MicrobesOnline Operon Predictions for Shigella flexneri 2a str. 301

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 285275 2177455 SF0001 SF0002 thrL thrA FALSE 0.210 81.000 0.043 1.000   NA
 2177455 285277 SF0002 SF0003 thrA thrB TRUE 0.987 2.000 0.133 1.000 Y NA
 285277 285278 SF0003 SF0004 thrB thrC TRUE 0.993 1.000 0.233 1.000 Y NA
 285278 2177456 SF0004 SF0005 thrC   FALSE 0.020 223.000 0.003 NA   NA
 285280 2177457 SF0006 SF0007 yaaA yaaJ FALSE 0.279 70.000 0.000 NA   NA
 285281 2177458 SF0008 SF0009   talB TRUE 0.592 -121.000 0.000 NA   NA
 2177458 2177459 SF0009 SF0010 talB mogA FALSE 0.117 115.000 0.042 1.000 N NA
 285284 285285 SF0011 SF0012 yaaH   FALSE 0.116 149.000 0.043 NA   NA
 285285 285286 SF0012 SF0013   yaaI TRUE 0.985 26.000 0.500 NA   NA
 285287 2177460 SF0014 SF0015 dnaK dnaJ TRUE 0.903 89.000 0.236 0.004 Y NA
 2177460 285289 SF0015 SF0016 dnaJ nhaA FALSE 0.002 843.000 0.022 1.000 N NA
 285289 2177461 SF0016 SF0017 nhaA nhaR TRUE 0.698 66.000 0.292 1.000 N NA
 285291 285292 SF0018 SF0019 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 285292 2177462 SF0019 SF0020 insA rpsT FALSE 0.008 389.000 0.000 NA N NA
 285294 285295 SF0021 SF0022 ribF ileS TRUE 0.886 43.000 0.254 1.000 N NA
 285295 285296 SF0022 SF0023 ileS lspA TRUE 0.846 0.000 0.045 1.000 N NA
 285298 2177463 SF0025 SF0026 slpA lytB TRUE 0.990 2.000 0.626 1.000 N NA
 2177463 285300 SF0026 SF0027 lytB yaaF FALSE 0.180 66.000 0.028 1.000 N NA
 285300 285301 SF0027 SF0028 yaaF dapB FALSE 0.032 167.000 0.003 1.000 N NA
 285301 2177464 SF0028 SF0029 dapB carA FALSE 0.059 456.000 0.034 1.000 Y NA
 2177464 285303 SF0029 SF0030 carA carB TRUE 0.997 18.000 0.345 0.001 Y NA
 285303 285304 SF0030 SF0031 carB caiF FALSE 0.030 262.000 0.000 NA   NA
 285305 285306 SF0032 SF0033 caiE caiD TRUE 0.783 -15.000 0.000 1.000   NA
 285306 285307 SF0033 SF0034 caiD caiC TRUE 0.991 1.000 0.000 0.023 Y NA
 285307 285308 SF0034 SF0035 caiC caiB TRUE 0.748 59.000 0.154 0.023 N NA
 285308 285309 SF0035 SF0036 caiB caiA TRUE 0.685 129.000 0.529 1.000 N NA
 285309 285310 SF0036 SF0037 caiA caiT TRUE 0.852 31.000 0.118 1.000 N NA
 2177465 285312 SF0038 SF0039 fixA fixB TRUE 0.994 15.000 0.231 0.019 Y NA
 285312 285313 SF0039 SF0040 fixB fixC FALSE 0.470 201.000 0.000 0.053 Y NA
 285313 285314 SF0040 SF0041 fixC fixX TRUE 0.994 -3.000 0.167 0.053 Y NA
 285314 285315 SF0041 SF0042 fixX yaaU FALSE 0.319 59.000 0.000 1.000 N NA
 285315 285316 SF0042 SF0043 yaaU yabF TRUE 0.613 48.000 0.000 1.000   NA
 285316 285317 SF0043 SF0044 yabF kefC TRUE 0.986 -7.000 0.560 1.000   NA
 285317 2177466 SF0044 SF0045 kefC folA FALSE 0.026 191.000 0.012 1.000 N NA
 285319 285320 SF0046 SF0047 apaH apaG TRUE 0.958 7.000 0.267 NA N NA
 285320 285321 SF0047 SF0048 apaG ksgA TRUE 0.860 3.000 0.078 NA N NA
 285321 285322 SF0048 SF0049 ksgA pdxA TRUE 0.958 -3.000 0.197 1.000 N NA
 285322 285323 SF0049 SF0050 pdxA surA TRUE 0.990 0.000 0.561 1.000 N NA
 285323 285324 SF0050 SF0051 surA imp TRUE 0.709 53.000 0.182 1.000 N NA
 285326 285327 SF0053 SF0054 rluA hepA TRUE 0.901 -45.000 0.294 1.000 N NA
 285327 285328 SF0054 SF0055 hepA polB FALSE 0.541 165.000 0.098 1.000 Y NA
 285328 285329 SF0055 SF0056 polB araD FALSE 0.111 75.000 0.018 1.000 N NA
 285329 2177468 SF0056 SF0057 araD araA FALSE 0.062 200.000 0.000 NA   NA
 2177468 285330 SF0057 SF0058 araA araB TRUE 0.831 15.000 0.000 NA   NA
 2177469 285332 SF0059 SF0060 araC yabI FALSE 0.395 86.000 0.167 NA   NA
 2177470 285334 SF0061 SF0062 yabJ thiP TRUE 0.985 -16.000 0.522 0.016 N NA
 285334 2177471 SF0062 SF0063 thiP tbpA TRUE 0.988 -24.000 0.697 0.070 N NA
 2177471 2177472 SF0063 SF0064 tbpA yabN FALSE 0.198 164.000 0.010 0.070   NA
 285338 285339 SF0066 SF0067 leuD leuC TRUE 0.996 11.000 0.309 0.001 Y NA
 285339 285340 SF0067 SF0068 leuC leuB TRUE 0.997 3.000 0.275 0.001 Y NA
 285340 285341 SF0068 SF0069 leuB leuA TRUE 0.995 0.000 0.126 0.001 Y NA
 285341 285342 SF0069 SF0070 leuA leuL FALSE 0.430 93.000 0.010 0.001   NA
 285343 2177473 SF0071 SF0072 leuO ilvI FALSE 0.015 318.000 0.000 1.000 N NA
 2177473 2177474 SF0072 SF0073 ilvI ilvH TRUE 0.998 3.000 0.371 0.002 Y NA
 2177474 285346 SF0073 SF0074 ilvH fruL TRUE 0.809 12.000 0.000 NA   NA
 285346 285347 SF0074 SF0075 fruL fruR FALSE 0.211 82.000 0.000 NA   NA
 285347 285348 SF0075 SF0076 fruR insA FALSE 0.117 123.000 0.000 NA N NA
 285348 285349 SF0076 SF0077 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 285349 2177475 SF0077 SF0078 insB yabB FALSE 0.007 559.000 0.000 NA   NA
 2177475 285351 SF0078 SF0079 yabB yabC TRUE 0.991 2.000 0.635 NA   NA
 285351 285352 SF0079 SF0080 yabC ftsL TRUE 0.966 -3.000 0.227 1.000 N NA
 285352 285353 SF0080 SF0081 ftsL ftsI TRUE 0.896 16.000 0.124 1.000 N NA
 285353 285354 SF0081 SF0082 ftsI murE TRUE 0.964 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 285354 285355 SF0082 SF0083 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 285355 285356 SF0083 SF0084 murF mraY TRUE 0.996 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 285356 285357 SF0084 SF0085 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.004 Y NA
 285357 2177476 SF0085 SF0086 murD ftsW TRUE 0.990 0.000 0.297 0.003 N NA
 2177476 285359 SF0086 SF0087 ftsW murG TRUE 0.991 -3.000 0.647 1.000 N NA
 285359 285360 SF0087 SF0088 murG murC TRUE 0.952 54.000 0.283 1.000 Y NA
 285360 285361 SF0088 SF0089 murC ddlB TRUE 0.992 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 285361 285362 SF0089 SF0090 ddlB ftsQ TRUE 0.995 2.000 0.372 NA Y NA
 285362 285363 SF0090 SF0091 ftsQ ftsA TRUE 0.982 -3.000 0.389 NA N NA
 285363 2177477 SF0091 SF0092 ftsA ftsZ TRUE 0.957 61.000 0.460 1.000 Y NA
 2177477 285365 SF0092 SF0093 ftsZ lpxC FALSE 0.295 101.000 0.134 1.000 N NA
 285365 2177478 SF0093 SF0094 lpxC yacA FALSE 0.043 231.000 0.000 1.000   NA
 2177478 285367 SF0094 SF0095 yacA secA FALSE 0.400 62.000 0.065 1.000   NA
 285367 285368 SF0095 SF0096 secA mutT FALSE 0.574 60.000 0.168 1.000 N NA
 285369 285370 SF0097 SF0098   yacG TRUE 0.628 -49.000 0.000 NA   NA
 285370 285371 SF0098 SF0099 yacG yacF TRUE 0.972 10.000 0.356 NA   NA
 285371 285372 SF0099 SF0100 yacF yacE TRUE 0.935 0.000 0.110 NA   NA
 285374 285375 SF0102 SF0103   hofC TRUE 0.837 8.000 0.000 NA   NA
 285375 2177479 SF0103 SF0104 hofC hofB TRUE 0.799 -10.000 0.000 NA   NA
 2177479 285376 SF0104 SF0105 hofB ppdD TRUE 0.819 10.000 0.000 NA   NA
 285376 2177480 SF0105 SF0106 ppdD nadC FALSE 0.017 203.000 0.015 NA N NA
 285378 2177481 SF0107 SF0108 ampD ampE TRUE 0.993 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 2177482 285382 SF0110 SF0111 pdhR aceE FALSE 0.376 161.000 0.276 1.000 N NA
 285382 285383 SF0111 SF0112 aceE aceF TRUE 0.989 15.000 0.220 1.000 Y NA
 285383 2177483 SF0112 SF0113 aceF lpdA FALSE 0.429 325.000 0.463 1.000 Y NA
 2177485 285386 SF0115 SF0116 acnB yacL FALSE 0.112 175.000 0.068 NA   NA
 285387 285388 SF0117 SF0118 speD speE TRUE 0.985 16.000 0.162 1.000 Y NA
 285388 285389 SF0118 SF0120 speE yacC TRUE 0.640 106.000 0.354 NA   NA
 285394 285395 SF0124 SF0125 yadG yadH TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.088 Y NA
 285395 285396 SF0125 SF0126 yadH yadI FALSE 0.118 105.000 0.037 1.000 N NA
 285396 2177488 SF0126 SF0127 yadI yadE TRUE 0.899 64.000 0.222 1.000 Y NA
 285400 285401 SF0130 SF0131 panC panB TRUE 0.997 12.000 0.395 0.001 Y NA
 285401 285402 SF0131 SF0132 panB   FALSE 0.105 113.000 0.002 1.000   NA
 285404 2177490 SF0134 SF0135 folK pcnB TRUE 0.967 -3.000 0.234 1.000 N NA
 2177490 285406 SF0135 SF0136 pcnB yadB TRUE 0.959 39.000 0.131 1.000 Y NA
 285406 2177491 SF0136 SF0137 yadB dksA TRUE 0.624 67.000 0.231 1.000 N NA
 2177491 285408 SF0137 SF0138 dksA sfsA FALSE 0.192 178.000 0.151 NA   NA
 285408 285409 SF0138 SF0139 sfsA ligT TRUE 0.812 15.000 0.045 NA   NA
 285410 2177492 SF0140 SF0141 hrpB mrcB FALSE 0.135 196.000 0.158 1.000 N NA
 2177492 285412 SF0141 SF0142 mrcB fhuA FALSE 0.035 220.000 0.000 1.000 N NA
 285412 2177493 SF0142 SF0143 fhuA fhuC TRUE 0.938 51.000 0.156 1.000 Y NA
 2177493 2177494 SF0143 SF0144 fhuC fhuD TRUE 0.982 0.000 0.031 1.000 Y NA
 2177494 285415 SF0144 SF0145 fhuD fhuB TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 285417 2177495 SF0147 SF0148 yadQ yadR FALSE 0.160 82.000 0.031 NA   NA
 285419 285420 SF0149 SF0150 yadS yadT TRUE 0.892 38.000 0.213 NA   NA
 285420 285421 SF0150 SF0151 yadT pfs TRUE 0.826 -7.000 0.073 1.000 N NA
 285422 285423 SF0152 SF0153 dgt htrA FALSE 0.040 266.000 0.101 1.000 N NA
 285423 2177496 SF0153 SF0154 htrA yaeG FALSE 0.151 137.000 0.000 NA   NA
 285424 285425 SF0155 SF0156 yaeH dapD FALSE 0.015 314.000 0.035 NA   NA
 285425 285426 SF0156 SF0157 dapD glnD TRUE 0.829 31.000 0.097 1.000 N NA
 285426 285427 SF0157 SF0158 glnD map TRUE 0.680 62.000 0.243 1.000 N NA
 2177497 285429 SF0159 SF0160 rpsB tsf TRUE 0.706 258.000 0.748 1.000 Y NA
 285429 285430 SF0160 SF0161 tsf pyrH FALSE 0.570 147.000 0.416 1.000 N NA
 285430 285431 SF0161 SF0162 pyrH frr FALSE 0.267 292.000 0.626 1.000 N NA
 285431 285432 SF0162 SF0163 frr dxr FALSE 0.107 92.000 0.032 1.000 N NA
 285432 285433 SF0163 SF0164 dxr yaeS FALSE 0.349 186.000 0.025 1.000 Y NA
 285433 2177498 SF0164 SF0165 yaeS cdsA TRUE 0.994 13.000 0.400 1.000 Y NA
 2177498 2177499 SF0165 SF0166 cdsA yaeL TRUE 0.819 12.000 0.080 1.000 N NA
 2177499 285436 SF0166 SF0167 yaeL yaeT TRUE 0.985 30.000 0.204 1.000 Y NA
 285436 285437 SF0167 SF0168 yaeT hlpA TRUE 0.859 122.000 0.354 1.000 Y NA
 285437 285438 SF0168 SF0169 hlpA lpxD TRUE 0.998 4.000 0.814 1.000 Y NA
 285438 2177500 SF0169 SF0170 lpxD fabZ TRUE 0.822 105.000 0.796 1.000 N NA
 2177500 285440 SF0170 SF0171 fabZ lpxA TRUE 0.993 4.000 0.850 1.000 N NA
 285440 2177501 SF0171 SF0172 lpxA lpxB TRUE 0.995 0.000 0.289 1.000 Y NA
 2177501 285442 SF0172 SF0173 lpxB rnhB TRUE 0.956 -3.000 0.186 1.000 N NA
 285442 285443 SF0173 SF0174 rnhB dnaE TRUE 0.957 37.000 0.104 1.000 Y NA
 285443 285444 SF0174 SF0175 dnaE accA TRUE 0.880 13.000 0.122 1.000 N NA
 285444 285445 SF0175 SF0176 accA ldcC FALSE 0.071 99.000 0.010 1.000 N NA
 285445 285446 SF0176 SF0177 ldcC yaeR TRUE 0.831 57.000 0.039 1.000 Y NA
 285446 285447 SF0177 SF0178 yaeR mesJ FALSE 0.143 65.000 0.015 1.000 N NA
 285448 285449 SF0179 SF0180 yaeO yaeP TRUE 0.909 -13.000 0.179 NA   NA
 285450 285451 SF0181 SF0182 yaeQ yaeJ TRUE 0.848 -3.000 0.034 NA   NA
 285451 285452 SF0182 SF0183 yaeJ cutF TRUE 0.758 14.000 0.027 NA   NA
 2177502 2177503 SF0184 SF0185 yaeF proS FALSE 0.301 53.000 0.002 NA   NA
 2177503 285455 SF0185 SF0186 proS yaeB FALSE 0.169 111.000 0.048 NA   NA
 285455 285456 SF0186 SF0187 yaeB rcsF TRUE 0.972 -3.000 0.247 NA   NA
 285456 285457 SF0187 SF0188 rcsF yaeC TRUE 0.703 118.000 0.500 NA   NA
 285457 285458 SF0188 SF0189 yaeC yaeE TRUE 0.992 40.000 0.411 0.056 Y NA
 285458 285459 SF0189 SF0190 yaeE abc TRUE 0.996 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 285460 408042 SF0191 SF4435 yaeD rrsH FALSE 0.015 364.000 0.000 NA   NA
 408042 400012 SF4435 SF4436 rrsH tRNA-Ile FALSE 0.285 69.000 0.000 NA   NA
 400012 400013 SF4436 SF4437 tRNA-Ile tRNA-Ala TRUE 0.644 43.000 0.000 NA   NA
 400013 400014 SF4437 SF4438 tRNA-Ala tRNA-Glu FALSE 0.028 273.000 0.000 NA   NA
 400014 2177504 SF4438 SF4439 tRNA-Glu rrlH FALSE 0.070 194.000 0.000 NA   NA
 2177504 406619 SF4439 SF4440 rrlH rrfH FALSE 0.188 95.000 0.000 NA   NA
 406619 400015 SF4440 SF4441 rrfH tRNA-Asp FALSE 0.485 53.000 0.000 NA   NA
 400015 285461 SF4441 SF0192 tRNA-Asp yafB FALSE 0.112 163.000 0.000 NA   NA
 285462 285463 SF0193 SF0194 yi41 yafC FALSE 0.499 50.000 0.000 1.000 N NA
 285464 2177505 SF0195 SF0196 yafD yafE FALSE 0.046 228.000 0.066 NA   NA
 2177506 285467 SF0197 SF0198 dniR gloB TRUE 0.625 72.000 0.233 1.000   NA
 2177507 400016 SF0200 SF4442 dnaQ tRNA-Asp FALSE 0.155 133.000 0.000 NA   NA
 285471 285472 SF0202 SF0203 sciA   FALSE 0.029 268.000 0.000 NA   NA
 285472 285473 SF0203 SF0204   sciC TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 285473 2177508 SF0204 SF0205 sciC   TRUE 0.993 16.000 1.000 NA   NA
 2177508 2177509 SF0205 SF0206   sat1 FALSE 0.151 195.000 0.154 NA   NA
 2177509 285476 SF0206 SF0207 sat1   TRUE 0.894 -13.000 0.154 NA   NA
 285476 285477 SF0207 SF0208     FALSE 0.037 238.000 0.000 NA   NA
 285478 285479 SF0209 SF0210 yi21_g2 yi22_g5 TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 285480 285481 SF0211 SF0212     TRUE 0.824 14.000 0.000 NA   NA
 285481 285482 SF0212 SF0213     TRUE 0.709 -31.000 0.000 NA   NA
 285482 285483 SF0213 SF0214     TRUE 0.840 27.000 0.000 NA   NA
 285484 2177510 SF0215 SF0216     TRUE 0.942 1.000 0.143 NA   NA
 2177510 285486 SF0216 SF0217     TRUE 0.963 14.000 0.286 NA   NA
 285486 285487 SF0217 SF0218     TRUE 0.955 0.000 0.161 NA   NA
 285487 2177511 SF0218 SF0219     TRUE 0.627 45.000 0.000 NA   NA
 2177511 285489 SF0219 SF0220     TRUE 0.741 -22.000 0.000 NA   NA
 285489 285490 SF0220 SF0221     TRUE 0.990 0.000 0.500 NA   NA
 285490 285491 SF0221 SF0222     TRUE 0.978 0.000 0.286 NA   NA
 285491 2177512 SF0222 SF0223     TRUE 0.994 0.000 0.750 NA   NA
 2177512 285493 SF0223 SF0224     TRUE 0.990 3.000 0.600 NA   NA
 285493 285494 SF0224 SF0225     TRUE 0.969 10.000 0.333 NA   NA
 285494 2177513 SF0225 SF0226     TRUE 0.951 1.000 0.167 NA   NA
 2177513 285496 SF0226 SF0227     FALSE 0.163 126.000 0.000 NA   NA
 285496 285497 SF0227 SF0228     FALSE 0.055 215.000 0.000 1.000   NA
 285498 285499 SF0229 SF0230 psiF phoA FALSE 0.143 101.000 0.032 NA   NA
 285499 285500 SF0230 SF0231 phoA yaiB TRUE 0.715 32.000 0.032 NA   NA
 285504 2177514 SF0235 SF0236 yaiW sbmA TRUE 0.833 13.000 0.000 1.000   NA
 285507 2177515 SF0238 SF0239 yaiV yaiU TRUE 0.644 43.000 0.000 NA   NA
 2177515 285508 SF0239 SF0240 yaiU   TRUE 0.840 19.000 0.000 NA   NA
 285508 285509 SF0240 SF0241   tra5_g5 FALSE 0.282 274.000 0.000 0.052 Y NA
 285509 285510 SF0241 SF0242 tra5_g5   TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 285510 285511 SF0242 SF0243     FALSE 0.038 233.000 0.000 NA   NA
 285511 285512 SF0243 SF0244   yi22_g5 TRUE 0.730 -25.000 0.000 NA   NA
 285512 285513 SF0244 SF0245 yi22_g5 yi21_g2 TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 285514 285515 SF0246 SF0247 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 285518 285519 SF0250 SF0251 tauD tauC TRUE 0.962 -3.000 0.214 1.000 N NA
 285519 285520 SF0251 SF0252 tauC tauB TRUE 0.998 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 285520 285521 SF0252 SF0253 tauB tauA TRUE 0.970 13.000 0.047 1.000 Y NA
 285521 285522 SF0253 SF0254 tauA insB FALSE 0.006 558.000 0.000 1.000 N NA
 285522 285523 SF0254 SF0255 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 285524 2177516 SF0256 SF0257 ykgH   FALSE 0.237 76.000 0.000 NA   NA
