MicrobesOnline Operon Predictions for Xanthomonas campestris ATCC 33913

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 251337 251338 XCC0001 XCC0002 dnaA dnaN TRUE 0.657 276.000 0.328 1.000 Y NA
 251338 251339 XCC0002 XCC0003 dnaN recF FALSE 0.182 887.000 0.318 1.000 Y NA
 251339 251340 XCC0003 XCC0004 recF gyrB TRUE 0.965 114.000 0.249 0.004 Y NA
 251340 251341 XCC0004 XCC0005 gyrB   FALSE 0.371 62.000 0.005 NA   NA
 251341 251342 XCC0005 XCC0006     TRUE 0.625 63.000 0.079 NA   NA
 251342 251343 XCC0006 XCC0007     TRUE 0.554 139.000 0.063 1.000   NA
 251343 251344 XCC0007 XCC0008   tonB FALSE 0.491 154.000 0.095 1.000 N NA
 251344 251345 XCC0008 XCC0009 tonB exbB TRUE 0.945 85.000 0.600 0.018 N NA
 251345 251346 XCC0009 XCC0010 exbB exbD1 TRUE 0.979 47.000 0.600 0.069 Y NA
 251346 251347 XCC0010 XCC0011 exbD1 exbD2 TRUE 0.999 4.000 0.857 0.055 Y NA
 251348 251349 XCC0012 XCC0013 pdxJ   TRUE 0.887 8.000 0.009 NA   NA
 251349 251350 XCC0013 XCC0014   cls TRUE 0.850 75.000 0.417 NA   NA
 2165472 251353 XCC0016 XCC0017   ompP1 FALSE 0.009 642.000 0.000 NA   NA
 251354 251355 XCC0018 XCC0019     TRUE 0.809 29.000 0.096 NA   NA
 251355 251356 XCC0019 XCC0020   serA TRUE 0.967 0.000 0.043 NA   NA
 251357 251358 XCC0021 XCC0022 ctp   TRUE 0.857 165.000 0.408 0.048 N NA
 251359 251360 XCC0023 XCC0024     FALSE 0.228 59.000 0.000 1.000   NA
 251361 251362 XCC0025 XCC0026   egl FALSE 0.016 433.000 0.000 1.000   NA
 251362 251363 XCC0026 XCC0027 egl egl FALSE 0.287 409.000 0.000 0.003 Y NA
 251363 251364 XCC0027 XCC0028 egl egl FALSE 0.163 631.000 0.000 0.003 Y NA
 251366 251367 XCC0030 XCC0031   gltD FALSE 0.278 45.000 0.000 NA   NA
 251367 251368 XCC0031 XCC0032 gltD gltB TRUE 0.929 122.000 0.032 0.001 Y NA
 251368 251369 XCC0032 XCC0033 gltB   FALSE 0.202 203.000 0.011 NA   NA
 251371 251372 XCC0035 XCC0036     FALSE 0.006 925.000 0.000 NA   NA
 251373 251374 XCC0037 XCC0038     FALSE 0.085 219.000 0.000 NA   NA
 251374 251375 XCC0038 XCC0039     TRUE 0.832 -330.000 0.000 0.008   NA
 251376 251377 XCC0040 XCC0041     FALSE 0.040 291.000 0.000 1.000   NA
 251377 251378 XCC0041 XCC0042   nonF TRUE 0.983 -3.000 0.136 NA   NA
 251381 251382 XCC0045 XCC0046 mecI   TRUE 0.996 4.000 0.500 NA Y NA
 251382 251383 XCC0046 XCC0047     FALSE 0.012 527.000 0.000 NA   NA
 251383 251384 XCC0047 XCC0048     FALSE 0.064 242.000 0.000 NA   NA
 251385 2165473 XCC0049 XCC0050   cirA TRUE 0.987 11.000 0.600 1.000   NA
 251387 251388 XCC0051 XCC0052 xylR avrBs2 TRUE 0.865 139.000 0.667 NA N NA
 2165474 251390 XCC0053 XCC0054     TRUE 0.985 -3.000 0.010 0.018   NA
 251390 251391 XCC0054 XCC0055     FALSE 0.034 310.000 0.000 1.000   NA
 251393 251394 XCC0057 XCC0058     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 251394 251395 XCC0058 XCC0059     FALSE 0.033 326.000 0.000 NA   NA
 251395 251396 XCC0059 XCC0060     FALSE 0.144 172.000 0.000 NA   NA
 251396 251397 XCC0060 XCC0061     TRUE 0.588 -33.000 0.000 NA   NA
 251398 251399 XCC0062 XCC0063     FALSE 0.004 528.000 0.000 NA N NA
 251399 251400 XCC0063 XCC0064     FALSE 0.005 1034.000 0.000 NA   NA
 251401 2165476 XCC0065 XCC0066     FALSE 0.008 723.000 0.000 NA   NA
 2165476 251403 XCC0066 XCC0067     FALSE 0.006 816.000 0.000 NA   NA
 251403 251404 XCC0067 XCC0068     FALSE 0.025 364.000 0.000 NA   NA
 251406 251407 XCC0070 XCC0071     FALSE 0.505 135.000 0.036 NA   NA
 251411 251412 XCC0075 XCC0076     TRUE 0.986 -3.000 0.194 NA   NA
 251412 251413 XCC0076 XCC0077     FALSE 0.502 100.000 0.022 1.000   NA
 251414 251415 XCC0078 XCC0079     FALSE 0.014 488.000 0.000 NA   NA
 251415 251416 XCC0079 XCC0080     FALSE 0.028 345.000 0.000 NA   NA
 251416 251417 XCC0080 XCC0081   atsE TRUE 0.567 106.000 0.077 NA N NA
 251417 251418 XCC0081 XCC0082 atsE trxA TRUE 0.922 16.000 0.143 NA   NA
 251418 251419 XCC0082 XCC0083 trxA proP FALSE 0.006 816.000 0.000 1.000   NA
 251421 251422 XCC0085 XCC0086     FALSE 0.214 197.000 0.009 NA   NA
 251423 251424 XCC0087 XCC0088     TRUE 0.884 149.000 0.724 NA   NA
 251424 251425 XCC0088 XCC0089     TRUE 0.904 -81.000 0.172 NA   NA
 251425 251426 XCC0089 XCC0090     TRUE 0.657 149.000 0.161 NA   NA
 251426 251427 XCC0090 XCC0091   moxR TRUE 0.948 14.000 0.193 NA   NA
 251427 2165479 XCC0091 XCC0092 moxR   FALSE 0.280 287.000 0.168 NA   NA
 2165479 251429 XCC0092 XCC0093   tldD TRUE 0.996 -3.000 0.720 NA   NA
 251429 251430 XCC0093 XCC0094 tldD tldD TRUE 0.944 15.000 0.200 NA   NA
 251430 251431 XCC0094 XCC0095 tldD tldD FALSE 0.006 888.000 0.000 NA   NA
 251431 251432 XCC0095 XCC0096 tldD cbbFC FALSE 0.005 1038.000 0.000 NA   NA
 251432 251433 XCC0096 XCC0097 cbbFC tyrB FALSE 0.039 177.000 0.000 1.000 N NA
 251434 251435 XCC0098 XCC0099 yncD   TRUE 0.797 168.000 0.500 NA   NA
 251435 251436 XCC0099 XCC0100     FALSE 0.024 365.000 0.000 NA   NA
 251436 251437 XCC0100 XCC0101   aldA FALSE 0.077 227.000 0.000 NA   NA
 251437 251438 XCC0101 XCC0102 aldA   FALSE 0.339 165.000 0.014 NA   NA
 251438 251439 XCC0102 XCC0103     FALSE 0.013 508.000 0.000 NA   NA
 251439 251440 XCC0103 XCC0104     TRUE 0.966 0.000 0.043 NA   NA
 251440 251441 XCC0104 XCC0105     TRUE 0.777 7.000 0.000 1.000   NA
 251442 251443 XCC0106 XCC0107 lctD   FALSE 0.104 285.000 0.036 1.000 N NA
 251444 251445 XCC0108 XCC0109     TRUE 0.998 -3.000 0.333 0.034 Y NA
 251448 251449 XCC0112 XCC0113     FALSE 0.014 483.000 0.000 NA   NA
 251449 251450 XCC0113 XCC0114     TRUE 0.982 -3.000 0.133 NA   NA
 251451 251452 XCC0115 XCC0116     FALSE 0.249 195.000 0.015 NA   NA
 251453 251454 XCC0117 XCC0118   kdgK FALSE 0.054 156.000 0.000 1.000 N NA
 251455 251456 XCC0119 XCC0120 iroN iroN FALSE 0.429 179.000 0.000 0.026   NA
 251456 251457 XCC0120 XCC0121 iroN   FALSE 0.339 14.000 0.000 1.000 N NA
 251457 251458 XCC0121 XCC0122     TRUE 0.869 0.000 0.000 1.000   NA
 251458 251459 XCC0122 XCC0123     TRUE 0.795 101.000 0.250 NA   NA
 251459 251460 XCC0123 XCC0124     FALSE 0.082 223.000 0.000 NA   NA
 251460 251461 XCC0124 XCC0125     FALSE 0.017 441.000 0.000 NA   NA
 251461 251462 XCC0125 XCC0126     FALSE 0.004 1323.000 0.000 NA   NA
 251464 251465 XCC0128 XCC0129   rhsD FALSE 0.038 307.000 0.000 NA   NA
 251465 251466 XCC0129 XCC0130 rhsD   FALSE 0.022 381.000 0.000 NA   NA
 251467 2165480 XCC0131 XCC0132     FALSE 0.118 186.000 0.000 NA   NA
 2165481 251470 XCC0133 XCC0134     TRUE 0.998 -3.000 0.544 0.015   NA
 251470 2165482 XCC0134 XCC0135   glgB1 TRUE 0.988 12.000 0.027 0.007 Y NA
 251473 251474 XCC0137 XCC0138     TRUE 0.713 -10.000 0.000 NA   NA
 251474 251475 XCC0138 XCC0139     TRUE 0.979 -3.000 0.100 NA   NA
 251475 251476 XCC0139 XCC0140     FALSE 0.217 134.000 0.000 NA   NA
 251476 251477 XCC0140 XCC0141     FALSE 0.159 229.000 0.012 1.000   NA
 251478 251479 XCC0142 XCC0143   estA1 FALSE 0.076 62.000 0.000 1.000 N NA
 251479 251480 XCC0143 XCC0144 estA1 xynB TRUE 0.873 141.000 0.200 1.000 Y NA
 251481 251482 XCC0145 XCC0146 mhpD dctP TRUE 0.675 37.000 0.097 1.000 N NA
 251482 251483 XCC0146 XCC0147 dctP dctQ TRUE 0.964 119.000 0.756 NA Y NA
 251483 251484 XCC0147 XCC0148 dctQ ygiK TRUE 0.997 0.000 0.390 NA Y NA
 251484 251485 XCC0148 XCC0149 ygiK   TRUE 0.873 99.000 0.125 1.000 Y NA
 251485 251486 XCC0149 XCC0150     TRUE 0.612 132.000 0.143 1.000 N NA
 251486 251487 XCC0150 XCC0151   kduI FALSE 0.002 890.000 0.000 1.000 N NA
 251487 251488 XCC0151 XCC0152 kduI kduD TRUE 0.860 76.000 0.571 1.000 N NA
 251488 251489 XCC0152 XCC0153 kduD   FALSE 0.370 160.000 0.047 1.000 N NA
 251489 251490 XCC0153 XCC0154     FALSE 0.003 544.000 0.000 1.000 N NA
 251491 251492 XCC0155 XCC0156   pah FALSE 0.172 222.000 0.010 NA   NA
 251493 2165483 XCC0157 XCC0158   fpvA FALSE 0.016 251.000 0.000 1.000 N NA
 251495 2165484 XCC0159 XCC0160     FALSE 0.027 349.000 0.000 NA   NA
 2165484 251497 XCC0160 XCC0161   ylmA FALSE 0.049 275.000 0.000 NA   NA
 2165485 251499 XCC0162 XCC0163     TRUE 0.936 29.000 0.500 1.000   NA
 251499 251500 XCC0163 XCC0164   yehX FALSE 0.498 61.000 0.026 1.000   NA
 251500 251501 XCC0164 XCC0165 yehX yehZ TRUE 0.980 -3.000 0.171 1.000 N NA
 251503 251504 XCC0167 XCC0168     TRUE 0.992 -3.000 0.354 NA   NA
 251504 251505 XCC0168 XCC0169     TRUE 0.840 16.000 0.029 NA   NA
 251507 251508 XCC0171 XCC0172     FALSE 0.032 320.000 0.000 1.000   NA
 251508 251509 XCC0172 XCC0173     FALSE 0.315 38.000 0.000 NA   NA
 251509 251510 XCC0173 XCC0174   parA FALSE 0.025 360.000 0.000 NA   NA
 251510 251511 XCC0174 XCC0175 parA   TRUE 0.859 16.000 0.079 NA N NA
 251511 251512 XCC0175 XCC0176     TRUE 0.965 4.000 0.083 NA   NA
 251512 251513 XCC0176 XCC0177   cls TRUE 0.982 -3.000 0.128 NA   NA
 251513 2165487 XCC0177 XCC0178 cls   FALSE 0.165 299.000 0.107 NA N NA
 2165487 251515 XCC0178 XCC0179     FALSE 0.397 117.000 0.023 NA N NA
 251515 251516 XCC0179 XCC0180     FALSE 0.509 55.000 0.023 NA   NA
 251516 251517 XCC0180 XCC0181     TRUE 0.561 58.000 0.042 NA   NA
 251517 251518 XCC0181 XCC0182     FALSE 0.028 1013.000 0.083 NA   NA
 251519 251520 XCC0183 XCC0184   bacA TRUE 0.677 91.000 0.100 NA   NA
 251521 251522 XCC0185 XCC0186 glnA glnB FALSE 0.230 282.000 0.000 1.000 Y NA
 251522 251523 XCC0186 XCC0187 glnB amtB TRUE 0.876 -10.000 0.048 1.000 N NA
 251523 251524 XCC0187 XCC0188 amtB ntrB FALSE 0.014 272.000 0.000 1.000 N NA
 251524 251525 XCC0188 XCC0189 ntrB ntrC TRUE 0.997 -7.000 0.587 0.087 Y NA
 251525 251526 XCC0189 XCC0190 ntrC yojM FALSE 0.005 1277.000 0.007 1.000 N NA
 251526 251527 XCC0190 XCC0191 yojM sodC2 TRUE 0.937 199.000 0.375 0.002 Y NA
 251528 251529 XCC0192 XCC0193 gloA   TRUE 0.568 39.000 0.018 NA   NA
 251530 251531 XCC0194 XCC0195 yfcY   FALSE 0.452 85.000 0.011 NA   NA
 251532 251533 XCC0196 XCC0197 hemY   TRUE 0.998 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 251533 251534 XCC0197 XCC0198   hemD TRUE 0.958 104.000 0.600 1.000 Y NA
 251535 251536 XCC0199 XCC0200 lgtB   FALSE 0.473 105.000 0.014 NA   NA
 251536 251537 XCC0200 XCC0201     TRUE 0.712 30.000 0.035 NA   NA
 251537 251538 XCC0201 XCC0202     FALSE 0.506 50.000 0.019 NA   NA
 251538 251539 XCC0202 XCC0203   secB TRUE 0.673 110.000 0.158 NA N NA
 251539 251540 XCC0203 XCC0204 secB gpdA TRUE 0.673 18.000 0.015 1.000 N NA
 251542 251543 XCC0206 XCC0207 poxB   FALSE 0.273 46.000 0.000 NA   NA
 251543 251544 XCC0207 XCC0208     FALSE 0.402 30.000 0.000 NA   NA
 251545 251546 XCC0209 XCC0210     FALSE 0.404 55.000 0.007 NA   NA
 251547 251548 XCC0211 XCC0212   fabH TRUE 0.646 102.000 0.078 NA   NA
 251548 251549 XCC0212 XCC0213 fabH   FALSE 0.497 73.000 0.026 NA   NA
 251549 251550 XCC0213 XCC0214     TRUE 0.974 -3.000 0.071 1.000   NA
 251550 251551 XCC0214 XCC0215     TRUE 0.995 2.000 0.100 0.081 Y NA
 251551 251552 XCC0215 XCC0216   dhaA TRUE 0.971 -3.000 0.054 1.000   NA
 2165488 251555 XCC0218 XCC0219   cdh TRUE 0.829 94.000 0.418 1.000 N NA
 251555 251556 XCC0219 XCC0220 cdh   TRUE 0.605 65.000 0.070 NA   NA
 251557 2165489 XCC0221 XCC0222   ddl TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000   NA
 251559 251560 XCC0223 XCC0224   aarF TRUE 0.993 -3.000 0.432 1.000   NA
 251560 251561 XCC0224 XCC0225 aarF   FALSE 0.335 133.000 0.005 1.000   NA
 251563 251564 XCC0227 XCC0228     TRUE 0.933 3.000 0.014 1.000   NA
 251564 251565 XCC0228 XCC0229   ansA FALSE 0.298 132.000 0.013 1.000 N NA
 251565 251566 XCC0229 XCC0230 ansA dcp FALSE 0.186 315.000 0.000 1.000 Y NA
 2165490 251568 XCC0231 XCC0232     FALSE 0.018 412.000 0.000 NA   NA
 251570 251571 XCC0234 XCC0235     TRUE 0.671 74.000 0.118 NA   NA
 251571 251572 XCC0235 XCC0236   rbcR TRUE 0.885 35.000 0.000 0.053 Y NA
 251573 251574 XCC0237 XCC0238 mls aceA TRUE 0.692 156.000 0.016 1.000 Y NA
 251574 251575 XCC0238 XCC0239 aceA   FALSE 0.032 191.000 0.000 1.000 N NA
 251575 251576 XCC0239 XCC0240     TRUE 0.989 4.000 0.000 0.011 Y NA
 251579 251580 XCC0243 XCC0244   accC FALSE 0.291 103.000 0.008 1.000 N NA
 251580 251581 XCC0244 XCC0245 accC accD TRUE 0.729 309.000 0.158 0.002 Y NA
 251581 251582 XCC0245 XCC0246 accD acdA TRUE 0.990 11.000 0.316 1.000 Y NA
 251583 251584 XCC0247 XCC0248     TRUE 0.543 59.000 0.036 NA   NA
 251584 251585 XCC0248 XCC0249     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 251586 251587 XCC0250 XCC0251     TRUE 0.980 -3.000 0.111 NA   NA
 251587 251588 XCC0251 XCC0252     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 251588 251589 XCC0252 XCC0253     TRUE 0.936 19.000 0.286 NA   NA
 251590 251591 XCC0254 XCC0255     TRUE 0.734 102.000 0.158 NA   NA
 251594 251595 XCC0258 XCC0259     TRUE 0.545 98.000 0.032 NA   NA
 251596 251597 XCC0260 XCC0261     TRUE 0.521 80.000 0.026 NA   NA
 251597 251598 XCC0261 XCC0262     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 251598 251599 XCC0262 XCC0263     FALSE 0.045 285.000 0.000 NA   NA
 251599 251600 XCC0263 XCC0264   ohr TRUE 0.574 97.000 0.086 1.000 N NA
 251600 251601 XCC0264 XCC0265 ohr   FALSE 0.245 57.000 0.000 NA   NA
 251601 251602 XCC0265 XCC0266     FALSE 0.254 103.000 0.000 NA   NA
 251602 251603 XCC0266 XCC0267     FALSE 0.013 504.000 0.000 NA   NA
 251604 251605 XCC0268 XCC0269     FALSE 0.404 164.000 0.029 NA   NA
 251605 251606 XCC0269 XCC0270     FALSE 0.459 68.000 0.019 1.000   NA
 251606 251607 XCC0270 XCC0271   mocA TRUE 0.758 113.000 0.028 0.041   NA
 251608 251609 XCC0272 XCC0273     FALSE 0.019 623.000 0.008 1.000   NA
 251610 251611 XCC0274 XCC0275   hrpB FALSE 0.045 397.000 0.012 1.000   NA
 251613 251614 XCC0277 XCC0278     FALSE 0.457 117.000 0.014 NA   NA
 251614 251615 XCC0278 XCC0279     TRUE 0.924 -30.000 0.167 1.000   NA
 251615 251616 XCC0279 XCC0280     TRUE 0.980 -3.000 0.103 NA   NA
 251616 251617 XCC0280 XCC0281     TRUE 0.973 -3.000 0.061 NA   NA
 251617 251618 XCC0281 XCC0282     TRUE 0.951 -3.000 0.013 NA   NA
 251618 251619 XCC0282 XCC0283     TRUE 0.949 -3.000 0.036 1.000 N NA
 251619 251620 XCC0283 XCC0284   amaB TRUE 0.974 -10.000 0.060 1.000 Y NA
 251621 251622 XCC0285 XCC0286     FALSE 0.287 40.000 0.000 1.000   NA
 251624 251625 XCC0288 XCC0289 opdE   FALSE 0.017 428.000 0.000 NA   NA
 251625 251626 XCC0289 XCC0290     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 251627 251628 XCC0291 XCC0292 ggt gatA TRUE 0.961 0.000 0.068 1.000 N NA
 251628 251629 XCC0292 XCC0293 gatA   FALSE 0.082 137.000 0.000 NA N NA
 251629 2165492 XCC0293 XCC0294   add TRUE 0.802 130.000 0.048 NA Y NA
 2165492 251631 XCC0294 XCC0295 add yieG FALSE 0.436 130.000 0.017 1.000   NA
 251631 251632 XCC0295 XCC0296 yieG vanB FALSE 0.015 452.000 0.000 1.000   NA
 251632 251633 XCC0296 XCC0297 vanB vanA TRUE 0.988 -3.000 0.091 0.055 N NA
 251634 251635 XCC0298 XCC0299   mttC FALSE 0.010 336.000 0.000 NA N NA
 251636 251637 XCC0300 XCC0301     FALSE 0.009 613.000 0.000 NA   NA
 251639 251640 XCC0303 XCC0304     FALSE 0.217 69.000 0.000 1.000   NA
 251640 251641 XCC0304 XCC0305   fhuA TRUE 0.962 4.000 0.000 0.026   NA
 251642 251643 XCC0306 XCC0307   frp FALSE 0.435 82.000 0.031 1.000 N NA
 251643 251644 XCC0307 XCC0308 frp   FALSE 0.467 53.000 0.040 1.000 N NA
 251644 251645 XCC0308 XCC0309     FALSE 0.026 357.000 0.000 NA   NA
 251645 251646 XCC0309 XCC0310   purU FALSE 0.102 201.000 0.000 NA   NA
 251649 251650 XCC0313 XCC0314 cmfA metF FALSE 0.013 502.000 0.000 NA   NA
 251650 251651 XCC0314 XCC0315 metF metR FALSE 0.421 116.000 0.031 1.000 N NA
 251652 251653 XCC0316 XCC0317 sflA   FALSE 0.502 170.000 0.088 NA   NA
 251653 251654 XCC0317 XCC0318   metE TRUE 0.991 -7.000 0.775 NA   NA
 251654 251655 XCC0318 XCC0319 metE   FALSE 0.005 441.000 0.000 NA N NA
 251656 251657 XCC0320 XCC0321     FALSE 0.007 765.000 0.000 NA   NA
 251658 251659 XCC0322 XCC0323     FALSE 0.009 669.000 0.000 NA   NA
 251659 251660 XCC0323 XCC0324   tsr FALSE 0.040 300.000 0.000 NA   NA
 251661 251662 XCC0325 XCC0326     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 251662 251663 XCC0326 XCC0327     FALSE 0.069 235.000 0.000 NA   NA
 251663 2165493 XCC0327 XCC0328     FALSE 0.040 298.000 0.000 NA   NA
 2165493 251665 XCC0328 XCC0329   attT FALSE 0.232 66.000 0.000 NA   NA
 251665 251666 XCC0329 XCC0330 attT   FALSE 0.085 219.000 0.000 NA   NA
 251666 251667 XCC0330 XCC0331     FALSE 0.212 138.000 0.000 NA   NA
 251667 251668 XCC0331 XCC0333     TRUE 0.968 3.000 0.077 NA   NA
 251669 251670 XCC0332 XCC0334     FALSE 0.008 726.000 0.000 NA   NA
 251671 251672 XCC0335 XCC0336     FALSE 0.008 680.000 0.000 NA   NA
 251673 251674 XCC0337 XCC0338 pigH pig FALSE 0.009 624.000 0.000 NA   NA
 251675 251676 XCC0339 XCC0340     FALSE 0.007 734.000 0.000 NA   NA
 251677 251678 XCC0341 XCC0342     FALSE 0.005 1238.000 0.000 NA   NA
 251683 251684 XCC0347 XCC0348     FALSE 0.253 82.000 0.000 NA   NA
 251685 251686 XCC0349 XCC0350 vanK   FALSE 0.424 149.000 0.056 1.000 N NA
 251686 251687 XCC0350 XCC0351     FALSE 0.002 753.000 0.000 1.000 N NA
 251687 251688 XCC0351 XCC0352     TRUE 0.890 123.000 0.600 NA   NA
 251688 251689 XCC0352 XCC0353   drb0080 TRUE 0.771 33.000 0.091 NA   NA
 251689 251690 XCC0353 XCC0354 drb0080 xylC TRUE 0.988 7.000 0.286 0.041 N NA
 251692 251693 XCC0356 XCC0357 pobA   TRUE 0.535 19.000 0.000 NA   NA
 251694 251695 XCC0358 XCC0359 glpK glpF FALSE 0.258 68.000 0.008 1.000 N NA
 251695 251696 XCC0359 XCC0360 glpF glpD FALSE 0.414 185.000 0.129 1.000 N NA
 251696 251697 XCC0360 XCC0361 glpD glpR FALSE 0.068 349.000 0.040 1.000 N NA
 251697 251698 XCC0361 XCC0362 glpR pobB FALSE 0.013 277.000 0.000 1.000 N NA
 251698 251699 XCC0362 XCC0363 pobB vanA TRUE 0.853 148.000 0.170 0.001 N NA
 251700 251701 XCC0364 XCC0365 gctA gctB TRUE 0.999 -3.000 0.739 0.001 Y NA
 251701 251702 XCC0365 XCC0366 gctB pcaF TRUE 0.997 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 251702 251703 XCC0366 XCC0367 pcaF pcaH TRUE 0.828 73.000 0.066 0.001 N NA
 251703 251704 XCC0367 XCC0368 pcaH pcaG TRUE 0.999 5.000 0.782 0.001 Y NA
 251704 251705 XCC0368 XCC0369 pcaG pcaB FALSE 0.444 234.000 0.314 1.000 N NA
 251705 251706 XCC0369 XCC0370 pcaB catD TRUE 0.887 10.000 0.014 1.000   NA
 251706 251707 XCC0370 XCC0371 catD pcaC TRUE 0.950 28.000 0.600 1.000   NA
 251707 251708 XCC0371 XCC0372 pcaC   FALSE 0.010 582.000 0.000 1.000   NA
 251710 251711 XCC0374 XCC0375     FALSE 0.012 288.000 0.000 1.000 N NA
 251712 251713 XCC0376 XCC0377   gidA FALSE 0.031 332.000 0.000 NA   NA
 251713 251714 XCC0377 XCC0378 gidA   FALSE 0.011 553.000 0.000 NA   NA
 251715 251716 XCC0379 XCC0380 ilvA   TRUE 0.668 -15.000 0.000 NA   NA
 251716 251717 XCC0380 XCC0381     FALSE 0.284 44.000 0.000 NA   NA
 251718 251719 XCC0382 XCC0383 aspH bioC FALSE 0.013 276.000 0.000 1.000 N NA
 251719 251720 XCC0383 XCC0384 bioC   TRUE 0.677 97.000 0.000 1.000 Y NA
 251720 251721 XCC0384 XCC0385   bioH FALSE 0.006 778.000 0.000 1.000   NA
 251721 251722 XCC0385 XCC0386 bioH   TRUE 0.747 32.000 0.065 NA   NA
 251722 251723 XCC0386 XCC0387   bioF TRUE 0.559 33.000 0.008 NA   NA
 251723 251724 XCC0387 XCC0388 bioF bioB TRUE 0.961 100.000 0.168 0.002 Y NA
 399331 251727 XCC0391 XCC0392 tRNA-Arg int FALSE 0.172 160.000 0.000 NA   NA
 251727 251728 XCC0392 XCC0393 int   FALSE 0.019 405.000 0.000 NA   NA
 251729 251730 XCC0394 XCC0395 fhuA sodM FALSE 0.080 485.000 0.000 1.000 Y NA
 251731 251732 XCC0396 XCC0397   bfeA FALSE 0.004 1274.000 0.000 1.000   NA
 251732 251733 XCC0397 XCC0398 bfeA nifS FALSE 0.084 51.000 0.000 1.000 N NA
 251733 251734 XCC0398 XCC0399 nifS   FALSE 0.163 159.000 0.000 1.000   NA
 251734 251735 XCC0399 XCC0400     TRUE 0.773 -186.000 0.000 0.079   NA
 251738 251739 XCC0403 XCC0404 mdoB   FALSE 0.006 835.000 0.000 NA   NA
 251740 251741 XCC0405 XCC0406     FALSE 0.421 87.000 0.008 1.000   NA
 251743 251744 XCC0408 XCC0409 glgA glgB2 TRUE 0.965 42.000 0.600 1.000 Y NA
 251744 251745 XCC0409 XCC0410 glgB2   TRUE 0.999 2.000 0.600 0.006 Y NA
 251745 251746 XCC0410 XCC0411   malQ TRUE 0.997 -3.000 0.093 0.015 Y NA
 251746 251747 XCC0411 XCC0412 malQ glgY TRUE 0.998 -3.000 0.141 0.015 Y NA
 251747 251748 XCC0412 XCC0413 glgY   TRUE 0.964 -3.000 0.031 NA   NA
 251748 251749 XCC0413 XCC0414   glgX TRUE 0.857 43.000 0.333 NA   NA
 251749 251750 XCC0414 XCC0415 glgX   TRUE 0.937 -31.000 0.016 1.000 Y NA
 251752 251753 XCC0417 XCC0418   virK FALSE 0.033 323.000 0.000 NA   NA
 251755 251756 XCC0420 XCC0421 ameR mexE TRUE 0.839 75.000 0.500 1.000 N NA
 251756 251757 XCC0421 XCC0422 mexE   TRUE 0.996 -3.000 0.857 NA N NA
 251757 251758 XCC0422 XCC0423     TRUE 0.746 132.000 0.218 NA   NA
 251758 251759 XCC0423 XCC0424     FALSE 0.153 321.000 0.074 NA   NA
 251762 251763 XCC0427 XCC0428 pdhB   TRUE 0.974 -3.000 0.064 NA   NA
 251763 251764 XCC0428 XCC0429   pdhB TRUE 0.961 2.000 0.042 NA   NA
 251764 251765 XCC0429 XCC0430 pdhB pdhA TRUE 0.981 80.000 0.458 0.001 Y NA
 251765 2165494 XCC0430 XCC0431 pdhA   FALSE 0.266 178.000 0.013 1.000   NA
 251767 251768 XCC0432 XCC0433   yhiP FALSE 0.104 410.000 0.000 1.000 Y NA
 251768 251769 XCC0433 XCC0434 yhiP   TRUE 0.962 12.000 0.211 NA   NA
 251771 251772 XCC0436 XCC0437     FALSE 0.044 278.000 0.000 1.000   NA
 251772 251773 XCC0437 XCC0438   hmgA TRUE 0.564 37.000 0.017 1.000   NA
 251776 251777 XCC0441 XCC0442   phaF TRUE 0.999 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 251777 251778 XCC0442 XCC0443 phaF phaE TRUE 0.999 -3.000 0.937 0.066 Y NA
 251778 251779 XCC0443 XCC0444 phaE phaD TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 251779 251780 XCC0444 XCC0445 phaD phaC TRUE 0.999 -3.000 0.976 0.006 Y NA
 251780 251781 XCC0445 XCC0446 phaC ndhF TRUE 0.999 -3.000 0.881 0.006 Y NA
 251783 251784 XCC0448 XCC0449     FALSE 0.011 573.000 0.000 NA   NA
 251784 251785 XCC0449 XCC0450     FALSE 0.251 110.000 0.000 NA   NA
 251785 251786 XCC0450 XCC0451     FALSE 0.249 80.000 0.000 NA   NA
 2165496 251792 XCC0455 XCC0457 rpe   TRUE 0.970 -3.000 0.050 1.000   NA
 251792 251793 XCC0457 XCC0458     FALSE 0.021 373.000 0.000 1.000   NA
 251793 251794 XCC0458 XCC0459   trpE FALSE 0.004 483.000 0.000 1.000 N NA
 251794 2165497 XCC0459 XCC0460 trpE   TRUE 0.984 0.000 0.007 1.000 Y NA
 2165497 251796 XCC0460 XCC0461     TRUE 0.659 14.000 0.000 NA   NA
 251796 251797 XCC0461 XCC0462   hsdR FALSE 0.231 125.000 0.000 NA   NA
 251797 251798 XCC0462 XCC0463 hsdR   TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.001 Y NA
 251798 251799 XCC0463 XCC0464     TRUE 0.990 -3.000 0.286 NA   NA
 251799 251800 XCC0464 XCC0465     TRUE 0.980 -3.000 0.102 NA   NA
 251800 251801 XCC0465 XCC0466     TRUE 0.978 -3.000 0.093 NA   NA
 251801 251802 XCC0466 XCC0467   trpG FALSE 0.229 146.000 0.008 1.000 N NA
 251802 251803 XCC0467 XCC0468 trpG   FALSE 0.418 124.000 0.013 1.000   NA
 251803 251804 XCC0468 XCC0469   trpD FALSE 0.337 125.000 0.003 1.000   NA
 251804 251805 XCC0469 XCC0470 trpD trpC TRUE 0.913 124.000 0.293 1.000 Y NA
 251805 251806 XCC0470 XCC0471 trpC   TRUE 0.966 -7.000 0.010 1.000 Y NA
 251808 251809 XCC0473 XCC0474 speD sugE FALSE 0.273 163.000 0.019 1.000 N NA
 251811 251812 XCC0476 XCC0477   rpsI TRUE 0.999 3.000 0.601 0.015 Y NA
 399385 399384 XCC0478 XCC0479 tRNA-Gln tRNA-Met FALSE 0.248 55.000 0.000 NA   NA
 251813 251814 XCC0480 XCC0481 nudH   FALSE 0.361 80.000 0.015 NA N NA
 251814 251815 XCC0481 XCC0482   bfr TRUE 0.586 224.000 0.070 NA Y NA
 251816 2165498 XCC0483 XCC0484     TRUE 0.999 1.000 0.556 0.026 Y NA
 2165498 251818 XCC0484 XCC0485     FALSE 0.385 177.000 0.045 NA   NA
 2165499 251820 XCC0486 XCC0487     TRUE 0.965 4.000 0.086 NA   NA
 251820 251821 XCC0487 XCC0488     TRUE 0.641 80.000 0.079 NA   NA
 251821 251822 XCC0488 XCC0489   nudC FALSE 0.397 77.000 0.007 NA   NA
 251822 251823 XCC0489 XCC0490 nudC   FALSE 0.338 137.000 0.020 1.000 N NA
 251824 251825 XCC0491 XCC0492     TRUE 0.982 0.000 0.148 NA   NA
 251825 251826 XCC0492 XCC0493   aas FALSE 0.028 335.000 0.000 1.000   NA
 251826 251827 XCC0493 XCC0494 aas   FALSE 0.294 68.000 0.011 1.000 N NA
 251829 251830 XCC0496 XCC0497   purD FALSE 0.255 88.000 0.000 NA   NA
 251830 251831 XCC0497 XCC0498 purD purH FALSE 0.189 712.000 0.238 1.000 Y NA
 251832 251833 XCC0499 XCC0500 pgsA   TRUE 0.905 55.000 0.215 NA Y NA
 251833 251834 XCC0500 XCC0501     TRUE 0.990 -3.000 0.285 NA   NA
 251834 251835 XCC0501 XCC0502     TRUE 0.978 -3.000 0.090 NA   NA
 251835 251836 XCC0502 XCC0503     TRUE 0.907 -99.000 0.200 NA   NA
 251836 251837 XCC0503 XCC0504   pgsA TRUE 0.895 -21.000 0.069 NA   NA
 251837 251838 XCC0504 XCC0505 pgsA   TRUE 0.996 -3.000 0.246 1.000 Y NA
 251838 251839 XCC0505 XCC0506   cdsA TRUE 0.919 39.000 0.595 1.000   NA
 251839 251840 XCC0506 XCC0507 cdsA   FALSE 0.005 1022.000 0.000 1.000   NA
 251841 2165500 XCC0508 XCC0509 fis   FALSE 0.241 116.000 0.000 NA   NA
 2165500 251843 XCC0509 XCC0510     FALSE 0.044 286.000 0.000 NA   NA
 251846 251847 XCC0513 XCC0514     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 251848 251849 XCC0515 XCC0516 accC   FALSE 0.516 43.000 0.014 NA   NA
 251849 251850 XCC0516 XCC0517   bccP TRUE 0.700 18.000 0.004 NA   NA
 251850 251851 XCC0517 XCC0518 bccP aroQ TRUE 0.745 80.000 0.254 1.000 N NA
 251851 251852 XCC0518 XCC0519 aroQ dsbD FALSE 0.002 830.000 0.000 1.000 N NA
 251852 251853 XCC0519 XCC0520 dsbD cutA TRUE 0.867 6.000 0.014 1.000 N NA
 251853 2165501 XCC0520 XCC0521 cutA   FALSE 0.003 601.000 0.000 1.000 N NA
 251855 251856 XCC0522 XCC0523 groES groEL TRUE 0.953 146.000 0.269 0.007 Y NA
 251856 251857 XCC0523 XCC0524 groEL   FALSE 0.431 163.000 0.000 0.099   NA
 251857 251858 XCC0524 XCC0525     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 251858 251859 XCC0525 XCC0526     FALSE 0.061 246.000 0.000 NA   NA
 251859 251860 XCC0526 XCC0527     FALSE 0.315 38.000 0.000 NA   NA
 251860 251861 XCC0527 XCC0528     TRUE 0.976 0.000 0.000 0.015   NA
 2165502 2165503 XCC0529 XCC0530     FALSE 0.023 374.000 0.000 NA   NA
 251866 251867 XCC0533 XCC0534     FALSE 0.366 33.000 0.000 NA   NA
 251870 251871 XCC0537 XCC0538     TRUE 0.605 -28.000 0.000 NA   NA
 251871 251872 XCC0538 XCC0539   ompW TRUE 0.615 155.000 0.133 NA   NA
 251873 251874 XCC0540 XCC0541     FALSE 0.298 158.000 0.006 NA   NA
 251874 251875 XCC0541 XCC0542   phdB FALSE 0.227 127.000 0.000 NA   NA
 251875 251876 XCC0542 XCC0543 phdB   TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 251876 251877 XCC0543 XCC0544   lpdA TRUE 0.755 17.000 0.009 NA   NA
 251877 2165506 XCC0544 XCC0545 lpdA   FALSE 0.006 387.000 0.000 1.000 N NA
 251880 251881 XCC0547 XCC0548   atpB TRUE 0.677 26.000 0.014 NA   NA
 251881 251882 XCC0548 XCC0549 atpB atpE TRUE 0.981 74.000 0.557 0.003 Y NA
 251882 251883 XCC0549 XCC0550 atpE atpF TRUE 0.985 113.000 0.666 0.003 Y NA
 251883 251884 XCC0550 XCC0551 atpF atpH TRUE 0.998 4.000 0.242 0.003 Y NA
 251884 251885 XCC0551 XCC0552 atpH atpA TRUE 0.990 48.000 0.864 0.003 Y NA
 251885 251886 XCC0552 XCC0553 atpA atpG TRUE 0.988 113.000 0.846 0.003 Y NA
 251886 251887 XCC0553 XCC0554 atpG atpD TRUE 0.986 123.000 0.724 0.003 Y NA
 251887 251888 XCC0554 XCC0555 atpD atpC TRUE 0.977 174.000 0.837 0.003 Y NA
 251888 251889 XCC0555 XCC0556 atpC pheA FALSE 0.036 184.000 0.000 1.000 N NA
 251891 251892 XCC0558 XCC0559 glmU   TRUE 0.867 1.000 0.000 NA   NA
 2165507 251894 XCC0560 XCC0561     TRUE 0.774 -186.000 0.000 0.078   NA
 251894 2165508 XCC0561 XCC0562     FALSE 0.263 45.000 0.000 1.000   NA
 2165508 251896 XCC0562 XCC0563   ntrC TRUE 0.999 5.000 0.957 0.099 Y NA
 251896 251897 XCC0563 XCC0564 ntrC   FALSE 0.131 174.000 0.000 1.000   NA
 251897 251898 XCC0564 XCC0565   ybjZ FALSE 0.254 105.000 0.000 NA   NA
 251898 251899 XCC0565 XCC0566 ybjZ ybjZ TRUE 0.971 64.000 1.000 NA Y NA
 251899 251900 XCC0566 XCC0567 ybjZ ycfV TRUE 0.989 11.000 0.250 NA Y NA
 251900 251901 XCC0567 XCC0568 ycfV ybjY TRUE 0.877 41.000 0.500 1.000 N NA
 251902 2165509 XCC0569 XCC0570 glmS   FALSE 0.022 370.000 0.000 1.000   NA
