MicrobesOnline Operon Predictions for Yersinia pestis CO92

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 143502 143503 YPO0001 YPO0002   asnC TRUE 0.534 93.000 0.165 1.000 N NA
 143505 143506 YPO0004 YPO0005     TRUE 0.988 4.000 0.443 NA   NA
 143507 143508 YPO0006 YPO0007 kup   FALSE 0.021 205.000 0.010 1.000 N NA
 143508 143509 YPO0007 YPO0008   rbsK TRUE 0.842 51.000 0.010 1.000 Y NA
 143510 143511 YPO0009 YPO0010     TRUE 0.617 80.000 0.133 1.000   NA
 2201025 5922241 YPOr01 YPt_01 16S_rRNA   FALSE 0.187 181.000 0.000 NA   NA
 5922241 407417 YPt_01 YPOr02   23S_rRNA FALSE 0.078 253.000 0.000 NA   NA
 407417 2201026 YPOr02 YPOr03 23S_rRNA 5S_rRNA TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 2201026 143512 YPOr03 YPO0011 5S_rRNA y1062 FALSE 0.020 495.000 0.000 NA   NA
 143513 143514 YPO0012 YPO0013 mobB mobA TRUE 0.995 0.000 0.064 0.003 Y NA
 143515 143516 YPO0013a YPO0014     TRUE 0.541 80.000 0.106 NA   NA
 143516 143517 YPO0014 YPO0015   dsbA TRUE 0.804 28.000 0.111 NA   NA
 143517 143518 YPO0015 YPO0017 dsbA polA FALSE 0.021 492.000 0.000 1.000   NA
 143518 2201027 YPO0017 YPOs01 polA spf FALSE 0.224 160.000 0.000 NA   NA
 2201027 143519 YPOs01 YPO0018 spf tnp FALSE 0.243 146.000 0.000 NA   NA
 143521 143522 YPO0020 YPO0021   hemN FALSE 0.335 183.000 0.107 NA   NA
 143523 143524 YPO0022 YPO0023 ntrC ntrB TRUE 0.998 8.000 0.587 0.090 Y NA
 143524 143525 YPO0023 YPO0024 ntrB glnA FALSE 0.045 253.000 0.053 1.000 N NA
 143525 143526 YPO0024 YPO0025 glnA   FALSE 0.116 186.000 0.003 NA   NA
 143527 143528 YPO0026 YPO0027 bipA   FALSE 0.031 322.000 0.007 1.000   NA
 143528 143529 YPO0027 YPO0028   rbn FALSE 0.300 97.000 0.031 1.000   NA
 143529 143530 YPO0028 YPO0029 rbn   TRUE 0.881 7.000 0.069 1.000   NA
 143531 143532 YPO0030 YPO0031     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 143534 143535 YPO0033 YPO0034     TRUE 0.672 148.000 0.257 NA   NA
 143537 143538 YPO0036 YPO0037 recG trmH TRUE 0.897 1.000 0.076 1.000 N NA
 143538 143539 YPO0037 YPO0038 trmH spoT TRUE 0.855 6.000 0.095 1.000 N NA
 143539 143540 YPO0038 YPO0039 spoT rpoZ TRUE 0.985 20.000 0.291 1.000 Y NA
 143540 143541 YPO0039 YPO0040 rpoZ gmk TRUE 0.902 55.000 0.471 1.000 N NA
 143543 143544 YPO0042 YPO0043     FALSE 0.028 403.000 0.000 NA   NA
 143545 143546 YPO0044 YPO0045 rph pyrE FALSE 0.269 167.000 0.108 1.000 N NA
 143547 143548 YPO0046 YPO0047 ttk dut FALSE 0.202 122.000 0.060 1.000 N NA
 143548 143549 YPO0047 YPO0048 dut dfp TRUE 0.966 -19.000 0.201 1.000 N NA
 143550 143551 YPO0049 YPO0050 radC rpmB FALSE 0.007 263.000 0.002 1.000 N NA
 143551 143552 YPO0050 YPO0051 rpmB rpmG TRUE 0.995 12.000 0.332 0.016 Y NA
 143552 143553 YPO0051 YPO0052 rpmG mutM FALSE 0.146 83.000 0.034 1.000 N NA
 143554 143555 YPO0053 YPO0054 coaD kdtX TRUE 0.700 -3.000 0.023 NA N NA
 143555 143556 YPO0054 YPO0055 kdtX kdtA TRUE 0.989 1.000 0.083 NA Y NA
 143556 143557 YPO0055 YPO0056 kdtA rfaC FALSE 0.142 420.000 0.028 1.000 Y NA
 143557 143558 YPO0056 YPO0057 rfaC rfaF TRUE 0.998 0.000 0.205 0.001 Y NA
 143558 143559 YPO0057 YPO0058 rfaF rfaD TRUE 0.957 31.000 0.146 1.000 Y NA
 143560 143561 YPO0059 YPO0060 kbl tdh TRUE 0.982 10.000 0.547 1.000 N NA
 2201028 143562 YPO0061 YPO0063     FALSE 0.225 159.000 0.000 NA   NA
 143562 143563 YPO0063 YPO0064     TRUE 0.820 28.000 0.170 1.000 N NA
 143564 143565 YPO0065 YPO0066   grxC FALSE 0.145 119.000 0.048 NA N NA
 143565 143566 YPO0066 YPO0067 grxC secB FALSE 0.158 88.000 0.038 1.000 N NA
 143566 143567 YPO0067 YPO0068 secB gpsA TRUE 0.973 0.000 0.206 1.000 N NA
 143567 143568 YPO0068 YPO0069 gpsA   TRUE 0.432 60.000 0.000 NA   NA
 143568 143569 YPO0069 YPO0070   cysE FALSE 0.395 66.000 0.000 NA   NA
 143572 143573 YPO0073 YPO0074 cpxA cpxR TRUE 0.999 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 143574 143575 YPO0075 YPO0076 cpxP   FALSE 0.014 678.000 0.000 NA   NA
 143575 143576 YPO0076 YPO0077     FALSE 0.017 562.000 0.000 NA   NA
 143576 143577 YPO0077 YPO0078   pfkA FALSE 0.051 218.000 0.040 1.000 N NA
 143577 143578 YPO0078 YPO0079 pfkA sbp1 FALSE 0.062 221.000 0.049 1.000 N NA
 143579 143580 YPO0080 YPO0081     TRUE 0.865 76.000 0.000 0.068 Y NA
 143580 143581 YPO0081 YPO0082     FALSE 0.205 66.000 0.000 1.000 N NA
 143581 143582 YPO0082 YPO0083     TRUE 0.993 -3.000 0.353 NA   NA
 143584 143585 YPO0085 YPO0086 tpiA   FALSE 0.320 129.000 0.058 NA   NA
 143587 2201029 YPO0088 YPO0089 fpr 'glpX FALSE 0.231 155.000 0.000 NA   NA
 2201029 2201030 YPO0089 YPO0090 'glpX glpK' FALSE 0.368 71.000 0.000 NA   NA
 2201030 143588 YPO0090 YPO0091 glpK' glpF FALSE 0.194 177.000 0.000 NA   NA
 143588 143589 YPO0091 YPO0092 glpF   TRUE 0.802 10.000 0.000 NA   NA
 143591 2201031 YPO0094 YPO0098 tnp   FALSE 0.031 378.000 0.000 NA   NA
 2201031 143592 YPO0098 YPO0096     TRUE 0.890 -2136.000 0.000 NA   NA
 143592 143593 YPO0096 YPO0097     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 143593 143594 YPO0097 YPO0099     FALSE 0.005 912.000 0.000 1.000 N NA
 143595 143596 YPO0100 YPO0101     FALSE 0.196 175.000 0.000 NA   NA
 143596 143597 YPO0101 YPO0102     FALSE 0.049 306.000 0.000 NA   NA
 143598 143599 YPO0103 YPO0104 menG menA TRUE 0.826 142.000 0.158 NA Y NA
 143599 143600 YPO0104 YPO0105 menA hslU FALSE 0.054 236.000 0.051 1.000 N NA
 143600 143601 YPO0105 YPO0106 hslU hslV TRUE 0.984 71.000 0.752 1.000 Y NA
 143601 143602 YPO0106 YPO0107 hslV ftsN FALSE 0.396 100.000 0.122 NA N NA
 143602 143603 YPO0107 YPO0108 ftsN cytR TRUE 0.730 66.000 0.245 NA N NA
 143603 143604 YPO0108 YPO0110 cytR priA FALSE 0.005 353.000 0.013 1.000 N NA
 2201032 143609 YPO0115 YPO0116 metB metL TRUE 0.886 3.000 0.000 NA   NA
 143609 143610 YPO0116 YPO0117 metL metF FALSE 0.394 233.000 0.017 1.000 Y NA
 143611 143612 YPO0118 YPO0119     TRUE 0.932 54.000 0.167 1.000 Y NA
 143612 143613 YPO0119 YPO0120   glpR FALSE 0.072 193.000 0.000 1.000 N NA
 143613 143614 YPO0120 YPO0121 glpR   TRUE 0.864 35.000 0.190 1.000   NA
 143614 143615 YPO0121 YPO0122   glpE TRUE 0.969 18.000 0.405 1.000   NA
 143615 143616 YPO0122 YPO0123 glpE malT FALSE 0.013 375.000 0.000 1.000 N NA
 2201033 143617 YPO0124 YPO0126 malP malP TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 143618 143619 YPO0127 YPO0128     TRUE 0.538 60.000 0.066 1.000   NA
 143620 143621 YPO0129 YPO0130 bioH   FALSE 0.146 170.000 0.010 NA   NA
 143622 143623 YPO0131 YPO0132   feoB TRUE 0.949 36.000 0.455 NA   NA
 143623 143624 YPO0132 YPO0133 feoB feoA TRUE 0.890 92.000 0.177 1.000 Y NA
 143624 143625 YPO0133 YPO0134 feoA   FALSE 0.007 524.000 0.000 1.000 N NA
 143626 143627 YPO0135 YPO0136 greB ompR TRUE 0.822 136.000 0.067 0.090 Y NA
 143627 143628 YPO0136 YPO0137 ompR envZ TRUE 0.999 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 143629 143630 YPO0138 YPO0139 pckA hslO FALSE 0.081 197.000 0.048 1.000 N NA
 143630 143631 YPO0139 YPO0140 hslO hslR FALSE 0.354 163.000 0.140 1.000 N NA
 143631 143632 YPO0140 YPO0141 hslR   TRUE 0.701 29.000 0.056 1.000   NA
 143632 143633 YPO0141 YPO0142     TRUE 0.466 144.000 0.122 1.000   NA
 143634 143635 YPO0143 YPO0144     FALSE 0.287 113.000 0.000 NA   NA
 143637 143638 YPO0146 YPO0147     TRUE 0.998 0.000 0.870 NA   NA
 143638 143639 YPO0147 YPO0148     TRUE 0.978 -7.000 0.174 NA   NA
 143639 143640 YPO0148 YPO0149     TRUE 0.874 26.000 0.167 NA   NA
 143640 143641 YPO0149 YPO0150     FALSE 0.039 427.000 0.072 NA   NA
 143641 143642 YPO0150 YPO0151   aroK FALSE 0.255 349.000 0.319 1.000   NA
 143642 143643 YPO0151 YPO0152 aroK aroB TRUE 0.940 57.000 0.208 1.000 Y NA
 143643 143644 YPO0152 YPO0153 aroB   FALSE 0.060 254.000 0.022 NA   NA
 143644 143645 YPO0153 YPO0154   dam TRUE 0.750 84.000 0.234 NA   NA
 143645 143646 YPO0154 YPO0155 dam rpe FALSE 0.028 303.000 0.053 1.000 N NA
 143646 143647 YPO0155 YPO0156 rpe gph TRUE 0.933 -7.000 0.050 1.000   NA
 143647 143648 YPO0156 YPO0157 gph trpS TRUE 0.959 2.000 0.118 1.000   NA
 143649 143650 YPO0158 YPO0159 cysG nirC FALSE 0.267 88.000 0.065 1.000 N NA
 143650 143651 YPO0159 YPO0160 nirC nirD TRUE 0.817 203.000 0.283 1.000 Y NA
 143651 143652 YPO0160 YPO0161 nirD nirB TRUE 0.999 -3.000 0.829 0.001 N NA
 143656 143657 YPO0165 YPO0166     FALSE 0.302 249.000 0.267 1.000 N NA
 143658 143659 YPO0167 YPO0168 ppiA   FALSE 0.046 326.000 0.000 1.000   NA
 143659 143660 YPO0168 YPO0169   pabA FALSE 0.064 243.000 0.007 1.000   NA
 143660 2201034 YPO0169 YPO0170 pabA argD FALSE 0.257 133.000 0.000 NA   NA
 2201034 143661 YPO0170 YPO0171 argD   TRUE 0.892 -1641.000 0.000 NA   NA
 143661 143662 YPO0171 YPO0172     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 143663 143664 YPO0174 YPO0175   crp TRUE 0.541 86.000 0.111 NA   NA
 143665 143666 YPO0176 YPO0177     FALSE 0.364 72.000 0.000 NA   NA
 143667 143668 YPO0178 YPO0179 prk   TRUE 0.714 149.000 0.303 NA   NA
 143668 143669 YPO0179 YPO0180     TRUE 0.987 -3.000 0.222 NA   NA
 143670 143671 YPO0181 YPO0182   tauA FALSE 0.061 203.000 0.000 1.000 N NA
 143671 143672 YPO0182 YPO0183 tauA tauB TRUE 0.977 9.000 0.023 0.093 Y NA
 143672 143673 YPO0183 YPO0184 tauB tauC TRUE 1.000 -3.000 0.728 0.093 Y NA
 143673 143674 YPO0184 YPO0185 tauC tauD TRUE 0.979 -3.000 0.214 1.000 N NA
 143675 143676 YPO0186 YPO0187     FALSE 0.366 93.000 0.053 NA   NA
 143676 2201035 YPO0187 YPO0188     FALSE 0.255 135.000 0.000 NA   NA
 143677 143678 YPO0190 YPO0191   kefB TRUE 0.997 4.000 0.927 1.000   NA
 143678 143679 YPO0191 YPO0192 kefB   TRUE 0.970 16.000 0.400 1.000   NA
 143679 143680 YPO0192 YPO0193   slyD FALSE 0.401 95.000 0.060 1.000   NA
 143682 143683 YPO0195 YPO0196 fkpA   TRUE 0.455 242.000 0.310 NA   NA
 143683 143684 YPO0196 YPO0197     TRUE 0.983 0.000 0.220 NA   NA
 143684 143685 YPO0197 YPO0198     TRUE 0.999 0.000 0.790 NA Y NA
 143685 143686 YPO0198 YPO0199     TRUE 0.996 20.000 0.804 NA Y NA
 143686 143687 YPO0199 YPO0200   rpsl FALSE 0.163 138.000 0.058 NA N NA
 143687 143688 YPO0200 YPO0201 rpsl rpsG TRUE 0.986 97.000 0.620 0.003 Y NA
 143688 143689 YPO0201 YPO0202 rpsG fusA TRUE 0.970 94.000 0.579 1.000 Y NA
 143689 143690 YPO0202 YPO0203 fusA tufA TRUE 0.891 73.000 0.005 0.001 Y NA
 143690 143691 YPO0203 YPO0204 tufA tnp FALSE 0.061 203.000 0.000 1.000 N NA
 143691 143692 YPO0204 YPO0205 tnp bfd FALSE 0.066 188.000 0.000 NA N NA
 143692 143693 YPO0205 YPO0206 bfd bfr TRUE 0.748 79.000 0.013 NA Y NA
 143693 143694 YPO0206 YPO0209 bfr rpsJ FALSE 0.011 414.000 0.000 1.000 N NA
 143694 143695 YPO0209 YPO0210 rpsJ rplC TRUE 0.988 33.000 0.307 0.020 Y NA
 143695 143696 YPO0210 YPO0211 rplC rplD TRUE 0.996 17.000 0.486 0.015 Y NA
 143696 143697 YPO0211 YPO0212 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.015 Y NA
 143697 143698 YPO0212 YPO0213 rplW rplB TRUE 0.998 17.000 0.849 0.018 Y NA
 143698 143699 YPO0213 YPO0214 rplB rpsS TRUE 0.998 15.000 0.820 0.020 Y NA
 143699 143700 YPO0214 YPO0215 rpsS rplV TRUE 0.998 15.000 0.769 0.020 Y NA
 143700 143701 YPO0215 YPO0216 rplV rpsC TRUE 0.998 18.000 0.719 0.020 Y NA
 143701 143702 YPO0216 YPO0217 rpsC rplP TRUE 0.999 13.000 0.828 0.020 Y NA
 143702 143703 YPO0217 YPO0218 rplP rpmC TRUE 1.000 0.000 0.802 0.015 Y NA
 143703 143704 YPO0218 YPO0219 rpmC rpsQ TRUE 1.000 0.000 0.828 0.015 Y NA
 143704 143705 YPO0219 YPO0220 rpsQ rplN TRUE 0.979 181.000 0.791 0.020 Y NA
 143705 143706 YPO0220 YPO0221 rplN rplX TRUE 0.999 11.000 0.810 0.020 Y NA
 143706 143707 YPO0221 YPO0222 rplX rplE TRUE 0.998 15.000 0.758 0.015 Y NA
 143707 143708 YPO0222 YPO0222a rplE rpsN TRUE 0.997 14.000 0.496 0.015 Y NA
 143708 143709 YPO0222a YPO0223 rpsN rpsH TRUE 0.993 34.000 0.473 0.015 Y NA
 143709 143710 YPO0223 YPO0224 rpsH rplF TRUE 0.998 15.000 0.808 0.015 Y NA
 143710 143711 YPO0224 YPO0225 rplF rplR TRUE 0.999 10.000 0.815 0.015 Y NA
 143711 143712 YPO0225 YPO0226 rplR rpsE TRUE 0.998 15.000 0.814 0.020 Y NA
 143712 143713 YPO0226 YPO0227 rpsE rpmD TRUE 0.999 3.000 0.789 0.020 Y NA
 143713 143714 YPO0227 YPO0228 rpmD rplO TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 143714 143715 YPO0228 YPO0229 rplO secY TRUE 0.990 8.000 0.730 1.000 N NA
 143715 143716 YPO0229 YPO0230 secY rpmJ FALSE 0.336 34.000 0.036 1.000 N NA
 143716 143717 YPO0230 YPO0231 rpmJ rpsM TRUE 0.852 148.000 0.086 0.015 Y NA
 143717 143718 YPO0231 YPO0232 rpsM rpsK TRUE 0.998 17.000 0.810 0.015 Y NA
 143718 143719 YPO0232 YPO0233 rpsK rpsD TRUE 0.994 31.000 0.509 0.020 Y NA
 143719 143720 YPO0233 YPO0234 rpsD rpoA TRUE 0.963 26.000 0.549 1.000 N NA
 143720 143721 YPO0234 YPO0235 rpoA rplQ TRUE 0.974 41.000 0.873 1.000 N NA
 143721 143722 YPO0235 YPO0236 rplQ   FALSE 0.003 447.000 0.005 1.000 N NA
 143722 143723 YPO0236 YPO0237     TRUE 0.722 88.000 0.219 NA   NA
 143724 143725 YPO0238 YPO0239 mscL trkA FALSE 0.037 139.000 0.007 1.000 N NA
 143725 143726 YPO0239 YPO0240 trkA   FALSE 0.088 56.000 0.007 1.000 N NA
 143726 143727 YPO0240 YPO0241   fmt TRUE 0.933 94.000 0.305 1.000 Y NA
 143727 143728 YPO0241 YPO0242 fmt def TRUE 0.967 25.000 0.058 0.023 Y NA
 143729 143730 YPO0243 YPO0244     TRUE 0.921 8.000 0.124 NA   NA
 143730 143731 YPO0244 YPO0245     TRUE 0.911 41.000 0.331 NA   NA
 143731 143732 YPO0245 YPO0245a     TRUE 0.943 2.000 0.137 NA N NA
 143732 143733 YPO0245a YPO0246   aroE TRUE 0.808 9.000 0.087 NA N NA
 2201036 143734 YPO0247 YPO0248     FALSE 0.387 67.000 0.000 NA   NA
 143734 143735 YPO0248 YPO0249     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 143736 143737 YPO0251 YPO0252     TRUE 0.998 -3.000 0.733 NA   NA
 143737 143738 YPO0252 YPO0253   acs TRUE 0.725 57.000 0.147 NA   NA
 143740 143741 YPO0255 YPO0256     TRUE 0.998 13.000 0.688 0.012 Y NA
 143742 143743 YPO0257 YPO0258     TRUE 0.984 2.000 0.268 NA   NA
 143743 143744 YPO0258 YPO0259     TRUE 0.887 19.000 0.146 NA   NA
 143744 143745 YPO0259 YPO0260     FALSE 0.209 174.000 0.000 1.000   NA
 143745 143746 YPO0260 YPO0260a     TRUE 0.932 10.000 0.150 1.000   NA
 143746 143747 YPO0260a YPO0261     TRUE 0.997 -3.000 0.650 NA   NA
 143747 143748 YPO0261 YPO0262     TRUE 0.842 98.000 0.407 NA   NA
 143748 143749 YPO0262 YPO0263     TRUE 0.997 -3.000 0.407 0.015   NA
 143749 143750 YPO0263 YPO0264     TRUE 0.891 175.000 0.786 NA   NA
 143750 143751 YPO0264 YPO0265     TRUE 0.996 -3.000 0.538 NA   NA
 143751 143752 YPO0265 YPO0266     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 143752 143753 YPO0266 YPO0267     TRUE 0.999 -13.000 0.647 0.011 Y NA
 143753 143754 YPO0267 YPO0268     TRUE 0.982 -3.000 0.176 NA   NA
 143754 143755 YPO0268 YPO0268a     TRUE 0.935 164.000 1.000 NA   NA
 143755 143756 YPO0268a YPO0269     TRUE 0.931 20.000 0.231 NA   NA
 143756 143757 YPO0269 YPO0270     TRUE 0.842 127.000 0.154 1.000 Y NA
 143757 143758 YPO0270 YPO0271     TRUE 0.997 -3.000 0.136 0.015 Y NA
 143758 143759 YPO0271 YPO0272     TRUE 0.999 2.000 0.516 0.089 Y NA
 143759 143760 YPO0272 YPO0273     TRUE 0.998 -10.000 0.406 0.089 Y NA
 143760 143761 YPO0273 YPO0274     FALSE 0.033 383.000 0.045 NA   NA
 143761 143762 YPO0274 YPO0275     TRUE 0.998 -3.000 0.844 NA   NA
 143764 143765 YPO0277 YPO0278   metC TRUE 0.877 46.000 0.043 NA Y NA
 143766 143767 YPO0279 YPO0280 hmuV hmuU TRUE 0.996 -7.000 0.220 1.000 Y NA
 143767 143768 YPO0280 YPO0281 hmuU hmuT TRUE 0.999 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 143768 143769 YPO0281 YPO0282 hmuT hmuS TRUE 0.998 -3.000 0.384 1.000 Y NA
 143769 143770 YPO0282 YPO0283 hmuS hmuR TRUE 0.760 119.000 0.064 1.000 Y NA
 143770 143771 YPO0283 YPO0284 hmuR   FALSE 0.011 415.000 0.000 1.000 N NA
 143771 143772 YPO0284 YPO0285     TRUE 0.454 34.000 0.054 1.000 N NA
 143772 143773 YPO0285 YPO0286     TRUE 0.962 -3.000 0.135 1.000 N NA
 143773 143774 YPO0286 YPO0287     FALSE 0.016 341.000 0.000 1.000 N NA
 143774 143775 YPO0287 YPO0288     FALSE 0.045 315.000 0.000 NA   NA
 143775 143776 YPO0288 YPO0289     FALSE 0.028 397.000 0.000 NA   NA
 143776 143777 YPO0289 YPO0290     TRUE 0.993 0.000 0.420 NA   NA
 143777 143778 YPO0290 YPO0291     TRUE 0.989 -7.000 0.296 NA   NA
 143778 143779 YPO0291 YPO0292     TRUE 0.968 -7.000 0.126 NA   NA
 143779 143780 YPO0292 YPO0293     TRUE 0.950 12.000 0.217 1.000   NA
 143781 143782 YPO0294 YPO0295 terZ terA TRUE 0.979 0.000 0.054 0.004   NA
 143782 143783 YPO0295 YPO0296 terA terB TRUE 0.873 33.000 0.200 NA   NA
 143783 143784 YPO0296 YPO0297 terB terC TRUE 0.936 22.000 0.000 NA Y NA
 143784 143785 YPO0297 YPO0298 terC terD FALSE 0.215 64.000 0.000 1.000 N NA
 143785 143786 YPO0298 YPO0299 terD terE TRUE 0.931 184.000 0.310 0.004 Y NA
 143786 143787 YPO0299 YPO0300 terE tnp FALSE 0.073 192.000 0.000 1.000 N NA
 143787 143788 YPO0300 YPO0301 tnp   FALSE 0.013 774.000 0.000 NA   NA
 143788 143789 YPO0301 YPO0302     FALSE 0.080 251.000 0.000 NA   NA
 143789 143790 YPO0302 YPO0303     TRUE 0.974 72.000 0.571 NA Y NA
 143790 143791 YPO0303 YPO0304     TRUE 0.816 8.000 0.000 NA   NA
 143791 143792 YPO0304 YPO0306     FALSE 0.012 1112.000 0.000 NA   NA
 143792 143793 YPO0306 YPO0307     FALSE 0.025 423.000 0.000 NA   NA
 143793 143794 YPO0307 YPO0308     FALSE 0.041 332.000 0.000 NA   NA
 143796 143797 YPO0310 YPO0311 ubiC ubiA TRUE 0.862 166.000 0.248 NA Y NA
 143799 143800 YPO0313 YPO0314 dgkA lexA FALSE 0.422 125.000 0.141 1.000 N NA
 143802 143803 YPO0316 YPO0318 cysH   FALSE 0.029 516.000 0.070 NA   NA
 143805 143806 YPO0320 YPO0321 cysG2 alr TRUE 0.735 97.000 0.317 1.000 N NA
 143806 143807 YPO0321 YPO0322 alr tyrB FALSE 0.374 186.000 0.181 1.000 N NA
 143807 143808 YPO0322 YPO0323 tyrB   FALSE 0.018 527.000 0.000 NA   NA
 143811 143812 YPO0326 YPO0327     TRUE 0.814 14.000 0.063 NA   NA
 143812 143813 YPO0327 YPO0328   rhaD TRUE 0.587 67.000 0.041 0.007 N NA
 143813 143814 YPO0328 YPO0329 rhaD rhaA TRUE 0.987 13.000 0.247 1.000 Y NA
 143814 143815 YPO0329 YPO0330 rhaA rhaB TRUE 0.998 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 143816 143817 YPO0331 YPO0332   rhaS FALSE 0.113 222.000 0.000 NA   NA
 143817 143818 YPO0332 YPO0333 rhaS rhaR TRUE 0.986 133.000 0.800 0.039 Y NA
 143822 143823 YPO0338 YPO0339     TRUE 0.746 15.000 0.000 NA   NA
 5922242 143824 YPt_02 YPO0341     FALSE 0.244 145.000 0.000 NA   NA
 143825 143826 YPO0342 YPO0343   hydN TRUE 0.946 23.000 0.222 0.014 N NA
 143826 143827 YPO0343 YPO0344 hydN fdhF TRUE 0.959 23.000 0.231 0.046   NA
 143828 143829 YPO0345 YPO0346 dsbD   TRUE 0.908 -24.000 0.092 1.000 N NA
 143829 143830 YPO0346 YPO0347   dcuA FALSE 0.132 185.000 0.007 1.000   NA
 143830 143831 YPO0347 YPO0348 dcuA aspA FALSE 0.243 120.000 0.023 1.000   NA
 143832 143833 YPO0349 YPO0350   groES FALSE 0.076 255.000 0.040 NA   NA
 143833 143834 YPO0350 YPO0351 groES groEL TRUE 0.994 47.000 0.631 0.007 Y NA
 143834 143835 YPO0351 YPO0352 groEL   FALSE 0.015 636.000 0.000 NA   NA
 143837 143838 YPO0354 YPO0355 efp sugE FALSE 0.035 247.000 0.000 1.000 N NA
 143839 143840 YPO0356 YPO0357 tnp frdD FALSE 0.066 198.000 0.000 1.000 N NA
 143840 143841 YPO0357 YPO0358 frdD frdC TRUE 0.998 17.000 0.787 0.003 Y NA
 143841 143842 YPO0358 YPO0359 frdC frdB TRUE 0.996 17.000 0.454 0.003 Y NA
 143842 143843 YPO0359 YPO0360 frdB frdA TRUE 0.999 -7.000 0.470 0.003 Y NA
 143844 143845 YPO0361 YPO0362     FALSE 0.224 160.000 0.000 NA   NA
 143846 143847 YPO0363 YPO0364   psd TRUE 0.807 24.000 0.148 NA N NA
 143847 143848 YPO0364 YPO0365 psd   FALSE 0.087 325.000 0.095 1.000   NA
 143849 5922243 YPO0366 YPt_03 orn   FALSE 0.017 558.000 0.000 NA   NA
 143851 143852 YPO0368 YPO0369     TRUE 0.903 11.000 0.118 NA   NA
 143852 143853 YPO0369 YPO0370     TRUE 0.431 140.000 0.109 NA   NA
 143853 143854 YPO0370 YPO0371   mutL TRUE 0.755 16.000 0.092 1.000 N NA
 143854 143855 YPO0371 YPO0372 mutL miaA TRUE 0.971 -7.000 0.188 1.000 N NA
 143855 143856 YPO0372 YPO0373 miaA ymr TRUE 0.878 116.000 0.531 1.000   NA
 143856 143857 YPO0373 YPO0374 ymr hflX TRUE 0.585 99.000 0.141 1.000   NA
 143857 143858 YPO0374 YPO0375 hflX hflK TRUE 0.438 241.000 0.184 0.088   NA
 143858 143859 YPO0375 YPO0376 hflK hflC TRUE 0.999 4.000 0.947 0.017 Y NA
 143859 143860 YPO0376 YPO0377 hflC   TRUE 0.712 172.000 0.348 NA   NA
 143860 143861 YPO0377 YPO0378   purA FALSE 0.340 100.000 0.051 NA   NA
 143861 143862 YPO0378 YPO0379 purA   FALSE 0.003 369.000 0.010 NA N NA
 143862 143863 YPO0379 YPO0380   rnr FALSE 0.402 241.000 0.038 NA Y NA
 143863 143864 YPO0380 YPO0381 rnr   TRUE 0.654 119.000 0.147 0.018 N NA
 143864 143865 YPO0381 YPO0383   aidB FALSE 0.003 408.000 0.005 1.000 N NA
 143866 143867 YPO0384 YPO0385     FALSE 0.040 340.000 0.000 NA   NA
 143867 143868 YPO0385 YPO0386     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 143869 143870 YPO0387 YPO0388     TRUE 0.999 -3.000 0.759 NA Y NA
 143870 143871 YPO0388 YPO0389     FALSE 0.387 67.000 0.000 NA   NA
 143871 143872 YPO0389 YPO0390     FALSE 0.084 247.000 0.000 NA   NA
 143872 143873 YPO0390 YPO0391     TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 143873 143874 YPO0391 YPO0392     TRUE 0.490 50.000 0.000 NA   NA
 143874 143875 YPO0392 YPO0393     FALSE 0.291 110.000 0.000 NA   NA
 143877 143878 YPO0395 YPO0396   dcuB FALSE 0.337 85.000 0.000 NA   NA
 143878 143879 YPO0396 YPO0397 dcuB   TRUE 0.953 -3.000 0.068 NA   NA
 143880 143881 YPO0398 YPO0399     TRUE 0.989 11.000 0.637 NA   NA
 143882 143883 YPO0400 YPO0401     TRUE 0.906 2.000 0.000 1.000   NA
 143884 143885 YPO0402 YPO0403     TRUE 0.875 93.000 0.000 0.007 Y NA
 143885 143886 YPO0403 YPO0404     TRUE 0.765 341.000 0.400 0.007 Y NA
 143888 143889 YPO0406 YPO0407     FALSE 0.051 301.000 0.000 NA   NA
 143889 143890 YPO0407 YPO0408     FALSE 0.383 64.000 0.028 1.000   NA
 143890 143891 YPO0408 YPO0409     TRUE 0.867 56.000 0.062 NA Y NA
 143891 143892 YPO0409 YPO0410     TRUE 0.988 66.000 0.844 NA Y NA
 143892 143893 YPO0410 YPO0411     TRUE 1.000 -3.000 0.788 0.013 Y NA
 143893 143894 YPO0411 YPO0412     TRUE 0.999 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 143894 143895 YPO0412 YPO0413     FALSE 0.291 110.000 0.000 NA   NA
 2201038 143896 YPO0414 YPO0415     FALSE 0.205 171.000 0.000 NA   NA
 143896 143897 YPO0415 YPO0416     FALSE 0.009 469.000 0.000 1.000 N NA
 143897 143898 YPO0416 YPO0417     TRUE 0.914 48.000 0.105 NA Y NA
 143898 143899 YPO0417 YPO0418     FALSE 0.016 586.000 0.000 NA   NA
 143899 143900 YPO0418 YPO0419     TRUE 0.646 27.000 0.000 NA   NA
 143900 143901 YPO0419 YPO0420     TRUE 0.479 52.000 0.000 NA   NA
 143901 143902 YPO0420 YPO0421     TRUE 0.968 0.000 0.185 NA N NA
 143903 143904 YPO0422 YPO0423     TRUE 0.802 147.000 0.429 NA   NA
 5922244 143908 YPt_04 YPO0427   rsmC FALSE 0.075 257.000 0.000 NA   NA
 143909 143910 YPO0428 YPO0429 holD rimI TRUE 0.957 -55.000 0.121 1.000   NA
 143910 143911 YPO0429 YPO0430 rimI prfC FALSE 0.171 179.000 0.026 1.000   NA
 143911 143912 YPO0430 YPO0431 prfC osmY FALSE 0.043 327.000 0.000 NA   NA
 143912 143913 YPO0431 YPO0432 osmY   TRUE 0.450 167.000 0.140 NA   NA
 143913 143914 YPO0432 YPO0433     TRUE 0.731 74.000 0.211 NA   NA
 143914 143915 YPO0433 YPO0434     TRUE 0.628 37.000 0.057 NA   NA
 143915 143916 YPO0434 YPO0435     FALSE 0.004 535.000 0.027 NA N NA
 143916 143917 YPO0435 YPO0436   deoC FALSE 0.101 576.000 0.000 1.000 Y NA
 143917 2201039 YPO0436 YPO0437 deoC deoA FALSE 0.277 121.000 0.000 NA   NA
 2201039 143918 YPO0437 YPO0439 deoA deoB FALSE 0.258 132.000 0.000 NA   NA
 143918 143919 YPO0439 YPO0440 deoB deoD TRUE 0.767 125.000 0.414 1.000 N NA
 143921 143922 YPO0442 YPO0443 serB radA FALSE 0.105 88.000 0.024 1.000 N NA
 143922 143923 YPO0443 YPO0444 radA nadR FALSE 0.055 159.000 0.021 1.000 N NA
 143923 143924 YPO0444 YPO0445 nadR   FALSE 0.240 157.000 0.000 1.000   NA
 2201040 143925 YPO0446 YPO0448     FALSE 0.183 183.000 0.000 NA   NA
 143925 143926 YPO0448 YPO0449     TRUE 0.964 6.000 0.290 1.000 N NA
 143926 143927 YPO0449 YPO0450     TRUE 0.937 21.000 0.259 NA   NA
 143927 143928 YPO0450 YPO0451     FALSE 0.032 375.000 0.000 NA   NA
 143929 143930 YPO0452 YPO0453   trpR FALSE 0.180 251.000 0.167 1.000 N NA
 143936 143937 YPO0459 YPO0460 thrA thrB TRUE 0.990 3.000 0.133 1.000 Y NA
 143937 143938 YPO0460 YPO0461 thrB thrC TRUE 0.993 4.000 0.233 1.000 Y NA
 143940 143941 YPO0463 YPO0464 talB mogA FALSE 0.025 288.000 0.042 1.000 N NA
 143941 143942 YPO0464 YPO0465 mogA   FALSE 0.122 128.000 0.039 1.000 N NA
 143943 143944 YPO0466 YPO0467     FALSE 0.057 289.000 0.000 NA   NA
 143945 143946 YPO0468 YPO0469 dnaK dnaJ TRUE 0.952 112.000 0.236 0.003 Y NA
 143946 143947 YPO0469 YPO0470 dnaJ nhaA FALSE 0.020 243.000 0.022 1.000 N NA
 143947 143948 YPO0470 YPO0471 nhaA nhaR TRUE 0.660 130.000 0.292 1.000 N NA
 143949 143950 YPO0472 YPO0473 rpsT   TRUE 0.689 22.000 0.000 NA   NA
 143951 143952 YPO0474 YPO0475 ribF ileS TRUE 0.875 32.000 0.254 1.000 N NA
 143952 143953 YPO0475 YPO0476 ileS lspA TRUE 0.833 0.000 0.045 1.000 N NA
 143953 143954 YPO0476 YPO0476a lspA fkpB TRUE 0.578 68.000 0.154 1.000 N NA
 143954 143955 YPO0476a YPO0477 fkpB lytB TRUE 0.993 -19.000 0.626 1.000 N NA
 143955 143956 YPO0477 YPO0478 lytB   TRUE 0.632 29.000 0.000 NA   NA
 143956 143957 YPO0478 YPO0479   tnp FALSE 0.170 189.000 0.000 NA   NA
 143957 143958 YPO0479 YPO0480 tnp dapB FALSE 0.009 453.000 0.000 1.000 N NA
 143958 143959 YPO0480 YPO0481 dapB carA FALSE 0.124 473.000 0.034 1.000 Y NA
 143959 143960 YPO0481 YPO0482 carA carB TRUE 0.996 16.000 0.345 0.001 Y NA
 143962 143963 YPO0484 YPO0485     TRUE 0.997 -9.000 0.704 NA   NA
 143963 143964 YPO0485 YPO0486   folA FALSE 0.405 150.000 0.104 NA   NA
 143964 143965 YPO0486 YPO0487 folA tnp FALSE 0.055 212.000 0.000 1.000 N NA
 143965 143966 YPO0487 YPO0488 tnp   FALSE 0.018 535.000 0.000 NA   NA
 143966 143967 YPO0488 YPO0489     FALSE 0.267 127.000 0.000 NA   NA
 143968 143969 YPO0490 YPO0491 apaH apaG TRUE 0.925 17.000 0.267 NA N NA
 143969 143970 YPO0491 YPO0492 apaG ksgA TRUE 0.728 14.000 0.078 NA N NA
 143970 143971 YPO0492 YPO0493 ksgA pdxA TRUE 0.972 -7.000 0.197 1.000 N NA
 143971 143972 YPO0493 YPO0494 pdxA surA TRUE 0.993 -16.000 0.561 1.000 N NA
 143972 143973 YPO0494 YPO0495 surA imp TRUE 0.632 68.000 0.182 1.000 N NA
 143975 143976 YPO0497 YPO0498 rluA   FALSE 0.012 1223.000 0.000 NA   NA
 143977 143978 YPO0499 YPO0500     TRUE 0.995 11.000 1.000 NA   NA
 143978 143979 YPO0500 YPO0501     TRUE 0.997 0.000 0.700 NA   NA
 143979 143980 YPO0501 YPO0502     TRUE 0.818 163.000 0.500 NA   NA
 143980 143981 YPO0502 YPO0503     TRUE 0.942 74.000 0.714 NA   NA
 143981 143982 YPO0503 YPO0504     TRUE 0.964 33.000 0.533 NA   NA
 143982 143983 YPO0504 YPO0505     TRUE 0.995 -7.000 0.533 NA   NA
 143983 143984 YPO0505 YPO0506   clpB TRUE 0.989 3.000 0.400 NA   NA
 143984 143985 YPO0506 YPO0507 clpB   FALSE 0.299 104.000 0.000 NA   NA
 143985 143986 YPO0507 YPO0508     TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 143986 143987 YPO0508 YPO0509     TRUE 0.665 25.000 0.000 NA   NA
 143987 143988 YPO0509 YPO0510     TRUE 0.653 26.000 0.000 NA   NA
 143988 143989 YPO0510 YPO0511     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 143989 143990 YPO0511 YPO0511a     TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   NA
 143990 143991 YPO0511a YPO0512     TRUE 0.996 -7.000 0.667 NA   NA
 143991 143992 YPO0512 YPO0513     FALSE 0.278 120.000 0.000 NA   NA
 143992 143993 YPO0513 YPO0514     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 143993 143994 YPO0514 YPO0515     TRUE 0.955 50.000 0.615 NA   NA
 143994 143995 YPO0515 YPO0516     TRUE 0.991 22.000 1.000 NA   NA
 143996 143997 YPO0517 YPO0518     FALSE 0.190 461.000 0.098 1.000 Y NA
 143999 144000 YPO0520 YPO0521 thiQ thiP TRUE 0.987 14.000 0.522 0.020 N NA
 144000 144001 YPO0521 YPO0522 thiP   TRUE 0.986 24.000 0.697 0.090 N NA
 144004 2201041 YPO0525 YPO0526   setA FALSE 0.078 253.000 0.000 NA   NA
 144005 144006 YPO0527 YPO0528     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144006 144007 YPO0528 YPO0530   leuD FALSE 0.006 580.000 0.000 1.000 N NA
 144007 144008 YPO0530 YPO0531 leuD leuC TRUE 0.995 15.000 0.309 0.001 Y NA
 144008 144009 YPO0531 YPO0532 leuC leuB TRUE 0.998 2.000 0.275 0.001 Y NA
 144009 144010 YPO0532 YPO0533 leuB leuA TRUE 0.996 3.000 0.126 0.001 Y NA
 144010 144011 YPO0533 YPO0534 leuA tnp FALSE 0.112 147.000 0.000 1.000 N NA
 144012 144013 YPO0535 YPO0536 leuO   FALSE 0.042 329.000 0.000 NA   NA
 144013 144014 YPO0536 YPO0537     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144014 144015 YPO0537 YPO0538     TRUE 0.614 31.000 0.000 NA   NA
 144015 144016 YPO0538 YPO0539   ilvI FALSE 0.045 319.000 0.000 NA   NA
 144016 144017 YPO0539 YPO0540 ilvI ilvH TRUE 0.998 3.000 0.371 0.002 Y NA
 144017 144018 YPO0540 YPO0541 ilvH tnp FALSE 0.065 199.000 0.000 1.000 N NA
 144022 144023 YPO0546 YPO0547     TRUE 0.994 3.000 0.635 NA   NA
 144023 144024 YPO0547 YPO0548   ftsL TRUE 0.981 -3.000 0.227 1.000 N NA
 144024 144025 YPO0548 YPO0549 ftsL ftsI TRUE 0.517 66.000 0.124 1.000 N NA
 144025 144026 YPO0549 YPO0550 ftsI murE TRUE 0.986 2.000 0.059 1.000 Y NA
 144026 144027 YPO0550 YPO0551 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 144027 144028 YPO0551 YPO0552 murF mraY TRUE 0.999 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 144028 144029 YPO0552 YPO0553 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.004 Y NA
 144029 144030 YPO0553 YPO0554 murD ftsW TRUE 0.993 0.000 0.297 0.003 N NA
 144030 144031 YPO0554 YPO0555 ftsW murG TRUE 0.996 -3.000 0.647 1.000 N NA
