801 30.000 0.318 NA   NA
 2207820 2207821 pRL110126 pRL110127     TRUE 0.697 34.000 0.208 NA   NA
 2207822 2207823 pRL110128 pRL110129     FALSE 0.198 63.000 0.000 NA   NA
 2207823 2207824 pRL110129 pRL110130     FALSE 0.005 317.000 0.000 NA   NA
 2207826 2207827 pRL110132 pRL110133     FALSE 0.025 222.000 0.000 1.000   NA
 2207827 2207828 pRL110133 pRL110134     FALSE 0.113 128.000 0.000 1.000   NA
 2207828 2207829 pRL110134 pRL110135     FALSE 0.369 34.000 0.000 1.000   NA
 2207829 2207830 pRL110135 pRL110136   cpo FALSE 0.498 93.000 0.000 0.005   NA
 2207830 2207831 pRL110136 pRL110137 cpo   FALSE 0.534 99.000 0.033 0.012   NA
 2207831 2207832 pRL110137 pRL110138     FALSE 0.140 88.000 0.000 NA   NA
 2207832 2207833 pRL110138 pRL110139     FALSE 0.237 47.000 0.000 NA   NA
 2207833 1576316 pRL110139 pRL110140     FALSE 0.070 143.000 0.000 NA   NA
 2207834 2207835 pRL110141 pRL110142     FALSE 0.137 89.000 0.000 NA   NA
 2207835 2207836 pRL110142 pRL110143     FALSE 0.330 25.000 0.000 NA   NA
 2207836 2207837 pRL110143 pRL110144     TRUE 0.901 51.000 0.444 0.041   NA
 2207837 2207838 pRL110144 pRL110145     FALSE 0.001 990.000 0.000 1.000   NA
 2207839 2207840 pRL110146 pRL110147     FALSE 0.220 59.000 0.000 1.000 N NA
 2207841 2207842 pRL110148 pRL110149     FALSE 0.336 27.000 0.000 1.000 N NA
 2207842 2207843 pRL110149 pRL110150     TRUE 0.984 -12.000 0.088 1.000 Y NA
 2207843 2207844 pRL110150 pRL110151     TRUE 0.951 -3.000 0.066 NA   NA
 2207844 2207845 pRL110151 pRL110152     TRUE 0.903 25.000 0.538 NA   NA
 2207845 2207846 pRL110152 pRL110153   ttuC FALSE 0.342 26.000 0.000 1.000 N NA
 2207846 2207847 pRL110153 pRL110154 ttuC   TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.070 Y NA
 2207847 2207848 pRL110154 pRL110155     TRUE 0.722 23.000 0.000 0.043 N NA
 2207848 2207849 pRL110155 pRL110156     FALSE 0.031 193.000 0.000 1.000 N NA
 2207850 2207851 pRL110157 pRL110158     FALSE 0.002 407.000 0.000 NA   NA
 2207851 2207852 pRL110158 pRL110159     TRUE 0.964 -3.000 0.091 1.000   NA
 2207853 2207854 pRL110160 pRL110161     FALSE 0.225 57.000 0.000 1.000 N NA
 2207854 2207855 pRL110161 pRL110162   gyaR TRUE 0.541 60.000 0.000 0.070 N NA
 2207855 2207856 pRL110162 pRL110163 gyaR   FALSE 0.068 107.000 0.000 NA N NA
 2207856 2207857 pRL110163 pRL110164     FALSE 0.229 26.000 0.000 NA N NA
 2207859 2207860 pRL110166 pRL110167     FALSE 0.202 68.000 0.000 1.000 N NA
 2207860 2207861 pRL110167 pRL110168     TRUE 0.890 31.000 0.049 1.000 Y NA
 2207861 2207862 pRL110168 pRL110169     TRUE 0.959 11.000 0.049 NA Y NA
 2207863 2207864 pRL110170 pRL110171     FALSE 0.008 275.000 0.000 1.000 N NA
 2207865 2207866 pRL110172 pRL110173     TRUE 0.545 12.000 0.000 NA   NA
 2207866 2207867 pRL110173 pRL110174     FALSE 0.338 24.000 0.000 NA   NA
 2207867 2207868 pRL110174 pRL110175     FALSE 0.536 67.000 0.000 0.043 N NA
 2207868 2207869 pRL110175 pRL110176     FALSE 0.102 142.000 0.000 1.000   NA
 2207870 2207871 pRL110177 pRL110178     FALSE 0.044 177.000 0.000 1.000 N NA
 2207871 2207872 pRL110178 pRL110179     FALSE 0.304 33.000 0.000 1.000 N NA
 2207872 2207873 pRL110179 pRL110180     FALSE 0.353 37.000 0.000 1.000   NA
 2207873 2207874 pRL110180 pRL110181     FALSE 0.205 85.000 0.000 1.000   NA
 2207874 2207875 pRL110181 pRL110181A     FALSE 0.112 129.000 0.000 1.000   NA
 2207875 2207876 pRL110181A pRL110182     FALSE 0.063 151.000 0.000 NA   NA
 2207876 2207877 pRL110182 pRL110183     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207878 2207879 pRL110184 pRL110185     FALSE 0.155 86.000 0.000 1.000 N NA
 2207879 2207880 pRL110185 pRL110186     FALSE 0.185 69.000 0.000 NA   NA
