MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli CFT073

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 301840 301841 c5491 c0002 thrL   FALSE 0.023 279.000 0.000 1.000   NA
 301841 301842 c0002 c0003   thrA FALSE 0.211 137.000 0.000 1.000 N NA
 301842 301843 c0003 c0004 thrA thrB TRUE 0.961 2.000 0.133 1.000 Y NA
 301843 301844 c0004 c0005 thrB thrC TRUE 0.976 1.000 0.233 1.000 Y NA
 301844 301845 c0005 c0006 thrC   FALSE 0.026 68.000 0.000 NA   NA
 301845 301846 c0006 c0007   yaaX FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 301849 301850 c0010 c0011 yaaA yaaJ FALSE 0.015 70.000 0.028 NA   NA
 301851 301852 c0012 c0013 talB mog FALSE 0.302 112.000 0.042 1.000 N NA
 301854 301855 c0015 c0016 yaaH yaaW FALSE 0.042 149.000 0.043 NA   NA
 301855 301856 c0016 c0017 yaaW yaaI TRUE 0.849 26.000 0.500 NA   NA
 301856 301857 c0017 c0018 yaaI   FALSE 0.002 330.000 0.000 NA   NA
 301858 301859 c0019 c0020 dnaK dnaJ TRUE 0.936 89.000 0.236 0.004 Y NA
 301859 301860 c0020 c0021 dnaJ   FALSE 0.001 872.000 0.000 NA   NA
 301860 301861 c0021 c0022     TRUE 0.876 -16.000 0.571 NA   NA
 301861 301862 c0022 c0023     FALSE 0.015 129.000 0.000 NA   NA
 301862 301863 c0023 c0024   nhaA FALSE 0.004 235.000 0.000 NA   NA
 301863 301864 c0024 c0025 nhaA nhaR TRUE 0.787 66.000 0.292 1.000 N NA
 301865 301866 c0026 c0027   rpsT FALSE 0.114 1.000 0.000 NA   NA
 301867 301868 c0028 c0029 yaaY ribF FALSE 0.052 8.000 0.019 NA   NA
 301868 301869 c0029 c0030 ribF ileS TRUE 0.799 43.000 0.254 1.000 N NA
 301869 301870 c0030 c0031 ileS lspA TRUE 0.770 0.000 0.045 1.000 N NA
 301870 301871 c0031 c0032 lspA slpA TRUE 0.589 108.000 0.154 1.000 N NA
 301871 301872 c0032 c0033 slpA ispH TRUE 0.974 2.000 0.626 1.000 N NA
 301872 2179490 c0033 c0034 ispH   FALSE 0.026 66.000 0.000 NA   NA
 2179490 2179491 c0034 c0035   yaaF FALSE 0.027 64.000 0.000 NA   NA
 2179491 301873 c0035 c0036 yaaF   FALSE 0.041 23.000 0.000 NA   NA
 301873 301874 c0036 c0037   dapB FALSE 0.010 161.000 0.000 NA   NA
 301876 301877 c0039 c0040   carA FALSE 0.037 13.000 0.002 NA   NA
 301877 301878 c0040 c0041 carA carB TRUE 0.979 18.000 0.345 0.001 Y NA
 301881 301882 c0044 c0045 caiE caiD FALSE 0.283 -15.000 0.000 1.000   NA
 301882 301883 c0045 c0046 caiD caiC TRUE 0.777 109.000 0.000 0.027 Y NA
 301883 301884 c0046 c0047 caiC caiB TRUE 0.801 58.000 0.154 0.027 N NA
 301884 301885 c0047 c0048 caiB caiA TRUE 0.793 128.000 0.529 1.000 N NA
 301885 301886 c0048 c0049 caiA caiT TRUE 0.676 31.000 0.118 1.000 N NA
 301887 2179492 c0050 c0051 fixA   FALSE 0.054 15.000 0.000 NA   NA
 2179492 2179493 c0051 c0052     FALSE 0.040 24.000 0.000 NA   NA
 2179493 301888 c0052 c0053   fixC FALSE 0.041 23.000 0.000 NA   NA
 301888 301889 c0053 c0054 fixC fixX TRUE 0.978 -3.000 0.167 0.060 Y NA
 301889 301890 c0054 c0055 fixX yaaU FALSE 0.358 59.000 0.000 1.000 N NA
 301890 301891 c0055 c0056 yaaU yabF FALSE 0.147 108.000 0.000 1.000   NA
 301891 301892 c0056 c0057 yabF kefC TRUE 0.933 -7.000 0.560 1.000   NA
 301892 301893 c0057 c0058 kefC folA FALSE 0.254 57.000 0.012 1.000 N NA
 301893 301894 c0058 c0059 folA   FALSE 0.172 86.000 0.000 1.000   NA
 301894 301895 c0059 c0060     FALSE 0.503 3.000 0.000 1.000   NA
 301898 301899 c0063 c0064 apaG ksgA TRUE 0.750 3.000 0.078 NA N NA
 301899 301900 c0064 c0065 ksgA pdxA TRUE 0.914 -3.000 0.197 1.000 N NA
 301900 301901 c0065 c0066 pdxA surA TRUE 0.973 0.000 0.561 1.000 N NA
 301901 301902 c0066 c0067 surA imp TRUE 0.721 53.000 0.182 1.000 N NA
 301904 301905 c0069 c0070 yabO hepA TRUE 0.907 12.000 0.294 1.000 N NA
 301905 301906 c0070 c0071 hepA polB TRUE 0.708 165.000 0.098 0.079 Y NA
 301908 301909 c0073 c0074 araD araA FALSE 0.174 285.000 0.017 1.000 Y NA
 301909 301910 c0074 c0075 araA araB TRUE 0.831 11.000 0.138 1.000 N NA
 301911 301912 c0076 c0077 araC   FALSE 0.003 265.000 0.000 NA   NA
 301912 301913 c0077 c0078     FALSE 0.016 125.000 0.000 NA   NA
 301913 301914 c0078 c0079     FALSE 0.032 42.000 0.000 NA   NA
 301914 301915 c0079 c0080     FALSE 0.088 7.000 0.000 NA   NA
 301915 301916 c0080 c0081   yabI FALSE 0.010 155.000 0.000 NA   NA
 301917 301918 c0082 c0083 thiQ yabK TRUE 0.948 -16.000 0.522 0.018 N NA
 301918 301919 c0083 c0084 yabK tbpA TRUE 0.945 -24.000 0.697 0.086 N NA
 301919 301920 c0084 c0085 tbpA yabN FALSE 0.144 164.000 0.010 0.086   NA
 301924 301925 c0089 c0090 leuC leuB TRUE 0.989 3.000 0.275 0.001 Y NA
 301925 301926 c0090 c0091 leuB leuA TRUE 0.983 0.000 0.126 0.001 Y NA
 301926 301927 c0091 c5492 leuA leuL FALSE 0.538 49.000 0.010 0.001   NA
 301928 301929 c0092 c0093   leuO FALSE 0.028 59.000 0.000 NA   NA
 301931 301932 c0095 c0096 ilvI ilvH TRUE 0.991 3.000 0.371 0.002 Y NA
 301932 301933 c0096 c5493 ilvH fruL FALSE 0.066 12.000 0.000 NA   NA
 301933 301934 c5493 c0097 fruL   FALSE 0.017 -46.000 0.000 NA   NA
 301934 301935 c0097 c0098   fruR FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 301935 301936 c0098 c0099 fruR yabB FALSE 0.001 566.000 0.000 NA   NA
 301936 301937 c0099 c0100 yabB yabC TRUE 0.959 2.000 0.635 NA   NA
 301937 301938 c0100 c0101 yabC ftsL TRUE 0.926 -3.000 0.227 1.000 N NA
 301938 301939 c0101 c0102 ftsL ftsI TRUE 0.760 16.000 0.124 1.000 N NA
 301939 301940 c0102 c0103 ftsI murE TRUE 0.859 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 301940 301941 c0103 c0104 murE murF TRUE 0.994 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 301941 301942 c0104 c0105 murF mraY TRUE 0.983 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 301942 301943 c0105 c0106 mraY murD TRUE 0.995 3.000 0.647 0.004 Y NA
 301943 301944 c0106 c0107 murD ftsW TRUE 0.971 -3.000 0.297 0.003 N NA
 301944 301945 c0107 c0108 ftsW murG TRUE 0.974 -3.000 0.647 1.000 N NA
 301945 301946 c0108 c0109 murG murC TRUE 0.918 54.000 0.283 1.000 Y NA
 301946 301947 c0109 c0110 murC ddlB TRUE 0.968 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 301947 301948 c0110 c0111 ddlB ftsQ TRUE 0.979 2.000 0.372 NA Y NA
 301948 301949 c0111 c0112 ftsQ ftsA TRUE 0.944 -3.000 0.389 NA N NA
 301949 301950 c0112 c0113 ftsA ftsZ TRUE 0.944 61.000 0.460 1.000 Y NA
 301950 301951 c0113 c0114 ftsZ lpxC TRUE 0.573 101.000 0.134 1.000 N NA
 301951 301952 c0114 c0115 lpxC yacA FALSE 0.034 231.000 0.000 1.000   NA
 301952 301953 c0115 c0116 yacA secA FALSE 0.362 62.000 0.065 1.000   NA
 301953 301954 c0116 c0117 secA mutT TRUE 0.694 60.000 0.168 1.000 N NA
 301954 301955 c0117 c0118 mutT   FALSE 0.154 103.000 0.000 1.000   NA
 301955 301956 c0118 c0119     TRUE 0.677 100.000 0.167 0.079   NA
 301956 301957 c0119 c0120     FALSE 0.026 70.000 0.000 NA   NA
 301958 301959 c0121 c0122 yacG yacF TRUE 0.891 10.000 0.356 NA   NA
 301959 301960 c0122 c0123 yacF yacE TRUE 0.755 0.000 0.110 NA   NA
 301962 301963 c0125 c0126 hofC hofB TRUE 0.976 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 301963 301964 c0126 c0127 hofB ppdD TRUE 0.979 10.000 0.556 NA Y NA
 301964 301965 c0127 c0128 ppdD nadC FALSE 0.021 204.000 0.015 NA N NA
 301966 301967 c0129 c0130 ampD ampE TRUE 0.975 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 2179494 301969 c0132 c0133     FALSE 0.119 0.000 0.000 NA   NA
 301972 301973 c0137 c0138     FALSE 0.013 374.000 0.000 1.000   NA
 301973 301974 c0138 c0139     TRUE 0.949 -3.000 0.000 0.079 Y NA
 301974 301975 c0139 c0140   pdhR FALSE 0.126 182.000 0.000 1.000 N NA
 301977 301978 c0142 c0145 aceE lpdA FALSE 0.062 2116.000 0.000 1.000 Y NA
 301980 301981 c0147 c0148 acnB yacL FALSE 0.084 175.000 0.068 NA   NA
 301982 301983 c0149 c0150 speD speE TRUE 0.927 16.000 0.162 1.000 Y NA
 301983 301984 c0150 c0151 speE yacC TRUE 0.663 106.000 0.354 NA   NA
 301989 301990 c0156 c0157 yadG yadH TRUE 0.994 -3.000 0.688 0.098 Y NA
 301990 301991 c0157 c0158 yadH yadI FALSE 0.299 105.000 0.037 1.000 N NA
 301991 301992 c0158 c0159 yadI yadE TRUE 0.895 64.000 0.222 1.000 Y NA
 301994 301995 c0161 c0162   yadD FALSE 0.016 121.000 0.000 NA   NA
 301995 301996 c0162 c0163 yadD   FALSE 0.026 69.000 0.000 NA   NA
 301997 301998 c0164 c0165 panC panB TRUE 0.960 91.000 0.395 0.001 Y NA
 301998 301999 c0165 c0166 panB yadC FALSE 0.265 112.000 0.000 1.000 N NA
 301999 302000 c0166 c0167 yadC yadK TRUE 0.880 26.000 0.000 0.013 Y NA
 302000 302001 c0167 c0168 yadK yadL TRUE 0.938 27.000 0.571 0.013   NA
 302001 302002 c0168 c0169 yadL yadM TRUE 0.974 6.000 0.571 0.013   NA
 302002 302003 c0169 c0170 yadM htrE TRUE 0.916 17.000 0.571 1.000   NA
 302003 302004 c0170 c0171 htrE ecpD TRUE 0.977 35.000 1.000 1.000 Y NA
 302004 302005 c0171 c0172 ecpD yadN TRUE 0.926 109.000 0.500 1.000 Y NA
 302005 302006 c0172 c0173 yadN   FALSE 0.024 -31.000 0.000 NA   NA
 302008 302009 c0175 c0176 folK pcnB TRUE 0.928 -3.000 0.234 1.000 N NA
 302009 302010 c0176 c0177 pcnB yadB TRUE 0.874 39.000 0.131 1.000 Y NA
 302010 302011 c0177 c0178 yadB dksA TRUE 0.748 67.000 0.231 1.000 N NA
 302011 302012 c0178 c0179 dksA sfsA FALSE 0.209 178.000 0.151 NA   NA
 302012 302013 c0179 c0180 sfsA yadP FALSE 0.201 15.000 0.045 NA   NA
 302018 302019 c0185 c0186 fhuA fhuC TRUE 0.877 51.000 0.156 1.000 Y NA
 302019 302020 c0186 c0187 fhuC fhuD TRUE 0.915 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 302020 302021 c0187 c0188 fhuD fhuB TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 302023 302024 c0190 c0191 yadQ yadR FALSE 0.018 49.000 0.031 NA   NA
 302025 302026 c0192 c0193   yadS FALSE 0.034 35.000 0.000 NA   NA
 302026 302027 c0193 c0194 yadS yadT TRUE 0.644 38.000 0.213 NA   NA
 302027 302028 c0194 c0195 yadT pfs TRUE 0.716 -7.000 0.073 1.000 N NA
 302029 302030 c0196 c0197 dgt htrA FALSE 0.424 130.000 0.101 1.000 N NA
 302030 302031 c0197 c0198 htrA   FALSE 0.214 135.000 0.000 1.000 N NA
 302031 302032 c0198 c0199   yaeG FALSE 0.042 222.000 0.000 NA N NA
 302033 302034 c0200 c0201 yaeH dapD FALSE 0.003 312.000 0.035 NA   NA
 302034 302035 c0201 c0202 dapD glnD TRUE 0.641 31.000 0.097 1.000 N NA
 302035 302036 c0202 c0203 glnD map TRUE 0.762 62.000 0.243 1.000 N NA
 302039 302040 c0206 c0207 tsf pyrH TRUE 0.699 147.000 0.416 1.000 N NA
 302040 302041 c0207 c0208 pyrH frr TRUE 0.775 150.000 0.626 1.000 N NA
 302041 2179496 c0208 c0209 frr   FALSE 0.022 92.000 0.000 NA   NA
 2179496 2179497 c0209 c0210   yaeM FALSE 0.085 8.000 0.000 NA   NA
 2179497 302042 c0210 c0211 yaeM yaeS FALSE 0.007 186.000 0.000 NA   NA
 302042 302043 c0211 c0212 yaeS cdsA TRUE 0.972 13.000 0.400 1.000 Y NA
 302043 302044 c0212 c0213 cdsA yaeL FALSE 0.473 -33.000 0.080 1.000 N NA
 302044 302045 c0213 c0214 yaeL yaeT TRUE 0.915 30.000 0.204 1.000 Y NA
 302045 302046 c0214 c0215 yaeT hlpA TRUE 0.885 122.000 0.354 1.000 Y NA
 302046 302047 c0215 c0216 hlpA lpxD TRUE 0.991 4.000 0.814 1.000 Y NA
 302047 302048 c0216 c0217 lpxD fabZ TRUE 0.965 12.000 0.796 1.000 N NA
 302048 302049 c0217 c0218 fabZ lpxA TRUE 0.979 4.000 0.850 1.000 N NA
 302049 302050 c0218 c0219 lpxA lpxB TRUE 0.981 0.000 0.289 1.000 Y NA
 302050 302051 c0219 c0220 lpxB rnhB TRUE 0.912 -3.000 0.186 1.000 N NA
 302051 302052 c0220 c0221 rnhB dnaE TRUE 0.858 37.000 0.104 1.000 Y NA
 302054 302055 c0223 c0224 accA ldcC FALSE 0.190 98.000 0.010 1.000 N NA
 302055 302056 c0224 c0225 ldcC yaeR TRUE 0.748 57.000 0.039 1.000 Y NA
 302056 302057 c0225 c0226 yaeR mesJ FALSE 0.250 65.000 0.015 1.000 N NA
 302058 302059 c0227 c0228 yaeO   TRUE 0.675 -13.000 0.179 NA   NA
 302060 302061 c0229 c0230 yaeQ yaeJ FALSE 0.500 -3.000 0.034 1.000   NA
 302061 302062 c0230 c0231 yaeJ cutF FALSE 0.034 14.000 0.027 NA   NA
 302063 302064 c0232 c0233     TRUE 0.678 100.000 0.167 0.078   NA
 302064 302065 c0233 c0234   yaeF FALSE 0.023 86.000 0.000 NA   NA
 302065 302066 c0234 c0235 yaeF proS FALSE 0.017 53.000 0.002 NA   NA
 302066 302067 c0235 c0236 proS yaeB FALSE 0.092 111.000 0.048 NA   NA
 302067 302068 c0236 c0237 yaeB rcsF TRUE 0.878 -3.000 0.247 NA   NA
 302068 302069 c0237 c0238 rcsF yaeC TRUE 0.709 118.000 0.500 NA   NA
 302069 302070 c0238 c0239 yaeC yaeE TRUE 0.965 40.000 0.411 0.068 Y NA
 302070 302071 c0239 c0240 yaeE abc TRUE 0.981 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 302072 407925 c0241 c5600 yaeD rrsH FALSE 0.002 366.000 0.000 NA   NA
 407925 400308 c5600 c5511 rrsH tRNA-Glu FALSE 0.023 86.000 0.000 NA   NA
 400308 400309 c5511 c5512 tRNA-Glu tRNA-Ala FALSE 0.061 13.000 0.000 NA   NA
 400309 407189 c5512 c5601 tRNA-Ala rrlH FALSE 0.007 184.000 0.000 NA   NA
 407189 406694 c5601 c5602 rrlH rrfH FALSE 0.022 94.000 0.000 NA   NA
 406694 400310 c5602 c5513 rrfH aspU FALSE 0.029 53.000 0.000 NA   NA
 400310 302073 c5513 c0244 aspU yafB FALSE 0.009 163.000 0.000 NA   NA
 302075 302076 c0246 c0247 yafD yafE FALSE 0.211 78.000 0.066 NA   NA
 302077 302078 c0248 c0249 dniR gloB TRUE 0.678 72.000 0.233 1.000   NA
 302081 400311 c0252 c5514 dnaQ aspV FALSE 0.014 133.000 0.000 NA   NA
 400311 302082 c5514 c0253 aspV   FALSE 0.033 40.000 0.000 NA   NA
 302083 302084 c0254 c0255     FALSE 0.009 166.000 0.000 NA   NA
 302085 302086 c0256 c0257     FALSE 0.026 70.000 0.000 NA   NA
 302086 302087 c0257 c0258     TRUE 0.727 31.000 0.000 NA Y NA
 302087 302088 c0258 c0259     FALSE 0.016 -49.000 0.000 NA   NA
 302089 302090 c0260 c0261     FALSE 0.001 587.000 0.000 NA   NA
 302091 302092 c0262 c0263     FALSE 0.012 148.000 0.000 NA   NA
 302092 302093 c0263 c0264     FALSE 0.031 48.000 0.000 NA   NA
 2179498 302095 c0266 c0268     FALSE 0.002 293.000 0.000 NA   NA
 302096 302097 c0269 c0270     FALSE 0.031 47.000 0.000 NA   NA
 302097 302098 c0270 c0271     FALSE 0.019 -40.000 0.000 NA   NA
 302098 302099 c0271 c0272     TRUE 0.906 19.000 0.667 NA   NA
 302099 302100 c0272 c0273     FALSE 0.027 63.000 0.000 NA   NA
 302102 302103 c0275 c0276     FALSE 0.042 22.000 0.000 NA   NA
 302105 302106 c0278 c0279     FALSE 0.021 100.000 0.000 NA   NA
 302106 302107 c0279 c0280     FALSE 0.017 118.000 0.000 NA   NA
 302107 302108 c0280 c0281     FALSE 0.016 123.000 0.000 NA   NA
