MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus agalactiae 2603V/R

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 274658 274659 SAG0001 SAG0002 dnaA dnaN TRUE 0.686 155.000 0.328 1.000 Y NA
 274659 274660 SAG0002 SAG0003 dnaN   TRUE 0.374 70.000 0.003 1.000 N NA
 274660 274661 SAG0003 SAG0004     TRUE 0.877 10.000 0.015 NA   NA
 274661 274662 SAG0004 SAG0005     FALSE 0.035 202.000 0.000 NA   NA
 274662 274663 SAG0005 SAG0006   ychF FALSE 0.098 160.000 0.002 NA   NA
 274663 274664 SAG0006 SAG0007 ychF pth TRUE 0.827 84.000 0.184 1.000 Y NA
 274664 274665 SAG0007 SAG0008 pth mfd TRUE 0.967 -3.000 0.137 1.000 N NA
 274665 274666 SAG0008 SAG0009 mfd   FALSE 0.064 161.000 0.000 NA   NA
 274666 274667 SAG0009 SAG0010     TRUE 0.689 35.000 0.000 NA   NA
 274667 274668 SAG0010 SAG0011     TRUE 0.957 -13.000 0.053 1.000 N NA
 274668 274669 SAG0011 SAG0012     TRUE 0.877 3.000 0.009 NA   NA
 274669 274670 SAG0012 SAG0013     TRUE 0.952 0.000 0.105 NA   NA
 274670 274671 SAG0013 SAG0014     TRUE 0.892 2.000 0.014 NA N NA
 274671 274672 SAG0014 SAG0015   hpt TRUE 0.927 5.000 0.067 0.063 N NA
 274672 274673 SAG0015 SAG0016 hpt ftsH TRUE 0.958 23.000 0.192 1.000 N NA
 274673 2194563 SAG0016 Sa16SA ftsH   FALSE 0.011 493.000 0.000 NA   NA
 2194563 5922163 Sa16SA tRNA-Ala-2     TRUE 0.446 53.000 0.000 NA   NA
 5922163 407077 tRNA-Ala-2 Sa23SA   rrl FALSE 0.074 155.000 0.000 NA   NA
 407077 3827815 Sa23SA SAG_r01 rrl   FALSE 0.275 74.000 0.000 NA   NA
 3827815 5922164 SAG_r01 tRNA-Val-1     TRUE 0.795 4.000 0.000 NA   NA
 5922164 5922165 tRNA-Val-1 tRNA-Asp-1     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 5922165 5922166 tRNA-Asp-1 tRNA-Lys-2     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 5922166 5922167 tRNA-Lys-2 tRNA-Leu-1     TRUE 0.784 10.000 0.000 NA   NA
 5922167 5922168 tRNA-Leu-1 tRNA-Thr-1     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5922168 5922169 tRNA-Thr-1 tRNA-Gly-1     TRUE 0.700 34.000 0.000 NA   NA
 5922169 5922170 tRNA-Gly-1 tRNA-Leu-2     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 5922170 5922171 tRNA-Leu-2 tRNA-Arg-3     TRUE 0.812 12.000 0.000 NA   NA
 5922171 5922172 tRNA-Arg-3 tRNA-Pro-1     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 5922172 2194564 tRNA-Pro-1 Sa16SB     FALSE 0.090 145.000 0.000 NA   NA
 2194564 5922173 Sa16SB tRNA-Ala-3     TRUE 0.446 53.000 0.000 NA   NA
 5922173 407078 tRNA-Ala-3 Sa23SB   rrl FALSE 0.074 155.000 0.000 NA   NA
 407078 3827816 Sa23SB SAG_r02 rrl   FALSE 0.275 74.000 0.000 NA   NA
 3827816 5922174 SAG_r02 tRNA-Val-2     TRUE 0.795 4.000 0.000 NA   NA
 5922174 5922175 tRNA-Val-2 tRNA-Asp-2     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 5922175 5922176 tRNA-Asp-2 tRNA-Lys-3     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 5922176 5922177 tRNA-Lys-3 tRNA-Leu-3     TRUE 0.784 10.000 0.000 NA   NA
 5922177 5922178 tRNA-Leu-3 tRNA-Thr-2     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5922178 5922179 tRNA-Thr-2 tRNA-Gly-2     TRUE 0.700 34.000 0.000 NA   NA
 5922179 5922180 tRNA-Gly-2 tRNA-Leu-4     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 5922180 5922181 tRNA-Leu-4 tRNA-Arg-4     TRUE 0.812 12.000 0.000 NA   NA
 5922181 5922182 tRNA-Arg-4 tRNA-Pro-2     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 5922182 5922183 tRNA-Pro-2 tRNA-Met-1     TRUE 0.832 16.000 0.000 NA   NA
 5922183 5922184 tRNA-Met-1 tRNA-Met-2     TRUE 0.835 20.000 0.000 NA   NA
 5922184 5922185 tRNA-Met-2 tRNA-Ser-1     TRUE 0.832 16.000 0.000 NA   NA
 5922185 5922186 tRNA-Ser-1 tRNA-Met-3     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5922186 5922187 tRNA-Met-3 tRNA-Phe-1     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 5922187 5922188 tRNA-Phe-1 tRNA-Gly-3     TRUE 0.835 20.000 0.000 NA   NA
 5922188 5922189 tRNA-Gly-3 tRNA-Ile-1     TRUE 0.689 35.000 0.000 NA   NA
 5922189 5922190 tRNA-Ile-1 tRNA-Ser-2     TRUE 0.829 14.000 0.000 NA   NA
 5922190 274674 tRNA-Ser-2 SAG0017   pscB FALSE 0.026 236.000 0.000 NA   NA
 274674 274675 SAG0017 SAG0018 pscB prsA-1 FALSE 0.343 124.000 0.107 NA   NA
 274675 274676 SAG0018 SAG0019 prsA-1   TRUE 0.650 108.000 0.048 1.000 Y NA
 274676 274677 SAG0019 SAG0020     TRUE 0.940 -10.000 0.012 1.000 N NA
 274677 274678 SAG0020 SAG0021     FALSE 0.218 90.000 0.000 NA   NA
 274678 274679 SAG0021 SAG0022   plsX FALSE 0.254 78.000 0.000 NA   NA
 274679 274680 SAG0022 SAG0023 plsX acpP-1 TRUE 0.976 11.000 0.017 0.008 Y NA
 274680 274681 SAG0023 SAG0024 acpP-1 purC FALSE 0.228 124.000 0.017 1.000 N NA
 274681 274682 SAG0024 SAG0025 purC   TRUE 0.586 123.000 0.043 1.000 Y NA
 274682 274683 SAG0025 SAG0026   purF FALSE 0.086 412.000 0.024 1.000 Y NA
 274683 274684 SAG0026 SAG0027 purF purM TRUE 0.986 28.000 0.248 1.000 Y NA
 274684 274685 SAG0027 SAG0028 purM purN TRUE 0.645 168.000 0.238 0.003 Y NA
 274685 274686 SAG0028 SAG0029 purN   TRUE 0.878 23.000 0.003 1.000   NA
 274686 274687 SAG0029 SAG0030   purH TRUE 0.890 20.000 0.002 1.000   NA
 274687 274688 SAG0030 SAG0031 purH   FALSE 0.040 193.000 0.000 1.000   NA
 274688 274689 SAG0031 SAG0032     FALSE 0.091 147.000 0.000 1.000   NA
 274689 274690 SAG0032 SAG0033     FALSE 0.024 247.000 0.000 1.000   NA
 274690 274691 SAG0033 SAG0034     TRUE 0.845 47.000 0.000 1.000 Y NA
 274691 274692 SAG0034 SAG0035     TRUE 0.631 88.000 0.000 0.052 Y NA
 274692 274693 SAG0035 SAG0036     TRUE 0.999 10.000 1.000 0.052 Y NA
 274693 274694 SAG0036 SAG0037     TRUE 0.990 13.000 0.250 NA Y NA
 274694 274695 SAG0037 SAG0038     TRUE 0.835 20.000 0.000 NA   NA
 274695 274696 SAG0038 SAG0039     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 274696 274697 SAG0039 SAG0040     TRUE 0.808 17.000 0.000 NA N NA
 274697 274698 SAG0040 SAG0041     TRUE 0.913 8.000 0.105 NA N NA
 274700 274701 SAG0043 SAG0044 purD purE FALSE 0.143 281.000 0.044 1.000 Y NA
 274701 274702 SAG0044 SAG0045 purE purK TRUE 0.994 -13.000 0.136 0.001 Y NA
 274702 274703 SAG0045 SAG0046 purK   TRUE 0.419 54.000 0.000 NA   NA
 274703 274704 SAG0046 SAG0047   purB TRUE 0.797 25.000 0.000 NA   NA
 274704 274705 SAG0047 SAG0048 purB   FALSE 0.128 152.000 0.005 1.000   NA
 274705 274706 SAG0048 SAG0049   ruvB FALSE 0.028 297.000 0.002 1.000   NA
 274706 274707 SAG0049 SAG0050 ruvB   FALSE 0.115 152.000 0.005 1.000 N NA
 274707 274708 SAG0050 SAG0051     TRUE 0.885 7.000 0.019 NA   NA
 274708 274709 SAG0051 SAG0052     TRUE 0.989 -3.000 0.351 NA   NA
 274709 274710 SAG0052 SAG0053   adhE FALSE 0.018 270.000 0.000 1.000 N NA
 274710 274711 SAG0053 SAG0054 adhE adhP FALSE 0.134 179.000 0.012 0.003   NA
 274711 274712 SAG0054 SAG0055 adhP thrC FALSE 0.226 120.000 0.003 1.000   NA
 274712 274713 SAG0055 SAG0056 thrC   FALSE 0.077 147.000 0.000 1.000 N NA
 274713 274714 SAG0056 SAG0057   rpsJ FALSE 0.029 206.000 0.000 1.000 N NA
 274714 274715 SAG0057 SAG0058 rpsJ rplC TRUE 0.926 105.000 0.467 0.039 Y NA
 274715 274716 SAG0058 SAG0059 rplC rplD TRUE 0.997 24.000 0.544 0.030 Y NA
 274716 274717 SAG0059 SAG0060 rplD rplW TRUE 0.995 0.000 0.307 0.030 Y NA
 274717 274718 SAG0060 SAG0061 rplW rplB TRUE 0.999 18.000 0.849 0.034 Y NA
 274718 274719 SAG0061 SAG0062 rplB rpsS TRUE 0.975 99.000 0.820 0.039 Y NA
 274719 274720 SAG0062 SAG0063 rpsS rplV TRUE 0.998 16.000 0.769 0.039 Y NA
 274720 274721 SAG0063 SAG0064 rplV rpsC TRUE 0.998 13.000 0.719 0.039 Y NA
 274721 274722 SAG0064 SAG0065 rpsC rplP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.039 Y NA
 274722 274723 SAG0065 SAG0066 rplP rpmC TRUE 0.998 10.000 0.802 0.030 Y NA
 274723 274724 SAG0066 SAG0067 rpmC rpsQ TRUE 0.998 26.000 0.828 0.030 Y NA
 274724 274725 SAG0067 SAG0068 rpsQ rplN TRUE 0.998 25.000 0.791 0.039 Y NA
 274725 274726 SAG0068 SAG0069 rplN rplX TRUE 0.980 80.000 0.810 0.039 Y NA
 274726 274727 SAG0069 SAG0070 rplX rplE TRUE 0.998 24.000 0.758 0.030 Y NA
 274727 274728 SAG0070 SAG0071 rplE   TRUE 0.997 18.000 0.496 0.030 Y NA
 274728 274729 SAG0071 SAG0072   rpsH TRUE 0.824 155.000 0.473 0.030 Y NA
 274729 274730 SAG0072 SAG0073 rpsH rplF TRUE 0.969 110.000 0.808 0.030 Y NA
 274730 274731 SAG0073 SAG0074 rplF rplR TRUE 0.974 101.000 0.815 0.030 Y NA
 274731 274732 SAG0074 SAG0075 rplR rpsE TRUE 0.999 19.000 0.814 0.039 Y NA
 274732 274733 SAG0075 SAG0076 rpsE rpmD TRUE 0.999 15.000 0.789 0.039 Y NA
 274733 274734 SAG0076 SAG0077 rpmD rplO TRUE 0.943 125.000 0.653 0.005 Y NA
 274734 274735 SAG0077 SAG0078 rplO   TRUE 0.994 21.000 0.730 1.000 N NA
 274735 274736 SAG0078 SAG0079   adk TRUE 0.638 95.000 0.241 1.000 N NA
 274736 274737 SAG0079 SAG0080 adk infA FALSE 0.316 116.000 0.059 1.000 N NA
 274737 274738 SAG0080 SAG0081 infA rpmJ TRUE 0.971 26.000 0.067 1.000 Y NA
 274738 274739 SAG0081 SAG0082 rpmJ rpsM TRUE 0.985 18.000 0.086 0.030 Y NA
 274739 274740 SAG0082 SAG0083 rpsM rpsK TRUE 0.999 18.000 0.810 0.030 Y NA
 274740 274741 SAG0083 SAG0084 rpsK rpoA TRUE 0.891 50.000 0.308 1.000 N NA
 274741 274742 SAG0084 SAG0085 rpoA rplQ TRUE 0.996 15.000 0.873 1.000 N NA
 274742 2194565 SAG0085 Sa16SC rplQ   FALSE 0.010 587.000 0.000 NA   NA
 2194565 400653 Sa16SC tRNA-Ala-7   tRNA-Ala TRUE 0.446 53.000 0.000 NA   NA
 400653 407079 tRNA-Ala-7 Sa23SC tRNA-Ala rrl FALSE 0.074 155.000 0.000 NA   NA
 407079 3827817 Sa23SC SAG_r03 rrl   FALSE 0.275 74.000 0.000 NA   NA
 3827817 5922191 SAG_r03 tRNA-Val-5     TRUE 0.795 4.000 0.000 NA   NA
 5922191 5922192 tRNA-Val-5 tRNA-Asp-3     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 5922192 5922193 tRNA-Asp-3 tRNA-Lys-4     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 5922193 5922194 tRNA-Lys-4 tRNA-Leu-6     TRUE 0.784 10.000 0.000 NA   NA
 5922194 5922195 tRNA-Leu-6 tRNA-Thr-4     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5922195 5922196 tRNA-Thr-4 tRNA-Ile-4     TRUE 0.757 29.000 0.000 NA   NA
 5922196 5922197 tRNA-Ile-4 tRNA-Glu-5     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 5922197 5922198 tRNA-Glu-5 tRNA-Ser-5     TRUE 0.829 14.000 0.000 NA   NA
 5922198 5922199 tRNA-Ser-5 tRNA-Met-5     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5922199 5922200 tRNA-Met-5 tRNA-Phe-3     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 5922200 595904 tRNA-Phe-3 tRNA-Tyr-3     TRUE 0.812 12.000 0.000 NA   NA
 595904 5922201 tRNA-Tyr-3 tRNA-Trp-2     TRUE 0.788 7.000 0.000 NA   NA
 5922201 5922202 tRNA-Trp-2 tRNA-His-2     TRUE 0.828 15.000 0.000 NA   NA
 5922202 5922203 tRNA-His-2 tRNA-Gln-4     TRUE 0.788 7.000 0.000 NA   NA
 5922203 5922204 tRNA-Gln-4 tRNA-Leu-7     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5922204 274743 tRNA-Leu-7 SAG0086     FALSE 0.012 411.000 0.000 NA   NA
 274743 274744 SAG0086 SAG0087     TRUE 0.902 -9.000 0.000 NA   NA
 274744 274745 SAG0087 SAG0088     FALSE 0.297 70.000 0.000 NA   NA
 274745 274746 SAG0088 SAG0089     FALSE 0.009 915.000 0.000 NA   NA
 274746 274747 SAG0089 SAG0090     FALSE 0.029 220.000 0.000 NA   NA
 274747 274748 SAG0090 SAG0091     FALSE 0.023 245.000 0.000 NA   NA
 274748 274749 SAG0091 SAG0092     FALSE 0.148 122.000 0.000 NA   NA
 274749 274750 SAG0092 SAG0093     TRUE 0.973 -3.000 0.174 1.000 N NA
 274750 274751 SAG0093 SAG0094     TRUE 0.973 -3.000 0.174 1.000 N NA
 274751 274752 SAG0094 SAG0095   hrcA FALSE 0.138 143.000 0.009 1.000 N NA
 274752 274753 SAG0095 SAG0096 hrcA grpE TRUE 0.904 3.000 0.051 1.000 N NA
 274753 274754 SAG0096 SAG0097 grpE dnaK FALSE 0.339 181.000 0.026 0.007 Y NA
 274754 274755 SAG0097 SAG0098 dnaK dnaJ FALSE 0.316 289.000 0.196 0.003 Y NA
 274755 274756 SAG0098 SAG0099 dnaJ   FALSE 0.147 114.000 0.000 1.000 N NA
 274756 274757 SAG0099 SAG0100   truA FALSE 0.263 71.000 0.000 1.000 N NA
 274757 274758 SAG0100 SAG0101 truA   TRUE 0.958 -37.000 0.058 1.000 N NA
 274758 274759 SAG0101 SAG0102     TRUE 0.967 10.000 0.276 NA   NA
 274759 274760 SAG0102 SAG0103     TRUE 0.971 -3.000 0.149 NA   NA
 274762 274763 SAG0105 SAG0106 tig   FALSE 0.059 189.000 0.005 1.000 N NA
 274763 274764 SAG0106 SAG0107   pyrG FALSE 0.040 273.000 0.029 1.000 N NA
 274764 274765 SAG0107 SAG0108 pyrG   FALSE 0.220 109.000 0.002 NA N NA
 274765 5922205 SAG0108 tRNA-Leu-8     TRUE 0.544 47.000 0.000 NA   NA
 5922205 274766 tRNA-Leu-8 SAG0109   dut FALSE 0.351 63.000 0.000 NA   NA
 274766 274767 SAG0109 SAG0110 dut radA FALSE 0.116 162.000 0.028 1.000 N NA
 274767 274768 SAG0110 SAG0111 radA   FALSE 0.154 136.000 0.009 1.000 N NA
 274768 274769 SAG0111 SAG0112     FALSE 0.067 154.000 0.000 1.000 N NA
 274769 274770 SAG0112 SAG0113   gltX FALSE 0.027 209.000 0.000 1.000 N NA
 274771 274772 SAG0114 SAG0115 rbsB rbsC TRUE 0.990 53.000 0.847 NA Y NA
 274772 274773 SAG0115 SAG0116 rbsC rbsA TRUE 0.992 11.000 0.358 1.000 Y NA
 274773 274774 SAG0116 SAG0117 rbsA rbsD TRUE 0.990 16.000 0.243 1.000 Y NA
 274774 274775 SAG0117 SAG0118 rbsD rbsK TRUE 0.994 -25.000 0.183 1.000 Y NA
 274775 274776 SAG0118 SAG0119 rbsK rbsR TRUE 0.985 -7.000 0.281 1.000 N NA
 274776 274777 SAG0119 SAG0120 rbsR   TRUE 0.389 58.000 0.000 NA   NA
 274778 274779 SAG0121 SAG0122     TRUE 0.993 0.000 0.591 1.000 N NA
 274779 274780 SAG0122 SAG0123     TRUE 0.907 31.000 0.133 1.000 N NA
 274780 274781 SAG0123 SAG0124     TRUE 0.998 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 274781 274782 SAG0124 SAG0125   argG FALSE 0.067 154.000 0.000 1.000 N NA
 274782 274783 SAG0125 SAG0126 argG argH TRUE 0.992 19.000 0.278 1.000 Y NA
 274783 274784 SAG0126 SAG0127 argH fba FALSE 0.083 141.000 0.000 1.000 N NA
 274786 274787 SAG0129 SAG0130 rpmB   FALSE 0.241 132.000 0.044 NA   NA
 274787 274788 SAG0130 SAG0131     TRUE 0.982 33.000 0.567 NA   NA
 274788 274789 SAG0131 SAG0132     FALSE 0.141 148.000 0.006 1.000   NA
 274790 274791 SAG0133 SAG0134     FALSE 0.014 368.000 0.000 NA   NA
 274791 274792 SAG0134 SAG0135     FALSE 0.015 342.000 0.000 NA   NA
 274792 274793 SAG0135 SAG0136     TRUE 0.997 10.000 0.758 1.000 Y NA
 274794 274795 SAG0137 SAG0138     TRUE 0.817 46.000 0.118 NA   NA
 274795 274796 SAG0138 SAG0139     TRUE 0.378 120.000 0.132 NA N NA