 2207880 2207881 pRL110186 pRL110187     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207881 2207882 pRL110187 pRL110188     FALSE 0.073 136.000 0.000 NA   NA
 2207883 2207884 pRL110189 pRL110190     FALSE 0.220 54.000 0.000 NA   NA
 2207884 2207885 pRL110190 pRL110191     FALSE 0.235 161.000 0.000 0.042   NA
 2207886 2207887 pRL110192 pRL110193     FALSE 0.303 92.000 0.059 NA   NA
 2207888 2207889 pRL110193A pRL110194     FALSE 0.001 570.000 0.000 NA   NA
 2207890 2207891 pRL110195 pRL110196     FALSE 0.014 233.000 0.000 NA   NA
 1576375 2207892 pRL110197 pRL110198     FALSE 0.481 14.000 0.000 NA   NA
 2207892 2207893 pRL110198 pRL110199     TRUE 0.971 0.000 0.250 NA   NA
 2207893 2207894 pRL110199 pRL110200     FALSE 0.002 403.000 0.000 NA   NA
 2207895 2207896 pRL110201 pRL110202     FALSE 0.168 152.000 0.069 NA   NA
 2207896 2207897 pRL110202 pRL110203     TRUE 0.872 6.000 0.077 NA   NA
 2207897 2207898 pRL110203 pRL110204     TRUE 0.913 25.000 0.081 1.000 Y NA
 2207898 2207899 pRL110204 pRL110205   hutH1 TRUE 0.987 2.000 0.064 1.000 Y NA
 2207899 2207900 pRL110205 pRL110206 hutH1 hutI TRUE 0.988 -3.000 0.192 0.022 N NA
 2207901 2207902 pRL110207 pRL110208     FALSE 0.199 122.000 0.047 1.000 N NA
 2207903 2207904 pRL110209 pRL110210   hutC FALSE 0.005 313.000 0.000 NA   NA
 2207905 2207906 pRL110211 pRL110212     TRUE 0.766 219.000 0.722 0.086 Y NA
 2207906 2207907 pRL110212 pRL110213     TRUE 0.997 11.000 0.889 0.009 Y NA
 2207907 2207908 pRL110213 pRL110214     TRUE 0.980 29.000 0.727 1.000 Y NA
 2207908 2207909 pRL110214 pRL110215   hutH2 TRUE 0.998 -3.000 0.615 1.000 Y NA
 2207910 2207911 pRL110216 pRL110217     FALSE 0.036 182.000 0.000 NA   NA
 2207911 2207912 pRL110217 pRL110218     FALSE 0.085 121.000 0.000 NA   NA
 2207912 2207913 pRL110218 pRL110219     FALSE 0.133 91.000 0.000 NA   NA
 2207913 2207914 pRL110219 pRL110220     FALSE 0.433 72.000 0.094 NA   NA
 2207914 2207915 pRL110220 pRL110221     FALSE 0.411 77.000 0.094 NA   NA
 2207916 2207917 pRL110222 pRL110223     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 2207917 2207918 pRL110223 pRL110224     FALSE 0.440 100.000 0.000 0.013   NA
 2207918 2207919 pRL110224 pRL110225     FALSE 0.002 418.000 0.000 NA   NA
 2207919 2207920 pRL110225 pRL110226     FALSE 0.040 177.000 0.000 NA   NA
 2207920 2207921 pRL110226 pRL110227     TRUE 0.555 58.000 0.000 0.092   NA
 2207921 2207922 pRL110227 pRL110228     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207923 2207924 pRL110229 pRL110230     FALSE 0.015 231.000 0.000 NA   NA
 2207924 2207925 pRL110230 pRL110231     TRUE 0.980 0.000 0.082 0.023   NA
 2207925 2207926 pRL110231 pRL110232     FALSE 0.006 343.000 0.000 1.000   NA
 2207926 2207927 pRL110232 pRL110233     FALSE 0.108 78.000 0.000 NA N NA
 2207927 2207928 pRL110233 pRL110234     TRUE 0.843 6.000 0.043 NA   NA
 2207928 2207929 pRL110234 pRL110235     TRUE 0.960 2.000 0.231 NA   NA
 2207929 2207930 pRL110235 pRL110236     FALSE 0.002 420.000 0.000 1.000 N NA
 2207932 2207933 pRL110237 pRL110239     TRUE 0.944 1.000 0.125 NA   NA
 2207936 2207937 pRL110242 pRL110243     FALSE 0.488 124.000 0.348 1.000 N NA
 2207937 2207938 pRL110243 pRL110244     TRUE 0.907 178.000 0.867 0.086 Y NA
 2207938 2207939 pRL110244 pRL110245     TRUE 0.999 2.000 1.000 0.086 Y NA
 2207939 2207940 pRL110245 pRL110246     TRUE 0.983 11.000 0.857 1.000   NA
 2207940 2207941 pRL110246 pRL110247     TRUE 0.900 23.000 0.464 1.000   NA
 2207943 2207944 pRL110251 pRL110252     FALSE 0.316 27.000 0.000 NA   NA
 2207944 2207945 pRL110252 pRL110253     TRUE 0.855 14.000 0.227 NA   NA
 2207945 2207946 pRL110253 pRL110254     TRUE 0.639 55.000 0.227 NA   NA
