MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2194572 2194573 PA14_00010 PA14_00020 dnaA dnaN TRUE 0.973 29.000 0.328 1.000 Y NA
 2194573 2194574 PA14_00020 PA14_00030 dnaN recF TRUE 0.990 10.000 0.318 1.000 Y NA
 2194574 2194575 PA14_00030 PA14_00050 recF gyrB TRUE 0.998 -3.000 0.249 0.003 Y NA
 2194576 2194577 PA14_00060 PA14_00070     TRUE 0.954 12.000 0.310 1.000 N NA
 2194579 2194580 PA14_00090 PA14_00100 glyS glyQ TRUE 0.999 0.000 0.651 0.000 Y NA
 2194581 2194582 PA14_00110 PA14_00120 tag   FALSE 0.125 145.000 0.017 1.000 N NA
 2194582 2194583 PA14_00120 PA14_00130     FALSE 0.396 85.000 0.053 NA   NA
 2194583 2194584 PA14_00130 PA14_00140     FALSE 0.066 147.000 0.000 NA   NA
 2194585 2194586 PA14_00150 PA14_00160     FALSE 0.010 315.000 0.000 NA   NA
 2194586 2194587 PA14_00160 PA14_00170   trkA FALSE 0.125 149.000 0.008 1.000   NA
 2194587 2194588 PA14_00170 PA14_00180 trkA   TRUE 0.810 27.000 0.122 1.000 N NA
 2194588 2194589 PA14_00180 PA14_00190   fmt TRUE 0.996 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 2194589 2194590 PA14_00190 PA14_00200 fmt def TRUE 0.950 54.000 0.105 0.017 Y NA
 2194591 2194592 PA14_00210 PA14_00230     FALSE 0.218 135.000 0.043 1.000   NA
 2194592 2194593 PA14_00230 PA14_00240     FALSE 0.482 41.000 0.023 NA N NA
 2194595 2194596 PA14_00280 PA14_00290 hemF aroE TRUE 0.577 58.000 0.093 1.000 N NA
 2194596 2194597 PA14_00290 PA14_00300 aroE plcB FALSE 0.101 111.000 0.000 1.000   NA
 2194597 2194598 PA14_00300 PA14_00310 plcB   TRUE 0.756 -19.000 0.000 1.000   NA
 2194598 2194599 PA14_00310 PA14_00320     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2194600 2194601 PA14_00340 PA14_00360     TRUE 0.984 5.000 0.259 0.080 N NA
 2194601 2194602 PA14_00360 PA14_00380   betC TRUE 0.912 17.000 0.218 1.000 N NA
 2194603 2194604 PA14_00400 PA14_00410     TRUE 0.886 11.000 0.079 NA N NA
 2194605 2194606 PA14_00420 PA14_00430     TRUE 0.955 8.000 0.000 NA Y NA
 2194606 2194607 PA14_00430 PA14_00440   trpA FALSE 0.030 186.000 0.000 1.000 N NA
 2194607 2194608 PA14_00440 PA14_00450 trpA trpB TRUE 0.999 -3.000 0.344 0.000 Y NA
 2194609 2194610 PA14_00460 PA14_00470 trpI   FALSE 0.106 101.000 0.000 NA   NA
 2194610 2194611 PA14_00470 PA14_00480     FALSE 0.127 184.000 0.049 NA   NA
 2194611 2194612 PA14_00480 PA14_00490     FALSE 0.012 296.000 0.000 NA   NA
 2194612 2194613 PA14_00490 PA14_00510     FALSE 0.092 113.000 0.000 NA   NA
 2194613 2194614 PA14_00510 PA14_00520     FALSE 0.003 1312.000 0.000 NA   NA
 2194614 2194615 PA14_00520 PA14_00530     FALSE 0.027 210.000 0.000 NA   NA
 2194617 2194618 PA14_00560 PA14_00570 exoT   FALSE 0.004 542.000 0.000 1.000 N NA
 2194618 2194619 PA14_00570 PA14_00580     TRUE 0.947 31.000 0.625 NA   NA
 2194619 2194620 PA14_00580 PA14_00590     TRUE 0.690 153.000 0.740 NA   NA
 2194621 2194622 PA14_00600 PA14_00620     FALSE 0.013 282.000 0.000 NA   NA
 2194623 2194624 PA14_00630 PA14_00640   phzH FALSE 0.004 824.000 0.000 NA   NA
 2194625 2194626 PA14_00650 PA14_00660     FALSE 0.028 209.000 0.000 NA   NA
 2194626 2194627 PA14_00660 PA14_00670     FALSE 0.320 39.000 0.000 NA   NA
 2194627 2194628 PA14_00670 PA14_00680     FALSE 0.186 66.000 0.000 NA   NA
 2194629 2194630 PA14_00690 PA14_00700     TRUE 0.654 63.000 0.157 1.000   NA
 2194630 2194631 PA14_00700 PA14_00710   osmC TRUE 0.633 84.000 0.000 1.000 Y NA
 2194631 2194632 PA14_00710 PA14_00720 osmC   FALSE 0.213 111.000 0.026 NA   NA
 2194633 2194634 PA14_00730 PA14_00740     FALSE 0.219 57.000 0.000 NA   NA
 2194636 2194637 PA14_00760 PA14_00770     TRUE 0.551 33.000 0.009 1.000   NA
 2194637 2194638 PA14_00770 PA14_00780     TRUE 0.898 -7.000 0.016 1.000   NA
 2194639 2194640 PA14_00790 PA14_00800 prlC   TRUE 0.977 -3.000 0.173 NA   NA
 2194640 2194641 PA14_00800 PA14_00810     FALSE 0.227 89.000 0.006 NA   NA
 2194642 2194643 PA14_00820 PA14_00830     TRUE 0.894 62.000 0.714 NA   NA
 2194643 2194644 PA14_00830 PA14_00850     TRUE 0.966 -7.000 0.161 NA   NA
 2194644 2194645 PA14_00850 PA14_00860     TRUE 0.992 0.000 0.710 NA N NA
 2194645 2194646 PA14_00860 PA14_00875   ppkA TRUE 0.988 -3.000 0.160 0.100 N NA
 2194646 2194647 PA14_00875 PA14_00890 ppkA   TRUE 0.997 8.000 1.000 1.000 Y NA
 2194647 2194648 PA14_00890 PA14_00900     TRUE 0.928 10.000 0.128 NA   NA
 2194648 2194649 PA14_00900 PA14_00910     TRUE 0.971 -3.000 0.128 NA   NA
 2194649 2194650 PA14_00910 PA14_00925     FALSE 0.451 222.000 0.714 NA   NA
 2194650 2194651 PA14_00925 PA14_00940     TRUE 0.987 7.000 0.714 NA   NA
 2194651 2194652 PA14_00940 PA14_00960     TRUE 0.979 16.000 0.833 NA   NA
 2194652 2194653 PA14_00960 PA14_00970     TRUE 0.940 45.000 0.833 NA   NA
 2194653 2194654 PA14_00970 PA14_00980     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2194655 2194656 PA14_00990 PA14_01010     TRUE 0.597 89.000 0.209 NA   NA
 2194656 2194657 PA14_01010 PA14_01020     TRUE 0.974 13.000 0.588 NA   NA
 2194657 2194658 PA14_01020 PA14_01030     TRUE 0.726 76.000 0.294 NA   NA
 2194658 2194659 PA14_01030 PA14_01040     FALSE 0.241 168.000 0.125 NA   NA
 2194659 2194660 PA14_01040 PA14_01060     TRUE 0.979 2.000 0.311 NA   NA
 2194660 2194661 PA14_01060 PA14_01070     TRUE 0.969 -3.000 0.111 NA   NA
 2194661 2194662 PA14_01070 PA14_01080     TRUE 0.983 -36.000 0.500 NA   NA
 2194662 2194663 PA14_01080 PA14_01100     TRUE 0.983 -7.000 0.333 NA   NA
 2194663 2194664 PA14_01100 PA14_01110     TRUE 0.720 47.000 0.143 NA   NA
 2194665 2194666 PA14_01120 PA14_01130     TRUE 0.590 13.000 0.000 NA   NA
 2194666 2194667 PA14_01130 PA14_01140     TRUE 0.767 -10.000 0.000 NA   NA
 2194667 2194668 PA14_01140 PA14_01150     FALSE 0.161 79.000 0.000 NA   NA
 2194669 2194670 PA14_01160 PA14_01170     TRUE 0.842 28.000 0.160 NA   NA
 2194670 2194671 PA14_01170 PA14_01180     TRUE 0.950 -70.000 0.160 NA   NA
 2194671 2194672 PA14_01180 PA14_01190     TRUE 0.979 -3.000 0.200 NA   NA
 2194672 2194673 PA14_01190 PA14_01200     TRUE 0.973 0.000 0.200 NA   NA
 2194673 2194674 PA14_01200 PA14_01220     TRUE 0.642 11.000 0.000 NA   NA
 2194674 2194675 PA14_01220 PA14_01230     TRUE 0.664 10.000 0.000 NA   NA
 2194675 2194676 PA14_01230 PA14_01240     FALSE 0.008 376.000 0.000 1.000   NA
 2194676 2194677 PA14_01240 PA14_01250     TRUE 0.533 211.000 0.241 1.000 Y NA
 2194677 2194678 PA14_01250 PA14_01270     FALSE 0.253 137.000 0.069 NA   NA
 2194678 2194679 PA14_01270 PA14_01290   coxB FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 2194679 2194680 PA14_01290 PA14_01300 coxB coxA TRUE 0.998 10.000 0.741 0.003 Y NA
 2194680 2194681 PA14_01300 PA14_01310 coxA   TRUE 0.953 11.000 0.268 1.000 N NA
 2194681 2194682 PA14_01310 PA14_01320   coIII TRUE 0.976 11.000 0.536 1.000 N NA
 2194684 2194685 PA14_01340 PA14_01350     TRUE 0.989 -25.000 0.722 NA   NA
 2194685 2194686 PA14_01350 PA14_01360     TRUE 0.731 65.000 0.255 NA   NA
 2194686 2194687 PA14_01360 PA14_01380     TRUE 0.976 26.000 0.321 1.000 Y NA
 2194687 2194688 PA14_01380 PA14_01390     TRUE 0.814 26.000 0.099 1.000   NA
 2194690 2194691 PA14_01410 PA14_01430     FALSE 0.101 256.000 0.128 NA   NA
 2194691 2194692 PA14_01430 PA14_01440     TRUE 0.938 25.000 0.429 1.000   NA
 2194692 2194693 PA14_01440 PA14_01460     FALSE 0.018 230.000 0.000 1.000 N NA
 2194693 2194694 PA14_01460 PA14_01470     TRUE 0.650 49.000 0.102 1.000 N NA
 2194694 2194695 PA14_01470 PA14_01480     TRUE 0.793 101.000 0.000 0.003 Y NA
 2194695 2194696 PA14_01480 PA14_01490     FALSE 0.044 180.000 0.000 1.000   NA
 2194697 2194698 PA14_01500 PA14_01510     FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 2194698 2194699 PA14_01510 PA14_01520     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2194699 2194700 PA14_01520 PA14_01540     FALSE 0.043 176.000 0.000 NA   NA
 2194701 2194702 PA14_01550 PA14_01560     FALSE 0.185 72.000 0.000 1.000   NA
 2194703 2194704 PA14_01580 PA14_01600 gabP   FALSE 0.038 169.000 0.000 1.000 N NA
 2194704 2194705 PA14_01600 PA14_01610     FALSE 0.416 84.000 0.059 NA   NA
 2194705 2194706 PA14_01610 PA14_01620   aptA TRUE 0.942 0.000 0.059 NA   NA
 2194709 2194710 PA14_01670 PA14_01680     TRUE 0.991 0.000 0.590 1.000   NA
 2194710 2194711 PA14_01680 PA14_01690     TRUE 0.936 23.000 0.154 0.079   NA
 2194711 2194712 PA14_01690 PA14_01710   ahpC FALSE 0.100 112.000 0.000 1.000   NA
 2194712 2194713 PA14_01710 PA14_01720 ahpC ahpF TRUE 0.857 145.000 0.551 1.000 Y NA
 2194715 2194716 PA14_01750 PA14_01760   nuh FALSE 0.321 170.000 0.000 1.000 Y NA
 2194717 2194718 PA14_01770 PA14_01780     FALSE 0.279 35.000 0.000 NA N NA
 2194718 2194719 PA14_01780 PA14_01790     FALSE 0.394 150.000 0.000 NA Y NA
 2194720 2194721 PA14_01800 PA14_01810     TRUE 0.551 73.000 0.106 1.000   NA
 2194721 2194722 PA14_01810 PA14_01830     FALSE 0.232 105.000 0.025 1.000   NA
 2194722 2194723 PA14_01830 PA14_01840     FALSE 0.026 197.000 0.000 1.000 N NA
 2194723 2194724 PA14_01840 PA14_01860     TRUE 0.992 -3.000 0.588 NA N NA
 2194724 2194725 PA14_01860 PA14_01870     TRUE 0.608 148.000 0.085 NA Y NA
 2194725 2194726 PA14_01870 PA14_01890   pcaQ FALSE 0.006 378.000 0.000 1.000 N NA
 2194726 2194727 PA14_01890 PA14_01900 pcaQ pcaH TRUE 0.677 135.000 0.153 0.001 N NA
 2194727 2194728 PA14_01900 PA14_01910 pcaH pcaG TRUE 0.999 11.000 0.782 0.000 Y NA
 2194728 2194729 PA14_01910 PA14_01930 pcaG pcaR FALSE 0.021 216.000 0.000 1.000 N NA
 2194729 2194730 PA14_01930 PA14_01940 pcaR   FALSE 0.048 153.000 0.000 1.000 N NA
 2194730 2194731 PA14_01940 PA14_01960     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.015 Y NA
 2194731 2194732 PA14_01960 PA14_01970     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 2194732 2194733 PA14_01970 PA14_01980     FALSE 0.023 199.000 0.000 NA N NA
 2194733 2194734 PA14_01980 PA14_01990     FALSE 0.088 116.000 0.000 NA   NA
 2194734 2194735 PA14_01990 PA14_02010     FALSE 0.013 280.000 0.000 NA   NA
 2194735 2194736 PA14_02010 PA14_02020     FALSE 0.057 155.000 0.000 NA   NA
 2194738 2194739 PA14_02050 PA14_02060     FALSE 0.003 672.000 0.000 1.000 N NA
 2194739 2194740 PA14_02060 PA14_02070     FALSE 0.016 242.000 0.000 1.000 N NA
 2194740 2194741 PA14_02070 PA14_02090     TRUE 0.585 93.000 0.240 1.000 N NA
 2194741 2194742 PA14_02090 PA14_02100     TRUE 0.857 6.000 0.019 1.000   NA
 2194743 2194744 PA14_02110 PA14_02130     FALSE 0.282 127.000 0.073 NA   NA
 2194744 2194745 PA14_02130 PA14_02140     TRUE 0.970 27.000 0.911 NA   NA
 2194745 2194746 PA14_02140 PA14_02150     TRUE 0.934 9.000 0.133 NA   NA
 2194746 2194747 PA14_02150 PA14_02180   cheB FALSE 0.136 263.000 0.000 1.000 Y NA
 2194747 2194748 PA14_02180 PA14_02190 cheB   TRUE 0.954 20.000 0.078 1.000 Y NA
 2194748 2194749 PA14_02190 PA14_02200     TRUE 0.980 6.000 0.067 1.000 Y NA
 2194749 2194750 PA14_02200 PA14_02220     TRUE 0.936 70.000 0.444 1.000 Y NA
 2194750 2194751 PA14_02220 PA14_02230   cheW TRUE 0.938 36.000 0.000 0.012 Y NA
 2194751 2194752 PA14_02230 PA14_02250 cheW cheA TRUE 0.995 -13.000 0.105 0.012 Y NA
 2194752 2194753 PA14_02250 PA14_02260 cheA   TRUE 0.980 28.000 0.444 1.000 Y NA
 2194753 2194754 PA14_02260 PA14_02270     FALSE 0.429 198.000 0.082 1.000 Y NA
 2194754 2194755 PA14_02270 PA14_02290     FALSE 0.025 191.000 0.000 NA N NA
 2194757 2194758 PA14_02310 PA14_02330 atsA   TRUE 0.933 88.000 0.571 1.000 Y NA
 2194758 2194759 PA14_02330 PA14_02340     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 2194764 2194765 PA14_02410 PA14_02420     FALSE 0.262 41.000 0.000 1.000 N NA
 2194765 2194766 PA14_02420 PA14_02435     TRUE 0.830 68.000 0.000 0.076 Y NA
 2194766 2194767 PA14_02435 PA14_02450     FALSE 0.018 647.000 0.000 0.076 N NA
 2194767 2194768 PA14_02450 PA14_02460     TRUE 0.963 76.000 0.829 0.001   NA
 2194768 2194769 PA14_02460 PA14_02470   pntB TRUE 0.991 0.000 0.144 0.001   NA
 2194769 2194770 PA14_02470 PA14_02490 pntB tonB2 FALSE 0.007 344.000 0.000 1.000 N NA
 2194770 2194771 PA14_02490 PA14_02500 tonB2 exbB1 TRUE 0.983 29.000 0.778 0.017 N NA
 2194771 2194772 PA14_02500 PA14_02510 exbB1 exbD1 TRUE 0.999 2.000 0.778 0.096 Y NA
 2194774 2194775 PA14_02530 PA14_02550   mdcA FALSE 0.093 111.000 0.000 NA   NA
 2194775 2194776 PA14_02550 PA14_02560 mdcA   TRUE 0.989 0.000 0.508 1.000   NA
 2194776 2194777 PA14_02560 PA14_02570   mdcC TRUE 0.986 2.000 0.475 NA   NA
 2194777 2194778 PA14_02570 PA14_02580 mdcC mdcD TRUE 0.985 -7.000 0.400 NA   NA
 2194778 2194779 PA14_02580 PA14_02590 mdcD mdcE TRUE 0.994 -3.000 0.700 NA   NA
 2194779 2194780 PA14_02590 PA14_02610 mdcE   TRUE 0.948 16.000 0.339 NA   NA
 2194780 2194781 PA14_02610 PA14_02620     TRUE 0.994 -3.000 0.651 1.000   NA
 2194781 2194782 PA14_02620 PA14_02630     TRUE 0.726 57.000 0.200 1.000   NA
 2194782 2194783 PA14_02630 PA14_02640     TRUE 0.991 6.000 0.945 NA   NA
 2194784 2194785 PA14_02650 PA14_02660     FALSE 0.083 329.000 0.000 NA Y NA
 2194786 2194787 PA14_02680 PA14_02690     TRUE 0.611 58.000 0.118 1.000 N NA
 2194787 2194788 PA14_02690 PA14_02700     TRUE 0.842 31.000 0.200 1.000 N NA
 2194788 2194789 PA14_02700 PA14_02720     FALSE 0.041 164.000 0.000 1.000 N NA
 2194790 2194791 PA14_02730 PA14_02740     TRUE 0.787 60.000 0.333 1.000 N NA
 2194792 2194793 PA14_02750 PA14_02760     FALSE 0.050 151.000 0.000 1.000 N NA
 2194793 2194794 PA14_02760 PA14_02770     TRUE 1.000 -3.000 0.739 0.000 Y NA
 2194794 2194795 PA14_02770 PA14_02790   pcaF TRUE 0.997 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 2194795 2194796 PA14_02790 PA14_02810 pcaF pcaT FALSE 0.189 150.000 0.051 1.000 N NA
 2194796 2194797 PA14_02810 PA14_02830 pcaT pcaB TRUE 0.722 23.000 0.042 1.000 N NA
 2194797 2194798 PA14_02830 PA14_02840 pcaB pcaD TRUE 0.844 15.000 0.063 1.000   NA
 2194798 2194799 PA14_02840 PA14_02850 pcaD pcaC TRUE 0.938 11.000 0.174 1.000   NA
 2194799 2194800 PA14_02850 PA14_02870 pcaC   FALSE 0.077 128.000 0.000 NA   NA
 2194800 2194801 PA14_02870 PA14_02890     FALSE 0.220 191.000 0.167 NA   NA
 2194803 2194804 PA14_02910 PA14_02930     FALSE 0.170 244.000 0.222 1.000   NA
 2194804 2194805 PA14_02930 PA14_02960     TRUE 0.853 23.000 0.143 NA   NA
 2194805 2194806 PA14_02960 PA14_02970     FALSE 0.215 150.000 0.057 NA   NA
 2194807 2194808 PA14_02980 PA14_02990     TRUE 0.520 66.000 0.000 0.087   NA
 2194809 2194810 PA14_03000 PA14_03010     FALSE 0.448 93.000 0.122 1.000 N NA
 2194811 2194812 PA14_03020 PA14_03030   aroQ2 TRUE 0.998 -3.000 0.583 1.000 Y NA
 2194812 2194813 PA14_03030 PA14_03040 aroQ2   FALSE 0.071 117.000 0.000 1.000 N NA
 2194813 2194814 PA14_03040 PA14_03050   pobA FALSE 0.102 175.000 0.029 1.000 N NA
 2194816 2194817 PA14_03080 PA14_03090     FALSE 0.481 78.000 0.000 0.087   NA
 2194817 2194818 PA14_03090 PA14_03100     FALSE 0.050 165.000 0.000 NA   NA
 2194818 2194819 PA14_03100 PA14_03110     FALSE 0.015 268.000 0.000 NA   NA
 2194819 2194820 PA14_03110 PA14_03120     FALSE 0.125 92.000 0.000 NA   NA
 2194820 2194821 PA14_03120 PA14_03130     FALSE 0.240 41.000 0.000 NA N NA
 2194821 2194822 PA14_03130 PA14_03150     FALSE 0.073 134.000 0.000 NA   NA
 2194822 2194823 PA14_03150 PA14_03160     FALSE 0.051 164.000 0.000 NA   NA
 2194824 2194825 PA14_03163 PA14_03166     TRUE 0.985 0.000 0.364 NA   NA
 2194826 2194827 PA14_03170 PA14_03180     TRUE 0.779 33.000 0.000 0.054   NA
 2194827 2194828 PA14_03180 PA14_03190     FALSE 0.083 120.000 0.000 NA   NA
 2194828 2194829 PA14_03190 PA14_03200     FALSE 0.063 150.000 0.000 NA   NA