 302108 302109 c0281 c0282     FALSE 0.036 31.000 0.000 NA   NA
 302109 302110 c0282 c0283     TRUE 0.611 47.000 0.200 NA   NA
 302110 302111 c0283 c0284     FALSE 0.022 90.000 0.000 NA   NA
 302111 302112 c0284 c0285     TRUE 0.966 -3.000 0.800 NA   NA
 302112 302113 c0285 c0286     TRUE 0.954 -3.000 0.600 NA   NA
 302113 302114 c0286 c0287     FALSE 0.135 239.000 0.000 0.005   NA
 302114 302115 c0287 c0288     FALSE 0.005 218.000 0.000 NA   NA
 302115 302116 c0288 c0289     FALSE 0.049 17.000 0.000 NA   NA
 302116 302117 c0289 c0290     FALSE 0.010 159.000 0.000 NA   NA
 302118 2179499 c0291 c5503   ffs FALSE 0.002 361.000 0.000 NA   NA
 302121 302122 c0294 c0295     TRUE 0.985 8.000 0.556 1.000 Y NA
 302122 302123 c0295 c0296     TRUE 0.821 19.000 0.035 1.000 Y NA
 302123 302124 c0296 c0297     TRUE 0.992 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 302124 302125 c0297 c0298     FALSE 0.001 849.000 0.000 NA   NA
 302125 302126 c0298 c0299     FALSE 0.007 -355.000 0.000 NA   NA
 302128 302129 c0301 c0302     FALSE 0.021 101.000 0.000 NA   NA
 302132 302133 c0305 c0306     FALSE 0.023 88.000 0.000 NA   NA
 302133 302134 c0306 c0307     FALSE 0.001 384.000 0.000 NA   NA
 302135 302136 c0308 c0309     FALSE 0.004 232.000 0.000 NA   NA
 302136 302137 c0309 c0310     FALSE 0.002 366.000 0.000 NA   NA
 302137 302138 c0310 c0311     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 302138 302139 c0311 c0312     FALSE 0.006 202.000 0.000 NA   NA
 302139 302140 c0312 c0313     FALSE 0.037 28.000 0.000 NA   NA
 302140 302141 c0313 c0314     FALSE 0.029 53.000 0.000 NA   NA
 302141 302142 c0314 c0315     FALSE 0.009 -103.000 0.000 NA   NA
 302148 302149 c0321 c0322     FALSE 0.008 744.000 0.000 NA N NA
 302149 302150 c0322 c0323     FALSE 0.012 -70.000 0.000 NA   NA
 302153 302154 c0326 c0327     FALSE 0.002 343.000 0.000 NA   NA
 302154 302155 c0327 c0328     FALSE 0.001 506.000 0.000 NA   NA
 302158 302159 c0331 c0332     TRUE 0.898 28.000 0.209 NA Y NA
 302159 302160 c0332 c0333     TRUE 0.902 12.000 0.464 NA   NA
 302161 302162 c0334 c0335     TRUE 0.941 13.000 0.377 0.020   NA
 302162 302163 c0335 c0336     TRUE 0.950 16.000 0.130 0.015 Y NA
 302165 302166 c0338 c0339     FALSE 0.024 85.000 0.000 NA   NA
 2179500 2179501 c0342 c0343     FALSE 0.008 179.000 0.000 NA   NA
 2179501 2179502 c0343 c0344     FALSE 0.007 -322.000 0.000 NA   NA
 2179502 302169 c0344 c0345     FALSE 0.061 13.000 0.000 NA   NA
 302169 2179503 c0345 c0346     FALSE 0.001 521.000 0.000 NA   NA
 2179503 2179504 c0346 c0347     FALSE 0.033 -22.000 0.000 NA   NA
 2179504 302170 c0347 c0348     FALSE 0.001 501.000 0.000 NA   NA
 302170 302171 c0348 c0349     FALSE 0.012 145.000 0.000 NA   NA
 302174 302175 c0352 c0354     FALSE 0.025 681.000 0.000 0.076   NA
 302176 2179505 c0355 c0356     FALSE 0.034 37.000 0.000 NA   NA
 2179505 302177 c0356 c0357     FALSE 0.020 -37.000 0.000 NA   NA
 302177 302178 c0357 c0358     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 302180 302181 c0360 c0361     TRUE 0.910 25.000 0.333 0.083 N NA
 302181 302182 c0361 c0362     TRUE 0.955 46.000 0.333 0.097 Y NA
 302182 302183 c0362 c0363     FALSE 0.006 199.000 0.000 NA   NA
 302183 302184 c0363 c0364     FALSE 0.016 121.000 0.000 NA   NA
 302184 302185 c0364 c0365     TRUE 0.851 1.000 0.000 0.003   NA
 302186 302187 c0366 c0367     FALSE 0.013 141.000 0.000 NA   NA
 302192 302193 c0372 c0373 gmhA yafJ FALSE 0.347 190.000 0.229 1.000   NA
 302194 302195 c0374 c0375 yafK   FALSE 0.003 257.000 0.000 NA   NA
 302198 302199 c0378 c0379 mbhA dinP FALSE 0.336 71.000 0.000 1.000 N NA
 302199 302200 c0379 c0380 dinP yafP FALSE 0.193 -3.000 0.011 1.000   NA
 302200 302201 c0380 c0381 yafP   FALSE 0.007 190.000 0.000 NA   NA
 302201 302202 c0381 c0382   prfH TRUE 0.599 111.000 0.303 NA   NA
 302206 302207 c0386 c0387 yafA crl FALSE 0.131 58.000 0.048 NA   NA
 302209 302210 c0389 c0390 proB proA TRUE 0.937 12.000 0.026 0.001 Y NA
 302210 400312 c0390 c5515 proA thrW FALSE 0.018 115.000 0.000 NA   NA
 400312 302211 c5515 c0391 thrW   FALSE 0.010 155.000 0.000 NA   NA
 302212 302213 c0392 c0393     FALSE 0.120 126.000 0.000 1.000   NA
 302214 302215 c0394 c0395     FALSE 0.010 -82.000 0.000 NA   NA
 302215 302216 c0395 c0396     FALSE 0.033 40.000 0.000 NA   NA
 302216 302217 c0396 c0397     FALSE 0.076 302.000 0.000 0.018   NA
 302217 302218 c0397 c0398     FALSE 0.001 379.000 0.000 NA   NA
 302218 302219 c0398 c0399   yagU FALSE 0.003 263.000 0.000 NA   NA
 302220 302221 c0400 c0401 yagV yagW TRUE 0.653 -76.000 0.571 NA   NA
 302221 302222 c0401 c0402 yagW yagX TRUE 0.869 -10.000 0.429 NA   NA
 302222 302223 c0402 c0403 yagX yagY TRUE 0.764 26.000 0.308 NA   NA
 302223 302224 c0403 c0404 yagY matB TRUE 0.905 9.000 0.385 NA   NA
 302224 302225 c0404 c0405 matB matA TRUE 0.739 75.000 0.400 NA   NA
 302225 302226 c0405 c0406 matA   FALSE 0.006 1036.000 0.000 1.000   NA
 302226 302227 c0406 c0407   rpmE2 TRUE 0.732 -3.000 0.004 0.012   NA
 302227 302228 c0407 c0408 rpmE2   FALSE 0.001 940.000 0.000 NA   NA
 302228 302229 c0408 c0409     FALSE 0.066 12.000 0.000 NA   NA
 302229 302230 c0409 c0410     FALSE 0.068 172.000 0.000 1.000   NA
 302231 302232 c0411 c0412     TRUE 0.725 125.000 0.000 0.062 Y NA
 302233 302234 c0413 c0414     TRUE 0.863 27.000 0.438 1.000   NA
 302238 302239 c0418 c0419 ykgB ykgI FALSE 0.320 3.000 0.043 NA   NA
 302239 302240 c0419 c0420 ykgI ykgC TRUE 0.818 94.000 0.667 NA   NA
 302241 302242 c0421 c0422 ykgD ykgE FALSE 0.010 526.000 0.000 NA N NA
 302242 302243 c0422 c0423 ykgE ykgF TRUE 0.958 11.000 0.286 NA Y NA
 302243 302244 c0423 c0424 ykgF ykgG TRUE 0.940 -7.000 0.286 0.001   NA
 302245 302246 c0425 c0426 ykgH   FALSE 0.007 184.000 0.000 NA   NA
 302246 302247 c0426 c0427     FALSE 0.083 9.000 0.000 NA   NA
 302247 302248 c0427 c0428     FALSE 0.010 154.000 0.000 NA   NA
 302248 302249 c0428 c0429     FALSE 0.026 -28.000 0.000 NA   NA
 302249 302250 c0429 c0430     FALSE 0.002 293.000 0.000 NA   NA
 302250 302251 c0430 c0431   betA FALSE 0.014 1047.000 0.000 1.000 N NA
 302251 302252 c0431 c0432 betA betB TRUE 0.950 14.000 0.634 1.000 N NA
 302252 302253 c0432 c0433 betB betI TRUE 0.943 11.000 0.459 1.000 N NA
 302254 302255 c0434 c0435 betT   FALSE 0.015 870.000 0.000 1.000 N NA
 302256 302257 c0436 c0437 yahB yahC FALSE 0.022 92.000 0.000 NA   NA
 302258 302259 c0438 c0439   yahD FALSE 0.013 -61.000 0.000 NA   NA
 302259 302260 c0439 c0440 yahD yahE TRUE 0.874 40.000 0.667 NA   NA
 302260 302261 c0440 c0441 yahE   TRUE 0.869 -10.000 0.429 NA   NA
 302261 302262 c0441 c0444     FALSE 0.013 1844.000 0.000 1.000 N NA
 302262 302263 c0444 c0445   yahJ TRUE 0.915 10.000 0.278 1.000 N NA
 302265 400313 c0447 c5516 yahK pseudo-tRNA FALSE 0.001 552.000 0.000 NA   NA
 302269 302270 c0451 c0452 prpB prpC TRUE 0.703 160.000 0.502 1.000 N NA
 302270 302271 c0452 c0453 prpC prpD TRUE 0.726 34.000 0.216 1.000   NA
 302271 302272 c0453 c0454 prpD prpE TRUE 0.648 40.000 0.038 0.001   NA
 302272 302273 c0454 c0455 prpE codB FALSE 0.038 325.000 0.000 1.000 N NA
 302273 302274 c0455 c0456 codB codA TRUE 0.912 -25.000 0.250 1.000 Y NA
 302275 302276 c0457 c0458 lacA lacY TRUE 0.813 15.000 0.222 1.000   NA
 302276 302277 c0458 c0459 lacY lacZ TRUE 0.734 52.000 0.261 1.000   NA
 302277 302278 c0459 c0460 lacZ   FALSE 0.402 124.000 0.174 NA   NA
 302280 302281 c0463 c0464   yaiM FALSE 0.008 174.000 0.000 NA   NA
 302281 302282 c0464 c0465 yaiM adhC TRUE 0.716 93.000 0.327 1.000   NA
 302282 302283 c0465 c0466 adhC yaiN TRUE 0.844 35.000 0.531 NA   NA
 302283 302284 c0466 c0467 yaiN   FALSE 0.009 166.000 0.000 NA   NA
 302284 302285 c0467 c0468     FALSE 0.110 2.000 0.000 NA   NA
 302285 302286 c0468 c0469     FALSE 0.034 35.000 0.000 NA   NA
 302286 302287 c0469 c0470     TRUE 0.816 10.000 0.214 NA   NA
 302287 302288 c0470 c0471     FALSE 0.001 445.000 0.000 NA   NA
 302289 302290 c0472 c0473 tauA tauB TRUE 0.879 13.000 0.047 1.000 Y NA
 302292 302293 c0475 c0476 tauC tauD TRUE 0.920 -3.000 0.214 1.000 N NA
 302295 302296 c0478 c0479   yaiV TRUE 0.873 41.000 0.667 NA   NA
 302298 302299 c0481 c0482   sbmA FALSE 0.057 14.000 0.000 NA   NA
 302299 302300 c0482 c0483 sbmA yaiW FALSE 0.361 13.000 0.000 1.000   NA
 302302 302303 c0485 c0486   yaiZ FALSE 0.027 64.000 0.000 NA   NA
 302305 302306 c0488 c0489   yaiB FALSE 0.003 263.000 0.000 NA   NA
 302306 302307 c0489 c0490 yaiB phoA FALSE 0.021 32.000 0.032 NA   NA
 302307 302308 c0490 c0491 phoA psiF FALSE 0.012 101.000 0.032 NA   NA
 302308 302309 c0491 c0492 psiF yaiC TRUE 0.575 102.000 0.250 NA   NA
 302311 302312 c0494 c0495 yaiI aroL FALSE 0.004 183.000 0.007 NA   NA
 302312 302313 c0495 c0496 aroL yaiA FALSE 0.119 50.000 0.044 NA   NA
 302313 302314 c0496 c0497 yaiA   FALSE 0.007 191.000 0.000 NA   NA
 302314 302315 c0497 c0498   aroM FALSE 0.011 -79.000 0.000 NA   NA
 302315 302316 c0498 c0499 aroM yaiE FALSE 0.123 72.000 0.049 NA   NA
 302321 302322 c0504 c0505 araJ sbcC FALSE 0.371 42.000 0.030 1.000 N NA
 302322 302323 c0505 c0506 sbcC sbcD TRUE 0.959 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 302324 302325 c0507 c0508   phoB FALSE 0.025 73.000 0.000 NA   NA
 302325 302326 c0508 c0509 phoB phoR TRUE 0.966 58.000 0.453 0.015 Y NA
 302328 302329 c0511 c0512 brnQ proY TRUE 0.947 73.000 0.348 0.095 Y NA
 302329 302330 c0512 c0513 proY malZ FALSE 0.377 156.000 0.123 1.000 N NA
 302332 302333 c0515 c0516 queA tgt TRUE 0.967 55.000 0.360 0.001 Y NA
 302333 302334 c0516 c0517 tgt yajC TRUE 0.832 23.000 0.325 NA N NA
 302334 302335 c0517 c0518 yajC secD TRUE 0.762 28.000 0.045 NA Y NA
 302335 302336 c0518 c0519 secD secF TRUE 0.979 11.000 0.206 0.001 Y NA
 302336 302337 c0519 c0520 secF yajD FALSE 0.080 61.000 0.015 1.000   NA
 302338 302339 c0521 c0522 tsx yajI FALSE 0.003 251.000 0.000 NA   NA
 302340 302341 c0523 c0524 ybaD ribD TRUE 0.913 4.000 0.277 NA N NA
 302341 302342 c0524 c0525 ribD ribH TRUE 0.841 89.000 0.034 0.001 Y NA
 302344 302345 c0527 c0528 nusB thiL TRUE 0.727 78.000 0.225 1.000 N NA
 302345 302346 c0528 c0529 thiL pgpA TRUE 0.763 -22.000 0.206 1.000 N NA
 302347 302348 c0530 c0531 yajO dxs FALSE 0.240 55.000 0.009 1.000 N NA
 302348 302349 c0531 c0532 dxs ispA TRUE 0.838 25.000 0.060 1.000 Y NA
 302349 302350 c0532 c0533 ispA xseB TRUE 0.727 0.000 0.035 1.000 N NA
 302352 302353 c0535 c0536 thiJ apbA FALSE 0.390 -43.000 0.155 NA   NA
 302355 302356 c0538 c0539 yajR cyoE FALSE 0.499 -49.000 0.061 0.095 N NA
 302356 302357 c0539 c0540 cyoE cyoD TRUE 0.874 12.000 0.118 0.095 N NA
 302357 302358 c0540 c0541 cyoD cyoC TRUE 0.992 0.000 0.485 0.057 Y NA
 302358 302359 c0541 c0542 cyoC cyoB TRUE 0.988 -10.000 0.697 0.057 Y NA
 302359 302360 c0542 c0543 cyoB cyoA TRUE 0.906 22.000 0.041 0.004 Y NA
 302360 302361 c0543 c0544 cyoA ampG FALSE 0.032 459.000 0.000 0.095   NA
 302363 302364 c0546 c0547 yajG   FALSE 0.030 50.000 0.000 NA   NA
 302367 302368 c0550 c0551   tig FALSE 0.012 147.000 0.000 NA   NA
 302370 302371 c0553 c0554 clpP clpX TRUE 0.879 126.000 0.352 1.000 Y NA
 302371 302372 c0554 c0555 clpX lon TRUE 0.843 143.000 0.201 0.094 Y NA
 302372 302373 c0555 c0556 lon hupB FALSE 0.093 209.000 0.000 1.000 N NA
 302373 302374 c0556 c0557 hupB ybaU FALSE 0.111 192.000 0.000 1.000 N NA
 302374 302375 c0557 c0558 ybaU ybaV FALSE 0.171 151.000 0.033 1.000 N NA
 302375 302376 c0558 c0559 ybaV ybaW FALSE 0.115 106.000 0.027 1.000   NA
 302377 302378 c0560 c0561 ybaX ybaE FALSE 0.099 65.000 0.019 1.000   NA
 302379 302380 c0562 c0563 cof   FALSE 0.112 133.000 0.000 1.000   NA
 302380 302381 c0563 c0564   ybaO FALSE 0.260 114.000 0.000 1.000 N NA
 302381 302382 c0564 c0565 ybaO mdlA TRUE 0.761 30.000 0.179 1.000 N NA
 302382 302383 c0565 c0566 mdlA mdlB TRUE 0.993 -7.000 0.911 0.007 Y NA
 302392 302393 c0575 c0576 ylaB ylaC FALSE 0.010 158.000 0.000 NA   NA
 302393 302394 c0576 c0577 ylaC ylaD FALSE 0.453 77.000 0.101 1.000   NA
 302394 302395 c0577 c0578 ylaD hha FALSE 0.098 173.000 0.076 NA   NA
 302395 302396 c0578 c0579 hha ybaJ FALSE 0.467 14.000 0.080 NA   NA
 302396 302397 c0579 c0580 ybaJ acrB FALSE 0.001 545.000 0.000 NA   NA
 302397 302398 c0580 c0581 acrB acrA TRUE 0.903 23.000 0.458 1.000 N NA
 302399 302400 c0582 c0583 acrR   FALSE 0.024 82.000 0.000 NA   NA
 302400 302401 c0583 c0584   aefA FALSE 0.008 -118.000 0.000 NA   NA
 302402 302403 c0585 c0586 ybaM priC TRUE 0.890 14.000 0.474 NA   NA
 302404 302405 c0587 c0588 ybaN apt FALSE 0.076 99.000 0.043 NA   NA
 302405 302406 c0588 c0589 apt dnaX FALSE 0.400 129.000 0.088 1.000 N NA
 302408 302409 c0591 c0592 ybaB recR TRUE 0.960 0.000 0.604 NA   NA
 302409 302410 c0592 c0593 recR htpG FALSE 0.248 110.000 0.028 1.000 N NA
 302410 302411 c0593 c0594 htpG adk FALSE 0.252 181.000 0.035 0.093 N NA
 302411 302412 c0594 c0595 adk hemH FALSE 0.147 132.000 0.013 1.000 N NA
 302415 302416 c0598 c0599 ybaL fsr FALSE 0.141 238.000 0.000 0.094 N NA
 302418 302419 c0601 c0602 ybaK ybaP FALSE 0.003 204.000 0.022 NA   NA
 302422 302423 c0605 c0606 ybaS ybaT TRUE 0.913 3.000 0.028 1.000 Y NA
 302423 302424 c0606 c0607 ybaT ybbI FALSE 0.236 125.000 0.000 1.000 N NA
 302425 302426 c0608 c0609   ybbJ FALSE 0.017 119.000 0.000 NA   NA
 302426 302427 c0609 c0610 ybbJ ybbK TRUE 0.974 -3.000 0.313 NA Y NA
 302428 2179506 c0611 c0612 ybbL ybbM FALSE 0.019 -40.000 0.000 NA   NA
 302429 302430 c0613 c0614 ybbN ybbO TRUE 0.612 25.000 0.118 1.000   NA
 302430 302431 c0614 c0615 ybbO tesA TRUE 0.557 -10.000 0.072 1.000   NA
 302432 302433 c0616 c0617 ybbA ybbP TRUE 0.985 -3.000 0.535 NA Y NA
 302434 302435 c0618 c0619 ybbB ybbS FALSE 0.004 195.000 0.012 NA   NA
 302436 302437 c0620 c0621 ybbT ybbU TRUE 0.885 78.000 0.625 1.000 N NA
 302437 302438 c0621 c0622 ybbU gcl FALSE 0.268 90.000 0.054 1.000   NA
 302438 302439 c0622 c0623 gcl gip TRUE 0.565 13.000 0.065 1.000   NA
