MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus pyogenes MGAS8232

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 194878 194879 spyM18_0001 spyM18_0002 dnaA dnaN TRUE 0.671 152.000 0.328 1.000 Y NA
 194879 194880 spyM18_0002 spyM18_0004 dnaN   FALSE 0.003 602.000 0.000 1.000 N NA
 194880 194881 spyM18_0004 spyM18_0005   pth TRUE 0.805 70.000 0.184 1.000 Y NA
 194881 194882 spyM18_0005 spyM18_0007 pth trcF TRUE 0.875 3.000 0.137 1.000 N NA
 194882 194883 spyM18_0007 spyM18_0008 trcF   FALSE 0.103 162.000 0.024 1.000 N NA
 194883 194884 spyM18_0008 spyM18_0009   divIC TRUE 0.878 -13.000 0.053 1.000 N NA
 194884 194885 spyM18_0009 spyM18_0011 divIC   FALSE 0.102 135.000 0.011 1.000 N NA
 194885 194886 spyM18_0011 spyM18_0012   mesJ TRUE 0.788 -3.000 0.014 1.000 N NA
 194886 194887 spyM18_0012 spyM18_0013 mesJ hpt TRUE 0.964 5.000 0.067 0.065 N NA
 194887 194888 spyM18_0013 spyM18_0014 hpt ftsH TRUE 0.866 22.000 0.192 1.000 N NA
 194888 194889 spyM18_0014 spyM18_0015 ftsH   FALSE 0.019 326.000 0.009 1.000 N NA
 194889 2155616 spyM18_0015 spyM18_r01     FALSE 0.018 567.000 0.000 NA   NA
 2155616 3820225 spyM18_r01 spyM18_t01     TRUE 0.514 50.000 0.000 NA   NA
 3820225 407378 spyM18_t01 spyM18_r02   rrl FALSE 0.047 299.000 0.000 NA   NA
 407378 3820226 spyM18_r02 spyM18_r13 rrl   FALSE 0.307 87.000 0.000 NA   NA
 3820226 3820227 spyM18_r13 spyM18_t02     TRUE 0.781 18.000 0.000 NA   NA
 3820227 3820228 spyM18_t02 spyM18_t03     TRUE 0.781 18.000 0.000 NA   NA
 3820228 3820229 spyM18_t03 spyM18_t04     TRUE 0.665 32.000 0.000 NA   NA
 3820229 3820230 spyM18_t04 spyM18_t05     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 3820230 3820231 spyM18_t05 spyM18_t06     TRUE 0.800 11.000 0.000 NA   NA
 3820231 3820232 spyM18_t06 spyM18_t07     TRUE 0.797 13.000 0.000 NA   NA
 3820232 3820233 spyM18_t07 spyM18_t08     TRUE 0.800 9.000 0.000 NA   NA
 3820233 3820234 spyM18_t08 spyM18_t09     TRUE 0.785 17.000 0.000 NA   NA
 3820234 3820235 spyM18_t09 spyM18_t10     TRUE 0.803 7.000 0.000 NA   NA
 3820235 2155617 spyM18_t10 spyM18_r03     FALSE 0.200 127.000 0.000 NA   NA
 2155617 3820236 spyM18_r03 spyM18_t11     TRUE 0.514 50.000 0.000 NA   NA
 3820236 407379 spyM18_t11 spyM18_r04   rrl FALSE 0.047 299.000 0.000 NA   NA
 407379 196033 spyM18_r04 spyM18_14 rrl   FALSE 0.307 87.000 0.000 NA   NA
 196033 3820237 spyM18_14 spyM18_t12     TRUE 0.781 18.000 0.000 NA   NA
 3820237 3820238 spyM18_t12 spyM18_t13     TRUE 0.781 18.000 0.000 NA   NA
 3820238 3820239 spyM18_t13 spyM18_t14     TRUE 0.665 32.000 0.000 NA   NA
 3820239 3820240 spyM18_t14 spyM18_t15     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 3820240 3820241 spyM18_t15 spyM18_t16     TRUE 0.800 11.000 0.000 NA   NA
 3820241 3820242 spyM18_t16 spyM18_t17     TRUE 0.797 13.000 0.000 NA   NA
 3820242 3820243 spyM18_t17 spyM18_t18     TRUE 0.800 9.000 0.000 NA   NA
 3820243 3820244 spyM18_t18 spyM18_t19     TRUE 0.785 17.000 0.000 NA   NA
 3820244 3820245 spyM18_t19 spyM18_t20     TRUE 0.803 7.000 0.000 NA   NA
 3820245 3820246 spyM18_t20 spyM18_t21     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 3820246 3820247 spyM18_t21 spyM18_t22     TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 3820247 3820248 spyM18_t22 spyM18_t23     TRUE 0.740 23.000 0.000 NA   NA
 3820248 3820250 spyM18_t23 spyM18_t24     TRUE 0.797 10.000 0.000 NA   NA
 3820250 3820251 spyM18_t24 spyM18_t25     TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 3820251 3820252 spyM18_t25 spyM18_t26     TRUE 0.797 13.000 0.000 NA   NA
 3820252 3820253 spyM18_t26 spyM18_t27     TRUE 0.642 35.000 0.000 NA   NA
 3820253 3820254 spyM18_t27 spyM18_t28     TRUE 0.797 10.000 0.000 NA   NA
 3820254 194890 spyM18_t28 spyM18_0020     FALSE 0.012 1499.000 0.000 NA   NA
 194890 194891 spyM18_0020 spyM18_0021   prsA FALSE 0.173 253.000 0.107 NA   NA
 194891 194892 spyM18_0021 spyM18_0022 prsA   FALSE 0.025 186.000 0.000 1.000 N NA
 194892 194893 spyM18_0022 spyM18_0023     FALSE 0.155 98.000 0.011 1.000 N NA
 194893 194894 spyM18_0023 spyM18_0024   acp TRUE 0.994 -7.000 0.017 0.009 Y NA
 194894 194895 spyM18_0024 spyM18_0025 acp purC FALSE 0.140 121.000 0.017 1.000 N NA
 194895 194896 spyM18_0025 spyM18_0026 purC purL TRUE 0.655 76.000 0.043 1.000 Y NA
 194896 194897 spyM18_0026 spyM18_0027 purL purF FALSE 0.354 161.000 0.024 1.000 Y NA
 194897 194898 spyM18_0027 spyM18_0028 purF purM TRUE 0.950 28.000 0.248 1.000 Y NA
 194898 194899 spyM18_0028 spyM18_0029 purM purN TRUE 0.919 168.000 0.238 0.003 Y NA
 194899 194900 spyM18_0029 spyM18_0030 purN purH TRUE 0.536 184.000 0.225 1.000 Y NA
 194902 194903 spyM18_0032 spyM18_0033 purD purE FALSE 0.381 159.000 0.044 1.000 Y NA
 194903 194904 spyM18_0033 spyM18_0034 purE purK TRUE 0.996 -49.000 0.002 0.002 Y NA
 194904 194905 spyM18_0034 spyM18_0035 purK   TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 194905 194906 spyM18_0035 spyM18_0036     TRUE 0.894 -19.000 0.000 NA   NA
 194906 194907 spyM18_0036 spyM18_0037   purB FALSE 0.056 275.000 0.000 NA   NA
 194907 194908 spyM18_0037 spyM18_0038 purB   FALSE 0.156 134.000 0.005 1.000   NA
 194908 194909 spyM18_0038 spyM18_0039   ruvB FALSE 0.117 161.000 0.002 1.000   NA
 194909 194910 spyM18_0039 spyM18_0040 ruvB   FALSE 0.083 138.000 0.005 1.000 N NA
 194910 194911 spyM18_0040 spyM18_0041     TRUE 0.832 23.000 0.019 NA   NA
 194911 194912 spyM18_0041 spyM18_0042     TRUE 0.981 -3.000 0.351 NA   NA
 194912 194913 spyM18_0042 spyM18_0043   adhE FALSE 0.008 309.000 0.000 1.000 N NA
 194913 194914 spyM18_0043 spyM18_0045 adhE adhP TRUE 0.540 252.000 0.012 0.002   NA
 194914 194915 spyM18_0045 spyM18_0048 adhP   FALSE 0.015 388.000 0.000 1.000   NA
 194915 194916 spyM18_0048 spyM18_0049   rpsJ FALSE 0.023 199.000 0.000 1.000 N NA
 194916 194917 spyM18_0049 spyM18_0050 rpsJ rplC TRUE 0.833 248.000 0.467 0.042 Y NA
 194917 194918 spyM18_0050 spyM18_0051 rplC rplD TRUE 0.996 24.000 0.544 0.031 Y NA
 194918 194919 spyM18_0051 spyM18_0052 rplD rplW TRUE 0.996 0.000 0.307 0.031 Y NA
 194919 194920 spyM18_0052 spyM18_0053 rplW rplB TRUE 0.998 18.000 0.849 0.038 Y NA
 194920 194921 spyM18_0053 spyM18_0054 rplB rpsS TRUE 0.966 139.000 0.820 0.042 Y NA
 194921 194922 spyM18_0054 spyM18_0056 rpsS rplV TRUE 0.998 16.000 0.769 0.042 Y NA
 194922 194923 spyM18_0056 spyM18_0057 rplV rpsC TRUE 0.998 13.000 0.719 0.042 Y NA
 194923 194924 spyM18_0057 spyM18_0058 rpsC rplP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.042 Y NA
 194924 194925 spyM18_0058 spyM18_0060 rplP rpmC TRUE 0.998 10.000 0.802 0.031 Y NA
 194925 194926 spyM18_0060 spyM18_0061 rpmC rpsQ TRUE 0.997 26.000 0.828 0.031 Y NA
 194926 194927 spyM18_0061 spyM18_0062 rpsQ rplN TRUE 0.997 25.000 0.791 0.042 Y NA
 194927 194928 spyM18_0062 spyM18_0063 rplN rplX TRUE 0.985 79.000 0.810 0.042 Y NA
 194928 194929 spyM18_0063 spyM18_0064 rplX rplE TRUE 0.997 24.000 0.758 0.031 Y NA
 194929 194930 spyM18_0064 spyM18_0065 rplE rpsN TRUE 0.997 16.000 0.496 0.031 Y NA
 194930 194931 spyM18_0065 spyM18_0066 rpsN rpsH TRUE 0.936 151.000 0.473 0.031 Y NA
 194931 194932 spyM18_0066 spyM18_0067 rpsH rplF TRUE 0.945 203.000 0.808 0.031 Y NA
 194932 194933 spyM18_0067 spyM18_0068 rplF rplR TRUE 0.980 105.000 0.815 0.031 Y NA
 194933 194934 spyM18_0068 spyM18_0069 rplR rpsE TRUE 0.998 19.000 0.814 0.042 Y NA
 194934 194935 spyM18_0069 spyM18_0071 rpsE rpmD TRUE 0.998 15.000 0.789 0.042 Y NA
 194935 194936 spyM18_0071 spyM18_0072 rpmD rplO TRUE 0.944 215.000 0.653 0.005 Y NA
 194936 194937 spyM18_0072 spyM18_0073 rplO secY TRUE 0.975 17.000 0.730 1.000 N NA
 194937 194938 spyM18_0073 spyM18_0074 secY adk FALSE 0.360 150.000 0.241 1.000 N NA
 194938 194939 spyM18_0074 spyM18_0075 adk infA FALSE 0.205 118.000 0.059 1.000 N NA
 194939 194940 spyM18_0075 spyM18_0076 infA rpmJ TRUE 0.904 26.000 0.067 1.000 Y NA
 194940 194941 spyM18_0076 spyM18_0077 rpmJ rpsM TRUE 0.988 18.000 0.086 0.031 Y NA
 194941 194942 spyM18_0077 spyM18_0078 rpsM rpsK TRUE 0.998 18.000 0.810 0.031 Y NA
 194942 194943 spyM18_0078 spyM18_0079 rpsK rpoA TRUE 0.823 46.000 0.308 1.000 N NA
 194943 194944 spyM18_0079 spyM18_0080 rpoA rplQ TRUE 0.981 15.000 0.873 1.000 N NA
 194944 2155618 spyM18_0080 spyM18_r05 rplQ   FALSE 0.014 825.000 0.000 NA   NA
 2155618 3820256 spyM18_r05 spyM18_t29     TRUE 0.514 50.000 0.000 NA   NA
 3820256 407380 spyM18_t29 spyM18_r06   rrl FALSE 0.047 299.000 0.000 NA   NA
 407380 196114 spyM18_r06 spyM18_15 rrl   FALSE 0.307 87.000 0.000 NA   NA
 196114 3820257 spyM18_15 spyM18_t30     TRUE 0.781 18.000 0.000 NA   NA
 3820257 3820258 spyM18_t30 spyM18_t31     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 3820258 3820259 spyM18_t31 spyM18_t32     TRUE 0.642 35.000 0.000 NA   NA
 3820259 3820260 spyM18_t32 spyM18_t66     TRUE 0.740 23.000 0.000 NA   NA
 3820260 3820261 spyM18_t66 spyM18_t65     TRUE 0.800 11.000 0.000 NA   NA
 3820261 3820263 spyM18_t65 spyM18_t33     TRUE 0.797 10.000 0.000 NA   NA
 3820263 3820264 spyM18_t33 spyM18_t34     TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 3820264 3820265 spyM18_t34 spyM18_t35     TRUE 0.770 20.000 0.000 NA   NA
 3820265 3820266 spyM18_t35 spyM18_t36     TRUE 0.803 7.000 0.000 NA   NA
 3820266 3820267 spyM18_t36 spyM18_t37     TRUE 0.801 12.000 0.000 NA   NA
 3820267 3820268 spyM18_t37 spyM18_t38     TRUE 0.800 9.000 0.000 NA   NA
 3820268 3820269 spyM18_t38 spyM18_t39     TRUE 0.770 20.000 0.000 NA   NA
 3820269 194946 spyM18_t39 spyM18_0085     FALSE 0.064 260.000 0.000 NA   NA
 194946 194947 spyM18_0085 spyM18_0092   adcR FALSE 0.012 1323.000 0.000 NA   NA
 194947 194948 spyM18_0092 spyM18_0093 adcR adrC TRUE 0.904 4.000 0.192 1.000 N NA
 194948 194949 spyM18_0093 spyM18_0094 adrC adrB TRUE 0.995 -7.000 0.673 1.000 Y NA
 194950 194951 spyM18_0095 spyM18_0096   tyrS FALSE 0.255 56.000 0.004 1.000 N NA
 194952 194953 spyM18_0098 spyM18_0099 pbp ropB FALSE 0.012 264.000 0.000 1.000 N NA
 194953 194954 spyM18_0099 spyM18_0100 ropB ropC TRUE 0.991 91.000 0.851 0.002 Y NA
 194954 194955 spyM18_0100 spyM18_0101 ropC   FALSE 0.215 152.000 0.007 NA   NA
 194955 194956 spyM18_0101 spyM18_0102     TRUE 0.503 92.000 0.083 NA   NA
 194956 194957 spyM18_0102 spyM18_0103     TRUE 0.995 -121.000 0.639 1.000 Y NA
 194957 194958 spyM18_0103 spyM18_0105     TRUE 0.999 2.000 0.861 0.002 Y NA
 194958 194959 spyM18_0105 spyM18_0106     TRUE 0.982 -25.000 0.110 NA Y NA
 194959 194960 spyM18_0106 spyM18_0107     TRUE 0.988 5.000 0.786 NA   NA
 194960 194961 spyM18_0107 spyM18_0108     TRUE 0.977 -7.000 0.250 NA   NA
 194961 194962 spyM18_0108 spyM18_0109     TRUE 0.977 -16.000 0.232 NA   NA
 194962 194963 spyM18_0109 spyM18_0110     FALSE 0.485 98.000 0.087 NA   NA
 194963 194964 spyM18_0110 spyM18_0111     TRUE 0.546 59.000 0.130 1.000 N NA
 194964 194965 spyM18_0111 spyM18_0112     FALSE 0.123 187.000 0.000 NA   NA
 194966 194967 spyM18_0113 spyM18_0115     FALSE 0.477 48.000 0.041 1.000 N NA
 194968 194969 spyM18_0116 spyM18_0117 tra   TRUE 0.792 14.000 0.000 NA   NA
 194969 194970 spyM18_0117 spyM18_0118   trxA TRUE 0.957 -3.000 0.140 NA   NA
 194970 194971 spyM18_0118 spyM18_0119 trxA pheT1 TRUE 0.963 -3.000 0.239 1.000   NA
 194971 194972 spyM18_0119 spyM18_0120 pheT1 ssb FALSE 0.191 152.000 0.034 1.000   NA
 194973 194974 spyM18_0121 spyM18_0122     TRUE 0.578 20.000 0.005 1.000 N NA
 194974 194975 spyM18_0122 spyM18_0123     TRUE 0.858 -13.000 0.034 1.000 N NA
 194975 194976 spyM18_0123 spyM18_0125   nra.1 FALSE 0.017 1008.000 0.003 NA   NA
 194977 194978 spyM18_0126 spyM18_0127 cbp lepA TRUE 0.945 -7.000 0.061 NA   NA
 194978 194979 spyM18_0127 spyM18_0128 lepA   TRUE 0.876 21.000 0.061 NA   NA
 194979 194980 spyM18_0128 spyM18_0129     TRUE 0.983 1.000 0.500 NA   NA
 194980 194981 spyM18_0129 spyM18_0130     TRUE 0.990 17.000 1.000 NA   NA
 194987 194988 spyM18_0136 spyM18_0137     TRUE 0.948 12.000 0.100 1.000 Y NA
 194988 194989 spyM18_0137 spyM18_0138     TRUE 0.996 3.000 0.200 0.003 Y NA
 194991 194992 spyM18_0141 spyM18_0142     TRUE 0.642 37.000 0.016 NA N NA
 194992 194993 spyM18_0142 spyM18_0143     FALSE 0.023 455.000 0.000 NA   NA
 194993 194994 spyM18_0143 spyM18_0144     TRUE 0.890 -10.000 0.000 NA   NA
 194994 194995 spyM18_0144 spyM18_0145     TRUE 0.998 2.000 0.848 0.010   NA
 194995 194996 spyM18_0145 spyM18_0146     TRUE 0.910 68.000 0.045 0.004   NA
 194996 194997 spyM18_0146 spyM18_0147     TRUE 0.986 16.000 0.097 0.004   NA
 194997 194998 spyM18_0147 spyM18_0148     TRUE 0.999 -3.000 0.487 0.002 Y NA
 194998 194999 spyM18_0148 spyM18_0150     TRUE 0.921 201.000 0.462 0.010 Y NA
 194999 195000 spyM18_0150 spyM18_0151     TRUE 0.999 1.000 0.776 0.010 Y NA
 195000 195001 spyM18_0151 spyM18_0153     TRUE 0.988 45.000 0.238 0.004 Y NA
 195002 195003 spyM18_0154 spyM18_0155     TRUE 0.988 13.000 0.818 NA   NA
 195004 195005 spyM18_0156 spyM18_0158     FALSE 0.227 329.000 0.000 0.019   NA
 195005 195006 spyM18_0158 spyM18_0159     FALSE 0.080 173.000 0.000 1.000   NA
 195006 195007 spyM18_0159 spyM18_0163   nga FALSE 0.016 372.000 0.000 1.000   NA
 195007 195008 spyM18_0163 spyM18_0164 nga   TRUE 0.510 134.000 0.286 1.000   NA
 195008 195009 spyM18_0164 spyM18_0165   slo TRUE 0.890 15.000 0.125 1.000   NA
 195010 195011 spyM18_0166 spyM18_0167     FALSE 0.025 417.000 0.000 NA   NA
 195011 195012 spyM18_0167 spyM18_0168     FALSE 0.127 185.000 0.000 NA   NA
 195013 195014 spyM18_0170 spyM18_0171   leuS FALSE 0.020 209.000 0.000 1.000 N NA
 195014 195015 spyM18_0171 spyM18_0173 leuS   FALSE 0.024 307.000 0.000 1.000   NA
 195015 195016 spyM18_0173 spyM18_0174     TRUE 0.960 71.000 0.431 0.023   NA
 195016 195017 spyM18_0174 spyM18_0175     TRUE 0.933 123.000 0.279 0.017 Y NA
 195017 195018 spyM18_0175 spyM18_0176     TRUE 0.813 91.000 0.328 1.000 Y NA
 195018 195019 spyM18_0176 spyM18_0177     TRUE 0.994 -49.000 0.536 1.000 Y NA
 195019 195020 spyM18_0177 spyM18_0178     TRUE 0.995 -61.000 0.700 1.000 Y NA
 195020 195021 spyM18_0178 spyM18_0179     FALSE 0.085 328.000 0.200 1.000 N NA
 195021 195022 spyM18_0179 spyM18_0180     FALSE 0.273 253.000 0.231 NA   NA
 195022 195023 spyM18_0180 spyM18_0181     FALSE 0.021 490.000 0.000 NA   NA
 195023 195024 spyM18_0181 spyM18_0182     TRUE 0.989 16.000 0.177 0.086 Y NA
 195024 195025 spyM18_0182 spyM18_0184     FALSE 0.081 131.000 0.003 1.000 N NA
 195025 195026 spyM18_0184 spyM18_0185     FALSE 0.161 187.000 0.005 NA   NA
 195026 195027 spyM18_0185 spyM18_0186     TRUE 0.594 52.000 0.010 NA   NA
 195029 195030 spyM18_0189 spyM18_0191 tgt   FALSE 0.073 218.000 0.004 1.000   NA
 195030 195031 spyM18_0191 spyM18_0193     TRUE 0.894 4.000 0.039 NA   NA
 195031 195032 spyM18_0193 spyM18_0195     FALSE 0.295 139.000 0.033 NA   NA
 195032 195033 spyM18_0195 spyM18_0196     TRUE 0.980 0.000 0.013 0.022   NA
 195034 195035 spyM18_0197 spyM18_0199     FALSE 0.012 461.000 0.000 NA N NA
 195036 195037 spyM18_0201 spyM18_0202 speG   FALSE 0.315 85.000 0.000 NA   NA
 195037 195038 spyM18_0202 spyM18_0204   pgi FALSE 0.070 252.000 0.000 NA   NA
 195041 195042 spyM18_0210 spyM18_0212 hasC2 gpdA FALSE 0.462 33.000 0.007 1.000 N NA
 195043 195044 spyM18_0213 spyM18_0214     TRUE 0.895 -7.000 0.080 1.000 N NA
 195044 195045 spyM18_0214 spyM18_0215     TRUE 0.999 3.000 0.720 0.009 Y NA
 195045 195046 spyM18_0215 spyM18_0218     FALSE 0.299 118.000 0.010 NA   NA