 2194829 2194830 PA14_03200 PA14_03210     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2194830 2194831 PA14_03210 PA14_03220     TRUE 0.735 4.000 0.000 NA   NA
 2194831 2194832 PA14_03220 PA14_03240   hcpC FALSE 0.039 182.000 0.000 NA   NA
 2194833 2194834 PA14_03250 PA14_03265     TRUE 0.944 3.000 0.098 NA   NA
 2194834 2194835 PA14_03265 PA14_03270     TRUE 0.536 165.000 0.500 NA   NA
 2194835 2194836 PA14_03270 PA14_03285     TRUE 0.928 -16.000 0.068 NA   NA
 2194836 2194837 PA14_03285 PA14_03290     FALSE 0.031 200.000 0.000 NA   NA
 2194837 2194838 PA14_03290 PA14_03300     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.053 Y NA
 2194838 2194839 PA14_03300 PA14_03310     FALSE 0.003 616.000 0.000 1.000 N NA
 2194840 2194841 PA14_03320 PA14_03330     TRUE 0.707 6.000 0.000 NA   NA
 2194841 2194842 PA14_03330 PA14_03340     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2194842 2194843 PA14_03340 PA14_03350     FALSE 0.008 351.000 0.000 NA   NA
 2194843 2194844 PA14_03350 PA14_03360     TRUE 0.790 -7.000 0.000 NA   NA
 2194844 2194845 PA14_03360 PA14_03370     FALSE 0.010 319.000 0.000 NA   NA
 2194847 2194848 PA14_03390 PA14_03400     TRUE 0.973 -7.000 0.211 NA   NA
 2194848 1543224 PA14_03400 PA14_03410     FALSE 0.005 462.000 0.000 NA   NA
 1543224 2194849 PA14_03410 PA14_03420     FALSE 0.036 188.000 0.000 NA   NA
 2194850 2194851 PA14_03430 PA14_03450 gabD gabT FALSE 0.199 245.000 0.303 1.000 N NA
 2194851 2194852 PA14_03450 PA14_03470 gabT   FALSE 0.071 326.000 0.182 1.000 N NA
 2194854 2194855 PA14_03490 PA14_03510     TRUE 0.614 12.000 0.000 NA   NA
 2194855 2194856 PA14_03510 PA14_03520     FALSE 0.359 34.000 0.000 NA   NA
 2194857 2194858 PA14_03530 PA14_03550     TRUE 0.865 50.000 0.444 1.000 N NA
 2194858 2194859 PA14_03550 PA14_03560     FALSE 0.052 163.000 0.000 NA   NA
 2194859 2194860 PA14_03560 PA14_03580     FALSE 0.095 109.000 0.000 NA   NA
 2194862 2194863 PA14_03610 PA14_03620     FALSE 0.049 172.000 0.000 1.000   NA
 2194865 2194866 PA14_03650 PA14_03670 cysA cysW TRUE 0.996 4.000 0.587 1.000 Y NA
 2194866 2194867 PA14_03670 PA14_03680 cysW cysT TRUE 0.996 11.000 0.935 0.000 N NA
 2194867 2194868 PA14_03680 PA14_03700 cysT sbp FALSE 0.488 162.000 0.066 0.002 N NA
 2194868 2194869 PA14_03700 PA14_03710 sbp   FALSE 0.276 177.000 0.188 NA   NA
 2194869 2194870 PA14_03710 PA14_03720     FALSE 0.184 164.000 0.062 NA   NA
 2194871 2194872 PA14_03730 PA14_03760     FALSE 0.018 229.000 0.000 1.000 N NA
 2194872 2194873 PA14_03760 PA14_03770   speB1 TRUE 0.869 56.000 0.087 1.000 Y NA
 2194873 2194874 PA14_03770 PA14_03780 speB1   FALSE 0.203 53.000 0.000 1.000 N NA
 2194874 2194875 PA14_03780 PA14_03790     FALSE 0.075 113.000 0.000 1.000 N NA
 2194875 2194876 PA14_03790 PA14_03800   oprE FALSE 0.005 614.000 0.000 1.000   NA
 2194877 2194878 PA14_03810 PA14_03830 aguA aguB FALSE 0.465 86.000 0.084 1.000   NA
 2194878 2194879 PA14_03830 PA14_03840 aguB aguR FALSE 0.143 163.000 0.032 1.000   NA
 2194879 2194880 PA14_03840 PA14_03855 aguR   TRUE 0.566 63.000 0.105 1.000 N NA
 2194880 2194881 PA14_03855 PA14_03860     FALSE 0.145 256.000 0.000 1.000 Y NA
 2194882 2194883 PA14_03870 PA14_03880 spuA spuB TRUE 0.794 41.000 0.182 1.000   NA
 2194883 2194884 PA14_03880 PA14_03900 spuB spuC TRUE 0.697 66.000 0.239 1.000 N NA
 2194884 2194885 PA14_03900 PA14_03920 spuC spuD FALSE 0.072 116.000 0.000 1.000 N NA
 2194885 2194886 PA14_03920 PA14_03930 spuD spuE FALSE 0.142 419.000 0.000 0.023 Y NA
 2194886 2194887 PA14_03930 PA14_03940 spuE spuF TRUE 0.746 55.000 0.000 1.000 Y NA
 2194887 2194888 PA14_03940 PA14_03950 spuF spuG TRUE 0.878 27.000 0.000 1.000 Y NA
 2194888 2194889 PA14_03950 PA14_03960 spuG spuH TRUE 0.798 83.000 0.000 0.078 Y NA
 2194892 2194893 PA14_04010 PA14_04020     FALSE 0.100 105.000 0.000 NA   NA
 2194899 2194900 PA14_04080 PA14_04090     TRUE 0.976 72.000 0.625 0.078 Y NA
 2194903 2194904 PA14_04140 PA14_04150     FALSE 0.377 92.000 0.071 1.000 N NA
 2194904 2194905 PA14_04150 PA14_04160     FALSE 0.290 99.000 0.041 NA   NA
 2194905 2194906 PA14_04160 PA14_04180     TRUE 0.577 84.000 0.167 NA   NA
 2194907 2194908 PA14_04190 PA14_04210     FALSE 0.455 16.000 0.000 NA N NA
 2194908 2194909 PA14_04210 PA14_04220     FALSE 0.057 421.000 0.000 1.000 Y NA
 2194909 2194910 PA14_04220 PA14_04230     TRUE 0.991 48.000 1.000 0.078 Y NA
 2194910 2194911 PA14_04230 PA14_04240     TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.078 Y NA
 2194911 2194912 PA14_04240 PA14_04250     TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 2194914 2194915 PA14_04290 PA14_04300     FALSE 0.011 301.000 0.000 NA   NA
 2194915 2194916 PA14_04300 PA14_04310   rpiA FALSE 0.080 123.000 0.000 NA   NA
 2194917 2194918 PA14_04320 PA14_04330 ilvA1   FALSE 0.217 120.000 0.034 NA   NA
 2194918 2194919 PA14_04330 PA14_04340     TRUE 0.680 51.000 0.125 NA   NA
 2194919 2194920 PA14_04340 PA14_04350     TRUE 0.985 -3.000 0.286 NA   NA
 2194921 2194922 PA14_04370 PA14_04380     FALSE 0.475 50.000 0.032 1.000 N NA
 2194923 2194924 PA14_04390 PA14_04410 ygdP ptsP TRUE 0.810 23.000 0.097 1.000 N NA
 2194924 2194925 PA14_04410 PA14_04420 ptsP   TRUE 0.882 26.000 0.000 1.000 Y NA
 2194927 2194928 PA14_04440 PA14_04460   lgt TRUE 0.854 10.000 0.030 1.000   NA
 2194928 2194929 PA14_04460 PA14_04480 lgt thyA FALSE 0.178 206.000 0.164 1.000 N NA
 2194930 2194931 PA14_04490 PA14_04510     FALSE 0.351 35.000 0.000 NA   NA
 2194931 2194932 PA14_04510 PA14_04520     TRUE 0.994 -7.000 0.904 NA   NA
 2194935 2194936 PA14_04560 PA14_04570     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2194936 2194937 PA14_04570 PA14_04580   folA FALSE 0.173 71.000 0.000 NA   NA
 2194938 2194939 PA14_04590 PA14_04610     FALSE 0.076 139.000 0.000 1.000   NA
 2194939 2194940 PA14_04610 PA14_04630   ilvD FALSE 0.018 230.000 0.000 1.000 N NA
 2194940 2194941 PA14_04630 PA14_04640 ilvD   FALSE 0.010 328.000 0.000 1.000   NA
 2194941 2194942 PA14_04640 PA14_04650   pfpI FALSE 0.380 73.000 0.031 1.000   NA
 2194943 2194944 PA14_04660 PA14_04670   mutM FALSE 0.328 59.000 0.015 NA N NA
 2194944 2194945 PA14_04670 PA14_04680 mutM   FALSE 0.236 77.000 0.003 1.000 N NA
 2194945 2194946 PA14_04680 PA14_04690     FALSE 0.152 83.000 0.000 NA   NA
 2194946 2194947 PA14_04690 PA14_04700     FALSE 0.014 270.000 0.000 NA   NA
 2194948 2194949 PA14_04710 PA14_04730     FALSE 0.061 152.000 0.000 NA   NA
 2194949 2194950 PA14_04730 PA14_04750   fdx1 FALSE 0.293 128.000 0.076 1.000   NA
 2194950 2194951 PA14_04750 PA14_04760 fdx1 coaD FALSE 0.326 121.000 0.088 1.000   NA
 2194951 2194952 PA14_04760 PA14_04780 coaD   FALSE 0.111 149.000 0.011 1.000 N NA
 2194952 2194953 PA14_04780 PA14_04790     TRUE 0.926 56.000 0.886 NA   NA
 2194953 2194954 PA14_04790 PA14_04810     TRUE 0.805 55.000 0.308 NA   NA
 2194956 2194957 PA14_04830 PA14_04840     FALSE 0.196 63.000 0.000 NA   NA
 2194957 2194958 PA14_04840 PA14_04850     FALSE 0.335 37.000 0.000 NA   NA
 2194958 2194959 PA14_04850 PA14_04860     FALSE 0.013 279.000 0.000 NA   NA
 2194959 2194960 PA14_04860 PA14_04870     TRUE 0.949 0.000 0.070 1.000   NA
 2194960 2194961 PA14_04870 PA14_04890     TRUE 0.997 -7.000 0.598 0.006   NA
 2194962 2194963 PA14_04900 PA14_04910 ftsY ftsE TRUE 0.985 -3.000 0.117 0.098 N NA
 2194963 2194964 PA14_04910 PA14_04920 ftsE ftsX TRUE 0.985 0.000 0.035 NA Y NA
 2194964 2194965 PA14_04920 PA14_04930 ftsX rpoH FALSE 0.253 114.000 0.054 NA N NA
 2194965 2194966 PA14_04930 PA14_04940 rpoH   FALSE 0.305 65.000 0.005 NA   NA
 2194968 2194969 PA14_04960 PA14_04970     FALSE 0.317 103.000 0.058 NA   NA
 2194969 2194970 PA14_04970 PA14_04980   thiG TRUE 0.881 59.000 0.130 1.000 Y NA
 2194970 2194971 PA14_04980 PA14_05000 thiG micA FALSE 0.209 154.000 0.060 1.000   NA
 2194971 2194972 PA14_05000 PA14_05010 micA   FALSE 0.091 163.000 0.004 NA   NA
 2194973 2194974 PA14_05020 PA14_05030     FALSE 0.200 62.000 0.000 NA   NA
 2194974 2194975 PA14_05030 PA14_05040     FALSE 0.275 81.000 0.011 NA   NA
 2194975 2194976 PA14_05040 PA14_05050     FALSE 0.457 121.000 0.218 1.000 N NA
 2194976 2194977 PA14_05050 PA14_05060     TRUE 0.952 -3.000 0.050 NA   NA
 2194977 2194978 PA14_05060 PA14_05070     FALSE 0.310 132.000 0.100 NA   NA
 2194978 2194979 PA14_05070 PA14_05080   metX TRUE 0.981 8.000 0.509 NA   NA
 2194979 2194980 PA14_05080 PA14_05110 metX   FALSE 0.302 89.000 0.027 1.000   NA
 2194980 2194981 PA14_05110 PA14_05120     FALSE 0.175 108.000 0.010 NA   NA
 2194981 2194982 PA14_05120 PA14_05130     FALSE 0.468 123.000 0.220 NA   NA
 2194982 2194983 PA14_05130 PA14_05150   proC TRUE 0.929 11.000 0.152 NA   NA
 2194983 2194984 PA14_05150 PA14_05160 proC   TRUE 0.923 12.000 0.158 NA   NA
 2194985 2194986 PA14_05180 PA14_05190 pilT pilU TRUE 0.876 178.000 0.436 0.017 Y NA
 2194988 2194989 PA14_05210 PA14_05220     FALSE 0.019 243.000 0.000 NA   NA
 2194989 2194990 PA14_05220 PA14_05230     TRUE 0.997 -3.000 0.133 0.019 Y NA
 2194991 2194992 PA14_05250 PA14_05260   pyrB TRUE 0.997 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 2194992 2194993 PA14_05260 PA14_05270 pyrB pyrR TRUE 0.971 24.000 0.247 1.000 Y NA
 2194993 2194994 PA14_05270 PA14_05280 pyrR yqgF FALSE 0.356 112.000 0.109 1.000 N NA
 2194994 2194995 PA14_05280 PA14_05290 yqgF   TRUE 0.978 0.000 0.263 NA N NA
 2194995 2194996 PA14_05290 PA14_05300     TRUE 0.571 49.000 0.064 NA N NA
 2194996 2194997 PA14_05300 PA14_05310   gshB FALSE 0.472 81.000 0.089 1.000 N NA
 2194998 2194999 PA14_05320 PA14_05330 pilG pilH TRUE 0.977 47.000 0.296 0.022 Y NA
 2194999 2195000 PA14_05330 PA14_05340 pilH pilI TRUE 0.937 51.000 0.266 1.000 Y NA
 2195000 2195001 PA14_05340 PA14_05360 pilI pilJ TRUE 0.981 85.000 0.795 0.012 Y NA
 2195001 2195002 PA14_05360 PA14_05380 pilJ pilK TRUE 0.913 61.000 0.241 1.000 Y NA
 2195002 2195003 PA14_05380 PA14_05390 pilK chpA TRUE 0.984 12.000 0.217 1.000 Y NA
 2195003 2195004 PA14_05390 PA14_05400 chpA   TRUE 0.997 -7.000 0.217 0.012 Y NA
 2195004 2195005 PA14_05400 PA14_05410     TRUE 0.997 -3.000 0.517 0.012   NA
 2195005 2195006 PA14_05410 PA14_05420     TRUE 0.928 8.000 0.000 0.063   NA
 2195006 2195007 PA14_05420 PA14_05430     FALSE 0.443 77.000 0.067 1.000 N NA
 2195008 2195009 PA14_05440 PA14_05450     FALSE 0.351 35.000 0.000 NA   NA
 2195009 2195010 PA14_05450 PA14_05460   bioA FALSE 0.318 93.000 0.041 NA   NA
 2195011 2195012 PA14_05480 PA14_05500     FALSE 0.252 181.000 0.032 0.074 N NA
 2195012 2195013 PA14_05500 PA14_05510     TRUE 0.981 12.000 0.676 NA   NA
 2195015 2195016 PA14_05530 PA14_05540 mexA mexB TRUE 0.965 16.000 0.565 1.000 N NA
 2195016 2195017 PA14_05540 PA14_05550 mexB oprM TRUE 0.994 2.000 0.538 0.078 N NA
 2195018 2195019 PA14_05560 PA14_05580     FALSE 0.018 251.000 0.000 NA   NA
 2195019 2195020 PA14_05580 PA14_05590   metF FALSE 0.300 70.000 0.010 NA   NA
 2195020 2195021 PA14_05590 PA14_05600 metF   FALSE 0.292 43.000 0.000 NA   NA
 2195021 2195022 PA14_05600 PA14_05620   sahH FALSE 0.307 41.000 0.000 NA   NA
 2195023 2195024 PA14_05630 PA14_05640     FALSE 0.078 126.000 0.000 NA   NA
 2195024 2195025 PA14_05640 PA14_05650     TRUE 0.642 11.000 0.000 NA   NA
 2195025 2195026 PA14_05650 PA14_05660     FALSE 0.145 85.000 0.000 NA   NA
 2195027 2195028 PA14_05690 PA14_05700 codA codB TRUE 0.993 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 2195028 2195029 PA14_05700 PA14_05740 codB   FALSE 0.285 182.000 0.000 1.000 Y NA
 2195029 2195030 PA14_05740 PA14_05750     TRUE 0.995 -3.000 0.301 0.013 N NA
 2195030 2195031 PA14_05750 PA14_05770   dhT FALSE 0.293 95.000 0.043 1.000 N NA
 2195031 2195032 PA14_05770 PA14_05775 dhT   FALSE 0.097 107.000 0.000 NA   NA
 2195033 2195034 PA14_05790 PA14_05810   amaB TRUE 0.524 59.000 0.069 1.000 N NA
 2195035 2195036 PA14_05820 PA14_05840   gcdH FALSE 0.371 120.000 0.143 1.000 N NA
 2195037 2195038 PA14_05850 PA14_05860     FALSE 0.044 152.000 0.000 NA N NA
 2195040 2195041 PA14_05880 PA14_05890     TRUE 0.996 -3.000 0.330 NA Y NA
 2195041 2195042 PA14_05890 PA14_05910     FALSE 0.070 108.000 0.000 NA N NA
 2195043 2195044 PA14_05920 PA14_05950   dbpA FALSE 0.031 262.000 0.010 NA   NA
 2195045 2195046 PA14_05960 PA14_05970     FALSE 0.050 151.000 0.000 1.000 N NA
 2195048 2195049 PA14_06000 PA14_06010     FALSE 0.104 102.000 0.000 NA   NA
 2195051 2195052 PA14_06040 PA14_06060   creB FALSE 0.442 85.000 0.085 1.000 N NA
 2195052 2195053 PA14_06060 PA14_06070 creB creC TRUE 0.998 0.000 0.776 1.000 Y NA
 2195053 2195054 PA14_06070 PA14_06080 creC creD TRUE 0.598 102.000 0.311 NA N NA
 2195054 2195055 PA14_06080 PA14_06090 creD   FALSE 0.487 50.000 0.029 NA   NA
 2195056 2195057 PA14_06120 PA14_06130     FALSE 0.412 19.000 0.000 NA N NA
 2195059 2195060 PA14_06160 PA14_06170     TRUE 0.911 104.000 0.600 NA Y NA
 2195060 2195061 PA14_06170 PA14_06180     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 2195062 2195063 PA14_06190 PA14_06200     FALSE 0.050 140.000 0.000 NA N NA
 2195063 2195064 PA14_06200 PA14_06210     FALSE 0.255 50.000 0.000 NA   NA
 2195065 2195066 PA14_06230 PA14_06240     FALSE 0.007 348.000 0.000 1.000 N NA
 2195069 2195070 PA14_06270 PA14_06280     FALSE 0.292 43.000 0.000 NA   NA
 2195072 2195073 PA14_06300 PA14_06310     TRUE 0.858 32.000 0.048 0.085   NA
 2195074 2195075 PA14_06320 PA14_06330     FALSE 0.068 203.000 0.020 NA   NA
 2195075 2195076 PA14_06330 PA14_06340     FALSE 0.370 62.000 0.019 NA   NA
 2195076 2195077 PA14_06340 PA14_06350     FALSE 0.179 68.000 0.000 NA   NA
 2195077 2195078 PA14_06350 PA14_06360     FALSE 0.299 42.000 0.000 NA   NA
 2195078 2195079 PA14_06360 PA14_06390     FALSE 0.118 139.000 0.003 NA   NA
 2195079 2195080 PA14_06390 PA14_06400     FALSE 0.235 54.000 0.000 NA   NA
 2195081 2195082 PA14_06420 PA14_06430     TRUE 0.690 77.000 0.242 1.000   NA
 2195082 2195083 PA14_06430 PA14_06450     TRUE 0.932 11.000 0.154 1.000   NA
 2195083 2195084 PA14_06450 PA14_06460     TRUE 0.986 2.000 0.514 1.000 N NA
 2195084 2195085 PA14_06460 PA14_06480     TRUE 0.999 -10.000 0.886 0.004 Y NA
 2195085 2195086 PA14_06480 PA14_06500   bioB FALSE 0.003 601.000 0.000 1.000 N NA
 2195086 2195087 PA14_06500 PA14_06510 bioB bioF TRUE 0.919 106.000 0.168 0.001 Y NA
 2195087 2195088 PA14_06510 PA14_06530 bioF   TRUE 0.953 -7.000 0.092 NA   NA
 2195088 2195089 PA14_06530 PA14_06540     TRUE 0.967 -7.000 0.163 NA   NA
 2195089 2195090 PA14_06540 PA14_06570   bioD TRUE 0.981 4.000 0.063 0.001 N NA
 2195090 2195091 PA14_06570 PA14_06580 bioD   TRUE 0.536 109.000 0.244 NA   NA
 2195091 2195092 PA14_06580 PA14_06600     FALSE 0.009 341.000 0.000 NA   NA
 2195092 2195093 PA14_06600 PA14_06620     FALSE 0.450 213.000 0.000 0.008 Y NA
 2195093 2195094 PA14_06620 PA14_06640     TRUE 0.531 275.000 0.150 0.008 Y NA
 2195095 2195096 PA14_06650 PA14_06660 nirN nirE TRUE 0.953 -9.000 0.125 1.000 N NA
 2195096 2195097 PA14_06660 PA14_06670 nirE nirJ TRUE 0.948 11.000 0.217 1.000   NA
 2195097 2195098 PA14_06670 PA14_06680 nirJ nirH TRUE 0.986 -6.000 0.391 NA   NA
 2195098 2195099 PA14_06680 PA14_06690 nirH nirG TRUE 0.995 -25.000 0.483 NA Y NA
 2195099 2195100 PA14_06690 PA14_06700 nirG nirL TRUE 0.993 -7.000 0.241 NA Y NA
 2195100 2195101 PA14_06700 PA14_06710 nirL   TRUE 0.996 -3.000 0.333 NA Y NA
 2195101 2195102 PA14_06710 PA14_06720   nirF TRUE 0.908 9.000 0.070 1.000   NA
 2195102 2195103 PA14_06720 PA14_06730 nirF nirC TRUE 0.992 -3.000 0.186 0.015   NA
 2195103 2195104 PA14_06730 PA14_06740 nirC nirM TRUE 0.996 -3.000 0.062 0.015 Y NA
 2195104 2195105 PA14_06740 PA14_06750 nirM nirS TRUE 0.953 51.000 0.094 0.015 Y NA