 274796 274797 SAG0139 SAG0140     TRUE 0.973 2.000 0.267 NA N NA
 274797 274798 SAG0140 SAG0141     FALSE 0.097 165.000 0.013 1.000 N NA
 274798 274799 SAG0141 SAG0142     TRUE 0.962 37.000 0.139 1.000 Y NA
 274799 274800 SAG0142 SAG0143   csdB TRUE 0.991 2.000 0.606 1.000 N NA
 274800 274801 SAG0143 SAG0144 csdB   TRUE 0.987 -13.000 0.292 1.000 N NA
 274801 274802 SAG0144 SAG0145     TRUE 0.607 100.000 0.152 0.002 N NA
 274803 274804 SAG0146 SAG0147     TRUE 0.710 153.000 0.231 0.003 Y NA
 274805 274806 SAG0148 SAG0149     TRUE 0.524 119.000 0.000 0.051 Y NA
 274806 274807 SAG0149 SAG0150     TRUE 0.951 10.000 0.134 0.051   NA
 274807 274808 SAG0150 SAG0151     TRUE 0.976 13.000 0.286 1.000   NA
 274808 274809 SAG0151 SAG0152     TRUE 0.998 0.000 0.619 0.002 Y NA
 274809 2194566 SAG0152 Sa16SD     FALSE 0.013 397.000 0.000 NA   NA
 2194566 5922206 Sa16SD tRNA-Ala-1     TRUE 0.446 53.000 0.000 NA   NA
 5922206 407080 tRNA-Ala-1 Sa23SD   rrl FALSE 0.074 155.000 0.000 NA   NA
 407080 2194567 Sa23SD Sa5SD rrl   FALSE 0.275 74.000 0.000 NA   NA
 2194567 5922207 Sa5SD tRNA-Asn-1     TRUE 0.790 6.000 0.000 NA   NA
 5922207 274810 tRNA-Asn-1 SAG0153   ispE FALSE 0.096 140.000 0.000 NA   NA
 274810 274811 SAG0153 SAG0154 ispE adcR FALSE 0.341 86.000 0.008 1.000   NA
 274811 274812 SAG0154 SAG0155 adcR   TRUE 0.958 3.000 0.192 1.000   NA
 274812 274813 SAG0155 SAG0156     TRUE 0.999 -10.000 0.673 1.000 Y NA
 10942595 274814 SAG0157 SAG0158   tyrS FALSE 0.010 537.000 0.000 NA   NA
 274815 274816 SAG0159 SAG0160   rpoB FALSE 0.009 524.000 0.000 1.000 N NA
 274816 274817 SAG0160 SAG0161 rpoB rpoC TRUE 0.973 117.000 0.851 0.003 Y NA
 274817 274818 SAG0161 SAG0162 rpoC   FALSE 0.252 114.000 0.007 NA   NA
 274818 274819 SAG0162 SAG0163   cglA FALSE 0.135 173.000 0.083 NA   NA
 274819 274820 SAG0163 SAG0164 cglA cglB TRUE 0.883 89.000 0.639 1.000   NA
 274820 274821 SAG0164 SAG0165 cglB   TRUE 0.972 -3.000 0.000 NA Y NA
 274821 274822 SAG0165 SAG0166     TRUE 0.985 -22.000 0.232 NA   NA
 274822 274823 SAG0166 SAG0167     FALSE 0.361 115.000 0.087 NA   NA
 274823 274824 SAG0167 SAG0168   ackA TRUE 0.902 32.000 0.130 1.000 N NA
 274824 274825 SAG0168 SAG0169 ackA   FALSE 0.194 152.000 0.094 1.000 N NA
 274825 274826 SAG0169 SAG0170     TRUE 0.381 59.000 0.000 NA   NA
 274826 274827 SAG0170 SAG0171     TRUE 0.624 41.000 0.000 NA   NA
 274827 274828 SAG0171 SAG0172     FALSE 0.302 69.000 0.000 NA   NA
 274829 274830 SAG0173 SAG0174 proC pepA TRUE 0.481 70.000 0.041 1.000 N NA
 274830 274831 SAG0174 SAG0175 pepA   FALSE 0.042 185.000 0.000 NA   NA
 274832 274833 SAG0176 SAG0177     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 274833 274834 SAG0177 SAG0178     TRUE 0.948 33.000 0.239 1.000   NA
 274836 274837 SAG0180 SAG0181 ssb-1   FALSE 0.144 124.000 0.000 1.000   NA
 274837 274838 SAG0181 SAG0182     TRUE 0.778 27.000 0.000 1.000   NA
 274838 274839 SAG0182 SAG0183     TRUE 0.999 -19.000 0.538 0.018 Y NA
 274839 274840 SAG0183 SAG0184     FALSE 0.233 170.000 0.178 1.000   NA
 274840 274841 SAG0184 SAG0185     TRUE 0.996 2.000 0.869 1.000   NA
 274843 274844 SAG0187 SAG0188     TRUE 0.551 113.000 0.000 0.050 Y NA
 274844 274845 SAG0188 SAG0189     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.050 Y NA
 274845 274846 SAG0189 SAG0190     TRUE 0.992 12.000 0.333 1.000 Y NA
 274846 274847 SAG0190 SAG0191     TRUE 0.999 -16.000 0.750 0.032 Y NA
 274847 274848 SAG0191 SAG0192     FALSE 0.017 283.000 0.000 1.000 N NA
 274848 274849 SAG0192 SAG0193     TRUE 0.685 222.000 0.650 1.000 Y NA
 274849 274850 SAG0193 SAG0194     FALSE 0.026 216.000 0.000 1.000 N NA
 274852 274853 SAG0196 SAG0197     TRUE 0.965 3.000 0.156 0.013   NA
 274853 274854 SAG0197 SAG0198     TRUE 0.973 13.000 0.182 0.024   NA
 274854 274855 SAG0198 SAG0199     TRUE 0.977 3.000 0.333 1.000   NA
 274855 274856 SAG0199 SAG0200     TRUE 0.999 -3.000 0.742 0.002 Y NA
 274856 274857 SAG0200 SAG0201     FALSE 0.156 109.000 0.000 1.000 N NA
 274857 274858 SAG0201 SAG0202   rpsO FALSE 0.198 88.000 0.000 1.000 N NA
 274858 274859 SAG0202 SAG0203 rpsO pnp FALSE 0.285 381.000 0.335 1.000 Y NA
 274859 274860 SAG0203 SAG0204 pnp   TRUE 0.897 2.000 0.009 NA   NA
 274860 274861 SAG0204 SAG0205   cysE TRUE 0.918 9.000 0.097 NA   NA
 274861 274862 SAG0205 SAG0206 cysE   TRUE 0.784 10.000 0.000 NA   NA
 274862 274863 SAG0206 SAG0207   cysS TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 274863 274864 SAG0207 SAG0208 cysS   TRUE 0.971 -7.000 0.129 1.000   NA
 274864 274865 SAG0208 SAG0209     TRUE 0.598 103.000 0.150 0.006   NA
 274865 274866 SAG0209 SAG0210     TRUE 0.963 -3.000 0.109 NA   NA
 274866 274867 SAG0210 SAG0211     TRUE 0.388 93.000 0.036 NA   NA
 274867 274868 SAG0211 SAG0212     FALSE 0.111 133.000 0.000 NA   NA
 274868 274869 SAG0212 SAG0213     FALSE 0.165 114.000 0.000 NA   NA
 274869 274870 SAG0213 SAG0214   rplM FALSE 0.012 417.000 0.000 NA   NA
 274870 274871 SAG0214 SAG0215 rplM rpsI TRUE 0.998 21.000 0.601 0.028 Y NA
 274872 274873 SAG0216 SAG0217     TRUE 0.827 13.000 0.000 NA   NA
 274873 274874 SAG0217 SAG0218     FALSE 0.346 65.000 0.000 1.000   NA
 274875 274876 SAG0219 SAG0220     TRUE 0.672 137.000 0.500 NA   NA
 274876 274877 SAG0220 SAG0221     TRUE 0.986 11.000 0.500 NA   NA
 274877 274878 SAG0221 SAG0222     TRUE 0.997 13.000 1.000 NA   NA
 274878 274879 SAG0222 SAG0223     TRUE 0.991 4.000 0.667 NA   NA
 274879 274880 SAG0223 SAG0224     FALSE 0.040 190.000 0.000 NA   NA
 274880 274881 SAG0224 SAG0225     TRUE 0.677 36.000 0.000 NA   NA
 274881 274882 SAG0225 SAG0226     FALSE 0.017 316.000 0.000 NA   NA
 274882 274883 SAG0226 SAG0227     TRUE 0.808 168.000 1.000 NA   NA
 274884 274885 SAG0228 SAG0229     TRUE 0.994 -10.000 0.500 NA   NA
 274886 274887 SAG0230 SAG0231     FALSE 0.189 102.000 0.000 NA   NA
 274887 274888 SAG0231 SAG0232     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 274888 274889 SAG0232 SAG0233     TRUE 0.906 -27.000 0.000 NA   NA
 274889 274890 SAG0233 SAG0234     TRUE 0.905 -15.000 0.000 NA   NA
 274890 274891 SAG0234 SAG0235     TRUE 0.700 34.000 0.000 NA   NA
 274891 274892 SAG0235 SAG0236     FALSE 0.216 91.000 0.000 NA   NA
 274892 274893 SAG0236 SAG0237     FALSE 0.012 428.000 0.000 NA   NA
 274893 274894 SAG0237 SAG0238     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 274894 274895 SAG0238 SAG0239     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 274895 274896 SAG0239 SAG0240     TRUE 0.699 73.000 0.200 1.000   NA
 274897 274898 SAG0241 SAG0242     TRUE 0.991 10.000 0.619 0.050 N NA
 274898 274899 SAG0242 SAG0243     TRUE 0.993 3.000 0.650 0.050 N NA
 274899 274900 SAG0243 SAG0244     TRUE 0.997 0.000 0.450 0.095 Y NA
 2194568 5922208 Sa16SE tRNA-Ala-4     TRUE 0.446 53.000 0.000 NA   NA
 5922208 407081 tRNA-Ala-4 Sa23SE   rrl FALSE 0.074 155.000 0.000 NA   NA
 407081 3827818 Sa23SE SAG_r04 rrl   FALSE 0.275 74.000 0.000 NA   NA
 3827818 5922209 SAG_r04 tRNA-Val-3     TRUE 0.795 4.000 0.000 NA   NA
 5922209 5922210 tRNA-Val-3 tRNA-Gly-4     TRUE 0.790 6.000 0.000 NA   NA
 5922210 5922211 tRNA-Gly-4 tRNA-Ile-2     TRUE 0.666 37.000 0.000 NA   NA
 5922211 5922212 tRNA-Ile-2 tRNA-Glu-3     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 5922212 5922213 tRNA-Glu-3 tRNA-Ser-3     TRUE 0.829 14.000 0.000 NA   NA
 5922213 5922214 tRNA-Ser-3 tRNA-Met-4     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5922214 5922215 tRNA-Met-4 tRNA-Phe-2     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 5922215 5922216 tRNA-Phe-2 tRNA-Tyr-2     TRUE 0.812 12.000 0.000 NA   NA
 5922216 5922217 tRNA-Tyr-2 tRNA-Trp-1     TRUE 0.788 7.000 0.000 NA   NA
 5922217 5922218 tRNA-Trp-1 tRNA-His-1     TRUE 0.828 15.000 0.000 NA   NA
 5922218 5922219 tRNA-His-1 tRNA-Gln-3     TRUE 0.788 7.000 0.000 NA   NA
 5922219 5922220 tRNA-Gln-3 tRNA-Leu-5     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5922220 274901 tRNA-Leu-5 SAG0245     FALSE 0.017 310.000 0.000 NA   NA
 274901 274902 SAG0245 SAG0246     FALSE 0.343 64.000 0.000 NA   NA
 274902 274903 SAG0246 SAG0247     FALSE 0.011 478.000 0.000 NA   NA
 274903 274904 SAG0247 SAG0248     TRUE 0.997 19.000 1.000 NA   NA
 274904 274905 SAG0248 SAG0249     TRUE 0.784 10.000 0.000 NA   NA
 274905 274906 SAG0249 SAG0250     FALSE 0.009 861.000 0.000 NA   NA
 274906 274907 SAG0250 SAG0251     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 274907 274908 SAG0251 SAG0252     FALSE 0.009 573.000 0.000 1.000 N NA
 274908 274909 SAG0252 SAG0253     TRUE 0.614 100.000 0.000 0.015 Y NA
 274909 274910 SAG0253 SAG0254     TRUE 0.909 43.000 0.000 0.015 Y NA
 274911 274912 SAG0255 SAG0256     TRUE 0.988 -3.000 0.333 NA   NA
 274914 274915 SAG0258 SAG0259     TRUE 0.917 24.000 0.085 1.000 N NA
 274915 274916 SAG0259 SAG0260     TRUE 0.992 3.000 0.713 1.000 N NA
 274916 274917 SAG0260 SAG0261     FALSE 0.016 296.000 0.000 1.000 N NA
 274917 274918 SAG0261 SAG0262     TRUE 0.989 33.000 0.750 NA   NA
 274918 274919 SAG0262 SAG0263     TRUE 0.677 36.000 0.000 NA   NA
 274919 274920 SAG0263 SAG0264     FALSE 0.122 177.000 0.069 NA   NA
 274921 274922 SAG0265 SAG0266   nagA FALSE 0.020 278.000 0.000 NA   NA
 274922 274923 SAG0266 SAG0267 nagA   FALSE 0.159 119.000 0.000 1.000   NA
 274923 274924 SAG0267 SAG0268   glyQ FALSE 0.018 313.000 0.000 1.000   NA
 274924 274925 SAG0268 SAG0269 glyQ   TRUE 0.845 0.000 0.000 1.000 N NA
 274925 274926 SAG0269 SAG0270   glyS TRUE 0.771 4.000 0.000 1.000 N NA
 274926 274927 SAG0270 SAG0271 glyS   TRUE 0.900 12.000 0.020 NA   NA
 274927 274928 SAG0271 SAG0272     FALSE 0.219 89.000 0.000 NA   NA
 274928 274929 SAG0272 SAG0273   glpK FALSE 0.163 115.000 0.000 NA   NA
 274929 274930 SAG0273 SAG0274 glpK   TRUE 0.997 13.000 0.500 0.002 Y NA
 274930 274931 SAG0274 SAG0275   glpF-1 TRUE 0.986 12.000 0.500 1.000 N NA
 274931 274932 SAG0275 SAG0276 glpF-1   TRUE 0.768 88.000 0.364 1.000   NA
 274932 274933 SAG0276 SAG0277     TRUE 0.993 -9.000 0.462 NA   NA
 274933 274934 SAG0277 SAG0278   tkt FALSE 0.135 125.000 0.000 NA   NA
 274934 274935 SAG0278 SAG0279 tkt   FALSE 0.030 213.000 0.000 NA   NA
 274935 274936 SAG0279 SAG0280     TRUE 0.953 20.000 0.136 NA   NA
 274936 274937 SAG0280 SAG0281     TRUE 0.977 4.000 0.341 NA   NA
 274939 274940 SAG0283 SAG0284 proB proA TRUE 0.992 10.000 0.281 0.002 Y NA
 274940 274941 SAG0284 SAG0285 proA mraW FALSE 0.299 83.000 0.003 1.000 N NA
 274941 274942 SAG0285 SAG0286 mraW   TRUE 0.925 15.000 0.077 1.000 N NA
 274942 274943 SAG0286 SAG0287   pbpX TRUE 0.982 4.000 0.456 1.000 N NA
 274943 274944 SAG0287 SAG0288 pbpX mraY TRUE 0.976 2.000 0.038 1.000 Y NA
 274944 274945 SAG0288 SAG0289 mraY   FALSE 0.279 98.000 0.007 1.000 N NA
 274945 274946 SAG0289 SAG0290     FALSE 0.193 138.000 0.036 1.000 N NA
 274946 274947 SAG0290 SAG0291     TRUE 0.813 95.000 0.143 0.049 Y NA
 274947 274948 SAG0291 SAG0292     TRUE 0.994 0.000 0.310 1.000 Y NA
 274948 274949 SAG0292 SAG0293     TRUE 0.665 122.000 0.364 NA   NA
 274949 274950 SAG0293 SAG0294   trxB TRUE 0.598 69.000 0.117 NA   NA
 274950 274951 SAG0294 SAG0295 trxB   FALSE 0.117 158.000 0.017 1.000 N NA
 274951 274952 SAG0295 SAG0296   nadE TRUE 0.995 -3.000 0.194 0.003 Y NA
 274952 274953 SAG0296 SAG0297 nadE pepC FALSE 0.269 113.000 0.017 1.000 N NA
 274954 274955 SAG0298 SAG0299 pbp1A recU TRUE 0.989 -13.000 0.319 1.000   NA
 274956 274957 SAG0300 SAG0301     TRUE 0.906 -19.000 0.000 NA   NA
 274957 274958 SAG0301 SAG0302     TRUE 0.837 18.000 0.000 NA   NA
 274958 274959 SAG0302 SAG0303     FALSE 0.011 470.000 0.000 NA   NA
 274959 274960 SAG0303 SAG0304     TRUE 0.913 13.000 0.029 NA   NA
 274962 274963 SAG0306 SAG0307     TRUE 0.544 47.000 0.000 NA   NA
 274963 274964 SAG0307 SAG0308     TRUE 0.906 -19.000 0.000 NA   NA
 274964 274965 SAG0308 SAG0309     TRUE 0.974 -13.000 0.136 NA   NA
 274965 274966 SAG0309 SAG0310     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 274966 10942596 SAG0310 SAG0311     TRUE 0.831 2.000 0.000 NA   NA
 10942596 274967 SAG0311 SAG0312     TRUE 0.493 50.000 0.000 NA   NA
 274967 274968 SAG0312 SAG0313   gmk FALSE 0.058 167.000 0.000 NA   NA
 274968 274969 SAG0313 SAG0314 gmk   TRUE 0.985 23.000 0.471 1.000 N NA
 274969 274970 SAG0314 SAG0315   priA TRUE 0.515 74.000 0.032 0.073 N NA
 274970 274971 SAG0315 SAG0316 priA fmt TRUE 0.734 47.000 0.052 1.000 N NA
 274971 274972 SAG0316 SAG0317 fmt sun TRUE 0.996 -10.000 0.305 1.000 Y NA
 274972 274973 SAG0317 SAG0318 sun   TRUE 0.828 38.000 0.074 1.000 N NA
 274973 274974 SAG0318 SAG0319     TRUE 0.998 0.000 0.704 1.000 Y NA
 274974 274975 SAG0319 SAG0320     FALSE 0.141 161.000 0.039 NA   NA
 274975 274976 SAG0320 SAG0321     TRUE 0.996 -3.000 0.679 NA   NA
 274976 274977 SAG0321 SAG0322     TRUE 0.999 -7.000 0.853 0.017 Y NA
 274977 274978 SAG0322 SAG0323     TRUE 0.884 42.000 0.164 1.000   NA
 274978 274979 SAG0323 SAG0324     TRUE 0.977 -16.000 0.151 1.000   NA
 274981 274982 SAG0326 SAG0327     TRUE 0.793 119.000 0.188 0.042 Y NA
 274982 274983 SAG0327 SAG0328   celC FALSE 0.086 204.000 0.091 1.000 N NA
 274983 274984 SAG0328 SAG0329 celC   TRUE 0.999 17.000 0.889 0.012 Y NA
 274984 274985 SAG0329 SAG0330   celB TRUE 0.999 2.000 0.889 0.012 Y NA
 274985 274986 SAG0330 SAG0331 celB pflD-1 FALSE 0.141 181.000 0.132 1.000 N NA
 274986 274987 SAG0331 SAG0332 pflD-1   TRUE 0.975 10.000 0.368 1.000 N NA
 274987 274988 SAG0332 SAG0333   gldA TRUE 0.719 68.000 0.211 1.000 N NA
 274989 274990 SAG0334 SAG0335 cysK   TRUE 0.392 91.000 0.033 1.000   NA
 274991 274992 SAG0336 SAG0337     TRUE 0.960 0.000 0.130 1.000   NA
 274992 274993 SAG0337 SAG0338   yfiA TRUE 0.497 77.000 0.080 NA   NA
 274993 2194569 SAG0338 Sa16SF yfiA   FALSE 0.016 323.000 0.000 NA   NA
 2194569 5922221 Sa16SF tRNA-Ala-5     TRUE 0.446 53.000 0.000 NA   NA
 5922221 407082 tRNA-Ala-5 Sa23SF   rrl FALSE 0.074 155.000 0.000 NA   NA
 407082 2194570 Sa23SF Sa5SF rrl   FALSE 0.275 74.000 0.000 NA   NA
 2194570 5922222 Sa5SF tRNA-Asn-3     TRUE 0.790 6.000 0.000 NA   NA