 2207946 2207947 pRL110254 pRL110255     TRUE 0.952 8.000 0.368 NA   NA
 2207947 2207948 pRL110255 pRL110256     TRUE 0.808 22.000 0.263 NA   NA
 1576434 2207949 pRL110257 pRL110257A     FALSE 0.008 270.000 0.000 NA   NA
 2207949 2207950 pRL110257A pRL110257B     FALSE 0.220 54.000 0.000 NA   NA
 2207950 2207951 pRL110257B pRL110258     FALSE 0.033 187.000 0.000 NA   NA
 2207953 2207954 pRL110260A pRL110261     FALSE 0.274 35.000 0.000 NA   NA
 2207954 2207955 pRL110261 pRL110262     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 2207955 2207956 pRL110262 pRL110263     TRUE 0.992 -22.000 1.000 NA   NA
 2207956 2207957 pRL110263 pRL110264     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 2207957 2207958 pRL110264 pRL110265     TRUE 0.960 -24.000 0.333 NA   NA
 2207959 2207960 pRL110266 pRL110267     FALSE 0.022 210.000 0.000 NA   NA
 2207960 2207961 pRL110267 pRL110268     FALSE 0.004 321.000 0.000 NA   NA
 2207962 2207963 pRL110269 pRL110270     FALSE 0.002 382.000 0.000 NA N NA
 2207965 2207966 pRL110272 pRL110273     TRUE 0.948 -7.000 0.176 NA   NA
 2207967 2207968 pRL110274 pRL110275     TRUE 0.982 -3.000 0.300 NA   NA
 2207970 2207971 pRL110277 pRL110278     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.006 Y NA
 2207971 2207972 pRL110278 pRL110279     TRUE 0.997 2.000 0.714 1.000 Y NA
 2207972 2207973 pRL110279 pRL110280     TRUE 0.998 4.000 0.833 0.086 Y NA
 2207973 2207974 pRL110280 pRL110281     TRUE 0.921 114.000 0.500 0.086 Y NA
 2207974 2207975 pRL110281 pRL110282   abfA FALSE 0.036 313.000 0.250 1.000 N NA
 2207975 2207976 pRL110282 pRL110283 abfA   FALSE 0.099 211.000 0.167 1.000 N NA
 2207976 2207977 pRL110283 pRL110284     FALSE 0.003 402.000 0.000 1.000 N NA
 2207980 2207981 pRL110287 pRL110288 pcaI pcaJ TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.000 Y NA
 2207981 2207982 pRL110288 pRL110289 pcaJ pcaF TRUE 0.991 10.000 0.517 1.000 Y NA
 2207982 2207983 pRL110289 pRL110290 pcaF   FALSE 0.350 77.000 0.025 1.000   NA
 2207984 2207985 pRL110291 pRL110292   hycG FALSE 0.512 13.000 0.000 NA   NA
 2207985 2207986 pRL110292 pRL110293 hycG hycE TRUE 0.995 13.000 0.631 0.002 Y NA
 2207986 2207987 pRL110293 pRL110294 hycE hyfF TRUE 0.995 13.000 0.659 0.004 Y NA
 2207987 2207988 pRL110294 pRL110295 hyfF hyfE TRUE 0.999 -3.000 0.864 NA Y NA
 2207988 2207989 pRL110295 pRL110296 hyfE hycD TRUE 0.998 -3.000 0.679 NA Y NA
 2207989 2207990 pRL110296 pRL110297 hycD hyfB TRUE 0.984 -9.000 0.049 1.000 Y NA
 2207991 2207992 pRL110298 pRL110299     FALSE 0.003 381.000 0.000 NA   NA
 2207992 2207993 pRL110299 pRL110300     FALSE 0.003 412.000 0.000 1.000   NA
 2207993 2207994 pRL110300 pRL110301     TRUE 0.736 -13.000 0.000 NA   NA
 2207994 2207995 pRL110301 pRL110302     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 2207995 2207996 pRL110302 pRL110303     FALSE 0.151 83.000 0.000 NA   NA
 2207996 2207997 pRL110303 pRL110304   glgX TRUE 0.610 103.000 0.400 1.000 N NA
 2207997 2207998 pRL110304 pRL110305 glgX   TRUE 0.626 16.000 0.021 1.000 N NA
 2207998 1576485 pRL110305 pRL110306     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2207999 2208000 pRL110307 pRL110308     TRUE 0.855 7.000 0.067 NA   NA
 2208000 2208001 pRL110308 pRL110309     FALSE 0.471 54.000 0.074 NA   NA
 2208001 1576489 pRL110309 pRL110309A     FALSE 0.255 40.000 0.000 NA   NA
 1576489 2208002 pRL110309A pRL110310     TRUE 0.801 1.000 0.000 NA   NA
 2208002 2208003 pRL110310 pRL110311     FALSE 0.001 804.000 0.000 NA   NA
 2208003 2208004 pRL110311 pRL110312     TRUE 0.880 47.000 0.625 NA   NA
 2208005 2208006 pRL110313 pRL110314 cls   FALSE 0.375 94.000 0.121 NA   NA
