MicrobesOnline Operon Predictions for Yersinia pestis KIM

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 270568 270569 y0001 y0002 mioC asnC TRUE 0.629 93.000 0.165 1.000 N NA
 270571 270572 y0004 y0005     TRUE 0.975 4.000 0.443 NA   NA
 270573 270574 y0006 y0007 kup rbsD FALSE 0.046 205.000 0.010 1.000 N NA
 270574 270575 y0007 y0008 rbsD rbsK TRUE 0.815 51.000 0.010 1.000 Y NA
 270575 270576 y0008 y0009 rbsK   FALSE 0.178 20.000 0.000 NA   NA
 270577 270578 y0010 y0011     TRUE 0.621 80.000 0.133 1.000   NA
 2158879 2158880 yr001 yt001     FALSE 0.088 94.000 0.000 NA   NA
 2158880 407401 yt001 yr002   rrl FALSE 0.020 256.000 0.000 NA   NA
 407401 406743 yr002 yr003 rrl rrf FALSE 0.083 108.000 0.000 NA   NA
 406743 2158881 yr003 yt002 rrf   FALSE 0.218 14.000 0.000 NA   NA
 2158881 2158882 yt002 yr004     FALSE 0.124 44.000 0.000 NA   NA
 2158882 270580 yr004 y0013   metA FALSE 0.001 741.000 0.000 NA   NA
 270582 270583 y0015 y0016 aceB aceA TRUE 0.912 47.000 0.118 1.000 Y NA
 270583 270584 y0016 y0018 aceA aceK TRUE 0.793 73.000 0.273 1.000 N NA
 270585 270586 y0017 y0019   iclR FALSE 0.066 147.000 0.000 NA   NA
 270588 2158883 y0021 y0022 hylA   FALSE 0.230 13.000 0.000 NA   NA
 2158883 270589 y0022 y0023   lysC FALSE 0.002 481.000 0.000 NA   NA
 270590 270591 y0024 y0025 pgi   FALSE 0.138 135.000 0.015 1.000   NA
 270592 270593 y0026 y0027 malG malF TRUE 0.998 -7.000 0.814 0.069 Y NA
 270593 270594 y0027 y0028 malF malE TRUE 0.742 172.000 0.060 1.000 Y NA
 270595 270596 y0030 y0029     FALSE 0.096 -252.000 0.000 NA   NA
 270596 270597 y0029 y0031   malK FALSE 0.372 4.000 0.000 NA   NA
 270597 270598 y0031 y0032 malK lamB TRUE 0.838 71.000 0.000 0.095 Y NA
 270598 270599 y0032 y0033 lamB malM FALSE 0.058 223.000 0.000 1.000   NA
 270603 270604 y0037 y0038     TRUE 0.955 68.000 0.821 NA   NA
 270604 270605 y0038 y0039     TRUE 0.980 7.000 0.627 NA   NA
 270605 270606 y0039 y0040     TRUE 0.988 0.000 0.552 NA   NA
 270607 270608 y0041 y0042     FALSE 0.221 39.000 0.000 1.000   NA
 270608 270609 y0042 y0043     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 270612 270613 y0046 y0047 glpF glpK FALSE 0.067 177.000 0.013 1.000 N NA
 270613 270614 y0047 y0048 glpK glpX FALSE 0.055 237.000 0.025 1.000 N NA
 270614 270615 y0048 y0049 glpX fpr FALSE 0.426 155.000 0.117 1.000 N NA
 270617 270618 y0051 y0052   tpiA FALSE 0.288 129.000 0.058 NA   NA
 270620 270621 y0054 y0055     TRUE 0.979 -3.000 0.353 NA   NA
 270621 270622 y0055 y0056     FALSE 0.120 66.000 0.000 1.000 N NA
 270622 270623 y0056 y0057   modA TRUE 0.839 76.000 0.000 0.069 Y NA
 270624 270625 y0058 y0059 sbp pfkA FALSE 0.178 188.000 0.049 1.000 N NA
 270625 270626 y0059 y0060 pfkA   FALSE 0.105 218.000 0.040 1.000 N NA
 270628 270629 y0062 y0063     FALSE 0.124 45.000 0.000 NA   NA
 270630 270631 y0064 y0065     FALSE 0.268 10.000 0.000 NA   NA
 5915080 270634 y0067 y0069 cpxR cpxA TRUE 0.999 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 270635 270636 y0068 y0070   ada FALSE 0.084 102.000 0.000 NA   NA
 270638 270639 y0072 y0073 cysE gpsA TRUE 0.532 266.000 0.429 1.000 N NA
 270639 270640 y0073 y0074 gpsA secB TRUE 0.956 0.000 0.206 1.000 N NA
 270640 270641 y0074 y0075 secB grxC FALSE 0.246 88.000 0.038 1.000 N NA
 270641 270642 y0075 y0076 grxC   FALSE 0.210 119.000 0.048 NA N NA
 270643 270644 y0077 y0078     TRUE 0.874 10.000 0.170 1.000 N NA
 270644 2158884 y0078 y0079     FALSE 0.164 24.000 0.000 NA   NA
 270645 270646 y0080 y0081 tdh kbl TRUE 0.972 10.000 0.547 1.000 N NA
 270647 270648 y0083 y0082 rfaD   FALSE 0.092 -355.000 0.000 NA   NA
 270648 270649 y0082 y0084   rfaF FALSE 0.059 159.000 0.000 NA   NA
 270649 270650 y0084 y0085 rfaF rfaC TRUE 0.985 -24.000 0.205 0.001 Y NA
 270650 270651 y0085 y0086 rfaC kdtA FALSE 0.288 312.000 0.028 1.000 Y NA
 270651 270652 y0086 y0087 kdtA   TRUE 0.978 1.000 0.083 NA Y NA
 270652 270653 y0087 y0088   kdtB TRUE 0.506 -3.000 0.023 NA N NA
 270656 270657 y0091 y0092 rpmG radC FALSE 0.003 511.000 0.000 1.000 N NA
 270658 270659 y0093 y0094 dfp dut TRUE 0.845 -34.000 0.201 1.000 N NA
 270659 270660 y0094 y0095 dut ttk FALSE 0.318 122.000 0.060 1.000 N NA
 270661 270662 y0096 y0097 pyrE rph FALSE 0.385 167.000 0.108 1.000 N NA
 270663 270664 y0098 y0099     FALSE 0.005 403.000 0.000 NA   NA
 270666 270667 y0101 y0102 gmk rpoZ TRUE 0.903 55.000 0.471 1.000 N NA
 270667 270668 y0102 y0103 rpoZ spoT TRUE 0.975 20.000 0.291 1.000 Y NA
 270668 270669 y0103 y0104 spoT spoU TRUE 0.818 6.000 0.095 1.000 N NA
 270669 270670 y0104 y0105 spoU recG TRUE 0.861 1.000 0.076 1.000 N NA
 270672 270673 y0107 y0108     TRUE 0.690 148.000 0.257 NA   NA
 270675 270676 y0110 y0111     TRUE 0.993 -3.000 0.667 1.000   NA
 270676 270677 y0111 y0112     FALSE 0.082 16.000 0.000 NA N NA
 270678 270679 y0113 y0114     FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 407525 270682 ys001 y0117 rnpB   FALSE 0.178 20.000 0.000 NA   NA
 270683 270684 y0118 y0119     TRUE 0.659 84.000 0.172 NA   NA
 270685 270686 y0120 y0121     FALSE 0.164 24.000 0.000 NA   NA
 270687 270688 y0122 y0123     TRUE 0.962 -34.000 0.613 NA   NA
 270689 270690 y0124 y0125 mtgA   TRUE 0.853 -3.000 0.066 NA   NA
 270690 270691 y0125 y0126   arcB FALSE 0.009 242.000 0.000 NA N NA
 270691 270692 y0126 y0127 arcB   FALSE 0.184 264.000 0.113 1.000   NA
 270693 270694 y0128 y0129 gltB gltD TRUE 0.977 10.000 0.096 0.001 Y NA
 270694 270695 y0129 y0130 gltD   FALSE 0.003 441.000 0.000 NA   NA
 270696 270697 y0131 y0132 sspB sspA TRUE 0.989 6.000 0.831 NA   NA
 270697 270698 y0132 y0133 sspA rpsI FALSE 0.003 374.000 0.014 NA N NA
 270698 270699 y0133 y0134 rpsI rplM TRUE 0.994 15.000 0.601 0.014 Y NA
 270699 270700 y0134 y0135 rplM   FALSE 0.006 314.000 0.003 NA   NA
 270701 270702 y0136 y0137   degQ FALSE 0.255 253.000 0.154 NA   NA
 270705 270706 y0140 y0141 murA   TRUE 0.662 154.000 0.258 NA N NA
 270706 270707 y0141 y0142     TRUE 0.836 138.000 0.453 NA   NA
 270707 270708 y0142 y0143     TRUE 0.863 36.000 0.308 NA   NA
 270708 270709 y0143 y0144     TRUE 0.863 13.000 0.188 NA   NA
 270709 270710 y0144 y0145     TRUE 0.980 -10.000 0.562 NA   NA
 270710 270711 y0145 y0146     TRUE 0.925 218.000 0.530 NA Y NA
 270712 270713 y0147 y0149     TRUE 0.846 24.000 0.226 1.000 N NA
 270715 270716 y0150 y0151     TRUE 0.991 -3.000 0.617 NA   NA
 270716 270717 y0151 y0152     TRUE 0.937 -37.000 0.459 NA   NA
 270717 270718 y0152 y0153     TRUE 0.975 7.000 0.543 NA   NA
 270718 270719 y0153 y0154   rpoN TRUE 0.693 62.000 0.163 1.000   NA
 270719 270720 y0154 y0155 rpoN   TRUE 0.974 24.000 0.820 NA   NA
 270720 270721 y0155 y0156     FALSE 0.360 7.000 0.016 NA   NA
 270721 270722 y0156 y0157   ptsN TRUE 0.933 106.000 0.728 NA   NA
 270722 270723 y0157 y0158 ptsN   FALSE 0.189 306.000 0.186 NA   NA
 270723 270724 y0158 y0159   ptsO TRUE 0.952 -3.000 0.182 NA   NA
 270726 270727 y0161 y0162 pyrB pyrI TRUE 0.990 6.000 0.197 0.001 Y NA
 270727 270728 y0162 y0163 pyrI   FALSE 0.390 99.000 0.084 NA N NA
 270728 270729 y0163 y0164     FALSE 0.012 299.000 0.000 NA   NA
 270729 270730 y0164 y0165   treR FALSE 0.027 234.000 0.000 NA   NA
 270730 270731 y0165 y0166 treR treB FALSE 0.005 411.000 0.000 1.000 N NA
 270731 270732 y0166 y0167 treB treC TRUE 0.979 95.000 0.650 1.000 Y NA
 270732 270733 y0167 y0168 treC rnk FALSE 0.009 353.000 0.000 1.000 N NA
 270734 270735 y0169 y0170 cybC   FALSE 0.042 202.000 0.000 NA   NA
 270735 270736 y0170 y0171   pmbA FALSE 0.016 249.000 0.005 NA   NA
 270738 270739 y0173 y0174     TRUE 0.958 5.000 0.329 NA   NA
 270739 270740 y0174 y0175     FALSE 0.082 195.000 0.000 1.000   NA
 270740 270741 y0175 y0176   gabD TRUE 0.995 -3.000 0.667 0.052   NA
 270741 270742 y0176 y0177 gabD   FALSE 0.017 267.000 0.000 NA   NA
 270742 270743 y0177 y0178     TRUE 0.995 2.000 1.000 NA   NA
 270743 270744 y0178 y0179     TRUE 0.863 8.000 0.150 NA   NA
 270745 270746 y0180 y0181     TRUE 0.512 252.000 0.000 0.067 Y NA
 270748 270749 y0183 y0184 tcaA1 tcbA FALSE 0.128 41.000 0.000 NA   NA
 270749 270750 y0184 y0185 tcbA tcaC1 TRUE 0.987 -3.000 0.500 NA   NA
 270750 270751 y0185 y0186 tcaC1   FALSE 0.071 134.000 0.000 NA   NA
 270751 270752 y0186 y0187     FALSE 0.372 4.000 0.000 NA   NA
 270752 270753 y0187 y0188     TRUE 0.965 -12.000 0.400 NA   NA
 270753 270754 y0188 y0189     FALSE 0.315 -13.000 0.000 NA   NA
 270754 270755 y0189 y0190   tccC1 FALSE 0.128 41.000 0.000 NA   NA
 270755 270756 y0190 y0191 tccC1 tccC2 TRUE 0.909 25.000 0.000 0.016 Y NA
 270756 270757 y0191 y0192 tccC2   FALSE 0.124 -64.000 0.000 NA   NA
 270758 270759 y0193 y0194 tldD   TRUE 0.911 12.000 0.259 NA   NA
 270759 270760 y0194 y0195     TRUE 0.980 -3.000 0.358 NA   NA
 270760 270761 y0195 y0196   cafA FALSE 0.026 826.000 0.296 NA   NA
 270761 270762 y0196 y0197 cafA   TRUE 0.967 -10.000 0.417 NA N NA
 270766 270767 y0201 y0202 mreC mreB TRUE 0.856 204.000 0.689 1.000 N NA
 270767 270768 y0202 y0203 mreB   FALSE 0.010 337.000 0.000 1.000 N NA
 270769 270770 y0204 y0205     FALSE 0.323 139.000 0.059 1.000   NA
 270770 270771 y0205 y0206     TRUE 0.996 0.000 0.790 0.044   NA
 270771 270772 y0206 y0207     FALSE 0.029 263.000 0.006 1.000   NA
 270772 270773 y0207 y0208   accB TRUE 0.740 113.000 0.254 1.000 N NA
 270773 270774 y0208 y0209 accB accC TRUE 0.989 12.000 0.275 0.001 Y NA
 270774 270775 y0209 y0210 accC   FALSE 0.005 1358.000 0.103 NA   NA
 270775 270776 y0210 y0211   panF TRUE 0.986 -10.000 0.682 NA   NA
 270776 270777 y0211 y0212 panF prmA FALSE 0.274 76.000 0.041 1.000 N NA
 270777 270778 y0212 y0213 prmA   FALSE 0.093 487.000 0.042 1.000 Y NA
 270778 270779 y0213 y0214   fis TRUE 0.765 25.000 0.161 1.000 N NA
 270780 270781 y0215 y0216     FALSE 0.103 66.000 0.000 NA   NA
 270781 270782 y0216 y0217     FALSE 0.254 27.000 0.000 1.000   NA
 270782 270783 y0217 y0218     FALSE 0.434 154.000 0.105 1.000   NA
 270783 270784 y0218 y0219     FALSE 0.468 136.000 0.105 1.000   NA
 270784 270785 y0219 y0220     FALSE 0.179 65.000 0.000 1.000   NA
 270788 270789 y0223 y0224 cspI cspI TRUE 0.707 185.000 0.000 0.086 Y NA
 270791 270792 y0226 y0227     FALSE 0.126 43.000 0.000 NA   NA
 270795 270796 y0230 y0231     TRUE 0.947 -3.000 0.102 0.021 N NA
 270796 270797 y0231 y0232     TRUE 0.925 4.000 0.184 1.000 N NA
 270797 270798 y0232 y0233     TRUE 0.999 2.000 0.900 0.014 Y NA
 270798 270799 y0233 y0234     TRUE 0.998 -7.000 0.667 0.014 Y NA
 270799 270800 y0234 y0235     TRUE 0.960 204.000 0.714 NA Y NA
 270801 270802 y0236 y0237 ddg   FALSE 0.124 44.000 0.000 NA   NA
 270803 270804 y0238 y0239     FALSE 0.017 328.000 0.000 1.000   NA
 270805 270806 y0240 y0241     FALSE 0.359 356.000 0.500 NA   NA
 270807 270808 y0242 y0243 ssuB ssuC TRUE 0.997 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 270808 270809 y0243 y0244 ssuC   TRUE 0.917 9.000 0.226 1.000 N NA
 270809 270810 y0244 y0245   ssuA TRUE 0.915 19.000 0.341 1.000 N NA
 270810 270811 y0245 y0246 ssuA   TRUE 0.843 15.000 0.169 1.000   NA
 270812 270813 y0247 y0248     FALSE 0.073 154.000 0.000 1.000 N NA
 270813 270814 y0248 y0249     TRUE 0.941 6.000 0.000 1.000 Y NA
 270816 270817 y0251 y0252     TRUE 0.985 -3.000 0.455 NA   NA
 270817 270818 y0252 y0253     FALSE 0.035 215.000 0.000 NA   NA
 270819 270820 y0254 y0255     FALSE 0.283 9.000 0.000 NA   NA
 270820 270821 y0255 y0256     FALSE 0.131 39.000 0.000 NA   NA
 270821 270822 y0256 y0257     FALSE 0.414 3.000 0.000 NA   NA
 270822 270823 y0257 y0258     FALSE 0.492 -3.000 0.000 NA   NA
 270823 270824 y0258 y0259     FALSE 0.170 22.000 0.000 NA   NA
 270825 270826 y0260 y0261     TRUE 0.587 82.000 0.133 NA   NA
 270829 270830 y0264 y0265     TRUE 0.978 2.000 0.400 NA   NA
 270830 270831 y0265 y0266     FALSE 0.151 28.000 0.000 NA   NA
 270831 270832 y0266 y0267     TRUE 0.771 -34.000 0.143 NA   NA
 270832 270833 y0267 y0268     FALSE 0.322 6.000 0.000 NA   NA
 270833 2158885 y0268 y0269     FALSE 0.170 22.000 0.000 NA   NA
 2158886 270835 y0271 y0272     FALSE 0.084 104.000 0.000 NA   NA
 270835 270836 y0272 y0273     TRUE 0.986 -12.000 0.711 NA   NA
 270836 270837 y0273 y0274     TRUE 0.687 -12.000 0.053 NA   NA
 270837 270838 y0274 y0275   clpB TRUE 0.800 -3.000 0.039 1.000   NA
 270838 270839 y0275 y0276 clpB   TRUE 0.961 11.000 0.471 NA   NA
 270839 270840 y0276 y0277     TRUE 0.992 0.000 0.673 NA   NA
 270840 270841 y0277 y0278     TRUE 0.992 3.000 0.765 NA   NA
 270841 270842 y0278 y0279     TRUE 0.995 0.000 0.862 NA   NA
 270842 270843 y0279 y0280     TRUE 0.869 126.000 0.510 NA   NA
 270843 270844 y0280 y0281     TRUE 0.974 -45.000 0.863 NA   NA
 270845 270846 y0282 y0283     TRUE 0.927 54.000 0.167 1.000 Y NA
 270846 270847 y0283 y0284     TRUE 0.903 27.000 0.000 0.023 Y NA
 270847 270848 y0284 y0285     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 270849 270850 y0286 y0287     TRUE 0.990 -7.000 0.250 1.000 Y NA
 270851 270852 y0288 y0289     FALSE 0.052 175.000 0.000 NA   NA
 270855 270856 y0292 y0293 menG menA TRUE 0.863 142.000 0.158 NA Y NA
 270856 270857 y0293 y0294 menA hslU FALSE 0.126 224.000 0.051 1.000 N NA
 270857 270858 y0294 y0295 hslU hslV TRUE 0.987 71.000 0.752 1.000 Y NA
 270858 270859 y0295 y0296 hslV ftsN FALSE 0.491 100.000 0.122 NA N NA
 270859 270860 y0296 y0297 ftsN cytR TRUE 0.760 66.000 0.245 NA N NA
 270860 270861 y0297 y0298 cytR priA FALSE 0.009 353.000 0.013 1.000 N NA
 270863 270864 y0300 y0301   metJ FALSE 0.008 337.000 0.000 NA   NA
 2158887 270865 y0302 y0303   metL FALSE 0.414 3.000 0.000 NA   NA
