MicrobesOnline Operon Predictions for Burkholderia cenocepacia J2315

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5922282 5922283 BCAL0001 BCAL0002     TRUE 0.985 15.000 0.907 1.000   NA
 5922283 5922284 BCAL0002 BCAL0003     FALSE 0.003 508.000 0.000 1.000   NA
 5922284 5922285 BCAL0003 BCAL0004     TRUE 0.737 29.000 0.163 1.000 N NA
 5922285 5922286 BCAL0004 BCAL0005     FALSE 0.019 211.000 0.087 1.000 N NA
 5922286 5922287 BCAL0005 BCAL0006     FALSE 0.076 178.000 0.040 1.000   NA
 5922288 5922289 BCAL0007 BCAL0008     TRUE 0.924 121.000 0.833 1.000 Y NA
 5922291 5922292 BCAL0009 BCAL0010   phhA FALSE 0.054 161.000 0.087 1.000 N NA
 5922294 5922295 BCAL0012 BCAL0013     FALSE 0.022 205.000 0.089 NA N NA
 5922296 5922297 BCAL0014 BCAL0015     FALSE 0.020 439.000 0.000 1.000 Y NA
 5922297 5922298 BCAL0015 BCAL0016     TRUE 0.998 -3.000 0.716 0.021 Y NA
 5922298 5922299 BCAL0016 BCAL0017     TRUE 0.899 78.000 0.294 NA Y NA
 5922299 5922300 BCAL0017 BCAL0018     TRUE 0.735 133.000 0.273 NA Y NA
 5922300 5922301 BCAL0018 BCAL0019     TRUE 0.991 0.000 0.091 0.086 Y NA
 5922301 5922302 BCAL0019 BCAL0020     FALSE 0.011 1082.000 0.000 NA Y NA
 5922302 5922303 BCAL0020 BCAL0021     FALSE 0.341 207.000 0.320 NA Y NA
 5922303 5922304 BCAL0021 BCAL0022     TRUE 0.986 5.000 0.525 0.086 N NA
 5922304 5922305 BCAL0022 BCAL0023     TRUE 0.987 15.000 0.600 0.021 N NA
 5922305 5922306 BCAL0023 BCAL0024   gidA FALSE 0.000 541.000 0.009 1.000 N NA
 5922306 5922307 BCAL0024 BCAL0025 gidA gidB TRUE 0.958 -3.000 0.466 1.000 N NA
 5922307 5922308 BCAL0025 BCAL0026 gidB   TRUE 0.795 52.000 0.339 1.000 N NA
 5922308 5922309 BCAL0026 BCAL0027     TRUE 0.953 32.000 0.827 1.000 N NA
 5922309 5922310 BCAL0027 BCAL0028     FALSE 0.286 11.000 0.016 1.000 N NA
 5922310 5922311 BCAL0028 BCAL0029     FALSE 0.000 569.000 0.000 1.000 N NA
 5922311 5922312 BCAL0029 BCAL0030   atpB TRUE 0.838 110.000 0.291 1.000 Y NA
 5922312 5922313 BCAL0030 BCAL0031 atpB atpE TRUE 0.982 76.000 0.557 0.002 Y NA
 5922313 5922314 BCAL0031 BCAL0032 atpE atpF TRUE 0.958 130.000 0.666 0.002 Y NA
 5922314 5922315 BCAL0032 BCAL0033 atpF atpH TRUE 0.996 3.000 0.242 0.002 Y NA
 5922315 5922316 BCAL0033 BCAL0034 atpH atpA TRUE 0.995 45.000 0.864 0.002 Y NA
 5922316 5922317 BCAL0034 BCAL0035 atpA atpG TRUE 0.991 69.000 0.846 0.002 Y NA
 5922317 5922318 BCAL0035 BCAL0036 atpG atpD TRUE 0.989 67.000 0.724 0.002 Y NA
 5922318 5922319 BCAL0036 BCAL0037 atpD atpC TRUE 0.975 122.000 0.837 0.002 Y NA
 5922319 5922320 BCAL0037 BCAL0038 atpC   FALSE 0.000 283.000 0.002 1.000 N NA
 5922322 5922323 BCAL0040 BCAL0041 hemE priA FALSE 0.000 452.000 0.000 1.000 N NA
 5922323 5922324 BCAL0041 BCAL0042 priA putA FALSE 0.000 378.000 0.000 1.000 N NA
 5922324 5922325 BCAL0042 BCAL0043 putA   FALSE 0.277 85.000 0.095 1.000 N NA
 5922325 5922326 BCAL0043 BCAL0044     FALSE 0.159 134.000 0.000 1.000   NA
 5922326 5922327 BCAL0044 BCAL0045     TRUE 0.973 0.000 0.056 0.072   NA
 5922328 5922329 BCAL0046 BCAL0047     TRUE 0.955 52.000 0.357 1.000 Y NA
 5922330 5922331 BCAL0048A BCAL0049     FALSE 0.028 212.000 0.000 1.000   NA
 5922331 5922332 BCAL0049 BCAL0050     FALSE 0.003 169.000 0.000 1.000 N NA
 5922332 5922333 BCAL0050 BCAL0051     FALSE 0.000 287.000 0.000 1.000 N NA
 5922333 5922334 BCAL0051 BCAL0052     TRUE 0.915 16.000 0.333 1.000 N NA
 5922335 5922336 BCAL0053 BCAL0054     TRUE 0.905 69.000 0.250 1.000 Y NA
 5922339 5922340 BCAL0057 BCAL0058     FALSE 0.052 190.000 0.016 NA   NA
 5922340 5922341 BCAL0058 BCAL0059   eutB TRUE 0.773 140.000 0.407 1.000 Y NA
 5922341 5922342 BCAL0059 BCAL0060 eutB eutC TRUE 0.999 -3.000 0.859 0.000 Y NA
 5922346 5922347 BCAL0064 BCAL0065 acoD   FALSE 0.427 177.000 0.667 1.000   NA
 5922347 5922348 BCAL0065 BCAL0066     FALSE 0.085 206.000 0.143 1.000   NA
 5922349 5922350 BCAL0067 BCAL0068   ilvG TRUE 0.748 12.000 0.091 NA N NA
 5922351 5922352 BCAL0069 BCAL0070     TRUE 0.953 -3.000 0.238 NA   NA
 5922353 5922354 BCAL0071 BCAL0072 sdaA   TRUE 0.970 31.000 0.778 1.000   NA
 5922354 5922355 BCAL0072 BCAL0073   gcvP FALSE 0.129 152.000 0.012 1.000   NA
 5922355 5922356 BCAL0073 BCAL0074 gcvP gcvH TRUE 0.929 59.000 0.249 1.000 Y NA
 5922356 5922357 BCAL0074 BCAL0075 gcvH gcvT TRUE 0.930 127.000 0.317 0.001 Y NA
 5922357 5922358 BCAL0075 BCALr0075A gcvT   FALSE 0.352 84.000 0.000 NA   NA
 5922358 5922359 BCALr0075A BCALr0075B     TRUE 0.650 34.000 0.000 NA   NA
 5922359 5922360 BCALr0075B BCAL0076     FALSE 0.243 114.000 0.000 NA   NA
 5922360 5922361 BCAL0076 BCAL0077     FALSE 0.260 204.000 0.556 NA   NA
 5922361 5922362 BCAL0077 BCAL0078     FALSE 0.008 302.000 0.000 1.000   NA
 5922366 5922367 BCAL0081 BCAL0082     TRUE 0.886 -132.000 0.333 NA   NA
 5922367 5922368 BCAL0082 BCAL0083     FALSE 0.003 507.000 0.000 NA   NA
 5922368 5922369 BCAL0083 BCAL0083a     TRUE 0.976 6.000 0.429 NA   NA
 5922369 5922370 BCAL0083a BCAL0084     FALSE 0.183 128.000 0.000 NA   NA
 5922370 5922371 BCAL0084 BCAL0084a     TRUE 0.654 -12.000 0.000 NA   NA
 5922371 5922372 BCAL0084a BCAL0085     TRUE 0.785 15.000 0.000 NA   NA
 5922373 5922374 BCAL0086 BCAL0087     FALSE 0.003 572.000 0.000 1.000   NA
 5922374 5922375 BCAL0087 BCALr0087     FALSE 0.592 -55.000 0.000 NA   NA
 5922375 5922376 BCALr0087 BCAL0088     TRUE 0.710 25.000 0.000 NA   NA
 5922377 5922378 BCAL0089 BCAL0090     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 5922378 5922379 BCAL0090 BCAL0091     TRUE 0.950 23.000 0.400 NA   NA
 5922379 5922380 BCAL0091 BCAL0092     TRUE 0.962 16.000 0.400 NA   NA
 5922380 5922381 BCAL0092 BCAL0093     TRUE 0.990 9.000 1.000 NA   NA
 5922381 5922382 BCAL0093 BCAL0094     TRUE 0.752 77.000 0.286 NA   NA
 5922382 5922383 BCAL0094 BCAL0095     TRUE 0.977 29.000 1.000 NA   NA
 5922383 5922384 BCAL0095 BCAL0096     TRUE 0.924 55.000 0.571 NA   NA
 5922384 5922385 BCAL0096 BCAL0097     TRUE 0.946 16.000 0.286 NA   NA
 5922385 5922386 BCAL0097 BCAL0098     TRUE 0.962 7.000 0.286 NA   NA
 5922386 5922387 BCAL0098 BCAL0099     TRUE 0.875 68.000 0.500 NA   NA
 5922387 5922388 BCAL0099 BCAL0100     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 5922388 5922389 BCAL0100 BCAL0101     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 5922389 5922390 BCAL0101 BCAL0102     FALSE 0.005 386.000 0.000 NA   NA
 5922390 5922391 BCAL0102 BCAL0103     FALSE 0.235 117.000 0.000 NA   NA
 5922391 5922392 BCAL0103 BCAL0104     TRUE 0.880 -3.000 0.043 NA   NA
 5922392 5922393 BCAL0104 BCAL0105     TRUE 0.895 3.000 0.043 NA   NA
 5922393 5922394 BCAL0105 BCAL0106     TRUE 0.991 2.000 1.000 NA   NA
 5922394 5922395 BCAL0106 BCAL0107     TRUE 0.985 17.000 1.000 NA   NA
 5922396 5922397 BCAL0108 BCAL0109     FALSE 0.030 210.000 0.000 NA   NA
 5922398 5922399 BCAL0110 BCAL0111     TRUE 0.648 30.000 0.116 1.000 N NA
 5922399 5922400 BCAL0111 BCAL0112     FALSE 0.015 257.000 0.000 NA   NA
 5922400 5922401 BCAL0112 BCAL0113   fliD1 TRUE 0.969 26.000 0.667 NA   NA
 5922401 5922402 BCAL0113 BCAL0114 fliD1 fliC TRUE 0.681 133.000 0.188 1.000 Y NA
 5922407 5922408 BCAL0119 BCAL0120     FALSE 0.296 140.000 0.118 1.000   NA
 5922412 5922413 BCAL0124 BCAL0125 flhD flhC TRUE 0.970 93.000 0.938 0.001   NA
 5922413 5922414 BCAL0125 BCAL0126 flhC motA FALSE 0.163 181.000 0.204 1.000   NA
 5922414 5922415 BCAL0126 BCAL0127 motA motB TRUE 0.983 14.000 0.306 1.000 Y NA
 5922415 5922416 BCAL0127 BCAL0128 motB cheY TRUE 0.962 25.000 0.824 1.000 N NA
 5922416 5922417 BCAL0128 BCAL0129 cheY cheA TRUE 0.941 34.000 0.118 1.000 Y NA
 5922417 5922418 BCAL0129 BCAL0130 cheA cheW TRUE 0.969 48.000 0.064 0.007 Y NA
 5922418 5922419 BCAL0130 BCAL0131 cheW tar TRUE 0.979 38.000 0.106 0.007 Y NA
 5922419 5922420 BCAL0131 BCAL0132 tar cheR TRUE 0.971 4.000 0.037 1.000 Y NA
 5922420 5922421 BCAL0132 BCAL0133 cheR cheD TRUE 0.991 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 5922421 5922422 BCAL0133 BCAL0134 cheD cheB1 TRUE 0.960 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5922422 5922423 BCAL0134 BCAL0135 cheB1 cheY TRUE 0.927 68.000 0.000 0.018 Y NA
 5922423 5922424 BCAL0135 BCAL0136 cheY cheZ TRUE 0.995 3.000 0.741 1.000 Y NA
 5922424 5922425 BCAL0136 BCAL0137 cheZ   FALSE 0.014 260.000 0.000 NA   NA
 5922425 5922426 BCAL0137 BCAL0138     TRUE 0.768 17.000 0.000 NA   NA
 5922426 5922427 BCAL0138 BCAL0139     FALSE 0.076 164.000 0.000 NA   NA
 5922427 5922428 BCAL0139 BCAL0140   flhB FALSE 0.004 430.000 0.000 NA   NA
 5922428 5922429 BCAL0140 BCAL0141 flhB flhA TRUE 0.992 -3.000 0.088 0.010 Y NA
 5922429 5922430 BCAL0141 BCAL0142 flhA   TRUE 0.966 -3.000 0.028 1.000 Y NA
 5922430 5922431 BCAL0142 BCAL0143     FALSE 0.587 -7.000 0.083 1.000 N NA
 5922431 5922432 BCAL0143 BCAL0144   fliA TRUE 0.784 26.000 0.193 1.000 N NA
 5922432 5922433 BCAL0144 BCAL0145 fliA ahcY FALSE 0.001 252.000 0.000 1.000 N NA
 5922433 5922434 BCAL0145 BCAL0146 ahcY   FALSE 0.349 109.000 0.042 NA   NA
 5922434 5922435 BCAL0146 BCAL0147   metF TRUE 0.828 31.000 0.109 NA   NA
 5922436 5922437 BCAL0148 BCAL0149     FALSE 0.538 81.000 0.245 1.000 N NA
 5922438 5922439 BCAL0150 BCAL0151     FALSE 0.004 439.000 0.000 1.000   NA
 5922441 5922442 BCAL0153 BCAL0154     FALSE 0.006 357.000 0.000 1.000   NA
 5922442 5922443 BCAL0154 BCAL0155     FALSE 0.014 257.000 0.000 1.000   NA
 5922444 5922445 BCAL0156 BCAL0157     TRUE 0.801 80.000 0.395 1.000   NA
 5922445 5922446 BCAL0157 BCAL0158     TRUE 0.878 -3.000 0.044 1.000   NA
 5922449 5922450 BCAL0161 BCAL0162   gmhA FALSE 0.259 127.000 0.187 1.000 N NA
 5922450 5922451 BCAL0162 BCAL0163 gmhA   TRUE 0.983 -3.000 0.613 NA   NA
 5922451 5922452 BCAL0163 BCAL0164     TRUE 0.889 -3.000 0.054 NA   NA
 5922452 5922453 BCAL0164 BCALr0164     FALSE 0.440 67.000 0.000 NA   NA
 5922453 5922454 BCALr0164 BCAL0165     FALSE 0.002 890.000 0.000 NA   NA
 5922455 5922456 BCAL0166 BCAL0167     TRUE 0.973 0.000 0.056 0.072   NA
 5922456 5922457 BCAL0167 BCAL0168     FALSE 0.574 46.000 0.000 NA   NA
 5922457 5922458 BCAL0168 BCAL0169     FALSE 0.230 118.000 0.000 NA   NA
 5922459 5922460 BCAL0170 BCAL0171     TRUE 0.612 -22.000 0.000 NA   NA
 5922460 5922461 BCAL0171 BCAL0172     FALSE 0.006 343.000 0.000 NA   NA
 5922461 5922462 BCAL0172 BCAL0173     FALSE 0.481 127.000 0.222 NA   NA
 5922462 5922463 BCAL0173 BCAL0173a     TRUE 0.822 10.000 0.000 NA   NA
 5922463 5922464 BCAL0173a BCAL0174     TRUE 0.746 20.000 0.000 NA   NA
 5922464 5922465 BCAL0174 BCAL0175     TRUE 0.789 65.000 0.250 NA   NA
 5922465 5922466 BCAL0175 BCAL0176     TRUE 0.904 -9.000 0.250 NA   NA
 5922466 5922467 BCAL0176 BCAL0177     TRUE 0.972 -3.000 0.400 NA   NA
 5922467 5922468 BCAL0177 BCAL0178     FALSE 0.008 309.000 0.000 NA   NA
 5922469 5922470 BCAL0179 BCAL0180     TRUE 0.848 3.000 0.000 NA   NA
 5922470 5922471 BCAL0180 BCAL0181     TRUE 0.830 8.000 0.000 NA   NA
 5922471 5922472 BCAL0181 BCAL0182     FALSE 0.007 331.000 0.000 1.000   NA
 5922472 5922473 BCAL0182 BCAL0183   gudD FALSE 0.021 229.000 0.000 1.000   NA
 5922473 5922474 BCAL0183 BCAL0184 gudD gudP TRUE 0.894 63.000 0.769 1.000 N NA
 5922474 5922475 BCAL0184 BCAL0185 gudP   FALSE 0.001 215.000 0.000 NA N NA
 5922476 5922477 BCAL0186 BCAL0187     FALSE 0.188 127.000 0.000 NA   NA
 5922477 5922478 BCAL0187 BCAL0188     TRUE 0.970 16.000 0.500 NA   NA
 5922479 5922480 BCAL0189 BCAL0190     TRUE 0.980 9.000 0.820 NA N NA
 5922480 5922481 BCAL0190 BCAL0191     TRUE 0.992 22.000 0.839 NA Y NA
 5922481 5922482 BCAL0191 BCAL0192     TRUE 0.981 6.000 0.810 1.000 N NA
 5922485 5922486 BCAL0194 BCAL0195     FALSE 0.027 74.000 0.000 1.000 N NA
 5922489 5922490 BCAL0198 BCAL0199     TRUE 0.777 16.000 0.000 NA   NA
 5922490 5922491 BCAL0199 BCAL0200     FALSE 0.289 149.000 0.154 NA   NA
 5922491 5922492 BCAL0200 BCAL0201   argC FALSE 0.004 435.000 0.000 NA   NA
 5922492 5922493 BCAL0201 BCAL0202 argC   FALSE 0.141 192.000 0.214 1.000   NA
 5922493 5922494 BCAL0202 BCAL0203     FALSE 0.038 215.000 0.036 NA   NA
 5922494 5922495 BCAL0203 BCAL0204   pyrE FALSE 0.017 241.000 0.000 NA   NA
 5922501 5922502 BCAL0209 BCAL0210     FALSE 0.019 235.000 0.000 1.000   NA
 5922502 5922503 BCAL0210 BCAL0211     TRUE 0.963 14.000 0.383 NA   NA
 5922503 5922504 BCAL0211 BCAL0212   paaE FALSE 0.398 128.000 0.150 NA   NA
 5922504 5922505 BCAL0212 BCAL0213 paaE paaD TRUE 0.984 3.000 0.571 NA   NA
 5922505 5922506 BCAL0213 BCAL0214 paaD paaC TRUE 0.978 26.000 0.919 NA   NA
 5922506 5922507 BCAL0214 BCAL0215 paaC paaB TRUE 0.989 11.000 0.943 NA   NA
 5922507 5922508 BCAL0215 BCAL0216 paaB paaA TRUE 0.971 36.000 0.920 NA   NA
 5922509 5922510 BCAL0217       FALSE 0.003 566.000 0.000 NA   NA
 5922510 5922511   BCALr0217b     FALSE 0.459 65.000 0.000 NA   NA
 5922511 5922512 BCALr0217b BCALr0217c     FALSE 0.611 40.000 0.000 NA   NA
 5922512 5922513 BCALr0217c       FALSE 0.011 280.000 0.000 NA   NA
 5922513 5922514         FALSE 0.091 158.000 0.000 NA   NA
 5922514 5922515   BCAL0218     FALSE 0.002 1527.000 0.000 NA   NA
 5922515 5922516 BCAL0218 BCALr0218a     FALSE 0.008 306.000 0.000 NA   NA
 5922516 5922517 BCALr0218a BCALr0218b     FALSE 0.587 44.000 0.000 NA   NA
 5922517 5922518 BCALr0218b BCALr0218c     TRUE 0.726 23.000 0.000 NA   NA
 5922518 5922519 BCALr0218c BCAL0219   tufA1 FALSE 0.440 67.000 0.000 NA   NA
 5922519 5922520 BCAL0219 BCALr00219 tufA1   FALSE 0.500 60.000 0.000 NA   NA
 5922520 5922521 BCALr00219 BCAL0220   secE FALSE 0.593 43.000 0.000 NA   NA
 5922521 5922522 BCAL0220 BCAL0221 secE nusG TRUE 0.984 2.000 0.843 1.000 N NA
 5922522 5922523 BCAL0221 BCAL0222 nusG relC FALSE 0.561 142.000 0.681 1.000 N NA
 5922523 5922524 BCAL0222 BCAL0223 relC rplA TRUE 0.999 1.000 0.838 0.011 Y NA
 5922524 5922525 BCAL0223 BCAL0224 rplA rplJ FALSE 0.108 310.000 0.302 1.000 Y NA
 5922525 5922526 BCAL0224 BCAL0225 rplJ rplL TRUE 0.976 64.000 0.884 1.000 Y NA
 5922526 5922527 BCAL0225 BCAL0226 rplL   FALSE 0.020 382.000 0.223 1.000   NA
 5922527 5922528 BCAL0226 BCAL0227   rpoC TRUE 0.995 22.000 0.851 0.000   NA
 5922528 5922529 BCAL0227 BCAL0228 rpoC recQ FALSE 0.001 280.000 0.008 1.000 N NA
 5922529 5922530 BCAL0228 BCAL0229 recQ rpsL FALSE 0.001 227.000 0.000 1.000 N NA
 5922530 5922531 BCAL0229 BCAL0230 rpsL rpsG TRUE 0.865 173.000 0.620 0.002 Y NA
 5922531 5922532 BCAL0230 BCAL0231 rpsG fusA TRUE 0.878 124.000 0.579 1.000 Y NA
 5922532 5922533 BCAL0231 BCAL0232 fusA tuf TRUE 0.991 43.000 0.400 0.001 Y NA
 5922533 5922534 BCAL0232 BCAL0233 tuf rpsJ FALSE 0.139 288.000 0.318 1.000 Y NA
 5922534 5922535 BCAL0233 BCAL0234 rpsJ rplC TRUE 0.717 179.000 0.307 0.011 Y NA
 5922535 5922536 BCAL0234 BCAL0235a rplC rplD TRUE 0.998 0.000 0.486 0.008 Y NA