 2177517 285526 SF0258 SF0259 ykgG ykgF TRUE 0.986 -7.000 0.286 0.001   NA
 285526 285527 SF0259 SF0260 ykgF ykgE TRUE 0.989 11.000 0.286 NA Y NA
 285528 285529 SF0261 SF0262 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 285529 285530 SF0262 SF0263 insB   FALSE 0.079 185.000 0.000 NA   NA
 285530 285531 SF0263 SF0264     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 285531 285532 SF0264 SF0265     TRUE 0.845 25.000 0.000 NA   NA
 285532 285533 SF0265 SF0266     FALSE 0.008 490.000 0.000 NA   NA
 285533 285534 SF0266 SF0267     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 285534 285535 SF0267 SF0268     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 2177520 2177521 SF0272 SF0273 gmhA yafJ FALSE 0.219 206.000 0.229 1.000   NA
 2177522 285542 SF0275 SF0276 yafL yafM FALSE 0.094 176.000 0.000 NA   NA
 2177523 285545 SF0277 SF0279 mbhA dinP FALSE 0.224 71.000 0.000 1.000 N NA
 285545 285546 SF0279 SF0280 dinP yafN FALSE 0.420 52.000 0.000 NA N NA
 285546 285547 SF0280 SF0281 yafN yafO TRUE 0.987 3.000 0.500 NA   NA
 285547 285548 SF0281 SF0282 yafO yafP TRUE 0.819 10.000 0.000 NA   NA
 285548 2177524 SF0282 SF0283 yafP   FALSE 0.035 246.000 0.000 NA   NA
 2177524 285550 SF0283 SF0284   prfH FALSE 0.554 116.000 0.303 NA   NA
 285552 285553 SF0286 SF0287 gpt yafA FALSE 0.159 92.000 0.040 NA   NA
 285553 285554 SF0287 SF0288 yafA crl FALSE 0.375 58.000 0.048 NA   NA
 285556 285557 SF0290 SF0291 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 285557 2177526 SF0291 SF0292 insB proB FALSE 0.058 191.000 0.000 1.000 N NA
 2177526 285559 SF0292 SF0293 proB proA TRUE 0.985 12.000 0.026 0.001 Y NA
 285559 400017 SF0293 SF4443 proA tRNA-Thr FALSE 0.173 115.000 0.000 NA   NA
 285560 285561 SF0294 SF0295   tra5_g5 TRUE 0.939 27.000 0.000 0.052   NA
 285561 285562 SF0295 SF0296 tra5_g5   TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 285562 285563 SF0296 SF0297   intD FALSE 0.442 57.000 0.000 1.000   NA
 285563 285564 SF0297 SF0298 intD yfdT FALSE 0.041 227.000 0.000 NA   NA
 285564 285565 SF0298 SF0299 yfdT yfdS TRUE 0.890 0.000 0.000 NA   NA
 285565 285566 SF0299 SF0300 yfdS   TRUE 0.698 -34.000 0.000 NA   NA
 285566 285567 SF0300 SF0301     FALSE 0.055 215.000 0.000 1.000   NA
 285568 285569 SF0302 SF0303   tra5_g5 TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 285569 2177527 SF0303 SF0304 tra5_g5   FALSE 0.398 109.000 0.000 0.052   NA
 2177527 285571 SF0304 SF0305   gtrA FALSE 0.034 262.000 0.000 1.000   NA
 285571 285572 SF0305 SF0306 gtrA gtrB TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 285572 285573 SF0306 SF0307 gtrB gtrII TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 285576 285577 SF0310 SF0311     TRUE 0.719 -28.000 0.000 NA   NA
 285577 285578 SF0311 SF0312   tra5_g5 FALSE 0.485 53.000 0.000 NA   NA
 285578 285579 SF0312 SF0313 tra5_g5   TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 285580 285581 SF0314 SF0315 intD   FALSE 0.012 349.000 0.000 1.000 N NA
 285582 285583 SF0316 SF0317   tra5_g5 FALSE 0.162 127.000 0.000 NA   NA
 285583 285584 SF0317 SF0318 tra5_g5   TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 285584 285585 SF0318 SF0319     TRUE 0.946 -34.000 0.000 1.000 Y NA
 285585 285586 SF0319 SF0320     FALSE 0.055 215.000 0.000 1.000   NA
 285589 2177528 SF0323 SF0324 yaiI aroL FALSE 0.042 183.000 0.007 NA   NA
 2177528 285591 SF0324 SF0325 aroL yaiA FALSE 0.530 50.000 0.044 NA   NA
 285591 285592 SF0325 SF0326 yaiA aroM FALSE 0.032 258.000 0.000 NA   NA
 285592 285593 SF0326 SF0327 aroM yaiE FALSE 0.250 72.000 0.049 NA   NA
 285593 285594 SF0327 SF0328 yaiE ykiA FALSE 0.056 209.000 0.000 NA   NA
 285594 285595 SF0328 SF0329 ykiA   TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 285597 2177530 SF0330 SF0332 yajF   TRUE 0.745 -21.000 0.000 NA   NA
 2177531 285599 SF0333 SF0334 araJ sbcC FALSE 0.089 126.000 0.030 1.000 N NA
 285599 285600 SF0334 SF0335 sbcC sbcD TRUE 0.991 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 285601 285602 SF0336 SF0337 phoB phoR TRUE 0.979 58.000 0.453 0.012 Y NA
 285602 285603 SF0337 SF0338 phoR brnQ FALSE 0.009 407.000 0.000 1.000 N NA
 285603 2177532 SF0338 SF0339 brnQ proY TRUE 0.937 76.000 0.348 0.083 Y NA
 2177532 285605 SF0339 SF0340 proY malZ FALSE 0.187 155.000 0.123 1.000 N NA
 285607 285608 SF0342 SF0343 queA vacC TRUE 0.982 55.000 0.360 0.001 Y NA
 285608 285609 SF0343 SF0344 vacC yajC TRUE 0.968 23.000 0.325 NA N NA
 285609 285610 SF0344 SF0345 yajC secD TRUE 0.967 28.000 0.045 NA Y NA
 285610 2177533 SF0345 SF0346 secD secF TRUE 0.994 11.000 0.206 0.001 Y NA
 2177533 285612 SF0346 SF0347 secF yajD FALSE 0.109 129.000 0.015 1.000   NA
 2177534 285614 SF0348 SF0349 tsx yajI FALSE 0.022 298.000 0.000 NA   NA
 285615 285616 SF0350 SF0351 ybaD ribD TRUE 0.965 4.000 0.277 NA N NA
 285616 2177535 SF0351 SF0352 ribD ribH TRUE 0.795 89.000 0.034 0.001 Y NA
 2177535 285618 SF0352 SF0353 ribH nusB TRUE 0.972 20.000 0.347 1.000 N NA
 285618 285619 SF0353 SF0354 nusB thiL FALSE 0.517 78.000 0.225 1.000 N NA
 285619 2177536 SF0354 SF0355 thiL pgpA TRUE 0.902 -22.000 0.206 1.000 N NA
 285621 285622 SF0356 SF0357 yajO dxs FALSE 0.205 55.000 0.009 1.000 N NA
 285622 285623 SF0357 SF0358 dxs ispA TRUE 0.977 25.000 0.060 1.000 Y NA
 285623 285624 SF0358 SF0359 ispA xseB TRUE 0.817 0.000 0.035 1.000 N NA
 285626 285627 SF0361 SF0362 thiJ apbA TRUE 0.815 -43.000 0.155 NA   NA
 285629 2177538 SF0364 SF0365     TRUE 0.769 53.000 0.000 0.009   NA
 2177539 2177540 SF0367 SF0368     FALSE 0.023 294.000 0.000 NA   NA
 2177540 2177541 SF0368 SF0369   cyoE FALSE 0.089 184.000 0.000 1.000   NA
 2177541 285635 SF0369 SF0370 cyoE cyoD TRUE 0.944 15.000 0.118 0.083 N NA
 285635 285636 SF0370 SF0371 cyoD cyoC TRUE 0.998 0.000 0.485 0.052 Y NA
 285636 2177542 SF0371 SF0372 cyoC cyoB TRUE 0.799 -10.000 0.000 NA   NA
 2177542 2177543 SF0372 SF0373 cyoB cyoA TRUE 0.840 22.000 0.000 NA   NA
 2177543 285637 SF0373 SF0374 cyoA   TRUE 0.770 33.000 0.000 NA   NA
 285637 285638 SF0374 SF0375     FALSE 0.158 130.000 0.000 NA   NA
 285638 285639 SF0375 SF0376     TRUE 0.982 -3.000 0.000 NA Y NA
 285639 285640 SF0376 SF0377   ampG FALSE 0.016 370.000 0.000 1.000   NA
 285640 2177544 SF0377 SF0378 ampG yajG TRUE 0.894 44.000 0.256 NA   NA
 285642 285643 SF0379 SF0380 bolA   TRUE 0.611 -66.000 0.000 NA   NA
 285643 285644 SF0380 SF0381   tig FALSE 0.137 147.000 0.000 NA   NA
 285644 2177545 SF0381 SF0382 tig clpP FALSE 0.521 247.000 0.351 1.000 Y NA
 2177545 285646 SF0382 SF0383 clpP clpX TRUE 0.855 126.000 0.352 1.000 Y NA
 285646 2177546 SF0383 SF0384 clpX lon TRUE 0.686 188.000 0.201 0.085 Y NA
 2177546 285648 SF0384 SF0385 lon hupB FALSE 0.038 209.000 0.000 NA N NA
 285648 285649 SF0385 SF0386 hupB ybaU FALSE 0.050 192.000 0.000 NA N NA
 285649 285650 SF0386 SF0387 ybaU ybaV FALSE 0.072 151.000 0.033 1.000 N NA
 285650 285651 SF0387 SF0388 ybaV ybaW FALSE 0.151 94.000 0.027 1.000   NA
 285652 285653 SF0389 SF0390 ybaX ybaE FALSE 0.243 65.000 0.019 1.000   NA
 285654 2177547 SF0391 SF0392 cof ybaO FALSE 0.230 67.000 0.020 1.000   NA
 2177547 285656 SF0392 SF0393 ybaO mdlA TRUE 0.907 30.000 0.179 1.000 N NA
 285656 2177548 SF0393 SF0394 mdlA mdlB TRUE 0.999 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 2177548 2177549 SF0394 SF0395 mdlB glnK FALSE 0.043 181.000 0.028 1.000 N NA
 2177549 285659 SF0395 SF0396 glnK amtB TRUE 0.893 30.000 0.156 1.000 N NA
 285661 285662 SF0398 SF0399 ybaY yi41 FALSE 0.188 93.000 0.000 NA   NA
 2177552 285664 SF4554 SF0401 ffs ybaA FALSE 0.180 111.000 0.000 NA   NA
 2177553 2177554 SF0402 SF0403 ylaB ylaC FALSE 0.111 164.000 0.000 NA   NA
 2177554 2177555 SF0403 SF0404 ylaC ylaD FALSE 0.171 116.000 0.000 NA   NA
 2177555 2177556 SF0404 SF0405 ylaD hha FALSE 0.098 172.000 0.000 NA   NA
 2177556 285668 SF0405 SF0406 hha ybaJ TRUE 0.880 26.000 0.080 NA   NA
 285668 285669 SF0406 SF0407 ybaJ acrB FALSE 0.007 546.000 0.000 NA   NA
 285669 2177557 SF0407 SF0408 acrB acrA TRUE 0.980 23.000 0.458 1.000 N NA
 285671 285672 SF0409 SF0410 acrR aefA FALSE 0.129 128.000 0.000 1.000 N NA
 285673 285674 SF0411 SF0412 ybaM priC TRUE 0.981 14.000 0.474 NA   NA
 285675 2177558 SF0413 SF0414 ybaN apt FALSE 0.108 153.000 0.043 NA   NA
 2177558 285677 SF0414 SF0415 apt dnaX FALSE 0.185 129.000 0.088 1.000 N NA
 285677 2177559 SF0415 SF0416 dnaX ybaB TRUE 0.896 53.000 0.411 NA   NA
 2177559 285679 SF0416 SF0417 ybaB recR TRUE 0.992 0.000 0.604 NA   NA
 285679 285680 SF0417 SF0418 recR htpG FALSE 0.098 110.000 0.028 1.000 N NA
 285680 2177560 SF0418 SF0419 htpG adk FALSE 0.147 181.000 0.035 0.085 N NA
 2177560 285682 SF0419 SF0420 adk hemH FALSE 0.060 132.000 0.013 1.000 N NA
 285685 285686 SF0423 SF0424 ybaL fsr FALSE 0.077 238.000 0.000 0.082 N NA
 285688 285689 SF0426 SF0427 ybaK ybaP FALSE 0.037 204.000 0.022 NA   NA
 285692 285693 SF0430 SF0431 ybaS ybaT TRUE 0.977 3.000 0.028 1.000 Y NA
 285693 285694 SF0431 SF0432 ybaT ybbI FALSE 0.132 125.000 0.000 1.000 N NA
 2177561 285696 SF0433 SF0434 ybbJ ybbK TRUE 0.995 0.000 0.313 NA Y NA
 285697 285698 SF0435 SF0436 ybbL ybbM TRUE 0.816 -40.000 0.127 NA   NA
 285699 285700 SF0437 SF0438 ybbN ybbO TRUE 0.917 25.000 0.118 1.000   NA
 285700 2177562 SF0438 SF0440 ybbO tesA TRUE 0.799 -10.000 0.000 NA   NA
 285701 285702 SF0439 SF0441 ybbA ybbP TRUE 0.997 -3.000 0.535 1.000 Y NA
 285703 285704 SF0442 SF0443 ybbB ybbS FALSE 0.173 69.000 0.012 NA   NA
 285705 285706 SF0444 SF0445 ybbT ybbU TRUE 0.811 78.000 0.625 1.000 N NA
 285706 2177563 SF0445 SF0446 ybbU gcl FALSE 0.209 90.000 0.054 1.000   NA
 285708 285709 SF0447 SF0448 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 285709 285710 SF0448 SF0449 insA ylbA TRUE 0.803 29.000 0.000 NA   NA
 285710 2177564 SF0449 SF0450 ylbA ylbB TRUE 0.820 11.000 0.059 NA   NA
 285712 285713 SF0451 SF0452 ylbF arcC TRUE 0.984 -3.000 0.375 NA   NA
 2177565 2177566 SF0453 SF0454 purK purE TRUE 0.995 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 2177566 285716 SF0454 SF0455 purE ybbF FALSE 0.118 118.000 0.016 1.000   NA
 285716 285717 SF0455 SF0456 ybbF ppiB TRUE 0.969 3.000 0.237 1.000   NA
 285719 2177567 SF0458 SF0459 ybcI ybcJ FALSE 0.105 108.000 0.011 NA   NA
 2177567 285721 SF0459 SF0460 ybcJ folD TRUE 0.888 2.000 0.055 1.000   NA
 285722 285723 SF0461 SF0462 sfmA sfmC FALSE 0.262 220.000 0.000 1.000 Y NA
 285723 285724 SF0462 SF0463 sfmC   TRUE 0.990 31.000 0.875 1.000   NA
 285725 285726 SF0464 SF0465 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 285726 285727 SF0465 SF0466 insA   TRUE 0.757 34.000 0.000 NA   NA
 285728 285729 SF0467 SF0468 envY ybcH FALSE 0.083 183.000 0.000 NA   NA
 285729 2177568 SF0468 SF0469 ybcH nfrA TRUE 0.879 1.000 0.000 NA   NA
 2177568 285730 SF0469 SF0470 nfrA nfrB TRUE 0.774 -13.000 0.000 NA   NA
 285730 2177569 SF0470 SF0471 nfrB ybcZ FALSE 0.245 150.000 0.000 0.085 N NA
 2177569 285732 SF0471 SF0472 ybcZ ylcA TRUE 0.998 -10.000 0.600 0.001 Y NA
 285733 285734 SF0473 SF0474 ylcB ylcC TRUE 0.984 24.000 0.500 NA   NA
 285734 2177570 SF0474 SF0475 ylcC ylcD TRUE 0.838 16.000 0.000 NA   NA
 285735 285736 SF0476 SF0477     FALSE 0.281 215.000 0.000 1.000 Y NA
 285737 285738 SF0479 SF0480 yi22_g5 yi21_g2 TRUE 0.731 72.000 0.000 1.000 Y NA
 285739 2177572 SF0481 SF0482 ybdE pheP FALSE 0.339 101.000 0.000 0.082 N NA
 2177573 2177574 SF0483 SF0485 ybdG nfnB FALSE 0.186 108.000 0.000 NA   NA
 2177574 285742 SF0485 SF0484 nfnB   FALSE 0.556 -1557.000 0.000 NA   NA
 285742 285743 SF0484 SF0486   ybdF FALSE 0.008 528.000 0.000 NA   NA
 285743 285744 SF0486 SF0487 ybdF ybdJ FALSE 0.319 65.000 0.000 NA   NA
 285744 285745 SF0487 SF0488 ybdJ ybdK FALSE 0.310 66.000 0.000 NA   NA
 285747 285748 SF0490 SF0491 tra5_g5   TRUE 0.624 165.000 0.000 0.051 Y NA
 285748 285749 SF0491 SF0492     FALSE 0.281 215.000 0.000 1.000 Y NA
 285749 285750 SF0492 SF0493     TRUE 0.736 52.000 0.000 0.095   NA
 2177575 285753 SF0495 SF0496 entD fepA TRUE 0.674 166.000 0.700 1.000 N NA
 285754 285755 SF0497 SF0498 fes entF FALSE 0.047 217.000 0.083 NA N NA
 285755 285756 SF0498 SF0499 entF insA FALSE 0.148 84.000 0.000 NA N NA
 285756 285757 SF0499 SF0500 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 285757 2177576 SF0500 SF0501 insB fepE FALSE 0.054 211.000 0.000 NA   NA
 285758 285759 SF0502 SF0503 fepC fepG TRUE 0.981 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 285759 285760 SF0503 SF0504 fepG fepD TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.054 Y NA
 2177577 285763 SF0507 SF0508 entC entE TRUE 0.819 10.000 0.000 NA   NA
 285763 285764 SF0508 SF0509 entE entB TRUE 0.997 14.000 0.667 1.000 Y NA
 285764 2177578 SF0509 SF0510 entB entA TRUE 0.981 0.000 0.024 1.000 Y NA
 2177578 285766 SF0510 SF0511 entA ybdB TRUE 0.980 3.000 0.065 NA Y NA
 285766 285767 SF0511 SF0512 ybdB cstA FALSE 0.244 181.000 0.222 NA N NA
 285767 285768 SF0512 SF0513 cstA ybdD FALSE 0.393 182.000 0.333 NA   NA
 2177579 285771 SF0518 SF0516 ybdM   FALSE 0.560 -1358.000 0.000 NA   NA
 285771 285772 SF0516 SF0517   yi91 TRUE 0.976 27.000 0.000 1.000 Y NA
 285772 2177580 SF0517 SF0521 yi91 ybdN FALSE 0.157 131.000 0.000 NA   NA
 285773 285774 SF0519 SF0520     TRUE 0.843 57.000 0.000 1.000 Y NA
 285775 285776 SF0522 SF0523 ybdO dsbG FALSE 0.051 210.000 0.067 1.000 N NA
 285777 285778 SF0524 SF0525 ahpC ahpF TRUE 0.724 215.000 0.551 1.000 Y NA
 285781 285782 SF0528 SF0529 rnk rna FALSE 0.015 229.000 0.018 1.000 N NA
 285782 2177581 SF0529 SF0530 rna ybdS FALSE 0.188 96.000 0.000 NA   NA
 2177581 2177582 SF0530 SF0531 ybdS ybdU FALSE 0.005 904.000 0.000 NA   NA
 2177582 285783 SF0531 SF0532 ybdU citF TRUE 0.860 4.000 0.000 NA   NA
 285783 2177583 SF0532 SF0533 citF citE TRUE 0.938 11.000 0.000 0.001 N NA
 2177583 2177584 SF0533 SF0534 citE citD TRUE 0.995 -3.000 0.537 0.001 N NA
 2177584 2177585 SF0534 SF0535 citD citC TRUE 0.974 15.000 0.000 1.000 Y NA
 2177585 285787 SF0535 SF0536 citC insB FALSE 0.010 379.000 0.000 1.000 N NA
 285788 2177586 SF0537 SF0538   ybhA FALSE 0.041 236.000 0.000 1.000   NA
 285790 285791 SF0539 SF0540 modC modB TRUE 0.999 3.000 0.537 0.001 Y NA
 285791 285792 SF0540 SF0541 modB modA TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 285792 2177587 SF0541 SF0542 modA   FALSE 0.127 167.000 0.072 NA   NA
 285794 285795 SF0543 SF0544 modE modF FALSE 0.439 68.000 0.009 0.084   NA
 285795 2177588 SF0544 SF0545 modF galE FALSE 0.023 261.000 0.023 1.000   NA
 2177588 285797 SF0545 SF0546 galE galT TRUE 0.943 10.000 0.053 0.001 N NA
 285797 285798 SF0546 SF0547 galT galK TRUE 0.991 4.000 0.370 0.001 N NA
