MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus mutans UA159

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 294836 294837 SMU.01 SMU.02 dnaA dnaN TRUE 0.652 156.000 0.328 1.000 Y 0.096
 294837 294838 SMU.02 SMU.05 dnaN   FALSE 0.079 262.000 0.009 NA   0.340
 294838 294839 SMU.05 SMU.06     FALSE 0.024 164.000 0.064 NA   -0.125
 294839 294840 SMU.06 SMU.07   pth TRUE 0.922 87.000 0.184 1.000 Y 0.650
 294840 294841 SMU.07 SMU.08 pth trcF TRUE 0.993 2.000 0.137 1.000 N 0.824
 294841 294842 SMU.08 SMU.09 trcF   FALSE 0.226 130.000 0.024 1.000 N 0.419
 294842 294843 SMU.09 SMU.10     TRUE 0.970 -13.000 0.053 1.000 N 0.511
 294843 294844 SMU.10 SMU.11     TRUE 0.962 0.000 0.009 NA   0.578
 294844 294845 SMU.11 SMU.12     TRUE 0.901 31.000 0.105 NA   0.571
 294845 294846 SMU.12 SMU.13     TRUE 0.962 -3.000 0.014 1.000 N 0.558
 294846 294847 SMU.13 SMU.14   hprT FALSE 0.156 4.000 0.067 0.068 N -0.419
 294847 294848 SMU.14 SMU.15 hprT ftsH TRUE 0.988 22.000 0.192 1.000 N 0.842
 294848 294849 SMU.15 SMU.16 ftsH   FALSE 0.464 488.000 0.009 1.000 N 0.808
 294849 294850 SMU.16 SMU.18     TRUE 0.890 69.000 0.000 NA   0.899
 294850 2200790 SMU.18 SMUr01     FALSE 0.348 116.000 0.000 NA   NA
 2200790 400883 SMUr01 SMUt01   tRNA-Ala TRUE 0.614 58.000 0.000 NA   NA
 400883 2200791 SMUt01 SMUr02 tRNA-Ala   FALSE 0.173 259.000 0.000 NA   NA
 2200791 2200792 SMUr02 SMUr03     FALSE 0.239 181.000 0.000 NA   NA
 2200792 400884 SMUr03 SMUt02   tRNA-Val TRUE 0.942 1.000 0.000 NA   NA
 400884 400885 SMUt02 SMUt03 tRNA-Val tRNA-Asp TRUE 0.812 30.000 0.000 NA   NA
 400885 400886 SMUt03 SMUt04 tRNA-Asp tRNA-Lys TRUE 0.828 28.000 0.000 NA   NA
 400886 400887 SMUt04 SMUt05 tRNA-Lys tRNA-Leu TRUE 0.914 7.000 0.000 NA   NA
 400887 400888 SMUt05 SMUt06 tRNA-Leu tRNA-Thr TRUE 0.894 15.000 0.000 NA   NA
 400888 400889 SMUt06 SMUt07 tRNA-Thr tRNA-Gly TRUE 0.927 3.000 0.000 NA   NA
 400889 400890 SMUt07 SMUt08 tRNA-Gly tRNA-Leu TRUE 0.911 8.000 0.000 NA   NA
 400890 400891 SMUt08 SMUt09 tRNA-Leu tRNA-Arg TRUE 0.894 14.000 0.000 NA   NA
 400891 400892 SMUt09 SMUt10 tRNA-Arg tRNA-Pro TRUE 0.642 54.000 0.000 NA   NA
 400892 400893 SMUt10 SMUt11 tRNA-Pro tRNA-Met TRUE 0.917 6.000 0.000 NA   NA
 400893 400894 SMUt11 SMUt12 tRNA-Met tRNA-Met TRUE 0.851 24.000 0.000 NA   NA
 400894 400895 SMUt12 SMUt13 tRNA-Met tRNA-Ser TRUE 0.894 15.000 0.000 NA   NA
 400895 400896 SMUt13 SMUt14 tRNA-Ser tRNA-Met TRUE 0.893 13.000 0.000 NA   NA
 400896 400897 SMUt14 SMUt15 tRNA-Met tRNA-Phe TRUE 0.904 10.000 0.000 NA   NA
 400897 400898 SMUt15 SMUt16 tRNA-Phe tRNA-Gly TRUE 0.914 7.000 0.000 NA   NA
 400898 400899 SMUt16 SMUt17 tRNA-Gly tRNA-Ile TRUE 0.784 35.000 0.000 NA   NA
 400899 400900 SMUt17 SMUt18 tRNA-Ile tRNA-Ser TRUE 0.904 10.000 0.000 NA   NA
 400900 294851 SMUt18 SMU.20 tRNA-Ser mreC FALSE 0.454 74.000 0.000 NA   NA
 294851 294852 SMU.20 SMU.21 mreC mreD TRUE 0.998 2.000 0.550 0.004   0.929
 294852 294853 SMU.21 SMU.22 mreD gbpB FALSE 0.514 110.000 0.021 NA   0.621
 294853 294854 SMU.22 SMU.23 gbpB prs FALSE 0.008 125.000 0.107 NA   -0.385
 294854 294855 SMU.23 SMU.24 prs   TRUE 0.943 89.000 0.048 1.000 Y 0.756
 294855 294856 SMU.24 SMU.25   recO TRUE 0.987 -10.000 0.012 1.000 N 0.704
 294856 294857 SMU.25 SMU.26 recO plsX FALSE 0.004 208.000 0.011 1.000 N 0.088
 294857 294858 SMU.26 SMU.27 plsX acpP TRUE 0.960 2.000 0.017 0.009 Y 0.028
 294858 294859 SMU.27 SMU.28 acpP   FALSE 0.012 228.000 0.000 1.000   0.238
 294859 294860 SMU.28 SMU.29     FALSE 0.056 123.000 0.000 1.000   0.296
 294860 294861 SMU.29 SMU.30   purL TRUE 0.998 10.000 0.043 1.000 Y 0.891
 294861 294862 SMU.30 SMU.31 purL   TRUE 0.981 22.000 0.000 1.000 N 0.948
 294862 294863 SMU.31 SMU.32   purF TRUE 0.980 26.000 0.000 1.000 N 0.972
 294863 294864 SMU.32 SMU.33 purF   TRUE 0.724 217.000 0.000 NA   0.961
 294864 294865 SMU.33 SMU.34   purM TRUE 0.958 46.000 0.000 NA   0.957
 294865 294866 SMU.34 SMU.35 purM purN TRUE 0.999 0.000 0.002 0.003 Y 0.981
 294866 294867 SMU.35 SMU.36 purN   TRUE 0.860 107.000 0.000 NA   0.989
 294867 294868 SMU.36 SMU.37   purH TRUE 0.982 27.000 0.000 NA   0.983
 294870 294871 SMU.39 SMU.40     FALSE 0.005 177.000 0.000 NA   -0.032
 294871 294872 SMU.40 SMU.41     TRUE 0.995 -16.000 0.000 NA   0.875
 294872 294873 SMU.41 SMU.42     FALSE 0.049 67.000 0.000 NA   0.235
 294873 294874 SMU.42 SMU.43     FALSE 0.014 72.000 0.000 NA   -0.375
 294874 294875 SMU.43 SMU.44     TRUE 0.949 11.000 0.000 NA   0.701
 294875 294876 SMU.44 SMU.45     TRUE 0.838 187.000 0.182 NA   0.865
 294876 294877 SMU.45 SMU.46     TRUE 0.987 2.000 0.000 NA   0.824
 294877 294878 SMU.46 SMU.47     TRUE 0.993 0.000 0.000 NA   0.890
 294878 294879 SMU.47 SMU.48   purD FALSE 0.454 224.000 0.000 1.000   0.764
 294879 294880 SMU.48 SMU.49 purD   TRUE 0.930 60.000 0.000 1.000 N 0.965
 294880 294881 SMU.49 SMU.50   purE TRUE 0.629 323.000 0.000 1.000 N 0.990
 294881 294882 SMU.50 SMU.51 purE purK TRUE 0.999 -13.000 0.000 0.001 Y 0.978
 294882 294883 SMU.51 SMU.52 purK   TRUE 0.995 0.000 0.000 NA   0.982
 294883 294884 SMU.52 SMU.53     TRUE 0.989 16.000 0.000 NA   0.986
 294884 294885 SMU.53 SMU.54     TRUE 0.994 7.000 0.011 NA   0.983
 294885 294886 SMU.54 SMU.55     TRUE 0.844 102.000 0.000 NA   0.931
 294886 294887 SMU.55 SMU.56     TRUE 0.995 20.000 0.400 NA   0.929
 294887 294888 SMU.56 SMU.58     TRUE 0.858 103.000 0.000 NA   0.964
 294888 294889 SMU.58 SMU.59   purB TRUE 0.663 310.000 0.000 NA   0.960
 294889 294890 SMU.59 SMU.60 purB   TRUE 0.980 20.000 0.000 NA N 0.910
 294890 294891 SMU.60 SMU.61     FALSE 0.039 383.000 0.000 NA   0.362
 294893 294894 SMU.64 SMU.65 ruvB   TRUE 0.945 38.000 0.005 1.000 N 0.818
 294894 294895 SMU.65 SMU.66     TRUE 0.656 65.000 0.019 NA   0.585
 294895 294896 SMU.66 SMU.67     TRUE 0.987 -3.000 0.351 NA   0.535
 294896 294897 SMU.67 SMU.68     FALSE 0.180 266.000 0.000 NA   0.611
 294897 294898 SMU.68 SMU.70   thrC FALSE 0.003 339.000 0.000 NA   -0.292
 294898 294899 SMU.70 SMU.71 thrC   FALSE 0.272 408.000 0.000 1.000 N 0.734
 294899 294900 SMU.71 SMU.72     FALSE 0.035 359.000 0.000 1.000 N 0.411
 294900 294901 SMU.72 SMU.73     TRUE 0.880 20.000 0.569 NA   0.081
 294901 294902 SMU.73 SMU.74     FALSE 0.013 73.000 0.012 NA   -0.122
 294902 294903 SMU.74 SMU.75     TRUE 0.996 -16.000 0.174 1.000 N 0.793
 294903 294904 SMU.75 SMU.76     TRUE 0.991 4.000 0.174 1.000 N 0.796
 294904 294905 SMU.76 SMU.78   fruA FALSE 0.024 615.000 0.000 1.000 N 0.390
 294905 294906 SMU.78 SMU.79 fruA fruB TRUE 0.970 71.000 0.000 0.007 Y 0.930
 294906 294907 SMU.79 SMU.80 fruB hrcA FALSE 0.005 175.000 0.000 1.000 N 0.153
 294907 294908 SMU.80 SMU.81 hrcA grpE TRUE 0.972 43.000 0.051 1.000 N 0.932
 294908 294909 SMU.81 SMU.82 grpE dnaK TRUE 0.907 374.000 0.026 0.007 Y 0.951
 294909 294910 SMU.82 SMU.83 dnaK dnaJ TRUE 0.938 528.000 0.196 0.004 Y 0.976
 294910 294911 SMU.83 SMU.84 dnaJ truA TRUE 0.611 302.000 0.004 1.000 N 0.886
 294911 294912 SMU.84 SMU.85 truA thiD TRUE 0.998 -10.000 0.058 1.000 N 0.941
 294912 294913 SMU.85 SMU.86 thiD   TRUE 0.999 -13.000 0.276 NA   0.955
 294913 294914 SMU.86 SMU.87     TRUE 0.982 45.000 0.149 NA   0.956
 294915 294916 SMU.88c SMU.89c     FALSE 0.017 218.000 0.000 0.086 N 0.359
 294918 294919 SMU.92c SMU.93c     FALSE 0.008 119.000 0.000 NA   0.084
 294919 294920 SMU.93c SMU.94c     FALSE 0.004 201.000 0.000 NA   -0.103
 294921 294922 SMU.96 SMU.97 rpoE pyrG FALSE 0.049 134.000 0.029 1.000 N 0.126
 294922 400901 SMU.97 SMUt19 pyrG tRNA-Leu FALSE 0.134 918.000 0.000 NA   NA
 400901 294923 SMUt19 SMU.99 tRNA-Leu fbaA FALSE 0.279 157.000 0.000 NA   NA
 294923 294924 SMU.99 SMU.100 fbaA   FALSE 0.304 325.000 0.000 1.000 Y 0.350
 294924 294925 SMU.100 SMU.101     TRUE 0.999 13.000 0.917 0.027 Y 0.941
 294925 294926 SMU.101 SMU.102     TRUE 1.000 -10.000 0.917 0.027 Y 0.929
 294926 294927 SMU.102 SMU.103     TRUE 1.000 -3.000 0.667 0.027 Y 0.891
 294927 294928 SMU.103 SMU.104     TRUE 0.999 0.000 0.067 1.000 Y 0.923
 294928 294929 SMU.104 SMU.105     TRUE 0.996 1.000 0.044 1.000 N 0.948
 400902 294931 SMUt20 SMU.107 tRNA-Thr   FALSE 0.139 478.000 0.000 NA   NA
 294931 294932 SMU.107 SMU.108     TRUE 0.991 2.000 0.000 NA   0.874
 294932 294933 SMU.108 SMU.109     FALSE 0.253 165.000 0.000 NA   0.582
 294934 294935 SMU.110 SMU.112c mutR   FALSE 0.038 261.000 0.000 1.000   0.339
 294936 294937 SMU.113 SMU.114     TRUE 0.998 5.000 0.087 1.000 Y 0.869
 294937 294938 SMU.114 SMU.115     TRUE 0.998 15.000 0.217 0.016 Y 0.830
 294938 294939 SMU.115 SMU.116   lacD2 TRUE 0.996 18.000 0.000 1.000 Y 0.869
 294940 294941 SMU.117c SMU.118c     FALSE 0.038 615.000 0.000 NA   0.374
 294941 294942 SMU.118c SMU.119   adh TRUE 0.992 11.000 0.057 1.000   0.888
 294945 294946 SMU.123 SMU.124     FALSE 0.004 203.000 0.020 1.000 N -0.107
 294946 294947 SMU.124 SMU.125     TRUE 0.938 79.000 0.414 1.000   0.837
 294947 294948 SMU.125 SMU.127   adhA FALSE 0.003 376.000 0.000 1.000   -0.188
 294948 294949 SMU.127 SMU.128 adhA adhB TRUE 0.978 132.000 0.769 0.003 Y 0.843
 294949 294950 SMU.128 SMU.129 adhB adhC TRUE 0.955 100.000 0.000 0.071 Y 0.936
 294950 294951 SMU.129 SMU.130 adhC adhD TRUE 0.963 74.000 0.000 1.000 Y 0.881
 294951 294952 SMU.130 SMU.131 adhD lplA TRUE 0.905 106.000 0.200 1.000 N 0.893
 294952 294953 SMU.131 SMU.132 lplA   TRUE 0.597 265.000 0.000 1.000   0.871
 294956 294957 SMU.135 SMU.136c mleR   FALSE 0.070 190.000 0.429 1.000   -0.449
 294958 294959 SMU.137 SMU.138 mleS   TRUE 0.923 156.000 0.302 1.000   0.959
 294959 294960 SMU.138 SMU.139     TRUE 0.844 121.000 0.000 1.000   0.962
 294960 294961 SMU.139 SMU.140     TRUE 0.866 84.000 0.000 1.000 N 0.967
 294961 294962 SMU.140 SMU.141     TRUE 0.994 2.000 0.000 NA   0.979
 294963 294964 SMU.143c SMU.144c     TRUE 0.866 75.000 0.034 1.000 N 0.831
 294965 294966 SMU.145 SMU.148   adhE FALSE 0.004 200.000 0.000 1.000 N -0.702
 294966 294967 SMU.148 SMU.149 adhE   TRUE 0.617 210.000 0.000 1.000 N 0.875
 294967 294968 SMU.149 SMU.150     FALSE 0.123 512.000 0.000 NA   0.572
 294968 294969 SMU.150 SMU.151     TRUE 0.991 9.000 0.000 NA   0.981
 294969 294970 SMU.151 SMU.152     TRUE 0.754 195.000 0.000 NA   0.969
 294970 294971 SMU.152 SMU.153     FALSE 0.511 493.000 0.000 NA   0.849
 294971 294972 SMU.153 SMU.154     FALSE 0.015 743.000 0.000 NA   0.279
 294972 294973 SMU.154 SMU.155   pnpA TRUE 0.736 747.000 0.335 1.000 Y 0.613
 294973 294974 SMU.155 SMU.156 pnpA   TRUE 0.997 -10.000 0.009 NA   0.940
 294974 294975 SMU.156 SMU.157   cysE TRUE 0.997 -40.000 0.097 NA   0.821
 294975 294976 SMU.157 SMU.158 cysE cysS TRUE 0.904 74.000 0.035 0.065 N 0.913
 294976 294977 SMU.158 SMU.159 cysS   TRUE 0.994 -7.000 0.129 1.000   0.722
 294977 294978 SMU.159 SMU.160     FALSE 0.005 179.000 0.000 1.000   -0.523
 294978 294979 SMU.160 SMU.161     TRUE 0.997 -21.000 0.080 1.000 N 0.894
 294980 294981 SMU.162c SMU.163c     FALSE 0.409 189.000 0.000 NA   0.710
 294982 294983 SMU.164 SMU.165     TRUE 0.963 24.000 0.002 NA   0.769
 294983 294984 SMU.165 SMU.166     FALSE 0.007 132.000 0.000 NA   -0.375
 294984 294985 SMU.166 SMU.167     TRUE 0.995 0.000 0.000 NA   0.970
 294985 294986 SMU.167 SMU.168     TRUE 0.998 -3.000 0.051 NA   0.959
 294986 294987 SMU.168 SMU.169     FALSE 0.003 393.000 0.000 1.000 N -0.691
 294987 294988 SMU.169 SMU.170     TRUE 0.999 25.000 0.601 0.028 Y 0.931
 294988 294989 SMU.170 SMU.172     FALSE 0.003 322.000 0.000 NA   -0.548
 294989 294990 SMU.172 SMU.173     TRUE 0.997 -6.000 0.429 NA   0.755
 294992 294993 SMU.175 SMU.176     TRUE 0.630 88.000 0.000 NA   0.722
 294993 294994 SMU.176 SMU.177     FALSE 0.006 164.000 0.000 NA   0.060
 294994 294995 SMU.177 SMU.178     TRUE 0.995 -22.000 0.714 NA   0.667
 294995 294996 SMU.178 SMU.179     FALSE 0.007 142.000 0.000 NA   0.096
 294996 294997 SMU.179 SMU.180   ilvC TRUE 0.998 2.000 0.312 NA   0.940
 294997 294998 SMU.180 SMU.181 ilvC   FALSE 0.368 206.000 0.000 1.000 N 0.732
 294998 294999 SMU.181 SMU.182   sloA FALSE 0.067 222.000 0.000 1.000 N 0.451
 294999 295000 SMU.182 SMU.183 sloA sloB TRUE 0.999 -3.000 0.000 1.000 Y 0.908
 295000 295001 SMU.183 SMU.184 sloB sloC TRUE 0.988 47.000 0.000 1.000 Y 0.944
 295001 295002 SMU.184 SMU.185 sloC   TRUE 0.997 -16.000 0.000 NA   0.968
 295002 295003 SMU.185 SMU.186   sloR TRUE 0.927 64.000 0.000 NA   0.954
 295004 295005 SMU.187c SMU.188c     TRUE 0.988 -13.000 0.034 1.000 N 0.698
 295006 2200793 SMU.189 SMUr04     FALSE 0.348 116.000 0.000 NA   NA
 2200793 400903 SMUr04 SMUt21   tRNA-Ala TRUE 0.614 58.000 0.000 NA   NA
 400903 2200794 SMUt21 SMUr05 tRNA-Ala   FALSE 0.173 259.000 0.000 NA   NA
 2200794 2200795 SMUr05 SMUr06     FALSE 0.239 181.000 0.000 NA   NA
 2200795 400904 SMUr06 SMUt22   tRNA-Val TRUE 0.942 1.000 0.000 NA   NA
 400904 400905 SMUt22 SMUt23 tRNA-Val tRNA-Gly TRUE 0.917 6.000 0.000 NA   NA
 400905 400906 SMUt23 SMUt24 tRNA-Gly tRNA-Ile TRUE 0.784 35.000 0.000 NA   NA
 400906 400907 SMUt24 SMUt25 tRNA-Ile tRNA-Glu TRUE 0.894 12.000 0.000 NA   NA
 400907 400908 SMUt25 SMUt26 tRNA-Glu tRNA-Ser TRUE 0.894 15.000 0.000 NA   NA
 400908 400909 SMUt26 SMUt27 tRNA-Ser tRNA-Met TRUE 0.893 13.000 0.000 NA   NA
 400909 400910 SMUt27 SMUt28 tRNA-Met tRNA-Phe TRUE 0.904 10.000 0.000 NA   NA
 400910 400911 SMUt28 SMUt29 tRNA-Phe tRNA-Tyr TRUE 0.893 13.000 0.000 NA   NA
 400911 400912 SMUt29 SMUt30 tRNA-Tyr tRNA-Trp TRUE 0.914 7.000 0.000 NA   NA
 400912 400913 SMUt30 SMUt31 tRNA-Trp tRNA-His TRUE 0.894 14.000 0.000 NA   NA
 400913 400914 SMUt31 SMUt32 tRNA-His tRNA-Gln TRUE 0.888 17.000 0.000 NA   NA
 400914 400915 SMUt32 SMUt33 tRNA-Gln tRNA-Leu TRUE 0.894 15.000 0.000 NA   NA
 295007 295008 SMU.191c SMU.193c     TRUE 0.977 7.000 0.571 NA   0.542
 295008 295009 SMU.193c SMU.194c     TRUE 0.988 4.000 0.000 NA   0.866
 295009 295010 SMU.194c SMU.195c     TRUE 0.974 36.000 0.000 NA   0.981
 295010 295011 SMU.195c SMU.196c     TRUE 0.988 18.000 0.000 NA   0.984
 295011 295012 SMU.196c SMU.197c     TRUE 0.985 22.000 0.000 NA   0.973
 295012 295013 SMU.197c SMU.198c     TRUE 0.998 0.000 0.182 NA   0.984
 295013 295014 SMU.198c SMU.199c     TRUE 0.994 20.000 0.182 NA   0.972
 295014 295015 SMU.199c SMU.200c     TRUE 0.979 29.000 0.000 NA   0.948
 295015 295016 SMU.200c SMU.201c     TRUE 0.989 13.000 0.000 NA   0.972
 295016 295017 SMU.201c SMU.202c     TRUE 0.989 16.000 0.000 NA   0.970
 295017 295018 SMU.202c SMU.204c     TRUE 0.848 123.000 0.000 NA   0.983
 295018 295019 SMU.204c SMU.205c     TRUE 0.934 63.000 0.000 NA   0.979
 295019 295020 SMU.205c SMU.206c     TRUE 0.830 103.000 0.000 NA   0.910
 295020 295021 SMU.206c SMU.207c     TRUE 0.996 -37.000 0.000 NA   0.937
 295021 295022 SMU.207c SMU.208c     TRUE 0.713 235.000 0.000 1.000   0.971
 295022 295023 SMU.208c SMU.209c     TRUE 0.998 16.000 1.000 NA   0.988
