MicrobesOnline Operon Predictions for Xanthomonas axonopodis

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 255903 255904 XAC0001 XAC0002 dnaA dnaN TRUE 0.664 277.000 0.328 1.000 Y NA
 255904 255905 XAC0002 XAC0003 dnaN recF FALSE 0.371 1052.000 0.318 1.000 Y NA
 255905 255906 XAC0003 XAC0004 recF gyrB TRUE 0.967 115.000 0.249 0.004 Y NA
 255906 255907 XAC0004 XAC0005 gyrB   FALSE 0.120 221.000 0.002 NA   NA
 255907 255908 XAC0005 XAC0006     FALSE 0.309 184.000 0.032 NA   NA
 255908 255909 XAC0006 XAC0007     FALSE 0.155 278.000 0.063 1.000 N NA
 255909 255910 XAC0007 XAC0008   tonB TRUE 0.492 154.000 0.095 1.000 N NA
 255910 255911 XAC0008 XAC0009 tonB exbB TRUE 0.935 86.000 0.600 0.018 N NA
 255911 255912 XAC0009 XAC0010 exbB exbD1 TRUE 0.980 47.000 0.600 0.070 Y NA
 255912 255913 XAC0010 XAC0011 exbD1 exbD2 TRUE 0.999 4.000 0.857 0.056 Y NA
 255914 255915 XAC0012 XAC0013 pdxJ   TRUE 0.847 8.000 0.009 NA   NA
 255915 255916 XAC0013 XAC0014   cls TRUE 0.963 12.000 0.417 NA   NA
 255917 255918 XAC0015 XAC0016     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 255919 2165859 XAC0017 XAC0018     FALSE 0.214 184.000 0.009 NA   NA
 2165859 255921 XAC0018 XAC0019   ompP1 FALSE 0.048 270.000 0.000 NA   NA
 255922 255923 XAC0020 XAC0021     TRUE 0.611 109.000 0.096 NA   NA
 255923 255924 XAC0021 XAC0022   serA TRUE 0.966 0.000 0.043 NA   NA
 255925 255926 XAC0023 XAC0024 ctp   TRUE 0.898 105.000 0.408 0.049 N NA
 255927 255928 XAC0025 XAC0026     FALSE 0.461 162.000 0.049 1.000   NA
 11415342 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5590.000 0.000 NA   NA
 11557705 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5590.000 0.000 NA   NA
 11700097 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5590.000 0.000 NA   NA
 11415343 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5609.000 0.000 NA   NA
 11557706 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5609.000 0.000 NA   NA
 11700098 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5609.000 0.000 NA   NA
 11415344 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5646.000 0.000 NA   NA
 11557707 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5646.000 0.000 NA   NA
 11700099 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5646.000 0.000 NA   NA
 11415345 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5663.000 0.000 NA   NA
 11557708 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5663.000 0.000 NA   NA
 11700100 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5663.000 0.000 NA   NA
 11415346 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5700.000 0.000 NA   NA
 11557709 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5700.000 0.000 NA   NA
 11700101 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5700.000 0.000 NA   NA
 11415347 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5717.000 0.000 NA   NA
 11557710 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5717.000 0.000 NA   NA
 11700102 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5717.000 0.000 NA   NA
 11415348 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5754.000 0.000 NA   NA
 11557711 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5754.000 0.000 NA   NA
 11700103 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5754.000 0.000 NA   NA
 11415349 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5771.000 0.000 NA   NA
 11557712 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5771.000 0.000 NA   NA
 11700104 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5771.000 0.000 NA   NA
 11415350 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5811.000 0.000 NA   NA
 11557713 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5811.000 0.000 NA   NA
 11700105 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5811.000 0.000 NA   NA
 11415351 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5828.000 0.000 NA   NA
 11557714 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5828.000 0.000 NA   NA
 11700106 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5828.000 0.000 NA   NA
 11415352 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5866.000 0.000 NA   NA
 11557715 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5866.000 0.000 NA   NA
 11700107 255921   XAC0019   ompP1 FALSE NA 5866.000 0.000 NA   NA
 255929 255930 XAC0027 XAC0028   egl FALSE 0.050 293.000 0.000 1.000   NA
 255930 255931 XAC0028 XAC0029 egl egl FALSE 0.347 637.000 0.000 0.003 Y NA
 255931 255932 XAC0029 XAC0030 egl egl FALSE 0.329 778.000 0.000 0.003 Y NA
 255934 255935 XAC0032 XAC0033 gltD gltB TRUE 0.937 129.000 0.032 0.001 Y NA
 255935 255936 XAC0033 XAC0034 gltB   FALSE 0.201 203.000 0.011 1.000   NA
 255943 255944 XAC0041 XAC0042 wbdB wbpZ TRUE 0.999 -3.000 0.256 0.014 Y NA
 255944 255945 XAC0042 XAC0043 wbpZ wcaJ TRUE 0.691 67.000 0.000 NA Y NA
 255945 255946 XAC0043 XAC0044 wcaJ bplD TRUE 0.863 20.000 0.000 NA Y NA
 255947 2165860 XAC0045 XAC0046   rffM TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 2165860 255949 XAC0046 XAC0047 rffM   TRUE 0.948 -657.000 0.000 0.014 Y NA
 255949 255950 XAC0047 XAC0048     TRUE 0.966 4.000 0.100 NA   NA
 255950 255951 XAC0048 XAC0049     TRUE 0.971 -63.000 1.000 NA   NA
 255951 255952 XAC0049 XAC0050     TRUE 0.537 -49.000 0.000 NA   NA
 255952 255953 XAC0050 XAC0051   asnB FALSE 0.084 232.000 0.000 1.000   NA
 255953 255954 XAC0051 XAC0052 asnB   FALSE 0.243 53.000 0.000 NA   NA
 255954 255955 XAC0052 XAC0053     TRUE 0.572 -39.000 0.000 NA   NA
 255955 255956 XAC0053 XAC0054   rmd FALSE 0.056 250.000 0.000 NA   NA
 255956 255957 XAC0054 XAC0055 rmd   TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.042   NA
 255957 255958 XAC0055 XAC0056     FALSE 0.363 34.000 0.000 1.000   NA
 255958 255959 XAC0056 XAC0057   hetA TRUE 0.916 -3.000 0.000 1.000   NA
 255959 255960 XAC0057 XAC0058 hetA   TRUE 0.976 -3.000 0.055 NA   NA
 255960 255961 XAC0058 XAC0059   asn FALSE 0.033 338.000 0.000 NA   NA
 255962 255963 XAC0060 XAC0061     TRUE 0.913 22.000 0.333 1.000   NA
 255963 255964 XAC0061 XAC0062     FALSE 0.448 24.000 0.000 1.000   NA
 255964 255965 XAC0062 XAC0063     TRUE 0.916 -3.000 0.000 1.000   NA
 255966 255967 XAC0064 XAC0065     TRUE 0.912 -42.000 0.167 NA   NA
 255967 255968 XAC0065 XAC0066     FALSE 0.381 25.000 0.000 NA   NA
 255968 2165861 XAC0066 XAC0067   mdpB FALSE 0.381 25.000 0.000 NA   NA
 255970 255971 XAC0068 XAC0069   mecI FALSE 0.019 488.000 0.000 NA   NA
 255971 255972 XAC0069 XAC0070 mecI   TRUE 0.996 4.000 0.500 NA Y NA
 255972 255973 XAC0070 XAC0071     FALSE 0.016 675.000 0.000 NA   NA
 255973 255974 XAC0071 XAC0072     FALSE 0.217 84.000 0.000 NA   NA
 255975 2165862 XAC0073 XAC0074   cirA TRUE 0.977 11.000 0.600 1.000   NA
 255977 255978 XAC0075 XAC0076 xylR avrBs2 TRUE 0.734 190.000 0.667 NA   NA
 2165863 255980 XAC0077 XAC0078     TRUE 0.989 -3.000 0.010 0.020   NA
 255981 255982 XAC0079 XAC0080     FALSE 0.226 68.000 0.000 NA   NA
 255982 255983 XAC0080 XAC0081     TRUE 0.970 -12.000 0.333 NA   NA
 255984 255985 XAC0082 XAC0083     TRUE 0.960 60.000 0.250 0.064 Y NA
 255988 255989 XAC0086 XAC0087     FALSE 0.061 239.000 0.000 NA   NA
 255990 255991 XAC0088 XAC0089   abiR FALSE 0.209 95.000 0.000 NA   NA
 255992 255993 XAC0090 XAC0091     TRUE 0.859 54.000 0.000 0.081 Y NA
 255994 255995 XAC0092 XAC0093     FALSE 0.265 45.000 0.000 NA   NA
 255997 255998 XAC0095 XAC0096     FALSE 0.025 400.000 0.000 NA   NA
 255998 255999 XAC0096 XAC0097     TRUE 0.595 -30.000 0.000 NA   NA
 255999 256000 XAC0097 XAC0098     FALSE 0.200 118.000 0.000 NA   NA
 256000 256001 XAC0098 XAC0099     FALSE 0.015 730.000 0.000 NA   NA
 256001 256002 XAC0099 XAC0100     FALSE 0.130 173.000 0.000 NA   NA
 256002 2165864 XAC0100 XAC0101     FALSE 0.076 223.000 0.000 NA   NA
 256005 256006 XAC0103 XAC0104     TRUE 0.987 -3.000 0.194 NA   NA
 256006 256007 XAC0104 XAC0105     TRUE 0.466 111.000 0.022 1.000   NA
 256008 256009 XAC0106 XAC0107     FALSE 0.168 41.000 0.000 1.000 N NA
 256009 256010 XAC0107 XAC0108   atsE FALSE 0.009 386.000 0.000 NA N NA
 256010 256011 XAC0108 XAC0109 atsE trxA TRUE 0.852 21.000 0.143 NA   NA
 256011 256012 XAC0109 XAC0110 trxA proP FALSE 0.022 531.000 0.000 1.000   NA
 256014 2165866 XAC0112 XAC0113     FALSE 0.222 181.000 0.009 NA   NA
 256016 256017 XAC0114 XAC0115     TRUE 0.975 -28.000 0.724 NA   NA
 256017 256018 XAC0115 XAC0116     TRUE 0.879 -96.000 0.172 NA   NA
 256018 256019 XAC0116 XAC0117     TRUE 0.745 44.000 0.161 NA   NA
 256019 256020 XAC0117 XAC0118   moxR TRUE 0.924 14.000 0.193 NA   NA
 256020 2165867 XAC0118 XAC0119 moxR   TRUE 0.652 131.000 0.168 NA   NA
 2165867 256022 XAC0119 XAC0120   tldD TRUE 0.996 -3.000 0.720 NA   NA
 256022 256023 XAC0120 XAC0121 tldD tldD TRUE 0.920 15.000 0.200 NA   NA
 256023 256024 XAC0121 XAC0122 tldD tldD FALSE 0.020 470.000 0.000 NA   NA
 256024 256025 XAC0122 XAC0123 tldD   FALSE 0.023 416.000 0.000 NA   NA
 256025 256026 XAC0123 XAC0124   cbbFC FALSE 0.244 102.000 0.000 1.000   NA
 256026 256027 XAC0124 XAC0125 cbbFC tyrB FALSE 0.027 264.000 0.000 1.000 N NA
 2165868 256029 XAC0126 XAC0127 yncD   TRUE 0.717 178.000 0.500 NA   NA
 256029 256030 XAC0127 XAC0128     FALSE 0.183 135.000 0.000 NA   NA
 256030 2165869 XAC0128 XAC0129   aldA FALSE 0.042 220.000 0.000 1.000 N NA
 2165869 256032 XAC0129 XAC0130 aldA   FALSE 0.257 178.000 0.014 NA   NA
 256032 256033 XAC0130 XAC0131     FALSE 0.025 398.000 0.000 NA   NA
 256033 256034 XAC0131 XAC0132     TRUE 0.966 0.000 0.043 NA   NA
 256036 256037 XAC0134 XAC0135     FALSE 0.140 55.000 0.000 1.000 N NA
 256037 256038 XAC0135 XAC0136     TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.035 Y NA
 256041 256042 XAC0139 XAC0140     TRUE 0.870 -81.000 0.133 NA   NA
 256043 256044 XAC0141 XAC0142     FALSE 0.397 118.000 0.015 NA   NA
 256046 256047 XAC0144 XAC0145 iroN   FALSE 0.053 257.000 0.000 NA   NA
 256047 2165870 XAC0145 XAC0146     FALSE 0.021 458.000 0.000 NA   NA
 2165870 256049 XAC0146 XAC0147     FALSE 0.031 353.000 0.000 NA   NA
 256052 256053 XAC0150 XAC0151     FALSE 0.160 156.000 0.000 NA   NA
 256054 256055 XAC0152 XAC0153     TRUE 0.859 54.000 0.000 0.080 Y NA
 256055 2165871 XAC0153 XAC0154     FALSE 0.020 696.000 0.000 1.000   NA
 2165871 256057 XAC0154 XAC0155     TRUE 0.998 -3.000 0.544 0.015   NA
 256057 2165872 XAC0155 XAC0156   glgB1 TRUE 0.987 12.000 0.027 0.006 Y NA
 2165872 256059 XAC0156 XAC0157 glgB1   FALSE 0.121 193.000 0.000 1.000   NA
 256059 256060 XAC0157 XAC0158     FALSE 0.264 180.000 0.012 1.000   NA
 256061 256062 XAC0159 XAC0160 estA1 xynB TRUE 0.872 141.000 0.200 1.000 Y NA
 256063 256064 XAC0161 XAC0162 mhpD dctP TRUE 0.673 38.000 0.097 1.000 N NA
 256064 256065 XAC0162 XAC0163 dctP dctQ TRUE 0.951 119.000 0.756 NA Y NA
 256065 256066 XAC0163 XAC0164 dctQ ygiK TRUE 0.997 0.000 0.390 NA Y NA
 256066 256067 XAC0164 XAC0165 ygiK   TRUE 0.592 253.000 0.125 1.000 Y NA
 256067 256068 XAC0165 XAC0166     TRUE 0.468 176.000 0.143 1.000 N NA
 256068 256069 XAC0166 XAC0167     FALSE 0.032 350.000 0.000 NA   NA
 256069 256070 XAC0167 XAC0168   kduI FALSE 0.220 74.000 0.000 NA   NA
 256070 256071 XAC0168 XAC0169 kduI kduD TRUE 0.680 188.000 0.571 1.000 N NA
 256071 256072 XAC0169 XAC0170 kduD   FALSE 0.164 254.000 0.047 1.000 N NA
 256072 256073 XAC0170 XAC0171     FALSE 0.014 379.000 0.000 1.000 N NA
 256073 256074 XAC0171 XAC0172     FALSE 0.043 328.000 0.000 1.000   NA
 256075 256076 XAC0173 XAC0174   pah FALSE 0.321 141.000 0.010 NA   NA
 256077 2165873 XAC0175 XAC0176   fpvA FALSE 0.021 293.000 0.000 1.000 N NA
 256079 2165874 XAC0177 XAC0178     FALSE 0.017 586.000 0.000 NA   NA
 2165874 256081 XAC0178 XAC0179   ylmA FALSE 0.096 197.000 0.000 NA   NA
 2165875 256083 XAC0180 XAC0181     TRUE 0.854 38.000 0.333 1.000   NA
 256083 256084 XAC0181 XAC0182   yehX TRUE 0.526 64.000 0.026 1.000   NA
 256084 256085 XAC0182 XAC0183 yehX yehZ TRUE 0.979 0.000 0.171 1.000 N NA
 256087 2165876 XAC0185 XAC0186     TRUE 0.992 -3.000 0.354 NA   NA
 256089 256090 XAC0187 XAC0188 hipA   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 256090 2165877 XAC0188 XAC0189   iorA FALSE 0.096 146.000 0.000 1.000 N NA
 256092 256093 XAC0190 XAC0191     FALSE 0.021 619.000 0.000 1.000   NA
 256093 256094 XAC0191 XAC0192   parA FALSE 0.044 320.000 0.000 1.000   NA
 256094 256095 XAC0192 XAC0193 parA   TRUE 0.822 16.000 0.079 NA N NA
 256095 256096 XAC0193 XAC0194     TRUE 0.962 4.000 0.083 NA   NA
 256096 256097 XAC0194 XAC0195   cls TRUE 0.984 -3.000 0.128 NA   NA
 256097 256098 XAC0195 XAC0196 cls   FALSE 0.124 364.000 0.107 NA N NA
 256098 256099 XAC0196 XAC0197     FALSE 0.266 163.000 0.023 NA N NA
 256099 256100 XAC0197 XAC0198     TRUE 0.490 60.000 0.023 NA   NA
 256100 256101 XAC0198 XAC0199     FALSE 0.117 351.000 0.042 NA   NA
 256101 256102 XAC0199 XAC0200     FALSE 0.385 192.000 0.083 NA   NA
 256102 256103 XAC0200 XAC0201   adh FALSE 0.217 84.000 0.000 NA   NA
 256104 256105 XAC0202 XAC0203   bacA FALSE 0.014 278.000 0.000 NA N NA
 256106 256107 XAC0204 XAC0205 glnA glnB FALSE 0.289 271.000 0.000 1.000 Y NA
 256107 256108 XAC0205 XAC0206 glnB amtB TRUE 0.903 -10.000 0.048 1.000 N NA
 256108 256109 XAC0206 XAC0207 amtB ntrB FALSE 0.027 265.000 0.000 1.000 N NA
 256109 256110 XAC0207 XAC0208 ntrB ntrC TRUE 0.996 -7.000 0.587 1.000 Y NA
 256110 256111 XAC0208 XAC0209 ntrC yojM FALSE 0.025 499.000 0.007 1.000 N NA
 256111 256112 XAC0209 XAC0210 yojM sodC2 TRUE 0.948 199.000 0.375 0.001 Y NA
 256113 256114 XAC0211 XAC0212 gloA   TRUE 0.532 39.000 0.018 NA   NA
 256116 256117 XAC0214 XAC0215 hemY   TRUE 0.999 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 256117 256118 XAC0215 XAC0216   hemD TRUE 0.946 104.000 0.600 1.000 Y NA
 256119 256120 XAC0217 XAC0218 lgtB   FALSE 0.336 150.000 0.014 NA   NA
 256120 256121 XAC0218 XAC0219     TRUE 0.667 29.000 0.035 NA   NA
 256121 256122 XAC0219 XAC0220     FALSE 0.449 75.000 0.019 NA   NA
 256122 256123 XAC0220 XAC0221   secB TRUE 0.603 110.000 0.158 NA N NA
 256123 256124 XAC0221 XAC0222 secB gpdA TRUE 0.691 16.000 0.015 1.000 N NA
 256126 256127 XAC0224 XAC0225 poxB   FALSE 0.146 50.000 0.000 1.000 N NA
 256127 256128 XAC0225 XAC0226   ntrC TRUE 0.993 -15.000 0.556 1.000 Y NA
 256128 256129 XAC0226 XAC0227 ntrC   FALSE 0.427 190.000 0.111 NA   NA
 256129 256130 XAC0227 XAC0228     FALSE 0.220 76.000 0.000 NA   NA
 256130 256131 XAC0228 XAC0229     TRUE 0.658 93.000 0.133 NA   NA
 256132 256133 XAC0230 XAC0231     TRUE 0.525 27.000 0.007 NA   NA