 270865 270866 y0303 y0304 metL metF TRUE 0.497 233.000 0.017 1.000 Y NA
 270867 270868 y0305 y0306     TRUE 0.723 241.000 0.167 1.000 Y NA
 270870 270871 y0308 y0309 ppc argE FALSE 0.027 374.000 0.053 1.000 N NA
 270872 270873 y0310 y0311 argC argB TRUE 0.865 169.000 0.097 0.003 Y NA
 270873 270874 y0311 y0312 argB argH TRUE 0.671 167.000 0.017 1.000 Y NA
 270874 270875 y0312 y0313 argH hasR FALSE 0.002 599.000 0.000 1.000 N NA
 270875 270876 y0313 y0314 hasR hasA FALSE 0.032 222.000 0.000 NA   NA
 270876 270877 y0314 y0315 hasA hasD FALSE 0.064 151.000 0.000 NA   NA
 270877 270878 y0315 y0316 hasD hasE TRUE 0.978 76.000 1.000 0.012   NA
 270878 270879 y0316 y0317 hasE hasB TRUE 0.957 65.000 0.667 0.012 N NA
 270880 270881 y0318 y0319     TRUE 0.799 95.000 0.204 0.006 N NA
 270884 270885 y0322 y0323     TRUE 0.961 13.000 0.508 NA   NA
 270887 270888 y0325 y0326 btuB murI FALSE 0.251 -55.000 0.025 1.000 N NA
 270888 2158888 y0326 yr005 murI   FALSE 0.003 458.000 0.000 NA   NA
 2158888 2158889 yr005 yt003     FALSE 0.088 94.000 0.000 NA   NA
 2158889 407402 yt003 yr006   rrl FALSE 0.020 256.000 0.000 NA   NA
 407402 406745 yr006 yr007 rrl rrf FALSE 0.083 108.000 0.000 NA   NA
 406745 2158890 yr007 yt004 rrf   FALSE 0.076 124.000 0.000 NA   NA
 2158890 2158891 yt004 yt005     FALSE 0.322 6.000 0.000 NA   NA
 2158891 270890 yt005 y0328     FALSE 0.001 980.000 0.000 NA   NA
 270890 270891 y0328 y0329     TRUE 0.986 86.000 0.804 NA Y NA
 270891 270892 y0329 y0330     TRUE 0.994 12.000 0.506 0.014 Y NA
 270892 270893 y0330 y0331     TRUE 0.999 0.000 0.865 0.014 Y NA
 270897 270898 y0335 y0336 ilvL ilvG TRUE 0.621 141.000 0.091 0.002   NA
 270898 270899 y0336 y0337 ilvG ilvE FALSE 0.349 277.000 0.000 1.000 Y NA
 270899 270900 y0337 y0338 ilvE ilvD FALSE 0.383 311.000 0.075 1.000 Y NA
 270900 270901 y0338 y0339 ilvD ilvA TRUE 0.971 6.000 0.106 1.000 Y NA
 270902 270903 y0340 y0341     FALSE 0.109 59.000 0.000 NA   NA
 270903 270904 y0341 y0342     FALSE 0.109 59.000 0.000 NA   NA
 270904 2158892 y0342 y0343     FALSE 0.287 -16.000 0.000 NA   NA
 2158892 270905 y0343 y0344   ilvY FALSE 0.001 876.000 0.000 NA   NA
 270906 270907 y0345 y0346 ilvC   FALSE 0.051 181.000 0.000 NA   NA
 270907 270908 y0346 y0347     FALSE 0.045 196.000 0.000 NA   NA
 270909 270910 y0348 y0349     TRUE 0.985 -34.000 1.000 1.000   NA
 270910 270911 y0349 y0350   fimD TRUE 0.764 212.000 0.500 1.000   NA
 270911 270912 y0350 y0351 fimD   TRUE 0.984 28.000 0.500 1.000 Y NA
 270912 270913 y0351 y0352     TRUE 0.994 40.000 1.000 1.000 Y NA
 270913 270914 y0352 y0353     FALSE 0.001 810.000 0.000 1.000 N NA
 270914 270915 y0353 y0354     FALSE 0.101 97.000 0.000 1.000 N NA
 270915 270916 y0354 y0355   ppiC FALSE 0.048 239.000 0.000 1.000   NA
 270918 2158893 y0357 y0358     FALSE 0.414 3.000 0.000 NA   NA
 2158893 270919 y0358 y0359   rhlB FALSE 0.372 4.000 0.000 NA   NA
 270920 270921 y0360 y0361 trxA rho FALSE 0.021 480.000 0.087 1.000 N NA
 270921 270922 y0361 y0362 rho rfe FALSE 0.002 535.000 0.000 1.000 N NA
 270922 270923 y0362 y0363 rfe wzzE TRUE 0.994 36.000 0.735 0.004 Y NA
 270923 270924 y0363 y0364 wzzE wecB TRUE 0.965 227.000 0.677 0.004 Y NA
 270924 270925 y0364 y0365 wecB wecC TRUE 0.995 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 270925 270926 y0365 y0366 wecC rffG TRUE 0.989 -9.000 0.273 1.000 Y NA
 270926 270927 y0366 y0367 rffG rffH TRUE 0.991 85.000 0.739 0.004 Y NA
 270927 270928 y0367 y0368 rffH wecD TRUE 0.682 -79.000 0.145 1.000   NA
 270928 270929 y0368 y0369 wecD wecE TRUE 0.963 2.000 0.248 1.000   NA
 270929 270930 y0369 y0370 wecE wzxE TRUE 0.957 2.000 0.218 1.000   NA
 270930 270931 y0370 y0371 wzxE wecF TRUE 0.959 23.000 0.605 1.000   NA
 270931 270932 y0371 y0372 wecF wecF TRUE 0.993 -3.000 0.684 1.000   NA
 270932 270933 y0372 y0373 wecF wecG TRUE 0.850 9.000 0.126 1.000   NA
 270935 2158894 y0375 yt006     FALSE 0.065 149.000 0.000 NA   NA
 2158894 2158895 yt006 yt007     FALSE 0.093 87.000 0.000 NA   NA
 2158895 2158896 yt007 yt008     FALSE 0.178 20.000 0.000 NA   NA
 2158897 270937 yt009 y0377     FALSE 0.001 819.000 0.000 NA   NA
 270938 270939 y0378 y0379 hemY hemX TRUE 0.984 3.000 0.144 1.000 Y NA
 270939 270940 y0379 y0380 hemX hemD TRUE 0.989 22.000 0.600 1.000 Y NA
 270940 270941 y0380 y0381 hemD hemC TRUE 0.995 -3.000 0.205 0.002 Y NA
 270944 270945 y0384 y0385   dapF FALSE 0.047 184.000 0.021 NA N NA
 270945 270946 y0385 y0386 dapF   TRUE 0.687 65.000 0.175 NA   NA
 270946 270947 y0386 y0387   xerC TRUE 0.993 -3.000 0.714 NA   NA
 270947 270948 y0387 y0388 xerC   TRUE 0.981 0.000 0.367 1.000   NA
 270948 270949 y0388 y0389   uvrD TRUE 0.584 96.000 0.128 1.000   NA
 270951 270952 y0391 y0392     FALSE 0.482 14.000 0.042 NA   NA
 270952 270953 y0392 y0393   corA FALSE 0.002 649.000 0.000 1.000   NA
 270954 270955 y0394 y0395 rarD   TRUE 0.683 18.000 0.099 NA   NA
 270956 270957 y0396 y0397 pldA recQ FALSE 0.360 78.000 0.057 1.000 N NA
 270957 270958 y0397 y0398 recQ   FALSE 0.248 107.000 0.043 1.000 N NA
 270960 270961 y0400 y0401 pldB   TRUE 0.919 -94.000 0.524 1.000   NA
 270961 270962 y0401 y0402     FALSE 0.032 265.000 0.000 1.000   NA
 270964 270965 y0404 y0405 glpA glpB TRUE 0.982 -28.000 0.650 0.001 N NA
 270965 270966 y0405 y0406 glpB glpC TRUE 0.992 -3.000 0.547 0.043 N NA
 270967 270968 y0407 y0408     FALSE 0.319 130.000 0.066 NA   NA
 270970 270971 y0410 y0411 zntA   FALSE 0.217 414.000 0.325 0.086   NA
 270972 270973 y0412 y0413     FALSE 0.162 212.000 0.058 NA   NA
 270974 270975 y0414 y0415     TRUE 0.747 -10.000 0.063 NA   NA
 270976 270977 y0416 y0417 ftsY ftsE TRUE 0.845 6.000 0.117 1.000 N NA
 270977 270978 y0417 y0418 ftsE ftsX TRUE 0.975 -10.000 0.121 1.000 Y NA
 270978 270979 y0418 y0419 ftsX rpoH FALSE 0.047 311.000 0.051 1.000 N NA
 270979 270980 y0419 y0420 rpoH   FALSE 0.067 163.000 0.000 1.000 N NA
 270982 270983 y0422 y0423 livK livH TRUE 0.874 181.000 0.217 1.000 Y NA
 270983 270984 y0423 y0424 livH livM TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.066 Y NA
 270984 270985 y0424 y0425 livM livG TRUE 0.998 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 270985 270986 y0425 y0426 livG livF TRUE 0.995 45.000 0.967 0.023 Y NA
 270986 270987 y0426 y0427 livF   FALSE 0.030 228.000 0.000 NA   NA
 270988 270989 y0428 y0429     TRUE 0.964 78.000 1.000 NA   NA
 270989 270990 y0429 y0430     TRUE 0.925 62.000 0.600 NA   NA
 270990 270991 y0430 y0431     TRUE 0.952 -43.000 0.600 NA   NA
 270991 270992 y0431 y0432     TRUE 0.939 -15.000 0.286 NA   NA
 270992 270993 y0432 y0433     FALSE 0.039 252.000 0.000 1.000   NA
 270994 270995 y0434 y0435 ugpB ugpA TRUE 0.924 298.000 0.793 0.065 Y NA
 270995 270996 y0435 y0436 ugpA ugpE TRUE 0.996 -3.000 0.306 0.065 Y NA
 270996 270997 y0436 y0437 ugpE ugpC TRUE 0.990 7.000 0.272 0.065 Y NA
 270997 270998 y0437 y0438 ugpC ugpQ TRUE 0.664 -3.000 0.024 1.000 N NA
 270998 270999 y0438 y0439 ugpQ   FALSE 0.201 101.000 0.023 1.000   NA
 270999 271000 y0439 y0440     FALSE 0.052 320.000 0.000 0.086   NA
 271004 271005 y0444 y0445 udp   FALSE 0.175 121.000 0.030 1.000 N NA
 271005 271006 y0445 y0446   cstA FALSE 0.189 358.000 0.000 1.000 Y NA
 271006 271007 y0446 y0447 cstA   FALSE 0.084 233.000 0.041 NA   NA
 271007 271008 y0447 y0448     FALSE 0.327 208.000 0.125 NA   NA
 271008 271009 y0448 y0449   ubiE FALSE 0.275 92.000 0.047 NA   NA
 271009 271010 y0449 y0450 ubiE   TRUE 0.783 -37.000 0.145 1.000   NA
 271010 271011 y0450 y0451     TRUE 0.985 0.000 0.432 1.000   NA
 271011 271012 y0451 y0452     FALSE 0.134 180.000 0.025 1.000   NA
 271012 271013 y0452 y0453     TRUE 0.980 4.000 0.130 1.000 Y NA
 271013 271014 y0453 y0454     TRUE 0.993 3.000 0.333 NA Y NA
 271014 271015 y0454 y0455     TRUE 0.564 56.000 0.121 NA N NA
 271015 271016 y0455 y0456     TRUE 0.845 27.000 0.000 NA Y NA
 271016 271017 y0456 y0457     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 271017 271018 y0457 y0458     FALSE 0.221 39.000 0.000 1.000   NA
 271018 271019 y0458 y0459   hemB FALSE 0.474 15.000 0.031 1.000   NA
 271021 271022 y0461 y0462   fre TRUE 0.889 55.000 0.090 1.000 Y NA
 271023 271024 y0463 y0464 fadA fadB TRUE 0.993 12.000 0.607 1.000 Y NA
 271025 271026 y0465 y0466 pepQ   FALSE 0.022 263.000 0.000 1.000 N NA
 271026 271027 y0466 y0467     FALSE 0.171 73.000 0.000 1.000   NA
 271027 271028 y0467 y0468   trkH FALSE 0.202 40.000 0.007 1.000   NA
 271028 271029 y0468 y0469 trkH hemG TRUE 0.935 22.000 0.455 1.000 N NA
 271029 2158898 y0469 yr008 hemG   FALSE 0.003 476.000 0.000 NA   NA
 2158898 2158899 yr008 yt010     FALSE 0.108 60.000 0.000 NA   NA
 2158899 2158900 yt010 yt011     FALSE 0.112 55.000 0.000 NA   NA
 2158900 407403 yt011 yr009   rrl FALSE 0.032 222.000 0.000 NA   NA
 407403 406746 yr009 yr010 rrl rrf FALSE 0.083 108.000 0.000 NA   NA
 406746 271030 yr010 y0471 rrf murB FALSE 0.003 462.000 0.000 NA   NA
 271030 271031 y0471 y0470 murB   FALSE 0.094 -330.000 0.000 NA   NA
 271031 271032 y0470 y0472   birA FALSE 0.001 704.000 0.000 NA   NA
 271033 271034 y0473 y0474 coaA   FALSE 0.067 211.000 0.000 1.000   NA
 271035 271036 y0475 y0476     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 271036 2158901 y0476 yt012     FALSE 0.003 464.000 0.000 NA   NA
 2158901 2158902 yt012 yt013     FALSE 0.170 22.000 0.000 NA   NA
 2158902 2158903 yt013 yt014     FALSE 0.063 153.000 0.000 NA   NA
 2158903 2158904 yt014 yt015     FALSE 0.268 10.000 0.000 NA   NA
 2158904 271037 yt015 y0477   tufB FALSE 0.081 112.000 0.000 NA   NA
 271037 271038 y0477 y0478 tufB secE FALSE 0.024 251.000 0.009 1.000 N NA
 271038 271039 y0478 y0479 secE nusG TRUE 0.994 2.000 0.843 1.000 N NA
 271039 271040 y0479 y0480 nusG rplK TRUE 0.872 191.000 0.681 1.000 N NA
 271040 271041 y0480 y0481 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.017 Y NA
 271041 271042 y0481 y0482 rplA rplJ TRUE 0.641 365.000 0.302 0.017 Y NA
 271042 271043 y0482 y0483 rplJ rplL TRUE 0.993 67.000 0.884 0.013 Y NA
 271043 271044 y0483 y0484 rplL rpoB FALSE 0.190 343.000 0.223 1.000   NA
 271044 271045 y0484 y0485 rpoB rpoC TRUE 0.973 93.000 0.851 0.001   NA
 271046 271047 y0486 y0487   thiH FALSE 0.006 381.000 0.000 1.000 N NA
 271047 271048 y0487 y0488 thiH thiG TRUE 0.989 -22.000 0.277 0.003 Y NA
 271048 271049 y0488 y0489 thiG thiF TRUE 0.645 214.000 0.005 0.024 Y NA
 271049 271050 y0489 y0490 thiF thiE TRUE 0.987 -10.000 0.242 1.000 Y NA
 271050 271051 y0490 y0491 thiE thiC TRUE 0.960 -28.000 0.063 0.003 Y NA
 271051 271052 y0491 y0492 thiC   FALSE 0.007 376.000 0.000 1.000 N NA
 271053 271054 y0493 y0495     FALSE 0.089 93.000 0.000 NA   NA
 271056 271057 y0496 y0497 hemE nfi FALSE 0.212 66.000 0.028 1.000 N NA
 271057 271058 y0497 y0498 nfi   TRUE 0.529 46.000 0.086 NA   NA
 271058 271059 y0498 y0499   hupA TRUE 0.711 189.000 0.355 NA   NA
 271059 271060 y0499 y0500 hupA   TRUE 0.976 2.000 0.375 NA   NA
 271061 271062 y0501 y0502 purD purH TRUE 0.959 36.000 0.238 1.000 Y NA
 2158905 2158906 yr011 yt016     FALSE 0.088 94.000 0.000 NA   NA
 2158906 407404 yt016 yr012   rrl FALSE 0.020 256.000 0.000 NA   NA
 407404 406747 yr012 yr013 rrl rrf FALSE 0.083 108.000 0.000 NA   NA
 406747 271063 yr013 y0503 rrf   FALSE 0.003 465.000 0.000 NA   NA
 271063 271064 y0503 y0504     FALSE 0.269 24.000 0.000 1.000   NA
 271065 271066 y0505 y0506     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 271068 271069 y0508 y0509     TRUE 0.993 -3.000 0.733 NA   NA
 271069 271070 y0509 y0510   acs TRUE 0.651 57.000 0.147 NA   NA
 271072 271073 y0512 y0513     TRUE 0.996 13.000 0.688 0.011 Y NA
 271074 271075 y0514 y0515     TRUE 0.940 -13.000 0.268 NA   NA
 271075 271076 y0515 y0516     TRUE 0.769 19.000 0.146 NA   NA
 271076 271077 y0516 y0517     FALSE 0.095 174.000 0.000 1.000   NA
 271077 271078 y0517 y0518     TRUE 0.883 7.000 0.150 1.000   NA
 271078 271079 y0518 y0519     TRUE 0.991 -3.000 0.650 NA   NA
 271079 271080 y0519 y0520     TRUE 0.793 155.000 0.407 NA   NA
 271080 2158907 y0520 y0521     FALSE 0.492 -3.000 0.000 NA   NA
 271082 271083 y0523 y0524     TRUE 0.903 84.000 0.538 NA   NA
 271083 271084 y0524 y0525     FALSE 0.315 -13.000 0.000 NA   NA
 271084 271085 y0525 y0526   fliI TRUE 0.997 -13.000 0.647 0.011 Y NA
 271085 271086 y0526 y0527 fliI   TRUE 0.949 -3.000 0.176 NA   NA
 271086 271087 y0527 y0528     TRUE 0.989 -19.000 1.000 NA   NA
 271087 271088 y0528 y0529     TRUE 0.902 -22.000 0.231 NA   NA
 271088 271089 y0529 y0530     TRUE 0.914 67.000 0.154 1.000 Y NA
 271089 271090 y0530 y0531     TRUE 0.980 9.000 0.136 0.016 Y NA
 271090 271091 y0531 y0532     TRUE 0.997 2.000 0.516 0.085 Y NA
 271091 271092 y0532 y0533     TRUE 0.994 -13.000 0.406 0.085 Y NA
 271092 271093 y0533 y0534     FALSE 0.019 383.000 0.045 NA   NA
 271093 271094 y0534 y0535     TRUE 0.995 -3.000 0.844 NA   NA
 271096 271097 y0537 y0538   metC TRUE 0.846 46.000 0.043 NA Y NA
 271098 271099 y0539 y0540 hmuV hmuU TRUE 0.988 -7.000 0.220 1.000 Y NA
 271099 271100 y0540 y0541 hmuU hmuT TRUE 0.999 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 271100 271101 y0541 y0542 hmuT hmuS TRUE 0.996 -3.000 0.384 1.000 Y NA
 271101 271102 y0542 y0543 hmuS hmuR TRUE 0.817 119.000 0.064 1.000 Y NA
 271102 271103 y0543 y0544 hmuR hmuP FALSE 0.040 204.000 0.000 NA   NA
 271103 271104 y0544 y0545 hmuP   FALSE 0.093 86.000 0.000 NA   NA
 271104 271105 y0545 y0546     FALSE 0.441 34.000 0.054 1.000 N NA
 271105 271106 y0546 y0547     TRUE 0.932 -3.000 0.135 1.000 N NA
 271106 271107 y0547 y0548     FALSE 0.009 341.000 0.000 1.000 N NA