 2208007 2208008 pRL110315 pRL110316     FALSE 0.003 359.000 0.000 NA   NA
 2208008 2208009 pRL110316 pRL110317     FALSE 0.004 332.000 0.000 NA   NA
 2208011 2208012 pRL110318 pRL110319     FALSE 0.183 70.000 0.000 NA   NA
 2208013 2208014 pRL110320 pRL110321     FALSE 0.048 165.000 0.000 NA   NA
 2208014 2208015 pRL110321 pRL110322     FALSE 0.001 566.000 0.000 NA   NA
 2208015 2208016 pRL110322 pRL110323     FALSE 0.014 234.000 0.000 NA   NA
 2208017 2208018 pRL110324 pRL110325     FALSE 0.457 15.000 0.000 NA   NA
 2208019 2208020 pRL110326 pRL110327     FALSE 0.251 42.000 0.000 NA   NA
 2208020 2208021 pRL110327 pRL110328     TRUE 0.988 5.000 0.800 NA   NA
 2208021 2208022 pRL110328 pRL110329     TRUE 0.684 101.000 0.500 NA   NA
 2208023 2208024 pRL110330 pRL110331 hmrR   TRUE 0.839 55.000 0.250 0.002 N NA
 2208025 2208026 pRL110332 pRL110333     FALSE 0.078 129.000 0.000 NA   NA
 2208027 2208028 pRL110335 pRL110336     FALSE 0.311 28.000 0.000 NA   NA
 2208028 2208029 pRL110336 pRL110337     FALSE 0.077 130.000 0.000 NA   NA
 2208030 1576519 pRL110338 pRL110339     FALSE 0.001 533.000 0.000 NA   NA
 1576519 2208031 pRL110339 pRL110340     FALSE 0.481 14.000 0.000 NA   NA
 2208031 2208032 pRL110340 pRL110341     TRUE 0.957 7.000 0.116 0.041   NA
 2208035 2208036 pRL110344 pRL110345     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 2208036 2208037 pRL110345 pRL110346     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 2208037 2208038 pRL110346 pRL110347     FALSE 0.015 229.000 0.000 NA   NA
 2208038 2208039 pRL110347 pRL110348     FALSE 0.001 584.000 0.000 NA   NA
 2208039 2208040 pRL110348 pRL110349     FALSE 0.018 220.000 0.000 NA   NA
 2208040 2208041 pRL110349 pRL110350     FALSE 0.056 157.000 0.000 NA   NA
 2208041 2208042 pRL110350 pRL110351     FALSE 0.025 200.000 0.000 NA   NA
 2208042 2208043 pRL110351 pRL110351A     FALSE 0.269 36.000 0.000 NA   NA
 2208043 2208044 pRL110351A pRL110352     FALSE 0.044 170.000 0.000 NA   NA
 2208045 2208046 pRL110353 pRL110354     FALSE 0.097 113.000 0.000 NA   NA
 2208046 2208047 pRL110354 pRL110354A     FALSE 0.087 119.000 0.000 NA   NA
 2208048 2208049 pRL110354B pRL110355     FALSE 0.003 359.000 0.000 NA   NA
 2208050 2208051 pRL110356 pRL110357     FALSE 0.072 137.000 0.000 NA   NA
 2208055 2208056 pRL110361 pRL110362     FALSE 0.038 179.000 0.000 NA   NA
 2208056 2208057 pRL110362 pRL110363     TRUE 0.990 -3.000 0.478 1.000 N NA
 2208057 2208058 pRL110363 pRL110364     TRUE 0.744 36.000 0.265 1.000 N NA
 2208058 2208059 pRL110364 pRL110365     TRUE 0.943 97.000 0.529 0.085 Y NA
 2208059 2208060 pRL110365 pRL110366     TRUE 0.997 5.000 0.647 0.085 Y NA
 2208060 2208061 pRL110366 pRL110367     TRUE 0.989 5.000 0.088 0.085 Y NA
 2208061 2208062 pRL110367 pRL110368     FALSE 0.242 73.000 0.000 1.000   NA
 2208062 2208063 pRL110368 pRL110369   pepT FALSE 0.157 103.000 0.000 1.000   NA
 2208064 2208065 pRL110370 pRL110371     FALSE 0.010 263.000 0.000 1.000 N NA
 2208065 2208066 pRL110371 pRL110372     TRUE 0.960 11.000 0.025 1.000 Y NA
 2208066 2208067 pRL110372 pRL110373     TRUE 0.997 -10.000 0.935 0.000 N NA
 2208067 2208068 pRL110373 pRL110374     TRUE 0.938 9.000 0.026 0.001 N NA
 2208070 2208071 pRL110376 pRL110377   kdpE TRUE 0.901 42.000 0.169 1.000 Y NA
 2208071 2208072 pRL110377 pRL110378 kdpE kdpD TRUE 0.998 -3.000 0.695 1.000 Y NA
 2208072 2208073 pRL110378 pRL110379 kdpD kdpC TRUE 0.612 82.000 0.106 0.091 N NA
 2208073 2208074 pRL110379 pRL110380 kdpC kdpB TRUE 0.985 76.000 0.877 0.000 Y NA
 2208074 2208075 pRL110380 pRL110381 kdpB kdpA TRUE 0.599 210.000 0.201 0.000 Y NA