 302439 302440 c0623 c0624 gip ybbQ TRUE 0.607 100.000 0.154 1.000 N NA
 302440 302441 c0624 c0625 ybbQ ybbW FALSE 0.142 170.000 0.000 1.000 N NA
 302441 302442 c0625 c0626 ybbW ybbX TRUE 0.870 60.000 0.161 1.000 Y NA
 302442 302443 c0626 c0627 ybbX ybbY TRUE 0.880 50.000 0.161 1.000 Y NA
 302443 302444 c0627 c0628 ybbY ybbZ TRUE 0.771 16.000 0.133 1.000 N NA
 302445 302446 c0629 c0630 ylbA ylbB FALSE 0.398 11.000 0.059 NA   NA
 302446 302447 c0630 c0631 ylbB   TRUE 0.899 4.000 0.174 1.000 N NA
 302448 302449 c0632 c0633 fdrA ylbE TRUE 0.905 10.000 0.412 NA   NA
 302449 302450 c0633 c0634 ylbE ylbF FALSE 0.419 -82.000 0.265 NA   NA
 302450 302451 c0634 c0635 ylbF arcC TRUE 0.923 -3.000 0.375 NA   NA
 302452 302453 c0636 c0637 purK purE TRUE 0.981 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 302453 302454 c0637 c0638 purE   FALSE 0.015 69.000 0.002 NA   NA
 302454 302455 c0638 c0639   ybbF FALSE 0.011 111.000 0.005 NA   NA
 302459 302460 c0643 c0644 ybcI ybcJ FALSE 0.004 193.000 0.011 NA   NA
 302460 302461 c0644 c0645 ybcJ folD TRUE 0.671 2.000 0.055 1.000   NA
 302462 400314 c0646 c5517   tRNA-Arg FALSE 0.035 33.000 0.000 NA   NA
 2179507 2179508 c0647 c0648     FALSE 0.015 -52.000 0.000 NA   NA
 302463 302464 c0649 c0650 ydfM   FALSE 0.028 -27.000 0.000 NA   NA
 302465 302466 c0651 c0652   ompT FALSE 0.033 235.000 0.000 1.000   NA
 302466 302467 c0652 c0653 ompT ybcH FALSE 0.001 659.000 0.000 NA   NA
 302467 302468 c0653 c0654 ybcH nfrA TRUE 0.948 1.000 0.500 NA   NA
 302468 302469 c0654 c0655 nfrA nfrB FALSE 0.533 -34.000 0.159 1.000   NA
 302469 302470 c0655 c0656 nfrB cusS FALSE 0.161 225.000 0.000 0.093 N NA
 302470 302471 c0656 c0657 cusS cusR TRUE 0.989 -10.000 0.600 0.001 Y NA
 302472 302473 c0658 c0659 cusC cusX TRUE 0.856 24.000 0.500 NA   NA
 302473 302474 c0659 c0660 cusX cusB FALSE 0.051 16.000 0.000 NA   NA
 302474 302475 c0660 c0661 cusB cusA TRUE 0.944 12.000 0.500 1.000 N NA
 302475 302476 c0661 c0662 cusA pheP TRUE 0.543 66.000 0.000 0.094 N NA
 302477 302478 c0663 c0664 ybdG nfnB FALSE 0.060 108.000 0.012 NA N NA
 302478 302479 c0664 c0665 nfnB ybdF TRUE 0.779 79.000 0.500 NA   NA
 302479 302480 c0665 c0666 ybdF ybdJ FALSE 0.027 65.000 0.000 NA   NA
 302480 302481 c0666 c0667 ybdJ ybdK FALSE 0.026 66.000 0.000 NA   NA
 302481 302482 c0667 c0668 ybdK entD FALSE 0.007 726.000 0.000 1.000   NA
 302482 302483 c0668 c0669 entD fepA TRUE 0.936 25.000 0.700 1.000 N NA
 302484 302485 c0670 c0671   fes FALSE 0.017 119.000 0.000 NA   NA
 302485 302486 c0671 c0672 fes   TRUE 0.907 3.000 0.320 NA   NA
 302486 302487 c0672 c0673   entF TRUE 0.627 -3.000 0.080 NA   NA
 302487 302488 c0673 c0674 entF fepE FALSE 0.063 247.000 0.000 1.000 N NA
 302489 302490 c0675 c0676 fepC fepG TRUE 0.922 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 302490 302491 c0676 c0677 fepG fepD TRUE 0.950 -3.000 0.000 0.065 Y NA
 302494 302495 c0680 c0681 entC entE TRUE 0.986 10.000 0.667 1.000 Y NA
 302495 302496 c0681 c0682 entE entB TRUE 0.981 14.000 0.667 1.000 Y NA
 302496 302497 c0682 c0683 entB entA TRUE 0.921 0.000 0.024 1.000 Y NA
 302497 302498 c0683 c0684 entA ybdB TRUE 0.921 3.000 0.065 NA Y NA
 302498 302499 c0684 c0685 ybdB cstA FALSE 0.372 181.000 0.222 NA N NA
 302499 302500 c0685 c0686 cstA   TRUE 0.620 113.000 0.333 NA   NA
 302503 302504 c0689 c0690     FALSE 0.199 -27.000 0.000 1.000   NA
 302504 302505 c0690 c0691   ybdO TRUE 0.581 147.000 0.333 1.000   NA
 302505 302506 c0691 c0692 ybdO dsbG FALSE 0.230 169.000 0.067 1.000 N NA
 302506 302507 c0692 c0693 dsbG   FALSE 0.002 339.000 0.000 NA   NA
 302508 302509 c0694 c0695 ahpC ahpF TRUE 0.900 141.000 0.551 1.000 Y NA
 302512 302513 c0698 c0699 rnk rna FALSE 0.051 230.000 0.018 1.000 N NA
 302513 302514 c0699 c0700 rna ybdS FALSE 0.249 96.000 0.024 1.000 N NA
 302514 302515 c0700 c0701 ybdS citG TRUE 0.738 51.000 0.194 1.000 N NA
 302515 302516 c0701 c0702 citG ybdU TRUE 0.940 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 302520 2179509 c0706 c0707 citE   FALSE 0.038 -18.000 0.000 NA   NA
 302522 302523 c0710 c0711 citA citB TRUE 0.792 -31.000 0.000 0.082 Y NA
 302525 302526 c0713 c0714 crcA cspE FALSE 0.485 175.000 0.333 1.000   NA
 302528 302529 c0716 c0717 ybeM ybeC FALSE 0.499 129.000 0.196 1.000   NA
 302530 302531 c0718 c0719 lipA   FALSE 0.004 232.000 0.000 NA   NA
 302531 302532 c0719 c0720   lipB FALSE 0.003 247.000 0.000 NA   NA
 302532 302533 c0720 c0721 lipB ybeD FALSE 0.537 101.000 0.219 NA   NA
 302533 302534 c0721 c0722 ybeD dacA FALSE 0.226 110.000 0.081 NA   NA
 302536 302537 c0724 c0725 rlpA mrdB FALSE 0.436 11.000 0.035 NA N NA
 302537 302538 c0725 c0726 mrdB mrdA TRUE 0.747 3.000 0.046 1.000 N NA
 302538 302539 c0726 c0727 mrdA ybeA FALSE 0.021 31.000 0.031 NA   NA
 302539 302540 c0727 c0728 ybeA ybeB TRUE 0.896 4.000 0.307 NA   NA
 302540 302541 c0728 c0729 ybeB phpB FALSE 0.003 260.000 0.000 NA   NA
 302541 302542 c0729 c0730 phpB ybeN TRUE 0.576 21.000 0.057 1.000 N NA
 302542 302543 c0730 c0731 ybeN holA FALSE 0.249 -61.000 0.045 1.000 N NA
 302543 302544 c0731 c0732 holA rlpB TRUE 0.903 0.000 0.199 NA N NA
 302544 302545 c0732 c0733 rlpB leuS TRUE 0.787 15.000 0.182 NA N NA
 302547 302548 c0735 c0736 rihA gltL TRUE 0.542 118.000 0.195 NA N NA
 302548 302549 c0736 c0737 gltL gltK TRUE 0.985 0.000 0.379 1.000 Y NA
 302549 302550 c0737 c0738 gltK gltJ TRUE 0.996 0.000 0.933 0.017 Y NA
 302550 302551 c0738 c0739 gltJ ybeJ TRUE 0.655 170.000 0.067 0.064 Y NA
 302552 302553 c0740 c0741     FALSE 0.006 197.000 0.000 NA   NA
 302554 302555 c0742 c0743 lnt ybeX TRUE 0.917 25.000 0.557 1.000 N NA
 302555 302556 c0743 c0744 ybeX ybeY FALSE 0.435 90.000 0.150 NA   NA
 302556 302557 c0744 c0745 ybeY ybeZ TRUE 0.937 -3.000 0.457 NA   NA
 400396 400395 c5518 c5519 glnX glnV FALSE 0.033 38.000 0.000 NA   NA
 400395 400394 c5519 c5520 glnV metU FALSE 0.031 49.000 0.000 NA   NA
 400394 400393 c5520 c5521 metU glnW FALSE 0.051 16.000 0.000 NA   NA
 400393 400392 c5521 c5522 glnW glnU FALSE 0.034 35.000 0.000 NA   NA
 400392 400391 c5522 c5523 glnU tRNA-Leu FALSE 0.040 24.000 0.000 NA   NA
 400391 400390 c5523 c5524 tRNA-Leu tRNA-Met FALSE 0.071 11.000 0.000 NA   NA
 400390 302561 c5524 c0749 tRNA-Met asnB FALSE 0.001 381.000 0.000 NA   NA
 302561 302562 c0749 c0750 asnB nagD FALSE 0.059 256.000 0.000 1.000 N NA
 302562 302563 c0750 c0751 nagD nagC TRUE 0.815 48.000 0.070 1.000 Y NA
 302563 302564 c0751 c0752 nagC nagA TRUE 0.985 9.000 0.571 1.000 Y NA
 302564 302565 c0752 c0753 nagA nagB TRUE 0.977 60.000 0.557 0.001 Y NA
 302565 302566 c0753 c0754 nagB   FALSE 0.024 49.000 0.033 NA   NA
 302568 302569 c0756 c0757     FALSE 0.022 -33.000 0.000 NA   NA
 302569 302570 c0757 c0758     FALSE 0.369 14.000 0.000 NA N NA
 302570 302571 c0758 c0759     TRUE 0.936 -3.000 0.092 NA Y NA
 302571 302572 c0759 c0760     FALSE 0.389 36.000 0.031 1.000 N NA
 302572 302573 c0760 c0761     TRUE 0.629 60.000 0.125 1.000 N NA
 302573 302574 c0761 c0762     TRUE 0.947 4.000 0.208 0.062 N NA
 302575 302576 c0763 c0764     TRUE 0.870 -7.000 0.361 NA   NA
 302576 302577 c0764 c0765     TRUE 0.969 2.000 0.533 1.000 N NA
 302577 302578 c0765 c0766   glnS FALSE 0.084 220.000 0.000 1.000 N NA
 302578 302579 c0766 c0767 glnS   FALSE 0.073 231.000 0.000 1.000 N NA
 302579 302580 c0767 c0768   ybfM FALSE 0.010 465.000 0.000 1.000   NA
 302580 302581 c0768 c0769 ybfM ybfN FALSE 0.030 50.000 0.000 NA   NA
 302582 302583 c0770 c0771 fur fldA FALSE 0.159 289.000 0.156 1.000 N NA
 302583 302584 c0771 c0772 fldA ybfE TRUE 0.692 140.000 0.473 1.000   NA
 302584 302585 c0772 c0773 ybfE ybfF TRUE 0.650 71.000 0.276 NA   NA
 302586 302587 c0774 c0775 seqA pgm TRUE 0.684 -25.000 0.151 1.000 N NA
 302588 302589 c0776 c0777 potE speF TRUE 0.948 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 302589 302590 c0777 c0778 speF   FALSE 0.092 5.000 0.000 NA   NA
 302590 302591 c0778 c0779   kdpE FALSE 0.001 460.000 0.000 NA   NA
 302591 302592 c0779 c0780 kdpE kdpD TRUE 0.983 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 302592 302593 c0780 c0781 kdpD kdpC TRUE 0.731 -10.000 0.100 1.000 N NA
 302593 302594 c0781 c0782 kdpC kdpB TRUE 0.991 -15.000 0.877 0.001 Y NA
 302594 302595 c0782 c0783 kdpB kdpA TRUE 0.963 23.000 0.201 0.001 Y NA
 302595 302596 c0783 c0784 kdpA   TRUE 0.853 0.000 0.022 0.001   NA
 302597 302598 c0785 c0786 ybfA ybgA TRUE 0.557 101.000 0.231 NA   NA
 302598 302599 c0786 c0787 ybgA phrB FALSE 0.064 -3.000 0.019 NA   NA
 302601 302602 c0789 c0790 ybgI ybgJ FALSE 0.203 23.000 0.050 NA   NA
 302602 302603 c0790 c0791 ybgJ ybgK TRUE 0.968 -6.000 0.379 NA Y NA
 302603 302604 c0791 c0792 ybgK ybgL TRUE 0.741 -10.000 0.211 NA   NA
 302604 302605 c0792 c0793 ybgL nei FALSE 0.256 36.000 0.037 1.000   NA
 302606 302607 c0794 c0795 abrB   FALSE 0.004 239.000 0.000 NA   NA
 302607 302608 c0795 c0796   gltA FALSE 0.012 148.000 0.000 NA   NA
 302609 302610 c0797 c0798   sdhC FALSE 0.009 536.000 0.000 1.000   NA
 302612 302613 c0800 c0801 sdhD sdhA TRUE 0.996 0.000 0.705 0.002 Y NA
 302613 302614 c0801 c0802 sdhA sdhB TRUE 0.988 16.000 0.604 0.002 Y NA
 302614 302615 c0802 c0803 sdhB sucA FALSE 0.117 551.000 0.067 1.000 Y NA
 302615 302616 c0803 c0804 sucA sucB TRUE 0.980 15.000 0.667 1.000 Y NA
 302616 302617 c0804 c0805 sucB sucC TRUE 0.821 94.000 0.136 1.000 Y NA
 302617 302618 c0805 c0806 sucC sucD TRUE 0.997 0.000 0.806 0.001 Y NA
 302618 302619 c0806 c0807 sucD   FALSE 0.030 240.000 0.000 1.000   NA
 302619 302620 c0807 c0808     FALSE 0.037 29.000 0.000 NA   NA
 302621 302622 c0809 c0810     FALSE 0.047 18.000 0.000 NA   NA
 302623 302624 c0811 c0812 cydA cydB TRUE 0.900 16.000 0.000 0.056 Y NA
 302626 302627 c0814 c0815 ybgE ybgC FALSE 0.174 150.000 0.095 NA   NA
 302627 302628 c0815 c0816 ybgC tolQ TRUE 0.963 -3.000 0.593 1.000   NA
 302628 302629 c0816 c0817 tolQ tolR TRUE 0.991 4.000 0.556 0.080 Y NA
 302629 302630 c0817 c0818 tolR tolA FALSE 0.513 65.000 0.114 NA N NA
 302630 302631 c0818 c0819 tolA tolB FALSE 0.193 130.000 0.051 NA N NA
 302633 302634 c0821 c0822 pal ybgF TRUE 0.705 10.000 0.088 1.000   NA
 302634 302635 c0822 c0823 ybgF   FALSE 0.336 -76.000 0.043 0.011   NA
 400315 400316 c5525 c5526 lysT valT FALSE 0.034 36.000 0.000 NA   NA
 400316 400317 c5526 c5527 valT lysW FALSE 0.104 3.000 0.000 NA   NA
 400317 400318 c5527 c5528 lysW valZ FALSE 0.030 52.000 0.000 NA   NA
 400318 400319 c5528 c5529 valZ lysY FALSE 0.097 4.000 0.000 NA   NA
 400319 400320 c5529 c5530 lysY lysZ FALSE 0.031 49.000 0.000 NA   NA
 400320 400321 c5530 c5531 lysZ lysQ FALSE 0.035 34.000 0.000 NA   NA
 400321 302637 c5531 c0825 lysQ nadA FALSE 0.003 278.000 0.000 NA   NA
 302637 302638 c0825 c0826 nadA pnuC TRUE 0.745 38.000 0.023 1.000 Y NA
 302643 302644 c0831 c0832 gpmA galM FALSE 0.335 188.000 0.009 1.000 Y NA
 302644 302645 c0832 c0833 galM galK TRUE 0.963 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 302645 302646 c0833 c0834 galK galT TRUE 0.977 4.000 0.370 0.001 N NA
 302646 302647 c0834 c0835 galT galE TRUE 0.883 10.000 0.053 0.001 N NA
 302647 302648 c0835 c0836 galE modF FALSE 0.016 262.000 0.023 1.000   NA
 302648 302649 c0836 c0837 modF modE FALSE 0.325 68.000 0.009 0.091   NA
 302650 302651 c0838 c0839 ybhT   FALSE 0.013 -64.000 0.000 NA   NA
 302651 302652 c0839 c0840   modA FALSE 0.042 22.000 0.000 NA   NA
 302652 302653 c0840 c0841 modA modB TRUE 0.996 0.000 0.627 0.001 Y NA
 302653 302654 c0841 c0842 modB modC TRUE 0.994 3.000 0.537 0.001 Y NA
 302658 302659 c0846 c0847 ybhH ybhI FALSE 0.025 76.000 0.000 NA   NA
 302659 302660 c0847 c0848 ybhI ybhJ FALSE 0.505 183.000 0.300 1.000 N NA
 302661 302662 c0849 c0850 ybhC ybhB FALSE 0.011 152.000 0.000 NA   NA
 302664 302665 c0852 c0853   bioA FALSE 0.001 885.000 0.000 NA   NA
 302666 302667 c0854 c0855   bioB FALSE 0.001 1113.000 0.000 NA   NA
 302667 302668 c0855 c0856 bioB bioF TRUE 0.983 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 302668 302669 c0856 c0857 bioF bioC FALSE 0.038 701.000 0.000 0.002   NA
 302669 302670 c0857 c0858 bioC bioD TRUE 0.759 -7.000 0.000 0.002   NA
 302674 302675 c0862 c0863 moaA moaB TRUE 0.941 22.000 0.108 0.003 Y NA
 302677 302678 c0865 c0866 moaC moaD TRUE 0.972 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 302678 302679 c0866 c0867 moaD moaE TRUE 0.994 2.000 0.501 0.003 Y NA
 302679 302680 c0867 c0868 moaE ybhL FALSE 0.017 56.000 0.025 NA   NA
 302683 302684 c0871 c0872 ybhN ybhO TRUE 0.624 0.000 0.071 NA   NA
 302684 302685 c0872 c0873 ybhO ybhP TRUE 0.912 -3.000 0.333 NA   NA
 302687 302688 c0875 c0876 ybhR ybhS TRUE 0.991 11.000 0.609 0.007 Y NA
 302688 302689 c0876 c0877 ybhS ybhF TRUE 0.791 -7.000 0.085 0.091   NA
 302689 302690 c0877 c0878 ybhF ybhG TRUE 0.542 -22.000 0.109 1.000   NA
 302690 302691 c0878 c0879 ybhG ybiH TRUE 0.938 0.000 0.236 1.000 N NA
 302695 302696 c0883 c0884 dinG ybiB FALSE 0.469 28.000 0.041 1.000 N NA
 302696 302697 c0884 c0885 ybiB ybiC FALSE 0.380 141.000 0.000 0.061 N NA
 302698 302700 c0886 c0888 ybiJ   FALSE 0.002 265.000 0.027 NA   NA
 302700 302701 c0888 c0889   ybiX FALSE 0.183 74.000 0.000 1.000   NA
 302701 302702 c0889 c0890 ybiX ybiL FALSE 0.223 216.000 0.171 1.000   NA
 302702 302703 c0890 c0891 ybiL ybiM FALSE 0.003 265.000 0.000 NA   NA
 302705 302706 c0893 c0894 ybiO glnQ FALSE 0.146 117.000 0.000 NA N NA
 302706 302707 c0894 c0895 glnQ glnP TRUE 0.922 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 302707 302708 c0895 c0896 glnP glnH TRUE 0.716 139.000 0.051 0.079 Y NA
 302708 302709 c0896 c0897 glnH   FALSE 0.011 -73.000 0.000 NA   NA
 302709 302710 c0897 c0898   dps FALSE 0.003 286.000 0.000 NA   NA
 302710 302711 c0898 c0899 dps ybiF FALSE 0.010 301.000 0.044 NA   NA
 302713 302714 c0901 c0902 ybiP   FALSE 0.003 272.000 0.000 NA   NA
 302715 302716 c0903 c0904   ybiR TRUE 0.585 -3.000 0.014 1.000 N NA
 302719 302720 c0907 c0908 ybiV ybiW FALSE 0.096 146.000 0.000 1.000   NA