 2195106 2195107 PA14_06770 PA14_06790 nirQ   TRUE 0.919 35.000 0.071 0.001   NA
 2195107 2195108 PA14_06790 PA14_06800     TRUE 0.988 8.000 0.750 NA   NA
 2195108 2195109 PA14_06800 PA14_06810   norC FALSE 0.130 90.000 0.000 NA   NA
 2195109 2195110 PA14_06810 PA14_06830 norC norB TRUE 0.998 0.000 0.794 0.001   NA
 2195110 2195111 PA14_06830 PA14_06840 norB   TRUE 0.997 2.000 0.118 0.001 Y NA
 2195112 2195113 PA14_06860 PA14_06870   dnr FALSE 0.148 84.000 0.000 NA   NA
 2195115 2195116 PA14_06890 PA14_06900     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2195116 2195117 PA14_06900 PA14_06920     TRUE 0.790 -7.000 0.000 NA   NA
 2195117 2195118 PA14_06920 PA14_06930     TRUE 0.910 0.000 0.029 1.000 N NA
 2195120 2195121 PA14_06950 PA14_06960     FALSE 0.007 339.000 0.000 1.000 N NA
 2195121 2195122 PA14_06960 PA14_06970     TRUE 0.910 18.000 0.226 1.000 N NA
 2195123 2195124 PA14_06980 PA14_06990     TRUE 0.855 4.000 0.013 NA   NA
 2195124 2195125 PA14_06990 PA14_07000   dsbB FALSE 0.137 88.000 0.000 NA   NA
 2195126 2195127 PA14_07010 PA14_07020     TRUE 0.717 70.000 0.267 NA   NA
 2195127 2195128 PA14_07020 PA14_07030     FALSE 0.329 114.000 0.080 NA   NA
 2195133 2195134 PA14_07090 PA14_07110 metK   TRUE 0.951 16.000 0.036 1.000 Y NA
 2195135 2195136 PA14_07130 PA14_07140 tktA   TRUE 0.800 0.000 0.000 NA   NA
 2195138 2195139 PA14_07170 PA14_07190 epd pgk TRUE 0.993 6.000 0.070 0.003 Y NA
 2195139 2195140 PA14_07190 PA14_07200 pgk   FALSE 0.269 73.000 0.003 NA   NA
 2195140 2195141 PA14_07200 PA14_07210     FALSE 0.411 160.000 0.273 NA   NA
 2195141 2195142 PA14_07210 PA14_07230   fda FALSE 0.315 120.000 0.084 NA   NA
 2195142 2195143 PA14_07230 PA14_07240 fda   FALSE 0.186 66.000 0.000 NA   NA
 2195147 2195148 PA14_07290 PA14_07300     FALSE 0.432 26.000 0.000 NA   NA
 2195149 2195150 PA14_07310 PA14_07330     FALSE 0.083 129.000 0.000 1.000   NA
 2195150 2195151 PA14_07330 PA14_07340     FALSE 0.045 178.000 0.000 1.000   NA
 2195155 2195156 PA14_07380 PA14_07400     TRUE 0.538 16.000 0.000 NA   NA
 2195156 2195157 PA14_07400 PA14_07410     TRUE 0.568 14.000 0.000 NA   NA
 2195157 2195158 PA14_07410 PA14_07420     TRUE 0.767 -10.000 0.000 NA   NA
 2195158 2195159 PA14_07420 PA14_07430     FALSE 0.035 191.000 0.000 NA   NA
 2195159 2195160 PA14_07430 PA14_07440     FALSE 0.004 569.000 0.000 NA   NA
 2195160 2195161 PA14_07440 PA14_07450     FALSE 0.122 93.000 0.000 NA   NA
 2195161 2195162 PA14_07450 PA14_07460     FALSE 0.016 259.000 0.000 NA   NA
 2195162 1543540 PA14_07460 PA14_07470     FALSE 0.074 132.000 0.000 NA   NA
 1543540 2195163 PA14_07470 PA14_07480     FALSE 0.110 98.000 0.000 NA   NA
 2195163 2195164 PA14_07480 PA14_07500     FALSE 0.003 1081.000 0.000 1.000 N NA
 2195164 2195165 PA14_07500 PA14_07520   rpoD FALSE 0.167 107.000 0.013 1.000 N NA
 2195165 2195166 PA14_07520 PA14_07530 rpoD dnaG TRUE 0.704 80.000 0.299 1.000 N NA
 2195166 2195167 PA14_07530 PA14_07550 dnaG   TRUE 0.558 83.000 0.137 1.000   NA
 2195167 2195168 PA14_07550 PA14_07560   rpsU TRUE 0.834 70.000 0.173 0.016   NA
 2195171 2195172 PA14_07590 PA14_07600 folB   TRUE 0.996 -9.000 0.500 1.000 Y NA
 2195173 2195174 PA14_07620 PA14_07630 cca   FALSE 0.436 44.000 0.008 NA   NA
 2195174 2195175 PA14_07630 PA14_07650     FALSE 0.203 95.000 0.007 NA   NA
 2195175 2195176 PA14_07650 PA14_07660     TRUE 0.995 -3.000 0.761 NA   NA
 2195176 2195177 PA14_07660 PA14_07680     TRUE 0.793 101.000 0.683 NA   NA
 2195177 2195178 PA14_07680 PA14_07690     FALSE 0.010 279.000 0.000 NA N NA
 2195178 2195179 PA14_07690 PA14_07700   apaH TRUE 0.592 44.000 0.045 1.000   NA
 2195179 2195180 PA14_07700 PA14_07710 apaH   TRUE 0.980 0.000 0.267 NA   NA
 2195180 2195181 PA14_07710 PA14_07730   ksgA TRUE 0.685 37.000 0.078 NA N NA
 2195181 2195182 PA14_07730 PA14_07740 ksgA pdxA FALSE 0.449 116.000 0.197 1.000 N NA
 2195182 2195183 PA14_07740 PA14_07760 pdxA surA TRUE 0.992 -3.000 0.561 1.000 N NA
 2195183 2195184 PA14_07760 PA14_07770 surA ostA TRUE 0.921 -19.000 0.070 1.000 N NA
 2195185 2195186 PA14_07780 PA14_07790     TRUE 0.994 -3.000 0.642 NA   NA
 2195186 2195187 PA14_07790 PA14_07800     TRUE 0.942 2.000 0.091 1.000 N NA
 2195189 2195190 PA14_07820 PA14_07840     TRUE 0.989 46.000 0.667 0.027 Y NA
 2195190 2195191 PA14_07840 PA14_07850     FALSE 0.062 129.000 0.000 1.000 N NA
 2195191 2195192 PA14_07850 PA14_07860     FALSE 0.175 234.000 0.000 1.000 Y NA
 2195192 2195193 PA14_07860 PA14_07870     TRUE 0.961 56.000 0.556 1.000 Y NA
 2195193 2195194 PA14_07870 PA14_07890     TRUE 0.837 115.000 0.108 0.076 Y NA
 2195194 2195195 PA14_07890 PA14_07900     TRUE 0.867 106.000 0.145 0.076 Y NA
 2195195 2195196 PA14_07900 PA14_07910   rpe FALSE 0.126 124.000 0.007 1.000 N NA
 2195196 2195197 PA14_07910 PA14_07930 rpe   TRUE 0.963 0.000 0.120 1.000   NA
 2195197 2195198 PA14_07930 PA14_07940   trpE TRUE 0.690 73.000 0.233 1.000   NA
 2195199 2195200 PA14_07950 PA14_07960 prtN prtR FALSE 0.108 100.000 0.000 NA   NA
 2195201 2195202 PA14_07970 PA14_07980     FALSE 0.266 48.000 0.000 NA   NA
 2195202 2195203 PA14_07980 PA14_07990     FALSE 0.007 364.000 0.000 NA   NA
 2195203 2195204 PA14_07990 PA14_08000     FALSE 0.467 22.000 0.000 NA   NA
 2195204 2195205 PA14_08000 PA14_08010     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 2195205 2195206 PA14_08010 PA14_08020     TRUE 0.583 153.000 0.500 NA   NA
 2195206 2195207 PA14_08020 PA14_08030     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2195207 2195208 PA14_08030 PA14_08040     TRUE 0.790 -7.000 0.000 NA   NA
 2195208 2195209 PA14_08040 PA14_08050     TRUE 0.769 2.000 0.000 NA   NA
 2195209 2195210 PA14_08050 PA14_08060     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2195210 2195211 PA14_08060 PA14_08070     FALSE 0.292 43.000 0.000 NA   NA
 2195211 2195212 PA14_08070 PA14_08090     TRUE 0.964 13.000 0.423 NA   NA
 2195212 2195213 PA14_08090 PA14_08100     TRUE 0.916 15.000 0.192 NA   NA
 2195213 2195214 PA14_08100 PA14_08110     TRUE 0.726 -31.000 0.000 NA   NA
 2195214 2195215 PA14_08110 PA14_08120     FALSE 0.128 91.000 0.000 NA   NA
 2195215 2195216 PA14_08120 PA14_08130     TRUE 0.937 10.000 0.158 NA   NA
 2195216 2195217 PA14_08130 PA14_08140     TRUE 0.963 -25.000 0.211 NA   NA
 2195217 2195218 PA14_08140 PA14_08150     FALSE 0.216 58.000 0.000 NA   NA
 2195218 2195219 PA14_08150 PA14_08160     FALSE 0.367 33.000 0.000 NA   NA
 2195219 2195220 PA14_08160 PA14_08180     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2195220 2195221 PA14_08180 PA14_08190     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2195221 2195222 PA14_08190 PA14_08200     TRUE 0.551 15.000 0.000 NA   NA
 2195222 2195223 PA14_08200 PA14_08210     TRUE 0.568 14.000 0.000 NA   NA
 2195223 2195224 PA14_08210 PA14_08220     TRUE 0.960 12.000 0.333 NA   NA
 2195224 2195225 PA14_08220 PA14_08230     TRUE 0.946 30.000 0.600 NA   NA
 2195225 2195226 PA14_08230 PA14_08240     FALSE 0.269 47.000 0.000 NA   NA
 2195226 2195227 PA14_08240 PA14_08250     TRUE 0.790 -7.000 0.000 NA   NA
 2195227 2195228 PA14_08250 PA14_08260     TRUE 0.691 8.000 0.000 NA   NA
 2195228 2195229 PA14_08260 PA14_08270     TRUE 0.933 3.000 0.071 NA   NA
 2195229 2195230 PA14_08270 PA14_08280     FALSE 0.229 55.000 0.000 NA   NA
 2195230 2195231 PA14_08280 PA14_08300     FALSE 0.212 59.000 0.000 NA   NA
 2195231 2195232 PA14_08300 PA14_08310     FALSE 0.003 1030.000 0.000 NA   NA
 2195232 2195233 PA14_08310 PA14_08320     TRUE 0.800 0.000 0.000 NA   NA
 2195233 2195234 PA14_08320 PA14_08330     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2195234 2195235 PA14_08330 PA14_08340   trpG FALSE 0.006 419.000 0.000 NA   NA
 2195235 2195236 PA14_08340 PA14_08350 trpG trpD TRUE 0.988 2.000 0.105 1.000 Y NA
 2195236 2195237 PA14_08350 PA14_08360 trpD trpC TRUE 0.996 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 2195239 2195240 PA14_08380 PA14_08390   speD FALSE 0.023 320.000 0.025 1.000 N NA
 2195241 2195242 PA14_08400 PA14_08420     FALSE 0.196 100.000 0.018 1.000 N NA
 2195244 2195245 PA14_08440 PA14_08450     TRUE 0.518 61.000 0.057 1.000   NA
 2195245 2195246 PA14_08450 PA14_08460     FALSE 0.402 122.000 0.154 1.000   NA
 2195246 2195247 PA14_08460 PA14_08470     TRUE 0.737 17.000 0.024 NA   NA
 2195248 2195249 PA14_08480 PA14_08490 argC   TRUE 0.886 0.000 0.008 NA   NA
 2195249 2195250 PA14_08490 PA14_08500     TRUE 0.953 1.000 0.103 NA   NA
 2195250 2195251 PA14_08500 PA14_08510     FALSE 0.487 78.000 0.079 NA   NA
 2195252 2195253 PA14_08520 PA14_08540     TRUE 0.959 3.000 0.184 NA N NA
 2195254 1543633 PA14_08560 PA14_08570 tyrZ   FALSE 0.005 549.000 0.000 NA   NA
 1543633 1543634 PA14_08570 PA14_08580     FALSE 0.186 66.000 0.000 NA   NA
 1543634 1543635 PA14_08580 PA14_08590     FALSE 0.375 32.000 0.000 NA   NA
 1543635 1543636 PA14_08590 PA14_08600     FALSE 0.022 230.000 0.000 NA   NA
 1543636 1543637 PA14_08600 PA14_08610     FALSE 0.071 137.000 0.000 NA   NA
 1543637 2195255 PA14_08610 PA14_08620   birA FALSE 0.058 154.000 0.000 NA   NA
 2195255 2195256 PA14_08620 PA14_08630 birA   TRUE 0.972 -3.000 0.147 1.000 N NA
 2195256 2195257 PA14_08630 PA14_08640     TRUE 0.817 9.000 0.012 NA   NA
 2195257 1543641 PA14_08640 PA14_08650     FALSE 0.065 148.000 0.000 NA   NA
 1543641 1543642 PA14_08650 PA14_08660     FALSE 0.392 30.000 0.000 NA   NA
 1543642 1543643 PA14_08660 PA14_08670     FALSE 0.455 23.000 0.000 NA   NA
 1543643 2195258 PA14_08670 PA14_08680   tufB FALSE 0.137 88.000 0.000 NA   NA
 2195258 1543645 PA14_08680 PA14_08690 tufB   FALSE 0.224 56.000 0.000 NA   NA
 1543645 2195259 PA14_08690 PA14_08695   secE FALSE 0.261 49.000 0.000 NA   NA
 2195259 2195260 PA14_08695 PA14_08710 secE nusG TRUE 0.987 10.000 0.843 1.000 N NA
 2195260 2195261 PA14_08710 PA14_08720 nusG rplK TRUE 0.745 117.000 0.681 1.000 N NA
 2195261 2195262 PA14_08720 PA14_08730 rplK rplA TRUE 0.999 0.000 0.838 0.013 Y NA
 2195262 2195263 PA14_08730 PA14_08740 rplA rplJ TRUE 0.804 199.000 0.302 0.013 Y NA
 2195263 2195264 PA14_08740 PA14_08750 rplJ rplL TRUE 0.986 79.000 0.884 0.010 Y NA
 2195264 2195265 PA14_08750 PA14_08760 rplL rpoB FALSE 0.190 222.000 0.223 1.000 N NA
 2195265 2195266 PA14_08760 PA14_08780 rpoB rpoC TRUE 0.990 66.000 0.851 0.000 Y NA
 2195266 2195267 PA14_08780 PA14_08790 rpoC rpsL FALSE 0.273 152.000 0.122 1.000 N NA
 2195267 2195268 PA14_08790 PA14_08810 rpsL rpsG TRUE 0.971 100.000 0.620 0.002 Y NA
 2195268 2195269 PA14_08810 PA14_08820 rpsG fusA1 TRUE 0.982 31.000 0.579 1.000 Y NA
 2195269 2195270 PA14_08820 PA14_08830 fusA1 tufA TRUE 0.992 31.000 0.400 0.001 Y NA
 2195270 2195271 PA14_08830 PA14_08840 tufA rpsJ TRUE 0.757 156.000 0.318 1.000 Y NA
 2195271 2195272 PA14_08840 PA14_08850 rpsJ rplC TRUE 0.958 83.000 0.307 0.013 Y NA
 2195272 2195273 PA14_08850 PA14_08860 rplC rplD TRUE 0.996 14.000 0.486 0.010 Y NA
 2195273 2195274 PA14_08860 PA14_08870 rplD rplW TRUE 0.998 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 2195274 2195275 PA14_08870 PA14_08880 rplW rplB TRUE 0.995 12.000 0.849 1.000 Y NA
 2195275 2195276 PA14_08880 PA14_08890 rplB rpsS TRUE 0.997 17.000 0.820 0.013 Y NA
 2195276 2195277 PA14_08890 PA14_08900 rpsS rplV TRUE 0.998 13.000 0.769 0.013 Y NA
 2195277 2195278 PA14_08900 PA14_08910 rplV rpsC TRUE 0.998 13.000 0.719 0.013 Y NA
 2195278 2195279 PA14_08910 PA14_08920 rpsC rplP TRUE 0.998 12.000 0.828 0.013 Y NA
 2195279 2195280 PA14_08920 PA14_08930 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.010 Y NA
 2195280 2195281 PA14_08930 PA14_08940 rpmC rpsQ TRUE 0.999 3.000 0.828 0.010 Y NA
 2195281 2195282 PA14_08940 PA14_08950 rpsQ rplN TRUE 0.996 24.000 0.791 0.013 Y NA
 2195282 2195283 PA14_08950 PA14_08960 rplN rplX TRUE 0.998 13.000 0.810 0.013 Y NA
 2195283 2195284 PA14_08960 PA14_08970 rplX rplE TRUE 0.997 20.000 0.758 0.010 Y NA
 2195284 2195285 PA14_08970 PA14_08980 rplE rpsN TRUE 0.994 14.000 0.309 0.010 Y NA
 2195285 2195286 PA14_08980 PA14_08990 rpsN rpsH TRUE 0.824 190.000 0.295 0.010 Y NA
 2195286 2195287 PA14_08990 PA14_09000 rpsH rplF TRUE 0.998 12.000 0.808 0.010 Y NA
 2195287 2195288 PA14_09000 PA14_09010 rplF rplR TRUE 0.998 11.000 0.815 0.010 Y NA
 2195288 2195289 PA14_09010 PA14_09020 rplR rpsE TRUE 0.999 4.000 0.814 0.013 Y NA
 2195289 2195290 PA14_09020 PA14_09030 rpsE rpmD TRUE 0.999 3.000 0.789 0.013 Y NA
 2195290 2195291 PA14_09030 PA14_09040 rpmD rplO TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 2195291 2195292 PA14_09040 PA14_09050 rplO secY TRUE 0.991 1.000 0.730 1.000 N NA
 2195292 2195293 PA14_09050 PA14_09070 secY rpmJ TRUE 0.653 29.000 0.036 1.000 N NA
 2195293 2195294 PA14_09070 PA14_09080 rpmJ rpsM TRUE 0.834 131.000 0.086 0.010 Y NA
 2195294 2195295 PA14_09080 PA14_09090 rpsM rpsK TRUE 0.997 19.000 0.810 0.010 Y NA
 2195295 2195296 PA14_09090 PA14_09100 rpsK rpsD TRUE 0.995 17.000 0.509 0.013 Y NA
 2195296 2195297 PA14_09100 PA14_09115 rpsD rpoA TRUE 0.950 23.000 0.549 1.000 N NA
 2195297 2195298 PA14_09115 PA14_09130 rpoA rplQ TRUE 0.941 44.000 0.873 1.000 N NA
 2195298 2195299 PA14_09130 PA14_09150 rplQ katA FALSE 0.010 281.000 0.000 1.000 N NA
 2195299 2195300 PA14_09150 PA14_09160 katA bfrA FALSE 0.445 131.000 0.000 1.000 Y NA
 2195302 2195303 PA14_09195 PA14_09200   ssb TRUE 0.828 17.000 0.075 1.000 N NA
 2195304 2195305 PA14_09210 PA14_09220 pchA pchB TRUE 0.926 -3.000 0.027 1.000 N NA
 2195305 2195306 PA14_09220 PA14_09230 pchB pchC TRUE 0.964 0.000 0.149 1.000 N NA
 2195306 2195307 PA14_09230 PA14_09240 pchC pchD TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2195308 2195309 PA14_09260 PA14_09270 pchR pchE FALSE 0.194 194.000 0.154 1.000 N NA
 2195309 2195310 PA14_09270 PA14_09280 pchE pchF TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 2195310 2195311 PA14_09280 PA14_09290 pchF pchG TRUE 0.991 -3.000 0.074 1.000 Y NA
 2195311 2195312 PA14_09290 PA14_09300 pchG   TRUE 0.956 -3.000 0.000 0.092 N NA
 2195312 2195313 PA14_09300 PA14_09320     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.005 Y NA
 2195313 2195314 PA14_09320 PA14_09340   fptA TRUE 0.809 92.000 0.667 1.000 N NA
 2195314 2195315 PA14_09340 PA14_09350 fptA   TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 2195315 2195316 PA14_09350 PA14_09370     FALSE 0.009 332.000 0.000 NA   NA
 2195316 2195317 PA14_09370 PA14_09380     TRUE 0.790 -7.000 0.000 NA   NA
 2195318 2195319 PA14_09400 PA14_09410 phzS phzG1 FALSE 0.082 338.000 0.000 1.000 Y NA
 2195319 2195320 PA14_09410 PA14_09420 phzG1 phzF1 TRUE 0.902 23.000 0.235 1.000   NA
 2195320 2195321 PA14_09420 PA14_09440 phzF1 phzE1 TRUE 0.925 14.000 0.016 0.021   NA
 2195321 2195322 PA14_09440 PA14_09450 phzE1 phzD1 TRUE 0.985 -3.000 0.055 0.021 N NA
 2195322 2195323 PA14_09450 PA14_09460 phzD1 phzC1 TRUE 0.807 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2195323 2195324 PA14_09460 PA14_09470 phzC1 phzB1 FALSE 0.365 36.000 0.000 1.000   NA
 2195324 2195325 PA14_09470 PA14_09480 phzB1 phzA1 TRUE 0.840 30.000 0.000 0.004   NA
 2195327 2195328 PA14_09500 PA14_09520 opmD mexI TRUE 0.958 -3.000 0.080 NA N NA
 2195328 2195329 PA14_09520 PA14_09530 mexI mexH TRUE 0.962 13.000 0.435 NA N NA
 2195329 2195330 PA14_09530 PA14_09540 mexH mexG TRUE 0.948 8.000 0.174 NA   NA
 2195330 2195331 PA14_09540 PA14_09550 mexG   FALSE 0.004 651.000 0.000 NA   NA
 2195331 2195332 PA14_09550 PA14_09570     FALSE 0.119 80.000 0.000 NA N NA
 2195333 2195334 PA14_09580 PA14_09600   ddlA FALSE 0.123 96.000 0.000 1.000   NA