 271107 271108 y0548 y0549     FALSE 0.010 315.000 0.000 NA   NA
 271108 271109 y0549 y0550     FALSE 0.005 397.000 0.000 NA   NA
 271109 271110 y0550 y0551     TRUE 0.983 0.000 0.420 NA   NA
 271110 271111 y0551 y0552     TRUE 0.959 -7.000 0.296 NA   NA
 271111 271112 y0552 y0553     TRUE 0.677 -52.000 0.126 NA   NA
 271112 271113 y0553 y0554     TRUE 0.899 12.000 0.217 1.000   NA
 271114 271115 y0555 y0556 terZ terA TRUE 0.930 0.000 0.054 0.004   NA
 271115 271116 y0556 y0557 terA terB TRUE 0.787 33.000 0.200 NA   NA
 271116 271117 y0557 y0558 terB terC TRUE 0.729 109.000 0.000 NA Y NA
 271117 271118 y0558 y0559 terC terD FALSE 0.127 58.000 0.000 1.000 N NA
 271118 271119 y0559 y0560 terD terE TRUE 0.941 184.000 0.310 0.004 Y NA
 271119 271120 y0560 y0561 terE   FALSE 0.001 713.000 0.000 NA   NA
 271120 271121 y0561 y0562     FALSE 0.022 251.000 0.000 NA   NA
 271121 271122 y0562 y0563     TRUE 0.977 72.000 0.571 NA Y NA
 271122 271123 y0563 y0564     FALSE 0.290 8.000 0.000 NA   NA
 271123 271124 y0564 y0565     FALSE 0.001 1112.000 0.000 NA   NA
 271124 271125 y0565 y0566     FALSE 0.001 1009.000 0.000 1.000   NA
 271127 271128 y0568 y0569 ubiC ubiA TRUE 0.892 166.000 0.248 NA Y NA
 271130 271131 y0571 y0572 dgkA lexA TRUE 0.541 125.000 0.141 1.000 N NA
 271133 271134 y0574 y0575     FALSE 0.014 516.000 0.070 NA   NA
 271136 271137 y0577 y0578 dnaB alr TRUE 0.800 97.000 0.317 1.000 N NA
 271137 271138 y0578 y0579 alr tyrB TRUE 0.511 185.000 0.181 1.000 N NA
 271140 271141 y0581 y0582   ssb FALSE 0.015 281.000 0.000 NA   NA
 271142 271143 y0583 y0584     TRUE 0.656 11.000 0.063 NA   NA
 271143 271144 y0584 y0585   rhaD TRUE 0.545 67.000 0.041 0.006 N NA
 271144 271145 y0585 y0586 rhaD rhaA TRUE 0.978 13.000 0.247 1.000 Y NA
 271145 271146 y0586 y0587 rhaA rhaB TRUE 0.993 -9.000 0.387 1.000 Y NA
 271149 271150 y0590 y0591 rhaS rhaR TRUE 0.988 133.000 0.800 0.035 Y NA
 271151 271152 y0592 y0593   rhaT FALSE 0.230 -25.000 0.000 NA   NA
 271153 271154 y0594 y0595     FALSE 0.100 71.000 0.000 NA   NA
 2158908 271157 yt017 y0598     FALSE 0.066 145.000 0.000 NA   NA
 271158 271159 y0599 y0600   hydN TRUE 0.898 23.000 0.222 0.013 N NA
 271159 271160 y0600 y0601 hydN fdhF TRUE 0.905 23.000 0.231 0.042   NA
 271163 271164 y0604 y0605 cutA dcuA FALSE 0.080 185.000 0.007 1.000   NA
 271164 271165 y0605 y0606 dcuA aspA FALSE 0.183 120.000 0.023 1.000   NA
 271166 271167 y0607 y0608 fxsA mopB FALSE 0.062 255.000 0.040 NA   NA
 271167 271168 y0608 y0609 mopB mopA TRUE 0.990 47.000 0.631 0.007 Y NA
 271168 271169 y0609 y0610 mopA   FALSE 0.003 480.000 0.000 NA   NA
 271171 271172 y0612 y0613 efp sugE FALSE 0.099 100.000 0.000 1.000 N NA
 271173 271174 y0614 y0615 frdD frdC TRUE 0.996 17.000 0.787 0.003 Y NA
 271174 271175 y0615 y0616 frdC frdB TRUE 0.991 17.000 0.454 0.003 Y NA
 271175 271176 y0616 y0617 frdB frdA TRUE 0.997 -7.000 0.470 0.003 Y NA
 271178 271179 y0619 y0620   psd TRUE 0.728 24.000 0.148 NA N NA
 271182 2158909 y0623 yt018     FALSE 0.004 436.000 0.000 NA   NA
 2158909 2158910 yt018 yt019     FALSE 0.087 95.000 0.000 NA   NA
 271184 271185 y0625 y0626     TRUE 0.792 11.000 0.118 NA   NA
 271185 271186 y0626 y0627   amiB TRUE 0.809 8.000 0.109 NA   NA
 271186 271187 y0627 y0628 amiB mutL TRUE 0.688 16.000 0.092 1.000 N NA
 271187 271188 y0628 y0629 mutL miaA TRUE 0.930 -7.000 0.188 1.000 N NA
 271188 271189 y0629 y0630 miaA hfq TRUE 0.892 116.000 0.531 1.000   NA
 271189 271190 y0630 y0632 hfq hflX TRUE 0.600 99.000 0.141 1.000   NA
 271192 271193 y0633 y0634 hflK hflC TRUE 0.999 4.000 0.947 0.017 Y NA
 271193 271194 y0634 y0635 hflC purA FALSE 0.005 460.000 0.019 1.000 N NA
 271194 271195 y0635 y0636 purA   FALSE 0.002 369.000 0.010 NA N NA
 271195 271196 y0636 y0637   vacB TRUE 0.496 241.000 0.038 NA Y NA
 271196 271197 y0637 y0638 vacB   TRUE 0.693 119.000 0.147 0.017 N NA
 271197 271198 y0638 y0639   aidB FALSE 0.004 408.000 0.005 1.000 N NA
 271201 271202 y0642 y0643     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 271203 271204 y0644 y0645   rpsF FALSE 0.010 367.000 0.005 1.000   NA
 271204 271205 y0645 y0646 rpsF rpsR TRUE 0.722 331.000 0.319 0.013 Y NA
 271205 271206 y0646 y0647 rpsR rplI TRUE 0.986 40.000 0.499 0.013 Y NA
 271206 271207 y0647 y0648 rplI   FALSE 0.078 145.000 0.000 1.000 N NA
 271208 271209 y0649 y0650     FALSE 0.219 140.000 0.047 NA   NA
 271211 271212 y0652 y0653   cpdB FALSE 0.094 155.000 0.030 NA N NA
 271216 271217 y0657 y0658   msrA FALSE 0.050 278.000 0.042 NA   NA
 271218 271219 y0659 y0661     TRUE 0.990 -3.000 0.575 NA   NA
 271219 271220 y0661 y0660     FALSE 0.086 -780.000 0.000 NA   NA
 271220 271221 y0660 y0662     FALSE 0.000 3140.000 0.000 NA   NA
 271222 271223 y0663 y0664 ppa fbp FALSE 0.141 200.000 0.043 1.000 N NA
 271225 271226 y0666 y0667   argR FALSE 0.005 389.000 0.000 NA   NA
 271231 271232 y0672 y0673 rplU rpmA TRUE 0.994 20.000 0.667 0.013 Y NA
 271232 271233 y0673 y0674 rpmA   FALSE 0.133 88.000 0.019 NA   NA
 271233 271234 y0674 y0675     TRUE 0.493 1.000 0.015 NA   NA
 271235 271236 y0676 y0677 basS basR TRUE 0.996 -3.000 0.381 1.000 Y NA
 271236 271237 y0677 y0678 basR dacB TRUE 0.825 6.000 0.101 1.000 N NA
 271240 271241 y0681 y0682 rrmJ hflB TRUE 0.689 48.000 0.152 1.000 N NA
 271241 271242 y0682 y0683 hflB folP TRUE 0.790 120.000 0.325 1.000 N NA
 271242 271243 y0683 y0684 folP mrsA TRUE 0.924 10.000 0.260 1.000 N NA
 271243 271244 y0684 y0685 mrsA secG FALSE 0.045 223.000 0.016 1.000 N NA
 271244 2158911 y0685 yt020 secG   FALSE 0.089 93.000 0.000 NA   NA
 2158911 2158912 yt020 yt021     FALSE 0.105 64.000 0.000 NA   NA
 2158912 271245 yt021 y0686     FALSE 0.033 219.000 0.000 NA   NA
 271245 271246 y0686 y0687   nusA TRUE 0.990 4.000 0.759 NA   NA
 271246 271247 y0687 y0688 nusA infB TRUE 0.902 25.000 0.342 1.000 N NA
 271247 271248 y0688 y0689 infB rbfA TRUE 0.977 66.000 0.530 1.000 Y NA
 271248 271249 y0689 y0690 rbfA truB TRUE 0.994 0.000 0.318 1.000 Y NA
 271249 271250 y0690 y0691 truB rpsO TRUE 0.913 122.000 0.211 1.000 Y NA
 271250 271251 y0691 y0692 rpsO   FALSE 0.120 66.000 0.000 1.000 N NA
 271251 271252 y0692 y0693     TRUE 0.927 54.000 0.167 1.000 Y NA
 271252 271253 y0693 y0694   pnp FALSE 0.064 171.000 0.000 1.000 N NA
 271253 271254 y0694 y0695 pnp   FALSE 0.392 125.000 0.071 1.000   NA
 271254 271255 y0695 y0696   deaD FALSE 0.219 187.000 0.053 1.000   NA
 271255 271256 y0696 y0697 deaD   FALSE 0.178 20.000 0.000 NA   NA
 271256 271257 y0697 y0698     FALSE 0.126 43.000 0.000 NA   NA
 271257 271258 y0698 y0699     FALSE 0.164 24.000 0.000 NA   NA
 271259 271260 y0700 y0701     FALSE 0.006 369.000 0.000 NA   NA
 271261 271262 y0702 y0703 acrA acrB TRUE 0.892 4.000 0.133 1.000 N NA
 271262 271263 y0703 y0704 acrB   TRUE 0.983 2.000 0.367 0.064 N NA
 271264 271265 y0705 y0706     TRUE 0.999 -9.000 0.948 0.003 Y NA
 271266 271267 y0707 y0708     TRUE 0.966 -6.000 0.295 1.000   NA
 271268 271269 y0709 y0710     FALSE 0.052 231.000 0.000 1.000   NA
 271269 271270 y0710 y0711     TRUE 0.924 72.000 0.400 0.001   NA
 271271 271272 y0712 y0713     TRUE 0.996 8.000 0.611 0.064 Y NA
 271272 271273 y0713 y0714     TRUE 0.993 19.000 0.611 0.064 Y NA
 271273 271274 y0714 y0715   ugpC TRUE 0.990 12.000 0.364 0.064 Y NA
 271274 271275 y0715 y0716 ugpC   TRUE 0.909 15.000 0.273 1.000   NA
 271275 271276 y0716 y0717     FALSE 0.231 117.000 0.032 1.000   NA
 271276 271277 y0717 y0718     FALSE 0.291 152.000 0.056 1.000   NA
 271280 271281 y0721 y0722 phnN phnM TRUE 0.992 0.000 0.235 NA Y NA
 271281 271282 y0722 y0723 phnM phnL TRUE 0.995 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 271284 271285 y0725 y0726 phnK phnJ TRUE 0.999 0.000 0.883 1.000 Y NA
 271285 271286 y0726 y0727 phnJ phnI TRUE 0.998 -7.000 0.880 1.000 Y NA
 271286 271287 y0727 y0728 phnI phnH TRUE 0.999 -6.000 0.960 0.002 Y NA
 271287 271288 y0728 y0729 phnH phnG TRUE 0.999 -3.000 0.967 0.002 Y NA
 271288 271289 y0729 y0730 phnG phnF TRUE 0.992 1.000 0.691 1.000 N NA
 271289 271290 y0730 y0731 phnF   FALSE 0.160 25.000 0.000 NA   NA
 271290 271291 y0731 y0732   nrdG FALSE 0.074 127.000 0.000 NA   NA
 271291 271292 y0732 y0733 nrdG nrdD TRUE 0.743 207.000 0.464 1.000 N NA
 271292 271293 y0733 y0734 nrdD   FALSE 0.004 434.000 0.000 1.000 N NA
 271293 271294 y0734 y0735   dppD TRUE 0.996 -13.000 0.550 0.023 Y NA
 271294 271295 y0735 y0736 dppD dppC TRUE 0.977 -37.000 0.324 1.000 Y NA
 271295 271296 y0736 y0737 dppC   TRUE 0.989 19.000 0.441 0.064 Y NA
 271296 2158913 y0737 y0738     FALSE 0.087 96.000 0.000 NA   NA
 271300 271301 y0742 y0743   valS TRUE 0.702 143.000 0.008 1.000 Y NA
 271301 271302 y0743 y0745 valS holC TRUE 0.722 13.000 0.089 1.000 N NA
 271305 271306 y0747 y0748     TRUE 0.993 0.000 0.631 0.084   NA
 271306 2158914 y0748 yt022     FALSE 0.083 105.000 0.000 NA   NA
 2158914 271307 yt022 y0749   intB FALSE 0.056 166.000 0.000 NA   NA
 271307 271308 y0749 y0750 intB   FALSE 0.116 52.000 0.000 NA   NA
 271308 271309 y0750 y0751     FALSE 0.267 -19.000 0.000 NA   NA
 271310 271311 y0752 y0753     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 271313 271314 y0755 y0756     TRUE 0.717 186.000 0.356 NA   NA
 271314 271315 y0756 y0757     TRUE 0.910 -3.000 0.110 NA   NA
 271317 271318 y0759 y0760 hofC hofB TRUE 0.998 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 271318 271319 y0760 y0761 hofB ppdD TRUE 0.991 -25.000 0.556 NA Y NA
 271319 271320 y0761 y0762 ppdD nadC FALSE 0.023 203.000 0.015 NA N NA
 271321 271322 y0763 y0764 ampD ampE TRUE 0.681 290.000 0.249 1.000 Y NA
 271324 271325 y0766 y0767 pdhR aceE TRUE 0.624 196.000 0.276 1.000 N NA
 271325 271326 y0767 y0768 aceE aceF TRUE 0.974 14.000 0.220 1.000 Y NA
 271326 271327 y0768 y0769 aceF lpdA TRUE 0.783 303.000 0.463 1.000 Y NA
 271327 271328 y0769 y0770 lpdA   FALSE 0.055 192.000 0.000 1.000 N NA
 271328 271329 y0770 y0771   acnB FALSE 0.002 570.000 0.000 1.000 N NA
 271329 271330 y0771 y0772 acnB   FALSE 0.071 299.000 0.068 NA   NA
 271331 271332 y0773 y0774   speD FALSE 0.004 438.000 0.000 NA   NA
 271332 271333 y0774 y0775 speD speE TRUE 0.912 78.000 0.162 1.000 Y NA
 271333 271334 y0775 y0776 speE   TRUE 0.810 117.000 0.354 NA   NA
 271335 271336 y0777 y0778   hpt FALSE 0.039 220.000 0.010 1.000 N NA
 271338 271339 y0780 y0781     TRUE 0.998 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 271339 271340 y0781 y0782     FALSE 0.039 207.000 0.000 NA   NA
 271340 271341 y0782 y0783     FALSE 0.267 -19.000 0.000 NA   NA
 271342 271343 y0784 y0785 panD panC FALSE 0.487 411.000 0.342 1.000 Y NA
 271343 271344 y0785 y0786 panC panB TRUE 0.977 88.000 0.395 0.001 Y NA
 271344 271345 y0786 y0787 panB folK TRUE 0.557 269.000 0.117 1.000 Y NA
 271345 271346 y0787 y0788 folK pcnB TRUE 0.923 8.000 0.234 1.000 N NA
 271346 271347 y0788 y0789 pcnB   TRUE 0.892 89.000 0.131 1.000 Y NA
 271349 271350 y0790 y0792 dksA sfsA FALSE 0.475 170.000 0.151 NA   NA
 271350 271351 y0792 y0793 sfsA   TRUE 0.518 -25.000 0.045 NA   NA
 271352 271353 y0794 y0795 hrpB mrcB FALSE 0.236 264.000 0.158 1.000 N NA
 271353 271354 y0795 y0796 mrcB fhuC FALSE 0.011 322.000 0.000 1.000 N NA
 271354 271355 y0796 y0797 fhuC fhuD TRUE 0.983 0.000 0.094 1.000 Y NA
 271355 271356 y0797 y0798 fhuD fhuB TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 271358 271359 y0800 y0801     FALSE 0.174 116.000 0.031 NA   NA
 271360 271361 y0802 y0803     FALSE 0.066 146.000 0.000 NA   NA
 271361 271362 y0803 y0804     TRUE 0.807 -48.000 0.213 NA   NA
 271362 271363 y0804 y0805   pfs TRUE 0.867 0.000 0.073 1.000 N NA
 271364 271365 y0806 y0807 dgt htrA FALSE 0.312 198.000 0.101 1.000 N NA
 271367 271368 y0809 y0810     FALSE 0.198 16.000 0.000 NA   NA
 271368 271369 y0810 y0811   relA FALSE 0.268 10.000 0.000 NA   NA
 271369 271370 y0811 y0812 relA mazG FALSE 0.156 202.000 0.040 1.000   NA
 271370 271371 y0812 y0813 mazG pyrG FALSE 0.099 212.000 0.025 1.000   NA
 271371 271372 y0813 y0814 pyrG eno FALSE 0.411 81.000 0.068 1.000 N NA
 271372 271373 y0814 y0815 eno sodC FALSE 0.007 372.000 0.000 1.000 N NA
 271373 271374 y0815 y0816 sodC   FALSE 0.068 104.000 0.004 1.000 N NA
 271376 271377 y0818 y0819 cysJ cysI TRUE 0.999 0.000 0.791 0.001 Y NA
 271377 2158915 y0819 y0820 cysI   FALSE 0.492 -3.000 0.000 NA   NA
 2158916 271379 y0822 y0823   cysD FALSE 0.253 11.000 0.000 NA   NA
 271379 271380 y0823 y0824 cysD cysN TRUE 0.982 12.000 0.574 0.001 N NA
 271380 271381 y0824 y0825 cysN cysC TRUE 0.970 -61.000 0.340 1.000 Y NA
 271381 271382 y0825 y0826 cysC   TRUE 0.552 173.000 0.198 NA   NA
 271382 271383 y0826 y0827     FALSE 0.022 314.000 0.028 NA   NA
 271383 271384 y0827 y0828     TRUE 0.926 4.000 0.185 1.000 N NA
 271384 271385 y0828 y0829     TRUE 0.956 130.000 0.419 1.000 Y NA
 271385 271386 y0829 y0830     TRUE 0.877 11.000 0.173 1.000   NA
 271386 271387 y0830 y0831   surE TRUE 0.912 -22.000 0.235 1.000   NA
 271387 271388 y0831 y0832 surE pcm TRUE 0.974 -6.000 0.353 1.000   NA
 271388 271389 y0832 y0833 pcm nlpD FALSE 0.188 104.000 0.030 1.000 N NA
 271389 271390 y0833 y0834 nlpD rpoS TRUE 0.650 55.000 0.142 1.000 N NA
 271394 271395 y0838 y0839     FALSE 0.402 64.000 0.000 0.024 N NA
 271395 271396 y0839 y0840     TRUE 0.831 0.000 0.058 1.000 N NA
 271396 271397 y0840 y0842     TRUE 0.989 7.000 0.211 0.001 Y NA
 271397 271398 y0842 y0841     FALSE 0.098 -166.000 0.000 NA   NA
 271399 271400 y0843 y0844   arsB FALSE 0.002 528.000 0.000 1.000 N NA
 271400 271401 y0844 y0845 arsB arsR FALSE 0.109 85.000 0.000 1.000 N NA
 271401 271402 y0845 y0846 arsR   FALSE 0.001 721.000 0.000 NA   NA
