MicrobesOnline Operon Predictions for Desulfovibrio desulfuricans G20

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 393370 393369 Dde_0001 Dde_0002 dnaA dnaN TRUE 0.783 143.000 0.014 1.000 Y 0.810
 393369 393368 Dde_0002 Dde_0003 dnaN gyrB TRUE 0.997 1.000 0.114 1.000 Y 0.751
 393368 393367 Dde_0003 Dde_0004 gyrB gyrA TRUE 0.998 22.000 0.306 0.001 Y 0.732
 393367 3333889 Dde_0004 Dde_0005 gyrA   TRUE 0.968 10.000 0.004 1.000   0.659
 3333889 393365 Dde_0005 Dde_0009     FALSE 0.001 904.000 0.000 1.000   -0.095
 393365 393364 Dde_0009 Dde_0011   hisS FALSE 0.020 241.000 0.004 1.000 N -0.452
 393364 393363 Dde_0011 Dde_0012 hisS aspS TRUE 0.977 63.000 0.161 0.046 Y 0.715
 393363 393362 Dde_0012 Dde_0013 aspS def FALSE 0.248 210.000 0.008 1.000 Y 0.348
 393362 393361 Dde_0013 Dde_0014 def fmt TRUE 0.995 -24.000 0.033 0.032 Y 0.837
 393361 393360 Dde_0014 Dde_0015 fmt   TRUE 0.485 167.000 0.048 NA   0.581
 393360 393359 Dde_0015 Dde_0016     TRUE 0.775 7.000 0.000 NA   0.264
 393359 3333893 Dde_0016 Dde_0017     TRUE 0.970 -3.000 0.031 NA   0.319
 393357 393356 Dde_0019 Dde_0020     TRUE 0.979 12.000 0.029 NA   0.570
 393356 393355 Dde_0020 Dde_0021     TRUE 0.986 19.000 0.429 NA   -0.502
 393355 393354 Dde_0021 Dde_0022     TRUE 0.951 23.000 0.000 NA Y 0.717
 393354 393353 Dde_0022 Dde_0023     TRUE 0.944 4.000 0.000 NA Y 0.338
 393353 393352 Dde_0023 Dde_0024     TRUE 0.991 3.000 0.250 NA   0.228
 393352 393351 Dde_0024 Dde_0028   rfaE FALSE 0.000 976.000 0.000 NA   -0.467
 393351 393350 Dde_0028 Dde_0029 rfaE parB TRUE 0.895 16.000 0.011 NA N 0.057
 393348 393347 Dde_0031 Dde_0033 parA capI FALSE 0.014 339.000 0.000 1.000 N 0.549
 393347 393346 Dde_0033 Dde_0036 capI   FALSE 0.031 897.000 0.017 NA N 0.682
 393346 393345 Dde_0036 Dde_0037     TRUE 0.988 56.000 0.330 NA Y 0.904
 393345 393344 Dde_0037 Dde_0038     FALSE 0.141 254.000 0.038 NA   0.190
 393344 393343 Dde_0038 Dde_0039   coaBC TRUE 0.911 -18.000 0.013 NA   0.038
 393343 393342 Dde_0039 Dde_0040 coaBC   TRUE 0.985 0.000 0.011 NA   0.933
 393341 393340 Dde_0042 Dde_0043 queA oorD FALSE 0.464 151.000 0.011 1.000   0.656
 393340 393339 Dde_0043 Dde_0044 oorD   TRUE 0.997 5.000 0.116 0.004   0.948
 393339 393338 Dde_0044 Dde_0045     TRUE 1.000 4.000 0.822 0.004 Y 0.892
 393338 393337 Dde_0045 Dde_0046     TRUE 1.000 5.000 0.797 0.004 Y 0.941
 393336 393335 Dde_0047 Dde_0048     FALSE 0.180 -9.000 0.000 1.000   -0.432
 3333902 3333905 Dde_0050 Dde_0053     FALSE 0.000 419.000 0.000 NA   -0.354
 393333 393332 Dde_0054 Dde_0056 putA pyrD FALSE 0.045 349.000 0.000 1.000 N 0.895
 393332 393331 Dde_0056 Dde_0057 pyrD pyrK TRUE 0.999 11.000 0.592 0.001 N 0.934
 393329 393328 Dde_0059 Dde_0060     TRUE 0.481 152.000 0.087 NA   0.058
 393326 393325 Dde_0063 Dde_0064     TRUE 0.693 -3.000 0.000 1.000   0.149
 393324 393323 Dde_0065 Dde_0066 ilvE dnaX FALSE 0.447 70.000 0.020 1.000 N -0.668
 393323 393322 Dde_0066 Dde_0067 dnaX   TRUE 0.969 41.000 0.411 NA   0.278
 393322 3333909 Dde_0067 Dde_0068     TRUE 0.998 5.000 0.604 NA   0.602
 3333909 393320 Dde_0068 Dde_0070     FALSE 0.000 1149.000 0.000 1.000 N -0.226
 393319 393318 Dde_0071 Dde_0073     FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   -0.182
 393318 393317 Dde_0073 Dde_0074     TRUE 0.893 -3.000 0.003 NA   0.144
 393317 393316 Dde_0074 Dde_0075     TRUE 0.734 23.000 0.005 NA   -0.477
 393316 393315 Dde_0075 Dde_0076   mtnS FALSE 0.050 78.000 0.000 1.000   -0.103
 393314 393313 Dde_0077 Dde_0079   trpB FALSE 0.000 433.000 0.000 1.000 N -0.776
 393313 393312 Dde_0079 Dde_0081 trpB hydA FALSE 0.000 6396.000 0.000 1.000   -0.198
 393312 393311 Dde_0081 Dde_0082 hydA hydB TRUE 0.994 10.000 0.026 0.004   0.931
 393311 393310 Dde_0082 Dde_0084 hydB   FALSE 0.021 255.000 0.000 NA   0.350
 393305 393304 Dde_0089 Dde_0090     TRUE 0.998 1.000 0.429 NA N 0.955
 393302 393301 Dde_0092 Dde_0093     TRUE 0.997 11.000 0.571 NA   0.550
 393301 393300 Dde_0093 Dde_0095     FALSE 0.008 455.000 0.000 NA   0.472
 393300 393299 Dde_0095 Dde_0096     TRUE 0.656 57.000 0.015 NA   0.073
 393299 393298 Dde_0096 Dde_0097     TRUE 0.492 38.000 0.000 NA   0.382
 393297 393296 Dde_0098 Dde_0099   asnS FALSE 0.356 147.000 0.005 1.000 N 0.647
 393295 393294 Dde_0102 Dde_0104 glnN glnA FALSE 0.055 278.000 0.000 0.001   0.367
 3333924 393291 Dde_0107 Dde_0108     FALSE 0.006 157.000 0.000 NA   -0.260
 393290 393289 Dde_0109 Dde_0110 hydG hydH TRUE 0.994 27.000 0.214 1.000 Y 0.748
 393288 393287 Dde_0111 Dde_0113   nrdE FALSE 0.037 261.000 0.000 NA   0.552
 393287 393286 Dde_0113 Dde_0114 nrdE ftsE TRUE 0.748 68.000 0.004 1.000 N 0.795
 393286 393285 Dde_0114 Dde_0115 ftsE ftsX TRUE 0.996 -6.000 0.431 NA Y -0.127
 393285 393284 Dde_0115 Dde_0116 ftsX ilvD FALSE 0.168 104.000 0.006 NA N -0.356
 393284 393283 Dde_0116 Dde_0119 ilvD   FALSE 0.022 428.000 0.000 1.000 N 0.717
 393282 393281 Dde_0120 Dde_0121 23S rRNA pseudouridylate synthase C   FALSE 0.013 97.000 0.000 1.000   -0.782
 393275 393274 Dde_0127 Dde_0128 pdxA   FALSE 0.238 69.000 0.000 1.000   0.302
 393274 393273 Dde_0128 Dde_0129   kdgT TRUE 0.960 -3.000 0.000 1.000   0.953
 393273 393272 Dde_0129 Dde_0130 kdgT   FALSE 0.452 130.000 0.000 1.000   0.955
 393272 393271 Dde_0130 Dde_0132     FALSE 0.032 452.000 0.000 NA   0.860
 393271 393270 Dde_0132 Dde_0133   bfr FALSE 0.011 284.000 0.000 NA   0.248
 393270 393269 Dde_0133 Dde_0136 bfr ade FALSE 0.002 695.000 0.000 1.000 N 0.364
 393269 393268 Dde_0136 Dde_0137 ade   TRUE 0.501 61.000 0.000 1.000   0.620
 393268 393267 Dde_0137 Dde_0138     TRUE 0.664 63.000 0.000 0.047   0.659
 393267 393266 Dde_0138 Dde_0139     TRUE 0.960 -3.000 0.000 1.000   0.882
 393266 393265 Dde_0139 Dde_0140     TRUE 0.964 2.000 0.000 1.000   0.893
 393265 393264 Dde_0140 Dde_0141     FALSE 0.007 142.000 0.000 1.000   -0.775
 3333936 393262 Dde_0145 Dde_0146     TRUE 0.721 135.000 0.000 0.023 Y 0.833
 393260 393259 Dde_0150 Dde_0151 ubiX   TRUE 0.965 30.000 0.018 1.000   0.965
 393259 11399269 Dde_0151 Dde_4011     TRUE 0.635 61.000 0.006 1.000   NA
 11399269 3333939 Dde_4011 Dde_0152     TRUE 0.884 42.000 0.006 1.000 Y NA
 393256 393255 Dde_0153 Dde_0154   modB TRUE 0.992 10.000 0.089 NA   0.708
 393255 393254 Dde_0154 Dde_0155 modB modA TRUE 0.957 4.000 0.000 1.000 N 0.891
 393254 393253 Dde_0155 Dde_0157 modA   FALSE 0.028 253.000 0.000 1.000 N 0.526
 393252 393251 Dde_0158 Dde_0159     TRUE 0.997 3.000 0.225 NA   0.917
 393250 393249 Dde_0160 Dde_0161 lytS lytR TRUE 0.988 41.000 0.262 0.050 Y 0.565
 393247 393246 Dde_0166 Dde_0167 glnQ glnP TRUE 0.986 18.000 0.179 1.000 Y -0.512
 393246 393245 Dde_0167 Dde_0168 glnP glnH TRUE 0.948 128.000 0.141 0.062 Y 0.848
 393245 393244 Dde_0168 Dde_0171 glnH thrC FALSE 0.017 1166.000 0.000 1.000 Y 0.561
 393244 393243 Dde_0171 Dde_0172 thrC   TRUE 0.911 2.000 0.008 1.000   -0.155
 393243 393242 Dde_0172 Dde_0173     TRUE 0.961 38.000 0.048 1.000   0.824
 393242 393241 Dde_0173 Dde_0174   purH TRUE 0.597 77.000 0.051 1.000   -0.811
 393239 393238 Dde_0176 Dde_0177 purA holB TRUE 0.968 4.000 0.078 1.000   -0.560
 393238 393237 Dde_0177 Dde_0178 holB   FALSE 0.015 91.000 0.000 1.000   -0.558
 393237 393236 Dde_0178 Dde_0179   phrB FALSE 0.221 0.000 0.000 1.000   -0.536
 393236 393235 Dde_0179 Dde_0180 phrB   FALSE 0.016 87.000 0.000 1.000 N -0.070
 393234 393233 Dde_0181 Dde_0182   glcD FALSE 0.033 52.000 0.000 NA   -0.582
 393233 393232 Dde_0182 Dde_0183 glcD   TRUE 0.512 161.000 0.190 1.000 N -0.026
 393232 393231 Dde_0183 Dde_0184     TRUE 0.999 0.000 0.643 1.000 Y 0.828
 393231 393230 Dde_0184 Dde_0185     TRUE 0.999 14.000 0.600 1.000 Y 0.682
 393230 393229 Dde_0185 Dde_0186   artJ TRUE 0.837 261.000 0.378 0.062 Y 0.782
 393227 393226 Dde_0188 Dde_0189 ablB ablA TRUE 0.997 5.000 0.245 0.062   0.700
 393226 393225 Dde_0189 Dde_0191 ablA   FALSE 0.000 562.000 0.000 NA   -0.239
 393225 393224 Dde_0191 Dde_0193     FALSE 0.013 495.000 0.000 NA   0.638
 393222 393221 Dde_0196 Dde_0197 serS   FALSE 0.178 188.000 0.003 NA   0.604
 393219 393218 Dde_0202 Dde_0203     TRUE 0.749 52.000 0.000 NA   0.870
 393217 393216 Dde_0204 Dde_0205     TRUE 0.986 29.000 0.156 NA   0.861
 393216 393215 Dde_0205 Dde_0206     TRUE 0.755 124.000 0.062 NA   0.678
 393215 393214 Dde_0206 Dde_0207     FALSE 0.422 43.000 0.000 NA   0.350
 393213 393212 Dde_0208 Dde_0209 lysW ppiB FALSE 0.001 381.000 0.000 1.000 N -0.340
 393208 393207 Dde_0213 Dde_0214 potA   TRUE 0.992 -24.000 0.122 NA   0.885
 393206 393205 Dde_0215 Dde_0216     TRUE 0.870 95.000 0.273 NA   0.416
 393205 393204 Dde_0216 Dde_0217     TRUE 0.974 0.000 0.018 1.000 N 0.619
 393204 393203 Dde_0217 Dde_0218     FALSE 0.003 415.000 0.000 1.000 N 0.237
 393203 3333953 Dde_0218 Dde_0220     FALSE 0.000 461.000 0.000 1.000   -0.539
 393201 393200 Dde_0221 Dde_0222     TRUE 0.603 83.000 0.000 NA   0.920
 393200 393199 Dde_0222 Dde_0223     TRUE 0.985 16.000 0.090 NA   0.611
 393199 393198 Dde_0223 Dde_0224   rrf2 TRUE 0.625 165.000 0.038 NA   0.798
 393198 393197 Dde_0224 Dde_0225 rrf2   FALSE 0.000 437.000 0.000 NA   -0.485
 393197 393196 Dde_0225 Dde_0227   cstA FALSE 0.008 277.000 0.000 NA   0.119
 393196 393195 Dde_0227 Dde_0228 cstA tyrS FALSE 0.001 284.000 0.000 1.000 N -0.590
 393195 393194 Dde_0228 Dde_0229 tyrS   FALSE 0.365 106.000 0.022 1.000   -0.779
 393194 393193 Dde_0229 Dde_0230   moeA TRUE 0.982 0.000 0.008 1.000   0.803
 393193 393192 Dde_0230 Dde_0232 moeA cysA FALSE 0.110 239.000 0.000 1.000 N 0.920
 393192 393191 Dde_0232 Dde_0233 cysA cysW TRUE 0.992 -3.000 0.067 1.000 N 0.923
 393191 393190 Dde_0233 Dde_0234 cysW   TRUE 0.863 155.000 0.524 NA Y -0.314
 393190 393189 Dde_0234 Dde_0235     FALSE 0.051 246.000 0.000 NA N 0.668
 393185 393184 Dde_0240 Dde_0241 fumC   FALSE 0.009 131.000 0.000 1.000 N -0.060
 393184 393183 Dde_0241 Dde_0243     FALSE 0.006 154.000 0.000 1.000 N -0.693
 393183 393182 Dde_0243 Dde_0244     FALSE 0.319 64.000 0.010 NA N -0.637
 3333959 393180 Dde_0246 Dde_0247   rpoZ TRUE 0.738 34.000 0.005 NA   0.181
 393180 393179 Dde_0247 Dde_0248 rpoZ dnaJ TRUE 0.988 7.000 0.020 1.000 N 0.940
 393179 3333960 Dde_0248 Dde_0249 dnaJ   TRUE 0.983 3.000 0.010 1.000 N 0.922
 3333960 3333961 Dde_0249 Dde_0250     FALSE 0.008 141.000 0.000 1.000   -0.475
 3333961 393176 Dde_0250 Dde_0251   mutT TRUE 0.985 48.000 0.706 1.000   0.557
 393176 393175 Dde_0251 Dde_0252 mutT   TRUE 0.862 13.000 0.000 NA   0.504
 393175 393174 Dde_0252 Dde_0253     TRUE 0.756 98.000 0.118 NA   0.300
 393174 393173 Dde_0253 Dde_0254   asd TRUE 0.930 51.000 0.074 1.000 N 0.757
 393173 393172 Dde_0254 Dde_0255 asd   TRUE 0.973 19.000 0.000 1.000 Y 0.947
 393172 393171 Dde_0255 Dde_0256     FALSE 0.010 119.000 0.000 1.000 N -0.475
 3333962 393168 Dde_0258 Dde_0259   livH TRUE 0.564 273.000 0.581 1.000 Y -0.674
 393168 3333963 Dde_0259 Dde_0260 livH   TRUE 1.000 -3.000 0.783 0.046 Y 0.953
 3333963 393166 Dde_0260 Dde_0261   livG TRUE 0.995 -3.000 0.429 1.000 Y -0.603
 393166 393165 Dde_0261 Dde_0262 livG livF TRUE 0.999 10.000 0.320 0.023 Y 0.653
 393164 393163 Dde_0263 Dde_0264     FALSE 0.362 150.000 0.000 NA   0.955
 393163 393162 Dde_0264 Dde_0265     TRUE 0.921 23.000 0.000 NA   0.963
 393162 393161 Dde_0265 Dde_0266     FALSE 0.009 125.000 0.000 1.000   -0.275
 393161 393160 Dde_0266 Dde_0267     FALSE 0.005 162.000 0.000 1.000   -0.334
 393158 393157 Dde_0269 Dde_0270 pbpC   TRUE 0.967 46.000 0.473 1.000   0.202
 393157 393156 Dde_0270 Dde_0271   oppF FALSE 0.001 352.000 0.000 1.000   -0.465
 393156 393155 Dde_0271 Dde_0272 oppF oppD TRUE 1.000 4.000 0.667 0.002 Y 0.862
 393155 393154 Dde_0272 Dde_0273 oppD oppC TRUE 0.998 4.000 0.543 1.000 Y 0.359
 393154 393153 Dde_0273 Dde_0274 oppC   TRUE 1.000 1.000 1.000 0.062 Y 0.651
 393153 393152 Dde_0274 Dde_0275     TRUE 0.999 8.000 0.848 0.046 Y 0.290
 393152 393151 Dde_0275 Dde_0276   malY FALSE 0.030 269.000 0.000 1.000 Y -0.520
 393151 393150 Dde_0276 Dde_0277 malY   FALSE 0.001 260.000 0.000 1.000 N -0.188
 393150 393149 Dde_0277 Dde_0278   nrdG TRUE 0.967 35.000 0.046 1.000   0.913
 393149 393148 Dde_0278 Dde_0281 nrdG   FALSE 0.024 567.000 0.000 NA   0.847
 393148 393147 Dde_0281 Dde_0282     FALSE 0.155 180.000 0.000 NA   0.699
 393147 393146 Dde_0282 Dde_0283     TRUE 0.901 28.000 0.000 NA   0.945
 3333967 393144 Dde_0284 Dde_0285     TRUE 0.981 0.000 0.100 1.000   0.099
 393141 393140 Dde_0288 Dde_0289     FALSE 0.060 141.000 0.000 0.043   -0.665
 393139 393138 Dde_0291 Dde_0292     TRUE 0.999 1.000 0.684 NA   0.774
 393137 393136 Dde_0293 Dde_0294     TRUE 0.963 8.000 0.000 NA   0.866
 393136 393135 Dde_0294 Dde_0295   eno TRUE 0.544 77.000 0.008 1.000 N 0.454
 393135 393134 Dde_0295 Dde_0296 eno folD FALSE 0.001 257.000 0.000 1.000 N -0.657
 393134 393133 Dde_0296 Dde_0298 folD flgE FALSE 0.009 448.000 0.000 1.000 N 0.545
 393133 393132 Dde_0298 Dde_0299 flgE   FALSE 0.004 172.000 0.000 1.000 N -0.171
 393132 3333970 Dde_0299 Dde_0300     TRUE 0.803 100.000 0.222 1.000   0.164
 393129 393128 Dde_0301 Dde_0303     FALSE 0.000 444.000 0.000 NA N -0.124
 393128 393127 Dde_0303 Dde_0304     FALSE 0.004 281.000 0.000 0.018 N -0.874
 393127 393126 Dde_0304 Dde_0305     TRUE 0.508 90.000 0.048 1.000 N -0.518
 393126 393125 Dde_0305 Dde_0306     TRUE 0.999 6.000 0.667 0.035   0.860
 393125 393124 Dde_0306 Dde_0307     FALSE 0.007 146.000 0.000 NA   -0.585
 393123 393122 Dde_0308 Dde_0309     TRUE 0.996 -3.000 0.190 0.046 Y 0.439
 393122 393121 Dde_0309 Dde_0310     FALSE 0.451 105.000 0.000 1.000 N 0.845
 393121 393120 Dde_0310 Dde_0312     FALSE 0.001 319.000 0.000 1.000 N -0.213
 393120 393119 Dde_0312 Dde_0314     FALSE 0.013 391.000 0.008 1.000 N -0.126
 393119 3333974 Dde_0314 Dde_0315     TRUE 0.992 0.000 0.043 1.000   0.916
 3333974 393117 Dde_0315 Dde_0316     FALSE 0.000 389.000 0.000 NA   -0.845
 393117 3333976 Dde_0316 Dde_0318     FALSE 0.000 495.000 0.000 NA   -0.875
 3333976 393115 Dde_0318 Dde_0319     TRUE 0.934 57.000 0.286 NA   0.383
 393115 393114 Dde_0319 Dde_0320     TRUE 0.894 18.000 0.000 NA   0.662
 393114 393113 Dde_0320 Dde_0321     TRUE 0.998 4.000 0.474 1.000 Y 0.414
 393113 393112 Dde_0321 Dde_0322     TRUE 0.931 90.000 0.333 1.000   0.655
 393112 393111 Dde_0322 Dde_0323     FALSE 0.015 301.000 0.000 1.000   0.373
 393111 393110 Dde_0323 Dde_0324     TRUE 0.950 24.000 0.000 0.036   0.932
 393110 3333977 Dde_0324 Dde_0325     TRUE 0.852 35.000 0.000 NA   0.881
 3333977 393108 Dde_0325 Dde_0326     TRUE 0.991 32.000 0.308 NA   0.906
 393108 393107 Dde_0326 Dde_0327     TRUE 0.856 79.000 0.154 1.000 N 0.555
 393107 393106 Dde_0327 Dde_0328     TRUE 0.934 45.000 0.000 0.036 Y 0.899