 195046 195047 spyM18_0218 spyM18_0219   dut FALSE 0.302 110.000 0.005 NA   NA
 195047 195048 spyM18_0219 spyM18_0220 dut radA FALSE 0.253 81.000 0.028 1.000 N NA
 195048 195049 spyM18_0220 spyM18_0221 radA   FALSE 0.062 188.000 0.009 1.000 N NA
 195049 195050 spyM18_0221 spyM18_0222     TRUE 0.585 131.000 0.278 NA   NA
 195050 195051 spyM18_0222 spyM18_0223   gluS FALSE 0.181 182.000 0.008 NA   NA
 195051 195052 spyM18_0223 spyM18_0224 gluS   FALSE 0.005 394.000 0.000 1.000 N NA
 195052 195053 spyM18_0224 spyM18_0226     TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA Y NA
 195053 195054 spyM18_0226 spyM18_0227     TRUE 0.991 4.000 0.571 NA Y NA
 195054 195055 spyM18_0227 spyM18_0228   rnpA FALSE 0.003 540.000 0.000 1.000 N NA
 195055 195056 spyM18_0228 spyM18_0229 rnpA   TRUE 0.879 -34.000 0.052 1.000 N NA
 195056 195057 spyM18_0229 spyM18_0230     TRUE 0.886 12.000 0.106 1.000   NA
 195057 195058 spyM18_0230 spyM18_0232   rpmH FALSE 0.031 315.000 0.002 1.000   NA
 195058 195059 spyM18_0232 spyM18_0233 rpmH   FALSE 0.031 274.000 0.000 1.000   NA
 195059 195060 spyM18_0233 spyM18_0234     TRUE 0.950 49.000 0.500 1.000 Y NA
 195060 195061 spyM18_0234 spyM18_0236     TRUE 0.889 105.000 0.133 0.042 Y NA
 195061 195062 spyM18_0236 spyM18_0237     TRUE 0.998 13.000 1.000 0.042 Y NA
 195062 195063 spyM18_0237 spyM18_0238     TRUE 0.974 20.000 0.250 NA Y NA
 195063 195064 spyM18_0238 spyM18_0239     TRUE 0.900 44.000 0.300 NA   NA
 195064 195065 spyM18_0239 spyM18_0240     TRUE 0.979 12.000 0.500 NA   NA
 195065 195066 spyM18_0240 spyM18_0241     TRUE 0.797 22.000 0.108 1.000 N NA
 195068 195069 spyM18_0243 spyM18_0244     TRUE 0.975 -7.000 0.058 NA Y NA
 195069 195070 spyM18_0244 spyM18_0246   ksgA FALSE 0.267 114.000 0.093 1.000 N NA
 195070 195071 spyM18_0246 spyM18_0247 ksgA   FALSE 0.019 423.000 0.003 1.000   NA
 195071 195072 spyM18_0247 spyM18_0248     TRUE 0.931 10.000 0.213 1.000   NA
 195072 195073 spyM18_0248 spyM18_0249     TRUE 0.935 -7.000 0.166 1.000 N NA
 195073 195074 spyM18_0249 spyM18_0250     TRUE 0.897 2.000 0.030 NA   NA
 195074 195075 spyM18_0250 spyM18_0251     TRUE 0.938 -10.000 0.030 NA   NA
 195077 195078 spyM18_0255 spyM18_0256 purR   TRUE 0.931 -9.000 0.017 NA   NA
 195078 195079 spyM18_0256 spyM18_0258   rpsL FALSE 0.153 208.000 0.012 NA   NA
 195079 195080 spyM18_0258 spyM18_0259 rpsL rpsG TRUE 0.995 21.000 0.224 0.006 Y NA
 195080 195081 spyM18_0259 spyM18_0260 rpsG fusA FALSE 0.399 368.000 0.579 1.000 Y NA
 195081 195082 spyM18_0260 spyM18_0261 fusA gapA FALSE 0.007 347.000 0.000 1.000 N NA
 195083 195084 spyM18_0262 spyM18_0263     FALSE 0.287 142.000 0.032 NA   NA
 195084 195085 spyM18_0263 spyM18_0264     TRUE 0.995 -7.000 0.758 1.000 Y NA
 195086 195087 spyM18_0265 spyM18_0268     TRUE 0.669 66.000 0.118 NA   NA
 195087 195088 spyM18_0268 spyM18_0269     FALSE 0.318 146.000 0.132 NA N NA
 195088 195089 spyM18_0269 spyM18_0270   rgpG TRUE 0.946 7.000 0.267 NA N NA
 195089 195090 spyM18_0270 spyM18_0273 rgpG   FALSE 0.128 122.000 0.013 1.000 N NA
 195090 195091 spyM18_0273 spyM18_0275     TRUE 0.667 95.000 0.139 1.000 Y NA
 195091 195092 spyM18_0275 spyM18_0276     TRUE 0.945 31.000 0.606 1.000 N NA
 195092 195093 spyM18_0276 spyM18_0277     TRUE 0.966 -13.000 0.292 1.000 N NA
 195093 195094 spyM18_0277 spyM18_0278     TRUE 0.994 -7.000 0.152 0.002 N NA
 195095 195096 spyM18_0279 spyM18_0280   dacA TRUE 0.925 168.000 0.231 0.002 Y NA
 195097 195098 spyM18_0281 spyM18_0282 oppA oppB TRUE 0.964 65.000 0.273 0.042 Y NA
 195098 195099 spyM18_0282 spyM18_0283 oppB oppC TRUE 0.998 0.000 0.556 0.042 Y NA
 195099 195100 spyM18_0283 spyM18_0284 oppC oppD TRUE 0.989 9.000 0.650 1.000 Y NA
 195100 195101 spyM18_0284 spyM18_0285 oppD oppF TRUE 0.997 -7.000 0.095 0.001 Y NA
 195101 2155619 spyM18_0285 spyM18_r07 oppF   FALSE 0.013 987.000 0.000 NA   NA
 2155619 3820270 spyM18_r07 spyM18_t40     TRUE 0.514 50.000 0.000 NA   NA
 3820270 407381 spyM18_t40 spyM18_r08   rrl FALSE 0.047 299.000 0.000 NA   NA
 407381 196202 spyM18_r08 spyM18_16 rrl   FALSE 0.307 87.000 0.000 NA   NA
 196202 3820271 spyM18_16 spyM18_t41     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 3820271 3820272 spyM18_t41 spyM18_t42     FALSE 0.340 80.000 0.000 NA   NA
 3820272 195102 spyM18_t42 spyM18_0300     TRUE 0.881 -4.000 0.000 NA   NA
 195102 195103 spyM18_0300 spyM18_0301     FALSE 0.011 502.000 0.000 1.000   NA
 195103 195104 spyM18_0301 spyM18_0302     TRUE 0.981 0.000 0.555 1.000   NA
 195104 195105 spyM18_0302 spyM18_0303     TRUE 0.858 25.000 0.068 NA   NA
 195105 195106 spyM18_0303 spyM18_0304     TRUE 0.621 69.000 0.150 NA N NA
 195106 195107 spyM18_0304 spyM18_0305     TRUE 0.979 -3.000 0.199 1.000 Y NA
 195107 195108 spyM18_0305 spyM18_0306     TRUE 0.904 24.000 0.149 NA   NA
 195108 195109 spyM18_0306 spyM18_0308     TRUE 0.933 0.000 0.085 NA   NA
 195109 195110 spyM18_0308 spyM18_0309     FALSE 0.162 254.000 0.094 NA   NA
 195110 195111 spyM18_0309 spyM18_0311     FALSE 0.028 481.000 0.003 NA   NA
 195111 195112 spyM18_0311 spyM18_0312     FALSE 0.108 203.000 0.000 NA   NA
 195112 195113 spyM18_0312 spyM18_0314     FALSE 0.022 328.000 0.000 NA N NA
 195113 195114 spyM18_0314 spyM18_0315     FALSE 0.177 250.000 0.000 NA Y NA
 195114 195115 spyM18_0315 spyM18_0316     TRUE 0.995 1.000 0.938 1.000 Y NA
 195118 195119 spyM18_0320 spyM18_0321     TRUE 0.998 10.000 0.490 0.004 Y NA
 195119 195120 spyM18_0321 spyM18_0323   gidB FALSE 0.212 70.000 0.006 1.000 N NA
 195121 195122 spyM18_0324 spyM18_0325 lemA htpX TRUE 0.856 47.000 0.222 NA   NA
 195122 195123 spyM18_0325 spyM18_0326 htpX   FALSE 0.101 234.000 0.002 NA   NA
 195123 195124 spyM18_0326 spyM18_0328   covR FALSE 0.094 267.000 0.014 NA   NA
 195124 195125 spyM18_0328 spyM18_0329 covR covS TRUE 0.995 6.000 0.438 0.084 Y NA
 195125 195126 spyM18_0329 spyM18_0330 covS   FALSE 0.084 215.000 0.007 NA N NA
 195126 195127 spyM18_0330 spyM18_0331     TRUE 0.944 -16.000 0.109 NA N NA
 195127 195128 spyM18_0331 spyM18_0332     TRUE 0.992 22.000 0.817 NA Y NA
 195128 195129 spyM18_0332 spyM18_0334     FALSE 0.398 63.000 0.008 1.000   NA
 195129 195130 spyM18_0334 spyM18_0335   snf FALSE 0.080 210.000 0.004 1.000   NA
 195131 195132 spyM18_0336 spyM18_0338 int   FALSE 0.163 311.000 0.000 0.076   NA
 195132 195133 spyM18_0338 spyM18_0339     TRUE 0.800 11.000 0.000 NA   NA
 195133 195134 spyM18_0339 spyM18_0340     TRUE 0.812 4.000 0.000 NA   NA
 195135 195136 spyM18_0341 spyM18_0342     TRUE 0.642 35.000 0.000 NA   NA
 195136 195137 spyM18_0342 spyM18_0343     TRUE 0.902 74.000 0.667 NA   NA
 195137 195138 spyM18_0343 spyM18_0344     FALSE 0.017 672.000 0.000 NA   NA
 195138 195139 spyM18_0344 spyM18_0345     TRUE 0.971 14.000 0.400 NA   NA
 195139 195140 spyM18_0345 spyM18_0346     FALSE 0.283 93.000 0.000 NA   NA
 195140 195141 spyM18_0346 spyM18_0348     FALSE 0.048 296.000 0.000 NA   NA
 195141 195142 spyM18_0348 spyM18_0349     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 195142 195143 spyM18_0349 spyM18_0350     TRUE 0.844 0.000 0.000 NA   NA
 195143 195144 spyM18_0350 spyM18_0351     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195144 195145 spyM18_0351 spyM18_0352     TRUE 0.890 -10.000 0.000 NA   NA
 195145 195146 spyM18_0352 spyM18_0353     TRUE 0.983 17.000 0.667 NA   NA
 195146 195147 spyM18_0353 spyM18_0355     FALSE 0.148 164.000 0.000 NA   NA
 195147 195148 spyM18_0355 spyM18_0356     TRUE 0.890 -10.000 0.000 NA   NA
 195148 195149 spyM18_0356 spyM18_0357     TRUE 0.808 5.000 0.000 NA   NA
 195149 195150 spyM18_0357 spyM18_0358     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195150 195151 spyM18_0358 spyM18_0359   ssb TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195151 195152 spyM18_0359 spyM18_0360 ssb   FALSE 0.010 293.000 0.000 1.000 N NA
 195152 195153 spyM18_0360 spyM18_0361     TRUE 0.711 3.000 0.000 NA N NA
 195153 195154 spyM18_0361 spyM18_0362     TRUE 0.789 15.000 0.000 NA   NA
 195154 195155 spyM18_0362 spyM18_0363     FALSE 0.087 160.000 0.000 1.000   NA
 195155 195156 spyM18_0363 spyM18_0364     FALSE 0.157 154.000 0.000 NA   NA
 195156 195157 spyM18_0364 spyM18_0365     FALSE 0.455 58.000 0.000 NA   NA
 195157 195158 spyM18_0365 spyM18_0366     TRUE 0.706 26.000 0.000 NA   NA
 195158 195159 spyM18_0366 spyM18_0367     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 195159 195160 spyM18_0367 spyM18_0368     TRUE 0.592 142.000 0.312 NA   NA
 195160 195161 spyM18_0368 spyM18_0369     TRUE 0.971 13.000 0.385 NA   NA
 195161 195162 spyM18_0369 spyM18_0370     FALSE 0.032 368.000 0.000 NA   NA
 195162 195163 spyM18_0370 spyM18_0371     TRUE 0.894 -19.000 0.000 NA   NA
 195163 195164 spyM18_0371 spyM18_0372     TRUE 0.785 17.000 0.000 NA   NA
 195164 195165 spyM18_0372 spyM18_0373     TRUE 0.792 14.000 0.000 NA   NA
 195165 195166 spyM18_0373 spyM18_0374     TRUE 0.844 0.000 0.000 NA   NA
 195166 195167 spyM18_0374 spyM18_0375     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 195167 195168 spyM18_0375 spyM18_0376     TRUE 0.975 2.000 0.375 NA   NA
 195168 195169 spyM18_0376 spyM18_0378     TRUE 0.987 -7.000 0.444 NA   NA
 195169 195170 spyM18_0378 spyM18_0379     TRUE 0.983 12.000 0.615 NA   NA
 195170 195171 spyM18_0379 spyM18_0380     TRUE 0.669 93.000 0.231 NA   NA
 195171 195172 spyM18_0380 spyM18_0382     FALSE 0.084 226.000 0.000 NA   NA
 195172 195173 spyM18_0382 spyM18_0383     TRUE 0.676 13.000 0.000 1.000   NA
 195173 195174 spyM18_0383 spyM18_0384     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195174 195175 spyM18_0384 spyM18_0385   hylP TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195175 195176 spyM18_0385 spyM18_0386 hylP   TRUE 0.797 10.000 0.000 NA   NA
 195176 195177 spyM18_0386 spyM18_0387     TRUE 0.801 12.000 0.000 NA   NA
 195177 195178 spyM18_0387 spyM18_0388     TRUE 0.817 3.000 0.000 NA   NA
 195178 195179 spyM18_0388 spyM18_0389     TRUE 0.801 12.000 0.000 NA   NA
 195179 195180 spyM18_0389 spyM18_0390     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 195180 195181 spyM18_0390 spyM18_0391     FALSE 0.217 119.000 0.000 NA   NA
 195183 195184 spyM18_0394 spyM18_0396     FALSE 0.042 309.000 0.000 NA   NA
 195184 195185 spyM18_0396 spyM18_0398     TRUE 0.710 40.000 0.013 NA   NA
 195185 195186 spyM18_0398 spyM18_0399     TRUE 0.565 46.000 0.014 1.000   NA
 195186 195187 spyM18_0399 spyM18_0401     FALSE 0.460 118.000 0.120 NA   NA
 195187 195188 spyM18_0401 spyM18_0402     TRUE 0.864 25.000 0.079 NA   NA
 195189 195190 spyM18_0404 spyM18_0405     FALSE 0.463 82.000 0.154 1.000 N NA
 195191 195192 spyM18_0406 spyM18_0407     TRUE 0.673 39.000 0.043 1.000   NA
 195192 195193 spyM18_0407 spyM18_0408     TRUE 0.920 15.000 0.123 NA   NA
 195193 195194 spyM18_0408 spyM18_0409     FALSE 0.134 178.000 0.000 NA   NA
 195194 195195 spyM18_0409 spyM18_0411     FALSE 0.201 178.000 0.014 NA   NA
 195195 195196 spyM18_0411 spyM18_0412     TRUE 0.830 -3.000 0.034 1.000 N NA
 195196 195197 spyM18_0412 spyM18_0413     TRUE 0.937 -21.000 0.085 1.000   NA
 195197 195198 spyM18_0413 spyM18_0414     TRUE 0.912 -3.000 0.065 1.000   NA
 195198 195199 spyM18_0414 spyM18_0415     TRUE 0.931 -3.000 0.111 1.000   NA
 195199 195200 spyM18_0415 spyM18_0416     TRUE 0.901 0.000 0.017 NA   NA
 195200 195201 spyM18_0416 spyM18_0417     TRUE 0.989 -3.000 0.570 NA   NA
 195201 195202 spyM18_0417 spyM18_0418     TRUE 0.577 97.000 0.224 NA N NA
 195202 195203 spyM18_0418 spyM18_0419     TRUE 0.916 -3.000 0.014 NA   NA
 195203 195204 spyM18_0419 spyM18_0421     FALSE 0.295 89.000 0.000 NA   NA
 195204 195205 spyM18_0421 spyM18_0424     FALSE 0.037 144.000 0.000 1.000 N NA
 195207 195208 spyM18_0427 spyM18_0428     TRUE 0.985 2.000 0.600 NA   NA
 195208 195209 spyM18_0428 spyM18_0430     FALSE 0.067 293.000 0.050 1.000   NA
 195209 195210 spyM18_0430 spyM18_0431     TRUE 0.933 39.000 0.408 NA   NA
 195210 195211 spyM18_0431 spyM18_0432   hylX FALSE 0.293 133.000 0.023 NA   NA
 195211 195212 spyM18_0432 spyM18_0433 hylX   TRUE 0.882 6.000 0.028 NA   NA
 195212 195213 spyM18_0433 spyM18_0434     FALSE 0.134 131.000 0.023 1.000 N NA
 195213 195214 spyM18_0434 spyM18_0435     FALSE 0.482 76.000 0.015 NA   NA
 195215 195216 spyM18_0436 spyM18_0437 fhuG fhuB TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.040 Y NA
 195216 195217 spyM18_0437 spyM18_0438 fhuB fhuD TRUE 0.981 -10.000 0.179 1.000 Y NA
 195217 195218 spyM18_0438 spyM18_0439 fhuD fhuC TRUE 0.988 26.000 0.889 1.000 Y NA
 195218 195219 spyM18_0439 spyM18_0440 fhuC murE FALSE 0.070 246.000 0.062 1.000 N NA
 195220 195221 spyM18_0442 spyM18_0443   upp FALSE 0.114 167.000 0.002 1.000   NA
 195221 195222 spyM18_0443 spyM18_0444 upp   TRUE 0.895 -31.000 0.000 NA   NA
 195222 195223 spyM18_0444 spyM18_0446   clpP FALSE 0.213 121.000 0.000 NA   NA
 195223 195224 spyM18_0446 spyM18_0447 clpP   FALSE 0.046 495.000 0.065 NA   NA
 195224 195225 spyM18_0447 spyM18_0449   tdk FALSE 0.071 249.000 0.000 NA   NA
 195225 195226 spyM18_0449 spyM18_0450 tdk   TRUE 0.915 18.000 0.254 1.000 N NA
 195226 195227 spyM18_0450 spyM18_0451     TRUE 0.965 19.000 0.372 NA   NA
 195229 195230 spyM18_0455 spyM18_0456     TRUE 0.893 5.000 0.043 NA   NA
 195230 195231 spyM18_0456 spyM18_0457     TRUE 0.762 27.000 0.005 NA   NA
 195235 195236 spyM18_0462 spyM18_0464     FALSE 0.033 267.000 0.000 1.000   NA
 195236 195237 spyM18_0464 spyM18_0467     FALSE 0.015 769.000 0.000 NA   NA
 195237 195238 spyM18_0467 spyM18_0468   metS FALSE 0.075 243.000 0.000 NA   NA
 195238 195239 spyM18_0468 spyM18_0470 metS nrdF FALSE 0.004 494.000 0.000 1.000 N NA
 195239 195240 spyM18_0470 spyM18_0471 nrdF nrdI TRUE 0.992 4.000 0.643 NA Y NA
 195240 195241 spyM18_0471 spyM18_0472 nrdI   TRUE 0.998 -33.000 1.000 NA Y NA
 195243 195244 spyM18_0477 spyM18_0479     FALSE 0.025 415.000 0.000 NA   NA
 195246 195247 spyM18_0482 spyM18_0483     TRUE 0.993 -7.000 0.710 NA   NA
 195247 195248 spyM18_0483 spyM18_0484     FALSE 0.469 76.000 0.067 1.000   NA
 195248 195249 spyM18_0484 spyM18_0485   glpT FALSE 0.020 333.000 0.000 1.000   NA
 195249 195250 spyM18_0485 spyM18_0486 glpT glmU FALSE 0.055 173.000 0.002 1.000 N NA
 195250 195251 spyM18_0486 spyM18_0487 glmU   TRUE 0.519 34.000 0.015 1.000 N NA
 195251 195252 spyM18_0487 spyM18_0489     TRUE 0.906 0.000 0.025 NA   NA
 195252 195253 spyM18_0489 spyM18_0490   pfs TRUE 0.869 20.000 0.041 NA   NA
 195253 195254 spyM18_0490 spyM18_0491 pfs   FALSE 0.163 151.000 0.000 NA   NA
 195256 195257 spyM18_0494 spyM18_0496 mtsA mtsB TRUE 0.787 64.000 0.135 1.000 Y NA
 195257 195258 spyM18_0496 spyM18_0498 mtsB mtsC TRUE 0.962 1.000 0.130 1.000 Y NA
 195262 195263 spyM18_0503 spyM18_0504 rl11 rl1 TRUE 0.979 106.000 0.838 0.038 Y NA
 195263 195264 spyM18_0504 spyM18_0505 rl1 pyrH FALSE 0.014 322.000 0.002 1.000 N NA
 195264 195265 spyM18_0505 spyM18_0506 pyrH rrf TRUE 0.949 29.000 0.626 1.000 N NA
 195265 195266 spyM18_0506 spyM18_0507 rrf   FALSE 0.236 109.000 0.012 1.000   NA
 195266 195267 spyM18_0507 spyM18_0509   msrA FALSE 0.377 73.000 0.016 1.000   NA
 195267 195268 spyM18_0509 spyM18_0510 msrA   TRUE 0.919 -3.000 0.080 1.000   NA
 195268 195269 spyM18_0510 spyM18_0511     FALSE 0.172 156.000 0.023 1.000   NA
 195269 195270 spyM18_0511 spyM18_0512     FALSE 0.040 315.000 0.000 NA   NA
 195270 195271 spyM18_0512 spyM18_0513   phoH FALSE 0.194 159.000 0.004 NA   NA