 302720 302721 c0908 c0909 ybiW   TRUE 0.968 6.000 0.316 0.003 N NA
 302723 302724 c0911 c0912 moeB moeA TRUE 0.991 0.000 0.323 0.003 Y NA
 302725 302726 c0913 c0914 ybiK yliA FALSE 0.446 -31.000 0.104 1.000   NA
 302726 302727 c0914 c0915 yliA   FALSE 0.173 -136.000 0.083 1.000   NA
 302727 302728 c0915 c0916   yliC TRUE 0.987 18.000 0.803 0.063 Y NA
 302728 302729 c0916 c0917 yliC yliD TRUE 0.994 3.000 0.689 0.063 Y NA
 302729 302730 c0917 c0918 yliD yliE FALSE 0.070 177.000 0.000 NA N NA
 302730 302731 c0918 c0919 yliE yliF TRUE 0.870 8.000 0.000 NA Y NA
 302733 302734 c0921 c0922 bssR yliI FALSE 0.088 111.000 0.047 NA   NA
 302737 302738 c0925 c0926 deoR ybjG TRUE 0.705 58.000 0.235 1.000   NA
 302740 302741 c0928 c0929 ybjH   FALSE 0.023 86.000 0.000 NA   NA
 302741 302742 c0929 c0930   ybjJ FALSE 0.503 -3.000 0.000 1.000   NA
 302744 302745 c0932 c0933 intT   FALSE 0.023 87.000 0.000 NA   NA
 302745 302746 c0933 c0934     FALSE 0.061 13.000 0.000 NA   NA
 302747 302748 c0935 c0936 coxT   TRUE 0.551 -21.000 0.154 NA   NA
 302748 302749 c0936 c0937     FALSE 0.033 -22.000 0.000 NA   NA
 302749 302750 c0937 c0938     TRUE 0.836 102.000 0.800 NA   NA
 302750 302751 c0938 c0939     TRUE 0.757 62.000 0.400 NA   NA
 302751 302752 c0939 c0940     TRUE 0.954 12.000 1.000 NA   NA
 302752 302753 c0940 c0941     TRUE 0.977 -3.000 1.000 1.000   NA
 302753 302754 c0941 c0942     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 302754 302755 c0942 c0943     FALSE 0.003 281.000 0.000 NA   NA
 302755 302756 c0943 c0944     FALSE 0.005 221.000 0.000 NA   NA
 302756 302757 c0944 c0945     FALSE 0.097 4.000 0.000 NA   NA
 302757 302758 c0945 c0946     FALSE 0.005 220.000 0.000 NA   NA
 302759 302760 c0947 c0948     TRUE 0.959 -3.000 0.667 NA   NA
 302760 302761 c0948 c0949     FALSE 0.077 10.000 0.000 NA   NA
 302764 302765 c0952 c0953     TRUE 0.885 103.000 1.000 1.000   NA
 302765 302766 c0953 c0954     TRUE 0.966 33.000 1.000 0.001   NA
 302766 302767 c0954 c0955     TRUE 0.975 0.000 1.000 NA   NA
 302767 302768 c0955 c0956     FALSE 0.097 4.000 0.000 NA   NA
 302768 302769 c0956 c0957     TRUE 0.838 -19.000 0.500 NA   NA
 302769 302770 c0957 c0958     TRUE 0.794 -40.000 0.667 NA   NA
 302770 302771 c0958 c0959     TRUE 0.972 -3.000 1.000 NA   NA
 302771 302772 c0959 c0960     TRUE 0.882 75.000 1.000 NA   NA
 302774 302775 c0962 c0963     TRUE 0.886 69.000 1.000 NA   NA
 302775 302776 c0963 c0964     TRUE 0.942 -3.000 0.500 NA   NA
 302776 302777 c0964 c0965     FALSE 0.046 -13.000 0.000 NA   NA
 302777 302778 c0965 c0966     TRUE 0.952 -7.000 1.000 NA   NA
 302780 302781 c0968 c0969   yfdK FALSE 0.104 3.000 0.000 NA   NA
 302783 302784 c0971 c0972     FALSE 0.077 10.000 0.000 NA   NA
 302788 302789 c0976 c0977     TRUE 0.912 -3.000 0.333 NA   NA
 302789 302790 c0977 c0978     TRUE 0.972 -3.000 1.000 NA   NA
 302790 302791 c0978 c0979   ogrK FALSE 0.028 58.000 0.000 NA   NA
 302795 302796 c0983 c0984 ybjC mdaA TRUE 0.607 -16.000 0.159 NA   NA
 302796 302797 c0984 c0985 mdaA rimK FALSE 0.354 61.000 0.000 1.000 N NA
 302797 302798 c0985 c0986 rimK ybjN FALSE 0.256 40.000 0.065 NA   NA
 302798 302799 c0986 c0987 ybjN potF FALSE 0.005 205.000 0.000 NA   NA
 302799 302800 c0987 c0988 potF potG TRUE 0.952 95.000 0.679 1.000 Y NA
 302800 302801 c0988 c0989 potG potH TRUE 0.989 10.000 0.857 1.000 Y NA
 302801 302802 c0989 c0990 potH potI TRUE 0.948 -45.000 0.528 0.063 Y NA
 302802 302803 c0990 c0991 potI ybjO TRUE 0.660 60.000 0.264 NA   NA
 302803 302804 c0991 c0992 ybjO ybjF TRUE 0.660 41.000 0.226 NA   NA
 302805 302806 c0993 c0994 artJ artM TRUE 0.730 175.000 0.143 0.078 Y NA
 302806 302807 c0994 c0995 artM artQ TRUE 0.995 0.000 0.714 0.016 Y NA
 302807 302808 c0995 c0996 artQ artI TRUE 0.982 7.000 0.260 0.063 Y NA
 302808 302809 c0996 c0997 artI artP TRUE 0.954 18.000 0.323 1.000 Y NA
 302809 302810 c0997 c0998 artP ybjP FALSE 0.111 218.000 0.081 1.000   NA
 302811 302812 c0999 c1000 ybjQ ybjR FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 302813 302814 c1001 c1002   ybjT TRUE 0.868 36.000 0.022 0.003 Y NA
 302814 302815 c1002 c1003 ybjT ybjU FALSE 0.325 -64.000 0.074 1.000 N NA
 302815 302816 c1003 c1004 ybjU poxB TRUE 0.785 37.000 0.041 1.000 Y NA
 302816 302817 c1004 c1005 poxB   FALSE 0.186 133.000 0.025 1.000 N NA
 302817 302818 c1005 c1006   ybjW TRUE 0.947 6.000 0.000 0.017 Y NA
 302818 302819 c1006 c1007 ybjW ybjE FALSE 0.098 144.000 0.000 1.000   NA
 302821 302822 c1009 c1010 aqpZ   FALSE 0.005 207.000 0.000 NA   NA
 302825 302826 c1013 c1014   macA FALSE 0.010 -88.000 0.000 NA   NA
 302826 2179511 c1014 c1015 macA macB FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 2179511 302827 c1015 c1016 macB   FALSE 0.007 -406.000 0.000 NA   NA
 302829 302830 c1018 c1019 yljA clpA TRUE 0.866 31.000 0.596 NA   NA
 400389 302832 c5532 c1021 serW infA FALSE 0.003 254.000 0.000 NA   NA
 302832 302833 c1021 c1022 infA aat FALSE 0.035 285.000 0.020 1.000 N NA
 302833 302834 c1022 c1023 aat cydC TRUE 0.792 42.000 0.049 1.000 Y NA
 302834 302835 c1023 c1024 cydC cydD TRUE 0.995 1.000 0.631 0.007 Y NA
 302835 302836 c1024 c1025 cydD trxB TRUE 0.648 123.000 0.049 1.000 Y NA
 302837 302838 c1026 c1027 lrp ftsK TRUE 0.698 135.000 0.345 1.000 N NA
 302838 302839 c1027 c1028 ftsK lolA TRUE 0.593 156.000 0.305 1.000 N NA
 302839 302840 c1028 c1029 lolA ycaJ TRUE 0.858 11.000 0.167 1.000 N NA
 302840 302841 c1029 c1030 ycaJ serS TRUE 0.625 91.000 0.078 0.089 N NA
 302841 302842 c1030 c1031 serS dmsA FALSE 0.067 239.000 0.000 1.000 N NA
 302842 302843 c1031 c1032 dmsA dmsB TRUE 0.969 11.000 0.172 0.054 Y NA
 302843 302844 c1032 c1033 dmsB dmsC TRUE 0.935 2.000 0.333 1.000   NA
 302845 302846 c1034 c1035 ycaC   FALSE 0.029 56.000 0.000 NA   NA
 302847 302848 c1036 c1037   ycaD FALSE 0.040 -54.000 0.040 NA   NA
 302849 2179512 c1038 c1039 pflA   FALSE 0.006 192.000 0.000 NA   NA
 2179513 302851 c1041 c1042   focA_2 FALSE 0.029 55.000 0.000 NA   NA
 302851 302852 c1042 c1043 focA_2 ycaO FALSE 0.026 67.000 0.000 NA   NA
 302853 302854 c1044 c1045 ycaP serC FALSE 0.003 199.000 0.014 NA   NA
 302854 302855 c1045 c1046 serC aroA TRUE 0.711 71.000 0.033 1.000 Y NA
 302855 302856 c1046 c1047 aroA ycaL FALSE 0.076 161.000 0.003 1.000 N NA
 302856 302857 c1047 c1048 ycaL cmk FALSE 0.067 173.000 0.004 1.000 N NA
 302857 302858 c1048 c1049 cmk rpsA TRUE 0.712 111.000 0.281 1.000 N NA
 302858 302859 c1049 c1050 rpsA himD TRUE 0.568 160.000 0.292 1.000 N NA
 302861 302863 c1052 c1054 ycaI msbA TRUE 0.637 37.000 0.075 0.090   NA
 302863 2179514 c1054 c1055 msbA   FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 2179514 2179515 c1055 c1056   ycaH FALSE 0.041 23.000 0.000 NA   NA
 2179515 302864 c1056 c1057 ycaH ycaQ FALSE 0.034 37.000 0.000 NA   NA
 302864 302865 c1057 c1058 ycaQ ycaR FALSE 0.018 52.000 0.016 NA   NA
 302865 302866 c1058 c1059 ycaR kdsB TRUE 0.889 -3.000 0.265 NA   NA
 302866 302867 c1059 c1060 kdsB ycbJ FALSE 0.006 154.000 0.023 NA   NA
 302868 302869 c1061 c1062 ycbC   FALSE 0.015 -97.000 0.036 NA   NA
 302870 302871 c1063 c1064 smtA mukF TRUE 0.931 -3.000 0.325 NA N NA
 302871 302872 c1064 c1065 mukF mukE TRUE 0.555 -46.000 0.036 NA Y NA
 302872 302873 c1065 c1066 mukE mukB TRUE 0.968 0.000 0.000 0.001 Y NA
 302873 302874 c1066 c1067 mukB ycbB FALSE 0.027 261.000 0.000 1.000   NA
 302874 302875 c1067 c1068 ycbB ycbK FALSE 0.460 172.000 0.372 NA   NA
 302875 302876 c1068 c1069 ycbK ycbL FALSE 0.407 27.000 0.089 NA   NA
 302877 302878 c1070 c1071 aspC ompF FALSE 0.125 185.000 0.036 1.000 N NA
 302878 302879 c1071 c1072 ompF asnS FALSE 0.018 603.000 0.000 1.000 N NA
 302879 302880 c1072 c1073 asnS pncB FALSE 0.144 169.000 0.034 1.000 N NA
 302881 302882 c1074 c1075   pepN FALSE 0.001 1265.000 0.000 NA   NA
 302883 302884 c1076 c1077 ycbE ycbM TRUE 0.986 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 302884 302885 c1077 c1078 ycbM ycbN TRUE 0.906 9.000 0.226 1.000 N NA
 302885 302886 c1078 c1079 ycbN ycbO TRUE 0.950 -3.000 0.341 1.000 N NA
 302886 302887 c1079 c1080 ycbO ycbP TRUE 0.794 -7.000 0.169 1.000   NA
 302888 302889 c1081 c1082 pyrD ycbW FALSE 0.170 138.000 0.081 NA   NA
 302890 2179516 c1083 c5504 ycbX dicF FALSE 0.007 -498.000 0.000 NA   NA
 302891 302892 c1084 c1085 ycbY uup TRUE 0.571 12.000 0.061 1.000   NA
 302892 302893 c1085 c1086 uup pqiA FALSE 0.095 130.000 0.054 NA   NA
 302893 302894 c1086 c1087 pqiA pqiB TRUE 0.780 -55.000 0.819 NA   NA
 302894 302895 c1087 c1088 pqiB ymbA TRUE 0.946 -3.000 0.531 NA   NA
 302896 302897 c1089 c1090   fabA FALSE 0.006 196.000 0.000 NA   NA
 302897 302898 c1090 c1091 fabA   TRUE 0.781 69.000 0.290 1.000 N NA
 302904 302905 c1097 c1098 yccS yccF TRUE 0.597 10.000 0.090 NA   NA
 302907 302908 c1100 c1101 mgsA yccT FALSE 0.137 96.000 0.055 NA   NA
 302909 302910 c1102 c1103     FALSE 0.024 -31.000 0.000 NA   NA
 302911 302912 c1104 c1105 yccV yccW TRUE 0.644 7.000 0.094 NA   NA
 302914 302917 c1107 c1110 yccK yccA FALSE 0.503 92.000 0.140 1.000   NA
 302917 400388 c1110 c5533 yccA serT FALSE 0.005 207.000 0.000 NA   NA
 400388 302919 c5533 c1112 serT   FALSE 0.003 268.000 0.000 NA   NA
 302920 302921 c1113 c1114 hyaA hyaB TRUE 0.964 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 302921 302922 c1114 c1115 hyaB hyaC TRUE 0.973 19.000 0.355 0.054 Y NA
 302922 302923 c1115 c1116 hyaC hyaD TRUE 0.968 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 302923 302924 c1116 c1117 hyaD hyaE TRUE 0.693 -3.000 0.096 NA   NA
 302924 302925 c1117 c1118 hyaE hyaF TRUE 0.964 -3.000 0.769 NA   NA
 302925 302926 c1118 c1119 hyaF appC FALSE 0.210 134.000 0.061 1.000   NA
 302926 302927 c1119 c1120 appC appB TRUE 0.965 12.000 0.158 0.054 Y NA
 302927 302928 c1120 c1121 appB appA FALSE 0.083 155.000 0.000 1.000   NA
 302930 302931 c1123 c1124 cspG sfa FALSE 0.013 141.000 0.000 NA   NA
 302931 302932 c1124 c1125 sfa   FALSE 0.052 -10.000 0.000 NA   NA
 302933 302934 c1126 c1127   yccM FALSE 0.035 34.000 0.000 NA   NA
 302934 302935 c1127 c1128 yccM torS FALSE 0.321 83.000 0.000 1.000 N NA
 302939 302940 c1132 c1133 torC torA TRUE 0.958 0.000 0.000 0.054 Y NA
 302940 302941 c1133 c1134 torA torD TRUE 0.868 -3.000 0.077 0.054   NA
 302942 302943 c1135 c1136 yccD cbpA TRUE 0.952 0.000 0.512 NA   NA
 302944 302945 c1137 c1138 agp   TRUE 0.620 31.000 0.182 NA   NA
 302946 302947 c1139 c1140 yccJ wrbA TRUE 0.772 21.000 0.290 NA   NA
 302948 302949 c1141 c1142     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 302950 302951 c1143 c1144 ycdG   FALSE 0.132 -45.000 0.000 1.000   NA
 302951 302952 c1144 c1145     FALSE 0.359 -49.000 0.000 0.033   NA
 302952 302953 c1145 c1146   ycdJ TRUE 0.846 10.000 0.256 NA   NA
 302953 302954 c1146 c1147 ycdJ ycdK TRUE 0.903 8.000 0.365 NA   NA
 302954 302955 c1147 c1148 ycdK ycdL TRUE 0.921 12.000 0.442 NA N NA
 302955 302956 c1148 c1149 ycdL   TRUE 0.814 -42.000 0.621 NA N NA
 302961 302962 c1154 c1155 putP   FALSE 0.025 284.000 0.000 NA N NA
 302962 302963 c1155 c1156   ycdO TRUE 0.916 58.000 0.356 NA Y NA
 302963 302964 c1156 c1157 ycdO ycdB TRUE 0.975 6.000 0.378 NA Y NA
 302967 302968 c1160 c1161 ycdP ycdQ TRUE 0.941 2.000 0.462 NA   NA
 302968 302969 c1161 c1162 ycdQ ycdR TRUE 0.934 -7.000 0.435 1.000 N NA
 302969 302970 c1162 c1163 ycdR ycdS TRUE 0.961 9.000 0.696 1.000   NA
 302971 302972 c1164 c1165 ycdT   FALSE 0.051 279.000 0.000 1.000 N NA
 302974 302975 c1167 c1168     FALSE 0.534 48.000 0.000 0.016   NA
 302975 302976 c1168 c1169   alpA FALSE 0.027 272.000 0.000 NA N NA
 302976 302977 c1169 c1170 alpA   FALSE 0.001 625.000 0.000 NA   NA
 302977 302978 c1170 c1171     FALSE 0.001 964.000 0.000 NA   NA
 302981 302982 c1174 c1175     FALSE 0.081 -85.000 0.000 1.000   NA
 302982 302983 c1175 c1176     FALSE 0.011 422.000 0.000 1.000   NA
 2179517 2179518 c1177 c1178     FALSE 0.033 38.000 0.000 NA   NA
 2179519 2179520 c1179 c1180     FALSE 0.045 19.000 0.000 NA   NA
 2179520 2179521 c1180 c1181     FALSE 0.009 -105.000 0.000 NA   NA
 2179521 2179522 c1181 c1182     FALSE 0.040 25.000 0.000 NA   NA
 302984 302985 c1183 c1184     FALSE 0.033 39.000 0.000 NA   NA
 302986 302987 c1185 c1186     FALSE 0.001 547.000 0.000 NA   NA
 302987 302988 c1186 c1187     TRUE 0.986 -3.000 0.486 1.000 Y NA
 302988 302989 c1187 c1188     TRUE 0.982 0.000 0.397 NA Y NA
 302989 302990 c1188 c1189     TRUE 0.984 -3.000 0.514 NA Y NA
 302990 302991 c1189 c1190     TRUE 0.888 -7.000 0.422 NA   NA
 302991 302992 c1190 c1191     TRUE 0.902 -3.000 0.305 NA   NA
 302992 302993 c1191 c1192     FALSE 0.443 -31.000 0.146 NA   NA
 302993 302994 c1192 c1193     TRUE 0.805 -3.000 0.110 1.000   NA
 302994 302995 c1193 c1194     TRUE 0.806 4.000 0.167 NA   NA
 302995 302996 c1194 c1195     FALSE 0.026 -28.000 0.000 NA   NA
 302996 302997 c1195 c1196     FALSE 0.016 -49.000 0.000 NA   NA
 302997 302998 c1196 c1197     TRUE 0.888 -37.000 0.368 NA Y NA
 302998 302999 c1197 c1198     TRUE 0.964 -3.000 0.758 NA   NA
 302999 303000 c1198 c1199     TRUE 0.935 2.000 0.422 NA   NA
 303000 303001 c1199 c1200     TRUE 0.962 12.000 0.117 0.006 Y NA
 303001 303002 c1200 c1201     TRUE 0.883 -25.000 0.170 1.000 Y NA
 303002 303003 c1201 c1202     TRUE 0.870 -21.000 0.636 NA   NA
 303003 303004 c1202 c1203     FALSE 0.487 17.000 0.093 NA   NA
 303004 303005 c1203 c1204     TRUE 0.605 65.000 0.222 NA   NA
 303006 303007 c1205 c1206     FALSE 0.019 -40.000 0.000 NA   NA
 303007 303008 c1206 c1207     FALSE 0.019 -40.000 0.000 NA   NA
 303008 303009 c1207 c1208     FALSE 0.001 521.000 0.000 NA   NA
 303009 303010 c1208 c1209     FALSE 0.001 500.000 0.000 NA   NA
 303011 2179523 c1210 c1211     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 2179523 2179524 c1211 c1212     FALSE 0.052 -10.000 0.000 NA   NA
 303015 303016 c1216 c1217     FALSE 0.043 21.000 0.000 NA   NA
 303016 303017 c1217 c1218     FALSE 0.024 82.000 0.000 NA   NA
