MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudomonas aeruginosa PAO1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 56451 56452 PA0001 PA0002 dnaA dnaN TRUE 0.968 29.000 0.328 1.000 Y NA
 56452 56453 PA0002 PA0003 dnaN recF TRUE 0.988 10.000 0.318 1.000 Y NA
 56453 56454 PA0003 PA0004 recF gyrB TRUE 0.999 -3.000 0.249 0.003 Y NA
 56455 56456 PA0005 PA0006 lptA   TRUE 0.949 12.000 0.310 1.000 N NA
 56458 56459 PA0008 PA0009 glyS glyQ TRUE 0.999 0.000 0.651 0.000 Y NA
 56460 56461 PA0010 PA0011 tag   FALSE 0.130 144.000 0.017 1.000 N NA
 56461 56462 PA0011 PA0012     FALSE 0.393 85.000 0.053 NA   NA
 56462 56463 PA0012 PA0013     FALSE 0.063 147.000 0.000 NA   NA
 56464 56465 PA0014 PA0015     FALSE 0.011 293.000 0.000 NA   NA
 56465 56466 PA0015 PA0016   trkA FALSE 0.119 149.000 0.008 1.000   NA
 56466 56467 PA0016 PA0017 trkA   TRUE 0.799 28.000 0.122 1.000 N NA
 56467 56468 PA0017 PA0018   fmt TRUE 0.997 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 56468 56469 PA0018 PA0019 fmt def TRUE 0.938 55.000 0.105 0.017 Y NA
 56470 56471 PA0020 PA0021     FALSE 0.216 135.000 0.043 1.000   NA
 56471 56472 PA0021 PA0022     TRUE 0.488 41.000 0.023 NA N NA
 56474 56475 PA0024 PA0025 hemF aroE TRUE 0.583 58.000 0.093 1.000 N NA
 56475 56476 PA0025 PA0026 aroE plcB FALSE 0.094 111.000 0.000 1.000   NA
 56476 56477 PA0026 PA0027 plcB   TRUE 0.816 -19.000 0.000 1.000   NA
 56477 56478 PA0027 PA0028     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 56479 56480 PA0029 PA0030     TRUE 0.982 5.000 0.259 0.080 N NA
 56480 56481 PA0030 PA0031   betC TRUE 0.907 17.000 0.218 1.000 N NA
 56483 56484 PA0033 PA0034     TRUE 0.947 8.000 0.000 NA Y NA
 56484 56485 PA0034 PA0035   trpA FALSE 0.032 186.000 0.000 1.000 N NA
 56485 56486 PA0035 PA0036 trpA trpB TRUE 0.999 -3.000 0.344 0.000 Y NA
 56487 56488 PA0037 PA0038 trpI   FALSE 0.102 101.000 0.000 NA   NA
 56488 56489 PA0038 PA0039     FALSE 0.131 184.000 0.049 NA   NA
 56489 56490 PA0039 PA0040     FALSE 0.011 297.000 0.000 NA   NA
 56490 56491 PA0040 PA0041     FALSE 0.088 113.000 0.000 NA   NA
 56491 56492 PA0041 PA0042     FALSE 0.003 3025.000 0.000 NA   NA
 56494 56495 PA0044 PA0045 exoT   FALSE 0.004 497.000 0.000 1.000 N NA
 56495 56496 PA0045 PA0046     TRUE 0.940 31.000 0.625 NA   NA
 56496 56497 PA0046 PA0047     TRUE 0.678 153.000 0.740 NA   NA
 56498 56499 PA0048 PA0049     FALSE 0.012 282.000 0.000 NA   NA
 56500 56501 PA0050 PA0051   phzH FALSE 0.003 824.000 0.000 NA   NA
 56504 56505 PA0054 PA0055     FALSE 0.301 39.000 0.000 NA   NA
 56505 56506 PA0055 PA0056     FALSE 0.176 66.000 0.000 NA   NA
 56507 56508 PA0057 PA0058     TRUE 0.651 63.000 0.157 1.000   NA
 56508 56509 PA0058 PA0059   osmC TRUE 0.605 84.000 0.000 1.000 Y NA
 56509 56510 PA0059 PA0060 osmC   FALSE 0.215 111.000 0.026 NA   NA
 56511 56512 PA0061 PA0062     FALSE 0.205 57.000 0.000 NA   NA
 56514 56515 PA0064 PA0065     TRUE 0.519 33.000 0.009 1.000   NA
 56515 56516 PA0065 PA0066     TRUE 0.926 -7.000 0.016 1.000   NA
 56517 56518 PA0067 PA0068 prlC   TRUE 0.982 -3.000 0.173 NA   NA
 56518 56519 PA0068 PA0069     FALSE 0.219 89.000 0.006 NA   NA
 56520 56521 PA0070 PA0071     TRUE 0.885 62.000 0.714 NA   NA
 56521 56522 PA0071 PA0072     TRUE 0.978 -7.000 0.161 NA   NA
 56522 56523 PA0072 PA0073     TRUE 0.992 0.000 0.710 NA N NA
 56523 56524 PA0073 PA0074   ppkA TRUE 0.990 -3.000 0.160 0.100 N NA
 56524 56525 PA0074 PA0075 ppkA   TRUE 0.996 8.000 1.000 1.000 Y NA
 56525 56526 PA0075 PA0076     TRUE 0.920 10.000 0.128 NA   NA
 56526 56527 PA0076 PA0077     TRUE 0.978 -3.000 0.128 NA   NA
 56527 56528 PA0077 PA0078     FALSE 0.441 222.000 0.714 NA   NA
 56528 56529 PA0078 PA0079     TRUE 0.985 7.000 0.714 NA   NA
 56529 56530 PA0079 PA0080     TRUE 0.975 16.000 0.833 NA   NA
 56530 56531 PA0080 PA0081     TRUE 0.932 45.000 0.833 NA   NA
 56532 56533 PA0082 PA0083     TRUE 0.601 89.000 0.209 NA   NA
 56533 56534 PA0083 PA0084     TRUE 0.969 13.000 0.588 NA   NA
 56534 56535 PA0084 PA0085     TRUE 0.719 76.000 0.294 NA   NA
 56535 56536 PA0085 PA0086     FALSE 0.251 168.000 0.125 NA   NA
 56536 56537 PA0086 PA0087     TRUE 0.979 2.000 0.311 NA   NA
 56537 56538 PA0087 PA0088     TRUE 0.976 -3.000 0.111 NA   NA
 56538 56539 PA0088 PA0089     TRUE 0.989 -36.000 0.500 NA   NA
 56539 56540 PA0089 PA0090     TRUE 0.988 -7.000 0.333 NA   NA
 56540 56541 PA0090 PA0091     TRUE 0.714 47.000 0.143 NA   NA
 56542 56543 PA0092 PA0093     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 56543 56544 PA0093 PA0094     TRUE 0.499 16.000 0.000 NA   NA
 56545 56546 PA0095 PA0096     TRUE 0.833 28.000 0.160 NA   NA
 56546 56547 PA0096 PA0097     TRUE 0.970 -70.000 0.160 NA   NA
 56547 56548 PA0097 PA0098     TRUE 0.984 -3.000 0.200 NA   NA
 56548 56549 PA0098 PA0099     TRUE 0.976 0.000 0.200 NA   NA
 56549 56550 PA0099 PA0100     FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 56550 56551 PA0100 PA0101     TRUE 0.964 -18.000 0.105 NA   NA
 56551 56552 PA0101 PA0102     FALSE 0.007 376.000 0.000 1.000   NA
 56552 56553 PA0102 PA0103     TRUE 0.525 211.000 0.241 1.000 Y NA
 56553 56554 PA0103 PA0104     FALSE 0.259 137.000 0.069 NA   NA
 56554 56555 PA0104 PA0105   coxB FALSE 0.015 264.000 0.000 NA   NA
 56555 56556 PA0105 PA0106 coxB coxA TRUE 0.998 10.000 0.741 0.003 Y NA
 56556 56557 PA0106 PA0107 coxA   TRUE 0.948 11.000 0.268 1.000 N NA
 56557 56558 PA0107 PA0108   coIII TRUE 0.972 11.000 0.536 1.000 N NA
 56560 56561 PA0110 PA0111     TRUE 0.993 -25.000 0.722 NA   NA
 56561 56562 PA0111 PA0112     TRUE 0.731 65.000 0.255 NA   NA
 56562 56563 PA0112 PA0113     TRUE 0.972 26.000 0.321 1.000 Y NA
 56563 56564 PA0113 PA0114     TRUE 0.801 26.000 0.099 1.000   NA
 56566 56567 PA0116 PA0117     FALSE 0.101 257.000 0.128 NA   NA
 56567 56568 PA0117 PA0118     TRUE 0.931 25.000 0.429 1.000   NA
 56568 56569 PA0118 PA0119     FALSE 0.018 230.000 0.000 1.000 N NA
 56569 56570 PA0119 PA0120     TRUE 0.652 49.000 0.102 1.000 N NA
 56570 56571 PA0120 PA0121     TRUE 0.759 101.000 0.000 0.003 Y NA
 56571 56572 PA0121 PA0122     FALSE 0.040 180.000 0.000 1.000   NA
 56573 56574 PA0123 PA0124     FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 56574 56575 PA0124 PA0125     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 56575 56576 PA0125 PA0126     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 56577 56578 PA0127 PA0128     FALSE 0.164 73.000 0.000 1.000   NA
 56579 56580 PA0129 PA0130 gabP   FALSE 0.040 169.000 0.000 1.000 N NA
 56580 56581 PA0130 PA0131     FALSE 0.413 84.000 0.059 NA   NA
 56581 56582 PA0131 PA0132     TRUE 0.948 0.000 0.059 NA   NA
 56585 56586 PA0135 PA0136     FALSE 0.004 581.000 0.000 NA   NA
 56586 56587 PA0136 PA0137     TRUE 0.991 0.000 0.590 1.000   NA
 56587 56588 PA0137 PA0138     TRUE 0.925 23.000 0.154 0.079   NA
 56588 56589 PA0138 PA0139   ahpC FALSE 0.050 165.000 0.000 1.000   NA
 56589 56590 PA0139 PA0140 ahpC ahpF TRUE 0.845 145.000 0.551 1.000 Y NA
 56592 56593 PA0142 PA0143   nuh TRUE 0.493 108.000 0.000 1.000 Y NA
 56594 56595 PA0144 PA0145     FALSE 0.378 150.000 0.000 NA Y NA
 56596 56597 PA0146 PA0147     TRUE 0.544 73.000 0.106 1.000   NA
 56597 56598 PA0147 PA0148     FALSE 0.227 105.000 0.025 1.000   NA
 56598 56599 PA0148 PA0149     FALSE 0.027 198.000 0.000 1.000 N NA
 56599 56600 PA0149 PA0150     TRUE 0.994 -3.000 0.588 NA N NA
 56600 56601 PA0150 PA0151     TRUE 0.599 149.000 0.085 NA Y NA
 56601 56602 PA0151 PA0152   pcaQ FALSE 0.006 377.000 0.000 1.000 N NA
 56602 56603 PA0152 PA0153 pcaQ pcaH TRUE 0.653 135.000 0.153 0.001 N NA
 56603 56604 PA0153 PA0154 pcaH pcaG TRUE 0.998 11.000 0.782 0.000 Y NA
 56604 56605 PA0154 PA0155 pcaG pcaR FALSE 0.024 207.000 0.000 1.000 N NA
 56605 56606 PA0155 PA0156 pcaR   FALSE 0.051 153.000 0.000 1.000 N NA
 56606 56607 PA0156 PA0157     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.014 Y NA
 56607 56608 PA0157 PA0158     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 56608 56609 PA0158 PA0159     FALSE 0.026 199.000 0.000 NA N NA
 56609 56610 PA0159 PA0160     FALSE 0.085 116.000 0.000 NA   NA
 56610 56611 PA0160 PA0161     FALSE 0.013 280.000 0.000 NA   NA
 56611 56612 PA0161 PA0162     FALSE 0.055 155.000 0.000 NA   NA
 56614 56615 PA0164 PA0165     FALSE 0.003 672.000 0.000 1.000 N NA
 56615 56616 PA0165 PA0166     FALSE 0.016 242.000 0.000 1.000 N NA
 56616 56617 PA0166 PA0167     TRUE 0.596 93.000 0.240 1.000 N NA
 56617 56618 PA0167 PA0168     TRUE 0.841 6.000 0.019 1.000   NA
 56619 56620 PA0169 PA0170     FALSE 0.290 127.000 0.073 NA   NA
 56620 56621 PA0170 PA0171     TRUE 0.965 27.000 0.911 NA   NA
 56621 56622 PA0171 PA0172     TRUE 0.928 9.000 0.133 NA   NA
 56622 56623 PA0172 PA0173     FALSE 0.125 263.000 0.000 1.000 Y NA
 56623 56624 PA0173 PA0174     TRUE 0.947 20.000 0.078 1.000 Y NA
 56624 56625 PA0174 PA0175     TRUE 0.978 6.000 0.067 1.000 Y NA
 56625 56626 PA0175 PA0176   aer2 TRUE 0.929 70.000 0.444 1.000 Y NA
 56626 56627 PA0176 PA0177 aer2   TRUE 0.921 36.000 0.000 0.012 Y NA
 56627 56628 PA0177 PA0178     TRUE 0.996 -13.000 0.105 0.012 Y NA
 56628 56629 PA0178 PA0179     TRUE 0.976 28.000 0.444 1.000 Y NA
 56629 56630 PA0179 PA0180     FALSE 0.420 198.000 0.082 1.000 Y NA
 56630 56631 PA0180 PA0181     FALSE 0.029 193.000 0.000 1.000 N NA
 56633 56634 PA0183 PA0184 atsA   TRUE 0.925 88.000 0.571 1.000 Y NA
 56634 56635 PA0184 PA0185     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 56636 56637 PA0186 PA0187     FALSE 0.005 418.000 0.000 1.000 N NA
 56637 56638 PA0187 PA0188     TRUE 0.972 -3.000 0.082 1.000   NA
 56642 56643 PA0192 PA0193     FALSE 0.262 41.000 0.000 1.000 N NA
 56643 56644 PA0193 PA0194     TRUE 0.800 68.000 0.000 0.077 Y NA
 56644 56645 PA0194 PA0195   pntA FALSE 0.014 647.000 0.000 0.077 N NA
 56645 56646 PA0195 PA0195.1 pntA pntAB TRUE 0.952 76.000 0.829 0.001   NA
 56646 56647 PA0195.1 PA0196 pntAB pntB TRUE 0.991 0.000 0.144 0.001   NA
 56647 56648 PA0196 PA0197 pntB   FALSE 0.007 343.000 0.000 1.000 N NA
 56648 56649 PA0197 PA0198   exbB1 TRUE 0.978 29.000 0.778 0.017 N NA
 56649 56650 PA0198 PA0199 exbB1 exbD1 TRUE 0.998 2.000 0.778 0.096 Y NA
 56653 56654 PA0202 PA0203     TRUE 0.823 66.000 0.500 1.000 N NA
 56654 56655 PA0203 PA0204     TRUE 0.993 23.000 0.800 0.079 Y NA
 56655 56656 PA0204 PA0205     TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.079 Y NA
 56656 56657 PA0205 PA0206     TRUE 0.974 26.000 0.364 1.000 Y NA
 56658 56659 PA0207 PA0208   mdcA FALSE 0.084 121.000 0.000 1.000   NA
 56659 56660 PA0208 PA0209 mdcA   TRUE 0.990 0.000 0.508 1.000   NA
 56660 56661 PA0209 PA0210   mdcC TRUE 0.986 2.000 0.475 NA   NA
 56661 56662 PA0210 PA0211 mdcC mdcD TRUE 0.990 -7.000 0.400 NA   NA
 56662 56663 PA0211 PA0212 mdcD mdcE TRUE 0.995 -3.000 0.700 NA   NA
 56663 56664 PA0212 PA0213 mdcE   TRUE 0.942 16.000 0.339 NA   NA
 56664 56665 PA0213 PA0214     TRUE 0.995 -3.000 0.651 1.000   NA
 56665 56666 PA0214 PA0215     TRUE 0.720 57.000 0.200 1.000   NA
 56666 56667 PA0215 PA0216     TRUE 0.989 6.000 0.945 NA   NA
 56668 56669 PA0217 PA0218     FALSE 0.144 329.000 0.000 0.099 Y NA
 56670 56671 PA0219 PA0220     TRUE 0.615 58.000 0.118 1.000 N NA
 56671 56672 PA0220 PA0221     TRUE 0.838 31.000 0.200 1.000 N NA
 56672 56673 PA0221 PA0222     FALSE 0.043 164.000 0.000 1.000 N NA
 56674 56675 PA0223 PA0224     TRUE 0.787 60.000 0.333 1.000 N NA
 56676 56677 PA0225 PA0226     FALSE 0.053 151.000 0.000 1.000 N NA
 56677 56678 PA0226 PA0227     TRUE 0.999 -3.000 0.739 0.000 Y NA
 56678 56679 PA0227 PA0228   pcaF TRUE 0.997 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 56679 56680 PA0228 PA0229 pcaF pcaT FALSE 0.198 150.000 0.051 1.000 N NA
 56680 56681 PA0229 PA0230 pcaT pcaB TRUE 0.713 23.000 0.042 1.000 N NA
 56681 56682 PA0230 PA0231 pcaB pcaD TRUE 0.822 16.000 0.063 1.000   NA
 56682 56683 PA0231 PA0232 pcaD pcaC TRUE 0.929 11.000 0.174 1.000   NA
 56683 56684 PA0232 PA0233 pcaC   FALSE 0.043 175.000 0.000 1.000   NA
 56684 56685 PA0233 PA0234     FALSE 0.226 191.000 0.167 NA   NA
 56687 56688 PA0236 PA0237     FALSE 0.170 243.000 0.222 1.000   NA
 56688 56689 PA0237 PA0238     TRUE 0.845 23.000 0.143 NA   NA
 56689 56690 PA0238 PA0239     FALSE 0.219 150.000 0.057 NA   NA
 56691 56692 PA0240 PA0241     FALSE 0.474 66.000 0.000 0.087   NA
 56693 56694 PA0242 PA0243     FALSE 0.464 93.000 0.122 1.000 N NA
 56695 56696 PA0244 PA0245   aroQ2 TRUE 0.998 -3.000 0.583 1.000 Y NA
 56696 56697 PA0245 PA0246 aroQ2   FALSE 0.075 117.000 0.000 1.000 N NA
 56697 56698 PA0246 PA0247   pobA FALSE 0.107 175.000 0.029 1.000 N NA
 56700 56701 PA0249 PA0250     FALSE 0.428 78.000 0.000 0.087   NA
 56701 56702 PA0250 PA0251     FALSE 0.055 155.000 0.000 NA   NA
 56702 56703 PA0251 PA0252     FALSE 0.014 265.000 0.000 NA   NA
 56703 56704 PA0252 PA0253     FALSE 0.120 92.000 0.000 NA   NA
 56704 56705 PA0253 PA0254     FALSE 0.252 41.000 0.000 NA N NA
 56705 56706 PA0254 PA0255     FALSE 0.070 134.000 0.000 NA   NA
 56706 56707 PA0255 PA0256     FALSE 0.049 164.000 0.000 NA   NA
 56707 56708 PA0256 PA0257     FALSE 0.015 264.000 0.000 NA   NA
 56708 56709 PA0257 PA0258     TRUE 0.924 30.000 0.476 NA   NA
 56709 56710 PA0258 PA0259     FALSE 0.043 172.000 0.000 NA   NA
 56710 56711 PA0259 PA0260     FALSE 0.061 150.000 0.000 NA   NA
 56711 56712 PA0260 PA0261     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 56712 56713 PA0261 PA0262     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 56713 56714 PA0262 PA0263   hcpC FALSE 0.038 182.000 0.000 NA   NA