 285798 285799 SF0547 SF0548 galK galM TRUE 0.991 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 285799 2177589 SF0548 SF0549 galM gpmA FALSE 0.274 203.000 0.009 1.000 Y NA
 285802 285803 SF0551 SF0552 ybgS ybgR FALSE 0.201 114.000 0.057 1.000   NA
 285804 285805 SF0553 SF0554 pnuC nadA TRUE 0.931 38.000 0.023 1.000 Y NA
 285805 400108 SF0554 SF4445 nadA tRNA-Lys FALSE 0.034 249.000 0.000 NA   NA
 400108 400107 SF4445 SF4446 tRNA-Lys tRNA-Val TRUE 0.860 4.000 0.000 NA   NA
 400107 400106 SF4446 SF4447 tRNA-Val tRNA-Lys FALSE 0.152 136.000 0.000 NA   NA
 400106 285806 SF4447 SF0555 tRNA-Lys ybgF FALSE 0.109 165.000 0.000 NA   NA
 285806 2177590 SF0555 SF0556 ybgF pal TRUE 0.880 10.000 0.088 1.000   NA
 2177590 2177591 SF0556 SF0557 pal tolB TRUE 0.975 35.000 0.592 1.000 N NA
 2177591 285809 SF0557 SF0558 tolB tolA FALSE 0.105 133.000 0.051 NA N NA
 285809 285810 SF0558 SF0559 tolA tolR FALSE 0.393 65.000 0.114 NA N NA
 285810 285811 SF0559 SF0560 tolR tolQ TRUE 0.998 4.000 0.556 0.067 Y NA
 285811 285812 SF0560 SF0561 tolQ ybgC TRUE 0.992 -3.000 0.593 1.000   NA
 285812 285813 SF0561 SF0562 ybgC ybgE FALSE 0.189 150.000 0.095 NA   NA
 285813 285814 SF0562 SF0563 ybgE cydB FALSE 0.238 128.000 0.100 NA   NA
 285814 285815 SF0563 SF0564 cydB cydA TRUE 0.986 16.000 0.000 0.051 Y NA
 285815 285816 SF0564 SF0565 cydA ybgG FALSE 0.004 846.000 0.000 1.000 N NA
 285816 285817 SF0565 SF0566 ybgG   TRUE 0.973 18.000 0.036 1.000 Y NA
 285819 285820 SF0568 SF0569 sucD sucC TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 285820 285821 SF0569 SF0570 sucC sucB TRUE 0.727 94.000 0.136 1.000 Y NA
 285821 285822 SF0570 SF0571 sucB sucA TRUE 0.997 15.000 0.667 1.000 Y NA
 285822 285823 SF0571 SF0572 sucA   TRUE 0.753 -18.000 0.000 NA   NA
 285823 285824 SF0572 SF0573   sdhB FALSE 0.376 59.000 0.000 NA   NA
 285824 2177592 SF0573 SF0574 sdhB sdhA TRUE 0.998 16.000 0.604 0.003 Y NA
 2177592 285826 SF0574 SF0575 sdhA sdhD TRUE 0.999 0.000 0.705 0.003 Y NA
 285826 285827 SF0575 SF0576 sdhD sdhC TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 285828 285829 SF0577 SF0578 gltA ybgD FALSE 0.010 391.000 0.000 1.000 N NA
 285829 2177593 SF0578 SF0579 ybgD ybgQ TRUE 0.900 51.000 0.000 1.000 Y NA
 2177593 2177594 SF0579 SF0580 ybgQ ybgP TRUE 0.974 15.000 0.000 1.000 Y NA
 2177594 2177595 SF0580 SF0581 ybgP ybgO TRUE 0.704 -33.000 0.000 NA   NA
 2177595 2177596 SF0581 SF0582 ybgO abrB FALSE 0.188 107.000 0.000 NA   NA
 285833 285834 SF0583 SF0584 nei ybgL TRUE 0.696 36.000 0.037 1.000   NA
 285834 2177597 SF0584 SF0585 ybgL ybgK TRUE 0.799 -10.000 0.000 NA   NA
 2177597 285835 SF0585 SF0586 ybgK ybgJ TRUE 0.839 -6.000 0.000 NA   NA
 285835 285836 SF0586 SF0587 ybgJ ybgI TRUE 0.835 23.000 0.050 NA   NA
 285838 285839 SF0589 SF0590 phrB ybgA TRUE 0.814 -3.000 0.019 NA   NA
 285841 285842 SF0592 SF0593     FALSE 0.336 63.000 0.000 NA   NA
 285842 285843 SF0593 SF0594     TRUE 0.617 -55.000 0.000 NA   NA
 285843 285844 SF0594 SF0595   insB FALSE 0.006 616.000 0.000 NA   NA
 285844 285845 SF0595 SF0596 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 285845 285846 SF0596 SF0597 insA ybfA FALSE 0.009 473.000 0.000 NA   NA
 2177598 2177599 SF0598 SF0599 kdpA kdpB TRUE 0.842 23.000 0.000 NA   NA
 2177599 2177600 SF0599 SF0600 kdpB kdpD FALSE 0.007 574.000 0.000 NA   NA
 2177600 2177601 SF0600 SF0601 kdpD kdpE TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 2177602 285849 SF0603 SF0604 speF potE TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 2177603 2177604 SF0605 SF0606 pgm seqA TRUE 0.919 26.000 0.151 1.000 N NA
 285852 2177605 SF0607 SF0608 ybfF ybfE TRUE 0.662 71.000 0.276 NA   NA
 2177605 2177606 SF0608 SF0609 ybfE fldA TRUE 0.661 140.000 0.473 1.000   NA
 2177606 285855 SF0609 SF0610 fldA fur FALSE 0.052 289.000 0.156 1.000 N NA
 2177607 285857 SF0611 SF0612 ybfN ybfM TRUE 0.693 37.000 0.000 NA   NA
 285857 285858 SF0612 SF0613 ybfM glnS FALSE 0.008 579.000 0.000 1.000   NA
 285858 285859 SF0613 SF0614 glnS nagE FALSE 0.019 203.000 0.006 1.000 N NA
 285860 285861 SF0615 SF0616 nagB nagA TRUE 0.985 60.000 0.557 0.001 Y NA
 285861 285862 SF0616 SF0617 nagA nagC TRUE 0.996 9.000 0.571 1.000 Y NA
 285862 2177608 SF0617 SF0618 nagC nagD TRUE 0.586 48.000 0.000 NA   NA
 2177608 285863 SF0618 SF0619 nagD asnB FALSE 0.012 397.000 0.000 NA   NA
 285863 400019 SF0619 SF4448 asnB tRNA-Met FALSE 0.013 381.000 0.000 NA   NA
 400019 400020 SF4448 SF4449 tRNA-Met tRNA-Leu TRUE 0.819 10.000 0.000 NA   NA
 400020 400021 SF4449 SF4450 tRNA-Leu tRNA-Gln TRUE 0.843 24.000 0.000 NA   NA
 400021 400022 SF4450 SF4451 tRNA-Gln tRNA-Gln TRUE 0.745 35.000 0.000 NA   NA
 400022 400023 SF4451 SF4452 tRNA-Gln tRNA-Met TRUE 0.838 16.000 0.000 NA   NA
 400023 400024 SF4452 SF4453 tRNA-Met tRNA-Gln TRUE 0.586 48.000 0.000 NA   NA
 400024 400025 SF4453 SF4454 tRNA-Gln tRNA-Gln TRUE 0.683 38.000 0.000 NA   NA
 285865 2177610 SF0621 SF0622 yleA ybeZ FALSE 0.429 114.000 0.220 1.000 N NA
 2177610 285867 SF0622 SF0623 ybeZ ybeY TRUE 0.987 -3.000 0.457 NA   NA
 285867 285868 SF0623 SF0624 ybeY ybeX FALSE 0.356 90.000 0.150 NA   NA
 285868 285869 SF0624 SF0625 ybeX lnt TRUE 0.985 25.000 0.557 1.000 N NA
 285869 2177611 SF0625 SF0626 lnt ybeJ FALSE 0.009 397.000 0.000 1.000 N NA
 2177611 285871 SF0626 SF0627 ybeJ gltJ TRUE 0.599 170.000 0.000 0.053 Y NA
 285871 285872 SF0627 SF0628 gltJ gltK TRUE 0.999 0.000 0.933 0.015 Y NA
 285872 285873 SF0628 SF0629 gltK gltL TRUE 0.996 0.000 0.379 1.000 Y NA
 285873 2177612 SF0629 SF0630 gltL ybeK FALSE 0.364 118.000 0.195 NA N NA
 2177612 2177613 SF0630 SF0631 ybeK ybeW FALSE 0.205 84.000 0.000 NA   NA
 285875 285876 SF0632 SF0633 ybeV ybeU TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 285878 285879 SF0635 SF0636 ybeS ybeR TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 2177614 285883 SF0639 SF0640 leuS rlpB TRUE 0.928 15.000 0.182 NA N NA
 285883 285884 SF0640 SF0641 rlpB holA TRUE 0.959 0.000 0.199 NA N NA
 285884 285885 SF0641 SF0642 holA nadD TRUE 0.823 2.000 0.045 1.000 N NA
 285885 2177615 SF0642 SF0643 nadD phpB TRUE 0.816 24.000 0.057 1.000 N NA
 2177615 285887 SF0643 SF0644 phpB ybeB FALSE 0.014 368.000 0.000 NA   NA
 285887 285888 SF0644 SF0645 ybeB ybeA TRUE 0.974 4.000 0.307 NA   NA
 285888 285889 SF0645 SF0646 ybeA mrdA TRUE 0.722 31.000 0.031 NA   NA
 285889 285890 SF0646 SF0647 mrdA mrdB TRUE 0.818 3.000 0.046 1.000 N NA
 285890 285891 SF0647 SF0648 mrdB rlpA TRUE 0.659 11.000 0.035 NA N NA
 285891 285892 SF0648 SF0649 rlpA dacA TRUE 0.874 139.000 0.475 NA Y NA
 285892 285893 SF0649 SF0650 dacA ybeD FALSE 0.229 111.000 0.081 NA   NA
 285893 2177616 SF0650 SF0651 ybeD lipB FALSE 0.485 101.000 0.219 NA   NA
 2177616 2177617 SF0651 SF0652 lipB ybeF FALSE 0.008 412.000 0.000 1.000 N NA
 2177617 285896 SF0652 SF0653 ybeF lipA FALSE 0.017 209.000 0.005 1.000 N NA
 285897 2177618 SF0654 SF0655 tatE ybeM FALSE 0.410 129.000 0.196 1.000   NA
 2177619 285901 SF0657 SF0658 cspE crcA FALSE 0.437 175.000 0.333 1.000   NA
 2177621 285903 SF0660 SF0661 citB   FALSE 0.017 338.000 0.000 NA   NA
 2177622 285905 SF0662 SF0663     FALSE 0.578 62.000 0.000 0.094   NA
 285905 285906 SF0663 SF0664     TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 285906 285907 SF0664 SF0665     TRUE 0.809 12.000 0.000 NA   NA
 285908 285909 SF0666 SF0667     FALSE 0.141 145.000 0.000 NA   NA
 285909 285910 SF0667 SF0668     TRUE 0.860 4.000 0.000 NA   NA
 285910 2177623 SF0668 SF0669     TRUE 0.860 4.000 0.000 NA   NA
 2177623 285912 SF0669 SF0670     FALSE 0.094 176.000 0.000 NA   NA
 285912 285913 SF0670 SF0671     FALSE 0.044 221.000 0.000 NA   NA
 285913 285914 SF0671 SF0672     TRUE 0.783 -15.000 0.000 1.000   NA
 285914 285915 SF0672 SF0673   ybiA TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 285915 2177624 SF0673 SF0674 ybiA   FALSE 0.258 76.000 0.000 1.000   NA
 2177624 285917 SF0674 SF0675     TRUE 0.992 11.000 1.000 NA   NA
 285918 285919 SF0676 SF0677   yi91 FALSE 0.014 371.000 0.000 NA   NA
 285919 285920 SF0677 SF0678 yi91   TRUE 0.976 27.000 0.000 1.000 Y NA
 285920 285921 SF0678 SF0679     TRUE 0.803 29.000 0.000 NA   NA
 285921 400026 SF0679 SF4455   tRNA-Met FALSE 0.075 190.000 0.000 NA   NA
 400026 400027 SF4455 SF4456 tRNA-Met tRNA-Arg TRUE 0.874 2.000 0.000 NA   NA
 400027 400028 SF4456 SF4457 tRNA-Arg tRNA-Thr TRUE 0.867 3.000 0.000 NA   NA
 400028 400029 SF4457 SF4458 tRNA-Thr tRNA-Gly TRUE 0.860 4.000 0.000 NA   NA
 285922 285923 SF0680 SF0681     TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 285925 285926 SF0683 SF0685   yi91 TRUE 0.976 27.000 0.000 1.000 Y NA
 2177625 285928 SF0684 SF0686   dnaB TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.083 Y NA
 285928 285929 SF0686 SF0687 dnaB   TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 285929 2177626 SF0687 SF0688   ybcQ FALSE 0.025 288.000 0.000 NA   NA
 2177626 400030 SF0688 SF4459 ybcQ tRNA-Met FALSE 0.062 200.000 0.000 NA   NA
 400030 400031 SF4459 SF4460 tRNA-Met tRNA-Arg TRUE 0.874 2.000 0.000 NA   NA
 400031 400032 SF4460 SF4461 tRNA-Arg tRNA-Thr TRUE 0.867 3.000 0.000 NA   NA
 400032 400033 SF4461 SF4462 tRNA-Thr tRNA-Gly TRUE 0.860 4.000 0.000 NA   NA
 400033 285931 SF4462 SF0689 tRNA-Gly   FALSE 0.023 293.000 0.000 NA   NA
 285931 285932 SF0689 SF0690     TRUE 0.860 4.000 0.000 NA   NA
 285932 2177627 SF0690 SF0691     FALSE 0.017 330.000 0.000 NA   NA
 2177627 2177628 SF0691 SF0692     TRUE 0.894 -3.000 0.000 1.000   NA
 2177628 285935 SF0692 SF0693     FALSE 0.370 62.000 0.000 1.000   NA
 285936 285937 SF0694 SF0695     FALSE 0.211 82.000 0.000 NA   NA
 285937 285938 SF0695 SF0696     TRUE 0.890 0.000 0.000 NA   NA
 285939 285940 SF0697 SF0698     TRUE 0.813 28.000 0.000 NA   NA
 285940 285941 SF0698 SF0699     TRUE 0.719 -28.000 0.000 NA   NA
 285941 285942 SF0699 SF0700     FALSE 0.177 112.000 0.000 NA   NA
 285942 285943 SF0700 SF0701     FALSE 0.062 201.000 0.000 NA   NA
 285943 2177629 SF0701 SF0702     TRUE 0.869 -85.000 0.000 0.001   NA
 2177629 285945 SF0702 SF0703     TRUE 0.910 -10.000 0.150 1.000   NA
 285945 285946 SF0703 SF0704     TRUE 0.716 37.000 0.000 1.000   NA
 285946 285947 SF0704 SF0705     FALSE 0.394 58.000 0.000 NA   NA
 285947 2177630 SF0705 SF0706     FALSE 0.518 52.000 0.000 NA   NA
 2177630 285949 SF0706 SF0707     TRUE 0.809 12.000 0.000 NA   NA
 285949 2177631 SF0707 SF0708     TRUE 0.809 -13.000 0.071 NA   NA
 2177631 285951 SF0708 SF0709     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 285951 285952 SF0709 SF0710     TRUE 0.994 5.000 1.000 NA   NA
 285952 285953 SF0710 SF0711     TRUE 0.662 41.000 0.000 NA   NA
 285953 285954 SF0711 SF0712     TRUE 0.831 9.000 0.000 NA   NA
 285954 285955 SF0712 SF0713     TRUE 0.957 -28.000 0.400 NA   NA
 285955 285956 SF0713 SF0714     TRUE 0.986 0.000 0.400 NA   NA
 285956 285957 SF0714 SF0715     TRUE 0.890 0.000 0.000 NA   NA
 285957 285958 SF0715 SF0716     TRUE 0.854 5.000 0.000 NA   NA
 285958 285959 SF0716 SF0717     TRUE 0.692 -36.000 0.000 NA   NA
 285959 285960 SF0717 SF0718     TRUE 0.864 61.000 0.500 NA   NA
 285960 285961 SF0718 SF0719     FALSE 0.292 68.000 0.000 NA   NA
 285961 285962 SF0719 SF0720     TRUE 0.855 22.000 0.000 1.000   NA
 285962 285963 SF0720 SF0721     FALSE 0.022 301.000 0.000 NA   NA
 285964 2177632 SF0722 SF0723 ipaH9.8 ybhB FALSE 0.007 583.000 0.000 NA   NA
 2177632 285966 SF0723 SF0725 ybhB bioA FALSE 0.216 59.000 0.003 NA   NA
 285967 285968 SF0724 SF0726 bioB bioF TRUE 0.995 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 285968 2177633 SF0726 SF0727 bioF bioC TRUE 0.988 -13.000 0.133 0.002 Y NA
 2177633 2177634 SF0727 SF0728 bioC bioD TRUE 0.988 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 2177634 285971 SF0728 SF0729 bioD uvrB FALSE 0.015 579.000 0.000 0.082 N NA
 2177636 285974 SF0731 SF0732 moaA moaB TRUE 0.991 22.000 0.108 0.003 Y NA
 285974 285975 SF0732 SF0733 moaB moaC TRUE 0.993 3.000 0.109 0.003 Y NA
 285975 2177637 SF0733 SF0734 moaC moaD TRUE 0.993 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 2177637 285977 SF0734 SF0735 moaD moaE TRUE 0.998 2.000 0.501 0.003 Y NA
 285977 2177638 SF0735 SF0736 moaE ybhL FALSE 0.103 137.000 0.025 NA   NA
 2177638 2177639 SF0736 SF0737 ybhL ybhM FALSE 0.047 205.000 0.037 NA   NA
 285980 285981 SF0738 SF0739 ybhN ybhO TRUE 0.910 0.000 0.071 NA   NA
 285981 285982 SF0739 SF0740 ybhO ybhP TRUE 0.981 -3.000 0.333 NA   NA
 285984 285985 SF0742 SF0743 ybhR ybhS TRUE 0.998 11.000 0.609 0.005 Y NA
 285985 285986 SF0743 SF0744 ybhS ybhF TRUE 0.991 -7.000 0.547 0.082   NA
 285986 285987 SF0744 SF0745 ybhF ybhG TRUE 0.975 -22.000 0.545 1.000   NA
 285987 285988 SF0745 SF0746 ybhG ybiH TRUE 0.970 0.000 0.236 1.000 N NA
 2177640 285992 SF0748 SF0750 dinG ybiB TRUE 0.729 28.000 0.041 1.000 N NA
 285992 285993 SF0750 SF0751 ybiB ybiC FALSE 0.292 141.000 0.000 0.047 N NA
 285994 285995 SF0752 SF0753 ybiJ ybiI FALSE 0.020 265.000 0.027 NA   NA
 285995 285996 SF0753 SF0754 ybiI ybiX FALSE 0.274 74.000 0.000 1.000   NA
 285996 2177641 SF0754 SF0756 ybiX   TRUE 0.654 42.000 0.000 NA   NA
 286000 286001 SF0759 SF0760 ybiO glnQ FALSE 0.008 422.000 0.000 1.000 N NA
 286001 286002 SF0760 SF0761 glnQ glnP TRUE 0.981 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 286002 286003 SF0761 SF0762 glnP glnH TRUE 0.694 139.000 0.051 0.066 Y NA
 286003 2177642 SF0762 SF0763 glnH dps FALSE 0.009 404.000 0.000 1.000 N NA
 2177642 2177643 SF0763 SF0764 dps ybiF FALSE 0.022 299.000 0.044 1.000   NA
 286008 286009 SF0767 SF0768 ybiQ ybiR TRUE 0.728 -3.000 0.014 1.000 N NA
 2177645 286013 SF0771 SF0772 ybiU ybiV FALSE 0.126 152.000 0.000 NA   NA
 286013 286014 SF0772 SF0773 ybiV ybiW FALSE 0.153 146.000 0.000 1.000   NA
 286014 286015 SF0773 SF0774 ybiW ybiY TRUE 0.987 6.000 0.316 0.002 N NA
 286017 286018 SF0776 SF0777 moeB moeA TRUE 0.998 0.000 0.323 0.003 Y NA
 286019 2177646 SF0778 SF0779 ybiK   TRUE 0.905 20.000 0.104 1.000   NA
 2177646 2177647 SF0779 SF0780     TRUE 0.888 20.000 0.083 1.000   NA
 2177647 286022 SF0780 SF0781   yliC TRUE 0.999 18.000 0.803 0.052 Y NA
 286022 286023 SF0781 SF0782 yliC yliD TRUE 0.999 3.000 0.689 0.052 Y NA
 286023 2177648 SF0782 SF0783 yliD   FALSE 0.068 195.000 0.000 NA   NA
 2177648 286024 SF0783 SF0784     TRUE 0.837 8.000 0.000 NA   NA
 286026 286027 SF0786 SF0787   yliI FALSE 0.167 111.000 0.047 NA   NA
 286029 286030 SF0789 SF0790 dacC   TRUE 0.760 29.000 0.000 1.000 N NA
 286030 286031 SF0790 SF0791     TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 286031 286032 SF0791 SF0792     TRUE 0.855 27.000 0.000 1.000   NA
 286033 2177649 SF0793 SF0794 deoR ybjG TRUE 0.755 58.000 0.235 1.000   NA
 286036 2177650 SF0796 SF0797 ybjH   FALSE 0.197 86.000 0.000 NA   NA