 303017 303018 c1218 c1219     FALSE 0.026 -28.000 0.000 NA   NA
 303019 303020 c1220 c1221     FALSE 0.008 -112.000 0.000 NA   NA
 303020 303021 c1221 c1222     FALSE 0.002 350.000 0.000 NA   NA
 2179525 303022 c1223 c1224     FALSE 0.030 -25.000 0.000 NA   NA
 303022 303023 c1224 c1225     TRUE 0.556 -16.000 0.000 0.070   NA
 303023 2179526 c1225 c1226     FALSE 0.001 738.000 0.000 NA   NA
 303024 2179527 c1227 c1228 mchB   FALSE 0.014 -55.000 0.000 NA   NA
 2179527 303025 c1228 c1229   mchC FALSE 0.005 205.000 0.000 NA   NA
 303025 303026 c1229 c1230 mchC mchD TRUE 0.862 26.000 0.429 1.000   NA
 303026 303027 c1230 c1231 mchD mchE FALSE 0.171 153.000 0.000 1.000 N NA
 303027 303028 c1231 c1232 mchE mchF TRUE 0.745 -25.000 0.000 1.000 Y NA
 303029 303030 c1233 c1234     FALSE 0.021 100.000 0.000 NA   NA
 303031 303032 c1235 c1236     FALSE 0.004 233.000 0.000 NA   NA
 303034 303035 c1238 c1239 sfaB focA FALSE 0.013 372.000 0.000 1.000   NA
 303035 303036 c1239 c1240 focA sfaD TRUE 0.816 86.000 0.000 0.012 Y NA
 303036 303037 c1240 c1241 sfaD focC TRUE 0.764 41.000 0.000 1.000 Y NA
 303037 303038 c1241 c1242 focC focD TRUE 0.808 22.000 0.000 1.000 Y NA
 303038 303039 c1242 c1243 focD focF TRUE 0.862 13.000 0.000 1.000 Y NA
 303039 303040 c1243 c1244 focF focG TRUE 0.621 22.000 0.000 0.012   NA
 303040 303041 c1244 c1245 focG focH FALSE 0.376 -49.000 0.000 0.012   NA
 303041 303042 c1245 c1246 focH   FALSE 0.022 304.000 0.000 NA N NA
 303042 303043 c1246 c1247   focX FALSE 0.103 147.000 0.000 NA N NA
 303045 303046 c1249 c1250   iroN FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 303047 303048 c1251 c1252 iroE iroD FALSE 0.024 85.000 0.000 NA   NA
 303048 303049 c1252 c1253 iroD iroC FALSE 0.167 104.000 0.000 NA N NA
 303049 303050 c1253 c1254 iroC iroB FALSE 0.353 62.000 0.000 1.000 N NA
 303051 303052 c1255 c1256     FALSE 0.015 127.000 0.000 NA   NA
 303054 303055 c1258 c1259     FALSE 0.007 -178.000 0.000 NA   NA
 303055 400322 c1259 c5534   tRNA-Arg FALSE 0.005 208.000 0.000 NA   NA
 303056 303057 c1260 c1261     TRUE 0.716 12.000 0.000 0.017   NA
 303057 303058 c1261 c1262     FALSE 0.076 162.000 0.000 1.000   NA
 303058 303059 c1262 c1263     TRUE 0.950 -3.000 0.000 0.069 Y NA
 303059 303060 c1263 c1264     FALSE 0.258 26.000 0.000 1.000   NA
 303061 303062 c1265 c1266     TRUE 0.773 19.000 0.000 NA Y NA
 303062 303063 c1266 c1267     FALSE 0.006 201.000 0.000 NA   NA
 303065 303066 c1269 c1270     FALSE 0.034 36.000 0.000 NA   NA
 303068 303069 c1272 c1273     FALSE 0.065 175.000 0.000 1.000   NA
 303069 303070 c1273 c1274     FALSE 0.018 115.000 0.000 NA   NA
 303070 303071 c1274 c1275     FALSE 0.025 76.000 0.000 NA   NA
 303071 303072 c1275 c1276     FALSE 0.047 18.000 0.000 NA   NA
 303078 303079 c1282 c1284     FALSE 0.001 2479.000 0.000 NA   NA
 303079 303080 c1284 c1285     FALSE 0.045 19.000 0.000 NA   NA
 303080 303081 c1285 c1286     FALSE 0.030 50.000 0.000 NA   NA
 303081 303082 c1286 c1287     FALSE 0.051 16.000 0.000 NA   NA
 303082 303083 c1287 c1288     FALSE 0.031 47.000 0.000 NA   NA
 303083 303084 c1288 c1289     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 303084 303085 c1289 c1290     FALSE 0.044 20.000 0.000 NA   NA
 303085 303086 c1290 c1291     FALSE 0.011 153.000 0.000 NA   NA
 303086 303087 c1291 c1292     FALSE 0.014 134.000 0.000 NA   NA
 303088 400387 c1293 c5535   serX FALSE 0.002 310.000 0.000 NA   NA
 400387 303089 c5535 c1294 serX   FALSE 0.021 100.000 0.000 NA   NA
 303090 303091 c1295 c1296 ycdW ycdX TRUE 0.880 55.000 0.169 1.000 Y NA
 303091 303092 c1296 c1297 ycdX ycdY TRUE 0.863 24.000 0.417 1.000   NA
 303092 303093 c1297 c1298 ycdY ycdZ FALSE 0.495 54.000 0.145 NA   NA
 303094 303095 c1299 c1300 csgG csgF FALSE 0.126 27.000 0.043 NA   NA
 303095 303096 c1300 c1301 csgF csgE TRUE 0.901 25.000 0.723 NA   NA
 303096 303097 c1301 c1302 csgE csgD TRUE 0.812 5.000 0.176 NA   NA
 303100 303101 c1305 c1306 csgB csgA TRUE 0.837 41.000 0.222 0.012   NA
 303101 303102 c1306 c1307 csgA csgC TRUE 0.854 59.000 0.667 NA   NA
 303102 303103 c1307 c1308 csgC ymdA TRUE 0.668 121.000 0.429 NA   NA
 303103 303104 c1308 c1309 ymdA ymdB FALSE 0.013 95.000 0.028 NA   NA
 303104 303105 c1309 c1310 ymdB ymdC FALSE 0.061 -58.000 0.046 NA   NA
 303106 303107 c1311 c1312 ymdD   FALSE 0.032 45.000 0.000 NA   NA
 303108 303109 c1313 c1314 mdoG mdoH TRUE 0.821 -37.000 0.469 1.000 N NA
 303109 303110 c1314 c1315 mdoH   FALSE 0.083 9.000 0.000 NA   NA
 303110 303111 c1315 c1316   yceK FALSE 0.013 -61.000 0.000 NA   NA
 303112 303113 c1317 c1318   msyB FALSE 0.007 -355.000 0.000 NA   NA
 303113 303114 c1318 c1319 msyB yceE TRUE 0.689 80.000 0.333 NA   NA
 303114 303115 c1319 c1320 yceE htrB TRUE 0.845 172.000 0.857 0.087 N NA
 303117 303118 c1322 c1323 yceI   TRUE 0.966 4.000 0.676 1.000   NA
 303120 303121 c1325 c1326 yceO solA TRUE 0.758 21.000 0.269 NA   NA
 303121 303122 c1326 c1327 solA bssS TRUE 0.678 115.000 0.423 NA   NA
 303122 303123 c1327 c1328 bssS dinI FALSE 0.003 290.000 0.000 NA   NA
 303123 303124 c1328 c1329 dinI pyrC FALSE 0.015 74.000 0.031 NA   NA
 303124 303125 c1329 c1330 pyrC yceB FALSE 0.012 106.000 0.022 NA   NA
 303125 303126 c1330 c1331 yceB grxB FALSE 0.259 77.000 0.078 NA   NA
 303126 303127 c1331 c1332 grxB yceL TRUE 0.581 64.000 0.103 1.000 N NA
 303128 303129 c1333 c1334 rimJ yceH TRUE 0.650 11.000 0.116 NA   NA
 303129 2179528 c1334 c1335 yceH   FALSE 0.024 -31.000 0.000 NA   NA
 2179528 2179529 c1335 c1336     FALSE 0.017 118.000 0.000 NA   NA
 303132 303133 c1339 c1340 flgN flgM TRUE 0.990 5.000 0.361 0.002 Y NA
 303133 303134 c1340 c1341 flgM flgA TRUE 0.896 76.000 0.330 NA Y NA
 303135 303136 c1342 c1343 flgB flgC TRUE 0.995 4.000 0.824 0.003 Y NA
 303136 303137 c1343 c1344 flgC flgD TRUE 0.937 12.000 0.186 NA Y NA
 303137 303138 c1344 c1345 flgD flgE TRUE 0.856 25.000 0.116 NA Y NA
 303138 303139 c1345 c1346 flgE flgF TRUE 0.982 20.000 0.476 0.003 Y NA
 303139 303140 c1346 c1347 flgF flgG TRUE 0.904 172.000 0.420 0.001 Y NA
 303140 303141 c1347 c1348 flgG flgH TRUE 0.959 38.000 0.268 0.005 Y NA
 303141 303142 c1348 c1349 flgH flgI TRUE 0.962 9.000 0.073 0.006 Y NA
 303142 303143 c1349 c1350 flgI flgJ TRUE 0.965 0.000 0.036 0.006 Y NA
 303143 303144 c1350 c1351 flgJ flgK TRUE 0.980 66.000 0.705 0.002 Y NA
 303144 303145 c1351 c1352 flgK flgL TRUE 0.970 12.000 0.142 0.001 Y NA
 303147 303148 c1354 c1355   rluC FALSE 0.010 118.000 0.005 NA   NA
 303149 303150 c1356 c1357 maf   FALSE 0.066 12.000 0.000 NA   NA
 303151 303152 c1358 c1359 yceD plsX FALSE 0.010 306.000 0.044 NA   NA
 303152 303153 c1359 c1360 plsX fabH TRUE 0.962 68.000 0.380 0.004 Y NA
 303153 303154 c1360 c1361 fabH fabD TRUE 0.965 16.000 0.182 0.004 Y NA
 303156 303157 c1364 c1365 acpP fabF TRUE 0.915 87.000 0.346 1.000 Y NA
 303157 303158 c1365 c1366 fabF pabC TRUE 0.600 120.000 0.187 1.000 N NA
 303158 303161 c1366 c1369 pabC yceG FALSE 0.151 243.000 0.204 NA   NA
 303161 303162 c1369 c1370 yceG tmk TRUE 0.738 -10.000 0.209 NA   NA
 303162 303163 c1370 c1371 tmk holB TRUE 0.919 -3.000 0.211 1.000 N NA
 303163 303164 c1371 c1372 holB ycfH TRUE 0.914 11.000 0.110 NA Y NA
 303164 303165 c1372 c1373 ycfH ptsG FALSE 0.003 295.000 0.004 NA N NA
 303166 303167 c1374 c1375 fhuE   FALSE 0.035 33.000 0.000 NA   NA
 303168 303169 c1376 c1377 ycfF ycfL FALSE 0.426 3.000 0.051 NA   NA
 303169 303170 c1377 c1378 ycfL ycfM TRUE 0.918 11.000 0.516 NA   NA
 303170 303171 c1378 c1379 ycfM ycfN TRUE 0.749 -19.000 0.310 NA   NA
 303171 303172 c1379 c1380 ycfN nagZ TRUE 0.732 11.000 0.069 1.000 N NA
 303172 303173 c1380 c1381 nagZ ycfP FALSE 0.434 23.000 0.091 NA   NA
 303173 303174 c1381 c1382 ycfP ndh FALSE 0.013 372.000 0.057 NA   NA
 303174 303175 c1382 c1383 ndh ycfJ FALSE 0.134 188.000 0.071 1.000   NA
 303175 303176 c1383 c1384 ycfJ   FALSE 0.092 148.000 0.000 1.000   NA
 303179 2179530 c1387 c1388 ycfS   FALSE 0.026 -28.000 0.000 NA   NA
 2179530 303180 c1388 c1389   mfd FALSE 0.026 -28.000 0.000 NA   NA
 303180 303181 c1389 c1390 mfd ycfT FALSE 0.016 65.000 0.003 1.000   NA
 303182 303183 c1391 c1392 lolC lolD TRUE 0.905 -7.000 0.175 0.075 N NA
 303183 303184 c1392 c1393 lolD lolE TRUE 0.934 0.000 0.125 0.075 N NA
 303184 303185 c1393 c1394 lolE ycfX TRUE 0.802 29.000 0.225 1.000 N NA
 303185 303186 c1394 c1395 ycfX cobB TRUE 0.910 16.000 0.119 1.000 Y NA
 303187 303188 c1396 c1397 ycfZ ymfA FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 303188 303189 c1397 c1398 ymfA potD FALSE 0.051 16.000 0.000 NA   NA
 303189 303190 c1398 c1399 potD potC TRUE 0.951 -3.000 0.000 0.060 Y NA
 303190 303191 c1399 c1400 potC   FALSE 0.071 167.000 0.000 1.000   NA
 303191 303192 c1400 c1401   xisN TRUE 0.888 -31.000 0.500 0.012   NA
 303192 303193 c1401 c1402 xisN recE FALSE 0.208 53.000 0.000 1.000   NA
 303195 303196 c1404 c1405 ydfD dicB FALSE 0.049 -12.000 0.000 NA   NA
 303198 303199 c1407 c1408 ydfC ydfB FALSE 0.036 30.000 0.000 NA   NA
 303199 303200 c1408 c1409 ydfB ydfA FALSE 0.019 -40.000 0.000 NA   NA
 303200 303201 c1409 c1410 ydfA   FALSE 0.007 185.000 0.000 NA   NA
 303202 303203 c1411 c1412     FALSE 0.013 141.000 0.000 NA   NA
 303203 303204 c1412 c1413     FALSE 0.033 41.000 0.000 NA   NA
 303204 303205 c1413 c1414     FALSE 0.114 1.000 0.000 NA   NA
 303207 303208 c1416 c1417     FALSE 0.063 -7.000 0.000 NA   NA
 303208 303209 c1417 c1418     FALSE 0.001 445.000 0.000 NA   NA
 303209 303210 c1418 c1419     FALSE 0.001 453.000 0.000 NA   NA
 303214 303216 c1423 c1425     FALSE 0.007 184.000 0.000 NA   NA
 303216 303217 c1425 c1426     FALSE 0.332 15.000 0.000 1.000   NA
 303217 303218 c1426 c1427     FALSE 0.148 200.000 0.000 0.068   NA
 303218 400323 c1427 c5536   tRNA-Met FALSE 0.012 146.000 0.000 NA   NA
 400323 400324 c5536 c5537 tRNA-Met tRNA-Arg FALSE 0.085 8.000 0.000 NA   NA
 400324 400325 c5537 c5538 tRNA-Arg tRNA-Arg FALSE 0.057 14.000 0.000 NA   NA
 400325 303219 c5538 c1428 tRNA-Arg   FALSE 0.001 500.000 0.000 NA   NA
 303220 303221 c1429 c1430 ycgW   FALSE 0.015 126.000 0.000 NA   NA
 303222 303223 c1431 c1432     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 303223 303224 c1432 c1433     FALSE 0.032 45.000 0.000 NA   NA
 303224 303225 c1433 c1434   ydfR FALSE 0.092 5.000 0.000 NA   NA
 303227 303228 c1436 c1437     FALSE 0.253 -18.000 0.000 1.000   NA
 303228 303229 c1437 c1438     FALSE 0.049 -12.000 0.000 NA   NA
 303229 303230 c1438 c1439     FALSE 0.009 167.000 0.000 NA   NA
 303234 303235 c1443 c1444     FALSE 0.016 122.000 0.000 NA   NA
 303235 303236 c1444 c1445     FALSE 0.026 -28.000 0.000 NA   NA
 303236 303237 c1445 c1446     FALSE 0.041 -16.000 0.000 NA   NA
 303237 303238 c1446 c1447     FALSE 0.503 -3.000 0.000 1.000   NA
 303238 303239 c1447 c1448     TRUE 0.731 -10.000 0.150 1.000   NA
 303241 303242 c1450 c1451     FALSE 0.028 58.000 0.000 NA   NA
 303242 303243 c1451 c1452     FALSE 0.097 4.000 0.000 NA   NA
 303243 303244 c1452 c1453     FALSE 0.063 -7.000 0.000 NA   NA
 303244 303245 c1453 c1454     FALSE 0.051 16.000 0.000 NA   NA
 303245 303246 c1454 c1455     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 303246 303247 c1455 c1456     FALSE 0.085 8.000 0.000 NA   NA
 303249 303250 c1458 c1459     TRUE 0.889 27.000 0.667 NA   NA
 303250 303251 c1459 c1460     FALSE 0.035 -19.000 0.000 NA   NA
 303251 303252 c1460 c1461     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 303252 303253 c1461 c1462     FALSE 0.119 0.000 0.000 NA   NA
 303255 303256 c1464 c1465     TRUE 0.861 -36.000 1.000 NA   NA
 303256 303257 c1465 c1466     FALSE 0.002 344.000 0.000 NA   NA
 303257 303258 c1466 c1467   lomP FALSE 0.026 68.000 0.000 NA   NA
 303258 303259 c1467 c1468 lomP   FALSE 0.086 152.000 0.000 1.000   NA
 303261 303262 c1470 c1471     FALSE 0.077 10.000 0.000 NA   NA
 303267 303268 c1476 c1477 potB potA TRUE 0.977 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 303268 303269 c1477 c1478 potA   FALSE 0.034 -21.000 0.000 NA   NA
 303271 303272 c1480 c1481 ycfD   FALSE 0.026 71.000 0.000 NA   NA
 303276 303277 c1485 c1486     FALSE 0.040 25.000 0.000 NA   NA
 303278 303279 c1487 c1488     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 303281 303282 c1490 c1491     FALSE 0.030 -25.000 0.000 NA   NA
 303282 303283 c1491 c1492     FALSE 0.110 2.000 0.000 NA   NA
 303283 303284 c1492 c1493     FALSE 0.090 6.000 0.000 NA   NA
 303286 303287 c1495 c1496     FALSE 0.003 289.000 0.000 NA   NA
 303287 303288 c1496 c1497     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 303288 303289 c1497 c1498     FALSE 0.001 514.000 0.000 NA   NA
 303289 303290 c1498 c1499     FALSE 0.119 0.000 0.000 NA   NA
 303290 303291 c1499 c1500     FALSE 0.066 12.000 0.000 NA   NA
 303291 303292 c1500 c1501     FALSE 0.061 13.000 0.000 NA   NA
 303294 303295 c1503 c1504     FALSE 0.036 30.000 0.000 NA   NA
 303295 303296 c1504 c1505     FALSE 0.023 89.000 0.000 NA   NA
 303299 303300 c1508 c1509 phoQ phoP TRUE 0.994 0.000 0.940 1.000 Y NA
 303300 303301 c1509 c1510 phoP purB FALSE 0.087 170.000 0.011 1.000 N NA
 303301 303302 c1510 c1511 purB ycfC TRUE 0.666 4.000 0.093 NA   NA
 303302 303303 c1511 c1512 ycfC trmU TRUE 0.620 30.000 0.180 NA   NA
 303303 303304 c1512 c1513 trmU   TRUE 0.691 54.000 0.158 1.000 N NA
 303304 303305 c1513 c1514     FALSE 0.299 188.000 0.182 1.000   NA
 303308 303309 c1517 c1518 icdA   FALSE 0.032 45.000 0.000 NA   NA
 303311 303312 c1520 c1521     TRUE 0.950 -3.000 0.000 0.067 Y NA
 303313 303314 c1522 c1523     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 303314 303315 c1523 c1524     FALSE 0.010 -91.000 0.000 NA   NA
 303315 303316 c1524 c1525     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 303316 303317 c1525 c1526     FALSE 0.019 -40.000 0.000 NA   NA
 303317 303318 c1526 c1527     FALSE 0.057 -9.000 0.000 NA   NA
 303318 303319 c1527 c1528     FALSE 0.035 -19.000 0.000 NA   NA