 274997 274998 SAG0342 SAG0343     TRUE 0.423 96.000 0.098 1.000 N NA
 274998 274999 SAG0343 SAG0344   fabH TRUE 0.940 0.000 0.070 1.000 N NA
 274999 275000 SAG0344 SAG0345 fabH acpP TRUE 0.729 58.000 0.065 0.008   NA
 275000 275001 SAG0345 SAG0346 acpP fabK FALSE 0.339 155.000 0.216 1.000   NA
 275001 275002 SAG0346 SAG0347 fabK fabD TRUE 0.941 20.000 0.099 1.000   NA
 275002 275003 SAG0347 SAG0348 fabD fabG TRUE 0.995 9.000 0.432 0.008 Y NA
 275003 275004 SAG0348 SAG0349 fabG fabF TRUE 0.977 16.000 0.056 1.000 Y NA
 275004 275005 SAG0349 SAG0350 fabF accB TRUE 0.979 2.000 0.074 1.000 Y NA
 275005 275006 SAG0350 SAG0351 accB fabZ TRUE 0.990 -3.000 0.047 0.008 Y NA
 275006 275007 SAG0351 SAG0352 fabZ accC TRUE 0.942 38.000 0.045 1.000 Y NA
 275007 275008 SAG0352 SAG0353 accC accD TRUE 0.981 9.000 0.090 0.003 Y NA
 275008 275009 SAG0353 SAG0354 accD accA TRUE 0.996 -7.000 0.234 0.002 Y NA
 275009 275010 SAG0354 SAG0355 accA   FALSE 0.011 470.000 0.000 NA   NA
 275013 275014 SAG0358 SAG0359     TRUE 0.812 119.000 0.583 NA   NA
 275014 275015 SAG0359 SAG0360   manM TRUE 0.999 15.000 0.812 0.023 Y NA
 275015 275016 SAG0360 SAG0361 manM manL TRUE 0.998 33.000 0.943 0.023 Y NA
 275016 275017 SAG0361 SAG0362 manL   FALSE 0.018 303.000 0.000 1.000   NA
 275018 275019 SAG0363 SAG0364     TRUE 0.778 90.000 0.400 NA   NA
 275019 275020 SAG0364 SAG0365     TRUE 0.383 103.000 0.068 NA   NA
 275020 275021 SAG0365 SAG0366     FALSE 0.344 83.000 0.008 NA   NA
 275021 275022 SAG0366 SAG0367     TRUE 0.956 -46.000 0.033 NA   NA
 275022 275023 SAG0367 SAG0368     TRUE 0.968 9.000 0.283 NA   NA
 275024 275025 SAG0369 SAG0370   hit TRUE 0.954 -3.000 0.063 NA   NA
 275028 275029 SAG0373 SAG0374     TRUE 0.955 2.000 0.167 NA N NA
 275029 275030 SAG0374 SAG0375     TRUE 0.646 58.000 0.107 NA N NA
 275030 275031 SAG0375 SAG0376     TRUE 0.977 -10.000 0.154 NA   NA
 275031 5922223 SAG0376 tRNA-Ser-4     TRUE 0.592 44.000 0.000 NA   NA
 5922223 275032 tRNA-Ser-4 SAG0377     FALSE 0.011 452.000 0.000 NA   NA
 275032 275033 SAG0377 SAG0378   nusA TRUE 0.988 36.000 0.759 NA   NA
 275033 275034 SAG0378 SAG0379 nusA   TRUE 0.992 22.000 0.323 NA Y NA
 275034 275035 SAG0379 SAG0380     TRUE 0.991 -7.000 0.408 NA N NA
 275035 275036 SAG0380 SAG0381     TRUE 0.990 20.000 0.223 NA Y NA
 275036 275037 SAG0381 SAG0382   rbfA TRUE 0.936 91.000 0.530 1.000 Y NA
 275039 275040 SAG0384 SAG0385     TRUE 0.921 13.000 0.064 1.000 N NA
 275040 275041 SAG0385 SAG0386     TRUE 0.953 41.000 0.048 0.006 Y NA
 275041 275042 SAG0386 SAG0387     FALSE 0.173 110.000 0.000 NA   NA
 275042 275043 SAG0387 SAG0388     TRUE 0.923 15.000 0.047 NA   NA
 275043 275044 SAG0388 SAG0389   polA FALSE 0.174 113.000 0.000 1.000   NA
 275044 275045 SAG0389 SAG0390 polA   TRUE 0.827 30.000 0.005 NA   NA
 275045 275046 SAG0390 SAG0391     FALSE 0.353 82.000 0.010 NA   NA
 275046 275047 SAG0391 SAG0392     FALSE 0.081 153.000 0.000 1.000   NA
 275047 275048 SAG0392 SAG0393     TRUE 0.676 113.000 0.333 1.000   NA
 275048 275049 SAG0393 SAG0394     TRUE 0.996 2.000 0.500 1.000 Y NA
 275051 275052 SAG0396 SAG0397 tgt   FALSE 0.256 110.000 0.004 1.000   NA
 275052 275053 SAG0397 SAG0398     TRUE 0.899 7.000 0.039 NA   NA
 275053 275054 SAG0398 SAG0399     FALSE 0.199 139.000 0.033 NA   NA
 275054 275055 SAG0399 SAG0400     TRUE 0.948 0.000 0.013 0.024   NA
 275055 275056 SAG0400 SAG0401     FALSE 0.189 102.000 0.000 NA   NA
 275056 275057 SAG0401 SAG0402   pgi TRUE 0.677 36.000 0.000 NA   NA
 275057 275058 SAG0402 SAG0403 pgi   FALSE 0.014 322.000 0.000 1.000 N NA
 275058 275059 SAG0403 SAG0404     TRUE 0.957 -9.000 0.037 1.000   NA
 275059 275060 SAG0404 SAG0405     FALSE 0.118 132.000 0.000 1.000   NA
 275061 275062 SAG0406 SAG0407 galU gpsA TRUE 0.802 37.000 0.032 1.000 N NA
 275063 275064 SAG0408 SAG0409 rnpA   TRUE 0.918 13.000 0.052 1.000 N NA
 275064 275065 SAG0409 SAG0410     TRUE 0.924 8.000 0.106 1.000   NA
 275065 2194571 SAG0410 Sa16SG     FALSE 0.015 341.000 0.000 NA   NA
 2194571 595912 Sa16SG tRNA-Ala-6     TRUE 0.446 53.000 0.000 NA   NA
 595912 407083 tRNA-Ala-6 Sa23SG   rrl FALSE 0.074 155.000 0.000 NA   NA
 407083 3827819 Sa23SG SAG_r05 rrl   FALSE 0.275 74.000 0.000 NA   NA
 3827819 5922224 SAG_r05 tRNA-Val-4     TRUE 0.795 4.000 0.000 NA   NA
 5922224 5922225 tRNA-Val-4 tRNA-Gly-5     TRUE 0.790 6.000 0.000 NA   NA
 5922225 5922226 tRNA-Gly-5 tRNA-Ile-3     TRUE 0.666 37.000 0.000 NA   NA
 5922226 5922227 tRNA-Ile-3 tRNA-Glu-4     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 275066 275067 SAG0411 SAG0412     TRUE 0.389 84.000 0.025 NA   NA
 275068 275069 SAG0413 SAG0414     FALSE 0.022 269.000 0.000 1.000   NA
 275069 275070 SAG0414 SAG0415     FALSE 0.095 143.000 0.000 1.000   NA
 275070 275071 SAG0415 SAG0416     FALSE 0.042 188.000 0.000 1.000   NA
 275071 275072 SAG0416 SAG0417     FALSE 0.031 210.000 0.000 NA   NA
 275072 275073 SAG0417 SAG0418   nrdF-1 FALSE 0.010 552.000 0.000 NA   NA
 275073 275074 SAG0418 SAG0419 nrdF-1 nrdI-1 TRUE 0.998 1.000 0.643 NA Y NA
 275074 275075 SAG0419 SAG0420 nrdI-1 nrdE-1 TRUE 0.999 2.000 1.000 NA Y NA
 275075 275076 SAG0420 SAG0421 nrdE-1   FALSE 0.351 63.000 0.000 NA   NA
 275076 275077 SAG0421 SAG0422     TRUE 0.965 13.000 0.200 NA   NA
 275078 275079 SAG0423 SAG0424     FALSE 0.021 272.000 0.000 NA   NA
 275079 275080 SAG0424 SAG0425     FALSE 0.223 87.000 0.000 NA   NA
 275080 275081 SAG0425 SAG0426     TRUE 0.954 24.000 0.167 1.000   NA
 275081 275082 SAG0426 SAG0427     TRUE 0.938 10.000 0.095 0.059   NA
 275082 275083 SAG0427 SAG0428     TRUE 0.932 16.000 0.095 1.000 N NA
 275083 275084 SAG0428 SAG0429     FALSE 0.179 110.000 0.000 1.000   NA
 275084 275085 SAG0429 SAG0430     FALSE 0.234 85.000 0.000 1.000   NA
 275089 275090 SAG0435 SAG0436     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275090 275091 SAG0436 SAG0437     FALSE 0.078 153.000 0.000 NA   NA
 275091 10942598 SAG0437 SAG0438     FALSE 0.011 514.000 0.000 NA   NA
 5922228 10942599 tRNA-Thr-3 SAG0439     FALSE 0.014 353.000 0.000 NA   NA
 275092 275093 SAG0440 SAG0441     FALSE 0.176 109.000 0.000 NA   NA
 275093 275094 SAG0441 SAG0442     FALSE 0.022 268.000 0.000 1.000   NA
 275094 275095 SAG0442 SAG0443     TRUE 0.726 98.000 0.022 0.014 Y NA
 275095 275096 SAG0443 SAG0444     TRUE 0.947 -3.000 0.033 NA   NA
 275096 275097 SAG0444 SAG0445   valS TRUE 0.916 0.000 0.008 NA   NA
 275097 275098 SAG0445 SAG0446 valS   FALSE 0.055 171.000 0.000 1.000   NA
 275098 275099 SAG0446 SAG0447     TRUE 0.454 161.000 0.375 1.000   NA
 275101 275102 SAG0449 SAG0450   asnA FALSE 0.244 114.000 0.005 NA   NA
 275104 275105 SAG0452 SAG0453     TRUE 0.812 12.000 0.000 NA   NA
 275105 275106 SAG0453 SAG0454   coaD TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275106 275107 SAG0454 SAG0455 coaD   TRUE 0.956 -10.000 0.052 1.000 N NA
 275107 10942600 SAG0455 SAG0456     FALSE 0.267 75.000 0.000 NA   NA
 10942600 275108 SAG0456 SAG0457     FALSE 0.225 86.000 0.000 NA   NA
 275108 275109 SAG0457 SAG0458     TRUE 0.647 51.000 0.016 NA   NA
 275109 275110 SAG0458 SAG0459     TRUE 0.921 0.000 0.012 NA   NA
 275110 275111 SAG0459 SAG0460     FALSE 0.287 179.000 0.045 NA Y NA
 275111 275112 SAG0460 SAG0461     TRUE 1.000 -10.000 0.911 0.007 Y NA
 275112 275113 SAG0461 SAG0462   trpG FALSE 0.111 128.000 0.000 1.000 N NA
 275114 275115 SAG0463 SAG0464   bioB TRUE 0.849 1.000 0.000 NA   NA
 275116 275117 SAG0465 SAG0466     TRUE 0.904 10.000 0.058 NA   NA
 275117 275118 SAG0466 SAG0467     TRUE 0.998 -7.000 0.576 1.000 Y NA
 275118 275119 SAG0467 SAG0468   nth FALSE 0.150 113.000 0.000 1.000 N NA
 275121 275122 SAG0470 SAG0471   glk TRUE 0.993 -3.000 0.496 NA   NA
 275122 275123 SAG0471 SAG0472 glk   TRUE 0.911 12.000 0.064 NA N NA
 275123 275124 SAG0472 SAG0473     FALSE 0.037 232.000 0.003 NA N NA
 275124 275125 SAG0473 SAG0474     TRUE 0.728 45.000 0.015 NA   NA
 275125 275126 SAG0474 SAG0475   murD FALSE 0.185 130.000 0.006 NA   NA
 275126 275127 SAG0475 SAG0476 murD murG TRUE 0.973 3.000 0.060 1.000 Y NA
 275127 275128 SAG0476 SAG0477 murG   TRUE 0.972 4.000 0.072 NA Y NA
 275128 275129 SAG0477 SAG0478   ftsA FALSE 0.137 356.000 0.389 NA N NA
 275129 275130 SAG0478 SAG0479 ftsA ftsZ TRUE 0.995 22.000 0.460 1.000 Y NA
 275130 275131 SAG0479 SAG0480 ftsZ   TRUE 0.853 6.000 0.002 NA   NA
 275131 275132 SAG0480 SAG0481   ylmF TRUE 0.871 12.000 0.002 NA   NA
 275132 275133 SAG0481 SAG0482 ylmF   TRUE 0.980 3.000 0.370 NA   NA
 275133 275134 SAG0482 SAG0483   ylmH TRUE 0.977 2.000 0.287 1.000   NA
 275134 275135 SAG0483 SAG0484 ylmH   TRUE 0.988 10.000 0.579 NA   NA
 275135 275136 SAG0484 SAG0485   ileS FALSE 0.031 285.000 0.012 NA N NA
 275137 275138 SAG0486 SAG0487     TRUE 0.637 64.000 0.114 NA   NA
 275138 275139 SAG0487 SAG0488     FALSE 0.100 186.000 0.079 1.000 N NA
 275140 275141 SAG0489 SAG0490     TRUE 0.656 38.000 0.000 NA   NA
 275141 275142 SAG0490 SAG0491     FALSE 0.202 142.000 0.044 NA   NA
 275142 275143 SAG0491 SAG0492     TRUE 0.998 -7.000 0.640 1.000 Y NA
 275143 275144 SAG0492 SAG0493     FALSE 0.016 287.000 0.000 1.000 N NA
 275144 275145 SAG0493 SAG0494   folD FALSE 0.156 139.000 0.013 1.000 N NA
 275145 275146 SAG0494 SAG0495 folD   TRUE 0.938 -3.000 0.030 NA N NA
 275146 275147 SAG0495 SAG0496   xseA FALSE 0.178 126.000 0.005 NA N NA
 275147 275148 SAG0496 SAG0497 xseA xseB TRUE 0.998 -22.000 0.412 0.001 Y NA
 275148 275149 SAG0497 SAG0498 xseB   TRUE 0.947 0.000 0.100 1.000 N NA
 275149 275150 SAG0498 SAG0499     TRUE 0.955 -7.000 0.058 1.000 N NA
 275150 275151 SAG0499 SAG0500     TRUE 0.956 -13.000 0.048 1.000 N NA
 275151 275152 SAG0500 SAG0501   recN TRUE 0.903 12.000 0.037 1.000 N NA
 275152 275153 SAG0501 SAG0502 recN   FALSE 0.253 113.000 0.006 NA   NA
 275153 275154 SAG0502 SAG0503     TRUE 0.981 -7.000 0.203 NA   NA
 275154 275155 SAG0503 SAG0504     TRUE 0.998 -25.000 0.828 NA   NA
 275155 275156 SAG0504 SAG0505   hup TRUE 0.511 103.000 0.156 NA   NA
 275156 275157 SAG0505 SAG0506 hup   FALSE 0.037 197.000 0.000 NA   NA
 275158 275159 SAG0507 SAG0508 pyrDA fibB FALSE 0.036 187.000 0.000 1.000 N NA
 275159 275160 SAG0508 SAG0509 fibB fibA TRUE 0.997 19.000 0.467 0.010 Y NA
 275160 275161 SAG0509 SAG0510 fibA   TRUE 0.989 13.000 0.133 0.001 Y NA
 275161 275162 SAG0510 SAG0511     TRUE 0.959 0.000 0.125 1.000   NA
 275162 275163 SAG0511 SAG0512     TRUE 0.497 71.000 0.035 1.000   NA
 275164 275165 SAG0513 SAG0514     FALSE 0.014 344.000 0.000 NA   NA
 275167 275168 SAG0516 SAG0517     FALSE 0.339 90.000 0.018 1.000 N NA
 275168 10942601 SAG0517 SAG0518     FALSE 0.302 69.000 0.000 NA   NA
 10942601 275169 SAG0518 SAG0519   ftsE TRUE 0.837 19.000 0.000 NA   NA
 275169 275170 SAG0519 SAG0520 ftsE ftsX TRUE 0.997 -16.000 0.431 1.000 Y NA
 275171 275172 SAG0521 SAG0522     TRUE 0.926 -3.000 0.004 NA   NA
 275173 275174 SAG0523 SAG0524     FALSE 0.159 108.000 0.000 1.000 N NA
 275174 275175 SAG0524 SAG0525   aspC FALSE 0.364 86.000 0.028 1.000 N NA
 275175 275176 SAG0525 SAG0526 aspC asnS TRUE 0.924 21.000 0.068 1.000 N NA
 275177 275178 SAG0527 SAG0528     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275178 275179 SAG0528 SAG0529     TRUE 0.716 33.000 0.000 NA   NA
 275179 275180 SAG0529 SAG0530     FALSE 0.205 97.000 0.000 NA   NA
 275181 275182 SAG0531 SAG0532     TRUE 0.980 -3.000 0.214 NA   NA
 275182 275183 SAG0532 SAG0533     TRUE 0.992 -3.000 0.470 NA   NA
 275183 275184 SAG0533 SAG0534     TRUE 0.907 15.000 0.015 1.000   NA
 275184 275185 SAG0534 SAG0535     TRUE 0.416 142.000 0.250 1.000 N NA
 275186 275187 SAG0536 SAG0537 rpmE   FALSE 0.312 109.000 0.020 1.000   NA
 275188 275189 SAG0538 SAG0539     TRUE 0.563 59.000 0.034 1.000 N NA
 275189 275190 SAG0539 SAG0540     TRUE 0.610 77.000 0.167 1.000 N NA
 275190 275191 SAG0540 SAG0541     TRUE 0.961 -7.000 0.094 1.000 N NA
 275191 275192 SAG0541 SAG0542     FALSE 0.011 453.000 0.000 NA   NA
 275192 275193 SAG0542 SAG0543     TRUE 0.989 33.000 0.750 NA   NA
 275193 275194 SAG0543 SAG0544   rplS FALSE 0.038 183.000 0.000 1.000 N NA
 275194 5922229 SAG0544 tRNA-Arg-5 rplS   FALSE 0.171 111.000 0.000 NA   NA
 275195 275196 SAG0545 SAG0546     FALSE 0.149 123.000 0.000 1.000   NA
 275196 275197 SAG0546 SAG0547     FALSE 0.192 103.000 0.000 1.000   NA
 275197 275198 SAG0547 SAG0548     TRUE 0.837 2.000 0.000 1.000   NA
 275201 275202 SAG0551 SAG0552     TRUE 0.745 30.000 0.000 NA   NA
 275204 275205 SAG0554 SAG0555     FALSE 0.319 68.000 0.000 1.000   NA
 275205 275206 SAG0555 SAG0556     TRUE 0.812 12.000 0.000 NA   NA
 275206 275207 SAG0556 SAG0557     FALSE 0.083 150.000 0.000 NA   NA
 275207 275208 SAG0557 SAG0558     FALSE 0.100 138.000 0.000 NA   NA
 275208 275209 SAG0558 SAG0559     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 275209 275210 SAG0559 SAG0560     TRUE 0.951 -19.000 0.018 NA   NA
 275210 275211 SAG0560 SAG0561     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275211 275212 SAG0561 SAG0562     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 275212 275213 SAG0562 SAG0563     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 275213 275214 SAG0563 SAG0564     TRUE 0.831 2.000 0.000 NA   NA
 275214 275215 SAG0564 SAG0565     TRUE 0.953 1.000 0.125 NA   NA
 275215 275216 SAG0565 SAG0566   ssb-2 TRUE 0.970 -7.000 0.125 NA   NA
 275216 275217 SAG0566 SAG0567 ssb-2   FALSE 0.043 581.000 0.000 1.000 Y NA
 275217 275218 SAG0567 SAG0568     FALSE 0.132 126.000 0.000 NA   NA
 275218 275219 SAG0568 SAG0569     TRUE 0.903 -10.000 0.000 NA   NA
 275219 275220 SAG0569 SAG0570     TRUE 0.903 -10.000 0.000 NA   NA
 275220 275221 SAG0570 SAG0571     FALSE 0.017 318.000 0.000 NA   NA
 275221 275222 SAG0571 SAG0572     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 275222 275223 SAG0572 SAG0573     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275223 275224 SAG0573 SAG0574     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275224 275225 SAG0574 SAG0575     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 275225 275226 SAG0575 SAG0576     FALSE 0.233 83.000 0.000 NA   NA