 2165509 251904 XCC0570 XCC0571     FALSE 0.230 68.000 0.000 NA   NA
 251904 251905 XCC0571 XCC0572     FALSE 0.072 232.000 0.000 NA   NA
 251906 251907 XCC0573 XCC0574     FALSE 0.098 1052.000 0.500 NA   NA
 251907 251908 XCC0574 XCC0575   gloA FALSE 0.028 343.000 0.000 NA   NA
 251908 251909 XCC0575 XCC0576 gloA copB FALSE 0.003 524.000 0.000 1.000 N NA
 251909 251910 XCC0576 XCC0577 copB copA TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.003 N NA
 251910 2165510 XCC0577 XCC0579 copA   TRUE 0.900 98.000 0.600 NA   NA
 251912 251913 XCC0578 XCC0580 cysM prlC TRUE 0.609 187.000 0.028 1.000 Y NA
 251914 251915 XCC0581 XCC0582 fabB fabA TRUE 0.997 0.000 0.451 1.000 Y NA
 251916 251917 XCC0583 XCC0584 dinP gph FALSE 0.414 137.000 0.015 1.000   NA
 251918 251919 XCC0585 XCC0586     TRUE 0.945 -3.000 0.009 NA   NA
 251921 251922 XCC0588 XCC0589   ptps FALSE 0.300 190.000 0.028 NA   NA
 251922 251923 XCC0589 XCC0590 ptps rhlE FALSE 0.432 117.000 0.035 1.000 N NA
 251924 251925 XCC0591 XCC0592 uptA uptB TRUE 0.864 44.000 0.495 1.000 N NA
 251927 251928 XCC0594 XCC0595 uptD uptE TRUE 0.997 -3.000 0.857 NA   NA
 251928 251929 XCC0595 XCC0596 uptE   FALSE 0.054 263.000 0.000 NA   NA
 251929 251930 XCC0596 XCC0597   cysB FALSE 0.296 232.000 0.081 NA   NA
 251930 251931 XCC0597 XCC0598 cysB metB TRUE 0.946 94.000 0.133 0.015 Y NA
 251931 251932 XCC0598 XCC0599 metB wxcA TRUE 0.906 -3.000 0.009 1.000 N NA
 251932 251933 XCC0599 XCC0600 wxcA wzm TRUE 0.819 78.000 0.050 1.000 Y NA
 251933 251934 XCC0600 XCC0601 wzm wzt TRUE 0.999 -3.000 0.450 0.099 Y NA
 251934 251935 XCC0601 XCC0602 wzt wxcB TRUE 0.612 41.000 0.000 0.099   NA
 251935 251936 XCC0602 XCC0603 wxcB wxcC FALSE 0.325 35.000 0.000 1.000   NA
 251936 251937 XCC0603 XCC0604 wxcC wxcD TRUE 0.868 21.000 0.000 NA Y NA
 251937 2165511 XCC0604 XCC0605 wxcD   TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 2165511 251939 XCC0605 XCC0606     FALSE 0.253 82.000 0.000 NA   NA
 251939 251940 XCC0606 XCC0607     FALSE 0.231 114.000 0.000 1.000   NA
 251940 251941 XCC0607 XCC0608   rmd FALSE 0.240 105.000 0.000 1.000   NA
 251942 251943 XCC0609 XCC0610     FALSE 0.312 200.000 0.000 0.078   NA
 251943 251944 XCC0610 XCC0611     TRUE 0.926 75.000 0.500 0.078   NA
 251944 251945 XCC0611 XCC0612     FALSE 0.188 291.000 0.000 0.024   NA
 251945 251946 XCC0612 XCC0613     FALSE 0.135 176.000 0.000 NA   NA
 251946 251947 XCC0613 XCC0614   wxcN TRUE 0.714 12.000 0.000 NA   NA
 251947 251948 XCC0614 XCC0615 wxcN wxcM TRUE 0.883 -19.000 0.051 1.000   NA
 251948 251949 XCC0615 XCC0616 wxcM wxcL TRUE 0.964 -3.000 0.067 NA N NA
 251949 251950 XCC0616 XCC0617 wxcL wxcK TRUE 0.963 -15.000 0.035 NA Y NA
 251950 251951 XCC0617 XCC0618 wxcK wxcH FALSE 0.247 49.000 0.000 1.000   NA
 251951 251952 XCC0618 XCC0619 wxcH etfA FALSE 0.227 60.000 0.000 1.000   NA
 251952 251953 XCC0619 XCC0620 etfA etfB TRUE 0.998 0.000 0.316 0.012 Y NA
 251954 251955 XCC0621 XCC0622 rmlB rmlA TRUE 0.951 61.000 0.143 0.004 Y NA
 251955 251956 XCC0622 XCC0623 rmlA rmlC TRUE 0.994 -3.000 0.163 1.000 Y NA
 251956 251957 XCC0623 XCC0624 rmlC rmlD TRUE 0.991 -3.000 0.063 1.000 Y NA
 251958 251959 XCC0625 XCC0626 xanB xanA TRUE 0.863 46.000 0.500 1.000 N NA
 251960 251961 XCC0627 XCC0628 ipsI ipsJ TRUE 0.997 0.000 0.070 0.001 Y NA
 2165512 251963 XCC0629 XCC0630   etf-QO FALSE 0.033 444.000 0.008 1.000   NA
 251965 251966 XCC0632 XCC0633     TRUE 0.987 -3.000 0.201 NA   NA
 251966 251967 XCC0633 XCC0634   yrbF TRUE 0.995 3.000 0.275 NA Y NA
 251967 251968 XCC0634 XCC0635 yrbF yrbE TRUE 0.947 83.000 0.472 NA Y NA
 251970 251971 XCC0637 XCC0638     FALSE 0.392 173.000 0.000 0.078   NA
 251971 251972 XCC0638 XCC0639   proS FALSE 0.055 251.000 0.000 1.000   NA
 251972 251973 XCC0639 XCC0640 proS   FALSE 0.362 114.000 0.002 NA   NA
 251974 251975 XCC0641 XCC0642 pssA   TRUE 0.934 -3.000 0.005 1.000   NA
 251975 2165513 XCC0642 XCC0643   rimI TRUE 0.882 6.000 0.005 1.000   NA
 2165513 251977 XCC0643 XCC0644 rimI pel FALSE 0.007 702.000 0.000 1.000   NA
 251977 2165514 XCC0644 XCC0645 pel pel TRUE 0.618 238.000 0.000 0.002 Y NA
 251979 251980 XCC0646 XCC0647 valS   FALSE 0.007 782.000 0.000 NA   NA
 251980 251981 XCC0647 XCC0648   holC TRUE 0.757 10.000 0.000 NA   NA
 251981 251982 XCC0648 XCC0649 holC pepA TRUE 0.837 115.000 0.494 1.000 N NA
 251983 251984 XCC0650 XCC0651     TRUE 0.998 -3.000 0.631 0.065   NA
 251984 251985 XCC0651 XCC0652     FALSE 0.448 -222.000 0.000 NA   NA
 251987 251988 XCC0654 XCC0655 xerD dsbC FALSE 0.056 252.000 0.004 1.000 N NA
 251988 251989 XCC0655 XCC0656 dsbC purL FALSE 0.041 332.000 0.011 1.000 N NA
 251989 251990 XCC0656 XCC0657 purL   FALSE 0.006 878.000 0.000 NA   NA
 251990 251991 XCC0657 XCC0658   xadA FALSE 0.012 533.000 0.000 NA   NA
 251991 251992 XCC0658 XCC0659 xadA   FALSE 0.163 159.000 0.000 1.000   NA
 251992 251993 XCC0659 XCC0660   xpsE TRUE 0.546 120.000 0.043 1.000   NA
 251993 251994 XCC0660 XCC0661 xpsE xpsF TRUE 0.892 215.000 0.255 0.006 Y NA
 251994 251995 XCC0661 XCC0662 xpsF xpsG TRUE 0.755 265.000 0.125 0.006 Y NA
 251995 251996 XCC0662 XCC0663 xpsG xpsH TRUE 0.997 11.000 0.348 0.006 Y NA
 251996 251997 XCC0663 XCC0664 xpsH xpsI TRUE 0.994 -3.000 0.130 NA Y NA
 251997 251998 XCC0664 XCC0665 xpsI xpsJ TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 251998 251999 XCC0665 XCC0666 xpsJ xpsK TRUE 0.990 -3.000 0.308 NA   NA
 251999 252000 XCC0666 XCC0667 xpsK xpsL TRUE 0.997 -3.000 0.385 NA Y NA
 252000 252001 XCC0667 XCC0668 xpsL xpsM TRUE 0.969 -16.000 0.364 NA   NA
 252001 252002 XCC0668 XCC0669 xpsM xpsN TRUE 0.988 -10.000 0.700 NA   NA
 252002 252003 XCC0669 XCC0670 xpsN xpsD TRUE 0.991 -3.000 0.333 NA   NA
 252003 252004 XCC0670 XCC0671 xpsD   FALSE 0.082 438.000 0.074 NA   NA
 252005 252006 XCC0672 XCC0673   pnuC FALSE 0.490 104.000 0.047 1.000 N NA
 252006 252007 XCC0673 XCC0674 pnuC   FALSE 0.470 188.000 0.186 1.000 N NA
 252007 252008 XCC0674 XCC0675     TRUE 0.617 32.000 0.014 NA   NA
 252009 252010 XCC0676 XCC0677 gtrB   FALSE 0.165 256.000 0.026 NA   NA
 252010 2165515 XCC0677 XCC0678     TRUE 0.883 14.000 0.040 NA   NA
 2165515 252012 XCC0678 XCC0679     TRUE 0.809 -52.000 0.030 1.000   NA
 252012 252013 XCC0679 XCC0680     TRUE 0.836 -63.000 0.053 1.000   NA
 252013 252014 XCC0680 XCC0681   pncB FALSE 0.010 578.000 0.000 1.000   NA
 252014 252015 XCC0681 XCC0682 pncB   FALSE 0.254 52.000 0.000 NA   NA
 252015 252016 XCC0682 XCC0683   bcsC FALSE 0.433 -514.000 0.000 NA   NA
 252017 252018 XCC0684 XCC0685     TRUE 0.985 -7.000 0.500 NA   NA
 252019 252020 XCC0686 XCC0687 arsC def FALSE 0.016 256.000 0.000 1.000 N NA
 252022 252023 XCC0689 XCC0690   glyA FALSE 0.093 210.000 0.000 NA   NA
 252023 252024 XCC0690 XCC0691 glyA   FALSE 0.256 102.000 0.004 NA N NA
 252024 252025 XCC0691 XCC0692     TRUE 0.887 6.000 0.005 NA   NA
 252025 252026 XCC0692 XCC0693   ribD TRUE 0.932 -3.000 0.005 1.000   NA
 252028 252029 XCC0695 XCC0696 ribE ribA TRUE 0.986 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 252029 252030 XCC0696 XCC0697 ribA ribH TRUE 0.978 113.000 0.417 0.002 Y NA
 252030 252031 XCC0697 XCC0698 ribH nusB TRUE 0.913 -3.000 0.011 1.000 N NA
 252031 252032 XCC0698 XCC0699 nusB thiL TRUE 0.730 111.000 0.225 1.000 N NA
 252032 252033 XCC0699 XCC0700 thiL   FALSE 0.018 402.000 0.000 1.000   NA
 252033 252034 XCC0700 XCC0701     FALSE 0.006 831.000 0.000 NA   NA
 252034 252035 XCC0701 XCC0702   kdpA TRUE 0.887 16.000 0.071 NA   NA
 252035 252036 XCC0702 XCC0703 kdpA kdpB TRUE 0.993 14.000 0.145 0.001 Y NA
 252036 252037 XCC0703 XCC0704 kdpB kdpC TRUE 0.995 31.000 0.877 0.001 Y NA
 252037 252038 XCC0704 XCC0705 kdpC kdpD FALSE 0.414 98.000 0.026 1.000 N NA
 252038 252039 XCC0705 XCC0706 kdpD kdpE TRUE 0.991 -10.000 0.379 1.000 Y NA
 252040 252041 XCC0707 XCC0708   dld TRUE 0.636 71.000 0.091 NA   NA
 252041 252042 XCC0708 XCC0709 dld   TRUE 0.982 -3.000 0.130 NA   NA
 252042 252043 XCC0709 XCC0710     TRUE 0.715 17.000 0.004 NA   NA
 252043 252044 XCC0710 XCC0711     TRUE 0.974 5.000 0.172 NA   NA
 252045 2165516 XCC0712 XCC0713   rnpB FALSE 0.197 145.000 0.000 NA   NA
 252046 252047 XCC0714 XCC0715     TRUE 0.985 -3.000 0.170 NA   NA
 252047 252048 XCC0715 XCC0716     TRUE 0.944 -3.000 0.009 NA   NA
 252049 252050 XCC0717 XCC0718   mraW TRUE 0.915 45.000 0.635 NA   NA
 252050 252051 XCC0718 XCC0719 mraW ftsL TRUE 0.984 -3.000 0.227 1.000 N NA
 252051 252052 XCC0719 XCC0720 ftsL ftsI FALSE 0.427 47.000 0.024 1.000 N NA
 252052 252053 XCC0720 XCC0721 ftsI murE TRUE 0.987 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 252053 252054 XCC0721 XCC0722 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 252054 252055 XCC0722 XCC0723 murF mraY TRUE 0.996 -10.000 0.309 0.004 Y NA
 252055 252056 XCC0723 XCC0724 mraY ftsW TRUE 0.985 0.000 0.018 0.004 N NA
 252056 252057 XCC0724 XCC0725 ftsW murG TRUE 0.994 -3.000 0.647 1.000 N NA
 252057 252058 XCC0725 XCC0726 murG murC TRUE 0.996 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 252058 252059 XCC0726 XCC0727 murC ddlB TRUE 0.998 -3.000 0.153 0.004 Y NA
 252059 252060 XCC0727 XCC0728 ddlB ftsQ TRUE 0.937 107.000 0.372 NA Y NA
 252060 252061 XCC0728 XCC0729 ftsQ ftsA TRUE 0.990 -3.000 0.389 NA N NA
 252061 252062 XCC0729 XCC0730 ftsA ftsZ TRUE 0.684 296.000 0.460 1.000 Y NA
 252062 252063 XCC0730 XCC0731 ftsZ lpxC FALSE 0.309 227.000 0.134 1.000 N NA
 252065 252066 XCC0733 XCC0734   secA FALSE 0.423 158.000 0.068 1.000 N NA
 252066 252067 XCC0734 XCC0735 secA   FALSE 0.015 470.000 0.000 NA   NA
 252067 252068 XCC0735 XCC0736     FALSE 0.284 181.000 0.016 NA   NA
 252068 252069 XCC0736 XCC0737     TRUE 0.695 -12.000 0.000 NA   NA
 252070 252071 XCC0738 XCC0739   metF TRUE 0.599 33.000 0.014 NA   NA
 252071 252072 XCC0739 XCC0740 metF   FALSE 0.399 99.000 0.007 1.000   NA
 252073 252074 XCC0741 XCC0742     FALSE 0.008 691.000 0.000 NA   NA
 252077 252078 XCC0745 XCC0746     FALSE 0.422 28.000 0.000 NA   NA
 252078 252079 XCC0746 XCC0747     TRUE 0.611 -27.000 0.000 NA   NA
 252079 252080 XCC0747 XCC0748   amy FALSE 0.064 567.000 0.000 NA Y NA
 252081 252082 XCC0749 XCC0750     TRUE 0.609 130.000 0.080 NA   NA
 252083 252084 XCC0751 XCC0752   sahH FALSE 0.009 623.000 0.000 NA   NA
 252085 252086 XCC0753 XCC0754   ppc FALSE 0.347 189.000 0.089 1.000 N NA
 252086 252087 XCC0754 XCC0755 ppc   TRUE 0.893 -42.000 0.105 1.000   NA
 252087 252088 XCC0755 XCC0756     TRUE 0.967 -3.000 0.039 NA   NA
 252088 252089 XCC0756 XCC0757     TRUE 0.976 -3.000 0.078 NA   NA
 252089 2165517 XCC0757 XCC0758     TRUE 0.629 186.000 0.286 NA   NA
 2165517 2165518 XCC0758 XCC0759   cirA FALSE 0.002 906.000 0.000 1.000 N NA
 2165518 252092 XCC0759 XCC0760 cirA appA TRUE 0.976 -10.000 0.375 1.000   NA
 252095 252096 XCC0763 XCC0764   rbsK FALSE 0.003 612.000 0.000 1.000 N NA
 252096 252097 XCC0764 XCC0765 rbsK yeiM FALSE 0.417 81.000 0.027 1.000 N NA
 252098 252099 XCC0766 XCC0767     FALSE 0.015 473.000 0.000 NA   NA
 252099 252100 XCC0767 XCC0768   phuR FALSE 0.194 146.000 0.000 NA   NA
 252100 252101 XCC0768 XCC0769 phuR   TRUE 0.971 6.000 0.160 NA   NA
 252101 2165519 XCC0769 XCC0770     TRUE 0.690 29.000 0.024 NA   NA
 252103 252104 XCC0771 XCC0772   nrtB FALSE 0.444 89.000 0.011 NA   NA
 252104 252105 XCC0772 XCC0773 nrtB nrtCD TRUE 0.999 -3.000 0.795 1.000 Y NA
 252105 252106 XCC0773 XCC0774 nrtCD   TRUE 0.997 4.000 0.553 NA Y NA
 252106 252107 XCC0774 XCC0775   tauD TRUE 0.895 46.000 0.647 NA N NA
 252107 252108 XCC0775 XCC0776 tauD   TRUE 0.626 171.000 0.011 NA Y NA
 252108 252109 XCC0776 XCC0777   ftsE TRUE 0.993 -3.000 0.535 NA N NA
 252110 252111 XCC0778 XCC0779 tesA colR FALSE 0.331 67.000 0.016 1.000 N NA
 252111 252112 XCC0779 XCC0780 colR colS TRUE 0.934 142.000 0.500 1.000 Y NA
 252114 252115 XCC0782 XCC0783 dgkA   FALSE 0.389 117.000 0.007 NA   NA
 252115 252116 XCC0783 XCC0784     FALSE 0.029 341.000 0.000 NA   NA
 252116 252117 XCC0784 XCC0785     TRUE 0.954 -3.000 0.015 NA   NA
 252117 252118 XCC0785 XCC0786   lgt FALSE 0.383 55.000 0.005 NA   NA
 252118 252119 XCC0786 XCC0787 lgt thyA TRUE 0.979 -3.000 0.164 1.000 N NA
 252119 252120 XCC0787 XCC0788 thyA folA TRUE 0.618 73.000 0.134 1.000 N NA
 252121 252122 XCC0789 XCC0790 apaH apaG TRUE 0.893 29.000 0.267 NA   NA
 252122 252123 XCC0790 XCC0791 apaG ksgA TRUE 0.557 78.000 0.078 NA N NA
 252123 252124 XCC0791 XCC0792 ksgA pdxA FALSE 0.071 567.000 0.197 1.000 N NA
 252124 252125 XCC0792 XCC0793 pdxA surA TRUE 0.988 5.000 0.561 1.000 N NA
 252125 252126 XCC0793 XCC0794 surA ostA TRUE 0.934 -3.000 0.020 1.000 N NA
 252126 252127 XCC0794 XCC0795 ostA   TRUE 0.783 131.000 0.357 NA N NA
 252127 252128 XCC0795 XCC0796     TRUE 0.527 39.000 0.013 NA   NA
 252128 252129 XCC0796 XCC0797     TRUE 0.939 2.000 0.013 NA   NA
 252130 252131 XCC0798 XCC0799 ubiH visC TRUE 0.999 -3.000 0.474 0.001 Y NA
 252131 252132 XCC0799 XCC0800 visC   TRUE 0.790 103.000 0.017 0.006   NA
 252132 252133 XCC0800 XCC0801     TRUE 0.792 115.000 0.273 1.000   NA
 252133 252134 XCC0801 XCC0802     TRUE 0.674 49.000 0.091 NA   NA
 252136 252137 XCC0804 XCC0805 pcaH ligA TRUE 0.990 10.000 0.190 0.001   NA
 252137 252138 XCC0805 XCC0806 ligA pcaQ TRUE 0.639 73.000 0.095 1.000   NA
 252139 252140 XCC0807 XCC0808     FALSE 0.288 216.000 0.000 0.065   NA
 252140 252141 XCC0808 XCC0809   badH TRUE 0.893 -15.000 0.000 0.065   NA
 252141 252142 XCC0809 XCC0810 badH fadB TRUE 0.891 87.000 0.333 0.065 N NA
 252142 252143 XCC0810 XCC0811 fadB   TRUE 0.903 34.000 0.500 1.000 N NA
 252143 252144 XCC0811 XCC0812     FALSE 0.186 145.000 0.000 1.000   NA
 252144 252145 XCC0812 XCC0813     FALSE 0.154 168.000 0.000 NA   NA
 252145 252146 XCC0813 XCC0814     TRUE 0.670 52.000 0.094 NA   NA
 252148 252149 XCC0816 XCC0817     TRUE 0.775 22.000 0.032 NA   NA
 252149 252150 XCC0817 XCC0818     FALSE 0.014 471.000 0.000 1.000   NA
 252150 252151 XCC0818 XCC0819     FALSE 0.238 53.000 0.000 1.000   NA
 252151 252152 XCC0819 XCC0820     TRUE 0.623 126.000 0.000 0.017   NA
 252152 252153 XCC0820 XCC0821   glnS FALSE 0.095 44.000 0.000 1.000 N NA
 252154 252155 XCC0822 XCC0823 gst   TRUE 0.758 -109.000 0.024 NA   NA
 252156 252157 XCC0824 XCC0825   torS TRUE 0.998 -3.000 0.167 0.025 Y NA
 252157 252158 XCC0825 XCC0826 torS   TRUE 0.990 -3.000 0.167 0.082 N NA
 252159 252160 XCC0827 XCC0828   pms FALSE 0.462 84.000 0.013 NA   NA
 252161 252162 XCC0829 XCC0830   talB FALSE 0.048 277.000 0.000 NA   NA
 252162 2165520 XCC0830 XCC0831 talB rnk FALSE 0.396 63.000 0.027 1.000 N NA
 2165520 252164 XCC0831 XCC0832 rnk oxyR TRUE 0.592 229.000 0.008 0.082 Y NA
 252164 252165 XCC0832 XCC0833 oxyR ahpF FALSE 0.473 91.000 0.041 1.000 N NA
 252165 252166 XCC0833 XCC0834 ahpF ahpC TRUE 0.886 190.000 0.551 1.000 Y NA
 252167 252168 XCC0835 XCC0836 hemK pip FALSE 0.271 175.000 0.012 1.000   NA
 252169 252170 XCC0837 XCC0838     TRUE 0.927 -19.000 0.135 1.000   NA
 252170 252171 XCC0838 XCC0839   exo TRUE 0.823 -111.000 0.068 1.000   NA
 252171 252172 XCC0839 XCC0840 exo   TRUE 0.923 -3.000 0.014 1.000 N NA
 252173 2165521 XCC0841 XCC0842     FALSE 0.083 222.000 0.000 NA   NA
 2165522 252178 XCC0845 XCC0846     TRUE 0.990 6.000 0.556 NA   NA
 252178 252179 XCC0846 XCC0847     TRUE 0.974 -3.000 0.065 NA   NA
 252179 252180 XCC0847 XCC0848     FALSE 0.083 222.000 0.000 NA   NA
 252181 252182 XCC0849 XCC0850   ilvE FALSE 0.454 65.000 0.017 1.000   NA
 252182 252183 XCC0850 XCC0851 ilvE   FALSE 0.010 314.000 0.000 1.000 N NA
 252183 252184 XCC0851 XCC0852     TRUE 0.986 92.000 0.667 0.004 Y NA
 252184 252185 XCC0852 XCC0853     FALSE 0.431 -558.000 0.000 NA   NA
 252185 2165523 XCC0853 XCC0854     FALSE 0.004 1325.000 0.000 NA   NA
 252187 252188 XCC0855 XCC0856   aspG TRUE 0.903 4.000 0.006 1.000   NA
 252190 252191 XCC0858 XCC0859     TRUE 0.995 -3.000 0.657 NA   NA
 252192 252193 XCC0860 XCC0861 rbn yneN TRUE 0.957 -3.000 0.020 1.000   NA
 252193 252194 XCC0861 XCC0862 yneN acyP TRUE 0.655 0.000 0.000 1.000 N NA
 252194 252195 XCC0862 XCC0863 acyP   FALSE 0.255 88.000 0.000 NA   NA
 252196 252197 XCC0864 XCC0865   moaB TRUE 0.548 31.000 0.006 1.000   NA
 252197 252198 XCC0865 XCC0866 moaB   FALSE 0.003 612.000 0.000 1.000 N NA
 252198 252199 XCC0866 XCC0867   prfA TRUE 0.876 -3.000 0.004 1.000 N NA
 252199 252200 XCC0867 XCC0868 prfA hemA TRUE 0.964 -22.000 0.171 0.038 N NA
 252201 252202 XCC0869 XCC0870   lolB TRUE 0.959 -3.000 0.024 1.000   NA
 252202 252203 XCC0870 XCC0871 lolB ipk TRUE 0.916 -18.000 0.157 1.000 N NA
 252203 399332 XCC0871 XCC0872 ipk tRNA-Gln TRUE 0.831 4.000 0.000 NA   NA
 399332 252204 XCC0872 XCC0873 tRNA-Gln prsA FALSE 0.120 185.000 0.000 NA   NA
 252204 252205 XCC0873 XCC0874 prsA rplY TRUE 0.625 109.000 0.122 1.000 N NA
 252205 252206 XCC0874 XCC0875 rplY pth TRUE 0.976 51.000 0.496 0.022 Y NA
 252206 252207 XCC0875 XCC0876 pth ychF TRUE 0.889 77.000 0.184 1.000 Y NA
 252207 399333 XCC0876 XCC0877 ychF tRNA-Tyr FALSE 0.185 152.000 0.000 NA   NA
 399333 399334 XCC0877 XCC0878 tRNA-Tyr tRNA-Gly FALSE 0.402 30.000 0.000 NA   NA
 399334 399335 XCC0878 XCC0879 tRNA-Gly tRNA-Thr FALSE 0.355 34.000 0.000 NA   NA
 399335 252208 XCC0879 XCC0880 tRNA-Thr tufA FALSE 0.268 47.000 0.000 NA   NA
 252208 399336 XCC0880 XCC0881 tufA tRNA-Trp FALSE 0.253 107.000 0.000 NA   NA
 399336 252209 XCC0881 XCC0882 tRNA-Trp secE FALSE 0.258 50.000 0.000 NA   NA
 252209 252210 XCC0882 XCC0883 secE nusG TRUE 0.983 14.000 0.843 1.000 N NA
 252210 252211 XCC0883 XCC0884 nusG rplK TRUE 0.746 198.000 0.681 1.000 N NA
 252211 252212 XCC0884 XCC0885 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.019 Y NA
 252212 252213 XCC0885 XCC0886 rplA rplJ FALSE 0.482 549.000 0.302 0.019 Y NA
 252213 252214 XCC0886 XCC0887 rplJ rplL TRUE 0.987 55.000 0.884 0.015 Y NA
 252214 252215 XCC0887 XCC0888 rplL rpoB FALSE 0.413 243.000 0.223 1.000   NA
 252215 252216 XCC0888 XCC0889 rpoB rpoC TRUE 0.976 101.000 0.851 0.001   NA
 252216 252217 XCC0889 XCC0890 rpoC rpsL FALSE 0.302 224.000 0.122 1.000 N NA
 252217 252218 XCC0890 XCC0891 rpsL rpsG TRUE 0.998 13.000 0.620 0.003 Y NA
 252218 252219 XCC0891 XCC0892 rpsG fusA TRUE 0.945 138.000 0.579 1.000 Y NA
 252219 252220 XCC0892 XCC0893 fusA tufB TRUE 0.981 49.000 0.400 0.001 Y NA
 252220 252221 XCC0893 XCC0894 tufB rpsJ FALSE 0.370 456.000 0.318 1.000 Y NA
 252221 252222 XCC0894 XCC0895 rpsJ rplC TRUE 0.995 12.000 0.307 0.019 Y NA
 252222 252223 XCC0895 XCC0896 rplC rplD TRUE 0.996 13.000 0.486 0.015 Y NA
 252223 252224 XCC0896 XCC0897 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.015 Y NA
 252224 252225 XCC0897 XCC0898 rplW rplB TRUE 0.998 11.000 0.849 0.018 Y NA
 252225 252226 XCC0898 XCC0899 rplB rpsS TRUE 0.999 7.000 0.820 0.019 Y NA
 252226 252227 XCC0899 XCC0900 rpsS rplV TRUE 0.999 7.000 0.769 0.019 Y NA
 252227 252228 XCC0900 XCC0901 rplV rpsC TRUE 0.996 18.000 0.719 0.019 Y NA
 252228 252229 XCC0901 XCC0902 rpsC rplP TRUE 0.999 6.000 0.828 0.019 Y NA
 252229 252230 XCC0902 XCC0903 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.015 Y NA
 252230 252231 XCC0903 XCC0904 rpmC rpsQ TRUE 0.998 12.000 0.828 0.015 Y NA
 252231 252232 XCC0904 XCC0905 rpsQ rplN TRUE 0.997 15.000 0.791 0.019 Y NA
 252232 252233 XCC0905 XCC0906 rplN rplX TRUE 0.997 16.000 0.810 0.019 Y NA
 252233 252234 XCC0906 XCC0907 rplX rplE TRUE 0.998 12.000 0.758 0.015 Y NA
 252234 252235 XCC0907 XCC0908 rplE rpsN TRUE 0.990 19.000 0.309 0.015 Y NA
 252235 252236 XCC0908 XCC0909 rpsN rpsH TRUE 0.898 206.000 0.295 0.015 Y NA
 252236 252237 XCC0909 XCC0910 rpsH rplF TRUE 0.997 16.000 0.808 0.015 Y NA
 252237 252238 XCC0910 XCC0911 rplF rplR TRUE 0.986 83.000 0.815 0.015 Y NA
 252238 252239 XCC0911 XCC0912 rplR rpsE TRUE 0.977 160.000 0.814 0.019 Y NA
 252239 252240 XCC0912 XCC0913 rpsE rpmD TRUE 0.995 23.000 0.789 0.019 Y NA
 252240 252241 XCC0913 XCC0914 rpmD rplO TRUE 0.998 11.000 0.653 0.002 Y NA
 252241 252242 XCC0914 XCC0915 rplO secY TRUE 0.989 8.000 0.730 1.000 N NA
 252242 252243 XCC0915 XCC0916 secY rpsM FALSE 0.043 333.000 0.011 1.000 N NA
 252243 252244 XCC0916 XCC0917 rpsM   TRUE 0.998 11.000 0.810 0.015 Y NA
 252244 252245 XCC0917 XCC0918   rpsD TRUE 0.995 16.000 0.509 0.019 Y NA
 252245 252246 XCC0918 XCC0919 rpsD rpoA TRUE 0.862 54.000 0.549 1.000 N NA
 252246 252247 XCC0919 XCC0920 rpoA rplQ TRUE 0.829 176.000 0.873 1.000 N NA
 252247 252248 XCC0920 XCC0921 rplQ dsbB FALSE 0.003 588.000 0.000 1.000 N NA
 252248 2165524 XCC0921 XCC0922 dsbB dhs1 FALSE 0.444 45.000 0.025 1.000 N NA
 2165524 252250 XCC0922 XCC0923 dhs1   FALSE 0.125 227.000 0.015 NA N NA
 252251 252252 XCC0924 XCC0925 gatAX   FALSE 0.314 202.000 0.045 NA   NA
 252252 2165525 XCC0925 XCC0926   typA TRUE 0.692 19.000 0.006 NA   NA
 252254 252255 XCC0927 XCC0928 ppiB mdh FALSE 0.363 116.000 0.018 1.000 N NA
 252256 252257 XCC0929 XCC0930 gst   TRUE 0.662 62.000 0.111 1.000   NA
 252259 252260 XCC0932 XCC0933   fadH FALSE 0.036 315.000 0.000 NA   NA
 252260 252261 XCC0933 XCC0934 fadH   FALSE 0.084 654.000 0.017 1.000 Y NA
 252262 252263 XCC0935 XCC0936 mopB   TRUE 0.654 190.000 0.333 NA   NA
 252263 252264 XCC0936 XCC0937     TRUE 0.931 18.000 0.227 NA   NA
 252265 252266 XCC0938 XCC0939   kbl TRUE 0.918 3.000 0.007 1.000   NA
 252267 252268 XCC0940 XCC0941 sbp cysU TRUE 0.982 4.000 0.020 0.001 N NA
 252268 252269 XCC0941 XCC0942 cysU cysW TRUE 0.999 -3.000 0.935 0.001 N NA
 252269 252270 XCC0942 XCC0943 cysW cysA TRUE 0.980 8.000 0.050 1.000 Y NA
 252270 252271 XCC0943 XCC0944 cysA   FALSE 0.042 294.000 0.000 NA   NA
 252272 252273 XCC0945 XCC0946 tdh fecA FALSE 0.003 563.000 0.000 1.000 N NA
 252274 252275 XCC0947 XCC0948   pgmA FALSE 0.043 172.000 0.000 1.000 N NA
 252275 252276 XCC0948 XCC0949 pgmA   TRUE 0.555 18.000 0.000 NA   NA
 252276 252277 XCC0949 XCC0950   folC FALSE 0.007 772.000 0.000 NA   NA
 252277 252278 XCC0950 XCC0951 folC   FALSE 0.429 68.000 0.013 NA   NA
 252278 252279 XCC0951 XCC0952   cvpA FALSE 0.415 92.000 0.007 NA   NA
 252279 252280 XCC0952 XCC0953 cvpA purF TRUE 0.881 31.000 0.262 1.000   NA
 252280 252281 XCC0953 XCC0954 purF   TRUE 0.589 32.000 0.012 1.000   NA
 252281 252282 XCC0954 XCC0955     FALSE 0.009 608.000 0.000 1.000   NA
 252282 2165526 XCC0955 XCC0956     TRUE 0.697 124.000 0.143 NA   NA
 252284 252285 XCC0957 XCC0958     FALSE 0.401 112.000 0.008 1.000   NA
 252285 252286 XCC0958 XCC0959   gtrB TRUE 0.923 -19.000 0.125 1.000   NA
 252286 252287 XCC0959 XCC0960 gtrB ppx FALSE 0.115 237.000 0.018 1.000 N NA
 252287 252288 XCC0960 XCC0961 ppx ppk TRUE 0.839 58.000 0.076 1.000 Y NA
 252288 252289 XCC0961 XCC0962 ppk phoR FALSE 0.436 133.000 0.045 1.000 N NA
 252289 252290 XCC0962 XCC0963 phoR phoB TRUE 0.948 47.000 0.453 1.000 Y NA
 252290 252291 XCC0963 XCC0964 phoB   FALSE 0.439 70.000 0.016 1.000   NA
 252292 252293 XCC0965 XCC0966 grxC   TRUE 0.969 -3.000 0.045 NA   NA
 252293 252294 XCC0966 XCC0967   icd FALSE 0.123 294.000 0.025 NA   NA
 399337 399338 XCC0969 XCC0970 tRNA-Pro tRNA-Arg FALSE 0.284 44.000 0.000 NA   NA
 399338 399339 XCC0970 XCC0971 tRNA-Arg tRNA-His FALSE 0.378 32.000 0.000 NA   NA
 399339 399340 XCC0971 XCC0972 tRNA-His tRNA-Lys FALSE 0.255 84.000 0.000 NA   NA
 399340 399341 XCC0972 XCC0973 tRNA-Lys tRNA-Leu FALSE 0.244 78.000 0.000 NA   NA
 399341 252296 XCC0973 XCC0974 tRNA-Leu tig FALSE 0.098 203.000 0.000 NA   NA
 252296 252297 XCC0974 XCC0975 tig clpP TRUE 0.933 95.000 0.351 1.000 Y NA
 252297 252298 XCC0975 XCC0976 clpP clpX TRUE 0.925 125.000 0.352 1.000 Y NA
 252298 252299 XCC0976 XCC0977 clpX lon TRUE 0.924 145.000 0.201 0.096 Y NA
 252299 252300 XCC0977 XCC0978 lon hupB FALSE 0.104 215.000 0.008 1.000 N NA
 252300 399342 XCC0978 XCC0979 hupB tRNA-Val TRUE 0.714 12.000 0.000 NA   NA
 399342 399343 XCC0979 XCC0980 tRNA-Val tRNA-Asp FALSE 0.402 30.000 0.000 NA   NA
 399343 399344 XCC0980 XCC0981 tRNA-Asp tRNA-Asp FALSE 0.253 97.000 0.000 NA   NA
 399344 252301 XCC0981 XCC0982 tRNA-Asp ppiD FALSE 0.160 166.000 0.000 NA   NA
 252301 252302 XCC0982 XCC0983 ppiD   FALSE 0.011 541.000 0.000 NA   NA
 252303 252304 XCC0984 XCC0985 dniR gloB TRUE 0.941 -3.000 0.008 1.000   NA
 252305 252306 XCC0986 XCC0987   rnhA TRUE 0.599 25.000 0.003 NA   NA
 252306 252307 XCC0987 XCC0988 rnhA dnaQ TRUE 0.990 9.000 0.248 1.000 Y NA
 399345 252309 XCC0990 XCC0991 tRNA-Ser   FALSE 0.037 309.000 0.000 NA   NA
 252311 252312 XCC0993 XCC0994     TRUE 0.961 0.000 0.032 1.000   NA
 252312 252313 XCC0994 XCC0995   moaA TRUE 0.940 12.000 0.108 1.000   NA
 252313 252314 XCC0995 XCC0996 moaA   TRUE 0.760 25.000 0.037 NA   NA
 252314 252315 XCC0996 XCC0997   moaC TRUE 0.609 25.000 0.004 NA   NA
 252315 252316 XCC0997 XCC0998 moaC moaD TRUE 0.998 -3.000 0.175 0.002 Y NA
 252316 252317 XCC0998 XCC0999 moaD moaE TRUE 0.999 3.000 0.501 0.002 Y NA
 252317 399346 XCC0999 XCC1000 moaE tRNA-Ser FALSE 0.102 201.000 0.000 NA   NA
 399346 252318 XCC1000 XCC1001 tRNA-Ser dnaX FALSE 0.026 356.000 0.000 NA   NA
 252318 252319 XCC1001 XCC1002 dnaX   TRUE 0.986 7.000 0.411 NA   NA
 252319 252320 XCC1002 XCC1003   recR TRUE 0.902 97.000 0.604 NA   NA
 252320 252321 XCC1003 XCC1004 recR   FALSE 0.331 106.000 0.013 1.000 N NA
 252322 252323 XCC1005 XCC1006 slp   TRUE 0.950 -3.000 0.012 NA   NA
 252323 252324 XCC1006 XCC1007     TRUE 0.990 -7.000 0.727 NA   NA
 252324 252325 XCC1007 XCC1008   moxR TRUE 0.993 5.000 0.739 NA   NA
 252326 252327 XCC1009 XCC1010     TRUE 0.742 20.000 0.014 NA   NA
 252327 252328 XCC1010 XCC1011     FALSE 0.503 55.000 0.021 NA   NA
 252328 252329 XCC1011 XCC1012     FALSE 0.181 246.000 0.029 NA   NA
 252331 252332 XCC1014 XCC1015   rpmF TRUE 0.898 97.000 0.599 NA   NA
 252332 252333 XCC1015 XCC1016 rpmF fabH FALSE 0.353 90.000 0.014 1.000 N NA
 252333 252334 XCC1016 XCC1017 fabH fabD FALSE 0.391 645.000 0.182 0.003 Y NA
 252334 252335 XCC1017 XCC1018 fabD fabG TRUE 0.978 79.000 0.432 0.003 Y NA
 252335 252336 XCC1018 XCC1019 fabG acpP TRUE 0.958 156.000 0.321 0.003 Y NA
 252336 252337 XCC1019 XCC1020 acpP fabF TRUE 0.913 141.000 0.346 1.000 Y NA
 252337 252338 XCC1020 XCC1021 fabF trpE TRUE 0.650 162.000 0.030 0.013 N NA
 252338 252339 XCC1021 XCC1022 trpE   FALSE 0.420 61.000 0.010 NA   NA
 252339 252340 XCC1022 XCC1023   holB TRUE 0.936 -3.000 0.005 NA   NA
 252340 252341 XCC1023 XCC1024 holB pilZ TRUE 0.990 -3.000 0.382 NA N NA
 252341 399347 XCC1024 XCC1025 pilZ tRNA-Val FALSE 0.132 177.000 0.000 NA   NA
 399347 252342 XCC1025 XCC1026 tRNA-Val   FALSE 0.254 105.000 0.000 NA   NA
 252342 252343 XCC1026 XCC1027     TRUE 0.960 -78.000 0.500 NA   NA
 252343 252344 XCC1027 XCC1028     FALSE 0.020 398.000 0.000 NA   NA
 252344 252345 XCC1028 XCC1029     FALSE 0.262 49.000 0.000 NA   NA
 252347 252348 XCC1031 XCC1032 prpB prpC TRUE 0.848 76.000 0.502 1.000 N NA
 252348 252349 XCC1032 XCC1033 prpC acnA TRUE 0.802 199.000 0.289 1.000 Y NA
 252349 252350 XCC1033 XCC1034 acnA   FALSE 0.472 36.000 0.018 1.000 N NA
 252350 252351 XCC1034 XCC1035     TRUE 0.988 -3.000 0.241 NA   NA
 252351 252352 XCC1035 XCC1036     FALSE 0.486 94.000 0.017 NA   NA
 252352 252353 XCC1036 XCC1037   fyuA FALSE 0.057 255.000 0.000 NA   NA
 252353 252354 XCC1037 XCC1038 fyuA   TRUE 0.703 125.000 0.214 NA N NA
 252354 252355 XCC1038 XCC1039     FALSE 0.006 891.000 0.000 NA   NA
 2165527 252358 XCC1041 XCC1042 fecA glpQ TRUE 0.575 230.000 0.400 1.000   NA
 252358 252359 XCC1042 XCC1043 glpQ   FALSE 0.230 70.000 0.000 NA   NA
 252359 252360 XCC1043 XCC1044   pbpC FALSE 0.254 105.000 0.000 NA   NA
 252361 252362 XCC1045 XCC1046     TRUE 0.722 43.000 0.016 0.038 N NA
 252363 252364 XCC1047 XCC1048 hspA cbpA TRUE 0.845 143.000 0.133 NA Y NA
 252364 252365 XCC1048 XCC1049 cbpA pilH FALSE 0.145 317.000 0.111 1.000 N NA
 252365 252366 XCC1049 XCC1050 pilH hflK FALSE 0.001 972.000 0.000 1.000 N NA