 2208077 2208078 pRL110383 pRL110384     TRUE 0.568 31.000 0.073 NA   NA
 2208078 2208079 pRL110384 pRL110385     TRUE 0.986 -3.000 0.364 NA   NA
 2208079 2208080 pRL110385 pRL110386     FALSE 0.084 193.000 0.071 NA   NA
 2208083 2208084 pRL110389 pRL110390     TRUE 0.569 118.000 0.000 1.000 Y NA
 2208084 2208085 pRL110390 pRL110391     TRUE 0.911 27.000 0.091 1.000 Y NA
 2208085 2208086 pRL110391 pRL110392     TRUE 0.925 -13.000 0.136 NA   NA
 2208086 2208087 pRL110392 pRL110393     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2208087 2208088 pRL110393 pRL110394     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2208088 2208089 pRL110394 pRL110395     TRUE 0.780 -7.000 0.000 NA   NA
 2208089 2208090 pRL110395 pRL110396     TRUE 0.680 6.000 0.000 NA   NA
 2208090 2208091 pRL110396 pRL110397     FALSE 0.519 17.000 0.000 1.000   NA
 2208091 2208092 pRL110397 pRL110398     FALSE 0.013 239.000 0.000 NA   NA
 2208092 2208093 pRL110398 pRL110399     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2208093 2208094 pRL110399 pRL110400     FALSE 0.002 481.000 0.000 NA   NA
 2208094 2208095 pRL110400 pRL110401     TRUE 0.993 6.000 0.548 NA Y NA
 2208095 2208096 pRL110401 pRL110402     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.030 Y NA
 2208096 2208097 pRL110402 pRL110403     TRUE 0.993 5.000 0.447 1.000 Y NA
 2208097 2208098 pRL110403 pRL110404     TRUE 0.999 2.000 0.902 0.085 Y NA
 2208098 2208099 pRL110404 pRL110405     TRUE 0.821 123.000 0.390 1.000 Y NA
 2208099 2208100 pRL110405 pRL110406     TRUE 0.898 11.000 0.222 1.000 N NA
 2208101 2208102 pRL110407 pRL110408   rhaK FALSE 0.505 80.000 0.188 1.000 N NA
 2208102 2208103 pRL110408 pRL110409 rhaK rhaU TRUE 0.967 -3.000 0.147 NA   NA
 2208103 2208104 pRL110409 pRL110410 rhaU rhaQ TRUE 0.969 -3.000 0.168 NA   NA
 2208104 2208105 pRL110410 pRL110411 rhaQ rhaP TRUE 0.999 -3.000 0.515 0.085 Y NA
 2208105 2208106 pRL110411 pRL110412 rhaP rhaT TRUE 0.997 10.000 0.794 0.094 Y NA
 2208106 2208107 pRL110412 pRL110413 rhaT rhaS TRUE 0.922 71.000 0.446 NA Y NA
 2208107 2208108 pRL110413 pRL110414 rhaS rhaR TRUE 0.959 22.000 0.357 NA Y NA
 2208109 2208110 pRL110415 pRL110416 rhaD rhaI FALSE 0.058 239.000 0.147 NA   NA
 2208112 2208113 pRL110418 pRL110419     FALSE 0.305 167.000 0.273 1.000   NA
 2208117 2208118 pRL110423 pRL110424     TRUE 0.877 14.000 0.267 NA   NA
 2208119 2208120 pRL110425 pRL110426     TRUE 0.836 72.000 0.625 NA   NA
 2208121 2208122 pRL110427 pRL110428     TRUE 0.682 65.000 0.333 NA N NA
 2208124 2208125 pRL110430 pRL110431     FALSE 0.355 88.000 0.086 NA   NA
 2208125 2208126 pRL110431 pRL110432     FALSE 0.489 98.000 0.250 NA   NA
 2208127 2208128 pRL110433 pRL110434     TRUE 0.844 71.000 0.125 1.000 Y NA
 2208128 2208129 pRL110434 pRL110435     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.006 Y NA
 2208129 2208130 pRL110435 pRL110436     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 2208130 2208131 pRL110436 pRL110437     TRUE 0.999 2.000 0.800 0.085 Y NA
 2208131 2208132 pRL110437 pRL110438     TRUE 0.983 56.000 0.800 0.085 Y NA
 2208132 2208133 pRL110438 pRL110439     FALSE 0.387 43.000 0.013 1.000 N NA
 2208133 2208134 pRL110439 pRL110440     TRUE 0.539 25.000 0.013 1.000   NA
 2208134 2208135 pRL110440 pRL110441   thiD FALSE 0.021 234.000 0.000 1.000   NA
 2208135 2208136 pRL110441 pRL110442 thiD thiE TRUE 0.997 -3.000 0.109 0.003 Y NA
 2208136 2208137 pRL110442 pRL110443 thiE thiM TRUE 0.997 -3.000 0.146 0.003 Y NA
 2208137 2208138 pRL110443 pRL110444 thiM   FALSE 0.020 239.000 0.000 1.000   NA
 2208138 2208139 pRL110444 pRL110445     TRUE 0.696 10.000 0.000 1.000   NA
 2208139 2208140 pRL110445 pRL110446     FALSE 0.107 135.000 0.000 1.000   NA