 144031 144032 YPO0555 YPO0556 murG murC TRUE 0.901 138.000 0.283 1.000 Y NA
 144032 144033 YPO0556 YPO0557 murC ddlB TRUE 0.997 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 144033 144034 YPO0557 YPO0558 ddlB ftsQ TRUE 0.997 2.000 0.372 NA Y NA
 144034 144035 YPO0558 YPO0559 ftsQ ftsA TRUE 0.935 27.000 0.389 NA N NA
 144035 144036 YPO0559 YPO0560 ftsA ftsZ TRUE 0.966 73.000 0.460 1.000 Y NA
 144036 144037 YPO0560 YPO0561 ftsZ lpxC TRUE 0.453 100.000 0.134 1.000 N NA
 144039 144040 YPO0563 YPO0564   secA TRUE 0.451 78.000 0.065 1.000   NA
 144040 144041 YPO0564 YPO0565 secA   FALSE 0.006 295.000 0.003 1.000 N NA
 144042 144043 YPO0566 YPO0567     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144043 144044 YPO0567 YPO0568     FALSE 0.062 279.000 0.000 NA   NA
 144044 144045 YPO0568 YPO0569     FALSE 0.133 331.000 0.161 NA   NA
 144045 144046 YPO0569 YPO0569a     TRUE 0.983 -3.000 0.185 NA   NA
 144046 144047 YPO0569a YPO0570     TRUE 0.971 3.000 0.185 NA   NA
 144047 144048 YPO0570 YPO0571     TRUE 0.844 5.000 0.000 NA   NA
 144048 144049 YPO0571 YPO0572     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 144049 144050 YPO0572 YPO0573     TRUE 0.766 226.000 0.684 NA   NA
 144050 144051 YPO0573 YPO0574     TRUE 0.971 -3.000 0.118 NA   NA
 144051 144052 YPO0574 YPO0575     FALSE 0.062 278.000 0.000 NA   NA
 144052 144053 YPO0575 YPO0576   exuR FALSE 0.105 228.000 0.000 NA   NA
 144053 144054 YPO0576 YPO0577 exuR exuT FALSE 0.421 263.000 0.433 1.000 N NA
 144055 144056 YPO0578 YPO0579   uxaC FALSE 0.018 531.000 0.000 NA   NA
 144056 144057 YPO0579 YPO0580 uxaC uxaB TRUE 0.642 199.000 0.095 1.000 Y NA
 144057 144058 YPO0580 YPO0581 uxaB uxaA TRUE 0.979 11.000 0.126 1.000 Y NA
 144058 144059 YPO0581 YPO0582 uxaA   TRUE 0.456 153.000 0.126 NA   NA
 144060 144061 YPO0583 YPO0584 tnp   FALSE 0.064 201.000 0.000 1.000 N NA
 144061 144062 YPO0584 YPO0585     FALSE 0.020 523.000 0.000 1.000   NA
 144062 144063 YPO0585 YPO0586     FALSE 0.207 203.000 0.072 NA   NA
 144063 144064 YPO0586 YPO0587     FALSE 0.095 239.000 0.000 NA   NA
 144066 144067 YPO0589 YPO0590 fadH   FALSE 0.135 213.000 0.000 1.000   NA
 144069 144070 YPO0592 YPO0593     TRUE 0.956 32.000 0.452 1.000   NA
 144070 144071 YPO0593 YPO0594     TRUE 0.966 56.000 0.789 NA   NA
 144071 144072 YPO0594 YPO0595     TRUE 0.932 102.000 0.750 NA   NA
 144072 144073 YPO0595 YPO0596   terX TRUE 0.970 2.000 0.164 NA   NA
 144073 144074 YPO0596 YPO0597 terX terY TRUE 0.873 33.000 0.200 NA   NA
 144075 144076 YPO0598 YPO0599     TRUE 0.876 45.000 0.000 NA Y NA
 144076 144077 YPO0599 YPO0600     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144077 144078 YPO0600 YPO0601     FALSE 0.068 266.000 0.000 NA   NA
 144078 144079 YPO0601 YPO0602     FALSE 0.344 81.000 0.000 NA   NA
 144080 144081 YPO0606 YPO0607 yapF   TRUE 0.448 60.000 0.000 1.000   NA
 144081 144082 YPO0607 YPO0608     FALSE 0.231 102.000 0.016 NA   NA
 144083 144084 YPO0609 YPO0610     TRUE 0.766 83.000 0.030 1.000 Y NA
 144084 144085 YPO0610 YPO0611     FALSE 0.263 109.000 0.073 1.000 N NA
 144085 144086 YPO0611 YPO0612     FALSE 0.371 77.000 0.089 1.000 N NA
 144086 144087 YPO0612 YPO0613     TRUE 0.993 54.000 0.733 0.064 Y NA
 144087 144088 YPO0613 YPO0614     TRUE 0.995 0.000 0.105 0.064 Y NA
 144088 144089 YPO0614 YPO0615     TRUE 0.946 30.000 0.375 NA   NA
 144089 144090 YPO0615 YPO0616     TRUE 0.909 51.000 0.375 NA   NA
 144091 144092 YPO0617 YPO0618     TRUE 0.994 5.000 0.750 NA   NA
 144092 144093 YPO0618 YPO0619     TRUE 0.946 116.000 0.889 NA   NA
 144093 144094 YPO0619 YPO0620     TRUE 0.993 10.000 0.778 NA   NA
 144094 144095 YPO0620 YPO0621     TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   NA
 144095 144096 YPO0621 YPO0622     FALSE 0.200 173.000 0.000 NA   NA
 144097 144098 YPO0623 YPO0624     TRUE 0.977 -7.000 0.222 1.000 N NA
 144098 144099 YPO0624 YPO0625     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 144099 144100 YPO0625 YPO0626     FALSE 0.207 170.000 0.000 NA   NA
 144100 144101 YPO0626 YPO0627     TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 144101 144102 YPO0627 YPO0628     FALSE 0.291 285.000 0.000 NA Y NA
 144103 144104 YPO0629 YPO0630     FALSE 0.072 260.000 0.000 NA   NA
 144105 2201042 YPO0631 YPO0632     FALSE 0.023 451.000 0.000 NA   NA
 144106 144107 YPO0634 YPO0635     FALSE 0.152 198.000 0.000 NA   NA
 144108 144109 YPO0636 YPO0637 ddpA   FALSE 0.215 165.000 0.000 NA   NA
 144109 144110 YPO0637 YPO0638     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144110 144111 YPO0638 YPO0639     FALSE 0.282 126.000 0.000 1.000   NA
 144111 144112 YPO0639 YPO0640     TRUE 0.810 9.000 0.000 NA   NA
 144112 144113 YPO0640 YPO0641     FALSE 0.350 78.000 0.000 NA   NA
 144113 144114 YPO0641 YPO0641a     TRUE 0.725 17.000 0.000 NA   NA
 144114 144115 YPO0641a YPO0642     FALSE 0.154 197.000 0.000 NA   NA
 5922245 144116 YPt_05 YPO0643   rpoD FALSE 0.156 196.000 0.000 NA   NA
 144116 144117 YPO0643 YPO0644 rpoD dnaG TRUE 0.624 158.000 0.299 1.000 N NA
 144117 144118 YPO0644 YPO0645 dnaG rpsU FALSE 0.205 136.000 0.067 1.000 N NA
 144121 144122 YPO0648 YPO0649 folB bacA FALSE 0.108 274.000 0.128 1.000 N NA
 144123 144124 YPO0650 YPO0651 cca   FALSE 0.266 160.000 0.106 NA N NA
 144125 144126 YPO0652 YPO0653   glnE FALSE 0.249 171.000 0.053 1.000   NA
 144126 144127 YPO0653 YPO0654 glnE rfaE FALSE 0.252 135.000 0.083 1.000 N NA
 144127 144128 YPO0654 YPO0655 rfaE asoB FALSE 0.156 37.000 0.012 1.000 N NA
 144130 144131 YPO0657 YPO0658   ribB FALSE 0.221 162.000 0.000 NA   NA
 144131 144132 YPO0658 YPO0659 ribB   FALSE 0.027 459.000 0.048 1.000   NA
 144133 144134 YPO0660 YPO0661     TRUE 0.989 10.000 0.632 NA   NA
 144137 144138 YPO0664 YPO0665     TRUE 0.951 34.000 0.443 NA   NA
 144138 144139 YPO0665 YPO0666   icc TRUE 0.871 82.000 0.433 NA   NA
 144139 144140 YPO0666 YPO0667 icc   TRUE 0.994 -3.000 0.427 NA   NA
 144140 144141 YPO0667 YPO0668   parE TRUE 0.689 102.000 0.217 NA   NA
 144141 144142 YPO0668 YPO0669 parE   TRUE 0.566 4.000 0.022 1.000 N NA
 144144 144145 YPO0671 YPO0672 parC   FALSE 0.025 289.000 0.043 1.000 N NA
 144145 144146 YPO0672 YPO0673   sufI FALSE 0.344 179.000 0.154 1.000 N NA
 144146 2201043 YPO0673 YPO0674 sufI   FALSE 0.048 308.000 0.000 NA   NA
 144151 144152 YPO0680 YPO0681   metC TRUE 0.491 193.000 0.212 NA   NA
 144153 144154 YPO0682 YPO0683     TRUE 0.999 4.000 0.810 0.088 Y NA
 144155 144156 YPO0684 YPO0685     TRUE 0.969 25.000 0.500 NA   NA
 144156 144157 YPO0685 YPO0686     TRUE 0.490 50.000 0.000 NA   NA
 144157 144158 YPO0686 YPO0687     TRUE 0.986 0.000 0.000 NA Y NA
 144158 144159 YPO0687 YPO0688     TRUE 0.984 20.000 0.273 1.000 Y NA
 144159 144160 YPO0688 YPO0689     TRUE 1.000 -3.000 0.909 0.014 Y NA
 144160 144161 YPO0689 YPO0690     TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 144161 144162 YPO0690 YPO0691     TRUE 0.997 12.000 0.727 NA Y NA
 144162 2201044 YPO0691 YPO0692     FALSE 0.156 196.000 0.000 NA   NA
 2201044 144163 YPO0692 YPO0694     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144163 144164 YPO0694 YPO0695     TRUE 0.833 52.000 0.222 NA   NA
 144165 144166 YPO0696 YPO0697 tnp tnp TRUE 0.525 252.000 0.000 0.032 Y NA
 144166 144167 YPO0697 YPO0698 tnp   FALSE 0.015 353.000 0.000 1.000 N NA
 144167 144168 YPO0698 YPO0699     TRUE 0.945 18.000 0.000 1.000 Y NA
 144168 144169 YPO0699 YPO0700     TRUE 0.931 25.000 0.000 1.000 Y NA
 144172 2201045 YPO0703 YPO0704     FALSE 0.124 215.000 0.000 NA   NA
 2201045 144173 YPO0704 YPO0706   flhB TRUE 0.909 -10.000 0.000 NA   NA
 144173 144174 YPO0706 YPO0707 flhB fliR TRUE 0.999 0.000 1.000 1.000 Y NA
 144174 144175 YPO0707 YPO0708 fliR fliQ TRUE 0.996 7.000 0.281 0.004 Y NA
 144175 144176 YPO0708 YPO0709 fliQ fliP TRUE 0.996 5.000 0.263 0.014 Y NA
 144176 144177 YPO0709 YPO0710 fliP fliN TRUE 0.998 -3.000 0.368 1.000 Y NA
 144177 144178 YPO0710 YPO0711 fliN fliM TRUE 0.967 -7.000 0.123 NA   NA
 144179 144180 YPO0712 YPO0713   fliE TRUE 0.975 17.000 0.576 1.000 N NA
 144180 144181 YPO0713 YPO0714 fliE fliF TRUE 0.999 10.000 1.000 0.012 Y NA
 144181 144182 YPO0714 YPO0715 fliF fliG TRUE 1.000 -28.000 0.970 0.012 Y NA
 144182 144183 YPO0715 YPO0716 fliG fliH TRUE 1.000 2.000 0.789 0.006 Y NA
 144183 144184 YPO0716 YPO0717 fliH fliI TRUE 0.999 -7.000 0.816 1.000 Y NA
 144184 144185 YPO0717 YPO0718 fliI   TRUE 0.769 13.000 0.035 1.000   NA
 144186 144187 YPO0719 YPO0720     TRUE 0.947 109.000 0.585 0.004   NA
 144187 144188 YPO0720 YPO0721   flgA FALSE 0.214 229.000 0.113 NA   NA
 144189 144190 YPO0722 YPO0723 flgB flgC TRUE 1.000 3.000 0.972 0.006 Y NA
 144190 144191 YPO0723 YPO0724 flgC flgD TRUE 0.999 3.000 0.914 NA Y NA
 144191 144192 YPO0724 YPO0725 flgD flgE TRUE 0.993 55.000 0.970 NA Y NA
 144192 2201046 YPO0725 YPO0727 flgE flgF TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 144194 144195 YPO0728 YPO0729 flgG flgH TRUE 0.998 35.000 0.941 0.012 Y NA
 144195 144196 YPO0729 YPO0730 flgH flgI TRUE 0.993 77.000 0.912 0.014 Y NA
 144196 144197 YPO0730 YPO0731 flgI flgJ TRUE 0.983 10.000 0.457 NA   NA
 144197 144198 YPO0731 YPO0732 flgJ flgK TRUE 0.849 113.000 0.457 NA   NA
 144198 144199 YPO0732 YPO0733 flgK flgL TRUE 0.987 29.000 0.576 0.002   NA
 144199 144200 YPO0733 YPO0734 flgL ggt TRUE 0.964 45.000 0.667 NA   NA
 144201 144202 YPO0735 YPO0736     TRUE 0.925 104.000 0.714 NA   NA
 144203 144204 YPO0737 YPO0738 flaA1 flaA2 FALSE 0.241 515.000 0.000 0.002 Y NA
 144204 144205 YPO0738 YPO0739 flaA2 flaA3 TRUE 0.508 283.000 0.000 0.002 Y NA
 144205 144206 YPO0739 YPO0740 flaA3 fliD TRUE 0.474 220.000 0.000 1.000 Y NA
 144206 144207 YPO0740 YPO0741 fliD fliS TRUE 0.999 10.000 0.865 0.004 Y NA
 144207 144208 YPO0741 YPO0742 fliS   TRUE 0.918 2.000 0.054 NA   NA
 144208 144209 YPO0742 YPO0743     TRUE 0.926 2.000 0.062 NA   NA
 144209 144210 YPO0743 YPO0744     TRUE 0.908 39.000 0.296 1.000   NA
 144210 144211 YPO0744 YPO0745   fliA TRUE 0.979 6.000 0.333 1.000   NA
 144211 144212 YPO0745 YPO0746 fliA motA TRUE 0.970 16.000 0.500 1.000 N NA
 144212 144213 YPO0746 YPO0747 motA motB TRUE 0.999 0.000 0.846 1.000 Y NA
 144213 144214 YPO0747 YPO0748 motB   FALSE 0.374 69.000 0.000 NA   NA
 144214 144215 YPO0748 YPO0749     FALSE 0.142 203.000 0.000 NA   NA
 144215 144216 YPO0749 YPO0750     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144216 144217 YPO0750 YPO0751     FALSE 0.358 74.000 0.000 NA   NA
 2201047 144218 YPO0752 YPO0754 pcpY   FALSE 0.081 250.000 0.000 NA   NA
 144219 144220 YPO0755 YPO0756     TRUE 0.932 54.000 0.167 1.000 Y NA
 144221 144222 YPO0758 YPO0759     FALSE 0.025 282.000 0.000 1.000 N NA
 144223 144224 YPO0760 YPO0761     FALSE 0.018 544.000 0.000 NA   NA
 144224 144225 YPO0761 YPO0762     FALSE 0.064 275.000 0.000 NA   NA
 144225 144226 YPO0762 YPO0763     TRUE 0.770 14.000 0.000 1.000   NA
 144226 144227 YPO0763 YPO0764     TRUE 0.653 26.000 0.000 NA   NA
 144227 2201049 YPO0764 YPO0765     FALSE 0.016 589.000 0.000 NA   NA
 2201049 144228 YPO0765 YPO0767   gntP FALSE 0.012 1001.000 0.000 NA   NA
 144229 144230 YPO0768 YPO0769     FALSE 0.024 436.000 0.000 NA   NA
 144231 144232 YPO0770 YPO0771     TRUE 0.994 -7.000 0.000 0.006 Y NA
 144232 144233 YPO0771 YPO0772     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 144233 144234 YPO0772 YPO0773     TRUE 0.909 -10.000 0.000 NA   NA
 144234 144235 YPO0773 YPO0774     TRUE 0.990 -7.000 0.074 1.000 Y NA
 144235 144236 YPO0774 YPO0775     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144236 144237 YPO0775 YPO0776     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144237 144238 YPO0776 YPO0777     TRUE 0.932 13.000 0.000 0.002   NA
 144238 144239 YPO0777 YPO0778     TRUE 0.817 44.000 0.000 0.002   NA
 144239 144240 YPO0778 YPO0779     FALSE 0.226 61.000 0.000 1.000 N NA
 144240 144241 YPO0779 YPO0780     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144241 2201050 YPO0780 YPO0781     FALSE 0.337 85.000 0.000 NA   NA
 2201050 144242 YPO0781 YPO0782     TRUE 0.582 35.000 0.000 NA   NA
 144242 144243 YPO0782 YPO0783   thyA TRUE 0.614 31.000 0.000 NA   NA
 144243 144244 YPO0783 YPO0784 thyA lgt TRUE 0.917 7.000 0.164 1.000 N NA
 144244 144245 YPO0784 YPO0785 lgt ptsP FALSE 0.008 251.000 0.003 1.000 N NA
 144245 144246 YPO0785 YPO0786 ptsP   FALSE 0.324 13.000 0.012 1.000 N NA
 144246 144247 YPO0786 YPO0787     TRUE 0.549 26.000 0.008 NA   NA
 144247 144248 YPO0787 YPO0788     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144249 144250 YPO0789 YPO0790 mutH tas FALSE 0.007 335.000 0.015 1.000 N NA
 144251 144252 YPO0791 YPO0792     FALSE 0.212 167.000 0.000 NA   NA
 144252 144253 YPO0792 YPO0793   aas TRUE 0.973 -3.000 0.124 NA   NA
 144253 144254 YPO0793 YPO0794 aas bisC FALSE 0.009 449.000 0.000 1.000 N NA
 144258 144259 YPO0798 YPO0799     FALSE 0.013 369.000 0.000 1.000 N NA
 144260 144261 YPO0800 YPO0801     TRUE 0.593 113.000 0.157 1.000   NA
 144262 144263 YPO0802 YPO0803 cheD   FALSE 0.142 203.000 0.000 NA   NA
 144263 144264 YPO0803 YPO0804     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 144266 144267 YPO0806 YPO0807     TRUE 0.653 26.000 0.000 NA   NA
 144267 144268 YPO0807 YPO0808     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144268 144269 YPO0808 YPO0809     TRUE 0.998 5.000 0.537 0.083 Y NA
 144269 144270 YPO0809 YPO0810     TRUE 0.995 9.000 0.461 1.000 Y NA
 144270 144271 YPO0810 YPO0811     TRUE 0.998 -7.000 0.569 0.003   NA
 144271 144272 YPO0811 YPO0812     TRUE 0.907 38.000 0.132 0.003   NA
 144272 144273 YPO0812 YPO0813     TRUE 0.991 5.000 0.087 0.003 Y NA
 144273 2201051 YPO0813 YPO0814     TRUE 0.682 23.000 0.000 NA   NA
 2201051 144274 YPO0814 YPO0815     TRUE 0.904 -13.000 0.000 NA   NA
 144274 144275 YPO0815 YPO0816     TRUE 0.995 -3.000 0.012 0.003 Y NA
 144275 144276 YPO0816 YPO0817     TRUE 0.930 81.000 0.667 NA   NA
 144276 144277 YPO0817 YPO0818     TRUE 0.939 68.000 0.667 NA   NA
 144277 144278 YPO0818 YPO0819     FALSE 0.013 743.000 0.000 NA   NA
 144279 144280 YPO0820 YPO0821   wbyI FALSE 0.030 387.000 0.000 NA   NA
 144280 144281 YPO0821 YPO0822 wbyI   TRUE 0.689 22.000 0.000 NA   NA
 144281 144282 YPO0822 YPO0823   wzy TRUE 0.753 115.000 0.286 1.000   NA
 144282 144283 YPO0823 YPO0824 wzy   TRUE 0.891 70.000 0.444 1.000   NA
 144283 2201052 YPO0824 YPO0824A   tnp FALSE 0.117 220.000 0.000 NA   NA
 144284 144285 YPO0825 YPO0826     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144285 144286 YPO0826 YPO0829     FALSE 0.005 943.000 0.000 1.000 N NA
 144287 144288 YPO0831 YPO0832   agaZ TRUE 0.975 50.000 0.400 1.000 Y NA
 144288 144289 YPO0832 YPO0833 agaZ   TRUE 0.983 -3.000 0.240 1.000 N NA
 144289 144290 YPO0833 YPO0834   ushA TRUE 0.845 18.000 0.150 1.000 N NA
 144290 144291 YPO0834 YPO0835 ushA   TRUE 0.997 47.000 0.909 0.010 Y NA
 144291 144292 YPO0835 YPO0836     TRUE 1.000 -10.000 0.917 0.010 Y NA
 144292 144293 YPO0836 YPO0837     TRUE 0.992 86.000 0.833 0.010 Y NA
 144293 144294 YPO0837 YPO0838     TRUE 0.988 3.000 0.104 1.000 Y NA
 144294 144295 YPO0838 YPO0839   kduD2 FALSE 0.068 196.000 0.000 1.000 N NA
 144295 144296 YPO0839 YPO0840 kduD2   TRUE 0.976 16.000 0.462 1.000   NA
 144296 144297 YPO0840 YPO0841     FALSE 0.226 244.000 0.000 0.022   NA
 144297 144298 YPO0841 YPO0842     TRUE 0.981 21.000 0.615 1.000   NA
 144298 144299 YPO0842 YPO0843     TRUE 0.919 123.000 0.727 NA   NA
 144299 144300 YPO0843 YPO0844   agaY TRUE 0.733 109.000 0.261 NA   NA
 144300 144301 YPO0844 YPO0845 agaY   TRUE 0.871 24.000 0.148 NA   NA
 144303 144304 YPO0847 YPO0848     TRUE 0.916 148.000 0.341 1.000 Y NA
 144307 144308 YPO0851 YPO0852   bgaB TRUE 0.847 112.000 0.143 1.000 Y NA
 144308 144309 YPO0852 YPO0853 bgaB   TRUE 0.972 51.000 0.190 0.004 Y NA
 144309 144310 YPO0853 YPO0854     TRUE 0.994 5.000 0.308 1.000 Y NA
 144310 144311 YPO0854 YPO0855     TRUE 0.999 12.000 0.885 0.062 Y NA
 144311 144312 YPO0855 YPO0856     TRUE 0.973 160.000 0.815 1.000 Y NA
 144313 144314 YPO0857 YPO0858     FALSE 0.106 549.000 0.000 1.000 Y NA
 144314 144315 YPO0858 YPO0859     TRUE 0.958 66.000 0.200 0.013 Y NA
 144315 144316 YPO0859 YPO0860     TRUE 0.488 435.000 0.217 0.013 Y NA
 144316 144317 YPO0860 YPO0862     FALSE 0.013 779.000 0.000 NA   NA
 144317 144318 YPO0862 YPO0863     FALSE 0.031 376.000 0.000 NA   NA
 144318 144319 YPO0863 YPO0864     FALSE 0.025 424.000 0.000 NA   NA
 144319 144320 YPO0864 YPO0865     TRUE 0.940 0.000 0.065 NA   NA
 144321 144322 YPO0866 YPO0867     FALSE 0.122 217.000 0.000 NA   NA
 144322 144323 YPO0867 YPO0868     FALSE 0.344 81.000 0.000 NA   NA
 144323 144324 YPO0868 YPO0869     FALSE 0.047 312.000 0.000 NA   NA
 144324 144325 YPO0869 YPO0870     TRUE 0.967 21.000 0.429 NA   NA
 144325 144326 YPO0870 YPO0871     FALSE 0.088 245.000 0.000 NA   NA
 144326 144327 YPO0871 YPO0872     TRUE 0.509 47.000 0.000 NA   NA
 144327 144328 YPO0872 YPO0873   fabF1 FALSE 0.019 510.000 0.000 NA   NA
 144328 144329 YPO0873 YPO0874 fabF1   FALSE 0.021 504.000 0.000 1.000   NA
 144330 144331 YPO0875 YPO0876     TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 144331 144332 YPO0876 YPO0877     TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   NA
 144332 144333 YPO0877 YPO0878     FALSE 0.185 182.000 0.000 NA   NA
 144336 144337 YPO0881 YPO0882     TRUE 0.998 0.000 0.857 NA   NA
 144337 144338 YPO0882 YPO0883     FALSE 0.217 164.000 0.000 NA   NA
 144338 144339 YPO0883 YPO0884     TRUE 0.755 63.000 0.189 NA   NA
 144339 144340 YPO0884 YPO0887   int FALSE 0.004 865.000 0.000 NA N NA
 144340 5922246 YPO0887 YPt_06 int   FALSE 0.214 166.000 0.000 NA   NA
 5922246 144341 YPt_06 YPO0888   lysS FALSE 0.161 194.000 0.000 NA   NA
 144341 144342 YPO0888 YPO0889 lysS prfB TRUE 0.990 10.000 0.162 0.050 Y NA
 144342 144343 YPO0889 YPO0890 prfB recJ FALSE 0.058 179.000 0.028 1.000 N NA
 144343 144344 YPO0890 YPO0891 recJ dsbC TRUE 0.818 7.000 0.082 1.000 N NA
 144344 144345 YPO0891 YPO0892 dsbC xerD TRUE 0.597 31.000 0.079 1.000 N NA
 144347 144348 YPO0894 YPO0895 creD creC TRUE 0.716 100.000 0.311 NA N NA
 144348 144349 YPO0895 YPO0896 creC creB TRUE 0.995 25.000 0.776 1.000 Y NA
 144349 144350 YPO0896 YPO0896a creB   TRUE 0.941 -3.000 0.051 NA   NA
 144350 144351 YPO0896a YPO0897     TRUE 0.925 -19.000 0.061 NA   NA
 144353 144354 YPO0899 YPO0900     FALSE 0.074 258.000 0.000 NA   NA
 144354 144355 YPO0900 YPO0901     FALSE 0.145 202.000 0.000 NA   NA
 144355 144356 YPO0901 YPO0902     FALSE 0.418 62.000 0.000 NA   NA
 144356 144357 YPO0902 YPO0904     FALSE 0.012 1210.000 0.000 NA   NA
 144357 144358 YPO0904 YPO0905   gcvP FALSE 0.031 378.000 0.000 NA   NA
 144358 144359 YPO0905 YPO0906 gcvP gcsH TRUE 0.778 212.000 0.249 1.000 Y NA
 144359 144360 YPO0906 YPO0907 gcsH gcvT TRUE 0.977 69.000 0.317 0.001 Y NA
 144360 144361 YPO0907 YPO0908 gcvT visC FALSE 0.001 721.000 0.004 1.000 N NA
 144361 144362 YPO0908 YPO0909 visC ubiH TRUE 0.967 173.000 0.474 0.001 Y NA
 144362 144363 YPO0909 YPO0910 ubiH pepP FALSE 0.222 69.000 0.047 1.000 N NA
 144363 144364 YPO0910 YPO0911 pepP   TRUE 0.442 88.000 0.073 NA   NA
 144365 2201053 YPO0912 YPOs02   ssrS TRUE 0.455 56.000 0.000 NA   NA
 2201053 144366 YPOs02 YPO0913 ssrS   FALSE 0.267 127.000 0.000 NA   NA
 144367 144368 YPO0914 YPO0915 serA rpiA FALSE 0.014 307.000 0.029 1.000 N NA
 144370 144371 YPO0917 YPO0918     FALSE 0.252 190.000 0.075 NA   NA
 144371 144372 YPO0918 YPO0919     FALSE 0.079 263.000 0.049 NA   NA
 144372 144373 YPO0919 YPO0920   fbaA FALSE 0.008 438.000 0.038 NA N NA
 144373 144374 YPO0920 YPO0921 fbaA pgk TRUE 0.864 120.000 0.056 0.006 Y NA
 144374 144375 YPO0921 YPO0922 pgk epd TRUE 0.886 103.000 0.070 0.006 Y NA
 144375 144376 YPO0922 YPO0923 epd   FALSE 0.018 315.000 0.000 1.000 N NA
 144376 144377 YPO0923 YPO0924     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144377 144378 YPO0924 YPO0925   tnp TRUE 0.709 184.000 0.000 0.097 Y NA
 144378 144379 YPO0925 YPO0926 tnp tktA FALSE 0.020 308.000 0.000 1.000 N NA
 144381 144382 YPO0928 YPO0929   speA FALSE 0.031 160.000 0.006 1.000 N NA
 144383 144384 YPO0931 YPO0932 metK   FALSE 0.153 193.000 0.030 1.000   NA
 144384 144385 YPO0932 YPO0933   endA TRUE 0.694 98.000 0.210 1.000   NA
 144385 144386 YPO0933 YPO0934 endA   FALSE 0.286 252.000 0.201 NA   NA
 144386 144387 YPO0934 YPO0935   gshB TRUE 0.880 26.000 0.173 NA   NA
 144387 144388 YPO0935 YPO0936 gshB   FALSE 0.366 116.000 0.120 NA N NA
 144388 144389 YPO0936 YPO0937     TRUE 0.981 0.000 0.263 NA N NA
 144389 144390 YPO0937 YPO0938     FALSE 0.137 180.000 0.004 1.000   NA
 144390 144391 YPO0938 YPO0939     TRUE 0.930 4.000 0.095 1.000   NA
 144393 144394 YPO0941 YPO0942   proC TRUE 0.480 133.000 0.125 NA   NA
 144394 144395 YPO0942 YPO0943 proC   FALSE 0.129 288.000 0.117 NA   NA
 144395 144396 YPO0943 YPO0944     TRUE 0.959 -3.000 0.081 NA   NA
 144396 144397 YPO0944 YPO0945     FALSE 0.233 100.000 0.016 NA   NA
 144397 144398 YPO0945 YPO0946     TRUE 0.976 -7.000 0.218 1.000 N NA
 144399 2201054 YPO0947 YPO0948     FALSE 0.019 502.000 0.000 NA   NA
 2201054 144400 YPO0948 YPO0949     FALSE 0.332 88.000 0.000 NA   NA
 144400 144401 YPO0949 YPO0950     TRUE 0.514 111.000 0.123 NA   NA
 144401 144402 YPO0950 YPO0951     TRUE 0.955 0.000 0.092 NA   NA
 144403 144404 YPO0952 YPO0953 mutY   FALSE 0.341 178.000 0.150 1.000 N NA
 144404 144405 YPO0953 YPO0954   mltC FALSE 0.270 183.000 0.128 NA N NA
 144405 144406 YPO0954 YPO0955 mltC   FALSE 0.018 300.000 0.000 NA N NA
 144406 144407 YPO0955 YPO0956     TRUE 0.940 38.000 0.128 1.000 Y NA
 144408 144409 YPO0957 YPO0958   mglA TRUE 1.000 -3.000 0.727 0.013 Y NA
 144409 144410 YPO0958 YPO0959 mglA   TRUE 0.985 46.000 0.545 NA Y NA
 144410 144411 YPO0959 YPO0960   speC FALSE 0.006 556.000 0.000 NA N NA
 144412 144413 YPO0961 YPO0962     TRUE 0.675 24.000 0.000 NA   NA
 144413 144414 YPO0962 YPO0963   insB FALSE 0.015 608.000 0.000 NA   NA
 144414 144415 YPO0963 YPO0964 insB insA TRUE 0.893 66.000 0.000 0.032 Y NA
 144415 144416 YPO0964 YPO0965 insA   FALSE 0.317 96.000 0.000 NA   NA
 144416 144417 YPO0965 YPO0966   rhlE TRUE 0.844 5.000 0.000 NA   NA
 144417 144418 YPO0966 YPO0967 rhlE   TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 144418 144419 YPO0967 YPO0967a     FALSE 0.018 535.000 0.000 NA   NA
 144419 144420 YPO0967a YPO0968     TRUE 0.918 54.000 0.000 0.032 Y NA
 144420 144421 YPO0968 YPO0968a     FALSE 0.030 387.000 0.000 NA   NA
 144421 144422 YPO0968a YPO0969     FALSE 0.290 111.000 0.000 NA   NA
 144422 144423 YPO0969 YPO0970     TRUE 0.746 15.000 0.000 NA   NA
 144423 144424 YPO0970 YPO0971   clpB3 TRUE 0.973 -3.000 0.125 NA   NA
 144424 144425 YPO0971 YPO0973 clpB3   FALSE 0.045 418.000 0.083 NA   NA
 144425 144426 YPO0973 YPO0974     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 144426 144427 YPO0974 YPO0975     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 144427 144428 YPO0975 YPO0976     TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 144428 144429 YPO0976 YPO0977     TRUE 0.781 12.000 0.000 NA   NA
 144429 144430 YPO0977 YPO0978     TRUE 0.526 43.000 0.000 NA   NA
 144430 144431 YPO0978 YPO0980     FALSE 0.011 1400.000 0.000 NA   NA
 144431 144432 YPO0980 YPO0980A   insB FALSE 0.296 106.000 0.000 NA   NA
 144432 144433 YPO0980A YPO0981 insB insA TRUE 0.799 36.000 0.000 0.032   NA
 144433 144434 YPO0981 YPO0982 insA   FALSE 0.380 68.000 0.000 NA   NA
 144434 144435 YPO0982 YPO0983     FALSE 0.023 451.000 0.000 NA   NA
 144438 144439 YPO0986 YPO0987 xapB   FALSE 0.033 377.000 0.000 1.000   NA
 2201055 144441 YPO0989 YPO0991 iucA iucB TRUE 0.904 -13.000 0.000 NA   NA
 144441 144442 YPO0991 YPO0992 iucB iucC TRUE 0.989 -3.000 0.250 1.000   NA
 144442 144443 YPO0992 YPO0993 iucC iucD TRUE 0.998 -3.000 0.417 1.000 Y NA
 144443 144444 YPO0993 YPO0994 iucD iutA FALSE 0.417 72.000 0.100 1.000 N NA
 144446 144447 YPO0996 YPO0997     TRUE 0.932 54.000 0.167 1.000 Y NA
 144448 144449 YPO0998 YPO0999     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 144450 144451 YPO1000 YPO1001     TRUE 0.990 13.000 0.842 1.000 N NA
 144453 144454 YPO1003 YPO1004   yapH FALSE 0.013 854.000 0.000 NA   NA
 144455 144456 YPO1005 YPO1006     FALSE 0.050 563.000 0.000 0.016   NA
 144456 144457 YPO1006 YPO1007     FALSE 0.323 208.000 0.000 0.016   NA
 144458 144459 YPO1008 YPO1009     FALSE 0.353 78.000 0.089 NA N NA
 144459 144460 YPO1009 YPO1011     FALSE 0.012 388.000 0.000 1.000 N NA
 144460 2201056 YPO1011 YPO1012     FALSE 0.187 181.000 0.000 NA   NA
 2201056 144461 YPO1012 YPO1013     FALSE 0.335 87.000 0.000 NA   NA
 144461 144462 YPO1013 YPO1014     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144462 144463 YPO1014 YPO1014a     FALSE 0.403 65.000 0.000 NA   NA
 144463 144464 YPO1014a YPO1015     TRUE 0.992 -6.000 0.368 NA   NA
 144464 144465 YPO1015 YPO1016     TRUE 0.993 -3.000 0.373 NA   NA
 144465 144466 YPO1016 YPO1017     TRUE 0.994 -12.000 0.538 NA   NA
 144466 144467 YPO1017 YPO1018   recC FALSE 0.224 135.000 0.076 NA N NA
 144467 144468 YPO1018 YPO1019 recC ptrA FALSE 0.367 82.000 0.092 1.000 N NA
 144468 144469 YPO1019 YPO1020 ptrA recB TRUE 0.938 -3.000 0.092 1.000 N NA
 144469 144470 YPO1020 YPO1021 recB recD TRUE 1.000 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 5922248 5922249 YPt_08 YPt_09     FALSE 0.272 124.000 0.000 NA   NA
 144473 144474 YPO1025 YPO1026     FALSE 0.061 143.000 0.021 1.000 N NA
 144475 144476 YPO1027 YPO1028     TRUE 0.720 135.000 0.122 0.002   NA
 144477 144478 YPO1029 YPO1030 gcvA   FALSE 0.322 166.000 0.081 NA   NA
 144478 144479 YPO1030 YPO1031     TRUE 0.972 -7.000 0.144 NA   NA
 144480 144481 YPO1032 YPO1033 xni   FALSE 0.240 260.000 0.178 NA   NA
 144481 144482 YPO1033 YPO1034     FALSE 0.342 153.000 0.079 NA   NA
 144483 2201057 YPO1035 YPOs03 syd csrB FALSE 0.070 263.000 0.000 NA   NA
 2201057 144484 YPOs03 YPO1036 csrB tnp FALSE 0.243 146.000 0.000 NA   NA
 144484 144485 YPO1036 YPO1037 tnp   FALSE 0.077 254.000 0.000 NA   NA
 144485 144486 YPO1037 YPO1038     TRUE 0.995 0.000 0.518 NA   NA
 144486 144487 YPO1038 YPO1039     TRUE 0.855 28.000 0.209 1.000 N NA
 144488 144489 YPO1040 YPO1041   dapD FALSE 0.260 124.000 0.035 NA   NA
 144489 144490 YPO1041 YPO1042 dapD glnD FALSE 0.228 175.000 0.097 1.000 N NA
 144490 144491 YPO1042 YPO1043 glnD ampM TRUE 0.971 3.000 0.243 1.000 N NA
 144492 144493 YPO1044 YPO1045 rpsB tsf TRUE 0.974 128.000 0.748 1.000 Y NA
 144493 144494 YPO1045 YPO1046 tsf pyrH TRUE 0.574 209.000 0.416 1.000 N NA
 144494 144495 YPO1046 YPO1047 pyrH frr TRUE 0.851 136.000 0.626 1.000 N NA
 144495 144496 YPO1047 YPO1048 frr dxr FALSE 0.041 214.000 0.032 1.000 N NA
 144496 144497 YPO1048 YPO1049 dxr uppS TRUE 0.433 224.000 0.025 1.000 Y NA
 144497 144498 YPO1049 YPO1050 uppS cdsA TRUE 0.994 10.000 0.400 1.000 Y NA
 144498 144499 YPO1050 YPO1051 cdsA   TRUE 0.616 29.000 0.080 1.000 N NA
 144499 144500 YPO1051 YPO1052     TRUE 0.961 37.000 0.204 1.000 Y NA
 144500 144501 YPO1052 YPO1053   ompH TRUE 0.913 158.000 0.354 1.000 Y NA
 144501 144502 YPO1053 YPO1054 ompH lpxD TRUE 0.999 4.000 0.814 1.000 Y NA
 144502 144503 YPO1054 YPO1055 lpxD fabZ TRUE 0.886 158.000 0.796 1.000 N NA
 144503 144504 YPO1055 YPO1056 fabZ lpxA TRUE 0.995 4.000 0.850 1.000 N NA
 144504 144505 YPO1056 YPO1057 lpxA lpxB TRUE 0.994 4.000 0.289 1.000 Y NA
 144505 144506 YPO1057 YPO1058 lpxB rnhB TRUE 0.975 -3.000 0.186 1.000 N NA
 144506 144507 YPO1058 YPO1059 rnhB dnaE TRUE 0.790 130.000 0.104 1.000 Y NA
 144507 144508 YPO1059 YPO1060 dnaE accA TRUE 0.842 13.000 0.122 1.000 N NA
 144508 144509 YPO1060 YPO1061 accA   FALSE 0.017 184.000 0.008 NA N NA
 144509 144510 YPO1061 YPO1062     TRUE 0.499 2.000 0.015 NA N NA
 144510 144511 YPO1062 YPO1063     FALSE 0.011 237.000 0.005 1.000 N NA
 144512 144513 YPO1064 YPO1064a     TRUE 0.975 -13.000 0.179 NA   NA
 144514 144515 YPO1065 YPO1066     TRUE 0.883 3.000 0.034 1.000   NA
 144515 144516 YPO1066 YPO1067   cutF TRUE 0.494 40.000 0.027 NA   NA
 144517 144518 YPO1068 YPO1069 proS   FALSE 0.325 104.000 0.048 NA   NA
 144518 144519 YPO1069 YPO1070   rcsF TRUE 0.988 -3.000 0.247 NA   NA
 144519 144520 YPO1070 YPO1071 rcsF intA2 TRUE 0.862 118.000 0.500 NA   NA
 144520 144521 YPO1071 YPO1072 intA2   TRUE 0.966 64.000 0.411 NA Y NA
 144521 144522 YPO1072 YPO1073   abc TRUE 0.999 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 144523 2201058 YPO1074 YPOr04   16S_rRNA FALSE 0.021 469.000 0.000 NA   NA
 2201058 5922250 YPOr04 YPt_10 16S_rRNA   FALSE 0.217 164.000 0.000 NA   NA
 5922250 407418 YPt_10 YPOr05   23S_rRNA FALSE 0.078 253.000 0.000 NA   NA
 407418 2201059 YPOr05 YPOr06 23S_rRNA 5S_rRNA TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 2201059 5922251 YPOr06 YPt_11 5S_rRNA   FALSE 0.281 118.000 0.000 NA   NA
 5922251 144524 YPt_11 YPO1075     FALSE 0.035 359.000 0.000 NA   NA
 144524 144525 YPO1075 YPO1076     TRUE 0.582 35.000 0.000 NA   NA
 144525 144526 YPO1076 YPO1077     FALSE 0.034 361.000 0.000 NA   NA
 144527 144528 YPO1078 YPO1079 mltD gloB TRUE 0.900 33.000 0.233 1.000   NA
 144531 5922252 YPO1082 YPt_12 chb   FALSE 0.287 113.000 0.000 NA   NA
 144533 144534 YPO1085 YPO1086     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144534 144535 YPO1086 YPO1086a   intA FALSE 0.331 89.000 0.000 NA   NA
 144536 144537 YPO1087 YPO1088     TRUE 0.816 8.000 0.000 NA   NA
