MicrobesOnline Operon Predictions for Chlamydophila pneumoniae TW-183

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 654217 654218 CpB0002 CpB0003     TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 654218 654219 CpB0003 CpB0004     TRUE 0.996 17.000 0.643 0.005 Y NA
 654219 654220 CpB0004 CpB0005     TRUE 0.993 -3.000 0.492 0.005 Y NA
 654220 654221 CpB0005 CpB0006     FALSE 0.041 291.000 0.000 1.000   NA
 654223 654224 CpB0008 CpB0009     FALSE 0.020 365.000 0.000 NA   NA
 654224 654225 CpB0009 CpB0010     FALSE 0.100 127.000 0.000 NA   NA
 654225 654226 CpB0010 CpB0011     FALSE 0.044 201.000 0.000 NA   NA
 654226 654227 CpB0011 CpB0012     FALSE 0.124 94.000 0.000 NA   NA
 654227 654228 CpB0012 CpB0013     FALSE 0.083 143.000 0.000 NA   NA
 654228 654229 CpB0013 CpB0014     TRUE 0.687 27.000 0.000 NA   NA
 654229 654230 CpB0014 CpB0015     FALSE 0.022 348.000 0.000 NA   NA
 654230 654231 CpB0015 CpB0016     FALSE 0.437 -69.000 0.000 NA   NA
 654231 654232 CpB0016 CpB0017     FALSE 0.028 283.000 0.000 NA   NA
 654232 654233 CpB0017 CpB0018     FALSE 0.440 -66.000 0.000 NA   NA
 654233 654234 CpB0018 CpB0019     FALSE 0.085 239.000 0.000 0.039   NA
 654234 654235 CpB0019 CpB0020     FALSE 0.427 -82.000 0.000 NA   NA
 654235 654236 CpB0020 CpB0021     FALSE 0.080 145.000 0.000 NA   NA
 654236 654237 CpB0021 CpB0022     TRUE 0.814 16.000 0.000 NA   NA
 654237 654238 CpB0022 CpB0023     TRUE 0.919 16.000 0.000 0.039   NA
 654239 654240 CpB0024 CpB0025     TRUE 0.912 -10.000 0.500 NA   NA
 654240 654241 CpB0025 CpB0026     TRUE 0.821 -18.000 0.017 NA N NA
 654241 654242 CpB0026 CpB0027     TRUE 0.838 29.000 0.017 NA   NA
 654242 654243 CpB0027 CpB0028   xerC TRUE 0.648 43.000 0.010 1.000   NA
 654243 654244 CpB0028 CpB0029 xerC   FALSE 0.300 85.000 0.009 1.000   NA
 654244 654245 CpB0029 CpB0030     FALSE 0.068 155.000 0.000 NA   NA
 654245 654246 CpB0030 CpB0031     FALSE 0.072 150.000 0.000 NA   NA
 654246 654247 CpB0031 CpB0032     FALSE 0.025 306.000 0.000 NA   NA
 654247 654248 CpB0032 CpB0033     FALSE 0.187 62.000 0.000 NA   NA
 654249 654250 CpB0034 CpB0035     FALSE 0.114 179.000 0.006 1.000   NA
 654250 654251 CpB0035 CpB0036     TRUE 0.864 36.000 0.412 1.000   NA
 654251 654252 CpB0036 CpB0037     TRUE 0.630 37.000 0.000 1.000 N NA
 654253 654254 CpB0038 CpB0039     FALSE 0.140 109.000 0.002 NA   NA
 654255 654256 CpB0040 CpB0041     TRUE 0.661 -7.000 0.000 NA   NA
 654256 654257 CpB0041 CpB0042     TRUE 0.992 1.000 0.026 0.007 Y NA
 654258 654259 CpB0043 CpB0044     TRUE 0.544 65.000 0.411 NA   NA
 654260 654261 CpB0045 CpB0046     FALSE 0.210 58.000 0.000 NA   NA
 654261 654262 CpB0046 CpB0047     FALSE 0.020 371.000 0.000 NA   NA
 654262 654263 CpB0047 CpB0048     FALSE 0.048 189.000 0.000 NA   NA
 654263 654264 CpB0048 CpB0049     TRUE 0.571 32.000 0.000 NA   NA
 654265 654266 CpB0050 CpB0051     FALSE 0.045 200.000 0.000 NA   NA
 654268 654269 CpB0053 CpB0054     TRUE 0.789 -22.000 0.007 1.000 N NA
 654269 654270 CpB0054 CpB0055     TRUE 0.769 -34.000 0.007 1.000 N NA
 654271 654272 CpB0056 CpB0057     FALSE 0.069 360.000 0.034 NA   NA
 654272 654273 CpB0057 CpB0058     FALSE 0.247 185.000 0.067 1.000 N NA
 654273 654274 CpB0058 CpB0059     FALSE 0.349 82.000 0.009 1.000 N NA
 654274 654275 CpB0059 CpB0060     TRUE 0.561 51.000 0.008 1.000 N NA
 654275 654276 CpB0060 CpB0061   fruA TRUE 0.800 -22.000 0.008 1.000 N NA
 654276 654277 CpB0061 CpB0062 fruA ptsN TRUE 0.994 3.000 0.231 0.003 Y NA
 654277 654278 CpB0062 CpB0063 ptsN mst101 FALSE 0.404 97.000 0.231 NA   NA
 654278 654279 CpB0063 CpB0064 mst101   FALSE 0.028 279.000 0.000 NA   NA
 654279 654280 CpB0064 CpB0065     FALSE 0.106 114.000 0.000 NA   NA
 654280 654281 CpB0065 CpB0066     FALSE 0.023 324.000 0.000 NA   NA
 654281 654282 CpB0066 CpB0067     FALSE 0.030 271.000 0.000 NA   NA
 654282 654283 CpB0067 CpB0068     FALSE 0.026 295.000 0.000 NA   NA
 654286 654287 CpBt01 CpB0071     FALSE 0.142 73.000 0.000 NA   NA
 654287 654288 CpB0071 CpB0072     TRUE 0.946 9.000 0.054 NA   NA
 654289 654290 CpB0073 CpBt02     FALSE 0.131 81.000 0.000 NA   NA
 654290 654291 CpBt02 CpB0074     FALSE 0.332 45.000 0.000 NA   NA
 654291 654292 CpB0074 CpBt03     FALSE 0.414 41.000 0.000 NA   NA
 654292 654293 CpBt03 CpB0075   secE TRUE 0.595 31.000 0.000 NA   NA
 654293 654294 CpB0075 CpB0076 secE nusG TRUE 0.978 5.000 0.843 1.000 N NA
 654294 654295 CpB0076 CpB0077 nusG   TRUE 0.564 107.000 0.681 1.000 N NA
 654295 654296 CpB0077 CpB0078     TRUE 0.993 27.000 0.838 0.074 Y NA
 654296 654297 CpB0078 CpB0079     TRUE 0.994 16.000 0.302 1.000 Y NA
 654297 654298 CpB0079 CpB0080     TRUE 0.966 44.000 0.884 1.000 Y NA
 654298 654299 CpB0080 CpB0081     FALSE 0.415 137.000 0.223 1.000 N NA
 654299 654300 CpB0081 CpB0082     TRUE 0.995 24.000 0.851 0.003 Y NA
 654300 654301 CpB0082 CpB0083     FALSE 0.262 109.000 0.006 1.000 N NA
 654301 654302 CpB0083 CpB0084     TRUE 0.642 59.000 0.667 NA   NA
 654304 654305 CpB0086 CpB0087 HrpE   FALSE 0.282 49.000 0.000 NA   NA
 654305 654306 CpB0087 CpB0088     TRUE 0.932 -6.000 0.633 NA   NA
 654306 654307 CpB0088 CpB0089     TRUE 0.996 5.000 0.806 0.011 Y NA
 654307 654308 CpB0089 CpB0090     TRUE 0.990 -15.000 0.903 0.011 Y NA
 654308 654309 CpB0090 CpB0091   ntpI TRUE 0.989 -9.000 0.270 0.011 Y NA
 654309 654310 CpB0091 CpB0092 ntpI   TRUE 0.665 95.000 0.848 0.011   NA
 654310 654311 CpB0092 CpB0093     TRUE 0.696 -121.000 0.030 NA   NA
 654311 654312 CpB0093 CpB0094     FALSE 0.144 134.000 0.006 NA   NA
 654312 654313 CpB0094 CpB0095   pkn1 TRUE 0.908 21.000 0.006 1.000 N NA
 654316 654317 CpB0098 CpB0099     TRUE 0.662 53.000 0.429 NA   NA
 654317 654318 CpB0099 CpB0100     TRUE 0.475 36.000 0.000 NA   NA
 654318 654319 CpB0100 CpB0101     TRUE 0.789 -18.000 0.018 NA   NA
 654320 654321 CpB0102 CpB0103     TRUE 0.996 11.000 0.622 0.023 Y NA
 654322 654323 CpB0104 CpB0105     FALSE 0.359 151.000 0.750 NA   NA
 654325 654326 CpB0107 CpB0108     FALSE 0.055 174.000 0.000 NA   NA
 654326 654327 CpB0108 CpB0109     FALSE 0.124 94.000 0.000 NA   NA
 654329 654330 CpB0111 CpB0112     FALSE 0.204 197.000 0.333 NA   NA
 654331 654332 CpB0113 CpB0114     FALSE 0.375 239.000 0.005 1.000 Y NA
 654332 654333 CpB0114 CpB0115     TRUE 0.954 -34.000 0.009 1.000 Y NA
 654333 654334 CpB0115 CpB0116   ffh TRUE 0.924 15.000 0.005 1.000 N NA
 654334 654335 CpB0116 CpB0117 ffh   TRUE 0.936 -9.000 0.361 1.000 N NA
 654335 654336 CpB0117 CpB0118     TRUE 0.992 14.000 0.033 1.000 Y NA
 654336 654337 CpB0118 CpB0119     TRUE 0.988 28.000 0.567 1.000 Y NA
 654337 654338 CpB0119 CpB0120     TRUE 0.647 56.000 0.066 1.000 N NA
 654338 654339 CpB0120 CpB0121   gmk TRUE 0.864 -3.000 0.003 1.000 N NA
 654339 654340 CpB0121 CpB0122 gmk   TRUE 0.770 -3.000 0.003 NA   NA
 654340 654341 CpB0122 CpB0123     TRUE 0.860 0.000 0.008 NA   NA
 654343 654344 CpB0125 CpB0126     TRUE 0.722 25.000 0.000 NA   NA
 654349 654350 CpB0131 CpBt04     FALSE 0.141 74.000 0.000 NA   NA
 654351 654352 CpB0132 CpB0133     TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 654353 654354 CpB0134 CpB0135     FALSE 0.372 130.000 0.400 NA   NA