 271402 271403 y0846 y0847     FALSE 0.004 421.000 0.000 NA   NA
 271403 271404 y0847 y0848     FALSE 0.121 65.000 0.000 1.000 N NA
 271404 271405 y0848 y0849     FALSE 0.027 237.000 0.000 NA   NA
 271406 271407 y0850 y0851     FALSE 0.004 433.000 0.000 NA   NA
 271408 271409 y0852 y0853 map   TRUE 0.983 -3.000 0.410 NA   NA
 271409 271410 y0853 y0854   fumA FALSE 0.073 129.000 0.000 NA   NA
 271410 271411 y0854 y0855 fumA lyxK FALSE 0.006 398.000 0.000 1.000 N NA
 271411 271412 y0855 y0856 lyxK sgbU TRUE 0.998 11.000 1.000 0.020 Y NA
 271412 271413 y0856 y0857 sgbU   TRUE 0.862 206.000 0.250 1.000 Y NA
 271413 271414 y0857 y0858     TRUE 0.998 13.000 0.938 0.013 Y NA
 271414 271415 y0858 y0859     TRUE 0.999 -7.000 0.941 0.013 Y NA
 271415 271416 y0859 y0860     FALSE 0.075 151.000 0.000 1.000 N NA
 271416 271417 y0860 y0861     FALSE 0.016 200.000 0.000 NA N NA
 271417 271418 y0861 y0862     TRUE 0.941 62.000 0.235 NA Y NA
 271419 271420 y0863 y0864 araD dmsA FALSE 0.004 442.000 0.000 1.000 N NA
 271420 271421 y0864 y0865 dmsA dmsB TRUE 0.970 12.000 0.103 0.041 Y NA
 271421 271422 y0865 y0866 dmsB dmsC TRUE 0.926 -61.000 0.500 1.000   NA
 271422 271423 y0866 y0867 dmsC   TRUE 0.498 146.000 0.125 1.000   NA
 271424 271425 y0868 y0869 cybB cybC TRUE 0.780 148.000 0.000 0.041 Y NA
 271425 271426 y0869 y0870 cybC katG FALSE 0.309 158.000 0.000 0.006 N NA
 271427 271428 y0871 y0872     TRUE 0.774 93.000 0.280 NA   NA
 271428 271429 y0872 y0873     TRUE 0.972 0.000 0.292 NA   NA
 271429 271430 y0873 y0874   rbsC TRUE 0.999 -3.000 0.793 0.013 Y NA
 271430 2158917 y0874 y0875 rbsC   FALSE 0.022 251.000 0.000 NA   NA
 2158917 271431 y0875 y0876   glpK FALSE 0.414 3.000 0.000 NA   NA
 271431 271432 y0876 y0877 glpK   TRUE 0.734 21.000 0.127 1.000 N NA
 271433 271434 y0878 y0879     FALSE 0.041 248.000 0.000 1.000   NA
 271435 271436 y0880 y0881   recA FALSE 0.401 115.000 0.082 NA   NA
 271436 271437 y0881 y0882 recA oraA TRUE 0.759 138.000 0.296 1.000   NA
 271437 271438 y0882 y0883 oraA alaS FALSE 0.410 140.000 0.085 1.000   NA
 271438 271439 y0883 y0884 alaS csrA FALSE 0.038 250.000 0.020 1.000 N NA
 271439 2158918 y0884 yt023 csrA   FALSE 0.007 363.000 0.000 NA   NA
 2158918 2158919 yt023 yt024     FALSE 0.242 12.000 0.000 NA   NA
 2158919 2158920 yt024 yt025     FALSE 0.107 61.000 0.000 NA   NA
 2158920 2158921 yt025 yt026     FALSE 0.094 83.000 0.000 NA   NA
 2158921 271440 yt026 y0885     FALSE 0.004 426.000 0.000 NA   NA
 271440 271441 y0885 y0886     TRUE 0.855 -3.000 0.067 NA   NA
 271441 271442 y0886 y0887   gshA FALSE 0.484 44.000 0.071 NA   NA
 271442 271443 y0887 y0888 gshA   FALSE 0.330 168.000 0.087 1.000 N NA
 271443 271444 y0888 y0889     FALSE 0.074 153.000 0.000 1.000 N NA
 271445 271446 y0890 y0891     TRUE 0.748 162.000 0.349 NA   NA
 271449 271450 y0894 y0895 rpsP rimM TRUE 0.985 22.000 0.342 0.013 Y NA
 271450 271451 y0895 y0896 rimM trmD TRUE 0.995 -18.000 0.672 1.000 Y NA
 271451 271452 y0896 y0897 trmD rplS TRUE 0.978 81.000 0.567 1.000 Y NA
 271452 271453 y0897 y0898 rplS   FALSE 0.068 161.000 0.000 1.000 N NA
 271454 2158922 y0899 y0900     FALSE 0.016 278.000 0.000 NA   NA
 2158922 271455 y0900 y0901     FALSE 0.088 -680.000 0.000 NA   NA
 271455 271456 y0901 y0902     FALSE 0.007 429.000 0.000 1.000   NA
 271457 271458 y0903 y0904 aroF tyrA TRUE 0.915 13.000 0.023 1.000 Y NA
 2158923 271459 y0907 y0905     FALSE 0.084 -1253.000 0.000 NA   NA
 271459 271460 y0905 y0906     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 271462 271463 y0909 y0910 pheL   FALSE 0.072 132.000 0.000 NA   NA
 271463 271464 y0910 y0911     FALSE 0.013 253.000 0.004 NA   NA
 271465 271466 y0912 y0913 sfhB   TRUE 0.934 2.000 0.168 NA   NA
 271466 271467 y0913 y0914   clpB FALSE 0.478 109.000 0.108 NA   NA
 271467 2158924 y0914 yr014 clpB   FALSE 0.002 518.000 0.000 NA   NA
 2158924 2158925 yr014 yt027     FALSE 0.108 60.000 0.000 NA   NA
 2158925 2158926 yt027 yt028     FALSE 0.112 55.000 0.000 NA   NA
 2158926 407405 yt028 yr015   rrl FALSE 0.032 222.000 0.000 NA   NA
 407405 406748 yr015 yr016 rrl rrf FALSE 0.083 108.000 0.000 NA   NA
 271468 271469 y0915 y0916   pssA TRUE 0.502 62.000 0.089 NA   NA
 271469 271470 y0916 y0917 pssA   TRUE 0.535 173.000 0.121 0.048 N NA
 271470 271471 y0917 y0918     TRUE 0.792 43.000 0.222 NA   NA
 271471 271472 y0918 y0919   trxC FALSE 0.313 170.000 0.084 NA   NA
 271474 271475 y0921 y0922 emrB emrA TRUE 0.970 39.000 0.875 1.000 N NA
 271475 271476 y0922 y0923 emrA emrR FALSE 0.059 372.000 0.107 1.000 N NA
 271476 271477 y0923 y0924 emrR   FALSE 0.293 148.000 0.065 NA   NA
 271477 271478 y0924 y0925     TRUE 0.995 -3.000 0.915 NA   NA
 271478 271479 y0925 y0926     FALSE 0.215 160.000 0.060 NA N NA
 271479 271480 y0926 y0927     FALSE 0.030 228.000 0.000 NA   NA
 271480 271481 y0927 y0928     TRUE 0.801 29.000 0.203 NA   NA
 271481 271482 y0928 y0929     TRUE 0.919 -3.000 0.122 NA   NA
 271483 271484 y0930 y0931     FALSE 0.054 171.000 0.000 NA   NA
 271484 271485 y0931 y0932     FALSE 0.011 328.000 0.000 1.000 N NA
 271485 271486 y0932 y0933     TRUE 0.996 13.000 0.765 0.063 Y NA
 271486 271487 y0933 y0934     TRUE 0.998 -3.000 0.433 0.018 Y NA
 271487 271488 y0934 y0935   glnQ TRUE 0.993 -19.000 0.532 1.000 Y NA
 271488 2158927 y0935 y0938 glnQ   FALSE 0.144 32.000 0.000 NA   NA
 271489 271490 y0936 y0937     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 271491 271492 y0939 y0940     FALSE 0.001 762.000 0.000 NA   NA
 271492 271493 y0940 y0941     FALSE 0.038 208.000 0.000 NA   NA
 271493 271494 y0941 y0942     TRUE 0.754 41.000 0.188 NA   NA
 271494 271495 y0942 y0943     FALSE 0.408 -6.000 0.000 NA   NA
 271495 271496 y0943 y0944     FALSE 0.445 155.000 0.125 NA   NA
 271496 271497 y0944 y0945     TRUE 0.595 2.000 0.000 1.000   NA
 271499 271500 y0947 y0948 gmhA   TRUE 0.568 203.000 0.229 1.000   NA
 271501 271502 y0949 y0950     FALSE 0.011 309.000 0.000 NA   NA
 271503 271504 y0951 y0952 nqrA nqrB TRUE 0.999 4.000 0.854 0.002 Y NA
 271504 271505 y0952 y0953 nqrB nqrC TRUE 0.990 -67.000 0.603 0.002 Y NA
 271505 271506 y0953 y0954 nqrC nqrD TRUE 0.995 -7.000 0.312 0.002 Y NA
 271506 271507 y0954 y0955 nqrD   TRUE 0.994 1.000 0.188 0.002 Y NA
 271507 271508 y0955 y0956   nqrF TRUE 0.994 16.000 0.551 0.002 Y NA
 271508 271509 y0956 y0957 nqrF   TRUE 0.969 -19.000 0.519 1.000 N NA
 271515 271516 y0963 y0964 gpt frsA FALSE 0.479 127.000 0.120 NA   NA
 271516 271517 y0964 y0965 frsA crl TRUE 0.522 60.000 0.095 NA   NA
 271517 271518 y0965 y0966 crl proB TRUE 0.643 177.000 0.262 NA   NA
 271518 271519 y0966 y0967 proB proA TRUE 0.962 10.000 0.026 0.001 Y NA
 271519 271520 y0967 y0968 proA   FALSE 0.003 328.000 0.000 NA N NA
 271520 271521 y0968 y0969     FALSE 0.190 183.000 0.053 NA   NA
 271521 271522 y0969 y0970     FALSE 0.023 246.000 0.000 NA   NA
 271522 271523 y0970 y0971     FALSE 0.002 700.000 0.000 1.000   NA
 271523 271524 y0971 y0972   aroL FALSE 0.027 247.000 0.000 1.000 N NA
 271524 271525 y0972 y0973 aroL   FALSE 0.003 490.000 0.016 NA   NA
 271528 271529 y0976 y0977 sbcC sbcD TRUE 0.999 -3.000 0.669 0.002 Y NA
 271530 271531 y0978 y0979 phoB phoR TRUE 0.987 25.000 0.453 0.080 Y NA
 271531 271532 y0979 y0980 phoR   TRUE 0.791 22.000 0.168 1.000 N NA
 271532 271533 y0980 y0981   brnQ FALSE 0.003 474.000 0.000 1.000 N NA
 271533 271534 y0981 y0982 brnQ proY TRUE 0.959 76.000 0.261 0.082 Y NA
 271534 271535 y0982 y0983 proY malZ FALSE 0.020 561.000 0.123 1.000 N NA
 271535 271536 y0983 y0984 malZ   FALSE 0.181 155.000 0.031 1.000   NA
 271537 271538 y0985 y0986 ggt   TRUE 0.933 -3.000 0.043 0.001   NA
 271540 271541 y0988 y0989     FALSE 0.024 299.000 0.014 1.000   NA
 271542 271543 y0990 y0991 queA tgt TRUE 0.975 93.000 0.360 0.001 Y NA
 271543 271544 y0991 y0992 tgt yajC TRUE 0.780 112.000 0.325 NA N NA
 271544 271545 y0992 y0993 yajC secD TRUE 0.876 28.000 0.045 NA Y NA
 271545 271546 y0993 y0994 secD secF TRUE 0.986 11.000 0.206 0.001 Y NA
 271546 271547 y0994 y0995 secF   FALSE 0.071 156.000 0.000 1.000 N NA
 271549 271550 y0997 y0998     FALSE 0.141 33.000 0.000 NA   NA
 271550 271551 y0998 y0999     FALSE 0.100 71.000 0.000 NA   NA
 271551 271552 y0999 y1000   ribD TRUE 0.689 150.000 0.277 NA N NA
 271552 271553 y1000 y1001 ribD ribH TRUE 0.844 136.000 0.034 0.002 Y NA
 271553 271554 y1001 y1002 ribH nusB TRUE 0.912 21.000 0.347 1.000 N NA
 271554 271555 y1002 y1003 nusB thiL FALSE 0.421 241.000 0.225 1.000 N NA
 271555 271556 y1003 y1004 thiL pgpA TRUE 0.936 -7.000 0.206 1.000 N NA
 271556 271557 y1004 y1005 pgpA   FALSE 0.048 203.000 0.000 1.000 N NA
 271557 271558 y1005 y1006     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 271558 271559 y1006 y1007     TRUE 0.741 118.000 0.000 1.000 Y NA
 271560 271561 y1008 y1009 dxs ispA TRUE 0.766 156.000 0.060 1.000 Y NA
 271561 271562 y1009 y1010 ispA xseB TRUE 0.601 5.000 0.035 1.000 N NA
 271563 271564 y1011 y1012     FALSE 0.086 98.000 0.000 NA   NA
 271565 271566 y1013 y1014 thiJ apbA TRUE 0.755 -43.000 0.155 NA   NA
 271566 271567 y1014 y1015 apbA   FALSE 0.101 -73.000 0.008 NA   NA
 271569 271570 y1017 y1018   cyoE FALSE 0.027 478.000 0.061 0.082 N NA
 271570 271571 y1018 y1019 cyoE cyoC FALSE 0.011 325.000 0.000 1.000 N NA
 271571 271572 y1019 y1020 cyoC cyoB TRUE 0.998 -10.000 0.697 0.040 Y NA
 271572 271573 y1020 y1021 cyoB cyoA TRUE 0.990 5.000 0.204 0.006 Y NA
 271573 271574 y1021 y1022 cyoA   FALSE 0.006 370.000 0.000 NA   NA
 271574 271575 y1022 y1023   ampG FALSE 0.013 292.000 0.000 NA   NA
 271575 271576 y1023 y1024 ampG   TRUE 0.716 118.000 0.256 NA N NA
 271577 271578 y1025 y1026 bolA tig FALSE 0.001 417.000 0.000 NA N NA
 271578 271579 y1026 y1027 tig clpP FALSE 0.397 462.000 0.351 1.000 Y NA
 271579 271580 y1027 y1028 clpP clpX TRUE 0.902 206.000 0.352 1.000 Y NA
 271580 271581 y1028 y1029 clpX lon TRUE 0.898 141.000 0.201 1.000 Y NA
 271581 271582 y1029 y1030 lon hupB FALSE 0.030 218.000 0.005 1.000 N NA
 271582 271583 y1030 y1031 hupB   FALSE 0.045 301.000 0.046 1.000 N NA
 271583 271584 y1031 y1032     FALSE 0.080 140.000 0.000 1.000 N NA
 271584 271585 y1032 y1033     FALSE 0.015 336.000 0.000 1.000   NA
 271586 271587 y1034 y1035     FALSE 0.042 265.000 0.019 1.000   NA
 271590 271591 y1038 y1039   mdlA TRUE 0.649 102.000 0.179 1.000 N NA
 271591 271592 y1039 y1040 mdlA mdlB TRUE 0.999 -7.000 0.911 0.006 Y NA
 271592 271593 y1040 y1041 mdlB glnK FALSE 0.010 410.000 0.028 1.000 N NA
 271593 271594 y1041 y1042 glnK amtB TRUE 0.730 34.000 0.156 1.000 N NA
 271598 271599 y1046 y1047 hha   TRUE 0.503 49.000 0.080 NA   NA
 271599 271600 y1047 y1048   rpmE2 FALSE 0.001 1545.000 0.000 NA   NA
 271600 271601 y1048 y1049 rpmE2 acrB FALSE 0.051 186.000 0.008 1.000 N NA
 271601 271602 y1049 y1050 acrB acrA TRUE 0.950 17.000 0.500 1.000 N NA
 271603 271604 y1051 y1052 acrR   TRUE 0.648 13.000 0.075 NA N NA
 271607 271608 y1055 y1056     TRUE 0.820 159.000 0.474 NA   NA
 271608 271609 y1056 y1057     FALSE 0.044 199.000 0.000 NA   NA
 271610 271611 y1058 y1059   apt FALSE 0.083 239.000 0.043 NA   NA
 271611 271612 y1059 y1060 apt dnaX FALSE 0.010 656.000 0.088 1.000 N NA
 271612 271613 y1060 y1061 dnaX   TRUE 0.882 56.000 0.411 NA   NA
 271613 271614 y1061 y1062   recR TRUE 0.990 0.000 0.604 NA   NA
 271614 271615 y1062 y1063 recR   FALSE 0.208 15.000 0.000 NA   NA
 271615 271616 y1063 y1064   htpG FALSE 0.182 19.000 0.000 NA   NA
 271616 271617 y1064 y1065 htpG adk FALSE 0.084 227.000 0.035 1.000 N NA
 271617 271618 y1065 y1066 adk hemH FALSE 0.098 90.000 0.008 1.000 N NA
 271618 271619 y1066 y1067 hemH ascD FALSE 0.002 598.000 0.000 1.000 N NA
 271619 271620 y1067 y1068 ascD   FALSE 0.368 26.000 0.038 1.000 N NA
 271620 271621 y1068 y1069     TRUE 0.972 141.000 0.624 1.000 Y NA
 271621 271622 y1069 y1070     TRUE 0.972 18.000 0.247 1.000 Y NA
 271622 271623 y1070 y1071     TRUE 0.888 37.000 0.000 0.023 Y NA
 271623 271624 y1071 y1072     FALSE 0.229 1.000 0.000 NA N NA
 271624 271625 y1072 y1074     FALSE 0.106 62.000 0.000 NA   NA
 271627 271628 y1075 y1076     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 271628 2158929 y1076 y1077     FALSE 0.492 -3.000 0.000 NA   NA
 2158929 271629 y1077 y1078     FALSE 0.036 213.000 0.000 NA   NA
 271629 2158930 y1078 y1079     FALSE 0.198 16.000 0.000 NA   NA
 2158930 271630 y1079 y1080   wcaG FALSE 0.322 6.000 0.000 NA   NA
 271630 271631 y1080 y1081 wcaG cpsB TRUE 0.670 181.000 0.028 1.000 Y NA
 271631 271632 y1081 y1082 cpsB   TRUE 0.974 3.000 0.073 NA Y NA
 271632 271633 y1082 y1083   cpsG TRUE 0.624 5.000 0.049 NA N NA
 271633 271634 y1083 y1084 cpsG   FALSE 0.140 48.000 0.000 1.000 N NA
 271634 271635 y1084 y1085   gsk FALSE 0.047 204.000 0.000 1.000 N NA
 271636 271637 y1086 y1087 rosB rosA TRUE 0.570 235.000 0.000 0.081 Y NA
 271638 271639 y1089 y1090     FALSE 0.013 292.000 0.000 NA   NA
 271639 271640 y1090 y1091     FALSE 0.033 255.000 0.022 NA   NA
 271640 271641 y1091 y1093     FALSE 0.003 521.000 0.018 NA   NA
 271642 271643 y1092 y1094     FALSE 0.001 650.000 0.000 NA   NA
 271644 271645 y1095 y1096     TRUE 0.992 3.000 0.313 NA Y NA
 271645 271646 y1096 y1097     TRUE 0.715 195.000 0.075 NA Y NA
 271646 271647 y1097 y1098     TRUE 0.584 77.000 0.118 1.000   NA
 271647 271648 y1098 y1099   tesA FALSE 0.041 387.000 0.072 1.000   NA
 271649 271650 y1100 y1101     TRUE 0.993 -15.000 0.535 NA Y NA
 271651 271652 y1102 y1103 purK purE TRUE 0.993 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 271654 271655 y1105 y1106   ppiB TRUE 0.917 11.000 0.237 1.000   NA
