MicrobesOnline Operon Predictions for Prochlorococcus marinus str. MIT 9301

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1197606 1197605     dnaN   FALSE 0.415 2.000 0.022 NA   NA
 1197605 1197604         FALSE 0.448 4.000 0.039 NA   NA
 1197604 1197603       purF TRUE 0.654 48.000 0.019 1.000 Y NA
 1197602 1197601         FALSE 0.334 78.000 0.143 1.000   NA
 1197601 1197600         TRUE 0.585 -3.000 0.042 1.000   NA
 1197599 1197598       nusB FALSE 0.335 4.000 0.016 NA   NA
 1197598 1197597     nusB ftsY FALSE 0.185 63.000 0.005 1.000   NA
 1197597 1197596     ftsY rsbU FALSE 0.135 68.000 0.018 1.000 N NA
 1197596 1197595     rsbU argH FALSE 0.159 62.000 0.021 1.000 N NA
 1197595 1197594     argH   FALSE 0.083 116.000 0.019 1.000   NA
 1197592 1197591       grpE TRUE 0.657 75.000 0.021 1.000 Y NA
 1197591 1197590     grpE dnaJ TRUE 0.903 30.000 0.168 0.018 Y NA
 1197590 1198961     dnaJ   TRUE 0.557 0.000 0.067 1.000   NA
 1198961 1197589         TRUE 0.565 -10.000 0.058 1.000   NA
 1197588 1197587       murB FALSE 0.257 18.000 0.030 NA   NA
 1197587 1197586     murB murC TRUE 0.911 16.000 0.136 0.008 Y NA
 1197584 1197583     thiL   FALSE 0.427 -7.000 0.031 1.000 N NA
 1197582 1197581     efp accB FALSE 0.454 0.000 0.120 1.000 N NA
 1197580 1197579     pdxA   FALSE 0.151 65.000 0.020 1.000 N NA
 1197578 1197577         FALSE 0.051 167.000 0.250 NA   NA
 1197577 1197576         FALSE 0.217 57.000 0.091 NA   NA
 1197573 1197572     cbiD   FALSE 0.163 55.000 0.023 1.000 N NA
 1197571 1197570         FALSE 0.065 326.000 0.000 0.013   NA
 1197569 1197568         FALSE 0.413 80.000 0.300 NA   NA
 1197568 1198959         FALSE 0.116 109.000 0.150 NA   NA
 1198959 1197567         FALSE 0.018 156.000 0.012 NA   NA
 1197566 1197565         TRUE 0.589 18.000 0.458 NA   NA
 1197565 1197564         TRUE 0.948 17.000 0.457 0.004 Y NA
 1197556 1197555         FALSE 0.161 10.000 0.000 1.000   NA
 1197555 1198958         FALSE 0.051 -13.000 0.000 NA   NA
 1197554 1198957         FALSE 0.019 41.000 0.000 NA   NA
 1197550 1197549         TRUE 0.813 2.000 0.522 NA   NA
 1197549 1294334         FALSE 0.051 167.000 0.250 NA   NA
 1197548 1198955         FALSE 0.444 81.000 0.350 NA   NA
 1198955 1197547       smc FALSE 0.287 77.000 0.150 NA   NA
 1197547 1197546     smc   FALSE 0.319 46.000 0.177 NA   NA
 1197545 1309143       tRNA-Leu FALSE 0.040 5.000 0.000 NA   NA
 1197542 1197541         TRUE 0.610 80.000 0.556 NA   NA
 1197540 1197539         TRUE 0.781 9.000 0.576 1.000   NA
 1197539 1197538         FALSE 0.329 43.000 0.182 NA   NA
 1197538 1197537       hit FALSE 0.145 47.000 0.010 NA   NA
 1197537 1197536     hit def FALSE 0.236 5.000 0.013 1.000 N NA
 1197534 1197533         FALSE 0.410 0.000 0.081 1.000 N NA
 1197533 1197532       sufC TRUE 0.909 5.000 0.482 1.000 Y NA
 1197532 1197531     sufC   TRUE 0.829 18.000 0.466 1.000 Y NA
 1197530 1197529         FALSE 0.001 288.000 0.000 NA   NA
 1197529 1197528         TRUE 0.804 13.000 0.947 NA   NA
 1197528 1197527       pgm FALSE 0.188 33.000 0.017 NA   NA
 1197527 1197526     pgm mgs1 FALSE 0.106 34.000 0.009 1.000 N NA
 1197523 1197522       cysH FALSE 0.214 16.000 0.026 1.000 N NA
 1197521 1197520       citT FALSE 0.392 50.000 0.296 1.000 N NA
 1197520 1197519     citT trkG TRUE 0.975 5.000 0.500 0.004 Y NA
 1197519 1197518     trkG   TRUE 0.943 19.000 0.438 0.004 Y NA
 1197516 1197515         TRUE 0.635 35.000 0.533 NA   NA
 1197514 1198953         FALSE 0.094 112.000 0.128 NA   NA
 1198952 1197512         FALSE 0.056 128.000 0.105 NA   NA
 1197512 1197511         TRUE 0.777 23.000 1.000 NA   NA
 1197511 1197510         TRUE 0.515 70.000 0.421 NA   NA
 1198951 1197509       rbn FALSE 0.025 12.000 0.000 NA   NA
 1197509 1197508     rbn   FALSE 0.245 91.000 0.154 1.000   NA
 1197508 1197507         FALSE 0.380 3.000 0.096 1.000 N NA
 1197507 1197506         FALSE 0.240 26.000 0.128 1.000 N NA
 1197505 1197504       nadB FALSE 0.450 0.000 0.024 NA   NA
 1198950 1197501         FALSE 0.370 65.000 0.238 NA   NA
 1197501 1197500         FALSE 0.364 62.000 0.238 NA   NA
 1197500 1197499         FALSE 0.285 18.000 0.125 NA   NA
 1197499 1197498         TRUE 0.914 -3.000 0.370 1.000 Y NA
 1197494 1198949         FALSE 0.279 27.000 0.129 NA   NA
 1197493 1197492       rbfA FALSE 0.473 0.000 0.030 NA   NA
 1197492 1197491     rbfA hemD FALSE 0.189 -13.000 0.006 1.000 N NA
 1197490 1197489       crtQ TRUE 0.860 4.000 0.800 NA   NA
 1197488 1197487         TRUE 0.654 7.000 0.375 NA   NA
 1197487 1197486         TRUE 0.726 2.000 0.389 NA   NA
 1197486 1294306         TRUE 0.881 -7.000 0.778 NA   NA
 1197483 1197482         FALSE 0.420 17.000 0.190 1.000   NA
 1197481 1197480         FALSE 0.377 9.000 0.117 NA   NA
 1197480 1309178       tRNA-Asn FALSE 0.018 50.000 0.000 NA   NA
 1309178 1198948     tRNA-Asn   FALSE 0.000 567.000 0.000 NA   NA