 195271 195272 spyM18_0513 spyM18_0514 phoH   TRUE 0.515 46.000 0.005 NA N NA
 195272 195273 spyM18_0514 spyM18_0515     FALSE 0.192 159.000 0.003 NA   NA
 195273 195274 spyM18_0515 spyM18_0516     TRUE 0.942 -25.000 0.035 NA   NA
 195274 195275 spyM18_0516 spyM18_0517   era FALSE 0.295 120.000 0.063 1.000   NA
 195275 195276 spyM18_0517 spyM18_0518 era   TRUE 0.743 20.000 0.007 1.000   NA
 195278 195279 spyM18_0536 spyM18_0538 tra   FALSE 0.004 441.000 0.000 1.000 N NA
 195279 195280 spyM18_0538 spyM18_0539     TRUE 0.974 1.000 0.222 1.000 Y NA
 195281 195282 spyM18_0540 spyM18_0542     FALSE 0.054 859.000 0.250 1.000   NA
 195282 195283 spyM18_0542 spyM18_0543     TRUE 0.941 11.000 0.250 1.000   NA
 195284 195285 spyM18_0544 spyM18_0545     TRUE 0.966 13.000 0.333 NA   NA
 195285 195286 spyM18_0545 spyM18_0547     FALSE 0.033 361.000 0.000 NA   NA
 195286 195287 spyM18_0547 spyM18_0548     FALSE 0.013 1182.000 0.000 NA   NA
 195287 195288 spyM18_0548 spyM18_0549     TRUE 0.574 45.000 0.000 NA   NA
 195290 195291 spyM18_0551 spyM18_0554     FALSE 0.015 763.000 0.000 NA   NA
 195291 195292 spyM18_0554 spyM18_0555     FALSE 0.117 172.000 0.004 1.000   NA
 195292 195293 spyM18_0555 spyM18_0556     TRUE 0.869 -3.000 0.066 1.000 N NA
 195293 195294 spyM18_0556 spyM18_0558     FALSE 0.068 190.000 0.000 1.000   NA
 195294 195295 spyM18_0558 spyM18_0559   proP FALSE 0.152 146.000 0.007 1.000   NA
 195295 195296 spyM18_0559 spyM18_0561 proP   FALSE 0.380 189.000 0.007 0.063 N NA
 195296 195297 spyM18_0561 spyM18_0562   vacB FALSE 0.275 94.000 0.064 1.000 N NA
 195297 195298 spyM18_0562 spyM18_0563 vacB smpB TRUE 0.980 3.000 0.143 0.035 N NA
 195298 195299 spyM18_0563 spyM18_0564 smpB   TRUE 0.889 6.000 0.000 1.000 Y NA
 195300 195301 spyM18_0565 spyM18_0566 pcp   TRUE 0.873 50.000 0.300 NA   NA
 195301 195302 spyM18_0566 spyM18_0567     TRUE 0.993 0.000 0.939 NA   NA
 195302 195303 spyM18_0567 spyM18_0568     FALSE 0.098 211.000 0.000 NA   NA
 195303 195304 spyM18_0568 spyM18_0569     FALSE 0.173 145.000 0.012 NA N NA
 195304 195305 spyM18_0569 spyM18_0570     TRUE 0.713 11.000 0.019 1.000 N NA
 195305 195306 spyM18_0570 spyM18_0571   pepQ FALSE 0.491 49.000 0.053 1.000 N NA
 195306 195307 spyM18_0571 spyM18_0572 pepQ tra FALSE 0.273 31.000 0.000 1.000 N NA
 195308 195309 spyM18_0573 spyM18_0574 ccpA   FALSE 0.147 131.000 0.033 1.000 N NA
 195309 195310 spyM18_0574 spyM18_0575     TRUE 0.997 2.000 0.413 0.011 Y NA
 195310 195311 spyM18_0575 spyM18_0576     FALSE 0.005 421.000 0.000 1.000 N NA
 195313 195314 spyM18_0579 spyM18_0580     TRUE 0.825 2.000 0.000 NA   NA
 195314 195315 spyM18_0580 spyM18_0582     TRUE 0.903 2.000 0.042 NA   NA
 195316 195317 spyM18_0583 spyM18_0584     TRUE 0.969 15.000 0.625 1.000 N NA
 195318 195319 spyM18_0585 spyM18_0586     TRUE 0.997 11.000 0.316 0.003 Y NA
 195319 195320 spyM18_0586 spyM18_0587     TRUE 0.911 0.000 0.099 1.000   NA
 195320 195321 spyM18_0587 spyM18_0588     TRUE 0.996 14.000 0.857 0.063   NA
 195321 195322 spyM18_0588 spyM18_0589     TRUE 0.679 135.000 0.429 NA   NA
 195322 195323 spyM18_0589 spyM18_0590     TRUE 0.949 -31.000 0.058 NA   NA
 195323 195324 spyM18_0590 spyM18_0592     TRUE 0.994 -43.000 0.576 1.000 Y NA
 195324 195325 spyM18_0592 spyM18_0593     FALSE 0.413 95.000 0.030 NA   NA
 195325 195326 spyM18_0593 spyM18_0594   vicR FALSE 0.218 162.000 0.013 NA   NA
 195326 195327 spyM18_0594 spyM18_0595 vicR vicK TRUE 0.998 -7.000 0.597 0.059 Y NA
 195327 195328 spyM18_0595 spyM18_0596 vicK vicX TRUE 0.845 4.000 0.038 1.000   NA
 195328 195329 spyM18_0596 spyM18_0597 vicX rnc FALSE 0.017 443.000 0.002 1.000   NA
 195329 195330 spyM18_0597 spyM18_0598 rnc smc TRUE 0.875 1.000 0.120 1.000 N NA
 195332 195333 spyM18_0600 spyM18_0601 aroD   TRUE 0.786 -3.000 0.000 NA N NA
 195333 195334 spyM18_0601 spyM18_0602     TRUE 0.825 2.000 0.000 NA   NA
 195334 195335 spyM18_0602 spyM18_0603     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 195335 195336 spyM18_0603 spyM18_0604     TRUE 0.797 10.000 0.000 NA   NA
 195336 195337 spyM18_0604 spyM18_0605     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 195337 195338 spyM18_0605 spyM18_0606     FALSE 0.473 55.000 0.000 NA   NA
 195338 195339 spyM18_0606 spyM18_0607     FALSE 0.027 403.000 0.000 NA   NA
 195339 195340 spyM18_0607 spyM18_0608     FALSE 0.184 137.000 0.000 NA   NA
 195340 195341 spyM18_0608 spyM18_0609     FALSE 0.197 85.000 0.000 1.000   NA
 195342 195343 spyM18_0610 spyM18_0611     TRUE 0.986 -10.000 0.400 NA   NA
 195343 195344 spyM18_0611 spyM18_0612     FALSE 0.315 85.000 0.000 NA   NA
 195344 195345 spyM18_0612 spyM18_0613     TRUE 0.889 -9.000 0.000 NA   NA
 195345 195346 spyM18_0613 spyM18_0615     TRUE 0.980 0.000 0.429 NA   NA
 195347 195348 spyM18_0616 spyM18_0617     TRUE 0.969 0.000 0.273 NA   NA
 195348 195349 spyM18_0617 spyM18_0618     TRUE 0.670 133.000 0.400 NA   NA
 195349 195350 spyM18_0618 spyM18_0620     FALSE 0.254 105.000 0.000 NA   NA
 195350 195351 spyM18_0620 spyM18_0621     TRUE 0.595 42.000 0.000 NA   NA
 195351 195352 spyM18_0621 spyM18_0622     FALSE 0.027 405.000 0.000 NA   NA
 195352 195353 spyM18_0622 spyM18_0624     TRUE 0.590 24.000 0.000 1.000   NA
 195353 195354 spyM18_0624 spyM18_0626     FALSE 0.119 125.000 0.000 1.000   NA
 195354 195355 spyM18_0626 spyM18_0630     FALSE 0.018 594.000 0.000 NA   NA
 195355 195356 spyM18_0630 spyM18_0631     TRUE 0.797 13.000 0.000 NA   NA
 195356 195357 spyM18_0631 spyM18_0632     FALSE 0.215 120.000 0.000 NA   NA
 195357 195358 spyM18_0632 spyM18_0633     TRUE 0.903 -3.000 0.006 NA   NA
 195359 195360 spyM18_0634 spyM18_0635 tnpA   TRUE 0.980 48.000 0.333 0.071 Y NA
 195361 195362 spyM18_0636 spyM18_0637     TRUE 0.994 4.000 0.375 0.020   NA
 195362 195363 spyM18_0637 spyM18_0638     TRUE 0.968 0.000 0.007 0.078   NA
 195365 195366 spyM18_0640 spyM18_0641     TRUE 0.951 2.000 0.259 1.000   NA
 195366 195367 spyM18_0641 spyM18_0642     TRUE 0.973 19.000 0.318 1.000 Y NA
 195368 195369 spyM18_0643 spyM18_0644     TRUE 0.992 0.000 0.841 NA   NA
 195370 195371 spyM18_0646 spyM18_0648     FALSE 0.105 206.000 0.000 NA   NA
 195371 195372 spyM18_0648 spyM18_0649     TRUE 0.976 -13.000 0.215 NA   NA
 195372 195373 spyM18_0649 spyM18_0651     TRUE 0.599 64.000 0.051 NA   NA
 195373 195374 spyM18_0651 spyM18_0653   ptsK FALSE 0.160 305.000 0.017 NA Y NA
 195374 195375 spyM18_0653 spyM18_0654 ptsK   TRUE 0.976 -3.000 0.494 1.000 N NA
 195375 195376 spyM18_0654 spyM18_0656     TRUE 0.881 22.000 0.079 NA   NA
 195376 195377 spyM18_0656 spyM18_0657     TRUE 0.973 -7.000 0.206 NA   NA
 195379 195380 spyM18_0659 spyM18_0660     TRUE 0.945 102.000 0.156 0.003 Y NA
 195380 195381 spyM18_0660 spyM18_0661     FALSE 0.097 212.000 0.000 NA   NA
 195384 195385 spyM18_0665 spyM18_0666 pgmA   FALSE 0.059 340.000 0.018 NA   NA
 195385 195386 spyM18_0666 spyM18_0667     FALSE 0.380 91.000 0.010 NA   NA
 195386 195387 spyM18_0667 spyM18_0668     FALSE 0.096 269.000 0.016 NA   NA
 195388 195389 spyM18_0669 spyM18_0670     TRUE 0.986 -16.000 0.375 NA   NA
 195390 195391 spyM18_0672 spyM18_0673 bsaA pepF TRUE 0.876 -7.000 0.059 1.000 N NA
 195392 195393 spyM18_0675 spyM18_0676 pepC ftsW FALSE 0.102 170.000 0.028 1.000 N NA
 195395 195396 spyM18_0678 spyM18_0680 tufA tpiA FALSE 0.030 241.000 0.003 1.000 N NA
 195397 195398 spyM18_0682 spyM18_0683 femA femB TRUE 0.997 -13.000 0.200 0.011 Y NA
 195398 195399 spyM18_0683 spyM18_0684 femB   TRUE 0.979 0.000 0.500 1.000   NA
 195399 195400 spyM18_0684 spyM18_0686     FALSE 0.163 151.000 0.000 NA   NA
 195400 195401 spyM18_0686 spyM18_0687     FALSE 0.373 72.000 0.000 NA   NA
 195402 195403 spyM18_0688 spyM18_0689   pacL FALSE 0.082 230.000 0.000 NA   NA
 195404 195405 spyM18_0692 spyM18_0693     TRUE 0.902 64.000 0.562 NA   NA
 195405 195406 spyM18_0693 spyM18_0694     TRUE 0.787 86.000 0.375 NA   NA
 195406 195407 spyM18_0694 spyM18_0695     TRUE 0.999 -13.000 0.933 0.021 Y NA
 195407 195408 spyM18_0695 spyM18_0696     TRUE 0.999 19.000 0.933 0.021 Y NA
 195408 195409 spyM18_0696 spyM18_0697     TRUE 0.846 36.000 0.200 1.000   NA
 195409 195410 spyM18_0697 spyM18_0698     TRUE 0.919 0.000 0.120 1.000   NA
 195411 195412 spyM18_0699 spyM18_0700     TRUE 0.850 25.000 0.197 1.000 N NA
 195412 195413 spyM18_0700 spyM18_0701   kdgK TRUE 0.906 29.000 0.094 1.000 Y NA
 195413 195414 spyM18_0701 spyM18_0702 kdgK alkH TRUE 0.962 5.000 0.167 1.000 Y NA
 195414 195415 spyM18_0702 spyM18_0703 alkH   FALSE 0.201 296.000 0.000 0.047   NA
 195415 195416 spyM18_0703 spyM18_0704     FALSE 0.009 695.000 0.000 1.000   NA
 195416 195417 spyM18_0704 spyM18_0705   prfB FALSE 0.074 154.000 0.006 1.000 N NA
 195417 195418 spyM18_0705 spyM18_0706 prfB ftsE TRUE 0.749 19.000 0.053 1.000 N NA
 195418 195419 spyM18_0706 spyM18_0707 ftsE fts TRUE 0.991 -7.000 0.431 1.000 Y NA
 195421 195422 spyM18_0709 spyM18_0710   dinG FALSE 0.056 108.000 0.000 1.000 N NA
 195422 195423 spyM18_0710 spyM18_0711 dinG aspC FALSE 0.007 335.000 0.000 1.000 N NA
 195423 195424 spyM18_0711 spyM18_0712 aspC asnS TRUE 0.761 21.000 0.068 1.000 N NA
 195424 195425 spyM18_0712 spyM18_0713 asnS   FALSE 0.026 414.000 0.000 NA   NA
 195425 195426 spyM18_0713 spyM18_0714     TRUE 0.970 -3.000 0.214 NA   NA
 195426 195427 spyM18_0714 spyM18_0715     TRUE 0.986 -3.000 0.470 NA   NA
 195428 195429 spyM18_0716 spyM18_0717 int   FALSE 0.208 123.000 0.000 NA   NA
 195429 195430 spyM18_0717 spyM18_0718     TRUE 0.797 10.000 0.000 NA   NA
 195433 195434 spyM18_0722 spyM18_0723     FALSE 0.374 49.000 0.000 1.000   NA
 195434 195435 spyM18_0723 spyM18_0724     FALSE 0.026 410.000 0.000 NA   NA
 195435 195436 spyM18_0724 spyM18_0725     TRUE 0.825 2.000 0.000 NA   NA
 195436 195437 spyM18_0725 spyM18_0726     FALSE 0.021 483.000 0.000 NA   NA
 195437 195438 spyM18_0726 spyM18_0727     TRUE 0.935 -19.000 0.018 NA   NA
 195438 195439 spyM18_0727 spyM18_0728     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195439 195440 spyM18_0728 spyM18_0729     TRUE 0.800 9.000 0.000 NA   NA
 195440 195441 spyM18_0729 spyM18_0730     FALSE 0.467 56.000 0.000 NA   NA
 195441 195442 spyM18_0730 spyM18_0731     TRUE 0.844 0.000 0.000 NA   NA
 195442 195443 spyM18_0731 spyM18_0732     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195443 195444 spyM18_0732 spyM18_0733     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 195444 195445 spyM18_0733 spyM18_0734     FALSE 0.136 177.000 0.000 NA   NA
 195445 195446 spyM18_0734 spyM18_0735     TRUE 0.896 -3.000 0.002 NA   NA
 195446 195447 spyM18_0735 spyM18_0736     TRUE 0.892 -13.000 0.000 NA   NA
 195447 195448 spyM18_0736 spyM18_0737     TRUE 0.881 -6.000 0.000 NA   NA
 195448 195449 spyM18_0737 spyM18_0738     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195449 195450 spyM18_0738 spyM18_0739     TRUE 0.797 10.000 0.000 NA   NA
 195450 195451 spyM18_0739 spyM18_0740     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195451 195452 spyM18_0740 spyM18_0741     TRUE 0.812 4.000 0.000 NA   NA
 195452 195453 spyM18_0741 spyM18_0742     TRUE 0.818 -34.000 0.000 1.000   NA
 195453 195454 spyM18_0742 spyM18_0743     TRUE 0.542 48.000 0.000 NA   NA
 195454 195455 spyM18_0743 spyM18_0744     FALSE 0.023 443.000 0.000 NA   NA
 195455 195456 spyM18_0744 spyM18_0745     FALSE 0.018 583.000 0.000 NA   NA
 195457 195458 spyM18_0746 spyM18_0747     TRUE 0.862 52.000 0.294 NA   NA
 195459 195460 spyM18_0748 spyM18_0749     FALSE 0.327 171.000 0.111 NA   NA
 195460 195461 spyM18_0749 spyM18_0750     TRUE 0.817 3.000 0.000 NA   NA
 195461 195462 spyM18_0750 spyM18_0751     TRUE 0.797 10.000 0.000 NA   NA
 195462 195463 spyM18_0751 spyM18_0752     TRUE 0.983 -3.000 0.400 NA   NA
 195463 195464 spyM18_0752 spyM18_0753     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 195464 195465 spyM18_0753 spyM18_0754     TRUE 0.652 34.000 0.000 NA   NA
 195465 195466 spyM18_0754 spyM18_0755     TRUE 0.894 -22.000 0.000 NA   NA
 195466 195467 spyM18_0755 spyM18_0756     TRUE 0.718 25.000 0.000 NA   NA
 195467 195468 spyM18_0756 spyM18_0757     TRUE 0.792 14.000 0.000 NA   NA
 195468 195469 spyM18_0757 spyM18_0758     TRUE 0.817 3.000 0.000 NA   NA
 195469 195470 spyM18_0758 spyM18_0759     TRUE 0.976 -3.000 0.286 NA   NA
 195470 195471 spyM18_0759 spyM18_0760     TRUE 0.959 -3.000 0.150 NA   NA
 195471 195472 spyM18_0760 spyM18_0761     TRUE 0.973 -3.000 0.250 NA   NA
 195472 195473 spyM18_0761 spyM18_0762     TRUE 0.983 16.000 0.667 NA   NA
 195473 195474 spyM18_0762 spyM18_0763     TRUE 0.874 53.000 0.333 NA   NA
 195474 195475 spyM18_0763 spyM18_0764     TRUE 0.983 30.000 1.000 NA   NA
 195475 195476 spyM18_0764 spyM18_0765     TRUE 0.984 13.000 0.667 NA   NA
 195476 195477 spyM18_0765 spyM18_0766     TRUE 0.989 0.000 0.667 NA   NA
 195477 195478 spyM18_0766 spyM18_0769     TRUE 0.902 31.000 0.200 NA   NA
 195478 195479 spyM18_0769 spyM18_0770   hylP TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195479 195480 spyM18_0770 spyM18_0771 hylP   TRUE 0.991 13.000 1.000 NA   NA
 195482 195483 spyM18_0774 spyM18_0775     TRUE 0.797 10.000 0.000 NA   NA
 195483 195484 spyM18_0775 spyM18_0776     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195484 195485 spyM18_0776 spyM18_0777     FALSE 0.225 116.000 0.000 NA   NA
 195486 195487 spyM18_0778 spyM18_0779 speC MF2 FALSE 0.144 111.000 0.000 1.000   NA
 195488 195489 spyM18_0780 spyM18_0781     FALSE 0.358 152.000 0.250 1.000 N NA
 195489 195490 spyM18_0781 spyM18_0783     FALSE 0.187 151.000 0.091 1.000 N NA
 195490 195491 spyM18_0783 spyM18_0784   agaS TRUE 0.871 20.000 0.178 1.000 N NA
 195492 195493 spyM18_0785 spyM18_0787 rl31   FALSE 0.249 115.000 0.020 1.000   NA
 195494 195495 spyM18_0788 spyM18_0789 flaV cm FALSE 0.234 176.000 0.167 1.000 N NA
 195495 195496 spyM18_0789 spyM18_0790 cm   TRUE 0.903 -7.000 0.094 1.000 N NA
 195496 195497 spyM18_0790 spyM18_0791   rpl19 FALSE 0.112 115.000 0.006 1.000 N NA
 195497 3820273 spyM18_0791 spyM18_t43 rpl19   FALSE 0.073 247.000 0.000 NA   NA
 195499 195500 spyM18_0794 spyM18_0795   gryB TRUE 0.831 1.000 0.013 1.000   NA
 195500 195501 spyM18_0795 spyM18_0796 gryB   FALSE 0.016 368.000 0.011 1.000 N NA
 195503 195504 spyM18_0798 spyM18_0799 eno sagA FALSE 0.015 768.000 0.000 NA   NA
 195504 195505 spyM18_0799 spyM18_0800 sagA sagB FALSE 0.085 222.000 0.000 NA   NA
 195505 195506 spyM18_0800 spyM18_0801 sagB sagC TRUE 0.968 -3.000 0.200 NA   NA
 195506 195507 spyM18_0801 spyM18_0802 sagC   TRUE 0.958 20.000 0.318 NA   NA
 195507 195508 spyM18_0802 spyM18_0803     TRUE 0.965 -25.000 0.136 NA   NA
 195508 195509 spyM18_0803 spyM18_0804     TRUE 0.990 0.000 0.750 NA   NA
 195509 195510 spyM18_0804 spyM18_0805     TRUE 0.981 23.000 0.750 NA   NA
 195510 195511 spyM18_0805 spyM18_0806   sagH TRUE 0.963 9.000 0.500 1.000 N NA
 195511 195512 spyM18_0806 spyM18_0807 sagH   TRUE 0.996 -3.000 0.160 0.008 Y NA
 195512 195513 spyM18_0807 spyM18_0808     FALSE 0.010 572.000 0.000 1.000   NA
 195513 195514 spyM18_0808 spyM18_0809     FALSE 0.055 278.000 0.000 NA   NA
 195514 195515 spyM18_0809 spyM18_0810   lig FALSE 0.167 194.000 0.010 NA   NA
 195515 195516 spyM18_0810 spyM18_0811 lig   TRUE 0.675 14.000 0.013 1.000 N NA
 195516 195517 spyM18_0811 spyM18_0812   atpL7 FALSE 0.015 391.000 0.000 1.000   NA