 2195335 2195336 PA14_09610 PA14_09630     FALSE 0.031 208.000 0.000 1.000   NA
 2195336 2195337 PA14_09630 PA14_09660     TRUE 0.896 118.000 0.600 1.000 Y NA
 2195338 2195339 PA14_09680 PA14_09690     TRUE 0.997 3.000 0.280 0.027 Y NA
 2195340 2195341 PA14_09700 PA14_09710     FALSE 0.329 168.000 0.000 1.000 Y NA
 2195341 2195342 PA14_09710 PA14_09730     TRUE 0.996 -7.000 0.690 0.083 N NA
 2195342 2195343 PA14_09730 PA14_09740     TRUE 0.677 65.000 0.208 1.000 N NA
 2195343 2195344 PA14_09740 PA14_09750     TRUE 0.711 136.000 0.714 1.000 N NA
 2195344 2195345 PA14_09750 PA14_09760     TRUE 0.633 94.000 0.300 1.000 N NA
 2195346 2195347 PA14_09770 PA14_09780     FALSE 0.432 26.000 0.000 NA   NA
 2195348 2195349 PA14_09790 PA14_09810     FALSE 0.413 28.000 0.000 NA   NA
 2195351 2195352 PA14_09850 PA14_09870     FALSE 0.022 238.000 0.000 1.000   NA
 2195352 2195353 PA14_09870 PA14_09880     FALSE 0.372 100.000 0.000 0.083   NA
 2195355 2195356 PA14_09900 PA14_09910 prpL   FALSE 0.005 533.000 0.000 1.000   NA
 2195358 2195359 PA14_09930 PA14_09940     FALSE 0.478 23.000 0.000 1.000   NA
 2195359 2195360 PA14_09940 PA14_09950     FALSE 0.077 136.000 0.000 1.000   NA
 2195366 2195367 PA14_10020 PA14_10040     FALSE 0.200 62.000 0.000 NA   NA
 2195367 2195368 PA14_10040 PA14_10050     FALSE 0.037 187.000 0.000 NA   NA
 2195368 2195369 PA14_10050 PA14_10070     TRUE 0.959 14.000 0.400 NA   NA
 2195369 2195370 PA14_10070 PA14_10080     TRUE 0.590 13.000 0.000 NA   NA
 2195372 2195373 PA14_10110 PA14_10120     TRUE 0.646 96.000 0.333 1.000 N NA
 2195375 2195376 PA14_10140 PA14_10160 fepG fepD TRUE 0.996 -3.000 0.079 0.075 Y NA
 2195376 2195377 PA14_10160 PA14_10170 fepD fepB TRUE 0.945 31.000 0.130 1.000 Y NA
 2195380 2195381 PA14_10200 PA14_10210     TRUE 0.741 68.000 0.318 NA N NA
 2195381 2195382 PA14_10210 PA14_10220     FALSE 0.004 437.000 0.000 NA N NA
 2195383 2195384 PA14_10230 PA14_10240 adh   TRUE 0.853 14.000 0.062 1.000   NA
 2195384 2195385 PA14_10240 PA14_10250   acoB TRUE 0.989 -3.000 0.375 1.000   NA
 2195385 2195386 PA14_10250 PA14_10260 acoB   TRUE 0.996 33.000 0.804 0.001 Y NA
 2195386 2195387 PA14_10260 PA14_10270     TRUE 0.932 23.000 0.141 0.083   NA
 2195387 2195388 PA14_10270 PA14_10280     TRUE 0.982 -3.000 0.054 0.083   NA
 2195389 2195390 PA14_10290 PA14_10300 acoR   FALSE 0.024 205.000 0.000 1.000 N NA
 2195391 2195392 PA14_10320 PA14_10330     FALSE 0.093 96.000 0.000 1.000 N NA
 2195392 2195393 PA14_10330 PA14_10340     TRUE 0.943 0.000 0.000 0.092 N NA
 2195393 2195394 PA14_10340 PA14_10350     TRUE 0.951 10.000 0.000 1.000 Y NA
 2195394 2195395 PA14_10350 PA14_10360     FALSE 0.112 97.000 0.000 NA   NA
 2195395 2195396 PA14_10360 PA14_10370     FALSE 0.011 309.000 0.000 NA   NA
 2195396 2195397 PA14_10370 PA14_10380     FALSE 0.321 132.000 0.111 NA   NA
 2195397 2195398 PA14_10380 PA14_10400     FALSE 0.073 133.000 0.000 NA   NA
 2195398 2195399 PA14_10400 PA14_10410     TRUE 0.510 18.000 0.000 NA   NA
 2195402 2195403 PA14_10470 PA14_10480     FALSE 0.117 86.000 0.000 1.000 N NA
 2195404 2195405 PA14_10490 PA14_10500     TRUE 0.869 84.000 0.800 NA   NA
 2195405 2195406 PA14_10500 PA14_10530     FALSE 0.013 264.000 0.000 1.000 N NA
 2195406 2195407 PA14_10530 PA14_10540     TRUE 0.668 98.000 0.385 1.000 N NA
 2195408 2195409 PA14_10550 PA14_10560     TRUE 0.985 -3.000 0.273 NA   NA
 2195410 2195411 PA14_10570 PA14_10590   hpcG TRUE 0.863 13.000 0.075 1.000 N NA
 2195411 2195412 PA14_10590 PA14_10600 hpcG   TRUE 0.820 18.000 0.075 1.000 N NA
 2195412 2195413 PA14_10600 PA14_10610   hpcD FALSE 0.290 93.000 0.039 1.000 N NA
 2195413 2195414 PA14_10610 PA14_10620 hpcD hpcB TRUE 0.964 11.000 0.330 1.000   NA
 2195414 2195415 PA14_10620 PA14_10630 hpcB hpcC TRUE 0.582 132.000 0.378 1.000   NA
 2195415 2195416 PA14_10630 PA14_10640 hpcC   TRUE 0.996 -3.000 0.510 0.083 N NA
 2195416 2195417 PA14_10640 PA14_10650     TRUE 0.998 11.000 0.618 0.000 Y NA
 2195418 2195419 PA14_10660 PA14_10670   aph FALSE 0.206 52.000 0.000 1.000 N NA
 2195420 2195421 PA14_10680 PA14_10700     FALSE 0.163 78.000 0.000 NA   NA
 2195421 2195422 PA14_10700 PA14_10710     TRUE 0.627 28.000 0.029 NA N NA
 2195422 2195423 PA14_10710 PA14_10730     FALSE 0.085 118.000 0.000 NA   NA
 2195424 2195425 PA14_10740 PA14_10750     FALSE 0.063 154.000 0.000 1.000   NA
 2195425 2195426 PA14_10750 PA14_10770     FALSE 0.063 128.000 0.000 1.000 N NA
 2195427 2195428 PA14_10780 PA14_10790   ampC FALSE 0.190 65.000 0.000 NA   NA
 2195430 2195431 PA14_10820 PA14_10830     FALSE 0.010 283.000 0.000 1.000 N NA
 2195433 2195434 PA14_10850 PA14_10870     FALSE 0.256 155.000 0.118 1.000 N NA
 2195434 2195435 PA14_10870 PA14_10890     FALSE 0.120 85.000 0.000 1.000 N NA
 2195435 2195436 PA14_10890 PA14_10900     TRUE 0.984 15.000 0.500 0.051 N NA
 2195436 2195437 PA14_10900 PA14_10910     TRUE 0.989 -3.000 0.417 1.000 N NA
 2195437 2195438 PA14_10910 PA14_10920     TRUE 0.764 71.000 0.333 1.000   NA
 2195439 2195440 PA14_10940 PA14_10950     FALSE 0.206 48.000 0.000 NA N NA
 2195441 2195442 PA14_10960 PA14_10970     TRUE 0.780 29.000 0.000 0.072   NA
 2195444 2195445 PA14_10990 PA14_11000 hpaC hpaA TRUE 0.939 30.000 0.097 0.001   NA
 2195445 2195446 PA14_11000 PA14_11010 hpaA   FALSE 0.049 166.000 0.000 NA   NA
 2195446 2195447 PA14_11010 PA14_11020     FALSE 0.011 303.000 0.000 NA   NA
 2195447 2195448 PA14_11020 PA14_11030     TRUE 0.933 -3.000 0.033 1.000 N NA
 2195448 2195449 PA14_11030 PA14_11050     TRUE 0.862 9.000 0.033 NA   NA
 2195450 2195451 PA14_11060 PA14_11070 cupB1 cupB2 TRUE 0.988 31.000 0.800 1.000 Y NA
 2195451 2195452 PA14_11070 PA14_11080 cupB2 cupB3 FALSE 0.387 322.000 0.400 1.000 Y NA
 2195452 2195453 PA14_11080 PA14_11090 cupB3 cupB4 TRUE 0.998 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 2195453 2195454 PA14_11090 PA14_11100 cupB4 cupB5 TRUE 0.610 88.000 0.000 1.000 Y NA
 2195454 2195455 PA14_11100 PA14_11110 cupB5 cupB6 TRUE 0.544 100.000 0.000 1.000 Y NA
 2195455 2195456 PA14_11110 PA14_11120 cupB6   FALSE 0.003 645.000 0.000 1.000 N NA
 2195457 2195458 PA14_11130 PA14_11140     FALSE 0.424 90.000 0.000 0.083   NA
 2195458 2195459 PA14_11140 PA14_11150     FALSE 0.022 211.000 0.000 1.000 N NA
 2195459 2195460 PA14_11150 PA14_11160     TRUE 0.988 -3.000 0.357 NA   NA
 2195463 2195464 PA14_11190 PA14_11210     FALSE 0.028 191.000 0.000 1.000 N NA
 2195464 2195465 PA14_11210 PA14_11230     TRUE 0.991 -25.000 0.864 NA   NA
 2195465 2195466 PA14_11230 PA14_11240     FALSE 0.053 161.000 0.000 NA   NA
 2195466 2195467 PA14_11240 PA14_11250     FALSE 0.012 269.000 0.000 1.000 N NA
 2195467 2195468 PA14_11250 PA14_11260     TRUE 0.974 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 2195469 2195470 PA14_11270 PA14_11280 oprG   FALSE 0.224 148.000 0.060 NA   NA
 2195470 2195471 PA14_11280 PA14_11290     TRUE 0.861 18.000 0.114 NA   NA
 2195471 2195472 PA14_11290 PA14_11310     TRUE 0.996 3.000 0.605 NA Y NA
 2195472 2195473 PA14_11310 PA14_11320     TRUE 0.704 89.000 0.336 NA   NA
 2195475 2195476 PA14_11340 PA14_11350     FALSE 0.350 72.000 0.022 1.000   NA
 2195476 2195477 PA14_11350 PA14_11370     TRUE 0.991 -3.000 0.462 NA   NA
 2195478 2195479 PA14_11380 PA14_11400   ribD TRUE 0.983 -3.000 0.277 NA N NA
 2195479 2195480 PA14_11400 PA14_11410 ribD ribC FALSE 0.295 428.000 0.456 1.000 Y NA
 2195480 2195481 PA14_11410 PA14_11420 ribC ribB TRUE 0.937 27.000 0.065 1.000 Y NA
 2195481 2195482 PA14_11420 PA14_11430 ribB ribE TRUE 0.854 118.000 0.049 0.001 Y NA
 2195482 2195483 PA14_11430 PA14_11450 ribE nusB TRUE 0.987 -3.000 0.347 1.000 N NA
 2195483 2195484 PA14_11450 PA14_11460 nusB thiL TRUE 0.905 19.000 0.225 1.000 N NA
 2195484 2195485 PA14_11460 PA14_11470 thiL pgpA TRUE 0.971 -7.000 0.206 1.000 N NA
 2195485 2195486 PA14_11470 PA14_11480 pgpA   TRUE 0.812 9.000 0.018 1.000 N NA
 2195486 2195487 PA14_11480 PA14_11490     TRUE 0.937 3.000 0.075 1.000   NA
 2195487 2195488 PA14_11490 PA14_11510   ribA FALSE 0.207 131.000 0.035 1.000   NA
 2195488 2195489 PA14_11510 PA14_11520 ribA   TRUE 0.951 -3.000 0.050 NA   NA
 2195489 2195490 PA14_11520 PA14_11530     TRUE 0.946 0.000 0.066 NA   NA
 2195491 2195492 PA14_11550 PA14_11560 dxs ispA TRUE 0.814 109.000 0.246 1.000 Y NA
 2195492 2195493 PA14_11560 PA14_11570 ispA xseB TRUE 0.976 -3.000 0.177 1.000 N NA
 2195495 2195496 PA14_11590 PA14_11600     TRUE 0.769 2.000 0.000 NA   NA
 2195496 2195497 PA14_11600 PA14_11610     TRUE 0.975 10.000 0.435 NA   NA
 2195497 2195498 PA14_11610 PA14_11620     TRUE 0.990 -3.000 0.426 1.000   NA
 2195498 2195499 PA14_11620 PA14_11630     FALSE 0.026 405.000 0.000 0.094 N NA
 2195499 2195500 PA14_11630 PA14_11650     TRUE 0.939 19.000 0.345 NA   NA
 2195500 2195501 PA14_11650 PA14_11660   aqpZ FALSE 0.049 166.000 0.000 NA   NA
 2195501 2195502 PA14_11660 PA14_11670 aqpZ   FALSE 0.008 347.000 0.000 NA   NA
 2195504 2195505 PA14_11690 PA14_11700 ppa   FALSE 0.317 80.000 0.022 NA   NA
 2195505 2195506 PA14_11700 PA14_11720     TRUE 0.896 3.000 0.030 NA   NA
 2195508 2195509 PA14_11740 PA14_11750     FALSE 0.273 50.000 0.000 1.000   NA
 2195509 2195510 PA14_11750 PA14_11760     FALSE 0.168 164.000 0.047 1.000   NA
 2195510 2195511 PA14_11760 PA14_11770   eutB TRUE 0.999 11.000 0.859 0.000 Y NA
 2195511 2195512 PA14_11770 PA14_11790 eutB   TRUE 0.945 59.000 0.407 1.000 Y NA
 2195512 2195513 PA14_11790 PA14_11810     FALSE 0.022 210.000 0.000 1.000 N NA
 2195514 2195515 PA14_11830 PA14_11845   mpl FALSE 0.275 158.000 0.020 0.094 N NA
 2195515 2195516 PA14_11845 PA14_11860 mpl   TRUE 0.955 9.000 0.235 1.000 N NA
 2195516 2195517 PA14_11860 PA14_11880     TRUE 0.938 2.000 0.070 NA   NA
 2195518 2195519 PA14_11890 PA14_11900     TRUE 0.605 47.000 0.056 1.000   NA
 2195519 2195520 PA14_11900 PA14_11910     FALSE 0.290 191.000 0.243 1.000   NA
 2195521 2195522 PA14_11920 PA14_11930     TRUE 0.994 0.000 0.818 NA   NA
 2195522 2195523 PA14_11930 PA14_11940     TRUE 0.715 20.000 0.027 NA   NA
 2195524 2195525 PA14_11960 PA14_11970     TRUE 0.928 -3.000 0.019 1.000   NA
 2195528 2195529 PA14_12010 PA14_12020 proA nadD TRUE 0.967 0.000 0.170 1.000 N NA
 2195529 2195530 PA14_12020 PA14_12030 nadD   TRUE 0.894 23.000 0.221 NA   NA
 2195530 2195531 PA14_12030 PA14_12050     TRUE 0.969 8.000 0.307 NA   NA
 2195531 2195532 PA14_12050 PA14_12060   pbpA TRUE 0.590 13.000 0.000 NA   NA
 2195532 2195533 PA14_12060 PA14_12070 pbpA rodA FALSE 0.325 32.000 0.000 1.000 N NA
 2195533 2195534 PA14_12070 PA14_12080 rodA sltB1 TRUE 0.911 9.000 0.096 NA N NA
 2195534 2195535 PA14_12080 PA14_12090 sltB1   TRUE 0.996 -3.000 0.298 NA Y NA
 2195535 2195536 PA14_12090 PA14_12100   dacC TRUE 0.902 66.000 0.241 NA Y NA
 2195536 2195537 PA14_12100 PA14_12110 dacC   TRUE 0.497 71.000 0.074 NA   NA
 2195537 2195538 PA14_12110 PA14_12120   lipB TRUE 0.976 0.000 0.219 NA   NA
 2195538 2195539 PA14_12120 PA14_12130 lipB lis TRUE 0.999 -3.000 0.319 0.000 Y NA
 2195544 2195545 PA14_12180 PA14_12200   holA FALSE 0.217 92.000 0.007 NA   NA
 2195545 2195546 PA14_12200 PA14_12210 holA   TRUE 0.799 38.000 0.199 NA N NA
 2195546 2195547 PA14_12210 PA14_12230   leuS TRUE 0.630 67.000 0.182 NA N NA
 2195548 2195549 PA14_12260 PA14_12270     TRUE 0.799 73.000 0.435 NA   NA
 2195550 2195551 PA14_12280 PA14_12300     FALSE 0.467 186.000 0.557 NA N NA
 2195551 2195552 PA14_12300 PA14_12310     TRUE 0.974 -3.000 0.150 NA   NA
 2195552 2195553 PA14_12310 PA14_12330     TRUE 0.985 -10.000 0.457 NA   NA
 2195553 2195554 PA14_12330 PA14_12350     FALSE 0.316 169.000 0.220 1.000 N NA
 2195556 2195557 PA14_12370 PA14_12390   hemL FALSE 0.056 209.000 0.008 1.000   NA
 2195557 2195558 PA14_12390 PA14_12400 hemL thiE TRUE 0.940 38.000 0.173 1.000 Y NA
 2195558 2195559 PA14_12400 PA14_12410 thiE thiD TRUE 0.985 11.000 0.209 1.000 Y NA
 10942643 2195560 PA14_12420 PA14_12440     FALSE 0.004 797.000 0.000 NA   NA
 2195560 2195561 PA14_12440 PA14_12450     TRUE 0.969 -3.000 0.127 1.000 N NA
 2195561 2195562 PA14_12450 PA14_12470     TRUE 0.532 12.000 0.000 NA N NA
 2195562 2195563 PA14_12470 PA14_12490     FALSE 0.176 55.000 0.000 NA N NA
 2195566 2195567 PA14_12550 PA14_12560     FALSE 0.309 101.000 0.051 NA   NA
 2195567 2195568 PA14_12560 PA14_12570     FALSE 0.132 202.000 0.077 NA   NA
 2195568 2195569 PA14_12570 PA14_12590     FALSE 0.007 382.000 0.000 NA   NA
 2195569 2195570 PA14_12590 PA14_12610     TRUE 0.721 -43.000 0.000 NA   NA
 2195570 2195571 PA14_12610 PA14_12620     FALSE 0.308 89.000 0.031 NA   NA
 2195573 2195574 PA14_12640 PA14_12650     FALSE 0.444 24.000 0.000 NA   NA
 2195574 2195575 PA14_12650 PA14_12670     FALSE 0.274 90.000 0.024 NA   NA
 2195577 2195578 PA14_12690 PA14_12700     TRUE 0.607 67.000 0.143 NA   NA
 2195578 2195579 PA14_12700 PA14_12710     FALSE 0.148 84.000 0.000 NA   NA
 2195579 2195580 PA14_12710 PA14_12730     FALSE 0.045 158.000 0.000 1.000 N NA
 2195581 2195582 PA14_12740 PA14_12750     FALSE 0.441 66.000 0.043 NA   NA
 2195582 2195583 PA14_12750 PA14_12760     FALSE 0.163 78.000 0.000 NA   NA
 2195584 2195585 PA14_12770 PA14_12780     FALSE 0.008 359.000 0.000 NA   NA
 2195586 2195587 PA14_12810 PA14_12820     TRUE 0.756 102.000 0.000 0.021 Y NA
 2195587 2195588 PA14_12820 PA14_12840     FALSE 0.021 215.000 0.000 1.000 N NA
 2195588 2195589 PA14_12840 PA14_12850     TRUE 0.967 27.000 0.014 0.008 Y NA
 2195589 2195590 PA14_12850 PA14_12860     TRUE 0.769 3.000 0.000 1.000   NA
 2195590 2195591 PA14_12860 PA14_12870   tesB FALSE 0.380 34.000 0.000 1.000   NA
 2195591 2195592 PA14_12870 PA14_12890 tesB   TRUE 0.954 -3.000 0.052 1.000   NA
 2195594 2195595 PA14_12910 PA14_12920     FALSE 0.029 207.000 0.000 NA   NA
 2195595 2195596 PA14_12920 PA14_12940     TRUE 0.850 64.000 0.093 1.000 Y NA
 2195596 2195597 PA14_12940 PA14_12960     TRUE 0.997 -10.000 0.728 1.000 Y NA
 2195597 2195598 PA14_12960 PA14_12970   tauD TRUE 0.495 107.000 0.214 1.000 N NA
 2195598 2195599 PA14_12970 PA14_12980 tauD   FALSE 0.052 163.000 0.000 NA   NA
 2195600 2195601 PA14_12990 PA14_13000     FALSE 0.029 190.000 0.000 1.000 N NA
 2195601 2195602 PA14_13000 PA14_13010     FALSE 0.351 176.000 0.294 NA N NA
 2195603 2195604 PA14_13030 PA14_13040 cioA cioB TRUE 0.985 4.000 0.000 0.071 Y NA
 2195604 2195605 PA14_13040 PA14_13050 cioB   TRUE 0.568 14.000 0.000 NA   NA
 2195609 2195610 PA14_13110 PA14_13130     FALSE 0.027 212.000 0.000 NA   NA
 2195610 2195611 PA14_13130 PA14_13140     TRUE 0.917 61.000 0.889 NA   NA
 2195611 2195612 PA14_13140 PA14_13150     FALSE 0.134 334.000 0.375 NA   NA
 2195614 2195615 PA14_13190 PA14_13200     FALSE 0.087 117.000 0.000 NA   NA
 2195616 2195617 PA14_13210 PA14_13220     FALSE 0.052 163.000 0.000 NA   NA
 2195618 2195619 PA14_13230 PA14_13240 moaC moaD TRUE 0.998 -3.000 0.175 0.002 Y NA
 2195619 2195620 PA14_13240 PA14_13250 moaD moaE TRUE 0.998 5.000 0.501 0.002 Y NA
 2195620 2195621 PA14_13250 PA14_13260 moaE moaB1 TRUE 0.841 102.000 0.018 0.002 Y NA
 2195621 2195622 PA14_13260 PA14_13280 moaB1 moeA1 TRUE 0.997 -3.000 0.073 0.002 Y NA
 2195622 2195623 PA14_13280 PA14_13290 moeA1   FALSE 0.073 115.000 0.000 1.000 N NA
 2195623 2195624 PA14_13290 PA14_13300     TRUE 0.999 12.000 0.948 0.003 Y NA
 2195624 2195625 PA14_13300 PA14_13320     TRUE 0.976 -6.000 0.235 1.000 N NA
 2195625 2195626 PA14_13320 PA14_13330     FALSE 0.014 252.000 0.000 1.000 N NA
 2195626 2195627 PA14_13330 PA14_13340     FALSE 0.335 37.000 0.000 NA   NA
 2195628 2195629 PA14_13350 PA14_13360     TRUE 0.993 -3.000 0.571 NA   NA
