MicrobesOnline Operon Predictions for Thermosynechococcus elongatus BP-1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 196724 196725     tll0002 tsl0003 FALSE 0.104 71.000 0.000 NA   NA
 196726 196727     tsr0004 ureC FALSE 0.144 54.000 0.000 NA   NA
 196727 196728   tlr0006 ureC   TRUE 0.673 4.000 0.000 1.000   NA
 196729 196730     tll0007 ycf81 FALSE 0.391 27.000 0.000 NA   NA
 196730 196731     ycf81 tll0009 FALSE 0.163 50.000 0.000 NA   NA
 196732 196733 tlr0010 tlr0011     TRUE 0.721 0.000 0.000 1.000   NA
 196733 196734 tlr0011 tlr0012     TRUE 0.694 3.000 0.000 1.000   NA
 196735 196736     tll0013 tll0014 FALSE 0.225 47.000 0.000 1.000   NA
 196736 196737     tll0014 tll0015 TRUE 0.673 4.000 0.000 1.000   NA
 196737 196738     tll0015 tll0016 TRUE 0.985 -3.000 0.286 1.000 N NA
 196738 196739     tll0016 tsl0017 FALSE 0.089 119.000 0.000 NA   NA
 196741 196742     tll0019 crtE TRUE 0.828 52.000 0.214 1.000   NA
 196742 196743     crtE folD TRUE 0.974 11.000 0.250 1.000 Y NA
 196743 196744     folD tll0022 FALSE 0.077 238.000 0.000 NA   NA
 196744 196745     tll0022 tsl0023 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 196745 196746     tsl0023 tll0024 FALSE 0.098 77.000 0.000 NA   NA
 196746 196747     tll0024 tll0025 TRUE 0.583 6.000 0.000 NA   NA
 196747 196748     tll0025 tll0026 FALSE 0.110 133.000 0.000 1.000   NA
 196749 196750 tlr0027 tlr0028     TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 196750 196751 tlr0028 tlr0029     FALSE 0.087 131.000 0.000 NA   NA
 196757 196758 tlr0035     sodB FALSE 0.181 47.000 0.000 NA   NA
 196759 196760     tll0037 rps21 TRUE 0.927 10.000 0.010 1.000   NA
 196760 196761     rps21 tll0039 TRUE 0.939 4.000 0.009 NA   NA
 196761 196762     tll0039 rps16 TRUE 0.980 4.000 0.385 NA   NA
 196763 196764   tlr0042 fabD   TRUE 0.808 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 196765 196766     gap1 tll0044 FALSE 0.431 23.000 0.000 NA N NA
 196766 196767     tll0044 ndhB FALSE 0.151 53.000 0.000 NA N NA
 196767 196768     ndhB tll0046 FALSE 0.083 175.000 0.000 NA N NA
 196768 196769     tll0046 tll0047 TRUE 0.644 2.000 0.000 NA   NA
 196769 196770     tll0047 fur TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 196770 196771     fur tll0049 FALSE 0.105 187.000 0.000 1.000 N NA
 196772 196773   tlr0051 tyrS   FALSE 0.098 382.000 0.000 1.000 N NA
 196773 196774 tlr0051     ccdA TRUE 0.740 5.000 0.000 1.000 Y NA
 196774 196775   tlr0053 ccdA   FALSE 0.098 396.000 0.000 1.000 N NA
 196777 196778 tlr0055 tlr0056     TRUE 0.600 10.000 0.000 1.000   NA
 196778 196779 tlr0056     ureG TRUE 0.658 5.000 0.000 1.000   NA
 196779 196780   tlr0058 ureG   FALSE 0.349 37.000 0.000 1.000   NA
 196780 196781 tlr0058 tlr0059     FALSE 0.107 69.000 0.000 NA   NA
 196782 196783     tll0060 tll0061 TRUE 0.559 14.000 0.000 1.000 N NA
 196783 196784     tll0061 tll0062 TRUE 0.755 -10.000 0.000 1.000 N NA
 196784 196785     tll0062 tsl0063 FALSE 0.255 41.000 0.000 NA   NA
 196785 196786     tsl0063 tll0064 FALSE 0.146 53.000 0.000 NA   NA
 196786 196787     tll0064 thiG TRUE 0.745 -3.000 0.000 1.000 N NA
 196788 196789 tlr0066     ribH FALSE 0.174 48.000 0.000 NA   NA
 196792 196793     tll0070 tll0071 TRUE 0.632 3.000 0.000 NA   NA
 196793 196794     tll0071 tll0072 TRUE 0.593 5.000 0.000 NA   NA
 196794 196795     tll0072 murD TRUE 0.696 -15.000 0.000 NA   NA
 196797 196798     tll0075 ycf46 TRUE 0.987 1.000 0.800 NA   NA
 196798 196799     ycf46 tll0077 TRUE 0.954 -3.000 0.007 NA   NA
 196799 196800     tll0077 tll0078 TRUE 0.632 3.000 0.000 NA   NA
 196800 196801     tll0078 tll0079 FALSE 0.117 63.000 0.000 NA   NA
 196801 196802     tll0079 tgt TRUE 0.696 -31.000 0.000 NA   NA
 196803 196804     rpl3 rpl4 TRUE 0.983 17.000 0.361 0.025 Y NA
 196804 196805     rpl4 rpl23 TRUE 0.994 -7.000 0.513 0.025 Y NA
 196805 196806     rpl23 rpl2 TRUE 0.990 12.000 0.849 0.029 Y NA
 196806 196807     rpl2 rps19 TRUE 0.985 23.000 0.820 0.032 Y NA
 196807 196808     rps19 rpl22 TRUE 0.980 31.000 0.769 0.032 Y NA
 196808 196809     rpl22 rps3 TRUE 0.988 13.000 0.719 0.032 Y NA
 196809 196810     rps3 rpl16 TRUE 0.988 15.000 0.828 0.032 Y NA
 196810 196811     rpl16 rpl29 TRUE 0.994 3.000 0.802 0.025 Y NA
 196811 196812     rpl29 rps17 TRUE 0.995 0.000 0.828 0.025 Y NA
 196812 196813     rps17 rpl14 TRUE 0.988 13.000 0.791 0.032 Y NA
 196813 196814     rpl14 rpl24 TRUE 0.994 0.000 0.810 0.032 Y NA
 196814 196815     rpl24 rpl5 TRUE 0.930 58.000 0.758 0.025 Y NA
 196815 196816     rpl5 rps8 TRUE 0.959 30.000 0.059 0.025 Y NA
 196816 196817     rps8 rpl6 TRUE 0.987 19.000 0.808 0.025 Y NA
 196817 196818     rpl6 rpl18 TRUE 0.994 1.000 0.815 0.025 Y NA
 196818 196819     rpl18 rps5 TRUE 0.989 12.000 0.814 0.032 Y NA
 196819 196820     rps5 rpl15 TRUE 0.978 14.000 0.148 0.032 Y NA
 196820 196821     rpl15 secY TRUE 0.976 13.000 0.730 1.000 N NA
 196821 196822   tlr0100 secY   TRUE 0.964 0.000 0.020 1.000 N NA
 196822 196823 tlr0100     infA TRUE 0.966 -7.000 0.015 1.000 N NA
 196823 196824     infA rpl36 TRUE 0.808 61.000 0.257 1.000   NA
 196824 196825     rpl36 rps13 TRUE 0.957 34.000 0.194 0.025   NA
 196825 196826     rps13 rps11 TRUE 0.963 43.000 0.810 0.025 Y NA
 196826 196827     rps11 rpoA TRUE 0.948 30.000 0.308 1.000 N NA
 196827 196828     rpoA rpl17 TRUE 0.973 23.000 0.873 1.000 N NA
 196828 196829   tlr0107 rpl17   TRUE 0.971 7.000 0.102 1.000 Y NA
 196829 196830 tlr0107     rpl13 TRUE 0.950 17.000 0.058 1.000 Y NA
 196830 196831     rpl13 rps9 TRUE 0.993 3.000 0.601 0.025 Y NA
 196831 196832     rps9 rpl31 TRUE 0.940 39.000 0.062 0.025 Y NA
 196832 196833   tlr0111 rpl31   TRUE 0.607 10.000 0.000 1.000 N NA
 196833 196834 tlr0111 tlr0112     TRUE 0.981 -3.000 0.158 1.000   NA
 196835 2177445   rTEt01 ftrC trnI_CAU FALSE 0.098 78.000 0.000 NA   NA
 2177445 196836 rTEt01   trnI_CAU tll0114 TRUE 0.692 -1827.000 0.000 NA   NA
 196837 196838   tlr0116 nifS   FALSE 0.075 315.000 0.000 NA   NA
 196839 196840     tsl0117 dnaJ TRUE 0.972 -3.000 0.051 NA   NA
 196840 196841     dnaJ pilC TRUE 0.932 9.000 0.010 1.000   NA
 196841 196842     pilC pilC TRUE 0.949 20.000 0.014 0.007   NA
 196842 196843     pilC pilT TRUE 0.938 31.000 0.218 1.000   NA
 196843 196844     pilT pilB TRUE 0.868 70.000 0.178 0.021 Y NA
 196845 196846     tsr0123 tsr0124 TRUE 0.651 1.000 0.000 NA   NA
 196846 196847   tlr0125 tsr0124   TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 196852 399872   rTEt02 menD trnG_UCC FALSE 0.083 150.000 0.000 NA   NA
 399872 196853 rTEt02   trnG_UCC ftsH FALSE 0.136 56.000 0.000 NA   NA
 196858 196859 tlr0136 tlr0137     FALSE 0.121 63.000 0.000 NA N NA
 196860 196861     tll0138 tll0139 FALSE 0.097 80.000 0.000 NA   NA
 196863 196864     tll0141 tll0142 FALSE 0.075 296.000 0.000 NA   NA
 196865 196866 tlr0143     cobA FALSE 0.148 54.000 0.000 NA N NA
 196867 196868     tll0145 tll0146 FALSE 0.109 68.000 0.000 NA   NA
 196869 196870     rps4 prfA TRUE 0.899 19.000 0.002 1.000 Y NA
 196870 196871     prfA tsr0149 TRUE 0.533 10.000 0.000 NA   NA
 196873 196874 tlr0151 tlr0152     FALSE 0.136 71.000 0.000 1.000 N NA
 196875 196876     tll0153 tll0154 TRUE 0.679 4.000 0.000 1.000 N NA
 196876 196877     tll0154 tll0155 FALSE 0.107 69.000 0.000 NA   NA
 196877 196878     tll0155 tll0156 TRUE 0.895 37.000 0.130 NA   NA
 196881 196882 tlr0159 tlr0160     FALSE 0.502 13.000 0.000 NA N NA
 196883 196884     tll0161 tll0162 TRUE 0.739 -3.000 0.000 1.000   NA
 196884 196885     tll0162 tsl0163 FALSE 0.146 64.000 0.000 1.000   NA
 196887 196888     tll0165 rpl27 FALSE 0.074 352.000 0.000 NA   NA
 196888 196889     rpl27 rpl21 TRUE 0.994 2.000 0.667 0.024 Y NA
 196889 196890     rpl21 tll0168 FALSE 0.093 118.000 0.000 NA N NA
 196890 196891     tll0168 tll0169 FALSE 0.213 44.000 0.000 NA N NA
 196891 196892     tll0169 tll0170 TRUE 0.690 -3.000 0.000 NA N NA
 196894 196895     cobL cobH TRUE 0.989 -3.000 0.054 0.022 Y NA
 399833 196896 rTEt03   trnS_GGA recJ FALSE 0.083 155.000 0.000 NA   NA
 196897 196898     tll0175 psbK FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 196902 196903     hisG tll0181 TRUE 0.989 4.000 0.239 0.006 N NA
 196903 196904     tll0181 tll0182 TRUE 0.636 7.000 0.000 1.000   NA
 196904 196905     tll0182 purU FALSE 0.113 123.000 0.000 1.000   NA
 196905 196906     purU uvrA FALSE 0.449 29.000 0.000 1.000 N NA
 196906 196907     uvrA groEL-1 FALSE 0.103 209.000 0.000 1.000 N NA
 196907 196908     groEL-1 groES TRUE 0.927 69.000 0.905 0.015 Y NA
 196908 196909     groES tll0187 FALSE 0.105 188.000 0.000 1.000 N NA
 196909 196910     tll0187 tll0188 TRUE 0.899 -79.000 0.000 0.044 N NA
 196911 196912 tlr0189     folC TRUE 0.533 10.000 0.000 NA   NA
 196912 196913   tlr0191 folC   FALSE 0.098 252.000 0.000 1.000   NA
 196913 196914 tlr0191 tlr0192     FALSE 0.153 62.000 0.000 1.000   NA
 196914 196915 tlr0192 tlr0193     TRUE 0.757 -24.000 0.000 1.000 N NA
 196915 196916 tlr0193 tlr0194     FALSE 0.090 118.000 0.000 NA   NA
 196916 196917 tlr0194 tlr0195     TRUE 0.651 1.000 0.000 NA   NA
 196917 196918 tlr0195 tlr0196     TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 196918 196919 tlr0196     psaM FALSE 0.093 106.000 0.000 NA   NA
 196919 196920   tlr0198 psaM   TRUE 0.688 141.000 0.184 NA   NA
 196921 196922     tll0199 tll0200 FALSE 0.098 78.000 0.000 NA   NA
 196922 196923     tll0200 tll0201 FALSE 0.081 169.000 0.000 NA   NA
 196923 196924     tll0201 secF TRUE 0.570 7.000 0.000 NA   NA
 196924 196925     secF secD TRUE 0.995 -3.000 0.516 0.001 Y NA
 196925 196926     secD tll0204 TRUE 0.973 3.000 0.091 1.000 N NA
 196926 196927     tll0204 tll0205 FALSE 0.102 225.000 0.000 1.000 N NA
 196928 196929 tlr0206 tlr0207     FALSE 0.121 110.000 0.000 1.000 N NA
 196929 196930 tlr0207 tlr0208     TRUE 0.971 -3.000 0.048 NA   NA
 196930 196931 tlr0208     sun TRUE 0.694 -9.000 0.000 NA   NA
 196932 196933     tll0210 tll0211 TRUE 0.948 29.000 0.378 NA   NA
 196933 196934     tll0211 lysS FALSE 0.128 59.000 0.000 NA   NA
 196938 196939     hisA tll0217 FALSE 0.391 27.000 0.000 NA   NA
 196939 399871   rTEt04 tll0217 trnG_CCC FALSE 0.474 15.000 0.000 NA   NA
 399871 196940 rTEt04   trnG_CCC tll0218 FALSE 0.435 20.000 0.000 NA   NA
 196944 196945     tll0222 tll0223 FALSE 0.076 264.000 0.000 NA   NA
 196945 196946     tll0223 tsl0224 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 196947 196948 tlr0225 tlr0226     FALSE 0.097 494.000 0.000 1.000 N NA
 196948 196949 tlr0226 tlr0227     FALSE 0.329 40.000 0.000 1.000 N NA
 196949 196950 tlr0227 tlr0228     TRUE 0.756 -51.000 0.000 1.000 N NA
 196950 196951 tlr0228 tlr0229     FALSE 0.343 32.000 0.000 NA   NA
 196951 196952 tlr0229 tlr0230     TRUE 0.981 5.000 0.619 NA   NA
 196953 196954     nadA tll0232 FALSE 0.520 19.000 0.000 1.000 N NA
 196954 196955     tll0232 hisIE FALSE 0.128 79.000 0.000 1.000 N NA
 2177446 196956 rTEs01 tlr0234 SRP_RNA   FALSE 0.085 137.000 0.000 NA   NA
 196956 196957 tlr0234     tsr0235 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 196958 196959     tll0236 tsl0237 FALSE 0.075 323.000 0.000 NA   NA
 196961 196962     tsl0239 tll0240 FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 196963 196964 tlr0241 tlr0242     TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 196964 196965 tlr0242 tlr0243     TRUE 0.920 -3.000 0.000 0.023 Y NA
 196965 196966 tlr0243 tlr0244     FALSE 0.095 386.000 0.000 1.000   NA
 196966 196967 tlr0244 tlr0245     FALSE 0.286 589.000 0.000 0.003   NA
 196967 196968 tlr0245 tlr0246     FALSE 0.094 679.000 0.000 1.000   NA
 196968 196969 tlr0246 tlr0247     FALSE 0.093 745.000 0.000 1.000   NA
 196971 196972 tlr0249 tlr0250     FALSE 0.099 86.000 0.000 NA   NA
 196972 2177447 tlr0250 rTEs02   tmRNA FALSE 0.075 311.000 0.000 NA   NA
 196977 196978     tll0255 tll0256 FALSE 0.140 69.000 0.000 1.000 N NA
 196979 196980 tlr0257     tsr0258 FALSE 0.091 114.000 0.000 NA   NA
 196981 196982     rrf pyrH TRUE 0.989 -13.000 0.626 1.000 N NA
 196982 399870   rTEt05 pyrH trnR_UCU FALSE 0.146 53.000 0.000 NA   NA
 196983 196984 tlr0261 tlr0262     TRUE 0.976 -19.000 0.066 NA   NA
 196984 196985 tlr0262 tlr0263     FALSE 0.072 1009.000 0.000 NA   NA
 196985 196986 tlr0263     sigD FALSE 0.074 364.000 0.000 NA   NA
 196986 196987     sigD cobO TRUE 0.679 4.000 0.000 1.000 N NA
 196990 196991     tll0268 tll0269 FALSE 0.107 150.000 0.000 1.000   NA
 196992 196993 tlr0270     chlH FALSE 0.102 228.000 0.000 1.000 N NA
 196993 196994     chlH tsr0272 FALSE 0.091 113.000 0.000 NA   NA
 196994 196995   tlr0273 tsr0272   FALSE 0.083 155.000 0.000 NA   NA
 196995 196996 tlr0273     sbpA FALSE 0.104 201.000 0.000 1.000 N NA
 196996 196997     sbpA cysT TRUE 0.985 0.000 0.031 0.003 N NA
 196997 196998     cysT cysW TRUE 0.992 -13.000 0.156 0.001 N NA
 196999 197000     thrA tll0278 FALSE 0.197 45.000 0.000 NA   NA
 197005 197006 tlr0283 tlr0284     TRUE 0.542 10.000 0.000 NA N NA
 197006 197007 tlr0284     trpE TRUE 0.979 -3.000 0.106 1.000 N NA
 197008 197009     tll0286 tll0287 TRUE 0.927 13.000 0.027 NA   NA
 197009 197010     tll0287 tll0288 TRUE 0.784 45.000 0.040 NA   NA
 197015 197016     secE nusG TRUE 0.963 31.000 0.843 1.000 N NA
 197016 197017     nusG rpl11 TRUE 0.974 15.000 0.681 1.000 N NA
 197017 197018     rpl11 rpl1 TRUE 0.912 87.000 0.838 0.031 Y NA
 197018 197019   tlr0297 rpl1 rplJ TRUE 0.760 179.000 0.302 1.000 Y NA
 197019 197020 tlr0297   rplJ rpl12 TRUE 0.862 76.000 0.884 1.000 Y NA