 195517 195518 spyM18_0812 spyM18_0813 atpL7 atpB TRUE 0.978 35.000 0.189 0.008   NA
 195518 195519 spyM18_0813 spyM18_0814 atpB atpF TRUE 0.989 18.000 0.032 0.008 Y NA
 195519 195520 spyM18_0814 spyM18_0815 atpF atpH TRUE 0.996 0.000 0.222 0.008 Y NA
 195520 195521 spyM18_0815 spyM18_0816 atpH atpA TRUE 0.999 16.000 0.864 0.008 Y NA
 195521 195522 spyM18_0816 spyM18_0817 atpA atpG TRUE 0.999 16.000 0.846 0.008 Y NA
 195522 195523 spyM18_0817 spyM18_0818 atpG atpD TRUE 0.968 162.000 0.724 0.008 Y NA
 195523 195524 spyM18_0818 spyM18_0819 atpD atpE TRUE 0.999 13.000 0.837 0.008 Y NA
 195524 195525 spyM18_0819 spyM18_0820 atpE   FALSE 0.113 266.000 0.039 NA   NA
 195525 195526 spyM18_0820 spyM18_0821   murA TRUE 0.804 65.000 0.279 NA   NA
 195526 195527 spyM18_0821 spyM18_0822 murA epuA TRUE 0.926 4.000 0.110 NA   NA
 195527 195528 spyM18_0822 spyM18_0827 epuA pheS FALSE 0.013 1182.000 0.000 NA   NA
 195528 195529 spyM18_0827 spyM18_0828 pheS pheT TRUE 0.954 210.000 0.574 0.001 Y NA
 195529 195530 spyM18_0828 spyM18_0829 pheT   FALSE 0.099 112.000 0.002 1.000 N NA
 195530 195531 spyM18_0829 spyM18_0830     TRUE 0.915 -7.000 0.006 NA   NA
 195531 195532 spyM18_0830 spyM18_0831     TRUE 0.895 -78.000 0.000 NA   NA
 195532 195533 spyM18_0831 spyM18_0832     TRUE 0.706 26.000 0.000 NA   NA
 195533 195534 spyM18_0832 spyM18_0833     TRUE 0.967 10.000 0.444 1.000   NA
 195536 195537 spyM18_0835 spyM18_0836 rexB rexA TRUE 0.993 -39.000 0.070 0.068 Y NA
 195537 195538 spyM18_0836 spyM18_0837 rexA   FALSE 0.050 116.000 0.000 1.000 N NA
 195538 195539 spyM18_0837 spyM18_0838   rpsU FALSE 0.200 141.000 0.027 1.000   NA
 195541 195542 spyM18_0840 spyM18_0841 dnaE rpoD TRUE 0.906 9.000 0.209 1.000 N NA
 195542 195543 spyM18_0841 spyM18_0842 rpoD   FALSE 0.146 237.000 0.044 NA   NA
 195543 195544 spyM18_0842 spyM18_0843     FALSE 0.444 138.000 0.152 NA   NA
 195544 195545 spyM18_0843 spyM18_0845     TRUE 0.672 119.000 0.212 1.000 Y NA
 195545 195546 spyM18_0845 spyM18_0846     TRUE 0.981 -10.000 0.289 NA   NA
 195546 195547 spyM18_0846 spyM18_0848     TRUE 0.894 45.000 0.289 NA   NA
 195547 195548 spyM18_0848 spyM18_0849     TRUE 0.497 0.000 0.000 1.000 N NA
 195548 195549 spyM18_0849 spyM18_0852     TRUE 0.718 25.000 0.000 NA   NA
 195549 195550 spyM18_0852 spyM18_0853     TRUE 0.982 -3.000 0.385 NA   NA
 195550 195551 spyM18_0853 spyM18_0855     TRUE 0.950 -3.000 0.000 NA Y NA
 195551 195552 spyM18_0855 spyM18_0856     FALSE 0.300 179.000 0.000 NA Y NA
 195552 195553 spyM18_0856 spyM18_0858     TRUE 0.984 2.000 0.568 NA   NA
 195553 195554 spyM18_0858 spyM18_0859     TRUE 0.933 -7.000 0.027 NA   NA
 195554 195555 spyM18_0859 spyM18_0860     TRUE 0.972 -19.000 0.182 NA   NA
 195555 195556 spyM18_0860 spyM18_0861   pepT FALSE 0.279 94.000 0.000 NA   NA
 195556 195557 spyM18_0861 spyM18_0862 pepT   TRUE 0.756 41.000 0.051 NA   NA
 195559 195560 spyM18_0864 spyM18_0865   cmk TRUE 0.782 15.000 0.012 1.000   NA
 195560 195561 spyM18_0865 spyM18_0866 cmk infC FALSE 0.080 162.000 0.010 1.000 N NA
 195561 195562 spyM18_0866 spyM18_0867 infC rpl35 TRUE 0.971 42.000 0.652 1.000 Y NA
 195562 195563 spyM18_0867 spyM18_0868 rpl35 rl20 TRUE 0.993 59.000 0.928 0.026 Y NA
 195565 195566 spyM18_0870 spyM18_0871   aroD TRUE 0.935 -3.000 0.125 1.000   NA
 195566 195567 spyM18_0871 spyM18_0872 aroD aroC TRUE 0.904 94.000 0.004 0.003 Y NA
 195567 195568 spyM18_0872 spyM18_0873 aroC   TRUE 0.512 61.000 0.005 NA   NA
 195568 195569 spyM18_0873 spyM18_0875   gshR FALSE 0.125 221.000 0.010 NA   NA
 195570 195571 spyM18_0876 spyM18_0877 folC   TRUE 0.934 30.000 0.308 NA   NA
 195572 195573 spyM18_0878 spyM18_0879 nifS thiI TRUE 0.944 12.000 0.349 1.000 N NA
 195573 195574 spyM18_0879 spyM18_0880 thiI   FALSE 0.476 38.000 0.014 1.000 N NA
 195574 195575 spyM18_0880 spyM18_0882   tra FALSE 0.045 124.000 0.000 1.000 N NA
 195575 195576 spyM18_0882 spyM18_0883 tra rpL21 FALSE 0.023 199.000 0.000 1.000 N NA
 195576 195577 spyM18_0883 spyM18_0884 rpL21   TRUE 0.975 12.000 0.208 NA Y NA
 195577 195578 spyM18_0884 spyM18_0885   rpl27 TRUE 0.956 28.000 0.203 NA Y NA
 195578 195579 spyM18_0885 spyM18_0886 rpl27   FALSE 0.171 146.000 0.000 NA   NA
 195579 195580 spyM18_0886 spyM18_0887     FALSE 0.260 102.000 0.000 NA   NA
 195580 195581 spyM18_0887 spyM18_0888   lspA TRUE 0.903 -3.000 0.119 1.000 N NA
 195581 195582 spyM18_0888 spyM18_0889 lspA sfhB TRUE 0.901 -10.000 0.082 1.000 N NA
 195582 195583 spyM18_0889 spyM18_0890 sfhB pyrR FALSE 0.022 396.000 0.048 1.000 N NA
 195583 195584 spyM18_0890 spyM18_0891 pyrR pyrP TRUE 0.951 16.000 0.140 1.000 Y NA
 195584 195585 spyM18_0891 spyM18_0892 pyrP pyrB TRUE 0.749 61.000 0.064 1.000 Y NA
 195585 195586 spyM18_0892 spyM18_0893 pyrB carA TRUE 0.798 44.000 0.014 1.000 Y NA
 195586 195587 spyM18_0893 spyM18_0895 carA carB TRUE 0.807 246.000 0.117 0.001 Y NA
 195587 195588 spyM18_0895 spyM18_0896 carB   FALSE 0.089 175.000 0.017 1.000 N NA
 195588 195589 spyM18_0896 spyM18_0897     TRUE 0.976 24.000 0.923 1.000 N NA
 195589 195590 spyM18_0897 spyM18_0898     TRUE 0.993 12.000 0.923 1.000 Y NA
 195590 195591 spyM18_0898 spyM18_0899     FALSE 0.013 254.000 0.000 1.000 N NA
 195591 195592 spyM18_0899 spyM18_0900   rpsP FALSE 0.084 127.000 0.003 1.000 N NA
 195592 195593 spyM18_0900 spyM18_0901 rpsP   TRUE 0.961 10.000 0.385 1.000   NA
 195593 195594 spyM18_0901 spyM18_0903     FALSE 0.007 932.000 0.000 1.000   NA
 195594 195595 spyM18_0903 spyM18_0904     TRUE 0.915 20.000 0.200 1.000   NA
 195597 195598 spyM18_0906 spyM18_0907   rimM FALSE 0.019 215.000 0.000 1.000 N NA
 195598 195599 spyM18_0907 spyM18_0908 rimM trmD TRUE 0.995 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 195599 195600 spyM18_0908 spyM18_0909 trmD trxB TRUE 0.639 12.000 0.007 1.000 N NA
 195600 195601 spyM18_0909 spyM18_0910 trxB   FALSE 0.254 178.000 0.059 NA   NA
 195601 195602 spyM18_0910 spyM18_0911   apbA TRUE 0.966 13.000 0.333 NA   NA
 195602 195603 spyM18_0911 spyM18_0912 apbA fruR FALSE 0.009 301.000 0.000 1.000 N NA
 195603 195604 spyM18_0912 spyM18_0913 fruR fruK TRUE 0.994 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 195604 195605 spyM18_0913 spyM18_0914 fruK fruA TRUE 0.995 -3.000 0.816 1.000 Y NA
 195605 195606 spyM18_0914 spyM18_0915 fruA acmA FALSE 0.188 99.000 0.022 1.000 N NA
 195606 195607 spyM18_0915 spyM18_0916 acmA alyS TRUE 0.950 151.000 0.333 0.002 Y NA
 195609 195610 spyM18_0924 spyM18_0925     FALSE 0.046 228.000 0.000 1.000   NA
 195610 195611 spyM18_0925 spyM18_0926     TRUE 0.947 0.000 0.139 NA   NA
 195611 195612 spyM18_0926 spyM18_0927   papS FALSE 0.274 125.000 0.009 NA   NA
 195612 195613 spyM18_0927 spyM18_0928 papS   TRUE 0.904 -3.000 0.056 1.000   NA
 195613 195614 spyM18_0928 spyM18_0930     FALSE 0.025 418.000 0.000 NA   NA
 195614 195615 spyM18_0930 spyM18_0932   def FALSE 0.066 256.000 0.000 NA   NA
 195617 195618 spyM18_0934 spyM18_0935     TRUE 0.986 3.000 0.800 1.000   NA
 195618 195619 spyM18_0935 spyM18_0936     TRUE 0.986 9.000 0.533 1.000 Y NA
 195619 195620 spyM18_0936 spyM18_0937   mvaK1 FALSE 0.009 294.000 0.000 1.000 N NA
 195620 195621 spyM18_0937 spyM18_0938 mvaK1 mvd TRUE 0.998 -18.000 0.281 0.003 Y NA
 195621 195622 spyM18_0938 spyM18_0939 mvd   TRUE 0.998 -7.000 0.312 0.004 Y NA
 195622 195623 spyM18_0939 spyM18_0940     TRUE 0.911 -13.000 0.097 1.000 N NA
 195624 195625 spyM18_0941 spyM18_0942 mvaS1 mvaS2 TRUE 0.982 -13.000 0.183 1.000 Y NA
 195626 195627 spyM18_0943 spyM18_0944 thyA dfr TRUE 0.641 80.000 0.295 1.000 N NA
 195627 195628 spyM18_0944 spyM18_0945 dfr   TRUE 0.860 20.000 0.030 NA   NA
 195628 195629 spyM18_0945 spyM18_0946   clpX FALSE 0.274 130.000 0.012 NA   NA
 195629 195630 spyM18_0946 spyM18_0947 clpX   TRUE 0.836 10.000 0.043 1.000   NA
 195630 195631 spyM18_0947 spyM18_0948     FALSE 0.212 148.000 0.004 NA   NA
 195633 195634 spyM18_0950 spyM18_0951 rpiA deoB TRUE 0.621 77.000 0.018 1.000 Y NA
 195634 195635 spyM18_0951 spyM18_0952 deoB arsC TRUE 0.821 19.000 0.108 1.000 N NA
 195635 195636 spyM18_0952 spyM18_0953 arsC pnp TRUE 0.917 -16.000 0.108 1.000 N NA
 195636 195637 spyM18_0953 spyM18_0955 pnp deoD FALSE 0.401 663.000 0.040 0.001 Y NA
 195637 195638 spyM18_0955 spyM18_0956 deoD   TRUE 0.959 -13.000 0.107 NA   NA
 195640 195641 spyM18_0958 spyM18_0959   pyrF FALSE 0.056 277.000 0.000 NA   NA
 195641 195642 spyM18_0959 spyM18_0960 pyrF pyrE TRUE 0.810 58.000 0.133 1.000 Y NA
 195642 195643 spyM18_0960 spyM18_0961 pyrE amiC FALSE 0.023 197.000 0.000 1.000 N NA
 195643 195644 spyM18_0961 spyM18_0962 amiC   FALSE 0.368 118.000 0.182 1.000 N NA
 195644 195645 spyM18_0962 spyM18_0963     TRUE 0.982 29.000 0.125 0.037 Y NA
 195645 195646 spyM18_0963 spyM18_0964   ung FALSE 0.134 133.000 0.025 1.000 N NA
 195646 195647 spyM18_0964 spyM18_0965 ung pyrC FALSE 0.080 159.000 0.009 1.000 N NA
 195649 195650 spyM18_0967 spyM18_0968 parE parC TRUE 0.983 91.000 0.552 0.003 Y NA
 195650 195651 spyM18_0968 spyM18_0969 parC ilvE FALSE 0.232 123.000 0.086 1.000 N NA
 195651 195652 spyM18_0969 spyM18_0970 ilvE   TRUE 0.660 64.000 0.095 NA   NA
 195652 3820274 spyM18_0970 spyM18_t44     FALSE 0.437 61.000 0.000 NA   NA
 3820274 3820275 spyM18_t44 spyM18_t45     TRUE 0.501 51.000 0.000 NA   NA
 3820275 195653 spyM18_t45 spyM18_0971     FALSE 0.200 127.000 0.000 NA   NA
 195653 3820276 spyM18_0971 spyM18_t46     FALSE 0.237 113.000 0.000 NA   NA
 195655 195656 spyM18_0973 spyM18_0974     FALSE 0.041 311.000 0.000 NA   NA
 195656 195657 spyM18_0974 spyM18_0975     FALSE 0.069 238.000 0.056 1.000 N NA
 195659 195660 spyM18_0978 spyM18_0979 miaA hflX FALSE 0.401 73.000 0.027 1.000   NA
 195660 195661 spyM18_0979 spyM18_0980 hflX   TRUE 0.887 -7.000 0.014 1.000   NA
 195661 195662 spyM18_0980 spyM18_0981     TRUE 0.808 15.000 0.022 1.000   NA
 195662 195663 spyM18_0981 spyM18_0982     TRUE 0.899 0.000 0.074 1.000   NA
 195663 195664 spyM18_0982 spyM18_0983   recJ TRUE 0.875 -3.000 0.016 1.000   NA
 195664 195665 spyM18_0983 spyM18_0984 recJ apt FALSE 0.226 150.000 0.128 1.000 N NA
 195665 195666 spyM18_0984 spyM18_0985 apt   FALSE 0.293 81.000 0.005 NA N NA
 195666 195667 spyM18_0985 spyM18_0986     TRUE 0.961 -3.000 0.007 NA Y NA
 195667 195668 spyM18_0986 spyM18_0987     FALSE 0.456 72.000 0.006 NA   NA
 195668 195669 spyM18_0987 spyM18_0988     TRUE 0.980 -10.000 0.283 NA   NA
 195669 195670 spyM18_0988 spyM18_0989     TRUE 0.729 40.000 0.021 NA   NA
 195670 195671 spyM18_0989 spyM18_0990   cpsFO FALSE 0.435 58.000 0.059 1.000 N NA
 195671 195672 spyM18_0990 spyM18_0992 cpsFO cpsFP TRUE 0.968 0.000 0.149 1.000 Y NA
 195672 195673 spyM18_0992 spyM18_0993 cpsFP cpsFQ FALSE 0.482 244.000 0.350 1.000 Y NA
 195673 195674 spyM18_0993 spyM18_0994 cpsFQ mutT FALSE 0.017 221.000 0.000 1.000 N NA
 195674 195675 spyM18_0994 spyM18_0995 mutT   TRUE 0.671 58.000 0.074 NA   NA
 195675 195676 spyM18_0995 spyM18_0996     TRUE 0.983 -10.000 0.324 NA   NA
 195678 195679 spyM18_0999 spyM18_1000     TRUE 0.808 5.000 0.000 NA   NA
 195679 195680 spyM18_1000 spyM18_1001     FALSE 0.136 177.000 0.000 NA   NA
 195680 195681 spyM18_1001 spyM18_1002     TRUE 0.992 -3.000 0.895 1.000   NA
 195681 195682 spyM18_1002 spyM18_1003     FALSE 0.120 204.000 0.026 1.000   NA
 195682 195683 spyM18_1003 spyM18_1005   estA FALSE 0.441 133.000 0.143 NA   NA
 195683 195684 spyM18_1005 spyM18_1007 estA   TRUE 0.881 30.000 0.150 NA   NA
 195684 195685 spyM18_1007 spyM18_1008     TRUE 0.701 46.000 0.029 NA   NA
 195685 195686 spyM18_1008 spyM18_1009   acoA FALSE 0.029 285.000 0.000 1.000   NA
 195686 195687 spyM18_1009 spyM18_1010 acoA acoB TRUE 0.995 59.000 0.769 0.001 Y NA
 195687 195688 spyM18_1010 spyM18_1011 acoB acoC TRUE 0.728 185.000 0.077 0.044 Y NA
 195688 195689 spyM18_1011 spyM18_1013 acoC acoL FALSE 0.071 331.000 0.000 1.000 Y NA
 195692 195693 spyM18_1016 spyM18_1017     TRUE 0.988 0.000 0.796 1.000   NA
 195694 195695 spyM18_1018 spyM18_1019     TRUE 0.988 -3.000 0.502 NA   NA
 195695 195696 spyM18_1019 spyM18_1020     TRUE 0.765 54.000 0.150 NA   NA
 195696 195697 spyM18_1020 spyM18_1021     FALSE 0.250 124.000 0.003 NA   NA
 195697 195698 spyM18_1021 spyM18_1022   hemN TRUE 0.566 63.000 0.021 NA   NA
 195698 195699 spyM18_1022 spyM18_1023 hemN   TRUE 0.785 10.000 0.060 1.000 N NA
 195699 195700 spyM18_1023 spyM18_1024     TRUE 0.825 0.000 0.055 1.000 N NA
 195700 195701 spyM18_1024 spyM18_1025     TRUE 0.975 0.000 0.330 NA   NA
 195701 195702 spyM18_1025 spyM18_1028   lepA FALSE 0.049 295.000 0.000 NA   NA
 195702 195703 spyM18_1028 spyM18_1032 lepA   FALSE 0.009 1431.000 0.002 1.000   NA
 195703 195704 spyM18_1032 spyM18_1033     FALSE 0.114 130.000 0.000 1.000   NA
 195704 195705 spyM18_1033 spyM18_1034     FALSE 0.059 207.000 0.000 1.000   NA
 195705 195706 spyM18_1034 spyM18_1035     TRUE 0.997 25.000 0.786 0.020 Y NA
 195706 195707 spyM18_1035 spyM18_1036     TRUE 0.998 17.000 0.778 0.024 Y NA
 195707 195708 spyM18_1036 spyM18_1037     TRUE 0.999 -3.000 0.778 0.024 Y NA
 195708 195709 spyM18_1037 spyM18_1038     TRUE 0.736 136.000 0.222 0.058 N NA
 195709 195710 spyM18_1038 spyM18_1039     TRUE 0.998 4.000 0.500 0.012 Y NA
 195710 195711 spyM18_1039 spyM18_1040     TRUE 0.983 -6.000 0.571 1.000 N NA
 195711 195712 spyM18_1040 spyM18_1041     FALSE 0.052 115.000 0.000 1.000 N NA
 195712 195713 spyM18_1041 spyM18_1042     FALSE 0.060 102.000 0.000 1.000 N NA
 195713 195714 spyM18_1042 spyM18_1043     FALSE 0.054 184.000 0.004 1.000 N NA
 195714 195715 spyM18_1043 spyM18_1044     FALSE 0.341 125.000 0.179 1.000 N NA
 195716 195717 spyM18_1045 spyM18_1046   tra TRUE 0.662 16.000 0.000 1.000   NA
 195721 195722 spyM18_1053 spyM18_1057   tra FALSE 0.018 218.000 0.000 1.000 N NA
 195723 195724 spyM18_1058 spyM18_1059 folC folE TRUE 0.867 35.000 0.057 1.000 Y NA
 195724 195725 spyM18_1059 spyM18_1060 folE folP TRUE 0.941 9.000 0.073 1.000 Y NA
 195725 195726 spyM18_1060 spyM18_1061 folP folQ TRUE 0.947 7.000 0.094 1.000 Y NA
 195726 195727 spyM18_1061 spyM18_1062 folQ folK TRUE 0.973 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 195727 195728 spyM18_1062 spyM18_1063 folK murB FALSE 0.090 150.000 0.010 1.000 N NA
 195728 195729 spyM18_1063 spyM18_1064 murB potA TRUE 0.498 46.000 0.041 1.000 N NA
 195729 195730 spyM18_1064 spyM18_1065 potA potB TRUE 0.999 -16.000 0.928 0.036 Y NA
 195730 195731 spyM18_1065 spyM18_1066 potB potC TRUE 0.998 -3.000 0.492 0.036 Y NA
 195731 195732 spyM18_1066 spyM18_1067 potC potD TRUE 0.997 -7.000 0.253 0.036 Y NA
 195733 195734 spyM18_1068 spyM18_1069     TRUE 0.980 -19.000 0.154 1.000 Y NA
 195735 195736 spyM18_1071 spyM18_1072 malP   TRUE 0.967 31.000 0.432 1.000 Y NA
 195738 195739 spyM18_1074 spyM18_1075     FALSE 0.077 177.000 0.000 1.000   NA
 195739 195740 spyM18_1075 spyM18_1076     FALSE 0.152 163.000 0.071 1.000 N NA
 195740 195741 spyM18_1076 spyM18_1077     TRUE 0.562 46.000 0.000 NA   NA
 195741 195742 spyM18_1077 spyM18_1078     TRUE 0.844 0.000 0.000 NA   NA
 195742 195743 spyM18_1078 spyM18_1079   radC TRUE 0.695 49.000 0.046 NA   NA
 195744 195745 spyM18_1080 spyM18_1081     TRUE 0.981 10.000 0.714 1.000   NA
 195745 195746 spyM18_1081 spyM18_1082     FALSE 0.161 252.000 0.083 NA   NA
 195746 195747 spyM18_1082 spyM18_1083   nifS TRUE 0.968 -10.000 0.166 NA   NA
 195747 195748 spyM18_1083 spyM18_1084 nifS prsA TRUE 0.966 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 195748 195749 spyM18_1084 spyM18_1085 prsA   FALSE 0.344 140.000 0.145 1.000   NA