 252366 252367 XCC1050 XCC1051 hflK hflC TRUE 0.999 0.000 0.947 0.009 Y NA
 252367 252368 XCC1051 XCC1052 hflC   TRUE 0.900 33.000 0.348 NA   NA
 252368 252369 XCC1052 XCC1053   purA FALSE 0.086 384.000 0.051 NA   NA
 252369 252370 XCC1053 XCC1054 purA pepN FALSE 0.046 168.000 0.000 1.000 N NA
 252370 252371 XCC1054 XCC1055 pepN   FALSE 0.251 81.000 0.000 NA   NA
 252372 252373 XCC1056 XCC1057     FALSE 0.004 1277.000 0.000 NA   NA
 252374 252375 XCC1058 XCC1059     FALSE 0.025 364.000 0.000 NA   NA
 252375 252376 XCC1059 XCC1060     FALSE 0.027 351.000 0.000 NA   NA
 252376 252377 XCC1060 XCC1061     TRUE 0.903 118.000 0.667 NA   NA
 252377 2165528 XCC1061 XCC1062     FALSE 0.025 364.000 0.000 NA   NA
 2165528 252379 XCC1062 XCC1063     TRUE 0.592 128.000 0.069 NA   NA
 252379 252380 XCC1063 XCC1064     TRUE 0.978 -16.000 0.517 NA   NA
 252380 252381 XCC1064 XCC1065     TRUE 0.693 96.000 0.118 NA   NA
 252381 252382 XCC1065 XCC1066     TRUE 0.994 7.000 1.000 NA   NA
 252382 252383 XCC1066 XCC1067     FALSE 0.315 38.000 0.000 NA   NA
 252383 252384 XCC1067 XCC1068     TRUE 0.995 2.000 0.354 0.075   NA
 252384 252385 XCC1068 XCC1069     TRUE 0.991 0.000 0.135 0.075   NA
 252385 252386 XCC1069 XCC1070     FALSE 0.032 328.000 0.000 NA   NA
 252386 252387 XCC1070 XCC1071     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 252391 252392 XCC1075 XCC1076     TRUE 0.984 2.000 0.013 NA Y NA
 252392 2165531 XCC1076 XCC1077   srfJ FALSE 0.003 585.000 0.000 NA N NA
 252394 252395 XCC1078 XCC1079     TRUE 0.985 -3.000 0.250 1.000 N NA
 252397 252398 XCC1081 XCC1082     FALSE 0.189 144.000 0.000 1.000   NA
 252399 2165532 XCC1083 XCC1084   trxB FALSE 0.052 172.000 0.000 NA N NA
 2165532 252401 XCC1084 XCC1085 trxB   TRUE 0.981 -3.000 0.125 1.000   NA
 252403 252404 XCC1087 XCC1088   uvrA2 FALSE 0.240 104.000 0.000 1.000   NA
 252404 2165533 XCC1088 XCC1089 uvrA2   FALSE 0.011 532.000 0.000 1.000   NA
 252406 252407 XCC1090 XCC1091 bglX   FALSE 0.011 296.000 0.000 1.000 N NA
 252407 252408 XCC1091 XCC1092     TRUE 1.000 -3.000 0.943 0.002 Y NA
 252408 252409 XCC1092 XCC1093     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.051 Y NA
 252410 252411 XCC1094 XCC1095     TRUE 0.959 -3.000 0.021 NA   NA
 252411 252412 XCC1095 XCC1096   tcmJ TRUE 0.531 70.000 0.038 NA   NA
 252412 252413 XCC1096 XCC1097 tcmJ   FALSE 0.409 168.000 0.038 NA   NA
 252413 252414 XCC1097 XCC1098   lexA FALSE 0.047 278.000 0.000 NA   NA
 252414 252415 XCC1098 XCC1099 lexA   TRUE 0.854 50.000 0.381 NA   NA
 252415 252416 XCC1099 XCC1100     TRUE 0.989 10.000 0.667 NA   NA
 252416 252417 XCC1100 XCC1101   dnaE2 TRUE 0.599 353.000 0.500 1.000 Y NA
 252419 252420 XCC1103 XCC1104 oliA   FALSE 0.025 364.000 0.000 NA   NA
 252420 2165534 XCC1104 XCC1105     FALSE 0.015 470.000 0.000 NA   NA
 252423 252424 XCC1107 XCC1108     TRUE 0.872 117.000 0.500 NA   NA
 252425 252426 XCC1109 XCC1110 katE   FALSE 0.079 220.000 0.000 1.000   NA
 252426 252427 XCC1110 XCC1111     FALSE 0.006 824.000 0.000 NA   NA
 252427 252428 XCC1111 XCC1112   gcvP FALSE 0.010 597.000 0.000 NA   NA
 252429 252430 XCC1113 XCC1114 bcr   TRUE 0.862 17.000 0.054 NA   NA
 252431 252432 XCC1115 XCC1116     FALSE 0.020 397.000 0.000 NA   NA
 252432 252433 XCC1116 XCC1117   yjdB TRUE 0.562 119.000 0.049 1.000   NA
 252433 252434 XCC1117 XCC1118 yjdB   TRUE 0.983 -3.000 0.152 1.000   NA
 252434 2165535 XCC1118 XCC1119     TRUE 0.608 101.000 0.061 1.000   NA
 252436 252437 XCC1120 XCC1121 colR colS TRUE 0.997 -7.000 0.833 1.000 Y NA
 252438 252439 XCC1122 XCC1123   minE TRUE 0.807 16.000 0.015 NA   NA
 252439 252440 XCC1123 XCC1124 minE minD TRUE 0.997 3.000 0.618 NA Y NA
 252440 252441 XCC1124 XCC1125 minD minC TRUE 0.960 37.000 0.466 1.000 Y NA
 252441 2165536 XCC1125 XCC1126 minC   TRUE 0.922 4.000 0.013 1.000   NA
 252443 252444 XCC1127 XCC1128     TRUE 0.999 0.000 0.900 0.030 Y NA
 252444 252445 XCC1128 XCC1129     FALSE 0.009 669.000 0.000 NA   NA
 252445 252446 XCC1129 XCC1130     FALSE 0.439 64.000 0.013 NA   NA
 252446 252447 XCC1130 XCC1131     TRUE 0.529 35.000 0.008 NA   NA
 252448 252449 XCC1132 XCC1133     FALSE 0.036 311.000 0.000 NA   NA
 252449 252450 XCC1133 XCC1134     TRUE 0.958 -3.000 0.020 NA   NA
 252450 252451 XCC1134 XCC1135     TRUE 0.958 -3.000 0.020 NA   NA
 252451 2165537 XCC1135 XCC1136     TRUE 0.901 10.000 0.018 NA   NA
 252454 252455 XCC1138 XCC1139     TRUE 0.958 27.000 0.667 NA   NA
 252455 252456 XCC1139 XCC1140     FALSE 0.032 328.000 0.000 NA   NA
 252456 252457 XCC1140 XCC1141   ate1 TRUE 0.782 -39.000 0.014 NA   NA
 252459 252460 XCC1143 XCC1144 rfaY   FALSE 0.023 374.000 0.000 NA   NA
 252460 252461 XCC1144 XCC1145   tesB FALSE 0.156 264.000 0.026 NA   NA
 252461 252462 XCC1145 XCC1146 tesB   TRUE 0.784 55.000 0.021 1.000 Y NA
 252462 252463 XCC1146 XCC1147     FALSE 0.065 234.000 0.000 1.000   NA
 252463 252464 XCC1147 XCC1148   uvrA1 TRUE 0.928 0.000 0.005 1.000   NA
 252465 252466 XCC1149 XCC1150 rplU rpmA TRUE 0.997 13.000 0.667 0.014 Y NA
 252466 252467 XCC1150 XCC1151 rpmA yhbZ FALSE 0.484 251.000 0.335 1.000   NA
 252469 252470 XCC1153 XCC1154 mviN ribF FALSE 0.374 238.000 0.169 1.000   NA
 252470 252471 XCC1154 XCC1155 ribF ileS TRUE 0.971 7.000 0.254 1.000 N NA
 252471 252472 XCC1155 XCC1156 ileS lspA FALSE 0.239 267.000 0.147 1.000 N NA
 252472 252473 XCC1156 XCC1157 lspA lytB TRUE 0.833 136.000 0.095 1.000 Y NA
 252473 399348 XCC1157 XCC1158 lytB tRNA-Thr FALSE 0.122 184.000 0.000 NA   NA
 399348 252474 XCC1158 XCC1159 tRNA-Thr cyoA FALSE 0.026 355.000 0.000 NA   NA
 252474 252475 XCC1159 XCC1160 cyoA cyoB TRUE 0.996 -10.000 0.385 0.008 Y NA
 252475 252476 XCC1160 XCC1161 cyoB cyoC TRUE 0.998 3.000 0.385 0.051 Y NA
 252476 252477 XCC1161 XCC1162 cyoC cyoD TRUE 0.999 0.000 0.917 0.051 Y NA
 252477 252478 XCC1162 XCC1163 cyoD   FALSE 0.196 340.000 0.167 1.000   NA
 252478 2165538 XCC1163 XCC1164   radA FALSE 0.047 585.000 0.000 0.042   NA
 2165538 252480 XCC1164 XCC1165 radA   FALSE 0.031 326.000 0.000 1.000   NA
 252482 252483 XCC1167 XCC1168 hrpXct hsp90xc FALSE 0.011 301.000 0.000 1.000 N NA
 252483 252484 XCC1168 XCC1169 hsp90xc   TRUE 0.967 23.000 0.727 1.000   NA
 252486 252487 XCC1171 XCC1172 rsbR rsbS TRUE 0.996 2.000 0.361 NA Y NA
 252487 252488 XCC1172 XCC1173 rsbS rsbT TRUE 0.997 -3.000 0.454 NA Y NA
 252488 252489 XCC1173 XCC1174 rsbT   TRUE 0.997 -9.000 0.522 0.093 Y NA
 252489 2165539 XCC1174 XCC1175     TRUE 0.998 -3.000 0.261 0.093 Y NA
 2165539 252491 XCC1175 XCC1176   cvgSY TRUE 0.992 -13.000 0.167 0.015 Y NA
 252491 252492 XCC1176 XCC1177 cvgSY   FALSE 0.008 672.000 0.000 1.000   NA
 252495 252496 XCC1180 XCC1181 trx   FALSE 0.420 176.000 0.059 NA   NA
 252496 252497 XCC1181 XCC1182     FALSE 0.124 182.000 0.000 NA   NA
 252497 252498 XCC1182 XCC1183   cheB TRUE 0.985 -3.000 0.176 1.000   NA
 252498 252499 XCC1183 XCC1184 cheB cheR TRUE 0.993 -3.000 0.416 1.000   NA
 252499 252500 XCC1184 XCC1185 cheR   TRUE 0.994 -3.000 0.156 1.000 Y NA
 2165541 252502 XCC1186 XCC1187     TRUE 0.995 -7.000 0.200 0.030 Y NA
 252503 252504 XCC1188 XCC1189 lamA   FALSE 0.073 230.000 0.000 NA   NA
 252509 252510 XCC1194 XCC1195 ffh   TRUE 0.624 22.000 0.002 NA   NA
 252510 252511 XCC1195 XCC1196     FALSE 0.055 259.000 0.000 NA   NA
 252511 252512 XCC1196 XCC1197     TRUE 0.860 2.000 0.000 NA   NA
 252512 252513 XCC1197 XCC1198     TRUE 0.916 -9.000 0.045 1.000   NA
 252513 252514 XCC1198 XCC1199   rpsP FALSE 0.239 109.000 0.004 1.000 N NA
 252514 252515 XCC1199 XCC1200 rpsP rimM TRUE 0.975 44.000 0.342 0.014 Y NA
 252515 252516 XCC1200 XCC1201 rimM trmD TRUE 0.959 65.000 0.672 1.000 Y NA
 252516 252517 XCC1201 XCC1202 trmD rplS TRUE 0.939 145.000 0.567 1.000 Y NA
 252520 252521 XCC1205 XCC1206 katG   FALSE 0.035 308.000 0.000 1.000   NA
 252521 252522 XCC1206 XCC1207   mutS FALSE 0.011 520.000 0.000 1.000   NA
 252523 2165542 XCC1208 XCC1209     FALSE 0.046 283.000 0.000 NA   NA
 2165542 252525 XCC1209 XCC1210     FALSE 0.074 225.000 0.000 1.000   NA
 252525 252526 XCC1210 XCC1211     TRUE 0.667 143.000 0.214 NA N NA
 252526 252527 XCC1211 XCC1212   nifS TRUE 0.776 36.000 0.188 NA N NA
 252527 252528 XCC1212 XCC1213 nifS ucpA TRUE 0.992 -3.000 0.188 0.063 N NA
 252528 252529 XCC1213 XCC1214 ucpA   TRUE 0.945 12.000 0.188 1.000 N NA
 252531 252532 XCC1216 XCC1217   hrpF FALSE 0.005 1010.000 0.000 1.000   NA
 252532 252533 XCC1217 XCC1218 hrpF   FALSE 0.223 130.000 0.000 NA   NA
 2165543 252535 XCC1219 XCC1220 hrpW hpaB FALSE 0.047 272.000 0.000 1.000   NA
 252535 252536 XCC1220 XCC1221 hpaB hrpE TRUE 0.934 56.000 1.000 NA   NA
 252536 252537 XCC1221 XCC1222 hrpE hrpD6 TRUE 0.937 86.000 1.000 NA   NA
 252537 252538 XCC1222 XCC1223 hrpD6 hrpD5 TRUE 0.980 11.000 0.400 NA   NA
 252538 252539 XCC1223 XCC1224 hrpD5 hpaA TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 252539 252540 XCC1224 XCC1225 hpaA hrcS TRUE 0.982 -3.000 0.133 NA   NA
 252540 252541 XCC1225 XCC1226 hrcS hrcR TRUE 0.987 23.000 0.267 0.010 Y NA
 252541 252542 XCC1226 XCC1227 hrcR hrcQ TRUE 0.982 -13.000 0.182 1.000 Y NA
 252542 252543 XCC1227 XCC1228 hrcQ hpaP TRUE 0.772 133.000 0.273 NA   NA
 252543 252544 XCC1228 XCC1229 hpaP hrcV TRUE 0.939 24.000 0.400 NA   NA
 252544 252545 XCC1229 XCC1230 hrcV hrcU TRUE 0.998 9.000 0.500 0.010 Y NA
 252546 252547 XCC1231 XCC1232 hrpB1 hrpB2 TRUE 0.942 32.000 0.600 NA   NA
 252547 252548 XCC1232 XCC1233 hrpB2 hrcJ TRUE 0.996 2.000 0.833 NA   NA
 252548 252549 XCC1233 XCC1234 hrcJ hrpB4 TRUE 0.992 10.000 0.833 NA   NA
 252549 252550 XCC1234 XCC1235 hrpB4 hrpB5 TRUE 0.965 -15.000 0.312 NA   NA
 252550 252551 XCC1235 XCC1236 hrpB5 hrcN TRUE 0.989 -10.000 0.312 NA Y NA
 252551 252552 XCC1236 XCC1237 hrcN hrpB7 TRUE 0.991 -7.000 0.800 NA   NA
 252552 252553 XCC1237 XCC1238 hrpB7 hrcT TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 252553 252554 XCC1238 XCC1239 hrcT hrcC TRUE 0.941 177.000 1.000 1.000 Y NA
 252557 252558 XCC1242 XCC1243     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 252558 252559 XCC1243 XCC1244     FALSE 0.013 509.000 0.000 NA   NA
 252559 252560 XCC1244 XCC1245     FALSE 0.488 -133.000 0.000 NA   NA
 252560 252561 XCC1245 XCC1246     FALSE 0.037 310.000 0.000 NA   NA
 2165544 252563 XCC1247 XCC1248     FALSE 0.256 85.000 0.000 NA   NA
 252565 252566 XCC1250 XCC1251 bglX   FALSE 0.469 270.000 0.000 0.026 Y NA
 252566 252567 XCC1251 XCC1252     TRUE 0.529 191.000 0.182 NA   NA
 252568 252569 XCC1253 XCC1254     FALSE 0.231 67.000 0.000 NA   NA
 252571 252572 XCC1256 XCC1257 bga galA TRUE 0.989 -216.000 0.400 0.014 Y NA
 252572 252573 XCC1257 XCC1258 galA btuB TRUE 0.653 168.000 0.222 1.000   NA
 252573 252574 XCC1258 XCC1259 btuB   FALSE 0.023 360.000 0.000 1.000   NA
 252575 252576 XCC1260 XCC1261 mmsA fadE9 TRUE 0.740 16.000 0.019 1.000 N NA
 252576 252577 XCC1261 XCC1262 fadE9 paaF TRUE 0.996 -3.000 0.242 1.000 Y NA
 252577 252578 XCC1262 XCC1263 paaF   TRUE 0.991 33.000 0.627 0.002 Y NA
 252578 252579 XCC1263 XCC1264   mmsB TRUE 0.991 17.000 0.687 1.000 Y NA
 252579 252580 XCC1264 XCC1265 mmsB czcD FALSE 0.003 551.000 0.000 1.000 N NA
 252582 252583 XCC1267 XCC1268 algU   TRUE 0.995 -3.000 0.705 NA N NA
 252583 252584 XCC1268 XCC1269   mucD FALSE 0.459 110.000 0.035 NA N NA
 252584 252585 XCC1269 XCC1270 mucD lepA FALSE 0.173 166.000 0.007 1.000 N NA
 252585 252586 XCC1270 XCC1271 lepA lepB TRUE 0.698 104.000 0.187 1.000 N NA
 252586 252587 XCC1271 XCC1272 lepB   TRUE 0.967 1.000 0.053 NA   NA
 252587 252588 XCC1272 XCC1273   rnc TRUE 0.862 -10.000 0.013 NA   NA
 252588 252589 XCC1273 XCC1274 rnc era TRUE 0.985 -3.000 0.017 0.041   NA
 252589 252590 XCC1274 XCC1275 era recO FALSE 0.142 240.000 0.012 1.000   NA
 252594 252595 XCC1279 XCC1280   frnE FALSE 0.485 77.000 0.021 1.000   NA
 252595 252596 XCC1280 XCC1281 frnE   TRUE 0.656 29.000 0.017 1.000   NA
 252596 252597 XCC1281 XCC1282     FALSE 0.293 171.000 0.013 1.000   NA
 252597 252598 XCC1282 XCC1283   nagZ FALSE 0.017 408.000 0.000 1.000   NA
 252598 252599 XCC1283 XCC1284 nagZ hpt TRUE 0.945 0.000 0.034 1.000 N NA
 252599 252600 XCC1284 XCC1285 hpt deoD TRUE 0.943 89.000 0.067 0.002 Y NA
 252600 252601 XCC1285 XCC1286 deoD scoF FALSE 0.340 87.000 0.013 1.000 N NA
 252601 252602 XCC1286 XCC1287 scoF   TRUE 0.609 97.000 0.107 1.000 N NA
 252603 252604 XCC1288 XCC1289   lhr2 TRUE 0.992 2.000 0.460 1.000   NA
 252604 252605 XCC1289 XCC1290 lhr2 lig2 TRUE 0.993 -3.000 0.214 0.093   NA
 252605 252606 XCC1290 XCC1291 lig2   TRUE 0.698 227.000 0.751 NA N NA
 252606 252607 XCC1291 XCC1292     FALSE 0.016 443.000 0.000 NA   NA
 252607 252608 XCC1292 XCC1293     TRUE 0.887 150.000 0.750 NA   NA
 252608 252609 XCC1293 XCC1294     TRUE 0.837 70.000 0.500 NA N NA
 252609 252610 XCC1294 XCC1295     TRUE 0.882 144.000 0.667 NA   NA
 252610 252611 XCC1295 XCC1296     FALSE 0.059 252.000 0.000 NA   NA
 252611 252612 XCC1296 XCC1297   atoB TRUE 0.762 124.000 0.222 NA   NA
 252614 252615 XCC1299 XCC1300 leu   FALSE 0.165 158.000 0.000 1.000   NA
 252615 252616 XCC1300 XCC1301     FALSE 0.205 141.000 0.000 NA   NA
 252621 252622 XCC1306 XCC1307 algU   TRUE 0.977 -3.000 0.087 NA   NA
 252622 252623 XCC1307 XCC1308     TRUE 0.714 12.000 0.000 NA   NA
 252624 252625 XCC1309 XCC1310 yegD slyD TRUE 0.722 131.000 0.009 1.000 Y NA
 252625 252626 XCC1310 XCC1311 slyD catA FALSE 0.053 158.000 0.000 1.000 N NA
 252628 252629 XCC1313 XCC1314     FALSE 0.012 529.000 0.000 NA   NA
 252629 252630 XCC1314 XCC1315   nerA FALSE 0.018 417.000 0.000 NA   NA
 252631 252632 XCC1316 XCC1317 araJ   FALSE 0.135 176.000 0.000 NA   NA
 252632 252633 XCC1317 XCC1318     FALSE 0.066 240.000 0.000 NA   NA
 252633 252634 XCC1318 XCC1319     FALSE 0.012 511.000 0.000 1.000   NA
 252634 252635 XCC1319 XCC1320     FALSE 0.481 36.000 0.005 NA   NA
 252635 252636 XCC1320 XCC1321     FALSE 0.048 276.000 0.000 NA   NA
 252636 252637 XCC1321 XCC1322   acvB FALSE 0.230 70.000 0.000 NA   NA
 252639 252640 XCC1324 XCC1325     TRUE 0.878 12.000 0.018 NA   NA
 252641 252642 XCC1326 XCC1327     TRUE 0.945 18.000 0.324 1.000   NA
 252642 252643 XCC1327 XCC1328     TRUE 0.981 -3.000 0.113 NA   NA
 252643 2165547 XCC1328 XCC1329   cfaA TRUE 0.978 -3.000 0.087 NA   NA
 2165547 252645 XCC1329 XCC1330 cfaA   TRUE 0.972 -3.000 0.053 NA   NA
 252645 252646 XCC1330 XCC1331     TRUE 0.974 -75.000 0.722 NA   NA
 252646 252647 XCC1331 XCC1332   desC TRUE 0.969 -3.000 0.047 1.000   NA
 252647 252648 XCC1332 XCC1333 desC   FALSE 0.037 309.000 0.000 NA   NA
 252648 252649 XCC1333 XCC1334   rpoE TRUE 0.969 -15.000 0.349 NA   NA
 252649 252650 XCC1334 XCC1335 rpoE   TRUE 0.573 59.000 0.048 NA   NA
 252650 252651 XCC1335 XCC1336     TRUE 0.955 -22.000 0.286 NA   NA
 252651 252652 XCC1336 XCC1337   ydgM FALSE 0.015 474.000 0.000 NA   NA
 252652 252653 XCC1337 XCC1338 ydgM cicA TRUE 0.796 12.000 0.014 1.000 N NA
 252653 252654 XCC1338 XCC1339 cicA metS FALSE 0.053 159.000 0.000 1.000 N NA
 252654 252655 XCC1339 XCC1340 metS btuB FALSE 0.195 140.000 0.000 1.000   NA
 252655 252656 XCC1340 XCC1341 btuB   FALSE 0.015 475.000 0.000 NA   NA
 252656 252657 XCC1341 XCC1342     FALSE 0.311 164.000 0.010 NA   NA
 252658 252659 XCC1343 XCC1344 ykfD mmuM TRUE 0.994 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 2165548 252661 XCC1345 XCC1346     FALSE 0.264 211.000 0.032 NA   NA
 252661 252662 XCC1346 XCC1347     TRUE 0.793 -49.000 0.020 NA   NA
 2165549 252664 XCC1348 XCC1349     FALSE 0.520 -81.000 0.000 NA   NA
 252666 252667 XCC1351 XCC1352     TRUE 0.993 -3.000 0.417 NA   NA
 2165550 252669 XCC1353 XCC1354 phaZ   FALSE 0.467 146.000 0.034 NA   NA
 252671 252672 XCC1356 XCC1357   accA FALSE 0.350 58.000 0.003 1.000   NA
 252672 252673 XCC1357 XCC1358 accA dnaE1 FALSE 0.520 155.000 0.122 1.000 N NA
 252673 252674 XCC1358 XCC1359 dnaE1 rnhB TRUE 0.578 237.000 0.104 1.000 Y NA
 252674 252675 XCC1359 XCC1360 rnhB lpxB TRUE 0.981 -3.000 0.186 1.000 N NA
 252675 252676 XCC1360 XCC1361 lpxB lpxA TRUE 0.915 117.000 0.289 1.000 Y NA
 252676 252677 XCC1361 XCC1362 lpxA fabZ TRUE 0.655 22.000 0.022 1.000 N NA
 252677 252678 XCC1362 XCC1363 fabZ lpxD TRUE 0.934 -3.000 0.019 1.000 N NA
 252680 252681 XCC1365 XCC1366 oma   TRUE 0.985 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 252681 252682 XCC1366 XCC1367   dxr TRUE 0.936 27.000 0.568 1.000 N NA
 252682 252683 XCC1367 XCC1368 dxr cdsA TRUE 0.996 3.000 0.372 1.000 Y NA
 252683 252684 XCC1368 XCC1369 cdsA uppS TRUE 0.997 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 252684 252685 XCC1369 XCC1370 uppS frr TRUE 0.988 3.000 0.409 1.000 N NA
 252685 252686 XCC1370 XCC1371 frr pyrH TRUE 0.615 237.000 0.626 1.000 N NA
 252686 252687 XCC1371 XCC1372 pyrH   FALSE 0.082 108.000 0.000 1.000 N NA
 252687 252688 XCC1372 XCC1373     TRUE 0.980 -3.000 0.000 NA Y NA
 252688 252689 XCC1373 XCC1374   tsf FALSE 0.025 345.000 0.002 NA N NA
 252689 252690 XCC1374 XCC1375 tsf rpsB TRUE 0.934 171.000 0.748 1.000 Y NA
 252690 252691 XCC1375 XCC1376 rpsB   FALSE 0.014 298.000 0.000 NA N NA
 252691 252692 XCC1376 XCC1377     TRUE 0.993 2.000 0.500 NA   NA
 252692 252693 XCC1377 XCC1378     TRUE 0.816 67.000 0.333 NA   NA
 252693 2165551 XCC1378 XCC1379   fasD TRUE 0.969 -24.000 0.444 NA   NA
 2165551 252695 XCC1379 XCC1380 fasD ecpD TRUE 0.991 17.000 0.667 NA Y NA
 252695 252696 XCC1380 XCC1381 ecpD pru TRUE 0.981 -3.000 0.125 NA   NA
 252697 252698 XCC1382 XCC1383 map glnD TRUE 0.975 -3.000 0.128 1.000 N NA
 252698 2165552 XCC1383 XCC1384 glnD dapD FALSE 0.041 339.000 0.012 1.000 N NA
 2165552 252700 XCC1384 XCC1385 dapD   FALSE 0.390 102.000 0.005 NA   NA
 252700 252701 XCC1385 XCC1386     TRUE 0.937 -3.000 0.006 NA   NA
 252701 252702 XCC1386 XCC1387   dapE TRUE 0.813 40.000 0.292 1.000 N NA
 252705 252706 XCC1390 XCC1391   fhuA FALSE 0.077 227.000 0.000 NA   NA
 252706 252707 XCC1391 XCC1392 fhuA acyII FALSE 0.016 427.000 0.000 1.000   NA
 252709 252710 XCC1394 XCC1395 tpmT parC FALSE 0.011 534.000 0.000 1.000   NA
 252710 252711 XCC1395 XCC1396 parC   FALSE 0.239 61.000 0.005 1.000 N NA
 252712 252713 XCC1397 XCC1398 yybA yjcP TRUE 0.989 -3.000 0.333 1.000 N NA
 252713 252714 XCC1398 XCC1399 yjcP pmrA TRUE 0.964 11.000 0.278 1.000 N NA
 252714 252715 XCC1399 XCC1400 pmrA pmrB TRUE 0.993 7.000 0.900 1.000   NA
 399383 252718 XCC1403 XCC1404 tRNA-Leu bglS FALSE 0.202 143.000 0.000 NA   NA
 252718 252719 XCC1404 XCC1405 bglS   FALSE 0.500 119.000 0.027 1.000   NA
 2165554 252721 XCC1406 XCC1407 ygdR   TRUE 0.952 8.000 0.091 1.000   NA
 2165555 252724 XCC1409 XCC1410     TRUE 0.926 33.000 0.500 NA   NA
 252724 252725 XCC1410 XCC1411     TRUE 0.850 65.000 0.429 NA   NA
 252728 252729 XCC1414 XCC1415 fpr msbA FALSE 0.160 224.000 0.028 1.000 N NA
 252730 252731 XCC1416 XCC1417 fumB   FALSE 0.051 272.000 0.000 NA   NA
 252731 252732 XCC1417 XCC1418   gst FALSE 0.411 29.000 0.000 NA   NA
 252732 252733 XCC1418 XCC1419 gst cynT FALSE 0.494 140.000 0.077 1.000 N NA
 252734 252735 XCC1420 XCC1421     FALSE 0.364 167.000 0.021 NA   NA
 252737 252738 XCC1423 XCC1424 pcp   TRUE 0.880 120.000 0.556 1.000   NA
 252740 252741 XCC1426 XCC1427     TRUE 0.948 0.000 0.013 NA   NA
 252742 252743 XCC1428 XCC1429   gcdH TRUE 0.734 177.000 0.429 1.000   NA
 252743 252744 XCC1429 XCC1430 gcdH   TRUE 0.963 15.000 0.333 NA   NA
 252744 252745 XCC1430 XCC1431   gst FALSE 0.220 230.000 0.033 NA   NA
 252745 252746 XCC1431 XCC1432 gst wbpS TRUE 0.665 23.000 0.028 1.000 N NA
 252746 252747 XCC1432 XCC1433 wbpS   TRUE 0.566 75.000 0.048 NA   NA
 252747 252748 XCC1433 XCC1434   dnaB FALSE 0.292 189.000 0.024 NA   NA
 252748 252749 XCC1434 XCC1435 dnaB phr FALSE 0.341 255.000 0.006 1.000 Y NA
 252749 252750 XCC1435 XCC1436 phr   FALSE 0.205 134.000 0.004 1.000 N NA
 252752 252753 XCC1438 XCC1439 dauE mexE TRUE 0.943 -3.000 0.009 1.000   NA
 252753 252754 XCC1439 XCC1440 mexE mexF TRUE 0.792 182.000 0.750 1.000 N NA
 252754 252755 XCC1440 XCC1441 mexF   TRUE 0.769 34.000 0.160 1.000 N NA
 252755 252756 XCC1441 XCC1442   oprN TRUE 0.953 -6.000 0.160 1.000 N NA
 252760 252761 XCC1446 XCC1447     FALSE 0.039 302.000 0.000 NA   NA
 252761 252762 XCC1447 XCC1448     FALSE 0.006 899.000 0.000 NA   NA
 252762 252763 XCC1448 XCC1449     FALSE 0.214 137.000 0.000 NA   NA
 252763 252764 XCC1449 XCC1450     FALSE 0.521 20.000 0.000 NA   NA
 252764 252765 XCC1450 XCC1451     TRUE 0.974 5.000 0.171 NA   NA
 252765 252766 XCC1451 XCC1452     TRUE 0.864 144.000 0.579 NA   NA
 252766 2165556 XCC1452 XCC1453     FALSE 0.072 1269.000 0.390 NA   NA
 2165556 2165557 XCC1453 XCC1454     FALSE 0.064 441.000 0.000 0.072   NA
 2165558 252770 XCC1455 XCC1456     TRUE 0.779 -186.000 0.000 0.072   NA
 252772 252773 XCC1458 XCC1459     TRUE 0.592 -31.000 0.000 NA   NA
 2165559 252775 XCC1460 XCC1461 orf35 repA FALSE 0.006 771.000 0.000 1.000   NA
 252775 2165560 XCC1461 XCC1462 repA   FALSE 0.005 1236.000 0.000 NA   NA
 2165560 252777 XCC1462 XCC1463     FALSE 0.005 1167.000 0.000 NA   NA
 252780 252781 XCC1467 XCC1468     TRUE 0.964 3.000 0.063 NA   NA
 252785 252786 XCC1472 XCC1473 hrcA grpE TRUE 0.622 26.000 0.025 1.000 N NA
 252786 252787 XCC1473 XCC1474 grpE dnaK TRUE 0.908 142.000 0.049 0.007 Y NA
 252787 252788 XCC1474 XCC1475 dnaK dnaJ TRUE 0.958 139.000 0.236 0.003 Y NA
 252788 252789 XCC1475 XCC1476 dnaJ pdxY FALSE 0.006 375.000 0.000 1.000 N NA
 252789 252790 XCC1476 XCC1477 pdxY tyrA TRUE 0.894 -3.000 0.007 1.000 N NA
 252791 252792 XCC1478 XCC1479     TRUE 0.995 -3.000 0.714 1.000 N NA
 252792 252793 XCC1479 XCC1480     TRUE 0.987 -16.000 0.351 1.000 Y NA
 252793 252794 XCC1480 XCC1481   oxyR FALSE 0.394 89.000 0.021 1.000 N NA
 252794 252795 XCC1481 XCC1482 oxyR draA FALSE 0.082 96.000 0.000 1.000 N NA
 252795 2165562 XCC1482 XCC1483 draA   TRUE 0.947 -3.000 0.012 1.000   NA
 2165562 252797 XCC1483 XCC1484     FALSE 0.084 221.000 0.000 NA   NA
 252797 252798 XCC1484 XCC1485   ldp FALSE 0.400 61.000 0.008 NA   NA
 252798 252799 XCC1485 XCC1486 ldp sucB TRUE 0.882 147.000 0.253 1.000 Y NA
 252799 2165563 XCC1486 XCC1487 sucB odhA TRUE 0.968 43.000 0.667 1.000 Y NA
 2165563 252801 XCC1487 XCC1488 odhA   FALSE 0.118 181.000 0.000 1.000   NA
 252801 252802 XCC1488 XCC1489     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 252802 252803 XCC1489 XCC1490     FALSE 0.146 171.000 0.000 NA   NA
 252803 2165564 XCC1490 XCC1491     FALSE 0.055 260.000 0.000 NA   NA
 2165564 252805 XCC1491 XCC1492   purB FALSE 0.058 253.000 0.000 NA   NA
 252805 252806 XCC1492 XCC1493 purB   FALSE 0.331 36.000 0.000 NA   NA
 252808 252809 XCC1495 XCC1496     TRUE 0.840 72.000 0.400 NA   NA
 252809 252810 XCC1496 XCC1497     TRUE 0.885 28.000 0.222 NA   NA
 252810 252811 XCC1497 XCC1498     TRUE 0.973 10.000 0.250 NA   NA
 252811 252812 XCC1498 XCC1499   nodI TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 252812 252813 XCC1499 XCC1500 nodI   TRUE 0.992 -3.000 0.500 1.000 N NA
 252814 252815 XCC1501 XCC1502 btuE fkpA TRUE 0.732 161.000 0.042 1.000 Y NA
 252815 252816 XCC1502 XCC1503 fkpA ugd TRUE 0.912 25.000 0.357 1.000 N NA
 252816 252817 XCC1503 XCC1504 ugd   TRUE 0.902 -7.000 0.020 NA   NA
 252817 252818 XCC1504 XCC1505     TRUE 0.954 1.000 0.024 NA   NA
 252818 252819 XCC1505 XCC1506     FALSE 0.058 254.000 0.000 NA   NA
 252819 252820 XCC1506 XCC1507     FALSE 0.165 314.000 0.077 NA   NA
 252820 252821 XCC1507 XCC1508   fucP TRUE 0.903 14.000 0.115 1.000 N NA
 252821 252822 XCC1508 XCC1509 fucP scrK TRUE 0.976 -75.000 0.308 1.000 Y NA
 252822 252823 XCC1509 XCC1510 scrK   TRUE 0.990 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 252824 252825 XCC1511 XCC1512 metH2 metH1 TRUE 0.919 83.000 0.009 0.001 Y NA
 252825 252826 XCC1512 XCC1513 metH1   TRUE 0.929 -3.000 0.017 1.000 N NA
 252827 252828 XCC1514 XCC1515 acdA   FALSE 0.001 1256.000 0.000 1.000 N NA
 2165565 252830 XCC1517 XCC1518 vacB   FALSE 0.340 127.000 0.004 1.000   NA
 252830 252831 XCC1518 XCC1519     FALSE 0.055 317.000 0.002 1.000   NA
 252831 2165566 XCC1519 XCC1520     FALSE 0.051 248.000 0.002 1.000 N NA
 252833 252834 XCC1521 XCC1522 rnt   FALSE 0.208 140.000 0.000 NA   NA
 252834 252835 XCC1522 XCC1523   phoU TRUE 0.610 135.000 0.087 NA   NA
 252835 2165567 XCC1523 XCC1524 phoU pstB TRUE 0.797 121.000 0.034 NA Y NA
 2165567 252837 XCC1524 XCC1525 pstB pstA TRUE 0.994 23.000 0.526 0.002 Y NA
 252837 252838 XCC1525 XCC1526 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.002 Y NA
 252838 252839 XCC1526 XCC1527 pstC pstS TRUE 0.929 113.000 0.033 0.002 Y NA
 252839 252840 XCC1527 XCC1528 pstS phoX TRUE 0.944 178.000 0.333 0.002 Y NA
 252840 252841 XCC1528 XCC1529 phoX oprO TRUE 0.964 120.000 0.750 NA Y NA
 252842 252843 XCC1530 XCC1531 cynT ychM TRUE 0.971 13.000 0.069 1.000 Y NA
 252844 252845 XCC1532 XCC1533 nth   TRUE 0.937 -3.000 0.005 NA   NA
 252845 252846 XCC1533 XCC1534   crt TRUE 0.959 11.000 0.160 NA   NA
 252847 252848 XCC1535 XCC1536     TRUE 0.524 91.000 0.028 1.000   NA
 252848 252849 XCC1536 XCC1537   sseA TRUE 0.957 -3.000 0.021 1.000   NA
 252849 252850 XCC1537 XCC1538 sseA   FALSE 0.430 74.000 0.012 NA   NA
 252852 252853 XCC1540 XCC1541     TRUE 0.963 -3.000 0.029 NA   NA
 252853 252854 XCC1541 XCC1542     TRUE 0.600 45.000 0.040 NA   NA
 252854 252855 XCC1542 XCC1543     FALSE 0.137 175.000 0.000 NA   NA
 252855 252856 XCC1543 XCC1544     FALSE 0.024 366.000 0.000 NA   NA
 252856 2165568 XCC1544 XCC1545     FALSE 0.231 171.000 0.004 1.000   NA
 2165568 252858 XCC1545 XCC1546     FALSE 0.026 212.000 0.000 1.000 N NA
 252858 252859 XCC1546 XCC1547     FALSE 0.292 201.000 0.036 1.000   NA
 252859 252860 XCC1547 XCC1548     TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000   NA
 252861 252862 XCC1549 XCC1550     TRUE 0.710 113.000 0.139 NA   NA
 252862 252863 XCC1550 XCC1551   sbcB TRUE 0.965 -3.000 0.034 NA   NA
 252863 252864 XCC1551 XCC1552 sbcB   FALSE 0.041 367.000 0.017 1.000 N NA
 252864 2165569 XCC1552 XCC1553     TRUE 0.607 50.000 0.100 1.000 N NA
 2165569 2165570 XCC1553 XCC1554     TRUE 0.730 33.000 0.060 NA   NA
 2165570 252867 XCC1554 XCC1555   haaO FALSE 0.475 63.000 0.019 NA   NA
 252867 252868 XCC1555 XCC1556 haaO yadF FALSE 0.502 76.000 0.027 1.000   NA
 252868 252869 XCC1556 XCC1557 yadF paiB FALSE 0.400 94.000 0.022 1.000 N NA
 252869 252870 XCC1557 XCC1558 paiB   TRUE 0.976 2.000 0.116 NA   NA
 252870 252871 XCC1558 XCC1559     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 252871 252872 XCC1559 XCC1560     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 252872 252873 XCC1560 XCC1561   asnS TRUE 0.532 32.000 0.005 NA   NA
 252874 252875 XCC1562 XCC1563   rpsF FALSE 0.027 349.000 0.000 NA   NA
 252875 252876 XCC1563 XCC1564 rpsF rpsR TRUE 0.996 12.000 0.319 0.014 Y NA
 252876 252877 XCC1564 XCC1565 rpsR rplI TRUE 0.847 293.000 0.499 0.014 Y NA
 252877 252878 XCC1565 XCC1566 rplI   FALSE 0.035 316.000 0.000 NA   NA
 252878 252879 XCC1566 XCC1567   smc TRUE 0.802 6.000 0.000 NA   NA
 252879 252880 XCC1567 XCC1568 smc zipA TRUE 0.944 57.000 0.115 0.008 Y NA
 252882 252883 XCC1570 XCC1571 lig1 lysS TRUE 0.879 -3.000 0.004 1.000 N NA
 252883 252884 XCC1571 XCC1572 lysS   FALSE 0.353 172.000 0.026 NA   NA
 252884 252885 XCC1572 XCC1573     FALSE 0.448 48.000 0.009 NA   NA
 252885 252886 XCC1573 XCC1574   gyrA FALSE 0.103 210.000 0.007 1.000 N NA
 252886 252887 XCC1574 XCC1575 gyrA gcd FALSE 0.094 193.000 0.002 1.000 N NA
 2165571 2165572 XCC1576 XCC1577   hutU FALSE 0.032 472.000 0.008 NA   NA
 2165572 252890 XCC1577 XCC1578 hutU hutG TRUE 0.959 16.000 0.061 1.000 Y NA
 252890 252891 XCC1578 XCC1579 hutG hutH TRUE 0.870 35.000 0.039 1.000 Y NA
 252891 2165573 XCC1579 XCC1581 hutH hutI TRUE 0.974 13.000 0.192 0.035 N NA
 2165574 2165575 XCC1580 XCC1582 sdeB hutC FALSE 0.422 86.000 0.027 1.000 N NA