 5922536 5922537 BCAL0235a BCAL0236 rplD rplW TRUE 0.992 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 5922537 5922538 BCAL0236 BCAL0237 rplW rplB TRUE 0.996 3.000 0.849 1.000 Y NA
 5922538 5922539 BCAL0237 BCAL0238 rplB rpsS TRUE 0.998 11.000 0.820 0.011 Y NA
 5922539 5922540 BCAL0238 BCAL0239a rpsS rplV TRUE 0.998 13.000 0.769 0.011 Y NA
 5922540 10942885 BCAL0239a BCAL0239 rplV   FALSE 0.557 -317.000 0.000 NA   NA
 10942885 5922541 BCAL0239 BCAL0240   rpsC TRUE 0.785 15.000 0.000 NA   NA
 5922541 5922542 BCAL0240 BCAL0241 rpsC rplP TRUE 0.999 3.000 0.828 0.011 Y NA
 5922542 5922543 BCAL0241 BCAL0242 rplP rpmC TRUE 0.998 10.000 0.802 0.008 Y NA
 5922543 5922544 BCAL0242 BCAL0243 rpmC rpsQ TRUE 0.998 -3.000 0.828 0.008 Y NA
 5922544 10942886 BCAL0243 BCAL0243a rpsQ   FALSE 0.561 -230.000 0.000 NA   NA
 10942886 5922545 BCAL0243a BCAL0244   rplN FALSE 0.007 334.000 0.000 NA   NA
 5922545 5922546 BCAL0244 BCAL0245 rplN rplX TRUE 0.998 10.000 0.810 0.011 Y NA
 5922546 5922547 BCAL0245 BCAL0246 rplX rplE TRUE 0.997 17.000 0.758 0.008 Y NA
 5922547 5922548 BCAL0246 BCAL0247 rplE rpsN TRUE 0.996 8.000 0.309 0.008 Y NA
 5922548 5922549 BCAL0247 BCAL0248 rpsN rpsH TRUE 0.994 15.000 0.295 0.008 Y NA
 5922549 5922550 BCAL0248 BCAL0249 rpsH rplF TRUE 0.997 19.000 0.808 0.008 Y NA
 5922550 5922551 BCAL0249 BCAL0250 rplF rplR TRUE 0.998 13.000 0.815 0.008 Y NA
 5922551 5922552 BCAL0250 BCAL0251 rplR rpsE TRUE 0.998 15.000 0.814 0.011 Y NA
 5922552 5922553 BCAL0251 BCAL0252 rpsE rpmD TRUE 0.998 16.000 0.789 0.011 Y NA
 5922553 5922554 BCAL0252 BCAL0253 rpmD rplO TRUE 0.996 27.000 0.653 0.002 Y NA
 5922554 5922555 BCAL0253 BCAL0254 rplO secY TRUE 0.926 43.000 0.730 1.000 N NA
 5922555 5922556 BCAL0254 BCAL0255 secY infA1 TRUE 0.748 8.000 0.083 1.000 N NA
 5922556 5922557 BCAL0255 BCAL0256 infA1 rpmJ TRUE 0.867 21.000 0.104 1.000   NA
 5922557 5922558 BCAL0256 BCAL0257 rpmJ rpsM TRUE 0.957 39.000 0.194 0.008   NA
 5922558 5922559 BCAL0257 BCAL0258 rpsM rpsK TRUE 0.996 29.000 0.810 0.008 Y NA
 5922559 5922560 BCAL0258 BCAL0259 rpsK rpsD TRUE 0.893 155.000 0.509 0.011 Y NA
 5922560 5922561 BCAL0259 BCAL0260 rpsD rpoA FALSE 0.589 125.000 0.549 1.000 N NA
 5922561 5922562 BCAL0260 BCAL0261 rpoA rplQ TRUE 0.655 139.000 0.873 1.000 N NA
 5922562 5922563 BCAL0261 BCAL0262 rplQ cutA FALSE 0.004 204.000 0.020 1.000 N NA
 5922563 5922564 BCAL0262 BCAL0263 cutA dsbD FALSE 0.111 -7.000 0.010 1.000 N NA
 5922565 5922566 BCAL0264 BCAL0265 hemB engB FALSE 0.020 253.000 0.024 1.000   NA
 5922567 5922568 BCAL0266 BCAL0267     FALSE 0.018 201.000 0.069 NA N NA
 5922568 5922569 BCAL0267 BCAL0268     TRUE 0.990 5.000 0.399 NA Y NA
 5922569 5922570 BCAL0268 BCAL0269     FALSE 0.175 159.000 0.097 1.000   NA
 5922570 5922571 BCAL0269 BCAL0270     TRUE 0.991 21.000 0.790 0.067   NA
 5922575 5922576 BCAL0275 BCAL0276     TRUE 0.850 -3.000 0.009 NA   NA
 5922576 5922577 BCAL0276 BCAL0277     TRUE 0.966 -3.000 0.333 NA   NA
 5922577 5922578 BCAL0277 BCAL0278     TRUE 0.859 -3.000 0.021 1.000   NA
 5922578 5922579 BCAL0278 BCAL0279   aroK TRUE 0.815 41.000 0.319 1.000 N NA
 5922579 5922580 BCAL0279 BCAL0280 aroK aroB TRUE 0.982 -3.000 0.208 1.000 Y NA
 5922580 5922581 BCAL0280 BCAL0281 aroB   FALSE 0.148 99.000 0.060 1.000 N NA
 5922581 5922582 BCAL0281 BCAL0282     FALSE 0.151 89.000 0.053 1.000 N NA
 5922582 5922583 BCAL0282 BCAL0283     TRUE 0.974 97.000 0.793 0.085 Y NA
 5922583 5922584 BCAL0283 BCAL0284     TRUE 0.994 -3.000 0.306 0.085 Y NA
 5922584 5922585 BCAL0284 BCAL0285     TRUE 0.984 32.000 0.272 0.085 Y NA
 5922585 5922586 BCAL0285 BCAL0286   ugpQ FALSE 0.363 27.000 0.040 1.000 N NA
 5922588 5922589 BCAL0288 BCAL0289   glt1 FALSE 0.009 169.000 0.022 1.000 N NA
 5922589 5922590 BCAL0289 BCAL0290 glt1 glt2 TRUE 0.964 86.000 0.236 0.000 Y NA
 5922590 5922591 BCAL0290 BCAL0291 glt2   FALSE 0.026 376.000 0.000 1.000 Y NA
 5922591 5922592 BCAL0291 BCAL0292     FALSE 0.313 -3.000 0.016 1.000 N NA
 5922593 5922594 BCAL0293 BCAL0294     TRUE 0.925 26.000 0.500 1.000 N NA
 5922594 5922595 BCAL0294 BCAL0295     FALSE 0.176 129.000 0.125 1.000 N NA
 5922595 5922596 BCAL0295 BCAL0296     TRUE 0.900 -3.000 0.071 1.000   NA
 5922597 5922598 BCALr0296 BCAL0297   thiO FALSE 0.023 226.000 0.000 NA   NA
 5922598 5922599 BCAL0297 BCAL0298 thiO thiS TRUE 0.862 33.000 0.342 1.000 N NA
 5922599 5922600 BCAL0298 BCAL0299 thiS thiG TRUE 0.918 39.000 0.064 1.000 Y NA
 5922600 5922601 BCAL0299 BCAL0300 thiG thiE TRUE 0.993 -3.000 0.118 0.003 Y NA
 5922601 5922602 BCAL0300 BCAL0301 thiE   FALSE 0.207 85.000 0.069 1.000 N NA
 5922602 5922603 BCAL0301 BCAL0302     TRUE 0.992 -3.000 0.530 NA Y NA
 5922603 5922604 BCAL0302 BCAL0303     TRUE 0.963 25.000 0.562 NA   NA
 5922604 5922605 BCAL0303 BCAL0304     TRUE 0.790 26.000 0.049 NA   NA
 5922605 5922606 BCAL0304 BCAL0305     TRUE 0.743 112.000 0.733 NA N NA
 5922606 5922607 BCAL0305 BCAL0306     TRUE 0.896 -3.000 0.064 NA   NA
 5922607 5922608 BCAL0306 BCAL0307     FALSE 0.120 193.000 0.174 NA   NA
 5922608 5922609 BCAL0307 BCAL0308     TRUE 0.993 -3.000 0.236 0.085 Y NA
 5922609 5922610 BCAL0308 BCAL0309     FALSE 0.434 54.000 0.088 NA N NA
 5922610 5922611 BCAL0309 BCAL0310   murA TRUE 0.790 15.000 0.129 NA N NA
 5922611 5922612 BCAL0310 BCAL0311 murA hisG TRUE 0.820 -3.000 0.123 1.000 N NA
 5922612 5922613 BCAL0311 BCAL0312 hisG hisD TRUE 0.991 25.000 0.254 0.002 Y NA
 5922613 5922614 BCAL0312 BCAL0313 hisD hisC TRUE 0.937 99.000 0.165 0.002 Y NA
 5922614 5922615 BCAL0313 BCAL0314 hisC hisB TRUE 0.980 66.000 0.341 0.002 Y NA
 5922615 5922616 BCAL0314 BCAL0315 hisB   FALSE 0.108 62.000 0.020 NA N NA
 5922616 5922617 BCAL0315 BCAL0316   hisH TRUE 0.729 -3.000 0.074 NA N NA
 5922617 5922618 BCAL0316 BCAL0317 hisH hisA TRUE 0.723 164.000 0.120 0.002 Y NA
 5922618 5922619 BCAL0317 BCAL0318 hisA hisF TRUE 0.963 107.000 0.433 0.002 Y NA
 5922619 5922620 BCAL0318 BCAL0319 hisF hisI TRUE 0.998 0.000 0.430 0.002 Y NA
 5922620 5922621 BCAL0319 BCAL0320 hisI hisE TRUE 0.994 -3.000 0.152 0.002 Y NA
 5922621 5922622 BCAL0320 BCAL0321 hisE   FALSE 0.565 71.000 0.070 NA   NA
 5922622 5922623 BCAL0321 BCAL0322     TRUE 0.742 32.000 0.037 NA   NA
 5922623 5922624 BCAL0322 BCAL0323   tatA FALSE 0.214 94.000 0.080 1.000 N NA
 5922624 5922625 BCAL0323 BCAL0324 tatA tatB TRUE 0.993 27.000 0.402 0.006 Y NA
 5922625 5922626 BCAL0324 BCAL0325 tatB tatC TRUE 0.939 42.000 0.167 NA Y NA
 5922628 5922629 BCAL0327 BCAL0328   petA FALSE 0.031 219.000 0.013 NA   NA
 5922629 5922630 BCAL0328 BCAL0329 petA petB TRUE 0.995 0.000 0.108 0.001 Y NA
 5922630 5922631 BCAL0329 BCAL0330 petB petC TRUE 0.997 22.000 0.630 0.001 Y NA
 5922631 5922632 BCAL0330 BCAL0331 petC   TRUE 0.613 95.000 0.370 NA N NA
 5922632 5922633 BCAL0331 BCAL0332     TRUE 0.927 69.000 0.831 NA   NA
 5922633 5922634 BCAL0332 BCALr0332     TRUE 0.754 19.000 0.000 NA   NA
 5922634 5922635 BCALr0332 BCAL0333     FALSE 0.006 355.000 0.000 NA   NA
 5922637 5922638 BCAL0335 BCAL0336     FALSE 0.359 82.000 0.000 NA   NA
 5922639 5922640 BCAL0337 BCAL0338     TRUE 0.984 -3.000 0.649 NA   NA
 5922640 5922641 BCAL0338 BCAL0339     TRUE 0.853 106.000 0.769 NA   NA
 5922642 5922643 BCAL0340 BCAL0341     TRUE 0.772 47.000 0.120 NA   NA
 5922643 5922644 BCAL0341 BCAL0342     TRUE 0.985 16.000 0.920 NA   NA
 5922644 5922645 BCAL0342 BCAL0343     TRUE 0.852 71.000 0.458 NA   NA
 5922645 5922646 BCAL0343 BCAL0344     TRUE 0.852 63.000 0.350 NA   NA
 5922646 5922647 BCAL0344 BCAL0345     FALSE 0.525 77.000 0.067 NA   NA
 5922647 5922648 BCAL0345 BCAL0346     TRUE 0.826 -36.000 0.167 NA   NA
 5922648 5922649 BCAL0346 BCAL0347   clpB TRUE 0.913 42.000 0.395 NA   NA
 5922649 5922650 BCAL0347 BCAL0348 clpB   TRUE 0.846 45.000 0.221 NA   NA
 5922651 5922652 BCAL0349 BCAL0350     TRUE 0.948 5.000 0.188 NA   NA
 5922652 5922653 BCAL0350 BCAL0351     TRUE 0.986 -3.000 0.750 NA   NA
 5922653 5922654 BCAL0351 BCAL0352     FALSE 0.016 302.000 0.067 NA   NA
 5922655 5922656 BCAL0353 BCAL0354     FALSE 0.039 212.000 0.031 NA   NA
 5922657 5922658 BCAL0355 BCAL0356     TRUE 0.710 25.000 0.000 NA   NA
 5922661 5922662 BCAL0359 BCAL0360     FALSE 0.100 155.000 0.000 NA   NA
 5922662 5922663 BCAL0360 BCAL0361     FALSE 0.151 138.000 0.000 NA   NA
 5922663 5922664 BCAL0361 BCAL0362     FALSE 0.426 90.000 0.042 NA   NA
 5922665 5922666 BCAL0363 BCAL0364     FALSE 0.476 77.000 0.041 NA   NA
 5922667 5922668 BCAL0365 BCAL0366     FALSE 0.028 156.000 0.040 NA N NA
 5922668 5922669 BCAL0366 BCAL0367     FALSE 0.004 190.000 0.014 1.000 N NA
 5922672 5922673 BCAL0370 BCAL0371     FALSE 0.049 203.000 0.039 1.000   NA
 5922673 5922674 BCAL0371 BCAL0372     TRUE 0.810 25.000 0.211 1.000 N NA
 5922674 5922675 BCAL0372 BCAL0373   hemK FALSE 0.423 68.000 0.124 1.000 N NA
 5922675 5922676 BCAL0373 BCAL0374 hemK prfA TRUE 0.984 8.000 0.229 1.000 Y NA
 5922676 5922677 BCAL0374 BCAL0375 prfA hemA TRUE 0.762 93.000 0.171 0.030 N NA
 5922677 5922678 BCAL0375 BCAL0376 hemA   FALSE 0.103 27.000 0.009 1.000 N NA
 5922679 5922680 BCAL0376a BCAL0377     TRUE 0.880 19.000 0.109 NA   NA
 5922680 5922681 BCAL0377 BCAL0378     FALSE 0.148 98.000 0.058 1.000 N NA
 5922681 5922682 BCAL0378 BCAL0379     TRUE 0.975 -3.000 0.156 0.096   NA
 5922683 5922684 BCAL0380 BCAL0381     FALSE 0.075 169.000 0.005 NA   NA
 5922684 5922685 BCAL0381 BCAL0382     FALSE 0.570 90.000 0.130 NA   NA
 5922686 5922687 BCAL0383 BCAL0384     FALSE 0.359 82.000 0.000 NA   NA
 5922687 5922688 BCAL0384 BCAL0385     FALSE 0.005 377.000 0.000 NA   NA
 5922688 5922689 BCAL0385 BCAL0386     FALSE 0.015 254.000 0.000 1.000   NA
 5922691 5922692 BCAL0388 BCAL0389   dsbC TRUE 0.829 91.000 0.814 1.000 N NA
 5922692 5922693 BCAL0389 BCAL0390 dsbC   FALSE 0.548 106.000 0.174 1.000   NA
 5922693 5922694 BCAL0390 BCAL0391   acpD FALSE 0.218 148.000 0.081 1.000   NA
 5922694 5922695 BCAL0391 BCAL0392 acpD   FALSE 0.237 115.000 0.000 1.000   NA
 5922695 5922696 BCAL0392 BCAL0393     TRUE 0.973 0.000 0.056 0.071   NA
 5922697 5922698 BCAL0394 BCAL0395 ung   TRUE 0.751 71.000 0.250 1.000   NA
 5922698 5922699 BCAL0395 BCAL0396   trpC TRUE 0.907 0.000 0.054 1.000   NA
 5922699 5922700 BCAL0396 BCAL0397 trpC trpD TRUE 0.970 29.000 0.293 1.000 Y NA
 5922700 5922701 BCAL0397 BCAL0398 trpD trpG TRUE 0.969 14.000 0.105 1.000 Y NA
 5922701 5922702 BCAL0398 BCAL0399 trpG trpE TRUE 0.995 14.000 0.230 0.000 Y NA
 5922702 5922703 BCAL0399 BCAL0400 trpE   FALSE 0.023 358.000 0.233 1.000   NA
 5922703 5922704 BCAL0400 BCAL0401     TRUE 0.948 5.000 0.192 1.000   NA
 5922705 5922706 BCAL0402 BCAL0403     FALSE 0.036 164.000 0.063 NA N NA
 5922707 5922708 BCAL0404 BCAL0405 paaK paaI FALSE 0.525 39.000 0.088 NA N NA
 5922708 5922709 BCAL0405 BCAL0406 paaI paaG TRUE 0.907 2.000 0.204 NA N NA
 5922709 5922710 BCAL0406 BCAL0407 paaG pcaF TRUE 0.898 46.000 0.051 1.000 Y NA
 5922710 5922711 BCAL0407 BCAL0408 pcaF paaZ FALSE 0.255 88.000 0.089 1.000 N NA
 5922712 5922713 BCAL0409   paaF   FALSE 0.003 568.000 0.000 NA   NA
 5922713 5922714   BCALr0409b     FALSE 0.459 65.000 0.000 NA   NA
 5922714 5922715 BCALr0409b BCALr0409c     TRUE 0.618 39.000 0.000 NA   NA
 5922715 5922716 BCALr0409c       FALSE 0.012 277.000 0.000 NA   NA
 5922716 5922717         FALSE 0.097 156.000 0.000 NA   NA
 5922719 5922720 BCAL0410 BCAL0411     TRUE 0.723 -6.000 0.000 NA   NA
 5922720 5922721 BCAL0411 BCAL0412     FALSE 0.556 50.000 0.000 NA   NA
 5922721 5922722 BCAL0412 BCAL0413     FALSE 0.104 154.000 0.000 NA   NA
 5922723 5922724 BCAL0415 BCAL0416     TRUE 0.723 -6.000 0.000 NA   NA
 5922725 5922726 BCAL0418 BCAL0419     TRUE 0.894 -3.000 0.061 NA   NA
 5922726 5922727 BCAL0419 BCAL0420     TRUE 0.956 -7.000 0.500 NA   NA
 5922728 5922729 BCAL0421 BCAL0422   dnaN FALSE 0.266 192.000 0.114 1.000 Y NA
 5922729 5922730 BCAL0422 BCAL0423 dnaN dnaA FALSE 0.516 171.000 0.328 1.000 Y NA
 5922731 5922732 BCAL0423a BCAL0424 rpmH rnpA TRUE 0.982 16.000 0.787 1.000   NA
 5922732 5922733 BCAL0424 BCAL0425 rnpA   TRUE 0.863 76.000 0.540 NA   NA
 5922733 5922734 BCAL0425 BCAL0426     TRUE 0.976 9.000 0.461 NA   NA
 5922737 5922738 BCAL0430 BCAL0431     FALSE 0.258 110.000 0.000 NA   NA
 5922738 5922739 BCAL0431 BCAL0432     FALSE 0.595 116.000 0.267 NA   NA
 5922740 5922741 BCAL0433 BCAL0434 speG   FALSE 0.003 491.000 0.000 NA   NA
 5922741 5922742 BCAL0434 BCAL0435     FALSE 0.058 189.000 0.028 NA   NA
 5922744 5922745 BCAL0437 BCAL0438     TRUE 0.931 -3.000 0.029 0.070 N NA
 5922745 5922746 BCAL0438 BCAL0439     FALSE 0.001 478.000 0.048 1.000 N NA
 5922750 5922751 BCAL0443 BCAL0444     FALSE 0.076 196.000 0.250 1.000 N NA
 5922752 5922753 BCAL0445 BCAL0446     TRUE 0.814 96.000 0.158 1.000 Y NA
 5922753 5922754 BCAL0446 BCAL0447     TRUE 0.931 48.000 0.833 1.000 N NA
 5922754 5922755 BCAL0447 BCAL0448     TRUE 0.977 -3.000 0.333 0.084 N NA
 5922755 5922756 BCAL0448 BCAL0449     TRUE 0.737 98.000 0.250 0.084 N NA
 5922757 5922758 BCAL0450 BCAL0451     TRUE 0.950 30.000 0.500 1.000   NA
 5922758 5922759 BCAL0451 BCAL0452     FALSE 0.002 180.000 0.000 1.000 N NA
 5922759 5922760 BCAL0452 BCAL0453     TRUE 0.996 15.000 0.594 0.098 Y NA
 5922760 5922761 BCAL0453 BCAL0454     TRUE 0.991 -3.000 0.481 1.000 Y NA
 5922764 5922765 BCAL0457 BCALr0457     FALSE 0.007 333.000 0.000 NA   NA
 5922766 5922767 BCAL0458 BCAL0459     TRUE 0.976 9.000 0.486 NA   NA
 5922770 5922771 BCAL0462 BCAL0463     FALSE 0.080 193.000 0.087 1.000   NA
 5922771 5922772 BCAL0463 BCAL0464     TRUE 0.687 37.000 0.022 1.000   NA
 5922773 5922774 BCAL0465 BCAL0466 def fmt TRUE 0.979 35.000 0.105 0.013 Y NA
 5922774 5922775 BCAL0466 BCAL0467 fmt   FALSE 0.019 121.000 0.012 1.000 N NA
 5922775 5922776 BCAL0467 BCAL0468     FALSE 0.153 100.000 0.062 1.000 N NA
 5922776 5922777 BCAL0468 BCAL0469   rsmB FALSE 0.014 221.000 0.075 1.000 N NA
 5922777 5922778 BCAL0469 BCAL0470 rsmB   TRUE 0.913 -3.000 0.094 NA   NA
 5922778 5922779 BCAL0470 BCAL0471     TRUE 0.962 41.000 0.810 NA   NA
 5922779 5922780 BCAL0471 BCAL0472     TRUE 0.986 1.000 0.605 1.000   NA
 5922780 5922781 BCAL0472 BCALr0472     FALSE 0.494 61.000 0.000 NA   NA
 5922781 5922782 BCALr0472 BCAL0473     FALSE 0.006 352.000 0.000 NA   NA
 5922782 5922783 BCAL0473 BCAL0474     TRUE 0.746 76.000 0.270 NA   NA
 5922783 5922784 BCAL0474 BCAL0475     TRUE 0.775 19.000 0.139 NA N NA
 5922784 5922785 BCAL0475 BCAL0476     FALSE 0.000 327.000 0.000 1.000 N NA
 5922785 5922786 BCAL0476 BCAL0477     TRUE 0.973 -3.000 0.417 1.000   NA
 5922787 5922788 BCAL0478 BCAL0479 rodA mrdA TRUE 0.695 12.000 0.073 1.000 N NA
