MicrobesOnline Operon Predictions for Caulobacter crescentus CB15

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 96831 96832 CC0001 CC0002     TRUE 0.935 -3.000 0.135 NA   NA
 96832 96833 CC0002 CC0003     TRUE 0.951 -3.000 0.169 NA N NA
 96833 96834 CC0003 CC0004     TRUE 0.784 -67.000 0.078 1.000 N NA
 96834 96835 CC0004 CC0005     TRUE 0.692 32.000 0.092 1.000 N NA
 96835 96836 CC0005 CC0006     FALSE 0.179 119.000 0.000 1.000 N NA
 96836 96837 CC0006 CC0007     FALSE 0.199 150.000 0.016 1.000 N NA
 96837 96838 CC0007 CC0008     FALSE 0.003 401.000 0.000 1.000 N NA
 96840 96841 CC0010 CC0011     TRUE 0.827 163.000 0.236 0.003 Y NA
 96841 96842 CC0011 CC0012     FALSE 0.181 87.000 0.003 1.000 N NA
 96842 96843 CC0012 CC0013     TRUE 0.602 21.000 0.021 1.000 N NA
 96844 96845 CC0014 CC0015     TRUE 0.963 -87.000 0.109 0.003 Y NA
 96845 96846 CC0015 CC0016     TRUE 0.978 1.000 0.018 0.003 Y NA
 96846 96847 CC0016 CC0017     TRUE 0.996 -3.000 0.501 0.003 Y NA
 96847 96848 CC0017 CC0018     TRUE 0.972 4.000 0.010 0.003 Y NA
 96850 96851 CC0020 CC0021     FALSE 0.227 172.000 0.100 NA   NA
 96851 96852 CC0021 CC0022     TRUE 0.990 -3.000 0.150 0.064 Y NA
 96852 96853 CC0022 CC0023     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 96855 96856 CC0025 CC0026     TRUE 0.738 58.000 0.400 1.000 N NA
 96856 96857 CC0026 CC_0027     FALSE 0.460 99.000 0.073 1.000   NA
 96857 96858 CC_0027 CC0028     FALSE 0.456 152.000 0.163 1.000   NA
 96859 96860 CC0029 CC0030     FALSE 0.329 49.000 0.018 1.000 N NA
 96861 96862 CC0031 CC0032     TRUE 0.978 1.000 0.750 NA   NA
 96862 96863 CC0032 CC0033     FALSE 0.077 109.000 0.000 NA   NA
 96863 96864 CC0033 CC0034     FALSE 0.039 157.000 0.000 NA   NA
 96864 96865 CC0034 CC0035     FALSE 0.383 249.000 0.335 1.000 Y NA
 96865 96866 CC0035 CC0036     TRUE 0.968 15.000 0.211 1.000 Y NA
 96866 96867 CC0036 CC0037     TRUE 0.988 3.000 0.318 1.000 Y NA
 96867 96868 CC0037 CC0038     FALSE 0.220 101.000 0.004 1.000 N NA
 96868 96869 CC0038 CC0039     FALSE 0.458 60.000 0.105 NA   NA
 96869 96870 CC0039 CC0040     TRUE 0.981 0.000 0.750 NA   NA
 96870 96871 CC0040 CC0041     FALSE 0.112 39.000 0.000 NA   NA
 96871 96872 CC0041 CC0042     FALSE 0.070 56.000 0.000 NA   NA
 96872 96873 CC0042 CC0043     FALSE 0.249 195.000 0.223 NA N NA
 96873 96874 CC0043 CC0044     TRUE 0.753 79.000 0.075 NA Y NA
 96874 96875 CC0044 CC0045     TRUE 0.977 3.000 0.759 NA   NA
 96875 96876 CC0045 CC0046     FALSE 0.481 0.000 0.000 NA   NA
 96877 96878 CC0047 CC0048     FALSE 0.255 16.000 0.000 NA   NA
 96879 96880 CC0049 CC0050     TRUE 0.820 -45.000 0.112 1.000   NA
 96880 96881 CC0050 CC0051     FALSE 0.371 120.000 0.028 1.000 N NA
 96881 96882 CC0051 CC0052     TRUE 0.536 34.000 0.037 1.000 N NA
 96882 96883 CC0052 CC0053     TRUE 0.952 -3.000 0.213 NA   NA
 96883 96884 CC0053 CC0054     TRUE 0.919 9.000 0.222 NA   NA
 96884 96885 CC0054 CC0055     TRUE 0.905 20.000 0.457 NA   NA
 96885 10938632 CC0055 CC_0056     FALSE 0.236 18.000 0.000 NA   NA
 10938632 96886 CC_0056 CC0057     FALSE 0.015 190.000 0.000 NA   NA
 96886 96887 CC0057 CC0058     FALSE 0.469 46.000 0.061 1.000   NA
 96887 96888 CC0058 CC0059     TRUE 0.923 9.000 0.209 1.000   NA
 96888 96889 CC0059 CC0060     TRUE 0.532 4.000 0.003 NA   NA
 96889 96890 CC0060 CC0061     FALSE 0.354 148.000 0.091 NA   NA
 96890 96891 CC0061 CC0062     FALSE 0.224 70.000 0.011 1.000 N NA
 96893 96894 CC0064 CC0065     FALSE 0.243 168.000 0.078 1.000   NA
 96894 96895 CC0065 CC0066     FALSE 0.073 150.000 0.000 1.000   NA
 96895 96896 CC0066 CC0067     FALSE 0.033 162.000 0.000 NA   NA
 96896 96897 CC0067 CC0068     FALSE 0.059 70.000 0.000 NA   NA
 96897 96898 CC0068 CC0069     TRUE 0.823 5.000 0.049 NA   NA
 96898 96899 CC0069 CC0070     TRUE 0.905 20.000 0.456 NA   NA
 96899 96900 CC0070 CC0071     TRUE 0.839 12.000 0.070 1.000 N NA
 96903 96904 CC0074 CC0075     TRUE 0.971 -3.000 0.408 NA   NA
 96904 399442 CC0075 CC_t01   tRNA-Thr-3 FALSE 0.101 42.000 0.000 NA   NA
 96905 96906 CC0076 CC0077     TRUE 0.928 97.000 0.562 1.000 Y NA
 96906 96907 CC0077 CC0078     FALSE 0.205 67.000 0.022 NA   NA
 96907 96908 CC0078 CC0079     TRUE 0.931 -3.000 0.118 NA   NA
 96908 96909 CC0079 CC0080     TRUE 0.986 3.000 0.103 0.008 Y NA
 96909 96910 CC0080 CC0081     FALSE 0.391 88.000 0.046 1.000 N NA
 96912 96913 CC0083 CC0084     FALSE 0.005 250.000 0.000 NA   NA
 96913 96914 CC0084 CC0085     FALSE 0.108 163.000 0.005 1.000 N NA
 96915 96916 CC0086 CC0087     TRUE 0.592 13.000 0.004 1.000 N NA
 96917 96918 CC0088 CC0089     FALSE 0.002 338.000 0.000 NA   NA
 96920 96921 CC0091 CC0092     FALSE 0.139 65.000 0.000 1.000 N NA
 96921 96922 CC0092 CC0093     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA N NA
 96922 96923 CC0093 CC0094     TRUE 0.918 -3.000 0.077 NA N NA
 96923 96924 CC0094 CC0095     FALSE 0.004 381.000 0.000 1.000 N NA
 96924 96925 CC0095 CC0096     FALSE 0.269 74.000 0.019 1.000 N NA
 96926 96927 CC0097 CC0098     FALSE 0.072 54.000 0.000 NA   NA
 96927 96928 CC0098 CC0099     FALSE 0.056 139.000 0.000 NA   NA
 96929 96930 CC0100 CC0101     TRUE 0.757 10.000 0.042 NA   NA
 96930 96931 CC0101 CC0102     FALSE 0.278 86.000 0.018 1.000 N NA
 96932 96933 CC0103 CC0104     FALSE 0.127 34.000 0.000 NA   NA
 96935 96936 CC0106 CC0107     FALSE 0.181 84.000 0.008 NA N NA
 96937 96938 CC0108 CC0109     TRUE 0.890 10.000 0.148 NA   NA
 96938 96939 CC0109 CC0110     TRUE 0.886 16.000 0.222 1.000   NA
 96939 96940 CC0110 CC0111     TRUE 0.644 110.000 0.245 NA   NA
 96941 96942 CC0112 CC0113     FALSE 0.403 5.000 0.000 NA   NA
 96942 96943 CC0113 CC0114     FALSE 0.062 80.000 0.000 NA   NA
 96943 96944 CC0114 CC0115     TRUE 0.926 -12.000 0.286 NA   NA
 96944 96945 CC0115 CC0116     FALSE 0.117 126.000 0.000 1.000   NA
 96947 96948 CC0118 CC0119     TRUE 0.547 11.000 0.000 1.000 N NA
 96948 96949 CC0119 CC0120     FALSE 0.338 -12.000 0.000 NA   NA
 96949 96950 CC0120 CC0121     FALSE 0.064 60.000 0.000 NA   NA
 96951 96952 CC0122 CC0123     TRUE 0.765 9.000 0.040 NA   NA
 96954 96955 CC0125 CC0126     TRUE 0.732 27.000 0.138 NA   NA
 96955 96956 CC0126 CC0127     TRUE 0.768 7.000 0.037 NA   NA
 96958 96959 CC0129 CC0130     FALSE 0.107 83.000 0.004 NA   NA
 96959 96960 CC0130 CC0131     FALSE 0.418 4.000 0.000 NA   NA
 96961 96962 CC0132 CC0133     FALSE 0.070 92.000 0.000 NA   NA
 96962 96963 CC0133 CC0134     FALSE 0.010 247.000 0.000 1.000   NA
 96963 96964 CC0134 CC0135     FALSE 0.158 95.000 0.003 1.000   NA
 96964 96965 CC0135 CC0136     TRUE 0.775 140.000 0.750 1.000   NA
 96966 96967 CC0137 CC0138     TRUE 0.889 34.000 0.750 NA   NA
 96969 96970 CC0140 CC0141     FALSE 0.288 109.000 0.013 1.000 N NA
 96970 96971 CC0141 CC0142     FALSE 0.250 56.000 0.018 1.000   NA
 96971 96972 CC0142 CC0143     TRUE 0.699 2.000 0.006 1.000   NA
 96972 96973 CC0143 CC0144     TRUE 0.945 0.000 0.165 1.000   NA
 96973 96974 CC0144 CC0145     FALSE 0.287 35.000 0.006 1.000   NA
 96974 96975 CC0145 CC0146     TRUE 0.936 -7.000 0.218 1.000 N NA
 96976 96977 CC0147 CC0148     FALSE 0.436 144.000 0.133 NA   NA
 96980 96981 CC0151 CC0152     FALSE 0.195 128.000 0.003 1.000 N NA
 96982 96983 CC0153 CC0154     TRUE 0.626 43.000 0.120 NA N NA
 96985 96986 CC0156 CC0157     FALSE 0.162 55.000 0.000 1.000 N NA
 96986 96987 CC0157 CC0158     FALSE 0.410 -28.000 0.000 NA N NA
 96987 96988 CC0158 CC0159     FALSE 0.014 228.000 0.000 NA N NA
 96988 96989 CC0159 CC0160     TRUE 0.934 45.000 0.249 0.004 Y NA
 96989 96990 CC0160 CC0161     FALSE 0.087 141.000 0.000 1.000   NA
 96990 96991 CC0161 CC0162     FALSE 0.001 425.000 0.000 NA   NA
 96991 96992 CC0162 CC0163     TRUE 0.897 -33.000 0.286 NA   NA
 96992 96993 CC0163 CC0164     TRUE 0.722 47.000 0.300 1.000   NA
 96993 96994 CC0164 CC0165     TRUE 0.966 -10.000 0.100 NA Y NA
 96995 96996 CC0166 CC0167     FALSE 0.002 357.000 0.000 NA   NA
 96997 96998 CC0168 CC0169     TRUE 0.676 121.000 0.250 1.000   NA
 96998 96999 CC0169 CC0170     FALSE 0.001 578.000 0.000 1.000   NA
 96999 97000 CC0170 CC0171     TRUE 0.689 80.000 0.373 1.000   NA
 97000 97001 CC0171 CC0172     FALSE 0.003 289.000 0.000 NA   NA
 97001 97002 CC0172 CC0173     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 97002 97003 CC0173 CC0174     TRUE 0.997 -3.000 0.776 0.004 Y NA
 97003 97004 CC0174 CC0175     TRUE 0.993 -13.000 0.653 0.004 Y NA
 97004 97005 CC0175 CC0176     TRUE 0.991 12.000 0.599 0.004 Y NA
 97005 97006 CC0176 CC0177     TRUE 0.812 59.000 0.425 0.004   NA
 97006 97007 CC0177 CC0178     TRUE 0.973 -19.000 0.605 0.004   NA
 97007 97008 CC0178 CC0179     TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.004 Y NA
 97008 97009 CC0179 CC0180     TRUE 0.993 -3.000 0.461 1.000 Y NA
 97009 97010 CC0180 CC0181     TRUE 0.990 -18.000 0.537 0.059 Y NA
 97010 97011 CC0181 CC0182     TRUE 0.995 -3.000 0.811 1.000 Y NA
 97011 97012 CC0182 CC0183     TRUE 0.981 -3.000 0.649 1.000   NA
 97013 97014 CC0184 CC0185     FALSE 0.021 226.000 0.000 1.000 N NA
 97014 399492 CC0185 CC_t02   tRNA-Arg-2 FALSE 0.001 444.000 0.000 NA   NA
 399492 97015 CC_t02 CC0186 tRNA-Arg-2   FALSE 0.064 85.000 0.000 NA   NA
 97015 97016 CC0186 CC0187     TRUE 0.932 -3.000 0.125 NA   NA
 97016 97017 CC0187 CC0188     FALSE 0.367 40.000 0.019 NA N NA
 97018 97019 CC0189 CC0190     TRUE 0.752 -22.000 0.055 NA   NA
 97019 97020 CC0190 CC0191     FALSE 0.106 63.000 0.000 NA N NA
 97021 97022 CC0192 CC0193     FALSE 0.053 196.000 0.007 1.000 N NA
 97022 97023 CC0193 CC0194     TRUE 0.881 2.000 0.015 0.044   NA
 97023 97024 CC0194 CC0195     TRUE 0.566 142.000 0.231 1.000   NA
 97024 97025 CC0195 CC0196     TRUE 0.987 -3.000 0.054 0.001 Y NA
 97025 97026 CC0196 CC0197     FALSE 0.003 590.000 0.008 1.000 N NA
 97026 97027 CC0197 CC0198     TRUE 0.992 3.000 0.567 1.000 Y NA
 97030 97031 CC0201 CC0202     TRUE 0.789 0.000 0.007 1.000 N NA
 97031 97032 CC0202 CC0203     TRUE 0.851 19.000 0.000 NA Y NA
 97033 97034 CC0204 CC0205     TRUE 0.977 4.000 0.750 1.000   NA
 97035 97036 CC0206 CC0207     TRUE 0.997 0.000 0.800 0.002 Y NA
 97037 97038 CC0208 CC0209     FALSE 0.062 81.000 0.000 NA   NA
 97039 97040 CC0210 CC0211     FALSE 0.440 55.000 0.057 1.000 N NA
 97040 97041 CC0211 CC0212     TRUE 0.945 0.000 0.158 1.000   NA
 97041 97042 CC0212 CC0213     TRUE 0.800 -3.000 0.014 1.000   NA
 97042 97043 CC0213 CC0214     FALSE 0.159 128.000 0.000 1.000 N NA
 97043 97044 CC0214 CC0215     FALSE 0.030 247.000 0.034 NA   NA
 97044 97045 CC0215 CC0216     FALSE 0.062 81.000 0.000 NA   NA
 97045 97046 CC0216 CC0217     FALSE 0.013 198.000 0.000 NA   NA
 97048 97049 CC0219 CC0220     FALSE 0.148 29.000 0.000 NA   NA
 97051 97052 CC0222 CC0223     FALSE 0.480 9.000 0.000 1.000   NA
 97054 97055 CC0225 CC0226     FALSE 0.289 -22.000 0.000 NA   NA
 97056 97057 CC0227 CC0228     TRUE 0.620 0.000 0.004 NA   NA
 97062 97063 CC0233 CC0234     TRUE 0.983 -51.000 0.678 1.000 Y NA
 97064 97065 CC0235 CC0236     FALSE 0.062 63.000 0.000 NA   NA
 97066 97067 CC0237 CC0238     TRUE 0.988 -25.000 0.829 1.000 Y NA
 97067 97068 CC0238 CC0239     TRUE 0.979 -3.000 0.304 0.022   NA
 97068 97069 CC0239 CC0240     TRUE 0.675 40.000 0.145 1.000   NA
 97069 97070 CC0240 CC0241     TRUE 0.995 -3.000 0.420 0.003 Y NA
 97071 97072 CC0242 CC0243     TRUE 0.804 68.000 1.000 NA   NA
 97073 97074 CC0244 CC0245     FALSE 0.422 29.000 0.016 1.000   NA
 97074 97075 CC0245 CC0246     FALSE 0.315 45.000 0.012 1.000 N NA
 97076 97077 CC0247 CC0248     TRUE 0.913 78.000 0.560 1.000 Y NA
 97078 97079 CC0249 CC0250     TRUE 0.605 60.000 0.250 NA   NA
 97079 97080 CC0250 CC0251     FALSE 0.197 49.000 0.011 NA   NA
 97082 97083 CC0253 CC0254     FALSE 0.146 137.000 0.011 NA   NA
 97084 97085 CC0255 CC0256     TRUE 0.863 19.000 0.179 1.000 N NA
 97085 97086 CC0256 CC0257     TRUE 0.678 119.000 0.004 1.000 Y NA
 97086 97087 CC0257 CC0258     FALSE 0.002 343.000 0.000 NA   NA
 97087 97088 CC0258 CC0259     FALSE 0.005 252.000 0.000 NA   NA
 97089 97090 CC0260 CC0261     FALSE 0.096 183.000 0.022 1.000 N NA
 97091 97092 CC0262 CC0263     FALSE 0.092 222.000 0.100 NA   NA
 97094 97095 CC0265 CC0266     FALSE 0.167 94.000 0.000 1.000 N NA
 97096 97097 CC0267 CC0268     FALSE 0.504 167.000 0.411 NA   NA
 97097 97098 CC0268 CC0269     FALSE 0.146 271.000 0.604 NA   NA
 97098 97099 CC0269 CC0270     FALSE 0.107 110.000 0.002 NA   NA
 97099 97100 CC0270 CC0271     FALSE 0.125 54.000 0.004 NA   NA
 97100 97101 CC0271 CC0272     TRUE 0.836 9.000 0.074 NA   NA
 97102 97103 CC0273 CC0274     FALSE 0.069 90.000 0.000 NA   NA
 97104 97105 CC0275 CC0276     TRUE 0.886 18.000 0.005 1.000 Y NA
 97105 97106 CC0276 CC0277     FALSE 0.255 52.000 0.016 1.000   NA
 97107 97108 CC0278 CC0279     TRUE 0.978 0.000 0.069 1.000 Y NA
 97110 97111 CC0281 CC0282     TRUE 0.867 6.000 0.071 1.000   NA
 97111 97112 CC0282 CC0283     TRUE 0.909 -3.000 0.069 1.000   NA
 97112 97113 CC0283 CC0284     FALSE 0.035 193.000 0.000 1.000 N NA
 97113 97114 CC0284 CC_0285   lovK TRUE 0.911 19.000 0.000 0.033 Y NA