 654354 654355 CpB0135 CpB0136     TRUE 0.972 42.000 0.412 0.015 Y NA
 654355 654356 CpB0136 CpB0137     TRUE 0.445 118.000 0.188 1.000 N NA
 654356 654357 CpB0137 CpB0138   ybgI FALSE 0.267 98.000 0.013 NA   NA
 654357 654358 CpB0138 CpB0139 ybgI   FALSE 0.018 443.000 0.000 NA   NA
 654358 654359 CpB0139 CpB0140     FALSE 0.286 71.000 0.006 NA N NA
 654359 654360 CpB0140 CpB0141     TRUE 0.920 14.000 0.012 NA   NA
 654360 654361 CpB0141 CpB0142     TRUE 0.852 -3.000 0.011 NA   NA
 654361 654362 CpB0142 CpB0143     TRUE 0.818 11.000 0.000 NA   NA
 654362 654363 CpB0143 CpB0144     FALSE 0.103 120.000 0.000 NA   NA
 654364 654365 CpB0145 CpB0146     FALSE 0.091 241.000 0.009 1.000   NA
 654365 654366 CpB0146 CpB0147     FALSE 0.034 241.000 0.000 NA   NA
 654366 654367 CpB0147 CpB0148     FALSE 0.100 127.000 0.000 NA   NA
 654367 654368 CpB0148 CpB0149     FALSE 0.057 172.000 0.000 NA   NA
 654368 654369 CpB0149 CpB0150     TRUE 0.915 10.000 0.006 1.000   NA
 654369 654370 CpB0150 CpB0151     FALSE 0.154 131.000 0.006 NA   NA
 654371 654372 CpB0152 CpB0153     FALSE 0.322 173.000 0.857 NA   NA
 654373 654374 CpB0154 CpB0155     TRUE 0.873 -3.000 0.006 1.000 N NA
 654374 654375 CpB0155 CpBt05     TRUE 0.722 25.000 0.000 NA   NA
 654375 654376 CpBt05 CpBt06     TRUE 0.814 16.000 0.000 NA   NA
 654377 654378 CpB0156 CpB0157     FALSE 0.136 76.000 0.000 NA   NA
 654378 654379 CpB0157 CpB0158     TRUE 0.602 -13.000 0.000 NA   NA
 654379 654380 CpB0158 CpB0159     FALSE 0.060 168.000 0.000 NA   NA
 654380 654381 CpB0159 CpB0160     TRUE 0.524 34.000 0.000 NA   NA
 654381 654382 CpB0160 CpB0161     FALSE 0.026 296.000 0.000 NA   NA
 654382 654383 CpB0161 CpB0162   cinI TRUE 0.973 4.000 0.857 1.000   NA
 654383 654384 CpB0162 CpB0163 cinI   FALSE 0.054 178.000 0.000 NA   NA
 654385 654386 CpB0164 CpB0165     FALSE 0.300 47.000 0.000 NA   NA
 654386 654387 CpB0165 CpB0166     TRUE 0.713 -3.000 0.000 NA   NA
 654387 654388 CpB0166 CpB0167     FALSE 0.332 45.000 0.000 NA   NA
 654389 654390 CpB0168 CpB0169     FALSE 0.110 108.000 0.000 NA   NA
 654390 654391 CpB0169 CpB0170     FALSE 0.170 66.000 0.000 NA   NA
 654393 654394 CpB0172 CpB0173     FALSE 0.151 120.000 0.000 1.000   NA
 654394 654395 CpB0173 CpB0174     TRUE 0.991 2.000 0.190 1.000 Y NA
 654395 654396 CpB0174 CpB0175     TRUE 0.460 61.000 0.006 0.048   NA
 654396 654397 CpB0175 CpB0176     FALSE 0.042 211.000 0.000 NA   NA
 654398 654399 CpB0177 CpB0178     FALSE 0.058 171.000 0.000 NA   NA
 654399 654400 CpB0178 CpB0179     TRUE 0.813 8.000 0.000 NA   NA
 654401 654402 CpB0180 CpB0181     FALSE 0.023 327.000 0.000 NA   NA
 654402 654403 CpB0181 CpB0182     TRUE 0.761 1.000 0.000 NA   NA
 654403 654404 CpB0182 CpB0183     TRUE 0.469 -51.000 0.000 NA   NA
 654404 654405 CpB0183 CpB0184     FALSE 0.405 -132.000 0.000 NA   NA
 654405 654406 CpB0184 CpB0185     FALSE 0.067 156.000 0.000 NA   NA
 654406 654407 CpB0185 CpB0186     TRUE 0.987 -3.000 0.011 0.003 Y NA
 654407 654408 CpB0186 CpB0187     TRUE 0.951 23.000 0.120 1.000 N NA
 654408 654409 CpB0187 CpB0188     TRUE 0.825 -13.000 0.007 1.000 N NA
 654410 654411 CpB0189 CpB0190     FALSE 0.078 177.000 0.000 NA N NA
 654411 654412 CpB0190 CpB0191     TRUE 0.452 63.000 0.017 1.000   NA
 654412 654413 CpB0191 CpB0192     TRUE 0.874 -3.000 0.017 NA   NA
 654413 654414 CpB0192 CpB0193     TRUE 0.467 91.000 0.500 NA   NA
 654415 654416 CpB0194 CpB0195     TRUE 0.989 -10.000 1.000 1.000 Y NA
 654416 654417 CpB0195 CpB0196     TRUE 0.779 49.000 0.500 1.000 N NA
 654418 654419 CpB0197 CpB0198     TRUE 0.706 -54.000 0.006 1.000 N NA
 654419 654420 CpB0198 CpB0199     TRUE 0.603 151.000 0.000 0.026 Y NA
 654420 654421 CpB0199 CpB0200     TRUE 0.857 56.000 0.000 0.026 Y NA
 654421 654422 CpB0200 CpB0201     TRUE 0.625 278.000 0.500 0.026 Y NA
 654422 654423 CpB0201 CpB0202   oppB FALSE 0.353 293.000 0.000 0.026 Y NA
 654423 654424 CpB0202 CpB0203 oppB oppC TRUE 0.986 31.000 0.273 0.026 Y NA
 654424 654425 CpB0203 CpB0204 oppC oppD TRUE 0.983 -7.000 0.044 1.000 Y NA
 654425 654426 CpB0204 CpB0205 oppD oppF TRUE 0.990 -3.000 0.044 0.021 Y NA
 654426 654427 CpB0205 CpB0206 oppF   FALSE 0.112 107.000 0.000 NA   NA
 654427 654428 CpB0206 CpB0207     FALSE 0.041 216.000 0.000 NA   NA
 654428 654429 CpB0207 CpB0208     TRUE 0.819 12.000 0.000 NA   NA
 654429 654430 CpB0208 CpB0209     FALSE 0.099 128.000 0.000 NA   NA
 654430 654431 CpB0209 CpB0210     FALSE 0.133 79.000 0.000 NA   NA
 654431 654432 CpB0210 CpB0211     TRUE 0.720 44.000 0.217 NA   NA
 654432 654433 CpB0211 CpB0212     FALSE 0.128 333.000 0.088 1.000 N NA
 654433 654434 CpB0212 CpB0213     FALSE 0.018 425.000 0.000 NA   NA
 654435 654436 CpB0214 CpB0215     FALSE 0.136 76.000 0.000 NA   NA
 654436 654437 CpB0215 CpB0216     FALSE 0.098 129.000 0.000 NA   NA
 654437 654438 CpB0216 CpB0217     TRUE 0.475 36.000 0.000 NA   NA
 654438 654439 CpB0217 CpB0218     FALSE 0.054 178.000 0.000 NA   NA
 654439 654440 CpB0218 CpB0219     FALSE 0.121 99.000 0.000 NA   NA
 654440 654441 CpB0219 CpB0220     FALSE 0.067 156.000 0.000 NA   NA
 654444 654445 CpB0223 CpB0224     FALSE 0.039 221.000 0.000 NA   NA
 654445 654446 CpB0224 CpB0225     FALSE 0.018 416.000 0.000 NA   NA
 654448 654449 CpB0227 CpB0228     FALSE 0.107 111.000 0.000 NA   NA
 654449 654450 CpB0228 CpB0229     FALSE 0.121 99.000 0.000 NA   NA
 654450 654451 CpB0229 CpB0230     TRUE 0.546 -21.000 0.000 NA   NA
 654451 654452 CpB0230 CpB0231     FALSE 0.300 47.000 0.000 NA   NA
 654452 654453 CpB0231 CpB0232     TRUE 0.758 22.000 0.000 NA   NA
 654454 654455 CpB0233 CpB0234     TRUE 0.981 -10.000 0.308 NA Y NA
 654457 654458 CpB0236 CpB0237     TRUE 0.914 -3.000 0.111 NA   NA
 654458 654459 CpB0237 CpBt07     TRUE 0.475 36.000 0.000 NA   NA
 654459 654460 CpBt07 CpBt08     TRUE 0.798 5.000 0.000 NA   NA
 654460 654461 CpBt08 CpB0238     FALSE 0.128 86.000 0.000 NA   NA
 654461 654462 CpB0238 CpB0239     FALSE 0.101 123.000 0.000 NA   NA
 654462 654463 CpB0239 CpB0240     FALSE 0.100 127.000 0.000 NA   NA
 654464 654465 CpB0241 CpB0242     TRUE 0.834 -24.000 0.018 1.000 N NA
 654465 654466 CpB0242 CpB0243     TRUE 0.852 -7.000 0.006 1.000 N NA
 654466 654467 CpB0243 CpB0244     FALSE 0.275 86.000 0.004 1.000 N NA
 654467 654468 CpB0244 CpB0245     TRUE 0.965 34.000 0.021 1.000 Y NA
 654469 654470 CpB0246 CpB0247     FALSE 0.022 339.000 0.000 NA   NA
 654470 654471 CpB0247 CpB0248     FALSE 0.104 118.000 0.000 NA   NA
 654471 654472 CpB0248 CpB0249     FALSE 0.041 212.000 0.000 NA   NA
 654473 654474 CpB0250 CpB0251     TRUE 0.661 -7.000 0.000 NA   NA
 654474 654475 CpB0251 CpB0252     FALSE 0.332 86.000 0.014 NA N NA
 654476 654477 CpB0253 CpB0254     TRUE 0.996 14.000 0.601 0.048 Y NA
 654477 654478 CpB0254 CpB0255     FALSE 0.072 232.000 0.000 1.000 N NA
 654478 654479 CpB0255 CpB0256     TRUE 0.993 3.000 0.545 1.000 Y NA
 654479 654480 CpB0256 CpB0257     FALSE 0.358 58.000 0.006 1.000   NA
 654482 654483 CpB0259 CpB0260     FALSE 0.402 -138.000 0.000 NA   NA
 654483 654484 CpB0260 CpB0261     TRUE 0.963 0.000 1.000 NA   NA
 654484 654485 CpB0261 CpB0262     TRUE 0.653 64.000 1.000 NA   NA