 144538 144539 YPO1089 YPO1090     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144539 144540 YPO1090 YPO1091     TRUE 0.994 -7.000 0.500 NA   NA
 144540 144541 YPO1091 YPO1092     FALSE 0.163 193.000 0.000 NA   NA
 144541 144542 YPO1092 YPO1092a     TRUE 0.969 13.000 0.333 NA   NA
 144542 144543 YPO1092a YPO1094     FALSE 0.327 92.000 0.000 NA   NA
 144545 144546 YPO1096 YPO1097     TRUE 0.856 51.000 0.250 NA   NA
 144546 144547 YPO1097 YPO1098     FALSE 0.347 79.000 0.000 NA   NA
 144547 144548 YPO1098 YPO1099   tnp TRUE 0.578 224.000 0.000 0.095 Y NA
 144550 144551 YPO1102 YPO1103     TRUE 0.967 -7.000 0.124 NA   NA
 144552 144553 YPO1104 YPO1105     FALSE 0.175 105.000 0.049 1.000 N NA
 144553 144554 YPO1105 YPO1106     TRUE 0.605 69.000 0.170 1.000 N NA
 144557 144558 YPO1109 YPO1110 sdhC sdhD TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 144558 144559 YPO1110 YPO1111 sdhD sdhA TRUE 1.000 1.000 0.705 0.002 Y NA
 144559 144560 YPO1111 YPO1112 sdhA sdhB TRUE 0.993 50.000 0.604 0.002 Y NA
 144560 144561 YPO1112 YPO1113 sdhB sucA FALSE 0.236 356.000 0.067 1.000 Y NA
 144561 144562 YPO1113 YPO1114 sucA sucB TRUE 0.993 30.000 0.667 1.000 Y NA
 144562 144563 YPO1114 YPO1115 sucB sucC TRUE 0.843 113.000 0.136 1.000 Y NA
 144563 144564 YPO1115 YPO1116 sucC sucD TRUE 1.000 0.000 0.806 0.001 Y NA
 144564 144565 YPO1116 YPO1117 sucD cydA FALSE 0.083 767.000 0.000 1.000 Y NA
 144565 144566 YPO1117 YPO1118 cydA cydB TRUE 0.994 15.000 0.348 0.042 Y NA
 144566 144567 YPO1118 YPO1119 cydB   TRUE 0.506 92.000 0.100 NA   NA
 144567 144568 YPO1119 YPO1120     FALSE 0.411 132.000 0.095 NA   NA
 144568 144569 YPO1120 YPO1121   tolQ TRUE 0.996 0.000 0.593 1.000   NA
 144569 144570 YPO1121 YPO1122 tolQ tolR TRUE 0.997 13.000 0.556 0.084 Y NA
 144570 144571 YPO1122 YPO1123 tolR tolA FALSE 0.357 112.000 0.114 NA N NA
 144571 144572 YPO1123 YPO1124 tolA tolB FALSE 0.153 120.000 0.051 NA N NA
 144572 144573 YPO1124 YPO1125 tolB pal TRUE 0.935 51.000 0.592 1.000 N NA
 144573 144574 YPO1125 YPO1126 pal   TRUE 0.889 10.000 0.088 1.000   NA
 144574 5922253 YPO1126 YPt_13     FALSE 0.167 191.000 0.000 NA   NA
 5922253 5922254 YPt_13 YPt_14     TRUE 0.639 28.000 0.000 NA   NA
 5922254 5922255 YPt_14 YPt_15     TRUE 0.632 29.000 0.000 NA   NA
 5922255 5922256 YPt_15 YPt_15     TRUE 0.894 -69.000 0.000 NA   NA
 5922256 144575 YPt_15 YPO1127   nadA FALSE 0.033 369.000 0.000 NA   NA
 144575 144576 YPO1127 YPO1128 nadA pnuC TRUE 0.698 122.000 0.023 1.000 Y NA
 144578 144579 YPO1131 YPO1132     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144579 144580 YPO1132 YPO1133   gpmA FALSE 0.014 366.000 0.000 1.000 N NA
 144580 144581 YPO1133 YPO1134 gpmA psiF FALSE 0.038 347.000 0.000 NA   NA
 144581 2201062 YPO1134 YPO1135 psiF galM FALSE 0.055 293.000 0.000 NA   NA
 2201062 144582 YPO1135 YPO1137 galM galK TRUE 0.923 -6.000 0.000 NA   NA
 144582 144583 YPO1137 YPO1138 galK galT TRUE 0.996 -3.000 0.370 0.001 N NA
 144583 144584 YPO1138 YPO1139 galT galE TRUE 0.929 10.000 0.053 0.001 N NA
 144584 144585 YPO1139 YPO1140 galE   FALSE 0.034 360.000 0.000 NA   NA
 144585 144586 YPO1140 YPO1142   modF FALSE 0.083 217.000 0.009 NA   NA
 144586 144587 YPO1142 YPO1143 modF modE FALSE 0.268 110.000 0.028 1.000   NA
 144588 144589 YPO1144 YPO1145   modA FALSE 0.147 235.000 0.072 NA   NA
 144589 144590 YPO1145 YPO1146 modA modB TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 144590 144591 YPO1146 YPO1147 modB modC TRUE 0.999 -6.000 0.537 0.001 Y NA
 144595 144596 YPO1151 YPO1152 bioB bioF TRUE 0.997 0.000 0.168 0.002 Y NA
 144596 144597 YPO1152 YPO1153 bioF bioC TRUE 0.996 -16.000 0.133 0.002 Y NA
 144597 144598 YPO1153 YPO1154 bioC bioD TRUE 0.995 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 144600 144601 YPO1156 YPO1157 uvrB   FALSE 0.034 292.000 0.003 NA   NA
 144603 144604 YPO1159 YPO1160 moaA moaC TRUE 0.870 101.000 0.039 0.003 Y NA
 144604 144605 YPO1160 YPO1161 moaC moaD TRUE 0.998 -3.000 0.175 0.003 Y NA
 144605 144606 YPO1161 YPO1162 moaD moaE TRUE 0.999 0.000 0.501 0.003 Y NA
 144606 144607 YPO1162 YPO1163 moaE   FALSE 0.207 143.000 0.025 NA   NA
 144607 144608 YPO1163 YPO1164   tnp FALSE 0.099 235.000 0.000 NA   NA
 144609 144610 YPO1165 YPO1166 betA betB TRUE 0.974 23.000 0.634 1.000 N NA
 144610 144611 YPO1166 YPO1167 betB fabF2 TRUE 0.893 58.000 0.459 1.000 N NA
 144612 144613 YPO1168 YPO1169 betT   FALSE 0.042 232.000 0.000 1.000 N NA
 144615 2201063 YPO1171 YPO1172 xapA xapB' FALSE 0.250 139.000 0.000 NA   NA
 2201063 144616 YPO1172 YPO1173 xapB' tnp FALSE 0.243 146.000 0.000 NA   NA
 144616 144617 YPO1173 YPO1174 tnp   FALSE 0.026 415.000 0.000 NA   NA
 144617 144618 YPO1174 YPO1175     FALSE 0.054 294.000 0.000 NA   NA
 144618 144619 YPO1175 YPO1176   pbpG FALSE 0.006 592.000 0.000 1.000 N NA
 144623 144624 YPO1180 YPO1181     TRUE 0.523 110.000 0.125 NA   NA
 144624 144625 YPO1181 YPO1182     FALSE 0.126 208.000 0.032 1.000   NA
 144625 144626 YPO1182 YPO1183     TRUE 0.995 37.000 0.589 0.002 Y NA
 144626 144627 YPO1183 YPO1184     TRUE 0.977 163.000 0.568 0.001 Y NA
 144627 144628 YPO1184 YPO1185     TRUE 0.999 -3.000 0.491 0.001 Y NA
 144628 144629 YPO1185 YPO1186     FALSE 0.086 246.000 0.000 NA   NA
 144629 144630 YPO1186 YPO1187     FALSE 0.024 435.000 0.000 NA   NA
 144630 144631 YPO1187 YPO1188     TRUE 0.968 124.000 0.654 1.000 Y NA
 144631 144632 YPO1188 YPO1189     TRUE 0.999 0.000 0.758 0.060 Y NA
 144632 144633 YPO1189 YPO1190     TRUE 0.998 -3.000 0.823 1.000   NA
 144633 144634 YPO1190 YPO1191     TRUE 0.963 94.000 0.731 0.022   NA
 144634 144635 YPO1191 YPO1192     FALSE 0.285 115.000 0.000 NA   NA
 144635 144636 YPO1192 YPO1193     TRUE 0.675 24.000 0.000 NA   NA
 2201064 144638 YPO1195 YPO1197     FALSE 0.072 261.000 0.000 NA   NA
 144638 144639 YPO1197 YPO1198     TRUE 0.999 -3.000 0.489 1.000 Y NA
 144639 144640 YPO1198 YPO1199     TRUE 0.999 -3.000 0.542 1.000 Y NA
 144640 144641 YPO1199 YPO1200     FALSE 0.126 478.000 0.000 1.000 Y NA
 144641 144642 YPO1200 YPO1201     TRUE 0.942 70.000 0.286 1.000 Y NA
 144643 144644 YPO1203 YPO1205   ompC2 FALSE 0.027 412.000 0.000 NA   NA
 144650 144651 YPO1211 YPO1212 eco   TRUE 0.520 35.000 0.023 NA   NA
 144651 144652 YPO1212 YPO1213   nrdB TRUE 0.677 4.000 0.034 1.000 N NA
 144652 144653 YPO1213 YPO1214 nrdB nrdA TRUE 0.990 163.000 1.000 0.002 Y NA
 144653 144654 YPO1214 YPO1215 nrdA ubiG FALSE 0.008 494.000 0.000 1.000 N NA
 144655 144656 YPO1216 YPO1217 gyrA rcsC FALSE 0.030 188.000 0.013 1.000 N NA
 144657 2201065 YPO1218 YPO1219 rcsB   TRUE 0.886 3.000 0.000 NA   NA
 2201065 144658 YPO1219 YPO1221     TRUE 0.675 24.000 0.000 NA   NA
 144658 2201066 YPO1221 YPOs05   micF FALSE 0.014 699.000 0.000 NA   NA
 144659 144660 YPO1222 YPO1223 ompC tnp FALSE 0.063 202.000 0.000 1.000 N NA
 144660 5922257 YPO1223 YPt_16 tnp   FALSE 0.025 434.000 0.000 NA   NA
 5922257 5922258 YPt_16 YPt_17     TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   NA
 144661 144662 YPO1224 YPO1226 ampH   FALSE 0.023 275.000 0.000 NA N NA
 144664 144665 YPO1229 YPO1231 tsr2 pla2 FALSE 0.010 422.000 0.000 1.000 N NA
 144665 144666 YPO1231 YPO1232 pla2 msgA FALSE 0.214 172.000 0.000 1.000   NA
 144666 144667 YPO1232 YPO1233 msgA   FALSE 0.144 206.000 0.000 1.000   NA
 144668 144669 YPO1234 YPO1235     FALSE 0.145 202.000 0.000 NA   NA
 144669 144670 YPO1235 YPO1236     TRUE 0.935 -3.000 0.044 NA   NA
 144670 144671 YPO1236 YPO1237     TRUE 0.754 80.000 0.015 1.000 Y NA
 144671 144672 YPO1237 YPO1238     TRUE 0.990 18.000 0.400 1.000 Y NA
 144672 144673 YPO1238 YPO1239     FALSE 0.015 614.000 0.000 NA   NA
 144673 144674 YPO1239 YPO1240     TRUE 0.513 46.000 0.000 NA   NA
 144674 144675 YPO1240 YPO1241     TRUE 0.989 5.000 0.500 NA   NA
 144675 144676 YPO1241 YPO1242     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 144676 144677 YPO1242 YPO1243     TRUE 0.991 22.000 1.000 NA   NA
 144677 144678 YPO1243 YPO1244     TRUE 0.998 2.000 1.000 NA   NA
 144678 144679 YPO1244 YPO1245     TRUE 0.906 121.000 0.667 NA   NA
 144679 144680 YPO1245 YPO1246     FALSE 0.105 267.000 0.074 NA   NA
 144680 144681 YPO1246 YPO1247     TRUE 0.957 -3.000 0.074 NA   NA
 144681 144682 YPO1247 YPO1248     TRUE 0.993 16.000 1.000 NA   NA
 144682 144683 YPO1248 YPO1249     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 144683 144684 YPO1249 YPO1250     TRUE 0.997 4.000 1.000 NA   NA
 144684 144685 YPO1250 YPO1250a     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 144685 144686 YPO1250a YPO1251     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144686 144687 YPO1251 YPO1252   stf FALSE 0.313 97.000 0.000 NA   NA
 144687 144688 YPO1252 YPO1253 stf   FALSE 0.052 298.000 0.000 NA   NA
 144688 144689 YPO1253 YPO1254   bglA FALSE 0.100 291.000 0.000 0.018 N NA
 144690 144691 YPO1255 YPO1257     FALSE 0.014 700.000 0.000 NA   NA
 144691 144692 YPO1257 YPO1258     TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 144692 144693 YPO1258 YPO1259     FALSE 0.035 357.000 0.000 NA   NA
 144693 5922259 YPO1259 YPt_18     TRUE 0.490 50.000 0.000 NA   NA
 5922259 144694 YPt_18 YPO1260     FALSE 0.297 105.000 0.000 NA   NA
 144694 144695 YPO1260 YPO1261     TRUE 0.639 28.000 0.040 NA   NA
 144696 144697 YPO1262 YPO1263   tnp FALSE 0.147 201.000 0.000 NA   NA
 144698 144699 YPO1264 YPO1265 rplY   FALSE 0.325 162.000 0.024 0.014 N NA
 144700 144701 YPO1266 YPO1267 rsuA bcr TRUE 0.445 119.000 0.145 1.000 N NA
 144701 144702 YPO1267 YPO1269 bcr   FALSE 0.012 967.000 0.000 NA   NA
 144703 144704 YPO1270 YPO1271     TRUE 0.997 2.000 0.758 1.000   NA
 144704 144705 YPO1271 YPO1272     TRUE 0.999 0.000 0.833 0.060   NA
 144705 144706 YPO1272 YPO1273     TRUE 0.996 10.000 0.848 0.060   NA
 144706 144707 YPO1273 YPO1274     TRUE 0.804 82.000 0.394 NA N NA
 144707 144708 YPO1274 YPO1275   spr FALSE 0.043 795.000 0.219 NA N NA
 144708 144709 YPO1275 YPO1276 spr   FALSE 0.024 442.000 0.000 NA   NA
 144709 144710 YPO1276 YPO1277     TRUE 0.844 59.000 0.275 NA   NA
 144711 144712 YPO1278 YPO1279     TRUE 0.656 109.000 0.200 NA   NA
 144715 144716 YPO1284 YPO1285   mtr TRUE 0.483 104.000 0.153 1.000 N NA
 144718 144719 YPO1287 YPO1288     TRUE 0.864 11.000 0.000 0.048 N NA
 144719 144720 YPO1288 YPO1289     TRUE 0.969 -3.000 0.017 0.048   NA
 144721 144722 YPO1290 YPO1291     TRUE 0.821 4.000 0.065 1.000 N NA
 144722 144723 YPO1291 YPO1292   rpiA TRUE 0.942 20.000 0.000 1.000 Y NA
 144723 144724 YPO1292 YPO1293 rpiA   TRUE 0.696 132.000 0.000 NA Y NA
 144724 144725 YPO1293 YPO1294     TRUE 0.939 109.000 0.375 NA Y NA
 144725 144726 YPO1294 YPO1295     TRUE 0.990 36.000 0.375 0.012 Y NA
 144728 144729 YPO1298 YPO1299 fruB fruK TRUE 0.993 -3.000 0.112 1.000 Y NA
 144729 144730 YPO1299 YPO1300 fruK fruA TRUE 0.995 15.000 0.562 1.000 Y NA
 144730 144731 YPO1300 YPO1301 fruA psaE FALSE 0.018 325.000 0.000 1.000 N NA
 144731 144732 YPO1301 YPO1302 psaE psaF TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 144732 144733 YPO1302 YPO1303 psaF psaA FALSE 0.017 545.000 0.000 NA   NA
 144733 144734 YPO1303 YPO1304 psaA psaB TRUE 0.807 127.000 0.400 NA   NA
 144734 144735 YPO1304 YPO1305 psaB psaC TRUE 0.885 42.000 0.000 1.000 Y NA
 144736 144737 YPO1306 YPO1307 nfo   FALSE 0.218 164.000 0.040 NA   NA
 144738 144739 YPO1308 YPO1309   lysP FALSE 0.231 258.000 0.222 1.000 N NA
 144739 144740 YPO1309 YPO1310 lysP   FALSE 0.024 286.000 0.000 1.000 N NA
 144740 144741 YPO1310 YPO1311     TRUE 0.756 195.000 0.175 1.000 Y NA
 144741 144742 YPO1311 YPO1312     TRUE 0.999 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 144742 144743 YPO1312 YPO1313     FALSE 0.347 260.000 0.000 1.000 Y NA
 144744 144745 YPO1314 YPO1315     FALSE 0.154 154.000 0.056 1.000 N NA
 144746 144747 YPO1316 YPO1317     FALSE 0.314 228.000 0.174 NA   NA
 144747 144748 YPO1317 YPO1318     TRUE 0.998 -3.000 0.323 NA Y NA
 144748 144749 YPO1318 YPO1319     TRUE 0.993 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 144749 144750 YPO1319 YPO1320   dacC FALSE 0.038 242.000 0.000 1.000 N NA
 144751 144752 YPO1321 YPO1322 sdaC deoR FALSE 0.005 1100.000 0.000 1.000 N NA
 144752 144753 YPO1322 YPO1323 deoR   FALSE 0.031 230.000 0.030 1.000 N NA
 144753 144754 YPO1323 YPO1324     FALSE 0.079 258.000 0.000 1.000   NA
 144754 144755 YPO1324 YPO1325     TRUE 0.909 9.000 0.106 1.000   NA
 144755 144756 YPO1325 YPO1326     FALSE 0.044 333.000 0.000 1.000   NA
 144756 144757 YPO1326 YPO1327   grxA FALSE 0.029 410.000 0.000 1.000   NA
 144758 144759 YPO1328 YPO1329     TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 144759 144760 YPO1329 YPO1330     TRUE 0.823 7.000 0.000 NA   NA
 144760 144761 YPO1330 YPO1331   potF FALSE 0.019 518.000 0.000 NA   NA
 144761 144762 YPO1331 YPO1332 potF potG TRUE 0.959 171.000 0.679 1.000 Y NA
 144762 144763 YPO1332 YPO1333 potG potH TRUE 0.996 25.000 0.857 1.000 Y NA
 144763 144764 YPO1333 YPO1334 potH potI TRUE 0.999 -3.000 0.528 0.059 Y NA
 144764 144765 YPO1334 YPO1335 potI   TRUE 0.713 125.000 0.264 NA   NA
 144765 144766 YPO1335 YPO1336     TRUE 0.559 84.000 0.119 NA   NA
 144767 144768 YPO1338 YPO1339     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144768 144769 YPO1339 YPO1341     FALSE 0.013 776.000 0.000 NA   NA
 144769 144770 YPO1341 YPO1342     FALSE 0.039 341.000 0.000 NA   NA
 144770 144771 YPO1342 YPO1343     FALSE 0.012 367.000 0.000 NA N NA
 144771 144772 YPO1343 YPO1344     TRUE 0.678 151.000 0.000 1.000 Y NA
 144772 144773 YPO1344 YPO1345     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144773 144774 YPO1345 YPO1346     TRUE 0.935 -3.000 0.000 1.000   NA
 144774 144775 YPO1346 YPO1347     TRUE 0.989 -7.000 0.312 NA   NA
 144775 144776 YPO1347 YPO1348     TRUE 0.973 -3.000 0.125 NA   NA
 144777 144778 YPO1349 YPO1350 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.018 Y NA
 144778 144779 YPO1350 YPO1351 artQ artI TRUE 0.993 12.000 0.260 0.082 Y NA
 144779 144780 YPO1351 YPO1352 artI artP TRUE 0.986 21.000 0.323 1.000 Y NA
 144780 144781 YPO1352 YPO1353 artP   FALSE 0.278 295.000 0.000 1.000 Y NA
 144781 144782 YPO1353 YPO1354     FALSE 0.157 170.000 0.018 NA   NA
 144782 144783 YPO1354 YPO1355     TRUE 0.627 97.000 0.167 NA   NA
 144783 144784 YPO1355 YPO1356     TRUE 0.856 100.000 0.022 0.004 Y NA
 144784 144785 YPO1356 YPO1357   ltaA TRUE 0.921 -3.000 0.074 1.000 N NA
 144785 144786 YPO1357 YPO1358 ltaA poxB FALSE 0.199 349.000 0.031 1.000 Y NA
 144786 144787 YPO1358 YPO1359 poxB hcr FALSE 0.052 144.000 0.017 1.000 N NA
 144787 144788 YPO1359 YPO1360 hcr hcp TRUE 0.882 114.000 0.085 0.012 Y NA
 144788 144789 YPO1360 YPO1361 hcp   FALSE 0.124 202.000 0.028 NA   NA
 144792 144793 YPO1364 YPO1365     TRUE 0.996 0.000 0.789 1.000 N NA
 144795 144796 YPO1367 YPO1368   clpA TRUE 0.975 26.000 0.596 NA   NA
 144796 144797 YPO1368 YPO1369 clpA tnp FALSE 0.022 293.000 0.000 1.000 N NA
 144798 144799 YPO1370 YPO1371 infA aat FALSE 0.051 166.000 0.020 1.000 N NA
 144799 144800 YPO1371 YPO1372 aat cydC TRUE 0.497 219.000 0.049 1.000 Y NA
 144800 144801 YPO1372 YPO1373 cydC cydD TRUE 0.999 3.000 0.631 0.006 Y NA
 144801 144802 YPO1373 YPO1374 cydD trxB FALSE 0.150 441.000 0.049 1.000 Y NA
 144803 144804 YPO1375 YPO1376 lrp ftsK TRUE 0.726 123.000 0.345 1.000 N NA
 144804 144805 YPO1376 YPO1377 ftsK lolA TRUE 0.530 193.000 0.305 1.000 N NA
 144805 144806 YPO1377 YPO1378 lolA   TRUE 0.904 11.000 0.167 1.000 N NA
 144806 144807 YPO1378 YPO1379   serS FALSE 0.085 242.000 0.078 1.000 N NA
 144807 144808 YPO1379 YPO1380 serS   FALSE 0.029 263.000 0.000 1.000 N NA
 144811 144812 YPO1383 YPO1384 pflB focA TRUE 0.685 56.000 0.172 1.000 N NA
 144812 144813 YPO1384 YPO1385 focA   FALSE 0.014 697.000 0.000 NA   NA
 144814 144815 YPO1386 YPO1387 ansB   FALSE 0.070 269.000 0.000 1.000   NA
 144815 144816 YPO1387 YPO1388     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 144816 144817 YPO1388 YPO1389   serC FALSE 0.033 367.000 0.000 NA   NA
 144817 144818 YPO1389 YPO1390 serC aroA TRUE 0.643 163.000 0.033 1.000 Y NA
 144818 144819 YPO1390 YPO1391 aroA cmk FALSE 0.139 313.000 0.209 1.000 N NA
 144819 144820 YPO1391 YPO1392 cmk rpsA TRUE 0.557 174.000 0.281 1.000 N NA
 144820 144821 YPO1392 YPO1393 rpsA ihfB TRUE 0.801 61.000 0.292 1.000 N NA
 144821 144822 YPO1393 YPO1394 ihfB   FALSE 0.012 547.000 0.003 1.000   NA
 144822 144823 YPO1394 YPO1395   msbA TRUE 0.828 36.000 0.075 0.079   NA
 144823 144824 YPO1395 YPO1396 msbA lpxK TRUE 0.978 -3.000 0.205 1.000 N NA
 144826 144827 YPO1398 YPO1399 cspB   FALSE 0.011 548.000 0.004 NA   NA
 144827 144828 YPO1399 YPO1400   kdsB TRUE 0.989 -3.000 0.265 NA   NA
 144828 144829 YPO1400 YPO1401 kdsB   FALSE 0.027 363.000 0.023 NA   NA
 144829 144830 YPO1401 YPO1402   smtA FALSE 0.013 773.000 0.000 NA   NA
 144830 144831 YPO1402 YPO1403 smtA mukF TRUE 0.988 -3.000 0.325 NA N NA
 144831 144832 YPO1403 YPO1404 mukF mukE TRUE 0.987 8.000 0.196 NA Y NA
 144832 144833 YPO1404 YPO1405 mukE mukB TRUE 1.000 -3.000 0.786 0.001 Y NA
 144833 144834 YPO1405 YPO1406 mukB tnp FALSE 0.165 216.000 0.000 0.093 N NA
 144834 144835 YPO1406 YPO1407 tnp   FALSE 0.063 284.000 0.000 1.000   NA
 144835 144836 YPO1407 YPO1408     TRUE 0.563 224.000 0.372 NA   NA
 144836 144837 YPO1408 YPO1409     TRUE 0.586 61.000 0.089 NA   NA
 144838 144839 YPO1410 YPO1411 aspC   FALSE 0.031 257.000 0.000 1.000 N NA
 144839 144840 YPO1411 YPO1412   asnS FALSE 0.021 298.000 0.000 1.000 N NA
 144840 144841 YPO1412 YPO1413 asnS pncB FALSE 0.006 499.000 0.034 1.000 N NA
 144842 144843 YPO1414 YPO1415 pepN pyrD FALSE 0.002 618.000 0.014 1.000 N NA
 144843 144844 YPO1415 YPO1416 pyrD   FALSE 0.280 183.000 0.081 NA   NA
 144846 144847 YPO1418 YPO1419   uup TRUE 0.878 6.000 0.061 1.000   NA
 144847 144848 YPO1419 YPO1420 uup pqiA FALSE 0.308 129.000 0.054 NA   NA
 144848 144849 YPO1420 YPO1421 pqiA pqiB TRUE 0.992 14.000 0.819 NA   NA
 144849 144850 YPO1421 YPO1422 pqiB   TRUE 0.996 -3.000 0.531 NA   NA
 144850 144851 YPO1422 YPO1423     TRUE 0.498 49.000 0.000 NA   NA
 144851 144852 YPO1423 YPO1423a   rmf FALSE 0.344 81.000 0.000 NA   NA
 144852 144853 YPO1423a YPO1424 rmf tnp FALSE 0.058 198.000 0.000 NA N NA
 2201068 144854 YPO1428 YPO1426     TRUE 0.891 -1826.000 0.000 NA   NA
 144854 144855 YPO1426 YPO1427     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144857 144858 YPO1430 YPO1431 fabA   TRUE 0.763 69.000 0.290 1.000 N NA
 144860 144861 YPO1434 YPO1435 tnp ompA FALSE 0.074 190.000 0.000 1.000 N NA
 144861 144862 YPO1435 YPO1436 ompA sulA FALSE 0.014 358.000 0.000 1.000 N NA
 144864 144865 YPO1438 YPO1439     TRUE 0.762 30.000 0.090 NA   NA
 144867 144868 YPO1441 YPO1442 mgsA   FALSE 0.227 179.000 0.055 NA   NA
 144870 144871 YPO1444 YPO1445     TRUE 0.721 37.000 0.094 NA   NA
 144874 144875 YPO1451 YPO1452     FALSE 0.355 154.000 0.000 0.025 N NA
 144876 144877 YPO1453 YPO1454     FALSE 0.042 330.000 0.000 NA   NA
 144877 144878 YPO1454 YPO1455     TRUE 0.989 -10.000 0.083 NA Y NA
 144878 144879 YPO1455 YPO1456     TRUE 0.989 -7.000 0.056 1.000 Y NA
 144879 144880 YPO1456 YPO1457     TRUE 0.989 16.000 0.333 1.000 Y NA
 144880 144881 YPO1457 YPO1458     TRUE 0.992 -7.000 0.120 1.000 Y NA
 144881 144882 YPO1458 YPO1459     TRUE 0.996 -7.000 0.120 0.020 Y NA
 144882 144883 YPO1459 YPO1460     TRUE 0.990 3.000 0.051 0.047 Y NA
 144883 144884 YPO1460 YPO1461     TRUE 0.550 39.000 0.000 NA   NA
 144884 144885 YPO1461 YPO1462     TRUE 0.556 38.000 0.000 NA   NA
 144885 144886 YPO1462 YPO1463     FALSE 0.323 99.000 0.000 1.000   NA
 144886 144887 YPO1463 YPO1464     FALSE 0.228 157.000 0.000 NA   NA
 144887 144888 YPO1464 YPO1465     FALSE 0.014 665.000 0.000 NA   NA
 144888 144889 YPO1465 YPO1466     TRUE 0.526 43.000 0.000 NA   NA
 144889 144890 YPO1466 YPO1467     TRUE 0.781 12.000 0.000 NA   NA
 144890 144891 YPO1467 YPO1468     TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 144891 144892 YPO1468 YPO1469     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 144892 144893 YPO1469 YPO1470     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 144893 144894 YPO1470 YPO1471     FALSE 0.051 388.000 0.083 NA   NA
 144894 144895 YPO1471 YPO1472     TRUE 0.954 3.000 0.125 NA   NA
 144895 144896 YPO1472 YPO1473     TRUE 0.969 16.000 0.400 NA   NA
 144896 144897 YPO1473 YPO1474     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144897 144898 YPO1474 YPO1475     FALSE 0.233 154.000 0.000 NA   NA
 144898 144899 YPO1475 YPO1476     TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 144899 144900 YPO1476 YPO1477     TRUE 0.801 173.000 0.500 NA   NA
 144900 144901 YPO1477 YPO1481     FALSE 0.011 2276.000 0.000 NA   NA
 144901 144902 YPO1481 YPO1482     TRUE 0.997 -3.000 0.625 NA   NA
 144902 144903 YPO1482 YPO1483     TRUE 0.733 44.000 0.120 NA   NA
 144903 144904 YPO1483 YPO1484     TRUE 0.912 -9.000 0.040 NA   NA
 144904 144905 YPO1484 YPO1484a     TRUE 0.988 0.000 0.286 NA   NA
 144905 144906 YPO1484a YPO1485     FALSE 0.115 221.000 0.000 NA   NA
 144906 144907 YPO1485 YPO1486     TRUE 0.996 -36.000 0.750 NA   NA
 144907 144908 YPO1486 YPO1487     TRUE 0.951 68.000 0.750 NA   NA
 144908 144909 YPO1487 YPO1488     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 144909 144910 YPO1488 YPO1489     TRUE 0.665 25.000 0.000 NA   NA
 144912 144913 YPO1491 YPO1492     FALSE 0.105 228.000 0.000 NA   NA
 144914 144915 YPO1493 YPO1494   moeB FALSE 0.118 136.000 0.000 1.000 N NA
 144915 144916 YPO1494 YPO1495 moeB moeA TRUE 0.997 5.000 0.323 0.003 Y NA
 144916 144917 YPO1495 YPO1496 moeA   FALSE 0.019 535.000 0.000 1.000   NA
 144917 144918 YPO1496 YPO1497     TRUE 0.893 10.000 0.094 1.000   NA
 144918 144919 YPO1497 YPO1498     TRUE 0.912 2.000 0.094 1.000 N NA
 144919 144920 YPO1498 YPO1499     TRUE 0.993 2.000 0.500 NA   NA
 144920 144921 YPO1499 YPO1500     FALSE 0.339 84.000 0.000 NA   NA
 144921 144922 YPO1500 YPO1501     FALSE 0.075 257.000 0.000 NA   NA
 144922 144923 YPO1501 YPO1502     TRUE 0.942 21.000 0.273 1.000   NA
 144923 144924 YPO1502 YPO1503     TRUE 0.533 280.000 0.636 1.000 N NA
 144925 144926 YPO1504 YPO1505   folE TRUE 0.581 184.000 0.250 NA   NA
 144926 144927 YPO1505 YPO1506 folE   TRUE 0.962 55.000 0.719 NA   NA
 144927 144928 YPO1506 YPO1507   tnpA_1 FALSE 0.013 748.000 0.000 NA   NA
 144928 144929 YPO1507 YPO1508 tnpA_1 mglA TRUE 0.728 230.000 0.250 NA Y NA
 144929 144930 YPO1508 YPO1509 mglA mglC TRUE 0.997 21.000 0.905 1.000 Y NA
 144931 144932 YPO1510 YPO1511   sfcA FALSE 0.064 281.000 0.045 NA   NA
 144932 144933 YPO1511 YPO1512 sfcA cdd FALSE 0.008 356.000 0.022 1.000 N NA
 144933 144934 YPO1512 YPO1513 cdd   FALSE 0.119 326.000 0.198 NA N NA
 144934 144935 YPO1513 YPO1514     TRUE 0.992 -3.000 0.340 NA   NA
 144935 144936 YPO1514 YPO1515     FALSE 0.178 242.000 0.021 0.078   NA
 144936 144937 YPO1515 YPO1516     FALSE 0.041 333.000 0.000 NA   NA
 144937 144938 YPO1516 YPO1517     TRUE 0.922 15.000 0.177 NA   NA
 144940 144941 YPO1519 YPO1520     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 144944 144945 YPO1523 YPO1524   udk FALSE 0.076 245.000 0.073 1.000 N NA
 144945 144946 YPO1524 YPO1525 udk dcd TRUE 0.813 105.000 0.098 1.000 Y NA
 144946 144947 YPO1525 YPO1526 dcd   FALSE 0.108 187.000 0.057 NA N NA
 144949 144950 YPO1528 YPO1529     FALSE 0.235 152.000 0.000 NA   NA
 144950 144951 YPO1529 YPO1530   alcA TRUE 0.964 35.000 0.667 1.000 N NA
 144951 144952 YPO1530 YPO1531 alcA alcB TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA N NA
 144952 144953 YPO1531 YPO1532 alcB   TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA N NA
 144954 144955 YPO1533 YPO1534     TRUE 0.999 -3.000 0.583 1.000 Y NA
 144955 144956 YPO1534 YPO1535     TRUE 0.999 -13.000 0.818 0.058 Y NA
 144956 144957 YPO1535 YPO1536     TRUE 0.998 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 144957 144958 YPO1536 YPO1537     TRUE 0.948 90.000 0.364 1.000 Y NA
 144958 144959 YPO1537 YPO1538     TRUE 0.775 213.000 0.455 0.002 N NA
 144960 144961 YPO1539 YPO1540 galU galF TRUE 0.933 84.000 0.111 0.001 Y NA
 144961 144962 YPO1540 YPO1541 galF gnd FALSE 0.012 386.000 0.000 1.000 N NA
 144963 144964 YPO1542 YPO1543 hisI hisF TRUE 0.999 -6.000 0.430 0.003 Y NA
 144964 144965 YPO1543 YPO1544 hisF hisA TRUE 0.999 -18.000 0.433 0.003 Y NA
 144965 144966 YPO1544 YPO1545 hisA hisH TRUE 0.995 6.000 0.210 0.003 Y NA
 144966 144967 YPO1545 YPO1546 hisH hisB TRUE 0.997 0.000 0.128 0.003 Y NA
 144967 144968 YPO1546 YPO1547 hisB hisC TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 144968 144969 YPO1547 YPO1548 hisC hisD TRUE 0.998 3.000 0.294 0.003 Y NA
 144969 144970 YPO1548 YPO1549 hisD hisG TRUE 0.995 4.000 0.171 0.003 Y NA
 144971 144972 YPO1550 YPO1551     FALSE 0.029 392.000 0.000 NA   NA
 144973 144974 YPO1552 YPO1553     FALSE 0.088 245.000 0.000 NA   NA
 144974 2201069 YPO1553 YPO1554     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 144975 144976 YPO1556 YPO1557     FALSE 0.009 460.000 0.000 1.000 N NA
 11424671 144976   YPO1557     FALSE NA 495.000 0.000 NA   NA
 11567034 144976   YPO1557     FALSE NA 495.000 0.000 NA   NA
 11709426 144976   YPO1557     FALSE NA 495.000 0.000 NA   NA
 11424672 144976   YPO1557     FALSE NA 523.000 0.000 NA   NA
 11567035 144976   YPO1557     FALSE NA 523.000 0.000 NA   NA
 11709427 144976   YPO1557     FALSE NA 523.000 0.000 NA   NA
 11424673 144976   YPO1557     FALSE NA 555.000 0.000 NA   NA
 11567036 144976   YPO1557     FALSE NA 555.000 0.000 NA   NA
 11709428 144976   YPO1557     FALSE NA 555.000 0.000 NA   NA
 11424674 144976   YPO1557     FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11567037 144976   YPO1557     FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11709429 144976   YPO1557     FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11424675 144976   YPO1557     FALSE NA 615.000 0.000 NA   NA
 11567038 144976   YPO1557     FALSE NA 615.000 0.000 NA   NA
 11709430 144976   YPO1557     FALSE NA 615.000 0.000 NA   NA
 11424676 144976   YPO1557     FALSE NA 643.000 0.000 NA   NA
 11567039 144976   YPO1557     FALSE NA 643.000 0.000 NA   NA
 11709431 144976   YPO1557     FALSE NA 643.000 0.000 NA   NA
 11424677 144976   YPO1557     FALSE NA 675.000 0.000 NA   NA
 11567040 144976   YPO1557     FALSE NA 675.000 0.000 NA   NA
 11709432 144976   YPO1557     FALSE NA 675.000 0.000 NA   NA
 144978 144979 YPO1559 YPO1560     FALSE 0.025 434.000 0.000 NA   NA
 144980 144981 YPO1561 YPO1563     FALSE 0.004 4044.000 0.000 1.000 N NA
 144983 144984 YPO1565 YPO1566     TRUE 0.983 48.000 0.333 0.046 Y NA
 144984 144985 YPO1566 YPO1567     TRUE 0.942 32.000 0.290 0.020 N NA
 144985 144986 YPO1567 YPO1568     FALSE 0.347 79.000 0.000 NA   NA
 144986 144987 YPO1568 YPO1569   lldD TRUE 0.517 45.000 0.000 NA   NA
 144990 144991 YPO1572 YPO1573     TRUE 0.721 36.000 0.136 1.000 N NA
 144992 144993 YPO1574 YPO1575     FALSE 0.282 117.000 0.000 NA   NA
 5922261 144994 YPt_20 YPO1576     FALSE 0.023 446.000 0.000 NA   NA
 144994 144995 YPO1576 YPO1577     FALSE 0.031 258.000 0.000 1.000 N NA
 144995 144996 YPO1577 YPO1578     TRUE 0.997 20.000 0.905 NA Y NA
 144996 144997 YPO1578 YPO1579     TRUE 0.983 124.000 0.947 NA Y NA
 144999 2201071 YPO1581 YPO1582   lacY FALSE 0.350 78.000 0.000 NA   NA
 145002 145003 YPO1586 YPO1587 dinI pyrC FALSE 0.040 313.000 0.031 NA   NA
 145005 145006 YPO1589 YPO1590   rne FALSE 0.155 96.000 0.000 1.000 N NA
 145007 145008 YPO1591 YPO1592   tnp FALSE 0.050 220.000 0.000 1.000 N NA
 145010 145011 YPO1594 YPO1595     TRUE 0.986 13.000 0.599 NA   NA
 145011 145012 YPO1595 YPO1596     TRUE 0.929 34.000 0.418 1.000 N NA
 145012 145013 YPO1596 YPO1597   fabH TRUE 0.997 7.000 0.380 0.004 Y NA
 145013 145014 YPO1597 YPO1598 fabH inv TRUE 0.978 38.000 0.182 0.004 Y NA
 145014 145015 YPO1598 YPO1599 inv fabG TRUE 0.997 14.000 0.432 0.004 Y NA
 145015 145016 YPO1599 YPO1600 fabG acpP TRUE 0.951 154.000 0.321 0.004 Y NA
 145016 145017 YPO1600 YPO1601 acpP fabF TRUE 0.943 95.000 0.346 1.000 Y NA
 145017 145018 YPO1601 YPO1602 fabF tnp FALSE 0.065 200.000 0.000 1.000 N NA
 145018 145019 YPO1602 YPO1603 tnp   FALSE 0.011 416.000 0.000 1.000 N NA
 145019 145020 YPO1603 YPO1604     FALSE 0.220 289.000 0.204 NA   NA
 145020 145021 YPO1604 YPO1605   tmk TRUE 0.980 -10.000 0.209 NA   NA
 145021 145022 YPO1605 YPO1606 tmk holB TRUE 0.974 0.000 0.211 1.000 N NA
 145022 145023 YPO1606 YPO1607 holB   TRUE 0.969 15.000 0.110 NA Y NA
 145023 145024 YPO1607 YPO1608   ptsG FALSE 0.003 306.000 0.004 NA N NA
 145024 145025 YPO1608 YPO1609 ptsG tnp FALSE 0.074 190.000 0.000 1.000 N NA
 145025 145026 YPO1609 YPO1610 tnp aroE FALSE 0.009 443.000 0.000 1.000 N NA
 145026 145027 YPO1610 YPO1611 aroE   FALSE 0.023 174.000 0.003 1.000 N NA
 145027 145028 YPO1611 YPO1612     TRUE 0.623 35.000 0.051 NA   NA
 145028 145029 YPO1612 YPO1613     TRUE 0.951 41.000 0.516 NA   NA
 145029 145030 YPO1613 YPO1614     TRUE 0.904 41.000 0.310 NA   NA
 145030 145031 YPO1614 YPO1615     FALSE 0.316 71.000 0.069 1.000 N NA
 145031 145032 YPO1615 YPO1616     FALSE 0.411 128.000 0.091 NA   NA
 145032 145033 YPO1616 YPO1617     FALSE 0.041 375.000 0.057 NA   NA
 145033 145034 YPO1617 YPO1618     FALSE 0.205 171.000 0.000 NA   NA
 145034 145035 YPO1618 YPO1619     FALSE 0.200 173.000 0.000 NA   NA
 145035 145036 YPO1619 YPO1620     TRUE 0.816 8.000 0.000 NA   NA
 145036 145037 YPO1620 YPO1621     FALSE 0.317 96.000 0.000 NA   NA