 256134 256135 XAC0232 XAC0233   fabH TRUE 0.585 102.000 0.078 NA   NA
 256135 256136 XAC0233 XAC0234 fabH   FALSE 0.203 112.000 0.000 NA   NA
 256136 256137 XAC0234 XAC0235   dhaA FALSE 0.240 116.000 0.000 1.000   NA
 2165878 256140 XAC0237 XAC0238   cdh TRUE 0.506 231.000 0.418 1.000 N NA
 256140 256141 XAC0238 XAC0239 cdh   TRUE 0.608 65.000 0.070 NA   NA
 256143 256144 XAC0241 XAC0242   aarF TRUE 0.994 -3.000 0.432 1.000   NA
 256144 256145 XAC0242 XAC0243 aarF   FALSE 0.335 31.000 0.000 NA   NA
 256145 256146 XAC0243 XAC0244     FALSE 0.041 292.000 0.000 NA   NA
 256148 256149 XAC0246 XAC0247     TRUE 0.937 3.000 0.014 1.000   NA
 256149 256150 XAC0247 XAC0248   ansA FALSE 0.216 171.000 0.013 1.000 N NA
 256150 256151 XAC0248 XAC0249 ansA dcp FALSE 0.458 199.000 0.000 1.000 Y NA
 256154 256155 XAC0252 XAC0253     TRUE 0.659 69.000 0.118 NA   NA
 256155 256156 XAC0253 XAC0254   yjl094C FALSE 0.117 115.000 0.000 1.000 N NA
 256156 256157 XAC0254 XAC0255 yjl094C rbcR FALSE 0.017 348.000 0.000 1.000 N NA
 256158 256159 XAC0256 XAC0257 mls aceA TRUE 0.677 169.000 0.016 1.000 Y NA
 256159 256160 XAC0257 XAC0258 aceA   FALSE 0.021 298.000 0.000 1.000 N NA
 256160 256161 XAC0258 XAC0259     TRUE 0.996 4.000 0.062 0.010 Y NA
 256164 256165 XAC0262 XAC0263   accC FALSE 0.275 100.000 0.008 1.000 N NA
 256165 256166 XAC0263 XAC0264 accC accD TRUE 0.871 233.000 0.158 0.003 Y NA
 256166 256167 XAC0264 XAC0265 accD acdA TRUE 0.987 11.000 0.316 1.000 Y NA
 256168 256169 XAC0266 XAC0267     TRUE 0.538 60.000 0.036 NA   NA
 256169 256170 XAC0267 XAC0268     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 256171 256172 XAC0269 XAC0270     TRUE 0.983 -3.000 0.111 NA   NA
 256172 256173 XAC0270 XAC0271     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 256173 256174 XAC0271 XAC0272     TRUE 0.861 29.000 0.286 NA   NA
 256175 256176 XAC0273 XAC0274     TRUE 0.575 164.000 0.158 NA   NA
 256179 256180 XAC0277 XAC0278     TRUE 0.481 99.000 0.032 NA   NA
 256181 256182 XAC0279 XAC0280     TRUE 0.473 88.000 0.026 NA   NA
 256182 256183 XAC0280 XAC0281     FALSE 0.028 373.000 0.000 NA   NA
 256183 256184 XAC0281 XAC0282   ohr TRUE 0.546 100.000 0.086 1.000 N NA
 256184 256185 XAC0282 XAC0283 ohr catD FALSE 0.043 280.000 0.000 NA   NA
 256188 256189 XAC0286 XAC0287 avrXacE1   FALSE 0.123 177.000 0.000 NA   NA
 256189 256190 XAC0287 XAC0288   mocA TRUE 0.747 130.000 0.028 0.038   NA
 256191 256192 XAC0289 XAC0290     FALSE 0.360 87.000 0.008 NA   NA
 256193 256194 XAC0291 XAC0292 oar   FALSE 0.051 290.000 0.000 1.000   NA
 256194 256195 XAC0292 XAC0293   hrpB FALSE 0.323 161.000 0.012 1.000   NA
 256195 256196 XAC0293 XAC0294 hrpB   FALSE 0.014 1063.000 0.000 NA   NA
 256196 256197 XAC0294 XAC0295     FALSE 0.303 166.000 0.014 NA   NA
 256197 256198 XAC0295 XAC0296     TRUE 0.928 -30.000 0.167 1.000   NA
 256198 256199 XAC0296 XAC0297     TRUE 0.982 -3.000 0.103 NA   NA
 256199 256200 XAC0297 XAC0298     TRUE 0.977 -3.000 0.061 NA   NA
 256200 256201 XAC0298 XAC0299     TRUE 0.955 -3.000 0.013 NA   NA
 256201 256202 XAC0299 XAC0300     TRUE 0.963 -3.000 0.036 1.000 N NA
 256202 256203 XAC0300 XAC0301   amaB TRUE 0.981 -10.000 0.060 1.000 Y NA
 256204 256205 XAC0302 XAC0303   opdE FALSE 0.019 318.000 0.000 1.000 N NA
 256206 256207 XAC0304 XAC0305 gvpU ggt FALSE 0.041 290.000 0.000 NA   NA
 256207 256208 XAC0305 XAC0306 ggt gatA TRUE 0.966 0.000 0.068 1.000 N NA
 256208 256209 XAC0306 XAC0307 gatA   FALSE 0.006 531.000 0.000 NA N NA
 256209 2165880 XAC0307 XAC0308   add TRUE 0.530 98.000 0.048 NA   NA
 2165880 256211 XAC0308 XAC0309 add yieG FALSE 0.421 127.000 0.017 1.000   NA
 256211 256212 XAC0309 XAC0310 yieG vanB FALSE 0.035 371.000 0.000 1.000   NA
 256212 256213 XAC0310 XAC0311 vanB vanA TRUE 0.931 18.000 0.091 0.053 N NA
 256214 256215 XAC0312 XAC0313   mttC FALSE 0.012 310.000 0.000 NA N NA
 256221 2165881 XAC0319 XAC0320     FALSE 0.054 280.000 0.000 1.000   NA
 2165881 256223 XAC0320 XAC0321   frp FALSE 0.432 81.000 0.031 1.000 N NA
 256223 256224 XAC0321 XAC0322 frp   TRUE 0.574 36.000 0.040 1.000 N NA
 256224 256225 XAC0322 XAC0323     FALSE 0.106 188.000 0.000 NA   NA
 256225 256226 XAC0323 XAC0324   purU FALSE 0.061 239.000 0.000 NA   NA
 256227 256228 XAC0325 XAC0326 smeR smeS TRUE 0.998 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 256229 256230 XAC0327 XAC0328 smeA smeB TRUE 0.956 10.000 0.300 1.000 N NA
 256230 256231 XAC0328 XAC0329 smeB smeC TRUE 0.998 -3.000 0.900 0.053 N NA
 256232 256233 XAC0330 XAC0331 cmfA metF FALSE 0.016 716.000 0.000 NA   NA
 256233 256234 XAC0331 XAC0332 metF   FALSE 0.365 131.000 0.014 NA   NA
 256234 256235 XAC0332 XAC0333   metR TRUE 0.945 0.000 0.014 NA   NA
 256236 256237 XAC0334 XAC0335 sflA   TRUE 0.554 142.000 0.088 NA   NA
 256237 256238 XAC0335 XAC0336   metE TRUE 0.935 29.000 0.775 NA   NA
 256239 256240 XAC0337 XAC0338 kdgT   FALSE 0.163 154.000 0.000 NA   NA
 256240 256241 XAC0338 XAC0339     FALSE 0.016 634.000 0.000 NA   NA
 256243 256244 XAC0341 XAC0342     FALSE 0.025 397.000 0.000 NA   NA
 256244 256245 XAC0342 XAC0343     TRUE 0.860 54.000 0.000 0.078 Y NA
 256248 256249 XAC0346 XAC0347     FALSE 0.238 55.000 0.000 NA   NA
 256251 256252 XAC0349 XAC0350 vanK   FALSE 0.428 150.000 0.056 1.000 N NA
 256252 256253 XAC0350 XAC0351     FALSE 0.010 497.000 0.000 1.000 N NA
 256253 256254 XAC0351 XAC0352     TRUE 0.739 168.000 0.600 NA N NA
 256254 256255 XAC0352 XAC0353   drb0080 TRUE 0.665 34.000 0.091 NA N NA
 256255 256256 XAC0353 XAC0354 drb0080 xylC TRUE 0.930 32.000 0.286 0.038 N NA
 256258 256259 XAC0356 XAC0357 pobA   FALSE 0.023 425.000 0.000 NA   NA
 256260 256261 XAC0358 XAC0359 glpK glpF FALSE 0.258 123.000 0.008 1.000 N NA
 256261 256262 XAC0359 XAC0360 glpF glpD FALSE 0.457 175.000 0.129 1.000 N NA
 256262 256263 XAC0360 XAC0361 glpD glpR FALSE 0.183 233.000 0.040 1.000 N NA
 256263 256264 XAC0361 XAC0362 glpR pobB FALSE 0.009 551.000 0.000 1.000 N NA
 256264 256265 XAC0362 XAC0363 pobB vanA TRUE 0.892 101.000 0.170 0.001 N NA
 256266 256267 XAC0364 XAC0365 gctA gctB TRUE 1.000 -3.000 0.739 0.001 Y NA
 256267 256268 XAC0365 XAC0366 gctB pcaF TRUE 0.998 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 256268 256269 XAC0366 XAC0367 pcaF pcaH TRUE 0.860 80.000 0.066 0.001 N NA
 256269 256270 XAC0367 XAC0368 pcaH pcaG TRUE 0.999 5.000 0.782 0.001 Y NA
 256270 256271 XAC0368 XAC0369 pcaG pcaB FALSE 0.253 353.000 0.314 1.000 N NA
 256271 256272 XAC0369 XAC0370 pcaB catD TRUE 0.841 11.000 0.014 1.000   NA
 256272 256273 XAC0370 XAC0371 catD pcaC TRUE 0.929 27.000 0.600 1.000   NA
 256273 256274 XAC0371 XAC0372 pcaC   FALSE 0.067 254.000 0.000 1.000   NA
 256276 256277 XAC0374 XAC0375     FALSE 0.025 271.000 0.000 1.000 N NA
 256278 256279 XAC0376 XAC0377   gidA FALSE 0.062 238.000 0.000 NA   NA
 256279 256280 XAC0377 XAC0378 gidA   FALSE 0.017 572.000 0.000 NA   NA
 256281 256282 XAC0379 XAC0380 ilvA   TRUE 0.973 -3.000 0.042 NA   NA
 256282 256283 XAC0380 XAC0381     TRUE 0.516 43.000 0.019 NA   NA
 256284 256285 XAC0382 XAC0383 aspH bioC FALSE 0.030 250.000 0.000 1.000 N NA
 256285 256286 XAC0383 XAC0384 bioC   TRUE 0.759 68.000 0.006 1.000 Y NA
 256286 256287 XAC0384 XAC0385   bioH TRUE 0.594 45.000 0.033 1.000   NA
 256287 256288 XAC0385 XAC0386 bioH   TRUE 0.563 101.000 0.065 NA   NA
 256288 256289 XAC0386 XAC0387   bioF FALSE 0.124 237.000 0.008 NA   NA
 256289 256290 XAC0387 XAC0388 bioF bioB TRUE 0.965 92.000 0.168 0.002 Y NA
 256292 256293 XAC0390 XAC0392 ubiA   FALSE 0.101 191.000 0.000 NA   NA
 2165882 256295 XAC0393 XAC0394 hpaF hrpF FALSE 0.018 858.000 0.000 1.000   NA
 256295 256296 XAC0394 XAC0395 hrpF   FALSE 0.014 1331.000 0.000 NA   NA
 256296 256297 XAC0395 XAC0396   hpaB FALSE 0.058 247.000 0.000 NA   NA
 256297 256298 XAC0396 XAC0397 hpaB hrpE TRUE 0.910 55.000 1.000 NA   NA
 256298 256299 XAC0397 XAC0398 hrpE hrpD6 TRUE 0.901 79.000 1.000 NA   NA
 256299 256300 XAC0398 XAC0399 hrpD6 hrpD5 TRUE 0.970 10.000 0.400 NA   NA
 256300 256301 XAC0399 XAC0400 hrpD5 hpaA TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 256301 256302 XAC0400 XAC0401 hpaA hrcS TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 256302 256303 XAC0401 XAC0402 hrcS hrcR TRUE 0.998 5.000 0.400 0.012 Y NA
 256303 256304 XAC0402 XAC0403 hrcR hrcQ TRUE 0.985 -13.000 0.182 1.000 Y NA
 256304 256305 XAC0403 XAC0404 hrcQ hpaP TRUE 0.719 132.000 0.273 NA   NA
 256305 256306 XAC0404 XAC0405 hpaP hrcV TRUE 0.909 24.000 0.400 NA   NA
 256306 256307 XAC0405 XAC0406 hrcV hrcU TRUE 0.998 -6.000 0.500 0.012 Y NA
 256308 256309 XAC0407 XAC0408 hrpB1 hrpB2 TRUE 0.909 34.000 0.600 NA   NA
 256309 256310 XAC0408 XAC0409 hrpB2 hrcJ TRUE 0.994 2.000 0.833 1.000   NA
 256310 256311 XAC0409 XAC0410 hrcJ hrpB4 TRUE 0.987 8.000 0.833 NA   NA
 256311 256312 XAC0410 XAC0411 hrpB4 hrpB5 TRUE 0.963 -15.000 0.312 NA   NA
 256312 256313 XAC0411 XAC0412 hrpB5 hrcN TRUE 0.990 -10.000 0.312 NA Y NA
 256313 256314 XAC0412 XAC0413 hrcN hrpB7 TRUE 0.990 -7.000 0.800 NA   NA
 256314 256315 XAC0413 XAC0414 hrpB7 hrcT TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 256315 256316 XAC0414 XAC0415 hrcT hrcC TRUE 0.965 82.000 1.000 1.000 Y NA
 256319 256320 XAC0418 XAC0419     FALSE 0.015 792.000 0.000 NA   NA
 256322 256323 XAC0421 XAC0422 mdoB   FALSE 0.028 431.000 0.000 1.000   NA
 256326 2165883 XAC0425 XAC0426 glgA glgB2 TRUE 0.961 45.000 0.600 1.000 Y NA
 2165883 256328 XAC0426 XAC0427 glgB2   TRUE 0.999 3.000 0.600 0.005 Y NA
 256328 256329 XAC0427 XAC0428   malQ TRUE 0.998 -3.000 0.093 0.015 Y NA
 256329 256330 XAC0428 XAC0429 malQ glgY TRUE 0.998 -3.000 0.141 0.015 Y NA
 256330 256331 XAC0429 XAC0430 glgY   TRUE 0.630 32.000 0.031 NA   NA
 256331 256332 XAC0430 XAC0431   glgX TRUE 0.769 118.000 0.333 NA   NA
 256332 256333 XAC0431 XAC0432 glgX   TRUE 0.945 -31.000 0.016 NA Y NA
 256335 256336 XAC0434 XAC0435   virK FALSE 0.071 229.000 0.000 NA   NA
 256338 256339 XAC0437 XAC0438 ameR mexE TRUE 0.816 77.000 0.500 1.000 N NA
 256339 256340 XAC0438 XAC0439 mexE   TRUE 0.890 49.000 0.857 NA N NA
 256340 256341 XAC0439 XAC0440     TRUE 0.711 118.000 0.218 NA   NA
 256341 256342 XAC0440 XAC0441     FALSE 0.156 333.000 0.074 NA   NA
 256343 256344 XAC0442 XAC0443 rhlE pdhB FALSE 0.011 452.000 0.000 1.000 N NA
 256344 256345 XAC0443 XAC0444 pdhB   TRUE 0.978 -3.000 0.064 NA   NA
 256345 256346 XAC0444 XAC0445   pdhB TRUE 0.959 2.000 0.042 NA   NA
 256346 256347 XAC0445 XAC0446 pdhB pdhA TRUE 0.982 80.000 0.458 0.001 Y NA
 256347 2165884 XAC0446 XAC0447 pdhA nucH FALSE 0.276 178.000 0.013 1.000   NA
 256349 256350 XAC0448 XAC0449   yhiP FALSE 0.184 385.000 0.000 1.000 Y NA
 256350 256351 XAC0449 XAC0450 yhiP   TRUE 0.618 12.000 0.000 NA   NA
 256353 256354 XAC0452 XAC0453     FALSE 0.095 221.000 0.000 1.000   NA
 256354 256355 XAC0453 XAC0454   hmgA TRUE 0.566 37.000 0.017 1.000   NA
 256358 256359 XAC0457 XAC0458   phaF TRUE 0.999 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 256359 256360 XAC0458 XAC0459 phaF phaE TRUE 0.998 9.000 0.937 0.064 Y NA
 256360 256361 XAC0459 XAC0460 phaE phaD TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 256361 256362 XAC0460 XAC0461 phaD phaC TRUE 1.000 -3.000 0.976 0.006 Y NA
 256362 256363 XAC0461 XAC0462 phaC ndhF TRUE 0.999 0.000 0.881 0.006 Y NA
 256365 2165885 XAC0464 XAC0465     FALSE 0.206 99.000 0.000 NA   NA
 2165885 2165886 XAC0465 XAC0466     FALSE 0.116 512.000 0.000 0.007 N NA
 2165886 256368 XAC0466 XAC0467     FALSE 0.221 73.000 0.000 NA   NA
 256368 256369 XAC0467 XAC0468     TRUE 0.572 -39.000 0.000 NA   NA
 256374 256375 XAC0472 XAC0474 rpe   TRUE 0.977 -3.000 0.050 1.000   NA
 256375 256376 XAC0474 XAC0475     FALSE 0.080 235.000 0.000 1.000   NA
 256376 256377 XAC0475 XAC0476   trpE FALSE 0.009 569.000 0.000 1.000 N NA
 256377 2165888 XAC0476 XAC0477 trpE   TRUE 0.987 0.000 0.007 1.000 Y NA
 2165888 256379 XAC0477 XAC0478   trpG TRUE 0.463 198.000 0.000 1.000 Y NA
 256379 256380 XAC0478 XAC0479 trpG   FALSE 0.348 152.000 0.013 1.000   NA
 256380 256381 XAC0479 XAC0480   trpD FALSE 0.335 116.000 0.003 1.000   NA
 256381 256382 XAC0480 XAC0481 trpD trpC TRUE 0.895 141.000 0.293 1.000 Y NA
 256382 256383 XAC0481 XAC0482 trpC   TRUE 0.975 -7.000 0.010 1.000 Y NA
 256385 256386 XAC0484 XAC0485 speD sugE FALSE 0.328 137.000 0.019 1.000 N NA
 256388 256389 XAC0487 XAC0488 rplM rpsI TRUE 0.999 3.000 0.601 0.014 Y NA
 399441 399440 XAC0489 XAC0490 tRNA-Gln tRNA-Met FALSE 0.243 53.000 0.000 NA   NA
 256390 256391 XAC0491 XAC0492 nudH   FALSE 0.311 81.000 0.015 NA N NA
 256391 256392 XAC0492 XAC0493   bfr FALSE 0.406 323.000 0.070 NA Y NA
 256393 2165889 XAC0494 XAC0495     TRUE 0.999 1.000 0.556 0.026 Y NA
 2165889 256395 XAC0495 XAC0496     FALSE 0.351 183.000 0.045 NA   NA
 2165890 256397 XAC0497 XAC0498     TRUE 0.963 4.000 0.086 NA   NA
 256397 256398 XAC0498 XAC0499     TRUE 0.603 84.000 0.079 NA   NA
 256402 256403 XAC0503 XAC0504 nudC ampE FALSE 0.385 74.000 0.020 1.000 N NA
 256404 256405 XAC0505 XAC0506     TRUE 0.981 0.000 0.148 NA   NA
 256405 256406 XAC0506 XAC0507   aas FALSE 0.024 481.000 0.000 1.000   NA
 256406 256407 XAC0507 XAC0508 aas   FALSE 0.324 69.000 0.011 1.000 N NA
 256409 256410 XAC0510 XAC0511   purD FALSE 0.018 517.000 0.000 NA   NA
 256410 256411 XAC0511 XAC0512 purD   FALSE 0.425 34.000 0.002 NA   NA
 256411 256412 XAC0512 XAC0513   purH TRUE 0.513 25.000 0.003 NA   NA
 256413 256414 XAC0514 XAC0515 pgsA   TRUE 0.895 86.000 0.215 NA Y NA
 256414 256415 XAC0515 XAC0516     TRUE 0.990 -3.000 0.285 NA   NA
 256415 256416 XAC0516 XAC0517     TRUE 0.983 -3.000 0.090 1.000   NA
 256416 256417 XAC0517 XAC0518     TRUE 0.988 -3.000 0.200 NA   NA
 256417 256418 XAC0518 XAC0519   pgsA TRUE 0.972 0.000 0.069 NA   NA
 256418 256419 XAC0519 XAC0520 pgsA   TRUE 0.997 -3.000 0.246 1.000 Y NA
 256419 256420 XAC0520 XAC0521   cdsA TRUE 0.901 39.000 0.595 1.000   NA
 256421 2165891 XAC0522 XAC0523 fis   FALSE 0.205 106.000 0.000 NA   NA
 2165891 256423 XAC0523 XAC0524     FALSE 0.035 320.000 0.000 NA   NA
 256426 256427 XAC0527 XAC0528     FALSE 0.248 50.000 0.000 NA   NA
 256427 256428 XAC0528 XAC0529     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 256429 256430 XAC0530 XAC0531 accC   TRUE 0.873 -10.000 0.014 NA   NA
 256430 256431 XAC0531 XAC0532   bccP TRUE 0.630 18.000 0.004 NA   NA
 256431 256432 XAC0532 XAC0533 bccP aroQ TRUE 0.704 98.000 0.254 1.000 N NA
 256432 256433 XAC0533 XAC0534 aroQ dsbD FALSE 0.008 844.000 0.000 1.000 N NA
 256433 256434 XAC0534 XAC0535 dsbD cutA TRUE 0.810 -13.000 0.014 1.000 N NA