 1198948 1198947         FALSE 0.053 -3.000 0.000 NA   NA
 1198947 1197479         FALSE 0.052 0.000 0.000 NA   NA
 1197476 1197475     holB tmk TRUE 0.633 -3.000 0.254 1.000 N NA
 1197475 1197474     tmk zntA FALSE 0.347 1.000 0.020 1.000 N NA
 1197471 1197470       plsX FALSE 0.394 1.000 0.026 1.000 N NA
 1197470 1197469     plsX fabH TRUE 0.921 54.000 0.380 0.008 Y NA
 1197469 1197468     fabH fabD TRUE 0.911 15.000 0.043 0.008 Y NA
 1197468 1197467     fabD   TRUE 0.848 6.000 0.218 1.000 Y NA
 1197466 1197465       ycf34 FALSE 0.313 10.000 0.023 NA   NA
 1197464 1197463         FALSE 0.283 59.000 0.074 1.000   NA
 1197462 1197461     crtB,pys pds TRUE 0.721 41.000 0.691 1.000   NA
 1197460 1197459         FALSE 0.333 72.000 0.205 NA   NA
 1197457 1197456       ndhF FALSE 0.269 34.000 0.041 NA   NA
 1197456 1197455     ndhF   TRUE 0.618 131.000 0.050 0.003 Y NA
 1197455 1197454         FALSE 0.054 124.000 0.009 1.000   NA
 1197454 1197453         FALSE 0.306 48.000 0.034 1.000   NA
 1294320 1197450         FALSE 0.226 67.000 0.090 NA   NA
 1197450 1197449         FALSE 0.467 1.000 0.101 NA   NA
 1197449 1197448       ndhE FALSE 0.289 10.000 0.071 1.000 N NA
 1197448 1197447     ndhE ndhG TRUE 0.951 19.000 0.506 0.004 Y NA
 1197447 1197446     ndhG ndhI TRUE 0.918 14.000 0.192 0.012 Y NA
 1197446 1197445     ndhI ndhA TRUE 0.904 69.000 0.242 0.012 Y NA
 1197445 1197444     ndhA gltA TRUE 0.686 76.000 0.137 1.000 Y NA
 1197444 1197443     gltA   FALSE 0.057 126.000 0.094 NA   NA
 1197440 1197439     sui1 cysC FALSE 0.075 43.000 0.006 1.000 N NA
 1197433 1197432     ndhH   FALSE 0.445 10.000 0.182 NA   NA
 1197431 1197430     menE menC TRUE 0.938 -3.000 0.283 0.002 N NA
 1197430 1197429     menC menA TRUE 0.862 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 1197427 1197426     gshB grxC FALSE 0.334 6.000 0.028 1.000 N NA
 1197425 1198945     prfB   FALSE 0.406 4.000 0.025 NA   NA
 1198945 1197424         FALSE 0.401 7.000 0.039 NA   NA
 1197424 1197423       dgkA FALSE 0.411 7.000 0.123 NA   NA
 1197423 1197422     dgkA pabA FALSE 0.397 13.000 0.231 1.000 N NA
 1197422 1197421     pabA   FALSE 0.379 21.000 0.231 NA   NA
 1197420 1197419       argS FALSE 0.298 0.000 0.015 1.000 N NA
 1197419 1197418     argS nadC FALSE 0.131 28.000 0.014 1.000 N NA
 1197418 1197417     nadC thdF FALSE 0.227 79.000 0.014 1.000   NA
 1197413 1197412     rluD   TRUE 0.496 -9.000 0.018 1.000   NA
 1197408 1197407       pyrD FALSE 0.141 18.000 0.016 1.000 N NA
 1197407 1197406     pyrD rnhA FALSE 0.332 7.000 0.031 1.000 N NA
 1197406 1197405     rnhA rplL FALSE 0.092 48.000 0.008 1.000 N NA
 1197405 1197404     rplL rplJ TRUE 0.900 29.000 0.884 1.000 Y NA
 1197404 1197403     rplJ rplA FALSE 0.164 191.000 0.302 1.000 Y NA
 1197403 1197402     rplA rplK TRUE 0.951 67.000 0.838 0.045 Y NA
 1197402 1197401     rplK nusG TRUE 0.663 68.000 0.681 1.000 N NA
 1197401 1197400     nusG secE TRUE 0.717 52.000 0.843 1.000 N NA
 1197400 1197399     secE clpB2 FALSE 0.169 63.000 0.023 1.000 N NA
 1197397 1197396         TRUE 0.840 -3.000 0.576 NA   NA
 1197394 1197393         TRUE 0.560 -3.000 0.152 NA   NA
 1197391 1197390     hemB   FALSE 0.301 63.000 0.033 1.000   NA
 1197390 1197389         FALSE 0.357 16.000 0.044 1.000   NA
 1197389 1197388       obg FALSE 0.207 41.000 0.008 1.000   NA
 1197388 1197387     obg   FALSE 0.013 87.000 0.000 NA   NA
 1197386 1197385       ecm4 FALSE 0.088 120.000 0.152 NA   NA
 1197382 1197381     psbA aroC FALSE 0.034 110.000 0.000 1.000   NA
 1197380 1197379     eda   TRUE 0.514 21.000 0.415 1.000 N NA
 1197379 1197378       met3 FALSE 0.204 46.000 0.061 1.000 N NA
 1197378 1197377     met3 psbO FALSE 0.293 74.000 0.064 1.000   NA
 1197377 1197376     psbO dfp FALSE 0.018 172.000 0.004 1.000   NA
 1197376 1197375     dfp   FALSE 0.472 -10.000 0.030 NA   NA
 1197374 1197373         TRUE 0.495 12.000 0.278 NA   NA
 1197372 1197371     pyrB   FALSE 0.150 21.000 0.019 1.000 N NA
 1309179 1198942     tRNA-Leu   FALSE 0.017 72.000 0.000 NA   NA
 1198942 1197368       ileS FALSE 0.025 120.000 0.003 NA   NA
 1294322 1198941         TRUE 0.824 -40.000 0.561 NA   NA
 1197364 1198940     thy1 dcd TRUE 0.854 2.000 0.042 1.000 Y NA
 1198940 1198939     dcd   FALSE 0.347 5.000 0.091 1.000 N NA
 1198938 1198937     ntcA   TRUE 0.667 40.000 0.612 NA   NA
 1198937 1198936         TRUE 0.490 1.000 0.047 NA   NA
 1198935 1198934       pth FALSE 0.308 10.000 0.022 NA   NA
 1198934 1198933     pth psbH FALSE 0.032 138.000 0.006 1.000   NA
 1198933 1199245     psbH   FALSE 0.263 21.000 0.048 NA   NA
 1198932 1198931     psbN psbI TRUE 0.569 109.000 0.216 0.007   NA
 1198930 1198929     leuD leuC TRUE 0.971 3.000 0.268 0.002 Y NA
 1198929 1198928     leuC cinA FALSE 0.361 13.000 0.032 1.000   NA
 1198928 1198927     cinA glyA TRUE 0.499 -3.000 0.018 1.000   NA
 1198927 1309161     glyA tRNA-Arg FALSE 0.018 78.000 0.000 NA   NA