 295023 295024 SMU.209c SMU.210c     TRUE 0.984 24.000 0.000 NA   0.973
 295024 295025 SMU.210c SMU.211c     TRUE 0.721 220.000 0.000 NA   0.962
 295025 295026 SMU.211c SMU.212c     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   0.659
 295026 295027 SMU.212c SMU.213c     TRUE 0.951 23.000 0.000 NA   0.753
 295027 295028 SMU.213c SMU.214c     FALSE 0.567 28.000 0.000 NA   0.386
 295028 295029 SMU.214c SMU.215c     TRUE 0.907 9.000 0.000 NA   0.593
 295029 295030 SMU.215c SMU.216c     FALSE 0.450 80.000 0.000 NA   0.614
 295030 295031 SMU.216c SMU.217c     FALSE 0.238 120.000 0.000 NA   0.506
 295032 295033 SMU.218 SMU.219     TRUE 0.968 7.000 0.000 1.000   0.739
 295034 295035 SMU.220c SMU.221c     FALSE 0.181 346.000 0.000 NA   0.636
 295035 295036 SMU.221c SMU.222c     FALSE 0.047 397.000 0.000 NA   0.392
 295036 295037 SMU.222c SMU.223c     FALSE 0.451 51.000 0.000 NA   0.447
 295037 295038 SMU.223c SMU.224c     FALSE 0.399 50.000 0.000 NA   0.410
 295038 295039 SMU.224c SMU.225c     TRUE 0.919 -19.000 0.000 NA   0.432
 295039 295040 SMU.225c SMU.226c     FALSE 0.361 95.000 0.000 NA   0.580
 295040 295041 SMU.226c SMU.227c     FALSE 0.157 749.000 0.000 1.000   0.628
 295042 295043 SMU.228 SMU.229     TRUE 0.997 0.000 0.567 NA   0.806
 295043 295044 SMU.229 SMU.231   ilvB FALSE 0.006 166.000 0.004 1.000   -0.424
 295044 295045 SMU.231 SMU.232 ilvB ilvH TRUE 0.999 -7.000 0.249 0.002 Y 0.797
 295045 295046 SMU.232 SMU.233 ilvH ilvC TRUE 0.967 67.000 0.130 0.003 Y 0.753
 295046 295047 SMU.233 SMU.234 ilvC ilvA FALSE 0.339 241.000 0.033 1.000 Y 0.082
 295047 295048 SMU.234 SMU.235 ilvA   TRUE 0.900 55.000 0.017 1.000 N 0.788
 295049 295050 SMU.236c SMU.237c     TRUE 0.855 26.000 0.085 1.000   0.411
 295050 295051 SMU.237c SMU.238c     TRUE 0.992 -3.000 0.713 1.000 N 0.621
 295051 295052 SMU.238c SMU.239c     FALSE 0.004 196.000 0.000 NA   0.025
 295052 295053 SMU.239c SMU.241c     FALSE 0.090 303.000 0.000 NA   0.479
 295053 295054 SMU.241c SMU.242c     TRUE 0.999 0.000 0.758 1.000 Y 0.772
 295055 295056 SMU.243 SMU.244   bacA TRUE 0.952 58.000 0.118 NA   0.836
 295056 295057 SMU.244 SMU.245 bacA mecA FALSE 0.102 90.000 0.132 NA N -0.001
 295057 295058 SMU.245 SMU.246 mecA rgpG TRUE 0.975 6.000 0.267 NA N 0.637
 295058 295059 SMU.246 SMU.247 rgpG   FALSE 0.020 74.000 0.013 1.000 N 0.121
 295059 295060 SMU.247 SMU.248     TRUE 0.991 38.000 0.139 1.000 Y 0.776
 295060 295061 SMU.248 SMU.249   nifS TRUE 0.989 5.000 0.606 1.000 N 0.703
 295061 295062 SMU.249 SMU.250 nifS nifU TRUE 0.996 -13.000 0.292 1.000 N 0.752
 295062 295063 SMU.250 SMU.251 nifU   TRUE 0.976 21.000 0.152 0.003 N 0.761
 295063 295064 SMU.251 SMU.252     FALSE 0.003 292.000 0.000 NA   -0.093
 295066 295067 SMU.255 SMU.256 oppA oppB TRUE 0.630 106.000 0.000 0.040 Y 0.451
 295067 295068 SMU.256 SMU.257 oppB oppC TRUE 0.982 11.000 0.134 0.040   0.739
 295068 295069 SMU.257 SMU.258 oppC oppD TRUE 0.986 10.000 0.286 1.000   0.721
 295069 295070 SMU.258 SMU.259 oppD oppF TRUE 0.995 -7.000 0.619 0.001 Y 0.230
 295070 295071 SMU.259 SMU.260 oppF   FALSE 0.002 656.000 0.000 1.000   -0.230
 295073 295074 SMU.262 SMU.263 otcA   TRUE 0.897 98.000 0.028 1.000 Y 0.697
 295074 295075 SMU.263 SMU.264     TRUE 0.992 10.000 0.147 1.000 Y 0.612
 295075 295076 SMU.264 SMU.265   arcC TRUE 0.943 32.000 0.000 1.000 Y 0.526
 295078 295079 SMU.268 SMU.270 purA sgaT FALSE 0.003 332.000 0.000 1.000   0.174
 295079 295080 SMU.270 SMU.271 sgaT ptxB FALSE 0.311 68.000 0.431 0.026   -0.141
 295080 295081 SMU.271 SMU.272 ptxB ptxA TRUE 0.983 66.000 0.279 0.015 Y 0.806
 295081 295082 SMU.272 SMU.273 ptxA   TRUE 0.985 39.000 0.328 1.000 Y 0.652
 295082 295083 SMU.273 SMU.274     TRUE 0.999 6.000 0.536 1.000 Y 0.856
 295083 295084 SMU.274 SMU.275     TRUE 0.999 3.000 0.700 1.000 Y 0.812
 295086 295087 SMU.277 SMU.278     TRUE 0.599 244.000 0.000 NA   0.858
 295087 295088 SMU.278 SMU.279     FALSE 0.138 485.000 0.000 NA   0.597
 295088 295089 SMU.279 SMU.281     TRUE 0.661 238.000 0.000 NA   0.910
 295089 295090 SMU.281 SMU.283     FALSE 0.531 1075.000 0.000 NA   0.873
 295090 295091 SMU.283 SMU.284     TRUE 0.959 25.000 0.000 NA   0.792
 295091 295092 SMU.284 SMU.285     FALSE 0.565 50.000 0.000 NA   0.527
 295092 295093 SMU.285 SMU.286     FALSE 0.003 429.000 0.000 NA   0.069
 295093 295094 SMU.286 SMU.287     TRUE 0.811 14.000 0.000 NA   0.471
 295094 295095 SMU.287 SMU.289     FALSE 0.027 357.000 0.000 NA   0.321
 295095 295096 SMU.289 SMU.290     FALSE 0.506 579.000 0.231 NA   0.705
 295096 295097 SMU.290 SMU.291   tkt FALSE 0.053 374.000 0.000 NA   0.403
 295097 295098 SMU.291 SMU.292 tkt   FALSE 0.126 527.000 0.000 1.000 N 0.623
 295098 295099 SMU.292 SMU.293     FALSE 0.370 131.000 0.000 NA   0.635
 295099 295100 SMU.293 SMU.294     FALSE 0.040 42.000 0.000 NA   -0.267
 295100 295101 SMU.294 SMU.295     TRUE 0.995 0.000 0.000 NA   0.946
 295101 295102 SMU.295 SMU.296     TRUE 0.988 18.000 0.000 NA   0.970
 295102 295103 SMU.296 SMU.297   polI FALSE 0.006 159.000 0.000 NA N 0.118
 295103 295104 SMU.297 SMU.298 polI   FALSE 0.434 93.000 0.005 NA   0.568
 295106 295107 SMU.300 SMU.301 tgt   TRUE 0.994 0.000 0.000 NA   0.891
 295107 295108 SMU.301 SMU.302     FALSE 0.458 427.000 0.000 NA   0.817
 295108 295109 SMU.302 SMU.303     FALSE 0.012 77.000 0.000 NA   0.057
 295109 295110 SMU.303 SMU.304     TRUE 0.970 0.000 0.013 0.022   0.635
 295110 295111 SMU.304 SMU.305     TRUE 0.978 -3.000 0.000 NA   0.681
 295111 295112 SMU.305 SMU.307   pgi FALSE 0.002 557.000 0.000 NA   0.177
 295112 295113 SMU.307 SMU.308 pgi   FALSE 0.021 166.000 0.005 1.000 N 0.221
 295113 295114 SMU.308 SMU.309     TRUE 0.982 22.000 0.357 1.000 N 0.752
 295114 295115 SMU.309 SMU.310     TRUE 0.996 0.000 0.070 NA Y 0.649
 295115 295116 SMU.310 SMU.311     TRUE 0.771 80.000 0.239 NA N 0.679
 295116 295117 SMU.311 SMU.312     TRUE 0.929 91.000 0.116 0.017 Y 0.716
 295117 295118 SMU.312 SMU.313     TRUE 0.995 42.000 0.600 0.017 Y 0.836
 295118 295119 SMU.313 SMU.314     FALSE 0.103 251.000 0.000 NA   0.483
 295119 295120 SMU.314 SMU.317     FALSE 0.004 223.000 0.000 NA   -0.008
 295120 295121 SMU.317 SMU.318     FALSE 0.505 757.000 0.372 1.000   0.682
 295121 295122 SMU.318 SMU.320     FALSE 0.003 334.000 0.006 1.000   -0.425
 295122 295123 SMU.320 SMU.321     TRUE 0.997 -13.000 0.037 1.000   0.880
 295124 295125 SMU.322c SMU.323   gpsA TRUE 0.995 2.000 0.032 1.000 N 0.940
 295126 295127 SMU.325 SMU.326     TRUE 0.985 10.000 0.002 1.000 N 0.859
 295127 295128 SMU.326 SMU.327     TRUE 0.994 -42.000 0.002 1.000 N 0.826
 295128 295129 SMU.327 SMU.328     FALSE 0.011 84.000 0.009 1.000 N -0.479
 295129 295130 SMU.328 SMU.329     TRUE 0.788 189.000 0.278 NA   0.793
 295130 295131 SMU.329 SMU.330   gltX FALSE 0.257 287.000 0.008 NA   0.636
 295131 295132 SMU.330 SMU.331 gltX   FALSE 0.332 116.000 0.000 1.000   0.584
 295132 295133 SMU.331 SMU.332     TRUE 0.873 67.000 0.107 NA   0.741
 295133 295134 SMU.332 SMU.333     FALSE 0.070 149.000 0.000 NA   0.335
 295134 295135 SMU.333 SMU.334     FALSE 0.004 197.000 0.000 NA   -0.081
 295135 295136 SMU.334 SMU.335     TRUE 0.660 343.000 0.278 1.000 Y 0.488
 295136 295137 SMU.335 SMU.336   rnpA FALSE 0.084 95.000 0.005 1.000 N 0.289
 295137 295138 SMU.336 SMU.337 rnpA   TRUE 0.995 -16.000 0.052 1.000 N 0.799
 295138 295139 SMU.337 SMU.338     TRUE 0.987 13.000 0.106 1.000   0.794
 295139 295140 SMU.338 SMU.339     FALSE 0.095 110.000 0.000 NA   0.339
 295140 295141 SMU.339 SMU.340     FALSE 0.004 223.000 0.000 NA   0.084
 295141 295142 SMU.340 SMU.341     FALSE 0.297 178.000 0.002 NA   0.595
 295142 295143 SMU.341 SMU.342     TRUE 0.570 168.000 0.058 NA Y 0.264
 295143 295144 SMU.342 SMU.343     FALSE 0.106 277.000 0.000 1.000 N 0.554
 295144 295145 SMU.343 SMU.344     TRUE 0.648 101.000 0.000 NA   0.750
 295147 295148 SMU.346 SMU.348     FALSE 0.078 100.000 0.000 1.000 N 0.386
 295148 295149 SMU.348 SMU.349     TRUE 0.928 12.000 0.002 1.000 N 0.656
 295149 295150 SMU.349 SMU.350     TRUE 0.950 10.000 0.003 NA   0.662
 400947 400946 SMUt34 SMUt35 tRNA-Ser tRNA-Leu FALSE 0.271 163.000 0.000 NA   NA
 295151 295152 SMU.351 SMU.352     TRUE 0.982 8.000 0.213 1.000   0.687
 295152 295153 SMU.352 SMU.353     TRUE 0.994 -7.000 0.166 1.000 N 0.739
 295153 295154 SMU.353 SMU.354     TRUE 0.987 7.000 0.030 NA   0.797
 295154 295155 SMU.354 SMU.355     TRUE 0.997 -10.000 0.030 NA   0.853
 295155 295156 SMU.355 SMU.356   purR FALSE 0.302 68.000 0.052 1.000   0.210
 295156 295157 SMU.356 SMU.357 purR   FALSE 0.003 260.000 0.000 1.000 N -0.702
 295157 295158 SMU.357 SMU.358     TRUE 0.998 18.000 0.224 0.005 Y 0.840
 295158 295159 SMU.358 SMU.359     TRUE 0.950 169.000 0.579 1.000 Y 0.758
 295159 295160 SMU.359 SMU.360   gapC FALSE 0.003 295.000 0.000 1.000 N -0.296
 295160 295161 SMU.360 SMU.361 gapC pgk FALSE 0.370 406.000 0.000 0.006 Y 0.505
 295161 295162 SMU.361 SMU.362 pgk   FALSE 0.034 387.000 0.002 NA   0.260
 295162 295163 SMU.362 SMU.363   glnR TRUE 0.822 82.000 0.154 NA   0.723
 295163 295164 SMU.363 SMU.364 glnR glnA TRUE 0.981 40.000 0.179 1.000 N 0.919
 295164 295165 SMU.364 SMU.365 glnA gltA TRUE 0.901 160.000 0.017 1.000 Y 0.774
 295165 295166 SMU.365 SMU.366 gltA gltB TRUE 0.999 2.000 0.222 0.001 Y 0.897
 295166 295167 SMU.366 SMU.367 gltB   TRUE 0.726 148.000 0.005 1.000   0.816
 295168 295169 SMU.368c SMU.369c     TRUE 0.983 2.000 0.576 NA   0.537
 295170 295171 SMU.370 SMU.371     TRUE 0.993 -7.000 0.500 NA   0.615
 295171 295172 SMU.371 SMU.372     TRUE 0.641 45.000 0.000 NA   0.547
 295172 295173 SMU.372 SMU.373     TRUE 0.991 -7.000 1.000 NA   0.430
 295173 295174 SMU.373 SMU.374     TRUE 0.941 -13.000 0.000 NA   0.487
 295174 295175 SMU.374 SMU.375     TRUE 0.977 11.000 0.000 NA   0.809
 295175 295176 SMU.375 SMU.376     TRUE 0.980 16.000 0.000 NA   0.832
 295176 295177 SMU.376 SMU.378     FALSE 0.089 195.000 0.000 NA   0.412
 295177 295178 SMU.378 SMU.379     TRUE 0.977 -22.000 0.000 NA   0.658
 295179 295180 SMU.381c SMU.382c     FALSE 0.003 375.000 0.000 1.000   0.143
 295180 295181 SMU.382c SMU.383c     FALSE 0.385 135.000 0.000 0.027 N 0.688
 295182 295183 SMU.384 SMU.385     TRUE 0.989 11.000 0.002 1.000 N 0.936
 295183 295184 SMU.385 SMU.386     TRUE 0.997 0.000 0.209 1.000   0.864
 295184 295185 SMU.386 SMU.387     TRUE 0.974 15.000 0.030 1.000   0.733
 295185 295186 SMU.387 SMU.388     FALSE 0.298 79.000 0.004 NA N 0.469
 295186 295187 SMU.388 SMU.389     TRUE 0.995 -10.000 0.338 NA   0.705
 295187 295188 SMU.389 SMU.390     TRUE 0.971 -117.000 0.000 NA   0.632
 295189 295190 SMU.391c SMU.392c     FALSE 0.115 98.000 0.000 NA   0.357
 295192 295193 SMU.394c SMU.395   pepX FALSE 0.065 259.000 0.000 NA   0.408
 295194 295195 SMU.396 SMU.399 glpF   FALSE 0.005 172.000 0.031 NA   -0.111
 295195 295196 SMU.399 SMU.400     TRUE 0.998 -3.000 0.326 NA   0.834
 295197 295198 SMU.401c SMU.402   pfl FALSE 0.137 162.000 0.154 1.000   0.039
 295200 295201 SMU.404c SMU.405c     TRUE 0.975 13.000 0.000 NA   0.803
 295201 295202 SMU.405c SMU.406c     FALSE 0.008 115.000 0.000 1.000   -0.571
 295203 295204 SMU.407 SMU.408     FALSE 0.378 70.000 0.068 NA   0.293
 295204 295205 SMU.408 SMU.409     FALSE 0.007 129.000 0.008 NA   -0.039
 295205 295206 SMU.409 SMU.410   brpA TRUE 0.595 331.000 0.000 NA   0.895
 295207 295208 SMU.411c SMU.412c     TRUE 0.992 -3.000 0.063 NA   0.733
 295209 295210 SMU.413 SMU.414     TRUE 0.994 3.000 0.167 NA N 0.857
 295210 295211 SMU.414 SMU.415     TRUE 0.855 59.000 0.107 NA N 0.700
 295211 295212 SMU.415 SMU.416     TRUE 0.965 10.000 0.154 NA   0.599
 295212 400916 SMU.416 SMUt36   tRNA-Ser FALSE 0.432 79.000 0.000 NA   NA
 400916 295213 SMUt36 SMU.417 tRNA-Ser   FALSE 0.355 107.000 0.000 NA   NA
 295213 295214 SMU.417 SMU.418   nusA TRUE 0.990 36.000 0.759 NA   0.868
 295214 295215 SMU.418 SMU.419 nusA   TRUE 0.995 18.000 0.323 NA Y 0.693
 295215 295216 SMU.419 SMU.420     TRUE 0.991 -7.000 0.408 NA N 0.635
 295216 295217 SMU.420 SMU.421     TRUE 0.964 21.000 0.223 NA Y 0.105
 295217 295218 SMU.421 SMU.422     TRUE 0.574 234.000 0.530 1.000 Y 0.108
 295218 295219 SMU.422 SMU.423     FALSE 0.003 485.000 0.000 NA   -0.299
 295219 295220 SMU.423 SMU.424   copY FALSE 0.342 391.000 0.000 NA   0.746
 295220 295221 SMU.424 SMU.426 copY copA TRUE 0.998 -3.000 0.064 1.000 N 0.972
 295221 295222 SMU.426 SMU.427 copA copZ TRUE 0.998 13.000 0.048 0.003 Y 0.970
 295222 295223 SMU.427 SMU.428 copZ   FALSE 0.531 241.000 0.000 1.000   0.815
 295225 295226 SMU.431 SMU.432     TRUE 0.999 1.000 0.849 NA   0.928
 295226 295227 SMU.432 SMU.433     FALSE 0.470 14.000 0.078 NA   -0.105
 295227 295228 SMU.433 SMU.434     TRUE 0.973 14.000 0.143 NA   0.677
 295228 295229 SMU.434 SMU.435     FALSE 0.003 322.000 0.000 NA   -0.100
 295230 10942651 SMU.436c SMU.437c     TRUE 0.964 -6.000 0.000 NA   NA
 10942651 295231 SMU.437c SMU.438c     FALSE 0.303 140.000 0.000 NA   NA
 295232 295233 SMU.439 SMU.440     FALSE 0.481 117.000 0.000 NA   0.678
 295233 295234 SMU.440 SMU.441     TRUE 0.999 -3.000 0.278 NA   0.965
 295234 295235 SMU.441 SMU.442     TRUE 0.998 -7.000 0.070 NA   0.961
 295235 295236 SMU.442 SMU.444     FALSE 0.199 199.000 0.000 NA   0.577
 295236 295237 SMU.444 SMU.445   sygA FALSE 0.365 145.000 0.000 NA   0.646
 295237 295238 SMU.445 SMU.446 sygA sygB TRUE 0.999 3.000 0.651 0.001 Y 0.793
 295238 295239 SMU.446 SMU.447 sygB   FALSE 0.525 106.000 0.020 NA   0.628
 295239 295240 SMU.447 SMU.448     FALSE 0.179 124.000 0.029 NA   0.267
 295240 295241 SMU.448 SMU.449   proB FALSE 0.047 489.000 0.000 1.000   0.396
 295241 295242 SMU.449 SMU.450 proB proA TRUE 0.995 4.000 0.281 0.003 Y 0.646
 295242 295243 SMU.450 SMU.451 proA   FALSE 0.022 112.000 0.000 NA   0.230
 295243 295244 SMU.451 SMU.453     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   0.448
 295244 295245 SMU.453 SMU.454   ftsL TRUE 0.958 10.000 0.077 1.000 N 0.645
 295245 295246 SMU.454 SMU.455 ftsL pbp2x TRUE 0.996 4.000 0.456 1.000 N 0.879
 295246 295247 SMU.455 SMU.456 pbp2x mraY TRUE 0.997 2.000 0.038 1.000 Y 0.741
 295247 295248 SMU.456 SMU.457 mraY   FALSE 0.520 94.000 0.000 NA   0.677
 295248 295249 SMU.457 SMU.458     FALSE 0.008 120.000 0.000 NA   -0.213
 295249 295250 SMU.458 SMU.459     FALSE 0.003 241.000 0.036 1.000 N -0.102
 295250 295251 SMU.459 SMU.460     TRUE 0.994 23.000 0.143 0.038 Y 0.749
 295251 295252 SMU.460 SMU.461     TRUE 0.999 0.000 0.310 1.000 Y 0.759
 295252 295253 SMU.461 SMU.462     TRUE 0.661 49.000 0.364 NA   0.132
 295253 295254 SMU.462 SMU.463   trxB TRUE 0.833 63.000 0.117 NA   0.670
 295254 295255 SMU.463 SMU.464 trxB   FALSE 0.089 464.000 0.017 1.000 N 0.433
 295255 295256 SMU.464 SMU.465   nadE TRUE 0.984 -3.000 0.194 0.003 Y -0.064
 295256 295257 SMU.465 SMU.466 nadE pepC FALSE 0.008 113.000 0.017 1.000 N -0.276