 145038 145039 YPO1622 YPO1623     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145042 145043 YPO1626 YPO1627     TRUE 0.982 -7.000 0.175 0.079 N NA
 145043 145044 YPO1627 YPO1628     TRUE 0.979 -3.000 0.125 0.079 N NA
 145044 145045 YPO1628 YPO1629     TRUE 0.905 19.000 0.225 1.000 N NA
 145045 145046 YPO1629 YPO1630     TRUE 0.690 194.000 0.119 1.000 Y NA
 145046 145047 YPO1630 YPO1631     FALSE 0.008 330.000 0.019 1.000 N NA
 145048 145049 YPO1632 YPO1633   phoQ TRUE 0.860 84.000 0.408 NA   NA
 145049 145050 YPO1633 YPO1634 phoQ phoP TRUE 0.999 6.000 0.940 1.000 Y NA
 145050 145051 YPO1634 YPO1635 phoP   FALSE 0.138 211.000 0.000 1.000   NA
 145051 145052 YPO1635 YPO1636   purB FALSE 0.120 188.000 0.002 1.000   NA
 145052 145053 YPO1636 YPO1637 purB   TRUE 0.592 61.000 0.093 NA   NA
 145053 145054 YPO1637 YPO1638     TRUE 0.765 58.000 0.180 NA   NA
 145054 145055 YPO1638 YPO1639   fcuA FALSE 0.328 187.000 0.158 1.000 N NA
 145055 145056 YPO1639 YPO1640 fcuA   TRUE 0.969 -7.000 0.182 1.000 N NA
 145058 145059 YPO1642 YPO1643     FALSE 0.063 276.000 0.000 NA   NA
 145059 145060 YPO1643 YPO1644     TRUE 0.507 120.000 0.125 NA   NA
 145060 145061 YPO1644 YPO1645     FALSE 0.005 920.000 0.000 1.000 N NA
 145062 2201073 YPO1646 YPO1647     TRUE 0.591 34.000 0.000 NA   NA
 2201073 145063 YPO1647 YPO1648     FALSE 0.051 301.000 0.000 NA   NA
 145064 145065 YPO1649 YPO1650     FALSE 0.056 291.000 0.000 NA   NA
 145065 145066 YPO1650 YPO1651     FALSE 0.348 89.000 0.045 NA   NA
 145066 145067 YPO1651 YPO1652     FALSE 0.020 491.000 0.000 NA   NA
 145067 145068 YPO1652 YPO1653     FALSE 0.059 283.000 0.000 NA   NA
 145068 145069 YPO1653 YPO1654   lacZ FALSE 0.011 407.000 0.000 1.000 N NA
 145070 145071 YPO1655 YPO1656     FALSE 0.238 215.000 0.105 NA   NA
 145072 145073 YPO1659 YPO1660   mgtC FALSE 0.040 340.000 0.000 NA   NA
 145073 145074 YPO1660 YPO1661 mgtC mgtB FALSE 0.040 401.000 0.065 NA   NA
 145074 2201076 YPO1661 YPO1662 mgtB flhD FALSE 0.012 1179.000 0.000 NA   NA
 2201076 145075 YPO1662 YPO1663 flhD flhC TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 145075 145076 YPO1663 YPO1664 flhC motA TRUE 0.663 205.000 0.408 1.000   NA
 145076 145077 YPO1664 YPO1665 motA motB TRUE 0.998 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 145077 145078 YPO1665 YPO1666 motB cheA TRUE 0.998 11.000 0.913 1.000 Y NA
 145078 145079 YPO1666 YPO1667 cheA cheW TRUE 0.965 163.000 0.447 0.003 Y NA
 145080 145081 YPO1668 YPO1669     TRUE 0.965 13.000 0.400 NA N NA
 145081 145082 YPO1669 YPO1670     TRUE 0.991 -3.000 0.400 NA N NA
 145083 145084 YPO1671 YPO1672     FALSE 0.021 475.000 0.000 NA   NA
 145084 145085 YPO1672 YPO1673     FALSE 0.018 528.000 0.000 NA   NA
 145085 145086 YPO1673 YPO1674     FALSE 0.374 69.000 0.000 NA   NA
 145086 145087 YPO1674 YPO1675   cheD FALSE 0.094 241.000 0.000 NA   NA
 145087 2201077 YPO1675 YPO1676 cheD   FALSE 0.180 184.000 0.000 NA   NA
 2201077 145088 YPO1676 YPO1678   cheR FALSE 0.200 173.000 0.000 NA   NA
 145088 145089 YPO1678 YPO1679 cheR cheB TRUE 0.991 0.000 0.087 1.000 Y NA
 145089 145090 YPO1679 YPO1680 cheB cheY TRUE 0.959 101.000 0.286 0.010 Y NA
 145090 145091 YPO1680 YPO1681 cheY cheZ TRUE 0.993 10.000 0.333 1.000 Y NA
 145093 2201078 YPO1683 YPO1684     FALSE 0.035 357.000 0.000 NA   NA
 2201078 145094 YPO1684 YPO1686     FALSE 0.305 100.000 0.000 NA   NA
 145096 145097 YPO1688 YPO1689     FALSE 0.029 393.000 0.000 NA   NA
 145097 145098 YPO1689 YPO1690     FALSE 0.231 155.000 0.000 NA   NA
 145099 145100 YPO1691 YPO1692     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145102 145103 YPO1694 YPO1695     FALSE 0.133 208.000 0.000 NA   NA
 145103 145104 YPO1695 YPO1696     TRUE 0.864 206.000 0.848 NA   NA
 145104 145105 YPO1696 YPO1697     TRUE 0.967 188.000 0.879 NA Y NA
 145105 145106 YPO1697 YPO1698     TRUE 0.892 31.000 0.219 NA   NA
 145106 145107 YPO1698 YPO1699     TRUE 0.985 21.000 0.714 NA   NA
 145107 145108 YPO1699 YPO1700     TRUE 0.957 6.000 0.192 NA   NA
 145108 145109 YPO1700 YPO1701     FALSE 0.021 479.000 0.000 NA   NA
 145109 145110 YPO1701 YPO1702     TRUE 0.997 -31.000 0.840 NA   NA
 145111 145112 YPO1703 YPO1704     TRUE 0.805 96.000 0.081 NA Y NA
 145112 145113 YPO1704 YPO1705     TRUE 0.929 20.000 0.304 NA N NA
 145113 145114 YPO1705 YPO1706     FALSE 0.038 474.000 0.042 0.023 N NA
 145114 145115 YPO1706 YPO1707     FALSE 0.006 658.000 0.000 1.000 N NA
 145115 145116 YPO1707 YPO1708     TRUE 0.970 153.000 0.750 1.000 Y NA
 145116 145117 YPO1708 YPO1709     TRUE 0.982 82.000 0.750 1.000 Y NA
 145117 145118 YPO1709 YPO1710     TRUE 0.995 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 145118 145119 YPO1710 YPO1711     TRUE 0.995 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 145121 145122 YPO1713 YPO1714 ogl kdgR FALSE 0.120 187.000 0.059 1.000 N NA
 145122 145123 YPO1714 YPO1715 kdgR hutC1 FALSE 0.012 385.000 0.000 1.000 N NA
 145124 145125 YPO1716 YPO1717     FALSE 0.278 198.000 0.102 NA   NA
 145125 145126 YPO1717 YPO1718     FALSE 0.020 480.000 0.000 NA   NA
 145126 145127 YPO1718 YPO1719     FALSE 0.129 298.000 0.000 0.057   NA
 145127 145128 YPO1719 YPO1720     TRUE 0.980 16.000 0.101 0.057 Y NA
 145128 145129 YPO1720 YPO1721     TRUE 0.985 14.000 0.131 0.057 Y NA
 145129 145130 YPO1721 YPO1722     TRUE 1.000 -7.000 0.917 0.057 Y NA
 145130 145131 YPO1722 YPO1723   pelW TRUE 0.860 41.000 0.217 1.000   NA
 145131 145132 YPO1723 YPO1724 pelW kduD1 FALSE 0.043 336.000 0.000 1.000   NA
 145132 145133 YPO1724 YPO1725 kduD1 kduI TRUE 0.595 92.000 0.192 1.000 N NA
 2201079 145134 YPO1726 YPO1727 kdgF   FALSE 0.364 72.000 0.000 NA   NA
 145134 2201080 YPO1727 YPO1728     FALSE 0.021 475.000 0.000 NA   NA
 2201080 145135 YPO1728 YPO1729     TRUE 0.891 -1923.000 0.000 NA   NA
 145135 145136 YPO1729 YPO1730     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5922262 145137 YPt_21 YPO1732     FALSE 0.193 178.000 0.000 NA   NA
 145137 145138 YPO1732 YPO1733     FALSE 0.029 390.000 0.000 NA   NA
 145138 145139 YPO1733 YPO1734     FALSE 0.096 237.000 0.000 NA   NA
 145139 145140 YPO1734 YPO1735     FALSE 0.080 103.000 0.021 1.000 N NA
 145145 145146 YPO1740 YPO1741     FALSE 0.168 263.000 0.125 NA   NA
 145146 145147 YPO1741 YPO1742     TRUE 0.934 43.000 0.429 NA   NA
 145147 145148 YPO1742 YPO1743     TRUE 0.576 237.000 0.429 NA   NA
 145150 145151 YPO1745 YPO1746     TRUE 0.891 43.000 0.286 NA   NA
 145154 2201081 YPO1749 YPO1752     FALSE 0.113 222.000 0.000 NA   NA
 145155 145156 YPO1750 YPO1751   kdgF TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145156 145157 YPO1751 YPO1753 kdgF   FALSE 0.004 2452.000 0.000 1.000 N NA
 145158 145159 YPO1754 YPO1755     FALSE 0.025 429.000 0.000 NA   NA
 145159 145160 YPO1755 YPO1756   manZ TRUE 0.849 200.000 0.755 NA   NA
 145160 145161 YPO1756 YPO1757 manZ manY TRUE 0.999 7.000 0.939 0.009 Y NA
 145161 145162 YPO1757 YPO1758 manY manX TRUE 0.892 92.000 0.064 0.009 Y NA
 2201082 145165 YPO1761 YPO1763 hpaG hpaE TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 145165 145166 YPO1763 YPO1764 hpaE hpaD TRUE 0.812 119.000 0.378 1.000   NA
 145166 145167 YPO1764 YPO1765 hpaD hpaF TRUE 0.948 25.000 0.330 1.000   NA
 145167 145168 YPO1765 YPO1766 hpaF hpaH TRUE 0.984 -6.000 0.282 1.000 N NA
 145168 145169 YPO1766 YPO1767 hpaH hpaI TRUE 0.973 11.000 0.439 1.000 N NA
 145169 145170 YPO1767 YPO1768 hpaI hpaX TRUE 0.969 26.000 0.175 1.000 Y NA
 145170 145171 YPO1768 YPO1769 hpaX hpaB FALSE 0.195 68.000 0.000 1.000 N NA
 145171 145172 YPO1769 YPO1770 hpaB hpaC TRUE 0.972 21.000 0.226 0.001   NA
 145173 145174 YPO1771 YPO1772     FALSE 0.147 708.000 0.409 1.000   NA
 145174 145175 YPO1772 YPO1773     TRUE 0.972 -3.000 0.116 1.000   NA
 145178 145179 YPO1776 YPO1777 dbpA   FALSE 0.245 94.000 0.014 NA   NA
 145179 145180 YPO1777 YPO1778     TRUE 0.592 40.000 0.053 NA   NA
 145180 145181 YPO1778 YPO1779     FALSE 0.354 92.000 0.048 NA   NA
 145181 145182 YPO1779 YPO1780   ptrB FALSE 0.047 310.000 0.000 NA   NA
 145182 145183 YPO1780 YPO1781 ptrB pip FALSE 0.039 722.000 0.000 0.023   NA
 145185 145186 YPO1783 YPO1784 ftnA   FALSE 0.026 397.000 0.029 1.000   NA
 145186 145187 YPO1784 YPO1785     TRUE 0.994 3.000 0.613 1.000   NA
 145187 145188 YPO1785 YPO1786     TRUE 0.936 82.000 0.704 NA   NA
 145188 145189 YPO1786 YPO1787     FALSE 0.061 280.000 0.000 NA   NA
 145190 145191 YPO1788 YPO1789 cheM   TRUE 0.998 -6.000 0.800 NA   NA
 145192 145193 YPO1790 YPO1791 flhB flhA TRUE 0.998 0.000 0.287 0.013 Y NA
 145193 145194 YPO1791 YPO1792 flhA flhD TRUE 0.979 0.000 0.053 0.003   NA
 145194 2201083 YPO1792 YPO1793 flhD inv FALSE 0.015 610.000 0.000 NA   NA
 2201083 145195 YPO1793 YPO1794 inv tnp TRUE 0.892 -1506.000 0.000 NA   NA
 145196 145197 YPO1796 YPO1797 flgN flgM TRUE 0.995 19.000 0.361 0.003 Y NA
 145197 145198 YPO1797 YPO1798 flgM flgA TRUE 0.907 151.000 0.330 NA Y NA
 145199 145200 YPO1799 YPO1800 flgB flgC TRUE 0.999 6.000 0.824 0.006 Y NA
 145200 145201 YPO1800 YPO1801 flgC flgD TRUE 0.981 15.000 0.186 1.000 Y NA
 145201 145202 YPO1801 YPO1802 flgD flgE TRUE 0.536 202.000 0.000 1.000 Y NA
 145202 145203 YPO1802 YPO1803 flgE flgF TRUE 0.979 22.000 0.095 0.007 Y NA
 145203 145204 YPO1803 YPO1804 flgF flgG TRUE 0.999 -19.000 0.420 0.001 Y NA
 145204 145205 YPO1804 YPO1805 flgG flgH TRUE 0.893 144.000 0.268 1.000 Y NA
 145205 145206 YPO1805 YPO1806 flgH flgI TRUE 0.982 15.000 0.085 0.012 Y NA
 145206 145207 YPO1806 YPO1807 flgI flgJ TRUE 0.994 0.000 0.048 0.012 Y NA
 145207 145208 YPO1807 YPO1808 flgJ flgK TRUE 0.713 871.000 0.705 0.003 Y NA
 145208 145209 YPO1808 YPO1809 flgK flgL TRUE 0.928 106.000 0.142 0.002 Y NA
 145211 145212 YPO1811 YPO1812     FALSE 0.253 148.000 0.000 1.000   NA
 145212 145213 YPO1812 YPO1813     TRUE 0.995 43.000 1.000 NA Y NA
 145213 145214 YPO1813 YPO1814     TRUE 0.811 66.000 0.000 NA Y NA
 145214 145215 YPO1814 YPO1815     TRUE 0.960 96.000 0.286 0.012 Y NA
 145215 145216 YPO1815 YPO1816     TRUE 0.867 49.000 0.000 NA Y NA
 145217 145218 YPO1817 YPO1818     TRUE 0.517 45.000 0.000 NA   NA
 145218 145219 YPO1818 YPO1819   fliR TRUE 0.938 21.000 0.000 NA Y NA
 145219 145220 YPO1819 YPO1820a fliR fliQ TRUE 0.993 3.000 0.069 0.003 Y NA
 145220 145221 YPO1820a YPO1820 fliQ fliP TRUE 0.990 106.000 0.827 0.013 Y NA
 145221 145222 YPO1820 YPO1821 fliP fliO TRUE 0.996 -3.000 0.203 1.000 Y NA
 145222 145223 YPO1821 YPO1822 fliO fliN TRUE 0.926 168.000 0.443 1.000 Y NA
 145223 145224 YPO1822 YPO1823 fliN hutC2 TRUE 0.998 -3.000 0.137 0.002 Y NA
 145224 145225 YPO1823 YPO1824 hutC2 fliL TRUE 0.999 6.000 0.957 0.002 Y NA
 145225 145226 YPO1824 YPO1825 fliL fliK TRUE 0.455 267.000 0.119 1.000 Y NA
 145226 145227 YPO1825 YPO1826 fliK fliJ TRUE 0.999 -3.000 0.317 0.010 Y NA
 145227 145228 YPO1826 YPO1827 fliJ fabH1 TRUE 0.793 100.000 0.073 1.000 Y NA
 145228 145229 YPO1827 YPO1828 fabH1 fliH TRUE 0.990 -37.000 0.115 1.000 Y NA
 145229 145230 YPO1828 YPO1829 fliH fliG TRUE 0.993 -7.000 0.007 0.006 Y NA
 145230 145231 YPO1829 YPO1830 fliG fliF TRUE 0.998 -3.000 0.220 0.010 Y NA
 145232 145233 YPO1831 YPO1832 fliE   FALSE 0.071 262.000 0.000 NA   NA
 145233 145234 YPO1832 YPO1833     TRUE 0.719 11.000 0.013 NA   NA
 145235 2201084 YPO1834 YPO1835     FALSE 0.222 161.000 0.000 NA   NA
 2201084 145236 YPO1835 YPO1837     FALSE 0.036 354.000 0.000 NA   NA
 145236 145237 YPO1837 YPO1838     TRUE 0.823 7.000 0.000 NA   NA
 145237 145238 YPO1838 YPO1839   fliT TRUE 0.461 55.000 0.000 NA   NA
 145238 145239 YPO1839 YPO1840 fliT fliS TRUE 0.971 11.000 0.324 1.000   NA
 145239 145240 YPO1840 YPO1841 fliS fliD TRUE 0.995 11.000 0.284 0.003 Y NA
 145241 145242 YPO1842 YPO1843 fliC fliA FALSE 0.015 347.000 0.000 1.000 N NA
 145242 145243 YPO1843 YPO1844 fliA fliZ FALSE 0.234 222.000 0.108 1.000   NA
 145243 145244 YPO1844 YPO1845 fliZ   FALSE 0.081 289.000 0.062 1.000   NA
 145244 145245 YPO1845 YPO1846   fliY TRUE 0.950 124.000 0.469 1.000 Y NA
 145245 145246 YPO1846 YPO1847 fliY   TRUE 0.995 0.000 0.100 0.078 Y NA
 145246 145247 YPO1847 YPO1848     TRUE 0.991 3.000 0.150 1.000 Y NA
 145248 145249 YPO1849 YPO1850     TRUE 0.662 34.000 0.061 NA   NA
 145249 145250 YPO1850 YPO1851   putA FALSE 0.022 464.000 0.000 NA   NA
 145251 145252 YPO1852 YPO1853   putP TRUE 0.624 30.000 0.000 NA   NA
 145252 145253 YPO1853 YPO1854 putP   FALSE 0.017 333.000 0.000 1.000 N NA
 145253 145254 YPO1854 YPO1855     TRUE 0.983 30.000 0.356 NA Y NA
 145254 145255 YPO1855 YPO1856     TRUE 0.993 11.000 0.378 NA Y NA
 5922263 145259 YPt_22 YPO1860     FALSE 0.014 687.000 0.000 NA   NA
 145262 145263 YPO1863 YPO1864     FALSE 0.395 128.000 0.085 NA   NA
 145264 145265 YPO1865 YPO1866 uvrY uvrC TRUE 0.962 -28.000 0.086 0.033 N NA
 145265 145266 YPO1866 YPO1867 uvrC pgsA TRUE 0.753 59.000 0.227 1.000 N NA
 145266 5922264 YPO1867 YPt_23 pgsA   FALSE 0.244 145.000 0.000 NA   NA
 5922264 5922265 YPt_23 YPt_24     TRUE 0.475 53.000 0.000 NA   NA
 5922265 5922266 YPt_24 YPt_25     TRUE 0.790 11.000 0.000 NA   NA
 145268 145269 YPO1869 YPO1870     FALSE 0.033 369.000 0.000 NA   NA
 145270 145271 YPO1871 YPO1872     TRUE 0.632 29.000 0.000 NA   NA
 145271 145272 YPO1872 YPO1873   tnpA FALSE 0.117 220.000 0.000 NA   NA
 145272 145273 YPO1873 YPO1874 tnpA   TRUE 0.942 72.000 0.521 0.088   NA
 145273 145274 YPO1874 YPO1875     FALSE 0.339 84.000 0.000 NA   NA
 145274 145275 YPO1875 YPO1876     FALSE 0.215 165.000 0.000 NA   NA
 145275 145276 YPO1876 YPO1877     TRUE 0.844 5.000 0.000 NA   NA
 145276 145277 YPO1877 YPO1878     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 145277 145278 YPO1878 YPO1879     FALSE 0.024 435.000 0.000 NA   NA
 145278 145279 YPO1879 YPO1880     TRUE 0.725 17.000 0.000 NA   NA
 145279 145280 YPO1880 YPO1881     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 145281 2201085 YPO1882 YPO1883     FALSE 0.395 66.000 0.000 NA   NA
 2201085 2201086 YPO1883 YPO1884     TRUE 0.504 48.000 0.000 NA   NA
 145282 145283 YPO1886 YPO1887     TRUE 0.781 12.000 0.000 NA   NA
 145284 145285 YPO1889 YPO1890     FALSE 0.174 187.000 0.000 NA   NA
 145287 145288 YPO1892 YPO1893     TRUE 0.640 30.000 0.000 1.000   NA
 145288 145289 YPO1893 YPO1894     TRUE 0.883 67.000 0.000 0.056 Y NA
 145289 145290 YPO1894 YPO1895     TRUE 0.993 -7.000 0.000 0.056 Y NA
 145290 145291 YPO1895 YPO1896     TRUE 0.931 25.000 0.000 1.000 Y NA
 145292 145293 YPO1897 YPO1898     TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 145293 145294 YPO1898 YPO1899     FALSE 0.161 194.000 0.000 NA   NA
 145295 145296 YPO1900 YPO1901     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145297 145298 YPO1902 YPO1903     TRUE 0.988 6.000 0.500 NA   NA
 145298 145299 YPO1903 YPO1904     TRUE 0.711 19.000 0.000 NA   NA
 145299 145300 YPO1904 YPO1905     TRUE 0.522 44.000 0.000 NA   NA
 145300 145301 YPO1905 YPO1905a     TRUE 0.816 8.000 0.000 NA   NA
 145301 145302 YPO1905a YPO1906   fyuA FALSE 0.012 873.000 0.000 NA   NA
 145302 145303 YPO1906 YPO1907 fyuA ybtE FALSE 0.370 131.000 0.125 1.000 N NA
 145303 145304 YPO1907 YPO1908 ybtE ybtT TRUE 0.984 4.000 0.094 1.000 Y NA
 145304 145305 YPO1908 YPO1909 ybtT ybtU TRUE 0.998 -3.000 0.406 1.000 Y NA
 145305 145306 YPO1909 YPO1910 ybtU irp1 TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.023 Y NA
 145306 145307 YPO1910 YPO1911 irp1 irp2 TRUE 0.944 88.000 0.158 0.002 Y NA
 145307 145308 YPO1911 YPO1912 irp2 ybtA TRUE 0.571 191.000 0.333 1.000 N NA
 145309 145310 YPO1913 YPO1914 ybtP ybtQ TRUE 1.000 -13.000 0.913 0.005 Y NA
 145310 145311 YPO1914 YPO1915 ybtQ ybtX TRUE 0.951 -7.000 0.130 NA N NA
 145311 145312 YPO1915 YPO1916 ybtX ybtS TRUE 0.820 28.000 0.176 NA N NA
 145313 5922267 YPO1917 YPt_26 int   FALSE 0.221 162.000 0.000 NA   NA
 5922267 145314 YPt_26 YPO1918     FALSE 0.050 303.000 0.000 NA   NA
 145314 145315 YPO1918 YPO1919     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 145315 145316 YPO1919 YPO1920     TRUE 0.986 16.000 0.667 NA   NA
 145316 145317 YPO1920 YPO1921     TRUE 0.982 49.000 0.500 1.000 Y NA
 145317 145318 YPO1921 YPO1922     TRUE 0.875 93.000 0.154 1.000 Y NA
 145318 2201087 YPO1922 YPO1923     FALSE 0.019 513.000 0.000 NA   NA
 2201087 145319 YPO1923 YPO1925     FALSE 0.310 98.000 0.000 NA   NA
 145319 145320 YPO1925 YPO1926     FALSE 0.005 826.000 0.000 1.000 N NA
 145320 145321 YPO1926 YPO1927   int3 TRUE 0.951 23.000 0.417 1.000 N NA
 145321 145322 YPO1927 YPO1928 int3   TRUE 0.938 50.000 0.600 1.000 N NA
 145324 145325 YPO1930 YPO1931     TRUE 0.665 25.000 0.000 NA   NA
 145325 145326 YPO1931 YPO1932     FALSE 0.117 220.000 0.000 NA   NA
 145326 145327 YPO1932 YPO1933     TRUE 0.892 66.000 0.417 1.000   NA
 145331 145332 YPO1937 YPO1938     FALSE 0.005 725.000 0.000 1.000 N NA
 145333 145334 YPO1939 YPO1940     FALSE 0.099 111.000 0.028 1.000 N NA
 145334 145335 YPO1940 YPO1941     FALSE 0.006 581.000 0.000 1.000 N NA
 145335 145336 YPO1941 YPO1942     TRUE 0.671 204.000 0.133 NA Y NA
 145336 145337 YPO1942 YPO1943     FALSE 0.371 301.000 0.386 NA   NA
 145337 145338 YPO1943 YPO1944     TRUE 0.994 3.000 0.625 1.000   NA
 145338 145339 YPO1944 YPO1945     TRUE 0.998 -10.000 0.878 0.098 N NA
 145339 145340 YPO1945 YPO1946     TRUE 0.944 4.000 0.175 1.000 N NA
 145340 145341 YPO1946 YPO1947     TRUE 0.902 -10.000 0.078 1.000 N NA
 145341 145342 YPO1947 YPO1948     TRUE 0.986 0.000 0.176 0.012 N NA
 145342 145343 YPO1948 YPO1949     FALSE 0.171 173.000 0.071 1.000 N NA
 145343 145344 YPO1949 YPO1950     FALSE 0.213 141.000 0.071 1.000 N NA
 145344 145345 YPO1950 YPO1951   hmsH FALSE 0.015 669.000 0.000 1.000   NA
 145345 145346 YPO1951 YPO1952 hmsH hmsF TRUE 0.990 13.000 0.696 1.000   NA
 145346 145347 YPO1952 YPO1953 hmsF hmsR TRUE 0.913 -10.000 0.087 1.000 N NA
 145347 145348 YPO1953 YPO1954 hmsR hmsS TRUE 0.979 -3.000 0.154 NA   NA
 145348 145349 YPO1954 YPO1955 hmsS   FALSE 0.041 333.000 0.000 NA   NA
 145349 145350 YPO1955 YPO1956     FALSE 0.024 439.000 0.000 NA   NA
 145350 145351 YPO1956 YPO1957   phoH TRUE 0.520 60.000 0.065 NA   NA
 145352 145353 YPO1958 YPO1959 chaA narX FALSE 0.025 549.000 0.000 0.074 N NA
 145354 145355 YPO1960 YPO1961     FALSE 0.092 242.000 0.000 NA   NA
 145355 145356 YPO1961 YPO1962   astC FALSE 0.152 198.000 0.000 NA   NA
 145356 145357 YPO1962 YPO1963 astC astA TRUE 0.985 30.000 0.400 1.000 Y NA
 145357 145358 YPO1963 YPO1964 astA astD TRUE 0.878 -3.000 0.051 1.000 N NA
 145358 145359 YPO1964 YPO1965 astD astB TRUE 0.923 24.000 0.306 1.000 N NA
 145359 145360 YPO1965 YPO1966 astB astE TRUE 0.857 61.000 0.063 1.000 Y NA
 145360 2201088 YPO1966 YPO1967 astE   FALSE 0.013 736.000 0.000 NA   NA
 2201088 145361 YPO1967 YPO1968     TRUE 0.891 -2007.000 0.000 NA   NA
 145361 145362 YPO1968 YPO1969     TRUE 0.987 0.000 0.000 1.000 Y NA
 145363 145364 YPO1971 YPO1972 hutG hutI TRUE 0.798 -3.000 0.031 1.000 N NA
 145364 145365 YPO1972 YPO1973 hutI hutC FALSE 0.021 204.000 0.010 1.000 N NA
 145366 145367 YPO1974 YPO1975     TRUE 0.942 0.000 0.067 NA   NA
 2201089 145369 YPO1977 YPO1979     TRUE 0.758 14.000 0.000 NA   NA
 145369 145370 YPO1979 YPO1980     TRUE 0.972 -7.000 0.133 1.000   NA
 145370 145371 YPO1980 YPO1981     TRUE 0.996 -3.000 0.550 NA   NA
 145371 145372 YPO1981 YPO1982     FALSE 0.152 134.000 0.054 NA N NA
 145372 145373 YPO1982 YPO1983     TRUE 0.922 0.000 0.000 1.000   NA
 145373 145374 YPO1983 YPO1984     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 145374 145375 YPO1984 YPO1985     TRUE 0.980 -3.000 0.167 NA   NA
 145376 145377 YPO1986 YPO1987     FALSE 0.207 170.000 0.000 NA   NA
 145380 145381 YPO1990 YPO1991     FALSE 0.090 247.000 0.000 1.000   NA
 145382 145383 YPO1992 YPO1993     TRUE 0.548 105.000 0.000 0.044   NA
 145383 145384 YPO1993 YPO1994     FALSE 0.039 341.000 0.000 NA   NA
 145384 145385 YPO1994 YPO1995     TRUE 0.904 -13.000 0.000 NA   NA
 145385 145386 YPO1995 YPO1996     TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   NA
 145386 145387 YPO1996 YPO1997     FALSE 0.013 791.000 0.000 NA   NA
 145387 145388 YPO1997 YPO1998     FALSE 0.127 213.000 0.000 NA   NA
 145388 145389 YPO1998 YPO1999     TRUE 0.751 55.000 0.154 1.000   NA
 145389 145390 YPO1999 YPO2000     FALSE 0.067 277.000 0.000 1.000   NA
 145390 145391 YPO2000 YPO2001   copR TRUE 0.999 6.000 0.793 0.001 Y NA
 145392 145393 YPO2002 YPO2003     FALSE 0.239 149.000 0.000 NA   NA
 145393 145394 YPO2003 YPO2004     TRUE 0.896 15.000 0.133 NA   NA
 145396 145397 YPO2006 YPO2007     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 145397 145398 YPO2007 YPO2008     TRUE 0.550 8.000 0.034 NA N NA
 145399 145400 YPO2009 YPO2009a     TRUE 0.974 18.000 0.476 NA   NA
 145400 145401 YPO2009a YPO2010     FALSE 0.053 297.000 0.000 NA   NA
 145401 145402 YPO2010 YPO2011   pth TRUE 0.827 164.000 0.184 1.000 Y NA
 145404 145405 YPO2013 YPO2014 prsA ipk FALSE 0.022 341.000 0.053 1.000 N NA
 145405 145406 YPO2014 YPO2015 ipk   TRUE 0.954 2.000 0.157 1.000 N NA
 145407 145408 YPO2016 YPO2017 hemA prfA TRUE 0.890 33.000 0.171 0.044 N NA
 145408 145409 YPO2017 YPO2018 prfA   TRUE 0.998 0.000 0.229 0.044 Y NA
 145409 145410 YPO2018 YPO2019     TRUE 0.614 64.000 0.109 NA   NA
 145410 145411 YPO2019 YPO2020     TRUE 0.984 -3.000 0.195 NA   NA
 145411 145412 YPO2020 YPO2021   kdsA TRUE 0.481 96.000 0.089 1.000   NA
 145412 145413 YPO2021 YPO2023 kdsA tnp FALSE 0.008 482.000 0.000 1.000 N NA
 2201090 145414 YPO2027 YPO2025     TRUE 0.893 -1278.000 0.000 NA   NA
 145414 145415 YPO2025 YPO2026     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145415 145416 YPO2026 YPO2027a     FALSE 0.011 1598.000 0.000 NA   NA
 145416 5922268 YPO2027a YPt_27     FALSE 0.051 301.000 0.000 NA   NA
 5922268 145417 YPt_27 YPO2028     FALSE 0.246 142.000 0.000 NA   NA
 145417 145418 YPO2028 YPO2029     FALSE 0.054 301.000 0.000 1.000   NA
 145418 145419 YPO2029 YPO2030     TRUE 0.984 20.000 0.480 0.055   NA
 145419 145420 YPO2030 YPO2031     TRUE 0.999 -3.000 0.440 0.055 Y NA
 145420 2201091 YPO2031 YPO2034     TRUE 0.810 9.000 0.000 NA   NA
 145421 145422 YPO2033 YPO2035 tnp   FALSE 0.006 629.000 0.000 1.000 N NA
 145422 145423 YPO2035 YPO2036     TRUE 0.959 14.000 0.375 NA N NA
 145424 145425 YPO2037 YPO2038     TRUE 0.943 37.000 0.417 1.000   NA
 145426 145427 YPO2039 YPO2040     FALSE 0.117 395.000 0.196 NA   NA
 145428 145429 YPO2041 YPO2042 rimJ   TRUE 0.826 8.000 0.000 1.000   NA
 145429 145430 YPO2042 YPO2043   mviN FALSE 0.056 267.000 0.022 1.000   NA
 145430 145431 YPO2043 YPO2044 mviN   FALSE 0.022 468.000 0.000 NA   NA
 145431 145432 YPO2044 YPO2045     TRUE 0.996 30.000 1.000 NA Y NA
 145434 145435 YPO2047 YPO2048   cutC FALSE 0.126 232.000 0.057 NA   NA
 145436 145437 YPO2049 YPO2050     TRUE 0.991 -3.000 0.315 NA   NA
 145437 145438 YPO2050 YPO2051     FALSE 0.275 191.000 0.089 NA   NA
 145438 145439 YPO2051 YPO2052     FALSE 0.388 180.000 0.126 NA   NA
 145440 145441 YPO2053 YPO2054 aspS nudB TRUE 0.852 0.000 0.050 1.000 N NA
 145441 145442 YPO2054 YPO2055 nudB   TRUE 0.424 58.000 0.035 NA   NA
 145442 145443 YPO2055 YPO2056   ruvC TRUE 0.517 209.000 0.277 NA   NA
 145443 145444 YPO2056 YPO2057 ruvC ruvA TRUE 0.853 283.000 0.451 0.010 Y NA
 145444 145445 YPO2057 YPO2058 ruvA ruvB TRUE 0.976 162.000 0.549 0.001 Y NA
 145446 145447 YPO2059 YPO2060 znuB znuC TRUE 0.999 -3.000 0.755 1.000 Y NA
 145448 145449 YPO2061 YPO2062 znuA   TRUE 0.806 21.000 0.131 1.000 N NA
 145449 145450 YPO2062 YPO2063   msbB FALSE 0.288 267.000 0.299 1.000 N NA
 145451 145452 YPO2064 YPO2065 pykA hexR FALSE 0.017 330.000 0.000 1.000 N NA
 145453 145454 YPO2066 YPO2067 zwf eda FALSE 0.397 242.000 0.034 1.000 Y NA
 145454 145455 YPO2067 YPO2068 eda   FALSE 0.006 694.000 0.000 1.000 N NA
 145455 145456 YPO2068 YPO2069     TRUE 0.998 20.000 0.869 0.073 Y NA
 145458 145459 YPO2071 YPO2072     FALSE 0.358 72.000 0.082 1.000 N NA
 145459 145460 YPO2072 YPO2073     FALSE 0.066 155.000 0.024 1.000 N NA
 145460 145461 YPO2073 YPO2074   fadD FALSE 0.037 643.000 0.169 1.000 N NA
 145461 145462 YPO2074 YPO2075 fadD rnd FALSE 0.297 160.000 0.115 1.000 N NA
 145463 145464 YPO2076 YPO2077 minE minD TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 145464 145465 YPO2077 YPO2078 minD minC TRUE 0.990 25.000 0.466 1.000 Y NA
 145465 145466 YPO2078 YPO2079 minC   FALSE 0.025 426.000 0.000 NA   NA
 145467 145468 YPO2080 YPO2081     TRUE 0.771 141.000 0.363 NA   NA
 145468 145469 YPO2081 YPO2082     FALSE 0.193 71.000 0.046 NA N NA
 145469 145470 YPO2082 YPO2083     TRUE 0.446 103.000 0.088 NA   NA
 145471 145472 YPO2085 YPO2086     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145473 145474 YPO2087 YPO2087a     FALSE 0.350 78.000 0.000 NA   NA
 145474 145475 YPO2087a YPO2088     TRUE 0.711 19.000 0.000 NA   NA
 145476 145477 YPO2089 YPO2090 ninB   FALSE 0.358 74.000 0.000 NA   NA
 145477 145478 YPO2090 YPO2091     TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 145478 145479 YPO2091 YPO2092     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 145479 145480 YPO2092 YPO2093     TRUE 0.498 49.000 0.000 NA   NA
 145484 145485 YPO2097 YPO2098     TRUE 0.614 31.000 0.000 NA   NA
 145485 145486 YPO2098 YPO2099   rzpR TRUE 0.909 -15.000 0.000 1.000   NA
 145486 145487 YPO2099 YPO2100 rzpR   FALSE 0.024 462.000 0.000 1.000   NA
 145487 145488 YPO2100 YPO2101     FALSE 0.022 457.000 0.000 NA   NA
 145488 145489 YPO2101 YPO2102     TRUE 0.976 31.000 0.667 NA   NA
 145489 2201093 YPO2102 YPO2103     TRUE 0.802 10.000 0.000 NA   NA
 2201093 145490 YPO2103 YPO2104     TRUE 0.891 -1834.000 0.000 NA   NA
 145490 2201094 YPO2104 YPO2106     FALSE 0.012 979.000 0.000 NA   NA
 2201094 145491 YPO2106 YPO2108     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 145491 145492 YPO2108 YPO2109     TRUE 0.952 122.000 1.000 NA   NA
 145492 145493 YPO2109 YPO2110     TRUE 0.994 14.000 1.000 NA   NA
 145493 145494 YPO2110 YPO2111     TRUE 0.983 0.000 0.222 NA   NA
 145494 145495 YPO2111 YPO2112     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 145495 145496 YPO2112 YPO2113     TRUE 0.900 2.000 0.000 NA   NA
 145496 145497 YPO2113 YPO2114     TRUE 0.982 2.000 0.235 NA   NA
 145497 145498 YPO2114 YPO2115     TRUE 0.991 -3.000 0.294 NA   NA
 145498 145499 YPO2115 YPO2116     TRUE 0.882 66.000 0.400 NA   NA
 145499 145500 YPO2116 YPO2117     TRUE 0.887 13.000 0.111 NA   NA
 145500 145501 YPO2117 YPO2118     TRUE 0.899 87.000 0.531 NA   NA
 145501 145502 YPO2118 YPO2119     TRUE 0.950 1.000 0.094 NA   NA
 145502 145503 YPO2119 YPO2120     TRUE 0.951 3.000 0.120 NA   NA
 145503 145504 YPO2120 YPO2121   tnp FALSE 0.049 305.000 0.000 NA   NA
 145504 145505 YPO2121 YPO2122 tnp   FALSE 0.277 121.000 0.000 NA   NA
 145505 145506 YPO2122 YPO2123     TRUE 0.996 3.000 0.714 NA   NA
 145506 145507 YPO2123 YPO2124     FALSE 0.072 261.000 0.000 NA   NA
 145509 145510 YPO2126 YPO2127     FALSE 0.308 99.000 0.000 NA   NA
 145510 145511 YPO2127 YPO2128     TRUE 0.816 8.000 0.000 NA   NA
 145511 145512 YPO2128 YPO2129     TRUE 0.455 56.000 0.000 NA   NA
 145514 145515 YPO2131 YPO2132     TRUE 0.990 0.000 0.333 NA   NA
 145515 145516 YPO2132 YPO2133     TRUE 0.725 17.000 0.000 NA   NA
 145516 145517 YPO2133 YPO2134     TRUE 0.790 11.000 0.000 NA   NA
 145517 145518 YPO2134 YPO2135     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 145519 145520 YPO2136 YPO2137     FALSE 0.049 305.000 0.000 NA   NA
 145520 145521 YPO2137 YPO2138     TRUE 0.822 4.000 0.019 NA   NA
 145521 145522 YPO2138 YPO2139     TRUE 0.659 17.000 0.019 NA   NA
 145524 145525 YPO2141 YPO2142 dsbB nhaB TRUE 0.708 236.000 0.723 1.000 N NA
 145529 145530 YPO2148 YPO2149     FALSE 0.069 265.000 0.000 NA   NA
 145532 145533 YPO2151 YPO2152     FALSE 0.213 105.000 0.007 NA   NA
 145533 145534 YPO2152 YPO2153     TRUE 0.894 150.000 0.683 NA   NA
 145536 145537 YPO2156 YPO2157   gapA FALSE 0.414 314.000 0.154 1.000 Y NA
 145538 145539 YPO2158 YPO2159     TRUE 0.746 71.000 0.216 NA   NA
 145540 145541 YPO2160 YPO2161 pncA ansA TRUE 0.535 15.000 0.040 1.000 N NA
 145541 145542 YPO2161 YPO2162 ansA sppA FALSE 0.360 117.000 0.113 1.000 N NA
 145543 145544 YPO2163 YPO2164   selD FALSE 0.037 225.000 0.033 1.000 N NA
 145544 145545 YPO2164 YPO2165 selD topB FALSE 0.242 59.000 0.041 1.000 N NA
 145545 145546 YPO2165 YPO2166 topB   TRUE 0.972 -3.000 0.123 NA   NA
 145547 145548 YPO2167 YPO2168 nudG xthA FALSE 0.215 98.000 0.056 1.000 N NA
 5922270 2201095 YPt_29 YPO2171   purU FALSE 0.239 149.000 0.000 NA   NA
 145552 145553 YPO2173 YPO2174     FALSE 0.020 307.000 0.000 1.000 N NA
 145556 145557 YPO2177 YPO2178     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145557 145558 YPO2178 YPO2180   adhE FALSE 0.007 540.000 0.000 1.000 N NA
 145559 145560 YPO2181 YPO2182   oppA FALSE 0.004 838.000 0.000 NA N NA
 145560 145561 YPO2182 YPO2183 oppA oppB TRUE 0.924 87.000 0.151 0.054 Y NA
 145561 145562 YPO2183 YPO2184 oppB oppC TRUE 0.998 19.000 0.870 0.054 Y NA
 145562 145563 YPO2184 YPO2185 oppC oppD TRUE 0.996 12.000 0.554 1.000 Y NA
 145563 145564 YPO2185 YPO2186 oppD oppF TRUE 0.999 -3.000 0.420 0.001 Y NA
 145565 145566 YPO2187 YPO2188   cls TRUE 0.611 165.000 0.231 NA   NA
 145566 145567 YPO2188 YPO2189 cls   FALSE 0.374 69.000 0.000 NA   NA
 145568 145569 YPO2190 YPO2191 ail   FALSE 0.115 221.000 0.000 NA   NA
 145572 145573 YPO2194 YPO2195     FALSE 0.098 148.000 0.000 NA N NA
