MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudomonas fluorescens Pf0-1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10485400 10485401 Pfl01_0001 Pfl01_0002 dnaA   TRUE 0.916 40.000 0.328 1.000 Y NA
 10485401 10485402 Pfl01_0002 Pfl01_0003   recF TRUE 0.968 15.000 0.318 1.000 Y NA
 10485402 10485403 Pfl01_0003 Pfl01_0004 recF gyrB TRUE 0.990 6.000 0.249 0.004 Y NA
 10485406 10485407 Pfl01_0007 Pfl01_0008     TRUE 0.806 38.000 0.310 1.000 N NA
 10485407 10485408 Pfl01_0008 Pfl01_0009   glyS TRUE 0.873 11.000 0.123 1.000 N NA
 10485408 10485409 Pfl01_0009 Pfl01_0010 glyS glyQ TRUE 0.999 -3.000 0.651 0.001 Y NA
 10485410 10485411 Pfl01_0011 Pfl01_0012     FALSE 0.347 41.000 0.017 1.000 N NA
 10485412 10485413 Pfl01_0013 Pfl01_0014   trkA FALSE 0.378 21.000 0.000 1.000   NA
 10485413 10485414 Pfl01_0014 Pfl01_0015 trkA   TRUE 0.771 23.000 0.122 1.000 N NA
 10485414 10485415 Pfl01_0015 Pfl01_0016   fmt TRUE 0.993 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 10485415 10485416 Pfl01_0016 Pfl01_0017 fmt def TRUE 0.875 57.000 0.105 0.016 Y NA
 10485417 10485418 Pfl01_0018 Pfl01_0019     FALSE 0.222 80.000 0.033 1.000   NA
 10485418 10485419 Pfl01_0019 Pfl01_0020     FALSE 0.235 55.000 0.023 NA N NA
 10485421 10485422 Pfl01_0022 Pfl01_0023   aroE TRUE 0.864 10.000 0.093 1.000 N NA
 10485423 10485424 Pfl01_0024 Pfl01_0025     TRUE 0.621 103.000 0.259 0.074 N NA
 10485424 10485425 Pfl01_0025 Pfl01_0026     TRUE 0.869 17.000 0.218 1.000 N NA
 10485430 10485431 Pfl01_0031 Pfl01_0032     TRUE 0.586 72.000 0.085 0.071 N NA
 10485431 10485432 Pfl01_0032 Pfl01_0033     FALSE 0.071 115.000 0.000 1.000 N NA
 10485432 10485433 Pfl01_0033 Pfl01_0034     FALSE 0.007 271.000 0.000 1.000 N NA
 10485433 10485434 Pfl01_0034 Pfl01_0035     TRUE 0.720 95.000 0.600 1.000   NA
 10485434 10485435 Pfl01_0035 Pfl01_0036     FALSE 0.352 77.000 0.109 NA   NA
 10485435 10485436 Pfl01_0036 Pfl01_0037     FALSE 0.400 56.000 0.075 NA   NA
 10485436 10485437 Pfl01_0037 Pfl01_0038     TRUE 0.995 -3.000 0.491 NA Y NA
 10485437 10485438 Pfl01_0038 Pfl01_0039     TRUE 0.994 2.000 0.650 NA Y NA
 10485438 10485439 Pfl01_0039 Pfl01_0040     TRUE 0.967 -3.000 0.201 NA   NA
 10485440 10485441 Pfl01_0041 Pfl01_0042   gltP FALSE 0.193 103.000 0.047 1.000   NA
 10485441 10485442 Pfl01_0042 Pfl01_0043 gltP   FALSE 0.001 698.000 0.000 NA   NA
 10485442 10485443 Pfl01_0043 Pfl01_0044     TRUE 0.911 3.000 0.140 NA   NA
 10485443 10485444 Pfl01_0044 Pfl01_0045     FALSE 0.319 68.000 0.070 NA   NA
 10485445 10485446 Pfl01_0046 Pfl01_0047     TRUE 0.992 11.000 0.455 0.037 Y NA
 10485447 10485448 Pfl01_0048 Pfl01_0049     FALSE 0.490 73.000 0.200 NA N NA
 10485448 10485449 Pfl01_0049 Pfl01_0050     TRUE 0.554 102.000 0.350 1.000 N NA
 10485449 10485450 Pfl01_0050 Pfl01_0051     TRUE 0.957 -3.000 0.147 NA   NA
 10485450 10485451 Pfl01_0051 Pfl01_0052     TRUE 0.827 15.000 0.162 NA   NA
 10485451 10485452 Pfl01_0052 Pfl01_0053     FALSE 0.080 201.000 0.088 1.000 N NA
 10485452 10485453 Pfl01_0053 Pfl01_0054     TRUE 0.907 33.000 0.039 0.014 Y NA
 10485456 10485457 Pfl01_0057 Pfl01_0058     TRUE 0.547 62.000 0.204 NA   NA
 10485459 10485460 Pfl01_0060 Pfl01_0061     TRUE 0.990 0.000 0.309 1.000 Y NA
 10485460 10485461 Pfl01_0061 Pfl01_0062     TRUE 0.998 -7.000 0.755 1.000 Y NA
 10485461 10485462 Pfl01_0062 Pfl01_0063     FALSE 0.386 38.000 0.037 NA   NA
 10485464 10485465 Pfl01_0065 Pfl01_0066 metN   TRUE 0.993 0.000 0.469 1.000 Y NA
 10485465 10485466 Pfl01_0066 Pfl01_0067     TRUE 0.931 75.000 0.867 NA Y NA
 10485467 10485468 Pfl01_0068 Pfl01_0069     TRUE 0.854 24.000 0.286 NA   NA
 10485468 10485469 Pfl01_0069 Pfl01_0070     FALSE 0.002 325.000 0.000 NA   NA
 10485469 10485470 Pfl01_0070 Pfl01_0071     TRUE 0.954 -3.000 0.099 1.000   NA
 10485470 10485471 Pfl01_0071 Pfl01_0072     TRUE 0.994 -3.000 0.321 1.000 Y NA
 10485471 10485472 Pfl01_0072 Pfl01_0073     TRUE 0.915 11.000 0.255 NA   NA
 10485472 10485473 Pfl01_0073 Pfl01_0074     TRUE 0.994 -7.000 0.722 NA   NA
 10485475 10485476 Pfl01_0076 Pfl01_0077     TRUE 0.930 26.000 0.536 1.000 N NA
 10485476 10485477 Pfl01_0077 Pfl01_0078     TRUE 0.846 28.000 0.268 1.000 N NA
 10485477 10485478 Pfl01_0078 Pfl01_0079     TRUE 0.957 83.000 0.741 0.003 Y NA
 10485480 10485481 Pfl01_0081 Pfl01_0082     TRUE 0.730 91.000 0.241 1.000 Y NA
 10485481 10485482 Pfl01_0082 Pfl01_0083     FALSE 0.010 238.000 0.000 1.000 N NA
 10485482 10485483 Pfl01_0083 Pfl01_0084     FALSE 0.162 75.000 0.006 1.000 N NA
 10485483 10485484 Pfl01_0084 Pfl01_0085     TRUE 0.980 13.000 0.579 0.065 N NA
 10485484 10485485 Pfl01_0085 Pfl01_0086     TRUE 0.996 3.000 0.895 0.001   NA
 10485487 10485488 Pfl01_0088 Pfl01_0089     FALSE 0.317 113.000 0.173 NA   NA
 10485488 10485489 Pfl01_0089 Pfl01_0090     TRUE 0.962 -3.000 0.173 NA   NA
 10485490 10485491 Pfl01_0091 Pfl01_0092     FALSE 0.451 29.000 0.016 1.000   NA
 10485493 10485494 Pfl01_0094 Pfl01_0095     TRUE 0.777 41.000 0.333 NA   NA
 10485495 10485496 Pfl01_0096 Pfl01_0097     FALSE 0.105 113.000 0.026 NA   NA
 10485498 10485499 Pfl01_0099 Pfl01_0100     FALSE 0.133 129.000 0.049 NA   NA
 10485502 10485503 Pfl01_0103 Pfl01_0104   trpA TRUE 0.996 0.000 0.344 0.001 Y NA
 10485503 10485504 Pfl01_0104 Pfl01_0105 trpA   FALSE 0.066 123.000 0.011 NA   NA
 10485505 10485506 Pfl01_0106 Pfl01_0107     TRUE 0.992 -3.000 0.647 NA   NA
 10485506 10485507 Pfl01_0107 Pfl01_0108     TRUE 0.942 28.000 0.727 NA   NA
 10485507 10485508 Pfl01_0108 Pfl01_0109     TRUE 0.745 108.000 0.800 NA   NA
 10485508 10485509 Pfl01_0109 Pfl01_0110     FALSE 0.002 334.000 0.000 NA   NA
 10485509 10485510 Pfl01_0110 Pfl01_0111     FALSE 0.002 322.000 0.000 NA   NA
 10485510 10485511 Pfl01_0111 Pfl01_0112     FALSE 0.178 215.000 0.077 1.000 Y NA
 10485511 10485512 Pfl01_0112 Pfl01_0113     TRUE 0.981 0.000 0.144 0.001   NA
 10485512 10485513 Pfl01_0113 Pfl01_0114     TRUE 0.988 16.000 0.829 0.001   NA
 10485516 10485517 Pfl01_0117 Pfl01_0118     TRUE 0.850 14.000 0.143 1.000 N NA
 10485519 10485520 Pfl01_R1 Pfl01_R2     FALSE 0.051 83.000 0.000 NA   NA
 10485520 10485521 Pfl01_R2 Pfl01_R3     FALSE 0.170 31.000 0.000 NA   NA
 10485521 10485522 Pfl01_R3 Pfl01_R4     FALSE 0.004 245.000 0.000 NA   NA
 10485522 10485523 Pfl01_R4 Pfl01_R5     FALSE 0.017 165.000 0.000 NA   NA
 10485523 10485524 Pfl01_R5 Pfl01_R6     FALSE 0.036 108.000 0.000 NA   NA
 10485525 10485526 Pfl01_0120 Pfl01_0121     FALSE 0.405 76.000 0.147 NA   NA
 10485526 10485527 Pfl01_0121 Pfl01_0122     FALSE 0.275 196.000 0.160 NA Y NA
 10485527 10485528 Pfl01_0122 Pfl01_0123     TRUE 0.980 0.000 0.444 NA N NA
 10485530 10485531 Pfl01_0125 Pfl01_0126     TRUE 0.944 24.000 0.667 NA   NA
 10485531 10485532 Pfl01_0126 Pfl01_0127     TRUE 0.938 14.000 0.400 1.000   NA
 10485532 10485533 Pfl01_0127 Pfl01_0128     TRUE 0.923 -3.000 0.063 NA   NA
 10485533 10485534 Pfl01_0128 Pfl01_0129     FALSE 0.001 755.000 0.000 NA   NA
 10485535 10485536 Pfl01_0130 Pfl01_0131     TRUE 0.890 15.000 0.273 NA   NA
 10485537 10485538 Pfl01_0132 Pfl01_0133     FALSE 0.171 147.000 0.097 NA   NA
 10485539 10485540 Pfl01_0134 Pfl01_0135     TRUE 0.637 26.000 0.053 1.000 N NA
 10485540 10485541 Pfl01_0135 Pfl01_0136     TRUE 0.998 -10.000 0.447 0.070 Y NA
 10485541 10485542 Pfl01_0136 Pfl01_0137     FALSE 0.006 288.000 0.000 1.000 N NA
 10485542 10485543 Pfl01_0137 Pfl01_0138     TRUE 0.950 19.000 0.647 NA N NA
 10485543 10485544 Pfl01_0138 Pfl01_0139     TRUE 0.989 6.000 0.553 NA Y NA
 10485544 10485545 Pfl01_0139 Pfl01_0140     TRUE 0.985 21.000 0.795 1.000 Y NA
 10485545 10485546 Pfl01_0140 Pfl01_0141     FALSE 0.157 59.000 0.000 1.000 N NA
 10485546 10485547 Pfl01_0141 Pfl01_0142     TRUE 0.546 103.000 0.400 NA   NA
 10485547 10485548 Pfl01_0142 Pfl01_0143     TRUE 0.904 20.000 0.385 NA   NA
 10485548 10485549 Pfl01_0143 Pfl01_0144     TRUE 0.987 -3.000 0.423 1.000 N NA
 10485549 10485550 Pfl01_0144 Pfl01_0145     FALSE 0.449 84.000 0.000 1.000 Y NA
 10485550 10485551 Pfl01_0145 Pfl01_0146     TRUE 0.959 -3.000 0.000 0.012   NA
 10485551 10485552 Pfl01_0146 Pfl01_0147     TRUE 0.691 1.000 0.000 1.000   NA
 10485552 10485553 Pfl01_0147 Pfl01_0148     FALSE 0.506 12.000 0.000 1.000   NA
 10485554 10485555 Pfl01_0149 Pfl01_0150     FALSE 0.318 13.000 0.000 NA   NA
 10485555 10485556 Pfl01_0150 Pfl01_0151     TRUE 0.967 13.000 0.667 NA   NA
 10485556 10485557 Pfl01_0151 Pfl01_0152     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 10485557 10485558 Pfl01_0152 Pfl01_0153     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10485558 10485559 Pfl01_0153 Pfl01_0154     FALSE 0.018 162.000 0.000 NA   NA
 10485559 10485560 Pfl01_0154 Pfl01_0155     FALSE 0.085 57.000 0.000 NA   NA
 10485561 10485562 Pfl01_0156 Pfl01_0157     FALSE 0.027 138.000 0.000 NA   NA
 10485563 10485564 Pfl01_0158 Pfl01_0159     FALSE 0.001 433.000 0.000 NA   NA
 10485565 10485566 Pfl01_0160 Pfl01_0161     TRUE 0.675 49.000 0.250 NA   NA
 10485566 10485567 Pfl01_0161 Pfl01_0162     TRUE 0.625 5.000 0.000 1.000 N NA
 10485567 10485568 Pfl01_0162 Pfl01_0163     TRUE 0.801 -3.000 0.000 1.000   NA
 10485568 10485569 Pfl01_0163 Pfl01_0164     TRUE 0.955 -3.000 0.133 NA   NA
 10485570 10485571 Pfl01_0165 Pfl01_0167     FALSE 0.488 3.000 0.000 NA   NA
 10485572 10485573 Pfl01_0168 Pfl01_0169     TRUE 0.618 130.000 0.600 NA   NA
 10485573 10485574 Pfl01_0169 Pfl01_0170     FALSE 0.007 212.000 0.000 NA   NA
 10485574 10485575 Pfl01_0170 Pfl01_0171     TRUE 0.986 -3.000 0.444 NA   NA
 10485575 10485576 Pfl01_0171 Pfl01_0172     TRUE 0.982 -3.000 0.353 NA   NA
 10485576 10485577 Pfl01_0172 Pfl01_0173     TRUE 0.989 -3.000 0.529 NA   NA
 10485577 10485578 Pfl01_0173 Pfl01_0174     TRUE 0.994 -3.000 0.800 1.000 N NA
 10485578 10485579 Pfl01_0174 Pfl01_0175     FALSE 0.238 94.000 0.080 NA   NA
 10485579 10485580 Pfl01_0175 Pfl01_0176     FALSE 0.143 200.000 0.250 NA   NA
 10485580 10485581 Pfl01_0176 Pfl01_0177   pgaA FALSE 0.004 258.000 0.000 NA   NA
 10485581 10485582 Pfl01_0177 Pfl01_0178 pgaA pgaB TRUE 0.972 13.000 0.696 1.000   NA
 10485582 10485583 Pfl01_0178 Pfl01_0179 pgaB   TRUE 0.977 2.000 0.435 1.000   NA
 10485583 10485584 Pfl01_0179 Pfl01_0180     TRUE 0.987 -3.000 0.462 NA   NA
 10485586 10485587 Pfl01_0182 Pfl01_0183     FALSE 0.120 88.000 0.020 NA   NA
 10485587 10485588 Pfl01_0183 Pfl01_0184     TRUE 0.942 0.000 0.168 NA   NA
 10485588 10485589 Pfl01_0184 Pfl01_0185     TRUE 0.885 -3.000 0.034 NA   NA
 10485589 10485590 Pfl01_0185 Pfl01_0186     TRUE 0.928 21.000 0.500 NA   NA
 10485592 10485593 Pfl01_0187 Pfl01_0188 gabD   FALSE 0.232 187.000 0.303 1.000 N NA
 10485593 10485594 Pfl01_0188 Pfl01_0189     FALSE 0.299 141.000 0.182 1.000 N NA
 10485595 10485596 Pfl01_0190 Pfl01_0191     FALSE 0.394 146.000 0.294 1.000 N NA
 10485597 10485598 Pfl01_0192 Pfl01_0193     FALSE 0.059 191.000 0.062 NA   NA
 10485598 10485599 Pfl01_0193 Pfl01_0194     FALSE 0.287 133.000 0.188 NA   NA
 10485599 10485600 Pfl01_0194 Pfl01_0195     TRUE 0.643 71.000 0.066 0.002 N NA
 10485600 10485601 Pfl01_0195 Pfl01_0196     TRUE 0.991 14.000 0.935 0.001 N NA
 10485601 10485602 Pfl01_0196 Pfl01_0197     TRUE 0.992 4.000 0.587 1.000 Y NA
 10485605 10485606 Pfl01_0200 Pfl01_0201     TRUE 0.919 17.000 0.409 NA   NA
 10485607 10485608 Pfl01_0202 Pfl01_0203     TRUE 0.999 -10.000 0.889 0.003 Y NA
 10485608 10485609 Pfl01_0203 Pfl01_0204     FALSE 0.067 115.000 0.000 1.000   NA
 10485609 10485610 Pfl01_0204 Pfl01_0205     FALSE 0.382 71.000 0.111 NA   NA
 10485613 10485614 Pfl01_0208 Pfl01_0209     TRUE 0.983 15.000 0.571 1.000 Y NA
 10485614 10485615 Pfl01_0209 Pfl01_0210     TRUE 0.996 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 10485619 10485620 Pfl01_0214 Pfl01_0215     FALSE 0.348 102.000 0.150 1.000 N NA
 10485623 10485624 Pfl01_0218 Pfl01_0219     TRUE 0.954 46.000 0.778 0.015 N NA
 10485624 10485625 Pfl01_0219 Pfl01_0220     TRUE 0.997 2.000 0.778 0.089 Y NA
 10485625 10485626 Pfl01_0220 Pfl01_0221     FALSE 0.123 170.000 0.111 NA   NA
 10485626 10485627 Pfl01_0221 Pfl01_0222     TRUE 0.771 57.000 0.444 NA   NA
 10485627 10485628 Pfl01_0222 Pfl01_0223     FALSE 0.277 165.000 0.294 NA N NA
 10485628 10485629 Pfl01_0223 Pfl01_0224     FALSE 0.092 54.000 0.000 NA   NA
 10485629 10485630 Pfl01_0224 Pfl01_0225     FALSE 0.038 101.000 0.000 NA   NA
 10485630 10485631 Pfl01_0225 Pfl01_0226     TRUE 0.996 11.000 0.841 0.013 Y NA
 10485631 10485632 Pfl01_0226 Pfl01_0227     TRUE 0.998 -3.000 0.773 1.000 Y NA
 10485632 10485633 Pfl01_0227 Pfl01_0228     TRUE 0.997 -3.000 0.671 1.000 Y NA
 10485635 10485636 Pfl01_0230 Pfl01_0231     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.011 Y NA
 10485636 10485637 Pfl01_0231 Pfl01_0232     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA N NA
 10485640 10485641 Pfl01_0235 Pfl01_0236     TRUE 0.993 -10.000 0.222 1.000 Y NA
 10485641 10485642 Pfl01_0236 Pfl01_0237     TRUE 0.995 3.000 0.800 NA Y NA
 10485642 10485643 Pfl01_0237 Pfl01_0238     TRUE 0.922 14.000 0.346 NA N NA
 10485643 10485644 Pfl01_0238 Pfl01_0239     TRUE 0.980 0.000 0.452 NA N NA
 10485644 10485645 Pfl01_0239 Pfl01_0240     TRUE 0.974 39.000 0.500 0.005 Y NA
 10485645 10485646 Pfl01_0240 Pfl01_0241     FALSE 0.003 267.000 0.000 NA   NA
 10485646 10485647 Pfl01_0241 Pfl01_0242     FALSE 0.001 457.000 0.000 NA   NA
 10485647 10485648 Pfl01_0242 Pfl01_0243     TRUE 0.970 5.000 0.150 1.000 Y NA
 10485648 10485649 Pfl01_0243 Pfl01_0244     TRUE 0.988 0.000 0.100 0.088 Y NA
 10485649 10485650 Pfl01_0244 Pfl01_0245     FALSE 0.328 246.000 0.469 1.000 Y NA
 10485651 10485652 Pfl01_0246 Pfl01_0247     FALSE 0.009 250.000 0.000 1.000 N NA
 10485653 10485654 Pfl01_0248 Pfl01_0249     FALSE 0.009 200.000 0.000 NA   NA
 10485655 10485656 Pfl01_0250 Pfl01_0251     TRUE 0.972 2.000 0.412 NA N NA
 10485656 10485657 Pfl01_0251 Pfl01_0252     TRUE 0.747 40.000 0.038 NA Y NA
 10485658 10485659 Pfl01_0253 Pfl01_0254 tauD   TRUE 0.625 58.000 0.214 1.000 N NA
 10485659 10485660 Pfl01_0254 Pfl01_0255   tauB TRUE 0.997 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 10485660 10485661 Pfl01_0255 Pfl01_0256 tauB   TRUE 0.907 17.000 0.058 1.000 Y NA
 10485661 10485662 Pfl01_0256 Pfl01_0257     FALSE 0.034 195.000 0.012 1.000 N NA
 10485662 10485663 Pfl01_0257 Pfl01_0258     FALSE 0.037 200.000 0.036 NA N NA
 10485663 10485664 Pfl01_0258 Pfl01_0259     TRUE 0.847 0.000 0.036 NA N NA
 10485665 10485666 Pfl01_0260 Pfl01_0261 ompR   TRUE 0.908 115.000 0.584 0.036 Y NA
 10485667 10485668 Pfl01_0262 Pfl01_0263     TRUE 0.956 -3.000 0.102 1.000 N NA
 10485668 10485669 Pfl01_0263 Pfl01_0264     TRUE 0.609 17.000 0.039 NA N NA
 10485672 10485673 Pfl01_0267 Pfl01_0268 hslO   FALSE 0.075 182.000 0.048 1.000 N NA
 10485674 10485675 Pfl01_0269 Pfl01_0270     TRUE 0.960 -9.000 0.125 NA   NA
 10485675 10485676 Pfl01_0270 Pfl01_0271     FALSE 0.036 112.000 0.000 NA   NA
 10485676 10485677 Pfl01_0271 Pfl01_0272     FALSE 0.001 551.000 0.000 NA   NA
 10485677 10485678 Pfl01_0272 Pfl01_0273     FALSE 0.037 103.000 0.000 NA   NA
 10485679 10485680 Pfl01_0274 Pfl01_0275     FALSE 0.001 373.000 0.000 NA   NA
 10485680 10485681 Pfl01_0275 Pfl01_0276     FALSE 0.145 110.000 0.028 1.000   NA
 10485681 10485682 Pfl01_0276 Pfl01_0277     FALSE 0.307 32.000 0.013 NA   NA
 10485683 10485684 Pfl01_0278 Pfl01_0279     FALSE 0.003 289.000 0.000 NA   NA