 252895 252896 XCC1583 XCC1584   phaF FALSE 0.281 242.000 0.087 NA   NA
 252896 252898 XCC1584 XCC1586 phaF   TRUE 0.625 136.000 0.095 NA   NA
 252899 252900 XCC1587 XCC1588     TRUE 0.942 152.000 0.790 0.049   NA
 252901 252902 XCC1589 XCC1590 serC pheA TRUE 0.876 49.000 0.121 1.000 Y NA
 252902 252903 XCC1590 XCC1591 pheA aroA TRUE 0.799 116.000 0.035 1.000 Y NA
 252904 252905 XCC1592 XCC1593     TRUE 0.707 81.000 0.000 0.003   NA
 252906 252907 XCC1594 XCC1595 serS   FALSE 0.013 278.000 0.000 1.000 N NA
 252907 399349 XCC1595 XCC1596   tRNA-Ser FALSE 0.142 173.000 0.000 NA   NA
 399349 2165577 XCC1596 XCC1597 tRNA-Ser   FALSE 0.178 156.000 0.000 NA   NA
 2165577 252909 XCC1597 XCC1598   mbtG FALSE 0.256 87.000 0.000 NA   NA
 252910 252911 XCC1599 XCC1600 yme   FALSE 0.013 509.000 0.000 NA   NA
 252911 252912 XCC1600 XCC1601     FALSE 0.066 240.000 0.000 NA   NA
 252912 252913 XCC1601 XCC1602     TRUE 0.982 18.000 1.000 NA   NA
 252913 252914 XCC1602 XCC1603     TRUE 0.942 46.000 1.000 NA   NA
 252915 252916 XCC1604 XCC1605     FALSE 0.251 110.000 0.000 NA   NA
 252916 252917 XCC1605 XCC1606     FALSE 0.041 297.000 0.000 NA   NA
 252917 252918 XCC1606 XCC1607     TRUE 0.556 75.000 0.000 0.071   NA
 252919 252920 XCC1608 XCC1609     FALSE 0.011 551.000 0.000 NA   NA
 252920 252921 XCC1609 XCC1610     FALSE 0.006 918.000 0.000 NA   NA
 252923 252924 XCC1612 XCC1613 int   TRUE 0.835 26.000 0.000 0.009   NA
 252925 252926 XCC1614 XCC1615     TRUE 0.982 12.000 0.500 NA   NA
 252926 252927 XCC1615 XCC1616     FALSE 0.018 413.000 0.000 NA   NA
 252927 252928 XCC1616 XCC1617     FALSE 0.278 45.000 0.000 NA   NA
 252928 252929 XCC1617 XCC1618     FALSE 0.029 339.000 0.000 NA   NA
 252929 252930 XCC1618 XCC1619     FALSE 0.019 399.000 0.000 NA   NA
 252930 252931 XCC1619 XCC1620     TRUE 0.608 16.000 0.000 NA   NA
 252931 252932 XCC1620 XCC1621     FALSE 0.254 52.000 0.000 NA   NA
 252933 252934 XCC1622 XCC1623     FALSE 0.224 129.000 0.000 NA   NA
 252935 252936 XCC1624 XCC1625     TRUE 0.953 37.000 1.000 NA   NA
 252936 2165578 XCC1625 XCC1626     FALSE 0.303 40.000 0.000 NA   NA
 2165578 252938 XCC1626 XCC1627     FALSE 0.006 935.000 0.000 NA   NA
 252938 252939 XCC1627 XCC1628     TRUE 0.781 -186.000 0.000 0.070   NA
 252939 252940 XCC1628 XCC1629   avrXccE1 FALSE 0.008 674.000 0.000 NA   NA
 252942 252943 XCC1631 XCC1632     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 252944 252945 XCC1633 XCC1634     TRUE 0.842 45.000 0.000 0.070 Y NA
 252945 2165579 XCC1634 XCC1635     FALSE 0.315 36.000 0.000 1.000   NA
 2165579 252947 XCC1635 XCC1636     FALSE 0.041 287.000 0.000 1.000   NA
 252948 2165580 XCC1637 XCC1638 rhsD   FALSE 0.253 107.000 0.000 NA   NA
 2165580 2165581 XCC1638 XCC1639     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2165581 252951 XCC1639 XCC1640     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 252952 252953 XCC1641 XCC1642   int FALSE 0.027 773.000 0.000 0.070   NA
 252953 252954 XCC1642 XCC1643 int gtrB FALSE 0.005 973.000 0.000 NA   NA
 252954 252955 XCC1643 XCC1644 gtrB   TRUE 0.959 -45.000 0.409 NA   NA
 252955 252956 XCC1644 XCC1645     TRUE 0.969 -3.000 0.045 NA   NA
 252956 2165582 XCC1645 XCC1646     TRUE 0.565 69.000 0.051 NA   NA
 252958 252959 XCC1647 XCC1648     FALSE 0.150 170.000 0.000 NA   NA
 252965 252966 XCC1654 XCC1655   cvgSY TRUE 0.994 -43.000 0.667 0.089 Y NA
 252967 252968 XCC1656 XCC1657   cycL TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA Y NA
 252968 252969 XCC1657 XCC1658 cycL dsbE TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 252969 252970 XCC1658 XCC1659 dsbE cycK TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.003 Y NA
 252970 252971 XCC1659 XCC1660 cycK cycJ TRUE 0.896 67.000 0.008 0.003 Y NA
 252971 252972 XCC1660 XCC1661 cycJ   TRUE 0.989 -3.000 0.344 1.000 N NA
 252972 252973 XCC1661 XCC1662   ccmC TRUE 0.993 -3.000 0.501 1.000 N NA
 252973 2165584 XCC1662 XCC1663 ccmC   TRUE 0.871 9.000 0.008 1.000   NA
 2165584 252975 XCC1663 XCC1664     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 252975 252976 XCC1664 XCC1665   rpoE TRUE 0.974 -108.000 0.833 NA   NA
 252976 252977 XCC1665 XCC1666 rpoE   TRUE 0.902 63.000 0.667 NA   NA
 252977 2165585 XCC1666 XCC1667   cycA FALSE 0.426 259.000 0.286 NA   NA
 2165585 252979 XCC1667 XCC1668 cycA   TRUE 0.889 58.000 0.571 NA   NA
 252979 2165586 XCC1668 XCC1669     TRUE 0.875 57.000 0.500 NA   NA
 252981 252982 XCC1670 XCC1671     FALSE 0.502 146.000 0.047 NA   NA
 252982 252983 XCC1671 XCC1672     TRUE 0.947 -3.000 0.012 1.000   NA
 252983 252984 XCC1672 XCC1673     TRUE 0.965 -3.000 0.034 NA   NA
 252984 252985 XCC1673 XCC1674     TRUE 0.827 -43.000 0.034 NA   NA
 252985 252986 XCC1674 XCC1675     TRUE 0.989 -13.000 1.000 NA   NA
 252986 252987 XCC1675 XCC1676     FALSE 0.160 162.000 0.000 1.000   NA
 252987 252988 XCC1676 XCC1677     TRUE 0.946 1.000 0.043 1.000 N NA
 252988 252989 XCC1677 XCC1678   bioC TRUE 0.968 -3.000 0.083 1.000 N NA
 252989 252990 XCC1678 XCC1679 bioC   FALSE 0.444 125.000 0.042 1.000 N NA
 252990 252991 XCC1679 XCC1680     TRUE 0.970 -54.000 0.011 0.012 Y NA
 252992 252993 XCC1681 XCC1683     TRUE 0.894 26.000 0.222 NA   NA
 252994 252995 XCC1682 XCC1684     TRUE 0.660 103.000 0.007 0.089   NA
 2165587 252998 XCC1686 XCC1687     FALSE 0.418 61.000 0.011 1.000   NA
 252999 253000 XCC1688 XCC1689 exoD tlyC TRUE 0.799 41.000 0.200 1.000   NA
 253001 253002 XCC1690 XCC1691   pitA TRUE 0.974 10.000 0.030 NA Y NA
 253002 253003 XCC1691 XCC1692 pitA   FALSE 0.087 218.000 0.000 NA   NA
 253007 253008 XCC1696 XCC1697   pyrG FALSE 0.157 167.000 0.000 NA   NA
 253008 253009 XCC1697 XCC1698 pyrG kdsA FALSE 0.090 414.000 0.138 1.000 N NA
 253009 253010 XCC1698 XCC1699 kdsA   TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 253010 253011 XCC1699 XCC1700   eno FALSE 0.229 126.000 0.000 NA   NA
 253011 253012 XCC1700 XCC1701 eno   TRUE 0.976 4.000 0.241 1.000 N NA
 253012 253013 XCC1701 XCC1702   ispD TRUE 0.981 -3.000 0.185 1.000 N NA
 253013 253014 XCC1702 XCC1703 ispD ispF TRUE 0.995 6.000 0.419 1.000 Y NA
 253014 253015 XCC1703 XCC1704 ispF   TRUE 0.741 96.000 0.173 1.000   NA
 253017 253018 XCC1706 XCC1707 surE pcm TRUE 0.992 -3.000 0.353 1.000   NA
 253018 253019 XCC1707 XCC1708 pcm   TRUE 0.840 19.000 0.055 NA   NA
 253019 253020 XCC1708 XCC1709   nlpD TRUE 0.899 -21.000 0.074 NA   NA
 253021 253022 XCC1710 XCC1711     TRUE 0.786 17.000 0.014 NA   NA
 253023 253024 XCC1712 XCC1713 ftsJ hflB TRUE 0.536 56.000 0.066 NA N NA
 253024 253025 XCC1713 XCC1714 hflB folP FALSE 0.303 307.000 0.325 1.000 N NA
 253025 253026 XCC1714 XCC1715 folP miaA TRUE 0.902 0.000 0.009 1.000 N NA
 253026 253027 XCC1715 XCC1716 miaA hfq TRUE 0.880 77.000 0.531 1.000   NA
 253027 253028 XCC1716 XCC1717 hfq hflX TRUE 0.948 12.000 0.141 1.000   NA
 253028 253029 XCC1717 XCC1718 hflX   FALSE 0.031 412.000 0.002 NA   NA
 253029 2165589 XCC1718 XCC1719     FALSE 0.012 512.000 0.000 NA   NA
 2165589 253031 XCC1719 XCC1720   aarF FALSE 0.016 425.000 0.000 1.000   NA
 253031 253032 XCC1720 XCC1721 aarF lexA TRUE 0.864 67.000 0.500 1.000   NA
 253032 253033 XCC1721 XCC1722 lexA recA FALSE 0.409 173.000 0.005 0.070 N NA
 253033 253034 XCC1722 XCC1723 recA recX TRUE 0.804 116.000 0.296 1.000   NA
 253034 253035 XCC1723 XCC1724 recX alaS TRUE 0.649 102.000 0.085 1.000   NA
 253035 253036 XCC1724 XCC1725 alaS csrA FALSE 0.322 142.000 0.020 1.000 N NA
 253036 399350 XCC1725 XCC1726 csrA tRNA-Ser FALSE 0.256 86.000 0.000 NA   NA
 399350 253037 XCC1726 XCC1727 tRNA-Ser mcpA FALSE 0.005 1037.000 0.000 NA   NA
 253038 253039 XCC1728 XCC1729     TRUE 0.772 -6.000 0.000 NA   NA
 253040 253041 XCC1730 XCC1731     TRUE 0.803 45.000 0.222 NA   NA
 399381 399380 XCC1732 XCC1733 tRNA-Arg tRNA-Arg FALSE 0.253 97.000 0.000 NA   NA
 399380 253042 XCC1733 XCC1734 tRNA-Arg   FALSE 0.230 69.000 0.000 NA   NA
 253042 253043 XCC1734 XCC1735   thiD TRUE 0.955 -9.000 0.148 NA   NA
 253043 2165590 XCC1735 XCC1736 thiD   TRUE 0.638 52.000 0.074 NA   NA
 2165590 2165591 XCC1736 XCC1737     TRUE 0.960 0.000 0.027 NA   NA
 2165591 253046 XCC1737 XCC1738     FALSE 0.498 83.000 0.050 1.000 N NA
 253046 253047 XCC1738 XCC1739     FALSE 0.439 39.000 0.002 NA   NA
 253047 253048 XCC1739 XCC1740   gcvR TRUE 0.705 26.000 0.020 NA   NA
 253049 253050 XCC1741 XCC1742 dapA   TRUE 0.821 17.000 0.028 NA   NA
 253051 253052 XCC1743 XCC1744   dgoK TRUE 0.625 215.000 0.500 1.000 N NA
 253052 2165592 XCC1744 XCC1745 dgoK   TRUE 0.991 -3.000 0.053 NA Y NA
 2165592 253054 XCC1745 XCC1746   dgoA TRUE 0.915 -6.000 0.053 NA N NA
 253054 253055 XCC1746 XCC1747 dgoA dgoA TRUE 0.993 -3.000 0.192 0.037 N NA
 253056 253057 XCC1748 XCC1749 gbpR fhuA FALSE 0.364 258.000 0.286 1.000 N NA
 253057 253058 XCC1749 XCC1750 fhuA cirA TRUE 0.733 173.000 0.000 0.022 Y NA
 253058 253059 XCC1750 XCC1751 cirA   TRUE 0.641 106.000 0.000 0.022   NA
 253059 253060 XCC1751 XCC1752     TRUE 0.858 112.000 0.429 1.000   NA
 253060 253061 XCC1752 XCC1753     TRUE 0.861 104.000 0.429 1.000   NA
 253061 253062 XCC1753 XCC1754     TRUE 0.817 84.000 0.300 1.000   NA
 253062 2165593 XCC1754 XCC1755   xylS TRUE 0.815 249.000 0.250 0.025 Y NA
 2165593 253064 XCC1755 XCC1756 xylS   TRUE 0.664 83.000 0.094 1.000   NA
 253064 253065 XCC1756 XCC1757     TRUE 0.962 -3.000 0.029 1.000   NA
 253065 253066 XCC1757 XCC1758   xylA TRUE 0.893 37.000 0.091 1.000 Y NA
 253066 253067 XCC1758 XCC1759 xylA xylE FALSE 0.424 68.000 0.013 1.000   NA
 253067 2165594 XCC1759 XCC1760 xylE   FALSE 0.021 382.000 0.000 NA   NA
 253069 253070 XCC1761 XCC1762     FALSE 0.118 186.000 0.000 NA   NA
 253071 253072 XCC1763 XCC1764 amiC   TRUE 0.622 35.000 0.026 1.000   NA
 253073 253074 XCC1766 XCC1767 pcnB   TRUE 0.976 4.000 0.234 1.000 N NA
 253074 253075 XCC1767 XCC1768   panB TRUE 0.906 36.000 0.117 1.000 Y NA
 253075 253076 XCC1768 XCC1769 panB panC TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 253076 253077 XCC1769 XCC1770 panC panD TRUE 0.932 108.000 0.342 1.000 Y NA
 253077 253078 XCC1770 XCC1771 panD pgi TRUE 0.911 -3.000 0.011 1.000 N NA
 253078 253079 XCC1771 XCC1772 pgi   FALSE 0.214 137.000 0.000 NA   NA
 253079 2165595 XCC1772 XCC1773     FALSE 0.454 -187.000 0.000 NA   NA
 2165596 253083 XCC1775 XCC1776 celD sglT FALSE 0.222 261.000 0.071 1.000   NA
 253086 253087 XCC1779 XCC1780 regR regS TRUE 0.998 -3.000 0.682 1.000 Y NA
 253088 253089 XCC1781 XCC1782     TRUE 0.938 -19.000 0.006 1.000 Y NA
 253090 253091 XCC1783 XCC1784 proP   TRUE 0.888 -339.000 0.039 0.046   NA
 253091 253092 XCC1784 XCC1785   ygeA FALSE 0.216 195.000 0.011 1.000   NA
 253092 253093 XCC1785 XCC1786 ygeA   FALSE 0.261 145.000 0.011 NA N NA
 253093 253094 XCC1786 XCC1787   murB TRUE 0.815 -6.000 0.008 NA N NA
 253094 253095 XCC1787 XCC1788 murB pyrD TRUE 0.907 -3.000 0.009 1.000 N NA
 253095 253096 XCC1788 XCC1789 pyrD   TRUE 0.886 6.000 0.006 1.000   NA
 253096 253097 XCC1789 XCC1790     TRUE 0.983 -3.000 0.138 NA   NA
 253097 253098 XCC1790 XCC1791     FALSE 0.105 330.000 0.032 NA   NA
 399351 253099 XCC1792 XCC1793 tRNA-Arg fhaC FALSE 0.006 882.000 0.000 NA   NA
 253099 253100 XCC1793 XCC1794 fhaC fhaB TRUE 0.815 70.000 0.333 NA   NA
 253101 253102 XCC1795 XCC1796     TRUE 0.782 -186.000 0.000 0.069   NA
 253102 2165597 XCC1796 XCC1797     FALSE 0.119 361.000 0.000 0.022   NA
 2165597 253104 XCC1797 XCC1798     FALSE 0.028 949.000 0.000 0.022   NA
 253105 253106 XCC1799 XCC1800 tspO metL FALSE 0.002 724.000 0.000 1.000 N NA
 253106 253107 XCC1800 XCC1801 metL thrB TRUE 0.986 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 2165598 253110 XCC1803 XCC1804 thrC   FALSE 0.376 100.000 0.003 NA   NA
 253112 253113 XCC1806 XCC1807 hisS   FALSE 0.064 236.000 0.000 1.000   NA
 253113 253114 XCC1807 XCC1808   hisG TRUE 0.885 10.000 0.013 1.000   NA
 253114 253115 XCC1808 XCC1809 hisG hisD TRUE 0.998 -3.000 0.171 0.002 Y NA
 253115 253116 XCC1809 XCC1810 hisD hisC TRUE 0.999 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 253116 253117 XCC1810 XCC1811 hisC hisB TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.002 Y NA
 253117 253118 XCC1811 XCC1812 hisB hisH TRUE 0.998 -3.000 0.128 0.002 Y NA
 253118 253119 XCC1812 XCC1813 hisH hisA TRUE 0.998 -3.000 0.210 0.002 Y NA
 253119 253120 XCC1813 XCC1814 hisA hisF TRUE 0.998 -6.000 0.433 0.002 Y NA
 253120 253121 XCC1814 XCC1815 hisF hisI TRUE 0.997 -10.000 0.430 0.002 Y NA
 253121 2165599 XCC1815 XCC1816 hisI   FALSE 0.008 1092.000 0.003 1.000   NA
 253123 253124 XCC1817 XCC1818     FALSE 0.201 203.000 0.012 1.000   NA
 253124 253125 XCC1818 XCC1819     TRUE 0.984 3.000 0.231 1.000   NA
 253125 253126 XCC1819 XCC1820     TRUE 0.807 34.000 0.148 1.000   NA
 253126 253127 XCC1820 XCC1821   yhdG FALSE 0.022 668.000 0.041 1.000 N NA
 253127 253128 XCC1821 XCC1822 yhdG yhdG TRUE 0.987 74.000 0.833 0.003 Y NA
 253129 253130 XCC1823 XCC1824     FALSE 0.253 107.000 0.000 NA   NA
 253132 253133 XCC1826 XCC1827     TRUE 0.771 35.000 0.111 NA   NA
 253133 253134 XCC1827 XCC1828     TRUE 0.990 -3.000 0.294 NA   NA
 253135 253136 XCC1829 XCC1830   yeiP TRUE 0.964 2.000 0.051 NA   NA
 253136 253137 XCC1830 XCC1831 yeiP hadH2 TRUE 0.573 101.000 0.085 1.000 N NA
 253137 253138 XCC1831 XCC1832 hadH2 mvaB TRUE 0.808 104.000 0.125 0.059 N NA
 253138 253139 XCC1832 XCC1833 mvaB   TRUE 0.733 77.000 0.054 0.059 N NA
 253140 253141 XCC1834 XCC1835 feoA feoB TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 253141 253142 XCC1835 XCC1836 feoB   TRUE 0.954 2.000 0.028 NA   NA
 253142 253143 XCC1836 XCC1837     TRUE 0.936 25.000 0.400 NA   NA
 253143 253144 XCC1837 XCC1838   avtA FALSE 0.326 175.000 0.021 NA   NA
 253144 253145 XCC1838 XCC1839 avtA   TRUE 0.989 -3.000 0.031 0.013   NA
 253145 253146 XCC1839 XCC1840   dapB FALSE 0.223 75.000 0.000 1.000   NA
 253146 253147 XCC1840 XCC1841 dapB carA FALSE 0.467 240.000 0.034 1.000 Y NA
 253147 253148 XCC1841 XCC1842 carA   TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 253148 253149 XCC1842 XCC1843   carB FALSE 0.243 58.000 0.000 NA   NA
 253149 253150 XCC1843 XCC1844 carB greA TRUE 0.985 -3.000 0.241 1.000 N NA
 253150 253151 XCC1844 XCC1845 greA rpfE TRUE 0.920 4.000 0.011 NA   NA
 253151 253152 XCC1845 XCC1846 rpfE recJ TRUE 0.946 -3.000 0.010 NA   NA
 253153 253154 XCC1847 XCC1848 rpfI   FALSE 0.254 90.000 0.000 NA   NA
 253154 253155 XCC1848 XCC1849     TRUE 0.700 74.000 0.000 0.002   NA
 253155 253156 XCC1849 XCC1850     TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.002   NA
 253157 253158 XCC1851 XCC1852 rpfD prfB FALSE 0.056 258.000 0.000 NA   NA
 253158 253159 XCC1852 XCC1853 prfB lysU TRUE 0.836 215.000 0.162 0.035 Y NA
 253159 253160 XCC1853 XCC1854 lysU rpfG FALSE 0.214 139.000 0.005 1.000 N NA
 253160 253161 XCC1854 XCC1855 rpfG rpfH TRUE 0.978 2.000 0.133 NA   NA
 253161 253162 XCC1855 XCC1856 rpfH rpfC TRUE 0.956 8.000 0.100 NA   NA
 253163 253164 XCC1857 XCC1858 rpfF rpfB TRUE 0.856 177.000 0.108 0.059 Y NA
 253167 253168 XCC1861 XCC1862     TRUE 0.985 -3.000 0.177 NA   NA
 253168 253169 XCC1862 XCC1863   acnB FALSE 0.516 53.000 0.023 NA   NA
 253169 253170 XCC1863 XCC1864 acnB pcaD FALSE 0.190 196.000 0.007 1.000   NA
 253171 253172 XCC1865 XCC1866 pdeA cheB TRUE 0.915 108.000 0.045 0.028 Y NA
 253172 253173 XCC1866 XCC1867 cheB cheD TRUE 0.996 -3.000 0.267 1.000 Y NA
 253173 253174 XCC1867 XCC1868 cheD cheR TRUE 0.991 -3.000 0.056 1.000 Y NA
 253174 253175 XCC1868 XCC1869 cheR tsr FALSE 0.430 195.000 0.000 1.000 Y NA
 253175 253176 XCC1869 XCC1870 tsr   TRUE 0.778 80.000 0.222 NA   NA
 253176 253177 XCC1870 XCC1871   cheW FALSE 0.286 354.000 0.333 NA   NA
 253177 253178 XCC1871 XCC1872 cheW   TRUE 0.711 112.000 0.200 NA N NA
 253178 253179 XCC1872 XCC1873   tsr FALSE 0.002 967.000 0.000 NA N NA
 253179 253180 XCC1873 XCC1874 tsr   TRUE 0.927 13.000 0.000 0.014   NA
 253180 2165600 XCC1874 XCC1875   tsr FALSE 0.070 509.000 0.000 0.014   NA
 2165600 2165601 XCC1875 XCC1876 tsr tsr FALSE 0.120 738.000 0.000 0.013 Y NA
 2165601 253183 XCC1876 XCC1877 tsr   FALSE 0.255 84.000 0.000 NA   NA
 253183 2165602 XCC1877 XCC1878   tsr TRUE 0.814 5.000 0.000 NA   NA
 2165602 253185 XCC1878 XCC1879 tsr tsr FALSE 0.221 465.000 0.000 0.013 Y NA
 253185 2165603 XCC1879 XCC1880 tsr tsr TRUE 0.585 232.000 0.000 0.013 Y NA
 2165603 253187 XCC1880 XCC1881 tsr tsr TRUE 0.983 114.000 0.667 0.013 Y NA
 253187 253188 XCC1881 XCC1882 tsr tsr FALSE 0.303 40.000 0.000 NA   NA
 253188 2165604 XCC1882 XCC1883 tsr   FALSE 0.007 734.000 0.000 NA   NA
 2165604 253190 XCC1883 XCC1884   tsr FALSE 0.068 237.000 0.000 NA   NA
 253190 253191 XCC1884 XCC1885 tsr cheA FALSE 0.224 460.000 0.000 0.013 Y NA
 253191 253192 XCC1885 XCC1886 cheA cheY TRUE 0.921 34.000 0.135 1.000 Y NA
 253192 253193 XCC1886 XCC1887 cheY   TRUE 0.994 -3.000 0.514 NA   NA
 253193 2165605 XCC1887 XCC1888   cheW TRUE 0.758 98.000 0.190 NA   NA
 2165605 253195 XCC1888 XCC1889 cheW parA TRUE 0.944 -3.000 0.028 1.000 N NA
 253195 253196 XCC1889 XCC1890 parA motB TRUE 0.978 2.000 0.199 1.000 N NA
 253196 253197 XCC1890 XCC1891 motB motA TRUE 0.991 8.000 0.248 1.000 Y NA
 253198 253199 XCC1892 XCC1893 cirA   FALSE 0.012 515.000 0.000 NA   NA
 253199 253200 XCC1893 XCC1894     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 253202 2165606 XCC1896 XCC1897     FALSE 0.256 87.000 0.000 NA   NA
 2165606 253204 XCC1897 XCC1898     TRUE 0.611 -27.000 0.000 NA   NA
 253204 253205 XCC1898 XCC1899     FALSE 0.129 175.000 0.000 1.000   NA
 253205 2165607 XCC1899 XCC1900     FALSE 0.012 513.000 0.000 NA   NA
 2165607 253207 XCC1900 XCC1901     FALSE 0.251 81.000 0.000 NA   NA
 253207 253208 XCC1901 XCC1902     TRUE 0.802 6.000 0.000 NA   NA
 253209 253210 XCC1903 XCC1904 cheA cheZ TRUE 0.996 3.000 0.341 1.000 Y NA
 253210 253211 XCC1904 XCC1905 cheZ cheY TRUE 0.998 0.000 0.516 1.000 Y NA
 253211 253212 XCC1905 XCC1906 cheY fliA TRUE 0.906 36.000 0.283 0.074 N NA
 253212 253213 XCC1906 XCC1907 fliA fleN TRUE 0.992 -3.000 0.482 1.000 N NA
 253213 253214 XCC1907 XCC1908 fleN flhF TRUE 0.893 -106.000 0.241 1.000 N NA
 253214 253215 XCC1908 XCC1909 flhF flhA FALSE 0.045 1000.000 0.008 1.000 Y NA
 253215 253216 XCC1909 XCC1910 flhA flhB TRUE 0.996 -3.000 0.029 0.009 Y NA
 253216 253217 XCC1910 XCC1911 flhB   FALSE 0.022 447.000 0.012 1.000 N NA
 253217 253218 XCC1911 XCC1912     TRUE 0.868 88.000 0.000 0.010 Y NA
 253218 253219 XCC1912 XCC1913     TRUE 0.866 95.000 0.000 0.010 Y NA
 253219 253220 XCC1913 XCC1914   fliR TRUE 0.615 105.000 0.111 1.000 N NA
 253220 253221 XCC1914 XCC1915 fliR fliQ TRUE 0.984 13.000 0.215 1.000 Y NA
 253221 253222 XCC1915 XCC1916 fliQ fliP FALSE 0.244 1086.000 0.177 0.009 Y NA
 253222 253223 XCC1916 XCC1917 fliP fliO TRUE 0.987 2.000 0.029 1.000 Y NA
 253223 253224 XCC1917 XCC1918 fliO fliN TRUE 0.997 -3.000 0.443 1.000 Y NA
 253224 253225 XCC1918 XCC1919 fliN fliM TRUE 0.999 -3.000 0.741 0.001 Y NA
 253225 253226 XCC1919 XCC1920 fliM fliL TRUE 0.989 13.000 0.029 0.001 Y NA
 253226 253227 XCC1920 XCC1921 fliL fliK TRUE 0.591 191.000 0.025 1.000 Y NA
 253227 253228 XCC1921 XCC1922 fliK fliJ TRUE 0.999 -3.000 0.317 0.005 Y NA
 253228 253229 XCC1922 XCC1923 fliJ fliI TRUE 0.985 4.000 0.044 1.000 Y NA
 253229 253230 XCC1923 XCC1924 fliI fliH TRUE 0.992 -3.000 0.085 1.000 Y NA
 253230 253231 XCC1924 XCC1925 fliH fliG TRUE 0.999 -3.000 0.320 0.003 Y NA
 253231 253232 XCC1925 XCC1926 fliG fliF TRUE 0.995 11.000 0.189 0.005 Y NA
 253232 253233 XCC1926 XCC1927 fliF fliE TRUE 0.998 14.000 0.910 0.005 Y NA
 253233 253234 XCC1927 XCC1928 fliE rbfC FALSE 0.032 328.000 0.000 NA   NA
 253234 253235 XCC1928 XCC1929 rbfC   TRUE 0.714 12.000 0.000 NA   NA
 253235 253236 XCC1929 XCC1930     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 253236 253237 XCC1930 XCC1931     TRUE 0.665 -13.000 0.000 1.000   NA
 253237 253238 XCC1931 XCC1932   vioA TRUE 0.898 -10.000 0.000 0.036 N NA
 253238 253239 XCC1932 XCC1933 vioA fleQ FALSE 0.328 76.000 0.014 1.000 N NA
 253239 253240 XCC1933 XCC1934 fleQ   TRUE 0.988 -7.000 0.050 0.074 Y NA
 253240 253241 XCC1934 XCC1935   rpoN TRUE 0.962 9.000 0.050 0.074 N NA
 253241 253242 XCC1935 XCC1936 rpoN   TRUE 0.633 226.000 0.000 0.005 Y NA
 253242 253243 XCC1936 XCC1937     TRUE 0.766 70.000 0.238 NA   NA
 253243 253244 XCC1937 XCC1938     TRUE 0.540 210.000 0.250 NA   NA
 253244 253245 XCC1938 XCC1939   fliS TRUE 0.990 -3.000 0.300 NA   NA
 253245 253246 XCC1939 XCC1940 fliS fliD TRUE 0.974 148.000 0.500 0.002 Y NA
 253246 253247 XCC1940 XCC1941 fliD fliC FALSE 0.361 221.000 0.000 1.000 Y NA
 253247 253248 XCC1941 XCC1942 fliC flgL FALSE 0.463 319.000 0.000 0.001 Y NA
 253248 253249 XCC1942 XCC1943 flgL flgK TRUE 0.998 0.000 0.108 0.001 Y NA
 253249 253250 XCC1943 XCC1944 flgK flgJ TRUE 0.990 12.000 0.034 0.002 Y NA
 253250 253251 XCC1944 XCC1945 flgJ flgI TRUE 0.996 2.000 0.064 0.006 Y NA
 253251 253252 XCC1945 XCC1946 flgI flgH TRUE 0.993 11.000 0.106 0.006 Y NA
 253252 253253 XCC1946 XCC1947 flgH flgG TRUE 0.961 39.000 0.120 0.005 Y NA
 253253 253254 XCC1947 XCC1948 flgG flgF FALSE 0.344 794.000 0.174 0.001 Y NA
 253254 253255 XCC1948 XCC1949 flgF flgE TRUE 0.978 144.000 0.594 0.003 Y NA
 253255 253256 XCC1949 XCC1950 flgE flgD TRUE 0.984 32.000 0.875 NA Y NA
 253256 253257 XCC1950 XCC1951 flgD flgC TRUE 0.956 24.000 0.174 NA Y NA
 253257 253258 XCC1951 XCC1952 flgC flgB TRUE 0.999 4.000 0.611 0.003 Y NA
 253258 253259 XCC1952 XCC1953 flgB cheV FALSE 0.331 465.000 0.267 1.000 Y NA
 2165608 253261 XCC1954 XCC1955 flgA flgM TRUE 0.831 67.000 0.371 NA   NA
 253261 253262 XCC1955 XCC1956 flgM   TRUE 0.970 15.000 0.052 0.001   NA
 253262 253263 XCC1956 XCC1957     TRUE 0.837 78.000 0.364 1.000   NA
 253264 253265 XCC1958 XCC1960 pdeA hrpX TRUE 0.988 4.000 0.000 0.028 Y NA
 2165609 253267 XCC1959 XCC1961     FALSE 0.019 405.000 0.000 NA   NA
 253268 253269 XCC1962 XCC1963 mcp   FALSE 0.457 152.000 0.036 NA   NA
 253269 253270 XCC1963 XCC1964   trmU TRUE 0.985 -3.000 0.180 NA   NA
 253270 253271 XCC1964 XCC1965 trmU mutT TRUE 0.979 -3.000 0.158 1.000 N NA
 253272 253273 XCC1966 XCC1967   clpA TRUE 0.866 144.000 0.596 NA   NA
 253274 253275 XCC1968 XCC1969 infA aat FALSE 0.387 81.000 0.020 1.000 N NA
 253275 253276 XCC1969 XCC1970 aat   TRUE 0.526 42.000 0.015 NA   NA
 253276 253277 XCC1970 XCC1971   trxB FALSE 0.423 58.000 0.010 NA   NA
 253278 253279 XCC1972 XCC1973 ftsK   FALSE 0.424 162.000 0.033 NA   NA
 253279 253280 XCC1973 XCC1974   lolA FALSE 0.445 107.000 0.011 NA   NA
 253283 253284 XCC1977 XCC1978   fadA FALSE 0.008 334.000 0.000 1.000 N NA
 253284 253285 XCC1978 XCC1979 fadA fadB TRUE 0.938 148.000 0.588 1.000 Y NA
 253285 253286 XCC1979 XCC1980 fadB psrA TRUE 0.595 26.000 0.019 1.000 N NA
 253287 253288 XCC1981 XCC1982 ndk   TRUE 0.900 19.000 0.156 1.000   NA
 253288 253289 XCC1982 XCC1983   pilF TRUE 0.939 11.000 0.086 1.000   NA
 253289 253290 XCC1983 XCC1984 pilF   TRUE 0.987 -3.000 0.204 1.000   NA
 253290 253291 XCC1984 XCC1985     FALSE 0.217 71.000 0.000 1.000   NA
 253291 253292 XCC1985 XCC1986     TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000   NA
 253292 253293 XCC1986 XCC1987   engA TRUE 0.965 11.000 0.203 1.000   NA
 253293 253294 XCC1987 XCC1988 engA moeA FALSE 0.361 32.000 0.000 1.000   NA
 253296 253297 XCC1990 XCC1991 cirA   TRUE 0.879 81.000 0.500 NA   NA
 253299 253300 XCC1993 XCC1994 cypC   TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 253300 253301 XCC1994 XCC1995     TRUE 0.993 4.000 0.667 NA   NA
 253301 253302 XCC1995 XCC1996   fdh TRUE 0.978 -3.000 0.091 NA   NA
 253306 253307 XCC2000 XCC2001 moeA mobA TRUE 0.748 47.000 0.002 NA Y NA
 253307 253308 XCC2001 XCC2002 mobA   FALSE 0.440 -271.000 0.000 NA   NA
 253310 253311 XCC2004 XCC2005 nasT nasF TRUE 0.972 5.000 0.218 NA N NA
 253311 2165611 XCC2005 XCC2006 nasF nasA FALSE 0.165 335.000 0.000 NA Y NA
 2165611 253313 XCC2006 XCC2007 nasA nasD TRUE 0.770 23.000 0.074 1.000 N NA
 253313 253314 XCC2007 XCC2008 nasD nasE TRUE 0.997 3.000 0.539 0.001 N NA
 253314 253315 XCC2008 XCC2009 nasE   TRUE 0.881 57.000 0.294 0.047 N NA
 253315 253316 XCC2009 XCC2010   cysG TRUE 0.576 37.000 0.048 1.000 N NA
 253317 2165612 XCC2011 XCC2012     FALSE 0.095 57.000 0.000 NA N NA
 2165612 253319 XCC2012 XCC2013   rfbD TRUE 0.980 -3.000 0.163 NA N NA
 253319 253320 XCC2013 XCC2014 rfbD   TRUE 0.991 -3.000 0.054 1.000 Y NA
 253320 253321 XCC2014 XCC2015     TRUE 0.982 5.000 0.038 1.000 Y NA
 253321 253322 XCC2015 XCC2016     FALSE 0.248 55.000 0.000 NA   NA
 253323 253324 XCC2017 XCC2018     TRUE 0.731 -9.000 0.000 NA   NA
 253326 253327 XCC2020 XCC2021   cheB FALSE 0.020 382.000 0.000 1.000   NA
 253327 253328 XCC2021 XCC2022 cheB   FALSE 0.200 138.000 0.000 1.000   NA
 253331 253332 XCC2025 XCC2027     FALSE 0.004 1504.000 0.000 1.000   NA
 253334 253335 XCC2028 XCC2029     FALSE 0.008 713.000 0.000 NA   NA
 253335 253336 XCC2029 XCC2030     FALSE 0.223 130.000 0.000 NA   NA
 253337 253338 XCC2031 XCC2032     TRUE 0.991 -3.000 0.317 NA   NA
 253338 2165613 XCC2032 XCC2033     FALSE 0.083 216.000 0.000 1.000   NA
 2165613 253340 XCC2033 XCC2034   exoI FALSE 0.020 379.000 0.000 1.000   NA
 253341 253342 XCC2035 XCC2036     FALSE 0.091 203.000 0.000 1.000   NA
 253343 253344 XCC2037 XCC2038     FALSE 0.016 446.000 0.000 NA   NA
 253344 253345 XCC2038 XCC2039     TRUE 0.867 1.000 0.000 NA   NA
 253348 253349 XCC2042 XCC2043     TRUE 0.975 -81.000 0.800 NA   NA
 253349 253350 XCC2043 XCC2044     FALSE 0.413 178.000 0.062 NA   NA
 253350 253351 XCC2044 XCC2045     FALSE 0.010 606.000 0.000 NA   NA
 253355 2165614 XCC2049 XCC2050     FALSE 0.013 511.000 0.000 NA   NA
 2165614 2165615 XCC2050 XCC2051     FALSE 0.253 91.000 0.000 NA   NA
 2165615 253358 XCC2051 XCC2052     FALSE 0.040 299.000 0.000 NA   NA
 253358 253359 XCC2052 XCC2053   cheY FALSE 0.009 666.000 0.000 NA   NA
 253360 253361 XCC2054 XCC2055 cvgSY ndvB FALSE 0.009 331.000 0.000 1.000 N NA
 253361 253362 XCC2055 XCC2056 ndvB   TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 253364 253365 XCC2058 XCC2059 gII gV TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 253365 253366 XCC2059 XCC2060 gV gVII TRUE 0.963 32.000 1.000 NA   NA
 253366 253367 XCC2060 XCC2061 gVII gIX TRUE 0.986 -24.000 1.000 NA   NA
 253367 253368 XCC2061 XCC2062 gIX gVIII FALSE 0.422 28.000 0.000 NA   NA
 253368 2165616 XCC2062 XCC2063 gVIII gIII FALSE 0.253 97.000 0.000 NA   NA
 2165616 253370 XCC2063 XCC2064 gIII gVI FALSE 0.342 35.000 0.000 NA   NA
 253370 253371 XCC2064 XCC2065 gVI gI TRUE 0.860 2.000 0.000 NA   NA
 253374 253375 XCC2068 XCC2069 gI gVI TRUE 0.860 2.000 0.000 NA   NA
 253375 2165617 XCC2069 XCC2070 gVI gIII TRUE 0.739 11.000 0.000 NA   NA
 2165617 253377 XCC2070 XCC2071 gIII gVIII FALSE 0.253 97.000 0.000 NA   NA
 253377 253378 XCC2071 XCC2072 gVIII gIX FALSE 0.422 28.000 0.000 NA   NA
 253378 253379 XCC2072 XCC2073 gIX gVII TRUE 0.986 -24.000 1.000 NA   NA
 253379 253380 XCC2073 XCC2074 gVII gV TRUE 0.963 32.000 1.000 NA   NA
 253380 253381 XCC2074 XCC2075 gV gII TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 253383 253384 XCC2077 XCC2078 trbP   FALSE 0.224 129.000 0.000 NA   NA
 253384 253385 XCC2078 XCC2079     TRUE 0.524 116.000 0.030 NA   NA
 253386 253387 XCC2080 XCC2081 phhb   TRUE 0.960 -3.000 0.025 1.000   NA
 253387 253388 XCC2081 XCC2082     TRUE 0.550 128.000 0.050 1.000   NA
 253391 253392 XCC2085 XCC2086 gacA   FALSE 0.089 216.000 0.000 NA   NA
 253392 253393 XCC2086 XCC2087     TRUE 0.598 34.000 0.015 NA   NA
 253394 253395 XCC2088 XCC2089 fkpA   TRUE 0.891 12.000 0.028 1.000   NA
 253397 253398 XCC2092 XCC2093     FALSE 0.007 740.000 0.000 NA   NA
 2165618 253400 XCC2094 XCC2095     FALSE 0.018 405.000 0.000 1.000   NA