 145573 145574 YPO2195 YPO2196   ispZ TRUE 0.553 80.000 0.167 NA N NA
 145576 145577 YPO2200 YPO2201   ompW FALSE 0.293 109.000 0.000 NA   NA
 145578 145579 YPO2202 YPO2203   trpA FALSE 0.028 343.000 0.018 NA   NA
 145579 145580 YPO2203 YPO2204 trpA trpB TRUE 1.000 0.000 0.947 0.001 Y NA
 145580 145581 YPO2204 YPO2205 trpB trpC TRUE 0.935 157.000 0.221 0.001 Y NA
 145581 145582 YPO2205 YPO2206 trpC trpD TRUE 0.994 4.000 0.293 1.000 Y NA
 145582 145583 YPO2206 YPO2207 trpD trpG TRUE 0.964 15.000 0.083 1.000 Y NA
 145583 145584 YPO2207 YPO2208 trpG trpE TRUE 1.000 0.000 0.703 0.001 Y NA
 145584 145585 YPO2208 YPO2209 trpE   FALSE 0.237 116.000 0.023 NA   NA
 145585 145586 YPO2209 YPO2210     TRUE 0.632 29.000 0.000 NA   NA
 145587 145588 YPO2211 YPO2212 trpH   TRUE 0.949 17.000 0.281 NA   NA
 145588 145589 YPO2212 YPO2213     FALSE 0.254 347.000 0.075 NA Y NA
 145590 145591 YPO2214 YPO2215 btuR   TRUE 0.577 17.000 0.050 1.000 N NA
 145594 145595 YPO2217a YPO2218   topA TRUE 0.646 27.000 0.000 NA   NA
 145595 145596 YPO2218 YPO2219 topA cysB FALSE 0.004 397.000 0.008 1.000 N NA
 145596 145597 YPO2219 YPO2220 cysB   FALSE 0.040 336.000 0.000 NA   NA
 145597 145598 YPO2220 YPO2221   acnA FALSE 0.034 364.000 0.000 NA   NA
 145600 145601 YPO2223 YPO2224 pgpB   TRUE 0.462 169.000 0.143 1.000   NA
 145601 145602 YPO2224 YPO2225     TRUE 0.990 7.000 0.576 1.000   NA
 145604 145605 YPO2227 YPO2228 pyrF   TRUE 0.834 0.000 0.045 1.000 N NA
 145610 145611 YPO2233 YPO2234   cstA TRUE 0.972 -7.000 0.143 NA   NA
 145611 145612 YPO2234 YPO2235 cstA rnb FALSE 0.015 350.000 0.000 1.000 N NA
 145613 145614 YPO2237 YPO2238     TRUE 0.936 35.000 0.103 1.000 Y NA
 145615 145616 YPO2239 YPO2240 nth   TRUE 0.949 -3.000 0.109 1.000 N NA
 145616 145617 YPO2240 YPO2241     TRUE 1.000 -3.000 0.908 0.038 Y NA
 145617 145618 YPO2241 YPO2242     TRUE 0.999 10.000 0.924 0.038 Y NA
 145620 145621 YPO2244 YPO2245     TRUE 0.991 50.000 0.537 0.011 Y NA
 145621 145622 YPO2245 YPO2246     TRUE 0.999 0.000 0.564 0.038 Y NA
 145622 145623 YPO2246 YPO2247     TRUE 0.539 128.000 0.148 NA   NA
 2201097 2201098 YPO2249 YPO2250     TRUE 0.665 25.000 0.000 NA   NA
 2201098 145624 YPO2250 YPO2252     TRUE 0.900 2.000 0.000 NA   NA
 145625 145626 YPO2253 YPO2254 araA araB FALSE 0.193 84.000 0.046 1.000 N NA
 145627 145628 YPO2255 YPO2256 araF araG TRUE 0.992 98.000 0.917 0.011 Y NA
 145628 145629 YPO2256 YPO2257 araG araH TRUE 0.996 18.000 0.451 0.011 Y NA
 145629 145630 YPO2257 YPO2258 araH araC FALSE 0.284 221.000 0.196 1.000 N NA
 145630 145631 YPO2258 YPO2259 araC   TRUE 0.724 128.000 0.276 1.000   NA
 145631 145632 YPO2259 YPO2260     FALSE 0.170 194.000 0.000 1.000   NA
 145632 145633 YPO2260 YPO2261     FALSE 0.136 206.000 0.000 NA   NA
 145634 145635 YPO2262 YPO2263   manA TRUE 0.776 240.000 0.778 NA   NA
 145637 145638 YPO2265 YPO2266 tus   FALSE 0.024 385.000 0.018 1.000   NA
 2201099 145639 YPO2267 YPO2268   mlc FALSE 0.122 217.000 0.000 NA   NA
 145639 145640 YPO2268 YPO2269 mlc bioD TRUE 0.551 224.000 0.455 NA N NA
 145641 145642 YPO2270 YPO2271     FALSE 0.025 426.000 0.000 NA   NA
 145642 145643 YPO2271 YPO2272     TRUE 0.689 22.000 0.000 NA   NA
 145643 145644 YPO2272 YPO2273     FALSE 0.313 97.000 0.000 NA   NA
 145645 145646 YPO2274 YPO2275     TRUE 0.951 12.000 0.222 NA   NA
 145646 145647 YPO2275 YPO2276     TRUE 0.989 3.000 0.400 NA   NA
 145647 145648 YPO2276 YPO2276a     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 145648 145649 YPO2276a YPO2277     TRUE 0.885 65.000 0.400 NA   NA
 145649 145650 YPO2277 YPO2278     TRUE 0.990 13.000 0.714 NA   NA
 145650 145651 YPO2278 YPO2279     TRUE 0.990 4.000 0.500 NA   NA
 145651 145652 YPO2279 YPO2280     TRUE 0.996 0.000 0.625 NA   NA
 145652 145653 YPO2280 YPO2281     FALSE 0.020 483.000 0.000 NA   NA
 145654 145655 YPO2282 YPO2283     FALSE 0.275 122.000 0.000 NA   NA
 145655 145656 YPO2283 YPO2284     FALSE 0.409 64.000 0.000 NA   NA
 145656 145657 YPO2284 YPO2285     FALSE 0.244 144.000 0.000 NA   NA
 145658 145659 YPO2286 YPO2287     TRUE 0.998 4.000 0.520 0.054 Y NA
 145661 145662 YPO2289 YPO2290     TRUE 0.927 5.000 0.111 NA   NA
 145662 145663 YPO2290 YPO2291     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 145665 145666 YPO2293 YPO2294   ilvN TRUE 0.998 2.000 0.649 0.002   NA
 145667 145668 YPO2295 YPO2296     FALSE 0.240 131.000 0.033 NA   NA
 145668 145669 YPO2296 YPO2297     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 145669 145670 YPO2297 YPO2298   phoA FALSE 0.017 546.000 0.000 NA   NA
 145671 145672 YPO2299 YPO2300 ogt fnr FALSE 0.174 73.000 0.038 1.000 N NA
 145672 145673 YPO2300 YPO2301 fnr   TRUE 0.963 135.000 0.619 1.000 Y NA
 145674 145675 YPO2302 YPO2303 pntB pntA TRUE 0.993 73.000 0.745 0.001 Y NA
 145675 145676 YPO2303 YPO2304 pntA   FALSE 0.201 121.000 0.010 NA   NA
 145677 145678 YPO2305 YPO2306     FALSE 0.179 270.000 0.143 NA   NA
 145680 145681 YPO2308 YPO2309 rstA rstB TRUE 0.968 28.000 0.181 1.000 Y NA
 145681 145682 YPO2309 YPO2310 rstB   TRUE 0.729 94.000 0.300 1.000 N NA
 145684 145685 YPO2312 YPO2313     TRUE 0.886 3.000 0.000 NA   NA
 145686 145687 YPO2314 YPO2315     FALSE 0.019 514.000 0.000 NA   NA
 145687 145688 YPO2315 YPO2316     TRUE 0.980 26.000 0.676 NA   NA
 145689 145690 YPO2317 YPO2318   asr TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 145690 145691 YPO2318 YPO2319 asr   FALSE 0.041 334.000 0.000 NA   NA
 145692 145693 YPO2320 YPO2321     TRUE 0.958 -3.000 0.077 NA   NA
 145693 145694 YPO2321 YPO2322   hrpA FALSE 0.036 354.000 0.000 NA   NA
 145698 145699 YPO2326 YPO2327     TRUE 0.992 10.000 0.726 NA   NA
 145699 145700 YPO2327 YPO2328     TRUE 0.865 6.000 0.057 NA   NA
 145701 145702 YPO2329 YPO2330 ldhA hslJ FALSE 0.101 70.000 0.024 NA N NA
 145706 145707 YPO2334 YPO2335 nifJ   FALSE 0.023 275.000 0.000 NA N NA
 145707 145708 YPO2335 YPO2336     FALSE 0.023 271.000 0.000 NA N NA
 145708 145709 YPO2336 YPO2337     FALSE 0.019 312.000 0.000 1.000 N NA
 145710 145711 YPO2338 YPO2339   mppA FALSE 0.018 243.000 0.019 1.000 N NA
 145714 145715 YPO2342 YPO2343 tpx tnp FALSE 0.033 253.000 0.000 1.000 N NA
 145717 145718 YPO2345 YPO2346     TRUE 0.897 62.000 0.412 NA   NA
 145719 145720 YPO2347 YPO2348     TRUE 0.998 -3.000 0.791 NA   NA
 145720 145721 YPO2348 YPO2349   pspC FALSE 0.181 308.000 0.190 NA   NA
 145721 145722 YPO2349 YPO2350 pspC pspB TRUE 0.998 0.000 0.913 NA   NA
 145722 145723 YPO2350 YPO2351 pspB pspA TRUE 0.898 162.000 0.739 NA   NA
 145726 145727 YPO2354 YPO2355   sapA FALSE 0.253 136.000 0.000 NA   NA
 145727 145728 YPO2355 YPO2356 sapA sapB TRUE 0.992 -3.000 0.264 0.053 N NA
 145728 145729 YPO2356 YPO2357 sapB sapC TRUE 0.998 -13.000 0.284 0.053 Y NA
 145729 145730 YPO2357 YPO2358 sapC sapD TRUE 0.999 0.000 0.667 1.000 Y NA
 145730 145731 YPO2358 YPO2359 sapD sapF TRUE 0.999 0.000 0.684 0.019 Y NA
 145731 145732 YPO2359 YPO2360 sapF   FALSE 0.029 390.000 0.000 NA   NA
 145732 145733 YPO2360 YPO2361     FALSE 0.015 643.000 0.000 NA   NA
 145733 145734 YPO2361 YPO2362     FALSE 0.076 255.000 0.000 NA   NA
 145734 145735 YPO2362 YPO2363     FALSE 0.086 246.000 0.000 NA   NA
 145736 145737 YPO2364 YPO2365     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2201100 145738 YPO2366 YPO2367   gst TRUE 0.517 45.000 0.000 NA   NA
 145739 145740 YPO2368 YPO2369 pdxY tyrS FALSE 0.110 155.000 0.041 1.000 N NA
 145740 145741 YPO2369 YPO2370 tyrS pdxH FALSE 0.114 182.000 0.054 1.000 N NA
 145741 145742 YPO2370 YPO2371 pdxH   FALSE 0.306 91.000 0.034 NA   NA
 145742 145743 YPO2371 YPO2372     TRUE 0.422 58.000 0.034 NA   NA
 145745 145746 YPO2374 YPO2375 slyA   FALSE 0.014 798.000 0.000 1.000   NA
 145746 145747 YPO2375 YPO2376     FALSE 0.273 132.000 0.045 NA   NA
 145748 145749 YPO2377 YPO2378     FALSE 0.266 223.000 0.128 1.000   NA
 145749 145750 YPO2378 YPO2379     TRUE 0.788 88.000 0.362 1.000 N NA
 145752 145753 YPO2381 YPO2382 gloA rnt TRUE 0.435 112.000 0.136 1.000 N NA
 145754 145755 YPO2383 YPO2384     FALSE 0.305 100.000 0.000 NA   NA
 145756 145757 YPO2385 YPO2386   sodB FALSE 0.004 378.000 0.015 NA N NA
 145757 145758 YPO2386 YPO2387 sodB purR FALSE 0.007 527.000 0.000 1.000 N NA
 145760 145761 YPO2389 YPO2390   cfa FALSE 0.008 480.000 0.000 1.000 N NA
 145763 5922271 YPO2392 YPt_30     FALSE 0.090 243.000 0.000 NA   NA
 5922271 5922272 YPt_30 YPt_31     TRUE 0.432 60.000 0.000 NA   NA
 5922272 145764 YPt_31 YPO2393   pykF FALSE 0.016 576.000 0.000 NA   NA
 145764 145765 YPO2393 YPO2394 pykF lpp FALSE 0.018 321.000 0.000 1.000 N NA
 145765 145766 YPO2394 YPO2395 lpp tnp FALSE 0.073 191.000 0.000 1.000 N NA
 145766 145767 YPO2395 YPO2396 tnp   FALSE 0.156 582.000 0.000 0.083 Y NA
 145767 145768 YPO2396 YPO2397     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2201101 145769 YPO2398 YPO2399     FALSE 0.065 271.000 0.000 NA   NA
 145769 145770 YPO2399 YPO2400     TRUE 0.674 89.000 0.183 NA   NA
 145770 145771 YPO2400 YPO2401     TRUE 0.976 -3.000 0.193 1.000 N NA
 145771 145772 YPO2401 YPO2402     TRUE 0.998 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 145772 145773 YPO2402 YPO2403     TRUE 0.915 186.000 0.466 1.000 Y NA
 145773 145774 YPO2403 YPO2404     TRUE 0.750 15.000 0.041 NA   NA
 145774 145775 YPO2404 YPO2405     FALSE 0.193 178.000 0.000 NA   NA
 145775 145776 YPO2405 YPO2406     FALSE 0.073 259.000 0.000 NA   NA
 145776 145777 YPO2406 YPO2407     FALSE 0.392 122.000 0.129 NA N NA
 145780 145781 YPO2410 YPO2411   aroH TRUE 0.525 157.000 0.165 1.000   NA
 2201102 145782 YPO2412 YPO2414   lplA TRUE 0.479 52.000 0.000 NA   NA
 145782 145783 YPO2414 YPO2415 lplA nlpC FALSE 0.277 125.000 0.091 NA N NA
 145783 145784 YPO2415 YPO2416 nlpC   FALSE 0.187 280.000 0.161 NA   NA
 145784 145785 YPO2416 YPO2417     TRUE 0.998 -3.000 0.613 0.093   NA
 145785 145786 YPO2417 YPO2418     TRUE 0.992 -3.000 0.227 0.093   NA
 145786 145787 YPO2418 YPO2419     TRUE 0.901 -3.000 0.061 1.000 N NA
 145787 145788 YPO2419 YPO2420     TRUE 0.998 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 145788 145789 YPO2420 YPO2421   pmrF TRUE 0.996 -3.000 0.220 NA Y NA
 145789 145790 YPO2421 YPO2422 pmrF   TRUE 0.997 -13.000 0.378 NA Y NA
 145790 145791 YPO2422 YPO2423   btuD FALSE 0.064 350.000 0.129 1.000 N NA
 145791 145792 YPO2423 YPO2424 btuD btuE TRUE 0.441 22.000 0.036 1.000 N NA
 145792 145793 YPO2424 YPO2425 btuE btuC FALSE 0.371 70.000 0.084 1.000 N NA
 145793 145794 YPO2425 YPO2426 btuC   FALSE 0.113 227.000 0.044 NA   NA
 145794 145795 YPO2426 YPO2427   ihfA FALSE 0.041 334.000 0.000 NA   NA
 145795 145796 YPO2427 YPO2428 ihfA pheT TRUE 0.947 5.000 0.208 1.000 N NA
 145796 145797 YPO2428 YPO2429 pheT pheS TRUE 0.998 14.000 0.574 0.001 Y NA
 145797 145798 YPO2429 YPO2429a pheS pheM FALSE 0.035 357.000 0.000 NA   NA
 145798 145799 YPO2429a YPO2430 pheM rplT FALSE 0.310 98.000 0.000 NA   NA
 145799 145800 YPO2430 YPO2431 rplT rpmI TRUE 0.997 38.000 0.928 0.012 Y NA
 145800 145801 YPO2431 YPO2432 rpmI infC TRUE 0.974 97.000 0.652 1.000 Y NA
 145801 145802 YPO2432 YPO2433 infC thrS TRUE 0.991 4.000 0.186 1.000 Y NA
 145803 145804 YPO2434 YPO2435     FALSE 0.047 310.000 0.000 NA   NA
 145808 145809 YPO2439 YPO2440 yfeA yfeB TRUE 0.999 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 145809 145810 YPO2440 YPO2441 yfeB yfeC TRUE 1.000 0.000 0.857 0.099 Y NA
 145810 145811 YPO2441 YPO2442 yfeC yfeD TRUE 0.999 -3.000 0.525 0.005 Y NA
 145811 145812 YPO2442 YPO2443 yfeD   FALSE 0.380 68.000 0.000 NA   NA
 145812 145813 YPO2443 YPO2444     TRUE 0.665 25.000 0.000 NA   NA
 145817 145818 YPO2448 YPO2449 solA   FALSE 0.028 267.000 0.000 1.000 N NA
 145819 145820 YPO2450 YPO2451     FALSE 0.218 149.000 0.033 NA   NA
 145820 145821 YPO2451 YPO2452     TRUE 0.522 44.000 0.000 NA   NA
 145821 145822 YPO2452 YPO2453     FALSE 0.174 187.000 0.000 NA   NA
 145822 145823 YPO2453 YPO2454     FALSE 0.258 132.000 0.000 NA   NA
 145823 145824 YPO2454 YPO2455     TRUE 0.565 37.000 0.000 NA   NA
 145826 145827 YPO2457 YPO2458 ypeR   FALSE 0.196 487.000 0.000 0.055 Y NA
 145828 145829 YPO2459 YPO2460     TRUE 0.888 47.000 0.286 1.000   NA
 145829 145830 YPO2460 YPO2461     TRUE 0.991 11.000 0.714 1.000   NA
 145831 145832 YPO2462 YPO2463     TRUE 0.982 11.000 0.468 NA   NA
 145832 145833 YPO2463 YPO2464     TRUE 0.988 18.000 0.787 NA   NA
 145833 145834 YPO2464 YPO2465     TRUE 0.998 -3.000 0.895 NA   NA
 145834 145835 YPO2465 YPO2466     TRUE 0.556 38.000 0.000 NA   NA
 145835 145836 YPO2466 YPO2467     FALSE 0.284 116.000 0.000 NA   NA
 145836 145837 YPO2467 YPO2468     TRUE 0.997 -3.000 0.707 NA   NA
 145837 145838 YPO2468 YPO2469     FALSE 0.031 382.000 0.000 NA   NA
 11424678 145831   YPO2462     FALSE NA 8358.000 0.000 NA   NA
 11567041 145831   YPO2462     FALSE NA 8358.000 0.000 NA   NA
 11709433 145831   YPO2462     FALSE NA 8358.000 0.000 NA   NA
 11424679 145831   YPO2462     FALSE NA 8386.000 0.000 NA   NA
 11567042 145831   YPO2462     FALSE NA 8386.000 0.000 NA   NA
 11709434 145831   YPO2462     FALSE NA 8386.000 0.000 NA   NA
 11424680 145831   YPO2462     FALSE NA 8418.000 0.000 NA   NA
 11567043 145831   YPO2462     FALSE NA 8418.000 0.000 NA   NA
 11709435 145831   YPO2462     FALSE NA 8418.000 0.000 NA   NA
 11424681 145831   YPO2462     FALSE NA 8446.000 0.000 NA   NA
 11567044 145831   YPO2462     FALSE NA 8446.000 0.000 NA   NA
 11709436 145831   YPO2462     FALSE NA 8446.000 0.000 NA   NA
 11424682 145831   YPO2462     FALSE NA 8478.000 0.000 NA   NA
 11567045 145831   YPO2462     FALSE NA 8478.000 0.000 NA   NA
 11709437 145831   YPO2462     FALSE NA 8478.000 0.000 NA   NA
 11424683 145831   YPO2462     FALSE NA 8506.000 0.000 NA   NA
 11567046 145831   YPO2462     FALSE NA 8506.000 0.000 NA   NA
 11709438 145831   YPO2462     FALSE NA 8506.000 0.000 NA   NA
 11424684 145831   YPO2462     FALSE NA 8538.000 0.000 NA   NA
 11567047 145831   YPO2462     FALSE NA 8538.000 0.000 NA   NA
 11709439 145831   YPO2462     FALSE NA 8538.000 0.000 NA   NA
 11424685 145831   YPO2462     FALSE NA 8566.000 0.000 NA   NA
 11567048 145831   YPO2462     FALSE NA 8566.000 0.000 NA   NA
 11709440 145831   YPO2462     FALSE NA 8566.000 0.000 NA   NA
 11424686 145831   YPO2462     FALSE NA 8598.000 0.000 NA   NA
 11567049 145831   YPO2462     FALSE NA 8598.000 0.000 NA   NA
 11709441 145831   YPO2462     FALSE NA 8598.000 0.000 NA   NA
 11424687 145831   YPO2462     FALSE NA 8626.000 0.000 NA   NA
 11567050 145831   YPO2462     FALSE NA 8626.000 0.000 NA   NA
 11709442 145831   YPO2462     FALSE NA 8626.000 0.000 NA   NA
 11424688 145831   YPO2462     FALSE NA 8658.000 0.000 NA   NA
 11567051 145831   YPO2462     FALSE NA 8658.000 0.000 NA   NA
 11709443 145831   YPO2462     FALSE NA 8658.000 0.000 NA   NA
 11424689 145831   YPO2462     FALSE NA 8686.000 0.000 NA   NA
 11567052 145831   YPO2462     FALSE NA 8686.000 0.000 NA   NA
 11709444 145831   YPO2462     FALSE NA 8686.000 0.000 NA   NA
 11424690 145831   YPO2462     FALSE NA 8718.000 0.000 NA   NA
 11567053 145831   YPO2462     FALSE NA 8718.000 0.000 NA   NA
 11709445 145831   YPO2462     FALSE NA 8718.000 0.000 NA   NA
 11424691 145831   YPO2462     FALSE NA 8746.000 0.000 NA   NA
 11567054 145831   YPO2462     FALSE NA 8746.000 0.000 NA   NA
 11709446 145831   YPO2462     FALSE NA 8746.000 0.000 NA   NA
 11424692 145831   YPO2462     FALSE NA 8778.000 0.000 NA   NA
 11567055 145831   YPO2462     FALSE NA 8778.000 0.000 NA   NA
 11709447 145831   YPO2462     FALSE NA 8778.000 0.000 NA   NA
 11424693 145831   YPO2462     FALSE NA 8806.000 0.000 NA   NA
 11567056 145831   YPO2462     FALSE NA 8806.000 0.000 NA   NA
 11709448 145831   YPO2462     FALSE NA 8806.000 0.000 NA   NA
 11424694 145831   YPO2462     FALSE NA 8839.000 0.000 NA   NA
 11567057 145831   YPO2462     FALSE NA 8839.000 0.000 NA   NA
 11709449 145831   YPO2462     FALSE NA 8839.000 0.000 NA   NA
 145840 145841 YPO2471 YPO2472   ureD TRUE 0.550 39.000 0.000 NA   NA
 145841 145842 YPO2472 YPO2473 ureD   FALSE 0.274 123.000 0.000 NA   NA
 145842 145843 YPO2473 YPO2474     TRUE 0.646 27.000 0.000 NA   NA
 145843 145844 YPO2474 YPO2475     TRUE 0.677 147.000 0.000 NA Y NA
 145844 145845 YPO2475 YPO2476     TRUE 0.999 1.000 0.711 0.052 Y NA
 145845 145846 YPO2476 YPO2477     TRUE 0.986 109.000 0.733 0.052 Y NA
 145847 145848 YPO2478 YPO2479   manB TRUE 0.511 17.000 0.000 1.000 N NA
 145848 145849 YPO2479 YPO2480 manB mtlK TRUE 0.749 100.000 0.000 1.000 Y NA
 145850 145851 YPO2481 YPO2482     FALSE 0.074 258.000 0.000 NA   NA
 145851 145852 YPO2482 YPO2483     FALSE 0.305 100.000 0.000 NA   NA
 145852 145853 YPO2483 YPO2484     FALSE 0.246 142.000 0.000 NA   NA
 145853 145854 YPO2484 YPO2485     FALSE 0.142 203.000 0.000 NA   NA
 145854 145855 YPO2485 YPO2486     TRUE 0.802 10.000 0.000 NA   NA
 145857 145858 YPO2488 YPO2489     FALSE 0.088 245.000 0.000 NA   NA
 145858 145859 YPO2489 YPO2490     TRUE 0.816 8.000 0.000 NA   NA
 145859 145860 YPO2490 YPO2491     TRUE 0.687 144.000 0.000 1.000 Y NA
 145860 145861 YPO2491 YPO2492     FALSE 0.006 652.000 0.000 1.000 N NA
 145861 145862 YPO2492 YPO2493     TRUE 0.450 96.000 0.000 0.036 N NA
 145862 145863 YPO2493 YPO2494     TRUE 0.490 117.000 0.167 1.000 N NA
 145863 145864 YPO2494 YPO2495     FALSE 0.018 531.000 0.000 NA   NA
 145864 145865 YPO2495 YPO2496     FALSE 0.374 69.000 0.000 NA   NA
 145866 145867 YPO2497 YPO2498     TRUE 0.526 247.000 0.000 0.054 Y NA
 145868 145869 YPO2499 YPO2500 rbsC rbsA TRUE 0.997 -3.000 0.111 0.011 Y NA
 145869 145870 YPO2500 YPO2501 rbsA rbsB TRUE 0.966 40.000 0.125 0.011 Y NA
 145870 145871 YPO2501 YPO2502 rbsB gutB FALSE 0.290 175.000 0.125 1.000 N NA
 145871 145872 YPO2502 YPO2503 gutB   FALSE 0.016 583.000 0.000 NA   NA
 145872 145873 YPO2503 YPO2504     FALSE 0.156 196.000 0.000 NA   NA
 145873 145874 YPO2504 YPO2505     FALSE 0.096 238.000 0.000 NA   NA
 145874 145875 YPO2505 YPO2506   ompX FALSE 0.018 316.000 0.000 1.000 N NA
 145876 145877 YPO2507 YPO2508     TRUE 0.679 16.000 0.016 1.000   NA
 145877 145878 YPO2508 YPO2509   tam TRUE 0.861 23.000 0.000 0.041   NA
 145878 145879 YPO2509 YPO2510 tam dps FALSE 0.080 257.000 0.000 1.000   NA
 145879 145880 YPO2510 YPO2511 dps   FALSE 0.048 320.000 0.000 1.000   NA
 145880 145881 YPO2511 YPO2512   glnH FALSE 0.017 570.000 0.000 1.000   NA
 145881 145882 YPO2512 YPO2513 glnH glnP TRUE 0.960 35.000 0.103 0.071 Y NA
 145882 145883 YPO2513 YPO2514 glnP glnQ TRUE 0.990 -3.000 0.051 1.000 Y NA
 145885 145886 YPO2516 YPO2517     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 145889 145890 YPO2522 YPO2523   menE FALSE 0.205 66.000 0.000 1.000 N NA
 145890 145891 YPO2523 YPO2524 menE menC TRUE 0.992 -12.000 0.283 0.001 N NA
 145891 145892 YPO2524 YPO2525 menC menB TRUE 0.998 0.000 0.171 0.001 Y NA
 145892 145893 YPO2525 YPO2526 menB   TRUE 0.957 14.000 0.280 NA   NA
 145893 145894 YPO2526 YPO2527   menD TRUE 0.993 -3.000 0.355 NA   NA
 145894 145895 YPO2527 YPO2528 menD menF TRUE 0.759 228.000 0.281 1.000 Y NA
 145895 145896 YPO2528 YPO2530 menF   FALSE 0.018 528.000 0.000 NA   NA
 145896 145897 YPO2530 YPO2531   elaB FALSE 0.017 555.000 0.000 NA   NA
 145897 145898 YPO2531 YPO2532 elaB   FALSE 0.015 648.000 0.000 NA   NA
 145898 145899 YPO2532 YPO2533   edd FALSE 0.395 66.000 0.000 NA   NA
 145899 145900 YPO2533 YPO2534 edd   TRUE 0.803 4.000 0.008 NA   NA
 145900 145901 YPO2534 YPO2535     TRUE 0.613 30.000 0.036 NA   NA
 145901 145902 YPO2535 YPO2536     FALSE 0.259 531.000 0.667 1.000 N NA
 145902 145903 YPO2536 YPO2537     FALSE 0.009 466.000 0.000 1.000 N NA
 145904 145905 YPO2538 YPO2539   idnO FALSE 0.014 759.000 0.000 1.000   NA
 145905 145906 YPO2539 YPO2540 idnO idnK TRUE 0.539 49.000 0.095 1.000 N NA
 145906 145907 YPO2540 YPO2541 idnK   TRUE 0.841 78.000 0.095 NA Y NA
 145908 145909 YPO2542 YPO2543   nuoN FALSE 0.067 236.000 0.011 NA   NA
 145909 145910 YPO2543 YPO2544 nuoN nuoM TRUE 0.998 7.000 0.437 0.001 Y NA
 145910 145911 YPO2544 YPO2545 nuoM nuoL TRUE 0.996 40.000 0.713 0.001 Y NA
 145911 145912 YPO2545 YPO2546 nuoL nuoK TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.003 Y NA
 145912 145913 YPO2546 YPO2547 nuoK nuoJ TRUE 0.999 -3.000 0.269 0.002 Y NA
 145913 145914 YPO2547 YPO2548 nuoJ nuoI TRUE 0.997 13.000 0.428 0.003 Y NA
 145914 145915 YPO2548 YPO2549 nuoI nuoH TRUE 0.996 15.000 0.423 0.003 Y NA
 145915 145916 YPO2549 YPO2550 nuoH nuoG TRUE 1.000 -3.000 0.664 0.003 Y NA
 145916 145917 YPO2550 YPO2551 nuoG nuoF TRUE 0.948 87.000 0.180 0.003 Y NA
 145917 145918 YPO2551 YPO2552 nuoF nuoE TRUE 0.998 -3.000 0.186 0.003 Y NA
 145918 145919 YPO2552 YPO2553 nuoE nuoD TRUE 0.989 48.000 0.407 0.003 Y NA
 145919 145920 YPO2553 YPO2554 nuoD nuoB TRUE 0.985 141.000 0.691 0.002 Y NA
 145920 145921 YPO2554 YPO2555 nuoB nuoA TRUE 0.973 102.000 0.377 0.002 Y NA
 145921 145922 YPO2555 YPO2556 nuoA pecT FALSE 0.006 684.000 0.000 1.000 N NA
 145922 145923 YPO2556 YPO2557 pecT   FALSE 0.023 451.000 0.000 NA   NA
 145924 145925 YPO2558 YPO2559 aat   FALSE 0.414 151.000 0.104 1.000   NA
 145926 145927 YPO2560 YPO2561     TRUE 0.646 27.000 0.000 NA   NA
 145927 145928 YPO2561 YPO2562     FALSE 0.154 292.000 0.136 1.000   NA
 145928 145929 YPO2562 YPO2563     TRUE 0.744 165.000 0.375 NA   NA
 145929 145930 YPO2563 YPO2564     FALSE 0.211 308.000 0.221 NA   NA
 145931 145932 YPO2565 YPO2566   ackA TRUE 0.909 -10.000 0.000 NA   NA
 145932 145933 YPO2566 YPO2567 ackA pta TRUE 0.864 168.000 0.634 1.000   NA
 145935 2201103 YPO2569 YPO2570     FALSE 0.209 169.000 0.000 NA   NA
 145936 2201104 YPO2571 YPO2572   pbpC FALSE 0.361 73.000 0.000 NA   NA
 2201104 145937 YPO2572 YPO2573 pbpC   TRUE 0.449 57.000 0.000 NA   NA
 145937 145938 YPO2573 YPO2574     FALSE 0.033 371.000 0.000 NA   NA
 145938 145939 YPO2574 YPO2576     FALSE 0.014 689.000 0.000 NA   NA
 145940 145941 YPO2577 YPO2578     TRUE 0.779 14.000 0.093 1.000 N NA
 145941 2201105 YPO2578 YPO2579     FALSE 0.054 294.000 0.000 NA   NA
 2201105 145942 YPO2579 YPO2581     FALSE 0.269 126.000 0.000 NA   NA
 145942 145943 YPO2581 YPO2582     TRUE 0.994 49.000 0.667 0.010 Y NA
 145943 145944 YPO2582 YPO2583     TRUE 0.997 12.000 0.444 0.010 Y NA
 145944 145945 YPO2583 YPO2584     TRUE 0.896 24.000 0.176 1.000   NA
 145945 145946 YPO2584 YPO2585     TRUE 0.698 32.000 0.064 1.000   NA
 145946 145947 YPO2585 YPO2586     TRUE 0.744 153.000 0.086 1.000 Y NA
 145947 145948 YPO2586 YPO2587     TRUE 0.987 10.000 0.199 1.000 Y NA
 145948 145949 YPO2587 YPO2588     FALSE 0.009 465.000 0.000 1.000 N NA
 145952 145953 YPO2591 YPO2592     FALSE 0.185 182.000 0.000 NA   NA
 145959 145960 YPO2598 YPO2599 lipA lipB TRUE 0.934 193.000 0.319 0.001 Y NA
 145960 145961 YPO2599 YPO2600 lipB   FALSE 0.391 224.000 0.219 NA   NA
 145961 145962 YPO2600 YPO2601   dacA FALSE 0.237 198.000 0.081 NA   NA
 145962 145963 YPO2601 YPO2602 dacA rlpA TRUE 0.591 403.000 0.475 NA Y NA
 145963 145964 YPO2602 YPO2603 rlpA rodA TRUE 0.540 10.000 0.035 NA N NA
 145964 145965 YPO2603 YPO2604 rodA pbpA FALSE 0.092 185.000 0.046 1.000 N NA
 145965 145966 YPO2604 YPO2605 pbpA   FALSE 0.311 82.000 0.031 NA   NA
 145966 145967 YPO2605 YPO2606     TRUE 0.981 4.000 0.307 NA   NA
 145967 145968 YPO2606 YPO2607   nadD FALSE 0.098 224.000 0.032 NA   NA
 145968 145969 YPO2607 YPO2608 nadD holA TRUE 0.818 -10.000 0.045 1.000 N NA
 145969 145970 YPO2608 YPO2609 holA rlpB TRUE 0.976 -3.000 0.199 NA N NA
 145970 145971 YPO2609 YPO2610 rlpB leuS TRUE 0.888 15.000 0.182 NA N NA
 145973 145974 YPO2612 YPO2613 gltL gltK TRUE 0.998 -3.000 0.379 1.000 Y NA
 145974 145975 YPO2613 YPO2614 gltK gltJ TRUE 1.000 0.000 0.933 0.016 Y NA
 145975 145976 YPO2614 YPO2615 gltJ glnH TRUE 0.857 174.000 0.150 0.051 Y NA
 145976 145977 YPO2615 YPO2616 glnH cutE FALSE 0.005 765.000 0.000 1.000 N NA
 145977 145978 YPO2616 YPO2617 cutE   TRUE 0.984 8.000 0.557 1.000 N NA
 145978 145979 YPO2617 YPO2618     TRUE 0.560 118.000 0.150 NA   NA
 145979 145980 YPO2618 YPO2619     TRUE 0.995 -3.000 0.457 NA   NA
 145980 145981 YPO2619 YPO2620   miaB FALSE 0.183 288.000 0.220 1.000 N NA
 5922273 5922274 YPt_32 YPt_33     TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   NA
 5922274 5922275 YPt_33 YPt_34     TRUE 0.599 33.000 0.000 NA   NA
 5922275 5922276 YPt_34 YPt_35     TRUE 0.624 30.000 0.000 NA   NA
 5922276 5922277 YPt_35 YPt_36     TRUE 0.816 8.000 0.000 NA   NA
 145984 145985 YPO2623 YPO2624 asnB nagD FALSE 0.014 355.000 0.000 1.000 N NA
 145985 145986 YPO2624 YPO2625 nagD nagC TRUE 0.828 73.000 0.070 1.000 Y NA
 145986 145987 YPO2625 YPO2626 nagC nagA TRUE 0.995 14.000 0.571 1.000 Y NA
 145987 145988 YPO2626 YPO2627 nagA nagB TRUE 0.997 20.000 0.557 0.001 Y NA
 145989 145990 YPO2628 YPO2629 nagE tnp FALSE 0.028 265.000 0.000 1.000 N NA
 145990 145991 YPO2629 YPO2630 tnp glnS FALSE 0.063 202.000 0.000 1.000 N NA
 145991 145992 YPO2630 YPO2631 glnS   FALSE 0.015 706.000 0.000 1.000   NA
 145992 2201106 YPO2631 YPO2632   chb FALSE 0.042 328.000 0.000 NA   NA
 145993 145994 YPO2634 YPO2635 fur fldA FALSE 0.073 367.000 0.156 1.000 N NA
 145994 145995 YPO2635 YPO2637 fldA   FALSE 0.288 417.000 0.473 1.000   NA
 145995 145996 YPO2637 YPO2638     FALSE 0.239 332.000 0.276 1.000   NA
 145996 145997 YPO2638 YPO2639     FALSE 0.012 1125.000 0.000 NA   NA
 145997 145998 YPO2639 YPO2640   trp1400A FALSE 0.341 83.000 0.000 NA   NA
 145998 145999 YPO2640 YPO2641 trp1400A intA TRUE 0.715 49.000 0.000 0.080   NA
 145999 146000 YPO2641 YPO2642 intA   FALSE 0.403 67.000 0.000 1.000   NA
 146000 146001 YPO2642 YPO2643     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 146002 146003 YPO2645 YPO2646 proX proW TRUE 0.994 48.000 0.695 0.051 Y NA
 146003 146004 YPO2646 YPO2647 proW proV TRUE 0.999 -7.000 0.630 0.089 Y NA
 146004 146005 YPO2647 YPO2648 proV nrdF FALSE 0.006 676.000 0.000 1.000 N NA
 146005 146006 YPO2648 YPO2649 nrdF nrdE TRUE 0.947 107.000 0.190 0.001 Y NA
 146006 146007 YPO2649 YPO2650 nrdE nrdI TRUE 0.948 51.000 0.216 NA Y NA
 146007 146008 YPO2650 YPO2651 nrdI nrdH TRUE 0.967 14.000 0.440 NA N NA
 146009 146010 YPO2652 YPO2653 asr   FALSE 0.021 478.000 0.000 NA   NA
 146013 146014 YPO2659 YPO2660 cspB   FALSE 0.005 877.000 0.000 1.000 N NA
 146014 146015 YPO2660 YPO2661     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.051 Y NA
 146015 146016 YPO2661 YPO2662     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.051 Y NA
 146016 146017 YPO2662 YPO2663     TRUE 0.998 0.000 1.000 1.000   NA
 146017 146018 YPO2663 YPO2664     TRUE 0.997 -7.000 0.500 0.018   NA
 146018 146019 YPO2664 YPO2665   ureA FALSE 0.074 1199.000 0.000 1.000 Y NA
 146019 146020 YPO2665 YPO2666 ureA ureB TRUE 0.982 53.000 0.267 0.001 Y NA
 146020 146021 YPO2666 YPO2667 ureB ureC TRUE 0.967 90.000 0.267 0.001 Y NA
 146021 146022 YPO2667 YPO2668 ureC ureE FALSE 0.172 296.000 0.067 0.001 N NA
 146022 146023 YPO2668 YPO2669 ureE ureF TRUE 0.996 22.000 0.460 0.002 Y NA
 146023 146024 YPO2669 YPO2670 ureF ureG TRUE 0.875 127.000 0.064 0.002 Y NA
 146024 2201109 YPO2670 YPO2671 ureG ureD TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 2201109 146025 YPO2671 YPO2672 ureD   FALSE 0.159 195.000 0.000 NA   NA
 146025 146026 YPO2672 YPO2673     TRUE 0.465 149.000 0.095 0.068 N NA
 146029 146030 YPO2676 YPO2677     TRUE 0.990 16.000 0.233 0.089 Y NA
 146031 146032 YPO2678 YPO2679 celA celB TRUE 0.995 11.000 0.250 0.005 Y NA
 146032 146033 YPO2679 YPO2680 celB celC TRUE 0.986 167.000 0.833 0.005 Y NA
 146033 146034 YPO2680 YPO2681 celC celD TRUE 0.967 37.000 0.727 1.000 N NA
 146034 146035 YPO2681 YPO2682 celD   TRUE 0.837 52.000 0.222 1.000   NA
 146036 146037 YPO2683 YPO2684     FALSE 0.288 112.000 0.000 NA   NA
 146038 146039 YPO2685 YPO2686 seqA pgm TRUE 0.552 73.000 0.151 1.000 N NA
 146040 146041 YPO2687 YPO2688   kdpE TRUE 0.579 95.000 0.129 1.000   NA
 146041 146042 YPO2688 YPO2689 kdpE kdpD TRUE 0.694 293.000 0.385 1.000 Y NA
 146042 146043 YPO2689 YPO2690 kdpD kdpC TRUE 0.917 10.000 0.100 0.089 N NA
 146043 146044 YPO2690 YPO2691 kdpC kdpB TRUE 0.979 212.000 0.877 0.001 Y NA
 146044 146045 YPO2691 YPO2692 kdpB kdpA TRUE 0.954 94.000 0.201 0.001 Y NA
 146046 146047 YPO2693 YPO2694     FALSE 0.192 339.000 0.231 NA   NA
 146047 146048 YPO2694 YPO2695   phrB FALSE 0.206 130.000 0.019 NA   NA
 146048 146049 YPO2695 YPO2696 phrB   TRUE 0.621 -3.000 0.008 1.000 N NA
 146049 146050 YPO2696 YPO2697     FALSE 0.204 123.000 0.013 NA   NA
 146050 2201110 YPO2697 YPO2698     FALSE 0.015 619.000 0.000 NA   NA
 2201110 146051 YPO2698 YPO2699   fliB TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 146051 146052 YPO2699 YPO2700 fliB   TRUE 0.985 -3.000 0.211 NA   NA
 146052 146053 YPO2700 YPO2701     TRUE 0.664 85.000 0.173 NA   NA
 146053 146054 YPO2701 YPO2702     TRUE 0.998 -3.000 0.939 NA   NA
 146054 146055 YPO2702 YPO2703   pcp TRUE 0.970 10.000 0.300 NA   NA
 146057 146058 YPO2705 YPO2706   yplA FALSE 0.201 179.000 0.000 1.000   NA
 146058 146059 YPO2706 YPO2707 yplA yplB TRUE 0.851 78.000 0.375 NA   NA
 146063 146064 YPO2711 YPO2712 rpoE rseA TRUE 0.975 26.000 0.705 NA N NA
 146064 146065 YPO2712 YPO2713 rseA rseB TRUE 0.999 0.000 0.856 NA Y NA
 146065 146066 YPO2713 YPO2714 rseB rseC TRUE 0.999 -3.000 0.609 NA Y NA
 146068 146069 YPO2716 YPO2717 lepA lepB TRUE 0.947 10.000 0.187 1.000   NA
 146069 146070 YPO2717 YPO2718 lepB rnc FALSE 0.089 352.000 0.117 1.000   NA
 146070 146071 YPO2718 YPO2719 rnc era TRUE 0.987 -3.000 0.127 0.047   NA