 256435 256436 XAC0536 XAC0537 virS   FALSE 0.023 429.000 0.000 NA   NA
 256436 256437 XAC0537 XAC0538     FALSE 0.123 177.000 0.000 NA   NA
 256437 256438 XAC0538 XAC0539     FALSE 0.054 255.000 0.000 NA   NA
 256440 256441 XAC0541 XAC0542 groES groEL TRUE 0.958 147.000 0.269 0.008 Y NA
 2165894 256444 XAC0544 XAC0545   aroG FALSE 0.022 529.000 0.000 1.000   NA
 256444 256445 XAC0545 XAC0546 aroG   FALSE 0.015 789.000 0.000 NA   NA
 256445 256446 XAC0546 XAC0547     FALSE 0.210 94.000 0.000 NA   NA
 256447 256448 XAC0548 XAC0549 GNL   TRUE 0.957 0.000 0.025 NA   NA
 2165895 256454 XAC0554 XAC0555     TRUE 0.584 151.000 0.132 NA   NA
 256454 256455 XAC0555 XAC0556     FALSE 0.265 45.000 0.000 NA   NA
 256455 256456 XAC0556 XAC0557   appA FALSE 0.302 36.000 0.000 NA   NA
 256457 256458 XAC0558 XAC0559 mxcB   FALSE 0.230 310.000 0.223 NA N NA
 256459 256460 XAC0560 XAC0561 mdcA mdcD TRUE 0.966 10.000 0.342 NA   NA
 256460 256461 XAC0561 XAC0562 mdcD mdcB TRUE 0.809 107.000 0.438 NA   NA
 256461 256462 XAC0562 XAC0563 mdcB mdcC TRUE 0.987 -9.000 0.700 NA   NA
 256462 256463 XAC0563 XAC0564 mdcC mdcE TRUE 0.971 3.000 0.102 NA   NA
 256463 256464 XAC0564 XAC0565 mdcE citG TRUE 0.982 -3.000 0.085 1.000   NA
 256464 256465 XAC0565 XAC0566 citG mdcH FALSE 0.372 230.000 0.203 1.000 N NA
 256465 256466 XAC0566 XAC0567 mdcH matC TRUE 0.608 88.000 0.070 1.000   NA
 256466 256467 XAC0567 XAC0568 matC mdcY TRUE 0.786 79.000 0.300 1.000   NA
 256468 256469 XAC0569 XAC0570 virP spoIIAA FALSE 0.264 187.000 0.015 1.000   NA
 256469 256470 XAC0570 XAC0571 spoIIAA   TRUE 0.995 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 256470 256471 XAC0571 XAC0572   icfG TRUE 0.995 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 256472 256473 XAC0573 XAC0574     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 256473 256474 XAC0574 XAC0575     FALSE 0.028 427.000 0.000 1.000   NA
 256474 256475 XAC0575 XAC0576   aceE FALSE 0.008 802.000 0.000 1.000 N NA
 256475 256476 XAC0576 XAC0577 aceE dcm FALSE 0.174 166.000 0.000 1.000   NA
 256477 256478 XAC0578 XAC0579     TRUE 0.861 54.000 0.000 0.076 Y NA
 256478 256479 XAC0579 XAC0580     FALSE 0.214 140.000 0.000 1.000   NA
 256480 256481 XAC0581 XAC0582     FALSE 0.056 249.000 0.000 NA   NA
 256483 256484 XAC0584 XAC0585     FALSE 0.181 138.000 0.000 NA   NA
 256484 256485 XAC0585 XAC0586     TRUE 0.815 -25.000 0.041 NA N NA
 256486 256487 XAC0587 XAC0588     FALSE 0.224 69.000 0.000 NA   NA
 256487 256488 XAC0588 XAC0589     FALSE 0.238 55.000 0.000 NA   NA
 2165896 256491 XAC0591 XAC0592     FALSE 0.028 377.000 0.000 NA   NA
 256492 256493 XAC0593 XAC0594     FALSE 0.076 223.000 0.000 NA   NA
 256494 256495 XAC0595 XAC0596     FALSE 0.031 353.000 0.000 NA   NA
 2165897 256498 XAC0598 XAC0599 pheC   FALSE 0.063 237.000 0.000 NA   NA
 256502 2165900 XAC0603 XAC0604   treA FALSE 0.026 395.000 0.000 NA   NA
 2165900 256504 XAC0604 XAC0605 treA   FALSE 0.046 273.000 0.000 NA   NA
 256505 256506 XAC0606 XAC0607     FALSE 0.018 516.000 0.000 NA   NA
 256507 256508 XAC0608 XAC0609 phS   FALSE 0.021 463.000 0.000 NA   NA
 256510 256511 XAC0611 XAC0612 tsr engXCA FALSE 0.011 446.000 0.000 1.000 N NA
 256512 2165901 XAC0613 XAC0614 ybaR   FALSE 0.010 523.000 0.000 1.000 N NA
 2165901 256514 XAC0614 XAC0615     FALSE 0.036 364.000 0.000 1.000   NA
 256515 256516 XAC0616 XAC0617     TRUE 0.561 -42.000 0.000 NA   NA
 2165902 256518 XAC0618 XAC0619 hrpM   FALSE 0.451 155.000 0.046 NA   NA
 256518 256519 XAC0619 XAC0620   algZ TRUE 0.941 5.000 0.037 1.000   NA
 256519 256520 XAC0620 XAC0621 algZ algR TRUE 0.990 31.000 0.775 0.033 Y NA
 256520 256521 XAC0621 XAC0622 algR hemC TRUE 0.584 31.000 0.032 1.000 N NA
 256523 256524 XAC0624 XAC0625     TRUE 0.721 8.000 0.000 NA   NA
 256526 256527 XAC0627 XAC0628     TRUE 0.518 68.000 0.034 NA   NA
 256527 256528 XAC0628 XAC0629     FALSE 0.243 109.000 0.000 1.000   NA
 256530 256531 XAC0631 XAC0632 ptrB   FALSE 0.161 363.000 0.105 NA   NA
 256531 256532 XAC0632 XAC0633     FALSE 0.237 57.000 0.000 NA   NA
 256532 256533 XAC0633 XAC0634   dapF FALSE 0.328 32.000 0.000 NA   NA
 256533 256534 XAC0634 XAC0635 dapF   TRUE 0.953 -12.000 0.175 NA   NA
 256534 256535 XAC0635 XAC0636   xerC TRUE 0.771 181.000 0.714 NA   NA
 256535 256536 XAC0636 XAC0637 xerC hslV FALSE 0.192 197.000 0.020 1.000 N NA
 256536 256537 XAC0637 XAC0638 hslV hslU TRUE 0.955 111.000 0.752 1.000 Y NA
 256538 256539 XAC0639 XAC0640 codA   TRUE 0.962 -3.000 0.014 1.000   NA
 256539 256540 XAC0640 XAC0641     TRUE 0.540 116.000 0.044 1.000   NA
 256540 256541 XAC0641 XAC0642   rmrB TRUE 0.995 -3.000 0.578 1.000   NA
 256542 256543 XAC0643 XAC0644 ubiE   TRUE 0.694 10.000 0.002 1.000 N NA
 256543 256544 XAC0644 XAC0645   pepN FALSE 0.189 236.000 0.047 1.000 N NA
 256544 256545 XAC0645 XAC0646 pepN   FALSE 0.371 190.000 0.070 NA   NA
 256545 256546 XAC0646 XAC0647     FALSE 0.090 380.000 0.031 NA   NA
 256546 256547 XAC0647 XAC0648   mxaF FALSE 0.021 581.000 0.000 1.000   NA
 256547 256548 XAC0648 XAC0649 mxaF moxJ TRUE 0.844 48.000 0.500 1.000 N NA
 256548 256549 XAC0649 XAC0650 moxJ   TRUE 0.955 -58.000 0.500 1.000   NA
 256549 256550 XAC0650 XAC0651     TRUE 0.998 -3.000 0.400 0.009   NA
 256550 256551 XAC0651 XAC0652   adhC TRUE 0.880 35.000 0.400 1.000   NA
 256551 256552 XAC0652 XAC0653 adhC fepA TRUE 0.986 6.000 0.667 1.000 N NA
 256553 2165904 XAC0654 XAC0655 acoR   FALSE 0.027 262.000 0.000 1.000 N NA
 256555 256556 XAC0656 XAC0657 mreB mreC TRUE 0.765 173.000 0.689 1.000 N NA
 256556 256557 XAC0657 XAC0658 mreC mreD TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 256557 256558 XAC0658 XAC0659 mreD mrdA TRUE 0.982 4.000 0.013 1.000 Y NA
 256558 256559 XAC0659 XAC0660 mrdA mrdB TRUE 0.939 -3.000 0.013 1.000 N NA
 256559 256560 XAC0660 XAC0661 mrdB peh-1 FALSE 0.016 358.000 0.000 1.000 N NA
 256560 256561 XAC0661 XAC0662 peh-1 mltB FALSE 0.276 269.000 0.000 NA Y NA
 256561 256562 XAC0662 XAC0663 mltB rlpA TRUE 0.997 -3.000 0.298 NA Y NA
 256562 256563 XAC0663 XAC0664 rlpA dacC FALSE 0.321 417.000 0.080 NA Y NA
 256565 256566 XAC0666 XAC0667   lipB TRUE 0.960 -12.000 0.219 NA   NA
 256566 256567 XAC0667 XAC0668 lipB lipA TRUE 0.995 16.000 0.319 0.001 Y NA
 256567 256568 XAC0668 XAC0669 lipA prc FALSE 0.015 378.000 0.000 1.000 N NA
 256572 256573 XAC0673 XAC0674   pbeF TRUE 0.836 124.000 0.078 1.000 Y NA
 256573 256574 XAC0674 XAC0675 pbeF   TRUE 0.683 23.000 0.022 NA   NA
 256574 256575 XAC0675 XAC0676     TRUE 0.851 -7.000 0.003 NA   NA
 256575 256576 XAC0676 XAC0677     FALSE 0.402 39.000 0.003 NA   NA
 256576 256577 XAC0677 XAC0678     TRUE 0.523 125.000 0.053 NA   NA
 256577 256578 XAC0678 XAC0679     TRUE 0.499 94.000 0.035 NA   NA
 256578 256579 XAC0679 XAC0680   gndA TRUE 0.760 21.000 0.042 NA   NA
 256581 256582 XAC0682 XAC0683     FALSE 0.066 234.000 0.000 NA   NA
 256582 256583 XAC0683 XAC0684     TRUE 0.995 -3.000 0.093 1.000 Y NA
 256583 256584 XAC0684 XAC0685     TRUE 0.997 4.000 0.116 0.026 Y NA
 256584 256585 XAC0685 XAC0686   folK FALSE 0.354 92.000 0.017 1.000 N NA
 2165905 256588 XAC0687 XAC0689     TRUE 0.812 -12.000 0.005 NA   NA
 256589 2165906 XAC0690 XAC0691 fecA   FALSE 0.029 418.000 0.000 1.000   NA
 256591 256592 XAC0692 XAC0693   fecA TRUE 0.804 78.000 0.373 NA   NA
 256592 256593 XAC0693 XAC0694 fecA xcsC FALSE 0.342 170.000 0.043 1.000 N NA
 256593 256594 XAC0694 XAC0695 xcsC xcsD TRUE 0.998 -3.000 0.575 1.000 Y NA
 256594 256595 XAC0695 XAC0696 xcsD xcsE TRUE 0.999 5.000 0.776 0.005 Y NA
 256595 256596 XAC0696 XAC0697 xcsE xcsF TRUE 0.997 -19.000 0.653 0.005 Y NA
 256596 256597 XAC0697 XAC0698 xcsF xcsG TRUE 0.991 29.000 0.599 0.005 Y NA
 256597 256598 XAC0698 XAC0699 xcsG xcsH TRUE 0.955 43.000 0.425 0.005   NA
 256598 256599 XAC0699 XAC0700 xcsH xcsI TRUE 0.993 -16.000 0.605 0.005   NA
 256599 256600 XAC0700 XAC0701 xcsI xcsJ TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.005   NA
 256600 256601 XAC0701 XAC0702 xcsJ xcsK TRUE 0.997 0.000 0.461 1.000 Y NA
 256601 256602 XAC0702 XAC0703 xcsK xcsL TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.063 Y NA
 256602 256603 XAC0703 XAC0704 xcsL xcsM TRUE 0.999 -3.000 0.811 1.000 Y NA
 256603 256604 XAC0704 XAC0705 xcsM xcsN TRUE 0.995 -3.000 0.649 1.000   NA
 256604 256605 XAC0705 XAC0706 xcsN iroN FALSE 0.019 718.000 0.000 1.000   NA
 256605 256606 XAC0706 XAC0707 iroN lacZ FALSE 0.195 154.000 0.000 1.000   NA
 256606 256607 XAC0707 XAC0708 lacZ lacZ TRUE 0.922 -45.000 0.000 0.005   NA
 256607 256608 XAC0708 XAC0709 lacZ   TRUE 0.916 -3.000 0.000 1.000   NA
 256608 256609 XAC0709 XAC0710     TRUE 0.771 116.000 0.333 NA   NA
 256609 256610 XAC0710 XAC0711     FALSE 0.082 212.000 0.000 NA   NA
 256610 256611 XAC0711 XAC0712   gluP TRUE 0.643 44.000 0.093 1.000 N NA
 256611 256612 XAC0712 XAC0713 gluP   TRUE 0.701 41.000 0.140 1.000 N NA
 256612 2165907 XAC0713 XAC0714   glmS TRUE 0.888 7.000 0.030 1.000 N NA
 2165907 256614 XAC0714 XAC0715 glmS nagA TRUE 0.935 3.000 0.030 1.000 N NA
 256614 256615 XAC0715 XAC0716 nagA fyuA FALSE 0.007 1045.000 0.000 1.000 N NA
 256616 256617 XAC0717 XAC0718 cca betA FALSE 0.090 156.000 0.000 1.000 N NA
 256617 256618 XAC0718 XAC0719 betA betB TRUE 0.829 122.000 0.634 1.000 N NA
 256618 256619 XAC0719 XAC0720 betB betT FALSE 0.393 41.000 0.012 1.000 N NA
 256619 256620 XAC0720 XAC0721 betT   FALSE 0.134 282.000 0.029 NA   NA
 256620 256621 XAC0721 XAC0722   dsbA TRUE 0.634 50.000 0.074 NA   NA
 256621 256622 XAC0722 XAC0723 dsbA dsbA TRUE 0.984 92.000 0.714 0.006 Y NA
 256622 256623 XAC0723 XAC0724 dsbA cycA TRUE 0.724 94.000 0.286 1.000 N NA
 256625 256626 XAC0726 XAC0727 mpd ybcM FALSE 0.275 63.000 0.000 1.000   NA
 256628 256629 XAC0729 XAC0730     TRUE 0.996 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 256630 256631 XAC0731 XAC0732     FALSE 0.232 64.000 0.000 NA   NA
 256631 256632 XAC0732 XAC0733     FALSE 0.035 328.000 0.000 NA   NA
 256632 256633 XAC0733 XAC0734     TRUE 0.854 67.000 0.531 NA   NA
 256633 256634 XAC0734 XAC0735     TRUE 0.607 69.000 0.061 1.000   NA
 256634 256635 XAC0735 XAC0736     TRUE 0.617 59.000 0.057 1.000   NA
 256637 256638 XAC0738 XAC0739     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 256639 256640 XAC0740 XAC0741   yjjK FALSE 0.055 251.000 0.000 NA   NA
 256641 256642 XAC0742 XAC0743   glyA FALSE 0.095 198.000 0.000 NA   NA
 256642 256643 XAC0743 XAC0744 glyA   FALSE 0.195 102.000 0.004 NA N NA
 256643 256644 XAC0744 XAC0745     TRUE 0.860 6.000 0.005 NA   NA
 256644 256645 XAC0745 XAC0746   ribD TRUE 0.948 -3.000 0.005 1.000   NA
 256647 256648 XAC0748 XAC0749 ribE ribA TRUE 0.990 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 256648 256649 XAC0749 XAC0750 ribA ribH TRUE 0.859 337.000 0.417 0.002 Y NA
 256649 256650 XAC0750 XAC0751 ribH nusB TRUE 0.935 -3.000 0.011 1.000 N NA
 256650 256651 XAC0751 XAC0752 nusB thiL TRUE 0.683 111.000 0.225 1.000 N NA
 256651 256652 XAC0752 XAC0753 thiL   FALSE 0.030 407.000 0.000 1.000   NA
 256652 256653 XAC0753 XAC0754     FALSE 0.074 225.000 0.000 NA   NA
 256653 256654 XAC0754 XAC0755     FALSE 0.021 451.000 0.000 NA   NA
 256654 256655 XAC0755 XAC0756   kdpA TRUE 0.857 16.000 0.071 NA   NA
 256655 256656 XAC0756 XAC0757 kdpA kdpB TRUE 0.994 13.000 0.145 0.001 Y NA
 256656 256657 XAC0757 XAC0758 kdpB kdpC TRUE 0.991 53.000 0.877 0.001 Y NA
 256657 256658 XAC0758 XAC0759 kdpC kdpD FALSE 0.443 53.000 0.026 1.000 N NA
 256658 256659 XAC0759 XAC0760 kdpD kdpE TRUE 0.992 -10.000 0.379 1.000 Y NA
 256660 256661 XAC0761 XAC0762   dld FALSE 0.198 121.000 0.000 NA   NA
 256661 256662 XAC0762 XAC0763 dld   TRUE 0.984 -3.000 0.130 NA   NA
 256662 256663 XAC0763 XAC0764     FALSE 0.451 33.000 0.004 NA   NA
 256663 256664 XAC0764 XAC0765     TRUE 0.974 4.000 0.172 NA   NA
 256665 2165908 XAC0766 XAC0767   rnpB FALSE 0.084 209.000 0.000 NA   NA
 256666 256667 XAC0768 XAC0769     TRUE 0.680 101.000 0.170 NA   NA
 256667 256668 XAC0769 XAC0770     FALSE 0.401 54.000 0.009 NA   NA
 256669 256670 XAC0771 XAC0772   mraW TRUE 0.892 45.000 0.635 NA   NA
 256670 256671 XAC0772 XAC0773 mraW ftsL TRUE 0.987 -3.000 0.227 1.000 N NA
 256671 256672 XAC0773 XAC0774 ftsL ftsI FALSE 0.438 53.000 0.024 1.000 N NA
 256672 256673 XAC0774 XAC0775 ftsI murE TRUE 0.991 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 256673 256674 XAC0775 XAC0776 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 256674 256675 XAC0776 XAC0777 murF mraY TRUE 0.997 -10.000 0.309 0.004 Y NA
 256675 256676 XAC0777 XAC0778 mraY ftsW TRUE 0.988 0.000 0.018 0.004 N NA
 256676 256677 XAC0778 XAC0779 ftsW murG TRUE 0.994 -3.000 0.647 1.000 N NA
 256677 256678 XAC0779 XAC0780 murG murC TRUE 0.997 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 256678 256679 XAC0780 XAC0781 murC ddlB TRUE 0.999 -3.000 0.153 0.004 Y NA
 256679 256680 XAC0781 XAC0782 ddlB ftsQ TRUE 0.919 107.000 0.372 NA Y NA
 256680 256681 XAC0782 XAC0783 ftsQ ftsA TRUE 0.990 -3.000 0.389 NA N NA
 256681 2165909 XAC0783 XAC0784 ftsA ftsZ TRUE 0.698 291.000 0.460 1.000 Y NA
 2165909 256683 XAC0784 XAC0785 ftsZ lpxC FALSE 0.286 237.000 0.134 1.000 N NA
 256685 256686 XAC0787 XAC0788   secA FALSE 0.434 157.000 0.068 1.000 N NA
 256686 256687 XAC0788 XAC0789 secA   FALSE 0.043 336.000 0.006 1.000 N NA
 256688 256689 XAC0790 XAC0791   metF TRUE 0.467 46.000 0.014 NA   NA
 256689 256690 XAC0791 XAC0792 metF   TRUE 0.952 -3.000 0.007 1.000   NA
 256690 256691 XAC0792 XAC0793     TRUE 0.535 16.000 0.000 NA   NA
 256692 256693 XAC0794 XAC0795   xcp FALSE 0.073 242.000 0.000 1.000   NA
 256697 256698 XAC0799 XAC0800     TRUE 0.557 132.000 0.080 NA   NA
 256698 256699 XAC0800 XAC0801     FALSE 0.185 133.000 0.000 NA   NA
 256699 256700 XAC0801 XAC0802     FALSE 0.019 500.000 0.000 NA   NA
 256700 256701 XAC0802 XAC0803     TRUE 0.824 33.000 0.200 1.000   NA
 256703 256704 XAC0805 XAC0806   ppc FALSE 0.199 265.000 0.089 1.000 N NA
 256704 256705 XAC0806 XAC0807 ppc   TRUE 0.675 65.000 0.105 1.000   NA
 256705 256706 XAC0807 XAC0808     TRUE 0.972 -3.000 0.039 NA   NA
 256706 256707 XAC0808 XAC0809     TRUE 0.980 -3.000 0.078 NA   NA
 256707 256708 XAC0809 XAC0810     TRUE 0.772 93.000 0.286 1.000   NA
 256708 2165910 XAC0810 XAC0811   cirA FALSE 0.024 483.000 0.000 1.000   NA
 2165910 2165911 XAC0811 XAC0812 cirA appA TRUE 0.977 -10.000 0.375 1.000   NA
 256713 256714 XAC0815 XAC0816     TRUE 0.506 29.000 0.002 1.000   NA
 256714 256715 XAC0816 XAC0817     FALSE 0.347 85.000 0.002 1.000   NA