 253400 253401 XCC2095 XCC2096     FALSE 0.188 150.000 0.000 NA   NA
 253403 253404 XCC2097 XCC2099   avrBs1.1 FALSE 0.004 1216.000 0.000 1.000   NA
 253404 253405 XCC2099 XCC2100 avrBs1.1 avrBs1 TRUE 0.676 91.000 0.105 1.000   NA
 253406 253407 XCC2101 XCC2102     FALSE 0.256 87.000 0.000 NA   NA
 253407 253408 XCC2102 XCC2103     TRUE 0.990 -7.000 0.727 NA   NA
 253408 253409 XCC2103 XCC2104     TRUE 0.991 3.000 0.434 NA   NA
 253409 253410 XCC2104 XCC2105     FALSE 0.234 123.000 0.000 NA   NA
 253410 253411 XCC2105 XCC2106     FALSE 0.030 337.000 0.000 NA   NA
 253412 253413 XCC2107 XCC2108     FALSE 0.063 243.000 0.000 NA   NA
 253414 253415 XCC2109 XCC2110 avrXccC intS FALSE 0.004 1271.000 0.000 1.000   NA
 253415 399378 XCC2110 XCC2111 intS tRNA-Gly FALSE 0.082 223.000 0.000 NA   NA
 399378 399377 XCC2111 XCC2112 tRNA-Gly tRNA-Cys FALSE 0.251 81.000 0.000 NA   NA
 399377 399376 XCC2112 XCC2113 tRNA-Cys tRNA-Gly FALSE 0.230 70.000 0.000 NA   NA
 399376 253416 XCC2113 XCC2114 tRNA-Gly pgsA FALSE 0.322 37.000 0.000 NA   NA
 253416 253417 XCC2114 XCC2115 pgsA uvrC TRUE 0.983 0.000 0.227 1.000 N NA
 253417 253418 XCC2115 XCC2116 uvrC   TRUE 0.934 -3.000 0.004 NA   NA
 253418 253419 XCC2116 XCC2117     TRUE 0.710 -57.000 0.006 NA   NA
 253419 2165619 XCC2117 XCC2118   kdsB TRUE 0.958 -3.000 0.050 1.000 N NA
 2165619 253421 XCC2118 XCC2119 kdsB lpxK TRUE 0.830 81.000 0.054 1.000 Y NA
 253421 253422 XCC2119 XCC2120 lpxK msbA TRUE 0.983 -3.000 0.205 1.000 N NA
 253422 253423 XCC2120 XCC2121 msbA exbD TRUE 0.974 -3.000 0.120 1.000 N NA
 253423 253424 XCC2121 XCC2122 exbD exbB TRUE 0.999 4.000 0.746 0.056 Y NA
 253424 253425 XCC2122 XCC2123 exbB comA TRUE 0.736 29.000 0.045 1.000   NA
 253427 253428 XCC2125 XCC2126 ycfV lolC TRUE 0.940 50.000 0.620 0.056 N NA
 253428 253429 XCC2126 XCC2127 lolC   TRUE 0.840 15.000 0.020 NA   NA
 253429 253430 XCC2127 XCC2128     TRUE 0.626 32.000 0.016 NA   NA
 253430 253431 XCC2128 XCC2129   sdhB TRUE 0.727 98.000 0.151 NA   NA
 253431 253432 XCC2129 XCC2130 sdhB sdhA TRUE 0.941 233.000 0.604 0.001 Y NA
 253432 253433 XCC2130 XCC2131 sdhA sdhD TRUE 0.994 31.000 0.705 0.001 Y NA
 253433 253434 XCC2131 XCC2132 sdhD sdhC TRUE 0.999 -3.000 0.291 0.001 Y NA
 253434 253435 XCC2132 XCC2134 sdhC   FALSE 0.470 57.000 0.016 NA   NA
 253438 253439 XCC2136 XCC2137 zwf glk TRUE 0.991 -3.000 0.055 1.000 Y NA
 253439 253440 XCC2137 XCC2138 glk pgl TRUE 0.988 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 253440 253441 XCC2138 XCC2139 pgl edd TRUE 0.867 146.000 0.202 1.000 Y NA
 253441 253442 XCC2139 XCC2140 edd eda TRUE 0.952 53.000 0.523 1.000 Y NA
 253443 253444 XCC2141 XCC2142 acrD acrD TRUE 0.998 -3.000 0.481 NA Y NA
 253444 253445 XCC2142 XCC2143 acrD czcB TRUE 0.995 -3.000 0.778 NA N NA
 2165620 253447 XCC2144 XCC2145   cycM TRUE 0.984 66.000 0.688 0.007 Y NA
 253447 399353 XCC2145 XCC2146 cycM tRNA-Ala FALSE 0.256 87.000 0.000 NA   NA
 399353 399354 XCC2146 XCC2147 tRNA-Ala tRNA-Glu FALSE 0.265 48.000 0.000 NA   NA
 399354 399355 XCC2147 XCC2148 tRNA-Glu tRNA-Ala FALSE 0.007 754.000 0.000 NA   NA
 399355 399356 XCC2148 XCC2149 tRNA-Ala tRNA-Glu FALSE 0.250 54.000 0.000 NA   NA
 253448 399375 XCC2150 XCC2151   tRNA-Leu FALSE 0.046 280.000 0.000 NA   NA
 253449 253450 XCC2152 XCC2153     TRUE 0.964 66.000 0.333 0.022 Y NA
 253451 253452 XCC2154 XCC2155 tex   FALSE 0.438 105.000 0.010 NA   NA
 253454 253455 XCC2157 XCC2158     TRUE 0.858 -30.000 0.043 NA   NA
 253455 253456 XCC2158 XCC2159   phbC FALSE 0.451 103.000 0.032 NA N NA
 253456 253457 XCC2159 XCC2160 phbC phaE TRUE 0.987 -3.000 0.210 NA   NA
 253457 253458 XCC2160 XCC2161 phaE pssA FALSE 0.495 60.000 0.022 NA   NA
 253460 253461 XCC2163 XCC2164 mutT   TRUE 0.554 59.000 0.040 NA   NA
 253461 253462 XCC2164 XCC2165     FALSE 0.297 206.000 0.043 NA   NA
 253463 253464 XCC2166 XCC2167 ppsA yggB TRUE 0.932 0.000 0.018 NA N NA
 253465 253466 XCC2168 XCC2169 orn   FALSE 0.287 72.000 0.011 1.000 N NA
 253466 253467 XCC2169 XCC2170     TRUE 0.929 -3.000 0.016 1.000 N NA
 253468 253469 XCC2171 XCC2172 smf2 cpo FALSE 0.013 487.000 0.000 1.000   NA
 253469 253470 XCC2172 XCC2173 cpo   FALSE 0.254 101.000 0.000 NA   NA
 253471 2165621 XCC2174 XCC2175 tetV   TRUE 0.592 137.000 0.082 1.000   NA
 2165621 253473 XCC2175 XCC2176     TRUE 0.965 -3.000 0.033 NA   NA
 253473 253474 XCC2176 XCC2177     TRUE 0.975 -3.000 0.071 NA   NA
 253474 2165622 XCC2177 XCC2178     TRUE 0.972 -3.000 0.107 1.000 N NA
 253476 253477 XCC2179 XCC2180     TRUE 0.998 -7.000 0.600 0.027 Y NA
 253477 2165623 XCC2180 XCC2181   tlpC FALSE 0.022 372.000 0.000 1.000   NA
 2165623 253479 XCC2181 XCC2182 tlpC   TRUE 0.920 45.000 0.667 NA   NA
 253480 253481 XCC2183 XCC2184 guaA guaB FALSE 0.478 349.000 0.190 0.001   NA
 253481 253482 XCC2184 XCC2185 guaB folD FALSE 0.375 104.000 0.004 1.000   NA
 253484 253485 XCC2187 XCC2188 kefB galU FALSE 0.353 175.000 0.067 1.000 N NA
 253485 253486 XCC2188 XCC2189 galU   TRUE 0.999 0.000 0.350 0.012 Y NA
 253486 253487 XCC2189 XCC2190   rfb303 TRUE 0.825 83.000 0.048 1.000 Y NA
 253487 253488 XCC2190 XCC2191 rfb303   TRUE 0.948 0.000 0.038 1.000 N NA
 253488 253489 XCC2191 XCC2192     TRUE 0.990 7.000 0.576 NA   NA
 253489 253490 XCC2192 XCC2193   ihfB TRUE 0.750 67.000 0.208 NA   NA
 253490 253491 XCC2193 XCC2194 ihfB rpsA TRUE 0.772 90.000 0.292 1.000 N NA
 253491 253492 XCC2194 XCC2195 rpsA cmk TRUE 0.563 185.000 0.281 1.000 N NA
 253493 253494 XCC2196 XCC2197 rpmJ   FALSE 0.221 203.000 0.014 NA   NA
 253494 253495 XCC2197 XCC2198     FALSE 0.458 193.000 0.123 NA   NA
 253495 253496 XCC2198 XCC2199     TRUE 0.842 79.000 0.364 NA   NA
 253496 253497 XCC2199 XCC2200   pat TRUE 0.909 7.000 0.016 1.000   NA
 253497 253498 XCC2200 XCC2201 pat traB TRUE 0.908 -7.000 0.024 NA   NA
 253499 253500 XCC2202 XCC2203     FALSE 0.370 174.000 0.034 NA   NA
 253500 253501 XCC2203 XCC2204   lacG TRUE 0.994 -3.000 0.500 1.000   NA
 253501 253502 XCC2204 XCC2205 lacG lacF TRUE 0.997 -3.000 0.160 0.044 Y NA
 253502 253503 XCC2205 XCC2206 lacF malE TRUE 0.999 -3.000 0.660 0.044 Y NA
 253503 2165624 XCC2206 XCC2207 malE   TRUE 0.975 4.000 0.156 NA   NA
 2165624 253505 XCC2207 XCC2208     TRUE 0.795 104.000 0.250 NA   NA
 253505 253506 XCC2208 XCC2209     TRUE 0.901 107.000 0.750 1.000 N NA
 253506 253507 XCC2209 XCC2210     FALSE 0.005 476.000 0.000 NA N NA
 253507 253508 XCC2210 XCC2211     TRUE 0.980 -3.000 0.103 NA   NA
 2165625 253510 XCC2212 XCC2213     TRUE 0.867 -61.000 0.083 NA   NA
 253510 253511 XCC2213 XCC2214     TRUE 0.960 -7.000 0.210 NA N NA
 253514 253515 XCC2217 XCC2218   ybdL TRUE 0.584 148.000 0.099 1.000   NA
 253516 253517 XCC2219 XCC2220 ccmA cycW TRUE 0.997 -3.000 0.074 0.003 Y NA
 253517 253518 XCC2220 XCC2221 cycW cycZ TRUE 0.939 77.000 0.051 0.001 Y NA
 253518 253519 XCC2221 XCC2222 cycZ   TRUE 0.952 -3.000 0.015 1.000   NA
 253519 253520 XCC2222 XCC2223   cycJ TRUE 0.953 -3.000 0.016 1.000   NA
 253520 253521 XCC2223 XCC2224 cycJ cycK TRUE 0.907 124.000 0.016 0.003 Y NA
 253521 253522 XCC2224 XCC2225 cycK dsbE TRUE 0.999 -7.000 1.000 0.003 Y NA
 253522 253523 XCC2225 XCC2226 dsbE cycL TRUE 0.991 21.000 1.000 NA Y NA
 253523 253524 XCC2226 XCC2227 cycL cycH TRUE 0.997 -6.000 1.000 NA Y NA
 253524 253525 XCC2227 XCC2228 cycH met FALSE 0.071 341.000 0.039 1.000 N NA
 253525 253526 XCC2228 XCC2229 met   TRUE 0.688 22.000 0.011 1.000   NA
 253527 253528 XCC2230 XCC2231 cydC strW TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.003 Y NA
 253529 253530 XCC2232 XCC2233 cydA cydB TRUE 0.997 16.000 0.953 0.046 Y NA
 253530 253531 XCC2233 XCC2234 cydB   TRUE 0.793 79.000 0.256 NA   NA
 253531 399357 XCC2234 XCC2235   tRNA-Pro FALSE 0.236 63.000 0.000 NA   NA
 399357 253532 XCC2235 XCC2236 tRNA-Pro cynX FALSE 0.256 86.000 0.000 NA   NA
 253533 253534 XCC2237 XCC2238 gaa proA FALSE 0.019 386.000 0.000 1.000   NA
 253534 2165626 XCC2238 XCC2239 proA proB TRUE 0.894 139.000 0.007 0.001 Y NA
 2165626 253536 XCC2239 XCC2240 proB   TRUE 0.650 59.000 0.091 NA   NA
 253536 253537 XCC2240 XCC2241     TRUE 0.739 27.000 0.036 NA   NA
 253537 253538 XCC2241 XCC2242   argH TRUE 0.866 -3.000 0.002 1.000 N NA
 253538 253539 XCC2242 XCC2243 argH argC TRUE 0.774 76.000 0.020 1.000 Y NA
 253539 253540 XCC2243 XCC2244 argC argA TRUE 0.902 -3.000 0.008 1.000 N NA
 253540 253541 XCC2244 XCC2245 argA argB TRUE 0.815 6.000 0.006 1.000 N NA
 253541 253542 XCC2245 XCC2246 argB argE TRUE 0.763 49.000 0.009 1.000 Y NA
 253542 253543 XCC2246 XCC2247 argE argG FALSE 0.355 243.000 0.004 1.000 Y NA
 253543 253544 XCC2247 XCC2248 argG   FALSE 0.146 31.000 0.000 1.000 N NA
 253544 253545 XCC2248 XCC2249   argF TRUE 0.670 -3.000 0.000 1.000 N NA
 253545 253546 XCC2249 XCC2250 argF   FALSE 0.037 310.000 0.000 NA   NA
 253547 253548 XCC2251 XCC2252 cysS   FALSE 0.084 286.000 0.006 NA   NA
 253548 253549 XCC2252 XCC2253   tetV TRUE 0.966 -3.000 0.034 NA   NA
 253550 2165627 XCC2254 XCC2255     FALSE 0.006 913.000 0.000 NA   NA
 253552 253553 XCC2256 XCC2257   pyrC TRUE 0.946 -3.000 0.010 NA   NA
 253553 253554 XCC2257 XCC2258 pyrC   FALSE 0.242 -60.000 0.000 1.000 N NA
 253554 253555 XCC2258 XCC2259   eutP FALSE 0.002 874.000 0.000 1.000 N NA
 253555 253556 XCC2259 XCC2260 eutP eutA TRUE 0.997 -3.000 0.407 1.000 Y NA
 253556 253557 XCC2260 XCC2261 eutA eutC TRUE 1.000 -3.000 0.859 0.001 Y NA
 253558 2165628 XCC2262 XCC2263     TRUE 0.540 73.000 0.040 NA   NA
 2165628 253560 XCC2263 XCC2264     FALSE 0.048 267.000 0.000 1.000   NA
 253561 253562 XCC2265 XCC2266   pglA FALSE 0.002 743.000 0.000 1.000 N NA
 253563 253564 XCC2267 XCC2268   cbbZ TRUE 0.686 29.000 0.022 NA   NA
 253564 253565 XCC2268 XCC2269 cbbZ ubiG TRUE 0.790 113.000 0.259 1.000   NA
 253565 253566 XCC2269 XCC2270 ubiG   TRUE 0.760 29.000 0.104 1.000 N NA
 253566 253567 XCC2270 XCC2271     TRUE 0.922 6.000 0.018 NA   NA
 253567 253568 XCC2271 XCC2272   efP TRUE 0.874 6.000 0.002 NA   NA
 253570 253571 XCC2274 XCC2275     TRUE 0.983 -3.000 0.200 NA N NA
 253571 253572 XCC2275 XCC2276     FALSE 0.276 61.000 0.007 NA N NA
 2165629 253576 XCC2279 XCC2280     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 253579 253580 XCC2283 XCC2284 apt   FALSE 0.383 85.000 0.004 NA   NA
 253582 253583 XCC2286 XCC2287 gstA cspA FALSE 0.243 201.000 0.046 1.000 N NA
 253584 253585 XCC2288 XCC2289     FALSE 0.421 59.000 0.010 NA   NA
 253585 253586 XCC2289 XCC2290     TRUE 0.946 -3.000 0.011 1.000   NA
 253586 253587 XCC2290 XCC2291     FALSE 0.400 86.000 0.007 1.000   NA
 253589 253590 XCC2293 XCC2294   phbB TRUE 0.672 78.000 0.014 0.033 N NA
 253590 2165630 XCC2294 XCC2295 phbB   FALSE 0.421 160.000 0.031 NA   NA
 253592 253593 XCC2296 XCC2297     TRUE 0.995 0.000 0.625 NA   NA
 253593 253594 XCC2297 XCC2298   mutL FALSE 0.485 39.000 0.007 NA   NA
 253594 253595 XCC2298 XCC2299 mutL amiC FALSE 0.277 152.000 0.016 1.000 N NA
 253595 253596 XCC2299 XCC2300 amiC   FALSE 0.468 53.000 0.014 NA   NA
 253596 253597 XCC2300 XCC2301     TRUE 0.981 -3.000 0.118 NA   NA
 253598 253599 XCC2302 XCC2303 yjeS xseA FALSE 0.223 118.000 0.004 1.000 N NA
 253600 2165631 XCC2304 XCC2305 acvB   FALSE 0.253 107.000 0.000 NA   NA
 253603 253604 XCC2307 XCC2308 lig3   TRUE 0.978 12.000 0.400 NA   NA
 253605 399358 XCC2309 XCC2310 xrvA tRNA-Ala FALSE 0.253 91.000 0.000 NA   NA
 253606 253607 XCC2311 XCC2312     FALSE 0.006 938.000 0.000 NA   NA
 253609 253610 XCC2314 XCC2315 cheW mcp TRUE 0.998 10.000 0.500 0.013 Y NA
 253614 253615 XCC2319 XCC2320   sspB TRUE 0.812 14.000 0.009 NA   NA
 253615 253616 XCC2320 XCC2321 sspB sspA TRUE 0.924 79.000 0.831 NA   NA
 253616 253617 XCC2321 XCC2322 sspA petC TRUE 0.712 166.000 0.370 NA N NA
 253617 253618 XCC2322 XCC2323 petC petB TRUE 0.999 8.000 0.630 0.001 Y NA
 253618 253619 XCC2323 XCC2324 petB petA TRUE 0.999 0.000 0.233 0.001 Y NA
 253619 253620 XCC2324 XCC2325 petA yjbJ FALSE 0.083 364.000 0.033 NA   NA
 253620 253621 XCC2325 XCC2326 yjbJ dnrO TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 253622 253623 XCC2327 XCC2328 gstA   FALSE 0.210 67.000 0.003 1.000 N NA
 253623 253624 XCC2328 XCC2329     FALSE 0.062 675.000 0.220 1.000 N NA
 253624 2165632 XCC2329 XCC2330     FALSE 0.014 477.000 0.000 NA   NA
 2165632 253626 XCC2330 XCC2331     FALSE 0.359 56.000 0.002 NA   NA
 253626 253627 XCC2331 XCC2332     TRUE 0.932 0.000 0.005 NA   NA
 253627 253628 XCC2332 XCC2333   ybeX FALSE 0.095 330.000 0.024 NA   NA
 253628 253629 XCC2333 XCC2334 ybeX   TRUE 0.963 -3.000 0.029 NA   NA
 253629 253630 XCC2334 XCC2335   corA TRUE 0.914 15.000 0.095 NA   NA
 253633 2165633 XCC2338 XCC2339 potI potH TRUE 0.997 -3.000 0.094 0.044 Y NA
 2165633 253635 XCC2339 XCC2340 potH potG TRUE 0.915 145.000 0.385 1.000 Y NA
 253635 253636 XCC2340 XCC2341 potG oprN TRUE 0.631 82.000 0.125 1.000 N NA
 253636 253637 XCC2341 XCC2342 oprN rmrB TRUE 0.980 -13.000 0.520 1.000   NA
 253637 253638 XCC2342 XCC2343 rmrB rmrA TRUE 0.997 -3.000 0.880 1.000   NA
 253638 253639 XCC2343 XCC2344 rmrA potF FALSE 0.028 203.000 0.000 1.000 N NA
 253639 253640 XCC2344 XCC2345 potF bioA FALSE 0.025 217.000 0.000 1.000 N NA
 253640 253641 XCC2345 XCC2346 bioA glnA FALSE 0.003 567.000 0.000 1.000 N NA
 253641 253642 XCC2346 XCC2347 glnA guaA TRUE 0.959 7.000 0.111 1.000   NA
 253643 253644 XCC2348 XCC2349 glnA   TRUE 0.998 0.000 0.750 1.000 Y NA
 253644 253645 XCC2349 XCC2350   rrpX TRUE 0.788 129.000 0.375 1.000 N NA
 253645 253646 XCC2350 XCC2351 rrpX   TRUE 0.757 86.000 0.267 1.000 N NA
 253647 253648 XCC2352 XCC2353 yhjE   FALSE 0.018 412.000 0.000 NA   NA
 253648 253649 XCC2353 XCC2354     TRUE 0.910 -28.000 0.114 NA   NA
 253649 253650 XCC2354 XCC2355   fdsC TRUE 0.998 -3.000 0.086 0.001 Y NA
 253650 253651 XCC2355 XCC2356 fdsC yhjX TRUE 0.896 7.000 0.011 1.000   NA
 253652 253653 XCC2357 XCC2358     TRUE 0.930 11.000 0.064 1.000   NA
 253653 253654 XCC2358 XCC2359     FALSE 0.023 604.000 0.013 1.000   NA
 253654 253655 XCC2359 XCC2360     FALSE 0.348 156.000 0.013 1.000   NA
 253655 253656 XCC2360 XCC2361     TRUE 0.964 34.000 0.133 0.022 Y NA
 253656 253657 XCC2361 XCC2362   yieO FALSE 0.009 330.000 0.000 1.000 N NA
 253661 253662 XCC2366 XCC2367   acrA TRUE 0.972 15.000 0.571 1.000 N NA
 253662 253663 XCC2367 XCC2368 acrA acrB TRUE 0.987 13.000 1.000 1.000 N NA
 253665 253666 XCC2370 XCC2371 fruB fruK TRUE 0.995 -3.000 0.195 1.000 Y NA
 253666 253667 XCC2371 XCC2372 fruK fruA TRUE 0.933 154.000 0.562 1.000 Y NA
 253667 253668 XCC2372 XCC2373 fruA rpfN FALSE 0.184 327.000 0.025 0.055 N NA
 253668 253669 XCC2373 XCC2374 rpfN   FALSE 0.013 487.000 0.000 1.000   NA
 253670 253671 XCC2375 XCC2376 secF secD TRUE 0.951 92.000 0.084 0.001 Y NA
 253671 253672 XCC2376 XCC2377 secD yajC FALSE 0.403 308.000 0.083 NA Y NA
 253672 253673 XCC2377 XCC2378 yajC tgt TRUE 0.758 133.000 0.325 NA N NA
 253673 253674 XCC2378 XCC2379 tgt queA TRUE 0.979 86.000 0.360 0.001 Y NA
 253674 253675 XCC2379 XCC2380 queA   FALSE 0.035 305.000 0.004 1.000 N NA
 2165634 253678 XCC2382 XCC2383     FALSE 0.135 176.000 0.000 NA   NA
 253678 253679 XCC2383 XCC2384     TRUE 0.924 6.000 0.020 NA   NA
 253679 253680 XCC2384 XCC2385   cirA TRUE 0.983 0.000 0.220 NA N NA
 253682 253683 XCC2387 XCC2388 egl2 ggt FALSE 0.042 284.000 0.000 1.000   NA
 253683 253684 XCC2388 XCC2389 ggt   TRUE 0.975 -3.000 0.076 1.000   NA
 253684 253685 XCC2389 XCC2390     FALSE 0.252 202.000 0.020 NA   NA
 253685 253686 XCC2390 XCC2391   kdtB FALSE 0.391 63.000 0.007 NA   NA
 253686 253687 XCC2391 XCC2392 kdtB   TRUE 0.990 -3.000 0.367 1.000 N NA
 253689 253690 XCC2394 XCC2395   btuB TRUE 0.683 151.000 0.200 1.000   NA
 253690 253691 XCC2395 XCC2396 btuB avrXccA2 FALSE 0.080 422.000 0.000 0.038   NA
 253691 253692 XCC2396 XCC2397 avrXccA2   FALSE 0.067 475.000 0.000 0.038   NA
 253692 253693 XCC2397 XCC2398   xsa TRUE 0.572 75.000 0.053 1.000   NA
 253693 253694 XCC2398 XCC2399 xsa   TRUE 0.869 84.000 0.462 1.000   NA
 253694 253695 XCC2399 XCC2400   btuB FALSE 0.039 294.000 0.000 1.000   NA
 253695 253696 XCC2400 XCC2401 btuB   FALSE 0.010 580.000 0.000 1.000   NA
 253698 253699 XCC2403 XCC2404     TRUE 0.834 149.000 0.500 NA   NA
 253699 253700 XCC2404 XCC2405     TRUE 0.831 128.000 0.500 1.000 N NA
 253700 253701 XCC2405 XCC2406   yveA TRUE 0.975 -10.000 0.071 1.000 Y NA
 253701 253702 XCC2406 XCC2407 yveA   TRUE 0.607 65.000 0.071 NA   NA
 253702 253703 XCC2407 XCC2408     TRUE 0.977 -51.000 0.750 NA   NA
 253703 253704 XCC2408 XCC2409   pepQ FALSE 0.090 378.000 0.051 NA   NA
 253704 2165636 XCC2409 XCC2410 pepQ   TRUE 0.966 -3.000 0.077 1.000 N NA
 2165636 253706 XCC2410 XCC2411   dapA TRUE 0.523 185.000 0.044 0.056 N NA
 253706 253707 XCC2411 XCC2412 dapA   TRUE 0.982 -3.000 0.133 1.000   NA
 253707 253708 XCC2412 XCC2413   soxA TRUE 0.988 -28.000 0.600 0.045   NA
 253708 2165637 XCC2413 XCC2414 soxA   TRUE 0.983 -3.000 0.143 1.000   NA
 2165637 253710 XCC2414 XCC2415     TRUE 0.991 0.000 0.062 1.000 Y NA
 253711 253712 XCC2416 XCC2417   ftsY FALSE 0.198 126.000 0.002 1.000 N NA
 253712 253713 XCC2417 XCC2418 ftsY mutY FALSE 0.012 488.000 0.004 1.000 N NA
 253713 253714 XCC2418 XCC2419 mutY   TRUE 0.574 152.000 0.150 NA N NA
 253715 253716 XCC2420 XCC2421   fixL FALSE 0.182 154.000 0.000 NA   NA
 253716 253717 XCC2421 XCC2422 fixL qacE FALSE 0.017 244.000 0.000 1.000 N NA
 253723 399374 XCC2428 XCC2429   tRNA-Phe FALSE 0.014 485.000 0.000 NA   NA
 253724 253725 XCC2430 XCC2431 blc   TRUE 0.871 77.000 0.500 1.000   NA
 253725 253726 XCC2431 XCC2432     TRUE 0.869 38.000 0.333 1.000   NA
 253726 2165638 XCC2432 XCC2433     FALSE 0.002 850.000 0.000 1.000 N NA
 2165638 2165639 XCC2433 XCC2434   dxs FALSE 0.145 179.000 0.007 1.000 N NA
 253729 2165640 XCC2435 XCC2436 alg2   TRUE 0.944 -15.000 0.167 NA   NA
 2165640 253731 XCC2436 XCC2437     TRUE 0.713 -10.000 0.000 NA   NA
 253731 253732 XCC2437 XCC2438   cdh TRUE 0.978 -9.000 0.077 1.000 Y NA
 253732 253733 XCC2438 XCC2439 cdh gumP TRUE 0.988 -3.000 0.233 1.000   NA
 253733 2165641 XCC2439 XCC2440 gumP fabH TRUE 0.969 0.000 0.050 NA   NA
 2165641 253735 XCC2440 XCC2441 fabH gumN FALSE 0.090 369.000 0.044 NA   NA
 253735 253736 XCC2441 XCC2442 gumN   TRUE 0.608 54.000 0.059 NA   NA
 253736 253737 XCC2442 XCC2443   gumM TRUE 0.678 35.000 0.043 NA   NA
 253737 253738 XCC2443 XCC2444 gumM gumL TRUE 0.934 8.000 0.043 NA   NA
 253738 2165642 XCC2444 XCC2445 gumL gumK FALSE 0.297 41.000 0.000 NA   NA
 2165642 253740 XCC2445 XCC2446 gumK gumJ FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 253740 253741 XCC2446 XCC2447 gumJ gumI TRUE 0.989 -3.000 0.273 NA   NA
 253741 253742 XCC2447 XCC2448 gumI gumH TRUE 0.993 -3.000 0.111 NA Y NA
 253742 253743 XCC2448 XCC2449 gumH gumG TRUE 0.583 68.000 0.111 1.000 N NA
 253743 253744 XCC2449 XCC2450 gumG gumF TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.002 Y NA
 253744 253745 XCC2450 XCC2451 gumF gumE TRUE 0.981 -3.000 0.125 NA   NA
 253745 253746 XCC2451 XCC2452 gumE gumD TRUE 0.757 83.000 0.188 NA   NA
 253746 253747 XCC2452 XCC2453 gumD gumC FALSE 0.300 243.000 0.000 NA Y NA
 253747 253748 XCC2453 XCC2454 gumC gumB TRUE 0.889 72.000 0.200 1.000 Y NA
 253748 399373 XCC2454 XCC2455 gumB tRNA-Pro FALSE 0.012 527.000 0.000 NA   NA
 399373 253749 XCC2455 XCC2456 tRNA-Pro   FALSE 0.238 61.000 0.000 NA   NA
 253749 253750 XCC2456 XCC2457   himA TRUE 0.970 -19.000 0.535 1.000 N NA
 253750 253751 XCC2457 XCC2458 himA pheT TRUE 0.886 21.000 0.208 1.000 N NA
 253751 253752 XCC2458 XCC2459 pheT pheS TRUE 0.983 130.000 0.574 0.001 Y NA
 253752 253753 XCC2459 XCC2460 pheS rplT TRUE 0.528 300.000 0.202 1.000 Y NA
 253753 253754 XCC2460 XCC2461 rplT rpmI TRUE 0.999 11.000 0.928 0.013 Y NA
 253754 253755 XCC2461 XCC2462 rpmI infC TRUE 0.832 241.000 0.652 1.000 Y NA
 253755 253756 XCC2462 XCC2463 infC thrS TRUE 0.893 112.000 0.186 1.000 Y NA
 253758 253759 XCC2465 XCC2466 cgt suc1 TRUE 0.937 -105.000 0.333 NA   NA
 253759 2165643 XCC2466 XCC2467 suc1   TRUE 0.987 -3.000 0.200 NA   NA
 253761 253762 XCC2468 XCC2469 aglA btuB FALSE 0.052 258.000 0.000 1.000   NA
 253763 253764 XCC2470 XCC2471   aglA FALSE 0.009 322.000 0.000 1.000 N NA
 253765 253766 XCC2472 XCC2473     FALSE 0.115 379.000 0.000 0.014   NA
 253767 253768 XCC2474 XCC2475 virB4   TRUE 0.899 108.000 0.192 NA Y NA
 253768 253769 XCC2475 XCC2476   virB2 TRUE 0.992 -7.000 1.000 NA   NA
 253769 253770 XCC2476 XCC2477 virB2 virB1 TRUE 0.820 63.000 0.333 NA   NA
 253770 253771 XCC2477 XCC2478 virB1 virB11 TRUE 0.875 46.000 0.429 NA   NA
 253771 253772 XCC2478 XCC2479 virB11 virB10 TRUE 0.998 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 253772 253773 XCC2479 XCC2480 virB10 virB9 TRUE 0.999 -3.000 0.800 NA Y NA
 253773 253774 XCC2480 XCC2481 virB9 virB8 TRUE 0.997 -3.000 0.400 NA Y NA
 253774 253775 XCC2481 XCC2482 virB8   TRUE 0.854 111.000 0.400 NA   NA
 253775 253776 XCC2482 XCC2483   virD4 FALSE 0.013 497.000 0.000 NA   NA
 253776 399372 XCC2483 XCC2484 virD4 tRNA-Val FALSE 0.008 678.000 0.000 NA   NA
 399372 253777 XCC2484 XCC2485 tRNA-Val uvrB FALSE 0.253 99.000 0.000 NA   NA
 399371 253779 XCC2487 XCC2488 tRNA-Asn pilE1 FALSE 0.236 63.000 0.000 NA   NA
 253779 253780 XCC2488 XCC2489 pilE1 pilY1 TRUE 0.828 75.000 0.346 NA   NA
 253780 253781 XCC2489 XCC2490 pilY1   FALSE 0.251 110.000 0.000 NA   NA
 253781 253782 XCC2490 XCC2491     FALSE 0.432 27.000 0.000 NA   NA
 253782 253783 XCC2491 XCC2492   pilX TRUE 0.646 85.000 0.077 NA   NA
 253783 253784 XCC2492 XCC2493 pilX   TRUE 0.980 3.000 0.171 NA   NA
 253784 253785 XCC2493 XCC2494   pilV TRUE 0.991 4.000 0.143 NA Y NA
 253785 253786 XCC2494 XCC2495 pilV fimT TRUE 0.994 -3.000 0.119 NA Y NA
 253786 253787 XCC2495 XCC2496 fimT   FALSE 0.448 118.000 0.014 NA   NA
 253787 253788 XCC2496 XCC2497   oar FALSE 0.390 145.000 0.014 NA   NA
 253788 253789 XCC2497 XCC2498 oar   FALSE 0.007 395.000 0.000 NA N NA
 253789 253790 XCC2498 XCC2499     TRUE 0.922 -3.000 0.013 NA N NA
 253790 253791 XCC2499 XCC2500     TRUE 0.928 -3.000 0.016 1.000 N NA
 253793 253794 XCC2502 XCC2503   purE TRUE 0.998 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 253795 253796 XCC2504 XCC2505   nadC TRUE 0.869 9.000 0.006 NA   NA
 253796 253797 XCC2505 XCC2506 nadC   FALSE 0.438 42.000 0.005 NA   NA
 253798 253799 XCC2507 XCC2508 pnp rpsO TRUE 0.867 174.000 0.335 1.000 Y NA
 253799 253800 XCC2508 XCC2509 rpsO truB TRUE 0.855 158.000 0.211 1.000 Y NA
 253800 253801 XCC2509 XCC2510 truB rbfA TRUE 0.924 79.000 0.318 1.000 Y NA
 253801 253802 XCC2510 XCC2511 rbfA infB TRUE 0.952 110.000 0.530 1.000 Y NA
 253802 253803 XCC2511 XCC2512 infB nusA TRUE 0.799 54.000 0.342 1.000 N NA
 253803 253804 XCC2512 XCC2513 nusA   TRUE 0.993 5.000 0.759 NA   NA
 253804 399370 XCC2513 XCC2514   tRNA-Met FALSE 0.105 199.000 0.000 NA   NA
 399370 253805 XCC2514 XCC2515 tRNA-Met nuoN FALSE 0.100 202.000 0.000 NA   NA
 253805 253806 XCC2515 XCC2516 nuoN nuoM TRUE 0.982 37.000 0.340 0.002 Y NA
 253806 253807 XCC2516 XCC2517 nuoM nuoL TRUE 0.987 21.000 0.175 0.002 Y NA
 253807 253808 XCC2517 XCC2518 nuoL nuoK TRUE 0.998 8.000 0.451 0.005 Y NA
 253808 253809 XCC2518 XCC2519 nuoK nuoJ TRUE 0.999 -3.000 0.484 0.002 Y NA
 253809 253810 XCC2519 XCC2520 nuoJ nuoI TRUE 0.998 8.000 0.442 0.005 Y NA
 253810 253811 XCC2520 XCC2521 nuoI nuoH TRUE 0.999 1.000 0.500 0.005 Y NA
 253811 253812 XCC2521 XCC2522 nuoH nuoG TRUE 0.999 -3.000 0.515 0.005 Y NA
 253812 253813 XCC2522 XCC2523 nuoG nuoF TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.005 Y NA
 253813 253814 XCC2523 XCC2524 nuoF nuoE TRUE 0.998 4.000 0.343 0.005 Y NA
 253814 253815 XCC2524 XCC2525 nuoE nuoD TRUE 0.999 -3.000 0.355 0.005 Y NA
 253815 253816 XCC2525 XCC2526 nuoD nuoC TRUE 0.999 -3.000 0.483 0.005 Y NA
 253816 253817 XCC2526 XCC2527 nuoC nuoB TRUE 0.981 37.000 0.328 0.002 Y NA
 253817 253818 XCC2527 XCC2528 nuoB nuoA TRUE 0.996 -30.000 0.507 0.002 Y NA
 253818 399369 XCC2528 XCC2529 nuoA tRNA-Leu FALSE 0.254 106.000 0.000 NA   NA
 399369 253819 XCC2529 XCC2530 tRNA-Leu secG FALSE 0.258 50.000 0.000 NA   NA
 253819 253820 XCC2530 XCC2531 secG tpiA TRUE 0.787 34.000 0.184 1.000 N NA
 253821 253822 XCC2532 XCC2533     TRUE 0.695 55.000 0.125 NA   NA
 253823 253824 XCC2534 XCC2535 glbN   TRUE 0.995 -3.000 0.619 NA   NA
 253824 2165644 XCC2535 XCC2536     TRUE 0.862 -54.000 0.070 NA   NA
 2165644 253826 XCC2536 XCC2537     TRUE 0.983 -3.000 0.143 1.000   NA
 253826 253827 XCC2537 XCC2538     FALSE 0.519 49.000 0.023 1.000   NA
 253827 253828 XCC2538 XCC2539   mrsA FALSE 0.370 115.000 0.005 1.000   NA
 253828 253829 XCC2539 XCC2540 mrsA accD TRUE 0.900 -3.000 0.008 1.000 N NA
 253829 253830 XCC2540 XCC2541 accD trpA FALSE 0.478 202.000 0.232 1.000 N NA
 253830 253831 XCC2541 XCC2542 trpA   TRUE 0.939 -3.000 0.008 1.000   NA
 253831 253832 XCC2542 XCC2543   trpB TRUE 0.681 -69.000 0.005 1.000   NA
 253834 253835 XCC2545 XCC2546 trpF truA TRUE 0.977 -3.000 0.139 1.000 N NA
 253835 253836 XCC2546 XCC2547 truA   FALSE 0.437 40.000 0.003 NA   NA
 253836 253837 XCC2547 XCC2548   fimV TRUE 0.983 -3.000 0.143 NA   NA
 253837 253838 XCC2548 XCC2549 fimV asd FALSE 0.010 711.000 0.008 NA N NA
 253838 253839 XCC2549 XCC2550 asd   TRUE 0.711 85.000 0.008 0.006 N NA
 253839 253840 XCC2550 XCC2551   aroC TRUE 0.748 -7.000 0.005 1.000 N NA
 253840 253841 XCC2551 XCC2552 aroC   TRUE 0.713 -10.000 0.000 NA   NA
 253841 253842 XCC2552 XCC2553   yfcB FALSE 0.342 35.000 0.000 NA   NA
 253843 253844 XCC2554 XCC2555   dpsD TRUE 0.970 -3.000 0.051 1.000   NA
 253844 253845 XCC2555 XCC2556 dpsD   FALSE 0.046 283.000 0.000 NA   NA
 2165645 253850 XCC2560 XCC2561     TRUE 0.538 -70.000 0.000 NA   NA
 253854 253855 XCC2565 XCC2566     FALSE 0.080 219.000 0.000 1.000   NA
 253855 253856 XCC2566 XCC2567     TRUE 0.931 -3.000 0.017 1.000 N NA
 253856 253857 XCC2567 XCC2568     TRUE 0.676 28.000 0.017 NA   NA
 253857 253858 XCC2568 XCC2569     FALSE 0.028 343.000 0.000 NA   NA
 253859 2165647 XCC2570 XCC2571 dcd   TRUE 0.617 96.000 0.112 1.000 N NA
 253861 253862 XCC2572 XCC2573 btuB oar FALSE 0.300 363.000 0.000 0.021 Y NA
 253862 253863 XCC2573 XCC2574 oar   FALSE 0.008 340.000 0.000 1.000 N NA
 253863 253864 XCC2574 XCC2575     FALSE 0.361 364.000 0.000 0.002 Y NA
 253864 253865 XCC2575 XCC2576     TRUE 0.948 185.000 0.400 0.002 Y NA
 253866 253867 XCC2577 XCC2578     TRUE 0.624 42.000 0.046 1.000   NA
 253867 253868 XCC2578 XCC2579     FALSE 0.028 203.000 0.000 1.000 N NA
 253868 253869 XCC2579 XCC2580   dadA TRUE 0.919 -3.000 0.013 1.000 N NA
 253869 253870 XCC2580 XCC2581 dadA yxaH TRUE 0.982 4.000 0.231 NA   NA
 253870 253871 XCC2581 XCC2582 yxaH slyD TRUE 0.674 91.000 0.098 NA   NA
 253872 253873 XCC2583 XCC2584     TRUE 0.973 110.000 1.000 NA Y NA
 253875 253876 XCC2586 XCC2587     TRUE 0.915 68.000 0.800 NA   NA
 253876 253877 XCC2587 XCC2588     TRUE 0.738 24.000 0.024 NA   NA
 253877 253878 XCC2588 XCC2589   oprO TRUE 0.692 29.000 0.024 NA   NA
 253878 253879 XCC2589 XCC2590 oprO pilR TRUE 0.763 22.000 0.062 1.000 N NA
 253879 253880 XCC2590 XCC2591 pilR   FALSE 0.437 166.000 0.000 0.070   NA
 253880 253881 XCC2591 XCC2592     FALSE 0.516 19.000 0.000 1.000   NA
 253884 253885 XCC2595 XCC2596   gltT FALSE 0.294 170.000 0.012 1.000   NA
 253886 253887 XCC2597 XCC2598 phoA mesJ FALSE 0.208 76.000 0.002 1.000 N NA
 253887 253888 XCC2598 XCC2599 mesJ xseB FALSE 0.389 32.000 0.006 1.000 N NA
 253888 253889 XCC2599 XCC2600 xseB ispA TRUE 0.977 1.000 0.177 1.000 N NA
 253889 253890 XCC2600 XCC2601 ispA   FALSE 0.014 482.000 0.000 NA   NA
 253890 253891 XCC2601 XCC2602     FALSE 0.422 28.000 0.000 NA   NA
 253892 253893 XCC2603 XCC2604   pmbA FALSE 0.383 128.000 0.008 NA   NA
 253897 253898 XCC2608 XCC2609   rng TRUE 0.699 170.000 0.296 NA   NA