 10485684 10485685 Pfl01_0279 Pfl01_0280     TRUE 0.998 -3.000 0.571 0.002 Y NA
 10485685 10485686 Pfl01_0280 Pfl01_0281     TRUE 0.567 93.000 0.333 1.000 N NA
 10485689 10485690 Pfl01_0284 Pfl01_0285 nudE   TRUE 0.945 12.000 0.373 1.000 N NA
 10485691 10485692 Pfl01_0286 Pfl01_0287     FALSE 0.350 41.000 0.035 NA   NA
 10485692 10485693 Pfl01_0287 Pfl01_0288     TRUE 0.994 -3.000 0.375 1.000 Y NA
 10485693 10485694 Pfl01_0288 Pfl01_0289     FALSE 0.308 101.000 0.111 1.000 N NA
 10485695 10485696 Pfl01_0290 Pfl01_0291     FALSE 0.335 180.000 0.130 1.000 Y NA
 10485696 10485697 Pfl01_0291 Pfl01_0292     FALSE 0.113 205.000 0.214 NA   NA
 10485699 10485700 Pfl01_0294 Pfl01_0295     FALSE 0.005 300.000 0.000 1.000   NA
 10485700 10485701 Pfl01_0295 Pfl01_0296     FALSE 0.005 233.000 0.000 NA   NA
 10485701 10485702 Pfl01_0296 Pfl01_0297     TRUE 0.872 -10.000 0.020 NA   NA
 10485702 10485703 Pfl01_0297 Pfl01_0298     TRUE 0.984 -3.000 0.400 NA   NA
 10485705 10485706 Pfl01_0300 Pfl01_0301     TRUE 0.801 -3.000 0.000 1.000   NA
 10485706 10485707 Pfl01_0301 Pfl01_0302     TRUE 0.733 34.000 0.000 1.000 Y NA
 10485709 10485710 Pfl01_0304 Pfl01_0305     TRUE 0.935 19.000 0.517 NA   NA
 10485710 10485711 Pfl01_0305 Pfl01_0306     FALSE 0.029 171.000 0.000 1.000   NA
 10485712 10485713 Pfl01_R8 Pfl01_0307     FALSE 0.057 77.000 0.000 NA   NA
 10485713 10485714 Pfl01_0307 Pfl01_0308     FALSE 0.002 345.000 0.000 NA   NA
 10485714 10485715 Pfl01_0308 Pfl01_0309     TRUE 0.784 11.000 0.069 NA   NA
 10485715 10485716 Pfl01_0309 Pfl01_0310     TRUE 0.995 -3.000 0.195 0.013 Y NA
 10485716 10485717 Pfl01_0310 Pfl01_0311     TRUE 0.817 79.000 0.169 0.088 Y NA
 10485717 10485718 Pfl01_0311 Pfl01_0312     TRUE 0.990 14.000 0.824 1.000 Y NA
 10485720 10485721 Pfl01_0314 Pfl01_0315     FALSE 0.416 7.000 0.000 NA   NA
 10485721 10485722 Pfl01_0315 Pfl01_0316     TRUE 0.592 21.000 0.047 NA   NA
 10485724 10485725 Pfl01_0318 Pfl01_R9     FALSE 0.028 136.000 0.000 NA   NA
 10485725 10485726 Pfl01_R9 Pfl01_0319     FALSE 0.037 105.000 0.000 NA   NA
 10485726 10485727 Pfl01_0319 Pfl01_0320     TRUE 0.959 -3.000 0.150 NA N NA
 10485727 10485728 Pfl01_0320 Pfl01_0321     TRUE 0.889 -3.000 0.033 NA N NA
 10485729 10485730 Pfl01_0322 Pfl01_0323   hisB FALSE 0.008 209.000 0.000 NA   NA
 10485730 10485731 Pfl01_0323 Pfl01_0324 hisB hisH TRUE 0.991 0.000 0.111 0.003 Y NA
 10485731 10485732 Pfl01_0324 Pfl01_0325 hisH   TRUE 0.877 1.000 0.069 NA   NA
 10485732 10485733 Pfl01_0325 Pfl01_0326     FALSE 0.241 43.000 0.016 NA   NA
 10485733 10485734 Pfl01_0326 Pfl01_0327     TRUE 0.993 10.000 0.433 0.003 Y NA
 10485734 10485735 Pfl01_0327 Pfl01_0328     FALSE 0.518 77.000 0.006 1.000 Y NA
 10485736 10485737 Pfl01_0329 Pfl01_0330     FALSE 0.033 119.000 0.000 NA   NA
 10485737 10485738 Pfl01_0330 Pfl01_0331     TRUE 0.945 3.000 0.210 1.000   NA
 10485738 10485739 Pfl01_0331 Pfl01_0332     TRUE 0.936 32.000 0.408 0.024 N NA
 10485739 10485740 Pfl01_0332 Pfl01_0333     FALSE 0.297 137.000 0.170 1.000 N NA
 10485741 10485742 Pfl01_0334 Pfl01_0335     TRUE 0.928 2.000 0.166 NA N NA
 10485742 10485743 Pfl01_0335 Pfl01_0336     TRUE 0.631 58.000 0.221 1.000 N NA
 10485746 10485747 Pfl01_0339 Pfl01_0340     TRUE 0.997 -3.000 0.587 1.000 Y NA
 10485747 10485748 Pfl01_0340 Pfl01_0341     FALSE 0.013 231.000 0.014 NA   NA
 10485748 10485749 Pfl01_0341 Pfl01_0342     TRUE 0.995 -3.000 0.889 NA   NA
 10485749 10485750 Pfl01_0342 Pfl01_0343     FALSE 0.039 100.000 0.000 NA   NA
 10485750 10485751 Pfl01_0343 Pfl01_0344     FALSE 0.030 129.000 0.000 NA   NA
 10485752 10485753 Pfl01_0345 Pfl01_0346     FALSE 0.184 44.000 0.005 NA   NA
 10485753 10485754 Pfl01_0346 Pfl01_0347     FALSE 0.085 140.000 0.011 1.000 N NA
 10485756 10485757 Pfl01_0349 Pfl01_0350     FALSE 0.087 103.000 0.016 NA   NA
 10485757 10485758 Pfl01_0350 Pfl01_0351     TRUE 0.977 -3.000 0.283 NA   NA
 10485758 10485759 Pfl01_0351 Pfl01_0352     FALSE 0.048 196.000 0.051 NA   NA
 10485759 10485760 Pfl01_0352 Pfl01_0353     TRUE 0.901 4.000 0.103 1.000   NA
 10485762 10485763 Pfl01_0355 Pfl01_0356     TRUE 0.745 32.000 0.208 NA   NA
 10485765 10485766 Pfl01_0358 Pfl01_0359     TRUE 0.965 -3.000 0.189 NA   NA
 10485766 10485767 Pfl01_0359 Pfl01_0360     FALSE 0.001 422.000 0.000 NA   NA
 10485767 10485768 Pfl01_0360 Pfl01_0361     FALSE 0.217 75.000 0.024 1.000 N NA
 10485768 10485769 Pfl01_0361 Pfl01_0362     FALSE 0.304 71.000 0.048 1.000 N NA
 10485769 10485770 Pfl01_0362 Pfl01_0363     TRUE 0.734 85.000 0.067 0.071 Y NA
 10485770 10485771 Pfl01_0363 Pfl01_0364     TRUE 0.996 -3.000 0.485 1.000 Y NA
 10485771 10485772 Pfl01_0364 Pfl01_0365     FALSE 0.344 135.000 0.008 1.000 Y NA
 10485772 10485773 Pfl01_0365 Pfl01_0366     TRUE 0.656 118.000 0.017 0.001 Y NA
 10485773 10485774 Pfl01_0366 Pfl01_0367     FALSE 0.071 227.000 0.008 0.034 N NA
 10485774 10485775 Pfl01_0367 Pfl01_0368     TRUE 0.700 11.000 0.019 1.000 N NA
 10485775 10485776 Pfl01_0368 Pfl01_0369     FALSE 0.341 122.000 0.000 1.000 Y NA
 10485776 10485777 Pfl01_0369 Pfl01_0370     TRUE 0.876 0.000 0.035 1.000 N NA
 10485777 10485778 Pfl01_0370 Pfl01_0371     FALSE 0.071 105.000 0.000 1.000   NA
 10485778 10485779 Pfl01_0371 Pfl01_0372     TRUE 0.968 -3.000 0.026 0.034   NA
 10485779 10485780 Pfl01_0372 Pfl01_0373   mdoG FALSE 0.004 322.000 0.000 1.000 N NA
 10485780 10485781 Pfl01_0373 Pfl01_0374 mdoG   TRUE 0.928 -7.000 0.052 NA N NA
 10485781 10485782 Pfl01_0374 Pfl01_0375     FALSE 0.002 363.000 0.000 NA N NA
 10485782 10485783 Pfl01_0375 Pfl01_0376     TRUE 0.645 150.000 0.179 0.088 Y NA
 10485783 10485784 Pfl01_0376 Pfl01_0377     TRUE 0.997 -7.000 0.536 1.000 Y NA
 10485785 10485786 Pfl01_0378 Pfl01_0379     FALSE 0.110 108.000 0.028 NA   NA
 10485786 10485787 Pfl01_0379 Pfl01_0380     TRUE 0.934 -3.000 0.076 NA   NA
 10485787 10485788 Pfl01_0380 Pfl01_0381   tatB FALSE 0.197 257.000 0.314 NA Y NA
 10485788 10485789 Pfl01_0381 Pfl01_0382 tatB tatA TRUE 0.982 11.000 0.157 0.008 Y NA
 10485789 10485790 Pfl01_0382 Pfl01_0383 tatA hisE FALSE 0.517 26.000 0.021 1.000 N NA
 10485790 10485791 Pfl01_0383 Pfl01_0384 hisE hisI TRUE 0.996 -7.000 0.152 0.003 Y NA
 10485791 10485792 Pfl01_0384 Pfl01_0385 hisI   FALSE 0.176 81.000 0.018 1.000   NA
 10485792 10485793 Pfl01_0385 Pfl01_0386     TRUE 0.988 -3.000 0.432 1.000   NA
 10485793 10485794 Pfl01_0386 Pfl01_0387   ubiE TRUE 0.945 0.000 0.145 1.000   NA
 10485795 10485796 Pfl01_0388 Pfl01_0389     FALSE 0.180 162.000 0.167 NA   NA
 10485796 10485797 Pfl01_0389 Pfl01_0390     TRUE 0.973 11.000 0.667 NA   NA
 10485798 10485799 Pfl01_0391 Pfl01_0392     TRUE 0.731 29.000 0.123 1.000 N NA
 10485799 10485800 Pfl01_0392 Pfl01_0393     FALSE 0.174 152.000 0.119 NA   NA
 10485800 10485801 Pfl01_0393 Pfl01_0394     FALSE 0.494 69.000 0.190 NA   NA
 10485801 10485802 Pfl01_0394 Pfl01_0395     FALSE 0.004 259.000 0.000 NA   NA
 10485802 10485803 Pfl01_0395 Pfl01_0396   hslU FALSE 0.282 77.000 0.070 NA   NA
 10485803 10485804 Pfl01_0396 Pfl01_0397 hslU   TRUE 0.951 56.000 0.752 1.000 Y NA
 10485804 10485805 Pfl01_0397 Pfl01_0398     FALSE 0.272 108.000 0.122 NA N NA
 10485805 10485806 Pfl01_0398 Pfl01_0399   argS TRUE 0.850 2.000 0.052 NA N NA
 10485806 10485807 Pfl01_0399 Pfl01_0400 argS   FALSE 0.128 143.000 0.036 1.000 N NA
 10485808 10485809 Pfl01_0401 Pfl01_0402 rpmE   FALSE 0.363 42.000 0.023 1.000 N NA
 10485809 10485810 Pfl01_0402 Pfl01_0403     FALSE 0.319 101.000 0.119 1.000 N NA
 10485812 10485813 Pfl01_0405 Pfl01_0406     TRUE 0.995 0.000 0.616 NA Y NA
 10485813 10485814 Pfl01_0406 Pfl01_0407     TRUE 0.997 -3.000 0.770 NA Y NA
 10485814 10485815 Pfl01_0407 Pfl01_0408     TRUE 0.997 -3.000 0.680 NA Y NA
 10485815 10485816 Pfl01_0408 Pfl01_0409     TRUE 0.985 15.000 0.668 NA Y NA
 10485816 10485817 Pfl01_0409 Pfl01_0410   aroK TRUE 0.956 5.000 0.319 1.000 N NA
 10485817 10485818 Pfl01_0410 Pfl01_0411 aroK aroB TRUE 0.529 153.000 0.208 1.000 Y NA
 10485818 10485819 Pfl01_0411 Pfl01_0412 aroB   TRUE 0.693 11.000 0.020 1.000   NA
 10485819 10485820 Pfl01_0412 Pfl01_0413   gltB FALSE 0.009 351.000 0.037 1.000   NA
 10485820 10485821 Pfl01_0413 Pfl01_0414 gltB gltD TRUE 0.958 34.000 0.214 0.001 Y NA
 10485821 10485822 Pfl01_0414 Pfl01_0415 gltD hemE FALSE 0.023 232.000 0.024 1.000 N NA
 10485826 10485827 Pfl01_0419 Pfl01_0420     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10485828 10485829 Pfl01_0421 Pfl01_0422     FALSE 0.233 21.000 0.000 NA   NA
 10485829 10485830 Pfl01_0422 Pfl01_0423   fabG TRUE 0.993 0.000 0.486 1.000 Y NA
 10485830 10485831 Pfl01_0423 Pfl01_0424 fabG   TRUE 0.995 -7.000 0.397 NA Y NA
 10485831 10485832 Pfl01_0424 Pfl01_0425     TRUE 0.996 -3.000 0.514 NA Y NA
 10485832 10485833 Pfl01_0425 Pfl01_0426     TRUE 0.948 -3.000 0.110 NA   NA
 10485833 10485834 Pfl01_0426 Pfl01_0427     TRUE 0.921 0.000 0.106 NA   NA
 10485834 10485835 Pfl01_0427 Pfl01_0428     TRUE 0.967 -3.000 0.162 1.000 N NA
 10485835 10485836 Pfl01_0428 Pfl01_0429     TRUE 0.867 2.000 0.068 NA   NA
 10485836 10485837 Pfl01_0429 Pfl01_0430     TRUE 0.921 -3.000 0.061 NA   NA
 10485837 10485838 Pfl01_0430 Pfl01_0431     TRUE 0.994 -10.000 0.732 NA   NA
 10485838 10485839 Pfl01_0431 Pfl01_0432     TRUE 0.990 -3.000 0.532 1.000   NA
 10485839 10485840 Pfl01_0432 Pfl01_0433     TRUE 0.989 -7.000 0.413 1.000   NA
 10485840 10485841 Pfl01_0433 Pfl01_0434     TRUE 0.986 -19.000 0.333 1.000   NA
 10485841 10485842 Pfl01_0434 Pfl01_0435     TRUE 0.935 -3.000 0.080 NA   NA
 10485842 10485843 Pfl01_0435 Pfl01_0436     TRUE 0.956 -7.000 0.103 NA N NA
 10485843 10485844 Pfl01_0436 Pfl01_0437     TRUE 0.993 -3.000 0.758 NA   NA
 10485844 10485845 Pfl01_0437 Pfl01_0438     TRUE 0.985 -3.000 0.422 NA   NA
 10485845 10485846 Pfl01_0438 Pfl01_0439     TRUE 0.932 10.000 0.052 0.005   NA
 10485846 10485847 Pfl01_0439 Pfl01_0440     TRUE 0.954 -19.000 0.075 1.000   NA
 10485847 10485848 Pfl01_0440 Pfl01_0441     TRUE 0.992 -3.000 0.636 1.000   NA
 10485850 10485851 Pfl01_0443 Pfl01_0444     FALSE 0.091 82.000 0.006 NA   NA
 10485851 10485852 Pfl01_0444 Pfl01_0445     FALSE 0.272 49.000 0.028 NA   NA
 10485852 10485853 Pfl01_0445 Pfl01_0446     TRUE 0.838 35.000 0.379 NA N NA
 10485853 10485854 Pfl01_0446 Pfl01_0447     FALSE 0.004 342.000 0.000 1.000 N NA
 10485855 10485856 Pfl01_0448 Pfl01_0449     TRUE 0.785 -3.000 0.005 NA   NA
 10485856 10485857 Pfl01_0449 Pfl01_0450     FALSE 0.067 101.000 0.005 NA   NA
 10485858 10485859 Pfl01_0451 Pfl01_0452   putA FALSE 0.115 144.000 0.031 1.000 N NA
 10485860 10485861 Pfl01_0453 Pfl01_0454     FALSE 0.006 228.000 0.000 NA   NA
 10485861 10485862 Pfl01_0454 Pfl01_0455     TRUE 0.917 17.000 0.400 NA   NA
 10485862 10485863 Pfl01_0455 Pfl01_0456     FALSE 0.002 330.000 0.000 NA   NA
 10485866 10485867 Pfl01_0459 Pfl01_0460     FALSE 0.164 106.000 0.032 1.000 N NA
 10485867 10485868 Pfl01_0460 Pfl01_0461     FALSE 0.005 240.000 0.000 NA   NA
 10485868 10485869 Pfl01_0461 Pfl01_0462   aceF FALSE 0.003 268.000 0.000 NA   NA
 10485869 10485870 Pfl01_0462 Pfl01_0463 aceF aceE TRUE 0.958 12.000 0.167 1.000 Y NA
 10485871 10485872 Pfl01_0464 Pfl01_0465     FALSE 0.278 52.000 0.014 1.000 N NA
 10485872 10485873 Pfl01_0465 Pfl01_0466     TRUE 0.993 2.000 0.205 0.001 Y NA
 10485873 10485874 Pfl01_0466 Pfl01_0467     TRUE 0.986 0.000 0.217 1.000 Y NA
 10485874 10485875 Pfl01_0467 Pfl01_0468     TRUE 0.958 1.000 0.241 1.000   NA
 10485875 10485876 Pfl01_0468 Pfl01_0469     TRUE 0.979 0.000 0.133 0.002   NA
 10485876 10485877 Pfl01_0469 Pfl01_0470     TRUE 0.987 -3.000 0.133 0.002   NA
 10485877 10485878 Pfl01_0470 Pfl01_0471     TRUE 0.976 0.000 0.095 0.002   NA
 10485878 10485879 Pfl01_0471 Pfl01_0472     FALSE 0.031 124.000 0.000 NA   NA
 10485879 10485880 Pfl01_0472 Pfl01_0473     FALSE 0.102 173.000 0.091 NA   NA
 10485880 10485881 Pfl01_0473 Pfl01_0474     TRUE 0.995 -16.000 0.409 0.018 N NA
 10485881 10485882 Pfl01_0474 Pfl01_0475     TRUE 0.968 0.000 0.312 NA   NA
 10485882 10485883 Pfl01_0475 Pfl01_0476     TRUE 0.991 -3.000 0.625 NA   NA
 10485883 10485884 Pfl01_0476 Pfl01_0477     TRUE 0.959 -3.000 0.154 NA   NA
 10485884 10485885 Pfl01_0477 Pfl01_0478     TRUE 0.927 -3.000 0.068 NA   NA
 10485886 10485887 Pfl01_0479 Pfl01_0480     TRUE 0.736 0.000 0.000 1.000 N NA
 10485888 10485889 Pfl01_0481 Pfl01_0482     FALSE 0.033 165.000 0.009 NA   NA
 10485889 10485890 Pfl01_0482 Pfl01_0483     TRUE 0.984 -7.000 0.333 NA   NA
 10485890 10485891 Pfl01_0483 Pfl01_0484     FALSE 0.106 103.000 0.006 1.000 N NA
 10485892 10485893 Pfl01_0485 Pfl01_0486     TRUE 0.843 32.000 0.324 1.000   NA
 10485893 10485894 Pfl01_0486 Pfl01_0487     TRUE 0.995 -3.000 0.441 1.000 Y NA
 10485894 10485895 Pfl01_0487 Pfl01_0488     FALSE 0.523 130.000 0.400 1.000 N NA
 10485896 10485897 Pfl01_0489 Pfl01_0490     TRUE 0.709 12.000 0.028 1.000 N NA
 10485899 10485900 Pfl01_0492 Pfl01_0493     FALSE 0.096 121.000 0.007 1.000 N NA
 10485902 10485903 Pfl01_0495 Pfl01_0496     TRUE 0.989 -9.000 0.443 NA   NA
 10485903 10485904 Pfl01_0496 Pfl01_0497     TRUE 0.572 106.000 0.433 NA   NA
 10485904 10485905 Pfl01_0497 Pfl01_0498     TRUE 0.588 97.000 0.427 NA   NA
 10485905 10485906 Pfl01_0498 Pfl01_0499     TRUE 0.672 43.000 0.217 NA   NA
 10485906 10485907 Pfl01_0499 Pfl01_0500     TRUE 0.745 0.000 0.012 NA   NA
 10485907 10485908 Pfl01_0500 Pfl01_0501     FALSE 0.002 322.000 0.000 NA   NA
 10485908 10485909 Pfl01_0501 Pfl01_0502     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10485909 10485910 Pfl01_0502 Pfl01_0503     TRUE 0.714 8.000 0.016 1.000   NA
 10485910 10485911 Pfl01_0503 Pfl01_0504     FALSE 0.012 229.000 0.012 NA   NA
 10485916 10485917 Pfl01_0509 Pfl01_0510 psd   TRUE 0.797 19.000 0.125 1.000 N NA
 10485917 10485918 Pfl01_0510 Pfl01_0511     TRUE 0.624 40.000 0.156 NA   NA
 10485919 10485920 Pfl01_0512 Pfl01_0513   motB TRUE 0.994 4.000 0.722 1.000 Y NA
 10485922 10485923 Pfl01_0515 Pfl01_0516     FALSE 0.108 84.000 0.013 NA   NA
 10485925 10485926 Pfl01_0518 Pfl01_0519     TRUE 0.702 27.000 0.118 NA   NA
 10485926 10485927 Pfl01_0519 Pfl01_0520     TRUE 0.586 16.000 0.033 NA   NA
 10485927 10485928 Pfl01_0520 Pfl01_0521   mutL TRUE 0.909 -3.000 0.030 1.000 N NA
 10485928 10485929 Pfl01_0521 Pfl01_0522 mutL miaA TRUE 0.955 0.000 0.188 1.000 N NA
 10485929 10485930 Pfl01_0522 Pfl01_0523 miaA hfq TRUE 0.691 94.000 0.531 1.000   NA
 10485930 10485931 Pfl01_0523 Pfl01_0524 hfq   TRUE 0.857 13.000 0.141 1.000   NA
 10485931 10485932 Pfl01_0524 Pfl01_0525     TRUE 0.577 97.000 0.184 0.068   NA
 10485932 10485933 Pfl01_0525 Pfl01_0526     TRUE 0.999 0.000 0.947 0.008 Y NA
 10485933 10485934 Pfl01_0526 Pfl01_0527   hisZ FALSE 0.013 314.000 0.045 1.000 N NA
 10485934 10485935 Pfl01_0527 Pfl01_0528 hisZ   TRUE 0.586 55.000 0.161 1.000 N NA
 10485935 10485936 Pfl01_0528 Pfl01_0529     FALSE 0.241 54.000 0.007 1.000 N NA
 10485937 10485938 Pfl01_0530 Pfl01_0531     TRUE 0.997 0.000 0.529 0.071 Y NA
 10485938 10485939 Pfl01_0531 Pfl01_R10     FALSE 0.010 193.000 0.000 NA   NA
 10485939 10485940 Pfl01_R10 Pfl01_R11     FALSE 0.012 182.000 0.000 NA   NA
 10485941 10485942 Pfl01_0532 Pfl01_0533     TRUE 0.985 -3.000 0.147 0.013 N NA
 10485942 10485943 Pfl01_0533 Pfl01_0534   rpsF FALSE 0.043 307.000 0.017 1.000 Y NA
 10485943 10485944 Pfl01_0534 Pfl01_0535 rpsF rpsR TRUE 0.972 29.000 0.319 0.009 Y NA
 10485944 10485945 Pfl01_0535 Pfl01_0536 rpsR   FALSE 0.377 37.000 0.034 NA   NA