 654485 654486 CpB0262 CpB0263     FALSE 0.037 230.000 0.000 NA   NA
 654486 654487 CpB0263 CpB0264     TRUE 0.963 0.000 1.000 NA   NA
 654487 654488 CpB0264 CpB0265     FALSE 0.175 311.000 1.000 NA   NA
 654488 654489 CpB0265 CpB0266     FALSE 0.076 147.000 0.000 NA   NA
 654489 654490 CpB0266 CpBt09     TRUE 0.769 21.000 0.000 NA   NA
 654490 654491 CpBt09 CpBt10     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 654491 654492 CpBt10 CpB0267     FALSE 0.166 67.000 0.000 NA   NA
 654493 654494 CpB0268 CpB0269   surE TRUE 0.526 55.000 0.015 1.000   NA
 654494 654495 CpB0269 CpBt11 surE   FALSE 0.087 140.000 0.000 NA   NA
 654495 654496 CpBt11 CpBt12     TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 654496 654497 CpBt12 CpB0270     TRUE 0.737 24.000 0.000 NA   NA
 654498 654499 CpB0271 CpB0272     TRUE 0.985 -3.000 0.029 1.000 Y NA
 654500 654501 CpB0273 CpB0274     FALSE 0.032 252.000 0.000 NA   NA
 654501 654502 CpB0274 CpB0275     FALSE 0.180 64.000 0.000 NA   NA
 654503 654504 CpB0276 CpB0277     TRUE 0.936 15.000 0.012 NA N NA
 654506 654507 CpB0278 CpB0280 dnaX   FALSE 0.430 132.000 0.254 1.000 N NA
 654507 654508 CpB0280 CpB0281     TRUE 0.926 5.000 0.007 1.000 N NA
 654508 654509 CpB0281 CpB0282     TRUE 0.996 16.000 0.306 0.005 Y NA
 654509 654510 CpB0282 CpB0283     TRUE 0.923 4.000 0.028 NA   NA
 654512 654513 CpB0285 CpB0286     FALSE 0.076 147.000 0.000 NA   NA
 654513 654514 CpB0286 CpB0287     TRUE 0.990 -3.000 0.667 NA Y NA
 654514 654515 CpB0287 CpB0288     TRUE 0.993 10.000 0.089 1.000 Y NA
 654516 654517 CpB0289 CpB0290     TRUE 0.977 20.000 1.000 1.000 N NA
 654518 654519 CpB0291 CpB0292     FALSE 0.267 51.000 0.000 NA   NA
 654519 654520 CpB0292 CpB0293     FALSE 0.134 78.000 0.000 NA   NA
 654520 654521 CpB0293 CpB0294   mgtE TRUE 0.544 52.000 0.033 NA   NA
 654521 654522 CpB0294 CpB0295 mgtE   TRUE 0.914 27.000 0.044 1.000   NA
 654522 654523 CpB0295 CpB0296     FALSE 0.022 347.000 0.000 NA   NA
 654524 654525 CpB0297 CpB0299     TRUE 0.789 43.000 0.273 1.000   NA
 654527 654528 CpB0300 CpB0301     TRUE 0.926 31.000 1.000 NA   NA
 654528 654529 CpB0301 CpB0302     TRUE 0.458 110.000 0.667 NA   NA
 654529 654530 CpB0302 CpB0303     FALSE 0.085 366.000 0.182 NA   NA
 654531 654532 CpB0304 CpB0305     TRUE 0.650 156.000 0.007 0.012 Y NA
 654532 654533 CpB0305 CpB0306   fabD TRUE 0.993 6.000 0.019 0.012 Y NA
 654533 654534 CpB0306 CpB0307 fabD yjaX TRUE 0.992 17.000 0.009 0.012 Y NA
 654535 654536 CpB0308 CpB0309 recR   FALSE 0.052 359.000 0.003 1.000 N NA
 654536 654537 CpB0309 CpB0310     TRUE 0.823 95.000 0.175 1.000 Y NA
 654537 654538 CpB0310 CpB0311     TRUE 0.987 22.000 0.018 1.000 Y NA
 654540 654541 CpB0313 CpB0314     TRUE 0.991 -7.000 0.456 0.002 Y NA
 654541 654542 CpB0314 CpB0315     TRUE 0.993 5.000 0.254 1.000 Y NA
 654545 654546 CpB0317 CpB0319 dnaA   TRUE 0.642 72.000 0.714 1.000 N NA
 654546 654547 CpB0319 CpB0320     FALSE 0.181 154.000 0.006 1.000 N NA
 654548 654549 CpB0321 CpB0323     TRUE 0.941 11.000 0.036 NA   NA
 654551 654552 CpB0324 CpB0325     FALSE 0.218 57.000 0.000 NA   NA
 654552 654553 CpB0325 CpB0326     FALSE 0.352 101.000 0.006 0.042 N NA
 654553 654554 CpB0326 CpB0327     TRUE 0.866 -61.000 0.342 1.000 N NA
 654554 654555 CpB0327 CpB0328   rbfA TRUE 0.995 14.000 0.530 1.000 Y NA
 654555 654556 CpB0328 CpB0329 rbfA   TRUE 0.936 46.000 0.111 1.000 Y NA
 654556 654557 CpB0329 CpB0331   ribC TRUE 0.912 -16.000 0.308 1.000 N NA
 654559 654560 CpB0332 CpB0333   lcrD TRUE 0.993 0.000 0.219 0.013 Y NA
 654560 654561 CpB0333 CpB0334 lcrD copN TRUE 0.914 29.000 0.188 1.000   NA
 654561 654562 CpB0334 CpB0335 copN scc1 TRUE 0.974 17.000 0.240 0.008   NA
 654562 654563 CpB0335 CpB0336 scc1   TRUE 0.953 -3.000 0.600 1.000   NA
 654563 654564 CpB0336 CpB0337     FALSE 0.100 217.000 0.005 1.000 N NA
 654564 654565 CpB0337 CpB0338     TRUE 0.810 27.000 0.005 NA N NA
 654565 654566 CpB0338 CpB0339     FALSE 0.389 93.000 0.038 NA N NA
 654567 654568 CpB0340 CpB0341     TRUE 0.962 23.000 1.000 NA   NA
 654568 654569 CpB0341 CpB0342   ltuB FALSE 0.021 360.000 0.000 NA   NA
 654570 654571 CpB0343 CpB0344     TRUE 0.772 -9.000 0.007 NA   NA
 654571 654572 CpB0344 CpB0346   apbE TRUE 0.965 -27.000 0.025 1.000 Y NA
 654574 654575 CpB0347 CpB0351     FALSE 0.017 1244.000 0.000 NA   NA
 654576 654577 CpB0350 CpB0352     TRUE 0.973 13.000 0.568 1.000   NA
 654577 654578 CpB0352 CpB0353     FALSE 0.277 129.000 0.008 1.000 N NA
 654578 654579 CpB0353 CpB0354     TRUE 0.994 0.000 0.443 0.006 Y NA
 654579 654580 CpB0354 CpB0355     TRUE 0.988 -6.000 0.432 1.000 Y NA
 654580 654581 CpB0355 CpB0356     TRUE 0.986 -16.000 0.898 1.000 Y NA
 654582 654583 CpB0357 CpB0358     FALSE 0.054 177.000 0.000 NA   NA
 654583 654584 CpB0358 CpB0359     FALSE 0.044 201.000 0.000 NA   NA
 654584 654585 CpB0359 CpB0360     FALSE 0.104 118.000 0.000 NA   NA
 654585 654586 CpB0360 CpB0361     FALSE 0.201 60.000 0.000 NA   NA
 654586 654587 CpB0361 CpB0362     TRUE 0.648 29.000 0.000 NA   NA
 654588 654589 CpB0363 CpB0364     FALSE 0.040 217.000 0.000 NA   NA
 654589 654590 CpB0364 CpB0365     TRUE 0.809 7.000 0.000 NA   NA
 654590 654591 CpB0365 CpB0366     FALSE 0.031 258.000 0.000 NA   NA
 654592 654593 CpB0367 CpB0368     TRUE 0.819 15.000 0.000 NA   NA
 654594 654595 CpB0369 CpB0370     TRUE 0.935 21.000 0.014 1.000 N NA
 654595 654596 CpB0370 CpB0371     FALSE 0.101 123.000 0.000 NA   NA
 654596 654597 CpB0371 CpB0372     FALSE 0.120 100.000 0.000 NA   NA
 654597 654598 CpB0372 CpB0373     FALSE 0.370 115.000 0.025 1.000 N NA
 654599 654600 CpBt13 CpB0374     FALSE 0.377 43.000 0.000 NA   NA
 654600 654601 CpB0374 CpB0375     FALSE 0.030 272.000 0.000 NA   NA
 654601 654602 CpB0375 CpB0376     FALSE 0.069 152.000 0.000 NA   NA
 654602 654603 CpB0376 CpB0377     FALSE 0.100 125.000 0.000 NA   NA
 654605 654606 CpB0379 CpB0380     FALSE 0.434 -70.000 0.000 NA   NA
 654606 654607 CpB0380 CpB0381     FALSE 0.034 241.000 0.000 NA   NA
 654607 654608 CpB0381 CpB0382     FALSE 0.036 235.000 0.000 NA   NA
 654608 654609 CpB0382 CpB0383     FALSE 0.036 232.000 0.000 NA   NA
 654609 654610 CpB0383 CpB0384     FALSE 0.052 181.000 0.000 NA   NA
 654610 654611 CpB0384 CpB0385   aarC FALSE 0.019 376.000 0.000 NA   NA
 654611 654612 CpB0385 CpB0386 aarC   FALSE 0.379 57.000 0.009 NA   NA
 654612 654613 CpB0386 CpB0387     FALSE 0.066 157.000 0.000 NA   NA
 654613 654614 CpB0387 CpB0388     FALSE 0.035 236.000 0.000 NA   NA
 654615 654616 CpB0389 CpB0390     TRUE 0.994 4.000 0.667 1.000 Y NA
 654617 654618 CpB0391 CpB0392     TRUE 0.675 -34.000 0.008 NA   NA
 654619 654620 CpB0393 CpB0394     FALSE 0.059 221.000 0.000 1.000   NA
 654620 654621 CpB0394 CpB0395     TRUE 0.865 -3.000 0.007 1.000   NA
 654621 654622 CpB0395 CpB0396     FALSE 0.182 166.000 0.006 0.045   NA
 654622 654623 CpB0396 CpB0397     FALSE 0.250 142.000 0.017 1.000   NA
 654623 654624 CpB0397 CpB0398     TRUE 0.916 25.000 0.013 1.000 N NA
 654624 654625 CpB0398 CpB0399     FALSE 0.087 171.000 0.000 1.000   NA
 654627 654628 CpB0400 CpB0402   ruvB TRUE 0.864 -3.000 0.007 1.000   NA
 654628 654629 CpB0402 CpB0403 ruvB   FALSE 0.021 363.000 0.000 NA   NA