 56714 2200464 PA0263 PA0263.1 hcpC   FALSE 0.003 1255.000 0.000 NA   NA
 2200464 56715 PA0263.1 PA0264     FALSE 0.034 189.000 0.000 NA   NA
 56716 56717 PA0265 PA0266 gabD gabT FALSE 0.202 245.000 0.303 1.000 N NA
 56717 56718 PA0266 PA0267 gabT   FALSE 0.076 326.000 0.182 1.000 N NA
 56720 56721 PA0269 PA0270     TRUE 0.567 12.000 0.000 NA   NA
 56721 56722 PA0270 PA0271     FALSE 0.333 34.000 0.000 NA   NA
 56723 56724 PA0272 PA0273     TRUE 0.859 50.000 0.444 1.000 N NA
 56724 56725 PA0273 PA0274     FALSE 0.050 163.000 0.000 NA   NA
 56725 56726 PA0274 PA0275     FALSE 0.092 109.000 0.000 NA   NA
 56728 56729 PA0277 PA0278     FALSE 0.045 172.000 0.000 1.000   NA
 56731 56732 PA0280 PA0281 cysA cysW TRUE 0.995 4.000 0.587 1.000 Y NA
 56732 56733 PA0281 PA0282 cysW cysT TRUE 0.995 11.000 0.935 0.000 N NA
 56733 56734 PA0282 PA0283 cysT sbp FALSE 0.465 162.000 0.066 0.002 N NA
 56734 56735 PA0283 PA0284 sbp   FALSE 0.283 177.000 0.188 NA   NA
 56735 56736 PA0284 PA0285     FALSE 0.190 164.000 0.062 NA   NA
 56737 56738 PA0286 PA0287   gpuP FALSE 0.018 231.000 0.000 1.000 N NA
 56738 56739 PA0287 PA0288 gpuP gpuA TRUE 0.859 56.000 0.087 1.000 Y NA
 56739 56740 PA0288 PA0289 gpuA gpuR FALSE 0.200 53.000 0.000 1.000 N NA
 56740 56741 PA0289 PA0290 gpuR   FALSE 0.078 113.000 0.000 1.000 N NA
 56741 56742 PA0290 PA0291   oprE FALSE 0.004 613.000 0.000 1.000   NA
 56743 56744 PA0292 PA0293 aguA aguB FALSE 0.461 86.000 0.084 1.000   NA
 56744 56745 PA0293 PA0294 aguB aguR FALSE 0.142 163.000 0.032 1.000   NA
 56745 56746 PA0294 PA0295 aguR   TRUE 0.575 63.000 0.105 1.000 N NA
 56746 56747 PA0295 PA0296     FALSE 0.134 256.000 0.000 1.000 Y NA
 56748 56749 PA0297 PA0298 spuA spuB TRUE 0.789 41.000 0.182 1.000   NA
 56749 56750 PA0298 PA0299 spuB spuC TRUE 0.703 66.000 0.239 1.000 N NA
 56750 56751 PA0299 PA0300 spuC spuD FALSE 0.076 116.000 0.000 1.000 N NA
 56751 56752 PA0300 PA0301 spuD spuE FALSE 0.118 419.000 0.000 0.023 Y NA
 56752 56753 PA0301 PA0302 spuE spuF TRUE 0.721 55.000 0.000 1.000 Y NA
 56753 56754 PA0302 PA0303 spuF spuG TRUE 0.858 27.000 0.000 1.000 Y NA
 56754 56755 PA0303 PA0304 spuG spuH TRUE 0.762 83.000 0.000 0.079 Y NA
 56764 56765 PA0313 PA0314     TRUE 0.969 72.000 0.625 0.079 Y NA
 56768 56769 PA0317 PA0318     FALSE 0.391 92.000 0.071 1.000 N NA
 56769 56770 PA0318 PA0319     FALSE 0.295 99.000 0.041 NA   NA
 56770 56771 PA0319 PA0320     TRUE 0.661 62.000 0.167 NA   NA
 56772 56773 PA0321 PA0322     FALSE 0.453 16.000 0.000 NA N NA
 56773 56774 PA0322 PA0323     FALSE 0.051 421.000 0.000 1.000 Y NA
 56774 56775 PA0323 PA0324     TRUE 0.988 48.000 1.000 0.079 Y NA
 56775 56776 PA0324 PA0325     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.079 Y NA
 56776 56777 PA0325 PA0326     TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 56779 56780 PA0328 PA0329     FALSE 0.011 301.000 0.000 NA   NA
 56780 56781 PA0329 PA0330   rpiA FALSE 0.078 124.000 0.000 NA   NA
 56782 56783 PA0331 PA0332 ilvA1   FALSE 0.221 120.000 0.034 NA   NA
 56783 56784 PA0332 PA0333     TRUE 0.674 51.000 0.125 NA   NA
 56785 56786 PA0334 PA0335     FALSE 0.472 50.000 0.032 1.000 N NA
 56787 56788 PA0336 PA0337 ygdP ptsP TRUE 0.806 23.000 0.097 1.000 N NA
 56788 56789 PA0337 PA0338 ptsP   TRUE 0.863 26.000 0.000 1.000 Y NA
 56791 56792 PA0340 PA0341   lgt TRUE 0.833 10.000 0.030 1.000   NA
 56792 56793 PA0341 PA0342 lgt thyA FALSE 0.188 206.000 0.164 1.000 N NA
 56794 56795 PA0343 PA0344     FALSE 0.328 35.000 0.000 NA   NA
 56795 56796 PA0344 PA0345     TRUE 0.996 -7.000 0.904 NA   NA
 56799 56800 PA0348 PA0349     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 56800 56801 PA0349 PA0350   folA FALSE 0.141 83.000 0.000 NA   NA
 56802 56803 PA0351 PA0352     FALSE 0.070 139.000 0.000 1.000   NA
 56803 56804 PA0352 PA0353   ilvD FALSE 0.018 230.000 0.000 1.000 N NA
 56804 56805 PA0353 PA0354 ilvD   FALSE 0.009 329.000 0.000 1.000   NA
 56805 56806 PA0354 PA0355   pfpI FALSE 0.365 73.000 0.031 1.000   NA
 56807 56808 PA0356 PA0357   mutM FALSE 0.334 59.000 0.015 NA N NA
 56808 56809 PA0357 PA0358 mutM   FALSE 0.231 77.000 0.003 1.000 N NA
 56809 56810 PA0358 PA0359     FALSE 0.141 83.000 0.000 NA   NA
 56810 56811 PA0359 PA0360     FALSE 0.014 270.000 0.000 NA   NA
 56812 56813 PA0361 PA0362   fdx1 FALSE 0.297 128.000 0.076 1.000   NA
 56813 56814 PA0362 PA0363 fdx1 coaD FALSE 0.334 121.000 0.088 1.000   NA
 56814 56815 PA0363 PA0364 coaD   FALSE 0.107 152.000 0.011 1.000 N NA
 56815 56816 PA0364 PA0365     TRUE 0.917 56.000 0.886 NA   NA
 56816 56817 PA0365 PA0366     TRUE 0.799 55.000 0.308 NA   NA
 56819 56820 PA0368 PA0369     FALSE 0.314 37.000 0.000 NA   NA
 56820 56821 PA0369 PA0370     FALSE 0.013 279.000 0.000 NA   NA
 56821 56822 PA0370 PA0371     TRUE 0.954 0.000 0.070 1.000   NA
 56822 56823 PA0371 PA0372     TRUE 0.997 -7.000 0.598 0.006   NA
 56824 56825 PA0373 PA0374 ftsY ftsE TRUE 0.988 -3.000 0.117 0.098 N NA
 56825 56826 PA0374 PA0375 ftsE ftsX TRUE 0.985 0.000 0.035 NA Y NA
 56826 56827 PA0375 PA0376 ftsX rpoH FALSE 0.270 114.000 0.054 NA N NA
 56827 56828 PA0376 PA0377 rpoH   FALSE 0.295 65.000 0.005 NA   NA
 56830 56831 PA0379 PA0380     FALSE 0.323 103.000 0.058 NA   NA
 56831 56832 PA0380 PA0381   thiG TRUE 0.872 59.000 0.130 1.000 Y NA
 56832 56833 PA0381 PA0382 thiG micA FALSE 0.212 154.000 0.060 1.000   NA
 56833 56834 PA0382 PA0383 micA   FALSE 0.089 163.000 0.004 NA   NA
 56835 56836 PA0384 PA0385     FALSE 0.188 62.000 0.000 NA   NA
 56836 56837 PA0385 PA0386     FALSE 0.261 81.000 0.011 NA   NA
 56837 56838 PA0386 PA0387     FALSE 0.474 121.000 0.218 1.000 N NA
 56838 56839 PA0387 PA0388     TRUE 0.963 -3.000 0.050 NA   NA
 56839 56840 PA0388 PA0389     FALSE 0.319 132.000 0.100 NA   NA
 56840 56841 PA0389 PA0390   metX TRUE 0.978 8.000 0.509 NA   NA
 56841 56842 PA0390 PA0391 metX   FALSE 0.293 89.000 0.027 1.000   NA
 56842 56843 PA0391 PA0392     FALSE 0.006 401.000 0.000 NA   NA
 56843 56844 PA0392 PA0393   proC TRUE 0.920 11.000 0.152 NA   NA
 56844 56845 PA0393 PA0394 proC   TRUE 0.914 12.000 0.158 NA   NA
 56846 56847 PA0395 PA0396 pilT pilU TRUE 0.856 178.000 0.436 0.017 Y NA
 56849 56850 PA0398 PA0399     FALSE 0.018 243.000 0.000 NA   NA
 56850 56851 PA0399 PA0400     TRUE 0.997 -3.000 0.133 0.019 Y NA
 56852 56853 PA0401 PA0402 pyrC pyrB TRUE 0.998 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 56853 56854 PA0402 PA0403 pyrB pyrR TRUE 0.966 24.000 0.247 1.000 Y NA
 56854 56855 PA0403 PA0404 pyrR   FALSE 0.373 112.000 0.109 1.000 N NA
 56855 56856 PA0404 PA0405     TRUE 0.981 0.000 0.263 NA N NA
 56856 56857 PA0405 PA0406     TRUE 0.578 49.000 0.064 NA N NA
 56857 56858 PA0406 PA0407   gshB TRUE 0.478 81.000 0.089 1.000 N NA
 56859 56860 PA0408 PA0409 pilG pilH TRUE 0.972 47.000 0.296 0.022 Y NA
 56860 56861 PA0409 PA0410 pilH pilI TRUE 0.930 51.000 0.266 1.000 Y NA
 56861 56862 PA0410 PA0411 pilI pilJ TRUE 0.976 85.000 0.795 0.012 Y NA
 56862 56863 PA0411 PA0412 pilJ pilK TRUE 0.907 61.000 0.241 1.000 Y NA
 56863 56864 PA0412 PA0413 pilK chpA TRUE 0.980 12.000 0.217 1.000 Y NA
 56864 56865 PA0413 PA0414 chpA chpB TRUE 0.998 -7.000 0.217 0.012 Y NA
 56865 56866 PA0414 PA0415 chpB chpC TRUE 0.997 -3.000 0.517 0.012   NA
 56866 56867 PA0415 PA0416 chpC chpD TRUE 0.908 8.000 0.000 0.063   NA
 56867 56868 PA0416 PA0417 chpD chpE FALSE 0.450 76.000 0.067 1.000 N NA
 56869 56870 PA0418 PA0419     FALSE 0.328 35.000 0.000 NA   NA
 56870 56871 PA0419 PA0420   bioA FALSE 0.321 93.000 0.041 NA   NA
 56872 56873 PA0421 PA0422     FALSE 0.239 181.000 0.032 0.076 N NA
 56873 56874 PA0422 PA0423     TRUE 0.977 12.000 0.676 NA   NA
 56876 56877 PA0425 PA0426 mexA mexB TRUE 0.961 16.000 0.565 1.000 N NA
 56877 56878 PA0426 PA0427 mexB oprM TRUE 0.993 2.000 0.538 0.078 N NA
 56879 56880 PA0428 PA0429     FALSE 0.017 251.000 0.000 NA   NA
 56880 56881 PA0429 PA0430   metF FALSE 0.286 70.000 0.010 NA   NA
 56881 56882 PA0430 PA0431 metF   FALSE 0.272 43.000 0.000 NA   NA
 56882 56883 PA0431 PA0432   sahH FALSE 0.288 41.000 0.000 NA   NA
 56884 56885 PA0433 PA0434     FALSE 0.076 126.000 0.000 NA   NA
 56885 56886 PA0434 PA0435     TRUE 0.595 11.000 0.000 NA   NA
 56886 56887 PA0435 PA0436     FALSE 0.136 85.000 0.000 NA   NA
 56888 56889 PA0437 PA0438 codA codB TRUE 0.995 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 56889 56890 PA0438 PA0439 codB   FALSE 0.271 182.000 0.000 1.000 Y NA
 56890 56891 PA0439 PA0440     TRUE 0.995 -3.000 0.301 0.014 N NA
 56891 56892 PA0440 PA0441   dht FALSE 0.306 95.000 0.043 1.000 N NA
 56892 56893 PA0441 PA0442 dht   FALSE 0.094 107.000 0.000 NA   NA
 56894 56895 PA0443 PA0444     TRUE 0.532 59.000 0.069 1.000 N NA
 56896 56897 PA0445 PA0446     FALSE 0.014 256.000 0.000 1.000 N NA
 56897 56898 PA0446 PA0447   gcdH FALSE 0.389 120.000 0.143 1.000 N NA
 56899 56900 PA0448 PA0449     FALSE 0.426 18.000 0.000 NA N NA
 56902 56903 PA0451 PA0452     TRUE 0.997 -3.000 0.330 NA Y NA
 56904 56905 PA0453 PA0454     FALSE 0.124 90.000 0.000 NA   NA
 56905 56906 PA0454 PA0455   dbpA FALSE 0.030 261.000 0.010 NA   NA
 56907 56908 PA0456 PA0457     FALSE 0.053 151.000 0.000 1.000 N NA
 5922240 56909 PA0457.1 PA0458     TRUE 0.763 2.000 0.000 NA   NA
 56910 56911 PA0459 PA0460     FALSE 0.100 102.000 0.000 NA   NA
 56913 56914 PA0462 PA0463   creB FALSE 0.452 85.000 0.085 1.000 N NA
 56914 56915 PA0463 PA0464 creB creC TRUE 0.998 0.000 0.776 1.000 Y NA
 56915 56916 PA0464 PA0465 creC creD TRUE 0.611 102.000 0.311 NA N NA
 56916 56917 PA0465 PA0466 creD   FALSE 0.473 50.000 0.029 NA   NA
 56918 56919 PA0467 PA0468     FALSE 0.414 19.000 0.000 NA N NA
 56921 56922 PA0470 PA0471     TRUE 0.904 104.000 0.600 NA Y NA
 56922 56923 PA0471 PA0472     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 56924 56925 PA0473 PA0474     FALSE 0.056 140.000 0.000 NA N NA
 56925 56926 PA0474 PA0475     FALSE 0.236 50.000 0.000 NA   NA
 56927 56928 PA0476 PA0477     FALSE 0.007 348.000 0.000 1.000 N NA
 56931 56932 PA0480 PA0481     FALSE 0.272 43.000 0.000 NA   NA
 56934 56935 PA0483 PA0484     TRUE 0.832 32.000 0.048 0.086   NA
 56936 56937 PA0485 PA0486     FALSE 0.070 202.000 0.020 NA   NA
 56937 56938 PA0486 PA0487     FALSE 0.360 62.000 0.019 NA   NA
 56938 56939 PA0487 PA0488     FALSE 0.168 68.000 0.000 NA   NA
 56939 56940 PA0488 PA0489     FALSE 0.280 42.000 0.000 NA   NA
 56940 56941 PA0489 PA0490     FALSE 0.115 139.000 0.003 NA   NA
 56941 56942 PA0490 PA0491     FALSE 0.218 54.000 0.000 NA   NA
 56943 56944 PA0492 PA0493     TRUE 0.681 77.000 0.242 1.000   NA
 56944 56945 PA0493 PA0494     TRUE 0.922 11.000 0.154 1.000   NA
 56945 56946 PA0494 PA0495     TRUE 0.986 2.000 0.514 1.000 N NA
 56946 56947 PA0495 PA0496     TRUE 0.999 -10.000 0.886 0.005 Y NA
 56948 56949 PA0497 PA0498     TRUE 0.573 78.000 0.000 0.002   NA
 56949 56950 PA0498 PA0499     TRUE 0.510 16.000 0.000 1.000   NA
 56951 56952 PA0500 PA0501 bioB bioF TRUE 0.904 106.000 0.168 0.001 Y NA
 56952 56953 PA0501 PA0502 bioF   TRUE 0.968 -7.000 0.092 NA   NA
 56953 56954 PA0502 PA0503     TRUE 0.978 -7.000 0.163 NA   NA
 56954 56955 PA0503 PA0504   bioD TRUE 0.977 4.000 0.063 0.001 N NA
 56955 56956 PA0504 PA0505 bioD   TRUE 0.542 109.000 0.244 NA   NA
 56956 56957 PA0505 PA0506     FALSE 0.008 340.000 0.000 NA   NA
 56957 56958 PA0506 PA0507     FALSE 0.405 213.000 0.000 0.008 Y NA
 56958 56959 PA0507 PA0508     TRUE 0.489 274.000 0.150 0.008 Y NA
 56960 56961 PA0509 PA0510 nirN   TRUE 0.970 -9.000 0.125 1.000 N NA
 56961 56962 PA0510 PA0511   nirJ TRUE 0.606 11.000 0.000 1.000   NA
 56962 56963 PA0511 PA0512 nirJ   TRUE 0.851 -6.000 0.000 NA   NA
 56963 56964 PA0512 PA0513     TRUE 0.997 -25.000 0.483 NA Y NA
 56964 56965 PA0513 PA0514   nirL TRUE 0.995 -7.000 0.241 NA Y NA
 56965 56966 PA0514 PA0515 nirL   TRUE 0.997 -3.000 0.333 NA Y NA
 56966 56967 PA0515 PA0516   nirF TRUE 0.898 9.000 0.070 1.000   NA
 56967 56968 PA0516 PA0517 nirF nirC TRUE 0.994 -3.000 0.186 0.015   NA
 56968 56969 PA0517 PA0518 nirC nirM TRUE 0.997 -3.000 0.062 0.015 Y NA
 56969 56970 PA0518 PA0519 nirM nirS TRUE 0.942 51.000 0.094 0.015 Y NA
 56971 56972 PA0520 PA0521 nirQ   TRUE 0.711 35.000 0.071 1.000   NA
 56972 56973 PA0521 PA0522     TRUE 0.985 8.000 0.750 NA   NA
 56973 56974 PA0522 PA0523   norC FALSE 0.124 90.000 0.000 NA   NA
 56974 56975 PA0523 PA0524 norC norB TRUE 0.998 0.000 0.794 0.001   NA
 56975 56976 PA0524 PA0525 norB   TRUE 0.996 2.000 0.118 0.001 Y NA
 56977 56978 PA0526 PA0527   dnr FALSE 0.139 84.000 0.000 NA   NA
 56980 56981 PA0529 PA0530     FALSE 0.117 226.000 0.000 0.019   NA
 56981 56982 PA0530 PA0531     TRUE 0.921 0.000 0.029 1.000 N NA
 56984 56985 PA0533 PA0534     FALSE 0.007 338.000 0.000 1.000 N NA
 56985 56986 PA0534 PA0535     TRUE 0.905 18.000 0.226 1.000 N NA
 56987 56988 PA0536 PA0537     TRUE 0.844 4.000 0.013 NA   NA
 56988 56989 PA0537 PA0538   dsbB FALSE 0.129 88.000 0.000 NA   NA
 56990 56991 PA0539 PA0540     TRUE 0.713 70.000 0.267 NA   NA
 56991 56992 PA0540 PA0541     FALSE 0.340 113.000 0.080 NA   NA
 56997 56998 PA0546 PA0547 metK   TRUE 0.942 16.000 0.036 1.000 Y NA
 56999 57000 PA0548 PA0549 tktA   TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 57002 57003 PA0551 PA0552 epd pgk TRUE 0.992 6.000 0.070 0.003 Y NA
 57003 57004 PA0552 PA0553 pgk   FALSE 0.254 73.000 0.003 NA   NA
 57004 57005 PA0553 PA0554     FALSE 0.418 160.000 0.273 NA   NA
 57005 57006 PA0554 PA0555   fda FALSE 0.326 120.000 0.084 NA   NA
 57006 57007 PA0555 PA0556 fda   FALSE 0.176 66.000 0.000 NA   NA