 197020 197021     rpl12 rnhA TRUE 0.552 74.000 0.008 1.000 N NA
 197023 2177448   tlr0301a ycf65 petL FALSE 0.210 49.000 0.000 1.000   NA
 2177448 197024 tlr0301a tlr0302 petL   FALSE 0.162 59.000 0.000 1.000   NA
 197025 399869   rTEt06 tll0303 trnP_UGG FALSE 0.097 79.000 0.000 NA   NA
 197026 197027 tlr0304     tsr0305 FALSE 0.519 11.000 0.000 NA   NA
 197028 197029     tll0306 clpC FALSE 0.474 15.000 0.000 NA   NA
 197030 197031 tlr0308 tlr0310     FALSE 0.096 311.000 0.000 1.000   NA
 197031 197032 tlr0310 tlr0311     FALSE 0.174 48.000 0.000 NA   NA
 197035 197036     tll0314 tll0315 TRUE 0.651 1.000 0.000 NA   NA
 197036 197037     tll0315 tll0316 FALSE 0.080 188.000 0.000 NA   NA
 197038 197039   tlr0318 sigH   TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 197039 197040 tlr0318 tlr0319     FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 197040 197041 tlr0319 tlr0320     FALSE 0.107 153.000 0.000 1.000   NA
 197042 197043     tll0321 tll0322 TRUE 0.694 3.000 0.000 1.000   NA
 197044 197045 tlr0323 tlr0324     FALSE 0.073 735.000 0.000 NA   NA
 197045 197046 tlr0324     serA FALSE 0.107 147.000 0.000 1.000   NA
 197046 197047   tlr0326 serA   TRUE 0.957 9.000 0.053 1.000 N NA
 197048 197049     tll0327 tll0328 FALSE 0.209 50.000 0.000 1.000 N NA
 197049 197050     tll0328 tll0329 TRUE 0.679 4.000 0.000 1.000 N NA
 197050 197051     tll0329 ureB FALSE 0.389 34.000 0.000 1.000 N NA
 197051 197052     ureB pdxH FALSE 0.329 40.000 0.000 1.000 N NA
 197052 197053     pdxH tll0332 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 197054 197055 tlr0333     thiC FALSE 0.085 141.000 0.000 NA   NA
 197055 197056   tlr0335 thiC   TRUE 0.679 4.000 0.000 1.000 N NA
 197057 197058     tll0336 crtQ TRUE 0.989 -3.000 0.800 NA   NA
 197059 197060     tsr0338 sir TRUE 0.612 92.000 0.036 NA   NA
 197060 399834   rTEt07 sir trnC_GCA FALSE 0.290 37.000 0.000 NA   NA
 197062 197063 tlr0341 tlr0342     TRUE 0.959 14.000 0.212 NA   NA
 197063 197064 tlr0342     aroA FALSE 0.174 48.000 0.000 NA   NA
 197064 197065   tlr0344 aroA   FALSE 0.096 313.000 0.000 1.000   NA
 197065 197066 tlr0344 tlr0345     FALSE 0.133 71.000 0.000 1.000   NA
 197066 197067 tlr0345 tlr0346     TRUE 0.870 87.000 0.222 0.016 Y NA
 197067 197068 tlr0346     cheW TRUE 0.987 6.000 0.857 1.000 Y NA
 197068 197069   tlr0348 cheW   TRUE 0.892 199.000 0.762 0.006 Y NA
 197069 197070 tlr0348 tlr0349     TRUE 0.986 19.000 0.524 0.006 Y NA
 197070 197071 tlr0349 tlr0350     TRUE 0.965 -3.000 0.017 1.000 N NA
 197072 197073 tlr0351 tlr0352     TRUE 0.697 -28.000 0.000 NA   NA
 197073 197074 tlr0352 tlr0353     FALSE 0.319 34.000 0.000 NA   NA
 197074 197075 tlr0353 tlr0354     TRUE 0.593 5.000 0.000 NA   NA
 197076 197077   tlr0356 trxA   TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 197078 197079     tll0357 ccmA FALSE 0.504 20.000 0.000 1.000   NA
 197082 197083 tlr0361 tlr0362     FALSE 0.260 887.000 0.000 0.010   NA
 197083 197084 tlr0362 tlr0363     FALSE 0.097 97.000 0.000 NA   NA
 197084 197085 tlr0363 tlr0364     FALSE 0.088 126.000 0.000 NA   NA
 197086 197087     ho1 argH FALSE 0.128 96.000 0.000 1.000 N NA
 197087 197088     argH tsl0367 TRUE 0.884 16.000 0.003 NA   NA
 197088 197089     tsl0367 tsl0368 FALSE 0.097 98.000 0.000 NA   NA
 197089 197090     tsl0368 tll0369 FALSE 0.096 317.000 0.000 1.000   NA
 197090 197091     tll0369 tll0370 TRUE 0.648 6.000 0.000 1.000   NA
 197091 197092     tll0370 murC TRUE 0.991 -3.000 0.136 0.007 Y NA
 197093 197094 tlr0372     tsr0373 FALSE 0.073 541.000 0.000 NA   NA
 197094 197095   tlr0374 tsr0373   FALSE 0.412 25.000 0.000 NA   NA
 197095 197096 tlr0374     tsr0375 TRUE 0.632 3.000 0.000 NA   NA
 197096 197097     tsr0375 fbaA FALSE 0.082 160.000 0.000 NA   NA
 197098 399835 tlr0377 rTEt11   trnL_CAA FALSE 0.412 25.000 0.000 NA   NA
 197101 197102     tll0380 tll0381 FALSE 0.097 269.000 0.000 1.000   NA
 197102 197103     tll0381 tll0382 TRUE 0.575 12.000 0.000 1.000   NA
 197103 197104     tll0382 tll0383 TRUE 0.695 -49.000 0.000 NA   NA
 197104 197105     tll0383 tll0384 FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 197105 197106     tll0384 atpC FALSE 0.126 92.000 0.000 1.000   NA
 197106 197107     atpC tll0386 FALSE 0.117 63.000 0.000 NA   NA
 197107 197108     tll0386 tll0387 FALSE 0.079 196.000 0.000 NA   NA
 197108 197109     tll0387 tsl0388 FALSE 0.081 173.000 0.000 NA   NA
 197111 197112     tll0390 tll0391 FALSE 0.213 44.000 0.000 NA N NA
 197112 197113     tll0391 tll0392 FALSE 0.282 38.000 0.000 NA   NA
 197115 399865   rTEt12 tll0394 trnV_CAC FALSE 0.103 72.000 0.000 NA   NA
 399865 197116 rTEt12   trnV_CAC pyrF FALSE 0.157 51.000 0.000 NA   NA
 197116 197117     pyrF tll0396 FALSE 0.115 64.000 0.000 NA   NA
 197117 197118     tll0396 tll0397 FALSE 0.354 31.000 0.000 NA   NA
 197118 197119     tll0397 tll0398 TRUE 0.643 7.000 0.000 1.000 N NA
 197119 197120     tll0398 tll0399 FALSE 0.099 94.000 0.000 NA   NA
 197120 197121     tll0399 tll0400 FALSE 0.082 163.000 0.000 NA   NA
 197122 197123 tlr0401     ubiA FALSE 0.076 477.000 0.000 NA N NA
 197124 197125     tll0403 tll0404 FALSE 0.435 20.000 0.000 NA   NA
 197126 197127 tlr0405 tlr0406     FALSE 0.096 824.000 0.000 1.000 N NA
 197127 197128 tlr0406 tlr0407     FALSE 0.236 42.000 0.000 NA   NA
 197128 197129 tlr0407 tlr0408     TRUE 0.694 -70.000 0.000 NA   NA
 197129 197130 tlr0408 tlr0409     FALSE 0.157 51.000 0.000 NA   NA
 197130 197131 tlr0409 tlr0410     FALSE 0.093 108.000 0.000 NA   NA
 197131 197132 tlr0410     tsr0411 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 197132 197133   tlr0412 tsr0411   FALSE 0.236 42.000 0.000 NA   NA
 197133 197134 tlr0412 tlr0413     TRUE 0.817 -49.000 0.000 1.000 Y NA
 197134 197135 tlr0413 tlr0414     FALSE 0.104 71.000 0.000 NA   NA
 197137 197138   tlr0417 putA   TRUE 0.663 0.000 0.000 NA   NA
 197140 197141 tlr0419 tlr0420     FALSE 0.126 60.000 0.000 NA   NA
 197141 197142 tlr0420 tlr0421     FALSE 0.104 71.000 0.000 NA   NA
 197143 197144     hemB tll0423 FALSE 0.108 168.000 0.000 1.000 N NA
 197144 197145   tll0424 tll0423 tll0424 TRUE 0.655 6.000 0.000 1.000 N NA
 197145 197146 tll0424   tll0424 phrA FALSE 0.128 83.000 0.000 1.000 N NA
 197146 197147     phrA tll0426 FALSE 0.207 44.000 0.000 NA   NA
 197148 197149   tlr0428 tsr0427   TRUE 0.787 51.000 0.113 NA   NA
 197149 197150 tlr0428     atp1 FALSE 0.532 16.000 0.000 1.000   NA
 197150 197151     atp1 atpI TRUE 0.881 42.000 0.151 1.000   NA
 197151 197152     atpI atpH TRUE 0.979 33.000 0.679 0.005 Y NA
 197152 197153     atpH atpG TRUE 0.912 62.000 0.368 0.005 Y NA
 197153 197154     atpG atpF TRUE 0.993 3.000 0.569 0.005 Y NA
 197154 197155     atpF atpD TRUE 0.991 -3.000 0.132 0.005 Y NA
 197155 197156     atpD atpA TRUE 0.971 42.000 0.864 0.005 Y NA
 197156 197157   tlr0436 atpA   FALSE 0.102 224.000 0.000 1.000 N NA
 197157 197158 tlr0436 tlr0437     FALSE 0.230 47.000 0.000 1.000 N NA
 197158 197159 tlr0437 tlr0438     FALSE 0.108 164.000 0.000 1.000 N NA
 197162 197163     tsl0441 tll0442 FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 197163 197164     tll0442 tll0443 FALSE 0.099 87.000 0.000 NA   NA
 197164 197165     tll0443 psbO TRUE 0.562 13.000 0.000 1.000   NA
 197166 197167 tlr0445     tsr0446 FALSE 0.116 116.000 0.000 1.000   NA
 197168 197169     tll0447 tsl0448 FALSE 0.094 634.000 0.000 1.000   NA
 197170 197171 tlr0449 tlr0450     TRUE 0.700 3.000 0.000 1.000 N NA
 197172 197173     chlM tll0452 TRUE 0.621 9.000 0.000 1.000 N NA
 197173 197174     tll0452 tll0453 TRUE 0.990 -31.000 0.431 1.000 Y NA
 197174 197175     tll0453 tll0454 TRUE 0.959 -54.000 0.006 1.000 N NA
 197177 197178     rfbC rfbA TRUE 0.818 -31.000 0.000 1.000 Y NA
 197178 197179     rfbA rfbB TRUE 0.987 -102.000 0.018 0.003 Y NA
 197182 197183 tlr0461 tlr0462     TRUE 0.694 -63.000 0.000 NA   NA
 197184 197185     aroC tll0464 FALSE 0.474 15.000 0.000 NA   NA
 197185 197186     tll0464 tll0465 FALSE 0.507 12.000 0.000 NA   NA
 197186 197187     tll0465 tll0466 FALSE 0.521 18.000 0.000 1.000   NA
 197187 197188     tll0466 tll0467 FALSE 0.234 46.000 0.000 1.000   NA
 197188 197189     tll0467 tll0468 FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 197189 197190     tll0468 tsl0469 FALSE 0.081 173.000 0.000 NA   NA
 197193 197194 tlr0472     tsr0473 FALSE 0.077 232.000 0.000 NA   NA
 197194 197195   tlr0474 tsr0473   FALSE 0.087 131.000 0.000 NA   NA
 197196 197197     tll0475 tll0476 FALSE 0.138 70.000 0.000 1.000 N NA
 197197 197198     tll0476 tsl0477 TRUE 0.723 51.000 0.033 NA   NA
 197198 197199     tsl0477 tll0478 FALSE 0.079 197.000 0.000 NA   NA
 197202 197203     kaiA kaiB TRUE 0.983 6.000 0.732 1.000   NA
 197203 197204     kaiB kaiC TRUE 0.845 76.000 0.927 1.000   NA
 197204 197205   tlr0484 kaiC   TRUE 0.664 5.000 0.000 1.000 N NA
 197205 197206 tlr0484 tlr0485     FALSE 0.156 61.000 0.000 1.000   NA
 197207 197208     tll0486 tll0487 TRUE 0.593 5.000 0.000 NA   NA
 197208 197209     tll0487 ycf83 FALSE 0.268 43.000 0.000 1.000   NA
 197212 197213 tlr0491 tlr0492     TRUE 0.704 2.000 0.000 1.000   NA
 197213 197214 tlr0492     psbW FALSE 0.289 42.000 0.000 1.000   NA
 197214 197215     psbW aroQ FALSE 0.096 317.000 0.000 1.000   NA
 197217 197218 tlr0496 tlr0497     FALSE 0.083 184.000 0.000 NA N NA
 197218 197219 tlr0497 tlr0498     FALSE 0.107 69.000 0.000 NA   NA
 197219 197220 tlr0498     sigC FALSE 0.097 98.000 0.000 NA   NA
 197224 197225 tlr0503     cysK FALSE 0.119 64.000 0.000 NA N NA
 197225 197226   tlr0505 cysK   FALSE 0.091 113.000 0.000 NA   NA
 197227 197228     gltX tll0507 FALSE 0.162 59.000 0.000 1.000   NA
 197229 197230 tlr0508     clpP1 TRUE 0.646 96.000 0.025 1.000 Y NA
 197230 197231     clpP1 clpX TRUE 0.905 33.000 0.037 1.000 Y NA
 197232 197233     tll0511 tll0512 FALSE 0.101 200.000 0.000 1.000   NA
 197233 197234     tll0512 tll0513 FALSE 0.112 139.000 0.000 1.000 N NA
 197234 197235     tll0513 tll0514 FALSE 0.097 81.000 0.000 NA   NA
 197235 197236     tll0514 tll0515 FALSE 0.107 69.000 0.000 NA   NA
 197238 197239     tll0517 dnaX FALSE 0.477 26.000 0.000 1.000 N NA
 197239 197240     dnaX tll0519 TRUE 0.745 -3.000 0.000 1.000 N NA
 197240 197241     tll0519 tll0520 FALSE 0.130 92.000 0.000 1.000 N NA
 197241 197242     tll0520 tll0521 FALSE 0.107 69.000 0.000 NA   NA
 197245 197246     tsr0524 atpB FALSE 0.077 227.000 0.000 NA   NA
 197246 197247     atpB atpE TRUE 0.928 68.000 0.837 0.005 Y NA
 197250 197251     tldD rpl25 FALSE 0.150 52.000 0.000 NA   NA
 197251 197252     rpl25 purA TRUE 0.920 15.000 0.017 1.000 N NA
 399836 197253 rTEt13   trnT_CGU ruvA FALSE 0.236 42.000 0.000 NA   NA
 197255 197256   tlr0535 ycf19   FALSE 0.407 32.000 0.000 1.000   NA
 197256 197257 tlr0535     ureD TRUE 0.643 7.000 0.000 1.000 N NA
 197257 197258   tlr0537 ureD   TRUE 0.695 -12.000 0.000 NA   NA
 197259 197260     tll0538 opcA TRUE 0.582 12.000 0.000 1.000 N NA
 197260 197261     opcA zwf TRUE 0.733 70.000 0.080 1.000 Y NA
 197261 197262     zwf fbpII TRUE 0.958 4.000 0.015 1.000 Y NA
 197262 197263     fbpII tsl0542 FALSE 0.125 78.000 0.000 1.000   NA
 197263 197264     tsl0542 tsl0543 TRUE 0.696 -13.000 0.000 NA   NA
 197264 197265     tsl0543 tsl0544 FALSE 0.074 350.000 0.000 NA   NA
 197265 197266     tsl0544 tll0545 FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 197266 197267     tll0545 tsl0546 FALSE 0.236 42.000 0.000 NA   NA
 197268 197269 tlr0547 tlr0548     TRUE 0.928 43.000 1.000 NA   NA
 197269 197270 tlr0548     tsr0549 TRUE 0.977 15.000 1.000 NA   NA
 197270 197271   tlr0550 tsr0549   TRUE 0.547 9.000 0.000 NA   NA
 197271 197272 tlr0550 tlr0551     FALSE 0.317 41.000 0.000 1.000 N NA
 197273 197274     tll0552 tll0553 TRUE 0.704 2.000 0.000 1.000   NA
 197274 197275     tll0553 pilT TRUE 0.988 -70.000 0.462 1.000   NA
 197275 197276     pilT tll0555 FALSE 0.125 84.000 0.000 1.000   NA
 197277 197278 tlr0556     tsr0557 FALSE 0.098 82.000 0.000 NA   NA
 197278 197279   tlr0558 tsr0557   FALSE 0.084 144.000 0.000 NA   NA
 197282 197283     tll0561 tll0562 FALSE 0.493 13.000 0.000 NA   NA
 197284 197285     cobM tsr0564 FALSE 0.218 43.000 0.000 NA   NA
 197286 197287     tll0565 tll0566 FALSE 0.453 18.000 0.000 NA   NA
 197287 197288     tll0566 tll0567 FALSE 0.093 930.000 0.000 1.000   NA
 197288 197289     tll0567 tll0568 TRUE 0.994 -7.000 0.500 0.006   NA
 197289 197290     tll0568 tll0569 TRUE 0.991 3.000 0.231 0.006 Y NA
 197290 197291     tll0569 tll0570 TRUE 0.982 25.000 0.385 0.005 Y NA
 197291 197292     tll0570 tll0571 TRUE 0.984 3.000 0.250 1.000 Y NA
 197292 197293     tll0571 tll0572 TRUE 0.892 67.000 0.300 0.016 Y NA
 197293 197294     tll0572 tll0573 FALSE 0.101 200.000 0.000 1.000   NA
 197294 197295     tll0573 tll0574 FALSE 0.104 175.000 0.000 1.000   NA
 197296 197297   tlr0576 por   FALSE 0.128 80.000 0.000 1.000 N NA
 197297 197298 tlr0576 tlr0577     FALSE 0.356 37.000 0.000 1.000 N NA
 197299 197300     glgB pyrD FALSE 0.129 84.000 0.000 1.000 N NA
 197300 197301     pyrD tll0580 FALSE 0.157 51.000 0.000 NA   NA
 197301 197302     tll0580 tll0581 FALSE 0.089 119.000 0.000 NA   NA
 197304 197305     tll0583 tll0584 FALSE 0.127 75.000 0.000 1.000   NA
 197308 197309 tlr0587 tlr0588     TRUE 0.746 20.000 0.000 0.056   NA
 197309 197310 tlr0588 tlr0589     FALSE 0.172 56.000 0.000 1.000   NA
 197311 197312     aroE glnB TRUE 0.960 7.000 0.032 1.000 Y NA