 97114 97115 CC_0285 CC0286 lovK   FALSE 0.072 167.000 0.000 1.000 N NA
 97115 97116 CC0286 CC0287     FALSE 0.265 15.000 0.000 NA   NA
 97116 97117 CC0287 CC0288     FALSE 0.005 251.000 0.000 NA   NA
 97118 97119 CC0289 CC0290     FALSE 0.199 145.000 0.012 1.000 N NA
 97119 97120 CC0290 CC0291     TRUE 0.993 -7.000 0.485 0.001 Y NA
 97120 97121 CC0291 CC0292     TRUE 0.936 60.000 0.402 0.001 Y NA
 97121 97122 CC0292 CC0293     TRUE 0.937 26.000 0.203 NA Y NA
 97122 97123 CC0293 CC0294     TRUE 0.791 22.000 0.128 NA N NA
 97124 97125 CC0295 CC0296     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 97128 97129 CC0299 CC0300     TRUE 0.867 8.000 0.080 1.000   NA
 97130 97131 CC0301 CC0302     TRUE 0.968 -3.000 0.017 1.000 Y NA
 97131 97132 CC0302 CC0303     TRUE 0.972 -3.000 0.333 1.000 N NA
 97132 97133 CC0303 CC0304     TRUE 0.767 -28.000 0.066 NA   NA
 97133 97134 CC0304 CC0305     TRUE 0.780 -3.000 0.017 NA   NA
 97136 97137 CC0307 CC0308     TRUE 0.874 30.000 0.515 NA   NA
 97137 97138 CC0308 CC0309     TRUE 0.947 -3.000 0.182 NA   NA
 97138 97139 CC0309 CC0310     FALSE 0.213 56.000 0.018 NA   NA
 97139 97140 CC0310 CC0311     FALSE 0.188 85.000 0.016 NA   NA
 97140 97141 CC0311 CC0312     TRUE 0.792 1.000 0.027 NA   NA
 97141 97142 CC0312 CC0313     FALSE 0.288 26.000 0.006 NA   NA
 97142 97143 CC0313 CC0314     FALSE 0.392 24.000 0.006 NA N NA
 97143 97144 CC0314 CC0315     TRUE 0.923 -3.000 0.087 1.000   NA
 97146 97147 CC0317 CC0318     FALSE 0.324 183.000 0.011 1.000 Y NA
 97147 97148 CC0318 CC0319     TRUE 0.979 31.000 0.667 0.016 Y NA
 97149 97150 CC0320 CC0321     TRUE 0.808 43.000 0.500 NA   NA
 97154 97155 CC0325 CC0326     TRUE 0.542 13.000 0.006 1.000   NA
 97157 97158 CC0328 CC0329     TRUE 0.996 3.000 0.660 0.001 Y NA
 97160 97161 CC0331 CC0332     FALSE 0.452 38.000 0.043 NA   NA
 97161 97162 CC0332 CC0333     TRUE 0.894 11.000 0.182 NA   NA
 97162 97163 CC0333 CC0334     TRUE 0.797 15.000 0.091 NA   NA
 97163 97164 CC0334 CC0335     TRUE 0.798 -60.000 0.103 1.000   NA
 97164 97165 CC0335 CC0336     TRUE 0.737 69.000 0.276 0.050 N NA
 97165 97166 CC0336 CC0337     FALSE 0.005 330.000 0.000 1.000 N NA
 97166 97167 CC0337 CC0338     TRUE 0.993 1.000 0.256 0.001 Y NA
 97167 97168 CC0338 CC_0339   kgd TRUE 0.518 179.000 0.092 1.000 Y NA
 97168 97169 CC_0339 CC0340 kgd   TRUE 0.926 60.000 0.667 1.000 Y NA
 97172 97173 CC0343 CC0344     FALSE 0.079 174.000 0.005 1.000 N NA
 97173 97174 CC0344 CC0345     TRUE 0.917 -3.000 0.093 NA   NA
 97177 97178 CC0348 CC0349     TRUE 0.907 -19.000 0.250 NA   NA
 97178 97179 CC0349 CC0350     FALSE 0.026 171.000 0.000 NA   NA
 97179 97180 CC0350 CC0351     FALSE 0.059 71.000 0.000 NA   NA
 97180 97181 CC0351 CC0352     TRUE 0.701 109.000 0.333 NA   NA
 97182 97183 CC0353 CC0354     FALSE 0.278 -28.000 0.000 NA   NA
 97185 97186 CC0356 CC0357     FALSE 0.289 52.000 0.032 NA   NA
 97186 97187 CC0357 CC0358     FALSE 0.467 31.000 0.016 1.000 N NA
 97187 97188 CC0358 CC0359     FALSE 0.255 79.000 0.015 1.000 N NA
 97188 97189 CC0359 CC0360     TRUE 0.529 114.000 0.081 1.000 N NA
 97190 97191 CC0361 CC0362     TRUE 0.987 -3.000 0.059 0.001 Y NA
 97191 97192 CC0362 CC0363     TRUE 0.977 6.000 0.038 0.001 Y NA
 97192 97193 CC0363 CC0364     FALSE 0.045 150.000 0.000 NA   NA
 97194 97195 CC0365 CC0366     TRUE 0.994 11.000 0.863 0.004 Y NA
 97195 97196 CC0366 CC0367     TRUE 0.776 127.000 0.278 0.004   NA
 97196 97197 CC0367 CC0368     TRUE 0.875 50.000 0.628 0.004   NA
 97197 97198 CC0368 CC0369     TRUE 0.921 6.000 0.195 NA   NA
 97199 97200 CC0370 CC0371     FALSE 0.071 55.000 0.000 NA   NA
 97200 97201 CC0371 CC0372     FALSE 0.242 44.000 0.014 NA   NA
 97202 97203 CC0373 CC0374     FALSE 0.399 22.000 0.004 NA N NA
 97203 97204 CC0374 CC0375     TRUE 0.994 0.000 0.750 NA Y NA
 97204 97205 CC0375 CC0376     FALSE 0.028 239.000 0.025 NA   NA
 97207 97208 CC0378 CC0379     TRUE 0.710 139.000 0.048 1.000 Y NA
 97209 97210 CC0380 CC0381     FALSE 0.132 48.000 0.000 1.000   NA
 97213 97214 CC0384 CC0385     FALSE 0.046 149.000 0.000 NA   NA
 97215 97216 CC0386 CC0387     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 97216 97217 CC0387 CC0388     FALSE 0.062 81.000 0.000 NA   NA
 97218 97219 CC0389 CC0390     TRUE 0.944 -3.000 0.167 NA   NA
 97224 97225 CC0395 CC0396     FALSE 0.400 45.000 0.039 1.000   NA
 97225 97226 CC0396 CC0397     TRUE 0.956 -3.000 0.172 1.000 N NA
 97226 97227 CC0397 CC0398     FALSE 0.032 457.000 0.000 0.088 Y NA
 97227 97228 CC0398 CC0399     TRUE 0.958 0.000 0.286 NA   NA
 97228 97229 CC0399 CC0400     TRUE 0.892 -3.000 0.062 NA   NA
 97233 97234 CC0404 CC0405     FALSE 0.062 63.000 0.000 NA   NA
 97234 97235 CC0405 CC0406     TRUE 0.601 33.000 0.080 NA   NA
 97235 97236 CC0406 CC0407     TRUE 0.967 -3.000 0.346 NA   NA
 97236 97237 CC0407 CC0408     TRUE 0.631 105.000 0.163 1.000 N NA
 97237 97238 CC0408 CC0409     TRUE 0.730 6.000 0.009 1.000 N NA
 97239 97240 CC0410 CC0411     FALSE 0.231 102.000 0.019 NA   NA
 97240 97241 CC0411 CC0412     TRUE 0.770 4.000 0.028 NA   NA
 97242 97243 CC0413 CC0414     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 97244 97245 CC0415 CC0416     TRUE 0.786 -3.000 0.018 NA   NA
 97245 97246 CC0416 CC0417     FALSE 0.456 107.000 0.055 1.000 N NA
 97247 97248 CC0418 CC0419     FALSE 0.015 247.000 0.000 1.000 N NA
 97250 97251 CC0421 CC0422     FALSE 0.059 69.000 0.000 NA   NA
 97251 97252 CC0422 CC0423     TRUE 0.968 0.000 0.400 NA   NA
 97254 97255 CC0425 CC0426     FALSE 0.476 102.000 0.095 NA   NA
 97255 97256 CC0426 CC0427     TRUE 0.549 110.000 0.095 1.000 N NA
 97256 97257 CC0427 CC0428     FALSE 0.032 199.000 0.000 1.000 N NA
 97259 97260 CC0430 CC0431     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA Y NA
 97260 97261 CC0431 CC0432     TRUE 0.987 -3.000 0.200 NA Y NA
 97261 97262 CC0432 CC0433     TRUE 0.923 70.000 0.711 1.000 Y NA
 97262 97263 CC0433 CC0434     TRUE 0.988 4.000 0.156 0.012 Y NA
 97263 97264 CC0434 CC0435     TRUE 0.983 0.000 0.109 1.000 Y NA
 97264 97265 CC0435 CC0436     TRUE 0.992 0.000 0.439 1.000 Y NA
 97265 97266 CC0436 CC0437     TRUE 0.990 4.000 0.258 0.028 Y NA
 97266 97267 CC0437 CC0438     TRUE 0.991 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 97267 97268 CC0438 CC0439     TRUE 0.851 4.000 0.060 NA   NA
 97268 97269 CC0439 CC0440     TRUE 0.974 8.000 1.000 NA   NA
 97269 97270 CC0440 CC0441     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 97270 97271 CC0441 CC0442     FALSE 0.004 270.000 0.000 NA   NA
 97272 97273 CC0443 CC0444     TRUE 0.702 0.000 0.000 1.000 N NA
 97273 97274 CC0444 CC0445     FALSE 0.306 29.000 0.000 1.000 N NA
 97275 97276 CC0446 CC0447     FALSE 0.486 158.000 0.250 1.000   NA
 97276 97277 CC0447 CC0448     TRUE 0.957 14.000 0.100 1.000 Y NA
 97277 97278 CC0448 CC0449     TRUE 0.994 -3.000 0.258 0.003 Y NA
 97278 97279 CC0449 CC0450     FALSE 0.339 127.000 0.000 0.057 N NA
 399491 97280 CC_t03 CC0451 tRNA-Ser-4   FALSE 0.011 205.000 0.000 NA   NA
 97280 97281 CC0451 CC0452     TRUE 0.774 93.000 0.600 NA   NA
 97281 97282 CC0452 CC0453     FALSE 0.043 168.000 0.003 NA   NA
 97283 97284 CC0454 CC0455     FALSE 0.373 187.000 0.035 1.000 Y NA
 97285 97286 CC0456 CC0457     TRUE 0.922 -13.000 0.003 1.000 Y NA
 97289 97290 CC0460 CC0461     TRUE 0.573 3.000 0.004 NA   NA
 97290 97291 CC0461 CC0462     TRUE 0.560 7.000 0.006 NA   NA
 97291 97292 CC0462 CC0463     FALSE 0.319 53.000 0.041 NA   NA
 97292 97293 CC0463 CC0464     TRUE 0.802 -3.000 0.021 NA   NA
 97293 97294 CC0464 CC0465     TRUE 0.895 0.000 0.014 0.042   NA
 97295 97296 CC0466 CC0467     TRUE 0.896 -3.000 0.067 NA   NA
 97296 97297 CC0467 CC0468     TRUE 0.959 -3.000 0.200 1.000 N NA
 97298 97299 CC0469 CC0470     TRUE 0.570 57.000 0.184 NA   NA
 97301 97302 CC0472 CC0473     TRUE 0.980 6.000 0.058 0.001 Y NA
 97302 97303 CC0473 CC0474     TRUE 0.995 6.000 0.630 0.001 Y NA
 97304 97305 CC0475 CC0476     FALSE 0.059 66.000 0.000 NA   NA
 97305 97306 CC0476 CC0477     TRUE 0.643 -3.000 0.000 NA N NA
 97306 97307 CC0477 CC0478     TRUE 0.996 0.000 0.600 0.002 Y NA
 97307 97308 CC0478 CC0479     FALSE 0.161 65.000 0.002 1.000 N NA
 97308 97309 CC0479 CC0480     FALSE 0.075 125.000 0.000 NA   NA
 97310 97311 CC0481 CC0482     FALSE 0.001 416.000 0.000 NA   NA
 97312 97313 CC0483 CC0484     TRUE 0.635 3.000 0.003 1.000   NA
 97313 97314 CC0484 CC0485     TRUE 0.938 88.000 0.496 0.025 Y NA
 97314 97315 CC0485 CC0486     FALSE 0.061 158.000 0.004 NA   NA
 97315 97316 CC0486 CC0487     FALSE 0.028 231.000 0.018 NA   NA
 97316 97317 CC0487 CC0488     FALSE 0.087 141.000 0.000 1.000   NA
 97317 97318 CC0488 CC0489     TRUE 0.948 -19.000 0.533 NA   NA
 97318 97319 CC0489 CC0490     FALSE 0.083 48.000 0.000 NA   NA
 97319 97320 CC0490 CC0491     TRUE 0.926 -3.000 0.107 NA   NA
 97320 97321 CC0491 CC0492     TRUE 0.894 -13.000 0.170 NA   NA
 97322 97323 CC0493 CC0494     FALSE 0.323 181.000 0.308 NA   NA
 97323 97324 CC0494 CC0495     FALSE 0.372 69.000 0.062 1.000   NA
 97324 97325 CC0495 CC0496     FALSE 0.003 350.000 0.000 1.000   NA
 97325 97326 CC0496 CC0497     TRUE 0.970 46.000 0.884 0.016 Y NA
 97326 97327 CC0497 CC0498     FALSE 0.001 424.000 0.000 NA   NA
 97329 97330 CC0500 CC0501     FALSE 0.061 76.000 0.000 NA   NA
 97330 97331 CC0501 CC0502     FALSE 0.003 294.000 0.000 NA   NA
 97331 97332 CC0502 CC0503     TRUE 0.907 114.000 0.851 0.001   NA
 97332 97333 CC0503 CC0504     FALSE 0.115 147.000 0.000 1.000 N NA
 97334 97335 CC0505 CC0506     FALSE 0.014 195.000 0.000 NA   NA
 97337 97338 CC0508 CC0509     FALSE 0.281 49.000 0.026 NA   NA
 97339 97340 CC0510 CC0511     TRUE 0.715 71.000 0.044 1.000 Y NA
 97340 97341 CC0511 CC0512     TRUE 0.526 37.000 0.062 NA   NA
 97341 97342 CC0512 CC0513     FALSE 0.020 178.000 0.000 NA   NA
 97342 97343 CC0513 CC0514     FALSE 0.256 25.000 0.000 1.000   NA
 97343 97344 CC0514 CC0515     TRUE 0.919 -6.000 0.077 0.056   NA
 97344 97345 CC0515 CC0516     FALSE 0.403 -84.000 0.000 1.000 N NA
 97346 97347 CC0517 CC0518     FALSE 0.005 256.000 0.000 NA   NA
 97347 97348 CC0518 CC0519     TRUE 0.851 6.000 0.071 NA   NA
 97349 97350 CC0520 CC0521     FALSE 0.292 73.000 0.036 1.000   NA
 97350 97351 CC0521 CC0522     TRUE 0.701 85.000 0.333 1.000 N NA
 97352 97353 CC0523 CC0524     TRUE 0.756 -3.000 0.014 NA   NA
 97353 97354 CC0524 CC0525     TRUE 0.752 128.000 0.509 NA   NA
 97355 97356 CC0526 CC0527     TRUE 0.818 -3.000 0.026 NA   NA
 97356 97357 CC0527 CC0528     TRUE 0.927 -3.000 0.108 NA   NA
 97357 97358 CC0528 CC0529     TRUE 0.658 -3.000 0.005 NA   NA
 97358 97359 CC0529 CC0530     TRUE 0.841 10.000 0.082 NA   NA
 97361 97362 CC0532 CC0533     FALSE 0.381 123.000 0.000 0.035 N NA
 97362 97363 CC0533 CC0534     TRUE 0.989 -28.000 1.000 1.000 Y NA
 97363 97364 CC0534 CC0535     TRUE 0.986 0.000 1.000 1.000 N NA
 97364 97365 CC0535 CC0536     TRUE 0.912 38.000 1.000 1.000 N NA
 97366 97367 CC0537 CC0538     TRUE 0.994 -3.000 0.258 0.003 Y NA
 97367 97368 CC0538 CC0539     FALSE 0.010 247.000 0.000 1.000   NA
 97368 97369 CC0539 CC0540     FALSE 0.497 140.000 0.167 NA   NA
 97369 97370 CC0540 CC0541     TRUE 0.966 -3.000 0.333 NA   NA
 97370 97371 CC0541 CC0542     TRUE 0.841 9.000 0.077 NA   NA
 97371 97372 CC0542 CC0543     FALSE 0.507 43.000 0.077 NA   NA
 97373 97374 CC0544 CC0545     FALSE 0.205 -90.000 0.000 NA   NA
 97375 97376 CC0546 CC0547     FALSE 0.028 168.000 0.000 NA   NA
 97378 97379 CC0549 CC0550     FALSE 0.066 88.000 0.000 NA   NA
 97381 10938633 CC0552 CC_0553     FALSE 0.023 174.000 0.000 NA   NA
 97382 97383 CC0554 CC0555     FALSE 0.218 -78.000 0.000 NA   NA
 97383 97384 CC0555 CC0556     TRUE 0.953 4.000 0.333 NA   NA
 97384 97385 CC0556 CC0557     TRUE 0.907 13.000 0.267 NA   NA
 97385 97386 CC0557 CC0558     FALSE 0.018 180.000 0.000 NA   NA
 97386 97387 CC0558 CC0559     TRUE 0.971 5.000 0.667 NA   NA
 97387 97388 CC0559 CC0560     FALSE 0.001 557.000 0.000 NA   NA
 97388 97389 CC0560 CC0561     FALSE 0.363 -42.000 0.000 NA N NA
 97391 97392 CC0563 CC0564     FALSE 0.076 51.000 0.000 NA   NA
 97393 97394 CC0565 CC0566     TRUE 0.916 -13.000 0.101 0.049   NA
 97394 97395 CC0566 CC0567     TRUE 0.979 -3.000 0.648 NA   NA
 97395 97396 CC0567 CC0568     TRUE 0.953 -3.000 0.216 NA   NA
 97396 97397 CC0568 CC0569     TRUE 0.968 -7.000 0.708 NA   NA
 97399 97400 CC0571 CC0572     FALSE 0.148 132.000 0.000 1.000 N NA
 97400 97401 CC0572 CC0573     FALSE 0.147 84.000 0.000 1.000 N NA
 97401 97402 CC0573 CC0574     TRUE 0.512 13.000 0.000 1.000 N NA
 97402 97403 CC0574 CC0575     FALSE 0.006 312.000 0.000 1.000 N NA
 97404 97405 CC0576 CC0577     TRUE 0.717 -3.000 0.000 1.000 N NA
 97405 97406 CC0577 CC0578     FALSE 0.294 -123.000 0.000 1.000   NA
 97406 97407 CC0578 CC0579     TRUE 0.955 17.000 0.833 1.000   NA
 97407 97408 CC0579 CC0580     FALSE 0.005 294.000 0.000 1.000   NA
 97409 97410 CC0581 CC0582     TRUE 0.556 -13.000 0.000 1.000 N NA
 97410 97411 CC0582 CC0583     TRUE 0.717 -3.000 0.000 1.000 N NA
 97411 97412 CC0583 CC0584     TRUE 0.954 10.000 0.000 0.002 Y NA