 271656 271657 y1107 y1108 cysS   FALSE 0.015 296.000 0.000 1.000 N NA
 271658 271659 y1109 y1110   folD TRUE 0.610 15.000 0.055 1.000   NA
 271660 271661 y1111 y1112     FALSE 0.132 38.000 0.000 NA   NA
 271662 271663 y1113 y1114     FALSE 0.127 42.000 0.000 NA   NA
 271663 271664 y1114 y1115     FALSE 0.141 33.000 0.000 NA   NA
 271664 271665 y1115 y1116     TRUE 0.963 -7.000 0.179 0.002   NA
 271665 271666 y1116 y1117     TRUE 0.923 10.000 0.238 1.000   NA
 271666 271667 y1117 y1118     TRUE 0.977 -3.000 0.054 NA Y NA
 271667 271668 y1118 y1119     TRUE 0.990 -7.000 0.285 NA Y NA
 271668 271669 y1119 y1120     TRUE 0.685 -18.000 0.063 NA   NA
 271670 271671 y1121 y1122     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 271673 271674 y1124 y1125     TRUE 0.935 23.000 0.438 1.000   NA
 271675 271676 y1126 y1127     FALSE 0.060 157.000 0.000 NA   NA
 271677 271678 y1128 y1129     FALSE 0.059 159.000 0.000 NA   NA
 271678 271679 y1129 y1130     TRUE 0.797 -7.000 0.068 NA   NA
 271680 271681 y1131 y1132     FALSE 0.008 342.000 0.000 NA   NA
 271681 271682 y1132 y1133     FALSE 0.096 79.000 0.000 NA   NA
 271684 271685 y1135 y1136     FALSE 0.164 24.000 0.000 NA   NA
 271686 271687 y1137 y1138     FALSE 0.028 233.000 0.000 NA   NA
 271687 271688 y1138 y1139     FALSE 0.029 229.000 0.000 NA   NA
 271692 271693 y1143 y1144     FALSE 0.006 371.000 0.000 NA   NA
 271693 271694 y1144 y1145     FALSE 0.001 629.000 0.000 NA   NA
 271695 271696 y1146 y1147     TRUE 0.546 50.000 0.093 1.000 N NA
 271696 2158933 y1147 y1148     FALSE 0.013 294.000 0.000 NA   NA
 2158933 271697 y1148 y1149     FALSE 0.083 108.000 0.000 NA   NA
 271697 271698 y1149 y1150   rbsA TRUE 0.991 49.000 0.667 0.012 Y NA
 271698 271699 y1150 y1151 rbsA rbsC TRUE 0.993 12.000 0.444 0.012 Y NA
 271699 271700 y1151 y1152 rbsC   TRUE 0.820 21.000 0.176 1.000   NA
 271700 271701 y1152 y1153     TRUE 0.542 32.000 0.064 1.000   NA
 271701 271702 y1153 y1154     TRUE 0.942 15.000 0.086 1.000 Y NA
 271702 271703 y1154 y1155     TRUE 0.977 10.000 0.199 1.000 Y NA
 271703 271704 y1155 y1156     FALSE 0.059 159.000 0.000 NA   NA
 271709 271710 y1161 y1163     FALSE 0.050 182.000 0.000 NA   NA
 271711 271712 y1162 y1164     FALSE 0.001 642.000 0.000 NA   NA
 271713 271715 y1165 y1167     FALSE 0.021 252.000 0.000 NA   NA
 271717 271718 y1169 y1170     FALSE 0.112 55.000 0.000 NA   NA
 271719 271720 y1171 y1173 lipA lipB TRUE 0.943 193.000 0.319 0.001 Y NA
 271722 271723 y1174 y1175   dacA FALSE 0.258 198.000 0.081 NA   NA
 271723 271724 y1175 y1176 dacA rlpA TRUE 0.575 403.000 0.475 NA Y NA
 271724 271725 y1176 y1177 rlpA mrdB FALSE 0.423 10.000 0.035 NA N NA
 271725 271726 y1177 y1178 mrdB mrdA FALSE 0.171 185.000 0.046 1.000 N NA
 271726 271727 y1178 y1179 mrdA   FALSE 0.201 82.000 0.031 NA   NA
 271727 271728 y1179 y1180     TRUE 0.959 4.000 0.307 NA   NA
 271728 271729 y1180 y1181     FALSE 0.072 224.000 0.032 NA   NA
 271729 271730 y1181 y1182   holA FALSE 0.436 -40.000 0.045 1.000 N NA
 271730 271731 y1182 y1183 holA rlpB TRUE 0.951 -3.000 0.199 NA N NA
 271731 271732 y1183 y1184 rlpB leuS TRUE 0.829 15.000 0.182 NA N NA
 271734 271735 y1186 y1187 gltL gltK TRUE 0.996 -3.000 0.379 1.000 Y NA
 271735 271736 y1187 y1188 gltK gltJ TRUE 0.999 0.000 0.933 0.018 Y NA
 271736 271737 y1188 y1189 gltJ gltI TRUE 0.913 123.000 0.150 0.061 Y NA
 271737 271738 y1189 y1190 gltI lnt FALSE 0.001 765.000 0.000 1.000 N NA
 271738 271739 y1190 y1191 lnt corC TRUE 0.960 -31.000 0.557 1.000 N NA
 271741 271742 y1193 y1194     TRUE 0.985 -3.000 0.457 NA   NA
 271742 271743 y1194 y1195     FALSE 0.278 288.000 0.220 1.000 N NA
 2158935 2158936 yt031 yt032     FALSE 0.135 36.000 0.000 NA   NA
 2158936 2158937 yt032 yt033     FALSE 0.093 87.000 0.000 NA   NA
 2158937 2158938 yt033 yt034     FALSE 0.141 33.000 0.000 NA   NA
 2158938 2158939 yt034 yt035     FALSE 0.253 11.000 0.000 NA   NA
 2158939 271746 yt035 y1198   asnB FALSE 0.003 458.000 0.000 NA   NA
 271746 271747 y1198 y1199 asnB nagD FALSE 0.008 355.000 0.000 1.000 N NA
 271747 271748 y1199 y1200 nagD nagC TRUE 0.859 73.000 0.070 1.000 Y NA
 271748 271749 y1200 y1201 nagC nagA TRUE 0.993 -22.000 0.571 1.000 Y NA
 271749 271750 y1201 y1202 nagA nagB TRUE 0.993 20.000 0.557 0.001 Y NA
 271751 271752 y1203 y1204 nagE   FALSE 0.042 214.000 0.000 1.000 N NA
 271752 271753 y1204 y1205   glnS FALSE 0.049 202.000 0.000 1.000 N NA
 271753 271754 y1205 y1206 glnS   FALSE 0.002 706.000 0.000 1.000   NA
 271754 2158940 y1206 y1207     FALSE 0.010 316.000 0.000 NA   NA
 271755 271756 y1208 y1209 fur fldA FALSE 0.097 367.000 0.156 1.000 N NA
 271756 271757 y1209 y1210 fldA   FALSE 0.099 73.000 0.000 NA   NA
 271757 271758 y1210 y1211     FALSE 0.087 96.000 0.000 NA   NA
 271758 271759 y1211 y1212     FALSE 0.250 332.000 0.276 1.000   NA
 271759 271760 y1212 y1213     FALSE 0.001 1125.000 0.000 NA   NA
 271760 271761 y1213 y1214     FALSE 0.094 83.000 0.000 NA   NA
 271761 271762 y1214 y1215     FALSE 0.424 49.000 0.000 0.094   NA
 271762 271763 y1215 y1216     FALSE 0.317 16.000 0.000 1.000   NA
 271763 271764 y1216 y1217     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 271766 271767 y1219 y1220 proX proW TRUE 0.991 48.000 0.695 0.060 Y NA
 271767 271768 y1220 y1221 proW proV TRUE 0.997 -7.000 0.630 1.000 Y NA
 271768 271769 y1221 y1222 proV nrdF FALSE 0.002 559.000 0.000 1.000 N NA
 271769 271770 y1222 y1223 nrdF nrdE TRUE 0.942 125.000 0.190 0.001 Y NA
 271770 2158941 y1223 y1224 nrdE   FALSE 0.278 -18.000 0.000 NA   NA
 2158941 271771 y1224 y1225   nrdH FALSE 0.027 235.000 0.000 NA   NA
 271772 271773 y1226 y1227 asr   FALSE 0.003 478.000 0.000 NA   NA
 271774 271775 y1228 y1229     TRUE 0.510 165.000 0.167 NA   NA
 271776 271777 y1230 y1231 cspG   FALSE 0.001 793.000 0.000 1.000 N NA
 271777 271778 y1231 y1232     TRUE 0.998 -15.000 1.000 0.060 Y NA
 271778 271779 y1232 y1233     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.060 Y NA
 271779 271780 y1233 y1234     TRUE 0.996 0.000 1.000 1.000   NA
 271780 271781 y1234 y1235     TRUE 0.958 -46.000 0.500 0.021   NA
 271783 271784 y1237 y1238 ureA ureB TRUE 0.990 11.000 0.267 0.001 Y NA
 271784 271785 y1238 y1239 ureB ureC TRUE 0.966 90.000 0.267 0.001 Y NA
 271785 271786 y1239 y1240 ureC ureE FALSE 0.205 287.000 0.067 0.001 N NA
 271786 271787 y1240 y1241 ureE ureF TRUE 0.991 22.000 0.460 0.002 Y NA
 271787 271788 y1241 y1242 ureF ureG TRUE 0.879 127.000 0.064 0.002 Y NA
 271788 2158942 y1242 y1243 ureG   FALSE 0.492 -3.000 0.000 NA   NA
 2158942 271789 y1243 y1244     FALSE 0.046 192.000 0.000 NA   NA
 271789 271790 y1244 y1245     TRUE 0.558 125.000 0.095 0.079 N NA
 271793 271794 y1248 y1249     TRUE 0.980 10.000 0.233 NA Y NA
 271794 271795 y1249 y1250     FALSE 0.091 89.000 0.000 NA   NA
 271796 271797 y1251 y1252 celA celB TRUE 0.988 11.000 0.250 0.006 Y NA
 271797 271798 y1252 y1253 celB celC TRUE 0.986 167.000 0.833 0.006 Y NA
 271798 271799 y1253 y1254 celC celD TRUE 0.960 37.000 0.727 1.000 N NA
 271799 271800 y1254 y1255 celD   TRUE 0.795 52.000 0.222 1.000   NA
 271802 271803 y1257 y1258 seqA pgm TRUE 0.733 31.000 0.151 1.000 N NA
 271803 271804 y1258 y1259 pgm   FALSE 0.034 218.000 0.000 NA   NA
 271805 271806 y1260 y1261   kdpE TRUE 0.554 95.000 0.129 NA   NA
 271806 271807 y1261 y1262 kdpE kdpD TRUE 0.767 293.000 0.385 1.000 Y NA
 271807 271808 y1262 y1263 kdpD kdpC TRUE 0.782 10.000 0.100 1.000 N NA
 271808 271809 y1263 y1264 kdpC kdpB TRUE 0.982 212.000 0.877 0.001 Y NA
 271809 271810 y1264 y1265 kdpB kdpA TRUE 0.953 94.000 0.201 0.001 Y NA
 271810 271811 y1265 y1266 kdpA   TRUE 0.972 1.000 0.172 0.001   NA
 271812 271813 y1267 y1268     FALSE 0.185 339.000 0.231 NA   NA
 271813 271814 y1268 y1270   phrB FALSE 0.106 130.000 0.019 NA   NA
 271816 271817 y1271 y1272     FALSE 0.077 140.000 0.013 NA   NA
 271817 271818 y1272 y1273     FALSE 0.006 619.000 0.050 NA   NA
 271818 271819 y1273 y1274     TRUE 0.728 25.000 0.052 0.004   NA
 271819 271820 y1274 y1275     TRUE 0.974 -6.000 0.379 NA   NA
 271820 271821 y1275 y1276     TRUE 0.824 -42.000 0.211 NA   NA
 271821 271822 y1276 y1277     TRUE 0.658 85.000 0.173 NA   NA
 271822 271823 y1277 y1278     TRUE 0.995 -3.000 0.939 NA   NA
 271823 271824 y1278 y1279     FALSE 0.446 4.000 0.018 NA   NA
 271824 271825 y1279 y1280     TRUE 0.934 10.000 0.300 NA   NA
 271829 271830 y1284 y1285 yplA yplB TRUE 0.849 78.000 0.375 NA   NA
 271830 271831 y1285 y1286 yplB   FALSE 0.152 -46.000 0.000 NA   NA
 271835 271836 y1290 y1291 rpoE rseA TRUE 0.961 26.000 0.705 NA N NA
 271836 271837 y1291 y1292 rseA rseB TRUE 0.999 0.000 0.856 NA Y NA
 271837 271838 y1292 y1293 rseB rseC TRUE 0.998 -3.000 0.609 NA Y NA
 271840 271841 y1295 y1296 lepA lepB TRUE 0.896 10.000 0.187 1.000   NA
 271841 271842 y1296 y1297 lepB rnc FALSE 0.087 352.000 0.117 1.000   NA
 271842 271843 y1297 y1298 rnc era TRUE 0.959 -3.000 0.127 0.053   NA
 271843 271844 y1298 y1299 era recO TRUE 0.815 10.000 0.109 1.000   NA
 271844 271845 y1299 y1300 recO pdxJ TRUE 0.523 159.000 0.166 1.000 N NA
 271845 271846 y1300 y1301 pdxJ acpS TRUE 0.976 0.000 0.326 1.000 N NA
 271846 271847 y1301 y1302 acpS   FALSE 0.075 151.000 0.000 1.000 N NA
 271848 271849 y1303 y1304     FALSE 0.268 162.000 0.056 1.000   NA
 271850 271851 y1305 y1306     FALSE 0.405 275.000 0.316 NA   NA
 271851 271852 y1306 y1307     FALSE 0.337 71.000 0.062 NA N NA
 271855 271856 y1310 y1311     FALSE 0.010 323.000 0.000 NA   NA
 271857 271858 y1312 y1313     FALSE 0.046 206.000 0.000 1.000 N NA
 271858 271859 y1313 y1314     TRUE 0.888 4.000 0.132 NA   NA
 271859 271860 y1314 y1315     TRUE 0.642 -67.000 0.130 NA   NA
 271860 271861 y1315 y1316     FALSE 0.275 160.000 0.065 1.000 N NA
 271861 271862 y1316 y1317   glnB TRUE 0.809 15.000 0.151 1.000 N NA
 271863 271864 y1319 y1320     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 271866 271867 y1322 y1323 glyA   FALSE 0.081 113.000 0.000 NA   NA
 271867 271868 y1323 y1324   ompX FALSE 0.098 74.000 0.000 NA   NA
 271868 271869 y1324 y1325 ompX hcaT FALSE 0.014 352.000 0.000 1.000   NA
 271871 271872 y1326 y1327     FALSE 0.137 35.000 0.000 NA   NA
 271872 271873 y1327 y1329     FALSE 0.020 256.000 0.000 NA   NA
 271873 271874 y1329 y1330     TRUE 0.895 -9.000 0.150 NA   NA
 271876 271877 y1332 y1333     TRUE 0.557 93.000 0.126 1.000 N NA
 271877 271878 y1333 y1334     TRUE 0.891 54.000 0.424 1.000 N NA
 271878 271879 y1334 y1335     TRUE 0.921 31.000 0.448 1.000 N NA
 271879 271880 y1335 y1336     TRUE 0.618 270.000 0.359 0.002   NA
 271880 271881 y1336 y1337     FALSE 0.189 -34.000 0.000 NA   NA
 271881 271882 y1337 y1338     FALSE 0.152 -46.000 0.000 NA   NA
 271882 271883 y1338 y1339   hscA TRUE 0.924 243.000 0.634 1.000 Y NA
 271883 271884 y1339 y1340 hscA fdx TRUE 0.992 3.000 0.794 1.000 N NA
 271884 271885 y1340 y1341 fdx   TRUE 0.954 30.000 0.625 1.000   NA
 271885 271886 y1341 y1342   pepB TRUE 0.604 140.000 0.171 1.000   NA
 271886 271887 y1342 y1343 pepB sseB TRUE 0.771 79.000 0.253 NA   NA
 271888 271889 y1344 y1345   yapB FALSE 0.463 -13.000 0.000 1.000   NA
 271889 271890 y1345 y1346 yapB yapA FALSE 0.013 558.000 0.000 0.009   NA
 271890 271891 y1346 y1347 yapA   FALSE 0.015 284.000 0.000 NA   NA
 271892 271893 y1348 y1349   ndk FALSE 0.009 327.000 0.000 NA   NA
 271893 271894 y1349 y1350 ndk   FALSE 0.259 262.000 0.156 1.000   NA
 271894 271895 y1350 y1351     FALSE 0.329 154.000 0.067 1.000   NA
 271895 271896 y1351 y1352     TRUE 0.903 -10.000 0.153 1.000   NA
 271896 271897 y1352 y1353   gcpE TRUE 0.789 62.000 0.233 1.000   NA
 271897 271898 y1353 y1354 gcpE hisS FALSE 0.484 209.000 0.207 1.000 N NA
 271898 271899 y1354 y1355 hisS   TRUE 0.909 14.000 0.259 1.000   NA
 271899 271900 y1355 y1356     TRUE 0.963 12.000 0.492 1.000   NA
 271900 271901 y1356 y1357     TRUE 0.640 148.000 0.203 1.000   NA
 271901 271902 y1357 y1358     FALSE 0.037 347.000 0.003 0.078   NA
 271902 271903 y1358 y1359     FALSE 0.391 49.000 0.055 NA   NA
 271903 271904 y1359 y1360     FALSE 0.123 -66.000 0.000 NA   NA
 271906 271907 y1362 y1363 guaB guaA TRUE 0.715 180.000 0.190 0.001   NA
 271907 271908 y1363 y1364 guaA   FALSE 0.011 324.000 0.000 1.000 N NA
 271909 271910 y1365 y1366     FALSE 0.164 24.000 0.000 NA   NA
 271910 271911 y1366 y1367     FALSE 0.105 64.000 0.000 NA   NA
 271911 271912 y1367 y1368     FALSE 0.132 38.000 0.000 NA   NA
 271912 271913 y1368 y1369     FALSE 0.105 64.000 0.000 NA   NA
 271913 271914 y1369 y1370     FALSE 0.492 -3.000 0.000 NA   NA
 271918 271919 y1374 y1375     FALSE 0.213 -28.000 0.000 NA   NA
 271920 271921 y1376 y1377     FALSE 0.156 26.000 0.000 NA   NA
 271922 271923 y1378 y1379     FALSE 0.002 636.000 0.000 1.000 N NA
 271923 271924 y1379 y1380     FALSE 0.014 275.000 0.008 NA   NA
 271924 271925 y1380 y1381   baeR FALSE 0.353 92.000 0.062 NA   NA
 271925 2158944 y1381 y1382 baeR   FALSE 0.268 10.000 0.000 NA   NA
 2158944 271926 y1382 y1383     FALSE 0.145 31.000 0.000 NA   NA
 271926 271927 y1383 y1384     TRUE 0.913 34.000 0.438 NA   NA
 271927 271928 y1384 y1385     TRUE 0.983 -3.000 0.094 NA Y NA
 271928 271929 y1385 y1386     TRUE 0.996 0.000 1.000 1.000 N NA
 271929 271930 y1386 y1388     FALSE 0.008 364.000 0.000 1.000 N NA
 271933 271934 y1390 y1391 goaG   TRUE 0.812 53.000 0.000 1.000 Y NA
 271934 271935 y1391 y1392     TRUE 0.920 -34.000 0.000 0.059 Y NA
 271935 271936 y1392 y1393     TRUE 0.918 47.000 0.072 0.059 Y NA
 271937 271938 y1394 y1395     FALSE 0.026 140.000 0.000 NA N NA