 197313 197314 tlr0592 tlr0593     TRUE 0.694 -7.000 0.000 NA   NA
 197314 197315 tlr0593 tlr0594     FALSE 0.081 172.000 0.000 NA   NA
 197315 197316 tlr0594 tlr0595     TRUE 0.755 -67.000 0.000 1.000 N NA
 197318 197319   tlr0598 rne   TRUE 0.621 9.000 0.000 1.000 N NA
 197320 197321     tll0599 tll0600 TRUE 0.973 9.000 0.254 1.000   NA
 197321 197322     tll0600 tll0601 TRUE 0.779 48.000 0.043 1.000 N NA
 197322 197323     tll0601 rpl34 TRUE 0.721 0.000 0.000 1.000   NA
 197327 197328     tll0606 tll0607 FALSE 0.096 100.000 0.000 NA   NA
 197329 197330   tlr0609 tsr0608   FALSE 0.141 55.000 0.000 NA   NA
 197330 197331 tlr0609 tlr0610     FALSE 0.076 252.000 0.000 NA   NA
 197331 197332 tlr0610 tlr0611     TRUE 0.627 72.000 0.029 1.000   NA
 197332 197333 tlr0611 tlr0612     FALSE 0.457 17.000 0.000 NA   NA
 197333 197334 tlr0612 tlr0613     TRUE 0.694 -9.000 0.000 NA   NA
 197337 197338     tll0616 sigA TRUE 0.697 -25.000 0.000 NA   NA
 197338 197339     sigA tll0618 FALSE 0.073 466.000 0.000 NA   NA
 197343 197344 tll0623   tll0623 tll0624 FALSE 0.120 105.000 0.000 1.000   NA
 197344 197345     tll0624 tll0625 FALSE 0.080 178.000 0.000 NA   NA
 197348 197349 tlr0628     tsr0629 FALSE 0.084 146.000 0.000 NA   NA
 197349 197350   tlr0630 tsr0629   FALSE 0.366 30.000 0.000 NA   NA
 197350 197351 tlr0630 tlr0631     TRUE 0.533 10.000 0.000 NA   NA
 197352 197353     tll0632 tll0633 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 197353 197354     tll0633 tll0634 TRUE 0.991 3.000 0.235 0.006 Y NA
 197354 197355     tll0634 tll0635 TRUE 0.753 4.000 0.000 1.000 Y NA
 399837 197356 rTEt14 tlr0636 trnS_GCU   FALSE 0.507 12.000 0.000 NA   NA
 197356 197357 tlr0636 tlr0637     TRUE 0.978 4.000 0.310 NA   NA
 197358 197359     tll0638 tll0639 TRUE 0.694 3.000 0.000 1.000   NA
 197359 197360     tll0639 rpoC2 FALSE 0.104 198.000 0.000 1.000 N NA
 197360 197361     rpoC2 rpoC1 TRUE 0.967 20.000 0.031 0.002 Y NA
 197361 197362     rpoC1 rpoB TRUE 0.925 76.000 0.851 0.002 Y NA
 197362 197363     rpoB tll0643 FALSE 0.098 398.000 0.000 1.000 N NA
 197363 197364     tll0643 tll0644 TRUE 0.980 9.000 0.077 0.040 Y NA
 197364 197365     tll0644 tll0645 TRUE 0.980 10.000 0.115 0.086 Y NA
 197365 197366     tll0645 tll0646 FALSE 0.130 89.000 0.000 1.000 N NA
 197369 197370     tll0649 tll0650 TRUE 0.570 7.000 0.000 NA   NA
 197371 197372 tlr0651 tlr0652     FALSE 0.340 39.000 0.000 1.000 N NA
 197372 197373 tlr0652 tlr0653     FALSE 0.519 11.000 0.000 NA   NA
 197373 197374 tlr0653 tlr0654     FALSE 0.188 46.000 0.000 NA   NA
 197374 197375 tlr0654 tlr0655     FALSE 0.383 28.000 0.000 NA   NA
 197375 197376 tlr0655 tlr0656     FALSE 0.098 369.000 0.000 1.000 N NA
 197378 197379 tlr0658 tlr0659     TRUE 0.945 1.000 0.002 1.000 N NA
 197380 197381     tll0660 bioB FALSE 0.080 186.000 0.000 NA   NA
 197381 197382     bioB pheT TRUE 0.755 -64.000 0.000 1.000 N NA
 197382 197383     pheT rhnB TRUE 0.757 -19.000 0.000 1.000 N NA
 197383 197384     rhnB tll0664 TRUE 0.700 3.000 0.000 1.000 N NA
 197384 197385     tll0664 rfbB TRUE 0.970 15.000 0.291 1.000 Y NA
 197385 197386     rfbB tll0666 FALSE 0.097 526.000 0.000 1.000 N NA
 197387 197388     ndhA ndhI TRUE 0.974 30.000 0.242 0.011 Y NA
 197388 197389     ndhI ndhG TRUE 0.984 12.000 0.192 0.011 Y NA
 197389 197390     ndhG ndhE TRUE 0.990 10.000 0.506 0.003 Y NA
 197390 197391   tlr0671 ndhE   FALSE 0.132 74.000 0.000 1.000 N NA
 197391 197392 tlr0671 tlr0672     TRUE 0.644 2.000 0.000 NA   NA
 197392 197393 tlr0672 tlr0673     FALSE 0.419 24.000 0.000 NA   NA
 197393 197394 tlr0673 tlr0674     TRUE 0.558 8.000 0.000 NA   NA
 197394 197395 tlr0674 tlr0675     TRUE 0.558 8.000 0.000 NA   NA
 197395 197396 tlr0675 tlr0676     TRUE 0.558 8.000 0.000 NA   NA
 197396 197397 tlr0676 tlr0677     TRUE 0.558 8.000 0.000 NA   NA
 197397 197398 tlr0677 tlr0678     FALSE 0.075 300.000 0.000 NA   NA
 197398 197399 tlr0678 tlr0679     TRUE 0.957 21.000 0.333 NA   NA
 197399 197400 tlr0679 tlr0680     TRUE 0.972 10.000 0.364 NA   NA
 197400 197401 tlr0680 tlr0681     TRUE 0.644 10.000 0.000 NA Y NA
 197401 197402 tlr0681 tlr0682     FALSE 0.174 63.000 0.000 NA Y NA
 197403 197404     ccs1 hemF FALSE 0.239 46.000 0.000 1.000 N NA
 197404 197405     hemF tll0685 FALSE 0.444 19.000 0.000 NA   NA
 197410 197411   tlr0691 pheS   TRUE 0.822 33.000 0.002 1.000 N NA
 197411 197412 tlr0691     tsr0692 FALSE 0.076 249.000 0.000 NA   NA
 197412 197413   tlr0693 tsr0692   FALSE 0.099 75.000 0.000 NA   NA
 197413 197414 tlr0693     pntA FALSE 0.132 940.000 0.000 1.000 Y NA
 197414 197415     pntA tsr0695 TRUE 0.988 16.000 0.829 0.002   NA
 197415 197416     tsr0695 pntB TRUE 0.984 6.000 0.090 0.002   NA
 197417 197418   tll0698 tll0697 trpC TRUE 0.694 3.000 0.000 1.000   NA
 197419 197420 tlr0699 tlr0700     TRUE 0.680 298.000 0.013 0.002   NA
 197420 197421 tlr0700 tlr0701     TRUE 0.981 0.000 0.013 0.002   NA
 197423 197424 tlr0703 tlr0704     FALSE 0.133 71.000 0.000 1.000   NA
 197424 197425 tlr0704     ndhK FALSE 0.117 121.000 0.000 1.000 N NA
 197425 197426     ndhK ndhL TRUE 0.630 39.000 0.000 0.011   NA
 197426 197427   tlr0707 ndhL   TRUE 0.985 6.000 0.925 NA   NA
 197427 197428 tlr0707 tlr0708     FALSE 0.402 26.000 0.000 NA   NA
 197430 197431 tlr0710 tlr0711     FALSE 0.101 235.000 0.000 1.000 N NA
 197431 197432 tlr0711     argG FALSE 0.126 99.000 0.000 1.000 N NA
 197434 197435 tlr0714 tlr0715     TRUE 0.663 0.000 0.000 NA   NA
 197436 197437     tll0716 tll0717 TRUE 0.756 -12.000 0.000 1.000 N NA
 197439 197440 tll0719   ndhD1 ndhF1 TRUE 0.894 49.000 0.050 0.005 Y NA
 197440 197441     ndhF1 tll0721 FALSE 0.122 101.000 0.000 1.000   NA
 197442 197443 tlr0722 tlr0723     FALSE 0.121 62.000 0.000 NA   NA
 197443 197444 tlr0723 tlr0724     FALSE 0.444 19.000 0.000 NA   NA
 197444 197445 tlr0724 tlr0725     FALSE 0.157 51.000 0.000 NA   NA
 197445 197446 tlr0725     tsr0726 TRUE 0.632 3.000 0.000 NA   NA
 197446 197447     tsr0726 tsr0727 FALSE 0.444 19.000 0.000 NA   NA
 197447 197448   tlr0728 tsr0727   FALSE 0.157 51.000 0.000 NA   NA
 197448 197449 tlr0728 tlr0729     FALSE 0.086 132.000 0.000 NA   NA
 197451 197452     psaA psaB TRUE 0.786 24.000 0.000 0.003   NA
 197452 197453   tlr0733 psaB   FALSE 0.073 442.000 0.000 NA   NA
 197454 197455     ftsH recG FALSE 0.391 62.000 0.000 0.008 N NA
 197455 197456     recG tll0736 TRUE 0.900 16.000 0.011 NA   NA
 197457 197458 tlr0737     sigF FALSE 0.103 213.000 0.000 1.000 N NA
 197458 197459   tlr0739 sigF   FALSE 0.511 20.000 0.000 1.000 N NA
 197459 197460 tlr0739     ycf45 TRUE 0.983 -7.000 0.189 1.000   NA
 197460 197461     ycf45 hemE FALSE 0.098 249.000 0.000 1.000   NA
 197461 197462   tlr0742 hemE   TRUE 0.968 0.000 0.032 1.000 N NA
 197462 197463 tlr0742 tlr0743     TRUE 0.695 -52.000 0.000 NA   NA
 197464 197465     tll0744 tll0745 FALSE 0.299 36.000 0.000 NA   NA
 197465 197466     tll0745 tll0746 TRUE 0.757 -16.000 0.000 1.000 N NA
 197466 197467     tll0746 tll0747 TRUE 0.757 -37.000 0.000 1.000 N NA
 197467 399864   rTEt15 tll0747 trnL_GAG FALSE 0.079 193.000 0.000 NA   NA
 399864 197468 rTEt15   trnL_GAG tll0748 FALSE 0.073 473.000 0.000 NA   NA
 197469 197470 tlr0749     metS FALSE 0.113 65.000 0.000 NA   NA
 197470 197471   tlr0751 metS   TRUE 0.625 66.000 0.027 NA   NA
 197471 197472 tlr0751 tlr0752     FALSE 0.236 42.000 0.000 NA   NA
 197472 197473 tlr0752     tsr0753 FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 197473 197474   tlr0754 tsr0753   FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 197474 197475 tlr0754 tlr0755     FALSE 0.383 28.000 0.000 NA   NA
 197475 197476 tlr0755 tlr0756     FALSE 0.343 32.000 0.000 NA   NA
 197476 197477 tlr0756 tlr0757     FALSE 0.402 26.000 0.000 NA   NA
 197477 197478 tlr0757 tlr0758     FALSE 0.078 209.000 0.000 NA   NA
 197479 197480     tll0759 tll0760 TRUE 0.745 -3.000 0.000 1.000 N NA
 197480 197481     tll0760 tll0761 FALSE 0.096 697.000 0.000 1.000 N NA
 197481 197482     tll0761 tll0762 FALSE 0.093 117.000 0.000 NA N NA
 197482 197483     tll0762 glgA FALSE 0.431 23.000 0.000 NA N NA
 197484 197485   tlr0765 proA   FALSE 0.098 360.000 0.000 1.000 N NA
 197485 197486 tlr0765 tlr0766     FALSE 0.124 103.000 0.000 1.000 N NA
 197486 197487 tlr0766 tlr0767     TRUE 0.655 6.000 0.000 1.000 N NA
 197488 197489     pyrG tll0769 FALSE 0.128 80.000 0.000 1.000 N NA
 197489 197490     tll0769 tll0770 FALSE 0.116 124.000 0.000 1.000 N NA
 197490 197491     tll0770 tll0771 FALSE 0.133 71.000 0.000 1.000   NA
 197491 197492     tll0771 tll0772 FALSE 0.256 44.000 0.000 1.000   NA
 197493 197494 tlr0773 tlr0774     FALSE 0.236 42.000 0.000 NA   NA
 197494 197495 tlr0774     tsr0775 FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 197495 197496   tlr0776 tsr0775   FALSE 0.075 292.000 0.000 NA   NA
 197496 197497 tlr0776     proS FALSE 0.144 54.000 0.000 NA   NA
 197497 197498   tlr0778 proS   TRUE 0.739 -3.000 0.000 1.000   NA
 197498 197499 tlr0778 tlr0779     TRUE 0.663 0.000 0.000 NA   NA
 197501 197502 tlr0781 tlr0782     FALSE 0.082 164.000 0.000 NA   NA
 197502 197503 tlr0782 tlr0783     FALSE 0.136 56.000 0.000 NA   NA
 197503 197504 tlr0783 tlr0784   aroB FALSE 0.181 47.000 0.000 NA   NA
 197507 197508     tll0787 tll0788 TRUE 0.890 24.000 0.016 NA   NA
 197508 197509     tll0788 tll0789 FALSE 0.319 34.000 0.000 NA   NA
 197509 197510     tll0789 dnaJ FALSE 0.289 42.000 0.000 1.000   NA
 197510 197511     dnaJ dnaK1 TRUE 0.984 12.000 0.196 0.008 Y NA
 197511 197512     dnaK1 tll0792 FALSE 0.082 164.000 0.000 NA   NA
 197512 197513     tll0792 tll0793 TRUE 0.900 14.000 0.007 NA   NA
 197513 197514     tll0793 tll0794 TRUE 0.939 3.000 0.005 NA   NA
 197514 197515     tll0794 tll0795 FALSE 0.085 141.000 0.000 NA   NA
 197516 197517     petB petD TRUE 0.859 106.000 0.471 0.084   NA
 197518 197519     tll0798 tll0799 FALSE 0.074 389.000 0.000 NA   NA
 197520 197521   tlr0801 recQ   FALSE 0.089 121.000 0.000 NA   NA
 197521 197522 tlr0801     tsr0802 FALSE 0.131 58.000 0.000 NA   NA
 197522 197523   tlr0803 tsr0802   FALSE 0.519 11.000 0.000 NA   NA
 197523 197524 tlr0803     tsr0804 FALSE 0.117 63.000 0.000 NA   NA
 197524 197525   tlr0805 tsr0804   FALSE 0.083 151.000 0.000 NA   NA
 197525 197526 tlr0805 tlr0806     TRUE 0.614 112.000 0.049 NA   NA
 197527 197528     tll0807 hsp33 FALSE 0.488 25.000 0.000 1.000 N NA
 197530 197531     tll0810 ycf40 TRUE 0.727 0.000 0.000 1.000 N NA
 197531 197532     ycf40 tll0812 FALSE 0.495 22.000 0.000 1.000   NA
 197534 197535     tll0814 tll0815 FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 197539 197540     tll0819 tll0820 TRUE 0.992 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 197541 197542 tlr0821 tlr0822     FALSE 0.276 39.000 0.000 NA   NA
 197542 197543 tlr0822 tlr0823     FALSE 0.084 149.000 0.000 NA   NA
 197544 197545     tll0824 tsl0825 FALSE 0.111 67.000 0.000 NA   NA
 197545 197546     tsl0825 argS FALSE 0.091 115.000 0.000 NA   NA
 197546 197547     argS tsl0827 TRUE 0.943 0.000 0.002 NA   NA
 197547 197548     tsl0827 petN TRUE 0.939 18.000 0.091 NA   NA
 197549 197550 tlr0828 tlr0829     TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 197551 197552     tll0830 sigB TRUE 0.696 -19.000 0.000 NA   NA
 197552 197553     sigB tll0832 FALSE 0.100 281.000 0.000 1.000 N NA
 197555 197556     tll0834 tll0835 FALSE 0.099 85.000 0.000 NA   NA
 197556 197557     tll0835 psbY FALSE 0.108 142.000 0.000 1.000   NA
 197558 197559 tlr0837     pdxJ FALSE 0.074 343.000 0.000 NA   NA
 197560 197561     tll0839 tll0840 FALSE 0.391 27.000 0.000 NA   NA
 197562 197563 tlr0841 tlr0842     TRUE 0.987 0.000 0.750 NA   NA
 197563 197564 tlr0842 tlr0843     FALSE 0.163 50.000 0.000 NA   NA
 197564 197565 tlr0843 tlr0844   plsX FALSE 0.102 195.000 0.000 1.000   NA
 197565 197566 tlr0844   plsX fabH TRUE 0.993 0.000 0.380 0.005 Y NA
 197566 197567   tlr0846 fabH   TRUE 0.618 4.000 0.000 NA N NA
 197568 197569     tll0847 tsl0848 FALSE 0.091 115.000 0.000 NA   NA
 197570 197571 tlr0849 tlr0850     TRUE 0.953 -3.000 0.006 NA   NA
 197571 197572 tlr0850     cysE FALSE 0.174 81.000 0.000 1.000 Y NA
 197573 197574     tll0852 tll0853 FALSE 0.391 27.000 0.000 NA   NA
 197574 197575     tll0853 tll0854 FALSE 0.111 67.000 0.000 NA   NA
 197575 197576     tll0854 tll0855 TRUE 0.783 22.000 0.000 0.005   NA
 197576 197577     tll0855 tll0856 FALSE 0.234 46.000 0.000 1.000   NA
 197577 197578     tll0856 lig FALSE 0.117 113.000 0.000 1.000   NA
 197578 197579     lig tll0858 TRUE 0.655 6.000 0.000 1.000 N NA
 197579 197580     tll0858 ycf39 TRUE 0.978 9.000 0.314 1.000 Y NA
 197580 197581     ycf39 tll0860 FALSE 0.093 106.000 0.000 NA   NA
 197582 197583   tlr0862 aat   FALSE 0.080 182.000 0.000 NA   NA
 197583 197584 tlr0862 tlr0863     FALSE 0.077 225.000 0.000 NA   NA
 197584 197585 tlr0863     tsr0864 FALSE 0.099 87.000 0.000 NA   NA
 197586 197587     tsl0865 tsl0866 TRUE 0.696 -18.000 0.000 NA   NA
 197587 197588     tsl0866 ycf57 FALSE 0.076 271.000 0.000 NA   NA
 197588 197589     ycf57 tll0868 FALSE 0.282 38.000 0.000 NA   NA
 197589 197590     tll0868 tll0869 FALSE 0.083 155.000 0.000 NA   NA
 197593 197594 tlr0872     hspA FALSE 0.076 243.000 0.000 NA   NA
 197595 197596     ycf64 tsl0875 TRUE 0.971 7.000 0.220 NA N NA
 197596 197597     tsl0875 tll0876 FALSE 0.158 70.000 0.000 NA Y NA
 197598 197599   tlr0878 petG   FALSE 0.289 42.000 0.000 1.000   NA