 146071 146072 YPO2719 YPO2720 era recO TRUE 0.906 10.000 0.109 1.000   NA
 146072 146073 YPO2720 YPO2721 recO   TRUE 0.825 127.000 0.000 0.021 Y NA
 146073 146074 YPO2721 YPO2722     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 146074 146075 YPO2722 YPO2723     FALSE 0.403 67.000 0.000 1.000   NA
 146075 146076 YPO2723 YPO2724     TRUE 0.962 9.000 0.235 NA   NA
 146076 146077 YPO2724 YPO2725     FALSE 0.054 294.000 0.000 NA   NA
 146077 146078 YPO2725 YPO2726     FALSE 0.035 359.000 0.000 NA   NA
 146078 146079 YPO2726 YPO2727     TRUE 0.989 20.000 0.833 NA   NA
 146079 146080 YPO2727 YPO2728     TRUE 0.959 97.000 1.000 NA   NA
 146080 146081 YPO2728 YPO2729     TRUE 0.665 25.000 0.000 NA   NA
 146082 146083 YPO2730 YPO2731     FALSE 0.031 376.000 0.000 NA   NA
 146083 146084 YPO2731 YPO2732   lemA TRUE 0.897 5.000 0.074 NA   NA
 5922278 146085 YPt_37 YPO2733     FALSE 0.076 255.000 0.000 NA   NA
 146085 146086 YPO2733 YPO2734   ccmA FALSE 0.023 445.000 0.000 NA   NA
 146086 146087 YPO2734 YPO2735 ccmA ccmB TRUE 0.999 -30.000 0.503 0.002 Y NA
 146087 146088 YPO2735 YPO2736 ccmB ccmC TRUE 0.989 63.000 0.501 0.001 Y NA
 146088 146089 YPO2736 YPO2737 ccmC ccmD TRUE 0.994 -3.000 0.501 1.000 N NA
 146089 146090 YPO2737 YPO2738 ccmD ccmE TRUE 0.990 -3.000 0.344 1.000 N NA
 146090 146091 YPO2738 YPO2739 ccmE ccmF TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 146091 146092 YPO2739 YPO2740 ccmF ccmG TRUE 1.000 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 146092 146093 YPO2740 YPO2741 ccmG ccmH TRUE 0.999 -3.000 0.578 NA Y NA
 146093 5922279 YPO2741 YP02742 ccmH   TRUE 0.999 0.000 0.727 NA Y NA
 5922279 146095 YP02742 YPO2743   vacJ TRUE 0.852 36.000 0.239 1.000 N NA
 146097 146098 YPO2745 YPO2746     FALSE 0.078 287.000 0.061 NA   NA
 146098 146099 YPO2746 YPO2747   faoA TRUE 0.998 0.000 0.430 1.000 Y NA
 146099 146100 YPO2747 YPO2748 faoA sixA FALSE 0.007 569.000 0.000 1.000 N NA
 146102 146103 YPO2750 YPO2751   aroC FALSE 0.341 77.000 0.081 1.000 N NA
 146103 146104 YPO2751 YPO2752 aroC mepA TRUE 0.543 6.000 0.025 1.000 N NA
 146104 146105 YPO2752 YPO2753 mepA yapB4 TRUE 0.958 4.000 0.160 1.000   NA
 146105 146106 YPO2753 YPO2754 yapB4   TRUE 0.596 100.000 0.153 NA   NA
 146106 146107 YPO2754 YPO2755     TRUE 0.910 58.000 0.425 NA   NA
 146112 146113 YPO2760 YPO2761 flk   FALSE 0.132 285.000 0.118 NA   NA
 146114 146115 YPO2762 YPO2763   pdxB FALSE 0.310 47.000 0.043 1.000 N NA
 146117 146118 YPO2765 YPO2766 asd truA FALSE 0.166 87.000 0.040 1.000 N NA
 146118 146119 YPO2766 YPO2767 truA dedA FALSE 0.223 157.000 0.038 NA   NA
 146119 146120 YPO2767 YPO2768 dedA accD FALSE 0.078 231.000 0.020 NA   NA
 146120 146121 YPO2768 YPO2769 accD folC FALSE 0.419 249.000 0.383 1.000 N NA
 146121 146122 YPO2769 YPO2770 folC dedD TRUE 0.669 120.000 0.216 1.000   NA
 146122 146123 YPO2770 YPO2771 dedD cvpA FALSE 0.110 312.000 0.116 1.000   NA
 146123 146124 YPO2771 YPO2772 cvpA purF TRUE 0.958 13.000 0.262 1.000   NA
 146124 146125 YPO2772 YPO2773 purF ubiX FALSE 0.053 247.000 0.056 1.000 N NA
 146125 146126 YPO2773 YPO2774 ubiX hisJ FALSE 0.008 519.000 0.000 1.000 N NA
 146126 146127 YPO2774 YPO2775 hisJ hisQ TRUE 0.989 103.000 0.833 0.050 Y NA
 146127 146128 YPO2775 YPO2776 hisQ hisM TRUE 1.000 -3.000 0.900 0.015 Y NA
 146128 146129 YPO2776 YPO2777 hisM hisP TRUE 0.996 14.000 0.643 1.000 Y NA
 146131 146132 YPO2779 YPO2780     FALSE 0.147 201.000 0.000 NA   NA
 146132 146133 YPO2780 YPO2781     TRUE 0.493 222.000 0.143 0.009   NA
 146135 2201111 YPO2783 YPO2784   pbpC TRUE 0.565 37.000 0.000 NA   NA
 146137 146138 YPO2788 YPO2790     FALSE 0.066 268.000 0.000 NA   NA
 146138 146139 YPO2790 YPO2792     FALSE 0.077 254.000 0.000 NA   NA
 146140 146141 YPO2793 YPO2794     TRUE 0.675 24.000 0.000 NA   NA
 146141 146142 YPO2794 YPO2795     TRUE 0.550 39.000 0.000 NA   NA
 146143 146144 YPO2796 YPO2797 yapC   FALSE 0.018 535.000 0.000 NA   NA
 146145 146146 YPO2798 YPO2799     TRUE 0.565 37.000 0.000 NA   NA
 146147 146148 YPO2801 YPO2802     TRUE 0.944 -7.000 0.068 NA   NA
 146148 146149 YPO2802 YPO2803   bglB FALSE 0.225 159.000 0.000 NA   NA
 146151 146152 YPO2805 YPO2806     TRUE 0.962 26.000 0.438 1.000   NA
 146154 146155 YPO2808 YPO2809     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 146156 146157 YPO2811 YPO2812     FALSE 0.313 97.000 0.000 NA   NA
 146157 146158 YPO2812 YPO2813     TRUE 0.833 12.000 0.063 NA   NA
 146158 146159 YPO2813 YPO2814     TRUE 0.997 -7.000 0.285 NA Y NA
 146159 146160 YPO2814 YPO2815     TRUE 0.990 -3.000 0.054 NA Y NA
 146160 146161 YPO2815 YPO2816     TRUE 0.962 10.000 0.238 1.000   NA
 146161 146162 YPO2816 YPO2817     TRUE 0.992 -7.000 0.179 0.002   NA
 146162 146163 YPO2817 YPO2818     FALSE 0.107 227.000 0.000 NA   NA
 146164 146165 YPO2819 YPO2820 int   FALSE 0.341 83.000 0.000 NA   NA
 146165 146166 YPO2820 YPO2821     FALSE 0.058 286.000 0.000 NA   NA
 146166 146167 YPO2821 YPO2822     FALSE 0.286 114.000 0.000 NA   NA
 146167 146168 YPO2822 YPO2823     FALSE 0.073 259.000 0.000 NA   NA
 146169 146170 YPO2824 YPO2825 folD   TRUE 0.797 15.000 0.055 1.000   NA
 146171 146172 YPO2826 YPO2827 tnp upp FALSE 0.087 176.000 0.000 1.000 N NA
 146173 146174 YPO2828 YPO2829 purI purN TRUE 0.954 115.000 0.230 0.001 Y NA
 146174 146175 YPO2829 YPO2830 purN speG FALSE 0.019 229.000 0.017 1.000 N NA
 2201112 146176 YPO2831 YPO2833 fliB pstb FALSE 0.105 228.000 0.000 NA   NA
 146176 146177 YPO2833 YPO2834 pstb pstA TRUE 0.996 28.000 0.511 0.002 Y NA
 146177 146178 YPO2834 YPO2835 pstA pstC TRUE 0.996 0.000 0.489 0.088   NA
 146179 146180 YPO2836 YPO2837 ppk ppx TRUE 0.995 11.000 0.486 1.000 Y NA
 146180 146181 YPO2837 YPO2838 ppx   FALSE 0.310 112.000 0.047 NA   NA
 146181 146182 YPO2838 YPO2839   mgtE FALSE 0.422 52.000 0.024 NA   NA
 146182 146183 YPO2839 YPO2840 mgtE   FALSE 0.116 140.000 0.000 1.000 N NA
 146184 146185 YPO2841 YPO2842     TRUE 0.916 62.000 0.072 0.050 Y NA
 146185 146186 YPO2842 YPO2843     TRUE 0.927 47.000 0.000 0.050 Y NA
 146186 146187 YPO2843 YPO2844   goaG TRUE 0.860 53.000 0.000 1.000 Y NA
 146188 146189 YPO2845 YPO2846     FALSE 0.175 383.000 0.000 1.000 Y NA
 146189 146190 YPO2846 YPO2847     FALSE 0.014 364.000 0.000 1.000 N NA
 146190 146191 YPO2847 YPO2848     TRUE 0.998 0.000 1.000 1.000 N NA
 146191 146192 YPO2848 YPO2849     TRUE 0.992 -3.000 0.094 NA Y NA
 146192 146193 YPO2849 YPO2850   yegB TRUE 0.950 34.000 0.438 NA   NA
 146193 2201113 YPO2850 YPO2851 yegB baeS TRUE 0.614 31.000 0.000 NA   NA
 2201113 146194 YPO2851 YPO2853 baeS baeR TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 146194 146195 YPO2853 YPO2854 baeR   FALSE 0.318 137.000 0.062 NA   NA
 146195 146196 YPO2854 YPO2855     FALSE 0.042 275.000 0.008 NA   NA
 146196 146197 YPO2855 YPO2856     FALSE 0.006 636.000 0.000 1.000 N NA
 146201 2201114 YPO2860 YPO2861     TRUE 0.438 59.000 0.000 NA   NA
 146203 146204 YPO2863 YPO2864     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 146204 146205 YPO2864 YPO2865     FALSE 0.409 64.000 0.000 NA   NA
 146205 146206 YPO2865 YPO2866     TRUE 0.556 38.000 0.000 NA   NA
 146206 146207 YPO2866 YPO2867     FALSE 0.409 64.000 0.000 NA   NA
 146207 146208 YPO2867 YPO2868     TRUE 0.675 24.000 0.000 NA   NA
 146209 146210 YPO2869 YPO2870 tnp guaA FALSE 0.013 375.000 0.000 1.000 N NA
 146210 146211 YPO2870 YPO2871 guaA guaB TRUE 0.908 180.000 0.190 0.001 Y NA
 146213 146214 YPO2873 YPO2874     TRUE 0.555 49.000 0.055 NA   NA
 146214 146215 YPO2874 YPO2875     FALSE 0.072 347.000 0.003 0.066   NA
 146215 146216 YPO2875 YPO2876     TRUE 0.603 148.000 0.203 1.000   NA
 146216 146217 YPO2876 YPO2877     TRUE 0.983 12.000 0.492 1.000   NA
 146217 146218 YPO2877 YPO2878   hisS TRUE 0.955 14.000 0.259 1.000   NA
 146218 146219 YPO2878 YPO2879 hisS aarC FALSE 0.333 209.000 0.207 1.000 N NA
 146219 146220 YPO2879 YPO2880 aarC   TRUE 0.811 62.000 0.233 1.000   NA
 146220 146221 YPO2880 YPO2881     TRUE 0.972 -10.000 0.153 1.000   NA
 146221 146222 YPO2881 YPO2882     FALSE 0.320 154.000 0.067 1.000   NA
 146222 146223 YPO2882 YPO2883   ndk FALSE 0.216 262.000 0.156 1.000   NA
 146223 146224 YPO2883 YPO2884 ndk   FALSE 0.043 327.000 0.000 NA   NA
 146225 146226 YPO2885 YPO2886   yapA FALSE 0.036 354.000 0.000 NA   NA
 146226 2201115 YPO2886 YPO2887 yapA yapB FALSE 0.017 558.000 0.000 NA   NA
 146227 146228 YPO2888 YPO2889   pepB TRUE 0.773 79.000 0.253 NA   NA
 146228 146229 YPO2889 YPO2890 pepB   TRUE 0.569 140.000 0.171 1.000   NA
 146229 146230 YPO2890 YPO2891   fdx TRUE 0.974 30.000 0.625 1.000   NA
 146230 146231 YPO2891 YPO2892 fdx hscA TRUE 0.995 3.000 0.794 1.000 N NA
 146231 146232 YPO2892 YPO2893 hscA hscB TRUE 0.886 243.000 0.634 1.000 Y NA
 146232 146233 YPO2893 YPO2894 hscB   TRUE 0.871 111.000 0.500 1.000   NA
 146233 146234 YPO2894 YPO2895   nifU TRUE 0.629 270.000 0.359 0.002   NA
 146234 146235 YPO2895 YPO2896 nifU   TRUE 0.941 31.000 0.448 1.000 N NA
 146235 146236 YPO2896 YPO2897     TRUE 0.891 54.000 0.424 1.000 N NA
 146236 146237 YPO2897 YPO2898     FALSE 0.337 156.000 0.126 1.000 N NA
 146238 146239 YPO2899 YPO2900   tnp FALSE 0.060 204.000 0.000 1.000 N NA
 146240 146241 YPO2901 YPO2902     TRUE 0.972 -9.000 0.150 NA   NA
 146243 146244 YPO2904 YPO2905 hcaT ail FALSE 0.039 352.000 0.000 1.000   NA
 146244 146245 YPO2905 YPO2906 ail   FALSE 0.291 110.000 0.000 NA   NA
 146245 146246 YPO2906 YPO2907   glyA FALSE 0.287 113.000 0.000 NA   NA
 146247 2201116 YPO2908 YPO2909 hmp   FALSE 0.025 431.000 0.000 NA   NA
 146248 146249 YPO2911 YPO2912 glnB nadE TRUE 0.865 15.000 0.151 1.000 N NA
 146249 146250 YPO2912 YPO2914 nadE   FALSE 0.355 160.000 0.065 0.093 N NA
 146250 146251 YPO2914 YPO2915     TRUE 0.961 -37.000 0.130 NA   NA
 146251 146252 YPO2915 YPO2916     TRUE 0.613 76.000 0.132 NA   NA
 146252 146253 YPO2916 YPO2917   tnp FALSE 0.059 206.000 0.000 1.000 N NA
 146254 146255 YPO2918 YPO2919     FALSE 0.044 323.000 0.000 NA   NA
 146258 146259 YPO2923 YPO2924     FALSE 0.107 194.000 0.062 NA N NA
 146259 146260 YPO2924 YPO2925     FALSE 0.363 275.000 0.316 NA   NA
 146261 146262 YPO2926 YPO2927   fdx FALSE 0.276 162.000 0.056 1.000   NA
 146263 146264 YPO2928 YPO2929 tnp acpS FALSE 0.063 202.000 0.000 1.000 N NA
 146264 146265 YPO2929 YPO2930 acpS pdxJ TRUE 0.986 0.000 0.326 1.000 N NA
 146265 146266 YPO2930 YPO2931 pdxJ   FALSE 0.074 190.000 0.000 1.000 N NA
 146266 146267 YPO2931 YPO2932     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 146267 2201117 YPO2932 YPO2933     FALSE 0.336 86.000 0.000 NA   NA
 2201117 146268 YPO2933 YPO2934     TRUE 0.599 33.000 0.000 NA   NA
 146268 146269 YPO2934 YPO2935     TRUE 0.996 4.000 0.833 NA   NA
 146269 146270 YPO2935 YPO2937     TRUE 0.439 253.000 0.333 NA   NA
 146270 146271 YPO2937 YPO2938     FALSE 0.420 326.000 0.500 NA   NA
 146271 146272 YPO2938 YPO2939     TRUE 0.987 24.000 0.800 NA   NA
 146272 146273 YPO2939 YPO2940     TRUE 0.914 105.000 0.667 NA   NA
 146273 2201118 YPO2940 YPO2943     TRUE 0.530 42.000 0.000 NA   NA
 146275 146276 YPO2944 YPO2945     TRUE 0.983 139.000 1.000 1.000 Y NA
 146276 146277 YPO2945 YPO2946   clpB5 TRUE 0.871 201.000 1.000 1.000 N NA
 146278 146279 YPO2947 YPO2948     TRUE 0.998 0.000 0.833 NA   NA
 146279 146280 YPO2948 YPO2949     TRUE 0.958 99.000 1.000 NA   NA
 146280 146281 YPO2949 YPO2950     TRUE 0.993 7.000 0.714 NA   NA
 146281 146282 YPO2950 YPO2951     TRUE 0.972 40.000 0.714 NA   NA
 146282 146283 YPO2951 YPO2952     TRUE 0.996 -3.000 0.600 NA   NA
 146283 146284 YPO2952 YPO2953     TRUE 0.991 1.000 0.400 NA   NA
 146284 146285 YPO2953 YPO2954     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 146286 146287 YPO2955 YPO2957   mltB FALSE 0.004 1255.000 0.000 NA N NA
 146288 146289 YPO2958 YPO2959 sfuA sfuB TRUE 0.994 56.000 0.824 0.049 Y NA
 146289 146290 YPO2959 YPO2960 sfuB sfuC TRUE 0.992 -3.000 0.275 0.049 N NA
 146294 146295 YPO2965 YPO2966 dmsA dmsB TRUE 0.997 12.000 0.500 0.034 Y NA
 146295 146296 YPO2966 YPO2967 dmsB dmsC TRUE 0.996 2.000 0.667 1.000   NA
 146296 146297 YPO2967 YPO2968 dmsC   FALSE 0.029 413.000 0.000 1.000   NA
 146297 146298 YPO2968 YPO2969     TRUE 0.996 -3.000 0.333 0.034   NA
 146299 146300 YPO2970 YPO2971     TRUE 0.998 -3.000 0.740 NA   NA
 146300 146301 YPO2971 YPO2972     TRUE 0.976 27.000 0.625 NA   NA
 146303 146304 YPO2974 YPO2975     FALSE 0.012 245.000 0.009 1.000 N NA
 146306 146307 YPO2977 YPO2978 glk   FALSE 0.204 181.000 0.048 NA   NA
 146308 146309 YPO2979 YPO2980     FALSE 0.150 136.000 0.050 1.000 N NA
 146309 146310 YPO2980 YPO2981     FALSE 0.286 171.000 0.071 NA   NA
 5922281 401328 YPt_39 YPt_40   tRNA-Val FALSE 0.149 200.000 0.000 NA   NA
 401328 401327 YPt_40 YPt_41 tRNA-Val tRNA-Val TRUE 0.517 45.000 0.000 NA   NA
 401327 401326 YPt_41 YPt_42 tRNA-Val tRNA-Val TRUE 0.565 37.000 0.000 NA   NA
 146313 146314 YPO2984 YPO2985 gltX tnp FALSE 0.072 193.000 0.000 1.000 N NA
 146314 401298 YPO2985 YPt_43 tnp tRNA-Ala FALSE 0.056 291.000 0.000 NA   NA
 401298 401299 YPt_43 YPt_44 tRNA-Ala tRNA-Ala FALSE 0.350 78.000 0.000 NA   NA
 401299 146315 YPt_44 YPO2986 tRNA-Ala   FALSE 0.159 195.000 0.000 NA   NA
 146315 146316 YPO2986 YPO2987     FALSE 0.222 132.000 0.027 NA   NA
 146317 146318 YPO2988 YPO2989   ligA TRUE 0.628 20.000 0.017 NA   NA
 146318 146319 YPO2989 YPO2990 ligA   FALSE 0.067 91.000 0.013 1.000 N NA
 146320 146321 YPO2991 YPO2992   cysK TRUE 0.778 157.000 0.122 1.000 Y NA
 146321 146322 YPO2992 YPO2993 cysK ptsH FALSE 0.004 499.000 0.019 1.000 N NA
 146322 146323 YPO2993 YPO2994 ptsH ptsI TRUE 0.933 49.000 0.033 0.006 Y NA
 146323 146324 YPO2994 YPO2995 ptsI crr TRUE 0.935 49.000 0.038 0.006 Y NA
 146325 146326 YPO2996 YPO2997 tnp   FALSE 0.027 270.000 0.000 1.000 N NA
 146326 146327 YPO2997 YPO2998     TRUE 0.974 26.000 0.216 1.000 Y NA
 146328 146329 YPO2999 YPO3000     TRUE 0.990 4.000 0.439 0.087 N NA
 146330 146331 YPO3001 YPO3002     TRUE 0.448 60.000 0.000 1.000   NA
 146331 146332 YPO3002 YPO3003     TRUE 0.993 -3.000 0.357 NA   NA
 146332 2201119 YPO3003 YPO3004     FALSE 0.246 143.000 0.000 NA   NA
 2201119 146333 YPO3004 YPO3006     TRUE 0.591 34.000 0.000 NA   NA
 146334 146335 YPO3007 YPO3008     FALSE 0.100 233.000 0.000 NA   NA
 146335 146336 YPO3008 YPO3009     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 146337 146338 YPO3010 YPO3011   cysM FALSE 0.088 245.000 0.000 NA   NA
 146338 146339 YPO3011 YPO3012 cysM cysA FALSE 0.113 171.000 0.049 1.000 N NA
 146339 146340 YPO3012 YPO3013 cysA cysW TRUE 0.994 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 146340 146341 YPO3013 YPO3014 cysW cysT TRUE 0.997 0.000 0.583 0.001 N NA
 146341 146342 YPO3014 YPO3015 cysT cysP TRUE 0.997 0.000 0.479 0.001 N NA
 146342 146343 YPO3015 YPO3016 cysP   FALSE 0.018 315.000 0.000 1.000 N NA
 146343 146344 YPO3016 YPO3017     FALSE 0.006 605.000 0.000 1.000 N NA
 146344 146345 YPO3017 YPO3018     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 146345 146346 YPO3018 YPO3019     TRUE 0.543 40.000 0.000 NA   NA
 146346 146347 YPO3019 YPO3020     TRUE 0.866 97.000 0.154 NA Y NA
 2201120 146348 YPO3021 YPO3023     FALSE 0.136 206.000 0.000 NA   NA
 146348 146349 YPO3023 YPO3024     TRUE 0.425 63.000 0.087 1.000 N NA
 146350 146351 YPO3025 YPO3026     TRUE 0.686 178.000 0.333 NA   NA
 146352 146353 YPO3027 YPO3028     FALSE 0.020 487.000 0.000 NA   NA
 146357 146358 YPO3032 YPO3033 hemF   TRUE 0.886 0.000 0.016 NA   NA
 146359 146360 YPO3034 YPO3035 maeB   FALSE 0.312 196.000 0.047 0.005 N NA
 146360 146361 YPO3035 YPO3036   napC FALSE 0.151 184.000 0.070 1.000 N NA
 146361 146362 YPO3036 YPO3037 napC napB TRUE 0.990 25.000 0.490 NA Y NA
 146362 146363 YPO3037 YPO3038 napB napA TRUE 0.760 83.000 0.031 NA Y NA
 146363 146364 YPO3038 YPO3039 napA napD TRUE 0.998 -3.000 0.875 NA N NA
 146364 146365 YPO3039 YPO3040 napD napF TRUE 0.980 -10.000 0.209 NA   NA
 146368 146369 YPO3043 YPO3044     FALSE 0.102 231.000 0.000 NA   NA
 146369 146370 YPO3044 YPO3045     FALSE 0.057 289.000 0.000 NA   NA
 146371 146372 YPO3046 YPO3047     TRUE 0.945 58.000 0.600 1.000   NA
 146372 146373 YPO3047 YPO3048   flaA1 FALSE 0.008 478.000 0.000 1.000 N NA
 146373 146374 YPO3048 YPO3049 flaA1   TRUE 0.997 -7.000 0.585 0.049 N NA
 146374 146375 YPO3049 YPO3050     TRUE 0.986 95.000 0.688 0.049 Y NA
 146376 146377 YPO3051 YPO3052     FALSE 0.165 160.000 0.006 1.000   NA
 146377 146378 YPO3052 YPO3053   dapE TRUE 0.980 2.000 0.292 1.000 N NA
 146378 146379 YPO3053 YPO3054 dapE   TRUE 0.986 -3.000 0.163 0.020 N NA
 146379 146380 YPO3054 YPO3055     TRUE 0.635 68.000 0.130 NA   NA
 146381 146382 YPO3056 YPO3057     TRUE 0.950 2.000 0.100 NA   NA
 146382 146383 YPO3057 YPO3058     FALSE 0.254 94.000 0.018 NA   NA
 146383 146384 YPO3058 YPO3059   purC FALSE 0.084 219.000 0.004 1.000   NA
 146384 146385 YPO3059 YPO3060 purC tnp FALSE 0.111 148.000 0.000 1.000 N NA
 146385 146386 YPO3060 YPO3061 tnp pcpY FALSE 0.077 175.000 0.000 NA N NA
 146386 146387 YPO3061 YPO3062 pcpY dapA TRUE 0.940 18.000 0.032 NA Y NA
 146388 146389 YPO3063 YPO3064 gcvR bcp TRUE 0.933 0.000 0.102 1.000 N NA
 146390 146391 YPO3065 YPO3066     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 146394 146395 YPO3069 YPO3070     TRUE 0.739 107.000 0.259 1.000   NA
 146396 146397 YPO3071 YPO3072   tnp TRUE 0.622 176.000 0.000 1.000 Y NA
 146397 146398 YPO3072 YPO3073 tnp cysS FALSE 0.015 347.000 0.000 1.000 N NA
 146399 146400 YPO3074 YPO3075 ppiB   TRUE 0.959 11.000 0.237 1.000   NA
 146400 146401 YPO3075 YPO3076   purE FALSE 0.041 296.000 0.016 1.000   NA
 146401 146402 YPO3076 YPO3077 purE purK TRUE 0.998 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 146403 146404 YPO3078 YPO3079     TRUE 0.999 -3.000 0.535 1.000 Y NA
 146405 146406 YPO3080 YPO3081 tesA   FALSE 0.048 387.000 0.072 1.000   NA
 146406 146407 YPO3081 YPO3082   shlB TRUE 0.584 77.000 0.118 1.000   NA
 146407 146408 YPO3082 YPO3083 shlB   TRUE 0.627 195.000 0.075 1.000 Y NA
 146408 146409 YPO3083 YPO3084     TRUE 0.996 3.000 0.313 NA Y NA
 146411 146412 YPO3086 YPO3087     FALSE 0.014 521.000 0.018 NA   NA
 146412 146413 YPO3087 YPO3088     FALSE 0.053 264.000 0.022 NA   NA
 146413 146414 YPO3088 YPO3089     FALSE 0.055 292.000 0.000 NA   NA
 146415 146416 YPO3093 YPO3094 rosA rosB TRUE 0.562 235.000 0.000 0.065 Y NA
 146417 146418 YPO3095 YPO3096 gsk wzz FALSE 0.060 204.000 0.000 1.000 N NA
 146418 146419 YPO3096 YPO3097 wzz manB FALSE 0.287 48.000 0.000 1.000 N NA
 146419 146420 YPO3097 YPO3098 manB wbyL TRUE 0.707 5.000 0.049 NA N NA
 146420 146421 YPO3098 YPO3099 wbyL manC TRUE 0.985 3.000 0.073 NA Y NA
 146421 2201122 YPO3099 YPO3100 manC fcL FALSE 0.172 188.000 0.000 NA   NA
 2201122 2201123 YPO3100 YPO3102 fcL gmd TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   NA
 2201123 146422 YPO3102 YPO3104 gmd wbyK TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 146422 2201124 YPO3104 YPO3105 wbyK wzy FALSE 0.082 249.000 0.000 NA   NA
 2201124 146423 YPO3105 YPO3107 wzy wbyJ TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 146423 2201125 YPO3107 YPO3108 wbyJ wbyI FALSE 0.203 172.000 0.000 NA   NA
 2201125 146424 YPO3108 YPO3110 wbyI wzx TRUE 0.790 11.000 0.000 NA   NA
 146424 146425 YPO3110 YPO3111 wzx wbyH FALSE 0.358 74.000 0.000 NA   NA
 146425 146426 YPO3111 YPO3112 wbyH prt TRUE 0.768 1.000 0.000 NA N NA
 146426 146427 YPO3112 YPO3113 prt ddhC TRUE 0.945 37.000 0.000 0.017 Y NA
 146427 2201126 YPO3113 YPO3114 ddhC ddhB TRUE 0.718 18.000 0.000 NA   NA
 2201126 146428 YPO3114 YPO3115 ddhB ddhA TRUE 0.844 5.000 0.000 NA   NA
 146428 146429 YPO3115 YPO3116 ddhA ddhD FALSE 0.410 26.000 0.038 1.000 N NA
 146429 146430 YPO3116 YPO3117 ddhD hemH FALSE 0.006 598.000 0.000 1.000 N NA
 146430 146431 YPO3117 YPO3118 hemH adk FALSE 0.058 90.000 0.008 1.000 N NA
 146431 146432 YPO3118 YPO3119 adk htpG FALSE 0.138 227.000 0.035 0.092 N NA
 146432 146433 YPO3119 YPO3120 htpG recR FALSE 0.050 192.000 0.028 1.000 N NA
 146433 146434 YPO3120 YPO3121 recR   TRUE 0.996 0.000 0.604 NA   NA
 146434 146435 YPO3121 YPO3122   dnaX TRUE 0.910 56.000 0.411 NA   NA
 146435 146436 YPO3122 YPO3123 dnaX apt FALSE 0.015 656.000 0.088 1.000 N NA
 146436 2201127 YPO3123 YPO3125 apt   FALSE 0.026 417.000 0.000 NA   NA
 2201127 2201128 YPO3125 YPO3126     FALSE 0.328 91.000 0.000 NA   NA
 146437 146438 YPO3127 YPO3128 priC   TRUE 0.791 171.000 0.474 NA   NA
 146439 146440 YPO3129 YPO3130     FALSE 0.051 240.000 0.054 NA N NA
 146440 146441 YPO3130 YPO3131   acrR TRUE 0.735 13.000 0.075 NA N NA
 146442 146443 YPO3132 YPO3133 acrA acrB TRUE 0.969 17.000 0.500 1.000 N NA
 146443 146444 YPO3133 YPO3134 acrB   FALSE 0.026 186.000 0.008 1.000 N NA
 146444 146445 YPO3134 YPO3135     TRUE 0.930 16.000 0.083 0.011   NA
 146445 146446 YPO3135 YPO3136     FALSE 0.013 874.000 0.000 1.000   NA
 146446 146447 YPO3136 YPO3137     TRUE 0.769 159.000 0.400 NA   NA
 146447 146448 YPO3137 YPO3138   ymoA TRUE 0.629 49.000 0.080 NA   NA
 146452 146453 YPO3142 YPO3143   glnK TRUE 0.767 34.000 0.156 1.000 N NA
 146453 146454 YPO3143 YPO3144 glnK mdlB FALSE 0.007 410.000 0.028 1.000 N NA
 146454 146455 YPO3144 YPO3145 mdlB mdlA TRUE 1.000 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 146455 146456 YPO3145 YPO3146 mdlA   TRUE 0.542 102.000 0.179 1.000 N NA
 146459 146460 YPO3149 YPO3150     FALSE 0.056 265.000 0.019 1.000   NA
 146461 146462 YPO3151 YPO3152     FALSE 0.039 354.000 0.000 1.000   NA
 146462 146463 YPO3152 YPO3153   ppiD FALSE 0.116 140.000 0.000 1.000 N NA
 146463 146464 YPO3153 YPO3154 ppiD hupB FALSE 0.024 301.000 0.046 1.000 N NA
 146464 146465 YPO3154 YPO3155 hupB lon FALSE 0.015 218.000 0.005 1.000 N NA
 146465 146466 YPO3155 YPO3156 lon clpX TRUE 0.846 195.000 0.201 0.091 Y NA
 146466 146467 YPO3156 YPO3157 clpX clpP TRUE 0.849 206.000 0.352 1.000 Y NA
 146467 146468 YPO3157 YPO3158 clpP tig TRUE 0.445 462.000 0.351 1.000 Y NA
 146468 146469 YPO3158 YPO3159 tig   FALSE 0.254 73.000 0.002 NA   NA
 146469 146470 YPO3159 YPO3160   bolA FALSE 0.179 141.000 0.011 NA   NA
 146471 146472 YPO3161 YPO3162   ampG TRUE 0.633 118.000 0.256 NA N NA
 146472 146473 YPO3162 YPO3163 ampG   FALSE 0.055 292.000 0.000 NA   NA
 146473 146474 YPO3163 YPO3164   cyoA FALSE 0.033 370.000 0.000 NA   NA
 146474 146475 YPO3164 YPO3165 cyoA cyoB TRUE 0.995 5.000 0.204 0.005 Y NA
 146475 146476 YPO3165 YPO3166 cyoB cyoC TRUE 0.999 -10.000 0.697 0.034 Y NA
 146476 146477 YPO3166 YPO3167 cyoC cyoD TRUE 0.999 0.000 0.485 0.034 Y NA
 146477 146478 YPO3167 YPO3168 cyoD cyoE TRUE 0.926 11.000 0.118 0.065 N NA
 146478 146479 YPO3168 YPO3169 cyoE   FALSE 0.040 478.000 0.061 0.065 N NA
 146481 146482 YPO3171 YPO3172 apbA thiJ TRUE 0.967 -37.000 0.155 NA   NA
 146483 146484 YPO3173 YPO3174 thiI   FALSE 0.310 98.000 0.000 NA   NA
 146485 146486 YPO3175 YPO3176 xseB ispA TRUE 0.645 5.000 0.035 1.000 N NA
 146486 146487 YPO3176 YPO3177 ispA dxs TRUE 0.702 156.000 0.060 1.000 Y NA
 146488 146489 YPO3178 YPO3179 tnp pgpA FALSE 0.054 214.000 0.000 1.000 N NA
 146489 146490 YPO3179 YPO3180 pgpA thiL TRUE 0.974 -7.000 0.206 1.000 N NA
 146490 146491 YPO3180 YPO3181 thiL nusB FALSE 0.284 241.000 0.225 1.000 N NA
 146491 146492 YPO3181 YPO3182 nusB ribH TRUE 0.942 21.000 0.347 1.000 N NA
 146492 146493 YPO3182 YPO3183 ribH ribD TRUE 0.850 136.000 0.034 0.001 Y NA
 146493 146494 YPO3183 YPO3184 ribD   TRUE 0.602 150.000 0.277 NA N NA
 146494 146495 YPO3184 YPO3185     FALSE 0.368 71.000 0.000 NA   NA
 146495 146496 YPO3185 YPO3186     TRUE 0.599 33.000 0.000 NA   NA
 146496 146497 YPO3186 YPO3187   tnp FALSE 0.052 298.000 0.000 NA   NA
 146497 146498 YPO3187 YPO3188 tnp secF FALSE 0.058 207.000 0.000 1.000 N NA
 146498 146499 YPO3188 YPO3189 secF secD TRUE 0.994 11.000 0.206 0.000 Y NA
 146499 146500 YPO3189 YPO3190 secD   TRUE 0.924 28.000 0.045 NA Y NA
 146500 146501 YPO3190 YPO3191   tgt TRUE 0.713 112.000 0.325 NA N NA
 146501 146502 YPO3191 YPO3192 tgt queA TRUE 0.977 93.000 0.360 0.000 Y NA
 146503 146504 YPO3193 YPO3194   ahpC FALSE 0.039 299.000 0.014 1.000   NA
 146504 146505 YPO3194 YPO3195 ahpC tnp FALSE 0.053 215.000 0.000 1.000 N NA
 146506 146507 YPO3196 YPO3197     TRUE 0.653 26.000 0.000 NA   NA
 146508 146509 YPO3199 YPO3200   malZ FALSE 0.219 155.000 0.031 1.000   NA
 146509 146510 YPO3200 YPO3201 malZ proY FALSE 0.027 561.000 0.123 1.000 N NA
 146510 146511 YPO3201 YPO3202 proY brnQ TRUE 0.957 76.000 0.261 0.065 Y NA
 146511 146512 YPO3202 YPO3203 brnQ pstS FALSE 0.008 474.000 0.000 1.000 N NA
 146512 146513 YPO3203 YPO3204 pstS phoR TRUE 0.848 22.000 0.168 1.000 N NA
 146513 146514 YPO3204 YPO3205 phoR phoB TRUE 0.993 25.000 0.453 0.065 Y NA
 146515 2201131 YPO3206 YPO3207 sbcD sbcC TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 146516 146517 YPO3208 YPO3209     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 146517 146518 YPO3209 YPO3211     FALSE 0.005 732.000 0.000 1.000 N NA
 146520 146521 YPO3213 YPO3214     FALSE 0.409 64.000 0.000 NA   NA
 146521 146522 YPO3214 YPO3215   aroL FALSE 0.076 256.000 0.000 NA   NA
 146522 146523 YPO3215 YPO3216 aroL   FALSE 0.035 247.000 0.000 1.000 N NA
 146525 146526 YPO3218 YPO3219     FALSE 0.086 246.000 0.000 NA   NA
 146526 146527 YPO3219 YPO3220     FALSE 0.212 183.000 0.053 NA   NA
 146527 146528 YPO3220 YPO3221   proA FALSE 0.015 328.000 0.000 NA N NA
 146528 146529 YPO3221 YPO3222 proA proB TRUE 0.985 10.000 0.026 0.001 Y NA
 146529 146530 YPO3222 YPO3223 proB crl TRUE 0.615 177.000 0.262 NA   NA
 146530 146531 YPO3223 YPO3224 crl   TRUE 0.606 60.000 0.095 NA   NA
 146531 146532 YPO3224 YPO3225   gpt TRUE 0.478 127.000 0.120 NA   NA
 146533 146534 YPO3226 YPO3227     FALSE 0.154 197.000 0.000 NA   NA
 146535 146536 YPO3228 YPO3229     FALSE 0.014 722.000 0.000 NA   NA
 146540 146541 YPO3233 YPO3234   apbE TRUE 0.980 13.000 0.481 NA   NA
 146541 146542 YPO3234 YPO3235 apbE nqrF TRUE 0.936 41.000 0.519 1.000 N NA
 146542 146543 YPO3235 YPO3236 nqrF nqrE TRUE 0.997 16.000 0.551 0.002 Y NA
 146543 146544 YPO3236 YPO3237 nqrE nqrD TRUE 0.995 7.000 0.188 0.002 Y NA
 146544 146545 YPO3237 YPO3238 nqrD nqrC TRUE 0.999 -7.000 0.312 0.002 Y NA
 146545 146546 YPO3238 YPO3239 nqrC nqrB TRUE 0.999 -10.000 0.603 0.002 Y NA
 146546 146547 YPO3239 YPO3240 nqrB nqrA TRUE 0.999 4.000 0.854 0.002 Y NA
 146549 146550 YPO3242 YPO3243   lpcA TRUE 0.492 203.000 0.229 1.000   NA
 146552 146553 YPO3245 YPO3246   hmwC TRUE 0.906 2.000 0.000 1.000   NA
 146553 146554 YPO3246 YPO3247 hmwC hmwA TRUE 0.455 155.000 0.125 1.000   NA
 146554 146555 YPO3247 YPO3248 hmwA hxuB TRUE 0.833 41.000 0.188 NA   NA
 146555 146556 YPO3248 YPO3249 hxuB   FALSE 0.004 1089.000 0.000 NA N NA
 146556 2201132 YPO3249 YPO3250     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 146557 146558 YPO3251 YPO3252     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 146559 146560 YPO3254 YPO3255     TRUE 0.998 -19.000 0.532 1.000 Y NA
 146560 146561 YPO3255 YPO3256     TRUE 0.999 -3.000 0.433 0.015 Y NA
 146561 146562 YPO3256 YPO3257     TRUE 0.998 13.000 0.765 0.048 Y NA
 146562 146563 YPO3257 YPO3258     FALSE 0.290 111.000 0.000 NA   NA
 146563 146564 YPO3258 YPO3259     TRUE 0.900 2.000 0.000 NA   NA
 146565 146566 YPO3260 YPO3261     TRUE 0.972 -3.000 0.122 NA   NA
 146566 146567 YPO3261 YPO3262     TRUE 0.889 29.000 0.203 NA   NA
 146567 146568 YPO3262 YPO3263     FALSE 0.105 228.000 0.000 NA   NA
 146568 146569 YPO3263 YPO3264     FALSE 0.148 160.000 0.060 NA N NA
 146569 146570 YPO3264 YPO3265     TRUE 0.998 -3.000 0.915 NA   NA
 146570 146571 YPO3265 YPO3266   emrR FALSE 0.269 172.000 0.065 NA   NA
 146571 146572 YPO3266 YPO3267 emrR emrA FALSE 0.040 384.000 0.107 1.000 N NA
 146572 146573 YPO3267 YPO3268 emrA emrB TRUE 0.975 39.000 0.875 1.000 N NA
 146575 146576 YPO3270 YPO3271 trxC   FALSE 0.319 170.000 0.084 NA   NA
 146576 146577 YPO3271 YPO3272     TRUE 0.857 43.000 0.222 NA   NA
 146577 146578 YPO3272 YPO3273   pssA TRUE 0.484 173.000 0.121 0.039 N NA
 146578 146579 YPO3273 YPO3274 pssA tatD2 TRUE 0.579 62.000 0.089 NA   NA
 2201133 407419 YPOr07 YPOr08 5S_rRNA 23S_rRNA TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 407419 401325 YPOr08 YPt_45 23S_rRNA tRNA-Ala FALSE 0.119 219.000 0.000 NA   NA
 401325 401324 YPt_45 YPt_46 tRNA-Ala tRNA-Ile TRUE 0.479 52.000 0.000 NA   NA
 401324 2201134 YPt_46 YPOr09 tRNA-Ile 16S_rRNA FALSE 0.261 130.000 0.000 NA   NA
 2201134 146580 YPOr09 YPO3275 16S_rRNA clpB FALSE 0.018 544.000 0.000 NA   NA
 146580 146581 YPO3275 YPO3276 clpB   TRUE 0.445 130.000 0.108 NA   NA
 146581 146582 YPO3276 YPO3277   rluD TRUE 0.972 2.000 0.168 NA   NA
 146583 146584 YPO3278 YPO3279     FALSE 0.022 355.000 0.004 NA   NA
 2201135 146586 YPO3281 YPO3282 pheA   TRUE 0.890 -2042.000 0.000 NA   NA
 146586 146587 YPO3282 YPO3283     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 146588 146589 YPO3285 YPO3286 tyrA aroF TRUE 0.953 13.000 0.023 1.000 Y NA
 146590 2201136 YPO3287 YPO3288   dcuB FALSE 0.025 429.000 0.000 NA   NA
 2201136 146591 YPO3288 YPO3290 dcuB   FALSE 0.044 323.000 0.000 NA   NA
 146592 146593 YPO3291 YPO3292 tnp rplS FALSE 0.055 212.000 0.000 1.000 N NA
 146593 146594 YPO3292 YPO3293 rplS trmD TRUE 0.972 81.000 0.567 1.000 Y NA
 146594 146595 YPO3293 YPO3294 trmD rimM TRUE 0.991 39.000 0.672 1.000 Y NA