 303319 303320 c1528 c1529     FALSE 0.029 53.000 0.000 NA   NA
 303320 303321 c1529 c1530     FALSE 0.503 -3.000 0.000 1.000   NA
 303321 303322 c1530 c1531     FALSE 0.023 89.000 0.000 NA   NA
 303322 303323 c1531 c1532     FALSE 0.002 317.000 0.000 NA   NA
 303323 303324 c1532 c1533     FALSE 0.008 175.000 0.000 NA   NA
 303324 303325 c1533 c1534     FALSE 0.057 -9.000 0.000 NA   NA
 303327 303328 c1536 c1537   gamW FALSE 0.218 6.000 0.040 NA   NA
 303328 303329 c1537 c1538 gamW   FALSE 0.024 -31.000 0.000 NA   NA
 303329 303330 c1538 c1539     FALSE 0.017 -45.000 0.000 NA   NA
 303330 303331 c1539 c1540     FALSE 0.024 -31.000 0.000 NA   NA
 303331 303332 c1540 c1541     FALSE 0.025 73.000 0.000 NA   NA
 303332 303333 c1541 c1542     FALSE 0.007 183.000 0.000 NA   NA
 303335 303336 c1544 c1545     TRUE 0.959 -3.000 0.667 NA   NA
 303336 303337 c1545 c1546     FALSE 0.033 40.000 0.000 NA   NA
 303338 303339 c1547 c1548     FALSE 0.099 142.000 0.000 1.000   NA
 303339 303340 c1548 c1549     FALSE 0.240 33.000 0.000 1.000   NA
 303340 303341 c1549 c1550     TRUE 0.932 -3.000 0.333 1.000   NA
 303341 303342 c1550 c1551     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 303342 303343 c1551 c1552     FALSE 0.022 92.000 0.000 NA   NA
 303343 303344 c1552 c1553     TRUE 0.950 -3.000 0.000 0.066 Y NA
 303344 303345 c1553 c1554     FALSE 0.024 82.000 0.000 NA   NA
 303345 303346 c1554 c1555     FALSE 0.022 -33.000 0.000 NA   NA
 303346 303347 c1555 c1556     FALSE 0.008 176.000 0.000 NA   NA
 303347 303348 c1556 c1557   rus FALSE 0.005 207.000 0.000 NA   NA
 303348 303349 c1557 c1558 rus   FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 303349 303350 c1558 c1559   ybcQ FALSE 0.026 71.000 0.000 NA   NA
 303352 303353 c1561 c1562   ybcS FALSE 0.119 0.000 0.000 NA   NA
 303353 303354 c1562 c1563 ybcS   FALSE 0.283 -15.000 0.000 1.000   NA
 303358 303359 c1567 c1568   nohA FALSE 0.001 563.000 0.000 NA   NA
 303359 303360 c1568 c1569 nohA   FALSE 0.015 -52.000 0.000 NA   NA
 303360 303361 c1569 c1570     FALSE 0.041 -16.000 0.000 NA   NA
 303361 303362 c1570 c1571     FALSE 0.503 -3.000 0.000 1.000   NA
 303362 303363 c1571 c1572     TRUE 0.731 -10.000 0.150 1.000   NA
 303365 303366 c1574 c1575     FALSE 0.028 58.000 0.000 NA   NA
 303366 303367 c1575 c1576     FALSE 0.097 4.000 0.000 NA   NA
 303367 303368 c1576 c1577     FALSE 0.026 -28.000 0.000 NA   NA
 303368 303369 c1577 c1578     FALSE 0.066 12.000 0.000 NA   NA
 303369 303370 c1578 c1579     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 303370 303371 c1579 c1580     FALSE 0.033 -22.000 0.000 NA   NA
 2179531 303373 c1582 c1583     FALSE 0.051 16.000 0.000 NA   NA
 303373 303374 c1583 c1584     TRUE 0.888 -18.000 0.667 NA   NA
 303374 303375 c1584 c1585     FALSE 0.063 -7.000 0.000 NA   NA
 303377 303378 c1587 c1588     FALSE 0.090 6.000 0.000 NA   NA
 303378 303379 c1588 c1589     FALSE 0.013 -63.000 0.000 NA   NA
 303379 303380 c1589 c1590     FALSE 0.028 61.000 0.000 NA   NA
 303380 303381 c1590 c1591     FALSE 0.029 53.000 0.000 NA   NA
 303383 303384 c1593 c1594     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 303384 303385 c1594 c1595     FALSE 0.061 13.000 0.000 NA   NA
 303386 303387 c1596 c1597   sitD FALSE 0.012 -70.000 0.000 NA   NA
 303387 303388 c1597 c1598 sitD sitC TRUE 0.993 -3.000 0.525 0.006 Y NA
 303388 303389 c1598 c1599 sitC sitB TRUE 0.995 -3.000 0.857 0.083 Y NA
 303389 303390 c1599 c1600 sitB sitA TRUE 0.973 51.000 0.894 1.000 Y NA
 303391 303392 c1601 c1602     FALSE 0.001 472.000 0.000 NA   NA
 303393 303394 c1603 c1604 ycgX ycgE FALSE 0.005 221.000 0.000 NA   NA
 303394 303395 c1604 c1605 ycgE   FALSE 0.010 -90.000 0.000 NA   NA
 303395 303396 c1605 c1606   ycgF FALSE 0.012 143.000 0.000 NA   NA
 303399 303400 c1609 c1610 ymgB   FALSE 0.001 701.000 0.000 NA   NA
 303400 303401 c1610 c1611     FALSE 0.021 96.000 0.000 NA   NA
 303401 2179532 c1611 c1612     FALSE 0.001 398.000 0.000 NA   NA
 2179532 2179533 c1612 c1613     FALSE 0.051 16.000 0.000 NA   NA
 2179533 2179534 c1613 c1614     FALSE 0.011 151.000 0.000 NA   NA
 2179534 303402 c1614 c1615     FALSE 0.012 146.000 0.000 NA   NA
 303403 303404 c1616 c1617 ymgD   FALSE 0.097 4.000 0.000 NA   NA
 303404 303405 c1617 c1618     FALSE 0.110 2.000 0.000 NA   NA
 303406 303407 c1619 c1620     FALSE 0.032 46.000 0.000 NA   NA
 303408 303409 c1621 c1622 minE minD TRUE 0.986 4.000 0.618 NA Y NA
 303409 303410 c1622 c1623 minD minC TRUE 0.962 24.000 0.466 1.000 Y NA
 303411 303412 c1624 c1625   ycgJ FALSE 0.011 153.000 0.000 NA   NA
 303414 303415 c1627 c1628 ycgL   FALSE 0.169 72.000 0.056 NA   NA
 303415 303416 c1628 c1629   ycgN FALSE 0.277 92.000 0.088 NA   NA
 303418 303419 c1631 c1632 umuD umuC TRUE 0.723 0.000 0.000 1.000 N NA
 303420 303421 c1633 c1634 dsbB nhaB TRUE 0.814 146.000 0.723 1.000 N NA
 303423 303424 c1636 c1637   ycgB FALSE 0.030 50.000 0.000 NA   NA
 303425 303426 c1638 c1639 dadA dadX TRUE 0.870 10.000 0.168 1.000 N NA
 303427 303428 c1640 c1641 ycgO ldcA FALSE 0.434 95.000 0.103 NA N NA
 303433 303434 c1646 c1647 prrA modD TRUE 0.663 5.000 0.034 1.000 N NA
 303434 303435 c1647 c1648 modD   FALSE 0.503 -3.000 0.034 1.000   NA
 303437 303438 c1650 c1651   fecD TRUE 0.992 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 303438 303439 c1651 c1652 fecD   TRUE 0.929 84.000 0.422 1.000 Y NA
 303439 303440 c1652 c1653     FALSE 0.026 68.000 0.000 NA   NA
 303440 303441 c1653 c1654   treA FALSE 0.013 138.000 0.000 NA   NA
 303443 303444 c1656 c1657 ycgC   TRUE 0.794 5.000 0.118 1.000   NA
 303444 303445 c1657 c1658   ycgT TRUE 0.895 -67.000 0.226 0.000 Y NA
 303447 303448 c1660 c1661   ychF FALSE 0.013 138.000 0.000 NA   NA
 303448 303449 c1661 c1662 ychF pth TRUE 0.824 117.000 0.184 1.000 Y NA
 303451 303452 c1664 c1665 ychM prsA FALSE 0.208 125.000 0.027 1.000 N NA
 303452 303453 c1665 c1666 prsA ispE FALSE 0.404 85.000 0.053 1.000 N NA
 303453 303454 c1666 c1667 ispE hemM TRUE 0.909 0.000 0.157 1.000 N NA
 303455 303456 c1668 c1669 hemA prfA TRUE 0.837 42.000 0.171 0.041 N NA
 303456 303457 c1669 c1670 prfA hemK TRUE 0.986 0.000 0.229 0.041 Y NA
 303457 303458 c1670 c1671 hemK   TRUE 0.725 -3.000 0.109 NA   NA
 303458 303459 c1671 c1672   ychA TRUE 0.836 4.000 0.195 NA   NA
 303462 303463 c1675 c1676   chaA FALSE 0.004 239.000 0.000 NA   NA
 303464 303465 c1677 c1678 chaB chaC FALSE 0.370 110.000 0.140 NA   NA
 303468 303469 c1681 c1682 narL narX TRUE 0.929 -73.000 0.521 0.013 Y NA
 303470 303471 c1683 c1684   narK FALSE 0.023 89.000 0.000 NA   NA
 303471 303472 c1684 c1685 narK narG FALSE 0.027 393.000 0.000 1.000 N NA
 303472 303473 c1685 c1686 narG narH TRUE 0.993 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 303473 303474 c1686 c1687 narH narJ TRUE 0.994 -3.000 0.588 0.004 Y NA
 303474 303475 c1687 c1688 narJ narI TRUE 0.994 0.000 0.500 0.004 Y NA
 303475 303476 c1688 c1689 narI   FALSE 0.197 76.000 0.000 NA N NA
 303476 303477 c1689 c1690     TRUE 0.890 -3.000 0.200 NA N NA
 303477 303478 c1690 c1691     TRUE 0.591 -22.000 0.133 1.000   NA
 303478 303479 c1691 c1692     TRUE 0.948 -3.000 0.550 NA   NA
 303479 303480 c1692 c1693     TRUE 0.629 -15.000 0.162 NA   NA
 303480 303481 c1693 c1694     TRUE 0.745 -7.000 0.179 NA   NA
 303481 303482 c1694 c1695     FALSE 0.501 -13.000 0.103 NA   NA
 400386 400385 c5539 c5540 tyrV tyrT FALSE 0.035 34.000 0.000 NA   NA
 400385 303483 c5540 c1696 tyrT purU FALSE 0.010 160.000 0.000 NA   NA
 303483 303484 c1696 c1697 purU ychJ TRUE 0.603 50.000 0.200 NA   NA
 303485 303486 c1698 c1699 ychK hnr FALSE 0.237 92.000 0.048 1.000   NA
 303486 303487 c1699 c1700 hnr galU FALSE 0.390 202.000 0.235 1.000 N NA
 303488 303489 c1701 c1702 hns   FALSE 0.022 92.000 0.000 NA   NA
 303491 303492 c1704 c1705   adhE FALSE 0.233 126.000 0.000 1.000 N NA
 303493 303494 c1706 c1707 ychE oppA FALSE 0.008 666.000 0.000 NA N NA
 303494 303495 c1707 c1708 oppA oppB TRUE 0.897 86.000 0.151 0.057 Y NA
 303495 303496 c1708 c1709 oppB oppC TRUE 0.990 15.000 0.870 0.057 Y NA
 303496 303497 c1709 c1710 oppC oppD TRUE 0.980 12.000 0.554 1.000 Y NA
 303497 303498 c1710 c1711 oppD oppF TRUE 0.992 -3.000 0.420 0.001 Y NA
 303499 303500 c1712 c1713 yciU cls TRUE 0.678 35.000 0.231 NA   NA
 303502 303503 c1715 c1716 kch yciI FALSE 0.003 282.000 0.000 NA   NA
 303505 303506 c1718 c1719   yciA FALSE 0.002 329.000 0.000 NA   NA
 303506 303507 c1719 c1720 yciA ispZ TRUE 0.540 105.000 0.167 NA N NA
 303507 303508 c1720 c1721 ispZ yciC FALSE 0.257 30.000 0.061 NA   NA
 303510 303511 c1723 c1724 yciE yciF TRUE 0.779 46.000 0.115 0.001   NA
 303511 303512 c1724 c1725 yciF trpA FALSE 0.017 324.000 0.000 1.000   NA
 303512 303513 c1725 c1726 trpA trpB TRUE 0.997 0.000 0.947 0.000 Y NA
 303513 2179535 c1726 c1727 trpB   FALSE 0.066 12.000 0.000 NA   NA
 2179535 2179536 c1727 c1728   trpC FALSE 0.034 36.000 0.000 NA   NA
 2179536 303514 c1728 c1729 trpC trpD FALSE 0.114 1.000 0.000 NA   NA
 303514 303515 c1729 c1730 trpD trpE TRUE 0.961 0.000 0.010 0.001 Y NA
 303515 303516 c1730 c5494 trpE trpL FALSE 0.013 92.000 0.023 NA   NA
 303517 303518 c1731 c1732 trpH yciO TRUE 0.590 -39.000 0.281 NA   NA
 303518 303519 c1732 c1733 yciO yciQ FALSE 0.040 25.000 0.000 NA   NA
 303519 303520 c1733 c1734 yciQ yciL FALSE 0.005 213.000 0.000 NA   NA
 303521 303522 c1735 c1736 btuR yciK TRUE 0.758 -3.000 0.050 1.000 N NA
 303523 303524 c1737 c1738 sohB   FALSE 0.128 180.000 0.000 1.000 N NA
 303526 303527 c1740 c1741   topA FALSE 0.007 190.000 0.000 NA   NA
 303527 303528 c1741 c1742 topA cysB FALSE 0.050 210.000 0.008 1.000 N NA
 303528 303529 c1742 c1743 cysB   FALSE 0.002 295.000 0.000 NA   NA
 303529 303530 c1743 c1744     TRUE 0.861 -18.000 0.556 NA   NA
 303530 303531 c1744 c1745   acnA FALSE 0.002 359.000 0.000 NA   NA
 303533 303534 c1747 c1748 pgpB yciS FALSE 0.264 149.000 0.143 NA   NA
 303534 303535 c1748 c1749 yciS yciM TRUE 0.943 7.000 0.576 NA   NA
 303535 303536 c1749 c1750 yciM pyrF TRUE 0.670 40.000 0.125 1.000 N NA
 303536 303537 c1750 c1751 pyrF yciH TRUE 0.744 -3.000 0.045 1.000 N NA
 303537 303538 c1751 c1752 yciH   FALSE 0.040 24.000 0.000 NA   NA
 303539 303540 c1753 c1754 osmB yciT FALSE 0.003 269.000 0.000 NA   NA
 303540 303541 c1754 c1755 yciT   FALSE 0.432 89.000 0.146 NA   NA
 303541 303542 c1755 c1756   yciR FALSE 0.155 148.000 0.083 NA   NA
 303542 303543 c1756 c1757 yciR rnb FALSE 0.071 234.000 0.000 1.000 N NA
 303543 303544 c1757 c1758 rnb yciW FALSE 0.366 68.000 0.105 NA   NA
 303544 303545 c1758 c1759 yciW fabI FALSE 0.091 145.000 0.057 NA   NA
 303546 303547 c1760 c1761     TRUE 0.702 116.000 0.286 1.000 N NA
 303547 303548 c1761 c1762     FALSE 0.024 -31.000 0.000 NA   NA
 303550 303551 c1764 c1765     TRUE 0.969 4.000 0.367 0.057 N NA
 303551 303552 c1765 c1766     TRUE 0.916 9.000 0.143 0.057 N NA
 303553 303554 c1767 c1768 sapF sapD TRUE 0.995 2.000 0.684 0.013 Y NA
 303554 303555 c1768 c1769 sapD sapC TRUE 0.992 0.000 0.667 1.000 Y NA
 303555 303556 c1769 c1770 sapC sapB TRUE 0.967 -13.000 0.284 0.057 Y NA
 303556 303557 c1770 c1771 sapB sapA TRUE 0.961 -3.000 0.264 0.057 N NA
 303557 303558 c1771 c1772 sapA ymjA FALSE 0.002 313.000 0.000 NA   NA
 303558 303559 c1772 c1773 ymjA pspF FALSE 0.001 427.000 0.000 NA   NA
 303560 303561 c1774 c1775 pspA pspB TRUE 0.871 54.000 0.739 NA   NA
 303563 303564 c1777 c1778 pspC pspD TRUE 0.776 9.000 0.167 NA   NA
 303564 303565 c1778 c1779 pspD pspE FALSE 0.426 75.000 0.133 NA   NA
 303565 303566 c1779 c1780 pspE ycjM FALSE 0.118 187.000 0.000 1.000 N NA
 303568 303569 c1782 c1783 ycjN ycjO TRUE 0.983 21.000 0.620 0.057 Y NA
 303569 303570 c1783 c1784 ycjO ycjP TRUE 0.987 -13.000 0.805 0.057 Y NA
 303570 303571 c1784 c1785 ycjP ycjQ TRUE 0.780 31.000 0.205 1.000 N NA
 303571 303572 c1785 c1786 ycjQ ycjR TRUE 0.886 10.000 0.261 NA N NA
 303572 303573 c1786 c1787 ycjR ycjS TRUE 0.888 10.000 0.347 NA   NA
 303573 303574 c1787 c1788 ycjS ycjT FALSE 0.503 -3.000 0.000 1.000   NA
 303574 303575 c1788 c1789 ycjT ycjU FALSE 0.503 -3.000 0.000 1.000   NA
 303575 303576 c1789 c1790 ycjU ycjV TRUE 0.667 14.000 0.103 1.000   NA
 303576 303577 c1790 c1791 ycjV ompG TRUE 0.912 -6.000 0.222 0.057   NA
 303579 303580 c1793 c1794 ycjX ycjF TRUE 0.965 -3.000 0.791 NA   NA
 303580 303581 c1794 c1795 ycjF tyrR FALSE 0.333 121.000 0.137 NA   NA
 2179537 2179538 c1798 c1799   ycjI FALSE 0.114 1.000 0.000 NA   NA
 2179538 303584 c1799 c1800 ycjI   FALSE 0.009 162.000 0.000 NA   NA
 303584 303585 c1800 c1801     FALSE 0.185 71.000 0.000 1.000   NA
 303586 303587 c1802 c1803   mppA FALSE 0.040 316.000 0.000 1.000 N NA
 303590 303591 c1806 c1807 ydaA fnr TRUE 0.896 152.000 0.619 1.000 Y NA
 303591 303592 c1807 c1808 fnr ogt FALSE 0.107 195.000 0.000 1.000 N NA
 303592 303593 c1808 c1809 ogt   FALSE 0.071 11.000 0.000 NA   NA
 303593 303594 c1809 c1810     FALSE 0.002 311.000 0.000 NA   NA
 303595 303596 c1811 c1812     TRUE 0.776 -15.000 0.293 NA   NA
 303600 303601 c1816 c1817 ydaN dbpA FALSE 0.022 478.000 0.000 1.000 N NA
 303602 303603 c1818 c1819 ydaO   FALSE 0.018 52.000 0.012 NA   NA
 303603 303604 c1819 c1820     FALSE 0.006 1509.000 0.000 1.000   NA
 303604 303605 c1820 c1821   ynaF FALSE 0.168 89.000 0.000 1.000   NA
 303605 303606 c1821 c1822 ynaF ompN FALSE 0.340 69.000 0.000 1.000 N NA
 303606 303607 c1822 c1823 ompN ydbK FALSE 0.031 366.000 0.000 1.000 N NA
 303607 303608 c1823 c1824 ydbK   FALSE 0.209 71.000 0.065 NA   NA
 303610 303611 c1826 c1827 hslJ ldhA FALSE 0.173 99.000 0.000 NA N NA
 303612 303613 c1828 c1829 ydbH ynbE TRUE 0.566 -3.000 0.068 NA   NA
 303613 303614 c1829 c1830 ynbE ydbL TRUE 0.872 -25.000 0.726 NA   NA
 303614 2179539 c1830 c5621 ydbL ydbA_1 FALSE 0.002 375.000 0.000 NA   NA
 2179539 2179540 c5621 c1831 ydbA_1 ydbA_2 FALSE 0.033 38.000 0.000 NA   NA
 2179540 303615 c1831 c1832 ydbA_2 ydbC FALSE 0.005 219.000 0.000 NA   NA
