MicrobesOnline Operon Predictions for Yersinia pestis CO92

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 143502 143503 YPO0001 YPO0002   asnC TRUE 0.534 93.000 0.165 1.000 N NA
 143505 143506 YPO0004 YPO0005     TRUE 0.988 4.000 0.443 NA   NA
 143507 143508 YPO0006 YPO0007 kup   FALSE 0.021 205.000 0.010 1.000 N NA
 143508 143509 YPO0007 YPO0008   rbsK TRUE 0.842 51.000 0.010 1.000 Y NA
 143510 143511 YPO0009 YPO0010     TRUE 0.617 80.000 0.133 1.000   NA
 2201025 5922241 YPOr01 YPt_01 16S_rRNA   FALSE 0.187 181.000 0.000 NA   NA
 5922241 407417 YPt_01 YPOr02   23S_rRNA FALSE 0.078 253.000 0.000 NA   NA
 407417 2201026 YPOr02 YPOr03 23S_rRNA 5S_rRNA TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 2201026 143512 YPOr03 YPO0011 5S_rRNA y1062 FALSE 0.020 495.000 0.000 NA   NA
 143513 143514 YPO0012 YPO0013 mobB mobA TRUE 0.995 0.000 0.064 0.003 Y NA
 143515 143516 YPO0013a YPO0014     TRUE 0.541 80.000 0.106 NA   NA
 143516 143517 YPO0014 YPO0015   dsbA TRUE 0.804 28.000 0.111 NA   NA
 143517 143518 YPO0015 YPO0017 dsbA polA FALSE 0.021 492.000 0.000 1.000   NA
 143518 2201027 YPO0017 YPOs01 polA spf FALSE 0.224 160.000 0.000 NA   NA
 2201027 143519 YPOs01 YPO0018 spf tnp FALSE 0.243 146.000 0.000 NA   NA
 143521 143522 YPO0020 YPO0021   hemN FALSE 0.335 183.000 0.107 NA   NA
 143523 143524 YPO0022 YPO0023 ntrC ntrB TRUE 0.998 8.000 0.587 0.090 Y NA
 143524 143525 YPO0023 YPO0024 ntrB glnA FALSE 0.045 253.000 0.053 1.000 N NA
 143525 143526 YPO0024 YPO0025 glnA   FALSE 0.116 186.000 0.003 NA   NA
 143527 143528 YPO0026 YPO0027 bipA   FALSE 0.031 322.000 0.007 1.000   NA
 143528 143529 YPO0027 YPO0028   rbn FALSE 0.300 97.000 0.031 1.000   NA
 143529 143530 YPO0028 YPO0029 rbn   TRUE 0.881 7.000 0.069 1.000   NA
 143531 143532 YPO0030 YPO0031     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 143534 143535 YPO0033 YPO0034     TRUE 0.672 148.000 0.257 NA   NA
 143537 143538 YPO0036 YPO0037 recG trmH TRUE 0.897 1.000 0.076 1.000 N NA
 143538 143539 YPO0037 YPO0038 trmH spoT TRUE 0.855 6.000 0.095 1.000 N NA
 143539 143540 YPO0038 YPO0039 spoT rpoZ TRUE 0.985 20.000 0.291 1.000 Y NA
 143540 143541 YPO0039 YPO0040 rpoZ gmk TRUE 0.902 55.000 0.471 1.000 N NA
 143543 143544 YPO0042 YPO0043     FALSE 0.028 403.000 0.000 NA   NA
 143545 143546 YPO0044 YPO0045 rph pyrE FALSE 0.269 167.000 0.108 1.000 N NA
 143547 143548 YPO0046 YPO0047 ttk dut FALSE 0.202 122.000 0.060 1.000 N NA
 143548 143549 YPO0047 YPO0048 dut dfp TRUE 0.966 -19.000 0.201 1.000 N NA
 143550 143551 YPO0049 YPO0050 radC rpmB FALSE 0.007 263.000 0.002 1.000 N NA
 143551 143552 YPO0050 YPO0051 rpmB rpmG TRUE 0.995 12.000 0.332 0.016 Y NA
 143552 143553 YPO0051 YPO0052 rpmG mutM FALSE 0.146 83.000 0.034 1.000 N NA
 143554 143555 YPO0053 YPO0054 coaD kdtX TRUE 0.700 -3.000 0.023 NA N NA
 143555 143556 YPO0054 YPO0055 kdtX kdtA TRUE 0.989 1.000 0.083 NA Y NA
 143556 143557 YPO0055 YPO0056 kdtA rfaC FALSE 0.142 420.000 0.028 1.000 Y NA
 143557 143558 YPO0056 YPO0057 rfaC rfaF TRUE 0.998 0.000 0.205 0.001 Y NA
 143558 143559 YPO0057 YPO0058 rfaF rfaD TRUE 0.957 31.000 0.146 1.000 Y NA
 143560 143561 YPO0059 YPO0060 kbl tdh TRUE 0.982 10.000 0.547 1.000 N NA
 2201028 143562 YPO0061 YPO0063     FALSE 0.225 159.000 0.000 NA   NA
 143562 143563 YPO0063 YPO0064     TRUE 0.820 28.000 0.170 1.000 N NA
 143564 143565 YPO0065 YPO0066   grxC FALSE 0.145 119.000 0.048 NA N NA
 143565 143566 YPO0066 YPO0067 grxC secB FALSE 0.158 88.000 0.038 1.000 N NA
 143566 143567 YPO0067 YPO0068 secB gpsA TRUE 0.973 0.000 0.206 1.000 N NA
 143567 143568 YPO0068 YPO0069 gpsA   TRUE 0.432 60.000 0.000 NA   NA
 143568 143569 YPO0069 YPO0070   cysE FALSE 0.395 66.000 0.000 NA   NA
 143572 143573 YPO0073 YPO0074 cpxA cpxR TRUE 0.999 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 143574 143575 YPO0075 YPO0076 cpxP   FALSE 0.014 678.000 0.000 NA   NA
 143575 143576 YPO0076 YPO0077     FALSE 0.017 562.000 0.000 NA   NA
 143576 143577 YPO0077 YPO0078   pfkA FALSE 0.051 218.000 0.040 1.000 N NA
 143577 143578 YPO0078 YPO0079 pfkA sbp1 FALSE 0.062 221.000 0.049 1.000 N NA
 143579 143580 YPO0080 YPO0081     TRUE 0.865 76.000 0.000 0.068 Y NA
 143580 143581 YPO0081 YPO0082     FALSE 0.205 66.000 0.000 1.000 N NA
 143581 143582 YPO0082 YPO0083     TRUE 0.993 -3.000 0.353 NA   NA
 143584 143585 YPO0085 YPO0086 tpiA   FALSE 0.320 129.000 0.058 NA   NA
 143587 2201029 YPO0088 YPO0089 fpr 'glpX FALSE 0.231 155.000 0.000 NA   NA
 2201029 2201030 YPO0089 YPO0090 'glpX glpK' FALSE 0.368 71.000 0.000 NA   NA
 2201030 143588 YPO0090 YPO0091 glpK' glpF FALSE 0.194 177.000 0.000 NA   NA
 143588 143589 YPO0091 YPO0092 glpF   TRUE 0.802 10.000 0.000 NA   NA
 143591 2201031 YPO0094 YPO0098 tnp   FALSE 0.031 378.000 0.000 NA   NA
 2201031 143592 YPO0098 YPO0096     TRUE 0.890 -2136.000 0.000 NA   NA
 143592 143593 YPO0096 YPO0097     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 143593 143594 YPO0097 YPO0099     FALSE 0.005 912.000 0.000 1.000 N NA
 143595 143596 YPO0100 YPO0101     FALSE 0.196 175.000 0.000 NA   NA
 143596 143597 YPO0101 YPO0102     FALSE 0.049 306.000 0.000 NA   NA
 143598 143599 YPO0103 YPO0104 menG menA TRUE 0.826 142.000 0.158 NA Y NA
 143599 143600 YPO0104 YPO0105 menA hslU FALSE 0.054 236.000 0.051 1.000 N NA
 143600 143601 YPO0105 YPO0106 hslU hslV TRUE 0.984 71.000 0.752 1.000 Y NA
 143601 143602 YPO0106 YPO0107 hslV ftsN FALSE 0.396 100.000 0.122 NA N NA
 143602 143603 YPO0107 YPO0108 ftsN cytR TRUE 0.730 66.000 0.245 NA N NA
 143603 143604 YPO0108 YPO0110 cytR priA FALSE 0.005 353.000 0.013 1.000 N NA
 2201032 143609 YPO0115 YPO0116 metB metL TRUE 0.886 3.000 0.000 NA   NA
 143609 143610 YPO0116 YPO0117 metL metF FALSE 0.394 233.000 0.017 1.000 Y NA
 143611 143612 YPO0118 YPO0119     TRUE 0.932 54.000 0.167 1.000 Y NA
 143612 143613 YPO0119 YPO0120   glpR FALSE 0.072 193.000 0.000 1.000 N NA
 143613 143614 YPO0120 YPO0121 glpR   TRUE 0.864 35.000 0.190 1.000   NA
 143614 143615 YPO0121 YPO0122   glpE TRUE 0.969 18.000 0.405 1.000   NA
 143615 143616 YPO0122 YPO0123 glpE malT FALSE 0.013 375.000 0.000 1.000 N NA
 2201033 143617 YPO0124 YPO0126 malP malP TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 143618 143619 YPO0127 YPO0128     TRUE 0.538 60.000 0.066 1.000   NA
 143620 143621 YPO0129 YPO0130 bioH   FALSE 0.146 170.000 0.010 NA   NA
 143622 143623 YPO0131 YPO0132   feoB TRUE 0.949 36.000 0.455 NA   NA
 143623 143624 YPO0132 YPO0133 feoB feoA TRUE 0.890 92.000 0.177 1.000 Y NA
 143624 143625 YPO0133 YPO0134 feoA   FALSE 0.007 524.000 0.000 1.000 N NA
 143626 143627 YPO0135 YPO0136 greB ompR TRUE 0.822 136.000 0.067 0.090 Y NA
 143627 143628 YPO0136 YPO0137 ompR envZ TRUE 0.999 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 143629 143630 YPO0138 YPO0139 pckA hslO FALSE 0.081 197.000 0.048 1.000 N NA
 143630 143631 YPO0139 YPO0140 hslO hslR FALSE 0.354 163.000 0.140 1.000 N NA
 143631 143632 YPO0140 YPO0141 hslR   TRUE 0.701 29.000 0.056 1.000   NA
 143632 143633 YPO0141 YPO0142     TRUE 0.466 144.000 0.122 1.000   NA
 143634 143635 YPO0143 YPO0144     FALSE 0.287 113.000 0.000 NA   NA
 143637 143638 YPO0146 YPO0147     TRUE 0.998 0.000 0.870 NA   NA
 143638 143639 YPO0147 YPO0148     TRUE 0.978 -7.000 0.174 NA   NA
 143639 143640 YPO0148 YPO0149     TRUE 0.874 26.000 0.167 NA   NA
 143640 143641 YPO0149 YPO0150     FALSE 0.039 427.000 0.072 NA   NA
 143641 143642 YPO0150 YPO0151   aroK FALSE 0.255 349.000 0.319 1.000   NA
 143642 143643 YPO0151 YPO0152 aroK aroB TRUE 0.940 57.000 0.208 1.000 Y NA
 143643 143644 YPO0152 YPO0153 aroB   FALSE 0.060 254.000 0.022 NA   NA
 143644 143645 YPO0153 YPO0154   dam TRUE 0.750 84.000 0.234 NA   NA
 143645 143646 YPO0154 YPO0155 dam rpe FALSE 0.028 303.000 0.053 1.000 N NA
 143646 143647 YPO0155 YPO0156 rpe gph TRUE 0.933 -7.000 0.050 1.000   NA
 143647 143648 YPO0156 YPO0157 gph trpS TRUE 0.959 2.000 0.118 1.000   NA
 143649 143650 YPO0158 YPO0159 cysG nirC FALSE 0.267 88.000 0.065 1.000 N NA
 143650 143651 YPO0159 YPO0160 nirC nirD TRUE 0.817 203.000 0.283 1.000 Y NA
 143651 143652 YPO0160 YPO0161 nirD nirB TRUE 0.999 -3.000 0.829 0.001 N NA
 143656 143657 YPO0165 YPO0166     FALSE 0.302 249.000 0.267 1.000 N NA
 143658 143659 YPO0167 YPO0168 ppiA   FALSE 0.046 326.000 0.000 1.000   NA
 143659 143660 YPO0168 YPO0169   pabA FALSE 0.064 243.000 0.007 1.000   NA
 143660 2201034 YPO0169 YPO0170 pabA argD FALSE 0.257 133.000 0.000 NA   NA
 2201034 143661 YPO0170 YPO0171 argD   TRUE 0.892 -1641.000 0.000 NA   NA
 143661 143662 YPO0171 YPO0172     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 143663 143664 YPO0174 YPO0175   crp TRUE 0.541 86.000 0.111 NA   NA
 143665 143666 YPO0176 YPO0177     FALSE 0.364 72.000 0.000 NA   NA
 143667 143668 YPO0178 YPO0179 prk   TRUE 0.714 149.000 0.303 NA   NA
 143668 143669 YPO0179 YPO0180     TRUE 0.987 -3.000 0.222 NA   NA
 143670 143671 YPO0181 YPO0182   tauA FALSE 0.061 203.000 0.000 1.000 N NA
 143671 143672 YPO0182 YPO0183 tauA tauB TRUE 0.977 9.000 0.023 0.093 Y NA
 143672 143673 YPO0183 YPO0184 tauB tauC TRUE 1.000 -3.000 0.728 0.093 Y NA
 143673 143674 YPO0184 YPO0185 tauC tauD TRUE 0.979 -3.000 0.214 1.000 N NA
 143675 143676 YPO0186 YPO0187     FALSE 0.366 93.000 0.053 NA   NA
 143676 2201035 YPO0187 YPO0188     FALSE 0.255 135.000 0.000 NA   NA
 143677 143678 YPO0190 YPO0191   kefB TRUE 0.997 4.000 0.927 1.000   NA
 143678 143679 YPO0191 YPO0192 kefB   TRUE 0.970 16.000 0.400 1.000   NA
 143679 143680 YPO0192 YPO0193   slyD FALSE 0.401 95.000 0.060 1.000   NA
 143682 143683 YPO0195 YPO0196 fkpA   TRUE 0.455 242.000 0.310 NA   NA
 143683 143684 YPO0196 YPO0197     TRUE 0.983 0.000 0.220 NA   NA
 143684 143685 YPO0197 YPO0198     TRUE 0.999 0.000 0.790 NA Y NA
 143685 143686 YPO0198 YPO0199     TRUE 0.996 20.000 0.804 NA Y NA
 143686 143687 YPO0199 YPO0200   rpsl FALSE 0.163 138.000 0.058 NA N NA
 143687 143688 YPO0200 YPO0201 rpsl rpsG TRUE 0.986 97.000 0.620 0.003 Y NA
 143688 143689 YPO0201 YPO0202 rpsG fusA TRUE 0.970 94.000 0.579 1.000 Y NA
 143689 143690 YPO0202 YPO0203 fusA tufA TRUE 0.891 73.000 0.005 0.001 Y NA
 143690 143691 YPO0203 YPO0204 tufA tnp FALSE 0.061 203.000 0.000 1.000 N NA
 143691 143692 YPO0204 YPO0205 tnp bfd FALSE 0.066 188.000 0.000 NA N NA
 143692 143693 YPO0205 YPO0206 bfd bfr TRUE 0.748 79.000 0.013 NA Y NA
 143693 143694 YPO0206 YPO0209 bfr rpsJ FALSE 0.011 414.000 0.000 1.000 N NA
 143694 143695 YPO0209 YPO0210 rpsJ rplC TRUE 0.988 33.000 0.307 0.020 Y NA
 143695 143696 YPO0210 YPO0211 rplC rplD TRUE 0.996 17.000 0.486 0.015 Y NA
 143696 143697 YPO0211 YPO0212 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.015 Y NA
 143697 143698 YPO0212 YPO0213 rplW rplB TRUE 0.998 17.000 0.849 0.018 Y NA
 143698 143699 YPO0213 YPO0214 rplB rpsS TRUE 0.998 15.000 0.820 0.020 Y NA
 143699 143700 YPO0214 YPO0215 rpsS rplV TRUE 0.998 15.000 0.769 0.020 Y NA
 143700 143701 YPO0215 YPO0216 rplV rpsC TRUE 0.998 18.000 0.719 0.020 Y NA
 143701 143702 YPO0216 YPO0217 rpsC rplP TRUE 0.999 13.000 0.828 0.020 Y NA
 143702 143703 YPO0217 YPO0218 rplP rpmC TRUE 1.000 0.000 0.802 0.015 Y NA
 143703 143704 YPO0218 YPO0219 rpmC rpsQ TRUE 1.000 0.000 0.828 0.015 Y NA
 143704 143705 YPO0219 YPO0220 rpsQ rplN TRUE 0.979 181.000 0.791 0.020 Y NA
 143705 143706 YPO0220 YPO0221 rplN rplX TRUE 0.999 11.000 0.810 0.020 Y NA
 143706 143707 YPO0221 YPO0222 rplX rplE TRUE 0.998 15.000 0.758 0.015 Y NA
 143707 143708 YPO0222 YPO0222a rplE rpsN TRUE 0.997 14.000 0.496 0.015 Y NA
 143708 143709 YPO0222a YPO0223 rpsN rpsH TRUE 0.993 34.000 0.473 0.015 Y NA
 143709 143710 YPO0223 YPO0224 rpsH rplF TRUE 0.998 15.000 0.808 0.015 Y NA
 143710 143711 YPO0224 YPO0225 rplF rplR TRUE 0.999 10.000 0.815 0.015 Y NA
 143711 143712 YPO0225 YPO0226 rplR rpsE TRUE 0.998 15.000 0.814 0.020 Y NA
 143712 143713 YPO0226 YPO0227 rpsE rpmD TRUE 0.999 3.000 0.789 0.020 Y NA
 143713 143714 YPO0227 YPO0228 rpmD rplO TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 143714 143715 YPO0228 YPO0229 rplO secY TRUE 0.990 8.000 0.730 1.000 N NA
 143715 143716 YPO0229 YPO0230 secY rpmJ FALSE 0.336 34.000 0.036 1.000 N NA
 143716 143717 YPO0230 YPO0231 rpmJ rpsM TRUE 0.852 148.000 0.086 0.015 Y NA
 143717 143718 YPO0231 YPO0232 rpsM rpsK TRUE 0.998 17.000 0.810 0.015 Y NA
 143718 143719 YPO0232 YPO0233 rpsK rpsD TRUE 0.994 31.000 0.509 0.020 Y NA
 143719 143720 YPO0233 YPO0234 rpsD rpoA TRUE 0.963 26.000 0.549 1.000 N NA
 143720 143721 YPO0234 YPO0235 rpoA rplQ TRUE 0.974 41.000 0.873 1.000 N NA
 143721 143722 YPO0235 YPO0236 rplQ   FALSE 0.003 447.000 0.005 1.000 N NA
 143722 143723 YPO0236 YPO0237     TRUE 0.722 88.000 0.219 NA   NA
 143724 143725 YPO0238 YPO0239 mscL trkA FALSE 0.037 139.000 0.007 1.000 N NA
 143725 143726 YPO0239 YPO0240 trkA   FALSE 0.088 56.000 0.007 1.000 N NA
 143726 143727 YPO0240 YPO0241   fmt TRUE 0.933 94.000 0.305 1.000 Y NA
 143727 143728 YPO0241 YPO0242 fmt def TRUE 0.967 25.000 0.058 0.023 Y NA
 143729 143730 YPO0243 YPO0244     TRUE 0.921 8.000 0.124 NA   NA
 143730 143731 YPO0244 YPO0245     TRUE 0.911 41.000 0.331 NA   NA
 143731 143732 YPO0245 YPO0245a     TRUE 0.943 2.000 0.137 NA N NA
 143732 143733 YPO0245a YPO0246   aroE TRUE 0.808 9.000 0.087 NA N NA
 2201036 143734 YPO0247 YPO0248     FALSE 0.387 67.000 0.000 NA   NA
 143734 143735 YPO0248 YPO0249     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 143736 143737 YPO0251 YPO0252     TRUE 0.998 -3.000 0.733 NA   NA
 143737 143738 YPO0252 YPO0253   acs TRUE 0.725 57.000 0.147 NA   NA
 143740 143741 YPO0255 YPO0256     TRUE 0.998 13.000 0.688 0.012 Y NA
 143742 143743 YPO0257 YPO0258     TRUE 0.984 2.000 0.268 NA   NA
 143743 143744 YPO0258 YPO0259     TRUE 0.887 19.000 0.146 NA   NA
 143744 143745 YPO0259 YPO0260     FALSE 0.209 174.000 0.000 1.000   NA
 143745 143746 YPO0260 YPO0260a     TRUE 0.932 10.000 0.150 1.000   NA
 143746 143747 YPO0260a YPO0261     TRUE 0.997 -3.000 0.650 NA   NA
 143747 143748 YPO0261 YPO0262     TRUE 0.842 98.000 0.407 NA   NA
 143748 143749 YPO0262 YPO0263     TRUE 0.997 -3.000 0.407 0.015   NA
 143749 143750 YPO0263 YPO0264     TRUE 0.891 175.000 0.786 NA   NA
 143750 143751 YPO0264 YPO0265     TRUE 0.996 -3.000 0.538 NA   NA