 5922788 5922789 BCAL0479 BCAL0480 mrdA   TRUE 0.766 102.000 0.108 1.000 Y NA
 5922789 5922790 BCAL0480 BCAL0481     TRUE 0.998 -3.000 0.550 0.001 Y NA
 5922790 5922791 BCAL0481 BCAL0482   mreB FALSE 0.585 139.000 0.689 1.000 N NA
 5922792 5922793 BCAL0483 BCAL0484 gatC gatA TRUE 0.988 70.000 0.643 0.001 Y NA
 5922793 5922794 BCAL0484 BCAL0485 gatA gatB TRUE 0.998 5.000 0.492 0.001 Y NA
 5922794 5922795 BCAL0485 BCAL0486 gatB   FALSE 0.265 119.000 0.016 NA   NA
 5922795 5922796 BCAL0486 BCAL0487     TRUE 0.671 41.000 0.024 NA   NA
 5922799 5922800 BCAL0490 BCAL0491     TRUE 0.770 -10.000 0.054 NA   NA
 5922800 5922801 BCAL0491 BCAL0492   metW FALSE 0.391 117.000 0.087 NA   NA
 5922801 5922802 BCAL0492 BCAL0493 metW metX TRUE 0.979 -3.000 0.509 NA   NA
 5922802 5922803 BCAL0493 BCAL0494 metX   FALSE 0.001 267.000 0.006 1.000 N NA
 5922803 5922804 BCAL0494 BCAL0495     TRUE 0.793 -33.000 0.122 1.000   NA
 5922804 5922805 BCAL0495 BCAL0496   argB TRUE 0.898 -3.000 0.069 1.000   NA
 5922806 5922807 BCAL0497 BCAL0499     TRUE 0.993 14.000 0.682 1.000 Y NA
 5922808 5922809 BCAL0500 BCAL0501 hslU hslV TRUE 0.994 10.000 0.752 1.000 Y NA
 5922809 5922810 BCAL0501 BCAL0502 hslV   FALSE 0.001 237.000 0.011 1.000 N NA
 5922810 5922811 BCAL0502 BCAL0503     FALSE 0.005 495.000 0.045 NA   NA
 5922811 5922812 BCAL0503 BCAL0504     FALSE 0.083 193.000 0.094 NA   NA
 5922812 5922813 BCAL0504 BCAL0505   xerC FALSE 0.588 77.000 0.110 1.000   NA
 5922813 5922814 BCAL0505 BCAL0506 xerC   TRUE 0.982 14.000 0.714 NA   NA
 5922814 5922815 BCAL0506 BCAL0507   dapF TRUE 0.927 14.000 0.175 NA   NA
 5922815 5922816 BCAL0507 BCAL0508 dapF   FALSE 0.001 297.000 0.010 1.000 N NA
 5922822 5922823 BCAL0514 BCAL0515     FALSE 0.006 354.000 0.000 NA   NA
 5922824 5922825 BCAL0516 BCAL0517     TRUE 0.639 57.000 0.053 NA   NA
 5922828 5922829 BCAL0520 BCAL0521 fliK fliJ TRUE 0.990 32.000 0.317 0.004 Y NA
 5922829 5922830 BCAL0521 BCAL0522 fliJ fliI TRUE 0.973 6.000 0.070 1.000 Y NA
 5922830 5922831 BCAL0522 BCAL0523 fliI fliH TRUE 0.942 33.000 0.115 1.000 Y NA
 5922831 5922832 BCAL0523 BCAL0524 fliH fliG TRUE 0.992 -7.000 0.320 0.002 Y NA
 5922832 5922833 BCAL0524 BCAL0525 fliG fliF TRUE 0.988 -10.000 0.220 0.004 Y NA
 5922834 5922835 BCAL0526 BCAL0527 fliE fliS FALSE 0.386 240.000 0.149 0.002 Y NA
 5922835 5922836 BCAL0527 BCAL0528 fliS   TRUE 0.943 -3.000 0.189 1.000   NA
 5922836 5922837 BCAL0528 BCAL0529     FALSE 0.360 133.000 0.143 1.000   NA
 5922837 5922838 BCAL0529 BCAL0530     TRUE 0.825 -3.000 0.000 1.000   NA
 5922838 5922839 BCAL0530 BCAL0531     FALSE 0.016 270.000 0.016 NA   NA
 5922840 5922841 BCAL0532 BCAL0533     FALSE 0.001 252.000 0.000 1.000 N NA
 5922841 5922842 BCAL0533 BCAL0534     FALSE 0.015 216.000 0.075 1.000 N NA
 5922842 5922843 BCAL0534 BCAL0535     TRUE 0.994 8.000 0.238 0.020 Y NA
 5922843 5922844 BCAL0535 BCAL0536   fpr FALSE 0.000 416.000 0.000 1.000 N NA
 5922844 5922845 BCAL0536 BCAL0537 fpr   FALSE 0.008 309.000 0.000 NA   NA
 5922845 5922846 BCAL0537 BCAL0538     TRUE 0.990 6.000 1.000 NA   NA
 5922846 5922847 BCAL0538 BCAL0539     FALSE 0.272 147.000 0.125 NA   NA
 5922848 5922849 BCAL0540 BCAL0541     FALSE 0.093 177.000 0.065 1.000   NA
 5922849 5922850 BCAL0541 BCAL0542     FALSE 0.140 161.000 0.065 1.000   NA
 5922850 5922851 BCAL0542 BCAL0543     FALSE 0.076 192.000 0.074 1.000   NA
 5922851 5922852 BCAL0543 BCAL0544   dppA FALSE 0.030 322.000 0.000 0.084   NA
 5922852 5922853 BCAL0544 BCAL0545 dppA dppB TRUE 0.855 111.000 0.072 0.084 Y NA
 5922853 5922854 BCAL0545 BCAL0546 dppB dppC TRUE 0.998 5.000 0.779 0.084 Y NA
 5922854 5922855 BCAL0546 BCAL0547 dppC dppD TRUE 0.978 39.000 0.560 1.000 Y NA
 5922855 5922856 BCAL0547 BCAL0548 dppD dppF TRUE 0.997 -3.000 0.377 0.001 Y NA
 5922856 5922857 BCAL0548 BCAL0549 dppF   FALSE 0.070 230.000 0.188 NA   NA
 5922858 5922859 BCAL0550 BCAL0551     TRUE 0.923 3.000 0.092 1.000   NA
 5922859 5922860 BCAL0551 BCAL0552     TRUE 0.979 -3.000 0.155 1.000 Y NA
 5922863 5922864 BCAL0555 BCAL0556     TRUE 0.911 51.000 0.110 1.000 Y NA
 5922864 5922865 BCAL0556 BCAL0557     FALSE 0.277 63.000 0.060 1.000 N NA
 5922865 5922866 BCAL0557 BCAL0558   cca TRUE 0.756 -3.000 0.087 1.000 N NA
 5922869 5922870 BCAL0561 BCAL0562 flgN flgM TRUE 0.911 79.000 0.211 0.001   NA
 5922870 5922871 BCAL0562 BCAL0563 flgM flgA TRUE 0.630 118.000 0.330 NA   NA
 5922872 5922873 BCAL0564 BCAL0565 flgB flgC TRUE 0.995 39.000 0.714 0.002 Y NA
 5922873 5922874 BCAL0565 BCAL0566 flgC flgD TRUE 0.836 98.000 0.221 NA Y NA
 5922874 5922875 BCAL0566 BCAL0567 flgD flgE1 TRUE 0.931 28.000 0.035 NA Y NA
 5922875 5922876 BCAL0567 BCAL0568 flgE1 flgF TRUE 0.991 20.000 0.200 0.003 Y NA
 5922876 5922877 BCAL0568 BCAL0569 flgF flgG TRUE 0.992 35.000 0.357 0.001 Y NA
 5922877 5922878 BCAL0569 BCAL0570 flgG flgH TRUE 0.995 21.000 0.463 0.004 Y NA
 5922878 5922879 BCAL0570 BCAL0571 flgH flgI TRUE 0.991 -6.000 0.256 0.004 Y NA
 5922879 5922880 BCAL0571 BCAL0572 flgI flgJ TRUE 0.995 1.000 0.131 0.004 Y NA
 5922882 5922883 BCAL0575 BCAL0576   flgK FALSE 0.021 182.000 0.057 NA N NA
 5922883 5922884 BCAL0576 BCAL0577 flgK flgL TRUE 0.989 18.000 0.074 0.001 Y NA
 5922884 5922885 BCAL0577 BCAL0578 flgL   FALSE 0.000 279.000 0.000 1.000 N NA
 5922887 5922888 BCAL0580 BCAL0581     TRUE 0.998 -3.000 0.571 0.001 Y NA
 5922890 5922891 BCAL0583 BCAL0584     FALSE 0.006 345.000 0.000 NA   NA
 5922891 5922892 BCAL0584 BCAL0585     FALSE 0.005 369.000 0.000 NA   NA
 5922892 5922893 BCAL0585 BCAL0586   gor FALSE 0.023 241.000 0.026 NA   NA
 5922893 5922894 BCAL0586 BCAL0587 gor   FALSE 0.000 527.000 0.000 1.000 N NA
 5922894 5922895 BCAL0587 BCAL0588     TRUE 0.926 58.000 0.625 NA   NA
 5922895 5922896 BCAL0588 BCAL0589     TRUE 0.985 11.000 0.740 NA   NA
 5922897 5922898 BCAL0590 BCAL0591     TRUE 0.990 0.000 0.056 0.070 Y NA
 5922898 5922899 BCAL0591 BCAL0592     FALSE 0.018 96.000 0.000 1.000 N NA
 5922899 5922900 BCAL0592 BCAL0593     TRUE 0.992 26.000 1.000 1.000 Y NA
 5922900 5922901 BCAL0593 BCAL0594     TRUE 0.864 98.000 0.750 NA   NA
 5922901 5922902 BCAL0594 BCAL0595   potI FALSE 0.563 116.000 0.231 NA   NA
 5922902 5922903 BCAL0595 BCAL0596 potI potH TRUE 0.998 -3.000 0.929 0.083 Y NA
 5922903 5922904 BCAL0596 BCAL0597 potH potG TRUE 0.983 44.000 0.800 1.000 Y NA
 5922904 5922905 BCAL0597 BCAL0598 potG potF FALSE 0.337 189.000 0.200 1.000 Y NA
 5922905 5922906 BCAL0598 BCAL0599 potF   TRUE 0.974 19.000 1.000 1.000 N NA
 5922906 5922907 BCAL0599 BCAL0600     TRUE 0.957 35.000 1.000 1.000 N NA
 5922907 5922908 BCAL0600 BCAL0601     TRUE 0.891 29.000 0.214 1.000   NA
 5922909 5922910 BCAL0602 BCAL0603   puuC FALSE 0.064 89.000 0.023 1.000 N NA
 5922912 5922913 BCAL0605 BCAL0606     TRUE 0.980 13.000 0.629 NA   NA
 5922914 5922915 BCAL0607 BCAL0608     TRUE 0.985 0.000 0.571 NA   NA
 5922915 5922916 BCAL0608 BCAL0609     TRUE 0.626 71.000 0.111 NA   NA
 5922916 5922917 BCAL0609 BCAL0610     TRUE 0.966 -7.000 0.636 NA   NA
 5922917 5922918 BCAL0610 BCAL0611   glmS1 FALSE 0.309 131.000 0.091 NA   NA
 5922918 5922919 BCAL0611 BCAL0612 glmS1 glmU TRUE 0.870 51.000 0.010 1.000 Y NA
 5922919 5922920 BCAL0612 BCAL0613 glmU   FALSE 0.016 136.000 0.014 NA N NA
 5922920 5922921 BCAL0613 BCAL0614     TRUE 0.648 12.000 0.059 NA N NA
 5922921 5922922 BCAL0614 BCAL0615     FALSE 0.382 76.000 0.000 NA   NA
 5922923 5922924 BCAL0616 BCAL0616a     TRUE 0.871 14.000 0.058 NA   NA
 5922925 5922926 BCAL0617 BCAL0618     FALSE 0.573 110.000 0.214 NA   NA
 5922926 5922927 BCAL0618 BCAL0619     TRUE 0.967 -3.000 0.034 1.000 Y NA
 5922927 5922928 BCAL0619 BCAL0620     TRUE 0.850 3.000 0.128 1.000 N NA
 5922928 5922929 BCAL0620 BCAL0621     FALSE 0.003 383.000 0.088 1.000 N NA
 5922929 5922930 BCAL0621 BCAL0622     FALSE 0.052 207.000 0.056 1.000   NA
 5922931 5922932 BCAL0623 BCAL0624     FALSE 0.006 346.000 0.000 NA   NA
 5922932 5922933 BCAL0624 BCAL0625     FALSE 0.229 184.000 0.560 NA N NA
 5922938 5922939 BCAL0629a BCAL0630     TRUE 0.865 -3.000 0.025 NA   NA
 5922939 5922940 BCAL0630 BCAL0631     TRUE 0.852 27.000 0.119 NA   NA
 5922940 5922941 BCAL0631 BCAL0632     TRUE 0.952 33.000 0.176 1.000 Y NA
 5922944 5922945 BCAL0635 BCAL0636 yagT yagS TRUE 0.997 19.000 0.818 0.066 Y NA
 5922945 5922946 BCAL0636 BCAL0637 yagS xdhA TRUE 0.999 -3.000 0.909 0.001 Y NA
 5922950 5922951 BCAL0641 BCAL0641A     FALSE 0.007 324.000 0.000 NA   NA
 5922953 5922954 BCAL0645 BCAL0646 sbp   FALSE 0.313 127.000 0.077 1.000   NA
 5922956 5922957 BCAL0648 BCAL0650     FALSE 0.002 1726.000 0.000 NA   NA
 5922959 5922960 BCAL0652 BCAL0653     FALSE 0.223 157.000 0.133 NA   NA
 5922960 5922961 BCAL0653 BCAL0654     TRUE 0.932 -3.000 0.143 NA   NA
 5922961 5922962 BCAL0654 BCAL0655     FALSE 0.258 110.000 0.000 NA   NA
 5922962 5922963 BCAL0655 BCAL0656     FALSE 0.484 62.000 0.000 NA   NA
 5922964 5922965 BCAL0657 BCAL0658     FALSE 0.043 222.000 0.219 NA N NA
 5922965 5922966 BCAL0658 BCAL0659     TRUE 0.997 -10.000 0.886 0.002 Y NA
 5922966 5922967 BCAL0659 BCAL0660   accC TRUE 0.964 -3.000 0.514 1.000 N NA
 5922967 5922968 BCAL0660 BCAL0661 accC   TRUE 0.940 5.000 0.154 1.000   NA
 5922968 5922969 BCAL0661 BCAL0662     TRUE 0.918 23.000 0.242 1.000   NA
 5922971 5922972 BCAL0664 BCAL0665 bioB bioD TRUE 0.971 42.000 0.005 0.001 Y NA
 5922972 5922973 BCAL0665 BCAL0666 bioD bioF TRUE 0.991 -3.000 0.017 0.001 Y NA
 5922973 5922974 BCAL0666 BCAL0667 bioF bioA TRUE 0.992 -3.000 0.054 0.001 Y NA
 5922974 5922975 BCAL0667 BCAL0668 bioA   FALSE 0.000 480.000 0.000 1.000 N NA
 5922975 5922976 BCAL0668 BCAL0669     FALSE 0.418 107.000 0.075 NA   NA
 5922976 5922977 BCAL0669 BCAL0670     TRUE 0.699 39.000 0.034 NA   NA
 5922977 5922978 BCAL0670 BCAL0671     FALSE 0.030 112.000 0.016 1.000 N NA
 5922978 5922979 BCAL0671 BCAL0672     FALSE 0.578 57.000 0.158 1.000 N NA
 5922981 5922982 BCAL0674 BCAL0675     FALSE 0.054 193.000 0.032 1.000   NA
 5922982 5922983 BCAL0675 BCAL0676     FALSE 0.006 352.000 0.000 1.000   NA
 5922983 5922984 BCAL0676 BCAL0677   dsbA TRUE 0.959 20.000 0.434 1.000   NA
 5922984 5922985 BCAL0677 BCAL0678 dsbA   TRUE 0.815 71.000 0.573 NA N NA
 5922985 5922986 BCAL0678 BCAL0679   argS FALSE 0.029 171.000 0.062 NA N NA
 5922988 5922989 BCAL0681 BCAL0682 metH1 metH2 TRUE 0.976 43.000 0.041 0.000 Y NA
 5922989 5922990 BCAL0682 BCAL0683 metH2   FALSE 0.120 203.000 0.216 NA   NA
 5922990 5922991 BCAL0683 BCAL0684     FALSE 0.044 259.000 0.162 NA   NA
 5922991 5922992 BCAL0684 BCAL0685     TRUE 0.825 64.000 0.304 NA   NA
 5922993 5922994 BCAL0686 BCAL0687     FALSE 0.396 133.000 0.087 0.094 N NA
 5922994 5922995 BCAL0687 BCAL0688     TRUE 0.809 82.000 0.413 NA   NA
 5922995 5922996 BCAL0688 BCAL0689     TRUE 0.863 25.000 0.121 NA   NA
 5922996 5922997 BCAL0689 BCAL0690     FALSE 0.004 466.000 0.000 1.000   NA
 5922997 5922998 BCAL0690 BCAL0691     FALSE 0.138 162.000 0.068 1.000   NA
 5922999 5923000 BCAL0692 BCAL0693     FALSE 0.044 198.000 0.015 NA   NA
 5923000 5923001 BCAL0693 BCAL0694     TRUE 0.848 -3.000 0.147 1.000 N NA
 5923001 5923002 BCAL0694 BCAL0695     FALSE 0.011 281.000 0.000 1.000   NA
 5923002 5923003 BCAL0695 BCAL0696   cpdB TRUE 0.852 9.000 0.015 1.000   NA
 5923004 5923005 BCAL0697 BCAL0698     TRUE 0.996 -3.000 0.922 NA Y NA
 5923005 5923006 BCAL0698 BCAL0699     TRUE 0.992 18.000 0.750 NA Y NA
 5923006 5923007 BCAL0699 BCAL0700     TRUE 0.698 84.000 0.239 NA   NA
 5923007 5923008 BCAL0700 BCAL0701     TRUE 0.871 20.000 0.103 NA   NA
 5923008 5923009 BCAL0701 BCAL0702     FALSE 0.385 155.000 0.320 NA   NA
 5923009 5923010 BCAL0702 BCAL0703     TRUE 0.928 14.000 0.179 NA   NA
 5923010 5923011 BCAL0703 BCAL0704     FALSE 0.006 509.000 0.079 NA   NA
 5923011 5923012 BCAL0704 BCAL0705     TRUE 0.827 49.000 0.390 1.000 N NA
 5923012 5923013 BCAL0705 BCAL0706     TRUE 0.947 0.000 0.155 NA   NA
 5923015 5923016 BCAL0708 BCAL0709   lipB FALSE 0.070 179.000 0.028 NA   NA
 5923016 5923017 BCAL0709 BCAL0710 lipB lipA TRUE 0.993 -7.000 0.319 0.001 Y NA
 5923017 5923018 BCAL0710 BCAL0711 lipA tauA FALSE 0.001 261.000 0.000 1.000 N NA
 5923018 5923019 BCAL0711 BCAL0712 tauA tauB TRUE 0.961 39.000 0.302 1.000 Y NA
 5923019 5923020 BCAL0712 BCAL0713 tauB tauC TRUE 0.961 72.000 0.728 1.000 Y NA
 5923021 5923022 BCAL0714 BCAL0715     FALSE 0.374 84.000 0.136 NA N NA
 5923023 5923024 BCAL0716 BCAL0717     TRUE 0.979 30.000 0.450 1.000 Y NA
 5923024 5923025 BCAL0717 BCAL0718     TRUE 0.990 15.000 0.100 0.007 Y NA
 5923025 5923026 BCAL0718 BCAL0719     TRUE 0.949 30.000 0.750 1.000 N NA
 5923026 5923027 BCAL0719 BCAL0720     FALSE 0.525 96.000 0.118 NA   NA
 5923027 5923028 BCAL0720 BCAL0721     TRUE 0.952 12.000 0.263 NA   NA
 5923028 5923029 BCAL0721 BCAL0722   dctA FALSE 0.005 381.000 0.000 1.000   NA
 5923029 5923030 BCAL0722 BCAL0723 dctA dctB TRUE 0.843 5.000 0.130 1.000 N NA
 5923030 5923031 BCAL0723 BCAL0724 dctB dctD TRUE 0.925 88.000 0.174 0.083 Y NA
 5923034 5923035 BCAL0727 BCAL0728     FALSE 0.026 265.000 0.074 NA   NA
 5923036 5923037 BCAL0729 BCAL0730 glnB1   FALSE 0.564 65.000 0.189 1.000 N NA
 5923037 5923038 BCAL0730 BCAL0731   gshA FALSE 0.017 244.000 0.000 1.000   NA
 5923038 5923039 BCAL0731 BCAL0732 gshA gshB TRUE 0.947 26.000 0.120 0.083   NA
 5923039 5923040 BCAL0732 BCAL0734 gshB   FALSE 0.006 238.000 0.048 1.000 N NA
 5923040 5923041 BCAL0734 BCAL0735   ptsH TRUE 0.970 74.000 0.261 0.001 Y NA
 5923041 5923042 BCAL0735 BCAL0736 ptsH   FALSE 0.608 202.000 0.205 0.001 Y NA
 5923043 5923044 BCAL0737 BCAL0738     FALSE 0.185 105.000 0.082 1.000 N NA
 5923044 5923045 BCAL0738 BCAL0739   gpmA FALSE 0.003 257.000 0.036 1.000 N NA
 5923046 5923047 BCAL0740 BCAL0741   grxC TRUE 0.918 -3.000 0.269 1.000 N NA
 5923047 5923048 BCAL0741 BCAL0742 grxC secB FALSE 0.398 108.000 0.221 1.000 N NA
 5923048 5923049 BCAL0742 BCAL0743 secB gpsA TRUE 0.630 26.000 0.097 1.000 N NA
 5923049 5923050 BCAL0743 BCAL0744 gpsA   FALSE 0.552 93.000 0.127 1.000   NA
 5923051 5923052 BCAL0745 BCAL0746     FALSE 0.373 103.000 0.045 1.000   NA
 5923053 5923054 BCAL0747 BCAL0748     FALSE 0.025 235.000 0.018 NA   NA
 5923054 5923055 BCAL0748 BCAL0749     FALSE 0.557 81.000 0.095 NA   NA
 5923055 5923056 BCAL0749 BCAL0750   ctaD TRUE 0.995 44.000 0.741 0.001 Y NA
 5923056 5923057 BCAL0750 BCAL0751 ctaD   FALSE 0.496 81.000 0.057 NA   NA
 5923057 5923058 BCAL0751 BCAL0752     TRUE 0.733 36.000 0.046 NA   NA
 5923058 5923059 BCAL0752 BCAL0753     TRUE 0.899 17.000 0.129 NA   NA
 5923059 5923060 BCAL0753 BCAL0754     FALSE 0.223 159.000 0.152 NA   NA
 5923062 5923063 BCAL0756 BCAL0757     TRUE 0.933 61.000 0.722 NA   NA