 1294344 1198926         TRUE 0.717 15.000 0.667 NA   NA
 1198924 1198923     sfsA amtB FALSE 0.024 180.000 0.040 NA   NA
 1198923 1198922     amtB lytB FALSE 0.282 90.000 0.286 1.000 N NA
 1198922 1198921     lytB   FALSE 0.128 104.000 0.143 NA   NA
 1198915 1198914     tgt psbK FALSE 0.323 34.000 0.034 1.000   NA
 1198912 1309160       tRNA-Met FALSE 0.020 19.000 0.000 NA   NA
 1198911 1198910     pyrE   FALSE 0.405 11.000 0.034 1.000   NA
 1198908 1198907         FALSE 0.342 -36.000 0.020 1.000 N NA
 1198906 1198905         FALSE 0.150 71.000 0.020 1.000 N NA
 1198905 1198904       fabI FALSE 0.173 21.000 0.021 1.000 N NA
 1198903 1198902       degT FALSE 0.295 54.000 0.057 1.000   NA
 1198901 1198900     phrB   TRUE 0.867 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 1198900 1198899       folK FALSE 0.205 48.000 0.033 1.000 N NA
 1198897 1198896         TRUE 0.924 6.000 0.690 NA Y NA
 1198894 1198893     ndhJ ndhK TRUE 0.977 0.000 0.406 0.004 Y NA
 1198893 1198892     ndhK ndhC TRUE 0.971 5.000 0.428 0.004 Y NA
 1198891 1198890     rub   TRUE 0.730 10.000 0.521 NA   NA
 1198890 1198889       psbE FALSE 0.247 131.000 0.625 NA   NA
 1198889 1198888     psbE psbF TRUE 0.969 3.000 0.837 0.004   NA
 1198888 1198887     psbF psbL TRUE 0.944 12.000 0.872 0.006   NA
 1198887 1198886     psbL psbJ TRUE 0.953 10.000 0.878 0.006   NA
 1198883 1198882       uvrD FALSE 0.320 6.000 0.025 1.000 N NA
 1198882 1199242     uvrD   FALSE 0.166 23.000 0.012 NA   NA
 1198880 1199241     cpeS   TRUE 0.647 -25.000 0.259 NA   NA
 1199241 1198879         FALSE 0.195 117.000 0.375 NA   NA
 1309159 1198877     tRNA-Phe xylB FALSE 0.010 92.000 0.000 NA   NA
 1198877 1198876     xylB metK FALSE 0.235 13.000 0.028 1.000 N NA
 1198876 1198875     metK rps1a, rpsA1 FALSE 0.038 135.000 0.008 1.000   NA
 1198875 1198874     rps1a, rpsA1   FALSE 0.114 109.000 0.025 1.000   NA
 1198874 1198873       psbT FALSE 0.145 100.000 0.028 1.000   NA
 1198873 1198872     psbT psbB TRUE 0.874 24.000 0.651 0.063   NA
 1198871 1198870     fdx psbM FALSE 0.357 105.000 0.472 1.000   NA
 1198870 1198869     psbM hemK FALSE 0.386 12.000 0.111 1.000   NA
 1198869 1198868     hemK sua5 TRUE 0.795 24.000 0.444 NA Y NA
 1198868 1199240     sua5   FALSE 0.050 1.000 0.000 NA   NA
 1309158 1198867     tRNA-Thr minE FALSE 0.018 66.000 0.000 NA   NA
 1198867 1198866     minE minD TRUE 0.890 2.000 0.347 NA Y NA
 1198866 1198865     minD minC FALSE 0.240 112.000 0.368 1.000   NA
 1198865 1198864     minC   FALSE 0.412 11.000 0.038 1.000   NA
 1198864 1198863         FALSE 0.309 37.000 0.071 1.000   NA
 1198862 1198861     petB petD TRUE 0.842 33.000 0.471 0.063   NA
 1198860 1199239         FALSE 0.001 241.000 0.000 NA   NA
 1309398 1309162     rrs tRNA-Ile FALSE 0.004 126.000 0.000 NA   NA
 1309162 1309163     tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.023 13.000 0.000 NA   NA
 1309163 1365722     tRNA-Ala rrl FALSE 0.001 259.000 0.000 NA   NA
 1365722 1309399     rrl rrf FALSE 0.018 67.000 0.000 NA   NA
 1198859 1198858     mutM psaE TRUE 0.510 5.000 0.040 1.000   NA
 1198858 1198857     psaE   FALSE 0.334 81.000 0.152 1.000   NA
 1198857 1198856         FALSE 0.407 73.000 0.227 1.000   NA
 1362549 1198852     pseudo   FALSE 0.025 12.000 0.000 NA   NA
 1199234 1198851         FALSE 0.270 91.000 0.250 NA   NA
 1198850 1198849         FALSE 0.105 116.000 0.167 NA   NA
 1198849 1198848         FALSE 0.243 39.000 0.100 NA   NA
 1198844 1198843         TRUE 0.769 5.000 0.500 NA   NA
 1198843 1294351         TRUE 0.571 91.000 0.714 NA   NA
 1198842 1198841         FALSE 0.197 84.000 0.086 NA   NA
 1198840 1199232         FALSE 0.001 230.000 0.000 NA   NA
 1198839 1294330         FALSE 0.029 123.000 0.007 NA   NA
 1294348 1198838         FALSE 0.115 63.000 0.006 NA   NA
 1198838 1199231         FALSE 0.317 18.000 0.150 NA   NA
 1294288 1198837         FALSE 0.000 520.000 0.000 NA   NA
 1198836 1198835         FALSE 0.003 128.000 0.000 NA   NA
 1198834 1198833       thiD FALSE 0.362 50.000 0.263 1.000 N NA
 1199229 1198831         FALSE 0.210 82.000 0.088 NA   NA
 1198831 1198830         FALSE 0.245 71.000 0.118 NA   NA
 1199228 1198828         FALSE 0.003 131.000 0.000 NA   NA
 1198828 1198827         FALSE 0.019 45.000 0.000 NA   NA
 1198827 1198826         FALSE 0.000 479.000 0.000 NA   NA
 1199227 1199226         FALSE 0.472 28.000 0.333 NA   NA
 1199226 1199225         FALSE 0.001 226.000 0.000 NA   NA
 1199225 1309157       tRNA-Thr FALSE 0.018 77.000 0.000 NA   NA
 1309157 1309156     tRNA-Thr tRNA-Tyr FALSE 0.028 11.000 0.000 NA   NA
 1198825 1198824     aroQ miaE FALSE 0.438 1.000 0.039 1.000 N NA
 1198824 1198823     miaE cobI/cbiL FALSE 0.190 17.000 0.022 1.000 N NA
 1198823 1198822     cobI/cbiL   FALSE 0.370 0.000 0.015 NA   NA
 1198822 1198821         FALSE 0.149 75.000 0.011 NA   NA
 1198821 1198820       cbiQ TRUE 0.555 0.000 0.029 1.000   NA