 2208140 2208141 pRL110446 pRL110447     TRUE 0.988 -3.000 0.389 1.000   NA
 2208141 2208142 pRL110447 pRL110448     TRUE 0.738 68.000 0.389 1.000 N NA
 2208142 2208143 pRL110448 pRL110449     TRUE 0.922 26.000 0.000 0.085 Y NA
 2208143 2208144 pRL110449 pRL110450     TRUE 0.991 0.000 0.000 0.085 Y NA
 2208144 2208145 pRL110450 pRL110451     TRUE 0.983 0.000 0.438 NA N NA
 2208145 2208146 pRL110451 pRL110452     TRUE 0.996 -3.000 0.938 NA N NA
 2208146 2208147 pRL110452 pRL110453     FALSE 0.016 225.000 0.000 NA   NA
 2208148 2208149 pRL110454 pRL110455     TRUE 0.958 81.000 0.542 0.085 Y NA
 2208149 2208150 pRL110455 pRL110456     TRUE 0.999 0.000 0.625 0.085 Y NA
 2208150 2208151 pRL110456 pRL110457     TRUE 0.650 51.000 0.250 NA N NA
 2208151 2208152 pRL110457 pRL110458     FALSE 0.474 69.000 0.146 NA N NA
 2208152 2208153 pRL110458 pRL110459     TRUE 0.599 36.000 0.083 1.000   NA
 2208155 2208156 pRL110461 pRL110462     FALSE 0.092 116.000 0.000 NA   NA
 2208156 2208157 pRL110462 pRL110463     FALSE 0.374 20.000 0.000 NA   NA
 2208157 2208158 pRL110463 pRL110464     FALSE 0.386 19.000 0.000 NA   NA
 2208160 2208161 pRL110466 pRL110467     FALSE 0.095 114.000 0.000 NA   NA
 2208161 2208162 pRL110467 pRL110468     TRUE 0.987 7.000 0.842 NA   NA
 2208163 2208164 pRL110469 pRL110470     FALSE 0.201 61.000 0.000 NA   NA
 2208164 2208165 pRL110470 pRL110471     FALSE 0.083 123.000 0.000 NA   NA
 2208165 2208166 pRL110471 pRL110472     FALSE 0.110 77.000 0.000 NA N NA
 2208167 2208168 pRL110473 pRL110474     TRUE 0.990 -3.000 0.477 NA   NA
 2208169 2208170 pRL110475 pRL110476     FALSE 0.517 88.000 0.200 1.000   NA
 2208170 2208171 pRL110476 pRL110477     TRUE 0.815 25.000 0.300 1.000 N NA
 2208171 2208172 pRL110477 pRL110478     TRUE 0.974 2.000 0.308 1.000   NA
 2208172 2208173 pRL110478 pRL110479     TRUE 0.991 -3.000 0.474 1.000   NA
 2208173 2208174 pRL110479 pRL110480     TRUE 0.998 -3.000 0.474 0.085 Y NA
 2208174 2208175 pRL110480 pRL110481     FALSE 0.240 179.000 0.267 1.000 N NA
 2208175 2208176 pRL110481 pRL110482     TRUE 0.969 38.000 0.400 0.072 Y NA
 2208179 2208180 pRL110485 pRL110486     TRUE 0.902 14.000 0.300 1.000   NA
 2208180 2208181 pRL110486 pRL110487     TRUE 0.998 -3.000 0.433 0.085 Y NA
 2208181 2208182 pRL110487 pRL110488     TRUE 0.942 74.000 0.357 0.085 Y NA
 2208182 2208183 pRL110488 pRL110489     TRUE 0.719 193.000 0.400 0.085 Y NA
 2208184 2208185 pRL110490 pRL110491     TRUE 0.559 15.000 0.000 1.000   NA
 2208185 2208186 pRL110491 pRL110492     TRUE 0.990 3.000 0.429 0.036   NA
 2208186 2208187 pRL110492 pRL110493     TRUE 0.823 17.000 0.000 0.007   NA
 2208187 2208188 pRL110493 pRL110494     TRUE 0.864 -3.000 0.000 NA   NA
 2208188 2208189 pRL110494 pRL110495     TRUE 0.988 -3.000 0.429 NA   NA
 2208189 2208190 pRL110495 pRL110496     TRUE 0.977 -3.000 0.200 1.000   NA
 2208190 2208191 pRL110496 pRL110497     FALSE 0.035 183.000 0.000 NA   NA
 2208191 2208192 pRL110497 pRL110498     FALSE 0.156 80.000 0.000 NA   NA
 2208192 2208193 pRL110498 pRL110499     TRUE 0.959 1.000 0.205 NA   NA
 2208193 2208194 pRL110499 pRL110500     TRUE 0.732 31.000 0.231 NA   NA
 2208195 2208196 pRL110501 pRL110502     TRUE 0.905 22.000 0.538 NA N NA
 2208196 2208197 pRL110502 pRL110503     TRUE 0.988 -3.000 0.417 1.000 N NA
 2208197 2208198 pRL110503 pRL110504     TRUE 0.592 62.000 0.167 1.000   NA
 2208198 2208199 pRL110504 pRL110505     TRUE 0.658 85.000 0.333 1.000   NA
 2208202 2208203 pRL110508 pRL110509     TRUE 0.794 51.000 0.167 0.042   NA
 2208205 2208206 pRL110511 pRL110512     FALSE 0.312 49.000 0.000 1.000   NA