 195750 195751 spyM18_1086 spyM18_1087     TRUE 0.992 -25.000 0.725 1.000   NA
 195751 195752 spyM18_1087 spyM18_1088     TRUE 0.919 -3.000 0.150 1.000 N NA
 195752 195753 spyM18_1088 spyM18_1089   pta TRUE 0.811 4.000 0.067 1.000 N NA
 195753 195754 spyM18_1089 spyM18_1090 pta   TRUE 0.653 127.000 0.031 0.044   NA
 195756 195757 spyM18_1093 spyM18_1094     TRUE 0.973 -7.000 0.382 1.000 N NA
 195757 195758 spyM18_1094 spyM18_1095     FALSE 0.011 278.000 0.000 1.000 N NA
 195758 195759 spyM18_1095 spyM18_1096   xpt FALSE 0.110 305.000 0.009 1.000 Y NA
 195759 195760 spyM18_1096 spyM18_1097 xpt   TRUE 0.949 0.000 0.046 1.000 Y NA
 195761 195762 spyM18_1098 spyM18_1099     TRUE 0.743 53.000 0.189 1.000   NA
 195763 195764 spyM18_1100 spyM18_1101 tdk prfA TRUE 0.629 35.000 0.062 1.000 N NA
 195764 195765 spyM18_1101 spyM18_1102 prfA hemK TRUE 0.958 0.000 0.084 1.000 Y NA
 195765 195766 spyM18_1102 spyM18_1103 hemK   TRUE 0.973 -16.000 0.029 NA Y NA
 195766 195767 spyM18_1103 spyM18_1104     TRUE 0.849 18.000 0.012 NA   NA
 195767 195768 spyM18_1104 spyM18_1105   glyA TRUE 0.921 -10.000 0.056 1.000   NA
 195768 195769 spyM18_1105 spyM18_1106 glyA   TRUE 0.803 7.000 0.000 NA   NA
 195769 195770 spyM18_1106 spyM18_1107     TRUE 0.831 1.000 0.000 NA   NA
 195770 195771 spyM18_1107 spyM18_1108     TRUE 0.883 10.000 0.035 NA   NA
 195771 195772 spyM18_1108 spyM18_1109     TRUE 0.999 3.000 0.895 0.008 Y NA
 195772 195773 spyM18_1109 spyM18_1110   nox FALSE 0.042 241.000 0.000 1.000   NA
 195775 195776 spyM18_1112 spyM18_1113 gyrA   TRUE 0.771 20.000 0.013 NA N NA
 195776 195777 spyM18_1113 spyM18_1114     FALSE 0.381 83.000 0.039 NA N NA
 195777 195778 spyM18_1114 spyM18_1115     FALSE 0.021 487.000 0.000 NA   NA
 195778 195779 spyM18_1115 spyM18_1116     TRUE 0.802 8.000 0.000 NA   NA
 195780 195781 spyM18_1117 spyM18_1119   hylIII FALSE 0.390 117.000 0.135 1.000   NA
 195781 195782 spyM18_1119 spyM18_1120 hylIII   TRUE 0.942 -3.000 0.146 1.000   NA
 195783 195784 spyM18_1121 spyM18_1122   rnhB TRUE 0.952 -10.000 0.148 1.000   NA
 195784 195785 spyM18_1122 spyM18_1123 rnhB smf TRUE 0.695 65.000 0.037 1.000 Y NA
 195785 195786 spyM18_1123 spyM18_1124 smf topA TRUE 0.728 107.000 0.238 1.000 Y NA
 195786 195787 spyM18_1124 spyM18_1125 topA   FALSE 0.263 135.000 0.137 1.000 N NA
 195787 195788 spyM18_1125 spyM18_1126     FALSE 0.059 178.000 0.005 1.000 N NA
 195788 195789 spyM18_1126 spyM18_1127     TRUE 0.887 43.000 0.250 NA   NA
 195789 195790 spyM18_1127 spyM18_1128     TRUE 0.984 0.000 0.500 NA   NA
 195790 195791 spyM18_1128 spyM18_1129     TRUE 0.790 10.000 0.062 1.000 N NA
 195792 195793 spyM18_1130 spyM18_1131     TRUE 0.987 -7.000 0.700 1.000 N NA
 195793 195794 spyM18_1131 spyM18_1132     FALSE 0.472 158.000 0.400 1.000 N NA
 195795 195796 spyM18_1133 spyM18_1134     TRUE 0.694 54.000 0.077 NA   NA
 195796 195797 spyM18_1134 spyM18_1135     TRUE 0.632 45.000 0.103 1.000 N NA
 195797 195798 spyM18_1135 spyM18_1136     TRUE 0.993 18.000 0.273 0.003   NA
 195798 195799 spyM18_1136 spyM18_1137   citD TRUE 0.840 36.000 0.192 1.000   NA
 195799 195800 spyM18_1137 spyM18_1139 citD citE TRUE 0.996 -12.000 0.284 0.002 N NA
 195800 195801 spyM18_1139 spyM18_1140 citE citF TRUE 0.990 3.000 0.119 0.001 N NA
 195801 195802 spyM18_1140 spyM18_1141 citF citX TRUE 0.923 -7.000 0.138 1.000 N NA
 195802 195803 spyM18_1141 spyM18_1142 citX oadA TRUE 0.886 0.000 0.123 1.000 N NA
 195804 195805 spyM18_1143 spyM18_1144 citC   FALSE 0.182 89.000 0.000 1.000   NA
 195805 195806 spyM18_1144 spyM18_1147     FALSE 0.008 699.000 0.000 1.000   NA
 195808 195809 spyM18_1151 spyM18_1152 ffh ylmX TRUE 0.904 15.000 0.151 1.000   NA
 195809 195810 spyM18_1152 spyM18_1153 ylmX   TRUE 0.763 89.000 0.032 0.043   NA
 195810 195811 spyM18_1153 spyM18_1154     TRUE 0.508 83.000 0.057 NA   NA
 195813 195814 spyM18_1156 spyM18_1157     FALSE 0.017 366.000 0.000 1.000   NA
 195816 195817 spyM18_1159 spyM18_1160   pdxK TRUE 0.966 -22.000 0.142 NA   NA
 195818 195819 spyM18_1161 spyM18_1162     FALSE 0.173 145.000 0.000 NA   NA
 195820 195821 spyM18_1163 spyM18_1164   cls FALSE 0.022 322.000 0.000 1.000   NA
 195821 195822 spyM18_1164 spyM18_1165 cls fhs FALSE 0.357 85.000 0.094 1.000 N NA
 195822 195823 spyM18_1165 spyM18_1166 fhs lplA FALSE 0.361 128.000 0.200 1.000 N NA
 195823 195824 spyM18_1166 spyM18_1167 lplA   TRUE 0.782 47.000 0.250 1.000 N NA
 195824 195825 spyM18_1167 spyM18_1168     TRUE 0.979 -7.000 0.286 NA   NA
 195825 195826 spyM18_1168 spyM18_1169     TRUE 0.956 -7.000 0.107 NA   NA
 195826 195827 spyM18_1169 spyM18_1170     TRUE 0.937 42.000 0.571 NA N NA
 195827 195828 spyM18_1170 spyM18_1171     TRUE 0.976 -3.000 0.100 NA Y NA
 195828 195829 spyM18_1171 spyM18_1172     TRUE 0.806 -3.000 0.019 1.000 N NA
 195830 195831 spyM18_1173 spyM18_1174 dfpB dfp TRUE 0.850 -7.000 0.002 1.000   NA
 195831 195832 spyM18_1174 spyM18_1175 dfp   TRUE 0.590 58.000 0.019 NA   NA
 195832 195833 spyM18_1175 spyM18_1176     FALSE 0.307 175.000 0.098 NA   NA
 195834 195835 spyM18_1177 spyM18_1178     TRUE 0.997 2.000 0.720 0.036   NA
 195835 195836 spyM18_1178 spyM18_1179     TRUE 0.983 -7.000 0.438 1.000   NA
 195836 195837 spyM18_1179 spyM18_1180     FALSE 0.216 139.000 0.036 1.000   NA
 195837 195838 spyM18_1180 spyM18_1181   cdd TRUE 0.650 94.000 0.300 1.000   NA
 195838 195839 spyM18_1181 spyM18_1182 cdd   FALSE 0.004 509.000 0.000 1.000 N NA
 195840 195841 spyM18_1183 spyM18_1184 coaA rpS20 FALSE 0.264 69.000 0.014 1.000 N NA
 195842 195843 spyM18_1186 spyM18_1187     TRUE 0.994 -7.000 0.606 1.000 Y NA
 195843 195844 spyM18_1187 spyM18_1188   pepN FALSE 0.033 346.000 0.061 1.000 N NA
 195844 195845 spyM18_1188 spyM18_1189 pepN phoU FALSE 0.160 205.000 0.067 NA N NA
 195845 195846 spyM18_1189 spyM18_1190 phoU pstB1 TRUE 0.922 68.000 0.413 NA Y NA
 195846 195847 spyM18_1190 spyM18_1191 pstB1 pstB2 TRUE 0.999 13.000 0.542 0.001 Y NA
 195847 195848 spyM18_1191 spyM18_1192 pstB2 pstA TRUE 0.998 16.000 0.490 0.002 Y NA
 195848 195849 spyM18_1192 spyM18_1193 pstA pstC TRUE 1.000 -10.000 0.907 0.002 Y NA
 195849 195850 spyM18_1193 spyM18_1194 pstC pstS TRUE 0.966 11.000 0.206 1.000 Y NA
 195850 195851 spyM18_1194 spyM18_1195 pstS   TRUE 0.521 139.000 0.303 NA N NA
 195851 195852 spyM18_1195 spyM18_1196     TRUE 0.944 3.000 0.229 NA N NA
 195852 195853 spyM18_1196 spyM18_1197     TRUE 0.984 -10.000 0.337 NA   NA
 195853 195854 spyM18_1197 spyM18_1198     TRUE 0.948 2.000 0.169 NA   NA
 195854 195855 spyM18_1198 spyM18_1199     FALSE 0.460 43.000 0.017 1.000 N NA
 195855 195856 spyM18_1199 spyM18_1200   truB TRUE 0.889 29.000 0.308 1.000 N NA
 195856 195857 spyM18_1200 spyM18_1201 truB   FALSE 0.323 116.000 0.014 NA   NA
 195857 195858 spyM18_1201 spyM18_1202     FALSE 0.426 97.000 0.045 NA   NA
 195858 195859 spyM18_1202 spyM18_1203     TRUE 0.890 11.000 0.045 NA   NA
 195859 195860 spyM18_1203 spyM18_1205     FALSE 0.457 92.000 0.121 1.000   NA
 195860 195861 spyM18_1205 spyM18_1207     TRUE 0.982 15.000 0.438 1.000 Y NA
 195863 195864 spyM18_1209 spyM18_1210     TRUE 0.817 3.000 0.000 NA   NA
 195864 195865 spyM18_1210 spyM18_1211     FALSE 0.478 163.000 0.238 NA   NA
 195865 195866 spyM18_1211 spyM18_1212     TRUE 0.983 11.000 0.600 NA   NA
 195866 195867 spyM18_1212 spyM18_1213     TRUE 0.955 41.000 0.600 NA   NA
 195867 195868 spyM18_1213 spyM18_1214     TRUE 0.897 13.000 0.060 NA   NA
 195868 195869 spyM18_1214 spyM18_1215     TRUE 0.931 11.000 0.143 NA   NA
 195869 195870 spyM18_1215 spyM18_1216     TRUE 0.928 37.000 0.357 NA   NA
 195870 195871 spyM18_1216 spyM18_1217   pcrA FALSE 0.018 363.000 0.000 1.000   NA
 195872 195873 spyM18_1219 spyM18_1220     TRUE 0.621 120.000 0.060 0.071 N NA
 195874 195875 spyM18_1221 spyM18_1223 cfa   FALSE 0.031 369.000 0.000 NA   NA
 195875 195876 spyM18_1223 spyM18_1224     TRUE 0.955 16.000 0.154 1.000 Y NA
 195876 195877 spyM18_1224 spyM18_1225     TRUE 0.952 10.000 0.130 1.000 Y NA
 195877 195878 spyM18_1225 spyM18_1226     FALSE 0.169 107.000 0.018 1.000 N NA
 195878 195879 spyM18_1226 spyM18_1228   glmS FALSE 0.057 196.000 0.008 1.000 N NA
 195879 195880 spyM18_1228 spyM18_1229 glmS   FALSE 0.075 176.000 0.011 1.000 N NA
 195880 195881 spyM18_1229 spyM18_1230   pyk FALSE 0.094 218.000 0.072 1.000 N NA
 195881 195882 spyM18_1230 spyM18_1231 pyk pfk TRUE 0.980 63.000 0.261 0.006 Y NA
 195882 195883 spyM18_1231 spyM18_1232 pfk dnaE FALSE 0.392 80.000 0.098 1.000 N NA
 195884 195885 spyM18_1233 spyM18_1234     TRUE 0.964 0.000 0.412 1.000 N NA
 195885 195886 spyM18_1234 spyM18_1235     TRUE 0.976 10.000 0.471 NA   NA
 195887 195888 spyM18_1236 spyM18_1237     FALSE 0.018 559.000 0.000 NA   NA
 195888 195889 spyM18_1237 spyM18_1238     FALSE 0.232 115.000 0.000 NA   NA
 195889 195890 spyM18_1238 spyM18_1239     FALSE 0.353 282.000 0.000 0.006   NA
 195890 195891 spyM18_1239 spyM18_1240     FALSE 0.045 304.000 0.000 NA   NA
 195891 195892 spyM18_1240 spyM18_1241     TRUE 0.977 -12.000 0.231 NA   NA
 195892 195893 spyM18_1241 spyM18_1242     FALSE 0.179 140.000 0.000 NA   NA
 195893 195894 spyM18_1242 spyM18_1243     FALSE 0.060 269.000 0.000 NA   NA
 195894 195895 spyM18_1243 spyM18_1244     FALSE 0.044 233.000 0.000 1.000   NA
 195895 195896 spyM18_1244 spyM18_1247     FALSE 0.225 116.000 0.000 NA   NA
 195896 195897 spyM18_1247 spyM18_1248     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195897 195898 spyM18_1248 spyM18_1249     TRUE 0.787 16.000 0.000 NA   NA
 195898 195899 spyM18_1249 spyM18_1251     TRUE 0.817 3.000 0.000 NA   NA
 195899 195900 spyM18_1251 spyM18_1253     FALSE 0.016 681.000 0.000 NA   NA
 195900 195901 spyM18_1253 spyM18_1254   hylP TRUE 0.666 15.000 0.000 1.000   NA
 195901 195902 spyM18_1254 spyM18_1255 hylP   TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195902 195903 spyM18_1255 spyM18_1256     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195903 195904 spyM18_1256 spyM18_1257     TRUE 0.665 32.000 0.000 NA   NA
 195904 195905 spyM18_1257 spyM18_1258     TRUE 0.895 -133.000 0.000 NA   NA
 195905 195906 spyM18_1258 spyM18_1259     TRUE 0.789 15.000 0.000 NA   NA
 195906 195907 spyM18_1259 spyM18_1260     TRUE 0.935 30.000 0.312 NA   NA
 195907 195908 spyM18_1260 spyM18_1261     TRUE 0.717 53.000 0.093 NA   NA
 195908 195909 spyM18_1261 spyM18_1262     TRUE 0.893 16.000 0.062 NA   NA
 195909 195910 spyM18_1262 spyM18_1263     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 195910 195911 spyM18_1263 spyM18_1264     TRUE 0.970 -19.000 0.167 NA   NA
 195911 195912 spyM18_1264 spyM18_1265     TRUE 0.976 -3.000 0.286 NA   NA
 195912 195913 spyM18_1265 spyM18_1266     TRUE 0.972 14.000 0.429 NA   NA
 195913 195914 spyM18_1266 spyM18_1267     TRUE 0.960 10.000 0.286 NA   NA
 195914 195915 spyM18_1267 spyM18_1268     TRUE 0.965 3.000 0.286 NA   NA
 195915 195916 spyM18_1268 spyM18_1269     TRUE 0.906 10.000 0.077 NA   NA
 195916 195917 spyM18_1269 spyM18_1270     FALSE 0.239 112.000 0.000 NA   NA
 195917 195918 spyM18_1270 spyM18_1271     TRUE 0.825 2.000 0.000 NA   NA
 195918 195919 spyM18_1271 spyM18_1272     FALSE 0.232 115.000 0.000 NA   NA
 195919 195920 spyM18_1272 spyM18_1273     FALSE 0.272 96.000 0.000 NA   NA
 195920 195921 spyM18_1273 spyM18_1274     FALSE 0.442 60.000 0.000 NA   NA
 195921 195922 spyM18_1274 spyM18_1275     TRUE 0.889 -9.000 0.000 NA   NA
 195922 195923 spyM18_1275 spyM18_1276     TRUE 0.894 -19.000 0.000 NA   NA
 195923 195924 spyM18_1276 spyM18_1277     TRUE 0.957 12.000 0.250 NA   NA
 195924 195925 spyM18_1277 spyM18_1278     TRUE 0.990 -28.000 0.000 0.002   NA
 195925 195926 spyM18_1278 spyM18_1279     FALSE 0.018 543.000 0.000 NA   NA
 195926 195927 spyM18_1279 spyM18_1280     TRUE 0.718 25.000 0.000 NA   NA
 195927 195928 spyM18_1280 spyM18_1281     TRUE 0.817 3.000 0.000 NA   NA
 195928 195929 spyM18_1281 spyM18_1282     TRUE 0.825 2.000 0.000 NA   NA
 195929 195930 spyM18_1282 spyM18_1283     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195930 195931 spyM18_1283 spyM18_1284     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195931 195932 spyM18_1284 spyM18_1285     TRUE 0.893 -16.000 0.000 NA   NA
 195932 195933 spyM18_1285 spyM18_1286     FALSE 0.076 242.000 0.000 NA   NA
 195933 195934 spyM18_1286 spyM18_1287     TRUE 0.893 -16.000 0.000 NA   NA
 195934 195935 spyM18_1287 spyM18_1288     TRUE 0.894 20.000 0.080 NA   NA
 195935 195936 spyM18_1288 spyM18_1289     FALSE 0.065 257.000 0.000 NA   NA
 195936 195937 spyM18_1289 spyM18_1290     TRUE 0.909 18.000 0.100 NA   NA
 195937 195938 spyM18_1290 spyM18_1291     TRUE 0.983 5.000 0.600 NA   NA
 195938 195939 spyM18_1291 spyM18_1292     TRUE 0.838 72.000 0.400 NA   NA
 195939 195940 spyM18_1292 spyM18_1293     TRUE 0.968 -3.000 0.200 NA   NA
 195940 195941 spyM18_1293 spyM18_1294     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195941 195942 spyM18_1294 spyM18_1295     TRUE 0.844 0.000 0.000 NA   NA
 195942 195943 spyM18_1295 spyM18_1296     TRUE 0.893 -16.000 0.000 NA   NA
 195943 195944 spyM18_1296 spyM18_1297     TRUE 0.893 -16.000 0.000 NA   NA
 195944 195945 spyM18_1297 spyM18_1298     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 195945 195946 spyM18_1298 spyM18_1299     FALSE 0.223 78.000 0.000 1.000   NA
 195947 195948 spyM18_1300 spyM18_1301     FALSE 0.064 259.000 0.000 NA   NA
 195948 195949 spyM18_1301 spyM18_1302     FALSE 0.193 131.000 0.000 NA   NA
 195953 195954 spyM18_1306 spyM18_1307     TRUE 0.676 13.000 0.000 1.000   NA
 195956 195957 spyM18_1309 spyM18_1310 int   FALSE 0.033 363.000 0.000 NA   NA
 195958 195959 spyM18_1311 spyM18_1312 glgP malQ TRUE 0.990 35.000 0.289 0.020 Y NA
 195959 195960 spyM18_1312 spyM18_1313 malQ malR TRUE 0.672 116.000 0.538 1.000 N NA
 195961 195962 spyM18_1314 spyM18_1315 malE malF TRUE 0.872 274.000 0.690 0.034 Y NA
 195962 195963 spyM18_1315 spyM18_1316 malF malG TRUE 0.999 0.000 0.793 0.034 Y NA
 195964 195965 spyM18_1319 spyM18_1320     FALSE 0.032 366.000 0.000 NA   NA
 195965 195966 spyM18_1320 spyM18_1321     TRUE 0.730 31.000 0.042 NA N NA
 195966 195967 spyM18_1321 spyM18_1322     TRUE 0.986 -7.000 0.409 NA   NA
 195967 195968 spyM18_1322 spyM18_1323     TRUE 0.968 18.000 0.387 NA   NA
 195968 195969 spyM18_1323 spyM18_1324   dltA TRUE 0.980 -3.000 0.435 NA N NA
 195969 195970 spyM18_1324 spyM18_1325 dltA   TRUE 0.980 12.000 0.549 NA   NA
 195970 195971 spyM18_1325 spyM18_1326   uvrB FALSE 0.063 263.000 0.000 NA   NA
 195972 195973 spyM18_1327 spyM18_1328 glnH glnQ TRUE 0.983 0.000 0.326 1.000 Y NA
 195974 195975 spyM18_1329 spyM18_1331     TRUE 0.965 -3.000 0.182 NA   NA
 195975 195976 spyM18_1331 spyM18_1332     FALSE 0.445 190.000 0.273 NA   NA
 195976 195977 spyM18_1332 spyM18_1333   ptcA TRUE 0.987 -3.000 0.500 NA   NA
 195977 195978 spyM18_1333 spyM18_1334 ptcA ptcB TRUE 0.998 3.000 0.500 0.014 Y NA
 195978 195979 spyM18_1334 spyM18_1335 ptcB   TRUE 0.966 23.000 0.064 0.014 N NA
 195979 195980 spyM18_1335 spyM18_1336     FALSE 0.340 106.000 0.064 1.000   NA
 195980 195981 spyM18_1336 spyM18_1338   bglA TRUE 0.972 9.000 0.500 1.000   NA
 195983 195984 spyM18_1340 spyM18_1342   obgE FALSE 0.488 69.000 0.009 NA   NA
 195984 195985 spyM18_1342 spyM18_1343 obgE   TRUE 0.537 62.000 0.011 NA   NA
 195986 195987 spyM18_1344 spyM18_1345 tra   TRUE 0.969 21.000 0.000 0.062 Y NA