 256715 256716 XAC0817 XAC0818   rbsK FALSE 0.022 536.000 0.000 1.000   NA
 256716 256717 XAC0818 XAC0819 rbsK yeiM FALSE 0.408 91.000 0.027 1.000 N NA
 256717 256718 XAC0819 XAC0820 yeiM   FALSE 0.030 359.000 0.000 NA   NA
 256719 256720 XAC0821 XAC0822     FALSE 0.370 157.000 0.023 NA   NA
 256720 256721 XAC0822 XAC0823   phuR FALSE 0.461 149.000 0.046 NA   NA
 256721 256722 XAC0823 XAC0824 phuR   TRUE 0.963 6.000 0.160 NA   NA
 256722 256723 XAC0824 XAC0825     FALSE 0.429 127.000 0.024 NA   NA
 256724 256725 XAC0826 XAC0827   nrtB FALSE 0.385 80.000 0.011 NA   NA
 256725 256726 XAC0827 XAC0828 nrtB nrtCD TRUE 0.999 -3.000 0.795 1.000 Y NA
 256726 256727 XAC0828 XAC0829 nrtCD   TRUE 0.996 4.000 0.553 NA Y NA
 256727 256728 XAC0829 XAC0830   tauD TRUE 0.840 71.000 0.647 NA N NA
 256728 256729 XAC0830 XAC0831 tauD   FALSE 0.305 305.000 0.011 NA Y NA
 256729 256730 XAC0831 XAC0832   ftsE TRUE 0.993 -3.000 0.535 NA N NA
 256731 256732 XAC0833 XAC0834 tesA colR FALSE 0.376 59.000 0.016 1.000 N NA
 256732 256733 XAC0834 XAC0835 colR colS TRUE 0.924 145.000 0.500 1.000 Y NA
 256735 256736 XAC0837 XAC0838 dgkA   FALSE 0.337 97.000 0.007 NA   NA
 256736 256737 XAC0838 XAC0839     FALSE 0.028 370.000 0.000 NA   NA
 256737 256738 XAC0839 XAC0840     TRUE 0.947 0.000 0.015 NA   NA
 256738 256739 XAC0840 XAC0841   lgt FALSE 0.362 54.000 0.005 NA   NA
 256739 256740 XAC0841 XAC0842 lgt thyA TRUE 0.983 -3.000 0.164 1.000 N NA
 256740 256741 XAC0842 XAC0843 thyA   FALSE 0.246 51.000 0.000 NA   NA
 256741 256742 XAC0843 XAC0844   folA TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 256743 256744 XAC0845 XAC0846 flbD msuC TRUE 0.829 50.000 0.467 1.000 N NA
 256744 256745 XAC0846 XAC0847 msuC ssuB FALSE 0.111 125.000 0.000 1.000 N NA
 256745 256746 XAC0847 XAC0848 ssuB ssuC TRUE 0.997 -3.000 0.273 1.000 Y NA
 256746 256747 XAC0848 XAC0849 ssuC ssuA TRUE 0.998 9.000 0.795 0.051 Y NA
 256747 256748 XAC0849 XAC0850 ssuA ssuD FALSE 0.457 12.000 0.000 1.000 N NA
 256748 256749 XAC0850 XAC0851 ssuD slfA FALSE 0.102 211.000 0.000 1.000   NA
 256750 256751 XAC0852 XAC0853     FALSE 0.161 155.000 0.000 NA   NA
 256751 256752 XAC0853 XAC0854     TRUE 0.678 -15.000 0.000 NA   NA
 256752 256753 XAC0854 XAC0855     TRUE 0.983 -3.000 0.190 NA N NA
 256753 256754 XAC0855 XAC0856   oppA FALSE 0.285 15.000 0.000 NA N NA
 256754 256755 XAC0856 XAC0857 oppA oppB TRUE 0.999 -3.000 0.889 0.051 Y NA
 256755 256756 XAC0857 XAC0858 oppB oppC TRUE 0.999 -3.000 0.533 0.051 Y NA
 256756 256757 XAC0858 XAC0859 oppC   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 256757 256758 XAC0859 XAC0860   oppD FALSE 0.220 76.000 0.000 NA   NA
 256759 256760 XAC0861 XAC0862 apaH apaG TRUE 0.821 29.000 0.267 NA N NA
 256760 256761 XAC0862 XAC0863 apaG ksgA TRUE 0.627 37.000 0.078 NA N NA
 256761 256762 XAC0863 XAC0864 ksgA pdxA TRUE 0.652 118.000 0.197 1.000 N NA
 256762 256763 XAC0864 XAC0865 pdxA surA TRUE 0.937 20.000 0.561 1.000 N NA
 256763 256764 XAC0865 XAC0866 surA ostA TRUE 0.951 -3.000 0.020 1.000 N NA
 256764 256765 XAC0866 XAC0867 ostA   TRUE 0.782 117.000 0.357 NA   NA
 256765 256766 XAC0867 XAC0868     FALSE 0.220 76.000 0.000 NA   NA
 256766 256767 XAC0868 XAC0869     FALSE 0.321 33.000 0.000 NA   NA
 256767 256768 XAC0869 XAC0870     TRUE 0.487 39.000 0.013 NA   NA
 256768 256769 XAC0870 XAC0871     TRUE 0.915 4.000 0.013 NA   NA
 256770 256771 XAC0872 XAC0873 ubiH visC TRUE 0.997 -18.000 0.474 0.001 Y NA
 256771 256772 XAC0873 XAC0874 visC   TRUE 0.790 98.000 0.017 0.007   NA
 256772 256773 XAC0874 XAC0875     TRUE 0.758 103.000 0.273 1.000   NA
 256773 256774 XAC0875 XAC0876     FALSE 0.412 188.000 0.091 NA   NA
 256776 256777 XAC0878 XAC0879 pcaH ligA TRUE 0.987 11.000 0.190 0.001   NA
 256777 256778 XAC0879 XAC0880 ligA pcaQ TRUE 0.654 73.000 0.095 1.000   NA
 256779 256780 XAC0881 XAC0882   badH FALSE 0.302 204.000 0.000 0.059 N NA
 256780 256781 XAC0882 XAC0883 badH fadB TRUE 0.885 84.000 0.333 0.059 N NA
 256781 256782 XAC0883 XAC0884 fadB   TRUE 0.849 46.000 0.500 1.000 N NA
 256782 256783 XAC0884 XAC0885     FALSE 0.224 130.000 0.000 1.000   NA
 256783 256784 XAC0885 XAC0886     FALSE 0.369 26.000 0.000 NA   NA
 256784 256785 XAC0886 XAC0887     TRUE 0.926 10.000 0.094 NA   NA
 256787 256788 XAC0889 XAC0890     TRUE 0.601 37.000 0.032 NA   NA
 256788 256789 XAC0890 XAC0891     TRUE 0.972 0.000 0.065 NA   NA
 256789 256790 XAC0891 XAC0892     FALSE 0.015 821.000 0.000 NA   NA
 256790 256791 XAC0892 XAC0893   glnS FALSE 0.034 382.000 0.000 1.000   NA
 256792 256793 XAC0894 XAC0895 gst   TRUE 0.727 -109.000 0.024 NA   NA
 256794 256795 XAC0896 XAC0897   torS TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.025 Y NA
 256795 256796 XAC0897 XAC0898 torS   TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.080 N NA
 256797 256798 XAC0899 XAC0900   pms FALSE 0.387 96.000 0.013 NA   NA
 256799 256800 XAC0901 XAC0902   talB FALSE 0.030 357.000 0.000 NA   NA
 256800 2165913 XAC0902 XAC0903 talB rnk FALSE 0.283 54.000 0.000 1.000   NA
 2165913 256802 XAC0903 XAC0904 rnk   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 256802 256803 XAC0904 XAC0905   oxyR FALSE 0.053 256.000 0.000 NA   NA
 256803 256804 XAC0905 XAC0906 oxyR ahpF FALSE 0.463 92.000 0.041 1.000 N NA
 256804 256805 XAC0906 XAC0907 ahpF ahpC TRUE 0.886 186.000 0.551 1.000 Y NA
 256806 256807 XAC0908 XAC0909 hemK pip FALSE 0.147 239.000 0.012 1.000   NA
 256808 256809 XAC0910 XAC0911     TRUE 0.721 50.000 0.135 1.000   NA
 256809 256810 XAC0911 XAC0912   exo TRUE 0.822 -111.000 0.068 1.000   NA
 256810 256811 XAC0912 XAC0913 exo   TRUE 0.942 -3.000 0.014 1.000 N NA
 2165914 256813 XAC0914 XAC0915     FALSE 0.076 223.000 0.000 NA   NA
 256815 256816 XAC0917 XAC0918   pntA FALSE 0.021 622.000 0.000 1.000   NA
 256816 256817 XAC0918 XAC0919 pntA pntA TRUE 0.914 19.000 0.000 0.001   NA
 2165915 256819 XAC0920 XAC0921     TRUE 0.985 6.000 0.556 NA   NA
 256819 256820 XAC0921 XAC0922     TRUE 0.978 -3.000 0.065 NA   NA
 256821 256822 XAC0923 XAC0924 pntA pntB TRUE 0.998 -3.000 0.321 0.001   NA
 256824 256825 XAC0926 XAC0927   ilvE TRUE 0.483 65.000 0.017 1.000   NA
 256825 256826 XAC0927 XAC0928 ilvE   FALSE 0.020 310.000 0.000 1.000 N NA
 256826 2165916 XAC0928 XAC0929     TRUE 0.992 30.000 0.667 0.005 Y NA
 2165916 2165917 XAC0929 XAC0930     TRUE 0.508 341.000 0.000 0.005 Y NA
 256829 256830 XAC0931 XAC0932   aspG TRUE 0.892 5.000 0.006 1.000   NA
 256831 256832 XAC0933 XAC0934     TRUE 0.919 18.000 0.000 0.001   NA
 256833 256834 XAC0935 XAC0936     TRUE 0.995 -3.000 0.657 NA   NA
 256835 256836 XAC0937 XAC0938 rbn yneN TRUE 0.967 -3.000 0.020 1.000   NA
 256836 256837 XAC0938 XAC0939 yneN acyP TRUE 0.917 0.000 0.011 1.000 N NA
 256837 256838 XAC0939 XAC0940 acyP   FALSE 0.210 94.000 0.000 NA   NA
 256839 256840 XAC0941 XAC0942   moaB TRUE 0.508 33.000 0.006 1.000   NA
 256840 256841 XAC0942 XAC0943 moaB   FALSE 0.017 351.000 0.000 1.000 N NA
 256841 256842 XAC0943 XAC0944   prfA TRUE 0.911 -3.000 0.004 1.000 N NA
 256842 256843 XAC0944 XAC0945 prfA hemA TRUE 0.994 -3.000 0.171 0.035 N NA
 256844 256845 XAC0946 XAC0947   lolB TRUE 0.969 -3.000 0.024 1.000   NA
 256845 256846 XAC0947 XAC0948 lolB ipk TRUE 0.924 -18.000 0.157 1.000 N NA
 256846 399387 XAC0948 XAC0949 ipk tRNA-Gln TRUE 0.819 4.000 0.000 NA   NA
 399387 256847 XAC0949 XAC0950 tRNA-Gln prsA FALSE 0.103 190.000 0.000 NA   NA
 256847 256848 XAC0950 XAC0951 prsA rplY TRUE 0.590 109.000 0.122 1.000 N NA
 256848 256849 XAC0951 XAC0952 rplY pth TRUE 0.979 52.000 0.496 0.020 Y NA
 256849 256850 XAC0952 XAC0953 pth ychF TRUE 0.893 78.000 0.184 1.000 Y NA
 256850 399388 XAC0953 XAC0954 ychF tRNA-Tyr FALSE 0.161 155.000 0.000 NA   NA
 399388 399389 XAC0954 XAC0955 tRNA-Tyr tRNA-Gly FALSE 0.341 30.000 0.000 NA   NA
 399389 399390 XAC0955 XAC0956 tRNA-Gly tRNA-Thr FALSE 0.313 34.000 0.000 NA   NA
 399390 256851 XAC0956 XAC0957 tRNA-Thr tufB FALSE 0.259 47.000 0.000 NA   NA
 256851 399391 XAC0957 XAC0958 tufB tRNA-Trp FALSE 0.204 107.000 0.000 NA   NA
 399391 256852 XAC0958 XAC0959 tRNA-Trp secE FALSE 0.248 50.000 0.000 NA   NA
 256852 256853 XAC0959 XAC0960 secE nusG TRUE 0.972 14.000 0.843 1.000 N NA
 256853 256854 XAC0960 XAC0961 nusG rplK TRUE 0.692 198.000 0.681 1.000 N NA
 256854 256855 XAC0961 XAC0962 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.018 Y NA
 256855 256856 XAC0962 XAC0963 rplA rplJ FALSE 0.422 544.000 0.302 1.000 Y NA
 256856 256857 XAC0963 XAC0964 rplJ rplL TRUE 0.966 55.000 0.884 1.000 Y NA
 256857 256858 XAC0964 XAC0965 rplL rpoB FALSE 0.329 280.000 0.223 1.000   NA
 256858 256859 XAC0965 XAC0966 rpoB rpoC TRUE 0.960 151.000 0.851 0.001   NA
 256859 256860 XAC0966 XAC0967 rpoC rpsL FALSE 0.324 219.000 0.122 1.000 N NA
 256860 256861 XAC0967 XAC0968 rpsL rpsG TRUE 0.997 13.000 0.620 0.002 Y NA
 256861 256862 XAC0968 XAC0969 rpsG fusA TRUE 0.936 138.000 0.579 1.000 Y NA
 256862 256863 XAC0969 XAC0970 fusA tufA TRUE 0.984 49.000 0.400 0.001 Y NA
 256863 256864 XAC0970 XAC0971 tufA rpsJ TRUE 0.465 467.000 0.318 1.000 Y NA
 256864 256865 XAC0971 XAC0972 rpsJ rplC TRUE 0.994 12.000 0.307 0.018 Y NA
 256865 256866 XAC0972 XAC0973 rplC rplD TRUE 0.996 13.000 0.486 0.013 Y NA
 256866 256867 XAC0973 XAC0974 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.013 Y NA
 256867 256868 XAC0974 XAC0975 rplW rplB TRUE 0.998 11.000 0.849 0.017 Y NA
 256868 256869 XAC0975 XAC0976 rplB rpsS TRUE 0.998 7.000 0.820 0.018 Y NA
 256869 256870 XAC0976 XAC0977 rpsS rplV TRUE 0.998 7.000 0.769 0.018 Y NA
 256870 256871 XAC0977 XAC0978 rplV rpsC TRUE 0.995 18.000 0.719 0.018 Y NA
 256871 256872 XAC0978 XAC0979 rpsC rplP TRUE 0.999 6.000 0.828 0.018 Y NA
 256872 256873 XAC0979 XAC0980 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.013 Y NA
 256873 256874 XAC0980 XAC0981 rpmC rpsQ TRUE 0.997 12.000 0.828 0.013 Y NA
 256874 256875 XAC0981 XAC0982 rpsQ rplN TRUE 0.996 15.000 0.791 0.018 Y NA
 256875 256876 XAC0982 XAC0983 rplN rplX TRUE 0.996 16.000 0.810 0.018 Y NA
 256876 256877 XAC0983 XAC0984 rplX rplE TRUE 0.997 12.000 0.758 0.013 Y NA
 256877 256878 XAC0984 XAC0985 rplE rpsN TRUE 0.990 19.000 0.309 0.013 Y NA
 256878 256879 XAC0985 XAC0986 rpsN rpsH TRUE 0.914 205.000 0.295 0.013 Y NA
 256879 256880 XAC0986 XAC0987 rpsH rplF TRUE 0.996 16.000 0.808 0.013 Y NA
 256880 256881 XAC0987 XAC0988 rplF rplR TRUE 0.985 89.000 0.815 0.013 Y NA
 256881 256882 XAC0988 XAC0989 rplR rpsE TRUE 0.976 159.000 0.814 0.018 Y NA
 256882 256883 XAC0989 XAC0990 rpsE rpmD TRUE 0.993 23.000 0.789 0.018 Y NA
 256883 256884 XAC0990 XAC0991 rpmD rplO TRUE 0.999 5.000 0.653 0.002 Y NA
 256884 256885 XAC0991 XAC0992 rplO secY TRUE 0.983 8.000 0.730 1.000 N NA
 256885 256886 XAC0992 XAC0993 secY rpsM FALSE 0.055 333.000 0.011 1.000 N NA
 256886 256887 XAC0993 XAC0994 rpsM rpsK TRUE 0.998 11.000 0.810 0.013 Y NA
 256887 256888 XAC0994 XAC0995 rpsK rpsD TRUE 0.995 16.000 0.509 0.018 Y NA
 256888 256889 XAC0995 XAC0996 rpsD rpoA TRUE 0.845 54.000 0.549 1.000 N NA
 256889 256890 XAC0996 XAC0997 rpoA rplQ TRUE 0.773 181.000 0.873 1.000 N NA
 256890 256891 XAC0997 XAC0998 rplQ dsbB FALSE 0.013 400.000 0.000 1.000 N NA
 256893 256894 XAC1000 XAC1001 dhs1   FALSE 0.308 86.000 0.015 NA N NA
 256895 256896 XAC1002 XAC1003 gatAX   FALSE 0.254 224.000 0.045 NA   NA
 256896 256897 XAC1003 XAC1004   typA TRUE 0.658 17.000 0.006 NA   NA
 256898 256899 XAC1005 XAC1006 ppiB mdh FALSE 0.345 119.000 0.018 1.000 N NA
 256900 256901 XAC1007 XAC1008 gst   FALSE 0.148 409.000 0.111 1.000   NA
 256903 256904 XAC1010 XAC1011 fadH   TRUE 0.758 207.000 0.017 0.050 Y NA
 256905 256906 XAC1012 XAC1013 mopB   TRUE 0.595 193.000 0.333 NA   NA
 256906 256907 XAC1013 XAC1014     TRUE 0.735 86.000 0.227 NA   NA
 256908 256909 XAC1015 XAC1016   kbl TRUE 0.925 3.000 0.007 1.000   NA
 256910 256911 XAC1017 XAC1018 sbp cysU TRUE 0.986 4.000 0.020 0.001 N NA
 256911 256912 XAC1018 XAC1019 cysU cysW TRUE 0.999 -3.000 0.935 0.001 N NA
 256912 256913 XAC1019 XAC1020 cysW cysA TRUE 0.991 2.000 0.050 1.000 Y NA
 256913 256914 XAC1020 XAC1021 cysA   FALSE 0.043 283.000 0.000 NA   NA
 256915 256916 XAC1022 XAC1023 tdh fecA FALSE 0.010 525.000 0.000 1.000 N NA
 256917 256918 XAC1024 XAC1025     FALSE 0.142 167.000 0.000 NA   NA
 256918 256919 XAC1025 XAC1026     FALSE 0.381 25.000 0.000 NA   NA
 256919 256920 XAC1026 XAC1027     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 256920 256921 XAC1027 XAC1028   pgmA TRUE 0.666 93.000 0.143 NA   NA
 256921 256922 XAC1028 XAC1029 pgmA folC FALSE 0.063 269.000 0.006 1.000 N NA
 256922 256923 XAC1029 XAC1030 folC   FALSE 0.413 68.000 0.013 NA   NA
 256923 256924 XAC1030 XAC1031   cvpA FALSE 0.151 214.000 0.007 NA   NA
 256924 256925 XAC1031 XAC1032 cvpA purF TRUE 0.856 31.000 0.262 1.000   NA
 256925 256926 XAC1032 XAC1033 purF   FALSE 0.224 196.000 0.012 1.000   NA
 256926 256927 XAC1033 XAC1034     FALSE 0.021 591.000 0.000 1.000   NA
 256927 2165918 XAC1034 XAC1035     TRUE 0.625 135.000 0.143 NA   NA
 256929 256930 XAC1036 XAC1037     FALSE 0.044 493.000 0.008 1.000   NA
 256930 256931 XAC1037 XAC1038   gtrB TRUE 0.931 -19.000 0.125 1.000   NA
 256931 256932 XAC1038 XAC1039 gtrB ppx FALSE 0.145 224.000 0.018 1.000 N NA
 256932 256933 XAC1039 XAC1040 ppx ppk TRUE 0.760 172.000 0.076 1.000 Y NA
 256933 256934 XAC1040 XAC1041 ppk phoR FALSE 0.459 113.000 0.045 1.000 N NA
 256934 256935 XAC1041 XAC1042 phoR phoB TRUE 0.943 58.000 0.453 1.000 Y NA
 256935 256936 XAC1042 XAC1043 phoB   FALSE 0.276 183.000 0.016 1.000   NA
 256937 256938 XAC1044 XAC1045 grxC   TRUE 0.974 -3.000 0.045 NA   NA
 256938 256939 XAC1045 XAC1046   icd FALSE 0.200 227.000 0.025 NA   NA
 399392 399393 XAC1048 XAC1049 tRNA-Pro tRNA-Arg FALSE 0.272 43.000 0.000 NA   NA
 399393 399394 XAC1049 XAC1050 tRNA-Arg tRNA-His FALSE 0.321 33.000 0.000 NA   NA
 399394 256941 XAC1050 XAC1051 tRNA-His   FALSE 0.158 157.000 0.000 NA   NA
 256942 256943 XAC1052 XAC1053     TRUE 0.876 45.000 0.000 0.074 Y NA
 256943 256944 XAC1053 XAC1054     TRUE 0.676 42.000 0.000 0.074   NA
 256944 256945 XAC1054 XAC1055     TRUE 0.668 12.000 0.000 1.000   NA
 256946 256947 XAC1056 XAC1057     FALSE 0.020 471.000 0.000 NA   NA
 256948 256949 XAC1058 XAC1059   ard TRUE 0.549 -46.000 0.000 NA   NA
 256949 256950 XAC1059 XAC1060 ard   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 256950 256951 XAC1060 XAC1061     FALSE 0.206 100.000 0.000 NA   NA
 256951 256952 XAC1061 XAC1062     FALSE 0.013 2116.000 0.000 NA   NA
 256952 256953 XAC1062 XAC1063   p13 FALSE 0.030 361.000 0.000 NA   NA