 275226 275227 SAG0576 SAG0577     FALSE 0.213 93.000 0.000 NA   NA
 275227 275228 SAG0577 SAG0578     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275228 275229 SAG0578 SAG0579     FALSE 0.013 388.000 0.000 NA   NA
 275229 10942602 SAG0579 SAG0580     FALSE 0.009 625.000 0.000 NA   NA
 10942602 275230 SAG0580 SAG0581     FALSE 0.081 152.000 0.000 NA   NA
 275230 275231 SAG0581 SAG0582     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275231 275232 SAG0582 SAG0583     TRUE 0.990 -7.000 0.353 NA   NA
 275232 10942603 SAG0583 SAG0584     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 10942603 275233 SAG0584 SAG0585     FALSE 0.179 108.000 0.000 NA   NA
 275233 275234 SAG0585 SAG0586     TRUE 0.715 81.000 0.263 NA   NA
 275234 275235 SAG0586 SAG0587     TRUE 0.982 3.000 0.417 NA   NA
 275235 275236 SAG0587 SAG0588     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275236 275237 SAG0588 SAG0589     TRUE 0.829 14.000 0.000 NA   NA
 275237 275238 SAG0589 SAG0590     TRUE 0.996 -49.000 0.667 NA   NA
 275238 275239 SAG0590 SAG0591     TRUE 0.993 -7.000 0.467 NA   NA
 275239 275240 SAG0591 SAG0592     TRUE 0.995 1.000 0.750 NA   NA
 275240 275241 SAG0592 SAG0593     TRUE 0.982 10.000 0.444 NA   NA
 275241 275242 SAG0593 SAG0594     TRUE 0.976 0.000 0.222 NA   NA
 275242 275243 SAG0594 SAG0595     TRUE 0.996 15.000 0.833 NA   NA
 275243 275244 SAG0595 SAG0596     TRUE 0.979 0.000 0.250 NA   NA
 275244 275245 SAG0596 SAG0597     TRUE 0.969 -6.000 0.125 NA   NA
 275245 275246 SAG0597 SAG0598     TRUE 0.849 1.000 0.000 NA   NA
 275246 275247 SAG0598 SAG0599     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 275247 275248 SAG0599 SAG0600     TRUE 0.970 26.000 0.300 NA   NA
 275248 275249 SAG0600 SAG0601     TRUE 0.906 -25.000 0.000 NA   NA
 275249 275250 SAG0601 SAG0602     TRUE 0.827 13.000 0.000 NA   NA
 275250 275251 SAG0602 SAG0603     TRUE 0.831 2.000 0.000 NA   NA
 275251 275252 SAG0603 SAG0604     TRUE 0.831 2.000 0.000 NA   NA
 275252 275253 SAG0604 SAG0605     FALSE 0.015 333.000 0.000 NA   NA
 275253 275254 SAG0605 SAG0606     FALSE 0.184 104.000 0.000 NA   NA
 275257 10942605 SAG0610 SAG0611     FALSE 0.062 162.000 0.000 NA   NA
 275259 275260 SAG0613 SAG0614 vex1 vex2 TRUE 0.995 10.000 0.917 1.000 N NA
 275260 275261 SAG0614 SAG0615 vex2 vex3 TRUE 0.992 0.000 0.542 1.000 N NA
 275261 275262 SAG0615 SAG0616 vex3 vncR TRUE 0.758 97.000 0.409 1.000 N NA
 275262 275263 SAG0616 SAG0617 vncR vncS TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 275264 275265 SAG0619 SAG0620     TRUE 0.615 42.000 0.000 NA   NA
 275265 275266 SAG0620 SAG0621   rodA FALSE 0.012 425.000 0.000 NA   NA
 275266 275267 SAG0621 SAG0622 rodA   TRUE 0.693 119.000 0.385 1.000   NA
 275267 275268 SAG0622 SAG0623   gyrB TRUE 0.916 1.000 0.013 1.000   NA
 275268 275269 SAG0623 SAG0624 gyrB   FALSE 0.301 94.000 0.011 1.000 N NA
 275269 275270 SAG0624 SAG0625   serB FALSE 0.294 94.000 0.009 1.000 N NA
 275271 275272 SAG0626 SAG0627     TRUE 0.827 13.000 0.000 NA   NA
 275275 275276 SAG0630 SAG0631 aroA aroK TRUE 0.984 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 275276 275277 SAG0631 SAG0632 aroK   TRUE 0.663 57.000 0.111 NA N NA
 275277 275278 SAG0632 SAG0633     TRUE 0.386 101.000 0.093 NA N NA
 275278 275279 SAG0633 SAG0634     FALSE 0.160 117.000 0.000 NA   NA
 275279 275280 SAG0634 SAG0635     FALSE 0.274 118.000 0.017 NA   NA
 275280 275281 SAG0635 SAG0636     FALSE 0.016 321.000 0.000 NA   NA
 10942607 275282 SAG0637 SAG0639     FALSE 0.009 632.000 0.000 NA   NA
 275282 275283 SAG0639 SAG0640     TRUE 0.975 48.000 0.333 0.067 Y NA
 10942608 275284 SAG0641 SAG0642     FALSE 0.225 86.000 0.000 NA   NA
 10942609 275285 SAG0643 SAG0644     FALSE 0.038 194.000 0.000 NA   NA
 275286 275287 SAG0645 SAG0646     FALSE 0.339 89.000 0.000 0.013   NA
 275287 275288 SAG0646 SAG0647     TRUE 0.831 2.000 0.000 NA   NA
 275288 275289 SAG0647 SAG0648     TRUE 0.998 26.000 1.000 NA Y NA
 275289 275290 SAG0648 SAG0649     TRUE 0.909 78.000 0.667 NA   NA
 275290 275291 SAG0649 SAG0650     FALSE 0.020 275.000 0.000 NA   NA
 275291 275292 SAG0650 SAG0651     FALSE 0.022 249.000 0.000 NA   NA
 275292 10942610 SAG0651 SAG0652     FALSE 0.025 238.000 0.000 NA   NA
 10942610 275293 SAG0652 SAG0654     FALSE 0.009 783.000 0.000 NA   NA
 275293 275294 SAG0654 SAG0655     FALSE 0.012 433.000 0.000 NA   NA
 275296 275297 SAG0657 SAG0658     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 275297 275298 SAG0658 SAG0659     FALSE 0.037 200.000 0.000 1.000   NA
 275298 275299 SAG0659 SAG0660     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 275299 275300 SAG0660 SAG0661     TRUE 0.831 2.000 0.000 NA   NA
 275300 275301 SAG0661 SAG0662     FALSE 0.009 625.000 0.000 NA   NA
 275301 275302 SAG0662 SAG0663   cylD TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 275302 275303 SAG0663 SAG0664 cylD cylG TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.058 Y NA
 275303 275304 SAG0664 SAG0665 cylG   TRUE 0.902 -7.000 0.000 1.000   NA
 275304 275305 SAG0665 SAG0666     TRUE 0.979 -16.000 0.167 NA   NA
 275305 275306 SAG0666 SAG0667   cylA TRUE 0.886 -10.000 0.000 NA N NA
 275306 275307 SAG0667 SAG0668 cylA cylB TRUE 0.998 -7.000 0.849 NA   NA
 275307 275308 SAG0668 SAG0669 cylB cylE TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275308 275309 SAG0669 SAG0670 cylE cylF TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275309 275310 SAG0670 SAG0671 cylF cylI TRUE 0.872 -3.000 0.000 1.000 N NA
 275310 275311 SAG0671 SAG0672 cylI cylJ TRUE 0.767 5.000 0.000 1.000 N NA
 275311 275312 SAG0672 SAG0673 cylJ cylK TRUE 0.906 -31.000 0.000 NA   NA
 275312 275313 SAG0673 SAG0674 cylK   FALSE 0.015 343.000 0.000 NA   NA
 275313 275314 SAG0674 SAG0675     TRUE 0.700 34.000 0.000 NA   NA
 275314 275315 SAG0675 SAG0676     TRUE 0.470 52.000 0.000 NA   NA
 275315 275316 SAG0676 SAG0677     FALSE 0.192 103.000 0.000 1.000   NA
 275316 10942611 SAG0677 SAG0678     FALSE 0.043 184.000 0.000 NA   NA
 10942611 275317 SAG0678 SAG0679     TRUE 0.728 32.000 0.000 NA   NA
 275317 275318 SAG0679 SAG0680     TRUE 0.689 35.000 0.000 NA   NA
 275318 275319 SAG0680 SAG0681     TRUE 0.689 35.000 0.000 NA   NA
 275319 275320 SAG0681 SAG0682     FALSE 0.139 124.000 0.000 NA   NA
 275320 10942612 SAG0682 SAG0683     TRUE 0.784 10.000 0.000 NA   NA
 10942612 275321 SAG0683 SAG0684     FALSE 0.205 97.000 0.000 NA   NA
 275325 275326 SAG0688 SAG0689     TRUE 0.966 -3.000 0.127 NA   NA
 275326 275327 SAG0689 SAG0690     FALSE 0.060 164.000 0.000 NA   NA
 10942613 275331 SAG0694 SAG0695   ldhA TRUE 0.829 14.000 0.000 NA   NA
 275331 275332 SAG0695 SAG0696 ldhA   FALSE 0.027 207.000 0.000 NA N NA
 275332 275333 SAG0696 SAG0697     TRUE 0.679 67.000 0.000 NA Y NA
 275333 275334 SAG0697 SAG0698     TRUE 0.958 17.000 0.000 1.000 Y NA
 275334 275335 SAG0698 SAG0699     TRUE 0.967 29.000 0.333 1.000 N NA
 275335 275336 SAG0699 SAG0700   eda-1 TRUE 0.808 117.000 0.583 1.000 N NA
 275336 275337 SAG0700 SAG0701 eda-1 uxaC TRUE 0.995 17.000 0.467 1.000 Y NA
 275337 275338 SAG0701 SAG0702 uxaC uxuA TRUE 0.998 18.000 0.533 0.001 Y NA
 275338 275339 SAG0702 SAG0703 uxuA   TRUE 0.633 124.000 0.364 1.000 N NA
 275339 275340 SAG0703 SAG0704     FALSE 0.217 153.000 0.035 0.058   NA
 275340 275341 SAG0704 SAG0705     TRUE 0.902 16.000 0.012 1.000   NA
 275343 275344 SAG0707 SAG0708     FALSE 0.222 132.000 0.041 1.000 N NA
 275344 275345 SAG0708 SAG0709     TRUE 0.748 45.000 0.037 1.000 N NA
 275345 275346 SAG0709 SAG0710     TRUE 0.996 2.000 0.413 0.011 Y NA
 275346 275347 SAG0710 SAG0711   thrS FALSE 0.010 457.000 0.000 1.000 N NA
 275347 275348 SAG0711 SAG0712 thrS   FALSE 0.025 222.000 0.000 1.000 N NA
 275348 275349 SAG0712 SAG0713     FALSE 0.201 98.000 0.000 NA   NA
 275349 275350 SAG0713 SAG0714     FALSE 0.057 168.000 0.000 NA   NA
 275351 275352 SAG0715 SAG0716     TRUE 0.999 12.000 0.947 0.012 Y NA
 275352 275353 SAG0716 SAG0717     TRUE 0.995 13.000 0.400 0.043 Y NA
 275353 275354 SAG0717 SAG0718     TRUE 0.986 12.000 0.185 1.000 Y NA
 275355 275356 SAG0719 SAG0720     TRUE 0.999 -7.000 0.597 0.015 Y NA
 275356 275357 SAG0720 SAG0721     TRUE 0.905 4.000 0.038 1.000   NA
 275357 275358 SAG0721 SAG0722     TRUE 0.881 3.000 0.011 NA   NA
 275358 275359 SAG0722 SAG0723   rnc FALSE 0.120 152.000 0.002 NA   NA
 275359 275360 SAG0723 SAG0724 rnc   TRUE 0.922 8.000 0.120 1.000 N NA
 275360 275361 SAG0724 SAG0725     FALSE 0.223 91.000 0.000 1.000   NA
 275361 275362 SAG0725 SAG0726     TRUE 0.985 0.000 0.250 0.022   NA
 275362 275363 SAG0726 SAG0727   ftsY TRUE 0.939 0.000 0.007 0.083   NA
 275364 275365 SAG0728 SAG0729     TRUE 0.997 0.000 0.841 NA   NA
 275365 275366 SAG0729 SAG0730     TRUE 0.927 6.000 0.114 NA   NA
 275367 275368 SAG0731 SAG0732     FALSE 0.157 105.000 0.000 NA N NA
 275368 275369 SAG0732 SAG0733     TRUE 0.982 -7.000 0.215 NA   NA
 275369 275370 SAG0733 SAG0734     TRUE 0.446 81.000 0.051 NA   NA
 275370 275371 SAG0734 SAG0735     TRUE 0.906 -22.000 0.000 NA   NA
 275371 275372 SAG0735 SAG0736   hprK FALSE 0.162 116.000 0.000 NA   NA
 275372 275373 SAG0736 SAG0737 hprK lgt TRUE 0.993 -7.000 0.494 1.000 N NA
 275373 275374 SAG0737 SAG0738 lgt   TRUE 0.931 15.000 0.079 NA   NA
 275374 275375 SAG0738 SAG0739     TRUE 0.979 -3.000 0.206 NA   NA
 275377 275378 SAG0741 SAG0742     TRUE 0.736 130.000 0.156 0.002 Y NA
 275378 275379 SAG0742 SAG0743     FALSE 0.128 127.000 0.000 NA   NA
 275379 275380 SAG0743 SAG0744     FALSE 0.139 124.000 0.000 NA   NA
 275382 275383 SAG0746 SAG0747 ribD ribE TRUE 0.998 -19.000 0.456 1.000 Y NA
 275383 275384 SAG0747 SAG0748 ribE ribA TRUE 0.978 18.000 0.051 1.000 Y NA
 275384 275385 SAG0748 SAG0749 ribA ribH TRUE 0.984 15.000 0.054 0.002 Y NA
 275388 275389 SAG0752 SAG0753     TRUE 0.904 22.000 0.018 NA   NA
 275392 275393 SAG0756 SAG0757     TRUE 0.986 -16.000 0.250 NA   NA
 275395 275396 SAG0759 SAG0760 ppc   FALSE 0.117 126.000 0.000 1.000 N NA
 275396 275397 SAG0760 SAG0761   ftsW FALSE 0.046 173.000 0.000 1.000 N NA
 275397 275398 SAG0761 SAG0762 ftsW tuf FALSE 0.012 352.000 0.000 1.000 N NA
 275398 275399 SAG0762 SAG0763 tuf tpiA FALSE 0.062 181.000 0.003 1.000 N NA
 275399 275400 SAG0763 SAG0764 tpiA   FALSE 0.189 177.000 0.000 1.000 Y NA
 275400 275401 SAG0764 SAG0765     FALSE 0.108 129.000 0.000 1.000 N NA
 275401 275402 SAG0765 SAG0766   recR TRUE 0.890 15.000 0.013 1.000 N NA
 275402 275403 SAG0766 SAG0767 recR   FALSE 0.144 141.000 0.010 1.000 N NA
 275403 275404 SAG0767 SAG0768   murF TRUE 0.536 147.000 0.046 0.010 Y NA
 275404 275405 SAG0768 SAG0769 murF   FALSE 0.036 187.000 0.000 1.000 N NA
 275405 275406 SAG0769 SAG0770     FALSE 0.123 129.000 0.000 NA   NA
 275406 275407 SAG0770 SAG0771     FALSE 0.046 179.000 0.000 NA   NA
 275407 275408 SAG0771 SAG0772   prfC FALSE 0.050 177.000 0.000 1.000   NA
 275408 275409 SAG0772 SAG0773 prfC   FALSE 0.315 86.000 0.003 NA   NA
 275409 275410 SAG0773 SAG0774     FALSE 0.150 121.000 0.000 NA   NA
 275410 275411 SAG0774 SAG0775     TRUE 0.988 -7.000 0.067 1.000 Y NA
 275411 275412 SAG0775 SAG0776     TRUE 0.994 16.000 0.400 NA Y NA
 275412 275413 SAG0776 SAG0777     FALSE 0.022 235.000 0.000 NA N NA
 275414 275415 SAG0778 SAG0779     TRUE 0.982 -7.000 0.209 1.000   NA
 275416 275417 SAG0780 SAG0781   celA FALSE 0.295 100.000 0.014 1.000 N NA
 275417 275418 SAG0781 SAG0782 celA   TRUE 0.973 -16.000 0.130 1.000   NA
 275418 275419 SAG0782 SAG0783     FALSE 0.213 126.000 0.000 0.021   NA
 275419 275420 SAG0783 SAG0784     TRUE 0.957 11.000 0.200 1.000   NA
 275422 275423 SAG0786 SAG0787     TRUE 0.385 54.000 0.000 1.000 N NA
 275423 275424 SAG0787 SAG0788   sodA FALSE 0.354 80.000 0.012 1.000 N NA
 275424 275425 SAG0788 SAG0789 sodA   FALSE 0.016 338.000 0.000 1.000   NA
 275425 275426 SAG0789 SAG0790     TRUE 0.986 -7.000 0.259 1.000   NA
 275426 275427 SAG0790 SAG0791   bglA TRUE 0.993 17.000 0.318 1.000 Y NA
 275429 275430 SAG0793 SAG0794 garK   TRUE 0.975 25.000 0.095 1.000 Y NA
 275430 275431 SAG0794 SAG0795     FALSE 0.198 101.000 0.000 1.000   NA
 275432 275433 SAG0796 SAG0797   queA FALSE 0.216 81.000 0.000 1.000 N NA
 275434 275435 SAG0798 SAG0799   nagB FALSE 0.197 151.000 0.071 NA   NA
 275439 275440 SAG0803 SAG0804   coiA TRUE 0.696 52.000 0.056 NA   NA
 275440 275441 SAG0804 SAG0805 coiA pepB TRUE 0.967 16.000 0.204 NA   NA
 275441 275442 SAG0805 SAG0806 pepB   FALSE 0.039 195.000 0.000 1.000   NA
 275442 275443 SAG0806 SAG0807     TRUE 0.416 74.000 0.012 1.000   NA
 275443 275444 SAG0807 SAG0808     TRUE 0.508 61.000 0.008 1.000   NA
 275444 275445 SAG0808 SAG0809     FALSE 0.024 242.000 0.000 NA   NA
 275445 275446 SAG0809 SAG0810   alaS TRUE 0.892 16.000 0.006 NA   NA
 275446 275447 SAG0810 SAG0811 alaS   FALSE 0.236 82.000 0.000 NA   NA
 275447 275448 SAG0811 SAG0812     FALSE 0.221 88.000 0.000 NA   NA
 275448 275449 SAG0812 SAG0813     FALSE 0.091 144.000 0.000 NA   NA
 275449 275450 SAG0813 SAG0814     TRUE 0.642 39.000 0.000 NA   NA
 275450 275451 SAG0814 SAG0815     TRUE 0.961 45.000 0.500 NA   NA
 275451 275452 SAG0815 SAG0816     TRUE 0.955 0.000 0.115 NA   NA
 275453 275454 SAG0817 SAG0818   nrdF-2 FALSE 0.024 241.000 0.000 NA   NA
 275454 275455 SAG0818 SAG0819 nrdF-2 nrdE-2 TRUE 0.718 203.000 0.500 0.002 Y NA
 275455 275456 SAG0819 SAG0820 nrdE-2 nrdH TRUE 0.872 78.000 0.562 1.000 N NA
 275457 275458 SAG0821 SAG0822 ptsH ptsI TRUE 0.991 5.000 0.240 0.011 Y NA
 275458 275459 SAG0822 SAG0823 ptsI gapN FALSE 0.160 150.000 0.035 1.000 N NA
 275459 275460 SAG0823 SAG0824 gapN   FALSE 0.173 140.000 0.028 1.000 N NA
 275462 275463 SAG0826 SAG0827 udk   FALSE 0.193 87.000 0.000 NA N NA
 275463 275464 SAG0827 SAG0828   dnaX TRUE 0.924 0.000 0.030 NA N NA
 275464 275465 SAG0828 SAG0829 dnaX   TRUE 0.431 89.000 0.067 NA   NA
 275467 275468 SAG0831 SAG0832 metK   FALSE 0.010 521.000 0.000 NA   NA
 275468 275469 SAG0832 SAG0833     FALSE 0.322 67.000 0.000 NA   NA