 195989 195990 spyM18_1347 spyM18_1348     FALSE 0.350 78.000 0.000 NA   NA
 195995 195996 spyM18_1357 spyM18_1358     FALSE 0.315 85.000 0.000 NA   NA
 195996 195997 spyM18_1358 spyM18_1359     FALSE 0.154 159.000 0.000 NA   NA
 195997 195998 spyM18_1359 spyM18_1360     TRUE 0.614 39.000 0.000 NA   NA
 195998 195999 spyM18_1360 spyM18_1362     TRUE 0.574 49.000 0.093 1.000 N NA
 195999 196000 spyM18_1362 spyM18_1363   aroK FALSE 0.134 208.000 0.111 1.000 N NA
 196000 196001 spyM18_1363 spyM18_1364 aroK aroA TRUE 0.955 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 196001 196002 spyM18_1364 spyM18_1365 aroA   FALSE 0.195 111.000 0.003 1.000   NA
 196002 196003 spyM18_1365 spyM18_1366   map TRUE 0.966 2.000 0.373 1.000   NA
 196003 196004 spyM18_1366 spyM18_1367 map   TRUE 0.910 16.000 0.235 1.000 N NA
 196004 196005 spyM18_1367 spyM18_1368     TRUE 0.944 9.000 0.342 1.000 N NA
 196005 196006 spyM18_1368 spyM18_1369   grab FALSE 0.043 238.000 0.000 1.000   NA
 196006 196007 spyM18_1369 spyM18_1371 grab murA FALSE 0.018 357.000 0.000 1.000   NA
 196007 196008 spyM18_1371 spyM18_1372 murA metK FALSE 0.098 173.000 0.026 1.000 N NA
 196008 196009 spyM18_1372 spyM18_1373 metK   FALSE 0.010 537.000 0.000 1.000   NA
 196011 196012 spyM18_1375 spyM18_1376   dnaX TRUE 0.849 26.000 0.067 NA   NA
 196012 196013 spyM18_1376 spyM18_1377 dnaX   TRUE 0.868 0.000 0.030 NA N NA
 196015 196016 spyM18_1379 spyM18_1380   udk FALSE 0.437 80.000 0.010 NA   NA
 196018 196019 spyM18_1382 spyM18_1383 deadD2 gapN FALSE 0.202 96.000 0.028 1.000 N NA
 196019 196020 spyM18_1383 spyM18_1384 gapN pts1 FALSE 0.097 185.000 0.035 1.000 N NA
 196020 196021 spyM18_1384 spyM18_1385 pts1   TRUE 0.995 5.000 0.240 0.014 Y NA
 196022 196023 spyM18_1386 spyM18_1387 nrdH nrdE TRUE 0.961 20.000 0.562 1.000 N NA
 196023 196024 spyM18_1387 spyM18_1389 nrdE nrdF TRUE 0.850 333.000 0.500 0.002 Y NA
 196024 196025 spyM18_1389 spyM18_1390 nrdF   TRUE 0.905 -25.000 0.083 1.000 N NA
 196025 196026 spyM18_1390 spyM18_1391     FALSE 0.166 96.000 0.000 1.000   NA
 196027 196028 spyM18_1394 spyM18_1395     TRUE 0.895 19.000 0.077 NA   NA
 196028 196029 spyM18_1395 spyM18_1396     TRUE 0.981 -3.000 0.362 NA   NA
 196029 196030 spyM18_1396 spyM18_1397     TRUE 0.642 35.000 0.000 NA   NA
 196030 196031 spyM18_1397 spyM18_1399   alaS FALSE 0.127 185.000 0.000 NA   NA
 196031 5915075 spyM18_1399 spyM18_1400 alaS prsA FALSE 0.005 387.000 0.000 1.000 N NA
 5915075 10350598 spyM18_1400 spyM18_1401 prsA   FALSE 0.416 63.000 0.012 1.000   NA
 10350598 196034 spyM18_1401 spyM18_1402     FALSE 0.393 66.000 0.012 1.000   NA
 196034 196035 spyM18_1402 spyM18_1403   pepB FALSE 0.006 376.000 0.000 1.000 N NA
 196035 196036 spyM18_1403 spyM18_1405 pepB   TRUE 0.948 13.000 0.204 NA   NA
 196036 196037 spyM18_1405 spyM18_1406     FALSE 0.083 295.000 0.020 NA   NA
 196037 196038 spyM18_1406 spyM18_1407   nagB FALSE 0.339 71.000 0.051 1.000 N NA
 196039 196040 spyM18_1408 spyM18_1409 queA   TRUE 0.760 7.000 0.004 1.000   NA
 196041 196042 spyM18_1411 spyM18_1412     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 196042 196043 spyM18_1412 spyM18_1413     FALSE 0.467 56.000 0.000 NA   NA
 196043 196044 spyM18_1413 spyM18_1414   sodA FALSE 0.147 167.000 0.000 NA   NA
 196044 196045 spyM18_1414 spyM18_1415 sodA   FALSE 0.162 97.000 0.012 1.000 N NA
 196045 196046 spyM18_1415 spyM18_1416     TRUE 0.620 71.000 0.163 1.000   NA
 196046 196047 spyM18_1416 spyM18_1417     TRUE 0.949 -19.000 0.130 1.000   NA
 196047 196048 spyM18_1417 spyM18_1418     FALSE 0.065 199.000 0.014 1.000 N NA
 196049 196050 spyM18_1419 spyM18_1420     TRUE 0.965 -10.000 0.209 1.000   NA
 196051 196052 spyM18_1423 spyM18_1424   deaD FALSE 0.103 127.000 0.007 1.000 N NA
 196052 196053 spyM18_1424 spyM18_1425 deaD   FALSE 0.081 307.000 0.000 1.000 Y NA
 196053 196054 spyM18_1425 spyM18_1428     FALSE 0.092 248.000 0.003 NA   NA
 196054 196055 spyM18_1428 spyM18_1429     TRUE 0.561 80.000 0.078 NA   NA
 196055 196056 spyM18_1429 spyM18_1431     TRUE 0.764 199.000 0.046 0.010 Y NA
 196056 196057 spyM18_1431 spyM18_1432   recR FALSE 0.150 101.000 0.010 1.000 N NA
 196057 196058 spyM18_1432 spyM18_1435 recR   FALSE 0.013 1080.000 0.000 NA   NA
 196058 196059 spyM18_1435 spyM18_1437     FALSE 0.336 161.000 0.107 NA   NA
 196059 196060 spyM18_1437 spyM18_1439     FALSE 0.240 107.000 0.012 1.000   NA
 196062 196063 spyM18_1442 spyM18_1443     TRUE 0.503 72.000 0.018 NA   NA
 196063 196064 spyM18_1443 spyM18_1444     FALSE 0.019 531.000 0.000 NA   NA
 196065 196066 spyM18_1446 spyM18_1447     FALSE 0.060 269.000 0.000 NA   NA
 196067 196068 spyM18_1448 spyM18_1450     FALSE 0.225 116.000 0.000 NA   NA
 196068 196069 spyM18_1450 spyM18_1451     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 196069 196070 spyM18_1451 spyM18_1452     TRUE 0.797 10.000 0.000 NA   NA
 196070 196071 spyM18_1452 spyM18_1453     TRUE 0.817 3.000 0.000 NA   NA
 196071 196072 spyM18_1453 spyM18_1454     TRUE 0.801 12.000 0.000 NA   NA
 196072 196073 spyM18_1454 spyM18_1455   hylP TRUE 0.789 15.000 0.000 NA   NA
 196073 196074 spyM18_1455 spyM18_1456 hylP   TRUE 0.844 0.000 0.000 NA   NA
 196074 196075 spyM18_1456 spyM18_1457     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 196075 196078 spyM18_1457 spyM18_1461     FALSE 0.012 2013.000 0.000 NA   NA
 196078 196080 spyM18_1461 spyM18_1463     FALSE 0.016 700.000 0.000 NA   NA
 196080 196081 spyM18_1463 spyM18_1464     TRUE 0.988 15.000 0.833 NA   NA
 196081 196082 spyM18_1464 spyM18_1465     TRUE 0.952 11.000 0.222 NA   NA
 196082 196083 spyM18_1465 spyM18_1466     TRUE 0.975 12.000 0.444 NA   NA
 196083 196084 spyM18_1466 spyM18_1467     TRUE 0.989 1.000 0.750 NA   NA
 196084 196085 spyM18_1467 spyM18_1468     TRUE 0.987 -7.000 0.467 NA   NA
 196085 196086 spyM18_1468 spyM18_1469     TRUE 0.993 -31.000 0.667 NA   NA
 196086 196087 spyM18_1469 spyM18_1470     TRUE 0.797 10.000 0.000 NA   NA
 196087 196088 spyM18_1470 spyM18_1471     TRUE 0.844 0.000 0.000 NA   NA
 196088 196089 spyM18_1471 spyM18_1472     TRUE 0.959 25.000 0.417 NA   NA
 196089 196090 spyM18_1472 spyM18_1474     TRUE 0.735 82.000 0.263 NA   NA
 196090 196091 spyM18_1474 spyM18_1475     FALSE 0.327 82.000 0.000 NA   NA
 196091 196092 spyM18_1475 spyM18_1476     TRUE 0.895 -52.000 0.000 NA   NA
 196092 196093 spyM18_1476 spyM18_1479     FALSE 0.085 222.000 0.000 NA   NA
 196093 196094 spyM18_1479 spyM18_1480     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 196094 196095 spyM18_1480 spyM18_1481     TRUE 0.983 -7.000 0.353 NA   NA
 196095 196096 spyM18_1481 spyM18_1482     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 196096 196097 spyM18_1482 spyM18_1484     FALSE 0.166 150.000 0.000 NA   NA
 196097 196098 spyM18_1484 spyM18_1485     TRUE 0.643 108.000 0.250 NA   NA
 196098 196099 spyM18_1485 spyM18_1486     TRUE 0.938 76.000 1.000 NA   NA
 196099 196100 spyM18_1486 spyM18_1487     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 196100 196101 spyM18_1487 spyM18_1488     TRUE 0.542 48.000 0.000 NA   NA
 196101 196102 spyM18_1488 spyM18_1489     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 196102 196103 spyM18_1489 spyM18_1490     TRUE 0.695 28.000 0.000 NA   NA
 196103 196104 spyM18_1490 spyM18_1491     TRUE 0.892 -13.000 0.000 NA   NA
 196104 196105 spyM18_1491 spyM18_1492     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 196105 196106 spyM18_1492 spyM18_1493     FALSE 0.251 106.000 0.000 NA   NA
 196106 196107 spyM18_1493 spyM18_1494     TRUE 0.984 10.000 0.667 NA   NA
 196107 196108 spyM18_1494 spyM18_1495     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 196108 196109 spyM18_1495 spyM18_1496     TRUE 0.817 3.000 0.000 NA   NA
 196109 196110 spyM18_1496 spyM18_1497     FALSE 0.467 56.000 0.000 NA   NA
 196110 196111 spyM18_1497 spyM18_1498     TRUE 0.800 9.000 0.000 NA   NA
 196111 196112 spyM18_1498 spyM18_1499     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 196112 5915076 spyM18_1499 spyM18_1500     TRUE 0.894 -19.000 0.000 NA   NA
 5915076 10350599 spyM18_1500 spyM18_1501     FALSE 0.020 504.000 0.000 NA   NA
 10350599 196115 spyM18_1501 spyM18_1502     TRUE 0.825 2.000 0.000 NA   NA
 196115 196116 spyM18_1502 spyM18_1503     FALSE 0.059 270.000 0.000 NA   NA
 196117 196118 spyM18_1504 spyM18_1505     TRUE 0.801 12.000 0.000 NA   NA
 196118 196119 spyM18_1505 spyM18_1506   int FALSE 0.205 124.000 0.000 NA   NA
 196119 196120 spyM18_1506 spyM18_1508 int   FALSE 0.208 123.000 0.000 NA   NA
 196121 196122 spyM18_1509 spyM18_1510     TRUE 0.995 -22.000 0.828 NA   NA
 196122 196123 spyM18_1510 spyM18_1511     TRUE 0.975 -25.000 0.203 NA   NA
 196123 196124 spyM18_1511 spyM18_1512     FALSE 0.083 228.000 0.000 NA   NA
 196124 196125 spyM18_1512 spyM18_1513   recN FALSE 0.081 172.000 0.000 1.000   NA
 196125 196126 spyM18_1513 spyM18_1514 recN argR TRUE 0.690 22.000 0.037 1.000 N NA
 196126 196127 spyM18_1514 spyM18_1515 argR   TRUE 0.872 -13.000 0.048 1.000 N NA
 196127 196128 spyM18_1515 spyM18_1516   ispA TRUE 0.874 -7.000 0.058 1.000 N NA
 196128 196129 spyM18_1516 spyM18_1517 ispA   TRUE 0.872 0.000 0.100 1.000 N NA
 196129 196130 spyM18_1517 spyM18_1518     TRUE 0.999 -22.000 0.412 0.001 Y NA
 196130 196131 spyM18_1518 spyM18_1520   folD FALSE 0.131 153.000 0.045 1.000 N NA
 196131 196132 spyM18_1520 spyM18_1521 folD   FALSE 0.059 208.000 0.013 1.000 N NA
 196132 196133 spyM18_1521 spyM18_1523     FALSE 0.056 178.000 0.004 1.000 N NA
 196133 196134 spyM18_1523 spyM18_1524     FALSE 0.036 149.000 0.000 1.000 N NA
 196134 196135 spyM18_1524 spyM18_1525     TRUE 0.992 0.000 0.640 1.000 Y NA
 196135 196136 spyM18_1525 spyM18_1526     FALSE 0.334 127.000 0.044 NA   NA
 196137 196138 spyM18_1527 spyM18_1528 clp   FALSE 0.211 128.000 0.079 1.000 N NA
 196138 196139 spyM18_1528 spyM18_1529     TRUE 0.747 51.000 0.114 NA   NA
 196140 196141 spyM18_1531 spyM18_1532 ileS   FALSE 0.058 273.000 0.012 NA N NA
 196141 196142 spyM18_1532 spyM18_1533     TRUE 0.982 10.000 0.579 NA   NA
 196142 196143 spyM18_1533 spyM18_1534     TRUE 0.961 0.000 0.287 1.000   NA
 196143 196144 spyM18_1534 spyM18_1535     TRUE 0.971 5.000 0.370 NA   NA
 196144 196145 spyM18_1535 spyM18_1536     TRUE 0.945 12.000 0.194 NA   NA
 196145 196146 spyM18_1536 spyM18_1537   ftsZ TRUE 0.891 3.000 0.030 NA   NA
 196146 196147 spyM18_1537 spyM18_1538 ftsZ ftsA TRUE 0.976 24.000 0.460 1.000 Y NA
 196147 196148 spyM18_1538 spyM18_1540 ftsA ftsQ FALSE 0.410 212.000 0.389 NA N NA
 196148 196149 spyM18_1540 spyM18_1541 ftsQ murG TRUE 0.964 1.000 0.072 NA Y NA
 196149 196150 spyM18_1541 spyM18_1542 murG murD TRUE 0.969 -21.000 0.060 1.000 Y NA
 196150 196151 spyM18_1542 spyM18_1543 murD   FALSE 0.047 356.000 0.006 NA   NA
 196151 196152 spyM18_1543 spyM18_1544   typA FALSE 0.305 122.000 0.015 NA   NA
 196152 196153 spyM18_1544 spyM18_1545 typA   FALSE 0.106 183.000 0.003 NA N NA
 196153 196154 spyM18_1545 spyM18_1546     TRUE 0.861 10.000 0.064 NA N NA
 196154 196155 spyM18_1546 spyM18_1547     TRUE 0.979 5.000 0.496 NA   NA
 196155 196156 spyM18_1547 spyM18_1548     FALSE 0.321 142.000 0.058 NA   NA
 196158 196159 spyM18_1550 spyM18_1551     TRUE 0.877 4.000 0.016 NA   NA
 196159 196160 spyM18_1551 spyM18_1552     FALSE 0.024 424.000 0.000 NA   NA
 196160 196161 spyM18_1552 spyM18_1553     FALSE 0.005 414.000 0.000 1.000 N NA
 196161 196162 spyM18_1553 spyM18_1554     TRUE 0.876 -13.000 0.052 1.000 N NA
 196162 196163 spyM18_1554 spyM18_1555     TRUE 0.973 -10.000 0.367 1.000 N NA
 196163 196164 spyM18_1555 spyM18_1556     FALSE 0.102 123.000 0.006 1.000 N NA
 196164 196165 spyM18_1556 spyM18_1558     FALSE 0.077 313.000 0.000 1.000 Y NA
 196165 196166 spyM18_1558 spyM18_1560     TRUE 0.916 20.000 0.035 1.000 Y NA
 196166 196167 spyM18_1560 spyM18_1561     TRUE 0.894 17.000 0.140 1.000   NA
 196167 196168 spyM18_1561 spyM18_1562   arcB FALSE 0.245 170.000 0.104 1.000   NA
 196168 196169 spyM18_1562 spyM18_1563 arcB   TRUE 0.748 40.000 0.104 1.000   NA
 196169 196170 spyM18_1563 spyM18_1564   arcA FALSE 0.338 100.000 0.056 1.000   NA
 196170 196171 spyM18_1564 spyM18_1565 arcA   FALSE 0.011 274.000 0.000 1.000 N NA
 196173 196174 spyM18_1567 spyM18_1568     TRUE 0.810 23.000 0.009 NA   NA
 196174 196175 spyM18_1568 spyM18_1569     FALSE 0.336 73.000 0.007 1.000   NA
 196175 196176 spyM18_1569 spyM18_1570     TRUE 0.997 -3.000 0.480 0.011   NA
 196176 196177 spyM18_1570 spyM18_1571     TRUE 0.624 88.000 0.240 1.000   NA
 196177 196178 spyM18_1571 spyM18_1572     TRUE 0.980 43.000 0.875 1.000 Y NA
 196178 196179 spyM18_1572 spyM18_1573     TRUE 0.985 13.000 0.500 1.000 Y NA
 196179 196180 spyM18_1573 spyM18_1575     FALSE 0.244 221.000 0.000 0.066 N NA
 196180 196181 spyM18_1575 spyM18_1577     TRUE 0.708 92.000 0.375 1.000   NA
 196183 196184 spyM18_1579 spyM18_1581 valS   TRUE 0.874 2.000 0.008 NA   NA
 196184 196185 spyM18_1581 spyM18_1582     TRUE 0.927 -3.000 0.033 NA   NA
 196185 196186 spyM18_1582 spyM18_1583     FALSE 0.024 426.000 0.000 NA   NA
 196186 196187 spyM18_1583 spyM18_1584     TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 3820277 196188 spyM18_t47 spyM18_1585   aroA FALSE 0.075 243.000 0.000 NA   NA
 196188 196189 spyM18_1585 spyM18_1586 aroA aroB TRUE 0.955 56.000 0.003 0.003 Y NA
 196190 196191 spyM18_1588 spyM18_1589     TRUE 0.825 2.000 0.000 NA   NA
 196191 196192 spyM18_1589 spyM18_1590     TRUE 0.630 53.000 0.026 NA   NA
 196194 196195 spyM18_1592 spyM18_1594 aroE   FALSE 0.174 138.000 0.061 1.000 N NA
 196195 196196 spyM18_1594 spyM18_1595     TRUE 0.942 -70.000 0.167 1.000 N NA
 196196 196197 spyM18_1595 spyM18_1596     TRUE 0.995 0.000 0.167 0.011 Y NA
 196197 196198 spyM18_1596 spyM18_1597     TRUE 0.992 -10.000 0.667 NA   NA
 196198 196199 spyM18_1597 spyM18_1598     FALSE 0.044 306.000 0.000 NA   NA
 196199 196200 spyM18_1598 spyM18_1599     TRUE 0.963 81.000 0.333 0.033 Y NA
 196200 5915077 spyM18_1599 spyM18_1601     TRUE 0.998 10.000 0.917 0.033 Y NA
 196203 196204 spyM18_1605 spyM18_1606   hyl TRUE 0.888 24.000 0.182 1.000   NA
 196204 196205 spyM18_1606 spyM18_1609 hyl   TRUE 0.819 51.000 0.286 1.000   NA
 196206 196207 spyM18_1610 spyM18_1611     TRUE 0.921 15.000 0.194 1.000   NA
 196208 196209 spyM18_1614 spyM18_1615     FALSE 0.017 665.000 0.000 NA   NA
 196210 196211 spyM18_1616 spyM18_1617     FALSE 0.479 80.000 0.025 NA   NA
 196211 196212 spyM18_1617 spyM18_1618     FALSE 0.191 132.000 0.000 NA   NA
 196212 196213 spyM18_1618 spyM18_1619     FALSE 0.232 115.000 0.000 NA   NA
 3820278 3820279 spyM18_t67 spyM18_t48     TRUE 0.740 23.000 0.000 NA   NA
 3820279 3820280 spyM18_t48 spyM18_t49     TRUE 0.630 36.000 0.000 NA   NA
 3820280 3820281 spyM18_t49 spyM18_t50     TRUE 0.800 11.000 0.000 NA   NA
 3820281 3820282 spyM18_t50 spyM18_t51     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 3820282 3820283 spyM18_t51 spyM18_t52     TRUE 0.665 32.000 0.000 NA   NA
 3820283 3820284 spyM18_t52 spyM18_t53     TRUE 0.781 18.000 0.000 NA   NA
 3820284 196276 spyM18_t53 spyM18_17   glyQ TRUE 0.781 18.000 0.000 NA   NA
 196276 407382 spyM18_17 spyM18_r09 glyQ rrl FALSE 0.307 87.000 0.000 NA   NA
 407382 3820285 spyM18_r09 spyM18_t54 rrl   FALSE 0.047 299.000 0.000 NA   NA
 3820285 2155620 spyM18_t54 spyM18_r10     TRUE 0.514 50.000 0.000 NA   NA