 143751 143752 YPO0265 YPO0266     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 143752 143753 YPO0266 YPO0267     TRUE 0.999 -13.000 0.647 0.011 Y NA
 143753 143754 YPO0267 YPO0268     TRUE 0.982 -3.000 0.176 NA   NA
 143754 143755 YPO0268 YPO0268a     TRUE 0.935 164.000 1.000 NA   NA
 143755 143756 YPO0268a YPO0269     TRUE 0.931 20.000 0.231 NA   NA
 143756 143757 YPO0269 YPO0270     TRUE 0.842 127.000 0.154 1.000 Y NA
 143757 143758 YPO0270 YPO0271     TRUE 0.997 -3.000 0.136 0.015 Y NA
 143758 143759 YPO0271 YPO0272     TRUE 0.999 2.000 0.516 0.089 Y NA
 143759 143760 YPO0272 YPO0273     TRUE 0.998 -10.000 0.406 0.089 Y NA
 143760 143761 YPO0273 YPO0274     FALSE 0.033 383.000 0.045 NA   NA
 143761 143762 YPO0274 YPO0275     TRUE 0.998 -3.000 0.844 NA   NA
 143764 143765 YPO0277 YPO0278   metC TRUE 0.877 46.000 0.043 NA Y NA
 143766 143767 YPO0279 YPO0280 hmuV hmuU TRUE 0.996 -7.000 0.220 1.000 Y NA
 143767 143768 YPO0280 YPO0281 hmuU hmuT TRUE 0.999 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 143768 143769 YPO0281 YPO0282 hmuT hmuS TRUE 0.998 -3.000 0.384 1.000 Y NA
 143769 143770 YPO0282 YPO0283 hmuS hmuR TRUE 0.760 119.000 0.064 1.000 Y NA
 143770 143771 YPO0283 YPO0284 hmuR   FALSE 0.011 415.000 0.000 1.000 N NA
 143771 143772 YPO0284 YPO0285     TRUE 0.454 34.000 0.054 1.000 N NA
 143772 143773 YPO0285 YPO0286     TRUE 0.962 -3.000 0.135 1.000 N NA
 143773 143774 YPO0286 YPO0287     FALSE 0.016 341.000 0.000 1.000 N NA
 143774 143775 YPO0287 YPO0288     FALSE 0.045 315.000 0.000 NA   NA
 143775 143776 YPO0288 YPO0289     FALSE 0.028 397.000 0.000 NA   NA
 143776 143777 YPO0289 YPO0290     TRUE 0.993 0.000 0.420 NA   NA
 143777 143778 YPO0290 YPO0291     TRUE 0.989 -7.000 0.296 NA   NA
 143778 143779 YPO0291 YPO0292     TRUE 0.968 -7.000 0.126 NA   NA
 143779 143780 YPO0292 YPO0293     TRUE 0.950 12.000 0.217 1.000   NA
 143781 143782 YPO0294 YPO0295 terZ terA TRUE 0.979 0.000 0.054 0.004   NA
 143782 143783 YPO0295 YPO0296 terA terB TRUE 0.873 33.000 0.200 NA   NA
 143783 143784 YPO0296 YPO0297 terB terC TRUE 0.936 22.000 0.000 NA Y NA
 143784 143785 YPO0297 YPO0298 terC terD FALSE 0.215 64.000 0.000 1.000 N NA
 143785 143786 YPO0298 YPO0299 terD terE TRUE 0.931 184.000 0.310 0.004 Y NA
 143786 143787 YPO0299 YPO0300 terE tnp FALSE 0.073 192.000 0.000 1.000 N NA
 143787 143788 YPO0300 YPO0301 tnp   FALSE 0.013 774.000 0.000 NA   NA
 143788 143789 YPO0301 YPO0302     FALSE 0.080 251.000 0.000 NA   NA
 143789 143790 YPO0302 YPO0303     TRUE 0.974 72.000 0.571 NA Y NA
 143790 143791 YPO0303 YPO0304     TRUE 0.816 8.000 0.000 NA   NA
 143791 143792 YPO0304 YPO0306     FALSE 0.012 1112.000 0.000 NA   NA
 143792 143793 YPO0306 YPO0307     FALSE 0.025 423.000 0.000 NA   NA
 143793 143794 YPO0307 YPO0308     FALSE 0.041 332.000 0.000 NA   NA
 143796 143797 YPO0310 YPO0311 ubiC ubiA TRUE 0.862 166.000 0.248 NA Y NA
 143799 143800 YPO0313 YPO0314 dgkA lexA FALSE 0.422 125.000 0.141 1.000 N NA
 143802 143803 YPO0316 YPO0318 cysH   FALSE 0.029 516.000 0.070 NA   NA
 143805 143806 YPO0320 YPO0321 cysG2 alr TRUE 0.735 97.000 0.317 1.000 N NA
 143806 143807 YPO0321 YPO0322 alr tyrB FALSE 0.374 186.000 0.181 1.000 N NA
 143807 143808 YPO0322 YPO0323 tyrB   FALSE 0.018 527.000 0.000 NA   NA
 143811 143812 YPO0326 YPO0327     TRUE 0.814 14.000 0.063 NA   NA
 143812 143813 YPO0327 YPO0328   rhaD TRUE 0.587 67.000 0.041 0.007 N NA
 143813 143814 YPO0328 YPO0329 rhaD rhaA TRUE 0.987 13.000 0.247 1.000 Y NA
 143814 143815 YPO0329 YPO0330 rhaA rhaB TRUE 0.998 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 143816 143817 YPO0331 YPO0332   rhaS FALSE 0.113 222.000 0.000 NA   NA
 143817 143818 YPO0332 YPO0333 rhaS rhaR TRUE 0.986 133.000 0.800 0.039 Y NA
 143822 143823 YPO0338 YPO0339     TRUE 0.746 15.000 0.000 NA   NA
 5922242 143824 YPt_02 YPO0341     FALSE 0.244 145.000 0.000 NA   NA
 143825 143826 YPO0342 YPO0343   hydN TRUE 0.946 23.000 0.222 0.014 N NA
 143826 143827 YPO0343 YPO0344 hydN fdhF TRUE 0.959 23.000 0.231 0.046   NA
 143828 143829 YPO0345 YPO0346 dsbD   TRUE 0.908 -24.000 0.092 1.000 N NA
 143829 143830 YPO0346 YPO0347   dcuA FALSE 0.132 185.000 0.007 1.000   NA
 143830 143831 YPO0347 YPO0348 dcuA aspA FALSE 0.243 120.000 0.023 1.000   NA
 143832 143833 YPO0349 YPO0350   groES FALSE 0.076 255.000 0.040 NA   NA
 143833 143834 YPO0350 YPO0351 groES groEL TRUE 0.994 47.000 0.631 0.007 Y NA
 143834 143835 YPO0351 YPO0352 groEL   FALSE 0.015 636.000 0.000 NA   NA
 143837 143838 YPO0354 YPO0355 efp sugE FALSE 0.035 247.000 0.000 1.000 N NA
 143839 143840 YPO0356 YPO0357 tnp frdD FALSE 0.066 198.000 0.000 1.000 N NA
 143840 143841 YPO0357 YPO0358 frdD frdC TRUE 0.998 17.000 0.787 0.003 Y NA
 143841 143842 YPO0358 YPO0359 frdC frdB TRUE 0.996 17.000 0.454 0.003 Y NA
 143842 143843 YPO0359 YPO0360 frdB frdA TRUE 0.999 -7.000 0.470 0.003 Y NA
 143844 143845 YPO0361 YPO0362     FALSE 0.224 160.000 0.000 NA   NA
 143846 143847 YPO0363 YPO0364   psd TRUE 0.807 24.000 0.148 NA N NA
 143847 143848 YPO0364 YPO0365 psd   FALSE 0.087 325.000 0.095 1.000   NA
 143849 5922243 YPO0366 YPt_03 orn   FALSE 0.017 558.000 0.000 NA   NA
 143851 143852 YPO0368 YPO0369     TRUE 0.903 11.000 0.118 NA   NA
 143852 143853 YPO0369 YPO0370     TRUE 0.431 140.000 0.109 NA   NA
 143853 143854 YPO0370 YPO0371   mutL TRUE 0.755 16.000 0.092 1.000 N NA
 143854 143855 YPO0371 YPO0372 mutL miaA TRUE 0.971 -7.000 0.188 1.000 N NA
 143855 143856 YPO0372 YPO0373 miaA ymr TRUE 0.878 116.000 0.531 1.000   NA
 143856 143857 YPO0373 YPO0374 ymr hflX TRUE 0.585 99.000 0.141 1.000   NA
 143857 143858 YPO0374 YPO0375 hflX hflK TRUE 0.438 241.000 0.184 0.088   NA
 143858 143859 YPO0375 YPO0376 hflK hflC TRUE 0.999 4.000 0.947 0.017 Y NA
 143859 143860 YPO0376 YPO0377 hflC   TRUE 0.712 172.000 0.348 NA   NA
 143860 143861 YPO0377 YPO0378   purA FALSE 0.340 100.000 0.051 NA   NA
 143861 143862 YPO0378 YPO0379 purA   FALSE 0.003 369.000 0.010 NA N NA
 143862 143863 YPO0379 YPO0380   rnr FALSE 0.402 241.000 0.038 NA Y NA
 143863 143864 YPO0380 YPO0381 rnr   TRUE 0.654 119.000 0.147 0.018 N NA
 143864 143865 YPO0381 YPO0383   aidB FALSE 0.003 408.000 0.005 1.000 N NA
 143866 143867 YPO0384 YPO0385     FALSE 0.040 340.000 0.000 NA   NA
 143867 143868 YPO0385 YPO0386     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 143869 143870 YPO0387 YPO0388     TRUE 0.999 -3.000 0.759 NA Y NA
 143870 143871 YPO0388 YPO0389     FALSE 0.387 67.000 0.000 NA   NA
 143871 143872 YPO0389 YPO0390     FALSE 0.084 247.000 0.000 NA   NA
 143872 143873 YPO0390 YPO0391     TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 143873 143874 YPO0391 YPO0392     TRUE 0.490 50.000 0.000 NA   NA
 143874 143875 YPO0392 YPO0393     FALSE 0.291 110.000 0.000 NA   NA
 143877 143878 YPO0395 YPO0396   dcuB FALSE 0.337 85.000 0.000 NA   NA
 143878 143879 YPO0396 YPO0397 dcuB   TRUE 0.953 -3.000 0.068 NA   NA
 143880 143881 YPO0398 YPO0399     TRUE 0.989 11.000 0.637 NA   NA
 143882 143883 YPO0400 YPO0401     TRUE 0.906 2.000 0.000 1.000   NA
 143884 143885 YPO0402 YPO0403     TRUE 0.875 93.000 0.000 0.007 Y NA
 143885 143886 YPO0403 YPO0404     TRUE 0.765 341.000 0.400 0.007 Y NA
 143888 143889 YPO0406 YPO0407     FALSE 0.051 301.000 0.000 NA   NA
 143889 143890 YPO0407 YPO0408     FALSE 0.383 64.000 0.028 1.000   NA
 143890 143891 YPO0408 YPO0409     TRUE 0.867 56.000 0.062 NA Y NA
 143891 143892 YPO0409 YPO0410     TRUE 0.988 66.000 0.844 NA Y NA
 143892 143893 YPO0410 YPO0411     TRUE 1.000 -3.000 0.788 0.013 Y NA
 143893 143894 YPO0411 YPO0412     TRUE 0.999 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 143894 143895 YPO0412 YPO0413     FALSE 0.291 110.000 0.000 NA   NA
 2201038 143896 YPO0414 YPO0415     FALSE 0.205 171.000 0.000 NA   NA
 143896 143897 YPO0415 YPO0416     FALSE 0.009 469.000 0.000 1.000 N NA
 143897 143898 YPO0416 YPO0417     TRUE 0.914 48.000 0.105 NA Y NA
 143898 143899 YPO0417 YPO0418     FALSE 0.016 586.000 0.000 NA   NA
 143899 143900 YPO0418 YPO0419     TRUE 0.646 27.000 0.000 NA   NA
 143900 143901 YPO0419 YPO0420     TRUE 0.479 52.000 0.000 NA   NA
 143901 143902 YPO0420 YPO0421     TRUE 0.968 0.000 0.185 NA N NA
 143903 143904 YPO0422 YPO0423     TRUE 0.802 147.000 0.429 NA   NA
 5922244 143908 YPt_04 YPO0427   rsmC FALSE 0.075 257.000 0.000 NA   NA
 143909 143910 YPO0428 YPO0429 holD rimI TRUE 0.957 -55.000 0.121 1.000   NA
 143910 143911 YPO0429 YPO0430 rimI prfC FALSE 0.171 179.000 0.026 1.000   NA
 143911 143912 YPO0430 YPO0431 prfC osmY FALSE 0.043 327.000 0.000 NA   NA
 143912 143913 YPO0431 YPO0432 osmY   TRUE 0.450 167.000 0.140 NA   NA
 143913 143914 YPO0432 YPO0433     TRUE 0.731 74.000 0.211 NA   NA
 143914 143915 YPO0433 YPO0434     TRUE 0.628 37.000 0.057 NA   NA
 143915 143916 YPO0434 YPO0435     FALSE 0.004 535.000 0.027 NA N NA
 143916 143917 YPO0435 YPO0436   deoC FALSE 0.101 576.000 0.000 1.000 Y NA
 143917 2201039 YPO0436 YPO0437 deoC deoA FALSE 0.277 121.000 0.000 NA   NA
 2201039 143918 YPO0437 YPO0439 deoA deoB FALSE 0.258 132.000 0.000 NA   NA
 143918 143919 YPO0439 YPO0440 deoB deoD TRUE 0.767 125.000 0.414 1.000 N NA
 143921 143922 YPO0442 YPO0443 serB radA FALSE 0.105 88.000 0.024 1.000 N NA
 143922 143923 YPO0443 YPO0444 radA nadR FALSE 0.055 159.000 0.021 1.000 N NA
 143923 143924 YPO0444 YPO0445 nadR   FALSE 0.240 157.000 0.000 1.000   NA
 2201040 143925 YPO0446 YPO0448     FALSE 0.183 183.000 0.000 NA   NA
 143925 143926 YPO0448 YPO0449     TRUE 0.964 6.000 0.290 1.000 N NA
 143926 143927 YPO0449 YPO0450     TRUE 0.937 21.000 0.259 NA   NA
 143927 143928 YPO0450 YPO0451     FALSE 0.032 375.000 0.000 NA   NA
 143929 143930 YPO0452 YPO0453   trpR FALSE 0.180 251.000 0.167 1.000 N NA
 143936 143937 YPO0459 YPO0460 thrA thrB TRUE 0.990 3.000 0.133 1.000 Y NA
 143937 143938 YPO0460 YPO0461 thrB thrC TRUE 0.993 4.000 0.233 1.000 Y NA
 143940 143941 YPO0463 YPO0464 talB mogA FALSE 0.025 288.000 0.042 1.000 N NA
 143941 143942 YPO0464 YPO0465 mogA   FALSE 0.122 128.000 0.039 1.000 N NA
 143943 143944 YPO0466 YPO0467     FALSE 0.057 289.000 0.000 NA   NA
 143945 143946 YPO0468 YPO0469 dnaK dnaJ TRUE 0.952 112.000 0.236 0.003 Y NA
 143946 143947 YPO0469 YPO0470 dnaJ nhaA FALSE 0.020 243.000 0.022 1.000 N NA
 143947 143948 YPO0470 YPO0471 nhaA nhaR TRUE 0.660 130.000 0.292 1.000 N NA
 143949 143950 YPO0472 YPO0473 rpsT   TRUE 0.689 22.000 0.000 NA   NA
 143951 143952 YPO0474 YPO0475 ribF ileS TRUE 0.875 32.000 0.254 1.000 N NA
 143952 143953 YPO0475 YPO0476 ileS lspA TRUE 0.833 0.000 0.045 1.000 N NA
 143953 143954 YPO0476 YPO0476a lspA fkpB TRUE 0.578 68.000 0.154 1.000 N NA
 143954 143955 YPO0476a YPO0477 fkpB lytB TRUE 0.993 -19.000 0.626 1.000 N NA
 143955 143956 YPO0477 YPO0478 lytB   TRUE 0.632 29.000 0.000 NA   NA
 143956 143957 YPO0478 YPO0479   tnp FALSE 0.170 189.000 0.000 NA   NA
 143957 143958 YPO0479 YPO0480 tnp dapB FALSE 0.009 453.000 0.000 1.000 N NA
 143958 143959 YPO0480 YPO0481 dapB carA FALSE 0.124 473.000 0.034 1.000 Y NA
 143959 143960 YPO0481 YPO0482 carA carB TRUE 0.996 16.000 0.345 0.001 Y NA
 143962 143963 YPO0484 YPO0485     TRUE 0.997 -9.000 0.704 NA   NA
 143963 143964 YPO0485 YPO0486   folA FALSE 0.405 150.000 0.104 NA   NA
 143964 143965 YPO0486 YPO0487 folA tnp FALSE 0.055 212.000 0.000 1.000 N NA
 143965 143966 YPO0487 YPO0488 tnp   FALSE 0.018 535.000 0.000 NA   NA
 143966 143967 YPO0488 YPO0489     FALSE 0.267 127.000 0.000 NA   NA
 143968 143969 YPO0490 YPO0491 apaH apaG TRUE 0.925 17.000 0.267 NA N NA
 143969 143970 YPO0491 YPO0492 apaG ksgA TRUE 0.728 14.000 0.078 NA N NA
 143970 143971 YPO0492 YPO0493 ksgA pdxA TRUE 0.972 -7.000 0.197 1.000 N NA
 143971 143972 YPO0493 YPO0494 pdxA surA TRUE 0.993 -16.000 0.561 1.000 N NA
 143972 143973 YPO0494 YPO0495 surA imp TRUE 0.632 68.000 0.182 1.000 N NA
 143975 143976 YPO0497 YPO0498 rluA   FALSE 0.012 1223.000 0.000 NA   NA
 143977 143978 YPO0499 YPO0500     TRUE 0.995 11.000 1.000 NA   NA
 143978 143979 YPO0500 YPO0501     TRUE 0.997 0.000 0.700 NA   NA
 143979 143980 YPO0501 YPO0502     TRUE 0.818 163.000 0.500 NA   NA
 143980 143981 YPO0502 YPO0503     TRUE 0.942 74.000 0.714 NA   NA
 143981 143982 YPO0503 YPO0504     TRUE 0.964 33.000 0.533 NA   NA
 143982 143983 YPO0504 YPO0505     TRUE 0.995 -7.000 0.533 NA   NA
 143983 143984 YPO0505 YPO0506   clpB TRUE 0.989 3.000 0.400 NA   NA
 143984 143985 YPO0506 YPO0507 clpB   FALSE 0.299 104.000 0.000 NA   NA
 143985 143986 YPO0507 YPO0508     TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 143986 143987 YPO0508 YPO0509     TRUE 0.665 25.000 0.000 NA   NA
 143987 143988 YPO0509 YPO0510     TRUE 0.653 26.000 0.000 NA   NA
 143988 143989 YPO0510 YPO0511     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 143989 143990 YPO0511 YPO0511a     TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   NA
 143990 143991 YPO0511a YPO0512     TRUE 0.996 -7.000 0.667 NA   NA
 143991 143992 YPO0512 YPO0513     FALSE 0.278 120.000 0.000 NA   NA
 143992 143993 YPO0513 YPO0514     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 143993 143994 YPO0514 YPO0515     TRUE 0.955 50.000 0.615 NA   NA
 143994 143995 YPO0515 YPO0516     TRUE 0.991 22.000 1.000 NA   NA
 143996 143997 YPO0517 YPO0518     FALSE 0.190 461.000 0.098 1.000 Y NA
 143999 144000 YPO0520 YPO0521 thiQ thiP TRUE 0.987 14.000 0.522 0.020 N NA
 144000 144001 YPO0521 YPO0522 thiP   TRUE 0.986 24.000 0.697 0.090 N NA
 144004 2201041 YPO0525 YPO0526   setA FALSE 0.078 253.000 0.000 NA   NA
 144005 144006 YPO0527 YPO0528     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144006 144007 YPO0528 YPO0530   leuD FALSE 0.006 580.000 0.000 1.000 N NA
 144007 144008 YPO0530 YPO0531 leuD leuC TRUE 0.995 15.000 0.309 0.001 Y NA
 144008 144009 YPO0531 YPO0532 leuC leuB TRUE 0.998 2.000 0.275 0.001 Y NA
 144009 144010 YPO0532 YPO0533 leuB leuA TRUE 0.996 3.000 0.126 0.001 Y NA
 144010 144011 YPO0533 YPO0534 leuA tnp FALSE 0.112 147.000 0.000 1.000 N NA
 144012 144013 YPO0535 YPO0536 leuO   FALSE 0.042 329.000 0.000 NA   NA
 144013 144014 YPO0536 YPO0537     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144014 144015 YPO0537 YPO0538     TRUE 0.614 31.000 0.000 NA   NA
 144015 144016 YPO0538 YPO0539   ilvI FALSE 0.045 319.000 0.000 NA   NA
 144016 144017 YPO0539 YPO0540 ilvI ilvH TRUE 0.998 3.000 0.371 0.002 Y NA