 57011 57012 PA0560 PA0561     FALSE 0.397 26.000 0.000 NA   NA
 57013 57014 PA0562 PA0563     FALSE 0.077 129.000 0.000 1.000   NA
 57014 57015 PA0563 PA0564     FALSE 0.042 178.000 0.000 1.000   NA
 57019 57020 PA0568 PA0569     TRUE 0.499 16.000 0.000 NA   NA
 57020 57021 PA0569 PA0570     TRUE 0.526 14.000 0.000 NA   NA
 57021 57022 PA0570 PA0571     TRUE 0.826 -10.000 0.000 NA   NA
 57022 57023 PA0571 PA0572     FALSE 0.033 191.000 0.000 NA   NA
 57023 57024 PA0572 PA0573     FALSE 0.004 570.000 0.000 1.000   NA
 57024 57025 PA0573 PA0574     FALSE 0.122 93.000 0.000 1.000   NA
 57025 2200466 PA0574 PA0574.1     FALSE 0.004 550.000 0.000 NA   NA
 2200466 57026 PA0574.1 PA0575     TRUE 0.485 17.000 0.000 NA   NA
 57026 57027 PA0575 PA0576   rpoD FALSE 0.172 107.000 0.013 1.000 N NA
 57027 57028 PA0576 PA0577 rpoD dnaG TRUE 0.702 80.000 0.299 1.000 N NA
 57028 57029 PA0577 PA0578 dnaG   TRUE 0.550 83.000 0.137 1.000   NA
 57029 57030 PA0578 PA0579   rpsU TRUE 0.813 70.000 0.173 0.017   NA
 57033 57034 PA0582 PA0583 folB   TRUE 0.997 -9.000 0.500 1.000 Y NA
 57035 57036 PA0584 PA0585 cca   FALSE 0.416 44.000 0.008 NA   NA
 57036 57037 PA0585 PA0586     FALSE 0.203 94.000 0.007 NA   NA
 57037 57038 PA0586 PA0587     TRUE 0.996 -3.000 0.761 NA   NA
 57038 57039 PA0587 PA0588     TRUE 0.785 101.000 0.683 NA   NA
 57039 57040 PA0588 PA0589   glpE FALSE 0.011 279.000 0.000 NA N NA
 57040 57041 PA0589 PA0590 glpE apaH TRUE 0.578 44.000 0.045 1.000   NA
 57041 57042 PA0590 PA0591 apaH   TRUE 0.982 0.000 0.267 NA   NA
 57042 57043 PA0591 PA0592   ksgA TRUE 0.693 37.000 0.078 NA N NA
 57043 57044 PA0592 PA0593 ksgA pdxA FALSE 0.465 116.000 0.197 1.000 N NA
 57044 57045 PA0593 PA0594 pdxA surA TRUE 0.994 -3.000 0.561 1.000 N NA
 57045 57046 PA0594 PA0595 surA ostA TRUE 0.951 -19.000 0.070 1.000 N NA
 57047 57048 PA0596 PA0597     TRUE 0.995 -3.000 0.642 NA   NA
 57048 57049 PA0597 PA0598     TRUE 0.946 2.000 0.091 1.000 N NA
 57051 57052 PA0600 PA0601     TRUE 0.986 46.000 0.667 0.028 Y NA
 57052 57053 PA0601 PA0602     FALSE 0.065 129.000 0.000 1.000 N NA
 57053 57054 PA0602 PA0603     FALSE 0.162 234.000 0.000 1.000 Y NA
 57054 57055 PA0603 PA0604     TRUE 0.955 56.000 0.556 1.000 Y NA
 57055 57056 PA0604 PA0605     TRUE 0.821 114.000 0.108 0.077 Y NA
 57056 57057 PA0605 PA0606     TRUE 0.851 106.000 0.145 0.077 Y NA
 57057 57058 PA0606 PA0607   rpe FALSE 0.131 124.000 0.007 1.000 N NA
 57058 57059 PA0607 PA0608 rpe gph TRUE 0.966 0.000 0.120 1.000   NA
 57059 57060 PA0608 PA0609 gph trpE TRUE 0.681 73.000 0.233 1.000   NA
 57061 57062 PA0610 PA0611 prtN prtR FALSE 0.104 100.000 0.000 NA   NA
 57063 57064 PA0612 PA0613     FALSE 0.246 48.000 0.000 NA   NA
 57064 57065 PA0613 PA0614     FALSE 0.007 364.000 0.000 NA   NA
 57065 57066 PA0614 PA0615     FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 57066 57067 PA0615 PA0616     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 57067 57068 PA0616 PA0617     TRUE 0.580 153.000 0.500 NA   NA
 57068 57069 PA0617 PA0618     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57069 57070 PA0618 PA0619     TRUE 0.842 -7.000 0.000 NA   NA
 57070 57071 PA0619 PA0620     TRUE 0.763 2.000 0.000 NA   NA
 57071 57072 PA0620 PA0621     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57072 57073 PA0621 PA0622     FALSE 0.272 43.000 0.000 NA   NA
 57073 57074 PA0622 PA0623     TRUE 0.958 13.000 0.423 NA   NA
 57074 57075 PA0623 PA0624     TRUE 0.909 15.000 0.192 NA   NA
 57075 57076 PA0624 PA0625     FALSE 0.359 170.000 0.250 NA   NA
 57076 57077 PA0625 PA0626     TRUE 0.930 10.000 0.158 NA   NA
 57077 57078 PA0626 PA0627     TRUE 0.977 -25.000 0.211 NA   NA
 57078 57079 PA0627 PA0628     FALSE 0.201 58.000 0.000 NA   NA
 57079 57080 PA0628 PA0629     FALSE 0.340 33.000 0.000 NA   NA
 57080 57081 PA0629 PA0630     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57081 57082 PA0630 PA0631     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57082 57083 PA0631 PA0632     TRUE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 57083 57084 PA0632 PA0633     FALSE 0.161 71.000 0.000 NA   NA
 57084 57085 PA0633 PA0634     TRUE 0.954 12.000 0.333 NA   NA
 57085 57086 PA0634 PA0635     TRUE 0.939 30.000 0.600 NA   NA
 57086 57087 PA0635 PA0636     FALSE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 57087 57088 PA0636 PA0637     TRUE 0.842 -7.000 0.000 NA   NA
 57088 57089 PA0637 PA0638     TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 57089 57090 PA0638 PA0639     TRUE 0.933 3.000 0.071 NA   NA
 57090 57091 PA0639 PA0640     FALSE 0.213 55.000 0.000 NA   NA
 57091 57092 PA0640 PA0641     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 57092 57093 PA0641 PA0642     FALSE 0.019 236.000 0.000 NA   NA
 57093 57094 PA0642 PA0643     FALSE 0.409 24.000 0.000 NA   NA
 57094 57095 PA0643 PA0644     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 57095 57096 PA0644 PA0645     TRUE 0.809 -19.000 0.000 NA   NA
 57096 57097 PA0645 PA0646     FALSE 0.110 96.000 0.000 NA   NA
 57097 57098 PA0646 PA0647     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 57098 57099 PA0647 PA0648     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57099 57100 PA0648 PA0649   trpG FALSE 0.006 419.000 0.000 NA   NA
 57100 57101 PA0649 PA0650 trpG trpD TRUE 0.988 2.000 0.105 1.000 Y NA
 57101 57102 PA0650 PA0651 trpD trpC TRUE 0.997 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 57104 57105 PA0653 PA0654   speD FALSE 0.024 320.000 0.025 1.000 N NA
 57106 57107 PA0655 PA0656     FALSE 0.203 100.000 0.018 1.000 N NA
 57109 57110 PA0658 PA0659     TRUE 0.512 61.000 0.057 1.000   NA
 57110 57111 PA0659 PA0660     FALSE 0.410 122.000 0.154 1.000   NA
 57111 57112 PA0660 PA0661     TRUE 0.714 17.000 0.024 NA   NA
 57113 57114 PA0662 PA0663 argC   TRUE 0.893 0.000 0.008 NA   NA
 57114 57115 PA0663 PA0664     TRUE 0.956 1.000 0.103 NA   NA
 57115 57116 PA0664 PA0665     TRUE 0.483 78.000 0.079 NA   NA
 57117 57118 PA0666 PA0667     TRUE 0.961 3.000 0.184 NA N NA
 57119 2200467 PA0668 PA0668.1 tyrZ   FALSE 0.004 540.000 0.000 NA   NA
 2200467 2200468 PA0668.1 PA0668.2     FALSE 0.180 65.000 0.000 NA   NA
 2200468 2200469 PA0668.2 PA0668.3     FALSE 0.369 29.000 0.000 NA   NA
 2200469 2200470 PA0668.3 PA0668.4     FALSE 0.022 227.000 0.000 NA   NA
 2200470 2200471 PA0668.4 PA0668.5     FALSE 0.065 143.000 0.000 NA   NA
 57120 57121 PA0669 PA0670 dnaE2   TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 57121 57122 PA0670 PA0671     TRUE 0.984 8.000 0.667 NA   NA
 57125 57126 PA0674 PA0675     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 57126 57127 PA0675 PA0676     TRUE 0.873 70.000 0.800 NA N NA
 57128 57129 PA0677 PA0678     TRUE 0.976 -16.000 0.000 NA Y NA
 57132 57133 PA0681 PA0682     TRUE 0.967 8.000 0.029 1.000 Y NA
 57133 57134 PA0682 PA0683     TRUE 0.780 62.000 0.136 0.084   NA
 57134 57135 PA0683 PA0684     TRUE 0.954 -13.000 0.061 1.000   NA
 57135 57136 PA0684 PA0685     TRUE 0.991 -3.000 0.044 1.000 Y NA
 57136 57137 PA0685 PA0686     TRUE 0.999 -3.000 0.776 0.005 Y NA
 57137 57138 PA0686 PA0687     TRUE 0.999 0.000 0.653 0.005 Y NA
 57138 57139 PA0687 PA0688     FALSE 0.004 514.000 0.000 NA N NA
 57139 57140 PA0688 PA0689     TRUE 0.918 86.000 0.500 NA Y NA
 57140 57141 PA0689 PA0690     FALSE 0.037 183.000 0.000 NA   NA
 57141 57142 PA0690 PA0691     FALSE 0.006 392.000 0.000 NA   NA
 57142 57143 PA0691 PA0692     FALSE 0.276 164.000 0.139 NA   NA
 57143 57144 PA0692 PA0693   exbB2 TRUE 0.938 24.000 0.472 1.000   NA
 57144 57145 PA0693 PA0694 exbB2 exbD2 TRUE 0.988 11.000 0.655 0.092   NA
 57145 57146 PA0694 PA0695 exbD2   TRUE 0.942 9.000 0.190 1.000 N NA
 57146 57147 PA0695 PA0696     TRUE 0.776 68.000 0.360 1.000   NA
 57147 57148 PA0696 PA0697     TRUE 0.913 35.000 0.480 NA   NA
 57148 57149 PA0697 PA0698     TRUE 0.920 29.000 0.429 NA   NA
 57149 57150 PA0698 PA0699     TRUE 0.981 5.000 0.500 NA   NA
 57150 57151 PA0699 PA0700     TRUE 0.962 0.000 0.100 NA   NA
 57151 57152 PA0700 PA0701     TRUE 0.621 10.000 0.000 NA   NA
 57153 57154 PA0702 PA0703     FALSE 0.127 79.000 0.000 NA N NA
 57154 57155 PA0703 PA0704     TRUE 0.570 71.000 0.133 1.000 N NA
 57155 57156 PA0704 PA0705     FALSE 0.063 128.000 0.000 NA N NA
 57156 57157 PA0705 PA0706   cat FALSE 0.016 255.000 0.000 NA   NA
 57157 57158 PA0706 PA0707 cat toxR FALSE 0.118 93.000 0.000 NA   NA
 57158 57159 PA0707 PA0708 toxR   FALSE 0.012 286.000 0.000 NA   NA
 57160 57161 PA0709 PA0710   gloA2 FALSE 0.269 45.000 0.000 1.000   NA
 57162 57163 PA0711 PA0712     TRUE 0.558 61.000 0.080 NA   NA
 57164 57165 PA0713 PA0714     FALSE 0.020 232.000 0.000 NA   NA
 57165 57166 PA0714 PA0715     FALSE 0.003 795.000 0.000 NA   NA
 57166 57167 PA0715 PA0716     TRUE 0.745 3.000 0.000 1.000   NA
 57167 57168 PA0716 PA0717     FALSE 0.003 891.000 0.000 NA   NA
 57168 57169 PA0717 PA0718     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 57169 57170 PA0718 PA0719     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 57170 57171 PA0719 PA0720     FALSE 0.069 135.000 0.000 NA   NA
 57171 57172 PA0720 PA0721     TRUE 0.485 17.000 0.000 NA   NA
 57172 57173 PA0721 PA0722     TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 57173 57174 PA0722 PA0723   coaB TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 57174 57175 PA0723 PA0724 coaB   FALSE 0.068 136.000 0.000 NA   NA
 57175 57176 PA0724 PA0725     TRUE 0.694 5.000 0.000 NA   NA
 57176 57177 PA0725 PA0726     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 57177 57178 PA0726 PA0727     FALSE 0.021 230.000 0.000 NA   NA
 57178 57179 PA0727 PA0728     TRUE 0.991 0.000 0.600 NA   NA
 57179 57180 PA0728 PA0729     FALSE 0.005 475.000 0.000 NA   NA
 2200472 57181 PA0729.1 PA0730     FALSE 0.072 131.000 0.000 NA   NA
 57181 57182 PA0730 PA0731     FALSE 0.005 452.000 0.000 NA   NA
 57182 57183 PA0731 PA0732     FALSE 0.147 80.000 0.000 NA   NA
 57183 57184 PA0732 PA0733     FALSE 0.068 136.000 0.000 NA   NA
 57184 57185 PA0733 PA0734     TRUE 0.976 0.000 0.189 NA   NA
 57185 57186 PA0734 PA0735     FALSE 0.440 21.000 0.000 NA   NA
 57186 57187 PA0735 PA0736     TRUE 0.994 -3.000 0.556 NA   NA
 57188 57189 PA0737 PA0738     FALSE 0.084 117.000 0.000 NA   NA
 57192 57193 PA0741 PA0742     FALSE 0.084 117.000 0.000 NA   NA
 57193 57194 PA0742 PA0743     FALSE 0.006 393.000 0.000 NA   NA
 57194 57195 PA0743 PA0744     TRUE 0.909 112.000 0.687 1.000 Y NA
 57195 57196 PA0744 PA0745     TRUE 0.982 59.000 0.627 0.004 Y NA
 57196 57197 PA0745 PA0746     TRUE 0.898 66.000 0.242 1.000 Y NA
 57197 57198 PA0746 PA0747     TRUE 0.725 12.000 0.013 1.000 N NA
 57199 57200 PA0748 PA0749     FALSE 0.176 57.000 0.000 NA N NA
 57200 57201 PA0749 PA0750   ung FALSE 0.088 100.000 0.000 NA N NA
 57202 57203 PA0751 PA0752     TRUE 0.990 -7.000 0.429 NA   NA
 57203 57204 PA0752 PA0753     TRUE 0.983 11.000 0.857 NA   NA
 57204 57205 PA0753 PA0754     TRUE 0.808 49.000 0.277 NA   NA
 57205 57206 PA0754 PA0755     FALSE 0.371 30.000 0.000 1.000   NA
 57207 57208 PA0756 PA0757     TRUE 0.994 -7.000 0.163 1.000 Y NA
 57209 57210 PA0758 PA0759     FALSE 0.266 101.000 0.034 NA   NA
 57213 57214 PA0762 PA0763 algU mucA TRUE 0.943 32.000 0.705 NA N NA
 57214 57215 PA0763 PA0764 mucA mucB TRUE 0.995 9.000 0.856 NA Y NA
 57215 57216 PA0764 PA0765 mucB mucC TRUE 0.998 -3.000 0.609 NA Y NA
 57216 57217 PA0765 PA0766 mucC mucD TRUE 0.802 40.000 0.206 NA N NA
 57217 57218 PA0766 PA0767 mucD lepA FALSE 0.129 150.000 0.020 1.000 N NA
 57218 57219 PA0767 PA0768 lepA lepB TRUE 0.950 6.000 0.187 1.000 N NA
 57219 57220 PA0768 PA0769 lepB   FALSE 0.253 169.000 0.133 NA   NA
 57220 57221 PA0769 PA0770   rnc TRUE 0.953 -3.000 0.033 NA   NA
 57221 57222 PA0770 PA0771 rnc era TRUE 0.989 -7.000 0.127 0.061   NA
 57222 57223 PA0771 PA0772 era recO TRUE 0.604 61.000 0.109 1.000   NA
 57223 57224 PA0772 PA0773 recO pdxJ TRUE 0.977 -7.000 0.166 1.000 N NA
 57225 57226 PA0774 PA0775     TRUE 0.990 -3.000 0.315 NA   NA
 57226 57227 PA0775 PA0776     FALSE 0.175 105.000 0.008 NA   NA
 57227 57228 PA0776 PA0777     FALSE 0.071 132.000 0.000 NA   NA
 57228 57229 PA0777 PA0778   icp FALSE 0.106 99.000 0.000 NA   NA
 57229 57230 PA0778 PA0779 icp   FALSE 0.261 111.000 0.041 NA   NA
 57233 57234 PA0782 PA0783 putA putP FALSE 0.023 312.000 0.020 1.000 N NA
 57236 57237 PA0785 PA0786     TRUE 0.890 10.000 0.077 1.000 N NA
 57237 57238 PA0786 PA0787     FALSE 0.209 56.000 0.000 NA   NA
 57243 57244 PA0792 PA0793 prpD   FALSE 0.233 135.000 0.053 NA   NA
 57244 57245 PA0793 PA0794     TRUE 0.753 119.000 0.733 NA   NA
 57245 57246 PA0794 PA0795   prpC TRUE 0.788 131.000 0.289 1.000 Y NA
 57246 57247 PA0795 PA0796 prpC prpB TRUE 0.749 93.000 0.502 1.000 N NA
 57247 57248 PA0796 PA0797 prpB   TRUE 0.881 11.000 0.080 1.000 N NA
 57251 57252 PA0800 PA0801     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 57252 57253 PA0801 PA0802     TRUE 0.964 0.000 0.111 NA   NA
 57253 57254 PA0802 PA0803     FALSE 0.133 86.000 0.000 NA   NA
 57254 57255 PA0803 PA0804     FALSE 0.357 32.000 0.000 1.000   NA
 57257 57258 PA0806 PA0807     FALSE 0.004 627.000 0.000 NA   NA
 57258 57259 PA0807 PA0808     FALSE 0.165 69.000 0.000 NA   NA
 57260 57261 PA0809 PA0810     FALSE 0.098 107.000 0.000 1.000   NA
 57261 57262 PA0810 PA0811     FALSE 0.363 31.000 0.000 1.000   NA
 57262 57263 PA0811 PA0812     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 57263 57264 PA0812 PA0813     FALSE 0.049 288.000 0.000 0.083   NA