 256953 256954 XAC1063 XAC1064 p13 gp19 FALSE 0.051 263.000 0.000 NA   NA
 256954 256955 XAC1064 XAC1065 gp19   TRUE 0.981 0.000 0.143 NA   NA
 256955 256956 XAC1065 XAC1066   gpY TRUE 0.505 -66.000 0.000 NA   NA
 256956 256957 XAC1066 XAC1067 gpY   TRUE 0.721 8.000 0.000 NA   NA
 256957 256958 XAC1067 XAC1068   stf TRUE 0.678 -15.000 0.000 NA   NA
 256958 256959 XAC1068 XAC1069 stf   TRUE 0.612 -25.000 0.000 NA   NA
 256960 256961 XAC1070 XAC1071     TRUE 0.862 54.000 0.000 0.073 Y NA
 256963 256964 XAC1074 XAC1075     TRUE 0.843 -282.000 0.000 0.020   NA
 399396 256965 XAC1076 XAC1077 tRNA-Leu tig FALSE 0.090 202.000 0.000 NA   NA
 256965 256966 XAC1077 XAC1078 tig clpP TRUE 0.925 93.000 0.351 1.000 Y NA
 256966 256967 XAC1078 XAC1079 clpP clpX TRUE 0.917 125.000 0.352 1.000 Y NA
 256967 256968 XAC1079 XAC1080 clpX lon TRUE 0.932 145.000 0.201 0.095 Y NA
 256968 256969 XAC1080 XAC1081 lon hupB FALSE 0.112 214.000 0.008 1.000 N NA
 256969 399397 XAC1081 XAC1082 hupB tRNA-Val TRUE 0.618 12.000 0.000 NA   NA
 399397 399398 XAC1082 XAC1083 tRNA-Val tRNA-Asp FALSE 0.348 29.000 0.000 NA   NA
 399398 399399 XAC1083 XAC1084 tRNA-Asp tRNA-Asp FALSE 0.209 95.000 0.000 NA   NA
 399399 256970 XAC1084 XAC1085 tRNA-Asp ppiD FALSE 0.044 279.000 0.000 NA   NA
 256971 256972 XAC1086 XAC1087 dniR gloB TRUE 0.955 -3.000 0.008 1.000   NA
 256973 256974 XAC1088 XAC1089   rnhA TRUE 0.481 28.000 0.003 NA   NA
 256974 256975 XAC1089 XAC1090 rnhA dnaQ TRUE 0.988 9.000 0.248 1.000 Y NA
 399400 256977 XAC1092 XAC1093 tRNA-Ser   FALSE 0.044 278.000 0.000 NA   NA
 256979 256980 XAC1095 XAC1096     TRUE 0.965 0.000 0.032 1.000   NA
 256980 256981 XAC1096 XAC1097   moaA TRUE 0.797 27.000 0.108 1.000   NA
 256981 256982 XAC1097 XAC1098 moaA moaC TRUE 0.506 400.000 0.003 0.002 Y NA
 256982 256983 XAC1098 XAC1099 moaC moaD TRUE 0.999 -3.000 0.175 0.002 Y NA
 256983 256984 XAC1099 XAC1100 moaD moaE TRUE 0.999 3.000 0.501 0.002 Y NA
 256984 256985 XAC1100 XAC1101 moaE   FALSE 0.019 786.000 0.000 1.000   NA
 256985 256986 XAC1101 XAC1102     FALSE 0.321 42.000 0.000 1.000   NA
 256986 256987 XAC1102 XAC1103     TRUE 0.862 54.000 0.000 0.073 Y NA
 256987 256988 XAC1103 XAC1104   mobL FALSE 0.351 36.000 0.000 1.000   NA
 256989 256990 XAC1105 XAC1106     TRUE 0.846 166.000 1.000 NA   NA
 256990 2165919 XAC1106 XAC1107     FALSE 0.170 146.000 0.000 NA   NA
 2165919 399439 XAC1107 XAC1108   tRNA-Ser FALSE 0.156 158.000 0.000 NA   NA
 256992 256993 XAC1109 XAC1110 dnaX   TRUE 0.979 7.000 0.411 NA   NA
 256993 256994 XAC1110 XAC1111   recR TRUE 0.852 98.000 0.604 NA   NA
 256994 256995 XAC1111 XAC1112 recR   FALSE 0.307 105.000 0.013 1.000 N NA
 256996 256997 XAC1113 XAC1114 slp   TRUE 0.550 30.000 0.012 NA   NA
 256997 256998 XAC1114 XAC1115     TRUE 0.989 -7.000 0.727 NA   NA
 256998 256999 XAC1115 XAC1116   moxR TRUE 0.989 6.000 0.739 NA   NA
 257000 257001 XAC1117 XAC1118     TRUE 0.716 -73.000 0.014 NA   NA
 257001 257002 XAC1118 XAC1119     FALSE 0.174 246.000 0.029 NA   NA
 257004 257005 XAC1121 XAC1122   rpmF TRUE 0.848 98.000 0.599 NA   NA
 257005 257006 XAC1122 XAC1123 rpmF fabH FALSE 0.338 91.000 0.014 1.000 N NA
 257006 257007 XAC1123 XAC1124 fabH   FALSE 0.073 242.000 0.000 1.000   NA
 257009 257010 XAC1126 XAC1127 fabD fabG TRUE 0.979 83.000 0.432 0.003 Y NA
 257010 257011 XAC1127 XAC1128 fabG acpP TRUE 0.930 205.000 0.321 0.003 Y NA
 257011 257012 XAC1128 XAC1129 acpP fabF TRUE 0.906 142.000 0.346 1.000 Y NA
 257012 257013 XAC1129 XAC1130 fabF trpE TRUE 0.665 167.000 0.030 0.013 N NA
 257013 257014 XAC1130 XAC1131 trpE   FALSE 0.404 61.000 0.010 NA   NA
 257014 257015 XAC1131 XAC1132   holB TRUE 0.942 -3.000 0.005 NA   NA
 257015 257016 XAC1132 XAC1133 holB pilZ TRUE 0.990 -3.000 0.382 NA N NA
 257016 399401 XAC1133 XAC1134 pilZ tRNA-Val FALSE 0.146 165.000 0.000 NA   NA
 399401 257017 XAC1134 XAC1135 tRNA-Val   FALSE 0.047 271.000 0.000 NA   NA
 257019 257020 XAC1137 XAC1138 prpB prpC TRUE 0.823 76.000 0.502 1.000 N NA
 257020 257021 XAC1138 XAC1139 prpC acnA TRUE 0.889 146.000 0.289 1.000 Y NA
 257021 257022 XAC1139 XAC1140 acnA   FALSE 0.383 68.000 0.018 1.000 N NA
 257022 257023 XAC1140 XAC1141     TRUE 0.989 -3.000 0.241 NA   NA
 257023 257024 XAC1141 XAC1142     FALSE 0.160 234.000 0.017 NA   NA
 257024 2165920 XAC1142 XAC1143   fyuA FALSE 0.081 215.000 0.000 NA   NA
 2165920 257026 XAC1143 XAC1144 fyuA   TRUE 0.480 185.000 0.214 NA N NA
 257026 257027 XAC1144 XAC1145     FALSE 0.016 703.000 0.000 NA   NA
 257027 2165921 XAC1145 XAC1146   fecA FALSE 0.043 327.000 0.000 1.000   NA
 2165921 257029 XAC1146 XAC1147 fecA glpQ FALSE 0.443 274.000 0.400 1.000   NA
 257029 257030 XAC1147 XAC1148 glpQ pbpC FALSE 0.027 436.000 0.000 1.000   NA
 257031 257032 XAC1149 XAC1150     TRUE 0.765 43.000 0.016 0.035 N NA
 257033 257034 XAC1151 XAC1152 hspA cbpA FALSE 0.370 412.000 0.133 NA Y NA
 257036 257037 XAC1154 XAC1155 pilH hflK FALSE 0.008 688.000 0.000 1.000 N NA
 257037 257038 XAC1155 XAC1156 hflK hflC TRUE 0.999 0.000 0.947 0.010 Y NA
 257038 257039 XAC1156 XAC1157 hflC   FALSE 0.014 385.000 0.000 1.000 N NA
 257039 257040 XAC1157 XAC1158   purA FALSE 0.007 899.000 0.000 1.000 N NA
 257040 257041 XAC1158 XAC1159 purA pepN FALSE 0.015 377.000 0.000 1.000 N NA
 257043 257044 XAC1161 XAC1162     FALSE 0.029 364.000 0.000 NA   NA
 257044 257045 XAC1162 XAC1163     FALSE 0.024 408.000 0.000 NA   NA
 257045 257046 XAC1163 XAC1164     TRUE 0.874 69.000 0.667 NA   NA
 257046 2165922 XAC1164 XAC1165     TRUE 0.484 -81.000 0.000 NA   NA
 2165922 257048 XAC1165 XAC1166     TRUE 0.541 130.000 0.069 NA   NA
 257048 257049 XAC1166 XAC1167     TRUE 0.975 -16.000 0.517 NA   NA
 257049 257050 XAC1167 XAC1168     TRUE 0.638 96.000 0.118 NA   NA
 257050 257051 XAC1168 XAC1169     FALSE 0.030 358.000 0.000 NA   NA
 257051 257052 XAC1169 XAC1170     FALSE 0.164 153.000 0.000 NA   NA
 257056 257057 XAC1174 XAC1175     TRUE 0.987 0.000 0.013 NA Y NA
 257057 2165925 XAC1175 XAC1176   srfJ FALSE 0.006 492.000 0.000 NA N NA
 257059 257060 XAC1177 XAC1178     TRUE 0.987 -3.000 0.250 1.000 N NA
 257060 257061 XAC1178 XAC1179     FALSE 0.012 433.000 0.000 1.000 N NA
 257061 257062 XAC1179 XAC1180     FALSE 0.056 275.000 0.000 1.000   NA
 257063 2165926 XAC1181 XAC1182   trxB FALSE 0.010 352.000 0.000 NA N NA
 2165926 257065 XAC1182 XAC1183 trxB   TRUE 0.985 -3.000 0.125 1.000   NA
 257067 257068 XAC1185 XAC1186   uvrA2 FALSE 0.064 259.000 0.000 1.000   NA
 257069 257070 XAC1187 XAC1188     TRUE 1.000 -3.000 0.943 0.001 Y NA
 257070 257071 XAC1188 XAC1189     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.049 Y NA
 257072 257073 XAC1190 XAC1191     TRUE 0.963 -3.000 0.021 NA   NA
 257073 257074 XAC1191 XAC1192   tcmJ TRUE 0.540 63.000 0.038 NA   NA
 257074 257075 XAC1192 XAC1193 tcmJ   FALSE 0.395 166.000 0.038 NA   NA
 257076 257077 XAC1194 XAC1195 doc   TRUE 0.979 -3.000 0.074 NA   NA
 257078 257079 XAC1196 XAC1197 lexA   TRUE 0.838 47.000 0.381 NA   NA
 257079 257080 XAC1197 XAC1198     TRUE 0.981 10.000 0.667 NA   NA
 257080 257081 XAC1198 XAC1199   dnaE2 TRUE 0.576 236.000 0.500 1.000   NA
 257081 257082 XAC1199 XAC1200 dnaE2   FALSE 0.133 67.000 0.000 1.000 N NA
 257082 257083 XAC1200 XAC1201     FALSE 0.043 216.000 0.000 1.000 N NA
 257083 257084 XAC1201 XAC1202   oliA FALSE 0.023 424.000 0.000 NA   NA
 257084 257085 XAC1202 XAC1203 oliA   FALSE 0.017 615.000 0.000 NA   NA
 257085 2165927 XAC1203 XAC1204     FALSE 0.040 294.000 0.000 NA   NA
 2165928 257089 XAC1206 XAC1207     TRUE 0.721 177.000 0.500 NA   NA
 257089 2165929 XAC1207 XAC1208     FALSE 0.016 715.000 0.000 NA   NA
 257091 257092 XAC1209 XAC1210     FALSE 0.125 176.000 0.000 NA   NA
 257092 257093 XAC1210 XAC1211   katE FALSE 0.045 277.000 0.000 NA   NA
 257093 257094 XAC1211 XAC1212 katE   FALSE 0.109 203.000 0.000 1.000   NA
 257094 257095 XAC1212 XAC1213     FALSE 0.280 56.000 0.000 1.000   NA
 257095 257096 XAC1213 XAC1214   gcvP FALSE 0.065 180.000 0.000 1.000 N NA
 257097 257098 XAC1215 XAC1216 bcr   TRUE 0.827 17.000 0.054 NA   NA
 257099 257100 XAC1217 XAC1218   yjdB TRUE 0.553 111.000 0.049 1.000   NA
 257100 257101 XAC1218 XAC1219 yjdB   TRUE 0.987 -3.000 0.152 1.000   NA
 257101 2165930 XAC1219 XAC1220     TRUE 0.580 100.000 0.061 1.000   NA
 257103 257104 XAC1221 XAC1222 colR colS TRUE 0.997 -7.000 0.833 1.000 Y NA
 257105 257106 XAC1223 XAC1224   minE FALSE 0.442 62.000 0.015 NA   NA
 257106 257107 XAC1224 XAC1225 minE minD TRUE 0.997 3.000 0.618 NA Y NA
 257107 257108 XAC1225 XAC1226 minD minC TRUE 0.959 36.000 0.466 1.000 Y NA
 257108 2165931 XAC1226 XAC1227 minC   TRUE 0.925 4.000 0.013 1.000   NA
 257110 257111 XAC1228 XAC1229     TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.031 Y NA
 257111 257112 XAC1229 XAC1230     FALSE 0.034 332.000 0.000 NA   NA
 257112 257113 XAC1230 XAC1231     FALSE 0.386 103.000 0.013 NA   NA
 257113 257114 XAC1231 XAC1232     TRUE 0.516 30.000 0.008 NA   NA
 257115 257116 XAC1233 XAC1234     FALSE 0.048 299.000 0.000 1.000   NA
 257116 257117 XAC1234 XAC1235     TRUE 0.963 -3.000 0.020 NA   NA
 257117 257118 XAC1235 XAC1236     FALSE 0.319 167.000 0.018 NA   NA
 257120 257121 XAC1238 XAC1239   ate1 TRUE 0.750 -46.000 0.014 NA   NA
 257123 257124 XAC1241 XAC1242   pthX FALSE 0.077 222.000 0.000 NA   NA
 257124 257125 XAC1242 XAC1243 pthX tesB FALSE 0.247 200.000 0.026 NA   NA
 257125 257126 XAC1243 XAC1244 tesB   TRUE 0.799 71.000 0.021 1.000 Y NA
 257128 257129 XAC1246 XAC1247   uvrA1 TRUE 0.936 0.000 0.005 1.000   NA
 257130 257131 XAC1248 XAC1249 rplU rpmA TRUE 0.997 13.000 0.667 0.013 Y NA
 257131 257132 XAC1249 XAC1250 rpmA yhbZ FALSE 0.461 252.000 0.335 1.000   NA
 257134 257135 XAC1252 XAC1253 mviN ribF TRUE 0.525 185.000 0.169 1.000   NA
 257135 257136 XAC1253 XAC1254 ribF ileS TRUE 0.964 7.000 0.254 1.000 N NA
 257136 257137 XAC1254 XAC1255 ileS lspA FALSE 0.191 315.000 0.147 1.000 N NA
 257137 257138 XAC1255 XAC1256 lspA lytB TRUE 0.870 67.000 0.095 1.000 Y NA
 257138 399402 XAC1256 XAC1257 lytB tRNA-Thr FALSE 0.220 76.000 0.000 NA   NA
 399402 257139 XAC1257 XAC1258 tRNA-Thr cyoA FALSE 0.030 362.000 0.000 NA   NA
 257139 257140 XAC1258 XAC1259 cyoA cyoB TRUE 0.999 0.000 0.385 0.008 Y NA
 257140 257141 XAC1259 XAC1260 cyoB cyoC TRUE 0.998 3.000 0.385 0.049 Y NA
 257141 257142 XAC1260 XAC1261 cyoC cyoD TRUE 0.999 0.000 0.917 0.049 Y NA
 257142 257143 XAC1261 XAC1262 cyoD   FALSE 0.231 341.000 0.167 1.000   NA
 257143 257144 XAC1262 XAC1263   radA FALSE 0.188 334.000 0.000 0.043   NA
 257144 257145 XAC1263 XAC1264 radA   FALSE 0.029 416.000 0.000 1.000   NA
 257147 257148 XAC1266 XAC1267 hrpXct hsp90xc FALSE 0.045 211.000 0.000 1.000 N NA
 257148 257149 XAC1267 XAC1268 hsp90xc   TRUE 0.945 25.000 0.727 1.000   NA
 257149 257150 XAC1268 XAC1269   rsbR FALSE 0.016 638.000 0.000 NA   NA
 257150 257151 XAC1269 XAC1270 rsbR rsbS TRUE 0.996 2.000 0.361 NA Y NA
 257151 257152 XAC1270 XAC1271 rsbS rsbT TRUE 0.998 -3.000 0.454 NA Y NA
 257152 257153 XAC1271 XAC1272 rsbT   TRUE 0.993 -9.000 0.522 0.093   NA
 257153 2165932 XAC1272 XAC1273     TRUE 0.996 -3.000 0.261 0.093   NA
 2165932 257155 XAC1273 XAC1274   cvgSY TRUE 0.995 -10.000 0.125 0.015 Y NA
 257158 257159 XAC1277 XAC1278 trx   FALSE 0.412 174.000 0.059 NA   NA
 257159 257160 XAC1278 XAC1279     FALSE 0.029 367.000 0.000 NA   NA
 257160 257161 XAC1279 XAC1280   cheB TRUE 0.979 -3.000 0.059 1.000   NA
 257161 257162 XAC1280 XAC1281 cheB cheR TRUE 0.993 -3.000 0.416 1.000   NA
 257162 257163 XAC1281 XAC1283 cheR   TRUE 0.992 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 2165935 257165 XAC1282 XAC1284     TRUE 0.996 -7.000 0.200 0.031 Y NA
 257166 257167 XAC1285 XAC1286 lamA   FALSE 0.121 624.000 0.000 1.000 Y NA
 257170 257171 XAC1289 XAC1290 ffh   FALSE 0.030 734.000 0.003 1.000   NA
 257171 257172 XAC1290 XAC1291     TRUE 0.934 -9.000 0.045 1.000   NA
 257172 257173 XAC1291 XAC1292   rpsP FALSE 0.235 98.000 0.004 1.000 N NA
 257173 257174 XAC1292 XAC1293 rpsP rimM TRUE 0.979 44.000 0.342 0.013 Y NA
 257174 257175 XAC1293 XAC1294 rimM trmD TRUE 0.958 64.000 0.672 1.000 Y NA
 257175 257176 XAC1294 XAC1295 trmD rplS TRUE 0.931 145.000 0.567 1.000 Y NA
 257177 257178 XAC1296 XAC1297     TRUE 0.993 4.000 0.087 0.001   NA
 257179 257180 XAC1298 XAC1299   gstA TRUE 0.584 74.000 0.116 NA N NA
 257180 257181 XAC1299 XAC1300 gstA hslR FALSE 0.042 221.000 0.000 1.000 N NA
 2165936 257183 XAC1301 XAC1302 katG   FALSE 0.026 450.000 0.000 1.000   NA
 257183 257184 XAC1302 XAC1303   mutS FALSE 0.047 307.000 0.000 1.000   NA
 257185 257186 XAC1304 XAC1305   wapA TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 257186 257187 XAC1305 XAC1306 wapA   FALSE 0.004 1266.000 0.000 NA N NA
 257187 257188 XAC1306 XAC1307     TRUE 0.487 192.000 0.182 NA   NA
 257189 257190 XAC1308 XAC1309 bga galA TRUE 0.998 -3.000 0.400 0.014   NA
 257190 2165937 XAC1309 XAC1310 galA btuB TRUE 0.553 190.000 0.222 1.000   NA
 2165937 257192 XAC1310 XAC1311 btuB   FALSE 0.023 518.000 0.000 1.000   NA
 257193 257194 XAC1312 XAC1313 mmsA fadE9 TRUE 0.799 11.000 0.019 1.000 N NA
 257194 257195 XAC1313 XAC1314 fadE9 paaF TRUE 0.997 -3.000 0.242 1.000 Y NA
 257195 257196 XAC1314 XAC1315 paaF   TRUE 0.991 33.000 0.627 0.002 Y NA
 257196 257197 XAC1315 XAC1316   mmsB TRUE 0.924 170.000 0.687 1.000 Y NA
 257197 257198 XAC1316 XAC1317 mmsB czcD FALSE 0.042 220.000 0.000 1.000 N NA
 257200 257201 XAC1319 XAC1320 algU   TRUE 0.994 -3.000 0.705 NA N NA
 257201 257202 XAC1320 XAC1321   mucD FALSE 0.398 110.000 0.035 NA N NA
 257202 257203 XAC1321 XAC1322 mucD lepA FALSE 0.169 173.000 0.007 1.000 N NA
 257203 257204 XAC1322 XAC1323 lepA lepB TRUE 0.652 104.000 0.187 1.000 N NA
 257204 257205 XAC1323 XAC1324 lepB   TRUE 0.965 1.000 0.053 NA   NA
 257205 257206 XAC1324 XAC1325   rnc TRUE 0.866 -10.000 0.013 NA   NA
 257206 257207 XAC1325 XAC1326 rnc era TRUE 0.990 -3.000 0.017 0.040   NA
 257207 257208 XAC1326 XAC1327 era recO FALSE 0.155 236.000 0.012 1.000   NA
 257210 257211 XAC1329 XAC1330     FALSE 0.388 87.000 0.007 1.000   NA
 257211 257212 XAC1330 XAC1331   frnE FALSE 0.302 183.000 0.021 1.000   NA
 257212 257213 XAC1331 XAC1332 frnE   TRUE 0.560 38.000 0.017 1.000   NA
 257213 257214 XAC1332 XAC1333     FALSE 0.278 177.000 0.013 1.000   NA
 257214 257215 XAC1333 XAC1334   nagZ FALSE 0.238 118.000 0.000 1.000   NA
 257215 257216 XAC1334 XAC1335 nagZ hpt TRUE 0.953 0.000 0.034 1.000 N NA
 257216 257217 XAC1335 XAC1336 hpt deoD TRUE 0.952 86.000 0.067 0.002 Y NA
 257217 257218 XAC1336 XAC1337 deoD scoF FALSE 0.325 88.000 0.013 1.000 N NA