 144017 144018 YPO0540 YPO0541 ilvH tnp FALSE 0.065 199.000 0.000 1.000 N NA
 144022 144023 YPO0546 YPO0547     TRUE 0.994 3.000 0.635 NA   NA
 144023 144024 YPO0547 YPO0548   ftsL TRUE 0.981 -3.000 0.227 1.000 N NA
 144024 144025 YPO0548 YPO0549 ftsL ftsI TRUE 0.517 66.000 0.124 1.000 N NA
 144025 144026 YPO0549 YPO0550 ftsI murE TRUE 0.986 2.000 0.059 1.000 Y NA
 144026 144027 YPO0550 YPO0551 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 144027 144028 YPO0551 YPO0552 murF mraY TRUE 0.999 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 144028 144029 YPO0552 YPO0553 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.004 Y NA
 144029 144030 YPO0553 YPO0554 murD ftsW TRUE 0.993 0.000 0.297 0.003 N NA
 144030 144031 YPO0554 YPO0555 ftsW murG TRUE 0.996 -3.000 0.647 1.000 N NA
 144031 144032 YPO0555 YPO0556 murG murC TRUE 0.901 138.000 0.283 1.000 Y NA
 144032 144033 YPO0556 YPO0557 murC ddlB TRUE 0.997 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 144033 144034 YPO0557 YPO0558 ddlB ftsQ TRUE 0.997 2.000 0.372 NA Y NA
 144034 144035 YPO0558 YPO0559 ftsQ ftsA TRUE 0.935 27.000 0.389 NA N NA
 144035 144036 YPO0559 YPO0560 ftsA ftsZ TRUE 0.966 73.000 0.460 1.000 Y NA
 144036 144037 YPO0560 YPO0561 ftsZ lpxC TRUE 0.453 100.000 0.134 1.000 N NA
 144039 144040 YPO0563 YPO0564   secA TRUE 0.451 78.000 0.065 1.000   NA
 144040 144041 YPO0564 YPO0565 secA   FALSE 0.006 295.000 0.003 1.000 N NA
 144042 144043 YPO0566 YPO0567     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144043 144044 YPO0567 YPO0568     FALSE 0.062 279.000 0.000 NA   NA
 144044 144045 YPO0568 YPO0569     FALSE 0.133 331.000 0.161 NA   NA
 144045 144046 YPO0569 YPO0569a     TRUE 0.983 -3.000 0.185 NA   NA
 144046 144047 YPO0569a YPO0570     TRUE 0.971 3.000 0.185 NA   NA
 144047 144048 YPO0570 YPO0571     TRUE 0.844 5.000 0.000 NA   NA
 144048 144049 YPO0571 YPO0572     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 144049 144050 YPO0572 YPO0573     TRUE 0.766 226.000 0.684 NA   NA
 144050 144051 YPO0573 YPO0574     TRUE 0.971 -3.000 0.118 NA   NA
 144051 144052 YPO0574 YPO0575     FALSE 0.062 278.000 0.000 NA   NA
 144052 144053 YPO0575 YPO0576   exuR FALSE 0.105 228.000 0.000 NA   NA
 144053 144054 YPO0576 YPO0577 exuR exuT FALSE 0.421 263.000 0.433 1.000 N NA
 144055 144056 YPO0578 YPO0579   uxaC FALSE 0.018 531.000 0.000 NA   NA
 144056 144057 YPO0579 YPO0580 uxaC uxaB TRUE 0.642 199.000 0.095 1.000 Y NA
 144057 144058 YPO0580 YPO0581 uxaB uxaA TRUE 0.979 11.000 0.126 1.000 Y NA
 144058 144059 YPO0581 YPO0582 uxaA   TRUE 0.456 153.000 0.126 NA   NA
 144060 144061 YPO0583 YPO0584 tnp   FALSE 0.064 201.000 0.000 1.000 N NA
 144061 144062 YPO0584 YPO0585     FALSE 0.020 523.000 0.000 1.000   NA
 144062 144063 YPO0585 YPO0586     FALSE 0.207 203.000 0.072 NA   NA
 144063 144064 YPO0586 YPO0587     FALSE 0.095 239.000 0.000 NA   NA
 144066 144067 YPO0589 YPO0590 fadH   FALSE 0.135 213.000 0.000 1.000   NA
 144069 144070 YPO0592 YPO0593     TRUE 0.956 32.000 0.452 1.000   NA
 144070 144071 YPO0593 YPO0594     TRUE 0.966 56.000 0.789 NA   NA
 144071 144072 YPO0594 YPO0595     TRUE 0.932 102.000 0.750 NA   NA
 144072 144073 YPO0595 YPO0596   terX TRUE 0.970 2.000 0.164 NA   NA
 144073 144074 YPO0596 YPO0597 terX terY TRUE 0.873 33.000 0.200 NA   NA
 144075 144076 YPO0598 YPO0599     TRUE 0.876 45.000 0.000 NA Y NA
 144076 144077 YPO0599 YPO0600     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144077 144078 YPO0600 YPO0601     FALSE 0.068 266.000 0.000 NA   NA
 144078 144079 YPO0601 YPO0602     FALSE 0.344 81.000 0.000 NA   NA
 144080 144081 YPO0606 YPO0607 yapF   TRUE 0.448 60.000 0.000 1.000   NA
 144081 144082 YPO0607 YPO0608     FALSE 0.231 102.000 0.016 NA   NA
 144083 144084 YPO0609 YPO0610     TRUE 0.766 83.000 0.030 1.000 Y NA
 144084 144085 YPO0610 YPO0611     FALSE 0.263 109.000 0.073 1.000 N NA
 144085 144086 YPO0611 YPO0612     FALSE 0.371 77.000 0.089 1.000 N NA
 144086 144087 YPO0612 YPO0613     TRUE 0.993 54.000 0.733 0.064 Y NA
 144087 144088 YPO0613 YPO0614     TRUE 0.995 0.000 0.105 0.064 Y NA
 144088 144089 YPO0614 YPO0615     TRUE 0.946 30.000 0.375 NA   NA
 144089 144090 YPO0615 YPO0616     TRUE 0.909 51.000 0.375 NA   NA
 144091 144092 YPO0617 YPO0618     TRUE 0.994 5.000 0.750 NA   NA
 144092 144093 YPO0618 YPO0619     TRUE 0.946 116.000 0.889 NA   NA
 144093 144094 YPO0619 YPO0620     TRUE 0.993 10.000 0.778 NA   NA
 144094 144095 YPO0620 YPO0621     TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   NA
 144095 144096 YPO0621 YPO0622     FALSE 0.200 173.000 0.000 NA   NA
 144097 144098 YPO0623 YPO0624     TRUE 0.977 -7.000 0.222 1.000 N NA
 144098 144099 YPO0624 YPO0625     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 144099 144100 YPO0625 YPO0626     FALSE 0.207 170.000 0.000 NA   NA
 144100 144101 YPO0626 YPO0627     TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 144101 144102 YPO0627 YPO0628     FALSE 0.291 285.000 0.000 NA Y NA
 144103 144104 YPO0629 YPO0630     FALSE 0.072 260.000 0.000 NA   NA
 144105 2201042 YPO0631 YPO0632     FALSE 0.023 451.000 0.000 NA   NA
 144106 144107 YPO0634 YPO0635     FALSE 0.152 198.000 0.000 NA   NA
 144108 144109 YPO0636 YPO0637 ddpA   FALSE 0.215 165.000 0.000 NA   NA
 144109 144110 YPO0637 YPO0638     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144110 144111 YPO0638 YPO0639     FALSE 0.282 126.000 0.000 1.000   NA
 144111 144112 YPO0639 YPO0640     TRUE 0.810 9.000 0.000 NA   NA
 144112 144113 YPO0640 YPO0641     FALSE 0.350 78.000 0.000 NA   NA
 144113 144114 YPO0641 YPO0641a     TRUE 0.725 17.000 0.000 NA   NA
 144114 144115 YPO0641a YPO0642     FALSE 0.154 197.000 0.000 NA   NA
 5922245 144116 YPt_05 YPO0643   rpoD FALSE 0.156 196.000 0.000 NA   NA
 144116 144117 YPO0643 YPO0644 rpoD dnaG TRUE 0.624 158.000 0.299 1.000 N NA
 144117 144118 YPO0644 YPO0645 dnaG rpsU FALSE 0.205 136.000 0.067 1.000 N NA
 144121 144122 YPO0648 YPO0649 folB bacA FALSE 0.108 274.000 0.128 1.000 N NA
 144123 144124 YPO0650 YPO0651 cca   FALSE 0.266 160.000 0.106 NA N NA
 144125 144126 YPO0652 YPO0653   glnE FALSE 0.249 171.000 0.053 1.000   NA
 144126 144127 YPO0653 YPO0654 glnE rfaE FALSE 0.252 135.000 0.083 1.000 N NA
 144127 144128 YPO0654 YPO0655 rfaE asoB FALSE 0.156 37.000 0.012 1.000 N NA
 144130 144131 YPO0657 YPO0658   ribB FALSE 0.221 162.000 0.000 NA   NA
 144131 144132 YPO0658 YPO0659 ribB   FALSE 0.027 459.000 0.048 1.000   NA
 144133 144134 YPO0660 YPO0661     TRUE 0.989 10.000 0.632 NA   NA
 144137 144138 YPO0664 YPO0665     TRUE 0.951 34.000 0.443 NA   NA
 144138 144139 YPO0665 YPO0666   icc TRUE 0.871 82.000 0.433 NA   NA
 144139 144140 YPO0666 YPO0667 icc   TRUE 0.994 -3.000 0.427 NA   NA
 144140 144141 YPO0667 YPO0668   parE TRUE 0.689 102.000 0.217 NA   NA
 144141 144142 YPO0668 YPO0669 parE   TRUE 0.566 4.000 0.022 1.000 N NA
 144144 144145 YPO0671 YPO0672 parC   FALSE 0.025 289.000 0.043 1.000 N NA
 144145 144146 YPO0672 YPO0673   sufI FALSE 0.344 179.000 0.154 1.000 N NA
 144146 2201043 YPO0673 YPO0674 sufI   FALSE 0.048 308.000 0.000 NA   NA
 144151 144152 YPO0680 YPO0681   metC TRUE 0.491 193.000 0.212 NA   NA
 144153 144154 YPO0682 YPO0683     TRUE 0.999 4.000 0.810 0.088 Y NA
 144155 144156 YPO0684 YPO0685     TRUE 0.969 25.000 0.500 NA   NA
 144156 144157 YPO0685 YPO0686     TRUE 0.490 50.000 0.000 NA   NA
 144157 144158 YPO0686 YPO0687     TRUE 0.986 0.000 0.000 NA Y NA
 144158 144159 YPO0687 YPO0688     TRUE 0.984 20.000 0.273 1.000 Y NA
 144159 144160 YPO0688 YPO0689     TRUE 1.000 -3.000 0.909 0.014 Y NA
 144160 144161 YPO0689 YPO0690     TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 144161 144162 YPO0690 YPO0691     TRUE 0.997 12.000 0.727 NA Y NA
 144162 2201044 YPO0691 YPO0692     FALSE 0.156 196.000 0.000 NA   NA
 2201044 144163 YPO0692 YPO0694     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144163 144164 YPO0694 YPO0695     TRUE 0.833 52.000 0.222 NA   NA
 144165 144166 YPO0696 YPO0697 tnp tnp TRUE 0.525 252.000 0.000 0.032 Y NA
 144166 144167 YPO0697 YPO0698 tnp   FALSE 0.015 353.000 0.000 1.000 N NA
 144167 144168 YPO0698 YPO0699     TRUE 0.945 18.000 0.000 1.000 Y NA
 144168 144169 YPO0699 YPO0700     TRUE 0.931 25.000 0.000 1.000 Y NA
 144172 2201045 YPO0703 YPO0704     FALSE 0.124 215.000 0.000 NA   NA
 2201045 144173 YPO0704 YPO0706   flhB TRUE 0.909 -10.000 0.000 NA   NA
 144173 144174 YPO0706 YPO0707 flhB fliR TRUE 0.999 0.000 1.000 1.000 Y NA
 144174 144175 YPO0707 YPO0708 fliR fliQ TRUE 0.996 7.000 0.281 0.004 Y NA
 144175 144176 YPO0708 YPO0709 fliQ fliP TRUE 0.996 5.000 0.263 0.014 Y NA
 144176 144177 YPO0709 YPO0710 fliP fliN TRUE 0.998 -3.000 0.368 1.000 Y NA
 144177 144178 YPO0710 YPO0711 fliN fliM TRUE 0.967 -7.000 0.123 NA   NA
 144179 144180 YPO0712 YPO0713   fliE TRUE 0.975 17.000 0.576 1.000 N NA
 144180 144181 YPO0713 YPO0714 fliE fliF TRUE 0.999 10.000 1.000 0.012 Y NA
 144181 144182 YPO0714 YPO0715 fliF fliG TRUE 1.000 -28.000 0.970 0.012 Y NA
 144182 144183 YPO0715 YPO0716 fliG fliH TRUE 1.000 2.000 0.789 0.006 Y NA
 144183 144184 YPO0716 YPO0717 fliH fliI TRUE 0.999 -7.000 0.816 1.000 Y NA
 144184 144185 YPO0717 YPO0718 fliI   TRUE 0.769 13.000 0.035 1.000   NA
 144186 144187 YPO0719 YPO0720     TRUE 0.947 109.000 0.585 0.004   NA
 144187 144188 YPO0720 YPO0721   flgA FALSE 0.214 229.000 0.113 NA   NA
 144189 144190 YPO0722 YPO0723 flgB flgC TRUE 1.000 3.000 0.972 0.006 Y NA
 144190 144191 YPO0723 YPO0724 flgC flgD TRUE 0.999 3.000 0.914 NA Y NA
 144191 144192 YPO0724 YPO0725 flgD flgE TRUE 0.993 55.000 0.970 NA Y NA
 144192 2201046 YPO0725 YPO0727 flgE flgF TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 144194 144195 YPO0728 YPO0729 flgG flgH TRUE 0.998 35.000 0.941 0.012 Y NA
 144195 144196 YPO0729 YPO0730 flgH flgI TRUE 0.993 77.000 0.912 0.014 Y NA
 144196 144197 YPO0730 YPO0731 flgI flgJ TRUE 0.983 10.000 0.457 NA   NA
 144197 144198 YPO0731 YPO0732 flgJ flgK TRUE 0.849 113.000 0.457 NA   NA
 144198 144199 YPO0732 YPO0733 flgK flgL TRUE 0.987 29.000 0.576 0.002   NA
 144199 144200 YPO0733 YPO0734 flgL ggt TRUE 0.964 45.000 0.667 NA   NA
 144201 144202 YPO0735 YPO0736     TRUE 0.925 104.000 0.714 NA   NA
 144203 144204 YPO0737 YPO0738 flaA1 flaA2 FALSE 0.241 515.000 0.000 0.002 Y NA
 144204 144205 YPO0738 YPO0739 flaA2 flaA3 TRUE 0.508 283.000 0.000 0.002 Y NA
 144205 144206 YPO0739 YPO0740 flaA3 fliD TRUE 0.474 220.000 0.000 1.000 Y NA
 144206 144207 YPO0740 YPO0741 fliD fliS TRUE 0.999 10.000 0.865 0.004 Y NA
 144207 144208 YPO0741 YPO0742 fliS   TRUE 0.918 2.000 0.054 NA   NA
 144208 144209 YPO0742 YPO0743     TRUE 0.926 2.000 0.062 NA   NA
 144209 144210 YPO0743 YPO0744     TRUE 0.908 39.000 0.296 1.000   NA
 144210 144211 YPO0744 YPO0745   fliA TRUE 0.979 6.000 0.333 1.000   NA
 144211 144212 YPO0745 YPO0746 fliA motA TRUE 0.970 16.000 0.500 1.000 N NA
 144212 144213 YPO0746 YPO0747 motA motB TRUE 0.999 0.000 0.846 1.000 Y NA
 144213 144214 YPO0747 YPO0748 motB   FALSE 0.374 69.000 0.000 NA   NA
 144214 144215 YPO0748 YPO0749     FALSE 0.142 203.000 0.000 NA   NA
 144215 144216 YPO0749 YPO0750     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144216 144217 YPO0750 YPO0751     FALSE 0.358 74.000 0.000 NA   NA
 2201047 144218 YPO0752 YPO0754 pcpY   FALSE 0.081 250.000 0.000 NA   NA
 144219 144220 YPO0755 YPO0756     TRUE 0.932 54.000 0.167 1.000 Y NA
 144221 144222 YPO0758 YPO0759     FALSE 0.025 282.000 0.000 1.000 N NA
 144223 144224 YPO0760 YPO0761     FALSE 0.018 544.000 0.000 NA   NA
 144224 144225 YPO0761 YPO0762     FALSE 0.064 275.000 0.000 NA   NA
 144225 144226 YPO0762 YPO0763     TRUE 0.770 14.000 0.000 1.000   NA
 144226 144227 YPO0763 YPO0764     TRUE 0.653 26.000 0.000 NA   NA
 144227 2201049 YPO0764 YPO0765     FALSE 0.016 589.000 0.000 NA   NA
 2201049 144228 YPO0765 YPO0767   gntP FALSE 0.012 1001.000 0.000 NA   NA
 144229 144230 YPO0768 YPO0769     FALSE 0.024 436.000 0.000 NA   NA
 144231 144232 YPO0770 YPO0771     TRUE 0.994 -7.000 0.000 0.006 Y NA
 144232 144233 YPO0771 YPO0772     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 144233 144234 YPO0772 YPO0773     TRUE 0.909 -10.000 0.000 NA   NA
 144234 144235 YPO0773 YPO0774     TRUE 0.990 -7.000 0.074 1.000 Y NA
 144235 144236 YPO0774 YPO0775     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144236 144237 YPO0775 YPO0776     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144237 144238 YPO0776 YPO0777     TRUE 0.932 13.000 0.000 0.002   NA
 144238 144239 YPO0777 YPO0778     TRUE 0.817 44.000 0.000 0.002   NA
 144239 144240 YPO0778 YPO0779     FALSE 0.226 61.000 0.000 1.000 N NA
 144240 144241 YPO0779 YPO0780     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144241 2201050 YPO0780 YPO0781     FALSE 0.337 85.000 0.000 NA   NA
 2201050 144242 YPO0781 YPO0782     TRUE 0.582 35.000 0.000 NA   NA
 144242 144243 YPO0782 YPO0783   thyA TRUE 0.614 31.000 0.000 NA   NA
 144243 144244 YPO0783 YPO0784 thyA lgt TRUE 0.917 7.000 0.164 1.000 N NA
 144244 144245 YPO0784 YPO0785 lgt ptsP FALSE 0.008 251.000 0.003 1.000 N NA
 144245 144246 YPO0785 YPO0786 ptsP   FALSE 0.324 13.000 0.012 1.000 N NA
 144246 144247 YPO0786 YPO0787     TRUE 0.549 26.000 0.008 NA   NA
 144247 144248 YPO0787 YPO0788     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144249 144250 YPO0789 YPO0790 mutH tas FALSE 0.007 335.000 0.015 1.000 N NA
 144251 144252 YPO0791 YPO0792     FALSE 0.212 167.000 0.000 NA   NA
 144252 144253 YPO0792 YPO0793   aas TRUE 0.973 -3.000 0.124 NA   NA
 144253 144254 YPO0793 YPO0794 aas bisC FALSE 0.009 449.000 0.000 1.000 N NA
 144258 144259 YPO0798 YPO0799     FALSE 0.013 369.000 0.000 1.000 N NA
 144260 144261 YPO0800 YPO0801     TRUE 0.593 113.000 0.157 1.000   NA
 144262 144263 YPO0802 YPO0803 cheD   FALSE 0.142 203.000 0.000 NA   NA
 144263 144264 YPO0803 YPO0804     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 144266 144267 YPO0806 YPO0807     TRUE 0.653 26.000 0.000 NA   NA
 144267 144268 YPO0807 YPO0808     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144268 144269 YPO0808 YPO0809     TRUE 0.998 5.000 0.537 0.083 Y NA
 144269 144270 YPO0809 YPO0810     TRUE 0.995 9.000 0.461 1.000 Y NA
 144270 144271 YPO0810 YPO0811     TRUE 0.998 -7.000 0.569 0.003   NA
 144271 144272 YPO0811 YPO0812     TRUE 0.907 38.000 0.132 0.003   NA