 197600 197601     tll0879 ilvN TRUE 0.946 4.000 0.006 NA Y NA
 197601 197602     ilvN tll0881 FALSE 0.209 50.000 0.000 1.000 N NA
 197603 197604   tlr0883 aroK   TRUE 0.692 -6.000 0.000 NA   NA
 197604 197605 tlr0883 tlr0884     FALSE 0.207 44.000 0.000 NA   NA
 197606 197607     tll0885 tll0886 FALSE 0.099 90.000 0.000 NA   NA
 197607 197608     tll0886 tll0887 FALSE 0.276 39.000 0.000 NA   NA
 197608 197609     tll0887 tll0888 FALSE 0.136 56.000 0.000 NA   NA
 197609 197610     tll0888 tll0889 FALSE 0.334 33.000 0.000 NA   NA
 197617 197618 tlr0896 tlr0897     FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 197618 197619 tlr0897 tlr0898     TRUE 0.694 -7.000 0.000 NA   NA
 197622 197623     tll0901 tll0902 FALSE 0.099 75.000 0.000 NA   NA
 197624 197625 tlr0903     ndhF3 FALSE 0.108 164.000 0.000 1.000 N NA
 197625 197626     ndhF3 ndhD3 TRUE 0.995 0.000 0.714 0.005 Y NA
 197626 197627   tlr0906 ndhD3   TRUE 0.978 12.000 0.857 NA   NA
 197627 197628 tlr0906     tsr0907 FALSE 0.096 99.000 0.000 NA   NA
 197628 197629     tsr0907 gshB TRUE 0.957 0.000 0.010 1.000 N NA
 197629 197630     gshB leuC FALSE 0.097 429.000 0.000 1.000 N NA
 197630 197631   tlr0910 leuC   FALSE 0.084 144.000 0.000 NA   NA
 197631 197632 tlr0910 tlr0911     FALSE 0.086 133.000 0.000 NA   NA
 197633 197634     tll0912 nifS TRUE 0.614 9.000 0.000 1.000   NA
 197634 197635     nifS tll0914 FALSE 0.081 172.000 0.000 NA   NA
 197635 197636     tll0914 ycf56 FALSE 0.197 45.000 0.000 NA   NA
 197636 197637     ycf56 tll0916 TRUE 0.632 3.000 0.000 NA   NA
 197639 197640     tll0918 tsl0919 FALSE 0.082 165.000 0.000 NA   NA
 197640 197641     tsl0919 tll0920 FALSE 0.089 121.000 0.000 NA   NA
 197641 197642     tll0920 tsl0921 FALSE 0.123 61.000 0.000 NA   NA
 197642 197643     tsl0921 tll0922 FALSE 0.073 445.000 0.000 NA   NA
 197643 197644     tll0922 tll0923 TRUE 0.727 0.000 0.000 1.000 N NA
 197647 197648 tlr0926 tlr0927     TRUE 0.711 1.000 0.000 1.000   NA
 197648 197649 tlr0927     ftsY FALSE 0.449 29.000 0.000 1.000 N NA
 197652 197653     tll0931 tll0932 TRUE 0.974 -3.000 0.047 1.000 N NA
 197653 197654     tll0932 tll0933 FALSE 0.400 41.000 0.000 1.000 Y NA
 197655 197656     tsr0934 tsr0935 FALSE 0.082 168.000 0.000 NA   NA
 197656 197657   tlr0936 tsr0935   FALSE 0.098 96.000 0.000 NA   NA
 197657 197658 tlr0936 tlr0937     TRUE 0.974 -93.000 0.051 NA   NA
 197658 197659 tlr0937 tlr0938     FALSE 0.080 189.000 0.000 NA   NA
 197659 197660 tlr0938 tlr0939     TRUE 0.940 14.000 0.043 1.000 N NA
 197660 197661 tlr0939 tlr0940     TRUE 0.995 -34.000 0.550 0.004 Y NA
 197664 197665     ccmN ccmM TRUE 0.783 22.000 0.000 0.005   NA
 197665 197666     ccmM ccmL FALSE 0.444 19.000 0.000 NA   NA
 197666 197667     ccmL ccmK1 TRUE 0.990 0.000 0.818 NA Y NA
 197667 197668     ccmK1 ccmK2 TRUE 0.783 98.000 0.316 NA Y NA
 197668 197669     ccmK2 tll0948 FALSE 0.074 412.000 0.000 NA   NA
 197674 197675 tlr0953     ccmK3 FALSE 0.081 171.000 0.000 NA   NA
 197676 197677     apcC apcB TRUE 0.868 143.000 0.531 0.009   NA
 197677 197678     apcB apcA TRUE 0.925 65.000 0.906 0.005   NA
 197678 197679     apcA tll0958 FALSE 0.077 230.000 0.000 NA   NA
 197680 197681     petC petA TRUE 0.984 21.000 0.881 0.052   NA
 197681 197682   tlr0961 petA   FALSE 0.495 22.000 0.000 1.000   NA
 197682 197683 tlr0961 tlr0962     TRUE 0.876 4.000 0.000 0.009   NA
 197683 197684 tlr0962 tlr0963     FALSE 0.129 76.000 0.000 1.000 N NA
 197686 197687 tlr0965     tpi FALSE 0.319 34.000 0.000 NA   NA
 197687 197688   tlr0967 tpi   FALSE 0.108 143.000 0.000 1.000   NA
 197688 197689 tlr0967     tsr0968 FALSE 0.107 69.000 0.000 NA   NA
 197689 197690   tlr0969 tsr0968   TRUE 0.947 6.000 0.026 NA   NA
 197691 197692     tll0970 tll0971 TRUE 0.755 -55.000 0.000 1.000 N NA
 197692 197693     tll0971 tsl0972 TRUE 0.818 31.000 0.002 NA   NA
 197694 197695 tlr0973 tlr0974     FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 197695 197696 tlr0974 tlr0975     FALSE 0.519 11.000 0.000 NA   NA
 197696 197697 tlr0975 tlr0976     TRUE 0.751 -28.000 0.000 1.000   NA
 197697 197698 tlr0976 tlr0977     FALSE 0.076 239.000 0.000 NA   NA
 197702 197703     ureA thrC FALSE 0.148 168.000 0.000 1.000 Y NA
 197703 197704     thrC tsr0983 TRUE 0.837 51.000 0.215 1.000 N NA
 197704 197705   tlr0984 tsr0983   FALSE 0.084 170.000 0.000 NA N NA
 197706 197707     tll0985 tll0986 FALSE 0.074 403.000 0.000 NA   NA
 197707 197708     tll0986 tll0987 TRUE 0.692 -6.000 0.000 NA   NA
 197708 197709     tll0987 tsl0988 TRUE 0.976 -3.000 0.058 1.000   NA
 197709 197710     tsl0988 tll0989 FALSE 0.480 25.000 0.000 1.000   NA
 197710 197711     tll0989 tll0990 FALSE 0.480 25.000 0.000 1.000   NA
 197711 197712     tll0990 tll0991 FALSE 0.099 306.000 0.000 1.000 N NA
 197712 197713     tll0991 tll0992 FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 197713 197714     tll0992 tll0993 FALSE 0.402 26.000 0.000 NA   NA
 197714 197715     tll0993 tll0994 TRUE 0.696 -15.000 0.000 NA   NA
 197715 197716     tll0994 tll0995 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 197717 197718 tlr0996 tlr0997     FALSE 0.449 29.000 0.000 1.000 N NA
 197718 197719 tlr0997 tlr0998     FALSE 0.073 632.000 0.000 NA   NA
 197719 197720 tlr0998 tlr0999     FALSE 0.236 42.000 0.000 NA   NA
 197720 197721 tlr0999     tsr1000 FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 197721 197722   tlr1001 tsr1000   FALSE 0.075 307.000 0.000 NA   NA
 197722 197723 tlr1001     tsr1002 FALSE 0.097 97.000 0.000 NA   NA
 197725 197726 tlr1004 tlr1005     TRUE 0.973 -3.000 0.054 NA   NA
 197726 197727 tlr1005 tlr1006     FALSE 0.097 80.000 0.000 NA   NA
 197727 197728 tlr1006 tlr1007     TRUE 0.964 30.000 1.000 NA   NA
 197729 197730     tll1008 petF FALSE 0.119 106.000 0.000 1.000   NA
 197730 197731     petF tll1010 FALSE 0.104 199.000 0.000 1.000 N NA
 197731 197732     tll1010 tll1011 FALSE 0.112 140.000 0.000 1.000 N NA
 197736 197737 tll2478     tll1015 FALSE 0.072 1373.000 0.000 NA   NA
 197737 197738     tll1015 tsl1016 FALSE 0.092 110.000 0.000 NA   NA
 197739 197740 tlr1017 tlr1018     TRUE 0.751 -22.000 0.000 1.000   NA
 197741 197742     tll1019 tll1020 FALSE 0.172 56.000 0.000 1.000   NA
 197742 197743     tll1020 tll1021 FALSE 0.126 93.000 0.000 1.000   NA
 197743 197744     tll1021 tll1022 TRUE 0.990 14.000 0.857 0.005 Y NA
 197744 197745     tll1022 tll1023 TRUE 0.996 -3.000 0.833 0.005 Y NA
 197745 197746     tll1023 tll1024 TRUE 0.991 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 197746 197747     tll1024 tll1025 TRUE 0.994 -3.000 0.500 0.015 Y NA
 197749 197750     metH tll1028 FALSE 0.111 143.000 0.000 1.000 N NA
 197750 197751     tll1028 ycf39 TRUE 0.678 11.000 0.000 1.000 Y NA
 197751 197752     ycf39 tll1030 TRUE 0.570 7.000 0.000 NA   NA
 197752 197753     tll1030 ubiX TRUE 0.663 0.000 0.000 NA   NA
 197755 197756     tll1033 glyQ FALSE 0.488 25.000 0.000 1.000 N NA
 197756 197757     glyQ cysH TRUE 0.755 -58.000 0.000 1.000 N NA
 197762 197763 tlr1040 tlr1041     FALSE 0.376 42.000 0.000 1.000 Y NA
 197764 197765     tll1042 tll1043 FALSE 0.103 210.000 0.000 1.000 N NA
 197765 197766     tll1043 tll1044 FALSE 0.096 1258.000 0.000 1.000 N NA
 197767 197768 tlr1045 tlr1046     FALSE 0.136 56.000 0.000 NA   NA
 197768 197769 tlr1046 tlr1047     FALSE 0.128 83.000 0.000 1.000 N NA
 197770 197771     tll1048 tll1049 TRUE 0.850 69.000 0.100 0.014 Y NA
 197773 197774     tsl1051 tll1052 TRUE 0.632 3.000 0.000 NA   NA
 197774 399863   rTEt16 tll1052 trnP_CGG FALSE 0.131 58.000 0.000 NA   NA
 197775 197776 tlr1053 tlr1054     FALSE 0.104 204.000 0.000 1.000 N NA
 197776 197777 tlr1054     tsr1055 FALSE 0.463 16.000 0.000 NA   NA
 197777 197778   tlr1056 tsr1055   TRUE 0.954 3.000 0.019 NA   NA
 197779 197780     ilvD tll1058 FALSE 0.236 42.000 0.000 NA   NA
 197780 197781     tll1058 tll1059 TRUE 0.695 -10.000 0.000 NA   NA
 197783 197784     tll1061 tll1062 FALSE 0.129 94.000 0.000 1.000 N NA
 197784 197785     tll1062 ycf36 TRUE 0.954 33.000 0.810 NA   NA
 197786 197787 tlr1064 tlr1065     TRUE 0.757 -19.000 0.000 1.000 N NA
 197787 197788 tlr1065     infB FALSE 0.143 199.000 0.000 1.000 Y NA
 197788 197789   tlr1067 infB   FALSE 0.150 64.000 0.000 1.000 N NA
 197789 197790 tlr1067     tsr1068 FALSE 0.084 146.000 0.000 NA   NA
 197790 197791     tsr1068 tsr1069 TRUE 0.663 0.000 0.000 NA   NA
 197791 197792   tlr1070 tsr1069   FALSE 0.083 159.000 0.000 NA   NA
 197792 197793 tlr1070     clpP2 FALSE 0.103 72.000 0.000 NA   NA
 197793 197794   tlr1072 clpP2   FALSE 0.402 26.000 0.000 NA   NA
 197794 197795 tlr1072     ycf60 FALSE 0.519 11.000 0.000 NA   NA
 197795 197796     ycf60 psbI FALSE 0.115 64.000 0.000 NA   NA
 197796 197797   tlr1075 psbI   TRUE 0.704 291.000 0.324 NA   NA
 197797 197798 tlr1075 tlr1076     FALSE 0.493 13.000 0.000 NA   NA
 197799 197800     tll1077 tll1078 TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 197802 197803     tll1080 tsl1081 FALSE 0.402 26.000 0.000 NA   NA
 197804 197805 tlr1082 tlr1083     FALSE 0.474 15.000 0.000 NA   NA
 197806 197807     tll1084 tll1085 TRUE 0.673 4.000 0.000 1.000   NA
 197807 197808     tll1085 tll1086 FALSE 0.444 19.000 0.000 NA   NA
 197809 197810   tlr1088 tsr1087   FALSE 0.092 110.000 0.000 NA   NA
 399838 197812 rTEt17 tlr1090 trnL_UAG   FALSE 0.072 1097.000 0.000 NA   NA
 197812 197813 tlr1090 tlr1091     FALSE 0.078 209.000 0.000 NA   NA
 399862 197814 rTEt18   trnC_GAC ycf51 FALSE 0.366 30.000 0.000 NA   NA
 197814 197815     ycf51 tll1093 TRUE 0.950 0.000 0.008 NA   NA
 197815 197816     tll1093 tll1094 FALSE 0.207 44.000 0.000 NA   NA
 197816 197817     tll1094 tll1095 TRUE 0.651 1.000 0.000 NA   NA
 197817 197818     tll1095 tll1096 FALSE 0.129 94.000 0.000 1.000 N NA
 197819 197820 tlr1097 tlr1098     FALSE 0.310 41.000 0.000 1.000   NA
 197821 197822     tll1099 secG TRUE 0.607 10.000 0.000 1.000 N NA
 197823 197824 tlr1101 tlr1102     TRUE 0.966 -6.000 0.022 NA   NA
 197824 197825 tlr1102     radA TRUE 0.614 9.000 0.000 1.000   NA
 197826 197827     cobP tll1105 TRUE 0.533 17.000 0.000 1.000 N NA
 197827 197828     tll1105 argF TRUE 0.815 -91.000 0.000 1.000 Y NA
 197828 197829     argF tll1107 FALSE 0.113 123.000 0.000 1.000   NA
 197829 197830     tll1107 tll1108 TRUE 0.955 25.000 0.369 NA   NA
 197830 197831     tll1108 tll1109 TRUE 0.989 -10.000 0.762 NA   NA
 197831 197832     tll1109 tll1110 TRUE 0.593 5.000 0.000 NA   NA
 197832 197833     tll1110 tll1111 FALSE 0.106 70.000 0.000 NA   NA
 197833 197834     tll1111 tll1112 TRUE 0.570 7.000 0.000 NA   NA
 197838 197839     tll1116 tll1117 TRUE 0.696 -34.000 0.000 NA   NA
 197840 197841 tlr1118 tlr1120     FALSE 0.096 1090.000 0.000 1.000 N NA
 197841 197842 tlr1120 tlr1121     TRUE 0.678 111.000 0.092 1.000   NA
 197842 197843 tlr1121 tlr1122     TRUE 0.995 -7.000 0.888 0.024   NA
 197843 197844 tlr1122 tlr1123     TRUE 0.970 6.000 0.137 1.000   NA
 197844 197845 tlr1123 tlr1124     TRUE 0.989 -3.000 0.126 0.023   NA
 197846 197847     tll1125 tll1126 TRUE 0.895 -36.000 0.000 0.078   NA
 197848 197849 tlr1127 tlr1128     FALSE 0.161 119.000 0.000 1.000 Y NA
 197849 197850 tlr1128 tlr1129     FALSE 0.354 31.000 0.000 NA   NA
 197850 197851 tlr1129 tlr1130     FALSE 0.106 70.000 0.000 NA   NA
 197851 197852 tlr1130     tsr1131 FALSE 0.087 130.000 0.000 NA   NA
 197852 197853   tlr1132 tsr1131   FALSE 0.086 132.000 0.000 NA   NA
 197855 197856 tlr1134 tlr1135     TRUE 0.694 -58.000 0.000 NA   NA
 197856 197857 tlr1135     ndbB TRUE 0.986 -3.000 0.324 1.000   NA
 197857 197858     ndbB ruvC TRUE 0.655 6.000 0.000 1.000 N NA
 197860 197861 tlr1139 tlr1140     FALSE 0.306 35.000 0.000 NA   NA
 197863 197864 tlr1142 tlr1143     FALSE 0.074 407.000 0.000 NA   NA
 197866 197867   tlr1146 tsr1145   FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 197867 197868 tlr1146 tlr1147     TRUE 0.694 3.000 0.000 1.000   NA
 197869 197870     tll1148 tll1149 TRUE 0.671 0.000 0.000 NA N NA
 197870 197871     tll1149 tll1150 TRUE 0.696 -19.000 0.000 NA   NA
 197874 197875 tlr1153 tlr1154     FALSE 0.427 22.000 0.000 NA   NA
 197876 197877     tll1155 tll1156 FALSE 0.100 224.000 0.000 1.000   NA
 197878 197879 tlr1157 tlr1158     FALSE 0.255 41.000 0.000 NA   NA
 197879 197880 tlr1158 tlr1159     FALSE 0.122 106.000 0.000 1.000 N NA
 197886 197887 tlr1165 tlr1166     TRUE 0.696 -45.000 0.000 NA   NA
 197889 197890   tlr1169 ycf20   FALSE 0.074 422.000 0.000 NA   NA
 197890 197891 tlr1169 tlr1170     FALSE 0.128 59.000 0.000 NA   NA
 197891 197892 tlr1170 tlr1171     TRUE 0.965 -3.000 0.026 NA   NA
 197894 197895 tlr1173 tlr1174     FALSE 0.493 13.000 0.000 NA   NA
 197897 197898 tlr1176 tlr1177     FALSE 0.113 68.000 0.000 NA N NA
 197898 197899 tlr1177 tlr1178     TRUE 0.985 -3.000 0.014 0.004 Y NA
 197899 197900 tlr1178 tlr1179     TRUE 0.960 -3.000 0.009 1.000 N NA
 197900 197901 tlr1179 tlr1180     TRUE 0.924 26.000 0.050 1.000 N NA
 197902 197903     tll1181 tll1182 TRUE 0.814 11.000 0.000 0.031   NA
 197903 197904     tll1182 tll1183 FALSE 0.289 42.000 0.000 1.000   NA
 197905 197906 tlr1184     hisF FALSE 0.493 13.000 0.000 NA   NA
 197907 197908     tll1186 tatD FALSE 0.076 488.000 0.000 NA N NA
 197908 197909     tatD rps20 TRUE 0.953 6.000 0.034 NA N NA
 197909 197910     rps20 cpmA FALSE 0.268 43.000 0.000 1.000   NA
 197910 197911     cpmA tll1190 TRUE 0.711 1.000 0.000 1.000   NA