 295258 295259 SMU.467 SMU.469 pbp1a recU TRUE 0.595 101.000 0.319 1.000   0.487
 295260 295261 SMU.470 SMU.471     FALSE 0.490 106.000 0.579 NA   0.270
 295261 295262 SMU.471 SMU.472     FALSE 0.006 450.000 0.000 NA   0.225
 295262 295263 SMU.472 SMU.473     TRUE 0.819 91.000 0.029 NA   0.795
 295265 295266 SMU.475 SMU.478   kguA FALSE 0.069 447.000 0.010 1.000   0.357
 295266 295267 SMU.478 SMU.479 kguA rpoZ TRUE 0.944 24.000 0.471 1.000 N 0.536
 295267 295268 SMU.479 SMU.480 rpoZ priA FALSE 0.508 42.000 0.032 0.063 N 0.341
 295268 295269 SMU.480 SMU.481 priA   FALSE 0.075 48.000 0.052 1.000 N 0.006
 295269 295270 SMU.481 SMU.482   sunL TRUE 0.997 -10.000 0.305 1.000 Y 0.496
 295270 295271 SMU.482 SMU.483 sunL   TRUE 0.746 39.000 0.074 1.000 N 0.450
 295271 295272 SMU.483 SMU.484   pknB TRUE 0.999 -3.000 0.704 1.000 Y 0.670
 295272 295273 SMU.484 SMU.485 pknB   FALSE 0.037 318.000 0.039 NA   0.092
 295273 295274 SMU.485 SMU.486     TRUE 0.972 -3.000 0.679 NA   0.139
 295274 295275 SMU.486 SMU.487     TRUE 0.997 -13.000 0.853 0.014 Y 0.391
 295275 295276 SMU.487 SMU.488     TRUE 0.675 44.000 0.164 1.000   0.250
 295276 295277 SMU.488 SMU.489     TRUE 0.976 -22.000 0.151 1.000   0.417
 295279 295280 SMU.491 SMU.493   pfl2 FALSE 0.003 249.000 0.083 1.000 N -0.135
 295280 295281 SMU.493 SMU.494 pfl2   TRUE 0.995 19.000 0.368 1.000 N 0.943
 295281 295282 SMU.494 SMU.495   gldA TRUE 0.984 35.000 0.211 1.000 N 0.883
 295283 295284 SMU.496 SMU.497c cysK   FALSE 0.010 91.000 0.033 1.000   -0.114
 295285 295286 SMU.498 SMU.499 comF   TRUE 0.998 -3.000 0.130 1.000   0.891
 295286 295287 SMU.499 SMU.500     TRUE 0.578 79.000 0.080 NA   0.541
 295287 295288 SMU.500 SMU.501     FALSE 0.008 124.000 0.000 NA   0.162
 295288 295289 SMU.501 SMU.502     TRUE 0.910 20.000 0.000 NA   0.657
 295291 295292 SMU.504 SMU.505 dam   TRUE 0.995 -10.000 0.058 0.003 Y 0.544
 295292 295293 SMU.505 SMU.506     TRUE 0.999 -16.000 0.347 0.063   0.944
 295293 295294 SMU.506 SMU.507     FALSE 0.002 524.000 0.000 1.000   0.167
 295294 295295 SMU.507 SMU.508     TRUE 0.977 12.000 0.000 1.000   0.812
 295295 295296 SMU.508 SMU.509     FALSE 0.015 69.000 0.000 NA   0.148
 295297 295298 SMU.510c SMU.512c     FALSE 0.008 128.000 0.000 NA   -0.321
 295299 295300 SMU.513 SMU.514     FALSE 0.389 221.000 0.000 NA   0.728
 295300 295301 SMU.514 SMU.515     FALSE 0.008 121.000 0.000 1.000   -0.379
 295301 295302 SMU.515 SMU.516     FALSE 0.002 584.000 0.000 1.000   -0.684
 295302 295303 SMU.516 SMU.517     TRUE 0.999 -10.000 0.367 1.000 N 0.944
 295303 295304 SMU.517 SMU.518     TRUE 0.998 -22.000 0.052 1.000 N 0.947
 295304 295305 SMU.518 SMU.520     FALSE 0.013 73.000 0.023 1.000 N 0.037
 295305 295306 SMU.520 SMU.521     TRUE 0.943 -3.000 0.347 NA   0.009
 295306 295307 SMU.521 SMU.522     TRUE 0.997 -3.000 0.016 NA   0.946
 295307 295308 SMU.522 SMU.523     TRUE 0.995 0.000 0.012 NA   0.905
 295308 295309 SMU.523 SMU.524     TRUE 0.859 139.000 0.045 NA Y 0.677
 295309 295310 SMU.524 SMU.525     TRUE 1.000 -10.000 0.911 0.012 Y 0.856
 295316 295317 SMU.531 SMU.532   trpE TRUE 0.998 9.000 0.022 1.000 Y 0.978
 295317 295318 SMU.532 SMU.533 trpE trpG TRUE 1.000 -3.000 0.321 0.001 Y 0.936
 295318 295319 SMU.533 SMU.534 trpG trpD TRUE 0.996 21.000 0.018 1.000 Y 0.867
 295319 295320 SMU.534 SMU.535 trpD trpC TRUE 1.000 -7.000 0.216 1.000 Y 0.941
 295320 295321 SMU.535 SMU.536 trpC trpF TRUE 1.000 -13.000 0.264 0.003 Y 0.927
 295321 295322 SMU.536 SMU.537 trpF trpB TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.003 Y 0.837
 295322 295323 SMU.537 SMU.538 trpB trpA TRUE 0.995 4.000 0.248 0.001 Y 0.650
 295325 295326 SMU.540 SMU.541 dpr   FALSE 0.079 207.000 0.058 NA   0.125
 295326 295327 SMU.541 SMU.542   glk TRUE 0.996 -7.000 0.496 NA   0.722
 295327 295328 SMU.542 SMU.543 glk   TRUE 0.986 10.000 0.064 NA N 0.803
 295328 295329 SMU.543 SMU.545     TRUE 0.609 68.000 0.000 NA   0.661
 295329 295330 SMU.545 SMU.546     FALSE 0.466 26.000 0.000 NA   0.327
 295330 295331 SMU.546 SMU.547     TRUE 0.979 29.000 0.015 NA   0.873
 295331 295332 SMU.547 SMU.548   murD FALSE 0.091 189.000 0.006 NA   0.314
 295332 295333 SMU.548 SMU.549 murD murG TRUE 0.988 3.000 0.060 1.000 Y 0.464
 295333 295334 SMU.549 SMU.550 murG ftsQ TRUE 0.992 0.000 0.072 NA Y 0.461
 295334 295335 SMU.550 SMU.551 ftsQ ftsA FALSE 0.290 152.000 0.389 NA N 0.235
 295335 295336 SMU.551 SMU.552 ftsA ftsZ TRUE 0.996 24.000 0.460 1.000 Y 0.758
 295336 295337 SMU.552 SMU.553 ftsZ ylmE TRUE 0.990 3.000 0.030 NA   0.807
 295337 295338 SMU.553 SMU.554 ylmE ylmF TRUE 0.979 14.000 0.194 NA   0.694
 295338 295339 SMU.554 SMU.555 ylmF ylmG TRUE 0.985 0.000 0.370 NA   0.552
 295339 295340 SMU.555 SMU.556 ylmG ylmH TRUE 0.993 4.000 0.287 1.000   0.778
 295340 295341 SMU.556 SMU.557 ylmH divIVA TRUE 0.991 11.000 0.579 NA   0.749
 295341 295342 SMU.557 SMU.558 divIVA   FALSE 0.002 510.000 0.012 NA N 0.114
 295343 295344 SMU.560c SMU.561c     TRUE 0.786 43.000 0.114 NA   0.454
 295344 295345 SMU.561c SMU.562   clpE FALSE 0.127 51.000 0.079 1.000 N -0.016
 295346 295347 SMU.563 SMU.564     FALSE 0.124 77.000 0.052 NA   0.034
 295348 295349 SMU.565c SMU.566c     TRUE 1.000 -6.000 1.000 0.062 Y 0.852
 295350 295351 SMU.567 SMU.568     TRUE 0.998 0.000 0.640 1.000 Y 0.596
 295351 295352 SMU.568 SMU.569   feoA FALSE 0.096 193.000 0.022 1.000 N 0.334
 295352 295353 SMU.569 SMU.570 feoA feoB TRUE 1.000 -3.000 0.871 1.000 Y 0.855
 295353 295354 SMU.570 SMU.571 feoB   TRUE 0.989 13.000 0.057 NA   0.843
 295354 295355 SMU.571 SMU.572   folD FALSE 0.008 120.000 0.009 NA   -0.061
 295355 295356 SMU.572 SMU.573 folD   TRUE 0.947 -3.000 0.030 NA N 0.439
 295357 295358 SMU.574c SMU.575c     TRUE 0.999 2.000 0.869 1.000   0.967
 295358 295359 SMU.575c SMU.576   lytR TRUE 0.827 176.000 0.178 1.000   0.840
 295359 295360 SMU.576 SMU.577 lytR lytS TRUE 1.000 -19.000 0.538 0.014 Y 0.874
 295361 295362 SMU.580 SMU.581     TRUE 0.999 -25.000 0.000 0.001 Y 0.884
 295362 295363 SMU.581 SMU.582     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 N 0.794
 295363 295364 SMU.582 SMU.583     TRUE 0.995 -7.000 0.058 1.000 N 0.808
 295364 295365 SMU.583 SMU.584     TRUE 0.990 -13.000 0.048 1.000 N 0.709
 295365 295366 SMU.584 SMU.585   recN TRUE 0.939 17.000 0.037 1.000 N 0.639
 295366 295367 SMU.585 SMU.586 recN   FALSE 0.149 222.000 0.006 NA   0.455
 295367 295368 SMU.586 SMU.587     TRUE 0.988 -7.000 0.203 NA   0.584
 295368 295369 SMU.587 SMU.588     TRUE 0.994 -25.000 0.828 NA   0.597
 295369 295370 SMU.588 SMU.589     FALSE 0.283 97.000 0.156 NA   0.166
 295371 295372 SMU.590c SMU.591c     FALSE 0.332 128.000 0.000 1.000   0.600
 295372 295373 SMU.591c SMU.592c     TRUE 0.962 7.000 0.000 1.000   0.716
 295374 295375 SMU.593 SMU.594 furR   TRUE 0.782 63.000 0.000 NA   0.735
 295377 295378 SMU.596 SMU.597 pmgY pbp2b FALSE 0.003 247.000 0.000 1.000 N -0.168
 295378 295379 SMU.597 SMU.598 pbp2b recM TRUE 0.755 10.000 0.013 1.000 N 0.352
 295379 295380 SMU.598 SMU.599 recM   FALSE 0.004 212.000 0.010 1.000 N -0.144
 295382 295383 SMU.602 SMU.603   murF FALSE 0.479 78.000 0.000 1.000   0.628
 295383 295384 SMU.603 SMU.604 murF   FALSE 0.009 107.000 0.000 1.000   0.162
 295384 295385 SMU.604 SMU.605     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   0.565
 295385 295386 SMU.605 SMU.606     TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   0.505
 295386 295387 SMU.606 SMU.607     TRUE 0.854 56.000 0.000 NA   0.758
 295387 295388 SMU.607 SMU.608     FALSE 0.026 184.000 0.000 NA   0.267
 295388 295389 SMU.608 SMU.609     FALSE 0.108 254.000 0.000 1.000   0.493
 295389 295390 SMU.609 SMU.610   spaP FALSE 0.004 238.000 0.000 1.000   0.172
 295390 295391 SMU.610 SMU.611 spaP   FALSE 0.003 290.000 0.000 1.000 N 0.009
 295391 295392 SMU.611 SMU.613     FALSE 0.557 490.000 0.000 NA   0.883
 295392 295393 SMU.613 SMU.614     TRUE 0.850 94.000 0.000 NA   0.918
 295393 295394 SMU.614 SMU.616     FALSE 0.002 1051.000 0.000 NA   -0.839
 295394 295395 SMU.616 SMU.618     TRUE 0.825 104.000 0.000 NA   0.905
 295395 295396 SMU.618 SMU.620     FALSE 0.417 577.000 0.000 NA   0.799
 295397 295398 SMU.621c SMU.622c     FALSE 0.189 46.000 0.000 NA   0.288
 295398 295399 SMU.622c SMU.623c     FALSE 0.010 89.000 0.000 NA   0.138
 295400 295401 SMU.624 SMU.625   comEA FALSE 0.050 141.000 0.014 1.000 N 0.216
 295401 295402 SMU.625 SMU.626 comEA   TRUE 0.996 -10.000 0.130 1.000   0.774
 295402 295403 SMU.626 SMU.627     FALSE 0.179 186.000 0.002 0.069   0.489
 295403 295404 SMU.627 SMU.628     FALSE 0.016 168.000 0.000 1.000   0.235
 295404 295405 SMU.628 SMU.629   sod FALSE 0.006 147.000 0.012 1.000 N 0.020
 295405 295406 SMU.629 SMU.630 sod   FALSE 0.015 552.000 0.000 1.000   0.276
 295406 295407 SMU.630 SMU.631     FALSE 0.006 165.000 0.000 NA   0.175
 295407 295408 SMU.631 SMU.632     FALSE 0.510 69.000 0.000 NA   0.610
 295408 295409 SMU.632 SMU.633     TRUE 0.799 47.000 0.000 1.000 N 0.712
 295411 295412 SMU.635 SMU.636     FALSE 0.238 130.000 0.071 NA   0.292
 295414 295415 SMU.638 SMU.639     TRUE 0.908 15.000 0.000 1.000   0.626
 295417 295418 SMU.641 SMU.642     FALSE 0.511 245.000 0.000 NA   0.806
 295418 295419 SMU.642 SMU.643     TRUE 0.779 106.000 0.000 NA   0.844
 295419 295420 SMU.643 SMU.644     FALSE 0.055 308.000 0.000 NA   0.399
 295420 295421 SMU.644 SMU.645   pepB TRUE 0.987 22.000 0.204 NA   0.810
 295421 295422 SMU.645 SMU.646 pepB   TRUE 0.618 213.000 0.000 1.000   0.847
 295422 295423 SMU.646 SMU.647     FALSE 0.570 50.000 0.012 1.000   0.424
 295423 295424 SMU.647 SMU.648   prtM TRUE 0.796 62.000 0.008 1.000   0.704
 295424 295425 SMU.648 SMU.649 prtM   FALSE 0.107 239.000 0.000 NA   0.482
 295425 295426 SMU.649 SMU.650     FALSE 0.188 215.000 0.006 NA   0.515
 295427 295428 SMU.651c SMU.652c     TRUE 0.996 20.000 0.000 1.000 Y 0.943
 295428 295429 SMU.652c SMU.653c     TRUE 0.999 -6.000 0.000 1.000 Y 0.920
 295430 295431 SMU.654 SMU.655 mutF mutE1 TRUE 0.992 2.000 0.449 NA   0.713
 295431 295432 SMU.655 SMU.656 mutE1 mutE2 TRUE 0.992 -15.000 0.000 NA   0.800
 295432 295433 SMU.656 SMU.657 mutE2 mutG TRUE 0.996 0.000 0.490 NA   0.763
 295433 295434 SMU.657 SMU.658 mutG   FALSE 0.346 376.000 0.000 NA   0.747
 295434 295435 SMU.658 SMU.659     FALSE 0.415 40.000 0.074 NA   0.042
 295435 295436 SMU.659 SMU.660     TRUE 0.998 -9.000 0.741 0.014 Y 0.571
 295436 295437 SMU.660 SMU.661     FALSE 0.003 306.000 0.000 1.000 N 0.047
 295437 295438 SMU.661 SMU.662     FALSE 0.365 145.000 0.000 NA   0.646
 295438 295439 SMU.662 SMU.663   argC FALSE 0.150 135.000 0.000 NA   0.430
 295439 295440 SMU.663 SMU.664 argC argJ TRUE 0.931 159.000 0.303 0.004 Y 0.748
 295440 295441 SMU.664 SMU.665 argJ argB TRUE 0.994 29.000 0.067 0.004 Y 0.815
 295441 295442 SMU.665 SMU.666 argB argD TRUE 0.864 136.000 0.322 1.000 Y 0.550
 295443 295444 SMU.667 SMU.668c nrdG   TRUE 0.892 563.000 0.500 0.002 Y 0.782
 295444 295445 SMU.668c SMU.669c     TRUE 0.840 200.000 0.562 1.000 N 0.841
 295446 295447 SMU.670 SMU.671 citB citZ TRUE 0.998 5.000 0.013 1.000 Y 0.927
 295447 295448 SMU.671 SMU.672 citZ idh TRUE 0.999 2.000 0.140 1.000 Y 0.950
 295448 295449 SMU.672 SMU.673 idh   FALSE 0.537 668.000 0.000 NA   0.874
 295449 295450 SMU.673 SMU.674   ptsH FALSE 0.052 166.000 0.000 NA   0.316
 295450 295451 SMU.674 SMU.675 ptsH   TRUE 0.999 5.000 0.240 0.014 Y 0.872
 295451 295452 SMU.675 SMU.676   gapN FALSE 0.004 230.000 0.035 1.000 N -0.079
 295452 295453 SMU.676 SMU.677 gapN   FALSE 0.097 671.000 0.000 1.000 N 0.576
 295453 295454 SMU.677 SMU.678     TRUE 0.987 0.000 0.095 1.000   0.679
 295454 295455 SMU.678 SMU.679     TRUE 0.987 10.000 0.000 0.025   0.909
 295455 295456 SMU.679 SMU.680     TRUE 0.807 42.000 0.000 NA   0.665
 295456 295457 SMU.680 SMU.681     FALSE 0.079 411.000 0.000 NA   0.476
 295457 295458 SMU.681 SMU.682     FALSE 0.003 303.000 0.000 NA   0.116
 295458 295459 SMU.682 SMU.683     TRUE 0.958 16.000 0.125 NA   0.608
 295459 295460 SMU.683 SMU.684     TRUE 0.991 4.000 0.188 NA   0.771
 295460 295461 SMU.684 SMU.685     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   0.800
 295463 295464 SMU.688 SMU.689     FALSE 0.503 246.000 0.000 NA   0.803
 295464 295465 SMU.689 SMU.690     TRUE 0.961 21.000 0.000 NA   0.773
 295465 295466 SMU.690 SMU.691   pepT FALSE 0.010 93.000 0.013 NA   -0.437
 295466 295467 SMU.691 SMU.692 pepT   FALSE 0.026 56.000 0.051 1.000   -0.260
 295469 295470 SMU.695 SMU.696     TRUE 0.914 11.000 0.012 NA   0.548
 295470 295471 SMU.696 SMU.697     FALSE 0.224 167.000 0.010 1.000 N 0.529
 295471 295472 SMU.697 SMU.698     TRUE 0.998 35.000 0.652 1.000 Y 0.955
 295472 295473 SMU.698 SMU.699     TRUE 0.997 45.000 0.928 0.025 Y 0.941
 295474 295475 SMU.700c SMU.701c     TRUE 0.977 8.000 0.021 NA   0.725
 295475 295476 SMU.701c SMU.702c     TRUE 0.991 5.000 0.016 NA   0.847
 295476 295477 SMU.702c SMU.703c     TRUE 0.990 -3.000 0.012 NA   0.741
 295477 295478 SMU.703c SMU.704c     FALSE 0.037 44.000 0.000 NA   -0.417
 295478 295479 SMU.704c SMU.706c     FALSE 0.346 90.000 0.000 NA   0.556
 295479 295480 SMU.706c SMU.707c     FALSE 0.006 157.000 0.016 NA   -0.692
 295481 295482 SMU.709 SMU.711     TRUE 0.998 -16.000 0.200 NA   0.857
 295482 295483 SMU.711 SMU.712   capP FALSE 0.008 118.000 0.000 NA   -0.129
 295483 295484 SMU.712 SMU.713 capP ftsW FALSE 0.028 295.000 0.028 1.000 N 0.171
 295484 295485 SMU.713 SMU.714 ftsW   FALSE 0.221 219.000 0.000 1.000 N 0.654
 295485 295486 SMU.714 SMU.715     FALSE 0.101 296.000 0.003 1.000 N 0.484
 295487 295488 SMU.716 SMU.717 murN murM TRUE 0.995 3.000 0.467 0.010 Y 0.567
 295488 295489 SMU.717 SMU.718c murM   TRUE 0.971 0.000 0.500 1.000   0.302
 295489 295490 SMU.718c SMU.719c     FALSE 0.245 248.000 0.035 1.000   0.543
 295491 295492 SMU.720 SMU.721     TRUE 0.934 62.000 0.017 NA   0.872
 295492 295493 SMU.721 SMU.722     TRUE 0.855 76.000 0.000 NA   0.874
 295493 295494 SMU.722 SMU.723     FALSE 0.161 147.000 0.000 NA   0.454
 295494 295495 SMU.723 SMU.724     FALSE 0.008 113.000 0.000 1.000 N -0.374
 295497 295498 SMU.727 SMU.728     TRUE 0.984 -13.000 0.000 1.000 N 0.728
 295498 295499 SMU.728 SMU.730     FALSE 0.003 269.000 0.000 NA   -0.130
 295499 295500 SMU.730 SMU.731     TRUE 0.981 2.000 0.000 NA   0.768
 295500 295501 SMU.731 SMU.732     TRUE 0.998 0.000 0.857 NA   0.824
 295501 295502 SMU.732 SMU.734     TRUE 0.651 214.000 0.000 NA   0.874
 295502 295503 SMU.734 SMU.735     FALSE 0.005 186.000 0.000 NA   0.118
 295503 295504 SMU.735 SMU.737     FALSE 0.134 66.000 0.000 NA   0.308
 295504 295505 SMU.737 SMU.738     FALSE 0.003 321.000 0.000 NA   -0.138
 295507 295508 SMU.741 SMU.742     FALSE 0.558 64.000 0.000 NA   0.605
 295508 295509 SMU.742 SMU.743     TRUE 0.969 -3.000 0.250 0.020   0.346
 295509 295510 SMU.743 SMU.744   ftsY TRUE 0.907 2.000 0.007 1.000   0.438