 144272 144273 YPO0812 YPO0813     TRUE 0.991 5.000 0.087 0.003 Y NA
 144273 2201051 YPO0813 YPO0814     TRUE 0.682 23.000 0.000 NA   NA
 2201051 144274 YPO0814 YPO0815     TRUE 0.904 -13.000 0.000 NA   NA
 144274 144275 YPO0815 YPO0816     TRUE 0.995 -3.000 0.012 0.003 Y NA
 144275 144276 YPO0816 YPO0817     TRUE 0.930 81.000 0.667 NA   NA
 144276 144277 YPO0817 YPO0818     TRUE 0.939 68.000 0.667 NA   NA
 144277 144278 YPO0818 YPO0819     FALSE 0.013 743.000 0.000 NA   NA
 144279 144280 YPO0820 YPO0821   wbyI FALSE 0.030 387.000 0.000 NA   NA
 144280 144281 YPO0821 YPO0822 wbyI   TRUE 0.689 22.000 0.000 NA   NA
 144281 144282 YPO0822 YPO0823   wzy TRUE 0.753 115.000 0.286 1.000   NA
 144282 144283 YPO0823 YPO0824 wzy   TRUE 0.891 70.000 0.444 1.000   NA
 144283 2201052 YPO0824 YPO0824A   tnp FALSE 0.117 220.000 0.000 NA   NA
 144284 144285 YPO0825 YPO0826     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144285 144286 YPO0826 YPO0829     FALSE 0.005 943.000 0.000 1.000 N NA
 144287 144288 YPO0831 YPO0832   agaZ TRUE 0.975 50.000 0.400 1.000 Y NA
 144288 144289 YPO0832 YPO0833 agaZ   TRUE 0.983 -3.000 0.240 1.000 N NA
 144289 144290 YPO0833 YPO0834   ushA TRUE 0.845 18.000 0.150 1.000 N NA
 144290 144291 YPO0834 YPO0835 ushA   TRUE 0.997 47.000 0.909 0.010 Y NA
 144291 144292 YPO0835 YPO0836     TRUE 1.000 -10.000 0.917 0.010 Y NA
 144292 144293 YPO0836 YPO0837     TRUE 0.992 86.000 0.833 0.010 Y NA
 144293 144294 YPO0837 YPO0838     TRUE 0.988 3.000 0.104 1.000 Y NA
 144294 144295 YPO0838 YPO0839   kduD2 FALSE 0.068 196.000 0.000 1.000 N NA
 144295 144296 YPO0839 YPO0840 kduD2   TRUE 0.976 16.000 0.462 1.000   NA
 144296 144297 YPO0840 YPO0841     FALSE 0.226 244.000 0.000 0.022   NA
 144297 144298 YPO0841 YPO0842     TRUE 0.981 21.000 0.615 1.000   NA
 144298 144299 YPO0842 YPO0843     TRUE 0.919 123.000 0.727 NA   NA
 144299 144300 YPO0843 YPO0844   agaY TRUE 0.733 109.000 0.261 NA   NA
 144300 144301 YPO0844 YPO0845 agaY   TRUE 0.871 24.000 0.148 NA   NA
 144303 144304 YPO0847 YPO0848     TRUE 0.916 148.000 0.341 1.000 Y NA
 144307 144308 YPO0851 YPO0852   bgaB TRUE 0.847 112.000 0.143 1.000 Y NA
 144308 144309 YPO0852 YPO0853 bgaB   TRUE 0.972 51.000 0.190 0.004 Y NA
 144309 144310 YPO0853 YPO0854     TRUE 0.994 5.000 0.308 1.000 Y NA
 144310 144311 YPO0854 YPO0855     TRUE 0.999 12.000 0.885 0.062 Y NA
 144311 144312 YPO0855 YPO0856     TRUE 0.973 160.000 0.815 1.000 Y NA
 144313 144314 YPO0857 YPO0858     FALSE 0.106 549.000 0.000 1.000 Y NA
 144314 144315 YPO0858 YPO0859     TRUE 0.958 66.000 0.200 0.013 Y NA
 144315 144316 YPO0859 YPO0860     TRUE 0.488 435.000 0.217 0.013 Y NA
 144316 144317 YPO0860 YPO0862     FALSE 0.013 779.000 0.000 NA   NA
 144317 144318 YPO0862 YPO0863     FALSE 0.031 376.000 0.000 NA   NA
 144318 144319 YPO0863 YPO0864     FALSE 0.025 424.000 0.000 NA   NA
 144319 144320 YPO0864 YPO0865     TRUE 0.940 0.000 0.065 NA   NA
 144321 144322 YPO0866 YPO0867     FALSE 0.122 217.000 0.000 NA   NA
 144322 144323 YPO0867 YPO0868     FALSE 0.344 81.000 0.000 NA   NA
 144323 144324 YPO0868 YPO0869     FALSE 0.047 312.000 0.000 NA   NA
 144324 144325 YPO0869 YPO0870     TRUE 0.967 21.000 0.429 NA   NA
 144325 144326 YPO0870 YPO0871     FALSE 0.088 245.000 0.000 NA   NA
 144326 144327 YPO0871 YPO0872     TRUE 0.509 47.000 0.000 NA   NA
 144327 144328 YPO0872 YPO0873   fabF1 FALSE 0.019 510.000 0.000 NA   NA
 144328 144329 YPO0873 YPO0874 fabF1   FALSE 0.021 504.000 0.000 1.000   NA
 144330 144331 YPO0875 YPO0876     TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 144331 144332 YPO0876 YPO0877     TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   NA
 144332 144333 YPO0877 YPO0878     FALSE 0.185 182.000 0.000 NA   NA
 144336 144337 YPO0881 YPO0882     TRUE 0.998 0.000 0.857 NA   NA
 144337 144338 YPO0882 YPO0883     FALSE 0.217 164.000 0.000 NA   NA
 144338 144339 YPO0883 YPO0884     TRUE 0.755 63.000 0.189 NA   NA
 144339 144340 YPO0884 YPO0887   int FALSE 0.004 865.000 0.000 NA N NA
 144340 5922246 YPO0887 YPt_06 int   FALSE 0.214 166.000 0.000 NA   NA
 5922246 144341 YPt_06 YPO0888   lysS FALSE 0.161 194.000 0.000 NA   NA
 144341 144342 YPO0888 YPO0889 lysS prfB TRUE 0.990 10.000 0.162 0.050 Y NA
 144342 144343 YPO0889 YPO0890 prfB recJ FALSE 0.058 179.000 0.028 1.000 N NA
 144343 144344 YPO0890 YPO0891 recJ dsbC TRUE 0.818 7.000 0.082 1.000 N NA
 144344 144345 YPO0891 YPO0892 dsbC xerD TRUE 0.597 31.000 0.079 1.000 N NA
 144347 144348 YPO0894 YPO0895 creD creC TRUE 0.716 100.000 0.311 NA N NA
 144348 144349 YPO0895 YPO0896 creC creB TRUE 0.995 25.000 0.776 1.000 Y NA
 144349 144350 YPO0896 YPO0896a creB   TRUE 0.941 -3.000 0.051 NA   NA
 144350 144351 YPO0896a YPO0897     TRUE 0.925 -19.000 0.061 NA   NA
 144353 144354 YPO0899 YPO0900     FALSE 0.074 258.000 0.000 NA   NA
 144354 144355 YPO0900 YPO0901     FALSE 0.145 202.000 0.000 NA   NA
 144355 144356 YPO0901 YPO0902     FALSE 0.418 62.000 0.000 NA   NA
 144356 144357 YPO0902 YPO0904     FALSE 0.012 1210.000 0.000 NA   NA
 144357 144358 YPO0904 YPO0905   gcvP FALSE 0.031 378.000 0.000 NA   NA
 144358 144359 YPO0905 YPO0906 gcvP gcsH TRUE 0.778 212.000 0.249 1.000 Y NA
 144359 144360 YPO0906 YPO0907 gcsH gcvT TRUE 0.977 69.000 0.317 0.001 Y NA
 144360 144361 YPO0907 YPO0908 gcvT visC FALSE 0.001 721.000 0.004 1.000 N NA
 144361 144362 YPO0908 YPO0909 visC ubiH TRUE 0.967 173.000 0.474 0.001 Y NA
 144362 144363 YPO0909 YPO0910 ubiH pepP FALSE 0.222 69.000 0.047 1.000 N NA
 144363 144364 YPO0910 YPO0911 pepP   TRUE 0.442 88.000 0.073 NA   NA
 144365 2201053 YPO0912 YPOs02   ssrS TRUE 0.455 56.000 0.000 NA   NA
 2201053 144366 YPOs02 YPO0913 ssrS   FALSE 0.267 127.000 0.000 NA   NA
 144367 144368 YPO0914 YPO0915 serA rpiA FALSE 0.014 307.000 0.029 1.000 N NA
 144370 144371 YPO0917 YPO0918     FALSE 0.252 190.000 0.075 NA   NA
 144371 144372 YPO0918 YPO0919     FALSE 0.079 263.000 0.049 NA   NA
 144372 144373 YPO0919 YPO0920   fbaA FALSE 0.008 438.000 0.038 NA N NA
 144373 144374 YPO0920 YPO0921 fbaA pgk TRUE 0.864 120.000 0.056 0.006 Y NA
 144374 144375 YPO0921 YPO0922 pgk epd TRUE 0.886 103.000 0.070 0.006 Y NA
 144375 144376 YPO0922 YPO0923 epd   FALSE 0.018 315.000 0.000 1.000 N NA
 144376 144377 YPO0923 YPO0924     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144377 144378 YPO0924 YPO0925   tnp TRUE 0.709 184.000 0.000 0.097 Y NA
 144378 144379 YPO0925 YPO0926 tnp tktA FALSE 0.020 308.000 0.000 1.000 N NA
 144381 144382 YPO0928 YPO0929   speA FALSE 0.031 160.000 0.006 1.000 N NA
 144383 144384 YPO0931 YPO0932 metK   FALSE 0.153 193.000 0.030 1.000   NA
 144384 144385 YPO0932 YPO0933   endA TRUE 0.694 98.000 0.210 1.000   NA
 144385 144386 YPO0933 YPO0934 endA   FALSE 0.286 252.000 0.201 NA   NA
 144386 144387 YPO0934 YPO0935   gshB TRUE 0.880 26.000 0.173 NA   NA
 144387 144388 YPO0935 YPO0936 gshB   FALSE 0.366 116.000 0.120 NA N NA
 144388 144389 YPO0936 YPO0937     TRUE 0.981 0.000 0.263 NA N NA
 144389 144390 YPO0937 YPO0938     FALSE 0.137 180.000 0.004 1.000   NA
 144390 144391 YPO0938 YPO0939     TRUE 0.930 4.000 0.095 1.000   NA
 144393 144394 YPO0941 YPO0942   proC TRUE 0.480 133.000 0.125 NA   NA
 144394 144395 YPO0942 YPO0943 proC   FALSE 0.129 288.000 0.117 NA   NA
 144395 144396 YPO0943 YPO0944     TRUE 0.959 -3.000 0.081 NA   NA
 144396 144397 YPO0944 YPO0945     FALSE 0.233 100.000 0.016 NA   NA
 144397 144398 YPO0945 YPO0946     TRUE 0.976 -7.000 0.218 1.000 N NA
 144399 2201054 YPO0947 YPO0948     FALSE 0.019 502.000 0.000 NA   NA
 2201054 144400 YPO0948 YPO0949     FALSE 0.332 88.000 0.000 NA   NA
 144400 144401 YPO0949 YPO0950     TRUE 0.514 111.000 0.123 NA   NA
 144401 144402 YPO0950 YPO0951     TRUE 0.955 0.000 0.092 NA   NA
 144403 144404 YPO0952 YPO0953 mutY   FALSE 0.341 178.000 0.150 1.000 N NA
 144404 144405 YPO0953 YPO0954   mltC FALSE 0.270 183.000 0.128 NA N NA
 144405 144406 YPO0954 YPO0955 mltC   FALSE 0.018 300.000 0.000 NA N NA
 144406 144407 YPO0955 YPO0956     TRUE 0.940 38.000 0.128 1.000 Y NA
 144408 144409 YPO0957 YPO0958   mglA TRUE 1.000 -3.000 0.727 0.013 Y NA
 144409 144410 YPO0958 YPO0959 mglA   TRUE 0.985 46.000 0.545 NA Y NA
 144410 144411 YPO0959 YPO0960   speC FALSE 0.006 556.000 0.000 NA N NA
 144412 144413 YPO0961 YPO0962     TRUE 0.675 24.000 0.000 NA   NA
 144413 144414 YPO0962 YPO0963   insB FALSE 0.015 608.000 0.000 NA   NA
 144414 144415 YPO0963 YPO0964 insB insA TRUE 0.893 66.000 0.000 0.032 Y NA
 144415 144416 YPO0964 YPO0965 insA   FALSE 0.317 96.000 0.000 NA   NA
 144416 144417 YPO0965 YPO0966   rhlE TRUE 0.844 5.000 0.000 NA   NA
 144417 144418 YPO0966 YPO0967 rhlE   TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 144418 144419 YPO0967 YPO0967a     FALSE 0.018 535.000 0.000 NA   NA
 144419 144420 YPO0967a YPO0968     TRUE 0.918 54.000 0.000 0.032 Y NA
 144420 144421 YPO0968 YPO0968a     FALSE 0.030 387.000 0.000 NA   NA
 144421 144422 YPO0968a YPO0969     FALSE 0.290 111.000 0.000 NA   NA
 144422 144423 YPO0969 YPO0970     TRUE 0.746 15.000 0.000 NA   NA
 144423 144424 YPO0970 YPO0971   clpB3 TRUE 0.973 -3.000 0.125 NA   NA
 144424 144425 YPO0971 YPO0973 clpB3   FALSE 0.045 418.000 0.083 NA   NA
 144425 144426 YPO0973 YPO0974     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 144426 144427 YPO0974 YPO0975     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 144427 144428 YPO0975 YPO0976     TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 144428 144429 YPO0976 YPO0977     TRUE 0.781 12.000 0.000 NA   NA
 144429 144430 YPO0977 YPO0978     TRUE 0.526 43.000 0.000 NA   NA
 144430 144431 YPO0978 YPO0980     FALSE 0.011 1400.000 0.000 NA   NA
 144431 144432 YPO0980 YPO0980A   insB FALSE 0.296 106.000 0.000 NA   NA
 144432 144433 YPO0980A YPO0981 insB insA TRUE 0.799 36.000 0.000 0.032   NA
 144433 144434 YPO0981 YPO0982 insA   FALSE 0.380 68.000 0.000 NA   NA
 144434 144435 YPO0982 YPO0983     FALSE 0.023 451.000 0.000 NA   NA
 144438 144439 YPO0986 YPO0987 xapB   FALSE 0.033 377.000 0.000 1.000   NA
 2201055 144441 YPO0989 YPO0991 iucA iucB TRUE 0.904 -13.000 0.000 NA   NA
 144441 144442 YPO0991 YPO0992 iucB iucC TRUE 0.989 -3.000 0.250 1.000   NA
 144442 144443 YPO0992 YPO0993 iucC iucD TRUE 0.998 -3.000 0.417 1.000 Y NA
 144443 144444 YPO0993 YPO0994 iucD iutA FALSE 0.417 72.000 0.100 1.000 N NA
 144446 144447 YPO0996 YPO0997     TRUE 0.932 54.000 0.167 1.000 Y NA
 144448 144449 YPO0998 YPO0999     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 144450 144451 YPO1000 YPO1001     TRUE 0.990 13.000 0.842 1.000 N NA
 144453 144454 YPO1003 YPO1004   yapH FALSE 0.013 854.000 0.000 NA   NA
 144455 144456 YPO1005 YPO1006     FALSE 0.050 563.000 0.000 0.016   NA
 144456 144457 YPO1006 YPO1007     FALSE 0.323 208.000 0.000 0.016   NA
 144458 144459 YPO1008 YPO1009     FALSE 0.353 78.000 0.089 NA N NA
 144459 144460 YPO1009 YPO1011     FALSE 0.012 388.000 0.000 1.000 N NA
 144460 2201056 YPO1011 YPO1012     FALSE 0.187 181.000 0.000 NA   NA
 2201056 144461 YPO1012 YPO1013     FALSE 0.335 87.000 0.000 NA   NA
 144461 144462 YPO1013 YPO1014     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144462 144463 YPO1014 YPO1014a     FALSE 0.403 65.000 0.000 NA   NA
 144463 144464 YPO1014a YPO1015     TRUE 0.992 -6.000 0.368 NA   NA
 144464 144465 YPO1015 YPO1016     TRUE 0.993 -3.000 0.373 NA   NA
 144465 144466 YPO1016 YPO1017     TRUE 0.994 -12.000 0.538 NA   NA
 144466 144467 YPO1017 YPO1018   recC FALSE 0.224 135.000 0.076 NA N NA
 144467 144468 YPO1018 YPO1019 recC ptrA FALSE 0.367 82.000 0.092 1.000 N NA
 144468 144469 YPO1019 YPO1020 ptrA recB TRUE 0.938 -3.000 0.092 1.000 N NA
 144469 144470 YPO1020 YPO1021 recB recD TRUE 1.000 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 5922248 5922249 YPt_08 YPt_09     FALSE 0.272 124.000 0.000 NA   NA
 144473 144474 YPO1025 YPO1026     FALSE 0.061 143.000 0.021 1.000 N NA
 144475 144476 YPO1027 YPO1028     TRUE 0.720 135.000 0.122 0.002   NA
 144477 144478 YPO1029 YPO1030 gcvA   FALSE 0.322 166.000 0.081 NA   NA
 144478 144479 YPO1030 YPO1031     TRUE 0.972 -7.000 0.144 NA   NA
 144480 144481 YPO1032 YPO1033 xni   FALSE 0.240 260.000 0.178 NA   NA
 144481 144482 YPO1033 YPO1034     FALSE 0.342 153.000 0.079 NA   NA
 144483 2201057 YPO1035 YPOs03 syd csrB FALSE 0.070 263.000 0.000 NA   NA
 2201057 144484 YPOs03 YPO1036 csrB tnp FALSE 0.243 146.000 0.000 NA   NA
 144484 144485 YPO1036 YPO1037 tnp   FALSE 0.077 254.000 0.000 NA   NA
 144485 144486 YPO1037 YPO1038     TRUE 0.995 0.000 0.518 NA   NA
 144486 144487 YPO1038 YPO1039     TRUE 0.855 28.000 0.209 1.000 N NA
 144488 144489 YPO1040 YPO1041   dapD FALSE 0.260 124.000 0.035 NA   NA
 144489 144490 YPO1041 YPO1042 dapD glnD FALSE 0.228 175.000 0.097 1.000 N NA
 144490 144491 YPO1042 YPO1043 glnD ampM TRUE 0.971 3.000 0.243 1.000 N NA
 144492 144493 YPO1044 YPO1045 rpsB tsf TRUE 0.974 128.000 0.748 1.000 Y NA
 144493 144494 YPO1045 YPO1046 tsf pyrH TRUE 0.574 209.000 0.416 1.000 N NA
 144494 144495 YPO1046 YPO1047 pyrH frr TRUE 0.851 136.000 0.626 1.000 N NA
 144495 144496 YPO1047 YPO1048 frr dxr FALSE 0.041 214.000 0.032 1.000 N NA
 144496 144497 YPO1048 YPO1049 dxr uppS TRUE 0.433 224.000 0.025 1.000 Y NA
 144497 144498 YPO1049 YPO1050 uppS cdsA TRUE 0.994 10.000 0.400 1.000 Y NA
 144498 144499 YPO1050 YPO1051 cdsA   TRUE 0.616 29.000 0.080 1.000 N NA
 144499 144500 YPO1051 YPO1052     TRUE 0.961 37.000 0.204 1.000 Y NA
 144500 144501 YPO1052 YPO1053   ompH TRUE 0.913 158.000 0.354 1.000 Y NA
 144501 144502 YPO1053 YPO1054 ompH lpxD TRUE 0.999 4.000 0.814 1.000 Y NA
 144502 144503 YPO1054 YPO1055 lpxD fabZ TRUE 0.886 158.000 0.796 1.000 N NA
 144503 144504 YPO1055 YPO1056 fabZ lpxA TRUE 0.995 4.000 0.850 1.000 N NA
 144504 144505 YPO1056 YPO1057 lpxA lpxB TRUE 0.994 4.000 0.289 1.000 Y NA
 144505 144506 YPO1057 YPO1058 lpxB rnhB TRUE 0.975 -3.000 0.186 1.000 N NA
 144506 144507 YPO1058 YPO1059 rnhB dnaE TRUE 0.790 130.000 0.104 1.000 Y NA
 144507 144508 YPO1059 YPO1060 dnaE accA TRUE 0.842 13.000 0.122 1.000 N NA
 144508 144509 YPO1060 YPO1061 accA   FALSE 0.017 184.000 0.008 NA N NA
 144509 144510 YPO1061 YPO1062     TRUE 0.499 2.000 0.015 NA N NA
 144510 144511 YPO1062 YPO1063     FALSE 0.011 237.000 0.005 1.000 N NA