 253898 253899 XCC2609 XCC2610 rng   TRUE 0.990 1.000 0.417 NA N NA
 253900 253901 XCC2611 XCC2612 bp26 tonB FALSE 0.020 383.000 0.000 1.000   NA
 253904 253905 XCC2615 XCC2616   nadD TRUE 0.569 57.000 0.044 NA   NA
 253905 253906 XCC2616 XCC2617 nadD holA TRUE 0.891 -3.000 0.006 1.000 N NA
 253906 253907 XCC2617 XCC2618 holA rlpB TRUE 0.877 22.000 0.199 NA N NA
 253907 253908 XCC2618 XCC2619 rlpB leuS FALSE 0.146 408.000 0.182 NA   NA
 253908 253909 XCC2619 XCC2620 leuS leuS TRUE 0.906 -88.000 0.021 0.032   NA
 253909 253910 XCC2620 XCC2621 leuS   FALSE 0.362 73.000 0.005 NA   NA
 253911 253912 XCC2622 XCC2623 trx   FALSE 0.420 122.000 0.011 NA   NA
 253912 253913 XCC2623 XCC2624     FALSE 0.146 171.000 0.000 NA   NA
 253913 253914 XCC2624 XCC2625     FALSE 0.067 238.000 0.000 NA   NA
 253916 253917 XCC2627 XCC2628     FALSE 0.432 278.000 0.000 0.042 Y NA
 253917 253918 XCC2628 XCC2629     FALSE 0.005 1156.000 0.000 NA   NA
 253918 253919 XCC2629 XCC2630     FALSE 0.507 60.000 0.026 NA   NA
 253922 253923 XCC2633 XCC2634 bapA yjl094C FALSE 0.104 317.000 0.000 0.054 N NA
 253923 253924 XCC2634 XCC2635 yjl094C   FALSE 0.039 304.000 0.000 NA   NA
 253924 253925 XCC2635 XCC2636     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 253925 253926 XCC2636 XCC2637   menG TRUE 0.735 40.000 0.167 NA N NA
 253927 253928 XCC2638 XCC2639     FALSE 0.008 673.000 0.000 NA   NA
 253929 253930 XCC2640 XCC2641     FALSE 0.508 57.000 0.057 1.000 N NA
 253930 253931 XCC2641 XCC2642   deaD FALSE 0.125 176.000 0.004 1.000 N NA
 253932 253933 XCC2643 XCC2644 rfaY   TRUE 0.875 31.000 0.231 NA   NA
 253933 253934 XCC2644 XCC2645     FALSE 0.212 183.000 0.005 NA   NA
 253934 253935 XCC2645 XCC2646     FALSE 0.098 203.000 0.000 NA   NA
 253936 253937 XCC2647 XCC2648 visC   FALSE 0.503 112.000 0.021 NA   NA
 253937 253938 XCC2648 XCC2649     TRUE 0.856 26.000 0.138 NA   NA
 253938 253939 XCC2649 XCC2650     FALSE 0.247 113.000 0.000 NA   NA
 253939 253940 XCC2650 XCC2651     TRUE 0.705 66.000 0.154 NA   NA
 253941 253942 XCC2652 XCC2653 Ada ogt TRUE 0.999 -3.000 0.275 0.001 Y NA
 253942 253943 XCC2653 XCC2654 ogt   FALSE 0.038 450.000 0.013 1.000   NA
 253943 253944 XCC2654 XCC2655   yadQ FALSE 0.479 46.000 0.013 1.000   NA
 253945 253946 XCC2656 XCC2657     TRUE 0.936 109.000 1.000 NA   NA
 253947 253948 XCC2658 XCC2659 phuR   FALSE 0.007 361.000 0.000 1.000 N NA
 253948 253949 XCC2659 XCC2660     TRUE 0.992 -3.000 0.400 1.000   NA
 253950 253951 XCC2661 XCC2662 qxtB qxtA TRUE 0.987 16.000 0.154 0.044 Y NA
 253951 253952 XCC2662 XCC2663 qxtA   TRUE 0.945 13.000 0.154 NA   NA
 253952 253953 XCC2663 XCC2664     TRUE 0.991 0.000 0.333 NA   NA
 253954 253955 XCC2665 XCC2666 fhuA   FALSE 0.006 793.000 0.000 1.000   NA
 253955 253956 XCC2666 XCC2667     TRUE 0.823 31.000 0.000 0.003   NA
 253956 253957 XCC2667 XCC2668     TRUE 0.860 2.000 0.000 NA   NA
 253957 253958 XCC2668 XCC2669     FALSE 0.043 288.000 0.000 NA   NA
 253959 253960 XCC2670 XCC2671 mocA mocA TRUE 0.551 -55.000 0.000 NA   NA
 253960 253961 XCC2671 XCC2672 mocA araJ TRUE 0.851 61.000 0.158 0.054   NA
 253962 253963 XCC2673 XCC2674     FALSE 0.007 754.000 0.000 1.000   NA
 253963 253964 XCC2674 XCC2675     TRUE 0.860 2.000 0.000 NA   NA
 253964 253965 XCC2675 XCC2676     FALSE 0.010 585.000 0.000 NA   NA
 253968 253969 XCC2679 XCC2680     FALSE 0.014 272.000 0.000 1.000 N NA
 253969 253970 XCC2680 XCC2681   oprM TRUE 0.709 26.000 0.053 1.000 N NA
 253970 253971 XCC2681 XCC2682 oprM mexB TRUE 0.992 2.000 0.263 0.042 N NA
 253971 253972 XCC2682 XCC2683 mexB mexA TRUE 0.936 16.000 0.278 1.000 N NA
 253974 253975 XCC2685 XCC2686   gluS TRUE 0.732 14.000 0.012 1.000 N NA
 253975 253976 XCC2686 XCC2687 gluS   FALSE 0.353 70.000 0.004 NA   NA
 253976 253977 XCC2687 XCC2688   nthA FALSE 0.511 137.000 0.038 NA   NA
 253977 253978 XCC2688 XCC2689 nthA   TRUE 0.855 60.000 0.437 1.000   NA
 253978 253979 XCC2689 XCC2690     FALSE 0.342 35.000 0.000 NA   NA
 253979 253980 XCC2690 XCC2691     FALSE 0.234 74.000 0.000 NA   NA
 253980 253981 XCC2691 XCC2692   creD FALSE 0.520 47.000 0.019 NA   NA
 253983 253984 XCC2694 XCC2695 creC creB TRUE 0.694 358.000 0.776 1.000 Y NA
 253985 253986 XCC2696 XCC2697     FALSE 0.268 167.000 0.007 1.000   NA
 253986 253987 XCC2697 XCC2698   mfd FALSE 0.007 702.000 0.002 1.000 N NA
 253987 253988 XCC2698 XCC2699 mfd   FALSE 0.002 752.000 0.000 NA N NA
 253988 253989 XCC2699 XCC2700   cheA TRUE 0.994 10.000 0.455 NA Y NA
 253989 253990 XCC2700 XCC2701 cheA mcp TRUE 0.799 225.000 0.091 0.012 Y NA
 253990 253991 XCC2701 XCC2702 mcp cheW TRUE 0.999 11.000 1.000 0.012 Y NA
 253991 253992 XCC2702 XCC2703 cheW vieA TRUE 0.977 27.000 0.500 1.000 Y NA
 253992 253993 XCC2703 XCC2704 vieA cheR TRUE 0.976 -16.000 0.136 1.000 Y NA
 253993 253994 XCC2704 XCC2705 cheR cheB TRUE 0.974 15.000 0.136 1.000 Y NA
 253996 253997 XCC2707 XCC2708     TRUE 0.946 18.000 0.000 0.064 Y NA
 253997 253998 XCC2708 XCC2709     TRUE 0.812 63.000 0.000 0.064 Y NA
 253999 254000 XCC2710 XCC2711     TRUE 0.851 166.000 0.667 NA   NA
 254000 254001 XCC2711 XCC2712   gpm TRUE 0.588 85.000 0.045 NA   NA
 254002 254003 XCC2713 XCC2714 nfi   FALSE 0.024 366.000 0.000 NA   NA
 254003 254004 XCC2714 XCC2715     FALSE 0.060 250.000 0.000 NA   NA
 254005 254006 XCC2716 XCC2717     TRUE 0.590 34.000 0.014 NA   NA
 254007 254008 XCC2718 XCC2719 cstA   TRUE 0.983 0.000 0.156 NA   NA
 254010 254011 XCC2721 XCC2722 plaS   TRUE 0.844 37.000 0.250 NA   NA
 254012 254013 XCC2723 XCC2724     TRUE 0.623 266.000 0.667 NA   NA
 254013 254014 XCC2724 XCC2725     FALSE 0.005 939.000 0.000 NA   NA
 254014 254015 XCC2725 XCC2726     FALSE 0.008 676.000 0.000 NA   NA
 254015 254016 XCC2726 XCC2727   yagR TRUE 0.687 30.000 0.056 NA N NA
 254016 254017 XCC2727 XCC2728 yagR yagS TRUE 0.999 2.000 0.917 0.001 Y NA
 254017 254018 XCC2728 XCC2729 yagS yagT TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.044 Y NA
 254018 254019 XCC2729 XCC2730 yagT   FALSE 0.326 334.000 0.000 0.044 Y NA
 254021 254022 XCC2732 XCC2733     TRUE 0.985 -16.000 0.759 NA   NA
 254022 254023 XCC2733 XCC2734     TRUE 0.831 4.000 0.000 NA   NA
 254023 254024 XCC2734 XCC2735   ssb FALSE 0.050 273.000 0.000 NA   NA
 254026 254027 XCC2737 XCC2738   murD FALSE 0.030 199.000 0.000 1.000 N NA
 254027 254028 XCC2738 XCC2739 murD   TRUE 0.840 -19.000 0.019 NA   NA
 254028 254029 XCC2739 XCC2740     TRUE 0.978 -3.000 0.091 NA   NA
 254029 254030 XCC2740 XCC2741   lysA TRUE 0.836 -16.000 0.014 NA   NA
 254031 254032 XCC2742 XCC2743     TRUE 0.982 32.000 0.800 0.011   NA
 254033 254034 XCC2744 XCC2745   osmC FALSE 0.238 183.000 0.011 1.000   NA
 254034 254035 XCC2745 XCC2746 osmC pyrB FALSE 0.004 445.000 0.000 1.000 N NA
 254035 254036 XCC2746 XCC2747 pyrB   TRUE 0.753 16.000 0.022 1.000 N NA
 254036 254037 XCC2747 XCC2748   algH TRUE 0.966 -7.000 0.263 NA N NA
 254038 254039 XCC2749 XCC2750   tag TRUE 0.971 -3.000 0.051 NA   NA
 254039 254040 XCC2750 XCC2751 tag   TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 254040 254041 XCC2751 XCC2752     FALSE 0.082 223.000 0.000 NA   NA
 254042 254043 XCC2753 XCC2754   pilU FALSE 0.040 298.000 0.000 NA   NA
 254043 254044 XCC2754 XCC2755 pilU pilT TRUE 0.973 123.000 0.436 0.013 Y NA
 254045 254046 XCC2756 XCC2757   proC TRUE 0.959 -31.000 0.357 NA   NA
 254046 254047 XCC2757 XCC2758 proC hup FALSE 0.010 545.000 0.000 1.000   NA
 254047 254048 XCC2758 XCC2759 hup   TRUE 0.756 144.000 0.286 1.000   NA
 254048 254049 XCC2759 XCC2760     TRUE 0.803 78.000 0.286 NA   NA
 254049 254050 XCC2760 XCC2761     TRUE 0.909 54.000 0.667 NA   NA
 254050 254051 XCC2761 XCC2762     TRUE 0.538 211.000 0.250 NA   NA
 254052 254053 XCC2763 XCC2764 pfpI   TRUE 0.877 108.000 0.500 1.000   NA
 254054 254055 XCC2765 XCC2766   ynhE TRUE 0.854 16.000 0.078 1.000 N NA
 254055 254056 XCC2766 XCC2767 ynhE ynhD TRUE 0.909 165.000 0.466 1.000 Y NA
 254056 254057 XCC2767 XCC2768 ynhD ynhC TRUE 0.997 0.000 0.482 1.000 Y NA
 254057 254058 XCC2768 XCC2769 ynhC nifS TRUE 0.953 -3.000 0.041 1.000 N NA
 254058 254059 XCC2769 XCC2770 nifS   TRUE 0.604 213.000 0.066 0.012   NA
 254059 254060 XCC2770 XCC2771   bedB TRUE 0.987 -3.000 0.217 1.000   NA
 254060 254061 XCC2771 XCC2772 bedB fhuA FALSE 0.151 344.000 0.000 1.000 Y NA
 254061 254062 XCC2772 XCC2773 fhuA   TRUE 0.827 49.000 0.312 1.000   NA
 254062 254063 XCC2773 XCC2774     TRUE 0.972 -7.000 0.250 1.000   NA
 254063 254064 XCC2774 XCC2775     TRUE 0.939 6.000 0.038 NA   NA
 254064 254065 XCC2775 XCC2776     TRUE 0.971 24.000 0.848 NA   NA
 254065 254066 XCC2776 XCC2777     TRUE 0.892 152.000 0.808 NA   NA
 254066 254067 XCC2777 XCC2778   apbE FALSE 0.448 273.000 0.462 1.000 N NA
 254067 254068 XCC2778 XCC2779 apbE   TRUE 0.992 -3.000 0.500 1.000 N NA
 254069 254070 XCC2780 XCC2781   comEA FALSE 0.013 502.000 0.000 NA   NA
 254071 254072 XCC2782 XCC2783 dapE   FALSE 0.155 164.000 0.000 1.000   NA
 254072 254073 XCC2783 XCC2784     FALSE 0.394 55.000 0.006 NA   NA
 254073 254074 XCC2784 XCC2785   glgC TRUE 0.995 -3.000 0.642 NA   NA
 254075 254076 XCC2786 XCC2787   perM TRUE 0.988 -3.000 0.217 NA   NA
 254076 254077 XCC2787 XCC2788 perM   TRUE 0.977 -3.000 0.087 NA   NA
 2165649 254079 XCC2789 XCC2790 purM   TRUE 0.724 17.000 0.005 NA   NA
 254079 254080 XCC2790 XCC2791   purN TRUE 0.574 35.000 0.014 NA   NA
 254080 2165650 XCC2791 XCC2792 purN   FALSE 0.481 64.000 0.020 NA   NA
 2165650 2165651 XCC2792 XCC2793     TRUE 0.995 4.000 1.000 NA   NA
 254083 254084 XCC2794 XCC2795   murA TRUE 0.949 -3.000 0.013 1.000   NA
 254084 254085 XCC2795 XCC2796 murA   TRUE 0.633 114.000 0.129 NA N NA
 254086 254087 XCC2797 XCC2798 kpsF   TRUE 0.900 49.000 0.598 1.000   NA
 254087 254088 XCC2798 XCC2799     TRUE 0.995 -3.000 0.617 NA   NA
 254088 254089 XCC2799 XCC2800     TRUE 0.971 -22.000 0.459 NA   NA
 254089 254090 XCC2800 XCC2801   yhbG TRUE 0.994 0.000 0.543 NA   NA
 254090 254091 XCC2801 XCC2802 yhbG rpoN TRUE 0.778 40.000 0.163 1.000   NA
 254091 254092 XCC2802 XCC2803 rpoN   FALSE 0.511 88.000 0.050 NA N NA
 254092 254093 XCC2803 XCC2804   ptsN TRUE 0.669 22.000 0.022 NA N NA
 254093 254094 XCC2804 XCC2805 ptsN ptsK TRUE 0.991 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 254094 254095 XCC2805 XCC2806 ptsK   TRUE 0.906 21.000 0.194 NA   NA
 254095 254096 XCC2806 XCC2807     FALSE 0.101 508.000 0.171 NA   NA
 254096 254097 XCC2807 XCC2808   ptsH TRUE 0.997 -7.000 0.261 0.002 Y NA
 254097 254098 XCC2808 XCC2809 ptsH ptsI TRUE 0.963 59.000 0.205 0.002 Y NA
 254098 254099 XCC2809 XCC2810 ptsI mgtE FALSE 0.403 144.000 0.042 1.000 N NA
 254099 254100 XCC2810 XCC2811 mgtE   FALSE 0.443 99.000 0.012 1.000   NA
 254101 254102 XCC2812 XCC2813 qxtB   TRUE 0.999 0.000 0.667 0.044 Y NA
 254102 254103 XCC2813 XCC2814   gabP FALSE 0.006 367.000 0.000 1.000 N NA
 254103 254104 XCC2814 XCC2815 gabP pelB FALSE 0.005 431.000 0.000 1.000 N NA
 254106 254107 XCC2817 XCC2818   ahyR FALSE 0.236 439.000 0.520 1.000 N NA
 254108 254109 XCC2819 XCC2820     FALSE 0.013 500.000 0.000 NA   NA
 254109 2165652 XCC2820 XCC2821     TRUE 0.529 -76.000 0.000 NA   NA
 2165653 254112 XCC2822 XCC2823 cheB   FALSE 0.008 699.000 0.000 NA   NA
 254114 254115 XCC2825 XCC2826 prnA   TRUE 0.929 38.000 0.647 NA   NA
 254115 254116 XCC2826 XCC2827     TRUE 0.988 11.000 0.647 NA   NA
 254116 254117 XCC2827 XCC2828   fecA TRUE 0.846 97.000 0.364 NA   NA
 254117 254118 XCC2828 XCC2829 fecA   FALSE 0.007 739.000 0.000 1.000   NA
 254118 254119 XCC2829 XCC2830     FALSE 0.239 76.000 0.000 NA   NA
 254119 254120 XCC2830 XCC2831   soxR FALSE 0.392 31.000 0.000 NA   NA
 254122 254123 XCC2833 XCC2834     TRUE 0.986 2.000 0.244 NA   NA
 254123 254124 XCC2834 XCC2835     TRUE 0.978 13.000 0.470 NA   NA
 254124 254125 XCC2835 XCC2836     TRUE 0.897 35.000 0.379 NA   NA
 254125 254126 XCC2836 XCC2837     TRUE 0.991 3.000 0.455 NA   NA
 254126 254127 XCC2837 XCC2838     TRUE 0.853 27.000 0.143 NA   NA
 254127 254128 XCC2838 XCC2839     TRUE 0.989 13.000 0.911 NA   NA
 254128 254129 XCC2839 XCC2840   pdxH FALSE 0.344 131.000 0.004 NA   NA
 254130 254131 XCC2841 XCC2842 aroK aroB TRUE 0.995 -3.000 0.208 1.000 Y NA
 254131 254132 XCC2842 XCC2843 aroB   FALSE 0.010 905.000 0.002 NA   NA
 254132 254133 XCC2843 XCC2844   hemE TRUE 0.813 13.000 0.006 NA   NA
 254133 254134 XCC2844 XCC2845 hemE emrA FALSE 0.001 981.000 0.000 1.000 N NA
 254135 2165654 XCC2846 XCC2847     FALSE 0.207 484.000 0.000 0.013 Y NA
 2165654 254137 XCC2847 XCC2848     TRUE 0.852 76.000 0.000 0.013 Y NA
 254138 254139 XCC2849 XCC2850   yodB TRUE 0.988 -3.000 0.222 NA   NA
 254139 254140 XCC2850 XCC2851 yodB   TRUE 0.939 11.000 0.080 NA   NA
 254142 254143 XCC2853 XCC2854 sdaA   FALSE 0.003 591.000 0.000 1.000 N NA
 2165655 254145 XCC2855 XCC2856   metB TRUE 0.842 42.000 0.039 1.000 Y NA
 254145 254146 XCC2856 XCC2857 metB metA TRUE 0.993 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 2165656 254148 XCC2858 XCC2859   prfC FALSE 0.252 116.000 0.006 1.000 N NA
 254148 254149 XCC2859 XCC2860 prfC hly3 FALSE 0.389 76.000 0.008 1.000   NA
 254149 254150 XCC2860 XCC2861 hly3   TRUE 0.525 52.000 0.025 NA   NA
 254151 254152 XCC2862 XCC2863   gtrB TRUE 0.907 -40.000 0.128 NA   NA
 254152 254153 XCC2863 XCC2864 gtrB mtgA TRUE 0.861 12.000 0.013 NA   NA
 254154 254155 XCC2865 XCC2866     FALSE 0.402 123.000 0.010 1.000   NA
 254155 254156 XCC2866 XCC2867   btuB FALSE 0.071 228.000 0.000 1.000   NA
 254158 254159 XCC2869 XCC2870     TRUE 0.968 -3.000 0.045 1.000   NA
 254160 254161 XCC2871 XCC2872     FALSE 0.481 57.000 0.017 NA   NA
 254162 254163 XCC2873 XCC2874 bla   FALSE 0.004 1387.000 0.000 NA   NA
 254164 254165 XCC2875 XCC2876   gcvH FALSE 0.005 1050.000 0.000 NA   NA
 254165 254166 XCC2876 XCC2877 gcvH gcvT TRUE 0.968 140.000 0.317 0.001 Y NA
 254166 254167 XCC2877 XCC2878 gcvT   FALSE 0.115 208.000 0.008 NA N NA
 254167 254168 XCC2878 XCC2879     TRUE 0.995 4.000 0.313 NA Y NA
 254168 254169 XCC2879 XCC2880     FALSE 0.027 352.000 0.000 NA   NA
 254169 254170 XCC2880 XCC2881     TRUE 0.937 -3.000 0.006 NA   NA
 254170 2165657 XCC2881 XCC2882   cysQ FALSE 0.506 35.000 0.007 1.000   NA
 2165657 254172 XCC2882 XCC2883 cysQ nudE TRUE 0.990 -3.000 0.373 1.000 N NA
 254173 254174 XCC2884 XCC2885 bioA   TRUE 0.915 -9.000 0.041 NA   NA
 254176 254177 XCC2887 XCC2888 iroN fucA1 TRUE 0.693 203.000 0.600 1.000 N NA
 254177 254178 XCC2888 XCC2889 fucA1   TRUE 0.980 15.000 0.214 0.012   NA
 254178 254179 XCC2889 XCC2890   nahA TRUE 0.830 180.000 0.286 0.012   NA
 254179 254180 XCC2890 XCC2891 nahA   TRUE 0.989 -823.000 0.417 0.012 Y NA
 254180 254181 XCC2891 XCC2892     TRUE 0.875 262.000 0.500 0.023 Y NA
 254181 254182 XCC2892 XCC2893     TRUE 0.862 88.000 0.429 1.000   NA
 254182 254183 XCC2893 XCC2894     TRUE 0.940 137.000 0.600 0.033   NA
 254183 254184 XCC2894 XCC2895   bga TRUE 0.772 218.000 0.300 1.000 Y NA
 254185 254186 XCC2896 XCC2897 psvA   FALSE 0.015 444.000 0.000 1.000   NA
 254186 254187 XCC2897 XCC2898     TRUE 0.845 45.000 0.000 0.063 Y NA
 254187 2165658 XCC2898 XCC2899     FALSE 0.005 1108.000 0.000 NA   NA
 2165658 254189 XCC2899 XCC2900     FALSE 0.007 756.000 0.000 NA   NA
 254190 254191 XCC2901 XCC2902   hsdM TRUE 0.970 18.000 0.291 0.063   NA
 254191 254192 XCC2902 XCC2903 hsdM   TRUE 0.917 -13.000 0.073 NA   NA
 254192 254193 XCC2903 XCC2904     FALSE 0.052 268.000 0.000 NA   NA
 254193 254194 XCC2904 XCC2905     TRUE 0.999 -3.000 0.265 0.001 Y NA
 254194 254195 XCC2905 XCC2906     TRUE 0.995 -3.000 0.644 NA   NA
 254195 254196 XCC2906 XCC2907     FALSE 0.018 416.000 0.000 NA   NA
 254199 254200 XCC2910 XCC2911     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 254200 254201 XCC2911 XCC2912     TRUE 0.740 -7.000 0.000 1.000   NA
 254201 254202 XCC2912 XCC2913   cutC FALSE 0.025 218.000 0.000 1.000 N NA
 254202 2165659 XCC2913 XCC2914 cutC aspG TRUE 0.759 18.000 0.038 1.000 N NA
 2165660 254205 XCC2915 XCC2916     TRUE 0.739 88.000 0.168 1.000   NA
 254205 254206 XCC2916 XCC2917     TRUE 0.956 -3.000 0.017 NA   NA
 254207 254208 XCC2918 XCC2919 rimJ   FALSE 0.035 308.000 0.000 1.000   NA
 254208 254209 XCC2919 XCC2920     TRUE 0.891 35.000 0.071 0.012   NA
 254209 254210 XCC2920 XCC2921   pilL TRUE 0.993 8.000 0.054 0.012 Y NA
 254210 254211 XCC2921 XCC2922 pilL pilJ TRUE 0.979 63.000 0.554 0.012 Y NA
 254211 254212 XCC2922 XCC2923 pilJ pilI TRUE 0.989 40.000 0.795 0.012 Y NA
 254212 254213 XCC2923 XCC2924 pilI pilH TRUE 0.992 -3.000 0.076 1.000 Y NA
 254213 254214 XCC2924 XCC2925 pilH pilG TRUE 0.981 18.000 0.085 0.021 Y NA
 254215 254216 XCC2926 XCC2927 gshB tonB TRUE 0.969 -3.000 0.089 1.000 N NA
 254217 254218 XCC2928 XCC2929 draG   TRUE 0.983 0.000 0.002 NA Y NA
 254218 254219 XCC2929 XCC2930   yoaA FALSE 0.054 476.000 0.082 1.000 N NA
 254219 254220 XCC2930 XCC2931 yoaA   FALSE 0.012 505.000 0.000 1.000   NA
 254220 254221 XCC2931 XCC2932   ponB TRUE 0.865 13.000 0.021 1.000   NA
 254223 254224 XCC2934 XCC2935     FALSE 0.429 -655.000 0.000 NA   NA
 254224 254225 XCC2935 XCC2936   relA FALSE 0.110 186.000 0.000 1.000   NA
 254226 254227 XCC2937 XCC2938 pqqG pqqC TRUE 0.999 -3.000 0.825 0.001   NA
 254227 254228 XCC2938 XCC2939 pqqC pqqC/D TRUE 0.998 -3.000 0.404 0.001   NA
 254228 254229 XCC2939 XCC2940 pqqC/D pqqE TRUE 0.998 -3.000 0.361 0.001   NA
 254229 254230 XCC2940 XCC2941 pqqE   FALSE 0.458 61.000 0.015 NA   NA
 254230 254231 XCC2941 XCC2942     FALSE 0.054 263.000 0.000 NA   NA
 254231 254232 XCC2942 XCC2943   glk FALSE 0.028 343.000 0.000 NA   NA
 254232 254233 XCC2943 XCC2944 glk fepA TRUE 0.822 107.000 0.400 1.000 N NA
 254235 254236 XCC2946 XCC2947   recQ FALSE 0.027 355.000 0.005 1.000 N NA
 254236 254237 XCC2947 XCC2948 recQ   FALSE 0.382 140.000 0.011 NA   NA
 254237 254238 XCC2948 XCC2949     TRUE 0.829 79.000 0.333 NA   NA
 254238 2165662 XCC2949 XCC2950     FALSE 0.005 1002.000 0.000 NA   NA
 254242 254243 XCC2953 XCC2954   yggA FALSE 0.150 166.000 0.000 1.000   NA
 254247 254248 XCC2958 XCC2959 exsF exsG TRUE 0.997 -3.000 0.083 0.026 Y NA
 254248 254249 XCC2959 XCC2960 exsG   FALSE 0.248 55.000 0.000 NA   NA
 254252 254253 XCC2963 XCC2964 umuD umuC TRUE 0.972 0.000 0.111 NA N NA
 254253 254254 XCC2964 XCC2965 umuC   FALSE 0.002 719.000 0.000 1.000 N NA
 254254 254255 XCC2965 XCC2966     TRUE 0.972 0.000 0.065 NA   NA
 254256 254257 XCC2967 XCC2968     TRUE 0.911 -82.000 0.200 NA   NA
 254257 254258 XCC2968 XCC2969   Q TRUE 0.819 26.000 0.087 NA   NA
 254258 254259 XCC2969 XCC2970 Q P TRUE 0.991 0.000 0.348 NA   NA
 254260 254261 XCC2971 XCC2972 O N TRUE 0.822 49.000 0.300 1.000   NA
 254261 254262 XCC2972 XCC2973 N M TRUE 0.990 4.000 0.500 1.000   NA
 254262 254263 XCC2973 XCC2974 M L TRUE 0.903 99.000 0.136 0.001   NA
 254263 254264 XCC2974 XCC2975 L X TRUE 0.973 0.000 0.068 NA   NA
 254264 254265 XCC2975 XCC2976 X orf89 TRUE 0.995 5.000 1.000 NA   NA
 254265 254266 XCC2976 XCC2977 orf89 orf90 TRUE 0.990 -7.000 0.750 NA   NA
 254266 254267 XCC2977 XCC2978 orf90 lys TRUE 0.989 -3.000 0.250 NA   NA
 254267 254268 XCC2978 XCC2979 lys   TRUE 0.988 0.000 0.250 NA   NA
 254268 254269 XCC2979 XCC2980   R TRUE 0.988 -3.000 0.217 NA   NA
 254269 254270 XCC2980 XCC2981 R S TRUE 0.942 -12.000 0.130 NA   NA
 254270 254271 XCC2981 XCC2982 S J FALSE 0.005 1131.000 0.000 NA   NA
 254271 254272 XCC2982 XCC2983 J I TRUE 0.985 -7.000 0.500 NA   NA
 254272 254273 XCC2983 XCC2984 I orf8 TRUE 0.995 4.000 0.833 NA   NA
 254273 254274 XCC2984 XCC2985 orf8   TRUE 0.564 -46.000 0.000 NA   NA
 254274 254275 XCC2985 XCC2986   V FALSE 0.246 79.000 0.000 NA   NA
 254275 254276 XCC2986 XCC2987 V W TRUE 0.990 -3.000 0.286 NA   NA
 254276 254277 XCC2987 XCC2988 W FI TRUE 0.974 12.000 0.333 NA   NA
 254277 254278 XCC2988 XCC2989 FI FII TRUE 0.905 31.000 0.333 NA   NA
 254278 254279 XCC2989 XCC2990 FII E TRUE 0.908 46.000 0.600 NA   NA
 254279 254280 XCC2990 XCC2991 E orf52 TRUE 0.983 9.000 0.400 NA   NA
 254280 254281 XCC2991 XCC2992 orf52 T TRUE 0.877 30.000 0.222 NA   NA
 254281 254282 XCC2992 XCC2993 T U TRUE 0.970 13.000 0.333 NA   NA
 254282 254283 XCC2993 XCC2994 U D TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 254283 254284 XCC2994 XCC2995 D   FALSE 0.044 287.000 0.000 NA   NA
 254284 254285 XCC2995 XCC2996     FALSE 0.037 309.000 0.000 NA   NA
 254287 254288 XCC2998 XCC2999     FALSE 0.243 115.000 0.000 NA   NA
 254288 254289 XCC2999 XCC3000     FALSE 0.128 179.000 0.000 NA   NA
 254289 254290 XCC3000 XCC3001     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 254290 254291 XCC3001 XCC3002   orf37 TRUE 0.794 28.000 0.077 NA   NA
 254291 254292 XCC3002 XCC3003 orf37   FALSE 0.010 581.000 0.000 NA   NA
 254292 254293 XCC3003 XCC3004     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 254293 254294 XCC3004 XCC3005     FALSE 0.246 79.000 0.000 NA   NA
 254294 254295 XCC3005 XCC3006     TRUE 0.983 14.000 0.667 NA   NA
 254295 254296 XCC3006 XCC3007     TRUE 0.754 -7.000 0.000 NA   NA
 254296 254297 XCC3007 XCC3008     FALSE 0.253 93.000 0.000 NA   NA
 254297 254298 XCC3008 XCC3009     TRUE 0.867 177.000 1.000 NA   NA
 254298 254299 XCC3009 XCC3010     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 254299 254300 XCC3010 XCC3011     TRUE 0.967 -42.000 0.500 NA   NA
 254300 254301 XCC3011 XCC3012   int TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 399368 254302 XCC3013 XCC3014 tRNA-Lys exsB FALSE 0.268 47.000 0.000 NA   NA
 254302 254303 XCC3014 XCC3015 exsB   TRUE 0.585 197.000 0.270 1.000   NA
 254303 254304 XCC3015 XCC3016     TRUE 0.635 45.000 0.059 1.000   NA
 254304 254305 XCC3016 XCC3017   ompP6 TRUE 0.978 7.000 0.278 1.000   NA
 254305 254306 XCC3017 XCC3018 ompP6 tolB TRUE 0.866 58.000 0.592 1.000 N NA
 254306 254307 XCC3018 XCC3019 tolB tolA FALSE 0.365 265.000 0.215 NA   NA
 254307 254308 XCC3019 XCC3020 tolA tolR TRUE 0.980 -10.000 0.460 NA   NA
 254308 254309 XCC3020 XCC3021 tolR tolQ TRUE 0.977 92.000 0.556 0.051 Y NA
 254309 254310 XCC3021 XCC3022 tolQ   TRUE 0.984 12.000 0.593 1.000   NA
 254310 254311 XCC3022 XCC3023   ruvB TRUE 0.642 53.000 0.082 1.000   NA
 254311 254312 XCC3023 XCC3024 ruvB kup FALSE 0.005 1164.000 0.005 1.000 N NA
 254312 254313 XCC3024 XCC3025 kup ruvA FALSE 0.113 200.000 0.007 1.000 N NA
 254313 254314 XCC3025 XCC3026 ruvA ruvC TRUE 0.976 113.000 0.451 0.008 Y NA
 254314 254315 XCC3026 XCC3027 ruvC   TRUE 0.779 130.000 0.277 NA   NA
 254315 254316 XCC3027 XCC3028     FALSE 0.382 76.000 0.006 NA   NA
 254316 254317 XCC3028 XCC3029     FALSE 0.417 185.000 0.075 NA   NA
 254317 254318 XCC3029 XCC3030   aspS FALSE 0.026 348.000 0.000 1.000   NA
 254320 254321 XCC3032 XCC3033     TRUE 0.941 -3.000 0.007 NA   NA
 254322 2165663 XCC3034 XCC3035 ycaD   TRUE 0.867 60.000 0.125 NA Y NA
 2165663 254324 XCC3035 XCC3036   fhuA FALSE 0.044 171.000 0.000 1.000 N NA
 254324 254325 XCC3036 XCC3037 fhuA plcN FALSE 0.158 413.000 0.300 1.000 N NA
 254326 254327 XCC3038 XCC3039 xynB bla FALSE 0.025 216.000 0.000 1.000 N NA
 254329 254330 XCC3041 XCC3042   yheS TRUE 0.768 51.000 0.200 NA   NA
 254331 254332 XCC3043 XCC3044 bfeA   FALSE 0.088 217.000 0.000 NA   NA
 254332 2165664 XCC3044 XCC3045   bfeA FALSE 0.048 276.000 0.000 NA   NA
 2165664 2165665 XCC3045 XCC3046 bfeA bfeA FALSE 0.355 331.000 0.000 0.020 Y NA
 254336 254337 XCC3048 XCC3049 ybaL mphE FALSE 0.032 193.000 0.000 1.000 N NA
 254337 254338 XCC3049 XCC3050 mphE fecA TRUE 0.979 1.000 0.194 1.000 N NA
 254338 254339 XCC3050 XCC3051 fecA   TRUE 0.683 122.000 0.194 1.000 N NA
 254339 2165666 XCC3051 XCC3052     TRUE 0.993 -3.000 0.561 1.000 N NA
 2165666 254341 XCC3052 XCC3053   yceE TRUE 0.993 -3.000 0.463 1.000   NA
 254341 254342 XCC3053 XCC3054 yceE iucA TRUE 0.969 -22.000 0.433 1.000   NA
 254342 254343 XCC3054 XCC3055 iucA lysA TRUE 0.984 -3.000 0.222 1.000 N NA
 254344 254345 XCC3056 XCC3057   cobS FALSE 0.101 41.000 0.000 1.000 N NA
 254345 254346 XCC3057 XCC3058 cobS   TRUE 0.713 -3.000 0.000 NA N NA
 254346 254347 XCC3058 XCC3059   cobT TRUE 0.713 -3.000 0.000 NA N NA
 254347 254348 XCC3059 XCC3060 cobT cobU TRUE 0.994 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 254348 254349 XCC3060 XCC3061 cobU   TRUE 0.974 -12.000 0.079 1.000 Y NA
 254349 254350 XCC3061 XCC3062   cobD FALSE 0.133 1120.000 0.017 0.005 Y NA
 254350 254351 XCC3062 XCC3063 cobD cobB TRUE 0.949 23.000 0.000 0.005 Y NA
 254351 254352 XCC3063 XCC3064 cobB btuR TRUE 0.996 3.000 0.069 0.005 Y NA
 254352 2165667 XCC3064 XCC3065 btuR   TRUE 0.960 -3.000 0.024 NA   NA
 2165667 2165668 XCC3065 XCC3066     TRUE 0.798 42.000 0.200 NA   NA
 2165668 254355 XCC3066 XCC3067   btuB FALSE 0.234 123.000 0.000 NA   NA
 254355 254356 XCC3067 XCC3068 btuB metB FALSE 0.002 892.000 0.000 1.000 N NA
 254356 254357 XCC3068 XCC3069 metB   FALSE 0.123 183.000 0.000 NA   NA
 254357 254358 XCC3069 XCC3070   clpB FALSE 0.332 131.000 0.003 NA   NA
 254358 254359 XCC3070 XCC3071 clpB   FALSE 0.182 154.000 0.000 NA   NA
 254360 254361 XCC3072 XCC3073     TRUE 0.886 8.000 0.010 1.000   NA
 254362 254363 XCC3074 XCC3075     FALSE 0.188 150.000 0.000 NA   NA
 254363 254364 XCC3075 XCC3076     TRUE 0.986 -3.000 0.182 NA   NA
 254364 2165669 XCC3076 XCC3077     TRUE 0.706 138.000 0.182 NA   NA
 2165669 254366 XCC3077 XCC3078     TRUE 0.785 -252.000 0.057 NA   NA
 254367 254368 XCC3079 XCC3080 bfeA ostB FALSE 0.002 695.000 0.000 1.000 N NA
 254368 254369 XCC3080 XCC3081 ostB   TRUE 0.895 50.000 0.174 1.000 Y NA
 254369 254370 XCC3081 XCC3082   ostA TRUE 0.991 -3.000 0.057 1.000 Y NA
 254370 254371 XCC3082 XCC3083 ostA gcd FALSE 0.034 924.000 0.000 1.000 Y NA
 254371 254372 XCC3083 XCC3084 gcd mcp1 FALSE 0.003 533.000 0.000 1.000 N NA
 254373 254374 XCC3085 XCC3086     TRUE 0.904 -13.000 0.052 NA   NA
 254374 254375 XCC3086 XCC3087     TRUE 0.653 21.000 0.004 NA   NA
 254375 254376 XCC3087 XCC3088   rluD TRUE 0.981 2.000 0.168 NA   NA
 254377 254378 XCC3089 XCC3090 comL   FALSE 0.015 451.000 0.000 1.000   NA
 254379 254380 XCC3091 XCC3092     TRUE 0.953 -3.000 0.014 NA   NA
 254380 254381 XCC3092 XCC3093   sucD FALSE 0.012 518.000 0.000 NA   NA
 254381 254382 XCC3093 XCC3094 sucD sucC TRUE 0.996 25.000 0.806 0.001 Y NA
 254383 254384 XCC3095 XCC3096 pilS pilR TRUE 0.929 200.000 0.556 0.078 Y NA
 254385 254386 XCC3097 XCC3098 pilB   TRUE 0.891 65.000 0.013 0.013 Y NA
 254386 254387 XCC3098 XCC3099   pilE TRUE 0.889 80.000 0.000 0.001 Y NA
 254388 254389 XCC3100 XCC3101 pilC pilD TRUE 0.995 7.000 0.454 1.000 Y NA
 254389 254390 XCC3101 XCC3102 pilD   TRUE 0.905 14.000 0.122 1.000 N NA
 254390 254391 XCC3102 XCC3103     FALSE 0.013 499.000 0.000 NA   NA
 254391 254392 XCC3103 XCC3104     FALSE 0.236 75.000 0.000 NA   NA
 254392 254393 XCC3104 XCC3105     TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000   NA
 254394 254395 XCC3106 XCC3107 colS colR TRUE 0.889 170.000 0.400 1.000 Y NA
 254395 254396 XCC3107 XCC3108 colR rimK FALSE 0.002 650.000 0.000 1.000 N NA
 254398 254399 XCC3110 XCC3111 xrvA   TRUE 0.936 91.000 1.000 NA   NA
 254399 254400 XCC3111 XCC3112     FALSE 0.132 177.000 0.000 NA   NA
 254401 254402 XCC3113 XCC3114     TRUE 0.826 54.000 0.000 0.062 Y NA
 254402 2165670 XCC3114 XCC3115     FALSE 0.253 93.000 0.000 NA   NA
 2165670 254404 XCC3115 XCC3116     FALSE 0.157 167.000 0.000 NA   NA
 254404 254405 XCC3116 XCC3117     FALSE 0.028 345.000 0.000 NA   NA
 254405 254406 XCC3117 XCC3118     FALSE 0.010 596.000 0.000 NA   NA
 254406 254407 XCC3118 XCC3119     TRUE 0.976 -7.000 0.300 NA   NA
 254411 254412 XCC3123 XCC3124     TRUE 0.567 75.000 0.000 0.062   NA
 254413 254414 XCC3125 XCC3126     FALSE 0.020 398.000 0.000 NA   NA
 254414 254415 XCC3126 XCC3127     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 254415 254416 XCC3127 XCC3128     FALSE 0.020 398.000 0.000 NA   NA