 1198820 1198819     cbiQ   TRUE 0.569 19.000 0.447 NA   NA
 1198819 1198818         FALSE 0.426 4.000 0.065 NA   NA
 1198818 1198817         FALSE 0.052 151.000 0.194 NA   NA
 1198817 1198816       proC TRUE 0.515 8.000 0.224 NA   NA
 1198815 1198814       recO FALSE 0.077 85.000 0.009 1.000 N NA
 1198814 1198813     recO deoC FALSE 0.193 1.000 0.007 1.000 N NA
 1198813 1198812     deoC lrtA FALSE 0.095 8.000 0.017 NA N NA
 1198811 1198810     lipB fadD FALSE 0.207 28.000 0.029 1.000 N NA
 1198810 1198809     fadD   TRUE 0.507 39.000 0.388 NA   NA
 1198809 1198808       pdhC FALSE 0.023 219.000 0.176 NA   NA
 1198808 1198807     pdhC queA FALSE 0.220 7.000 0.014 1.000 N NA
 1198806 1198805         TRUE 0.846 85.000 0.095 0.024 Y NA
 1198805 1198804       metB TRUE 0.968 4.000 0.250 0.002 Y NA
 1198804 1198803     metB rpsD FALSE 0.079 78.000 0.008 1.000 N NA
 1198802 1199223         FALSE 0.390 5.000 0.025 NA   NA
 1199223 1198801       murE FALSE 0.435 10.000 0.049 1.000   NA
 1198801 1198800     murE   FALSE 0.217 82.000 0.014 1.000   NA
 1198799 1198798         TRUE 0.683 37.000 0.082 0.054 N NA
 1198798 1198797         FALSE 0.222 78.000 0.086 NA   NA
 1198795 1198794     mqo lepA FALSE 0.185 56.000 0.007 1.000   NA
 1198794 1198793     lepA dppC FALSE 0.006 169.000 0.006 1.000 N NA
 1198791 1198790         FALSE 0.022 178.000 0.028 NA   NA
 1198790 1198789         FALSE 0.430 3.000 0.084 NA   NA
 1198789 1199221         FALSE 0.194 50.000 0.020 NA   NA
 1199221 1198788         FALSE 0.305 -40.000 0.009 NA   NA
 1198788 1199220         FALSE 0.064 106.000 0.013 NA   NA
 1199220 1199219         TRUE 0.613 20.000 0.500 NA   NA
 1199219 1198787       sun FALSE 0.103 51.000 0.004 NA   NA
 1198786 1198785     mrcB chlG TRUE 0.752 2.000 0.452 1.000 N NA
 1198785 1198784     chlG   FALSE 0.382 9.000 0.119 NA   NA
 1198783 1198782     hisF ubiE FALSE 0.117 46.000 0.012 1.000 N NA
 1198779 1198778     salX ndhB FALSE 0.262 17.000 0.134 1.000 N NA
 1198777 1198776     topA   FALSE 0.311 8.000 0.020 NA   NA
 1198776 1198775         FALSE 0.248 21.000 0.105 NA   NA
 1198775 1198774       cobT FALSE 0.374 12.000 0.155 NA   NA
 1198774 1198773     cobT   TRUE 0.507 1.000 0.130 NA   NA
 1198770 1198769       ctaE TRUE 0.594 98.000 1.000 NA   NA
 1198769 1198768     ctaE cyoB TRUE 0.974 7.000 0.500 0.002 Y NA
 1198768 1198767     cyoB cyoA TRUE 0.983 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 1198766 1198765     ctaA cyoE TRUE 0.862 -3.000 0.090 1.000 Y NA
 1198765 1198764     cyoE ccmA FALSE 0.213 40.000 0.033 1.000 N NA
 1198764 1198763     ccmA   FALSE 0.411 50.000 0.321 1.000 N NA
 1198763 1198762         TRUE 0.701 8.000 0.455 NA   NA
 1198757 1198756       ubiA FALSE 0.322 10.000 0.043 1.000 N NA
 1198754 1198753       cobM FALSE 0.227 56.000 0.016 1.000   NA
 1198753 1198752     cobM lgt FALSE 0.431 -7.000 0.061 1.000 N NA
 1198752 1198751     lgt petA TRUE 0.704 11.000 0.476 1.000   NA
 1198751 1198750     petA petC TRUE 0.954 5.000 0.881 0.055   NA
 1198748 1198747     tatC   FALSE 0.221 78.000 0.027 NA   NA
 1198747 1198746         FALSE 0.210 30.000 0.020 NA   NA
 1199218 1198744     psaJ psaF TRUE 0.861 29.000 0.455 0.021   NA
 1198743 1199217     qri7   FALSE 0.297 6.000 0.015 NA   NA
 1199217 1198742       nhaP FALSE 0.029 163.000 0.034 NA   NA
 1198741 1309155     gltX tRNA-Asp FALSE 0.020 18.000 0.000 NA   NA
 1309155 1198740     tRNA-Asp   FALSE 0.002 150.000 0.000 NA   NA
 1198740 1309154       tRNA-Trp FALSE 0.019 36.000 0.000 NA   NA
 1309154 1198739     tRNA-Trp rplS FALSE 0.017 54.000 0.000 NA   NA
 1198739 1198738     rplS   FALSE 0.169 24.000 0.013 NA   NA
 1198735 1198734     pta   FALSE 0.330 26.000 0.177 NA   NA
 1198734 1198733         FALSE 0.204 67.000 0.021 NA   NA
 1198733 1199216         FALSE 0.219 28.000 0.021 NA   NA
 1198731 1198730     hemL xthA FALSE 0.001 230.000 0.000 1.000 N NA
 1198729 1198728         FALSE 0.361 41.000 0.217 NA   NA
 1198728 1198727         FALSE 0.245 53.000 0.042 NA   NA
 1198727 1208627         TRUE 0.504 -9.000 0.042 NA   NA
 1198726 1198725     thiP   FALSE 0.025 177.000 0.053 NA   NA
 1198725 1198724         FALSE 0.205 31.000 0.020 NA   NA
 1198724 1198723         FALSE 0.205 37.000 0.020 NA   NA
 1198722 1198721         FALSE 0.343 64.000 0.246 1.000 N NA
 1198720 1198719     hemC   FALSE 0.047 98.000 0.009 1.000 N NA
 1198717 1198716       argB FALSE 0.396 4.000 0.023 NA   NA
 1198716 1198715     argB   FALSE 0.226 65.000 0.027 NA   NA
 1198712 1198711     cobK cutA FALSE 0.215 29.000 0.031 1.000 N NA
 1198710 1198709       purA FALSE 0.189 16.000 0.021 1.000 N NA
 1198709 1198708     purA psb27 FALSE 0.192 82.000 0.022 NA   NA
 1198708 1198707     psb27 proS FALSE 0.225 27.000 0.023 NA   NA
 1198706 1199214         FALSE 0.243 97.000 0.273 NA   NA
 1199214 1198705         TRUE 0.501 -10.000 0.041 NA   NA
 1198705 1198704       arsC FALSE 0.458 -3.000 0.045 1.000 N NA