 10485945 10485946 Pfl01_0536 Pfl01_0537   rplI TRUE 0.545 20.000 0.034 NA   NA
 10485946 10485947 Pfl01_0537 Pfl01_0538 rplI   FALSE 0.226 121.000 0.074 1.000 N NA
 10485949 10485950 Pfl01_0540 Pfl01_0541     FALSE 0.002 307.000 0.000 NA   NA
 10485950 10485951 Pfl01_0541 Pfl01_0542     TRUE 0.749 89.000 0.667 NA   NA
 10485951 10485952 Pfl01_0542 Pfl01_0543     TRUE 0.989 0.000 0.734 NA   NA
 10485953 10485954 Pfl01_0544 Pfl01_0545     FALSE 0.066 69.000 0.000 NA   NA
 10485956 10485957 Pfl01_0547 Pfl01_0548 nadE   TRUE 0.947 5.000 0.033 1.000 Y NA
 10485957 10485958 Pfl01_0548 Pfl01_0549     FALSE 0.106 108.000 0.007 1.000 N NA
 10485959 10485960 Pfl01_0550 Pfl01_0551     FALSE 0.196 168.000 0.173 1.000 N NA
 10485960 10485961 Pfl01_0551 Pfl01_0552     FALSE 0.022 365.000 0.000 1.000 Y NA
 10485961 10485962 Pfl01_0552 Pfl01_0553     FALSE 0.202 230.000 0.175 1.000 Y NA
 10485962 10485963 Pfl01_0553 Pfl01_0554     TRUE 0.990 4.000 0.263 0.070 Y NA
 10485963 10485964 Pfl01_0554 Pfl01_0555     TRUE 0.992 -3.000 0.268 1.000 Y NA
 10485964 10485965 Pfl01_0555 Pfl01_0556     TRUE 0.999 -3.000 0.881 0.019 Y NA
 10485965 10485966 Pfl01_0556 Pfl01_0557     FALSE 0.001 740.000 0.000 1.000   NA
 10485966 10485967 Pfl01_0557 Pfl01_0558     FALSE 0.092 130.000 0.012 1.000   NA
 10485968 10485969 Pfl01_0559 Pfl01_0560     FALSE 0.279 101.000 0.118 NA N NA
 10485969 10485970 Pfl01_0560 Pfl01_0561     TRUE 0.858 28.000 0.068 NA Y NA
 10485970 10485971 Pfl01_0561 Pfl01_0562     TRUE 0.988 23.000 0.550 0.002 Y NA
 10485971 10485972 Pfl01_0562 Pfl01_0563   ureE TRUE 0.998 -3.000 0.560 0.002 Y NA
 10485972 10485973 Pfl01_0563 Pfl01_0564 ureE   FALSE 0.017 204.000 0.000 1.000 N NA
 10485973 10485974 Pfl01_0564 Pfl01_0565     FALSE 0.044 175.000 0.028 NA   NA
 10485976 10485977 Pfl01_0567 Pfl01_0568     FALSE 0.123 99.000 0.011 1.000 N NA
 10485978 10485979 Pfl01_0569 Pfl01_0570     TRUE 0.909 1.000 0.077 1.000 N NA
 10485979 10485980 Pfl01_0570 Pfl01_0571     TRUE 0.568 92.000 0.333 1.000   NA
 10485982 10485983 Pfl01_0573 Pfl01_0574     FALSE 0.326 64.000 0.067 NA   NA
 10485983 10485984 Pfl01_0574 Pfl01_0575     FALSE 0.006 349.000 0.031 NA   NA
 10485986 10485987 Pfl01_0577 Pfl01_0578     TRUE 0.924 24.000 0.512 NA   NA
 10485988 10485989 Pfl01_0579 Pfl01_0580   ureC FALSE 0.062 157.000 0.010 1.000 N NA
 10485989 10485990 Pfl01_0580 Pfl01_0581 ureC ureB TRUE 0.804 171.000 0.486 0.001 Y NA
 10485990 10485991 Pfl01_0581 Pfl01_0582 ureB   TRUE 0.836 0.000 0.019 1.000   NA
 10485991 10485992 Pfl01_0582 Pfl01_0583     TRUE 0.933 6.000 0.041 0.011   NA
 10485992 10485993 Pfl01_0583 Pfl01_0584   ureA TRUE 0.754 10.000 0.029 1.000 N NA
 10485993 10485994 Pfl01_0584 Pfl01_0585 ureA   TRUE 0.965 34.000 0.664 0.002 N NA
 10485994 10485995 Pfl01_0585 Pfl01_0586     TRUE 0.796 31.000 0.221 1.000 N NA
 10485995 10485996 Pfl01_0586 Pfl01_0587     TRUE 0.811 138.000 0.731 0.019   NA
 10485996 10485997 Pfl01_0587 Pfl01_0588     TRUE 0.995 -3.000 0.823 1.000   NA
 10485997 10485998 Pfl01_0588 Pfl01_0589     TRUE 0.998 0.000 0.758 0.070 Y NA
 10485998 10485999 Pfl01_0589 Pfl01_0590     TRUE 0.756 160.000 0.654 1.000 Y NA
 10485999 10486000 Pfl01_0590 Pfl01_0591     FALSE 0.017 206.000 0.000 1.000 N NA
 10486000 10486001 Pfl01_0591 Pfl01_0592     TRUE 0.998 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 10486001 10486002 Pfl01_0592 Pfl01_0593     TRUE 0.994 -3.000 0.368 1.000 Y NA
 10486002 10486003 Pfl01_0593 Pfl01_0594     TRUE 0.961 13.000 0.211 1.000 Y NA
 10486003 10486004 Pfl01_0594 Pfl01_0595     FALSE 0.125 163.000 0.071 1.000   NA
 10486004 10486005 Pfl01_0595 Pfl01_0596     FALSE 0.208 80.000 0.029 1.000   NA
 10486005 10486006 Pfl01_0596 Pfl01_0597     FALSE 0.162 73.000 0.023 NA   NA
 10486006 10486007 Pfl01_0597 Pfl01_0598     TRUE 0.835 22.000 0.238 NA   NA
 10486007 10486008 Pfl01_0598 Pfl01_0599     TRUE 0.611 49.000 0.190 NA   NA
 10486008 10486009 Pfl01_0599 Pfl01_0600     FALSE 0.105 48.000 0.000 NA   NA
 10486009 10486010 Pfl01_0600 Pfl01_0601     FALSE 0.197 27.000 0.000 NA   NA
 10486010 10486011 Pfl01_0601 Pfl01_0602   cbiD TRUE 0.994 -3.000 0.123 0.007 Y NA
 10486011 10486012 Pfl01_0602 Pfl01_0603 cbiD   TRUE 0.993 -7.000 0.043 0.007 Y NA
 10486013 10486014 Pfl01_0604 Pfl01_0605   cobH TRUE 0.970 -7.000 0.149 1.000 N NA
 10486014 10486015 Pfl01_0605 Pfl01_0606 cobH   TRUE 0.995 -3.000 0.191 0.007 Y NA
 10486015 10486016 Pfl01_0606 Pfl01_0607     TRUE 0.990 0.000 0.097 0.007 Y NA
 10486016 10486017 Pfl01_0607 Pfl01_0608     FALSE 0.002 345.000 0.000 NA   NA
 10486017 10486018 Pfl01_0608 Pfl01_0609     FALSE 0.002 321.000 0.000 NA   NA
 10486019 10486020 Pfl01_0610 Pfl01_0611     FALSE 0.188 63.000 0.020 NA N NA
 10486020 10486021 Pfl01_0611 Pfl01_0612     FALSE 0.115 103.000 0.010 1.000 N NA
 10486021 10486022 Pfl01_0612 Pfl01_0613   purH TRUE 0.547 154.000 0.238 1.000 Y NA
 10486022 10486023 Pfl01_0613 Pfl01_0614 purH fis FALSE 0.422 71.000 0.101 1.000 N NA
 10486023 10486024 Pfl01_0614 Pfl01_0615 fis   TRUE 0.967 -3.000 0.161 1.000 N NA
 10486024 10486025 Pfl01_0615 Pfl01_0616     FALSE 0.021 186.000 0.005 NA   NA
 10486025 10486026 Pfl01_0616 Pfl01_0617   prmA FALSE 0.292 31.000 0.009 NA   NA
 10486026 10486027 Pfl01_0617 Pfl01_0618 prmA   FALSE 0.184 167.000 0.152 1.000 N NA
 10486027 10486028 Pfl01_0618 Pfl01_0619     TRUE 0.982 18.000 0.275 0.001 Y NA
 10486028 10486029 Pfl01_0619 Pfl01_0620     TRUE 0.853 25.000 0.254 1.000 N NA
 10486029 10486030 Pfl01_0620 Pfl01_0621   dipZ FALSE 0.089 133.000 0.010 1.000 N NA
 10486030 10486031 Pfl01_0621 Pfl01_0622 dipZ   TRUE 0.674 59.000 0.273 1.000 N NA
 10486031 10486032 Pfl01_0622 Pfl01_0623     TRUE 0.900 51.000 0.350 1.000 Y NA
 10486033 10486034 Pfl01_0624 Pfl01_0625     TRUE 0.881 4.000 0.101 NA   NA
 10486034 10486035 Pfl01_0625 Pfl01_0626     FALSE 0.043 187.000 0.017 1.000 N NA
 10486035 10486036 Pfl01_0626 Pfl01_0627     FALSE 0.028 219.000 0.023 1.000 N NA
 10486036 10486037 Pfl01_0627 Pfl01_0628     FALSE 0.005 233.000 0.000 NA   NA
 10486037 10486038 Pfl01_0628 Pfl01_0629     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10486039 10486040 Pfl01_0630 Pfl01_0631     FALSE 0.270 38.000 0.015 NA   NA
 10486041 10486042 Pfl01_0632 Pfl01_0633     TRUE 0.910 0.000 0.088 NA   NA
 10486042 10486043 Pfl01_0633 Pfl01_0634     TRUE 0.783 13.000 0.087 NA   NA
 10486043 10486044 Pfl01_0634 Pfl01_0635     TRUE 0.788 55.000 0.455 NA   NA
 10486044 10486045 Pfl01_0635 Pfl01_0636     FALSE 0.241 148.000 0.182 NA   NA
 10486046 10486047 Pfl01_0637 Pfl01_0638     TRUE 0.986 -3.000 0.429 NA N NA
 10486048 10486049 Pfl01_0639 Pfl01_0640     TRUE 0.732 92.000 0.600 1.000 N NA
 10486050 10486051 Pfl01_0641 Pfl01_0642     FALSE 0.002 356.000 0.000 NA   NA
 10486051 10486052 Pfl01_0642 Pfl01_0643     TRUE 0.956 12.000 0.500 NA   NA
 10486052 10486053 Pfl01_0643 Pfl01_0644     TRUE 0.986 12.000 0.620 NA Y NA
 10486053 10486054 Pfl01_0644 Pfl01_0645     TRUE 0.998 -3.000 0.844 NA Y NA
 10486054 10486055 Pfl01_0645 Pfl01_0646     TRUE 0.991 11.000 0.822 NA Y NA
 10486055 10486056 Pfl01_0646 Pfl01_0647     TRUE 0.997 -3.000 0.732 NA Y NA
 10486056 10486057 Pfl01_0647 Pfl01_0648     TRUE 0.997 -3.000 0.696 NA Y NA
 10486057 10486058 Pfl01_0648 Pfl01_0649     TRUE 0.937 22.000 0.234 NA Y NA
 10486059 10486060 Pfl01_0650 Pfl01_0651     FALSE 0.375 86.000 0.160 NA   NA
 10486061 10486062 Pfl01_0652 Pfl01_0653     FALSE 0.032 123.000 0.000 NA   NA
 10486062 10486063 Pfl01_0653 Pfl01_0654     FALSE 0.002 307.000 0.000 NA   NA
 10486063 10486064 Pfl01_0654 Pfl01_0655   fabG TRUE 0.937 3.000 0.000 1.000 Y NA
 10486067 10486068 Pfl01_0658 Pfl01_0659     FALSE 0.085 57.000 0.000 NA   NA
 10486069 10486070 Pfl01_0660 Pfl01_0661     TRUE 0.997 -3.000 0.667 0.003 N NA
 10486070 10486071 Pfl01_0661 Pfl01_0662     TRUE 0.713 78.000 0.500 NA   NA
 10486072 10486073 Pfl01_0663 Pfl01_0664     FALSE 0.341 115.000 0.161 1.000 N NA
 10486074 10486075 Pfl01_0665 Pfl01_0666     FALSE 0.268 167.000 0.300 NA   NA
 10486075 10486076 Pfl01_0666 Pfl01_0667     TRUE 0.931 32.000 0.400 0.049   NA
 10486077 10486078 Pfl01_0668 Pfl01_0669     FALSE 0.065 306.000 0.000 0.092 Y NA
 10486078 10486079 Pfl01_0669 Pfl01_0670     FALSE 0.063 126.000 0.000 1.000 N NA
 10486080 10486081 Pfl01_0671 Pfl01_0672     FALSE 0.193 82.000 0.025 1.000   NA
 10486081 10486082 Pfl01_0672 Pfl01_0673     FALSE 0.485 59.000 0.106 1.000   NA
 10486084 10486085 Pfl01_0675 Pfl01_0676     FALSE 0.129 185.000 0.135 1.000   NA
 10486085 10486086 Pfl01_0676 Pfl01_0677     FALSE 0.320 28.000 0.000 1.000   NA
 10486088 10486089 Pfl01_0679 Pfl01_0680     TRUE 0.974 0.000 0.154 0.070   NA
 10486089 10486090 Pfl01_0680 Pfl01_0681     TRUE 0.964 13.000 0.590 1.000   NA
 10486090 10486091 Pfl01_0681 Pfl01_0682     FALSE 0.002 538.000 0.000 1.000   NA
 10486091 10486092 Pfl01_0682 Pfl01_0683     TRUE 0.724 9.000 0.019 1.000   NA
 10486092 10486093 Pfl01_0683 Pfl01_0684     TRUE 0.657 96.000 0.045 0.092 Y NA
 10486094 10486095 Pfl01_0685 Pfl01_0686     TRUE 0.722 77.000 0.455 1.000 N NA
 10486097 10486098 Pfl01_R12 Pfl01_R13     FALSE 0.051 83.000 0.000 NA   NA
 10486098 10486099 Pfl01_R13 Pfl01_R14     FALSE 0.170 31.000 0.000 NA   NA
 10486099 10486100 Pfl01_R14 Pfl01_R15     FALSE 0.004 245.000 0.000 NA   NA
 10486100 10486101 Pfl01_R15 Pfl01_R16     FALSE 0.016 166.000 0.000 NA   NA
 10486101 10486102 Pfl01_R16 Pfl01_0688     FALSE 0.020 156.000 0.000 NA   NA
 10486102 10486103 Pfl01_0688 Pfl01_0689     TRUE 0.998 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 10486103 10486104 Pfl01_0689 Pfl01_0690     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 10486104 10486105 Pfl01_0690 Pfl01_0691     FALSE 0.069 120.000 0.011 NA   NA
 10486105 10486106 Pfl01_0691 Pfl01_0692     TRUE 0.988 -3.000 0.475 NA   NA
 10486106 10486107 Pfl01_0692 Pfl01_0693     TRUE 0.983 0.000 0.475 1.000 N NA
 10486109 10486110 Pfl01_0695 Pfl01_0696     TRUE 0.994 10.000 1.000 0.001 N NA
 10486112 10486113 Pfl01_0698 Pfl01_0699     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10486113 10486114 Pfl01_0699 Pfl01_0700     FALSE 0.457 23.000 0.023 NA   NA
 10486114 10486115 Pfl01_0700 Pfl01_0701     FALSE 0.300 55.000 0.023 1.000 N NA
 10486115 10486116 Pfl01_0701 Pfl01_0702     TRUE 0.948 43.000 0.273 0.004 Y NA
 10486118 10486119 Pfl01_0704 Pfl01_0705     FALSE 0.077 231.000 0.000 1.000 Y NA
 10486119 10486120 Pfl01_0705 Pfl01_0706     FALSE 0.215 136.000 0.087 1.000 N NA
 10486120 10486121 Pfl01_0706 Pfl01_0707     TRUE 0.986 -3.000 0.435 NA N NA
 10486121 10486122 Pfl01_0707 Pfl01_0708     TRUE 0.837 10.000 0.091 NA N NA
 10486122 10486123 Pfl01_0708 Pfl01_0709     FALSE 0.057 131.000 0.000 1.000   NA
 10486123 10486124 Pfl01_0709 Pfl01_0710     FALSE 0.104 75.000 0.006 NA   NA
 10486125 10486126 Pfl01_0711 Pfl01_0712     FALSE 0.145 60.000 0.000 1.000   NA
 10486126 10486127 Pfl01_0712 Pfl01_0713     FALSE 0.047 147.000 0.000 1.000   NA
 10486127 10486128 Pfl01_0713 Pfl01_0714     TRUE 0.633 52.000 0.193 1.000   NA
 10486128 10486129 Pfl01_0714 Pfl01_0715     FALSE 0.336 46.000 0.023 1.000   NA
 10486132 10486133 Pfl01_0718 Pfl01_0719     TRUE 0.638 61.000 0.250 1.000   NA
 10486133 10486134 Pfl01_0719 Pfl01_0720     FALSE 0.505 104.000 0.304 1.000 N NA
 10486134 10486135 Pfl01_0720 Pfl01_0721     FALSE 0.061 250.000 0.000 1.000 Y NA
 10486135 10486136 Pfl01_0721 Pfl01_0722     TRUE 0.791 16.000 0.093 1.000 N NA
 10486136 10486137 Pfl01_0722 Pfl01_0723     TRUE 0.983 2.000 0.558 1.000 N NA
 10486137 10486138 Pfl01_0723 Pfl01_0724     FALSE 0.136 118.000 0.042 NA   NA
 10486141 10486142 Pfl01_0727 Pfl01_0728     FALSE 0.001 467.000 0.000 NA   NA
 10486143 10486144 Pfl01_0729 Pfl01_0730     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10486145 10486146 Pfl01_0731 Pfl01_0732     FALSE 0.131 69.000 0.000 1.000 N NA
 10486148 10486149 Pfl01_0734 Pfl01_0736     FALSE 0.001 861.000 0.000 NA   NA
 10486149 10486150 Pfl01_0736 Pfl01_0737     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 10486151 10486152 Pfl01_0738 Pfl01_0739     TRUE 0.910 16.000 0.344 NA   NA
 10486152 10486153 Pfl01_0739 Pfl01_0740     TRUE 0.965 3.000 0.365 NA   NA
 10486153 10486154 Pfl01_0740 Pfl01_0741     TRUE 0.991 -3.000 0.623 NA   NA
 10486155 10486156 Pfl01_0742 Pfl01_0743     FALSE 0.002 306.000 0.000 NA   NA
 10486157 10486158 Pfl01_0744 Pfl01_0745     TRUE 0.965 -7.000 0.154 NA   NA
 10486158 10486159 Pfl01_0745 Pfl01_0746     TRUE 0.984 -16.000 0.333 NA   NA
 10486160 10486161 Pfl01_0747 Pfl01_R17     FALSE 0.011 187.000 0.000 NA   NA
 10486161 10486162 Pfl01_R17 Pfl01_0748     FALSE 0.041 96.000 0.000 NA   NA
 10486162 10486163 Pfl01_0748 Pfl01_0749     FALSE 0.093 131.000 0.029 NA   NA
 10486163 10486164 Pfl01_0749 Pfl01_0750     TRUE 0.972 -3.000 0.203 1.000   NA
 10486164 10486165 Pfl01_0750 Pfl01_0751     TRUE 0.995 0.000 0.639 0.001   NA
 10486165 10486166 Pfl01_0751 Pfl01_0752     TRUE 0.997 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 10486166 10486167 Pfl01_0752 Pfl01_0753     FALSE 0.359 151.000 0.045 1.000 Y NA
 10486170 10486171 Pfl01_0756 Pfl01_0757     TRUE 0.679 8.000 0.024 NA   NA
 10486171 10486172 Pfl01_0757 Pfl01_0758     TRUE 0.948 -7.000 0.086 NA   NA
 10486176 10486177 Pfl01_0762 Pfl01_0763   dnaK TRUE 0.701 103.000 0.049 0.006 Y NA
 10486177 10486178 Pfl01_0763 Pfl01_0764 dnaK   FALSE 0.425 229.000 0.236 0.002 Y NA
 10486178 10486179 Pfl01_0764 Pfl01_0765   dapB TRUE 0.787 10.000 0.041 1.000 N NA
 10486179 10486180 Pfl01_0765 Pfl01_0766 dapB   FALSE 0.105 233.000 0.034 1.000 Y NA
 10486180 10486181 Pfl01_0766 Pfl01_0767   carB TRUE 0.867 126.000 0.345 0.000 Y NA
 10486181 10486182 Pfl01_0767 Pfl01_0768 carB greA TRUE 0.976 -3.000 0.241 1.000 N NA
 10486182 10486183 Pfl01_0768 Pfl01_0769 greA   FALSE 0.349 29.000 0.014 NA   NA
 10486185 10486186 Pfl01_0771 Pfl01_0772     FALSE 0.051 203.000 0.066 NA N NA
 10486186 10486187 Pfl01_0772 Pfl01_0773     TRUE 0.950 9.000 0.325 1.000 N NA
 10486187 10486188 Pfl01_0773 Pfl01_0774   glmM TRUE 0.888 17.000 0.260 1.000 N NA
 10486188 10486189 Pfl01_0774 Pfl01_0775 glmM tpiA TRUE 0.706 66.000 0.082 1.000 Y NA
 10486189 10486190 Pfl01_0775 Pfl01_0776 tpiA secG TRUE 0.926 5.000 0.184 1.000 N NA
 10486190 10486191 Pfl01_0776 Pfl01_R18 secG   FALSE 0.221 23.000 0.000 NA   NA
 10486191 10486192 Pfl01_R18 Pfl01_R19     FALSE 0.040 98.000 0.000 NA   NA
 10486192 10486193 Pfl01_R19 Pfl01_0777     FALSE 0.058 76.000 0.000 NA   NA
 10486193 10486194 Pfl01_0777 Pfl01_0778   nusA TRUE 0.896 48.000 0.759 NA   NA
 10486194 10486195 Pfl01_0778 Pfl01_0779 nusA infB TRUE 0.880 28.000 0.342 1.000 N NA
 10486195 10486196 Pfl01_0779 Pfl01_0780 infB rbfA TRUE 0.708 160.000 0.530 1.000 Y NA
 10486196 10486197 Pfl01_0780 Pfl01_0781 rbfA truB TRUE 0.983 5.000 0.318 1.000 Y NA
 10486197 10486198 Pfl01_0781 Pfl01_0782 truB rpsO TRUE 0.587 142.000 0.211 1.000 Y NA
 10486198 10486199 Pfl01_0782 Pfl01_0783 rpsO   FALSE 0.451 195.000 0.335 1.000 Y NA
 10486199 10486200 Pfl01_0783 Pfl01_R20     FALSE 0.029 132.000 0.000 NA   NA
 10486200 10486201 Pfl01_R20 Pfl01_0784     FALSE 0.007 217.000 0.000 NA   NA
 10486203 10486204 Pfl01_0786 Pfl01_0787     FALSE 0.272 65.000 0.048 NA   NA
 10486204 10486205 Pfl01_0787 Pfl01_0788     TRUE 0.992 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 10486205 10486206 Pfl01_0788 Pfl01_0789     FALSE 0.104 158.000 0.042 1.000 N NA