 197911 197912     tll1190 htpG FALSE 0.469 26.000 0.000 1.000   NA
 197912 197913     htpG hemN2 FALSE 0.348 38.000 0.000 1.000 N NA
 197913 197914     hemN2 tll1193 FALSE 0.095 360.000 0.000 1.000   NA
 197917 197918   tlr1197 tsr1196   FALSE 0.493 13.000 0.000 NA   NA
 197918 197919 tlr1197 tlr1198     FALSE 0.133 73.000 0.000 1.000 N NA
 399861 197920 rTEt19   trnS_UGA tll1199 FALSE 0.097 80.000 0.000 NA   NA
 197920 197921     tll1199 tll1200 TRUE 0.601 20.000 0.000 1.000 Y NA
 197921 197922     tll1200 tll1201 TRUE 0.926 28.000 0.046 1.000 Y NA
 197922 197923     tll1201 tll1202 TRUE 0.966 2.000 0.019 1.000 Y NA
 197923 197924     tll1202 tll1203 TRUE 0.959 -43.000 0.011 NA   NA
 197924 197925     tll1203 tsl1204 FALSE 0.074 335.000 0.000 NA   NA
 197925 197926     tsl1204 tll1205 TRUE 0.745 -3.000 0.000 1.000 N NA
 197927 197928   tsr1207 ycf30 rpsO FALSE 0.122 106.000 0.000 1.000 N NA
 197928 197929 tsr1207 tlr1208 rpsO   TRUE 0.564 168.000 0.037 NA   NA
 197929 197930 tlr1208 tlr1209     FALSE 0.077 227.000 0.000 NA   NA
 197930 197931 tlr1209 tlr1210     FALSE 0.474 15.000 0.000 NA   NA
 197931 197932 tlr1210     petH FALSE 0.113 133.000 0.000 1.000 N NA
 197932 197933     petH tsr1212 FALSE 0.080 184.000 0.000 NA   NA
 197935 197936 tlr1214 tlr1215     TRUE 0.745 -3.000 0.000 1.000 N NA
 197936 197937 tlr1215     ycf50 FALSE 0.074 351.000 0.000 NA   NA
 197937 197938     ycf50 proC TRUE 0.983 -25.000 0.224 NA   NA
 197938 197939   tlr1218 proC   TRUE 0.651 1.000 0.000 NA   NA
 197939 197940 tlr1218     dapA TRUE 0.632 3.000 0.000 NA   NA
 197940 197941   tlr1220 dapA   TRUE 0.832 66.000 0.605 1.000   NA
 197950 197951     tsl1229 tll1230 FALSE 0.073 631.000 0.000 NA   NA
 197951 197952     tll1230 tll1231 FALSE 0.507 12.000 0.000 NA   NA
 197953 197954   tlr1233 tsr1232   FALSE 0.099 90.000 0.000 NA   NA
 197954 197955 tlr1233 tlr1234     TRUE 0.607 10.000 0.000 1.000 N NA
 197955 197956 tlr1234 tlr1235     FALSE 0.074 377.000 0.000 NA   NA
 197956 197957 tlr1235 tlr1236     FALSE 0.078 214.000 0.000 NA   NA
 197958 197959     glmS tll1238 FALSE 0.435 20.000 0.000 NA   NA
 197960 197961   tlr1240 murE   FALSE 0.236 42.000 0.000 NA   NA
 197964 197965     tll1243 tsl1244 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 197965 197966     tsl1244 tll1245 FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 197967 197968 tlr1246 tlr1247     FALSE 0.098 78.000 0.000 NA   NA
 197970 197971   tlr1250 ycf23   TRUE 0.694 -73.000 0.000 NA   NA
 197973 197974 tlr1252 tlr1253     FALSE 0.125 96.000 0.000 1.000   NA
 197974 197975 tlr1253 tlr1254     FALSE 0.102 232.000 0.000 1.000 N NA
 197975 197976 tlr1254     tsr1255 FALSE 0.081 171.000 0.000 NA   NA
 197976 197977   tlr1256 tsr1255   FALSE 0.236 42.000 0.000 NA   NA
 197977 197978 tlr1256 tlr1257     FALSE 0.128 79.000 0.000 1.000 N NA
 197978 197979 tlr1257     purK FALSE 0.133 73.000 0.000 1.000 N NA
 197979 197980   tlr1259 purK   FALSE 0.493 13.000 0.000 NA   NA
 197980 197981 tlr1259 tlr1260     TRUE 0.695 -12.000 0.000 NA   NA
 197981 197982 tlr1260 tlr1261     TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 197986 197987 tlr1265 tlr1266     TRUE 0.868 35.000 0.031 1.000   NA
 197987 197988 tlr1266 tlr1267     FALSE 0.098 77.000 0.000 NA   NA
 197989 197990     tll1268 tll1269 TRUE 0.834 78.000 1.000 NA   NA
 197991 197992 tlr1270 tlr1271     TRUE 0.632 3.000 0.000 NA   NA
 197992 197993 tlr1271 tlr1272     TRUE 0.750 -49.000 0.000 1.000   NA
 197996 197997     tll1275 fbpI FALSE 0.128 79.000 0.000 1.000 N NA
 197997 197998     fbpI tll1277 FALSE 0.147 173.000 0.000 1.000 Y NA
 197998 197999     tll1277 tll1278 FALSE 0.266 155.000 0.000 0.033 N NA
 198000 198001   tlr1280 rps6   FALSE 0.329 40.000 0.000 1.000 N NA
 198001 198002 tlr1280 tlr1281     FALSE 0.193 52.000 0.000 1.000 N NA
 198003 198004     tll1282 petJ FALSE 0.105 194.000 0.000 1.000 N NA
 198004 198005     petJ tll1284 TRUE 0.851 100.000 0.222 0.008   NA
 198005 198006     tll1284 psbV TRUE 0.968 31.000 0.242 0.008   NA
 198006 198007     psbV tsl1286 TRUE 0.953 22.000 0.273 NA   NA
 198008 198009 tlr1287     ndhH FALSE 0.130 89.000 0.000 1.000 N NA
 198009 198010   tlr1289 ndhH   FALSE 0.440 30.000 0.000 1.000 N NA
 198010 399839 tlr1289 rTEt20   trnR_CCU FALSE 0.276 39.000 0.000 NA   NA
 399839 198011 rTEt20 tlr1290 trnR_CCU   FALSE 0.117 63.000 0.000 NA   NA
 198012 198013     tll1291 tll1292 TRUE 0.651 1.000 0.000 NA   NA
 198013 198014     tll1292 tsl1293 FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 198015 198016     efp accB TRUE 0.969 6.000 0.120 1.000 N NA
 198016 198017     accB ilvG FALSE 0.106 177.000 0.000 1.000 N NA
 198018 198019     tll1297 tll1298 TRUE 0.673 4.000 0.000 1.000   NA
 198019 198020     tll1298 tll1299 TRUE 0.679 4.000 0.000 1.000 N NA
 198020 198021     tll1299 tll1300 TRUE 0.727 73.000 0.176 NA   NA
 198021 198022     tll1300 tll1301 TRUE 0.978 6.000 0.388 NA   NA
 198023 198024 tlr1302     rpl19 FALSE 0.124 62.000 0.000 NA N NA
 198024 399840   rTEt21 rpl19 trnW_CCA TRUE 0.547 9.000 0.000 NA   NA
 198026 198027   tlr1306 tsr1305   FALSE 0.126 60.000 0.000 NA   NA
 198028 198029     cobJ tll1308 TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 198029 198030     tll1308 folE FALSE 0.082 160.000 0.000 NA   NA
 198030 198031     folE tll1310 TRUE 0.945 33.000 0.391 1.000   NA
 198031 198032     tll1310 accA TRUE 0.971 -3.000 0.033 1.000   NA
 198032 198033     accA tll1312 TRUE 0.919 24.000 0.033 1.000   NA
 198033 198034     tll1312 tll1313 TRUE 0.945 45.000 0.659 0.026   NA
 198035 198036   tlr1315 grpE   TRUE 0.539 16.000 0.000 1.000 N NA
 198039 198040     tll1318 tll1319 TRUE 0.849 59.000 0.361 1.000 Y NA
 198041 198042     tsr1320 tsr1321 FALSE 0.083 158.000 0.000 NA   NA
 198042 198043     tsr1321 tsr1322 FALSE 0.080 189.000 0.000 NA   NA
 198043 198044   tlr1323 tsr1322   FALSE 0.097 98.000 0.000 NA   NA
 198045 198046     ycf38 tll1325 FALSE 0.162 59.000 0.000 1.000   NA
 198051 198052 tlr1330     bioF FALSE 0.215 49.000 0.000 1.000 N NA
 198052 198053     bioF tsr1332 FALSE 0.098 82.000 0.000 NA   NA
 198053 198054   tlr1333 tsr1332   FALSE 0.099 87.000 0.000 NA   NA
 198056 198057   tlr1336 tsr1335   FALSE 0.444 19.000 0.000 NA   NA
 198058 198059     tll1337 tll1338 TRUE 0.739 -3.000 0.000 1.000   NA
 198059 198060     tll1338 polA TRUE 0.748 -111.000 0.000 1.000   NA
 198060 198061     polA tll1340 FALSE 0.130 92.000 0.000 1.000 N NA
 198062 198063   tlr1342 cysC2   FALSE 0.159 60.000 0.000 1.000   NA
 198063 198064 tlr1342 tlr1343     FALSE 0.073 694.000 0.000 NA   NA
 198064 198065 tlr1343 tlr1344     TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198065 198066 tlr1344 tlr1345     TRUE 0.538 595.000 0.029 1.000   NA
 198066 198067 tlr1345 tlr1346     TRUE 0.628 155.000 0.091 NA   NA
 198067 198068 tlr1346     tsr1347 FALSE 0.106 70.000 0.000 NA   NA
 198068 198069     tsr1347 tsr1348 FALSE 0.080 186.000 0.000 NA   NA
 198069 198070     tsr1348 nirA FALSE 0.109 140.000 0.000 1.000   NA
 198070 198071     nirA nrtA TRUE 0.727 78.000 0.128 NA Y NA
 198071 198072     nrtA nrtB TRUE 0.982 12.000 0.915 NA Y NA
 198072 198073     nrtB nrtC TRUE 0.930 48.000 0.191 0.003 Y NA
 198073 198074   tlr1353 nrtC   FALSE 0.450 28.000 0.000 1.000   NA
 198074 198075 tlr1353     nrtD FALSE 0.504 20.000 0.000 1.000   NA
 198075 198076     nrtD narB TRUE 0.679 4.000 0.000 1.000 N NA
 198076 198077   tlr1356 narB   TRUE 0.628 78.000 0.048 NA   NA
 198078 198079     tll1357 tll1358 TRUE 0.717 1.000 0.000 1.000 N NA
 198079 198080     tll1358 ntcB TRUE 0.977 -19.000 0.051 1.000 N NA
 198080 198081     ntcB moaE FALSE 0.097 530.000 0.000 1.000 N NA
 198081 198082     moaE tsl1361 TRUE 0.982 8.000 0.501 1.000 Y NA
 198082 198083     tsl1361 moaC TRUE 0.975 -16.000 0.027 1.000 Y NA
 198083 198084     moaC moaA TRUE 0.987 -25.000 0.016 0.002 Y NA
 198084 198085     moaA moeA TRUE 0.991 -27.000 0.053 0.002 Y NA
 198085 198086     moeA ureF TRUE 0.664 5.000 0.000 1.000 N NA
 198086 198087     ureF ureE TRUE 0.995 -10.000 0.560 0.003 Y NA
 198087 198088     ureE tll1367 TRUE 0.727 0.000 0.000 1.000 N NA
 198088 198089     tll1367 glsF FALSE 0.182 55.000 0.000 1.000 N NA
 198090 198091   tlr1370 gyrA   FALSE 0.222 48.000 0.000 1.000 N NA
 198091 198092 tlr1370 tlr1371     FALSE 0.209 50.000 0.000 1.000 N NA
 198092 198093 tlr1371 tlr1372     FALSE 0.116 122.000 0.000 1.000 N NA
 198094 198095     tll1373 tll1374 FALSE 0.296 127.000 0.000 0.019 N NA
 198095 198096     tll1374 tll1375 FALSE 0.113 132.000 0.000 1.000 N NA
 198096 198097     tll1375 tll1376 TRUE 0.757 -34.000 0.000 1.000 N NA
 198098 198099 tlr1377 tlr1378     TRUE 0.679 4.000 0.000 1.000 N NA
 198101 198102 tlr1380 tlr1381     FALSE 0.091 124.000 0.000 NA N NA
 198103 198104     tll1382 tll1383 FALSE 0.265 131.000 0.000 0.075 N NA
 198104 198105     tll1383 pth FALSE 0.132 74.000 0.000 1.000 N NA
 198105 198106     pth tsl1385 TRUE 0.655 6.000 0.000 1.000 N NA
 198106 198107     tsl1385 psbH TRUE 0.673 4.000 0.000 1.000   NA
 198112 198113 tlr1391 tlr1392     TRUE 0.533 10.000 0.000 NA   NA
 198113 198114 tlr1392 tlr1393     TRUE 0.651 1.000 0.000 NA   NA
 198114 399841 tlr1393 rTEt22   trnP_GGG FALSE 0.276 39.000 0.000 NA   NA
 198115 198116     tll1394 tll1395 TRUE 0.694 -7.000 0.000 NA   NA
 198116 198117     tll1395 tll1396 FALSE 0.444 19.000 0.000 NA   NA
 198117 198118     tll1396 leuA TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 198118 198119     leuA tll1398 FALSE 0.112 128.000 0.000 1.000   NA
 198119 198120     tll1398 tll1399 FALSE 0.100 210.000 0.000 1.000   NA
 198120 198121     tll1399 tll1400 FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 198121 198122     tll1400 tll1401 TRUE 0.988 -25.000 0.597 NA   NA
 198124 198125     tll1403 tll1404 FALSE 0.401 65.000 0.000 0.025 Y NA
 198125 198126     tll1404 tll1405 FALSE 0.170 58.000 0.000 1.000 N NA
 198126 198127     tll1405 tll1406 FALSE 0.128 80.000 0.000 1.000 N NA
 198127 198128     tll1406 tll1407 FALSE 0.089 120.000 0.000 NA   NA
 198128 198129     tll1407 argB FALSE 0.236 42.000 0.000 NA   NA
 198129 198130     argB tll1409 FALSE 0.453 18.000 0.000 NA   NA
 198130 198131     tll1409 tll1410 FALSE 0.085 141.000 0.000 NA   NA
 198131 198132     tll1410 tll1411 FALSE 0.089 122.000 0.000 NA   NA
 198135 198136   tlr1415 tsr1414   TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198136 198137 tlr1415     tsr1416 FALSE 0.099 87.000 0.000 NA   NA
 198138 198139     tll1417 tll1418 TRUE 0.898 -37.000 0.000 0.048   NA
 198139 198140     tll1418 tll1419 TRUE 0.982 -30.000 0.150 1.000   NA
 198140 198141     tll1419 tll1420 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198142 198143 tlr1421     tsr1422 FALSE 0.391 27.000 0.000 NA   NA
 198143 198144   tlr1423 tsr1422   TRUE 0.955 11.000 0.105 NA   NA
 198144 198145 tlr1423 tlr1424     FALSE 0.076 280.000 0.000 NA   NA
 198145 198146 tlr1424 tlr1425     FALSE 0.412 25.000 0.000 NA   NA
 198146 198147 tlr1425     ycf59 FALSE 0.141 55.000 0.000 NA   NA
 198147 198148     ycf59 tsr1427 FALSE 0.077 225.000 0.000 NA   NA
 198150 198151     ndhC ndhJ TRUE 0.930 36.000 0.014 0.003 Y NA
 198151 198152   tlr1431 ndhJ   FALSE 0.145 67.000 0.000 1.000 N NA
 198152 198153 tlr1431     tsr1432 FALSE 0.236 42.000 0.000 NA   NA
 198157 198158 tlr1436     ycf49 TRUE 0.651 1.000 0.000 NA   NA
 198158 198159   tlr1438 ycf49   FALSE 0.080 186.000 0.000 NA   NA
 198159 198160 tlr1438 tlr1439     FALSE 0.089 121.000 0.000 NA   NA
 198161 198162     tll1440 tll1441 FALSE 0.136 56.000 0.000 NA   NA
 198163 198164 tlr1442     tsr1443 FALSE 0.077 232.000 0.000 NA   NA
 198164 198165   tlr1444 tsr1443   FALSE 0.444 19.000 0.000 NA   NA
 198165 198166 tlr1444     ycf63 TRUE 0.958 10.000 0.111 NA   NA
 198166 198167   tlr1446 ycf63   FALSE 0.507 12.000 0.000 NA   NA
 198167 198168 tlr1446 tlr1447     FALSE 0.354 31.000 0.000 NA   NA
 198168 198169 tlr1447     feoB TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198169 198170     feoB cobI TRUE 0.755 -54.000 0.000 1.000 N NA
 198171 198172     tll1450 tll1451 TRUE 0.958 -3.000 0.007 1.000 N NA
 198172 198173     tll1451 tll1452 FALSE 0.124 79.000 0.000 1.000   NA
 198173 198174     tll1452 tll1453 TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 198174 198175     tll1453 tpx FALSE 0.087 130.000 0.000 NA   NA
 198175 198176     tpx tsl1455 FALSE 0.098 96.000 0.000 NA   NA
 198176 198177     tsl1455 tsl1456 FALSE 0.087 127.000 0.000 NA   NA
 198177 198178     tsl1456 tll1457 FALSE 0.074 340.000 0.000 NA   NA
 198178 198179     tll1457 tll1458 TRUE 0.745 -3.000 0.000 1.000 N NA
 198179 399860   rTEt23 tll1458 trnH_GUG FALSE 0.474 15.000 0.000 NA   NA
 198180 198181 tlr1459 tlr1460     FALSE 0.074 377.000 0.000 NA   NA
 198181 198182 tlr1460 tlr1461     FALSE 0.128 142.000 0.000 NA Y NA
 198183 198184     tll1462 tll1463 FALSE 0.099 86.000 0.000 NA   NA
 198184 198185     tll1463 tll1464 FALSE 0.334 33.000 0.000 NA   NA
 198185 198186     tll1464 tll1465 TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 198186 198187     tll1465 tll1466 TRUE 0.832 36.000 0.011 1.000 N NA
 198187 198188     tll1466 tll1467 TRUE 0.663 88.000 0.050 1.000 N NA
 198189 198190 tlr1468 tlr1469     FALSE 0.084 144.000 0.000 NA   NA
 198192 198193   tlr1472 trpG   TRUE 0.816 37.000 0.014 NA   NA
 198193 198194 tlr1472 tlr1473     FALSE 0.112 66.000 0.000 NA   NA