 5923063 5923064 BCAL0757 BCAL0758     TRUE 0.914 26.000 0.255 1.000   NA
 5923064 5923065 BCAL0758 BCAL0759     TRUE 0.987 9.000 0.321 1.000 Y NA
 5923065 5923066 BCAL0759 BCAL0760     TRUE 0.791 19.000 0.017 1.000   NA
 5923068 5923069 BCAL0762 BCAL0763     FALSE 0.019 227.000 0.111 NA N NA
 5923071 5923072 BCAL0765 BCAL0766     TRUE 0.640 140.000 0.562 NA   NA
 5923072 5923073 BCAL0766 BCAL0767     TRUE 0.989 2.000 0.771 1.000   NA
 5923073 5923074 BCAL0767 BCAL0768     FALSE 0.119 160.000 0.036 NA   NA
 5923074 5923075 BCAL0768 BCAL0769     TRUE 0.863 -67.000 0.250 NA   NA
 5923075 5923076 BCAL0769 BCAL0770   dnaE2 TRUE 0.982 10.000 0.600 1.000   NA
 5923079 5923080 BCAL0773 BCAL0774     FALSE 0.548 26.000 0.071 1.000 N NA
 5923080 5923081 BCAL0774 BCAL0775     FALSE 0.558 25.000 0.071 1.000 N NA
 5923082 5923083 BCAL0776 BCAL0777     FALSE 0.042 302.000 0.000 NA Y NA
 5923083 5923084 BCAL0777 BCAL0778     FALSE 0.216 87.000 0.073 1.000 N NA
 5923084 5923085 BCAL0778 BCAL0779     FALSE 0.472 -16.000 0.073 1.000 N NA
 5923085 5923086 BCAL0779 BCAL0780     TRUE 0.621 16.000 0.067 1.000 N NA
 5923086 5923087 BCAL0780 BCAL0781     TRUE 0.963 87.000 0.258 0.001 Y NA
 5923088 5923089 BCAL0782 BCAL0783     FALSE 0.003 571.000 0.000 NA   NA
 5923089 5923090 BCAL0783 BCAL0784   cydB TRUE 0.875 63.000 0.421 NA   NA
 5923090 5923091 BCAL0784 BCAL0785 cydB cydA TRUE 0.991 32.000 0.474 0.065 Y NA
 5923091 5923092 BCAL0785 BCAL0786 cydA   TRUE 0.960 -10.000 0.625 NA   NA
 5923092 5923093 BCAL0786 BCAL0787   rpoH FALSE 0.005 367.000 0.000 NA   NA
 5923094 5923095 BCAL0788 BCAL0789     TRUE 0.825 46.000 0.190 NA   NA
 5923096 5923097 BCAL0790 BCAL0791     FALSE 0.026 369.000 0.000 1.000 Y NA
 5923100 5923101 BCAL0794 BCAL0795   coaD FALSE 0.539 112.000 0.367 NA N NA
 5923101 5923102 BCAL0795 BCAL0796 coaD   TRUE 0.680 60.000 0.088 NA   NA
 5923103 5923104 BCAL0797 BCAL0798   pth FALSE 0.024 117.000 0.014 1.000 N NA
 5923104 5923105 BCAL0798 BCAL0799 pth   TRUE 0.949 121.000 0.496 0.013 Y NA
 5923105 5923106 BCAL0799 BCAL0800   prs FALSE 0.110 150.000 0.122 1.000 N NA
 5923106 5923107 BCAL0800   prs   FALSE 0.404 72.000 0.000 NA   NA
 5923107 5923108   BCAL0803     FALSE 0.002 965.000 0.000 NA   NA
 5923108 5923109 BCAL0803 BCAL0804     TRUE 0.848 6.000 0.139 1.000 N NA
 5923110 5923111 BCAL0805 BCAL0806 mutM mutY TRUE 0.982 25.000 0.021 0.002 Y NA
 5923112 5923113 BCAL0807 BCAL0808     TRUE 0.780 27.000 0.047 NA   NA
 5923113 5923114 BCAL0808 BCAL0809     TRUE 0.691 75.000 0.194 NA   NA
 5923114 5923115 BCAL0809 BCAL0810     FALSE 0.175 130.000 0.000 NA   NA
 5923115 5923116 BCAL0810 BCAL0812     FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 5923116 5923117 BCAL0812 BCAL0813   rpoN FALSE 0.380 159.000 0.574 NA N NA
 5923117 5923118 BCAL0813 BCAL0814 rpoN   FALSE 0.110 173.000 0.075 1.000   NA
 5923118 5923119 BCAL0814 BCAL0815     TRUE 0.980 -3.000 0.543 NA   NA
 5923119 5923120 BCAL0815 BCAL0816     TRUE 0.976 -3.000 0.459 NA   NA
 5923120 5923121 BCAL0816 BCAL0817   kdsC TRUE 0.985 4.000 0.617 NA   NA
 5923121 5923122 BCAL0817 BCAL0818 kdsC   TRUE 0.985 0.000 0.598 1.000   NA
 5923123 5923124 BCAL0819 BCAL0820     FALSE 0.173 39.000 0.022 1.000 N NA
 5923124 5923125 BCAL0820 BCAL0821     FALSE 0.074 76.000 0.022 1.000 N NA
 5923125 5923126 BCAL0821 BCAL0822     TRUE 0.929 6.000 0.124 1.000   NA
 5923126 5923127 BCAL0822 BCAL0823     TRUE 0.926 74.000 0.955 1.000   NA
 5923128 5923129 BCAL0824 BCAL0825   uvrA FALSE 0.028 221.000 0.007 NA   NA
 5923130 5923131 BCAL0826 BCAL0827   ssb FALSE 0.087 100.000 0.037 1.000 N NA
 5923131 5923132 BCAL0827 BCAL0828 ssb   FALSE 0.568 123.000 0.000 NA Y NA
 5923132 5923133 BCAL0828 BCAL0829     TRUE 0.966 5.000 0.005 NA Y NA
 5923133 5923134 BCAL0829 BCAL0830     FALSE 0.050 51.000 0.005 1.000 N NA
 5923134 5923135 BCAL0830 BCAL0831     FALSE 0.003 498.000 0.000 NA   NA
 5923135 5923136 BCAL0831 BCAL0832   phaA FALSE 0.010 289.000 0.000 NA   NA
 5923136 5923137 BCAL0832 BCAL0833 phaA phbB FALSE 0.211 211.000 0.125 1.000 Y NA
 5923137 5923138 BCAL0833 BCAL0834 phbB   TRUE 0.671 106.000 0.312 NA   NA
 5923139 5923140 BCAL0835 BCAL0836     TRUE 0.932 -3.000 0.143 NA   NA
 5923140 5923141 BCAL0836 BCAL0837     TRUE 0.947 -3.000 0.206 NA   NA
 5923141 5923142 BCAL0837 BCAL0838     TRUE 0.962 9.000 0.303 NA   NA
 5923142 5923143 BCAL0838 BCAL0839     FALSE 0.348 64.000 0.083 1.000 N NA
 5923143 5923144 BCAL0839 BCAL0840     TRUE 0.949 -3.000 0.217 NA   NA
 5923144 5923145 BCAL0840 BCAL0841     TRUE 0.988 0.000 0.727 NA   NA
 5923145 5923146 BCAL0841 BCAL0842     TRUE 0.944 -3.000 0.196 1.000   NA
 5923146 5923147 BCAL0842 BCAL0843     TRUE 0.885 -3.000 0.051 1.000   NA
 5923147 5923148 BCAL0843 BCAL0844     TRUE 0.764 60.000 0.168 NA   NA
 5923149 5923150 BCAL0845 BCAL0846 acpP   FALSE 0.487 70.000 0.027 1.000   NA
 5923150 5923151 BCAL0846 BCAL0847     TRUE 0.625 38.000 0.000 NA   NA
 5923151 5923152 BCAL0847 BCAL0848     FALSE 0.192 126.000 0.000 NA   NA
 5923152 5923153 BCAL0848 BCAL0849     FALSE 0.001 203.000 0.000 NA N NA
 5923154 5923155 BCAL0850 BCAL0851 glcA   TRUE 0.911 49.000 0.098 1.000 Y NA
 5923155 5923156 BCAL0851 BCAL0852     TRUE 0.995 -3.000 0.639 0.002   NA
 5923156 5923157 BCAL0852 BCAL0853     TRUE 0.944 -3.000 0.194 NA   NA
 5923158 5923159 BCAL0854 BCAL0855     FALSE 0.001 203.000 0.000 1.000 N NA
 5923159 5923160 BCAL0855 BCAL0856     FALSE 0.017 244.000 0.125 1.000 N NA
 5923162 5923163 BCAL0858 BCAL0859     FALSE 0.500 90.000 0.081 NA   NA
 5923165 5923166 BCAL0861 BCAL0862     TRUE 0.859 59.000 0.553 NA N NA
 5923167 5923168 BCAL0863 BCAL0864     FALSE 0.141 158.000 0.052 1.000   NA
 5923169 5923170 BCAL0865 BCAL0866   dan TRUE 0.971 3.000 0.558 1.000 N NA
 5923170 5923171 BCAL0866 BCAL0867 dan   TRUE 0.812 79.000 0.654 NA N NA
 5923172 5923173 BCAL0868 BCAL0869   ilvA TRUE 0.878 13.000 0.062 1.000   NA
 5923174 5923175 BCAL0870 BCAL0871     FALSE 0.331 85.000 0.118 1.000 N NA
 5923175 5923176 BCAL0871 BCAL0872     TRUE 0.908 -3.000 0.084 NA   NA
 5923176 5923177 BCAL0872 BCAL0873   ubiE TRUE 0.696 53.000 0.074 NA   NA
 5923177 5923178 BCAL0873 BCAL0874 ubiE   TRUE 0.693 42.000 0.044 1.000   NA
 5923178 5923179 BCAL0874 BCAL0875     FALSE 0.178 165.000 0.135 1.000   NA
 5923179 5923180 BCAL0875 BCAL0876     TRUE 0.970 13.000 0.432 1.000   NA
 5923180 5923181 BCAL0876 BCAL0877     TRUE 0.828 18.000 0.044 1.000   NA
 5923181 5923182 BCAL0877 BCAL0878     FALSE 0.416 96.000 0.050 NA   NA
 5923182 5923183 BCAL0878 BCAL0879     TRUE 0.748 65.000 0.190 NA   NA
 5923183 5923184 BCAL0879 BCAL0880   aspS FALSE 0.576 67.000 0.057 NA   NA
 5923184 5923185 BCAL0880 BCAL0881 aspS   FALSE 0.030 160.000 0.050 1.000 N NA
 5923185 5923186 BCAL0881 BCAL0882     TRUE 0.791 -3.000 0.105 1.000 N NA
 5923186 5923187 BCAL0882 BCAL0883     FALSE 0.106 201.000 0.176 1.000   NA
 5923187 5923188 BCAL0883 BCAL0884     TRUE 0.941 59.000 0.767 1.000   NA
 5923188 5923189 BCAL0884 BCAL0885     TRUE 0.726 114.000 0.108 1.000 Y NA
 5923189 5923190 BCAL0885 BCAL0886     TRUE 0.953 71.000 0.588 1.000 Y NA
 5923190 5923191 BCAL0886 BCAL0887     TRUE 0.791 92.000 0.100 1.000 Y NA
 5923196 5923197 BCAL0892 BCAL0893     TRUE 0.970 23.000 0.642 NA   NA
 5923198 5923199 BCAL0894 BCAL0895     FALSE 0.433 82.000 0.168 1.000 N NA
 5923199 5923200 BCAL0895 BCAL0896   pdxA TRUE 0.963 12.000 0.561 1.000 N NA
 5923200 5923201 BCAL0896 BCAL0897 pdxA ksgA TRUE 0.671 48.000 0.197 1.000 N NA
 5923204 5923205 BCAL0900 BCAL0901     TRUE 0.753 46.000 0.099 NA   NA
 5923205 5923206 BCAL0901 BCAL0902     TRUE 0.775 44.000 0.279 1.000 N NA
 5923206 5923207 BCAL0902 BCAL0903   glyS TRUE 0.810 11.000 0.123 1.000 N NA
 5923207 5923208 BCAL0903 BCAL0904 glyS glyQ TRUE 0.997 23.000 0.651 0.000 Y NA
 5923210 5923211 BCAL0906 BCAL0907     FALSE 0.048 53.000 0.000 NA N NA
 5923211 5923212 BCAL0907 BCAL0908     FALSE 0.020 488.000 0.019 NA Y NA
 5923212 5923213 BCAL0908 BCAL0909     TRUE 0.833 13.000 0.014 NA   NA
 5923213 5923214 BCAL0909 BCAL0910     FALSE 0.509 152.000 0.457 NA   NA
 5923214 5923215 BCAL0910 BCAL0911   miaB TRUE 0.792 30.000 0.220 1.000 N NA
 5923215 5923216 BCAL0911 BCAL0912 miaB   FALSE 0.001 214.000 0.005 NA N NA
 5923217 5923218 BCAL0913 BCAL0914     FALSE 0.001 220.000 0.000 NA N NA
 5923218 5923219 BCAL0914 BCALr0914     FALSE 0.044 188.000 0.000 NA   NA
 5923219 5923220 BCALr0914 BCAL0915   ribB FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 5923221 5923222 BCAL0916 BCAL0917     FALSE 0.277 144.000 0.120 1.000   NA
 5923222 5923223 BCAL0917 BCAL0918     TRUE 0.755 39.000 0.071 NA   NA
 5923223 5923224 BCAL0918 BCAL0919     TRUE 0.772 41.000 0.095 NA   NA
 5923224 5923225 BCAL0919 BCAL0920     FALSE 0.501 144.000 0.375 NA   NA
 5923226 5923227 BCAL0921 BCAL0922     TRUE 0.915 37.000 0.571 NA N NA
 5923227 5923228 BCAL0922 BCAL0923     TRUE 0.980 5.000 0.500 NA   NA
 5923229 5923230 BCAL0924 BCAL0925 glpF glpK FALSE 0.367 82.000 0.131 1.000 N NA
 5923230 5923231 BCAL0925 BCAL0926 glpK glpD TRUE 0.916 96.000 0.032 0.001 Y NA
 5923233 5923234 BCAL0928 BCAL0929   glpR FALSE 0.009 301.000 0.000 NA   NA
 5923235 5923236 BCAL0930 BCAL0931     FALSE 0.007 328.000 0.000 1.000   NA
 5923236 5923237 BCAL0931 BCAL0932     TRUE 0.788 71.000 0.306 NA   NA
 5923238 5923239 BCAL0933 BCAL0934 rhlE1   FALSE 0.104 138.000 0.088 1.000 N NA
 5923239 5923240 BCAL0934 BCAL0935     TRUE 0.998 20.000 1.000 0.011 Y NA
 5923246 5923247 BCAL0940 BCAL0941     FALSE 0.001 247.000 0.000 NA N NA
 5923249 5923250 BCAL0943 BCAL0944     TRUE 0.858 21.000 0.088 NA   NA
 5923251 5923252 BCAL0945 BCAL0946     FALSE 0.453 165.000 0.174 NA Y NA
 5923253 5923254 BCAL0947a BCAL0948     FALSE 0.013 270.000 0.000 NA   NA
 5923254 5923255 BCAL0948 BCAL0949     FALSE 0.075 275.000 0.000 0.007   NA
 5923255 5923256 BCAL0949 BCALr0949     FALSE 0.372 78.000 0.000 NA   NA
 5923256 5923257 BCALr0949 BCAL0950     FALSE 0.081 162.000 0.000 NA   NA
 5923257 5923258 BCAL0950 BCAL0951     FALSE 0.001 228.000 0.000 1.000 N NA
 5923258 5923259 BCAL0951 BCAL0952     TRUE 0.993 18.000 0.812 1.000 Y NA
 5923260 5923261 BCAL0953 BCAL0954     TRUE 0.968 0.000 0.296 1.000   NA
 5923261 5923262 BCAL0954 BCAL0955     FALSE 0.113 156.000 0.010 NA   NA
 5923262 5923263 BCAL0955 BCAL0956   sucC FALSE 0.591 69.000 0.076 NA   NA
 5923263 5923264 BCAL0956 BCAL0957 sucC sucD TRUE 0.971 65.000 0.151 0.000 Y NA
 5923264 5923265 BCAL0957 BCAL0958 sucD   FALSE 0.041 158.000 0.060 1.000 N NA
 5923265 5923266 BCAL0958 BCAL0959   pilA FALSE 0.341 98.000 0.154 1.000 N NA
 5923266 5923267 BCAL0959 BCAL0960 pilA   FALSE 0.314 126.000 0.229 NA N NA
 5923267 5923268 BCAL0960 BCAL0961     FALSE 0.004 452.000 0.000 NA   NA
 5923271 5923272 BCAL0964 BCAL0965     TRUE 0.864 -7.000 0.131 NA   NA
 5923272 5923273 BCAL0965 BCAL0966     TRUE 0.786 34.000 0.075 NA   NA
 5923273 5923274 BCAL0966 BCAL0967   waaF FALSE 0.398 116.000 0.088 NA   NA
 5923274 5923275 BCAL0967 BCAL0968 waaF   FALSE 0.322 140.000 0.138 NA   NA
 5923275 5923276 BCAL0968 BCAL0969     FALSE 0.131 144.000 0.000 NA   NA
 5923276 5923277 BCAL0969 BCAL0970     TRUE 0.826 21.000 0.054 NA   NA
 5923277 5923278 BCAL0970 BCALr0970a     FALSE 0.183 128.000 0.000 NA   NA
 5923278 5923279 BCALr0970a BCALr0970b     FALSE 0.394 74.000 0.000 NA   NA
 5923279 5923280 BCALr0970b BCAL0971     FALSE 0.280 103.000 0.000 NA   NA
 5923281 5923282 BCAL0972 BCAL0973 pncB   FALSE 0.475 88.000 0.063 1.000   NA
 5923282 5923283 BCAL0973 BCAL0974     TRUE 0.821 44.000 0.170 1.000   NA
 5923283 5923284 BCAL0974 BCAL0975     FALSE 0.578 82.000 0.283 1.000 N NA
 5923284 5923285 BCAL0975 BCAL0976     TRUE 0.907 3.000 0.058 NA   NA
 5923286 5923287 BCAL0977 BCAL0978     TRUE 0.971 -3.000 0.389 NA   NA
 5923287 5923288 BCAL0978 BCAL0979   moeA2 TRUE 0.828 40.000 0.156 NA   NA
 5923288 5923289 BCAL0979 BCAL0980 moeA2 mobA2 TRUE 0.905 112.000 0.089 0.002 Y NA
 5923289 5923290 BCAL0980 BCAL0981 mobA2 moaA2 TRUE 0.986 23.000 0.075 0.002 Y NA
 5923290 5923291 BCAL0981 BCAL0982 moaA2 rne2 FALSE 0.052 131.000 0.042 1.000 N NA
 5923292 5923293 BCAL0983 BCAL0984 rluC2   TRUE 0.972 6.000 0.389 1.000   NA
 5923293 5923294 BCAL0984 BCAL0985     TRUE 0.945 -3.000 0.199 NA   NA
 5923294 5923295 BCAL0985 BCAL0986     TRUE 0.882 13.000 0.218 NA N NA
 5923296 5923297 BCAL0987 BCAL0988     TRUE 0.919 -3.000 0.107 NA   NA
 5923298 5923299 BCAL0989 BCAL0990   rpmF2 TRUE 0.825 99.000 0.599 NA   NA
 5923299 5923300 BCAL0990 BCAL0991 rpmF2 plsX2 FALSE 0.471 130.000 0.418 1.000 N NA
 5923300 5923301 BCAL0991 BCAL0992 plsX2 fabH2 TRUE 0.997 1.000 0.380 0.004 Y NA
 5923301 5923302 BCAL0992 BCAL0993 fabH2 fabD2 TRUE 0.951 85.000 0.182 0.004 Y NA
 5923302 5923303 BCAL0993 BCAL0994 fabD2 fabG2 TRUE 0.992 37.000 0.432 0.004 Y NA
 5923303 5923304 BCAL0994 BCAL0995 fabG2 acpP2 TRUE 0.884 145.000 0.321 0.004 Y NA
 5923304 5923305 BCAL0995 BCAL0996 acpP2 fabF2 FALSE 0.580 165.000 0.346 1.000 Y NA
 5923305 5923306 BCAL0996 BCAL0997 fabF2   TRUE 0.854 12.000 0.028 NA   NA
 5923306 5923307 BCAL0997 BCAL0998   rpoE2 FALSE 0.457 92.000 0.062 NA   NA
 5923307 5923308 BCAL0998 BCAL0999 rpoE2 rseA2 TRUE 0.840 75.000 0.705 NA N NA
 5923308 5923309 BCAL0999 BCAL1000 rseA2 mucB2 TRUE 0.996 6.000 0.856 NA Y NA
 5923309 5923310 BCAL1000 BCAL1001 mucB2 mucD2 TRUE 0.859 17.000 0.218 NA N NA
 5923310 5923311 BCAL1001 BCAL1002 mucD2   TRUE 0.910 8.000 0.085 NA   NA
 5923311 5923312 BCAL1002 BCAL1003   lepA2 FALSE 0.048 190.000 0.002 NA   NA
 5923312 5923313 BCAL1003 BCAL1004 lepA2 lepB2 TRUE 0.919 17.000 0.187 1.000   NA
 5923313 5923314 BCAL1004 BCAL1005 lepB2 rnc2 FALSE 0.223 154.000 0.117 1.000   NA
 5923314 5923315 BCAL1005 BCAL1006 rnc2 era2 TRUE 0.865 61.000 0.058 0.066   NA
 5923315 5923316 BCAL1006 BCAL1007 era2 recO2 TRUE 0.742 -13.000 0.049 1.000   NA
 5923316 5923317 BCAL1007 BCAL1008 recO2 pdxJ2 TRUE 0.863 -3.000 0.166 1.000 N NA
 5923317 5923318 BCAL1008 BCAL1009 pdxJ2 acpS2 TRUE 0.620 82.000 0.326 1.000 N NA
 5923318 5923319 BCAL1009 BCAL1010 acpS2 nagZ2 TRUE 0.666 17.000 0.081 1.000 N NA
 5923320 5923321 BCAL1011 BCAL1012   efp2 FALSE 0.001 268.000 0.000 1.000 N NA
 5923321 5923322 BCAL1012 BCAL1013 efp2   FALSE 0.258 138.000 0.074 NA   NA
 5923323 5923324 BCAL1014 BCAL1017 uvrC2   FALSE 0.547 -1541.000 0.000 NA   NA
 5923324 5923325 BCAL1017 BCAL1019   pgsA2 FALSE 8.73931014197314e-05 1766.000 0.000 1.000 N NA
 5923325 5923326 BCAL1019 BCALr1019a pgsA2   FALSE 0.137 142.000 0.000 NA   NA
 5923326 5923327 BCALr1019a BCALr1019b     FALSE 0.539 53.000 0.000 NA   NA
 5923327 5923328 BCALr1019b BCALr1019c     FALSE 0.544 52.000 0.000 NA   NA