 2177650 286038 SF0797 SF0798   ybjJ TRUE 0.855 27.000 0.000 1.000   NA
 286045 286046 SF0805 SF0806 mdaA rimK FALSE 0.299 61.000 0.000 1.000 N NA
 286046 2177653 SF0806 SF0807 rimK ybjN FALSE 0.212 88.000 0.065 NA   NA
 2177653 2177654 SF0807 SF0808 ybjN potF FALSE 0.015 352.000 0.000 NA   NA
 2177654 286049 SF0808 SF0809 potF potG TRUE 0.940 95.000 0.679 1.000 Y NA
 286049 286050 SF0809 SF0810 potG potH TRUE 0.998 10.000 0.857 1.000 Y NA
 286050 2177655 SF0810 SF0811 potH potI TRUE 0.998 -3.000 0.528 0.052 Y NA
 2177655 2177656 SF0811 SF0812 potI ybjO TRUE 0.743 60.000 0.264 NA   NA
 2177656 286053 SF0812 SF0813 ybjO ybjF TRUE 0.892 41.000 0.226 NA   NA
 2177657 286055 SF0814 SF0815 artJ artM FALSE 0.330 292.000 0.143 0.066 Y NA
 286055 286056 SF0815 SF0816 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.015 Y NA
 286056 286057 SF0816 SF0817 artQ artI TRUE 0.995 7.000 0.260 0.052 Y NA
 286057 2177658 SF0817 SF0818 artI artP TRUE 0.993 18.000 0.323 1.000 Y NA
 2177658 2177659 SF0818 SF0819 artP ybjP FALSE 0.060 218.000 0.081 NA   NA
 2177660 286061 SF0820 SF0821   ybjQ FALSE 0.054 211.000 0.000 NA   NA
 286061 286062 SF0821 SF0822 ybjQ ybjR TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 2177661 2177662 SF0823 SF0824   ybjT TRUE 0.877 63.000 0.022 0.003 Y NA
 2177662 286065 SF0824 SF0825 ybjT ybjU TRUE 0.810 11.000 0.074 1.000 N NA
 286065 286066 SF0825 SF0826 ybjU poxB TRUE 0.941 37.000 0.041 1.000 Y NA
 286066 2177663 SF0826 SF0827 poxB   FALSE 0.077 133.000 0.025 1.000 N NA
 2177663 286068 SF0827 SF0828   ybjW TRUE 0.984 12.000 0.000 0.017 Y NA
 286068 286069 SF0828 SF0829 ybjW ybjE FALSE 0.156 144.000 0.000 1.000   NA
 286069 286070 SF0829 SF0830 ybjE yi22_g5 FALSE 0.246 78.000 0.000 1.000   NA
 286070 286071 SF0830 SF0831 yi22_g5 yi21_g2 TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 286071 2177664 SF0831 SF0832 yi21_g2 aqpZ FALSE 0.009 398.000 0.000 1.000 N NA
 2177664 286073 SF0832 SF0833 aqpZ insB FALSE 0.455 52.000 0.000 1.000 N NA
 286073 286074 SF0833 SF0834 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286077 2177665 SF0837 SF0838     TRUE 0.600 -88.000 0.000 NA   NA
 2177665 286079 SF0838 SF0839   ybjZ TRUE 0.996 -3.000 0.789 0.090 N NA
 286081 2177666 SF0841 SF0842 yljA clpA TRUE 0.982 31.000 0.596 NA   NA
 400105 286083 SF4463 SF0843 tRNA-Ser infA FALSE 0.033 254.000 0.000 NA   NA
 286083 286084 SF0843 SF0844 infA aat FALSE 0.010 285.000 0.020 1.000 N NA
 286084 286085 SF0844 SF0845 aat cydC TRUE 0.933 42.000 0.049 1.000 Y NA
 286085 286086 SF0845 SF0846 cydC cydD TRUE 0.999 1.000 0.631 0.005 Y NA
 286086 2177667 SF0846 SF0847 cydD trxB TRUE 0.592 123.000 0.049 1.000 Y NA
 2177668 286089 SF0848 SF0849 lrp ftsK FALSE 0.546 135.000 0.345 1.000 N NA
 286089 286090 SF0849 SF0850 ftsK lolA FALSE 0.440 152.000 0.305 1.000 N NA
 286090 286091 SF0850 SF0851 lolA ycaJ TRUE 0.908 11.000 0.167 1.000 N NA
 286091 286092 SF0851 SF0852 ycaJ serS FALSE 0.381 91.000 0.078 0.082 N NA
 286092 286093 SF0852 SF0853 serS dmsA FALSE 0.006 566.000 0.000 1.000 N NA
 286093 286094 SF0853 SF0854 dmsA dmsB TRUE 0.990 11.000 0.172 0.050 Y NA
 286094 2177669 SF0854 SF0855 dmsB dmsC TRUE 0.981 2.000 0.333 1.000   NA
 286097 286098 SF0857 SF0858 ycaD   FALSE 0.016 313.000 0.000 1.000 N NA
 286098 286099 SF0858 SF0859     TRUE 0.982 -3.000 0.000 NA Y NA
 286099 286100 SF0859 SF0860     TRUE 0.974 20.000 0.000 NA Y NA
 286100 286101 SF0860 SF0861     TRUE 0.745 35.000 0.000 NA   NA
 286102 286103 SF0862 SF0863   yi91 TRUE 0.976 27.000 0.000 1.000 Y NA
 286103 286104 SF0863 SF0864 yi91   FALSE 0.135 148.000 0.000 NA   NA
 286105 286106 SF0865 SF0866     TRUE 0.952 36.000 0.000 1.000 Y NA
 2177670 286108 SF0867 SF0868   rem TRUE 0.676 39.000 0.000 NA   NA
 286108 286109 SF0868 SF0869 rem   FALSE 0.006 633.000 0.000 NA   NA
 286111 2177671 SF0871 SF0872     TRUE 0.831 15.000 0.000 NA   NA
 2177671 286112 SF0872 SF0873     FALSE 0.139 146.000 0.000 NA   NA
 286112 286113 SF0873 SF0874     FALSE 0.226 78.000 0.000 NA   NA
 286113 286114 SF0874 SF0875     TRUE 0.759 -16.000 0.000 NA   NA
 286115 2177672 SF0876 SF0877     FALSE 0.060 203.000 0.000 NA   NA
 286117 286118 SF0878 SF0879 yi22_g5 yi21_g2 TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 286119 286120 SF0880 SF0881     FALSE 0.008 514.000 0.000 NA   NA
 286120 286121 SF0881 SF0882   tra5_g5 TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 286122 286123 SF0883 SF0884   tra5_g5 FALSE 0.016 344.000 0.000 NA   NA
 286123 286124 SF0884 SF0885 tra5_g5   TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 2177677 2177678 SF0890 SF0891 ybhH ybhI FALSE 0.148 139.000 0.000 NA   NA
 2177678 2177679 SF0891 SF0892 ybhI ybhJ FALSE 0.326 183.000 0.300 1.000 N NA
 286130 286131 SF0893 SF0894 ybhC intE FALSE 0.358 135.000 0.200 1.000 N NA
 286131 286132 SF0894 SF0895 intE   FALSE 0.435 212.000 0.000 0.049 Y NA
 286132 286133 SF0895 SF0896     TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 286133 2177680 SF0896 SF0897   pflA FALSE 0.008 409.000 0.000 1.000 N NA
 2177680 286135 SF0897 SF0898 pflA pflB FALSE 0.089 192.000 0.092 1.000 N NA
 286135 2177681 SF0898 SF0899 pflB focA TRUE 0.841 55.000 0.345 1.000 N NA
 2177681 2177682 SF0899 SF0900 focA ycaO FALSE 0.011 406.000 0.000 NA   NA
 286138 286139 SF0901 SF0902   serC FALSE 0.035 199.000 0.014 NA   NA
 286139 286140 SF0902 SF0903 serC aroA TRUE 0.712 71.000 0.033 1.000 Y NA
 286140 286141 SF0903 SF0904 aroA yi41 FALSE 0.131 126.000 0.000 1.000 N NA
 286141 2177683 SF0904 SF0905 yi41 ycaL FALSE 0.122 136.000 0.000 1.000 N NA
 2177683 286143 SF0905 SF0906 ycaL cmk FALSE 0.030 173.000 0.004 1.000 N NA
 286143 286144 SF0906 SF0907 cmk rpsA FALSE 0.513 111.000 0.281 1.000 N NA
 286144 286145 SF0907 SF0908 rpsA himD FALSE 0.399 160.000 0.292 1.000 N NA
 286145 2177684 SF0908 SF0909 himD ycaI FALSE 0.158 130.000 0.000 NA   NA
 2177684 286146 SF0909 SF0910 ycaI msbA TRUE 0.693 37.000 0.000 NA   NA
 286146 286147 SF0910 SF0911 msbA lpxK TRUE 0.960 -3.000 0.205 1.000 N NA
 286147 286148 SF0911 SF0912 lpxK ycaQ FALSE 0.559 37.000 0.017 NA   NA
 286148 286149 SF0912 SF0913 ycaQ ycaR FALSE 0.375 52.000 0.016 NA   NA
 286149 286150 SF0913 SF0914 ycaR kdsB TRUE 0.974 -3.000 0.265 NA   NA
 286150 286151 SF0914 SF0915 kdsB ycbJ FALSE 0.080 154.000 0.023 NA   NA
 2177686 286154 SF0917 SF0918 smtA mukF TRUE 0.977 -3.000 0.325 NA N NA
 286154 2177687 SF0918 SF0919 mukF mukE TRUE 0.970 8.000 0.036 NA Y NA
 2177687 286156 SF0919 SF0920 mukE mukB TRUE 0.993 0.000 0.000 0.001 Y NA
 286156 286157 SF0920 SF0921 mukB yi41 FALSE 0.113 145.000 0.000 1.000 N NA
 286157 286158 SF0921 SF0922 yi41 ycbB FALSE 0.063 208.000 0.000 1.000   NA
 286158 2177688 SF0922 SF0923 ycbB ycbK FALSE 0.433 181.000 0.372 NA   NA
 2177688 286160 SF0923 SF0924 ycbK ycbL TRUE 0.887 27.000 0.089 NA   NA
 286161 286162 SF0925 SF0926 aspC ompF FALSE 0.046 185.000 0.036 1.000 N NA
 286162 2177689 SF0926 SF0927 ompF asnS FALSE 0.005 601.000 0.000 1.000 N NA
 2177689 2177690 SF0927 SF0928 asnS pncB FALSE 0.057 169.000 0.034 1.000 N NA
 286166 286167 SF0930 SF0931 ssuB ssuC TRUE 0.997 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 286167 286168 SF0931 SF0932 ssuC yi22_g5 TRUE 0.678 -25.000 0.000 1.000 N NA
 286168 286169 SF0932 SF0933 yi22_g5 yi21_g2 TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 286169 286170 SF0933 SF0934 yi21_g2 ycbN FALSE 0.020 283.000 0.000 1.000 N NA
 286170 2177691 SF0934 SF0935 ycbN ycbO TRUE 0.980 -3.000 0.341 1.000 N NA
 2177691 2177692 SF0935 SF0936 ycbO ycbP TRUE 0.932 -7.000 0.169 1.000   NA
 2177692 286173 SF0936 SF0937 ycbP   TRUE 0.604 -81.000 0.000 NA   NA
 286175 286176 SF0939 SF0940 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 2177693 286178 SF0941 SF0942 ycbS   TRUE 0.970 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 286178 286179 SF0942 SF0943     TRUE 0.789 98.000 0.000 0.005 Y NA
 286179 286180 SF0943 SF0944     TRUE 0.996 -40.000 0.667 0.005 Y NA
 286180 286181 SF0944 SF0945   ycbF TRUE 0.990 -34.000 0.500 1.000 Y NA
 286181 2177694 SF0945 SF0946 ycbF pyrD FALSE 0.146 111.000 0.000 1.000 N NA
 2177694 286183 SF0946 SF0947 pyrD ycbW FALSE 0.193 138.000 0.081 NA   NA
 286185 286186 SF0949 SF0950 ycbY uup TRUE 0.839 12.000 0.061 1.000   NA
 286186 286187 SF0950 SF0951 uup pqiA FALSE 0.160 130.000 0.054 NA   NA
 286187 2177695 SF0951 SF0952 pqiA pqiB TRUE 0.993 5.000 0.819 NA   NA
 2177695 286189 SF0952 SF0953 pqiB ymbA TRUE 0.990 -3.000 0.531 NA   NA
 286190 286191 SF0954 SF0955 fabA ycbZ TRUE 0.661 70.000 0.290 1.000 N NA
 2177696 2177697 SF0957 SF0958 ompA sulA FALSE 0.012 357.000 0.000 1.000 N NA
 2177698 286195 SF0959 SF0960   yi21_g2 FALSE 0.237 76.000 0.000 NA   NA
 286195 286196 SF0960 SF0961 yi21_g2 yi22_g5 TRUE 0.688 -42.000 0.000 1.000   NA
 286197 286198 SF0962 SF0963 yccS yccF TRUE 0.872 10.000 0.090 NA   NA
 286200 286201 SF0965 SF0966 mgsA yccT FALSE 0.192 96.000 0.055 NA   NA
 286203 286204 SF0968 SF0970 yccV yccW TRUE 0.892 7.000 0.094 NA   NA
 286206 286207 SF0971 SF0972 yccK yccA FALSE 0.355 91.000 0.140 1.000   NA
 286207 400104 SF0972 SF4464 yccA tRNA-Ser FALSE 0.057 207.000 0.000 NA   NA
 2177701 286209 SF0973 SF0974 hyaA hyaB TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 286209 286210 SF0974 SF0975 hyaB hyaC TRUE 0.996 19.000 0.355 0.049 Y NA
 286210 286211 SF0975 SF0976 hyaC hyaD TRUE 0.991 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 286211 286212 SF0976 SF0977 hyaD hyaE TRUE 0.922 -3.000 0.096 NA   NA
 286212 286213 SF0977 SF0978 hyaE hyaF TRUE 0.994 -3.000 0.769 NA   NA
 286213 286214 SF0978 SF0979 hyaF   TRUE 0.583 -166.000 0.000 NA   NA
 286214 2177702 SF0979 SF0980   appC FALSE 0.168 134.000 0.061 NA   NA
 2177702 286216 SF0980 SF0981 appC appB TRUE 0.990 12.000 0.158 0.049 Y NA
 286216 2177703 SF0981 SF0982 appB appA FALSE 0.089 184.000 0.000 1.000   NA
 286218 286219 SF0983 SF0984 yccC etp FALSE 0.489 240.000 1.000 1.000 N NA
 286219 2177704 SF0984 SF0985 etp yccZ TRUE 0.985 -12.000 0.750 1.000 N NA
 2177704 286221 SF0985 SF0986 yccZ ymcA TRUE 0.611 46.000 0.000 NA   NA
 286221 286222 SF0986 SF0987 ymcA ymcB TRUE 0.899 0.000 0.060 NA   NA
 286222 286223 SF0987 SF0988 ymcB ymcC TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA   NA
 286223 2177705 SF0988 SF0989 ymcC ymcD FALSE 0.188 107.000 0.000 NA   NA
 2177705 286225 SF0989 SF0990 ymcD cspH FALSE 0.010 424.000 0.000 NA   NA
 2177706 286227 SF0991 SF0992 cspG sfa FALSE 0.096 174.000 0.000 NA   NA
 286227 286228 SF0992 SF0993 sfa yccL TRUE 0.799 -10.000 0.000 NA   NA
 2177707 286230 SF0994 SF0995 yccM torS FALSE 0.154 102.000 0.000 1.000 N NA
 2177708 2177709 SF0997 SF0999 torC torA TRUE 0.890 0.000 0.000 NA   NA
 2177709 2177710 SF0999 SF1000 torA torD TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 286234 286235 SF1001 SF1002 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286235 2177711 SF1002 SF1003 insA yccD FALSE 0.007 566.000 0.000 NA   NA
 2177711 286237 SF1003 SF1004 yccD cbpA TRUE 0.990 0.000 0.512 NA   NA
 286238 2177712 SF1005 SF1006 yccE agp FALSE 0.023 293.000 0.000 NA   NA
 286240 286241 SF1007 SF1008 yccJ wrbA TRUE 0.967 21.000 0.290 NA   NA
 286241 286242 SF1008 SF1009 wrbA ycdG FALSE 0.008 562.000 0.000 1.000   NA
 286242 2177713 SF1009 SF1010 ycdG   TRUE 0.959 -45.000 0.533 1.000   NA
 2177713 286244 SF1010 SF1011   ycdI TRUE 0.979 47.000 0.625 0.027   NA
 286244 2177714 SF1011 SF1012 ycdI   TRUE 0.959 10.000 0.256 1.000   NA
 2177714 286246 SF1012 SF1013   ycdK TRUE 0.976 8.000 0.365 NA   NA
 286246 286247 SF1013 SF1014 ycdK ycdL TRUE 0.973 12.000 0.442 NA N NA
 286247 2177715 SF1014 SF1015 ycdL   TRUE 0.965 -42.000 0.621 NA N NA
 286250 286251 SF1017 SF1018 insB   TRUE 0.901 0.000 0.000 1.000   NA
 286252 286253 SF1019 SF1020 ycdN ycdO TRUE 0.835 58.000 0.356 NA   NA
 286253 286254 SF1020 SF1021 ycdO ycdB TRUE 0.994 6.000 0.378 NA Y NA
 286254 286255 SF1021 SF1022 ycdB phoH FALSE 0.006 472.000 0.000 NA N NA
 286256 286257 SF1023 SF1024 tra5_g5   TRUE 0.894 -3.000 0.000 1.000   NA
 2177716 286258 SF1025 SF1026     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 2177717 286259 SF1027 SF1028 ycdW ycdX FALSE 0.445 55.000 0.000 NA   NA
 286259 286260 SF1028 SF1029 ycdX ycdY TRUE 0.981 24.000 0.417 1.000   NA
 286260 2177718 SF1029 SF1030 ycdY ycdZ FALSE 0.451 72.000 0.145 NA   NA
 2177719 286262 SF1031 SF1032 csgG   FALSE 0.030 265.000 0.000 NA   NA
 286262 286263 SF1032 SF1033   csgE FALSE 0.017 333.000 0.000 NA   NA
 286263 2177720 SF1033 SF1034 csgE csgD TRUE 0.944 5.000 0.176 NA   NA
 2177721 2177722 SF1035 SF1036 csgB csgA TRUE 0.662 41.000 0.000 NA   NA
 2177722 286266 SF1036 SF1037 csgA   FALSE 0.580 -475.000 0.000 NA   NA
 286266 286267 SF1037 SF1038     TRUE 0.952 36.000 0.000 1.000 Y NA
 286267 2177723 SF1038 SF1039   csgC FALSE 0.011 405.000 0.000 NA   NA
 2177723 286269 SF1039 SF1040 csgC   TRUE 0.659 121.000 0.429 NA   NA
 286269 286270 SF1040 SF1041   ymdB FALSE 0.135 95.000 0.028 NA   NA
 286270 2177724 SF1041 SF1042 ymdB ymdC TRUE 0.588 -58.000 0.046 NA   NA
 2177726 2177727 SF1044 SF1045 mdoG mdoH TRUE 0.978 -7.000 0.469 1.000 N NA
 286275 286276 SF1046 SF1048 insB   TRUE 0.901 0.000 0.000 1.000   NA
 286278 286279 SF1049 SF1050     FALSE 0.055 215.000 0.000 1.000   NA
 286280 286281 SF1051 SF1052 yi91   TRUE 0.976 27.000 0.000 1.000 Y NA
 286283 286284 SF1054 SF1055 yi21_g2 yi22_g5 TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 286284 286285 SF1055 SF1056 yi22_g5   FALSE 0.083 396.000 0.000 1.000 Y NA
 286285 286286 SF1056 SF1057     FALSE 0.281 215.000 0.000 1.000 Y NA
 286286 286287 SF1057 SF1058     FALSE 0.162 288.000 0.000 1.000 Y NA
 286287 286288 SF1058 SF1059     TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 2177728 2177729 SF1060 SF1061   htrB FALSE 0.009 393.000 0.000 1.000 N NA
 286292 2177731 SF1063 SF1064 yceI   TRUE 0.992 4.000 0.676 1.000   NA
 2177731 2177732 SF1064 SF1065   yceO FALSE 0.031 261.000 0.000 NA   NA
 2177732 286295 SF1065 SF1066 yceO solA TRUE 0.880 48.000 0.269 NA   NA
 286295 2177733 SF1066 SF1067 solA dinI FALSE 0.006 659.000 0.000 NA   NA
 2177733 286297 SF1067 SF1068 dinI pyrC FALSE 0.192 74.000 0.031 NA   NA
 286297 2177734 SF1068 SF1069 pyrC yceB FALSE 0.125 106.000 0.022 NA   NA
 2177734 286299 SF1069 SF1070 yceB grxB FALSE 0.193 134.000 0.078 NA   NA
 286299 2177735 SF1070 SF1071 grxB yceL FALSE 0.403 64.000 0.103 1.000 N NA
 286301 286302 SF1072 SF1073 rimJ yceH TRUE 0.886 11.000 0.116 NA   NA
 286302 2177736 SF1073 SF1074 yceH mviM TRUE 0.920 2.000 0.103 NA   NA
 2177736 2177737 SF1074 SF1075 mviM mviN FALSE 0.046 200.000 0.022 1.000   NA
 286305 286306 SF1076 SF1077 flgN flgM TRUE 0.997 5.000 0.361 0.002 Y NA