 57264 57265 PA0813 PA0814     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 57270 57271 PA0819 PA0820     FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 57272 57273 PA0821 PA0822     TRUE 0.485 17.000 0.000 NA   NA
 57273 57274 PA0822 PA0823     FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 57274 57275 PA0823 PA0824     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57275 57276 PA0824 PA0825     FALSE 0.042 174.000 0.000 NA   NA
 57276 57277 PA0825 PA0826     FALSE 0.018 243.000 0.000 NA   NA
 57277 2200473 PA0826 PA0826.2   ssrA FALSE 0.005 474.000 0.000 NA   NA
 2200473 57278 PA0826.2 PA0827 ssrA   FALSE 0.188 62.000 0.000 NA   NA
 57279 57280 PA0828 PA0829     FALSE 0.238 109.000 0.031 1.000   NA
 57282 57283 PA0831 PA0832 oruR   FALSE 0.175 102.000 0.004 1.000   NA
 57283 57284 PA0832 PA0833     FALSE 0.213 106.000 0.021 1.000   NA
 57285 57286 PA0834 PA0835   pta FALSE 0.415 127.000 0.170 1.000   NA
 57286 57287 PA0835 PA0836 pta   TRUE 0.543 63.000 0.075 1.000   NA
 10491229 57288 PA0836.1 PA0837   slyD FALSE 0.023 225.000 0.000 NA   NA
 57288 57289 PA0837 PA0838 slyD   FALSE 0.294 206.000 0.024 1.000 Y NA
 57289 57290 PA0838 PA0839     FALSE 0.119 153.000 0.018 1.000 N NA
 57290 57291 PA0839 PA0840     TRUE 0.653 41.000 0.070 1.000 N NA
 57291 57292 PA0840 PA0841     FALSE 0.033 191.000 0.000 NA   NA
 57293 57294 PA0842 PA0843   plcR FALSE 0.129 88.000 0.000 NA   NA
 57294 57295 PA0843 PA0844 plcR plcH TRUE 0.934 18.000 0.333 NA   NA
 57295 57296 PA0844 PA0845 plcH   FALSE 0.008 342.000 0.000 NA   NA
 57296 57297 PA0845 PA0846     FALSE 0.007 378.000 0.000 NA   NA
 57297 57298 PA0846 PA0847     FALSE 0.223 85.000 0.007 1.000 N NA
 57299 57300 PA0848 PA0849   trxB2 TRUE 0.519 134.000 0.024 1.000 Y NA
 57300 57301 PA0849 PA0850 trxB2   FALSE 0.016 254.000 0.000 NA   NA
 57302 57303 PA0851 PA0852   cbpD FALSE 0.042 177.000 0.000 1.000   NA
 57303 57304 PA0852 PA0853 cbpD   FALSE 0.013 280.000 0.000 1.000   NA
 57304 57305 PA0853 PA0854   fumC2 TRUE 0.914 -7.000 0.007 1.000   NA
 57305 57306 PA0854 PA0855 fumC2   FALSE 0.130 129.000 0.005 NA   NA
 57307 57308 PA0856 PA0857   bolA TRUE 0.825 14.000 0.056 NA   NA
 57308 57309 PA0857 PA0858 bolA   FALSE 0.167 165.000 0.049 NA   NA
 57309 57310 PA0858 PA0859     TRUE 0.587 40.000 0.038 NA   NA
 57310 57311 PA0859 PA0860     TRUE 0.990 -7.000 0.407 1.000 N NA
 57311 57312 PA0860 PA0861     FALSE 0.081 295.000 0.158 1.000 N NA
 57312 57313 PA0861 PA0862     TRUE 0.655 75.000 0.222 NA N NA
 57314 57315 PA0863 PA0864     FALSE 0.011 283.000 0.000 1.000 N NA
 57316 57317 PA0865 PA0866 hpd aroP2 FALSE 0.095 298.000 0.000 1.000 Y NA
 57317 57318 PA0866 PA0867 aroP2   FALSE 0.060 153.000 0.000 1.000   NA
 57318 57319 PA0867 PA0868     FALSE 0.084 121.000 0.000 1.000   NA
 57320 57321 PA0869 PA0870 pbpG phhC FALSE 0.009 314.000 0.000 1.000 N NA
 57321 57322 PA0870 PA0871 phhC phhB TRUE 0.953 -3.000 0.037 1.000 N NA
 57322 57323 PA0871 PA0872 phhB phhA TRUE 0.506 105.000 0.203 1.000 N NA
 57325 57326 PA0874 PA0875     FALSE 0.014 269.000 0.000 NA   NA
 57329 57330 PA0878 PA0879     TRUE 0.784 46.000 0.216 NA   NA
 57330 57331 PA0879 PA0880     TRUE 0.705 15.000 0.021 NA N NA
 57331 57332 PA0880 PA0881     TRUE 0.520 39.000 0.021 NA   NA
 57332 57333 PA0881 PA0882     TRUE 0.804 56.000 0.324 1.000   NA
 57333 57334 PA0882 PA0883     TRUE 0.970 11.000 0.500 1.000 N NA
 57334 57335 PA0883 PA0884     TRUE 0.802 114.000 0.250 1.000 Y NA
 57335 57336 PA0884 PA0885     TRUE 0.834 49.000 0.034 NA Y NA
 57336 57337 PA0885 PA0886     TRUE 0.999 -3.000 0.882 NA Y NA
 57337 57338 PA0886 PA0887   acsA FALSE 0.033 182.000 0.000 1.000 N NA
 57338 10491230 PA0887 PA0887.1 acsA   FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 10491230 57339 PA0887.1 PA0888   aotJ FALSE 0.032 194.000 0.000 NA   NA
 57339 57340 PA0888 PA0889 aotJ aotQ TRUE 0.640 119.000 0.000 0.075 Y NA
 57340 57341 PA0889 PA0890 aotQ aotM TRUE 0.996 17.000 0.875 0.013 Y NA
 57341 57342 PA0890 PA0891 aotM   TRUE 0.538 14.000 0.000 1.000   NA
 57342 57343 PA0891 PA0892   aotP FALSE 0.470 19.000 0.000 1.000   NA
 57343 57344 PA0892 PA0893 aotP argR TRUE 0.918 33.000 0.500 1.000 N NA
 57346 57347 PA0895 PA0896 aruC aruF TRUE 0.710 199.000 0.533 1.000 Y NA
 57347 57348 PA0896 PA0897 aruF aruG TRUE 0.998 12.000 1.000 0.000 Y NA
 57348 57349 PA0897 PA0898 aruG aruD TRUE 0.784 43.000 0.205 1.000 N NA
 57349 57350 PA0898 PA0899 aruD aruB TRUE 0.989 -3.000 0.306 1.000 N NA
 57350 57351 PA0899 PA0900 aruB   TRUE 0.847 14.000 0.072 NA   NA
 57351 57352 PA0900 PA0901   aruE TRUE 0.979 14.000 0.909 NA   NA
 57352 57353 PA0901 PA0902 aruE   TRUE 0.515 145.000 0.031 1.000 Y NA
 57353 57354 PA0902 PA0903   alaS FALSE 0.139 122.000 0.009 1.000 N NA
 57354 57355 PA0903 PA0904 alaS lysC FALSE 0.229 148.000 0.065 1.000 N NA
 57355 57356 PA0904 PA0905 lysC rsmA FALSE 0.160 185.000 0.079 1.000 N NA
 57356 2200474 PA0905 PA0905.1 rsmA   FALSE 0.188 62.000 0.000 NA   NA
 2200474 2200475 PA0905.1 PA0905.2     FALSE 0.083 118.000 0.000 NA   NA
 2200475 2200476 PA0905.2 PA0905.3     FALSE 0.089 112.000 0.000 NA   NA
 57358 57359 PA0907 PA0908     FALSE 0.048 165.000 0.000 NA   NA
 57359 57360 PA0908 PA0909     TRUE 0.842 -7.000 0.000 NA   NA
 57360 57361 PA0909 PA0910     FALSE 0.120 92.000 0.000 NA   NA
 57361 57362 PA0910 PA0911     FALSE 0.222 53.000 0.000 NA   NA
 57365 57366 PA0914 PA0915     TRUE 0.842 -7.000 0.000 NA   NA
 57366 57367 PA0915 PA0916     FALSE 0.188 62.000 0.000 NA   NA
 57369 57370 PA0918 PA0919     FALSE 0.043 161.000 0.000 NA N NA
 57370 57371 PA0919 PA0920     TRUE 0.966 2.000 0.176 NA   NA
 57373 2200477 PA0922 PA0922.1     FALSE 0.039 179.000 0.000 NA   NA
 57375 57376 PA0924 PA0925     FALSE 0.088 113.000 0.000 NA   NA
 57376 57377 PA0925 PA0926     TRUE 0.595 68.000 0.135 NA   NA
 57377 57378 PA0926 PA0927   ldhA TRUE 0.541 36.000 0.020 NA   NA
 57378 57379 PA0927 PA0928 ldhA gacS TRUE 0.867 3.000 0.020 1.000 N NA
 57380 57381 PA0929 PA0930     TRUE 0.994 0.000 0.222 1.000 Y NA
 57381 57382 PA0930 PA0931   pirA FALSE 0.017 236.000 0.000 1.000 N NA
 57382 57383 PA0931 PA0932 pirA cysM FALSE 0.015 250.000 0.000 1.000 N NA
 57383 57384 PA0932 PA0933 cysM ygcA TRUE 0.854 9.000 0.039 1.000 N NA
 57384 57385 PA0933 PA0934 ygcA relA FALSE 0.364 85.000 0.047 1.000 N NA
 57385 57386 PA0934 PA0935 relA   FALSE 0.259 105.000 0.035 1.000   NA
 57388 57389 PA0937 PA0938     FALSE 0.035 188.000 0.000 NA   NA
 57390 57391 PA0939 PA0940     TRUE 0.847 6.000 0.024 NA   NA
 57391 57392 PA0940 PA0941     TRUE 0.567 12.000 0.000 NA   NA
 57394 57395 PA0943 PA0944   purN TRUE 0.961 -7.000 0.065 NA   NA
 57395 57396 PA0944 PA0945 purN purM TRUE 0.998 0.000 0.230 0.002 Y NA
 57397 57398 PA0946 PA0947     FALSE 0.212 202.000 0.174 NA   NA
 57399 57400 PA0948 PA0949   wrbA TRUE 0.990 2.000 0.657 NA   NA
 57400 57401 PA0949 PA0950 wrbA   TRUE 0.990 -3.000 0.112 0.072   NA
 57404 57405 PA0953 PA0954     TRUE 0.815 0.000 0.000 1.000   NA
 57406 57407 PA0955 PA0956   proS TRUE 0.796 9.000 0.013 NA   NA
 57410 57411 PA0959 PA0960     TRUE 0.919 1.000 0.035 NA   NA
 57412 57413 PA0961 PA0962     FALSE 0.003 638.000 0.000 1.000 N NA
 57414 57415 PA0963 PA0964 aspS   FALSE 0.417 67.000 0.039 NA   NA
 57415 57416 PA0964 PA0965   ruvC TRUE 0.676 85.000 0.277 NA   NA
 57416 57417 PA0965 PA0966 ruvC ruvA TRUE 0.970 17.000 0.011 0.005 Y NA
 57417 57418 PA0966 PA0967 ruvA ruvB TRUE 0.983 11.000 0.011 0.001 Y NA
 57418 57419 PA0967 PA0968 ruvB   TRUE 0.610 53.000 0.082 1.000   NA
 57419 57420 PA0968 PA0969   tolQ TRUE 0.989 2.000 0.593 1.000   NA
 57420 57421 PA0969 PA0970 tolQ tolR TRUE 0.990 23.000 0.556 0.090 Y NA
 57421 57422 PA0970 PA0971 tolR tolA TRUE 0.983 3.000 0.460 1.000   NA
 57422 57423 PA0971 PA0972 tolA tolB TRUE 0.995 -3.000 0.215 0.008   NA
 57423 57424 PA0972 PA0973 tolB oprL TRUE 0.881 53.000 0.592 1.000 N NA
 57424 57425 PA0973 PA0974 oprL   TRUE 0.957 10.000 0.278 1.000   NA
 57425 57426 PA0974 PA0975     FALSE 0.460 72.000 0.059 1.000   NA
 57426 57427 PA0975 PA0976     TRUE 0.929 16.000 0.270 1.000   NA
 57427 2200478 PA0976 PA0976.1     FALSE 0.195 60.000 0.000 NA   NA
 57428 57429 PA0977 PA0978     FALSE 0.007 374.000 0.000 NA   NA
 57429 57430 PA0978 PA0979     TRUE 0.934 27.000 0.000 0.048 Y NA
 57431 57432 PA0980 PA0981     FALSE 0.321 36.000 0.000 NA   NA
 57434 57435 PA0983 PA0984     FALSE 0.004 545.000 0.000 1.000   NA
 57437 57438 PA0986 PA0987     TRUE 0.736 33.000 0.000 0.048   NA
 57438 57439 PA0987 PA0988     FALSE 0.005 438.000 0.000 NA   NA
 57440 57441 PA0989 PA0990     FALSE 0.006 385.000 0.000 NA   NA
 57442 57443 PA0991 PA0992   cupC1 FALSE 0.004 446.000 0.000 NA N NA
 57443 57444 PA0992 PA0993 cupC1 cupC2 TRUE 0.973 58.000 1.000 1.000 Y NA
 57444 57445 PA0993 PA0994 cupC2 cupC3 TRUE 0.927 111.000 0.875 1.000 Y NA
 57447 57448 PA0996 PA0997 pqsA pqsB TRUE 0.982 -6.000 0.000 NA Y NA
 57448 57449 PA0997 PA0998 pqsB pqsC TRUE 0.980 -7.000 0.000 NA Y NA
 57449 57450 PA0998 PA0999 pqsC pqsD TRUE 0.778 43.000 0.000 NA Y NA
 57450 57451 PA0999 PA1000 pqsD pqsE TRUE 0.991 -6.000 0.438 NA   NA
 57451 57452 PA1000 PA1001 pqsE phnA FALSE 0.087 118.000 0.000 1.000   NA
 57452 57453 PA1001 PA1002 phnA phnB TRUE 0.999 -22.000 0.703 0.001 Y NA
 57457 57458 PA1006 PA1007     TRUE 0.772 34.000 0.121 NA   NA
 57459 57460 PA1008 PA1009 bcp   TRUE 0.883 12.000 0.102 NA N NA
 57461 57462 PA1010 PA1011 dapA   TRUE 0.953 18.000 0.088 NA Y NA
 57462 57463 PA1011 PA1012     TRUE 0.910 -61.000 0.022 NA   NA
 57463 57464 PA1012 PA1013   purC TRUE 0.602 29.000 0.021 1.000   NA
 57464 2200479 PA1013 PA1013.1 purC   FALSE 0.115 94.000 0.000 NA   NA
 2200479 57465 PA1013.1 PA1014     FALSE 0.008 340.000 0.000 NA   NA
 57467 57468 PA1016 PA1017   pauA TRUE 0.538 110.000 0.250 1.000 N NA
 57468 57469 PA1017 PA1018 pauA   TRUE 0.981 -16.000 0.250 1.000 N NA
 57469 57470 PA1018 PA1019   mucK FALSE 0.128 82.000 0.000 1.000 N NA
 57470 57471 PA1019 PA1020 mucK   FALSE 0.004 524.000 0.000 1.000 N NA
 57471 57472 PA1020 PA1021     TRUE 0.976 0.000 0.000 1.000 Y NA
 57472 57473 PA1021 PA1022     TRUE 0.968 2.000 0.000 1.000 Y NA
 57473 57474 PA1022 PA1023     TRUE 0.794 41.000 0.000 1.000 Y NA
 57474 57475 PA1023 PA1024     TRUE 0.843 16.000 0.000 0.049   NA
 57475 57476 PA1024 PA1025     FALSE 0.154 79.000 0.000 1.000   NA
 57478 57479 PA1027 PA1028     TRUE 0.689 56.000 0.173 1.000 N NA
 57479 57480 PA1028 PA1029     FALSE 0.060 153.000 0.000 1.000   NA
 57480 57481 PA1029 PA1030     FALSE 0.069 135.000 0.000 NA   NA
 57481 10491231 PA1030 PA1030.1     FALSE 0.066 142.000 0.000 NA   NA
 10491231 57482 PA1030.1 PA1031     FALSE 0.004 549.000 0.000 NA   NA
 57483 57484 PA1032 PA1033     FALSE 0.324 123.000 0.086 1.000   NA
 57484 57485 PA1033 PA1034     FALSE 0.047 167.000 0.000 NA   NA
 57485 57486 PA1034 PA1035     TRUE 0.941 8.000 0.163 NA   NA
 57488 57489 PA1037 PA1038     FALSE 0.141 83.000 0.000 NA   NA
 57489 57490 PA1038 PA1039     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 57490 57491 PA1039 PA1040     TRUE 0.981 3.000 0.407 NA   NA
 57492 57493 PA1041 PA1042     FALSE 0.085 116.000 0.000 NA   NA
 57493 57494 PA1042 PA1043     TRUE 0.971 -7.000 0.106 NA   NA
 57496 57497 PA1045 PA1046     FALSE 0.337 79.000 0.029 1.000   NA
 57497 57498 PA1046 PA1047     TRUE 0.795 77.000 0.467 1.000   NA
 57498 57499 PA1047 PA1048     FALSE 0.466 206.000 0.667 1.000 N NA
 57499 57500 PA1048 PA1049   pdxH FALSE 0.223 99.000 0.023 1.000 N NA
 57500 57501 PA1049 PA1050 pdxH   TRUE 0.774 8.000 0.006 1.000 N NA
 57501 57502 PA1050 PA1051     FALSE 0.265 159.000 0.120 1.000 N NA
 57502 57503 PA1051 PA1052     TRUE 0.875 42.000 0.047 1.000 Y NA
 57503 57504 PA1052 PA1053     FALSE 0.026 409.000 0.065 1.000 N NA
 57504 57505 PA1053 PA1054     FALSE 0.008 329.000 0.000 1.000 N NA
 57505 57506 PA1054 PA1055     TRUE 0.999 0.000 0.881 0.004 Y NA
 57506 57507 PA1055 PA1056     TRUE 1.000 -3.000 0.976 0.004 Y NA
 57507 57508 PA1056 PA1057     TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 57508 57509 PA1057 PA1058     TRUE 0.999 -15.000 0.937 0.081 Y NA
 57509 57510 PA1058 PA1059     TRUE 0.999 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 57510 57511 PA1059 PA1060     FALSE 0.166 113.000 0.016 NA N NA
 57511 57512 PA1060 PA1061     TRUE 0.933 11.000 0.000 NA Y NA
 57512 57513 PA1061 PA1062     TRUE 0.856 11.000 0.000 0.081 N NA
 57513 57514 PA1062 PA1063     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57518 57519 PA1067 PA1068     FALSE 0.094 99.000 0.000 1.000 N NA
 57519 57520 PA1068 PA1069     TRUE 0.940 37.000 0.727 1.000   NA
 57521 57522 PA1070 PA1071 braG braF TRUE 0.999 3.000 0.967 0.017 Y NA
 57522 57523 PA1071 PA1072 braF braE TRUE 0.998 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 57523 57524 PA1072 PA1073 braE braD TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.074 Y NA
 57524 57525 PA1073 PA1074 braD braC FALSE 0.195 261.000 0.033 1.000 Y NA
 57526 57527 PA1075 PA1076     FALSE 0.426 67.000 0.041 NA   NA
 57527 57528 PA1076 PA1077   flgB FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 57528 57529 PA1077 PA1078 flgB flgC TRUE 0.998 6.000 0.800 0.002 Y NA
 57529 57530 PA1078 PA1079 flgC flgD TRUE 0.978 13.000 0.207 NA Y NA
 57530 57531 PA1079 PA1080 flgD flgE TRUE 0.987 28.000 0.875 NA Y NA
 57531 57532 PA1080 PA1081 flgE flgF TRUE 0.845 218.000 0.594 0.002 Y NA
 57532 57533 PA1081 PA1082 flgF flgG TRUE 0.972 47.000 0.207 0.001 Y NA
 57533 57534 PA1082 PA1083 flgG flgH TRUE 0.987 46.000 0.632 0.005 Y NA
 57534 57535 PA1083 PA1084 flgH flgI TRUE 0.989 12.000 0.128 0.006 Y NA