 295511 295512 SMU.745 SMU.746c lmrB   FALSE 0.008 110.000 0.000 NA   -0.378
 295512 295513 SMU.746c SMU.747c     TRUE 0.998 -3.000 0.841 NA   0.783
 295516 295517 SMU.751 SMU.752     TRUE 0.999 -13.000 0.215 NA   0.929
 295517 295518 SMU.752 SMU.753     TRUE 0.852 88.000 0.051 NA   0.807
 295518 295519 SMU.753 SMU.754     TRUE 0.919 198.000 0.017 NA Y 0.863
 295519 295520 SMU.754 SMU.755     TRUE 0.999 -7.000 0.494 1.000 N 0.946
 295520 295521 SMU.755 SMU.756     TRUE 0.982 29.000 0.079 NA   0.843
 295521 295522 SMU.756 SMU.757     TRUE 0.998 0.000 0.206 NA   0.933
 295524 295525 SMU.759 SMU.761     TRUE 0.869 272.000 0.156 0.004 Y 0.771
 295525 295526 SMU.761 SMU.764   ahpC FALSE 0.176 130.000 0.000 1.000 Y -0.468
 295526 295527 SMU.764 SMU.765 ahpC   TRUE 0.999 10.000 0.551 1.000 Y 0.978
 295527 295528 SMU.765 SMU.766     FALSE 0.416 71.000 0.000 1.000 N NA
 295528 295529 SMU.766 SMU.767     TRUE 0.999 -6.000 1.000 0.060 Y NA
 295532 295533 SMU.770c SMU.771c     FALSE 0.002 540.000 0.000 NA   -0.395
 295538 295539 SMU.776 SMU.777   aroD TRUE 0.944 7.000 0.125 1.000   0.467
 295539 295540 SMU.777 SMU.778 aroD aroE TRUE 0.999 -10.000 0.500 1.000 Y 0.769
 295540 295541 SMU.778 SMU.779 aroE aroB TRUE 0.991 14.000 0.010 1.000 Y 0.698
 295541 295542 SMU.779 SMU.780 aroB aroC TRUE 0.999 2.000 0.110 0.004 Y 0.843
 295542 295543 SMU.780 SMU.781 aroC   TRUE 0.982 64.000 0.010 1.000 Y 0.906
 295543 295544 SMU.781 SMU.782     TRUE 0.983 11.000 0.058 NA   0.763
 295544 295545 SMU.782 SMU.784   aroA FALSE 0.006 163.000 0.003 NA   -0.192
 295545 295546 SMU.784 SMU.785 aroA aroK TRUE 0.999 -7.000 0.012 1.000 Y 0.811
 295546 295547 SMU.785 SMU.786 aroK pheA TRUE 0.998 -3.000 0.025 1.000 Y 0.731
 295547 295548 SMU.786 SMU.787 pheA   TRUE 0.808 45.000 0.025 NA N 0.640
 295548 295549 SMU.787 SMU.788     FALSE 0.182 172.000 0.093 NA N 0.336
 295549 295550 SMU.788 SMU.789     FALSE 0.100 520.000 0.000 NA   0.533
 295550 295551 SMU.789 SMU.790     FALSE 0.002 581.000 0.000 NA   0.072
 295553 295554 SMU.793 SMU.794     TRUE 0.820 87.000 0.000 NA   0.855
 295554 295555 SMU.794 SMU.795     TRUE 0.970 34.000 0.000 NA   0.904
 295555 295556 SMU.795 SMU.796     TRUE 0.864 90.000 0.000 1.000   0.936
 295556 295557 SMU.796 SMU.797     TRUE 0.973 35.000 0.000 NA   0.938
 295558 295559 SMU.798c SMU.799c     FALSE 0.307 200.000 0.000 NA   0.668
 295560 295561 SMU.800 SMU.801   obgE FALSE 0.521 60.000 0.011 NA   0.447
 295561 295562 SMU.801 SMU.802 obgE   FALSE 0.047 302.000 0.009 NA   0.260
 295565 295566 SMU.805c SMU.806c     TRUE 0.999 0.000 0.326 1.000 Y 0.775
 295567 295568 SMU.807 SMU.809   uvrB FALSE 0.004 197.000 0.000 NA   -0.504
 295568 295569 SMU.809 SMU.811 uvrB   TRUE 0.579 368.000 0.000 NA   0.889
 295569 295570 SMU.811 SMU.812     TRUE 0.993 0.000 0.000 NA   0.888
 295570 295571 SMU.812 SMU.813     TRUE 0.665 191.000 0.000 NA   0.858
 295571 295572 SMU.813 SMU.814   mutT TRUE 0.694 58.000 0.000 1.000 N 0.680
 295572 295573 SMU.814 SMU.815 mutT   FALSE 0.446 108.000 0.111 1.000 N 0.522
 295573 295574 SMU.815 SMU.816     FALSE 0.455 216.000 0.000 1.000 Y 0.452
 295574 295575 SMU.816 SMU.817     TRUE 0.988 33.000 0.133 1.000 Y 0.699
 295575 295576 SMU.817 SMU.818     FALSE 0.118 236.000 0.027 1.000   0.342
 295578 295579 SMU.820 SMU.821   dnaG FALSE 0.207 153.000 0.000 NA   0.525
 295579 295580 SMU.821 SMU.822 dnaG rpoD TRUE 0.988 8.000 0.209 1.000 N 0.768
 295580 295581 SMU.822 SMU.823 rpoD   TRUE 0.950 13.000 0.044 NA   0.622
 295581 295582 SMU.823 SMU.824     FALSE 0.562 317.000 0.152 NA   0.739
 295582 295583 SMU.824 SMU.825   rgpA TRUE 0.591 173.000 0.212 NA   0.649
 295583 295584 SMU.825 SMU.826 rgpA rgpB TRUE 0.999 -10.000 0.289 NA   0.919
 295584 295585 SMU.826 SMU.827 rgpB rgpC TRUE 0.999 0.000 0.289 NA Y 0.848
 295585 295586 SMU.827 SMU.828 rgpC rgpD TRUE 0.999 0.000 0.500 1.000 Y 0.850
 295586 295587 SMU.828 SMU.829 rgpD rgpE TRUE 0.991 23.000 0.222 NA   0.871
 295587 295588 SMU.829 SMU.830 rgpE rgpF TRUE 0.991 -3.000 0.385 NA   0.613
 295588 295589 SMU.830 SMU.831 rgpF   TRUE 0.998 -3.000 0.385 1.000 Y 0.614
 295589 295590 SMU.831 SMU.832     TRUE 0.829 37.000 0.222 NA   0.378
 295590 295591 SMU.832 SMU.833     TRUE 0.975 17.000 0.075 NA   0.721
 295591 295592 SMU.833 SMU.834     TRUE 0.917 132.000 0.014 NA Y 0.777
 295592 295593 SMU.834 SMU.835     FALSE 0.563 134.000 0.000 NA   0.738
 295593 295594 SMU.835 SMU.836     FALSE 0.117 206.000 0.000 NA   0.468
 295594 295595 SMU.836 SMU.837     FALSE 0.206 119.000 0.000 NA   0.467
 295595 295596 SMU.837 SMU.838   gshR FALSE 0.281 133.000 0.000 1.000   0.566
 295597 295598 SMU.839 SMU.840c fol   FALSE 0.063 340.000 0.308 NA   -0.166
 295599 295600 SMU.841 SMU.842   thiI TRUE 0.935 115.000 0.349 1.000 N 0.954
 295600 295601 SMU.842 SMU.843 thiI   FALSE 0.007 138.000 0.014 1.000 N -0.823
 295601 295602 SMU.843 SMU.844     TRUE 0.974 31.000 0.013 1.000   0.855
 295602 295603 SMU.844 SMU.845     TRUE 0.968 28.000 0.000 NA   0.841
 295605 295606 SMU.846 SMU.848     TRUE 0.999 12.000 0.208 NA Y 0.890
 295606 295607 SMU.848 SMU.849     TRUE 0.998 22.000 0.203 NA Y 0.912
 295607 295608 SMU.849 SMU.850     TRUE 0.612 314.000 0.000 1.000 Y 0.681
 295608 295609 SMU.850 SMU.851     TRUE 0.991 1.000 0.000 1.000   0.859
 295609 295610 SMU.851 SMU.852     FALSE 0.470 653.000 0.000 1.000   0.827
 295610 295611 SMU.852 SMU.853   lspA TRUE 0.995 9.000 0.119 1.000 N 0.956
 295611 295612 SMU.853 SMU.854 lspA   TRUE 0.998 -10.000 0.082 1.000 N 0.948
 295612 295613 SMU.854 SMU.855     FALSE 0.529 202.000 0.000 NA   0.789
 295613 295614 SMU.855 SMU.856   pyrR FALSE 0.004 223.000 0.000 NA   -0.747
 295614 295615 SMU.856 SMU.857 pyrR   TRUE 0.999 -3.000 0.140 1.000 Y 0.925
 295615 295616 SMU.857 SMU.858   pyrB TRUE 0.998 5.000 0.064 1.000 Y 0.880
 295616 295617 SMU.858 SMU.859 pyrB pyrA TRUE 0.907 129.000 0.014 1.000 Y 0.754
 295617 295618 SMU.859 SMU.860 pyrA pyrAB TRUE 0.878 180.000 0.117 0.001 Y 0.735
 295618 295619 SMU.860 SMU.862 pyrAB   FALSE 0.003 267.000 0.017 1.000 N -0.207
 295619 295620 SMU.862 SMU.863     TRUE 0.993 6.000 0.923 1.000 N 0.739
 295620 295621 SMU.863 SMU.864     TRUE 0.998 10.000 0.923 1.000 Y 0.734
 295621 295622 SMU.864 SMU.865     FALSE 0.003 403.000 0.000 1.000 N 0.086
 295622 295623 SMU.865 SMU.866     TRUE 0.995 11.000 0.385 1.000   0.880
 295623 295624 SMU.866 SMU.867   rimM FALSE 0.345 89.000 0.324 1.000   0.091
 295624 295625 SMU.867 SMU.868 rimM trmD TRUE 0.998 -10.000 0.672 1.000 Y 0.575
 295625 295626 SMU.868 SMU.869 trmD trxB2 FALSE 0.077 84.000 0.007 1.000 N 0.252
 295626 295627 SMU.869 SMU.870 trxB2   FALSE 0.035 69.000 0.000 1.000 N 0.309
 295627 295628 SMU.870 SMU.871   pfkB TRUE 1.000 -3.000 0.721 1.000 Y 0.905
 295628 295629 SMU.871 SMU.872 pfkB   TRUE 1.000 -3.000 0.816 1.000 Y 0.935
 295629 295630 SMU.872 SMU.873   metE FALSE 0.126 332.000 0.000 1.000 N 0.607
 295630 295631 SMU.873 SMU.874 metE   TRUE 0.981 18.000 0.030 1.000 Y 0.526
 295632 295633 SMU.875c SMU.876   msmR FALSE 0.103 945.000 0.000 0.059 N 0.612
 295634 295635 SMU.877 SMU.878 agaL msmE TRUE 0.999 13.000 0.286 1.000 Y 0.959
 295635 295636 SMU.878 SMU.879 msmE msmF TRUE 0.999 13.000 0.275 0.036 Y 0.969
 295636 295637 SMU.879 SMU.880 msmF msmG TRUE 0.999 15.000 0.925 0.036 Y 0.984
 295637 295638 SMU.880 SMU.881 msmG gtfA TRUE 0.967 155.000 0.050 1.000 Y 0.984
 295638 295639 SMU.881 SMU.882 gtfA msmK TRUE 0.999 15.000 0.250 1.000 Y 0.978
 295639 295640 SMU.882 SMU.883 msmK dexB TRUE 0.985 91.000 0.171 1.000 Y 0.982
 295642 295643 SMU.886 SMU.887 galK galT TRUE 0.999 5.000 0.107 0.002 Y 0.973
 295643 295644 SMU.887 SMU.888 galT galE FALSE 0.449 86.000 0.204 0.002 N 0.428
 295644 295645 SMU.888 SMU.889 galE pbpX FALSE 0.066 289.000 0.000 1.000   0.421
 295645 295646 SMU.889 SMU.890 pbpX   FALSE 0.060 204.000 0.000 1.000   0.367
 295646 295647 SMU.890 SMU.891   hsdM FALSE 0.206 132.000 0.000 1.000   0.489
 295647 295648 SMU.891 SMU.892 hsdM hsdS TRUE 0.999 -7.000 0.022 0.059 Y 0.853
 295648 295649 SMU.892 SMU.893 hsdS   TRUE 0.944 31.000 0.000 0.059   0.795
 295649 295650 SMU.893 SMU.895     FALSE 0.013 74.000 0.000 NA   0.009
 295650 295651 SMU.895 SMU.896     TRUE 0.904 -13.000 0.000 NA   0.403
 295651 295652 SMU.896 SMU.897     TRUE 0.816 3.000 0.000 NA   0.412
 295652 295653 SMU.897 SMU.898     FALSE 0.004 214.000 0.000 1.000   -0.002
 295653 295654 SMU.898 SMU.899     TRUE 0.957 6.000 0.000 NA   0.694
 295654 295655 SMU.899 SMU.900   dapB TRUE 0.942 12.000 0.000 NA   0.688
 295655 295656 SMU.900 SMU.901 dapB papS FALSE 0.275 -3.000 0.015 1.000 N -0.084
 295656 295657 SMU.901 SMU.902 papS   TRUE 0.971 3.000 0.056 1.000   0.640
 295657 295658 SMU.902 SMU.905     FALSE 0.339 457.000 0.008 1.000   0.712
 295658 295659 SMU.905 SMU.906     TRUE 0.999 11.000 0.846 0.011 Y 0.877
 295659 295660 SMU.906 SMU.909     FALSE 0.280 116.000 0.000 0.066   0.558
 295660 295661 SMU.909 SMU.910   gtfD FALSE 0.004 220.000 0.000 1.000   -0.136
 295664 295665 SMU.914c SMU.915c     TRUE 0.819 109.000 0.000 NA   0.895
 295665 295666 SMU.915c SMU.916c     TRUE 0.993 13.000 0.101 1.000   0.920
 295666 295667 SMU.916c SMU.917c     TRUE 0.998 -18.000 0.280 1.000 N 0.864
 295667 295668 SMU.917c SMU.919c     TRUE 0.997 0.000 0.062 1.000   0.937
 295669 295670 SMU.921 SMU.922     TRUE 0.988 4.000 0.296 1.000 N 0.730
 295670 295671 SMU.922 SMU.923     TRUE 1.000 -10.000 1.000 0.011 Y 0.814
 295671 295672 SMU.923 SMU.924   tpx FALSE 0.056 197.000 0.000 1.000 N 0.413
 295672 295673 SMU.924 SMU.925 tpx   FALSE 0.213 137.000 0.000 NA   0.507
 295673 295674 SMU.925 SMU.926     FALSE 0.079 228.000 0.000 NA   0.421
 295674 295675 SMU.926 SMU.927     TRUE 0.998 1.000 0.800 1.000   0.892
 295675 295676 SMU.927 SMU.928     TRUE 0.999 0.000 0.533 1.000 Y 0.810
 295677 295678 SMU.929c SMU.930c     FALSE 0.006 147.000 0.000 NA   -0.234
 295679 295680 SMU.932 SMU.933     TRUE 0.987 24.000 0.005 1.000   0.950
 295680 295681 SMU.933 SMU.934     TRUE 0.999 10.000 0.455 0.035 Y 0.970
 295681 295682 SMU.934 SMU.935     TRUE 0.999 9.000 0.545 0.013 Y 0.955
 295682 295683 SMU.935 SMU.936     TRUE 0.999 10.000 0.176 1.000 Y 0.910
 295683 295684 SMU.936 SMU.937     FALSE 0.190 207.000 0.000 1.000 N 0.622
 295684 295685 SMU.937 SMU.938     TRUE 0.999 2.000 0.312 0.005 Y 0.852
 295685 295686 SMU.938 SMU.939     TRUE 0.976 10.000 0.097 1.000 N 0.716
 295687 295688 SMU.940c SMU.941c     TRUE 0.999 -31.000 0.146 NA   0.968
 295688 295689 SMU.941c SMU.942   mvaA FALSE 0.556 272.000 0.020 NA   0.786
 295689 295690 SMU.942 SMU.943c mvaA   TRUE 1.000 -22.000 0.183 1.000 Y 0.966
 295691 295692 SMU.944 SMU.946 thyA   TRUE 0.766 117.000 0.000 1.000 N 0.873
 295692 295693 SMU.946 SMU.947   dfrA TRUE 0.921 85.000 0.000 1.000 Y 0.775
 295693 295694 SMU.947 SMU.948 dfrA   TRUE 0.992 18.000 0.030 NA   0.959
 295694 295695 SMU.948 SMU.949   clpX TRUE 0.988 25.000 0.012 NA   0.970
 295695 295696 SMU.949 SMU.950 clpX   TRUE 0.993 16.000 0.043 1.000   0.947
 295696 295697 SMU.950 SMU.951     FALSE 0.566 329.000 0.000 1.000   0.872
 295697 295698 SMU.951 SMU.952     TRUE 0.998 10.000 0.093 1.000 Y 0.881
 295700 295701 SMU.954 SMU.955     TRUE 0.998 -3.000 0.142 NA   0.880
 295703 295704 SMU.957 SMU.958     TRUE 0.997 -283.000 0.000 NA   0.967
 295706 295707 SMU.960 SMU.961     FALSE 0.392 267.000 0.000 NA   0.749
 295707 295708 SMU.961 SMU.962     TRUE 0.994 21.000 0.200 NA   0.985
 295710 295711 SMU.965 SMU.966     TRUE 0.991 2.000 0.036 1.000 Y 0.546
 295711 295712 SMU.966 SMU.967   folC FALSE 0.270 170.000 0.006 1.000 N 0.589
 295712 295713 SMU.967 SMU.968 folC   TRUE 0.992 6.000 0.057 1.000 Y 0.620
 295713 295714 SMU.968 SMU.969   folP TRUE 0.984 10.000 0.073 1.000 Y 0.455
 295714 295715 SMU.969 SMU.970 folP folA TRUE 0.974 8.000 0.094 1.000 Y 0.195
 295715 295716 SMU.970 SMU.971 folA folK TRUE 0.998 -3.000 0.142 1.000 Y 0.708
 295716 295717 SMU.971 SMU.972 folK murB FALSE 0.007 135.000 0.010 1.000 N -0.217
 295717 295718 SMU.972 SMU.973 murB potA TRUE 0.973 4.000 0.041 1.000 N 0.695
 295718 295719 SMU.973 SMU.974 potA potB TRUE 0.997 -16.000 0.928 0.035 Y 0.369
 295719 295720 SMU.974 SMU.975 potB potC TRUE 0.993 -3.000 0.492 0.035 Y 0.198
 295720 295721 SMU.975 SMU.976 potC potD TRUE 0.998 -7.000 0.253 0.035 Y 0.608
 295721 295722 SMU.976 SMU.977 potD licT FALSE 0.245 248.000 0.000 1.000   0.659
 295722 295723 SMU.977 SMU.980 licT bglP FALSE 0.003 401.000 0.000 1.000   0.025
 295723 295724 SMU.980 SMU.981 bglP bglB1 FALSE 0.197 173.000 0.000 NA   0.538
 295724 295725 SMU.981 SMU.982 bglB1 bglB2 TRUE 0.920 38.000 0.000 NA   0.771
 295727 295728 SMU.984 SMU.985   bglA TRUE 0.826 131.000 0.000 NA   0.943
 295730 295731 SMU.987 SMU.988 wapA   FALSE 0.003 317.000 0.000 1.000   0.142
 295731 295732 SMU.988 SMU.989   asd FALSE 0.003 285.000 0.000 1.000 N -0.128
 295732 295733 SMU.989 SMU.990 asd dapA TRUE 0.904 41.000 0.063 1.000 Y 0.208
 295733 295734 SMU.990 SMU.991 dapA   FALSE 0.003 278.000 0.000 NA   -0.179
 295734 295735 SMU.991 SMU.992     FALSE 0.003 285.000 0.000 NA   -0.446
 295735 295736 SMU.992 SMU.993     FALSE 0.532 197.000 0.000 NA   0.786
 295736 295737 SMU.993 SMU.994   rnh TRUE 0.996 -13.000 0.148 1.000   0.784
 295737 295738 SMU.994 SMU.995 rnh   FALSE 0.005 174.000 0.000 1.000 N 0.229
 295738 295739 SMU.995 SMU.996     TRUE 1.000 -3.000 0.870 0.035 Y 0.817
 295739 295740 SMU.996 SMU.997     TRUE 0.999 -3.000 0.870 1.000 Y 0.775
 295740 295741 SMU.997 SMU.998     TRUE 0.976 42.000 0.012 1.000 Y 0.722
 295741 295742 SMU.998 SMU.999     FALSE 0.524 72.000 0.000 NA   0.629
 295742 295743 SMU.999 SMU.1000     TRUE 0.989 -25.000 0.000 NA   0.747
 295743 295744 SMU.1000 SMU.1001   smf FALSE 0.111 67.000 0.000 NA   0.293
 295744 295745 SMU.1001 SMU.1002 smf topA TRUE 0.900 95.000 0.238 1.000 Y 0.590
 295745 295746 SMU.1002 SMU.1003 topA gid TRUE 0.777 366.000 0.137 1.000 N 0.976
 295746 295747 SMU.1003 SMU.1004 gid gtfB FALSE 0.041 446.000 0.000 1.000   0.379
 295747 295748 SMU.1004 SMU.1005 gtfB gtfC FALSE 0.072 196.000 0.000 0.002   0.424
 295748 295749 SMU.1005 SMU.1006 gtfC   FALSE 0.003 265.000 0.000 1.000   0.100
 295749 295750 SMU.1006 SMU.1007     TRUE 0.976 2.000 0.855 1.000   0.359
 295750 295751 SMU.1007 SMU.1008     FALSE 0.357 42.000 0.094 1.000   -0.017
 295751 295752 SMU.1008 SMU.1009     TRUE 0.998 -3.000 0.812 1.000 Y 0.599
 295753 295754 SMU.1010 SMU.1011 citC citG FALSE 0.344 176.000 0.000 1.000 N 0.694
 295754 295755 SMU.1011 SMU.1012c citG   TRUE 0.980 6.000 0.700 1.000 N 0.595
 295755 295756 SMU.1012c SMU.1013c     FALSE 0.356 230.000 0.400 1.000 N 0.493
 295757 295758 SMU.1014 SMU.1016   bcc TRUE 0.974 19.000 0.077 NA   0.724
 295758 295759 SMU.1016 SMU.1017 bcc oadB TRUE 0.989 23.000 0.103 1.000 N 0.916
 295759 295760 SMU.1017 SMU.1018 oadB   TRUE 0.988 34.000 0.273 0.002   0.916