 5923328 5923329 BCALr1019c BCALr1019d     FALSE 0.289 100.000 0.000 NA   NA
 5923329 5923330 BCALr1019d BCAL1020     FALSE 0.003 644.000 0.000 NA   NA
 5923330 5923331 BCAL1020 BCAL1021     FALSE 0.045 185.000 0.000 1.000   NA
 5923332 5923333 BCAL1022 BCAL1023     FALSE 0.412 51.000 0.077 1.000 N NA
 5923334 5923335 BCAL1024 BCAL1025     TRUE 0.978 0.000 0.410 NA   NA
 5923339 5923340 BCAL1030 BCAL1031     FALSE 0.427 142.000 0.267 NA   NA
 5923341 5923342 BCAL1032 BCAL1033     TRUE 0.934 11.000 0.167 NA   NA
 5923342 5923343 BCAL1033 BCAL1034     TRUE 0.938 9.000 0.167 NA   NA
 5923344 5923345 BCAL1035 BCAL1036 otsB otsA TRUE 0.993 -3.000 0.079 0.001 Y NA
 5923345 5923346 BCAL1036 BCAL1037 otsA   FALSE 0.337 87.000 0.000 1.000   NA
 5923346 5923347 BCAL1037 BCAL1038     TRUE 0.974 0.000 0.056 0.068   NA
 5923349 5923350 BCAL1040 BCAL1041     FALSE 0.019 236.000 0.000 NA   NA
 5923350 5923351 BCAL1041 BCAL1042     TRUE 0.778 40.000 0.096 NA   NA
 5923354 5923355 BCAL1045 BCAL1046   plcN FALSE 0.003 372.000 0.067 NA N NA
 5923355 5923356 BCAL1046 BCAL1047 plcN pdxY FALSE 0.002 278.000 0.029 1.000 N NA
 5923359 5923360 BCAL1050 BCAL1051     FALSE 0.328 156.000 0.257 1.000   NA
 5923360 5923361 BCAL1051 BCAL1052     TRUE 0.982 4.000 0.527 1.000   NA
 5923361 5923362 BCAL1052 BCAL1053     TRUE 0.968 -3.000 0.347 NA   NA
 5923362 5923363 BCAL1053 BCAL1054     FALSE 0.532 122.000 0.238 NA   NA
 5923363 5923364 BCAL1054 BCAL1055   hisQ FALSE 0.005 368.000 0.000 NA   NA
 5923364 5923365 BCAL1055 BCAL1056 hisQ hisM TRUE 0.993 -3.000 0.150 0.009 Y NA
 5923365 5923366 BCAL1056 BCAL1057 hisM hisP TRUE 0.970 21.000 0.200 1.000 Y NA
 5923366 5923367 BCAL1057 BCAL1058 hisP   TRUE 0.737 32.000 0.176 1.000 N NA
 5923367 5923368 BCAL1058 BCAL1059   argM FALSE 0.003 1039.000 0.176 1.000 N NA
 5923368 5923369 BCAL1059 BCAL1060 argM   TRUE 0.989 31.000 0.833 1.000 Y NA
 5923369 5923370 BCAL1060 BCAL1061     TRUE 0.999 -3.000 0.778 0.000 Y NA
 5923370 5923371 BCAL1061 BCAL1062   astD TRUE 0.982 8.000 0.875 1.000 N NA
 5923371 5923372 BCAL1062 BCAL1063 astD astB TRUE 0.785 15.000 0.126 1.000 N NA
 5923372 5923373 BCAL1063 BCAL1064 astB astE TRUE 0.978 8.000 0.126 1.000 Y NA
 5923373 5923374 BCAL1064 BCAL1065 astE   FALSE 0.028 356.000 0.000 1.000 Y NA
 5923375 5923376 BCAL1066 BCAL1067     TRUE 0.991 0.000 0.056 0.068 Y NA
 5923376 5923377 BCAL1067 BCAL1068     FALSE 0.016 104.000 0.000 NA N NA
 5923377 5923378 BCAL1068 BCAL1069     TRUE 0.942 26.000 0.062 NA Y NA
 5923383 5923384 BCAL1074 BCAL1075 iorA iorB TRUE 0.986 -16.000 0.231 0.003 Y NA
 5923384 5923385 BCAL1075 BCAL1076 iorB   FALSE 0.380 89.000 0.154 1.000 N NA
 5923385 5923386 BCAL1076 BCAL1077     TRUE 0.859 32.000 0.333 1.000 N NA
 5923386 5923387 BCAL1077 BCAL1078     TRUE 0.962 -22.000 0.333 0.068   NA
 5923388 5923389 BCAL1079 BCAL1080 mdtC mdtB TRUE 0.982 4.000 0.154 NA Y NA
 5923389 5923390 BCAL1080 BCAL1081 mdtB mdtA TRUE 0.972 16.000 0.800 NA N NA
 5923390 5923391 BCAL1081 BCAL1082 mdtA   FALSE 0.015 256.000 0.000 NA   NA
 5923391 5923392 BCAL1082 BCAL1083     FALSE 0.003 641.000 0.000 NA   NA
 5923392 5923393 BCAL1083 BCAL1084     FALSE 0.107 160.000 0.021 NA   NA
 5923393 5923394 BCAL1084 BCAL1085     FALSE 0.015 254.000 0.000 NA   NA
 5923395 5923396 BCAL1086 BCAL1087     FALSE 0.610 91.000 0.171 NA   NA
 5923396 5923397 BCAL1087 BCAL1088     FALSE 0.254 158.000 0.182 NA   NA
 5923397 5923398 BCAL1088 BCAL1089     FALSE 0.021 247.000 0.020 1.000   NA
 5923399 5923400 BCAL1090 BCAL1091     FALSE 0.390 5.000 0.021 1.000 N NA
 5923400 5923401 BCAL1091 BCAL1092     TRUE 0.967 -10.000 0.026 0.081 Y NA
 5923403 5923404 BCAL1094 BCAL1095     FALSE 0.023 300.000 0.125 NA   NA
 5923405 5923406 BCAL1096 BCAL1097     TRUE 0.998 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 5923406 5923407 BCAL1097 BCAL1098     TRUE 0.996 -3.000 0.688 0.001   NA
 5923407 5923408 BCAL1098 BCAL1099     TRUE 0.863 -3.000 0.025 1.000   NA
 5923409 5923410 BCAL1100 BCAL1101     FALSE 0.004 444.000 0.000 NA   NA
 5923410 5923411 BCAL1101 BCAL1102     FALSE 0.183 148.000 0.050 NA   NA
 5923411 5923412 BCAL1102 BCAL1103     FALSE 0.112 151.000 0.000 NA   NA
 5923412 5923413 BCAL1103 BCAL1104   thiC FALSE 0.019 246.000 0.003 NA   NA
 5923413 5923414 BCAL1104 BCALr1104 thiC   FALSE 0.382 76.000 0.000 NA   NA
 5923415 5923416 BCAL1105 BCAL1106     FALSE 0.569 77.000 0.093 NA   NA
 5923416 5923417 BCAL1106 BCAL1107     TRUE 0.951 30.000 0.143 0.064   NA
 5923418 5923419 BCAL1108 BCAL1109     TRUE 0.827 -3.000 0.000 NA   NA
 5923421 5923422 BCAL1111 BCAL1112     FALSE 0.092 175.000 0.056 1.000   NA
 5923422 5923423 BCAL1112 BCAL1113     TRUE 0.784 85.000 0.382 1.000   NA
 5923423 5923424 BCAL1113 BCAL1114     TRUE 0.996 14.000 0.632 0.081 Y NA
 5923424 5923425 BCAL1114 BCAL1115     TRUE 0.939 65.000 0.660 0.081 N NA
 5923425 5923426 BCAL1115 BCAL1116     TRUE 0.988 18.000 0.870 0.081 N NA
 5923426 5923427 BCAL1116 BCAL1117     TRUE 0.854 75.000 0.761 1.000 N NA
 5923428 5923429 BCALr1117 BCAL1118     FALSE 0.029 211.000 0.000 NA   NA
 5923429 5923430 BCAL1118 BCAL1119     FALSE 0.440 67.000 0.000 NA   NA
 5923430 5923431 BCAL1119 BCAL1120     FALSE 0.012 274.000 0.000 NA   NA
 5923431 5923432 BCAL1120 BCAL1121     TRUE 0.988 4.000 0.750 NA   NA
 5923432 5923433 BCAL1121 BCAL1122     TRUE 0.965 46.000 1.000 NA   NA
 5923433 5923434 BCAL1122 BCAL1123     TRUE 0.827 -3.000 0.000 NA   NA
 5923434 5923435 BCAL1123 BCAL1124     FALSE 0.004 409.000 0.000 NA   NA
 5923436 5923437 BCAL1124a BCAL1125     FALSE 0.552 -647.000 0.000 NA   NA
 5923437 5923438 BCAL1125 BCAL1127     FALSE 0.002 1424.000 0.000 NA   NA
 5923438 5923439 BCAL1127 BCAL1128     TRUE 0.959 -7.000 0.520 NA   NA
 5923439 5923440 BCAL1128 BCAL1129     TRUE 0.638 36.000 0.000 NA   NA
 5923441 5923442 BCAL1130 BCAL1131     TRUE 0.979 1.000 0.438 NA   NA
 5923442 5923443 BCAL1131 BCAL1132     FALSE 0.431 68.000 0.000 NA   NA
 5923444 5923445 BCAL1133 BCAL1138     FALSE 0.002 1384.000 0.000 NA   NA
 5923445 5923446 BCAL1138 BCAL1139     FALSE 0.296 139.000 0.111 NA   NA
 5923446 5923447 BCAL1139 BCAL1140     FALSE 0.494 61.000 0.000 NA   NA
 5923448 5923449 BCAL1141 BCAL1142     TRUE 0.901 33.000 0.000 0.068   NA
 5923449 5923450 BCAL1142 BCAL1143     FALSE 0.565 48.000 0.000 NA   NA
 5923450 5923451 BCAL1143 BCAL1143a     FALSE 0.003 663.000 0.000 NA   NA
 5923451 5923452 BCAL1143a BCAL1144     FALSE 0.091 158.000 0.000 NA   NA
 5923452 5923453 BCAL1144 BCAL1145     FALSE 0.372 78.000 0.000 NA   NA
 5923455 5923456 BCAL1147 BCAL1148     FALSE 0.606 -3.000 0.049 1.000 N NA
 5923456 5923457 BCAL1148 BCAL1149     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA N NA
 5923457 5923458 BCAL1149 BCAL1150     FALSE 0.000 311.000 0.000 NA N NA
 5923459 5923460 BCAL1151 BCAL1152     FALSE 0.059 43.000 0.000 NA N NA
 5923460 5923461 BCAL1152 BCAL1153     TRUE 0.928 24.000 0.000 NA Y NA
 5923461 5923462 BCAL1153 BCAL1154     FALSE 0.000 282.000 0.000 1.000 N NA
 5923462 5923463 BCAL1154 BCAL1155     FALSE 0.001 211.000 0.000 NA N NA
 5923463 5923464 BCAL1155 BCAL1156     FALSE 0.078 32.000 0.000 NA N NA
 5923464 5923465 BCAL1156 BCAL1157     TRUE 0.957 12.000 0.500 1.000 N NA
 5923465 5923466 BCAL1157 BCAL1158     TRUE 0.975 12.000 0.500 NA   NA
 5923466 5923467 BCAL1158 BCAL1159     TRUE 0.978 -3.000 0.500 NA   NA
 5923467 5923468 BCAL1159 BCAL1160     TRUE 0.979 22.000 0.500 0.032 N NA
 5923468 5923469 BCAL1160 BCAL1161     TRUE 0.920 64.000 0.667 NA   NA
 5923469 5923470 BCAL1161 BCAL1162     TRUE 0.735 130.000 0.667 NA   NA
 5923471 5923472 BCAL1162a BCAL1163     TRUE 0.972 -3.000 0.400 NA   NA
 5923472 5923473 BCAL1163 BCAL1164     TRUE 0.864 64.000 0.400 NA   NA
 5923473 5923474 BCAL1164 BCAL1165     FALSE 0.002 1030.000 0.000 NA   NA
 5923474 5923475 BCAL1165 BCAL1166     TRUE 0.876 61.000 0.400 NA   NA
 5923475 5923476 BCAL1166 BCAL1167     TRUE 0.822 10.000 0.000 NA   NA
 5923476 5923477 BCAL1167 BCAL1168     TRUE 0.960 13.000 0.333 NA   NA
 5923477 5923478 BCAL1168 BCAL1169     FALSE 0.422 69.000 0.000 NA   NA
 5923481 5923482 BCAL1173 BCAL1174     TRUE 0.858 52.000 0.000 NA Y NA
 5923482 5923483 BCAL1174 BCAL1175     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA Y NA
 5923483 5923484 BCAL1175 BCAL1176     FALSE 0.001 260.000 0.000 1.000 N NA
 5923484 5923485 BCAL1176 BCAL1176a     TRUE 0.924 3.000 0.091 NA   NA
 5923485 5923486 BCAL1176a BCAL1177     TRUE 0.817 11.000 0.000 NA   NA
 5923486 5923487 BCAL1177 BCAL1178     FALSE 0.415 70.000 0.000 NA   NA
 5923487 5923488 BCAL1178 BCAL1179     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA N NA
 5923488 5923489 BCAL1179 BCAL1180     FALSE 0.233 175.000 0.000 NA Y NA
 5923489 5923490 BCAL1180 BCAL1181   glxK FALSE 0.001 214.000 0.000 NA N NA
 5923490 5923491 BCAL1181 BCAL1182 glxK   FALSE 0.013 118.000 0.000 1.000 N NA
 5923492 5923493 BCAL1183 BCAL1184     FALSE 0.318 93.000 0.000 NA   NA
 5923493 5923494 BCAL1184 BCAL1185     FALSE 0.605 41.000 0.000 NA   NA
 5923494 5923495 BCAL1185 BCAL1186     FALSE 0.004 415.000 0.000 1.000   NA
 5923495 5923496 BCAL1186 BCAL1187     TRUE 0.934 4.000 0.125 1.000   NA
 5923496 5923497 BCAL1187 BCAL1188     TRUE 0.981 0.000 0.476 NA   NA
 5923498 5923499 BCAL1189 BCAL1190     TRUE 0.897 97.000 1.000 NA   NA
 5923499 5923500 BCAL1190 BCAL1191     FALSE 0.048 183.000 0.000 NA   NA
 5923502 5923503 BCAL1193 BCAL1194     TRUE 0.852 2.000 0.000 NA   NA
 5923503 5923504 BCAL1194 BCAL1195     TRUE 0.887 103.000 1.000 NA   NA
 5923504 5923505 BCAL1195 BCAL1196     TRUE 0.941 67.000 1.000 NA   NA
 5923505 5923506 BCAL1196 BCAL1197     TRUE 0.827 -3.000 0.000 NA   NA
 5923506 5923507 BCAL1197 BCAL1198     FALSE 0.550 51.000 0.000 NA   NA
 5923507 5923508 BCAL1198 BCAL1199     TRUE 0.969 12.000 0.400 NA   NA
 5923508 5923509 BCAL1199 BCAL1200     FALSE 0.408 71.000 0.000 NA   NA
 5923509 5923510 BCAL1200 BCAL1201     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 5923510 5923511 BCAL1201 BCAL1202     FALSE 0.318 93.000 0.000 NA   NA
 5923511 5923512 BCAL1202 BCAL1202A     TRUE 0.700 -7.000 0.000 NA   NA
 5923512 5923513 BCAL1202A BCAL1203     FALSE 0.565 48.000 0.000 NA   NA
 5923515 5923516 BCAL1205 BCAL1207     FALSE 0.005 155.000 0.000 1.000 N NA
 5923516 5923517 BCAL1207 BCAL1208     FALSE 0.276 104.000 0.000 NA   NA
 5923517 5923518 BCAL1208 BCAL1209   morB FALSE 0.511 58.000 0.000 NA   NA
 5923519 5923520 BCAL1210 BCAL1211     FALSE 0.115 150.000 0.000 NA   NA
 5923520 5923521 BCAL1211 BCAL1212   bkdA1 FALSE 0.004 407.000 0.000 1.000   NA
 5923521 5923522 BCAL1212 BCAL1213 bkdA1 bkdA2 TRUE 0.994 39.000 0.558 0.000 Y NA
 5923522 5923523 BCAL1213 BCAL1214 bkdA2 bkdB TRUE 0.986 2.000 0.000 0.091 Y NA
 5923523 5923524 BCAL1214 BCAL1215 bkdB lpdV TRUE 0.972 5.000 0.057 1.000 Y NA
 5923524 5923525 BCAL1215 BCAL1216 lpdV   FALSE 0.000 317.000 0.000 NA N NA
 5923527 5923528 BCAL1218 BCAL1219 speB   TRUE 0.697 -7.000 0.000 1.000   NA
 5923528 5923529 BCAL1219 BCAL1220     FALSE 0.003 503.000 0.000 1.000   NA
 5923529 5923530 BCAL1220 BCAL1221     FALSE 0.041 148.000 0.048 1.000 N NA
 5923532 5923533 BCAL1223 BCAL1224     TRUE 0.879 26.000 0.333 1.000 N NA
 5923533 5923534 BCAL1224 BCAL1225     TRUE 0.888 24.000 0.333 NA N NA
 5923535 5923536 BCAL1226 BCAL1227     FALSE 0.000 754.000 0.000 NA N NA
 5923538 5923539 BCAL1229 BCAL1230     FALSE 0.357 118.000 0.068 NA   NA
 5923540 5923541 BCAL1231 BCAL1232     FALSE 0.605 91.000 0.167 NA   NA
 5923542 5923543 BCAL1233 BCAL1234     TRUE 0.982 17.000 0.333 NA Y NA
 5923545 5923546 BCAL1236 BCAL1237     FALSE 0.110 162.000 0.033 NA   NA
 5923547 5923548 BCAL1238 BCAL1239     TRUE 0.982 21.000 0.945 NA   NA
 5923548 5923549 BCAL1239 BCAL1240     FALSE 0.271 134.000 0.073 NA   NA
 5923549 5923550 BCAL1240 BCAL1241     TRUE 0.961 11.000 0.316 NA   NA
 5923550 5923551 BCAL1241 BCAL1242     TRUE 0.975 -3.000 0.438 NA   NA
 5923551 5923552 BCAL1242 BCAL1243     TRUE 0.962 -13.000 0.700 NA   NA
 5923552 5923553 BCAL1243 BCAL1244     TRUE 0.721 -13.000 0.034 NA   NA
 5923553 5923554 BCAL1244 BCAL1245     TRUE 0.871 -3.000 0.034 1.000   NA
 5923554 5923555 BCAL1245 BCAL1246     TRUE 0.828 -3.000 0.127 1.000 N NA
 5923555 5923556 BCAL1246 BCAL1247     FALSE 0.217 129.000 0.020 NA   NA
 5923556 5923557 BCAL1247 BCAL1248     TRUE 0.688 126.000 0.500 NA   NA
 5923559 5923560 BCAL1250 BCAL1251     FALSE 0.067 185.000 0.041 NA   NA
 5923563 5923564 BCAL1254 BCAL1255 dnaQ rnhA TRUE 0.952 41.000 0.248 1.000 Y NA
 5923564 5923565 BCAL1255 BCAL1256 rnhA   TRUE 0.844 -3.000 0.005 1.000   NA
 5923566 5923567 BCAL1257 BCAL1258     FALSE 0.123 152.000 0.004 1.000   NA
 5923567 5923568 BCAL1258 BCAL1259     FALSE 0.448 96.000 0.067 NA   NA
 5923568 5923569 BCAL1259 BCAL1260   carA FALSE 0.000 366.000 0.000 NA N NA
 5923569 5923570 BCAL1260 BCAL1261 carA   TRUE 0.909 37.000 0.026 1.000 Y NA
 5923570 5923571 BCAL1261 BCAL1262   carB TRUE 0.881 50.000 0.030 1.000 Y NA
 5923571 5923572 BCAL1262 BCAL1263 carB greA FALSE 0.370 119.000 0.241 1.000 N NA
 5923572 5923573 BCAL1263 BCAL1264 greA   TRUE 0.887 15.000 0.089 NA   NA
 5923575 5923576 BCAL1266 BCAL1267   ftsH FALSE 0.051 167.000 0.095 NA N NA
 5923576 5923577 BCAL1267 BCAL1268 ftsH folP FALSE 0.579 92.000 0.325 1.000 N NA
 5923577 5923578 BCAL1268 BCAL1269 folP   TRUE 0.832 28.000 0.260 1.000 N NA
 5923578 5923579 BCAL1269 BCAL1270   pstS FALSE 0.000 440.000 0.000 1.000 N NA
 5923579 5923580 BCAL1270 BCAL1271 pstS pstC TRUE 0.928 95.000 0.072 0.001 Y NA
 5923580 5923581 BCAL1271 BCAL1272 pstC pstA TRUE 0.993 39.000 0.537 0.001 Y NA
 5923581 5923582 BCAL1272 BCAL1273 pstA pstB TRUE 0.997 16.000 0.526 0.001 Y NA
 5923582 5923583 BCAL1273 BCAL1274 pstB   TRUE 0.980 19.000 0.317 NA Y NA
 5923583 5923584 BCAL1274 BCAL1275   phoB TRUE 0.612 32.000 0.104 NA N NA
 5923584 5923585 BCAL1275 BCAL1276 phoB   TRUE 0.959 58.000 0.453 1.000 Y NA
 5923588 5923589 BCAL1279 BCALr1279     FALSE 0.024 223.000 0.000 NA   NA
 5923590 5923591 BCAL1280 BCAL1281     FALSE 0.120 172.000 0.085 NA   NA
 5923592 5923593 BCAL1282 BCAL1285     FALSE 0.006 338.000 0.000 NA   NA
 5923593 5923594 BCAL1285 BCAL1286     TRUE 0.871 11.000 0.042 NA   NA
 5923594 5923595 BCAL1286 BCAL1287     FALSE 0.598 73.000 0.096 NA   NA
 5923595 5923596 BCAL1287 BCAL1288     FALSE 0.000 369.000 0.000 1.000 N NA
 5923596 5923597 BCAL1288 BCAL1289     FALSE 0.363 133.000 0.320 1.000 N NA
 5923598 5923599 BCAL1290 BCALr1290     FALSE 0.050 181.000 0.000 NA   NA
 5923599 5923600 BCALr1290 BCAL1291     FALSE 0.003 600.000 0.000 NA   NA