 254416 254417 XCC3128 XCC3129   virB6 FALSE 0.230 69.000 0.000 NA   NA
 254417 2165671 XCC3129 XCC3130 virB6   TRUE 0.948 32.000 0.667 NA   NA
 2165671 254419 XCC3130 XCC3131     FALSE 0.005 1157.000 0.000 NA   NA
 254420 254421 XCC3132 XCC3133     FALSE 0.015 461.000 0.000 NA   NA
 254421 254422 XCC3133 XCC3134     FALSE 0.031 325.000 0.000 1.000   NA
 254423 254424 XCC3135 XCC3136     TRUE 0.567 75.000 0.000 0.062   NA
 254425 254426 XCC3137 XCC3138     TRUE 0.656 39.000 0.000 0.062   NA
 254426 254427 XCC3138 XCC3139     TRUE 0.788 -186.000 0.000 0.062   NA
 254427 254428 XCC3139 XCC3140     TRUE 0.646 127.000 0.000 0.011   NA
 254428 254429 XCC3140 XCC3141     FALSE 0.017 425.000 0.000 NA   NA
 254429 254430 XCC3141 XCC3142     FALSE 0.007 753.000 0.000 NA   NA
 254433 254434 XCC3145 XCC3146   intS FALSE 0.009 637.000 0.000 NA   NA
 254434 399367 XCC3146 XCC3147 intS tRNA-Gly FALSE 0.072 232.000 0.000 NA   NA
 399367 254435 XCC3147 XCC3148 tRNA-Gly estA FALSE 0.234 123.000 0.000 NA   NA
 254436 254437 XCC3149 XCC3150   thiG TRUE 0.880 49.000 0.130 1.000 Y NA
 254437 254438 XCC3150 XCC3151 thiG micA TRUE 0.527 145.000 0.060 1.000   NA
 254438 254439 XCC3151 XCC3152 micA sac1 FALSE 0.412 67.000 0.012 1.000   NA
 254441 254442 XCC3154 XCC3155     TRUE 0.910 93.000 0.667 NA   NA
 254442 254443 XCC3155 XCC3156   mscL FALSE 0.276 63.000 0.008 1.000 N NA
 254443 254444 XCC3156 XCC3157 mscL   FALSE 0.385 115.000 0.007 1.000   NA
 254444 254445 XCC3157 XCC3158     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 254445 254446 XCC3158 XCC3159   salR FALSE 0.254 52.000 0.000 NA   NA
 254447 254448 XCC3160 XCC3161   iroN FALSE 0.006 886.000 0.000 1.000   NA
 254448 2165672 XCC3161 XCC3162 iroN   TRUE 0.717 138.000 0.200 1.000   NA
 254451 254452 XCC3164 XCC3165     TRUE 0.933 3.000 0.036 1.000 N NA
 254452 254453 XCC3165 XCC3166     TRUE 0.960 -3.000 0.055 1.000 N NA
 254453 254454 XCC3166 XCC3167     TRUE 0.665 101.000 0.154 1.000 N NA
 254454 254455 XCC3167 XCC3168   pepN TRUE 0.906 16.000 0.167 1.000 N NA
 254455 254456 XCC3168 XCC3169 pepN acrF FALSE 0.006 387.000 0.000 1.000 N NA
 254456 254457 XCC3169 XCC3170 acrF   TRUE 0.993 -3.000 0.260 0.099 N NA
 254457 254458 XCC3170 XCC3171   nodQ FALSE 0.015 263.000 0.000 1.000 N NA
 254458 254459 XCC3171 XCC3172 nodQ cysD TRUE 0.995 0.000 0.203 0.001 N NA
 254460 254461 XCC3173 XCC3174 cysJ cysI TRUE 0.989 109.000 0.791 0.001 Y NA
 254461 254462 XCC3174 XCC3175 cysI cysH TRUE 0.974 -3.000 0.116 1.000 N NA
 254463 254464 XCC3176 XCC3177   fecA TRUE 0.968 -12.000 0.312 1.000   NA
 254466 254467 XCC3179 XCC3180   cysB TRUE 0.834 95.000 0.333 NA   NA
 254468 254469 XCC3181 XCC3182 cysG cysK TRUE 0.798 17.000 0.048 1.000 N NA
 254469 254470 XCC3182 XCC3183 cysK   FALSE 0.062 163.000 0.000 NA N NA
 254470 254471 XCC3183 XCC3184     FALSE 0.013 508.000 0.000 NA   NA
 254472 254473 XCC3185 XCC3186   pykA FALSE 0.309 465.000 0.010 0.004 Y NA
 254473 254474 XCC3186 XCC3187 pykA idgB FALSE 0.200 200.000 0.009 1.000   NA
 254474 254475 XCC3187 XCC3188 idgB pgk TRUE 0.929 -3.000 0.004 1.000   NA
 254475 254476 XCC3188 XCC3189 pgk   FALSE 0.034 321.000 0.000 NA   NA
 254476 254477 XCC3189 XCC3190     TRUE 0.989 0.000 0.283 NA   NA
 254477 254478 XCC3190 XCC3191     FALSE 0.341 171.000 0.020 NA   NA
 254478 254479 XCC3191 XCC3192   gapA FALSE 0.092 212.000 0.000 NA   NA
 254480 254481 XCC3193 XCC3194   ompW FALSE 0.085 219.000 0.000 NA   NA
 254481 254482 XCC3194 XCC3195 ompW omp21 TRUE 0.918 120.000 0.034 0.005 Y NA
 254483 254484 XCC3196 XCC3197     FALSE 0.019 386.000 0.000 1.000   NA
 254484 254485 XCC3197 XCC3198     TRUE 0.939 14.000 0.158 1.000   NA
 254486 254487 XCC3199 XCC3200   modA FALSE 0.024 219.000 0.000 1.000 N NA
 254487 254488 XCC3200 XCC3201 modA modB TRUE 0.998 11.000 0.627 0.001 Y NA
 254488 254489 XCC3201 XCC3202 modB modC TRUE 0.998 0.000 0.537 0.001   NA
 254489 254490 XCC3202 XCC3203 modC   FALSE 0.438 25.000 0.000 1.000   NA
 254491 254492 XCC3204 XCC3205     TRUE 0.995 4.000 1.000 NA   NA
 254492 254493 XCC3205 XCC3206   blaI TRUE 0.996 -10.000 0.833 1.000 Y NA
 254494 254495 XCC3207 XCC3208     TRUE 0.553 134.000 0.053 NA   NA
 254495 2165673 XCC3208 XCC3209   cirA TRUE 0.699 134.000 0.167 NA   NA
 2165673 254497 XCC3209 XCC3210 cirA   FALSE 0.036 302.000 0.000 1.000   NA
 254497 254498 XCC3210 XCC3211     TRUE 0.974 4.000 0.146 1.000   NA
 2165674 254502 XCC3214 XCC3215   fhuE FALSE 0.029 332.000 0.000 1.000   NA
 254502 254503 XCC3215 XCC3216 fhuE   TRUE 0.915 -15.000 0.000 0.020   NA
 254504 254505 XCC3217 XCC3218     TRUE 0.789 -186.000 0.000 0.061   NA
 254505 254506 XCC3218 XCC3219     FALSE 0.013 481.000 0.000 1.000   NA
 254507 254508 XCC3220 XCC3221 tktA gltP FALSE 0.291 239.000 0.150 1.000 N NA
 254508 254509 XCC3221 XCC3222 gltP   FALSE 0.066 542.000 0.100 NA   NA
 254509 254510 XCC3222 XCC3223     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 254510 254511 XCC3223 XCC3224     TRUE 0.915 -9.000 0.041 NA   NA
 254511 254512 XCC3224 XCC3225     TRUE 0.972 -3.000 0.055 NA   NA
 254512 254513 XCC3225 XCC3226     TRUE 0.990 -3.000 0.308 NA   NA
 254513 254514 XCC3226 XCC3227   moxR TRUE 0.609 54.000 0.060 NA   NA
 254514 254515 XCC3227 XCC3228 moxR pilQ FALSE 0.119 277.000 0.017 1.000   NA
 254515 254516 XCC3228 XCC3229 pilQ pilP TRUE 0.988 20.000 0.668 NA Y NA
 254516 254517 XCC3229 XCC3230 pilP pilO TRUE 0.998 -3.000 0.680 NA Y NA
 254517 254518 XCC3230 XCC3231 pilO pilN TRUE 0.999 -3.000 0.770 NA Y NA
 254518 254519 XCC3231 XCC3232 pilN pilM TRUE 0.998 0.000 0.616 NA Y NA
 254520 254521 XCC3233 XCC3234 mrcA   FALSE 0.044 579.000 0.050 NA   NA
 254522 254523 XCC3235 XCC3236 gltA rpmE FALSE 0.069 230.000 0.004 1.000 N NA
 254523 254524 XCC3236 XCC3237 rpmE   FALSE 0.264 72.000 0.008 1.000 N NA
 254524 254525 XCC3237 XCC3238   recG FALSE 0.243 129.000 0.007 1.000 N NA
 254525 254526 XCC3238 XCC3239 recG yjgF TRUE 0.815 19.000 0.076 NA N NA
 254526 2165675 XCC3239 XCC3240 yjgF   FALSE 0.080 139.000 0.000 NA N NA
 2165675 254528 XCC3240 XCC3241     FALSE 0.325 35.000 0.000 1.000   NA
 254528 254529 XCC3241 XCC3242   tcbD FALSE 0.230 78.000 0.000 1.000   NA
 254529 254530 XCC3242 XCC3243 tcbD exuT TRUE 0.731 20.000 0.037 1.000 N NA
 254530 254531 XCC3243 XCC3244 exuT   FALSE 0.079 115.000 0.000 1.000 N NA
 254531 254532 XCC3244 XCC3245   dapA TRUE 0.988 0.000 0.104 0.052 N NA
 254534 254535 XCC3247 XCC3248 spoT rpoZ TRUE 0.898 142.000 0.291 1.000 Y NA
 254535 254536 XCC3248 XCC3249 rpoZ gmk FALSE 0.507 245.000 0.471 1.000 N NA
 254536 254537 XCC3249 XCC3250 gmk   TRUE 0.803 112.000 0.276 NA   NA
 254538 254539 XCC3251 XCC3252 rph   TRUE 0.935 -3.000 0.005 NA   NA
 254539 254540 XCC3252 XCC3253     TRUE 0.734 -27.000 0.003 NA   NA
 254540 254541 XCC3253 XCC3254     TRUE 0.915 17.000 0.218 1.000 N NA
 254541 2165676 XCC3254 XCC3255     FALSE 0.372 68.000 0.006 NA   NA
 2165676 254543 XCC3255 XCC3256     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 254543 254544 XCC3256 XCC3257   pepQ FALSE 0.379 198.000 0.072 NA   NA
 254545 254546 XCC3258 XCC3259   pepP FALSE 0.182 289.000 0.000 0.035   NA
 254546 254547 XCC3259 XCC3260 pepP   TRUE 0.969 13.000 0.329 NA   NA
 254548 254549 XCC3261 XCC3262     TRUE 0.972 -3.000 0.053 NA   NA
 254549 254550 XCC3262 XCC3263     FALSE 0.038 564.000 0.034 NA   NA
 254550 254551 XCC3263 XCC3264     TRUE 0.675 24.000 0.011 NA   NA
 254551 254552 XCC3264 XCC3265   rpiA FALSE 0.441 102.000 0.011 NA   NA
 254552 254553 XCC3265 XCC3266 rpiA   FALSE 0.357 133.000 0.006 NA   NA
 254553 254554 XCC3266 XCC3267     TRUE 0.557 41.000 0.020 NA   NA
 254557 254558 XCC3270 XCC3271     TRUE 0.837 -132.000 0.000 0.020   NA
 254559 254560 XCC3272 XCC3273 hemL acoK FALSE 0.021 229.000 0.000 1.000 N NA
 254561 254562 XCC3274 XCC3275 az1 hisC FALSE 0.051 163.000 0.000 1.000 N NA
 254562 254563 XCC3275 XCC3276 hisC tdcF TRUE 0.637 33.000 0.050 NA N NA
 254563 254564 XCC3276 XCC3277 tdcF   TRUE 0.709 26.000 0.050 NA N NA
 254564 254565 XCC3277 XCC3278     TRUE 0.987 -3.000 0.065 0.042 N NA
 254565 254566 XCC3278 XCC3279   fhuA FALSE 0.481 157.000 0.095 1.000 N NA
 254567 254568 XCC3280 XCC3281     FALSE 0.484 -139.000 0.000 NA   NA
 254571 254572 XCC3284 XCC3285     FALSE 0.012 534.000 0.000 NA   NA
 254572 254573 XCC3285 XCC3286     FALSE 0.515 126.000 0.033 NA   NA
 254575 254576 XCC3288 XCC3289     FALSE 0.327 142.000 0.005 NA   NA
 254576 254577 XCC3289 XCC3290   mpl TRUE 0.819 15.000 0.015 1.000   NA
 254577 254578 XCC3290 XCC3291 mpl adk FALSE 0.067 356.000 0.000 0.077 N NA
 254579 2165677 XCC3292 XCC3293 pfkA   FALSE 0.006 839.000 0.000 NA   NA
 2165677 254581 XCC3293 XCC3294   virB6 TRUE 0.915 48.000 0.667 NA   NA
 254581 254582 XCC3294 XCC3295 virB6   FALSE 0.005 1233.000 0.000 NA   NA
 254582 254583 XCC3295 XCC3296     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 254583 2165678 XCC3296 XCC3297   virB6 FALSE 0.240 89.000 0.000 1.000   NA
 2165678 254585 XCC3297 XCC3298 virB6   FALSE 0.256 51.000 0.000 NA   NA
 254585 254586 XCC3298 XCC3299     FALSE 0.006 834.000 0.000 NA   NA
 254586 254587 XCC3299 XCC3300     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 254587 254588 XCC3300 XCC3301   virB6 FALSE 0.242 86.000 0.000 1.000   NA
 254588 254589 XCC3301 XCC3302 virB6   FALSE 0.355 34.000 0.000 NA   NA
 254589 254590 XCC3302 XCC3303     TRUE 0.731 -9.000 0.000 NA   NA
 254590 254591 XCC3303 XCC3304     FALSE 0.023 372.000 0.000 NA   NA
 254591 254592 XCC3304 XCC3305     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 254592 254593 XCC3305 XCC3306     FALSE 0.268 47.000 0.000 NA   NA
 254593 254594 XCC3306 XCC3307     TRUE 0.789 -186.000 0.000 0.061   NA
 254594 254595 XCC3307 XCC3308     FALSE 0.062 245.000 0.000 NA   NA
 254595 254596 XCC3308 XCC3309     TRUE 0.814 5.000 0.000 NA   NA
 254597 254598 XCC3310 XCC3311     FALSE 0.035 317.000 0.000 NA   NA
 254601 254602 XCC3314 XCC3315 ppa   FALSE 0.228 147.000 0.009 1.000 N NA
 254603 254604 XCC3316 XCC3317 btuB   TRUE 0.925 46.000 0.750 1.000   NA
 254604 254605 XCC3317 XCC3318     TRUE 0.915 120.000 0.500 0.061 N NA
 254605 254606 XCC3318 XCC3319   thiC FALSE 0.005 395.000 0.000 1.000 N NA
 254608 254609 XCC3321 XCC3322 tar ggt FALSE 0.115 379.000 0.154 1.000 N NA
 254610 254611 XCC3323 XCC3324 ilvC ilvG TRUE 0.929 46.000 0.012 0.001 Y NA
 254611 254612 XCC3324 XCC3325 ilvG ilvM TRUE 0.996 -16.000 0.943 0.001   NA
 254612 254613 XCC3325 XCC3326 ilvM tdcB FALSE 0.463 76.000 0.017 1.000   NA
 254613 254614 XCC3326 XCC3327 tdcB leuA TRUE 0.987 -3.000 0.013 1.000 Y NA
 254615 254616 XCC3328 XCC3329 leuB   FALSE 0.490 38.000 0.026 1.000 N NA
 254616 254617 XCC3329 XCC3330   leuD TRUE 0.650 33.000 0.060 1.000 N NA
 254617 254618 XCC3330 XCC3331 leuD leuC TRUE 0.980 65.000 0.463 0.001 Y NA
 254621 254622 XCC3334 XCC3335   pcm FALSE 0.368 129.000 0.023 1.000 N NA
 254622 254623 XCC3335 XCC3336 pcm tolC TRUE 0.690 21.000 0.028 1.000 N NA
 254626 254627 XCC3339 XCC3340     TRUE 0.962 -19.000 0.050 NA Y NA
 254627 254628 XCC3340 XCC3341     TRUE 0.929 11.000 0.058 NA   NA
 2165680 254633 XCC3345 XCC3346 maeB dctA TRUE 0.738 166.000 0.058 1.000 Y NA
 254634 254635 XCC3347 XCC3348 oprO   TRUE 0.631 116.000 0.130 NA N NA
 254636 2165681 XCC3349 XCC3350   afuA FALSE 0.233 276.000 0.158 1.000 N NA
 2165681 254638 XCC3350 XCC3351 afuA tctE TRUE 0.980 0.000 0.190 1.000 N NA
 254638 254639 XCC3351 XCC3352 tctE tctD TRUE 0.987 -7.000 0.190 1.000 Y NA
 254640 254641 XCC3353 XCC3354 oprO citM FALSE 0.204 225.000 0.048 NA N NA
 254641 254642 XCC3354 XCC3355 citM phbB FALSE 0.464 163.000 0.094 1.000 N NA
 254642 254643 XCC3355 XCC3356 phbB cebR FALSE 0.057 368.000 0.038 1.000 N NA
 254645 254646 XCC3358 XCC3359 fyuA   TRUE 0.624 34.000 0.052 1.000 N NA
 254647 254648 XCC3360 XCC3361 nonF   FALSE 0.486 103.000 0.016 NA   NA
 254648 254649 XCC3361 XCC3362     TRUE 0.968 0.000 0.052 1.000   NA
 254649 254650 XCC3362 XCC3363     FALSE 0.092 212.000 0.000 NA   NA
 254651 254652 XCC3364 XCC3365 aspC   TRUE 0.986 0.000 0.013 1.000 Y NA
 254652 254653 XCC3365 XCC3366     FALSE 0.358 58.000 0.017 1.000 N NA
 2165682 254656 XCC3368 XCC3369     FALSE 0.482 101.000 0.016 NA   NA
 254658 254659 XCC3371 XCC3372     TRUE 0.999 9.000 0.874 0.003 Y NA
 254659 254660 XCC3372 XCC3373     FALSE 0.163 165.000 0.000 NA   NA
 254660 254661 XCC3373 XCC3374     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 254661 254662 XCC3374 XCC3375     FALSE 0.052 268.000 0.000 NA   NA
 254662 254663 XCC3375 XCC3376     FALSE 0.507 -97.000 0.000 NA   NA
 254663 254664 XCC3376 XCC3377     FALSE 0.118 186.000 0.000 NA   NA
 254664 254665 XCC3377 XCC3378     TRUE 0.982 1.000 0.000 0.001   NA
 254665 254666 XCC3378 XCC3379     FALSE 0.246 79.000 0.000 NA   NA
 254667 254668 XCC3380 XCC3381   celS FALSE 0.281 286.000 0.000 0.001   NA
 254669 254670 XCC3382 XCC3383     TRUE 0.900 93.000 0.600 NA   NA
 254671 254672 XCC3384 XCC3385     TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000   NA
 254674 254675 XCC3387 XCC3388     TRUE 0.586 60.000 0.057 1.000   NA
 254675 254676 XCC3388 XCC3389     TRUE 0.579 67.000 0.061 1.000   NA
 254676 254677 XCC3389 XCC3390     TRUE 0.878 64.000 0.531 NA   NA
 254677 254678 XCC3390 XCC3391   ybhD FALSE 0.094 208.000 0.000 NA   NA
 254681 254682 XCC3394 XCC3395     TRUE 0.994 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 254683 254684 XCC3396 XCC3397 gsh1 yihA FALSE 0.013 496.000 0.000 1.000   NA
 254685 254686 XCC3398 XCC3399 cycA dsbA TRUE 0.767 105.000 0.286 1.000 N NA
 254686 254687 XCC3399 XCC3400 dsbA dsbA TRUE 0.986 94.000 0.714 0.004 Y NA
 254687 254688 XCC3400 XCC3401 dsbA   TRUE 0.642 50.000 0.074 NA   NA
 254688 254689 XCC3401 XCC3402   betT FALSE 0.507 125.000 0.029 NA   NA
 254689 254690 XCC3402 XCC3403 betT betB FALSE 0.372 41.000 0.012 1.000 N NA
 254690 254691 XCC3403 XCC3404 betB betA TRUE 0.882 91.000 0.634 1.000 N NA
 254693 254694 XCC3406 XCC3407 slt cca FALSE 0.417 71.000 0.034 1.000 N NA
 254695 254696 XCC3408 XCC3409 fyuA   FALSE 0.006 771.000 0.000 1.000   NA
 254696 254697 XCC3409 XCC3410   nagA FALSE 0.007 711.000 0.000 1.000   NA
 254697 2165683 XCC3410 XCC3411 nagA glmS TRUE 0.927 3.000 0.030 1.000 N NA
 2165683 254699 XCC3411 XCC3412 glmS   TRUE 0.894 7.000 0.030 1.000 N NA
 254699 254700 XCC3412 XCC3413   gluP TRUE 0.699 41.000 0.140 1.000 N NA
 254700 254701 XCC3413 XCC3414 gluP   TRUE 0.614 46.000 0.093 1.000 N NA
 254701 254702 XCC3414 XCC3415   xcsN FALSE 0.031 321.000 0.000 1.000   NA
 254702 254703 XCC3415 XCC3416 xcsN xcsM TRUE 0.995 -3.000 0.649 1.000   NA
 254703 254704 XCC3416 XCC3417 xcsM xcsL TRUE 0.999 -3.000 0.811 1.000 Y NA
 254704 254705 XCC3417 XCC3418 xcsL xcsK TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.050 Y NA
 254705 254706 XCC3418 XCC3419 xcsK xcsJ TRUE 0.997 -3.000 0.461 1.000 Y NA
 254706 254707 XCC3419 XCC3420 xcsJ xcsI TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.005   NA
 254707 254708 XCC3420 XCC3421 xcsI xcsH TRUE 0.993 -16.000 0.605 0.005   NA
 254708 254709 XCC3421 XCC3422 xcsH xcsG TRUE 0.941 61.000 0.425 0.005   NA
 254709 254710 XCC3422 XCC3423 xcsG xcsF TRUE 0.992 27.000 0.599 0.005 Y NA
 254710 254711 XCC3423 XCC3424 xcsF xcsE TRUE 0.998 -13.000 0.653 0.005 Y NA
 254711 254712 XCC3424 XCC3425 xcsE xcsD TRUE 0.999 5.000 0.776 0.005 Y NA
 254712 254713 XCC3425 XCC3426 xcsD xcsC TRUE 0.998 -3.000 0.575 1.000 Y NA
 254713 254714 XCC3426 XCC3427 xcsC fecA FALSE 0.331 168.000 0.043 1.000 N NA
 254714 254715 XCC3427 XCC3428 fecA   TRUE 0.846 80.000 0.373 NA   NA
 254717 2165685 XCC3430 XCC3432     TRUE 0.810 -12.000 0.005 NA   NA
 254720 254721 XCC3433 XCC3434 folK   FALSE 0.368 97.000 0.017 1.000 N NA
 254721 254722 XCC3434 XCC3435     TRUE 0.996 4.000 0.116 0.020 Y NA
 254722 254723 XCC3435 XCC3436     TRUE 0.993 -3.000 0.093 1.000 Y NA
 254723 254724 XCC3436 XCC3437     FALSE 0.011 540.000 0.000 NA   NA
 254726 254727 XCC3439 XCC3440 gndA   TRUE 0.785 23.000 0.042 NA   NA
 254727 254728 XCC3440 XCC3441     TRUE 0.558 84.000 0.035 NA   NA
 254728 2165686 XCC3441 XCC3442     TRUE 0.569 126.000 0.053 NA   NA
 2165686 254730 XCC3442 XCC3443     FALSE 0.443 39.000 0.003 NA   NA
 254730 254731 XCC3443 XCC3444     TRUE 0.844 -7.000 0.003 NA   NA
 254731 254732 XCC3444 XCC3445   pbeF TRUE 0.766 -91.000 0.022 NA   NA
 254732 254733 XCC3445 XCC3446 pbeF   TRUE 0.839 60.000 0.078 1.000 Y NA
 254737 254738 XCC3450 XCC3451 prc lipA FALSE 0.023 224.000 0.000 1.000 N NA
 254738 254739 XCC3451 XCC3452 lipA lipB TRUE 0.995 15.000 0.319 0.001 Y NA
 254739 254740 XCC3452 XCC3453 lipB   TRUE 0.960 -12.000 0.219 NA   NA
 254740 2165687 XCC3453 XCC3454     FALSE 0.378 126.000 0.007 NA   NA
 254743 254744 XCC3456 XCC3457 dacC rlpA TRUE 0.832 129.000 0.080 NA Y NA
 254744 254745 XCC3457 XCC3458 rlpA mltB TRUE 0.996 -3.000 0.298 NA Y NA
 254745 254746 XCC3458 XCC3459 mltB peh-1 FALSE 0.146 355.000 0.000 NA Y NA
 254746 254747 XCC3459 XCC3460 peh-1   FALSE 0.026 357.000 0.000 NA   NA
 254747 2165688 XCC3460 XCC3461     FALSE 0.007 744.000 0.000 NA   NA
 2165688 254749 XCC3461 XCC3462     FALSE 0.004 1274.000 0.000 1.000   NA
 254749 2165689 XCC3462 XCC3463     FALSE 0.461 -168.000 0.000 1.000   NA
 2165689 254751 XCC3463 XCC3464     TRUE 0.791 -186.000 0.000 0.060   NA
 254751 254752 XCC3464 XCC3465     FALSE 0.247 49.000 0.000 1.000   NA
 254752 254753 XCC3465 XCC3466   mrdB FALSE 0.018 397.000 0.000 1.000   NA
 254753 254754 XCC3466 XCC3467 mrdB mrdA TRUE 0.919 -3.000 0.013 1.000 N NA
 254754 254755 XCC3467 XCC3468 mrdA mreD TRUE 0.980 4.000 0.013 1.000 Y NA
 254755 254756 XCC3468 XCC3469 mreD mreC TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 254756 254757 XCC3469 XCC3470 mreC mreB FALSE 0.444 333.000 0.689 1.000 N NA
 254758 254759 XCC3471 XCC3472   acoR FALSE 0.003 611.000 0.000 1.000 N NA
 254759 254760 XCC3472 XCC3473 acoR   FALSE 0.002 674.000 0.000 1.000 N NA
 254761 254762 XCC3474 XCC3475 fepA adhC TRUE 0.985 11.000 0.667 1.000 N NA
 254762 254763 XCC3475 XCC3476 adhC   TRUE 0.901 35.000 0.400 NA   NA
 254763 254764 XCC3476 XCC3477     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 254764 254765 XCC3477 XCC3478   moxJ TRUE 0.964 -52.000 0.500 1.000   NA
 254765 254766 XCC3478 XCC3479 moxJ mxaF TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000   NA
 254766 254767 XCC3479 XCC3480 mxaF   TRUE 0.858 1.000 0.000 1.000   NA
 254767 254768 XCC3480 XCC3481     TRUE 0.847 45.000 0.000 0.060 Y NA
 254768 254769 XCC3481 XCC3482   mxaF FALSE 0.116 36.000 0.000 1.000 N NA
 254769 254770 XCC3482 XCC3483 mxaF   FALSE 0.006 839.000 0.000 1.000   NA
 254770 254771 XCC3483 XCC3484     TRUE 0.603 40.000 0.031 NA   NA
 254771 254772 XCC3484 XCC3485   pepN FALSE 0.044 626.000 0.070 NA   NA
 254772 254773 XCC3485 XCC3486 pepN   TRUE 0.956 -3.000 0.047 1.000 N NA
 254773 254774 XCC3486 XCC3488   ubiE FALSE 0.117 176.000 0.002 1.000 N NA
 2165690 2165691 XCC3487 XCC3489 rmrB   TRUE 0.995 -3.000 0.578 1.000   NA
 2165691 254777 XCC3489 XCC3490     TRUE 0.760 26.000 0.044 1.000   NA
 254777 254778 XCC3490 XCC3491   codA TRUE 0.951 -3.000 0.014 1.000   NA
 254778 254779 XCC3491 XCC3492 codA   FALSE 0.085 219.000 0.000 NA   NA
 254780 254781 XCC3493 XCC3494 hslU hslV TRUE 0.964 119.000 0.752 1.000 Y NA
 254782 254783 XCC3495 XCC3496     TRUE 0.947 18.000 0.000 0.060 Y NA
 254784 254785 XCC3497 XCC3498 xerC   TRUE 0.990 -7.000 0.714 NA   NA
 254785 254786 XCC3498 XCC3499   dapF TRUE 0.952 -12.000 0.175 NA   NA
 254786 254787 XCC3499 XCC3500 dapF   TRUE 0.859 -10.000 0.012 NA   NA
 254787 254788 XCC3500 XCC3501     TRUE 0.580 40.000 0.024 NA   NA
 254788 254789 XCC3501 XCC3502   ptrB FALSE 0.042 768.000 0.105 NA   NA
 254791 254792 XCC3504 XCC3505     TRUE 0.985 -13.000 0.667 NA   NA
 254792 254793 XCC3505 XCC3506     FALSE 0.067 238.000 0.000 NA   NA
 254793 254794 XCC3506 XCC3507     FALSE 0.518 69.000 0.034 NA   NA
 254798 254799 XCC3511 XCC3512 hemC algR TRUE 0.599 31.000 0.032 1.000 N NA
 254799 254800 XCC3512 XCC3513 algR algZ TRUE 0.994 25.000 0.775 0.025 Y NA
 254800 254801 XCC3513 XCC3514 algZ   TRUE 0.949 4.000 0.037 NA   NA
 254801 254802 XCC3514 XCC3515   hrpM TRUE 0.586 106.000 0.046 NA   NA
 254802 254803 XCC3515 XCC3516 hrpM sac1 FALSE 0.034 318.000 0.000 NA   NA
 254803 254804 XCC3516 XCC3517 sac1   FALSE 0.007 700.000 0.000 1.000   NA
 2165693 254807 XCC3519 XCC3520   ybaR FALSE 0.014 266.000 0.000 1.000 N NA
 254808 254809 XCC3521 XCC3522 engXCA tsr FALSE 0.002 848.000 0.000 1.000 N NA
 254811 254812 XCC3524 XCC3525   phS FALSE 0.043 288.000 0.000 NA   NA
 254813 254814 XCC3526 XCC3527     FALSE 0.180 155.000 0.000 NA   NA
 254815 2165694 XCC3528 XCC3529   treA FALSE 0.058 253.000 0.000 NA   NA
 2165694 254817 XCC3529 XCC3530 treA   FALSE 0.048 277.000 0.000 NA   NA
 254817 254818 XCC3530 XCC3531     FALSE 0.061 246.000 0.000 NA   NA
 254819 254820 XCC3532 XCC3533 corA cycA FALSE 0.438 148.000 0.062 1.000 N NA
 254821 254822 XCC3534 XCC3535     FALSE 0.296 394.000 0.000 0.005 Y NA
 254831 254832 XCC3544 XCC3545     FALSE 0.056 692.000 0.195 NA N NA
 254832 254833 XCC3545 XCC3546     FALSE 0.422 103.000 0.024 NA N NA
 254834 2165695 XCC3547 XCC3548     FALSE 0.142 173.000 0.000 NA   NA
 254837 254838 XCC3550 XCC3551     FALSE 0.157 167.000 0.000 NA   NA
 254838 254839 XCC3551 XCC3552     FALSE 0.452 -204.000 0.000 NA   NA
 254839 254840 XCC3552 XCC3553     TRUE 0.731 -9.000 0.000 NA   NA
 254840 254841 XCC3553 XCC3554     FALSE 0.514 -84.000 0.000 NA   NA
 254841 254842 XCC3554 XCC3555     FALSE 0.197 145.000 0.000 NA   NA
 254842 254843 XCC3555 XCC3556     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 254843 254844 XCC3556 XCC3557     FALSE 0.042 284.000 0.000 1.000   NA
 254844 254845 XCC3557 XCC3558     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 254845 254846 XCC3558 XCC3559     FALSE 0.049 275.000 0.000 NA   NA
 254847 254848 XCC3560 XCC3561     TRUE 0.727 22.000 0.041 NA N NA
 254848 254849 XCC3561 XCC3562     FALSE 0.182 154.000 0.000 NA   NA
 254851 2165696 XCC3564 XCC3565     FALSE 0.054 263.000 0.000 NA   NA
 254854 254855 XCC3567 XCC3568     FALSE 0.253 98.000 0.000 NA   NA
 254855 254856 XCC3568 XCC3569     FALSE 0.160 166.000 0.000 NA   NA
 254856 254857 XCC3569 XCC3570     FALSE 0.244 78.000 0.000 NA   NA
 254857 254858 XCC3570 XCC3571     FALSE 0.070 233.000 0.000 NA   NA
 254859 254860 XCC3572 XCC3573     FALSE 0.200 261.000 0.000 0.060   NA
 254860 254861 XCC3573 XCC3574   V TRUE 0.570 -43.000 0.000 NA   NA
 254861 254862 XCC3574 XCC3575 V   FALSE 0.004 1391.000 0.000 NA   NA
 254862 254863 XCC3575 XCC3576     TRUE 0.791 -186.000 0.000 0.060   NA
 254863 254864 XCC3576 XCC3577     FALSE 0.256 86.000 0.000 NA   NA
 254864 254865 XCC3577 XCC3578     FALSE 0.073 230.000 0.000 NA   NA
 254866 254867 XCC3579 XCC3580     TRUE 0.954 9.000 0.000 0.011   NA
 254867 254868 XCC3580 XCC3581     TRUE 0.791 -186.000 0.000 0.060   NA
 254868 254869 XCC3581 XCC3582     TRUE 0.613 47.000 0.000 0.060   NA
 254869 254870 XCC3582 XCC3583     TRUE 0.625 45.000 0.000 0.060   NA
 254871 254872 XCC3584 XCC3585     FALSE 0.077 227.000 0.000 NA   NA
 254876 254877 XCC3589 XCC3590     FALSE 0.023 374.000 0.000 NA   NA
 254878 254879 XCC3591 XCC3592 GNL   TRUE 0.958 0.000 0.025 NA   NA
 254880 254881 XCC3593 XCC3594 fecI fecR TRUE 0.867 79.000 0.571 NA N NA
 254881 254882 XCC3594 XCC3595 fecR pbuA FALSE 0.061 588.000 0.000 NA Y NA
 254882 254883 XCC3595 XCC3596 pbuA   TRUE 0.866 32.000 0.222 NA   NA
 254883 254884 XCC3596 XCC3597     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 254884 254885 XCC3597 XCC3598     FALSE 0.493 -111.000 0.000 NA   NA
 254885 254886 XCC3598 XCC3599   glnE FALSE 0.113 190.000 0.000 NA   NA
 2165697 254888 XCC3600 XCC3601     FALSE 0.006 846.000 0.000 NA   NA
 254888 254889 XCC3601 XCC3602     FALSE 0.075 229.000 0.000 NA   NA
 254889 254890 XCC3602 XCC3603     TRUE 0.978 -3.000 0.088 NA   NA
 254890 254891 XCC3603 XCC3604     TRUE 0.677 47.000 0.088 NA   NA
 254892 254893 XCC3605 XCC3606     TRUE 0.709 91.000 0.132 NA   NA
 254894 254895 XCC3607 XCC3608 mxcB   TRUE 0.729 114.000 0.223 NA N NA
 254896 254897 XCC3609 XCC3610 mdcA mdcD TRUE 0.980 10.000 0.342 NA   NA
 254897 254898 XCC3610 XCC3611 mdcD mdcB FALSE 0.253 422.000 0.438 NA   NA
 254898 254899 XCC3611 XCC3612 mdcB mdcC TRUE 0.996 -3.000 0.700 NA   NA
 254899 254900 XCC3612 XCC3613 mdcC mdcE TRUE 0.972 3.000 0.102 NA   NA
 254900 254901 XCC3613 XCC3614 mdcE citG FALSE 0.157 324.000 0.085 1.000   NA
 254901 254902 XCC3614 XCC3615 citG mdcH TRUE 0.596 164.000 0.203 1.000 N NA
 254902 254903 XCC3615 XCC3616 mdcH matC TRUE 0.623 90.000 0.070 1.000   NA
 254903 254904 XCC3616 XCC3617 matC mdcY TRUE 0.812 80.000 0.300 1.000   NA
 254905 254906 XCC3618 XCC3619 virP spoIIAA FALSE 0.468 93.000 0.015 1.000   NA
 254906 254907 XCC3619 XCC3620 spoIIAA   TRUE 0.994 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 254907 254908 XCC3620 XCC3621   icfG TRUE 0.992 1.000 0.125 1.000 Y NA
 254909 254910 XCC3622 XCC3623     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 254910 254911 XCC3623 XCC3624   galA FALSE 0.019 388.000 0.000 1.000   NA
 254911 254912 XCC3624 XCC3625 galA aceE FALSE 0.004 462.000 0.000 1.000 N NA
 254912 254913 XCC3625 XCC3626 aceE   FALSE 0.074 225.000 0.000 1.000   NA
 254913 254914 XCC3626 XCC3627     FALSE 0.046 274.000 0.000 1.000   NA
 254915 254916 XCC3628 XCC3629   yaeE TRUE 0.799 202.000 0.294 NA Y NA
 254916 254917 XCC3629 XCC3630 yaeE abc TRUE 0.996 -3.000 0.312 1.000 Y NA
 254917 254918 XCC3630 XCC3631 abc   TRUE 0.564 154.000 0.094 1.000   NA
 254919 254920 XCC3632 XCC3633     FALSE 0.285 170.000 0.010 NA   NA
 254921 2165698 XCC3634 XCC3635     TRUE 0.977 0.000 0.097 1.000   NA
 254924 254925 XCC3637 XCC3638   rsuA TRUE 0.971 -3.000 0.053 1.000   NA
 254925 254926 XCC3638 XCC3639 rsuA rsmC TRUE 0.993 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 254928 254929 XCC3641 XCC3642 sndH   TRUE 0.576 89.000 0.042 NA   NA
 254929 254930 XCC3642 XCC3643     TRUE 0.850 140.000 0.500 NA   NA
 254930 254931 XCC3643 XCC3644     FALSE 0.491 246.000 0.333 NA   NA
 254931 254932 XCC3644 XCC3645     TRUE 0.936 101.000 1.000 NA   NA
 254934 254935 XCC3647 XCC3648 alr dadA TRUE 0.969 0.000 0.099 1.000 N NA
 254938 254939 XCC3651 XCC3652     FALSE 0.423 82.000 0.008 NA   NA
 254939 254940 XCC3652 XCC3653   motA TRUE 0.587 111.000 0.049 NA   NA
 254940 254941 XCC3653 XCC3654 motA motB TRUE 0.994 11.000 0.571 1.000 Y NA
 254941 254942 XCC3654 XCC3655 motB   TRUE 0.961 22.000 0.571 NA   NA
 254942 254943 XCC3655 XCC3656     TRUE 0.906 34.000 0.400 NA   NA
 254946 254947 XCC3659 XCC3660 yadH yadG TRUE 0.998 -3.000 0.303 0.075 Y NA
 254947 2165699 XCC3660 XCC3661 yadG yjcE FALSE 0.005 413.000 0.000 1.000 N NA
 254949 254950 XCC3662 XCC3663     FALSE 0.118 186.000 0.000 NA   NA
 254951 254952 XCC3664 XCC3665     FALSE 0.230 636.000 0.748 1.000   NA
 254952 254953 XCC3665 XCC3666     FALSE 0.060 242.000 0.000 1.000   NA
 254954 2165700 XCC3667 XCC3668   wrbA TRUE 0.544 54.000 0.036 1.000   NA
 2165700 254956 XCC3668 XCC3669 wrbA   FALSE 0.117 511.000 0.034 0.030   NA
 254956 254957 XCC3669 XCC3670     FALSE 0.457 105.000 0.034 NA N NA
 254957 254958 XCC3670 XCC3671     TRUE 0.609 103.000 0.100 NA N NA
 254961 254962 XCC3674 XCC3675 ybeC   FALSE 0.323 190.000 0.036 NA   NA
 254962 254963 XCC3675 XCC3676   algR TRUE 0.651 73.000 0.100 NA   NA
 254963 2165701 XCC3676 XCC3677 algR   TRUE 0.995 -3.000 0.268 0.024   NA
 254967 254968 XCC3680 XCC3681 entB   FALSE 0.200 138.000 0.000 1.000   NA
 254968 254969 XCC3681 XCC3682     TRUE 0.764 41.000 0.000 0.002   NA
 254969 254970 XCC3682 XCC3683     TRUE 0.883 138.000 0.167 0.002   NA