 10486206 10486207 Pfl01_0789 Pfl01_0790     FALSE 0.180 154.000 0.133 NA   NA
 10486208 10486209 Pfl01_0791 Pfl01_0792     TRUE 0.697 4.000 0.017 NA N NA
 10486210 10486211 Pfl01_0793 Pfl01_0794     TRUE 0.979 0.000 0.101 1.000 Y NA
 10486211 10486212 Pfl01_0794 Pfl01_0795     TRUE 0.986 12.000 0.562 1.000 Y NA
 10486212 10486213 Pfl01_0795 Pfl01_0796     FALSE 0.247 60.000 0.017 1.000 N NA
 10486214 10486215 Pfl01_0797 Pfl01_0798     TRUE 0.647 133.000 0.068 0.019 Y NA
 10486216 10486217 Pfl01_0799 Pfl01_0800     TRUE 0.691 1.000 0.000 1.000   NA
 10486220 10486221 Pfl01_0803 Pfl01_0804     TRUE 0.998 -3.000 0.903 1.000 Y NA
 10486221 10486222 Pfl01_0804 Pfl01_0805     TRUE 0.957 14.000 0.313 0.069 N NA
 10486222 10486223 Pfl01_0805 Pfl01_0806     TRUE 0.952 22.000 0.403 0.069 N NA
 10486224 10486225 Pfl01_0807 Pfl01_0808 prfC   FALSE 0.003 269.000 0.000 NA   NA
 10486226 10486227 Pfl01_0809 Pfl01_0810 dppF   TRUE 0.996 0.000 0.377 0.001 Y NA
 10486227 10486228 Pfl01_0810 Pfl01_0811     TRUE 0.987 11.000 0.560 1.000 Y NA
 10486228 10486229 Pfl01_0811 Pfl01_0812     TRUE 0.995 12.000 0.779 0.069 Y NA
 10486229 10486230 Pfl01_0812 Pfl01_0813     TRUE 0.741 74.000 0.036 0.069 Y NA
 10486230 10486231 Pfl01_0813 Pfl01_0814     TRUE 0.881 79.000 0.714 0.085   NA
 10486231 10486232 Pfl01_0814 Pfl01_0815     TRUE 0.626 178.000 0.714 0.085   NA
 10486232 10486233 Pfl01_0815 Pfl01_0816     FALSE 0.100 261.000 0.000 0.069 Y NA
 10486236 10486237 Pfl01_0819 Pfl01_0820     FALSE 0.007 217.000 0.000 NA   NA
 10486237 10486238 Pfl01_0820 Pfl01_0821     TRUE 0.998 -7.000 0.682 1.000 Y NA
 10486238 10486239 Pfl01_0821 Pfl01_0822     FALSE 0.168 97.000 0.030 1.000   NA
 10486239 10486240 Pfl01_0822 Pfl01_0823     FALSE 0.388 54.000 0.048 1.000   NA
 10486241 10486242 Pfl01_0824 Pfl01_0825     FALSE 0.038 102.000 0.000 NA   NA
 10486242 10486243 Pfl01_0825 Pfl01_0826     TRUE 0.974 12.000 0.750 NA   NA
 10486244 10486245 Pfl01_0827 Pfl01_0828     TRUE 0.537 62.000 0.039 0.086 N NA
 10486245 10486246 Pfl01_0828 Pfl01_0829     FALSE 0.430 58.000 0.071 1.000 N NA
 10486246 10486247 Pfl01_0829 Pfl01_0830     TRUE 0.953 12.000 0.130 1.000 Y NA
 10486247 10486248 Pfl01_0830 Pfl01_0831     FALSE 0.077 98.000 0.000 1.000   NA
 10486249 10486250 Pfl01_0832 Pfl01_0833     TRUE 0.959 -3.000 0.122 1.000   NA
 10486250 10486251 Pfl01_0833 Pfl01_0834     TRUE 0.798 47.000 0.417 NA   NA
 10486251 10486252 Pfl01_0834 Pfl01_0835   gatB FALSE 0.046 149.000 0.010 NA   NA
 10486252 10486253 Pfl01_0835 Pfl01_0836 gatB gatA TRUE 0.994 11.000 0.492 0.001 Y NA
 10486253 10486254 Pfl01_0836 Pfl01_0837 gatA gatC TRUE 0.993 17.000 0.643 0.001 Y NA
 10486255 10486256 Pfl01_0838 Pfl01_0839     FALSE 0.499 177.000 0.689 1.000 N NA
 10486256 10486257 Pfl01_0839 Pfl01_0840     TRUE 0.997 0.000 0.550 0.002 Y NA
 10486257 10486258 Pfl01_0840 Pfl01_0841   maf TRUE 0.659 44.000 0.206 NA N NA
 10486258 10486259 Pfl01_0841 Pfl01_0842 maf   TRUE 0.841 37.000 0.417 NA N NA
 10486259 10486260 Pfl01_0842 Pfl01_0843     TRUE 0.578 76.000 0.296 NA   NA
 10486260 10486261 Pfl01_0843 Pfl01_0844     TRUE 0.710 59.000 0.358 NA   NA
 10486261 10486262 Pfl01_0844 Pfl01_0845     TRUE 0.934 6.000 0.259 NA   NA
 10486264 10486265 Pfl01_0847 Pfl01_0848     FALSE 0.036 162.000 0.010 NA   NA
 10486265 10486266 Pfl01_0848 Pfl01_0849   fumC TRUE 0.762 11.000 0.058 NA   NA
 10486266 10486267 Pfl01_0849 Pfl01_0850 fumC   FALSE 0.500 28.000 0.024 1.000   NA
 10486267 10486268 Pfl01_0850 Pfl01_0851     TRUE 0.941 2.000 0.179 1.000   NA
 10486268 10486269 Pfl01_0851 Pfl01_0852     TRUE 0.958 31.000 0.464 1.000 Y NA
 10486270 10486271 Pfl01_0853 Pfl01_0854     TRUE 0.834 16.000 0.182 NA   NA
 10486271 10486272 Pfl01_0854 Pfl01_0855     TRUE 0.928 3.000 0.186 NA   NA
 10486272 10486273 Pfl01_0855 Pfl01_0856     TRUE 0.973 12.000 0.728 NA N NA
 10486273 10486274 Pfl01_0856 Pfl01_0857     TRUE 0.840 74.000 0.820 NA N NA
 10486274 10486275 Pfl01_0857 Pfl01_0858     FALSE 0.139 187.000 0.163 1.000   NA
 10486275 10486276 Pfl01_0858 Pfl01_0859     TRUE 0.984 0.000 0.543 NA   NA
 10486276 10486277 Pfl01_0859 Pfl01_0860     TRUE 0.989 -13.000 0.459 NA   NA
 10486277 10486278 Pfl01_0860 Pfl01_0861     TRUE 0.974 9.000 0.617 NA   NA
 10486278 10486279 Pfl01_0861 Pfl01_0862     TRUE 0.985 1.000 0.598 1.000   NA
 10486280 10486281 Pfl01_0863 Pfl01_0864     TRUE 0.993 0.000 0.530 NA Y NA
 10486281 10486282 Pfl01_0864 Pfl01_0865     TRUE 0.984 0.000 0.562 NA   NA
 10486282 10486283 Pfl01_0865 Pfl01_0866     TRUE 0.803 12.000 0.091 NA   NA
 10486283 10486284 Pfl01_0866 Pfl01_0867     TRUE 0.982 -3.000 0.353 NA   NA
 10486284 10486285 Pfl01_0867 Pfl01_0868     FALSE 0.181 116.000 0.067 NA   NA
 10486285 10486286 Pfl01_0868 Pfl01_0869     TRUE 0.846 23.000 0.258 NA N NA
 10486286 10486287 Pfl01_0869 Pfl01_0870   hisG FALSE 0.272 128.000 0.123 1.000 N NA
 10486287 10486288 Pfl01_0870 Pfl01_0871 hisG hisD TRUE 0.812 126.000 0.254 0.003 Y NA
 10486288 10486289 Pfl01_0871 Pfl01_0872 hisD   TRUE 0.987 3.000 0.087 0.003 Y NA
 10486290 10486291 Pfl01_0873 Pfl01_0874     TRUE 0.946 13.000 0.152 NA Y NA
 10486291 10486292 Pfl01_0874 Pfl01_0875     FALSE 0.095 88.000 0.000 1.000 N NA
 10486293 10486294 Pfl01_0876 Pfl01_0877     FALSE 0.075 149.000 0.030 NA   NA
 10486294 10486295 Pfl01_0877 Pfl01_0878     TRUE 0.957 10.000 0.096 0.000 N NA
 10486296 10486297 Pfl01_0879 Pfl01_0880     TRUE 0.957 5.000 0.170 0.085   NA
 10486297 10486298 Pfl01_0880 Pfl01_0881     FALSE 0.406 61.000 0.094 NA   NA
 10486299 10486300 Pfl01_0882 Pfl01_0883     FALSE 0.432 124.000 0.036 1.000 Y NA
 10486300 10486301 Pfl01_0883 Pfl01_0884     FALSE 0.078 158.000 0.024 1.000 N NA
 10486302 10486303 Pfl01_0885 Pfl01_0886     FALSE 0.324 43.000 0.015 1.000 N NA
 10486305 10486306 Pfl01_0888 Pfl01_0889     TRUE 0.953 -7.000 0.097 NA   NA
 10486306 10486307 Pfl01_0889 Pfl01_0890   folX TRUE 0.847 3.000 0.061 NA   NA
 10486307 10486308 Pfl01_0890 Pfl01_0891 folX   TRUE 0.961 1.000 0.030 1.000 Y NA
 10486308 10486309 Pfl01_0891 Pfl01_0892     TRUE 0.751 23.000 0.100 1.000 N NA
 10486309 10486310 Pfl01_0892 Pfl01_0893     TRUE 0.718 57.000 0.120 0.049   NA
 10486312 10486313 Pfl01_0895 Pfl01_0896     TRUE 0.548 55.000 0.167 NA   NA
 10486316 10486317 Pfl01_0899 Pfl01_0900     TRUE 0.995 -10.000 0.840 NA   NA
 10486317 10486318 Pfl01_0900 Pfl01_0901     FALSE 0.105 133.000 0.034 NA N NA
 10486318 10486319 Pfl01_0901 Pfl01_0902     TRUE 0.940 0.000 0.125 1.000   NA
 10486319 10486320 Pfl01_0902 Pfl01_0903     FALSE 0.183 153.000 0.100 1.000   NA
 10486322 10486323 Pfl01_0905 Pfl01_0906     TRUE 0.959 24.000 0.857 NA   NA
 10486323 10486324 Pfl01_0906 Pfl01_0907     FALSE 0.410 140.000 0.333 NA   NA
 10486324 10486325 Pfl01_0907 Pfl01_0908     FALSE 0.026 140.000 0.000 NA   NA
 10486327 10486328 Pfl01_0910 Pfl01_0911     TRUE 0.976 4.000 0.188 1.000 Y NA
 10486328 10486329 Pfl01_0911 Pfl01_0912     TRUE 0.934 13.000 0.077 0.001 N NA
 10486329 10486330 Pfl01_0912 Pfl01_0913     TRUE 0.560 82.000 0.267 1.000 N NA
 10486335 10486336 Pfl01_0918 Pfl01_0919     FALSE 0.009 200.000 0.000 NA   NA
 10486336 10486337 Pfl01_0919 Pfl01_0920     TRUE 0.940 64.000 0.750 1.000 Y NA
 10486338 10486339 Pfl01_0921 Pfl01_0922     FALSE 0.009 201.000 0.000 NA   NA
 10486340 10486341 Pfl01_0923 Pfl01_0924     TRUE 0.795 91.000 0.400 NA Y NA
 10486341 10486342 Pfl01_0924 Pfl01_0925     TRUE 0.979 9.000 0.714 NA N NA
 10486343 10486344 Pfl01_0926 Pfl01_0927     TRUE 0.991 -3.000 0.625 NA   NA
 10486344 10486345 Pfl01_0927 Pfl01_0928     TRUE 0.964 0.000 0.278 NA   NA
 10486345 10486346 Pfl01_0928 Pfl01_0929     TRUE 0.945 2.000 0.222 NA   NA
 10486346 10486347 Pfl01_0929 Pfl01_0930     TRUE 0.991 -3.000 0.588 NA N NA
 10486347 10486348 Pfl01_0930 Pfl01_0931     FALSE 0.521 105.000 0.085 NA Y NA
 10486350 10486351 Pfl01_0933 Pfl01_0934     FALSE 0.005 232.000 0.000 NA   NA
 10486352 10486353 Pfl01_0935 Pfl01_0936     FALSE 0.023 148.000 0.000 NA   NA
 10486353 10486354 Pfl01_0936 Pfl01_0937     FALSE 0.033 588.000 0.429 1.000 N NA
 10486355 10486356 Pfl01_0938 Pfl01_0939     TRUE 0.649 140.000 0.714 NA   NA
 10486358 10486359 Pfl01_0940 Pfl01_0941     TRUE 0.932 11.000 0.318 NA   NA
 10486360 10486361 Pfl01_0942 Pfl01_0943     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10486363 10486364 Pfl01_0945 Pfl01_0946     TRUE 0.904 36.000 0.636 NA   NA
 10486365 10486366 Pfl01_0947 Pfl01_0948     FALSE 0.011 190.000 0.000 NA   NA
 10486367 10486368 Pfl01_0949 Pfl01_0950     TRUE 0.541 107.000 0.400 NA   NA
 10486368 10486369 Pfl01_0950 Pfl01_0951     TRUE 0.971 16.000 0.889 NA   NA
 10486369 10486370 Pfl01_0951 Pfl01_0952     TRUE 0.981 11.000 0.889 NA   NA
 10486370 10486371 Pfl01_0952 Pfl01_0953   algL FALSE 0.244 200.000 0.438 NA   NA
 10486371 10486372 Pfl01_0953 Pfl01_0954 algL   TRUE 0.973 9.000 0.562 1.000   NA
 10486372 10486373 Pfl01_0954 Pfl01_0955     TRUE 0.960 11.000 0.500 NA   NA
 10486373 10486374 Pfl01_0955 Pfl01_0956     TRUE 0.933 27.000 0.625 NA   NA
 10486374 10486375 Pfl01_0956 Pfl01_0957     TRUE 0.985 -3.000 0.417 NA   NA
 10486375 10486376 Pfl01_0957 Pfl01_0958     TRUE 0.959 10.000 0.455 NA   NA
 10486376 10486377 Pfl01_0958 Pfl01_0959     TRUE 0.872 36.000 0.500 NA   NA
 10486377 10486378 Pfl01_0959 Pfl01_0960     TRUE 0.779 75.000 0.625 NA   NA
 10486378 10486379 Pfl01_0960 Pfl01_0961     FALSE 0.001 811.000 0.000 NA   NA
 10486380 10486381 Pfl01_0962 Pfl01_0963     FALSE 0.003 350.000 0.000 1.000   NA
 10486381 10486382 Pfl01_0963 Pfl01_0964   moaC FALSE 0.123 102.000 0.013 1.000 N NA
 10486382 10486383 Pfl01_0964 Pfl01_0965 moaC   TRUE 0.989 -3.000 0.175 1.000 Y NA
 10486383 10486384 Pfl01_0965 Pfl01_0966     TRUE 0.991 4.000 0.501 1.000 Y NA
 10486384 10486385 Pfl01_0966 Pfl01_0967     FALSE 0.025 183.000 0.000 1.000 N NA
 10486386 10486387 Pfl01_0968 Pfl01_0969     TRUE 0.559 94.000 0.333 1.000   NA
 10486387 10486388 Pfl01_0969 Pfl01_0970     TRUE 0.907 15.000 0.286 1.000   NA
 10486388 10486389 Pfl01_0970 Pfl01_0971     FALSE 0.115 125.000 0.019 1.000 N NA
 10486389 10486390 Pfl01_0971 Pfl01_0972     FALSE 0.040 97.000 0.000 NA   NA
 10486391 10486392 Pfl01_0973 Pfl01_0974     TRUE 0.946 66.000 0.548 0.068 Y NA
 10486392 10486393 Pfl01_0974 Pfl01_0975     TRUE 0.996 11.000 0.815 0.013 Y NA
 10486393 10486394 Pfl01_0975 Pfl01_0976     TRUE 0.990 12.000 0.734 1.000 Y NA
 10486394 10486395 Pfl01_0976 Pfl01_0977     FALSE 0.056 138.000 0.000 1.000 N NA
 10486395 10486396 Pfl01_0977 Pfl01_0978     TRUE 0.981 -10.000 0.250 1.000 N NA
 10486396 10486397 Pfl01_0978 Pfl01_0979     FALSE 0.161 101.000 0.048 NA   NA
 10486397 10486398 Pfl01_0979 Pfl01_0980     FALSE 0.311 40.000 0.026 NA   NA
 10486398 10486399 Pfl01_0980 Pfl01_0981     FALSE 0.005 469.000 0.041 NA N NA
 10486400 10486401 Pfl01_0982 Pfl01_0983   ndpA TRUE 0.566 0.000 0.000 NA   NA
 10486403 10486404 Pfl01_0985 Pfl01_0986   valS FALSE 0.076 134.000 0.003 1.000   NA
 10486404 10486405 Pfl01_0986 Pfl01_0987 valS   FALSE 0.018 200.000 0.009 NA   NA
 10486405 10486406 Pfl01_0987 Pfl01_0988     TRUE 0.722 9.000 0.034 NA   NA
 10486406 10486407 Pfl01_0988 Pfl01_0989   pepA TRUE 0.794 61.000 0.494 1.000 N NA
 10486408 10486409 Pfl01_0990 Pfl01_0991     TRUE 0.996 -7.000 0.631 0.066   NA
 10486409 10486410 Pfl01_0991 Pfl01_0992     FALSE 0.038 173.000 0.003 1.000   NA
 10486410 10486411 Pfl01_0992 Pfl01_0993     TRUE 0.911 10.000 0.187 1.000 N NA
 10486411 10486412 Pfl01_0993 Pfl01_0994   rnc FALSE 0.124 183.000 0.117 1.000 N NA
 10486412 10486413 Pfl01_0994 Pfl01_0995 rnc era TRUE 0.985 -7.000 0.127 0.054   NA
 10486413 10486414 Pfl01_0995 Pfl01_0996 era recO FALSE 0.149 168.000 0.109 1.000   NA
 10486414 10486415 Pfl01_0996 Pfl01_0997 recO   TRUE 0.675 40.000 0.166 1.000 N NA
 10486417 10486418 Pfl01_0999 Pfl01_1000     TRUE 0.648 6.000 0.016 NA   NA
 10486418 10486419 Pfl01_1000 Pfl01_1001     FALSE 0.003 261.000 0.000 NA   NA
 10486419 10486420 Pfl01_1001 Pfl01_1002     TRUE 0.923 32.000 0.667 NA   NA
 10486421 10486422 Pfl01_1003 Pfl01_1004     TRUE 0.975 24.000 0.258 0.002 Y NA
 10486422 10486423 Pfl01_1004 Pfl01_1005     TRUE 0.737 36.000 0.200 1.000 N NA
 10486423 10486424 Pfl01_1005 Pfl01_1006     TRUE 0.970 -7.000 0.146 1.000 N NA
 10486424 10486425 Pfl01_1006 Pfl01_1007     TRUE 0.732 31.000 0.146 1.000 N NA
 10486425 10486426 Pfl01_1007 Pfl01_1008     FALSE 0.004 260.000 0.000 NA   NA
 10486426 10486427 Pfl01_1008 Pfl01_1009     FALSE 0.189 103.000 0.065 NA   NA
 10486428 10486429 Pfl01_1010 Pfl01_1011     FALSE 0.504 48.000 0.078 1.000   NA
 10486429 10486430 Pfl01_1011 Pfl01_1012     TRUE 0.922 -3.000 0.062 NA   NA
 10486430 10486431 Pfl01_1012 Pfl01_1013     FALSE 0.157 65.000 0.016 NA   NA
 10486431 10486432 Pfl01_1013 Pfl01_1014   purT FALSE 0.099 101.000 0.019 NA   NA
 10486433 10486434 Pfl01_1015 Pfl01_1016     FALSE 0.010 236.000 0.008 NA N NA
 10486434 10486435 Pfl01_1016 Pfl01_1017     TRUE 0.927 13.000 0.349 NA   NA
 10486436 10486437 Pfl01_1018 Pfl01_1019   rpsP FALSE 0.119 250.000 0.361 1.000 N NA
 10486437 10486438 Pfl01_1019 Pfl01_1020 rpsP rimM TRUE 0.992 6.000 0.342 0.009 Y NA
 10486438 10486439 Pfl01_1020 Pfl01_1021 rimM trmD TRUE 0.994 4.000 0.672 1.000 Y NA
 10486439 10486440 Pfl01_1021 Pfl01_1022 trmD rplS TRUE 0.944 46.000 0.567 1.000 Y NA
 10486440 10486441 Pfl01_1022 Pfl01_1023 rplS   FALSE 0.081 91.000 0.004 NA N NA
 10486443 10486444 Pfl01_1025 Pfl01_1026 xerD   FALSE 0.107 144.000 0.026 1.000 N NA
 10486444 10486445 Pfl01_1026 Pfl01_1027     FALSE 0.126 133.000 0.029 1.000 N NA
 10486445 10486446 Pfl01_1027 Pfl01_1028     TRUE 0.740 67.000 0.125 1.000 Y NA
 10486446 10486447 Pfl01_1028 Pfl01_1029     FALSE 0.379 102.000 0.000 1.000 Y NA
 10486447 10486448 Pfl01_1029 Pfl01_1030     FALSE 0.033 119.000 0.000 NA   NA
 10486448 10486449 Pfl01_1030 Pfl01_1031     FALSE 0.017 165.000 0.000 NA   NA
 10486450 10486451 Pfl01_1032 Pfl01_1033     TRUE 0.820 14.000 0.103 1.000   NA
 10486452 10486453 Pfl01_1034 Pfl01_1035     FALSE 0.244 55.000 0.011 1.000   NA
 10486453 10486454 Pfl01_1035 Pfl01_1036     FALSE 0.015 232.000 0.002 1.000 N NA
 10486454 10486455 Pfl01_1036 Pfl01_1037     FALSE 0.272 92.000 0.000 0.084   NA
 10486456 10486457 Pfl01_1038 Pfl01_1039 mdoD   FALSE 0.001 600.000 0.000 NA   NA
 10486457 10486458 Pfl01_1039 Pfl01_1040     FALSE 0.039 100.000 0.000 NA   NA
 10486459 10486460 Pfl01_1041 Pfl01_1042     TRUE 0.928 3.000 0.184 NA   NA
 10486461 10486462 Pfl01_1043 Pfl01_1044     FALSE 0.051 146.000 0.000 1.000 N NA
 10486462 10486463 Pfl01_1044 Pfl01_1045     FALSE 0.498 51.000 0.081 1.000 N NA
 10486463 10486464 Pfl01_1045 Pfl01_1046     TRUE 0.999 -10.000 0.821 0.068 Y NA
 10486464 10486465 Pfl01_1046 Pfl01_1047     TRUE 0.997 2.000 0.643 0.068 Y NA
 10486465 10486466 Pfl01_1047 Pfl01_1048     FALSE 0.399 298.000 0.609 0.068 Y NA
 10486466 10486467 Pfl01_1048 Pfl01_1049     FALSE 0.296 83.000 0.065 1.000 N NA
 10486467 10486468 Pfl01_1049 Pfl01_1050     FALSE 0.330 100.000 0.125 1.000 N NA
 10486469 10486470 Pfl01_1051 Pfl01_1052     FALSE 0.009 260.000 0.018 NA   NA
 10486470 10486471 Pfl01_1052 Pfl01_1053     TRUE 0.997 0.000 0.600 0.013 Y NA
 10486471 10486472 Pfl01_1053 Pfl01_1054     TRUE 0.997 -3.000 0.635 1.000 Y NA
 10486472 10486473 Pfl01_1054 Pfl01_1055     TRUE 0.996 -3.000 0.558 1.000 Y NA
 10486473 10486474 Pfl01_1055 Pfl01_1056     TRUE 0.998 -3.000 0.587 0.014 Y NA