 146595 146596 YPO3294 YPO3295 rimM rpsP TRUE 0.993 22.000 0.342 0.011 Y NA
 146596 146597 YPO3295 YPO3296 rpsP ffh TRUE 0.465 228.000 0.361 1.000 N NA
 146598 146599 YPO3297 YPO3298     TRUE 0.736 162.000 0.349 NA   NA
 146600 146601 YPO3299 YPO3300 tnp luxS FALSE 0.060 204.000 0.000 1.000 N NA
 146601 146602 YPO3300 YPO3301 luxS gshA FALSE 0.217 168.000 0.087 1.000 N NA
 146602 146603 YPO3301 YPO3302 gshA   TRUE 0.444 83.000 0.071 NA   NA
 146603 146604 YPO3302 YPO3303     TRUE 0.952 -3.000 0.067 NA   NA
 146604 401323 YPO3303 YPt_47   tRNA-Arg FALSE 0.016 595.000 0.000 NA   NA
 401323 401322 YPt_47 YPt_48 tRNA-Arg tRNA-Arg TRUE 0.444 58.000 0.000 NA   NA
 401322 401321 YPt_48 YPt_49 tRNA-Arg tRNA-Ser TRUE 0.810 9.000 0.000 NA   NA
 401321 146605 YPt_49 YPO3304 tRNA-Ser csrA FALSE 0.034 363.000 0.000 NA   NA
 146605 146606 YPO3304 YPO3305 csrA alaS FALSE 0.017 250.000 0.020 1.000 N NA
 146606 146607 YPO3305 YPO3306 alaS recX FALSE 0.386 140.000 0.085 1.000   NA
 146607 146608 YPO3306 YPO3307 recX recA TRUE 0.729 138.000 0.296 1.000   NA
 146608 146609 YPO3307 YPO3308 recA   FALSE 0.410 115.000 0.082 NA   NA
 146610 146611 YPO3309 YPO3310     FALSE 0.089 248.000 0.000 1.000   NA
 146612 146613 YPO3311 YPO3312     TRUE 0.799 21.000 0.127 1.000 N NA
 146613 146614 YPO3312 YPO3313     TRUE 0.992 3.000 0.596 1.000 N NA
 146614 146615 YPO3313 YPO3314     TRUE 1.000 -7.000 0.860 0.001 Y NA
 146615 146616 YPO3314 YPO3315     TRUE 0.423 256.000 0.075 1.000 Y NA
 146616 146617 YPO3315 YPO3316     TRUE 1.000 -3.000 0.793 0.010 Y NA
 146617 146618 YPO3316 YPO3317     TRUE 0.988 0.000 0.292 NA   NA
 146618 146619 YPO3317 YPO3318     TRUE 0.773 93.000 0.280 NA   NA
 146620 146621 YPO3319 YPO3320 katY cybC TRUE 0.556 77.000 0.000 0.005 N NA
 146621 146622 YPO3320 YPO3321 cybC cybB TRUE 0.801 148.000 0.000 0.033 Y NA
 146623 146624 YPO3322 YPO3323   dmsC TRUE 0.471 146.000 0.125 1.000   NA
 146624 146625 YPO3323 YPO3324 dmsC dmsB TRUE 0.993 2.000 0.500 1.000   NA
 146625 146626 YPO3324 YPO3325 dmsB dmsA TRUE 0.986 12.000 0.103 0.033 Y NA
 146626 146627 YPO3325 YPO3326 dmsA araD FALSE 0.009 463.000 0.000 1.000 N NA
 146628 146629 YPO3327 YPO3328     TRUE 0.941 62.000 0.235 NA Y NA
 146629 146630 YPO3328 YPO3329   tnp FALSE 0.029 251.000 0.000 NA N NA
 146630 146631 YPO3329 YPO3330 tnp   FALSE 0.109 151.000 0.000 1.000 N NA
 146631 146632 YPO3330 YPO3331     TRUE 1.000 -7.000 0.941 0.010 Y NA
 146632 146633 YPO3331 YPO3332     TRUE 0.999 13.000 0.938 0.010 Y NA
 146633 146634 YPO3332 YPO3333   sgbU TRUE 0.791 206.000 0.250 1.000 Y NA
 146634 146635 YPO3333 YPO3334 sgbU sgbK TRUE 0.999 11.000 1.000 0.015 Y NA
 146635 146636 YPO3334 YPO3335 sgbK fumA FALSE 0.011 398.000 0.000 1.000 N NA
 146636 146637 YPO3335 YPO3336 fumA   FALSE 0.264 129.000 0.000 NA   NA
 146637 146638 YPO3336 YPO3337   map TRUE 0.994 -3.000 0.410 NA   NA
 146639 2201137 YPO3339 YPO3340     FALSE 0.025 433.000 0.000 NA   NA
 146640 146641 YPO3342 YPO3343     FALSE 0.210 65.000 0.000 1.000 N NA
 146641 146642 YPO3343 YPO3344     FALSE 0.026 421.000 0.000 NA   NA
 146642 146643 YPO3344 YPO3345     FALSE 0.156 196.000 0.000 NA   NA
 146643 146644 YPO3345 YPO3346   arsR FALSE 0.090 247.000 0.000 1.000   NA
 146644 146645 YPO3346 YPO3347 arsR arsB FALSE 0.167 85.000 0.000 1.000 N NA
 146645 146646 YPO3347 YPO3348 arsB   FALSE 0.007 567.000 0.000 1.000 N NA
 146647 146648 YPO3349 YPO3350   dhaK TRUE 0.995 7.000 0.211 0.000 Y NA
 146648 146649 YPO3350 YPO3351 dhaK   FALSE 0.242 87.000 0.058 1.000 N NA
 146649 146650 YPO3351 YPO3352     TRUE 0.562 64.000 0.000 0.020 N NA
 146651 146652 YPO3353 YPO3354 rpiB mutS FALSE 0.005 794.000 0.000 1.000 N NA
 146653 146654 YPO3355 YPO3356 rpoS nlpD TRUE 0.629 55.000 0.142 1.000 N NA
 146654 146655 YPO3356 YPO3357 nlpD pcm FALSE 0.108 104.000 0.030 1.000 N NA
 146655 146656 YPO3357 YPO3358 pcm surE TRUE 0.992 -6.000 0.353 1.000   NA
 146656 146657 YPO3358 YPO3359 surE   TRUE 0.982 -22.000 0.235 1.000   NA
 146657 146658 YPO3359 YPO3360   ispF TRUE 0.938 11.000 0.173 1.000   NA
 146658 146659 YPO3360 YPO3361 ispF ispD TRUE 0.936 139.000 0.419 1.000 Y NA
 146659 146660 YPO3361 YPO3362 ispD   TRUE 0.948 4.000 0.185 1.000 N NA
 146660 146661 YPO3362 YPO3363     FALSE 0.038 314.000 0.028 NA   NA
 146661 146662 YPO3363 YPO3364   cysC TRUE 0.476 191.000 0.198 NA   NA
 146662 146663 YPO3364 YPO3365 cysC cysN TRUE 0.997 2.000 0.340 1.000 Y NA
 146663 146664 YPO3365 YPO3366 cysN cysD TRUE 0.946 93.000 0.574 0.000 N NA
 146664 146665 YPO3366 YPO3367 cysD cysG TRUE 0.994 11.000 0.417 1.000 Y NA
 146665 146666 YPO3367 YPO3368 cysG   FALSE 0.051 301.000 0.000 NA   NA
 2201138 146668 YPO3370 YPO3371 cysH cysI TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 146668 146669 YPO3371 YPO3372 cysI cysJ TRUE 1.000 0.000 0.791 0.000 Y NA
 146671 146672 YPO3374 YPO3375   sodC FALSE 0.041 104.000 0.004 1.000 N NA
 146672 146673 YPO3375 YPO3376 sodC eno FALSE 0.013 372.000 0.000 1.000 N NA
 146673 146674 YPO3376 YPO3377 eno pyrG FALSE 0.290 81.000 0.068 1.000 N NA
 146674 146675 YPO3377 YPO3378 pyrG   FALSE 0.113 212.000 0.025 1.000   NA
 146675 146676 YPO3378 YPO3379     TRUE 0.823 7.000 0.000 NA   NA
 146676 146677 YPO3379 YPO3380   relA TRUE 0.565 37.000 0.000 NA   NA
 146679 146680 YPO3382 YPO3383 gsrA dgt FALSE 0.185 198.000 0.101 1.000 N NA
 146681 146682 YPO3384 YPO3385 mtn   TRUE 0.904 0.000 0.073 1.000 N NA
 146682 146683 YPO3385 YPO3386     TRUE 0.982 0.000 0.213 NA   NA
 146684 146685 YPO3387 YPO3388     FALSE 0.229 136.000 0.031 NA   NA
 146687 146688 YPO3390 YPO3391 fhuB fhuD TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 146688 146689 YPO3391 YPO3392 fhuD fhuC TRUE 0.991 0.000 0.094 1.000 Y NA
 146689 146690 YPO3392 YPO3393 fhuC mrcB FALSE 0.018 322.000 0.000 1.000 N NA
 146690 146691 YPO3393 YPO3394 mrcB hrpB TRUE 0.698 109.000 0.158 0.012 N NA
 146692 146693 YPO3395 YPO3396 ligT sfsA FALSE 0.300 113.000 0.045 NA   NA
 146693 146694 YPO3396 YPO3397 sfsA dksA TRUE 0.465 170.000 0.151 NA   NA
 146694 146695 YPO3397 YPO3398 dksA   FALSE 0.208 280.000 0.231 1.000 N NA
 146695 146696 YPO3398 YPO3399   pcnB TRUE 0.864 89.000 0.131 1.000 Y NA
 146696 146697 YPO3399 YPO3400 pcnB folK TRUE 0.948 8.000 0.234 1.000 N NA
 146697 146698 YPO3400 YPO3401 folK panB TRUE 0.455 266.000 0.117 1.000 Y NA
 146698 146699 YPO3401 YPO3402 panB panC TRUE 0.979 88.000 0.395 0.000 Y NA
 146699 146700 YPO3402 YPO3403 panC panD TRUE 0.490 411.000 0.342 1.000 Y NA
 146701 146702 YPO3404 YPO3405     FALSE 0.017 327.000 0.000 1.000 N NA
 146702 146703 YPO3405 YPO3406     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.090 Y NA
 146705 146706 YPO3408 YPO3409 hpt   FALSE 0.018 220.000 0.010 1.000 N NA
 146707 146708 YPO3410 YPO3411   speE TRUE 0.796 117.000 0.354 NA   NA
 146708 146709 YPO3411 YPO3412 speE speD TRUE 0.890 78.000 0.162 1.000 Y NA
 146709 146710 YPO3412 YPO3413 speD   FALSE 0.026 438.000 0.000 1.000   NA
 146711 146712 YPO3414 YPO3415   acnB FALSE 0.076 299.000 0.068 NA   NA
 146712 146713 YPO3415 YPO3416 acnB tnp FALSE 0.007 570.000 0.000 1.000 N NA
 146713 146714 YPO3416 YPO3417 tnp lpdA FALSE 0.038 243.000 0.000 1.000 N NA
 146714 146715 YPO3417 YPO3418 lpdA aceF TRUE 0.723 303.000 0.463 1.000 Y NA
 146715 146716 YPO3418 YPO3419 aceF aceE TRUE 0.985 14.000 0.220 1.000 Y NA
 146716 146717 YPO3419 YPO3420 aceE pdhR TRUE 0.481 196.000 0.276 1.000 N NA
 146719 146720 YPO3422 YPO3423 ampE ampD TRUE 0.585 290.000 0.249 1.000 Y NA
 146721 146722 YPO3424 YPO3425 nadC ppdD FALSE 0.018 203.000 0.015 NA N NA
 146722 146723 YPO3425 YPO3426 ppdD hofB TRUE 0.999 -7.000 0.556 NA Y NA
 146723 146724 YPO3426 YPO3427 hofB hofC TRUE 0.999 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 146726 146727 YPO3429 YPO3430     TRUE 0.802 10.000 0.000 NA   NA
 146727 146728 YPO3430 YPO3431     TRUE 0.969 -3.000 0.110 NA   NA
 146728 146729 YPO3431 YPO3432     TRUE 0.683 186.000 0.356 NA   NA
 146731 146732 YPO3434 YPO3435     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2201139 146733 YPO3436 YPO3437     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 146733 146734 YPO3437 YPO3438   intB FALSE 0.233 154.000 0.000 NA   NA
 146734 401320 YPO3438 YPt_50 intB tRNA-Leu FALSE 0.150 199.000 0.000 NA   NA
 401320 146735 YPt_50 YPO3439 tRNA-Leu   FALSE 0.297 105.000 0.000 NA   NA
 146735 146736 YPO3439 YPO3440     TRUE 0.998 0.000 0.631 0.064   NA
 146737 146738 YPO3441 YPO3442 pepA holC TRUE 0.779 151.000 0.494 1.000 N NA
 146738 146739 YPO3442 YPO3443 holC valS TRUE 0.784 13.000 0.089 1.000 N NA
 146739 146740 YPO3443 YPO3444 valS   TRUE 0.648 143.000 0.008 1.000 Y NA
 2201140 146744 YPO3448 YPO3450   iucA FALSE 0.317 96.000 0.000 NA   NA
 146744 146745 YPO3450 YPO3451 iucA   TRUE 0.995 19.000 0.441 0.048 Y NA
 146745 146746 YPO3451 YPO3452     TRUE 0.997 -7.000 0.324 1.000 Y NA
 146746 146747 YPO3452 YPO3453     TRUE 0.999 2.000 0.550 0.017 Y NA
 146747 146748 YPO3453 YPO3454   nrdD FALSE 0.010 434.000 0.000 1.000 N NA
 146748 146749 YPO3454 YPO3455 nrdD nrdG TRUE 0.621 207.000 0.464 1.000 N NA
 146749 146750 YPO3455 YPO3456 nrdG phnF FALSE 0.017 328.000 0.000 1.000 N NA
 146750 146751 YPO3456 YPO3457 phnF phnG TRUE 0.995 1.000 0.691 1.000 N NA
 146751 146752 YPO3457 YPO3458 phnG phnH TRUE 1.000 0.000 0.967 0.002 Y NA
 146752 146753 YPO3458 YPO3459 phnH phnI TRUE 1.000 0.000 0.960 0.002 Y NA
 146753 146754 YPO3459 YPO3460 phnI phnJ TRUE 0.999 -7.000 0.880 1.000 Y NA
 146754 146755 YPO3460 YPO3461 phnJ phnK TRUE 0.999 0.000 0.883 1.000 Y NA
 146755 146756 YPO3461 YPO3462 phnK phnL TRUE 0.880 389.000 0.859 0.017 Y NA
 146756 146757 YPO3462 YPO3463 phnL phnM TRUE 0.998 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 146757 146758 YPO3463 YPO3464 phnM phnN TRUE 0.996 0.000 0.235 NA Y NA
 146758 146759 YPO3464 YPO3465 phnN phnP TRUE 0.981 -9.000 0.214 NA   NA
 146760 146761 YPO3466 YPO3467     FALSE 0.295 152.000 0.056 1.000   NA
 146761 146762 YPO3467 YPO3468     FALSE 0.297 99.000 0.032 1.000   NA
 146762 146763 YPO3468 YPO3469     TRUE 0.954 15.000 0.273 1.000   NA
 146763 146764 YPO3469 YPO3470     TRUE 0.996 12.000 0.364 0.048 Y NA
 146764 146765 YPO3470 YPO3471     TRUE 0.997 19.000 0.611 0.048 Y NA
 146765 146766 YPO3471 YPO3472     TRUE 0.998 8.000 0.611 0.048 Y NA
 146767 146768 YPO3473 YPO3474     TRUE 0.983 24.000 0.400 0.001   NA
 146768 146769 YPO3474 YPO3475     FALSE 0.108 231.000 0.000 1.000   NA
 146770 146771 YPO3476 YPO3477     TRUE 0.990 -6.000 0.295 1.000   NA
 146772 146773 YPO3478 YPO3479     FALSE 0.291 110.000 0.000 NA   NA
 146773 146774 YPO3479 YPO3480     TRUE 0.999 12.000 0.948 0.002 Y NA
 146775 146776 YPO3481 YPO3482 ibeB   TRUE 0.992 2.000 0.367 0.048 N NA
 146776 146777 YPO3482 YPO3483     TRUE 0.922 4.000 0.133 1.000 N NA
 146779 146780 YPO3485 YPO3486     TRUE 0.675 24.000 0.000 NA   NA
 146780 146781 YPO3486 YPO3487     TRUE 0.526 43.000 0.000 NA   NA
 146781 146782 YPO3487 YPO3488   deaD TRUE 0.703 20.000 0.000 NA   NA
 146782 146783 YPO3488 YPO3489 deaD nlpI FALSE 0.211 187.000 0.053 1.000   NA
 146783 146784 YPO3489 YPO3490 nlpI pnp FALSE 0.377 125.000 0.071 1.000   NA
 146784 146785 YPO3490 YPO3491 pnp   FALSE 0.028 267.000 0.000 1.000 N NA
 146785 146786 YPO3491 YPO3492     TRUE 0.932 54.000 0.167 1.000 Y NA
 146786 146787 YPO3492 YPO3493   rpsO FALSE 0.166 87.000 0.000 1.000 N NA
 146787 146788 YPO3493 YPO3494 rpsO truB TRUE 0.882 122.000 0.211 1.000 Y NA
 146788 146789 YPO3494 YPO3495 truB rbfA TRUE 0.997 0.000 0.318 1.000 Y NA
 146789 146790 YPO3495 YPO3496 rbfA infB TRUE 0.975 66.000 0.530 1.000 Y NA
 146790 146791 YPO3496 YPO3497 infB nusA TRUE 0.932 25.000 0.342 1.000 N NA
 146791 146792 YPO3497 YPO3498 nusA   TRUE 0.986 22.000 0.759 NA   NA
 146792 401319 YPO3498 YPt_51   tRNA-Met FALSE 0.123 216.000 0.000 NA   NA
 401319 401318 YPt_51 YPt_52 tRNA-Met tRNA-Leu TRUE 0.425 61.000 0.000 NA   NA
 401318 146793 YPt_52 YPO3499 tRNA-Leu secG FALSE 0.324 93.000 0.000 NA   NA
 146793 146794 YPO3499 YPO3500 secG mrsA FALSE 0.020 223.000 0.016 1.000 N NA
 146794 146795 YPO3500 YPO3501 mrsA folP TRUE 0.949 10.000 0.260 1.000 N NA
 146795 146796 YPO3501 YPO3502 folP ftsH TRUE 0.711 120.000 0.325 1.000 N NA
 146796 146797 YPO3502 YPO3503 ftsH ftsJ TRUE 0.641 57.000 0.152 1.000 N NA
 146800 146801 YPO3506 YPO3507 dacB basR TRUE 0.863 6.000 0.101 1.000 N NA
 146801 146802 YPO3507 YPO3508 basR basS TRUE 0.998 -3.000 0.381 1.000 Y NA
 146803 146804 YPO3509 YPO3510     TRUE 0.879 1.000 0.015 1.000   NA
 146804 146805 YPO3510 YPO3511   rpmA FALSE 0.284 88.000 0.019 1.000   NA
 146805 146806 YPO3511 YPO3512 rpmA rplU TRUE 0.997 20.000 0.667 0.011 Y NA
 146808 146809 YPO3514 YPO3515     FALSE 0.098 236.000 0.000 NA   NA
 146809 146810 YPO3515 YPO3516   mdh FALSE 0.027 409.000 0.000 NA   NA
 146811 146812 YPO3517 YPO3518 argR   FALSE 0.029 389.000 0.000 NA   NA
 146814 146815 YPO3520 YPO3521 fbp ppa FALSE 0.070 200.000 0.043 1.000 N NA
 146816 146817 YPO3522 YPO3523     TRUE 0.966 3.000 0.167 NA   NA
 146817 146818 YPO3523 YPO3524     TRUE 0.996 -3.000 0.575 NA   NA
 146819 146820 YPO3525 YPO3526 msrA   FALSE 0.064 278.000 0.042 NA   NA
 146824 146825 YPO3530 YPO3531 cpdB   FALSE 0.065 155.000 0.030 NA N NA
 146827 146828 YPO3533 YPO3534     FALSE 0.267 140.000 0.047 NA   NA
 146829 146830 YPO3535 YPO3536 tnp rplI FALSE 0.068 196.000 0.000 1.000 N NA
 146830 146831 YPO3536 YPO3537 rplI rpsR TRUE 0.992 40.000 0.499 0.011 Y NA
 146831 146832 YPO3537 YPO3538 rpsR priB TRUE 0.905 5.000 0.128 1.000 N NA
 146832 146833 YPO3538 YPO3539 priB rpsF TRUE 0.888 6.000 0.122 1.000 N NA
 146833 146834 YPO3539 YPO3540 rpsF   TRUE 0.758 14.000 0.000 NA   NA
 146834 2201141 YPO3540 YPO3541     FALSE 0.356 75.000 0.000 NA   NA
 146835 146836 YPO3542 YPO3543     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 146836 2201142 YPO3543 YPO3544     FALSE 0.387 67.000 0.000 NA   NA
 407541 146839 YPOs07 YPO3547 rnpB   TRUE 0.703 20.000 0.000 NA   NA
 146840 146841 YPO3548 YPO3549     TRUE 0.665 84.000 0.172 NA   NA
 146841 146842 YPO3549 YPO3550     FALSE 0.169 271.000 0.187 1.000 N NA
 146842 146843 YPO3550 YPO3551     TRUE 0.988 11.000 0.613 NA   NA
 146844 146845 YPO3552 YPO3553 mtgA elbB TRUE 0.951 -3.000 0.066 NA   NA
 146845 146846 YPO3553 YPO3554 elbB   TRUE 0.624 30.000 0.000 NA   NA
 146846 146847 YPO3554 YPO3555   arcB TRUE 0.718 18.000 0.000 NA   NA
 146847 146848 YPO3555 YPO3556 arcB   FALSE 0.155 264.000 0.113 1.000   NA
 146849 146850 YPO3557 YPO3558 gltB gltD TRUE 0.991 10.000 0.096 0.000 Y NA
 146850 146851 YPO3558 YPO3559 gltD   FALSE 0.024 441.000 0.000 NA   NA
 146852 146853 YPO3560 YPO3561 sspB sspA TRUE 0.995 6.000 0.831 NA   NA
 146853 146854 YPO3561 YPO3562 sspA rpsI FALSE 0.004 374.000 0.014 NA N NA
 146854 146855 YPO3562 YPO3563 rpsI rplM TRUE 0.998 15.000 0.601 0.011 Y NA
 146855 146856 YPO3563 YPO3564 rplM   FALSE 0.028 314.000 0.003 NA   NA
 146857 146858 YPO3565 YPO3566   degQ FALSE 0.191 271.000 0.154 NA   NA
 146861 146862 YPO3569 YPO3570 murA   TRUE 0.573 154.000 0.258 NA N NA
 146862 146863 YPO3570 YPO3571     TRUE 0.822 138.000 0.453 NA   NA
 146863 146864 YPO3571 YPO3572     TRUE 0.917 36.000 0.308 NA   NA
 146864 146865 YPO3572 YPO3573     TRUE 0.936 13.000 0.188 NA   NA
 146865 146866 YPO3573 YPO3574     TRUE 0.991 5.000 0.562 NA   NA
 146866 146867 YPO3574 YPO3575     TRUE 0.890 218.000 0.530 NA Y NA
 146868 146869 YPO3576 YPO3577     TRUE 0.613 111.000 0.226 1.000 N NA
 146869 146870 YPO3577 YPO3578     TRUE 0.658 249.000 0.598 1.000   NA
 146870 146871 YPO3578 YPO3579     TRUE 0.997 -3.000 0.617 NA   NA
 146871 146872 YPO3579 YPO3580     TRUE 0.992 -16.000 0.459 NA   NA
 146872 146873 YPO3580 YPO3581     TRUE 0.988 7.000 0.543 NA   NA
 146873 146874 YPO3581 YPO3582   rpoN TRUE 0.727 62.000 0.163 1.000   NA
 146874 2201143 YPO3582 YPO3583 rpoN yhbH TRUE 0.675 24.000 0.000 NA   NA
 2201143 146875 YPO3583 YPO3585 yhbH ptsN FALSE 0.281 118.000 0.000 NA   NA
 146875 146876 YPO3585 YPO3586 ptsN   FALSE 0.181 306.000 0.186 NA   NA
 146876 146877 YPO3586 YPO3587   ptsO TRUE 0.983 -3.000 0.182 NA   NA
 146877 146878 YPO3587 YPO3588 ptsO pyrB FALSE 0.016 338.000 0.000 1.000 N NA
 146878 146879 YPO3588 YPO3589 pyrB pyrI TRUE 0.994 12.000 0.197 0.000 Y NA
 146879 146880 YPO3589 YPO3590 pyrI   FALSE 0.239 138.000 0.084 NA N NA
 146880 146881 YPO3590 YPO3591     FALSE 0.014 341.000 0.000 NA N NA
 146881 146882 YPO3591 YPO3592     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2201144 146884 YPO3593 YPO3594     TRUE 0.886 3.000 0.000 NA   NA
 146884 146885 YPO3594 YPO3595     TRUE 0.861 126.000 0.510 NA   NA
 146885 146886 YPO3595 YPO3596     TRUE 0.998 0.000 0.862 NA   NA
 146886 146887 YPO3596 YPO3597     TRUE 0.996 3.000 0.765 NA   NA
 146887 146888 YPO3597 YPO3598     TRUE 0.997 0.000 0.673 NA   NA
 146888 146889 YPO3598 YPO3599   clpB2 TRUE 0.982 11.000 0.471 NA   NA
 146889 146890 YPO3599 YPO3600 clpB2   TRUE 0.935 -3.000 0.039 1.000   NA
 146890 146891 YPO3600 YPO3601     TRUE 0.942 -3.000 0.053 NA   NA
 146891 146892 YPO3601 YPO3602     TRUE 0.997 -3.000 0.711 NA   NA
 146892 146893 YPO3602 YPO3603     TRUE 0.980 32.000 0.750 NA   NA
 146893 146894 YPO3603 YPO3604     TRUE 0.754 125.000 0.312 NA   NA
 146894 146895 YPO3604 YPO3605     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 146895 146896 YPO3605 YPO3606     TRUE 0.689 22.000 0.000 NA   NA
 146896 146897 YPO3606 YPO3607     TRUE 0.832 6.000 0.000 NA   NA
 146897 146898 YPO3607 YPO3608     TRUE 0.972 -7.000 0.143 NA   NA
 146898 146899 YPO3608 YPO3609     TRUE 0.639 28.000 0.000 NA   NA
 146899 146900 YPO3609 YPO3610     TRUE 0.990 2.000 0.400 NA   NA
 146901 146902 YPO3611 YPO3612     FALSE 0.031 382.000 0.000 NA   NA
 146903 146904 YPO3613 YPO3614     TRUE 0.886 3.000 0.000 NA   NA
 146904 146905 YPO3614 YPO3615     TRUE 0.517 45.000 0.000 NA   NA
 146905 146906 YPO3615 YPO3616     TRUE 0.810 9.000 0.000 NA   NA
 146907 146908 YPO3617 YPO3618     TRUE 0.995 -3.000 0.455 NA   NA
 146910 146911 YPO3620 YPO3621     TRUE 0.971 6.000 0.000 1.000 Y NA
 146911 146912 YPO3621 YPO3622     FALSE 0.107 154.000 0.000 1.000 N NA
 146913 146914 YPO3623 YPO3624 ssuE ssuA TRUE 0.920 15.000 0.169 1.000   NA
 146914 146915 YPO3624 YPO3625 ssuA ssuD TRUE 0.944 19.000 0.341 1.000 N NA
 146915 146916 YPO3625 YPO3626 ssuD ssuC TRUE 0.943 9.000 0.226 1.000 N NA
 146916 146917 YPO3626 YPO3627 ssuC ssuB TRUE 0.999 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 146919 146920 YPO3629 YPO3630     FALSE 0.040 349.000 0.000 1.000   NA
 146921 146922 YPO3631 YPO3632     FALSE 0.235 152.000 0.000 NA   NA
 146923 146924 YPO3633 YPO3634     TRUE 0.939 204.000 0.714 NA Y NA
 146924 146925 YPO3634 YPO3635     TRUE 0.999 -7.000 0.667 0.010 Y NA
 146925 146926 YPO3635 YPO3636     TRUE 1.000 2.000 0.900 0.010 Y NA
 146926 146927 YPO3636 YPO3637     TRUE 0.875 19.000 0.184 1.000 N NA
 146927 146928 YPO3637 YPO3638     TRUE 0.980 -3.000 0.102 0.014 N NA
 146933 146934 YPO3643 YPO3644 cspa2 cspa1 TRUE 0.479 260.000 0.000 0.063 Y NA
 146934 146935 YPO3644 YPO3645 cspa1   FALSE 0.324 93.000 0.000 NA   NA
 146935 146936 YPO3645 YPO3646   pcp FALSE 0.063 276.000 0.000 NA   NA
 146937 146938 YPO3647 YPO3648     FALSE 0.419 65.000 0.000 1.000   NA
 146938 146939 YPO3648 YPO3649     FALSE 0.356 178.000 0.105 1.000   NA
 146939 146940 YPO3649 YPO3650     FALSE 0.412 154.000 0.105 1.000   NA
 146940 146941 YPO3650 YPO3651     FALSE 0.344 90.000 0.000 1.000   NA
 146941 146942 YPO3651 YPO3652     FALSE 0.395 66.000 0.000 NA   NA
 146942 146943 YPO3652 YPO3653     FALSE 0.102 231.000 0.000 NA   NA
 146944 146945 YPO3654 YPO3655 fiS   TRUE 0.822 25.000 0.161 1.000 N NA
 146945 146946 YPO3655 YPO3656   prmA FALSE 0.100 589.000 0.042 1.000 Y NA
 146946 146947 YPO3656 YPO3657 prmA panF FALSE 0.184 76.000 0.041 1.000 N NA
 146947 146948 YPO3657 YPO3657a panF   TRUE 0.996 -10.000 0.682 NA   NA
 146948 146949 YPO3657a YPO3658   accC FALSE 0.025 1358.000 0.103 NA   NA
 146949 146950 YPO3658 YPO3659 accC accB TRUE 0.996 12.000 0.275 0.000 Y NA
 146950 146951 YPO3659 YPO3660 accB aroQ TRUE 0.572 158.000 0.254 1.000 N NA
 146951 146952 YPO3660 YPO3661 aroQ   FALSE 0.049 263.000 0.006 1.000   NA
 146952 146953 YPO3661 YPO3662     TRUE 0.999 0.000 0.790 0.033   NA
 146953 146954 YPO3662 YPO3663     FALSE 0.150 223.000 0.059 1.000   NA
 146955 146956 YPO3664 YPO3665   mreB FALSE 0.016 337.000 0.000 1.000 N NA
 146956 146957 YPO3665 YPO3666 mreB mreC TRUE 0.770 204.000 0.689 1.000 N NA
 146957 146958 YPO3666 YPO3667 mreC mreD TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 146958 146959 YPO3667 YPO3668 mreD   TRUE 0.907 14.000 0.206 NA N NA
 146959 146960 YPO3668 YPO3669   cafA TRUE 0.989 -10.000 0.417 NA N NA
 146960 146961 YPO3669 YPO3670 cafA   TRUE 0.788 94.000 0.296 NA   NA
 146961 146962 YPO3670 YPO3671     TRUE 0.993 -3.000 0.358 NA   NA
 146962 146963 YPO3671 YPO3672   tldD TRUE 0.959 12.000 0.259 NA   NA
 146964 146965 YPO3673 YPO3674     TRUE 0.965 25.000 0.000 0.011 Y NA
 146965 146966 YPO3674 YPO3675     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 146966 146967 YPO3675 YPO3676     TRUE 0.994 -3.000 0.400 NA   NA
 146967 146968 YPO3676 YPO3677     TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 146968 146969 YPO3677 YPO3678     FALSE 0.256 134.000 0.000 NA   NA
 146969 2201145 YPO3678 YPO3679     TRUE 0.449 57.000 0.000 NA   NA
 2201145 146970 YPO3679 YPO3681     TRUE 0.535 41.000 0.000 NA   NA
 146970 146971 YPO3681 YPO3682     FALSE 0.098 236.000 0.000 NA   NA
 146971 146972 YPO3682 YPO3683     TRUE 0.486 261.000 0.000 0.049 Y NA
 146973 146974 YPO3684 YPO3685     TRUE 0.936 8.000 0.150 NA   NA
 146974 146975 YPO3685 YPO3686     TRUE 0.998 2.000 1.000 NA   NA
 146975 2201146 YPO3686 YPO3687     FALSE 0.067 267.000 0.000 NA   NA
 2201146 146976 YPO3687 YPO3689     FALSE 0.131 210.000 0.000 NA   NA
 146976 146977 YPO3689 YPO3690     TRUE 0.980 5.000 0.329 NA   NA
 146979 146980 YPO3692 YPO3693 pmbA   FALSE 0.049 255.000 0.005 NA   NA
 146980 146981 YPO3693 YPO3694     FALSE 0.133 208.000 0.000 NA   NA
 146982 146983 YPO3695 YPO3696 rnk treC FALSE 0.015 353.000 0.000 1.000 N NA
 146983 146984 YPO3696 YPO3697 treC treB TRUE 0.974 95.000 0.650 1.000 Y NA
 146984 146985 YPO3697 YPO3698 treB treR FALSE 0.011 411.000 0.000 1.000 N NA
 146985 146986 YPO3698 YPO3699 treR   FALSE 0.100 234.000 0.000 NA   NA
 146986 146987 YPO3699 YPO3700     FALSE 0.284 116.000 0.000 NA   NA
 146987 146988 YPO3700 YPO3701     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 146989 146990 YPO3702 YPO3703     TRUE 0.764 54.000 0.167 NA   NA
 2201147 146991 YPO3704 YPO3705     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 146991 146992 YPO3705 YPO3706     TRUE 0.991 7.000 0.627 NA   NA
 146992 146993 YPO3706 YPO3707     TRUE 0.958 68.000 0.821 NA   NA
 146995 146996 YPO3709 YPO3710   malM FALSE 0.027 411.000 0.000 NA   NA
 146996 146997 YPO3710 YPO3711 malM lamB FALSE 0.119 223.000 0.000 1.000   NA
 146997 146998 YPO3711 YPO3712 lamB malK TRUE 0.872 71.000 0.000 0.065 Y NA
 146998 146999 YPO3712 YPO3713 malK   TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 147000 147001 YPO3714 YPO3715 malE malF TRUE 0.626 187.000 0.060 1.000 Y NA
 147001 147002 YPO3715 YPO3716 malF malG TRUE 0.998 14.000 0.814 0.047 Y NA
 147003 147004 YPO3717 YPO3718   pgi FALSE 0.205 135.000 0.015 1.000   NA
 147005 147006 YPO3719 YPO3720 lysC shlB FALSE 0.006 568.000 0.000 NA N NA
 147006 147007 YPO3720 YPO3721 shlB   TRUE 0.925 70.000 0.600 NA   NA
 147009 147010 YPO3724 YPO3725 aceK aceA FALSE 0.287 256.000 0.273 1.000 N NA
 147010 147011 YPO3725 YPO3726 aceA aceB TRUE 0.923 47.000 0.118 1.000 Y NA
 147011 147012 YPO3726 YPO3727 aceB metA FALSE 0.010 421.000 0.000 1.000 N NA
 147012 2201149 YPO3727 YPOr10 metA 5S_rRNA FALSE 0.013 732.000 0.000 NA   NA
 2201149 401317 YPOr10 YPt_53 5S_rRNA tRNA-Thr TRUE 0.624 30.000 0.000 NA   NA
 401317 2201150 YPt_53 YPOr11 tRNA-Thr 5S_rRNA TRUE 0.810 9.000 0.000 NA   NA
 2201150 407420 YPOr11 YPOr12 5S_rRNA 23S_rRNA TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 407420 401316 YPOr12 YPt_54 23S_rRNA tRNA-Ala FALSE 0.119 219.000 0.000 NA   NA
 401316 401315 YPt_54 YPt_55 tRNA-Ala tRNA-Ile TRUE 0.479 52.000 0.000 NA   NA
 401315 2201151 YPt_55 YPOr13 tRNA-Ile 16S_rRNA FALSE 0.261 130.000 0.000 NA   NA
 147013 147014 YPO3728 YPO3729 purH purD TRUE 0.946 60.000 0.238 1.000 Y NA
 147015 147016 YPO3730 YPO3731   hupA TRUE 0.990 2.000 0.375 NA   NA
 147016 147017 YPO3731 YPO3732 hupA   TRUE 0.672 189.000 0.355 NA   NA
 147017 147018 YPO3732 YPO3733   nfi TRUE 0.658 46.000 0.086 NA   NA
 147018 147019 YPO3733 YPO3734 nfi hemE FALSE 0.148 66.000 0.028 1.000 N NA
 147019 147020 YPO3734 YPO3735 hemE   FALSE 0.280 119.000 0.000 NA   NA
 147020 147021 YPO3735 YPO3736     FALSE 0.324 93.000 0.000 NA   NA
 147022 147023 YPO3737 YPO3738 rsd   FALSE 0.274 123.000 0.000 NA   NA
 147023 147024 YPO3738 YPO3739   thiC TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 147024 147025 YPO3739 YPO3740 thiC thiE TRUE 0.984 14.000 0.063 0.002 Y NA
 147025 147026 YPO3740 YPO3741 thiE thiF TRUE 0.996 -10.000 0.242 1.000 Y NA
 147026 147027 YPO3741 YPO3742 thiF thiG TRUE 0.614 214.000 0.005 0.016 Y NA
 147027 147028 YPO3742 YPO3743 thiG thiH TRUE 0.998 -7.000 0.277 0.002 Y NA
 147031 147032 YPO3746 YPO3747 rpoC rpoB TRUE 0.972 129.000 0.851 0.001   NA
 147032 147033 YPO3747 YPO3748 rpoB rplL FALSE 0.186 343.000 0.223 1.000   NA
 147033 147034 YPO3748 YPO3749 rplL rplJ TRUE 0.994 67.000 0.884 0.011 Y NA
 147034 147035 YPO3749 YPO3750 rplJ rplA TRUE 0.656 365.000 0.302 0.014 Y NA
 147035 147036 YPO3750 YPO3751 rplA rplK TRUE 0.999 4.000 0.838 0.014 Y NA
 147036 147037 YPO3751 YPO3752 rplK nusG TRUE 0.802 191.000 0.681 1.000 N NA
 147037 147038 YPO3752 YPO3753 nusG secE TRUE 0.996 2.000 0.843 1.000 N NA
 147038 147039 YPO3753 YPO3754 secE tufA FALSE 0.011 251.000 0.009 1.000 N NA
 147039 401314 YPO3754 YPt_56 tufA tRNA-Thr FALSE 0.293 109.000 0.000 NA   NA
 401314 401313 YPt_56 YPt_57 tRNA-Thr tRNA-Gly TRUE 0.823 7.000 0.000 NA   NA
 401313 401312 YPt_57 YPt_58 tRNA-Gly tRNA-Tyr FALSE 0.237 150.000 0.000 NA   NA
 401312 401311 YPt_58 YPt_59 tRNA-Tyr tRNA-Thr TRUE 0.711 19.000 0.000 NA   NA
 401311 147040 YPt_59 YPO3755 tRNA-Thr   FALSE 0.022 464.000 0.000 NA   NA
 147040 147041 YPO3755 YPO3756     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 147042 147043 YPO3757 YPO3758   coaA FALSE 0.138 211.000 0.000 1.000   NA
 147044 147045 YPO3759 YPO3760 birA murB TRUE 0.979 -3.000 0.211 1.000 N NA
 147045 2201152 YPO3760 YPOr14 murB 5S_rRNA FALSE 0.023 456.000 0.000 NA   NA
 2201152 407421 YPOr14 YPOr15 5S_rRNA 23S_rRNA TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 407421 401310 YPOr15 YPt_60 23S_rRNA tRNA-Ala FALSE 0.119 219.000 0.000 NA   NA
 401310 401309 YPt_60 YPt_61 tRNA-Ala tRNA-Ile TRUE 0.479 52.000 0.000 NA   NA
 401309 2201153 YPt_61 YPOr16 tRNA-Ile 16S_rRNA FALSE 0.261 130.000 0.000 NA   NA
 2201153 147046 YPOr16 YPO3761 16S_rRNA hemG FALSE 0.019 502.000 0.000 NA   NA
 147046 147047 YPO3761 YPO3762 hemG trkH TRUE 0.958 22.000 0.455 1.000 N NA
 147047 2201154 YPO3762 YPO3763 trkH   TRUE 0.543 40.000 0.000 NA   NA
 2201154 147048 YPO3763 YPO3764   tnp TRUE 0.893 -772.000 0.000 NA   NA
 147048 147049 YPO3764 YPO3765 tnp pepQ FALSE 0.019 314.000 0.000 1.000 N NA
 147050 147051 YPO3766 YPO3767 fadB fadA TRUE 0.996 12.000 0.607 1.000 Y NA
 147052 147053 YPO3768 YPO3769 fadI   TRUE 0.893 55.000 0.090 1.000 Y NA
 147055 2201155 YPO3771 YPO3775 hemB tatD TRUE 0.746 15.000 0.000 NA   NA
 2201155 147056 YPO3775 YPO3773 tatD   TRUE 0.893 -1156.000 0.000 NA   NA
 147056 147057 YPO3773 YPO3774     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 147057 147058 YPO3774 YPO3776   tatC FALSE 0.005 622.000 0.000 NA N NA
 147058 147059 YPO3776 YPO3777 tatC tatB TRUE 0.996 3.000 0.333 NA Y NA
 147059 147060 YPO3777 YPO3778 tatB tatA TRUE 0.988 4.000 0.130 1.000 Y NA
 147060 147061 YPO3778 YPO3779 tatA aarF FALSE 0.167 180.000 0.025 1.000   NA
 147061 147062 YPO3779 YPO3780 aarF   TRUE 0.993 0.000 0.432 1.000   NA
 147062 147063 YPO3780 YPO3781   ubiE TRUE 0.835 32.000 0.145 1.000   NA
 147063 147064 YPO3781 YPO3782 ubiE rumC FALSE 0.350 92.000 0.047 NA   NA
 147064 147065 YPO3782 YPO3783 rumC   FALSE 0.148 280.000 0.125 NA   NA
 147065 147066 YPO3783 YPO3784     FALSE 0.065 272.000 0.041 NA   NA
 147066 147067 YPO3784 YPO3785     FALSE 0.198 358.000 0.000 1.000 Y NA
 147067 147068 YPO3785 YPO3786   udp FALSE 0.098 121.000 0.030 1.000 N NA
 147072 147073 YPO3790 YPO3791     FALSE 0.077 382.000 0.000 0.062   NA
 147073 147074 YPO3791 YPO3792   ugpQ FALSE 0.267 101.000 0.023 1.000   NA
 147074 147075 YPO3792 YPO3793 ugpQ ugpC TRUE 0.759 -3.000 0.024 1.000 N NA
 147075 147076 YPO3793 YPO3794 ugpC ugpE TRUE 0.995 7.000 0.272 0.046 Y NA
 147076 147077 YPO3794 YPO3795 ugpE ugpA TRUE 0.999 -3.000 0.306 0.046 Y NA
 147077 147078 YPO3795 YPO3796 ugpA ugpB TRUE 0.915 298.000 0.793 0.046 Y NA
 147079 147080 YPO3797 YPO3798     FALSE 0.071 267.000 0.000 1.000   NA
 147080 147081 YPO3798 YPO3799     TRUE 0.949 18.000 0.286 NA   NA
 147081 147082 YPO3799 YPO3800     TRUE 0.995 -28.000 0.600 NA   NA
 147082 147083 YPO3800 YPO3801     TRUE 0.938 62.000 0.600 NA   NA
 147083 147084 YPO3801 YPO3802     TRUE 0.954 113.000 1.000 NA   NA
 147085 147086 YPO3803 YPO3804   livF FALSE 0.105 228.000 0.000 NA   NA