 286306 286307 SF1077 SF1078 flgM flgA TRUE 0.891 76.000 0.330 NA Y NA
 286308 286309 SF1079 SF1080 flgB flgE FALSE 0.072 1139.000 0.000 0.002 Y NA
 286309 2177738 SF1080 SF1081 flgE flgF TRUE 0.838 20.000 0.000 NA   NA
 2177738 286310 SF1081 SF1082 flgF flgG FALSE 0.149 138.000 0.000 NA   NA
 286310 2177739 SF1082 SF1083 flgG flgH TRUE 0.976 53.000 0.268 0.004 Y NA
 2177739 2177740 SF1083 SF1084 flgH flgI TRUE 0.987 12.000 0.073 0.005 Y NA
 2177740 2177741 SF1084 SF1085 flgI flgJ TRUE 0.992 0.000 0.036 0.005 Y NA
 2177741 2177742 SF1085 SF1086 flgJ flgK FALSE 0.310 66.000 0.000 NA   NA
 2177742 2177743 SF1086 SF1087 flgK flgL TRUE 0.809 12.000 0.000 NA   NA
 286315 286316 SF1089 SF1090   rluC FALSE 0.087 118.000 0.005 NA   NA
 286318 286319 SF1092 SF1093 yceD rpmF TRUE 0.942 52.000 0.599 NA   NA
 286319 2177745 SF1093 SF1094 rpmF plsX TRUE 0.698 81.000 0.418 1.000 N NA
 2177745 286321 SF1094 SF1095 plsX fabH TRUE 0.964 68.000 0.380 0.004 Y NA
 286321 286322 SF1095 SF1096 fabH fabD TRUE 0.994 16.000 0.182 0.004 Y NA
 286322 286323 SF1096 SF1097 fabD fabG TRUE 0.997 13.000 0.432 0.004 Y NA
 286323 286324 SF1097 SF1098 fabG acpP TRUE 0.753 211.000 0.321 0.004 Y NA
 286324 286325 SF1098 SF1099 acpP fabF TRUE 0.880 86.000 0.346 1.000 Y NA
 286325 286326 SF1099 SF1100 fabF pabC FALSE 0.368 120.000 0.187 1.000 N NA
 286326 286327 SF1100 SF1101 pabC yceG TRUE 0.959 3.000 0.204 NA   NA
 286327 286328 SF1101 SF1102 yceG tmk TRUE 0.937 -10.000 0.209 NA   NA
 286328 286329 SF1102 SF1103 tmk holB TRUE 0.962 -3.000 0.211 1.000 N NA
 286329 2177746 SF1103 SF1104 holB ycfH TRUE 0.976 11.000 0.110 NA Y NA
 2177746 286331 SF1104 SF1105 ycfH ptsG FALSE 0.005 296.000 0.004 NA N NA
 2177748 286333 SF1107 SF1108 ycfF ycfL TRUE 0.864 3.000 0.051 NA   NA
 286333 286334 SF1108 SF1109 ycfL ycfM TRUE 0.981 12.000 0.516 NA   NA
 286334 286335 SF1109 SF1110 ycfM ycfN TRUE 0.927 40.000 0.310 NA   NA
 286335 286336 SF1110 SF1111 ycfN ycfO TRUE 0.801 11.000 0.069 1.000 N NA
 286336 2177749 SF1111 SF1112 ycfO ycfP TRUE 0.889 23.000 0.091 NA   NA
 2177749 2177750 SF1112 SF1113 ycfP ndh FALSE 0.012 408.000 0.057 NA   NA
 2177750 2177751 SF1113 SF1114 ndh ycfJ FALSE 0.055 227.000 0.071 1.000   NA
 2177752 2177753 SF1117 SF1118 ycfS mfd FALSE 0.088 143.000 0.006 1.000   NA
 2177753 286344 SF1118 SF1119 mfd ycfT FALSE 0.096 128.000 0.003 1.000   NA
 2177754 286346 SF1120 SF1121 ycfU lolD TRUE 0.959 -7.000 0.175 0.064 N NA
 286346 286347 SF1121 SF1122 lolD lolE TRUE 0.968 0.000 0.125 0.064 N NA
 286347 286348 SF1122 SF1123 lolE ycfX TRUE 0.938 29.000 0.225 1.000 N NA
 286348 286349 SF1123 SF1124 ycfX cobB TRUE 0.982 16.000 0.119 1.000 Y NA
 286350 286351 SF1125 SF1126 potD potC TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.051 Y NA
 286351 2177755 SF1126 SF1127 potC potB TRUE 0.997 -3.000 0.286 0.051 Y NA
 2177755 286353 SF1127 SF1128 potB potA TRUE 0.996 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 286356 286357 SF1131 SF1132     TRUE 0.813 28.000 0.000 NA   NA
 286357 286358 SF1132 SF1133     FALSE 0.006 621.000 0.000 NA   NA
 286358 286359 SF1133 SF1134     FALSE 0.005 874.000 0.000 NA   NA
 286359 2177757 SF1134 SF1135     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 2177757 2177758 SF1135 SF1136     FALSE 0.014 367.000 0.000 NA   NA
 2177758 2177759 SF1136 SF1137     FALSE 0.006 615.000 0.000 NA   NA
 2177759 2177760 SF1137 SF1138     FALSE 0.033 253.000 0.000 NA   NA
 2177760 2177761 SF1138 SF1139     TRUE 0.669 40.000 0.000 NA   NA
 2177761 286364 SF1139 SF1140     TRUE 0.895 2.000 0.071 NA   NA
 286364 286365 SF1140 SF1141     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 286365 286366 SF1141 SF1142     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 286366 2177762 SF1142 SF1143     FALSE 0.040 228.000 0.000 NA   NA
 2177762 286368 SF1143 SF1144     TRUE 0.759 -16.000 0.000 NA   NA
 286368 286369 SF1144 SF1145     TRUE 0.722 71.000 0.333 NA   NA
 286369 2177763 SF1145 SF1146     FALSE 0.540 167.000 0.444 NA   NA
 2177763 286371 SF1146 SF1147     TRUE 0.824 14.000 0.000 NA   NA
 286372 286373 SF1148 SF1149 phoQ phoP TRUE 0.999 0.000 0.940 1.000 Y NA
 286373 286374 SF1149 SF1150 phoP purB FALSE 0.036 169.000 0.011 1.000 N NA
 286374 2177764 SF1150 SF1151 purB ycfC TRUE 0.905 4.000 0.093 NA   NA
 2177764 286376 SF1151 SF1152 ycfC trmU TRUE 0.884 36.000 0.180 NA   NA
 286376 286377 SF1152 SF1153 trmU ymfB TRUE 0.655 54.000 0.158 1.000 N NA
 286377 286378 SF1153 SF1154 ymfB ymfC TRUE 0.927 10.000 0.182 1.000 N NA
 286379 2177765 SF1155 SF1156 icdA   FALSE 0.003 885.000 0.000 NA N NA
 2177765 286381 SF1156 SF1157     FALSE 0.003 1077.000 0.000 NA N NA
 286382 2177766 SF1158 SF1159 ymgD   TRUE 0.860 4.000 0.000 NA   NA
 286384 286385 SF1161 SF1162 minE minD TRUE 0.997 4.000 0.618 NA Y NA
 286385 2177768 SF1162 SF1163 minD minC TRUE 0.995 24.000 0.466 1.000 Y NA
 2177768 286387 SF1163 SF1164 minC yi22_g5 FALSE 0.004 724.000 0.000 1.000 N NA
 286387 286388 SF1164 SF1165 yi22_g5 yi21_g2 TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 286389 286390 SF1166 SF1167   tra5_g5 TRUE 0.894 -3.000 0.000 1.000   NA
 286390 286391 SF1167 SF1168 tra5_g5 ycgL FALSE 0.015 358.000 0.000 NA   NA
 286391 286392 SF1168 SF1169 ycgL ycgM FALSE 0.272 72.000 0.056 NA   NA
 286392 286393 SF1169 SF1170 ycgM ycgN FALSE 0.254 92.000 0.088 NA   NA
 286394 286395 SF1172 SF1173 umuD umuC TRUE 0.863 0.000 0.000 1.000 N NA
 2177770 2177771 SF1174 SF1175 dsbB nhaB TRUE 0.740 146.000 0.723 1.000 N NA
 2177773 286401 SF1178 SF1179 dadA dadX TRUE 0.915 10.000 0.168 1.000 N NA
 286402 2177774 SF1180 SF1181     FALSE 0.006 718.000 0.000 NA   NA
 2177774 286404 SF1181 SF1182   ldcA FALSE 0.228 95.000 0.103 NA N NA
 286407 286408 SF1185 SF1186 ymgE mltE FALSE 0.151 137.000 0.000 NA   NA
 2177776 2177777 SF1189 SF1190 prrA modD TRUE 0.854 5.000 0.000 NA   NA
 2177777 286412 SF1190 SF1191 modD   TRUE 0.982 0.000 0.034 1.000 Y NA
 286412 286413 SF1191 SF1192     TRUE 0.980 10.000 0.123 1.000 Y NA
 286413 286414 SF1192 SF1193     TRUE 0.999 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 286414 2177778 SF1193 SF1194     TRUE 0.997 0.000 0.422 1.000 Y NA
 286417 286418 SF1196 SF1197 insB insA FALSE 0.575 130.000 0.000 NA Y NA
 286419 2177779 SF1198 SF1199   ycgY FALSE 0.149 138.000 0.000 NA   NA
 2177780 2177781 SF1200 SF1201 treA ycgC FALSE 0.021 320.000 0.000 1.000   NA
 2177781 2177782 SF1201 SF1202 ycgC   TRUE 0.895 11.000 0.118 1.000   NA
 2177782 2177783 SF1202 SF1203     TRUE 0.994 11.000 0.226 0.001 Y NA
 286425 286426 SF1205 SF1206   ychF FALSE 0.004 844.000 0.000 1.000 N NA
 286426 286427 SF1206 SF1207 ychF pth TRUE 0.759 117.000 0.184 1.000 Y NA
 2177784 2177785 SF1209 SF1210 ychM prsA FALSE 0.063 152.000 0.027 1.000 N NA
 2177785 286431 SF1210 SF1211 prsA ychB FALSE 0.101 151.000 0.053 1.000 N NA
 286431 286432 SF1211 SF1212 ychB hemM TRUE 0.946 0.000 0.157 1.000 N NA
 2177786 286434 SF1213 SF1214 hemA prfA TRUE 0.910 42.000 0.171 0.040 N NA
 286434 286435 SF1214 SF1215 prfA hemK TRUE 0.996 0.000 0.229 0.040 Y NA
 286435 286436 SF1215 SF1216 hemK ychQ TRUE 0.930 -3.000 0.109 NA   NA
 286436 286437 SF1216 SF1217 ychQ ychA TRUE 0.955 4.000 0.195 NA   NA
 286437 286438 SF1217 SF1218 ychA kdsA TRUE 0.808 36.000 0.089 1.000   NA
 286440 2177787 SF1220 SF1221 chaB chaC FALSE 0.278 137.000 0.140 NA   NA
 2177789 286445 SF1224 SF1225 narL narX TRUE 0.998 -7.000 0.521 0.011 Y NA
 2177790 286447 SF1226 SF1227 narK narG FALSE 0.009 393.000 0.000 1.000 N NA
 286447 286448 SF1227 SF1228 narG narH TRUE 0.999 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 286448 286449 SF1228 SF1229 narH narJ TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.003 Y NA
 286449 286450 SF1229 SF1230 narJ narI TRUE 0.999 0.000 0.500 0.003 Y NA
 400102 286452 SF4466 SF1232 tRNA-Tyr purU FALSE 0.115 160.000 0.000 NA   NA
 286452 2177791 SF1232 SF1233 purU ychJ TRUE 0.819 50.000 0.200 NA   NA
 2177792 286455 SF1234 SF1235 ychK hnr FALSE 0.194 92.000 0.048 1.000   NA
 286455 286456 SF1235 SF1236 hnr galU FALSE 0.205 202.000 0.235 1.000 N NA
 286459 286460 SF1239 SF1240 yi41 adhE FALSE 0.151 108.000 0.000 1.000 N NA
 286462 286463 SF1242 SF1243 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 2177794 286465 SF1244 SF1245 oppA oppB TRUE 0.842 86.000 0.151 0.050 Y NA
 286465 286466 SF1245 SF1246 oppB oppC TRUE 0.999 15.000 0.870 0.050 Y NA
 286466 286467 SF1246 SF1247 oppC oppD TRUE 0.995 12.000 0.554 1.000 Y NA
 286467 286468 SF1247 SF1248 oppD oppF TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 2177795 286470 SF1249 SF1250   cls TRUE 0.927 35.000 0.231 NA   NA
 286470 2177796 SF1250 SF1251 cls kch FALSE 0.011 371.000 0.000 1.000 N NA
 286472 286473 SF1252 SF1253   tra5_g5 TRUE 0.715 141.000 0.182 1.000 Y NA
 286476 286477 SF1256 SF1257 yciA yciB FALSE 0.332 105.000 0.167 NA N NA
 286477 2177798 SF1257 SF1258 yciB yciC TRUE 0.810 30.000 0.061 NA   NA
 286480 2177799 SF1260 SF1261 yciE yciF TRUE 0.907 46.000 0.115 0.001   NA
 2177799 286482 SF1261 SF1262 yciF yciG FALSE 0.197 86.000 0.000 NA   NA
 286482 286483 SF1262 SF1263 yciG trpA FALSE 0.019 323.000 0.000 NA   NA
 286483 286484 SF1263 SF1264 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 286484 286485 SF1264 SF1265 trpB trpC TRUE 0.994 12.000 0.221 0.001 Y NA
 286485 286486 SF1265 SF1266 trpC trpD TRUE 0.994 1.000 0.293 1.000 Y NA
 286486 286487 SF1266 SF1267 trpD trpE TRUE 0.992 0.000 0.010 0.001 Y NA
 286487 286488 SF1267 SF1268 trpE trpL FALSE 0.128 92.000 0.023 NA   NA
 286489 286490 SF1269 SF1270 yciV yciO TRUE 0.922 -39.000 0.281 NA   NA
 286490 2177800 SF1270 SF1271 yciO yciL FALSE 0.190 101.000 0.000 NA   NA
 286491 286492 SF1272 SF1273 btuR yciK TRUE 0.846 -3.000 0.050 1.000 N NA
 2177801 286496 SF1276 SF1277 topA cysB FALSE 0.018 210.000 0.008 1.000 N NA
 286496 286497 SF1277 SF1278 cysB   FALSE 0.023 295.000 0.000 NA   NA
 286497 286498 SF1278 SF1279   yciX TRUE 0.976 -18.000 0.556 NA   NA
 286498 286499 SF1279 SF1280 yciX acnA FALSE 0.014 373.000 0.000 NA   NA
 286501 286502 SF1282 SF1283 pgpB   FALSE 0.256 149.000 0.143 NA   NA
 286502 286503 SF1283 SF1284   yciM TRUE 0.987 7.000 0.576 NA   NA
 286503 286504 SF1284 SF1285 yciM pyrF FALSE 0.115 193.000 0.125 1.000 N NA
 286504 286505 SF1285 SF1286 pyrF yciH TRUE 0.836 -3.000 0.045 1.000 N NA
 286506 286507 SF1287 SF1288 osmB yciT FALSE 0.029 269.000 0.000 NA   NA
 286507 286508 SF1288 SF1289 yciT   FALSE 0.351 90.000 0.146 NA   NA
 286508 2177803 SF1289 SF1290   yciR FALSE 0.148 139.000 0.000 NA   NA
 2177803 286509 SF1290 SF1291 yciR rnb FALSE 0.037 235.000 0.000 NA   NA
 286509 2177804 SF1291 SF1292 rnb yciW FALSE 0.414 68.000 0.105 NA   NA
 2177804 286511 SF1292 SF1293 yciW fabI FALSE 0.149 144.000 0.057 NA   NA
 286511 286512 SF1293 SF1294 fabI ycjD FALSE 0.016 368.000 0.000 1.000   NA
 286512 286513 SF1294 SF1295 ycjD sapF FALSE 0.316 68.000 0.000 1.000   NA
 286513 286514 SF1295 SF1296 sapF sapD TRUE 0.999 2.000 0.684 0.015 Y NA
 286514 286515 SF1296 SF1297 sapD sapC TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 286515 286516 SF1297 SF1298 sapC sapB TRUE 0.993 -13.000 0.284 0.050 Y NA
 286516 286517 SF1298 SF1299 sapB sapA TRUE 0.985 -3.000 0.264 0.050 N NA
 286517 286518 SF1299 SF1300 sapA ymjA FALSE 0.021 313.000 0.000 NA   NA
 286518 2177805 SF1300 SF1301 ymjA ycjJ FALSE 0.154 134.000 0.000 NA   NA
 2177805 2177806 SF1301 SF1302 ycjJ   FALSE 0.143 303.000 0.000 1.000 Y NA
 2177807 286522 SF1303 SF1304 ycjL ycjC TRUE 0.842 27.000 0.046 1.000   NA
 286522 2177808 SF1304 SF1305 ycjC aldH FALSE 0.083 150.000 0.040 1.000 N NA
 2177808 286524 SF1305 SF1306 aldH ordL TRUE 0.993 2.000 0.500 0.026 N NA
 286524 286525 SF1306 SF1307 ordL goaG TRUE 0.955 38.000 0.100 1.000 Y NA
 286527 286528 SF1309 SF1310 pspA pspB TRUE 0.945 54.000 0.739 NA   NA
 286528 286529 SF1310 SF1311 pspB pspC TRUE 0.995 0.000 0.913 NA   NA
 286529 2177809 SF1311 SF1312 pspC pspD TRUE 0.929 9.000 0.167 NA   NA
 2177809 286531 SF1312 SF1313 pspD pspE TRUE 0.791 43.000 0.133 NA   NA
 286531 2177810 SF1313 SF1314 pspE ycjM FALSE 0.079 185.000 0.000 NA   NA
 2177810 286532 SF1314 SF1315 ycjM insA FALSE 0.563 -1283.000 0.000 NA   NA
 286532 2177811 SF1315 SF1316 insA   FALSE 0.005 1022.000 0.000 NA   NA
 2177811 286533 SF1316 SF1317   ycjO TRUE 0.839 21.000 0.000 NA   NA
 286533 286534 SF1317 SF1318 ycjO ycjP TRUE 0.998 -13.000 0.805 0.050 Y NA
 286534 286535 SF1318 SF1319 ycjP ycjQ TRUE 0.921 31.000 0.205 1.000 N NA
 286535 2177812 SF1319 SF1320 ycjQ   FALSE 0.020 314.000 0.000 NA   NA
 2177812 2177813 SF1320 SF1321   ycjS TRUE 0.819 10.000 0.000 NA   NA
 2177813 2177814 SF1321 SF1322 ycjS ycjT TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 2177814 286537 SF1322 SF1323 ycjT ycjU TRUE 0.894 -3.000 0.000 1.000   NA
 286537 286538 SF1323 SF1324 ycjU ycjV TRUE 0.895 14.000 0.103 1.000   NA
 286538 2177815 SF1324 SF1325 ycjV ompG FALSE 0.120 156.000 0.000 NA   NA
 286540 286541 SF1327 SF1328 ycjX ycjF TRUE 0.994 -3.000 0.791 NA   NA
 286541 2177816 SF1328 SF1329 ycjF tyrR FALSE 0.251 148.000 0.137 NA   NA
 2177818 2177819 SF1332 SF1333 ycjI   FALSE 0.019 291.000 0.000 1.000 N NA
 2177819 286547 SF1333 SF1334     TRUE 0.841 18.000 0.000 NA   NA
 286549 286550 SF1336 SF1337   ycjY TRUE 0.890 0.000 0.000 NA   NA
 286551 286552 SF1339 SF1340 tra5_g5   TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 286553 286554 SF1342 SF1343 yi22_g5 yi21_g2 TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 286555 286556 SF1344 SF1345     TRUE 0.831 15.000 0.000 NA   NA
 286556 286557 SF1345 SF1346     TRUE 0.879 1.000 0.000 NA   NA
 286557 286558 SF1346 SF1347     FALSE 0.188 93.000 0.000 NA   NA
 286558 286559 SF1347 SF1348     TRUE 0.874 2.000 0.000 NA   NA
 286559 286560 SF1348 SF1349     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 286560 286561 SF1349 SF1350     TRUE 0.890 0.000 0.000 NA   NA
 286562 286563 SF1351 SF1352 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286564 286565 SF1353 SF1354     TRUE 0.993 0.000 0.667 NA   NA
 286565 286566 SF1354 SF1355     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 286566 286567 SF1355 SF1356     FALSE 0.013 388.000 0.000 NA   NA
 286567 286568 SF1356 SF1357   tra5_g5 TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 286568 286569 SF1357 SF1358 tra5_g5   TRUE 0.813 28.000 0.000 NA   NA
 286569 286570 SF1358 SF1359     FALSE 0.066 197.000 0.000 NA   NA
 286570 2177822 SF1359 SF1360     TRUE 0.843 24.000 0.000 NA   NA
 2177822 2177823 SF1360 SF1361     TRUE 0.808 11.000 0.000 NA   NA
 286573 286574 SF1362 SF1363 sitD sitC TRUE 0.999 -3.000 0.525 0.005 Y NA
 286574 286575 SF1363 SF1364 sitC sitB TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.078 Y NA