 654630 654631 CpB0404 CpB0405     TRUE 0.680 -106.000 0.021 NA   NA
 654631 654632 CpB0405 CpB0406     TRUE 0.960 10.000 0.364 NA   NA
 654632 654633 CpB0406 CpB0407     TRUE 0.925 -7.000 0.545 NA   NA
 654634 654635 CpB0408 CpB0409 nifS   TRUE 0.937 25.000 0.041 1.000 N NA
 654635 654636 CpB0409 CpB0410     FALSE 0.180 64.000 0.000 NA   NA
 654636 654637 CpB0410 CpB0411     FALSE 0.107 111.000 0.000 NA   NA
 654638 654639 CpB0412 CpB0413     TRUE 0.965 10.000 0.500 NA   NA
 654640 654641 CpB0414 CpB0415     TRUE 0.815 1.000 0.005 NA   NA
 654643 654644 CpB0417 CpB0418     FALSE 0.096 130.000 0.000 NA   NA
 654644 654645 CpB0418 CpB0419     FALSE 0.147 72.000 0.000 NA   NA
 654647 654648 CpB0420 CpB0422     TRUE 0.751 0.000 0.000 NA   NA
 654648 654649 CpB0422 CpB0423     TRUE 0.713 -3.000 0.000 NA   NA
 654650 654651 CpB0424 CpB0425     FALSE 0.371 61.000 0.012 NA   NA
 654651 654652 CpB0425 CpB0426     TRUE 0.944 8.000 0.050 NA   NA
 654652 654653 CpB0426 CpB0427     TRUE 0.893 -3.000 0.031 NA   NA
 654653 654654 CpB0427 CpB0429     TRUE 0.532 -22.000 0.000 NA   NA
 654655 654656 CpB0428 CpB0430 hetA   TRUE 0.790 -34.000 0.010 1.000 N NA
 654656 654657 CpB0430 CpB0431     FALSE 0.250 75.000 0.008 NA   NA
 654657 654658 CpB0431 CpB0432     TRUE 0.575 56.000 0.182 NA   NA
 654660 654661 CpB0433 CpB0434     TRUE 0.944 -85.000 0.014 1.000 Y NA
 654661 654662 CpB0434 CpB0435     FALSE 0.309 473.000 0.022 1.000 Y NA
 654662 654663 CpB0435 CpB0436     TRUE 0.869 -13.000 0.135 NA   NA
 654663 654664 CpB0436 CpB0437     TRUE 0.822 -3.000 0.007 NA   NA
 654665 654666 CpB0438 CpB0439     TRUE 0.949 4.000 0.286 NA   NA
 654666 654667 CpB0439 CpB0440     FALSE 0.028 393.000 0.000 1.000   NA
 654667 654668 CpB0440 CpB0442     TRUE 0.905 16.000 0.006 NA N NA
 654670 654671 CpB0443 CpB0444 nrqB   TRUE 0.994 4.000 0.093 0.002 Y NA
 654671 654672 CpB0444 CpB0445   nqrD TRUE 0.990 -3.000 0.034 0.007 Y NA
 654672 654673 CpB0445 CpB0446 nqrD nqr5 TRUE 0.993 4.000 0.034 0.007 Y NA
 654674 654675 CpB0447 CpB0448     TRUE 0.667 28.000 0.000 NA   NA
 654675 654676 CpB0448 CpB0449     FALSE 0.440 110.000 0.571 NA   NA
 654676 654677 CpB0449 CpB0450     TRUE 0.952 -3.000 0.857 NA   NA
 654677 654678 CpB0450 CpB0451     FALSE 0.277 121.000 0.032 NA   NA
 654678 654679 CpB0451 CpB0452     TRUE 0.951 -3.000 0.032 0.025 N NA
 654682 654683 CpB0455 CpB0456     TRUE 0.947 25.000 0.667 NA   NA
 654683 654684 CpB0456 CpB0457     FALSE 0.075 148.000 0.000 NA   NA
 654684 654685 CpB0457 CpB0458     FALSE 0.280 172.000 0.571 NA   NA
 654685 654686 CpB0458 CpB0459     FALSE 0.249 198.000 0.667 NA   NA
 654686 654687 CpB0459 CpB0460     FALSE 0.025 305.000 0.000 NA   NA
 654689 654690 CpB0462 CpB0463     TRUE 0.597 44.000 0.000 0.029   NA
 654690 654691 CpB0463 CpB0464     FALSE 0.175 150.000 0.000 0.029   NA
 654692 654693 CpB0465 CpB0466     FALSE 0.414 41.000 0.000 NA   NA
 654693 654694 CpB0466 CpB0467     FALSE 0.024 312.000 0.000 NA   NA
 654695 654696 CpB0468 CpB0469     FALSE 0.082 258.000 0.000 0.029   NA
 654696 654697 CpB0469 CpB0470     FALSE 0.052 371.000 0.000 0.029   NA
 654697 654698 CpB0470 CpB0471     TRUE 0.969 27.000 1.000 0.029   NA
 654699 654700 CpB0472 CpB0473     FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 654700 654701 CpB0473 CpB0474     FALSE 0.017 603.000 0.000 NA   NA
 654701 654702 CpB0474 CpB0475     FALSE 0.020 368.000 0.000 NA   NA
 654702 654703 CpB0475 CpB0476     FALSE 0.026 296.000 0.000 NA   NA
 654703 654704 CpB0476 CpB0477     TRUE 0.452 -58.000 0.000 NA   NA
 654704 654705 CpB0477 CpB0478     TRUE 0.761 1.000 0.000 NA   NA
 654705 654706 CpB0478 CpB0479     FALSE 0.017 543.000 0.000 NA   NA
 654706 654707 CpB0479 CpB0480     FALSE 0.091 136.000 0.000 NA   NA
 654707 654708 CpB0480 CpB0481     FALSE 0.418 -96.000 0.000 NA   NA
 654708 654709 CpB0481 CpB0482     TRUE 0.705 26.000 0.000 NA   NA
 654709 654710 CpB0482 CpB0483     FALSE 0.253 53.000 0.000 NA   NA
 654711 654712 CpB0484 CpB0485     TRUE 0.677 39.000 0.000 0.029   NA
 654712 654713 CpB0485 CpB0486     FALSE 0.033 246.000 0.000 NA   NA
 654713 654714 CpB0486 CpB0487     FALSE 0.114 105.000 0.000 NA   NA
 654714 654715 CpB0487 CpB0488     TRUE 0.659 -106.000 0.000 0.029   NA
 654715 654716 CpB0488 CpB0489     TRUE 0.834 29.000 0.000 0.029   NA
 654717 654718 CpB0490 CpB0491     FALSE 0.064 162.000 0.000 NA   NA
 654718 654719 CpB0491 CpB0492     FALSE 0.428 40.000 0.000 NA   NA
 654719 654720 CpB0492 CpB0493     TRUE 0.817 10.000 0.000 NA   NA
 654720 654721 CpB0493 CpB0494     FALSE 0.321 145.000 0.364 NA   NA
 654721 654722 CpB0494 CpB0495     TRUE 0.968 11.000 0.636 NA   NA
 654722 654723 CpB0495 CpB0496     TRUE 0.849 -3.000 0.010 NA   NA
 654723 654724 CpB0496 CpB0497     FALSE 0.215 101.000 0.005 1.000   NA
 654724 654725 CpB0497 CpB0498     TRUE 0.815 -12.000 0.008 1.000   NA
 654725 654726 CpB0498 CpB0499     FALSE 0.073 222.000 0.008 NA   NA
 654726 654727 CpB0499 CpB0502     FALSE 0.017 1655.000 0.000 NA   NA
 654728 654729 CpB0503 CpB0504     TRUE 0.958 3.000 0.333 1.000   NA
 654729 654730 CpB0504 CpB0505     FALSE 0.042 211.000 0.000 NA   NA
 654731 654732 CpB0506 CpB0507     FALSE 0.039 373.000 0.000 1.000 N NA
 654732 654733 CpB0507 CpB0508     FALSE 0.261 102.000 0.005 1.000 N NA
 654733 654734 CpB0508 CpB0509     TRUE 0.857 -3.000 0.011 NA   NA
 654738 654739 CpB0513 CpB0514     FALSE 0.088 139.000 0.000 NA   NA
 654740 654741 CpB0515 CpB0516     TRUE 0.899 -3.000 0.037 NA   NA
 654742 654743 CpB0517 CpB0518     TRUE 0.813 -7.000 0.010 NA   NA
 654743 654744 CpB0518 CpB0519     FALSE 0.305 168.000 0.667 NA   NA
 654745 654746 CpB0520 CpB0521   hrcA FALSE 0.410 65.000 0.007 1.000 N NA
 654746 654747 CpB0521 CpB0522 hrcA grpE TRUE 0.949 -3.000 0.286 1.000 N NA
 654747 654748 CpB0522 CpB0523 grpE   TRUE 0.987 30.000 0.224 0.012 Y NA
 654750 654751 CpB0525 CpB0526     TRUE 0.900 2.000 0.005 1.000 N NA
 654751 654752 CpB0526 CpB0527     TRUE 0.681 -48.000 0.011 NA   NA
 654752 654753 CpB0527 CpB0528     FALSE 0.267 118.000 0.024 NA   NA
 654753 654754 CpB0528 CpB0529     TRUE 0.966 17.000 0.667 NA   NA
 654754 654755 CpB0529 CpB0530     TRUE 0.682 32.000 0.006 NA   NA
 654755 654756 CpB0530 CpB0531     TRUE 0.941 2.000 0.222 NA   NA
 654756 654757 CpB0531 CpB0532     FALSE 0.138 165.000 0.011 NA   NA
 654757 654758 CpB0532 CpB0533     TRUE 0.598 62.000 0.571 NA   NA
 654758 654759 CpB0533 CpB0534     FALSE 0.108 187.000 0.011 NA   NA
 654759 654760 CpB0534 CpB0535     TRUE 0.833 -27.000 0.205 NA   NA
 654760 654761 CpB0535 CpB0536   ubiE TRUE 0.633 -52.000 0.008 NA   NA
 654762 654763 CpB0537 CpB0538     FALSE 0.431 -79.000 0.000 NA   NA
 654763 654764 CpB0538 CpB0539     FALSE 0.046 198.000 0.000 NA   NA
 654764 654765 CpB0539 CpB0540     FALSE 0.216 98.000 0.008 NA   NA
 654765 654766 CpB0540 CpB0541   clp TRUE 0.720 -43.000 0.006 1.000 N NA
 654766 654767 CpB0541 CpB0542 clp   TRUE 0.955 20.000 0.051 1.000 N NA
 654768 654769 CpB0543 CpB0544     TRUE 0.512 65.000 0.273 NA   NA
 654769 654770 CpB0544 CpB0545     TRUE 0.752 48.000 0.750 NA   NA
 654770 654771 CpB0545 CpB0546     FALSE 0.022 340.000 0.000 NA   NA