 303617 303618 c1834 c1835 ynbA ynbB TRUE 0.952 0.000 0.179 0.002   NA
 303618 303619 c1835 c1836 ynbB ynbC FALSE 0.051 16.000 0.000 NA   NA
 303619 303620 c1836 c1837 ynbC ynbD TRUE 0.751 -85.000 0.285 NA Y NA
 303620 303621 c1837 c1838 ynbD   FALSE 0.043 -15.000 0.000 NA   NA
 303623 303624 c1840 c1841 hrpA ydcF FALSE 0.003 273.000 0.000 NA   NA
 303624 303625 c1841 c1842 ydcF aldA FALSE 0.016 197.000 0.040 NA   NA
 303627 303628 c1844 c1845 cybB ydcA FALSE 0.004 245.000 0.000 NA   NA
 303628 303629 c1845 c1846 ydcA   FALSE 0.010 157.000 0.000 NA   NA
 303631 303632 c1848 c1849 ydcJ ydcG FALSE 0.004 225.000 0.000 NA   NA
 303632 303633 c1849 c1850 ydcG ydcH FALSE 0.008 134.000 0.026 NA   NA
 303633 303634 c1850 c1851 ydcH rimL FALSE 0.018 48.000 0.026 NA   NA
 303636 303637 c1853 c1854 tehA tehB TRUE 0.873 -3.000 0.175 1.000   NA
 303641 303642 c1858 c1859 ydcN ydcP FALSE 0.418 31.000 0.000 1.000 N NA
 303643 303644 c1860 c1861 yncJ   FALSE 0.028 57.000 0.000 NA   NA
 303645 303646 c1862 c1863   ydcR FALSE 0.179 79.000 0.000 1.000   NA
 303646 303647 c1863 c1864 ydcR ydcS FALSE 0.253 245.000 0.000 1.000 Y NA
 303647 303648 c1864 c1865 ydcS ydcT TRUE 0.984 18.000 0.609 0.056 Y NA
 303648 303649 c1865 c1866 ydcT ydcU TRUE 0.994 1.000 0.643 0.056 Y NA
 303649 303650 c1866 c1867 ydcU ydcV TRUE 0.989 -10.000 0.821 0.056 Y NA
 303650 2179541 c1867 c1868 ydcV   FALSE 0.057 14.000 0.000 NA   NA
 2179541 303651 c1868 c1869   ydcW FALSE 0.042 22.000 0.000 NA   NA
 303651 303652 c1869 c1870 ydcW   FALSE 0.002 312.000 0.000 NA   NA
 303652 303653 c1870 c1871   ydc FALSE 0.023 86.000 0.000 NA   NA
 303654 303655 c1872 c1873 ydcZ yncA TRUE 0.584 -3.000 0.070 NA   NA
 2179542 2179543 c1875 c1876     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 303659 303660 c1879 c1880     FALSE 0.461 113.000 0.000 0.002   NA
 303662 303663 c1882 c1883     FALSE 0.045 19.000 0.000 NA   NA
 303663 303664 c1883 c1884     FALSE 0.021 100.000 0.000 NA   NA
 303664 303665 c1884 c1885     FALSE 0.002 338.000 0.000 NA   NA
 303665 303666 c1885 c1886     TRUE 0.931 11.000 0.600 NA   NA
 303666 303667 c1886 c1887     FALSE 0.018 112.000 0.000 NA   NA
 303667 303668 c1887 c1888     FALSE 0.045 19.000 0.000 NA   NA
 303668 303669 c1888 c1889     FALSE 0.046 -13.000 0.000 NA   NA
 303669 303670 c1889 c1890     FALSE 0.002 337.000 0.000 NA   NA
 303670 303671 c1890 c1891     FALSE 0.005 219.000 0.000 NA   NA
 303671 303672 c1891 c1892     FALSE 0.104 -3.000 0.000 NA   NA
 303672 303673 c1892 c1893     FALSE 0.018 113.000 0.000 NA   NA
 303676 303677 c1896 c1897 yddE narV FALSE 0.178 80.000 0.000 1.000   NA
 303677 303678 c1897 c1898 narV narW TRUE 0.995 -3.000 0.714 0.004 Y NA
 303678 303679 c1898 c1899 narW narY TRUE 0.996 0.000 0.714 0.004 Y NA
 303679 303680 c1899 c1900 narY narZ TRUE 0.996 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 303680 303681 c1900 c1901 narZ narU TRUE 0.876 -28.000 0.556 1.000 N NA
 303681 303682 c1901 c1902 narU yddG FALSE 0.024 273.000 0.000 1.000   NA
 303685 303686 c1906 c1907 fdnH fdnI TRUE 0.984 -7.000 0.333 0.001 Y NA
 303686 303687 c1907 c1908 fdnI   FALSE 0.006 200.000 0.000 NA   NA
 303688 303689 c1909 c1910 yddM   TRUE 0.950 0.000 0.500 NA   NA
 303689 303690 c1910 c1911   adhP FALSE 0.006 192.000 0.000 NA   NA
 303690 303691 c1911 c1912 adhP sfcA FALSE 0.110 134.000 0.000 1.000   NA
 303691 303692 c1912 c1913 sfcA rpsV TRUE 0.745 157.000 0.750 1.000   NA
 303692 303693 c1913 c1914 rpsV   TRUE 0.780 102.000 0.571 NA   NA
 303694 303695 c1915 c1916   osmC FALSE 0.033 38.000 0.000 NA   NA
 303696 303697 c1918 c1919     TRUE 0.931 1.000 0.130 0.004   NA
 303697 303698 c1919 c1920   yddW FALSE 0.017 324.000 0.000 1.000   NA
 303698 303699 c1920 c1921 yddW xasA FALSE 0.113 131.000 0.000 1.000   NA
 303699 303700 c1921 c1922 xasA gadB TRUE 0.639 156.000 0.103 1.000 Y NA
 303700 303701 c1922 c1923 gadB pqqL FALSE 0.021 292.000 0.000 1.000   NA
 303701 303702 c1923 c1924 pqqL yddB TRUE 0.643 45.000 0.167 1.000   NA
 303702 303703 c1924 c1925 yddB yddA FALSE 0.507 38.000 0.000 0.070   NA
 303703 303704 c1925 c1926 yddA ydeM FALSE 0.021 291.000 0.000 1.000   NA
 303704 303705 c1926 c1927 ydeM ydeN TRUE 0.929 37.000 0.600 0.054   NA
 303705 303706 c1927 c1928 ydeN ydeO FALSE 0.030 369.000 0.000 1.000 N NA
 303706 303707 c1928 c1929 ydeO   FALSE 0.025 76.000 0.000 NA   NA
 303707 303708 c1929 c1930   ydeP FALSE 0.003 248.000 0.000 NA   NA
 303708 303709 c1930 c1931 ydeP ydeQ FALSE 0.016 339.000 0.000 1.000   NA
 303709 303710 c1931 c1932 ydeQ ydeR FALSE 0.524 60.000 0.000 0.011   NA
 303710 303711 c1932 c1933 ydeR ydeS TRUE 0.925 13.000 0.000 0.011 Y NA
 303711 303712 c1933 c1934 ydeS   TRUE 0.853 14.000 0.000 1.000 Y NA
 303712 303713 c1934 c1935     TRUE 0.763 42.000 0.000 1.000 Y NA
 303713 303714 c1935 c1936     FALSE 0.139 362.000 0.000 1.000 Y NA
 303714 303715 c1936 c1937     FALSE 0.016 728.000 0.000 1.000 N NA
 303716 303717 c1938 c1939 oprR   FALSE 0.007 -318.000 0.000 NA   NA
 303718 303719 c1940 c1941 hipA hipB TRUE 0.941 -6.000 0.675 NA   NA
 303721 303722 c1943 c1945 yneE yneF FALSE 0.001 1825.000 0.000 NA   NA
 303722 303723 c1945 c1946 yneF yneG FALSE 0.210 139.000 0.098 NA   NA
 303723 303724 c1946 c1947 yneG yneH FALSE 0.211 0.000 0.037 NA   NA
 303724 303725 c1947 c1948 yneH yneI FALSE 0.349 64.000 0.000 1.000 N NA
 303726 303727 c1949 c1950 yneJ sotB FALSE 0.030 339.000 0.027 1.000 N NA
 303729 303730 c1952 c1953 marR marA TRUE 0.985 21.000 0.667 0.043 Y NA
 303730 303731 c1953 c1954 marA marB FALSE 0.035 32.000 0.000 NA   NA
 303732 303733 c1955 c1956     TRUE 0.819 19.000 0.000 1.000 Y NA
 303733 303734 c1956 c1957     TRUE 0.947 55.000 0.250 0.012 Y NA
 303734 303735 c1957 c1958     TRUE 0.929 25.000 0.105 0.012 Y NA
 303735 303736 c1958 c1959     TRUE 0.978 76.000 0.789 0.012 Y NA
 303740 303741 c1963 c1964 ydeH dcp FALSE 0.021 501.000 0.000 1.000 N NA
 303742 303743 c1965 c1966 ydfG ydfH FALSE 0.168 89.000 0.000 1.000   NA
 303743 303744 c1966 c1967 ydfH ydfZ FALSE 0.008 177.000 0.000 NA   NA
 303745 303746 c1968 c1969   ydfJ FALSE 0.310 89.000 0.000 1.000 N NA
 303746 303747 c1969 c1970 ydfJ rspB FALSE 0.360 58.000 0.000 1.000 N NA
 303747 303748 c1970 c1971 rspB rspA TRUE 0.651 12.000 0.049 1.000 N NA
 303748 303749 c1971 c1972 rspA ynfA FALSE 0.033 173.000 0.020 1.000   NA
 303750 303751 c1973 c1974 ynfB speG FALSE 0.207 35.000 0.055 NA   NA
 303753 303754 c1976 c1977 ynfD ynfE FALSE 0.317 199.000 0.304 NA   NA
 303754 303755 c1977 c1978 ynfE ynfF TRUE 0.952 58.000 0.231 0.001 Y NA
 303755 303756 c1978 c1979 ynfF ynfG TRUE 0.991 11.000 0.667 0.049 Y NA
 303758 303759 c1981 c1982 ynfH ynfI TRUE 0.573 43.000 0.125 1.000   NA
 303759 303760 c1982 c1983 ynfI ynfJ FALSE 0.132 195.000 0.079 1.000   NA
 303761 303762 c1984 c1985 bioD mlc TRUE 0.775 125.000 0.455 1.000 N NA
 303762 303763 c1985 c1986 mlc ynfL TRUE 0.882 135.000 0.408 1.000 Y NA
 303764 303765 c1987 c1988 ynfM asr FALSE 0.001 412.000 0.000 NA   NA
 303765 303767 c1988 c1990 asr   FALSE 0.003 276.000 0.000 NA   NA
 303768 303769 c1991 c1992 ydgE ydgF TRUE 0.988 -13.000 0.869 0.081 Y NA
 303771 303772 c1994 c1995 pntB pntA TRUE 0.994 11.000 0.745 0.000 Y NA
 303773 303774 c1996 c1997 ydgH ydgI FALSE 0.237 159.000 0.143 NA   NA
 303774 303775 c1997 c1998 ydgI ydgB TRUE 0.694 37.000 0.140 1.000 N NA
 303777 303778 c2000 c2001 rstA rstB TRUE 0.965 4.000 0.181 1.000 Y NA
 303778 303779 c2001 c2002 rstB tus TRUE 0.651 64.000 0.200 1.000   NA
 303780 303781 c2003 c2004 fumC fumA TRUE 0.740 143.000 0.000 0.001 Y NA
 303782 303783 c2005 c2006 manA ydgA TRUE 0.833 101.000 0.778 NA   NA
 303784 303785 c2007 c2008 uidC uidB TRUE 0.821 39.000 0.375 1.000   NA
 303785 303786 c2008 c2009 uidB uidA TRUE 0.974 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 303786 303787 c2009 c2010 uidA uidR FALSE 0.027 390.000 0.000 1.000 N NA
 303787 303788 c2010 c2011 uidR hdhA FALSE 0.076 229.000 0.000 1.000 N NA
 303788 303789 c2011 c2012 hdhA malI FALSE 0.265 112.000 0.000 1.000 N NA
 303790 303791 c2013 c2014 malX malY TRUE 0.955 10.000 0.531 1.000 N NA
 303791 303792 c2014 c2015 malY add TRUE 0.564 104.000 0.132 1.000 N NA
 303794 303795 c2017 c2018 ydgT ydgK FALSE 0.417 62.000 0.120 NA   NA
 303795 303796 c2018 c2019 ydgK   FALSE 0.459 77.000 0.148 NA   NA
 303796 303797 c2019 c2020     TRUE 0.994 0.000 0.564 0.049 Y NA
 303797 303798 c2020 c2021     TRUE 0.987 -7.000 0.537 0.015 Y NA
 303798 303799 c2021 c2022   ydgO TRUE 0.995 1.000 0.814 0.049 Y NA
 303799 303800 c2022 c2023 ydgO   TRUE 0.995 4.000 0.924 0.049 Y NA
 303800 303801 c2023 c2024   ydgQ TRUE 0.995 4.000 0.908 0.049 Y NA
 303801 303802 c2024 c2025 ydgQ nth TRUE 0.877 0.000 0.109 1.000 N NA
 303802 303803 c2025 c2026 nth ydgR FALSE 0.017 611.000 0.000 1.000 N NA
 303803 303804 c2026 c2027 ydgR gst TRUE 0.768 106.000 0.344 1.000 N NA
 303805 303806 c2028 c2029 pdxY tyrS FALSE 0.398 59.000 0.041 1.000 N NA
 303806 303807 c2029 c2030 tyrS pdxH FALSE 0.335 117.000 0.054 1.000 N NA
 303807 303808 c2030 c2031 pdxH ydhA FALSE 0.197 59.000 0.034 1.000   NA
 303808 303809 c2031 c2032 ydhA ydhH FALSE 0.023 98.000 0.034 NA   NA
 303812 303813 c2035 c2036 ydhI ydhJ TRUE 0.695 -39.000 0.412 NA   NA
 303813 303814 c2036 c2037 ydhJ ydhK FALSE 0.119 0.000 0.000 NA   NA
 303815 303816 c2038 c2039 sodC ydhF FALSE 0.236 30.000 0.033 1.000   NA
 303816 303817 c2039 c2040 ydhF ydhL FALSE 0.125 49.000 0.045 NA   NA
 303818 303819 c2041 c2042   ydhM FALSE 0.005 212.000 0.000 NA   NA
 303819 303820 c2042 c2043 ydhM nemA TRUE 0.857 37.000 0.362 1.000 N NA
 303820 303821 c2043 c2044 nemA gloA FALSE 0.427 81.000 0.057 1.000 N NA
 303821 303822 c2044 c2045 gloA rnt TRUE 0.571 103.000 0.136 1.000 N NA
 303826 303827 c2049 c2050 ydhO sodB FALSE 0.159 128.000 0.015 1.000 N NA
 303830 2179544 c2053 c5505 ydhB dsrA FALSE 0.092 5.000 0.000 NA   NA
 303831 303832 c2054 c2055 ydhC cfa FALSE 0.046 291.000 0.000 1.000 N NA
 400326 400327 c5541 c5542 valV valW FALSE 0.092 5.000 0.000 NA   NA
 400327 303836 c5542 c2059 valW   FALSE 0.019 109.000 0.000 NA   NA
 303836 303837 c2059 c2060   ydhS FALSE 0.015 126.000 0.000 NA   NA
 303838 303839 c2061 c2062   ydhT FALSE 0.009 -106.000 0.000 NA   NA
 303841 303842 c2064 c2065 ydhU   TRUE 0.991 -3.000 0.444 0.048 Y NA
 303842 303843 c2065 c2066   ydhW TRUE 0.798 13.000 0.235 NA   NA
 303843 303844 c2066 c2067 ydhW ydhV TRUE 0.933 4.000 0.458 NA   NA
 303844 303845 c2067 c2068 ydhV   TRUE 0.983 21.000 0.600 0.015 Y NA
 303845 303846 c2068 c2069   ydhZ FALSE 0.001 456.000 0.000 NA   NA
 303847 303848 c2070 c2071   pykF FALSE 0.021 102.000 0.000 NA   NA
 303848 303849 c2071 c2072 pykF lpp FALSE 0.041 311.000 0.000 1.000 N NA
 303850 303851 c2073 c2074 ynhG ynhA FALSE 0.116 149.000 0.069 NA   NA
 303851 303852 c2074 c2075 ynhA   TRUE 0.744 13.000 0.183 NA   NA
 303852 303853 c2075 c2076   ynhC TRUE 0.914 -3.000 0.193 1.000 N NA
 303853 303854 c2076 c2077 ynhC ynhD TRUE 0.949 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 303854 303855 c2077 c2078 ynhD ynhE TRUE 0.980 10.000 0.466 1.000 Y NA
 303855 303856 c2078 c2079 ynhE ydiC FALSE 0.078 -30.000 0.041 NA   NA
 303856 303857 c2079 c2080 ydiC ydiH FALSE 0.001 549.000 0.000 NA   NA
 303857 303858 c2080 c2081 ydiH ydiI FALSE 0.027 19.000 0.032 NA   NA
 303858 303859 c2081 c2082 ydiI ydiJ TRUE 0.835 -3.000 0.129 NA N NA
 303860 303861 c2083 c2084 ydiK ydiL FALSE 0.001 402.000 0.000 NA   NA
 303861 303862 c2084 c2085 ydiL ydiM FALSE 0.399 100.000 0.095 1.000   NA
 303862 303863 c2085 c2086 ydiM ydiN FALSE 0.129 221.000 0.000 0.055   NA
 303863 303864 c2086 c2087 ydiN ydiB TRUE 0.746 12.000 0.082 1.000 N NA
 303864 303865 c2087 c2088 ydiB aroD TRUE 0.871 31.000 0.113 1.000 Y NA
 303865 303866 c2088 c2089 aroD ydiF FALSE 0.138 146.000 0.019 1.000 N NA
 303866 303867 c2089 c2090 ydiF ydiO TRUE 0.975 14.000 0.500 1.000 Y NA
 303868 303869 c2091 c2092 ydiP   FALSE 0.021 103.000 0.000 NA   NA
 303870 303871 c2093 c2094 ydiQ ydiR TRUE 0.990 20.000 1.000 0.015 Y NA
 303871 303872 c2094 c2095 ydiR ydiS TRUE 0.983 55.000 1.000 0.048 Y NA
 303872 303873 c2095 c2096 ydiS ydiT TRUE 0.990 -3.000 0.400 0.048 Y NA
 303873 303874 c2096 c2097 ydiT ydiD TRUE 0.824 3.000 0.080 1.000 N NA
 303876 303877 c2099 c2100 ydiA aroH FALSE 0.353 157.000 0.165 1.000   NA
 303877 303878 c2100 c2101 aroH ydiE FALSE 0.261 105.000 0.054 NA N NA
 303879 303880 c2102 c2103 ydiU ydiV FALSE 0.016 63.000 0.031 NA   NA
 303880 303881 c2103 c2104 ydiV nlpC FALSE 0.033 247.000 0.000 NA N NA
 303881 303882 c2104 c2105 nlpC btuD FALSE 0.196 78.000 0.000 NA N NA
 303882 303883 c2105 c2106 btuD btuE TRUE 0.723 0.000 0.000 1.000 N NA
 303883 303884 c2106 c2107 btuE btuC TRUE 0.547 62.000 0.084 1.000 N NA
 303884 303885 c2107 c2108 btuC   FALSE 0.009 -103.000 0.000 NA   NA
 303885 303886 c2108 c2109   himA FALSE 0.025 76.000 0.000 NA   NA
 303886 2179545 c2109 c2110 himA pheT FALSE 0.092 5.000 0.000 NA   NA
 2179545 2179546 c2110 c2111 pheT   FALSE 0.017 -46.000 0.000 NA   NA
 2179546 303887 c2111 c2112   pheS FALSE 0.054 15.000 0.000 NA   NA
 303887 303888 c2112 c5495 pheS pheM FALSE 0.003 284.000 0.000 NA   NA
 303888 303889 c5495 c2113 pheM rplT FALSE 0.016 123.000 0.000 NA   NA
 303891 303892 c2115 c2116 infC thrS TRUE 0.832 112.000 0.186 1.000 Y NA
 303893 303894 c2117 c2118     FALSE 0.047 18.000 0.000 NA   NA
 303894 303895 c2118 c2119     FALSE 0.035 -19.000 0.000 NA   NA
 303899 303900 c2123 c2124 ydiZ yniA FALSE 0.020 106.000 0.000 NA   NA
 303902 303903 c2126 c2127 yniC ydjM FALSE 0.095 164.000 0.068 NA   NA
 303903 303904 c2127 c2128 ydjM ydjN FALSE 0.230 133.000 0.102 NA   NA
 303905 303906 c2129 c2130     FALSE 0.009 166.000 0.000 NA   NA
 303908 303909 c2132 c2133 ydjC celF TRUE 0.948 13.000 0.429 0.018   NA
 303909 303910 c2133 c2134 celF celD TRUE 0.906 49.000 0.625 1.000 N NA
 303910 303911 c2134 c2135 celD celC TRUE 0.971 8.000 0.727 1.000 N NA