 144512 144513 YPO1064 YPO1064a     TRUE 0.975 -13.000 0.179 NA   NA
 144514 144515 YPO1065 YPO1066     TRUE 0.883 3.000 0.034 1.000   NA
 144515 144516 YPO1066 YPO1067   cutF TRUE 0.494 40.000 0.027 NA   NA
 144517 144518 YPO1068 YPO1069 proS   FALSE 0.325 104.000 0.048 NA   NA
 144518 144519 YPO1069 YPO1070   rcsF TRUE 0.988 -3.000 0.247 NA   NA
 144519 144520 YPO1070 YPO1071 rcsF intA2 TRUE 0.862 118.000 0.500 NA   NA
 144520 144521 YPO1071 YPO1072 intA2   TRUE 0.966 64.000 0.411 NA Y NA
 144521 144522 YPO1072 YPO1073   abc TRUE 0.999 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 144523 2201058 YPO1074 YPOr04   16S_rRNA FALSE 0.021 469.000 0.000 NA   NA
 2201058 5922250 YPOr04 YPt_10 16S_rRNA   FALSE 0.217 164.000 0.000 NA   NA
 5922250 407418 YPt_10 YPOr05   23S_rRNA FALSE 0.078 253.000 0.000 NA   NA
 407418 2201059 YPOr05 YPOr06 23S_rRNA 5S_rRNA TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 2201059 5922251 YPOr06 YPt_11 5S_rRNA   FALSE 0.281 118.000 0.000 NA   NA
 5922251 144524 YPt_11 YPO1075     FALSE 0.035 359.000 0.000 NA   NA
 144524 144525 YPO1075 YPO1076     TRUE 0.582 35.000 0.000 NA   NA
 144525 144526 YPO1076 YPO1077     FALSE 0.034 361.000 0.000 NA   NA
 144527 144528 YPO1078 YPO1079 mltD gloB TRUE 0.900 33.000 0.233 1.000   NA
 144531 5922252 YPO1082 YPt_12 chb   FALSE 0.287 113.000 0.000 NA   NA
 144533 144534 YPO1085 YPO1086     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144534 144535 YPO1086 YPO1086a   intA FALSE 0.331 89.000 0.000 NA   NA
 144536 144537 YPO1087 YPO1088     TRUE 0.816 8.000 0.000 NA   NA
 144538 144539 YPO1089 YPO1090     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144539 144540 YPO1090 YPO1091     TRUE 0.994 -7.000 0.500 NA   NA
 144540 144541 YPO1091 YPO1092     FALSE 0.163 193.000 0.000 NA   NA
 144541 144542 YPO1092 YPO1092a     TRUE 0.969 13.000 0.333 NA   NA
 144542 144543 YPO1092a YPO1094     FALSE 0.327 92.000 0.000 NA   NA
 144545 144546 YPO1096 YPO1097     TRUE 0.856 51.000 0.250 NA   NA
 144546 144547 YPO1097 YPO1098     FALSE 0.347 79.000 0.000 NA   NA
 144547 144548 YPO1098 YPO1099   tnp TRUE 0.578 224.000 0.000 0.095 Y NA
 144550 144551 YPO1102 YPO1103     TRUE 0.967 -7.000 0.124 NA   NA
 144552 144553 YPO1104 YPO1105     FALSE 0.175 105.000 0.049 1.000 N NA
 144553 144554 YPO1105 YPO1106     TRUE 0.605 69.000 0.170 1.000 N NA
 144557 144558 YPO1109 YPO1110 sdhC sdhD TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 144558 144559 YPO1110 YPO1111 sdhD sdhA TRUE 1.000 1.000 0.705 0.002 Y NA
 144559 144560 YPO1111 YPO1112 sdhA sdhB TRUE 0.993 50.000 0.604 0.002 Y NA
 144560 144561 YPO1112 YPO1113 sdhB sucA FALSE 0.236 356.000 0.067 1.000 Y NA
 144561 144562 YPO1113 YPO1114 sucA sucB TRUE 0.993 30.000 0.667 1.000 Y NA
 144562 144563 YPO1114 YPO1115 sucB sucC TRUE 0.843 113.000 0.136 1.000 Y NA
 144563 144564 YPO1115 YPO1116 sucC sucD TRUE 1.000 0.000 0.806 0.001 Y NA
 144564 144565 YPO1116 YPO1117 sucD cydA FALSE 0.083 767.000 0.000 1.000 Y NA
 144565 144566 YPO1117 YPO1118 cydA cydB TRUE 0.994 15.000 0.348 0.042 Y NA
 144566 144567 YPO1118 YPO1119 cydB   TRUE 0.506 92.000 0.100 NA   NA
 144567 144568 YPO1119 YPO1120     FALSE 0.411 132.000 0.095 NA   NA
 144568 144569 YPO1120 YPO1121   tolQ TRUE 0.996 0.000 0.593 1.000   NA
 144569 144570 YPO1121 YPO1122 tolQ tolR TRUE 0.997 13.000 0.556 0.084 Y NA
 144570 144571 YPO1122 YPO1123 tolR tolA FALSE 0.357 112.000 0.114 NA N NA
 144571 144572 YPO1123 YPO1124 tolA tolB FALSE 0.153 120.000 0.051 NA N NA
 144572 144573 YPO1124 YPO1125 tolB pal TRUE 0.935 51.000 0.592 1.000 N NA
 144573 144574 YPO1125 YPO1126 pal   TRUE 0.889 10.000 0.088 1.000   NA
 144574 5922253 YPO1126 YPt_13     FALSE 0.167 191.000 0.000 NA   NA
 5922253 5922254 YPt_13 YPt_14     TRUE 0.639 28.000 0.000 NA   NA
 5922254 5922255 YPt_14 YPt_15     TRUE 0.632 29.000 0.000 NA   NA
 5922255 5922256 YPt_15 YPt_15     TRUE 0.894 -69.000 0.000 NA   NA
 5922256 144575 YPt_15 YPO1127   nadA FALSE 0.033 369.000 0.000 NA   NA
 144575 144576 YPO1127 YPO1128 nadA pnuC TRUE 0.698 122.000 0.023 1.000 Y NA
 144578 144579 YPO1131 YPO1132     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144579 144580 YPO1132 YPO1133   gpmA FALSE 0.014 366.000 0.000 1.000 N NA
 144580 144581 YPO1133 YPO1134 gpmA psiF FALSE 0.038 347.000 0.000 NA   NA
 144581 2201062 YPO1134 YPO1135 psiF galM FALSE 0.055 293.000 0.000 NA   NA
 2201062 144582 YPO1135 YPO1137 galM galK TRUE 0.923 -6.000 0.000 NA   NA
 144582 144583 YPO1137 YPO1138 galK galT TRUE 0.996 -3.000 0.370 0.001 N NA
 144583 144584 YPO1138 YPO1139 galT galE TRUE 0.929 10.000 0.053 0.001 N NA
 144584 144585 YPO1139 YPO1140 galE   FALSE 0.034 360.000 0.000 NA   NA
 144585 144586 YPO1140 YPO1142   modF FALSE 0.083 217.000 0.009 NA   NA
 144586 144587 YPO1142 YPO1143 modF modE FALSE 0.268 110.000 0.028 1.000   NA
 144588 144589 YPO1144 YPO1145   modA FALSE 0.147 235.000 0.072 NA   NA
 144589 144590 YPO1145 YPO1146 modA modB TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 144590 144591 YPO1146 YPO1147 modB modC TRUE 0.999 -6.000 0.537 0.001 Y NA
 144595 144596 YPO1151 YPO1152 bioB bioF TRUE 0.997 0.000 0.168 0.002 Y NA
 144596 144597 YPO1152 YPO1153 bioF bioC TRUE 0.996 -16.000 0.133 0.002 Y NA
 144597 144598 YPO1153 YPO1154 bioC bioD TRUE 0.995 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 144600 144601 YPO1156 YPO1157 uvrB   FALSE 0.034 292.000 0.003 NA   NA
 144603 144604 YPO1159 YPO1160 moaA moaC TRUE 0.870 101.000 0.039 0.003 Y NA
 144604 144605 YPO1160 YPO1161 moaC moaD TRUE 0.998 -3.000 0.175 0.003 Y NA
 144605 144606 YPO1161 YPO1162 moaD moaE TRUE 0.999 0.000 0.501 0.003 Y NA
 144606 144607 YPO1162 YPO1163 moaE   FALSE 0.207 143.000 0.025 NA   NA
 144607 144608 YPO1163 YPO1164   tnp FALSE 0.099 235.000 0.000 NA   NA
 144609 144610 YPO1165 YPO1166 betA betB TRUE 0.974 23.000 0.634 1.000 N NA
 144610 144611 YPO1166 YPO1167 betB fabF2 TRUE 0.893 58.000 0.459 1.000 N NA
 144612 144613 YPO1168 YPO1169 betT   FALSE 0.042 232.000 0.000 1.000 N NA
 144615 2201063 YPO1171 YPO1172 xapA xapB' FALSE 0.250 139.000 0.000 NA   NA
 2201063 144616 YPO1172 YPO1173 xapB' tnp FALSE 0.243 146.000 0.000 NA   NA
 144616 144617 YPO1173 YPO1174 tnp   FALSE 0.026 415.000 0.000 NA   NA
 144617 144618 YPO1174 YPO1175     FALSE 0.054 294.000 0.000 NA   NA
 144618 144619 YPO1175 YPO1176   pbpG FALSE 0.006 592.000 0.000 1.000 N NA
 144623 144624 YPO1180 YPO1181     TRUE 0.523 110.000 0.125 NA   NA
 144624 144625 YPO1181 YPO1182     FALSE 0.126 208.000 0.032 1.000   NA
 144625 144626 YPO1182 YPO1183     TRUE 0.995 37.000 0.589 0.002 Y NA
 144626 144627 YPO1183 YPO1184     TRUE 0.977 163.000 0.568 0.001 Y NA
 144627 144628 YPO1184 YPO1185     TRUE 0.999 -3.000 0.491 0.001 Y NA
 144628 144629 YPO1185 YPO1186     FALSE 0.086 246.000 0.000 NA   NA
 144629 144630 YPO1186 YPO1187     FALSE 0.024 435.000 0.000 NA   NA
 144630 144631 YPO1187 YPO1188     TRUE 0.968 124.000 0.654 1.000 Y NA
 144631 144632 YPO1188 YPO1189     TRUE 0.999 0.000 0.758 0.060 Y NA
 144632 144633 YPO1189 YPO1190     TRUE 0.998 -3.000 0.823 1.000   NA
 144633 144634 YPO1190 YPO1191     TRUE 0.963 94.000 0.731 0.022   NA
 144634 144635 YPO1191 YPO1192     FALSE 0.285 115.000 0.000 NA   NA
 144635 144636 YPO1192 YPO1193     TRUE 0.675 24.000 0.000 NA   NA
 2201064 144638 YPO1195 YPO1197     FALSE 0.072 261.000 0.000 NA   NA
 144638 144639 YPO1197 YPO1198     TRUE 0.999 -3.000 0.489 1.000 Y NA
 144639 144640 YPO1198 YPO1199     TRUE 0.999 -3.000 0.542 1.000 Y NA
 144640 144641 YPO1199 YPO1200     FALSE 0.126 478.000 0.000 1.000 Y NA
 144641 144642 YPO1200 YPO1201     TRUE 0.942 70.000 0.286 1.000 Y NA
 144643 144644 YPO1203 YPO1205   ompC2 FALSE 0.027 412.000 0.000 NA   NA
 144650 144651 YPO1211 YPO1212 eco   TRUE 0.520 35.000 0.023 NA   NA
 144651 144652 YPO1212 YPO1213   nrdB TRUE 0.677 4.000 0.034 1.000 N NA
 144652 144653 YPO1213 YPO1214 nrdB nrdA TRUE 0.990 163.000 1.000 0.002 Y NA
 144653 144654 YPO1214 YPO1215 nrdA ubiG FALSE 0.008 494.000 0.000 1.000 N NA
 144655 144656 YPO1216 YPO1217 gyrA rcsC FALSE 0.030 188.000 0.013 1.000 N NA
 144657 2201065 YPO1218 YPO1219 rcsB   TRUE 0.886 3.000 0.000 NA   NA
 2201065 144658 YPO1219 YPO1221     TRUE 0.675 24.000 0.000 NA   NA
 144658 2201066 YPO1221 YPOs05   micF FALSE 0.014 699.000 0.000 NA   NA
 144659 144660 YPO1222 YPO1223 ompC tnp FALSE 0.063 202.000 0.000 1.000 N NA
 144660 5922257 YPO1223 YPt_16 tnp   FALSE 0.025 434.000 0.000 NA   NA
 5922257 5922258 YPt_16 YPt_17     TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   NA
 144661 144662 YPO1224 YPO1226 ampH   FALSE 0.023 275.000 0.000 NA N NA
 144664 144665 YPO1229 YPO1231 tsr2 pla2 FALSE 0.010 422.000 0.000 1.000 N NA
 144665 144666 YPO1231 YPO1232 pla2 msgA FALSE 0.214 172.000 0.000 1.000   NA
 144666 144667 YPO1232 YPO1233 msgA   FALSE 0.144 206.000 0.000 1.000   NA
 144668 144669 YPO1234 YPO1235     FALSE 0.145 202.000 0.000 NA   NA
 144669 144670 YPO1235 YPO1236     TRUE 0.935 -3.000 0.044 NA   NA
 144670 144671 YPO1236 YPO1237     TRUE 0.754 80.000 0.015 1.000 Y NA
 144671 144672 YPO1237 YPO1238     TRUE 0.990 18.000 0.400 1.000 Y NA
 144672 144673 YPO1238 YPO1239     FALSE 0.015 614.000 0.000 NA   NA
 144673 144674 YPO1239 YPO1240     TRUE 0.513 46.000 0.000 NA   NA
 144674 144675 YPO1240 YPO1241     TRUE 0.989 5.000 0.500 NA   NA
 144675 144676 YPO1241 YPO1242     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 144676 144677 YPO1242 YPO1243     TRUE 0.991 22.000 1.000 NA   NA
 144677 144678 YPO1243 YPO1244     TRUE 0.998 2.000 1.000 NA   NA
 144678 144679 YPO1244 YPO1245     TRUE 0.906 121.000 0.667 NA   NA
 144679 144680 YPO1245 YPO1246     FALSE 0.105 267.000 0.074 NA   NA
 144680 144681 YPO1246 YPO1247     TRUE 0.957 -3.000 0.074 NA   NA
 144681 144682 YPO1247 YPO1248     TRUE 0.993 16.000 1.000 NA   NA
 144682 144683 YPO1248 YPO1249     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 144683 144684 YPO1249 YPO1250     TRUE 0.997 4.000 1.000 NA   NA
 144684 144685 YPO1250 YPO1250a     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 144685 144686 YPO1250a YPO1251     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144686 144687 YPO1251 YPO1252   stf FALSE 0.313 97.000 0.000 NA   NA
 144687 144688 YPO1252 YPO1253 stf   FALSE 0.052 298.000 0.000 NA   NA
 144688 144689 YPO1253 YPO1254   bglA FALSE 0.100 291.000 0.000 0.018 N NA
 144690 144691 YPO1255 YPO1257     FALSE 0.014 700.000 0.000 NA   NA
 144691 144692 YPO1257 YPO1258     TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 144692 144693 YPO1258 YPO1259     FALSE 0.035 357.000 0.000 NA   NA
 144693 5922259 YPO1259 YPt_18     TRUE 0.490 50.000 0.000 NA   NA
 5922259 144694 YPt_18 YPO1260     FALSE 0.297 105.000 0.000 NA   NA
 144694 144695 YPO1260 YPO1261     TRUE 0.639 28.000 0.040 NA   NA
 144696 144697 YPO1262 YPO1263   tnp FALSE 0.147 201.000 0.000 NA   NA
 144698 144699 YPO1264 YPO1265 rplY   FALSE 0.325 162.000 0.024 0.014 N NA
 144700 144701 YPO1266 YPO1267 rsuA bcr TRUE 0.445 119.000 0.145 1.000 N NA
 144701 144702 YPO1267 YPO1269 bcr   FALSE 0.012 967.000 0.000 NA   NA
 144703 144704 YPO1270 YPO1271     TRUE 0.997 2.000 0.758 1.000   NA
 144704 144705 YPO1271 YPO1272     TRUE 0.999 0.000 0.833 0.060   NA
 144705 144706 YPO1272 YPO1273     TRUE 0.996 10.000 0.848 0.060   NA
 144706 144707 YPO1273 YPO1274     TRUE 0.804 82.000 0.394 NA N NA
 144707 144708 YPO1274 YPO1275   spr FALSE 0.043 795.000 0.219 NA N NA
 144708 144709 YPO1275 YPO1276 spr   FALSE 0.024 442.000 0.000 NA   NA
 144709 144710 YPO1276 YPO1277     TRUE 0.844 59.000 0.275 NA   NA
 144711 144712 YPO1278 YPO1279     TRUE 0.656 109.000 0.200 NA   NA
 144715 144716 YPO1284 YPO1285   mtr TRUE 0.483 104.000 0.153 1.000 N NA
 144718 144719 YPO1287 YPO1288     TRUE 0.864 11.000 0.000 0.048 N NA
 144719 144720 YPO1288 YPO1289     TRUE 0.969 -3.000 0.017 0.048   NA
 144721 144722 YPO1290 YPO1291     TRUE 0.821 4.000 0.065 1.000 N NA
 144722 144723 YPO1291 YPO1292   rpiA TRUE 0.942 20.000 0.000 1.000 Y NA
 144723 144724 YPO1292 YPO1293 rpiA   TRUE 0.696 132.000 0.000 NA Y NA
 144724 144725 YPO1293 YPO1294     TRUE 0.939 109.000 0.375 NA Y NA
 144725 144726 YPO1294 YPO1295     TRUE 0.990 36.000 0.375 0.012 Y NA
 144728 144729 YPO1298 YPO1299 fruB fruK TRUE 0.993 -3.000 0.112 1.000 Y NA
 144729 144730 YPO1299 YPO1300 fruK fruA TRUE 0.995 15.000 0.562 1.000 Y NA
 144730 144731 YPO1300 YPO1301 fruA psaE FALSE 0.018 325.000 0.000 1.000 N NA
 144731 144732 YPO1301 YPO1302 psaE psaF TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 144732 144733 YPO1302 YPO1303 psaF psaA FALSE 0.017 545.000 0.000 NA   NA
 144733 144734 YPO1303 YPO1304 psaA psaB TRUE 0.807 127.000 0.400 NA   NA
 144734 144735 YPO1304 YPO1305 psaB psaC TRUE 0.885 42.000 0.000 1.000 Y NA
 144736 144737 YPO1306 YPO1307 nfo   FALSE 0.218 164.000 0.040 NA   NA
 144738 144739 YPO1308 YPO1309   lysP FALSE 0.231 258.000 0.222 1.000 N NA
 144739 144740 YPO1309 YPO1310 lysP   FALSE 0.024 286.000 0.000 1.000 N NA
 144740 144741 YPO1310 YPO1311     TRUE 0.756 195.000 0.175 1.000 Y NA
 144741 144742 YPO1311 YPO1312     TRUE 0.999 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 144742 144743 YPO1312 YPO1313     FALSE 0.347 260.000 0.000 1.000 Y NA
 144744 144745 YPO1314 YPO1315     FALSE 0.154 154.000 0.056 1.000 N NA
 144746 144747 YPO1316 YPO1317     FALSE 0.314 228.000 0.174 NA   NA
 144747 144748 YPO1317 YPO1318     TRUE 0.998 -3.000 0.323 NA Y NA
 144748 144749 YPO1318 YPO1319     TRUE 0.993 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 144749 144750 YPO1319 YPO1320   dacC FALSE 0.038 242.000 0.000 1.000 N NA
 144751 144752 YPO1321 YPO1322 sdaC deoR FALSE 0.005 1100.000 0.000 1.000 N NA
 144752 144753 YPO1322 YPO1323 deoR   FALSE 0.031 230.000 0.030 1.000 N NA
 144753 144754 YPO1323 YPO1324     FALSE 0.079 258.000 0.000 1.000   NA
 144754 144755 YPO1324 YPO1325     TRUE 0.909 9.000 0.106 1.000   NA
 144755 144756 YPO1325 YPO1326     FALSE 0.044 333.000 0.000 1.000   NA
 144756 144757 YPO1326 YPO1327   grxA FALSE 0.029 410.000 0.000 1.000   NA
 144758 144759 YPO1328 YPO1329     TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 144759 144760 YPO1329 YPO1330     TRUE 0.823 7.000 0.000 NA   NA
 144760 144761 YPO1330 YPO1331   potF FALSE 0.019 518.000 0.000 NA   NA