 654772 654773 CpB0547 CpB0548 kpsF   TRUE 0.962 27.000 0.857 1.000 N NA
 654773 654774 CpB0548 CpB0549     TRUE 0.995 14.000 0.714 1.000 Y NA
 654774 654775 CpB0549 CpB0550   ycaH TRUE 0.927 0.000 0.013 1.000 N NA
 654775 654776 CpB0550 CpB0551 ycaH spoU FALSE 0.115 198.000 0.006 1.000 N NA
 654776 654777 CpB0551 CpB0552 spoU   TRUE 0.904 -12.000 0.213 1.000   NA
 654777 654778 CpB0552 CpB0553     TRUE 0.894 3.000 0.006 1.000   NA
 654779 654780 CpB0554 CpB0555     TRUE 0.879 25.000 0.009 NA N NA
 654780 654781 CpB0555 CpB0556     TRUE 0.835 36.000 0.038 1.000 N NA
 654781 654782 CpB0556 CpB0557     TRUE 0.775 46.000 0.038 0.053 N NA
 654782 654783 CpB0557 CpB0558     FALSE 0.337 139.000 0.333 NA   NA
 654783 654784 CpB0558 CpB0559     TRUE 0.971 5.000 1.000 NA   NA
 654784 654785 CpB0559 CpB0560     FALSE 0.047 191.000 0.000 NA   NA
 654785 654786 CpB0560 CpB0561     TRUE 0.454 146.000 0.400 0.028   NA
 654788 654789 CpB0562 CpB0563     TRUE 0.990 -3.000 0.509 1.000 Y NA
 654789 654790 CpB0563 CpB0565     TRUE 0.981 -21.000 0.616 1.000 Y NA
 654791 654792 CpB0564 CpB0566     TRUE 0.474 101.000 0.335 1.000   NA
 654792 654793 CpB0566 CpB0567     TRUE 0.994 25.000 0.667 0.040 Y NA
 654793 654794 CpB0567 CpBt16     FALSE 0.085 142.000 0.000 NA   NA
 654796 654797 CpB0569 CpB0570   rpsJ TRUE 0.903 21.000 0.006 1.000 N NA
 654797 654798 CpB0570 CpB0571 rpsJ   TRUE 0.988 8.000 0.007 1.000 Y NA
 654798 654799 CpB0571 CpB0572     TRUE 0.956 34.000 0.008 1.000 Y NA
 654799 654800 CpB0572 CpB0573     TRUE 0.939 48.000 0.029 0.009 Y NA
 654803 654804 CpB0576 CpB0577     FALSE 0.176 163.000 0.025 NA   NA
 654805 654806 CpB0578 CpB0579     FALSE 0.145 279.000 0.200 1.000   NA
 654806 654807 CpB0579 CpB0580     TRUE 0.451 167.000 0.600 0.002   NA
 654809 654810 CpB0582 CpB0583     FALSE 0.048 256.000 0.000 1.000   NA
 654810 654811 CpB0583 CpB0584     FALSE 0.017 511.000 0.000 NA   NA
 654811 654812 CpB0584 CpB0585   recJ FALSE 0.032 254.000 0.000 NA   NA
 654812 654813 CpB0585 CpB0586 recJ   FALSE 0.279 86.000 0.007 1.000   NA
 654813 654814 CpB0586 CpB0587     FALSE 0.052 180.000 0.000 NA   NA
 654815 654816 CpB0588 CpB0589     TRUE 0.992 1.000 0.400 1.000 Y NA
 654816 654817 CpB0589 CpB0590     TRUE 0.897 -3.000 0.008 1.000 N NA
 654817 654818 CpB0590 CpB0591     TRUE 0.897 -3.000 0.008 1.000 N NA
 654818 654819 CpB0591 CpB0593     TRUE 0.918 5.000 0.006 1.000 N NA
 654822 654823 CpB0595 CpB0596     TRUE 0.672 -13.000 0.003 NA   NA
 654823 654824 CpB0596 CpB0597   bltD TRUE 0.865 34.000 0.200 1.000   NA
 654824 654825 CpB0597 CpB0598 bltD   TRUE 0.978 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 654828 654829 CpB0601 CpB0602   yaeI FALSE 0.181 248.000 0.316 1.000   NA
 654829 654830 CpB0602 CpB0603 yaeI   TRUE 0.856 -7.000 0.010 1.000   NA
 654830 654831 CpB0603 CpB0605   truA TRUE 0.890 -3.000 0.007 1.000 N NA
 654833 654834 CpB0606 CpBt17     FALSE 0.218 57.000 0.000 NA   NA
 654834 654835 CpBt17 CpB0607     FALSE 0.121 99.000 0.000 NA   NA
 654835 654836 CpB0607 CpB0608   atoS TRUE 0.857 -13.000 0.057 NA   NA
 654838 654839 CpB0610 CpBt18 atoC   FALSE 0.133 79.000 0.000 NA   NA
 654839 654840 CpBt18 CpB0611     FALSE 0.117 103.000 0.000 NA   NA
 654840 654841 CpB0611 CpB0612     TRUE 0.459 -55.000 0.000 NA   NA
 654841 654842 CpB0612 CpB0613     TRUE 0.887 11.000 0.007 NA   NA
 654843 654844 CpB0614 CpBt19     FALSE 0.166 67.000 0.000 NA   NA
 654845 654846 CpB0615 CpB0617   hlyA FALSE 0.167 130.000 0.007 NA   NA
 654848 654849 CpB0618 CpB0619     TRUE 0.806 -3.000 0.006 NA   NA
 654849 654850 CpB0619 CpB0620     TRUE 0.942 10.000 0.038 NA   NA
 654851 654852 CpB0621 CpB0622   dppB TRUE 0.994 1.000 0.400 0.021 Y NA
 654852 654853 CpB0622 CpB0623 dppB   TRUE 0.985 -18.000 0.318 0.021 Y NA
 654853 654854 CpB0623 CpB0624     TRUE 0.450 37.000 0.000 NA   NA
 654854 654855 CpB0624 CpB0625     FALSE 0.024 314.000 0.000 NA   NA
 654855 654856 CpB0625 CpB0626     FALSE 0.047 194.000 0.000 NA   NA
 654858 654859 CpB0628 CpB0629     FALSE 0.108 202.000 0.005 1.000 N NA
 654859 654860 CpB0629 CpB0630     TRUE 0.869 -3.000 0.008 1.000   NA
 654860 654861 CpB0630 CpB0631     FALSE 0.417 99.000 0.070 1.000   NA
 654861 654862 CpB0631 CpB0632     FALSE 0.325 118.000 0.012 1.000 N NA
 654864 654865 CpB0634 CpB0635     TRUE 0.912 -3.000 0.013 1.000 N NA
 654865 654866 CpB0635 CpB0636     TRUE 0.898 -15.000 0.068 1.000 N NA
 654866 654867 CpB0636 CpB0637     TRUE 0.888 24.000 0.006 1.000 N NA
 654867 654868 CpB0637 CpB0638     FALSE 0.287 133.000 0.011 1.000 N NA
 654868 654869 CpB0638 CpB0639     FALSE 0.109 229.000 0.000 0.045 N NA
 654869 654870 CpB0639 CpBt20     FALSE 0.040 218.000 0.000 NA   NA
 654870 654871 CpBt20 CpB0640     FALSE 0.205 59.000 0.000 NA   NA
 654874 654875 CpB0643 CpB0644 gidA   TRUE 0.835 -13.000 0.008 1.000 N NA
 654876 654877 CpB0645 CpB0646   ruvA FALSE 0.331 72.000 0.006 1.000 N NA
 654877 654878 CpB0646 CpB0647 ruvA ruvC TRUE 0.995 2.000 0.451 0.012 Y NA
 654878 654879 CpB0647 CpB0648 ruvC   FALSE 0.083 143.000 0.000 NA   NA
 654879 654880 CpB0648 CpBt21     FALSE 0.089 138.000 0.000 NA   NA
 654880 654881 CpBt21 CpB0649     FALSE 0.049 188.000 0.000 NA   NA
 654881 654882 CpB0649 CpB0650     TRUE 0.952 15.000 0.128 NA   NA
 654882 654883 CpB0650 CpB0651     TRUE 0.646 42.000 0.006 1.000 N NA
 654883 654884 CpB0651 CpB0652     TRUE 0.980 7.000 0.873 1.000 N NA
 654884 654885 CpB0652 CpB0653     TRUE 0.962 21.000 0.308 1.000 N NA
 654885 654886 CpB0653 CpB0654     TRUE 0.995 22.000 0.810 0.039 Y NA
 654886 654887 CpB0654 CpB0655   secY TRUE 0.545 56.000 0.011 1.000 N NA
 654887 654888 CpB0655 CpB0656 secY   TRUE 0.964 25.000 0.730 1.000 N NA
 654888 654889 CpB0656 CpB0657     TRUE 0.988 -7.000 0.148 0.054 Y NA
 654889 654890 CpB0657 CpB0658     TRUE 0.996 18.000 0.814 0.054 Y NA
 654890 654891 CpB0658 CpB0659     TRUE 0.997 11.000 0.815 0.039 Y NA
 654891 654892 CpB0659 CpB0660     TRUE 0.993 27.000 0.808 0.039 Y NA
 654892 654893 CpB0660 CpB0661     TRUE 0.993 18.000 0.059 0.039 Y NA
 654893 654894 CpB0661 CpB0662     TRUE 0.995 2.000 0.758 0.039 Y NA
 654894 654895 CpB0662 CpB0663     TRUE 0.996 14.000 0.810 0.054 Y NA
 654895 654896 CpB0663 CpB0664     TRUE 0.994 23.000 0.791 0.054 Y NA
 654896 654897 CpB0664 CpB0665     TRUE 0.992 -7.000 0.828 0.039 Y NA
 654897 654898 CpB0665 CpB0666     TRUE 0.996 3.000 0.802 0.039 Y NA
 654898 654899 CpB0666 CpB0667     TRUE 0.991 29.000 0.828 0.054 Y NA
 654899 654900 CpB0667 CpB0668     TRUE 0.996 16.000 0.719 0.054 Y NA
 654900 654901 CpB0668 CpB0669     TRUE 0.996 19.000 0.769 0.054 Y NA
 654901 654902 CpB0669 CpB0670     TRUE 0.996 6.000 0.820 0.054 Y NA
 654902 654903 CpB0670 CpB0671     TRUE 0.995 22.000 0.849 0.036 Y NA
 654903 654904 CpB0671 CpB0672     TRUE 0.992 17.000 0.013 0.039 Y NA
 654904 654905 CpB0672 CpB0673   rplC TRUE 0.975 33.000 0.020 0.039 Y NA
 654905 654906 CpB0673 CpB0674 rplC   FALSE 0.027 289.000 0.000 NA   NA
 654906 654907 CpB0674 CpB0675     FALSE 0.165 104.000 0.006 NA   NA
 654907 654908 CpB0675 CpB0676     TRUE 0.842 -10.000 0.007 1.000 N NA
 654908 654909 CpB0676 CpB0677     TRUE 0.964 13.000 0.048 1.000 N NA