 1198704 1198703     arsC   FALSE 0.211 30.000 0.030 1.000 N NA
 1198701 1199213         FALSE 0.353 83.000 0.250 NA   NA
 1199213 1198700         TRUE 0.500 0.000 0.039 NA   NA
 1198700 1198699       tal FALSE 0.164 89.000 0.131 1.000 N NA
 1198698 1198697     fixC frr FALSE 0.382 -3.000 0.022 1.000 N NA
 1198697 1198696     frr pyrH TRUE 0.644 50.000 0.626 1.000 N NA
 1198696 1198695     pyrH cobO FALSE 0.021 129.000 0.010 1.000 N NA
 1198695 1198694     cobO   TRUE 0.729 34.000 0.024 0.039   NA
 1198693 1198692     hemH ilvB FALSE 0.226 138.000 0.031 1.000 Y NA
 1198692 1198691     ilvB   FALSE 0.284 68.000 0.149 NA   NA
 1198690 1198689         FALSE 0.010 236.000 0.020 NA   NA
 1198689 1198688       rps1b, rpsA2, nbp1 TRUE 0.827 -3.000 0.513 NA   NA
 1198687 1198686         TRUE 0.541 85.000 0.465 1.000   NA
 1198686 1198685         TRUE 0.687 109.000 0.659 0.041   NA
 1198685 1198684       accA TRUE 0.499 5.000 0.033 1.000   NA
 1198684 1198683     accA   TRUE 0.857 -25.000 0.033 1.000 Y NA
 1198683 1198682       folE FALSE 0.076 153.000 0.348 1.000 N NA
 1198678 1198677         FALSE 0.440 85.000 0.395 NA   NA
 1198677 1198676         FALSE 0.393 55.000 0.274 NA   NA
 1198675 1198674     chlL chlB FALSE 0.227 190.000 0.226 0.002 N NA
 1198674 1198673     chlB chlN TRUE 0.977 7.000 0.591 0.002 Y NA
 1198673 1198672     chlN   FALSE 0.028 158.000 0.068 NA   NA
 1198669 1198668     ccmK rbcL FALSE 0.403 70.000 0.373 NA N NA
 1198668 1198667     rbcL rbcS TRUE 0.795 90.000 0.392 0.001 N NA
 1198667 1198666     rbcS csoS2 FALSE 0.426 92.000 0.474 NA   NA
 1198666 1198665     csoS2 csoS3 TRUE 0.854 8.000 0.925 NA   NA
 1198665 1198664     csoS3   TRUE 0.888 3.000 0.925 NA   NA
 1198664 1198663         TRUE 0.892 18.000 0.868 NA Y NA
 1198663 1199212         FALSE 0.281 76.000 0.147 NA   NA
 1198662 1198661       tdcF FALSE 0.195 86.000 0.051 NA   NA
 1198661 1198660     tdcF   FALSE 0.206 25.000 0.020 NA   NA
 1198659 1198658     hisG   FALSE 0.227 11.000 0.021 1.000 N NA
 1198658 1198657         TRUE 0.674 0.000 0.222 1.000   NA
 1198656 1198655         FALSE 0.441 6.000 0.135 NA   NA
 1198650 1309164       tRNA-Leu FALSE 0.007 100.000 0.000 NA   NA
 1309164 1199211     tRNA-Leu   FALSE 0.017 79.000 0.000 NA   NA
 1199211 1199210         TRUE 0.875 5.000 0.925 NA   NA
 1199210 1198649       trpA FALSE 0.250 29.000 0.100 NA   NA
 1199209 1198646         TRUE 0.526 1.000 0.143 NA   NA
 1198646 1198645         TRUE 0.767 36.000 0.905 NA   NA
 1198645 1198644       hisI FALSE 0.008 155.000 0.006 1.000 N NA
 1198642 1198641     clpB petE FALSE 0.199 75.000 0.106 1.000 N NA
 1198641 1198640     petE   TRUE 0.481 61.000 0.404 1.000 N NA
 1198640 1198639       hemE FALSE 0.314 9.000 0.032 1.000 N NA
 1198639 1198638     hemE glgB FALSE 0.043 126.000 0.024 1.000 N NA
 1198638 1198637     glgB   FALSE 0.397 60.000 0.220 1.000   NA
 1198637 1294301         TRUE 0.821 8.000 0.760 NA   NA
 1294301 1198636         TRUE 0.693 41.000 0.684 NA   NA
 1198636 1198635         TRUE 0.524 12.000 0.317 NA   NA
 1198634 1198633       proA FALSE 0.114 65.000 0.006 NA   NA
 1198633 1198632     proA folB FALSE 0.228 12.000 0.023 1.000 N NA
 1198632 1198631     folB   TRUE 0.571 -13.000 0.047 1.000   NA
 1198630 1198629     prlC   TRUE 0.577 14.000 0.444 1.000 N NA
 1198629 1198628       thrB FALSE 0.191 80.000 0.031 1.000 N NA
 1198628 1198627     thrB glk FALSE 0.241 10.000 0.020 1.000 N NA
 1198627 1198626     glk thrS FALSE 0.216 11.000 0.020 1.000 N NA
 1198626 1198625     thrS trpS TRUE 0.933 4.000 0.016 0.059 Y NA
 1198625 1198624     trpS   TRUE 0.488 -10.000 0.034 NA   NA
 1198623 1198622         FALSE 0.303 12.000 0.065 NA   NA
 1198622 1198621         TRUE 0.952 4.000 0.894 1.000 Y NA
 1198621 1198620         TRUE 0.912 13.000 0.857 1.000 Y NA
 1198620 1198619         FALSE 0.471 -3.000 0.085 NA   NA
 1198618 1198617         TRUE 0.494 46.000 0.381 NA   NA
 1198616 1198615     menD menB TRUE 0.924 36.000 0.147 0.001 Y NA
 1198615 1198614     menB glgA FALSE 0.177 36.000 0.022 1.000 N NA
 1198614 1198613     glgA murF FALSE 0.346 13.000 0.182 1.000 N NA
 1198612 1198611     glmU   FALSE 0.211 20.000 0.021 NA   NA
 1198611 1198610       aroA FALSE 0.218 13.000 0.017 NA   NA
 1198609 1198608         FALSE 0.330 31.000 0.051 1.000   NA
 1198608 1198607       amiC TRUE 0.572 0.000 0.051 1.000   NA
 1198607 1198606     amiC murI TRUE 0.858 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 1198606 1198605     murI sds FALSE 0.188 28.000 0.024 1.000 N NA
 1198605 1198604     sds acs FALSE 0.104 95.000 0.080 1.000 N NA
 1198600 1199207     hisS   FALSE 0.296 -3.000 0.007 NA   NA
 1199207 1199206         TRUE 0.853 3.000 0.714 NA   NA
 1199206 1199205         FALSE 0.295 137.000 0.857 NA   NA
 1198599 1198598         FALSE 0.203 94.000 0.132 1.000   NA
 1198598 1198597         FALSE 0.359 37.000 0.211 NA   NA