 2208206 2208207 pRL110512 pRL110513     TRUE 0.643 12.000 0.000 1.000   NA
 2208207 2208208 pRL110513 pRL110514     TRUE 0.996 -3.000 0.051 0.006 Y NA
 2208208 2208209 pRL110514 pRL110515     TRUE 0.992 -3.000 0.051 1.000 Y NA
 2208209 2208210 pRL110515 pRL110516     TRUE 0.995 0.000 0.136 0.085 Y NA
 2208210 2208211 pRL110516 pRL110517     TRUE 0.957 21.000 0.091 0.085 Y NA
 2208212 2208213 pRL110518 pRL110519     FALSE 0.020 237.000 0.000 1.000   NA
 2208216 2208217 pRL110522 pRL110523     FALSE 0.018 218.000 0.000 NA   NA
 2208217 2208218 pRL110523 pRL110524     FALSE 0.240 46.000 0.000 NA   NA
 2208218 2208219 pRL110524 pRL110525     FALSE 0.030 191.000 0.000 NA   NA
 2208219 2208220 pRL110525 pRL110526     FALSE 0.002 442.000 0.000 NA   NA
 2208222 2208223 pRL110528 pRL110529     FALSE 0.336 144.000 0.235 1.000 N NA
 2208223 2208224 pRL110529 pRL110530     TRUE 0.977 -3.000 0.235 1.000 N NA
 2208224 2208225 pRL110530 pRL110531     FALSE 0.386 19.000 0.000 NA   NA
 2208225 2208226 pRL110531 pRL110532     FALSE 0.042 174.000 0.000 NA   NA
 2208226 2208227 pRL110532 pRL110533     FALSE 0.103 182.000 0.070 NA   NA
 2208227 2208228 pRL110533 pRL110534     FALSE 0.134 95.000 0.000 1.000 N NA
 2208228 2208229 pRL110534 pRL110535     TRUE 0.997 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 2208229 2208230 pRL110535 pRL110536     FALSE 0.017 248.000 0.000 1.000   NA
 2208231 2208232 pRL110537 pRL110538     FALSE 0.210 64.000 0.000 1.000 N NA
 2208232 2208233 pRL110538 pRL110539     FALSE 0.061 240.000 0.000 0.042 N NA
 2208235 2208236 pRL110541 pRL110542   cspA FALSE 0.008 283.000 0.000 1.000 N NA
 2208236 2208237 pRL110542 pRL110543 cspA   FALSE 0.001 599.000 0.000 NA   NA
 2208238 2208239 pRL110544 pRL110545 minE minD TRUE 0.998 -3.000 0.618 NA Y NA
 2208239 2208240 pRL110545 pRL110546 minD minC TRUE 0.917 83.000 0.466 1.000 Y NA
 2208240 2208241 pRL110546 pRL110547 minC   FALSE 0.032 210.000 0.000 1.000   NA
 2208241 2208242 pRL110547 pRL110548     FALSE 0.300 113.000 0.082 1.000   NA
 2208242 2208243 pRL110548 pRL110549     TRUE 0.551 51.000 0.122 NA   NA
 2208243 2208244 pRL110549 pRL110550     TRUE 0.887 32.000 0.543 NA   NA
 2208244 2208245 pRL110550 pRL110551     TRUE 0.997 -3.000 0.565 0.009   NA
 2208245 2208246 pRL110551 pRL110552     TRUE 0.949 12.000 0.438 1.000   NA
 2208246 2208247 pRL110552 pRL110553   purU FALSE 0.046 174.000 0.000 1.000 N NA
 2208247 2208248 pRL110553 pRL110554 purU glnT FALSE 0.357 95.000 0.104 1.000 N NA
 2208248 2208249 pRL110554 pRL110555 glnT gltB TRUE 0.922 81.000 0.493 1.000 Y NA
 2208249 2208250 pRL110555 pRL110556 gltB glxC TRUE 0.992 15.000 0.901 1.000 Y NA
 2208250 2208251 pRL110556 pRL110557 glxC glxB TRUE 0.999 -3.000 0.786 1.000 Y NA
 2208251 2208252 pRL110557 pRL110558 glxB   FALSE 0.491 89.000 0.206 1.000 N NA
 2208252 2208253 pRL110558 pRL110559     TRUE 0.954 30.000 0.140 0.023 Y NA
 2208254 2208255 pRL110560 pRL110561 soxB soxD TRUE 0.997 12.000 0.846 0.001 Y NA
 2208255 2208256 pRL110561 pRL110562 soxD soxA TRUE 0.998 -3.000 0.923 0.001   NA
 2208256 2208257 pRL110562 pRL110563 soxA soxG TRUE 0.991 -7.000 0.370 0.001   NA
 2208259 2208260 pRL110565 pRL110566     TRUE 0.940 14.000 0.500 NA   NA
 2208260 2208261 pRL110566 pRL110567     TRUE 0.963 6.000 0.400 NA   NA
 2208261 2208262 pRL110567 pRL110568     TRUE 0.993 -3.000 0.600 NA   NA
 2208262 2208263 pRL110568 pRL110569     TRUE 0.947 35.000 1.000 NA   NA
 2208263 2208264 pRL110569 pRL110570     TRUE 0.989 2.000 0.667 NA   NA
 2208264 2208265 pRL110570 pRL110571     TRUE 0.950 -3.000 0.062 NA   NA
 2208265 2208266 pRL110571 pRL110572     TRUE 0.630 21.000 0.062 NA   NA