 5923600 5923601 BCAL1291 BCAL1292     TRUE 0.856 25.000 0.111 NA   NA
 5923603 5923604 BCAL1294 BCAL1295     TRUE 0.810 12.000 0.000 NA   NA
 5923604 5923605 BCAL1295 BCAL1296     TRUE 0.982 0.000 0.500 NA   NA
 5923605 5923606 BCAL1296 BCAL1297     FALSE 0.253 111.000 0.000 NA   NA
 5923606 5923607 BCAL1297 BCAL1298     TRUE 0.777 16.000 0.000 NA   NA
 5923607 5923608 BCAL1298 BCAL1299     TRUE 0.852 2.000 0.000 NA   NA
 5923608 5923609 BCAL1299 BCAL1300     TRUE 0.973 3.000 0.000 0.009   NA
 5923609 5923610 BCAL1300 BCAL1301     FALSE 0.002 732.000 0.000 NA   NA
 5923610 5923611 BCAL1301 BCAL1302     TRUE 0.844 4.000 0.000 NA   NA
 5923611 5923612 BCAL1302 BCAL1305     TRUE 0.785 15.000 0.000 NA   NA
 5923613 5923614 BCAL1306 BCAL1307     TRUE 0.989 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 5923617 5923618 BCAL1315 BCAL1316     TRUE 0.956 -7.000 0.500 NA   NA
 5923620 5923621 BCAL1318 BCAL1319     FALSE 0.000 334.000 0.000 NA N NA
 5923621 5923622 BCAL1319 BCAL1320     FALSE 0.003 600.000 0.000 NA   NA
 5923623 5923624 BCAL1321 BCAL1322 glmS3   TRUE 0.929 50.000 0.562 1.000   NA
 5923624 5923625 BCAL1322 BCAL1323     TRUE 0.935 93.000 0.562 0.032   NA
 5923625 5923626 BCAL1323 BCAL1324     FALSE 0.008 316.000 0.000 NA   NA
 5923626 5923627 BCAL1324 BCAL1325     TRUE 0.984 14.000 0.769 NA   NA
 5923627 5923628 BCAL1325 BCAL1326     TRUE 0.817 11.000 0.000 NA   NA
 5923628 5923629 BCAL1326 BCAL1327     TRUE 0.871 4.000 0.016 NA   NA
 5923630 5923631 BCAL1328 BCAL1329 wecB   FALSE 0.000 327.000 0.000 1.000 N NA
 5923631 5923632 BCAL1329 BCAL1330     FALSE 0.029 352.000 0.000 1.000 Y NA
 5923632 5923633 BCAL1330 BCAL1331     TRUE 0.994 -3.000 0.145 0.003 Y NA
 5923633 5923634 BCAL1331 BCAL1332     FALSE 0.027 74.000 0.000 1.000 N NA
 5923634 5923635 BCAL1332 BCAL1333     FALSE 0.015 110.000 0.000 1.000 N NA
 5923635 5923636 BCAL1333 BCAL1334     FALSE 0.028 140.000 0.028 1.000 N NA
 5923638 5923639 BCAL1336 BCAL1337 fadH   TRUE 0.787 48.000 0.141 NA   NA
 5923640 5923641 BCAL1338 BCAL1339     TRUE 0.922 14.000 0.333 1.000 N NA
 5923641 5923642 BCAL1339 BCAL1340   tftE TRUE 0.967 52.000 0.500 1.000 Y NA
 5923642 5923643 BCAL1340 BCAL1341 tftE   TRUE 0.865 8.000 0.023 NA   NA
 5923643 5923644 BCAL1341 BCAL1342     TRUE 0.868 -3.000 0.028 NA   NA
 5923645 5923646 BCAL1343 BCAL1344     FALSE 0.023 84.000 0.000 NA N NA
 5923646 5923647 BCAL1344 BCAL1345     FALSE 0.007 139.000 0.000 NA N NA
 5923647 5923648 BCAL1345 BCAL1346     TRUE 0.989 12.000 0.421 1.000 Y NA
 5923648 5923649 BCAL1346 BCAL1347     TRUE 0.977 6.000 0.105 1.000 Y NA
 5923649 5923650 BCAL1347 BCAL1348     TRUE 0.960 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5923651 5923652 BCAL1349 BCAL1350     TRUE 0.995 1.000 0.688 1.000 Y NA
 5923653 5923654 BCAL1351 BCAL1352     FALSE 0.012 274.000 0.000 NA   NA
 5923655 5923656 BCAL1353 BCAL1354     TRUE 0.862 37.000 0.200 NA   NA
 5923657 5923658 BCAL1355 BCAL1356     TRUE 0.848 3.000 0.000 NA   NA
 5923658 5923659 BCAL1356 BCAL1357     FALSE 0.349 85.000 0.000 NA   NA
 5923659 5923660 BCAL1357 BCAL1358     TRUE 0.827 -3.000 0.000 NA   NA
 5923660 5923661 BCAL1358 BCAL1359     FALSE 0.484 62.000 0.000 NA   NA
 5923661 5923662 BCAL1359 BCAL1360     FALSE 0.253 111.000 0.000 NA   NA
 5923662 5923663 BCAL1360 BCAL1362     FALSE 0.006 343.000 0.000 NA   NA
 5923663 5923664 BCAL1362 BCAL1363     TRUE 0.939 6.000 0.154 NA   NA
 5923664 5923665 BCAL1363 BCAL1364     TRUE 0.827 -3.000 0.000 NA   NA
 5923665 5923666 BCAL1364 BCAL1365     TRUE 0.826 9.000 0.000 NA   NA
 5923666 5923667 BCAL1365 BCAL1366     TRUE 0.835 6.000 0.000 NA   NA
 5923668 5923669 BCAL1367 BCAL1368     FALSE 0.004 414.000 0.000 1.000   NA
 5923670 5923671 BCAL1369 BCAL1370 fecI fecR TRUE 0.911 4.000 0.222 NA N NA
 5923671 5923672 BCAL1370 BCAL1371 fecR   TRUE 0.731 103.000 0.064 NA Y NA
 5923672 5923673 BCAL1371 BCAL1372     TRUE 0.821 37.000 0.128 NA   NA
 5923675 5923676 BCAL1374 BCAL1375     FALSE 0.164 133.000 0.000 NA   NA
 5923678 5923679 BCAL1377 BCAL1378     TRUE 0.932 40.000 0.486 NA   NA
 5923679 5923680 BCAL1378 BCAL1379     TRUE 0.989 0.000 0.743 NA   NA
 5923681 5923682 BCAL1380 BCAL1381 ramA   FALSE 0.047 388.000 0.533 1.000   NA
 5923684 5923685 BCAL1383 BCAL1384     TRUE 0.949 38.000 0.595 1.000   NA
 5923686 5923687 BCAL1385 BCAL1386     TRUE 0.874 79.000 0.215 NA Y NA
 5923687 5923688 BCAL1386 BCAL1387     TRUE 0.959 -3.000 0.285 NA   NA
 5923688 5923689 BCAL1387 BCAL1388     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 5923689 5923690 BCAL1388 BCAL1389   bcsB FALSE 0.002 849.000 0.000 NA   NA
 5923690 5923691 BCAL1389 BCAL1390 bcsB bcsZ TRUE 0.879 82.000 0.667 1.000   NA
 5923691 5923692 BCAL1390 BCAL1391 bcsZ   FALSE 0.146 153.000 0.035 1.000   NA
 5923692 5923693 BCAL1391 BCAL1392     TRUE 0.921 17.000 0.193 NA   NA
 5923693 5923694 BCAL1392 BCAL1393     TRUE 0.901 -3.000 0.071 NA   NA
 5923694 5923695 BCAL1393 BCAL1394     TRUE 0.948 -3.000 0.211 NA   NA
 5923695 5923696 BCAL1394 BCAL1395   bcsA TRUE 0.920 -3.000 0.273 NA N NA
 5923696 5923697 BCAL1395 BCAL1396 bcsA   TRUE 0.891 28.000 0.205 NA   NA
 5923697 5923698 BCAL1396 BCAL1397     TRUE 0.884 -18.000 0.263 NA   NA
 5923699 5923700 BCAL1398 BCAL1399     TRUE 0.874 33.000 0.200 NA   NA
 5923700 5923701 BCAL1399 BCAL1400     TRUE 0.692 45.000 0.200 1.000 N NA
 5923701 5923702 BCAL1400 BCAL1401     TRUE 0.973 26.000 0.750 NA   NA
 5923705 5923706 BCAL1403A BCAL1404     TRUE 0.813 19.000 0.033 NA   NA
 5923706 5923707 BCAL1404 BCAL1405     TRUE 0.973 2.000 0.344 NA   NA
 5923707 5923708 BCAL1405 BCAL1406     TRUE 0.693 27.000 0.000 NA   NA
 5923708 5923709 BCAL1406 BCAL1407     TRUE 0.827 -3.000 0.000 NA   NA
 5923709 5923710 BCAL1407 BCAL1408     TRUE 0.966 -3.000 0.333 NA   NA
 5923712 5923713 BCAL1410 BCAL1411     FALSE 0.258 110.000 0.000 NA   NA
 5923713 5923714 BCAL1411 BCAL1412     TRUE 0.826 9.000 0.000 NA   NA
 5923716 5923717 BCAL1413A BCAL1414     FALSE 0.081 192.000 0.083 NA   NA
 5923721 5923722 BCAL1418 BCAL1419     FALSE 0.311 113.000 0.031 NA   NA
 5923722 5923723 BCAL1419 BCAL1420     FALSE 0.427 86.000 0.033 NA   NA
 5923723 5923724 BCAL1420 BCAL1421     TRUE 0.855 10.000 0.020 NA   NA
 5923724 5923725 BCAL1421 BCAL1422     TRUE 0.975 -7.000 0.059 0.079 Y NA
 5923725 5923726 BCAL1422 BCAL1423     TRUE 0.967 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 5923726 5923727 BCAL1423 BCAL1424     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.019 Y NA
 5923727 5923728 BCAL1424 BCAL1425     FALSE 0.002 194.000 0.000 1.000 N NA
 5923729 5923730 BCAL1426 BCAL1427     FALSE 0.259 123.000 0.026 NA   NA
 5923730 5923731 BCAL1427 BCAL1428     TRUE 0.922 57.000 0.199 1.000 Y NA
 5923731 5923732 BCAL1428 BCAL1429     FALSE 0.041 60.000 0.000 1.000 N NA
 5923732 5923733 BCAL1429 BCAL1430     TRUE 0.615 47.000 0.014 1.000   NA
 5923734 5923735 BCAL1431 BCAL1432     TRUE 0.955 67.000 0.538 NA Y NA
 5923735 5923736 BCAL1432 BCAL1433     TRUE 0.966 28.000 0.242 1.000 Y NA
 5923736 5923737 BCAL1433 BCAL1434     TRUE 0.933 44.000 0.152 NA Y NA
 5923737 5923738 BCAL1434 BCAL1435   idh FALSE 0.577 75.000 0.089 NA   NA
 5923738 5923739 BCAL1435 BCAL1436 idh   TRUE 0.770 40.000 0.089 1.000   NA
 5923739 5923740 BCAL1436 BCAL1437     TRUE 0.934 33.000 0.412 1.000   NA
 5923740 5923741 BCAL1437 BCAL1438     FALSE 0.045 220.000 0.069 1.000   NA
 5923743 5923744 BCAL1440 BCAL1441     FALSE 0.048 118.000 0.026 NA N NA
 5923744 5923745 BCAL1441 BCAL1442     FALSE 0.011 284.000 0.000 NA   NA
 5923745 5923746 BCAL1442 BCAL1443     FALSE 0.015 256.000 0.000 NA   NA
 5923746 5923747 BCAL1443 BCAL1444     TRUE 0.940 -3.000 0.172 NA   NA
 5923747 5923748 BCAL1444 BCAL1445     TRUE 0.966 11.000 0.345 NA   NA
 5923748 5923749 BCAL1445 BCAL1446     TRUE 0.956 38.000 0.667 NA   NA
 5923750 5923751 BCAL1447 BCAL1448 galU valS FALSE 0.029 88.000 0.010 1.000 N NA
 5923752 5923753 BCAL1449 BCAL1450     FALSE 0.564 -3.000 0.043 1.000 N NA
 5923756 5923757 BCAL1453 BCAL1454     TRUE 0.932 13.000 0.182 NA   NA
 5923757 5923758 BCAL1454 BCAL1455     TRUE 0.951 -3.000 0.227 NA   NA
 5923758 5923759 BCAL1455 BCAL1456     TRUE 0.956 15.000 0.333 NA   NA
 5923760 5923761 BCAL1457 BCAL1458     FALSE 0.509 118.000 0.188 NA   NA
 5923762 5923763 BCAL1459 BCAL1460     TRUE 0.944 26.000 0.400 1.000   NA
 5923763 5923764 BCAL1460 BCAL1461     TRUE 0.819 19.000 0.038 NA   NA
 5923764 5923765 BCAL1461 BCAL1462     TRUE 0.984 -3.000 0.657 NA   NA
 5923768 5923769 BCAL1465 BCAL1466     FALSE 0.502 140.000 0.073 0.089   NA
 5923769 5923770 BCAL1466 BCAL1467   aroC FALSE 0.000 289.000 0.008 1.000 N NA
 5923772 5923773 BCAL1469 BCAL1470     TRUE 0.757 78.000 0.300 1.000   NA
 5923775 5923776 BCAL1472 BCAL1473 scoA scoB TRUE 0.999 2.000 0.789 0.000 Y NA
 5923777 5923778 BCAL1474 BCAL1475     TRUE 0.956 5.000 0.412 1.000 N NA
 5923778 5923779 BCAL1475 BCAL1476     TRUE 0.953 12.000 0.267 NA   NA
 5923780 5923781 BCAL1477 BCAL1478     FALSE 0.254 124.000 0.027 NA   NA
 5923781 5923782 BCAL1478 BCAL1479     TRUE 0.679 81.000 0.202 NA   NA
 5923782 5923783 BCAL1479 BCAL1480   relA FALSE 0.405 101.000 0.202 NA N NA
 5923783 5923784 BCAL1480 BCALr1480 relA   FALSE 0.345 86.000 0.000 NA   NA
 5923784 5923785 BCALr1480 BCAL1481   thrS FALSE 0.013 272.000 0.000 NA   NA
 5923785 5923786 BCAL1481 BCAL1482 thrS infC TRUE 0.625 38.000 0.000 NA   NA
 5923786 5923787 BCAL1482 BCAL1483 infC rpmI FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 5923787 5923788 BCAL1483 BCAL1484 rpmI rplT TRUE 0.996 31.000 0.928 0.008 Y NA
 5923788 5923789 BCAL1484 BCAL1485 rplT pheS FALSE 0.606 149.000 0.202 1.000 Y NA
 5923789 5923790 BCAL1485 BCAL1486 pheS pheT TRUE 0.978 98.000 0.574 0.000 Y NA
 5923790 5923791 BCAL1486 BCAL1487 pheT ihfA FALSE 0.604 64.000 0.208 1.000 N NA
 5923791 5923792 BCAL1487 BCAL1488 ihfA   TRUE 0.855 59.000 0.535 1.000 N NA
 5923793 5923794 BCAL1489 BCAL1490     FALSE 0.011 280.000 0.000 NA   NA
 5923794 5923795 BCAL1490 BCAL1491     FALSE 0.007 331.000 0.000 NA   NA
 5923796 5923797 BCAL1492 BCALr1492     FALSE 0.168 132.000 0.000 NA   NA
 5923797 5923798 BCALr1492 BCAL1493     FALSE 0.140 141.000 0.000 NA   NA
 5923798 5923799 BCAL1493 BCAL1494     FALSE 0.003 534.000 0.000 NA   NA
 5923800 5923801 BCAL1495 BCAL1496     TRUE 0.728 137.000 0.733 NA   NA
 5923801 5923802 BCAL1496 BCAL1497     FALSE 0.030 210.000 0.000 NA   NA
 5923804 5923805 BCAL1499 BCAL1500     FALSE 0.092 199.000 0.133 NA   NA
 5923806 5923807 BCAL1501 BCAL1502     FALSE 0.417 75.000 0.140 NA N NA
 5923807 5923808 BCAL1502 BCAL1503     FALSE 0.001 273.000 0.000 NA N NA
 5923808 5923809 BCAL1503 BCAL1504     FALSE 0.351 61.000 0.074 NA N NA
 5923809 5923810 BCAL1504 BCAL1505     FALSE 0.005 431.000 0.004 NA   NA
 5923810 5923811 BCAL1505 BCAL1506   nusA TRUE 0.989 0.000 0.759 NA   NA
 5923811 5923812 BCAL1506 BCAL1507 nusA infB FALSE 0.608 92.000 0.342 1.000 N NA
 5923812 5923813 BCAL1507 BCAL1508 infB   TRUE 0.892 116.000 0.530 1.000 Y NA
 5923813 5923814 BCAL1508 BCAL1509   truB TRUE 0.984 14.000 0.318 1.000 Y NA
 5923815 5923816 BCAL1510 BCAL1511   emrA TRUE 0.969 29.000 0.733 1.000   NA
 5923816 5923817 BCAL1511 BCAL1512 emrA   TRUE 0.925 53.000 0.833 1.000 N NA
 5923817 5923818 BCAL1512 BCAL1513     TRUE 0.727 88.000 0.500 1.000 N NA
 5923819 5923820 BCAL1514 BCAL1515 typA sucA FALSE 0.000 317.000 0.000 1.000 N NA
 5923820 5923821 BCAL1515 BCAL1516 sucA sucB TRUE 0.860 137.000 0.667 1.000 Y NA
 5923821 5923822 BCAL1516 BCAL1517 sucB odhL TRUE 0.882 82.000 0.253 1.000 Y NA
 5923822 5923823 BCAL1517 BCAL1518 odhL   FALSE 0.488 99.000 0.103 NA   NA
 5923823 5923824 BCAL1518 BCAL1519     FALSE 0.336 149.000 0.206 NA   NA
 5923825 5923826 BCAL1520 BCAL1522     FALSE 0.086 175.000 0.047 NA   NA
 5923826 5923827 BCAL1522 BCAL1523     FALSE 0.209 145.000 0.062 NA   NA
 5923827 5923828 BCAL1523 BCAL1524     TRUE 0.947 41.000 0.600 NA   NA
 5923829 5923830 BCAL1525 BCAL1525a     TRUE 0.921 88.000 0.467 NA Y NA
 5923830 5923831 BCAL1525a BCAL1526     TRUE 0.991 -3.000 0.450 NA Y NA
 5923831 5923832 BCAL1526 BCAL1527     TRUE 0.912 95.000 0.483 NA Y NA
 5923832 5923833 BCAL1527 BCAL1528     TRUE 0.984 23.000 0.468 NA Y NA
 5923833 5923834 BCAL1528 BCAL1529     TRUE 0.956 76.000 0.696 1.000 Y NA
 5923834 5923835 BCAL1529 BCAL1530     TRUE 0.995 4.000 0.732 1.000 Y NA
 5923835 5923836 BCAL1530 BCAL1531     TRUE 0.990 -7.000 0.822 NA Y NA
 5923836 5923837 BCAL1531 BCAL1532     TRUE 0.996 5.000 0.844 NA Y NA
 5923837 5923838 BCAL1532 BCAL1533     TRUE 0.968 -3.000 0.045 NA Y NA
 5923838 5923839 BCAL1533 BCAL1534     TRUE 0.812 24.000 0.056 NA   NA
 5923839 5923840 BCAL1534 BCAL1535     FALSE 0.512 76.000 0.056 NA   NA
 5923840 5923841 BCAL1535 BCAL1536     TRUE 0.907 14.000 0.118 NA   NA
 5923841 5923842 BCAL1536 BCAL1537     TRUE 0.869 64.000 0.412 NA   NA
 5923845 5923846 BCAL1540 BCAL1541     TRUE 0.923 42.000 0.435 NA   NA
 5923846 5923847 BCAL1541 BCAL1542     FALSE 0.034 158.000 0.052 1.000 N NA
 5923847 5923848 BCAL1542 BCAL1543     FALSE 0.001 216.000 0.000 1.000 N NA
 5923849 5923850 BCAL1544 BCAL1545     FALSE 0.435 126.000 0.172 1.000   NA
 5923850 5923851 BCAL1545 BCAL1546     TRUE 0.928 26.000 0.317 1.000   NA
 5923852 5923853 BCAL1547 BCAL1548     TRUE 0.683 135.000 0.200 NA Y NA
 5923853 5923854 BCAL1548 BCAL1549     TRUE 0.704 101.000 0.333 NA   NA
 5923854 5923855 BCAL1549 BCAL1550     TRUE 0.931 43.000 0.500 1.000   NA
 5923855 5923856 BCAL1550 BCAL1551     TRUE 0.975 14.000 0.156 NA Y NA
 5923856 5923857 BCAL1551 BCALr1551a     FALSE 0.009 293.000 0.000 NA   NA
 5923857 5923858 BCALr1551a BCALr1551b     FALSE 0.016 247.000 0.000 NA   NA
 5923858 5923859 BCALr1551b BCAL1552     FALSE 0.249 112.000 0.000 NA   NA
 5923859 5923860 BCAL1552 BCALr1552     FALSE 0.044 188.000 0.000 NA   NA
 5923861 5923862 BCAL1553 BCAL1554     FALSE 0.476 149.000 0.147 0.011 N NA
 5923862 5923863 BCAL1554 BCAL1555     FALSE 0.015 110.000 0.002 1.000 N NA
 5923863 5923864 BCAL1555 BCAL1556   rpiA FALSE 0.020 93.000 0.003 1.000 N NA
 5923864 5923865 BCAL1556 BCAL1557 rpiA   FALSE 0.000 283.000 0.000 1.000 N NA
 5923866 5923867 BCAL1559 BCAL1560     TRUE 0.621 74.000 0.118 NA   NA
 5923867 5923868 BCAL1560 BCAL1561     TRUE 0.830 8.000 0.000 NA   NA
 5923868 5923869 BCAL1561 BCAL1562     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 5923869 5923870 BCAL1562 BCAL1563     TRUE 0.989 3.000 0.800 NA   NA
 5923870 5923871 BCAL1563 BCAL1564     TRUE 0.987 -3.000 0.800 NA   NA
 5923871 5923872 BCAL1564 BCAL1565     TRUE 0.814 85.000 0.444 NA   NA
 5923872 5923873 BCAL1565 BCAL1566     TRUE 0.953 0.000 0.188 NA   NA