 295760 295761 SMU.1018 SMU.1019   cilG TRUE 0.924 85.000 0.192 1.000   0.865
 295761 295762 SMU.1019 SMU.1020 cilG cilB TRUE 0.998 -12.000 0.284 0.002 N 0.906
 295762 295763 SMU.1020 SMU.1021 cilB cilA TRUE 0.997 -13.000 0.119 0.001 N 0.877
 295763 295764 SMU.1021 SMU.1022 cilA citG2 TRUE 0.981 41.000 0.138 1.000 N 0.952
 295764 295765 SMU.1022 SMU.1023 citG2 pycB TRUE 0.993 13.000 0.123 1.000 N 0.949
 295767 295768 SMU.1025 SMU.1026     FALSE 0.557 47.000 0.000 NA   0.505
 295768 295769 SMU.1026 SMU.1027     FALSE 0.008 118.000 0.000 NA   0.030
 295769 295770 SMU.1027 SMU.1028     TRUE 0.678 36.000 0.062 NA   0.292
 295770 295771 SMU.1028 SMU.1029     FALSE 0.002 524.000 0.000 NA   -0.084
 295771 295772 SMU.1029 SMU.1030     FALSE 0.301 80.000 0.000 NA   0.495
 295772 295773 SMU.1030 SMU.1031   xis FALSE 0.400 367.000 0.000 NA   0.774
 295773 295774 SMU.1031 SMU.1032 xis tnr5 FALSE 0.189 81.000 0.000 0.058   0.427
 295776 295777 SMU.1035 SMU.1036 glrA   FALSE 0.091 21.000 0.000 NA   0.108
 295778 295779 SMU.1037c SMU.1038c     TRUE 1.000 0.000 0.750 1.000 Y 0.956
 295779 295780 SMU.1038c SMU.1039c     TRUE 0.806 133.000 0.000 1.000 N 0.964
 295780 295781 SMU.1039c SMU.1040c     TRUE 0.989 16.000 0.000 1.000   0.975
 295782 295783 SMU.1041 SMU.1042     TRUE 0.996 -3.000 0.341 NA   0.741
 295784 295785 SMU.1043c SMU.1044c     FALSE 0.110 17.000 0.067 1.000 N -0.429
 295785 295786 SMU.1044c SMU.1045c     TRUE 0.998 -3.000 0.150 1.000 N 0.915
 295786 295787 SMU.1045c SMU.1046c     TRUE 0.999 -25.000 0.725 1.000   0.936
 295787 295788 SMU.1046c SMU.1047c     FALSE 0.205 400.000 0.000 NA   0.662
 295789 295790 SMU.1048 SMU.1050   krpS TRUE 0.678 103.000 0.145 1.000   0.652
 295790 295791 SMU.1050 SMU.1051 krpS   TRUE 0.911 61.000 0.089 1.000 Y 0.480
 295791 295792 SMU.1051 SMU.1052     TRUE 0.919 2.000 0.166 NA   0.222
 295792 295793 SMU.1052 SMU.1053     FALSE 0.026 296.000 0.083 NA   -0.078
 295793 295794 SMU.1053 SMU.1054     TRUE 0.987 24.000 0.714 1.000   0.745
 295797 295798 SMU.1057 SMU.1058 satE satD TRUE 0.996 -3.000 0.250 NA   0.770
 295798 295799 SMU.1058 SMU.1059 satD satC FALSE 0.487 97.000 0.000 NA   0.665
 295799 295800 SMU.1059 SMU.1060 satC ffh TRUE 0.862 20.000 0.000 NA   0.580
 295800 295801 SMU.1060 SMU.1061 ffh ylxM TRUE 0.829 113.000 0.151 1.000   0.772
 295801 295802 SMU.1061 SMU.1062 ylxM opuAb FALSE 0.532 110.000 0.000 1.000   0.699
 295802 295803 SMU.1062 SMU.1063 opuAb opuAa TRUE 0.998 3.000 0.000 0.071 Y 0.936
 295803 295804 SMU.1063 SMU.1064c opuAa   FALSE 0.033 273.000 0.052 1.000 N 0.123
 295804 295805 SMU.1064c SMU.1065c     TRUE 0.993 4.000 0.000 0.043 Y 0.736
 295807 295808 SMU.1067c SMU.1068c     TRUE 0.998 -19.000 0.114 NA   0.952
 295808 295809 SMU.1068c SMU.1069c     TRUE 0.990 10.000 0.000 NA   0.953
 295809 295810 SMU.1069c SMU.1070c     TRUE 0.997 -10.000 0.000 NA   0.954
 295810 295811 SMU.1070c SMU.1071c     FALSE 0.006 164.000 0.000 NA   0.184
 295811 295812 SMU.1071c SMU.1072c     FALSE 0.204 49.000 0.000 NA   0.302
 295812 295813 SMU.1072c SMU.1073   fthS TRUE 0.890 64.000 0.021 1.000 N 0.818
 295814 295815 SMU.1074 SMU.1075   dfp TRUE 0.997 -7.000 0.013 1.000   0.928
 295815 295816 SMU.1075 SMU.1076 dfp   TRUE 0.926 75.000 0.019 NA   0.955
 295816 295817 SMU.1076 SMU.1077   pgm FALSE 0.130 95.000 0.098 NA   0.006
 295818 295819 SMU.1078c SMU.1079c     TRUE 1.000 -3.000 0.895 0.011 Y 0.841
 295819 295820 SMU.1079c SMU.1080c     TRUE 0.990 10.000 0.053 NA   0.829
 295820 295821 SMU.1080c SMU.1081c     TRUE 0.997 2.000 0.128 NA   0.947
 295821 295822 SMU.1081c SMU.1082   glyA TRUE 0.998 -3.000 0.103 NA   0.963
 295822 295823 SMU.1082 SMU.1083c glyA   TRUE 0.992 10.000 0.015 NA N 0.969
 295823 295824 SMU.1083c SMU.1084   hemK TRUE 0.999 -7.000 0.029 NA Y 0.946
 295824 295825 SMU.1084 SMU.1085 hemK rf1 TRUE 0.999 -3.000 0.084 1.000 Y 0.941
 295825 295826 SMU.1085 SMU.1086 rf1 kitH TRUE 0.957 60.000 0.062 1.000 N 0.945
 295827 295828 SMU.1087 SMU.1088   apbE TRUE 0.578 82.000 0.189 1.000   0.462
 295828 295829 SMU.1088 SMU.1089 apbE   TRUE 0.993 25.000 0.243 NA   0.946
 295829 295830 SMU.1089 SMU.1090     TRUE 0.996 20.000 0.588 NA   0.929
 295830 295831 SMU.1090 SMU.1091   wapE FALSE 0.003 242.000 0.000 NA   0.068
 295831 295832 SMU.1091 SMU.1093 wapE   FALSE 0.062 330.000 0.000 1.000   0.423
 295832 295833 SMU.1093 SMU.1094     TRUE 0.991 16.000 0.667 1.000   0.755
 295834 295835 SMU.1095 SMU.1096 opuBc opuBa TRUE 0.998 0.000 0.382 1.000 N 0.944
 295835 295836 SMU.1096 SMU.1097c opuBa   TRUE 0.997 -3.000 0.046 1.000 N 0.961
 295836 295837 SMU.1097c SMU.1098c     TRUE 0.995 0.000 0.231 1.000 N 0.789
 295837 295838 SMU.1098c SMU.1100c     FALSE 0.003 273.000 0.000 NA   -0.278
 295838 295839 SMU.1100c SMU.1102   ascB FALSE 0.003 385.000 0.000 NA   -0.531
 295839 295840 SMU.1102 SMU.1104c ascB   TRUE 0.907 208.000 0.000 1.000 Y 0.927
 295840 295841 SMU.1104c SMU.1105c     TRUE 0.999 -3.000 0.000 0.025 Y 0.942
 295841 295842 SMU.1105c SMU.1106c     TRUE 0.999 12.000 0.667 0.025 Y 0.906
 295842 295843 SMU.1106c SMU.1107c     FALSE 0.464 557.000 0.000 1.000 N 0.850
 295843 295844 SMU.1107c SMU.1108c     TRUE 0.805 132.000 0.071 1.000   0.804
 295844 295845 SMU.1108c SMU.1109c     FALSE 0.061 215.000 0.000 NA   0.379
 295845 295846 SMU.1109c SMU.1111c     FALSE 0.028 280.000 0.000 NA   0.310
 295846 295847 SMU.1111c SMU.1112c     FALSE 0.205 220.000 0.024 NA   0.481
 295847 295848 SMU.1112c SMU.1113   srtA FALSE 0.006 218.000 0.039 NA N 0.015
 295848 295849 SMU.1113 SMU.1114 srtA gyrA TRUE 0.962 7.000 0.013 NA N 0.694
 295851 295852 SMU.1116c SMU.1117   naoX FALSE 0.158 167.000 0.000 NA   0.478
 295852 295853 SMU.1117 SMU.1118c naoX   FALSE 0.003 240.000 0.000 1.000   -0.114
 295853 295854 SMU.1118c SMU.1119c     TRUE 0.996 2.000 0.720 0.035   0.798
 295854 295855 SMU.1119c SMU.1120     TRUE 0.996 -7.000 0.438 1.000   0.732
 295855 295856 SMU.1120 SMU.1121c     FALSE 0.444 118.000 0.036 1.000   0.543
 295856 295857 SMU.1121c SMU.1122   cdd FALSE 0.398 90.000 0.300 1.000   0.190
 295857 295858 SMU.1122 SMU.1123 cdd deoC TRUE 0.995 -10.000 0.051 1.000 Y 0.499
 295858 295859 SMU.1123 SMU.1124 deoC pdp TRUE 0.981 19.000 0.106 1.000 Y 0.461
 295859 295860 SMU.1124 SMU.1125c pdp   TRUE 0.855 109.000 0.044 1.000 N 0.877
 295861 295862 SMU.1126 SMU.1127 coaA rpsT FALSE 0.014 72.000 0.014 1.000 N -0.056
 295863 295864 SMU.1128 SMU.1129 ciaH ciaR TRUE 1.000 -10.000 0.606 0.013 Y 0.836
 295864 295865 SMU.1129 SMU.1131c ciaR   TRUE 0.884 51.000 0.000 NA   0.783
 295865 295866 SMU.1131c SMU.1132   pepN FALSE 0.003 401.000 0.000 NA   -0.277
 295866 295867 SMU.1132 SMU.1133 pepN phoU TRUE 0.972 41.000 0.067 NA N 0.895
 295867 295868 SMU.1133 SMU.1134c phoU   TRUE 0.997 32.000 0.413 NA Y 0.882
 295868 295869 SMU.1134c SMU.1135   pstB TRUE 0.999 12.000 0.542 0.001 Y 0.849
 295869 295870 SMU.1135 SMU.1136 pstB pstC TRUE 0.999 16.000 0.490 0.002 Y 0.917
 295870 295871 SMU.1136 SMU.1137 pstC pstC1 TRUE 1.000 -10.000 0.907 0.002 Y 0.951
 295871 295872 SMU.1137 SMU.1138 pstC1 pstS TRUE 0.988 73.000 0.206 1.000 Y 0.941
 295872 295873 SMU.1138 SMU.1139c pstS   TRUE 0.682 97.000 0.303 NA N 0.627
 295873 295874 SMU.1139c SMU.1140c     TRUE 0.721 64.000 0.229 NA N 0.529
 295874 295875 SMU.1140c SMU.1141c     TRUE 0.980 56.000 0.337 NA   0.929
 295875 295876 SMU.1141c SMU.1142c     TRUE 0.979 -7.000 0.169 NA   0.441
 295876 295877 SMU.1142c SMU.1143c     FALSE 0.432 61.000 0.017 1.000 N 0.415
 295877 295878 SMU.1143c SMU.1144   truB TRUE 0.989 31.000 0.308 1.000 N 0.913
 295878 295879 SMU.1144 SMU.1145c truB   FALSE 0.008 110.000 0.000 1.000 N -0.490
 295879 295880 SMU.1145c SMU.1146c     TRUE 0.997 1.000 0.000 1.000 Y 0.796
 295880 295881 SMU.1146c SMU.1147c     TRUE 0.955 19.000 0.000 NA   0.740
 295882 295883 SMU.1148 SMU.1149     TRUE 0.996 0.000 0.111 NA   0.872
 295883 295884 SMU.1149 SMU.1150     TRUE 0.996 -3.000 0.095 NA   0.820
 295885 295886 SMU.1151c SMU.1152c     TRUE 0.998 -3.000 0.229 NA   0.878
 295886 295887 SMU.1152c SMU.1153c     TRUE 0.720 173.000 0.000 NA   0.876
 295887 295888 SMU.1153c SMU.1154c     TRUE 0.620 419.000 0.000 1.000   0.941
 295890 295891 SMU.1156c SMU.1157c     TRUE 0.627 219.000 0.000 NA   0.860
 295891 295892 SMU.1157c SMU.1158c     TRUE 0.986 12.000 0.033 NA   0.813
 295892 295893 SMU.1158c SMU.1159c     TRUE 0.845 88.000 0.000 NA   0.891
 295893 295894 SMU.1159c SMU.1160c     TRUE 0.838 43.000 0.000 NA   0.698
 295894 295895 SMU.1160c SMU.1161c     FALSE 0.104 73.000 0.000 NA   0.305
 295895 295896 SMU.1161c SMU.1163c     FALSE 0.003 278.000 0.000 NA   0.024
 295896 295897 SMU.1163c SMU.1164c     TRUE 0.999 -7.000 0.800 0.010 Y 0.666
 295897 295898 SMU.1164c SMU.1165c     TRUE 0.945 11.000 0.750 1.000 N 0.339
 295898 295899 SMU.1165c SMU.1166c     FALSE 0.004 193.000 0.000 1.000 N -0.309
 295899 295900 SMU.1166c SMU.1167c     TRUE 0.979 16.000 0.438 1.000 N 0.678
 295902 295903 SMU.1169c SMU.1170   ccdA TRUE 0.995 14.000 0.000 1.000 Y 0.826
 295903 295904 SMU.1170 SMU.1171c ccdA   FALSE 0.084 197.000 0.000 1.000   0.408
 295904 295905 SMU.1171c SMU.1172c     FALSE 0.009 97.000 0.000 NA   0.158
 295905 295906 SMU.1172c SMU.1173   cysD TRUE 0.984 14.000 0.000 NA   0.875
 295906 295907 SMU.1173 SMU.1174 cysD pcrA FALSE 0.529 281.000 0.000 1.000 N 0.858
 295908 295909 SMU.1175 SMU.1176     TRUE 0.789 99.000 0.060 0.070 N 0.798
 295910 295911 SMU.1177c SMU.1178c     TRUE 0.997 22.000 0.154 1.000 Y 0.855
 295911 295912 SMU.1178c SMU.1179c     TRUE 0.997 9.000 0.130 1.000 Y 0.765
 295912 295913 SMU.1179c SMU.1180   phnA TRUE 0.730 191.000 0.018 1.000 N 0.875
 295913 295914 SMU.1180 SMU.1182 phnA mtlD FALSE 0.005 175.000 0.007 1.000 N -0.531
 295914 295915 SMU.1182 SMU.1183 mtlD mtlA2 TRUE 0.997 16.000 0.062 1.000 Y 0.822
 295915 295916 SMU.1183 SMU.1184c mtlA2   TRUE 0.987 2.000 0.131 0.013 N 0.748
 295916 295917 SMU.1184c SMU.1185   mtlA1 TRUE 0.966 30.000 0.336 0.013 N 0.728
 295917 295918 SMU.1185 SMU.1187 mtlA1 glmS FALSE 0.002 548.000 0.003 1.000 N -0.456
 295918 295919 SMU.1187 SMU.1188 glmS lepB FALSE 0.255 173.000 0.011 1.000   0.517
 295919 295920 SMU.1188 SMU.1189c lepB   FALSE 0.079 79.000 0.000 0.063   0.324
 295920 295921 SMU.1189c SMU.1190   pykF FALSE 0.086 291.000 0.000 1.000   0.464
 295921 295922 SMU.1190 SMU.1191 pykF pfk TRUE 0.816 74.000 0.261 0.005 Y 0.257
 295922 295923 SMU.1191 SMU.1192 pfk dnaE FALSE 0.011 83.000 0.098 1.000 N -0.551
 295924 295925 SMU.1193 SMU.1194     TRUE 0.998 -3.000 0.412 1.000 N 0.900
 295925 295926 SMU.1194 SMU.1195     TRUE 0.995 10.000 0.471 NA   0.838
 400945 295929 SMUt37 SMU.1200 tRNA-Arg rs1 FALSE 0.304 138.000 0.000 NA   NA
 295929 400944 SMU.1200 SMUt38 rs1 tRNA-Gln FALSE 0.324 130.000 0.000 NA   NA
 400944 400943 SMUt38 SMUt39 tRNA-Gln tRNA-Tyr FALSE 0.279 157.000 0.000 NA   NA
 400943 295930 SMUt39 SMU.1201c tRNA-Tyr   TRUE 0.593 60.000 0.000 NA   NA
 295930 295931 SMU.1201c SMU.1203   ilvE FALSE 0.236 134.000 0.095 NA   0.272
 295931 295932 SMU.1203 SMU.1204 ilvE parC FALSE 0.003 243.000 0.086 1.000 N -0.360
 295932 295933 SMU.1204 SMU.1205c parC   FALSE 0.476 193.000 0.000 1.000   0.749
 295933 295934 SMU.1205c SMU.1206c     TRUE 0.781 103.000 0.000 1.000   0.844
 295934 295935 SMU.1206c SMU.1207   fic TRUE 0.790 118.000 0.000 1.000   0.868
 295935 295936 SMU.1207 SMU.1208c fic   TRUE 0.947 45.000 0.000 NA   0.881
 295936 295937 SMU.1208c SMU.1209c     TRUE 0.639 276.000 0.000 NA   0.916
 295937 295938 SMU.1209c SMU.1210   parE TRUE 0.973 16.000 0.000 NA   0.794
 295940 295941 SMU.1213c SMU.1214   pyrC TRUE 0.937 186.000 0.005 1.000 Y 0.936
 295941 295942 SMU.1214 SMU.1215 pyrC ung TRUE 0.988 10.000 0.009 1.000 N 0.893
 295942 295943 SMU.1215 SMU.1216c ung   TRUE 0.913 23.000 0.025 1.000 N 0.638
 295943 295944 SMU.1216c SMU.1217c     FALSE 0.453 150.000 0.125 0.034 Y -0.123
 295944 295945 SMU.1217c SMU.1218   nylA FALSE 0.218 115.000 0.136 1.000 N 0.233
 295945 295946 SMU.1218 SMU.1219c nylA   FALSE 0.209 60.000 0.000 NA   0.334
 295946 295947 SMU.1219c SMU.1220c     FALSE 0.005 174.000 0.000 NA   -0.377
 295947 295948 SMU.1220c SMU.1221   pyrE FALSE 0.153 332.000 0.000 NA   0.600
 295948 295949 SMU.1221 SMU.1222 pyrE pyrF TRUE 0.785 101.000 0.133 1.000 Y 0.395
 295949 295950 SMU.1222 SMU.1223 pyrF pyrDB TRUE 0.982 -7.000 0.154 0.003 Y -0.182
 295950 295951 SMU.1223 SMU.1224 pyrDB pyrK TRUE 0.971 10.000 0.592 1.000 N 0.555
 295953 295954 SMU.1226c SMU.1227   deoD TRUE 0.994 2.000 0.107 NA   0.831
 295954 295955 SMU.1227 SMU.1228c deoD   TRUE 0.899 214.000 0.000 1.000 Y 0.912
 295955 295956 SMU.1228c SMU.1229   punA TRUE 0.998 10.000 0.029 1.000 Y 0.882
 295956 295957 SMU.1229 SMU.1230c punA   TRUE 0.984 11.000 0.000 NA   0.867
 295957 295958 SMU.1230c SMU.1231c     TRUE 0.728 119.000 0.000 NA   0.817
 295958 295959 SMU.1231c SMU.1232c     TRUE 0.747 109.000 0.000 NA   0.823
 295959 295960 SMU.1232c SMU.1233   deoB TRUE 0.995 2.000 0.120 NA   0.861
 295960 295961 SMU.1233 SMU.1234 deoB rpiA TRUE 0.987 55.000 0.018 1.000 Y 0.866
 295963 295964 SMU.1236c SMU.1237c     TRUE 0.679 18.000 0.000 NA   0.389
 295964 295965 SMU.1237c SMU.1238c     FALSE 0.015 521.000 0.000 NA   0.276
 295965 295966 SMU.1238c SMU.1239   pepV TRUE 0.832 73.000 0.031 NA N 0.788
 295966 295967 SMU.1239 SMU.1240c pepV   TRUE 0.887 15.000 0.179 1.000 N 0.341
 295967 295968 SMU.1240c SMU.1241   uvrC FALSE 0.287 147.000 0.004 1.000 N 0.575
 295970 295971 SMU.1245c SMU.1246c     FALSE 0.029 352.000 0.000 1.000   0.331
 295971 295972 SMU.1246c SMU.1247   eno FALSE 0.093 64.000 0.000 1.000   0.265
 295972 295973 SMU.1247 SMU.1249c eno   FALSE 0.219 397.000 0.000 1.000   0.671
 295973 295974 SMU.1249c SMU.1250c     TRUE 0.970 38.000 0.000 NA   0.957
 295976 295977 SMU.1252 SMU.1253c grk   TRUE 0.987 11.000 0.000 1.000   0.916
 295979 295980 SMU.1255c SMU.1256c     FALSE 0.141 211.000 0.000 NA   0.521
 295980 295981 SMU.1256c SMU.1257c     FALSE 0.302 -7.000 0.000 NA   0.118
 295981 295982 SMU.1257c SMU.1258c     FALSE 0.008 123.000 0.000 NA   0.129
 295984 295985 SMU.1260c SMU.1261c     TRUE 0.989 13.000 0.000 NA   0.951
 295985 295986 SMU.1261c SMU.1262c     TRUE 0.887 80.000 0.000 NA   0.960
 295986 295987 SMU.1262c SMU.1263   hisI TRUE 0.827 114.000 0.000 NA   0.916
 295987 295988 SMU.1263 SMU.1264 hisI hisF TRUE 1.000 0.000 0.430 0.006 Y 0.965
 295988 295989 SMU.1264 SMU.1265 hisF hisA TRUE 0.999 3.000 0.433 0.006 Y 0.965
 295989 295990 SMU.1265 SMU.1266 hisA hisH TRUE 0.930 440.000 0.124 0.006 Y 0.968
 295990 295991 SMU.1266 SMU.1267c hisH   TRUE 0.996 -3.000 0.000 NA   0.968
 295991 295992 SMU.1267c SMU.1268   hisB TRUE 0.991 7.000 0.000 NA   0.956
 295992 295993 SMU.1268 SMU.1269 hisB serB TRUE 0.999 -3.000 0.002 1.000 Y 0.965
 295993 295994 SMU.1269 SMU.1270 serB hisD TRUE 0.999 -13.000 0.003 1.000 Y 0.933