 97417 97418 CC0589 CC0590     FALSE 0.062 79.000 0.000 NA   NA
 97418 97419 CC0590 CC0591     FALSE 0.388 6.000 0.000 NA   NA
 97419 97420 CC0591 CC0592     FALSE 0.001 468.000 0.000 NA   NA
 97421 97422 CC0593 CC0594     TRUE 0.835 37.000 0.000 0.012 Y NA
 97422 97423 CC0594 CC0595     TRUE 0.980 -3.000 0.014 0.012 Y NA
 97423 97424 CC0595 CC0596     TRUE 0.956 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 97424 97425 CC0596 CC_0597     TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.027 Y NA
 97425 97426 CC_0597 CC0598     TRUE 0.975 -3.000 0.042 1.000 Y NA
 97426 97427 CC0598 CC0599     FALSE 0.001 537.000 0.000 NA   NA
 97427 97428 CC0599 CC0600     FALSE 0.388 6.000 0.000 NA   NA
 97429 97430 CC0601 CC0602     FALSE 0.261 -33.000 0.000 NA   NA
 97430 97431 CC0602 CC0603     TRUE 0.626 -3.000 0.000 1.000   NA
 97431 97432 CC0603 CC0604     FALSE 0.008 230.000 0.000 NA   NA
 97432 97433 CC0604 CC0605     FALSE 0.012 204.000 0.000 NA   NA
 97433 97434 CC0605 CC0606     FALSE 0.232 -51.000 0.000 NA   NA
 97435 97436 CC0607 CC0608     FALSE 0.001 490.000 0.000 NA   NA
 97436 97437 CC0608 CC0609     TRUE 0.775 13.000 0.064 NA   NA
 97437 97438 CC0609 CC0610     TRUE 0.989 12.000 0.915 NA Y NA
 97438 97439 CC0610 CC0611     TRUE 0.987 13.000 0.323 0.001 Y NA
 97439 97440 CC0611 CC0612     TRUE 0.777 5.000 0.015 1.000 N NA
 97440 10938634 CC0612 CC_0613     FALSE 0.021 176.000 0.000 NA   NA
 10938634 97441 CC_0613 CC0614     FALSE 0.127 34.000 0.000 NA   NA
 97441 97442 CC0614 CC0615     TRUE 0.682 29.000 0.074 1.000 N NA
 97442 97443 CC0615 CC0616     TRUE 0.980 9.000 0.539 0.001 N NA
 97443 97444 CC0616 CC0617     TRUE 0.963 1.000 0.294 1.000 N NA
 97444 97445 CC0617 CC0618     TRUE 0.765 -10.000 0.022 1.000 N NA
 97447 97448 CC0620 CC0621     TRUE 0.980 -3.000 0.025 0.055 Y NA
 97448 97449 CC0621 CC0622     TRUE 0.847 -3.000 0.000 0.055   NA
 97449 97450 CC0622 CC0623     TRUE 0.726 11.000 0.000 0.055   NA
 97451 97452 CC0624 CC0625     TRUE 0.847 -3.000 0.000 0.055   NA
 97452 97453 CC0625 CC0626     FALSE 0.104 41.000 0.000 NA   NA
 97453 97454 CC0626 CC0627     FALSE 0.245 17.000 0.000 NA   NA
 97454 399490 CC0627 CC_t05   tRNA-Arg-4 FALSE 0.001 422.000 0.000 NA   NA
 97455 97456 CC0628 CC0629     TRUE 0.957 -3.000 0.182 1.000 N NA
 97456 97457 CC0629 CC0630     TRUE 0.995 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 97458 97459 CC0631 CC0632     TRUE 0.975 11.000 0.222 NA Y NA
 97459 97460 CC0632 CC0633     TRUE 0.934 -3.000 0.105 NA N NA
 97460 97461 CC0633 CC0634     TRUE 0.952 -3.000 0.000 NA Y NA
 97461 97462 CC0634 CC0635     TRUE 0.983 10.000 0.375 NA Y NA
 97462 97463 CC0635 CC0636     FALSE 0.063 134.000 0.000 NA   NA
 97465 97466 CC0638 CC0639     FALSE 0.491 -34.000 0.011 NA   NA
 97466 97467 CC0639 CC0640     FALSE 0.001 387.000 0.000 NA   NA
 97467 97468 CC0640 CC0641     TRUE 0.996 5.000 0.838 0.021 Y NA
 97470 97471 CC0643 CC0644     TRUE 0.891 12.000 0.160 1.000   NA
 97473 97474 CC0646 CC0647     FALSE 0.292 13.000 0.000 NA   NA
 97474 97475 CC0647 CC0648     TRUE 0.986 -3.000 0.898 NA N NA
 97477 97478 CC0650 CC0651     FALSE 0.305 -19.000 0.000 NA   NA
 97480 97481 CC0653 CC0654     FALSE 0.007 299.000 0.000 1.000 N NA
 97483 97484 CC0656 CC0657     TRUE 0.984 -3.000 0.116 1.000 Y NA
 97484 97485 CC0657 CC0658     FALSE 0.007 265.000 0.000 1.000   NA
 97488 97489 CC0661 CC0662     FALSE 0.001 440.000 0.000 NA   NA
 97491 97492 CC0664 CC0665     FALSE 0.043 152.000 0.000 NA   NA
 97494 97495 CC0667 CC0668     FALSE 0.097 43.000 0.000 NA   NA
 97496 97497 CC0669 CC0670     FALSE 0.046 149.000 0.000 NA   NA
 97497 97498 CC0670 CC0671     FALSE 0.075 100.000 0.000 NA   NA
 97498 97499 CC0671 CC0672     TRUE 0.959 -3.000 0.260 NA   NA
 97502 97503 CC0675 CC0676     FALSE 0.202 -118.000 0.000 NA   NA
 97503 97504 CC0676 CC0677     FALSE 0.015 189.000 0.000 NA   NA
 97505 97506 CC0678 CC0679     FALSE 0.002 320.000 0.000 NA   NA
 97508 97509 CC0681 CC0682     FALSE 0.002 338.000 0.000 NA   NA
 97510 97511 CC0683 CC0684     FALSE 0.353 -39.000 0.000 1.000   NA
 97512 97513 CC0685 CC0686     TRUE 0.821 58.000 0.043 0.008 Y NA
 97514 97515 CC0687 CC0688     FALSE 0.223 19.000 0.000 NA   NA
 97516 97517 CC0689 CC0690     FALSE 0.500 51.000 0.071 1.000 N NA
 97518 97519 CC0691 CC0692     FALSE 0.507 73.000 0.154 NA   NA
 97519 97520 CC0692 CC0693     TRUE 0.918 23.000 0.667 NA   NA
 97520 97521 CC0693 CC0694     TRUE 0.679 76.000 0.400 NA   NA
 97523 97524 CC0696 CC0697     TRUE 0.772 60.000 0.667 NA   NA
 97524 97525 CC0697 CC0698     FALSE 0.072 54.000 0.000 NA   NA
 97526 97527 CC0699 CC0700     TRUE 0.954 11.000 0.588 NA   NA
 97527 97528 CC0700 CC0701     FALSE 0.312 147.000 0.045 1.000 N NA
 97528 97529 CC0701 CC0702     FALSE 0.005 314.000 0.000 1.000 N NA
 97529 97530 CC0702 CC0703     FALSE 0.003 403.000 0.000 1.000 N NA
 97530 97531 CC0703 CC0704     TRUE 0.890 0.000 0.044 1.000 N NA
 97531 97532 CC0704 CC0705     TRUE 0.883 25.000 0.216 0.084 N NA
 97533 97534 CC0706 CC0707     FALSE 0.007 236.000 0.000 NA   NA
 97535 97536 CC0708 CC0709     TRUE 0.800 -3.000 0.021 NA   NA
 97536 97537 CC0709 CC0710     FALSE 0.128 99.000 0.000 NA N NA
 97538 97539 CC0711 CC0712     TRUE 0.852 128.000 0.178 1.000 Y NA
 97540 97541 CC0713 CC0714     FALSE 0.065 59.000 0.000 NA   NA
 97541 97542 CC0714 CC0715     FALSE 0.061 76.000 0.000 NA   NA
 97542 97543 CC0715 CC0716     FALSE 0.199 138.000 0.007 1.000 N NA
 97543 97544 CC0716 CC0717     FALSE 0.037 158.000 0.000 NA   NA
 97544 97545 CC0717 CC0718     FALSE 0.151 148.000 0.018 NA   NA
 97545 97546 CC0718 CC0719     TRUE 0.948 -78.000 1.000 NA   NA
 97546 97547 CC0719 CC0720     FALSE 0.050 145.000 0.000 NA   NA
 97549 97550 CC0722 CC0723     FALSE 0.143 135.000 0.000 1.000 N NA
 97550 97551 CC0723 CC0724     FALSE 0.059 70.000 0.000 NA   NA
 97551 97552 CC0724 CC0725     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 97552 97553 CC0725 CC0726     FALSE 0.403 5.000 0.000 NA   NA
 97553 97554 CC0726 CC0727     TRUE 0.995 0.000 0.417 0.012 Y NA
 97554 97555 CC0727 CC0728     FALSE 0.081 49.000 0.000 NA   NA
 97555 97556 CC0728 CC0729     FALSE 0.042 153.000 0.000 NA   NA
 97556 97557 CC0729 CC0730     TRUE 0.683 38.000 0.156 NA   NA
 97558 97559 CC0731 CC0732     TRUE 0.972 -3.000 0.429 NA   NA
 97559 97560 CC0732 CC0733     TRUE 0.944 84.000 0.571 0.012 Y NA
 97561 97562 CC0734 CC0735     FALSE 0.001 378.000 0.000 NA   NA
 97563 97564 CC0736 CC0737     FALSE 0.012 387.000 0.045 1.000 N NA
 97567 97568 CC0740 CC0741     TRUE 0.625 55.000 0.000 1.000 Y NA
 97568 97569 CC0741 CC0742     FALSE 0.003 290.000 0.000 NA   NA
 97569 97570 CC0742 CC0743     FALSE 0.073 126.000 0.000 NA   NA
 97571 399444 CC0744 CC_t06   tRNA-Val-3 FALSE 0.077 110.000 0.000 NA   NA
 97572 97573 CC0745 CC0746     FALSE 0.004 276.000 0.000 NA   NA
 97581 97582 CC0754 CC0755     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 97583 97584 CC0756 CC0757     FALSE 0.123 110.000 0.000 1.000   NA
 97585 97586 CC0758 CC0759     TRUE 0.991 -7.000 0.375 0.031 Y NA
 97586 97587 CC0759 CC0760     FALSE 0.104 199.000 0.008 0.055 N NA
 97587 97588 CC0760 CC0761     TRUE 0.868 173.000 0.631 0.004 Y NA
 97589 97590 CC0762 CC0763     TRUE 0.992 15.000 0.953 0.057 Y NA
 97590 97591 CC0763 CC0764     FALSE 0.007 300.000 0.000 1.000 N NA
 97592 97593 CC0765 CC0766     FALSE 0.008 230.000 0.000 NA   NA
 97593 97594 CC0766 CC0767     TRUE 0.588 90.000 0.082 0.055   NA
 97594 97595 CC0767 CC0768     TRUE 0.901 8.000 0.105 1.000 N NA
 97595 97596 CC0768 CC0769     TRUE 0.829 94.000 0.787 1.000   NA
 97596 97597 CC0769 CC0770     FALSE 0.006 280.000 0.000 1.000   NA
 97597 97598 CC0770 CC0771     FALSE 0.228 177.000 0.089 1.000 N NA
 97598 97599 CC0771 CC0772     TRUE 0.881 32.000 0.500 1.000 N NA
 97599 97600 CC0772 CC0773     FALSE 0.103 60.000 0.000 1.000   NA
 97600 97601 CC0773 CC0774     TRUE 0.741 6.000 0.018 1.000   NA
 97601 97602 CC0774 CC0775     FALSE 0.164 26.000 0.000 NA   NA
 97602 97603 CC0775 CC0776     FALSE 0.017 186.000 0.000 NA   NA
 97603 97604 CC0776 CC0777     FALSE 0.013 232.000 0.000 NA N NA
 97604 97605 CC0777 CC0778     FALSE 0.061 161.000 0.000 NA N NA
 97605 97606 CC0778 CC0779     FALSE 0.449 56.000 0.074 NA N NA
 97606 97607 CC0779 CC0780     TRUE 0.533 45.000 0.100 NA   NA
 97607 97608 CC0780 CC0781     TRUE 0.712 72.000 0.500 NA   NA
 97608 97609 CC0781 CC0782     TRUE 0.735 88.000 0.500 NA   NA
 97609 97610 CC0782 CC0783     TRUE 0.834 34.000 0.000 0.047 Y NA
 97610 97611 CC0783 CC_0784     FALSE 0.077 163.000 0.000 1.000 N NA
 97611 97612 CC_0784 CC0785     TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 97612 97613 CC0785 CC0786     FALSE 0.007 232.000 0.000 NA   NA
 97614 97615 CC0787 CC0788     FALSE 0.002 307.000 0.000 NA   NA
 97615 97616 CC0788 CC0789     TRUE 0.973 -99.000 0.250 0.019 Y NA
 97618 97619 CC0791 CC0792     FALSE 0.002 443.000 0.000 1.000   NA
 97619 97620 CC0792 CC0793     FALSE 0.031 551.000 0.000 0.003 Y NA
 97620 97621 CC0793 CC0794     FALSE 0.069 336.000 0.000 0.003 Y NA
 97622 97623 CC0795 CC0796     FALSE 0.057 161.000 0.000 1.000   NA
 97624 97625 CC0797 CC0798     FALSE 0.005 293.000 0.000 1.000   NA
 97626 97627 CC0799 CC0800     FALSE 0.036 159.000 0.000 NA   NA
 97627 97628 CC0800 CC0801     FALSE 0.063 84.000 0.000 NA   NA
 97628 97629 CC0801 CC0802     FALSE 0.061 76.000 0.000 NA   NA
 97629 97630 CC0802 CC0803     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 97630 97631 CC0803 CC0804     FALSE 0.175 39.000 0.000 1.000   NA
 97633 97634 CC0806 CC0807     TRUE 0.974 2.000 0.286 0.047 N NA
 97634 97635 CC0807 CC0808     TRUE 0.961 13.000 0.667 1.000 N NA
 97639 97640 CC0812 CC0813     TRUE 0.632 141.000 0.286 1.000 N NA
 97640 97641 CC0813 CC0814     FALSE 0.040 172.000 0.000 1.000   NA
 97643 97644 CC0816 CC0817     FALSE 0.403 5.000 0.000 NA   NA
 97644 97645 CC0817 CC0818     FALSE 0.076 124.000 0.000 NA   NA
 97645 97646 CC0818 CC0819     FALSE 0.079 115.000 0.000 NA   NA
 97646 97647 CC0819 CC0820     TRUE 0.962 -19.000 0.116 NA Y NA
 97647 97648 CC0820 CC0821     TRUE 0.752 125.000 0.417 NA N NA
 97648 97649 CC0821 CC0822     TRUE 0.933 6.000 0.091 0.083 N NA
 97649 97650 CC0822 CC0823     TRUE 0.741 17.000 0.017 0.083   NA
 97652 97653 CC0825 CC0826     FALSE 0.060 65.000 0.000 NA   NA
 97653 97654 CC0826 CC0827     FALSE 0.059 66.000 0.000 NA   NA
 97654 97655 CC0827 CC0828     TRUE 0.753 20.000 0.097 NA   NA
 97655 97656 CC0828 CC0829     TRUE 0.864 -3.000 0.035 1.000   NA
 97656 97657 CC0829 CC0830     FALSE 0.486 29.000 0.027 1.000   NA
 97659 97660 CC0832 CC0833     FALSE 0.430 -21.000 0.000 NA N NA
 97660 97661 CC0833 CC0834     FALSE 0.136 32.000 0.000 NA   NA
 97662 97663 CC0835 CC0836     FALSE 0.092 157.000 0.000 1.000 N NA
 97664 97665 CC0837 CC0838     TRUE 0.967 -3.000 0.346 NA   NA
 97665 97666 CC0838 CC0839     FALSE 0.064 156.000 0.000 1.000   NA
 97666 97667 CC0839 CC0840     FALSE 0.024 192.000 0.000 1.000   NA
 97667 97668 CC0840 CC0841     FALSE 0.434 3.000 0.000 NA   NA
 97668 97669 CC0841 CC0842     FALSE 0.346 -10.000 0.000 NA   NA
 97670 97671 CC0843 CC0844     FALSE 0.017 183.000 0.000 NA   NA
 97671 97672 CC0844 CC0845     FALSE 0.075 125.000 0.000 NA   NA
 97673 97674 CC0846 CC0847     FALSE 0.067 58.000 0.000 NA   NA
 97675 97676 CC0848 CC0849     FALSE 0.001 487.000 0.000 NA   NA
 97678 97679 CC0851 CC0852     FALSE 0.322 11.000 0.000 NA   NA
 97682 97683 CC0855 CC0856     TRUE 0.944 4.000 0.002 1.000 Y NA
 97686 97687 CC0859 CC0860     TRUE 0.819 23.000 0.000 NA Y NA
 97687 97688 CC0860 CC0861     TRUE 0.993 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 97689 97690 CC0862 CC0863     FALSE 0.108 40.000 0.000 NA   NA
 97690 97691 CC0863 CC0864     TRUE 0.980 -3.000 0.667 NA   NA
 97691 97692 CC0864 CC0865     TRUE 0.866 -63.000 0.250 NA   NA
 97692 97693 CC0865 CC0866     FALSE 0.170 25.000 0.000 NA   NA
 97693 97694 CC0866 CC0867     FALSE 0.255 16.000 0.000 NA   NA
 97694 97695 CC0867 CC0868     FALSE 0.062 63.000 0.000 NA   NA
 97695 97696 CC0868 CC0869     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 97696 97697 CC0869 CC0870     FALSE 0.077 110.000 0.000 NA   NA
 97697 97698 CC0870 CC0871     FALSE 0.062 79.000 0.000 NA   NA
 97700 97701 CC0873 CC0874     TRUE 0.969 -3.000 0.385 NA   NA
 97702 97703 CC0875 CC0876     FALSE 0.018 259.000 0.021 NA   NA
 97703 97704 CC0876 CC0877     FALSE 0.028 168.000 0.000 NA   NA
 97704 97705 CC0877 CC0878     TRUE 0.657 99.000 0.003 1.000 Y NA
 97705 97706 CC0878 CC0879     FALSE 0.454 1.000 0.000 NA   NA
 97707 97708 CC0880 CC0881     FALSE 0.454 1.000 0.000 NA   NA
 97708 97709 CC0881 CC0882     FALSE 0.075 105.000 0.000 NA   NA
 97709 97710 CC0882 CC0883     FALSE 0.028 168.000 0.000 NA   NA
 97710 97711 CC0883 CC0884     FALSE 0.341 10.000 0.000 NA   NA
 97712 97713 CC0885 CC0886     TRUE 0.985 11.000 0.456 1.000 Y NA
 97713 97714 CC0886 CC0887     TRUE 0.914 -24.000 0.009 1.000 Y NA
 97714 97715 CC0887 CC0888     TRUE 0.942 16.000 0.008 0.002 Y NA