 57535 57536 PA1084 PA1085 flgI flgJ TRUE 0.995 11.000 0.405 0.006 Y NA
 57536 57537 PA1085 PA1086 flgJ flgK TRUE 0.996 19.000 0.705 0.002 Y NA
 57537 57538 PA1086 PA1087 flgK flgL TRUE 0.974 26.000 0.057 0.001 Y NA
 57538 57539 PA1087 PA1088 flgL   TRUE 0.632 55.000 0.118 1.000 N NA
 57539 57540 PA1088 PA1089     TRUE 0.934 5.000 0.017 0.081 N NA
 57540 57541 PA1089 PA1090     TRUE 0.899 -24.000 0.017 1.000 N NA
 57541 57542 PA1090 PA1091     TRUE 0.991 -7.000 0.069 1.000 Y NA
 57542 57543 PA1091 PA1092   fliC FALSE 0.006 361.000 0.000 1.000 N NA
 57543 57544 PA1092 PA1093 fliC   TRUE 0.714 79.000 0.025 NA Y NA
 57544 57545 PA1093 PA1094   fliD TRUE 0.798 86.000 0.117 NA Y NA
 57545 57546 PA1094 PA1095 fliD   TRUE 0.889 122.000 0.194 0.002 Y NA
 57546 57547 PA1095 PA1096     TRUE 0.940 23.000 0.478 NA   NA
 57547 57548 PA1096 PA1097   fleQ FALSE 0.051 282.000 0.056 NA   NA
 57548 57549 PA1097 PA1098 fleQ fleS TRUE 0.909 113.000 0.377 0.092 Y NA
 57549 57550 PA1098 PA1099 fleS fleR TRUE 0.998 5.000 0.679 0.092 Y NA
 57550 57551 PA1099 PA1100 fleR fliE FALSE 0.262 247.000 0.446 1.000 N NA
 57551 57552 PA1100 PA1101 fliE fliF TRUE 0.996 23.000 0.910 0.005 Y NA
 57552 57553 PA1101 PA1102 fliF fliG TRUE 0.994 6.000 0.189 0.005 Y NA
 57553 57554 PA1102 PA1103 fliG   TRUE 0.998 2.000 0.320 0.003 Y NA
 57554 57555 PA1103 PA1104   fliI TRUE 0.997 -10.000 0.115 0.003 Y NA
 57555 57556 PA1104 PA1105 fliI fliJ TRUE 0.983 14.000 0.070 0.006 Y NA
 57557 57558 PA1106 PA1107     FALSE 0.031 199.000 0.000 NA   NA
 57558 57559 PA1107 PA1108     FALSE 0.075 117.000 0.000 1.000 N NA
 57562 57563 PA1111 PA1112     FALSE 0.118 93.000 0.000 NA   NA
 57563 57564 PA1112 PA1113     FALSE 0.003 990.000 0.000 1.000 N NA
 57565 57566 PA1114 PA1115     FALSE 0.097 104.000 0.000 NA   NA
 57568 57569 PA1117 PA1118     FALSE 0.094 107.000 0.000 NA   NA
 57569 57570 PA1118 PA1119     FALSE 0.064 146.000 0.000 NA   NA
 57570 57571 PA1119 PA1120     TRUE 0.982 -28.000 0.290 1.000 N NA
 57571 57572 PA1120 PA1121     TRUE 0.981 0.000 0.259 NA   NA
 57575 57576 PA1124 PA1125 dgt   TRUE 0.494 14.000 0.000 1.000 N NA
 57577 57578 PA1126 PA1127     FALSE 0.115 94.000 0.000 NA   NA
 57579 57580 PA1128 PA1129     FALSE 0.289 35.000 0.000 NA N NA
 57581 57582 PA1130 PA1131 rhlC   TRUE 0.822 -12.000 0.000 NA   NA
 57584 57585 PA1133 PA1134     FALSE 0.172 67.000 0.000 NA   NA
 57585 57586 PA1134 PA1135     FALSE 0.062 149.000 0.000 NA   NA
 57589 57590 PA1138 PA1139     FALSE 0.122 91.000 0.000 NA   NA
 57591 57592 PA1140 PA1141     FALSE 0.137 137.000 0.013 NA   NA
 57592 57593 PA1141 PA1142     TRUE 0.483 166.000 0.000 0.092 Y NA
 57593 57594 PA1142 PA1143     FALSE 0.128 82.000 0.000 1.000 N NA
 57594 57595 PA1143 PA1144     FALSE 0.151 68.000 0.000 1.000 N NA
 57597 57598 PA1146 PA1147     FALSE 0.236 102.000 0.029 1.000 N NA
 57598 57599 PA1147 PA1148   toxA FALSE 0.015 260.000 0.000 NA   NA
 57599 57600 PA1148 PA1149 toxA   FALSE 0.017 250.000 0.000 NA   NA
 57601 57602 PA1150 PA1151 pys2 imm2 TRUE 0.771 2.000 0.000 1.000   NA
 57602 57603 PA1151 PA1152 imm2   FALSE 0.004 516.000 0.000 NA   NA
 57604 57605 PA1153 PA1154     FALSE 0.003 533.000 0.000 NA N NA
 57605 57606 PA1154 PA1155   nrdB FALSE 0.007 355.000 0.000 1.000 N NA
 57606 57607 PA1155 PA1156 nrdB nrdA TRUE 0.767 264.000 0.564 0.001 Y NA
 57608 57609 PA1157 PA1158     FALSE 0.248 342.000 0.229 1.000 Y NA
 57609 57610 PA1158 PA1159     FALSE 0.008 320.000 0.000 1.000 N NA
 57611 57612 PA1160 PA1161   rrmA TRUE 0.830 18.000 0.083 NA   NA
 57612 57613 PA1161 PA1162 rrmA dapE TRUE 0.930 0.000 0.033 1.000   NA
 57613 57614 PA1162 PA1163 dapE   FALSE 0.171 115.000 0.018 1.000 N NA
 57616 57617 PA1165 PA1166 pcpS   FALSE 0.317 228.000 0.069 1.000 Y NA
 57618 57619 PA1167 PA1168     FALSE 0.004 500.000 0.000 NA   NA
 57619 57620 PA1168 PA1169     FALSE 0.150 78.000 0.000 NA   NA
 57623 57624 PA1172 PA1173 napC napB TRUE 0.988 11.000 0.143 0.071 Y NA
 57624 57625 PA1173 PA1174 napB napA TRUE 0.996 11.000 0.643 0.071 Y NA
 57625 57626 PA1174 PA1175 napA napD TRUE 0.974 -3.000 0.106 NA N NA
 57626 57627 PA1175 PA1176 napD napF TRUE 0.932 -7.000 0.023 NA   NA
 57627 57628 PA1176 PA1177 napF napE TRUE 0.886 9.000 0.058 NA   NA
 57629 57630 PA1178 PA1179 oprH phoP TRUE 0.612 80.000 0.180 1.000   NA
 57630 57631 PA1179 PA1180 phoP phoQ TRUE 0.999 -3.000 0.940 1.000 Y NA
 57631 57632 PA1180 PA1181 phoQ   TRUE 0.727 102.000 0.000 0.016 Y NA
 57636 57637 PA1185 PA1186     TRUE 0.987 -3.000 0.250 NA   NA
 57637 57638 PA1186 PA1187     FALSE 0.105 102.000 0.000 1.000   NA
 57638 57639 PA1187 PA1188     FALSE 0.113 89.000 0.000 1.000 N NA
 57640 57641 PA1189 PA1190     FALSE 0.120 168.000 0.028 NA   NA
 57641 57642 PA1190 PA1191     FALSE 0.208 159.000 0.066 NA   NA
 57643 57644 PA1192 PA1193     FALSE 0.402 47.000 0.015 NA N NA
 57645 57646 PA1194 PA1195     TRUE 0.683 105.000 0.065 1.000 Y NA
 57647 57648 PA1196 PA1197     TRUE 0.919 13.000 0.000 1.000 Y NA
 57648 57649 PA1197 PA1198     TRUE 0.722 66.000 0.267 NA N NA
 57649 57650 PA1198 PA1199     TRUE 0.956 83.000 0.909 NA Y NA
 57650 57651 PA1199 PA1200     TRUE 0.914 20.000 0.273 NA   NA
 57653 57654 PA1202 PA1203     FALSE 0.057 144.000 0.000 1.000 N NA
 57654 57655 PA1203 PA1204     FALSE 0.380 28.000 0.000 NA   NA
 57655 57656 PA1204 PA1205     FALSE 0.389 27.000 0.000 NA   NA
 57656 57657 PA1205 PA1206     FALSE 0.052 160.000 0.000 NA   NA
 57657 57658 PA1206 PA1207   kefB TRUE 0.737 3.000 0.000 NA   NA
 57658 57659 PA1207 PA1208 kefB   FALSE 0.320 167.000 0.000 1.000 Y NA
 57660 57661 PA1209 PA1210     FALSE 0.044 170.000 0.000 NA   NA
 57661 57662 PA1210 PA1211     FALSE 0.083 118.000 0.000 NA   NA
 57662 57663 PA1211 PA1212     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57663 57664 PA1212 PA1213     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 57664 57665 PA1213 PA1214     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 57665 57666 PA1214 PA1215     TRUE 0.787 0.000 0.000 1.000 N NA
 57666 57667 PA1215 PA1216     FALSE 0.118 202.000 0.000 0.080   NA
 57667 57668 PA1216 PA1217     TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.080   NA
 57668 57669 PA1217 PA1218     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57669 57670 PA1218 PA1219     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57670 57671 PA1219 PA1220     TRUE 0.851 -6.000 0.000 NA   NA
 57671 57672 PA1220 PA1221     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57672 57673 PA1221 PA1222     FALSE 0.003 684.000 0.000 1.000 N NA
 57673 57674 PA1222 PA1223     FALSE 0.098 96.000 0.000 1.000 N NA
 57677 57678 PA1226 PA1227     FALSE 0.301 39.000 0.000 NA   NA
 57679 57680 PA1228 PA1229     FALSE 0.091 110.000 0.000 NA   NA
 57681 57682 PA1230 PA1231     TRUE 0.922 13.000 0.200 NA   NA
 57682 57683 PA1231 PA1232     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 57683 57684 PA1232 PA1233     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57687 57688 PA1236 PA1237     TRUE 0.989 -10.000 0.429 1.000   NA
 57688 57689 PA1237 PA1238     TRUE 0.994 -3.000 0.600 1.000 N NA
 57689 57690 PA1238 PA1239     FALSE 0.007 383.000 0.000 NA   NA
 57690 57691 PA1239 PA1240     FALSE 0.205 57.000 0.000 NA   NA
 57692 57693 PA1241 PA1242     FALSE 0.131 80.000 0.000 1.000 N NA
 57694 57695 PA1243 PA1244     FALSE 0.019 236.000 0.000 NA   NA
 57696 57697 PA1245 PA1246   aprD FALSE 0.131 87.000 0.000 NA   NA
 57697 57698 PA1246 PA1247 aprD aprE TRUE 0.977 -3.000 0.000 0.008   NA
 57698 57699 PA1247 PA1248 aprE aprF TRUE 0.991 4.000 0.375 0.008 N NA
 57699 57700 PA1248 PA1249 aprF aprA FALSE 0.006 359.000 0.000 1.000 N NA
 57700 57701 PA1249 PA1250 aprA aprI FALSE 0.097 247.000 0.095 1.000   NA
 57704 57705 PA1253 PA1254     FALSE 0.352 93.000 0.000 0.080 N NA
 57705 57706 PA1254 PA1255     FALSE 0.376 151.000 0.000 1.000 Y NA
 57706 57707 PA1255 PA1256     TRUE 0.863 26.000 0.000 1.000 Y NA
 57707 57708 PA1256 PA1257     TRUE 0.998 -3.000 0.650 1.000 Y NA
 57708 57709 PA1257 PA1258     TRUE 0.998 11.000 0.846 0.012 Y NA
 57709 57710 PA1258 PA1259     TRUE 0.815 0.000 0.000 1.000   NA
 57710 57711 PA1259 PA1260     FALSE 0.206 59.000 0.000 1.000   NA
 57711 57712 PA1260 PA1261     FALSE 0.014 258.000 0.000 1.000 N NA
 57712 57713 PA1261 PA1262     FALSE 0.050 165.000 0.000 1.000   NA
 57717 57718 PA1266 PA1267     FALSE 0.130 230.000 0.000 0.004   NA
 57718 57719 PA1267 PA1268     TRUE 0.991 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 57719 57720 PA1268 PA1269     FALSE 0.249 117.000 0.046 1.000 N NA
 57721 57722 PA1270 PA1271     FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 57722 57723 PA1271 PA1272   cobO TRUE 0.682 64.000 0.000 1.000 Y NA
 57723 57724 PA1272 PA1273 cobO cobB TRUE 0.962 32.000 0.054 0.006 Y NA
 57724 57725 PA1273 PA1274 cobB   TRUE 0.938 2.000 0.071 1.000 N NA
 57725 57726 PA1274 PA1275   cobD TRUE 0.962 -3.000 0.053 1.000 N NA
 57726 57727 PA1275 PA1276 cobD cobC TRUE 0.996 -7.000 0.463 0.006 N NA
 57727 57728 PA1276 PA1277 cobC cobQ TRUE 0.983 -7.000 0.033 0.006 N NA
 57728 57729 PA1277 PA1278 cobQ cobP TRUE 0.992 -7.000 0.079 1.000 Y NA
 57729 57730 PA1278 PA1279 cobP cobU TRUE 0.995 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 57730 57731 PA1279 PA1280 cobU   TRUE 0.972 -3.000 0.090 1.000 N NA
 57731 57732 PA1280 PA1281   cobV TRUE 0.869 3.000 0.021 1.000 N NA
 57736 57737 PA1285 PA1286     TRUE 0.657 74.000 0.220 1.000 N NA
 57737 57738 PA1286 PA1287     FALSE 0.147 165.000 0.042 1.000 N NA
 57739 57740 PA1288 PA1289     FALSE 0.028 206.000 0.000 NA   NA
 57740 57741 PA1289 PA1290     FALSE 0.023 222.000 0.000 NA   NA
 57743 57744 PA1292 PA1293     FALSE 0.009 301.000 0.000 1.000 N NA
 57745 57746 PA1294 PA1295 rnd   TRUE 0.970 -3.000 0.073 NA   NA
 57746 57747 PA1295 PA1296     FALSE 0.066 255.000 0.056 NA   NA
 57749 57750 PA1298 PA1299     FALSE 0.152 77.000 0.000 NA   NA
 57750 57751 PA1299 PA1300     FALSE 0.062 149.000 0.000 NA   NA
 57751 57752 PA1300 PA1301     TRUE 0.994 -3.000 0.615 NA N NA
 57752 57753 PA1301 PA1302     TRUE 0.698 129.000 0.148 NA Y NA
 57754 57755 PA1303 PA1304     TRUE 0.486 77.000 0.000 0.028 N NA
 57756 57757 PA1305 PA1306     TRUE 0.563 64.000 0.091 NA   NA
 57757 57758 PA1306 PA1307     TRUE 0.841 4.000 0.011 1.000   NA
 57758 57759 PA1307 PA1308     TRUE 0.724 27.000 0.053 NA   NA
 57761 57762 PA1310 PA1311 phnW phnX TRUE 0.789 36.000 0.030 0.080   NA
 57764 57765 PA1313 PA1314     TRUE 0.526 14.000 0.000 NA   NA
 57767 57768 PA1316 PA1317   cyoA FALSE 0.014 627.000 0.000 0.080 N NA
 57768 57769 PA1317 PA1318 cyoA cyoB TRUE 0.980 7.000 0.000 0.014 Y NA
 57769 57770 PA1318 PA1319 cyoB cyoC TRUE 0.995 4.000 0.258 0.070 Y NA
 57770 57771 PA1319 PA1320 cyoC cyoD TRUE 0.997 0.000 0.273 0.070 Y NA
 57771 57772 PA1320 PA1321 cyoD cyoE TRUE 0.938 11.000 0.064 0.080 N NA
 57772 57773 PA1321 PA1322 cyoE   FALSE 0.016 239.000 0.000 1.000 N NA
 57773 57774 PA1322 PA1323     FALSE 0.074 129.000 0.000 NA   NA
 57774 57775 PA1323 PA1324     FALSE 0.195 60.000 0.000 NA   NA
 57775 10491232 PA1324 PA1324.1     FALSE 0.115 94.000 0.000 NA   NA
 10491232 57776 PA1324.1 PA1325     FALSE 0.260 45.000 0.000 NA   NA
 57776 57777 PA1325 PA1326   ilvA2 TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 57777 57778 PA1326 PA1327 ilvA2   FALSE 0.107 92.000 0.000 1.000 N NA
 57780 57781 PA1329 PA1330     TRUE 0.883 6.000 0.041 NA   NA
 57782 57783 PA1331 PA1332     FALSE 0.014 269.000 0.000 NA   NA
 57783 57784 PA1332 PA1333     FALSE 0.070 134.000 0.000 NA   NA
 57784 57785 PA1333 PA1334     FALSE 0.032 195.000 0.000 NA   NA
 57785 57786 PA1334 PA1335     FALSE 0.009 308.000 0.000 1.000 N NA
 57786 57787 PA1335 PA1336     TRUE 0.982 45.000 0.613 0.090 Y NA
 57787 57788 PA1336 PA1337   ansB FALSE 0.098 96.000 0.000 1.000 N NA
 57788 57789 PA1337 PA1338 ansB ggt TRUE 0.594 86.000 0.000 1.000 Y NA
 57789 57790 PA1338 PA1339 ggt   TRUE 0.783 78.000 0.065 1.000 Y NA
 57790 57791 PA1339 PA1340     TRUE 0.995 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 57791 57792 PA1340 PA1341     TRUE 0.999 -3.000 0.933 0.012 Y NA
 57792 57793 PA1341 PA1342     FALSE 0.377 203.000 0.000 0.073 Y NA
 57794 57795 PA1343 PA1344     FALSE 0.110 96.000 0.000 NA   NA
 57795 57796 PA1344 PA1345     FALSE 0.032 184.000 0.000 1.000 N NA
 57797 57798 PA1346 PA1347     FALSE 0.124 84.000 0.000 1.000 N NA
 57799 57800 PA1348 PA1349     FALSE 0.037 183.000 0.000 NA   NA
 57800 57801 PA1349 PA1350     FALSE 0.042 175.000 0.000 NA   NA
 57801 57802 PA1350 PA1351     FALSE 0.472 18.000 0.000 NA   NA
 57803 57804 PA1352 PA1353     FALSE 0.046 168.000 0.000 NA   NA
 57804 57805 PA1353 PA1354     TRUE 0.758 37.000 0.123 NA   NA
 57806 57807 PA1355 PA1356     TRUE 0.843 23.000 0.139 NA   NA
 57807 57808 PA1356 PA1357     FALSE 0.165 69.000 0.000 NA   NA
 57809 57810 PA1358 PA1359     FALSE 0.307 38.000 0.000 NA   NA
 57813 57814 PA1362 PA1363     TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 57814 57815 PA1363 PA1364     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA N NA
 57815 57816 PA1364 PA1365     TRUE 0.625 78.000 0.000 NA Y NA
 57817 57818 PA1366 PA1367     FALSE 0.006 424.000 0.000 1.000   NA
 57818 57819 PA1367 PA1368     FALSE 0.013 283.000 0.000 1.000   NA
 57820 57821 PA1369 PA1370     FALSE 0.421 23.000 0.000 NA   NA
 57822 57823 PA1371 PA1372     TRUE 0.975 -7.000 0.143 NA   NA
 57823 57824 PA1372 PA1373   fabF2 FALSE 0.003 720.000 0.000 1.000   NA
 57825 57826 PA1374 PA1375   pdxB FALSE 0.021 215.000 0.000 NA N NA