 5923873 5923874 BCAL1566 BCAL1567     TRUE 0.971 6.000 0.375 NA   NA
 5923874 5923875 BCAL1567 BCAL1568     TRUE 0.953 0.000 0.185 NA   NA
 5923875 5923876 BCAL1568 BCAL1569     TRUE 0.745 58.000 0.136 NA   NA
 5923876 5923877 BCAL1569 BCAL1570     TRUE 0.918 83.000 1.000 NA   NA
 5923877 5923878 BCAL1570 BCAL1571     TRUE 0.775 46.000 0.120 NA   NA
 5923878 5923879 BCAL1571 BCAL1572     TRUE 0.785 44.000 0.120 NA   NA
 5923879 5923880 BCAL1572 BCAL1573     TRUE 0.686 59.000 0.088 NA   NA
 5923880 5923881 BCAL1573 BCAL1574     TRUE 0.940 0.000 0.125 NA   NA
 5923881 5923882 BCAL1574 BCAL1575     TRUE 0.927 -3.000 0.125 NA   NA
 5923882 5923883 BCAL1575 BCAL1576     TRUE 0.899 -3.000 0.069 NA   NA
 5923883 5923884 BCAL1576 BCAL1577     FALSE 0.387 75.000 0.000 NA   NA
 5923884 5923885 BCAL1577 BCAL1578     TRUE 0.758 51.000 0.120 NA   NA
 5923885 5923886 BCAL1578 BCAL1579     TRUE 0.872 46.000 0.286 NA   NA
 5923886 5923887 BCAL1579 BCAL1580     FALSE 0.027 214.000 0.000 NA   NA
 5923887 5923888 BCAL1580 BCAL1581     TRUE 0.966 -3.000 0.333 NA   NA
 5923888 5923889 BCAL1581 BCAL1582     TRUE 0.962 2.000 0.250 NA   NA
 5923889 5923890 BCAL1582 BCAL1583     TRUE 0.989 0.000 0.750 NA   NA
 5923890 5923891 BCAL1583 BCAL1584     TRUE 0.827 -3.000 0.000 NA   NA
 5923891 5923892 BCAL1584 BCAL1585   hupB FALSE 0.376 77.000 0.000 NA   NA
 5923892 5923893 BCAL1585 BCAL1586 hupB   TRUE 0.828 63.000 0.300 NA   NA
 5923893 5923894 BCAL1586 BCAL1587     TRUE 0.964 11.000 0.333 NA   NA
 5923894 5923895 BCAL1587 BCAL1588     TRUE 0.975 -3.000 0.444 NA   NA
 5923895 5923896 BCAL1588 BCAL1589     TRUE 0.954 -13.000 0.600 NA   NA
 5923896 5923897 BCAL1589 BCAL1590     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 5923897 5923898 BCAL1590 BCAL1591     TRUE 0.909 8.000 0.083 NA   NA
 5923898 5923899 BCAL1591 BCAL1592     TRUE 0.965 10.000 0.333 NA   NA
 5923899 5923900 BCAL1592 BCAL1593     TRUE 0.961 40.000 0.778 NA   NA
 5923900 5923901 BCAL1593 BCAL1594     TRUE 0.827 -3.000 0.000 NA   NA
 5923902 5923903 BCAL1595 BCAL1596     FALSE 0.529 55.000 0.000 NA   NA
 5923903 5923904 BCAL1596 BCAL1597     TRUE 0.700 -7.000 0.000 NA   NA
 5923904 5923905 BCAL1597 BCAL1598     FALSE 0.137 142.000 0.000 NA   NA
 5923905 5923906 BCAL1598 BCAL1599     TRUE 0.972 -3.000 0.400 NA   NA
 5923906 5923907 BCAL1599 BCAL1599a     TRUE 0.827 -3.000 0.000 NA   NA
 5923907 5923908 BCAL1599a BCAL1599b     FALSE 0.274 105.000 0.000 NA   NA
 5923908 5923909 BCAL1599b BCAL1601     TRUE 0.827 -3.000 0.000 NA   NA
 5923909 5923910 BCAL1601 BCAL1602     TRUE 0.926 4.000 0.103 NA   NA
 5923910 5923911 BCAL1602 BCAL1603     TRUE 0.977 7.000 0.485 NA   NA
 5923911 5923912 BCAL1603 BCAL1604     TRUE 0.872 -10.000 0.182 NA   NA
 5923912 5923913 BCAL1604 BCAL1605     TRUE 0.891 45.000 0.333 NA   NA
 5923913 5923914 BCAL1605 BCAL1606     TRUE 0.987 1.000 0.667 NA   NA
 5923915 5923916 BCAL1609 BCAL1610     TRUE 0.963 123.000 0.857 0.077 Y NA
 5923916 5923917 BCAL1610 BCAL1611   pyrD FALSE 0.050 100.000 0.022 1.000 N NA
 5923917 5923918 BCAL1611 BCAL1612 pyrD   FALSE 0.102 99.000 0.044 1.000 N NA
 5923918 5923919 BCAL1612 BCAL1613     TRUE 0.964 34.000 0.285 1.000 Y NA
 5923919 5923920 BCAL1613 BCAL1614     TRUE 0.635 12.000 0.058 1.000 N NA
 5923920 5923921 BCAL1614 BCALr1614     FALSE 0.057 175.000 0.000 NA   NA
 5923922 5923923 BCAL1615 BCAL1616   qacE TRUE 0.963 4.000 0.273 NA   NA
 5923923 5923924 BCAL1616 BCAL1617 qacE   FALSE 0.304 83.000 0.105 1.000 N NA
 5923926 5923927 BCAL1619 BCAL1620 ssuD ssuC TRUE 0.915 17.000 0.340 1.000 N NA
 5923927 5923928 BCAL1620 BCAL1621 ssuC ssuB TRUE 0.964 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 5923928 5923929 BCAL1621 BCAL1622 ssuB mopII TRUE 0.749 58.000 0.043 0.077 N NA
 5923929 5923930 BCAL1622 BCAL1623 mopII   FALSE 0.405 145.000 0.261 NA   NA
 5923930 5923931 BCAL1623 BCAL1624     TRUE 0.955 56.000 0.933 NA   NA
 5923931 5923932 BCAL1624 BCAL1625     FALSE 0.584 53.000 0.011 NA   NA
 5923932 5923933 BCAL1625 BCALr1625     FALSE 0.529 55.000 0.000 NA   NA
 5923933 5923934 BCALr1625 BCAL1626     FALSE 0.025 220.000 0.000 NA   NA
 5923934 5923935 BCAL1626 BCAL1627     FALSE 0.003 522.000 0.000 NA   NA
 5923939 5923940 BCAL1631 BCAL1632     TRUE 0.885 41.000 0.286 NA   NA
 5923940 5923941 BCAL1632 BCAL1633     TRUE 0.803 13.000 0.000 NA   NA
 5923941 5923942 BCAL1633 BCAL1634     FALSE 0.085 160.000 0.000 NA   NA
 5923945 5923946 BCAL1636 BCAL1637     FALSE 0.006 344.000 0.000 NA   NA
 5923947 5923948 BCAL1638 BCAL1639     FALSE 0.017 148.000 0.019 NA N NA
 5923949 5923950 BCAL1640 BCAL1641     TRUE 0.931 36.000 0.667 1.000 N NA
 5923951 5923952 BCAL1642 BCAL1643     FALSE 0.514 65.000 0.016 NA   NA
 5923952 5923953 BCAL1643 BCAL1644     TRUE 0.868 -3.000 0.028 NA   NA
 5923953 5923954 BCAL1644 BCAL1645     FALSE 0.355 102.000 0.030 NA   NA
 5923955 5923956 BCAL1646 BCAL1647     TRUE 0.999 7.000 0.955 0.001 Y NA
 5923958 5923959 BCAL1649 BCAL1650     TRUE 0.935 30.000 0.389 NA   NA
 5923959 5923960 BCAL1650 BCAL1651   lexA TRUE 0.823 27.000 0.083 NA   NA
 5923961 5923962 BCAL1652 BCAL1653 sbp cysT TRUE 0.641 124.000 0.097 0.001 N NA
 5923962 5923963 BCAL1653 BCAL1654 cysT cysW TRUE 0.996 -3.000 0.935 0.000 N NA
 5923963 5923964 BCAL1654 BCAL1655 cysW cysA TRUE 0.991 14.000 0.587 1.000 Y NA
 5923964 5923965 BCAL1655 BCAL1656 cysA ssuR FALSE 0.207 76.000 0.058 NA N NA
 5923965 5923966 BCAL1656 BCAL1657 ssuR   FALSE 0.000 728.000 0.000 NA N NA
 5923966 5923967 BCAL1657 BCAL1658     FALSE 0.478 146.000 0.044 NA Y NA
 5923967 5923968 BCAL1658 BCAL1659     TRUE 0.992 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5923968 5923969 BCAL1659 BCAL1660     TRUE 0.801 35.000 0.258 1.000 N NA
 5923969 5923970 BCAL1660 BCAL1661     TRUE 0.942 -3.000 0.355 1.000 N NA
 5923970 5923971 BCAL1661 BCAL1662     FALSE 0.000 289.000 0.000 1.000 N NA
 5923971 5923972 BCAL1662 BCAL1663     FALSE 0.015 552.000 0.000 NA Y NA
 5923972 5923973 BCAL1663 BCAL1664     TRUE 0.766 126.000 0.683 NA   NA
 5923973 5923974 BCAL1664 BCAL1665     TRUE 0.652 153.000 0.761 NA   NA
 5923974 5923975 BCAL1665 BCAL1666   kgtP FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 5923975 5923976 BCAL1666 BCAL1667 kgtP   FALSE 0.206 123.000 0.000 NA   NA
 5923976 5923977 BCAL1667 BCAL1668     FALSE 0.015 258.000 0.000 NA   NA
 5923977 5923978 BCAL1668 BCAL1669     TRUE 0.964 74.000 0.395 0.090 Y NA
 5923978 5923979 BCAL1669 BCAL1670     TRUE 0.994 -30.000 0.692 0.009 Y NA
 5923980 5923981 BCAL1671 BCAL1672     FALSE 0.006 339.000 0.000 NA   NA
 5923982 5923983 BCAL1674 BCAL1675 amrA amrB TRUE 0.817 16.000 0.158 1.000 N NA
 5923983 5923984 BCAL1675 BCAL1676 amrB   TRUE 0.979 -3.000 0.368 0.077 N NA
 5923984 5923985 BCAL1676 BCAL1677     FALSE 0.011 863.000 0.000 1.000 Y NA
 5923985 5923986 BCAL1677 BCAL1678     TRUE 0.906 90.000 0.400 1.000 Y NA
 5923986 5923987 BCAL1678 BCAL1679     TRUE 0.992 16.000 0.700 1.000 Y NA
 5923987 5923988 BCAL1679 BCAL1680     TRUE 0.973 -3.000 0.421 1.000   NA
 5923988 5923989 BCAL1680 BCAL1681     FALSE 0.349 85.000 0.000 NA   NA
 5923990 5923991 BCAL1682 BCAL1683     FALSE 0.593 43.000 0.000 NA   NA
 5923992 5923993 BCAL1684 BCAL1685     TRUE 0.995 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 5923994 5923995 BCAL1686 BCAL1687     FALSE 0.569 47.000 0.000 NA   NA
 5923996 5923997 BCAL1688 BCAL1689 orbS orbH TRUE 0.766 86.000 0.342 NA   NA
 5923997 5923998 BCAL1689 BCAL1690 orbH orbG TRUE 0.902 46.000 0.382 NA   NA
 5923998 5923999 BCAL1690 BCAL1691 orbG orbC TRUE 0.679 42.000 0.176 1.000 N NA
 5923999 5924000 BCAL1691 BCAL1692 orbC orbD TRUE 0.988 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 5924000 5924001 BCAL1692 BCAL1693 orbD orbF TRUE 0.913 -3.000 0.092 NA   NA
 5924001 5924002 BCAL1693 BCAL1694 orbF orbB FALSE 0.265 132.000 0.062 NA   NA
 5924004 5924005 BCAL1696 BCAL1697 orbI orbJ TRUE 0.998 10.000 0.750 0.001 Y NA
 5924005 5924006 BCAL1697 BCAL1698 orbJ orbK TRUE 0.949 -10.000 0.500 NA   NA
 5924006 5924007 BCAL1698 BCAL1699 orbK pvdA TRUE 0.966 33.000 0.750 NA   NA
 5924007 5924008 BCAL1699 BCAL1700 pvdA orbA TRUE 0.933 23.000 0.500 NA N NA
 5924008 5924009 BCAL1700 BCAL1701 orbA orbF FALSE 0.022 86.000 0.003 1.000 N NA
 5924009 5924010 BCAL1701 BCAL1702 orbF orbL TRUE 0.747 -6.000 0.004 1.000   NA
 5924010 5924011 BCAL1702 BCAL1703 orbL   FALSE 0.090 158.000 0.000 1.000   NA
 5924012 5924013 BCAL1704 BCAL1705   cobB TRUE 0.687 28.000 0.000 NA   NA
 5924013 5924014 BCAL1705 BCAL1706 cobB cobO TRUE 0.993 3.000 0.069 0.006 Y NA
 5924014 5924015 BCAL1706 BCAL1707 cobO   TRUE 0.932 36.000 0.026 0.006   NA
 5924015 5924016 BCAL1707 BCAL1708   cobA TRUE 0.873 0.000 0.010 1.000   NA
 5924016 5924017 BCAL1708 BCALr1708 cobA   FALSE 0.065 169.000 0.000 NA   NA
 5924017 5924018 BCALr1708 BCAL1709     FALSE 0.415 70.000 0.000 NA   NA
 5924019 5924020 BCALr1709 BCAL1710   cobW FALSE 0.007 325.000 0.000 NA   NA
 5924020 5924021 BCAL1710 BCAL1711 cobW   TRUE 0.960 7.000 0.274 1.000   NA
 5924021 5924022 BCAL1711 BCAL1712     TRUE 0.971 -3.000 0.070 1.000 Y NA
 5924022 5924023 BCAL1712 BCAL1713     TRUE 0.953 69.000 0.568 NA Y NA
 5924023 5924024 BCAL1713 BCAL1714     FALSE 0.515 63.000 0.007 NA   NA
 5924024 5924025 BCAL1714 BCAL1715     FALSE 0.578 53.000 0.007 NA   NA
 5924025 5924026 BCAL1715 BCAL1716     TRUE 0.741 26.000 0.013 NA   NA
 5924027 5924028 BCAL1717 BCAL1717A     TRUE 0.664 144.000 0.667 NA   NA
 5924029 5924030 BCAL1718 BCAL1719     TRUE 0.921 127.000 1.000 1.000 Y NA
 5924030 5924031 BCAL1719 BCAL1720     FALSE 0.557 38.000 0.100 1.000 N NA
 5924031 5924032 BCAL1720 BCAL1721     FALSE 0.537 61.000 0.150 1.000 N NA
 5924033 5924034 BCAL1722 BCAL1723   cobJ FALSE 0.007 332.000 0.000 1.000   NA
 5924034 5924035 BCAL1723 BCAL1724 cobJ cobI TRUE 0.994 0.000 0.097 0.006 Y NA
 5924035 5924036 BCAL1724 BCAL1725 cobI cobH TRUE 0.994 -3.000 0.191 0.006 Y NA
 5924036 5924037 BCAL1725 BCAL1726 cobH   TRUE 0.734 -7.000 0.149 1.000 N NA
 5924037 5924038 BCAL1726 BCALr1726     FALSE 0.267 107.000 0.000 NA   NA
 5924039 5924040 BCAL1727 BCAL1728 cobL   TRUE 0.992 0.000 0.043 0.006 Y NA
 5924040 5924041 BCAL1728 BCAL1729   cobK TRUE 0.993 -3.000 0.123 0.006 Y NA
 5924041 5924042 BCAL1729 BCAL1730 cobK cobM TRUE 0.974 43.000 0.076 0.006 Y NA
 5924045 5924046 BCAL1733 BCAL1734     FALSE 0.015 108.000 0.000 1.000 N NA
 5924046 5924047 BCAL1734 BCAL1735     FALSE 0.007 143.000 0.000 1.000 N NA
 5924048 5924049 BCAL1736 BCAL1737     TRUE 0.844 4.000 0.000 NA   NA
 5924049 5924050 BCAL1737 BCAL1738   tauD TRUE 0.914 11.000 0.273 1.000 N NA
 5924050 5924051 BCAL1738 BCAL1739 tauD   FALSE 0.409 131.000 0.182 1.000   NA
 5924051 5924052 BCAL1739 BCAL1740     TRUE 0.685 156.000 1.000 NA   NA
 5924052 5924053 BCAL1740 BCAL1741     TRUE 0.663 32.000 0.000 NA   NA
 5924053 5924054 BCAL1741 BCAL1742     FALSE 0.008 311.000 0.000 NA   NA
 5924054 5924055 BCAL1742 BCAL1743   aglK TRUE 0.969 50.000 0.562 0.077   NA
 5924055 5924056 BCAL1743 BCAL1744 aglK   TRUE 0.954 50.000 0.594 0.077 N NA
 5924056 5924057 BCAL1744 BCAL1745     TRUE 0.926 90.000 0.864 0.077 N NA
 5924057 5924058 BCAL1745 BCAL1746     FALSE 0.443 122.000 0.150 NA   NA
 5924058 5924059 BCAL1746 BCAL1747A     FALSE 0.081 219.000 0.182 NA   NA
 5924061 5924062 BCAL1749 BCAL1750     TRUE 0.936 22.000 0.192 0.087 N NA
 5924062 5924063 BCAL1750 BCAL1751     TRUE 0.753 35.000 0.055 NA   NA
 5924063 5924064 BCAL1751 BCAL1752     FALSE 0.033 204.000 0.000 NA   NA
 5924064 5924065 BCAL1752 BCAL1753     FALSE 0.075 33.000 0.000 NA N NA
 5924067 5924068 BCAL1755 BCAL1756     FALSE 0.598 42.000 0.000 NA   NA
 5924069 5924070 BCAL1757 BCAL1758     TRUE 0.803 13.000 0.000 NA   NA
 5924071 5924072 BCAL1759 BCAL1760     FALSE 0.300 116.000 0.031 1.000   NA
 5924072 5924073 BCAL1760 BCAL1761     FALSE 0.019 236.000 0.000 1.000   NA
 5924074 5924075 BCAL1762 BCAL1763     FALSE 0.065 169.000 0.000 NA   NA
 5924075 5924076 BCAL1763 BCAL1764     TRUE 0.924 77.000 1.000 NA   NA
 5924076 5924077 BCAL1764 BCAL1765     FALSE 0.494 61.000 0.000 NA   NA
 5924077 5924078 BCAL1765 BCAL1766     FALSE 0.422 69.000 0.000 NA   NA
 5924082 5924083 BCAL1770 BCAL1771     TRUE 0.860 51.000 0.000 1.000 Y NA
 5924083 5924084 BCAL1771 BCAL1772     TRUE 0.997 -3.000 0.600 0.087 Y NA
 5924084 5924085 BCAL1772 BCAL1773     TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.031 Y NA
 5924085 5924086 BCAL1773 BCAL1774     TRUE 0.997 0.000 0.800 0.008   NA
 5924086 5924087 BCAL1774 BCAL1775     TRUE 0.985 23.000 0.500 0.060   NA
 5924087 5924088 BCAL1775 BCAL1776   andR FALSE 0.016 103.000 0.000 1.000 N NA
 5924088 5924089 BCAL1776 BCAL1777 andR   FALSE 0.000 675.000 0.000 1.000 N NA
 5924091 5924092 BCAL1778 BCAL1779 mexD   FALSE 0.242 113.000 0.000 1.000   NA
 5924092 5924093 BCAL1779 BCAL1780     TRUE 0.985 12.000 0.750 1.000   NA
 5924093 5924094 BCAL1780 BCAL1781     TRUE 0.985 -46.000 1.000 0.076   NA
 5924094 5924095 BCAL1781 BCAL1782     TRUE 0.993 13.000 0.750 0.076   NA
 5924095 5924096 BCAL1782 BCAL1783     FALSE 0.017 241.000 0.000 NA   NA
 5924096 5924097 BCAL1783 BCAL1785     FALSE 0.006 352.000 0.000 NA   NA
 5924097 5924098 BCAL1785 BCAL1786     FALSE 0.096 156.000 0.000 1.000   NA
 5924098 5924099 BCAL1786 BCAL1787     TRUE 0.954 16.000 0.333 1.000   NA
 5924099 5924100 BCAL1787 BCAL1788     TRUE 0.958 99.000 0.500 0.076 Y NA
 5924100 5924101 BCAL1788 BCAL1789     TRUE 0.997 21.000 1.000 0.090 Y NA
 5924101 5924102 BCAL1789 BCAL1790     TRUE 0.799 129.000 0.500 0.010 N NA
 5924102 5924103 BCAL1790 BCAL1791     FALSE 0.002 846.000 0.000 NA   NA
 5924106 5924107 BCAL1794 BCAL1795     TRUE 0.827 -3.000 0.000 NA   NA
 5924108 5924109 BCAL1796 BCAL1797     FALSE 0.002 498.000 0.067 1.000 N NA
 5924110 5924111 BCAL1798 BCAL1799     FALSE 0.465 136.000 0.261 NA   NA
 5924112 5924113 BCAL1800 BCAL1801     TRUE 0.955 14.000 0.312 NA   NA
 5924113 5924114 BCAL1801 BCAL1802     TRUE 0.835 56.000 0.260 NA   NA
 5924114 5924115 BCAL1802 BCAL1803   tkrA FALSE 0.000 333.000 0.000 1.000 N NA
 5924115 5924116 BCAL1803 BCAL1804 tkrA   TRUE 0.932 5.000 0.294 1.000 N NA
 5924116 5924117 BCAL1804 BCAL1805     TRUE 0.798 116.000 0.238 1.000 Y NA
 5924117 5924118 BCAL1805 BCAL1806     TRUE 0.959 29.000 0.571 NA   NA
 5924118 5924119 BCAL1806 BCAL1807     FALSE 0.170 162.000 0.105 NA   NA
 5924120 5924121 BCAL1808 BCAL1809     FALSE 0.604 68.000 0.079 NA   NA
 5924123 5924124 BCAL1811 BCAL1812     TRUE 0.887 -3.000 0.200 NA N NA
 5924124 5924125 BCAL1812 BCAL1813     TRUE 0.977 3.000 0.667 NA N NA