 97715 97716 CC0888 CC0889     FALSE 0.111 91.000 0.000 1.000   NA
 97716 97717 CC0889 CC0890     FALSE 0.076 51.000 0.000 NA   NA
 97720 97721 CC0893 CC0894     FALSE 0.033 162.000 0.000 NA   NA
 97722 97723 CC0895 CC0896     FALSE 0.123 93.000 0.000 NA N NA
 97724 97725 CC0897 CC0898     FALSE 0.245 126.000 0.008 1.000 N NA
 97725 97726 CC0898 CC0899     TRUE 0.996 4.000 0.800 0.005 Y NA
 10938635 97727 CC_0900 CC0901     FALSE 0.306 12.000 0.000 NA   NA
 97727 97728 CC0901 CC0902     TRUE 0.823 147.000 0.276 NA Y NA
 97728 97729 CC0902 CC0903     FALSE 0.226 169.000 0.072 1.000   NA
 97729 97730 CC0903 CC0904     FALSE 0.024 172.000 0.000 NA   NA
 97730 97731 CC0904 CC_0905   fliF FALSE 0.191 -153.000 0.000 NA   NA
 97731 97732 CC_0905 CC0906 fliF   TRUE 0.997 0.000 0.762 0.005 Y NA
 97732 97733 CC0906 CC0907     TRUE 0.842 11.000 0.095 NA   NA
 97733 97734 CC0907 CC0908     TRUE 0.833 16.000 0.139 NA   NA
 97734 97735 CC0908 CC0909     TRUE 0.868 34.000 0.484 1.000 N NA
 97735 97736 CC0909 CC0910     FALSE 0.092 268.000 0.226 1.000 N NA
 97736 97737 CC0910 CC0911     FALSE 0.179 40.000 0.000 NA N NA
 97738 97739 CC0912 CC0913     FALSE 0.081 49.000 0.000 NA   NA
 97741 97742 CC0915 CC0916     TRUE 0.823 11.000 0.052 1.000 N NA
 97742 97743 CC0916 CC0917     FALSE 0.001 562.000 0.000 1.000   NA
 97749 97750 CC0923 CC0924     FALSE 0.005 334.000 0.011 NA   NA
 97752 97753 CC0926 CC0927     FALSE 0.067 58.000 0.000 NA   NA
 97753 399489 CC0927 CC_t07   tRNA-Pro-1 FALSE 0.023 174.000 0.000 NA   NA
 399445 97754 CC_t08 CC0928 tRNA-Gln-1   FALSE 0.063 134.000 0.000 NA   NA
 97754 97755 CC0928 CC0929     TRUE 0.610 126.000 0.000 NA Y NA
 97755 97756 CC0929 CC0930     FALSE 0.103 152.000 0.000 1.000 N NA
 97756 97757 CC0930 CC0931     TRUE 0.968 5.000 0.070 NA Y NA
 97757 97758 CC0931 CC0932     TRUE 0.981 -3.000 0.647 NA N NA
 97758 97759 CC0932 CC0933     FALSE 0.056 174.000 0.000 1.000 N NA
 97760 97761 CC0934 CC0935     TRUE 0.751 74.000 0.500 1.000 N NA
 97761 97762 CC0935 CC0936     TRUE 0.818 6.000 0.030 1.000 N NA
 97763 97764 CC0937 CC0938     TRUE 0.676 61.000 0.375 NA   NA
 97767 97768 CC0941 CC0942     FALSE 0.145 62.000 0.000 1.000 N NA
 97768 97769 CC0942 CC0943     FALSE 0.060 65.000 0.000 NA   NA
 97769 97770 CC0943 CC0944     FALSE 0.060 72.000 0.000 NA   NA
 97770 97771 CC0944 CC0945     FALSE 0.406 161.000 0.143 1.000 N NA
 97772 97773 CC0946 CC0947     FALSE 0.019 231.000 0.000 1.000 N NA
 97773 97774 CC0947 CC0948     FALSE 0.002 365.000 0.000 NA   NA
 97774 97775 CC0948 CC0949     FALSE 0.075 103.000 0.000 NA   NA
 97776 97777 CC0950 CC0951     TRUE 0.796 21.000 0.103 1.000 N NA
 97777 97778 CC0951 CC0952     TRUE 0.825 0.000 0.023 1.000   NA
 97779 97780 CC0953 CC0954     TRUE 0.988 13.000 0.804 NA Y NA
 97780 97781 CC0954 CC0955     TRUE 0.968 11.000 0.037 0.003 Y NA
 97782 97783 CC0956 CC0957     FALSE 0.124 35.000 0.000 NA   NA
 97783 97784 CC0957 CC0958     TRUE 0.788 125.000 0.061 1.000 Y NA
 97784 97785 CC0958 CC0959     TRUE 0.764 119.000 0.039 1.000 Y NA
 97785 97786 CC0959 CC0960     TRUE 0.973 -3.000 0.192 0.039 N NA
 97787 97788 CC0961 CC0962     TRUE 0.830 -3.000 0.013 1.000 N NA
 399488 97789 CC_t09 CC0963 tRNA-Met-1   FALSE 0.004 264.000 0.000 NA   NA
 97790 97791 CC0964 CC0965     TRUE 0.895 -3.000 0.000 0.003 N NA
 97791 97792 CC0965 CC0966     FALSE 0.009 276.000 0.000 1.000 N NA
 97793 97794 CC0967 CC0968     FALSE 0.042 171.000 0.000 1.000   NA
 97794 97795 CC0968 CC0969     TRUE 0.728 64.000 0.429 1.000 N NA
 97796 97797 CC0970 CC0971     FALSE 0.267 227.000 0.600 NA   NA
 97797 97798 CC0971 CC0972     TRUE 0.958 10.000 0.600 NA   NA
 97799 97800 CC0973 CC0974     FALSE 0.292 13.000 0.000 NA   NA
 97800 97801 CC0974 CC0975     FALSE 0.318 -16.000 0.000 NA   NA
 97801 97802 CC0975 CC0976     FALSE 0.013 198.000 0.000 NA   NA
 97804 97805 CC0978 CC0979     FALSE 0.094 68.000 0.000 1.000   NA
 97806 97807 CC0980 CC0981     FALSE 0.141 75.000 0.000 1.000 N NA
 97807 97808 CC0981 CC0982     TRUE 0.948 -36.000 0.667 NA N NA
 97808 97809 CC0982 CC0983     TRUE 0.795 78.000 0.118 NA Y NA
 97809 97810 CC0983 CC0984     FALSE 0.092 157.000 0.000 1.000 N NA
 97811 97812 CC0985 CC0986     FALSE 0.100 82.000 0.000 1.000   NA
 97813 97814 CC0987 CC0988     FALSE 0.059 67.000 0.000 NA   NA
 97814 97815 CC0988 CC0989     TRUE 0.987 -3.000 0.171 1.000 Y NA
 97816 97817 CC0990 CC0991     FALSE 0.001 563.000 0.000 NA   NA
 97819 97820 CC0993 CC0994     TRUE 0.707 0.000 0.010 NA   NA
 399446 97821 CC_t10 CC0995 tRNA-Ser-1   FALSE 0.006 247.000 0.000 NA   NA
 97821 97822 CC0995 CC0996     FALSE 0.037 158.000 0.000 NA   NA
 97822 97823 CC0996 CC0997     FALSE 0.003 290.000 0.000 NA   NA
 97823 97824 CC0997 CC0998     FALSE 0.063 61.000 0.000 NA   NA
 97824 97825 CC0998 CC0999     FALSE 0.002 446.000 0.000 1.000   NA
 97825 97826 CC0999 CC1000     TRUE 0.744 99.000 0.455 NA   NA
 97826 97827 CC1000 CC1001     TRUE 0.979 -3.000 0.647 NA   NA
 97827 97828 CC1001 CC1002     TRUE 0.911 24.000 0.647 NA   NA
 97829 97830 CC1003 CC1004     TRUE 0.848 11.000 0.100 NA   NA
 97830 97831 CC1004 CC1005     FALSE 0.141 31.000 0.000 NA   NA
 97831 97832 CC1005 CC1006     TRUE 0.667 83.000 0.364 NA   NA
 97833 97834 CC1007 CC1008     FALSE 0.010 243.000 0.000 1.000   NA
 97834 97835 CC1008 CC1009     TRUE 0.847 68.000 0.688 0.007   NA
 97835 97836 CC1009 CC1010     FALSE 0.129 140.000 0.000 1.000 N NA
 97836 97837 CC1010 CC1011     TRUE 0.608 0.000 0.000 1.000   NA
 97837 97838 CC1011 CC1012     TRUE 0.889 -3.000 0.050 1.000   NA
 97838 97839 CC1012 CC1013     TRUE 0.974 4.000 0.080 1.000 Y NA
 97839 97840 CC1013 CC1014     TRUE 0.993 11.000 0.714 0.014 Y NA
 97840 97841 CC1014 CC1015     TRUE 0.881 57.000 0.286 1.000 Y NA
 97844 97845 CC1018 CC1019     TRUE 0.811 42.000 0.444 1.000   NA
 97849 97850 CC1023 CC1024     FALSE 0.322 11.000 0.000 NA   NA
 97850 97851 CC1024 CC1025     FALSE 0.052 143.000 0.000 NA   NA
 97854 97855 CC1028 CC1029     TRUE 0.514 46.000 0.095 NA   NA
 97857 97858 CC1031 CC1032     TRUE 0.970 -3.000 0.400 NA   NA
 97859 97860 CC1033 CC1034     FALSE 0.035 193.000 0.000 1.000 N NA
 97862 97863 CC1036 CC1037     FALSE 0.081 49.000 0.000 NA   NA
 97863 97864 CC1037 CC1038     TRUE 0.893 -6.000 0.116 NA   NA
 97864 97865 CC1038 CC1039     FALSE 0.061 76.000 0.000 NA   NA
 97865 97866 CC1039 CC1040     FALSE 0.323 54.000 0.043 NA   NA
 97866 97867 CC1040 CC1041     TRUE 0.963 -15.000 0.750 NA   NA
 97867 97868 CC1041 CC1042     TRUE 0.790 127.000 0.667 NA   NA
 97868 97869 CC1042 CC1043     FALSE 0.062 79.000 0.000 NA   NA
 97869 97870 CC1043 CC1044     TRUE 0.912 158.000 0.574 0.001 Y NA
 97870 97871 CC1044 CC1045     FALSE 0.308 249.000 0.202 1.000 Y NA
 97871 97872 CC1045 CC1046     TRUE 0.992 16.000 0.928 0.015 Y NA
 97872 97873 CC1046 CC1047     FALSE 0.204 122.000 0.002 1.000 N NA
 97873 97874 CC1047 CC1048     TRUE 0.769 67.000 0.600 1.000 N NA
 97874 97875 CC1048 CC1049     FALSE 0.170 133.000 0.002 1.000 N NA
 97875 97876 CC1049 CC1050     FALSE 0.104 131.000 0.000 1.000   NA
 97876 97877 CC1050 CC1051     FALSE 0.119 99.000 0.000 1.000   NA
 97877 97878 CC1051 CC1052     TRUE 0.985 -3.000 0.141 1.000 Y NA
 97879 97880 CC1053 CC1054     FALSE 0.228 41.000 0.000 1.000 N NA
 399447 399448 CC_t11 CC_t12 tRNA-Gly-1 tRNA-Gly-2 FALSE 0.076 51.000 0.000 NA   NA
 399448 97882 CC_t12 CC1056 tRNA-Gly-2   FALSE 0.083 48.000 0.000 NA   NA
 97882 97883 CC1056 CC1057     FALSE 0.434 3.000 0.000 NA   NA
 97883 97884 CC1057 CC1058     FALSE 0.003 328.000 0.000 1.000   NA
 97884 97885 CC1058 CC1059     FALSE 0.242 66.000 0.032 NA   NA
 97886 97887 CC1060 CC1061     FALSE 0.367 -7.000 0.000 NA   NA
 97887 97888 CC1061 CC1062     FALSE 0.267 43.000 0.016 NA   NA
 97891 97892 CC1065 CC1066     FALSE 0.339 129.000 0.051 NA   NA
 97897 97898 CC1071 CC1072     FALSE 0.031 179.000 0.000 1.000   NA
 97898 97899 CC1072 CC1073     FALSE 0.002 328.000 0.000 NA   NA
 97900 97901 CC1074 CC1075     FALSE 0.044 151.000 0.000 NA   NA
 97901 97902 CC1075 CC1076     TRUE 0.993 15.000 0.929 0.002 Y NA
 97902 97903 CC1076 CC1077     TRUE 0.991 10.000 0.788 1.000 Y NA
 97903 97904 CC1077 CC1078     TRUE 0.654 103.000 0.200 1.000 N NA
 97905 97906 CC1079 CC1080     TRUE 0.688 122.000 0.308 NA   NA
 97906 97907 CC1080 CC1081     TRUE 0.804 39.000 0.400 NA   NA
 97907 97908 CC1081 CC1082     FALSE 0.089 45.000 0.000 NA   NA
 97908 97909 CC1082 CC1083     FALSE 0.068 57.000 0.000 NA   NA
 97910 97911 CC1084 CC1085     FALSE 0.076 108.000 0.000 NA   NA
 97913 97914 CC1087 CC1088     FALSE 0.001 687.000 0.000 NA   NA
 97915 97916 CC1089 CC1090     TRUE 0.648 30.000 0.075 NA N NA
 97916 97917 CC1090 CC1091     TRUE 0.888 23.000 0.188 0.055 N NA
 97920 97921 CC1094 CC1095     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 97921 97922 CC1095 CC1096     TRUE 0.511 11.000 0.007 NA   NA
 97922 97923 CC1096 CC1097     TRUE 0.736 2.000 0.010 1.000   NA
 97923 97924 CC1097 CC1098     FALSE 0.281 85.000 0.029 1.000   NA
 97924 97925 CC1098 CC1099     FALSE 0.016 214.000 0.000 1.000   NA
 97925 97926 CC1099 CC1100     FALSE 0.393 157.000 0.154 NA   NA
 97926 97927 CC1100 CC1101     FALSE 0.026 171.000 0.000 NA   NA
 97927 97928 CC1101 CC1102     TRUE 0.768 -106.000 0.111 NA   NA
 97928 97929 CC1102 CC1103     FALSE 0.005 249.000 0.000 NA   NA
 97929 97930 CC1103 CC1104     FALSE 0.338 123.000 0.031 NA N NA
 97930 97931 CC1104 CC1105     FALSE 0.279 144.000 0.031 1.000 N NA
 97931 97932 CC1105 CC1106     FALSE 0.002 348.000 0.000 NA   NA
 97932 97933 CC1106 CC1107     FALSE 0.041 155.000 0.000 NA   NA
 97933 97934 CC1107 CC1108     FALSE 0.295 -21.000 0.000 NA   NA
 97935 97936 CC1109 CC1110     FALSE 0.481 0.000 0.000 NA   NA
 97936 97937 CC1110 CC1111     TRUE 0.953 0.000 0.000 1.000 Y NA
 97937 97938 CC1111 CC1112     FALSE 0.074 96.000 0.000 NA   NA
 97938 97939 CC1112 CC1113     FALSE 0.223 19.000 0.000 NA   NA
 97939 399487 CC1113 CC_t13   tRNA-Lys-1 FALSE 0.007 238.000 0.000 NA   NA
 97940 97941 CC1114 CC1115     FALSE 0.181 111.000 0.010 NA   NA
 97942 97943 CC1116 CC1117     TRUE 0.697 24.000 0.060 1.000 N NA
 97944 97945 CC1118 CC1119     FALSE 0.004 363.000 0.000 1.000 N NA
 97945 97946 CC1119 CC1120     TRUE 0.925 -16.000 0.309 NA   NA
 97946 97947 CC1120 CC1121     TRUE 0.931 0.000 0.139 NA   NA
 97949 97950 CC1123 CC1124     FALSE 0.093 44.000 0.000 NA   NA
 97950 97951 CC1124 CC1125     TRUE 0.639 19.000 0.033 1.000   NA
 97951 97952 CC1125 CC1126     TRUE 0.618 -52.000 0.026 1.000   NA
 97952 97953 CC1126 CC1127     FALSE 0.314 -18.000 0.000 NA   NA
 97953 97954 CC1127 CC1128     FALSE 0.009 220.000 0.000 NA   NA
 97954 97955 CC1128 CC1129     FALSE 0.009 218.000 0.000 NA   NA
 97955 97956 CC1129 CC1130     TRUE 0.986 -3.000 1.000 NA N NA
 97956 97957 CC1130 CC1131     TRUE 0.900 76.000 0.500 NA Y NA
 97957 97958 CC1131 CC1132     TRUE 0.513 106.000 0.097 1.000   NA
 97959 97960 CC1133 CC1134     TRUE 0.952 -3.000 0.000 NA Y NA
 97960 97961 CC1134 CC1135     TRUE 0.952 -3.000 0.000 NA Y NA
 97961 97962 CC1135 CC1136     FALSE 0.030 286.000 0.052 1.000 N NA
 97962 97963 CC1136 CC1137     FALSE 0.105 151.000 0.000 1.000 N NA
 97966 97967 CC1140 CC1141     TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 97968 97969 CC1142 CC1143     TRUE 0.562 68.000 0.222 NA   NA
 97969 97970 CC1143 CC1144     TRUE 0.944 -3.000 0.167 NA   NA
 97970 97971 CC1144 CC1145     FALSE 0.153 88.000 0.000 1.000 N NA
 97971 97972 CC1145 CC1146     TRUE 0.518 75.000 0.111 1.000 N NA
 97973 97974 CC1147 CC1148     TRUE 0.987 2.000 0.286 NA Y NA
 97974 97975 CC1148 CC1149     TRUE 0.858 -21.000 0.107 NA N NA
 97975 97976 CC1149 CC1150     TRUE 0.993 -3.000 0.270 0.030 Y NA
 97976 97977 CC1150 CC1151     TRUE 0.568 10.000 0.000 1.000 N NA
 97977 97978 CC1151 CC1152     FALSE 0.021 226.000 0.000 1.000 N NA
 97979 97980 CC1153 CC1154     TRUE 0.899 -3.000 0.069 NA   NA
 97980 97981 CC1154 CC1155     TRUE 0.652 0.000 0.005 NA   NA
 97981 97982 CC1155 CC1156     TRUE 0.987 -3.000 0.631 0.052   NA
 97982 97983 CC1156 CC1157     TRUE 0.749 -3.000 0.007 1.000   NA
 97983 97984 CC1157 CC1158     FALSE 0.310 106.000 0.027 1.000   NA
 97985 97986 CC1159 CC1160     TRUE 0.962 -81.000 0.250 1.000 Y NA
 97987 97988 CC1161 CC1162     FALSE 0.265 15.000 0.000 NA   NA
 97988 97989 CC1162 CC1163     TRUE 0.942 4.000 0.191 1.000 N NA
 97989 97990 CC1163 CC1164     FALSE 0.349 77.000 0.038 1.000 N NA
 97990 97991 CC1164 CC1165     TRUE 0.886 -10.000 0.096 1.000 N NA
 97991 97992 CC1165 CC1166     TRUE 0.805 20.000 0.129 1.000   NA
 97992 97993 CC1166 CC1167     TRUE 0.975 -3.000 0.500 NA   NA
 97993 97994 CC1167 CC1168     TRUE 0.814 2.000 0.036 NA   NA
 97995 97996 CC1169 CC1170     TRUE 0.969 -3.000 0.333 NA N NA
 97998 97999 CC1172 CC1173     TRUE 0.888 -12.000 0.148 NA   NA
 97999 98000 CC1173 CC1174     FALSE 0.249 -37.000 0.000 NA   NA
 98002 98003 CC1176 CC1177     FALSE 0.460 64.000 0.100 1.000   NA
 98004 98005 CC1178 CC1179     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 98005 98006 CC1179 CC1180     FALSE 0.075 98.000 0.000 NA   NA