 295994 295995 SMU.1270 SMU.1271 hisD hisG TRUE 1.000 -3.000 0.254 0.006 Y 0.910
 295995 295996 SMU.1271 SMU.1272 hisG hisZ TRUE 0.999 10.000 0.239 1.000 Y 0.929
 295996 295997 SMU.1272 SMU.1273 hisZ hisC TRUE 0.999 -3.000 0.012 1.000 Y 0.911
 295997 295998 SMU.1273 SMU.1276c hisC   FALSE 0.002 1174.000 0.000 1.000 N 0.023
 295998 295999 SMU.1276c SMU.1277   gyrB FALSE 0.009 96.000 0.011 1.000 N 0.045
 295999 296000 SMU.1277 SMU.1278c gyrB   TRUE 0.978 0.000 0.013 1.000   0.663
 296000 296001 SMU.1278c SMU.1279c     FALSE 0.569 422.000 0.385 1.000   0.708
 296001 296002 SMU.1279c SMU.1280c     FALSE 0.004 207.000 0.000 NA N -0.371
 400942 296004 SMUt40 SMU.1284c tRNA-Arg   FALSE 0.426 80.000 0.000 NA   NA
 296004 296005 SMU.1284c SMU.1286c     TRUE 0.993 2.000 0.000 1.000   0.939
 296007 296008 SMU.1288 SMU.1289c rl19   FALSE 0.005 189.000 0.006 1.000 N -0.798
 296008 296009 SMU.1289c SMU.1290c     TRUE 0.970 86.000 0.031 0.001 Y 0.892
 296009 296010 SMU.1290c SMU.1291c     TRUE 0.998 -10.000 0.094 1.000 N 0.949
 296010 296011 SMU.1291c SMU.1292c     FALSE 0.033 46.000 0.050 NA   -0.244
 296011 296012 SMU.1292c SMU.1293c     FALSE 0.075 422.000 0.000 NA   0.464
 296012 296013 SMU.1293c SMU.1294   flaW FALSE 0.006 160.000 0.003 1.000 N -0.386
 296013 296014 SMU.1294 SMU.1295 flaW add TRUE 0.910 59.000 0.034 1.000 N 0.807
 296015 296016 SMU.1296 SMU.1297     TRUE 0.924 72.000 0.013 1.000   0.938
 296016 296017 SMU.1297 SMU.1298   rl31 TRUE 0.839 97.000 0.020 1.000   0.831
 296018 296019 SMU.1299c SMU.1300c     TRUE 0.989 -7.000 0.150 NA   0.616
 296019 296020 SMU.1300c SMU.1301c     TRUE 0.581 54.000 0.026 1.000   0.404
 296020 296021 SMU.1301c SMU.1302   adcA TRUE 0.626 161.000 0.000 1.000 N 0.821
 296021 296022 SMU.1302 SMU.1303c adcA   FALSE 0.030 227.000 0.250 1.000 N -0.246
 296022 296023 SMU.1303c SMU.1304c     TRUE 0.589 363.000 0.015 NA   0.830
 296023 296024 SMU.1304c SMU.1305c     TRUE 0.998 -3.000 0.470 NA   0.861
 296024 296025 SMU.1305c SMU.1306c     TRUE 0.998 -3.000 0.214 NA   0.955
 296025 296026 SMU.1306c SMU.1307c     TRUE 0.996 -7.000 0.030 NA   0.818
 296026 296027 SMU.1307c SMU.1308   aldR FALSE 0.504 131.000 0.000 NA   0.702
 296027 296028 SMU.1308 SMU.1309c aldR   TRUE 0.912 30.000 0.000 NA N 0.740
 296030 296031 SMU.1311 SMU.1312 asnS aspB TRUE 0.953 47.000 0.068 1.000 N 0.842
 296031 296032 SMU.1312 SMU.1313c aspB   TRUE 0.664 66.000 0.028 1.000 N 0.632
 296034 296035 SMU.1315c SMU.1316c     TRUE 0.991 2.000 0.000 NA   0.879
 296035 296036 SMU.1316c SMU.1317c     TRUE 0.970 38.000 0.000 NA   0.951
 296036 296037 SMU.1317c SMU.1319c     FALSE 0.002 831.000 0.000 NA   -0.286
 296037 296038 SMU.1319c SMU.1321c     TRUE 0.841 190.000 0.217 NA   0.861
 296038 296039 SMU.1321c SMU.1322   budC FALSE 0.007 144.000 0.000 1.000 N -0.386
 296041 296042 SMU.1324 SMU.1325 ftsX ftsE TRUE 0.998 -7.000 0.431 1.000 Y 0.643
 296042 296043 SMU.1325 SMU.1326 ftsE rf2 TRUE 0.926 22.000 0.053 1.000 N 0.635
 296043 296044 SMU.1326 SMU.1327c rf2   FALSE 0.005 168.000 0.006 1.000 N -0.222
 296044 296045 SMU.1327c SMU.1329c     FALSE 0.002 760.000 0.000 1.000   0.036
 296045 296046 SMU.1329c SMU.1330c     FALSE 0.406 46.000 0.000 NA   0.399
 296046 296047 SMU.1330c SMU.1331c     FALSE 0.012 75.000 0.000 NA   0.184
 296047 296048 SMU.1331c SMU.1332c     FALSE 0.090 88.000 0.000 NA   0.312
 296048 296049 SMU.1332c SMU.1334   sfp FALSE 0.002 782.000 0.000 NA   -0.161
 296049 296050 SMU.1334 SMU.1335c sfp   TRUE 0.981 28.000 0.000 1.000   0.964
 296050 296051 SMU.1335c SMU.1336   pksD TRUE 0.989 13.000 0.000 1.000   0.952
 296051 296052 SMU.1336 SMU.1337c pksD   TRUE 0.979 29.000 0.000 NA   0.945
 296052 296053 SMU.1337c SMU.1338c     TRUE 0.978 29.000 0.000 NA   0.931
 296053 296054 SMU.1338c SMU.1339   bacD TRUE 0.858 91.000 0.000 1.000   0.929
 296054 296055 SMU.1339 SMU.1340 bacD bacA2 TRUE 0.949 98.000 0.000 0.003 Y 0.911
 296055 296056 SMU.1340 SMU.1341c bacA2   TRUE 0.999 0.000 0.000 0.003 Y 0.944
 296056 296057 SMU.1341c SMU.1342   bacA1 TRUE 0.996 19.000 0.000 0.002 Y 0.959
 296057 296058 SMU.1342 SMU.1343c bacA1   TRUE 0.954 46.000 0.000 0.002   0.964
 296058 296059 SMU.1343c SMU.1344c     TRUE 0.958 45.000 0.000 0.012   0.964
 296059 296060 SMU.1344c SMU.1345c     TRUE 0.997 15.000 0.000 0.056 Y 0.957
 296060 296061 SMU.1345c SMU.1346   bacT TRUE 0.997 12.000 0.000 1.000 Y 0.956
 296061 296062 SMU.1346 SMU.1347c bacT   FALSE 0.302 -7.000 0.000 1.000 N -0.122
 296062 296063 SMU.1347c SMU.1348c     TRUE 0.853 5.000 0.300 1.000 N 0.061
 296064 296065 SMU.1349 SMU.1351     FALSE 0.048 183.000 0.000 NA   0.326
 296065 296066 SMU.1351 SMU.1352     TRUE 0.999 -22.000 1.000 NA   0.812
 296066 296067 SMU.1352 SMU.1353     TRUE 0.957 25.000 0.000 1.000   0.786
 296068 296069 SMU.1354c SMU.1355c     TRUE 0.876 15.000 0.000 NA   0.562
 296069 296070 SMU.1355c SMU.1356c     TRUE 0.941 15.000 0.000 NA   0.686
 296071 296072 SMU.1357 SMU.1358     TRUE 0.968 11.000 0.000 NA   0.761
 296072 296073 SMU.1358 SMU.1359     FALSE 0.496 136.000 0.000 NA   0.705
 296074 296075 SMU.1360c SMU.1361c     TRUE 0.972 -22.000 0.000 NA   0.633
 296075 296076 SMU.1361c SMU.1363c     FALSE 0.096 641.000 0.000 1.000   0.529
 296076 296077 SMU.1363c SMU.1365c     FALSE 0.300 434.000 0.000 1.000   0.726
 296077 296078 SMU.1365c SMU.1366c     TRUE 0.997 2.000 0.300 1.000 N 0.929
 296078 296079 SMU.1366c SMU.1367c     TRUE 0.982 13.000 0.000 1.000 N 0.880
 296080 296081 SMU.1368 SMU.1369     FALSE 0.451 241.000 0.000 NA   0.770
 296082 296083 SMU.1370c SMU.1372c     FALSE 0.002 762.000 0.000 1.000   -0.545
 296083 296084 SMU.1372c SMU.1373c     FALSE 0.501 176.000 0.000 0.021   0.758
 296086 296087 SMU.1375c SMU.1377c     FALSE 0.008 118.000 0.000 NA   0.002
 296088 296089 SMU.1378 SMU.1379     FALSE 0.237 156.000 0.000 1.000   0.552
 296089 10942652 SMU.1379 SMU.1380     FALSE 0.294 -6.000 0.000 NA   0.068
 296090 296091 SMU.1381 SMU.1382 leuD leuC TRUE 0.999 2.000 0.477 0.001 Y 0.876
 296091 296092 SMU.1382 SMU.1383 leuC leuB TRUE 0.939 126.000 0.000 0.002 Y 0.907
 296092 296093 SMU.1383 SMU.1384 leuB leuA TRUE 0.997 10.000 0.005 0.002 Y 0.924
 296093 296094 SMU.1384 SMU.1386 leuA urk FALSE 0.003 326.000 0.000 1.000 N -0.312
 296095 296096 SMU.1387 SMU.1388     TRUE 0.988 -3.000 0.200 1.000   0.606
 296099 296100 SMU.1391c SMU.1392c     FALSE 0.036 80.000 0.000 NA   0.236
 296100 296101 SMU.1392c SMU.1393c     TRUE 0.753 79.000 0.000 NA   0.782
 296101 296102 SMU.1393c SMU.1394   lepA TRUE 0.843 29.000 0.000 NA   0.625
 296102 296103 SMU.1394 SMU.1395c lepA   FALSE 0.003 249.000 0.000 NA   -0.383
 296103 296104 SMU.1395c SMU.1396   gbpC FALSE 0.027 395.000 0.000 NA   0.326
 296104 296105 SMU.1396 SMU.1397c gbpC   FALSE 0.125 209.000 0.000 1.000   0.489
 296106 296107 SMU.1398 SMU.1399     FALSE 0.003 268.000 0.000 NA   -0.339
 11477443 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7032.000 0.000 NA   NA
 11619806 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7032.000 0.000 NA   NA
 11762198 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7032.000 0.000 NA   NA
 11477444 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7068.000 0.000 NA   NA
 11619807 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7068.000 0.000 NA   NA
 11762199 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7068.000 0.000 NA   NA
 11477445 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7098.000 0.000 NA   NA
 11619808 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7098.000 0.000 NA   NA
 11762200 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7098.000 0.000 NA   NA
 11477446 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7134.000 0.000 NA   NA
 11619809 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7134.000 0.000 NA   NA
 11762201 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7134.000 0.000 NA   NA
 11477447 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7164.000 0.000 NA   NA
 11619810 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7164.000 0.000 NA   NA
 11762202 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7164.000 0.000 NA   NA
 11477448 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7200.000 0.000 NA   NA
 11619811 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7200.000 0.000 NA   NA
 11762203 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7200.000 0.000 NA   NA
 11477449 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7230.000 0.000 NA   NA
 11619812 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7230.000 0.000 NA   NA
 11762204 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7230.000 0.000 NA   NA
 11477450 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7266.000 0.000 NA   NA
 11619813 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7266.000 0.000 NA   NA
 11762205 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7266.000 0.000 NA   NA
 11477451 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7296.000 0.000 NA   NA
 11619814 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7296.000 0.000 NA   NA
 11762206 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7296.000 0.000 NA   NA
 11477452 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7332.000 0.000 NA   NA
 11619815 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7332.000 0.000 NA   NA
 11762207 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7332.000 0.000 NA   NA
 11477453 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7362.000 0.000 NA   NA
 11619816 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7362.000 0.000 NA   NA
 11762208 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7362.000 0.000 NA   NA
 11477454 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7398.000 0.000 NA   NA
 11619817 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7398.000 0.000 NA   NA
 11762209 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7398.000 0.000 NA   NA
 11477455 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7428.000 0.000 NA   NA
 11619818 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7428.000 0.000 NA   NA
 11762210 296100   SMU.1392c     FALSE NA 7428.000 0.000 NA   NA
 296108 296109 SMU.1400c SMU.1402c     FALSE 0.019 306.000 0.000 NA   0.284
 296109 296110 SMU.1402c SMU.1403c     TRUE 0.920 80.000 0.253 NA   0.826
 296110 296111 SMU.1403c SMU.1404c     TRUE 0.997 12.000 0.876 NA   0.921
 296111 296112 SMU.1404c SMU.1405c     TRUE 0.998 0.000 0.546 NA   0.885
 296112 296113 SMU.1405c SMU.1406c     FALSE 0.007 381.000 0.000 NA   0.230
 296113 296114 SMU.1406c SMU.1407c     FALSE 0.348 116.000 0.000 NA   NA
 296114 296115 SMU.1407c SMU.1408c     TRUE 0.999 -6.000 1.000 0.053 Y NA
 296115 296116 SMU.1408c SMU.1409c     FALSE 0.295 95.000 0.000 0.053 N NA
 296117 296118 SMU.1410 SMU.1411     TRUE 0.901 67.000 0.500 1.000   0.702
 296119 296120 SMU.1412c SMU.1414c     FALSE 0.010 95.000 0.000 NA   -0.657
 296120 296121 SMU.1414c SMU.1415c     TRUE 0.999 -10.000 0.330 NA   0.908
 296121 296122 SMU.1415c SMU.1416c     TRUE 0.979 15.000 0.023 1.000 N 0.794
 296122 296123 SMU.1416c SMU.1417c     TRUE 0.973 21.000 0.015 1.000 N 0.801
 296123 296124 SMU.1417c SMU.1418   hemN TRUE 0.977 3.000 0.060 1.000 N 0.697
 296125 296126 SMU.1419 SMU.1420     TRUE 0.992 -3.000 0.150 1.000   0.696
 296127 296128 SMU.1421 SMU.1422 pdhC pdhB TRUE 0.999 14.000 0.295 0.054 Y 0.961
 296128 296129 SMU.1422 SMU.1423 pdhB pdhA TRUE 0.999 13.000 0.804 0.002 Y 0.963
 296129 296130 SMU.1423 SMU.1424 pdhA pdhD TRUE 0.997 26.000 0.054 1.000 Y 0.974
 296130 296131 SMU.1424 SMU.1425 pdhD clpB FALSE 0.064 229.000 0.000 1.000 N 0.449
 296131 296132 SMU.1425 SMU.1426c clpB   FALSE 0.004 193.000 0.000 1.000 N 0.175
 296132 296133 SMU.1426c SMU.1427c     TRUE 0.947 51.000 0.150 NA   0.783
 296133 296134 SMU.1427c SMU.1428c     TRUE 0.998 -7.000 0.502 NA   0.827
 296135 296136 SMU.1429 SMU.1430 murC2 cobQ TRUE 0.998 0.000 0.796 1.000   0.892
 296137 296138 SMU.1431c SMU.1432c     FALSE 0.011 82.000 0.000 1.000   -0.457
 296138 296139 SMU.1432c SMU.1434c     TRUE 0.697 234.000 0.016 NA N 0.895
 296139 296140 SMU.1434c SMU.1435c     TRUE 0.816 119.000 0.000 NA   0.906
 296140 296141 SMU.1435c SMU.1436c     TRUE 0.988 14.000 0.000 NA   0.930
 296141 296142 SMU.1436c SMU.1437   epsC TRUE 0.991 8.000 0.000 NA   0.971
 296142 296143 SMU.1437 SMU.1438c epsC   FALSE 0.469 327.000 0.000 1.000 N 0.834
 296143 296144 SMU.1438c SMU.1442c     FALSE 0.002 601.000 0.000 NA   -0.310
 296144 296145 SMU.1442c SMU.1443c     FALSE 0.014 71.000 0.000 NA   0.150
 296145 296146 SMU.1443c SMU.1444c     FALSE 0.008 488.000 0.143 NA   -0.344
 296146 296147 SMU.1444c SMU.1445c     FALSE 0.003 247.000 0.026 1.000   -0.167
 296147 296148 SMU.1445c SMU.1446c     TRUE 0.997 -3.000 0.895 1.000   0.741
 296148 296149 SMU.1446c SMU.1447c     TRUE 0.576 111.000 0.368 NA   0.458
 296150 296151 SMU.1449 SMU.1450     FALSE 0.003 305.000 0.000 NA N -0.358
 296152 296153 SMU.1451 SMU.1452 aldB alsS TRUE 0.904 14.000 0.044 1.000 N 0.520
 296153 296154 SMU.1452 SMU.1453c alsS   FALSE 0.279 133.000 0.022 1.000   0.430
 296154 296155 SMU.1453c SMU.1454c     FALSE 0.278 239.000 0.048 NA   0.558
 296155 296156 SMU.1454c SMU.1455   mutX TRUE 0.637 69.000 0.074 NA   0.543
 296156 296157 SMU.1455 SMU.1456c mutX   FALSE 0.275 -3.000 0.000 NA   0.050
 296157 296158 SMU.1456c SMU.1457   rmlB FALSE 0.005 170.000 0.000 NA   -0.143
 296158 296159 SMU.1457 SMU.1459c rmlB   TRUE 0.575 404.000 0.100 NA   0.776
 296159 296160 SMU.1459c SMU.1460   rmlC TRUE 0.777 63.000 0.150 NA   0.585
 296160 296161 SMU.1460 SMU.1461 rmlC rmlA TRUE 0.711 137.000 0.149 1.000 Y 0.329
 296161 296162 SMU.1461 SMU.1462c rmlA   FALSE 0.104 65.000 0.059 1.000 N 0.046
 296162 296163 SMU.1462c SMU.1463c     TRUE 0.701 27.000 0.021 NA   0.309
 296163 296164 SMU.1463c SMU.1464c     TRUE 0.994 -10.000 0.283 NA   0.668
 296164 296165 SMU.1464c SMU.1465c     TRUE 0.942 -10.000 0.012 NA   0.390
 296165 296166 SMU.1465c SMU.1466   metA TRUE 0.933 10.000 0.021 NA N 0.610
 296166 296167 SMU.1466 SMU.1467 metA apt TRUE 0.685 104.000 0.009 1.000 N 0.764
 296167 296168 SMU.1467 SMU.1470c apt   FALSE 0.002 673.000 0.000 NA   -0.312
 296168 296169 SMU.1470c SMU.1471c     FALSE 0.238 253.000 0.294 NA   0.333
 296169 296170 SMU.1471c SMU.1472   recJ FALSE 0.008 120.000 0.000 1.000 N -0.464
 296170 296171 SMU.1472 SMU.1473c recJ   TRUE 0.994 -3.000 0.016 1.000   0.801
 296171 296172 SMU.1473c SMU.1474c     TRUE 0.995 -3.000 0.074 1.000   0.788
 296172 296173 SMU.1474c SMU.1475c     TRUE 0.966 28.000 0.022 NA   0.772
 296173 296174 SMU.1475c SMU.1476c     TRUE 0.997 -13.000 0.014 NA   0.867
 296174 296175 SMU.1476c SMU.1477   miaA TRUE 0.723 189.000 0.027 1.000   0.826