 1198594 1198593         TRUE 0.607 6.000 0.235 1.000   NA
 1198591 1198590     mscS pncA FALSE 0.187 79.000 0.029 1.000 N NA
 1198588 1198587       stpA FALSE 0.314 41.000 0.059 1.000   NA
 1198586 1198585         FALSE 0.245 94.000 0.250 NA   NA
 1198585 1198584       MET17 FALSE 0.282 73.000 0.149 NA   NA
 1198584 1198583     MET17 metA TRUE 0.857 -46.000 0.048 1.000 Y NA
 1198582 1198581         TRUE 0.725 31.000 0.800 1.000 N NA
 1198580 1198579         FALSE 0.000 380.000 0.000 NA   NA
 1199202 1198576         TRUE 0.807 3.000 0.538 NA   NA
 1198576 1198575       gloA FALSE 0.004 267.000 0.000 1.000   NA
 1198574 1198573         TRUE 0.735 8.000 0.500 NA   NA
 1198573 1198572         TRUE 0.616 57.000 0.571 NA   NA
 1198572 1199200         FALSE 0.001 227.000 0.000 NA   NA
 1199200 1198571         FALSE 0.052 -9.000 0.000 NA   NA
 1198571 1198570         FALSE 0.052 0.000 0.000 NA   NA
 1198570 1198569         TRUE 0.909 -3.000 1.000 NA   NA
 1198569 1309153       tRNA-Ser FALSE 0.001 220.000 0.000 NA   NA
 1198567 1198566       pilT TRUE 0.740 33.000 0.218 1.000 Y NA
 1198566 1198565     pilT   TRUE 0.956 -3.000 0.037 0.024 Y NA
 1208626 1198564         TRUE 0.909 -3.000 1.000 NA   NA
 1198564 1199199         TRUE 0.907 -9.000 1.000 NA   NA
 1199199 1198563         TRUE 0.875 6.000 1.000 NA   NA
 1198563 1198562         FALSE 0.098 109.000 0.040 NA   NA
 1198561 1198560         TRUE 0.807 1.000 0.500 NA   NA
 1198560 1198559         TRUE 0.895 3.000 1.000 NA   NA
 1198559 1198558         TRUE 0.904 1.000 1.000 NA   NA
 1198558 1198557         TRUE 0.762 69.000 1.000 NA   NA
 1198556 1198555         FALSE 0.001 286.000 0.000 NA   NA
 1198554 1199198         FALSE 0.051 -13.000 0.000 NA   NA
 1199198 1199197         FALSE 0.017 53.000 0.000 NA   NA
 1199197 1199196         FALSE 0.019 21.000 0.000 NA   NA
 1198552 1199195         FALSE 0.002 159.000 0.000 NA   NA
 1199195 1198551         FALSE 0.003 135.000 0.000 NA   NA
 1199193 1198550       nrdJ FALSE 0.194 89.000 0.132 NA   NA
 1198549 1198548       prfC FALSE 0.173 21.000 0.021 1.000 N NA
 1198548 1198547     prfC   FALSE 0.221 52.000 0.012 1.000   NA
 1198546 1198545         FALSE 0.232 -10.000 0.009 1.000 N NA
 1198544 1198543         TRUE 0.622 10.000 0.388 NA   NA
 1198543 1198542         FALSE 0.373 7.000 0.095 NA   NA
 1198541 1198540     tesA   FALSE 0.364 50.000 0.264 1.000 N NA
 1198540 1362550       pseudo FALSE 0.003 128.000 0.000 NA   NA
 1362550 1198539     pseudo   FALSE 0.038 6.000 0.000 NA   NA
 1198539 1198538       phnD TRUE 0.950 -3.000 0.690 1.000 Y NA
 1198538 1198537     phnD aspC FALSE 0.403 13.000 0.238 1.000 N NA
 1198536 1198535       gcpE FALSE 0.181 36.000 0.022 1.000 N NA
 1198535 1198534     gcpE   FALSE 0.180 62.000 0.026 1.000 N NA
 1198528 1198527     purK   FALSE 0.001 365.000 0.000 NA   NA
 1198527 1199192         TRUE 0.847 -3.000 0.600 NA   NA
 1199192 1294350         TRUE 0.812 -10.000 0.500 NA   NA
 1199191 1198526         FALSE 0.248 -24.000 0.003 NA   NA
 1198526 1199190         FALSE 0.248 1.000 0.003 NA   NA
 1199190 1198525         TRUE 0.617 31.000 0.500 NA   NA
 1198525 1198524         FALSE 0.059 139.000 0.176 NA   NA
 1198523 1362551       pseudo FALSE 0.047 2.000 0.000 NA   NA
 1199189 1199188         TRUE 0.672 7.000 0.400 NA   NA
 1199188 1199187         FALSE 0.374 100.000 0.500 NA   NA
 1199187 1294299         FALSE 0.001 348.000 0.000 NA   NA
 1294299 1199186         TRUE 0.725 52.000 0.833 NA   NA
 1199186 1199185         FALSE 0.191 89.000 0.128 NA   NA
 1199185 1199184         FALSE 0.020 182.000 0.077 NA   NA
 1199184 1199183         TRUE 0.746 -16.000 0.400 NA   NA
 1199183 1199182         TRUE 0.496 61.000 0.400 NA   NA
 1199181 1198521         FALSE 0.001 292.000 0.000 NA   NA
 1198521 1198520         TRUE 0.896 0.000 0.857 NA   NA
 1198520 1294308         TRUE 0.571 91.000 0.714 NA   NA
 1294308 1199180         TRUE 0.694 17.000 0.625 NA   NA
 1199180 1199179         FALSE 0.001 290.000 0.000 NA   NA
 1198519 1198518         FALSE 0.397 23.000 0.250 NA   NA
 1199178 1198517         TRUE 0.519 99.000 0.800 NA   NA
 1198516 1199177         TRUE 0.609 8.000 0.333 NA   NA
 1199177 1199176         TRUE 0.757 -3.000 0.400 NA   NA
 1199176 1198515         FALSE 0.331 122.000 0.714 NA   NA
 1198515 1198514         TRUE 0.687 77.000 0.714 NA   NA
 1198514 1198513         FALSE 0.020 184.000 0.065 NA   NA
 1198513 1198512       petJ FALSE 0.275 55.000 0.026 1.000   NA
 1198512 1199175     petJ   FALSE 0.050 1.000 0.000 NA   NA
 1199175 1198511         FALSE 0.001 372.000 0.000 NA   NA
 1198511 1198510       pstC TRUE 0.722 106.000 0.000 0.003 Y NA
 1198510 1198509     pstC pstA TRUE 0.975 7.000 0.541 0.003 Y NA
 1198509 1198508     pstA pstB TRUE 0.989 1.000 0.952 0.003 Y NA
 1198508 1199174     pstB   FALSE 0.001 228.000 0.000 NA   NA
 1199174 1199173         TRUE 0.635 11.000 0.429 NA   NA