 98006 98007 CC1180 CC1181     TRUE 0.917 23.000 0.600 1.000   NA
 98007 98008 CC1181 CC1182     TRUE 0.991 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 98008 98009 CC1182 CC1183     FALSE 0.193 91.000 0.008 1.000   NA
 98009 98010 CC1183 CC1184     FALSE 0.220 30.000 0.000 1.000   NA
 98012 98013 CC1186 CC1187     FALSE 0.002 310.000 0.000 NA   NA
 98013 10938636 CC1187 CC_1188     FALSE 0.388 6.000 0.000 NA   NA
 10938636 98014 CC_1188 CC1189     FALSE 0.236 18.000 0.000 NA   NA
 98015 98016 CC1190 CC1191     TRUE 0.976 5.000 0.667 1.000 N NA
 98016 98017 CC1191 CC1192     TRUE 0.985 -57.000 0.833 1.000 Y NA
 98017 98018 CC1192 CC1193     TRUE 0.995 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 98020 98021 CC1195 CC1196     TRUE 0.907 0.000 0.058 1.000 N NA
 98022 98023 CC1197 CC1198     FALSE 0.001 438.000 0.000 NA   NA
 98023 98024 CC1198 CC1199     TRUE 0.950 -3.000 0.202 NA   NA
 98024 98025 CC1199 CC1200     TRUE 0.985 -3.000 0.939 NA   NA
 98026 98027 CC1201 CC1202     TRUE 0.762 39.000 0.294 NA   NA
 98027 98028 CC1202 CC1203     FALSE 0.210 170.000 0.080 NA   NA
 98028 98029 CC1203 CC1204     TRUE 0.960 0.000 0.260 NA N NA
 98029 98030 CC1204 CC1205     TRUE 0.862 16.000 0.154 NA N NA
 98031 10938637 CC1206 CC_1207     FALSE 0.194 -135.000 0.000 NA   NA
 10938637 98032 CC_1207 CC1208     FALSE 0.059 67.000 0.000 NA   NA
 98032 98033 CC1208 CC1209     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 98033 98034 CC1209 CC1210     FALSE 0.100 78.000 0.000 1.000   NA
 98038 98039 CC1214 CC1215     TRUE 0.594 5.000 0.007 NA   NA
 98039 399486 CC1215 CC_t14   tRNA-Thr-1 FALSE 0.164 26.000 0.000 NA   NA
 399486 98040 CC_t14 CC1216 tRNA-Thr-1   FALSE 0.062 77.000 0.000 NA   NA
 98041 98042 CC1217 CC1218     TRUE 0.902 0.000 0.054 1.000 N NA
 98042 98043 CC1218 CC1219     TRUE 0.960 17.000 0.155 1.000 Y NA
 98044 98045 CC1220 CC1221     TRUE 0.531 28.000 0.044 NA   NA
 98046 98047 CC1222 CC1223     FALSE 0.255 16.000 0.000 NA   NA
 98047 98048 CC1223 CC1224     FALSE 0.176 71.000 0.004 1.000 N NA
 98048 98049 CC1224 CC1225     TRUE 0.898 3.000 0.081 1.000   NA
 98049 98050 CC1225 CC1226     TRUE 0.963 -3.000 0.273 1.000   NA
 98056 98057 CC1232 CC1233     TRUE 0.735 54.000 0.455 NA   NA
 98057 98058 CC1233 CC1234     TRUE 0.980 -3.000 0.667 NA   NA
 98058 10938638 CC1234 CC_1235     FALSE 0.018 181.000 0.000 NA   NA
 10938638 98059 CC_1235 CC1236     FALSE 0.194 -135.000 0.000 NA   NA
 399449 399450 CC_t15 CC_t16 tRNA-Tyr-1 tRNA-Gly-3 FALSE 0.078 111.000 0.000 NA   NA
 399450 98063 CC_t16 CC1240 tRNA-Gly-3   FALSE 0.071 55.000 0.000 NA   NA
 98063 98064 CC1240 CC1241     FALSE 0.072 93.000 0.000 NA   NA
 98064 98065 CC1241 CC1242     FALSE 0.033 162.000 0.000 NA   NA
 98065 98066 CC1242 CC1243     TRUE 0.985 0.000 0.047 0.001 Y NA
 98066 98067 CC1243 CC1244     TRUE 0.534 6.000 0.000 NA N NA
 98069 98070 CC1246 CC1247     FALSE 0.277 14.000 0.000 NA   NA
 98070 98071 CC1247 CC_1248   rplC TRUE 0.984 14.000 0.307 0.019 Y NA
 98071 98072 CC_1248 CC1249 rplC   TRUE 0.995 0.000 0.486 0.014 Y NA
 98072 98073 CC1249 CC1250     TRUE 0.995 0.000 0.513 0.014 Y NA
 98073 98074 CC1250 CC1251     TRUE 0.996 4.000 0.849 0.014 Y NA
 98074 98075 CC1251 CC1252     TRUE 0.996 4.000 0.820 0.019 Y NA
 98075 98076 CC1252 CC1253     TRUE 0.987 3.000 0.119 0.019 Y NA
 98076 98077 CC1253 CC1254     TRUE 0.989 0.000 0.109 0.019 Y NA
 98077 98078 CC1254 CC1255     TRUE 0.992 14.000 0.828 0.019 Y NA
 98078 98079 CC1255 CC1256     TRUE 0.995 6.000 0.802 0.014 Y NA
 98079 98080 CC1256 CC1257     TRUE 0.994 11.000 0.828 0.014 Y NA
 98080 98081 CC1257 CC1258     TRUE 0.990 18.000 0.791 0.019 Y NA
 98081 98082 CC1258 CC1259     TRUE 0.997 0.000 0.810 0.019 Y NA
 98082 98083 CC1259 CC1260     TRUE 0.994 -7.000 0.758 0.014 Y NA
 98083 98084 CC1260 CC1261     TRUE 0.975 22.000 0.309 0.014 Y NA
 98084 98085 CC1261 CC1262     TRUE 0.987 11.000 0.295 0.014 Y NA
 98085 98086 CC1262 CC1263     TRUE 0.989 19.000 0.808 0.014 Y NA
 98086 98087 CC1263 CC1264     TRUE 0.996 4.000 0.815 0.014 Y NA
 98087 98088 CC1264 CC1265     TRUE 0.993 11.000 0.814 0.019 Y NA
 98088 98089 CC1265 CC1266     TRUE 0.996 4.000 0.789 0.019 Y NA
 98089 98090 CC1266 CC1267     TRUE 0.874 173.000 0.653 0.002 Y NA
 98090 98091 CC1267 CC1268     FALSE 0.240 253.000 0.730 1.000 N NA
 98091 98092 CC1268 CC1269     FALSE 0.220 135.000 0.009 1.000 N NA
 98092 98093 CC1269 CC1270     FALSE 0.021 247.000 0.006 1.000 N NA
 98093 98094 CC1270 CC1271     TRUE 0.992 14.000 0.810 0.014 Y NA
 98094 98095 CC1271 CC1272     TRUE 0.681 78.000 0.308 1.000 N NA
 98095 98096 CC1272 CC1273     FALSE 0.459 205.000 0.873 1.000 N NA
 98096 98097 CC1273 CC1274     FALSE 0.002 313.000 0.000 NA   NA
 98098 98099 CC1275 CC1276     TRUE 0.981 0.000 0.750 NA   NA
 98100 98101 CC1277 CC1278     FALSE 0.095 70.000 0.000 1.000   NA
 98101 98102 CC1278 CC1279     FALSE 0.059 71.000 0.000 NA   NA
 98102 98103 CC1279 CC1280     TRUE 0.953 -3.000 0.217 NA   NA
 98103 98104 CC1280 CC1281     FALSE 0.405 -22.000 0.000 1.000   NA
 98104 98105 CC1281 CC1282     FALSE 0.379 93.000 0.037 1.000 N NA
 98105 98106 CC1282 CC1283     FALSE 0.453 119.000 0.051 1.000 N NA
 98106 98107 CC1283 CC1284     TRUE 0.757 -3.000 0.002 1.000 N NA
 98107 98108 CC1284 CC1285     TRUE 0.885 -13.000 0.148 NA   NA
 98108 98109 CC1285 CC1286     FALSE 0.035 161.000 0.000 NA   NA
 98109 98110 CC1286 CC1287     FALSE 0.040 187.000 0.000 1.000 N NA
 98110 98111 CC1287 CC1288     FALSE 0.252 -36.000 0.000 NA   NA
 98111 98112 CC1288 CC1289     FALSE 0.072 54.000 0.000 NA   NA
 98112 98113 CC1289 CC1290     FALSE 0.065 59.000 0.000 NA   NA
 98113 98114 CC1290 CC1291     FALSE 0.002 312.000 0.000 NA   NA
 98114 98115 CC1291 CC1292     TRUE 0.610 126.000 0.000 NA Y NA
 98116 98117 CC1293 CC1294     TRUE 0.992 1.000 0.464 1.000 Y NA
 98117 98118 CC1294 CC1295     FALSE 0.005 322.000 0.000 1.000 N NA
 98118 98119 CC1295 CC1296     FALSE 0.004 311.000 0.000 1.000   NA
 98120 98121 CC1297 CC1298     FALSE 0.336 129.000 0.029 1.000 N NA
 98121 98122 CC1298 CC1299     TRUE 0.831 2.000 0.021 1.000 N NA
 98122 98123 CC1299 CC1300     TRUE 0.975 4.000 0.600 1.000 N NA
 98123 98124 CC1300 CC1301     TRUE 0.967 0.000 0.019 1.000 Y NA
 98124 98125 CC1301 CC1302     FALSE 0.271 34.000 0.000 1.000 N NA
 98125 98126 CC1302 CC1303     FALSE 0.124 122.000 0.000 1.000   NA
 98126 98127 CC1303 CC1304     TRUE 0.967 0.000 0.344 1.000   NA
 98127 98128 CC1304 CC1305     TRUE 0.967 39.000 0.963 1.000 Y NA
 98128 98129 CC1305 CC1306     FALSE 0.019 231.000 0.000 1.000 N NA
 98130 98131 CC1307 CC1308     FALSE 0.010 306.000 0.021 NA   NA
 98132 98133 CC1309 CC1310     FALSE 0.224 152.000 0.024 1.000 N NA
 98133 98134 CC1310 CC1311     TRUE 0.920 61.000 0.323 0.007 Y NA
 98134 98135 CC1311 CC1312     FALSE 0.002 307.000 0.000 NA   NA
 98137 98138 CC1314 CC1315     TRUE 0.798 4.000 0.017 1.000 N NA
 98138 98139 CC1315 CC1316     FALSE 0.132 139.000 0.000 1.000 N NA
 98139 399451 CC1316 CC_t17   tRNA-Asn-1 FALSE 0.009 219.000 0.000 NA   NA
 399451 399452 CC_t17 CC_t18 tRNA-Asn-1 tRNA-Asn-2 FALSE 0.061 136.000 0.000 NA   NA
 399452 98140 CC_t18 CC1317 tRNA-Asn-2   FALSE 0.001 475.000 0.000 NA   NA
 98140 98141 CC1317 CC1318     FALSE 0.318 125.000 0.019 1.000 N NA
 98141 98142 CC1318 CC1319     FALSE 0.331 129.000 0.049 NA   NA
 98142 98143 CC1319 CC1320     FALSE 0.286 127.000 0.033 NA   NA
 98143 98144 CC1320 CC1321     FALSE 0.007 295.000 0.000 1.000 N NA
 98145 98146 CC1322 CC1323     FALSE 0.061 76.000 0.000 NA   NA
 98149 98150 CC1326 CC1327     TRUE 0.655 7.000 0.007 NA N NA
 98150 98151 CC1327 CC1328     FALSE 0.182 49.000 0.000 1.000 N NA
 98151 98152 CC1328 CC1329     FALSE 0.142 76.000 0.000 1.000 N NA
 98152 98153 CC1329 CC1330     FALSE 0.139 65.000 0.000 1.000 N NA
 98153 98154 CC1330 CC1331     FALSE 0.040 156.000 0.000 NA   NA
 98155 98156 CC1332 CC1333     TRUE 0.565 37.000 0.051 1.000 N NA
 98157 98158 CC1334 CC1335     FALSE 0.444 75.000 0.091 1.000   NA
 98158 98159 CC1335 CC1336     TRUE 0.725 27.000 0.107 1.000   NA
 98159 98160 CC1336 CC1337     TRUE 0.647 8.000 0.003 1.000 N NA
 98161 98162 CC1338 CC1339     TRUE 0.527 27.000 0.020 1.000 N NA
 98162 98163 CC1339 CC1340     FALSE 0.007 234.000 0.000 NA   NA
 98164 98165 CC1341 CC1342     TRUE 0.994 7.000 0.651 0.001 Y NA
 98166 98167 CC1343 CC1344     FALSE 0.009 218.000 0.000 NA   NA
 98169 98170 CC1346 CC1347     TRUE 0.800 -3.000 0.007 1.000 N NA
 98170 98171 CC1347 CC1348     FALSE 0.204 59.000 0.005 1.000 N NA
 98172 98173 CC1349 CC1350     FALSE 0.006 246.000 0.000 NA   NA
 98173 98174 CC1350 CC1351     TRUE 0.739 8.000 0.013 1.000 N NA
 98174 98175 CC1351 CC1352     TRUE 0.889 9.000 0.041 0.078 N NA
 98175 98176 CC1352 CC1353     FALSE 0.407 122.000 0.061 NA   NA
 98176 98177 CC1353 CC1354     FALSE 0.488 72.000 0.143 NA   NA
 98177 98178 CC1354 CC1355     FALSE 0.243 176.000 0.096 1.000 N NA
 98180 98181 CC1357 CC1358     TRUE 0.565 33.000 0.052 NA N NA
 98181 98182 CC1358 CC1359     FALSE 0.132 66.000 0.003 NA N NA
 98182 98183 CC1359 CC1360     TRUE 0.973 -3.000 0.347 1.000 N NA
 98183 98184 CC1360 CC1361     TRUE 0.892 -40.000 0.225 1.000 N NA
 98184 98185 CC1361 CC1362     FALSE 0.103 142.000 0.006 NA   NA
 98185 98186 CC1362 CC1363     FALSE 0.006 243.000 0.000 NA   NA
 98187 98188 CC1364 CC1365     FALSE 0.009 275.000 0.000 1.000 N NA
 98189 98190 CC1366 CC1367     TRUE 0.812 -15.000 0.071 NA   NA
 98190 98191 CC1367 CC1368     FALSE 0.122 176.000 0.044 NA   NA
 98191 98192 CC1368 CC1369     TRUE 0.992 6.000 0.380 0.004 Y NA
 98192 98193 CC1369 CC1370     FALSE 0.190 215.000 0.207 1.000 N NA
 98193 98194 CC1370 CC1371     TRUE 0.953 13.000 0.535 1.000 N NA
 98194 399453 CC1371 CC_t19   tRNA-Pro-2 FALSE 0.061 64.000 0.000 NA   NA
 98196 98197 CC1373 CC1374     FALSE 0.001 383.000 0.000 NA   NA
 98199 98200 CC1376 CC1377     TRUE 0.990 4.000 0.231 0.014 Y NA
 98200 98201 CC1377 CC1378     FALSE 0.414 92.000 0.049 1.000 N NA
 98202 98203 CC1379 CC1380     FALSE 0.066 88.000 0.000 NA   NA
 98204 98205 CC1381 CC1382     FALSE 0.231 109.000 0.018 NA   NA
 98205 98206 CC1382 CC1383     TRUE 0.918 37.000 0.202 1.000 Y NA
 98206 98207 CC1383 CC1384     TRUE 0.520 75.000 0.112 1.000 N NA
 98207 98208 CC1384 CC1385     TRUE 0.903 28.000 0.013 0.001 Y NA
 98208 98209 CC1385 CC1386     FALSE 0.163 68.000 0.002 1.000 N NA
 98209 399454 CC1386 CC_t20   tRNA-Glu-1 FALSE 0.066 130.000 0.000 NA   NA
 399454 399455 CC_t20 CC_t21 tRNA-Glu-1 tRNA-Glu-2 FALSE 0.086 46.000 0.000 NA   NA
 399455 98210 CC_t21 CC1387 tRNA-Glu-2   FALSE 0.001 569.000 0.000 NA   NA
 98210 98211 CC1387 CC1388     TRUE 0.885 -31.000 0.226 NA   NA
 98211 399456 CC1388 CC_t22   tRNA-Pro-3 FALSE 0.060 65.000 0.000 NA   NA
 399456 98212 CC_t22 CC1389 tRNA-Pro-3   FALSE 0.158 27.000 0.000 NA   NA
 98212 399457 CC1389 CC_t23   tRNA-Arg-1 FALSE 0.148 29.000 0.000 NA   NA
 98214 98215 CC1391 CC1392     TRUE 0.981 3.000 1.000 NA   NA
 98215 98216 CC1392 CC1393     FALSE 0.454 1.000 0.000 NA   NA
 98219 98220 CC1396 CC1397     FALSE 0.033 198.000 0.000 1.000 N NA
 98220 98221 CC1397 CC1398     FALSE 0.003 290.000 0.000 NA   NA
 98224 98225 CC1401 CC1402     TRUE 0.949 9.000 0.135 0.002 N NA
 98225 98226 CC1402 CC1403     TRUE 0.972 -3.000 0.143 0.002 N NA
 98226 98227 CC1403 CC1404     TRUE 0.976 0.000 0.217 0.002 N NA
 98227 98228 CC1404 CC1405     TRUE 0.984 6.000 0.116 0.011 Y NA
 98228 98229 CC1405 CC1406     TRUE 0.927 -3.000 0.092 NA N NA
 98229 98230 CC1406 CC1407     TRUE 0.987 -3.000 0.206 NA Y NA
 98230 98231 CC1407 CC1408     TRUE 0.994 -3.000 0.713 NA Y NA
 98231 98232 CC1408 CC1409     FALSE 0.176 131.000 0.007 NA N NA
 98232 98233 CC1409 CC1410     FALSE 0.043 182.000 0.000 1.000 N NA
 98233 98234 CC1410 CC1411     FALSE 0.199 45.000 0.000 1.000 N NA
 98241 98242 CC1418 CC1419     FALSE 0.163 41.000 0.000 1.000   NA
 98243 98244 CC1420 CC1421     FALSE 0.064 170.000 0.000 1.000 N NA
 98244 98245 CC1421 CC1422     TRUE 0.755 113.000 0.035 1.000 Y NA
 98245 98246 CC1422 CC1423     FALSE 0.095 71.000 0.000 1.000   NA
 98247 98248 CC1424 CC1425     TRUE 0.687 25.000 0.060 1.000 N NA
 98248 98249 CC1425 CC1426     FALSE 0.302 74.000 0.027 1.000 N NA
 98249 98250 CC1426 CC1427     FALSE 0.151 177.000 0.041 1.000 N NA
 98250 98251 CC1427 CC1428     FALSE 0.385 56.000 0.041 1.000 N NA
 98252 98253 CC1429 CC1430     TRUE 0.949 3.000 0.004 1.000 Y NA
 98253 98254 CC1430 CC1431     FALSE 0.195 102.000 0.006 NA N NA
 98254 98255 CC1431 CC1432     TRUE 0.953 11.000 0.065 NA Y NA
 98255 98256 CC1432 CC1433     TRUE 0.747 32.000 0.200 NA   NA
 98257 98258 CC1434 CC1435     TRUE 0.968 -3.000 0.367 NA   NA
 98260 98261 CC1437 CC1438     FALSE 0.189 43.000 0.007 NA   NA
 98261 98262 CC1438 CC1439     FALSE 0.442 66.000 0.107 NA   NA
 98262 98263 CC1439 CC1440     TRUE 0.986 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 98263 98264 CC1440 CC1441     TRUE 0.983 5.000 0.100 0.050 Y NA
 98264 98265 CC1441 CC1442     FALSE 0.301 108.000 0.015 1.000 N NA
 98266 98267 CC1443 CC1444     TRUE 0.880 0.000 0.060 NA   NA