 393105 393104 Dde_0329 Dde_0331   hisF FALSE 0.031 238.000 0.000 1.000   0.414
 393104 393103 Dde_0331 Dde_0332 hisF hisH TRUE 0.996 -10.000 0.028 0.004 Y 0.968
 393102 393101 Dde_0333 Dde_0334 carB purF TRUE 0.986 5.000 0.023 1.000 Y 0.275
 393101 3333979 Dde_0334 Dde_0335 purF   FALSE 0.265 139.000 0.010 1.000 N 0.197
 3333979 393099 Dde_0335 Dde_0336     FALSE 0.158 148.000 0.013 NA N -0.389
 393099 393098 Dde_0336 Dde_0337     FALSE 0.304 153.000 0.000 NA   0.779
 393098 3333981 Dde_0337 Dde_0339     FALSE 0.042 366.000 0.000 NA   0.807
 393096 393095 Dde_0340 Dde_0341   deaD TRUE 0.994 13.000 0.167 NA   0.787
 393095 393094 Dde_0341 Dde_0342 deaD cobH FALSE 0.215 179.000 0.031 1.000 N 0.052
 393094 393093 Dde_0342 Dde_0343 cobH cobB TRUE 0.962 34.000 0.047 0.012 Y -0.137
 393093 393092 Dde_0343 Dde_0344 cobB   TRUE 0.989 12.000 0.333 NA   -0.379
 393091 3333983 Dde_0346 Dde_0347     FALSE 0.037 156.000 0.000 1.000 N 0.265
 393087 393086 Dde_0350 Dde_0351 fliI   TRUE 0.960 45.000 0.138 0.005 Y -0.539
 393086 393085 Dde_0351 Dde_0352   fliG TRUE 0.997 -13.000 0.308 1.000 Y 0.617
 393085 393084 Dde_0352 Dde_0353 fliG fliF TRUE 0.997 -16.000 0.477 0.008 Y -0.059
 393084 393083 Dde_0353 Dde_0354 fliF fliE TRUE 0.981 41.000 0.180 0.008 Y 0.306
 393083 393082 Dde_0354 Dde_0355 fliE flgC TRUE 0.996 16.000 0.271 0.006 Y 0.203
 393082 393081 Dde_0355 Dde_0356 flgC flgB TRUE 0.998 0.000 0.092 0.006 Y 0.888
 393077 393076 Dde_0360 Dde_0361     TRUE 0.981 -9.000 0.039 1.000 Y 0.064
 393076 393075 Dde_0361 Dde_0362     FALSE 0.062 292.000 0.000 1.000 Y 0.442
 393075 393074 Dde_0362 Dde_0363   hypE FALSE 0.008 137.000 0.000 1.000 N -0.261
 393074 393073 Dde_0363 Dde_0364 hypE hypD TRUE 0.996 5.000 0.353 1.000 Y -0.016
 393072 393071 Dde_0365 Dde_0366   ddlB TRUE 0.907 -34.000 0.021 1.000   -0.570
 393071 393070 Dde_0366 Dde_0367 ddlB kdtA TRUE 0.974 -3.000 0.014 1.000 Y 0.029
 393070 3333986 Dde_0367 Dde_0369 kdtA   FALSE 0.001 326.000 0.000 1.000 N -0.797
 393068 393067 Dde_0370 Dde_0371     TRUE 0.952 -3.000 0.000 1.000 N 0.947
 393065 393064 Dde_0373 Dde_0374   nox FALSE 0.197 126.000 0.000 1.000   0.506
 393064 393063 Dde_0374 Dde_0376 nox hflX FALSE 0.003 1075.000 0.000 1.000   0.354
 393063 393062 Dde_0376 Dde_0377 hflX purH FALSE 0.390 186.000 0.008 1.000   0.866
 393061 393060 Dde_0378 Dde_0379 fliR flhB TRUE 0.999 13.000 0.353 1.000 Y 0.926
 393060 393059 Dde_0379 Dde_0380 flhB flhA TRUE 0.994 22.000 0.171 0.010 Y 0.452
 393059 393058 Dde_0380 Dde_0381 flhA   TRUE 0.996 0.000 0.440 1.000 Y -0.255
 393058 393057 Dde_0381 Dde_0382   minD TRUE 0.814 65.000 0.241 1.000 N -0.734
 393057 3333988 Dde_0382 Dde_0383 minD   TRUE 0.985 -43.000 0.058 1.000 N 0.776
 3333988 393055 Dde_0383 Dde_0384   cheY TRUE 0.984 19.000 0.041 0.091 N 0.713
 393055 393054 Dde_0384 Dde_0385 cheY   TRUE 0.767 51.000 0.000 1.000   0.915
 393054 393053 Dde_0385 Dde_0386     TRUE 0.963 2.000 0.000 NA   0.930
 393053 393052 Dde_0386 Dde_0387     TRUE 0.715 101.000 0.182 NA   -0.236
 393052 393051 Dde_0387 Dde_0388     TRUE 0.871 101.000 0.364 NA   0.271
 393051 393050 Dde_0388 Dde_0389     TRUE 0.968 18.000 0.002 NA   0.876
 393050 393049 Dde_0389 Dde_0390   ispH TRUE 0.845 -9.000 0.011 1.000 N -0.460
 393049 393048 Dde_0390 Dde_0391 ispH cheV-4 TRUE 0.953 43.000 0.208 1.000 N 0.578
 405365 393047 Dde_0392 Dde_0393     FALSE 0.025 206.000 0.000 NA   0.258
 393047 393046 Dde_0393 Dde_0394     FALSE 0.053 131.000 0.000 1.000   0.056
 393045 393044 Dde_0395 Dde_0396     TRUE 0.976 63.000 0.087 0.046 Y 0.881
 393044 3333990 Dde_0396 Dde_0398     FALSE 0.047 657.000 0.000 1.000 Y 0.851
 3333990 393042 Dde_0398 Dde_0399   ilvH TRUE 0.999 -25.000 0.649 0.003   0.821
 393041 393040 Dde_0400 Dde_0401   acrB TRUE 0.993 -10.000 0.103 0.046 N 0.760
 393040 393039 Dde_0401 Dde_0402 acrB acrE TRUE 0.999 4.000 0.842 1.000 N 0.740
 393039 393038 Dde_0402 Dde_0403 acrE   TRUE 0.759 47.000 0.000 1.000 N 0.927
 393038 393037 Dde_0403 Dde_0404     FALSE 0.003 191.000 0.000 NA   -0.859
 393036 393035 Dde_0407 Dde_0408     TRUE 0.995 -3.000 0.250 1.000 N 0.734
 393035 393034 Dde_0408 Dde_0409   glpF TRUE 0.877 82.000 0.087 1.000 N 0.768
 393034 393033 Dde_0409 Dde_0410 glpF glpK TRUE 0.910 31.000 0.044 1.000 N 0.290
 393032 393031 Dde_0411 Dde_0412     TRUE 0.981 66.000 0.626 NA Y 0.377
 393030 3333993 Dde_0413 Dde_0414 tesA   FALSE 0.002 761.000 0.000 1.000   0.122
 393028 393027 Dde_0415 Dde_0416     TRUE 0.964 9.000 0.000 1.000   0.973
 393027 393026 Dde_0416 Dde_0417   gabT TRUE 0.956 10.000 0.000 1.000 N 0.959
 393026 393025 Dde_0417 Dde_0418 gabT   FALSE 0.475 80.000 0.000 1.000 N 0.723
 393025 393024 Dde_0418 Dde_0419     TRUE 0.982 -3.000 0.032 NA   0.631
 393024 393023 Dde_0419 Dde_0420     TRUE 0.869 -3.000 0.000 NA   0.514
 393023 393022 Dde_0420 Dde_0421     TRUE 0.524 -3.000 0.000 NA   0.014
 393022 393021 Dde_0421 Dde_0422     TRUE 0.880 -13.000 0.000 1.000   0.608
 393021 393020 Dde_0422 Dde_0423     TRUE 0.845 -7.000 0.000 1.000   0.476
 393019 393018 Dde_0425 Dde_0426     TRUE 0.787 47.000 0.000 NA   0.924
 393018 3333995 Dde_0426 Dde_0427     TRUE 0.963 0.000 0.000 NA   0.927
 3333995 393016 Dde_0427 Dde_0428     TRUE 0.874 47.000 0.000 1.000 Y 0.764
 393016 3333996 Dde_0428 Dde_0429     FALSE 0.270 36.000 0.000 1.000   0.043
 3333996 393014 Dde_0429 Dde_0430     TRUE 0.897 -3.000 0.000 1.000   0.583
 393014 393013 Dde_0430 Dde_0431     TRUE 0.723 40.000 0.000 1.000 Y 0.178
 393012 393011 Dde_0432 Dde_0434 gmd   FALSE 0.001 285.000 0.000 1.000 N -0.708
 393010 393009 Dde_0435 Dde_0436 ugpQ corA FALSE 0.008 141.000 0.000 1.000 N 0.006
 393007 393006 Dde_0438 Dde_0439     TRUE 0.936 40.000 0.083 NA Y -0.179
 393006 393005 Dde_0439 Dde_0441     FALSE 0.028 118.000 0.000 1.000   -0.104
 393005 393004 Dde_0441 Dde_0444   pqqL FALSE 0.000 768.000 0.000 1.000   -0.379
 393004 393003 Dde_0444 Dde_0445 pqqL   TRUE 0.993 8.000 0.047 1.000   0.958
 393003 393002 Dde_0445 Dde_0446     TRUE 0.807 124.000 0.047 NA   0.892
 393002 393001 Dde_0446 Dde_0447     TRUE 0.518 99.000 0.000 NA   0.984
 393001 3334001 Dde_0447 Dde_0448     TRUE 0.948 128.000 0.333 0.046   0.972
 3334001 392999 Dde_0448 Dde_0449     TRUE 0.999 3.000 0.833 0.046   0.980
 392999 392998 Dde_0449 Dde_0450   oppC TRUE 0.998 -7.000 0.300 0.046   0.982
 392998 392997 Dde_0450 Dde_0451 oppC   TRUE 0.996 -3.000 0.200 1.000   0.980
 392997 3334002 Dde_0451 Dde_0452     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   0.988
 3334002 3334003 Dde_0452 Dde_0453     TRUE 0.960 0.000 0.000 NA   0.970
 3334003 3334004 Dde_0453 Dde_0454     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.009 Y 0.985
 3334004 392993 Dde_0454 Dde_0455     TRUE 0.998 -3.000 0.154 0.061 Y 0.914
 392993 3334005 Dde_0455 Dde_0456     TRUE 0.995 -3.000 0.154 1.000   0.947
 3334005 392991 Dde_0456 Dde_0457     TRUE 0.943 18.000 0.000 1.000   0.972
 392990 392989 Dde_0458 Dde_0459     FALSE 0.165 162.000 0.000 1.000 Y 0.038
 392988 3334007 Dde_0461 Dde_0462 nhaC   TRUE 0.997 35.000 1.000 1.000 N 0.963
 3334007 392986 Dde_0462 Dde_0463     TRUE 0.948 71.000 0.750 1.000 N -0.104
 392986 392985 Dde_0463 Dde_0464     TRUE 0.537 90.000 0.030 1.000   -0.227
 392985 392984 Dde_0464 Dde_0465   trxB TRUE 0.969 32.000 0.030 1.000   0.945
 392984 3334008 Dde_0465 Dde_0466 trxB   TRUE 0.974 38.000 0.667 NA   -0.871
 3334008 392982 Dde_0466 Dde_0467     TRUE 0.707 -3.000 0.000 NA   0.197
 392982 392981 Dde_0467 Dde_0468     TRUE 0.942 89.000 0.400 NA Y 0.171
 392981 3334012 Dde_0468 Dde_0473     FALSE 0.020 699.000 0.000 NA   0.952
 3334012 392978 Dde_0473 Dde_0474   fhcB TRUE 0.968 -15.000 0.000 0.007   0.979
 392978 392977 Dde_0474 Dde_0475 fhcB fhcC TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.042   0.973
 392977 392976 Dde_0475 Dde_0476 fhcC fhcD TRUE 0.999 11.000 0.417 0.042   0.972
 392976 3334013 Dde_0476 Dde_0477 fhcD   FALSE 0.034 217.000 0.000 1.000 N 0.498
 3334015 392972 Dde_0480 Dde_0481     TRUE 0.973 -7.000 0.000 NA Y 0.746
 392972 392971 Dde_0481 Dde_0483     FALSE 0.004 603.000 0.000 1.000   0.281
 392971 392970 Dde_0483 Dde_0484     TRUE 0.997 10.000 0.297 NA   0.870
 392970 392969 Dde_0484 Dde_0485     TRUE 0.997 11.000 0.250 NA   0.886
 392968 392967 Dde_0486 Dde_0487     FALSE 0.089 161.000 0.000 NA   NA
 405364 3334017 Dde_0488 Dde_0489     TRUE 0.580 89.000 0.000 NA   0.924
 3334017 392965 Dde_0489 Dde_0490     TRUE 0.963 1.000 0.000 NA   0.935
 392965 3334018 Dde_0490 Dde_0491     TRUE 0.930 21.000 0.000 NA   0.959
 3334018 392963 Dde_0491 Dde_0492     TRUE 0.998 -3.000 0.600 NA   0.979
 392963 392962 Dde_0492 Dde_0493     TRUE 0.958 13.000 0.000 NA   0.893
 392962 392961 Dde_0493 Dde_0494     TRUE 0.962 5.000 0.000 NA   0.857
 392961 392960 Dde_0494 Dde_0495     TRUE 0.990 7.000 0.033 NA   0.795
 392960 392959 Dde_0495 Dde_0496     TRUE 0.957 -3.000 0.022 1.000   0.096
 392959 392958 Dde_0496 Dde_0497   fur2 FALSE 0.239 178.000 0.000 1.000   0.965
 392958 392957 Dde_0497 Dde_0498 fur2   TRUE 0.964 3.000 0.000 1.000   0.944
 392956 392955 Dde_0499 Dde_0500     FALSE 0.035 343.000 0.000 NA   0.708
 392955 392954 Dde_0500 Dde_0501     TRUE 0.997 -7.000 0.379 NA   0.933
 392954 392953 Dde_0501 Dde_0502   glmS FALSE 0.024 498.000 0.000 NA   0.792
 392953 392952 Dde_0502 Dde_0503 glmS   FALSE 0.011 105.000 0.000 NA   -0.669
 392952 392951 Dde_0503 Dde_0504   rdgB FALSE 0.013 99.000 0.000 NA   -0.889
 392951 392950 Dde_0504 Dde_0505 rdgB   TRUE 0.912 34.000 0.004 1.000 N 0.930
 392949 392948 Dde_0506 Dde_0507   rpsA TRUE 0.669 94.000 0.007 1.000 Y 0.331
 392948 3334019 Dde_0507 Dde_0508 rpsA   TRUE 0.937 -16.000 0.057 1.000 N -0.505
 3334019 392946 Dde_0508 Dde_0510   malQ FALSE 0.037 374.000 0.000 1.000 N 0.857
 392946 392945 Dde_0510 Dde_0511 malQ   TRUE 0.976 17.000 0.000 1.000 Y 0.878
 392943 392942 Dde_0513 Dde_0514   ung TRUE 0.953 38.000 0.036 1.000 N 0.950
 392939 392938 Dde_0518 Dde_0519   rlpA FALSE 0.371 130.000 0.000 NA N 0.823
 392938 392937 Dde_0519 Dde_0520 rlpA   FALSE 0.252 205.000 0.010 NA N 0.728
 392937 392936 Dde_0520 Dde_0521     TRUE 0.992 -3.000 0.200 1.000   0.566
 392936 392935 Dde_0521 Dde_0523     FALSE 0.001 283.000 0.000 NA   -0.350
 392935 392934 Dde_0523 Dde_0524     TRUE 0.619 133.000 0.150 NA   -0.138
 392933 392932 Dde_0526 Dde_0527 dsrA dsrB TRUE 0.999 22.000 0.879 0.002 Y 0.801
 392932 392931 Dde_0527 Dde_0528 dsrB dsrD TRUE 0.559 67.000 0.000 0.002   0.434
 392931 3334024 Dde_0528 Dde_0529 dsrD   FALSE 0.013 99.000 0.000 1.000   -0.942
 3334025 392927 Dde_0531 Dde_0532     FALSE 0.010 115.000 0.000 NA   -0.385
 392923 10942586 Dde_0536 Dde_4002     FALSE 0.296 147.000 0.006 NA   NA
 10942586 392921 Dde_4002 Dde_0537   rne TRUE 0.976 3.000 0.032 NA   NA
 392921 392920 Dde_0537 Dde_0538 rne   TRUE 0.882 64.000 0.026 1.000 N 0.963
 392919 392918 Dde_0539 Dde_0540     FALSE 0.067 217.000 0.000 1.000 N 0.662
 392918 392917 Dde_0540 Dde_0541     TRUE 0.983 -9.000 0.048 1.000   0.641
 392917 392916 Dde_0541 Dde_0542   mutM FALSE 0.029 285.000 0.007 1.000   -0.320
 392916 392915 Dde_0542 Dde_0543 mutM mviN TRUE 0.973 15.000 0.003 1.000   0.832
 392915 392914 Dde_0543 Dde_0544 mviN barA TRUE 0.504 107.000 0.000 1.000   0.958
 392914 392913 Dde_0544 Dde_0546 barA murA FALSE 0.000 493.000 0.000 1.000 N -0.380
 392913 392912 Dde_0546 Dde_0547 murA   FALSE 0.354 73.000 0.008 1.000   -0.462
 392911 392910 Dde_0548 Dde_0549     TRUE 0.996 -13.000 0.449 NA N 0.766
 392906 392905 Dde_0552 Dde_0553     FALSE 0.086 109.000 0.000 NA   0.183
 392902 392901 Dde_0556 Dde_0557     TRUE 0.997 19.000 0.500 1.000   0.915
 392899 392898 Dde_0560 Dde_0561 ftsY   FALSE 0.000 438.000 0.000 1.000   -0.468
 392897 392896 Dde_0563 Dde_0564     TRUE 0.997 6.000 0.250 NA   0.975
 392896 392895 Dde_0564 Dde_0565     TRUE 0.837 83.000 0.300 NA   -0.261
 392895 392894 Dde_0565 Dde_0566     FALSE 0.368 153.000 0.051 1.000 N -0.008
 392894 392893 Dde_0566 Dde_0567   trk1 TRUE 0.992 15.000 0.270 1.000 Y -0.516
 392890 392889 Dde_0571 Dde_0572 speA   TRUE 0.958 40.000 0.052 1.000 Y 0.505
 392889 3334032 Dde_0572 Dde_0573     TRUE 0.997 -27.000 0.444 1.000 Y 0.499
 3334032 392887 Dde_0573 Dde_0574   speB TRUE 0.933 63.000 0.035 1.000 Y 0.686
 392886 392885 Dde_0575 Dde_0576 cheW-1   FALSE 0.139 121.000 0.000 NA   0.377
 392885 392884 Dde_0576 Dde_0577   lemA TRUE 0.612 114.000 0.074 NA   0.174
 3334034 3334035 Dde_0579 Dde_0580     FALSE 0.003 185.000 0.000 NA   -0.742
 3334035 392882 Dde_0580 Dde_0581     TRUE 0.999 0.000 0.556 0.041   0.940
 392882 392881 Dde_0581 Dde_0582     TRUE 0.999 18.000 0.571 0.076 Y 0.882
 392881 392880 Dde_0582 Dde_0583     TRUE 0.996 4.000 0.119 0.076 Y 0.519
 392880 392879 Dde_0583 Dde_0584   nqr4 TRUE 0.974 62.000 0.167 0.076 Y 0.667
 392879 392878 Dde_0584 Dde_0585 nqr4 b1627 TRUE 0.998 13.000 0.135 0.076 Y 0.764
 392878 392877 Dde_0585 Dde_0586 b1627   TRUE 0.963 76.000 0.055 0.076 Y 0.912
 392877 392876 Dde_0586 Dde_0587     TRUE 0.908 61.000 0.043 1.000 N 0.861
 392876 392875 Dde_0587 Dde_0589     FALSE 0.042 342.000 0.000 1.000 N 0.826
 392875 392874 Dde_0589 Dde_0590   cls FALSE 0.133 195.000 0.042 1.000 N -0.691
 392874 3334037 Dde_0590 Dde_0591 cls   FALSE 0.377 200.000 0.028 NA   0.698
 3334037 392872 Dde_0591 Dde_0592     FALSE 0.112 176.000 0.000 NA   0.609
 392872 392871 Dde_0592 Dde_0593     TRUE 0.996 15.000 0.025 0.024 Y 0.946
 3334040 3334041 Dde_0597 Dde_0598     TRUE 0.928 71.000 0.107 NA   0.841
 3334041 392867 Dde_0598 Dde_0600     FALSE 0.348 327.000 0.536 NA   0.204
 392867 392866 Dde_0600 Dde_0601     TRUE 0.897 84.000 0.333 NA   0.337
 392866 392865 Dde_0601 Dde_0602     TRUE 0.999 -3.000 0.867 1.000 N 0.831
 392865 3334043 Dde_0602 Dde_0603     TRUE 0.692 184.000 0.400 0.048   0.047
 3334043 392863 Dde_0603 Dde_0604     TRUE 0.939 44.000 0.286 1.000   -0.079
 392863 392862 Dde_0604 Dde_0605     TRUE 0.998 -3.000 0.611 1.000   0.737
 392862 392861 Dde_0605 Dde_0607     FALSE 0.002 218.000 0.000 NA   -0.433
 392860 392859 Dde_0608 Dde_0609 livF livG TRUE 0.997 -7.000 0.381 0.022 Y -0.183
 392859 392858 Dde_0609 Dde_0610 livG livM TRUE 0.991 40.000 0.381 1.000 Y 0.653
 392858 392857 Dde_0610 Dde_0611 livM livH TRUE 0.998 51.000 0.882 0.045 Y 0.962
 392857 392856 Dde_0611 Dde_0612 livH livK TRUE 0.934 124.000 0.667 1.000 Y -0.463
 392856 392855 Dde_0612 Dde_0618 livK   FALSE 0.002 1729.000 0.000 1.000 N NA
 392850 3334053 Dde_0625 Dde_0624     FALSE 0.306 67.000 0.000 NA   NA
 392849 392848 Dde_0626 Dde_0628 glnS   FALSE 0.004 172.000 0.000 1.000 N -0.125
 392848 392847 Dde_0628 Dde_0629     TRUE 0.982 49.000 0.375 1.000 N 0.927
 392847 392846 Dde_0629 Dde_0630     TRUE 0.765 102.000 0.013 1.000   0.906