 2195629 2195630 PA14_13360 PA14_13370     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2195630 2195631 PA14_13370 PA14_13380     TRUE 0.790 -7.000 0.000 NA   NA
 2195631 2195632 PA14_13380 PA14_13390     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2195632 2195633 PA14_13390 PA14_13410     FALSE 0.007 385.000 0.000 NA   NA
 2195635 2195636 PA14_13430 PA14_13450 fecA   TRUE 0.889 95.000 0.400 NA Y NA
 2195636 2195637 PA14_13450 PA14_13460     TRUE 0.984 -3.000 0.286 NA N NA
 2195637 2195638 PA14_13460 PA14_13470     TRUE 0.756 101.000 0.000 0.033 Y NA
 2195640 2195641 PA14_13500 PA14_13510     FALSE 0.096 95.000 0.000 1.000 N NA
 2195642 2195643 PA14_13520 PA14_13530     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2195643 2195644 PA14_13530 PA14_13560     FALSE 0.023 227.000 0.000 NA   NA
 2195645 2195646 PA14_13580 PA14_13590     TRUE 0.995 13.000 0.903 1.000 Y NA
 2195646 2195647 PA14_13590 PA14_13600     TRUE 0.992 0.000 0.313 0.074 N NA
 2195647 2195648 PA14_13600 PA14_13610     TRUE 0.993 0.000 0.403 0.074 N NA
 2195650 2195651 PA14_13630 PA14_13650     FALSE 0.384 31.000 0.000 NA   NA
 2195651 2195652 PA14_13650 PA14_13660     FALSE 0.082 105.000 0.000 1.000 N NA
 2195652 2195653 PA14_13660 PA14_13670     FALSE 0.116 95.000 0.000 NA   NA
 2195653 2195654 PA14_13670 PA14_13680     TRUE 0.932 21.000 0.333 NA   NA
 2195654 2195655 PA14_13680 PA14_13690     FALSE 0.440 88.000 0.000 0.082   NA
 2195655 2195656 PA14_13690 PA14_13710     TRUE 0.561 16.000 0.000 1.000   NA
 2195656 2195657 PA14_13710 PA14_13720     FALSE 0.049 166.000 0.000 NA   NA
 2195657 2195658 PA14_13720 PA14_13730   narL FALSE 0.145 85.000 0.000 NA   NA
 2195658 2195659 PA14_13730 PA14_13740 narL narX TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.027 Y NA
 2195660 2195661 PA14_13750 PA14_13770 narK1 narK2 TRUE 0.969 13.000 0.000 0.082 Y NA
 2195661 2195662 PA14_13770 PA14_13780 narK2 narG FALSE 0.138 76.000 0.000 1.000 N NA
 2195662 2195663 PA14_13780 PA14_13800 narG narH TRUE 0.998 12.000 0.727 0.000 Y NA
 2195663 2195664 PA14_13800 PA14_13810 narH narJ TRUE 0.999 6.000 0.818 0.001 Y NA
 2195664 2195665 PA14_13810 PA14_13830 narJ narI TRUE 0.999 3.000 0.818 0.001 Y NA
 2195665 2195666 PA14_13830 PA14_13840 narI   TRUE 0.620 55.000 0.091 1.000   NA
 2195666 2195667 PA14_13840 PA14_13850   moaA1 TRUE 0.510 57.000 0.045 1.000   NA
 2195668 2195669 PA14_13860 PA14_13870     FALSE 0.072 135.000 0.000 NA   NA
 2195669 2195670 PA14_13870 PA14_13880     FALSE 0.292 43.000 0.000 NA   NA
 2195670 2195671 PA14_13880 PA14_13890     TRUE 0.743 53.000 0.200 NA   NA
 2195671 10942644 PA14_13890 PA14_13900     FALSE 0.005 556.000 0.000 NA   NA
 2195672 2195673 PA14_13920 PA14_13940     FALSE 0.004 622.000 0.000 NA   NA
 2195673 2195674 PA14_13940 PA14_13950     TRUE 0.800 0.000 0.000 NA   NA
 2195675 2195676 PA14_13960 PA14_13970     TRUE 0.719 5.000 0.000 NA   NA
 2195678 2195679 PA14_14000 PA14_14010     TRUE 0.791 63.000 0.333 1.000   NA
 2195679 2195680 PA14_14010 PA14_14020     TRUE 0.975 23.000 0.286 1.000 Y NA
 2195680 2195681 PA14_14020 PA14_14040   rhl FALSE 0.104 161.000 0.019 1.000 N NA
 2195684 2195685 PA14_14100 PA14_14110   pcs FALSE 0.074 114.000 0.000 1.000 N NA
 2195685 2195686 PA14_14110 PA14_14130 pcs   FALSE 0.335 71.000 0.020 NA   NA
 2195686 2195687 PA14_14130 PA14_14140     FALSE 0.182 67.000 0.000 NA   NA
 2195687 2195688 PA14_14140 PA14_14150     TRUE 0.729 -7.000 0.000 NA N NA
 2195688 2195689 PA14_14150 PA14_14160     FALSE 0.424 29.000 0.000 1.000   NA
 2195689 2195690 PA14_14160 PA14_14170     FALSE 0.089 121.000 0.000 1.000   NA
 2195690 2195691 PA14_14170 PA14_14200     TRUE 0.735 4.000 0.000 NA   NA
 2195691 2195692 PA14_14200 PA14_14210     FALSE 0.134 89.000 0.000 NA   NA
 2195693 2195694 PA14_14220 PA14_14230     FALSE 0.122 93.000 0.000 NA   NA
 2195694 2195695 PA14_14230 PA14_14250     FALSE 0.168 74.000 0.000 NA   NA
 2195699 2195700 PA14_14300 PA14_14310     TRUE 0.952 -69.000 0.179 1.000 N NA
 2195702 2195703 PA14_14330 PA14_14340     FALSE 0.039 188.000 0.000 1.000   NA
 2195703 2195704 PA14_14340 PA14_14360     FALSE 0.234 92.000 0.010 1.000   NA
 2195704 2195705 PA14_14360 PA14_14370     FALSE 0.091 119.000 0.000 1.000   NA
 2195705 2195706 PA14_14370 PA14_14380     TRUE 0.991 3.000 0.771 1.000   NA
 2195706 2195707 PA14_14380 PA14_14390     TRUE 0.813 84.000 0.562 NA   NA
 2195708 2195709 PA14_14400 PA14_14420     FALSE 0.122 93.000 0.000 NA   NA
 2195709 2195710 PA14_14420 PA14_14430     FALSE 0.003 1565.000 0.000 NA   NA
 2195711 2195712 PA14_14440 PA14_14450 valS   FALSE 0.152 121.000 0.009 NA   NA
 2195712 2195713 PA14_14450 PA14_14460   holC TRUE 0.829 12.000 0.034 NA   NA
 2195713 2195714 PA14_14460 PA14_14470 holC pepA TRUE 0.991 -3.000 0.494 1.000 N NA
 2195715 2195716 PA14_14480 PA14_14490     FALSE 0.160 84.000 0.000 1.000   NA
 2195716 2195717 PA14_14490 PA14_14500     FALSE 0.037 193.000 0.000 1.000   NA
 2195717 2195718 PA14_14500 PA14_14510     TRUE 0.996 -7.000 0.631 0.082   NA
 2195720 2195721 PA14_14530 PA14_14540     FALSE 0.020 237.000 0.000 NA   NA
 2195721 2195722 PA14_14540 PA14_14550     TRUE 0.722 -40.000 0.000 NA   NA
 2195723 1544111 PA14_14560 PA14_14570     FALSE 0.119 94.000 0.000 NA   NA
 2195724 2195725 PA14_14590 PA14_14600 queA tgt TRUE 0.996 13.000 0.360 0.000 Y NA
 2195725 2195726 PA14_14600 PA14_14610 tgt   TRUE 0.841 44.000 0.325 NA N NA
 2195726 2195727 PA14_14610 PA14_14630   secD TRUE 0.801 60.000 0.031 NA Y NA
 2195727 2195728 PA14_14630 PA14_14650 secD secF TRUE 0.995 11.000 0.171 0.001 Y NA
 2195728 2195729 PA14_14650 PA14_14660 secF   FALSE 0.133 184.000 0.050 1.000   NA
 2195731 2195732 PA14_14690 PA14_14700   cysE TRUE 0.973 0.000 0.208 1.000 N NA
 2195732 2195733 PA14_14700 PA14_14710 cysE   FALSE 0.450 145.000 0.271 1.000 N NA
 2195733 2195734 PA14_14710 PA14_14730   iscS TRUE 0.919 30.000 0.424 1.000 N NA
 2195734 2195735 PA14_14730 PA14_14740 iscS   FALSE 0.297 36.000 0.000 1.000 N NA
 2195735 2195736 PA14_14740 PA14_14750     TRUE 0.872 28.000 0.000 0.001   NA
 2195736 2195737 PA14_14750 PA14_14770   hscB TRUE 0.981 8.000 0.500 1.000   NA
 2195737 2195738 PA14_14770 PA14_14780 hscB hscA TRUE 0.976 43.000 0.634 1.000 Y NA
 2195738 2195739 PA14_14780 PA14_14800 hscA fdx2 TRUE 0.988 7.000 0.794 1.000 N NA
 2195739 2195740 PA14_14800 PA14_14810 fdx2   TRUE 0.957 26.000 0.625 1.000   NA
 2195740 2195741 PA14_14810 PA14_14820   ndk FALSE 0.044 244.000 0.017 1.000   NA
 2195741 2195742 PA14_14820 PA14_14830 ndk   TRUE 0.858 25.000 0.156 1.000   NA
 2195742 2195743 PA14_14830 PA14_14850   pilF TRUE 0.846 18.000 0.086 1.000   NA
 2195743 2195744 PA14_14850 PA14_14860 pilF   TRUE 0.980 -3.000 0.204 1.000   NA
 2195744 2195745 PA14_14860 PA14_14880   gcpE TRUE 0.983 -3.000 0.233 1.000   NA
 2195745 2195746 PA14_14880 PA14_14890 gcpE hisS TRUE 0.897 19.000 0.207 1.000 N NA
 2195746 2195747 PA14_14890 PA14_14900 hisS   TRUE 0.898 27.000 0.259 1.000   NA
 2195747 2195748 PA14_14900 PA14_14910     TRUE 0.987 2.000 0.492 1.000   NA
 2195748 2195749 PA14_14910 PA14_14930     TRUE 0.651 78.000 0.203 1.000   NA
 2195749 2195750 PA14_14930 PA14_14940     FALSE 0.023 297.000 0.006 1.000   NA
 2195750 2195751 PA14_14940 PA14_14960     TRUE 0.948 -12.000 0.099 1.000   NA
 2195751 2195752 PA14_14960 PA14_14975     FALSE 0.073 134.000 0.000 NA   NA
 2195754 2195755 PA14_15000 PA14_15020     FALSE 0.235 54.000 0.000 NA   NA
 2195757 2195758 PA14_15050 PA14_15070   oprC FALSE 0.082 121.000 0.000 NA   NA
 2195758 2195759 PA14_15070 PA14_15080 oprC   FALSE 0.404 65.000 0.029 1.000   NA
 2195760 2195761 PA14_15090 PA14_15100     FALSE 0.139 87.000 0.000 NA   NA
 2195762 2195763 PA14_15110 PA14_15120     FALSE 0.076 129.000 0.000 NA   NA
 2195763 2195764 PA14_15120 PA14_15130     FALSE 0.219 57.000 0.000 NA   NA
 2195767 2195768 PA14_15160 PA14_15180     TRUE 0.746 59.000 0.258 1.000 N NA
 2195768 2195769 PA14_15180 PA14_15190     TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA Y NA
 2195769 2195770 PA14_15190 PA14_15200     TRUE 0.942 73.000 0.533 NA Y NA
 2195770 2195771 PA14_15200 PA14_15210     FALSE 0.478 152.000 0.333 1.000 N NA
 2195771 2195772 PA14_15210 PA14_15230   xseA TRUE 0.651 7.000 0.000 1.000 N NA
 2195772 2195773 PA14_15230 PA14_15240 xseA   FALSE 0.455 37.000 0.006 1.000 N NA
 2195775 2195776 PA14_15260 PA14_15270     TRUE 0.848 30.000 0.208 NA N NA
 2195776 2195777 PA14_15270 PA14_15280     TRUE 0.928 13.000 0.214 NA N NA
 2195777 2195778 PA14_15280 PA14_15290     FALSE 0.302 135.000 0.120 NA N NA
 2195779 2195780 PA14_15310 PA14_15340 guaB guaA TRUE 0.957 80.000 0.190 0.000 Y NA
 2195780 2195781 PA14_15340 PA14_15350 guaA   FALSE 0.017 307.000 0.002 1.000 N NA
 2195782 2195783 PA14_15360 PA14_15370     FALSE 0.073 134.000 0.000 NA   NA
 2195784 2195785 PA14_15380 PA14_15400 repA   TRUE 0.981 -28.000 0.429 NA   NA
 10942645 2195786 PA14_15410 PA14_15430     FALSE 0.041 179.000 0.000 NA   NA
 2195786 2195787 PA14_15430 PA14_15435     FALSE 0.055 131.000 0.000 NA N NA
 2195787 2195788 PA14_15435 PA14_15445   merE TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2195788 2195789 PA14_15445 PA14_15450 merE merD TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2195789 2195790 PA14_15450 PA14_15460 merD merA FALSE 0.455 18.000 0.000 1.000 N NA
 2195790 2195791 PA14_15460 PA14_15470 merA merP TRUE 0.646 72.000 0.000 0.001 N NA
 2195791 2195792 PA14_15470 PA14_15475 merP merT TRUE 0.938 13.000 0.000 0.000   NA
 2195793 2195794 PA14_15480 PA14_15490 merR   FALSE 0.017 254.000 0.000 NA   NA
 2195794 2195795 PA14_15490 PA14_15500     FALSE 0.314 40.000 0.000 NA   NA
 2195795 2195796 PA14_15500 PA14_15510   traJ FALSE 0.012 294.000 0.000 NA   NA
 2195796 2195797 PA14_15510 PA14_15520 traJ trbJ FALSE 0.015 265.000 0.000 NA   NA
 2195797 2195798 PA14_15520 PA14_15530 trbJ   TRUE 0.970 18.000 0.667 NA   NA
 2195798 2195799 PA14_15530 PA14_15540     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 2195801 2195802 PA14_15570 PA14_15580     FALSE 0.468 59.000 0.039 NA   NA
 2195802 2195803 PA14_15580 PA14_15590     FALSE 0.058 1031.000 0.434 NA N NA
 2195803 2195804 PA14_15590 PA14_15600     TRUE 0.992 -7.000 0.727 NA   NA
 2195804 2195805 PA14_15600 PA14_15610     FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 2195805 2195806 PA14_15610 PA14_15620     FALSE 0.004 601.000 0.000 NA   NA
 2195806 2195807 PA14_15620 PA14_15630     TRUE 0.733 -79.000 0.000 1.000   NA
 2195809 2195810 PA14_15660 PA14_15670     FALSE 0.248 164.000 0.000 0.049   NA
 2195810 2195811 PA14_15670 PA14_15680     TRUE 0.917 -9.000 0.045 1.000 N NA
 2195811 2195812 PA14_15680 PA14_15700     FALSE 0.005 389.000 0.000 1.000 N NA
 2195812 2195813 PA14_15700 PA14_15710     FALSE 0.078 126.000 0.000 NA   NA
 2195815 2195816 PA14_15740 PA14_15750 purL   TRUE 0.699 7.000 0.000 NA   NA
 2195816 2195817 PA14_15750 PA14_15770     FALSE 0.040 180.000 0.000 NA   NA
 2195818 2195819 PA14_15780 PA14_15790     TRUE 0.990 25.000 0.258 0.002 Y NA
 2195819 2195820 PA14_15790 PA14_15810     TRUE 0.904 17.000 0.200 1.000 N NA
 2195820 2195821 PA14_15810 PA14_15820     TRUE 0.972 -3.000 0.146 1.000 N NA
 2195821 2195822 PA14_15820 PA14_15830     TRUE 0.879 17.000 0.146 1.000 N NA
 2195822 2195823 PA14_15830 PA14_15840     FALSE 0.019 243.000 0.000 NA   NA
 2195823 2195824 PA14_15840 PA14_15850     TRUE 0.513 63.000 0.065 NA   NA
 2195825 2195826 PA14_15860 PA14_15870     TRUE 0.709 38.000 0.078 1.000   NA
 2195826 2195827 PA14_15870 PA14_15880     TRUE 0.957 -3.000 0.062 NA   NA
 2195827 2195828 PA14_15880 PA14_15890   purT TRUE 0.781 38.000 0.154 NA   NA
 2195828 2195829 PA14_15890 PA14_15910 purT   TRUE 0.900 2.000 0.033 1.000 N NA
 2195830 2195831 PA14_15920 PA14_15930     FALSE 0.017 304.000 0.008 NA N NA
 2195831 2195832 PA14_15930 PA14_15940     TRUE 0.958 13.000 0.349 NA   NA
 2195833 2195834 PA14_15960 PA14_15970 ffh rpsP FALSE 0.301 210.000 0.361 1.000 N NA
 2195834 2195835 PA14_15970 PA14_15980 rpsP rimM TRUE 0.994 16.000 0.342 0.010 Y NA
 2195835 2195836 PA14_15980 PA14_15990 rimM trmD TRUE 0.996 7.000 0.672 1.000 Y NA
 2195836 2195837 PA14_15990 PA14_16000 trmD rplS TRUE 0.974 42.000 0.567 1.000 Y NA
 2195837 2195838 PA14_16000 PA14_16010 rplS   FALSE 0.087 152.000 0.004 NA N NA
 2195839 2195840 PA14_16020 PA14_16030     FALSE 0.092 113.000 0.000 NA   NA
 2195841 2195842 PA14_16040 PA14_16050 xerD dsbC FALSE 0.166 127.000 0.026 1.000 N NA
 2195842 2195843 PA14_16050 PA14_16070 dsbC hom FALSE 0.063 214.000 0.029 1.000 N NA
 2195843 2195844 PA14_16070 PA14_16090 hom thrC TRUE 0.895 53.000 0.125 1.000 Y NA
 2195848 2195849 PA14_16140 PA14_16150     TRUE 0.982 15.000 0.911 NA   NA
 2195849 2195850 PA14_16150 PA14_16160     TRUE 0.627 56.000 0.107 NA   NA
 2195850 2195851 PA14_16160 PA14_16180     TRUE 0.940 36.000 0.644 NA   NA
 2195851 2195852 PA14_16180 PA14_16190     TRUE 0.694 150.000 0.711 NA   NA
 2195852 2195853 PA14_16190 PA14_16200     TRUE 0.826 19.000 0.073 1.000   NA
 2195853 2195854 PA14_16200 PA14_16210     FALSE 0.105 107.000 0.000 1.000   NA
 2195854 2195855 PA14_16210 PA14_16220   recJ FALSE 0.464 44.000 0.011 1.000   NA
 2195855 2195856 PA14_16220 PA14_16250 recJ lasB FALSE 0.010 287.000 0.000 1.000 N NA
 2195856 2195857 PA14_16250 PA14_16260 lasB   FALSE 0.037 170.000 0.000 1.000 N NA
 2195857 2195858 PA14_16260 PA14_16270     FALSE 0.036 188.000 0.000 NA   NA
 2195860 2195861 PA14_16290 PA14_16300     TRUE 0.691 8.000 0.000 NA   NA
 2195861 2195862 PA14_16300 PA14_16310     FALSE 0.065 148.000 0.000 NA   NA
 2195865 2195866 PA14_16340 PA14_16350     FALSE 0.082 121.000 0.000 NA   NA
 2195866 2195867 PA14_16350 PA14_16360     FALSE 0.011 324.000 0.000 1.000   NA
 2195870 2195871 PA14_16390 PA14_16410     FALSE 0.343 109.000 0.094 1.000 N NA
 2195871 2195872 PA14_16410 PA14_16430   wspA FALSE 0.012 267.000 0.000 1.000 N NA
 2195872 2195873 PA14_16430 PA14_16440 wspA   TRUE 0.998 5.000 0.600 0.011 Y NA
 2195873 2195874 PA14_16440 PA14_16450   wspC TRUE 0.998 -3.000 0.635 1.000 Y NA
 2195874 2195875 PA14_16450 PA14_16460 wspC wspD TRUE 0.997 -7.000 0.558 1.000 Y NA
 2195875 2195876 PA14_16460 PA14_16470 wspD   TRUE 0.999 -3.000 0.587 0.011 Y NA
 2195876 2195877 PA14_16470 PA14_16480   wspF TRUE 0.999 -3.000 0.324 0.011 Y NA
 2195877 2195878 PA14_16480 PA14_16500 wspF wspR TRUE 0.948 108.000 0.480 0.021 Y NA
 2195878 2195879 PA14_16500 PA14_16510 wspR   FALSE 0.037 220.000 0.002 1.000 N NA
 2195879 2195880 PA14_16510 PA14_16530   lysS TRUE 0.751 181.000 0.162 0.035 Y NA
 2195880 2195881 PA14_16530 PA14_16550 lysS   FALSE 0.057 212.000 0.012 1.000   NA
 2195881 2195882 PA14_16550 PA14_16560     TRUE 0.634 97.000 0.304 NA   NA
 2195882 2195883 PA14_16560 PA14_16580     TRUE 0.924 9.000 0.104 NA   NA
 2195883 2195884 PA14_16580 PA14_16590     FALSE 0.319 69.000 0.015 NA   NA
 2195884 2195885 PA14_16590 PA14_16600     TRUE 0.920 -3.000 0.015 NA   NA
 2195885 2195886 PA14_16600 PA14_16610     TRUE 0.977 -3.000 0.174 NA   NA
 2195886 2195887 PA14_16610 PA14_16620     TRUE 0.925 -3.000 0.020 NA   NA
 2195888 2195889 PA14_16630 PA14_16640     TRUE 0.842 49.000 0.333 NA   NA
 2195889 2195890 PA14_16640 PA14_16660     FALSE 0.007 402.000 0.000 NA   NA
 2195893 2195894 PA14_16690 PA14_16700 ppc adk FALSE 0.043 161.000 0.000 1.000 N NA
 2195894 2195895 PA14_16700 PA14_16710 adk   FALSE 0.189 104.000 0.019 1.000 N NA
 2195895 2195896 PA14_16710 PA14_16720     FALSE 0.284 74.000 0.008 NA   NA