 257218 257219 XAC1337 XAC1338 scoF   TRUE 0.582 94.000 0.107 1.000 N NA
 257220 257221 XAC1339 XAC1340   lhr2 TRUE 0.991 2.000 0.460 1.000   NA
 257221 257222 XAC1340 XAC1341 lhr2 lig2 TRUE 0.995 -3.000 0.214 0.093   NA
 257222 257223 XAC1341 XAC1342 lig2   TRUE 0.628 227.000 0.751 NA N NA
 257223 257224 XAC1342 XAC1343     FALSE 0.063 237.000 0.000 NA   NA
 257224 257225 XAC1343 XAC1344     TRUE 0.841 150.000 0.750 NA   NA
 257225 257226 XAC1344 XAC1345     TRUE 0.465 250.000 0.500 NA N NA
 257226 257227 XAC1345 XAC1346     TRUE 0.860 111.000 0.667 NA   NA
 257227 257228 XAC1346 XAC1347     FALSE 0.070 230.000 0.000 NA   NA
 257228 257229 XAC1347 XAC1348   atoB TRUE 0.709 123.000 0.222 NA   NA
 257231 2165939 XAC1350 XAC1351 leu   FALSE 0.189 157.000 0.000 1.000   NA
 2165939 257233 XAC1351 XAC1352     FALSE 0.106 188.000 0.000 NA   NA
 257237 257238 XAC1356 XAC1357   yegD FALSE 0.014 834.000 0.000 NA   NA
 257238 257239 XAC1357 XAC1358 yegD slyD TRUE 0.700 147.000 0.009 1.000 Y NA
 257239 257240 XAC1358 XAC1359 slyD catA FALSE 0.017 341.000 0.000 1.000 N NA
 257242 257243 XAC1361 XAC1362   nerA FALSE 0.232 64.000 0.000 NA   NA
 257244 257245 XAC1363 XAC1364 araJ   FALSE 0.022 558.000 0.000 1.000   NA
 257245 257246 XAC1364 XAC1365     FALSE 0.057 274.000 0.000 1.000   NA
 257246 257247 XAC1365 XAC1366     FALSE 0.437 36.000 0.005 NA   NA
 257247 2165940 XAC1366 XAC1367     TRUE 0.587 64.000 0.056 NA   NA
 2165940 257249 XAC1367 XAC1368   acvB TRUE 0.574 70.000 0.056 NA   NA
 257251 257252 XAC1370 XAC1371     TRUE 0.836 11.000 0.018 NA   NA
 257253 257254 XAC1372 XAC1373     TRUE 0.930 18.000 0.324 1.000   NA
 257254 257255 XAC1373 XAC1374     TRUE 0.983 -3.000 0.113 NA   NA
 257255 2165942 XAC1374 XAC1375   cfaA TRUE 0.981 -3.000 0.087 NA   NA
 2165942 257257 XAC1375 XAC1376 cfaA   TRUE 0.976 -3.000 0.053 NA   NA
 257257 257258 XAC1376 XAC1377     TRUE 0.880 72.000 0.722 NA   NA
 257258 257259 XAC1377 XAC1378   desC TRUE 0.977 -3.000 0.047 1.000   NA
 257259 257260 XAC1378 XAC1379 desC   FALSE 0.035 327.000 0.000 NA   NA
 257260 257261 XAC1379 XAC1380   rpoE TRUE 0.967 -15.000 0.349 NA   NA
 257261 257262 XAC1380 XAC1381 rpoE   TRUE 0.572 59.000 0.048 NA   NA
 257262 257263 XAC1381 XAC1382     TRUE 0.763 86.000 0.286 NA   NA
 257263 257264 XAC1382 XAC1383     TRUE 0.508 17.000 0.000 NA   NA
 257264 257265 XAC1383 XAC1384   ydgM FALSE 0.243 53.000 0.000 NA   NA
 257265 257266 XAC1384 XAC1385 ydgM   FALSE 0.334 -76.000 0.000 1.000 N NA
 257266 257267 XAC1385 XAC1386   metS FALSE 0.308 307.000 0.333 1.000 N NA
 257267 257268 XAC1386 XAC1387 metS   FALSE 0.142 253.000 0.019 NA   NA
 257268 257269 XAC1387 XAC1388     FALSE 0.068 232.000 0.000 NA   NA
 257269 257270 XAC1388 XAC1389   yfiL TRUE 0.925 13.000 0.150 1.000   NA
 257270 257271 XAC1389 XAC1390 yfiL   FALSE 0.064 140.000 0.000 NA N NA
 257272 257273 XAC1391 XAC1392 ykfD mmuM TRUE 0.996 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 2165943 257275 XAC1393 XAC1394     FALSE 0.145 275.000 0.032 NA   NA
 257275 257276 XAC1394 XAC1395     TRUE 0.801 14.000 0.020 NA   NA
 257279 257280 XAC1398 XAC1399     TRUE 0.588 213.000 0.417 NA   NA
 257281 257282 XAC1400 XAC1401     FALSE 0.117 329.000 0.034 NA   NA
 257284 257285 XAC1403 XAC1404     FALSE 0.219 78.000 0.000 NA   NA
 257285 257286 XAC1404 XAC1405   accA FALSE 0.333 115.000 0.003 1.000   NA
 257286 257287 XAC1405 XAC1406 accA dnaE1 TRUE 0.503 160.000 0.122 1.000 N NA
 257287 257288 XAC1406 XAC1407 dnaE1 rnhB TRUE 0.557 263.000 0.104 1.000 Y NA
 257288 257289 XAC1407 XAC1408 rnhB lpxB TRUE 0.985 -3.000 0.186 1.000 N NA
 257289 257290 XAC1408 XAC1409 lpxB lpxA TRUE 0.953 30.000 0.289 1.000 Y NA
 257290 257291 XAC1409 XAC1410 lpxA fabZ TRUE 0.575 26.000 0.022 1.000 N NA
 257291 257292 XAC1410 XAC1411 fabZ lpxD TRUE 0.951 -3.000 0.019 1.000 N NA
 257294 257295 XAC1413 XAC1414 oma   TRUE 0.755 84.000 0.007 1.000 Y NA
 257295 257296 XAC1414 XAC1415   dxr TRUE 0.909 27.000 0.568 1.000 N NA
 257296 257297 XAC1415 XAC1416 dxr cdsA TRUE 0.996 3.000 0.372 1.000 Y NA
 257297 257298 XAC1416 XAC1417 cdsA uppS TRUE 0.998 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 257298 257299 XAC1417 XAC1418 uppS frr TRUE 0.986 3.000 0.409 1.000 N NA
 257299 257300 XAC1418 XAC1419 frr pyrH TRUE 0.707 185.000 0.626 1.000 N NA
 257300 257301 XAC1419 XAC1420 pyrH   FALSE 0.236 107.000 0.004 1.000 N NA
 257301 257302 XAC1420 XAC1421   tsf FALSE 0.047 279.000 0.002 1.000 N NA
 257302 257303 XAC1421 XAC1422 tsf rpsB TRUE 0.927 170.000 0.748 1.000 Y NA
 257303 257304 XAC1422 XAC1423 rpsB   FALSE 0.008 395.000 0.000 NA N NA
 257304 257305 XAC1423 XAC1424     FALSE 0.027 384.000 0.000 NA   NA
 257305 2165945 XAC1424 XAC1425   fasD TRUE 0.989 3.000 0.444 NA   NA
 2165945 257307 XAC1425 XAC1426 fasD ecpD TRUE 0.986 17.000 0.667 NA Y NA
 257307 257308 XAC1426 XAC1427 ecpD pru TRUE 0.941 9.000 0.125 NA   NA
 257309 257310 XAC1428 XAC1429 map glnD TRUE 0.981 -3.000 0.128 1.000 N NA
 257310 2165946 XAC1429 XAC1430 glnD dapD FALSE 0.048 364.000 0.012 1.000 N NA
 2165946 257312 XAC1430 XAC1431 dapD   FALSE 0.310 190.000 0.061 1.000 N NA
 257312 257313 XAC1431 XAC1432   dapE FALSE 0.346 265.000 0.292 1.000 N NA
 257313 257314 XAC1432 XAC1433 dapE asnB FALSE 0.256 294.000 0.000 1.000 Y NA
 257315 257316 XAC1434 XAC1435   fhuA FALSE 0.021 451.000 0.000 NA   NA
 257316 257317 XAC1435 XAC1436 fhuA acyII FALSE 0.027 440.000 0.000 1.000   NA
 257317 257318 XAC1436 XAC1437 acyII acyII TRUE 0.914 19.000 0.000 0.001   NA
 257320 257321 XAC1439 XAC1440 tpmT   FALSE 0.023 422.000 0.000 NA   NA
 257321 257322 XAC1440 XAC1441   parC TRUE 0.819 4.000 0.000 NA   NA
 257322 257323 XAC1441 XAC1442 parC   FALSE 0.276 62.000 0.005 1.000 N NA
 257324 257325 XAC1443 XAC1444 yybA yjcP TRUE 0.880 24.000 0.333 1.000 N NA
 257325 257326 XAC1444 XAC1445 yjcP pmrA TRUE 0.946 11.000 0.278 1.000 N NA
 257326 257327 XAC1445 XAC1446 pmrA pmrB TRUE 0.990 7.000 0.900 1.000   NA
 399438 257328 XAC1447 XAC1448 tRNA-Leu bglS FALSE 0.176 142.000 0.000 NA   NA
 257328 257329 XAC1448 XAC1449 bglS   TRUE 0.478 122.000 0.027 1.000   NA
 2165947 257331 XAC1450 XAC1451 ygdR   TRUE 0.874 -58.000 0.091 1.000   NA
 2165948 257334 XAC1453 XAC1454     TRUE 0.982 7.000 0.500 NA   NA
 257334 257335 XAC1454 XAC1455     TRUE 0.829 66.000 0.429 NA   NA
 257338 257339 XAC1458 XAC1459 fpr msbA FALSE 0.185 216.000 0.028 1.000 N NA
 257340 257341 XAC1460 XAC1461 fumB gst FALSE 0.070 254.000 0.006 1.000 N NA
 257341 257342 XAC1461 XAC1462 gst cynT TRUE 0.661 35.000 0.077 1.000 N NA
 257343 257344 XAC1463 XAC1464     FALSE 0.308 174.000 0.021 NA   NA
 257346 257347 XAC1466 XAC1468 pcp   TRUE 0.832 133.000 0.556 1.000   NA
 257349 257350 XAC1469 XAC1470     FALSE 0.053 433.000 0.013 NA   NA
 257351 257352 XAC1471 XAC1472   gcdH TRUE 0.785 145.000 0.429 1.000   NA
 257352 257353 XAC1472 XAC1473 gcdH   TRUE 0.944 15.000 0.333 NA   NA
 257353 2165949 XAC1473 XAC1474   gst FALSE 0.449 135.000 0.033 NA   NA
 2165949 257355 XAC1474 XAC1475 gst   FALSE 0.202 203.000 0.028 1.000 N NA
 257355 257356 XAC1475 XAC1476     FALSE 0.398 172.000 0.048 NA   NA
 257356 257357 XAC1476 XAC1477   dnaB FALSE 0.208 222.000 0.024 NA   NA
 257357 257358 XAC1477 XAC1478 dnaB phr TRUE 0.755 70.000 0.006 1.000 Y NA
 257358 257359 XAC1478 XAC1479 phr   FALSE 0.048 291.000 0.004 1.000 N NA
 257361 257362 XAC1481 XAC1482   mexE TRUE 0.956 -3.000 0.009 1.000   NA
 257362 257363 XAC1482 XAC1483 mexE mexF TRUE 0.759 178.000 0.750 1.000 N NA
 257363 257364 XAC1483 XAC1484 mexF   TRUE 0.718 41.000 0.160 1.000 N NA
 257364 257365 XAC1484 XAC1485   oprN TRUE 0.962 -6.000 0.160 1.000 N NA
 257373 257374 XAC1493 XAC1494   orf2 TRUE 0.984 -7.000 0.500 NA   NA
 257374 257375 XAC1494 XAC1495 orf2 xrvA FALSE 0.016 636.000 0.000 NA   NA
 257376 257377 XAC1496 XAC1497     FALSE 0.455 20.000 0.000 NA   NA
 257377 257378 XAC1497 XAC1498   int FALSE 0.045 275.000 0.000 NA   NA
 257378 257379 XAC1498 XAC1500 int   FALSE 0.014 1502.000 0.000 NA   NA
 257380 257381 XAC1499 XAC1501     FALSE 0.233 124.000 0.000 1.000   NA
 257381 257382 XAC1501 XAC1502     TRUE 0.620 -40.000 0.000 1.000   NA
 257382 257383 XAC1502 XAC1503     TRUE 0.542 -48.000 0.000 NA   NA
 257383 257384 XAC1503 XAC1504     FALSE 0.121 178.000 0.000 NA   NA
 257384 257385 XAC1504 XAC1505     TRUE 0.956 -6.000 0.000 0.071   NA
 257388 2165950 XAC1508 XAC1509     TRUE 0.734 28.000 0.067 NA   NA
 2165950 257390 XAC1509 XAC1510   int TRUE 0.841 18.000 0.067 1.000   NA
 257390 2165951 XAC1510 XAC1511 int   FALSE 0.205 105.000 0.000 NA   NA
 257393 257394 XAC1514 XAC1515     TRUE 0.742 26.000 0.063 NA   NA
 257396 257397 XAC1517 XAC1518 fur   FALSE 0.246 51.000 0.000 NA   NA
 257399 257400 XAC1520 XAC1521 hrcA grpE FALSE 0.389 101.000 0.025 1.000 N NA
 257400 257401 XAC1521 XAC1522 grpE dnaK TRUE 0.924 142.000 0.049 0.007 Y NA
 257401 257402 XAC1522 XAC1523 dnaK dnaJ TRUE 0.954 161.000 0.236 0.003 Y NA
 257402 257403 XAC1523 XAC1524 dnaJ pdxY FALSE 0.011 459.000 0.000 1.000 N NA
 257403 257404 XAC1524 XAC1525 pdxY tyrA TRUE 0.922 -3.000 0.007 1.000 N NA
 257405 257406 XAC1526 XAC1527     TRUE 0.995 -3.000 0.714 1.000 N NA
 257406 257407 XAC1527 XAC1528     TRUE 0.994 5.000 0.351 1.000 Y NA
 257407 257408 XAC1528 XAC1529   oxyR TRUE 0.785 12.000 0.021 1.000 N NA
 257408 257409 XAC1529 XAC1530 oxyR draA FALSE 0.032 241.000 0.000 1.000 N NA
 257409 257410 XAC1530 XAC1531 draA   FALSE 0.454 57.000 0.012 1.000   NA
 257410 257411 XAC1531 XAC1532     FALSE 0.066 234.000 0.000 NA   NA
 257411 257412 XAC1532 XAC1533   ldp FALSE 0.281 155.000 0.008 NA   NA
 257412 257413 XAC1533 XAC1534 ldp sucB TRUE 0.880 147.000 0.253 1.000 Y NA
 257413 2165953 XAC1534 XAC1535 sucB odhA TRUE 0.965 43.000 0.667 1.000 Y NA
 2165953 257415 XAC1535 XAC1536 odhA   FALSE 0.141 181.000 0.000 1.000   NA
 257415 257416 XAC1536 XAC1537     TRUE 0.977 -3.000 0.061 NA   NA
 257416 2165954 XAC1537 XAC1538     FALSE 0.058 246.000 0.000 NA   NA
 2165954 257418 XAC1538 XAC1539   purB FALSE 0.026 386.000 0.000 NA   NA
 257422 257423 XAC1543 XAC1544     FALSE 0.438 268.000 0.400 NA   NA
 257423 257424 XAC1544 XAC1545     FALSE 0.237 56.000 0.000 NA   NA
 257424 257425 XAC1545 XAC1546     TRUE 0.646 11.000 0.000 NA   NA
 257425 257426 XAC1546 XAC1547   nodI TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 257426 257427 XAC1547 XAC1548 nodI   TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000 N NA
 257428 257429 XAC1549 XAC1550 btuE fkpA TRUE 0.755 160.000 0.042 1.000 Y NA
 257429 257430 XAC1550 XAC1551 fkpA ugd TRUE 0.877 26.000 0.357 1.000 N NA
 257430 257431 XAC1551 XAC1552 ugd   TRUE 0.909 -7.000 0.020 NA   NA
 257431 257432 XAC1552 XAC1553     TRUE 0.740 19.000 0.024 NA   NA
 257432 257433 XAC1553 XAC1554     FALSE 0.047 271.000 0.000 NA   NA
 257433 257434 XAC1554 XAC1555     FALSE 0.331 210.000 0.077 NA   NA
 257434 257435 XAC1555 XAC1556   fucP TRUE 0.882 14.000 0.115 1.000 N NA
 257435 257436 XAC1556 XAC1557 fucP scrK TRUE 0.975 -75.000 0.308 1.000 Y NA
 257436 257437 XAC1557 XAC1558 scrK   TRUE 0.993 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 257438 257439 XAC1559 XAC1560 metH metH TRUE 0.747 248.000 0.009 0.001 Y NA
 257439 257440 XAC1560 XAC1561 metH   FALSE 0.420 45.000 0.017 1.000 N NA
 257444 399437 XAC1566 XAC1565   tRNA-Leu TRUE 0.471 -92.000 0.000 NA   NA
 2165955 257446 XAC1567 XAC1568 vacB   FALSE 0.085 282.000 0.004 1.000   NA
 257446 257447 XAC1568 XAC1569     FALSE 0.068 312.000 0.002 1.000   NA
 257447 2165956 XAC1569 XAC1570     FALSE 0.054 264.000 0.002 1.000 N NA
 257451 2165957 XAC1573 XAC1574 phoU pstB TRUE 0.777 129.000 0.034 NA Y NA
 2165957 257453 XAC1574 XAC1575 pstB pstA TRUE 0.993 23.000 0.526 0.002 Y NA
 257453 257454 XAC1575 XAC1576 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.002 Y NA
 257454 257455 XAC1576 XAC1577 pstC pstS TRUE 0.938 113.000 0.033 0.002 Y NA
 257455 257456 XAC1577 XAC1578 pstS phoX TRUE 0.831 351.000 0.333 0.002 Y NA
 257456 257457 XAC1578 XAC1579 phoX oprO TRUE 0.900 188.000 0.750 NA Y NA
 257458 257459 XAC1580 XAC1581 cynT ychM TRUE 0.970 12.000 0.069 1.000 Y NA
 257460 257461 XAC1582 XAC1583 nth   FALSE 0.411 42.000 0.005 NA   NA
 257461 257462 XAC1583 XAC1584   crt TRUE 0.953 8.000 0.160 NA   NA
 257463 257464 XAC1585 XAC1586     FALSE 0.133 298.000 0.028 1.000   NA
 257464 257465 XAC1586 XAC1587   sseA TRUE 0.967 -3.000 0.021 1.000   NA
 257465 257466 XAC1587 XAC1588 sseA   FALSE 0.358 128.000 0.012 NA   NA
 257468 257469 XAC1590 XAC1591     TRUE 0.968 -3.000 0.029 NA   NA
 257469 257470 XAC1591 XAC1592     TRUE 0.605 41.000 0.040 NA   NA
 257470 257471 XAC1592 XAC1593     FALSE 0.136 184.000 0.000 1.000   NA
 257471 257472 XAC1593 XAC1594     FALSE 0.254 167.000 0.004 1.000   NA
 257472 257473 XAC1594 XAC1595     FALSE 0.043 217.000 0.000 1.000 N NA
 257473 257474 XAC1595 XAC1596     FALSE 0.388 173.000 0.036 1.000   NA
 257475 257476 XAC1597 XAC1598     FALSE 0.107 663.000 0.139 NA   NA
 257476 257477 XAC1598 XAC1599   sbcB TRUE 0.970 -3.000 0.034 NA   NA
 257477 257478 XAC1599 XAC1600 sbcB   FALSE 0.042 456.000 0.017 1.000 N NA
 257478 257479 XAC1600 XAC1601     TRUE 0.497 154.000 0.100 1.000 N NA
 257479 257480 XAC1601 XAC1602     TRUE 0.686 34.000 0.060 NA   NA
 257480 257481 XAC1602 XAC1603   haaO TRUE 0.463 64.000 0.019 NA   NA
 257481 257482 XAC1603 XAC1604 haaO yadF TRUE 0.506 86.000 0.027 1.000   NA
 257483 257484 XAC1605 XAC1606     TRUE 0.832 43.000 0.333 NA   NA
 257484 257485 XAC1606 XAC1607     TRUE 0.857 52.000 0.500 NA   NA
 257485 257486 XAC1607 XAC1608     TRUE 0.901 48.000 0.750 NA   NA
 257486 257487 XAC1608 XAC1609     FALSE 0.014 898.000 0.000 NA   NA
 257487 257488 XAC1609 XAC1610     TRUE 0.782 40.000 0.200 NA   NA
 257488 257489 XAC1610 XAC1611     TRUE 0.769 6.000 0.000 NA   NA
 257489 257490 XAC1611 XAC1612     FALSE 0.028 373.000 0.000 NA   NA
 257490 257491 XAC1612 XAC1613     FALSE 0.053 282.000 0.000 1.000   NA
 257491 257492 XAC1613 XAC1614     FALSE 0.088 204.000 0.000 NA   NA
 257493 257494 XAC1615 XAC1616 paiB   TRUE 0.937 -13.000 0.116 NA   NA
 257494 257495 XAC1616 XAC1617     TRUE 0.996 -3.000 0.833 NA   NA
 257495 257496 XAC1617 XAC1618   asnS FALSE 0.108 256.000 0.009 NA   NA
 257497 257498 XAC1619 XAC1620   rpsF FALSE 0.029 363.000 0.000 NA   NA
 257498 257499 XAC1620 XAC1621 rpsF rpsR TRUE 0.995 12.000 0.319 0.013 Y NA
 257499 257500 XAC1621 XAC1622 rpsR rplI TRUE 0.948 188.000 0.499 0.013 Y NA
 257500 257501 XAC1622 XAC1623 rplI smc FALSE 0.127 78.000 0.000 1.000 N NA