 654909 654910 CpB0677 CpB0678     TRUE 0.948 12.000 0.012 1.000 N NA
 654910 654911 CpB0678 CpB0679     TRUE 0.973 30.000 0.012 1.000 Y NA
 654911 654912 CpB0679 CpB0680     TRUE 0.957 10.000 0.072 NA N NA
 654912 654913 CpB0680 CpB0681     FALSE 0.344 131.000 0.072 NA N NA
 654915 654916 CpB0683 CpB0684     FALSE 0.303 69.000 0.010 NA   NA
 654917 654918 CpBt22 CpB0685     FALSE 0.315 46.000 0.000 NA   NA
 654919 654920 CpB0686 CpB0687     TRUE 0.909 -3.000 0.011 1.000 N NA
 654920 654921 CpB0687 CpB0688     FALSE 0.349 69.000 0.006 1.000 N NA
 654921 654922 CpB0688 CpB0689     TRUE 0.966 -25.000 0.009 0.051 Y NA
 654922 654923 CpB0689 CpB0690     FALSE 0.020 364.000 0.000 NA   NA
 654924 654925 CpB0691 CpB0692 uhpC   TRUE 0.918 20.000 0.007 1.000 N NA
 654927 654928 CpB0694 CpB0695     TRUE 0.971 14.000 0.750 NA   NA
 654928 654929 CpB0695 CpB0696     TRUE 0.894 -31.000 0.875 NA   NA
 654931 654932 CpB0698 CpB0699 dacB   FALSE 0.147 72.000 0.000 NA   NA
 654932 654933 CpB0699 CpB0700     TRUE 0.587 -15.000 0.000 NA   NA
 654934 654935 CpB0701 CpB0702     FALSE 0.259 97.000 0.012 NA   NA
 654935 654936 CpB0702 CpB0703     TRUE 0.481 129.000 1.000 NA   NA
 654936 654937 CpB0703 CpB0704     TRUE 0.847 36.000 0.500 NA   NA
 654937 654938 CpB0704 CpB0705     FALSE 0.029 278.000 0.000 NA   NA
 654938 654939 CpB0705 CpB0706     FALSE 0.017 519.000 0.000 NA   NA
 654939 654940 CpB0706 CpB0707     TRUE 0.618 38.000 0.005 1.000   NA
 654940 654941 CpB0707 CpB0708     TRUE 0.973 7.000 0.937 NA   NA
 654942 654943 CpB0709 CpB0710   dppF TRUE 0.989 -10.000 0.250 0.002 Y NA
 654943 654944 CpB0710 CpB0712 dppF   FALSE 0.147 72.000 0.000 NA   NA
 654945 654946 CpB0711 CpB0713 spoOJ   FALSE 0.092 135.000 0.000 NA   NA
 654947 654948 CpB0714 CpB0715     FALSE 0.153 309.000 0.714 NA   NA
 654949 654950 CpB0716 CpB0717     TRUE 0.927 29.000 0.193 1.000 N NA
 654950 654951 CpB0717 CpB0718     TRUE 0.982 -16.000 0.482 1.000 Y NA
 654951 654952 CpB0718 CpB0719     TRUE 0.994 6.000 0.466 1.000 Y NA
 654952 654953 CpB0719 CpB0720     FALSE 0.035 325.000 0.000 1.000   NA
 654953 654954 CpB0720 CpB0721     TRUE 0.559 71.000 0.400 1.000   NA
 654955 654956 CpB0722 CpBt23     FALSE 0.038 226.000 0.000 NA   NA
 654956 654957 CpBt23 CpB0723     FALSE 0.127 88.000 0.000 NA   NA
 654957 654958 CpB0723 CpB0724     TRUE 0.993 0.000 0.748 1.000 Y NA
 654958 654959 CpB0724 CpB0725     TRUE 0.973 8.000 0.416 1.000 N NA
 654959 654960 CpB0725 CpB0726     TRUE 0.917 -22.000 0.626 1.000 N NA
 654960 654961 CpB0726 CpBt24     FALSE 0.121 99.000 0.000 NA   NA
 654961 654962 CpBt24 CpBt25     TRUE 0.705 26.000 0.000 NA   NA
 654962 654963 CpBt25 CpB0727     FALSE 0.118 102.000 0.000 NA   NA
 654963 654964 CpB0727 CpB0728     TRUE 0.936 -13.000 0.848 1.000   NA
 654965 654966 CpBt26 CpB0729     FALSE 0.080 145.000 0.000 NA   NA
 654966 654967 CpB0729 CpB0730     TRUE 0.946 -3.000 0.208 1.000 N NA
 654967 654968 CpB0730 CpB0731   fliN TRUE 0.976 16.000 0.583 1.000 N NA
 654968 654969 CpB0731 CpB0732 fliN   TRUE 0.967 10.000 0.600 NA   NA
 654969 654970 CpB0732 CpB0733     TRUE 0.965 4.000 0.750 NA   NA
 654970 654971 CpB0733 CpB0734   yopN TRUE 0.969 18.000 0.875 NA   NA
 654971 654972 CpB0734 CpB0735 yopN   TRUE 0.964 2.000 0.857 NA   NA
 654972 654973 CpB0735 CpB0736     TRUE 0.524 34.000 0.000 NA   NA
 654973 654974 CpB0736 CpB0737     TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 654974 654975 CpB0737 CpB0738     TRUE 0.962 22.000 0.857 NA   NA
 654975 654976 CpB0738 CpB0739     TRUE 0.951 8.000 0.171 NA   NA
 654976 654977 CpB0739 CpB0740     TRUE 0.953 14.000 0.146 NA   NA
 654977 654978 CpB0740 CpB0741     FALSE 0.033 352.000 0.000 1.000   NA
 654978 654979 CpB0741 CpB0742     FALSE 0.028 280.000 0.000 NA   NA
 654980 654981 CpB0743 CpB0744     TRUE 0.994 4.000 0.110 0.004 Y NA
 654981 654982 CpB0744 CpB0745     FALSE 0.191 105.000 0.007 NA   NA
 654982 654983 CpB0745 CpB0746     TRUE 0.963 0.000 1.000 NA   NA
 654983 654984 CpB0746 CpB0747     FALSE 0.036 287.000 0.002 NA   NA
 654984 654985 CpB0747 CpB0748     FALSE 0.281 110.000 0.004 0.035   NA
 654987 654988 CpB0749 CpB0750     TRUE 0.853 -3.000 0.011 NA   NA
 654988 654989 CpB0750 CpB0751     TRUE 0.902 7.000 0.009 NA   NA
 654990 654991 CpB0752 CpB0753     FALSE 0.218 57.000 0.000 NA   NA
 654991 654992 CpB0753 CpB0754     TRUE 0.555 66.000 0.500 NA   NA
 654994 654995 CpB0756 CpB0757     TRUE 0.482 112.000 0.833 NA   NA
 654995 654996 CpB0757 CpB0758   mviN FALSE 0.210 103.000 0.008 NA   NA
 654997 654998 CpB0759 CpB0760     FALSE 0.022 335.000 0.000 NA   NA
 655001 655002 CpB0763 CpB0764     FALSE 0.048 321.000 0.000 1.000 N NA
 655003 655004 CpB0765 CpB0767     TRUE 0.989 -13.000 0.542 0.004 Y NA
 655005 655006 CpB0766 CpB0768     TRUE 0.819 -10.000 0.005 1.000 N NA
 655009 655010 CpB0770 CpB0771     FALSE 0.434 71.000 0.086 NA   NA
 655011 655012 CpB0772 CpB0773     FALSE 0.021 355.000 0.000 NA   NA
 655013 655014 CpB0774 CpB0775     FALSE 0.273 105.000 0.009 1.000   NA
 655014 655015 CpB0775 CpBt29     TRUE 0.821 14.000 0.000 NA   NA
 655016 655017 CpB0776 CpB0777     TRUE 0.871 16.000 0.000 1.000   NA
 655017 655018 CpB0777 CpB0778   tctD FALSE 0.199 75.000 0.000 1.000   NA
 655019 655020 CpB0779 CpB0780   recD FALSE 0.205 167.000 0.023 1.000   NA
 655021 655022 CpB0781 CpB0782   rpsT TRUE 0.668 31.000 0.004 NA   NA
 655023 655024 CpB0783 CpB0784     FALSE 0.358 159.000 0.857 NA   NA
 655024 655025 CpB0784 CpB0785     TRUE 0.630 54.000 0.030 1.000 N NA
 655025 655026 CpB0785 CpB0786     TRUE 0.966 -27.000 0.030 1.000 Y NA
 655026 655027 CpB0786 CpB0787     TRUE 0.982 26.000 0.015 1.000 Y NA
 655027 655028 CpB0787 CpB0788     TRUE 0.727 -43.000 0.017 NA   NA
 655028 655029 CpB0788 CpB0789     TRUE 0.553 55.000 0.055 NA   NA
 655030 655031 CpB0790 CpB0791 recA   FALSE 0.039 372.000 0.000 1.000 N NA
 655031 655032 CpB0791 CpB0792     TRUE 0.875 10.000 0.006 NA   NA
 655032 655033 CpB0792 CpB0793     TRUE 0.913 -9.000 0.429 NA   NA
 655033 655034 CpB0793 CpB0794     TRUE 0.974 9.000 1.000 NA   NA
 655035 655036 CpB0795 CpB0797   nifR3 TRUE 0.714 -21.000 0.005 1.000   NA
 655039 655040 CpB0799 CpB0800     TRUE 0.938 3.000 0.015 1.000 N NA
 655041 655042 CpB0801 CpB0803     TRUE 0.863 -15.000 0.140 NA   NA
 655044 655045 CpB0804 CpB0805     FALSE 0.344 111.000 0.128 NA   NA
 655045 655046 CpB0805 CpBt30     FALSE 0.039 220.000 0.000 NA   NA
 655046 655047 CpBt30 CpB0806     TRUE 0.595 31.000 0.000 NA   NA
 655048 655049 CpB0807 CpB0808     TRUE 0.482 107.000 0.750 NA   NA
 655049 655050 CpB0808 CpB0809     TRUE 0.939 -10.000 0.750 1.000   NA
 655050 655051 CpB0809 CpB0810   tolB TRUE 0.964 -3.000 0.750 1.000 N NA
 655051 655052 CpB0810 CpB0811 tolB   TRUE 0.908 32.000 0.750 NA   NA
 655052 655053 CpB0811 CpB0812   exbD TRUE 0.958 4.000 0.500 NA   NA
 655053 655054 CpB0812 CpB0813 exbD exbB TRUE 0.993 -3.000 0.583 0.030 Y NA
 655055 655056 CpB0814 CpB0815 dsbD mttC FALSE 0.058 323.000 0.008 NA N NA
 655056 655057 CpB0815 CpB0816 mttC   FALSE 0.185 138.000 0.007 NA N NA
 655057 655058 CpB0816 CpB0817     TRUE 0.994 4.000 0.179 0.003 Y NA
 655058 655059 CpB0817 CpB0818   sdhB TRUE 0.996 14.000 0.231 0.003 Y NA