 198194 198195 tlr1473 tlr1474     TRUE 0.989 -49.000 0.710 NA   NA
 198195 198196 tlr1474 tlr1475     TRUE 0.968 13.000 0.379 NA   NA
 198196 198197 tlr1475 tlr1476     FALSE 0.528 11.000 0.000 NA N NA
 198197 198198 tlr1476     psbA3 FALSE 0.246 184.000 0.000 0.074   NA
 198198 198199   tlr1478 psbA3   FALSE 0.090 117.000 0.000 NA   NA
 198200 198201     tsl1479 tll1480 FALSE 0.080 179.000 0.000 NA   NA
 198201 198202     tll1480 tll1481 TRUE 0.632 3.000 0.000 NA   NA
 198202 198203     tll1481 tll1482 FALSE 0.098 83.000 0.000 NA   NA
 198204 198205   tlr1484 ycf33   TRUE 0.533 10.000 0.000 NA   NA
 198205 198206 tlr1484 tlr1485     TRUE 0.983 -3.000 0.250 NA   NA
 198207 198208     tll1486 tll1487 TRUE 0.741 28.000 0.000 0.008   NA
 198208 198209     tll1487 tll1488 FALSE 0.218 43.000 0.000 NA   NA
 198210 198211 tlr1489     ssb FALSE 0.147 95.000 0.000 NA Y NA
 198211 198212   tlr1491 ssb   FALSE 0.193 52.000 0.000 1.000 N NA
 198213 198214     tll1492 tll1493 FALSE 0.078 214.000 0.000 NA   NA
 198216 198217     tll1495 purC TRUE 0.643 7.000 0.000 1.000 N NA
 198218 198219 tlr1497 tlr1498     FALSE 0.519 11.000 0.000 NA   NA
 198221 198222 tlr1500 tlr1501     TRUE 0.558 8.000 0.000 NA   NA
 198222 198223 tlr1501 tlr1502     FALSE 0.111 129.000 0.000 1.000   NA
 198223 198224 tlr1502     valS FALSE 0.477 26.000 0.000 1.000 N NA
 198225 198226     rbcS rbcX TRUE 0.961 31.000 0.913 NA   NA
 198226 198227     rbcX rbcL TRUE 0.870 54.000 0.792 NA   NA
 198228 198229 tlr1507 tlr1508     FALSE 0.126 60.000 0.000 NA   NA
 198229 198230 tlr1508 tlr1509     FALSE 0.072 1107.000 0.000 NA   NA
 198230 198231 tlr1509     tsr1510 FALSE 0.087 129.000 0.000 NA   NA
 198233 198234 tlr1512     cobL FALSE 0.513 19.000 0.000 1.000   NA
 198234 198235   tlr1514 cobL   TRUE 0.721 0.000 0.000 1.000   NA
 198236 198237     tll1515 tsl1516 FALSE 0.123 61.000 0.000 NA   NA
 198237 198238     tsl1516 ftrV FALSE 0.507 12.000 0.000 NA   NA
 198238 198239     ftrV tll1518 FALSE 0.089 120.000 0.000 NA   NA
 198239 198240     tll1518 sodB FALSE 0.078 214.000 0.000 NA   NA
 198241 198242 tlr1520 tlr1521     FALSE 0.478 34.000 0.000 1.000 Y NA
 198242 198243 tlr1521     folP TRUE 0.745 -3.000 0.000 1.000 N NA
 198244 198245     tll1523 tsl1524 FALSE 0.507 12.000 0.000 NA   NA
 198245 198246     tsl1524 ycf3 TRUE 0.886 30.000 0.020 1.000   NA
 198247 198248 tlr1526 tlr1527     FALSE 0.463 16.000 0.000 NA   NA
 198248 198249 tlr1527 tlr1528     TRUE 0.983 -3.000 0.273 NA   NA
 198251 198252     psbB psbT TRUE 0.981 20.000 0.651 0.073   NA
 198252 198253   tlr1532 psbT   FALSE 0.107 148.000 0.000 1.000   NA
 198253 198254 tlr1532     pyrC TRUE 0.939 4.000 0.003 1.000 N NA
 198256 198257     tsr1535 hisH FALSE 0.099 85.000 0.000 NA   NA
 198259 198260     tll1538 chlG TRUE 0.607 10.000 0.000 1.000 N NA
 198261 198262 tlr1540     psbE FALSE 0.109 140.000 0.000 1.000   NA
 198262 198263     psbE psbF TRUE 0.992 8.000 0.837 0.002   NA
 198263 198264     psbF psbL TRUE 0.989 13.000 0.872 0.004   NA
 198264 198265     psbL psbJ TRUE 0.972 40.000 0.878 0.004   NA
 198267 198268 tlr1546     purH FALSE 0.443 37.000 0.000 1.000 Y NA
 198268 198269   tlr1548 purH   TRUE 0.600 10.000 0.000 1.000   NA
 198269 198270 tlr1548 tlr1549     FALSE 0.099 85.000 0.000 NA   NA
 198271 198272     tll1550 apcD FALSE 0.234 46.000 0.000 1.000   NA
 198273 198274     serS murF TRUE 0.901 -30.000 0.000 0.041 N NA
 198274 399843   rTEt25 murF trnN_GUU FALSE 0.168 49.000 0.000 NA   NA
 198275 198276     tll1554 tll1555 FALSE 0.089 119.000 0.000 NA   NA
 198276 198277     tll1555 ribF TRUE 0.964 -7.000 0.013 1.000   NA
 198277 198278     ribF tsl1557 FALSE 0.115 118.000 0.000 1.000   NA
 198278 198279     tsl1557 pyrB TRUE 0.739 -3.000 0.000 1.000   NA
 198279 198280     pyrB tll1559 TRUE 0.739 -3.000 0.000 1.000   NA
 198280 198281     tll1559 pys TRUE 0.648 6.000 0.000 1.000   NA
 198281 198282     pys pds TRUE 0.990 -16.000 0.691 1.000   NA
 198282 198283     pds ycf21 FALSE 0.096 99.000 0.000 NA   NA
 198284 198285 tlr1563 tlr1564     FALSE 0.444 20.000 0.000 NA N NA
 198285 198286 tlr1564 tlr1565     FALSE 0.491 23.000 0.000 1.000   NA
 198287 198288     fpg psaE TRUE 0.910 12.000 0.003 1.000   NA
 198290 198291     tll1569 tll1570 FALSE 0.360 36.000 0.000 1.000   NA
 198291 198292     tll1570 tll1571 TRUE 0.945 3.000 0.005 1.000   NA
 198292 198293     tll1571 tll1572 TRUE 0.968 -40.000 0.027 NA   NA
 198296 198297 tlr1575 tlr1576     FALSE 0.126 60.000 0.000 NA   NA
 198297 198298 tlr1576 tlr1577     FALSE 0.427 22.000 0.000 NA   NA
 198298 198299 tlr1577 tlr1578     TRUE 0.721 0.000 0.000 1.000   NA
 198302 198303     tsl1581 tll1582 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198304 198305 tlr1583     tsr1584 FALSE 0.141 55.000 0.000 NA   NA
 198305 198306   tlr1585 tsr1584   TRUE 0.921 19.000 0.039 NA   NA
 198306 198307 tlr1585 tlr1586     TRUE 0.672 113.000 0.123 NA   NA
 198308 198309     tll1587 glnA FALSE 0.101 236.000 0.000 1.000 N NA
 198309 198310     glnA tll1589 FALSE 0.099 85.000 0.000 NA   NA
 198310 198311     tll1589 tll1590 FALSE 0.081 169.000 0.000 NA   NA
 198311 198312     tll1590 tll1591 FALSE 0.440 60.000 0.000 0.018 Y NA
 198313 198314 tlr1592 tlr1593     TRUE 0.751 -16.000 0.000 1.000   NA
 198314 198315 tlr1593     ycf53 TRUE 0.979 -24.000 0.122 NA   NA
 198315 198316   tlr1595 ycf53   FALSE 0.319 34.000 0.000 NA   NA
 198318 198319 tlr1597 tlr1598     TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198319 198320 tlr1598 tlr1599     FALSE 0.181 47.000 0.000 NA   NA
 198320 198321 tlr1599     leuB FALSE 0.131 58.000 0.000 NA   NA
 198322 198323     cydB cydA TRUE 0.984 23.000 0.750 0.046 Y NA
 198323 198324     cydA tll1603 FALSE 0.100 259.000 0.000 1.000 N NA
 198324 198325     tll1603 tll1604 FALSE 0.389 34.000 0.000 1.000 N NA
 198326 198327 tlr1605 tlr1606     TRUE 0.727 0.000 0.000 1.000 N NA
 198327 198328 tlr1606     ctpA FALSE 0.146 66.000 0.000 1.000 N NA
 198329 198330     tll1608 tsl1609 FALSE 0.121 62.000 0.000 NA   NA
 198331 198332 tlr1610 tlr1611     TRUE 0.727 0.000 0.000 1.000 N NA
 198332 198333 tlr1611 tlr1612     FALSE 0.129 95.000 0.000 1.000 N NA
 198333 198334 tlr1612 tlr1613     TRUE 0.607 10.000 0.000 1.000 N NA
 198336 198337     ccsA ycf62 TRUE 0.898 14.000 0.002 1.000 N NA
 198338 198339     gyrA tll1618 FALSE 0.170 58.000 0.000 1.000 N NA
 198339 198340     tll1618 tll1619 TRUE 0.973 7.000 0.200 1.000 N NA
 198341 198342   tlr1621 infC   FALSE 0.526 17.000 0.000 1.000   NA
 198343 198344     tll1622 tll1623 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198344 198345     tll1623 cobW FALSE 0.075 315.000 0.000 NA   NA
 198345 198346     cobW glcD TRUE 0.542 15.000 0.000 1.000   NA
 198347 198348 tlr1626 tlr1627     TRUE 0.731 62.000 0.111 NA   NA
 198348 198349 tlr1627 tlr1628     TRUE 0.966 4.000 0.083 NA   NA
 198351 198352     psbD1 psbC TRUE 0.996 -52.000 0.878 0.003   NA
 198353 198354     tll1632 tll1633 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198354 198355     tll1633 tll1634 FALSE 0.306 35.000 0.000 NA   NA
 198355 198356     tll1634 tll1635 FALSE 0.407 32.000 0.000 1.000   NA
 198357 198358 tlr1636 tlr1637     FALSE 0.103 177.000 0.000 1.000   NA
 198359 198360     tll1638 tll1639 FALSE 0.099 75.000 0.000 NA   NA
 198362 198363     tll1641 tll1642 TRUE 0.941 9.000 0.018 1.000 N NA
 198364 198365   tlr1644 accD   FALSE 0.124 103.000 0.000 1.000 N NA
 198365 198366 tlr1644 tlr1645     FALSE 0.113 135.000 0.000 1.000 N NA
 198367 198368     hemC tll1647 FALSE 0.132 74.000 0.000 1.000 N NA
 198369 198370   tlr1649 tsr1648   TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198371 198372     ntcA tll1651 FALSE 0.092 109.000 0.000 NA   NA
 198372 198373     tll1651 tll1652 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198375 198376     tll1654 tll1655 FALSE 0.079 204.000 0.000 NA   NA
 198377 198378 tlr1656 tlr1657     TRUE 0.957 7.000 0.042 1.000 N NA
 198379 198380     tll1658 tll1659 FALSE 0.117 63.000 0.000 NA   NA
 198381 198382 tlr1660 tlr1661     FALSE 0.144 54.000 0.000 NA   NA
 198382 198383 tlr1661 tlr1662     FALSE 0.383 28.000 0.000 NA   NA
 198384 198385     tll1663 glcE TRUE 0.975 21.000 0.153 0.024 Y NA
 198385 198386     glcE tll1665 TRUE 0.739 -3.000 0.000 1.000   NA
 198388 198389     tll1667 tll1668 TRUE 0.695 -49.000 0.000 NA   NA
 198391 198392     tll1670 tll1671 FALSE 0.077 238.000 0.000 NA   NA
 198392 198393     tll1671 trpE FALSE 0.482 167.000 0.006 1.000 N NA
 198393 198394     trpE tll1673 FALSE 0.389 34.000 0.000 1.000 N NA
 198395 198396 tlr1674 tlr1675     FALSE 0.157 51.000 0.000 NA   NA
 198396 198397 tlr1675 tlr1676     FALSE 0.099 76.000 0.000 NA   NA
 198397 198398 tlr1676     tsr1677 TRUE 0.965 19.000 0.511 NA   NA
 198398 198399   tlr1678 tsr1677   FALSE 0.457 17.000 0.000 NA   NA
 198399 198400 tlr1678 tlr1679     TRUE 0.785 1.000 0.000 1.000 Y NA
 198401 198402     ppx tll1681 FALSE 0.093 107.000 0.000 NA   NA
 198403 198404     ycf52 purL FALSE 0.322 40.000 0.000 1.000   NA
 198404 198405     purL purF TRUE 0.984 1.000 0.223 1.000 Y NA
 198405 198406   tlr1685 purF   TRUE 0.745 -3.000 0.000 1.000 N NA
 198406 198407 tlr1685     ribC TRUE 0.559 14.000 0.000 1.000 N NA
 198408 198409     tsf rps2 TRUE 0.972 18.000 0.748 1.000   NA
 198410 198411 tlr1689     cysA FALSE 0.098 359.000 0.000 1.000 N NA
 198411 399844   rTEt26 cysA trnQ_UUG FALSE 0.104 71.000 0.000 NA   NA
 399844 198412 rTEt26 tlr1691 trnQ_UUG   FALSE 0.453 18.000 0.000 NA   NA
 198412 399845 tlr1691 rTEt27   trnK_UUU FALSE 0.141 55.000 0.000 NA   NA
 198413 198414     tll1692 tll1693 FALSE 0.179 48.000 0.000 NA N NA
 198414 198415     tll1693 tll1694 FALSE 0.170 58.000 0.000 1.000 N NA
 198415 198416     tll1694 ycf48 FALSE 0.265 40.000 0.000 NA   NA
 198416 198417     ycf48 rub TRUE 0.987 -10.000 0.521 NA   NA
 198419 198420     tll1698 ycf58 TRUE 0.721 0.000 0.000 1.000   NA
 198421 198422 tlr1700     tsr1701 TRUE 0.926 37.000 0.379 NA   NA
 198423 198424     comE tsl1703 FALSE 0.092 111.000 0.000 NA   NA
 198424 198425     tsl1703 gidB FALSE 0.080 184.000 0.000 NA   NA
 198425 198426     gidB tll1705 TRUE 0.696 -19.000 0.000 NA   NA
 198426 198427     tll1705 tll1706 FALSE 0.080 187.000 0.000 NA   NA
 198430 198431 tlr1709 tlr1710     TRUE 0.938 8.000 0.019 NA   NA
 198432 198433     tll1711 tll1712 FALSE 0.102 73.000 0.000 NA   NA
 198433 198434     tll1712 nadC FALSE 0.520 19.000 0.000 1.000 N NA
 198434 198435     nadC trpD TRUE 0.755 -10.000 0.000 1.000 N NA
 198435 198436     trpD tll1715 FALSE 0.109 68.000 0.000 NA   NA
 198436 198437     tll1715 cobQ FALSE 0.097 97.000 0.000 NA   NA
 198437 198438     cobQ tll1717 FALSE 0.097 293.000 0.000 1.000   NA
 198440 198441     desC3 hemN1 TRUE 0.633 90.000 0.032 1.000 N NA
 198441 198442     hemN1 ho2 TRUE 0.904 39.000 0.161 1.000 N NA
 198444 198445     tll1723 psaD FALSE 0.094 105.000 0.000 NA   NA
 198449 198450     tsl1728 tll1729 TRUE 0.651 1.000 0.000 NA   NA
 198450 198451     tll1729 tll1730 TRUE 0.570 7.000 0.000 NA   NA
 198451 198452     tll1730 tll1731 FALSE 0.076 245.000 0.000 NA   NA
 198453 198454 tlr1732     dnaK2 FALSE 0.112 127.000 0.000 1.000   NA
 198454 198455     dnaK2 tsr1734 FALSE 0.078 205.000 0.000 NA   NA
 198455 198456   tlr1735 tsr1734   FALSE 0.519 11.000 0.000 NA   NA
 198456 198457 tlr1735 tlr1736     FALSE 0.259 141.000 0.000 0.071   NA
 198458 198459     tll1737 hemA TRUE 0.655 6.000 0.000 1.000 N NA
 198460 198461 tlr1739     feoB TRUE 0.637 15.000 0.000 1.000 Y NA
 198461 198462   tlr1741 feoB   FALSE 0.147 173.000 0.000 1.000 Y NA
 198464 198465 tlr1743 tlr1744     TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 198465 198466 tlr1744 tlr1745     FALSE 0.136 56.000 0.000 NA   NA
 198466 198467 tlr1745 tlr1746     TRUE 0.694 -76.000 0.000 NA   NA
 198467 198468 tlr1746     rps12 FALSE 0.133 57.000 0.000 NA   NA
 198468 198469     rps12 rps7 TRUE 0.919 68.000 0.620 0.004 Y NA
 198469 198470     rps7 fus TRUE 0.834 75.000 0.579 1.000 Y NA
 198470 198471     fus tufA TRUE 0.986 18.000 0.400 0.001 Y NA
 198471 198472     tufA rps10 TRUE 0.795 103.000 0.318 1.000 Y NA
 198472 198473   tlr1752 rps10   FALSE 0.419 31.000 0.000 1.000   NA
 198473 198474 tlr1752     uvrC TRUE 0.562 13.000 0.000 1.000   NA
 198475 198476 tlr1754     tsr1755 TRUE 0.851 46.000 0.167 1.000   NA
 198476 198477   tlr1756 tsr1755   TRUE 0.673 4.000 0.000 1.000   NA
 198477 198478 tlr1756     sds FALSE 0.129 95.000 0.000 1.000 N NA
 198478 198479   tlr1758 sds   FALSE 0.081 204.000 0.000 NA N NA
 198481 198482 tlr1760     lysA FALSE 0.182 55.000 0.000 1.000 N NA
 198482 198483   tlr1762 lysA   TRUE 0.918 21.000 0.040 NA   NA
 198483 198484 tlr1762 tlr1763     TRUE 0.927 17.000 0.043 NA   NA
 198484 198485 tlr1763 tlr1764     FALSE 0.136 71.000 0.000 1.000 N NA
 198485 198486 tlr1764     thrB TRUE 0.679 4.000 0.000 1.000 N NA
 198486 198487   tlr1766 thrB   FALSE 0.099 93.000 0.000 NA   NA
 198488 198489     tll1767 tll1768 TRUE 0.832 12.000 0.000 0.071 Y NA
 198490 198491 tlr1769 tlr1770     FALSE 0.334 33.000 0.000 NA   NA
 198492 198493     tll1771 tll1772 FALSE 0.119 116.000 0.000 1.000 N NA
 198496 198497     tsr1775 tsr1776 FALSE 0.107 69.000 0.000 NA   NA
 198498 198499     tll1777 tsl1778 TRUE 0.651 1.000 0.000 NA   NA
 198501 198502     tll1780 tll1781 TRUE 0.816 52.000 0.217 NA   NA
 198504 198505     tll1783 tll1784 FALSE 0.124 97.000 0.000 1.000   NA