 271938 271939 y1395 y1396     FALSE 0.198 52.000 0.024 NA   NA
 271939 271940 y1396 y1397   ppx FALSE 0.253 112.000 0.047 NA   NA
 271940 271941 y1397 y1398 ppx ppk TRUE 0.991 11.000 0.486 1.000 Y NA
 271942 271943 y1399 y1400     TRUE 0.987 -3.000 0.489 1.000   NA
 271943 271944 y1400 y1401   pstB TRUE 0.991 28.000 0.511 0.002 Y NA
 271944 271945 y1401 y1402 pstB   FALSE 0.030 228.000 0.000 NA   NA
 271945 271946 y1402 y1403     FALSE 0.237 -24.000 0.000 NA   NA
 271946 271947 y1403 y1404     FALSE 0.100 70.000 0.000 NA   NA
 271948 271949 y1405 y1406 speG purN FALSE 0.044 229.000 0.017 1.000 N NA
 271949 271950 y1406 y1407 purN purM TRUE 0.954 115.000 0.230 0.002 Y NA
 271951 271952 y1408 y1409 upp   FALSE 0.087 125.000 0.000 1.000 N NA
 271952 271953 y1409 y1410     TRUE 0.647 176.000 0.000 1.000 Y NA
 271954 271955 y1411 y1412     TRUE 0.949 5.000 0.259 1.000   NA
 271956 271957 y1413 y1414 perM   FALSE 0.016 276.000 0.000 NA   NA
 271957 271958 y1414 y1415     FALSE 0.052 178.000 0.000 NA   NA
 271958 271959 y1415 y1416     FALSE 0.372 4.000 0.000 NA   NA
 271961 271962 y1418 y1419 dapA nlpB TRUE 0.903 15.000 0.032 NA Y NA
 271962 271963 y1419 y1420 nlpB   FALSE 0.029 124.000 0.000 NA N NA
 271963 271964 y1420 y1421   purC FALSE 0.076 148.000 0.000 1.000 N NA
 271964 271965 y1421 y1422 purC   FALSE 0.048 219.000 0.004 1.000   NA
 271965 271966 y1422 y1423     FALSE 0.134 73.000 0.018 NA   NA
 271966 271967 y1423 y1424     TRUE 0.881 2.000 0.100 NA   NA
 271968 271969 y1425 y1426     TRUE 0.596 68.000 0.130 NA   NA
 271969 271970 y1426 y1427   dapE TRUE 0.965 -3.000 0.163 0.025 N NA
 271970 271971 y1427 y1428 dapE   TRUE 0.968 2.000 0.292 1.000 N NA
 271971 271972 y1428 y1429     FALSE 0.089 160.000 0.006 1.000   NA
 271973 271974 y1430 y1431     TRUE 0.987 95.000 0.688 0.059 Y NA
 271974 271975 y1431 y1432   potA TRUE 0.971 -34.000 0.585 0.059 N NA
 271975 271976 y1432 y1433 potA   FALSE 0.218 14.000 0.000 NA   NA
 271976 271977 y1433 y1434     FALSE 0.019 258.000 0.000 NA   NA
 271977 271978 y1434 y1436     TRUE 0.941 46.000 0.600 1.000   NA
 271979 271980 y1435 y1437     FALSE 0.001 1171.000 0.000 NA   NA
 271980 271981 y1437 y1438     FALSE 0.014 289.000 0.000 NA   NA
 271981 271982 y1438 y1439   acrD FALSE 0.029 231.000 0.000 NA   NA
 271985 271986 y1442 y1443 napF napD TRUE 0.905 -16.000 0.209 NA   NA
 271986 2158945 y1443 y1444 napD   FALSE 0.492 -3.000 0.000 NA   NA
 271988 271989 y1446 y1447 napB napC TRUE 0.991 10.000 0.490 NA Y NA
 271989 271990 y1447 y1448 napC   FALSE 0.305 157.000 0.070 1.000 N NA
 271990 271991 y1448 y1449     FALSE 0.348 196.000 0.047 0.006 N NA
 271992 271993 y1450 y1451   hemF TRUE 0.544 0.000 0.016 NA   NA
 271994 271995 y1452 y1453     FALSE 0.003 473.000 0.000 NA   NA
 271996 271997 y1454 y1455     FALSE 0.002 487.000 0.000 NA   NA
 271998 271999 y1456 y1457     TRUE 0.733 163.000 0.333 NA   NA
 272000 272001 y1458 y1459     TRUE 0.512 57.000 0.087 1.000 N NA
 272001 272002 y1459 y1460     FALSE 0.071 206.000 0.000 1.000   NA
 272003 272004 y1461 y1462     TRUE 0.900 82.000 0.154 NA Y NA
 272004 272005 y1462 y1463     FALSE 0.130 40.000 0.000 NA   NA
 272005 272006 y1463 y1464     FALSE 0.492 -3.000 0.000 NA   NA
 272006 272007 y1464 y1465   nanT FALSE 0.002 605.000 0.000 1.000 N NA
 272007 272008 y1465 y1466 nanT cysP FALSE 0.012 315.000 0.000 1.000 N NA
 272008 272009 y1466 y1467 cysP cysU TRUE 0.991 0.000 0.479 0.002 N NA
 272009 272010 y1467 y1468 cysU cysW TRUE 0.994 0.000 0.583 0.001 N NA
 272010 272011 y1468 y1469 cysW cysA TRUE 0.959 -37.000 0.180 1.000 Y NA
 272011 272012 y1469 y1470 cysA cysM FALSE 0.195 171.000 0.049 1.000 N NA
 272012 272013 y1470 y1471 cysM   FALSE 0.024 245.000 0.000 NA   NA
 272014 272015 y1472 y1473     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 272015 272016 y1473 y1474     FALSE 0.028 233.000 0.000 NA   NA
 272017 272018 y1475 y1476     FALSE 0.295 19.000 0.000 1.000   NA
 272018 272019 y1476 y1477     TRUE 0.548 57.000 0.000 0.001   NA
 272019 272020 y1477 y1478     FALSE 0.214 337.000 0.000 1.000 Y NA
 272020 272021 y1478 y1479     FALSE 0.185 60.000 0.000 1.000   NA
 272022 272023 y1480 y1481     TRUE 0.975 4.000 0.439 1.000 N NA
 272024 272025 y1482 y1483 cpxR   TRUE 0.960 26.000 0.216 1.000 Y NA
 272025 272026 y1483 y1484     FALSE 0.039 219.000 0.000 1.000 N NA
 272026 272027 y1484 y1486     FALSE 0.091 90.000 0.000 NA   NA
 272028 272029 y1485 y1487 crr ptsI TRUE 0.902 49.000 0.038 0.007 Y NA
 272029 272030 y1487 y1488 ptsI ptsH TRUE 0.899 49.000 0.033 0.007 Y NA
 272030 272031 y1488 y1489 ptsH cysK FALSE 0.004 499.000 0.019 1.000 N NA
 272031 272032 y1489 y1490 cysK cysZ TRUE 0.830 157.000 0.122 1.000 Y NA
 272033 272034 y1491 y1492 zipA lig FALSE 0.113 91.000 0.013 1.000 N NA
 272034 272035 y1492 y1493 lig   FALSE 0.456 -7.000 0.017 NA   NA
 272038 2158946 y1496 yt036     FALSE 0.048 186.000 0.000 NA   NA
 2158946 2158947 yt036 yt037     FALSE 0.096 81.000 0.000 NA   NA
 2158947 272039 yt037 y1497     FALSE 0.014 291.000 0.000 NA   NA
 272039 272040 y1497 y1498   gltX FALSE 0.079 142.000 0.000 1.000 N NA
 2158948 2158949 yt038 yt039     FALSE 0.130 40.000 0.000 NA   NA
 2158949 2158950 yt039 yt040     FALSE 0.121 48.000 0.000 NA   NA
 2158950 2158951 yt040 yt041     FALSE 0.041 203.000 0.000 NA   NA
 272043 272044 y1501 y1502     FALSE 0.158 234.000 0.071 NA   NA
 272044 272045 y1502 y1503     FALSE 0.251 136.000 0.050 1.000 N NA
 272046 272047 y1504 y1505   glk FALSE 0.175 178.000 0.048 NA   NA
 272049 272050 y1507 y1510     FALSE 0.053 189.000 0.009 1.000 N NA
 272050 272051 y1510 y1508     FALSE 0.097 -181.000 0.000 NA   NA
 272052 272053 y1509 y1511     FALSE 0.009 331.000 0.000 NA   NA
 272054 272055 y1512 y1513     TRUE 0.977 -18.000 0.625 NA   NA
 272055 272056 y1513 y1514     TRUE 0.993 -3.000 0.740 NA   NA
 272057 272058 y1515 y1516     TRUE 0.986 -3.000 0.333 0.038   NA
 272058 272059 y1516 y1517     FALSE 0.008 404.000 0.000 1.000   NA
 272059 272060 y1517 y1518   dmsB TRUE 0.955 -55.000 0.667 1.000   NA
 272060 272061 y1518 y1519 dmsB   TRUE 0.994 12.000 0.500 0.038 Y NA
 272062 272063 y1520 y1521     FALSE 0.001 737.000 0.000 NA   NA
 272066 272067 y1524 y1525 yfuC yfuB TRUE 0.981 -3.000 0.275 0.059 N NA
 272067 272068 y1525 y1526 yfuB yfuA TRUE 0.994 41.000 0.824 0.059 Y NA
 272069 272070 y1527 y1528 mltB   FALSE 0.000 1266.000 0.000 NA N NA
 272071 272072 y1529 y1530     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 272072 272073 y1530 y1531     TRUE 0.979 1.000 0.400 NA   NA
 272073 272074 y1531 y1532     TRUE 0.944 -54.000 0.600 NA   NA
 272074 272075 y1532 y1533     TRUE 0.956 40.000 0.714 NA   NA
 272075 272076 y1533 y1534     TRUE 0.985 7.000 0.714 NA   NA
 272076 272077 y1534 y1536     TRUE 0.907 210.000 1.000 NA   NA
 272080 272081 y1538 y1539     TRUE 0.926 192.000 1.000 1.000 N NA
 272083 2158952 y1541 y1543 ecpD   FALSE 0.091 89.000 0.000 NA   NA
 272085 272086 y1544 y1545     TRUE 0.929 84.000 0.667 NA   NA
 272086 272087 y1545 y1546     TRUE 0.992 3.000 0.800 NA   NA
 272087 272088 y1546 y1547     TRUE 0.668 242.000 0.500 NA   NA
 272088 272089 y1547 y1548     TRUE 0.625 214.000 0.333 NA   NA
 272089 272090 y1548 y1549     TRUE 0.991 4.000 0.833 NA   NA
 272090 2158953 y1549 y1552     FALSE 0.492 -3.000 0.000 NA   NA
 2158953 272091 y1552 y1550     FALSE 0.083 -1704.000 0.000 NA   NA
 272091 272092 y1550 y1551     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 272092 272093 y1551 y1553     FALSE 0.001 1110.000 0.000 NA   NA
 272093 272094 y1553 y1555     FALSE 0.013 294.000 0.000 NA   NA
 272095 272096 y1554 y1556     FALSE 0.090 -396.000 0.000 NA   NA
 272097 272098 y1557 y1559     TRUE 0.953 0.000 0.200 NA   NA
 272100 272101 y1560 y1561     TRUE 0.952 129.000 1.000 NA   NA
 272101 272102 y1561 y1562     FALSE 0.302 7.000 0.000 NA   NA
 272103 272104 y1563 y1564 phnA   FALSE 0.006 376.000 0.000 NA   NA
 272104 272105 y1564 y1565     TRUE 0.522 -55.000 0.074 NA   NA
 2158954 272106 yt042 y1566     FALSE 0.033 219.000 0.000 NA   NA
 272106 272107 y1566 y1567   ccmA FALSE 0.003 445.000 0.000 NA   NA
 272107 272108 y1567 y1568 ccmA ccmB TRUE 0.989 -57.000 0.503 0.002 Y NA
 272108 272109 y1568 y1569 ccmB ccmC TRUE 0.986 63.000 0.501 0.001 Y NA
 272109 272110 y1569 y1570 ccmC ccmD TRUE 0.988 -3.000 0.501 1.000 N NA
 272110 272111 y1570 y1571 ccmD ccmE TRUE 0.979 -3.000 0.344 1.000 N NA
 272111 272112 y1571 y1572 ccmE ccmF TRUE 0.995 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 272112 272113 y1572 y1573 ccmF dsbE TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 272113 272114 y1573 y1574 dsbE   TRUE 0.997 -3.000 0.578 NA Y NA
 272114 272115 y1574 y1575     TRUE 0.998 0.000 0.727 NA Y NA
 272115 272116 y1575 y1576   vacJ TRUE 0.857 24.000 0.239 1.000 N NA
 272118 272119 y1578 y1579     FALSE 0.074 287.000 0.061 NA   NA
 272119 272120 y1579 y1580     TRUE 0.996 -3.000 0.430 1.000 Y NA
 272120 272121 y1580 y1581     FALSE 0.003 439.000 0.000 NA   NA
 272121 272122 y1581 y1582     FALSE 0.213 -28.000 0.000 NA   NA
 272124 272125 y1584 y1585   aroC FALSE 0.461 74.000 0.081 1.000 N NA
 272125 272126 y1585 y1586 aroC mepA FALSE 0.321 -36.000 0.025 1.000 N NA
 272126 272127 y1586 y1587 mepA   TRUE 0.917 4.000 0.160 1.000   NA
 272127 272128 y1587 y1588     TRUE 0.595 100.000 0.153 NA   NA
 272128 272129 y1588 y1589     TRUE 0.887 55.000 0.425 NA   NA
 272134 272135 y1594 y1595 div   FALSE 0.143 285.000 0.118 NA   NA
 272136 272137 y1596 y1597   pdxB TRUE 0.629 -13.000 0.043 1.000 N NA
 272137 272138 y1597 y1598 pdxB usg TRUE 0.859 170.000 0.097 0.009 Y NA
 272138 272139 y1598 y1599 usg truA TRUE 0.755 0.000 0.040 1.000 N NA
 272139 272140 y1599 y1600 truA dedA FALSE 0.188 130.000 0.038 NA   NA
 272140 272141 y1600 y1601 dedA accD FALSE 0.045 231.000 0.020 NA   NA
 272141 272142 y1601 y1602 accD folC TRUE 0.760 171.000 0.383 1.000 N NA
 272142 272143 y1602 y1603 folC dedD TRUE 0.699 120.000 0.216 1.000   NA
 272143 272144 y1603 y1604 dedD cvpA FALSE 0.137 297.000 0.116 1.000   NA
 272144 272145 y1604 y1605 cvpA purF TRUE 0.916 13.000 0.262 1.000   NA
 272145 272146 y1605 y1606 purF ubiX FALSE 0.129 232.000 0.056 1.000 N NA
 272146 272147 y1606 y1607 ubiX hisJ FALSE 0.025 252.000 0.000 1.000 N NA
 272147 272148 y1607 y1608 hisJ hisQ TRUE 0.990 103.000 0.833 0.058 Y NA
 272148 272149 y1608 y1609 hisQ hisM TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.017 Y NA
 272149 272150 y1609 y1610 hisM hisP TRUE 0.993 14.000 0.643 1.000 Y NA
 272152 272153 y1612 y1613     FALSE 0.048 188.000 0.000 NA   NA
 272153 272154 y1613 y1614     TRUE 0.493 222.000 0.143 0.011   NA
 272157 272158 y1617 y1618     TRUE 0.520 211.000 0.130 0.006   NA
 272163 272164 y1623 y1624     FALSE 0.224 308.000 0.221 NA   NA
 272164 272165 y1624 y1625     TRUE 0.758 165.000 0.375 NA   NA
 272165 272166 y1625 y1626     FALSE 0.314 232.000 0.136 1.000   NA
 272167 272168 y1627 y1628     FALSE 0.437 151.000 0.104 1.000   NA
 272169 272170 y1629 y1630 lrhA nuoA FALSE 0.001 678.000 0.000 1.000 N NA
 272170 272171 y1630 y1631 nuoA nuoB TRUE 0.974 102.000 0.377 0.002 Y NA
 272171 272172 y1631 y1632 nuoB nuoC TRUE 0.986 141.000 0.691 0.002 Y NA
 272172 272173 y1632 y1633 nuoC nuoE TRUE 0.997 3.000 0.407 0.004 Y NA
 272173 272174 y1633 y1634 nuoE nuoF TRUE 0.994 -3.000 0.186 0.004 Y NA
 272174 272175 y1634 y1635 nuoF nuoG TRUE 0.947 87.000 0.180 0.004 Y NA
 272175 272176 y1635 y1636 nuoG nuoH TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.004 Y NA
 272176 272177 y1636 y1637 nuoH nuoI TRUE 0.991 15.000 0.423 0.004 Y NA
 272177 272178 y1637 y1638 nuoI nuoJ TRUE 0.992 13.000 0.428 0.004 Y NA
 272178 272179 y1638 y1639 nuoJ nuoK TRUE 0.996 -3.000 0.269 0.002 Y NA
 272179 272180 y1639 y1640 nuoK nuoL TRUE 0.995 -3.000 0.211 0.004 Y NA
 272180 272181 y1640 y1641 nuoL nuoM TRUE 0.994 40.000 0.713 0.001 Y NA
 272181 272182 y1641 y1642 nuoM nuoN TRUE 0.995 7.000 0.437 0.001 Y NA
 272182 272183 y1642 y1643 nuoN   FALSE 0.048 191.000 0.011 NA   NA
 272185 272186 y1645 y1646   gntV TRUE 0.558 49.000 0.095 1.000 N NA
 272186 272187 y1646 y1647 gntV   FALSE 0.491 78.000 0.095 NA   NA
 272188 272189 y1648 y1649     FALSE 0.001 654.000 0.000 NA   NA
 272190 272191 y1650 y1651     FALSE 0.003 466.000 0.000 1.000 N NA
 272191 272192 y1651 y1652     FALSE 0.221 507.000 0.667 1.000 N NA
 272192 272193 y1652 y1653     FALSE 0.331 30.000 0.036 NA   NA
 272193 272194 y1653 y1654   edd FALSE 0.344 4.000 0.008 NA   NA
 272195 272196 y1655 y1656     FALSE 0.052 175.000 0.000 NA   NA
 272197 272198 y1657 y1658 elaB   FALSE 0.002 555.000 0.000 NA   NA
 272198 272199 y1658 y1659   menF FALSE 0.002 528.000 0.000 NA   NA
 272199 272200 y1659 y1660 menF menD TRUE 0.840 228.000 0.281 1.000 Y NA
 272200 272201 y1660 y1661 menD   TRUE 0.980 -3.000 0.355 NA   NA
 272201 272202 y1661 y1662   menB TRUE 0.907 14.000 0.280 NA   NA
 272202 272203 y1662 y1663 menB menC TRUE 0.994 0.000 0.171 0.001 Y NA
 272203 272204 y1663 y1664 menC menE TRUE 0.907 -63.000 0.283 0.001 N NA
 272204 272205 y1664 y1665 menE   FALSE 0.120 66.000 0.000 1.000 N NA
 272205 272206 y1665 y1666     FALSE 0.028 233.000 0.000 NA   NA
 272209 272210 y1669 y1670     FALSE 0.002 579.000 0.000 NA   NA
 272210 272211 y1670 y1671     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 272213 272214 y1673 y1674 glnQ glnP TRUE 0.978 -3.000 0.051 1.000 Y NA
 272214 272215 y1674 y1675 glnP glnH TRUE 0.937 35.000 0.103 0.080 Y NA
 272215 272216 y1675 y1676 glnH   FALSE 0.003 570.000 0.000 1.000   NA