 655060 655061 CpB0819 CpB0820     TRUE 0.895 31.000 0.429 NA   NA
 655061 655062 CpB0820 CpB0821   rsbU TRUE 0.957 -3.000 0.750 1.000   NA
 655062 655063 CpB0821 CpB0822 rsbU   TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 655064 655065 CpB0823 CpB0824     FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 655065 655066 CpB0824 CpB0825     FALSE 0.117 103.000 0.000 NA   NA
 655066 655067 CpB0825 CpB0826     FALSE 0.042 209.000 0.000 NA   NA
 655067 655068 CpB0826 CpB0827     FALSE 0.074 149.000 0.000 NA   NA
 655069 655070 CpB0828 CpB0829     FALSE 0.031 260.000 0.000 NA   NA
 655070 655071 CpB0829 CpB0830     FALSE 0.123 192.000 0.006 1.000 N NA
 655071 655072 CpB0830 CpB0831     TRUE 0.947 9.000 0.006 0.048 N NA
 655072 655073 CpB0831 CpB0832     TRUE 0.942 9.000 0.039 NA   NA
 655073 655074 CpB0832 CpB0833     TRUE 0.965 4.000 0.750 NA   NA
 655074 655075 CpB0833 CpB0834   soj TRUE 0.970 5.000 0.875 NA   NA
 655075 655076 CpB0834 CpB0835 soj   TRUE 0.871 33.000 0.035 1.000 N NA
 655078 655079 CpB0837 CpB0838     TRUE 0.943 33.000 0.750 0.007   NA
 655079 655080 CpB0838 CpB0839     TRUE 0.868 37.000 0.857 NA   NA
 655080 655081 CpB0839 CpB0840   lcrH TRUE 0.769 21.000 0.000 NA   NA
 655082 655083 CpB0841 CpB0842 mutL   TRUE 0.930 5.000 0.007 1.000 N NA
 655083 655084 CpB0842 CpB0843     FALSE 0.181 146.000 0.014 NA   NA
 655084 655085 CpB0843 CpB0844     TRUE 0.950 1.000 0.467 NA   NA
 655085 655086 CpB0844 CpB0845   xcpR TRUE 0.986 -10.000 0.467 1.000 Y NA
 655086 655087 CpB0845 CpB0846 xcpR   TRUE 0.992 10.000 0.035 1.000 Y NA
 655087 655088 CpB0846 CpB0847     TRUE 0.903 24.000 0.030 NA   NA
 655088 655089 CpB0847 CpB0848     TRUE 0.963 4.000 0.667 NA   NA
 655089 655090 CpB0848 CpB0849     TRUE 0.908 -15.000 0.667 NA   NA
 655090 655091 CpB0849 CpB0850     TRUE 0.904 -16.000 0.667 NA   NA
 655091 655092 CpB0850 CpB0851     TRUE 0.904 34.000 1.000 NA   NA
 655093 655094 CpB0852 CpB0853     TRUE 0.996 8.000 0.875 1.000 Y NA
 655094 655095 CpB0853 CpB0854   yscR TRUE 0.997 12.000 0.700 0.010 Y NA
 655095 655096 CpB0854 CpB0855 yscR   TRUE 0.995 15.000 0.700 1.000 Y NA
 655096 655097 CpB0855 CpB0856     FALSE 0.419 121.000 0.556 NA   NA
 655097 655098 CpB0856 CpB0857     TRUE 0.961 0.000 0.875 NA   NA
 655099 655100 CpB0858 CpB0859     FALSE 0.083 143.000 0.000 NA   NA
 655100 655101 CpB0859 CpB0860     FALSE 0.025 305.000 0.000 NA   NA
 655102 655103 CpB0861 CpB0862     TRUE 0.899 -3.000 0.009 1.000 N NA
 655105 655106 CpB0864 CpB0865   brnQ TRUE 0.938 30.000 0.545 1.000 N NA
 655106 655107 CpB0865 CpB0866 brnQ   FALSE 0.121 185.000 0.004 1.000 N NA
 655107 655108 CpB0866 CpB0867     TRUE 0.918 7.000 0.007 1.000   NA
 655109 655110 CpB0868 CpB0869     FALSE 0.280 60.000 0.000 1.000   NA
 655110 655111 CpB0869 CpB0870   secA FALSE 0.077 184.000 0.000 1.000   NA
 655111 655112 CpB0870 CpB0872 secA   FALSE 0.059 170.000 0.000 NA   NA
 655113 655114 CpB0871 CpB0873     FALSE 0.182 76.000 0.005 NA   NA
 655114 655115 CpB0873 CpB0874     FALSE 0.209 117.000 0.006 1.000   NA
 655115 655116 CpB0874 CpB0875     TRUE 0.824 30.000 0.006 1.000 N NA
 655116 655117 CpB0875 CpB0876     TRUE 0.994 10.000 0.352 1.000 Y NA
 655117 655118 CpB0876 CpB0877     TRUE 0.676 179.000 0.351 1.000 Y NA
 655118 655119 CpB0877 CpBt31     TRUE 0.500 35.000 0.000 NA   NA
 655120 655121 CpB0878 CpB0879     TRUE 0.936 5.000 0.009 1.000 N NA
 655121 655122 CpB0879 CpB0880     TRUE 0.933 3.000 0.011 1.000 N NA
 655122 655123 CpB0880 CpB0881     FALSE 0.270 118.000 0.026 NA   NA
 655123 655124 CpB0881 CpB0882     TRUE 0.966 21.000 1.000 NA   NA
 655125 655126 CpB0883 CpB0884     FALSE 0.264 166.000 0.375 NA   NA
 655126 655127 CpB0884 CpB0885     TRUE 0.935 -3.000 0.044 1.000 N NA
 655127 655128 CpB0885 CpB0886     TRUE 0.945 12.000 0.044 NA   NA
 655128 655129 CpB0886 CpB0887     TRUE 0.914 -3.000 0.108 NA   NA
 655129 655130 CpB0887 CpB0888     TRUE 0.912 -3.000 0.081 NA   NA
 655130 655131 CpB0888 CpB0889     TRUE 0.961 17.000 0.500 NA   NA
 655131 655132 CpB0889 CpB0890     FALSE 0.128 292.000 0.136 NA N NA
 655132 655133 CpB0890 CpB0891   nifS TRUE 0.943 -3.000 0.138 1.000 N NA
 655133 655134 CpB0891 CpB0892 nifS   TRUE 0.815 -45.000 0.021 1.000 N NA
 655135 655136 CpB0893 CpB0895     TRUE 0.745 41.000 0.080 NA   NA
 655139 655140 CpB0897 CpB0898 copA   TRUE 0.957 12.000 0.052 1.000   NA
 655140 655141 CpB0898 CpB0899     TRUE 0.773 44.000 0.286 1.000   NA
 655142 655143 CpB0900 CpB0901     TRUE 0.870 61.000 0.007 0.004 Y NA
 655143 655144 CpB0901 CpB0902     TRUE 0.987 23.000 0.006 0.004 Y NA
 655146 655147 CpB0904 CpB0905     FALSE 0.375 119.000 0.316 NA   NA
 655147 655148 CpB0905 CpB0906     TRUE 0.960 13.000 0.316 NA   NA
 655149 655150 CpB0907 CpB0908     TRUE 0.852 -12.000 0.016 1.000   NA
 655150 655151 CpB0908 CpB0909     TRUE 0.923 2.000 0.016 1.000   NA
 655151 655152 CpB0909 CpBt32     FALSE 0.127 89.000 0.000 NA   NA
 655153 655154 CpBr01 CpBr02     FALSE 0.025 300.000 0.000 NA   NA
 655154 655155 CpBr02 CpBr03     FALSE 0.106 115.000 0.000 NA   NA
 655155 655156 CpBr03 CpB0910     FALSE 0.029 274.000 0.000 NA   NA
 655156 655157 CpB0910 CpB0911     FALSE 0.229 56.000 0.000 NA   NA
 655158 655159 CpB0912 CpB0913     FALSE 0.183 141.000 0.007 NA N NA
 655159 655160 CpB0913 CpB0914     FALSE 0.305 71.000 0.007 NA N NA
 655163 655164 CpB0917 CpB0919     TRUE 0.779 20.000 0.000 NA   NA
 655165 655166 CpB0918 CpB0920     TRUE 0.975 36.000 0.056 0.004 Y NA
 655166 655167 CpB0920 CpB0921     TRUE 0.976 -19.000 0.012 0.004 Y NA
 655167 655168 CpB0921 CpB0922     TRUE 0.931 11.000 0.006 1.000 N NA
 655168 655169 CpB0922 CpB0923     TRUE 0.752 -30.000 0.006 1.000 N NA
 655172 655173 CpB0926 CpB0927     TRUE 0.601 35.000 0.006 NA   NA
 655174 655175 CpB0928 CpB0929 cpdA   FALSE 0.218 164.000 0.027 1.000   NA
 655175 655176 CpB0929 CpBt33     FALSE 0.141 74.000 0.000 NA   NA
 655177 655178 CpB0930 CpB0931     FALSE 0.315 46.000 0.000 NA   NA
 655178 655179 CpB0931 CpB0932     TRUE 0.993 17.000 0.018 0.006 Y NA
 655179 655180 CpB0932 CpB0933     TRUE 0.996 3.000 0.647 0.006 Y NA
 655180 655181 CpB0933 CpB0934   lytE TRUE 0.985 3.000 0.006 1.000 Y NA
 655181 655182 CpB0934 CpB0935 lytE   TRUE 0.959 19.000 0.088 1.000 N NA
 655182 655183 CpB0935 CpB0936     TRUE 0.802 -91.000 0.037 1.000 N NA
 655183 655184 CpB0936 CpB0937     TRUE 0.994 10.000 0.270 1.000 Y NA
 655185 655186 CpB0938 CpB0939   cutA1 TRUE 0.723 -48.000 0.009 1.000   NA
 655186 655187 CpB0939 CpB0940 cutA1   TRUE 0.848 -3.000 0.010 NA   NA
 655188 655189 CpB0941 CpB0943     TRUE 0.962 10.000 0.040 1.000 N NA
 655191 655192 CpB0944 CpB0945     TRUE 0.713 -3.000 0.000 NA   NA
 655192 655193 CpB0945 CpB0946     FALSE 0.267 51.000 0.000 NA   NA
 655193 655194 CpB0946 CpB0947     FALSE 0.194 61.000 0.000 NA   NA
 655194 655195 CpB0947 CpB0948     TRUE 0.889 17.000 0.008 NA   NA
 655195 655196 CpB0948 CpB0949     TRUE 0.965 3.000 0.333 1.000 N NA
 655200 655201 CpB0953 CpB0954     TRUE 0.993 18.000 0.032 0.033 Y NA
 655201 655202 CpB0954 CpB0956     TRUE 0.634 54.000 0.032 1.000 N NA
 655203 655204 CpB0955 CpB0957 priA   TRUE 0.613 -51.000 0.007 NA   NA