 10486474 10486475 Pfl01_1056 Pfl01_1057     TRUE 0.997 -3.000 0.324 0.014 Y NA
 10486475 10486476 Pfl01_1057 Pfl01_1058     TRUE 0.962 49.000 0.480 0.027 Y NA
 10486476 10486477 Pfl01_1058 Pfl01_1059     FALSE 0.004 360.000 0.002 1.000 N NA
 10486477 10486478 Pfl01_1059 Pfl01_1060   lysS TRUE 0.758 116.000 0.162 0.033 Y NA
 10486478 10486479 Pfl01_1060 Pfl01_1061 lysS   FALSE 0.103 119.000 0.012 1.000   NA
 10486479 10486480 Pfl01_1061 Pfl01_1062     FALSE 0.365 146.000 0.304 NA   NA
 10486480 10486481 Pfl01_1062 Pfl01_1063     TRUE 0.609 34.000 0.104 NA   NA
 10486481 10486482 Pfl01_1063 Pfl01_1064     FALSE 0.347 59.000 0.065 NA   NA
 10486482 10486483 Pfl01_1064 Pfl01_1065     TRUE 0.963 -3.000 0.174 NA   NA
 10486484 10486485 Pfl01_1066 Pfl01_1067     TRUE 0.652 56.000 0.263 NA   NA
 10486485 10486486 Pfl01_1067 Pfl01_1068     FALSE 0.001 365.000 0.000 NA   NA
 10486487 10486488 Pfl01_1069 Pfl01_1070   adk FALSE 0.006 289.000 0.000 1.000 N NA
 10486488 10486489 Pfl01_1070 Pfl01_1071 adk   FALSE 0.149 95.000 0.019 1.000 N NA
 10486489 10486490 Pfl01_1071 Pfl01_1072     FALSE 0.027 174.000 0.008 NA   NA
 10486490 10486491 Pfl01_1072 Pfl01_1073     TRUE 0.899 0.000 0.074 NA   NA
 10486491 10486492 Pfl01_1073 Pfl01_1074     FALSE 0.428 33.000 0.037 NA   NA
 10486492 10486493 Pfl01_1074 Pfl01_1075     TRUE 0.883 3.000 0.090 NA   NA
 10486497 10486498 Pfl01_1079 Pfl01_1080     TRUE 0.953 7.000 0.354 NA N NA
 10486498 10486499 Pfl01_1080 Pfl01_1081     FALSE 0.001 639.000 0.000 NA   NA
 10486500 10486501 Pfl01_1082 Pfl01_1083     TRUE 0.539 25.000 0.042 NA   NA
 10486501 10486502 Pfl01_1083 Pfl01_1084     FALSE 0.354 52.000 0.052 NA   NA
 10486504 10486505 Pfl01_1086 Pfl01_1087     FALSE 0.313 76.000 0.083 NA   NA
 10486505 10486506 Pfl01_1087 Pfl01_1088     TRUE 0.868 0.000 0.033 1.000   NA
 10486506 10486507 Pfl01_1088 Pfl01_1089     FALSE 0.138 100.000 0.018 1.000 N NA
 10486509 10486510 Pfl01_1091 Pfl01_1092     TRUE 0.950 -3.000 0.116 NA   NA
 10486510 10486511 Pfl01_1092 Pfl01_1093     TRUE 0.897 39.000 0.244 1.000 Y NA
 10486511 10486512 Pfl01_1093 Pfl01_1094     TRUE 0.610 32.000 0.069 1.000 N NA
 10486514 10486515 Pfl01_1096 Pfl01_1097     FALSE 0.012 183.000 0.000 NA   NA
 10486515 10486516 Pfl01_1097 Pfl01_1098     FALSE 0.070 166.000 0.028 1.000   NA
 10486516 10486517 Pfl01_1098 Pfl01_1099   glnD TRUE 0.737 44.000 0.257 1.000 N NA
 10486517 10486518 Pfl01_1099 Pfl01_1100 glnD   TRUE 0.901 41.000 0.651 1.000 N NA
 10486519 10486520 Pfl01_1101 Pfl01_1102 rpsB tsf TRUE 0.679 191.000 0.748 1.000 Y NA
 10486520 10486521 Pfl01_1102 Pfl01_1103 tsf pyrH FALSE 0.027 212.000 0.017 1.000 N NA
 10486521 10486522 Pfl01_1103 Pfl01_1104 pyrH frr TRUE 0.909 -3.000 0.030 1.000 N NA
 10486522 10486523 Pfl01_1104 Pfl01_1105 frr   TRUE 0.937 15.000 0.409 1.000 N NA
 10486523 10486524 Pfl01_1105 Pfl01_1106     TRUE 0.992 0.000 0.400 1.000 Y NA
 10486524 10486525 Pfl01_1106 Pfl01_1107     TRUE 0.994 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 10486525 10486526 Pfl01_1107 Pfl01_1108     TRUE 0.851 54.000 0.568 1.000 N NA
 10486526 10486527 Pfl01_1108 Pfl01_1109     TRUE 0.544 75.000 0.014 1.000 Y NA
 10486527 10486528 Pfl01_1109 Pfl01_1110     TRUE 0.760 46.000 0.050 1.000 Y NA
 10486528 10486529 Pfl01_1110 Pfl01_1111   lpxD TRUE 0.995 4.000 0.814 1.000 Y NA
 10486529 10486530 Pfl01_1111 Pfl01_1112 lpxD fabZ TRUE 0.767 107.000 0.796 1.000 N NA
 10486530 10486531 Pfl01_1112 Pfl01_1113 fabZ   TRUE 0.995 -3.000 0.850 1.000 N NA
 10486531 10486532 Pfl01_1113 Pfl01_1114   lpxB TRUE 0.985 3.000 0.289 1.000 Y NA
 10486532 10486533 Pfl01_1114 Pfl01_1115 lpxB rnhB TRUE 0.970 -3.000 0.186 1.000 N NA
 10486533 10486534 Pfl01_1115 Pfl01_1116 rnhB dnaE TRUE 0.683 77.000 0.104 1.000 Y NA
 10486534 10486535 Pfl01_1116 Pfl01_1117 dnaE   FALSE 0.245 140.000 0.122 1.000 N NA
 10486535 10486536 Pfl01_1117 Pfl01_1118     FALSE 0.229 147.000 0.123 1.000 N NA
 10486536 10486537 Pfl01_1118 Pfl01_1119   pyrG FALSE 0.012 275.000 0.016 1.000 N NA
 10486537 10486538 Pfl01_1119 Pfl01_1120 pyrG   TRUE 0.906 6.000 0.138 1.000 N NA
 10486538 10486539 Pfl01_1120 Pfl01_1121   eno FALSE 0.196 157.000 0.125 1.000 N NA
 10486539 10486540 Pfl01_1121 Pfl01_1122 eno   FALSE 0.231 172.000 0.241 1.000 N NA
 10486540 10486541 Pfl01_1122 Pfl01_1123   ispD TRUE 0.970 -3.000 0.185 1.000 N NA
 10486543 10486544 Pfl01_1125 Pfl01_1126     TRUE 0.841 56.000 0.567 1.000   NA
 10486544 10486545 Pfl01_1126 Pfl01_1127   ispF FALSE 0.299 44.000 0.012 1.000   NA
 10486545 10486546 Pfl01_1127 Pfl01_1128 ispF truD TRUE 0.968 -3.000 0.173 1.000   NA
 10486546 10486547 Pfl01_1128 Pfl01_1129 truD surE TRUE 0.980 -12.000 0.235 1.000   NA
 10486547 10486548 Pfl01_1129 Pfl01_1130 surE pcm TRUE 0.976 0.000 0.353 1.000   NA
 10486548 10486549 Pfl01_1130 Pfl01_1131 pcm   FALSE 0.022 213.000 0.007 1.000 N NA
 10486549 10486550 Pfl01_1131 Pfl01_1132     FALSE 0.257 107.000 0.081 1.000 N NA
 10486551 10486552 Pfl01_1133 Pfl01_1134     FALSE 0.067 164.000 0.020 1.000 N NA
 10486553 10486554 Pfl01_1135 Pfl01_1136     FALSE 0.001 528.000 0.000 NA   NA
 10486554 10486555 Pfl01_1136 Pfl01_1137     FALSE 0.031 126.000 0.000 NA   NA
 10486555 10486556 Pfl01_1137 Pfl01_1138     FALSE 0.064 71.000 0.000 NA   NA
 10486556 10486557 Pfl01_1138 Pfl01_1139     TRUE 0.951 4.000 0.300 NA   NA
 10486557 10486558 Pfl01_1139 Pfl01_1140     TRUE 0.900 15.000 0.300 NA   NA
 10486558 10486559 Pfl01_1140 Pfl01_1141     TRUE 0.983 -3.000 0.375 NA   NA
 10486559 10486560 Pfl01_1141 Pfl01_1142     TRUE 0.978 -3.000 0.292 NA   NA
 10486560 10486561 Pfl01_1142 Pfl01_1143     TRUE 0.528 1.000 0.000 NA   NA
 10486561 10486562 Pfl01_1143 Pfl01_1144     FALSE 0.386 10.000 0.000 NA   NA
 10486562 10486563 Pfl01_1144 Pfl01_1145     FALSE 0.002 302.000 0.000 NA   NA
 10486563 10486564 Pfl01_1145 Pfl01_1146     TRUE 0.909 0.000 0.087 NA   NA
 10486564 10486565 Pfl01_1146 Pfl01_1147     TRUE 0.700 81.000 0.500 NA   NA
 10486565 10486566 Pfl01_1147 Pfl01_1148     FALSE 0.030 129.000 0.000 NA   NA
 10486566 10486567 Pfl01_1148 Pfl01_1149     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10486567 10486568 Pfl01_1149 Pfl01_1150     TRUE 0.990 -7.000 0.500 NA   NA
 10486568 10486569 Pfl01_1150 Pfl01_1151     TRUE 0.963 10.000 0.500 NA   NA
 10486569 10486570 Pfl01_1151 Pfl01_1152     FALSE 0.075 62.000 0.000 NA   NA
 10486570 10486571 Pfl01_1152 Pfl01_1153     TRUE 0.978 -3.000 0.300 NA   NA
 10486571 10486572 Pfl01_1153 Pfl01_1154     TRUE 0.990 0.000 0.800 NA   NA
 10486572 10486573 Pfl01_1154 Pfl01_1155     TRUE 0.880 68.000 1.000 NA   NA
 10486573 10486574 Pfl01_1155 Pfl01_1156     TRUE 0.995 -3.000 0.900 NA   NA
 10486574 10486575 Pfl01_1156 Pfl01_1157     FALSE 0.303 131.000 0.200 NA   NA
 10486575 10486576 Pfl01_1157 Pfl01_1158     TRUE 0.975 -13.000 0.222 NA   NA
 10486576 10486577 Pfl01_1158 Pfl01_1159     TRUE 0.940 4.000 0.250 NA   NA
 10486577 10486578 Pfl01_1159 Pfl01_1160     TRUE 0.702 28.000 0.125 NA   NA
 10486578 10486579 Pfl01_1160 Pfl01_1161     TRUE 0.988 0.000 0.667 NA   NA
 10486579 10486580 Pfl01_1161 Pfl01_1162     TRUE 0.967 -10.000 0.167 NA   NA
 10486580 10486581 Pfl01_1162 Pfl01_1163     TRUE 0.974 -12.000 0.208 NA   NA
 10486581 10486582 Pfl01_1163 Pfl01_1164     FALSE 0.339 12.000 0.000 NA   NA
 10486582 10486583 Pfl01_1164 Pfl01_1165     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10486583 10486584 Pfl01_1165 Pfl01_1166     FALSE 0.030 128.000 0.000 NA   NA
 10486584 10486585 Pfl01_1166 Pfl01_1167     TRUE 0.977 8.000 0.667 NA   NA
 10486585 10486586 Pfl01_1167 Pfl01_1168     FALSE 0.285 15.000 0.000 NA   NA
 10486586 10486587 Pfl01_1168 Pfl01_1169     FALSE 0.488 3.000 0.000 NA   NA
 10486587 10486588 Pfl01_1169 Pfl01_1170     TRUE 0.901 30.000 0.500 NA   NA
 10486588 10486589 Pfl01_1170 Pfl01_1171     FALSE 0.339 12.000 0.000 NA   NA
 10486589 10486590 Pfl01_1171 Pfl01_1172     FALSE 0.085 57.000 0.000 NA   NA
 10486590 10486591 Pfl01_1172 Pfl01_1173     TRUE 0.992 -3.000 0.600 1.000   NA
 10486591 10486592 Pfl01_1173 Pfl01_1174     FALSE 0.286 36.000 0.016 NA   NA
 10486592 10486593 Pfl01_1174 Pfl01_1175   recA FALSE 0.276 84.000 0.082 NA   NA
 10486593 10486594 Pfl01_1175 Pfl01_1176 recA recX TRUE 0.944 9.000 0.296 1.000   NA
 10486596 10486597 Pfl01_1178 Pfl01_1179     FALSE 0.043 92.000 0.000 NA   NA
 10486599 10486600 Pfl01_1181 Pfl01_1182     FALSE 0.017 225.000 0.022 NA   NA
 10486600 10486601 Pfl01_1182 Pfl01_1183     TRUE 0.631 76.000 0.316 1.000 N NA
 10486604 10486605 Pfl01_1186 Pfl01_1187     FALSE 0.253 51.000 0.025 NA   NA
 10486605 10486606 Pfl01_1187 Pfl01_1188     FALSE 0.069 128.000 0.014 NA   NA
 10486606 10486607 Pfl01_1188 Pfl01_1189     FALSE 0.226 74.000 0.043 NA   NA
 10486607 10486608 Pfl01_1189 Pfl01_1190     FALSE 0.400 84.000 0.139 1.000   NA
 10486608 10486609 Pfl01_1190 Pfl01_1191   rimO FALSE 0.322 91.000 0.009 0.083   NA
 10486611 10486612 Pfl01_1193 Pfl01_1194     TRUE 0.944 0.000 0.176 NA   NA
 10486612 10486613 Pfl01_1194 Pfl01_R21     FALSE 0.003 281.000 0.000 NA   NA
 10486613 10486614 Pfl01_R21 Pfl01_R22     FALSE 0.008 204.000 0.000 NA   NA
 10486616 10486617 Pfl01_1196 Pfl01_1197     FALSE 0.437 18.000 0.013 NA   NA
 10486617 10486618 Pfl01_1197 Pfl01_1198     FALSE 0.059 116.000 0.004 NA   NA
 10486618 10486619 Pfl01_1198 Pfl01_1199     TRUE 0.550 44.000 0.120 NA   NA
 10486622 10486623 Pfl01_1202 Pfl01_1203 dcd   FALSE 0.082 107.000 0.014 NA   NA
 10486624 10486625 Pfl01_1204 Pfl01_1205     TRUE 0.989 -3.000 0.460 1.000   NA
 10486625 10486626 Pfl01_1205 Pfl01_1206     FALSE 0.453 60.000 0.008 0.097   NA
 10486626 10486627 Pfl01_1206 Pfl01_1207     TRUE 0.960 14.000 0.571 1.000   NA
 10486627 10486628 Pfl01_1207 Pfl01_1208     TRUE 0.887 13.000 0.200 1.000   NA
 10486628 10486629 Pfl01_1208 Pfl01_1209     TRUE 0.995 -3.000 0.200 0.012 Y NA
 10486629 10486630 Pfl01_1209 Pfl01_1210     TRUE 0.890 57.000 0.200 0.082 Y NA
 10486630 10486631 Pfl01_1210 Pfl01_1211     FALSE 0.004 334.000 0.000 1.000 N NA
 10486631 10486632 Pfl01_1211 Pfl01_1212     TRUE 0.993 -3.000 0.751 NA N NA
 10486632 10486633 Pfl01_1212 Pfl01_1213     FALSE 0.008 209.000 0.000 NA   NA
 10486633 10486634 Pfl01_1213 Pfl01_1214     FALSE 0.194 144.000 0.086 1.000   NA
 10486636 10486637 Pfl01_1216 Pfl01_1217     TRUE 0.961 -3.000 0.163 NA   NA
 10486637 10486638 Pfl01_1217 Pfl01_1218     TRUE 0.735 32.000 0.200 NA   NA
 10486638 10486639 Pfl01_1218 Pfl01_1219     TRUE 0.962 5.000 0.407 NA   NA
 10486640 10486641 Pfl01_1220 Pfl01_1221     TRUE 0.903 90.000 0.400 0.006 Y NA
 10486641 10486642 Pfl01_1221 Pfl01_1222     FALSE 0.076 163.000 0.045 NA   NA
 10486642 10486643 Pfl01_1222 Pfl01_1223     TRUE 0.956 -7.000 0.106 NA   NA
 10486645 10486646 Pfl01_1225 Pfl01_1226 dinG   FALSE 0.164 96.000 0.029 1.000   NA
 10486646 10486647 Pfl01_1226 Pfl01_1227     TRUE 0.624 107.000 0.467 1.000   NA
 10486647 10486648 Pfl01_1227 Pfl01_1228     TRUE 0.720 114.000 0.667 1.000 N NA
 10486648 10486649 Pfl01_1228 Pfl01_1229     TRUE 0.533 25.000 0.023 1.000 N NA
 10486652 10486653 Pfl01_1232 Pfl01_1233     FALSE 0.244 19.000 0.000 NA   NA
 10486653 10486654 Pfl01_1233 Pfl01_1234   nhaA FALSE 0.062 122.000 0.000 1.000   NA
 10486656 10486657 Pfl01_1236 Pfl01_1237     FALSE 0.098 96.000 0.017 NA   NA
 10486657 10486658 Pfl01_1237 Pfl01_1238     FALSE 0.317 60.000 0.056 NA   NA
 10486660 10486661 Pfl01_1240 Pfl01_1241     TRUE 0.961 -3.000 0.167 NA   NA
 10486661 10486662 Pfl01_1241 Pfl01_1242     TRUE 0.967 -3.000 0.200 NA   NA
 10486662 10486663 Pfl01_1242 Pfl01_1243     TRUE 0.773 17.000 0.120 NA   NA
 10486663 10486664 Pfl01_1243 Pfl01_1244     FALSE 0.089 159.000 0.051 NA   NA
 10486664 10486665 Pfl01_1244 Pfl01_1245   livG TRUE 0.998 1.000 0.967 0.018 Y NA
 10486665 10486666 Pfl01_1245 Pfl01_1246 livG livM TRUE 0.997 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 10486666 10486667 Pfl01_1246 Pfl01_1247 livM   TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.067 Y NA
 10486667 10486668 Pfl01_1247 Pfl01_1248     FALSE 0.075 232.000 0.000 1.000 Y NA
 10486672 10486673 Pfl01_1252 Pfl01_1253     FALSE 0.076 164.000 0.046 NA   NA
 10486677 10486678 Pfl01_1257 Pfl01_1258     TRUE 0.694 -3.000 0.000 NA N NA
 10486678 10486679 Pfl01_1258 Pfl01_1259     FALSE 0.209 89.000 0.054 NA N NA
 10486680 10486681 Pfl01_1260 Pfl01_1261     FALSE 0.251 146.000 0.182 NA   NA
 10486685 10486686 Pfl01_1265 Pfl01_1266     FALSE 0.006 296.000 0.000 1.000 N NA
 10486686 10486687 Pfl01_1266 Pfl01_1267     FALSE 0.020 196.000 0.000 1.000 N NA
 10486687 10486688 Pfl01_1267 Pfl01_1268     TRUE 0.998 0.000 0.739 0.000 Y NA
 10486688 10486689 Pfl01_1268 Pfl01_1269     TRUE 0.994 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 10486689 10486690 Pfl01_1269 Pfl01_1270     TRUE 0.816 37.000 0.066 0.001 N NA
 10486690 10486691 Pfl01_1270 Pfl01_1271     TRUE 0.998 2.000 0.782 0.000 Y NA
 10486691 10486692 Pfl01_1271 Pfl01_1272     FALSE 0.136 93.000 0.013 1.000 N NA
 10486692 10486693 Pfl01_1272 Pfl01_1273     FALSE 0.419 47.000 0.042 1.000 N NA
 10486693 10486694 Pfl01_1273 Pfl01_1274     TRUE 0.776 13.000 0.063 1.000   NA
 10486694 10486695 Pfl01_1274 Pfl01_1275     TRUE 0.895 11.000 0.174 1.000   NA
 10486696 10486697 Pfl01_1276 Pfl01_1277     FALSE 0.029 171.000 0.000 1.000   NA
 10486697 10486698 Pfl01_1277 Pfl01_1278     FALSE 0.023 290.000 0.000 0.081   NA
 10486698 10486699 Pfl01_1278 Pfl01_1279     TRUE 0.992 -3.000 0.385 0.066 N NA
 10486699 10486700 Pfl01_1279 Pfl01_1280     TRUE 0.979 4.000 0.565 1.000 N NA
 10486702 10486703 Pfl01_1282 Pfl01_1283     TRUE 0.576 33.000 0.080 NA N NA
 10486703 10486704 Pfl01_1283 Pfl01_1284     TRUE 0.728 34.000 0.204 NA N NA
 10486706 10486707 Pfl01_1286 Pfl01_1287     TRUE 0.966 0.000 0.286 NA   NA
 10486708 10486709 Pfl01_1288 Pfl01_1289     FALSE 0.277 32.000 0.000 1.000   NA
 10486709 10486710 Pfl01_1289 Pfl01_1290     TRUE 0.994 -3.000 0.833 NA   NA
 10486710 10486711 Pfl01_1290 Pfl01_1291     FALSE 0.256 144.000 0.182 NA   NA
 10486711 10486712 Pfl01_1291 Pfl01_1292     TRUE 0.688 80.000 0.429 1.000   NA
 10486712 10486713 Pfl01_1292 Pfl01_1293     TRUE 0.988 -3.000 0.429 1.000 N NA
 10486713 10486714 Pfl01_1293 Pfl01_1294     FALSE 0.476 60.000 0.100 1.000 N NA
 10486714 10486715 Pfl01_1294 Pfl01_1295     FALSE 0.218 82.000 0.050 NA   NA
 10486715 10486716 Pfl01_1295 Pfl01_1296     TRUE 0.972 2.000 0.412 NA   NA
 10486718 10486719 Pfl01_1298 Pfl01_1299     TRUE 0.890 14.000 0.257 NA   NA
 10486719 10486720 Pfl01_1299 Pfl01_1300     TRUE 0.857 29.000 0.338 NA   NA
 10486720 10486721 Pfl01_1300 Pfl01_1301     FALSE 0.044 91.000 0.000 NA   NA
 10486723 10486724 Pfl01_1303 Pfl01_1304     FALSE 0.221 23.000 0.000 NA   NA
 10486724 10486725 Pfl01_1304 Pfl01_1305     FALSE 0.060 155.000 0.025 NA   NA
 10486725 10486726 Pfl01_1305 Pfl01_1306     TRUE 0.988 0.000 0.667 NA   NA
 10486727 10486728 Pfl01_1307 Pfl01_1308     TRUE 0.879 27.000 0.333 1.000 N NA
 10486733 10486734 Pfl01_1313 Pfl01_1314     TRUE 0.711 104.000 0.625 1.000 N NA
 10486734 10486735 Pfl01_1314 Pfl01_1315     TRUE 0.996 -3.000 0.688 0.082 N NA
 10486735 10486736 Pfl01_1315 Pfl01_1316     TRUE 0.797 83.000 0.750 NA N NA
 10486738 10486739 Pfl01_1318 Pfl01_1319     FALSE 0.062 72.000 0.000 NA   NA
 10486739 10486740 Pfl01_1319 Pfl01_1320     TRUE 0.943 36.000 1.000 NA   NA