 5924125 5924126 BCAL1813 BCAL1814     FALSE 0.283 125.000 0.200 1.000 N NA
 5924127 5924128 BCAL1814A BCAL1815     TRUE 0.693 -25.000 0.036 NA   NA
 5924128 5924129 BCAL1815 BCAL1816     TRUE 0.977 9.000 0.491 NA   NA
 5924129 5924130 BCAL1816 BCAL1817     FALSE 0.035 231.000 0.058 NA   NA
 5924131 5924132 BCAL1818 BCAL1819     TRUE 0.896 29.000 0.230 1.000   NA
 5924132 5924133 BCAL1819 BCAL1820     TRUE 0.919 19.000 0.203 1.000   NA
 5924134 5924135 BCAL1821 BCAL1822 potI potH TRUE 0.998 -3.000 0.938 0.076 Y NA
 5924135 5924136 BCAL1822 BCAL1823 potH potG TRUE 0.985 -3.000 0.267 1.000 Y NA
 5924136 5924137 BCAL1823 BCAL1824 potG potF TRUE 0.838 87.000 0.158 1.000 Y NA
 5924138 5924139 BCAL1825 BCAL1826     FALSE 0.003 606.000 0.000 NA   NA
 5924139 5924140 BCAL1826 BCAL1827     TRUE 0.776 91.000 0.400 NA   NA
 5924140 5924141 BCAL1827 BCAL1828     TRUE 0.915 29.000 0.000 1.000 Y NA
 5924142 5924143 BCAL1829 BCAL1830     FALSE 0.294 123.000 0.050 1.000   NA
 5924143 5924144 BCAL1830 BCAL1831     FALSE 0.601 124.000 0.011 0.049   NA
 5924147 5924148 BCAL1834 BCAL1835     TRUE 0.768 17.000 0.000 NA   NA
 5924151 5924152 BCAL1838 BCAL1839     TRUE 0.978 8.000 0.500 1.000   NA
 5924152 5924153 BCAL1839 BCAL1840     TRUE 0.869 -3.000 0.029 NA   NA
 5924153 5924154 BCAL1840 BCAL1841     TRUE 0.872 2.000 0.010 NA   NA
 5924154 5924155 BCAL1841 BCAL1842     TRUE 0.873 1.000 0.010 NA   NA
 5924155 5924156 BCAL1842 BCAL1843     FALSE 0.020 233.000 0.000 1.000   NA
 5924159 5924160 BCAL1846 BCAL1847     TRUE 0.907 -3.000 0.081 NA   NA
 5924161 5924162 BCAL1848 BCAL1849     FALSE 0.023 224.000 0.000 NA   NA
 5924162 5924163 BCAL1849 BCAL1850     TRUE 0.852 54.000 0.286 NA   NA
 5924164 5924165 BCAL1851 BCAL1852     FALSE 0.003 167.000 0.005 NA N NA
 5924166 5924167 BCAL1853 BCAL1854     TRUE 0.669 114.000 0.348 NA   NA
 5924167 5924168 BCAL1854 BCAL1855     FALSE 0.374 119.000 0.083 NA   NA
 5924168 5924169 BCAL1855 BCAL1856     FALSE 0.459 4.000 0.026 1.000 N NA
 5924170 5924171 BCAL1857 BCAL1858     FALSE 0.382 76.000 0.000 NA   NA
 5924172 5924173 BCAL1859 BCAL1860   pbhF FALSE 0.003 657.000 0.000 NA   NA
 5924173 5924174 BCAL1860 BCAL1861 pbhF phbB FALSE 0.433 120.000 0.130 NA   NA
 5924174 5924175 BCAL1861 BCAL1862 phbB phbA TRUE 0.863 122.000 0.491 1.000 Y NA
 5924175 5924176 BCAL1862 BCAL1863 phbA phbC TRUE 0.895 100.000 0.420 1.000 Y NA
 5924176 5924177 BCAL1863 BCAL1864 phbC   FALSE 0.006 361.000 0.006 NA   NA
 5924177 5924178 BCAL1864 BCAL1865     TRUE 0.942 7.000 0.168 NA   NA
 5924180 5924181 BCAL1867 BCAL1868     FALSE 0.600 56.000 0.028 NA   NA
 5924181 5924182 BCAL1868 BCAL1869     FALSE 0.551 77.000 0.081 NA   NA
 5924184 5924185 BCAL1871 BCAL1872 kup   FALSE 0.009 338.000 0.031 1.000   NA
 5924185 5924186 BCAL1872 BCAL1873   purA TRUE 0.680 44.000 0.042 1.000   NA
 5924186 5924187 BCAL1873 BCAL1874 purA   FALSE 0.294 114.000 0.161 1.000 N NA
 5924187 5924188 BCAL1874 BCAL1875     FALSE 0.445 114.000 0.117 NA   NA
 5924188 5924189 BCAL1875 BCAL1876   hflC TRUE 0.915 37.000 0.348 NA   NA
 5924189 5924190 BCAL1876 BCAL1877 hflC hflK TRUE 0.998 16.000 0.947 0.007 Y NA
 5924190 5924191 BCAL1877 BCAL1878 hflK hflX TRUE 0.935 48.000 0.184 0.059   NA
 5924191 5924192 BCAL1878 BCAL1879 hflX hfq TRUE 0.642 58.000 0.058 1.000   NA
 5924192 5924193 BCAL1879 BCAL1880 hfq engA FALSE 0.185 142.000 0.036 1.000   NA
 5924193 5924194 BCAL1880 BCAL1881 engA   FALSE 0.058 247.000 0.203 1.000   NA
 5924194 5924195 BCAL1881 BCAL1882     TRUE 0.929 42.000 0.492 NA   NA
 5924195 5924196 BCAL1882 BCAL1883   hisS TRUE 0.834 56.000 0.259 NA   NA
 5924196 5924197 BCAL1883 BCAL1884 hisS   TRUE 0.829 21.000 0.207 1.000 N NA
 5924197 5924198 BCAL1884 BCAL1885     FALSE 0.573 113.000 0.233 1.000   NA
 5924198 5924199 BCAL1885 BCAL1886     FALSE 0.094 164.000 0.020 1.000   NA
 5924199 5924200 BCAL1886 BCAL1887   ndk TRUE 0.769 56.000 0.156 1.000   NA
 5924204 5924205 BCAL1891 BCAL1892   rpoS TRUE 0.806 4.000 0.101 1.000 N NA
 5924205 5924206 BCAL1892 BCAL1893 rpoS   TRUE 0.766 12.000 0.101 1.000 N NA
 5924206 5924207 BCAL1893 BCAL1894     FALSE 0.444 -3.000 0.028 1.000 N NA
 5924207 5924208 BCAL1894 BCAL1895     TRUE 0.968 -3.000 0.353 1.000   NA
 5924208 5924209 BCAL1895 BCAL1896     FALSE 0.032 222.000 0.027 1.000   NA
 5924209 5924210 BCAL1896 BCAL1897   recR FALSE 0.116 49.000 0.018 1.000 N NA
 5924210 5924211 BCAL1897 BCAL1898 recR   TRUE 0.959 32.000 0.604 NA   NA
 5924211 5924212 BCAL1898 BCAL1899   dnaX TRUE 0.767 96.000 0.411 NA   NA
 5924212 5924213 BCAL1899 BCALr1899 dnaX   FALSE 0.192 126.000 0.000 NA   NA
 5924214 5924215 BCAL1900 BCAL1900A trxA   TRUE 0.746 20.000 0.000 NA   NA
 5924215 5924216 BCAL1900A BCAL1901   rho FALSE 0.449 66.000 0.000 NA   NA
 5924216 5924217 BCAL1901 BCAL1902 rho   FALSE 0.365 157.000 0.012 1.000 Y NA
 5924217 5924218 BCAL1902 BCAL1903     FALSE 0.369 168.000 0.438 NA   NA
 5924218 5924219 BCAL1903 BCAL1904     TRUE 0.754 39.000 0.071 NA   NA
 5924219 5924220 BCAL1904 BCAL1905   rpmE2 FALSE 0.120 157.000 0.022 NA   NA
 5924220 5924221 BCAL1905 BCAL1906 rpmE2   FALSE 0.092 131.000 0.067 NA N NA
 5924221 5924222 BCAL1906 BCAL1907     TRUE 0.875 3.000 0.154 NA N NA
 5924223 5924224 BCAL1908 BCAL1909 lipA acoC TRUE 0.866 3.000 0.008 1.000   NA
 5924224 5924225 BCAL1909 BCAL1910 acoC acoB TRUE 0.972 5.000 0.375 1.000   NA
 5924225 5924226 BCAL1910 BCAL1911 acoB acoA TRUE 0.994 55.000 0.804 0.001 Y NA
 5924226 5924227 BCAL1911 BCAL1912 acoA budC TRUE 0.837 33.000 0.043 0.086 N NA
 5924227 5924228 BCAL1912 BCAL1913 budC acoX TRUE 0.941 60.000 0.375 0.086   NA
 5924230 5924231 BCAL1915 BCAL1916     TRUE 0.865 -16.000 0.211 1.000   NA
 5924232 5924233 BCAL1917 BCAL1918     TRUE 0.844 89.000 0.571 NA   NA
 5924234 5924235 BCAL1919 BCAL1920 clpB   FALSE 0.011 146.000 0.011 NA N NA
 5924237 5924238 BCAL1922 BCAL1923 moaE moaD TRUE 0.997 11.000 0.501 0.002 Y NA
 5924238 5924239 BCAL1923 BCAL1924 moaD moeA3 TRUE 0.988 20.000 0.095 0.002 Y NA
 5924239 5924240 BCAL1924 BCAL1925 moeA3 thrC FALSE 0.001 248.000 0.011 1.000 N NA
 5924240 5924241 BCAL1925 BCAL1926 thrC hom TRUE 0.973 13.000 0.125 1.000 Y NA
 5924241 5924242 BCAL1926 BCAL1927 hom   TRUE 0.903 54.000 0.102 1.000 Y NA
 5924243 5924244 BCAL1928 BCAL1929     FALSE 0.306 124.000 0.060 NA   NA
 5924244 5924245 BCAL1929 BCAL1930     TRUE 0.980 14.000 0.667 1.000   NA
 5924245 5924246 BCAL1930 BCAL1931   arnB TRUE 0.677 131.000 0.545 1.000   NA
 5924246 5924247 BCAL1931 BCAL1932 arnB   TRUE 0.989 7.000 0.351 NA Y NA
 5924247 5924248 BCAL1932 BCAL1933     TRUE 0.959 -3.000 0.473 NA N NA
 5924248 5924249 BCAL1933 BCAL1934     TRUE 0.901 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5924249 5924250 BCAL1934 BCAL1935     TRUE 0.988 14.000 0.447 1.000 Y NA
 5924250 5924251 BCAL1935 BCAL1936     FALSE 0.043 111.000 0.023 1.000 N NA
 5924251 5924252 BCAL1936 BCAL1937     FALSE 0.001 489.000 0.050 1.000 N NA
 5924252 5924253 BCAL1937 BCAL1938     FALSE 0.001 237.000 0.000 NA N NA
 5924254 5924255 BCAL1939 BCAL1940     TRUE 0.989 11.000 0.396 NA Y NA
 5924255 5924256 BCAL1940 BCAL1941   dnaB FALSE 0.100 139.000 0.085 NA N NA
 5924256 5924257 BCAL1941 BCAL1942 dnaB rplI FALSE 0.083 141.000 0.074 1.000 N NA
 5924257 5924258 BCAL1942 BCAL1943 rplI rpsR TRUE 0.994 28.000 0.499 0.007 Y NA
 5924258 5924259 BCAL1943 BCAL1944 rpsR   TRUE 0.840 5.000 0.128 1.000 N NA
 5924259 5924260 BCAL1944 BCAL1945   rpsF FALSE 0.592 41.000 0.122 1.000 N NA
 5924260 5924261 BCAL1945 BCAL1946 rpsF   FALSE 0.001 231.000 0.002 NA N NA
 5924261 5924262 BCAL1946 BCAL1947     TRUE 0.985 -10.000 0.659 NA Y NA
 5924262 5924263 BCAL1947 BCAL1948     FALSE 0.361 168.000 0.088 NA Y NA
 5924264 5924265 BCAL1949 BCAL1950 gcl hyi TRUE 0.926 44.000 0.495 1.000   NA
 5924265 5924266 BCAL1950 BCAL1951 hyi glxR TRUE 0.880 42.000 0.492 1.000 N NA
 5924266 5924267 BCAL1951 BCAL1952 glxR   FALSE 0.004 460.000 0.000 1.000   NA
 5924269 5924270 BCAL1954 BCAL1955     FALSE 0.014 260.000 0.000 NA   NA
 5924270 5924271 BCAL1955 BCAL1956     FALSE 0.016 250.000 0.000 NA   NA
 5924272 5924273 BCAL1957 BCAL1958     FALSE 0.010 285.000 0.000 NA   NA
 5924273 5924274 BCAL1958 BCAL1959     TRUE 0.713 44.000 0.058 NA   NA
 5924274 5924275 BCAL1959 BCAL1960     FALSE 0.509 90.000 0.088 NA   NA
 5924275 5924276 BCAL1960 BCAL1961     FALSE 0.506 119.000 0.194 NA   NA
 5924276 5924277 BCAL1961 BCAL1962     TRUE 0.690 44.000 0.046 NA   NA
 5924277 5924278 BCAL1962 BCAL1963     FALSE 0.570 142.000 0.110 NA Y NA
 5924278 5924279 BCAL1963 BCAL1964     TRUE 0.843 19.000 0.211 1.000 N NA
 5924279 5924280 BCAL1964 BCAL1965     TRUE 0.957 0.000 0.209 NA   NA
 5924281 5924282 BCAL1966 BCAL1967     FALSE 0.458 77.000 0.032 NA   NA
 5924283 5924284 BCAL1968 BCAL1969     TRUE 0.885 62.000 0.147 0.086   NA
 5924284 5924285 BCAL1969 BCAL1970     FALSE 0.244 66.000 0.056 NA N NA
 5924285 5924286 BCAL1970 BCAL1971     TRUE 0.891 -3.000 0.057 NA   NA
 5924286 5924287 BCAL1971 BCAL1972     FALSE 0.003 561.000 0.000 NA   NA
 5924287 5924288 BCAL1972 BCAL1973     FALSE 0.200 124.000 0.000 NA   NA
 5924290 5924291 BCAL1975 BCAL1977     FALSE 0.001 263.000 0.000 1.000 N NA
 5924291 5924292 BCAL1977 BCAL1978     FALSE 0.208 51.000 0.034 1.000 N NA
 5924292 5924293 BCAL1978 BCAL1979     FALSE 0.229 45.000 0.034 1.000 N NA
 5924293 5924294 BCAL1979 BCAL1980     FALSE 0.145 240.000 0.139 1.000 Y NA
 5924295 5924296 BCAL1981 BCAL1982   msrB TRUE 0.753 45.000 0.095 NA   NA
 5924296 5924297 BCAL1982 BCAL1983 msrB   FALSE 0.186 130.000 0.136 1.000 N NA
 5924297 5924298 BCAL1983 BCAL1984     TRUE 0.859 2.000 0.133 NA N NA
 5924298 5924299 BCAL1984 BCAL1985     TRUE 0.803 19.000 0.162 NA N NA
 5924300 5924301 BCAL1986 BCAL1987   purL TRUE 0.823 9.000 0.000 1.000   NA
 5924302 5924303 BCAL1988 BCAL1989     FALSE 0.130 53.000 0.022 1.000 N NA
 5924303 5924304 BCAL1989 BCAL1990   pgi TRUE 0.645 112.000 0.010 1.000 Y NA
 5924307 5924308 BCAL1993 BCALr1993a     FALSE 0.005 403.000 0.000 NA   NA
 5924308 5924309 BCALr1993a BCALr1993b     TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 5924309 5924310 BCALr1993b BCAL1994   lon FALSE 0.031 207.000 0.000 NA   NA
 5924310 5924311 BCAL1994 BCAL1995 lon clpX FALSE 0.502 198.000 0.201 0.076 Y NA
 5924311 5924312 BCAL1995 BCAL1996 clpX clpP FALSE 0.592 164.000 0.352 1.000 Y NA
 5924312 5924313 BCAL1996 BCAL1997 clpP tig TRUE 0.742 141.000 0.351 1.000 Y NA
 5924314 5924315 BCAL1998 BCAL1999     FALSE 0.319 63.000 0.071 1.000 N NA
 5924316 5924317 BCAL2000 BCAL2001     FALSE 0.509 108.000 0.320 1.000 N NA
 5924318 5924319 BCAL2002 BCAL2003     TRUE 0.868 22.000 0.273 NA N NA
 5924319 5924320 BCAL2003 BCAL2004     TRUE 0.686 -3.000 0.062 NA N NA
 5924320 5924321 BCAL2004 BCAL2005     FALSE 0.373 112.000 0.062 NA   NA
 5924321 5924322 BCAL2005 BCAL2006     FALSE 0.040 193.000 0.000 NA   NA
 5924325 5924326 BCAL2008 BCAL2009     TRUE 0.840 68.000 0.389 NA   NA
 5924326 5924327 BCAL2009 BCAL2010     FALSE 0.244 135.000 0.056 NA   NA
 5924328 5924329 BCAL2011 BCAL2012 ompR   TRUE 0.919 42.000 0.088 1.000 Y NA
 5924329 5924330 BCAL2012 BCAL2013     FALSE 0.003 190.000 0.010 1.000 N NA
 5924330 5924331 BCAL2013 BCAL2014     FALSE 0.511 77.000 0.058 NA   NA
 5924332 5924333 BCAL2015 BCAL2016 ispF ispD TRUE 0.978 29.000 0.419 1.000 Y NA
 5924334 5924335 BCAL2017 BCAL2018 mfd   FALSE 0.026 105.000 0.013 1.000 N NA
 5924335 5924336 BCAL2018 BCAL2019     TRUE 0.955 61.000 0.441 1.000 Y NA
 5924336 5924337 BCAL2019 BCAL2020     FALSE 0.202 145.000 0.057 NA   NA
 5924339 5924340 BCAL2022 BCAL2023     TRUE 0.824 96.000 0.565 NA   NA
 5924340 5924341 BCAL2023 BCAL2024   mscL FALSE 0.021 239.000 0.012 1.000   NA
 5924341 5924342 BCAL2024 BCAL2025 mscL   FALSE 0.010 289.000 0.000 NA   NA
 5924344 5924345 BCAL2027 BCAL2028     FALSE 0.029 222.000 0.014 NA   NA
 5924347 5924348 BCAL2030 BCAL2031     TRUE 0.909 52.000 0.463 1.000   NA
 5924349 5924350 BCAL2032 BCAL2033     FALSE 0.564 61.000 0.024 NA   NA
 5924354 5924355 BCAL2037 BCAL2038     TRUE 0.996 -3.000 0.895 1.000 Y NA
 5924355 5924356 BCAL2038 BCAL2039     TRUE 0.900 63.000 0.522 NA   NA
 5924356 5924357 BCAL2039 BCAL2040     TRUE 0.932 -3.000 0.143 NA   NA
 5924357 5924358 BCAL2040 BCAL2041   hyuE FALSE 0.093 161.000 0.143 1.000 N NA
 5924358 5924359 BCAL2041 BCAL2042 hyuE   TRUE 0.954 11.000 0.458 1.000 N NA
 5924359 5924360 BCAL2042 BCAL2043     TRUE 0.720 42.000 0.208 1.000 N NA
 5924360 5924361 BCAL2043 BCAL2044   ldcA FALSE 0.000 309.000 0.000 NA N NA
 5924361 5924362 BCAL2044 BCAL2045 ldcA   FALSE 0.262 102.000 0.115 NA N NA
 5924362 5924363 BCAL2045 BCAL2046     TRUE 0.889 -3.000 0.053 NA   NA
 5924363 5924364 BCAL2046 BCAL2047     FALSE 0.009 301.000 0.000 NA   NA
 5924365 5924366 BCAL2048 BCAL2049     TRUE 0.930 -3.000 0.310 1.000 N NA
 5924366 5924367 BCAL2049 BCAL2050     TRUE 0.992 12.000 0.595 NA Y NA
 5924367 5924368 BCAL2050 BCAL2051     TRUE 0.846 51.000 0.439 NA N NA
 5924368 5924369 BCAL2051 BCAL2052     TRUE 0.991 45.000 0.732 0.075 Y NA
 5924369 5924370 BCAL2052 BCAL2053     TRUE 0.990 -3.000 0.424 1.000 Y NA
 5924370 5924371 BCAL2053 BCAL2054     TRUE 0.791 38.000 0.263 1.000 N NA
 5924371 5924372 BCAL2054 BCAL2055     TRUE 0.964 -3.000 0.318 NA   NA
 5924372 5924373 BCAL2055 BCAL2056     FALSE 0.267 107.000 0.000 NA   NA
 5924373 5924374 BCAL2056 BCAL2057     FALSE 0.051 50.000 0.000 1.000 N NA
 5924374 5924375 BCAL2057 BCAL2058     FALSE 0.018 97.000 0.000 1.000 N NA
 5924378 5924379 BCAL2061 BCAL2062 guaA   FALSE 0.300 108.000 0.011 NA   NA
 5924379 5924380 BCAL2062 BCAL2063   guaB TRUE 0.867 7.000 0.023 NA   NA
 5924380 5924381 BCAL2063 BCAL2064 guaB   FALSE 0.011 281.000 0.000 NA   NA
 5924381 5924382 BCAL2064 BCAL2065     TRUE 0.909 29.000 0.267 NA   NA
 5924383 5924384 BCAL2066 BCAL2067     TRUE 0.852 2.000 0.000 NA   NA
 5924384 5924385 BCAL2067 BCAL2068     FALSE 0.350 122.000 0.078 NA   NA
 5924386 5924387 BCAL2069 BCAL2070     TRUE 0.880 5.000 0.033 NA   NA
 5924389 5924390 BCAL2072 BCAL2073     TRUE 0.936 34.000 0.091 NA Y NA
 5924390 5924391 BCAL2073 BCAL2074   ppsA FALSE 0.018 178.000 0.048 NA N NA
 5924393 5924394 BCAL2076 BCAL2077   rnhB TRUE 0.954 -3.000 0.046 0.011 N NA
 5924394 5924395 BCAL2077 BCAL2078 rnhB   TRUE 0.878 -3.000 0.186 1.000 N NA
 5924395 5924396 BCAL2078 BCAL2079   lpxA TRUE 0.988 4.000 0.289 1.000 Y NA
 5924396 5924397 BCAL2079 BCAL2080 lpxA fabZ TRUE 0.890 68.000 0.850 1.000 N NA
 5924397 5924398 BCAL2080 BCAL2081 fabZ lpxD TRUE 0.753 115.000 0.796 1.000 N NA
 5924398 5924399 BCAL2081 BCAL2082 lpxD   TRUE 0.993 17.000 0.814 1.000 Y NA
 5924399 5924400 BCAL2082