 303911 303912 c2135 c2136 celC celB TRUE 0.983 51.000 0.833 0.012 Y NA
 303912 303913 c2136 c2137 celB celA TRUE 0.964 85.000 0.500 0.012 Y NA
 303913 303914 c2137 c2138 celA osmE FALSE 0.020 300.000 0.000 1.000   NA
 303915 303916 c2139 c2140 nadE ydjQ FALSE 0.043 230.000 0.010 1.000 N NA
 303919 303920 c2143 c2144 spy ydjS FALSE 0.019 330.000 0.000 NA N NA
 303920 303921 c2144 c2145 ydjS   TRUE 0.930 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 303921 303922 c2145 c2146     TRUE 0.943 -3.000 0.306 1.000 N NA
 303922 303923 c2146 c2147     TRUE 0.673 84.000 0.179 1.000 N NA
 303923 303924 c2147 c2148   cstC TRUE 0.989 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 303925 303926 c2149 c2150   xthA FALSE 0.061 13.000 0.000 NA   NA
 303926 303927 c2150 c2151 xthA ydjX FALSE 0.010 119.000 0.016 NA   NA
 303927 303928 c2151 c2152 ydjX ydjY FALSE 0.106 -157.000 0.083 NA   NA
 303928 303929 c2152 c2153 ydjY ydjZ TRUE 0.716 14.000 0.174 NA   NA
 303929 303930 c2153 c2154 ydjZ ynjA TRUE 0.692 0.000 0.087 NA   NA
 303930 303931 c2154 c2155 ynjA   FALSE 0.047 10.000 0.032 NA   NA
 303931 303932 c2155 c2156   ynjC TRUE 0.860 -51.000 0.627 0.055   NA
 303932 303933 c2156 c2157 ynjC ynjD TRUE 0.837 -33.000 0.602 1.000   NA
 303933 303934 c2157 c2158 ynjD   FALSE 0.524 52.000 0.111 1.000   NA
 303939 303940 c2163 c2164   ybeW FALSE 0.503 -3.000 0.000 1.000   NA
 303940 303941 c2164 c2165 ybeW   FALSE 0.026 70.000 0.000 NA   NA
 303941 303942 c2165 c2166   topB FALSE 0.017 119.000 0.000 NA   NA
 303942 303943 c2166 c2167 topB selD FALSE 0.257 -52.000 0.041 1.000 N NA
 303943 303944 c2167 c2168 selD ydjA FALSE 0.265 111.000 0.033 1.000 N NA
 303945 303946 c2169 c2170   sppA FALSE 0.014 -57.000 0.000 NA   NA
 303946 303947 c2170 c2171 sppA ansA FALSE 0.324 167.000 0.113 1.000 N NA
 303947 303948 c2171 c2172 ansA ydjB TRUE 0.627 11.000 0.040 1.000 N NA
 303949 303950 c2173 c2174 ydjE ydjF TRUE 0.860 49.000 0.125 1.000 Y NA
 303950 303951 c2174 c2175 ydjF ydjG TRUE 0.634 137.000 0.269 1.000 N NA
 303951 303952 c2175 c2176 ydjG ydjH TRUE 0.913 10.000 0.269 1.000 N NA
 303952 303953 c2176 c2177 ydjH ydjI TRUE 0.953 -16.000 0.368 1.000 Y NA
 303953 303954 c2177 c2178 ydjI ydjJ TRUE 0.886 21.000 0.194 0.016 N NA
 303954 303955 c2178 c2179 ydjJ ydjK TRUE 0.799 17.000 0.167 1.000 N NA
 303955 303956 c2179 c2180 ydjK   FALSE 0.424 -115.000 0.333 NA   NA
 303956 303957 c2180 c2181   ydjL FALSE 0.528 -10.000 0.100 NA   NA
 303957 303958 c2181 c2182 ydjL yeaC FALSE 0.002 370.000 0.000 NA   NA
 303958 303959 c2182 c2183 yeaC yeaA TRUE 0.861 -3.000 0.216 NA   NA
 303960 303961 c2184 c2185 gapA yeaD TRUE 0.865 63.000 0.154 1.000 Y NA
 303962 303963 c2186 c2187 yeaE yeaF FALSE 0.266 45.000 0.067 NA   NA
 303964 303965 c2188 c2189 yeaG yeaH TRUE 0.796 113.000 0.683 NA   NA
 303965 303966 c2189 c2190 yeaH yeaI FALSE 0.012 147.000 0.000 NA   NA
 303966 303967 c2190 c2191 yeaI yeaJ TRUE 0.605 181.000 0.000 0.004 Y NA
 303967 303968 c2191 c2192 yeaJ yeaK FALSE 0.344 43.000 0.083 NA   NA
 303972 303973 c2196 c2197 yeaN yeaO FALSE 0.017 55.000 0.007 NA   NA
 303976 303977 c2200 c2201 yeaQ   FALSE 0.066 12.000 0.000 NA   NA
 303977 303978 c2201 c2202   yoaG FALSE 0.057 14.000 0.000 NA   NA
 303980 303981 c2204 c2205 yeaR yeaS FALSE 0.074 173.000 0.000 NA N NA
 303981 303982 c2205 c2206 yeaS   FALSE 0.015 127.000 0.000 NA   NA
 303984 303985 c2208 c2209 rnd fadD TRUE 0.592 70.000 0.115 1.000 N NA
 303985 303986 c2209 c2210 fadD yeaY FALSE 0.517 139.000 0.169 1.000 N NA
 303986 303987 c2210 c2211 yeaY yeaZ FALSE 0.341 40.000 0.024 1.000 N NA
 303987 303988 c2211 c2212 yeaZ   TRUE 0.547 58.000 0.082 1.000 N NA
 303989 303990 c2213 c2214 yoaB yoaC FALSE 0.002 362.000 0.000 NA   NA
 303990 303991 c2214 c2215 yoaC   FALSE 0.017 117.000 0.000 NA   NA
 303993 303994 c2217 c2218 pabB yeaB TRUE 0.800 4.000 0.116 1.000   NA
 303994 303995 c2218 c2219 yeaB sdaA FALSE 0.516 184.000 0.409 1.000   NA
 303995 303996 c2219 c2220 sdaA   FALSE 0.473 28.000 0.111 NA   NA
 303996 303997 c2220 c2221   yoaD FALSE 0.385 -55.000 0.182 NA   NA
 303999 304000 c2223 c2224 manX manY TRUE 0.837 63.000 0.000 0.013 Y NA
 304002 304003 c2226 c2227 manZ yobD TRUE 0.872 55.000 0.755 NA   NA
 304003 304004 c2227 c2228 yobD yebN FALSE 0.002 375.000 0.000 NA   NA
 304007 304008 c2231 c2232 cspC yobF TRUE 0.776 13.000 0.214 NA   NA
 304008 304009 c2232 c2233 yobF yebO FALSE 0.001 670.000 0.000 NA   NA
 304009 304010 c2233 c2234 yebO yobG TRUE 0.783 75.000 0.500 NA   NA
 304014 304015 c2238 c2239 htpX prc FALSE 0.275 192.000 0.042 0.022 N NA
 304015 304016 c2239 c2240 prc proQ TRUE 0.832 20.000 0.304 NA N NA
 304016 304017 c2240 c2241 proQ   TRUE 0.715 97.000 0.081 NA Y NA
 304018 304019 c2242 c2243 yebS yebT TRUE 0.751 -73.000 0.840 NA   NA
 304019 304020 c2243 c2244 yebT yebU TRUE 0.749 74.000 0.420 NA   NA
 304020 304021 c2244 c2245 yebU yebV FALSE 0.350 103.000 0.121 NA   NA
 304021 304022 c2245 c2246 yebV yebW TRUE 0.813 21.000 0.353 NA   NA
 304023 304024 c2247 c2248 pphA   FALSE 0.004 222.000 0.000 NA   NA
 304024 304025 c2248 c2249   yebY FALSE 0.047 18.000 0.000 NA   NA
 304025 304026 c2249 c2250 yebY yebZ TRUE 0.934 13.000 0.704 NA   NA
 304026 304027 c2250 c2251 yebZ   TRUE 0.962 4.000 0.613 1.000   NA
 304028 304029 c2252 c2253 holE yobB TRUE 0.614 103.000 0.222 1.000   NA
 304029 304030 c2253 c2254 yobB   TRUE 0.884 24.000 0.500 1.000   NA
 304031 304032 c2255 c2256   ptrB TRUE 0.911 1.000 0.067 0.000   NA
 304034 304035 c2258 c2259 yebE yebF FALSE 0.001 327.000 0.028 NA   NA
 304035 304036 c2259 c2260 yebF yebG FALSE 0.017 55.000 0.027 NA   NA
 2179547 2179548 c2261 c2262     FALSE 0.034 37.000 0.000 NA   NA
 304037 304038 c2263 c2264 eda edd TRUE 0.959 37.000 0.523 1.000 Y NA
 304038 304039 c2264 c2265 edd zwf FALSE 0.290 235.000 0.041 1.000 Y NA
 304039 304040 c2265 c2266 zwf   FALSE 0.009 166.000 0.000 NA   NA
 304041 304042 c2267 c2268 yebK pykA FALSE 0.358 128.000 0.071 1.000 N NA
 304043 304044 c2269 c2270 msbB yebA TRUE 0.869 119.000 0.299 1.000 Y NA
 304044 304045 c2270 c2271 yebA znuA TRUE 0.769 16.000 0.131 1.000 N NA
 304046 304047 c2272 c2273 yebM yebI TRUE 0.994 -3.000 0.755 0.078 Y NA
 304048 304049 c2274 c2275 ruvB ruvA TRUE 0.992 9.000 0.549 0.001 Y NA
 304051 304052 c2277 c2278 ruvC yebC TRUE 0.723 32.000 0.277 NA   NA
 304052 304053 c2278 c2279 yebC ntpA FALSE 0.044 29.000 0.035 NA   NA
 304053 304054 c2279 c2280 ntpA aspS TRUE 0.770 2.000 0.050 1.000 N NA
 304055 304056 c2281 c2282 yecD yecE TRUE 0.670 -3.000 0.089 NA   NA
 304056 304057 c2282 c2283 yecE yecN FALSE 0.452 53.000 0.126 NA   NA
 304057 304058 c2283 c2284 yecN yecO FALSE 0.369 41.000 0.089 NA   NA
 304058 304059 c2284 c2285 yecO yecP TRUE 0.905 -3.000 0.315 NA   NA
 304060 304061 c2286 c2287 bisZ yecK TRUE 0.990 7.000 0.481 0.047 Y NA
 304061 304062 c2287 c2288 yecK   FALSE 0.009 -94.000 0.000 NA   NA
 304062 304063 c2288 c2289     FALSE 0.002 351.000 0.000 NA   NA
 304063 304064 c2289 c2290   yecM FALSE 0.326 14.000 0.057 NA   NA
 304066 304067 c2292 c2293 flhE flhA TRUE 0.946 0.000 0.158 0.002   NA
 304067 304068 c2293 c2294 flhA flhB TRUE 0.980 -7.000 0.287 0.007 Y NA
 304070 304071 c2296 c2297 cheZ cheY TRUE 0.880 11.000 0.000 1.000 Y NA
 304071 304072 c2297 c2298 cheY cheB TRUE 0.917 15.000 0.000 0.010 Y NA
 304072 304073 c2298 c2299 cheB cheR TRUE 0.918 3.000 0.000 1.000 Y NA
 304073 304074 c2299 c2300 cheR   FALSE 0.015 126.000 0.000 NA   NA
 304074 304075 c2300 c2301   tar FALSE 0.032 43.000 0.000 NA   NA
 304075 304076 c2301 c2302 tar cheW TRUE 0.786 124.000 0.043 0.003 Y NA
 304076 304077 c2302 c2303 cheW cheA TRUE 0.980 21.000 0.447 0.003 Y NA
 304077 304078 c2303 c2304 cheA motB TRUE 0.949 -49.000 0.913 1.000 Y NA
 304078 304079 c2304 c2305 motB motA TRUE 0.985 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 304079 304080 c2305 c2306 motA flhC TRUE 0.698 126.000 0.408 1.000   NA
 304080 304082 c2306 c2308 flhC flhD TRUE 0.855 3.000 0.000 0.001   NA
 304084 304085 c2310 c2311 otsA otsB TRUE 0.875 -34.000 0.068 0.000 Y NA
 304085 304086 c2311 c2312 otsB araH TRUE 0.658 110.000 0.037 1.000 Y NA
 304086 304087 c2312 c2313 araH araG TRUE 0.988 12.000 0.451 0.002 Y NA
 304087 304088 c2313 c2314 araG araF TRUE 0.984 70.000 0.917 0.002 Y NA
 304098 400384 c2324 c5543 yecA leuZ FALSE 0.006 196.000 0.000 NA   NA
 400384 400383 c5543 c5544 leuZ cysT FALSE 0.061 13.000 0.000 NA   NA
 400383 400382 c5544 c5545 cysT glyW FALSE 0.029 54.000 0.000 NA   NA
 400382 304099 c5545 c2325 glyW pgsA FALSE 0.011 152.000 0.000 NA   NA
 304099 304100 c2325 c2326 pgsA uvrC TRUE 0.758 57.000 0.227 1.000 N NA
 304100 304101 c2326 c2327 uvrC uvrY TRUE 0.915 -3.000 0.086 0.021 N NA
 304101 304102 c2327 c2328 uvrY   FALSE 0.004 239.000 0.000 NA   NA
 304104 304105 c2330 c2331 sdiA yecC FALSE 0.133 230.000 0.071 1.000 N NA
 304105 304106 c2331 c2332 yecC yecS TRUE 0.963 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 304106 304107 c2332 c2333 yecS yedO TRUE 0.868 15.000 0.050 1.000 Y NA
 304107 304108 c2333 c2334 yedO   FALSE 0.145 168.000 0.000 1.000 N NA
 304108 304109 c2334 c2335   fliY FALSE 0.203 140.000 0.000 1.000 N NA
 304109 304110 c2335 c2336 fliY fliZ TRUE 0.780 31.000 0.280 1.000   NA
 304110 304111 c2336 c2337 fliZ fliA TRUE 0.746 10.000 0.108 1.000   NA
 304111 304112 c2337 c2338 fliA fliC FALSE 0.024 320.000 0.012 1.000 N NA
 304113 304114 c2339 c2340 fliD fliS TRUE 0.968 25.000 0.284 0.002 Y NA
 304114 304115 c2340 c2341 fliS fliT TRUE 0.938 0.000 0.324 1.000   NA
 304115 304116 c2341 c2342 fliT amyA FALSE 0.482 78.000 0.115 1.000   NA
 304118 304119 c2344 c2345 yedE yedF TRUE 0.968 -3.000 0.844 NA   NA
 304119 304120 c2345 c2346 yedF yedK FALSE 0.019 109.000 0.000 NA   NA
 304120 304121 c2346 c2347 yedK   FALSE 0.001 452.000 0.000 NA   NA
 304121 304122 c2347 c2348     FALSE 0.024 -31.000 0.000 NA   NA
 304123 304124 c2349 c2350 ybcM ybcL TRUE 0.940 10.000 0.625 NA   NA
 304126 304127 c2352 c2353 emrE fliE FALSE 0.033 345.000 0.000 1.000 N NA
 304128 304129 c2354 c2355 fliF fliG TRUE 0.975 -7.000 0.220 0.004 Y NA
 304131 304132 c2357 c2358 fliH fliI TRUE 0.966 0.000 0.000 0.003 Y NA
 304132 304133 c2358 c2359 fliI fliJ TRUE 0.881 19.000 0.006 0.005 Y NA
 304133 304134 c2359 c2360 fliJ fliK TRUE 0.989 -3.000 0.317 0.004 Y NA
 304134 304135 c2360 c2361 fliK fliL TRUE 0.796 105.000 0.119 1.000 Y NA
 304135 304136 c2361 c2362 fliL fliM TRUE 0.979 -40.000 0.957 0.001 Y NA
 304136 304137 c2362 c2363 fliM fliN TRUE 0.981 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 304137 304138 c2363 c2364 fliN fliO TRUE 0.987 0.000 0.443 1.000 Y NA
 304138 304139 c2364 c2365 fliO fliP TRUE 0.974 0.000 0.203 1.000 Y NA
 304139 304140 c2365 c2366 fliP fliQ TRUE 0.994 10.000 0.827 0.007 Y NA
 304140 304141 c2366 c2367 fliQ fliR TRUE 0.951 9.000 0.000 0.002 Y NA
 304141 304143 c2367 c2369 fliR rcsA FALSE 0.047 290.000 0.000 1.000 N NA
 304144 304145 c2370 c2371 dsrB   FALSE 0.021 97.000 0.000 NA   NA
 304146 304147 c2372 c2373 yodD yedP FALSE 0.002 298.000 0.000 NA   NA
 304148 304149 c2374 c2375 yedQ   FALSE 0.009 -94.000 0.000 NA   NA
 304149 304150 c2375 c2376   yodC FALSE 0.027 62.000 0.000 NA   NA
 304150 304151 c2376 c2377 yodC yedI FALSE 0.014 79.000 0.025 NA   NA
 304153 304154 c2379 c2380 vsr dcm TRUE 0.858 -19.000 0.000 0.062 Y NA
 304154 304155 c2380 c2381 dcm yedJ FALSE 0.139 112.000 0.000 1.000   NA
 304155 304156 c2381 c2382 yedJ yedR FALSE 0.378 13.000 0.062 NA   NA
 304157 304159 c2383 c2385   yedU FALSE 0.001 596.000 0.000 NA   NA
 304160 304161 c2386 c2387 yedV yedW TRUE 0.997 0.000 0.857 0.001 Y NA
 304162 304163 c2388 c2389   yedY FALSE 0.146 109.000 0.000 1.000   NA
 304163 304164 c2389 c2390 yedY yedZ TRUE 0.985 1.000 0.790 0.047   NA
 304164 304165 c2390 c2391 yedZ yodA FALSE 0.027 258.000 0.000 1.000   NA
 304165 304166 c2391 c2392 yodA   FALSE 0.007 866.000 0.000 1.000   NA
 304166 304167 c2392 c2393     FALSE 0.018 114.000 0.000 NA   NA
 304168 304169 c2394 c2395     FALSE 0.539 53.000 0.167 NA   NA
 304169 304170 c2395 c2396     FALSE 0.012 399.000 0.000 1.000   NA
 304171 304172 c2397 c2398     FALSE 0.203 57.000 0.000 1.000   NA
 304175 304176 c2401 c2402     TRUE 0.873 41.000 0.667 NA   NA
 304177 304178 c2403 c2404     FALSE 0.052 -10.000 0.000 NA   NA
 304179 304180 c2405 c2406     FALSE 0.030 52.000 0.000 NA   NA
 304181 304182 c2407 c2408     FALSE 0.001 883.000 0.000 NA   NA
 304184 304185 c2410 c2411     TRUE 0.581 159.000 0.500 NA   NA
 304186 304187 c2412 c2413     FALSE 0.024 79.000 0.000 NA   NA
 304187 304188 c2413 c2414     FALSE 0.025 73.000 0.000 NA   NA
 304188 304189 c2414 c2415     TRUE 0.899 53.000 1.000 NA   NA
 304189 304190 c2415 c2416     FALSE 0.001 505.000 0.000 NA   NA
 304190 400381 c2416 c5546   serU FALSE 0.005 221.000 0.000 NA   NA
 304191 400328 c2417 c5547 yeeI asnT FALSE 0.021 101.000 0.000 NA   NA
 400328 304192 c5547 c2418 asnT   FALSE 0.001 381.000 0.000 NA   NA
 304193 304194 c2419 c2420     TRUE 0.705 28.000 0.176 NA N NA
 304194 304195 c2420 c2421     FALSE 0.259 -130.000 0.130 NA N NA
 304195 304196 c2421 c2422     TRUE 0.976 -40.000 0.913 0.006 Y NA
 304197 304198 c2423 c2424     FALSE 0.138 173.000 0.000 1.000 N NA
 304200 304201 c2426 c2427     FALSE 0.181 76.000 0.000 1.000   NA
 304201 304202 c2427 c2428     FALSE 0.358 -100.000 0.000 0.005 N NA
 304202 304203 c2428 c2429     FALSE 0.309 -202.000 0.000 0.005 N NA
 304203 304204 c2429 c2430     TRUE 0.981 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 304206 304207 c2432 c2433     TRUE 0.946 4.000 0.094 1.000 Y NA
 304207 304208 c2433 c2434     FALSE 0.032 45.000 0.000 NA   NA
 304210 304211 c2436 c2437     FALSE 0.001 591.000 0.000 NA   NA
 304211 304212 c2437 c2438     FALSE 0.011 -73.000 0.000 NA   NA
 304212 304213 c2438 c2439     FALSE 0.034 36.000 0.000 NA   NA
 304213 304214 c2439 c2440     FALSE 0.061 13.000 0.000 NA   NA