 296176 296177 SMU.1479 SMU.1480     FALSE 0.004 322.000 0.000 NA   0.210
 296178 296179 SMU.1482c SMU.1483c     TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA   0.795
 296179 296180 SMU.1483c SMU.1484c     TRUE 0.693 84.000 0.000 NA   0.749
 296180 296181 SMU.1484c SMU.1485c     TRUE 0.996 -13.000 0.467 NA   0.708
 296181 296182 SMU.1485c SMU.1486c     TRUE 0.968 7.000 0.000 NA   0.737
 296184 296185 SMU.1488c SMU.1489   lacX TRUE 0.982 20.000 0.000 NA   0.894
 296185 296186 SMU.1489 SMU.1490 lacX lacG TRUE 0.837 247.000 0.000 1.000 Y 0.828
 296186 296187 SMU.1490 SMU.1491 lacG lacE TRUE 0.997 12.000 0.000 1.000 Y 0.933
 296187 296188 SMU.1491 SMU.1492 lacE lacF TRUE 0.985 7.000 0.000 0.012 Y 0.648
 296188 296189 SMU.1492 SMU.1493 lacF lacD TRUE 0.994 16.000 0.000 1.000 Y 0.803
 296189 296190 SMU.1493 SMU.1494 lacD lacC TRUE 0.999 5.000 0.500 0.002 Y 0.954
 296190 296191 SMU.1494 SMU.1495 lacC lacB TRUE 0.997 19.000 0.000 1.000 Y 0.961
 296191 296192 SMU.1495 SMU.1496 lacB lacA TRUE 0.998 26.000 0.750 0.001 Y 0.826
 296192 296193 SMU.1496 SMU.1498 lacA lacR FALSE 0.146 307.000 0.000 1.000 Y -0.060
 296193 296194 SMU.1498 SMU.1499 lacR rexA FALSE 0.004 225.000 0.000 1.000 N -0.193
 296194 296195 SMU.1499 SMU.1500 rexA rexB TRUE 0.994 -10.000 0.070 0.052 Y 0.416
 296195 296196 SMU.1500 SMU.1502c rexB   FALSE 0.040 872.000 0.000 NA   0.385
 296196 296197 SMU.1502c SMU.1504c     FALSE 0.005 175.000 0.000 NA   -0.300
 296197 296198 SMU.1504c SMU.1505c     FALSE 0.003 364.000 0.000 NA   0.025
 296198 296199 SMU.1505c SMU.1506c     FALSE 0.514 366.000 0.000 1.000   0.840
 296199 296200 SMU.1506c SMU.1507c     TRUE 0.996 -3.000 0.182 NA   0.789
 296200 296201 SMU.1507c SMU.1508c     TRUE 0.997 -3.000 0.125 NA   0.837
 296201 296202 SMU.1508c SMU.1509   rgg FALSE 0.099 206.000 0.000 1.000   0.439
 296202 296203 SMU.1509 SMU.1510 rgg syfB FALSE 0.004 211.000 0.000 1.000   -0.402
 296203 296204 SMU.1510 SMU.1511c syfB   TRUE 0.954 14.000 0.007 1.000   0.681
 296204 296205 SMU.1511c SMU.1512   syfA TRUE 0.787 73.000 0.009 1.000   0.749
 296205 296206 SMU.1512 SMU.1513 syfA smc FALSE 0.003 441.000 0.000 1.000 N -0.175
 296206 296207 SMU.1513 SMU.1514 smc rnc TRUE 0.917 0.000 0.120 1.000 N 0.285
 296207 296208 SMU.1514 SMU.1515 rnc covX FALSE 0.219 107.000 0.002 1.000   0.401
 296208 296209 SMU.1515 SMU.1516 covX covS TRUE 0.994 -3.000 0.038 1.000   0.773
 296209 296210 SMU.1516 SMU.1517 covS covR TRUE 1.000 -7.000 0.597 0.062 Y 0.823
 296211 296212 SMU.1519 SMU.1520 glnQ   TRUE 0.999 -3.000 0.185 1.000 Y 0.804
 296212 296213 SMU.1520 SMU.1521     TRUE 0.999 18.000 0.400 0.032 Y 0.942
 296213 296214 SMU.1521 SMU.1522   glnP TRUE 0.999 15.000 0.947 0.011 Y 0.940
 296215 296216 SMU.1523 SMU.1524c endA   TRUE 0.713 42.000 0.237 NA   0.215
 296216 296217 SMU.1524c SMU.1525   murA TRUE 0.940 3.000 0.110 NA   0.413
 296217 296218 SMU.1525 SMU.1526c murA   FALSE 0.330 66.000 0.279 NA   -0.091
 296218 296219 SMU.1526c SMU.1527   atpA FALSE 0.017 297.000 0.039 NA   -0.019
 296219 296220 SMU.1527 SMU.1528 atpA atpB TRUE 0.997 14.000 0.837 0.004 Y 0.685
 296220 296221 SMU.1528 SMU.1529 atpB atpC TRUE 0.990 26.000 0.724 0.004 Y 0.563
 296221 296222 SMU.1529 SMU.1530 atpC atpD TRUE 0.998 19.000 0.846 0.004 Y 0.768
 296222 296223 SMU.1530 SMU.1531 atpD atpE TRUE 0.996 16.000 0.864 0.004 Y 0.662
 296223 296224 SMU.1531 SMU.1532 atpE atpF TRUE 0.999 0.000 0.222 0.004 Y 0.920
 296224 296225 SMU.1532 SMU.1533 atpF atpG TRUE 0.996 18.000 0.032 0.004 Y 0.818
 296225 296226 SMU.1533 SMU.1534 atpG atpH TRUE 0.988 30.000 0.189 0.004   0.905
 296226 296227 SMU.1534 SMU.1535 atpH phsG FALSE 0.003 239.000 0.000 1.000   -0.626
 296227 296228 SMU.1535 SMU.1536 phsG glgA TRUE 0.998 31.000 0.171 1.000 Y 0.968
 296228 296229 SMU.1536 SMU.1537 glgA glgD TRUE 1.000 -3.000 0.395 1.000 Y 0.933
 296229 296230 SMU.1537 SMU.1538 glgD glgC TRUE 1.000 -10.000 0.810 0.001 Y 0.970
 296230 296231 SMU.1538 SMU.1539 glgC glgB TRUE 0.999 20.000 0.317 0.002 Y 0.955
 296231 296232 SMU.1539 SMU.1541 glgB pulA TRUE 0.751 217.000 0.067 0.009 Y 0.658
 296232 296233 SMU.1541 SMU.1542c pulA   TRUE 0.620 99.000 0.088 1.000 N 0.663
 296233 296234 SMU.1542c SMU.1543   dnlJ FALSE 0.115 13.000 0.013 1.000 N 0.062
 296234 296235 SMU.1543 SMU.1545c dnlJ   FALSE 0.139 210.000 0.010 NA   0.416
 296237 296238 SMU.1547c SMU.1548c     TRUE 0.996 -3.000 0.857 0.012 Y 0.327
 296238 296239 SMU.1548c SMU.1550c     FALSE 0.366 89.000 0.500 NA   0.018
 296239 296240 SMU.1550c SMU.1551c     TRUE 0.989 -3.000 0.136 NA   0.656
 296240 296241 SMU.1551c SMU.1552c     TRUE 0.728 37.000 0.000 NA   0.559
 296241 296242 SMU.1552c SMU.1553c     TRUE 0.995 -10.000 0.000 NA   0.866
 296242 296243 SMU.1553c SMU.1554c     TRUE 0.917 9.000 0.000 NA   0.614
 296243 296244 SMU.1554c SMU.1555c     FALSE 0.006 156.000 0.000 NA   -0.419
 296244 296245 SMU.1555c SMU.1556   ampM TRUE 0.967 12.000 0.373 1.000   0.549
 296245 296246 SMU.1556 SMU.1557c ampM   TRUE 0.956 18.000 0.235 1.000 N 0.599
 296246 296247 SMU.1557c SMU.1558c     TRUE 0.999 -7.000 0.342 1.000 N 0.934
 296249 296250 SMU.1561 SMU.1562 trkB trk TRUE 0.995 14.000 0.000 0.003 Y 0.860
 296250 296251 SMU.1562 SMU.1563 trk pacL TRUE 0.990 37.000 0.000 1.000 Y 0.875
 296251 296252 SMU.1563 SMU.1564 pacL glgP FALSE 0.150 272.000 0.000 1.000 N 0.619
 296252 296253 SMU.1564 SMU.1565 glgP malQ TRUE 1.000 -28.000 0.289 0.020 Y 0.921
 296253 296254 SMU.1565 SMU.1566 malQ malR FALSE 0.291 115.000 0.538 1.000 N 0.063
 296255 296256 SMU.1568 SMU.1569 malX malF TRUE 0.991 77.000 0.690 0.032 Y 0.934
 296256 296257 SMU.1569 SMU.1570 malF malG TRUE 1.000 0.000 0.793 0.032 Y 0.984
 296257 296258 SMU.1570 SMU.1571 malG   TRUE 0.996 25.000 0.000 0.032 Y 0.970
 296259 296260 SMU.1572 SMU.1573 murZ metK TRUE 0.739 144.000 0.026 1.000 N 0.813
 296260 296261 SMU.1573 SMU.1574c metK   FALSE 0.002 784.000 0.000 NA   -0.715
 296261 296262 SMU.1574c SMU.1575c     FALSE 0.205 330.000 0.000 NA   0.652
 296262 296263 SMU.1575c SMU.1576c     TRUE 0.974 -19.000 0.000 NA   0.642
 296263 296264 SMU.1576c SMU.1577c     TRUE 0.596 57.000 0.000 NA   0.574
 296265 296266 SMU.1578 SMU.1579 birA   TRUE 0.993 -28.000 0.000 NA   0.806
 296267 296268 SMU.1581 SMU.1582c dnaX   TRUE 0.931 0.000 0.030 NA N 0.431
 296268 296269 SMU.1582c SMU.1584c     FALSE 0.003 317.000 0.000 NA   0.137
 296269 296270 SMU.1584c SMU.1585c     FALSE 0.057 119.000 0.222 NA   -0.413
 296270 296271 SMU.1585c SMU.1586   syt1 FALSE 0.003 304.000 0.000 1.000   -0.449
 296271 296272 SMU.1586 SMU.1587c syt1   TRUE 0.861 -3.000 0.002 1.000   0.291
 296272 296273 SMU.1587c SMU.1588c     FALSE 0.012 265.000 0.000 1.000   0.247
 296273 296274 SMU.1588c SMU.1589c     TRUE 0.990 2.000 0.413 0.011 Y 0.309
 296274 296275 SMU.1589c SMU.1590   amyA FALSE 0.474 120.000 0.037 1.000 N 0.619
 296275 296276 SMU.1590 SMU.1591 amyA ccpA TRUE 0.801 148.000 0.041 1.000 N 0.861
 296278 296279 SMU.1593c SMU.1595   cah FALSE 0.263 142.000 0.000 NA   0.561
 296279 296280 SMU.1595 SMU.1596 cah ptcC FALSE 0.003 266.000 0.000 1.000 N -0.052
 296280 296281 SMU.1596 SMU.1597c ptcC   TRUE 0.976 16.000 0.842 NA   0.547
 296281 296282 SMU.1597c SMU.1598   ptcA TRUE 0.951 20.000 0.211 NA   0.560
 296282 296283 SMU.1598 SMU.1599 ptcA celR TRUE 0.996 0.000 0.085 0.012 N 0.890
 296283 296284 SMU.1599 SMU.1600 celR ptcB TRUE 0.959 45.000 0.128 0.012 N 0.840
 296284 296285 SMU.1600 SMU.1601 ptcB bgl FALSE 0.294 232.000 0.000 1.000 Y 0.237
 296286 296287 SMU.1602 SMU.1603   lguL TRUE 0.967 36.000 0.009 1.000 N 0.884
 296290 296291 SMU.1606 SMU.1607 smpB vacB TRUE 0.998 -37.000 0.143 0.025 N 0.952
 296291 296292 SMU.1607 SMU.1609c vacB   TRUE 0.580 347.000 0.064 1.000 N 0.814
 296292 296293 SMU.1609c SMU.1610   rl33 FALSE 0.030 49.000 0.012 1.000 N 0.071
 296293 296294 SMU.1610 SMU.1611c rl33   TRUE 0.961 0.000 0.012 1.000   0.562
 296294 296295 SMU.1611c SMU.1612c     FALSE 0.016 122.000 0.000 1.000   0.223
 296295 296296 SMU.1612c SMU.1613c     TRUE 0.996 -7.000 0.000 1.000 Y 0.701
 296296 296297 SMU.1613c SMU.1614   fpg TRUE 0.994 -3.000 0.066 1.000 N 0.783
 296297 296298 SMU.1614 SMU.1615c fpg   TRUE 0.787 51.000 0.000 NA   0.691
 296298 296299 SMU.1615c SMU.1616c     FALSE 0.367 100.000 0.000 NA   0.599
 296299 296300 SMU.1616c SMU.1617   era TRUE 0.853 45.000 0.007 1.000   0.685
 296300 296301 SMU.1617 SMU.1618 era dagK TRUE 0.815 21.000 0.063 1.000   0.316
 296301 296302 SMU.1618 SMU.1619c dagK   TRUE 0.989 -22.000 0.035 NA   0.678
 296302 296303 SMU.1619c SMU.1620   phoH FALSE 0.071 404.000 0.457 NA   -0.224
 296303 296304 SMU.1620 SMU.1621c phoH   TRUE 0.618 67.000 0.010 NA   0.604
 296304 296305 SMU.1621c SMU.1622   pmsR TRUE 0.991 -3.000 0.080 NA   0.705
 296305 296306 SMU.1622 SMU.1623c pmsR   FALSE 0.537 69.000 0.016 1.000   0.530
 296306 296307 SMU.1623c SMU.1624   rrf1 TRUE 0.631 245.000 0.012 1.000   0.831
 296307 296308 SMU.1624 SMU.1625 rrf1 pyrH TRUE 0.739 351.000 0.626 1.000 N 0.808
 296308 296309 SMU.1625 SMU.1626 pyrH rl1 FALSE 0.466 174.000 0.002 1.000 N 0.722
 296309 296310 SMU.1626 SMU.1627 rl1 rl11 TRUE 0.987 98.000 0.838 0.027 Y 0.883
 296314 296315 SMU.1632 SMU.1633c pfs   TRUE 0.990 11.000 0.041 NA   0.859
 296315 296316 SMU.1633c SMU.1634c     TRUE 0.988 12.000 0.025 NA   0.849
 296316 296317 SMU.1634c SMU.1635   glmU TRUE 0.987 10.000 0.015 1.000 N 0.855
 296317 296318 SMU.1635 SMU.1636c glmU   TRUE 0.847 39.000 0.003 NA   0.650
 296318 296319 SMU.1636c SMU.1637c     FALSE 0.440 102.000 0.000 NA   0.648
 296319 296320 SMU.1637c SMU.1638c     TRUE 0.710 144.000 0.000 NA   0.830
 296320 296321 SMU.1638c SMU.1639   metS TRUE 0.763 35.000 0.000 NA   0.574
 296321 296322 SMU.1639 SMU.1641c metS   FALSE 0.002 578.000 0.000 NA   0.121
 296322 296323 SMU.1641c SMU.1642c     FALSE 0.013 73.000 0.000 NA   -0.067
 296323 296324 SMU.1642c SMU.1643c     TRUE 0.938 73.000 0.083 NA   0.922
 296324 296325 SMU.1643c SMU.1644c     FALSE 0.003 375.000 0.000 NA   0.174
 296327 296328 SMU.1646c SMU.1647c     TRUE 0.999 -10.000 0.667 NA   0.925
 296328 296329 SMU.1647c SMU.1648c     FALSE 0.008 119.000 0.000 NA   -0.198
 296331 296332 SMU.1650 SMU.1651 end3   FALSE 0.331 65.000 0.003 1.000 N 0.425
 296332 296333 SMU.1651 SMU.1652   ogt TRUE 0.958 37.000 0.050 1.000 N 0.805
 296333 296334 SMU.1652 SMU.1653 ogt serA TRUE 0.645 89.000 0.009 1.000 N 0.719
 296334 296335 SMU.1653 SMU.1654c serA   TRUE 0.867 86.000 0.013 0.053   0.873
 296335 296336 SMU.1654c SMU.1655c     TRUE 0.601 193.000 0.000 NA   0.820
 296336 296337 SMU.1655c SMU.1656   serC FALSE 0.507 118.000 0.000 NA   0.691
 296337 296338 SMU.1656 SMU.1657c serC   FALSE 0.239 220.000 0.000 1.000 Y 0.095
 296338 296339 SMU.1657c SMU.1658   nrgA TRUE 0.994 16.000 0.160 1.000 N 0.962
 296339 296340 SMU.1658 SMU.1659c nrgA   FALSE 0.003 305.000 0.000 1.000   -0.049
 296340 296341 SMU.1659c SMU.1660c     TRUE 0.987 6.000 0.043 1.000   0.777
 296341 296342 SMU.1660c SMU.1661c     TRUE 0.990 -7.000 0.183 NA   0.628
 296342 296343 SMU.1661c SMU.1662   holB TRUE 0.995 -3.000 0.372 NA   0.705
 296343 296344 SMU.1662 SMU.1663 holB kthY TRUE 0.989 13.000 0.254 1.000 N 0.804
 296344 296345 SMU.1663 SMU.1664c kthY   FALSE 0.170 77.000 0.006 1.000   0.281
 296345 296346 SMU.1664c SMU.1665   livF FALSE 0.526 116.000 0.214 1.000   0.473
 296346 296347 SMU.1665 SMU.1666 livF livG TRUE 0.996 0.000 0.128 0.028 Y 0.642
 296347 296348 SMU.1666 SMU.1667 livG livM TRUE 1.000 0.000 0.349 1.000 Y 0.925
 296348 296349 SMU.1667 SMU.1668 livM livH TRUE 0.999 4.000 0.363 0.064 Y 0.923
 296349 296350 SMU.1668 SMU.1669 livH livK TRUE 0.878 84.000 0.150 1.000 Y 0.534
 296350 296351 SMU.1669 SMU.1670c livK   FALSE 0.243 103.000 0.109 NA   0.204
 296351 296352 SMU.1670c SMU.1671c     TRUE 0.981 7.000 0.500 NA   0.606
 296352 296353 SMU.1671c SMU.1672   clpP FALSE 0.368 116.000 0.055 NA   0.436
 296353 296354 SMU.1672 SMU.1673 clpP upp FALSE 0.030 532.000 0.010 1.000 N 0.301
 296354 296355 SMU.1673 SMU.1674 upp metC FALSE 0.003 313.000 0.004 1.000 N -0.293
 296355 296356 SMU.1674 SMU.1675 metC metB TRUE 0.998 15.000 0.082 0.012 Y 0.913
 296356 296357 SMU.1675 SMU.1676c metB   FALSE 0.004 227.000 0.018 1.000   -0.366
 296358 296359 SMU.1677 SMU.1678 murE   FALSE 0.495 234.000 0.000 NA   0.793
 296360 296361 SMU.1679c SMU.1680c     TRUE 0.976 26.000 0.000 NA   0.884
 296361 296362 SMU.1680c SMU.1681c     TRUE 0.993 1.000 0.000 NA   0.922
 296362 296363 SMU.1681c SMU.1682c     FALSE 0.021 61.000 0.000 NA   -0.192
 296363 296364 SMU.1682c SMU.1683c     FALSE 0.019 64.000 0.000 NA   -0.115
 296364 296365 SMU.1683c SMU.1685c     FALSE 0.478 58.000 0.000 NA   0.494
 296365 296366 SMU.1685c SMU.1687   ppaC FALSE 0.033 207.000 0.015 NA   0.111
 296366 296367 SMU.1687 SMU.1688 ppaC dltD FALSE 0.020 62.000 0.000 NA N 0.013
 296367 296368 SMU.1688 SMU.1689 dltD dltC TRUE 0.997 -7.000 0.409 NA   0.774
 296368 296369 SMU.1689 SMU.1690 dltC dltB TRUE 0.993 15.000 0.387 NA   0.811
 296369 296370 SMU.1690 SMU.1691 dltB dltA TRUE 0.998 -3.000 0.435 NA N 0.917
 296370 296371 SMU.1691 SMU.1692 dltA pflA FALSE 0.002 818.000 0.000 1.000 N -0.084
 296371 296372 SMU.1692 SMU.1693 pflA hlyX FALSE 0.012 75.000 0.028 NA   -0.170
 296372 296373 SMU.1693 SMU.1694c hlyX   TRUE 0.852 36.000 0.098 NA   0.507
 296375 296376 SMU.1697c SMU.1699c     TRUE 0.986 -3.000 0.408 NA   0.499
 296376 296377 SMU.1699c SMU.1700c     FALSE 0.485 105.000 0.000 1.000   0.674
 296377 296378 SMU.1700c SMU.1701c     TRUE 0.998 -3.000 0.121 1.000   0.932
 296378 296379 SMU.1701c SMU.1702c     FALSE 0.038 187.000 0.000 1.000   0.303
 296379 296380 SMU.1702c SMU.1703c     TRUE 0.999 -10.000 0.600 NA   0.909
 296381 296382 SMU.1704 SMU.1705     TRUE 0.996 -13.000 0.000 NA   0.916
 296382 296383 SMU.1705 SMU.1706     TRUE 0.995 -3.000 0.000 NA   0.889
 296385 296386 SMU.1708 SMU.1709 trkA trkH TRUE 0.989 7.000 0.163 0.003 Y 0.519
 296387 296388 SMU.1710c SMU.1711   rluB TRUE 0.994 0.000 0.014 NA   0.838
 296388 296389 SMU.1711 SMU.1712c rluB   TRUE 0.996 -10.000 0.224 NA N 0.792
 296389 296390 SMU.1712c SMU.1713c     TRUE 0.993 -3.000 0.570 NA   0.636
 296390 296391 SMU.1713c SMU.1714c     TRUE 0.702 0.000 0.017 NA   0.093
 296391 296392 SMU.1714c SMU.1715c     TRUE 0.995 -3.000 0.111 1.000   0.791
 296392 296393 SMU.1715c SMU.1716c     TRUE 0.996 -3.000 0.065 NA   0.827
 296393 296394 SMU.1716c SMU.1717c     TRUE 0.994 -18.000 0.085 NA   0.734
 296394 296395 SMU.1717c SMU.1718   murI TRUE 0.996 -3.000 0.034 1.000 N 0.857
 296395 296396 SMU.1718 SMU.1719c murI   TRUE 0.943 53.000 0.014 1.000   0.844
 296396 296397 SMU.1719c SMU.1721c     FALSE 0.305 373.000 0.051 1.000   0.640
 296397 296398 SMU.1721c SMU.1722c     FALSE 0.125 189.000 0.048 NA   0.250
 296398 296399 SMU.1722c SMU.1723c     TRUE 0.987 20.000 0.123 NA   0.823
 296399 296400 SMU.1723c SMU.1724c     FALSE 0.402 35.000 0.043 1.000   0.064