 272216 272217 y1676 y1677   dps FALSE 0.018 320.000 0.000 1.000   NA
 272217 272218 y1677 y1678 dps   FALSE 0.036 257.000 0.000 1.000   NA
 272218 272219 y1678 y1679     TRUE 0.566 23.000 0.000 0.044   NA
 272219 272220 y1679 y1680     FALSE 0.353 16.000 0.016 1.000   NA
 272221 272222 y1681 y1682   ompX FALSE 0.029 229.000 0.000 NA   NA
 272222 272223 y1682 y1683 ompX   FALSE 0.012 316.000 0.000 1.000 N NA
 272223 272224 y1683 y1684     FALSE 0.026 238.000 0.000 NA   NA
 272224 272225 y1684 y1685     FALSE 0.067 142.000 0.000 NA   NA
 272225 272226 y1685 y1686     FALSE 0.002 583.000 0.000 NA   NA
 272226 272227 y1686 y1687     FALSE 0.412 175.000 0.125 1.000 N NA
 272227 272228 y1687 y1688   rbsA TRUE 0.947 40.000 0.125 0.012 Y NA
 272228 272229 y1688 y1689 rbsA rbsC TRUE 0.991 -3.000 0.111 0.012 Y NA
 272230 272231 y1690 y1691     TRUE 0.533 247.000 0.000 0.057 Y NA
 272232 272233 y1692 y1693     FALSE 0.036 782.000 0.333 1.000 N NA
 272233 2158955 y1693 y1694     FALSE 0.141 33.000 0.000 NA   NA
 2158955 272234 y1694 y1695     FALSE 0.087 96.000 0.000 NA   NA
 272234 272235 y1695 y1696     FALSE 0.001 653.000 0.000 1.000 N NA
 272235 272236 y1696 y1697     TRUE 0.683 156.000 0.000 1.000 Y NA
 272236 272237 y1697 y1698     FALSE 0.439 2.000 0.000 NA   NA
 272239 272240 y1700 y1701     FALSE 0.001 652.000 0.000 NA   NA
 272240 272241 y1701 y1702     FALSE 0.268 10.000 0.000 NA   NA
 272241 272242 y1702 y1703     FALSE 0.002 512.000 0.000 NA   NA
 272242 272243 y1703 y1704     FALSE 0.058 160.000 0.000 NA   NA
 272243 272244 y1704 y1705     FALSE 0.019 258.000 0.000 NA   NA
 272247 272248 y1708 y1709   malK FALSE 0.110 57.000 0.000 NA   NA
 272248 272249 y1709 y1710 malK cpsG TRUE 0.804 58.000 0.000 1.000 Y NA
 272249 272250 y1710 y1711 cpsG   FALSE 0.243 -28.000 0.000 1.000 N NA
 272251 272252 y1712 y1713     TRUE 0.988 109.000 0.733 0.057 Y NA
 272252 272253 y1713 y1714     TRUE 0.999 1.000 0.711 0.057 Y NA
 272253 272254 y1714 y1715     TRUE 0.679 147.000 0.000 NA Y NA
 272254 272255 y1715 y1716     FALSE 0.153 27.000 0.000 NA   NA
 272255 272256 y1716 y1717     FALSE 0.080 117.000 0.000 NA   NA
 272256 272257 y1717 y1718     FALSE 0.131 39.000 0.000 NA   NA
 272258 272259 y1719 y1720     FALSE 0.024 243.000 0.000 NA   NA
 272262 272263 y1723 y1724     FALSE 0.275 409.000 0.528 NA   NA
 272263 272264 y1724 y1725     TRUE 0.995 -3.000 0.895 NA   NA
 272264 272265 y1725 y1726     TRUE 0.975 18.000 0.787 NA   NA
 272265 272266 y1726 y1727     TRUE 0.960 11.000 0.468 NA   NA
 272267 272268 y1728 y1729     TRUE 0.982 11.000 0.714 1.000   NA
 272268 272269 y1729 y1730     TRUE 0.848 47.000 0.286 1.000   NA
 272270 272271 y1731 y1732   ypeR FALSE 0.107 487.000 0.000 0.056 Y NA
 272273 272274 y1734 y1735     FALSE 0.134 37.000 0.000 NA   NA
 272276 272277 y1737 y1738     FALSE 0.011 305.000 0.000 NA   NA
 272277 272278 y1738 y1739   tqsA FALSE 0.148 149.000 0.033 NA   NA
 272279 272280 y1740 y1741     FALSE 0.101 344.000 0.143 NA   NA
 272280 272281 y1741 y1742   solA FALSE 0.031 240.000 0.000 1.000 N NA
 272282 272283 y1743 y1745     FALSE 0.031 223.000 0.000 NA   NA
 272285 272286 y1746 y1747 pyrC dinI FALSE 0.024 313.000 0.031 NA   NA
 272287 272288 y1748 y1749   rne FALSE 0.101 96.000 0.000 1.000 N NA
 272291 272292 y1752 y1753   rpmF TRUE 0.968 13.000 0.599 NA   NA
 272292 272293 y1753 y1755 rpmF plsX TRUE 0.910 34.000 0.418 1.000 N NA
 272295 272296 y1756 y1757 fabH fabD TRUE 0.965 38.000 0.182 0.003 Y NA
 272296 272297 y1757 y1758 fabD fabG TRUE 0.992 14.000 0.432 0.003 Y NA
 272297 272298 y1758 y1759 fabG acpP TRUE 0.955 154.000 0.321 0.003 Y NA
 272298 272299 y1759 y1760 acpP fabF TRUE 0.955 95.000 0.346 1.000 Y NA
 272299 272300 y1760 y1761 fabF   FALSE 0.076 149.000 0.000 1.000 N NA
 272300 272301 y1761 y1762   pabC FALSE 0.005 416.000 0.000 1.000 N NA
 272301 272302 y1762 y1763 pabC   FALSE 0.429 223.000 0.204 NA   NA
 272302 272303 y1763 y1764   tmk TRUE 0.925 -10.000 0.209 NA   NA
 272303 272304 y1764 y1765 tmk holB TRUE 0.876 -27.000 0.211 1.000 N NA
 272304 272305 y1765 y1766 holB   TRUE 0.945 15.000 0.110 NA Y NA
 272305 272306 y1766 y1767   ptsG FALSE 0.002 307.000 0.004 NA N NA
 272306 272307 y1767 y1768 ptsG   FALSE 0.081 139.000 0.000 1.000 N NA
 272307 272308 y1768 y1769   aroE FALSE 0.004 443.000 0.000 1.000 N NA
 272308 272309 y1769 y1770 aroE   FALSE 0.040 174.000 0.003 1.000 N NA
 272309 272310 y1770 y1771     TRUE 0.519 -31.000 0.051 NA   NA
 272310 272311 y1771 y1772     TRUE 0.924 41.000 0.516 NA   NA
 272311 272312 y1772 y1773     TRUE 0.891 -40.000 0.310 NA   NA
 272312 272313 y1773 y1775     FALSE 0.437 65.000 0.069 1.000 N NA
 272315 272316 y1776 y1777   ndh FALSE 0.028 375.000 0.057 NA   NA
 272316 272317 y1777 y1778 ndh   FALSE 0.054 171.000 0.000 NA   NA
 272317 272318 y1778 y1779     FALSE 0.053 173.000 0.000 NA   NA
 272318 272319 y1779 y1780     FALSE 0.290 8.000 0.000 NA   NA
 272319 272320 y1780 y1781     FALSE 0.087 96.000 0.000 NA   NA
 272320 272321 y1781 y1782     FALSE 0.021 303.000 0.000 1.000   NA
 272321 272322 y1782 y1783     FALSE 0.088 94.000 0.000 NA   NA
 272324 272325 y1785 y1786     TRUE 0.947 -7.000 0.175 0.078 N NA
 272325 272326 y1786 y1787     TRUE 0.951 -3.000 0.125 0.078 N NA
 272326 272327 y1787 y1788     TRUE 0.861 19.000 0.225 1.000 N NA
 272327 272328 y1788 y1789     TRUE 0.507 -22.000 0.028 1.000   NA
 272328 272329 y1789 y1790   cobB TRUE 0.639 49.000 0.119 1.000   NA
 272329 272330 y1790 y1791 cobB pepT FALSE 0.020 300.000 0.019 1.000 N NA
 272331 272332 y1792 y1793   phoQ TRUE 0.911 30.000 0.408 NA   NA
 272332 272333 y1793 y1794 phoQ phoP TRUE 0.998 6.000 0.940 1.000 Y NA
 272333 272334 y1794 y1795 phoP   FALSE 0.067 211.000 0.000 1.000   NA
 272334 272335 y1795 y1796     FALSE 0.408 -6.000 0.000 NA   NA
 272335 272336 y1796 y1797   purB FALSE 0.148 30.000 0.000 NA   NA
 272336 272337 y1797 y1798 purB   TRUE 0.534 52.000 0.093 NA   NA
 272337 272338 y1798 y1799     TRUE 0.720 52.000 0.180 NA   NA
 272338 272339 y1799 y1800     FALSE 0.462 187.000 0.158 1.000 N NA
 272339 272340 y1800 y1801     TRUE 0.927 -7.000 0.182 1.000 N NA
 272342 272343 y1803 y1804     FALSE 0.016 276.000 0.000 NA   NA
 272343 272344 y1804 y1805   aer TRUE 0.508 120.000 0.125 NA   NA
 272344 272345 y1805 y1806 aer   FALSE 0.001 863.000 0.000 1.000 N NA
 272346 272347 y1807 y1808     FALSE 0.095 82.000 0.000 NA   NA
 272350 272351 y1811 y1812     FALSE 0.014 291.000 0.000 NA   NA
 272351 272352 y1812 y1813     FALSE 0.293 68.000 0.045 NA   NA
 272352 272353 y1813 y1814     FALSE 0.018 263.000 0.000 NA   NA
 272353 272354 y1814 y1815     FALSE 0.095 82.000 0.000 NA   NA
 272354 272355 y1815 y1816     FALSE 0.015 283.000 0.000 NA   NA
 272355 272356 y1816 y1817   lacZ FALSE 0.007 371.000 0.000 1.000 N NA
 10350603 272357 y5002 y1818   dsrB FALSE 0.266 215.000 0.105 NA   NA
 272358 272359 y1820 y1821 mgtC mgtA FALSE 0.033 401.000 0.065 1.000   NA
 272359 272360 y1821 y1822 mgtA flhC FALSE 0.001 1532.000 0.000 1.000   NA
 272360 272361 y1822 y1823 flhC motA TRUE 0.728 205.000 0.408 1.000   NA
 272361 272362 y1823 y1826 motA motB TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 272363 272364 y1824 y1825     FALSE 0.102 -109.000 0.000 NA   NA
 272365 272366 y1827 y1828 cheA cheW TRUE 0.967 163.000 0.447 0.003 Y NA
 272367 272368 y1829 y1830     TRUE 0.940 13.000 0.400 NA N NA
 272368 272369 y1830 y1831     TRUE 0.927 -33.000 0.400 NA N NA
 272370 272371 y1832 y1833     FALSE 0.003 475.000 0.000 NA   NA
 272371 272372 y1833 y1834     FALSE 0.216 -61.000 0.000 1.000   NA
 272372 272373 y1834 y1835     FALSE 0.002 528.000 0.000 NA   NA
 272373 272374 y1835 y1836     FALSE 0.091 90.000 0.000 NA   NA
 272374 272375 y1836 y1837   tsr FALSE 0.026 241.000 0.000 NA   NA
 272375 272376 y1837 y1838 tsr tap TRUE 0.962 184.000 0.429 0.001 Y NA
 272376 272377 y1838 y1839 tap cheR TRUE 0.878 158.000 0.188 1.000 Y NA
 272377 272378 y1839 y1841 cheR cheB TRUE 0.984 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 272380 272381 y1842 y1843 cheY cheZ TRUE 0.987 10.000 0.333 1.000 Y NA
 272383 272384 y1845 y1846     FALSE 0.008 357.000 0.000 1.000 N NA
 272384 272385 y1846 y1847     FALSE 0.315 -13.000 0.000 NA   NA
 272385 272386 y1847 y1848     FALSE 0.085 100.000 0.000 NA   NA
 272387 272388 y1849 y1850     FALSE 0.005 402.000 0.000 NA   NA
 272389 272390 y1851 y1852     FALSE 0.005 393.000 0.000 NA   NA
 272391 272392 y1853 y1854     TRUE 0.742 117.000 0.000 1.000 Y NA
 272394 272395 y1856 y1857     FALSE 0.038 208.000 0.000 NA   NA
 272395 272396 y1857 y1858     TRUE 0.890 206.000 0.848 NA   NA
 272396 272397 y1858 y1859     TRUE 0.979 171.000 0.879 NA Y NA
 272397 272398 y1859 y1860     TRUE 0.813 31.000 0.219 NA   NA
 272398 272399 y1860 y1861     TRUE 0.990 -6.000 0.714 NA   NA
 272399 272400 y1861 y1862     TRUE 0.937 -6.000 0.192 NA   NA
 272400 272401 y1862 y1863     FALSE 0.003 479.000 0.000 NA   NA
 272401 272402 y1863 y1864     TRUE 0.977 -37.000 0.840 NA   NA
 272403 272404 y1865 y1866   proQ TRUE 0.838 96.000 0.081 NA Y NA
 272404 272405 y1866 y1867 proQ prc TRUE 0.887 20.000 0.304 NA N NA
 272405 272406 y1867 y1868 prc htpX FALSE 0.028 455.000 0.042 0.023 N NA
 272406 272407 y1868 y1869 htpX   FALSE 0.001 658.000 0.000 1.000 N NA
 272407 272408 y1869 y1870   ecpD TRUE 0.978 153.000 0.750 1.000 Y NA
 272408 272409 y1870 y1871 ecpD   TRUE 0.986 82.000 0.750 1.000 Y NA
 272409 272410 y1871 y1872     TRUE 0.982 -9.000 0.167 1.000 Y NA
 272410 272411 y1872 y1873     TRUE 0.990 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 272413 272414 y1875 y1876 ogl   FALSE 0.215 187.000 0.059 1.000 N NA
 272414 272415 y1876 y1877     FALSE 0.006 385.000 0.000 1.000 N NA
 272416 272417 y1878 y1879     FALSE 0.306 198.000 0.102 NA   NA
 272417 272418 y1879 y1880     FALSE 0.003 480.000 0.000 NA   NA
 272418 272419 y1880 y1881   togB FALSE 0.072 298.000 0.000 0.056   NA
 272419 272420 y1881 y1882 togB togA TRUE 0.960 16.000 0.101 0.056 Y NA
 272420 272421 y1882 y1883 togA togN TRUE 0.970 14.000 0.131 0.056 Y NA
 272421 272422 y1883 y1884 togN togM TRUE 0.994 -73.000 0.917 0.056 Y NA
 272422 272423 y1884 y1885 togM   TRUE 0.804 41.000 0.217 1.000   NA
 272423 272424 y1885 y1886   kduD FALSE 0.015 336.000 0.000 1.000   NA
 272424 272425 y1886 y1887 kduD kduI TRUE 0.753 47.000 0.192 1.000 N NA
 272426 272427 y1888 y1889 kdgF   FALSE 0.121 48.000 0.000 NA   NA
 272430 272431 y1892 y1893     FALSE 0.160 25.000 0.000 NA   NA
 272431 272432 y1893 y1894   yfeD FALSE 0.101 68.000 0.000 NA   NA
 272432 272433 y1894 y1895 yfeD yfeC TRUE 0.998 -3.000 0.525 0.006 Y NA
 272433 272434 y1895 y1896 yfeC yfeB TRUE 0.999 0.000 0.857 1.000 Y NA
 272434 272435 y1896 y1897 yfeB yfeA TRUE 0.999 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 272439 272440 y1901 y1902     FALSE 0.004 412.000 0.000 NA   NA
 272441 272442 y1903 y1904 thrS infC TRUE 0.985 4.000 0.186 1.000 Y NA
 272442 272443 y1904 y1905 infC rplT FALSE 0.225 332.000 0.000 1.000 Y NA
 272443 272444 y1905 y1906 rplT pheM FALSE 0.086 98.000 0.000 NA   NA
 272446 272447 y1908 y1909 pheS pheT TRUE 0.995 14.000 0.574 0.001 Y NA
 272451 272452 y1913 y1914   btuC FALSE 0.185 158.000 0.044 NA   NA
 272452 272453 y1914 y1915 btuC btuE FALSE 0.477 70.000 0.084 1.000 N NA
 272453 272454 y1915 y1916 btuE btuD FALSE 0.385 22.000 0.036 1.000 N NA
 272454 272455 y1916 y1917 btuD   FALSE 0.091 350.000 0.129 1.000 N NA
 272455 272456 y1917 y1918     TRUE 0.990 -13.000 0.378 NA Y NA
 272456 272457 y1918 y1919     TRUE 0.992 -3.000 0.220 NA Y NA
 272457 272458 y1919 y1920     TRUE 0.997 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 272458 272459 y1920 y1921     TRUE 0.846 -3.000 0.061 1.000 N NA
 272459 272460 y1921 y1922     TRUE 0.937 -21.000 0.227 0.096   NA
 272460 272461 y1922 y1923     TRUE 0.993 -3.000 0.613 0.096   NA
 272463 272464 y1925 y1926 nlpC lplA FALSE 0.376 125.000 0.091 NA N NA
 272464 2158957 y1926 y1927 lplA   FALSE 0.130 40.000 0.000 NA   NA
 272465 272466 y1928 y1929 aroH   TRUE 0.551 157.000 0.165 1.000   NA
 272469 272470 y1932 y1933     FALSE 0.491 122.000 0.129 NA N NA
 272470 272471 y1933 y1934     FALSE 0.002 568.000 0.000 NA   NA
 272471 272472 y1934 y1935     FALSE 0.463 15.000 0.041 NA   NA
 272472 272473 y1935 y1936   sufC TRUE 0.941 186.000 0.466 1.000 Y NA
 272473 272474 y1936 y1937 sufC   TRUE 0.990 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 272474 272475 y1937 y1938     TRUE 0.904 -15.000 0.193 1.000 N NA
 272475 272476 y1938 y1939     TRUE 0.671 89.000 0.183 NA   NA
 272476 272477 y1939 y1940     FALSE 0.140 271.000 0.103 NA   NA
 272478 272479 y1941 y1942     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 272479 272480 y1942 y1943     TRUE 0.895 27.000 0.000 0.086 Y NA
 272480 10350604 y1943 y5000   lpp FALSE 0.080 140.000 0.000 1.000 N NA
 10350604 272481 y5000 y1944 lpp pykF FALSE 0.011 321.000 0.000 1.000 N NA
 272481 2158958 y1944 yt043 pykF   FALSE 0.002 579.000 0.000 NA   NA
 2158958 2158959 yt043 yt044     FALSE 0.106 63.000 0.000 NA   NA
 2158959 272482 yt044 y1945     FALSE 0.024 243.000 0.000 NA   NA
 272484 272485 y1947 y1948 cfa   FALSE 0.003 480.000 0.000 1.000 N NA
 272487 272488 y1950 y1951 purR sodB FALSE 0.002 527.000 0.000 1.000 N NA
 272488 272489 y1951 y1952 sodB   FALSE 0.005 336.000 0.015 NA N NA
 272491 272492 y1954 y1955   rnt FALSE 0.038 209.000 0.000 NA   NA
 272494 272495 y1957 y1958 gloA nemA FALSE 0.357 79.000 0.057 1.000 N NA
 272495 272496 y1958 y1959 nemA   TRUE 0.840 88.000 0.362 1.000 N NA