 392846 392845 Dde_0630 Dde_0631     TRUE 0.999 13.000 0.916 NA   0.748
 392844 392843 Dde_0634 Dde_0635     TRUE 0.968 88.000 0.818 NA   0.518
 392843 392842 Dde_0635 Dde_0636     TRUE 0.999 2.000 0.889 NA   0.728
 392842 3334057 Dde_0636 Dde_0637     FALSE 0.296 127.000 0.000 NA Y 0.164
 392840 392839 Dde_0638 Dde_0639     TRUE 0.985 30.000 0.130 NA   0.946
 392838 392837 Dde_0640 Dde_0641 maf pgpA TRUE 0.830 66.000 0.013 NA N 0.969
 392835 392834 Dde_0643 Dde_0644     TRUE 0.922 -3.000 0.000 1.000 Y 0.135
 392834 392833 Dde_0644 Dde_0645     FALSE 0.003 182.000 0.000 1.000   -0.647
 392832 392831 Dde_0647 Dde_0648 rrf2 hmcF FALSE 0.280 84.000 0.000 NA N 0.589
 392831 392830 Dde_0648 Dde_0649 hmcF hmcE TRUE 0.998 26.000 1.000 NA   0.870
 392830 405363 Dde_0649 Dde_0650 hmcE hmcD TRUE 0.993 43.000 0.692 NA   0.827
 405363 392829 Dde_0650 Dde_0651 hmcD hmcC TRUE 0.994 23.000 0.333 NA   0.774
 392829 392828 Dde_0651 Dde_0652 hmcC hmcB TRUE 1.000 1.000 0.778 NA Y 0.925
 392828 392827 Dde_0652 Dde_0653 hmcB hmcA TRUE 0.997 24.000 0.455 0.041   0.962
 392825 392824 Dde_0656 Dde_0657     TRUE 0.991 -7.000 0.071 NA   0.795
 392822 11399271 Dde_0661 Dde_4013     FALSE 0.223 91.000 0.000 NA   NA
 3334064 3334065 Dde_0664 Dde_0665     FALSE 0.009 132.000 0.000 NA   -0.182
 3334065 395954 Dde_0665 Dde_0667     FALSE 0.021 532.000 0.000 NA   0.758
 395953 395952 Dde_0668 Dde_0669 bcr   FALSE 0.467 22.000 0.000 1.000 N 0.247
 395952 395951 Dde_0669 Dde_0670     FALSE 0.317 151.000 0.000 NA N 0.904
 395951 395950 Dde_0670 Dde_0671     TRUE 0.989 -3.000 0.276 NA N 0.198
 395949 395948 Dde_0673 Dde_0674 proV proW TRUE 0.998 0.000 0.125 0.001 Y 0.789
 395948 395947 Dde_0674 Dde_0675 proW   TRUE 0.962 99.000 0.526 0.060 Y 0.123
 395944 395943 Dde_0678 Dde_0679     TRUE 0.568 57.000 0.000 NA Y 0.142
 395943 395942 Dde_0679 Dde_0680   fdoI TRUE 0.910 64.000 0.250 NA N 0.484
 395942 395941 Dde_0680 Dde_0681 fdoI   TRUE 0.999 10.000 0.455 0.076 Y 0.671
 395941 395940 Dde_0681 Dde_0682     TRUE 0.999 -3.000 0.455 0.076 Y 0.910
 395940 395939 Dde_0682 Dde_0683     TRUE 0.897 85.000 0.211 0.076   0.402
 395938 395937 Dde_0685 Dde_0689     FALSE 0.000 1626.000 0.000 NA   -0.338
 395937 3334073 Dde_0689 Dde_0691     FALSE 0.001 371.000 0.000 NA   -0.083
 395935 395934 Dde_0692 Dde_0693     TRUE 0.951 13.000 0.000 1.000 N 0.890
 395934 395933 Dde_0693 Dde_0694   cheYI TRUE 0.899 26.000 0.000 1.000 N 0.959
 395933 395932 Dde_0694 Dde_0695 cheYI   FALSE 0.379 220.000 0.000 0.035 Y 0.905
 395932 395931 Dde_0695 Dde_0696   cckA TRUE 0.977 -3.000 0.000 1.000 Y 0.740
 395929 395928 Dde_0698 Dde_0699     TRUE 0.997 -3.000 0.671 1.000 N 0.597
 395928 395927 Dde_0699 Dde_0700     TRUE 0.998 4.000 0.752 1.000 Y -0.309
 395926 395925 Dde_0701 Dde_0702     TRUE 0.996 14.000 0.064 1.000 Y 0.961
 395924 395923 Dde_0703 Dde_0704     FALSE 0.234 172.000 0.000 1.000 N 0.910
 395922 395921 Dde_0706 Dde_0707     TRUE 0.993 3.000 0.261 NA N 0.564
 395921 395920 Dde_0707 Dde_0708     TRUE 0.998 0.000 0.600 1.000 N 0.777
 395920 395919 Dde_0708 Dde_0709   moaA TRUE 0.997 -3.000 0.032 0.004 Y 0.828
 395918 395917 Dde_0710 Dde_0711     TRUE 0.873 155.000 0.357 0.089 Y -0.038
 395917 395916 Dde_0711 Dde_0712     TRUE 0.999 -3.000 0.786 NA N 0.962
 395915 395914 Dde_0713 Dde_0714     TRUE 0.954 58.000 0.286 1.000   0.634
 395914 3334075 Dde_0714 Dde_0715     FALSE 0.004 175.000 0.000 NA   -0.773
 3334075 3334077 Dde_0715 Dde_0717     TRUE 0.998 26.000 1.000 NA   0.951
 3334077 395910 Dde_0717 Dde_0718   , TRUE 0.999 13.000 0.600 0.007 Y 0.988
 395910 3334078 Dde_0718 Dde_0719 ,   FALSE 0.069 345.000 0.000 0.042 N 0.961
 395908 395907 Dde_0720 Dde_0721 rsbV   TRUE 0.925 -3.000 0.000 1.000 Y 0.165
 395906 395905 Dde_0722 Dde_0723     TRUE 0.671 -25.000 0.000 NA   0.250
 395905 395904 Dde_0723 Dde_0725     FALSE 0.025 281.000 0.000 NA   0.502
 395904 395903 Dde_0725 Dde_0727     FALSE 0.004 606.000 0.000 1.000   0.322
 395902 395901 Dde_0728 Dde_0729     TRUE 0.999 10.000 0.769 NA   0.969
 395901 395900 Dde_0729 Dde_0730     TRUE 0.999 -3.000 0.923 NA   0.971
 395900 395899 Dde_0730 Dde_0731     TRUE 0.999 16.000 0.857 1.000 Y 0.793
 395899 395898 Dde_0731 Dde_0732     TRUE 0.959 -3.000 0.000 NA   0.904
 395898 395897 Dde_0732 Dde_0733     FALSE 0.017 80.000 0.000 NA   -0.163
 395897 395896 Dde_0733 Dde_0734     TRUE 0.718 56.000 0.020 NA   0.150
 395896 395895 Dde_0734 Dde_0735     TRUE 0.994 -3.000 0.081 0.015   0.695
 395895 395894 Dde_0735 Dde_0736   gpmB TRUE 0.997 10.000 0.328 1.000   0.757
 395894 395893 Dde_0736 Dde_0737 gpmB   TRUE 0.996 -3.000 0.276 1.000 N 0.890
 395893 395892 Dde_0737 Dde_0738   wcaL TRUE 0.999 21.000 0.477 0.024 Y 0.904
 395892 395891 Dde_0738 Dde_0739 wcaL   TRUE 0.997 -3.000 0.614 1.000   0.435
 395891 395890 Dde_0739 Dde_0740     TRUE 0.975 17.000 0.053 1.000   0.468
 395890 395889 Dde_0740 Dde_0741     FALSE 0.041 214.000 0.000 1.000   NA
 395888 3334083 Dde_0743 Dde_0746     FALSE 0.018 79.000 0.000 NA   -0.865
 3334083 3334082 Dde_0746 Dde_0745     FALSE 0.390 56.000 0.000 1.000   NA
 3334082 3334084 Dde_0745 Dde_0747     FALSE 0.002 1336.000 0.000 1.000 N NA
 3334084 395883 Dde_0747 Dde_0748     FALSE 0.276 46.000 0.000 NA   0.188
 395883 395882 Dde_0748 Dde_0749   uxuR TRUE 0.839 37.000 0.031 NA   -0.049
 395882 395881 Dde_0749 Dde_0750 uxuR lldD FALSE 0.205 228.000 0.125 1.000 N -0.210
 395881 395880 Dde_0750 Dde_0751 lldD   TRUE 0.734 64.000 0.060 1.000   -0.197
 395880 3334085 Dde_0751 Dde_0752     FALSE 0.161 123.000 0.000 NA   0.440
 395877 395876 Dde_0754 Dde_0755     TRUE 0.947 -10.000 0.000 NA   0.979
 395875 395874 Dde_0756 Dde_0757     FALSE 0.089 161.000 0.000 NA   NA
 3334086 395872 Dde_0758 Dde_0759     TRUE 0.963 2.000 0.000 1.000   0.962
 395872 3334087 Dde_0759 Dde_0760     TRUE 0.807 -3.000 0.000 1.000   0.346
 3334087 395870 Dde_0760 Dde_0761     FALSE 0.013 215.000 0.000 NA   0.102
 395869 395868 Dde_0762 Dde_0765 dsrC   FALSE 0.029 523.000 0.000 1.000   0.948
 395866 395865 Dde_0767 Dde_0768     TRUE 0.893 15.000 0.000 NA   0.626
 395865 395864 Dde_0768 Dde_0769     TRUE 0.948 -13.000 0.000 NA   0.885
 395864 395863 Dde_0769 Dde_0770     TRUE 0.996 18.000 0.333 NA   0.918
 395861 395860 Dde_0773 Dde_0774   cheY TRUE 0.518 105.000 0.000 1.000   0.905
 395860 11399272 Dde_0774 Dde_4014 cheY   FALSE 0.003 1411.000 0.000 NA   NA
 3334095 3334096 Dde_0779 Dde_0780     TRUE 0.961 10.000 0.000 NA   0.983
 3334096 3334097 Dde_0780 Dde_0781     TRUE 0.998 -3.000 0.407 NA   0.986
 395858 395857 Dde_0784 Dde_0785     TRUE 0.985 -3.000 0.016 1.000   0.782
 395857 395856 Dde_0785 Dde_0786     FALSE 0.179 285.000 0.010 1.000   0.823
 395856 395855 Dde_0786 Dde_0787     TRUE 0.983 13.000 0.017 1.000   0.729
 3334100 395853 Dde_0788 Dde_0789     TRUE 0.954 14.000 0.000 1.000   0.848
 395853 395851 Dde_0789 Dde_0791     FALSE 0.040 401.000 0.000 NA   0.879
 395851 3334102 Dde_0791 Dde_0792     FALSE 0.079 100.000 0.000 NA   0.118
 395849 395848 Dde_0793 Dde_0795     FALSE 0.001 340.000 0.000 NA   -0.692
 395848 395847 Dde_0795 Dde_0796     FALSE 0.449 60.000 0.010 NA   -0.504
 395847 395846 Dde_0796 Dde_0797     TRUE 0.993 -3.000 0.170 NA   0.707
 395846 395845 Dde_0797 Dde_0798     TRUE 0.996 -3.000 0.144 0.042 Y 0.545
 395843 395842 Dde_0800 Dde_0801   cobM FALSE 0.150 159.000 0.004 1.000   0.002
 395842 395841 Dde_0801 Dde_0802 cobM   TRUE 0.819 2.000 0.004 1.000 N -0.336
 395841 395840 Dde_0802 Dde_0803   cobL TRUE 0.984 4.000 0.012 1.000 N 0.899
 395840 395839 Dde_0803 Dde_0804 cobL cbiD TRUE 0.979 66.000 0.107 0.012 Y 0.936
 3334105 395837 Dde_0805 Dde_0806     TRUE 0.972 53.000 0.226 1.000   0.928
 395836 395835 Dde_0807 Dde_0808     TRUE 0.939 50.000 0.043 NA   0.887
 395835 395834 Dde_0808 Dde_0809     TRUE 0.785 37.000 0.000 NA N 0.790
 395834 395833 Dde_0809 Dde_0810     FALSE 0.129 236.000 0.000 NA   0.956
 395833 395832 Dde_0810 Dde_0811   pepP FALSE 0.006 215.000 0.000 NA   -0.043
 395832 395831 Dde_0811 Dde_0812 pepP fdoH FALSE 0.042 162.000 0.000 1.000 N 0.329
 395831 395830 Dde_0812 Dde_0813 fdoH fdnG TRUE 0.988 13.000 0.000 0.006 Y 0.841
 395830 405447 Dde_0813 Dde_0814 fdnG   TRUE 0.870 27.000 0.000 NA   0.721
 395827 395826 Dde_0818 Dde_0819     TRUE 0.552 45.000 0.000 NA   0.537
 395826 395825 Dde_0819 Dde_0820     FALSE 0.003 343.000 0.000 1.000   -0.036
 395822 395821 Dde_0823 Dde_0824     FALSE 0.125 159.000 0.000 NA   0.525
 395821 395820 Dde_0824 Dde_0825     TRUE 0.990 -3.000 0.061 NA   0.727
 395820 395819 Dde_0825 Dde_0826     TRUE 0.999 -3.000 0.429 1.000 Y 0.840
 395819 395818 Dde_0826 Dde_0827     TRUE 0.998 22.000 0.714 0.022   0.797
 395817 395816 Dde_0828 Dde_0829   pss TRUE 0.973 19.000 0.138 1.000 N 0.217
 395816 395815 Dde_0829 Dde_0830 pss   TRUE 0.993 0.000 0.169 1.000 Y 0.178
 395815 395814 Dde_0830 Dde_0831     TRUE 0.997 19.000 0.217 1.000 Y 0.924
 395814 395813 Dde_0831 Dde_0832     TRUE 0.804 98.000 0.217 1.000 N 0.301
 395813 395812 Dde_0832 Dde_0833   exeA TRUE 0.984 30.000 0.220 1.000 N 0.730
 395812 3334109 Dde_0833 Dde_0834 exeA   FALSE 0.366 146.000 0.040 NA   -0.255
 3334109 395810 Dde_0834 Dde_0835     FALSE 0.031 55.000 0.000 NA   -0.637
 395810 395809 Dde_0835 Dde_0836   capK TRUE 0.843 -7.000 0.000 1.000   0.471
 395809 395808 Dde_0836 Dde_0837 capK   TRUE 0.932 4.000 0.000 NA N 0.716
 395808 3334110 Dde_0837 Dde_0838     TRUE 0.974 -3.000 0.000 NA Y 0.718
 3334110 395806 Dde_0838 Dde_0839     TRUE 0.997 0.000 0.120 0.024 Y 0.585
 395806 3334111 Dde_0839 Dde_0840     TRUE 0.881 3.000 0.000 NA   0.514
 3334111 395804 Dde_0840 Dde_0841     TRUE 0.702 26.000 0.000 NA   0.438
 395804 395803 Dde_0841 Dde_0842     TRUE 0.832 27.000 0.000 1.000   0.654
 395803 3334112 Dde_0842 Dde_0843     TRUE 0.959 -3.000 0.000 NA   0.932
 3334112 3334113 Dde_0843 Dde_0844     TRUE 0.495 107.000 0.000 NA   0.958
 3334113 395800 Dde_0844 Dde_0845     TRUE 0.946 -10.000 0.000 NA   0.983
 395800 395799 Dde_0845 Dde_0846     TRUE 0.975 -13.000 0.000 NA Y 0.979
 395799 395798 Dde_0846 Dde_0847     TRUE 0.811 16.000 0.000 1.000   0.421
 395798 395797 Dde_0847 Dde_0848     TRUE 0.989 -10.000 0.250 NA   0.376
 395797 395796 Dde_0848 Dde_0849     TRUE 0.922 30.000 0.053 NA   0.143
 395796 395795 Dde_0849 Dde_0850     TRUE 0.986 74.000 0.693 1.000 Y 0.603
 395795 395794 Dde_0850 Dde_0851     TRUE 0.493 100.000 0.000 1.000 N 0.944
 11521314 395795   Dde_0850     FALSE NA 1771.000 0.000 NA   NA
 11663677 395795   Dde_0850     FALSE NA 1771.000 0.000 NA   NA
 11806069 395795   Dde_0850     FALSE NA 1771.000 0.000 NA   NA
 11521315 395795   Dde_0850     FALSE NA 1800.000 0.000 NA   NA
 11663678 395795   Dde_0850     FALSE NA 1800.000 0.000 NA   NA
 11806070 395795   Dde_0850     FALSE NA 1800.000 0.000 NA   NA
 11521316 395795   Dde_0850     FALSE NA 1832.000 0.000 NA   NA
 11663679 395795   Dde_0850     FALSE NA 1832.000 0.000 NA   NA
 11806071 395795   Dde_0850     FALSE NA 1832.000 0.000 NA   NA
 11521317 395795   Dde_0850     FALSE NA 1861.000 0.000 NA   NA
 11663680 395795   Dde_0850     FALSE NA 1861.000 0.000 NA   NA
 11806072 395795   Dde_0850     FALSE NA 1861.000 0.000 NA   NA
 11521318 395795   Dde_0850     FALSE NA 1893.000 0.000 NA   NA
 11663681 395795   Dde_0850     FALSE NA 1893.000 0.000 NA   NA
 11806073 395795   Dde_0850     FALSE NA 1893.000 0.000 NA   NA
 11521319 395795   Dde_0850     FALSE NA 1922.000 0.000 NA   NA
 11663682 395795   Dde_0850     FALSE NA 1922.000 0.000 NA   NA
 11806074 395795   Dde_0850     FALSE NA 1922.000 0.000 NA   NA
 11521320 395795   Dde_0850     FALSE NA 1954.000 0.000 NA   NA
 11663683 395795   Dde_0850     FALSE NA 1954.000 0.000 NA   NA
 11806075 395795   Dde_0850     FALSE NA 1954.000 0.000 NA   NA
 11521321 395795   Dde_0850     FALSE NA 1983.000 0.000 NA   NA
 11663684 395795   Dde_0850     FALSE NA 1983.000 0.000 NA   NA
 11806076 395795   Dde_0850     FALSE NA 1983.000 0.000 NA   NA
 11521322 395795   Dde_0850     FALSE NA 2015.000 0.000 NA   NA
 11663685 395795   Dde_0850     FALSE NA 2015.000 0.000 NA   NA
 11806077 395795   Dde_0850     FALSE NA 2015.000 0.000 NA   NA
 11521323 395795   Dde_0850     FALSE NA 2044.000 0.000 NA   NA
 11663686 395795   Dde_0850     FALSE NA 2044.000 0.000 NA   NA
 11806078 395795   Dde_0850     FALSE NA 2044.000 0.000 NA   NA
 11521324 395795   Dde_0850     FALSE NA 2076.000 0.000 NA   NA
 11663687 395795   Dde_0850     FALSE NA 2076.000 0.000 NA   NA
 11806079 395795   Dde_0850     FALSE NA 2076.000 0.000 NA   NA
 11521325 395795   Dde_0850     FALSE NA 2105.000 0.000 NA   NA
 11663688 395795   Dde_0850     FALSE NA 2105.000 0.000 NA   NA
 11806080 395795   Dde_0850     FALSE NA 2105.000 0.000 NA   NA
 11521326 395795   Dde_0850     FALSE NA 2137.000 0.000 NA   NA
 11663689 395795   Dde_0850     FALSE NA 2137.000 0.000 NA   NA
 11806081 395795   Dde_0850     FALSE NA 2137.000 0.000 NA   NA
 11521327 395795   Dde_0850     FALSE NA 2166.000 0.000 NA   NA
 11663690 395795   Dde_0850     FALSE NA 2166.000 0.000 NA   NA
 11806082 395795   Dde_0850     FALSE NA 2166.000 0.000 NA   NA
 11521328 395795   Dde_0850     FALSE NA 2198.000 0.000 NA   NA
 11663691 395795   Dde_0850     FALSE NA 2198.000 0.000 NA   NA
 11806083 395795   Dde_0850     FALSE NA 2198.000 0.000 NA   NA
 11521329 395795   Dde_0850     FALSE NA 2227.000 0.000 NA   NA
 11663692 395795   Dde_0850     FALSE NA 2227.000 0.000 NA   NA
 11806084 395795   Dde_0850     FALSE NA 2227.000 0.000 NA   NA
 11521330 395795   Dde_0850     FALSE NA 2259.000 0.000 NA   NA
 11663693 395795   Dde_0850     FALSE NA 2259.000 0.000 NA   NA
 11806085 395795   Dde_0850     FALSE NA 2259.000 0.000 NA   NA
 11521331 395795   Dde_0850     FALSE NA 2288.000 0.000 NA   NA
 11663694 395795   Dde_0850     FALSE NA 2288.000 0.000 NA   NA
 11806086 395795   Dde_0850     FALSE NA 2288.000 0.000 NA   NA
 11521332 395795   Dde_0850     FALSE NA 2320.000 0.000 NA   NA
 11663695 395795   Dde_0850     FALSE NA 2320.000 0.000 NA   NA
 11806087 395795   Dde_0850     FALSE NA 2320.000 0.000 NA   NA
 11521333 395795   Dde_0850     FALSE NA 2349.000 0.000 NA   NA
 11663696 395795   Dde_0850     FALSE NA 2349.000 0.000 NA   NA
 11806088 395795   Dde_0850     FALSE NA 2349.000 0.000 NA   NA
 11521334 395795   Dde_0850     FALSE NA 2381.000 0.000 NA   NA
 11663697 395795   Dde_0850     FALSE NA 2381.000 0.000 NA   NA
 11806089 395795   Dde_0850     FALSE NA 2381.000 0.000 NA   NA
 11521335 395795   Dde_0850     FALSE NA 2410.000 0.000 NA   NA
 11663698 395795   Dde_0850     FALSE NA 2410.000 0.000 NA   NA
 11806090 395795   Dde_0850     FALSE NA 2410.000 0.000 NA   NA
 11521336 395795   Dde_0850     FALSE NA 2442.000 0.000 NA   NA