 198508 198509   tlr1788 tsr1787   FALSE 0.080 183.000 0.000 NA   NA
 198509 198510 tlr1788 tlr1789     FALSE 0.118 119.000 0.000 1.000 N NA
 198510 198511 tlr1789 tlr1790     TRUE 0.957 12.000 0.052 1.000 Y NA
 198511 198512 tlr1790 tlr1791     TRUE 0.732 62.000 0.083 1.000 N NA
 198512 198513 tlr1791 tlr1792     TRUE 0.957 10.000 0.071 1.000 N NA
 198513 198514 tlr1792 tlr1793     FALSE 0.367 36.000 0.000 1.000 N NA
 198514 198515 tlr1793 tlr1794     FALSE 0.078 303.000 0.000 NA N NA
 198515 198516 tlr1794 tlr1795     TRUE 0.981 4.000 0.500 NA N NA
 198517 198518     tll1796 tll1797 FALSE 0.078 223.000 0.000 NA   NA
 198518 198519     tll1797 tll1798 TRUE 0.673 4.000 0.000 1.000   NA
 198521 198522     tll1800 tll1801 FALSE 0.078 311.000 0.000 NA N NA
 198522 198523     tll1801 tll1802 FALSE 0.093 108.000 0.000 NA   NA
 198523 198524     tll1802 aroH TRUE 0.957 3.000 0.018 1.000   NA
 198524 198525     aroH tll1804 TRUE 0.937 31.000 0.207 1.000 N NA
 198525 198526     tll1804 tll1805 FALSE 0.099 76.000 0.000 NA   NA
 198526 198527     tll1805 tll1806 TRUE 0.696 -19.000 0.000 NA   NA
 198527 198528     tll1806 tll1807 TRUE 0.547 9.000 0.000 NA   NA
 198529 198530     accC murG TRUE 0.727 0.000 0.000 1.000 N NA
 198530 198531   tlr1810 murG   TRUE 0.594 11.000 0.000 1.000 N NA
 198531 198532 tlr1810     purM TRUE 0.727 0.000 0.000 1.000 N NA
 198533 198534     tll1812 tll1813 TRUE 0.988 -3.000 0.489 NA Y NA
 198534 198535     tll1813 tsl1814 TRUE 0.988 -7.000 0.605 NA   NA
 198535 198536     tsl1814 tsl1815 TRUE 0.974 12.000 0.605 NA   NA
 198536 198537     tsl1815 tll1816 TRUE 0.990 -3.000 0.913 NA   NA
 198537 198538     tll1816 ndhD5 TRUE 0.986 -3.000 0.404 NA   NA
 198538 198539     ndhD5 tll1818 TRUE 0.991 4.000 0.306 0.009 Y NA
 198540 198541     ndhD2 cp12 FALSE 0.087 128.000 0.000 NA   NA
 198541 198542   tlr1821 cp12   TRUE 0.967 -21.000 0.024 NA   NA
 198542 198543 tlr1821 tlr1822     FALSE 0.120 112.000 0.000 1.000 N NA
 198543 198544 tlr1822 tlr1823     TRUE 0.739 -3.000 0.000 1.000   NA
 198545 198546     ilvB tsl1825 FALSE 0.177 75.000 0.000 1.000 Y NA
 198546 198547     tsl1825 rps14 FALSE 0.262 44.000 0.000 1.000 N NA
 198548 198549   tlr1828 cysS   TRUE 0.550 15.000 0.000 1.000 N NA
 198550 198551     purB tll1830 TRUE 0.591 52.000 0.002 NA   NA
 198551 198552     tll1830 tll1831 FALSE 0.343 32.000 0.000 NA   NA
 198552 198553     tll1831 ftsH TRUE 0.550 15.000 0.000 1.000 N NA
 198554 198555 tlr1833 tlr1834     TRUE 0.751 -40.000 0.000 1.000   NA
 198560 198561     purD tsr1840 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198562 198563     tll1841 tll1842 FALSE 0.520 19.000 0.000 1.000 N NA
 198564 198565     psbA1 psbA2 FALSE 0.298 313.000 0.000 0.002   NA
 198566 198567     tll1845 tll1846 TRUE 0.717 1.000 0.000 1.000 N NA
 198567 198568     tll1846 tsl1847 FALSE 0.519 11.000 0.000 NA   NA
 198569 198570   tlr1849 cobB   FALSE 0.157 62.000 0.000 1.000 N NA
 198571 198572     tll1850 secA FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 198572 198573     secA tll1852 FALSE 0.093 107.000 0.000 NA   NA
 198574 198575 tlr1853 tlr1854     TRUE 0.970 -79.000 0.025 1.000   NA
 198575 198576 tlr1854 tlr1855     FALSE 0.101 78.000 0.000 NA N NA
 198576 198577 tlr1855 tlr1856     FALSE 0.188 46.000 0.000 NA   NA
 198578 198579     tll1857 tsl1858 FALSE 0.157 51.000 0.000 NA   NA
 198579 198580     tsl1858 tll1859 FALSE 0.074 434.000 0.000 NA   NA
 198580 198581     tll1859 tll1860 FALSE 0.089 119.000 0.000 NA   NA
 198583 198584     tll1862 tll1863 FALSE 0.197 45.000 0.000 NA   NA
 198584 198585     tll1863 tsl1864 FALSE 0.168 49.000 0.000 NA   NA
 198585 198586     tsl1864 tsl1865 TRUE 0.979 -52.000 0.125 NA   NA
 198588 198589     tll1867 tll1868 FALSE 0.092 109.000 0.000 NA   NA
 198589 198590     tll1868 tll1869 TRUE 0.696 -34.000 0.000 NA   NA
 198590 198591     tll1869 tll1870 FALSE 0.097 97.000 0.000 NA   NA
 198591 198592     tll1870 tll1871 TRUE 0.887 37.000 0.062 1.000 N NA
 198592 198593     tll1871 acp TRUE 0.982 5.000 0.346 1.000 Y NA
 198594 198595     zam fmt TRUE 0.757 -22.000 0.000 1.000 N NA
 198595 198596   tlr1875 fmt   FALSE 0.110 132.000 0.000 1.000   NA
 198596 198597 tlr1875 tlr1876     TRUE 0.867 51.000 0.404 1.000   NA
 198597 198598 tlr1876 tlr1877     TRUE 0.785 73.000 0.423 NA   NA
 198598 198599 tlr1877 tlr1878     FALSE 0.079 193.000 0.000 NA   NA
 198599 198600 tlr1878 tlr1879     TRUE 0.750 -12.000 0.000 1.000   NA
 198601 198602     tll1880 topA TRUE 0.717 1.000 0.000 1.000 N NA
 198604 198605     ppa tll1884 FALSE 0.146 53.000 0.000 NA   NA
 198605 198606     tll1884 tll1885 FALSE 0.098 83.000 0.000 NA   NA
 198606 198607     tll1885 tll1886 FALSE 0.319 34.000 0.000 NA   NA
 198607 198608     tll1886 tsl1887 FALSE 0.101 74.000 0.000 NA   NA
 198608 198609     tsl1887 tll1888 TRUE 0.696 -16.000 0.000 NA   NA
 198609 198610     tll1888 tsl1889 FALSE 0.083 158.000 0.000 NA   NA
 198614 198615     ctaB tll1894 TRUE 0.982 -63.000 0.090 1.000 Y NA
 198615 198616     tll1894 tll1895 FALSE 0.084 147.000 0.000 NA   NA
 198616 198617     tll1895 tll1896 FALSE 0.115 64.000 0.000 NA   NA
 198617 198618     tll1896 tll1897 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198618 198619     tll1897 hisS TRUE 0.750 -55.000 0.000 1.000   NA
 198619 198620     hisS tll1899 FALSE 0.079 195.000 0.000 NA   NA
 198621 198622   tlr1901 crtR   TRUE 0.550 15.000 0.000 1.000 N NA
 198622 198623 tlr1901 tlr1902     FALSE 0.115 126.000 0.000 1.000 N NA
 198625 198626 tlr1904 tlr1905     TRUE 0.989 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 198627 198628   tll1907 tll1906 tll1907 FALSE 0.444 19.000 0.000 NA   NA
 198628 198629 tll1907   tll1907 tsl1908 FALSE 0.085 139.000 0.000 NA   NA
 198629 198630     tsl1908 tll1909 FALSE 0.099 86.000 0.000 NA   NA
 198630 198631     tll1909 tll1910 TRUE 0.991 -46.000 0.700 1.000 Y NA
 198631 198632     tll1910 argJ FALSE 0.124 104.000 0.000 1.000 N NA
 198632 198633     argJ ppc FALSE 0.096 614.000 0.000 1.000 N NA
 198633 198634     ppc tll1913 FALSE 0.095 103.000 0.000 NA   NA
 198634 198635     tll1913 prk FALSE 0.391 27.000 0.000 NA   NA
 198636 198637     rpl32 tsr1916 TRUE 0.632 3.000 0.000 NA   NA
 198637 198638   tlr1917 tsr1916   FALSE 0.412 25.000 0.000 NA   NA
 198638 198639 tlr1917 tlr1918     FALSE 0.103 72.000 0.000 NA   NA
 198639 198640 tlr1918 tlr1919     FALSE 0.092 112.000 0.000 NA   NA
 198642 198643   tlr1922 tsr1921   FALSE 0.075 326.000 0.000 NA   NA
 198643 399846 tlr1922 rTEt30   trnT_GGU FALSE 0.109 68.000 0.000 NA   NA
 198644 198645     tll1923 tll1924 FALSE 0.504 20.000 0.000 1.000   NA
 198646 198647 tlr1925 tlr1926     FALSE 0.099 91.000 0.000 NA   NA
 198651 198652 tlr1930 tlr1931     FALSE 0.236 42.000 0.000 NA   NA
 198652 198653 tlr1931     tsr1932 FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 198653 198654   tlr1933 tsr1932   FALSE 0.319 34.000 0.000 NA   NA
 198654 198655 tlr1933 tlr1934     FALSE 0.099 76.000 0.000 NA   NA
 198656 198657     tll1935 tsl1936 TRUE 0.704 -22.000 0.000 NA N NA
 198657 198658     tsl1936 tll1937 TRUE 0.983 3.000 0.323 NA Y NA
 198658 198659     tll1937 tll1938 TRUE 0.930 41.000 0.759 NA   NA
 198659 198660     tll1938 tll1939 FALSE 0.081 171.000 0.000 NA   NA
 198660 198661     tll1939 tll1941 FALSE 0.083 157.000 0.000 NA   NA
 198661 198662     tll1941 tll1940 TRUE 0.988 -265.000 0.689 NA   NA
 198662 198663     tll1940 tll1942 FALSE 0.099 88.000 0.000 NA   NA
 198663 198664     tll1942 tll1943 TRUE 0.694 -58.000 0.000 NA   NA
 198664 198665     tll1943 tll1944 FALSE 0.244 45.000 0.000 1.000   NA
 198668 198669   tlr1948 thiE   TRUE 0.808 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 198669 198670 tlr1948 tlr1949     TRUE 0.739 -3.000 0.000 1.000   NA
 198670 198671 tlr1949 tlr1950     FALSE 0.101 74.000 0.000 NA   NA
 198671 198672 tlr1950 tlr1951     TRUE 0.697 -22.000 0.000 NA   NA
 198672 198673 tlr1951 tlr1952     FALSE 0.115 64.000 0.000 NA   NA
 198673 198674 tlr1952 tlr1953     TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 198674 198675 tlr1953 tlr1954     TRUE 0.755 -54.000 0.000 1.000 N NA
 198675 198676 tlr1954 tlr1955     FALSE 0.076 421.000 0.000 NA N NA
 198678 198679     cpcB cpcA FALSE 0.375 69.000 0.000 0.004   NA
 198679 198680     cpcA cpcC TRUE 0.814 114.000 0.125 0.008   NA
 198680 198681     cpcC cpcD TRUE 0.624 40.000 0.000 0.008   NA
 198681 198682     cpcD cpcE TRUE 0.625 8.000 0.000 1.000   NA
 198682 198683     cpcE cpcF TRUE 0.903 -3.000 0.000 0.018   NA
 198683 198684     cpcF cpcG1 FALSE 0.532 16.000 0.000 1.000   NA
 198684 198685     cpcG1 cpcG2 TRUE 0.878 4.000 0.000 0.008   NA
 198685 198686     cpcG2 cpcG4 TRUE 0.683 34.000 0.000 0.008   NA
 198686 198687   tlr1966 cpcG4   FALSE 0.110 133.000 0.000 1.000   NA
 198687 198688 tlr1966     ycf9 FALSE 0.115 117.000 0.000 1.000   NA
 198689 198690     tll1968 tll1969 TRUE 0.745 -3.000 0.000 1.000 N NA
 198690 198691     tll1969 tll1970 TRUE 0.547 9.000 0.000 NA   NA
 198691 198692     tll1970 tll1971 FALSE 0.087 130.000 0.000 NA   NA
 198692 198693     tll1971 tsl1972 FALSE 0.402 26.000 0.000 NA   NA
 198695 198696     tll1974 tll1975 FALSE 0.113 124.000 0.000 1.000   NA
 198696 399857   rTEt31 tll1975 trnF_GAA FALSE 0.507 12.000 0.000 NA   NA
 198697 198698 tlr1976 tlr1977     TRUE 0.727 0.000 0.000 1.000 N NA
 198699 198700     tll1978 tll1979 FALSE 0.354 31.000 0.000 NA   NA
 198700 198701     tll1979 tll1980 TRUE 0.803 91.000 0.667 NA   NA
 198702 198703 tlr1981 tlr1982     TRUE 0.583 6.000 0.000 NA   NA
 198709 198710 tlr1988 tlr1989     FALSE 0.093 885.000 0.000 1.000   NA
 198710 198711 tlr1989 tlr1990     FALSE 0.102 73.000 0.000 NA   NA
 198711 198712 tlr1990 tlr1991     FALSE 0.306 35.000 0.000 NA   NA
 198712 198713 tlr1991 tlr1992     FALSE 0.412 25.000 0.000 NA   NA
 198713 198714 tlr1992 tlr1993     FALSE 0.483 14.000 0.000 NA   NA
 198714 198715 tlr1993     tsr1994 FALSE 0.507 12.000 0.000 NA   NA
 198715 198716   tlr1995 tsr1994   FALSE 0.207 44.000 0.000 NA   NA
 198716 198717 tlr1995 tlr1996   trpS FALSE 0.317 41.000 0.000 1.000 N NA
 198717 198718 tlr1996 tlr1997 trpS   TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198720 198721 tlr1999     cmpA FALSE 0.077 317.000 0.000 NA N NA
 198721 198722     cmpA cmpB TRUE 0.991 -88.000 0.867 NA Y NA
 198722 198723     cmpB cmpC TRUE 0.992 10.000 0.867 0.003 Y NA
 198723 198724     cmpC cmpD TRUE 0.982 18.000 0.200 0.003 Y NA
 198726 198727   tlr2006 tsr2005   TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 198727 399847 tlr2006 rTEt32   trnR_CCG FALSE 0.444 19.000 0.000 NA   NA
 399847 198728 rTEt32 tlr2007 trnR_CCG   FALSE 0.076 259.000 0.000 NA   NA
 198728 198729 tlr2007 tlr2008     FALSE 0.255 41.000 0.000 NA   NA
 198730 198731     ctaE ctaD TRUE 0.979 27.000 0.235 0.001 Y NA
 198731 198732     ctaD ctaC TRUE 0.981 36.000 1.000 0.001 Y NA
 198733 198734 tlr2012     psbX FALSE 0.109 68.000 0.000 NA   NA
 198734 198735     psbX ycf66 TRUE 0.639 104.000 0.056 NA   NA
 198735 198736   tlr2015 ycf66   FALSE 0.402 26.000 0.000 NA   NA
 198736 198737 tlr2015     minC TRUE 0.953 -3.000 0.006 NA   NA
 198737 198738     minC minD TRUE 0.936 39.000 0.368 1.000 Y NA
 198738 198739     minD minE TRUE 0.987 -3.000 0.347 NA Y NA
 198739 198740   tlr2019 minE   FALSE 0.203 45.000 0.000 NA N NA
 198740 198741 tlr2019 tlr2020     TRUE 0.757 -33.000 0.000 1.000 N NA
 198744 198745     tll2023 tll2024 FALSE 0.319 34.000 0.000 NA   NA
 198746 198747 tlr2025 tlr2026     TRUE 0.848 49.000 0.274 NA   NA
 198748 198749     tll2027 tll2028 TRUE 0.533 10.000 0.000 NA   NA
 198749 198750     tll2028 tsl2029 FALSE 0.076 239.000 0.000 NA   NA
 198750 198751     tsl2029 tll2030 TRUE 0.695 -10.000 0.000 NA   NA
 198751 198752     tll2030 tll2031 FALSE 0.117 112.000 0.000 1.000   NA
 198753 198754 tlr2032 tlr2033     FALSE 0.133 122.000 0.000 NA Y NA
 198754 198755 tlr2033     apcF FALSE 0.106 158.000 0.000 1.000   NA
 198755 198756   tlr2035 apcF   FALSE 0.126 88.000 0.000 1.000   NA
 198758 198759 tlr2037 tlr2038     TRUE 0.644 2.000 0.000 NA   NA
 198760 198761     tll2039 tll2040 TRUE 0.550 15.000 0.000 1.000 N NA
 198762 198763 tlr2041 tlr2042     TRUE 0.968 2.000 0.054 NA   NA
 198764 198765     tll2043 tll2044 TRUE 0.950 13.000 0.070 1.000   NA
 198765 198766     tll2044 pdxA FALSE 0.126 86.000 0.000 1.000   NA
 198766 198767     pdxA rps1 TRUE 0.953 2.000 0.009 1.000   NA
 198768 198769 tlr2047 tlr2048     TRUE 0.903 -31.000 0.000 0.032 N NA
 198770 198771     tll2049 tll2050 TRUE 0.754 -7.000 0.000 1.000 N NA
 198771 198772     tll2050 gldA TRUE 0.976 1.000 0.105 1.000 N NA
 198772 198773     gldA psbM FALSE 0.234 46.000 0.000 1.000   NA
 198773 198774     psbM tll2053 FALSE 0.469 26.000 0.000 1.000   NA
 198774 198775     tll2053 tll2054 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198777 198778     dnaE tll2057 FALSE 0.290 37.000 0.000 NA   NA
 198778 198779     tll2057 tll2058 FALSE 0.255 41.000 0.000 NA   NA
 198780 198781 tlr2059     rpl33 TRUE 0.919 36.000 0.243 NA   NA
 198781 198782     rpl33 rps18 TRUE 0.971 14.000 0.037 0.017 Y NA
 198782 198783   tlr2062 rps18   FALSE 0.116 123.000 0.000 1.000 N NA
 198783 198784 tlr2062 tlr2063     TRUE 0.989 -15.000 0.339 1.000 Y NA
 198786 198787 tlr2065 tlr2066     TRUE 0.669 83.000 0.091 NA   NA
 198790 198791     dnaE tll2070 FALSE 0.391 27.000 0.000 NA   NA