 144761 144762 YPO1331 YPO1332 potF potG TRUE 0.959 171.000 0.679 1.000 Y NA
 144762 144763 YPO1332 YPO1333 potG potH TRUE 0.996 25.000 0.857 1.000 Y NA
 144763 144764 YPO1333 YPO1334 potH potI TRUE 0.999 -3.000 0.528 0.059 Y NA
 144764 144765 YPO1334 YPO1335 potI   TRUE 0.713 125.000 0.264 NA   NA
 144765 144766 YPO1335 YPO1336     TRUE 0.559 84.000 0.119 NA   NA
 144767 144768 YPO1338 YPO1339     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144768 144769 YPO1339 YPO1341     FALSE 0.013 776.000 0.000 NA   NA
 144769 144770 YPO1341 YPO1342     FALSE 0.039 341.000 0.000 NA   NA
 144770 144771 YPO1342 YPO1343     FALSE 0.012 367.000 0.000 NA N NA
 144771 144772 YPO1343 YPO1344     TRUE 0.678 151.000 0.000 1.000 Y NA
 144772 144773 YPO1344 YPO1345     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144773 144774 YPO1345 YPO1346     TRUE 0.935 -3.000 0.000 1.000   NA
 144774 144775 YPO1346 YPO1347     TRUE 0.989 -7.000 0.312 NA   NA
 144775 144776 YPO1347 YPO1348     TRUE 0.973 -3.000 0.125 NA   NA
 144777 144778 YPO1349 YPO1350 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.018 Y NA
 144778 144779 YPO1350 YPO1351 artQ artI TRUE 0.993 12.000 0.260 0.082 Y NA
 144779 144780 YPO1351 YPO1352 artI artP TRUE 0.986 21.000 0.323 1.000 Y NA
 144780 144781 YPO1352 YPO1353 artP   FALSE 0.278 295.000 0.000 1.000 Y NA
 144781 144782 YPO1353 YPO1354     FALSE 0.157 170.000 0.018 NA   NA
 144782 144783 YPO1354 YPO1355     TRUE 0.627 97.000 0.167 NA   NA
 144783 144784 YPO1355 YPO1356     TRUE 0.856 100.000 0.022 0.004 Y NA
 144784 144785 YPO1356 YPO1357   ltaA TRUE 0.921 -3.000 0.074 1.000 N NA
 144785 144786 YPO1357 YPO1358 ltaA poxB FALSE 0.199 349.000 0.031 1.000 Y NA
 144786 144787 YPO1358 YPO1359 poxB hcr FALSE 0.052 144.000 0.017 1.000 N NA
 144787 144788 YPO1359 YPO1360 hcr hcp TRUE 0.882 114.000 0.085 0.012 Y NA
 144788 144789 YPO1360 YPO1361 hcp   FALSE 0.124 202.000 0.028 NA   NA
 144792 144793 YPO1364 YPO1365     TRUE 0.996 0.000 0.789 1.000 N NA
 144795 144796 YPO1367 YPO1368   clpA TRUE 0.975 26.000 0.596 NA   NA
 144796 144797 YPO1368 YPO1369 clpA tnp FALSE 0.022 293.000 0.000 1.000 N NA
 144798 144799 YPO1370 YPO1371 infA aat FALSE 0.051 166.000 0.020 1.000 N NA
 144799 144800 YPO1371 YPO1372 aat cydC TRUE 0.497 219.000 0.049 1.000 Y NA
 144800 144801 YPO1372 YPO1373 cydC cydD TRUE 0.999 3.000 0.631 0.006 Y NA
 144801 144802 YPO1373 YPO1374 cydD trxB FALSE 0.150 441.000 0.049 1.000 Y NA
 144803 144804 YPO1375 YPO1376 lrp ftsK TRUE 0.726 123.000 0.345 1.000 N NA
 144804 144805 YPO1376 YPO1377 ftsK lolA TRUE 0.530 193.000 0.305 1.000 N NA
 144805 144806 YPO1377 YPO1378 lolA   TRUE 0.904 11.000 0.167 1.000 N NA
 144806 144807 YPO1378 YPO1379   serS FALSE 0.085 242.000 0.078 1.000 N NA
 144807 144808 YPO1379 YPO1380 serS   FALSE 0.029 263.000 0.000 1.000 N NA
 144811 144812 YPO1383 YPO1384 pflB focA TRUE 0.685 56.000 0.172 1.000 N NA
 144812 144813 YPO1384 YPO1385 focA   FALSE 0.014 697.000 0.000 NA   NA
 144814 144815 YPO1386 YPO1387 ansB   FALSE 0.070 269.000 0.000 1.000   NA
 144815 144816 YPO1387 YPO1388     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 144816 144817 YPO1388 YPO1389   serC FALSE 0.033 367.000 0.000 NA   NA
 144817 144818 YPO1389 YPO1390 serC aroA TRUE 0.643 163.000 0.033 1.000 Y NA
 144818 144819 YPO1390 YPO1391 aroA cmk FALSE 0.139 313.000 0.209 1.000 N NA
 144819 144820 YPO1391 YPO1392 cmk rpsA TRUE 0.557 174.000 0.281 1.000 N NA
 144820 144821 YPO1392 YPO1393 rpsA ihfB TRUE 0.801 61.000 0.292 1.000 N NA
 144821 144822 YPO1393 YPO1394 ihfB   FALSE 0.012 547.000 0.003 1.000   NA
 144822 144823 YPO1394 YPO1395   msbA TRUE 0.828 36.000 0.075 0.079   NA
 144823 144824 YPO1395 YPO1396 msbA lpxK TRUE 0.978 -3.000 0.205 1.000 N NA
 144826 144827 YPO1398 YPO1399 cspB   FALSE 0.011 548.000 0.004 NA   NA
 144827 144828 YPO1399 YPO1400   kdsB TRUE 0.989 -3.000 0.265 NA   NA
 144828 144829 YPO1400 YPO1401 kdsB   FALSE 0.027 363.000 0.023 NA   NA
 144829 144830 YPO1401 YPO1402   smtA FALSE 0.013 773.000 0.000 NA   NA
 144830 144831 YPO1402 YPO1403 smtA mukF TRUE 0.988 -3.000 0.325 NA N NA
 144831 144832 YPO1403 YPO1404 mukF mukE TRUE 0.987 8.000 0.196 NA Y NA
 144832 144833 YPO1404 YPO1405 mukE mukB TRUE 1.000 -3.000 0.786 0.001 Y NA
 144833 144834 YPO1405 YPO1406 mukB tnp FALSE 0.165 216.000 0.000 0.093 N NA
 144834 144835 YPO1406 YPO1407 tnp   FALSE 0.063 284.000 0.000 1.000   NA
 144835 144836 YPO1407 YPO1408     TRUE 0.563 224.000 0.372 NA   NA
 144836 144837 YPO1408 YPO1409     TRUE 0.586 61.000 0.089 NA   NA
 144838 144839 YPO1410 YPO1411 aspC   FALSE 0.031 257.000 0.000 1.000 N NA
 144839 144840 YPO1411 YPO1412   asnS FALSE 0.021 298.000 0.000 1.000 N NA
 144840 144841 YPO1412 YPO1413 asnS pncB FALSE 0.006 499.000 0.034 1.000 N NA
 144842 144843 YPO1414 YPO1415 pepN pyrD FALSE 0.002 618.000 0.014 1.000 N NA
 144843 144844 YPO1415 YPO1416 pyrD   FALSE 0.280 183.000 0.081 NA   NA
 144846 144847 YPO1418 YPO1419   uup TRUE 0.878 6.000 0.061 1.000   NA
 144847 144848 YPO1419 YPO1420 uup pqiA FALSE 0.308 129.000 0.054 NA   NA
 144848 144849 YPO1420 YPO1421 pqiA pqiB TRUE 0.992 14.000 0.819 NA   NA
 144849 144850 YPO1421 YPO1422 pqiB   TRUE 0.996 -3.000 0.531 NA   NA
 144850 144851 YPO1422 YPO1423     TRUE 0.498 49.000 0.000 NA   NA
 144851 144852 YPO1423 YPO1423a   rmf FALSE 0.344 81.000 0.000 NA   NA
 144852 144853 YPO1423a YPO1424 rmf tnp FALSE 0.058 198.000 0.000 NA N NA
 2201068 144854 YPO1428 YPO1426     TRUE 0.891 -1826.000 0.000 NA   NA
 144854 144855 YPO1426 YPO1427     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144857 144858 YPO1430 YPO1431 fabA   TRUE 0.763 69.000 0.290 1.000 N NA
 144860 144861 YPO1434 YPO1435 tnp ompA FALSE 0.074 190.000 0.000 1.000 N NA
 144861 144862 YPO1435 YPO1436 ompA sulA FALSE 0.014 358.000 0.000 1.000 N NA
 144864 144865 YPO1438 YPO1439     TRUE 0.762 30.000 0.090 NA   NA
 144867 144868 YPO1441 YPO1442 mgsA   FALSE 0.227 179.000 0.055 NA   NA
 144870 144871 YPO1444 YPO1445     TRUE 0.721 37.000 0.094 NA   NA
 144874 144875 YPO1451 YPO1452     FALSE 0.355 154.000 0.000 0.025 N NA
 144876 144877 YPO1453 YPO1454     FALSE 0.042 330.000 0.000 NA   NA
 144877 144878 YPO1454 YPO1455     TRUE 0.989 -10.000 0.083 NA Y NA
 144878 144879 YPO1455 YPO1456     TRUE 0.989 -7.000 0.056 1.000 Y NA
 144879 144880 YPO1456 YPO1457     TRUE 0.989 16.000 0.333 1.000 Y NA
 144880 144881 YPO1457 YPO1458     TRUE 0.992 -7.000 0.120 1.000 Y NA
 144881 144882 YPO1458 YPO1459     TRUE 0.996 -7.000 0.120 0.020 Y NA
 144882 144883 YPO1459 YPO1460     TRUE 0.990 3.000 0.051 0.047 Y NA
 144883 144884 YPO1460 YPO1461     TRUE 0.550 39.000 0.000 NA   NA
 144884 144885 YPO1461 YPO1462     TRUE 0.556 38.000 0.000 NA   NA
 144885 144886 YPO1462 YPO1463     FALSE 0.323 99.000 0.000 1.000   NA
 144886 144887 YPO1463 YPO1464     FALSE 0.228 157.000 0.000 NA   NA
 144887 144888 YPO1464 YPO1465     FALSE 0.014 665.000 0.000 NA   NA
 144888 144889 YPO1465 YPO1466     TRUE 0.526 43.000 0.000 NA   NA
 144889 144890 YPO1466 YPO1467     TRUE 0.781 12.000 0.000 NA   NA
 144890 144891 YPO1467 YPO1468     TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 144891 144892 YPO1468 YPO1469     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 144892 144893 YPO1469 YPO1470     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 144893 144894 YPO1470 YPO1471     FALSE 0.051 388.000 0.083 NA   NA
 144894 144895 YPO1471 YPO1472     TRUE 0.954 3.000 0.125 NA   NA
 144895 144896 YPO1472 YPO1473     TRUE 0.969 16.000 0.400 NA   NA
 144896 144897 YPO1473 YPO1474     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144897 144898 YPO1474 YPO1475     FALSE 0.233 154.000 0.000 NA   NA
 144898 144899 YPO1475 YPO1476     TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 144899 144900 YPO1476 YPO1477     TRUE 0.801 173.000 0.500 NA   NA
 144900 144901 YPO1477 YPO1481     FALSE 0.011 2276.000 0.000 NA   NA
 144901 144902 YPO1481 YPO1482     TRUE 0.997 -3.000 0.625 NA   NA
 144902 144903 YPO1482 YPO1483     TRUE 0.733 44.000 0.120 NA   NA
 144903 144904 YPO1483 YPO1484     TRUE 0.912 -9.000 0.040 NA   NA
 144904 144905 YPO1484 YPO1484a     TRUE 0.988 0.000 0.286 NA   NA
 144905 144906 YPO1484a YPO1485     FALSE 0.115 221.000 0.000 NA   NA
 144906 144907 YPO1485 YPO1486     TRUE 0.996 -36.000 0.750 NA   NA
 144907 144908 YPO1486 YPO1487     TRUE 0.951 68.000 0.750 NA   NA
 144908 144909 YPO1487 YPO1488     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 144909 144910 YPO1488 YPO1489     TRUE 0.665 25.000 0.000 NA   NA
 144912 144913 YPO1491 YPO1492     FALSE 0.105 228.000 0.000 NA   NA
 144914 144915 YPO1493 YPO1494   moeB FALSE 0.118 136.000 0.000 1.000 N NA
 144915 144916 YPO1494 YPO1495 moeB moeA TRUE 0.997 5.000 0.323 0.003 Y NA
 144916 144917 YPO1495 YPO1496 moeA   FALSE 0.019 535.000 0.000 1.000   NA
 144917 144918 YPO1496 YPO1497     TRUE 0.893 10.000 0.094 1.000   NA
 144918 144919 YPO1497 YPO1498     TRUE 0.912 2.000 0.094 1.000 N NA
 144919 144920 YPO1498 YPO1499     TRUE 0.993 2.000 0.500 NA   NA
 144920 144921 YPO1499 YPO1500     FALSE 0.339 84.000 0.000 NA   NA
 144921 144922 YPO1500 YPO1501     FALSE 0.075 257.000 0.000 NA   NA
 144922 144923 YPO1501 YPO1502     TRUE 0.942 21.000 0.273 1.000   NA
 144923 144924 YPO1502 YPO1503     TRUE 0.533 280.000 0.636 1.000 N NA
 144925 144926 YPO1504 YPO1505   folE TRUE 0.581 184.000 0.250 NA   NA
 144926 144927 YPO1505 YPO1506 folE   TRUE 0.962 55.000 0.719 NA   NA
 144927 144928 YPO1506 YPO1507   tnpA_1 FALSE 0.013 748.000 0.000 NA   NA
 144928 144929 YPO1507 YPO1508 tnpA_1 mglA TRUE 0.728 230.000 0.250 NA Y NA
 144929 144930 YPO1508 YPO1509 mglA mglC TRUE 0.997 21.000 0.905 1.000 Y NA
 144931 144932 YPO1510 YPO1511   sfcA FALSE 0.064 281.000 0.045 NA   NA
 144932 144933 YPO1511 YPO1512 sfcA cdd FALSE 0.008 356.000 0.022 1.000 N NA
 144933 144934 YPO1512 YPO1513 cdd   FALSE 0.119 326.000 0.198 NA N NA
 144934 144935 YPO1513 YPO1514     TRUE 0.992 -3.000 0.340 NA   NA
 144935 144936 YPO1514 YPO1515     FALSE 0.178 242.000 0.021 0.078   NA
 144936 144937 YPO1515 YPO1516     FALSE 0.041 333.000 0.000 NA   NA
 144937 144938 YPO1516 YPO1517     TRUE 0.922 15.000 0.177 NA   NA
 144940 144941 YPO1519 YPO1520     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144944 144945 YPO1523 YPO1524   udk FALSE 0.076 245.000 0.073 1.000 N NA
 144945 144946 YPO1524 YPO1525 udk dcd TRUE 0.813 105.000 0.098 1.000 Y NA
 144946 144947 YPO1525 YPO1526 dcd   FALSE 0.108 187.000 0.057 NA N NA
 144949 144950 YPO1528 YPO1529     FALSE 0.235 152.000 0.000 NA   NA
 144950 144951 YPO1529 YPO1530   alcA TRUE 0.964 35.000 0.667 1.000 N NA
 144951 144952 YPO1530 YPO1531 alcA alcB TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA N NA
 144952 144953 YPO1531 YPO1532 alcB   TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA N NA
 144954 144955 YPO1533 YPO1534     TRUE 0.999 -3.000 0.583 1.000 Y NA
 144955 144956 YPO1534 YPO1535     TRUE 0.999 -13.000 0.818 0.058 Y NA
 144956 144957 YPO1535 YPO1536     TRUE 0.998 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 144957 144958 YPO1536 YPO1537     TRUE 0.948 90.000 0.364 1.000 Y NA
 144958 144959 YPO1537 YPO1538     TRUE 0.775 213.000 0.455 0.002 N NA
 144960 144961 YPO1539 YPO1540 galU galF TRUE 0.933 84.000 0.111 0.001 Y NA
 144961 144962 YPO1540 YPO1541 galF gnd FALSE 0.012 386.000 0.000 1.000 N NA
 144963 144964 YPO1542 YPO1543 hisI hisF TRUE 0.999 -6.000 0.430 0.003 Y NA
 144964 144965 YPO1543 YPO1544 hisF hisA TRUE 0.999 -18.000 0.433 0.003 Y NA
 144965 144966 YPO1544 YPO1545 hisA hisH TRUE 0.995 6.000 0.210 0.003 Y NA
 144966 144967 YPO1545 YPO1546 hisH hisB TRUE 0.997 0.000 0.128 0.003 Y NA
 144967 144968 YPO1546 YPO1547 hisB hisC TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 144968 144969 YPO1547 YPO1548 hisC hisD TRUE 0.998 3.000 0.294 0.003 Y NA
 144969 144970 YPO1548 YPO1549 hisD hisG TRUE 0.995 4.000 0.171 0.003 Y NA
 144971 144972 YPO1550 YPO1551     FALSE 0.029 392.000 0.000 NA   NA
 144973 144974 YPO1552 YPO1553     FALSE 0.088 245.000 0.000 NA   NA
 144974 2201069 YPO1553 YPO1554     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144975 144976 YPO1556 YPO1557     FALSE 0.009 460.000 0.000 1.000 N NA
 11424671 144976   YPO1557     FALSE NA 495.000 0.000 NA   NA
 11567034 144976   YPO1557     FALSE NA 495.000 0.000 NA   NA
 11709426 144976   YPO1557     FALSE NA 495.000 0.000 NA   NA
 11424672 144976   YPO1557     FALSE NA 523.000 0.000 NA   NA
 11567035 144976   YPO1557     FALSE NA 523.000 0.000 NA   NA
 11709427 144976   YPO1557     FALSE NA 523.000 0.000 NA   NA
 11424673 144976   YPO1557     FALSE NA 555.000 0.000 NA   NA
 11567036 144976   YPO1557     FALSE NA 555.000 0.000 NA   NA
 11709428 144976   YPO1557     FALSE NA 555.000 0.000 NA   NA
 11424674 144976   YPO1557     FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11567037 144976   YPO1557     FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11709429 144976   YPO1557     FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11424675 144976   YPO1557     FALSE NA 615.000 0.000 NA   NA
 11567038 144976   YPO1557     FALSE NA 615.000 0.000 NA   NA
 11709430 144976   YPO1557     FALSE NA 615.000 0.000 NA   NA
 11424676 144976   YPO1557     FALSE NA 643.000 0.000 NA   NA
 11567039 144976   YPO1557     FALSE NA 643.000 0.000 NA   NA
 11709431 144976   YPO1557     FALSE NA 643.000 0.000 NA   NA
 11424677 144976   YPO1557     FALSE NA 675.000 0.000 NA   NA
 11567040 144976   YPO1557     FALSE NA 675.000 0.000 NA   NA
 11709432 144976   YPO1557     FALSE NA 675.000 0.000 NA   NA
 144978 144979 YPO1559 YPO1560     FALSE 0.025 434.000 0.000 NA   NA
 144980 144981 YPO1561 YPO1563     FALSE 0.004 4044.000 0.000 1.000 N NA
 144983 144984 YPO1565 YPO1566     TRUE 0.983 48.000 0.333 0.046 Y NA
 144984 144985 YPO1566 YPO1567     TRUE 0.942 32.000 0.290 0.020 N NA
 144985 144986 YPO1567 YPO1568     FALSE 0.347 79.000 0.000 NA   NA
 144986 144987 YPO1568 YPO1569   lldD TRUE 0.517 45.000 0.000 NA   NA
 144990 144991 YPO1572 YPO1573     TRUE 0.721 36.000 0.136 1.000 N NA
 144992 144993 YPO1574 YPO1575     FALSE 0.282 117.000 0.000 NA   NA
 5922261 144994 YPt_20 YPO1576     FALSE 0.023 446.000 0.000 NA   NA
 144994 144995 YPO1576 YPO1577     FALSE 0.031 258.000 0.000 1.000 N NA