 11663699 395795   Dde_0850     FALSE NA 2442.000 0.000 NA   NA
 11806091 395795   Dde_0850     FALSE NA 2442.000 0.000 NA   NA
 11521337 395795   Dde_0850     FALSE NA 2471.000 0.000 NA   NA
 11663700 395795   Dde_0850     FALSE NA 2471.000 0.000 NA   NA
 11806092 395795   Dde_0850     FALSE NA 2471.000 0.000 NA   NA
 11521338 395795   Dde_0850     FALSE NA 2503.000 0.000 NA   NA
 11663701 395795   Dde_0850     FALSE NA 2503.000 0.000 NA   NA
 11806093 395795   Dde_0850     FALSE NA 2503.000 0.000 NA   NA
 11521339 395795   Dde_0850     FALSE NA 2532.000 0.000 NA   NA
 11663702 395795   Dde_0850     FALSE NA 2532.000 0.000 NA   NA
 11806094 395795   Dde_0850     FALSE NA 2532.000 0.000 NA   NA
 11521340 395795   Dde_0850     FALSE NA 2564.000 0.000 NA   NA
 11663703 395795   Dde_0850     FALSE NA 2564.000 0.000 NA   NA
 11806095 395795   Dde_0850     FALSE NA 2564.000 0.000 NA   NA
 11521341 395795   Dde_0850     FALSE NA 2593.000 0.000 NA   NA
 11663704 395795   Dde_0850     FALSE NA 2593.000 0.000 NA   NA
 11806096 395795   Dde_0850     FALSE NA 2593.000 0.000 NA   NA
 11521342 395795   Dde_0850     FALSE NA 2625.000 0.000 NA   NA
 11663705 395795   Dde_0850     FALSE NA 2625.000 0.000 NA   NA
 11806097 395795   Dde_0850     FALSE NA 2625.000 0.000 NA   NA
 11521343 395795   Dde_0850     FALSE NA 2654.000 0.000 NA   NA
 11663706 395795   Dde_0850     FALSE NA 2654.000 0.000 NA   NA
 11806098 395795   Dde_0850     FALSE NA 2654.000 0.000 NA   NA
 11521344 395795   Dde_0850     FALSE NA 2686.000 0.000 NA   NA
 11663707 395795   Dde_0850     FALSE NA 2686.000 0.000 NA   NA
 11806099 395795   Dde_0850     FALSE NA 2686.000 0.000 NA   NA
 11521345 395795   Dde_0850     FALSE NA 2715.000 0.000 NA   NA
 11663708 395795   Dde_0850     FALSE NA 2715.000 0.000 NA   NA
 11806100 395795   Dde_0850     FALSE NA 2715.000 0.000 NA   NA
 11521346 395795   Dde_0850     FALSE NA 2747.000 0.000 NA   NA
 11663709 395795   Dde_0850     FALSE NA 2747.000 0.000 NA   NA
 11806101 395795   Dde_0850     FALSE NA 2747.000 0.000 NA   NA
 11521347 395795   Dde_0850     FALSE NA 2776.000 0.000 NA   NA
 11663710 395795   Dde_0850     FALSE NA 2776.000 0.000 NA   NA
 11806102 395795   Dde_0850     FALSE NA 2776.000 0.000 NA   NA
 11521348 395795   Dde_0850     FALSE NA 2808.000 0.000 NA   NA
 11663711 395795   Dde_0850     FALSE NA 2808.000 0.000 NA   NA
 11806103 395795   Dde_0850     FALSE NA 2808.000 0.000 NA   NA
 11521349 395795   Dde_0850     FALSE NA 2837.000 0.000 NA   NA
 11663712 395795   Dde_0850     FALSE NA 2837.000 0.000 NA   NA
 11806104 395795   Dde_0850     FALSE NA 2837.000 0.000 NA   NA
 11521350 395795   Dde_0850     FALSE NA 2869.000 0.000 NA   NA
 11663713 395795   Dde_0850     FALSE NA 2869.000 0.000 NA   NA
 11806105 395795   Dde_0850     FALSE NA 2869.000 0.000 NA   NA
 11521351 395795   Dde_0850     FALSE NA 2898.000 0.000 NA   NA
 11663714 395795   Dde_0850     FALSE NA 2898.000 0.000 NA   NA
 11806106 395795   Dde_0850     FALSE NA 2898.000 0.000 NA   NA
 11521352 395795   Dde_0850     FALSE NA 2930.000 0.000 NA   NA
 11663715 395795   Dde_0850     FALSE NA 2930.000 0.000 NA   NA
 11806107 395795   Dde_0850     FALSE NA 2930.000 0.000 NA   NA
 395793 395792 Dde_0857 Dde_0858 cas2 cas1 TRUE 0.829 -19.000 0.000 NA   0.512
 395792 395791 Dde_0858 Dde_0860 cas1   FALSE 0.454 112.000 0.000 NA   0.819
 395791 395790 Dde_0860 Dde_0861     TRUE 0.996 -13.000 0.282 NA   0.932
 395790 395789 Dde_0861 Dde_0862     TRUE 0.999 5.000 0.780 NA   0.829
 395789 395788 Dde_0862 Dde_0863     TRUE 0.996 18.000 0.276 NA   0.916
 395788 395787 Dde_0863 Dde_0864     TRUE 0.997 -3.000 0.336 NA   0.899
 395787 395786 Dde_0864 Dde_0865     TRUE 0.799 99.000 0.263 NA   -0.068
 395784 395783 Dde_0868 Dde_0869     FALSE 0.026 219.000 0.000 1.000 N NA
 395783 395781 Dde_0869 Dde_0871     FALSE 0.149 100.000 0.000 1.000 N NA
 3334120 395779 Dde_0872 Dde_0873     TRUE 0.963 3.000 0.000 NA   0.931
 395779 3334123 Dde_0873 Dde_0876     FALSE 0.000 1320.000 0.000 NA   -0.898
 3334123 395777 Dde_0876 Dde_0877     TRUE 0.789 77.000 0.054 NA   0.488
 395777 3334124 Dde_0877 Dde_0878     TRUE 0.529 184.000 0.333 NA   -0.190
 3334124 395775 Dde_0878 Dde_0879     TRUE 0.998 39.000 0.833 1.000 Y 0.950
 395772 395771 Dde_0882 Dde_0884 sodB   FALSE 0.003 399.000 0.000 1.000   0.036
 395771 395770 Dde_0884 Dde_0885     FALSE 0.365 83.000 0.000 NA   0.608
 395770 395769 Dde_0885 Dde_0886   pleD FALSE 0.021 71.000 0.000 NA   -0.534
 395767 395766 Dde_0890 Dde_0891     TRUE 0.951 -7.000 0.000 NA   0.850
 395766 395765 Dde_0891 Dde_0892     TRUE 0.942 -7.000 0.000 NA   0.772
 395765 395764 Dde_0892 Dde_0893   lexA TRUE 0.662 51.000 0.000 NA   0.704
 3334128 3334129 Dde_0894 Dde_0895     TRUE 0.690 21.000 0.000 NA   0.337
 3334129 395761 Dde_0895 Dde_0896     TRUE 0.907 -7.000 0.000 1.000   0.646
 395761 395760 Dde_0896 Dde_0897     TRUE 0.956 0.000 0.000 NA   0.806
 395760 395759 Dde_0897 Dde_0899     FALSE 0.045 323.000 0.000 NA   0.736
 395759 395758 Dde_0899 Dde_0900     FALSE 0.151 216.000 0.000 NA   0.956
 395758 3334131 Dde_0900 Dde_0901     FALSE 0.384 109.000 0.000 NA   0.714
 3334131 395756 Dde_0901 Dde_0902     TRUE 0.774 -3.000 0.000 NA   0.302
 395756 395755 Dde_0902 Dde_0903     TRUE 0.668 26.000 0.000 NA   0.385
 395755 395754 Dde_0903 Dde_0904     TRUE 0.963 6.000 0.000 NA   0.867
 395754 3334132 Dde_0904 Dde_0905     TRUE 0.964 9.000 0.000 NA   0.947
 3334132 3334133 Dde_0905 Dde_0906     TRUE 0.939 -45.000 0.000 1.000   0.833
 3334133 3334134 Dde_0906 Dde_0907     TRUE 0.978 -3.000 0.000 1.000 Y 0.759
 395749 11399273 Dde_0910 Dde_4015     TRUE 0.805 -10.000 0.000 NA   NA
 11399273 3334136 Dde_4015 Dde_0911     FALSE 0.228 89.000 0.000 NA   NA
 395747 395746 Dde_0912 Dde_0913     TRUE 0.997 -19.000 0.333 0.061   0.852
 395746 3334137 Dde_0913 Dde_0914     TRUE 0.976 34.000 0.333 NA   NA
 395745 395744 Dde_0915 Dde_0916     TRUE 0.834 -3.000 0.000 NA   NA
 395744 395743 Dde_0916 Dde_0917     TRUE 0.691 0.000 0.000 NA   0.155
 395743 3334138 Dde_0917 Dde_0918     FALSE 0.063 115.000 0.000 NA   0.115
 3334138 395741 Dde_0918 Dde_0919     TRUE 0.864 0.000 0.000 NA   0.475
 395741 395740 Dde_0919 Dde_0920     TRUE 0.914 -3.000 0.000 NA   0.647
 395740 395739 Dde_0920 Dde_0921     TRUE 0.834 -3.000 0.000 NA   NA
 395739 395738 Dde_0921 Dde_0922     FALSE 0.186 104.000 0.000 NA   NA
 395738 395737 Dde_0922 Dde_0923     TRUE 0.988 13.000 0.136 NA   0.476
 395737 395736 Dde_0923 Dde_0924     TRUE 0.989 19.000 0.400 NA   0.179
 395736 395735 Dde_0924 Dde_0925     TRUE 0.996 19.000 0.400 NA   0.864
 395735 395734 Dde_0925 Dde_0926     TRUE 0.996 -13.000 0.600 NA   0.551
 395734 395733 Dde_0926 Dde_0927     TRUE 0.997 -13.000 0.750 NA   0.463
 395733 395732 Dde_0927 Dde_0928     TRUE 0.998 -10.000 0.750 NA   0.759
 395732 395731 Dde_0928 Dde_0929     TRUE 0.978 60.000 0.750 NA   0.491
 395731 395730 Dde_0929 Dde_0930     TRUE 0.998 13.000 0.750 NA   0.575
 395730 395729 Dde_0930 Dde_0931     TRUE 0.998 3.000 0.750 NA   NA
 395729 3334139 Dde_0931 Dde_0932     TRUE 0.804 16.000 0.000 NA   NA
 3334139 395727 Dde_0932 Dde_0933     TRUE 0.772 16.000 0.000 NA   0.372
 395727 395726 Dde_0933 Dde_0934     FALSE 0.369 144.000 0.000 NA   0.983
 395726 3334140 Dde_0934 Dde_0935     TRUE 0.996 9.000 0.500 NA   NA
 3334140 395725 Dde_0935 Dde_0936     TRUE 0.850 4.000 0.000 NA   NA
 395725 395724 Dde_0936 Dde_0937     TRUE 0.834 -3.000 0.000 NA   NA
 395724 395723 Dde_0937 Dde_0938     TRUE 0.977 67.000 0.750 NA   0.579
 395723 395722 Dde_0938 Dde_0939     TRUE 0.994 -7.000 0.250 NA   0.678
 395722 395721 Dde_0939 Dde_0940     TRUE 0.994 -3.000 0.250 NA   0.654
 395721 395720 Dde_0940 Dde_0941     TRUE 0.997 -7.000 0.750 NA   0.256
 395720 395719 Dde_0941 Dde_0942     TRUE 0.996 13.000 0.500 NA   NA
 395719 395718 Dde_0942 Dde_0943     TRUE 0.834 -3.000 0.000 NA   NA
 395718 11399274 Dde_0943 Dde_4016     TRUE 0.846 11.000 0.000 NA   NA
 11399274 3334141 Dde_4016 Dde_0944     TRUE 0.834 -3.000 0.000 NA   NA
 3334141 395716 Dde_0944 Dde_0945     TRUE 0.996 13.000 0.500 NA   NA
 395716 395715 Dde_0945 Dde_0946     TRUE 0.998 0.000 0.750 NA   NA
 395715 395714 Dde_0946 Dde_0947     FALSE 0.198 100.000 0.000 NA   NA
 395714 395713 Dde_0947 Dde_0948     TRUE 0.940 0.000 0.000 NA   0.702
 395713 395712 Dde_0948 Dde_0949     TRUE 0.960 11.000 0.000 NA   0.842
 395712 395711 Dde_0949 Dde_0950     TRUE 0.999 11.000 0.667 NA   0.830
 395711 11399275 Dde_0950 Dde_4017     TRUE 0.852 5.000 0.000 NA   NA
 11399275 11399276 Dde_4017 Dde_4018     TRUE 0.798 -13.000 0.000 NA   NA
 11399276 395710 Dde_4018 Dde_0953     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   NA
 395710 395709 Dde_0953 Dde_0954     TRUE 0.995 16.000 0.500 NA   NA
 395709 405443 Dde_0954 Dde_0955     TRUE 0.957 13.000 0.000 NA   0.871
 405443 395708 Dde_0955 Dde_0956     FALSE 0.115 250.000 0.000 NA   0.871
 395708 395707 Dde_0956 Dde_0957     TRUE 0.866 12.000 0.000 NA   0.490
 395707 395706 Dde_0957 Dde_0958     TRUE 0.923 -15.000 0.000 NA   0.720
 395706 395705 Dde_0958 Dde_0959     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   0.409
 395705 3334144 Dde_0959 Dde_0960     FALSE 0.065 149.000 0.000 NA   0.243
 3334144 3334145 Dde_0960 Dde_0961     TRUE 0.888 -3.000 0.000 1.000 N 0.633
 3334145 3334146 Dde_0961 Dde_0962     TRUE 0.960 -3.000 0.000 1.000 Y 0.574
 3334146 395701 Dde_0962 Dde_0963     TRUE 0.884 -13.000 0.000 1.000   0.620
 395701 11399277 Dde_0963 Dde_4019     TRUE 0.805 -10.000 0.000 NA   NA
 11399277 3334148 Dde_4019 Dde_0965     TRUE 0.834 -3.000 0.000 NA   NA
 3334148 395699 Dde_0965 Dde_0966     FALSE 0.206 -3.000 0.000 NA   -0.449
 395699 395698 Dde_0966 Dde_0967     TRUE 0.988 -3.000 0.167 1.000   0.386
 395698 395697 Dde_0967 Dde_0970     FALSE 0.015 600.000 0.000 1.000   0.691
 395697 395696 Dde_0970 Dde_0971     FALSE 0.076 293.000 0.000 NA   0.939
 395696 395695 Dde_0971 Dde_0972   ftsA-3 TRUE 0.740 156.000 0.114 NA   0.722
 395695 395694 Dde_0972 Dde_0973 ftsA-3   TRUE 0.968 3.000 0.047 NA   -0.044
 395694 395693 Dde_0973 Dde_0974     FALSE 0.395 110.000 0.010 NA   0.288
 395692 395691 Dde_0975 Dde_0976     FALSE 0.045 178.000 0.000 NA   0.306
 395689 395688 Dde_0978 Dde_0979     FALSE 0.243 341.000 0.064 NA   0.970
 395688 395687 Dde_0979 Dde_0980     TRUE 0.990 9.000 0.025 NA   0.960
 395687 395686 Dde_0980 Dde_0981   glmU TRUE 0.976 5.000 0.005 NA   0.740
 395686 395685 Dde_0981 Dde_0984 glmU atpC FALSE 0.020 936.000 0.067 1.000 N -0.148
 395685 395684 Dde_0984 Dde_0985 atpC atpD TRUE 1.000 12.000 0.837 0.004 Y 0.920
 395684 395683 Dde_0985 Dde_0986 atpD atpG TRUE 1.000 18.000 0.724 0.004 Y 0.968
 395683 395682 Dde_0986 Dde_0987 atpG atpA TRUE 1.000 15.000 0.846 0.004 Y 0.984
 395682 395681 Dde_0987 Dde_0988 atpA atpH TRUE 1.000 5.000 0.864 0.004 Y 0.976
 395681 395680 Dde_0988 Dde_0989 atpH atpF TRUE 0.998 -3.000 0.132 0.004 Y 0.986
 395680 395679 Dde_0989 Dde_0990 atpF   TRUE 0.998 33.000 0.569 0.004 Y 0.936
 395679 395678 Dde_0990 Dde_0991     FALSE 0.019 182.000 0.000 NA N 0.269
 395678 395677 Dde_0991 Dde_0992   mrdB FALSE 0.280 67.000 0.000 NA N 0.505
 395677 395676 Dde_0992 Dde_0993 mrdB mrdA TRUE 0.983 -3.000 0.075 1.000 N 0.543
 395676 395675 Dde_0993 Dde_0994 mrdA   TRUE 0.981 -16.000 0.246 NA   -0.110
 395675 395674 Dde_0994 Dde_0995   mreC TRUE 0.806 84.000 0.018 NA   0.780
 395674 395673 Dde_0995 Dde_0996 mreC mreB TRUE 0.994 38.000 0.689 1.000 N 0.967
 3334153 395671 Dde_0997 Dde_0998     TRUE 0.795 102.000 0.146 1.000   0.452
 3334154 395668 Dde_1000 Dde_1001     TRUE 0.839 -3.000 0.000 NA   0.442
 395667 395666 Dde_1002 Dde_1003     TRUE 0.999 4.000 0.404 0.001 Y 0.946
 395666 3334157 Dde_1003 Dde_1005     FALSE 0.000 914.000 0.000 NA   -0.256
 3334157 395665 Dde_1005 Dde_1006   fabI TRUE 0.656 28.000 0.000 NA   0.419
 395665 395664 Dde_1006 Dde_1007 fabI purC TRUE 0.951 31.000 0.014 1.000 N 0.954
 395664 395663 Dde_1007 Dde_1008 purC hisD TRUE 0.979 20.000 0.024 1.000 N 0.962
 395663 395662 Dde_1008 Dde_1010 hisD   FALSE 0.001 316.000 0.000 NA   -0.120
 395662 395661 Dde_1010 Dde_1011     FALSE 0.013 310.000 0.000 NA   0.370
 395660 395659 Dde_1014 Dde_1015 uvrC   TRUE 0.666 45.000 0.000 1.000   0.654
 395659 395658 Dde_1015 Dde_1016   atoC TRUE 0.971 46.000 0.080 1.000 Y 0.694
 395658 395657 Dde_1016 Dde_1017 atoC   TRUE 0.772 182.000 0.750 NA   0.006
 395657 395656 Dde_1017 Dde_1018     TRUE 0.799 105.000 0.286 NA   0.015
 395655 395654 Dde_1019 Dde_1020 trmU gatA TRUE 0.546 134.000 0.007 1.000 Y 0.289
 395654 395653 Dde_1020 Dde_1021 gatA gatC TRUE 0.993 49.000 0.643 0.001 Y 0.339
 395653 395652 Dde_1021 Dde_1022 gatC   TRUE 0.539 73.000 0.010 NA   0.204
 395652 395651 Dde_1022 Dde_1023   dnaK TRUE 0.565 88.000 0.008 NA   0.505
 395651 395650 Dde_1023 Dde_1024 dnaK   FALSE 0.058 270.000 0.000 NA   0.685
 395650 395649 Dde_1024 Dde_1025   grpE FALSE 0.053 309.000 0.000 NA   0.747
 395649 395648 Dde_1025 Dde_1026 grpE hrcA TRUE 0.837 110.000 0.286 1.000 N 0.492
 395648 395647 Dde_1026 Dde_1027 hrcA bcp FALSE 0.101 141.000 0.002 1.000 N -0.195
 395647 395646 Dde_1027 Dde_1028 bcp   TRUE 0.580 55.000 0.002 NA N 0.467
 395646 395645 Dde_1028 Dde_1029     FALSE 0.400 104.000 0.000 NA   0.708
 395643 395642 Dde_1031 Dde_1032   pyk TRUE 0.991 4.000 0.269 1.000 N 0.296
 395641 395640 Dde_1033 Dde_1034   mraW TRUE 0.989 27.000 0.635 NA   -0.096
 395640 395639 Dde_1034 Dde_1035 mraW   TRUE 0.960 10.000 0.014 NA   0.334
 395639 3334162 Dde_1035 Dde_1036     TRUE 0.959 121.000 0.929 NA   0.532
 3334162 395637 Dde_1036 Dde_1037   murE TRUE 0.989 3.000 0.073 1.000 Y 0.064
 395637 395636 Dde_1037 Dde_1038 murE murF TRUE 0.993 -9.000 0.099 0.002 Y 0.045
 395636 395635 Dde_1038 Dde_1039 murF mraY TRUE 0.997 7.000 0.309 0.006 Y -0.396
 395635 395634 Dde_1039 Dde_1040 mraY murD TRUE 0.999 15.000 0.647 0.006 Y 0.464
 395634 395633 Dde_1040 Dde_1041 murD ftsW TRUE 0.996 0.000 0.297 0.003 N 0.554
 395633 395632 Dde_1041 Dde_1042 ftsW murG TRUE 0.985 -3.000 0.098 1.000 N 0.565
 395632 395631 Dde_1042 Dde_1043 murG murC TRUE 0.995 5.000 0.270 1.000 Y 0.078
 395631 3334163 Dde_1043 Dde_1044 murC   TRUE 0.996 6.000 0.108 0.006 Y 0.447
 3334163 3334164 Dde_1044 Dde_1045     TRUE 0.512 237.000 0.024 NA Y 0.821
 3334164 395628 Dde_1045 Dde_1046   ftsA TRUE 0.988 27.000 0.389 NA N 0.601
 395628 395627 Dde_1046 Dde_1047 ftsA ftsZ TRUE 0.994 38.000 0.460 1.000 Y 0.734
 395624 395623 Dde_1051 Dde_1052 htpX   FALSE 0.149 166.000 0.007 1.000 N 0.209
 395623 395622 Dde_1052 Dde_1054     FALSE 0.037 345.000 0.000 1.000 N 0.782
 395622 395621 Dde_1054 Dde_1055   modF TRUE 0.970 -3.000 0.004 1.000   0.702