 10486740 10486741 Pfl01_1320 Pfl01_1321     FALSE 0.438 5.000 0.000 NA   NA
 10486741 10486742 Pfl01_1321 Pfl01_1322     TRUE 0.621 61.000 0.032 NA Y NA
 10486742 10486743 Pfl01_1322 Pfl01_1323     FALSE 0.408 78.000 0.118 1.000 N NA
 10486743 10486744 Pfl01_1323 Pfl01_1324     FALSE 0.002 350.000 0.000 NA   NA
 10486746 10486747 Pfl01_1326 Pfl01_1327     FALSE 0.034 162.000 0.000 1.000   NA
 10486750 10486751 Pfl01_1330 Pfl01_1331     FALSE 0.001 380.000 0.000 NA   NA
 10486751 10486752 Pfl01_1331 Pfl01_1332     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10486752 10486753 Pfl01_1332 Pfl01_1333     FALSE 0.001 425.000 0.000 NA   NA
 10486753 10486754 Pfl01_1333 Pfl01_R23     FALSE 0.002 326.000 0.000 NA   NA
 10486754 10486755 Pfl01_R23 Pfl01_1334     FALSE 0.015 171.000 0.000 NA   NA
 10486755 10486756 Pfl01_1334 Pfl01_1335     FALSE 0.002 317.000 0.000 NA   NA
 10486756 10486757 Pfl01_1335 Pfl01_1336     FALSE 0.008 257.000 0.000 1.000 N NA
 10486757 10486758 Pfl01_1336 Pfl01_1337     FALSE 0.032 169.000 0.000 1.000 N NA
 10486758 10486759 Pfl01_1337 Pfl01_1338     TRUE 0.915 25.000 0.437 1.000 N NA
 10486759 10486760 Pfl01_1338 Pfl01_1339     FALSE 0.199 281.000 0.835 NA   NA
 10486760 10486761 Pfl01_1339 Pfl01_1340     TRUE 0.980 12.000 0.931 NA   NA
 10486761 10486762 Pfl01_1340 Pfl01_1341     TRUE 0.910 14.000 0.314 NA   NA
 10486762 10486763 Pfl01_1341 Pfl01_1342     TRUE 0.998 -3.000 0.797 1.000 Y NA
 10486763 10486764 Pfl01_1342 Pfl01_1343     TRUE 0.982 19.000 0.719 NA Y NA
 10486765 10486766 Pfl01_1344 Pfl01_1345     FALSE 0.013 179.000 0.000 NA   NA
 10486766 10486767 Pfl01_1345 Pfl01_1346     FALSE 0.038 102.000 0.000 NA   NA
 10486767 10486768 Pfl01_1346 Pfl01_1347     TRUE 0.854 24.000 0.286 NA   NA
 10486771 10486772 Pfl01_1350 Pfl01_1351     TRUE 0.988 -7.000 0.429 NA   NA
 10486772 10486773 Pfl01_1351 Pfl01_1352     TRUE 0.989 2.000 0.857 NA   NA
 10486773 10486774 Pfl01_1352 Pfl01_1353     TRUE 0.657 57.000 0.277 NA   NA
 10486775 10486776 Pfl01_1354 Pfl01_1355     TRUE 0.991 -7.000 0.163 1.000 Y NA
 10486777 10486778 Pfl01_1356 Pfl01_1357     FALSE 0.384 36.000 0.034 NA   NA
 10486779 10486780 Pfl01_1358 Pfl01_1359     TRUE 0.887 -16.000 0.027 NA   NA
 10486781 10486782 Pfl01_1360 Pfl01_1361     FALSE 0.027 139.000 0.000 NA   NA
 10486783 10486784 Pfl01_1362 Pfl01_1363 algU   TRUE 0.929 32.000 0.705 NA N NA
 10486784 10486785 Pfl01_1363 Pfl01_1364     TRUE 0.993 9.000 0.856 NA Y NA
 10486785 10486786 Pfl01_1364 Pfl01_1365     FALSE 0.021 207.000 0.017 NA N NA
 10486788 10486789 Pfl01_1367 Pfl01_1368     TRUE 0.639 33.000 0.121 NA   NA
 10486790 10486791 Pfl01_1369 Pfl01_1370     TRUE 0.822 12.000 0.102 NA N NA
 10486792 10486793 Pfl01_1371 Pfl01_1372 dapA   TRUE 0.907 18.000 0.088 NA Y NA
 10486793 10486794 Pfl01_1372 Pfl01_1373     TRUE 0.694 5.000 0.022 NA   NA
 10486794 10486795 Pfl01_1373 Pfl01_1374     FALSE 0.476 29.000 0.021 1.000   NA
 10486795 10486796 Pfl01_1374 Pfl01_R24     FALSE 0.049 85.000 0.000 NA   NA
 10486797 10486798 Pfl01_1375 Pfl01_1376     TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   NA
 10486801 10486802 Pfl01_1379 Pfl01_1380     FALSE 0.461 4.000 0.000 NA   NA
 10486802 10486803 Pfl01_1380 Pfl01_1381     FALSE 0.233 21.000 0.000 NA   NA
 10486803 10486804 Pfl01_1381 Pfl01_1382     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10486804 10486805 Pfl01_1382 Pfl01_1383     FALSE 0.060 74.000 0.000 NA   NA
 10486805 10486806 Pfl01_1383 Pfl01_1384     FALSE 0.464 58.000 0.087 1.000 N NA
 10486807 10486808 Pfl01_1385 Pfl01_1386     FALSE 0.255 199.000 0.444 NA N NA
 10486809 10486810 Pfl01_1387 Pfl01_1388     FALSE 0.082 131.000 0.006 1.000   NA
 10486810 10486811 Pfl01_1388 Pfl01_1389     TRUE 0.931 -3.000 0.073 NA   NA
 10486811 10486812 Pfl01_1389 Pfl01_1390     FALSE 0.172 107.000 0.056 NA   NA
 10486814 10486815 Pfl01_1392 Pfl01_1393     TRUE 0.543 21.000 0.034 NA   NA
 10486816 10486817 Pfl01_1394 Pfl01_1395     FALSE 0.176 82.000 0.034 NA   NA
 10486817 10486818 Pfl01_1395 Pfl01_1396     FALSE 0.488 33.000 0.034 1.000   NA
 10486818 10486819 Pfl01_1396 Pfl01_1397     FALSE 0.320 49.000 0.023 1.000   NA
 10486819 10486820 Pfl01_1397 Pfl01_1398     FALSE 0.001 361.000 0.000 NA   NA
 10486820 10486821 Pfl01_1398 Pfl01_1399     FALSE 0.144 109.000 0.040 NA N NA
 10486822 10486823 Pfl01_1400 Pfl01_1401     TRUE 0.633 17.000 0.048 NA   NA
 10486823 10486824 Pfl01_1401 Pfl01_1402     TRUE 0.693 14.000 0.053 NA   NA
 10486826 10486827 Pfl01_1404 Pfl01_1405     FALSE 0.362 61.000 0.055 1.000   NA
 10486827 10486828 Pfl01_1405 Pfl01_1406     TRUE 0.995 -3.000 0.909 1.000   NA
 10486828 10486829 Pfl01_1406 Pfl01_1407     TRUE 0.998 -3.000 0.909 NA Y NA
 10486830 10486831 Pfl01_1408 Pfl01_1409     TRUE 0.942 13.000 0.431 NA   NA
 10486832 10486833 Pfl01_1410 Pfl01_1411     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10486835 10486836 Pfl01_1413 Pfl01_1414     FALSE 0.048 188.000 0.025 1.000 N NA
 10486839 10486840 Pfl01_1417 Pfl01_1418     FALSE 0.049 85.000 0.000 NA   NA
 10486841 10486842 Pfl01_1419 Pfl01_1420 aceK   FALSE 0.044 171.000 0.006 1.000 N NA
 10486842 10486843 Pfl01_1420 Pfl01_1421     FALSE 0.014 265.000 0.036 NA N NA
 10486843 10486844 Pfl01_1421 Pfl01_1422     FALSE 0.109 136.000 0.038 NA N NA
 10486844 10486845 Pfl01_1422 Pfl01_1423     TRUE 0.966 -6.000 0.160 NA   NA
 10486848 10486849 Pfl01_1426 Pfl01_1427     FALSE 0.096 189.000 0.000 0.063 N NA
 10486849 10486850 Pfl01_1427 Pfl01_1428     FALSE 0.421 89.000 0.171 1.000 N NA
 10486850 10486851 Pfl01_1428 Pfl01_1429     TRUE 0.954 4.000 0.286 1.000   NA
 10486851 10486852 Pfl01_1429 Pfl01_1430     TRUE 0.820 15.000 0.118 1.000   NA
 10486853 10486854 Pfl01_1431 Pfl01_1432     FALSE 0.493 161.000 0.600 NA   NA
 10486854 10486855 Pfl01_1432 Pfl01_1433     FALSE 0.014 213.000 0.000 1.000   NA
 10486860 10486861 Pfl01_1438 Pfl01_1439     TRUE 0.974 -3.000 0.250 NA   NA
 10486861 10486862 Pfl01_1439 Pfl01_1440     FALSE 0.004 249.000 0.000 NA   NA
 10486862 10486863 Pfl01_1440 Pfl01_1441     FALSE 0.052 82.000 0.000 NA   NA
 10486865 10486866 Pfl01_1443 Pfl01_1444     FALSE 0.232 78.000 0.051 NA   NA
 10486866 10486867 Pfl01_1444 Pfl01_1445     FALSE 0.007 217.000 0.000 NA   NA
 10486868 10486869 Pfl01_1446 Pfl01_1447     FALSE 0.200 46.000 0.009 NA   NA
 10486869 10486870 Pfl01_1447 Pfl01_1448     FALSE 0.066 165.000 0.038 NA   NA
 10486873 10486874 Pfl01_1451 Pfl01_1452     FALSE 0.161 32.000 0.000 NA   NA
 10486874 10486875 Pfl01_1452 Pfl01_1453     FALSE 0.201 44.000 0.000 1.000   NA
 10486875 10486876 Pfl01_1453 Pfl01_1454     FALSE 0.093 85.000 0.000 1.000   NA
 10486876 10486877 Pfl01_1454 Pfl01_1455     FALSE 0.441 79.000 0.150 1.000 N NA
 10486877 10486878 Pfl01_1455 Pfl01_1456     FALSE 0.452 56.000 0.100 NA   NA
 10486878 10486879 Pfl01_1456 Pfl01_1457     TRUE 0.892 11.000 0.200 NA   NA
 10486880 10486881 Pfl01_1458 Pfl01_1459     TRUE 0.735 5.000 0.031 NA   NA
 10486882 10486883 Pfl01_1460 Pfl01_1461     TRUE 0.978 11.000 0.447 0.063 N NA
 10486883 10486884 Pfl01_1461 Pfl01_1462     FALSE 0.475 34.000 0.032 1.000 N NA
 10486886 10486887 Pfl01_1464 Pfl01_1465     TRUE 0.708 -9.000 0.000 NA   NA
 10486887 10486888 Pfl01_1465 Pfl01_1466     FALSE 0.003 283.000 0.000 NA   NA
 10486888 10486889 Pfl01_1466 Pfl01_1467     TRUE 0.800 11.000 0.077 NA   NA
 10486890 10486891 Pfl01_1468 Pfl01_1469     FALSE 0.291 135.000 0.024 0.052 N NA
 10486891 10486892 Pfl01_1469 Pfl01_1470     FALSE 0.182 128.000 0.080 NA   NA
 10486895 10486896 Pfl01_1473 Pfl01_1474     FALSE 0.429 73.000 0.154 NA   NA
 10486898 10486899 Pfl01_1476 Pfl01_1477     FALSE 0.468 25.000 0.028 NA   NA
 10486903 10486904 Pfl01_1481 Pfl01_1482     TRUE 0.814 68.000 0.286 NA Y NA
 10486904 10486905 Pfl01_1482 Pfl01_1483     TRUE 0.653 137.000 0.318 NA Y NA
 10486905 10486906 Pfl01_1483 Pfl01_1484     TRUE 0.957 8.000 0.409 NA   NA
 10486906 10486907 Pfl01_1484 Pfl01_1485     FALSE 0.127 125.000 0.043 NA   NA
 10486907 10486908 Pfl01_1485 Pfl01_1486     TRUE 0.945 2.000 0.224 NA   NA
 10486909 10486910 Pfl01_1487 Pfl01_1488     TRUE 0.899 14.000 0.281 NA   NA
 10486910 10486911 Pfl01_1488 Pfl01_1489     TRUE 0.828 1.000 0.040 NA   NA
 10486911 10486912 Pfl01_1489 Pfl01_1490     TRUE 0.791 12.000 0.083 NA   NA
 10486912 10486913 Pfl01_1490 Pfl01_1491     TRUE 0.880 3.000 0.087 NA   NA
 10486913 10486914 Pfl01_1491 Pfl01_1492     FALSE 0.061 155.000 0.026 NA   NA
 10486914 10486915 Pfl01_1492 Pfl01_1493     FALSE 0.002 842.000 0.000 1.000 N NA
 10486915 10486916 Pfl01_1493 Pfl01_1494     FALSE 0.122 91.000 0.007 1.000   NA
 10486917 10486918 Pfl01_1495 Pfl01_1496     TRUE 0.764 84.000 0.667 NA   NA
 10486918 10486919 Pfl01_1496 Pfl01_1497     FALSE 0.001 402.000 0.000 NA   NA
 10486919 10486920 Pfl01_1497 Pfl01_1498   phhB TRUE 0.880 0.000 0.037 1.000 N NA
 10486920 10486921 Pfl01_1498 Pfl01_1499 phhB phhA FALSE 0.395 111.000 0.203 1.000 N NA
 10486922 10486923 Pfl01_1500 Pfl01_1501   flgF FALSE 0.017 205.000 0.000 1.000 N NA
 10486923 10486924 Pfl01_1501 Pfl01_1502 flgF flgG TRUE 0.934 46.000 0.207 0.003 Y NA
 10486924 10486925 Pfl01_1502 Pfl01_1503 flgG flgH TRUE 0.971 54.000 0.632 0.005 Y NA
 10486925 10486926 Pfl01_1503 Pfl01_1504 flgH flgI TRUE 0.954 28.000 0.128 0.006 Y NA
 10486926 10486927 Pfl01_1504 Pfl01_1505 flgI flgJ TRUE 0.990 12.000 0.405 0.006 Y NA
 10486927 10486928 Pfl01_1505 Pfl01_1506 flgJ flgK TRUE 0.992 22.000 0.705 0.002 Y NA
 10486928 10486929 Pfl01_1506 Pfl01_1507 flgK flgL TRUE 0.969 14.000 0.057 0.001 Y NA
 10486929 10486930 Pfl01_1507 Pfl01_1508 flgL   FALSE 0.324 117.000 0.182 NA N NA
 10486930 10486931 Pfl01_1508 Pfl01_1509     FALSE 0.005 230.000 0.000 NA   NA
 10486931 10486932 Pfl01_1509 Pfl01_1510     FALSE 0.004 256.000 0.000 NA   NA
 10486932 10486933 Pfl01_1510 Pfl01_1511     TRUE 0.997 -18.000 0.624 1.000 Y NA
 10486933 10486934 Pfl01_1511 Pfl01_1512     TRUE 0.988 -3.000 0.139 1.000 Y NA
 10486934 10486935 Pfl01_1512 Pfl01_1513     TRUE 0.989 -3.000 0.457 1.000   NA
 10486935 10486936 Pfl01_1513 Pfl01_1514     TRUE 0.947 -3.000 0.081 1.000   NA
 10486936 10486937 Pfl01_1514 Pfl01_1515     TRUE 0.656 3.000 0.000 1.000   NA
 10486937 10486938 Pfl01_1515 Pfl01_1516     FALSE 0.290 31.000 0.000 1.000   NA
 10486938 10486939 Pfl01_1516 Pfl01_1517     FALSE 0.297 52.000 0.036 NA   NA
 10486939 10486940 Pfl01_1517 Pfl01_1518     FALSE 0.335 30.000 0.014 NA   NA
 10486940 10486941 Pfl01_1518 Pfl01_1519     TRUE 0.993 -3.000 0.678 1.000   NA
 10486941 10486942 Pfl01_1519 Pfl01_1520     FALSE 0.306 32.000 0.013 NA   NA
 10486942 10486943 Pfl01_1520 Pfl01_1521     TRUE 0.902 -3.000 0.043 NA   NA
 10486943 10486944 Pfl01_1521 Pfl01_1522     TRUE 0.994 -3.000 0.355 1.000 Y NA
 10486944 10486945 Pfl01_1522 Pfl01_1523     TRUE 0.991 -3.000 0.236 1.000 Y NA
 10486945 10486946 Pfl01_1523 Pfl01_1524     FALSE 0.007 227.000 0.000 NA N NA
 10486946 10486947 Pfl01_1524 Pfl01_1525     FALSE 0.452 88.000 0.231 NA   NA
 10486947 10486948 Pfl01_1525 Pfl01_1526     TRUE 0.993 -3.000 0.750 NA   NA
 10486948 10486949 Pfl01_1526 Pfl01_1527     FALSE 0.004 244.000 0.000 NA   NA
 10486949 10486950 Pfl01_1527 Pfl01_1528     TRUE 0.532 75.000 0.025 NA Y NA
 10486950 10486951 Pfl01_1528 Pfl01_1529     TRUE 0.647 81.000 0.117 NA Y NA
 10486951 10486952 Pfl01_1529 Pfl01_1530   fliS TRUE 0.779 130.000 0.194 0.002 Y NA
 10486952 10486953 Pfl01_1530 Pfl01_1531 fliS   TRUE 0.958 11.000 0.478 NA   NA
 10486953 10486954 Pfl01_1531 Pfl01_1532     FALSE 0.072 173.000 0.056 NA   NA
 10486954 10486955 Pfl01_1532 Pfl01_1533     TRUE 0.845 111.000 0.377 0.094 Y NA
 10486955 10486956 Pfl01_1533 Pfl01_1534     TRUE 0.995 6.000 0.679 0.094 Y NA
 10486956 10486957 Pfl01_1534 Pfl01_1535   fliE TRUE 0.561 130.000 0.446 1.000 N NA
 10486957 10486958 Pfl01_1535 Pfl01_1536 fliE fliF TRUE 0.995 16.000 0.910 0.005 Y NA
 10486958 10486959 Pfl01_1536 Pfl01_1537 fliF fliG TRUE 0.996 -7.000 0.189 0.005 Y NA
 10486959 10486960 Pfl01_1537 Pfl01_1538 fliG fliH TRUE 0.981 5.000 0.320 NA Y NA
 10486960 10486961 Pfl01_1538 Pfl01_1539 fliH fliI TRUE 0.988 -10.000 0.115 NA Y NA
 10486961 10486962 Pfl01_1539 Pfl01_1540 fliI fliJ TRUE 0.955 7.000 0.070 1.000 Y NA
 10486962 10486963 Pfl01_1540 Pfl01_1541 fliJ   FALSE 0.107 102.000 0.022 NA N NA
 10486963 10486964 Pfl01_1541 Pfl01_1542     TRUE 0.985 6.000 0.429 NA Y NA
 10486964 10486965 Pfl01_1542 Pfl01_1543     TRUE 0.916 31.000 0.250 NA Y NA
 10486965 10486966 Pfl01_1543 Pfl01_1544     FALSE 0.200 106.000 0.069 NA N NA
 10486966 10486967 Pfl01_1544 Pfl01_1545   fliL FALSE 0.072 298.000 0.075 1.000 Y NA
 10486967 10486968 Pfl01_1545 Pfl01_1546 fliL fliM TRUE 0.986 10.000 0.171 0.001 Y NA
 10486968 10486969 Pfl01_1546 Pfl01_1547 fliM fliN TRUE 0.976 58.000 0.741 0.001 Y NA
 10486969 10486970 Pfl01_1547 Pfl01_1548 fliN   TRUE 0.969 22.000 0.443 1.000 Y NA
 10486970 10486971 Pfl01_1548 Pfl01_1549   fliP TRUE 0.973 0.000 0.061 1.000 Y NA
 10486971 10486972 Pfl01_1549 Pfl01_1550 fliP fliQ TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.010 Y NA
 10486972 10486973 Pfl01_1550 Pfl01_1551 fliQ fliR TRUE 0.998 4.000 1.000 0.001 Y NA
 10486973 10486974 Pfl01_1551 Pfl01_1552 fliR flhB TRUE 0.971 4.000 0.129 1.000 Y NA
 10486975 10486976 Pfl01_1553 Pfl01_1554     FALSE 0.001 499.000 0.000 NA   NA
 10486976 10486977 Pfl01_1554 Pfl01_1555     FALSE 0.110 45.000 0.000 NA   NA
 10486977 10486978 Pfl01_1555 Pfl01_1556     FALSE 0.191 28.000 0.000 NA   NA
 10486978 10486979 Pfl01_1556 Pfl01_1557     FALSE 0.005 243.000 0.000 NA   NA
 10486980 10486981 Pfl01_1558 Pfl01_1559     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10486981 10486982 Pfl01_1559 Pfl01_1560   flhA FALSE 0.012 183.000 0.000 NA   NA
 10486982 10486983 Pfl01_1560 Pfl01_1561 flhA flhF TRUE 0.960 12.000 0.178 1.000 Y NA
 10486983 10486984 Pfl01_1561 Pfl01_1562 flhF   FALSE 0.429 114.000 0.241 1.000 N NA
 10486984 10486985 Pfl01_1562 Pfl01_1563   fliA TRUE 0.989 -3.000 0.482 1.000 N NA
 10486985 10486986 Pfl01_1563 Pfl01_1564 fliA   FALSE 0.332 156.000 0.283 1.000 N NA
 10486986 10486987 Pfl01_1564 Pfl01_1565     TRUE 0.977 18.000 0.516 1.000 Y NA
 10486987 10486988 Pfl01_1565 Pfl01_1566     TRUE 0.921 40.000 0.341 1.000 Y NA
 10486988 10486989 Pfl01_1566 Pfl01_1567     TRUE 0.944 50.000 0.327 0.013 Y NA
 10486989 10486990 Pfl01_1567 Pfl01_1568   motC TRUE 0.982 0.000 0.153 1.000 Y NA
 10486990 10486991 Pfl01_1568 Pfl01_1569 motC   TRUE 0.965 13.000 0.248 1.000 Y NA
 10486991 10486992 Pfl01_1569 Pfl01_1570     TRUE 0.681 44.000 0.199 1.000 N NA
 10486992 10486993 Pfl01_1570 Pfl01_1571     TRUE 0.976 3.000 0.454 1.000   NA
 10486993 10486994 Pfl01_1571 Pfl01_1572     TRUE 0.928 74.000 0.886 0.012   NA
 10486994 10486995 Pfl01_1572 Pfl01_1573     TRUE 0.988 1.000 0.743 NA   NA
 10486996 10486997 Pfl01_1574 Pfl01_1575     FALSE 0.178 30.000 0.000 NA   NA
 10486997 10486998 Pfl01_1575 Pfl01_1576     TRUE 0.980 -3.000 0.286 1.000   NA
 10486999 10487000 Pfl01_1577 Pfl01_1578     TRUE 0.993 -3.000 0.074 0.003 Y NA
 10487000 10487001 Pfl01_1578 Pfl01_1579     TRUE 0.802 79.000 0.051 0.001 Y NA
 10487001 10487002 Pfl01_1579 Pfl01_1580     TRUE 0.990 -3.000 0.501 1.000 N NA
 10487002 10487003 Pfl01_1580 Pfl01_1581     TRUE 0.984 -3.000 0.344 1.000 N NA
 10487003 10487004 Pfl01_1581 Pfl01_1582     TRUE 0.990 4.000 0.211 0.003 Y NA
 10487004 10487005 Pfl01_1582 Pfl01_1583     TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.003 Y NA