 275469 275470 SAG0833 SAG0834     FALSE 0.066 160.000 0.000 NA   NA
 275470 275471 SAG0834 SAG0835     FALSE 0.179 108.000 0.000 NA   NA
 275471 275472 SAG0835 SAG0836     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275472 275473 SAG0836 SAG0837     TRUE 0.795 4.000 0.000 NA   NA
 275473 275474 SAG0837 SAG0838     TRUE 0.909 -45.000 0.000 1.000   NA
 275474 275475 SAG0838 SAG0839     FALSE 0.237 84.000 0.000 1.000   NA
 275475 275476 SAG0839 SAG0840   thiD TRUE 0.987 2.000 0.478 1.000 N NA
 275476 275477 SAG0840 SAG0841 thiD thiM TRUE 0.983 2.000 0.032 0.003 Y NA
 275477 275478 SAG0841 SAG0842 thiM thiE TRUE 0.985 14.000 0.061 0.003 Y NA
 275478 275479 SAG0842 SAG0843 thiE murA-1 FALSE 0.113 127.000 0.000 1.000 N NA
 275479 275480 SAG0843 SAG0844 murA-1   FALSE 0.351 102.000 0.052 1.000 N NA
 275480 275481 SAG0844 SAG0845     TRUE 0.989 -7.000 0.342 1.000 N NA
 275481 275482 SAG0845 SAG0846   map TRUE 0.966 23.000 0.235 1.000 N NA
 275482 275483 SAG0846 SAG0847 map   TRUE 0.983 2.000 0.373 1.000   NA
 275485 275486 SAG0849 SAG0850   ligA FALSE 0.159 140.000 0.010 NA   NA
 275486 275487 SAG0850 SAG0851 ligA   TRUE 0.880 12.000 0.013 1.000 N NA
 275487 275488 SAG0851 SAG0852     TRUE 0.912 4.000 0.088 1.000 N NA
 275488 275489 SAG0852 SAG0853   glgB FALSE 0.306 206.000 0.067 0.006 Y NA
 275489 275490 SAG0853 SAG0854 glgB glgC TRUE 0.984 42.000 0.317 0.001 Y NA
 275490 10942614 SAG0854 SAG0855 glgC   TRUE 0.903 -10.000 0.000 NA   NA
 10942614 275491 SAG0855 SAG0856   glgA TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275491 275492 SAG0856 SAG0857 glgA atpE FALSE 0.016 332.000 0.000 1.000   NA
 275492 275493 SAG0857 SAG0858 atpE atpB TRUE 0.954 33.000 0.189 0.004   NA
 275493 275494 SAG0858 SAG0859 atpB atpF TRUE 0.983 18.000 0.032 0.004 Y NA
 275494 275495 SAG0859 SAG0860 atpF atpH TRUE 0.994 0.000 0.222 0.004 Y NA
 275495 275496 SAG0860 SAG0861 atpH atpA TRUE 0.999 16.000 0.864 0.004 Y NA
 275496 275497 SAG0861 SAG0862 atpA atpG TRUE 0.999 16.000 0.846 0.004 Y NA
 275497 275498 SAG0862 SAG0863 atpG atpD TRUE 0.980 74.000 0.724 0.004 Y NA
 275498 275499 SAG0863 SAG0864 atpD atpC TRUE 0.999 13.000 0.837 0.004 Y NA
 275499 275500 SAG0864 SAG0865 atpC   TRUE 0.549 65.000 0.039 NA   NA
 275500 275501 SAG0865 SAG0866   murA-2 TRUE 0.815 63.000 0.279 NA   NA
 275501 275502 SAG0866 SAG0867 murA-2   TRUE 0.942 2.000 0.110 NA   NA
 275502 275503 SAG0867 SAG0868   endA TRUE 0.718 75.000 0.237 NA   NA
 275503 275504 SAG0868 SAG0869 endA pheS FALSE 0.019 292.000 0.000 1.000   NA
 275504 275505 SAG0869 SAG0870 pheS   FALSE 0.353 83.000 0.009 1.000   NA
 275505 275506 SAG0870 SAG0871   pheT TRUE 0.559 54.000 0.007 1.000   NA
 275508 275509 SAG0873 SAG0874 rexB rexA TRUE 0.991 -10.000 0.070 0.064 Y NA
 275509 275510 SAG0874 SAG0875 rexA   TRUE 0.806 13.000 0.000 1.000 N NA
 275512 275513 SAG0877 SAG0878     FALSE 0.086 150.000 0.000 1.000   NA
 275513 275514 SAG0878 SAG0879     TRUE 0.982 75.000 0.769 0.001 Y NA
 275514 275515 SAG0879 SAG0880     TRUE 0.619 127.000 0.051 0.056 Y NA
 275515 275516 SAG0880 SAG0881     TRUE 0.854 60.000 0.091 1.000 Y NA
 275516 275517 SAG0881 SAG0882   lplA-1 TRUE 0.572 98.000 0.200 1.000 N NA
 275518 275519 SAG0883 SAG0884     TRUE 0.996 0.000 0.796 1.000   NA
 275520 275521 SAG0885 SAG0886     TRUE 0.987 3.000 0.502 NA   NA
 275521 275522 SAG0886 SAG0887     TRUE 0.757 54.000 0.150 NA   NA
 275522 275523 SAG0887 SAG0888     FALSE 0.144 123.000 0.000 NA   NA
 275523 275524 SAG0888 SAG0889     TRUE 0.942 25.000 0.143 NA   NA
 275524 275525 SAG0889 SAG0890     FALSE 0.215 92.000 0.000 NA   NA
 275525 275526 SAG0890 SAG0891     TRUE 0.903 4.000 0.060 1.000 N NA
 275526 275527 SAG0891 SAG0892     TRUE 0.930 1.000 0.055 1.000 N NA
 275527 275528 SAG0892 SAG0893     TRUE 0.989 -10.000 0.330 NA   NA
 275528 275529 SAG0893 SAG0894     FALSE 0.013 388.000 0.000 NA   NA
 275529 275530 SAG0894 SAG0895     TRUE 0.990 2.000 0.546 NA   NA
 275530 275531 SAG0895 SAG0896     TRUE 0.996 12.000 0.876 NA   NA
 275531 275532 SAG0896 SAG0897     TRUE 0.986 -13.000 0.253 NA   NA
 275532 275533 SAG0897 SAG0898     FALSE 0.170 112.000 0.000 NA   NA
 11401406 275527   SAG0892     FALSE NA 7108.000 0.000 NA   NA
 11543769 275527   SAG0892     FALSE NA 7108.000 0.000 NA   NA
 11686161 275527   SAG0892     FALSE NA 7108.000 0.000 NA   NA
 275533 275534 SAG0898 SAG0899     TRUE 0.827 13.000 0.000 NA   NA
 11401407 275527   SAG0892     FALSE NA 7144.000 0.000 NA   NA
 11543770 275527   SAG0892     FALSE NA 7144.000 0.000 NA   NA
 11686162 275527   SAG0892     FALSE NA 7144.000 0.000 NA   NA
 11401408 275527   SAG0892     FALSE NA 7174.000 0.000 NA   NA
 11543771 275527   SAG0892     FALSE NA 7174.000 0.000 NA   NA
 11686163 275527   SAG0892     FALSE NA 7174.000 0.000 NA   NA
 11401409 275527   SAG0892     FALSE NA 7210.000 0.000 NA   NA
 11543772 275527   SAG0892     FALSE NA 7210.000 0.000 NA   NA
 11686164 275527   SAG0892     FALSE NA 7210.000 0.000 NA   NA
 11401410 275527   SAG0892     FALSE NA 7240.000 0.000 NA   NA
 11543773 275527   SAG0892     FALSE NA 7240.000 0.000 NA   NA
 11686165 275527   SAG0892     FALSE NA 7240.000 0.000 NA   NA
 11401411 275527   SAG0892     FALSE NA 7276.000 0.000 NA   NA
 11543774 275527   SAG0892     FALSE NA 7276.000 0.000 NA   NA
 11686166 275527   SAG0892     FALSE NA 7276.000 0.000 NA   NA
 11401412 275527   SAG0892     FALSE NA 7306.000 0.000 NA   NA
 11543775 275527   SAG0892     FALSE NA 7306.000 0.000 NA   NA
 11686167 275527   SAG0892     FALSE NA 7306.000 0.000 NA   NA
 11401413 275527   SAG0892     FALSE NA 7342.000 0.000 NA   NA
 11543776 275527   SAG0892     FALSE NA 7342.000 0.000 NA   NA
 11686168 275527   SAG0892     FALSE NA 7342.000 0.000 NA   NA
 11401414 275527   SAG0892     FALSE NA 7372.000 0.000 NA   NA
 11543777 275527   SAG0892     FALSE NA 7372.000 0.000 NA   NA
 11686169 275527   SAG0892     FALSE NA 7372.000 0.000 NA   NA
 275534 275535 SAG0899 SAG0900     FALSE 0.026 235.000 0.000 NA   NA
 11401415 275527   SAG0892     FALSE NA 7408.000 0.000 NA   NA
 11543778 275527   SAG0892     FALSE NA 7408.000 0.000 NA   NA
 11686170 275527   SAG0892     FALSE NA 7408.000 0.000 NA   NA
 11401416 275527   SAG0892     FALSE NA 7438.000 0.000 NA   NA
 11543779 275527   SAG0892     FALSE NA 7438.000 0.000 NA   NA
 11686171 275527   SAG0892     FALSE NA 7438.000 0.000 NA   NA
 11401417 275527   SAG0892     FALSE NA 7474.000 0.000 NA   NA
 11543780 275527   SAG0892     FALSE NA 7474.000 0.000 NA   NA
 11686172 275527   SAG0892     FALSE NA 7474.000 0.000 NA   NA
 11401418 275527   SAG0892     FALSE NA 7504.000 0.000 NA   NA
 11543781 275527   SAG0892     FALSE NA 7504.000 0.000 NA   NA
 11686173 275527   SAG0892     FALSE NA 7504.000 0.000 NA   NA
 11401419 275527   SAG0892     FALSE NA 7540.000 0.000 NA   NA
 11543782 275527   SAG0892     FALSE NA 7540.000 0.000 NA   NA
 11686174 275527   SAG0892     FALSE NA 7540.000 0.000 NA   NA
 11401420 275527   SAG0892     FALSE NA 7570.000 0.000 NA   NA
 11543783 275527   SAG0892     FALSE NA 7570.000 0.000 NA   NA
 11686175 275527   SAG0892     FALSE NA 7570.000 0.000 NA   NA
 11401421 275527   SAG0892     FALSE NA 7606.000 0.000 NA   NA
 11543784 275527   SAG0892     FALSE NA 7606.000 0.000 NA   NA
 11686176 275527   SAG0892     FALSE NA 7606.000 0.000 NA   NA
 11401422 275527   SAG0892     FALSE NA 7636.000 0.000 NA   NA
 11543785 275527   SAG0892     FALSE NA 7636.000 0.000 NA   NA
 11686177 275527   SAG0892     FALSE NA 7636.000 0.000 NA   NA
 11401423 275527   SAG0892     FALSE NA 7672.000 0.000 NA   NA
 11543786 275527   SAG0892     FALSE NA 7672.000 0.000 NA   NA
 11686178 275527   SAG0892     FALSE NA 7672.000 0.000 NA   NA
 11401424 275527   SAG0892     FALSE NA 7702.000 0.000 NA   NA
 11543787 275527   SAG0892     FALSE NA 7702.000 0.000 NA   NA
 11686179 275527   SAG0892     FALSE NA 7702.000 0.000 NA   NA
 11401425 275527   SAG0892     FALSE NA 7738.000 0.000 NA   NA
 11543788 275527   SAG0892     FALSE NA 7738.000 0.000 NA   NA
 11686180 275527   SAG0892     FALSE NA 7738.000 0.000 NA   NA
 11401426 275527   SAG0892     FALSE NA 7768.000 0.000 NA   NA
 11543789 275527   SAG0892     FALSE NA 7768.000 0.000 NA   NA
 11686181 275527   SAG0892     FALSE NA 7768.000 0.000 NA   NA
 275535 275536 SAG0900 SAG0901     FALSE 0.236 82.000 0.000 NA   NA
 11401427 275527   SAG0892     FALSE NA 7804.000 0.000 NA   NA
 11543790 275527   SAG0892     FALSE NA 7804.000 0.000 NA   NA
 11686182 275527   SAG0892     FALSE NA 7804.000 0.000 NA   NA
 11401428 275527   SAG0892     FALSE NA 7834.000 0.000 NA   NA
 11543791 275527   SAG0892     FALSE NA 7834.000 0.000 NA   NA
 11686183 275527   SAG0892     FALSE NA 7834.000 0.000 NA   NA
 11401429 275527   SAG0892     FALSE NA 7870.000 0.000 NA   NA
 11543792 275527   SAG0892     FALSE NA 7870.000 0.000 NA   NA
 11686184 275527   SAG0892     FALSE NA 7870.000 0.000 NA   NA
 11401430 275527   SAG0892     FALSE NA 7900.000 0.000 NA   NA
 11543793 275527   SAG0892     FALSE NA 7900.000 0.000 NA   NA
 11686185 275527   SAG0892     FALSE NA 7900.000 0.000 NA   NA
 11401431 275527   SAG0892     FALSE NA 7936.000 0.000 NA   NA
 11543794 275527   SAG0892     FALSE NA 7936.000 0.000 NA   NA
 11686186 275527   SAG0892     FALSE NA 7936.000 0.000 NA   NA
 11401432 275527   SAG0892     FALSE NA 7966.000 0.000 NA   NA
 11543795 275527   SAG0892     FALSE NA 7966.000 0.000 NA   NA
 11686187 275527   SAG0892     FALSE NA 7966.000 0.000 NA   NA
 11401433 275527   SAG0892     FALSE NA 8002.000 0.000 NA   NA
 11543796 275527   SAG0892     FALSE NA 8002.000 0.000 NA   NA
 11686188 275527   SAG0892     FALSE NA 8002.000 0.000 NA   NA
 11401434 275527   SAG0892     FALSE NA 8032.000 0.000 NA   NA
 11543797 275527   SAG0892     FALSE NA 8032.000 0.000 NA   NA
 11686189 275527   SAG0892     FALSE NA 8032.000 0.000 NA   NA
 275536 275537 SAG0901 SAG0902     TRUE 0.906 -22.000 0.000 NA   NA
 11401435 275527   SAG0892     FALSE NA 8068.000 0.000 NA   NA
 11543798 275527   SAG0892     FALSE NA 8068.000 0.000 NA   NA
 11686190 275527   SAG0892     FALSE NA 8068.000 0.000 NA   NA
 11401436 275527   SAG0892     FALSE NA 8098.000 0.000 NA   NA
 11543799 275527   SAG0892     FALSE NA 8098.000 0.000 NA   NA
 11686191 275527   SAG0892     FALSE NA 8098.000 0.000 NA   NA
 11401437 275527   SAG0892     FALSE NA 8134.000 0.000 NA   NA
 11543800 275527   SAG0892     FALSE NA 8134.000 0.000 NA   NA
 11686192 275527   SAG0892     FALSE NA 8134.000 0.000 NA   NA
 11401438 275527   SAG0892     FALSE NA 8164.000 0.000 NA   NA
 11543801 275527   SAG0892     FALSE NA 8164.000 0.000 NA   NA
 11686193 275527   SAG0892     FALSE NA 8164.000 0.000 NA   NA
 11401439 275527   SAG0892     FALSE NA 8200.000 0.000 NA   NA
 11543802 275527   SAG0892     FALSE NA 8200.000 0.000 NA   NA
 11686194 275527   SAG0892     FALSE NA 8200.000 0.000 NA   NA
 11401440 275527   SAG0892     FALSE NA 8230.000 0.000 NA   NA
 11543803 275527   SAG0892     FALSE NA 8230.000 0.000 NA   NA
 11686195 275527   SAG0892     FALSE NA 8230.000 0.000 NA   NA
 11401441 275527   SAG0892     FALSE NA 8266.000 0.000 NA   NA
 11543804 275527   SAG0892     FALSE NA 8266.000 0.000 NA   NA
 11686196 275527   SAG0892     FALSE NA 8266.000 0.000 NA   NA
 11401442 275527   SAG0892     FALSE NA 8296.000 0.000 NA   NA
 11543805 275527   SAG0892     FALSE NA 8296.000 0.000 NA   NA
 11686197 275527   SAG0892     FALSE NA 8296.000 0.000 NA   NA
 11401443 275527   SAG0892     FALSE NA 8332.000 0.000 NA   NA
 11543806 275527   SAG0892     FALSE NA 8332.000 0.000 NA   NA
 11686198 275527   SAG0892     FALSE NA 8332.000 0.000 NA   NA
 11401444 275527   SAG0892     FALSE NA 8362.000 0.000 NA   NA
 11543807 275527   SAG0892     FALSE NA 8362.000 0.000 NA   NA
 11686199 275527   SAG0892     FALSE NA 8362.000 0.000 NA   NA
 11401445 275527   SAG0892     FALSE NA 8398.000 0.000 NA   NA
 11543808 275527   SAG0892     FALSE NA 8398.000 0.000 NA   NA
 11686200 275527   SAG0892     FALSE NA 8398.000 0.000 NA   NA
 275537 275538 SAG0902 SAG0903     TRUE 0.795 4.000 0.000 NA   NA
 11401446 275527   SAG0892     FALSE NA 8428.000 0.000 NA   NA
 11543809 275527   SAG0892     FALSE NA 8428.000 0.000 NA   NA
 11686201 275527   SAG0892     FALSE NA 8428.000 0.000 NA   NA
 11401447 275527   SAG0892     FALSE NA 8464.000 0.000 NA   NA
 11543810 275527   SAG0892     FALSE NA 8464.000 0.000 NA   NA
 11686202 275527   SAG0892     FALSE NA 8464.000 0.000 NA   NA
 11401448 275527   SAG0892     FALSE NA 8495.000 0.000 NA   NA
 11543811 275527   SAG0892     FALSE NA 8495.000 0.000 NA   NA
 11686203 275527   SAG0892     FALSE NA 8495.000 0.000 NA   NA
 11401449 275527   SAG0892     FALSE NA 8531.000 0.000 NA   NA
 11543812 275527   SAG0892     FALSE NA 8531.000 0.000 NA   NA
 11686204 275527   SAG0892     FALSE NA 8531.000 0.000 NA   NA
 275538 275539 SAG0903 SAG0904     FALSE 0.014 369.000 0.000 NA   NA
 11401450 275527   SAG0892     FALSE NA 8561.000 0.000 NA   NA
 11543813 275527   SAG0892     FALSE NA 8561.000 0.000 NA   NA
 11686205 275527   SAG0892     FALSE NA 8561.000 0.000 NA   NA
 11401451 275527   SAG0892     FALSE NA 8597.000 0.000 NA   NA
 11543814 275527   SAG0892     FALSE NA 8597.000 0.000 NA   NA
 11686206 275527   SAG0892     FALSE NA 8597.000 0.000 NA   NA
 11401452 275527   SAG0892     FALSE NA 8626.000 0.000 NA   NA
 11543815 275527   SAG0892     FALSE NA 8626.000 0.000 NA   NA
 11686207 275527   SAG0892     FALSE NA 8626.000 0.000 NA   NA
 11401453 275527   SAG0892     FALSE NA 8662.000 0.000 NA   NA
 11543816 275527   SAG0892     FALSE NA 8662.000 0.000 NA   NA
 11686208 275527   SAG0892     FALSE NA 8662.000 0.000 NA   NA
 11401454 275527   SAG0892     FALSE NA 8692.000 0.000 NA   NA
 11543817 275527   SAG0892     FALSE NA 8692.000 0.000 NA   NA
 11686209 275527   SAG0892     FALSE NA 8692.000 0.000 NA   NA
 11401455 275527   SAG0892     FALSE NA 8728.000 0.000 NA   NA
 11543818 275527   SAG0892     FALSE NA 8728.000 0.000 NA   NA