 286575 2177824 SF1364 SF1365 sitB sitA TRUE 0.999 0.000 0.894 1.000 Y NA
 2177824 2177825 SF1365 SF1368 sitA   FALSE 0.009 456.000 0.000 NA   NA
 286577 286578 SF1366 SF1367 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286579 286580 SF1369 SF1370 ydaQ   TRUE 0.586 48.000 0.000 NA   NA
 286580 286581 SF1370 SF1371     FALSE 0.190 265.000 0.000 1.000 Y NA
 286581 2177826 SF1371 SF1372     FALSE 0.245 75.000 0.000 NA   NA
 2177826 286583 SF1372 SF1373   gamW FALSE 0.445 60.000 0.083 NA   NA
 286585 2177827 SF1375 SF1376     FALSE 0.189 100.000 0.000 NA   NA
 2177827 286587 SF1376 SF1377   kil FALSE 0.035 245.000 0.000 NA   NA
 286587 286588 SF1377 SF1378 kil yi22_g5 FALSE 0.231 77.000 0.000 NA   NA
 286588 286589 SF1378 SF1379 yi22_g5 yi21_g2 TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 286589 286590 SF1379 SF1380 yi21_g2   FALSE 0.033 253.000 0.000 NA   NA
 286591 286592 SF1381 SF1382     TRUE 0.624 -51.000 0.000 NA   NA
 286594 286595 SF1384 SF1385 insA insB TRUE 0.840 27.000 0.000 NA   NA
 286595 2177828 SF1385 SF1386 insB pphA FALSE 0.027 277.000 0.000 NA   NA
 2177828 286596 SF1386 SF1387 pphA tra5_g5 FALSE 0.568 -1074.000 0.000 NA   NA
 286597 2177829 SF1388 SF1389     TRUE 0.975 21.000 0.353 NA   NA
 2177829 286599 SF1389 SF1390   yebU FALSE 0.045 292.000 0.121 NA   NA
 286599 2177830 SF1390 SF1391 yebU   FALSE 0.218 80.000 0.000 NA   NA
 2177830 286600 SF1391 SF1392   yebS TRUE 0.690 -37.000 0.000 NA   NA
 286601 2177831 SF1393 SF1394 yebR yebJ FALSE 0.008 676.000 0.081 NA   NA
 2177831 2177832 SF1394 SF1395 yebJ prc TRUE 0.969 20.000 0.304 NA   NA
 2177832 2177833 SF1395 SF1396 prc htpX FALSE 0.147 195.000 0.042 0.021 N NA
 286608 286609 SF1400 SF1401 yobG   TRUE 0.791 75.000 0.500 NA   NA
 286609 286610 SF1401 SF1402   yobF FALSE 0.006 670.000 0.000 NA   NA
 286610 286611 SF1402 SF1403 yobF cspC TRUE 0.945 13.000 0.214 NA   NA
 286611 286612 SF1403 SF1404 cspC rrmA FALSE 0.097 166.000 0.038 1.000   NA
 286613 286614 SF1405 SF1406 yebN insB FALSE 0.008 488.000 0.000 NA   NA
 286614 286615 SF1406 SF1407 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286615 286616 SF1407 SF1408 insA yobD TRUE 0.803 29.000 0.000 NA   NA
 286616 286617 SF1408 SF1409 yobD manZ TRUE 0.942 55.000 0.755 NA   NA
 286617 286618 SF1409 SF1410 manZ manY TRUE 0.999 4.000 0.939 0.011 Y NA
 286618 286619 SF1410 SF1411 manY manX TRUE 0.884 63.000 0.000 0.011 Y NA
 2177834 286622 SF1413 SF1414   sdaA FALSE 0.576 131.000 0.389 NA N NA
 286622 286623 SF1414 SF1415 sdaA yeaB FALSE 0.457 184.000 0.409 1.000   NA
 286623 286624 SF1415 SF1416 yeaB pabB TRUE 0.925 4.000 0.116 1.000   NA
 286626 286627 SF1418 SF1419 yoaC yoaB FALSE 0.015 356.000 0.000 NA   NA
 286628 286629 SF1420 SF1421 yoaA yeaZ FALSE 0.422 58.000 0.082 1.000 N NA
 286629 286630 SF1421 SF1422 yeaZ yeaY FALSE 0.471 40.000 0.024 1.000 N NA
 286630 286631 SF1422 SF1423 yeaY fadD FALSE 0.290 140.000 0.169 1.000 N NA
 286631 2177835 SF1423 SF1424 fadD rnd FALSE 0.291 82.000 0.115 1.000 N NA
 286633 2177836 SF1425 SF1426 yeaX yeaW FALSE 0.430 56.000 0.000 NA   NA
 2177836 2177837 SF1426 SF1427 yeaW   FALSE 0.017 340.000 0.000 NA   NA
 286635 286636 SF1428 SF1429   tra5_g5 TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 286639 286640 SF1432 SF1433 yeaO yeaN FALSE 0.064 153.000 0.007 NA   NA
 286643 2177840 SF1437 SF1438   yeaJ TRUE 0.644 43.000 0.000 NA   NA
 286644 286645 SF1439 SF1440   tra5_g5 TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 286645 286646 SF1440 SF1441 tra5_g5   FALSE 0.007 407.000 0.000 NA N NA
 286646 286647 SF1441 SF1442   yeaE FALSE 0.216 90.000 0.067 NA   NA
 2177841 2177842 SF1443 SF1444 yeaD gapA TRUE 0.766 84.000 0.154 1.000 Y NA
 286650 2177843 SF1445 SF1446 yeaA   TRUE 0.881 42.000 0.216 NA   NA
 2177843 286652 SF1446 SF1447   ydjL FALSE 0.014 370.000 0.000 NA   NA
 286652 2177844 SF1447 SF1448 ydjL   TRUE 0.957 27.000 0.250 1.000 N NA
 2177844 2177845 SF1448 SF1449   ydjJ TRUE 0.840 17.000 0.000 NA   NA
 2177845 286654 SF1449 SF1450 ydjJ ydjI TRUE 0.839 21.000 0.000 NA   NA
 286654 2177846 SF1450 SF1451 ydjI   TRUE 0.994 5.000 0.368 NA Y NA
 2177846 2177847 SF1451 SF1452     TRUE 0.776 55.000 0.269 NA N NA
 2177847 286657 SF1452 SF1453   ydjF FALSE 0.450 137.000 0.269 1.000 N NA
 286657 2177848 SF1453 SF1454 ydjF ydjE TRUE 0.691 118.000 0.125 1.000 Y NA
 286659 286660 SF1455 SF1456 ydjB ansA TRUE 0.717 11.000 0.040 1.000 N NA
 286660 2177849 SF1456 SF1457 ansA sppA FALSE 0.149 167.000 0.113 1.000 N NA
 286662 2177850 SF1458 SF1459 ydjA selD FALSE 0.099 117.000 0.033 1.000 N NA
 2177850 2177851 SF1459 SF1460 selD topB TRUE 0.785 5.000 0.041 1.000 N NA
 2177851 286665 SF1460 SF1461 topB ynjI TRUE 0.838 16.000 0.000 NA   NA
 286667 286668 SF1463 SF1464 yi21_g2 yi22_g5 TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 286668 286669 SF1464 SF1465 yi22_g5 ynjH FALSE 0.012 395.000 0.000 NA   NA
 2177853 2177854 SF1468 SF1469     FALSE 0.518 52.000 0.000 NA   NA
 2177854 2177855 SF1469 SF1470     TRUE 0.890 0.000 0.000 NA   NA
 2177855 2177856 SF1470 SF1472     TRUE 0.841 18.000 0.000 NA   NA
 286674 2177857 SF1473 SF1474 ynjA ydjZ TRUE 0.650 50.000 0.087 NA   NA
 2177857 2177858 SF1474 SF1475 ydjZ ydjY TRUE 0.937 18.000 0.174 NA   NA
 2177858 2177859 SF1475 SF1476 ydjY ydjX TRUE 0.665 -157.000 0.083 NA   NA
 2177859 2177860 SF1476 SF1477 ydjX xthA FALSE 0.061 167.000 0.016 NA   NA
 2177861 2177862 SF1478 SF1479 cstC   TRUE 0.890 0.000 0.000 NA   NA
 2177862 286680 SF1479 SF1480   astD TRUE 0.950 -3.000 0.179 1.000 N NA
 286680 2177863 SF1480 SF1481 astD   FALSE 0.485 53.000 0.000 NA   NA
 2177863 286681 SF1481 SF1482   ydjS FALSE 0.191 89.000 0.000 NA   NA
 286681 286682 SF1482 SF1483 ydjS spy FALSE 0.012 330.000 0.000 NA N NA
 286682 2177864 SF1483 SF1484 spy   FALSE 0.042 203.000 0.028 NA   NA
 2177865 286685 SF1485 SF1486   nadE FALSE 0.013 230.000 0.010 1.000 N NA
 286686 286687 SF1487 SF1488 osmE celA FALSE 0.025 299.000 0.000 1.000   NA
 286687 286688 SF1488 SF1489 celA celB TRUE 0.954 85.000 0.500 0.010 Y NA
 286688 2177866 SF1489 SF1490 celB celC TRUE 0.990 59.000 0.833 0.010 Y NA
 2177866 2177867 SF1490 SF1491 celC celD TRUE 0.837 8.000 0.000 NA   NA
 286690 286691 SF1492 SF1493 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286692 286693 SF1494 SF1495 celF chbG TRUE 0.989 13.000 0.429 0.014   NA
 2177869 286696 SF1497 SF1498   ydjO FALSE 0.027 277.000 0.000 NA   NA
 286697 286698 SF1499 SF1500 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286698 286699 SF1500 SF1501 insA ydjN FALSE 0.009 470.000 0.000 NA   NA
 286699 2177870 SF1501 SF1502 ydjN   FALSE 0.234 133.000 0.102 NA   NA
 2177870 286701 SF1502 SF1503   yniC FALSE 0.131 163.000 0.068 NA   NA
 286703 286704 SF1505 SF1506 yniA ydiZ FALSE 0.189 106.000 0.000 NA   NA
 286704 2177871 SF1506 SF1507 ydiZ pfkB FALSE 0.190 101.000 0.000 NA   NA
 2177873 286707 SF1509 SF1510   insB TRUE 0.831 15.000 0.000 NA   NA
 286707 286708 SF1510 SF1511 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286709 286710 SF1512 SF1513 thrS infC TRUE 0.770 112.000 0.186 1.000 Y NA
 286710 2177874 SF1513 SF1514 infC rpmI TRUE 0.936 97.000 0.652 1.000 Y NA
 2177874 286712 SF1514 SF1515 rpmI rplT TRUE 0.994 53.000 0.928 0.012 Y NA
 286712 286713 SF1515 SF1516 rplT pheM FALSE 0.165 123.000 0.000 NA   NA
 286713 286714 SF1516 SF1517 pheM pheS FALSE 0.026 283.000 0.000 NA   NA
 286714 286715 SF1517 SF1518 pheS pheT TRUE 0.998 15.000 0.574 0.001 Y NA
 286715 286716 SF1518 SF1519 pheT himA TRUE 0.950 5.000 0.208 1.000 N NA
 286716 286717 SF1519 SF1520 himA btuC FALSE 0.093 101.000 0.023 1.000 N NA
 286717 286718 SF1520 SF1521 btuC btuE FALSE 0.371 63.000 0.084 1.000 N NA
 286718 286719 SF1521 SF1522 btuE btuD TRUE 0.863 0.000 0.000 1.000 N NA
 286719 286720 SF1522 SF1523 btuD nlpC FALSE 0.164 78.000 0.000 NA N NA
 286720 286721 SF1523 SF1524 nlpC ydiV FALSE 0.024 247.000 0.000 NA N NA
 286721 286722 SF1524 SF1525 ydiV ydiU FALSE 0.256 64.000 0.031 NA   NA
 286723 286724 SF1526 SF1527 aroH ydiA FALSE 0.273 157.000 0.165 1.000   NA
 286726 286727 SF1529 SF1530 ydiD ydiT TRUE 0.876 3.000 0.080 1.000 N NA
 286727 286728 SF1530 SF1531 ydiT ydiS TRUE 0.998 -3.000 0.400 0.047 Y NA
 286728 286729 SF1531 SF1532 ydiS ydiR TRUE 0.992 56.000 1.000 0.047 Y NA
 286729 2177875 SF1532 SF1533 ydiR ydiQ TRUE 0.999 20.000 1.000 0.016 Y NA
 2177876 286731 SF1534 SF1535   insA TRUE 0.757 34.000 0.000 NA   NA
 286731 286732 SF1535 SF1536 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286733 286734 SF1537 SF1538 ydeO ydeP FALSE 0.006 519.000 0.000 1.000 N NA
 286734 286735 SF1538 SF1539 ydeP ydeQ FALSE 0.019 334.000 0.000 1.000   NA
 286736 286737 SF1540 SF1541 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286737 286738 SF1541 SF1542 insB tra5_g5 TRUE 0.689 78.000 0.000 1.000 Y NA
 286738 286739 SF1542 SF1543 tra5_g5 ycgW FALSE 0.005 960.000 0.000 NA   NA
 400101 400100 SF4467 SF4468 tRNA-Arg tRNA-Met FALSE 0.190 102.000 0.000 NA   NA
 400100 286740 SF4468 SF1544 tRNA-Met   FALSE 0.141 145.000 0.000 NA   NA
 286740 286741 SF1544 SF1545     TRUE 0.846 15.000 0.000 1.000   NA
 286741 286742 SF1545 SF1546     TRUE 0.817 13.000 0.000 NA   NA
 286742 2177877 SF1546 SF1547     FALSE 0.016 347.000 0.000 NA   NA
 2177877 286744 SF1547 SF1548   relE FALSE 0.010 448.000 0.000 NA   NA
 286744 286745 SF1548 SF1549 relE relB TRUE 0.845 0.000 0.000 NA N NA
 286745 286746 SF1549 SF1550 relB tra5_g5 FALSE 0.116 327.000 0.000 NA Y NA
 286746 286747 SF1550 SF1551 tra5_g5   TRUE 0.715 141.000 0.182 1.000 Y NA
 286748 286749 SF1552 SF1553 ydfJ ydfI FALSE 0.543 89.000 0.250 1.000   NA
 286750 286751 SF1554 SF1555 ydfZ ydfH FALSE 0.090 178.000 0.000 NA   NA
 286751 2177878 SF1555 SF1556 ydfH ydfG FALSE 0.166 137.000 0.000 1.000   NA
 286758 2177881 SF1562 SF1563 marB marA TRUE 0.778 32.000 0.000 NA   NA
 2177881 2177882 SF1563 SF1564 marA marR TRUE 0.998 20.000 0.667 0.039 Y NA
 286762 286763 SF1566 SF1567 ydeA yneK FALSE 0.130 150.000 0.000 NA   NA
 2177883 286764 SF1568 SF1569   yneH FALSE 0.328 64.000 0.000 NA   NA
 286764 286765 SF1569 SF1570 yneH yneG TRUE 0.864 0.000 0.037 NA   NA
 286765 2177884 SF1570 SF1571 yneG   FALSE 0.010 625.000 0.098 NA   NA
 2177884 286767 SF1571 SF1572   uxaB FALSE 0.032 227.000 0.000 1.000 N NA
 286768 286769 SF1573 SF1574     TRUE 0.819 10.000 0.000 NA   NA
 286771 286772 SF1576 SF1577 tam yneC TRUE 0.693 40.000 0.000 1.000   NA
 286772 286773 SF1577 SF1578 yneC yneB TRUE 0.858 24.000 0.000 1.000   NA
 286773 286774 SF1578 SF1579 yneB yi22_g5 TRUE 0.809 25.000 0.000 1.000 N NA
 286774 286775 SF1579 SF1580 yi22_g5 yi21_g5 TRUE 0.688 -42.000 0.000 1.000   NA
 286775 2177885 SF1580 SF1581 yi21_g5 ydeV FALSE 0.012 389.000 0.000 NA   NA
 2177885 286776 SF1581 SF1582 ydeV ydeW FALSE 0.222 79.000 0.000 NA   NA
 286777 286778 SF1583 SF1584 ego ydeY TRUE 0.998 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 286778 286779 SF1584 SF1585 ydeY ydeZ TRUE 0.999 0.000 0.788 0.049 Y NA
 286779 2177886 SF1585 SF1586 ydeZ   TRUE 0.809 12.000 0.000 NA   NA
 2177886 286780 SF1586 SF1587   yi21_g2 FALSE 0.049 215.000 0.000 NA   NA
 286780 286781 SF1587 SF1588 yi21_g2 yi22_g5 TRUE 0.995 34.000 0.667 1.000 Y NA
 286782 286783 SF1589 SF1590     TRUE 0.843 57.000 0.000 1.000 Y NA
 286783 286784 SF1590 SF1591   rspA FALSE 0.224 71.000 0.000 1.000 N NA
 286784 2177887 SF1591 SF1592 rspA   FALSE 0.041 206.000 0.020 1.000   NA
 286786 2177888 SF1593 SF1594 ynfB speG TRUE 0.745 35.000 0.000 NA   NA
 2177890 286789 SF1596 SF1597     FALSE 0.293 199.000 0.304 NA   NA
 286789 286790 SF1597 SF1598     TRUE 0.934 -31.000 0.154 0.026   NA
 2177891 286792 SF1599 SF1600     FALSE 0.202 85.000 0.000 NA   NA
 286792 2177892 SF1600 SF1601     FALSE 0.019 321.000 0.000 NA   NA
 2177892 2177893 SF1601 SF1602     TRUE 0.799 -10.000 0.000 NA   NA
 2177893 286795 SF1602 SF1603     FALSE 0.010 431.000 0.000 NA   NA
 286795 286796 SF1603 SF1604     FALSE 0.011 412.000 0.000 NA   NA
 286796 286797 SF1604 SF1605     FALSE 0.520 72.000 0.000 0.046   NA
 286797 286798 SF1605 SF1606   yi91 TRUE 0.976 27.000 0.000 1.000 Y NA
 286798 286799 SF1606 SF1608 yi91   TRUE 0.757 34.000 0.000 NA   NA
 286800 2177894 SF1607 SF1609     FALSE 0.394 58.000 0.000 NA   NA
 2177894 286801 SF1609 SF1610   ynfG TRUE 0.808 11.000 0.000 NA   NA
 286801 2177895 SF1610 SF1611 ynfG   TRUE 0.981 2.000 0.333 1.000   NA
 2177895 2177896 SF1611 SF1612     TRUE 0.795 43.000 0.125 1.000   NA
 2177896 286804 SF1612 SF1613   ynfJ FALSE 0.095 195.000 0.079 1.000   NA
 2177897 286806 SF1614 SF1615 bioD mlc TRUE 0.646 125.000 0.455 1.000 N NA
 286806 286807 SF1615 SF1616 mlc ynfL TRUE 0.865 135.000 0.408 1.000 Y NA
 2177898 286808 SF1617 SF1618 ynfM asr FALSE 0.010 424.000 0.000 NA   NA
 286808 286809 SF1618 SF1619 asr   FALSE 0.027 276.000 0.000 NA   NA
 286810 286811 SF1620 SF1621 ydgE ydgF TRUE 0.998 -13.000 0.869 0.074 Y NA
 286813 2177899 SF1623 SF1624 pntB pntA TRUE 0.999 11.000 0.745 0.001 Y NA
 286815 286816 SF1625 SF1626     FALSE 0.159 186.000 0.143 NA   NA
 286816 286817 SF1626 SF1627   ydgB TRUE 0.808 37.000 0.140 1.000 N NA
 2177900 286820 SF1629 SF1630 rstA   FALSE 0.191 89.000 0.000 NA   NA
 286820 286821 SF1630 SF1631     FALSE 0.139 146.000 0.000 NA   NA
 286821 2177901 SF1631 SF1632   rstB FALSE 0.210 179.000 0.000 0.083   NA
 2177901 2177902 SF1632 SF1633 rstB tus FALSE 0.538 76.000 0.200 1.000   NA
 286824 286825 SF1634 SF1635 fumC fumA TRUE 0.753 143.000 0.000 0.001 Y NA
 2177903 286827 SF1636 SF1637 manA ydgA TRUE 0.830 101.000 0.778 NA   NA
 286828 2177904 SF1638 SF1639 uidC uidB TRUE 0.676 39.000 0.000 NA   NA
 2177904 286829 SF1639 SF1640 uidB uidA TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 286829 286830 SF1640 SF1641 uidA uidR FALSE 0.010 388.000 0.000 1.000 N NA
 286830 286831 SF1641 SF1642 uidR insB FALSE 0.009 405.000 0.000 1.000 N NA
 286831 286832 SF1642 SF1643 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286832 286833 SF1643 SF1644 insA hdhA FALSE 0.444 51.000 0.000 NA N NA
 286833 286834 SF1644 SF1646 hdhA malI FALSE 0.143 112.000 0.000 1.000 N NA
 2177905 286836 SF1645 SF1647 malX malY TRUE 0.981 10.000 0.531 1.000 N NA
 286836 286837 SF1647 SF1648 malY add FALSE 0.293 104.000 0.132 1.000 N NA
 286839 2177906 SF1650 SF1651     FALSE 0.318 86.000 0.120 NA   NA
 2177906 286841 SF1651 SF1652   ydgL FALSE 0.413 77.000 0.148 NA   NA
 286841 286842 SF1652 SF1653 ydgL ydgM TRUE 0.999 0.000 0.564 0.046 Y NA
 286842 286843 SF1653 SF1654 ydgM ydgN TRUE 0.998 -7.000 0.537 0.016 Y NA
 286843 286844 SF1654 SF1655 ydgN ydgO TRUE 0.999 1.000 0.814 0.046 Y NA
 286844 286845 SF1655 SF1656 ydgO ydgP TRUE 0.999 4.000 0.924 0.046 Y NA