 655206 655207 CpB0959 CpB0960     FALSE 0.147 72.000 0.000 NA   NA
 655207 655208 CpB0960 CpB0961     FALSE 0.043 202.000 0.000 NA   NA
 655209 655210 CpB0962 CpB0963     FALSE 0.021 363.000 0.000 NA   NA
 655215 655216 CpB0967 CpB0969     TRUE 0.977 12.000 0.787 1.000   NA
 655217 655218 CpB0970 CpB0971     TRUE 0.938 23.000 0.013 0.035   NA
 655221 655222 CpB0974 CpB0975   mutS TRUE 0.984 3.000 0.006 1.000 Y NA
 655222 655223 CpB0975 CpB0976 mutS   FALSE 0.125 93.000 0.000 NA   NA
 655224 655225 CpB0977 CpB0978     FALSE 0.212 221.000 0.625 NA   NA
 655225 655226 CpB0978 CpB0979     FALSE 0.159 271.000 0.500 NA   NA
 655226 655227 CpB0979 CpB0980     TRUE 0.502 70.000 0.333 NA   NA
 655228 655229 CpB0981 CpB0982     FALSE 0.377 43.000 0.000 NA   NA
 655232 655233 CpBt34 CpB0985     TRUE 0.794 18.000 0.000 NA   NA
 655233 655234 CpB0985 CpB0986     FALSE 0.377 43.000 0.000 NA   NA
 655234 655235 CpB0986 CpB0987     TRUE 0.994 2.000 0.496 0.055 Y NA
 655235 655236 CpB0987 CpB0988     TRUE 0.824 92.000 0.029 0.055 Y NA
 655236 655237 CpB0988 CpB0989     TRUE 0.995 18.000 0.319 0.035 Y NA
 655237 655238 CpB0989 CpB0990     TRUE 0.996 16.000 0.499 0.035 Y NA
 655238 655239 CpB0990 CpB0991     TRUE 0.720 35.000 0.007 1.000   NA
 655239 655240 CpB0991 CpB0992     TRUE 0.816 -57.000 0.009 0.002   NA
 655240 655241 CpB0992 CpB0993     FALSE 0.019 382.000 0.000 NA   NA
 655242 655243 CpB0994 CpB0995     TRUE 0.838 2.000 0.000 1.000   NA
 655243 655244 CpB0995 CpB0996     TRUE 0.945 11.000 0.019 1.000   NA
 655245 655246 CpB0997 CpB0998     TRUE 0.867 13.000 0.005 NA   NA
 655246 655247 CpB0998 CpB0999     TRUE 0.974 16.000 0.418 1.000 N NA
 655247 655248 CpB0999 CpB1000     FALSE 0.097 186.000 0.005 1.000   NA
 655249 655250 CpB1001 CpB1002     FALSE 0.088 170.000 0.000 1.000   NA
 655250 655251 CpB1002 CpB1003     TRUE 0.944 9.000 0.010 1.000 N NA
 655252 655253 CpB1004 CpB1005     TRUE 0.956 7.000 0.030 1.000 N NA
 655253 655254 CpB1005 CpB1006     FALSE 0.300 88.000 0.006 1.000 N NA
 655254 655255 CpB1006 CpB1007     TRUE 0.689 51.000 0.500 NA   NA
 655257 655258 CpB1009 CpB1010     TRUE 0.996 14.000 0.467 0.002 Y NA
 655258 655259 CpB1010 CpB1011     FALSE 0.032 252.000 0.000 NA   NA
 655259 655260 CpB1011 CpB1012     FALSE 0.018 389.000 0.000 NA   NA
 655260 655261 CpB1012 CpB1013     FALSE 0.018 442.000 0.000 NA   NA
 655261 655262 CpB1013 CpB1014     FALSE 0.051 183.000 0.000 NA   NA
 655262 655263 CpB1014 CpB1015     FALSE 0.031 260.000 0.000 NA   NA
 655263 655264 CpB1015 CpB1016   htrA FALSE 0.026 299.000 0.000 NA   NA
 655267 655268 CpB1019 CpB1020     TRUE 0.913 9.000 0.011 NA   NA
 655269 655270 CpB1021 CpB1022     TRUE 0.984 -36.000 0.564 0.002 Y NA
 655270 655271 CpB1022 CpB1023     FALSE 0.174 150.000 0.008 1.000   NA
 655274 655275 CpB1024 CpB1026     TRUE 0.564 45.000 0.005 1.000 N NA
 655275 655276 CpB1026 CpB1027     FALSE 0.018 385.000 0.000 NA   NA
 655277 655278 CpB1028 CpB1029     TRUE 0.981 -22.000 0.652 1.000 Y NA
 655278 655279 CpB1029 CpB1030     TRUE 0.996 19.000 0.928 0.034 Y NA
 655279 655280 CpB1030 CpB1031     TRUE 0.993 15.000 0.202 1.000 Y NA
 655280 655281 CpB1031 CpBt36     TRUE 0.769 2.000 0.000 NA   NA
 655281 655282 CpBt36 CpB1033     FALSE 0.028 279.000 0.000 NA   NA
 655283 655284 CpB1032 CpB1034     TRUE 0.976 4.000 0.631 0.039   NA
 655285 655286 CpB1035 CpB1036   ftsH FALSE 0.255 188.000 0.145 1.000 N NA
 655287 655288 CpB1037 CpB1038     TRUE 0.963 41.000 0.335 1.000 Y NA
 655289 655290 CpB1039 CpB1040     TRUE 0.813 -10.000 0.013 NA   NA
 655291 655292 CpB1041 CpB1042     TRUE 0.564 80.000 1.000 NA   NA
 655292 655293 CpB1042 CpB1043     TRUE 0.975 15.000 1.000 NA   NA
 655293 655294 CpB1043 CpB1044     TRUE 0.735 54.000 1.000 NA   NA
 655295 655296 CpB1045 CpB1047     TRUE 0.961 18.000 0.571 NA   NA
 655297 655298 CpB1046 CpB1048     TRUE 0.966 6.000 0.429 NA N NA
 655298 655299 CpB1048 CpB1049     TRUE 0.485 227.000 0.042 NA Y NA
 655299 655300 CpB1049 CpB1050     FALSE 0.307 112.000 0.020 NA N NA
 655303 655304 CpB1053 CpB1054     FALSE 0.319 146.000 0.400 NA   NA
 655304 655305 CpB1054 CpB1055     TRUE 0.470 105.000 0.400 1.000   NA
 655305 655306 CpB1055 CpB1056     TRUE 0.726 -40.000 0.017 NA   NA
 655309 655310 CpB1058 CpB1060     TRUE 0.814 16.000 0.000 NA   NA
 655310 655311 CpB1060 CpB1061     TRUE 0.751 0.000 0.000 NA   NA
 655312 655313 CpBt37 CpB1062     FALSE 0.126 90.000 0.000 NA   NA
 655315 655316 CpB1064 CpB1065     FALSE 0.341 115.000 0.133 NA   NA
 655316 655317 CpB1065 CpB1066     TRUE 0.500 35.000 0.000 NA   NA
 655317 655318 CpB1066 CpB1067     FALSE 0.034 243.000 0.000 NA   NA
 655318 655319 CpB1067 CpB1069     TRUE 0.922 6.000 0.018 NA   NA
 655320 655321 CpB1068 CpB1070     TRUE 0.646 -9.000 0.000 NA   NA
 655321 655322 CpB1070 CpB1071     TRUE 0.552 33.000 0.000 NA   NA
 655322 655323 CpB1071 CpB1072     TRUE 0.970 11.000 0.429 1.000   NA
 655323 655324 CpB1072 CpB1073     TRUE 0.887 34.000 0.429 1.000   NA
 655324 655325 CpB1073 CpB1074     FALSE 0.365 121.000 0.300 NA   NA
 655325 655326 CpB1074 CpB1075   aroDE TRUE 0.643 50.000 0.214 NA   NA
 655326 655327 CpB1075 CpB1076 aroDE   TRUE 0.972 -19.000 0.007 0.004 Y NA
 655327 655328 CpB1076 CpB1077     TRUE 0.991 -3.000 0.110 0.004 Y NA
 655328 655329 CpB1077 CpB1078     TRUE 0.977 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 655329 655330 CpB1078 CpB1079     TRUE 0.932 -64.000 0.006 1.000 Y NA
 655330 655331 CpB1079 CpB1080     FALSE 0.222 71.000 0.000 1.000   NA
 655331 655332 CpB1080 CpB1081     TRUE 0.717 -18.000 0.003 1.000   NA
 655332 655333 CpB1081 CpB1082     TRUE 0.974 -63.000 0.124 0.003 Y NA
 655333 655334 CpB1082 CpB1083     TRUE 0.974 -21.000 0.097 1.000 Y NA
 655334 655335 CpB1083 CpB1084     TRUE 0.959 -21.000 0.008 1.000 Y NA
 655335 655336 CpB1084 CpB1085     FALSE 0.043 207.000 0.000 NA   NA
 655336 655337 CpB1085 CpB1086     TRUE 0.843 -9.000 0.020 NA   NA
 655340 655341 CpB1089 CpB1090     TRUE 0.976 -12.000 0.022 1.000 Y NA
 655341 655342 CpB1090 CpB1091     TRUE 0.991 9.000 0.021 1.000 Y NA
 655342 655343 CpB1091 CpB1092     FALSE 0.064 161.000 0.000 NA   NA
 655343 655344 CpB1092 CpB1093     FALSE 0.081 144.000 0.000 NA   NA
 655344 655345 CpB1093 CpB1095     TRUE 0.556 -19.000 0.000 NA   NA
 2155317 655347 CpB1096 CpB1097     FALSE 0.037 228.000 0.000 NA   NA
 655347 655348 CpB1097 CpB1098     TRUE 0.778 3.000 0.000 NA   NA
 655348 655349 CpB1098 CpB1099     FALSE 0.030 266.000 0.000 NA   NA
 655349 655350 CpB1099 CpB1100     FALSE 0.404 149.000 0.667 1.000   NA
 655350 655351 CpB1100 CpB1101   ksgA TRUE 0.901 9.000 0.005 1.000   NA
 655352 655353 CpB1102 CpB1103     TRUE 0.905 5.000 0.011 NA   NA
 655353 655354 CpB1103 CpB1104     TRUE 0.878 5.000 0.007 NA   NA
 655354 655355 CpB1104 CpB1105     TRUE 0.977 4.000 0.412 0.002   NA
 655356 655357 CpB1106 CpB1107     TRUE 0.820 13.000 0.000 NA   NA
 655362 655363 CpB1112 CpB1113     FALSE 0.126 90.000 0.000 NA   NA
 655365 655366 CpB1115 CpB1116     FALSE 0.019 372.000 0.000 NA   NA
 655367 655368 CpB1117 CpB1118     FALSE 0.336 173.000 1.000 NA   NA
 655369 654216 CpBt38 CpB0001     FALSE 0.043 202.000 0.000 NA   NA