 147086 147087 YPO3804 YPO3805 livF livG TRUE 0.997 45.000 0.967 0.017 Y NA
 147087 147088 YPO3805 YPO3806 livG livM TRUE 0.999 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 147088 147089 YPO3806 YPO3807 livM livH TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.046 Y NA
 147089 147090 YPO3807 YPO3808 livH livK TRUE 0.822 181.000 0.217 1.000 Y NA
 147092 147093 YPO3810 YPO3811 tnp rpoH FALSE 0.054 214.000 0.000 1.000 N NA
 147093 147094 YPO3811 YPO3812 rpoH ftsX FALSE 0.026 311.000 0.051 1.000 N NA
 147094 147095 YPO3812 YPO3813 ftsX ftsE TRUE 0.992 -10.000 0.121 1.000 Y NA
 147095 147096 YPO3813 YPO3814 ftsE ftsY TRUE 0.940 6.000 0.117 0.087 N NA
 147097 147098 YPO3815 YPO3816     FALSE 0.291 110.000 0.000 NA   NA
 147098 147099 YPO3816 YPO3816a     TRUE 0.934 -10.000 0.063 NA   NA
 147100 147101 YPO3817 YPO3818     FALSE 0.163 212.000 0.058 NA   NA
 147102 147103 YPO3819 YPO3820     FALSE 0.297 414.000 0.325 0.062   NA
 147105 147106 YPO3822 YPO3823     FALSE 0.339 130.000 0.066 NA   NA
 147107 147108 YPO3824 YPO3825 glpC glpB TRUE 0.997 -3.000 0.547 0.032 N NA
 147108 147109 YPO3825 YPO3826 glpB glpA TRUE 0.998 -10.000 0.650 0.001 N NA
 147111 147112 YPO3828 YPO3829     FALSE 0.028 416.000 0.000 1.000   NA
 147112 147113 YPO3829 YPO3830   pldB TRUE 0.961 35.000 0.524 1.000   NA
 147115 147116 YPO3832 YPO3833 rhtC recQ FALSE 0.152 107.000 0.043 1.000 N NA
 147116 147117 YPO3833 YPO3834 recQ pldA FALSE 0.250 78.000 0.057 1.000 N NA
 147118 147119 YPO3835 YPO3836     TRUE 0.513 87.000 0.099 NA   NA
 147120 147121 YPO3837 YPO3838 corA yhbH FALSE 0.016 649.000 0.000 1.000   NA
 147121 147122 YPO3838 YPO3839 yhbH   TRUE 0.763 14.000 0.042 NA   NA
 147124 147125 YPO3841 YPO3842 uvrD   TRUE 0.558 102.000 0.128 1.000   NA
 147125 147126 YPO3842 YPO3843   xerC TRUE 0.992 0.000 0.367 1.000   NA
 147126 147127 YPO3843 YPO3844 xerC   TRUE 0.997 -3.000 0.714 NA   NA
 147127 147128 YPO3844 YPO3845   dapF TRUE 0.726 65.000 0.175 NA   NA
 147128 147129 YPO3845 YPO3846 dapF   FALSE 0.034 184.000 0.021 NA N NA
 147132 147133 YPO3849 YPO3850 hemC hemD TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 147133 147134 YPO3850 YPO3851 hemD hemX TRUE 0.991 31.000 0.600 1.000 Y NA
 147134 147135 YPO3851 YPO3852 hemX hemY TRUE 0.991 3.000 0.144 1.000 Y NA
 147136 401308 YPO3853 YPt_62 tnp tRNA-Pro FALSE 0.013 867.000 0.000 NA   NA
 401308 401307 YPt_62 YPt_63 tRNA-Pro tRNA-Leu FALSE 0.354 76.000 0.000 NA   NA
 401307 401306 YPt_63 YPt_64 tRNA-Leu tRNA-His TRUE 0.725 17.000 0.000 NA   NA
 401306 401305 YPt_64 YPt_65 tRNA-His tRNA-Arg FALSE 0.339 84.000 0.000 NA   NA
 401305 147137 YPt_65 YPO3854 tRNA-Arg   FALSE 0.239 149.000 0.000 NA   NA
 147137 147138 YPO3854 YPO3855   wecG FALSE 0.007 524.000 0.000 1.000 N NA
 147138 147139 YPO3855 YPO3856 wecG gabD2 TRUE 0.924 9.000 0.126 1.000   NA
 147139 147140 YPO3856 YPO3857 gabD2   TRUE 0.997 -3.000 0.684 1.000   NA
 147140 147141 YPO3857 YPO3858   wzxE TRUE 0.979 23.000 0.605 1.000   NA
 147141 147142 YPO3858 YPO3859 wzxE rffA TRUE 0.980 2.000 0.218 1.000   NA
 147142 147143 YPO3859 YPO3860 rffA rffC TRUE 0.983 2.000 0.248 1.000   NA
 147143 147144 YPO3860 YPO3861 rffC rffH TRUE 0.774 47.000 0.145 1.000   NA
 147144 147145 YPO3861 YPO3862 rffH rffG TRUE 0.924 295.000 0.739 0.003 Y NA
 147145 147146 YPO3862 YPO3863 rffG rffD TRUE 0.997 -3.000 0.273 1.000 Y NA
 147146 147147 YPO3863 YPO3864 rffD rffE TRUE 0.998 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 147147 147148 YPO3864 YPO3865 rffE wzzE TRUE 0.923 281.000 0.677 0.003 Y NA
 147148 147149 YPO3865 YPO3866 wzzE rfe TRUE 0.997 36.000 0.735 0.003 Y NA
 147149 147150 YPO3866 YPO3867 rfe rho FALSE 0.007 535.000 0.000 1.000 N NA
 147150 147151 YPO3867 YPO3868 rho trxA FALSE 0.021 480.000 0.087 1.000 N NA
 147152 2201156 YPO3869 YPO3870 rhlB gppA TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 147154 147155 YPO3873 YPO3874 ppiC   FALSE 0.101 239.000 0.000 1.000   NA
 147155 147156 YPO3874 YPO3875     FALSE 0.153 97.000 0.000 1.000 N NA
 147158 147159 YPO3877 YPO3878     TRUE 0.992 64.000 1.000 1.000 Y NA
 147159 147160 YPO3878 YPO3879     TRUE 0.990 28.000 0.500 1.000 Y NA
 147160 147161 YPO3879 YPO3880     TRUE 0.978 17.000 0.500 1.000   NA
 147161 147162 YPO3880 YPO3881     TRUE 0.985 38.000 1.000 1.000   NA
 147162 147163 YPO3881 YPO3882     TRUE 0.675 24.000 0.000 NA   NA
 147164 147165 YPO3883 YPO3884 imm   TRUE 0.906 2.000 0.000 1.000   NA
 147165 147166 YPO3884 YPO3885     FALSE 0.078 253.000 0.000 NA   NA
 147166 147167 YPO3885 YPO3886     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 147167 147168 YPO3886 YPO3887     FALSE 0.285 115.000 0.000 NA   NA
 147168 147169 YPO3887 YPO3888   ilvC FALSE 0.187 181.000 0.000 NA   NA
 147172 147173 YPO3891 YPO3892     TRUE 0.936 72.000 0.667 NA   NA
 147173 147174 YPO3892 YPO3893     TRUE 0.996 -16.000 0.667 NA   NA
 147174 147175 YPO3893 YPO3894     TRUE 0.438 59.000 0.000 NA   NA
 147175 147176 YPO3894 YPO3895     TRUE 0.438 59.000 0.000 NA   NA
 147177 147178 YPO3896 YPO3897 ilvA ilvD TRUE 0.982 6.000 0.106 1.000 Y NA
 147178 147179 YPO3897 YPO3899 ilvD ilvE FALSE 0.305 311.000 0.075 1.000 Y NA
 147179 147180 YPO3899 YPO3900 ilvE ilvM TRUE 0.913 23.000 0.205 1.000   NA
 147180 147181 YPO3900 YPO3901 ilvM ilvG TRUE 0.999 -3.000 0.943 0.001   NA
 147185 147186 YPO3905 YPO3906     TRUE 1.000 0.000 0.865 0.009 Y NA
 147186 147187 YPO3906 YPO3907     TRUE 0.998 12.000 0.506 0.009 Y NA
 147187 147188 YPO3907 YPO3908     TRUE 0.983 86.000 0.804 NA Y NA
 147188 401304 YPO3908 YPt_66   tRNA-Trp FALSE 0.012 978.000 0.000 NA   NA
 401304 401303 YPt_66 YPt_67 tRNA-Trp tRNA-Asp TRUE 0.810 9.000 0.000 NA   NA
 401303 2201157 YPt_67 YPOr17 tRNA-Asp 5S_rRNA FALSE 0.281 118.000 0.000 NA   NA
 2201157 407422 YPOr17 YPOr18 5S_rRNA 23S_rRNA TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 407422 401302 YPOr18 YPt_68 23S_rRNA tRNA-Glu FALSE 0.078 253.000 0.000 NA   NA
 401302 2201158 YPt_68 YPOr19 tRNA-Glu 16S_rRNA FALSE 0.217 164.000 0.000 NA   NA
 2201158 147189 YPOr19 YPO3909 16S_rRNA murI FALSE 0.020 483.000 0.000 NA   NA
 147189 147190 YPO3909 YPO3910 murI btuB TRUE 0.674 -55.000 0.025 1.000 N NA
 147192 147193 YPO3912 YPO3913     TRUE 0.983 13.000 0.508 NA   NA
 147196 147197 YPO3916 YPO3917     TRUE 0.789 95.000 0.204 0.004 N NA
 147198 147199 YPO3918 YPO3919     TRUE 0.963 65.000 0.667 0.007 N NA
 147199 147200 YPO3919 YPO3920     TRUE 0.983 76.000 1.000 0.007   NA
 147200 147201 YPO3920 YPO3922     FALSE 0.214 166.000 0.000 NA   NA
 147201 147202 YPO3922 YPO3923     FALSE 0.113 222.000 0.000 NA   NA
 147202 147203 YPO3923 YPO3924   argH FALSE 0.006 599.000 0.000 1.000 N NA
 147203 147204 YPO3924 YPO3925 argH argB TRUE 0.611 167.000 0.017 1.000 Y NA
 147204 147205 YPO3925 YPO3927 argB argC TRUE 0.862 169.000 0.097 0.002 Y NA
 147206 147207 YPO3928 YPO3929 argE ppc FALSE 0.018 374.000 0.053 1.000 N NA
 147207 147208 YPO3929 YPO3931 ppc   FALSE 0.005 742.000 0.000 1.000 N NA
 147208 147209 YPO3931 YPO3932     TRUE 0.932 54.000 0.167 1.000 Y NA
 147210 147211 YPO3934 YPO3935     TRUE 0.886 3.000 0.000 NA   NA
 147211 147212 YPO3935 YPO3936     FALSE 0.048 309.000 0.000 NA   NA
 147214 147215 YPO3938 YPO3939 glgP glgA TRUE 0.852 169.000 0.228 1.000 Y NA
 147215 147216 YPO3939 YPO3940 glgA glgC TRUE 0.948 68.000 0.307 1.000 Y NA
 147216 147217 YPO3940 YPO3941 glgC glgX TRUE 0.989 10.000 0.228 1.000 Y NA
 147217 147218 YPO3941 YPO3942 glgX glgB TRUE 0.994 2.000 0.069 0.002 Y NA
 147222 147223 YPO3946 YPO3947     TRUE 0.823 7.000 0.000 NA   NA
 147223 147224 YPO3947 YPO3948     FALSE 0.094 241.000 0.000 NA   NA
 147224 147225 YPO3948 YPO3949   asd FALSE 0.209 169.000 0.000 NA   NA
 147227 147228 YPO3951 YPO3952     FALSE 0.033 371.000 0.000 NA   NA
 147228 147229 YPO3952 YPO3953     FALSE 0.185 182.000 0.000 NA   NA
 147231 147232 YPO3955 YPO3956 gntR   FALSE 0.408 129.000 0.091 NA   NA
 147233 147234 YPO3957 YPO3958     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 147235 147236 YPO3959 YPO3960     TRUE 0.985 10.000 0.180 NA Y NA
 147236 147237 YPO3960 YPO3961     TRUE 0.860 26.000 0.149 NA   NA
 147237 147238 YPO3961 YPO3962     TRUE 0.525 75.000 0.095 NA   NA
 147238 147239 YPO3962 YPO3963     TRUE 0.955 31.000 0.238 0.009   NA
 147239 147240 YPO3963 YPO3964   tnpA_4 TRUE 0.923 -7.000 0.000 1.000   NA
 147243 147244 YPO3967 YPO3968   tnp FALSE 0.028 266.000 0.000 1.000 N NA
 147246 147247 YPO3970 YPO3971 fdoG gdhA FALSE 0.035 247.000 0.000 1.000 N NA
 147247 147248 YPO3971 YPO3973 gdhA   FALSE 0.037 245.000 0.000 1.000 N NA
 147249 147250 YPO3974 YPO3975   opdA TRUE 0.929 4.000 0.098 NA   NA
 147251 147252 YPO3976 YPO3977   gor FALSE 0.322 186.000 0.100 1.000   NA
 147252 147253 YPO3977 YPO3978 gor   FALSE 0.064 192.000 0.000 NA N NA
 147253 147254 YPO3978 YPO3979     TRUE 0.554 178.000 0.290 NA N NA
 147254 147255 YPO3979 YPO3980   glxK TRUE 0.991 11.000 0.295 1.000 Y NA
 147256 147257 YPO3981 YPO3982     FALSE 0.380 68.000 0.000 NA   NA
 147257 147258 YPO3982 YPO3983     TRUE 0.900 2.000 0.000 NA   NA
 147258 147259 YPO3983 YPO3984   yapE FALSE 0.332 88.000 0.000 NA   NA
 147260 147261 YPO3985 YPO3986   cdh TRUE 0.654 25.000 0.033 1.000   NA
 147262 147263 YPO3987 YPO3988     FALSE 0.018 305.000 0.000 NA N NA
 147264 147265 YPO3989 YPO3990   kdgK FALSE 0.060 279.000 0.034 1.000   NA
 147266 147267 YPO3991 YPO3992   dctA FALSE 0.064 365.000 0.088 1.000   NA
 147267 147268 YPO3992 YPO3993 dctA   FALSE 0.024 455.000 0.000 1.000   NA
 147268 147269 YPO3993 YPO3994   pelY TRUE 0.707 125.000 0.250 1.000   NA
 147269 147270 YPO3994 YPO3995 pelY   FALSE 0.381 246.000 0.250 1.000   NA
 147270 147271 YPO3995 YPO3996   yhjK FALSE 0.037 640.000 0.000 0.080   NA
 147271 2201159 YPO3996 YPO3998 yhjK   FALSE 0.243 146.000 0.000 NA   NA
 2201159 147272 YPO3998 YPO3999   dppF FALSE 0.299 104.000 0.000 NA   NA
 147272 147273 YPO3999 YPO4000 dppF dppD TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.001 Y NA
 147273 147274 YPO4000 YPO4001 dppD dppC TRUE 0.995 14.000 0.560 1.000 Y NA
 147274 147275 YPO4001 YPO4002 dppC dppB TRUE 0.990 82.000 0.779 0.046 Y NA
 147275 147276 YPO4002 YPO4003 dppB dppA TRUE 0.520 283.000 0.087 0.046 Y NA
 147276 147277 YPO4003 YPO4004 dppA   FALSE 0.028 403.000 0.000 NA   NA
 147277 147278 YPO4004 YPO4005     TRUE 0.718 18.000 0.000 NA   NA
 147278 147279 YPO4005 YPO4006     TRUE 0.754 109.000 0.286 NA   NA
 147279 401301 YPO4006 YPt_69   tRNA-Pro FALSE 0.046 313.000 0.000 NA   NA
 401301 147280 YPt_69 YPO4007 tRNA-Pro uhpC FALSE 0.282 117.000 0.000 NA   NA
 147280 2201160 YPO4007 YPO4008 uhpC uhpB FALSE 0.319 95.000 0.000 NA   NA
 2201160 147281 YPO4008 YPO4009 uhpB   TRUE 0.892 -1587.000 0.000 NA   NA
 147281 147282 YPO4009 YPO4010     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 147282 147283 YPO4010 YPO4012   uhpA FALSE 0.022 879.000 0.000 0.027 N NA
 147283 147284 YPO4012 YPO4013 uhpA   TRUE 0.474 116.000 0.103 1.000   NA
 147284 147285 YPO4013 YPO4014     FALSE 0.018 529.000 0.000 NA   NA
 147285 147286 YPO4014 YPO4015     FALSE 0.007 468.000 0.000 NA N NA
 147286 147287 YPO4015 YPO4016   hutH FALSE 0.129 418.000 0.006 1.000 Y NA
 147287 147288 YPO4016 YPO4017 hutH hutU TRUE 0.999 -3.000 0.315 0.000 Y NA
 147289 147290 YPO4018 YPO4019 cysM   TRUE 0.997 -3.000 0.800 1.000 N NA
 147290 147291 YPO4019 YPO4020     TRUE 0.771 83.000 0.250 1.000   NA
 147291 147292 YPO4020 YPO4021     TRUE 0.966 2.000 0.138 1.000   NA
 147292 147293 YPO4021 YPO4022     FALSE 0.007 523.000 0.000 1.000 N NA
 147293 147294 YPO4022 YPO4023     TRUE 0.993 10.000 0.356 1.000 Y NA
 147294 147295 YPO4023 YPO4024     TRUE 1.000 -10.000 0.870 0.046 Y NA
 147295 147296 YPO4024 YPO4025     TRUE 0.999 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 147298 2201161 YPO4028 YPO4029     TRUE 0.550 39.000 0.000 NA   NA
 2201161 147299 YPO4029 YPO4031     FALSE 0.198 174.000 0.000 NA   NA
 147300 147301 YPO4032 YPO4033     TRUE 0.809 59.000 0.222 NA   NA
 147301 401300 YPO4033 YPt_70   tRNA-SeC(p) FALSE 0.214 166.000 0.000 NA   NA
 401300 147302 YPt_70 YPO4034 tRNA-SeC(p)   FALSE 0.261 130.000 0.000 NA   NA
 147302 147303 YPO4034 YPO4035     TRUE 0.504 90.000 0.146 1.000 N NA
 147303 147304 YPO4035 YPO4036     TRUE 0.999 -13.000 0.469 0.009 Y NA
 147304 147305 YPO4036 YPO4037     TRUE 0.946 208.000 0.518 0.009 Y NA
 147306 147307 YPO4038 YPO4039 xylA xylB TRUE 0.691 124.000 0.020 1.000 Y NA
 147308 147309 YPO4040 YPO4041     TRUE 0.953 39.000 0.500 1.000   NA
 147309 2201162 YPO4041 YPO4042     FALSE 0.324 93.000 0.000 NA   NA
 2201162 147310 YPO4042 YPO4044     FALSE 0.354 76.000 0.000 NA   NA
 147310 147311 YPO4044 YPO4045     FALSE 0.013 882.000 0.000 1.000   NA
 147312 147313 YPO4046 YPO4047     TRUE 0.932 54.000 0.167 1.000 Y NA
 147313 147314 YPO4047 YPO4048   mdfA FALSE 0.008 473.000 0.000 1.000 N NA
 147314 147315 YPO4048 YPO4049 mdfA   FALSE 0.014 710.000 0.000 NA   NA
 2201163 147318 YPO4052 YPO4054 selB selA TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 147318 147319 YPO4054 YPO4055 selA fdhE FALSE 0.168 184.000 0.083 NA N NA
 147319 147320 YPO4055 YPO4056 fdhE fdoI TRUE 0.967 0.000 0.182 NA N NA
 147320 147321 YPO4056 YPO4057 fdoI fdoH TRUE 1.000 -3.000 0.944 0.000 Y NA
 147321 2201164 YPO4057 YPO4058 fdoH fdoG TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 147322 147323 YPO4060 YPO4061 fdhD sodA FALSE 0.007 436.000 0.029 1.000 N NA
 147323 147324 YPO4061 YPO4062 sodA tar FALSE 0.016 344.000 0.000 1.000 N NA
 147324 147325 YPO4062 YPO4063 tar   FALSE 0.169 190.000 0.000 NA   NA
 147325 147326 YPO4063 YPO4064     FALSE 0.017 556.000 0.000 NA   NA
 147327 147328 YPO4065 YPO4066   mtlR FALSE 0.116 249.000 0.067 NA   NA
 147328 147329 YPO4066 YPO4067 mtlR mtlD FALSE 0.372 207.000 0.230 NA N NA
 147329 147330 YPO4067 YPO4068 mtlD mtlA TRUE 0.905 137.000 0.292 1.000 Y NA
 147330 147331 YPO4068 YPO4070 mtlA   FALSE 0.015 650.000 0.000 NA   NA
 147331 147332 YPO4070 YPO4071   glyS FALSE 0.013 467.000 0.003 NA   NA
 147332 147333 YPO4071 YPO4072 glyS glyQ TRUE 0.999 10.000 0.651 0.000 Y NA
 147334 147335 YPO4074 YPO4075 tag   TRUE 0.924 -3.000 0.028 1.000   NA
 147335 147336 YPO4075 YPO4076     FALSE 0.037 358.000 0.000 1.000   NA
 147338 147339 YPO4078 YPO4080   malS FALSE 0.023 289.000 0.000 1.000 N NA
 147339 147340 YPO4080 YPO4081 malS   FALSE 0.026 415.000 0.000 NA   NA
 147340 147341 YPO4081 YPO4082   avtA FALSE 0.023 455.000 0.000 NA   NA
 147342 147343 YPO4083 YPO4084   ibpB FALSE 0.048 373.000 0.069 NA   NA
 147343 147344 YPO4084 YPO4085 ibpB ibpA FALSE 0.392 281.000 0.099 NA Y NA
 147346 147347 YPO4089 YPO4090     TRUE 0.997 -6.000 0.316 1.000 Y NA
 147347 147348 YPO4090 YPO4091     FALSE 0.058 207.000 0.000 1.000 N NA
 147348 147349 YPO4091 YPO4092     TRUE 0.932 54.000 0.167 1.000 Y NA
 147350 147351 YPO4093 YPO4094   gyrB FALSE 0.209 216.000 0.003 0.085   NA
 147351 147352 YPO4094 YPO4095 gyrB recF TRUE 0.992 20.000 0.249 0.003 Y NA
 147352 147353 YPO4095 YPO4096 recF dnaN TRUE 0.887 173.000 0.318 1.000 Y NA
 147353 147354 YPO4096 YPO4097 dnaN dnaA TRUE 0.994 5.000 0.328 1.000 Y NA
 147355 147356 YPO4098 YPO4100   rpmH FALSE 0.031 377.000 0.000 NA   NA
 147356 147357 YPO4100 YPO4101 rpmH rnpA TRUE 0.988 19.000 0.787 1.000   NA
 147357 147358 YPO4101 YPO4102 rnpA   FALSE 0.139 224.000 0.105 1.000 N NA
 147358 147359 YPO4102 YPO4103   thdF TRUE 0.761 143.000 0.221 0.060   NA
 147359 147360 YPO4103 YPO4104 thdF   FALSE 0.125 186.000 0.003 1.000   NA
 147361 147362 YPO4105 YPO4106     FALSE 0.380 68.000 0.000 NA   NA
 147362 147363 YPO4106 YPO4107     FALSE 0.017 545.000 0.000 NA   NA
 147365 147366 YPO4109 YPO4110     TRUE 0.998 2.000 0.282 0.014 Y NA
 147366 147367 YPO4110 YPO4111     TRUE 0.907 183.000 0.263 0.045 Y NA
 147367 147368 YPO4111 YPO4112     FALSE 0.044 220.000 0.000 NA N NA
 147368 147369 YPO4112 YPO4113   phoU FALSE 0.019 296.000 0.000 NA N NA
 147369 147370 YPO4113 YPO4114 phoU pstB TRUE 0.938 88.000 0.317 NA Y NA
 147370 147371 YPO4114 YPO4115 pstB pstA TRUE 0.986 81.000 0.526 0.002 Y NA
 147371 147372 YPO4115 YPO4116 pstA pstC TRUE 0.999 2.000 0.537 0.002 Y NA
 147372 147373 YPO4116 YPO4117 pstC pstS TRUE 0.818 214.000 0.145 0.002 Y NA
 147373 147374 YPO4117 YPO4118 pstS glmS FALSE 0.008 483.000 0.000 1.000 N NA
 147374 147375 YPO4118 YPO4119 glmS glmU TRUE 0.569 201.000 0.055 1.000 Y NA
 147375 147376 YPO4119 YPO4120 glmU atpC FALSE 0.012 621.000 0.067 1.000 N NA
 147376 147377 YPO4120 YPO4121 atpC atpD TRUE 0.998 22.000 0.837 0.003 Y NA
 147377 147378 YPO4121 YPO4122 atpD atpG TRUE 0.984 156.000 0.724 0.003 Y NA
 147378 147379 YPO4122 YPO4123 atpG atpA TRUE 0.995 62.000 0.846 0.003 Y NA
 147379 147380 YPO4123 YPO4124 atpA atpH TRUE 0.999 15.000 0.864 0.003 Y NA
 147380 147381 YPO4124 YPO4125 atpH atpF TRUE 0.993 15.000 0.242 0.003 Y NA
 147381 147382 YPO4125 YPO4126 atpF atpE TRUE 0.992 62.000 0.666 0.003 Y NA
 147382 147383 YPO4126 YPO4127 atpE atpB TRUE 0.992 50.000 0.557 0.003 Y NA
 147383 147384 YPO4127 YPO4128 atpB atpI TRUE 0.986 40.000 0.291 0.003 Y NA
 147384 147385 YPO4128 YPO4129 atpI gidB FALSE 0.002 667.000 0.005 1.000 N NA
 147385 147386 YPO4129 YPO4130 gidB gidA TRUE 0.773 146.000 0.466 1.000 N NA
 147386 143502 YPO4130 YPO0001 gidA   FALSE 0.012 382.000 0.000 1.000 N NA
 143273 143274 YPCD1.01 YPCD1.02     TRUE 0.987 0.000 0.000 1.000 Y NA
 143278 143279 YPCD1.06 YPCD1.07 yopE   TRUE 0.900 2.000 0.000 NA   NA
 143280 2201017 YPCD1.08c YPCD1.09c     TRUE 0.986 -7.000 0.250 NA   NA
 2201017 10942833 YPCD1.09c YPCD1.09n     TRUE 0.543 40.000 0.000 NA   NA
 143283 143284 YPCD1.12c YPCD1.13c sopB sopA TRUE 0.989 0.000 0.400 1.000 N NA
 143284 10942834 YPCD1.13c YPCD1.14c sopA   FALSE 0.013 778.000 0.000 NA   NA
 10942834 2201019 YPCD1.14c YPCD1.14n     TRUE 0.894 -219.000 0.000 NA   NA
 2201019 143286 YPCD1.14n YPCD1.15c     TRUE 0.562 109.000 0.000 0.017   NA
 143286 143287 YPCD1.15c YPCD1.16c     TRUE 0.958 24.000 0.250 0.071   NA
 143287 2201020 YPCD1.16c YPCD1.17c   ylpA FALSE 0.299 104.000 0.000 NA   NA
 2201020 10942835 YPCD1.17c YPCD1.18c ylpA   FALSE 0.125 214.000 0.000 NA   NA
 10942835 143289 YPCD1.18c YPCD1.19c   yopQ FALSE 0.225 159.000 0.000 NA   NA
 143290 143291 YPCD1.20 YPCD1.21 yopT sycT TRUE 0.997 0.000 0.500 0.007   NA
 143292 10942836 YPCD1.22c YPCD1.22n     TRUE 0.599 33.000 0.000 NA   NA
 143296 10942839 YPCD1.26c YPCD1.26n yopM   FALSE 0.027 409.000 0.000 NA   NA
 143297 143298 YPCD1.28c YPCD1.29c yopD yopB TRUE 0.977 19.000 0.526 NA   NA
 143298 143299 YPCD1.29c YPCD1.30c yopB sycD TRUE 0.995 -22.000 0.632 1.000   NA
 143299 143300 YPCD1.30c YPCD1.31c sycD lcrV TRUE 0.953 13.000 0.235 1.000   NA
 143300 143301 YPCD1.31c YPCD1.32c lcrV lcrG TRUE 0.994 2.000 0.556 NA   NA
 143301 143302 YPCD1.32c YPCD1.33c lcrG lcrR TRUE 0.983 42.000 1.000 NA   NA
 143302 143303 YPCD1.33c YPCD1.34c lcrR yscV TRUE 0.990 -3.000 0.281 NA   NA
 143303 143304 YPCD1.34c YPCD1.35c yscV yscY TRUE 0.933 -13.000 0.062 1.000   NA
 143304 143305 YPCD1.35c YPCD1.36c yscY yscX TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 143305 143306 YPCD1.36c YPCD1.37c yscX sycN TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 143306 143307 YPCD1.37c YPCD1.38c sycN tyeA TRUE 0.979 -13.000 0.214 NA   NA
 143307 143308 YPCD1.38c YPCD1.39c tyeA lcrE TRUE 0.960 -19.000 0.125 NA   NA
 143309 143310 YPCD1.40 YPCD1.41 yscN yscO TRUE 0.991 -3.000 0.300 NA   NA
 143310 143311 YPCD1.41 YPCD1.42 yscO yscP TRUE 0.973 0.000 0.150 NA   NA
 143311 143312 YPCD1.42 YPCD1.43 yscP yscQ TRUE 0.994 -3.000 0.235 0.008   NA
 143312 143313 YPCD1.43 YPCD1.44 yscQ yscR TRUE 0.999 -3.000 0.529 1.000 Y NA
 143313 143314 YPCD1.44 YPCD1.45 yscR yscS TRUE 0.992 2.000 0.000 0.010 Y NA
 143314 143315 YPCD1.45 YPCD1.46 yscS yscT TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.060 Y NA
 143315 143316 YPCD1.46 YPCD1.47 yscT yscU TRUE 0.999 0.000 0.548 0.060 Y NA
 143316 143317 YPCD1.47 YPCD1.48 yscU virG FALSE 0.016 576.000 0.000 NA   NA
 143317 143318 YPCD1.48 YPCD1.49 virG virF TRUE 0.560 124.000 0.154 NA   NA
 143318 143319 YPCD1.49 YPCD1.50 virF yscA TRUE 0.644 79.000 0.154 NA   NA
 143319 143320 YPCD1.50 YPCD1.51 yscA yscB FALSE 0.108 226.000 0.000 NA   NA
 143320 143321 YPCD1.51 YPCD1.52 yscB yscC TRUE 0.994 6.000 0.750 1.000   NA
 143321 143322 YPCD1.52 YPCD1.53 yscC yscD TRUE 0.986 -3.000 0.220 NA   NA
 143322 143323 YPCD1.53 YPCD1.54 yscD yscE TRUE 0.989 -3.000 0.268 NA   NA
 143323 143324 YPCD1.54 YPCD1.55 yscE yscF TRUE 0.996 1.000 0.417 0.007   NA
 143324 143325 YPCD1.55 YPCD1.56 yscF yscG TRUE 0.997 2.000 0.556 0.007   NA
 143325 143326 YPCD1.56 YPCD1.57 yscG yopR TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.007   NA
 143326 143327 YPCD1.57 YPCD1.58 yopR lcrO TRUE 0.995 1.000 0.333 0.007   NA
 143327 143328 YPCD1.58 YPCD1.59 lcrO ylpB TRUE 0.989 7.000 0.333 0.010   NA
 143328 143329 YPCD1.59 YPCD1.60 ylpB yscK TRUE 0.998 0.000 0.800 1.000   NA
 143329 143330 YPCD1.60 YPCD1.61 yscK yscL TRUE 0.996 -54.000 0.727 1.000   NA
 143330 143331 YPCD1.61 YPCD1.62 yscL lcrQ FALSE 0.115 225.000 0.000 1.000   NA
 143331 143332 YPCD1.62 YPCD1.63 lcrQ ORFA FALSE 0.018 548.000 0.000 1.000   NA
 143332 10942840 YPCD1.63 YPCD1.64 ORFA   TRUE 0.574 36.000 0.000 NA   NA
 10942840 143334 YPCD1.64 YPCD1.65   ORFC TRUE 0.614 31.000 0.000 NA   NA
 10942841 143336 YPCD1.66 YPCD1.67c   yopH FALSE 0.115 221.000 0.000 NA   NA
 143336 10942842 YPCD1.67c YPCD1.68c yopH   FALSE 0.059 283.000 0.000 NA   NA
 10942842 10942843 YPCD1.68c YPCD1.70c     FALSE 0.015 640.000 0.000 NA   NA
 10942843 143340 YPCD1.70c YPCD1.71c   yopJ FALSE 0.023 456.000 0.000 NA   NA
 143340 143341 YPCD1.71c YPCD1.72c yopJ ypkA FALSE 0.029 396.000 0.000 NA   NA
 143341 143342 YPCD1.72c YPCD1.73c ypkA   TRUE 0.974 8.000 0.308 1.000   NA
 143342 10942844 YPCD1.73c YPCD1.74c     FALSE 0.081 250.000 0.000 NA   NA
 10942844 143345 YPCD1.74c YPCD1.77c   repA1 FALSE 0.011 1598.000 0.000 NA   NA
 143345 143346 YPCD1.77c YPCD1.78c repA1 tap TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 143347 10942845 YPCD1.79c YPCD1.80c copB   FALSE 0.023 446.000 0.000 NA   NA
 10942845 10942846 YPCD1.80c YPCD1.82c     TRUE 0.894 -128.000 0.000 NA   NA
 10942846 10942847 YPCD1.82c YPCD1.83c     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 10942847 10942848 YPCD1.83c YPCD1.84c     FALSE 0.163 193.000 0.000 NA   NA
 143355 2201024 YPCD1.91 YPCD1.91n tnpR   TRUE 0.711 19.000 0.000 NA   NA
 2201024 143356 YPCD1.91n YPCD1.92     FALSE 0.250 139.000 0.000 NA   NA
 143356 143357 YPCD1.92 YPCD1.93     FALSE 0.305 100.000 0.000 NA   NA
 143357 143358 YPCD1.93 YPCD1.94     TRUE 0.843 24.000 0.000 0.070   NA
 143359 143360 YPCD1.95c YPCD1.96c sycH   FALSE 0.041 343.000 0.000 1.000   NA
 143360 143361 YPCD1.96c YPCD1.97c     TRUE 0.998 0.000 1.000 1.000   NA
 143362 143363 YPPCP1.01 YPPCP1.02     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 143363 143364 YPPCP1.02 YPPCP1.03   rop FALSE 0.012 1037.000 0.000 NA   NA
 143364 143365 YPPCP1.03 YPPCP1.04 rop pim FALSE 0.012 1236.000 0.000 NA   NA
 143367 143368 YPPCP1.06 YPPCP1.07   pla FALSE 0.090 243.000 0.000 NA   NA
 143369 143370 YPPCP1.08c YPPCP1.09c     TRUE 0.992 0.000 0.400 NA   NA
 143371 2201166 YPMT1.01 YPMT1.02     TRUE 0.987 0.000 0.000 1.000 Y NA
 143373 10942828 YPMT1.03c YPMT1.3Ac     FALSE 0.324 93.000 0.000 NA   NA
 10942828 2201167 YPMT1.3Ac YPMT1.04c     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 2201167 143376 YPMT1.04c YPMT1.05c     TRUE 0.599 33.000 0.000 NA   NA
 143376 143377 YPMT1.05c YPMT1.06c     TRUE 0.718 18.000 0.000 NA   NA
 143377 143378 YPMT1.06c YPMT1.07c     TRUE 0.962 16.000 0.333 NA   NA
 143378 143379 YPMT1.07c YPMT1.08c     TRUE 0.997 -12.000 0.800 NA   NA
 143379 143380 YPMT1.08c YPMT1.09c     TRUE 0.993 -7.000 0.444 NA   NA
 143380 143381 YPMT1.09c YPMT1.10c     TRUE 0.449 57.000 0.000 NA   NA
 143381 143382 YPMT1.10c YPMT1.11c     TRUE 0.530 42.000 0.000 NA   NA
 143382 143383 YPMT1.11c YPMT1.12c     TRUE 0.993 8.000 0.750 NA   NA
 143383 143384 YPMT1.12c YPMT1.13c     FALSE 0.344 81.000 0.000 NA   NA
 143384 143385 YPMT1.13c YPMT1.14c     TRUE 0.432 60.000 0.000 NA   NA
 143385 143386 YPMT1.14c YPMT1.15c     TRUE 0.836 75.000 0.333 NA   NA
 143386 143387 YPMT1.15c YPMT1.16c     TRUE 0.996 2.000 0.667 NA   NA
 143387 143388 YPMT1.16c YPMT1.17c     TRUE 0.996 -9.000 0.667 NA   NA
 143388 143389 YPMT1.17c YPMT1.18c     TRUE 0.996 -16.000 0.667 NA   NA
 143389 143390 YPMT1.18c YPMT1.19c     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 143390 143391 YPMT1.19c YPMT1.20c     TRUE 0.965 44.000 0.667 NA   NA
 143391 143392 YPMT1.20c YPMT1.21c     TRUE 0.539 75.000 0.100 NA   NA
 143392 143393 YPMT1.21c YPMT1.22c     TRUE 0.794 27.000 0.100 NA   NA
 143393 143394 YPMT1.22c YPMT1.23c     TRUE 0.931 23.000 0.250 NA   NA
 143394 143395 YPMT1.23c YPMT1.24c     TRUE 0.963 19.000 0.375 NA   NA
 143395 143396 YPMT1.24c YPMT1.25c     TRUE 0.995 3.000 0.667 1.000   NA
 143396 143397 YPMT1.25c YPMT1.25Ac     TRUE 0.824 196.000 0.667 NA   NA
 143397 143398 YPMT1.25Ac YPMT1.26c     TRUE 0.802 10.000 0.000 NA   NA
 143398 143399 YPMT1.26c YPMT1.26Ac     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 143399 2201168 YPMT1.26Ac YPMT1.27c     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 2201168 143401 YPMT1.27c YPMT1.28c     TRUE 0.955 -3.000 0.068 1.000   NA
 143401 143402 YPMT1.28c YPMT1.29c     TRUE 0.997 0.000 0.222 0.070 Y NA
 143403 143404 YPMT1.30 YPMT1.31     TRUE 0.966 3.000 0.167 NA   NA
 143404 143405 YPMT1.31 YPMT1.32     TRUE 0.703 60.000 0.143 NA   NA
 143405 143406 YPMT1.32 YPMT1.33     TRUE 0.944 5.000 0.143 NA   NA
 143406 143407 YPMT1.33 YPMT1.34     FALSE 0.044 322.000 0.000 NA   NA
 143407 143408 YPMT1.34 YPMT1.34A     TRUE 0.928 85.000 0.667 NA   NA
 143408 2201169 YPMT1.34A YPMT1.34N     FALSE 0.051 301.000 0.000 NA   NA
 143409 2201170 YPMT1.35c YPMT1.35N     TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 2201170 143410 YPMT1.35N YPMT1.36c     TRUE 0.896 -40.000 0.000 NA   NA
 143410 2201171 YPMT1.36c YPMT1.37c     FALSE 0.161 194.000 0.000 NA   NA
 2201171 143412 YPMT1.37c YPMT1.38c     FALSE 0.239 158.000 0.000 1.000   NA
 143412 143413 YPMT1.38c YPMT1.39c     TRUE 0.670 13.000 0.002 NA   NA
 143413 143414 YPMT1.39c YPMT1.40c     TRUE 0.991 -10.000 0.400 NA   NA
 143414 143415 YPMT1.40c YPMT1.40Ac     TRUE 0.980 9.000 0.400 NA   NA
 143415 143416 YPMT1.40Ac YPMT1.41c     TRUE 0.939 -3.000 0.049 NA   NA
 143418 143419 YPMT1.42Ac YPMT1.43c     FALSE 0.354 76.000 0.000 NA   NA
 143421 143422 YPMT1.45c YPMT1.46c     TRUE 0.997 -3.000 0.667 NA   NA
 143422 143423 YPMT1.46c YPMT1.46Ac     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 143423 143424 YPMT1.46Ac YPMT1.46Bc     TRUE 0.984 41.000 1.000 NA   NA
 143424 143425 YPMT1.46Bc YPMT1.47c     TRUE 0.969 68.000 1.000 NA   NA
 143425 143426 YPMT1.47c YPMT1.48c     TRUE 0.996 -16.000 0.667 NA   NA
 143426 143427 YPMT1.48c YPMT1.49c     TRUE 0.885 154.000 0.667 NA   NA
 143427 143428 YPMT1.49c YPMT1.49Ac     TRUE 0.994 4.000 0.667 NA   NA
 143428 143429 YPMT1.49Ac YPMT1.50c     FALSE 0.227 91.000 0.002 NA   NA
 143429 143430 YPMT1.50c YPMT1.50Ac     TRUE 0.886 3.000 0.000 NA   NA
 143430 143431 YPMT1.50Ac YPMT1.51c     TRUE 0.917 0.000 0.000 NA   NA
 143431 143432 YPMT1.51c YPMT1.52c     FALSE 0.399 61.000 0.033 NA   NA
 143432 143433 YPMT1.52c YPMT1.53c     TRUE 0.952 120.000 1.000 NA   NA
 143435 2201172 YPMT1.55c YPMT1.56c     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 2201172 143436 YPMT1.56c YPMT1.57c     FALSE 0.387 67.000 0.000 NA   NA
 143436 143437 YPMT1.57c YPMT1.58c     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 143437 143438 YPMT1.58c YPMT1.59c     FALSE 0.363 124.000 0.000 0.070 N NA
 143438 143439 YPMT1.59c YPMT1.60c     FALSE 0.361 73.000 0.000 NA   NA
 143439 143440 YPMT1.60c YPMT1.61c     FALSE 0.014 713.000 0.000 NA   NA
 143441 2201174 YPMT1.62c YPMT1.63c     TRUE 0.957 54.000 0.667 NA   NA
 2201174 143443 YPMT1.63c YPMT1.63Ac     TRUE 0.990 11.000 0.667 NA   NA
 143443 143444 YPMT1.63Ac YPMT1.64c     TRUE 0.996 0.000 0.667 NA   NA
 2201175 143445 YPMT1.64N YPMT1.65     FALSE 0.086 246.000 0.000 NA   NA
 143446 143447 YPMT1.66c YPMT1.67c     FALSE 0.033 379.000 0.000 1.000   NA
 143447 143448 YPMT1.67c YPMT1.68c     TRUE 0.996 -3.000 0.667 1.000 N NA
 143449 143450 YPMT1.68A YPMT1.69     TRUE 0.989 0.000 0.300 NA   NA
 143450 143451 YPMT1.69 YPMT1.70     FALSE 0.149 200.000 0.000 NA   NA
 143451 143452 YPMT1.70 YPMT1.71     TRUE 0.696 21.000 0.000 NA   NA
 143454 2201176 YPMT1.73 YPMT1.74     TRUE 0.630 78.000 0.000 0.015   NA
 143457 143458 YPMT1.76 YPMT1.76A     TRUE 0.993 -85.000 0.500 NA   NA
 143460 143461 YPMT1.79c YPMT1.80c     FALSE 0.219 469.000 0.000 0.022 Y NA
 143461 143462 YPMT1.80c YPMT1.81c     FALSE 0.056 349.000 0.000 0.069 N NA
 143463 143464 YPMT1.82 YPMT1.83     TRUE 0.994 25.000 0.667 1.000 Y NA
 143464 143465 YPMT1.83 YPMT1.84     TRUE 0.965 81.000 1.000 NA   NA
 143465 10942830 YPMT1.84 YPMT1.85     FALSE 0.014 685.000 0.000 NA   NA
 143468 143469 YPMT1.86A YPMT1.87     TRUE 0.912 110.000 0.667 NA   NA
 143469 143470 YPMT1.87 YPMT1.88     TRUE 0.920 97.000 0.667 NA   NA
 143470 2201178 YPMT1.88 YPMT1.89     FALSE 0.187 181.000 0.000 NA   NA
 2201178 143371 YPMT1.89 YPMT1.01     FALSE 0.331 89.000 0.000 NA   NA