 1198507 1198506         FALSE 0.001 204.000 0.000 NA   NA
 1198506 1198505         TRUE 0.808 1.000 0.460 1.000   NA
 1198505 1198504         TRUE 0.907 -3.000 0.214 0.036   NA
 1198504 1198503         TRUE 0.852 3.000 0.751 1.000 N NA
 1198503 1199172         FALSE 0.257 37.000 0.035 NA   NA
 1199172 1199171         FALSE 0.472 85.000 0.429 NA   NA
 1199171 1198502         FALSE 0.118 98.000 0.098 NA   NA
 1198502 1198501         FALSE 0.045 132.000 0.082 NA   NA
 1199165 1199164         TRUE 0.756 10.000 0.600 NA   NA
 1199164 1199163         FALSE 0.032 9.000 0.000 NA   NA
 1199163 1199162         FALSE 0.016 82.000 0.000 NA   NA
 1362552 1198499     pseudo   FALSE 0.009 94.000 0.000 NA   NA
 1198493 1198492         TRUE 0.941 0.000 0.352 0.005   NA
 1198491 1198490     pcyA   TRUE 0.787 0.000 0.455 NA   NA
 1198490 1198489         TRUE 0.949 0.000 0.769 NA Y NA
 1198489 1198488         TRUE 0.896 14.000 0.769 1.000 Y NA
 1198488 1198487         TRUE 0.737 19.000 0.800 NA   NA
 1198487 1198486         FALSE 0.360 62.000 0.234 NA   NA
 1198486 1198485       rpsB FALSE 0.038 128.000 0.017 NA   NA
 1198485 1198484     rpsB tsf TRUE 0.872 45.000 0.748 1.000 Y NA
 1198484 1198483     tsf   FALSE 0.291 -64.000 0.008 NA   NA
 1198483 1198482       recG FALSE 0.176 22.000 0.016 NA   NA
 1198482 1198481     recG ddpX FALSE 0.200 58.000 0.036 1.000 N NA
 1198477 1198476       typA FALSE 0.022 130.000 0.011 1.000 N NA
 1198476 1198475     typA   FALSE 0.242 12.000 0.019 NA   NA
 1198475 1198474         FALSE 0.143 80.000 0.011 NA   NA
 1198474 1198473       ccmC FALSE 0.067 112.000 0.008 1.000   NA
 1198471 1198470     glpX hemA FALSE 0.229 19.000 0.038 1.000 N NA
 1198470 1198469     hemA glgC FALSE 0.038 131.000 0.027 1.000 N NA
 1198469 1198468     glgC gnd TRUE 0.512 96.000 0.042 1.000 Y NA
 1198468 1198467     gnd   TRUE 0.966 -12.000 0.046 0.003 Y NA
 1198467 1198466         FALSE 0.465 31.000 0.321 NA   NA
 1198466 1198465         TRUE 0.725 -10.000 0.358 NA   NA
 1198464 1198463     ilvD   FALSE 0.315 24.000 0.165 NA   NA
 1198463 1198462       upp FALSE 0.228 30.000 0.023 NA   NA
 1198461 1198460       cobW FALSE 0.364 10.000 0.039 NA   NA
 1198460 1199160     cobW   FALSE 0.225 47.000 0.026 NA   NA
 1199160 1198459       purS FALSE 0.093 100.000 0.008 1.000   NA
 1198459 1198458     purS   TRUE 0.984 2.000 0.656 0.002 Y NA
 1198457 1198456     cbbA   FALSE 0.238 93.000 0.169 1.000   NA
 1198456 1198455         FALSE 0.432 3.000 0.092 NA   NA
 1198455 1198454       accD FALSE 0.300 2.000 0.009 NA   NA
 1198454 1198453     accD prkB FALSE 0.015 141.000 0.010 1.000 N NA
 1198453 1198452     prkB leuB TRUE 0.561 90.000 0.074 1.000 Y NA
 1198452 1198451     leuB lpxD FALSE 0.225 29.000 0.052 1.000 N NA
 1198451 1198450     lpxD proB FALSE 0.207 20.000 0.029 1.000 N NA
 1198450 1198449     proB   FALSE 0.460 -3.000 0.025 NA   NA
 1198449 1198448         TRUE 0.585 6.000 0.264 NA   NA
 1198448 1198447         FALSE 0.262 27.000 0.038 NA   NA
 1198447 1198446         TRUE 0.509 -3.000 0.042 NA   NA
 1198446 1198445         TRUE 0.787 1.000 0.467 NA   NA
 1198445 1198444         FALSE 0.334 11.000 0.111 NA   NA
 1198444 1198443         FALSE 0.308 15.000 0.131 NA   NA
 1198443 1198442       hisA FALSE 0.147 80.000 0.011 NA   NA
 1198438 1198437         FALSE 0.409 27.000 0.256 NA   NA
 1198437 1198436       nth FALSE 0.108 37.000 0.010 1.000 N NA
 1198435 1198434     potA   FALSE 0.001 244.000 0.000 1.000 N NA
 1294324 1198433         FALSE 0.433 41.000 0.294 NA   NA
 1198433 1198432       modF FALSE 0.001 333.000 0.000 1.000 N NA
 1198432 1198431     modF hcaE FALSE 0.455 105.000 0.143 1.000 Y NA
 1198430 1199154         FALSE 0.370 94.000 0.429 NA   NA
 1199153 1199152         FALSE 0.386 128.000 1.000 NA   NA
 1199152 1199151         FALSE 0.000 405.000 0.000 NA   NA
 1199151 1199150         TRUE 0.815 6.000 0.667 NA   NA
 1199150 1199149         FALSE 0.187 143.000 0.600 NA   NA
 1198429 1198428     livF urtD TRUE 0.893 3.000 0.126 0.019   NA
 1198428 1198427     urtD urtC TRUE 0.600 -7.000 0.137 1.000   NA
 1198427 1198426     urtC livH TRUE 0.987 0.000 0.888 0.013 Y NA
 1198426 1198425     livH   TRUE 0.755 83.000 0.429 NA Y NA
 1198425 1198424       ureG FALSE 0.023 129.000 0.079 NA N NA
 1198424 1198423     ureG ureF TRUE 0.977 4.000 0.550 0.005 Y NA
 1198423 1198422     ureF ureE TRUE 0.982 -7.000 0.560 0.005 Y NA
 1198421 1198420     ureD ureA TRUE 0.884 51.000 0.664 0.005 N NA
 1198420 1198419     ureA ureB TRUE 0.982 3.000 0.595 0.002 Y NA
 1198419 1198418     ureB ureC TRUE 0.976 5.000 0.486 0.002 Y NA
 1198416 1198415         TRUE 0.552 3.000 0.126 1.000   NA
 1198415 1198414         FALSE 0.472 2.000 0.050 NA   NA
 1198414 1198413         FALSE 0.204 91.000 0.162 NA   NA
 1198413 1199148         FALSE 0.188 90.000 0.136 NA   NA
 1199148 1199147         TRUE 0.592 64.000 0.500 NA   NA