 254970 254971 XCC3683 XCC3684     TRUE 0.811 82.000 0.286 NA   NA
 254972 2165702 XCC3685 XCC3686   cheR FALSE 0.007 794.000 0.000 NA   NA
 254975 254976 XCC3688 XCC3689     TRUE 0.814 33.000 0.143 NA   NA
 254977 2165703 XCC3690 XCC3691   cioA FALSE 0.050 273.000 0.000 NA   NA
 2165703 254979 XCC3691 XCC3692 cioA cioB TRUE 0.998 -9.000 0.667 0.040 Y NA
 254980 254981 XCC3693 XCC3694     TRUE 0.664 96.000 0.091 NA   NA
 254982 254983 XCC3695 XCC3696     FALSE 0.006 379.000 0.000 1.000 N NA
 254983 254984 XCC3696 XCC3697     TRUE 0.729 36.000 0.080 NA   NA
 254984 254985 XCC3697 XCC3698   rfbD TRUE 0.917 -12.000 0.065 NA   NA
 254985 254986 XCC3698 XCC3699 rfbD   TRUE 0.548 94.000 0.036 1.000   NA
 254986 254987 XCC3699 XCC3700   msbA TRUE 0.992 -3.000 0.348 1.000   NA
 254988 254989 XCC3701 XCC3702     TRUE 0.713 84.000 0.133 NA   NA
 254992 254993 XCC3705 XCC3706     TRUE 0.937 10.000 0.062 NA   NA
 254994 254995 XCC3707 XCC3708     FALSE 0.243 115.000 0.000 NA   NA
 254995 254996 XCC3708 XCC3709   yagR FALSE 0.010 598.000 0.000 NA   NA
 254997 254998 XCC3710 XCC3711     TRUE 0.911 -22.000 0.098 NA   NA
 254998 2165704 XCC3711 XCC3712     TRUE 0.996 -3.000 0.679 NA   NA
 2165704 255000 XCC3712 XCC3713     TRUE 0.996 -3.000 0.717 NA   NA
 255001 255002 XCC3714 XCC3715     TRUE 0.637 94.000 0.074 NA   NA
 255002 255003 XCC3715 XCC3716     TRUE 0.993 0.000 0.444 NA   NA
 255003 255004 XCC3716 XCC3717   drrA TRUE 0.989 -3.000 0.250 NA   NA
 255008 255009 XCC3721 XCC3722     TRUE 0.843 169.000 0.667 NA   NA
 255009 255010 XCC3722 XCC3723     TRUE 0.976 -3.000 0.075 NA   NA
 255010 255011 XCC3723 XCC3724   mocA TRUE 0.976 -3.000 0.075 NA   NA
 255015 2165706 XCC3728 XCC3729     FALSE 0.493 22.000 0.000 NA   NA
 2165706 255017 XCC3729 XCC3730     TRUE 0.683 100.000 0.000 NA Y NA
 255017 255018 XCC3730 XCC3731   avrXccB FALSE 0.008 717.000 0.000 NA   NA
 255019 255020 XCC3732 XCC3733     TRUE 0.948 18.000 0.000 0.059 Y NA
 399366 255021 XCC3734 XCC3735 tRNA-Met   FALSE 0.045 285.000 0.000 NA   NA
 255021 255022 XCC3735 XCC3736   rpoD FALSE 0.037 309.000 0.000 NA   NA
 255022 2165707 XCC3736 XCC3737 rpoD   FALSE 0.268 108.000 0.006 1.000 N NA
 255026 255027 XCC3740 XCC3741 ribA   FALSE 0.480 140.000 0.032 NA   NA
 255027 255028 XCC3741 XCC3742     TRUE 0.993 -3.000 0.429 NA   NA
 255031 2165708 XCC3745 XCC3746     TRUE 0.794 140.000 0.053 NA Y NA
 2165708 255033 XCC3746 XCC3747   sun TRUE 0.543 22.000 0.008 1.000 N NA
 255033 255034 XCC3747 XCC3748 sun fmt TRUE 0.996 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 255034 255035 XCC3748 XCC3749 fmt def FALSE 0.483 396.000 0.105 0.017 Y NA
 255036 255037 XCC3750 XCC3751   smf FALSE 0.510 73.000 0.033 1.000   NA
 255037 255038 XCC3751 XCC3752 smf smg TRUE 0.731 44.000 0.124 NA   NA
 255038 255039 XCC3752 XCC3753 smg pilA FALSE 0.073 377.000 0.030 NA   NA
 255039 2165709 XCC3753 XCC3754 pilA   TRUE 0.821 27.000 0.095 NA   NA
 2165709 255041 XCC3754 XCC3755   topA FALSE 0.205 181.000 0.003 NA   NA
 255041 255042 XCC3755 XCC3756 topA   TRUE 0.829 9.000 0.011 NA N NA
 255042 255043 XCC3756 XCC3757     FALSE 0.488 123.000 0.022 NA   NA
 255043 255044 XCC3757 XCC3758     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 255045 3820322 XCC3759 XCC3760   trn2 TRUE 0.800 -42.000 0.000 0.063 N NA
 3820322 255047 XCC3760 XCC3761 trn2 sppA FALSE 0.005 390.000 0.000 1.000 N NA
 255047 255048 XCC3761 XCC3762 sppA norM FALSE 0.340 85.000 0.013 1.000 N NA
 255048 255049 XCC3762 XCC3763 norM   FALSE 0.022 376.000 0.000 NA   NA
 255049 255050 XCC3763 XCC3764     TRUE 0.912 50.000 0.667 NA   NA
 255052 255053 XCC3766 XCC3767 gst   FALSE 0.485 51.000 0.016 NA   NA
 255053 2165710 XCC3767 XCC3768     TRUE 0.765 -36.000 0.010 NA   NA
 255055 255056 XCC3769 XCC3770 ndh   TRUE 0.568 53.000 0.040 NA   NA
 255057 255058 XCC3771 XCC3772 rpoH ung FALSE 0.104 201.000 0.005 1.000 N NA
 255058 255059 XCC3772 XCC3773 ung   TRUE 0.882 -3.000 0.005 1.000 N NA
 255059 255060 XCC3773 XCC3774   ftsX FALSE 0.241 57.000 0.005 1.000 N NA
 255060 255061 XCC3774 XCC3775 ftsX ftsE TRUE 0.986 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 255061 255062 XCC3775 XCC3776 ftsE   TRUE 0.577 76.000 0.007 0.074 N NA
 255063 255064 XCC3777 XCC3778 trxA rho FALSE 0.025 802.000 0.087 1.000 N NA
 255065 255066 XCC3779 XCC3780   aceK TRUE 0.981 10.000 0.375 1.000   NA
 255066 255067 XCC3780 XCC3781 aceK ampR TRUE 0.977 9.000 0.375 1.000 N NA
 255067 255068 XCC3781 XCC3782 ampR icd FALSE 0.005 405.000 0.000 1.000 N NA
 255068 255069 XCC3782 XCC3783 icd   FALSE 0.022 377.000 0.000 NA   NA
 255069 255070 XCC3783 XCC3784     FALSE 0.464 72.000 0.018 NA   NA
 255070 255071 XCC3784 XCC3785     FALSE 0.240 105.000 0.000 1.000   NA
 255071 255072 XCC3785 XCC3786   amaA FALSE 0.266 175.000 0.011 1.000   NA
 255073 255074 XCC3787 XCC3788 mtrC acrD TRUE 0.854 37.000 0.148 0.094 N NA
 255074 255075 XCC3788 XCC3789 acrD acrA TRUE 0.968 128.000 0.963 NA Y NA
 255075 255076 XCC3789 XCC3790 acrA   FALSE 0.045 284.000 0.000 NA   NA
 255076 255077 XCC3790 XCC3791     TRUE 0.857 24.000 0.123 NA   NA
 255077 2165711 XCC3791 XCC3792     FALSE 0.234 64.000 0.000 NA   NA
 255079 255080 XCC3793 XCC3794     FALSE 0.328 257.000 0.160 NA   NA
 255080 255081 XCC3794 XCC3795     TRUE 0.989 0.000 0.286 NA   NA
 255081 255082 XCC3795 XCC3796     FALSE 0.474 110.000 0.015 NA   NA
 255082 255083 XCC3796 XCC3797     FALSE 0.147 167.000 0.000 1.000   NA
 255083 255084 XCC3797 XCC3798     FALSE 0.334 241.000 0.000 0.003   NA
 255084 255085 XCC3798 XCC3799     FALSE 0.075 224.000 0.000 1.000   NA
 255085 2165712 XCC3799 XCC3800     FALSE 0.067 238.000 0.000 NA   NA
 2165712 255087 XCC3800 XCC3801     TRUE 0.739 11.000 0.000 NA   NA
 255087 255088 XCC3801 XCC3802     FALSE 0.033 316.000 0.000 1.000   NA
 255088 255089 XCC3802 XCC3803     FALSE 0.248 55.000 0.000 NA   NA
 255089 255090 XCC3803 XCC3804     FALSE 0.204 142.000 0.000 NA   NA
 255090 255091 XCC3804 XCC3805     FALSE 0.126 181.000 0.000 NA   NA
 255092 255093 XCC3806 XCC3807   tcbD TRUE 0.972 -3.000 0.055 NA   NA
 255093 255094 XCC3807 XCC3808 tcbD   FALSE 0.166 164.000 0.000 NA   NA
 255094 255095 XCC3808 XCC3809     TRUE 0.960 -3.000 0.024 NA   NA
 255095 255096 XCC3809 XCC3810     FALSE 0.255 88.000 0.000 NA   NA
 255096 255097 XCC3810 XCC3811     FALSE 0.178 156.000 0.000 NA   NA
 255100 255101 XCC3814 XCC3815 bglX folB FALSE 0.016 256.000 0.000 1.000 N NA
 255101 255102 XCC3815 XCC3816 folB gcp FALSE 0.344 95.000 0.014 1.000 N NA
 255103 255104 XCC3817 XCC3818 rpsU   TRUE 0.653 227.000 0.173 0.017   NA
 255104 255105 XCC3818 XCC3819   rbn FALSE 0.006 794.000 0.000 1.000   NA
 255105 255106 XCC3819 XCC3820 rbn dnaG FALSE 0.384 81.000 0.006 1.000   NA
 255106 255107 XCC3820 XCC3821 dnaG   TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 255107 255108 XCC3821 XCC3822     FALSE 0.254 89.000 0.000 NA   NA
 255108 255109 XCC3822 XCC3823     FALSE 0.068 230.000 0.000 1.000   NA
 255110 255111 XCC3824 XCC3825 coxD   TRUE 0.997 -3.000 0.321 1.000 Y NA
 255111 255112 XCC3825 XCC3826     TRUE 0.970 11.000 0.255 1.000   NA
 255112 255113 XCC3826 XCC3827     TRUE 0.960 28.000 0.722 NA   NA
 255115 255116 XCC3829 XCC3830 cox3 cox11 TRUE 0.898 37.000 0.536 1.000 N NA
 255116 255117 XCC3830 XCC3831 cox11   TRUE 0.946 -3.000 0.010 NA   NA
 255117 255118 XCC3831 XCC3832   ctaD TRUE 0.814 -19.000 0.012 NA   NA
 255118 255119 XCC3832 XCC3833 ctaD ctaC TRUE 0.991 40.000 0.741 0.001 Y NA
 255119 255120 XCC3833 XCC3834 ctaC   TRUE 0.846 17.000 0.042 NA   NA
 2165713 407152 XCC3836 XCC3837   rrl FALSE 0.229 126.000 0.000 NA   NA
 407152 399365 XCC3837 XCC3838 rrl tRNA-Ile FALSE 0.076 228.000 0.000 NA   NA
 399365 399364 XCC3838 XCC3839 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.521 20.000 0.000 NA   NA
 399364 407885 XCC3839 XCC3840 tRNA-Ala rrs FALSE 0.253 95.000 0.000 NA   NA
 407885 255122 XCC3840 XCC3841 rrs tyrS FALSE 0.007 780.000 0.000 NA   NA
 255123 255124 XCC3842 XCC3843     FALSE 0.423 204.000 0.184 NA N NA
 255125 255126 XCC3844 XCC3845   ampG TRUE 0.894 59.000 0.600 NA   NA
 255126 255127 XCC3845 XCC3846 ampG exoA FALSE 0.026 343.000 0.000 1.000   NA
 255128 255129 XCC3847 XCC3848 pyrE   FALSE 0.483 77.000 0.018 NA   NA
 255129 255130 XCC3848 XCC3849   parA FALSE 0.360 115.000 0.003 NA   NA
 255130 255131 XCC3849 XCC3850 parA parB TRUE 0.995 0.000 0.827 1.000 N NA
 255131 255132 XCC3850 XCC3851 parB mcrB TRUE 0.582 26.000 0.002 NA   NA
 255132 255133 XCC3851 XCC3852 mcrB   TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 255133 255134 XCC3852 XCC3853   wbnF TRUE 0.780 44.000 0.182 NA   NA
 255134 255135 XCC3853 XCC3854 wbnF dpm1 TRUE 0.907 80.000 0.227 1.000 Y NA
 255135 255136 XCC3854 XCC3855 dpm1   TRUE 0.988 0.000 0.273 1.000   NA
 255136 255137 XCC3855 XCC3856     FALSE 0.080 219.000 0.000 1.000   NA
 255138 255139 XCC3857 XCC3858 algC dut FALSE 0.014 964.000 0.039 1.000 N NA
 255139 255140 XCC3858 XCC3859 dut dfp TRUE 0.983 -3.000 0.201 1.000 N NA
 255141 255142 XCC3860 XCC3861 radC argS FALSE 0.253 88.000 0.005 1.000 N NA
 255142 255143 XCC3861 XCC3862 argS   TRUE 0.555 47.000 0.062 NA N NA
 255143 255144 XCC3862 XCC3863     TRUE 0.920 7.000 0.021 NA   NA
 255144 255145 XCC3863 XCC3864     TRUE 0.671 25.000 0.012 NA   NA
 255146 255147 XCC3865 XCC3866 oac ugt FALSE 0.002 678.000 0.000 1.000 N NA
 255147 255148 XCC3866 XCC3867 ugt entF TRUE 0.927 -7.000 0.091 1.000 N NA
 255148 2165714 XCC3867 XCC3868 entF speA FALSE 0.002 888.000 0.000 1.000 N NA
 255154 255155 XCC3873 XCC3874   comM TRUE 0.889 16.000 0.074 NA   NA
 255155 255156 XCC3874 XCC3875 comM blc FALSE 0.008 334.000 0.000 1.000 N NA
 255159 255160 XCC3878 XCC3879     TRUE 0.985 10.000 0.615 1.000 N NA
 255161 255162 XCC3880 XCC3881     FALSE 0.021 376.000 0.000 1.000   NA
 255162 255163 XCC3881 XCC3882     FALSE 0.001 1081.000 0.000 1.000 N NA
 255163 255164 XCC3882 XCC3883     TRUE 0.739 49.000 0.155 NA   NA
 255164 255165 XCC3883 XCC3884     FALSE 0.102 201.000 0.000 NA   NA
 255166 255167 XCC3885 XCC3886     TRUE 0.987 0.000 0.221 NA   NA
 255168 255169 XCC3887 XCC3888     TRUE 0.951 31.000 0.667 NA   NA
 255169 2165716 XCC3888 XCC3889     TRUE 0.900 124.000 0.667 NA   NA
 2165716 255171 XCC3889 XCC3890   sulA FALSE 0.123 183.000 0.000 NA   NA
 255172 255173 XCC3891 XCC3892     TRUE 0.992 -3.000 0.364 NA   NA
 255174 255175 XCC3893 XCC3894 ygiX ygiY TRUE 0.987 -228.000 0.833 1.000 Y NA
 255175 255176 XCC3894 XCC3895 ygiY   FALSE 0.254 101.000 0.000 NA   NA
 255176 255177 XCC3895 XCC3896     TRUE 0.928 68.000 1.000 NA   NA
 255179 255180 XCC3898 XCC3899 htrA   TRUE 0.747 116.000 0.192 NA   NA
 255180 255181 XCC3899 XCC3900     TRUE 0.995 4.000 0.857 NA   NA
 255181 255182 XCC3900 XCC3901     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 255182 255183 XCC3901 XCC3902   yhhT TRUE 0.869 91.000 0.455 NA   NA
 255183 255184 XCC3902 XCC3903 yhhT   FALSE 0.481 115.000 0.018 NA   NA
 255184 255185 XCC3903 XCC3904     TRUE 0.746 61.000 0.022 0.033   NA
 255185 255186 XCC3904 XCC3905   srpA FALSE 0.059 243.000 0.000 1.000   NA
 255186 255187 XCC3905 XCC3906 srpA   TRUE 0.998 -3.000 0.719 0.040   NA
 255188 255189 XCC3907 XCC3908     FALSE 0.056 257.000 0.000 NA   NA
 255189 255190 XCC3908 XCC3909     FALSE 0.392 182.000 0.054 NA   NA
 255190 255191 XCC3909 XCC3910     TRUE 0.961 89.000 0.270 0.024 Y NA
 255192 255193 XCC3911 XCC3912 acrE tptC FALSE 0.320 447.000 0.810 1.000 N NA
 255193 255194 XCC3912 XCC3913 tptC   TRUE 0.985 13.000 0.839 1.000 N NA
 255194 255195 XCC3913 XCC3914     TRUE 0.929 146.000 0.820 0.093 N NA
 255195 255196 XCC3914 XCC3915     FALSE 0.219 197.000 0.033 1.000 N NA
 255197 255198 XCC3916 XCC3917   yedA TRUE 0.977 -3.000 0.006 0.093   NA
 255199 255200 XCC3918 XCC3919     FALSE 0.034 321.000 0.000 NA   NA
 255200 2165717 XCC3919 XCC3920     TRUE 0.529 -76.000 0.000 NA   NA
 2165718 255203 XCC3921 XCC3922     FALSE 0.395 141.000 0.014 1.000   NA
 255203 255204 XCC3922 XCC3923   trpS FALSE 0.454 75.000 0.017 1.000   NA
 255204 255205 XCC3923 XCC3924 trpS   FALSE 0.384 154.000 0.017 NA   NA
 255205 255206 XCC3924 XCC3925   ecnA FALSE 0.016 444.000 0.000 NA   NA
 255206 255207 XCC3925 XCC3926 ecnA argI FALSE 0.475 111.000 0.017 1.000   NA
 255208 255209 XCC3927 XCC3928     TRUE 0.857 83.000 0.400 NA   NA
 255209 255210 XCC3928 XCC3929     TRUE 0.856 103.000 0.400 NA   NA
 255210 255211 XCC3929 XCC3930     TRUE 0.985 -3.000 0.167 NA   NA
 255211 255212 XCC3930 XCC3931   tmk FALSE 0.178 335.000 0.000 0.004   NA
 255214 255215 XCC3933 XCC3934     FALSE 0.253 108.000 0.000 NA   NA
 399363 255216 XCC3935 XCC3936 tRNA-Thr   FALSE 0.355 34.000 0.000 NA   NA
 255216 255217 XCC3936 XCC3937   baf TRUE 0.846 11.000 0.005 NA   NA
 255217 255218 XCC3937 XCC3938 baf birA TRUE 0.978 -3.000 0.147 1.000 N NA
 255220 255221 XCC3940 XCC3941     TRUE 0.873 15.000 0.041 NA   NA
 255221 255222 XCC3941 XCC3942   phoQ TRUE 0.831 112.000 0.333 NA   NA
 255222 255223 XCC3942 XCC3943 phoQ phoP TRUE 0.961 24.000 0.214 1.000 Y NA
 255223 255224 XCC3943 XCC3944 phoP   TRUE 0.697 73.000 0.143 NA   NA
 255224 255225 XCC3944 XCC3945     FALSE 0.035 316.000 0.000 NA   NA
 255227 255228 XCC3947 XCC3948   ankB FALSE 0.012 513.000 0.000 NA   NA
 255228 255229 XCC3948 XCC3949 ankB catB TRUE 0.691 61.000 0.130 NA   NA
 255229 255230 XCC3949 XCC3950 catB dinG FALSE 0.002 639.000 0.000 1.000 N NA
 255230 255231 XCC3950 XCC3951 dinG   FALSE 0.100 202.000 0.000 NA   NA
 255231 255232 XCC3951 XCC3952     TRUE 0.953 30.000 0.667 NA   NA
 255232 255233 XCC3952 XCC3953   aroE TRUE 0.620 -250.000 0.007 NA   NA
 255235 255236 XCC3955 XCC3956 piuB hemB FALSE 0.057 152.000 0.000 1.000 N NA
 255236 255237 XCC3956 XCC3957 hemB   FALSE 0.417 88.000 0.007 NA   NA
 255239 255240 XCC3959 XCC3960     FALSE 0.221 131.000 0.000 NA   NA
 255240 255241 XCC3960 XCC3961     TRUE 0.586 42.000 0.029 NA   NA
 255241 255242 XCC3961 XCC3962   gst FALSE 0.024 508.000 0.020 1.000 N NA
 255243 255244 XCC3963 XCC3964 iroN   TRUE 0.592 186.000 0.231 NA   NA
 255244 255245 XCC3964 XCC3965     TRUE 0.974 -10.000 0.333 NA   NA
 255245 255246 XCC3965 XCC3966   prnA TRUE 0.975 10.000 0.286 NA   NA
 255246 255247 XCC3966 XCC3967 prnA   TRUE 0.771 139.000 0.286 NA   NA
 255248 255249 XCC3968 XCC3969 natB natA TRUE 0.996 -3.000 0.271 NA Y NA
 255249 255250 XCC3969 XCC3970 natA   TRUE 0.885 32.000 0.292 1.000   NA
 255250 255251 XCC3970 XCC3971     TRUE 0.587 67.000 0.065 1.000   NA
 255251 255252 XCC3971 XCC3972     TRUE 0.992 -3.000 0.357 NA   NA
 255252 255253 XCC3972 XCC3973     FALSE 0.008 672.000 0.000 NA   NA
 255254 255255 XCC3974 XCC3975 czcD xynB FALSE 0.050 164.000 0.000 1.000 N NA
 255257 255258 XCC3976 XCC3978 yadG   TRUE 0.995 18.000 0.688 0.073 Y NA
 255258 255259 XCC3978 XCC3979     TRUE 0.758 -36.000 0.009 NA   NA
 255259 255260 XCC3979 XCC3980   apbA FALSE 0.431 116.000 0.011 NA   NA
 255260 255261 XCC3980 XCC3981 apbA   FALSE 0.079 226.000 0.000 NA   NA
 255262 255263 XCC3982 XCC3983   trxA FALSE 0.018 414.000 0.000 NA   NA
 255263 255264 XCC3983 XCC3984 trxA   TRUE 0.968 -28.000 0.484 1.000   NA
 255264 255265 XCC3984 XCC3985   nrdB TRUE 0.746 99.000 0.250 1.000 N NA
 255265 255266 XCC3985 XCC3986 nrdB nrdA TRUE 0.894 180.000 0.079 0.000 Y NA
 255266 255267 XCC3986 XCC3987 nrdA   FALSE 0.005 1077.000 0.000 1.000   NA
 255267 255268 XCC3987 XCC3988     TRUE 0.564 107.000 0.041 1.000   NA
 255268 2165720 XCC3988 XCC3989     FALSE 0.043 291.000 0.000 NA   NA
 2165720 255270 XCC3989 XCC3990   mgtE FALSE 0.503 72.000 0.028 NA   NA
 255271 255272 XCC3991 XCC3992 ecaA kefC FALSE 0.120 380.000 0.000 1.000 Y NA
 255273 255274 XCC3993 XCC3994 zwf   TRUE 0.954 -150.000 0.154 1.000 Y NA
 255274 255275 XCC3994 XCC3995     FALSE 0.427 64.000 0.013 1.000   NA
 255275 255276 XCC3995 XCC3996   ank2 TRUE 0.659 27.000 0.013 NA   NA
 255276 255277 XCC3996 XCC3997 ank2   TRUE 0.923 -7.000 0.040 NA   NA
 255278 255279 XCC3998 XCC3999 fabF   TRUE 0.990 0.000 0.303 NA   NA
 255279 255280 XCC3999 XCC4000     TRUE 0.967 -3.000 0.037 NA   NA
 255280 255281 XCC4000 XCC4001     TRUE 0.975 -3.000 0.070 NA   NA
 255282 255283 XCC4002 XCC4003   fabG FALSE 0.276 42.000 0.000 1.000   NA
 255283 255284 XCC4003 XCC4004 fabG   TRUE 0.786 169.000 0.123 NA Y NA
 255284 255285 XCC4004 XCC4005   actII-3 TRUE 0.949 -13.000 0.171 NA   NA
 255285 255286 XCC4005 XCC4006 actII-3   TRUE 0.921 -10.000 0.061 NA   NA
 255286 255287 XCC4006 XCC4007     TRUE 0.621 88.000 0.062 NA   NA
 255287 255288 XCC4007 XCC4008     TRUE 0.914 -76.000 0.196 NA   NA
 255288 255289 XCC4008 XCC4009     TRUE 0.990 -3.000 0.297 NA   NA
 255289 255290 XCC4009 XCC4010   plsC TRUE 0.972 12.000 0.045 NA Y NA
 255290 255291 XCC4010 XCC4011 plsC   TRUE 0.919 54.000 0.750 NA   NA
 255291 2165721 XCC4011 XCC4012   acpC TRUE 0.891 -25.000 0.071 NA   NA
 255293 2165722 XCC4013 XCC4014   rapK TRUE 0.718 111.000 0.143 NA   NA
 255296 2165723 XCC4016 XCC4017     FALSE 0.007 726.000 0.000 1.000   NA
 2165723 255298 XCC4017 XCC4018     TRUE 0.991 -3.000 0.333 NA   NA
 255298 255299 XCC4018 XCC4019   hemF FALSE 0.075 302.000 0.006 NA   NA
 255302 255303 XCC4022 XCC4023     TRUE 0.548 -57.000 0.000 NA   NA
 255303 255304 XCC4023 XCC4024     FALSE 0.019 404.000 0.000 NA   NA
 255304 255305 XCC4024 XCC4025   nodL FALSE 0.240 101.000 0.000 1.000   NA
 255305 255306 XCC4025 XCC4026 nodL uvrD FALSE 0.006 873.000 0.000 1.000   NA
 255306 255307 XCC4026 XCC4027 uvrD   FALSE 0.142 272.000 0.022 NA   NA
 255307 255308 XCC4027 XCC4028   cls FALSE 0.347 307.000 0.300 NA   NA
 255308 255309 XCC4028 XCC4029 cls fldY FALSE 0.452 10.000 0.000 1.000 N NA
 255310 255311 XCC4030 XCC4031 fldZ fldA TRUE 0.977 -7.000 0.309 NA   NA
 255311 255312 XCC4031 XCC4032 fldA fldW FALSE 0.243 235.000 0.050 NA   NA
 255313 255314 XCC4033 XCC4034 rpmG rpmB TRUE 0.995 14.000 0.332 0.011 Y NA
 255314 255315 XCC4034 XCC4035 rpmB   FALSE 0.009 342.000 0.000 NA N NA
 255315 255316 XCC4035 XCC4036   czcA TRUE 0.996 -3.000 0.286 NA Y NA
 255316 255317 XCC4036 XCC4037 czcA czcB FALSE 0.041 612.000 0.100 1.000 N NA
 255317 255318 XCC4037 XCC4038 czcB czcC TRUE 0.995 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 255318 255319 XCC4038 XCC4039 czcC   TRUE 0.851 56.000 0.400 NA   NA
 255319 255320 XCC4039 XCC4040     FALSE 0.053 265.000 0.000 NA   NA
 255320 2165724 XCC4040 XCC4041   gidB FALSE 0.192 147.000 0.000 NA   NA
 255325 255326 XCC4045 XCC4046   xthA1 TRUE 0.765 -30.000 0.010 1.000   NA
 255326 255327 XCC4046 XCC4047 xthA1   FALSE 0.254 90.000 0.000 NA   NA
 255327 255328 XCC4047 XCC4048     FALSE 0.238 61.000 0.000 NA   NA
 255328 255329 XCC4048 XCC4049     FALSE 0.197 145.000 0.000 NA   NA
 255329 255330 XCC4049 XCC4050     FALSE 0.251 81.000 0.000 NA   NA
 255330 255331 XCC4050 XCC4051     FALSE 0.061 247.000 0.000 NA   NA
 255331 255332 XCC4051 XCC4052   fecA TRUE 0.529 -76.000 0.000 NA   NA
 255334 255335 XCC4054 XCC4055     TRUE 0.894 13.000 0.040 NA   NA
 255335 255336 XCC4055 XCC4056     TRUE 0.956 4.000 0.053 1.000   NA
 255336 255337 XCC4056 XCC4057   actP FALSE 0.010 547.000 0.000 1.000   NA
 255337 255338 XCC4057 XCC4058 actP   TRUE 0.996 -3.000 0.684 NA   NA
 255338 2165725 XCC4058 XCC4059     TRUE 0.573 74.000 0.051 NA   NA
 255340 255341 XCC4060 XCC4061 acs tcsR FALSE 0.489 232.000 0.357 1.000 N NA
 255345 255346 XCC4065 XCC4066     TRUE 0.995 -3.000 0.600 1.000   NA
 255346 255347 XCC4066 XCC4067     TRUE 0.955 -135.000 0.214 0.048   NA
 255347 255348 XCC4067 XCC4068     TRUE 0.913 169.000 0.214 0.048 Y NA
 255348 255349 XCC4068 XCC4069     FALSE 0.048 492.000 0.000 0.030 N NA
 255350 255351 XCC4070 XCC4071   fucP TRUE 0.990 -3.000 0.300 NA   NA
 255352 255353 XCC4072 XCC4073 kdgR   TRUE 0.853 44.000 0.000 0.057 Y NA
 255353 255354 XCC4073 XCC4074     TRUE 0.797 112.000 0.273 1.000   NA
 255354 255355 XCC4074 XCC4075     FALSE 0.042 292.000 0.000 NA   NA
 255356 255357 XCC4076 XCC4077   ndvB FALSE 0.020 742.000 0.000 0.072 N NA
 255357 255358 XCC4077 XCC4078 ndvB ynaJ TRUE 0.996 3.000 0.344 1.000 Y NA
 255359 255360 XCC4079 XCC4080 idnK   FALSE 0.023 899.000 0.000 0.072   NA
 255361 255362 XCC4081 XCC4082   aroD TRUE 0.965 -97.000 0.600 NA   NA
 255362 255363 XCC4082 XCC4083 aroD   TRUE 0.966 20.000 0.600 NA   NA
 255363 2165726 XCC4083 XCC4084     FALSE 0.062 244.000 0.000 NA   NA
 2165726 255365 XCC4084 XCC4085     TRUE 0.995 -3.000 0.575 NA   NA
 255365 255366 XCC4085 XCC4086   glyS FALSE 0.105 188.000 0.003 1.000 N NA
 255366 255367 XCC4086 XCC4087 glyS glyQ TRUE 0.909 294.000 0.651 0.000 Y NA
 255368 255369 XCC4088 XCC4089 gspE guaA FALSE 0.003 565.000 0.000 1.000 N NA
 255369 2165727 XCC4089 XCC4090 guaA   TRUE 0.653 46.000 0.070 NA   NA
 255371 255372 XCC4091 XCC4092 tatC tatB TRUE 0.988 -3.000 0.015 NA Y NA
 255372 255373 XCC4092 XCC4093 tatB tatA TRUE 0.982 16.000 0.037 0.006 Y NA
 255373 255374 XCC4093 XCC4094 tatA   TRUE 0.609 73.000 0.073 NA   NA
 255375 255376 XCC4095 XCC4096 hemH   TRUE 0.965 -3.000 0.037 1.000   NA
 255377 255378 XCC4097 XCC4098     TRUE 0.758 37.000 0.121 1.000   NA
 255378 255379 XCC4098 XCC4099     FALSE 0.315 66.000 0.012 NA N NA
 255382 255383 XCC4102 XCC4103 aguA   TRUE 0.976 -3.000 0.082 1.000   NA
 255383 255384 XCC4103 XCC4104   rspA TRUE 0.991 12.000 1.000 1.000   NA
 255384 2165729 XCC4104 XCC4105 rspA xylB TRUE 0.991 6.000 0.800 1.000 N NA
 2165729 255386 XCC4105 XCC4106 xylB   TRUE 0.999 3.000 0.800 0.021 Y NA
 255386 255387 XCC4106 XCC4107   mtlD TRUE 0.934 112.000 0.364 1.000 Y NA
 255387 255388 XCC4107 XCC4108 mtlD   FALSE 0.089 204.000 0.000 1.000   NA
 255395 2165731 XCC4115 XCC4116 xynA   TRUE 0.954 141.000 0.250 0.010 Y NA
 2165731 255397 XCC4116 XCC4117   hrmI FALSE 0.418 275.000 0.049 1.000 Y NA
 255397 255398 XCC4117 XCC4118 hrmI xynB TRUE 0.678 52.000 0.000 1.000 Y NA
 255398 255399 XCC4118 XCC4119 xynB exuT TRUE 0.991 10.000 0.286 1.000 Y NA
 255400 255401 XCC4120 XCC4121 cirA xylP TRUE 0.828 98.000 0.136 0.037 N NA
 255401 255402 XCC4121 XCC4122 xylP xsa TRUE 0.904 36.000 0.455 1.000   NA
 255402 2165732 XCC4122 XCC4123 xsa blc FALSE 0.025 351.000 0.000 1.000   NA
 255404 255405 XCC4124 XCC4126     FALSE 0.113 190.000 0.000 NA   NA
 255407 255408 XCC4127 XCC4128   plsB FALSE 0.341 126.000 0.017 1.000 N NA
 255408 2165733 XCC4128 XCC4130 plsB   TRUE 0.967 0.000 0.043 NA   NA
 255410 255411 XCC4129 XCC4131     TRUE 0.821 165.000 0.667 1.000 N NA
 255411 255412 XCC4131 XCC4132     FALSE 0.383 337.000 0.000 0.005 Y NA
 255412 255413 XCC4132 XCC4133   prnA TRUE 0.898 111.000 0.600 NA   NA
 255414 255415 XCC4134 XCC4135 pyrF lppC TRUE 0.939 -3.000 0.008 1.000   NA
 255417 255418 XCC4137 XCC4138     TRUE 0.688 30.000 0.026 NA   NA
 255418 255419 XCC4138 XCC4139   rep FALSE 0.005 404.000 0.000 1.000 N NA
 255420 255421 XCC4140 XCC4141     TRUE 0.948 18.000 0.000 0.057 Y NA
 255423 255424 XCC4143 XCC4144 tdk   FALSE 0.079 337.000 0.000 0.072 N NA
 255425 255426 XCC4145 XCC4146 mdoG   TRUE 0.566 73.000 0.050 NA   NA
 255426 255427 XCC4146 XCC4147   mutM FALSE 0.009 637.000 0.000 NA   NA
 255427 2165734 XCC4147 XCC4148 mutM   FALSE 0.011 545.000 0.000 NA   NA
 2165734 407153 XCC4148 XCC4149   rrl FALSE 0.229 126.000 0.000 NA   NA
 407153 399362 XCC4149 XCC4150 rrl tRNA-Ile FALSE 0.076 228.000 0.000 NA   NA
 399362 399361 XCC4150 XCC4151 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.521 20.000 0.000 NA   NA
 399361 407886 XCC4151 XCC4152 tRNA-Ala rrs FALSE 0.253 95.000 0.000 NA   NA
 255429 255430 XCC4154 XCC4155 aphB   TRUE 0.973 -3.000 0.103 NA N NA
 255430 255431 XCC4155 XCC4156   tetA FALSE 0.280 192.000 0.051 NA N NA
 255431 255432 XCC4156 XCC4157 tetA   FALSE 0.003 555.000 0.000 1.000 N NA
 255432 255433 XCC4157 XCC4158     FALSE 0.352 188.000 0.045 NA   NA
 255433 255434 XCC4158 XCC4159     FALSE 0.063 243.000 0.000 NA   NA
 255435 255436 XCC4160 XCC4161     FALSE 0.197 145.000 0.000 NA   NA
 255437 255438 XCC4162 XCC4163     FALSE 0.018 403.000 0.000 1.000   NA
 255438 255439 XCC4163 XCC4164     FALSE 0.107 1116.000 0.561 NA   NA
 255439 255440 XCC4164 XCC4165     TRUE 0.967 -13.000 0.311 NA   NA
 255440 255441 XCC4165 XCC4166   folE TRUE 0.842 20.000 0.066 NA   NA
 255442 255443 XCC4167 XCC4168 slyA   TRUE 0.637 74.000 0.088 NA   NA
 255443 255444 XCC4168 XCC4169   fusE TRUE 0.979 -15.000 0.529 NA   NA
 255444 255445 XCC4169 XCC4170 fusE nodT TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.091 N NA
 255445 255446 XCC4170 XCC4171 nodT   TRUE 0.976 -3.000 0.080 NA   NA
 255447 2165735 XCC4172 XCC4173 kgtP   FALSE 0.473 193.000 0.133 NA   NA
 2165735 255449 XCC4173 XCC4174     FALSE 0.250 111.000 0.000 NA   NA
 255450 255451 XCC4175 XCC4176   cls FALSE 0.365 192.000 0.000 0.048   NA
 255453 255454 XCC4177 XCC4179     TRUE 0.964 -19.000 0.333 NA   NA
 255454 2165737 XCC4179 XCC4180     FALSE 0.005 1133.000 0.000 NA   NA
 255457 255458 XCC4182 XCC4183     FALSE 0.247 113.000 0.000 NA   NA
 255463 255464 XCC4188 XCC4189     FALSE 0.016 448.000 0.000 NA   NA
 255465 255466 XCC4190 XCC4191   cII FALSE 0.022 372.000 0.000 1.000   NA
 255467 255468 XCC4192 XCC4193     FALSE 0.009 591.000 0.000 1.000   NA
 255468 255469 XCC4193 XCC4194     TRUE 0.637 15.000 0.000 NA   NA
 255470 255471 XCC4195 XCC4196     FALSE 0.060 249.000 0.000 NA   NA
 255472 255473 XCC4197 XCC4198 vapI recD FALSE 0.142 169.000 0.000 1.000   NA
 255473 255474 XCC4198 XCC4199 recD recB TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 255474 255475 XCC4199 XCC4200 recB recC TRUE 0.999 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 255475 255476 XCC4200 XCC4201 recC   FALSE 0.011 296.000 0.000 1.000 N NA
 255477 255478 XCC4202 XCC4203     TRUE 0.898 75.000 0.649 NA   NA
 255478 255479 XCC4203 XCC4204     TRUE 0.887 61.000 0.571 NA   NA
 255479 255480 XCC4204 XCC4205     TRUE 0.947 -34.000 0.286 NA   NA
 255482 255483 XCC4207 XCC4208 yrbF yrbE TRUE 0.998 0.000 0.530 NA Y NA
 255483 255484 XCC4208 XCC4209 yrbE yrbD TRUE 0.892 109.000 0.562 NA   NA
 255484 255485 XCC4209 XCC4210 yrbD yrbC TRUE 0.961 -3.000 0.024 NA   NA
 255485 255486 XCC4210 XCC4211 yrbC   TRUE 0.863 -25.000 0.041 NA   NA
 255486 255487 XCC4211 XCC4212   vacJ TRUE 0.902 12.000 0.035 NA   NA
 255488 2165739 XCC4213 XCC4214 btuE   FALSE 0.499 84.000 0.018 NA   NA
 2165739 2165740 XCC4214 XCC4215     FALSE 0.010 1021.000 0.004 NA   NA
 2165740 255491 XCC4215 XCC4216     FALSE 0.009 629.000 0.000 NA   NA
 255492 255493 XCC4217 XCC4218     FALSE 0.234 74.000 0.000 NA   NA
 255493 255494 XCC4218 XCC4219     FALSE 0.021 388.000 0.000 NA   NA
 255494 255495 XCC4219 XCC4220   yhdG FALSE 0.027 353.000 0.000 NA   NA
 255496 255497 XCC4221 XCC4222     FALSE 0.083 98.000 0.000 1.000 N NA
 255497 255498 XCC4222 XCC4223     FALSE 0.014 484.000 0.000 NA   NA
 255498 255499 XCC4223 XCC4224     FALSE 0.253 108.000 0.000 NA   NA
 255499 255500 XCC4224 XCC4225     TRUE 0.526 232.000 0.000 0.060 Y NA
 255500 255501 XCC4225 XCC4226   glxK FALSE 0.436 51.000 0.030 1.000 N NA
 255501 255502 XCC4226 XCC4227 glxK ttuB TRUE 0.930 35.000 0.188 1.000 Y NA
 255502 255503 XCC4227 XCC4228 ttuB   FALSE 0.008 339.000 0.000 1.000 N NA
 255505 255506 XCC4230 XCC4231     FALSE 0.418 209.000 0.125 NA   NA
 255507 2165741 XCC4232 XCC4233 ygjT   FALSE 0.043 602.000 0.000 0.047   NA
 255509 2165742 XCC4234 XCC4235 glpQ fecA FALSE 0.006 383.000 0.000 1.000 N NA
 255511 255512 XCC4236 XCC4237 phoC oar FALSE 0.025 780.000 0.000 0.090   NA
 255513 2165743 XCC4238 XCC4239 thdF   TRUE 0.604 23.000 0.003 1.000   NA
 2165743 255515 XCC4239 XCC4240     FALSE 0.362 90.000 0.003 1.000   NA
 255515 255516 XCC4240 XCC4241   rnpA TRUE 0.876 16.000 0.105 1.000 N NA
 255516 255517 XCC4241 XCC4242 rnpA rpmH TRUE 0.939 39.000 0.787 1.000   NA