 144995 144996 YPO1577 YPO1578     TRUE 0.997 20.000 0.905 NA Y NA
 144996 144997 YPO1578 YPO1579     TRUE 0.983 124.000 0.947 NA Y NA
 144999 2201071 YPO1581 YPO1582   lacY FALSE 0.350 78.000 0.000 NA   NA
 145002 145003 YPO1586 YPO1587 dinI pyrC FALSE 0.040 313.000 0.031 NA   NA
 145005 145006 YPO1589 YPO1590   rne FALSE 0.155 96.000 0.000 1.000 N NA
 145007 145008 YPO1591 YPO1592   tnp FALSE 0.050 220.000 0.000 1.000 N NA
 145010 145011 YPO1594 YPO1595     TRUE 0.986 13.000 0.599 NA   NA
 145011 145012 YPO1595 YPO1596     TRUE 0.929 34.000 0.418 1.000 N NA
 145012 145013 YPO1596 YPO1597   fabH TRUE 0.997 7.000 0.380 0.004 Y NA
 145013 145014 YPO1597 YPO1598 fabH inv TRUE 0.978 38.000 0.182 0.004 Y NA
 145014 145015 YPO1598 YPO1599 inv fabG TRUE 0.997 14.000 0.432 0.004 Y NA
 145015 145016 YPO1599 YPO1600 fabG acpP TRUE 0.951 154.000 0.321 0.004 Y NA
 145016 145017 YPO1600 YPO1601 acpP fabF TRUE 0.943 95.000 0.346 1.000 Y NA
 145017 145018 YPO1601 YPO1602 fabF tnp FALSE 0.065 200.000 0.000 1.000 N NA
 145018 145019 YPO1602 YPO1603 tnp   FALSE 0.011 416.000 0.000 1.000 N NA
 145019 145020 YPO1603 YPO1604     FALSE 0.220 289.000 0.204 NA   NA
 145020 145021 YPO1604 YPO1605   tmk TRUE 0.980 -10.000 0.209 NA   NA
 145021 145022 YPO1605 YPO1606 tmk holB TRUE 0.974 0.000 0.211 1.000 N NA
 145022 145023 YPO1606 YPO1607 holB   TRUE 0.969 15.000 0.110 NA Y NA
 145023 145024 YPO1607 YPO1608   ptsG FALSE 0.003 306.000 0.004 NA N NA
 145024 145025 YPO1608 YPO1609 ptsG tnp FALSE 0.074 190.000 0.000 1.000 N NA
 145025 145026 YPO1609 YPO1610 tnp aroE FALSE 0.009 443.000 0.000 1.000 N NA
 145026 145027 YPO1610 YPO1611 aroE   FALSE 0.023 174.000 0.003 1.000 N NA
 145027 145028 YPO1611 YPO1612     TRUE 0.623 35.000 0.051 NA   NA
 145028 145029 YPO1612 YPO1613     TRUE 0.951 41.000 0.516 NA   NA
 145029 145030 YPO1613 YPO1614     TRUE 0.904 41.000 0.310 NA   NA
 145030 145031 YPO1614 YPO1615     FALSE 0.316 71.000 0.069 1.000 N NA
 145031 145032 YPO1615 YPO1616     FALSE 0.411 128.000 0.091 NA   NA
 145032 145033 YPO1616 YPO1617     FALSE 0.041 375.000 0.057 NA   NA
 145033 145034 YPO1617 YPO1618     FALSE 0.205 171.000 0.000 NA   NA
 145034 145035 YPO1618 YPO1619     FALSE 0.200 173.000 0.000 NA   NA
 145035 145036 YPO1619 YPO1620     TRUE 0.816 8.000 0.000 NA   NA
 145036 145037 YPO1620 YPO1621     FALSE 0.317 96.000 0.000 NA   NA
 145038 145039 YPO1622 YPO1623     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145042 145043 YPO1626 YPO1627     TRUE 0.982 -7.000 0.175 0.079 N NA
 145043 145044 YPO1627 YPO1628     TRUE 0.979 -3.000 0.125 0.079 N NA
 145044 145045 YPO1628 YPO1629     TRUE 0.905 19.000 0.225 1.000 N NA
 145045 145046 YPO1629 YPO1630     TRUE 0.690 194.000 0.119 1.000 Y NA
 145046 145047 YPO1630 YPO1631     FALSE 0.008 330.000 0.019 1.000 N NA
 145048 145049 YPO1632 YPO1633   phoQ TRUE 0.860 84.000 0.408 NA   NA
 145049 145050 YPO1633 YPO1634 phoQ phoP TRUE 0.999 6.000 0.940 1.000 Y NA
 145050 145051 YPO1634 YPO1635 phoP   FALSE 0.138 211.000 0.000 1.000   NA
 145051 145052 YPO1635 YPO1636   purB FALSE 0.120 188.000 0.002 1.000   NA
 145052 145053 YPO1636 YPO1637 purB   TRUE 0.592 61.000 0.093 NA   NA
 145053 145054 YPO1637 YPO1638     TRUE 0.765 58.000 0.180 NA   NA
 145054 145055 YPO1638 YPO1639   fcuA FALSE 0.328 187.000 0.158 1.000 N NA
 145055 145056 YPO1639 YPO1640 fcuA   TRUE 0.969 -7.000 0.182 1.000 N NA
 145058 145059 YPO1642 YPO1643     FALSE 0.063 276.000 0.000 NA   NA
 145059 145060 YPO1643 YPO1644     TRUE 0.507 120.000 0.125 NA   NA
 145060 145061 YPO1644 YPO1645     FALSE 0.005 920.000 0.000 1.000 N NA
 145062 2201073 YPO1646 YPO1647     TRUE 0.591 34.000 0.000 NA   NA
 2201073 145063 YPO1647 YPO1648     FALSE 0.051 301.000 0.000 NA   NA
 145064 145065 YPO1649 YPO1650     FALSE 0.056 291.000 0.000 NA   NA
 145065 145066 YPO1650 YPO1651     FALSE 0.348 89.000 0.045 NA   NA
 145066 145067 YPO1651 YPO1652     FALSE 0.020 491.000 0.000 NA   NA
 145067 145068 YPO1652 YPO1653     FALSE 0.059 283.000 0.000 NA   NA
 145068 145069 YPO1653 YPO1654   lacZ FALSE 0.011 407.000 0.000 1.000 N NA
 145070 145071 YPO1655 YPO1656     FALSE 0.238 215.000 0.105 NA   NA
 145072 145073 YPO1659 YPO1660   mgtC FALSE 0.040 340.000 0.000 NA   NA
 145073 145074 YPO1660 YPO1661 mgtC mgtB FALSE 0.040 401.000 0.065 NA   NA
 145074 2201076 YPO1661 YPO1662 mgtB flhD FALSE 0.012 1179.000 0.000 NA   NA
 2201076 145075 YPO1662 YPO1663 flhD flhC TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 145075 145076 YPO1663 YPO1664 flhC motA TRUE 0.663 205.000 0.408 1.000   NA
 145076 145077 YPO1664 YPO1665 motA motB TRUE 0.998 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 145077 145078 YPO1665 YPO1666 motB cheA TRUE 0.998 11.000 0.913 1.000 Y NA
 145078 145079 YPO1666 YPO1667 cheA cheW TRUE 0.965 163.000 0.447 0.003 Y NA
 145080 145081 YPO1668 YPO1669     TRUE 0.965 13.000 0.400 NA N NA
 145081 145082 YPO1669 YPO1670     TRUE 0.991 -3.000 0.400 NA N NA
 145083 145084 YPO1671 YPO1672     FALSE 0.021 475.000 0.000 NA   NA
 145084 145085 YPO1672 YPO1673     FALSE 0.018 528.000 0.000 NA   NA
 145085 145086 YPO1673 YPO1674     FALSE 0.374 69.000 0.000 NA   NA
 145086 145087 YPO1674 YPO1675   cheD FALSE 0.094 241.000 0.000 NA   NA
 145087 2201077 YPO1675 YPO1676 cheD   FALSE 0.180 184.000 0.000 NA   NA
 2201077 145088 YPO1676 YPO1678   cheR FALSE 0.200 173.000 0.000 NA   NA
 145088 145089 YPO1678 YPO1679 cheR cheB TRUE 0.991 0.000 0.087 1.000 Y NA
 145089 145090 YPO1679 YPO1680 cheB cheY TRUE 0.959 101.000 0.286 0.010 Y NA
 145090 145091 YPO1680 YPO1681 cheY cheZ TRUE 0.993 10.000 0.333 1.000 Y NA
 145093 2201078 YPO1683 YPO1684     FALSE 0.035 357.000 0.000 NA   NA
 2201078 145094 YPO1684 YPO1686     FALSE 0.305 100.000 0.000 NA   NA
 145096 145097 YPO1688 YPO1689     FALSE 0.029 393.000 0.000 NA   NA
 145097 145098 YPO1689 YPO1690     FALSE 0.231 155.000 0.000 NA   NA
 145099 145100 YPO1691 YPO1692     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145102 145103 YPO1694 YPO1695     FALSE 0.133 208.000 0.000 NA   NA
 145103 145104 YPO1695 YPO1696     TRUE 0.864 206.000 0.848 NA   NA
 145104 145105 YPO1696 YPO1697     TRUE 0.967 188.000 0.879 NA Y NA
 145105 145106 YPO1697 YPO1698     TRUE 0.892 31.000 0.219 NA   NA
 145106 145107 YPO1698 YPO1699     TRUE 0.985 21.000 0.714 NA   NA
 145107 145108 YPO1699 YPO1700     TRUE 0.957 6.000 0.192 NA   NA
 145108 145109 YPO1700 YPO1701     FALSE 0.021 479.000 0.000 NA   NA
 145109 145110 YPO1701 YPO1702     TRUE 0.997 -31.000 0.840 NA   NA
 145111 145112 YPO1703 YPO1704     TRUE 0.805 96.000 0.081 NA Y NA
 145112 145113 YPO1704 YPO1705     TRUE 0.929 20.000 0.304 NA N NA
 145113 145114 YPO1705 YPO1706     FALSE 0.038 474.000 0.042 0.023 N NA
 145114 145115 YPO1706 YPO1707     FALSE 0.006 658.000 0.000 1.000 N NA
 145115 145116 YPO1707 YPO1708     TRUE 0.970 153.000 0.750 1.000 Y NA
 145116 145117 YPO1708 YPO1709     TRUE 0.982 82.000 0.750 1.000 Y NA
 145117 145118 YPO1709 YPO1710     TRUE 0.995 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 145118 145119 YPO1710 YPO1711     TRUE 0.995 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 145121 145122 YPO1713 YPO1714 ogl kdgR FALSE 0.120 187.000 0.059 1.000 N NA
 145122 145123 YPO1714 YPO1715 kdgR hutC1 FALSE 0.012 385.000 0.000 1.000 N NA
 145124 145125 YPO1716 YPO1717     FALSE 0.278 198.000 0.102 NA   NA
 145125 145126 YPO1717 YPO1718     FALSE 0.020 480.000 0.000 NA   NA
 145126 145127 YPO1718 YPO1719     FALSE 0.129 298.000 0.000 0.057   NA
 145127 145128 YPO1719 YPO1720     TRUE 0.980 16.000 0.101 0.057 Y NA
 145128 145129 YPO1720 YPO1721     TRUE 0.985 14.000 0.131 0.057 Y NA
 145129 145130 YPO1721 YPO1722     TRUE 1.000 -7.000 0.917 0.057 Y NA
 145130 145131 YPO1722 YPO1723   pelW TRUE 0.860 41.000 0.217 1.000   NA
 145131 145132 YPO1723 YPO1724 pelW kduD1 FALSE 0.043 336.000 0.000 1.000   NA
 145132 145133 YPO1724 YPO1725 kduD1 kduI TRUE 0.595 92.000 0.192 1.000 N NA
 2201079 145134 YPO1726 YPO1727 kdgF   FALSE 0.364 72.000 0.000 NA   NA
 145134 2201080 YPO1727 YPO1728     FALSE 0.021 475.000 0.000 NA   NA
 2201080 145135 YPO1728 YPO1729     TRUE 0.891 -1923.000 0.000 NA   NA
 145135 145136 YPO1729 YPO1730     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5922262 145137 YPt_21 YPO1732     FALSE 0.193 178.000 0.000 NA   NA
 145137 145138 YPO1732 YPO1733     FALSE 0.029 390.000 0.000 NA   NA
 145138 145139 YPO1733 YPO1734     FALSE 0.096 237.000 0.000 NA   NA
 145139 145140 YPO1734 YPO1735     FALSE 0.080 103.000 0.021 1.000 N NA
 145145 145146 YPO1740 YPO1741     FALSE 0.168 263.000 0.125 NA   NA
 145146 145147 YPO1741 YPO1742     TRUE 0.934 43.000 0.429 NA   NA
 145147 145148 YPO1742 YPO1743     TRUE 0.576 237.000 0.429 NA   NA
 145150 145151 YPO1745 YPO1746     TRUE 0.891 43.000 0.286 NA   NA
 145154 2201081 YPO1749 YPO1752     FALSE 0.113 222.000 0.000 NA   NA
 145155 145156 YPO1750 YPO1751   kdgF TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145156 145157 YPO1751 YPO1753 kdgF   FALSE 0.004 2452.000 0.000 1.000 N NA
 145158 145159 YPO1754 YPO1755     FALSE 0.025 429.000 0.000 NA   NA
 145159 145160 YPO1755 YPO1756   manZ TRUE 0.849 200.000 0.755 NA   NA
 145160 145161 YPO1756 YPO1757 manZ manY TRUE 0.999 7.000 0.939 0.009 Y NA
 145161 145162 YPO1757 YPO1758 manY manX TRUE 0.892 92.000 0.064 0.009 Y NA
 2201082 145165 YPO1761 YPO1763 hpaG hpaE TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 145165 145166 YPO1763 YPO1764 hpaE hpaD TRUE 0.812 119.000 0.378 1.000   NA
 145166 145167 YPO1764 YPO1765 hpaD hpaF TRUE 0.948 25.000 0.330 1.000   NA
 145167 145168 YPO1765 YPO1766 hpaF hpaH TRUE 0.984 -6.000 0.282 1.000 N NA
 145168 145169 YPO1766 YPO1767 hpaH hpaI TRUE 0.973 11.000 0.439 1.000 N NA
 145169 145170 YPO1767 YPO1768 hpaI hpaX TRUE 0.969 26.000 0.175 1.000 Y NA
 145170 145171 YPO1768 YPO1769 hpaX hpaB FALSE 0.195 68.000 0.000 1.000 N NA
 145171 145172 YPO1769 YPO1770 hpaB hpaC TRUE 0.972 21.000 0.226 0.001   NA
 145173 145174 YPO1771 YPO1772     FALSE 0.147 708.000 0.409 1.000   NA
 145174 145175 YPO1772 YPO1773     TRUE 0.972 -3.000 0.116 1.000   NA
 145178 145179 YPO1776 YPO1777 dbpA   FALSE 0.245 94.000 0.014 NA   NA
 145179 145180 YPO1777 YPO1778     TRUE 0.592 40.000 0.053 NA   NA
 145180 145181 YPO1778 YPO1779     FALSE 0.354 92.000 0.048 NA   NA
 145181 145182 YPO1779 YPO1780   ptrB FALSE 0.047 310.000 0.000 NA   NA
 145182 145183 YPO1780 YPO1781 ptrB pip FALSE 0.039 722.000 0.000 0.023   NA
 145185 145186 YPO1783 YPO1784 ftnA   FALSE 0.026 397.000 0.029 1.000   NA
 145186 145187 YPO1784 YPO1785     TRUE 0.994 3.000 0.613 1.000   NA
 145187 145188 YPO1785 YPO1786     TRUE 0.936 82.000 0.704 NA   NA
 145188 145189 YPO1786 YPO1787     FALSE 0.061 280.000 0.000 NA   NA
 145190 145191 YPO1788 YPO1789 cheM   TRUE 0.998 -6.000 0.800 NA   NA
 145192 145193 YPO1790 YPO1791 flhB flhA TRUE 0.998 0.000 0.287 0.013 Y NA
 145193 145194 YPO1791 YPO1792 flhA flhD TRUE 0.979 0.000 0.053 0.003   NA
 145194 2201083 YPO1792 YPO1793 flhD inv FALSE 0.015 610.000 0.000 NA   NA
 2201083 145195 YPO1793 YPO1794 inv tnp TRUE 0.892 -1506.000 0.000 NA   NA
 145196 145197 YPO1796 YPO1797 flgN flgM TRUE 0.995 19.000 0.361 0.003 Y NA
 145197 145198 YPO1797 YPO1798 flgM flgA TRUE 0.907 151.000 0.330 NA Y NA
 145199 145200 YPO1799 YPO1800 flgB flgC TRUE 0.999 6.000 0.824 0.006 Y NA
 145200 145201 YPO1800 YPO1801 flgC flgD TRUE 0.981 15.000 0.186 1.000 Y NA
 145201 145202 YPO1801 YPO1802 flgD flgE TRUE 0.536 202.000 0.000 1.000 Y NA
 145202 145203 YPO1802 YPO1803 flgE flgF TRUE 0.979 22.000 0.095 0.007 Y NA
 145203 145204 YPO1803 YPO1804 flgF flgG TRUE 0.999 -19.000 0.420 0.001 Y NA
 145204 145205 YPO1804 YPO1805 flgG flgH TRUE 0.893 144.000 0.268 1.000 Y NA
 145205 145206 YPO1805 YPO1806 flgH flgI TRUE 0.982 15.000 0.085 0.012 Y NA
 145206 145207 YPO1806 YPO1807 flgI flgJ TRUE 0.994 0.000 0.048 0.012 Y NA
 145207 145208 YPO1807 YPO1808 flgJ flgK TRUE 0.713 871.000 0.705 0.003 Y NA
 145208 145209 YPO1808 YPO1809 flgK flgL TRUE 0.928 106.000 0.142 0.002 Y NA
 145211 145212 YPO1811 YPO1812     FALSE 0.253 148.000 0.000 1.000   NA
 145212 145213 YPO1812 YPO1813     TRUE 0.995 43.000 1.000 NA Y NA
 145213 145214 YPO1813 YPO1814     TRUE 0.811 66.000 0.000 NA Y NA
 145214 145215 YPO1814 YPO1815     TRUE 0.960 96.000 0.286 0.012 Y NA
 145215 145216 YPO1815 YPO1816     TRUE 0.867 49.000 0.000 NA Y NA
 145217 145218 YPO1817 YPO1818     TRUE 0.517 45.000 0.000 NA   NA
 145218 145219 YPO1818 YPO1819   fliR TRUE 0.938 21.000 0.000 NA Y NA
 145219 145220 YPO1819 YPO1820a fliR fliQ TRUE 0.993 3.000 0.069 0.003 Y NA
 145220 145221 YPO1820a YPO1820 fliQ fliP TRUE 0.990 106.000 0.827 0.013 Y NA
 145221 145222 YPO1820 YPO1821 fliP fliO TRUE 0.996 -3.000 0.203 1.000 Y NA
 145222 145223 YPO1821 YPO1822 fliO fliN TRUE 0.926 168.000 0.443 1.000 Y NA
 145223 145224 YPO1822 YPO1823 fliN hutC2 TRUE 0.998 -3.000 0.137 0.002 Y NA
 145224 145225 YPO1823 YPO1824 hutC2 fliL TRUE 0.999 6.000 0.957 0.002 Y NA
 145225 145226 YPO1824 YPO1825 fliL fliK TRUE 0.455 267.000 0.119 1.000 Y NA
 145226 145227 YPO1825 YPO1826 fliK fliJ TRUE 0.999 -3.000 0.317 0.010 Y NA
 145227 145228 YPO1826 YPO1827 fliJ fabH1 TRUE 0.793 100.000 0.073 1.000 Y NA
 145228 145229 YPO1827 YPO1828 fabH1 fliH TRUE 0.990 -37.000 0.115 1.000 Y NA
 145229 145230 YPO1828 YPO1829 fliH fliG TRUE 0.993 -7.000 0.007 0.006 Y NA
 145230 145231 YPO1829 YPO1830 fliG fliF TRUE 0.998 -3.000 0.220 0.010 Y NA
 145232 145233 YPO1831 YPO1832 fliE   FALSE 0.071 262.000 0.000 NA   NA
 145233 145234 YPO1832 YPO1833     TRUE 0.719 11.000 0.013 NA   NA
 145235 2201084 YPO1834 YPO1835     FALSE 0.222 161.000 0.000 NA   NA
 2201084 145236 YPO1835 YPO1837     FALSE 0.036 354.000 0.000 NA   NA
 145236 145237 YPO1837 YPO1838     TRUE 0.823 7.000 0.000 NA   NA
 145237 145238 YPO1838 YPO1839   fliT TRUE 0.461 55.000 0.000 NA   NA
 145238 145239 YPO1839 YPO1840 fliT fliS TRUE 0.971 11.000 0.324 1.000   NA
 145239 145240 YPO1840 YPO1841 fliS fliD TRUE 0.995 11.000 0.284 0.003 Y NA
 145241 145242 YPO1842 YPO1843 fliC fliA FALSE 0.015 347.000 0.000 1.000 N NA
 145242 145243 YPO1843 YPO1844 fliA fliZ FALSE 0.234 222.000 0.108 1.000   NA
 145243 145244 YPO1844 YPO1845 fliZ   FALSE 0.081 289.000 0.062 1.000   NA
 145244 145245 YPO1845 YPO1846   fliY TRUE 0.950 124.000 0.469 1.000 Y NA