 395621 395620 Dde_1055 Dde_1057 modF   FALSE 0.047 250.000 0.014 1.000   -0.866
 395620 395619 Dde_1057 Dde_1058     TRUE 0.877 65.000 0.017 NA   0.925
 395619 395618 Dde_1058 Dde_1059     FALSE 0.002 206.000 0.000 NA   -0.541
 395618 395617 Dde_1059 Dde_1060   pstA FALSE 0.394 98.000 0.000 1.000 N 0.716
 395617 395616 Dde_1060 Dde_1061 pstA pstC TRUE 0.999 10.000 0.198 0.001 Y 0.974
 395616 395615 Dde_1061 Dde_1062 pstC pstS TRUE 0.903 108.000 0.044 1.000 Y 0.975
 395614 395613 Dde_1063 Dde_1065     FALSE 0.015 376.000 0.000 NA   0.548
 395613 395612 Dde_1065 Dde_1066     TRUE 0.921 2.000 0.000 NA   0.642
 3334171 395608 Dde_1071 Dde_1072     FALSE 0.006 151.000 0.000 NA   -0.181
 395608 395607 Dde_1072 Dde_1073     FALSE 0.233 77.000 0.000 NA   0.373
 395606 395605 Dde_1074 Dde_1075     FALSE 0.047 344.000 0.000 1.000 Y 0.486
 395605 395604 Dde_1075 Dde_1076     TRUE 0.995 -3.000 0.321 1.000 Y -0.204
 395603 395602 Dde_1077 Dde_1078 mcpD cheW-3 TRUE 0.965 21.000 0.000 0.017 Y 0.641
 395601 395600 Dde_1079 Dde_1081 sir argJ FALSE 0.001 832.000 0.000 1.000   0.091
 395600 395599 Dde_1081 Dde_1082 argJ secA TRUE 0.830 50.000 0.017 1.000 N 0.628
 395599 3334173 Dde_1082 Dde_1083 secA   FALSE 0.002 436.000 0.000 NA   0.031
 3334173 395598 Dde_1083 Dde_1085     FALSE 0.003 603.000 0.000 NA   0.277
 395598 395597 Dde_1085 Dde_1086     FALSE 0.221 0.000 0.000 NA   -0.324
 395597 395596 Dde_1086 Dde_1087     FALSE 0.394 43.000 0.000 NA   0.310
 395596 395595 Dde_1087 Dde_1088   smpB FALSE 0.171 113.000 0.004 1.000 N -0.100
 395595 395594 Dde_1088 Dde_1089 smpB ptsI TRUE 0.963 28.000 0.017 1.000 N 0.936
 395594 395593 Dde_1089 Dde_1090 ptsI ptsO TRUE 0.999 1.000 0.163 0.002 Y 0.807
 395593 395592 Dde_1090 Dde_1091 ptsO   TRUE 0.962 69.000 0.039 0.003 Y 0.761
 395592 395591 Dde_1091 Dde_1092     TRUE 0.872 3.000 0.006 1.000   -0.479
 395591 395590 Dde_1092 Dde_1093     TRUE 0.986 -58.000 0.165 1.000   0.564
 395590 395589 Dde_1093 Dde_1094   rnhB TRUE 0.994 -6.000 0.111 1.000 Y 0.617
 395589 395588 Dde_1094 Dde_1095 rnhB rplS TRUE 0.801 70.000 0.066 1.000 N 0.488
 395588 395587 Dde_1095 Dde_1096 rplS trmD TRUE 0.967 88.000 0.567 1.000 Y 0.377
 395587 395586 Dde_1096 Dde_1097 trmD   TRUE 0.994 62.000 0.672 1.000 Y 0.981
 395586 395585 Dde_1097 Dde_1098     TRUE 0.991 33.000 0.324 1.000   0.918
 395585 395584 Dde_1098 Dde_1099   rpsP TRUE 0.961 91.000 0.385 1.000   0.921
 395584 395583 Dde_1099 Dde_1100 rpsP ffh TRUE 0.874 83.000 0.361 1.000 N 0.116
 395583 395582 Dde_1100 Dde_1102 ffh   FALSE 0.001 274.000 0.000 1.000 N -0.773
 395580 405442 Dde_1104 Dde_1105     FALSE 0.095 74.000 0.000 NA   0.056
 405442 395579 Dde_1105 Dde_1106     TRUE 0.996 -40.000 0.583 NA   0.610
 395578 3334179 Dde_1109 Dde_1110 ApsB   TRUE 0.998 46.000 0.925 0.001 Y 0.720
 3334179 395576 Dde_1110 Dde_1111   QmoA TRUE 0.845 159.000 0.189 0.069 Y 0.421
 395576 395575 Dde_1111 Dde_1112 QmoA QmoB TRUE 1.000 7.000 0.650 0.004 Y 0.940
 395575 395574 Dde_1112 Dde_1113 QmoB QmoC TRUE 0.998 14.000 0.120 0.004 Y 0.921
 395574 395573 Dde_1113 Dde_1114 QmoC   TRUE 0.911 72.000 0.060 NA   0.902
 395572 395571 Dde_1115 Dde_1116     TRUE 0.873 22.000 0.000 NA   0.677
 395571 395570 Dde_1116 Dde_1117     FALSE 0.073 77.000 0.000 NA   0.007
 395570 395569 Dde_1117 Dde_1118     TRUE 0.994 -7.000 0.217 NA   0.690
 395569 395568 Dde_1118 Dde_1119     FALSE 0.057 213.000 0.000 1.000 N 0.626
 395568 395567 Dde_1119 Dde_1120   fliD TRUE 0.925 22.000 0.000 0.002 Y 0.009
 395567 395566 Dde_1120 Dde_1121 fliD   FALSE 0.001 267.000 0.000 1.000 N -0.187
 395566 395565 Dde_1121 Dde_1122     TRUE 0.983 10.000 0.030 0.026 N 0.449
 395565 395564 Dde_1122 Dde_1123   dxr TRUE 0.952 58.000 0.568 1.000 N 0.167
 395564 395563 Dde_1123 Dde_1124 dxr   TRUE 0.973 5.000 0.004 1.000 N 0.768
 395563 395562 Dde_1124 Dde_1125   cdsA TRUE 0.645 31.000 0.003 1.000 N 0.040
 395562 395561 Dde_1125 Dde_1126 cdsA uppS TRUE 0.996 -3.000 0.400 1.000 Y -0.271
 395561 395560 Dde_1126 Dde_1128 uppS frr FALSE 0.477 213.000 0.409 1.000 N -0.006
 395560 395559 Dde_1128 Dde_1129 frr pyrH TRUE 0.996 6.000 0.626 1.000 N 0.136
 395559 395558 Dde_1129 Dde_1130 pyrH   FALSE 0.250 66.000 0.004 NA N -0.323
 395558 395557 Dde_1130 Dde_1131   lpsC TRUE 0.969 -3.000 0.007 NA Y 0.200
 395557 395556 Dde_1131 Dde_1132 lpsC tsf FALSE 0.079 191.000 0.000 1.000   0.554
 395556 395555 Dde_1132 Dde_1133 tsf rpsB TRUE 0.998 24.000 0.748 1.000   0.950
 3334182 395553 Dde_1135 Dde_1136     FALSE 0.003 206.000 0.000 1.000   -0.207
 395553 395552 Dde_1136 Dde_1137     TRUE 0.979 -27.000 0.122 1.000   0.324
 395552 395551 Dde_1137 Dde_1138     TRUE 0.650 87.000 0.027 1.000   0.307
 395551 395550 Dde_1138 Dde_1140     FALSE 0.001 338.000 0.000 1.000   -0.432
 395550 395549 Dde_1140 Dde_1143     FALSE 0.006 596.000 0.000 NA   0.465
 395549 395548 Dde_1143 Dde_1145     FALSE 0.008 507.000 0.000 NA   0.509
 395548 395547 Dde_1145 Dde_1146     FALSE 0.023 244.000 0.000 NA   0.355
 395546 395545 Dde_1147 Dde_1148 htpG   FALSE 0.136 162.000 0.000 NA   0.594
 395544 11399278 Dde_1149 Dde_4020     FALSE 0.249 82.000 0.000 NA   NA
 11399278 3334187 Dde_4020 Dde_1150     FALSE 0.176 108.000 0.000 NA   NA
 3334187 395541 Dde_1150 Dde_1151   hdd FALSE 0.001 320.000 0.000 1.000   -0.644
 395541 3334188 Dde_1151 Dde_1152 hdd   TRUE 0.617 53.000 0.000 NA   0.677
 395539 395538 Dde_1153 Dde_1154     TRUE 0.903 0.000 0.000 NA   0.593
 395538 395537 Dde_1154 Dde_1155     TRUE 0.964 9.000 0.000 NA   0.885
 395537 395536 Dde_1155 Dde_1156     FALSE 0.057 341.000 0.000 1.000   0.938
 395536 395535 Dde_1156 Dde_1157     TRUE 0.949 -12.000 0.000 NA   0.897
 395534 3334189 Dde_1158 Dde_1159     FALSE 0.064 196.000 0.000 NA   0.530
 3334191 395533 Dde_1161 Dde_1162     FALSE 0.006 167.000 0.000 NA   -0.133
 395532 3334193 Dde_1164 Dde_1165     FALSE 0.124 22.000 0.000 1.000 N -0.546
 395530 3334194 Dde_1166 Dde_1167     FALSE 0.175 145.000 0.000 NA   0.571
 3334194 395529 Dde_1167 Dde_1168     FALSE 0.311 54.000 0.000 NA   0.320
 395527 395526 Dde_1170 Dde_1171 isf-1   FALSE 0.169 186.000 0.000 NA   0.753
 395526 395525 Dde_1171 Dde_1172   hrpB FALSE 0.008 138.000 0.000 1.000 N -0.699
 3334195 395523 Dde_1173 Dde_1174   glcB FALSE 0.051 238.000 0.000 NA N 0.656
 3334197 395520 Dde_1177 Dde_1178   b1200 FALSE 0.013 252.000 0.000 1.000 N 0.322
 395520 395519 Dde_1178 Dde_1179 b1200 b1199 TRUE 0.981 93.000 0.226 0.001 Y 0.942
 395519 395518 Dde_1179 Dde_1180 b1199 ptsI TRUE 0.997 5.000 0.088 1.000 Y 0.762
 395517 395516 Dde_1181 Dde_1182 oppF dppD TRUE 0.962 44.000 0.100 0.002 Y -0.152
 395516 395515 Dde_1182 Dde_1183 dppD dppC TRUE 0.984 9.000 0.000 1.000 Y 0.932
 395515 395514 Dde_1183 Dde_1184 dppC dppB TRUE 1.000 3.000 0.779 0.054 Y 0.868
 395514 395513 Dde_1184 Dde_1185 dppB dppA FALSE 0.435 85.000 0.000 0.040 Y -0.596
 395513 395512 Dde_1185 Dde_1186 dppA   TRUE 0.510 150.000 0.000 1.000 Y 0.745
 3334199 395510 Dde_1188 Dde_1189   nikK FALSE 0.189 228.000 0.000 1.000 Y 0.679
 395510 3334200 Dde_1189 Dde_1190 nikK   TRUE 0.970 108.000 0.388 1.000 Y 0.811
 3334200 395508 Dde_1190 Dde_1191   nikL TRUE 0.991 25.000 0.200 NA   0.879
 395508 395507 Dde_1191 Dde_1192 nikL nikQ TRUE 0.992 12.000 0.057 NA   0.848
 395507 395506 Dde_1192 Dde_1193 nikQ nikO TRUE 0.997 -10.000 0.247 1.000 Y 0.705
 395505 395504 Dde_1194 Dde_1195     FALSE 0.003 185.000 0.000 1.000 N -0.220
 395504 395503 Dde_1195 Dde_1196     TRUE 0.942 3.000 0.000 NA N 0.762
 395503 395502 Dde_1196 Dde_1197     FALSE 0.329 133.000 0.000 NA N 0.764
 395502 395501 Dde_1197 Dde_1198     TRUE 0.986 91.000 0.571 1.000 Y 0.925
 395500 395499 Dde_1200 Dde_1201     FALSE 0.035 387.000 0.000 1.000 N 0.850
 395499 395498 Dde_1201 Dde_1202     TRUE 0.857 69.000 0.030 1.000   0.714
 395498 395497 Dde_1202 Dde_1203     TRUE 0.819 71.000 0.030 1.000   0.642
 395497 395496 Dde_1203 Dde_1204     TRUE 0.996 13.000 0.250 1.000 N 0.831
 395496 395495 Dde_1204 Dde_1205     TRUE 0.829 176.000 0.250 0.099 N 0.918
 395495 395494 Dde_1205 Dde_1207     FALSE 0.000 645.000 0.000 1.000 N -0.896
 395494 395493 Dde_1207 Dde_1208     TRUE 0.999 -3.000 0.429 0.004 Y 0.926
 395493 395492 Dde_1208 Dde_1209     TRUE 0.998 19.000 0.257 0.004 Y 0.827
 395492 3334203 Dde_1209 Dde_1210     TRUE 0.996 -33.000 0.171 1.000 Y 0.769
 3334203 395490 Dde_1210 Dde_1211     TRUE 0.960 -3.000 0.000 1.000   0.901
 395490 395489 Dde_1211 Dde_1212     TRUE 0.977 0.000 0.000 0.031   0.931
 395489 395488 Dde_1212 Dde_1213     TRUE 0.997 -7.000 0.182 0.031   0.926
 395488 395487 Dde_1213 Dde_1214     TRUE 0.990 19.000 0.076 0.031   0.694
 395487 3334204 Dde_1214 Dde_1215     FALSE 0.004 177.000 0.000 1.000   -0.617
 3334204 3334205 Dde_1215 Dde_1216     FALSE 0.093 131.000 0.000 1.000   0.228
 3334205 395484 Dde_1216 Dde_1217     TRUE 0.883 92.000 0.188 NA   0.643
 395483 395482 Dde_1218 Dde_1222     FALSE 0.001 546.000 0.000 1.000 N 0.182
 395482 3334211 Dde_1222 Dde_1225     FALSE 0.004 536.000 0.000 1.000 N NA
 3334211 3334212 Dde_1225 Dde_1226     FALSE 0.012 359.000 0.000 1.000   NA
 3334212 3334213 Dde_1226 Dde_1227     TRUE 0.961 12.000 0.000 NA   0.915
 3334213 3334214 Dde_1227 Dde_1228     TRUE 0.834 -3.000 0.000 NA   NA
 3334214 395481 Dde_1228 Dde_1229     TRUE 0.998 0.000 0.750 NA   NA
 3334215 3334219 Dde_1230 Dde_1234     FALSE 0.141 135.000 0.000 NA   NA
 3334219 3334218 Dde_1234 Dde_1233     FALSE 0.317 65.000 0.000 NA   NA
 395479 395478 Dde_1237 Dde_1239     FALSE 0.002 220.000 0.000 NA   -0.332
 395478 405440 Dde_1239 Dde_1241     FALSE 0.058 308.000 0.000 1.000   0.763
 395477 395476 Dde_1244 Dde_1245 lldR   FALSE 0.237 181.000 0.000 1.000   0.936
 395476 395475 Dde_1245 Dde_1246     FALSE 0.063 168.000 0.000 1.000   0.346
 395474 395473 Dde_1247 Dde_1248   rnk FALSE 0.019 75.000 0.000 1.000 N -0.040
 395473 395472 Dde_1248 Dde_1250 rnk gltA FALSE 0.001 461.000 0.000 1.000 N 0.135
 395472 395471 Dde_1250 Dde_1251 gltA   TRUE 0.997 -13.000 0.556 0.068 N 0.614
 395471 395470 Dde_1251 Dde_1252     TRUE 0.871 28.000 0.000 1.000 N 0.818
 395470 395469 Dde_1252 Dde_1253     FALSE 0.110 137.000 0.000 1.000 N 0.449
 395469 395468 Dde_1253 Dde_1254     TRUE 0.975 21.000 0.009 1.000 Y 0.637
 395468 395467 Dde_1254 Dde_1255     TRUE 0.986 0.000 0.000 0.002 Y 0.689
 395467 395466 Dde_1255 Dde_1256   frdB TRUE 0.931 -13.000 0.000 1.000 Y 0.397
 395466 395465 Dde_1256 Dde_1257 frdB frdA TRUE 0.999 13.000 0.153 0.001 Y 0.891
 395465 395464 Dde_1257 Dde_1258 frdA frdC TRUE 0.956 29.000 0.013 0.001   0.567
 395464 395463 Dde_1258 Dde_1260 frdC   FALSE 0.002 525.000 0.000 1.000   0.058
 395463 395462 Dde_1260 Dde_1261     TRUE 0.960 -19.000 0.000 0.032 Y 0.478
 395459 395458 Dde_1265 Dde_1266     TRUE 0.952 12.000 0.000 NA N 0.949
 395458 395457 Dde_1266 Dde_1267     TRUE 0.981 13.000 0.000 1.000 Y 0.969
 395457 395456 Dde_1267 Dde_1268     TRUE 0.998 18.000 0.250 1.000 Y 0.955
 395456 395455 Dde_1268 Dde_1269     TRUE 0.707 198.000 0.250 1.000 N 0.922
 395454 395453 Dde_1270 Dde_1272     TRUE 0.595 316.000 0.500 1.000 N 0.859
 395453 395452 Dde_1272 Dde_1273     TRUE 0.987 107.000 0.875 0.004 N 0.895
 395452 395451 Dde_1273 Dde_1274   dctM TRUE 0.951 97.000 0.375 1.000 N 0.917
 395451 395450 Dde_1274 Dde_1275 dctM dtcP TRUE 0.993 79.000 1.000 1.000 Y 0.762
 395449 395448 Dde_1278 Dde_1279     FALSE 0.164 207.000 0.000 1.000   0.849
 395445 395444 Dde_1283 Dde_1285 uidR   FALSE 0.001 258.000 0.000 0.080 N -0.697
 395444 395443 Dde_1285 Dde_1286     TRUE 0.944 -3.000 0.000 0.032 Y -0.134
 395443 395442 Dde_1286 Dde_1288   nrfG FALSE 0.002 222.000 0.000 1.000 N -0.025
 395442 395441 Dde_1288 Dde_1289 nrfG   FALSE 0.018 261.000 0.000 1.000 N NA
 3334245 395439 Dde_1298 Dde_1299     TRUE 0.512 40.000 0.000 NA   NA
 395439 395438 Dde_1299 Dde_1300     FALSE 0.021 382.000 0.000 NA   0.653
 395437 395436 Dde_1301 Dde_1302     FALSE 0.001 269.000 0.000 1.000   -0.336
 395436 395435 Dde_1302 Dde_1303     TRUE 0.974 51.000 0.462 NA   0.608
 395435 395434 Dde_1303 Dde_1304   b0965 TRUE 0.959 6.000 0.017 NA   0.194
 395432 395431 Dde_1306 Dde_1307   hypB FALSE 0.354 101.000 0.015 1.000 N -0.127
 395431 395430 Dde_1307 Dde_1308 hypB hybF TRUE 0.998 10.000 0.215 0.002   0.842
 395429 395428 Dde_1309 Dde_1310     TRUE 0.884 27.000 0.000 NA   0.761
 395428 395427 Dde_1310 Dde_1311     FALSE 0.002 224.000 0.000 NA   -0.390
 395424 395423 Dde_1314 Dde_1315     FALSE 0.099 196.000 0.000 NA   0.655
 395423 395422 Dde_1315 Dde_1317     FALSE 0.001 272.000 0.000 1.000   -0.461
 395421 395420 Dde_1318 Dde_1320 topB rbr2 FALSE 0.001 289.000 0.000 1.000 N -0.781
 395420 395419 Dde_1320 Dde_1322 rbr2   FALSE 0.001 268.000 0.000 1.000 N -0.762
 395419 3334249 Dde_1322 Dde_1323     FALSE 0.309 147.000 0.000 NA N 0.830
 395417 395416 Dde_1324 Dde_1325 pgl   FALSE 0.020 73.000 0.000 1.000 N -0.351
 395416 395415 Dde_1325 Dde_1326     TRUE 1.000 -7.000 1.000 0.020 Y 0.861
 395415 395414 Dde_1326 Dde_1327     TRUE 1.000 14.000 1.000 1.000 Y 0.988
 395414 395413 Dde_1327 Dde_1328     TRUE 0.999 2.000 0.286 0.040 Y 0.992
 395413 395412 Dde_1328 Dde_1329     TRUE 1.000 -15.000 0.875 0.040 Y 0.965
 395412 395411 Dde_1329 Dde_1331     FALSE 0.002 256.000 0.000 1.000   -0.201
 395411 395410 Dde_1331 Dde_1333     FALSE 0.007 145.000 0.000 NA   -0.166
 395410 395409 Dde_1333 Dde_1334     FALSE 0.050 47.000 0.000 NA   -0.145
 395409 395408 Dde_1334 Dde_1335     FALSE 0.011 109.000 0.000 1.000 N -0.361
 395408 395407 Dde_1335 Dde_1336     TRUE 0.946 2.000 0.000 0.099 Y -0.063
 395407 395406 Dde_1336 Dde_1337     FALSE 0.039 151.000 0.000 0.099 N -0.210
 395406 3334252 Dde_1337 Dde_1338     TRUE 0.985 -10.000 0.098 NA   0.595
 3334252 395405 Dde_1338 Dde_1339     FALSE 0.001 286.000 0.000 NA   -0.162
 395405 395404 Dde_1339 Dde_1340     TRUE 0.997 0.000 0.800 1.000 N 0.147
 395404 395403 Dde_1340 Dde_1341     FALSE 0.106 105.000 0.000 1.000 N 0.360
 395403 395402 Dde_1341 Dde_1342     FALSE 0.059 143.000 0.000 NA   0.179
 395401 395400 Dde_1343 Dde_1344 hspC   TRUE 0.999 14.000 0.429 NA Y 0.934
 395400 395399 Dde_1344 Dde_1345     FALSE 0.001 296.000 0.000 NA   -0.199
 395399 3334253 Dde_1345 Dde_1346     FALSE 0.010 220.000 0.000 NA   0.062
 3334253 395397 Dde_1346 Dde_1347     FALSE 0.135 72.000 0.000 NA   0.146
 395397 395396 Dde_1347 Dde_1349     FALSE 0.008 654.000 0.000 NA   0.594
 395396 395395 Dde_1349 Dde_1350   rarD TRUE 0.540 69.000 0.006 NA   0.355
 395395 3334255 Dde_1350 Dde_1351 rarD   FALSE 0.014 93.000 0.000 1.000   -0.534
 395392 395391 Dde_1353 Dde_1354     FALSE 0.012 104.000 0.000 NA   -0.625
 395391 3334256 Dde_1354 Dde_1355     FALSE 0.009 133.000 0.000 NA   -0.703
 395389 395388 Dde_1356 Dde_1357     TRUE 0.981 -3.000 0.007 NA   0.892