 2155620 196216 spyM18_r10 spyM18_1623     FALSE 0.014 911.000 0.000 NA   NA
 196216 196217 spyM18_1623 spyM18_1624     TRUE 0.564 80.000 0.080 NA   NA
 196217 196218 spyM18_1624 spyM18_1625     TRUE 0.964 -28.000 0.130 NA   NA
 196219 196220 spyM18_1626 spyM18_1627   cysK FALSE 0.231 128.000 0.033 1.000   NA
 196221 196222 spyM18_1628 spyM18_1629     TRUE 0.932 0.000 0.151 1.000   NA
 196222 196223 spyM18_1629 spyM18_1630     TRUE 0.872 25.000 0.164 1.000   NA
 196223 196224 spyM18_1630 spyM18_1631     TRUE 0.999 -7.000 0.853 0.011 Y NA
 196224 196225 spyM18_1631 spyM18_1632     TRUE 0.991 -3.000 0.679 NA   NA
 196225 196226 spyM18_1632 spyM18_1634   pnk TRUE 0.538 72.000 0.039 NA   NA
 196226 196227 spyM18_1634 spyM18_1635 pnk   TRUE 0.994 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 196227 196228 spyM18_1635 spyM18_1637     TRUE 0.631 38.000 0.074 1.000 N NA
 196228 196229 spyM18_1637 spyM18_1638   fmt TRUE 0.988 -10.000 0.305 1.000 Y NA
 196229 196230 spyM18_1638 spyM18_1639 fmt priA FALSE 0.392 62.000 0.052 1.000 N NA
 196230 196231 spyM18_1639 spyM18_1640 priA   TRUE 0.790 65.000 0.032 0.059 N NA
 196231 196232 spyM18_1640 spyM18_1642   gmk TRUE 0.953 19.000 0.471 1.000 N NA
 196232 196233 spyM18_1642 spyM18_1643 gmk   FALSE 0.228 110.000 0.010 1.000   NA
 196233 196234 spyM18_1643 spyM18_1644     FALSE 0.168 130.000 0.006 1.000   NA
 196235 196236 spyM18_1645 spyM18_1646 atoB atoD TRUE 0.938 24.000 0.150 1.000 Y NA
 196236 196237 spyM18_1646 spyM18_1647 atoD atoA TRUE 0.997 2.000 0.200 0.002 Y NA
 196237 196238 spyM18_1647 spyM18_1649 atoA   TRUE 0.978 33.000 0.111 0.039 Y NA
 196238 196239 spyM18_1649 spyM18_1651     TRUE 0.769 71.000 0.333 1.000   NA
 196239 196240 spyM18_1651 spyM18_1653   luxS FALSE 0.016 519.000 0.006 1.000   NA
 196241 196242 spyM18_1655 spyM18_1656     TRUE 0.874 14.000 0.029 NA   NA
 196242 196243 spyM18_1656 spyM18_1658     FALSE 0.023 445.000 0.000 NA   NA
 196243 196244 spyM18_1658 spyM18_1659     TRUE 0.784 122.000 0.579 NA   NA
 196245 196246 spyM18_1660 spyM18_1661     TRUE 0.977 -13.000 0.319 1.000   NA
 196247 196248 spyM18_1662 spyM18_1663 pepC nadE FALSE 0.080 185.000 0.017 1.000 N NA
 196248 196249 spyM18_1663 spyM18_1664 nadE   TRUE 0.997 -3.000 0.194 0.003 Y NA
 196249 196250 spyM18_1664 spyM18_1665     FALSE 0.106 171.000 0.032 1.000 N NA
 196250 196251 spyM18_1665 spyM18_1666   trxB FALSE 0.109 169.000 0.033 1.000 N NA
 196251 196252 spyM18_1666 spyM18_1667 trxB   TRUE 0.681 64.000 0.117 NA   NA
 196252 196253 spyM18_1667 spyM18_1668     TRUE 0.731 104.000 0.364 NA   NA
 196253 196254 spyM18_1668 spyM18_1669     TRUE 0.982 0.000 0.310 1.000 Y NA
 196254 196255 spyM18_1669 spyM18_1670     FALSE 0.176 104.000 0.018 1.000 N NA
 196255 196256 spyM18_1670 spyM18_1673     FALSE 0.077 158.000 0.007 1.000 N NA
 196256 196257 spyM18_1673 spyM18_1674     TRUE 0.939 2.000 0.038 1.000 Y NA
 196257 196258 spyM18_1674 spyM18_1675     TRUE 0.960 4.000 0.456 1.000 N NA
 196258 196259 spyM18_1675 spyM18_1676     TRUE 0.817 5.000 0.077 1.000 N NA
 196259 196260 spyM18_1676 spyM18_1678     FALSE 0.081 231.000 0.000 NA   NA
 196260 196261 spyM18_1678 spyM18_1679   proA TRUE 0.770 20.000 0.000 NA   NA
 196261 196262 spyM18_1679 spyM18_1681 proA proB TRUE 0.998 -7.000 0.281 0.002 Y NA
 196262 196263 spyM18_1681 spyM18_1684 proB   TRUE 0.501 64.000 0.006 NA   NA
 196263 196264 spyM18_1684 spyM18_1685     TRUE 0.985 -37.000 0.341 NA   NA
 196264 196265 spyM18_1685 spyM18_1686     TRUE 0.859 34.000 0.136 NA   NA
 196265 196266 spyM18_1686 spyM18_1687     FALSE 0.470 192.000 0.300 NA   NA
 196266 196267 spyM18_1687 spyM18_1689     FALSE 0.163 218.000 0.000 1.000 Y NA
 196267 196268 spyM18_1689 spyM18_1692     FALSE 0.202 126.000 0.000 NA   NA
 196268 196269 spyM18_1692 spyM18_1693     TRUE 0.988 -10.000 0.462 NA   NA
 196269 196270 spyM18_1693 spyM18_1694   glpF TRUE 0.655 109.000 0.364 1.000   NA
 196270 196271 spyM18_1694 spyM18_1695 glpF glpA TRUE 0.968 2.000 0.500 1.000 N NA
 196271 196272 spyM18_1695 spyM18_1696 glpA glpK TRUE 0.998 16.000 0.500 0.001 Y NA
 196272 196273 spyM18_1696 spyM18_1698 glpK   FALSE 0.018 360.000 0.000 1.000   NA
 196273 196274 spyM18_1698 spyM18_1699     TRUE 0.550 67.000 0.029 NA   NA
 196274 5915078 spyM18_1699 spyM18_1700   glyS FALSE 0.269 144.000 0.020 NA   NA
 5915078 10350601 spyM18_1700 spyM18_1701 glyS glyQ TRUE 0.853 378.000 0.651 0.002 Y NA
 10350601 196277 spyM18_1701 spyM18_1703 glyQ   FALSE 0.016 371.000 0.000 1.000   NA
 196277 196278 spyM18_1703 spyM18_1704     FALSE 0.280 132.000 0.074 1.000   NA
 196278 196279 spyM18_1704 spyM18_1705   nagA FALSE 0.260 122.000 0.045 1.000   NA
 196279 196280 spyM18_1705 spyM18_1706 nagA   FALSE 0.248 118.000 0.090 1.000 N NA
 196284 196285 spyM18_1711 spyM18_1712     TRUE 0.905 2.000 0.047 NA   NA
 196285 196286 spyM18_1712 spyM18_1714     FALSE 0.162 209.000 0.019 NA   NA
 196286 196287 spyM18_1714 spyM18_1715     TRUE 0.986 82.000 0.833 0.002   NA
 196287 196288 spyM18_1715 spyM18_1716     TRUE 0.977 10.000 0.600 1.000   NA
 196288 196289 spyM18_1716 spyM18_1717     TRUE 0.998 15.000 0.500 0.002 Y NA
 196289 196290 spyM18_1717 spyM18_1719     FALSE 0.120 257.000 0.000 1.000 Y NA
 196290 196291 spyM18_1719 spyM18_1720     TRUE 0.971 29.000 0.000 0.017 Y NA
 196291 196292 spyM18_1720 spyM18_1721     TRUE 0.998 -7.000 0.429 0.013 Y NA
 196294 196295 spyM18_1723 spyM18_1724     TRUE 0.992 14.000 0.048 0.003 Y NA
 196295 196296 spyM18_1724 spyM18_1726     TRUE 0.892 -45.000 0.064 1.000 N NA
 196298 196299 spyM18_1728 spyM18_1729     TRUE 0.691 200.000 0.530 1.000 Y NA
 196299 196300 spyM18_1729 spyM18_1730     TRUE 0.972 20.000 0.223 NA Y NA
 196300 196301 spyM18_1730 spyM18_1731     TRUE 0.981 -7.000 0.408 NA N NA
 196301 196302 spyM18_1731 spyM18_1732   nusA TRUE 0.981 16.000 0.323 NA Y NA
 196302 196303 spyM18_1732 spyM18_1733 nusA   TRUE 0.755 175.000 0.759 NA   NA
 196303 3820286 spyM18_1733 spyM18_t55     FALSE 0.064 261.000 0.000 NA   NA
 3820286 196304 spyM18_t55 spyM18_1734     FALSE 0.409 65.000 0.000 NA   NA
 196304 196305 spyM18_1734 spyM18_1735     TRUE 0.951 0.000 0.154 NA   NA
 196305 196306 spyM18_1735 spyM18_1736     TRUE 0.588 64.000 0.107 NA N NA
 196306 196307 spyM18_1736 spyM18_1737     TRUE 0.925 3.000 0.167 NA N NA
 196308 196309 spyM18_1738 spyM18_1739     TRUE 0.938 -3.000 0.063 NA   NA
 196310 196311 spyM18_1741 spyM18_1742     TRUE 0.947 9.000 0.283 NA N NA
 196311 196312 spyM18_1742 spyM18_1743     TRUE 0.941 -25.000 0.033 NA   NA
 196312 196313 spyM18_1743 spyM18_1744     FALSE 0.214 154.000 0.008 NA   NA
 196313 196314 spyM18_1744 spyM18_1745     FALSE 0.036 339.000 0.000 NA   NA
 196316 196317 spyM18_1747 spyM18_1749     TRUE 0.658 33.000 0.000 NA   NA
 196317 196318 spyM18_1749 spyM18_1750     FALSE 0.243 110.000 0.000 NA   NA
 196320 196321 spyM18_1753 spyM18_1754     TRUE 0.800 11.000 0.000 NA   NA
 196321 196322 spyM18_1754 spyM18_1755     TRUE 0.817 3.000 0.000 NA   NA
 196322 196323 spyM18_1755 spyM18_1756     TRUE 0.801 12.000 0.000 NA   NA
 196323 196324 spyM18_1756 spyM18_1757   hylP TRUE 0.666 15.000 0.000 1.000   NA
 196324 196325 spyM18_1757 spyM18_1761 hylP   FALSE 0.012 1987.000 0.000 NA   NA
 196325 196326 spyM18_1761 spyM18_1762     TRUE 0.968 -3.000 0.200 NA   NA
 196326 196327 spyM18_1762 spyM18_1763     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 196327 196328 spyM18_1763 spyM18_1764     TRUE 0.890 -10.000 0.000 NA   NA
 196328 196329 spyM18_1764 spyM18_1765     TRUE 0.938 4.000 0.150 NA   NA
 196329 196330 spyM18_1765 spyM18_1766     TRUE 0.974 44.000 1.000 NA   NA
 196330 196331 spyM18_1766 spyM18_1767     TRUE 0.993 0.000 1.000 NA   NA
 196331 196332 spyM18_1767 spyM18_1769     TRUE 0.966 -3.000 0.188 NA   NA
 196332 196333 spyM18_1769 spyM18_1770     TRUE 0.981 0.000 0.438 NA   NA
 196333 196334 spyM18_1770 spyM18_1771     TRUE 0.984 -37.000 0.333 NA   NA
 196334 196335 spyM18_1771 spyM18_1772     FALSE 0.480 54.000 0.000 NA   NA
 196335 196336 spyM18_1772 spyM18_1774     TRUE 0.812 4.000 0.000 NA   NA
 196336 196337 spyM18_1774 spyM18_1775     FALSE 0.202 126.000 0.000 NA   NA
 196337 196338 spyM18_1775 spyM18_1776     FALSE 0.307 87.000 0.000 NA   NA
 196338 196339 spyM18_1776 spyM18_1777     TRUE 0.844 0.000 0.000 NA   NA
 196339 196340 spyM18_1777 spyM18_1778     TRUE 0.982 5.000 0.567 NA   NA
 196340 196341 spyM18_1778 spyM18_1779     TRUE 0.970 -85.000 0.167 NA   NA
 196341 196342 spyM18_1779 spyM18_1780     TRUE 0.661 83.000 0.182 NA   NA
 196342 196343 spyM18_1780 spyM18_1781     TRUE 0.501 51.000 0.000 NA   NA
 196343 196344 spyM18_1781 spyM18_1782     FALSE 0.437 61.000 0.000 NA   NA
 196344 196345 spyM18_1782 spyM18_1783     FALSE 0.208 123.000 0.000 NA   NA
 196345 196346 spyM18_1783 spyM18_1784     TRUE 0.818 -21.000 0.000 1.000   NA
 196346 196347 spyM18_1784 spyM18_1785     FALSE 0.022 464.000 0.000 NA   NA
 196347 196348 spyM18_1785 spyM18_1786     FALSE 0.057 274.000 0.000 NA   NA
 196348 196349 spyM18_1786 spyM18_1787     TRUE 0.987 -3.000 0.500 NA   NA
 196349 196350 spyM18_1787 spyM18_1788     FALSE 0.213 121.000 0.000 NA   NA
 196350 196351 spyM18_1788 spyM18_1789     TRUE 0.825 2.000 0.000 NA   NA
 196351 196352 spyM18_1789 spyM18_1790     TRUE 0.800 11.000 0.000 NA   NA
 196352 196353 spyM18_1790 spyM18_1791     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 196353 196354 spyM18_1791 spyM18_1792     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 196354 196355 spyM18_1792 spyM18_1793     FALSE 0.076 242.000 0.000 NA   NA
 196355 196356 spyM18_1793 spyM18_1794     TRUE 0.920 -3.000 0.018 NA   NA
 196356 196357 spyM18_1794 spyM18_1795   ssb FALSE 0.179 209.000 0.000 1.000 Y NA
 196357 196358 spyM18_1795 spyM18_1796 ssb   TRUE 0.960 -7.000 0.125 NA   NA
 196358 196359 spyM18_1796 spyM18_1797     TRUE 0.938 1.000 0.125 NA   NA
 196359 196360 spyM18_1797 spyM18_1798     TRUE 0.948 22.000 0.286 NA   NA
 196360 196361 spyM18_1798 spyM18_1799     TRUE 0.993 -19.000 0.667 NA   NA
 196361 5915079 spyM18_1799 spyM18_1800     TRUE 0.985 11.000 0.667 NA   NA
 5915079 10350602 spyM18_1800 spyM18_1801     TRUE 0.844 0.000 0.000 NA   NA
 10350602 196364 spyM18_1801 spyM18_1803     TRUE 0.797 10.000 0.000 NA   NA
 196364 196365 spyM18_1803 spyM18_1804     TRUE 0.792 14.000 0.000 NA   NA
 196365 196366 spyM18_1804 spyM18_1802     FALSE 0.064 911.000 0.000 0.057   NA
 196367 196368 spyM18_1805 spyM18_1806     FALSE 0.029 385.000 0.000 NA   NA
 196368 196369 spyM18_1806 spyM18_1808   int FALSE 0.134 178.000 0.000 NA   NA
 196369 196370 spyM18_1808 spyM18_1809 int   FALSE 0.098 148.000 0.000 1.000   NA
 196370 196371 spyM18_1809 spyM18_1810     FALSE 0.019 352.000 0.000 1.000   NA
 196371 196372 spyM18_1810 spyM18_1811     TRUE 0.989 89.000 0.943 0.017 Y NA
 196372 196373 spyM18_1811 spyM18_1812     TRUE 0.998 17.000 0.812 0.017 Y NA
 196373 196374 spyM18_1812 spyM18_1813     TRUE 0.809 114.000 0.583 NA   NA
 196374 196375 spyM18_1813 spyM18_1814   serS FALSE 0.035 392.000 0.003 NA   NA
 196376 196377 spyM18_1815 spyM18_1816 accA accD TRUE 0.998 -3.000 0.234 0.002 Y NA
 196377 196378 spyM18_1816 spyM18_1817 accD accC TRUE 0.994 9.000 0.090 0.002 Y NA
 196378 196379 spyM18_1817 spyM18_1818 accC   TRUE 0.872 32.000 0.045 1.000 Y NA
 196379 196380 spyM18_1818 spyM18_1819   accB TRUE 0.993 0.000 0.047 0.007 Y NA
 196380 196381 spyM18_1819 spyM18_1820 accB   TRUE 0.950 2.000 0.074 1.000 Y NA
 196381 196382 spyM18_1820 spyM18_1821     TRUE 0.931 15.000 0.056 1.000 Y NA
 196382 196383 spyM18_1821 spyM18_1822     TRUE 0.999 -10.000 0.432 0.007 Y NA
 196383 196384 spyM18_1822 spyM18_1823     TRUE 0.829 25.000 0.099 1.000   NA
 196384 196385 spyM18_1823 spyM18_1825     FALSE 0.301 201.000 0.216 1.000   NA
 196385 196386 spyM18_1825 spyM18_1826     TRUE 0.925 61.000 0.065 0.007   NA
 196386 196387 spyM18_1826 spyM18_1827     TRUE 0.834 1.000 0.070 1.000 N NA
 196387 196388 spyM18_1827 spyM18_1829     FALSE 0.406 77.000 0.098 1.000 N NA
 196388 196389 spyM18_1829 spyM18_1830   dnaJ FALSE 0.017 221.000 0.000 1.000 N NA
 196389 196390 spyM18_1830 spyM18_1831 dnaJ dnaK TRUE 0.763 281.000 0.196 0.003 Y NA
 196390 196391 spyM18_1831 spyM18_1832 dnaK grpE TRUE 0.797 181.000 0.026 0.007 Y NA
 196391 196392 spyM18_1832 spyM18_1833 grpE hrcA TRUE 0.789 3.000 0.051 1.000 N NA
 196392 196393 spyM18_1833 spyM18_1834 hrcA   FALSE 0.099 134.000 0.009 1.000 N NA
 196393 196394 spyM18_1834 spyM18_1835     TRUE 0.929 -3.000 0.174 1.000 N NA
 196394 196395 spyM18_1835 spyM18_1836     TRUE 0.941 -10.000 0.174 1.000 N NA
 196395 196396 spyM18_1836 spyM18_1837     FALSE 0.015 392.000 0.000 1.000   NA
 196396 196397 spyM18_1837 spyM18_1838     FALSE 0.091 218.000 0.000 NA   NA
 196397 196398 spyM18_1838 spyM18_1839   gatB TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 196398 196399 spyM18_1839 spyM18_1840 gatB gatA TRUE 0.999 0.000 0.492 0.002 Y NA
 196399 196400 spyM18_1840 spyM18_1841 gatA gatC TRUE 0.999 0.000 0.643 0.002 Y NA
 196400 196401 spyM18_1841 spyM18_1844 gatC   FALSE 0.002 994.000 0.000 1.000 N NA
 196401 196402 spyM18_1844 spyM18_1846     FALSE 0.188 147.000 0.083 1.000 N NA
 196402 196403 spyM18_1846 spyM18_1849     FALSE 0.055 218.000 0.015 1.000 N NA
 196407 196408 spyM18_1855 spyM18_1856     TRUE 0.797 13.000 0.000 NA   NA
 196408 196409 spyM18_1856 spyM18_1857   recG FALSE 0.010 292.000 0.000 1.000 N NA
 196409 196410 spyM18_1857 spyM18_1859 recG   FALSE 0.016 375.000 0.000 1.000   NA
 196410 196411 spyM18_1859 spyM18_1860     TRUE 0.983 -54.000 0.429 1.000   NA
 196411 196412 spyM18_1860 spyM18_1861     TRUE 0.988 -3.000 0.562 NA   NA
 196412 196413 spyM18_1861 spyM18_1862     TRUE 0.944 -3.000 0.081 NA   NA
 196413 196414 spyM18_1862 spyM18_1863     TRUE 0.998 -7.000 0.576 0.007 N NA
 196414 196415 spyM18_1863 spyM18_1865     TRUE 0.845 -3.000 0.047 1.000 N NA
 196415 196416 spyM18_1865 spyM18_1866     TRUE 0.994 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 196416 196417 spyM18_1866 spyM18_1867     TRUE 0.994 2.000 0.877 1.000 Y NA
 196417 196418 spyM18_1867 spyM18_1868     FALSE 0.065 197.000 0.000 1.000   NA
 196418 196419 spyM18_1868 spyM18_1870   isp FALSE 0.021 490.000 0.000 NA   NA
 196419 196420 spyM18_1870 spyM18_1871 isp   FALSE 0.437 87.000 0.022 NA   NA
 196420 196421 spyM18_1871 spyM18_1872   acpS TRUE 0.888 -3.000 0.093 1.000 N NA
 196421 196422 spyM18_1872 spyM18_1873 acpS secA FALSE 0.120 116.000 0.008 1.000 N NA
 196424 196425 spyM18_1876 spyM18_1877 manA   TRUE 0.808 95.000 0.333 1.000 Y NA
 196425 196426 spyM18_1877 spyM18_1880     FALSE 0.034 264.000 0.000 1.000   NA
 196426 196427 spyM18_1880 spyM18_1881     FALSE 0.045 231.000 0.000 1.000   NA
 196428 196429 spyM18_1882 spyM18_1883     TRUE 0.970 5.000 0.571 1.000 N NA
 196430 196431 spyM18_1884 spyM18_1886     TRUE 0.978 -7.000 0.265 NA   NA
 196431 196432 spyM18_1886 spyM18_1887   efp TRUE 0.704 46.000 0.031 NA   NA
 196432 196433 spyM18_1887 spyM18_1888 efp   FALSE 0.129 96.000 0.005 1.000 N NA
 196433 196434 spyM18_1888 spyM18_1889   pepP TRUE 0.523 35.000 0.018 1.000 N NA
 196434 196435 spyM18_1889 spyM18_1890 pepP uvrA FALSE 0.118 116.000 0.008 1.000 N NA
 196436 196437 spyM18_1893 spyM18_1894     FALSE 0.360 133.000 0.072 NA   NA
 196438 196439 spyM18_1895 spyM18_1896 rpsR ssb FALSE 0.083 165.000 0.012 1.000 N NA