 2208266 2208267 pRL110572 pRL110573     TRUE 0.975 27.000 0.600 1.000 Y NA
 2208267 2208268 pRL110573 pRL110574     TRUE 0.997 -3.000 0.158 0.006 Y NA
 2208268 2208269 pRL110574 pRL110575     TRUE 0.938 3.000 0.158 NA   NA
 2208270 2208271 pRL110576 pRL110577     FALSE 0.003 383.000 0.000 1.000 N NA
 2208273 2208274 pRL110579 pRL110580     FALSE 0.002 470.000 0.000 NA   NA
 2208274 2208275 pRL110580 pRL110581     TRUE 0.981 15.000 0.500 NA Y NA
 2208275 2208276 pRL110581 pRL110582     FALSE 0.057 156.000 0.000 NA   NA
 2208276 2208277 pRL110582 pRL110583     FALSE 0.190 67.000 0.000 NA   NA
 2208277 2208278 pRL110583 pRL110584     TRUE 0.914 14.000 0.116 0.041   NA
 2208278 2208279 pRL110584 pRL110585     FALSE 0.112 102.000 0.000 NA   NA
 2208279 2208280 pRL110585 pRL110586     FALSE 0.097 113.000 0.000 NA   NA
 2208280 2208281 pRL110586 pRL110587     FALSE 0.045 169.000 0.000 NA   NA
 2208281 2208282 pRL110587 pRL110588     TRUE 0.617 44.000 0.158 1.000 N NA
 2208282 2208283 pRL110588 pRL110589     TRUE 0.961 14.000 0.158 1.000 Y NA
 2208283 2208284 pRL110589 pRL110590     TRUE 0.994 -3.000 0.300 0.001   NA
 2208284 2208285 pRL110590 pRL110591     TRUE 0.909 23.000 0.500 1.000   NA
 2208285 2208286 pRL110591 pRL110592     FALSE 0.021 211.000 0.000 NA   NA
 2208286 2208287 pRL110592 pRL110593     FALSE 0.401 18.000 0.000 NA   NA
 2208287 2208288 pRL110593 pRL110594     TRUE 0.823 0.000 0.000 NA   NA
 2208290 2208291 pRL110596 pRL110597     FALSE 0.005 363.000 0.000 1.000   NA
 2208291 2208292 pRL110597 pRL110598     FALSE 0.018 245.000 0.000 1.000   NA
 2208292 2208293 pRL110598 pRL110599     FALSE 0.345 109.000 0.000 0.069 N NA
 2208294 2208295 pRL110600 pRL110601     FALSE 0.523 73.000 0.131 1.000   NA
 2208295 2208296 pRL110601 pRL110602     FALSE 0.035 203.000 0.000 1.000   NA
 2208297 2208298 pRL110603 pRL110604     TRUE 0.858 67.000 0.667 NA   NA
 2208298 2208299 pRL110604 pRL110605     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 2208299 2208300 pRL110605 pRL110606     FALSE 0.009 264.000 0.000 NA   NA
 2208301 2208302 pRL110607 pRL110608     FALSE 0.019 215.000 0.000 NA   NA
 2208303 2208304 pRL110609 pRL110610     TRUE 0.835 33.000 0.400 1.000 N NA
 2208304 2208305 pRL110610 pRL110611     TRUE 0.636 30.000 0.118 NA   NA
 2208305 2208306 pRL110611 pRL110612     FALSE 0.339 87.000 0.071 NA   NA
 2208306 2208307 pRL110612 pRL110613     TRUE 0.988 5.000 0.250 1.000 Y NA
 2208307 2208308 pRL110613 pRL110614     TRUE 0.993 6.000 0.538 NA Y NA
 2208308 2208309 pRL110614 pRL110614A     FALSE 0.008 274.000 0.000 NA   NA
 2208309 2208310 pRL110614A pRL110615   nadC FALSE 0.004 321.000 0.000 NA   NA
 2208310 2208311 pRL110615 pRL110616 nadC nadB TRUE 0.996 -7.000 0.223 0.001 Y NA
 2208311 2208312 pRL110616 pRL110617 nadB nadA TRUE 0.998 -3.000 0.210 0.001 Y NA
 2208312 2208313 pRL110617 pRL110618 nadA   FALSE 0.404 70.000 0.037 1.000   NA
 2208313 2208314 pRL110618 pRL110619     FALSE 0.486 30.000 0.006 1.000   NA
 2208314 2208315 pRL110619 pRL110620     FALSE 0.512 27.000 0.008 1.000   NA
 2208315 2208316 pRL110620 pRL110621     TRUE 0.986 12.000 0.727 0.036   NA
 2208316 2208317 pRL110621 pRL110622     TRUE 0.979 22.000 1.000 0.042 N NA
 2208318 2208319 pRL110623 pRL110624     FALSE 0.531 163.000 0.119 NA Y NA
 2208320 2208321 pRL110625 pRL110626 cobM cobL TRUE 0.989 5.000 0.016 0.005 Y NA
 2208323 2208324 pRL110628 pRL110629 cobJ cobI TRUE 0.997 -3.000 0.138 0.005 Y NA
 2208324 2208325 pRL110629 pRL110630 cobI cobH TRUE 0.997 -3.000 0.191 0.005 Y NA
 2208325 2208326 pRL110630 pRL110631 cobH cobG TRUE 0.960 3.000 0.255 1.000 N NA
 2208326 2208327 pRL110631 pRL110632 cobG cobF FALSE 0.426 72.000 0.082 1.000 N NA