 11686210 275527   SAG0892     FALSE NA 8728.000 0.000 NA   NA
 11401456 275527   SAG0892     FALSE NA 8758.000 0.000 NA   NA
 11543819 275527   SAG0892     FALSE NA 8758.000 0.000 NA   NA
 11686211 275527   SAG0892     FALSE NA 8758.000 0.000 NA   NA
 275539 275540 SAG0904 SAG0905   ndk FALSE 0.111 133.000 0.000 NA   NA
 275540 275541 SAG0905 SAG0906 ndk lepA FALSE 0.140 136.000 0.003 1.000 N NA
 275541 275542 SAG0906 SAG0907 lepA   FALSE 0.024 247.000 0.000 1.000   NA
 275542 275543 SAG0907 SAG0908     FALSE 0.089 148.000 0.000 1.000   NA
 275543 275544 SAG0908 SAG0909     TRUE 0.871 9.000 0.010 1.000   NA
 275544 275545 SAG0909 SAG0910     TRUE 0.867 0.000 0.000 1.000   NA
 275545 275546 SAG0910 SAG0911     FALSE 0.071 152.000 0.000 1.000 N NA
 275546 275547 SAG0911 SAG0912     TRUE 0.867 0.000 0.000 1.000   NA
 275550 275551 SAG0915 SAG0916     FALSE 0.236 82.000 0.000 NA   NA
 275553 275554 SAG0918 SAG0919     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275554 275555 SAG0919 SAG0920     FALSE 0.047 178.000 0.000 NA   NA
 275557 275558 SAG0922 SAG0923   tetM TRUE 0.461 101.000 0.125 NA   NA
 275558 275559 SAG0923 SAG0924 tetM   TRUE 0.990 16.000 0.545 NA   NA
 275559 275560 SAG0924 SAG0925     FALSE 0.020 275.000 0.000 NA   NA
 275560 275561 SAG0925 SAG0926     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275561 275562 SAG0926 SAG0927     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275562 10942615 SAG0927 SAG0928     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 10942615 275563 SAG0928 SAG0929     TRUE 0.905 -16.000 0.000 NA   NA
 275563 275564 SAG0929 SAG0930     TRUE 0.906 -25.000 0.000 NA   NA
 275564 275565 SAG0930 SAG0931     FALSE 0.160 117.000 0.000 NA   NA
 275565 275566 SAG0931 SAG0932     TRUE 0.602 43.000 0.000 NA   NA
 275566 275567 SAG0932 SAG0933     FALSE 0.049 178.000 0.000 1.000   NA
 275567 275568 SAG0933 SAG0934     TRUE 0.757 29.000 0.000 NA   NA
 275568 275569 SAG0934 SAG0935     TRUE 0.832 16.000 0.000 NA   NA
 275569 275570 SAG0935 SAG0936     TRUE 0.817 23.000 0.000 NA   NA
 275570 10942616 SAG0936 SAG0937     FALSE 0.025 239.000 0.000 NA   NA
 10942616 275571 SAG0937 SAG0938     TRUE 0.849 1.000 0.000 NA   NA
 275572 275573 SAG0939 SAG0940 dnaE pfk TRUE 0.473 81.000 0.098 1.000 N NA
 275573 275574 SAG0940 SAG0941 pfk pyk TRUE 0.971 49.000 0.261 0.005 Y NA
 275574 275575 SAG0941 SAG0942 pyk   FALSE 0.138 171.000 0.072 1.000   NA
 275577 275578 SAG0944 SAG0945 glmS   FALSE 0.042 177.000 0.000 1.000 N NA
 275578 275579 SAG0945 SAG0946   phnA FALSE 0.062 179.000 0.000 0.058 N NA
 275579 275580 SAG0946 SAG0947 phnA   FALSE 0.180 135.000 0.018 1.000 N NA
 275580 275581 SAG0947 SAG0948     TRUE 0.977 10.000 0.130 1.000 Y NA
 275581 275582 SAG0948 SAG0949     TRUE 0.986 17.000 0.154 1.000 Y NA
 275583 275584 SAG0950 SAG0951 rpsT coaA TRUE 0.429 69.000 0.014 1.000 N NA
 275585 275586 SAG0952 SAG0953   cdd FALSE 0.014 326.000 0.000 1.000 N NA
 275586 275587 SAG0953 SAG0954 cdd   TRUE 0.822 65.000 0.300 1.000   NA
 275587 275588 SAG0954 SAG0955     FALSE 0.192 145.000 0.036 1.000   NA
 275588 275589 SAG0955 SAG0956     TRUE 0.992 -7.000 0.438 1.000   NA
 275589 275590 SAG0956 SAG0957     TRUE 0.995 2.000 0.720 0.038   NA
 275590 275591 SAG0957 SAG0958   nox-2 FALSE 0.034 205.000 0.000 1.000   NA
 275593 275594 SAG0960 SAG0961 gyrA srtA TRUE 0.859 7.000 0.013 NA N NA
 275594 275595 SAG0961 SAG0962 srtA   TRUE 0.913 16.000 0.039 NA N NA
 275595 275596 SAG0962 SAG0963     FALSE 0.152 153.000 0.024 NA   NA
 275598 275599 SAG0965 SAG0966     TRUE 0.989 33.000 0.750 NA   NA
 275601 275602 SAG0968 SAG0969   gid FALSE 0.147 114.000 0.000 1.000 N NA
 275602 275603 SAG0969 SAG0970 gid   FALSE 0.261 78.000 0.000 1.000   NA
 275603 275604 SAG0970 SAG0971     FALSE 0.111 133.000 0.000 NA   NA
 275605 275606 SAG0973 SAG0974     TRUE 0.894 26.000 0.033 1.000   NA
 275606 275607 SAG0974 SAG0975     TRUE 0.996 2.000 0.855 1.000   NA
 275607 275608 SAG0975 SAG0976     TRUE 0.391 110.000 0.094 1.000   NA
 275608 275609 SAG0976 SAG0977     TRUE 0.999 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 275612 275613 SAG0980 SAG0981     TRUE 0.986 -10.000 0.250 NA   NA
 275613 275614 SAG0981 SAG0982   ffh TRUE 0.420 67.000 0.002 NA   NA
 275614 275615 SAG0982 SAG0983 ffh   TRUE 0.958 18.000 0.151 1.000   NA
 275615 275616 SAG0983 SAG0984     FALSE 0.226 89.000 0.000 1.000   NA
 275616 275617 SAG0984 SAG0985   ciaR TRUE 0.998 -16.000 0.606 1.000 Y NA
 275617 275618 SAG0985 SAG0986 ciaR pepN FALSE 0.138 162.000 0.061 1.000 N NA
 275618 275619 SAG0986 SAG0987 pepN phoU FALSE 0.189 146.000 0.067 NA N NA
 275619 275620 SAG0987 SAG0988 phoU   TRUE 0.988 34.000 0.413 NA Y NA
 275620 275621 SAG0988 SAG0989     TRUE 0.997 12.000 0.542 0.002 Y NA
 275621 275622 SAG0989 SAG0990     TRUE 0.996 12.000 0.490 0.004 Y NA
 275622 275623 SAG0990 SAG0991     TRUE 1.000 -10.000 0.907 0.004 Y NA
 275623 275624 SAG0991 SAG0992     TRUE 0.958 46.000 0.206 1.000 Y NA
 275624 275625 SAG0992 SAG0993     FALSE 0.265 185.000 0.303 NA N NA
 275625 275626 SAG0993 SAG0994     TRUE 0.735 68.000 0.229 NA N NA
 275626 275627 SAG0994 SAG0995     TRUE 0.990 -10.000 0.337 NA   NA
 275627 275628 SAG0995 SAG0996     TRUE 0.978 -7.000 0.169 NA   NA
 275628 275629 SAG0996 SAG0997     TRUE 0.733 43.000 0.017 1.000 N NA
 275629 275630 SAG0997 SAG0998   truB TRUE 0.976 13.000 0.308 1.000 N NA
 275630 275631 SAG0998 SAG0999 truB   FALSE 0.221 92.000 0.000 1.000   NA
 275631 275632 SAG0999 SAG1000     TRUE 0.923 13.000 0.049 NA   NA
 275632 275633 SAG1000 SAG1001     TRUE 0.841 34.000 0.033 NA   NA
 275633 275634 SAG1001 SAG1002     FALSE 0.180 107.000 0.000 NA   NA
 275634 275635 SAG1002 SAG1003     FALSE 0.181 106.000 0.000 NA   NA
 275635 275636 SAG1003 SAG1004     TRUE 0.994 12.000 0.438 1.000 Y NA
 275636 275637 SAG1004 SAG1005   topA FALSE 0.090 137.000 0.000 1.000 N NA
 275637 275638 SAG1005 SAG1006 topA dprA TRUE 0.844 95.000 0.238 1.000 Y NA
 275638 275639 SAG1006 SAG1007 dprA   FALSE 0.088 138.000 0.000 1.000 N NA
 275639 275640 SAG1007 SAG1008     TRUE 0.793 62.000 0.012 1.000 Y NA
 275640 275641 SAG1008 SAG1009     TRUE 0.999 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 275641 275642 SAG1009 SAG1010     TRUE 0.999 -3.000 0.870 0.038 Y NA
 275642 275643 SAG1010 SAG1011     FALSE 0.026 239.000 0.000 1.000   NA
 275643 275644 SAG1011 SAG1012   rnhB TRUE 0.889 21.000 0.003 1.000   NA
 275644 275645 SAG1012 SAG1013 rnhB   TRUE 0.976 -13.000 0.148 1.000   NA
 275645 275646 SAG1013 SAG1014     FALSE 0.020 276.000 0.000 NA   NA
 275646 275647 SAG1014 SAG1015     FALSE 0.035 201.000 0.000 NA   NA
 275647 275648 SAG1015 SAG1016     TRUE 0.396 156.000 0.050 1.000 Y NA
 275648 275649 SAG1016 SAG1017     TRUE 0.997 12.000 0.538 0.014 Y NA
 275649 275650 SAG1017 SAG1018     FALSE 0.010 536.000 0.000 NA   NA
 275650 275651 SAG1018 SAG1019     FALSE 0.010 523.000 0.000 NA   NA
 275651 275652 SAG1019 SAG1020     FALSE 0.023 244.000 0.000 NA   NA
 275652 275653 SAG1020 SAG1021     FALSE 0.225 86.000 0.000 NA   NA
 275653 275654 SAG1021 SAG1022     FALSE 0.014 348.000 0.000 NA   NA
 275654 275655 SAG1022 SAG1023     TRUE 0.812 12.000 0.000 NA   NA
 275655 275656 SAG1023 SAG1024     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275656 275657 SAG1024 SAG1025     TRUE 0.792 5.000 0.000 NA   NA
 275657 10942618 SAG1025 SAG1026     FALSE 0.013 395.000 0.000 NA   NA
 10942618 275658 SAG1026 SAG1027     FALSE 0.128 127.000 0.000 NA   NA
 275658 275659 SAG1027 SAG1028     TRUE 0.830 21.000 0.000 NA   NA
 275659 275660 SAG1028 SAG1029     TRUE 0.829 14.000 0.000 NA   NA
 275660 275661 SAG1029 SAG1030     FALSE 0.123 129.000 0.000 NA   NA
 275661 275662 SAG1030 SAG1031     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 275662 275663 SAG1031 SAG1032     FALSE 0.183 105.000 0.000 NA   NA
 275663 275664 SAG1032 SAG1033     TRUE 0.920 14.000 0.038 NA   NA
 275664 275665 SAG1033 SAG1034     FALSE 0.017 311.000 0.000 NA   NA
 275665 275666 SAG1034 SAG1035     TRUE 0.990 7.000 0.623 NA   NA
 275666 275667 SAG1035 SAG1036     TRUE 0.997 0.000 0.833 NA   NA
 275667 275668 SAG1036 SAG1037     TRUE 0.985 -16.000 0.237 NA   NA
 275668 275669 SAG1037 SAG1038     TRUE 0.969 9.000 0.286 NA   NA
 275669 275670 SAG1038 SAG1039     TRUE 0.451 82.000 0.061 NA   NA
 275670 275671 SAG1039 SAG1040     FALSE 0.160 117.000 0.000 NA   NA
 275671 275672 SAG1040 SAG1041     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275672 275673 SAG1041 SAG1042   carB FALSE 0.128 127.000 0.000 NA   NA
 275673 275674 SAG1042 SAG1043 carB carA-1 TRUE 0.978 31.000 0.117 0.002 Y NA
 275674 275675 SAG1043 SAG1044 carA-1 pyrB TRUE 0.971 14.000 0.014 1.000 Y NA
 275675 275676 SAG1044 SAG1045 pyrB pyrC TRUE 0.723 165.000 0.452 1.000 Y NA
 275676 275677 SAG1045 SAG1046 pyrC pyrE TRUE 0.963 12.000 0.003 1.000 Y NA
 275677 275678 SAG1046 SAG1047 pyrE pyrF TRUE 0.983 13.000 0.133 1.000 Y NA
 275678 275679 SAG1047 SAG1048 pyrF   FALSE 0.030 213.000 0.000 NA   NA
 275679 275680 SAG1048 SAG1049     TRUE 0.631 40.000 0.000 NA   NA
 275680 10942619 SAG1049 SAG1050     FALSE 0.117 131.000 0.000 NA   NA
 10942619 275681 SAG1050 SAG1051   asd FALSE 0.055 170.000 0.000 NA   NA
 275681 275682 SAG1051 SAG1052 asd   FALSE 0.032 210.000 0.000 1.000   NA
 275684 275685 SAG1054 SAG1055 cls fhs FALSE 0.333 119.000 0.094 1.000 N NA
 275685 275686 SAG1055 SAG1056 fhs lplA-2 TRUE 0.598 89.000 0.200 1.000 N NA
 275686 275687 SAG1056 SAG1057 lplA-2   TRUE 0.959 27.000 0.250 1.000 N NA
 275687 275688 SAG1057 SAG1058     TRUE 0.988 -31.000 0.286 NA   NA
 275688 275689 SAG1058 SAG1059     TRUE 0.966 -7.000 0.107 NA   NA
 275689 275690 SAG1059 SAG1060     TRUE 0.985 29.000 0.571 NA N NA
 275690 275691 SAG1060 SAG1061     TRUE 0.987 -3.000 0.100 NA Y NA
 275691 275692 SAG1061 SAG1062     TRUE 0.943 -7.000 0.019 1.000 N NA
 275693 275694 SAG1063 SAG1064     TRUE 0.946 -7.000 0.013 1.000   NA
 275694 275695 SAG1064 SAG1065     TRUE 0.725 46.000 0.019 NA   NA
 275695 275696 SAG1065 SAG1066   pgm TRUE 0.391 110.000 0.098 NA   NA
 275696 275697 SAG1066 SAG1067 pgm   FALSE 0.289 72.000 0.000 NA   NA
 275697 275698 SAG1067 SAG1068     TRUE 0.906 -24.000 0.000 NA   NA
 275699 275700 SAG1069 SAG1070     TRUE 0.829 14.000 0.000 NA   NA
 275700 275701 SAG1070 SAG1071     TRUE 0.999 1.000 0.895 0.005 Y NA
 275701 275702 SAG1071 SAG1072     TRUE 0.917 12.000 0.053 NA   NA
 275702 275703 SAG1072 SAG1073     TRUE 0.948 2.000 0.128 NA   NA
 275703 275704 SAG1073 SAG1074     TRUE 0.923 5.000 0.103 NA   NA
 275704 275705 SAG1074 SAG1075     FALSE 0.317 92.000 0.015 NA N NA
 275705 275706 SAG1075 SAG1076     TRUE 0.935 38.000 0.029 NA Y NA
 275706 275707 SAG1076 SAG1077   prfA TRUE 0.987 0.000 0.084 0.044 Y NA
 275707 275708 SAG1077 SAG1078 prfA tdk TRUE 0.843 35.000 0.062 1.000 N NA
 275711 275712 SAG1081 SAG1082     TRUE 0.974 18.000 0.243 NA   NA
 275712 275713 SAG1082 SAG1083     TRUE 0.990 24.000 0.588 NA   NA
 275713 275714 SAG1083 SAG1084     FALSE 0.198 99.000 0.000 NA   NA
 275715 275716 SAG1085 SAG1086 pbuX xpt TRUE 0.982 0.000 0.046 1.000 Y NA
 275716 275717 SAG1086 SAG1087 xpt guaC FALSE 0.128 256.000 0.009 1.000 Y NA
 275717 275718 SAG1087 SAG1088 guaC   FALSE 0.035 204.000 0.000 1.000   NA
 275720 275721 SAG1090 SAG1091     FALSE 0.110 135.000 0.000 1.000   NA
 275721 275722 SAG1091 SAG1092     FALSE 0.147 174.000 0.031 0.050   NA
 275722 275723 SAG1092 SAG1093     TRUE 0.899 26.000 0.067 1.000 N NA
 275723 275724 SAG1093 SAG1094     TRUE 0.969 -3.000 0.150 1.000 N NA
 275724 275725 SAG1094 SAG1095     TRUE 0.997 -25.000 0.725 1.000   NA
 275726 275727 SAG1096 SAG1097   prsA-2 FALSE 0.179 177.000 0.145 1.000   NA
 275727 275728 SAG1097 SAG1098 prsA-2 iscS-1 TRUE 0.974 4.000 0.089 1.000 Y NA
 275728 275729 SAG1098 SAG1099 iscS-1   TRUE 0.958 2.000 0.166 NA   NA
 275729 275730 SAG1099 SAG1100     FALSE 0.163 161.000 0.083 NA   NA
 275731 275732 SAG1101 SAG1102 radC   TRUE 0.392 96.000 0.046 NA   NA
 275732 275733 SAG1102 SAG1103   ascB FALSE 0.216 91.000 0.000 NA   NA
 275733 275734 SAG1103 SAG1104 ascB   FALSE 0.054 163.000 0.000 1.000 N NA
 275734 275735 SAG1104 SAG1105     TRUE 0.401 101.000 0.071 1.000   NA
 275737 275738 SAG1107 SAG1108   potD TRUE 0.378 109.000 0.033 0.072 N NA
 275738 275739 SAG1108 SAG1109 potD potC TRUE 0.996 -7.000 0.253 0.037 Y NA
 275739 275740 SAG1109 SAG1110 potC potB TRUE 0.998 -3.000 0.492 0.037 Y NA
 275740 275741 SAG1110 SAG1111 potB potA TRUE 1.000 -16.000 0.928 0.037 Y NA
 275741 275742 SAG1111 SAG1112 potA murB TRUE 0.695 49.000 0.041 1.000 N NA
 275742 275743 SAG1112 SAG1113 murB folK FALSE 0.139 144.000 0.010 1.000 N NA
 275743 275744 SAG1113 SAG1114 folK folB TRUE 0.990 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 275744 275745 SAG1114 SAG1115 folB folP TRUE 0.980 2.000 0.094 1.000 Y NA
 275745 275746 SAG1115 SAG1116 folP folE TRUE 0.973 4.000 0.073 1.000 Y NA
 275746 275747 SAG1116 SAG1117 folE folC TRUE 0.978 19.000 0.057 1.000 Y NA
 275747 275748 SAG1117 SAG1118 folC rarD TRUE 0.837 2.000 0.000 1.000   NA
 275748 275749 SAG1118 SAG1119 rarD thrB TRUE 0.941 -13.000 0.005 1.000   NA
 275749 275750 SAG1119 SAG1120 thrB hom TRUE 0.976 2.000 0.036 1.000 Y NA
 275752 275753 SAG1122 SAG1123     TRUE 0.784 10.000 0.000 NA   NA
 275753 275754 SAG1123 SAG1124     TRUE 0.757 29.000 0.000 NA   NA
 275754 275755 SAG1124 SAG1125     FALSE 0.275 74.000 0.000 NA   NA
 275755 275756 SAG1125 SAG1126     FALSE 0.179 108.000 0.000 NA   NA
 275757 275758 SAG1127 SAG1128     FALSE 0.038 197.000 0.000 1.000   NA
 275758 275759 SAG1128 SAG1129     TRUE 0.579 45.000 0.000 NA   NA
 275759 275760 SAG1129 SAG1130     FALSE 0.016 329.000 0.000 NA   NA
 275761 275762 SAG1131 SAG1132 psaD   FALSE 0.248 73.000 0.000 NA N NA
 275762 275763 SAG1132 SAG1133     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 275763 275764 SAG1133 SAG1134     TRUE 0.798 5.000 0.000 1.000   NA
 275764 275765 SAG1134 SAG1135     FALSE 0.311 164.000 0.238 NA   NA