 145245 145246 YPO1846 YPO1847 fliY   TRUE 0.995 0.000 0.100 0.078 Y NA
 145246 145247 YPO1847 YPO1848     TRUE 0.991 3.000 0.150 1.000 Y NA
 145248 145249 YPO1849 YPO1850     TRUE 0.662 34.000 0.061 NA   NA
 145249 145250 YPO1850 YPO1851   putA FALSE 0.022 464.000 0.000 NA   NA
 145251 145252 YPO1852 YPO1853   putP TRUE 0.624 30.000 0.000 NA   NA
 145252 145253 YPO1853 YPO1854 putP   FALSE 0.017 333.000 0.000 1.000 N NA
 145253 145254 YPO1854 YPO1855     TRUE 0.983 30.000 0.356 NA Y NA
 145254 145255 YPO1855 YPO1856     TRUE 0.993 11.000 0.378 NA Y NA
 5922263 145259 YPt_22 YPO1860     FALSE 0.014 687.000 0.000 NA   NA
 145262 145263 YPO1863 YPO1864     FALSE 0.395 128.000 0.085 NA   NA
 145264 145265 YPO1865 YPO1866 uvrY uvrC TRUE 0.962 -28.000 0.086 0.033 N NA
 145265 145266 YPO1866 YPO1867 uvrC pgsA TRUE 0.753 59.000 0.227 1.000 N NA
 145266 5922264 YPO1867 YPt_23 pgsA   FALSE 0.244 145.000 0.000 NA   NA
 5922264 5922265 YPt_23 YPt_24     TRUE 0.475 53.000 0.000 NA   NA
 5922265 5922266 YPt_24 YPt_25     TRUE 0.790 11.000 0.000 NA   NA
 145268 145269 YPO1869 YPO1870     FALSE 0.033 369.000 0.000 NA   NA
 145270 145271 YPO1871 YPO1872     TRUE 0.632 29.000 0.000 NA   NA
 145271 145272 YPO1872 YPO1873   tnpA FALSE 0.117 220.000 0.000 NA   NA
 145272 145273 YPO1873 YPO1874 tnpA   TRUE 0.942 72.000 0.521 0.088   NA
 145273 145274 YPO1874 YPO1875     FALSE 0.339 84.000 0.000 NA   NA
 145274 145275 YPO1875 YPO1876     FALSE 0.215 165.000 0.000 NA   NA
 145275 145276 YPO1876 YPO1877     TRUE 0.844 5.000 0.000 NA   NA
 145276 145277 YPO1877 YPO1878     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 145277 145278 YPO1878 YPO1879     FALSE 0.024 435.000 0.000 NA   NA
 145278 145279 YPO1879 YPO1880     TRUE 0.725 17.000 0.000 NA   NA
 145279 145280 YPO1880 YPO1881     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 145281 2201085 YPO1882 YPO1883     FALSE 0.395 66.000 0.000 NA   NA
 2201085 2201086 YPO1883 YPO1884     TRUE 0.504 48.000 0.000 NA   NA
 145282 145283 YPO1886 YPO1887     TRUE 0.781 12.000 0.000 NA   NA
 145284 145285 YPO1889 YPO1890     FALSE 0.174 187.000 0.000 NA   NA
 145287 145288 YPO1892 YPO1893     TRUE 0.640 30.000 0.000 1.000   NA
 145288 145289 YPO1893 YPO1894     TRUE 0.883 67.000 0.000 0.056 Y NA
 145289 145290 YPO1894 YPO1895     TRUE 0.993 -7.000 0.000 0.056 Y NA
 145290 145291 YPO1895 YPO1896     TRUE 0.931 25.000 0.000 1.000 Y NA
 145292 145293 YPO1897 YPO1898     TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 145293 145294 YPO1898 YPO1899     FALSE 0.161 194.000 0.000 NA   NA
 145295 145296 YPO1900 YPO1901     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145297 145298 YPO1902 YPO1903     TRUE 0.988 6.000 0.500 NA   NA
 145298 145299 YPO1903 YPO1904     TRUE 0.711 19.000 0.000 NA   NA
 145299 145300 YPO1904 YPO1905     TRUE 0.522 44.000 0.000 NA   NA
 145300 145301 YPO1905 YPO1905a     TRUE 0.816 8.000 0.000 NA   NA
 145301 145302 YPO1905a YPO1906   fyuA FALSE 0.012 873.000 0.000 NA   NA
 145302 145303 YPO1906 YPO1907 fyuA ybtE FALSE 0.370 131.000 0.125 1.000 N NA
 145303 145304 YPO1907 YPO1908 ybtE ybtT TRUE 0.984 4.000 0.094 1.000 Y NA
 145304 145305 YPO1908 YPO1909 ybtT ybtU TRUE 0.998 -3.000 0.406 1.000 Y NA
 145305 145306 YPO1909 YPO1910 ybtU irp1 TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.023 Y NA
 145306 145307 YPO1910 YPO1911 irp1 irp2 TRUE 0.944 88.000 0.158 0.002 Y NA
 145307 145308 YPO1911 YPO1912 irp2 ybtA TRUE 0.571 191.000 0.333 1.000 N NA
 145309 145310 YPO1913 YPO1914 ybtP ybtQ TRUE 1.000 -13.000 0.913 0.005 Y NA
 145310 145311 YPO1914 YPO1915 ybtQ ybtX TRUE 0.951 -7.000 0.130 NA N NA
 145311 145312 YPO1915 YPO1916 ybtX ybtS TRUE 0.820 28.000 0.176 NA N NA
 145313 5922267 YPO1917 YPt_26 int   FALSE 0.221 162.000 0.000 NA   NA
 5922267 145314 YPt_26 YPO1918     FALSE 0.050 303.000 0.000 NA   NA
 145314 145315 YPO1918 YPO1919     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 145315 145316 YPO1919 YPO1920     TRUE 0.986 16.000 0.667 NA   NA
 145316 145317 YPO1920 YPO1921     TRUE 0.982 49.000 0.500 1.000 Y NA
 145317 145318 YPO1921 YPO1922     TRUE 0.875 93.000 0.154 1.000 Y NA
 145318 2201087 YPO1922 YPO1923     FALSE 0.019 513.000 0.000 NA   NA
 2201087 145319 YPO1923 YPO1925     FALSE 0.310 98.000 0.000 NA   NA
 145319 145320 YPO1925 YPO1926     FALSE 0.005 826.000 0.000 1.000 N NA
 145320 145321 YPO1926 YPO1927   int3 TRUE 0.951 23.000 0.417 1.000 N NA
 145321 145322 YPO1927 YPO1928 int3   TRUE 0.938 50.000 0.600 1.000 N NA
 145324 145325 YPO1930 YPO1931     TRUE 0.665 25.000 0.000 NA   NA
 145325 145326 YPO1931 YPO1932     FALSE 0.117 220.000 0.000 NA   NA
 145326 145327 YPO1932 YPO1933     TRUE 0.892 66.000 0.417 1.000   NA
 145331 145332 YPO1937 YPO1938     FALSE 0.005 725.000 0.000 1.000 N NA
 145333 145334 YPO1939 YPO1940     FALSE 0.099 111.000 0.028 1.000 N NA
 145334 145335 YPO1940 YPO1941     FALSE 0.006 581.000 0.000 1.000 N NA
 145335 145336 YPO1941 YPO1942     TRUE 0.671 204.000 0.133 NA Y NA
 145336 145337 YPO1942 YPO1943     FALSE 0.371 301.000 0.386 NA   NA
 145337 145338 YPO1943 YPO1944     TRUE 0.994 3.000 0.625 1.000   NA
 145338 145339 YPO1944 YPO1945     TRUE 0.998 -10.000 0.878 0.098 N NA
 145339 145340 YPO1945 YPO1946     TRUE 0.944 4.000 0.175 1.000 N NA
 145340 145341 YPO1946 YPO1947     TRUE 0.902 -10.000 0.078 1.000 N NA
 145341 145342 YPO1947 YPO1948     TRUE 0.986 0.000 0.176 0.012 N NA
 145342 145343 YPO1948 YPO1949     FALSE 0.171 173.000 0.071 1.000 N NA
 145343 145344 YPO1949 YPO1950     FALSE 0.213 141.000 0.071 1.000 N NA
 145344 145345 YPO1950 YPO1951   hmsH FALSE 0.015 669.000 0.000 1.000   NA
 145345 145346 YPO1951 YPO1952 hmsH hmsF TRUE 0.990 13.000 0.696 1.000   NA
 145346 145347 YPO1952 YPO1953 hmsF hmsR TRUE 0.913 -10.000 0.087 1.000 N NA
 145347 145348 YPO1953 YPO1954 hmsR hmsS TRUE 0.979 -3.000 0.154 NA   NA
 145348 145349 YPO1954 YPO1955 hmsS   FALSE 0.041 333.000 0.000 NA   NA
 145349 145350 YPO1955 YPO1956     FALSE 0.024 439.000 0.000 NA   NA
 145350 145351 YPO1956 YPO1957   phoH TRUE 0.520 60.000 0.065 NA   NA
 145352 145353 YPO1958 YPO1959 chaA narX FALSE 0.025 549.000 0.000 0.074 N NA
 145354 145355 YPO1960 YPO1961     FALSE 0.092 242.000 0.000 NA   NA
 145355 145356 YPO1961 YPO1962   astC FALSE 0.152 198.000 0.000 NA   NA
 145356 145357 YPO1962 YPO1963 astC astA TRUE 0.985 30.000 0.400 1.000 Y NA
 145357 145358 YPO1963 YPO1964 astA astD TRUE 0.878 -3.000 0.051 1.000 N NA
 145358 145359 YPO1964 YPO1965 astD astB TRUE 0.923 24.000 0.306 1.000 N NA
 145359 145360 YPO1965 YPO1966 astB astE TRUE 0.857 61.000 0.063 1.000 Y NA
 145360 2201088 YPO1966 YPO1967 astE   FALSE 0.013 736.000 0.000 NA   NA
 2201088 145361 YPO1967 YPO1968     TRUE 0.891 -2007.000 0.000 NA   NA
 145361 145362 YPO1968 YPO1969     TRUE 0.987 0.000 0.000 1.000 Y NA
 145363 145364 YPO1971 YPO1972 hutG hutI TRUE 0.798 -3.000 0.031 1.000 N NA
 145364 145365 YPO1972 YPO1973 hutI hutC FALSE 0.021 204.000 0.010 1.000 N NA
 145366 145367 YPO1974 YPO1975     TRUE 0.942 0.000 0.067 NA   NA
 2201089 145369 YPO1977 YPO1979     TRUE 0.758 14.000 0.000 NA   NA
 145369 145370 YPO1979 YPO1980     TRUE 0.972 -7.000 0.133 1.000   NA
 145370 145371 YPO1980 YPO1981     TRUE 0.996 -3.000 0.550 NA   NA
 145371 145372 YPO1981 YPO1982     FALSE 0.152 134.000 0.054 NA N NA
 145372 145373 YPO1982 YPO1983     TRUE 0.922 0.000 0.000 1.000   NA
 145373 145374 YPO1983 YPO1984     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 145374 145375 YPO1984 YPO1985     TRUE 0.980 -3.000 0.167 NA   NA
 145376 145377 YPO1986 YPO1987     FALSE 0.207 170.000 0.000 NA   NA
 145380 145381 YPO1990 YPO1991     FALSE 0.090 247.000 0.000 1.000   NA
 145382 145383 YPO1992 YPO1993     TRUE 0.548 105.000 0.000 0.044   NA
 145383 145384 YPO1993 YPO1994     FALSE 0.039 341.000 0.000 NA   NA
 145384 145385 YPO1994 YPO1995     TRUE 0.904 -13.000 0.000 NA   NA
 145385 145386 YPO1995 YPO1996     TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   NA
 145386 145387 YPO1996 YPO1997     FALSE 0.013 791.000 0.000 NA   NA
 145387 145388 YPO1997 YPO1998     FALSE 0.127 213.000 0.000 NA   NA
 145388 145389 YPO1998 YPO1999     TRUE 0.751 55.000 0.154 1.000   NA
 145389 145390 YPO1999 YPO2000     FALSE 0.067 277.000 0.000 1.000   NA
 145390 145391 YPO2000 YPO2001   copR TRUE 0.999 6.000 0.793 0.001 Y NA
 145392 145393 YPO2002 YPO2003     FALSE 0.239 149.000 0.000 NA   NA
 145393 145394 YPO2003 YPO2004     TRUE 0.896 15.000 0.133 NA   NA
 145396 145397 YPO2006 YPO2007     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 145397 145398 YPO2007 YPO2008     TRUE 0.550 8.000 0.034 NA N NA
 145399 145400 YPO2009 YPO2009a     TRUE 0.974 18.000 0.476 NA   NA
 145400 145401 YPO2009a YPO2010     FALSE 0.053 297.000 0.000 NA   NA
 145401 145402 YPO2010 YPO2011   pth TRUE 0.827 164.000 0.184 1.000 Y NA
 145404 145405 YPO2013 YPO2014 prsA ipk FALSE 0.022 341.000 0.053 1.000 N NA
 145405 145406 YPO2014 YPO2015 ipk   TRUE 0.954 2.000 0.157 1.000 N NA
 145407 145408 YPO2016 YPO2017 hemA prfA TRUE 0.890 33.000 0.171 0.044 N NA
 145408 145409 YPO2017 YPO2018 prfA   TRUE 0.998 0.000 0.229 0.044 Y NA
 145409 145410 YPO2018 YPO2019     TRUE 0.614 64.000 0.109 NA   NA
 145410 145411 YPO2019 YPO2020     TRUE 0.984 -3.000 0.195 NA   NA
 145411 145412 YPO2020 YPO2021   kdsA TRUE 0.481 96.000 0.089 1.000   NA
 145412 145413 YPO2021 YPO2023 kdsA tnp FALSE 0.008 482.000 0.000 1.000 N NA
 2201090 145414 YPO2027 YPO2025     TRUE 0.893 -1278.000 0.000 NA   NA
 145414 145415 YPO2025 YPO2026     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145415 145416 YPO2026 YPO2027a     FALSE 0.011 1598.000 0.000 NA   NA
 145416 5922268 YPO2027a YPt_27     FALSE 0.051 301.000 0.000 NA   NA
 5922268 145417 YPt_27 YPO2028     FALSE 0.246 142.000 0.000 NA   NA
 145417 145418 YPO2028 YPO2029     FALSE 0.054 301.000 0.000 1.000   NA
 145418 145419 YPO2029 YPO2030     TRUE 0.984 20.000 0.480 0.055   NA
 145419 145420 YPO2030 YPO2031     TRUE 0.999 -3.000 0.440 0.055 Y NA
 145420 2201091 YPO2031 YPO2034     TRUE 0.810 9.000 0.000 NA   NA
 145421 145422 YPO2033 YPO2035 tnp   FALSE 0.006 629.000 0.000 1.000 N NA
 145422 145423 YPO2035 YPO2036     TRUE 0.959 14.000 0.375 NA N NA
 145424 145425 YPO2037 YPO2038     TRUE 0.943 37.000 0.417 1.000   NA
 145426 145427 YPO2039 YPO2040     FALSE 0.117 395.000 0.196 NA   NA
 145428 145429 YPO2041 YPO2042 rimJ   TRUE 0.826 8.000 0.000 1.000   NA
 145429 145430 YPO2042 YPO2043   mviN FALSE 0.056 267.000 0.022 1.000   NA
 145430 145431 YPO2043 YPO2044 mviN   FALSE 0.022 468.000 0.000 NA   NA
 145431 145432 YPO2044 YPO2045     TRUE 0.996 30.000 1.000 NA Y NA
 145434 145435 YPO2047 YPO2048   cutC FALSE 0.126 232.000 0.057 NA   NA
 145436 145437 YPO2049 YPO2050     TRUE 0.991 -3.000 0.315 NA   NA
 145437 145438 YPO2050 YPO2051     FALSE 0.275 191.000 0.089 NA   NA
 145438 145439 YPO2051 YPO2052     FALSE 0.388 180.000 0.126 NA   NA
 145440 145441 YPO2053 YPO2054 aspS nudB TRUE 0.852 0.000 0.050 1.000 N NA
 145441 145442 YPO2054 YPO2055 nudB   TRUE 0.424 58.000 0.035 NA   NA
 145442 145443 YPO2055 YPO2056   ruvC TRUE 0.517 209.000 0.277 NA   NA
 145443 145444 YPO2056 YPO2057 ruvC ruvA TRUE 0.853 283.000 0.451 0.010 Y NA
 145444 145445 YPO2057 YPO2058 ruvA ruvB TRUE 0.976 162.000 0.549 0.001 Y NA
 145446 145447 YPO2059 YPO2060 znuB znuC TRUE 0.999 -3.000 0.755 1.000 Y NA
 145448 145449 YPO2061 YPO2062 znuA   TRUE 0.806 21.000 0.131 1.000 N NA
 145449 145450 YPO2062 YPO2063   msbB FALSE 0.288 267.000 0.299 1.000 N NA
 145451 145452 YPO2064 YPO2065 pykA hexR FALSE 0.017 330.000 0.000 1.000 N NA
 145453 145454 YPO2066 YPO2067 zwf eda FALSE 0.397 242.000 0.034 1.000 Y NA
 145454 145455 YPO2067 YPO2068 eda   FALSE 0.006 694.000 0.000 1.000 N NA
 145455 145456 YPO2068 YPO2069     TRUE 0.998 20.000 0.869 0.073 Y NA
 145458 145459 YPO2071 YPO2072     FALSE 0.358 72.000 0.082 1.000 N NA
 145459 145460 YPO2072 YPO2073     FALSE 0.066 155.000 0.024 1.000 N NA
 145460 145461 YPO2073 YPO2074   fadD FALSE 0.037 643.000 0.169 1.000 N NA
 145461 145462 YPO2074 YPO2075 fadD rnd FALSE 0.297 160.000 0.115 1.000 N NA
 145463 145464 YPO2076 YPO2077 minE minD TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 145464 145465 YPO2077 YPO2078 minD minC TRUE 0.990 25.000 0.466 1.000 Y NA
 145465 145466 YPO2078 YPO2079 minC   FALSE 0.025 426.000 0.000 NA   NA
 145467 145468 YPO2080 YPO2081     TRUE 0.771 141.000 0.363 NA   NA
 145468 145469 YPO2081 YPO2082     FALSE 0.193 71.000 0.046 NA N NA
 145469 145470 YPO2082 YPO2083     TRUE 0.446 103.000 0.088 NA   NA
 145471 145472 YPO2085 YPO2086     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145473 145474 YPO2087 YPO2087a     FALSE 0.350 78.000 0.000 NA   NA
 145474 145475 YPO2087a YPO2088     TRUE 0.711 19.000 0.000 NA   NA
 145476 145477 YPO2089 YPO2090 ninB   FALSE 0.358 74.000 0.000 NA   NA
 145477 145478 YPO2090 YPO2091     TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 145478 145479 YPO2091 YPO2092     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 145479 145480 YPO2092 YPO2093     TRUE 0.498 49.000 0.000 NA   NA
 145484 145485 YPO2097 YPO2098     TRUE 0.614 31.000 0.000 NA   NA
 145485 145486 YPO2098 YPO2099   rzpR TRUE 0.909 -15.000 0.000 1.000   NA
 145486 145487 YPO2099 YPO2100 rzpR   FALSE 0.024 462.000 0.000 1.000   NA
 145487 145488 YPO2100 YPO2101     FALSE 0.022 457.000 0.000 NA   NA
 145488 145489 YPO2101 YPO2102     TRUE 0.976 31.000 0.667 NA   NA
 145489 2201093 YPO2102 YPO2103     TRUE 0.802 10.000 0.000 NA   NA
 2201093 145490 YPO2103 YPO2104     TRUE 0.891 -1834.000 0.000 NA   NA
 145490 2201094 YPO2104 YPO2106     FALSE 0.012 979.000 0.000 NA   NA
 2201094 145491 YPO2106 YPO2108     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 145491 145492 YPO2108 YPO2109     TRUE 0.952 122.000 1.000 NA   NA
 145492 145493 YPO2109 YPO2110     TRUE 0.994 14.000 1.000 NA   NA
 145493 145494 YPO2110 YPO2111     TRUE 0.983 0.000 0.222 NA   NA
 145494 145495 YPO2111 YPO2112     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 145495 145496 YPO2112 YPO2113     TRUE 0.900 2.000 0.000 NA   NA
 145496 145497 YPO2113 YPO2114     TRUE 0.982 2.000 0.235 NA   NA
 145497 145498 YPO2114 YPO2115     TRUE 0.991 -3.000 0.294 NA   NA
 145498