 2195896 2195897 PA14_16720 PA14_16730     TRUE 0.822 19.000 0.074 NA   NA
 2195897 2195898 PA14_16730 PA14_16740     FALSE 0.392 73.000 0.037 NA   NA
 2195898 2195899 PA14_16740 PA14_16750     TRUE 0.931 5.000 0.090 NA   NA
 2195899 2195900 PA14_16750 PA14_16770     FALSE 0.395 56.000 0.017 NA   NA
 2195900 2195901 PA14_16770 PA14_16780     FALSE 0.402 29.000 0.000 NA   NA
 2195903 2195904 PA14_16800 PA14_16820     TRUE 0.974 5.000 0.354 NA N NA
 2195905 2195906 PA14_16830 PA14_16840     FALSE 0.205 137.000 0.042 NA   NA
 2195906 2195907 PA14_16840 PA14_16860   plsB FALSE 0.217 143.000 0.052 NA   NA
 2195908 2195909 PA14_16870 PA14_16880     TRUE 0.990 -3.000 0.426 1.000   NA
 2195909 2195910 PA14_16880 PA14_16890     TRUE 0.972 11.000 0.435 NA   NA
 2195910 2195911 PA14_16890 PA14_16910     TRUE 0.890 4.000 0.032 NA   NA
 2195912 2195913 PA14_16920 PA14_16930     TRUE 0.969 -3.000 0.116 NA   NA
 2195913 2195914 PA14_16930 PA14_16950   dapD TRUE 0.846 95.000 0.244 1.000 Y NA
 2195914 2195915 PA14_16950 PA14_16960 dapD   TRUE 0.864 30.000 0.000 1.000 Y NA
 2195915 2195916 PA14_16960 PA14_16970     TRUE 0.536 13.000 0.000 1.000 N NA
 2195918 2195919 PA14_16990 PA14_17000     FALSE 0.010 322.000 0.000 NA   NA
 2195921 2195922 PA14_17030 PA14_17040   glnD TRUE 0.919 18.000 0.257 1.000 N NA
 2195922 2195923 PA14_17040 PA14_17050 glnD map TRUE 0.590 167.000 0.651 1.000 N NA
 2195924 2195925 PA14_17060 PA14_17070 rpsB tsf TRUE 0.906 131.000 0.748 1.000 Y NA
 2195925 2195926 PA14_17070 PA14_17080 tsf pyrH FALSE 0.061 199.000 0.017 1.000 N NA
 2195926 2195927 PA14_17080 PA14_17100 pyrH frr TRUE 0.885 3.000 0.030 1.000 N NA
 2195927 2195928 PA14_17100 PA14_17110 frr uppS TRUE 0.952 16.000 0.409 1.000 N NA
 2195928 2195929 PA14_17110 PA14_17120 uppS cdsA TRUE 0.996 -6.000 0.400 1.000 Y NA
 2195929 2195930 PA14_17120 PA14_17130 cdsA dxr TRUE 0.997 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 2195930 2195931 PA14_17130 PA14_17140 dxr   TRUE 0.948 26.000 0.568 1.000 N NA
 2195931 2195932 PA14_17140 PA14_17150     TRUE 0.739 71.000 0.014 1.000 Y NA
 2195932 2195933 PA14_17150 PA14_17170     TRUE 0.860 51.000 0.050 1.000 Y NA
 2195933 2195934 PA14_17170 PA14_17180   lpxD TRUE 0.998 0.000 0.814 1.000 Y NA
 2195934 2195935 PA14_17180 PA14_17190 lpxD fabZ TRUE 0.931 46.000 0.796 1.000 N NA
 2195935 2195936 PA14_17190 PA14_17210 fabZ lpxA TRUE 0.995 -3.000 0.850 1.000 N NA
 2195936 2195937 PA14_17210 PA14_17220 lpxA lpxB TRUE 0.993 4.000 0.289 1.000 Y NA
 2195937 2195938 PA14_17220 PA14_17230 lpxB rnhB TRUE 0.970 0.000 0.186 1.000 N NA
 2195938 2195939 PA14_17230 PA14_17250 rnhB   FALSE 0.020 217.000 0.000 1.000 N NA
 2195939 2195940 PA14_17250 PA14_17260   dnaE FALSE 0.061 130.000 0.000 1.000 N NA
 2195940 2195941 PA14_17260 PA14_17270 dnaE accA FALSE 0.284 150.000 0.122 1.000 N NA
 2195941 2195942 PA14_17270 PA14_17280 accA   TRUE 0.555 70.000 0.123 1.000 N NA
 2195942 2195943 PA14_17280 PA14_17290   pyrG FALSE 0.085 171.000 0.016 1.000 N NA
 2195943 2195944 PA14_17290 PA14_17310 pyrG kdsA TRUE 0.951 3.000 0.138 1.000 N NA
 2195944 2195945 PA14_17310 PA14_17320 kdsA eno TRUE 0.694 46.000 0.125 1.000 N NA
 2195945 2195946 PA14_17320 PA14_17330 eno   TRUE 0.705 65.000 0.241 1.000 N NA
 2195946 2195947 PA14_17330 PA14_17340   ispD TRUE 0.883 20.000 0.185 1.000 N NA
 2195948 2195949 PA14_17350 PA14_17370     TRUE 0.991 -34.000 0.844 NA   NA
 2195949 2195950 PA14_17370 PA14_17380     FALSE 0.166 76.000 0.000 NA   NA
 2195951 2195952 PA14_17400 PA14_17410 adhC   TRUE 0.888 54.000 0.567 1.000   NA
 2195952 2195953 PA14_17410 PA14_17420   ispF FALSE 0.318 71.000 0.012 1.000   NA
 2195953 2195954 PA14_17420 PA14_17440 ispF   TRUE 0.978 -3.000 0.173 1.000   NA
 2195954 2195955 PA14_17440 PA14_17450   surE TRUE 0.972 -12.000 0.235 1.000   NA
 2195955 2195956 PA14_17450 PA14_17460 surE pcm TRUE 0.905 33.000 0.353 1.000   NA
 2195956 2195957 PA14_17460 PA14_17470 pcm   FALSE 0.388 46.000 0.007 1.000 N NA
 2195957 2195958 PA14_17470 PA14_17480   rpoS FALSE 0.336 105.000 0.081 1.000 N NA
 2195959 2195960 PA14_17490 PA14_17500 fdxA mutS FALSE 0.319 67.000 0.020 1.000 N NA
 2195960 2195961 PA14_17500 PA14_17510 mutS   FALSE 0.057 126.000 0.000 NA N NA
 2195962 2195963 PA14_17520 PA14_17530   recA FALSE 0.281 134.000 0.082 NA   NA
 2195963 2195964 PA14_17530 PA14_17540 recA   TRUE 0.971 6.000 0.296 1.000   NA
 2195965 2195966 PA14_17550 PA14_17570     FALSE 0.484 83.000 0.089 NA   NA
 2195968 2195969 PA14_17590 PA14_17600     TRUE 0.495 19.000 0.000 NA   NA
 2195969 2195970 PA14_17600 PA14_17610   potD FALSE 0.043 176.000 0.000 NA   NA
 2195970 2195971 PA14_17610 PA14_17620 potD potC TRUE 0.779 89.000 0.000 0.072 Y NA
 2195971 2195972 PA14_17620 PA14_17630 potC potB TRUE 0.993 -7.000 0.040 0.072 Y NA
 2195972 2195973 PA14_17630 PA14_17640 potB potA TRUE 0.994 5.000 0.440 1.000 Y NA
 2195976 2195977 PA14_17670 PA14_17675   dgkA FALSE 0.143 72.000 0.000 1.000 N NA
 2195979 2195980 PA14_17700 PA14_17710     TRUE 0.986 0.000 0.083 0.010   NA
 2195982 2195983 PA14_17730 PA14_17740     TRUE 0.542 200.000 0.750 1.000   NA
 2195983 2195984 PA14_17740 PA14_17760     FALSE 0.107 90.000 0.000 1.000 N NA
 2195985 2195986 PA14_17780 PA14_17790     FALSE 0.027 219.000 0.000 1.000   NA
 2195987 2195988 PA14_17810 PA14_17820     TRUE 0.700 39.000 0.094 1.000 N NA
 2195988 2195989 PA14_17820 PA14_17850     TRUE 0.535 60.000 0.000 0.080 N NA
 2195989 2195990 PA14_17850 PA14_17860     TRUE 0.996 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 2195990 2195991 PA14_17860 PA14_17880     TRUE 0.979 23.000 0.333 1.000 Y NA
 2195991 2195992 PA14_17880 PA14_17890     FALSE 0.257 53.000 0.000 1.000   NA
 2195995 2195996 PA14_17920 PA14_17930 glpM glpD FALSE 0.073 133.000 0.000 NA   NA
 2195996 2195997 PA14_17930 PA14_17940 glpD glpR FALSE 0.011 279.000 0.000 1.000 N NA
 2195997 2195998 PA14_17940 PA14_17960 glpR glpK FALSE 0.098 206.000 0.055 1.000 N NA
 2195998 2195999 PA14_17960 PA14_17980 glpK glpF TRUE 0.504 40.000 0.023 1.000 N NA
 2196000 2196001 PA14_17990 PA14_18010     FALSE 0.304 64.000 0.004 NA   NA
 2196001 2196002 PA14_18010 PA14_18020     FALSE 0.062 196.000 0.004 1.000   NA
 2196002 2196003 PA14_18020 PA14_18040     FALSE 0.004 815.000 0.000 NA   NA
 2196004 2196005 PA14_18050 PA14_18060     FALSE 0.109 99.000 0.000 NA   NA
 2196009 2196010 PA14_18100 PA14_18110   mmsR FALSE 0.078 127.000 0.000 NA   NA
 2196011 2196012 PA14_18120 PA14_18140 mmsA mmsB TRUE 0.903 16.000 0.000 0.002 N NA
 2196012 2196013 PA14_18140 PA14_18150 mmsB   TRUE 0.601 102.000 0.009 1.000 Y NA
 2196014 2196015 PA14_18160 PA14_18180     TRUE 0.975 22.000 0.400 0.049   NA
 2196017 2196018 PA14_18210 PA14_18230   fruR FALSE 0.158 113.000 0.017 NA N NA
 2196019 2196020 PA14_18250 PA14_18260   fruK TRUE 0.990 0.000 0.101 1.000 Y NA
 2196020 2196021 PA14_18260 PA14_18275 fruK fruA TRUE 0.997 2.000 0.562 1.000 Y NA
 2196022 2196023 PA14_18300 PA14_18310     TRUE 0.976 -3.000 0.161 1.000   NA
 2196023 2196024 PA14_18310 PA14_18320     TRUE 0.997 -3.000 0.613 0.080   NA
 2196024 2196025 PA14_18320 PA14_18330   arnT TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 2196025 2196026 PA14_18330 PA14_18340 arnT   TRUE 0.918 -3.000 0.020 1.000 N NA
 2196026 2196027 PA14_18340 PA14_18350     TRUE 0.997 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 2196027 2196028 PA14_18350 PA14_18360     TRUE 0.995 -3.000 0.220 NA Y NA
 2196028 2196029 PA14_18360 PA14_18370     TRUE 0.997 -3.000 0.378 NA Y NA
 2196029 2196030 PA14_18370 PA14_18380   algA FALSE 0.064 388.000 0.000 1.000 Y NA
 2196030 2196031 PA14_18380 PA14_18410 algA algF FALSE 0.372 197.000 0.400 NA   NA
 2196031 2196032 PA14_18410 PA14_18430 algF algJ TRUE 0.899 73.000 0.889 NA   NA
 2196032 2196033 PA14_18430 PA14_18450 algJ algI TRUE 0.982 15.000 0.889 NA   NA
 2196033 2196034 PA14_18450 PA14_18470 algI algL FALSE 0.280 242.000 0.438 NA   NA
 2196034 2196035 PA14_18470 PA14_18480 algL algX TRUE 0.986 4.000 0.562 NA   NA
 2196035 2196036 PA14_18480 PA14_18500 algX algG TRUE 0.970 13.000 0.500 NA   NA
 2196036 2196037 PA14_18500 PA14_18510 algG algE TRUE 0.963 21.000 0.625 NA   NA
 2196037 2196038 PA14_18510 PA14_18520 algE algK TRUE 0.990 -3.000 0.417 NA   NA
 2196038 2196039 PA14_18520 PA14_18550 algK alg44 TRUE 0.964 14.000 0.455 NA   NA
 2196039 2196040 PA14_18550 PA14_18565 alg44 alg8 TRUE 0.798 83.000 0.500 NA   NA
 2196040 2196041 PA14_18565 PA14_18580 alg8 algD TRUE 0.699 131.000 0.625 NA   NA
 2196041 2196042 PA14_18580 PA14_18590 algD   FALSE 0.004 903.000 0.000 NA   NA
 2196042 2196043 PA14_18590 PA14_18600     FALSE 0.097 107.000 0.000 NA   NA
 2196043 2196044 PA14_18600 PA14_18610   argF TRUE 0.974 5.000 0.025 1.000 Y NA
 2196047 2196048 PA14_18640 PA14_18650     FALSE 0.228 113.000 0.039 1.000 N NA
 2196048 2196049 PA14_18650 PA14_18660     FALSE 0.113 83.000 0.000 NA N NA
 2196050 2196051 PA14_18670 PA14_18680 bfrB   TRUE 0.566 210.000 0.286 NA Y NA
 2196053 2196054 PA14_18700 PA14_18710 rnt pyrC TRUE 0.955 -3.000 0.068 1.000 N NA
 2196055 2196056 PA14_18720 PA14_18740   argG FALSE 0.149 118.000 0.013 1.000 N NA
 2196058 2196059 PA14_18760 PA14_18780     TRUE 0.807 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2196059 2196060 PA14_18780 PA14_18790     TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.072 N NA
 2196060 2196061 PA14_18790 PA14_18800     FALSE 0.004 571.000 0.000 1.000 N NA
 2196061 2196062 PA14_18800 PA14_18810     FALSE 0.007 401.000 0.000 1.000   NA
 2196062 2196063 PA14_18810 PA14_18820     TRUE 0.836 33.000 0.000 0.002   NA
 2196063 2196064 PA14_18820 PA14_18830     FALSE 0.405 31.000 0.000 1.000   NA
 2196064 2196065 PA14_18830 PA14_18850     TRUE 0.993 0.000 0.000 0.001 Y NA
 2196065 2196066 PA14_18850 PA14_18860     FALSE 0.216 50.000 0.000 1.000 N NA
 2196067 2196068 PA14_18870 PA14_18880   nth FALSE 0.179 109.000 0.012 NA   NA
 2196068 2196069 PA14_18880 PA14_18890 nth   TRUE 0.966 -3.000 0.109 1.000 N NA
 2196069 2196070 PA14_18890 PA14_18900     TRUE 0.999 -7.000 0.908 0.069 Y NA
 2196070 2196071 PA14_18900 PA14_18910     TRUE 0.999 0.000 0.924 0.069 Y NA
 2196071 2196072 PA14_18910 PA14_18920     TRUE 0.999 3.000 0.814 0.069 Y NA
 2196072 2196073 PA14_18920 PA14_18930     TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.021 Y NA
 2196073 2196074 PA14_18930 PA14_18950     TRUE 0.999 -3.000 0.564 0.069 Y NA
 2196074 2196075 PA14_18950 PA14_18960     FALSE 0.041 178.000 0.000 NA   NA
 2196075 2196076 PA14_18960 PA14_18970   pldA FALSE 0.006 429.000 0.000 NA   NA
 2196076 2196077 PA14_18970 PA14_18985 pldA   TRUE 0.735 4.000 0.000 NA   NA
 2196077 2196078 PA14_18985 PA14_19010     FALSE 0.012 295.000 0.000 NA   NA
 2196078 2196079 PA14_19010 PA14_19020     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2196079 2196080 PA14_19020 PA14_19030     FALSE 0.139 87.000 0.000 NA   NA
 2196080 2196081 PA14_19030 PA14_19050   metG TRUE 0.562 34.000 0.018 NA   NA
 2196082 2196083 PA14_19065 PA14_19090     FALSE 0.389 102.000 0.112 1.000 N NA
 2196083 2196084 PA14_19090 PA14_19100   rhlA FALSE 0.006 424.000 0.000 NA   NA
 2196084 2196085 PA14_19100 PA14_19110 rhlA rhlB FALSE 0.186 66.000 0.000 NA   NA
 2196085 2196086 PA14_19110 PA14_19120 rhlB rhlR FALSE 0.065 125.000 0.000 1.000 N NA
 2196086 2196087 PA14_19120 PA14_19130 rhlR rhlI FALSE 0.244 181.000 0.182 1.000 N NA
 2196087 2196088 PA14_19130 PA14_19140 rhlI pheC FALSE 0.374 155.000 0.000 1.000 Y NA
 2196088 2196089 PA14_19140 PA14_19150 pheC   TRUE 0.572 94.000 0.000 1.000 Y NA
 2196089 2196090 PA14_19150 PA14_19160     TRUE 0.925 -3.000 0.019 NA   NA
 2196093 2196094 PA14_19205 PA14_19210     TRUE 0.807 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2196094 2196095 PA14_19210 PA14_19230     FALSE 0.426 18.000 0.000 NA N NA
 2196095 2196096 PA14_19230 PA14_19270     FALSE 0.034 168.000 0.000 NA N NA
 2196100 2196101 PA14_19330 PA14_19340     FALSE 0.249 51.000 0.000 NA   NA
 2196101 2196102 PA14_19340 PA14_19350     FALSE 0.303 137.000 0.125 NA N NA
 2196102 2196103 PA14_19350 PA14_19360     TRUE 0.990 -3.000 0.471 NA N NA
 2196103 2196104 PA14_19360 PA14_19370     TRUE 0.906 41.000 0.514 1.000 N NA
 2196106 2196107 PA14_19390 PA14_19400     FALSE 0.115 101.000 0.000 1.000   NA
 2196108 2196109 PA14_19410 PA14_19430     FALSE 0.150 153.000 0.029 NA   NA
 2196109 2196110 PA14_19430 PA14_19450     FALSE 0.076 129.000 0.000 NA   NA
 2196111 2196112 PA14_19470 PA14_19480 mqoA   FALSE 0.030 203.000 0.000 NA   NA
 2196113 2196114 PA14_19490 PA14_19500     FALSE 0.014 251.000 0.000 1.000 N NA
 2196114 2196115 PA14_19500 PA14_19510     TRUE 0.999 4.000 0.795 0.072 Y NA
 2196115 2196116 PA14_19510 PA14_19520     TRUE 0.996 -3.000 0.273 1.000 Y NA
 2196116 2196117 PA14_19520 PA14_19530     FALSE 0.063 154.000 0.000 1.000   NA
 2196117 2196118 PA14_19530 PA14_19540     FALSE 0.458 119.000 0.193 1.000   NA
 2196118 2196119 PA14_19540 PA14_19560   ssuD TRUE 0.599 78.000 0.176 1.000 N NA
 2196119 2196120 PA14_19560 PA14_19570 ssuD   TRUE 0.898 21.000 0.226 1.000 N NA
 2196120 2196121 PA14_19570 PA14_19580     TRUE 0.997 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 2196121 2196122 PA14_19580 PA14_19590     TRUE 0.875 41.000 0.161 0.090 N NA
 2196123 2196124 PA14_19600 PA14_19610     TRUE 0.640 52.000 0.097 NA   NA
 2196124 2196125 PA14_19610 PA14_19620   folX FALSE 0.256 129.000 0.061 NA   NA
 2196125 2196126 PA14_19620 PA14_19630 folX folE1 TRUE 0.981 2.000 0.030 1.000 Y NA
 2196126 2196127 PA14_19630 PA14_19640 folE1   TRUE 0.843 18.000 0.100 1.000 N NA
 2196127 2196128 PA14_19640 PA14_19650     FALSE 0.391 111.000 0.120 NA   NA
 2196131 2196132 PA14_19680 PA14_19690     TRUE 0.992 -13.000 0.840 NA   NA
 2196132 2196133 PA14_19690 PA14_19700     FALSE 0.176 129.000 0.034 NA N NA
 2196133 2196134 PA14_19700 PA14_19710     TRUE 0.972 -3.000 0.125 1.000   NA
 2196134 2196135 PA14_19710 PA14_19720     FALSE 0.109 99.000 0.000 NA   NA
 2196135 2196136 PA14_19720 PA14_19730     FALSE 0.088 116.000 0.000 NA   NA
 2196136 2196137 PA14_19730 PA14_19740     TRUE 0.746 117.000 0.021 0.079 Y NA
 2196138 2196139 PA14_19750 PA14_19770     TRUE 0.936 35.000 0.600 NA   NA
 2196139 2196140 PA14_19770 PA14_19800     TRUE 0.709 91.000 0.400 1.000 N NA
 2196141 2196142 PA14_19810 PA14_19830     FALSE 0.219 57.000 0.000 NA   NA
 2196142 2196143 PA14_19830 PA14_19850     TRUE 0.505 150.000 0.333 NA   NA
 2196145 2196146 PA14_19870 PA14_19900 ldh   FALSE 0.226 142.000 0.065 1.000 N NA
 2196146 2196147 PA14_19900 PA14_19910     TRUE 0.999 -7.000 0.458 0.001 Y NA
 2196147 2196148 PA14_19910 PA14_19920     TRUE 0.994 18.000 0.556 0.079 Y NA
 2196149 2196150 PA14_19930 PA14_19940     FALSE 0.359 34.000 0.000 NA   NA
 2196150 2196151 PA14_19940 PA14_19950     FALSE 0.344 36.000 0.000 NA   NA
 2196152 2196153 PA14_19960 PA14_19970     FALSE 0.083 120.000 0.000 NA   NA
 2196153 2196154 PA14_19970 PA14_19990     FALSE 0.165 77.000 0.000 NA   NA
 2196154 2196155 PA14_19990 PA14_20000     TRUE 0.902 65.000 0.875 NA N NA
 2196155 2196156 PA14_20000 PA14_20010   hasR TRUE 0.494 210.000 0.200 NA Y NA
 2196156 2196157 PA14_20010 PA14_20020 hasR hasAp TRUE 0.744 86.000 0.400 NA   NA
 2196157 2196158 PA14_20020 PA14_20030 hasAp hasD FALSE 0.025 218.000 0.000 NA   NA
 2196158 2196159 PA14_20030 PA14_20040 hasD hasE TRUE 0.995 -3.000 0.286 0.008   NA
 2196159 2196160 PA14_20040 PA14_20050 hasE   TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.008   NA
 2196162 2196163 PA14_20070 PA14_20080     FALSE 0.099 113.000 0.000 1.000   NA