 257501 257502 XAC1623 XAC1624 smc zipA TRUE 0.889 57.000 0.115 0.010   NA
 257502 257503 XAC1624 XAC1625 zipA   TRUE 0.746 7.000 0.000 NA   NA
 257505 257506 XAC1627 XAC1628 lig1 lysS TRUE 0.913 -3.000 0.004 1.000 N NA
 257506 257507 XAC1628 XAC1629 lysS   FALSE 0.462 94.000 0.026 NA   NA
 257507 257508 XAC1629 XAC1630     FALSE 0.191 194.000 0.009 NA   NA
 257508 257509 XAC1630 XAC1631   gyrA FALSE 0.111 210.000 0.007 1.000 N NA
 257509 257510 XAC1631 XAC1632 gyrA   FALSE 0.206 100.000 0.000 NA   NA
 257510 257511 XAC1632 XAC1633   gcd FALSE 0.341 30.000 0.000 NA   NA
 2165958 257513 XAC1634 XAC1635   hutU FALSE 0.036 560.000 0.008 NA   NA
 257513 257514 XAC1635 XAC1636 hutU hutG TRUE 0.952 17.000 0.061 1.000 Y NA
 257514 257515 XAC1636 XAC1637 hutG hutH TRUE 0.682 182.000 0.039 1.000 Y NA
 257515 2165959 XAC1637 XAC1638 hutH hutI TRUE 0.967 14.000 0.192 0.033 N NA
 257517 2165960 XAC1639 XAC1640 sdeB hutC FALSE 0.078 348.000 0.027 1.000 N NA
 257519 257520 XAC1641 XAC1642     FALSE 0.042 286.000 0.000 NA   NA
 257520 257521 XAC1642 XAC1643   phaF FALSE 0.220 76.000 0.000 NA   NA
 257521 257522 XAC1643 XAC1644 phaF   TRUE 0.516 163.000 0.095 NA   NA
 257524 257525 XAC1646 XAC1647     TRUE 0.944 126.000 0.790 0.047   NA
 257526 257527 XAC1648 XAC1649 serC pheA TRUE 0.873 83.000 0.121 1.000 Y NA
 257527 257528 XAC1649 XAC1650 pheA aroA TRUE 0.797 123.000 0.035 1.000 Y NA
 257529 257530 XAC1651 XAC1652     TRUE 0.809 227.000 0.333 0.002   NA
 257533 399403 XAC1655 XAC1656   tRNA-Ser FALSE 0.029 368.000 0.000 NA   NA
 257534 257535 XAC1657 XAC1658     FALSE 0.031 352.000 0.000 NA   NA
 257535 2165961 XAC1658 XAC1659     TRUE 0.809 131.000 0.500 NA   NA
 257537 257538 XAC1660 XAC1661     TRUE 0.863 54.000 0.000 0.070 Y NA
 257543 2165962 XAC1666 XAC1667 tsr   FALSE 0.017 346.000 0.000 1.000 N NA
 2165962 257545 XAC1667 XAC1668   slyA FALSE 0.180 37.000 0.000 1.000 N NA
 257548 257549 XAC1671 XAC1672   cvgSY TRUE 0.997 -13.000 0.667 0.090 Y NA
 257550 257551 XAC1673 XAC1674   cycL TRUE 0.997 0.000 0.500 NA Y NA
 257551 257552 XAC1674 XAC1675 cycL dsbE TRUE 0.965 66.000 1.000 NA Y NA
 257552 257553 XAC1675 XAC1676 dsbE cycK TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.003 Y NA
 257553 257554 XAC1676 XAC1677 cycK cycJ TRUE 0.925 67.000 0.008 0.003 Y NA
 257554 257555 XAC1677 XAC1678 cycJ   TRUE 0.990 -3.000 0.344 1.000 N NA
 257555 257556 XAC1678 XAC1679   ccmC TRUE 0.993 -3.000 0.501 1.000 N NA
 257556 2165964 XAC1679 XAC1680 ccmC   TRUE 0.954 11.000 0.008 1.000 Y NA
 2165964 257558 XAC1680 XAC1681     TRUE 0.996 -3.000 0.833 NA   NA
 257558 257559 XAC1681 XAC1682   rpoE TRUE 0.961 -108.000 0.833 NA   NA
 257559 257560 XAC1682 XAC1683 rpoE   TRUE 0.879 64.000 0.667 NA   NA
 257560 2165965 XAC1683 XAC1684   cycA FALSE 0.439 237.000 0.286 NA   NA
 2165965 257562 XAC1684 XAC1685 cycA   TRUE 0.868 54.000 0.571 NA   NA
 257562 2165966 XAC1685 XAC1686     TRUE 0.837 84.000 0.500 NA   NA
 257564 257565 XAC1687 XAC1688     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 257565 257566 XAC1688 XAC1689     TRUE 0.819 4.000 0.000 NA   NA
 257566 257567 XAC1689 XAC1690     TRUE 0.589 -31.000 0.000 NA   NA
 257567 257568 XAC1690 XAC1691     TRUE 0.977 0.000 0.100 NA   NA
 257568 257569 XAC1691 XAC1692     TRUE 0.959 -3.000 0.012 1.000   NA
 257569 257570 XAC1692 XAC1693     TRUE 0.970 -3.000 0.034 NA   NA
 257570 257571 XAC1693 XAC1694     TRUE 0.825 -42.000 0.034 NA   NA
 257571 257572 XAC1694 XAC1695     TRUE 0.973 -55.000 1.000 NA   NA
 257572 257573 XAC1695 XAC1696     FALSE 0.023 284.000 0.000 1.000 N NA
 257573 257574 XAC1696 XAC1697     TRUE 0.952 1.000 0.043 1.000 N NA
 257574 257575 XAC1697 XAC1698   bioC FALSE 0.142 326.000 0.083 1.000 N NA
 257575 257576 XAC1698 XAC1699 bioC   FALSE 0.435 125.000 0.042 1.000 N NA
 257576 257577 XAC1699 XAC1700     TRUE 0.966 -180.000 0.011 0.012 Y NA
 257578 257579 XAC1701 XAC1702     TRUE 0.815 35.000 0.222 NA   NA
 257580 257581 XAC1703 XAC1704     FALSE 0.153 160.000 0.000 NA   NA
 2165967 257584 XAC1706 XAC1707     FALSE 0.446 61.000 0.011 1.000   NA
 257585 257586 XAC1708 XAC1709 exoD tlyC TRUE 0.814 35.000 0.200 1.000   NA
 257587 257588 XAC1710 XAC1711   pitA TRUE 0.967 10.000 0.030 NA Y NA
 257588 257589 XAC1711 XAC1712 pitA   FALSE 0.204 107.000 0.000 NA   NA
 2165968 257591 XAC1713 XAC1714   parE FALSE 0.011 459.000 0.000 1.000 N NA
 257592 257593 XAC1715 XAC1716   pyrG FALSE 0.059 310.000 0.002 NA   NA
 257593 257594 XAC1716 XAC1717 pyrG kdsA FALSE 0.162 352.000 0.138 1.000 N NA
 257594 257595 XAC1717 XAC1718 kdsA   FALSE 0.306 106.000 0.004 NA   NA
 257595 257596 XAC1718 XAC1719   eno FALSE 0.291 125.000 0.003 NA   NA
 257596 257597 XAC1719 XAC1720 eno   TRUE 0.975 4.000 0.241 1.000 N NA
 257597 257598 XAC1720 XAC1721   ispD TRUE 0.984 -3.000 0.185 1.000 N NA
 257598 257599 XAC1721 XAC1722 ispD ispF TRUE 0.996 4.000 0.419 1.000 Y NA
 257599 257600 XAC1722 XAC1723 ispF   TRUE 0.697 113.000 0.173 1.000   NA
 257602 257603 XAC1725 XAC1726 surE pcm TRUE 0.993 -3.000 0.353 1.000   NA
 257603 257604 XAC1726 XAC1727 pcm   TRUE 0.806 19.000 0.055 NA   NA
 257604 257605 XAC1727 XAC1728   nlpD TRUE 0.979 -3.000 0.074 NA   NA
 257606 257607 XAC1729 XAC1730     TRUE 0.748 16.000 0.014 NA   NA
 257608 257609 XAC1731 XAC1732 ftsJ hflB TRUE 0.532 55.000 0.066 NA N NA
 257609 257610 XAC1732 XAC1733 hflB folP TRUE 0.723 126.000 0.325 1.000 N NA
 257610 257611 XAC1733 XAC1734 folP miaA TRUE 0.914 0.000 0.009 1.000 N NA
 257611 257612 XAC1734 XAC1735 miaA hfq TRUE 0.856 78.000 0.531 1.000   NA
 257612 257613 XAC1735 XAC1736 hfq hflX TRUE 0.928 12.000 0.141 1.000   NA
 257613 257614 XAC1736 XAC1737 hflX   FALSE 0.037 424.000 0.002 NA   NA
 257614 257615 XAC1737 XAC1738   aarF FALSE 0.048 435.000 0.011 NA   NA
 257615 257616 XAC1738 XAC1739 aarF lexA TRUE 0.845 86.000 0.500 1.000   NA
 257616 257617 XAC1739 XAC1740 lexA recA FALSE 0.460 173.000 0.005 0.069 N NA
 257617 257618 XAC1740 XAC1741 recA recX FALSE 0.329 313.000 0.296 1.000   NA
 257618 257619 XAC1741 XAC1742 recX alaS TRUE 0.616 102.000 0.085 1.000   NA
 257619 257620 XAC1742 XAC1743 alaS csrA FALSE 0.324 140.000 0.020 1.000 N NA
 257620 399404 XAC1743 XAC1744 csrA tRNA-Ser FALSE 0.217 84.000 0.000 NA   NA
 399404 257621 XAC1744 XAC1745 tRNA-Ser   FALSE 0.218 79.000 0.000 NA   NA
 257621 257622 XAC1745 XAC1746   mcpA FALSE 0.026 390.000 0.000 NA   NA
 257624 257625 XAC1748 XAC1749     TRUE 0.782 45.000 0.222 NA   NA
 399436 399435 XAC1750 XAC1751 tRNA-Arg tRNA-Arg FALSE 0.208 96.000 0.000 NA   NA
 399435 257626 XAC1751 XAC1752 tRNA-Arg   FALSE 0.279 41.000 0.000 NA   NA
 257626 257627 XAC1752 XAC1753   thiD TRUE 0.985 -3.000 0.148 NA   NA
 257627 2165969 XAC1753 XAC1754 thiD   TRUE 0.776 23.000 0.065 NA   NA
 2165969 257629 XAC1754 XAC1755     TRUE 0.928 8.000 0.065 NA   NA
 257629 257630 XAC1755 XAC1756     FALSE 0.253 199.000 0.027 NA   NA
 257630 257631 XAC1756 XAC1757     TRUE 0.493 83.000 0.050 1.000 N NA
 257631 257632 XAC1757 XAC1758     FALSE 0.404 38.000 0.002 NA   NA
 257632 257633 XAC1758 XAC1759   gcvR TRUE 0.531 41.000 0.020 NA   NA
 257634 257635 XAC1760 XAC1761 dapA   TRUE 0.775 17.000 0.028 NA   NA
 257636 257637 XAC1762 XAC1763   dgoK TRUE 0.814 84.000 0.500 1.000 N NA
 257637 257638 XAC1763 XAC1764 dgoK   TRUE 0.993 -3.000 0.053 NA Y NA
 257638 257639 XAC1764 XAC1765   dgoA TRUE 0.927 -6.000 0.053 NA N NA
 257639 257640 XAC1765 XAC1766 dgoA dgoA TRUE 0.995 -3.000 0.192 0.036 N NA
 257641 257642 XAC1767 XAC1768 gbpR fhuA FALSE 0.361 254.000 0.286 1.000 N NA
 257642 257643 XAC1768 XAC1769 fhuA cirA FALSE 0.461 339.000 0.000 0.021 Y NA
 257643 257644 XAC1769 XAC1770 cirA celA TRUE 0.817 112.000 0.429 1.000   NA
 257644 257645 XAC1770 XAC1771 celA   TRUE 0.827 89.000 0.429 1.000   NA
 257645 257646 XAC1771 XAC1772     TRUE 0.991 -3.000 0.300 1.000   NA
 257646 2165970 XAC1772 XAC1773   xylS TRUE 0.959 105.000 0.250 0.026 Y NA
 2165970 257648 XAC1773 XAC1774 xylS   TRUE 0.641 92.000 0.094 1.000   NA
 257648 257649 XAC1774 XAC1775     TRUE 0.971 -3.000 0.029 1.000   NA
 257649 2165971 XAC1775 XAC1776   xylA TRUE 0.884 48.000 0.091 1.000 Y NA
 2165971 2165972 XAC1776 XAC1777 xylA xylE FALSE 0.450 68.000 0.013 1.000   NA
 2165972 257652 XAC1777 XAC1778 xylE   FALSE 0.026 394.000 0.000 NA   NA
 257654 257655 XAC1780 XAC1781 amiC   TRUE 0.607 37.000 0.026 1.000   NA
 257656 257657 XAC1783 XAC1784 pcnB folK TRUE 0.975 4.000 0.234 1.000 N NA
 257657 257658 XAC1784 XAC1785 folK panB TRUE 0.913 36.000 0.117 1.000 Y NA
 257658 257659 XAC1785 XAC1786 panB panC TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 257659 257660 XAC1786 XAC1787 panC panD TRUE 0.881 167.000 0.342 1.000 Y NA
 257660 257661 XAC1787 XAC1788 panD pgi TRUE 0.934 -3.000 0.011 1.000 N NA
 257661 257662 XAC1788 XAC1789 pgi   FALSE 0.160 156.000 0.000 NA   NA
 257662 2165973 XAC1789 XAC1790     TRUE 0.539 199.000 0.278 NA   NA
 2165973 257664 XAC1790 XAC1791     TRUE 0.721 8.000 0.000 NA   NA
 257666 257667 XAC1793 XAC1794 celD sglT FALSE 0.243 257.000 0.071 1.000   NA
 257670 257671 XAC1797 XAC1798 regR regS TRUE 0.999 -3.000 0.682 1.000 Y NA
 257672 257673 XAC1799 XAC1800     TRUE 0.951 -19.000 0.006 1.000 Y NA
 257674 257675 XAC1801 XAC1802 proP ygeA FALSE 0.150 195.000 0.011 1.000 N NA
 257675 257676 XAC1802 XAC1803 ygeA   FALSE 0.227 140.000 0.011 NA N NA
 257676 257677 XAC1803 XAC1804   murB TRUE 0.826 -6.000 0.008 NA N NA
 257677 257678 XAC1804 XAC1805 murB pyrD TRUE 0.931 -3.000 0.009 1.000 N NA
 257678 257679 XAC1805 XAC1806 pyrD   TRUE 0.881 6.000 0.006 1.000   NA
 257679 257680 XAC1806 XAC1807     TRUE 0.985 -3.000 0.138 NA   NA
 257680 257681 XAC1807 XAC1808     FALSE 0.063 518.000 0.032 NA   NA
 257682 257683 XAC1810 XAC1811   hmsR TRUE 0.979 -3.000 0.077 NA   NA
 257683 257684 XAC1811 XAC1812 hmsR hmsF TRUE 0.937 4.000 0.043 1.000 N NA
 257684 257685 XAC1812 XAC1813 hmsF hmsH TRUE 0.981 -18.000 0.696 1.000   NA
 257686 257687 XAC1814 XAC1815 fhaC fhaB FALSE 0.279 41.000 0.000 NA   NA
 257687 257688 XAC1815 XAC1816 fhaB   FALSE 0.116 627.000 0.000 0.015   NA
 257688 257689 XAC1816 XAC1817     FALSE 0.025 399.000 0.000 NA   NA
 257689 257690 XAC1817 XAC1818     FALSE 0.071 228.000 0.000 NA   NA
 257690 257691 XAC1818 XAC1819   tspO FALSE 0.259 78.000 0.000 1.000   NA
 257691 257692 XAC1819 XAC1820 tspO metL FALSE 0.009 590.000 0.000 1.000 N NA
 257692 257693 XAC1820 XAC1821 metL thrB TRUE 0.990 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 2165974 257696 XAC1823 XAC1824 thrC   FALSE 0.301 113.000 0.003 NA   NA
 257698 257699 XAC1826 XAC1827 hisS   FALSE 0.098 216.000 0.000 1.000   NA
 257699 257700 XAC1827 XAC1828   hisG TRUE 0.854 10.000 0.013 1.000   NA
 257700 257701 XAC1828 XAC1829 hisG hisD TRUE 0.999 -3.000 0.171 0.003 Y NA
 257701 257702 XAC1829 XAC1830 hisD hisC TRUE 0.999 -3.000 0.294 0.003 Y NA
 257702 257703 XAC1830 XAC1831 hisC hisB TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 257703 257704 XAC1831 XAC1832 hisB hisH TRUE 0.999 -3.000 0.128 0.003 Y NA
 257704 257705 XAC1832 XAC1833 hisH hisA TRUE 0.999 -3.000 0.210 0.003 Y NA
 257705 257706 XAC1833 XAC1834 hisA hisF TRUE 0.999 -6.000 0.433 0.003 Y NA
 257706 257707 XAC1834 XAC1835 hisF hisI TRUE 0.998 -10.000 0.430 0.003 Y NA
 257707 2165975 XAC1835 XAC1836 hisI   FALSE 0.243 157.000 0.003 NA   NA
 257709 257710 XAC1837 XAC1838     FALSE 0.127 261.000 0.012 1.000   NA
 257710 257711 XAC1838 XAC1839     TRUE 0.983 3.000 0.231 1.000   NA
 257711 257712 XAC1839 XAC1840     TRUE 0.782 36.000 0.148 1.000   NA
 257712 257713 XAC1840 XAC1841   yhdG FALSE 0.461 90.000 0.041 1.000 N NA
 257713 257714 XAC1841 XAC1842 yhdG yhdG TRUE 0.988 77.000 0.833 0.003 Y NA
 257717 257718 XAC1845 XAC1846     TRUE 0.742 35.000 0.111 NA   NA
 257718 257719 XAC1846 XAC1847     TRUE 0.991 -3.000 0.294 NA   NA
 257720 257721 XAC1848 XAC1849   yeiP TRUE 0.969 0.000 0.051 NA   NA
 257721 257722 XAC1849 XAC1850 yeiP hadH2 TRUE 0.543 101.000 0.085 1.000 N NA
 257722 257723 XAC1850 XAC1851 hadH2 mvaB TRUE 0.781 136.000 0.125 0.055 N NA
 257723 257724 XAC1851 XAC1852 mvaB   TRUE 0.802 107.000 0.042 NA Y NA
 257724 257725 XAC1852 XAC1853     TRUE 0.781 -24.000 0.027 NA N NA
 257726 257727 XAC1854 XAC1855 feoA feoB TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 257727 257728 XAC1855 XAC1856 feoB   TRUE 0.952 2.000 0.028 NA   NA
 257728 257729 XAC1856 XAC1857     TRUE 0.918 22.000 0.400 NA   NA
 257729 257730 XAC1857 XAC1858   avtA FALSE 0.377 147.000 0.021 NA   NA
 257730 257731 XAC1858 XAC1859 avtA   TRUE 0.988 3.000 0.031 0.012   NA
 257731 257732 XAC1859 XAC1860   dapB FALSE 0.030 406.000 0.000 1.000   NA
 257732 257733 XAC1860 XAC1861 dapB carA TRUE 0.506 240.000 0.034 1.000 Y NA
 257733 257734 XAC1861 XAC1862 carA carB TRUE 0.785 452.000 0.345 0.001 Y NA
 257734 257735 XAC1862 XAC1863 carB greA TRUE 0.987 -3.000 0.241 1.000 N NA
 257735 257736 XAC1863 XAC1864 greA rpfE TRUE 0.699 17.000 0.011 NA   NA
 257736 257737 XAC1864 XAC1865 rpfE recJ TRUE 0.950 -3.000 0.010 NA   NA
 257737 257738 XAC1865 XAC1866 recJ wapA FALSE 0.038 308.000 0.000 NA   NA
 257738 257739 XAC1866 XAC1867 wapA   FALSE 0.414 -405.000 0.000 NA   NA
 257739 257740 XAC1867 XAC1868     TRUE 0.542 -48.000 0.000 NA   NA
 257740 257741 XAC1868 XAC1869     FALSE 0.437 21.000 0.000 NA   NA
 257741 257742 XAC1869 XAC1870     FALSE 0.205 104.000 0.000 NA   NA
 257743 257744 XAC1871 XAC1872     TRUE 0.863 -118.000 0.000 0.017   NA
 257744 257745 XAC1872 XAC1873     FALSE 0.075 239.000 0.000 1.000   NA
 257746 257747 XAC1874 XAC1875 rpfD prfB FALSE 0.027 381.000 0.000 NA   NA
 257747 257748 XAC1875 XAC1876 prfB lysU TRUE 0.873 205.000 0.162 0.032 Y NA
 257748 257749 XAC1876 XAC1877 lysU rpfG FALSE 0.214 142.000 0.005 1.000 N NA
 257749 257750 XAC1877 XAC1878 rpfG rpfC TRUE 0.998 4.000 0.450 0.023 Y NA
 257751 257752 XAC1879 XAC1880 rpfF rpfB TRUE 0.888 176.000 0.108 0.054 Y NA
 257755 257756 XAC1883 XAC1884     TRUE 0.987 -3.000 0.177 NA   NA
 257756 257757 XAC1884 XAC1885   acnB TRUE 0.503 52.000 0.023 NA   NA
 257757 257758 XAC1885 XAC1886 acnB pcaD FALSE 0.196 195.000 0.007 1.000   NA
 2165976 257760 XAC1887 XAC1888 pdeA cheB TRUE 0.865 178.000 0.045 0.030 Y NA
 257760 257761 XAC1888 XAC1889 cheB cheD TRUE 0.997 -3.000 0.267 1.000 Y NA
 257761 257762 XAC1889 XAC1890 cheD cheR TRUE 0.990 3.000 0.056 1.000 Y NA
 257762 2165977 XAC1890 XAC1891 cheR tsr FALSE 0.332 248.000 0.000 1.000 Y NA
 2165977 257764 XAC1891 XAC1892 tsr tsr FALSE 0.324 585.000 0.000 0.012 Y NA