 98267 98268 CC1444 CC1445     FALSE 0.112 131.000 0.000 NA N NA
 98268 98269 CC1445 CC1446     FALSE 0.009 279.000 0.000 1.000 N NA
 98269 98270 CC1446 CC1447     TRUE 0.926 78.000 0.756 NA Y NA
 98270 98271 CC1447 CC1448     TRUE 0.915 -9.000 0.000 NA Y NA
 98272 98273 CC1449 CC1450     FALSE 0.098 136.000 0.000 1.000   NA
 98273 98274 CC1450 CC1451     TRUE 0.773 -37.000 0.070 1.000   NA
 98275 98276 CC1452 CC1453     TRUE 0.717 32.000 0.154 NA   NA
 98277 98278 CC1454 CC1455     FALSE 0.240 99.000 0.020 NA   NA
 98278 98279 CC1455 CC1456     FALSE 0.222 109.000 0.010 1.000   NA
 98279 98280 CC1456 CC1457     FALSE 0.328 152.000 0.061 1.000 N NA
 98281 98282 CC1458 CC_1459   flaF TRUE 0.978 -40.000 0.500 NA Y NA
 98282 98283 CC_1459 CC1460 flaF   FALSE 0.099 248.000 0.000 NA Y NA
 98283 98284 CC1460 CC1461     FALSE 0.121 277.000 0.000 0.002 Y NA
 98284 98285 CC1461 CC1462     FALSE 0.078 113.000 0.000 NA   NA
 98285 10938639 CC1462 CC_1463     FALSE 0.018 180.000 0.000 NA   NA
 10938639 98286 CC_1463 CC1464     FALSE 0.059 66.000 0.000 NA   NA
 98286 98287 CC1464 CC1465     TRUE 0.672 80.000 0.375 NA   NA
 98287 98288 CC1465 CC1466     TRUE 0.754 62.000 0.625 NA   NA
 98288 98289 CC1466 CC1467     TRUE 0.949 18.000 0.833 NA   NA
 98289 98290 CC1467 CC1468     FALSE 0.140 257.000 0.429 NA   NA
 98290 98291 CC1468 CC1469     TRUE 0.670 51.000 0.286 NA   NA
 98293 98294 CC1471 CC1472     FALSE 0.063 84.000 0.000 NA   NA
 98297 98298 CC1475 CC1476     FALSE 0.069 90.000 0.000 NA   NA
 10938640 98300 CC_1478 CC1479     FALSE 0.004 273.000 0.000 NA   NA
 98301 98302 CC1480 CC1481     TRUE 0.654 2.000 0.008 NA   NA
 98303 98304 CC1482 CC1483     TRUE 0.984 0.000 0.390 0.001 N NA
 98305 98306 CC1484 CC1485   tipN FALSE 0.486 155.000 0.250 NA   NA
 98306 98307 CC1485 CC1486 tipN   TRUE 0.543 15.000 0.015 NA   NA
 98308 98309 CC1487 CC1488     TRUE 0.623 159.000 0.057 1.000 Y NA
 98310 98311 CC1489 CC1490     FALSE 0.485 108.000 0.066 1.000 N NA
 98311 98312 CC1490 CC1491     TRUE 0.895 25.000 0.049 1.000 Y NA
 98312 98313 CC1491 CC1492     TRUE 0.703 157.000 0.667 1.000 N NA
 98313 98314 CC1492 CC1493     FALSE 0.040 187.000 0.000 1.000 N NA
 98314 98315 CC1493 CC1494     FALSE 0.041 155.000 0.000 NA   NA
 98315 98316 CC1494 CC1495     FALSE 0.383 -6.000 0.000 NA   NA
 98316 98317 CC1495 CC1496     TRUE 0.962 7.000 0.051 1.000 Y NA
 98317 98318 CC1496 CC1497     FALSE 0.031 165.000 0.000 NA   NA
 98320 98321 CC1499 CC1500     FALSE 0.097 74.000 0.000 1.000   NA
 98321 98322 CC1500 CC1501     FALSE 0.177 112.000 0.000 1.000 N NA
 98322 98323 CC1501 CC1502     FALSE 0.143 77.000 0.000 1.000 N NA
 98324 98325 CC1503 CC1504     TRUE 0.910 -3.000 0.055 1.000 N NA
 98325 98326 CC1504 CC1505     TRUE 0.717 -3.000 0.000 1.000 N NA
 98328 98329 CC1507 CC1508     TRUE 0.652 115.000 0.000 1.000 Y NA
 98329 98330 CC1508 CC1509     TRUE 0.831 28.000 0.250 1.000 N NA
 98331 98332 CC1510 CC1511     FALSE 0.007 262.000 0.000 1.000   NA
 98332 98333 CC1511 CC1512     FALSE 0.206 72.000 0.022 NA   NA
 98336 98337 CC1515 CC1516     FALSE 0.128 125.000 0.000 NA N NA
 98337 98338 CC1516 CC1517     FALSE 0.008 286.000 0.000 1.000 N NA
 98339 98340 CC1518 CC1519     TRUE 0.957 -3.000 0.250 NA   NA
 98340 98341 CC1519 CC1520     TRUE 0.972 -3.000 0.444 NA   NA
 98343 98344 CC1522 CC1523     TRUE 0.976 -3.000 0.006 0.043 Y NA
 98344 98345 CC1523 CC1524     TRUE 0.773 -31.000 0.074 NA   NA
 98346 98347 CC1525 CC1526     FALSE 0.073 204.000 0.027 1.000 N NA
 98347 98348 CC1526 CC1527     FALSE 0.158 40.000 0.003 NA   NA
 98348 98349 CC1527 CC1528     FALSE 0.097 43.000 0.000 NA   NA
 98351 98352 CC1530 CC1531     FALSE 0.388 6.000 0.000 NA   NA
 98353 98354 CC1532 CC1533     FALSE 0.406 130.000 0.077 NA   NA
 98357 98358 CC1536 CC1537     TRUE 0.621 11.000 0.017 NA   NA
 98361 98362 CC1540 CC1541     FALSE 0.016 242.000 0.000 1.000 N NA
 98362 98363 CC1541 CC1542     FALSE 0.148 91.000 0.003 1.000   NA
 98363 98364 CC1542 CC1543     FALSE 0.003 354.000 0.000 1.000   NA
 98364 98365 CC1543 CC1544     TRUE 0.839 50.000 0.689 1.000 N NA
 98365 98366 CC1544 CC1545     TRUE 0.767 -3.000 0.015 NA   NA
 98366 98367 CC1545 CC1546     TRUE 0.917 5.000 0.156 NA   NA
 98367 98368 CC1546 CC1547     TRUE 0.935 -3.000 0.094 1.000 N NA
 98368 98369 CC1547 CC1548     TRUE 0.702 0.000 0.000 1.000 N NA
 98370 98371 CC1549 CC1550     TRUE 0.937 3.000 0.204 NA   NA
 98372 98373 CC1551 CC1552     FALSE 0.403 129.000 0.049 1.000 N NA
 98373 98374 CC1552 CC1553     TRUE 0.891 102.000 0.291 1.000 Y NA
 98378 98379 CC1557 CC1558     TRUE 0.971 -3.000 0.326 1.000 N NA
 98379 98380 CC1558 CC1559     FALSE 0.004 429.000 0.003 1.000 N NA
 98380 98381 CC1559 CC1560     FALSE 0.472 22.000 0.005 1.000 N NA
 98381 98382 CC1560 CC1561     FALSE 0.005 250.000 0.000 NA   NA
 98382 98383 CC1561 CC1562     FALSE 0.001 447.000 0.000 NA   NA
 98383 98384 CC1562 CC1563     TRUE 0.563 17.000 0.014 1.000   NA
 98384 98385 CC1563 CC1564     TRUE 0.601 -18.000 0.003 1.000 N NA
 98385 98386 CC1564 CC1565     FALSE 0.193 54.000 0.002 1.000 N NA
 98386 98387 CC1565 CC1566     FALSE 0.145 62.000 0.000 1.000 N NA
 98387 98388 CC1566 CC1567     FALSE 0.466 -87.000 0.003 1.000 N NA
 98388 98389 CC1567 CC1568     TRUE 0.764 112.000 0.000 0.004 Y NA
 98389 98390 CC1568 CC1569     TRUE 0.774 38.000 0.231 1.000 N NA
 98390 98391 CC1569 CC1570     TRUE 0.880 9.000 0.039 0.043   NA
 98391 98392 CC1570 CC1571     TRUE 0.845 13.000 0.039 0.043   NA
 98393 98394 CC1572 CC1573     FALSE 0.286 101.000 0.014 1.000 N NA
 98396 98397 CC1575 CC1576     TRUE 0.984 -3.000 0.029 0.001 Y NA
 98398 98399 CC1577 CC1578     FALSE 0.285 33.000 0.005 1.000   NA
 98401 98402 CC1580 CC1581     FALSE 0.468 27.000 0.012 1.000 N NA
 98402 98403 CC1581 CC1582     FALSE 0.035 236.000 0.015 1.000 N NA
 98403 98404 CC1582 CC1583     TRUE 0.961 126.000 0.750 0.004 Y NA
 98404 98405 CC1583 CC1584     TRUE 0.897 92.000 0.150 0.004 Y NA
 98406 98407 CC1585 CC1586     FALSE 0.101 42.000 0.000 NA   NA
 98408 98409 CC1587 CC1588     TRUE 0.995 0.000 0.360 0.001 Y NA
 399458 98411 CC_t24 CC1590 tRNA-Lys-2   FALSE 0.078 122.000 0.000 NA   NA
 98411 98412 CC1590 CC1591     FALSE 0.249 102.000 0.022 NA   NA
 98412 98413 CC1591 CC1592     TRUE 0.984 12.000 0.201 0.001 Y NA
 98413 98414 CC1592 CC1593     TRUE 0.985 28.000 0.877 0.001 Y NA
 98414 98415 CC1593 CC1594     TRUE 0.957 0.000 0.106 0.096 N NA
 98415 98416 CC1594 CC1595     TRUE 0.982 -67.000 0.695 1.000 Y NA
 98416 98417 CC1595 CC1596     FALSE 0.051 177.000 0.000 1.000 N NA
 98417 98418 CC1596 CC1597     TRUE 0.992 0.000 0.935 0.001 N NA
 98418 98419 CC1597 CC1598     TRUE 0.929 -43.000 0.050 1.000 Y NA
 98419 98420 CC1598 CC1599     TRUE 0.605 105.000 0.200 NA   NA
 98421 98422 CC1600 CC1601     TRUE 0.821 12.000 0.085 NA   NA
 98422 98423 CC1601 CC1602     TRUE 0.983 -3.000 0.805 NA   NA
 98424 98425 CC1603 CC1604     TRUE 0.835 -3.000 0.023 1.000   NA
 98425 98426 CC1604 CC1605     FALSE 0.119 102.000 0.000 1.000   NA
 98426 98427 CC1605 CC1606     TRUE 0.979 1.000 0.097 1.000 Y NA
 98427 98428 CC1606 CC1607     TRUE 0.984 -3.000 0.727 1.000 N NA
 98428 98429 CC1607 CC1608     TRUE 0.899 -3.000 0.045 1.000 N NA
 98429 98430 CC1608 CC1609     TRUE 0.870 -3.000 0.027 1.000 N NA
 98433 98434 CC1612 CC1613     FALSE 0.108 165.000 0.020 NA   NA
 98435 98436 CC1614 CC1615     TRUE 0.849 27.000 0.316 NA N NA
 98436 98437 CC1615 CC1616     TRUE 0.643 -3.000 0.000 NA N NA
 98437 98438 CC1616 CC1617     FALSE 0.164 93.000 0.000 1.000 N NA
 98438 98439 CC1617 CC1618     TRUE 0.570 4.000 0.004 NA   NA
 98439 98440 CC1618 CC1619     TRUE 0.761 0.000 0.016 NA   NA
 98440 98441 CC1619 CC1620     FALSE 0.374 33.000 0.013 NA N NA
 98442 98443 CC1621 CC1622     TRUE 0.873 14.000 0.154 1.000   NA
 98443 98444 CC1622 CC1623     TRUE 0.605 115.000 0.154 1.000   NA
 98444 98445 CC1623 CC1624     FALSE 0.011 205.000 0.000 NA   NA
 98446 10938641 CC1625 CC_1626     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 98448 98449 CC1628 CC1629     TRUE 0.970 1.000 0.500 NA   NA
 98449 98450 CC1629 CC1630     TRUE 0.890 0.000 0.068 NA   NA
 98450 98451 CC1630 CC1631     TRUE 0.965 0.000 0.347 NA   NA
 98451 98452 CC1631 CC1632     FALSE 0.338 58.000 0.040 NA N NA
 98454 98455 CC1634 CC1635     TRUE 0.982 0.000 0.800 NA   NA
 98455 98456 CC1635 CC1636     FALSE 0.075 105.000 0.000 NA   NA
 98457 98458 CC1637 CC1638     TRUE 0.906 3.000 0.107 NA   NA
 98458 98459 CC1638 CC1639     FALSE 0.252 174.000 0.107 NA N NA
 98459 98460 CC1639 CC1640     TRUE 0.992 -10.000 1.000 NA Y NA
 98461 98462 CC1641 CC1642     FALSE 0.247 48.000 0.005 1.000 N NA
 98462 98463 CC1642 CC1643     FALSE 0.205 52.000 0.008 1.000   NA
 98463 98464 CC1643 CC1644     FALSE 0.307 37.000 0.015 NA   NA
 98464 98465 CC1644 CC1645     TRUE 0.930 13.000 0.400 NA   NA
 98465 98466 CC1645 CC1646     TRUE 0.977 0.000 0.625 NA   NA
 98466 98467 CC1646 CC1647     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 98469 98470 CC1649 CC1650     TRUE 0.915 -79.000 0.500 NA   NA
 98470 98471 CC1650 CC1651     FALSE 0.054 162.000 0.003 NA   NA
 98471 98472 CC1651 CC1652     FALSE 0.191 153.000 0.026 1.000   NA
 98472 98473 CC1652 CC1653     TRUE 0.948 -3.000 0.154 1.000   NA
 98473 98474 CC1653 CC1654     TRUE 0.627 126.000 0.203 1.000   NA
 98475 98476 CC1655 CC1656     FALSE 0.027 186.000 0.000 1.000   NA
 98476 98477 CC1656 CC1657     FALSE 0.250 49.000 0.013 1.000   NA
 98477 98478 CC1657 CC1658     FALSE 0.436 20.000 0.007 1.000   NA
 98478 98479 CC1658 CC1659     TRUE 0.931 -3.000 0.101 1.000   NA
 98479 98480 CC1659 CC1660     TRUE 0.926 -3.000 0.094 1.000   NA
 98480 98481 CC1660 CC1661     FALSE 0.173 74.000 0.003 1.000 N NA
 98481 98482 CC1661 CC1662     TRUE 0.545 40.000 0.065 NA N NA
 98482 98483 CC1662 CC1663     FALSE 0.115 58.000 0.000 NA N NA
 98485 98486 CC1665 CC1666     FALSE 0.026 210.000 0.000 1.000 N NA
 98486 98487 CC1666 CC1667     FALSE 0.034 205.000 0.002 1.000 N NA
 98487 98488 CC1667 CC1668     TRUE 0.988 14.000 0.499 0.014 Y NA
 98488 98489 CC1668 CC1669     TRUE 0.984 15.000 0.319 0.014 Y NA
 98491 98492 CC1671 CC1672     TRUE 0.731 59.000 0.444 NA N NA
 98492 98493 CC1672 CC1673     FALSE 0.269 72.000 0.019 1.000 N NA
 98494 98495 CC1674 CC1675     TRUE 0.984 19.000 0.432 0.004 Y NA
 98495 98496 CC1675 CC1676     FALSE 0.286 22.000 0.000 1.000   NA
 98496 98497 CC1676 CC1677     FALSE 0.050 165.000 0.000 1.000   NA
 98497 98498 CC1677 CC1678     TRUE 0.647 167.000 0.106 1.000 Y NA
 98498 98499 CC1678 CC1679     TRUE 0.935 -3.000 0.134 NA   NA
 98499 98500 CC1679 CC1680     TRUE 0.852 4.000 0.060 NA   NA
 98500 98501 CC1680 CC1681     TRUE 0.933 -7.000 0.276 NA   NA
 98502 98503 CC1682 CC1683     FALSE 0.124 113.000 0.000 1.000   NA
 98503 98504 CC1683 CC1684     FALSE 0.063 83.000 0.000 NA   NA
 98504 98505 CC1684 CC1685     FALSE 0.061 64.000 0.000 NA   NA
 98505 98506 CC1685 CC1686     TRUE 0.651 99.000 0.197 1.000 N NA
 98506 98507 CC1686 CC1688     TRUE 0.981 -3.000 0.561 1.000 N NA
 98507 98508 CC1688 CC1689     TRUE 0.889 11.000 0.112 1.000 N NA
 98508 98509 CC1689 CC1690     TRUE 0.911 -7.000 0.153 1.000   NA
 98509 98510 CC1690 CC1691     TRUE 0.987 -3.000 0.631 0.049   NA
 98511 98512 CC1692 CC1693     TRUE 0.688 121.000 0.230 1.000 N NA
 98512 98513 CC1693 CC1694     FALSE 0.445 -81.000 0.012 NA   NA
 98516 98517 CC1697 CC1698     FALSE 0.225 54.000 0.019 NA   NA
 98518 10938642 CC1699 CC_1700     FALSE 0.062 81.000 0.000 NA   NA
 98519 98520 CC1701 CC1702     FALSE 0.062 79.000 0.000 NA   NA
 98520 98521 CC1702 CC1703     TRUE 0.840 161.000 0.230 0.002 Y NA
 98522 98523 CC1704 CC1705     FALSE 0.013 250.000 0.000 1.000 N NA
 98523 98524 CC1705 CC1706     FALSE 0.087 159.000 0.000 1.000 N NA
 98525 98526 CC1707 CC1708     FALSE 0.174 72.000 0.015 NA   NA
 98526 98527 CC1708 CC1709     FALSE 0.199 91.000 0.015 NA   NA
 98527 98528 CC1709 CC1710     TRUE 0.632 -3.000 0.004 NA   NA
 98528 98529 CC1710 CC1711     TRUE 0.590 53.000 0.134 1.000 N NA
 98529 98530 CC1711 CC1712     FALSE 0.021 177.000 0.000 NA   NA
 98530 98531 CC1712 CC1713     FALSE 0.196 -133.000 0.000 NA   NA
 98532 98533 CC1714 CC1715     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 98534 98535 CC1716 CC1717     FALSE 0.005 255.000 0.000 NA   NA
 98535 98536 CC1717 CC1718     FALSE 0.021 176.000 0.000 NA   NA
 98537 98538 CC1719 CC1720     TRUE 0.536 116.000 0.083 1.000 N NA
 98538 98539 CC1720 CC1721     FALSE 0.233 115.000 0.004 1.000 N NA
 98539 98540 CC1721 CC1722     FALSE 0.160 124.000 0.003 1.000   NA
 98542 98543 CC1724 CC1725     FALSE 0.012 354.000 0.032 1.000 N NA
 98543 98544 CC1725 CC1726     FALSE 0.326 166.000 0.104 1.000 N NA
 98544 98545 CC1726 CC1727     TRUE 0.996 -3.000 0.456 0.001 Y NA
 98545 98546 CC1727 CC1728     FALSE 0.388 6.000 0.000 NA   NA
 98546 98547 CC1728 CC1729     FALSE 0.073 126.000 0.000 NA   NA
 98547 98548 CC1729 CC1730     TRUE 0.584 19.000 0.013 1.000 N NA
 98548 98549 CC1730 CC1731     FALSE 0.253 83.000 0.014 1.000 N NA