 286845 286846 SF1656 SF1657 ydgP ydgQ TRUE 0.999 4.000 0.908 0.046 Y NA
 286846 286847 SF1657 SF1658 ydgQ nth TRUE 0.923 0.000 0.109 1.000 N NA
 286847 286848 SF1658 SF1659 nth ydgR FALSE 0.005 611.000 0.000 1.000 N NA
 286848 286849 SF1659 SF1660 ydgR gst TRUE 0.605 106.000 0.344 1.000 N NA
 286850 2177907 SF1661 SF1662 pdxY tyrS FALSE 0.127 107.000 0.041 1.000 N NA
 2177907 286852 SF1662 SF1663 tyrS pdxH FALSE 0.130 129.000 0.054 1.000 N NA
 286852 286853 SF1663 SF1664 pdxH ydhA FALSE 0.338 59.000 0.034 1.000   NA
 286853 286854 SF1664 SF1665 ydhA yi22_g5 TRUE 0.855 22.000 0.000 1.000   NA
 286854 286855 SF1665 SF1666 yi22_g5 yi21_g2 TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 286855 286856 SF1666 SF1667 yi21_g2 ydhH FALSE 0.030 220.000 0.000 NA N NA
 286859 286860 SF1670 SF1671 ydhI ydhJ TRUE 0.980 -6.000 0.412 NA   NA
 286860 2177908 SF1671 SF1672 ydhJ   TRUE 0.890 0.000 0.000 NA   NA
 2177909 286862 SF1673 SF1674 sodC ydhF FALSE 0.273 66.000 0.033 1.000   NA
 286862 2177910 SF1674 SF1675 ydhF   FALSE 0.545 49.000 0.045 NA   NA
 2177911 286865 SF1676 SF1677   nemA TRUE 0.941 37.000 0.362 1.000 N NA
 286865 286866 SF1677 SF1678 nemA gloA FALSE 0.184 81.000 0.057 1.000 N NA
 286866 286867 SF1678 SF1679 gloA rnt FALSE 0.297 103.000 0.136 1.000 N NA
 286867 2177912 SF1679 SF1680 rnt lhr FALSE 0.188 93.000 0.000 NA   NA
 2177913 286868 SF1681 SF1682   ydhD FALSE 0.007 547.000 0.000 NA   NA
 2177914 286870 SF1683 SF1684 ydhO sodB FALSE 0.065 128.000 0.015 1.000 N NA
 286874 286875 SF1688 SF1689 ydhC cfa FALSE 0.019 291.000 0.000 1.000 N NA
 286877 286878 SF1692 SF1693     FALSE 0.334 66.000 0.000 1.000   NA
 286878 286879 SF1693 SF1694   ydhQ FALSE 0.005 842.000 0.000 NA   NA
 400034 286880 SF4469 SF1695 tRNA-Val ydhR FALSE 0.186 108.000 0.000 NA   NA
 286880 2177916 SF1695 SF1696 ydhR   FALSE 0.163 126.000 0.000 NA   NA
 286881 286882 SF1697 SF1698 ydhT ydhU TRUE 0.962 4.000 0.222 NA   NA
 286882 286883 SF1698 SF1699 ydhU ydhX TRUE 0.998 -3.000 0.444 0.046 Y NA
 286883 2177917 SF1699 SF1700 ydhX   TRUE 0.952 13.000 0.235 NA   NA
 2177917 286885 SF1700 SF1701   ydhV TRUE 0.979 13.000 0.458 NA   NA
 286885 286886 SF1701 SF1702 ydhV ydhY TRUE 0.651 326.000 0.600 0.015 Y NA
 286886 286887 SF1702 SF1703 ydhY ydhZ FALSE 0.009 456.000 0.000 NA   NA
 286888 2177918 SF1704 SF1705 insB pykF FALSE 0.006 549.000 0.000 1.000 N NA
 2177918 286890 SF1705 SF1706 pykF mulI FALSE 0.016 312.000 0.000 1.000 N NA
 286891 286892 SF1707 SF1708 ynhG ynhA FALSE 0.155 149.000 0.069 NA   NA
 286892 2177919 SF1708 SF1710 ynhA   TRUE 0.817 13.000 0.000 NA   NA
 286894 286895 SF1711 SF1712 ynhC ynhD TRUE 0.991 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 286895 286896 SF1712 SF1713 ynhD ynhE TRUE 0.995 10.000 0.466 1.000 Y NA
 286896 286897 SF1713 SF1714 ynhE ydiC TRUE 0.805 9.000 0.041 NA   NA
 286897 286898 SF1714 SF1715 ydiC ydiH FALSE 0.007 548.000 0.000 NA   NA
 286898 286899 SF1715 SF1716 ydiH ydiI TRUE 0.791 19.000 0.032 NA   NA
 286899 286900 SF1716 SF1717 ydiI ydiJ TRUE 0.923 -3.000 0.129 NA N NA
 286901 2177920 SF1718 SF1719 ydiK   FALSE 0.010 429.000 0.000 NA   NA
 2177920 2177921 SF1719 SF1720     FALSE 0.169 160.000 0.095 NA   NA
 2177921 286904 SF1720 SF1721   ydiN FALSE 0.066 294.000 0.000 0.048   NA
 286904 286905 SF1721 SF1722 ydiN ydiB TRUE 0.825 12.000 0.082 1.000 N NA
 286905 286906 SF1722 SF1723 ydiB aroD TRUE 0.974 31.000 0.113 1.000 Y NA
 286907 286908 SF1724 SF1725 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286909 2177922 SF1726 SF1727 ydeN   TRUE 0.968 52.000 0.600 0.043   NA
 2177922 2177923 SF1727 SF1728   yddA FALSE 0.024 291.000 0.000 NA   NA
 2177923 286911 SF1728 SF1729 yddA yddB TRUE 0.683 38.000 0.000 NA   NA
 286913 286914 SF1731 SF1732 pqqL insA TRUE 0.757 34.000 0.000 NA   NA
 286914 286915 SF1732 SF1733 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286915 2177924 SF1733 SF1734 insB gadB FALSE 0.007 478.000 0.000 1.000 N NA
 2177924 2177925 SF1734 SF1735 gadB xasA FALSE 0.575 156.000 0.103 1.000 Y NA
 2177925 286918 SF1735 SF1736 xasA yddW FALSE 0.172 131.000 0.000 1.000   NA
 286918 286919 SF1736 SF1737 yddW yddV FALSE 0.015 377.000 0.000 1.000   NA
 286919 2177926 SF1737 SF1738 yddV   TRUE 0.606 -75.000 0.000 NA   NA
 2177926 2177927 SF1738 SF1739     FALSE 0.032 258.000 0.000 NA   NA
 2177927 2177928 SF1739 SF1740     TRUE 0.831 15.000 0.000 NA   NA
 2177928 286920 SF1740 SF1741   ddpD TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 286920 286921 SF1741 SF1742 ddpD ddpF TRUE 0.994 -7.000 0.219 0.003 Y NA
 286922 286923 SF1743 SF1744 osmC insB FALSE 0.077 173.000 0.000 1.000 N NA
 286923 286924 SF1744 SF1745 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 2177929 286926 SF1746 SF1747 sfcA adhP FALSE 0.169 134.000 0.000 1.000   NA
 286926 286927 SF1747 SF1748 adhP yddM FALSE 0.316 68.000 0.000 1.000   NA
 2177930 286929 SF1749 SF1750 fdnI fdnH TRUE 0.996 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 286929 286930 SF1750 SF1751 fdnH fdnG TRUE 0.997 13.000 0.429 0.002 Y NA
 286932 286933 SF1753 SF1754 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286934 286935 SF1755 SF1756 nmpC   FALSE 0.111 164.000 0.000 NA   NA
 286935 286936 SF1756 SF1757     FALSE 0.183 110.000 0.000 NA   NA
 286936 286937 SF1757 SF1758   insA FALSE 0.025 288.000 0.000 NA   NA
 286937 286938 SF1758 SF1759 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286938 2177931 SF1759 SF1760 insB narU FALSE 0.007 458.000 0.000 1.000 N NA
 2177931 2177932 SF1760 SF1761 narU narZ TRUE 0.845 25.000 0.000 NA   NA
 2177932 286940 SF1761 SF1762 narZ   TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 286940 286941 SF1762 SF1763     TRUE 0.762 -22.000 0.000 1.000   NA
 286941 286942 SF1763 SF1764   insB TRUE 0.901 0.000 0.000 1.000   NA
 286943 286944 SF1765 SF1766 yncC yncB FALSE 0.207 105.000 0.000 1.000   NA
 286944 286945 SF1766 SF1767 yncB yi22_g5 TRUE 0.716 37.000 0.000 1.000   NA
 286945 286946 SF1767 SF1768 yi22_g5 yi21_g2 TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2177933 286948 SF1769 SF1770   ydcZ TRUE 0.902 -3.000 0.070 NA   NA
 286949 286950 SF1771 SF1772 ydcY ydcX FALSE 0.197 86.000 0.000 NA   NA
 286950 286951 SF1772 SF1773 ydcX   FALSE 0.006 617.000 0.000 NA   NA
 286951 286952 SF1773 SF1774   ydcW FALSE 0.061 210.000 0.000 1.000   NA
 286952 286953 SF1774 SF1775 ydcW ydcV TRUE 0.948 22.000 0.216 1.000 N NA
 286953 2177934 SF1775 SF1776 ydcV   TRUE 0.799 -10.000 0.000 NA   NA
 2177935 286955 SF1778 SF1779   ydcL FALSE 0.006 692.000 0.000 NA   NA
 286955 286956 SF1779 SF1780 ydcL tehB FALSE 0.031 303.000 0.088 NA   NA
 286956 2177936 SF1780 SF1781 tehB tehA TRUE 0.958 -3.000 0.175 1.000   NA
 2177937 2177938 SF1783 SF1784 rimL ydcH FALSE 0.248 63.000 0.026 NA   NA
 286962 286963 SF1786 SF1787 ydcG ydcJ FALSE 0.042 225.000 0.000 NA   NA
 286967 286968 SF1791 SF1792 tra5_g5   TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 286968 286969 SF1792 SF1793   ydcA FALSE 0.007 596.000 0.000 NA   NA
 286969 286970 SF1793 SF1794 ydcA cybB FALSE 0.035 245.000 0.000 NA   NA
 286971 286972 SF1795 SF1796 gapC gapC_2 TRUE 0.970 -3.000 0.000 0.001   NA
 286973 2177939 SF1797 SF1798 aldA ydcF FALSE 0.066 197.000 0.000 NA   NA
 286974 286975 SF1799 SF1800     TRUE 0.976 27.000 0.000 1.000 Y NA
 286975 286976 SF1800 SF1801   tra5_g5 TRUE 0.959 45.000 0.000 0.046 Y NA
 286979 286980 SF1804 SF1805   tra5_g5 TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 286981 286982 SF1807 SF1808     TRUE 0.902 -49.000 0.285 NA   NA
 286982 286983 SF1808 SF1809   ynbB TRUE 0.838 16.000 0.000 NA   NA
 286983 2177942 SF1809 SF1810 ynbB   FALSE 0.541 152.000 0.179 0.002   NA
 2177942 2177943 SF1810 SF1811   ydbD FALSE 0.099 171.000 0.000 NA   NA
 2177944 286987 SF1813 SF1814 hslJ ldhA FALSE 0.189 99.000 0.000 NA   NA
 286988 286989 SF1815 SF1816 ydbH ynbE TRUE 0.899 -3.000 0.068 NA   NA
 286989 2177945 SF1816 SF1817 ynbE ydbL TRUE 0.991 5.000 0.726 NA   NA
 2177945 286991 SF1817 SF1818 ydbL insA FALSE 0.009 452.000 0.000 NA   NA
 286991 286992 SF1818 SF1819 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 286992 2177946 SF1819 SF1820 insB hslJ TRUE 0.838 16.000 0.000 NA   NA
 286994 286995 SF1822 SF1823   ompN FALSE 0.011 367.000 0.000 1.000 N NA
 286995 2177947 SF1823 SF1824 ompN ynaF FALSE 0.017 302.000 0.000 1.000 N NA
 2177947 286997 SF1824 SF1825 ynaF ydaO FALSE 0.065 176.000 0.000 NA N NA
 2177948 286999 SF1826 SF1827 dbpA ydaN FALSE 0.007 478.000 0.000 1.000 N NA
 2177950 287000 SF1829 SF1830 ydaL   FALSE 0.033 254.000 0.000 NA   NA
 287000 2177951 SF1830 SF1833     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 287001 287002 SF1831 SF1832     TRUE 0.819 10.000 0.000 NA   NA
 287002 2177952 SF1832 SF1834     FALSE 0.005 1337.000 0.000 1.000   NA
 2177952 287004 SF1834 SF1835   ogt FALSE 0.006 544.000 0.000 1.000 N NA
 287004 2177953 SF1835 SF1836 ogt fnr FALSE 0.054 195.000 0.000 1.000 N NA
 2177953 2177954 SF1836 SF1837 fnr ydaA TRUE 0.895 152.000 0.619 1.000 Y NA
 287007 287008 SF1838 SF1839     TRUE 0.976 27.000 0.000 1.000 Y NA
 287010 2177955 SF1841 SF1842   ycjZ FALSE 0.020 316.000 0.000 NA   NA
 287012 287013 SF1844 SF1845     FALSE 0.211 82.000 0.000 NA   NA
 287013 287014 SF1845 SF1846     TRUE 0.890 0.000 0.000 NA   NA
 287015 287016 SF1847 SF1848 tra5_g5   TRUE 0.825 12.000 0.000 1.000   NA
 287016 2177956 SF1848 SF1849     TRUE 0.698 -34.000 0.000 NA   NA
 287017 2177957 SF1850 SF1851     TRUE 0.817 13.000 0.000 NA   NA
 2177957 287018 SF1851 SF1852   yobA TRUE 0.860 4.000 0.000 NA   NA
 2177958 2177959 SF1853 SF1854 holE   FALSE 0.190 102.000 0.000 NA   NA
 2177959 2177960 SF1854 SF1855     TRUE 0.843 24.000 0.000 NA   NA
 287021 287022 SF1856 SF1857 ptrB yebE FALSE 0.082 210.000 0.092 NA   NA
 287022 2177961 SF1857 SF1858 yebE yebF FALSE 0.012 327.000 0.028 NA   NA
 287025 287026 SF1860 SF1861 eda edd TRUE 0.991 37.000 0.523 1.000 Y NA
 287026 2177962 SF1861 SF1862 edd zwf FALSE 0.037 235.000 0.000 NA   NA
 287027 2177963 SF1863 SF1864 yebK pykA FALSE 0.158 128.000 0.071 1.000 N NA
 287029 287030 SF1865 SF1866 msbB yebA TRUE 0.831 120.000 0.299 1.000 Y NA
 287030 287031 SF1866 SF1868 yebA znuA TRUE 0.901 16.000 0.131 1.000 N NA
 287032 287033 SF1867 SF1869 znuC znuB TRUE 0.998 20.000 0.755 0.075 Y NA
 287034 287035 SF1870 SF1871 ruvB ruvA TRUE 0.998 9.000 0.549 0.001 Y NA
 2177964 2177965 SF1873 SF1874 ruvC yebC TRUE 0.745 35.000 0.000 NA   NA
 2177965 2177966 SF1874 SF1875 yebC ntpA TRUE 0.803 29.000 0.000 NA   NA
 2177966 287039 SF1875 SF1876 ntpA aspS FALSE 0.149 88.000 0.050 1.000 N NA
 2177967 287040 SF1877 SF1878 yecD   FALSE 0.555 -1570.000 0.000 NA   NA
 287040 287041 SF1878 SF1879     FALSE 0.005 729.000 0.000 NA   NA
 287041 287042 SF1879 SF1880   ipaH9.8 FALSE 0.007 600.000 0.000 NA   NA
 287043 2177968 SF1881 SF1882     FALSE 0.022 301.000 0.000 NA   NA
 2177968 287045 SF1882 SF1883     FALSE 0.353 64.000 0.000 1.000   NA
 287045 287046 SF1883 SF1884     FALSE 0.292 68.000 0.000 NA   NA
 287046 2177969 SF1884 SF1885     TRUE 0.864 61.000 0.500 NA   NA
 2177969 2177970 SF1885 SF1886     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 2177970 287049 SF1886 SF1887     FALSE 0.133 149.000 0.000 NA   NA
 287049 287050 SF1887 SF1888     TRUE 0.890 0.000 0.000 NA   NA
 287050 287051 SF1888 SF1889     TRUE 0.986 0.000 0.400 NA   NA
 287051 2177971 SF1889 SF1890     TRUE 0.957 -28.000 0.400 NA   NA
 2177971 2177972 SF1890 SF1891     FALSE 0.336 63.000 0.000 NA   NA
 2177972 2177973 SF1891 SF1892     FALSE 0.376 59.000 0.000 NA   NA
 2177973 287055 SF1892 SF1893     TRUE 0.992 11.000 1.000 NA   NA
 287055 287056 SF1893 SF1894     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 287056 287057 SF1894 SF1895     TRUE 0.774 -13.000 0.000 NA   NA
 287057 287058 SF1895 SF1896     TRUE 0.809 12.000 0.000 NA   NA
 400099 400098 SF4470 SF4471 tRNA-Gly tRNA-Thr TRUE 0.860 4.000 0.000 NA   NA
 400098 400097 SF4471 SF4472 tRNA-Thr tRNA-Arg TRUE 0.867 3.000 0.000 NA   NA
 400097 400096 SF4472 SF4473 tRNA-Arg tRNA-Met TRUE 0.874 2.000 0.000 NA   NA
 400096 2177974 SF4473 SF1898 tRNA-Met   FALSE 0.092 177.000 0.000 NA   NA
 2177974 287061 SF1898 SF1899     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 287062 287063 SF1900 SF1901   tra5_g5 TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 287064 287065 SF1902 SF1903 insB insA TRUE 0.652 45.000 0.000 1.000   NA
 287066 2177975 SF1904 SF1905     TRUE 0.635 44.000 0.000 NA   NA
 2177975 287068 SF1905 SF1906     TRUE 0.985 -3.000 0.400 NA   NA
 287069 287070 SF1907 SF1908   yi91 TRUE 0.976 27.000 0.000 1.000 Y NA
 2177976 2177977 SF1909 SF1910 yecE yecN FALSE 0.485 53.000 0.000 NA   NA
 2177977 287072 SF1910 SF1911 yecN yecO TRUE 0.744 41.000 0.089 NA   NA
 287072 287073 SF1911 SF1912 yecO yecP TRUE 0.980 -3.000 0.315 NA   NA
 2177978 2177979 SF1913 SF1914 bisZ yecK TRUE 0.997 25.000 0.481 0.045 Y NA
 2177979 2177980 SF1914 SF1915 yecK cutC FALSE 0.014 388.000 0.000 1.000   NA
 2177980 2177981 SF1915 SF1916 cutC yecM FALSE 0.022 320.000 0.057 1.000   NA
 287078 287079 SF1917 SF1918 argS yecT FALSE 0.092 177.000 0.000 NA   NA
 287080 287081 SF1919 SF1920     FALSE 0.211 82.000 0.000 NA   NA
 287081 287082 SF1920 SF1921     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 287082 2177982 SF1921 SF1922   flhE FALSE 0.546 52.000 0.000 1.000   NA
 2177982 2177983 SF1922 SF1923 flhE flhA TRUE 0.874 2.000 0.000 NA   NA
 2177983 287084 SF1923 SF1924 flhA flhB TRUE 0.620 -53.000 0.000 NA   NA
 287084 287085 SF1924 SF1925 flhB   FALSE 0.005 629.000 0.000 1.000 N NA
 287085 287086 SF1925 SF1926   yi91 TRUE 0.976 27.000 0.000 1.000 Y NA
 287087 287088 SF1927 SF1928   tra5_g5 FALSE 0.012 390.000 0.000 NA   NA
 287088 287089 SF1928 SF1929 tra5_g5   TRUE 0.809 12.000 0.000 NA   NA
 2177984 287091 SF1930 SF1931 cheZ cheY TRUE 0.970 11.000 0.000 1.000 Y NA
 287091 287092 SF1931 SF1932 cheY cheB TRUE 0.987 15.000 0.000 0.009 Y NA
 287092 287093 SF1932 SF1933 cheB cheR TRUE 0.980 3.000 0.000 1.000 Y NA
 287093 2177985 SF1933 SF1934 cheR tap TRUE 0.988 19.000 0.188 1.000 Y NA
 2177985 2177986 SF1934 SF1935 tap tar TRUE 0.986 46.000 0.235 0.001 Y NA
 2177986 287096 SF1935 SF1936 tar cheW TRUE 0.719 145.000 0.043 0.003 Y NA
 287096 2177987 SF1936 SF1937 cheW cheA TRUE 0.998 21.000 0.447 0.002 Y NA
 2177987 287098 SF1937 SF1938 cheA motB TRUE 0.998 5.000 0.913 1.000 Y NA
 287098 287099 SF1938 SF1939 motB motA TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 287099 287100 SF1939 SF1940 motA flhC TRUE 0.648 127.000 0.408 1.000   NA
 287101 287102 SF1941 SF1942 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 2177988 2177989 SF1943 SF1944 otsA otsB TRUE 0.730 -25.000 0.000 NA   NA