 275765 275766 SAG1135 SAG1136     TRUE 0.823 22.000 0.000 NA   NA
 275766 275767 SAG1136 SAG1137     TRUE 0.544 47.000 0.000 NA   NA
 275767 275768 SAG1137 SAG1138     TRUE 0.640 56.000 0.060 NA   NA
 275768 275769 SAG1138 SAG1139     TRUE 0.937 10.000 0.143 NA   NA
 275769 275770 SAG1139 SAG1140     TRUE 0.828 15.000 0.000 NA   NA
 275770 275771 SAG1140 SAG1141     TRUE 0.637 48.000 0.000 0.056   NA
 275771 275772 SAG1141 SAG1142   pcrA FALSE 0.017 319.000 0.000 1.000   NA
 275772 275773 SAG1142 SAG1143 pcrA   FALSE 0.156 106.000 0.000 NA N NA
 275773 275774 SAG1143 SAG1144   uraA FALSE 0.094 133.000 0.000 NA N NA
 275775 275776 SAG1145 SAG1146     TRUE 0.630 64.000 0.060 0.072 N NA
 275776 275777 SAG1146 SAG1147     FALSE 0.070 159.000 0.000 1.000   NA
 275777 275778 SAG1147 SAG1148     TRUE 0.972 -19.000 0.121 1.000   NA
 275778 275779 SAG1148 SAG1149     FALSE 0.302 69.000 0.000 NA   NA
 5922230 275780 tRNA-Arg-1 SAG1150   rpsA FALSE 0.284 73.000 0.000 NA   NA
 275780 5922231 SAG1150 tRNA-Gln-1 rpsA   FALSE 0.144 123.000 0.000 NA   NA
 5922231 5922232 tRNA-Gln-1 tRNA-Tyr-1     TRUE 0.790 6.000 0.000 NA   NA
 5922232 275781 tRNA-Tyr-1 SAG1151     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 275781 275782 SAG1151 SAG1152   ilvE TRUE 0.474 84.000 0.095 NA   NA
 275782 275783 SAG1152 SAG1153 ilvE parC FALSE 0.344 114.000 0.086 1.000 N NA
 275783 275784 SAG1153 SAG1154 parC parE TRUE 0.911 134.000 0.552 0.002 Y NA
 275786 275787 SAG1156 SAG1157 ung   FALSE 0.198 99.000 0.000 NA   NA
 275787 275788 SAG1157 SAG1158   neuA FALSE 0.165 114.000 0.000 NA   NA
 275788 275789 SAG1158 SAG1159 neuA neuD TRUE 0.882 11.000 0.013 1.000   NA
 275789 275790 SAG1159 SAG1160 neuD neuC TRUE 0.938 -3.000 0.013 1.000   NA
 275790 275791 SAG1160 SAG1161 neuC neuB TRUE 0.953 77.000 0.549 1.000 Y NA
 275791 275792 SAG1161 SAG1162 neuB cpsL TRUE 0.867 0.000 0.000 1.000   NA
 275792 275793 SAG1162 SAG1163 cpsL cpsK TRUE 0.948 -3.000 0.033 1.000   NA
 275793 275794 SAG1163 SAG1164 cpsK cpsJ TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275794 275795 SAG1164 SAG1165 cpsJ cpsO TRUE 0.899 -7.000 0.000 NA   NA
 275795 275796 SAG1165 SAG1166 cpsO cpsN TRUE 0.795 4.000 0.000 NA   NA
 275796 275797 SAG1166 SAG1167 cpsN cpsM TRUE 0.784 26.000 0.000 NA   NA
 275797 275798 SAG1167 SAG1168 cpsM cpsH TRUE 0.642 39.000 0.000 NA   NA
 275798 275799 SAG1168 SAG1169 cpsH cpsG TRUE 0.905 -13.000 0.000 NA   NA
 275799 275800 SAG1169 SAG1170 cpsG cpsF TRUE 0.941 0.000 0.052 NA   NA
 275800 275801 SAG1170 SAG1171 cpsF cpsE TRUE 0.897 24.000 0.020 NA   NA
 275801 275802 SAG1171 SAG1172 cpsE cpsD TRUE 0.920 13.000 0.067 NA N NA
 275802 275803 SAG1172 SAG1173 cpsD cpsC TRUE 0.993 11.000 0.800 1.000 N NA
 275803 275804 SAG1173 SAG1174 cpsC cpsB TRUE 0.996 9.000 0.636 1.000 Y NA
 275804 275805 SAG1174 SAG1175 cpsB cpsA TRUE 0.988 6.000 0.583 1.000 N NA
 275807 275808 SAG1177 SAG1178   deoD-1 TRUE 0.922 9.000 0.107 NA   NA
 275808 275809 SAG1178 SAG1179 deoD-1   TRUE 0.949 -16.000 0.027 1.000 N NA
 275809 275810 SAG1179 SAG1180   deoD-2 TRUE 0.811 2.000 0.000 1.000 N NA
 275810 275811 SAG1180 SAG1181 deoD-2 arsC TRUE 0.843 39.000 0.108 1.000 N NA
 275811 275812 SAG1181 SAG1182 arsC deoB-1 TRUE 0.734 51.000 0.108 1.000 N NA
 275812 275813 SAG1182 SAG1183 deoB-1 rpiA TRUE 0.829 57.000 0.018 1.000 Y NA
 275813 275814 SAG1183 SAG1184 rpiA   FALSE 0.022 238.000 0.000 1.000 N NA
 275814 275815 SAG1184 SAG1185   estA TRUE 0.638 90.000 0.217 NA   NA
 275815 275816 SAG1185 SAG1186 estA   TRUE 0.730 57.000 0.143 NA   NA
 275816 275817 SAG1186 SAG1187     FALSE 0.039 296.000 0.026 1.000   NA
 275817 275818 SAG1187 SAG1188     TRUE 0.997 0.000 0.895 1.000   NA
 275818 275819 SAG1188 SAG1189     TRUE 0.982 13.000 0.368 NA   NA
 275821 275822 SAG1191 SAG1192 budA ilvK TRUE 0.916 14.000 0.044 1.000 N NA
 275822 275823 SAG1192 SAG1193 ilvK   FALSE 0.330 110.000 0.033 1.000   NA
 275823 275824 SAG1193 SAG1194     TRUE 0.989 -10.000 0.324 NA   NA
 275824 275825 SAG1194 SAG1195     FALSE 0.215 92.000 0.000 NA   NA
 275825 275826 SAG1195 SAG1196   mutX TRUE 0.890 -10.000 0.000 1.000 N NA
 275828 275829 SAG1198 SAG1199 rfbB   TRUE 0.506 207.000 0.350 1.000 Y NA
 275829 275830 SAG1199 SAG1200   rfbA TRUE 0.988 0.000 0.149 1.000 Y NA
 275830 275831 SAG1200 SAG1201 rfbA   TRUE 0.596 59.000 0.059 1.000 N NA
 275831 275832 SAG1201 SAG1202     TRUE 0.884 9.000 0.021 NA   NA
 275832 275833 SAG1202 SAG1203     TRUE 0.987 -10.000 0.283 NA   NA
 275833 275834 SAG1203 SAG1204     FALSE 0.293 104.000 0.012 NA   NA
 275834 275835 SAG1204 SAG1205   apt FALSE 0.209 118.000 0.005 NA N NA
 275835 275836 SAG1205 SAG1206 apt   FALSE 0.123 123.000 0.000 NA N NA
 275836 275837 SAG1206 SAG1207     TRUE 0.905 -16.000 0.000 NA   NA
 275837 275838 SAG1207 SAG1208   recJ FALSE 0.297 70.000 0.000 NA   NA
 275838 275839 SAG1208 SAG1209 recJ   TRUE 0.941 -3.000 0.016 1.000   NA
 275839 275840 SAG1209 SAG1210     TRUE 0.934 2.000 0.074 1.000   NA
 275840 275841 SAG1210 SAG1211     TRUE 0.770 42.000 0.022 NA   NA
 275841 275842 SAG1211 SAG1212   hflX TRUE 0.945 -7.000 0.014 NA   NA
 275842 275843 SAG1212 SAG1213 hflX miaA TRUE 0.379 91.000 0.027 1.000   NA
 275845 275846 SAG1215 SAG1216     FALSE 0.094 135.000 0.000 1.000 N NA
 275846 10942620 SAG1216 SAG1217     FALSE 0.056 169.000 0.000 NA   NA
 10942620 275847 SAG1217 SAG1218     TRUE 0.828 15.000 0.000 NA   NA
 275847 275848 SAG1218 SAG1219     FALSE 0.336 97.000 0.031 NA N NA
 275848 275849 SAG1219 SAG1220     TRUE 0.852 47.000 0.179 1.000 N NA
 275852 275853 SAG1224 SAG1225     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 275853 275854 SAG1225 SAG1226     TRUE 0.784 10.000 0.000 NA   NA
 275855 275856 SAG1227 SAG1228     FALSE 0.040 189.000 0.000 NA   NA
 275856 275857 SAG1228 SAG1229     TRUE 0.988 36.000 0.667 0.056   NA
 275857 275858 SAG1229 SAG1230     FALSE 0.028 224.000 0.000 NA   NA
 275858 10942622 SAG1230 SAG1231     TRUE 0.828 15.000 0.000 NA   NA
 275859 275860 SAG1233 SAG1234   lmb TRUE 0.995 13.000 0.800 NA   NA
 275860 275861 SAG1234 SAG1235 lmb   FALSE 0.023 234.000 0.000 1.000 N NA
 275861 10942623 SAG1235 SAG1236     FALSE 0.010 582.000 0.000 NA   NA
 10942623 275862 SAG1236 SAG1237     FALSE 0.009 655.000 0.000 NA   NA
 275862 275863 SAG1237 SAG1238     FALSE 0.179 108.000 0.000 NA   NA
 275863 275864 SAG1238 SAG1239     TRUE 0.493 50.000 0.000 NA   NA
 275864 10942624 SAG1239 SAG1240     FALSE 0.302 69.000 0.000 NA   NA
 275865 10942625 SAG1241 SAG1242     TRUE 0.524 48.000 0.000 NA   NA
 10942625 275866 SAG1242 SAG1243     FALSE 0.311 68.000 0.000 NA   NA
 275866 275867 SAG1243 SAG1244     TRUE 0.988 36.000 0.667 0.055   NA
 275870 275871 SAG1247 SAG1248     TRUE 0.967 23.000 0.222 NA   NA
 275871 275872 SAG1248 SAG1249     FALSE 0.020 279.000 0.000 NA   NA
 275872 275873 SAG1249 SAG1250     FALSE 0.045 181.000 0.000 NA   NA
 275873 275874 SAG1250 SAG1251     TRUE 0.905 -13.000 0.000 NA   NA
 275874 275875 SAG1251 SAG1252     TRUE 0.788 7.000 0.000 NA   NA
 275875 275876 SAG1252 SAG1253     FALSE 0.012 421.000 0.000 NA   NA
 275876 275877 SAG1253 SAG1254   merA-1 FALSE 0.058 160.000 0.000 1.000 N NA
 275877 275878 SAG1254 SAG1255 merA-1 merR-1 TRUE 0.846 29.000 0.000 0.002 N NA
 275879 275880 SAG1257 SAG1258   cadC TRUE 0.885 -7.000 0.000 1.000 N NA
 275884 10942627 SAG1262 SAG1263     FALSE 0.012 425.000 0.000 NA   NA
 10942627 275885 SAG1263 SAG1264     TRUE 0.905 -13.000 0.000 NA   NA
 275885 275886 SAG1264 SAG1265     FALSE 0.010 425.000 0.000 NA N NA
 275887 275888 SAG1266 SAG1267     TRUE 0.700 34.000 0.000 NA   NA
 275888 275889 SAG1267 SAG1268     FALSE 0.043 184.000 0.000 NA   NA
 275889 275890 SAG1268 SAG1269     TRUE 0.804 3.000 0.000 NA   NA
 275890 275891 SAG1269 SAG1270     TRUE 0.790 6.000 0.000 NA   NA
 275891 275892 SAG1270 SAG1271     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275892 275893 SAG1271 SAG1272     TRUE 0.905 -13.000 0.000 NA   NA
 275894 275895 SAG1273 SAG1274     TRUE 0.903 -10.000 0.000 NA   NA
 275895 275896 SAG1274 SAG1275     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 275896 275897 SAG1275 SAG1276     TRUE 0.980 54.000 1.000 NA   NA
 275897 275898 SAG1276 SAG1277     TRUE 0.642 39.000 0.000 NA   NA
 275898 275899 SAG1277 SAG1278     FALSE 0.024 243.000 0.000 NA   NA
 275899 275900 SAG1278 SAG1279     TRUE 0.997 14.000 1.000 NA   NA
 275900 275901 SAG1279 SAG1280     TRUE 0.923 71.000 0.667 NA   NA
 275901 275902 SAG1280 SAG1281     TRUE 0.913 49.000 0.333 NA   NA
 275902 275903 SAG1281 SAG1282     TRUE 0.905 -16.000 0.000 NA   NA
 275903 275904 SAG1282 SAG1283   ssp-5 TRUE 0.849 1.000 0.000 NA   NA
 275905 275906 SAG1284 SAG1285 abiGI abiGII TRUE 0.954 -3.000 0.061 NA   NA
 275907 275908 SAG1286 SAG1287     TRUE 0.993 2.000 0.667 NA   NA
 275908 10942628 SAG1287 SAG1288     TRUE 0.906 -22.000 0.000 NA   NA
 10942628 275909 SAG1288 SAG1289     FALSE 0.359 62.000 0.000 NA   NA
 275909 275910 SAG1289 SAG1290     TRUE 0.837 19.000 0.000 NA   NA
 275910 10942629 SAG1290 SAG1291     TRUE 0.837 18.000 0.000 NA   NA
 10942629 275911 SAG1291 SAG1292     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 275911 275912 SAG1292 SAG1293     FALSE 0.260 77.000 0.000 NA   NA
 275912 275913 SAG1293 SAG1294     TRUE 0.992 3.000 0.667 NA   NA
 275913 275914 SAG1294 SAG1295     TRUE 0.991 9.000 0.667 NA   NA
 275914 275915 SAG1295 SAG1296     TRUE 0.996 11.000 1.000 NA   NA
 275915 275916 SAG1296 SAG1297     TRUE 0.996 -16.000 0.667 NA   NA
 275916 275917 SAG1297 SAG1298     TRUE 0.470 52.000 0.000 NA   NA
 275917 275918 SAG1298 SAG1299     TRUE 0.831 2.000 0.000 NA   NA
 275918 275919 SAG1299 SAG1300     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275919 275920 SAG1300 SAG1301   rplL FALSE 0.054 199.000 0.002 NA   NA
 275920 275921 SAG1301 SAG1302 rplL rplJ TRUE 0.990 64.000 0.884 0.020 Y NA
 275923 275924 SAG1304 SAG1305     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 275924 275925 SAG1305 SAG1306     TRUE 0.974 5.000 0.093 1.000 Y NA
 275925 275926 SAG1306 SAG1307     FALSE 0.119 130.000 0.000 NA   NA
 275926 275927 SAG1307 SAG1308     FALSE 0.068 158.000 0.000 NA   NA
 275927 275928 SAG1308 SAG1309     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 275930 275931 SAG1311 SAG1312   clpX TRUE 0.906 11.000 0.043 1.000   NA
 275931 275932 SAG1312 SAG1313 clpX   TRUE 0.842 30.000 0.012 NA   NA
 275932 275933 SAG1313 SAG1314   folA TRUE 0.918 18.000 0.030 NA   NA
 275933 275934 SAG1314 SAG1315 folA thyA TRUE 0.729 80.000 0.295 1.000 N NA
 275935 275936 SAG1316 SAG1317     TRUE 0.987 2.000 0.183 1.000 Y NA
 275936 275937 SAG1317 SAG1318     FALSE 0.360 92.000 0.020 NA   NA
 275937 275938 SAG1318 SAG1319     TRUE 0.941 5.000 0.146 NA   NA
 275938 275939 SAG1319 SAG1320     TRUE 0.536 87.000 0.135 1.000   NA
 275939 275940 SAG1320 SAG1321     FALSE 0.165 101.000 0.000 NA N NA
 275941 275942 SAG1322 SAG1323     FALSE 0.311 68.000 0.000 NA   NA
 275942 275943 SAG1323 SAG1324     TRUE 0.956 -3.000 0.097 1.000 N NA
 275943 275944 SAG1324 SAG1325   mvaD TRUE 0.997 -7.000 0.312 0.004 Y NA
 275944 275945 SAG1325 SAG1326 mvaD   TRUE 0.997 -18.000 0.281 0.003 Y NA
 275945 275946 SAG1326 SAG1327     FALSE 0.144 116.000 0.000 1.000 N NA
 275946 275947 SAG1327 SAG1328     TRUE 0.997 0.000 0.533 1.000 Y NA
 275947 275948 SAG1328 SAG1329     TRUE 0.995 2.000 0.800 1.000   NA
 275948 275949 SAG1329 SAG1330     FALSE 0.085 149.000 0.000 NA   NA
 275949 275950 SAG1330 SAG1331     FALSE 0.009 652.000 0.000 NA   NA
 275950 275951 SAG1331 SAG1332     FALSE 0.009 759.000 0.000 1.000   NA
 275953 275954 SAG1334 SAG1335   gdhA TRUE 0.499 70.000 0.056 1.000 N NA
 275956 275957 SAG1337 SAG1338     TRUE 0.999 5.000 0.846 0.005 Y NA
 275957 275958 SAG1338 SAG1339     TRUE 0.449 67.000 0.013 1.000 N NA
 275958 275959 SAG1339 SAG1340     TRUE 0.930 -3.000 0.006 1.000   NA
 275959 275960 SAG1340 SAG1341     TRUE 0.910 11.000 0.056 1.000   NA
 275960 275961 SAG1341 SAG1342     FALSE 0.042 185.000 0.000 NA   NA
 275961 275962 SAG1342 SAG1343     TRUE 0.942 0.000 0.056 NA   NA
 275962 275963 SAG1343 SAG1344     TRUE 0.536 72.000 0.083 NA   NA
 275963 275964 SAG1344 SAG1345     TRUE 0.481 51.000 0.000 NA   NA
 275964 275965 SAG1345 SAG1346     FALSE 0.040 189.000 0.000 NA   NA
 275965 275966 SAG1346 SAG1347   fruK TRUE 0.999 -3.000 0.816 1.000 Y NA
 275966 275967 SAG1347 SAG1348 fruK lacR-1 TRUE 0.999 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 275967 275968 SAG1348 SAG1349 lacR-1   FALSE 0.103 131.000 0.000 1.000 N NA
 275968 275969 SAG1349 SAG1350     FALSE 0.094 144.000 0.000 1.000   NA
 275969 275970 SAG1350 SAG1351     FALSE 0.032 212.000 0.000 1.000   NA
 275970 275971 SAG1351 SAG1352     TRUE 0.980 13.000 0.333 NA   NA
 275971 275972 SAG1352 SAG1353     FALSE 0.230 137.000 0.059 NA   NA
 275972 275973 SAG1353 SAG1354   trmD TRUE 0.936 -19.000 0.007 1.000 N NA
 275973 275974 SAG1354 SAG1355 trmD rimM TRUE 0.999 -13.000 0.672 1.000 Y NA
 275974 5922233 SAG1355 tRNA-Glu-1 rimM   FALSE 0.351 63.000 0.000 NA   NA
 5922233 5922234 tRNA-Glu-1 tRNA-Gln-2     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 5922234 275975 tRNA-Gln-2 SAG1356     FALSE 0.179 108.000 0.000 NA   NA
 275975 275976 SAG1356 SAG1357     FALSE 0.114 132.000 0.000 NA   NA
 275976 275977 SAG1357 SAG1358   rpsP TRUE 0.978 10.000 0.385 1.000   NA
 275977 275978 SAG1358 SAG1359 rpsP   FALSE 0.108 129.000 0.000 1.000 N NA
 275978 275979 SAG1359 SAG1360     TRUE 0.999 15.000 0.923 1.000 Y NA
 275979 275980 SAG1360 SAG1361     TRUE 0.996 3.000 0.923 1.000 N NA
 275980 275981 SAG1361 SAG1362     FALSE 0.036 202.000 0.000 1.000   NA
 275981 275982 SAG1362 SAG1363   carA-2 TRUE 0.693 56.000 0.013 0.002   NA
 275982 275983 SAG1363 SAG1364 carA-2 pyrR TRUE 0.825 49.000 0.000 1.000 Y NA
 275983 275984 SAG1364 SAG1365 pyrR   FALSE 0.074 176.000 0.008 1.000 N NA
 275984 275985 SAG1365 SAG1366   lspA TRUE 0.961 -16.000 0.082 1.000 N NA