 395388 395387 Dde_1357 Dde_1358     TRUE 0.776 33.000 0.000 NA   0.670
 395387 11399279 Dde_1358 Dde_4021     TRUE 0.499 41.000 0.000 NA   NA
 11399279 395385 Dde_4021 Dde_1359     FALSE 0.248 86.000 0.000 1.000   NA
 395384 395383 Dde_1360 Dde_1361     FALSE 0.039 47.000 0.000 NA N -0.262
 3334259 395380 Dde_1365 Dde_1366     TRUE 0.671 75.000 0.052 1.000 N 0.067
 395380 3334260 Dde_1366 Dde_1367     TRUE 0.994 -3.000 0.620 1.000 N -0.164
 3334260 395378 Dde_1367 Dde_1368     TRUE 0.989 -16.000 0.075 1.000 N 0.913
 395378 3334262 Dde_1368 Dde_1370     TRUE 0.559 179.000 0.005 1.000 Y 0.832
 3334262 395376 Dde_1370 Dde_1371     TRUE 0.936 134.000 0.182 1.000 Y 0.869
 395376 395375 Dde_1371 Dde_1372   lpxD TRUE 0.992 13.000 0.010 1.000 Y 0.932
 395375 395374 Dde_1372 Dde_1373 lpxD fabZ TRUE 0.996 0.000 0.212 1.000 N 0.893
 395374 395373 Dde_1373 Dde_1374 fabZ lpxA TRUE 0.987 2.000 0.019 1.000 N 0.835
 395373 395372 Dde_1374 Dde_1375 lpxA   FALSE 0.463 166.000 0.034 NA   0.588
 395372 395371 Dde_1375 Dde_1376     TRUE 0.886 33.000 0.017 NA   NA
 395371 3334263 Dde_1376 Dde_1377     TRUE 0.806 31.000 0.000 0.015   NA
 3334263 395369 Dde_1377 Dde_1378   thiM FALSE 0.022 279.000 0.000 1.000   NA
 395369 395368 Dde_1378 Dde_1379 thiM thiE TRUE 0.998 -3.000 0.146 0.005 Y 0.693
 395368 395367 Dde_1379 Dde_1380 thiE   FALSE 0.227 65.000 0.000 NA   0.286
 395365 395364 Dde_1382 Dde_1384 fragments   FALSE 0.149 201.000 0.000 1.000   0.765
 395364 395363 Dde_1384 Dde_1385     TRUE 0.982 50.000 0.429 1.000   0.742
 395363 395362 Dde_1385 Dde_1386     TRUE 0.835 167.000 0.143 0.053 Y 0.626
 395362 395361 Dde_1386 Dde_1387     TRUE 0.997 -3.000 0.536 1.000 Y -0.111
 395361 395360 Dde_1387 Dde_1388     FALSE 0.024 275.000 0.000 1.000 Y -0.783
 395360 3334265 Dde_1388 Dde_1389     TRUE 0.826 60.000 0.088 NA   0.191
 3334265 3334266 Dde_1389 Dde_1390     TRUE 0.665 63.000 0.008 NA   0.471
 3334266 3334267 Dde_1390 Dde_1391     TRUE 0.739 62.000 0.006 1.000   0.657
 3334267 395356 Dde_1391 Dde_1392   ubiA TRUE 0.746 31.000 0.010 1.000   -0.308
 395356 395355 Dde_1392 Dde_1393 ubiA   TRUE 0.903 28.000 0.014 NA   0.410
 395355 395354 Dde_1393 Dde_1394     FALSE 0.259 167.000 0.000 NA   0.828
 395354 395353 Dde_1394 Dde_1395     FALSE 0.296 83.000 0.000 NA   0.511
 395352 395351 Dde_1396 Dde_1397     TRUE 0.664 29.000 0.000 1.000   NA
 395348 395347 Dde_1401 Dde_1402     TRUE 0.949 23.000 0.046 0.021 N -0.122
 395347 10942587 Dde_1402 Dde_4000     TRUE 0.994 -15.000 0.118 0.021 Y NA
 10942587 395345 Dde_4000 Dde_1404     TRUE 0.939 -9.000 0.007 1.000   NA
 395344 3334271 Dde_1405 Dde_1406 flrC   FALSE 0.004 352.000 0.000 1.000 N 0.281
 3334271 395342 Dde_1406 Dde_1407     TRUE 0.551 36.000 0.000 1.000 N 0.519
 395342 3334272 Dde_1407 Dde_1408     FALSE 0.183 180.000 0.000 NA   0.746
 395340 395339 Dde_1409 Dde_1410 dnaB rplI TRUE 0.978 -52.000 0.017 1.000 N 0.835
 395339 395338 Dde_1410 Dde_1411 rplI rpsR TRUE 0.999 11.000 0.499 0.016 Y 0.975
 395338 395337 Dde_1411 Dde_1412 rpsR rpsF TRUE 0.999 2.000 0.319 0.016 Y 0.786
 395335 395334 Dde_1415 Dde_1416 tolC   TRUE 0.500 64.000 0.000 1.000 N 0.681
 395333 395332 Dde_1418 Dde_1419 rtxB rtxD TRUE 0.934 33.000 0.096 0.048 N -0.072
 395332 3334276 Dde_1419 Dde_1420 rtxD   TRUE 0.994 0.000 0.545 1.000   -0.374
 3334276 395330 Dde_1420 Dde_1421     TRUE 0.998 16.000 0.600 1.000   0.772
 395329 395328 Dde_1422 Dde_1423 gid   FALSE 0.268 86.000 0.000 1.000 N 0.564
 395328 395327 Dde_1423 Dde_1424     FALSE 0.042 62.000 0.000 1.000 N 0.079
 3334277 395325 Dde_1425 Dde_1426   cstC TRUE 0.834 46.000 0.008 1.000 N 0.685
 395325 3334278 Dde_1426 Dde_1427 cstC   FALSE 0.011 188.000 0.000 NA   -0.016
 3334278 395323 Dde_1427 Dde_1428   glnQ FALSE 0.030 356.000 0.000 NA   0.691
 395323 395322 Dde_1428 Dde_1429 glnQ   TRUE 0.973 66.000 0.667 1.000 Y -0.289
 395322 395321 Dde_1429 Dde_1430   gltJ TRUE 0.984 84.000 0.833 0.040 Y 0.065
 395321 395320 Dde_1430 Dde_1431 gltJ   TRUE 1.000 10.000 1.000 0.012 Y 0.528
 395320 395319 Dde_1431 Dde_1432   prmA TRUE 0.889 2.000 0.006 1.000 N 0.026
 3334280 395316 Dde_1435 Dde_1436     TRUE 0.985 0.000 0.017 1.000 N 0.810
 395316 395315 Dde_1436 Dde_1437     TRUE 0.995 30.000 0.408 0.025 N 0.854
 395315 395314 Dde_1437 Dde_1438     TRUE 0.915 97.000 0.210 1.000   0.741
 395314 395313 Dde_1438 Dde_1439   ndk TRUE 0.493 81.000 0.002 1.000   0.469
 395313 395312 Dde_1439 Dde_1440 ndk proC TRUE 0.981 0.000 0.013 1.000 N 0.771
 395309 395308 Dde_1443 Dde_1444     FALSE 0.382 166.000 0.021 NA   0.520
 395308 395307 Dde_1444 Dde_1445     TRUE 0.997 4.000 0.092 1.000 Y 0.845
 395307 395306 Dde_1445 Dde_1446     FALSE 0.055 283.000 0.003 1.000   0.453
 395306 395305 Dde_1446 Dde_1447   RluD TRUE 0.610 61.000 0.009 1.000   0.246
 395304 3334281 Dde_1448 Dde_1449 upp   TRUE 0.743 172.000 0.101 0.001 Y 0.200
 3334282 395302 Dde_1450 Dde_1452   cmk FALSE 0.104 149.000 0.000 1.000   0.379
 395302 395301 Dde_1452 Dde_1453 cmk hisC TRUE 0.959 -7.000 0.004 1.000 N 0.714
 395301 395300 Dde_1453 Dde_1454 hisC   FALSE 0.242 109.000 0.000 1.000 N 0.628
 395299 3334285 Dde_1455 Dde_1457     FALSE 0.002 206.000 0.000 NA   -0.386
 395296 395295 Dde_1459 Dde_1460     FALSE 0.283 26.000 0.000 NA   -0.031
 395295 395294 Dde_1460 Dde_1461   glk FALSE 0.275 143.000 0.022 NA   -0.585
 395294 395293 Dde_1461 Dde_1462 glk   TRUE 0.832 44.000 0.088 NA   -0.607
 395293 3334286 Dde_1462 Dde_1463     TRUE 0.983 3.000 0.118 NA   0.121
 395291 395290 Dde_1464 Dde_1465   hisA FALSE 0.001 260.000 0.000 NA   -0.629
 395290 395289 Dde_1465 Dde_1466 hisA   TRUE 0.988 -3.000 0.019 NA   0.914
 395289 395288 Dde_1466 Dde_1467   hisB TRUE 0.987 0.000 0.018 NA   0.827
 395288 395287 Dde_1467 Dde_1468 hisB TatC TRUE 0.944 31.000 0.011 1.000 N 0.861
 395287 395286 Dde_1468 Dde_1469 TatC tatB TRUE 0.995 -3.000 0.014 0.009 Y 0.777
 395286 395285 Dde_1469 Dde_1470 tatB guaA TRUE 0.894 37.000 0.002 1.000 N 0.894
 395285 395284 Dde_1470 Dde_1471 guaA guaB TRUE 0.992 48.000 0.190 0.001 Y 0.958
 395284 395283 Dde_1471 Dde_1473 guaB   FALSE 0.030 377.000 0.000 1.000   0.714
 395283 11399280 Dde_1473 Dde_4022     TRUE 0.815 -7.000 0.000 NA   NA
 11399280 395281 Dde_4022 Dde_1474   ccmC TRUE 0.971 11.000 0.021 NA   NA
 395281 395280 Dde_1474 Dde_1475 ccmC ccmB TRUE 0.988 55.000 0.501 0.001 Y 0.203
 395280 395279 Dde_1475 Dde_1476 ccmB   TRUE 0.977 -6.000 0.196 1.000 N -0.267
 395279 395278 Dde_1476 Dde_1477   ccmF TRUE 0.961 -10.000 0.050 1.000 N 0.205
 395278 395277 Dde_1477 Dde_1478 ccmF   TRUE 0.660 128.000 0.013 0.003 Y -0.236
 395277 395276 Dde_1478 Dde_1479     FALSE 0.417 130.000 0.026 1.000   -0.081
 395275 395274 Dde_1481 Dde_1482   rfaQ TRUE 0.967 0.000 0.075 1.000 N -0.179
 395271 395270 Dde_1485 Dde_1486     TRUE 0.995 -3.000 0.250 NA   0.696
 3334289 3334290 Dde_1487 Dde_1488     TRUE 0.621 31.000 0.000 NA   0.426
 395267 395266 Dde_1489 Dde_1490 cbhK cutA TRUE 0.983 5.000 0.027 1.000 N 0.677
 395265 395264 Dde_1491 Dde_1492 nth   TRUE 0.990 0.000 0.003 1.000 Y 0.937
 395264 395263 Dde_1492 Dde_1493   cheV-2 FALSE 0.361 78.000 0.017 1.000 N -0.798
 395263 395262 Dde_1493 Dde_1494 cheV-2 cat TRUE 0.846 37.000 0.000 1.000   0.957
 395262 395261 Dde_1494 Dde_1495 cat   FALSE 0.389 72.000 0.000 NA   0.575
 395260 395259 Dde_1496 Dde_1497 metK   TRUE 0.971 -13.000 0.003 NA   0.886
 395259 395258 Dde_1497 Dde_1498   panC TRUE 0.943 17.000 0.000 NA   0.837
 3334291 395254 Dde_1501 Dde_1502   flaB3 FALSE 0.201 230.000 0.000 0.002 Y 0.459
 395254 395253 Dde_1502 Dde_1503 flaB3   FALSE 0.407 141.000 0.033 NA   -0.060
 395253 395252 Dde_1503 Dde_1504     FALSE 0.049 139.000 0.000 NA   0.105
 395252 3334293 Dde_1504 Dde_1506     FALSE 0.050 123.000 0.000 1.000   0.022
 3334293 395250 Dde_1506 Dde_1507     TRUE 0.494 113.000 0.032 1.000   -0.014
 395250 3334294 Dde_1507 Dde_1508     TRUE 0.987 28.000 0.310 1.000   0.630
 3334294 395248 Dde_1508 Dde_1509     TRUE 0.996 3.000 0.209 0.040   0.629
 395248 395247 Dde_1509 Dde_1510   rbsA TRUE 0.987 10.000 0.140 1.000   0.282
 395247 395246 Dde_1510 Dde_1511 rbsA   FALSE 0.054 269.000 0.000 1.000   0.657
 395244 395243 Dde_1513 Dde_1514 hflB folP TRUE 0.987 3.000 0.325 1.000 N -0.492
 395243 395242 Dde_1514 Dde_1515 folP   TRUE 0.981 10.000 0.133 NA   -0.155
 395242 395241 Dde_1515 Dde_1516     TRUE 0.998 4.000 0.502 NA   0.890
 395241 395240 Dde_1516 Dde_1517   glmM TRUE 0.812 79.000 0.150 NA   0.198
 395240 395239 Dde_1517 Dde_1518 glmM galU TRUE 0.888 34.000 0.004 1.000 N 0.742
 395239 3334295 Dde_1518 Dde_1519 galU   TRUE 0.678 19.000 0.003 1.000 N -0.418
 3334295 395237 Dde_1519 Dde_1520     TRUE 0.822 22.000 0.003 NA   0.121
 395237 395236 Dde_1520 Dde_1521     TRUE 0.851 143.000 0.750 NA   -0.722
 395236 3334296 Dde_1521 Dde_1522     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.031 Y 0.269
 395233 395232 Dde_1527 Dde_1528     FALSE 0.162 119.000 0.000 NA   NA
 395232 3334299 Dde_1528 Dde_1529     TRUE 0.507 99.000 0.011 1.000 N 0.487
 395228 395227 Dde_1532 Dde_1533   typA FALSE 0.005 163.000 0.000 NA   -0.273
 395227 395226 Dde_1533 Dde_1534 typA   FALSE 0.049 155.000 0.000 NA N 0.348
 11399281 395225 Dde_4023 Dde_1536     TRUE 0.841 12.000 0.000 NA   NA
 395223 395222 Dde_1538 Dde_1539 pomA motB TRUE 0.998 -10.000 0.571 1.000 Y 0.388
 395222 395221 Dde_1539 Dde_1540 motB   TRUE 0.998 6.000 0.462 NA   0.949
 395221 395220 Dde_1540 Dde_1541   accC TRUE 0.998 18.000 0.643 NA   0.841
 395220 395219 Dde_1541 Dde_1542 accC   TRUE 0.610 184.000 0.015 1.000 Y 0.786
 395219 395218 Dde_1542 Dde_1543     TRUE 0.762 51.000 0.010 NA   0.522
 395218 395217 Dde_1543 Dde_1544     TRUE 0.974 4.000 0.028 NA   0.384
 395217 395216 Dde_1544 Dde_1545   ssb TRUE 0.980 31.000 0.480 NA   -0.016
 395214 395213 Dde_1547 Dde_1548 alr   FALSE 0.011 107.000 0.000 1.000 N 0.026
 395213 395212 Dde_1548 Dde_1549     TRUE 0.997 1.000 0.533 NA Y -0.015
 395212 395211 Dde_1549 Dde_1550     TRUE 0.999 -3.000 0.500 NA Y 0.806
 395211 395210 Dde_1550 Dde_1551     TRUE 0.969 56.000 0.258 1.000 N 0.879
 395210 395209 Dde_1551 Dde_1552   flrA FALSE 0.219 169.000 0.000 1.000 N 0.825
 395209 395208 Dde_1552 Dde_1553 flrA ald FALSE 0.016 324.000 0.000 1.000 N 0.551
 395208 3334301 Dde_1553 Dde_1554 ald   FALSE 0.000 547.000 0.000 1.000 N -0.130
 3334301 395206 Dde_1554 Dde_1555   thiG TRUE 0.991 0.000 0.037 1.000 Y 0.558
 395206 395205 Dde_1555 Dde_1556 thiG thiH TRUE 0.999 -3.000 0.277 0.005 Y 0.915
 395205 3334302 Dde_1556 Dde_1557 thiH   TRUE 0.995 -3.000 0.037 1.000 Y 0.839
 3334302 395203 Dde_1557 Dde_1558   thiE TRUE 0.996 0.000 0.047 1.000 Y 0.860
 395203 3334303 Dde_1558 Dde_1559 thiE   FALSE 0.001 277.000 0.000 1.000 N 0.021
 3334303 395201 Dde_1559 Dde_1560     TRUE 0.944 0.000 0.000 1.000 N 0.766
 395201 3334304 Dde_1560 Dde_1561     TRUE 0.577 112.000 0.000 0.037 Y 0.510
 3334304 395199 Dde_1561 Dde_1562     TRUE 0.988 -3.000 0.250 1.000 N 0.204
 395199 395198 Dde_1562 Dde_1563     TRUE 0.990 12.000 0.357 NA N -0.025
 395196 395195 Dde_1565 Dde_1566     FALSE 0.301 68.000 0.000 NA   NA
 395195 3334305 Dde_1566 Dde_1567     FALSE 0.089 161.000 0.000 NA   NA
 3334305 395193 Dde_1567 Dde_1568     FALSE 0.085 166.000 0.000 1.000   NA
 395193 395192 Dde_1568 Dde_1569   spoT TRUE 0.988 1.000 0.167 1.000   0.280
 395190 395189 Dde_1571 Dde_1572 cheB-2   TRUE 0.651 82.000 0.020 1.000 N 0.485
 395189 395188 Dde_1572 Dde_1573   cheR TRUE 0.991 1.000 0.250 1.000 N 0.425
 395188 395187 Dde_1573 Dde_1574 cheR parA TRUE 0.907 55.000 0.057 1.000 N 0.714
 395187 395186 Dde_1574 Dde_1575 parA   TRUE 0.989 -6.000 0.057 1.000 N 0.797
 395186 395185 Dde_1575 Dde_1576   cheY-2 TRUE 0.999 12.000 0.615 1.000 Y 0.950
 395185 395184 Dde_1576 Dde_1577 cheY-2 cheA-2 TRUE 0.991 103.000 0.909 1.000 Y 0.928
 3334307 395181 Dde_1580 Dde_1581   drpA TRUE 0.565 64.000 0.014 1.000   -0.123
 395181 395180 Dde_1581 Dde_1582 drpA   TRUE 0.844 33.000 0.010 NA   0.394
 395180 395179 Dde_1582 Dde_1583     TRUE 0.996 12.000 0.529 NA   0.510
 395179 3334308 Dde_1583 Dde_1584     TRUE 0.998 8.000 0.471 1.000 Y 0.338
 3334308 395177 Dde_1584 Dde_1585   xerC TRUE 0.949 -25.000 0.015 1.000 N 0.534
 395176 395175 Dde_1586 Dde_1587 fabK   TRUE 0.730 96.000 0.011 NA   0.769
 395175 395174 Dde_1587 Dde_1588     TRUE 0.979 18.000 0.117 NA   0.369
 395174 395173 Dde_1588 Dde_1589   pfk TRUE 0.934 2.000 0.015 1.000 N 0.015
 395173 395172 Dde_1589 Dde_1590 pfk   FALSE 0.137 187.000 0.000 NA   0.697
 395172 395171 Dde_1590 Dde_1591     TRUE 0.985 16.000 0.019 NA   0.877
 395170 395169 Dde_1593 Dde_1594   metG TRUE 0.946 44.000 0.059 NA   0.736
 395168 11399282 Dde_1595 Dde_4024     TRUE 0.791 -16.000 0.000 NA   NA
 11399282 395167 Dde_4024 Dde_1596   dmt TRUE 0.854 8.000 0.000 NA   NA
 395167 395166 Dde_1596 Dde_1598 dmt feoB FALSE 0.000 430.000 0.000 NA N -0.787
 395166 395165 Dde_1598 Dde_1599 feoB feoA TRUE 0.983 2.000 0.000 1.000 Y 0.869
 395165 395164 Dde_1599 Dde_1600 feoA fepA FALSE 0.445 174.000 0.000 1.000 Y 0.947
 395164 395163 Dde_1600 Dde_1601 fepA   FALSE 0.224 182.000 0.000 0.052 N 0.742
 395163 395162 Dde_1601 Dde_1602     TRUE 0.988 -7.000 0.000 0.004 Y 0.951
 395162 395161 Dde_1602 Dde_1603     TRUE 0.964 3.000 0.000 1.000   0.916
 395161 395160 Dde_1603 Dde_1604     TRUE 0.871 -16.000 0.000 1.000   0.595
 395160 395159 Dde_1604 Dde_1605     TRUE 0.897 -13.000 0.000 1.000 N 0.690
 395158 3334311 Dde_1606 Dde_1607     FALSE 0.089 161.000 0.000 NA   NA
 395156 395155 Dde_1608 Dde_1609     TRUE 0.724 96.000 0.000 0.001 Y 0.599
 3334313 395153 Dde_1611 Dde_1612     FALSE 0.012 231.000 0.000 NA   0.119
 395153 395152 Dde_1612 Dde_1614     FALSE 0.009 318.000 0.000 NA   0.250
 395152 11399283 Dde_1614 Dde_4025     TRUE 0.993 0.000 0.286 NA   NA
 11399283 3334315 Dde_4025 Dde_1615     TRUE 0.982 -19.000 0.133 NA   NA
 3334315 3334316 Dde_1615 Dde_1616     TRUE 0.993 22.000 0.268 NA   0.816
 3334316 395148 Dde_1616 Dde_1617     TRUE 0.991 23.000 0.195 NA   0.836
 395147 395146 Dde_1618 Dde_1619 mdaB   FALSE 0.005 160.000 0.000 NA   -0.914
 395146 395145 Dde_1619 Dde_1620     TRUE 0.937 -3.000 0.000 NA   0.714
 395145 395144 Dde_1620 Dde_1621     TRUE 0.998 -3.000 0.432 NA   0.835
 395143 395142 Dde_1622 Dde_1623     TRUE 0.996 2.000 0.081 1.000 Y 0.771
 395142 395141 Dde_1623 Dde_1624   fepC TRUE 0.999 10.000 0.640 1.000 Y 0.441
 395141 395140 Dde_1624 Dde_1625 fepC   TRUE 0.985 11.000 0.120 1.000 N 0.412
 395140 395139 Dde_1625 Dde_1627     FALSE 0.010 174.000 0.000 1.000 N 0.123
 395134 395133 Dde_1632 Dde_1633 nadD proA TRUE 0.935 60.000 0.170 1.000 N 0.707
 395132 3334318 Dde_1634 Dde_1635     FALSE 0.168 211.000 0.000 1.000   0.910