 257764 257765 XAC1892 XAC1893 tsr tsr FALSE 0.318 618.000 0.000 0.012 Y NA
 257765 257766 XAC1893 XAC1894 tsr tsr FALSE 0.290 818.000 0.000 0.012 Y NA
 257766 2165978 XAC1894 XAC1895 tsr tsr FALSE 0.315 629.000 0.000 0.012 Y NA
 2165978 257768 XAC1895 XAC1896 tsr tsr FALSE 0.375 450.000 0.000 0.012 Y NA
 257768 257769 XAC1896 XAC1897 tsr tsr FALSE 0.420 395.000 0.000 0.012 Y NA
 257769 257770 XAC1897 XAC1898 tsr   FALSE 0.217 83.000 0.000 NA   NA
 257770 2165979 XAC1898 XAC1899   tsr TRUE 0.678 -15.000 0.000 NA   NA
 2165979 2165980 XAC1899 XAC1900 tsr tsr TRUE 0.868 126.000 0.000 0.012 Y NA
 2165980 2165981 XAC1900 XAC1901 tsr   FALSE 0.017 563.000 0.000 NA   NA
 2165981 257774 XAC1901 XAC1902   tsr FALSE 0.035 320.000 0.000 NA   NA
 257774 257775 XAC1902 XAC1903 tsr cheA FALSE 0.400 414.000 0.000 0.012 Y NA
 257775 257776 XAC1903 XAC1904 cheA cheY TRUE 0.922 34.000 0.135 1.000 Y NA
 257776 257777 XAC1904 XAC1905 cheY   TRUE 0.994 -3.000 0.514 NA   NA
 257777 2165982 XAC1905 XAC1906   cheW TRUE 0.694 103.000 0.190 NA   NA
 2165982 257779 XAC1906 XAC1907 cheW parA TRUE 0.958 -3.000 0.028 1.000 N NA
 257779 257780 XAC1907 XAC1908 parA motB TRUE 0.978 2.000 0.199 1.000 N NA
 257780 257781 XAC1908 XAC1909 motB motA TRUE 0.990 7.000 0.248 1.000 Y NA
 257782 257783 XAC1910 XAC1911 cirA   FALSE 0.062 238.000 0.000 NA   NA
 257783 257784 XAC1911 XAC1912     TRUE 0.922 -61.000 0.273 NA   NA
 257784 257785 XAC1912 XAC1913     TRUE 0.947 10.000 0.182 NA   NA
 257785 257786 XAC1913 XAC1914     FALSE 0.015 791.000 0.000 NA   NA
 257786 2165983 XAC1914 XAC1915     TRUE 0.899 87.000 1.000 NA   NA
 2165983 257788 XAC1915 XAC1916     FALSE 0.203 114.000 0.000 NA   NA
 257788 257789 XAC1916 XAC1917     FALSE 0.207 98.000 0.000 NA   NA
 257789 257790 XAC1917 XAC1918     FALSE 0.423 22.000 0.000 NA   NA
 257790 257791 XAC1918 XAC1919     FALSE 0.353 28.000 0.000 NA   NA
 257792 257793 XAC1920 XAC1921     TRUE 0.864 54.000 0.000 0.068 Y NA
 257794 257795 XAC1922 XAC1923     TRUE 0.964 -55.000 0.667 NA   NA
 257796 257797 XAC1924 XAC1925     TRUE 0.464 23.000 0.000 1.000   NA
 257798 257799 XAC1926 XAC1927   aslB FALSE 0.097 196.000 0.000 NA   NA
 257799 257800 XAC1927 XAC1928 aslB   TRUE 0.989 -3.000 0.250 NA   NA
 257801 2165984 XAC1929 XAC1930   cheA FALSE 0.038 353.000 0.000 1.000   NA
 2165984 257803 XAC1930 XAC1931 cheA cheZ TRUE 0.996 3.000 0.341 1.000 Y NA
 257803 257804 XAC1931 XAC1932 cheZ cheY TRUE 0.998 0.000 0.516 1.000 Y NA
 257804 257805 XAC1932 XAC1933 cheY fliA TRUE 0.910 35.000 0.283 0.073 N NA
 257805 257806 XAC1933 XAC1934 fliA fleN TRUE 0.992 -3.000 0.482 1.000 N NA
 257806 257807 XAC1934 XAC1935 fleN flhF TRUE 0.961 -88.000 0.241 0.015 N NA
 257807 257808 XAC1935 XAC1936 flhF flhA FALSE 0.153 665.000 0.008 1.000 Y NA
 257808 257809 XAC1936 XAC1937 flhA flhB TRUE 0.998 -3.000 0.029 0.010 Y NA
 257809 257810 XAC1937 XAC1938 flhB   FALSE 0.259 145.000 0.012 1.000 N NA
 257810 257811 XAC1938 XAC1939     TRUE 0.585 272.000 0.000 0.009 Y NA
 257811 257812 XAC1939 XAC1940     FALSE 0.379 459.000 0.000 0.009 Y NA
 257812 257813 XAC1940 XAC1941   fliR FALSE 0.331 208.000 0.111 1.000 N NA
 257813 257814 XAC1941 XAC1942 fliR fliQ TRUE 0.942 32.000 0.215 1.000 Y NA
 257816 257817 XAC1944 XAC1945 fliP fliO TRUE 0.824 59.000 0.029 1.000 Y NA
 257817 257818 XAC1945 XAC1946 fliO fliN TRUE 0.983 -3.000 0.090 1.000   NA
 257818 257819 XAC1946 XAC1947 fliN fliM TRUE 0.942 -135.000 0.026 0.001   NA
 257819 257820 XAC1947 XAC1948 fliM fliL TRUE 0.991 11.000 0.029 0.001 Y NA
 257820 257821 XAC1948 XAC1949 fliL fliK FALSE 0.293 190.000 0.025 1.000   NA
 257821 257822 XAC1949 XAC1950 fliK fliJ TRUE 0.922 114.000 0.317 0.005   NA
 257822 257823 XAC1950 XAC1951 fliJ fliI TRUE 0.955 4.000 0.044 1.000   NA
 257823 257824 XAC1951 XAC1952 fliI fliH TRUE 0.995 -3.000 0.085 1.000 Y NA
 257824 257825 XAC1952 XAC1953 fliH fliG TRUE 0.999 -3.000 0.320 0.003 Y NA
 257825 257826 XAC1953 XAC1954 fliG fliF TRUE 0.996 -10.000 0.189 0.005 Y NA
 257826 257827 XAC1954 XAC1955 fliF fliE TRUE 0.997 14.000 0.910 0.005 Y NA
 257829 257830 XAC1957 XAC1958 rbfC   FALSE 0.153 160.000 0.000 NA   NA
 257830 257831 XAC1958 XAC1959     FALSE 0.028 375.000 0.000 NA   NA
 257831 257832 XAC1959 XAC1960     TRUE 0.772 -10.000 0.000 1.000   NA
 257832 257833 XAC1960 XAC1961     TRUE 0.869 13.000 0.041 1.000   NA
 257833 257834 XAC1961 XAC1962     TRUE 0.978 -3.000 0.054 1.000   NA
 257834 257835 XAC1962 XAC1963   fabG TRUE 0.890 48.000 0.000 0.033 Y NA
 257835 257836 XAC1963 XAC1964 fabG fabH TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 257836 257837 XAC1964 XAC1965 fabH acp TRUE 0.780 45.000 0.219 NA   NA
 257837 257838 XAC1965 XAC1966 acp vioA TRUE 0.573 65.000 0.041 1.000   NA
 257838 257839 XAC1966 XAC1967 vioA fleQ FALSE 0.311 120.000 0.014 1.000 N NA
 257839 257840 XAC1967 XAC1968 fleQ   TRUE 0.993 -7.000 0.050 0.073 Y NA
 257840 257841 XAC1968 XAC1969   rpoN TRUE 0.959 9.000 0.050 0.073 N NA
 257841 257842 XAC1969 XAC1970 rpoN   TRUE 0.723 217.000 0.000 0.005 Y NA
 257842 257843 XAC1970 XAC1971     TRUE 0.747 69.000 0.238 NA   NA
 257843 257844 XAC1971 XAC1972     TRUE 0.987 0.000 0.250 NA   NA
 257844 257845 XAC1972 XAC1973   fliS TRUE 0.991 -3.000 0.300 NA   NA
 257845 257846 XAC1973 XAC1974 fliS fliD TRUE 0.975 151.000 0.500 0.002 Y NA
 257846 257847 XAC1974 XAC1975 fliD fliC FALSE 0.292 270.000 0.000 1.000 Y NA
 257847 257848 XAC1975 XAC1976 fliC flgL TRUE 0.577 319.000 0.000 0.001 Y NA
 257848 257849 XAC1976 XAC1977 flgL flgK TRUE 0.998 0.000 0.108 0.001 Y NA
 257849 257850 XAC1977 XAC1978 flgK flgJ TRUE 0.998 12.000 0.705 0.002 Y NA
 257850 257851 XAC1978 XAC1979 flgJ flgI TRUE 0.999 2.000 0.405 0.006 Y NA
 257851 257852 XAC1979 XAC1980 flgI flgH TRUE 0.993 11.000 0.106 0.006 Y NA
 257852 257853 XAC1980 XAC1981 flgH flgG TRUE 0.969 39.000 0.120 0.005 Y NA
 257853 257854 XAC1981 XAC1982 flgG flgF TRUE 0.632 773.000 0.174 0.001 Y NA
 257854 257855 XAC1982 XAC1983 flgF flgE TRUE 0.979 143.000 0.594 0.003 Y NA
 257855 257856 XAC1983 XAC1984 flgE flgD TRUE 0.977 32.000 0.875 NA Y NA
 257856 257857 XAC1984 XAC1985 flgD flgC TRUE 0.918 38.000 0.174 NA Y NA
 257857 257858 XAC1985 XAC1986 flgC flgB TRUE 0.999 4.000 0.611 0.003 Y NA
 257858 257859 XAC1986 XAC1987 flgB cheV TRUE 0.575 320.000 0.267 1.000 Y NA
 2165985 257861 XAC1988 XAC1989 flgA flgM TRUE 0.812 67.000 0.371 NA   NA
 257861 257862 XAC1989 XAC1990 flgM   TRUE 0.967 16.000 0.052 0.001   NA
 257862 257863 XAC1990 XAC1991     TRUE 0.720 167.000 0.364 1.000   NA
 257864 257865 XAC1992 XAC1994     TRUE 0.997 4.000 0.200 0.030 Y NA
 257867 257868 XAC1995 XAC1996   mcp TRUE 0.524 87.000 0.041 NA   NA
 257868 257869 XAC1996 XAC1997 mcp   FALSE 0.432 148.000 0.036 NA   NA
 257869 257870 XAC1997 XAC1998   trmU TRUE 0.983 0.000 0.180 NA   NA
 257870 257871 XAC1998 XAC1999 trmU mutT TRUE 0.983 -3.000 0.158 1.000 N NA
 257872 257873 XAC2000 XAC2001   clpA TRUE 0.820 143.000 0.596 NA   NA
 257874 257875 XAC2002 XAC2003 infA aat FALSE 0.383 81.000 0.020 1.000 N NA
 257875 257876 XAC2003 XAC2004 aat   FALSE 0.122 263.000 0.015 NA   NA
 257876 257877 XAC2004 XAC2005   trxB FALSE 0.403 58.000 0.010 NA   NA
 257878 257879 XAC2006 XAC2007 ftsK   FALSE 0.420 151.000 0.033 NA   NA
 257879 257880 XAC2007 XAC2008   lolA FALSE 0.368 107.000 0.011 NA   NA
 257882 257883 XAC2010 XAC2011     FALSE 0.103 179.000 0.002 NA N NA
 257884 2165988 XAC2012 XAC2013 fadA fadB TRUE 0.925 157.000 0.588 1.000 Y NA
 2165988 257886 XAC2013 XAC2014 fadB   TRUE 0.573 25.000 0.019 1.000 N NA
 257887 257888 XAC2015 XAC2016 ndk   TRUE 0.961 7.000 0.156 1.000   NA
 257888 257889 XAC2016 XAC2017   pilF TRUE 0.839 20.000 0.086 1.000   NA
 257889 257890 XAC2017 XAC2018 pilF   TRUE 0.989 -3.000 0.204 1.000   NA
 257890 257891 XAC2018 XAC2019     FALSE 0.457 71.000 0.015 1.000   NA
 257891 257892 XAC2019 XAC2020     TRUE 0.992 0.000 0.492 1.000   NA
 257892 257893 XAC2020 XAC2021   yfgK TRUE 0.949 11.000 0.203 1.000   NA
 257893 257894 XAC2021 XAC2022 yfgK moeA FALSE 0.045 313.000 0.000 1.000   NA
 257896 257897 XAC2024 XAC2025 cirA   TRUE 0.851 59.000 0.500 NA   NA
 257897 257898 XAC2025 XAC2026     FALSE 0.027 379.000 0.000 NA   NA
 257898 257899 XAC2026 XAC2027     TRUE 0.991 4.000 0.667 NA   NA
 257899 257900 XAC2027 XAC2028   fdh TRUE 0.890 14.000 0.091 NA   NA
 257904 257905 XAC2032 XAC2033 moeA mobA TRUE 0.933 38.000 0.000 0.002 Y NA
 257905 257906 XAC2033 XAC2034 mobA   TRUE 0.665 -16.000 0.000 NA   NA
 257907 257908 XAC2035 XAC2036 cpo smf2 FALSE 0.019 783.000 0.000 1.000   NA
 257909 257910 XAC2037 XAC2038     TRUE 0.914 3.000 0.016 1.000 N NA
 257910 257911 XAC2038 XAC2039   orn FALSE 0.314 72.000 0.011 1.000 N NA
 257912 257913 XAC2040 XAC2041 yggB ppsA TRUE 0.636 18.000 0.018 NA N NA
 257914 257915 XAC2042 XAC2043     FALSE 0.327 188.000 0.043 NA   NA
 257915 257916 XAC2043 XAC2044   mutT TRUE 0.531 71.000 0.040 NA   NA
 257918 257919 XAC2046 XAC2047 pssA phaE TRUE 0.485 58.000 0.022 NA   NA
 257919 257920 XAC2047 XAC2048 phaE phbC TRUE 0.988 -3.000 0.210 NA   NA
 257920 257921 XAC2048 XAC2049 phbC   FALSE 0.382 116.000 0.032 NA N NA
 257921 2165989 XAC2049 XAC2050     TRUE 0.859 -30.000 0.043 NA   NA
 257924 257925 XAC2052 XAC2053   tex FALSE 0.361 103.000 0.010 NA   NA
 257926 257927 XAC2054 XAC2055     FALSE 0.401 211.000 0.000 0.023   NA
 399406 257928 XAC2056 XAC2057 tRNA-Leu   FALSE 0.029 364.000 0.000 NA   NA
 399433 399432 XAC2058 XAC2059 tRNA-Glu tRNA-Ala FALSE 0.255 48.000 0.000 NA   NA
 399432 399431 XAC2059 XAC2060 tRNA-Ala tRNA-Glu FALSE 0.015 759.000 0.000 NA   NA
 399431 399430 XAC2060 XAC2061 tRNA-Glu tRNA-Ala FALSE 0.259 47.000 0.000 NA   NA
 399430 257929 XAC2061 XAC2062 tRNA-Ala cycM FALSE 0.214 91.000 0.000 NA   NA
 257929 257930 XAC2062 XAC2063 cycM   TRUE 0.985 66.000 0.688 0.008 Y NA
 257931 257932 XAC2064 XAC2065 czcB acrD TRUE 0.925 27.000 0.778 NA N NA
 257932 257933 XAC2065 XAC2066 acrD acrD TRUE 0.998 -3.000 0.481 NA Y NA
 257934 257935 XAC2067 XAC2068 eda edd TRUE 0.952 53.000 0.523 1.000 Y NA
 257935 257936 XAC2068 XAC2069 edd pgl TRUE 0.898 89.000 0.202 1.000 Y NA
 257936 257937 XAC2069 XAC2070 pgl glk TRUE 0.992 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 257937 257938 XAC2070 XAC2071 glk zwf TRUE 0.994 -3.000 0.055 1.000 Y NA
 2165990 257942 XAC2073 XAC2075   sdhC FALSE 0.451 57.000 0.016 NA   NA
 257942 257943 XAC2075 XAC2076 sdhC sdhD TRUE 0.999 -3.000 0.291 0.001 Y NA
 257943 257944 XAC2076 XAC2077 sdhD sdhA TRUE 0.992 34.000 0.705 0.001 Y NA
 257944 257945 XAC2077 XAC2078 sdhA sdhB TRUE 0.950 230.000 0.604 0.001 Y NA
 257945 257946 XAC2078 XAC2079 sdhB   TRUE 0.799 30.000 0.151 NA   NA
 257946 257947 XAC2079 XAC2080     TRUE 0.521 38.000 0.016 NA   NA
 257947 257948 XAC2080 XAC2081   lolC TRUE 0.656 24.000 0.020 NA   NA
 257948 257949 XAC2081 XAC2082 lolC ycfV TRUE 0.944 44.000 0.620 0.057 N NA
 257951 257952 XAC2084 XAC2085 comA exbB TRUE 0.797 -109.000 0.045 1.000   NA
 257952 257953 XAC2085 XAC2086 exbB exbD TRUE 0.999 4.000 0.746 0.057 Y NA
 257953 257954 XAC2086 XAC2087 exbD msbA TRUE 0.980 -3.000 0.120 1.000 N NA
 257954 257955 XAC2087 XAC2088 msbA lpxK TRUE 0.986 -3.000 0.205 1.000 N NA
 257955 257956 XAC2088 XAC2089 lpxK kdsB FALSE 0.439 293.000 0.054 1.000 Y NA
 257956 257957 XAC2089 XAC2090 kdsB   TRUE 0.969 -3.000 0.050 1.000 N NA
 257957 257958 XAC2090 XAC2091     TRUE 0.709 -57.000 0.006 1.000   NA
 257958 257959 XAC2091 XAC2092   uvrC TRUE 0.947 -3.000 0.004 1.000   NA
 257959 257960 XAC2092 XAC2093 uvrC pgsA TRUE 0.987 -3.000 0.227 1.000 N NA
 257960 399407 XAC2093 XAC2094 pgsA tRNA-Gly FALSE 0.296 37.000 0.000 NA   NA
 399407 399408 XAC2094 XAC2095 tRNA-Gly tRNA-Cys FALSE 0.224 69.000 0.000 NA   NA
 399408 399409 XAC2095 XAC2096 tRNA-Cys tRNA-Gly FALSE 0.218 82.000 0.000 NA   NA
 399409 257961 XAC2096 XAC2097 tRNA-Gly syrE1 FALSE 0.014 1461.000 0.000 NA   NA
 257961 257962 XAC2097 XAC2098 syrE1 syrE2 TRUE 0.981 13.000 0.000 0.002 Y NA
 257963 257964 XAC2099 XAC2100     TRUE 0.957 -6.000 0.000 0.067   NA
 257964 257965 XAC2100 XAC2101     TRUE 0.624 69.000 0.000 0.067   NA
 257965 257966 XAC2101 XAC2102     TRUE 0.645 54.000 0.000 0.067   NA
 257966 257967 XAC2102 XAC2103     TRUE 0.637 61.000 0.000 0.067   NA
 257967 399429 XAC2103 XAC2104   tRNA-Leu FALSE 0.066 234.000 0.000 NA   NA
 257969 257970 XAC2106 XAC2107   fkpA TRUE 0.874 11.000 0.028 1.000   NA
 257971 257972 XAC2108 XAC2109     FALSE 0.403 100.000 0.015 NA   NA
 257972 257973 XAC2109 XAC2110   gacA FALSE 0.061 239.000 0.000 NA   NA
 257976 257977 XAC2113 XAC2114     FALSE 0.040 294.000 0.000 NA   NA
 257977 257978 XAC2114 XAC2115     FALSE 0.202 266.000 0.050 1.000   NA
 257978 257979 XAC2115 XAC2116   phhb TRUE 0.950 3.000 0.025 1.000   NA
 257980 257981 XAC2117 XAC2118     TRUE 0.468 116.000 0.030 NA   NA
 257983 257984 XAC2120 XAC2121   mdmC FALSE 0.076 238.000 0.000 1.000   NA
 257984 2165991 XAC2121 XAC2122 mdmC   FALSE 0.025 474.000 0.000 1.000   NA
 2165991 257986 XAC2122 XAC2123     TRUE 0.546 93.000 0.051 NA   NA
 257986 257987 XAC2123 XAC2124     TRUE 0.974 -3.000 0.045 NA   NA
 257987 257988 XAC2124 XAC2125   gtrB TRUE 0.949 -48.000 0.409 NA   NA
 257988 257989 XAC2125 XAC2126 gtrB   FALSE 0.059 245.000 0.000 NA   NA
 257989 257990 XAC2126 XAC2127     FALSE 0.155 159.000 0.000 NA   NA
 257990 257991 XAC2127 XAC2128     TRUE 0.985 -3.000 0.147 NA   NA
 257991 257992 XAC2128 XAC2129   fabG FALSE 0.165 42.000 0.000 1.000 N NA
 257992 257993 XAC2129 XAC2130 fabG   FALSE 0.174 166.000 0.000 1.000   NA
 257994 257995 XAC2131 XAC2132     TRUE 0.865 54.000 0.000 0.067 Y NA
 257996 257997 XAC2133 XAC2134     FALSE 0.051 262.000 0.000 NA   NA
 257997 257998 XAC2134 XAC2135     FALSE 0.312 139.000 0.008 NA   NA
 257999 258000 XAC2136 XAC2137     TRUE 0.834 -385.000 0.000 0.032   NA
 258000 258001 XAC2137 XAC2138     FALSE 0.047 303.000 0.000 1.000   NA
 258001 258002 XAC2138 XAC2139     TRUE 0.991 -3.000 0.317 NA   NA
 258004 258005 XAC2141 XAC2142 lytT lytS TRUE 0.943 9.000 0.000 0.029   NA
 258005 258006 XAC2142 XAC2143 lytS   FALSE 0.066 234.000 0.000 NA   NA
 258009 258010 XAC2145 XAC2147 czcB czcA TRUE 0.983 -7.000 0.519 1.000 N NA
 258010 258011 XAC2147 XAC2148 czcA ttgC TRUE 0.989 -3.000 0.296 1.000 N NA
 258011 2165992 XAC2148 XAC2149 ttgC nodV FALSE 0.135 65.000 0.000 1.000 N NA
 2165992 258013 XAC2149 XAC2150 nodV nodW TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 258016 258017 XAC2153 XAC2154     FALSE 0.019 512.000 0.000 NA   NA
 258017 258018 XAC2154 XAC2155     FALSE 0.244 102.000 0.000 1.000   NA
 258018