 2196163 2196164 PA14_20080 PA14_20100     TRUE 0.996 4.000 0.538 NA Y NA
 2196164 2196165 PA14_20100 PA14_20110     TRUE 0.991 -3.000 0.086 NA Y NA
 2196165 2196166 PA14_20110 PA14_20120     FALSE 0.235 54.000 0.000 NA   NA
 2196169 2196170 PA14_20150 PA14_20170 nosL nosY TRUE 0.882 17.000 0.135 NA   NA
 2196170 2196171 PA14_20170 PA14_20180 nosY nosF TRUE 0.959 -9.000 0.135 NA   NA
 2196171 2196172 PA14_20180 PA14_20190 nosF nosD TRUE 0.994 -3.000 0.750 1.000 N NA
 2196172 2196173 PA14_20190 PA14_20200 nosD nosZ TRUE 0.985 -3.000 0.035 0.003 N NA
 2196173 2196174 PA14_20200 PA14_20230 nosZ nosR TRUE 0.656 44.000 0.088 1.000 N NA
 2196174 2196175 PA14_20230 PA14_20240 nosR   FALSE 0.016 229.000 0.000 NA N NA
 2196177 2196178 PA14_20260 PA14_20270   rhlG FALSE 0.451 53.000 0.025 NA   NA
 2196178 2196179 PA14_20270 PA14_20280 rhlG   FALSE 0.120 98.000 0.000 1.000   NA
 2196179 2196180 PA14_20280 PA14_20290     FALSE 0.063 154.000 0.000 1.000   NA
 2196181 2196182 PA14_20300 PA14_20320 phnC phnD TRUE 0.981 53.000 0.337 0.002 Y NA
 2196182 2196183 PA14_20320 PA14_20330 phnD phnE TRUE 0.974 68.000 0.330 0.001 Y NA
 2196183 2196184 PA14_20330 PA14_20350 phnE phnF TRUE 0.864 21.000 0.158 1.000 N NA
 2196184 2196185 PA14_20350 PA14_20360 phnF phnG TRUE 0.984 10.000 0.691 1.000 N NA
 2196185 2196186 PA14_20360 PA14_20370 phnG phnH TRUE 0.999 0.000 0.967 0.002 Y NA
 2196186 2196187 PA14_20370 PA14_20380 phnH phnI TRUE 0.999 0.000 0.960 0.002 Y NA
 2196187 2196188 PA14_20380 PA14_20390 phnI phnJ TRUE 0.999 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 2196188 2196189 PA14_20390 PA14_20400 phnJ phnK TRUE 0.999 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 2196189 2196190 PA14_20400 PA14_20420 phnK phnL TRUE 0.991 51.000 0.859 0.017 Y NA
 2196190 2196191 PA14_20420 PA14_20430 phnL phnM TRUE 0.994 -10.000 0.320 1.000 Y NA
 2196191 2196192 PA14_20430 PA14_20440 phnM phnN TRUE 0.994 0.000 0.235 NA Y NA
 2196192 2196193 PA14_20440 PA14_20450 phnN phnP TRUE 0.971 -9.000 0.214 NA   NA
 2196194 2196195 PA14_20460 PA14_20470     FALSE 0.244 52.000 0.000 NA   NA
 2196195 2196196 PA14_20470 PA14_20480     FALSE 0.134 89.000 0.000 NA   NA
 2196196 2196197 PA14_20480 PA14_20491     FALSE 0.034 193.000 0.000 NA   NA
 1544586 2196198 PA14_20500 PA14_20510     FALSE 0.003 1900.000 0.000 NA   NA
 2196198 2196199 PA14_20510 PA14_20520     TRUE 0.891 15.000 0.133 NA   NA
 2196199 2196200 PA14_20520 PA14_20530     TRUE 0.755 -13.000 0.000 NA   NA
 2196202 2196203 PA14_20560 PA14_20570 amiE   TRUE 0.647 84.000 0.222 1.000   NA
 2196203 2196204 PA14_20570 PA14_20580   amiC TRUE 0.799 26.000 0.083 1.000   NA
 2196204 2196205 PA14_20580 PA14_20590 amiC amiR TRUE 0.959 -3.000 0.083 NA N NA
 2196205 2196206 PA14_20590 PA14_20600 amiR   FALSE 0.005 522.000 0.000 NA   NA
 2196208 2196209 PA14_20620 PA14_20630     TRUE 0.970 23.000 0.818 NA   NA
 2196210 2196211 PA14_20640 PA14_20650   dsdA FALSE 0.219 57.000 0.000 NA   NA
 2196212 2196213 PA14_20670 PA14_20680     FALSE 0.454 184.000 0.462 1.000   NA
 2196213 2196214 PA14_20680 PA14_20690     FALSE 0.299 42.000 0.000 NA   NA
 2196215 2196216 PA14_20700 PA14_20720   flgN TRUE 0.796 29.000 0.121 1.000 N NA
 2196216 2196217 PA14_20720 PA14_20730 flgN flgM TRUE 0.982 55.000 0.361 0.001 Y NA
 2196217 2196218 PA14_20730 PA14_20740 flgM flgA TRUE 0.806 145.000 0.371 NA Y NA
 2196219 2196220 PA14_20750 PA14_20760     TRUE 0.964 77.000 0.838 1.000 Y NA
 2196220 2196221 PA14_20760 PA14_20770     FALSE 0.091 315.000 0.000 NA Y NA
 2196221 2196222 PA14_20770 PA14_20780     TRUE 0.995 2.000 0.429 NA Y NA
 2196222 2196223 PA14_20780 PA14_20800     TRUE 0.905 66.000 0.250 NA Y NA
 2196223 2196224 PA14_20800 PA14_20810   recQ FALSE 0.111 84.000 0.000 NA N NA
 2196224 2196225 PA14_20810 PA14_20820 recQ   FALSE 0.201 89.000 0.005 1.000 N NA
 2196225 2196226 PA14_20820 PA14_20840     FALSE 0.062 151.000 0.000 NA   NA
 2196226 2196227 PA14_20840 PA14_20850     FALSE 0.085 118.000 0.000 NA   NA
 2196227 2196228 PA14_20850 PA14_20860     FALSE 0.059 277.000 0.080 1.000 N NA
 2196230 2196231 PA14_20880 PA14_20890   rfaD FALSE 0.107 90.000 0.000 1.000 N NA
 2196232 2196233 PA14_20900 PA14_20920     FALSE 0.125 92.000 0.000 NA   NA
 2196233 2196234 PA14_20920 PA14_20940     FALSE 0.085 118.000 0.000 NA   NA
 2196234 2196235 PA14_20940 PA14_20950   fabH2 TRUE 0.590 14.000 0.000 1.000   NA
 2196235 2196236 PA14_20950 PA14_20960 fabH2   TRUE 0.752 4.000 0.000 1.000   NA
 2196236 2196237 PA14_20960 PA14_20970   cyp23 TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 2196237 2196238 PA14_20970 PA14_20980 cyp23   TRUE 0.805 -7.000 0.000 1.000   NA
 2196238 2196239 PA14_20980 PA14_21000     TRUE 0.769 2.000 0.000 NA   NA
 2196239 2196240 PA14_21000 PA14_21010     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2196240 2196241 PA14_21010 PA14_21020     TRUE 0.951 -3.000 0.059 1.000 N NA
 2196243 2196244 PA14_21040 PA14_21050     TRUE 0.664 10.000 0.000 NA   NA
 2196244 2196245 PA14_21050 PA14_21060     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 2196248 2196249 PA14_21090 PA14_21110   plcN FALSE 0.021 232.000 0.000 NA   NA
 2196250 2196251 PA14_21120 PA14_21130     FALSE 0.186 66.000 0.000 NA   NA
 2196251 2196252 PA14_21130 PA14_21140     FALSE 0.097 107.000 0.000 NA   NA
 2196252 2196253 PA14_21140 PA14_21150     TRUE 0.995 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 2196253 2196254 PA14_21150 PA14_21160     TRUE 0.998 -6.000 0.696 1.000 Y NA
 2196254 2196255 PA14_21160 PA14_21175     TRUE 0.999 -3.000 0.690 0.002 Y NA
 2196259 2196260 PA14_21220 PA14_21230   hepA FALSE 0.010 283.000 0.000 1.000 N NA
 2196261 2196262 PA14_21240 PA14_21250   alkB TRUE 0.696 54.000 0.156 NA   NA
 2196262 2196263 PA14_21250 PA14_21260 alkB   FALSE 0.006 407.000 0.000 NA   NA
 2196263 2196264 PA14_21260 PA14_21280     FALSE 0.028 208.000 0.000 NA   NA
 2196264 2196265 PA14_21280 PA14_21290     FALSE 0.025 218.000 0.000 NA   NA
 2196266 2196267 PA14_21300 PA14_21310   phaJ1 FALSE 0.050 151.000 0.000 1.000 N NA
 2196267 2196268 PA14_21310 PA14_21320 phaJ1   TRUE 0.990 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 2196269 2196270 PA14_21340 PA14_21370 fadD2 fadD1 FALSE 0.437 235.000 0.000 0.001 Y NA
 2196270 2196271 PA14_21370 PA14_21380 fadD1   FALSE 0.392 30.000 0.000 NA   NA
 2196271 2196272 PA14_21380 PA14_21400   hrpA FALSE 0.043 176.000 0.000 NA   NA
 2196274 2196275 PA14_21440 PA14_21450     FALSE 0.022 229.000 0.000 NA   NA
 2196275 2196276 PA14_21450 PA14_21460     TRUE 0.664 10.000 0.000 NA   NA
 2196276 2196277 PA14_21460 PA14_21470     TRUE 0.975 -60.000 0.333 NA   NA
 2196277 2196278 PA14_21470 PA14_21480     FALSE 0.187 523.000 1.000 NA   NA
 2196278 2196279 PA14_21480 PA14_21490     TRUE 0.983 15.000 1.000 NA   NA
 2196283 2196284 PA14_21540 PA14_21550     TRUE 0.893 3.000 0.038 NA N NA
 2196284 2196285 PA14_21550 PA14_21560     TRUE 0.969 -6.000 0.160 NA   NA
 2196285 2196286 PA14_21560 PA14_21570     FALSE 0.006 406.000 0.000 NA   NA
 2196286 2196287 PA14_21570 PA14_21580     TRUE 0.946 19.000 0.406 NA   NA
 2196287 2196288 PA14_21580 PA14_21590     TRUE 0.996 -3.000 0.914 NA   NA
 2196288 2196289 PA14_21590 PA14_21600     TRUE 0.974 3.000 0.271 NA   NA
 2196289 2196290 PA14_21600 PA14_21610   oprO FALSE 0.019 247.000 0.000 NA   NA
 2196290 2196291 PA14_21610 PA14_21620 oprO oprP FALSE 0.049 459.000 0.000 NA Y NA
 2196291 2196292 PA14_21620 PA14_21630 oprP   FALSE 0.047 169.000 0.000 NA   NA
 2196292 2196293 PA14_21630 PA14_21640     FALSE 0.079 125.000 0.000 NA   NA
 2196293 2196294 PA14_21640 PA14_21650     FALSE 0.021 233.000 0.000 NA   NA
 2196294 2196295 PA14_21650 PA14_21660     TRUE 0.972 -3.000 0.133 NA   NA
 2196297 2196298 PA14_21680 PA14_21690     FALSE 0.176 69.000 0.000 NA   NA
 2196300 2196301 PA14_21710 PA14_21720     TRUE 0.618 67.000 0.167 1.000 N NA
 2196301 2196302 PA14_21720 PA14_21730     FALSE 0.092 97.000 0.000 1.000 N NA
 2196302 2196303 PA14_21730 PA14_21750     FALSE 0.035 175.000 0.000 1.000 N NA
 2196304 2196305 PA14_21760 PA14_21770 capB   FALSE 0.021 215.000 0.000 1.000 N NA
 2196305 2196306 PA14_21770 PA14_21780     FALSE 0.265 140.000 0.074 1.000   NA
 2196306 2196307 PA14_21780 PA14_21790   rdgC FALSE 0.441 87.000 0.074 1.000   NA
 1544697 1544698 PA14_21800 PA14_21810     FALSE 0.485 20.000 0.000 NA   NA
 1544698 2196308 PA14_21810 PA14_21820     FALSE 0.016 260.000 0.000 NA   NA
 2196308 2196309 PA14_21820 PA14_21830     FALSE 0.007 370.000 0.000 NA   NA
 2196311 2196312 PA14_21850 PA14_21860     FALSE 0.008 358.000 0.000 1.000   NA
 2196313 2196314 PA14_21870 PA14_21880   tsp TRUE 0.540 39.000 0.029 1.000 N NA
 2196316 2196317 PA14_21900 PA14_21910     TRUE 0.890 72.000 0.222 1.000 Y NA
 2196317 2196318 PA14_21910 PA14_21920     TRUE 0.997 3.000 0.360 0.071 Y NA
 2196318 2196319 PA14_21920 PA14_21930     TRUE 0.996 -13.000 0.774 0.071   NA
 2196319 2196320 PA14_21930 PA14_21940     TRUE 0.986 -3.000 0.290 1.000   NA
 2196320 2196321 PA14_21940 PA14_21960     TRUE 0.871 55.000 0.500 1.000   NA
 2196322 2196323 PA14_21970 PA14_21980     FALSE 0.155 66.000 0.000 1.000 N NA
 2196324 2196325 PA14_21990 PA14_22000   rluA FALSE 0.097 169.000 0.022 1.000 N NA
 2196325 2196326 PA14_22000 PA14_22010 rluA minE FALSE 0.177 104.000 0.018 NA N NA
 2196326 2196327 PA14_22010 PA14_22020 minE minD TRUE 0.998 -3.000 0.618 NA Y NA
 2196327 2196328 PA14_22020 PA14_22040 minD minC TRUE 0.947 62.000 0.466 1.000 Y NA
 2196329 2196330 PA14_22050 PA14_22060 htrB   TRUE 0.503 68.000 0.069 1.000   NA
 2196331 2196332 PA14_22075 PA14_22080     FALSE 0.003 2505.000 0.000 NA   NA
 2196332 2196333 PA14_22080 PA14_22090     FALSE 0.009 337.000 0.000 NA   NA
 2196333 2196334 PA14_22090 PA14_22100     FALSE 0.003 2446.000 0.000 NA   NA
 2196334 2196335 PA14_22100 PA14_22110     FALSE 0.056 157.000 0.000 NA   NA
 2196335 2196336 PA14_22110 PA14_22120     FALSE 0.004 623.000 0.000 NA   NA
 2196336 2196337 PA14_22120 PA14_22130     TRUE 0.538 16.000 0.000 NA   NA
 2196337 2196338 PA14_22130 PA14_22140     FALSE 0.004 970.000 0.000 NA   NA
 2196338 2196339 PA14_22140 PA14_22160     FALSE 0.005 535.000 0.000 NA   NA
 2196339 2196340 PA14_22160 PA14_22180     FALSE 0.088 116.000 0.000 NA   NA
 2196340 2196341 PA14_22180 PA14_22190     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2196341 2196342 PA14_22190 PA14_22210     FALSE 0.174 70.000 0.000 NA   NA
 2196342 2196343 PA14_22210 PA14_22220     TRUE 0.769 2.000 0.000 NA   NA
 2196343 2196344 PA14_22220 PA14_22230     FALSE 0.004 567.000 0.000 NA   NA
 2196344 2196345 PA14_22230 PA14_22240     FALSE 0.006 422.000 0.000 NA   NA
 2196345 2196346 PA14_22240 PA14_22250     FALSE 0.108 100.000 0.000 NA   NA
 2196346 2196347 PA14_22250 PA14_22260     FALSE 0.367 33.000 0.000 NA   NA
 2196347 2196348 PA14_22260 PA14_22270     FALSE 0.004 914.000 0.000 NA   NA
 2196348 2196349 PA14_22270 PA14_22280     FALSE 0.384 31.000 0.000 NA   NA
 2196349 2196350 PA14_22280 PA14_22290   vacJ FALSE 0.138 140.000 0.014 NA   NA
 2196350 2196351 PA14_22290 PA14_22310 vacJ   TRUE 0.963 4.000 0.204 NA   NA
 2196351 2196352 PA14_22310 PA14_22320     FALSE 0.188 143.000 0.038 NA   NA
 2196353 2196354 PA14_22330 PA14_22340     FALSE 0.025 218.000 0.000 NA   NA
 2196354 2196355 PA14_22340 PA14_22350     TRUE 0.995 -3.000 0.733 NA   NA
 2196355 2196356 PA14_22350 PA14_22370     FALSE 0.141 90.000 0.000 1.000   NA
 2196356 2196357 PA14_22370 PA14_22380     TRUE 0.992 -3.000 0.588 1.000 N NA
 2196357 2196358 PA14_22380 PA14_22400     FALSE 0.095 109.000 0.000 NA   NA
 2196358 2196359 PA14_22400 PA14_22410     FALSE 0.014 277.000 0.000 NA   NA
 2196360 2196361 PA14_22420 PA14_22440     FALSE 0.013 282.000 0.000 NA   NA
 2196361 2196362 PA14_22440 PA14_22450   ppiA TRUE 0.646 63.000 0.171 1.000 N NA
 2196362 2196363 PA14_22450 PA14_22460 ppiA   TRUE 0.974 -18.000 0.286 1.000   NA
 2196363 2196364 PA14_22460 PA14_22470     TRUE 0.937 7.000 0.118 1.000   NA
 2196365 2196366 PA14_22480 PA14_22490   acpD TRUE 0.657 147.000 0.600 NA   NA
 2196367 2196368 PA14_22500 PA14_22510     FALSE 0.088 94.000 0.000 NA N NA
 2196368 2196369 PA14_22510 PA14_22520     FALSE 0.081 106.000 0.000 1.000 N NA
 2196369 2196370 PA14_22520 PA14_22530     TRUE 0.669 -70.000 0.000 1.000 N NA
 2196370 2196371 PA14_22530 PA14_22540     FALSE 0.179 76.000 0.000 1.000   NA
 2196373 2196374 PA14_22560 PA14_22570   csaA TRUE 0.806 10.000 0.009 1.000   NA
 2196374 2196375 PA14_22570 PA14_22580 csaA   FALSE 0.330 65.000 0.009 1.000   NA
 2196376 2196377 PA14_22590 PA14_22600     TRUE 0.984 -3.000 0.255 1.000   NA
 2196378 2196379 PA14_22620 PA14_22630 cyaB   FALSE 0.076 217.000 0.038 NA   NA
 2196381 2196382 PA14_22650 PA14_22660     TRUE 0.980 -3.000 0.201 NA   NA
 2196382 2196383 PA14_22660 PA14_22670     TRUE 0.997 2.000 0.650 NA Y NA
 2196383 2196384 PA14_22670 PA14_22680     TRUE 0.997 -3.000 0.491 NA Y NA
 2196384 2196385 PA14_22680 PA14_22690   trkH FALSE 0.137 67.000 0.000 NA N NA
 2196386 2196387 PA14_22700 PA14_22710     FALSE 0.336 65.000 0.014 NA   NA
 2196388 2196389 PA14_22720 PA14_22730     FALSE 0.284 44.000 0.000 NA   NA
 2196389 2196390 PA14_22730 PA14_22740     TRUE 0.820 115.000 0.286 NA Y NA
 2196390 2196391 PA14_22740 PA14_22760   cpxR TRUE 0.807 129.000 0.318 NA Y NA
 2196391 2196392 PA14_22760 PA14_22770 cpxR   TRUE 0.970 11.000 0.409 NA   NA
 2196392 2196393 PA14_22770 PA14_22780   yciI FALSE 0.133 176.000 0.043 NA   NA
 2196393 2196394 PA14_22780 PA14_22800 yciI yciB TRUE 0.972 2.000 0.224 NA   NA
 2196395 2196396 PA14_22820 PA14_22830     TRUE 0.985 -3.000 0.281 NA   NA
 2196396 2196397 PA14_22830 PA14_22840     FALSE 0.132 173.000 0.040 NA   NA
 2196397 2196398 PA14_22840 PA14_22860     FALSE 0.265 145.000 0.083 NA   NA
 2196398 2196399 PA14_22860 PA14_22870     FALSE 0.154 82.000 0.000 NA   NA
 2196399 2196400 PA14_22870 PA14_22880     FALSE 0.145 85.000 0.000 NA   NA
 2196402 2196403 PA14_22910 PA14_22930 edd glk TRUE 0.530 103.000 0.000 1.000 Y NA
 2196403 2196404 PA14_22930 PA14_22940 glk gltR FALSE 0.303 35.000 0.000 1.000 N NA
 2196404 2196405 PA14_22940 PA14_22960 gltR   TRUE 0.992 24.000 0.909 1.000 Y NA
 2196405 2196406 PA14_22960 PA14_22980     FALSE 0.069 525.000 0.367 1.000 N NA
 2196406 2196407 PA14_22980 PA14_22990     TRUE 0.935 101.000 0.367 0.070 Y NA
 2196407 2196408 PA14_22990 PA14_23000     TRUE 0.999 -7.000 0.816 0.070 Y NA
 2196408 2196409 PA14_23000 PA14_23010   gltK TRUE 0.993 33.000 0.723 0.070 Y NA
 2196409 2196410 PA14_23010 PA14_23030 gltK oprB TRUE 0.654 44.000 0.000 0.070 N NA
 2196410 2196411 PA14_23030 PA14_23050 oprB   FALSE 0.021 215.000 0.000 1.000 N NA
 2196413 2196414 PA14_23070 PA14_23080 zwf pgl TRUE 0.990 -13.000 0.163 1.000 Y NA
 2196414 2196415 PA14_23080 PA14_23090 pgl   TRUE 0.955 18.000 0.064 1.000 Y NA
 2196417 2196418 PA14_23110 PA14_23120     FALSE 0.122 93.000 0.000 NA   NA
 2196419 2196420 PA14_23130 PA14_23160   gltS FALSE 0.018 229.000 0.000 1.000 N NA
 2196420 2196421 PA14_23160 PA14_23170 gltS   TRUE 0.865 39.000 0.016 1.000 Y NA
 2196421 2196422 PA14_23170 PA14_23190     TRUE 0.775 16.000 0.039 1.000 N NA
 2196422 2196423 PA14_23190 PA14_23200     FALSE 0.044 159.000 0.000 1.000 N NA
 2196423 2196424 PA14_23200 PA14_23210     TRUE 0.768 65.000 0.098 0.078   NA
 2196424 2196425 PA14_23210 PA14_23220   ubiG TRUE 0.984 -3.000 0.259 1.000   NA
 2196425 2196426 PA14_23220 PA14_23240 ubiG   FALSE 0.258 151.000 0.104 1.000 N NA