 10487005 10487006 Pfl01_1583 Pfl01_1584     TRUE 0.990 -3.000 0.196 1.000 Y NA
 10487006 10487007 Pfl01_1584 Pfl01_1585     TRUE 0.996 -3.000 0.522 1.000 Y NA
 10487007 10487008 Pfl01_1585 Pfl01_1586     TRUE 0.940 26.000 0.667 NA   NA
 10487008 10487009 Pfl01_1586 Pfl01_1587     FALSE 0.005 232.000 0.000 NA   NA
 10487009 10487010 Pfl01_1587 Pfl01_1588     TRUE 0.944 0.000 0.176 NA   NA
 10487013 10487014 Pfl01_1591 Pfl01_1592     FALSE 0.455 107.000 0.030 1.000 Y NA
 10487014 10487015 Pfl01_1592 Pfl01_1593     TRUE 0.592 22.000 0.030 1.000 N NA
 10487015 10487016 Pfl01_1593 Pfl01_1594     FALSE 0.162 146.000 0.063 1.000 N NA
 10487016 10487017 Pfl01_1594 Pfl01_1595     TRUE 0.988 -3.000 0.148 1.000 Y NA
 10487017 10487018 Pfl01_1595 Pfl01_1596     FALSE 0.173 171.000 0.154 1.000 N NA
 10487018 10487019 Pfl01_1596 Pfl01_1597     TRUE 0.857 43.000 0.492 1.000 N NA
 10487019 10487020 Pfl01_1597 Pfl01_1598     TRUE 0.687 89.000 0.495 1.000   NA
 10487024 10487025 Pfl01_1602 Pfl01_1603     TRUE 0.973 -7.000 0.204 NA   NA
 10487028 10487029 Pfl01_1606 Pfl01_1607     FALSE 0.005 231.000 0.000 NA   NA
 10487029 10487030 Pfl01_1607 Pfl01_1608   actP TRUE 0.993 -3.000 0.733 NA   NA
 10487032 10487033 Pfl01_1610 Pfl01_1611     TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.000 Y NA
 10487033 10487034 Pfl01_1611 Pfl01_1612   sdhA TRUE 0.997 4.000 0.705 0.001 Y NA
 10487034 10487035 Pfl01_1612 Pfl01_1613 sdhA sdhB TRUE 0.995 12.000 0.604 0.001 Y NA
 10487035 10487036 Pfl01_1613 Pfl01_1614 sdhB sucA FALSE 0.102 254.000 0.067 1.000 Y NA
 10487036 10487037 Pfl01_1614 Pfl01_1615 sucA   TRUE 0.957 43.000 0.667 1.000 Y NA
 10487037 10487038 Pfl01_1615 Pfl01_1616     TRUE 0.719 98.000 0.253 1.000 Y NA
 10487038 10487039 Pfl01_1616 Pfl01_1617   sucC FALSE 0.202 202.000 0.069 1.000 Y NA
 10487039 10487040 Pfl01_1617 Pfl01_1618 sucC   TRUE 0.999 0.000 0.806 0.000 Y NA
 10487040 10487041 Pfl01_1618 Pfl01_1619     FALSE 0.004 329.000 0.000 1.000 N NA
 10487041 10487042 Pfl01_1619 Pfl01_1620     FALSE 0.111 152.000 0.060 NA   NA
 10487042 10487043 Pfl01_1620 Pfl01_1621     TRUE 0.839 0.000 0.036 NA   NA
 10487045 10487046 Pfl01_1623 Pfl01_1624     TRUE 0.998 -3.000 0.845 NA Y NA
 10487046 10487047 Pfl01_1624 Pfl01_1625     FALSE 0.101 82.000 0.007 NA N NA
 10487047 10487048 Pfl01_1625 Pfl01_1626     FALSE 0.187 69.000 0.008 1.000 N NA
 10487049 10487050 Pfl01_1627 Pfl01_1628     FALSE 0.199 62.000 0.025 NA   NA
 10487051 10487052 Pfl01_1629 Pfl01_1630     FALSE 0.280 131.000 0.143 1.000   NA
 10487053 10487054 Pfl01_1631 Pfl01_1632   purN TRUE 0.802 9.000 0.065 NA   NA
 10487054 10487055 Pfl01_1632 Pfl01_1633 purN   TRUE 0.994 0.000 0.230 0.002 Y NA
 10487056 10487057 Pfl01_1634 Pfl01_1635     TRUE 0.556 36.000 0.087 NA   NA
 10487057 10487058 Pfl01_1635 Pfl01_1636     FALSE 0.105 211.000 0.217 NA   NA
 10487058 10487059 Pfl01_1636 Pfl01_1637     FALSE 0.041 155.000 0.010 NA   NA
 10487059 10487060 Pfl01_1637 Pfl01_1638     TRUE 0.595 220.000 0.909 NA Y NA
 10487061 10487062 Pfl01_1639 Pfl01_1640     FALSE 0.251 66.000 0.042 NA   NA
 10487063 10487064 Pfl01_1641 Pfl01_1642     TRUE 0.992 -3.000 0.054 0.007 Y NA
 10487064 10487065 Pfl01_1642 Pfl01_1643     TRUE 0.944 -3.000 0.071 1.000 N NA
 10487065 10487066 Pfl01_1643 Pfl01_1644   cobD TRUE 0.933 -3.000 0.053 1.000 N NA
 10487066 10487067 Pfl01_1644 Pfl01_1645 cobD   TRUE 0.996 -7.000 0.463 0.007 N NA
 10487067 10487068 Pfl01_1645 Pfl01_1646     TRUE 0.974 -3.000 0.033 0.007 N NA
 10487068 10487069 Pfl01_1646 Pfl01_1647   cobU TRUE 0.987 -12.000 0.079 1.000 Y NA
 10487069 10487070 Pfl01_1647 Pfl01_1648 cobU cobT TRUE 0.988 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 10487070 10487071 Pfl01_1648 Pfl01_1649 cobT   TRUE 0.952 -3.000 0.090 1.000 N NA
 10487071 10487072 Pfl01_1649 Pfl01_1650   cobS TRUE 0.816 2.000 0.021 1.000 N NA
 10487072 10487073 Pfl01_1650 Pfl01_1651 cobS   FALSE 0.231 57.000 0.008 1.000 N NA
 10487073 10487074 Pfl01_1651 Pfl01_1652     TRUE 0.617 55.000 0.220 NA N NA
 10487074 10487075 Pfl01_1652 Pfl01_1653     TRUE 0.909 -3.000 0.049 NA   NA
 10487075 10487076 Pfl01_1653 Pfl01_1654     FALSE 0.196 56.000 0.017 NA   NA
 10487077 10487078 Pfl01_1655 Pfl01_1656     FALSE 0.246 147.000 0.182 NA   NA
 10487078 10487079 Pfl01_1656 Pfl01_1657     FALSE 0.003 278.000 0.000 NA   NA
 10487080 10487081 Pfl01_1658 Pfl01_1659     FALSE 0.455 62.000 0.130 NA   NA
 10487082 10487083 Pfl01_1660 Pfl01_1661     FALSE 0.183 133.000 0.065 1.000   NA
 10487084 10487085 Pfl01_1662 Pfl01_1663     FALSE 0.088 56.000 0.000 NA   NA
 10487085 10487086 Pfl01_1663 Pfl01_1664     FALSE 0.075 106.000 0.000 1.000 N NA
 10487086 10487087 Pfl01_1664 Pfl01_1665     FALSE 0.126 111.000 0.017 1.000 N NA
 10487088 10487089 Pfl01_1666 Pfl01_1667     FALSE 0.225 119.000 0.074 1.000   NA
 10487089 10487090 Pfl01_1667 Pfl01_1668   rdgC FALSE 0.345 75.000 0.074 1.000   NA
 10487091 10487092 Pfl01_R25 Pfl01_R26     FALSE 0.239 20.000 0.000 NA   NA
 10487092 10487093 Pfl01_R26 Pfl01_R27     FALSE 0.011 191.000 0.000 NA   NA
 10487093 10487094 Pfl01_R27 Pfl01_R28     FALSE 0.239 20.000 0.000 NA   NA
 10487095 10487096 Pfl01_1669 Pfl01_1670     TRUE 0.996 -3.000 0.667 0.057   NA
 10487097 10487098 Pfl01_1671 Pfl01_1672     FALSE 0.003 298.000 0.000 NA   NA
 10487098 10487099 Pfl01_1672 Pfl01_1673     TRUE 0.602 115.000 0.500 NA   NA
 10487099 10487100 Pfl01_1673 Pfl01_1674     TRUE 0.990 -3.000 0.562 NA   NA
 10487100 10487101 Pfl01_1674 Pfl01_1675     TRUE 0.528 1.000 0.000 NA   NA
 10487101 10487102 Pfl01_1675 Pfl01_1676     FALSE 0.006 226.000 0.000 NA   NA
 10487102 10487103 Pfl01_1676 Pfl01_1677     FALSE 0.400 9.000 0.000 NA   NA
 10487104 10487105 Pfl01_1678 Pfl01_1679     FALSE 0.123 135.000 0.029 1.000 N NA
 10487107 10487108 Pfl01_1681 Pfl01_1682     TRUE 0.903 35.000 0.222 1.000 Y NA
 10487108 10487109 Pfl01_1682 Pfl01_1683     TRUE 0.997 -3.000 0.360 0.064 Y NA
 10487109 10487110 Pfl01_1683 Pfl01_1684     TRUE 0.997 -13.000 0.774 0.064   NA
 10487110 10487111 Pfl01_1684 Pfl01_1685     TRUE 0.949 6.000 0.290 1.000   NA
 10487111 10487112 Pfl01_1685 Pfl01_1686     FALSE 0.375 181.000 0.500 1.000   NA
 10487114 10487115 Pfl01_1688 Pfl01_1689     TRUE 0.686 77.000 0.444 NA   NA
 10487115 10487116 Pfl01_1689 Pfl01_1690     FALSE 0.069 133.000 0.016 NA   NA
 10487116 10487117 Pfl01_1690 Pfl01_1691     FALSE 0.057 77.000 0.000 NA   NA
 10487117 10487118 Pfl01_1691 Pfl01_1692     FALSE 0.107 47.000 0.000 NA   NA
 10487118 10487119 Pfl01_1692 Pfl01_1693   minE FALSE 0.111 92.000 0.018 NA N NA
 10487119 10487120 Pfl01_1693 Pfl01_1694 minE   TRUE 0.995 0.000 0.618 NA Y NA
 10487120 10487121 Pfl01_1694 Pfl01_1695   minC TRUE 0.634 170.000 0.466 1.000 Y NA
 10487122 10487123 Pfl01_1696 Pfl01_1697     TRUE 0.563 36.000 0.069 1.000   NA
 10487124 10487125 Pfl01_1698 Pfl01_1699     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10487125 10487126 Pfl01_1699 Pfl01_1700     FALSE 0.511 2.000 0.000 NA   NA
 10487126 10487127 Pfl01_1700 Pfl01_1701     FALSE 0.425 87.000 0.200 NA N NA
 10487127 10487128 Pfl01_1701 Pfl01_1702     FALSE 0.200 170.000 0.192 1.000   NA
 10487128 10487129 Pfl01_1702 Pfl01_1703     TRUE 0.846 52.000 0.538 1.000   NA
 10487129 10487130 Pfl01_1703 Pfl01_1704     TRUE 0.846 121.000 0.647 1.000 Y NA
 10487130 10487131 Pfl01_1704 Pfl01_1705     TRUE 0.731 91.000 0.647 NA   NA
 10487131 10487132 Pfl01_1705 Pfl01_1706     TRUE 0.945 -3.000 0.097 NA   NA
 10487133 10487134 Pfl01_1707 Pfl01_1708     FALSE 0.094 53.000 0.000 NA   NA
 10487135 10487136 Pfl01_1709 Pfl01_1710     FALSE 0.015 170.000 0.000 NA   NA
 10487136 10487137 Pfl01_1710 Pfl01_1711     FALSE 0.454 88.000 0.200 1.000   NA
 10487137 10487138 Pfl01_1711 Pfl01_1712     FALSE 0.030 197.000 0.011 1.000   NA
 10487140 10487141 Pfl01_1714 Pfl01_1715   folE FALSE 0.276 103.000 0.090 1.000 N NA
 10487141 10487142 Pfl01_1715 Pfl01_1716 folE   TRUE 0.734 78.000 0.545 NA   NA
 10487142 10487143 Pfl01_1716 Pfl01_1717     TRUE 0.693 75.000 0.444 NA   NA
 10487143 10487144 Pfl01_1717 Pfl01_1718     FALSE 0.395 132.000 0.292 NA   NA
 10487146 10487147 Pfl01_1720 Pfl01_1721     FALSE 0.399 98.000 0.219 NA   NA
 10487148 10487149 Pfl01_1722 Pfl01_1723     TRUE 0.567 32.000 0.055 1.000   NA
 10487149 10487150 Pfl01_1723 Pfl01_1724     TRUE 0.885 -3.000 0.018 1.000   NA
 10487150 10487151 Pfl01_1724 Pfl01_1725     TRUE 0.718 32.000 0.148 1.000   NA
 10487151 10487152 Pfl01_1725 Pfl01_1726     TRUE 0.943 4.000 0.231 1.000   NA
 10487154 10487155 Pfl01_1728 Pfl01_1729     FALSE 0.271 98.000 0.105 NA   NA
 10487155 10487156 Pfl01_1729 Pfl01_1730     FALSE 0.418 91.000 0.211 NA   NA
 10487156 10487157 Pfl01_1730 Pfl01_1731     FALSE 0.062 72.000 0.000 NA   NA
 10487157 10487158 Pfl01_1731 Pfl01_1732     FALSE 0.028 135.000 0.000 NA   NA
 10487158 10487159 Pfl01_1732 Pfl01_1733     FALSE 0.019 157.000 0.000 NA   NA
 10487159 10487160 Pfl01_1733 Pfl01_1734     FALSE 0.007 211.000 0.000 NA   NA
 10487160 10487161 Pfl01_1734 Pfl01_1735     FALSE 0.001 402.000 0.000 NA   NA
 10487161 10487162 Pfl01_1735 Pfl01_1736     TRUE 0.974 13.000 0.805 NA   NA
 10487162 10487163 Pfl01_1736 Pfl01_1737     TRUE 0.983 -3.000 0.365 NA   NA
 10487165 10487166 Pfl01_1739 Pfl01_1740     TRUE 0.980 18.000 0.600 1.000 Y NA
 10487166 10487167 Pfl01_1740 Pfl01_1741     FALSE 0.195 96.000 0.038 1.000 N NA
 10487168 10487169 Pfl01_1742 Pfl01_1743     FALSE 0.110 135.000 0.022 1.000 N NA
 10487169 10487170 Pfl01_1743 Pfl01_1744     FALSE 0.113 205.000 0.000 1.000 Y NA
 10487171 10487172 Pfl01_R29 Pfl01_1745     FALSE 0.021 153.000 0.000 NA   NA
 10487174 10487175 Pfl01_1747 Pfl01_1748     FALSE 0.027 138.000 0.000 NA   NA
 10487175 10487176 Pfl01_1748 Pfl01_1749     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10487177 10487178 Pfl01_1750 Pfl01_1751     TRUE 0.706 -7.000 0.000 NA   NA
 10487182 10487183 Pfl01_1755 Pfl01_1756     TRUE 0.872 55.000 0.714 NA N NA
 10487183 10487184 Pfl01_1756 Pfl01_1757     FALSE 0.015 505.000 0.000 1.000 Y NA
 10487186 10487187 Pfl01_1759 Pfl01_1760     FALSE 0.180 109.000 0.042 1.000   NA
 10487187 10487188 Pfl01_1760 Pfl01_1761     TRUE 0.992 0.000 0.923 NA   NA
 10487188 10487189 Pfl01_1761 Pfl01_1762     TRUE 0.889 6.000 0.141 NA   NA
 10487190 10487191 Pfl01_1763 Pfl01_1764   prpB TRUE 0.948 -3.000 0.080 1.000 N NA
 10487191 10487192 Pfl01_1764 Pfl01_1765 prpB   TRUE 0.864 44.000 0.502 1.000 N NA
 10487192 10487193 Pfl01_1765 Pfl01_1766     TRUE 0.849 62.000 0.289 1.000 Y NA
 10487193 10487194 Pfl01_1766 Pfl01_1767     TRUE 0.933 34.000 0.733 1.000   NA
 10487194 10487195 Pfl01_1767 Pfl01_1768   prpD FALSE 0.190 118.000 0.053 1.000   NA
 10487197 10487198 Pfl01_1770 Pfl01_1771     FALSE 0.129 99.000 0.029 NA N NA
 10487198 10487199 Pfl01_1771 Pfl01_1772     FALSE 0.052 227.000 0.113 NA N NA
 10487199 10487200 Pfl01_1772 Pfl01_1773     TRUE 0.688 25.000 0.093 NA N NA
 10487200 10487201 Pfl01_1773 Pfl01_1774     FALSE 0.389 64.000 0.093 NA   NA
 10487201 10487202 Pfl01_1774 Pfl01_1775     TRUE 0.947 3.000 0.256 NA   NA
 10487202 10487203 Pfl01_1775 Pfl01_1776     FALSE 0.492 91.000 0.279 NA   NA
 10487203 10487204 Pfl01_1776 Pfl01_1777     FALSE 0.478 108.000 0.280 1.000 N NA
 10487205 10487206 Pfl01_1778 Pfl01_1779     TRUE 0.734 14.000 0.048 1.000 N NA
 10487206 10487207 Pfl01_1779 Pfl01_1780     TRUE 0.971 0.000 0.294 1.000 N NA
 10487207 10487208 Pfl01_1780 Pfl01_1781     TRUE 0.996 -3.000 0.539 0.000 N NA
 10487208 10487209 Pfl01_1781 Pfl01_1782     FALSE 0.014 292.000 0.033 1.000 N NA
 10487209 10487210 Pfl01_1782 Pfl01_1783     TRUE 0.955 8.000 0.337 1.000 N NA
 10487210 10487211 Pfl01_1783 Pfl01_1784     FALSE 0.013 221.000 0.000 1.000 N NA
 10487211 10487212 Pfl01_1784 Pfl01_1785     TRUE 0.858 16.000 0.218 NA N NA
 10487215 10487216 Pfl01_1788 Pfl01_1789 rlmL   FALSE 0.076 147.000 0.010 1.000 N NA
 10487221 10487222 Pfl01_1794 Pfl01_1795     TRUE 0.866 14.000 0.203 NA N NA
 10487222 10487223 Pfl01_1795 Pfl01_1796     TRUE 0.549 128.000 0.463 NA N NA
 10487223 10487224 Pfl01_1796 Pfl01_1797     TRUE 0.997 -7.000 0.269 0.000 Y NA
 10487225 10487226 Pfl01_1798 Pfl01_1799     TRUE 0.763 3.000 0.010 1.000 N NA
 10487226 10487227 Pfl01_1799 Pfl01_1800   zipA FALSE 0.230 259.000 0.115 0.007 Y NA
 10487227 10487228 Pfl01_1800 Pfl01_1801 zipA ligA FALSE 0.353 88.000 0.106 1.000 N NA
 10487228 10487229 Pfl01_1801 Pfl01_1802 ligA   FALSE 0.108 69.000 0.002 NA   NA
 10487229 10487230 Pfl01_1802 Pfl01_R30     FALSE 0.037 104.000 0.000 NA   NA
 10487230 10487231 Pfl01_R30 Pfl01_1803     FALSE 0.018 162.000 0.000 NA   NA
 10487233 10487234 Pfl01_1805 Pfl01_1806     TRUE 0.701 68.000 0.411 NA   NA
 10487234 10487235 Pfl01_1806 Pfl01_1807     FALSE 0.038 149.000 0.002 NA   NA
 10487235 10487236 Pfl01_1807 Pfl01_1808   recR FALSE 0.172 67.000 0.003 1.000   NA
 10487236 10487237 Pfl01_1808 Pfl01_1809 recR   FALSE 0.166 72.000 0.004 1.000 N NA
 10487238 10487239 Pfl01_1810 Pfl01_1811     FALSE 0.179 79.000 0.016 1.000 N NA
 10487241 10487242 Pfl01_1813 Pfl01_1814     FALSE 0.260 83.000 0.051 1.000   NA
 10487242 10487243 Pfl01_1814 Pfl01_1815     TRUE 0.979 -7.000 0.266 NA   NA
 10487243 10487244 Pfl01_1815 Pfl01_1816     TRUE 0.979 23.000 0.713 NA Y NA
 10487244 10487245 Pfl01_1816 Pfl01_1817     FALSE 0.090 214.000 0.197 NA   NA
 10487245 10487246 Pfl01_1817 Pfl01_1818     TRUE 0.824 12.000 0.111 NA   NA
 10487248 10487249 Pfl01_1820 Pfl01_1821     TRUE 0.994 -3.000 0.400 0.003   NA
 10487249 10487250 Pfl01_1821 Pfl01_1822     TRUE 0.981 6.000 0.333 0.003   NA
 10487250 10487251 Pfl01_1822 Pfl01_1823     TRUE 0.996 0.000 0.833 0.003 N NA
 10487251 10487252 Pfl01_1823 Pfl01_1824     FALSE 0.014 482.000 0.000 0.003 N NA
 10487252 10487253 Pfl01_1824 Pfl01_1825     TRUE 0.996 -3.000 0.600 0.003   NA
 10487253 10487254 Pfl01_1825 Pfl01_1826     TRUE 0.993 6.000 0.800 0.003   NA
 10487254 10487255 Pfl01_1826 Pfl01_1827     TRUE 0.986 11.000 0.556 0.003 N NA
 10487258 10487259 Pfl01_1830 Pfl01_1831     FALSE 0.001 538.000 0.000 NA   NA
 10487259 10487260 Pfl01_1831 Pfl01_1832     FALSE 0.047 88.000 0.000 NA   NA
 10487261 10487262 Pfl01_1833 Pfl01_1834     FALSE 0.158 103.000 0.048 NA   NA
 10487262 10487263 Pfl01_1834 Pfl01_1835     FALSE 0.028 134.000 0.000 NA   NA
 10487265 10487266 Pfl01_1837 Pfl01_1838     FALSE 0.363 11.000 0.000 NA   NA
 10487266 10487267 Pfl01_1838 Pfl01_1839     FALSE 0.002 309.000 0.000 NA   NA
 10487267 10487268 Pfl01_1839 Pfl01_1840     TRUE 0.968 -7.000 0.132 1.000 N NA
 10487268 10487269 Pfl01_1840 Pfl01_1841     FALSE 0.066 116.000 0.000 1.000   NA
 10487272 10487273 Pfl01_1844 Pfl01_1845     FALSE 0.136 195.000 0.000 1.000 Y NA
 10487273 10487274 Pfl01_1845 Pfl01_1846     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.002 Y NA
 10487274 10487275 Pfl01_1846 Pfl01_1847     TRUE 0.996 -3.000 0.182 0.002 Y NA
 10487275 10487276 Pfl01_1847 Pfl01_1848     FALSE 0.004 347.000 0.000 1.000 N NA
 10487277 10487278 Pfl01_1849 Pfl01_1850     TRUE 0.846 37.000 0.100 1.000 Y NA
 10487278 10487279 Pfl01_1850 Pfl01_1851     FALSE 0.357 88.000 0.150 NA   NA
 10487279 10487280 Pfl01_1851 Pfl01_1852     TRUE 0.844 37.000 0.429 NA   NA
 10487280 10487281 Pfl01_1852 Pfl01_1853     TRUE 0.990 -3.000 0.188 1.000 Y NA
 10487283 10487284 Pfl01_1855 Pfl01_1856     TRUE 0.950 8.000 0.314 1.000 N NA