 272496 272497 y1959 y1960     FALSE 0.322 223.000 0.128 1.000   NA
 272500 272501 y1963 y1964 anmK   FALSE 0.252 55.000 0.034 NA   NA
 272501 272502 y1964 y1965   pdxH FALSE 0.204 91.000 0.034 NA   NA
 272502 272503 y1965 y1966 pdxH tyrS FALSE 0.220 170.000 0.054 1.000 N NA
 272503 272504 y1966 y1967 tyrS pdxY FALSE 0.187 155.000 0.041 1.000 N NA
 272505 272506 y1968 y1969 gst   FALSE 0.125 242.000 0.062 NA   NA
 272506 272507 y1969 y1970     FALSE 0.023 246.000 0.000 NA   NA
 272507 272508 y1970 y1971   tppB FALSE 0.021 255.000 0.000 NA   NA
 272508 272509 y1971 y1972 tppB   FALSE 0.001 643.000 0.000 NA   NA
 272509 272510 y1972 y1973   sapF FALSE 0.005 390.000 0.000 NA   NA
 272510 272511 y1973 y1974 sapF sapD TRUE 0.999 0.000 0.684 0.020 Y NA
 272511 272512 y1974 y1975 sapD sapC TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 272512 272513 y1975 y1976 sapC sapB TRUE 0.991 -13.000 0.284 0.056 Y NA
 272513 272514 y1976 y1977 sapB sapA TRUE 0.980 -3.000 0.264 0.056 N NA
 272517 272518 y1980 y1981 pspA pspB TRUE 0.905 162.000 0.739 NA   NA
 272518 272519 y1981 y1982 pspB pspC TRUE 0.995 0.000 0.913 NA   NA
 272519 272520 y1982 y1983 pspC pspD TRUE 0.643 85.000 0.167 NA   NA
 272520 272521 y1983 y1984 pspD   TRUE 0.616 -19.000 0.052 NA   NA
 272521 272522 y1984 y1985     TRUE 0.994 -3.000 0.791 NA   NA
 272523 272524 y1986 y1987     TRUE 0.734 197.000 0.412 NA   NA
 272526 272527 y1989 y1990   tpx FALSE 0.049 202.000 0.000 1.000 N NA
 272530 272531 y1993 y1994   zntB FALSE 0.039 243.000 0.019 1.000 N NA
 272532 272533 y1995 y1996     FALSE 0.012 312.000 0.000 1.000 N NA
 272535 272536 y1998 y1999     FALSE 0.006 275.000 0.000 NA N NA
 272540 272541 y2003 y2004 hslJ ldhA FALSE 0.119 70.000 0.024 NA N NA
 272542 272543 y2005 y2006     FALSE 0.356 -117.000 0.057 NA   NA
 272543 272544 y2006 y2007     TRUE 0.982 10.000 0.726 NA   NA
 272548 272549 y2011 y2012 hrpA   FALSE 0.001 665.000 0.000 1.000 N NA
 272550 272551 y2013 y2014   asr FALSE 0.008 334.000 0.000 NA   NA
 272552 272553 y2015 y2016     FALSE 0.001 602.000 0.000 NA   NA
 272553 272554 y2016 y2017     FALSE 0.054 171.000 0.000 NA   NA
 272554 272555 y2017 y2018     FALSE 0.322 6.000 0.000 NA   NA
 272556 272557 y2019 y2020     FALSE 0.414 3.000 0.000 NA   NA
 272557 272558 y2020 y2021     FALSE 0.001 1105.000 0.000 1.000 N NA
 272558 272559 y2021 y2022     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 272559 272560 y2022 y2023   adhE FALSE 0.002 540.000 0.000 1.000 N NA
 272561 272562 y2024 y2025     FALSE 0.005 384.000 0.000 NA   NA
 272562 272563 y2025 y2026   oppA FALSE 0.000 838.000 0.000 NA N NA
 272563 272564 y2026 y2027 oppA oppB TRUE 0.930 87.000 0.151 0.055 Y NA
 272564 272565 y2027 y2028 oppB oppC TRUE 0.996 19.000 0.870 0.055 Y NA
 272565 272566 y2028 y2029 oppC oppD TRUE 0.992 12.000 0.554 1.000 Y NA
 272566 272567 y2029 y2030 oppD oppF TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.001 Y NA
 272567 272568 y2030 y2031 oppF   FALSE 0.002 561.000 0.000 NA   NA
 272569 272570 y2032 y2033   cls TRUE 0.627 165.000 0.231 NA   NA
 272571 272572 y2034 y2035 ompX   FALSE 0.230 -25.000 0.000 NA   NA
 272572 10350605 y2035 y5001     FALSE 0.079 118.000 0.000 NA   NA
 272575 272576 y2038 y2039     FALSE 0.010 232.000 0.000 NA N NA
 272576 272577 y2039 y2040     TRUE 0.627 80.000 0.167 NA N NA
 272579 272580 y2043 y2044     FALSE 0.086 97.000 0.000 NA   NA
 272581 272582 y2045 y2046     FALSE 0.051 180.000 0.000 NA   NA
 272582 272583 y2046 y2047   trpA FALSE 0.139 -54.000 0.000 NA   NA
 272583 272584 y2047 y2048 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 272584 272585 y2048 y2049 trpB trpC TRUE 0.937 157.000 0.221 0.001 Y NA
 272585 2158961 y2049 y2050 trpC   FALSE 0.372 4.000 0.000 NA   NA
 2158961 272586 y2050 y2051   trpE FALSE 0.477 0.000 0.000 NA   NA
 272587 272588 y2052 y2053     TRUE 0.893 17.000 0.281 NA   NA
 272588 272589 y2053 y2054     FALSE 0.260 364.000 0.075 NA Y NA
 272590 272591 y2055 y2056 btuR   TRUE 0.509 17.000 0.050 1.000 N NA
 272594 272595 y2059 y2060   topA FALSE 0.153 27.000 0.000 NA   NA
 272595 272596 y2060 y2061 topA cysB FALSE 0.005 397.000 0.008 1.000 N NA
 272596 272597 y2061 y2062 cysB   FALSE 0.008 336.000 0.000 NA   NA
 272597 272598 y2062 y2063   acnA FALSE 0.007 364.000 0.000 NA   NA
 272600 272601 y2065 y2066 pgpB   TRUE 0.514 157.000 0.143 1.000   NA
 272601 272602 y2066 y2067     TRUE 0.979 7.000 0.576 1.000   NA
 272604 272605 y2069 y2070 pyrF   TRUE 0.780 0.000 0.045 1.000 N NA
 272610 272611 y2075 y2076   cstA TRUE 0.782 -31.000 0.143 NA   NA
 272611 272612 y2076 y2077 cstA rnb FALSE 0.009 350.000 0.000 1.000 N NA
 272613 272614 y2078 y2079     TRUE 0.915 35.000 0.103 1.000 Y NA
 272615 272616 y2080 y2081 nth   TRUE 0.912 -3.000 0.109 1.000 N NA
 272616 272617 y2081 y2082     TRUE 0.999 -3.000 0.908 0.036 Y NA
 272617 272618 y2082 y2083     TRUE 0.998 10.000 0.924 0.036 Y NA
 272620 272621 y2085 y2086     TRUE 0.987 50.000 0.537 0.011 Y NA
 272621 272622 y2086 y2087     TRUE 0.998 0.000 0.564 0.036 Y NA
 272622 272623 y2087 y2088     TRUE 0.546 128.000 0.148 NA   NA
 272623 272624 y2088 y2089     FALSE 0.083 105.000 0.000 NA   NA
 272625 272626 y2090 y2091     FALSE 0.115 53.000 0.000 NA   NA
 272626 2158962 y2091 y2092     FALSE 0.160 25.000 0.000 NA   NA
 2158962 272627 y2092 y2093     FALSE 0.439 2.000 0.000 NA   NA
 272628 272629 y2094 y2095 araA araB FALSE 0.292 84.000 0.046 1.000 N NA
 272630 272631 y2096 y2097 araF araG TRUE 0.992 98.000 0.917 0.011 Y NA
 272631 272632 y2097 y2098 araG araH TRUE 0.990 18.000 0.451 0.011 Y NA
 272632 272633 y2098 y2100 araH araC FALSE 0.429 221.000 0.196 1.000 N NA
 272633 272634 y2100 y2099 araC   FALSE 0.092 -366.000 0.000 NA   NA
 272634 272635 y2099 y2101     FALSE 0.001 694.000 0.000 NA   NA
 272635 272636 y2101 y2102     FALSE 0.082 194.000 0.000 1.000   NA
 272636 272637 y2102 y2103     FALSE 0.039 206.000 0.000 NA   NA
 272638 272639 y2104 y2105   manA TRUE 0.909 165.000 0.778 NA   NA
 272641 272642 y2107 y2108 tus   FALSE 0.018 346.000 0.018 1.000   NA
 272643 272644 y2109 y2110   mlc TRUE 0.900 214.000 0.408 NA Y NA
 272644 272645 y2110 y2111 mlc   TRUE 0.742 200.000 0.455 NA N NA
 272646 272647 y2112 y2113   galR FALSE 0.002 636.000 0.000 1.000 N NA
 272647 272648 y2113 y2114 galR   FALSE 0.105 64.000 0.000 NA   NA
 272648 2158963 y2114 y2115     FALSE 0.068 141.000 0.000 NA   NA
 272649 272650 y2116 y2117     TRUE 0.997 4.000 0.520 0.055 Y NA
 272650 272651 y2117 y2118   tauB TRUE 0.993 10.000 0.520 1.000 Y NA
 272655 272656 y2122 y2123     TRUE 0.978 -3.000 0.333 NA   NA
 272658 272659 y2125 y2126 ivbL ilvB TRUE 0.704 95.000 0.216 NA   NA
 272659 272660 y2126 y2127 ilvB ilvN TRUE 0.990 -13.000 0.649 0.001   NA
 272661 272662 y2128 y2129     FALSE 0.166 131.000 0.033 NA   NA
 272662 272663 y2129 y2130   phoA FALSE 0.002 546.000 0.000 NA   NA
 272664 272665 y2131 y2132 ogt fnr FALSE 0.259 73.000 0.038 1.000 N NA
 272665 272666 y2132 y2133 fnr   TRUE 0.973 135.000 0.619 1.000 Y NA
 272667 272668 y2134 y2135 pntB pntA TRUE 0.992 73.000 0.745 0.001 Y NA
 272669 272670 y2136 y2137     FALSE 0.197 270.000 0.143 NA   NA
 272672 272673 y2139 y2140 rstA rstB TRUE 0.990 0.000 0.181 1.000 Y NA
 272673 272674 y2140 y2141 rstB   TRUE 0.791 95.000 0.300 1.000 N NA
 272676 272677 y2143 y2144     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 272680 272681 y2147 y2148   hnr FALSE 0.018 280.000 0.000 1.000 N NA
 272682 272683 y2149 y2150   purU FALSE 0.489 203.000 0.200 NA   NA
 272686 272687 y2153 y2154 xthA   FALSE 0.325 98.000 0.056 1.000 N NA
 272688 272689 y2155 y2156   topB TRUE 0.920 -3.000 0.123 NA   NA
 272689 272690 y2156 y2157 topB selD FALSE 0.325 47.000 0.041 1.000 N NA
 272690 272691 y2157 y2158 selD   FALSE 0.134 37.000 0.000 NA   NA
 272691 272692 y2158 y2159     FALSE 0.131 39.000 0.000 NA   NA
 272693 272694 y2160 y2161 sppA ansA FALSE 0.488 117.000 0.113 1.000 N NA
 272694 272695 y2161 y2162 ansA   FALSE 0.469 15.000 0.040 1.000 N NA
 272696 272697 y2163 y2164     TRUE 0.852 -34.000 0.216 NA   NA
 272698 272699 y2165 y2166 gapA   TRUE 0.494 314.000 0.154 1.000 Y NA
 272701 272702 y2168 y2169     TRUE 0.926 105.000 0.683 NA   NA
 272702 272703 y2169 y2170     FALSE 0.071 105.000 0.007 NA   NA
 272705 272706 y2172 y2173     FALSE 0.018 265.000 0.000 NA   NA
 272709 272710 y2176 y2177   fadR FALSE 0.100 70.000 0.000 NA   NA
 2158965 272711 y2178 y2179   dsbB FALSE 0.027 236.000 0.000 NA   NA
 272713 272714 y2181 y2182     FALSE 0.263 17.000 0.019 NA   NA
 272714 272715 y2182 y2183     FALSE 0.471 4.000 0.019 NA   NA
 272715 272716 y2183 y2184     FALSE 0.011 305.000 0.000 NA   NA
 272717 272718 y2185 y2186     FALSE 0.253 11.000 0.000 NA   NA
 272718 272719 y2186 y2187     FALSE 0.191 17.000 0.000 NA   NA
 272719 272720 y2187 y2188     TRUE 0.951 -15.000 0.333 NA   NA
 272720 272721 y2188 y2189     FALSE 0.002 572.000 0.000 NA   NA
 272721 272722 y2189 y2190     FALSE 0.004 414.000 0.000 NA   NA
 272722 272723 y2190 y2191     FALSE 0.085 99.000 0.000 NA   NA
 272725 272726 y2193 y2194     FALSE 0.019 261.000 0.000 NA   NA
 272726 272727 y2194 y2195     TRUE 0.990 3.000 0.714 NA   NA
 272727 272728 y2195 y2196     TRUE 0.778 174.000 0.429 NA   NA
 272728 272729 y2196 y2197     TRUE 0.890 3.000 0.120 NA   NA
 272729 272730 y2197 y2198     FALSE 0.011 309.000 0.000 NA   NA
 272730 272731 y2198 y2199     TRUE 0.759 13.000 0.111 NA   NA
 272731 272732 y2199 y2200     TRUE 0.866 66.000 0.400 NA   NA
 272732 272733 y2200 y2201     TRUE 0.973 -3.000 0.294 NA   NA
 272733 272734 y2201 y2202     TRUE 0.958 2.000 0.235 NA   NA
 272734 272735 y2202 y2203     FALSE 0.439 2.000 0.000 NA   NA
 272735 272736 y2203 y2204     FALSE 0.492 -3.000 0.000 NA   NA
 272736 272737 y2204 y2205     TRUE 0.884 -27.000 0.222 NA   NA
 272737 272738 y2205 y2206     TRUE 0.986 14.000 1.000 NA   NA
 272738 272739 y2206 y2207     TRUE 0.954 122.000 1.000 NA   NA
 272739 272740 y2207 y2208     FALSE 0.451 1.000 0.000 NA   NA
 272740 272741 y2208 y2209     FALSE 0.182 19.000 0.000 NA   NA
 272741 2158966 y2209 y2211     FALSE 0.477 0.000 0.000 NA   NA
 2158966 272742 y2211 y2210     FALSE 0.082 -1840.000 0.000 NA   NA
 272742 272743 y2210 y2212     FALSE 0.001 636.000 0.000 NA   NA
 272743 272744 y2212 y2213     TRUE 0.956 31.000 0.667 NA   NA
 272744 272745 y2213 y2214     FALSE 0.006 457.000 0.000 1.000   NA
 272745 272746 y2214 y2215     FALSE 0.005 462.000 0.000 1.000   NA
 272746 272747 y2215 y2216     FALSE 0.444 -15.000 0.000 1.000   NA
 272747 272748 y2216 y2217     FALSE 0.001 1103.000 0.000 NA   NA
 272748 272749 y2217 y2218     FALSE 0.004 424.000 0.000 NA   NA
 272749 272750 y2218 y2219     FALSE 0.065 149.000 0.000 NA   NA
 272750 272751 y2219 y2220     FALSE 0.492 -3.000 0.000 NA   NA
 272753 272754 y2222 y2223     FALSE 0.098 74.000 0.000 NA   NA
 272756 272757 y2225 y2226     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 272759 272760 y2228 y2229     FALSE 0.432 103.000 0.088 NA   NA
 272760 272761 y2229 y2230     FALSE 0.317 35.000 0.046 NA N NA
 272761 272762 y2230 y2231     TRUE 0.792 138.000 0.363 NA   NA
 272763 272764 y2232 y2233 minC minD TRUE 0.983 25.000 0.466 1.000 Y NA
 272764 272765 y2233 y2234 minD minE TRUE 0.996 4.000 0.618 NA Y NA
 272766 272767 y2235 y2236 rnd fadD FALSE 0.484 121.000 0.115 1.000 N NA
 272767 272768 y2236 y2237 fadD   FALSE 0.027 593.000 0.169 1.000 N NA
 272768 272769 y2237 y2238     FALSE 0.134 137.000 0.024 1.000 N NA
 272769 272770 y2238 y2239     TRUE 0.648 18.000 0.082 1.000 N NA
 272772 272773 y2241 y2242     TRUE 0.997 -31.000 0.869 0.071 Y NA
 272773 272774 y2242 y2243   eda FALSE 0.001 694.000 0.000 1.000 N NA
 272774 272775 y2243 y2244 eda zwf TRUE 0.505 242.000 0.034 1.000 Y NA
 272776 272777 y2245 y2246   pykA FALSE 0.010 330.000 0.000 1.000 N NA
 272778 272779 y2247 y2248 msbB   FALSE 0.407 267.000 0.299 1.000 N NA
 272779 272780 y2248 y2249   znuA TRUE 0.742 21.000 0.131 1.000 N NA
 272781 272782 y2250 y2251 znuC znuB TRUE 0.998 -3.000 0.755 1.000 Y NA
 272783 272784 y2252 y2253 ruvB ruvA TRUE 0.976 162.000 0.549 0.001 Y NA
 272784 272785 y2253 y2254 ruvA ruvC TRUE 0.874 283.000 0.451 0.010 Y NA
 272785 272786 y2254 y2255 ruvC   TRUE 0.578 209.000 0.277 NA   NA
 272788 272789 y2256 y2258 ntpA aspS TRUE 0.803 0.000 0.050 1.000 N NA
 272790 272791 y2259 y2260     FALSE 0.404 180.000 0.126 NA   NA
 272791 272792 y2260 y2261     FALSE 0.292 191.000 0.089 NA   NA
 272792 272793 y2261 y2262     TRUE 0.976 -3.000 0.315 NA   NA
 272794 272795 y2263 y2264 cutC   FALSE 0.126 232.000 0.057 NA   NA
 272796 272797 y2265 y2266   argS FALSE 0.003 439.000 0.000 NA   NA
 272798 272799 y2267 y2268     TRUE 0.994 30.000 1.000 NA Y NA
 272799 272800 y2268 y2269   mviN FALSE 0.002 539.000 0.000 NA   NA
 272800 272801 y2269 y2270 mviN   FALSE 0.044 267.000 0.022 1.000   NA
 272801 272802 y2270 y2271   rimJ FALSE 0.434 8.000 0.000 1.000   NA
 272803 272804 y2272 y2273     FALSE 0.124 365.000 0.196 NA   NA
 272805 272806 y2274 y2275     TRUE 0.911 37.000 0.417 1.000   NA
 272807 272808 y2276 y2277     TRUE 0.929 -28.000 0.375 NA N NA
 2158968 272809 y2278 y2279     FALSE 0.492 -3.000 0.000 NA   NA
 272809 272810 y2279 y2280     TRUE 0.997 -3.000 0.440 0.054 Y NA
 272810 272811 y2280 y2281     TRUE 0.961 20.000 0.480 0.054   NA
 272813 2158969 y2283 yt047     FALSE 0.067 142.000 0.000 NA   NA
 2158969 272814 yt047 y2284     FALSE 0.117 -72.000 0.000 NA   NA
 272814 272815 y2284 y2285     FALSE 0.001 730.000 0.000 NA   NA