 395130 395129 Dde_1636 Dde_1637   oorC TRUE 0.860 84.000 0.030 NA   0.945
 395129 395128 Dde_1637 Dde_1638 oorC oorB TRUE 0.999 -3.000 0.505 0.004 Y 0.926
 395128 395126 Dde_1638 Dde_1639 oorB oorA TRUE 1.000 8.000 0.771 0.004 Y 0.941
 395126 11399284 Dde_1639 Dde_4026 oorA   TRUE 0.999 2.000 0.469 0.004 Y NA
 395123 395122 Dde_1642 Dde_1643     FALSE 0.060 143.000 0.000 NA   0.184
 395122 395121 Dde_1643 Dde_1644     FALSE 0.415 50.000 0.000 NA   0.432
 395119 395118 Dde_1647 Dde_1648     FALSE 0.032 200.000 0.000 1.000 N NA
 11399285 3334323 Dde_4027 Dde_1650     FALSE 0.066 176.000 0.000 NA   NA
 395116 395115 Dde_1651 Dde_1652     TRUE 0.989 -3.000 0.182 NA   0.422
 395115 395114 Dde_1652 Dde_1653   phoH TRUE 0.987 -22.000 0.172 1.000   0.539
 395113 395112 Dde_1654 Dde_1656     TRUE 0.562 145.000 0.143 NA   -0.110
 395112 395111 Dde_1656 Dde_1657     TRUE 0.867 50.000 0.010 1.000 N 0.816
 395109 395108 Dde_1659 Dde_1660 cbpA   TRUE 0.966 35.000 0.326 NA   0.196
 395108 395107 Dde_1660 Dde_1661   clpB TRUE 0.916 35.000 0.015 NA   0.672
 395107 395106 Dde_1661 Dde_1662 clpB ppiB FALSE 0.037 226.000 0.000 1.000 Y -0.785
 395106 395105 Dde_1662 Dde_1663 ppiB aspA FALSE 0.298 160.000 0.015 1.000 N 0.407
 395105 3334325 Dde_1663 Dde_1664 aspA   TRUE 0.987 -3.000 0.273 NA   -0.257
 405434 395101 Dde_1668 Dde_1669   btuR TRUE 0.912 22.000 0.000 NA N 0.889
 395101 395100 Dde_1669 Dde_1670 btuR pflA TRUE 0.940 0.000 0.014 1.000 N 0.155
 395100 3334328 Dde_1670 Dde_1671 pflA   TRUE 0.856 16.000 0.000 NA   0.540
 395098 395096 Dde_1673 Dde_1676     FALSE 0.151 134.000 0.000 1.000   NA
 395095 395094 Dde_1677 Dde_1678     TRUE 0.998 14.000 0.600 NA   0.681
 3334330 395089 Dde_1682 Dde_1684   hydH FALSE 0.061 196.000 0.000 1.000 N 0.593
 395089 395088 Dde_1684 Dde_1685 hydH atoC TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y 0.256
 395088 395087 Dde_1685 Dde_1686 atoC   TRUE 0.789 140.000 0.250 NA   0.483
 395087 395086 Dde_1686 Dde_1687     TRUE 0.930 85.000 0.667 NA   -0.172
 395085 395084 Dde_1688 Dde_1689     TRUE 0.901 85.000 0.500 NA   -0.109
 395084 395083 Dde_1689 Dde_1690   lpdA FALSE 0.412 133.000 0.031 1.000 N 0.067
 395083 395082 Dde_1690 Dde_1691 lpdA gcvP TRUE 0.979 -10.000 0.012 1.000 N 0.952
 395082 395081 Dde_1691 Dde_1692 gcvP gcvP TRUE 0.999 0.000 0.316 0.001 Y 0.904
 395081 395080 Dde_1692 Dde_1693 gcvP gcvH TRUE 0.998 19.000 0.249 0.001 Y 0.773
 395080 395079 Dde_1693 Dde_1694 gcvH   TRUE 0.547 144.000 0.006 1.000 N 0.937
 395079 395078 Dde_1694 Dde_1695   pgm TRUE 0.497 151.000 0.005 1.000 N 0.870
 395078 395077 Dde_1695 Dde_1696 pgm   FALSE 0.009 128.000 0.000 1.000   -0.547
 395077 395076 Dde_1696 Dde_1697     FALSE 0.002 199.000 0.000 1.000   -0.528
 395076 395075 Dde_1697 Dde_1698   ychF FALSE 0.006 151.000 0.000 1.000 N -0.502
 395075 395074 Dde_1698 Dde_1699 ychF   FALSE 0.010 122.000 0.000 1.000 N -0.194
 395072 395071 Dde_1701 Dde_1702     TRUE 0.550 81.000 0.045 NA   -0.832
 395071 395070 Dde_1702 Dde_1703   exuT TRUE 0.638 126.000 0.158 NA   -0.177
 395065 395064 Dde_1711 Dde_1712 flgE flgD TRUE 0.936 78.000 0.041 NA Y 0.836
 395064 395063 Dde_1712 Dde_1713 flgD   FALSE 0.300 15.000 0.000 NA   -0.105
 395063 395062 Dde_1713 Dde_1714     FALSE 0.011 109.000 0.000 1.000   -0.655
 395062 395061 Dde_1714 Dde_1715     TRUE 0.991 -3.000 0.333 NA   0.102
 395061 395060 Dde_1715 Dde_1716     FALSE 0.230 5.000 0.000 NA   -0.595
 395060 395059 Dde_1716 Dde_1717   pomA TRUE 0.997 7.000 0.500 1.000 Y -0.021
 395059 395058 Dde_1717 Dde_1718 pomA   TRUE 0.980 27.000 0.364 0.052 N -0.451
 395058 395057 Dde_1718 Dde_1719     TRUE 0.934 64.000 0.182 1.000 N 0.721
 395056 3334336 Dde_1720 Dde_1721     FALSE 0.089 161.000 0.000 NA   NA
 395054 395053 Dde_1722 Dde_1723     TRUE 0.889 -19.000 0.000 1.000 Y 0.052
 395053 395052 Dde_1723 Dde_1724   dtd TRUE 0.966 -34.000 0.004 1.000 N 0.934
 395052 395051 Dde_1724 Dde_1725 dtd fadD TRUE 0.953 -3.000 0.004 1.000 N 0.641
 395051 395050 Dde_1725 Dde_1726 fadD   TRUE 0.504 111.000 0.003 1.000 Y 0.143
 395050 395049 Dde_1726 Dde_1728     FALSE 0.003 431.000 0.000 NA   0.121
 395049 395048 Dde_1728 Dde_1729     TRUE 0.936 56.000 0.055 NA   0.927
 395046 3334340 Dde_1731 Dde_1732     FALSE 0.057 318.000 0.000 NA   0.799
 3334340 405432 Dde_1732 Dde_1734     FALSE 0.014 320.000 0.000 NA   NA
 405432 395045 Dde_1734 Dde_1735   pin FALSE 0.004 748.000 0.000 NA   NA
 395044 395043 Dde_1737 Dde_1738     FALSE 0.130 141.000 0.000 NA   NA
 395043 395042 Dde_1738 Dde_1739     FALSE 0.008 436.000 0.000 NA   NA
 395042 395041 Dde_1739 Dde_1741     FALSE 0.157 212.000 0.000 NA   0.866
 395041 395040 Dde_1741 Dde_1742     FALSE 0.016 178.000 0.000 NA N 0.220
 395040 395039 Dde_1742 Dde_1743     TRUE 0.975 12.000 0.000 0.056   0.937
 395039 395038 Dde_1743 Dde_1744     TRUE 0.737 34.000 0.000 0.056   NA
 395038 395036 Dde_1744 Dde_1747     FALSE 0.005 595.000 0.000 NA   NA
 395036 395035 Dde_1747 Dde_1748     TRUE 0.998 -3.000 0.565 NA   0.892
 395033 395032 Dde_1753 Dde_1755     FALSE 0.009 327.000 0.000 1.000   0.264
 395031 395030 Dde_1756 Dde_1757   gpmA TRUE 0.988 0.000 0.020 NA   0.802
 395030 405431 Dde_1757 Dde_1758 gpmA   TRUE 0.976 -3.000 0.018 NA   0.633
 395028 3334350 Dde_1761 Dde_1762     TRUE 0.985 0.000 0.019 NA   0.727
 395027 395026 Dde_1763 Dde_1764   purL FALSE 0.257 70.000 0.003 NA   -0.478
 395025 395024 Dde_1765 Dde_1766 pyrG kdsA TRUE 0.676 181.000 0.138 1.000 N 0.970
 395024 395023 Dde_1766 Dde_1767 kdsA   TRUE 0.990 -10.000 0.048 1.000   0.879
 395023 3334351 Dde_1767 Dde_1768     TRUE 0.992 1.000 0.119 NA   0.669
 3334351 395021 Dde_1768 Dde_1769     TRUE 0.989 -13.000 0.051 NA   0.879
 395021 395020 Dde_1769 Dde_1770     TRUE 0.997 1.000 0.543 NA   0.541
 395020 395019 Dde_1770 Dde_1771   rpoN FALSE 0.238 193.000 0.059 1.000   -0.141
 395019 3334352 Dde_1771 Dde_1772 rpoN   TRUE 0.980 52.000 0.632 NA N 0.632
 3334352 395017 Dde_1772 Dde_1773   ptsN TRUE 0.993 4.000 0.561 NA N -0.461
 395017 395016 Dde_1773 Dde_1774 ptsN   TRUE 0.875 62.000 0.030 NA   0.715
 395016 3334353 Dde_1774 Dde_1775     TRUE 0.945 39.000 0.171 NA   0.356
 3334353 395014 Dde_1775 Dde_1776   agaB TRUE 0.998 6.000 0.093 0.001 Y 0.756
 395014 3334354 Dde_1776 Dde_1777 agaB   TRUE 0.997 -40.000 0.409 0.003   0.676
 3334354 3334355 Dde_1777 Dde_1778     FALSE 0.302 146.000 0.018 1.000   -0.086
 395011 395010 Dde_1779 Dde_1780     TRUE 0.987 8.000 0.020 NA   0.765
 395009 395008 Dde_1781 Dde_1782     TRUE 0.976 14.000 0.023 1.000 N 0.654
 395008 395007 Dde_1782 Dde_1783   coaD TRUE 0.931 -24.000 0.004 1.000 N 0.632
 395007 395006 Dde_1783 Dde_1784 coaD miaA TRUE 0.965 21.000 0.017 1.000 N 0.717
 395006 395005 Dde_1784 Dde_1785 miaA   TRUE 0.941 0.000 0.000 1.000 N 0.752
 395005 395004 Dde_1785 Dde_1786   mltC TRUE 0.589 32.000 0.000 NA N 0.514
 395004 3334356 Dde_1786 Dde_1787 mltC   FALSE 0.382 122.000 0.000 NA Y 0.391
 3334358 394999 Dde_1791 Dde_1792   porA TRUE 0.908 58.000 0.033 1.000 N 0.877
 394999 394998 Dde_1792 Dde_1793 porA porB TRUE 1.000 4.000 0.724 0.001 Y 0.950
 394998 394997 Dde_1793 Dde_1794 porB   TRUE 0.986 10.000 0.020 NA   0.720
 394996 394995 Dde_1795 Dde_1796   glpX TRUE 0.881 62.000 0.018 NA   0.842
 394995 394994 Dde_1796 Dde_1797 glpX dapA FALSE 0.170 193.000 0.000 1.000 N 0.882
 394994 394993 Dde_1797 Dde_1798 dapA dapF TRUE 0.952 54.000 0.017 1.000 Y 0.917
 394993 394992 Dde_1798 Dde_1799 dapF himD FALSE 0.144 209.000 0.000 1.000 N 0.900
 394992 394991 Dde_1799 Dde_1800 himD   TRUE 0.531 90.000 0.072 1.000 N -0.877
 394991 394990 Dde_1800 Dde_1801     TRUE 0.990 16.000 0.081 1.000 N 0.912
 394990 394989 Dde_1801 Dde_1802     FALSE 0.195 80.000 0.000 1.000 N NA
 394989 394988 Dde_1802 Dde_1803     FALSE 0.089 161.000 0.000 NA   NA
 394988 394987 Dde_1803 Dde_1804     FALSE 0.238 85.000 0.000 NA   NA
 394987 394986 Dde_1804 Dde_1805   prfB TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   0.594
 394986 394985 Dde_1805 Dde_1806 prfB cutE TRUE 0.961 12.000 0.012 1.000 N 0.540
 394985 394984 Dde_1806 Dde_1807 cutE   TRUE 0.762 44.000 0.031 1.000 N -0.105
 394984 394983 Dde_1807 Dde_1808     FALSE 0.377 123.000 0.008 NA   0.336
 394983 394982 Dde_1808 Dde_1809   gidA FALSE 0.349 105.000 0.005 NA   0.265
 394982 394981 Dde_1809 Dde_1810 gidA   TRUE 0.814 42.000 0.011 1.000 N 0.559
 394981 394980 Dde_1810 Dde_1811     TRUE 0.811 151.000 0.120 NA   0.880
 394980 394979 Dde_1811 Dde_1812     TRUE 0.850 119.000 0.101 NA   0.819
 394978 394977 Dde_1813 Dde_1814   gltB-1 FALSE 0.021 240.000 0.000 1.000   0.292
 394977 394976 Dde_1814 Dde_1815 gltB-1   TRUE 0.991 66.000 0.588 0.002 Y 0.646
 394976 394975 Dde_1815 Dde_1816   gltB TRUE 0.999 2.000 0.159 0.002 Y 0.891
 394975 394974 Dde_1816 Dde_1817 gltB Preprotein translocase yajC FALSE 0.319 103.000 0.005 1.000 N 0.307
 394974 394973 Dde_1817 Dde_1818 Preprotein translocase yajC secD TRUE 0.623 187.000 0.044 0.004 Y 0.395
 394973 394972 Dde_1818 Dde_1819 secD secF TRUE 0.999 13.000 0.370 0.001 Y 0.916
 394972 394971 Dde_1819 Dde_1821 secF   FALSE 0.190 174.000 0.000 1.000 N 0.778
 394971 394970 Dde_1821 Dde_1822     TRUE 0.665 28.000 0.000 0.065   0.033
 394970 394969 Dde_1822 Dde_1823   cyoB TRUE 0.993 47.000 1.000 0.065   0.575
 394969 394968 Dde_1823 Dde_1824 cyoB cyoC TRUE 1.000 -7.000 0.923 0.001 Y 0.852
 394968 394967 Dde_1824 Dde_1825 cyoC   TRUE 0.999 9.000 0.481 0.001   0.734
 394967 394966 Dde_1825 Dde_1826   coxB TRUE 0.998 8.000 0.444 0.001   0.613
 394966 3334360 Dde_1826 Dde_1827 coxB   TRUE 0.992 0.000 0.041 0.046 N 0.790
 3334360 394964 Dde_1827 Dde_1828     TRUE 0.969 13.000 0.014 NA   0.589
 394963 394962 Dde_1829 Dde_1830 nadB nadA TRUE 0.999 15.000 0.210 0.002 Y 0.907
 394962 394961 Dde_1830 Dde_1831 nadA nadC TRUE 0.999 4.000 0.198 0.002 Y 0.817
 394959 394958 Dde_1833 Dde_1834     FALSE 0.013 97.000 0.000 NA   -0.623
 3334361 394956 Dde_1835 Dde_1836   wcaC TRUE 0.990 -3.000 0.069 0.021 Y -0.252
 3334362 394953 Dde_1838 Dde_1839     TRUE 0.529 101.000 0.000 NA   0.928
 394952 394951 Dde_1840 Dde_1841     TRUE 0.517 67.000 0.008 NA   0.162
 3334363 394949 Dde_1842 Dde_1843     TRUE 0.999 -7.000 0.657 1.000 Y 0.878
 394949 394948 Dde_1843 Dde_1844     TRUE 0.999 -7.000 0.639 0.002   0.944
 394948 394947 Dde_1844 Dde_1846     FALSE 0.044 361.000 0.000 1.000   0.815
 394947 394946 Dde_1846 Dde_1847     FALSE 0.093 269.000 0.000 NA   0.827
 394946 394945 Dde_1847 Dde_1849     FALSE 0.134 228.000 0.000 NA   0.853
 3334366 10942588 Dde_1850 Dde_4001     FALSE 0.007 457.000 0.000 NA   NA
 10942588 394943 Dde_4001 Dde_1852     TRUE 0.968 -58.000 0.048 NA   NA
 394943 405428 Dde_1852 Dde_1853     TRUE 0.991 -7.000 0.214 NA   0.595
 405428 394942 Dde_1853 Dde_1854     TRUE 0.982 -3.000 0.077 NA   0.424
 394942 394941 Dde_1854 Dde_1855     TRUE 0.993 -3.000 0.125 1.000 N 0.779
 394941 394940 Dde_1855 Dde_1856     TRUE 0.970 -3.000 0.018 0.094 N 0.380
 394940 3334368 Dde_1856 Dde_1857     FALSE 0.352 70.000 0.000 NA   0.513
 3334368 394939 Dde_1857 Dde_1858     TRUE 0.658 61.000 0.000 NA   0.773
 394939 394938 Dde_1858 Dde_1859     TRUE 0.860 -10.000 0.000 0.055   0.245
 394938 394937 Dde_1859 Dde_1860     TRUE 0.995 -13.000 0.150 0.003 Y 0.285
 394937 394936 Dde_1860 Dde_1861     TRUE 0.996 -3.000 0.104 1.000 Y 0.762
 394936 394935 Dde_1861 Dde_1862     TRUE 0.991 10.000 0.100 0.055   0.493
 394935 394934 Dde_1862 Dde_1863     FALSE 0.005 161.000 0.000 NA   -0.301
 394934 394933 Dde_1863 Dde_1864     TRUE 0.958 -3.000 0.000 NA   0.876
 394933 394932 Dde_1864 Dde_1865     TRUE 0.994 -15.000 0.400 NA   0.548
 394932 394931 Dde_1865 Dde_1866     TRUE 0.998 12.000 0.667 NA   0.531
 394931 405427 Dde_1866 Dde_1867     FALSE 0.117 250.000 0.000 NA   0.910
 405427 394930 Dde_1867 Dde_1868     TRUE 0.996 13.000 0.500 NA   NA
 394930 394929 Dde_1868 Dde_1869     TRUE 0.804 16.000 0.000 NA   NA
 394929 3334369 Dde_1869 Dde_1870     TRUE 0.832 13.000 0.000 NA   NA
 3334369 11399287 Dde_1870 Dde_4029     TRUE 0.798 -13.000 0.000 NA   NA
 11399287 394928 Dde_4029 Dde_1871     TRUE 0.852 5.000 0.000 NA   NA
 394928 394927 Dde_1871 Dde_1872     TRUE 0.954 11.000 0.000 NA   0.784
 394927 394926 Dde_1872 Dde_1873     TRUE 0.893 11.000 0.000 NA   0.560
 394926 394925 Dde_1873 Dde_1874     TRUE 0.998 0.000 0.667 NA   0.570
 394925 394924 Dde_1874 Dde_1875     TRUE 0.943 100.000 0.667 NA   NA
 394924 394923 Dde_1875 Dde_1876     TRUE 0.998 0.000 0.750 NA   NA
 394923 394922 Dde_1876 Dde_1877     TRUE 0.832 13.000 0.000 NA   NA
 394922 11399288 Dde_1877 Dde_4030     TRUE 0.834 -3.000 0.000 NA   NA
 11399288 394921 Dde_4030 Dde_1878     TRUE 0.846 11.000 0.000 NA   NA
 394921 394920 Dde_1878 Dde_1879     TRUE 0.834 -3.000 0.000 NA   NA
 394920 394919 Dde_1879 Dde_1880     TRUE 0.822 14.000 0.000 NA   NA
 394919 394918 Dde_1880 Dde_1881     TRUE 0.815 -7.000 0.000 NA   NA
 394918 405426 Dde_1881 Dde_1882     TRUE 0.834 -3.000 0.000 NA   NA
 405426 394917 Dde_1882 Dde_1883     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   0.747
 394917 11399289 Dde_1883 Dde_4031     FALSE 0.306 67.000 0.000 NA   NA
 11399289 394915 Dde_4031 Dde_1884     TRUE 0.834 -3.000 0.000 NA   NA
 394915 3334370 Dde_1884 Dde_1885     TRUE 0.850 4.000 0.000 NA   NA
 3334370 394914 Dde_1885 Dde_1886     TRUE 0.854 9.000 0.000 NA   NA
 394914 394913 Dde_1886 Dde_1887     FALSE 0.384 144.000 0.000 NA   0.955
 394913 394912 Dde_1887 Dde_1888     TRUE 0.814 16.000 0.000 1.000   NA
 394912 394911 Dde_1888 Dde_1889     TRUE 0.804 16.000 0.000 NA   NA
 394911 11399290 Dde_1889 Dde_4032     TRUE 0.849 3.000 0.000 NA   NA
 11399290 394910 Dde_4032 Dde_1890     TRUE 0.832 13.000 0.000 NA   NA
 394910 405424 Dde_1890 Dde_1891     FALSE 0.011 106.000 0.000 NA   -0.164
 405424 394909 Dde_1891 Dde_1892     TRUE 0.537 89.000 0.000 1.000   0.782
 394908 10942589 Dde_1893 Dde_4009 mgtA   FALSE 0.323 64.000 0.000 NA   NA
 10942589 3334372 Dde_4009 Dde_1895     FALSE 0.074 169.000 0.000 NA   NA
 3334372 3334373 Dde_1895 Dde_1896     TRUE 0.650 72.000 0.000 NA   0.934
 3334373 3334374 Dde_1896 Dde_1897     TRUE 0.610 63.000 0.000 NA   0.723
 3334374 11399291 Dde_1897 Dde_4033     TRUE 0.791 -16.000 0.000 NA   NA
 394907 11399292 Dde_1899 Dde_4034     TRUE 0.805 -10.000 0.000 NA   NA
 11399292 394905 Dde_4034 Dde_1900     TRUE 0.809 -9.000 0.000 NA   NA
 394905 394904 Dde_1900 Dde_1901     TRUE 0.831 -16.000 0.000 NA   0.511
 394904 394903 Dde_1901 Dde_1902     TRUE 0.908 24.000 0.000 NA   0.801
 394903 394902 Dde_1902 Dde_1903     TRUE 0.937 19.000 0.000 NA   0.965
 394902 394901 Dde_1903 Dde_1904     TRUE 0.942 13.000 0.000 NA   0.732
 394901 394900 Dde_1904 Dde_1905     TRUE 0.729 104.000 0.091 NA   NA