 57828 57829 PA1377 PA1378     FALSE 0.065 143.000 0.000 NA   NA
 57831 57832 PA1380 PA1381     FALSE 0.007 361.000 0.000 NA   NA
 57832 57833 PA1381 PA1382     TRUE 0.813 -16.000 0.000 NA   NA
 57833 57834 PA1382 PA1383     FALSE 0.004 519.000 0.000 NA   NA
 57834 57835 PA1383 PA1384   galE FALSE 0.059 152.000 0.000 NA   NA
 57835 57836 PA1384 PA1385 galE   TRUE 0.899 24.000 0.011 1.000 Y NA
 57836 57837 PA1385 PA1386     FALSE 0.460 20.000 0.000 1.000   NA
 57837 57838 PA1386 PA1387     FALSE 0.063 147.000 0.000 NA   NA
 57838 57839 PA1387 PA1388     TRUE 0.485 17.000 0.000 NA   NA
 57839 57840 PA1388 PA1389     TRUE 0.769 97.000 0.600 NA   NA
 57840 57841 PA1389 PA1390     FALSE 0.036 186.000 0.000 NA   NA
 57841 57842 PA1390 PA1391     TRUE 0.851 -6.000 0.000 NA   NA
 57842 57843 PA1391 PA1392     TRUE 0.779 1.000 0.000 NA   NA
 57845 57846 PA1394 PA1395     TRUE 0.499 16.000 0.000 NA   NA
 57848 57849 PA1397 PA1398     FALSE 0.145 81.000 0.000 NA   NA
 57852 57853 PA1401 PA1402     FALSE 0.150 78.000 0.000 NA   NA
 57857 57858 PA1406 PA1407     FALSE 0.321 36.000 0.000 NA   NA
 57858 57859 PA1407 PA1408     FALSE 0.172 67.000 0.000 NA   NA
 57860 57861 PA1409 PA1410 aphA   TRUE 0.550 11.000 0.000 NA N NA
 57861 57862 PA1410 PA1411     FALSE 0.028 206.000 0.000 NA   NA
 57864 57865 PA1413 PA1414     TRUE 0.828 56.000 0.400 NA   NA
 57866 57867 PA1415 PA1416     FALSE 0.269 45.000 0.000 1.000   NA
 57867 57868 PA1416 PA1417     TRUE 0.494 14.000 0.000 1.000 N NA
 57868 57869 PA1417 PA1418     TRUE 0.634 76.000 0.000 1.000 Y NA
 57869 57870 PA1418 PA1419     TRUE 0.492 94.000 0.150 1.000 N NA
 57870 57871 PA1419 PA1420     TRUE 0.837 19.000 0.100 NA   NA
 57871 57872 PA1420 PA1421   gbuA TRUE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 57875 57876 PA1424 PA1425     FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 57876 57877 PA1425 PA1426     FALSE 0.288 41.000 0.000 NA   NA
 57877 57878 PA1426 PA1427     FALSE 0.086 115.000 0.000 NA   NA
 57878 57879 PA1427 PA1428     FALSE 0.003 740.000 0.000 NA   NA
 57879 57880 PA1428 PA1429     FALSE 0.181 166.000 0.000 0.079   NA
 57880 57881 PA1429 PA1430   lasR FALSE 0.005 451.000 0.000 1.000 N NA
 57884 57885 PA1433 PA1434     TRUE 0.979 1.000 0.273 NA   NA
 57886 57887 PA1435 PA1436     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 57887 57888 PA1436 PA1437     TRUE 0.542 104.000 0.240 NA N NA
 57888 57889 PA1437 PA1438     TRUE 0.999 -22.000 0.793 0.002 Y NA
 57890 57891 PA1439 PA1440     TRUE 0.872 12.000 0.077 NA   NA
 57892 57893 PA1441 PA1442     FALSE 0.286 244.000 0.075 1.000 Y NA
 57893 57894 PA1442 PA1443   fliM TRUE 0.994 8.000 0.171 0.001 Y NA
 57894 57895 PA1443 PA1444 fliM fliN TRUE 0.994 28.000 0.741 0.001 Y NA
 57895 57896 PA1444 PA1445 fliN fliO TRUE 0.995 2.000 0.443 1.000 Y NA
 57896 57897 PA1445 PA1446 fliO fliP TRUE 0.992 -3.000 0.061 1.000 Y NA
 57897 57898 PA1446 PA1447 fliP fliQ TRUE 0.990 48.000 1.000 0.013 Y NA
 57898 57899 PA1447 PA1448 fliQ fliR TRUE 0.999 0.000 1.000 0.001 Y NA
 57899 57900 PA1448 PA1449 fliR flhB TRUE 0.987 3.000 0.129 1.000 Y NA
 57900 57901 PA1449 PA1450 flhB   FALSE 0.158 73.000 0.000 NA   NA
 57901 57902 PA1450 PA1451     FALSE 0.340 33.000 0.000 NA   NA
 57902 57903 PA1451 PA1452   flhA FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 57903 57904 PA1452 PA1453 flhA flhF TRUE 0.842 84.000 0.178 1.000 Y NA
 57904 57905 PA1453 PA1454 flhF fleN TRUE 0.662 139.000 0.241 0.016 N NA
 57905 57906 PA1454 PA1455 fleN fliA TRUE 0.993 -3.000 0.482 1.000 N NA
 57906 57907 PA1455 PA1456 fliA cheY FALSE 0.447 102.000 0.145 1.000 N NA
 57907 57908 PA1456 PA1457 cheY cheZ TRUE 0.974 20.000 0.284 1.000 Y NA
 57908 57909 PA1457 PA1458 cheZ   TRUE 0.630 201.000 0.341 1.000 Y NA
 57909 57910 PA1458 PA1459     TRUE 0.971 54.000 0.327 0.011 Y NA
 57910 57911 PA1459 PA1460   motC TRUE 0.813 89.000 0.153 1.000 Y NA
 57911 57912 PA1460 PA1461 motC motD TRUE 0.980 13.000 0.248 1.000 Y NA
 57912 57913 PA1461 PA1462 motD   TRUE 0.543 95.000 0.199 1.000 N NA
 57913 57914 PA1462 PA1463     TRUE 0.741 92.000 0.454 1.000   NA
 57914 57915 PA1463 PA1464     TRUE 0.971 46.000 0.886 0.011   NA
 57915 57916 PA1464 PA1465     TRUE 0.950 31.000 0.743 NA   NA
 57918 57919 PA1467 PA1468     FALSE 0.122 91.000 0.000 NA   NA
 57919 57920 PA1468 PA1469     FALSE 0.195 60.000 0.000 NA   NA
 57920 57921 PA1469 PA1470     FALSE 0.070 134.000 0.000 NA   NA
 57922 57923 PA1471 PA1472     FALSE 0.093 108.000 0.000 NA   NA
 57923 57924 PA1472 PA1473     FALSE 0.106 101.000 0.000 1.000   NA
 57924 57925 PA1473 PA1474     TRUE 0.989 -3.000 0.286 1.000   NA
 57926 57927 PA1475 PA1476 ccmA ccmB TRUE 0.997 -3.000 0.074 0.002 Y NA
 57927 57928 PA1476 PA1477 ccmB ccmC TRUE 0.823 123.000 0.051 0.001 Y NA
 57928 57929 PA1477 PA1478 ccmC   TRUE 0.993 -3.000 0.501 1.000 N NA
 57929 57930 PA1478 PA1479   ccmE TRUE 0.990 -3.000 0.344 1.000 N NA
 57930 57931 PA1479 PA1480 ccmE ccmF TRUE 0.997 1.000 0.211 0.002 Y NA
 57931 57932 PA1480 PA1481 ccmF ccmG TRUE 0.999 4.000 0.804 0.002 Y NA
 57932 57933 PA1481 PA1482 ccmG ccmH TRUE 0.996 -3.000 0.196 NA Y NA
 57933 57934 PA1482 PA1483 ccmH cycH TRUE 0.998 -3.000 0.522 NA Y NA
 57936 57937 PA1485 PA1486     TRUE 0.970 14.000 0.148 NA Y NA
 57938 57939 PA1487 PA1488     TRUE 0.901 21.000 0.238 1.000   NA
 57939 57940 PA1488 PA1489     TRUE 0.994 -13.000 0.381 0.048   NA
 57940 57941 PA1489 PA1490     FALSE 0.024 404.000 0.048 1.000   NA
 57942 57943 PA1491 PA1492     TRUE 0.806 60.000 0.364 NA   NA
 57944 57945 PA1493 PA1494 cysP   FALSE 0.074 129.000 0.000 NA   NA
 57945 57946 PA1494 PA1495     FALSE 0.078 124.000 0.000 NA   NA
 57946 57947 PA1495 PA1496     TRUE 0.819 -13.000 0.000 NA   NA
 57947 57948 PA1496 PA1497     FALSE 0.374 66.000 0.030 1.000 N NA
 57948 57949 PA1497 PA1498   pykF FALSE 0.006 367.000 0.000 1.000 N NA
 57949 57950 PA1498 PA1499 pykF   TRUE 0.968 2.000 0.000 1.000 Y NA
 57950 57951 PA1499 PA1500     FALSE 0.078 297.000 0.154 1.000 N NA
 57951 57952 PA1500 PA1501     TRUE 0.795 75.000 0.492 1.000 N NA
 57952 57953 PA1501 PA1502   gcl TRUE 0.734 96.000 0.495 1.000   NA
 57956 57957 PA1505 PA1506 moaA2   FALSE 0.038 185.000 0.000 1.000   NA
 57958 57959 PA1507 PA1508     FALSE 0.003 683.000 0.000 NA   NA
 57959 57960 PA1508 PA1509     TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 57960 57961 PA1509 PA1510     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57961 57962 PA1510 PA1511     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57962 57963 PA1511 PA1512   hcpA FALSE 0.038 182.000 0.000 NA   NA
 57963 57964 PA1512 PA1513 hcpA   FALSE 0.005 486.000 0.000 NA   NA
 57964 57965 PA1513 PA1514     TRUE 0.886 49.000 0.538 1.000   NA
 57965 57966 PA1514 PA1515   alc TRUE 0.963 55.000 0.647 1.000 Y NA
 57966 57967 PA1515 PA1516 alc   TRUE 0.964 18.000 0.647 NA   NA
 57967 57968 PA1516 PA1517     TRUE 0.975 -3.000 0.097 NA   NA
 57972 57973 PA1521 PA1522     FALSE 0.276 70.000 0.013 NA N NA
 57973 57974 PA1522 PA1523   xdhB FALSE 0.346 27.000 0.000 NA N NA
 57974 57975 PA1523 PA1524 xdhB xdhA TRUE 0.999 -7.000 0.269 0.000 Y NA
 57975 57976 PA1524 PA1525 xdhA alkB2 FALSE 0.025 221.000 0.000 1.000   NA
 57977 57978 PA1526 PA1527     TRUE 0.558 26.000 0.010 1.000 N NA
 57978 57979 PA1527 PA1528   zipA TRUE 0.759 165.000 0.115 0.009 Y NA
 57979 57980 PA1528 PA1529 zipA lig FALSE 0.455 91.000 0.106 1.000 N NA
 57980 57981 PA1529 PA1530 lig   FALSE 0.255 46.000 0.000 NA   NA
 57981 2200480 PA1530 PA1530.1   ffs TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 57983 57984 PA1532 PA1533 dnaX   TRUE 0.866 46.000 0.411 NA   NA
 57984 57985 PA1533 PA1534   recR TRUE 0.829 79.000 0.604 NA   NA
 57985 57986 PA1534 PA1535 recR   FALSE 0.127 123.000 0.004 1.000 N NA
 57987 57988 PA1536 PA1537     FALSE 0.156 74.000 0.000 NA   NA
 57988 57989 PA1537 PA1538     TRUE 0.963 -3.000 0.050 NA   NA
 57991 57992 PA1540 PA1541     TRUE 0.999 -6.000 0.869 0.079 Y NA
 57992 57993 PA1541 PA1542     FALSE 0.006 409.000 0.000 NA   NA
 57993 57994 PA1542 PA1543   apt FALSE 0.019 240.000 0.000 NA   NA
 57994 57995 PA1543 PA1544 apt anr FALSE 0.244 86.000 0.016 1.000 N NA
 57997 57998 PA1546 PA1547 hemN   FALSE 0.248 128.000 0.051 1.000   NA
 57998 57999 PA1547 PA1548     TRUE 0.985 -7.000 0.266 NA   NA
 57999 58000 PA1548 PA1549     TRUE 0.998 -21.000 0.713 NA Y NA
 58000 58001 PA1549 PA1550     TRUE 0.984 -3.000 0.197 NA   NA
 58001 58002 PA1550 PA1551     TRUE 0.893 12.000 0.111 NA   NA
 58002 58003 PA1551 PA1552     FALSE 0.365 218.000 0.000 0.021 Y NA
 58003 58004 PA1552 PA1553     TRUE 0.510 188.000 0.000 0.002 Y NA
 58004 58005 PA1553 PA1554     TRUE 0.882 15.000 0.000 0.002 N NA
 58005 58006 PA1554 PA1555     FALSE 0.048 365.000 0.000 0.002 N NA
 58006 58007 PA1555 PA1556     TRUE 0.510 188.000 0.000 0.002 Y NA
 58007 58008 PA1556 PA1557     TRUE 0.913 11.000 0.000 0.002 N NA
 58009 58010 PA1558 PA1559     FALSE 0.132 89.000 0.000 1.000   NA
 58010 58011 PA1559 PA1560     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58012 58013 PA1561 PA1562 aer acnA FALSE 0.012 373.000 0.004 1.000 N NA
 58014 58015 PA1563 PA1564     FALSE 0.377 85.000 0.047 NA   NA
 58016 58017 PA1565 PA1566     TRUE 0.951 69.000 0.667 1.000 Y NA
 58017 58018 PA1566 PA1567     FALSE 0.045 468.000 0.000 1.000 Y NA
 58018 58019 PA1567 PA1568     TRUE 0.550 11.000 0.000 NA N NA
 58019 58020 PA1568 PA1569     FALSE 0.180 56.000 0.000 NA N NA
 58023 58024 PA1572 PA1573     TRUE 0.786 11.000 0.020 NA   NA
 58025 58026 PA1574 PA1575     FALSE 0.332 95.000 0.049 NA   NA
 58029 58030 PA1578 PA1579     FALSE 0.004 492.000 0.000 NA   NA
 58032 58033 PA1581 PA1582 sdhC sdhD TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.000 Y NA
 58033 58034 PA1582 PA1583 sdhD sdhA TRUE 0.999 4.000 0.705 0.001 Y NA
 58034 58035 PA1583 PA1584 sdhA sdhB TRUE 0.997 12.000 0.604 0.001 Y NA
 58035 58036 PA1584 PA1585 sdhB sucA FALSE 0.248 257.000 0.067 1.000 Y NA
 58036 58037 PA1585 PA1586 sucA sucB TRUE 0.974 43.000 0.667 1.000 Y NA
 58037 58038 PA1586 PA1587 sucB lpdG TRUE 0.895 69.000 0.253 1.000 Y NA
 58038 58039 PA1587 PA1588 lpdG sucC FALSE 0.160 329.000 0.069 1.000 Y NA
 58039 58040 PA1588 PA1589 sucC sucD TRUE 0.999 0.000 0.806 0.000 Y NA
 58040 58041 PA1589 PA1590 sucD braB FALSE 0.009 311.000 0.000 1.000 N NA
 58041 58042 PA1590 PA1591 braB   FALSE 0.208 146.000 0.048 NA   NA
 58044 58045 PA1593 PA1594     TRUE 0.999 -3.000 0.845 NA Y NA
 58045 58046 PA1594 PA1595     TRUE 0.656 37.000 0.054 NA   NA
 58046 58047 PA1595 PA1596   htpG FALSE 0.154 118.000 0.007 1.000   NA
 58047 58048 PA1596 PA1597 htpG   FALSE 0.272 68.000 0.008 1.000 N NA
 58051 58052 PA1600 PA1601     TRUE 0.982 50.000 0.625 0.069 Y NA
 58052 58053 PA1601 PA1602     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.069 Y NA
 58053 58054 PA1602 PA1603     FALSE 0.024 207.000 0.000 1.000 N NA
 58054 58055 PA1603 PA1604     FALSE 0.274 39.000 0.000 1.000 N NA
 58056 58057 PA1605 PA1606     TRUE 0.768 69.000 0.357 NA   NA
 58058 58059 PA1607 PA1608     FALSE 0.080 106.000 0.000 NA N NA
 58059 58060 PA1608 PA1609   fabB FALSE 0.050 154.000 0.000 1.000 N NA
 58060 58061 PA1609 PA1610 fabB fabA TRUE 0.989 12.000 0.451 1.000 Y NA
 58061 58062 PA1610 PA1611 fabA   FALSE 0.030 189.000 0.000 1.000 N NA
 58062 58063 PA1611 PA1612     TRUE 0.992 -3.000 0.444 NA   NA
 58063 58064 PA1612 PA1613     TRUE 0.479 172.000 0.444 NA   NA
 58065 58066 PA1614 PA1615 gpsA   TRUE 0.935 14.000 0.273 NA   NA
 58066 58067 PA1615 PA1616     TRUE 0.976 -3.000 0.114 NA   NA
 58067 58068 PA1616 PA1617     FALSE 0.225 127.000 0.045 1.000 N NA
 58068 58069 PA1617 PA1618     TRUE 0.669 53.000 0.143 NA N NA
 58069 58070 PA1618 PA1619     TRUE 0.504 58.000 0.057 NA N NA
 58070 58071 PA1619 PA1620     TRUE 0.905 41.000 0.545 1.000 N NA
 58071 58072 PA1620 PA1621     FALSE 0.244 102.000 0.029 NA   NA
 58072 58073 PA1621 PA1622     TRUE 0.974 -3.000 0.096 NA   NA
 58073 58074 PA1622 PA1623     FALSE 0.263 80.000 0.015 1.000 N NA
 58074 58075 PA1623 PA1624     TRUE 0.885 9.000 0.057 NA   NA
 58075 58076 PA1624 PA1625     TRUE 0.517 166.000 0.478 NA   NA
 58077 58078 PA1626 PA1627     TRUE 0.920 16.000 0.250 1.000 N NA
 58078 58079 PA1627 PA1628     FALSE 0.060 138.000 0.000 1.000 N NA
 58079 58080 PA1628 PA1629     TRUE 0.993 4.000 0.333 1.000 Y NA
 58081 58082 PA1630 PA1631     TRUE 0.636 55.000 0.120 1.000 N NA
 58082 58083 PA1631 PA1632   kdpF FALSE 0.037 188.000 0.000 1.000   NA
 58083 58084 PA1632 PA1633 kdpF kdpA TRUE 0.965 11.000 0.071 0.001   NA
 58084 58085 PA1633 PA1634 kdpA kdpB TRUE 0.987 12.000 0.059 0.001 Y NA
 58085 58086 PA1634 PA1635 kdpB kdpC TRUE 0.990 54.000 0.877 0.001 Y NA
 58086 58087 PA1635 PA1636 kdpC kdpD FALSE 0.190 108.000 0.020 1.000 N NA
 58087 58088 PA1636 PA1637 kdpD kdpE TRUE 0.913 101.000 0.621 1.000 Y NA
 58088 58089 PA1637 PA1638 kdpE   FALSE 0.070 122.000 0.000 1.000 N NA
 58089 58090 PA1638 PA1639     FALSE 0.090 111.000 0.000 NA   NA
 58092 58093 PA1641 PA1642   selD FALSE 0.139 84.000 0.000 NA   NA
 58093 58094 PA1642 PA1643 selD   TRUE 0.978 0.000 0.214 NA   NA
 58094 58095 PA1643 PA1644     FALSE 0.005 464.000 0.000 NA   NA
 58098 58099 PA1647 PA1648     FALSE 0.068 143.000 0.000 1.000   NA
 58100 58101 PA1649 PA1650     FALSE 0.144 159.000 0.029 1.000   NA
 58105 58106 PA1654 PA1655     TRUE 0.643 56.000 0.131 1.000 N NA
 58106 58107 PA1655 PA1656     FALSE 0.003 1173.000 0.000 NA   NA
 58107 58108 PA1656 PA1657     TRUE 0.716 36.000 0.080 NA   NA
 58108 58109 PA1657 PA1658     TRUE 0.721 29.000 0.060 NA   NA