 10487284 10487285 Pfl01_1856 Pfl01_1857     TRUE 0.992 1.000 0.943 1.000 N NA
 10487286 10487287 Pfl01_1858 Pfl01_1859     TRUE 0.609 114.000 0.500 NA N NA
 10487287 10487288 Pfl01_1859 Pfl01_1860     FALSE 0.001 495.000 0.000 NA N NA
 10487288 10487289 Pfl01_1860 Pfl01_1861     FALSE 0.397 55.000 0.072 NA   NA
 10487289 10487290 Pfl01_1861 Pfl01_1862     FALSE 0.060 74.000 0.000 NA   NA
 10487290 10487291 Pfl01_1862 Pfl01_1863     FALSE 0.036 108.000 0.000 NA   NA
 10487291 10487292 Pfl01_1863 Pfl01_1864     TRUE 0.991 8.000 0.333 0.025 Y NA
 10487294 10487295 Pfl01_1866 Pfl01_1867     FALSE 0.410 140.000 0.333 NA   NA
 10487295 10487296 Pfl01_1867 Pfl01_1868     FALSE 0.063 77.000 0.000 NA N NA
 10487296 10487297 Pfl01_1868 Pfl01_1869     FALSE 0.077 102.000 0.000 1.000 N NA
 10487302 10487303 Pfl01_1873 Pfl01_1874     FALSE 0.116 113.000 0.031 NA   NA
 10487305 10487306 Pfl01_1876 Pfl01_1877     TRUE 0.981 -10.000 0.250 1.000   NA
 10487307 10487308 Pfl01_1878 Pfl01_R32 gltX   FALSE 0.008 203.000 0.000 NA   NA
 10487308 10487309 Pfl01_R32 Pfl01_R33     FALSE 0.053 80.000 0.000 NA   NA
 10487309 10487310 Pfl01_R33 Pfl01_R34     FALSE 0.092 54.000 0.000 NA   NA
 10487310 10487311 Pfl01_R34 Pfl01_R35     FALSE 0.055 79.000 0.000 NA   NA
 10487311 10487312 Pfl01_R35 Pfl01_1879     FALSE 0.012 184.000 0.000 NA   NA
 10487312 10487313 Pfl01_1879 Pfl01_1880     FALSE 0.446 31.000 0.035 NA   NA
 10487313 10487314 Pfl01_1880 Pfl01_1881     FALSE 0.431 48.000 0.070 NA   NA
 10487314 10487315 Pfl01_1881 Pfl01_1882     FALSE 0.433 36.000 0.029 1.000   NA
 10487315 10487316 Pfl01_1882 Pfl01_1883     FALSE 0.090 122.000 0.021 NA N NA
 10487316 10487317 Pfl01_1883 Pfl01_1884     FALSE 0.011 186.000 0.000 NA   NA
 10487317 10487318 Pfl01_1884 Pfl01_1885     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 10487319 10487320 Pfl01_1886 Pfl01_1887     FALSE 0.074 108.000 0.000 1.000 N NA
 10487320 10487321 Pfl01_1887 Pfl01_1888     FALSE 0.506 69.000 0.163 1.000 N NA
 10487322 10487323 Pfl01_1889 Pfl01_1890   leuD TRUE 0.993 12.000 0.463 0.001 Y NA
 10487323 10487324 Pfl01_1890 Pfl01_1891 leuD   TRUE 0.547 36.000 0.060 1.000 N NA
 10487324 10487325 Pfl01_1891 Pfl01_1892     FALSE 0.241 70.000 0.026 1.000 N NA
 10487325 10487326 Pfl01_1892 Pfl01_1893     TRUE 0.879 67.000 0.196 0.030 Y NA
 10487326 10487327 Pfl01_1893 Pfl01_1894     TRUE 0.688 114.000 0.025 0.000 Y NA
 10487327 10487328 Pfl01_1894 Pfl01_1895     FALSE 0.028 210.000 0.017 1.000 N NA
 10487328 10487329 Pfl01_1895 Pfl01_1896   truA FALSE 0.108 151.000 0.035 1.000 N NA
 10487329 10487330 Pfl01_1896 Pfl01_1897 truA   FALSE 0.499 65.000 0.139 1.000 N NA
 10487330 10487331 Pfl01_1897 Pfl01_1898     FALSE 0.032 193.000 0.007 1.000 N NA
 10487331 10487332 Pfl01_1898 Pfl01_1899     TRUE 0.986 -3.000 0.383 1.000 N NA
 10487332 10487333 Pfl01_1899 Pfl01_1900     TRUE 0.978 -16.000 0.216 1.000   NA
 10487333 10487334 Pfl01_1900 Pfl01_1901     FALSE 0.316 99.000 0.116 1.000   NA
 10487334 10487335 Pfl01_1901 Pfl01_1902     TRUE 0.747 42.000 0.262 1.000   NA
 10487335 10487336 Pfl01_1902 Pfl01_1903     FALSE 0.435 81.000 0.153 1.000 N NA
 10487336 10487337 Pfl01_1903 Pfl01_1904     TRUE 0.796 6.000 0.033 1.000 N NA
 10487337 10487338 Pfl01_1904 Pfl01_R36     FALSE 0.044 91.000 0.000 NA   NA
 10487338 10487339 Pfl01_R36 Pfl01_R37     FALSE 0.088 56.000 0.000 NA   NA
 10487339 10487340 Pfl01_R37 Pfl01_R38     FALSE 0.042 94.000 0.000 NA   NA
 10487340 10487341 Pfl01_R38 Pfl01_1905     FALSE 0.001 422.000 0.000 NA   NA
 10487341 10487342 Pfl01_1905 Pfl01_1906     TRUE 0.995 -7.000 0.167 0.056 Y NA
 10487342 10487343 Pfl01_1906 Pfl01_1907     TRUE 0.995 3.000 0.452 0.017 Y NA
 10487343 10487344 Pfl01_1907 Pfl01_1908     TRUE 0.891 3.000 0.097 NA N NA
 10487346 10487347 Pfl01_R39 Pfl01_1910     FALSE 0.051 83.000 0.000 NA   NA
 10487347 10487348 Pfl01_1910 Pfl01_1911     FALSE 0.002 342.000 0.000 NA   NA
 10487350 10487351 Pfl01_1913 Pfl01_1914     FALSE 0.048 87.000 0.000 NA   NA
 10487352 10487353 Pfl01_1915 Pfl01_1916     TRUE 0.967 5.000 0.455 NA   NA
 10487353 10487354 Pfl01_1916 Pfl01_1917     FALSE 0.137 166.000 0.118 NA   NA
 10487355 10487356 Pfl01_1918 Pfl01_1919     FALSE 0.009 201.000 0.000 NA   NA
 10487356 10487357 Pfl01_1919 Pfl01_1920     TRUE 0.771 56.000 0.132 NA Y NA
 10487357 10487358 Pfl01_1920 Pfl01_1921     TRUE 0.998 -3.000 0.778 1.000 Y NA
 10487358 10487359 Pfl01_1921 Pfl01_1922     TRUE 0.944 4.000 0.226 1.000 N NA
 10487359 10487360 Pfl01_1922 Pfl01_1923     TRUE 0.926 24.000 0.484 1.000 N NA
 10487360 10487361 Pfl01_1923 Pfl01_1924     TRUE 0.978 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 10487361 10487362 Pfl01_1924 Pfl01_1925     FALSE 0.356 45.000 0.025 1.000 N NA
 10487364 10487365 Pfl01_1927 Pfl01_1928     FALSE 0.073 166.000 0.047 NA   NA
 10487366 10487367 Pfl01_1929 Pfl01_1930     FALSE 0.003 291.000 0.000 NA   NA
 10487368 10487369 Pfl01_1931 Pfl01_1932 thrS infC TRUE 0.941 18.000 0.186 1.000 Y NA
 10487369 10487370 Pfl01_1932 Pfl01_1933 infC rpmI TRUE 0.932 61.000 0.652 1.000 Y NA
 10487370 10487371 Pfl01_1933 Pfl01_1934 rpmI rplT TRUE 0.991 31.000 0.928 0.008 Y NA
 10487371 10487372 Pfl01_1934 Pfl01_1935 rplT pheS TRUE 0.655 110.000 0.202 1.000 Y NA
 10487372 10487373 Pfl01_1935 Pfl01_1936 pheS pheT TRUE 0.988 27.000 0.574 0.000 Y NA
 10487373 10487374 Pfl01_1936 Pfl01_1937 pheT ihfA TRUE 0.940 4.000 0.208 1.000 N NA
 10487374 10487375 Pfl01_1937 Pfl01_1938 ihfA   TRUE 0.992 -19.000 0.535 1.000 N NA
 10487375 10487376 Pfl01_1938 Pfl01_R40     FALSE 0.045 90.000 0.000 NA   NA
 10487376 10487377 Pfl01_R40 Pfl01_1939     FALSE 0.002 319.000 0.000 NA   NA
 10487377 10487378 Pfl01_1939 Pfl01_1940     FALSE 0.386 10.000 0.000 NA   NA
 10487378 10487379 Pfl01_1940 Pfl01_1941     FALSE 0.011 189.000 0.000 NA   NA
 10487379 10487380 Pfl01_1941 Pfl01_1942     FALSE 0.416 7.000 0.000 NA   NA
 10487380 10487381 Pfl01_1942 Pfl01_1943     FALSE 0.178 30.000 0.000 NA   NA
 10487383 10487384 Pfl01_1945 Pfl01_1946     FALSE 0.005 235.000 0.000 NA   NA
 10487384 10487385 Pfl01_1946 Pfl01_1947     TRUE 0.621 40.000 0.154 NA   NA
 10487385 10487386 Pfl01_1947 Pfl01_1948     TRUE 0.776 9.000 0.052 NA   NA
 10487386 10487387 Pfl01_1948 Pfl01_1949     FALSE 0.056 78.000 0.000 NA   NA
 10487388 10487389 Pfl01_1950 Pfl01_1951     FALSE 0.018 161.000 0.000 NA   NA
 10487389 10487390 Pfl01_1951 Pfl01_1952     FALSE 0.035 113.000 0.000 NA   NA
 10487390 10487391 Pfl01_1952 Pfl01_1953     FALSE 0.360 64.000 0.077 NA N NA
 10487394 10487395 Pfl01_1956 Pfl01_1957     TRUE 0.812 91.000 0.500 0.045   NA
 10487399 10487400 Pfl01_1961 Pfl01_1962     FALSE 0.195 46.000 0.000 1.000   NA
 10487400 10487401 Pfl01_1962 Pfl01_1963     FALSE 0.002 346.000 0.000 NA   NA
 10487401 10487402 Pfl01_1963 Pfl01_1964     FALSE 0.005 231.000 0.000 NA   NA
 10487402 10487403 Pfl01_1964 Pfl01_1965     TRUE 0.706 -7.000 0.000 NA   NA
 10487403 10487404 Pfl01_1965 Pfl01_1966     TRUE 0.653 46.000 0.180 1.000   NA
 10487404 10487405 Pfl01_1966 Pfl01_1967     FALSE 0.255 71.000 0.033 1.000   NA
 10487406 10487407 Pfl01_1968 Pfl01_1969     FALSE 0.080 64.000 0.000 NA N NA
 10487409 10487410 Pfl01_1971 Pfl01_1972     FALSE 0.057 77.000 0.000 NA   NA
 10487410 10487411 Pfl01_1972 Pfl01_1973     TRUE 0.986 15.000 0.333 0.003 Y NA
 10487412 10487413 Pfl01_1974 Pfl01_1975     FALSE 0.009 202.000 0.000 NA   NA
 10487413 10487414 Pfl01_1975 Pfl01_1976     TRUE 0.642 76.000 0.333 1.000   NA
 10487414 10487415 Pfl01_1976 Pfl01_1977     TRUE 0.974 14.000 0.500 0.056   NA
 10487415 10487416 Pfl01_1977 Pfl01_1978     TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.056   NA
 10487416 10487417 Pfl01_1978 Pfl01_1979     TRUE 0.992 10.000 1.000 0.056   NA
 10487417 10487418 Pfl01_1979 Pfl01_1980     TRUE 0.745 16.000 0.065 1.000 N NA
 10487418 10487419 Pfl01_1980 Pfl01_1981     FALSE 0.010 236.000 0.000 1.000 N NA
 10487419 10487420 Pfl01_1981 Pfl01_1982     TRUE 0.608 84.000 0.333 1.000 N NA
 10487420 10487421 Pfl01_1982 Pfl01_1983     TRUE 0.958 14.000 0.600 NA   NA
 10487421 10487422 Pfl01_1983 Pfl01_1984     TRUE 0.974 2.000 0.444 NA   NA
 10487422 10487423 Pfl01_1984 Pfl01_1985     TRUE 0.984 -13.000 0.333 NA   NA
 10487423 10487424 Pfl01_1985 Pfl01_1986     TRUE 0.990 0.000 0.750 NA   NA
 10487424 10487425 Pfl01_1986 Pfl01_1987     TRUE 0.988 -3.000 0.500 NA   NA
 10487425 10487426 Pfl01_1987 Pfl01_1988     TRUE 0.977 3.000 0.200 NA Y NA
 10487426 10487427 Pfl01_1988 Pfl01_1989     TRUE 0.982 6.000 0.350 NA Y NA
 10487427 10487428 Pfl01_1989 Pfl01_1990     TRUE 0.975 5.000 0.231 NA Y NA
 10487428 10487429 Pfl01_1990 Pfl01_1991     TRUE 0.919 -3.000 0.059 NA   NA
 10487429 10487430 Pfl01_1991 Pfl01_1992     TRUE 0.993 -3.000 0.723 NA   NA
 10487430 10487431 Pfl01_1992 Pfl01_1993     TRUE 0.619 30.000 0.085 NA   NA
 10487431 10487432 Pfl01_1993 Pfl01_1994     FALSE 0.001 903.000 0.000 NA   NA
 10487432 10487433 Pfl01_1994 Pfl01_1995     FALSE 0.135 37.000 0.000 NA   NA
 10487434 10487435 Pfl01_1996 Pfl01_1997     TRUE 0.949 27.000 0.333 0.001   NA
 10487435 10487436 Pfl01_1997 Pfl01_1998     TRUE 0.808 71.000 0.667 NA   NA
 10487436 10487437 Pfl01_1998 Pfl01_1999     TRUE 0.943 36.000 1.000 NA   NA
 10487438 10487439 Pfl01_2000 Pfl01_2001     FALSE 0.041 157.000 0.000 1.000 N NA
 10487439 10487440 Pfl01_2001 Pfl01_2002     TRUE 0.995 -3.000 0.857 1.000   NA
 10487440 10487441 Pfl01_2002 Pfl01_2003     FALSE 0.070 107.000 0.000 1.000   NA
 10487441 10487442 Pfl01_2003 Pfl01_2004     TRUE 0.992 -31.000 0.062 0.091 Y NA
 10487445 10487446 Pfl01_2007 Pfl01_2008     TRUE 0.964 3.000 0.357 NA   NA
 10487446 10487447 Pfl01_2008 Pfl01_2009     FALSE 0.023 149.000 0.000 NA   NA
 10487447 10487448 Pfl01_2009 Pfl01_2010     FALSE 0.034 118.000 0.000 NA   NA
 10487448 10487449 Pfl01_2010 Pfl01_2011     TRUE 0.920 32.000 0.600 1.000   NA
 10487449 10487450 Pfl01_2011 Pfl01_2012     TRUE 0.609 5.000 0.000 1.000   NA
 10487450 10487451 Pfl01_2012 Pfl01_2013     FALSE 0.067 68.000 0.000 NA   NA
 10487451 10487452 Pfl01_2013 Pfl01_2014     FALSE 0.497 57.000 0.136 NA   NA
 10487452 10487453 Pfl01_2014 Pfl01_2015     TRUE 0.962 -3.000 0.136 1.000   NA
 10487453 10487454 Pfl01_2015 Pfl01_2016     TRUE 0.563 14.000 0.024 NA   NA
 10487454 10487455 Pfl01_2016 Pfl01_2017     TRUE 0.977 -7.000 0.024 NA Y NA
 10487455 10487456 Pfl01_2017 Pfl01_2018     TRUE 0.988 -3.000 0.500 NA   NA
 10487456 10487457 Pfl01_2018 Pfl01_2019     TRUE 0.935 -3.000 0.080 NA   NA
 10487457 10487458 Pfl01_2019 Pfl01_2020     TRUE 0.985 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 10487458 10487459 Pfl01_2020 Pfl01_2021     TRUE 0.934 18.000 0.152 1.000 Y NA
 10487459 10487460 Pfl01_2021 Pfl01_2022     TRUE 0.823 22.000 0.211 NA N NA
 10487460 10487461 Pfl01_2022 Pfl01_2023     TRUE 0.940 0.000 0.158 NA N NA
 10487461 10487462 Pfl01_2023 Pfl01_2024     FALSE 0.500 66.000 0.000 NA Y NA
 10487463 10487464 Pfl01_2025 Pfl01_2026     FALSE 0.178 51.000 0.000 1.000   NA
 10487464 10487465 Pfl01_2026 Pfl01_2027     TRUE 0.953 21.000 0.680 NA N NA
 10487465 10487466 Pfl01_2027 Pfl01_2028     TRUE 0.993 -10.000 0.627 NA   NA
 10487466 10487467 Pfl01_2028 Pfl01_2029     FALSE 0.227 22.000 0.000 NA   NA
 10487467 10487468 Pfl01_2029 Pfl01_2030     FALSE 0.003 275.000 0.000 NA   NA
 10487468 10487469 Pfl01_2030 Pfl01_2031     FALSE 0.001 381.000 0.000 NA   NA
 10487469 10487470 Pfl01_2031 Pfl01_2032     TRUE 0.854 24.000 0.286 NA   NA
 10487473 10487474 Pfl01_2035 Pfl01_2036     FALSE 0.018 160.000 0.000 NA   NA
 10487474 10487475 Pfl01_2036 Pfl01_2037     FALSE 0.044 91.000 0.000 NA   NA
 10487475 10487476 Pfl01_2037 Pfl01_2038     FALSE 0.001 479.000 0.000 NA   NA
 10487476 10487477 Pfl01_2038 Pfl01_2039     FALSE 0.261 17.000 0.000 NA   NA
 10487477 10487478 Pfl01_2039 Pfl01_2040     TRUE 0.559 85.000 0.329 NA   NA
 10487478 10487479 Pfl01_2040 Pfl01_2041     FALSE 0.018 162.000 0.000 NA   NA
 10487479 10487480 Pfl01_2041 Pfl01_2042     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10487480 10487481 Pfl01_2042 Pfl01_2043     TRUE 0.669 -3.000 0.000 NA   NA
 10487481 10487482 Pfl01_2043 Pfl01_2044     FALSE 0.438 5.000 0.000 NA   NA
 10487482 10487483 Pfl01_2044 Pfl01_2045     TRUE 0.649 132.000 0.667 NA   NA
 10487483 10487484 Pfl01_2045 Pfl01_2046     FALSE 0.002 315.000 0.000 NA   NA
 10487484 10487485 Pfl01_2046 Pfl01_2047     FALSE 0.036 112.000 0.000 NA   NA
 10487485 10487486 Pfl01_2047 Pfl01_2048     FALSE 0.413 17.000 0.000 1.000   NA
 10487487 10487488 Pfl01_2049 Pfl01_2050     TRUE 0.649 85.000 0.400 1.000 N NA
 10487488 10487489 Pfl01_2050 Pfl01_2051     FALSE 0.001 554.000 0.000 NA   NA
 10487490 10487491 Pfl01_2052 Pfl01_2053     FALSE 0.038 161.000 0.000 1.000 N NA
 10487491 10487492 Pfl01_2053 Pfl01_2054     TRUE 0.984 56.000 1.000 0.001 Y NA
 10487492 10487493 Pfl01_2054 Pfl01_2055     FALSE 0.503 119.000 0.069 1.000 Y NA
 10487493 10487494 Pfl01_2055 Pfl01_2056     TRUE 0.568 88.000 0.054 1.000 Y NA
 10487494 10487495 Pfl01_2056 Pfl01_2057     TRUE 0.918 17.000 0.081 1.000 Y NA
 10487495 10487496 Pfl01_2057 Pfl01_2058     TRUE 0.938 -3.000 0.060 1.000 N NA
 10487496 10487497 Pfl01_2058 Pfl01_2059     TRUE 0.896 3.000 0.080 1.000 N NA
 10487498 10487499 Pfl01_2060 Pfl01_2061     TRUE 0.893 -3.000 0.035 NA N NA
 10487501 10487502 Pfl01_2063 Pfl01_2064     FALSE 0.008 254.000 0.000 1.000 N NA
 10487502 10487503 Pfl01_2064 Pfl01_2065     TRUE 0.684 128.000 0.667 1.000   NA
 10487503 10487504 Pfl01_2065 Pfl01_2066     FALSE 0.069 67.000 0.000 NA   NA
 10487508 10487509 Pfl01_2070 Pfl01_2071     FALSE 0.080 59.000 0.000 NA   NA
 10487512 10487513 Pfl01_2074 Pfl01_2075     TRUE 0.911 12.000 0.019 1.000 Y NA
 10487513 10487514 Pfl01_2075 Pfl01_2076     TRUE 0.982 25.000 0.352 0.000 Y NA
 10487516 10487517 Pfl01_2078 Pfl01_2079     FALSE 0.097 83.000 0.000 1.000   NA
 10487518 10487519 Pfl01_2080 Pfl01_2081     FALSE 0.014 172.000 0.000 NA   NA
 10487519 10487520 Pfl01_2081 Pfl01_2082     TRUE 0.996 -7.000 0.914 NA   NA
 10487521 10487522 Pfl01_2083 Pfl01_2084     TRUE 0.708 -13.000 0.000 NA   NA
 10487522 10487523 Pfl01_2084 Pfl01_2085     FALSE 0.042 93.000 0.000 NA   NA
 10487523 10487524 Pfl01_2085 Pfl01_2086     TRUE 0.998 -3.000 0.897 1.000 Y NA
 10487525 10487526 Pfl01_2087 Pfl01_2088     FALSE 0.178 30.000 0.000 NA   NA
 10487526 10487527 Pfl01_2088 Pfl01_2089     FALSE 0.056 78.000 0.000 NA   NA
 10487529 10487530 Pfl01_2091 Pfl01_2092     FALSE 0.202 26.000 0.000 NA   NA
 10487532 10487533 Pfl01_2094 Pfl01_2095     FALSE 0.016 168.000 0.000 NA   NA
 10487533 10487534 Pfl01_2095 Pfl01_2096     FALSE 0.339 12.000 0.000 NA   NA
 10487534 10487535 Pfl01_2096 Pfl01_2097   ligD FALSE 0.401 18.000 0.000 1.000   NA
 10487536 10487537 Pfl01_2098 Pfl01_2099     FALSE 0.037 106.000 0.000 NA   NA
 10487541 10487542 Pfl01_2103 Pfl01_2104     FALSE 0.001 403.000 0.000 NA   NA
 10487542 10487543 Pfl01_2104 Pfl01_2105     FALSE 0.029 131.000 0.000 NA   NA
 10487545 10487546 Pfl01_2107 Pfl01_2108     TRUE 0.999 -3.000 0.917 0.001 Y NA
 10487546 10487547 Pfl01_2108 Pfl01_2109     TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.055 Y NA
 10487548 10487549 Pfl01_2110 Pfl01_2111     FALSE 0.046 89.000 0.000 NA   NA
 10487551 10487552 Pfl01_2113 Pfl01_2114     FALSE 0.488 3.000 0.000 NA   NA
 10487555 10487556 Pfl01_2117 Pfl01_2118     TRUE 0.763 70.000 0.038 0.062 Y NA
 10487556 10487557