 98549 98550 CC1731 CC1732     FALSE 0.369 20.000 0.007 NA   NA
 98551 98552 CC1733 CC1734     TRUE 0.647 89.000 0.011 NA Y NA
 98553 98554 CC1735 CC1736     TRUE 0.894 4.000 0.081 NA N NA
 98555 98556 CC1737 CC1738     TRUE 0.508 39.000 0.061 NA   NA
 98557 98558 CC1739 CC1740     TRUE 0.729 27.000 0.094 1.000 N NA
 98558 98559 CC1740 CC1741     TRUE 0.993 -3.000 0.297 0.086 Y NA
 98559 98560 CC1741 CC1742     TRUE 0.819 158.000 0.205 0.082 Y NA
 98560 98561 CC1742 CC1743     TRUE 0.995 -3.000 0.533 0.082 Y NA
 98561 98562 CC1743 CC1744     TRUE 0.918 1.000 0.085 1.000 N NA
 98562 98563 CC1744 CC1745     FALSE 0.478 158.000 0.243 1.000   NA
 98563 98564 CC1745 CC1746     FALSE 0.483 70.000 0.115 1.000   NA
 98565 98566 CC1747 CC1748     FALSE 0.458 -37.000 0.004 1.000   NA
 98567 98568 CC1749 CC1750     FALSE 0.001 478.000 0.000 NA   NA
 98568 98569 CC1750 CC1751     TRUE 0.603 66.000 0.003 1.000 Y NA
 98571 98572 CC1753 CC1754     TRUE 0.644 135.000 0.250 1.000 N NA
 98572 98573 CC1754 CC1755     TRUE 0.725 115.000 0.375 NA   NA
 98573 98574 CC1755 CC1756     FALSE 0.178 24.000 0.000 NA   NA
 98574 98575 CC1756 CC1757     TRUE 0.877 0.000 0.000 0.017 N NA
 98576 98577 CC1758 CC1759     TRUE 0.994 -3.000 0.626 1.000 Y NA
 98582 98583 CC1764 CC1765     FALSE 0.073 342.000 0.054 1.000 Y NA
 98584 98585 CC1766 CC1767     FALSE 0.005 283.000 0.000 1.000   NA
 98585 98586 CC1767 CC1768     TRUE 0.991 -7.000 0.682 1.000 Y NA
 98586 98587 CC1768 CC1769     TRUE 0.948 -3.000 0.188 NA   NA
 98587 98588 CC1769 CC1770     TRUE 0.819 57.000 0.849 NA   NA
 98588 98589 CC1770 CC1771     TRUE 0.997 -3.000 0.906 0.051 Y NA
 98589 98590 CC1771 CC1772     TRUE 0.996 3.000 0.847 0.051 Y NA
 98590 98591 CC1772 CC1773     TRUE 0.990 19.000 0.915 0.011 Y NA
 98592 98593 CC1774 CC1775     FALSE 0.072 93.000 0.000 NA   NA
 98593 98594 CC1775 CC1776     FALSE 0.050 145.000 0.000 NA   NA
 98594 98595 CC1776 CC1777     FALSE 0.153 130.000 0.000 1.000 N NA
 98595 98596 CC1777 CC1778     TRUE 0.867 -57.000 0.000 1.000 Y NA
 98596 98597 CC1778 CC1779     FALSE 0.253 27.000 0.000 NA N NA
 98597 98598 CC1779 CC1780     FALSE 0.068 57.000 0.000 NA   NA
 98598 98599 CC1780 CC1781     FALSE 0.063 83.000 0.000 NA   NA
 98599 98600 CC1781 CC1782     TRUE 0.970 3.000 0.500 1.000   NA
 98600 98601 CC1782 CC1783     FALSE 0.005 258.000 0.000 NA   NA
 98602 98603 CC1784 CC1785     FALSE 0.046 149.000 0.000 NA   NA
 98604 98605 CC1786 CC1787     TRUE 0.774 89.000 0.500 1.000 N NA
 98605 98606 CC1787 CC1788     TRUE 0.986 -3.000 0.857 NA N NA
 98606 98607 CC1788 CC1789     FALSE 0.210 20.000 0.000 NA   NA
 98608 98609 CC1790 CC1791     TRUE 0.974 3.000 0.600 1.000   NA
 98609 98610 CC1791 CC1792     TRUE 0.794 145.000 1.000 NA N NA
 98610 98611 CC1792 CC1793     FALSE 0.306 12.000 0.000 NA   NA
 98612 98613 CC1794 CC1795     FALSE 0.403 5.000 0.000 NA   NA
 98614 98615 CC1796 CC1797     FALSE 0.006 240.000 0.000 NA   NA
 98620 98621 CC1802 CC1803     FALSE 0.320 77.000 0.000 0.042 N NA
 98621 98622 CC1803 CC1804     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 98622 98623 CC1804 CC1805     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 98623 98624 CC1805 CC1806     TRUE 0.729 119.000 0.333 NA N NA
 98624 98625 CC1806 CC1807     TRUE 0.990 8.000 0.333 0.006 Y NA
 98626 98627 CC1808 CC1809     FALSE 0.036 192.000 0.000 1.000 N NA
 98628 98629 CC1810 CC1811     FALSE 0.065 59.000 0.000 NA   NA
 98633 98634 CC1816 CC1817     FALSE 0.265 15.000 0.000 NA   NA
 98637 98638 CC1820 CC1821     FALSE 0.004 271.000 0.000 NA   NA
 98638 98639 CC1821 CC1822     TRUE 0.936 -3.000 0.139 NA   NA
 98639 98640 CC1822 CC1823     TRUE 0.974 -3.000 0.046 NA Y NA
 98640 98641 CC1823 CC1824     TRUE 0.976 -3.000 0.254 0.085 N NA
 98641 98642 CC1824 CC1825     FALSE 0.173 108.000 0.003 NA N NA
 399459 98643 CC_t25 CC1826 tRNA-Ser-2   FALSE 0.001 453.000 0.000 NA   NA
 98643 98644 CC1826 CC1827     TRUE 0.868 -3.000 0.046 NA   NA
 98644 98645 CC1827 CC1828     TRUE 0.968 11.000 0.931 NA   NA
 98645 98646 CC1828 CC1829     TRUE 0.966 11.000 0.835 NA   NA
 98646 98647 CC1829 CC1830     TRUE 0.977 -3.000 0.437 1.000 N NA
 98648 98649 CC1831 CC1832     TRUE 0.995 0.000 0.797 1.000 Y NA
 98649 98650 CC1832 CC1833     TRUE 0.955 56.000 0.719 0.042 Y NA
 98650 98651 CC1833 CC1834     FALSE 0.001 477.000 0.000 NA   NA
 98651 98652 CC1834 CC1835     FALSE 0.061 64.000 0.000 NA   NA
 98653 98654 CC1836 CC1837     FALSE 0.126 95.000 0.000 NA N NA
 98654 98655 CC1837 CC1838     TRUE 0.960 12.000 0.088 1.000 Y NA
 98655 98656 CC1838 CC1839     TRUE 0.739 -7.000 0.013 1.000 N NA
 98657 98658 CC1840 CC1841     FALSE 0.376 141.000 0.074 1.000   NA
 98659 98660 CC1842 CC1843     FALSE 0.321 82.000 0.029 1.000 N NA
 98661 98662 CC1844 CC1845     TRUE 0.868 5.000 0.078 NA   NA
 98662 98663 CC1845 CC1846     FALSE 0.261 -33.000 0.000 NA   NA
 98665 98666 CC1848 CC1849     TRUE 0.826 33.000 0.333 NA N NA
 98667 98668 CC1850 CC1851     TRUE 0.634 137.000 0.250 1.000 N NA
 98669 98670 CC1852 CC1853     FALSE 0.075 105.000 0.000 NA   NA
 98670 98671 CC1853 CC1854     TRUE 0.970 1.000 0.500 NA   NA
 98672 98673 CC1855 CC1856     TRUE 0.974 -3.000 0.375 1.000 N NA
 98674 98675 CC1857 CC1858     TRUE 0.781 0.000 0.020 NA   NA
 98675 98676 CC1858 CC1859     TRUE 0.624 93.000 0.240 NA   NA
 98676 98677 CC1859 CC1860     TRUE 0.939 8.000 0.309 NA   NA
 98677 98678 CC1860 CC1861     TRUE 0.955 0.000 0.193 1.000 N NA
 98678 98679 CC1861 CC1862     TRUE 0.993 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 98679 98680 CC1862 CC1863     FALSE 0.367 -7.000 0.000 NA   NA
 98680 98681 CC1863 CC1864     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 98681 98682 CC1864 CC1865     TRUE 0.938 0.000 0.109 1.000 N NA
 98682 98683 CC1865 CC1866     TRUE 0.955 -3.000 0.168 1.000 N NA
 98685 98686 CC1868 CC1869     FALSE 0.145 62.000 0.000 1.000 N NA
 98687 98688 CC1870 CC1871     FALSE 0.239 128.000 0.008 1.000 N NA
 98688 98689 CC1871 CC1872     FALSE 0.023 234.000 0.004 1.000 N NA
 98689 98690 CC1872 CC1873     TRUE 0.945 -19.000 0.053 NA Y NA
 98691 98692 CC1874 CC1875     FALSE 0.359 79.000 0.041 1.000 N NA
 98692 98693 CC1875 CC1876     TRUE 0.663 188.000 0.396 1.000 Y NA
 98694 98695 CC1877 CC1878     TRUE 0.519 32.000 0.039 1.000   NA
 98695 98696 CC1878 CC1879     TRUE 0.696 25.000 0.079 1.000   NA
 98697 98698 CC1880 CC1881     TRUE 0.776 145.000 0.130 1.000 Y NA
 98699 98700 CC1882 CC1883     FALSE 0.366 61.000 0.042 1.000 N NA
 98700 98701 CC1883 CC1884     TRUE 0.987 6.000 0.153 0.001 Y NA
 98701 98702 CC1884 CC1885     TRUE 0.577 100.000 0.114 1.000 N NA
 98703 98704 CC1886 CC1887     TRUE 0.899 -28.000 0.260 NA   NA
 98704 98705 CC1887 CC1888     FALSE 0.062 78.000 0.000 NA   NA
 98706 98707 CC1889 CC1890     FALSE 0.232 72.000 0.029 NA   NA
 98707 98708 CC1890 CC1891     FALSE 0.010 212.000 0.000 NA   NA
 98709 98710 CC1892 CC1893     FALSE 0.173 131.000 0.002 1.000 N NA
 98711 98712 CC1894 CC1895     TRUE 0.928 0.000 0.106 1.000   NA
 98714 98715 CC1897 CC1898     TRUE 0.945 9.000 0.019 1.000 Y NA
 98715 98716 CC1898 CC1899     TRUE 0.990 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 98716 98717 CC1899 CC1900     FALSE 0.169 96.000 0.000 1.000 N NA
 98717 98718 CC1900 CC1901     FALSE 0.306 51.000 0.000 0.073   NA
 98718 98719 CC1901 CC1902     FALSE 0.180 138.000 0.011 1.000   NA
 98720 98721 CC1903 CC1904     FALSE 0.206 28.000 0.002 NA   NA
 98722 98723 CC1905 CC1906     TRUE 0.522 68.000 0.127 1.000 N NA
 98724 98725 CC1907 CC1908     TRUE 0.903 -3.000 0.061 1.000   NA
 98725 98726 CC1908 CC1909     FALSE 0.141 86.000 0.003 1.000   NA
 98726 98727 CC1909 CC1910     TRUE 0.946 -3.000 0.173 NA   NA
 98727 98728 CC1910 CC1911     TRUE 0.956 10.000 0.552 NA   NA
 98728 98729 CC1911 CC1912     TRUE 0.966 -3.000 0.264 1.000 N NA
 98729 98730 CC1912 CC1913     TRUE 0.950 3.000 0.212 1.000 N NA
 98730 98731 CC1913 CC1914     TRUE 0.777 54.000 0.060 1.000 Y NA
 98731 98732 CC1914 CC1915     TRUE 0.980 3.000 0.123 1.000 Y NA
 98732 98733 CC1915 CC1916     TRUE 0.840 72.000 0.204 1.000 Y NA
 98733 98734 CC1916 CC1917     TRUE 0.921 23.000 0.568 1.000 N NA
 98734 98735 CC1917 CC1918     TRUE 0.984 -12.000 0.372 1.000 Y NA
 98735 98736 CC1918 CC1919     TRUE 0.981 -22.000 0.400 1.000 Y NA
 98736 98737 CC1919 CC1920     TRUE 0.765 52.000 0.409 1.000 N NA
 98737 98738 CC1920 CC1921     TRUE 0.912 27.000 0.626 1.000 N NA
 98738 98739 CC1921 CC1922     FALSE 0.451 178.000 0.416 1.000 N NA
 98739 98740 CC1922 CC1923     TRUE 0.920 140.000 0.748 1.000 Y NA
 98742 98743 CC1925 CC1926     FALSE 0.060 168.000 0.002 1.000   NA
 98743 98744 CC1926 CC1927     FALSE 0.122 36.000 0.000 NA   NA
 98746 98747 CC1929 CC1930     TRUE 0.969 -7.000 0.620 1.000 N NA
 98747 98748 CC1930 CC1931     TRUE 0.920 0.000 0.076 1.000 N NA
 98748 98749 CC1931 CC1932     FALSE 0.002 435.000 0.006 NA   NA
 98749 98750 CC1932 CC1933     TRUE 0.941 0.000 0.172 NA   NA
 98750 98751 CC1933 CC1934     TRUE 0.535 109.000 0.105 1.000   NA
 98751 98752 CC1934 CC1935     TRUE 0.912 0.000 0.080 1.000   NA
 98752 98753 CC1935 CC1936     TRUE 0.923 -3.000 0.071 1.000 N NA
 98753 98754 CC1936 CC1937     TRUE 0.967 2.000 0.372 1.000 N NA
 98754 98755 CC1937 CC1938     TRUE 0.993 8.000 0.453 0.001 Y NA
 98755 98756 CC1938 CC1939     TRUE 0.983 15.000 0.251 0.001 Y NA
 98756 98757 CC1939 CC1940     TRUE 0.992 9.000 0.451 0.005 Y NA
 98757 98758 CC1940 CC1941     TRUE 0.996 -3.000 0.484 0.002 Y NA
 98758 98759 CC1941 CC1942     TRUE 0.934 83.000 0.442 0.005 Y NA
 98759 98760 CC1942 CC1943     FALSE 0.470 11.000 0.004 NA   NA
 98760 98761 CC1943 CC1944     TRUE 0.980 -3.000 0.667 NA   NA
 98761 98762 CC1944 CC1945     TRUE 0.681 0.000 0.008 NA   NA
 98762 98763 CC1945 CC1946     TRUE 0.994 5.000 0.515 0.005 Y NA
 98763 98764 CC1946 CC1947     TRUE 0.992 6.000 0.395 0.005 Y NA
 98764 98765 CC1947 CC1948     TRUE 0.596 4.000 0.006 NA   NA
 98765 98766 CC1948 CC1949     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 98766 98767 CC1949 CC1950     TRUE 0.612 2.000 0.005 NA   NA
 98767 98768 CC1950 CC1951     TRUE 0.743 -3.000 0.012 NA   NA
 98768 98769 CC1951 CC1952     TRUE 0.801 -3.000 0.021 NA   NA
 98769 98770 CC1952 CC1953     FALSE 0.068 57.000 0.000 NA   NA
 98770 98771 CC1953 CC1954     FALSE 0.193 22.000 0.000 NA   NA
 98771 98772 CC1954 CC1955     TRUE 0.994 -3.000 0.262 0.002 Y NA
 98772 98773 CC1955 CC1956     TRUE 0.991 -9.000 0.396 0.002 Y NA
 399460 399461 CC_t26 CC_t27 tRNA-Asp-1 tRNA-Asp-2 FALSE 0.060 65.000 0.000 NA   NA
 399461 98774 CC_t27 CC1957 tRNA-Asp-2   FALSE 0.065 59.000 0.000 NA   NA
 98775 399485 CC1958 CC_t28   tRNA-Val-1 FALSE 0.002 303.000 0.000 NA   NA
 399485 98776 CC_t28 CC1959 tRNA-Val-1   FALSE 0.076 107.000 0.000 NA   NA
 98776 98777 CC1959 CC1960     FALSE 0.194 144.000 0.010 1.000 N NA
 98777 98778 CC1960 CC1961     FALSE 0.133 395.000 0.201 0.084 Y NA
 98780 98781 CC1963 CC1964     TRUE 0.703 178.000 0.351 1.000 Y NA
 98781 399484 CC1964 CC_t29   tRNA-Leu-1 FALSE 0.017 185.000 0.000 NA   NA
 399484 98782 CC_t29 CC1965 tRNA-Leu-1   FALSE 0.089 45.000 0.000 NA   NA
 98782 98783 CC1965 CC1966     TRUE 0.925 10.000 0.008 NA Y NA
 98783 98784 CC1966 CC1967     TRUE 0.781 6.000 0.027 NA N NA
 98785 98786 CC1968 CC1969     TRUE 0.877 44.000 0.145 1.000 Y NA
 98786 98787 CC1969 CC1970     FALSE 0.153 130.000 0.000 1.000 N NA
 98789 98790 CC1972 CC1973     TRUE 0.997 0.000 0.874 0.005 Y NA
 98790 98791 CC1973 CC1974     FALSE 0.047 199.000 0.006 1.000 N NA
 98792 98793 CC1975 CC1976     FALSE 0.111 128.000 0.000 1.000   NA
 98793 98794 CC1976 CC1977     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 98795 98796 CC1978 CC1979     TRUE 0.969 -3.000 0.378 NA   NA
 98797 98798 CC1980 CC1981     TRUE 0.930 -3.000 0.083 1.000 N NA
 98800 98801 CC1983 CC1984     FALSE 0.503 83.000 0.117 1.000   NA
 98801 98802 CC1984 CC_1985   lpxC FALSE 0.449 113.000 0.064 1.000   NA
 98804 98805 CC1987 CC1988     FALSE 0.255 72.000 0.035 NA   NA
 98805 98806 CC1988 CC1989     FALSE 0.236 96.000 0.020 NA   NA
 98806 98807 CC1989 CC1990     TRUE 0.760 0.000 0.016 NA   NA
 98807 98808 CC1990 CC1991     TRUE 0.967 13.000 0.044 0.001 Y NA
 98808 98809 CC1991 CC1992     TRUE 0.669 158.000 0.099 NA Y NA
 98810 98811 CC1993 CC1994     FALSE 0.061 75.000 0.000 NA   NA
 98811 98812 CC1994 CC1995     TRUE 0.514 6.000 0.000 1.000   NA
 98813 98814 CC1996 CC1997     TRUE 0.519 93.000 0.089 1.000 N NA
 98814 98815 CC1997 CC1998     TRUE 0.945 -3.000 0.147 1.000   NA
 98815 98816 CC1998 CC1999     TRUE 0.899 -3.000 0.058 1.000   NA
 98816 98817 CC1999 CC2000     FALSE 0.108 40.000 0.000 NA   NA
 98817 98818 CC2000 CC2001     FALSE 0.010 211.000 0.000 NA   NA
 98818 98819 CC2001 CC2002     TRUE 0.963 -3.000 0.014 NA Y NA
 98819 98820 CC2002 CC2003     TRUE 0.774 85.000 0.016 0.006 Y NA
 98820 98821 CC2003 CC2004     FALSE 0.385 134.000 0.060 NA N NA
 98821 98822 CC2004 CC2005     TRUE 0.977 -3.000 0.570 NA   NA
 98822 98823 CC2005 CC2006     TRUE 0.923 -3.000 0.103 NA   NA