 275985 275986 SAG1366 SAG1367 lspA   TRUE 0.921 9.000 0.119 1.000 N NA
 275986 275987 SAG1367 SAG1368   rpmA FALSE 0.026 216.000 0.000 1.000 N NA
 275987 275988 SAG1368 SAG1369 rpmA   TRUE 0.979 31.000 0.203 NA Y NA
 275988 275989 SAG1369 SAG1370   rplU TRUE 0.985 7.000 0.208 NA Y NA
 275989 275990 SAG1370 SAG1371 rplU   FALSE 0.035 190.000 0.000 1.000 N NA
 275990 275991 SAG1371 SAG1372   thiI FALSE 0.287 102.000 0.014 1.000 N NA
 275991 275992 SAG1372 SAG1373 thiI iscS-2 TRUE 0.980 2.000 0.349 1.000 N NA
 275994 275995 SAG1375 SAG1376 gor   FALSE 0.086 175.000 0.010 NA   NA
 275995 275996 SAG1376 SAG1377   aroC FALSE 0.327 84.000 0.005 NA   NA
 275996 275997 SAG1377 SAG1378 aroC aroB TRUE 0.989 1.000 0.110 0.002 Y NA
 275997 275998 SAG1378 SAG1379 aroB aroD TRUE 0.654 94.000 0.000 0.002 Y NA
 275998 275999 SAG1379 SAG1380 aroD   TRUE 0.958 0.000 0.125 NA   NA
 276001 276002 SAG1382 SAG1383 rplT rpmI TRUE 0.993 58.000 0.928 0.020 Y NA
 276002 276003 SAG1383 SAG1384 rpmI infC TRUE 0.992 40.000 0.652 1.000 Y NA
 276003 276004 SAG1384 SAG1385 infC cmk FALSE 0.099 161.000 0.010 1.000 N NA
 276004 276005 SAG1385 SAG1386 cmk   TRUE 0.878 11.000 0.012 1.000   NA
 276007 276008 SAG1388 SAG1389   pepT TRUE 0.887 29.000 0.051 NA   NA
 276008 276009 SAG1389 SAG1390 pepT   FALSE 0.110 135.000 0.000 1.000   NA
 276010 276011 SAG1391 SAG1392 murE   FALSE 0.156 156.000 0.062 1.000 N NA
 276011 276012 SAG1392 SAG1393     TRUE 0.998 24.000 0.889 1.000 Y NA
 276012 276013 SAG1393 SAG1394     TRUE 0.987 16.000 0.179 1.000 Y NA
 276013 276014 SAG1394 SAG1395     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.035 Y NA
 276015 276016 SAG1396 SAG1397   ppa TRUE 0.544 60.000 0.015 NA   NA
 276016 276017 SAG1397 SAG1398 ppa pflA-2 FALSE 0.266 117.000 0.023 1.000 N NA
 276017 276018 SAG1398 SAG1399 pflA-2   TRUE 0.495 68.000 0.028 NA   NA
 276018 276019 SAG1399 SAG1400     FALSE 0.092 180.000 0.023 NA   NA
 276019 276020 SAG1400 SAG1401     TRUE 0.991 -7.000 0.408 1.000   NA
 276020 276021 SAG1401 SAG1402     TRUE 0.411 93.000 0.050 1.000   NA
 276021 276022 SAG1402 SAG1403     TRUE 0.996 -19.000 0.600 NA   NA
 276022 276023 SAG1403 SAG1404     FALSE 0.018 301.000 0.000 NA   NA
 276023 276024 SAG1404 SAG1405     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 276024 276025 SAG1405 SAG1406     TRUE 0.999 0.000 0.909 NA Y NA
 276025 276026 SAG1406 SAG1407     FALSE 0.176 112.000 0.000 1.000   NA
 276026 276027 SAG1407 SAG1408     FALSE 0.201 130.000 0.000 0.008   NA
 276028 276029 SAG1410 SAG1411     TRUE 0.907 -10.000 0.000 1.000   NA
 276029 276030 SAG1411 SAG1412     TRUE 0.890 -3.000 0.000 1.000   NA
 276030 276031 SAG1412 SAG1413     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 276031 276032 SAG1413 SAG1414     TRUE 0.831 2.000 0.000 NA   NA
 276032 276033 SAG1414 SAG1415     TRUE 0.950 30.000 0.222 NA   NA
 276033 276034 SAG1415 SAG1416     TRUE 0.957 2.000 0.000 NA Y NA
 276034 276035 SAG1416 SAG1417     TRUE 0.845 0.000 0.000 1.000 N NA
 276035 276036 SAG1417 SAG1418     TRUE 0.839 0.000 0.000 NA N NA
 276036 276037 SAG1418 SAG1419     TRUE 0.797 25.000 0.000 NA   NA
 276037 276038 SAG1419 SAG1420     TRUE 0.899 -7.000 0.000 NA   NA
 276038 276039 SAG1420 SAG1421     TRUE 0.994 -3.000 0.568 NA   NA
 276039 276040 SAG1421 SAG1422     TRUE 0.831 2.000 0.000 NA   NA
 276040 276041 SAG1422 SAG1423     TRUE 0.988 -10.000 0.289 NA   NA
 276041 276042 SAG1423 SAG1424   rfbD TRUE 0.776 117.000 0.212 1.000 Y NA
 276042 276043 SAG1424 SAG1425 rfbD   TRUE 0.550 90.000 0.152 NA   NA
 276043 276044 SAG1425 SAG1426   rpoD FALSE 0.344 109.000 0.044 NA   NA
 276044 276045 SAG1426 SAG1427 rpoD dnaG TRUE 0.954 8.000 0.209 1.000 N NA
 276047 276048 SAG1429 SAG1430 rpsU   FALSE 0.184 104.000 0.000 NA   NA
 276048 276049 SAG1430 SAG1431     FALSE 0.233 83.000 0.000 NA   NA
 276049 276050 SAG1431 SAG1432     FALSE 0.022 325.000 0.000 0.046 N NA
 276056 276057 SAG1438 SAG1439 glgP malQ TRUE 0.993 12.000 0.289 0.016 Y NA
 276057 276058 SAG1439 SAG1440 malQ   TRUE 0.767 121.000 0.538 1.000 N NA
 276059 276060 SAG1441 SAG1442     TRUE 0.965 98.000 0.690 0.035 Y NA
 276060 276061 SAG1442 SAG1443     TRUE 0.999 0.000 0.793 0.035 Y NA
 276061 276062 SAG1443 SAG1444     FALSE 0.040 231.000 0.000 0.035 N NA
 10942631 276063 SAG1445 SAG1446     FALSE 0.230 84.000 0.000 NA   NA
 276063 276064 SAG1446 SAG1447     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 276064 276065 SAG1447 SAG1448     TRUE 0.981 -7.000 0.200 NA   NA
 276065 276066 SAG1448 SAG1449     TRUE 0.808 14.000 0.000 1.000 N NA
 276066 276067 SAG1449 SAG1450     TRUE 0.905 -13.000 0.000 NA   NA
 276067 276068 SAG1450 SAG1451     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 276068 276069 SAG1451 SAG1452     FALSE 0.236 82.000 0.000 NA   NA
 276069 276070 SAG1452 SAG1453     TRUE 0.914 0.000 0.007 NA   NA
 276070 276071 SAG1453 SAG1454     FALSE 0.139 124.000 0.000 NA   NA
 276071 276072 SAG1454 SAG1455     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 276072 10942632 SAG1455 SAG1456     TRUE 0.906 -19.000 0.000 NA   NA
 10942632 276073 SAG1456 SAG1457     FALSE 0.062 162.000 0.000 NA   NA
 276073 276074 SAG1457 SAG1458     TRUE 0.989 33.000 0.750 NA   NA
 276074 276075 SAG1458 SAG1459     FALSE 0.123 129.000 0.000 NA   NA
 276075 276076 SAG1459 SAG1460     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 276076 276077 SAG1460 SAG1461     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 276077 276078 SAG1461 SAG1462     FALSE 0.015 331.000 0.000 NA   NA
 276079 276080 SAG1464 SAG1465 uvrB   FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 276081 276082 SAG1466 SAG1467 glnP   TRUE 0.994 0.000 0.326 1.000 Y NA
 276082 276083 SAG1467 SAG1468     FALSE 0.085 149.000 0.000 NA   NA
 276084 276085 SAG1469 SAG1470   obgE TRUE 0.864 26.000 0.009 NA   NA
 276085 276086 SAG1470 SAG1471 obgE   TRUE 0.460 67.000 0.011 NA   NA
 276088 276089 SAG1473 SAG1474     FALSE 0.279 110.000 0.000 0.010   NA
 276089 276090 SAG1474 SAG1475   rsuA TRUE 0.573 85.000 0.000 1.000 Y NA
 276090 276091 SAG1475 SAG1476 rsuA   FALSE 0.041 191.000 0.000 1.000   NA
 276092 276093 SAG1477 SAG1478   gloA FALSE 0.311 88.000 0.009 1.000 N NA
 276093 276094 SAG1478 SAG1479 gloA   FALSE 0.104 129.000 0.000 NA N NA
 276094 276095 SAG1479 SAG1480     FALSE 0.104 129.000 0.000 NA N NA
 276096 276097 SAG1481 SAG1482 smpB vacB TRUE 0.957 3.000 0.143 0.023 N NA
 276097 276098 SAG1482 SAG1483 vacB   FALSE 0.331 113.000 0.064 1.000 N NA
 276098 276099 SAG1483 SAG1484   rpmG-1 TRUE 0.661 47.000 0.012 1.000 N NA
 276099 276100 SAG1484 SAG1485 rpmG-1   TRUE 0.928 -3.000 0.012 1.000 N NA
 276100 276101 SAG1485 SAG1486     FALSE 0.038 196.000 0.000 NA   NA
 276101 276102 SAG1486 SAG1487     TRUE 0.991 -10.000 0.385 NA   NA
 276102 276103 SAG1487 SAG1488     FALSE 0.123 124.000 0.000 1.000 N NA
 276103 276104 SAG1488 SAG1489   mutM TRUE 0.950 -3.000 0.066 1.000 N NA
 276104 276105 SAG1489 SAG1490 mutM   FALSE 0.133 149.000 0.004 1.000   NA
 276106 276107 SAG1491 SAG1492     TRUE 0.677 36.000 0.000 NA   NA
 276108 276109 SAG1493 SAG1494     FALSE 0.039 193.000 0.000 NA   NA
 276109 276110 SAG1494 SAG1495     FALSE 0.026 235.000 0.000 NA   NA
 276110 276111 SAG1495 SAG1496     TRUE 0.766 28.000 0.000 NA   NA
 276111 276112 SAG1496 SAG1497     FALSE 0.189 102.000 0.000 NA   NA
 276112 276113 SAG1497 SAG1498     FALSE 0.060 164.000 0.000 NA   NA
 276113 276114 SAG1498 SAG1499   era FALSE 0.025 237.000 0.000 NA   NA
 276114 276115 SAG1499 SAG1500 era dgkA TRUE 0.814 42.000 0.063 1.000   NA
 276115 276116 SAG1500 SAG1501 dgkA   TRUE 0.957 -19.000 0.035 NA   NA
 276116 276117 SAG1501 SAG1502     FALSE 0.013 407.000 0.000 NA   NA
 276117 276118 SAG1502 SAG1503     TRUE 0.579 45.000 0.000 NA   NA
 276118 276119 SAG1503 SAG1504     TRUE 0.666 37.000 0.000 NA   NA
 276119 276120 SAG1504 SAG1505     TRUE 0.792 5.000 0.000 NA   NA
 276122 276123 SAG1507 SAG1508     TRUE 0.387 73.000 0.004 NA   NA
 276123 276124 SAG1508 SAG1509     FALSE 0.070 157.000 0.000 NA   NA
 276124 276125 SAG1509 SAG1510   msrA TRUE 0.956 -3.000 0.080 NA   NA
 276125 276126 SAG1510 SAG1511 msrA   FALSE 0.185 138.000 0.016 1.000   NA
 276126 276127 SAG1511 SAG1512   frr FALSE 0.258 118.000 0.012 1.000   NA
 276127 276128 SAG1512 SAG1513 frr pyrH TRUE 0.992 16.000 0.626 1.000 N NA
 276128 276129 SAG1513 SAG1514 pyrH   FALSE 0.133 121.000 0.000 1.000 N NA
 276129 276130 SAG1514 SAG1515     TRUE 0.998 -13.000 0.500 0.022 Y NA
 276130 276131 SAG1515 SAG1516     TRUE 0.997 -12.000 0.353 1.000 Y NA
 276131 276132 SAG1516 SAG1517     TRUE 0.987 39.000 0.353 0.035 Y NA
 276132 276133 SAG1517 SAG1518     TRUE 0.995 -13.000 0.167 0.035 Y NA
 276133 276134 SAG1518 SAG1519   rplA FALSE 0.011 389.000 0.000 1.000 N NA
 276134 276135 SAG1519 SAG1520 rplA rplK TRUE 0.975 104.000 0.838 0.026 Y NA
 276137 276138 SAG1522 SAG1523     TRUE 0.793 8.000 0.000 1.000   NA
 276139 276140 SAG1524 SAG1525     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 276140 276141 SAG1525 SAG1526     FALSE 0.292 71.000 0.000 NA   NA
 276141 276142 SAG1526 SAG1527     TRUE 0.906 -24.000 0.000 NA   NA
 276143 276144 SAG1528 SAG1529     FALSE 0.212 82.000 0.000 1.000 N NA
 276146 276147 SAG1531 SAG1532     TRUE 0.983 2.000 0.130 1.000 Y NA
 276147 276148 SAG1532 SAG1533     TRUE 0.409 171.000 0.135 1.000 Y NA
 276150 276151 SAG1535 SAG1536 pfs   TRUE 0.898 10.000 0.041 NA   NA
 276151 276152 SAG1536 SAG1537     TRUE 0.931 0.000 0.025 NA   NA
 276152 276153 SAG1537 SAG1538   glmU TRUE 0.896 21.000 0.015 1.000 N NA
 276155 276156 SAG1540 SAG1541     TRUE 0.989 13.000 0.500 NA   NA
 276156 276157 SAG1541 SAG1542     FALSE 0.219 89.000 0.000 NA   NA
 276157 10942634 SAG1542 SAG1543     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 10942634 276158 SAG1543 SAG1544     FALSE 0.025 239.000 0.000 NA   NA
 276158 276159 SAG1544 SAG1545     TRUE 0.997 -7.000 0.710 NA   NA
 276159 276160 SAG1545 SAG1546     FALSE 0.218 90.000 0.000 NA   NA
 276160 276161 SAG1546 SAG1547     FALSE 0.036 198.000 0.000 NA   NA
 276161 276162 SAG1547 SAG1548     FALSE 0.024 240.000 0.000 NA   NA
 276163 276164 SAG1549 SAG1550     TRUE 0.989 33.000 0.750 NA   NA
 276165 276166 SAG1551 SAG1552     FALSE 0.233 140.000 0.083 NA   NA
 276166 276167 SAG1552 SAG1553     TRUE 0.947 7.000 0.167 NA   NA
 276167 276168 SAG1553 SAG1554     TRUE 0.995 5.000 0.857 NA   NA
 276168 276169 SAG1554 SAG1555     TRUE 0.924 52.000 0.429 NA   NA
 276169 276170 SAG1555 SAG1556   brnQ-1 FALSE 0.014 366.000 0.000 NA   NA
 276170 276171 SAG1556 SAG1557 brnQ-1 metG FALSE 0.033 196.000 0.000 1.000 N NA
 276173 276174 SAG1559 SAG1560     TRUE 0.828 15.000 0.000 NA   NA
 276175 276176 SAG1561 SAG1562     TRUE 0.997 -16.000 0.714 1.000   NA
 276176 276177 SAG1562 SAG1563   exoA FALSE 0.267 77.000 0.000 1.000   NA
 276178 276179 SAG1564 SAG1565   ogt TRUE 0.919 2.000 0.050 1.000 N NA
 276179 276180 SAG1565 SAG1566 ogt   TRUE 0.521 55.000 0.009 1.000 N NA
 276180 276181 SAG1566 SAG1567     TRUE 0.602 63.000 0.013 0.046   NA
 276181 10942635 SAG1567 SAG1568     FALSE 0.311 68.000 0.000 NA   NA
 276185 276186 SAG1572 SAG1573     TRUE 0.902 6.000 0.043 NA   NA
 276186 276187 SAG1573 SAG1574     TRUE 0.874 30.000 0.038 NA   NA
 276187 276188 SAG1574 SAG1575   tmk TRUE 0.973 20.000 0.254 1.000 N NA
 276189 276190 SAG1577 SAG1578   livF TRUE 0.970 19.000 0.214 1.000   NA
 276190 276191 SAG1578 SAG1579 livF livG TRUE 0.990 0.000 0.128 0.022 Y NA
 276191 276192 SAG1579 SAG1580 livG   TRUE 0.994 1.000 0.349 1.000 Y NA
 276192 276193 SAG1580 SAG1581   livH TRUE 0.994 3.000 0.363 0.034 Y NA
 276193 276194 SAG1581 SAG1582 livH   TRUE 0.748 106.000 0.150 1.000 Y NA
 276194 276195 SAG1582 SAG1583     FALSE 0.207 155.000 0.109 NA   NA
 276195 276196 SAG1583 SAG1584     FALSE 0.051 174.000 0.000 NA   NA
 276196 276197 SAG1584 SAG1585   clpP FALSE 0.137 119.000 0.000 1.000 N NA
 276197 276198 SAG1585 SAG1586 clpP upp FALSE 0.199 125.000 0.010 1.000 N NA
 276198 276199 SAG1586 SAG1587 upp   FALSE 0.230 110.000 0.004 1.000 N NA
 276199 276200 SAG1587 SAG1588     FALSE 0.092 136.000 0.000 1.000 N NA
 276200 276201 SAG1588 SAG1589     FALSE 0.046 173.000 0.000 1.000 N NA
 276202 276203 SAG1590 SAG1591     TRUE 0.990 17.000 0.163 0.004 Y NA
 276204 276205 SAG1592 SAG1593   rluB TRUE 0.924 0.000 0.014 NA   NA
 276205 276206 SAG1593 SAG1594 rluB   TRUE 0.983 -10.000 0.224 NA N NA
 276206 276207 SAG1594 SAG1595     TRUE 0.994 -3.000 0.570 NA   NA
 276207 276208 SAG1595 SAG1596     TRUE 0.927 0.000 0.017 NA   NA
 276208 276209 SAG1596 SAG1597     TRUE 0.969 -10.000 0.111 NA   NA
 276209 276210 SAG1597 SAG1598     TRUE 0.948 -3.000 0.034 NA   NA
 276210 276211 SAG1598 SAG1599     TRUE 0.941 -18.000 0.005 1.000   NA
 276211 276212 SAG1599 SAG1600   murI TRUE 0.943 -3.000 0.034 1.000 N NA
 276212 276213 SAG1600 SAG1601 murI   FALSE 0.096 175.000 0.014 1.000   NA
 276213 276214 SAG1601 SAG1602     FALSE 0.068 158.000 0.000 NA   NA
 276214 276215 SAG1602 SAG1603     TRUE 0.644 62.000 0.107 NA   NA
 276215 276216 SAG1603 SAG1604     FALSE 0.311 68.000 0.000 NA   NA
 276216 276217 SAG1604 SAG1605     TRUE 0.940 23.000 0.123 NA   NA
 276217 276218 SAG1605 SAG1606     TRUE 0.827 38.000 0.043 1.000   NA
 276219 276220 SAG1607 SAG1608     TRUE 0.548 85.000 0.154 1.000 N NA
 276221 276222 SAG1609 SAG1610     TRUE 0.985 24.000 0.125 0.034 Y NA
 276222 276223 SAG1610 SAG1611     FALSE 0.056 161.000 0.000 1.000 N NA
 276223 276224 SAG1611 SAG1612   greA FALSE 0.166 103.000 0.000 1.000 N NA
 276224 276225 SAG1612 SAG1613 greA   TRUE 0.526 73.000 0.079 NA   NA
 276225 276226 SAG1613 SAG1614     TRUE 0.503 87.000 0.120 NA   NA
 276226 276227 SAG1614 SAG1615   murC FALSE 0.365 86.000 0.014 1.000   NA
 276227 276228 SAG1615 SAG1616 murC   TRUE 0.872 10.000 0.013 NA   NA
 276228 276229 SAG1616 SAG1617     TRUE 0.792 5.000 0.000 NA   NA
 276229 276230 SAG1617 SAG1618     FALSE 0.359 62.000 0.000 NA   NA
 276230 276231 SAG1618 SAG1619     FALSE 0.282 163.000 0.000 0.052 Y NA