 58109 58110 PA1658 PA1659     TRUE 0.972 13.000 0.627 NA   NA
 58110 58111 PA1659 PA1660     FALSE 0.090 545.000 0.552 NA   NA
 58111 58112 PA1660 PA1661     TRUE 0.994 -36.000 0.863 NA   NA
 58112 58113 PA1661 PA1662     TRUE 0.951 7.000 0.196 NA   NA
 58113 58114 PA1662 PA1663     TRUE 0.962 11.000 0.118 0.016 N NA
 58114 58115 PA1663 PA1664     TRUE 0.819 89.000 0.667 NA   NA
 58115 58116 PA1664 PA1665     TRUE 0.922 18.000 0.278 NA   NA
 58116 58117 PA1665 PA1666     TRUE 0.971 6.000 0.333 NA   NA
 58117 58118 PA1666 PA1667     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 58118 58119 PA1667 PA1668     TRUE 0.991 3.000 0.833 NA   NA
 58119 58120 PA1668 PA1669     TRUE 0.965 16.000 0.600 NA   NA
 58120 58121 PA1669 PA1670   stp1 TRUE 0.975 0.000 0.188 NA   NA
 58121 58122 PA1670 PA1671 stp1 stk1 TRUE 0.998 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 58125 58126 PA1674 PA1675 folE2   TRUE 0.812 78.000 0.545 NA   NA
 58126 58127 PA1675 PA1676     TRUE 0.840 57.000 0.444 NA   NA
 58127 58128 PA1676 PA1677     FALSE 0.384 173.000 0.292 NA   NA
 58130 58131 PA1679 PA1680     TRUE 0.655 78.000 0.219 NA   NA
 58132 58133 PA1681 PA1682 aroC   TRUE 0.607 44.000 0.055 1.000   NA
 58133 58134 PA1682 PA1683     TRUE 0.940 -3.000 0.018 1.000   NA
 58134 58135 PA1683 PA1684     TRUE 0.981 -3.000 0.148 1.000   NA
 58135 58136 PA1684 PA1685   masA TRUE 0.683 72.000 0.231 1.000   NA
 58138 58139 PA1687 PA1688 speE   FALSE 0.054 161.000 0.000 1.000   NA
 58139 58140 PA1688 PA1689     TRUE 0.965 3.000 0.200 1.000   NA
 58141 58142 PA1690 PA1691 pscU pscT TRUE 0.999 -3.000 0.548 0.078 Y NA
 58142 58143 PA1691 PA1692 pscT   TRUE 0.997 -3.000 0.097 0.078 Y NA
 58143 58144 PA1692 PA1693   pscR TRUE 0.997 3.000 0.300 0.013 Y NA
 58144 58145 PA1693 PA1694 pscR pscQ TRUE 0.998 -3.000 0.529 1.000 Y NA
 58145 58146 PA1694 PA1695 pscQ pscP TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.005   NA
 58146 58147 PA1695 PA1696 pscP pscO TRUE 0.822 -12.000 0.000 NA   NA
 58147 58148 PA1696 PA1697 pscO   TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58149 58150 PA1698 PA1699 popN   TRUE 0.809 -19.000 0.000 NA   NA
 58150 58151 PA1699 PA1700     TRUE 0.819 -13.000 0.000 NA   NA
 58151 58152 PA1700 PA1701     TRUE 0.985 -3.000 0.214 NA   NA
 58152 58153 PA1701 PA1702     TRUE 0.694 5.000 0.000 NA   NA
 58153 58154 PA1702 PA1703   pcrD TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 58154 58155 PA1703 PA1704 pcrD pcrR TRUE 0.989 -3.000 0.281 NA   NA
 58155 58156 PA1704 PA1705 pcrR pcrG TRUE 0.965 28.000 1.000 NA   NA
 58156 58157 PA1705 PA1706 pcrG pcrV TRUE 0.976 10.000 0.556 NA   NA
 58157 58158 PA1706 PA1707 pcrV pcrH TRUE 0.954 9.000 0.235 1.000   NA
 58158 58159 PA1707 PA1708 pcrH popB TRUE 0.992 -19.000 0.632 1.000   NA
 58159 58160 PA1708 PA1709 popB popD TRUE 0.969 12.000 0.526 NA   NA
 58160 58161 PA1709 PA1710 popD exsC FALSE 0.428 126.000 0.182 NA   NA
 58161 58162 PA1710 PA1711 exsC exsE TRUE 0.640 9.000 0.000 NA   NA
 58162 58163 PA1711 PA1712 exsE exsB TRUE 0.640 9.000 0.000 NA   NA
 58163 58164 PA1712 PA1713 exsB exsA FALSE 0.082 298.000 0.154 1.000   NA
 58164 58165 PA1713 PA1714 exsA exsD TRUE 0.772 98.000 0.615 NA   NA
 58165 58166 PA1714 PA1715 exsD pscB TRUE 0.929 34.000 0.583 NA   NA
 58166 58167 PA1715 PA1716 pscB pscC TRUE 0.993 0.000 0.750 1.000   NA
 58167 58168 PA1716 PA1717 pscC pscD TRUE 0.972 2.000 0.220 NA   NA
 58168 58169 PA1717 PA1718 pscD pscE TRUE 0.981 -37.000 0.268 NA   NA
 58169 58170 PA1718 PA1719 pscE pscF TRUE 0.993 3.000 0.417 0.004   NA
 58170 58171 PA1719 PA1720 pscF pscG TRUE 0.994 3.000 0.556 0.004   NA
 58171 58172 PA1720 PA1721 pscG pscH TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.004   NA
 58172 58173 PA1721 PA1722 pscH pscI TRUE 0.994 0.000 0.333 0.004   NA
 58173 58174 PA1722 PA1723 pscI pscJ TRUE 0.996 -3.000 0.333 0.013   NA
 58174 58175 PA1723 PA1724 pscJ pscK TRUE 0.985 9.000 0.800 1.000   NA
 58175 58176 PA1724 PA1725 pscK pscL TRUE 0.993 -21.000 0.727 1.000   NA
 58177 58178 PA1726 PA1727 bglX   FALSE 0.039 171.000 0.000 1.000 N NA
 58179 58180 PA1728 PA1729     FALSE 0.107 98.000 0.000 NA   NA
 58180 58181 PA1729 PA1730     FALSE 0.006 400.000 0.000 NA   NA
 58181 58182 PA1730 PA1731     TRUE 0.991 3.000 0.805 NA   NA
 58182 58183 PA1731 PA1732     TRUE 0.991 -3.000 0.365 NA   NA
 58183 58184 PA1732 PA1733     TRUE 0.739 82.000 0.383 NA N NA
 58186 58187 PA1735 PA1736     FALSE 0.004 571.000 0.000 1.000   NA
 58187 58188 PA1736 PA1737     TRUE 0.990 14.000 0.600 1.000 Y NA
 58190 58191 PA1739 PA1740     FALSE 0.377 23.000 0.000 NA N NA
 58194 58195 PA1743 PA1744     FALSE 0.380 28.000 0.000 NA   NA
 58195 58196 PA1744 PA1745     FALSE 0.055 155.000 0.000 NA   NA
 58198 58199 PA1747 PA1748     FALSE 0.061 150.000 0.000 NA   NA
 58202 58203 PA1751 PA1752     TRUE 0.942 0.000 0.047 NA   NA
 58203 58204 PA1752 PA1753     FALSE 0.181 163.000 0.059 1.000 N NA
 58204 58205 PA1753 PA1754   cysB FALSE 0.287 132.000 0.085 1.000 N NA
 58206 58207 PA1755 PA1756   cysH FALSE 0.292 65.000 0.005 NA   NA
 58210 58211 PA1759 PA1760     TRUE 0.997 3.000 0.400 0.031 Y NA
 58211 58212 PA1760 PA1761     FALSE 0.020 232.000 0.000 NA   NA
 58212 58213 PA1761 PA1762     FALSE 0.148 79.000 0.000 NA   NA
 58213 58214 PA1762 PA1763     TRUE 0.872 41.000 0.357 NA   NA
 58214 58215 PA1763 PA1764     TRUE 0.955 20.000 0.571 NA   NA
 58215 58216 PA1764 PA1765     TRUE 0.900 14.000 0.154 1.000   NA
 58217 58218 PA1766 PA1767     TRUE 0.991 4.000 0.923 NA   NA
 58218 58219 PA1767 PA1768     TRUE 0.940 6.000 0.141 NA   NA
 58219 58220 PA1768 PA1769     FALSE 0.012 291.000 0.000 NA   NA
 58221 58222 PA1770 PA1771 ppsA estX FALSE 0.344 70.000 0.029 NA N NA
 58222 58223 PA1771 PA1772 estX   FALSE 0.384 107.000 0.113 NA N NA
 58223 58224 PA1772 PA1773   cmaX FALSE 0.165 188.000 0.093 NA N NA
 58224 58225 PA1773 PA1774 cmaX cfrX TRUE 0.649 49.000 0.093 NA   NA
 58225 58226 PA1774 PA1775 cfrX cmpX TRUE 0.972 3.000 0.256 NA   NA
 58226 58227 PA1775 PA1776 cmpX sigX FALSE 0.403 165.000 0.279 NA   NA
 58227 58228 PA1776 PA1777 sigX oprF TRUE 0.565 109.000 0.280 1.000 N NA
 58229 58230 PA1778 PA1779 cobA   TRUE 0.828 12.000 0.048 1.000 N NA
 58230 58231 PA1779 PA1780   nirD TRUE 0.948 27.000 0.294 0.068 N NA
 58231 58232 PA1780 PA1781 nirD nirB TRUE 0.953 53.000 0.539 0.000 N NA
 58232 10491233 PA1781 PA1781.1 nirB   FALSE 0.296 40.000 0.000 NA   NA
 10491233 58233 PA1781.1 PA1782     TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 58233 58234 PA1782 PA1783   nasA TRUE 0.742 75.000 0.337 1.000 N NA
 58234 58235 PA1783 PA1784 nasA   FALSE 0.008 354.000 0.000 NA   NA
 58235 58236 PA1784 PA1785     FALSE 0.021 230.000 0.000 NA   NA
 58236 58237 PA1785 PA1786     TRUE 0.905 17.000 0.218 NA N NA
 58237 58238 PA1786 PA1787   acnB FALSE 0.067 178.000 0.007 NA N NA
 58242 58243 PA1791 PA1792     FALSE 0.070 134.000 0.000 NA   NA
 58243 58244 PA1792 PA1793   ppiB TRUE 0.963 5.000 0.237 1.000   NA
 58245 58246 PA1794 PA1795 glnS cysS TRUE 0.983 10.000 0.032 0.034 Y NA
 2200481 2200482 PA1796.1 PA1796.2     FALSE 0.226 52.000 0.000 NA   NA
 2200482 2200483 PA1796.2 PA1796.3     FALSE 0.213 55.000 0.000 NA   NA
 2200483 2200484 PA1796.3 PA1796.4     FALSE 0.172 67.000 0.000 NA   NA
 58248 58249 PA1797 PA1798     FALSE 0.085 105.000 0.000 1.000 N NA
 58249 58250 PA1798 PA1799     TRUE 0.971 1.000 0.000 1.000 Y NA
 58251 58252 PA1800 PA1801 tig clpP TRUE 0.879 94.000 0.351 1.000 Y NA
 58252 58253 PA1801 PA1802 clpP clpX TRUE 0.856 105.000 0.352 1.000 Y NA
 58253 58254 PA1802 PA1803 clpX lon TRUE 0.832 132.000 0.201 0.088 Y NA
 58254 58255 PA1803 PA1804 lon hupB FALSE 0.196 136.000 0.040 1.000 N NA
 58255 2200485 PA1804 PA1804.1 hupB   FALSE 0.226 52.000 0.000 NA   NA
 2200485 58256 PA1804.1 PA1805   ppiD FALSE 0.097 104.000 0.000 NA   NA
 58257 58258 PA1806 PA1807 fabI   TRUE 0.769 22.000 0.057 1.000   NA
 58258 58259 PA1807 PA1808     TRUE 0.993 2.000 1.000 1.000   NA
 58259 58260 PA1808 PA1809     TRUE 0.995 5.000 1.000 0.070   NA
 58260 58261 PA1809 PA1810     TRUE 0.994 7.000 1.000 0.070   NA
 58261 58262 PA1810 PA1811     TRUE 0.997 -3.000 0.159 0.070 Y NA
 58262 58263 PA1811 PA1812   mltD FALSE 0.029 191.000 0.000 1.000 N NA
 58263 58264 PA1812 PA1813 mltD   FALSE 0.310 78.000 0.020 1.000   NA
 58265 58266 PA1814 PA1815   rnhA TRUE 0.854 3.000 0.009 1.000   NA
 58266 58267 PA1815 PA1816 rnhA dnaQ TRUE 0.902 65.000 0.248 1.000 Y NA
 58269 58270 PA1818 PA1819     TRUE 0.869 24.000 0.000 1.000 Y NA
 58272 58273 PA1821 PA1822   fimL TRUE 0.835 40.000 0.250 NA   NA
 58273 58274 PA1822 PA1823 fimL nudC TRUE 0.940 0.000 0.045 NA   NA
 58279 58280 PA1828 PA1829     TRUE 0.817 25.000 0.115 1.000   NA
 58280 58281 PA1829 PA1830     FALSE 0.016 258.000 0.000 1.000   NA
 58281 58282 PA1830 PA1831     TRUE 0.788 61.000 0.344 NA N NA
 58283 58284 PA1832 PA1833     FALSE 0.433 59.000 0.036 1.000 N NA
 58284 58285 PA1833 PA1834     FALSE 0.147 80.000 0.000 NA   NA
 58288 58289 PA1837 PA1838   cysI TRUE 0.973 -16.000 0.165 NA   NA
 58289 58290 PA1838 PA1839 cysI   FALSE 0.020 703.000 0.000 0.012   NA
 58291 58292 PA1840 PA1841     TRUE 0.526 14.000 0.000 NA   NA
 58293 58294 PA1842 PA1843   metH TRUE 0.733 15.000 0.024 NA   NA
 58294 58295 PA1843 PA1844 metH   FALSE 0.013 275.000 0.000 NA   NA
 58295 58296 PA1844 PA1845     FALSE 0.280 42.000 0.000 NA   NA
 58297 58298 PA1846 PA1847 cti   FALSE 0.456 123.000 0.030 0.020   NA
 58299 58300 PA1848 PA1849     TRUE 0.694 5.000 0.000 NA   NA
 58300 58301 PA1849 PA1850     TRUE 0.654 23.000 0.023 NA   NA
 58305 58306 PA1854 PA1855     FALSE 0.120 92.000 0.000 NA   NA
 58306 58307 PA1855 PA1856     TRUE 0.737 3.000 0.000 NA   NA
 58307 58308 PA1856 PA1857     FALSE 0.008 347.000 0.000 NA   NA
 58308 58309 PA1857 PA1858   str FALSE 0.085 116.000 0.000 NA   NA
 58309 58310 PA1858 PA1859 str   TRUE 0.610 9.000 0.000 1.000 N NA
 58312 58313 PA1861 PA1862 modC modB TRUE 0.998 2.000 0.308 0.001 Y NA
 58313 58314 PA1862 PA1863 modB modA TRUE 0.997 13.000 0.660 0.001 Y NA
 58314 58315 PA1863 PA1864 modA   FALSE 0.077 115.000 0.000 1.000 N NA
 58316 58317 PA1865 PA1866     TRUE 0.985 -7.000 0.254 NA   NA
 58317 58318 PA1866 PA1867     FALSE 0.005 441.000 0.000 NA   NA
 58318 58319 PA1867 PA1868   xqhA TRUE 0.819 -13.000 0.000 NA   NA
 58319 58320 PA1868 PA1869 xqhA   FALSE 0.041 168.000 0.000 1.000 N NA
 58320 58321 PA1869 PA1870     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 58321 58322 PA1870 PA1871   lasA FALSE 0.012 282.000 0.000 NA   NA
 58323 58324 PA1872 PA1873     FALSE 0.192 61.000 0.000 NA   NA
 58325 58326 PA1874 PA1875     TRUE 0.949 0.000 0.057 1.000   NA
 58326 58327 PA1875 PA1876     TRUE 0.989 -10.000 0.200 0.085 N NA
 58327 58328 PA1876 PA1877     TRUE 0.994 -10.000 0.364 0.077 N NA
 58329 58330 PA1878 PA1879     TRUE 0.532 89.000 0.148 1.000   NA
 58330 58331 PA1879 PA1880     FALSE 0.056 158.000 0.000 1.000   NA
 58331 58332 PA1880 PA1881     TRUE 0.994 5.000 0.214 0.068 Y NA
 58333 58334 PA1882 PA1883     TRUE 0.512 13.000 0.000 1.000 N NA
 58336 58337 PA1885 PA1886   polB FALSE 0.171 69.000 0.000 1.000   NA
 58338 58339 PA1887 PA1888     TRUE 0.813 -16.000 0.000 NA   NA
 58341 58342 PA1890 PA1891     FALSE 0.127 89.000 0.000 NA   NA
 58342 58343 PA1891 PA1892     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58343 58344 PA1892 PA1893     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58344 58345 PA1893 PA1894     FALSE 0.397 26.000 0.000 NA   NA
 58345 58346 PA1894 PA1895     TRUE 0.799 -52.000 0.000 NA   NA
 58346 58347 PA1895 PA1896     FALSE 0.459 19.000 0.000 NA   NA
 58347 58348 PA1896 PA1897     TRUE 0.679 6.000 0.000 NA   NA
 58349 58350 PA1898 PA1899 qscR phzA2 FALSE 0.005 482.000 0.000 1.000   NA
 58350 58351 PA1899 PA1900 phzA2 phzB2 TRUE 0.768 36.000 0.000 0.004   NA
 58351 58352 PA1900 PA1901 phzB2 phzC2 FALSE 0.420 24.000 0.000 1.000   NA
 58352 58353 PA1901 PA1902 phzC2 phzD2 TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000 N NA
 58353 58354 PA1902 PA1903 phzD2 phzE2 TRUE 0.987 -3.000 0.055 0.020 N NA
 58354 58355 PA1903 PA1904 phzE2 phzF2 TRUE 0.903 14.000 0.016 0.020   NA
 58355 60665 PA1904 PA1905 phzF2 phzG2 TRUE 0.893 23.000 0.235 1.000   NA
 58356 58357 PA1906 PA1907     FALSE 0.281 43.000 0.000 1.000   NA
 58357 58358 PA1907 PA1908     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 58358 58359 PA1908 PA1909     FALSE 0.036 187.000 0.000 NA   NA
 58359 58360 PA1909 PA1910     FALSE 0.288 41.000 0.000 NA   NA
 58360 58361 PA1910 PA1911     FALSE 0.206 209.000 0.000 NA Y NA
 58361 58362 PA1911 PA1912     TRUE 0.988 -3.000 0.286 NA N NA
 58362 58363 PA1912 PA1913     FALSE 0.120 92.000 0.000 NA   NA
 58363 58364 PA1913 PA1914     FALSE 0.094 107.000 0.000 NA   NA
 58364 58365 PA1914 PA1915     FALSE 0.004 568.000 0.000 NA   NA
 58365 58366 PA1915 PA1916     FALSE 0.158 64.000 0.000 NA N NA
 58366 58367 PA1916 PA1917     FALSE 0.260 45.000 0.000 NA   NA
 58367 58368 PA1917 PA1918     TRUE 0.935 13.000 0.250 NA   NA
 58368 58369 PA1918 PA1919     FALSE 0.029 194.000 0.000 1.000 N NA
 58369 58370 PA1919 PA1920     FALSE 0.193 187.000 0.122 1.000 N NA
 58370 58371 PA1920 PA1921     FALSE 0.056 158.000 0.000 1.000   NA
 58372 58373 PA1922 PA1923     TRUE 0.970 0.000 0.158 1.000 N NA
 58373 58374 PA1923 PA1924     TRUE 0.987 -3.000 0.263 NA N NA
 58374 58375 PA1924 PA1925     TRUE 0.993 0.000 0.778 NA   NA
 58375 58376 PA1925 PA1926     FALSE 0.004 501.000 0.000 NA   NA