 2177989 287104 SF1944 SF1945 otsB araH FALSE 0.443 167.000 0.037 1.000 Y NA
 287104 2177990 SF1945 SF1946 araH araG TRUE 0.997 12.000 0.451 0.002 Y NA
 2177990 2177991 SF1946 SF1947 araG araF FALSE 0.279 70.000 0.000 NA   NA
 287106 287108 SF1948 SF1950 ftnB yecR FALSE 0.005 795.000 0.000 NA   NA
 287108 2177992 SF1950 SF1951 yecR ftn FALSE 0.099 171.000 0.000 NA   NA
 287112 400095 SF1954 SF4474 yecA tRNA-Leu FALSE 0.067 196.000 0.000 NA   NA
 400095 400094 SF4474 SF4475 tRNA-Leu tRNA-Cys TRUE 0.817 13.000 0.000 NA   NA
 400094 400093 SF4475 SF4476 tRNA-Cys tRNA-Gly FALSE 0.445 55.000 0.000 NA   NA
 400093 287113 SF4476 SF1955 tRNA-Gly pgsA FALSE 0.126 152.000 0.000 NA   NA
 287113 2177993 SF1955 SF1956 pgsA uvrC TRUE 0.726 57.000 0.227 1.000 N NA
 2177993 287115 SF1956 SF1957 uvrC uvrY TRUE 0.962 -3.000 0.086 0.020 N NA
 2177994 287118 SF1959 SF1960 sdiA yecC FALSE 0.053 230.000 0.071 1.000   NA
 287118 287119 SF1960 SF1961 yecC yecS TRUE 0.989 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 287119 287120 SF1961 SF1962 yecS yedO TRUE 0.973 15.000 0.050 1.000 Y NA
 287120 287121 SF1962 SF1963 yedO fliY TRUE 0.905 105.000 0.469 1.000 Y NA
 287121 287122 SF1963 SF1964 fliY fliZ TRUE 0.954 31.000 0.280 1.000   NA
 287122 2177995 SF1964 SF1965 fliZ fliA TRUE 0.819 10.000 0.000 NA   NA
 2177995 287123 SF1965 SF1966 fliA fliC FALSE 0.109 165.000 0.000 NA   NA
 287124 287125 SF1967 SF1968 fliD fliS TRUE 0.996 25.000 0.284 0.002 Y NA
 287125 287126 SF1968 SF1969 fliS fliT TRUE 0.983 0.000 0.324 1.000   NA
 287126 287127 SF1969 SF1970 fliT amyA FALSE 0.366 78.000 0.115 1.000   NA
 2177997 287130 SF1972 SF1973 yedE yedF TRUE 0.995 -3.000 0.844 NA   NA
 287130 2177998 SF1973 SF1974 yedF yedK FALSE 0.188 107.000 0.000 NA   NA
 287132 287133 SF1976 SF1977   nmpC FALSE 0.004 719.000 0.000 1.000 N NA
 287134 287135 SF1978 SF1979 ybcM ybcL TRUE 0.987 10.000 0.625 NA   NA
 287135 287136 SF1979 SF1980 ybcL emrE FALSE 0.101 169.000 0.000 NA   NA
 2178001 2178002 SF1983 SF1984 fliF fliG TRUE 0.824 -7.000 0.000 NA   NA
 2178002 2178003 SF1984 SF1985 fliG fliH TRUE 0.987 -7.000 0.000 0.003 Y NA
 2178003 287140 SF1985 SF1986 fliH fliI TRUE 0.993 0.000 0.000 0.003 Y NA
 287140 287141 SF1986 SF1987 fliI fliJ TRUE 0.985 19.000 0.006 0.004 Y NA
 287141 287142 SF1987 SF1988 fliJ fliK TRUE 0.997 -3.000 0.317 0.004 Y NA
 287142 287143 SF1988 SF1989 fliK fliL TRUE 0.713 105.000 0.119 1.000 Y NA
 287143 2178004 SF1989 SF1990 fliL fliM TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 2178004 287145 SF1990 SF1991 fliM fliN TRUE 0.995 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 287145 287146 SF1991 SF1992 fliN fliO TRUE 0.996 3.000 0.443 1.000 Y NA
 287146 287147 SF1992 SF1993 fliO fliP TRUE 0.993 0.000 0.203 1.000 Y NA
 287147 287148 SF1993 SF1994 fliP fliQ TRUE 0.999 10.000 0.827 0.007 Y NA
 287148 2178005 SF1994 SF1995 fliQ fliR TRUE 0.988 9.000 0.000 0.002 Y NA
 2178005 287150 SF1995 SF1996 fliR rcsA FALSE 0.020 285.000 0.000 1.000 N NA
 287153 287154 SF2000 SF2001 yedQ yodC FALSE 0.046 381.000 0.208 NA   NA
 287154 287155 SF2001 SF2002 yodC yedI FALSE 0.155 79.000 0.025 NA   NA
 287157 287158 SF2004 SF2005 vsr dcm TRUE 0.958 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 287158 2178010 SF2005 SF2006 dcm yedJ FALSE 0.301 67.000 0.000 NA   NA
 2178010 287159 SF2006 SF2007 yedJ tra5_g5 FALSE 0.022 298.000 0.000 NA   NA
 287159 287160 SF2007 SF2008 tra5_g5   TRUE 0.843 57.000 0.000 1.000 Y NA
 287162 287163 SF2010 SF2011 yi22_g5 yi21_g2 TRUE 0.937 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 287164 287165 SF2012 SF2013 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 287165 287166 SF2013 SF2014 insB yedU TRUE 0.611 46.000 0.000 NA   NA
 287167 2178011 SF2015 SF2016 yedV yedW TRUE 0.999 0.000 0.857 0.001 Y NA
 287169 2178012 SF2017 SF2018 yedX   FALSE 0.185 109.000 0.000 NA   NA
 2178012 287170 SF2018 SF2019   yedZ TRUE 0.879 1.000 0.000 NA   NA
 287170 287171 SF2019 SF2020 yedZ yodA FALSE 0.035 258.000 0.000 1.000   NA
 287171 287172 SF2020 SF2021 yodA   FALSE 0.005 1404.000 0.000 1.000   NA
 287172 2178013 SF2021 SF2022   ipaH_5 FALSE 0.020 316.000 0.000 NA   NA
 2178013 287173 SF2022 SF2023 ipaH_5   FALSE 0.552 -1928.000 0.000 NA   NA
 287174 287175 SF2024 SF2025   tra5_g5 FALSE 0.143 143.000 0.000 NA   NA
 287177 287178 SF2027 SF2028     FALSE 0.292 68.000 0.000 NA   NA
 287178 287179 SF2028 SF2029     TRUE 0.746 85.000 0.500 NA   NA
 287179 287180 SF2029 SF2030     TRUE 0.995 0.000 0.900 NA   NA
 287180 287181 SF2030 SF2031     TRUE 0.996 0.000 1.000 NA   NA
 287181 2178014 SF2031 SF2032     FALSE 0.232 168.000 0.167 NA   NA
 2178014 287183 SF2032 SF2033   tra5_g5 FALSE 0.158 130.000 0.000 NA   NA
 287183 287184 SF2033 SF2034 tra5_g5   TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 287184 287185 SF2034 SF2035     TRUE 0.891 52.000 0.000 1.000 Y NA
 287185 287186 SF2035 SF2036     TRUE 0.974 20.000 0.000 NA Y NA
 287186 287187 SF2036 SF2037     TRUE 0.982 -3.000 0.000 NA Y NA
 287187 287188 SF2037 SF2038     FALSE 0.189 99.000 0.000 NA   NA
 287188 400092 SF2038 SF4477   tRNA-Gly FALSE 0.023 293.000 0.000 NA   NA
 400092 400091 SF4477 SF4478 tRNA-Gly tRNA-Thr TRUE 0.860 4.000 0.000 NA   NA
 400091 400090 SF4478 SF4479 tRNA-Thr tRNA-Lys TRUE 0.867 3.000 0.000 NA   NA
 400090 400089 SF4479 SF4480 tRNA-Lys tRNA-Met TRUE 0.874 2.000 0.000 NA   NA
 400089 2178015 SF4480 SF2039 tRNA-Met   FALSE 0.064 199.000 0.000 NA   NA
 2178015 287190 SF2039 SF2040     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 287190 2178016 SF2040 SF2041     TRUE 0.879 1.000 0.000 NA   NA
 2178016 287192 SF2041 SF2042     FALSE 0.253 74.000 0.000 NA   NA
 287192 2178017 SF2042 SF2043     FALSE 0.005 975.000 0.000 NA   NA
 287195 400035 SF2045 SF4482 yeeI tRNA-Asn FALSE 0.190 101.000 0.000 NA   NA
 400035 287196 SF4482 SF2046 tRNA-Asn   FALSE 0.006 675.000 0.000 NA   NA
 287196 287197 SF2046 SF2047     FALSE 0.285 69.000 0.000 NA   NA
 287198 287199 SF2048 SF2049   yi91 TRUE 0.976 27.000 0.000 1.000 Y NA
 2178019 287200 SF2050 SF2051     FALSE 0.572 -856.000 0.000 NA   NA
 287200 287201 SF2051 SF2052   tra5_g5 TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 287201 2178020 SF2052 SF2053 tra5_g5 amn FALSE 0.012 352.000 0.000 1.000 N NA
 2178020 287203 SF2053 SF2054 amn yeeN FALSE 0.016 343.000 0.000 NA   NA
 400087 2178021 SF4483 SF2055 tRNA-Asn yeeO FALSE 0.190 101.000 0.000 NA   NA
 287204 2178022 SF2056 SF2057 cbl nac TRUE 0.884 102.000 0.222 0.042 Y NA
 287206 287207 SF2058 SF2059 erfK cobT FALSE 0.224 62.000 0.015 NA   NA
 287207 2178023 SF2059 SF2060 cobT cobS TRUE 0.986 12.000 0.056 0.003 Y NA
 2178023 287209 SF2060 SF2061 cobS cobU TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 287209 287210 SF2061 SF2062 cobU tra5_g5 TRUE 0.766 12.000 0.000 1.000 N NA
 287210 287211 SF2062 SF2063 tra5_g5   TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 287212 287213 SF2064 SF2065     FALSE 0.055 215.000 0.000 1.000   NA
 287213 287214 SF2065 SF2066     FALSE 0.043 222.000 0.000 NA   NA
 287215 2178024 SF2067 SF2068 yeeX yeeA FALSE 0.189 106.000 0.000 NA   NA
 287216 287217 SF2069 SF2070 tnpC sbcB FALSE 0.055 545.000 0.000 1.000 Y NA
 287218 287219 SF2071 SF2072 yedF yeeE TRUE 0.978 14.000 0.419 NA   NA
 287219 287220 SF2072 SF2073 yeeE yeeF FALSE 0.089 179.000 0.000 NA   NA
 287220 2178025 SF2073 SF2074 yeeF yeeY FALSE 0.041 213.000 0.000 1.000 N NA
 2178025 287222 SF2074 SF2075 yeeY yeeZ FALSE 0.364 46.000 0.015 1.000 N NA
 287222 287223 SF2075 SF2076 yeeZ yoeB FALSE 0.208 83.000 0.000 NA   NA
 287223 287224 SF2076 SF2077 yoeB insB TRUE 0.840 22.000 0.000 NA   NA
 287224 287225 SF2077 SF2078 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 287225 287226 SF2078 SF2079 insA yefM TRUE 0.677 34.000 0.000 NA N NA
 287227 2178026 SF2080 SF2081 hisL hisG FALSE 0.319 146.000 0.003 0.002   NA
 2178026 2178027 SF2081 SF2082 hisG hisD TRUE 0.994 6.000 0.171 0.002 Y NA
 2178027 287230 SF2082 SF2083 hisD hisC TRUE 0.997 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 287230 2178028 SF2083 SF2084 hisC hisB TRUE 0.998 0.000 0.341 0.002 Y NA
 2178028 287232 SF2084 SF2085 hisB hisH TRUE 0.995 0.000 0.128 0.002 Y NA
 287232 2178029 SF2085 SF2086 hisH hisA TRUE 0.991 0.000 0.010 0.002 Y NA
 2178029 287234 SF2086 SF2087 hisA hisF TRUE 0.976 -18.000 0.003 0.002 Y NA
 287234 287235 SF2087 SF2088 hisF hisIE TRUE 0.998 -6.000 0.430 0.002 Y NA
 287236 2178030 SF2089 SF2090 wzzB ugd FALSE 0.183 110.000 0.000 NA   NA
 2178030 287237 SF2090 SF2091 ugd gnd FALSE 0.034 250.000 0.000 NA   NA
 287237 287238 SF2091 SF2092 gnd   FALSE 0.009 465.000 0.000 NA   NA
 287238 287239 SF2092 SF2093     FALSE 0.190 101.000 0.000 NA   NA
 287239 2178031 SF2093 SF2094     FALSE 0.046 217.000 0.000 NA   NA
 2178031 287241 SF2094 SF2095     FALSE 0.282 58.000 0.021 NA   NA
 287241 287242 SF2095 SF2096   rfbI FALSE 0.336 63.000 0.000 NA   NA
 287242 287243 SF2096 SF2097 rfbI rfc TRUE 0.860 4.000 0.000 NA   NA
 287243 287244 SF2097 SF2098 rfc rfbG TRUE 0.838 20.000 0.000 NA   NA
 287244 287245 SF2098 SF2099 rfbG rfbF TRUE 0.841 29.000 0.077 NA   NA
 287245 287246 SF2099 SF2100 rfbF rfbE TRUE 0.794 30.000 0.000 NA   NA
 287246 287247 SF2100 SF2101 rfbE rfbC TRUE 0.852 16.000 0.000 1.000   NA
 287247 287248 SF2101 SF2102 rfbC rfbA TRUE 0.990 5.000 0.211 1.000 Y NA
 287248 287249 SF2102 SF2103 rfbA rfbD TRUE 0.912 59.000 0.053 0.002 Y NA
 287249 287250 SF2103 SF2104 rfbD rfbB TRUE 0.994 0.000 0.084 0.001 Y NA
 287250 2178032 SF2104 SF2105 rfbB galF FALSE 0.095 373.000 0.000 1.000 Y NA
 2178032 287252 SF2105 SF2106 galF wcaM FALSE 0.342 175.000 0.259 NA   NA
 287252 2178033 SF2106 SF2107 wcaM wcaL TRUE 0.960 11.000 0.292 NA   NA
 2178033 287254 SF2107 SF2108 wcaL wcaK TRUE 0.921 -3.000 0.095 NA   NA
 287254 287255 SF2108 SF2109 wcaK wzxC FALSE 0.130 180.000 0.095 NA   NA
 287255 287256 SF2109 SF2110 wzxC wcaJ TRUE 0.977 2.000 0.304 NA   NA
 287256 2178034 SF2110 SF2111 wcaJ cpsG TRUE 0.901 55.000 0.538 NA N NA
 2178034 287258 SF2111 SF2112 cpsG cpsB_1 TRUE 0.662 193.000 1.000 1.000 N NA
 287258 287259 SF2112 SF2113 cpsB_1 wcaI TRUE 0.986 3.000 0.123 1.000 Y NA
 287259 2178035 SF2113 SF2114 wcaI wcaH TRUE 0.917 -3.000 0.108 1.000 N NA
 2178035 287261 SF2114 SF2115 wcaH wcaG TRUE 0.966 0.000 0.217 1.000 N NA
 287261 287262 SF2115 SF2116 wcaG gmd TRUE 0.990 3.000 0.000 0.007 Y NA
 287262 287263 SF2116 SF2117 gmd wcaF TRUE 0.797 26.000 0.022 1.000   NA
 287264 287265 SF2118 SF2119 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 2178036 287266 SF2120 SF2121 wcaD wcaC TRUE 0.595 -97.000 0.000 NA   NA
 287266 2178037 SF2121 SF2122 wcaC wcaB TRUE 0.970 -3.000 0.259 1.000 N NA
 2178037 2178038 SF2122 SF2123 wcaB wcaA TRUE 0.867 3.000 0.000 NA   NA
 2178038 287268 SF2123 SF2124 wcaA wzc FALSE 0.188 93.000 0.000 NA   NA
 287268 287269 SF2124 SF2125 wzc wzb TRUE 0.835 3.000 0.000 1.000 N NA
 287269 287270 SF2125 SF2126 wzb wza TRUE 0.965 6.000 0.286 1.000 N NA
 287272 287273 SF2128 SF2129 asmA dcd TRUE 0.794 22.000 0.057 NA N NA
 287273 287274 SF2129 SF2130 dcd udk TRUE 0.692 92.000 0.098 1.000 Y NA
 287275 287276 SF2132 SF2133   alkA FALSE 0.005 3229.000 0.000 1.000   NA
 287277 287278 SF2135 SF2136     TRUE 0.974 -12.000 0.455 NA   NA
 287278 2178042 SF2136 SF2137     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 287280 287281 SF2138 SF2139   yegM TRUE 0.886 2.000 0.000 1.000   NA
 287281 2178043 SF2139 SF2140 yegM yegN TRUE 0.890 0.000 0.000 NA   NA
 2178043 287282 SF2140 SF2141 yegN yegO TRUE 0.879 1.000 0.000 NA   NA
 287282 287283 SF2141 SF2142 yegO yegB TRUE 0.985 1.000 0.438 1.000 N NA
 287283 287284 SF2142 SF2143 yegB baeS TRUE 0.933 -3.000 0.139 1.000 N NA
 287284 287285 SF2143 SF2144 baeS baeR TRUE 0.998 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 287285 287286 SF2144 SF2145 baeR yegP FALSE 0.139 152.000 0.062 NA   NA
 287286 2178044 SF2145 SF2146 yegP yegQ FALSE 0.072 147.000 0.008 NA   NA
 2178045 287288 SF2147 SF2148     TRUE 0.786 -12.000 0.000 NA   NA
 287290 287291 SF2150 SF2151 gatR gatD FALSE 0.154 100.000 0.000 1.000 N NA
 287291 287292 SF2151 SF2152 gatD insB TRUE 0.723 33.000 0.000 1.000 N NA
 287292 287293 SF2152 SF2153 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 287293 287294 SF2153 SF2154 insA gatC FALSE 0.135 95.000 0.000 NA N NA
 287294 287295 SF2154 SF2155 gatC gatB TRUE 0.990 4.000 0.000 0.010 Y NA
 287295 287296 SF2155 SF2156 gatB gatA TRUE 0.983 31.000 0.000 0.010 Y NA
 287296 287297 SF2156 SF2157 gatA gatZ TRUE 0.972 10.000 0.000 1.000 Y NA
 287297 2178046 SF2157 SF2158 gatZ gatY TRUE 0.987 29.000 0.000 0.001 Y NA
 2178046 287299 SF2158 SF2159 gatY   FALSE 0.283 308.000 0.000 0.001 Y NA
 2178047 287300 SF2160 SF2161   yegV TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 2178049 287303 SF2164 SF2165 yegX thiD FALSE 0.267 65.000 0.000 1.000 N NA
 287303 287304 SF2165 SF2166 thiD thiM TRUE 0.991 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 287304 287305 SF2166 SF2167 thiM yohL FALSE 0.043 223.000 0.000 NA   NA
 2178050 287306 SF2168 SF2169 yohM yohN FALSE 0.045 219.000 0.000 NA   NA
 287307 2178051 SF2170 SF2171 yehA yehB TRUE 0.838 16.000 0.000 NA   NA
 2178051 2178052 SF2171 SF2174 yehB yehC TRUE 0.838 16.000 0.000 NA   NA
 287309 287310 SF2172 SF2173 insA_3 insB TRUE 0.652 45.000 0.000 1.000   NA
 287311 287312 SF2175 SF2176 yehD insB FALSE 0.021 276.000 0.000 1.000 N NA
 287312 287313 SF2176 SF2177 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 287313 2178053 SF2177 SF2178 insA mrp FALSE 0.004 640.000 0.000 NA N NA
 2178054 2178055 SF2179 SF2180 metG molR_1 FALSE 0.145 141.000 0.000 NA   NA
 2178055 287316 SF2180 SF2181 molR_1   FALSE 0.578 -557.000 0.000 NA   NA
 287316 287317 SF2181 SF2182   tra5_g5 TRUE 0.975 36.000 0.182 1.000 Y NA
 287317 287318 SF2182 SF2183 tra5_g5 insA FALSE 0.041 658.000 0.000 NA Y NA
 287318 287319 SF2183 SF2184 insA insB TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 287319 2178056 SF2184 SF2185 insB molR_2 FALSE 0.052 214.000 0.000 NA   NA
 2178056 2178057 SF2185 SF2186 molR_2 yehI FALSE 0.005 923.000 0.000 NA   NA
 2178057 287320 SF2186 SF2187 yehI   FALSE 0.354 61.000 0.000 NA   NA
 287320 2178058 SF2187 SF2188   yehL FALSE 0.009 476.000 0.000 NA   NA
 2178058 2178059 SF2188 SF2189 yehL yehM TRUE 0.808 11.000 0.000 NA   NA
 2178059 2178060 SF2189 SF2190 yehM yehP TRUE 0.824 -7.000 0.000 NA   NA
 2178060 2178061 SF2190 SF2191 yehP yehQ TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 287327 287328 SF2194 SF2195 insB insA TRUE 0.974 27.000 0.000 NA Y NA
 287328 287329 SF2195 SF2196 insA yehS TRUE 0.757