 198791 198792     tll2070 tll2071 FALSE 0.073 524.000 0.000 NA   NA
 198793 198794 tlr2072 tlr2073     FALSE 0.492 77.000 0.004 NA   NA
 198794 198795 tlr2073 tlr2074     TRUE 0.958 9.000 0.098 NA   NA
 198795 198796 tlr2074     psbP FALSE 0.480 25.000 0.000 1.000   NA
 198796 399848   rTEt33 psbP trnA_CGC FALSE 0.519 11.000 0.000 NA   NA
 198797 198798     tll2076 tll2077 FALSE 0.319 34.000 0.000 NA   NA
 198800 198801     tll2079 tll2080 FALSE 0.088 124.000 0.000 NA   NA
 198802 198803 tlr2081 tlr2082     TRUE 0.987 -3.000 0.648 NA   NA
 198804 198805     tsl2083 tll2084 FALSE 0.085 139.000 0.000 NA   NA
 198807 198808     tll2086 trxM2 FALSE 0.072 1143.000 0.000 NA   NA
 198809 198810 tlr2088     recA FALSE 0.106 70.000 0.000 NA   NA
 198811 198812     tll2090 tll2091 TRUE 0.704 2.000 0.000 1.000   NA
 198814 198815     tll2093 tsl2094 TRUE 0.745 -3.000 0.000 1.000 N NA
 198815 198816     tsl2094 tll2095 FALSE 0.109 68.000 0.000 NA   NA
 198816 198817     tll2095 tll2096 TRUE 0.632 3.000 0.000 NA   NA
 198817 198818     tll2096 tsl2097 TRUE 0.558 8.000 0.000 NA   NA
 198818 198819     tsl2097 leuS FALSE 0.097 98.000 0.000 NA   NA
 198819 198820     leuS tll2099 FALSE 0.128 83.000 0.000 1.000 N NA
 198820 198821     tll2099 tll2100 FALSE 0.150 52.000 0.000 NA   NA
 198822 198823     tll2101 tll2102 TRUE 0.600 10.000 0.000 1.000   NA
 198823 198824     tll2102 alaS FALSE 0.389 34.000 0.000 1.000 N NA
 198824 198825     alaS tll2104 FALSE 0.113 124.000 0.000 1.000   NA
 198826 2177450 tlr2105 rTEs04   rnpB FALSE 0.463 16.000 0.000 NA   NA
 2177450 198827 rTEs04 tlr2106 rnpB   FALSE 0.103 72.000 0.000 NA   NA
 198827 198828 tlr2106 tlr2107     TRUE 0.712 8.000 0.000 1.000 Y NA
 198830 198831   tlr2110 sigG   TRUE 0.765 48.000 0.047 NA   NA
 198832 198833     tll2111 tll2112 FALSE 0.493 13.000 0.000 NA   NA
 198833 198834     tll2112 tll2113 FALSE 0.093 106.000 0.000 NA   NA
 198834 198835     tll2113 tll2114 TRUE 0.694 -7.000 0.000 NA   NA
 198835 198836     tll2114 tll2115 TRUE 0.643 7.000 0.000 1.000 N NA
 198836 198837     tll2115 tll2116 TRUE 0.959 -54.000 0.005 1.000 N NA
 198837 198838     tll2116 tll2117 FALSE 0.096 598.000 0.000 1.000 N NA
 198838 198839     tll2117 proB FALSE 0.153 63.000 0.000 1.000 N NA
 198840 198841 tlr2119     tsr2120 FALSE 0.086 134.000 0.000 NA   NA
 198841 198842     tsr2120 tsr2121 FALSE 0.168 49.000 0.000 NA   NA
 198842 198843     tsr2121 tsr2122 FALSE 0.444 19.000 0.000 NA   NA
 198845 198846     ndhF4 ndhD4 TRUE 0.996 -15.000 0.875 0.004 Y NA
 198846 198847   tlr2126 ndhD4   TRUE 0.987 -3.000 0.625 NA   NA
 198847 198848 tlr2126     gylA FALSE 0.086 135.000 0.000 NA   NA
 198848 198849   tlr2128 gylA   TRUE 0.934 29.000 0.137 1.000 N NA
 198849 198850 tlr2128 tlr2129     TRUE 0.972 -37.000 0.032 1.000   NA
 198850 198851 tlr2129 tlr2130     TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198853 198854 tlr2132 tlr2133     FALSE 0.094 447.000 0.000 1.000   NA
 198854 198855 tlr2133 tlr2134     TRUE 0.984 -7.000 0.217 1.000 N NA
 198855 198856 tlr2134 tlr2135     TRUE 0.697 -30.000 0.000 NA   NA
 198857 198858     tll2136 tll2137 TRUE 0.751 -37.000 0.000 1.000   NA
 198859 198860     tsr2138 ycf35 TRUE 0.972 21.000 1.000 NA   NA
 198860 198861   tlr2140 ycf35   TRUE 0.972 13.000 0.550 NA   NA
 198863 198864   tlr2143 tsr2142   FALSE 0.078 214.000 0.000 NA   NA
 198864 198865 tlr2143 tlr2144     TRUE 0.696 -19.000 0.000 NA   NA
 198868 198869     tll2147 tll2148 FALSE 0.230 47.000 0.000 1.000 N NA
 198869 198870     tll2148 dnaJ TRUE 0.679 4.000 0.000 1.000 N NA
 198870 198871     dnaJ dnaK3 TRUE 0.935 51.000 0.390 0.007 Y NA
 198872 198873 tlr2151     ribD TRUE 0.533 10.000 0.000 NA   NA
 198875 198876 tlr2154     hemD FALSE 0.520 19.000 0.000 1.000 N NA
 198876 198877   tlr2156 hemD   FALSE 0.131 72.000 0.000 1.000   NA
 198878 198879     tll2157 rpl20 TRUE 0.550 15.000 0.000 1.000 N NA
 198879 198880     rpl20 rpl35 TRUE 0.975 40.000 0.928 0.017 Y NA
 198881 198882 tlr2160 tlr2161     TRUE 0.651 1.000 0.000 NA   NA
 198882 198883 tlr2161 tlr2162     TRUE 0.593 5.000 0.000 NA   NA
 198885 198886 tlr2164 tlr2165     TRUE 0.703 68.000 0.040 1.000 Y NA
 198886 198887 tlr2165 tlr2166     TRUE 0.994 1.000 0.485 0.002 Y NA
 198887 198888 tlr2166 tlr2167     TRUE 0.991 -6.000 0.086 0.002 Y NA
 198890 198891 tlr2169 tlr2170     TRUE 0.711 94.000 0.118 1.000 N NA
 198891 198892 tlr2170 tlr2171     FALSE 0.274 43.000 0.000 1.000 N NA
 198893 198894     tll2172 tsl2173 FALSE 0.073 656.000 0.000 NA   NA
 198894 198895     tsl2173 tsl2174 FALSE 0.077 231.000 0.000 NA   NA
 198896 198897 tlr2175 tlr2176     FALSE 0.117 63.000 0.000 NA   NA
 198898 198899     tll2177 tll2178 TRUE 0.558 8.000 0.000 NA   NA
 198901 198902     tll2180 tll2181 TRUE 0.981 -22.000 0.117 1.000   NA
 198905 198906 tlr2184     tsr2185 TRUE 0.679 4.000 0.000 1.000 N NA
 198906 198907   tlr2186 tsr2185   TRUE 0.583 6.000 0.000 NA   NA
 198907 198908 tlr2186     purL TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198908 198909   tlr2188 purL   FALSE 0.392 28.000 0.000 NA N NA
 198909 198910 tlr2188 tlr2189     FALSE 0.119 64.000 0.000 NA N NA
 198911 198912     tll2190 tll2191 TRUE 0.544 113.000 0.019 NA   NA
 198912 198913     tll2191 glyS FALSE 0.087 129.000 0.000 NA   NA
 198913 198914     glyS tll2193 TRUE 0.655 13.000 0.000 1.000 Y NA
 198914 198915     tll2193 tll2194 FALSE 0.103 72.000 0.000 NA   NA
 198916 198917     tsr2195 menA FALSE 0.319 34.000 0.000 NA   NA
 198918 198919     tsl2197 tll2198 FALSE 0.265 40.000 0.000 NA   NA
 198921 198922     tll2200 tll2201 FALSE 0.113 65.000 0.000 NA   NA
 198922 198923     tll2201 thrS FALSE 0.103 219.000 0.000 1.000 N NA
 198925 198926     recR tll2205 TRUE 0.930 8.000 0.006 1.000 N NA
 198927 198928 tlr2206     tsr2207 FALSE 0.290 37.000 0.000 NA   NA
 198930 198931 tlr2209 tlr2210     TRUE 0.960 24.000 0.500 NA   NA
 198931 198932 tlr2210 tlr2211     FALSE 0.136 56.000 0.000 NA   NA
 198932 198933 tlr2211     tsr2212 FALSE 0.075 331.000 0.000 NA   NA
 198934 198935     tsl2213 tsl2214 FALSE 0.112 66.000 0.000 NA   NA
 198935 198936     tsl2214 tll2215 FALSE 0.493 13.000 0.000 NA   NA
 198937 198938   tlr2217 hemH   TRUE 0.696 -37.000 0.000 NA   NA
 198938 198939 tlr2217     tsr2218 TRUE 0.533 10.000 0.000 NA   NA
 198941 198942 tlr2220 tlr2221     TRUE 0.957 6.000 0.049 NA   NA
 198943 198944     tll2222 tll2223 TRUE 0.644 2.000 0.000 NA   NA
 198944 198945     tll2223 tll2224 FALSE 0.101 74.000 0.000 NA   NA
 198947 198948     tsl2226 tll2227 TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 198948 198949     tll2227 tll2228 FALSE 0.082 164.000 0.000 NA   NA
 198949 198950     tll2228 tll2229 TRUE 0.914 -3.000 0.000 0.040 Y NA
 198950 198951     tll2229 tll2230 TRUE 0.995 -13.000 0.500 0.001 Y NA
 198951 198952     tll2230 tll2231 FALSE 0.084 149.000 0.000 NA   NA
 198952 198953     tll2231 tsl2232 TRUE 0.683 -3.000 0.000 NA   NA
 198953 198954     tsl2232 tll2233 TRUE 0.625 8.000 0.000 1.000   NA
 198955 198956 tlr2234 tlr2235     TRUE 0.954 -3.000 0.008 NA   NA
 198956 198957 tlr2235 tlr2236     FALSE 0.099 92.000 0.000 NA   NA
 198959 198960 tlr2238 tlr2239     FALSE 0.141 55.000 0.000 NA   NA
 198960 198961 tlr2239 tlr2240     FALSE 0.097 79.000 0.000 NA   NA
 198961 198962 tlr2240 tlr2241     FALSE 0.209 50.000 0.000 1.000 N NA
 198962 198963 tlr2241 tlr2242     FALSE 0.149 63.000 0.000 1.000   NA
 198963 198964 tlr2242 tlr2243     TRUE 0.962 25.000 0.483 1.000   NA
 198964 198965 tlr2243     tsr2244 FALSE 0.463 16.000 0.000 NA   NA
 198965 198966   tlr2245 tsr2244   FALSE 0.306 35.000 0.000 NA   NA
 198967 2177451   rTEr01 tsl2246 rrn5S FALSE 0.077 229.000 0.000 NA   NA
 2177451 2177452 rTEr01 rTEr02 rrn5S rrn23S FALSE 0.088 124.000 0.000 NA   NA
 2177452 198968 rTEr02   rrn23S tll2247 TRUE 0.693 -983.000 0.000 NA   NA
 198968 399856   rTEt35 tll2247 trnA_UGC FALSE 0.072 2779.000 0.000 NA   NA
 399856 399855 rTEt35 rTEt36 trnA_UGC renA_UGC FALSE 0.493 13.000 0.000 NA   NA
 399855 2177453 rTEt36 rTEr03 renA_UGC rrn16S FALSE 0.090 116.000 0.000 NA   NA
 198969 198970   tlr2249 tsr2248   FALSE 0.343 32.000 0.000 NA   NA
 198973 198974     hisD ruvB FALSE 0.096 631.000 0.000 1.000 N NA
 198974 198975     ruvB ilvC FALSE 0.520 19.000 0.000 1.000 N NA
 198975 198976     ilvC tsl2255 FALSE 0.112 126.000 0.000 1.000   NA
 198977 198978 tlr2256     ycf61 TRUE 0.896 15.000 0.003 1.000   NA
 198978 198979   tlr2258 ycf61   TRUE 0.955 3.000 0.021 NA   NA
 198979 198980 tlr2258 tlr2259     FALSE 0.402 26.000 0.000 NA   NA
 198980 198981 tlr2259 tlr2260     TRUE 0.745 -3.000 0.000 1.000 N NA
 198981 198982 tlr2260 tlr2261     FALSE 0.101 236.000 0.000 1.000 N NA
 198982 198983 tlr2261 tlr2262     FALSE 0.174 48.000 0.000 NA   NA
 198983 198984 tlr2262 tlr2263     TRUE 0.955 7.000 0.050 NA   NA
 198985 198986     tll2264 tll2265 FALSE 0.099 90.000 0.000 NA   NA
 198986 2177454   rTEt37 tll2265 trnL_UAA FALSE 0.141 55.000 0.000 NA   NA
 2177454 198987 rTEt37   trnL_UAA tll2266 FALSE 0.188 46.000 0.000 NA   NA
 198987 198988     tll2266 tll2267 TRUE 0.710 2.000 0.000 1.000 N NA
 198988 198989     tll2267 pgk FALSE 0.097 411.000 0.000 1.000 N NA
 198990 198991 tlr2269 tlr2270     FALSE 0.120 113.000 0.000 1.000 N NA
 198991 198992 tlr2270 tlr2271     FALSE 0.077 228.000 0.000 NA   NA
 198995 198996     tll2274 tll2275 TRUE 0.600 10.000 0.000 1.000   NA
 198997 198998 tlr2276     tsr2277 FALSE 0.430 21.000 0.000 NA   NA
 198998 198999   tlr2278 tsr2277   FALSE 0.207 44.000 0.000 NA   NA
 198999 199000 tlr2278 tlr2279     FALSE 0.094 104.000 0.000 NA   NA
 199002 399850 tlr2281 rTEt38   trnY_GUA FALSE 0.103 72.000 0.000 NA   NA
 399850 199003 rTEt38   trnY_GUA tsr2282 FALSE 0.074 341.000 0.000 NA   NA
 199003 199004   tlr2283 tsr2282   FALSE 0.074 432.000 0.000 NA   NA
 199004 199005 tlr2283     tsr2284 TRUE 0.663 0.000 0.000 NA   NA
 199007 199008   tlr2287 trxM1   FALSE 0.077 234.000 0.000 NA   NA
 199010 199011 tlr2289 tlr2290     FALSE 0.128 81.000 0.000 1.000 N NA
 199012 199013     tll2291 tll2292 TRUE 0.749 -7.000 0.000 1.000   NA
 199013 199014     tll2292 tll2293 FALSE 0.435 20.000 0.000 NA   NA
 199014 199015     tll2293 dapF TRUE 0.558 8.000 0.000 NA   NA
 199017 199018     tll2296 tll2297 FALSE 0.111 67.000 0.000 NA   NA
 199019 199020 tlr2298 tlr2299     TRUE 0.982 -34.000 0.182 NA   NA
 199020 199021 tlr2299 tlr2300     TRUE 0.978 10.000 0.786 NA   NA
 199021 199022 tlr2300 tlr2301     TRUE 0.911 46.000 0.800 1.000   NA
 199022 199023 tlr2301 tlr2302     TRUE 0.883 51.000 0.667 1.000   NA
 199023 199024 tlr2302 tlr2303     FALSE 0.349 37.000 0.000 1.000   NA
 199024 199025 tlr2303 tlr2304     TRUE 0.684 136.000 0.133 1.000   NA
 199025 199026 tlr2304 tlr2305     FALSE 0.256 44.000 0.000 1.000   NA
 199027 199028     tll2306 tll2307 TRUE 0.751 -30.000 0.000 1.000   NA
 199028 199029     tll2307 tll2308 TRUE 0.751 -16.000 0.000 1.000   NA
 199031 199032     tll2310 cysM FALSE 0.153 62.000 0.000 1.000   NA
 399851 199033 rTEt39   trnS_CGA cysC1 FALSE 0.075 310.000 0.000 NA   NA
 199035 199036 tlr2314 tlr2315     TRUE 0.696 -13.000 0.000 NA   NA
 199036 199037 tlr2315 tlr2316     TRUE 0.707 491.000 0.050 0.065   NA
 199037 199038 tlr2316 tlr2317     TRUE 0.696 -15.000 0.000 NA   NA
 199038 199039 tlr2317 tlr2318     TRUE 0.547 9.000 0.000 NA   NA
 199040 199041     tsl2319 tll2320 TRUE 0.696 -15.000 0.000 NA   NA
 199041 199042     tll2320 tll2321 FALSE 0.100 277.000 0.000 1.000 N NA
 199043 199044 tlr2322     ycf55 FALSE 0.076 289.000 0.000 NA   NA
 199044 199045   tlr2324 ycf55   FALSE 0.076 250.000 0.000 NA   NA
 199045 199046 tlr2324 tlr2325     TRUE 0.721 0.000 0.000 1.000   NA
 199046 199047 tlr2325     purN TRUE 0.958 -19.000 0.003 1.000 N NA
 199052 199053     tsl2331 pyrA TRUE 0.692 -6.000 0.000 NA   NA
 199053 199054     pyrA tll2333 FALSE 0.094 105.000 0.000 NA   NA
 199054 199055     tll2333 pilin TRUE 0.957 12.000 0.150 NA   NA
 199055 199056     pilin tll2335 TRUE 0.980 -22.000 0.150 NA   NA
 199056 199057     tll2335 tll2336 TRUE 0.969 13.000 0.400 NA   NA
 199058 199059 tlr2337 tlr2338     FALSE 0.204 50.000 0.000 1.000   NA
 199061 199062 tlr2340     pilM FALSE 0.100 269.000 0.000 1.000 N NA
 199062 199063   tlr2342 pilM   TRUE 0.957 12.000 0.087 NA Y NA
 199063 199064 tlr2342 tlr2343     TRUE 0.988 -3.000 0.760 NA   NA
 199064 199065 tlr2343 tlr2344     TRUE 0.742 95.000 0.240 NA   NA
 199066 199067     chlN tll2346 TRUE 0.850 34.000 0.019 NA   NA
 199067 199068     tll2346 chlL TRUE 0.765 44.000 0.022 NA   NA
 199070 199071     dnaN tll2350 FALSE 0.124 80.000 0.000 1.000   NA
 199071 199072     tll2350 tll2351 FALSE 0.141 67.000 0.000 1.000   NA
 199072 199073     tll2351 tll2352 TRUE 0.739 -3.000 0.000 1.000   NA
 199073 199074     tll2352 tll2353 FALSE 0.225 47.000 0.000 1.000   NA
 199075 199076 tlr2354 tlr2355     TRUE 0.773 -3.000 0.000 NA Y NA
 199076 199077 tlr2355     tsr2356 FALSE 0.096 332.000 0.000 1.000   NA
 199078 399854   rTEt40 aspC trnE_UUC FALSE 0.098 96.000 0.000 NA   NA
 199082 199083     tll2361 tll2362 FALSE 0.072 1115.000 0.000 NA   NA
 199083 199084     tll2362 tll2363 TRUE 0.583 6.000 0.000 NA   NA
 199084 199085     tll2363 tll2364 FALSE 0.491 23.000 0.000 1.000   NA
 199085 199086     tll2364 apcE FALSE 0.098 238.000 0.000 1.000   NA
 199086 199087     apcE tll2366 FALSE 0.099 227.000 0.000 1.000   NA
 199087 199088     tll2366 tll2367 TRUE 0.663 0.000 0.000 NA   NA
 199092