 394900 394899 Dde_1905 Dde_1906     TRUE 0.834 -3.000 0.000 NA   NA
 394899 394898 Dde_1906 Dde_1907     TRUE 0.951 -3.000 0.000 NA   0.789
 394898 394897 Dde_1907 Dde_1908     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   0.723
 394897 394896 Dde_1908 Dde_1909     FALSE 0.112 115.000 0.000 NA   0.289
 394896 394895 Dde_1909 Dde_1910     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   0.646
 394895 394894 Dde_1910 Dde_1911     TRUE 0.834 -3.000 0.000 NA   NA
 3334376 394893 Dde_1912 Dde_1913     TRUE 0.570 34.000 0.000 NA   NA
 394893 394892 Dde_1913 Dde_1914     TRUE 0.997 -19.000 0.333 0.055   0.836
 394891 394890 Dde_1915 Dde_1916     TRUE 0.971 92.000 0.600 NA   0.795
 394890 394889 Dde_1916 Dde_1917     TRUE 0.997 4.000 0.600 NA   0.509
 394889 394888 Dde_1917 Dde_1919     FALSE 0.001 491.000 0.000 NA   -0.082
 394888 394887 Dde_1919 Dde_1920     TRUE 0.992 0.000 0.161 NA   0.623
 394887 394886 Dde_1920 Dde_1921     FALSE 0.369 93.000 0.002 NA   0.310
 394886 394885 Dde_1921 Dde_1922     TRUE 0.989 -3.000 0.003 1.000 Y 0.972
 394885 394884 Dde_1922 Dde_1923     TRUE 0.998 -48.000 0.600 1.000   0.977
 394884 394883 Dde_1923 Dde_1924     TRUE 0.999 0.000 0.600 NA   0.980
 394883 394882 Dde_1924 Dde_1925     TRUE 0.993 13.000 0.094 NA   0.950
 394882 394881 Dde_1925 Dde_1926     TRUE 0.985 27.000 0.094 NA   0.961
 394881 394880 Dde_1926 Dde_1927     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA   0.986
 394880 394879 Dde_1927 Dde_1928     TRUE 0.967 105.000 0.600 NA   0.967
 394879 394878 Dde_1928 Dde_1929     TRUE 0.868 196.000 0.600 NA   0.953
 394878 405422 Dde_1929 Dde_1930     FALSE 0.039 323.000 0.000 NA   0.700
 405422 394877 Dde_1930 Dde_1931     TRUE 0.997 -7.000 0.400 NA   0.877
 394877 394876 Dde_1931 Dde_1932     TRUE 0.892 47.000 0.008 NA   0.970
 405421 3334378 Dde_1933 Dde_1934     TRUE 0.994 35.000 0.600 NA   0.890
 3334378 394874 Dde_1934 Dde_1935     TRUE 0.998 -7.000 0.600 1.000   0.917
 394874 394873 Dde_1935 Dde_1936     TRUE 0.997 -3.000 0.429 NA   0.770
 11399293 394872 Dde_4035 Dde_1940     FALSE 0.004 733.000 0.000 NA   NA
 394872 394871 Dde_1940 Dde_1941     FALSE 0.040 88.000 0.000 NA   -0.060
 394871 394870 Dde_1941 Dde_1942     TRUE 0.980 20.000 0.000 0.029 Y 0.837
 394870 394869 Dde_1942 Dde_1943     TRUE 0.928 -3.000 0.000 0.029   0.471
 394869 394868 Dde_1943 Dde_1944     FALSE 0.243 88.000 0.000 1.000   NA
 394868 394866 Dde_1944 Dde_1946   bacA FALSE 0.002 2390.000 0.000 1.000 N NA
 394865 394864 Dde_1947 Dde_1948     TRUE 0.979 0.000 0.012 NA   0.690
 394864 394863 Dde_1948 Dde_1949     TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.045   0.887
 394861 394860 Dde_1952 Dde_1953 aroQ efp TRUE 0.873 52.000 0.010 1.000 N 0.888
 394860 3334383 Dde_1953 Dde_1955 efp   FALSE 0.456 110.000 0.011 1.000 N 0.485
 3334383 394858 Dde_1955 Dde_1956   lolA TRUE 0.992 16.000 0.120 1.000 N 0.857
 394857 394856 Dde_1958 Dde_1959 rluB   TRUE 0.840 63.000 0.013 1.000   0.753
 394855 394854 Dde_1960 Dde_1961 msbA   TRUE 0.939 12.000 0.000 NA   0.711
 394854 394853 Dde_1961 Dde_1962   htrB TRUE 0.984 -7.000 0.194 NA   0.122
 394852 394851 Dde_1968 Dde_1969   folK TRUE 0.954 25.000 0.004 NA   0.967
 394851 394850 Dde_1969 Dde_1970 folK aspC4 TRUE 0.870 60.000 0.015 1.000 N 0.945
 394849 394848 Dde_1971 Dde_1972 xerD   TRUE 0.963 17.000 0.028 1.000 N 0.501
 394848 394847 Dde_1972 Dde_1973   hit FALSE 0.287 174.000 0.023 1.000 N 0.421
 394847 394846 Dde_1973 Dde_1974 hit   TRUE 0.992 11.000 0.049 NA   0.825
 394846 394845 Dde_1974 Dde_1975     TRUE 0.993 18.000 0.318 NA   0.632
 394845 3334390 Dde_1975 Dde_1976     TRUE 0.953 81.000 0.364 1.000 N 0.771
 3334390 394843 Dde_1976 Dde_1977     TRUE 0.997 -10.000 0.357 NA   0.897
 394843 394842 Dde_1977 Dde_1978   lysA TRUE 0.961 23.000 0.006 NA   0.860
 394842 394841 Dde_1978 Dde_1979 lysA mgsA TRUE 0.880 14.000 0.000 1.000 N 0.635
 394841 3334391 Dde_1979 Dde_1980 mgsA   FALSE 0.148 109.000 0.000 1.000 N 0.469
 3334391 405418 Dde_1980 Dde_1981     TRUE 0.884 80.000 0.182 NA   0.576
 394839 394838 Dde_1982 Dde_1983     TRUE 0.987 2.000 0.111 NA   0.430
 394838 394837 Dde_1983 Dde_1984     TRUE 0.999 -3.000 0.854 NA Y 0.344
 394837 394836 Dde_1984 Dde_1985     TRUE 0.999 4.000 0.875 NA Y 0.527
 394836 394835 Dde_1985 Dde_1987     FALSE 0.006 196.000 0.000 NA N 0.153
 394835 394834 Dde_1987 Dde_1988   Preprotein translocase secG FALSE 0.004 173.000 0.000 NA N -0.068
 394834 394833 Dde_1988 Dde_1989 Preprotein translocase secG tpiA TRUE 0.804 49.000 0.044 1.000 N 0.202
 394833 394832 Dde_1989 Dde_1990 tpiA rimI TRUE 0.958 12.000 0.009 1.000   0.480
 394830 394829 Dde_1992 Dde_1993 suhB mreB TRUE 0.837 18.000 0.013 1.000 N -0.548
 394829 394828 Dde_1993 Dde_1994 mreB   TRUE 0.960 0.000 0.000 NA   0.972
 3334393 3334394 Dde_1995 Dde_1996     TRUE 0.824 63.000 0.019 NA   0.665
 3334394 3334395 Dde_1996 Dde_1997     TRUE 0.730 45.000 0.013 NA   0.113
 3334395 394824 Dde_1997 Dde_1998     FALSE 0.451 123.000 0.008 NA   0.522
 394824 394823 Dde_1998 Dde_1999     TRUE 0.641 102.000 0.003 NA   0.792
 394823 3334396 Dde_1999 Dde_2000     TRUE 0.925 19.000 0.000 NA   0.771
 3334396 394821 Dde_2000 Dde_2001     TRUE 0.739 33.000 0.000 NA   0.633
 394821 3334397 Dde_2001 Dde_2002     FALSE 0.027 400.000 0.000 1.000 N 0.766
 394819 394818 Dde_2003 Dde_2004   gltX TRUE 0.573 69.000 0.011 NA   0.214
 405417 394816 Dde_2006 Dde_2007     FALSE 0.033 389.000 0.000 NA   0.759
 394816 394815 Dde_2007 Dde_2008   hspC TRUE 0.997 12.000 0.083 NA Y 0.892
 394815 394814 Dde_2008 Dde_2010 hspC ppiC FALSE 0.305 162.000 0.028 NA   0.077
 394811 394810 Dde_2013 Dde_2014 degQ hslU FALSE 0.438 205.000 0.000 0.007 Y 0.861
 394810 394809 Dde_2014 Dde_2015 hslU argB TRUE 0.927 21.000 0.021 1.000 N 0.285
 394807 394805 Dde_2018 Dde_2020     FALSE 0.094 186.000 0.015 NA   -0.851
 394804 394803 Dde_2021 Dde_2022     TRUE 0.991 18.000 0.611 NA   -0.617
 394802 394801 Dde_2023 Dde_2024 cysG-1   TRUE 0.991 -13.000 0.104 1.000   0.792
 394801 394800 Dde_2024 Dde_2025   hemA TRUE 0.994 4.000 0.112 1.000   0.757
 394800 394799 Dde_2025 Dde_2026 hemA   TRUE 0.987 -3.000 0.020 1.000   0.817
 394799 394798 Dde_2026 Dde_2027     TRUE 0.859 58.000 0.011 1.000   0.803
 394798 3334401 Dde_2027 Dde_2028     TRUE 0.745 76.000 0.006 1.000 N 0.827
 394796 394795 Dde_2029 Dde_2030 trkH trkA TRUE 0.996 11.000 0.163 0.002 Y 0.263
 394795 394794 Dde_2030 Dde_2031 trkA rpsT FALSE 0.095 207.000 0.002 1.000 N 0.489
 394792 394791 Dde_2033 Dde_2034 glyS glyQ TRUE 0.999 12.000 0.651 0.001 Y 0.328
 394791 394790 Dde_2034 Dde_2035 glyQ   TRUE 0.651 57.000 0.036 1.000 N -0.414
 394790 394789 Dde_2035 Dde_2036     TRUE 0.888 21.000 0.021 1.000   -0.631
 394789 394788 Dde_2036 Dde_2037     TRUE 0.953 15.000 0.000 1.000   0.856
 394788 394787 Dde_2037 Dde_2038     TRUE 0.577 125.000 0.000 0.005   0.801
 394787 394786 Dde_2038 Dde_2039   mfd TRUE 0.924 22.000 0.004 1.000   0.606
 394786 394785 Dde_2039 Dde_2040 mfd cheW-2 FALSE 0.396 92.000 0.007 1.000 N 0.284
 394782 394781 Dde_2043 Dde_2044 pdxJ acpS TRUE 0.994 22.000 0.326 1.000 N 0.826
 394781 394780 Dde_2044 Dde_2045 acpS   TRUE 0.855 39.000 0.028 NA N 0.374
 394780 394779 Dde_2045 Dde_2046     TRUE 0.985 -7.000 0.035 NA N 0.795
 394779 394778 Dde_2046 Dde_2047     TRUE 0.966 15.000 0.025 NA   0.414
 394778 394777 Dde_2047 Dde_2048     TRUE 0.910 50.000 0.022 NA   0.770
 394777 394776 Dde_2048 Dde_2049     TRUE 0.996 12.000 0.042 1.000 Y 0.950
 394775 394774 Dde_2050 Dde_2051     TRUE 0.943 40.000 0.182 1.000 N 0.431
 394774 394773 Dde_2051 Dde_2052   rpoD TRUE 0.798 43.000 0.011 0.074 N 0.251
 394773 394772 Dde_2052 Dde_2053 rpoD dnaG TRUE 0.995 -13.000 0.299 1.000 N 0.781
 394772 394771 Dde_2053 Dde_2054 dnaG mutS2 TRUE 0.935 28.000 0.015 1.000 Y -0.025
 394771 394770 Dde_2054 Dde_2055 mutS2   TRUE 0.989 3.000 0.021 1.000   0.846
 394770 394769 Dde_2055 Dde_2056   rpsU TRUE 0.891 113.000 0.173 0.025   0.658
 394769 405416 Dde_2056 Dde_2057 rpsU   FALSE 0.351 146.000 0.024 NA   0.006
 405416 394768 Dde_2057 Dde_2058   hupB TRUE 0.998 19.000 0.846 NA   0.625
 394768 394767 Dde_2058 Dde_2059 hupB ksgA FALSE 0.034 194.000 0.003 1.000 N -0.354
 394767 394766 Dde_2059 Dde_2060 ksgA otsA TRUE 0.710 0.000 0.002 1.000 N -0.502
 394766 394765 Dde_2060 Dde_2061 otsA otsB TRUE 0.971 99.000 0.467 0.001 Y 0.329
 394765 394764 Dde_2061 Dde_2062 otsB   FALSE 0.381 -25.000 0.000 NA   -0.031
 394764 394763 Dde_2062 Dde_2063   fusA TRUE 0.804 41.000 0.022 NA   0.055
 394763 394762 Dde_2063 Dde_2064 fusA   TRUE 0.933 52.000 0.203 NA   0.480
 394762 394761 Dde_2064 Dde_2065     FALSE 0.281 139.000 0.013 NA   -0.072
 394761 394760 Dde_2065 Dde_2066   trxB TRUE 0.980 -7.000 0.016 1.000   0.718
 394760 394759 Dde_2066 Dde_2067 trxB trx TRUE 0.990 0.000 0.231 1.000   0.247
 394759 394758 Dde_2067 Dde_2068 trx gcp FALSE 0.280 152.000 0.011 1.000   0.239
 394758 394757 Dde_2068 Dde_2069 gcp fbp TRUE 0.660 79.000 0.013 1.000 N 0.619
 394757 394756 Dde_2069 Dde_2070 fbp   TRUE 0.978 26.000 0.049 NA   0.764
 394756 394755 Dde_2070 Dde_2071     TRUE 0.987 44.000 0.462 NA   0.759
 394755 394754 Dde_2071 Dde_2072     TRUE 0.981 -16.000 0.013 1.000   0.949
 394754 394753 Dde_2072 Dde_2073     TRUE 0.990 3.000 0.023 NA   0.949
 394753 394752 Dde_2073 Dde_2074   pgsA TRUE 0.802 61.000 0.012 NA   0.679
 394752 394751 Dde_2074 Dde_2075 pgsA   FALSE 0.416 123.000 0.013 1.000 N 0.415
 394751 394750 Dde_2075 Dde_2076     TRUE 0.680 80.000 0.022 NA   0.416
 394750 394749 Dde_2076 Dde_2077   pcm TRUE 0.988 10.000 0.037 NA   0.702
 394748 3334403 Dde_2078 Dde_2079     TRUE 0.954 84.000 0.300 1.000   0.969
 394746 394745 Dde_2080 Dde_2081 ppsA pyc TRUE 0.584 194.000 0.101 1.000 N 0.974
 394745 394744 Dde_2081 Dde_2082 pyc   FALSE 0.400 93.000 0.030 1.000 N -0.839
 3334404 394742 Dde_2083 Dde_2084   ftsA-2 FALSE 0.001 267.000 0.000 1.000 N -0.815
 394741 394740 Dde_2085 Dde_2086     TRUE 0.934 27.000 0.068 0.063 N -0.487
 394739 394738 Dde_2088 Dde_2089   rtcB TRUE 0.593 68.000 0.015 NA   0.129
 394738 394737 Dde_2089 Dde_2090 rtcB   FALSE 0.230 5.000 0.000 NA   -0.690
 394736 394735 Dde_2091 Dde_2092   dapB TRUE 0.889 1.000 0.003 1.000 N 0.187
 394735 394734 Dde_2092 Dde_2093 dapB ligA TRUE 0.894 23.000 0.011 1.000 N 0.385
 394734 394733 Dde_2093 Dde_2094 ligA   TRUE 0.857 -3.000 0.002 NA   -0.068
 394733 394732 Dde_2094 Dde_2095     TRUE 0.986 7.000 0.039 NA   0.654
 394732 394731 Dde_2095 Dde_2096   uvrB TRUE 0.828 33.000 0.010 1.000 N 0.427
 394729 394728 Dde_2098 Dde_2099 aat clpA TRUE 0.979 27.000 0.087 1.000 Y 0.367
 394728 394727 Dde_2099 Dde_2100 clpA   TRUE 0.997 2.000 0.596 NA   0.409
 394727 394726 Dde_2100 Dde_2101     TRUE 0.637 65.000 0.021 NA   -0.019
 394725 394724 Dde_2102 Dde_2103 crcB   TRUE 0.874 37.000 0.038 NA   0.174
 394723 394722 Dde_2104 Dde_2105 cheB-1 cheR-1 TRUE 0.999 8.000 0.672 1.000 Y 0.895
 394722 394721 Dde_2105 Dde_2106 cheR-1 cheA TRUE 0.895 69.000 0.103 1.000 Y 0.133
 394721 394720 Dde_2106 Dde_2107 cheA cheY-4 TRUE 0.993 31.000 0.619 1.000 Y 0.079
 394720 394719 Dde_2107 Dde_2108 cheY-4   TRUE 0.959 47.000 0.105 1.000 Y 0.480
 394719 394718 Dde_2108 Dde_2110   radA FALSE 0.175 181.000 0.000 1.000 N 0.797
 394718 394717 Dde_2110 Dde_2111 radA   TRUE 0.945 16.000 0.004 NA   0.598
 394717 394716 Dde_2111 Dde_2112   hpt TRUE 0.961 33.000 0.023 NA   0.960
 394716 394715 Dde_2112 Dde_2113 hpt argA TRUE 0.958 22.000 0.023 1.000 N 0.639
 394715 394714 Dde_2113 Dde_2114 argA ccmG TRUE 0.879 11.000 0.000 1.000 N 0.593
 394714 394713 Dde_2114 Dde_2115 ccmG metH TRUE 0.782 13.000 0.000 1.000 N 0.439
 394712 394711 Dde_2116 Dde_2117 rpoH   TRUE 0.966 28.000 0.022 1.000 N 0.871
 394711 394710 Dde_2117 Dde_2118     TRUE 0.996 -3.000 0.231 NA   0.778
 394710 3334407 Dde_2118 Dde_2119     TRUE 0.990 35.000 0.429 NA   0.753
 3334407 394708 Dde_2119 Dde_2120   rpiB TRUE 0.991 16.000 0.064 NA   0.947
 394708 394707 Dde_2120 Dde_2121 rpiB cysS TRUE 0.647 33.000 0.006 1.000 N -0.048
 394707 394706 Dde_2121 Dde_2122 cysS   TRUE 0.956 2.000 0.006 1.000   0.514
 394706 394705 Dde_2122 Dde_2123     TRUE 0.979 12.000 0.020 NA   0.636
 394705 394704 Dde_2123 Dde_2124   hslV TRUE 0.879 13.000 0.007 NA   -0.274
 394704 394703 Dde_2124 Dde_2125 hslV ispE TRUE 0.831 1.000 0.004 1.000 N -0.220
 394703 394702 Dde_2125 Dde_2126 ispE prsA TRUE 0.669 122.000 0.012 1.000 N 0.850
 394702 394701 Dde_2126 Dde_2127 prsA   TRUE 0.906 64.000 0.056 1.000 N 0.989
 394701 394700 Dde_2127 Dde_2128   pth TRUE 0.956 137.000 0.496 0.025 Y 0.459
 394700 394699 Dde_2128 Dde_2129 pth   TRUE 0.570 92.000 0.010 1.000 N 0.602
 394699 3334408 Dde_2129 Dde_2130   rho TRUE 0.766 87.000 0.000 1.000 Y 0.880
 3334408 3334412 Dde_2130 Dde_2134 rho   FALSE 0.000 1397.000 0.000 1.000 N -0.140
 3334412 394696 Dde_2134 Dde_2135   hysA TRUE 0.998 33.000 0.571 0.001 Y 0.977
 394696 394695 Dde_2135 Dde_2136 hysA   TRUE 0.593 194.000 0.214 1.000 Y -0.036
 394695 394694 Dde_2136 Dde_2137   hynB-1 FALSE 0.019 376.000 0.000 1.000 Y -0.072
 394694 394693 Dde_2137 Dde_2138 hynB-1 hynA-1 TRUE 0.998 57.000 0.846 0.002 Y 0.957
 394693 3334413 Dde_2138 Dde_2139 hynA-1   TRUE 0.939 77.000 0.364 1.000 Y -0.168
 3334413 394691 Dde_2139 Dde_2140   hypC TRUE 0.985 19.000 0.050 NA N 0.956
 394691 394690 Dde_2140 Dde_2141 hypC tesA TRUE 0.830 3.000 0.009 NA N -0.764
 394690 394689 Dde_2141 Dde_2142 tesA ileS FALSE 0.011 110.000 0.000 1.000 N -0.670
 394689 3334414 Dde_2142 Dde_2143 ileS   TRUE 0.718 62.000 0.049 1.000 N 0.022
 3334414 11399294 Dde_2143 Dde_4036     TRUE 0.973 24.000 0.128 NA   NA
 11399294 3334415 Dde_4036 Dde_2144     TRUE 0.805 -10.000 0.000 NA   NA
 3334415 394685 Dde_2144 Dde_2145     FALSE 0.314 105.000 0.000 NA   0.640
 394685 394684 Dde_2145 Dde_2146     TRUE 0.977 33.000 0.133 1.000   0.722
 394684 394683 Dde_2146 Dde_2147     TRUE 0.937 67.000 0.108 NA   0.937
 394683 394682 Dde_2147 Dde_2148   CheZ TRUE 0.964 38.000 0.063 NA   0.990
 394682 394681 Dde_2148 Dde_2151 CheZ trxB FALSE 0.011 530.000 0.000 1.000 N 0.653
 394681 3334418 Dde_2151 Dde_2152 trxB   FALSE 0.003 678.000 0.000 NA   0.287
 3334418 394679 Dde_2152 Dde_2153     TRUE 0.959 -3.000 0.000 NA   0.903
 394679 394678 Dde_2153 Dde_2154     TRUE 0.999 -13.000 0.571 0.007 Y 0.987
 394678 394677 Dde_2154 Dde_2155     TRUE 1.000 3.000 0.750 0.049 Y 0.995
 394677 3334419 Dde_2155 Dde_2156     TRUE 0.998 -3.000 0.350 0.091 N 0.989
 3334419 394675 Dde_2156 Dde_2157     TRUE 0.956 -3.000 0.000 1.000   0.993
 394675 394674 Dde_2157 Dde_2159     FALSE 0.001 347.000 0.000 1.000   -0.461
 394674 3334421 Dde_2159 Dde_2160     FALSE 0.250 12.000 0.000 NA   -0.148
 394668