 98823 98824 CC2006 CC2007     TRUE 0.649 9.000 0.016 NA   NA
 98824 98825 CC2007 CC2008     FALSE 0.087 170.000 0.018 NA   NA
 98828 98829 CC2011 CC2012     FALSE 0.480 40.000 0.046 1.000   NA
 98835 98836 CC2018 CC2019     FALSE 0.338 89.000 0.051 NA   NA
 98837 98838 CC2020 CC2021     FALSE 0.079 119.000 0.000 NA   NA
 98839 98840 CC2022 CC2023     TRUE 0.749 8.000 0.033 NA   NA
 98841 98842 CC2024 CC2025     TRUE 0.928 0.000 0.130 NA   NA
 98842 98843 CC2025 CC2026     FALSE 0.271 62.000 0.037 NA   NA
 98843 98844 CC2026 CC2027     FALSE 0.004 275.000 0.000 NA   NA
 98844 98845 CC2027 CC2028     FALSE 0.002 484.000 0.000 1.000   NA
 98845 98846 CC2028 CC2029     FALSE 0.219 49.000 0.003 1.000 N NA
 98846 98847 CC2029 CC2030     FALSE 0.007 232.000 0.000 NA   NA
 98847 98848 CC2030 CC2031     TRUE 0.863 12.000 0.133 NA   NA
 98849 98850 CC2032 CC2033     TRUE 0.780 12.000 0.038 1.000 N NA
 98853 98854 CC2036 CC2037     FALSE 0.079 115.000 0.000 NA   NA
 98854 98855 CC2037 CC2038     FALSE 0.063 83.000 0.000 NA   NA
 98855 98856 CC2038 CC2039     FALSE 0.109 57.000 0.000 1.000   NA
 98857 98858 CC2040 CC2041     TRUE 0.973 -3.000 0.460 NA   NA
 98858 10938643 CC2041 CC_2042     FALSE 0.059 67.000 0.000 NA   NA
 10938643 98859 CC_2042 CC2043     FALSE 0.194 -135.000 0.000 NA   NA
 98860 10938644 CC2044 CC_2045     FALSE 0.006 244.000 0.000 NA   NA
 98863 98864 CC2048 CC2049     FALSE 0.078 114.000 0.000 NA   NA
 98864 98865 CC2049 CC2050     TRUE 0.707 73.000 0.000 0.006 Y NA
 98866 98867 CC2051 CC2052     TRUE 0.853 20.000 0.000 1.000 Y NA
 98867 98868 CC2052 CC2053     FALSE 0.007 298.000 0.000 1.000 N NA
 98868 98869 CC2053 CC2054     FALSE 0.150 86.000 0.000 1.000 N NA
 98869 98870 CC2054 CC2055     TRUE 0.941 15.000 0.058 1.000 Y NA
 98870 98871 CC2055 CC2056     TRUE 0.980 7.000 0.202 1.000 Y NA
 98871 98872 CC2056 CC2057     TRUE 0.983 3.000 0.163 1.000 Y NA
 98872 98873 CC2057 CC2058     FALSE 0.003 324.000 0.000 1.000   NA
 98873 98874 CC2058 CC2059     TRUE 0.956 10.000 0.556 NA   NA
 98874 98875 CC2059 CC2060     TRUE 0.981 -3.000 0.714 NA   NA
 98875 10938645 CC2060 CC_2061     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 98876 98877 CC2063 CC2064     TRUE 0.983 14.000 0.235 0.001 Y NA
 98877 98878 CC2064 CC2065     TRUE 0.960 5.000 0.043 NA Y NA
 98878 98879 CC2065 CC2066     TRUE 0.932 13.000 0.035 NA Y NA
 98879 98880 CC2066 CC2067     FALSE 0.068 57.000 0.000 NA   NA
 98881 98882 CC2068 CC2069     TRUE 0.944 18.000 0.088 1.000 Y NA
 98882 98883 CC2069 CC2070     TRUE 0.593 38.000 0.062 1.000 N NA
 98883 98884 CC2070 CC2071     FALSE 0.075 98.000 0.000 NA   NA
 98884 98885 CC2071 CC2072     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 98886 98887 CC2073 CC2074     FALSE 0.084 169.000 0.015 NA   NA
 98888 98889 CC2075 CC2076     TRUE 0.949 12.000 0.500 1.000   NA
 98890 98891 CC2077 CC2078     FALSE 0.500 -3.000 0.000 NA   NA
 98893 98894 CC2080 CC2081     FALSE 0.002 323.000 0.000 NA   NA
 98895 98896 CC2082 CC2083     FALSE 0.334 63.000 0.044 NA N NA
 98896 98897 CC2083 CC2084     TRUE 0.812 -3.000 0.015 NA N NA
 98897 98898 CC2084 CC2085     FALSE 0.156 44.000 0.000 NA N NA
 98899 98900 CC2086 CC2087     FALSE 0.223 19.000 0.000 NA   NA
 98901 98902 CC2088 CC2089     FALSE 0.246 63.000 0.020 NA N NA
 98903 98904 CC2090 CC2091     TRUE 0.989 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 98904 98905 CC2091 CC2092     TRUE 0.974 21.000 0.500 1.000 Y NA
 98905 98906 CC2092 CC2093     FALSE 0.002 1135.000 0.000 1.000 N NA
 98906 98907 CC2093 CC2094     FALSE 0.145 231.000 0.000 1.000 Y NA
 98908 98909 CC2095 CC2096     FALSE 0.106 88.000 0.000 1.000   NA
 98909 98910 CC2096 CC2097     TRUE 0.746 -3.000 0.007 1.000   NA
 98911 98912 CC2098 CC2099     TRUE 0.760 -3.000 0.014 NA   NA
 98912 98913 CC2099 CC2100     FALSE 0.001 464.000 0.000 NA   NA
 98913 98914 CC2100 CC2101     TRUE 0.928 43.000 0.146 0.001 Y NA
 98914 2166145 CC2101 CC_s01     FALSE 0.059 71.000 0.000 NA   NA
 2166145 98915 CC_s01 CC2102     FALSE 0.004 262.000 0.000 NA   NA
 98915 98916 CC2102 CC2103     TRUE 0.882 -3.000 0.055 NA   NA
 98916 98917 CC2103 CC2104     TRUE 0.881 8.000 0.108 NA   NA
 98917 98918 CC2104 CC2105     FALSE 0.487 79.000 0.108 1.000   NA
 98918 98919 CC2105 CC2106     TRUE 0.652 81.000 0.333 NA   NA
 98920 98921 CC2107 CC2108     TRUE 0.539 -42.000 0.018 NA   NA
 98922 98923 CC2109 CC2110     TRUE 0.582 8.000 0.003 1.000   NA
 98924 98925 CC2111 CC2112     FALSE 0.068 89.000 0.000 NA   NA
 98925 98926 CC2112 CC2113     TRUE 0.583 1.000 0.004 NA   NA
 98932 98933 CC2119 CC2120     FALSE 0.056 139.000 0.000 NA   NA
 98933 98934 CC2120 CC2121     FALSE 0.002 307.000 0.000 NA   NA
 98935 98936 CC2122 CC2123     FALSE 0.185 77.000 0.017 NA   NA
 98936 98937 CC2123 CC2124     FALSE 0.170 119.000 0.003 NA N NA
 98939 98940 CC2126 CC2127     FALSE 0.070 92.000 0.000 NA   NA
 98940 98941 CC2127 CC2128     FALSE 0.063 83.000 0.000 NA   NA
 98944 98945 CC2131 CC2132     TRUE 0.957 7.000 0.429 1.000   NA
 98945 98946 CC2132 CC2133     TRUE 0.559 122.000 0.143 NA   NA
 98946 98947 CC2133 CC2134     FALSE 0.056 180.000 0.015 NA   NA
 98949 98950 CC2136 CC2137     FALSE 0.011 262.000 0.000 1.000 N NA
 98950 98951 CC2137 CC2138     FALSE 0.493 178.000 0.008 0.001 Y NA
 98951 98952 CC2138 CC2139     TRUE 0.979 -3.000 0.571 1.000   NA
 98952 98953 CC2139 CC2140     TRUE 0.796 -3.000 0.014 1.000   NA
 98953 98954 CC2140 CC2141     TRUE 0.954 -3.000 0.160 1.000 N NA
 98954 98955 CC2141 CC2142     FALSE 0.198 44.000 0.008 NA   NA
 98955 98956 CC2142 CC2143     FALSE 0.136 32.000 0.000 NA   NA
 98960 98961 CC2147 CC2148     FALSE 0.086 142.000 0.000 1.000   NA
 98962 98963 CC2149 CC2150     TRUE 0.582 159.000 0.222 0.091 N NA
 98965 98966 CC2152 CC2153     TRUE 0.936 4.000 0.154 1.000 N NA
 98966 98967 CC2153 CC2154     FALSE 0.266 68.000 0.020 1.000 N NA
 98967 98968 CC2154 CC2155     FALSE 0.190 138.000 0.020 NA   NA
 98969 98970 CC2156 CC2157     TRUE 0.914 12.000 0.280 NA   NA
 98970 98971 CC2157 CC2158     TRUE 0.981 0.000 0.696 NA N NA
 98971 98972 CC2158 CC2159     FALSE 0.066 88.000 0.000 NA   NA
 98972 98973 CC2159 CC2160     FALSE 0.086 46.000 0.000 NA   NA
 98977 98978 CC2164 CC2165     FALSE 0.262 74.000 0.027 1.000   NA
 98980 98981 CC2167 CC2168     FALSE 0.025 208.000 0.008 NA   NA
 98981 98982 CC2168 CC2169     TRUE 0.693 61.000 0.000 0.071 Y NA
 98982 98983 CC2169 CC2170     TRUE 0.634 73.000 0.009 1.000 Y NA
 98985 98986 CC2172 CC2173     FALSE 0.028 226.000 0.011 1.000   NA
 98986 98987 CC2173 CC2174     FALSE 0.324 106.000 0.029 1.000   NA
 98987 399483 CC2174 CC_t30   tRNA-Leu-2 FALSE 0.046 149.000 0.000 NA   NA
 399483 98988 CC_t30 CC2175 tRNA-Leu-2   FALSE 0.065 86.000 0.000 NA   NA
 98989 98990 CC2176 CC2177     FALSE 0.122 36.000 0.000 NA   NA
 98991 98992 CC2178 CC2179     FALSE 0.278 84.000 0.028 1.000   NA
 98993 98994 CC2180 CC2181     TRUE 0.957 -3.000 0.250 NA   NA
 98996 98997 CC2183 CC2184     FALSE 0.277 14.000 0.000 NA   NA
 98997 98998 CC2184 CC2185     FALSE 0.063 61.000 0.000 NA   NA
 98999 399482 CC2186 CC_t31   tRNA-Leu-3 FALSE 0.078 113.000 0.000 NA   NA
 99003 99004 CC2190 CC2191     TRUE 0.616 156.000 0.500 NA   NA
 99004 99005 CC2191 CC2192     FALSE 0.347 35.000 0.019 NA   NA
 99005 99006 CC2192 CC2193     FALSE 0.073 126.000 0.000 NA   NA
 99007 99008 CC2194 CC2195     FALSE 0.207 103.000 0.015 NA   NA
 99008 99009 CC2195 CC2196     TRUE 0.969 -3.000 0.385 NA   NA
 99009 99010 CC2196 CC2197     TRUE 0.857 -45.000 0.145 1.000 N NA
 99010 99011 CC2197 CC2198     FALSE 0.283 107.000 0.012 1.000 N NA
 99011 99012 CC2198 CC2199     TRUE 0.680 108.000 0.300 NA   NA
 99013 99014 CC2200 CC2201     FALSE 0.238 163.000 0.050 1.000 N NA
 99014 99015 CC2201 CC2202     FALSE 0.236 52.000 0.006 1.000 N NA
 99015 99016 CC2202 CC2203     FALSE 0.020 178.000 0.000 NA   NA
 99017 99018 CC2204 CC2205     TRUE 0.782 -3.000 0.011 1.000   NA
 99019 99020 CC2206 CC2207     TRUE 0.971 9.000 0.833 NA   NA
 99020 99021 CC2207 CC2208     TRUE 0.966 -3.000 0.333 NA   NA
 99021 99022 CC2208 CC2209     FALSE 0.020 202.000 0.000 1.000   NA
 99022 99023 CC2209 CC2210     FALSE 0.119 102.000 0.000 1.000   NA
 99024 99025 CC2211 CC2212     FALSE 0.399 -21.000 0.003 NA   NA
 99025 99026 CC2212 CC2213     FALSE 0.463 10.000 0.003 NA   NA
 99027 99028 CC2214 CC2215     TRUE 0.828 -7.000 0.062 NA   NA
 99029 99030 CC2216 CC2217     TRUE 0.985 -3.000 0.139 1.000 Y NA
 99030 99031 CC2217 CC2218     TRUE 0.971 -3.000 0.417 NA   NA
 99031 99032 CC2218 CC2219     TRUE 0.957 -3.000 0.250 NA   NA
 99034 99035 CC2221 CC2222     FALSE 0.288 58.000 0.037 NA   NA
 99035 99036 CC2222 CC2223     TRUE 0.688 88.000 0.019 1.000 Y NA
 99036 99037 CC2223 CC2224     TRUE 0.980 7.000 0.198 1.000 Y NA
 99039 99040 CC2226 CC2227     FALSE 0.044 169.000 0.000 1.000   NA
 99040 399462 CC2227 CC_t32   tRNA-Gly-4 FALSE 0.059 67.000 0.000 NA   NA
 399462 99041 CC_t32 CC2228 tRNA-Gly-4   FALSE 0.265 -32.000 0.000 NA   NA
 99042 99043 CC2229 CC2230     TRUE 0.754 94.000 0.500 NA   NA
 99043 99044 CC2230 CC2231     FALSE 0.099 268.000 0.333 NA   NA
 99044 99045 CC2231 CC2232     TRUE 0.688 28.000 0.105 NA   NA
 99045 99046 CC2232 CC2233     TRUE 0.925 -3.000 0.105 NA   NA
 99046 99047 CC2233 CC2234     TRUE 0.873 -18.000 0.143 NA   NA
 99047 99048 CC2234 CC2235     TRUE 0.896 29.000 0.667 NA   NA
 99048 99049 CC2235 CC2236     TRUE 0.766 78.000 0.667 NA   NA
 99049 99050 CC2236 CC2237     FALSE 0.144 119.000 0.005 NA   NA
 99051 99052 CC2238 CC2239     TRUE 0.816 -19.000 0.066 NA N NA
 99053 99054 CC2240 CC2241     FALSE 0.073 94.000 0.000 NA   NA
 99054 99055 CC2241 CC2242     FALSE 0.083 218.000 0.052 1.000 N NA
 99055 99056 CC2242 CC2243     TRUE 0.764 118.000 0.038 1.000 Y NA
 99056 99057 CC2243 CC2244     FALSE 0.282 155.000 0.048 1.000 N NA
 99058 99059 CC2245 CC2246     FALSE 0.005 276.000 0.002 NA   NA
 99059 99060 CC2246 CC2247     FALSE 0.182 103.000 0.011 NA   NA
 99060 99061 CC2247 CC2248     FALSE 0.424 36.000 0.034 NA   NA
 99061 99062 CC2248 CC2249     FALSE 0.248 136.000 0.015 1.000 N NA
 99064 99065 CC2251 CC2252     TRUE 0.671 63.000 0.294 1.000 N NA
 99066 99067 CC2253 CC2254     TRUE 0.963 4.000 0.033 1.000 Y NA
 99067 99068 CC2254 CC2255     TRUE 0.618 89.000 0.250 NA   NA
 99072 99073 CC2259 CC2260     FALSE 0.075 103.000 0.000 NA   NA
 99073 99074 CC2260 CC2261     FALSE 0.333 93.000 0.045 NA   NA
 99075 99076 CC2262 CC2263     TRUE 0.828 -3.000 0.029 NA   NA
 99076 99077 CC2263 CC2264     FALSE 0.476 100.000 0.013 0.016 N NA
 99077 99078 CC2264 CC2265     FALSE 0.163 80.000 0.007 1.000   NA
 99078 99079 CC2265 CC2266     FALSE 0.101 134.000 0.000 1.000   NA
 99079 99080 CC2266 CC2267     FALSE 0.062 135.000 0.000 NA   NA
 99081 99082 CC2268 CC2269     FALSE 0.201 52.000 0.002 1.000 N NA
 99082 99083 CC2269 CC2270     TRUE 0.995 3.000 0.625 0.048 Y NA
 99084 99085 CC2271 CC2272     TRUE 0.739 82.000 0.500 1.000   NA
 99086 99087 CC2273 CC2274     FALSE 0.007 469.000 0.028 1.000 N NA
 99087 99088 CC2274 CC2275     FALSE 0.270 76.000 0.028 1.000   NA
 99088 99089 CC2275 CC2276     FALSE 0.108 40.000 0.000 NA   NA
 99089 99090 CC2276 CC2277     TRUE 0.784 -84.000 0.120 NA   NA
 99090 99091 CC2277 CC2278     TRUE 0.902 0.000 0.080 NA   NA
 99091 99092 CC2278 CC2279     FALSE 0.246 41.000 0.005 NA N NA
 99094 99095 CC2281 CC2282     FALSE 0.482 124.000 0.065 1.000 N NA
 99095 99096 CC2282 CC2283     TRUE 0.785 34.000 0.290 NA   NA
 99098 99099 CC2285 CC2286     TRUE 0.929 39.000 0.127 0.005 Y NA
 99100 99101 CC2287 CC2288     FALSE 0.280 187.000 0.273 NA   NA
 99102 99103 CC2289 CC2290     FALSE 0.278 -28.000 0.000 NA   NA
 99103 99104 CC2290 CC2291     TRUE 0.921 -6.000 0.077 0.045   NA
 99104 99105 CC2291 CC2292     FALSE 0.065 59.000 0.000 NA   NA
 99105 99106 CC2292 CC2293     FALSE 0.004 264.000 0.000 NA   NA
 99106 399481 CC2293 CC_t33   tRNA-Met-2 FALSE 0.013 199.000 0.000 NA   NA
 99109 99110 CC2296 CC2297     TRUE 0.975 2.000 0.667 NA   NA
 99111 99112 CC2298 CC2299     TRUE 0.692 83.000 0.000 0.070 Y NA
 99112 99113 CC2299 CC2300     FALSE 0.145 79.000 0.000 1.000 N NA
 99113 99114 CC2300 CC2301     FALSE 0.287 114.000 0.018 NA N NA
 99114 99115 CC2301 CC2302     TRUE 0.867 -3.000 0.035 NA N NA
 99115 99116 CC2302 CC2303     FALSE 0.413 43.000 0.026 1.000 N NA
 99116 99117 CC2303 CC2304     TRUE 0.806 -3.000 0.008 1.000 N NA
 99118 399463 CC2305 CC_t34   tRNA-Val-2 FALSE 0.083 48.000 0.000 NA   NA
 399463 99119 CC_t34 CC2306 tRNA-Val-2   FALSE 0.010 212.000 0.000 NA   NA
 99119 99120 CC2306 CC2307     FALSE 0.341 10.000 0.000 NA   NA
 99121 99122 CC2308 CC2309     FALSE 0.292 13.000 0.000 NA   NA
 99122 99123 CC2309 CC2310     FALSE 0.076 108.000 0.000 NA   NA
 99123 99124 CC2310 CC2311     FALSE 0.024 172.000 0.000 NA   NA
 99126 99127 CC2313 CC2314     FALSE 0.227 71.000 0.012 1.000 N NA
 99127 99128 CC2314 CC2315     FALSE 0.507 27.000 0.017 1.000 N NA
 99131 99132 CC2318 CC2319     TRUE 0.993 -3.000 0.491 NA Y NA
 99132 99133 CC2319 CC2320     TRUE 0.993 0.000 0.650 NA Y NA
 99133