 196439 196440 spyM18_1896 spyM18_1897 ssb rpS6 TRUE 0.605 22.000 0.012 1.000 N NA
 196440 196441 spyM18_1897 spyM18_1898 rpS6   FALSE 0.141 173.000 0.000 NA   NA
 196442 196443 spyM18_1899 spyM18_1900 mutY   FALSE 0.053 177.000 0.002 1.000 N NA
 196444 196445 spyM18_1901 spyM18_1902 trxA   FALSE 0.409 81.000 0.053 1.000   NA
 196445 196446 spyM18_1902 spyM18_1903     TRUE 0.779 4.000 0.005 1.000   NA
 196446 196447 spyM18_1903 spyM18_1904     FALSE 0.245 149.000 0.070 1.000   NA
 196447 196448 spyM18_1904 spyM18_1905     TRUE 0.885 3.000 0.019 NA   NA
 196449 196450 spyM18_1906 spyM18_1907   lepB TRUE 0.815 11.000 0.080 1.000 N NA
 196450 196451 spyM18_1907 spyM18_1908 lepB   TRUE 0.511 58.000 0.099 1.000 N NA
 196451 196452 spyM18_1908 spyM18_1909     FALSE 0.456 91.000 0.050 NA   NA
 196455 196456 spyM18_1913 spyM18_1914     TRUE 0.983 -15.000 0.326 NA   NA
 196458 196459 spyM18_1917 spyM18_1918   tra FALSE 0.038 141.000 0.000 1.000 N NA
 196459 196460 spyM18_1918 spyM18_1920 tra   FALSE 0.007 329.000 0.000 1.000 N NA
 196461 196462 spyM18_1921 spyM18_1922     TRUE 0.837 22.000 0.081 1.000   NA
 196464 196465 spyM18_1925 spyM18_1926     FALSE 0.147 193.000 0.002 NA   NA
 196466 196467 spyM18_1927 spyM18_1928     FALSE 0.254 153.000 0.156 1.000 N NA
 196467 196468 spyM18_1928 spyM18_1929     TRUE 0.711 49.000 0.057 NA   NA
 196470 196471 spyM18_1931 spyM18_1932 deoC   TRUE 0.959 30.000 0.333 1.000 Y NA
 196471 196472 spyM18_1932 spyM18_1933   udp TRUE 0.901 21.000 0.015 1.000 Y NA
 196473 196474 spyM18_1935 spyM18_1936   rs14 FALSE 0.017 220.000 0.000 1.000 N NA
 196475 196476 spyM18_1937 spyM18_1938   rimI TRUE 0.812 -10.000 0.000 1.000   NA
 196476 196477 spyM18_1938 spyM18_1939 rimI   TRUE 0.818 -28.000 0.000 1.000   NA
 196478 196479 spyM18_1940 spyM18_1941     TRUE 0.984 2.000 0.576 NA   NA
 196480 196481 spyM18_1942 spyM18_1943 glnA glnR TRUE 0.768 38.000 0.179 1.000 N NA
 196481 196482 spyM18_1943 spyM18_1944 glnR   TRUE 0.707 67.000 0.154 NA   NA
 196482 196483 spyM18_1944 spyM18_1946   pgk FALSE 0.078 263.000 0.002 NA   NA
 196483 196484 spyM18_1946 spyM18_1947 pgk   FALSE 0.093 193.000 0.003 1.000   NA
 196484 196485 spyM18_1947 spyM18_1949     FALSE 0.045 230.000 0.000 1.000   NA
 196485 196486 spyM18_1949 spyM18_1950     FALSE 0.068 237.000 0.006 1.000   NA
 196486 196487 spyM18_1950 spyM18_1951     TRUE 0.986 0.000 0.567 NA   NA
 196487 196488 spyM18_1951 spyM18_1953   rl28 FALSE 0.276 152.000 0.044 NA   NA
 196488 196489 spyM18_1953 spyM18_1954 rl28   FALSE 0.005 381.000 0.000 1.000 N NA
 196489 3820287 spyM18_1954 spyM18_t56     FALSE 0.103 208.000 0.000 NA   NA
 3820287 196490 spyM18_t56 spyM18_1957     FALSE 0.480 54.000 0.000 NA   NA
 196490 196491 spyM18_1957 spyM18_1959   pyrG FALSE 0.072 213.000 0.002 1.000   NA
 196491 196492 spyM18_1959 spyM18_1960 pyrG rpoE FALSE 0.046 257.000 0.029 1.000 N NA
 196492 196493 spyM18_1960 spyM18_1961 rpoE ropA FALSE 0.040 217.000 0.005 1.000 N NA
 196495 196496 spyM18_1963 spyM18_1964     TRUE 0.929 14.000 0.149 NA   NA
 196496 196497 spyM18_1964 spyM18_1965   thiD TRUE 0.979 -10.000 0.276 NA   NA
 196497 196498 spyM18_1965 spyM18_1966 thiD truA TRUE 0.881 -10.000 0.058 1.000 N NA
 196498 196499 spyM18_1966 spyM18_1967 truA   FALSE 0.070 187.000 0.000 1.000   NA
 196499 3820288 spyM18_1967 spyM18_t57     TRUE 0.706 26.000 0.000 NA   NA
 3820288 3820289 spyM18_t57 spyM18_t58     FALSE 0.340 80.000 0.000 NA   NA
 3820289 196363 spyM18_t58 spyM18_18     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 196363 407383 spyM18_18 spyM18_r11   rrl FALSE 0.307 87.000 0.000 NA   NA
 407383 3820290 spyM18_r11 spyM18_t59 rrl   FALSE 0.047 299.000 0.000 NA   NA
 3820290 2155621 spyM18_t59 spyM18_r12     TRUE 0.514 50.000 0.000 NA   NA
 2155621 196500 spyM18_r12 spyM18_1973     FALSE 0.022 461.000 0.000 NA   NA
 196501 196502 spyM18_1974 spyM18_1975 hsdR hsdS TRUE 0.995 13.000 0.087 0.001 Y NA
 196502 196503 spyM18_1975 spyM18_1976 hsdS hsdM TRUE 0.982 13.000 0.022 0.056 Y NA
 196504 196505 spyM18_1977 spyM18_1978     FALSE 0.177 142.000 0.000 NA   NA
 196505 196506 spyM18_1978 spyM18_1979     TRUE 0.996 -19.000 0.704 NA Y NA
 196506 196507 spyM18_1979 spyM18_1980     TRUE 0.606 40.000 0.000 NA   NA
 196507 196508 spyM18_1980 spyM18_1981     TRUE 0.714 2.000 0.000 1.000   NA
 196508 196509 spyM18_1981 spyM18_1982     TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.020   NA
 196509 196510 spyM18_1982 spyM18_1983     FALSE 0.199 84.000 0.000 1.000   NA
 196510 196511 spyM18_1983 spyM18_1984     FALSE 0.011 504.000 0.000 1.000   NA
 196511 196512 spyM18_1984 spyM18_1985     FALSE 0.454 88.000 0.000 1.000 Y NA
 196512 196513 spyM18_1985 spyM18_1986     TRUE 0.995 0.000 0.150 0.012 Y NA
 196513 196514 spyM18_1986 spyM18_1987     TRUE 0.985 24.000 0.667 1.000 Y NA
 196514 196515 spyM18_1987 spyM18_1989     TRUE 0.990 4.000 0.000 0.002 Y NA
 196515 196516 spyM18_1989 spyM18_1990     TRUE 0.697 48.000 0.000 1.000 Y NA
 196516 196517 spyM18_1990 spyM18_1991     TRUE 0.977 35.000 0.000 0.002 Y NA
 196518 196519 spyM18_1993 spyM18_1994     FALSE 0.017 661.000 0.000 NA   NA
 196519 196520 spyM18_1994 spyM18_1995     TRUE 0.989 -10.000 0.500 NA   NA
 196521 196522 spyM18_1999 spyM18_2000 rpS9 rplM TRUE 0.997 21.000 0.601 0.022 Y NA
 196522 196523 spyM18_2000 spyM18_2001 rplM   FALSE 0.018 218.000 0.000 1.000 N NA
 196523 196524 spyM18_2001 spyM18_2002     TRUE 0.933 -3.000 0.051 NA   NA
 196524 196525 spyM18_2002 spyM18_2003     FALSE 0.184 136.000 0.000 NA   NA
 196525 196526 spyM18_2003 spyM18_2004     FALSE 0.413 97.000 0.036 NA   NA
 196526 196527 spyM18_2004 spyM18_2005     TRUE 0.926 4.000 0.109 NA   NA
 196527 196528 spyM18_2005 spyM18_2006     TRUE 0.615 47.000 0.003 NA   NA
 196528 196529 spyM18_2006 spyM18_2007     FALSE 0.117 196.000 0.000 NA   NA
 196529 196530 spyM18_2007 spyM18_2008     TRUE 0.944 -7.000 0.129 1.000   NA
 196530 196531 spyM18_2008 spyM18_2009     TRUE 0.742 28.000 0.002 NA   NA
 196531 196532 spyM18_2009 spyM18_2010     TRUE 0.797 13.000 0.000 NA   NA
 196532 196533 spyM18_2010 spyM18_2012     FALSE 0.080 236.000 0.000 NA   NA
 196533 196534 spyM18_2012 spyM18_2013     TRUE 0.916 9.000 0.097 NA   NA
 196534 196535 spyM18_2013 spyM18_2014   pnp TRUE 0.920 -7.000 0.009 NA   NA
 196535 196536 spyM18_2014 spyM18_2015 pnp   FALSE 0.010 280.000 0.000 1.000 N NA
 196536 196537 spyM18_2015 spyM18_2016     TRUE 0.848 10.000 0.056 1.000   NA
 196537 196538 spyM18_2016 spyM18_2017     TRUE 0.983 27.000 0.241 0.020   NA
 196538 196539 spyM18_2017 spyM18_2018     TRUE 0.987 -7.000 0.048 0.012 N NA
 196539 196540 spyM18_2018 spyM18_2020     FALSE 0.237 225.000 0.143 NA   NA
 196540 196541 spyM18_2020 spyM18_2021   rpS15 TRUE 0.914 -16.000 0.002 NA   NA
 196541 196542 spyM18_2021 spyM18_2023 rpS15   FALSE 0.138 176.000 0.000 NA   NA
 196543 196544 spyM18_2024 spyM18_2025   def FALSE 0.260 102.000 0.000 NA   NA
 196545 196546 spyM18_2026 spyM18_2027     TRUE 0.620 131.000 0.414 1.000   NA
 196546 196547 spyM18_2027 spyM18_2028   dnaE FALSE 0.169 110.000 0.020 1.000 N NA
 196547 196548 spyM18_2028 spyM18_2030 dnaE proS FALSE 0.332 254.000 0.070 0.044 N NA
 196548 196549 spyM18_2030 spyM18_2031 proS   FALSE 0.135 198.000 0.095 1.000 N NA
 196549 196550 spyM18_2031 spyM18_2032   cdsA FALSE 0.307 73.000 0.040 1.000 N NA
 196550 196551 spyM18_2032 spyM18_2033 cdsA uppS TRUE 0.949 13.000 0.113 1.000 Y NA
 196551 196552 spyM18_2033 spyM18_2035 uppS   FALSE 0.081 219.000 0.007 NA N NA
 196552 196553 spyM18_2035 spyM18_2037     FALSE 0.199 116.000 0.006 NA N NA
 196553 196554 spyM18_2037 spyM18_2038     FALSE 0.142 115.000 0.000 NA N NA
 196554 196555 spyM18_2038 spyM18_2039     TRUE 0.790 198.000 0.049 0.006 Y NA
 196555 196556 spyM18_2039 spyM18_2040     TRUE 0.601 129.000 0.171 1.000 Y NA
 196556 196557 spyM18_2040 spyM18_2041     FALSE 0.049 298.000 0.071 1.000 N NA
 196559 196560 spyM18_2044 spyM18_2045     TRUE 0.882 15.000 0.177 1.000 N NA
 196560 196561 spyM18_2045 spyM18_2046   spa FALSE 0.051 218.000 0.000 1.000   NA
 196562 196563 spyM18_2047 spyM18_2048   nrdI FALSE 0.057 210.000 0.000 NA N NA
 196564 196565 spyM18_2049 spyM18_2050   ptsG TRUE 0.873 83.000 0.610 NA   NA
 196565 196566 spyM18_2050 spyM18_2051 ptsG   FALSE 0.034 356.000 0.000 NA   NA
 196566 196567 spyM18_2051 spyM18_2052   prmA TRUE 0.965 0.000 0.227 NA   NA
 196567 196568 spyM18_2052 spyM18_2053 prmA   TRUE 0.497 71.000 0.013 NA   NA
 196569 196570 spyM18_2055 spyM18_2056     FALSE 0.026 185.000 0.000 1.000 N NA
 196570 196571 spyM18_2056 spyM18_2057     TRUE 0.836 33.000 0.009 1.000 Y NA
 196571 196572 spyM18_2057 spyM18_2058     TRUE 0.588 33.000 0.035 1.000 N NA
 196572 3820291 spyM18_2058 spyM18_t60     FALSE 0.052 286.000 0.000 NA   NA
 3820291 196573 spyM18_t60 spyM18_2060     FALSE 0.179 140.000 0.000 NA   NA
 196573 196574 spyM18_2060 spyM18_2061     FALSE 0.323 55.000 0.000 1.000   NA
 196578 196579 spyM18_2066 spyM18_2067 dppA dppB TRUE 0.804 113.000 0.000 0.030 Y NA
 196579 196580 spyM18_2067 spyM18_2068 dppB dppC TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.030 Y NA
 196580 196581 spyM18_2068 spyM18_2069 dppC dppD TRUE 0.978 12.000 0.333 1.000 Y NA
 196581 196582 spyM18_2069 spyM18_2070 dppD dppE TRUE 0.999 -16.000 0.750 0.020 Y NA
 196583 196584 spyM18_2071 spyM18_2072     FALSE 0.145 169.000 0.000 NA   NA
 196584 196585 spyM18_2072 spyM18_2073     TRUE 0.988 13.000 0.800 NA   NA
 196585 196586 spyM18_2073 spyM18_2074   scpA FALSE 0.038 252.000 0.000 1.000   NA
 196586 196587 spyM18_2074 spyM18_2076 scpA emm18 FALSE 0.269 335.000 0.000 0.006   NA
 196587 196588 spyM18_2076 spyM18_2077 emm18 mga FALSE 0.119 193.000 0.000 NA   NA
 196588 196589 spyM18_2077 spyM18_2080 mga   FALSE 0.016 676.000 0.000 NA   NA
 196589 196590 spyM18_2080 spyM18_2082   isp TRUE 0.936 78.000 1.000 NA   NA
 196590 196591 spyM18_2082 spyM18_2083 isp   TRUE 0.531 102.000 0.200 1.000   NA
 196591 196592 spyM18_2083 spyM18_2084     TRUE 0.991 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 196592 196593 spyM18_2084 spyM18_2087     TRUE 0.544 94.000 0.267 1.000 N NA
 196593 196594 spyM18_2087 spyM18_2089     TRUE 0.984 13.000 0.467 1.000 Y NA
 196594 196595 spyM18_2089 spyM18_2090     TRUE 0.981 -13.000 0.385 NA N NA
 196595 196596 spyM18_2090 spyM18_2091     FALSE 0.152 424.000 0.333 NA   NA
 196596 196597 spyM18_2091 spyM18_2092     FALSE 0.168 149.000 0.000 NA   NA
 196599 196600 spyM18_2097 spyM18_2099   speB FALSE 0.008 787.000 0.000 1.000   NA
 196600 196601 spyM18_2099 spyM18_2101 speB   FALSE 0.058 272.000 0.000 NA   NA
 196602 196603 spyM18_2102 spyM18_2103     FALSE 0.053 283.000 0.000 NA   NA
 196606 196607 spyM18_2108 spyM18_2109 gldA   TRUE 0.677 57.000 0.211 1.000 N NA
 196607 196608 spyM18_2109 spyM18_2110   pflD TRUE 0.945 13.000 0.368 1.000 N NA
 196608 196609 spyM18_2110 spyM18_2111 pflD   FALSE 0.140 211.000 0.132 1.000 N NA
 196609 196610 spyM18_2111 spyM18_2113     TRUE 0.999 10.000 0.889 0.012 Y NA
 196610 196611 spyM18_2113 spyM18_2114     TRUE 0.998 28.000 0.889 0.012 Y NA
 196611 196612 spyM18_2114 spyM18_2115     FALSE 0.060 289.000 0.091 1.000 N NA
 196612 196613 spyM18_2115 spyM18_2116     TRUE 0.961 16.000 0.188 1.000 Y NA
 196615 196616 spyM18_2119 spyM18_2120 secE   FALSE 0.019 215.000 0.000 1.000 N NA
 196616 196617 spyM18_2120 spyM18_2121   tdcF TRUE 0.711 39.000 0.062 NA N NA
 196618 196619 spyM18_2122 spyM18_2124     TRUE 0.541 77.000 0.056 NA   NA
 196622 196623 spyM18_2129 spyM18_2131 groL groS TRUE 0.987 36.000 0.160 0.006 Y NA
 196625 196626 spyM18_2134 spyM18_2135 clp   TRUE 0.943 0.000 0.188 NA N NA
 196626 196627 spyM18_2135 spyM18_2136   cspC FALSE 0.342 196.000 0.013 NA Y NA
 196627 3820292 spyM18_2136 spyM18_t61 cspC   FALSE 0.020 509.000 0.000 NA   NA
 196628 196629 spyM18_2137 spyM18_2138 ahpC   TRUE 0.983 21.000 0.551 1.000 Y NA
 196631 196632 spyM18_2141 spyM18_2142 hutU   TRUE 0.647 88.000 0.086 1.000 Y NA
 196632 196633 spyM18_2142 spyM18_2143     TRUE 0.956 11.000 0.143 1.000 Y NA
 196633 196634 spyM18_2143 spyM18_2144     TRUE 0.729 18.000 0.038 1.000 N NA
 196634 196635 spyM18_2144 spyM18_2145     TRUE 0.853 22.000 0.038 NA   NA
 196635 196636 spyM18_2145 spyM18_2146     FALSE 0.180 220.000 0.062 NA   NA
 196636 196637 spyM18_2146 spyM18_2147     TRUE 0.909 11.000 0.006 1.000 Y NA
 196637 196638 spyM18_2147 spyM18_2148     TRUE 0.771 186.000 0.000 0.002 Y NA
 196640 196641 spyM18_2151 spyM18_2152 rpsB   TRUE 0.862 134.000 0.748 1.000 Y NA
 196642 196643 spyM18_2153 spyM18_2154 pepO   FALSE 0.021 208.000 0.000 1.000 N NA
 196643 196644 spyM18_2154 spyM18_2155     TRUE 0.937 68.000 0.650 1.000 Y NA
 196647 196648 spyM18_2161 spyM18_2163     FALSE 0.024 609.000 0.007 NA   NA
 196649 196650 spyM18_2164 spyM18_2165 nrdG   TRUE 0.934 0.000 0.159 1.000   NA
 196650 196651 spyM18_2165 spyM18_2166     TRUE 0.837 9.000 0.041 1.000   NA
 196651 196652 spyM18_2166 spyM18_2167     TRUE 0.812 29.000 0.041 NA   NA
 196652 196653 spyM18_2167 spyM18_2168   nrdD FALSE 0.254 182.000 0.062 NA   NA
 196653 196654 spyM18_2168 spyM18_2169 nrdD   FALSE 0.444 97.000 0.057 NA   NA
 196654 196655 spyM18_2169 spyM18_2170     FALSE 0.026 413.000 0.000 NA   NA
 196655 196656 spyM18_2170 spyM18_2171     TRUE 0.984 12.000 0.651 NA   NA
 196656 196657 spyM18_2171 spyM18_2172     TRUE 0.988 -3.000 0.537 NA   NA
 196657 196658 spyM18_2172 spyM18_2173     FALSE 0.367 113.000 0.032 NA   NA
 196658 196659 spyM18_2173 spyM18_2174   recA FALSE 0.020 291.000 0.004 1.000 N NA
 196659 196660 spyM18_2174 spyM18_2175 recA cinA FALSE 0.420 89.000 0.083 1.000   NA
 196660 196661 spyM18_2175 spyM18_2176 cinA tag FALSE 0.375 69.000 0.011 1.000   NA
 196661 196662 spyM18_2176 spyM18_2177 tag ruvA TRUE 0.915 10.000 0.012 1.000 Y NA
 196662 196663 spyM18_2177 spyM18_2178 ruvA   TRUE 0.795 2.000 0.005 1.000   NA
 196663 196664 spyM18_2178 spyM18_2179     TRUE 0.770 11.000 0.006 1.000   NA
 196664 196665 spyM18_2179 spyM18_2180     TRUE 0.944 129.000 0.220 0.002 Y NA
 196665 196666 spyM18_2180 spyM18_2181     TRUE 0.939 -13.000 0.031 NA   NA
 196666 196667 spyM18_2181 spyM18_2182   argR FALSE 0.311 143.000 0.054 NA   NA
 196668 196669 spyM18_2183 spyM18_2184 argS   FALSE 0.444 88.000 0.032 NA   NA
 196670 196671 spyM18_2185 spyM18_2186     TRUE 0.958 43.000 0.667 NA   NA
 196671 196672 spyM18_2186 spyM18_2187     TRUE 0.925 20.000 0.156 NA   NA
 196672 196673 spyM18_2187 spyM18_2188   aspS TRUE 0.928 -7.000 0.016 NA   NA
 196673 196674 spyM18_2188 spyM18_2189 aspS hisS FALSE 0.491 338.000 0.161 0.043 Y NA
 196675 196676 spyM18_2190 spyM18_2196   rpmF FALSE 0.059 105.000 0.000 1.000 N NA
 196676 196677 spyM18_2196 spyM18_2197 rpmF rpmG TRUE 0.985 16.000 0.012 0.028 Y NA
 196677 196678 spyM18_2197 spyM18_2198 rpmG   FALSE 0.030 282.000 0.000 NA N NA
 196678 196679 spyM18_2198 spyM18_2199     TRUE 0.987 12.000 0.875 NA N NA
 196679 196680 spyM18_2199 spyM18_2201     FALSE 0.013 1024.000 0.000 NA   NA
 196680 196681 spyM18_2201 spyM18_2202     TRUE 0.740 23.000 0.000 NA   NA
 196681 196682 spyM18_2202 spyM18_2203     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 196682 196683 spyM18_2203 spyM18_2207     FALSE 0.013 1210.000 0.000 NA   NA
 196685 196686 spyM18_2210 spyM18_2211     TRUE 0.982 -13.000 0.300 NA   NA
 196686 196687 spyM18_2211 spyM18_2212     TRUE 0.981 -3.000 0.350 NA   NA
 196690 196691 spyM18_2215 spyM18_2216