 296401 296402 SMU.1725 SMU.1727     FALSE 0.020 92.000 0.154 1.000 N -0.238
 296403 296404 SMU.1728 SMU.1729c greA   FALSE 0.371 136.000 0.079 NA   0.457
 296404 296405 SMU.1729c SMU.1730c     FALSE 0.185 174.000 0.120 NA   0.236
 296405 296406 SMU.1730c SMU.1731   murC TRUE 0.866 53.000 0.014 1.000   0.717
 296406 296407 SMU.1731 SMU.1732c murC   TRUE 0.939 17.000 0.013 NA   0.640
 296407 296408 SMU.1732c SMU.1733c     FALSE 0.556 62.000 0.151 NA   0.298
 296408 296409 SMU.1733c SMU.1734   accA FALSE 0.008 116.000 0.000 1.000 N 0.083
 296409 296410 SMU.1734 SMU.1735 accA accD TRUE 0.997 -3.000 0.234 0.002 Y 0.581
 296410 296411 SMU.1735 SMU.1736 accD accC TRUE 0.983 9.000 0.090 0.002 Y 0.437
 296411 296412 SMU.1736 SMU.1737 accC fabZ TRUE 0.644 167.000 0.045 1.000 Y 0.401
 296412 296413 SMU.1737 SMU.1738 fabZ bccP TRUE 0.997 -3.000 0.047 0.007 Y 0.665
 296413 296414 SMU.1738 SMU.1739 bccP fabF TRUE 0.996 3.000 0.074 1.000 Y 0.720
 296414 296415 SMU.1739 SMU.1740 fabF fabG TRUE 0.979 49.000 0.056 1.000 Y 0.746
 296415 296416 SMU.1740 SMU.1741 fabG fabD TRUE 0.998 15.000 0.432 0.007 Y 0.788
 296416 296417 SMU.1741 SMU.1742c fabD   TRUE 0.989 3.000 0.099 1.000   0.756
 296417 296418 SMU.1742c SMU.1743   acp TRUE 0.751 103.000 0.216 1.000   0.683
 296418 296419 SMU.1743 SMU.1744 acp fabH TRUE 0.949 60.000 0.065 0.007   0.882
 296419 296420 SMU.1744 SMU.1745c fabH   TRUE 0.997 0.000 0.070 1.000 N 0.942
 296420 296421 SMU.1745c SMU.1746c     FALSE 0.502 329.000 0.098 1.000 N 0.750
 296421 296422 SMU.1746c SMU.1747c     FALSE 0.006 162.000 0.083 0.052   -0.457
 400941 400940 SMUt41 SMUt42 tRNA-Pro tRNA-Arg TRUE 0.647 53.000 0.000 NA   NA
 400940 400939 SMUt42 SMUt43 tRNA-Arg tRNA-Leu TRUE 0.894 14.000 0.000 NA   NA
 400939 400938 SMUt43 SMUt44 tRNA-Leu tRNA-Gly TRUE 0.911 8.000 0.000 NA   NA
 400938 400937 SMUt44 SMUt45 tRNA-Gly tRNA-Thr TRUE 0.927 3.000 0.000 NA   NA
 400937 400936 SMUt45 SMUt46 tRNA-Thr tRNA-Leu TRUE 0.894 15.000 0.000 NA   NA
 400936 400935 SMUt46 SMUt47 tRNA-Leu tRNA-Lys TRUE 0.914 7.000 0.000 NA   NA
 400935 400934 SMUt47 SMUt48 tRNA-Lys tRNA-Asp TRUE 0.828 28.000 0.000 NA   NA
 400934 400933 SMUt48 SMUt49 tRNA-Asp tRNA-Val TRUE 0.812 30.000 0.000 NA   NA
 400933 2200796 SMUt49 SMUr07 tRNA-Val   TRUE 0.942 1.000 0.000 NA   NA
 2200796 2200797 SMUr07 SMUr08     FALSE 0.239 181.000 0.000 NA   NA
 2200797 400932 SMUr08 SMUt50   tRNA-Ala FALSE 0.173 259.000 0.000 NA   NA
 400932 2200798 SMUt50 SMUr09 tRNA-Ala   TRUE 0.614 58.000 0.000 NA   NA
 2200798 296424 SMUr09 SMU.1750c     FALSE 0.134 812.000 0.000 NA   NA
 296424 296425 SMU.1750c SMU.1752c     FALSE 0.559 304.000 0.000 NA   0.857
 296425 296426 SMU.1752c SMU.1753c     FALSE 0.543 278.000 0.000 NA   0.837
 296426 296427 SMU.1753c SMU.1754c     TRUE 0.998 11.000 0.882 NA   0.980
 296427 296428 SMU.1754c SMU.1755c     TRUE 0.926 76.000 0.017 NA   0.971
 296428 296429 SMU.1755c SMU.1757c     TRUE 0.998 -31.000 0.017 NA   0.963
 296429 296430 SMU.1757c SMU.1758c     TRUE 0.999 -3.000 0.773 NA   0.924
 296430 296431 SMU.1758c SMU.1760c     TRUE 0.999 29.000 0.711 NA Y 0.936
 296431 296432 SMU.1760c SMU.1761c     TRUE 0.998 4.000 0.948 NA   0.947
 296432 296433 SMU.1761c SMU.1762c     TRUE 0.998 -40.000 0.035 NA   0.938
 296433 296434 SMU.1762c SMU.1763c     TRUE 0.999 0.000 0.891 NA   0.949
 296434 296435 SMU.1763c SMU.1764c     TRUE 0.963 95.000 0.664 NA   0.968
 296435 296436 SMU.1764c SMU.1765c     FALSE 0.261 245.000 0.000 NA   0.667
 296436 296437 SMU.1765c SMU.1766c     FALSE 0.256 296.000 0.000 NA   0.681
 296437 296438 SMU.1766c SMU.1767c     TRUE 0.808 57.000 0.000 NA   0.722
 296438 296439 SMU.1767c SMU.1768c     TRUE 0.995 -16.000 0.000 NA   0.861
 296439 296440 SMU.1768c SMU.1770   syv FALSE 0.129 571.000 0.000 NA N 0.628
 296440 296441 SMU.1770 SMU.1771c syv   TRUE 0.933 12.000 0.000 1.000   0.669
 296441 296442 SMU.1771c SMU.1772c     TRUE 0.974 -28.000 0.000 NA   0.646
 296442 296443 SMU.1772c SMU.1773c     TRUE 0.948 -7.000 0.000 NA   0.526
 296443 296444 SMU.1773c SMU.1774c     FALSE 0.011 290.000 0.000 NA   0.244
 296445 296446 SMU.1775c SMU.1776c     FALSE 0.280 231.000 0.000 NA   0.672
 296446 296447 SMU.1776c SMU.1777   nrdI FALSE 0.003 254.000 0.000 NA N -0.127
 296447 296448 SMU.1777 SMU.1779c nrdI   TRUE 0.712 10.000 0.000 NA N 0.435
 296449 296450 SMU.1780 SMU.1781     FALSE 0.385 86.000 0.025 NA   0.440
 296450 296451 SMU.1781 SMU.1782     TRUE 0.952 60.000 0.051 NA   0.885
 400931 400930 SMUt52 SMUt53 pseudo-tRNA tRNA-Thr TRUE 0.927 3.000 0.000 NA   NA
 400930 400929 SMUt53 SMUt54 tRNA-Thr tRNA-Leu TRUE 0.894 15.000 0.000 NA   NA
 400929 400928 SMUt54 SMUt55 tRNA-Leu tRNA-Lys TRUE 0.914 7.000 0.000 NA   NA
 400928 400927 SMUt55 SMUt56 tRNA-Lys tRNA-Asp TRUE 0.828 28.000 0.000 NA   NA
 400927 400926 SMUt56 SMUt57 tRNA-Asp tRNA-Val TRUE 0.812 30.000 0.000 NA   NA
 400926 2200799 SMUt57 SMUr10 tRNA-Val   TRUE 0.942 1.000 0.000 NA   NA
 2200799 2200800 SMUr10 SMUr11     FALSE 0.239 181.000 0.000 NA   NA
 2200800 400925 SMUr11 SMUt58   tRNA-Ala FALSE 0.173 259.000 0.000 NA   NA
 400925 2200801 SMUt58 SMUr12 tRNA-Ala   TRUE 0.614 58.000 0.000 NA   NA
 2200801 296452 SMUr12 SMU.1783   proS FALSE 0.149 345.000 0.000 NA   NA
 296452 296453 SMU.1783 SMU.1784c proS   TRUE 0.890 27.000 0.000 1.000 N 0.694
 296453 296454 SMU.1784c SMU.1785   cdsA TRUE 0.940 16.000 0.027 1.000 N 0.645
 296454 296455 SMU.1785 SMU.1786 cdsA uppS TRUE 0.994 15.000 0.113 1.000 Y 0.705
 296455 296456 SMU.1786 SMU.1787c uppS   FALSE 0.330 112.000 0.007 NA N 0.554
 296456 296457 SMU.1787c SMU.1788c     TRUE 0.713 175.000 0.006 NA   0.835
 296457 296458 SMU.1788c SMU.1789c     FALSE 0.464 193.000 0.000 NA   0.743
 296458 296459 SMU.1789c SMU.1790c     FALSE 0.007 146.000 0.002 NA   -0.204
 296459 296460 SMU.1790c SMU.1791c     FALSE 0.487 86.000 0.023 NA   0.544
 296460 296461 SMU.1791c SMU.1792c     FALSE 0.284 148.000 0.000 NA   0.591
 296461 296462 SMU.1792c SMU.1794c     FALSE 0.497 73.000 0.000 NA   0.619
 296462 296463 SMU.1794c SMU.1795c     TRUE 0.708 61.000 0.000 NA   0.678
 296463 296464 SMU.1795c SMU.1797c     FALSE 0.096 274.000 0.085 NA   0.211
 296464 296465 SMU.1797c SMU.1798c     TRUE 0.995 1.000 0.149 NA   0.833
 296465 296466 SMU.1798c SMU.1799   nadD TRUE 0.996 -3.000 0.199 1.000 Y 0.531
 296466 296467 SMU.1799 SMU.1800c nadD   TRUE 0.908 27.000 0.150 NA N 0.555
 296467 296468 SMU.1800c SMU.1801c     TRUE 0.946 57.000 0.068 NA   0.827
 296468 296469 SMU.1801c SMU.1802c     TRUE 0.997 1.000 0.555 1.000   0.825
 296469 296470 SMU.1802c SMU.1803c     FALSE 0.009 105.000 0.000 NA   -0.621
 296470 296471 SMU.1803c SMU.1804c     TRUE 0.981 16.000 0.000 NA   0.844
 296472 296473 SMU.1805 SMU.1806     TRUE 0.989 -22.000 0.000 1.000 N 0.777
 296474 296475 SMU.1807c SMU.1808c     FALSE 0.278 95.000 0.000 NA   0.513
 296475 296476 SMU.1808c SMU.1809   scnG FALSE 0.161 374.000 0.000 NA   0.617
 296476 296477 SMU.1809 SMU.1810 scnG scnE TRUE 0.987 0.000 0.143 NA   0.665
 296477 296478 SMU.1810 SMU.1811 scnE scnF TRUE 0.996 2.000 1.000 NA   0.769
 296479 296480 SMU.1812 SMU.1813     FALSE 0.373 423.000 0.000 NA   0.768
 296481 296482 SMU.1814 SMU.1815 scnK scnR TRUE 0.998 18.000 0.333 1.000 Y 0.809
 296482 296483 SMU.1815 SMU.1816c scnR   FALSE 0.009 105.000 0.000 NA   0.125
 296483 296484 SMU.1816c SMU.1817c     FALSE 0.029 334.000 0.000 NA   0.328
 296484 296485 SMU.1817c SMU.1818c     FALSE 0.041 299.000 0.000 NA   0.358
 296485 296486 SMU.1818c SMU.1819   gatB FALSE 0.038 253.000 0.000 NA   0.336
 296486 296487 SMU.1819 SMU.1820c gatB   TRUE 0.990 0.000 0.492 0.002 Y 0.122
 296487 296488 SMU.1820c SMU.1821c     TRUE 0.998 0.000 0.643 0.002 Y 0.632
 296488 296489 SMU.1821c SMU.1822   gatA TRUE 0.736 127.000 0.003 1.000 Y 0.545
 296489 296490 SMU.1822 SMU.1823 gatA pncA FALSE 0.015 258.000 0.000 1.000 N 0.334
 296490 296491 SMU.1823 SMU.1824c pncA   TRUE 0.994 2.000 0.083 1.000 N 0.872
 296491 296492 SMU.1824c SMU.1826   yfbQ TRUE 0.715 109.000 0.015 1.000 N 0.772
 296493 296494 SMU.1827 SMU.1828     FALSE 0.380 98.000 0.000 NA   0.606
 296496 296497 SMU.1831 SMU.1832 aspG   TRUE 0.643 27.000 0.014 NA   0.289
 296498 296499 SMU.1833 SMU.1834 recG alr FALSE 0.549 173.000 0.078 1.000 N 0.699
 296499 296500 SMU.1834 SMU.1835 alr acpS TRUE 0.993 -3.000 0.093 1.000 N 0.755
 296500 296501 SMU.1835 SMU.1836 acpS aroG FALSE 0.057 270.000 0.000 1.000 N 0.451
 296501 296502 SMU.1836 SMU.1837 aroG aroH TRUE 0.900 2.000 0.000 0.001 Y -0.151
 296502 296503 SMU.1837 SMU.1838 aroH secA FALSE 0.096 20.000 0.000 1.000 N -0.370
 296503 296504 SMU.1838 SMU.1839 secA manA FALSE 0.408 178.000 0.042 1.000 N 0.649
 296504 296505 SMU.1839 SMU.1840 manA scrK TRUE 0.964 169.000 0.333 1.000 Y 0.843
 296505 296506 SMU.1840 SMU.1841 scrK scrA TRUE 0.867 200.000 0.062 1.000 Y 0.746
 296507 296508 SMU.1843 SMU.1844 scrB scrR TRUE 0.997 3.000 0.571 1.000 N 0.902
 296509 296510 SMU.1845 SMU.1846c nusB   TRUE 0.998 -7.000 0.265 NA   0.895
 296510 296511 SMU.1846c SMU.1847   efp TRUE 0.974 43.000 0.031 NA   0.926
 296513 296514 SMU.1849 SMU.1850 comEB pepP TRUE 0.611 170.000 0.018 1.000 N 0.767
 296514 296515 SMU.1850 SMU.1851 pepP uvrA TRUE 0.991 -10.000 0.008 1.000 N 0.760
 296516 296517 SMU.1852 SMU.1853     FALSE 0.237 282.000 0.072 NA   0.517
 296517 296518 SMU.1853 SMU.1854     FALSE 0.285 94.000 0.000 NA   0.518
 296518 296519 SMU.1854 SMU.1855     TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA   0.805
 296520 296521 SMU.1856c SMU.1858   rs18 FALSE 0.493 319.000 0.000 NA   0.822
 296521 296522 SMU.1858 SMU.1859 rs18 ssb TRUE 0.982 29.000 0.012 1.000 N 0.965
 296522 296523 SMU.1859 SMU.1860 ssb rs6 TRUE 0.988 18.000 0.012 1.000 N 0.932
 296523 296524 SMU.1860 SMU.1861c rs6   FALSE 0.216 156.000 0.000 NA   0.535
 296525 296526 SMU.1862 SMU.1865   mutY FALSE 0.038 1037.000 0.000 NA   0.374
 296527 296528 SMU.1867c SMU.1869   trxA TRUE 0.596 98.000 0.000 1.000 N 0.745
 296528 296529 SMU.1869 SMU.1870 trxA mutS2 FALSE 0.012 75.000 0.005 1.000 N -0.126
 296529 296530 SMU.1870 SMU.1871c mutS2   FALSE 0.323 69.000 0.070 1.000   0.212
 296530 296531 SMU.1871c SMU.1872c     TRUE 0.959 -3.000 0.019 NA   0.466
 296532 296533 SMU.1873 SMU.1874 rnh3 lepC TRUE 0.990 20.000 0.080 1.000 N 0.923
 296533 296534 SMU.1874 SMU.1875 lepC   TRUE 0.751 86.000 0.099 1.000 N 0.719
 296534 296535 SMU.1875 SMU.1876     FALSE 0.370 99.000 0.050 NA   0.427
 296535 296536 SMU.1876 SMU.1877   ptnA FALSE 0.002 877.000 0.000 NA   -0.203
 296536 296537 SMU.1877 SMU.1878 ptnA ptnC TRUE 0.999 35.000 0.943 0.019 Y 0.972
 296537 296538 SMU.1878 SMU.1879 ptnC   TRUE 0.999 15.000 0.812 0.019 Y 0.915
 296539 296540 SMU.1881c SMU.1882c     FALSE 0.532 550.000 0.000 NA   0.868
 296543 296544 SMU.1886 SMU.1888 sys   FALSE 0.046 321.000 0.000 NA   0.381
 296545 296546 SMU.1889c SMU.1891c     FALSE 0.005 174.000 0.000 NA   -0.189
 296546 296547 SMU.1891c SMU.1892c     TRUE 0.994 -55.000 0.000 NA   0.847
 296547 296548 SMU.1892c SMU.1893c     FALSE 0.339 120.000 0.000 NA   NA
 296548 296549 SMU.1893c SMU.1894c     TRUE 0.999 -6.000 1.000 0.049 Y NA
 296549 296550 SMU.1894c SMU.1895c     FALSE 0.353 109.000 0.000 1.000   NA
 296550 296551 SMU.1895c SMU.1896c     TRUE 0.955 45.000 0.000 NA   0.920
 296552 296553 SMU.1897 SMU.1898     TRUE 0.775 95.000 0.500 0.055   0.650
 296553 296554 SMU.1898 SMU.1899     TRUE 0.988 -28.000 0.000 NA   0.740
 296554 296555 SMU.1899 SMU.1900     TRUE 0.970 13.000 0.000 NA   0.775
 296556 296557 SMU.1902c SMU.1903c     TRUE 0.825 67.000 0.000 NA   0.795
 296557 296558 SMU.1903c SMU.1904c     TRUE 0.905 73.000 0.000 NA   0.970
 296558 296559 SMU.1904c SMU.1905c     TRUE 0.612 486.000 0.000 NA   0.938
 296559 296560 SMU.1905c SMU.1906c     TRUE 0.796 164.000 0.000 NA   0.959
 296562 296563 SMU.1908c SMU.1909c     TRUE 0.621 775.000 0.000 NA   0.958
 296563 296564 SMU.1909c SMU.1910c     TRUE 0.819 147.000 0.000 NA   0.969
 296564 296565 SMU.1910c SMU.1912c     TRUE 0.622 815.000 0.000 NA   0.960
 296565 296566 SMU.1912c SMU.1913c     TRUE 0.644 411.000 0.000 NA   0.970
 296566 296567 SMU.1913c SMU.1914c     TRUE 0.836 131.000 0.000 NA   0.967
 296569 296570 SMU.1916 SMU.1917 comD comE TRUE 0.999 -3.000 0.000 1.000 Y 0.905
 296570 296571 SMU.1917 SMU.1918 comE dedA FALSE 0.036 472.000 0.000 NA   0.359
 296571 296572 SMU.1918 SMU.1919 dedA sapR2 TRUE 0.911 47.000 0.000 NA   0.810
 296572 296573 SMU.1919 SMU.1920 sapR2 pgdA TRUE 0.741 75.000 0.000 NA   0.765
 296573 296574 SMU.1920 SMU.1921 pgdA dnaI TRUE 0.918 13.000 0.008 1.000   0.583
 296574 296575 SMU.1921 SMU.1922 dnaI dnaB TRUE 0.997 1.000 0.817 NA Y 0.500
 296575 296576 SMU.1922 SMU.1923c dnaB   TRUE 0.997 -13.000 0.109 NA N 0.840
 296576 296577 SMU.1923c SMU.1924   gcrR TRUE 0.773 370.000 0.000 NA Y 0.804
 296577 296578 SMU.1924 SMU.1925c gcrR   FALSE 0.167 357.000 0.014 NA   0.532
 296578 296579 SMU.1925c SMU.1926   psaR TRUE 0.992 -7.000 0.000 NA   0.796
 296580 296581 SMU.1927 SMU.1928   psaB TRUE 0.988 2.000 0.061 1.000 N 0.766
 296582 296583 SMU.1929 SMU.1930 htpX lemA TRUE 0.996 10.000 0.222 NA   0.933
 296585 296586 SMU.1933c SMU.1934c     TRUE 0.997 -7.000 0.530 1.000   0.754
 296586 296587 SMU.1934c SMU.1935c     TRUE 0.991 29.000 0.435 NA   0.864
 296587 296588 SMU.1935c SMU.1936c     TRUE 0.993 10.000 0.068 NA   0.894
 296588 296589 SMU.1936c SMU.1937   cnhA TRUE 0.679 124.000 0.000 NA   0.791
 296589 296590 SMU.1937 SMU.1938c cnhA   TRUE 0.847 68.000 0.000 1.000   0.823
 296590 296591 SMU.1938c SMU.1939c     TRUE 0.999 2.000 0.938 1.000 Y 0.865
 296591 296592 SMU.1939c SMU.1940c     TRUE 0.997 -7.000 0.042 1.000 N 0.930
 296592 296593 SMU.1940c SMU.1941   atmB TRUE 0.602 195.000 0.000 NA N 0.845
 296593 296594 SMU.1941 SMU.1942c atmB   TRUE 0.717 167.000 0.000 NA N 0.905
 296594 296595 SMU.1942c SMU.1943   syl FALSE 0.082 301.000 0.000 1.000 N 0.525
 296596 296597 SMU.1945 SMU.1946     TRUE 0.995 -7.000 0.000 NA   0.874
 296598 296599 SMU.1947 SMU.1948 nusG secE TRUE 0.805 156.000 0.843 1.000 N 0.722
 296599 296600 SMU.1948 SMU.1949 secE pbp2a FALSE 0.142 215.000 0.000 1.000 N 0.573
 296602 296603 SMU.1951c SMU.1954   groEL FALSE 0.415 644.000 0.000 NA   0.799
 296603 296604 SMU.1954 SMU.1955 groEL groES TRUE 0.974 112.000 0.160 0.005 Y 0.903
 296604 296605 SMU.1955 SMU.1956c groES   FALSE 0.094 122.000 0.000 NA   0.347
 296605 296606 SMU.1956c SMU.1957     TRUE 0.995 24.000 0.476 NA   0.948
 296606 296607 SMU.1957 SMU.1958c     TRUE 1.000 2.000 0.905 0.019 Y 0.981
 296607 296608 SMU.1958c SMU.1960c     TRUE 0.960 374.000 0.643 0.012 Y 0.955
 296608 296609 SMU.1960c SMU.1961c     TRUE 0.999 18.000 0.643 0.012 Y 0.954
 296609 296610 SMU.1961c SMU.1963c     FALSE 0.313 303.000 0.217 1.000 Y -0.251
 296610 296611 SMU.1963c SMU.1964c     TRUE 0.998