 58376 58377 PA1926 PA1927   metE FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 58378 58379 PA1928 PA1929 rimJ   FALSE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 58380 58381 PA1930 PA1931     FALSE 0.039 170.000 0.000 1.000 N NA
 58381 58382 PA1931 PA1932     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.068 Y NA
 58382 58383 PA1932 PA1933     TRUE 1.000 -3.000 0.943 0.001 Y NA
 58383 58384 PA1933 PA1934     FALSE 0.004 495.000 0.000 NA   NA
 58386 58387 PA1936 PA1937     FALSE 0.005 488.000 0.000 NA   NA
 58387 58388 PA1937 PA1938     TRUE 0.920 33.000 0.000 0.045 Y NA
 58389 58390 PA1939 PA1940     FALSE 0.007 357.000 0.000 1.000 N NA
 58390 58391 PA1940 PA1941     TRUE 0.718 179.000 0.667 0.068   NA
 58391 58392 PA1941 PA1942     FALSE 0.010 312.000 0.000 NA   NA
 58392 58393 PA1942 PA1943     FALSE 0.188 62.000 0.000 NA   NA
 58394 58395 PA1944 PA1945     FALSE 0.223 136.000 0.000 0.087 N NA
 58395 58396 PA1945 PA1946   rbsB FALSE 0.020 219.000 0.000 NA N NA
 58396 58397 PA1946 PA1947 rbsB rbsA TRUE 0.954 22.000 0.132 NA Y NA
 58397 58398 PA1947 PA1948 rbsA rbsC TRUE 0.987 24.000 0.778 1.000 Y NA
 58398 58399 PA1948 PA1949 rbsC rbsR TRUE 0.963 4.000 0.226 1.000 N NA
 58399 58400 PA1949 PA1950 rbsR rbsK TRUE 0.854 54.000 0.484 1.000 N NA
 58401 58402 PA1951 PA1952     TRUE 0.769 61.000 0.292 NA   NA
 58402 58403 PA1952 PA1953     TRUE 0.972 14.000 0.667 NA   NA
 58403 58404 PA1953 PA1954     TRUE 0.904 62.000 0.875 NA   NA
 58404 58405 PA1954 PA1955     TRUE 0.882 57.000 0.625 NA   NA
 58405 58406 PA1955 PA1956     TRUE 0.993 -3.000 0.455 NA   NA
 58406 58407 PA1956 PA1957     FALSE 0.011 303.000 0.000 NA   NA
 58407 58408 PA1957 PA1958     TRUE 0.996 -3.000 0.242 NA Y NA
 58409 58410 PA1959 PA1960 bacA   FALSE 0.363 71.000 0.029 1.000   NA
 58412 58413 PA1962 PA1963 acpD   FALSE 0.094 107.000 0.000 NA   NA
 58415 58416 PA1965 PA1966     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 58418 58419 PA1968 PA1969     FALSE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 58420 58421 PA1970 PA1971   braZ FALSE 0.021 229.000 0.000 NA   NA
 58422 58423 PA1972 PA1973   pqqF FALSE 0.158 77.000 0.000 1.000   NA
 58423 58424 PA1973 PA1974 pqqF   FALSE 0.015 267.000 0.000 1.000   NA
 58424 58425 PA1974 PA1975     TRUE 0.499 103.000 0.182 NA   NA
 58425 58426 PA1975 PA1976     TRUE 0.990 -70.000 0.562 NA   NA
 58427 58428 PA1977 PA1978     TRUE 0.621 10.000 0.000 NA   NA
 58429 58430 PA1979 PA1980     TRUE 0.985 13.000 0.545 0.025   NA
 58431 58432 PA1981 PA1982   exaA TRUE 0.890 54.000 0.625 NA   NA
 58433 58434 PA1983 PA1984 exaB   TRUE 0.590 87.000 0.000 1.000 Y NA
 58434 58435 PA1984 PA1985   pqqA FALSE 0.008 357.000 0.000 1.000   NA
 58435 58436 PA1985 PA1986 pqqA pqqB TRUE 0.702 53.000 0.000 0.001   NA
 58436 58437 PA1986 PA1987 pqqB pqqC TRUE 0.994 10.000 0.825 0.001   NA
 58437 58438 PA1987 PA1988 pqqC pqqD TRUE 0.996 -3.000 0.246 0.001   NA
 58438 58439 PA1988 PA1989 pqqD pqqE TRUE 0.993 -28.000 0.211 0.001   NA
 58439 58440 PA1989 PA1990 pqqE   TRUE 0.929 5.000 0.088 1.000   NA
 58440 58441 PA1990 PA1991     FALSE 0.340 86.000 0.041 1.000 N NA
 58441 58442 PA1991 PA1992     TRUE 0.792 -16.000 0.000 1.000 N NA
 58443 58444 PA1993 PA1994     FALSE 0.077 125.000 0.000 NA   NA
 58444 58445 PA1994 PA1995     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58445 58446 PA1995 PA1996   ppiC1 FALSE 0.459 19.000 0.000 NA   NA
 58446 58447 PA1996 PA1997 ppiC1   FALSE 0.401 58.000 0.023 1.000   NA
 58447 58448 PA1997 PA1998     FALSE 0.151 68.000 0.000 1.000 N NA
 58449 58450 PA1999 PA2000     TRUE 0.987 35.000 0.352 0.000 Y NA
 58450 58451 PA2000 PA2001   atoB FALSE 0.386 149.000 0.000 1.000 Y NA
 58451 58452 PA2001 PA2002 atoB   FALSE 0.201 213.000 0.000 1.000 Y NA
 58453 58454 PA2003 PA2004 bdhA   TRUE 0.859 37.000 0.288 1.000 N NA
 58454 58455 PA2004 PA2005     FALSE 0.013 262.000 0.000 1.000 N NA
 58455 58456 PA2005 PA2006     FALSE 0.148 69.000 0.000 1.000 N NA
 58456 58457 PA2006 PA2007   maiA TRUE 0.665 84.000 0.267 1.000 N NA
 58457 58458 PA2007 PA2008 maiA fahA TRUE 0.992 -3.000 0.077 0.001 N NA
 58458 58459 PA2008 PA2009 fahA hmgA TRUE 0.987 5.000 0.188 1.000 Y NA
 58461 58462 PA2011 PA2012 gnyL gnyA TRUE 0.945 21.000 0.229 0.076 N NA
 58462 58463 PA2012 PA2013 gnyA gnyH TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.076 Y NA
 58463 58464 PA2013 PA2014 gnyH gnyB TRUE 0.975 14.000 0.189 1.000 Y NA
 58464 58465 PA2014 PA2015 gnyB gnyD TRUE 0.813 123.000 0.316 1.000 Y NA
 58465 58466 PA2015 PA2016 gnyD gnyR FALSE 0.396 49.000 0.014 1.000 N NA
 58468 58469 PA2018 PA2019     FALSE 0.466 16.000 0.000 1.000 N NA
 58472 58473 PA2022 PA2023   galU TRUE 0.937 48.000 0.273 1.000 Y NA
 58476 58477 PA2026 PA2027     FALSE 0.056 154.000 0.000 NA   NA
 58478 58479 PA2028 PA2029     FALSE 0.409 24.000 0.000 NA   NA
 58480 58481 PA2030 PA2031     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58482 58483 PA2032 PA2033     FALSE 0.058 135.000 0.000 NA N NA
 58483 58484 PA2033 PA2034     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA N NA
 58486 58487 PA2036 PA2037     FALSE 0.066 141.000 0.000 NA   NA
 58488 58489 PA2038 PA2039     TRUE 0.993 -15.000 0.651 NA   NA
 58490 58491 PA2040 PA2041     FALSE 0.354 157.000 0.000 1.000 Y NA
 58491 58492 PA2041 PA2042     FALSE 0.042 488.000 0.000 1.000 Y NA
 58492 58493 PA2042 PA2043     FALSE 0.184 121.000 0.026 1.000 N NA
 58494 58495 PA2044 PA2045     FALSE 0.042 175.000 0.000 NA   NA
 58495 58496 PA2045 PA2046     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 58496 58497 PA2046 PA2047     FALSE 0.003 1035.000 0.000 NA   NA
 58500 58501 PA2050 PA2051     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 58502 58503 PA2052 PA2053 cynS cynT TRUE 0.843 40.000 0.011 1.000 Y NA
 58506 58507 PA2056 PA2057     FALSE 0.003 680.000 0.000 1.000 N NA
 58507 58508 PA2057 PA2058     TRUE 0.919 4.000 0.000 0.069 N NA
 58508 58509 PA2058 PA2059     TRUE 0.940 2.000 0.000 0.069   NA
 58509 58510 PA2059 PA2060     TRUE 0.940 2.000 0.000 0.069   NA
 58510 58511 PA2060 PA2061     TRUE 0.771 2.000 0.000 1.000   NA
 58511 58512 PA2061 PA2062     FALSE 0.066 146.000 0.000 1.000   NA
 58512 58513 PA2062 PA2063     FALSE 0.029 203.000 0.000 NA   NA
 58514 58515 PA2064 PA2065 pcoB pcoA TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.003 N NA
 58515 58516 PA2065 PA2066 pcoA   FALSE 0.062 149.000 0.000 NA   NA
 58516 58517 PA2066 PA2067     TRUE 0.941 -3.000 0.020 NA   NA
 58517 58518 PA2067 PA2068     TRUE 0.771 2.000 0.000 1.000   NA
 58518 58519 PA2068 PA2069     FALSE 0.274 44.000 0.000 1.000   NA
 58519 58520 PA2069 PA2070     FALSE 0.034 180.000 0.000 1.000 N NA
 58521 58522 PA2071 PA2072 fusA2   FALSE 0.038 172.000 0.000 1.000 N NA
 58522 58523 PA2072 PA2073     FALSE 0.021 218.000 0.000 1.000 N NA
 58523 58524 PA2073 PA2074     TRUE 0.951 0.000 0.062 1.000   NA
 58527 58528 PA2077 PA2078     TRUE 0.719 40.000 0.000 0.013   NA
 58528 58529 PA2078 PA2079     FALSE 0.012 286.000 0.000 1.000   NA
 58529 58530 PA2079 PA2080   kynU FALSE 0.463 156.000 0.028 1.000 Y NA
 58530 58531 PA2080 PA2081 kynU kynB TRUE 0.877 4.000 0.028 1.000   NA
 58532 58533 PA2082 PA2083     FALSE 0.026 202.000 0.000 1.000 N NA
 58533 58534 PA2083 PA2084     FALSE 0.115 88.000 0.000 1.000 N NA
 58534 58535 PA2084 PA2085     FALSE 0.349 28.000 0.000 1.000 N NA
 58535 58536 PA2085 PA2086     TRUE 0.890 11.000 0.000 0.036   NA
 58536 58537 PA2086 PA2087     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58537 58538 PA2087 PA2088     TRUE 0.813 -16.000 0.000 NA   NA
 58538 58539 PA2088 PA2089     FALSE 0.125 92.000 0.000 1.000   NA
 58539 58540 PA2089 PA2090     TRUE 0.499 13.000 0.000 NA N NA
 58540 58541 PA2090 PA2091     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 58541 58542 PA2091 PA2092     TRUE 0.989 -13.000 0.000 0.069 Y NA
 58542 58543 PA2092 PA2093     FALSE 0.088 103.000 0.000 1.000 N NA
 58543 58544 PA2093 PA2094     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 58545 58546 PA2095 PA2096     FALSE 0.062 149.000 0.000 NA   NA
 58547 58548 PA2097 PA2098     TRUE 0.876 11.000 0.074 1.000 N NA
 58548 58549 PA2098 PA2099     TRUE 0.977 -15.000 0.047 0.076   NA
 58551 58552 PA2101 PA2102     TRUE 0.871 2.000 0.011 NA   NA
 58552 58553 PA2102 PA2103     FALSE 0.080 263.000 0.093 NA   NA
 58553 58554 PA2103 PA2104     TRUE 0.695 19.000 0.029 1.000 N NA
 58554 58555 PA2104 PA2105     TRUE 0.733 82.000 0.037 1.000 Y NA
 58555 58556 PA2105 PA2106     TRUE 0.986 -3.000 0.042 0.033   NA
 58559 58560 PA2109 PA2110     FALSE 0.168 68.000 0.000 NA   NA
 58560 58561 PA2110 PA2111     TRUE 0.999 -3.000 0.909 NA Y NA
 58561 58562 PA2111 PA2112     TRUE 0.996 -3.000 0.909 1.000   NA
 58562 58563 PA2112 PA2113     FALSE 0.351 33.000 0.000 1.000   NA
 58563 58564 PA2113 PA2114     TRUE 0.755 25.000 0.000 0.076   NA
 58565 58566 PA2115 PA2116     FALSE 0.218 107.000 0.025 NA   NA
 58569 58570 PA2119 PA2120     FALSE 0.009 333.000 0.000 NA   NA
 58570 58571 PA2120 PA2121     FALSE 0.063 148.000 0.000 NA   NA
 58572 58573 PA2122 PA2123     FALSE 0.314 37.000 0.000 NA   NA
 58573 58574 PA2123 PA2124     TRUE 0.801 105.000 0.833 1.000 N NA
 58574 58575 PA2124 PA2125     TRUE 0.865 22.000 0.174 1.000 N NA
 58576 58577 PA2126 PA2127     FALSE 0.006 427.000 0.000 1.000   NA
 58578 58579 PA2128 PA2129 cupA1 cupA2 TRUE 0.855 88.000 0.231 1.000 Y NA
 58579 58580 PA2129 PA2130 cupA2 cupA3 TRUE 0.976 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 58580 58581 PA2130 PA2131 cupA3 cupA4 TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000   NA
 58581 58582 PA2131 PA2132 cupA4 cupA5 TRUE 0.989 -10.000 0.400 1.000   NA
 58582 58583 PA2132 PA2133 cupA5   TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 58583 58584 PA2133 PA2134     FALSE 0.118 93.000 0.000 NA   NA
 58584 58585 PA2134 PA2135     FALSE 0.369 29.000 0.000 NA   NA
 58587 58588 PA2137 PA2138     TRUE 0.483 18.000 0.000 1.000   NA
 58588 58589 PA2138 PA2139     FALSE 0.154 76.000 0.000 NA   NA
 58589 58590 PA2139 PA2140     FALSE 0.089 112.000 0.000 NA   NA
 58590 58591 PA2140 PA2141     TRUE 0.595 11.000 0.000 NA   NA
 58591 58592 PA2141 PA2142     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58592 58593 PA2142 PA2143     FALSE 0.005 451.000 0.000 NA   NA
 58593 58594 PA2143 PA2144   glgP FALSE 0.392 53.000 0.016 NA   NA
 58596 58597 PA2146 PA2147   katE FALSE 0.145 81.000 0.000 NA   NA
 58597 58598 PA2147 PA2148 katE   FALSE 0.022 228.000 0.000 NA   NA
 58598 58599 PA2148 PA2149     TRUE 0.867 14.000 0.095 NA   NA
 58599 58600 PA2149 PA2150     TRUE 0.674 23.000 0.029 NA   NA
 58600 58601 PA2150 PA2151     FALSE 0.067 144.000 0.000 1.000   NA
 58601 58602 PA2151 PA2152     TRUE 0.990 11.000 0.544 0.002   NA
 58602 58603 PA2152 PA2153   glgB TRUE 0.998 -3.000 0.115 0.002 Y NA
 58604 58605 PA2154 PA2155     TRUE 0.991 -3.000 0.357 NA   NA
 58605 58606 PA2155 PA2156     TRUE 0.995 -3.000 0.636 NA   NA
 58606 58607 PA2156 PA2157     TRUE 0.992 -3.000 0.417 NA   NA
 58607 58608 PA2157 PA2158     TRUE 0.951 4.000 0.150 NA   NA
 58608 58609 PA2158 PA2159     TRUE 0.561 67.000 0.100 1.000   NA
 58609 58610 PA2159 PA2160     FALSE 0.108 100.000 0.000 1.000   NA
 58610 58611 PA2160 PA2161     TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 58611 58612 PA2161 PA2162     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58612 58613 PA2162 PA2163     TRUE 0.998 -7.000 0.141 0.002 Y NA
 58613 58614 PA2163 PA2164     TRUE 0.998 -7.000 0.204 0.002 Y NA
 58614 58615 PA2164 PA2165     TRUE 0.998 0.000 0.917 1.000 Y NA
 58616 58617 PA2166 PA2167     FALSE 0.009 329.000 0.000 NA   NA
 58617 58618 PA2167 PA2168     TRUE 0.986 -3.000 0.221 NA   NA
 58618 58619 PA2168 PA2169     FALSE 0.079 126.000 0.000 1.000   NA
 58619 58620 PA2169 PA2170     FALSE 0.389 27.000 0.000 NA   NA
 58620 58621 PA2170 PA2171     FALSE 0.155 75.000 0.000 NA   NA
 58621 58622 PA2171 PA2172     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 58622 58623 PA2172 PA2173     FALSE 0.389 27.000 0.000 NA   NA
 58624 58625 PA2174 PA2175     FALSE 0.012 284.000 0.000 NA   NA
 58625 58626 PA2175 PA2176     TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 58628 58629 PA2178 PA2179     FALSE 0.007 375.000 0.000 NA   NA
 58629 58630 PA2179 PA2180     TRUE 0.981 -16.000 0.250 NA   NA
 58632 58633 PA2182 PA2183     FALSE 0.011 294.000 0.000 NA   NA
 58633 58634 PA2183 PA2184     TRUE 0.981 -3.000 0.154 NA   NA
 58635 58636 PA2185 PA2186 katN   FALSE 0.139 84.000 0.000 NA   NA
 58636 58637 PA2186 PA2187     FALSE 0.096 105.000 0.000 NA   NA
 58639 58640 PA2189 PA2190     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 58642 58643 PA2192 PA2193   hcnA FALSE 0.006 424.000 0.000 1.000   NA
 58643 58644 PA2193 PA2194 hcnA hcnB TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.001   NA
 58644 58645 PA2194 PA2195 hcnB hcnC TRUE 0.986 3.000 0.136 0.001   NA
 58645 58646 PA2195 PA2196 hcnC   FALSE 0.050 154.000 0.000 1.000 N NA
 58646 58647 PA2196 PA2197     FALSE 0.340 131.000 0.115 1.000   NA
 58647 58648 PA2197 PA2198     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.046   NA
 58648 58649 PA2198 PA2199     TRUE 0.689 6.000 0.000 1.000   NA
 58649 58650 PA2199 PA2200     FALSE 0.110 88.000 0.000 NA N NA
 58650 58651 PA2200 PA2201     FALSE 0.077 125.000 0.000 NA   NA
 58652 58653 PA2202 PA2203     TRUE 0.999 2.000 0.692 0.011 Y NA
 58653 58654 PA2203 PA2204     TRUE 0.948 81.000 0.395 0.083 Y NA
 58654 58655 PA2204 PA2205     FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 58655 58656 PA2205 PA2206     FALSE 0.143 82.000 0.000