 2196427 2196428 PA14_23250 PA14_23260   gyrA FALSE 0.033 237.000 0.007 1.000 N NA
 2196428 2196429 PA14_23260 PA14_23270 gyrA serC FALSE 0.389 88.000 0.067 1.000 N NA
 2196429 2196430 PA14_23270 PA14_23280 serC pheA TRUE 0.991 0.000 0.121 1.000 Y NA
 2196430 2196431 PA14_23280 PA14_23290 pheA hisC2 TRUE 0.838 69.000 0.098 1.000 Y NA
 2196431 2196432 PA14_23290 PA14_23310 hisC2   TRUE 0.983 -7.000 0.029 1.000 Y NA
 2196432 2196433 PA14_23310 PA14_23320   cmk TRUE 0.973 0.000 0.209 1.000 N NA
 2196433 2196434 PA14_23320 PA14_23330 cmk rpsA FALSE 0.153 268.000 0.281 1.000 N NA
 2196434 2196435 PA14_23330 PA14_23340 rpsA himD FALSE 0.485 137.000 0.292 1.000 N NA
 2196435 2196436 PA14_23340 PA14_23350 himD orfA TRUE 0.716 34.000 0.069 NA   NA
 2196436 2196437 PA14_23350 PA14_23360 orfA wzz FALSE 0.017 256.000 0.000 NA   NA
 2196437 2196438 PA14_23360 PA14_23370 wzz orfK TRUE 0.653 156.000 0.000 0.004 Y NA
 2196438 2196439 PA14_23370 PA14_23380 orfK orfH TRUE 0.744 81.000 0.030 1.000 Y NA
 2196439 2196440 PA14_23380 PA14_23390 orfH orfE FALSE 0.176 78.000 0.000 1.000   NA
 2196440 2196441 PA14_23390 PA14_23400 orfE   TRUE 0.734 -22.000 0.000 NA   NA
 2196441 2196442 PA14_23400 PA14_23410   orfJ TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2196442 2196443 PA14_23410 PA14_23420 orfJ   FALSE 0.090 114.000 0.000 NA   NA
 2196443 2196444 PA14_23420 PA14_23430     TRUE 0.927 9.000 0.115 NA   NA
 2196444 2196445 PA14_23430 PA14_23440   orfL TRUE 0.588 69.000 0.133 NA   NA
 2196445 2196446 PA14_23440 PA14_23450 orfL orfM TRUE 0.987 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 2196446 2196447 PA14_23450 PA14_23460 orfM orfN TRUE 0.994 0.000 0.250 1.000 Y NA
 2196447 2196448 PA14_23460 PA14_23470 orfN wbpM FALSE 0.088 445.000 0.041 1.000 Y NA
 2196448 2196449 PA14_23470 PA14_23480 wbpM   FALSE 0.062 191.000 0.012 1.000 N NA
 1544841 2196450 PA14_23490 PA14_23500   tyrB FALSE 0.176 69.000 0.000 NA   NA
 2196452 2196453 PA14_23520 PA14_23530     TRUE 0.800 50.000 0.250 1.000   NA
 2196454 2196455 PA14_23540 PA14_23560 act gltx FALSE 0.437 38.000 0.004 1.000 N NA
 2196455 1544848 PA14_23560 PA14_23570 gltx   FALSE 0.005 495.000 0.000 NA   NA
 1544848 1544849 PA14_23570 PA14_23580     FALSE 0.255 50.000 0.000 NA   NA
 1544849 2196456 PA14_23580 PA14_23590     FALSE 0.053 162.000 0.000 NA   NA
 2196456 2196457 PA14_23590 PA14_23610     TRUE 0.808 12.000 0.035 NA N NA
 2196457 2196458 PA14_23610 PA14_23620   kdgA FALSE 0.067 113.000 0.000 NA N NA
 2196458 2196459 PA14_23620 PA14_23630 kdgA   TRUE 0.893 0.000 0.008 1.000   NA
 2196459 2196460 PA14_23630 PA14_23640     FALSE 0.289 93.000 0.029 1.000   NA
 2196461 2196462 PA14_23650 PA14_23670     TRUE 0.849 17.000 0.000 0.077   NA
 2196465 2196466 PA14_23700 PA14_23720     FALSE 0.119 80.000 0.000 NA N NA
 2196468 2196469 PA14_23750 PA14_23760 leuC leuD TRUE 0.997 12.000 0.463 0.000 Y NA
 2196469 2196470 PA14_23760 PA14_23770 leuD   FALSE 0.059 270.000 0.060 1.000   NA
 2196470 2196471 PA14_23770 PA14_23790   leuB FALSE 0.424 59.000 0.026 1.000   NA
 2196471 2196472 PA14_23790 PA14_23800 leuB asd TRUE 0.946 70.000 0.196 0.033 Y NA
 2196472 2196473 PA14_23800 PA14_23810 asd   TRUE 0.865 102.000 0.025 0.000 Y NA
 2196473 2196474 PA14_23810 PA14_23830   fimV FALSE 0.088 169.000 0.017 1.000 N NA
 2196474 2196475 PA14_23830 PA14_23840 fimV truA TRUE 0.708 22.000 0.035 1.000 N NA
 2196475 2196476 PA14_23840 PA14_23850 truA trpF TRUE 0.496 89.000 0.139 1.000 N NA
 2196476 2196477 PA14_23850 PA14_23860 trpF accD FALSE 0.025 269.000 0.007 1.000 N NA
 2196477 2196478 PA14_23860 PA14_23880 accD folC TRUE 0.988 -3.000 0.383 1.000 N NA
 2196478 2196479 PA14_23880 PA14_23890 folC   TRUE 0.965 4.000 0.216 NA   NA
 2196479 2196480 PA14_23890 PA14_23900   cvpA TRUE 0.551 74.000 0.116 NA   NA
 2196480 2196481 PA14_23900 PA14_23920 cvpA purF FALSE 0.228 222.000 0.262 1.000   NA
 2196481 2196482 PA14_23920 PA14_23930 purF metZ TRUE 0.882 17.000 0.153 1.000 N NA
 2196482 2196483 PA14_23930 PA14_23950 metZ   TRUE 0.933 -3.000 0.033 1.000 N NA
 2196484 2196485 PA14_23970 PA14_23980 xcpQ xcpP TRUE 0.844 5.000 0.013 NA   NA
 2196486 2196487 PA14_23990 PA14_24010 xcpR xcpS TRUE 0.999 0.000 0.653 0.005 Y NA
 2196487 2196488 PA14_24010 PA14_24020 xcpS xcpT TRUE 0.998 5.000 0.599 0.005 Y NA
 2196488 2196489 PA14_24020 PA14_24040 xcpT xcpU TRUE 0.998 7.000 0.425 0.005 Y NA
 2196489 2196490 PA14_24040 PA14_24050 xcpU xcpV TRUE 0.999 -3.000 0.605 0.005 Y NA
 2196490 2196491 PA14_24050 PA14_24060 xcpV xcpW TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.005 Y NA
 2196491 2196492 PA14_24060 PA14_24070 xcpW xcpX TRUE 0.987 -3.000 0.024 1.000 Y NA
 2196492 2196493 PA14_24070 PA14_24080 xcpX xcpY TRUE 0.994 -3.000 0.020 0.078 Y NA
 2196493 2196494 PA14_24080 PA14_24100 xcpY xcpZ TRUE 0.998 2.000 0.811 1.000 Y NA
 2196494 1544889 PA14_24100 PA14_24110 xcpZ   FALSE 0.069 139.000 0.000 NA   NA
 1544889 1544890 PA14_24110 PA14_24120     FALSE 0.485 20.000 0.000 NA   NA
 1544890 1544891 PA14_24120 PA14_24130     FALSE 0.085 118.000 0.000 NA   NA
 2196495 2196496 PA14_24140 PA14_24150     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 2196497 2196498 PA14_24170 PA14_24180 fadH1   FALSE 0.022 337.000 0.024 NA   NA
 2196498 2196499 PA14_24180 PA14_24190     TRUE 0.934 5.000 0.099 NA   NA
 2196501 2196502 PA14_24220 PA14_24230     TRUE 0.936 0.000 0.045 1.000   NA
 2196502 2196503 PA14_24230 PA14_24240     TRUE 0.973 -3.000 0.131 1.000   NA
 2196503 2196504 PA14_24240 PA14_24245     TRUE 0.526 84.000 0.124 NA   NA
 2196504 2196505 PA14_24245 PA14_24260     TRUE 0.821 33.000 0.168 NA   NA
 2196505 2196506 PA14_24260 PA14_24270   pepN TRUE 0.801 19.000 0.059 NA   NA
 2196506 2196507 PA14_24270 PA14_24290 pepN gbt FALSE 0.006 447.000 0.000 NA   NA
 2196507 2196508 PA14_24290 PA14_24300 gbt   TRUE 0.879 59.000 0.600 NA   NA
 2196508 2196509 PA14_24300 PA14_24310     FALSE 0.181 180.000 0.091 NA   NA
 2196509 2196510 PA14_24310 PA14_24330     TRUE 0.984 12.000 0.409 0.077   NA
 2196511 2196512 PA14_24340 PA14_24350     TRUE 0.996 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 2196514 2196515 PA14_24370 PA14_24380     FALSE 0.235 54.000 0.000 NA   NA
 2196515 2196516 PA14_24380 PA14_24390     TRUE 0.984 -3.000 0.258 NA   NA
 2196516 2196517 PA14_24390 PA14_24400     TRUE 0.977 -3.000 0.171 NA   NA
 2196517 2196518 PA14_24400 PA14_24410     TRUE 0.982 -7.000 0.314 NA   NA
 2196518 2196519 PA14_24410 PA14_24420     TRUE 0.991 -3.000 0.484 NA   NA
 2196519 2196520 PA14_24420 PA14_24430     TRUE 0.937 11.000 0.179 NA   NA
 2196521 2196522 PA14_24440 PA14_24445   gdhB FALSE 0.014 274.000 0.000 NA   NA
 2196522 2196523 PA14_24445 PA14_24480 gdhB pelA FALSE 0.005 562.000 0.000 1.000   NA
 2196523 2196524 PA14_24480 PA14_24490 pelA pelB TRUE 0.751 -22.000 0.000 1.000   NA
 2196524 2196525 PA14_24490 PA14_24500 pelB pelC FALSE 0.314 40.000 0.000 NA   NA
 2196525 2196526 PA14_24500 PA14_24510 pelC pelD TRUE 0.977 6.000 0.400 NA   NA
 2196526 2196527 PA14_24510 PA14_24530 pelD pelE TRUE 0.976 -22.000 0.333 NA   NA
 2196527 2196528 PA14_24530 PA14_24550 pelE pelF TRUE 0.993 -3.000 0.600 1.000   NA
 2196528 2196529 PA14_24550 PA14_24560 pelF pelG TRUE 0.993 2.000 0.889 NA   NA
 2196531 2196532 PA14_24580 PA14_24590     FALSE 0.347 38.000 0.000 1.000   NA
 2196533 2196534 PA14_24600 PA14_24610     FALSE 0.052 168.000 0.000 1.000   NA
 2196534 2196535 PA14_24610 PA14_24620     FALSE 0.172 72.000 0.000 NA   NA
 2196536 2196537 PA14_24630 PA14_24640   pyrD FALSE 0.396 57.000 0.019 NA   NA
 2196539 2196540 PA14_24665 PA14_24675     TRUE 0.794 44.000 0.000 0.001   NA
 2196542 2196543 PA14_24700 PA14_24710     FALSE 0.006 427.000 0.000 NA   NA
 2196543 2196544 PA14_24710 PA14_24720     TRUE 0.973 14.000 0.000 0.020 Y NA
 2196545 2196546 PA14_24730 PA14_24740     FALSE 0.194 117.000 0.024 NA   NA
 2196546 2196547 PA14_24740 PA14_24760     TRUE 0.850 14.000 0.065 NA   NA
 2196547 2196548 PA14_24760 PA14_24770     TRUE 0.735 4.000 0.000 NA   NA
 2196550 2196551 PA14_24790 PA14_24810     FALSE 0.051 169.000 0.000 1.000   NA
 2196551 2196552 PA14_24810 PA14_24820     TRUE 0.814 0.000 0.000 1.000   NA
 2196552 2196553 PA14_24820 PA14_24830     TRUE 0.547 17.000 0.000 1.000   NA
 2196554 2196555 PA14_24840 PA14_24850     TRUE 0.699 7.000 0.000 NA   NA
 2196555 2196556 PA14_24850 PA14_24860   snr1 FALSE 0.007 367.000 0.000 NA   NA
 1544954 2196557 PA14_24870 PA14_24880     FALSE 0.058 154.000 0.000 NA   NA
 2196557 2196558 PA14_24880 PA14_24890     FALSE 0.074 132.000 0.000 NA   NA
 2196559 2196560 PA14_24900 PA14_24910 moaB2 moeA2 TRUE 0.997 -3.000 0.073 0.002 Y NA
 2196562 2196563 PA14_24940 PA14_24950     TRUE 0.646 201.000 0.352 1.000 Y NA
 2196563 2196564 PA14_24950 PA14_24960     TRUE 0.980 21.000 0.365 0.001 N NA
 2196564 2196565 PA14_24960 PA14_24970     FALSE 0.139 75.000 0.000 1.000 N NA
 2196565 2196566 PA14_24970 PA14_24980     FALSE 0.111 103.000 0.000 1.000   NA
 2196567 2196568 PA14_24990 PA14_25000     FALSE 0.219 57.000 0.000 NA   NA
 2196569 2196570 PA14_25020 PA14_25030     FALSE 0.134 151.000 0.019 NA   NA
 2196574 2196575 PA14_25080 PA14_25090 foaA foaB TRUE 0.983 31.000 0.607 1.000 Y NA
 2196575 2196576 PA14_25090 PA14_25100 foaB   FALSE 0.449 83.000 0.070 NA   NA
 2196576 2196577 PA14_25100 PA14_25110   topA FALSE 0.219 91.000 0.007 NA   NA
 2196577 2196578 PA14_25110 PA14_25130 topA   FALSE 0.181 107.000 0.011 NA   NA
 2196578 2196579 PA14_25130 PA14_25140     FALSE 0.321 206.000 0.348 NA   NA
 2196580 2196581 PA14_25150 PA14_25160   lexA TRUE 0.903 12.000 0.122 1.000 N NA
 2196582 2196583 PA14_25180 PA14_25195 psrA nagZ FALSE 0.071 202.000 0.028 1.000 N NA
 2196583 2196584 PA14_25195 PA14_25210 nagZ   TRUE 0.764 12.000 0.018 1.000 N NA
 2196585 2196586 PA14_25220 PA14_25230   mfd TRUE 0.891 11.000 0.071 NA   NA
 2196587 2196588 PA14_25250 PA14_25270   aroP1 FALSE 0.085 102.000 0.000 1.000 N NA
 2196588 2196589 PA14_25270 PA14_25280 aroP1 nqrA FALSE 0.013 259.000 0.000 1.000 N NA
 2196589 2196590 PA14_25280 PA14_25305 nqrA nqrB TRUE 0.999 4.000 0.618 0.001 Y NA
 2196590 2196591 PA14_25305 PA14_25320 nqrB nqrC TRUE 0.999 -7.000 0.538 0.001 Y NA
 2196591 2196592 PA14_25320 PA14_25330 nqrC nqrD TRUE 0.998 -3.000 0.188 0.001 Y NA
 2196592 2196593 PA14_25330 PA14_25340 nqrD nqrE TRUE 0.998 0.000 0.240 0.001 Y NA
 2196593 2196594 PA14_25340 PA14_25350 nqrE nqrF TRUE 0.998 12.000 0.700 0.001 Y NA
 2196594 2196595 PA14_25350 PA14_25360 nqrF   TRUE 0.969 -7.000 0.189 1.000 N NA
 2196595 2196596 PA14_25360 PA14_25370     TRUE 0.973 -3.000 0.137 NA   NA
 2196596 2196597 PA14_25370 PA14_25390   sth FALSE 0.210 179.000 0.121 NA   NA
 2196598 2196599 PA14_25400 PA14_25410     TRUE 0.978 -3.000 0.185 NA   NA
 2196599 2196600 PA14_25410 PA14_25420     TRUE 0.973 10.000 0.407 NA   NA
 2196601 2196602 PA14_25430 PA14_25440     TRUE 0.964 -7.000 0.025 0.085 N NA
 2196602 2196603 PA14_25440 PA14_25450     TRUE 0.987 13.000 0.620 0.085 N NA
 2196605 2196606 PA14_25480 PA14_25490     FALSE 0.430 73.000 0.045 1.000   NA
 2196606 2196607 PA14_25490 PA14_25500     TRUE 0.999 -3.000 0.746 0.085 Y NA
 2196607 2196608 PA14_25500 PA14_25510   lpxK TRUE 0.953 0.000 0.096 1.000 N NA
 2196608 2196609 PA14_25510 PA14_25520 lpxK   TRUE 0.851 38.000 0.263 NA   NA
 2196609 2196610 PA14_25520 PA14_25530   kdsB TRUE 0.979 0.000 0.265 NA   NA
 2196610 2196611 PA14_25530 PA14_25540 kdsB ptpA TRUE 0.932 0.000 0.050 1.000 N NA
 2196611 2196612 PA14_25540 PA14_25550 ptpA murB TRUE 0.947 -3.000 0.050 1.000 N NA
 2196614 2196615 PA14_25580 PA14_25590 rluC   TRUE 0.985 -7.000 0.389 1.000   NA
 2196615 2196616 PA14_25590 PA14_25600     TRUE 0.963 -7.000 0.134 1.000   NA
 2196618 2196619 PA14_25620 PA14_25630   rpmF TRUE 0.972 14.000 0.599 NA   NA
 2196619 2196620 PA14_25630 PA14_25640 rpmF plsX TRUE 0.907 34.000 0.418 1.000 N NA
 2196620 2196621 PA14_25640 PA14_25650 plsX fabD TRUE 0.889 106.000 0.106 0.003 Y NA
 2196621 2196622 PA14_25650 PA14_25660 fabD fabG TRUE 0.994 23.000 0.432 0.003 Y NA
 2196622 2196623 PA14_25660 PA14_25670 fabG acpP TRUE 0.836 196.000 0.321 0.003 Y NA
 2196623 2196624 PA14_25670 PA14_25690 acpP fabF1 TRUE 0.823 129.000 0.346 1.000 Y NA
 2196624 2196625 PA14_25690 PA14_25710 fabF1 pabC TRUE 0.970 0.000 0.187 1.000 N NA
 2196625 2196626 PA14_25710 PA14_25730 pabC   TRUE 0.958 6.000 0.204 NA   NA
 2196626 2196627 PA14_25730 PA14_25740   tmk TRUE 0.865 29.000 0.209 NA   NA
 2196627 2196628 PA14_25740 PA14_25760 tmk holB TRUE 0.987 -7.000 0.211 0.087 N NA
 2196628 2196629 PA14_25760 PA14_25770 holB pilZ TRUE 0.898 34.000 0.382 NA N NA
 2196629 2196630 PA14_25770 PA14_25780 pilZ   TRUE 0.851 15.000 0.089 NA N NA
 2196632 2196633 PA14_25800 PA14_25810     FALSE 0.158 167.000 0.058 1.000 N NA
 2196633 2196634 PA14_25810 PA14_25820     TRUE 0.540 65.000 0.077 1.000   NA
 2196634 2196635 PA14_25820 PA14_25830     TRUE 0.941 -7.000 0.062 NA   NA
 2196637 2196638 PA14_25860 PA14_25880 etfB etfA TRUE 0.991 0.000 0.000 0.020 Y NA
 2196638 2196639 PA14_25880 PA14_25900 etfA   FALSE 0.037 185.000 0.000 NA   NA
 2196640 2196641 PA14_25910 PA14_25920   cobM FALSE 0.083 129.000 0.000 1.000   NA
 2196641 2196642 PA14_25920 PA14_25930 cobM   TRUE 0.984 -3.000 0.025 0.006   NA
 2196642 2196643 PA14_25930 PA14_25940     TRUE 0.575 73.000 0.132 NA   NA
 2196644 2196645 PA14_25960 PA14_25970   cobN TRUE 0.717 76.000 0.274 1.000   NA
 2196647 2196648 PA14_25990 PA14_26000     TRUE 0.996 21.000 0.568 0.001 Y NA
 2196648 2196649 PA14_26000 PA14_26010     FALSE 0.066 122.000 0.000 1.000 N NA
 2196652 2196653 PA14_26060 PA14_26070     FALSE 0.114 96.000 0.000 NA   NA
 2196655 2196656 PA14_26090 PA14_26110     FALSE 0.467 22.000 0.000 NA   NA
 2196656 2196657 PA14_26110 PA14_26130   morB FALSE 0.155 66.000 0.000 1.000 N NA
 2196660 2196661 PA14_26160 PA14_26165     FALSE 0.176 69.000 0.000 NA   NA
 2196664 2196665 PA14_26210 PA14_26220 hisP hisM TRUE 0.900 21.000 0.000 1.000 Y NA
 2196665 2196666 PA14_26220 PA14_26230 hisM hisQ TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.011 Y NA
 2196666 2196667 PA14_26230 PA14_26240 hisQ hisJ TRUE 0.870 56.000 0.000 0.069 Y NA
 2196667 2196668 PA14_26240 PA14_26260 hisJ   FALSE 0.222 60.000 0.000 1.000   NA
 2196669 2196670 PA14_26270 PA14_26280     FALSE 0.120 85.000 0.000 1.000 N NA
 2196671 2196672 PA14_26300 PA14_26310     TRUE 0.521 54.000 0.045 NA   NA
 2196673 2196674 PA14_26330 PA14_26340     TRUE 0.862 51.000 0.448 1.000 N NA
 2196674 2196675 PA14_26340 PA14_26350     FALSE 0.091 120.000 0.000 1.000   NA
 2196676 2196677 PA14_26360 PA14_26390     TRUE 0.999 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 2196677 2196678 PA14_26390 PA14_26400     TRUE 0.997 -3.000 0.368 1.000 Y NA
 2196678 2196679 PA14_26400 PA14_26420     TRUE 0.888 53.000 0.105 1.000 Y NA
 2196681 2196682 PA14_26460 PA14_26470 cobK cbiD TRUE 0.997 -3.000 0.123 0.006 Y NA
 2196682 2196683 PA14_26470 PA14_26480 cbiD cobL TRUE 0.995 -7.000 0.043 0.006 Y NA
 2196684 2196685 PA14_26485 PA14_26500   cobH TRUE 0.972 -3.000 0.149 1.000 N NA
 2196685 2196686 PA14_26500 PA14_26510 cobH cobI TRUE 0.998 -3.000 0.191 0.006 Y NA
 2196686 2196687 PA14_26510 PA14_26530 cobI cobJ TRUE 0.996 -7.000 0.097 0.006 Y NA
 2196687 2196688 PA14_26530 PA14_26540 cobJ   FALSE 0.145 70.000 0.000 1.000 N NA
 2196688 2196689 PA14_26540 PA14_26550     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   NA
 2196689 2196690 PA14_26550 PA14_26560     TRUE 0.800 0.000 0.000 NA   NA
 2196690