 1309152 1198410     tRNA-Pro   FALSE 0.020 28.000 0.000 NA   NA
 1198410 1198409         FALSE 0.153 38.000 0.019 1.000 N NA
 1199146 1198408         FALSE 0.174 34.000 0.014 NA   NA
 1198408 1198407       carA TRUE 0.706 15.000 0.021 1.000 Y NA
 1198407 1198406     carA   FALSE 0.001 338.000 0.000 NA   NA
 1198406 1198405         FALSE 0.370 -3.000 0.013 NA   NA
 1198405 1198404         TRUE 0.894 5.000 0.150 0.007   NA
 1198404 1198403         FALSE 0.035 146.000 0.031 NA   NA
 1198403 1198402       gatA FALSE 0.224 31.000 0.022 NA   NA
 1198402 1198401     gatA dnaE FALSE 0.117 85.000 0.019 1.000 N NA
 1198400 1198399       rpsO FALSE 0.357 10.000 0.037 NA   NA
 1198399 1198398     rpsO ruvA FALSE 0.178 33.000 0.021 1.000 N NA
 1198398 1198397     ruvA   FALSE 0.442 1.000 0.010 1.000   NA
 1198397 1198396         FALSE 0.109 20.000 0.000 1.000   NA
 1198394 1198393       umuC TRUE 0.507 11.000 0.267 NA   NA
 1198393 1198392     umuC umuD TRUE 0.847 -3.000 0.625 1.000 N NA
 1198392 1198391     umuD   FALSE 0.070 99.000 0.011 NA   NA
 1198391 1199145         FALSE 0.138 20.000 0.008 NA   NA
 1198390 1198389     ksgA ispE FALSE 0.160 14.000 0.016 1.000 N NA
 1198389 1294346     ispE   TRUE 0.594 21.000 0.488 NA   NA
 1294346 1198388       pdhB FALSE 0.019 180.000 0.024 NA   NA
 1198388 1198387     pdhB secD FALSE 0.361 4.000 0.091 1.000 N NA
 1198387 1198386     secD secF TRUE 0.958 28.000 0.516 0.001 Y NA
 1198386 1294353     secF   FALSE 0.249 19.000 0.069 NA   NA
 1198385 1198384       psb28 TRUE 0.632 14.000 0.488 NA   NA
 1198384 1198383     psb28   FALSE 0.221 61.000 0.077 NA   NA
 1198382 1198381       rsbW FALSE 0.327 49.000 0.194 NA   NA
 1198380 1198379         FALSE 0.321 14.000 0.137 NA   NA
 1198379 1198378       glnA FALSE 0.073 103.000 0.022 1.000 N NA
 1198375 1199144     gadB   FALSE 0.425 4.000 0.030 NA   NA
 1198374 1362553       pseudo FALSE 0.050 1.000 0.000 NA   NA
 1362553 1199143     pseudo   FALSE 0.005 112.000 0.000 NA   NA
 1199143 1198373       salY FALSE 0.314 16.000 0.140 NA   NA
 1198373 1198372     salY pykF TRUE 0.786 -7.000 0.476 1.000 N NA
 1198370 1198369         FALSE 0.241 39.000 0.029 NA   NA
 1198369 1198368       ilvA FALSE 0.009 316.000 0.028 NA   NA
 1198366 1198365     psaK   FALSE 0.468 67.000 0.357 NA   NA
 1198365 1198364         TRUE 0.853 -7.000 0.625 NA   NA
 1198364 1198363         TRUE 0.514 5.000 0.180 NA   NA
 1198363 1198362       rpmB FALSE 0.258 6.000 0.018 1.000 N NA
 1198362 1198361     rpmB htpG FALSE 0.153 40.000 0.019 1.000 N NA
 1198361 1198360     htpG hisZ FALSE 0.024 118.000 0.008 1.000 N NA
 1198360 1198359     hisZ suhB FALSE 0.218 19.000 0.032 1.000 N NA
 1198359 1198358     suhB   FALSE 0.373 6.000 0.042 1.000 N NA
 1309165 1198357     tRNA-Ser   FALSE 0.001 215.000 0.000 NA   NA
 1198357 1198356         TRUE 0.977 -49.000 0.488 0.008 Y NA
 1198356 1198355         TRUE 0.597 34.000 0.488 NA   NA
 1198355 1198354         FALSE 0.263 40.000 0.045 NA   NA
 1198348 1198347     dapF   TRUE 0.854 0.000 0.021 1.000 Y NA
 1198347 1198346         TRUE 0.704 0.000 0.324 NA   NA
 1198346 1198345       dacB, pbp TRUE 0.484 8.000 0.195 NA   NA
 1198343 1198342       uvrC FALSE 0.344 10.000 0.015 1.000   NA
 1198342 1198341     uvrC   FALSE 0.088 89.000 0.008 NA   NA
 1198341 1198340         TRUE 0.505 -7.000 0.044 NA   NA
 1198338 1198337     ilvE metH TRUE 0.726 14.000 0.036 1.000 Y NA
 1198335 1198334       apa2 FALSE 0.243 49.000 0.035 NA   NA
 1198332 1198331       pheT FALSE 0.061 94.000 0.005 NA   NA
 1198330 1198329     rpmG rpsR TRUE 0.766 17.000 0.037 0.027   NA
 1198329 1198328     rpsR   FALSE 0.293 46.000 0.027 1.000   NA
 1198328 1198327       metG FALSE 0.225 69.000 0.013 1.000   NA
 1198327 1198326     metG   FALSE 0.353 -16.000 0.013 NA   NA
 1198324 1198323       cobU FALSE 0.257 11.000 0.019 NA   NA
 1198323 1198322     cobU cspR FALSE 0.223 3.000 0.009 1.000 N NA
 1198322 1309166     cspR tRNA-Met FALSE 0.020 30.000 0.000 NA   NA
 1309166 1198321     tRNA-Met   FALSE 0.018 68.000 0.000 NA   NA
 1198321 1198320         FALSE 0.025 12.000 0.000 NA   NA
 1198319 1198318         FALSE 0.000 406.000 0.000 NA   NA
 1199137 1199136         FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 1199134 1198316         FALSE 0.328 33.000 0.172 NA   NA
 1198314 1198313         TRUE 0.485 -13.000 0.035 NA   NA
 1198312 1198311         FALSE 0.053 -3.000 0.000 NA   NA
 1198311 1198310         TRUE 0.834 1.000 0.000 0.050   NA
 1198310 1198309       vacB TRUE 0.590 38.000 0.439 1.000   NA
 1198309 1198308     vacB   FALSE 0.249 67.000 0.049 NA   NA
 1198308 1198307         FALSE 0.451 65.000 0.333 NA   NA
 1198307 1198306       PNIL34,AT103 FALSE 0.307 80.000 0.181 NA   NA
 1198306 1198305     PNIL34,AT103 tldD FALSE 0.260 32.000 0.034 NA   NA
 1198305 1198304     tldD pmbA TRUE 0.490 4.000 0.146 NA   NA
 1198304 1198303     pmbA fmt FALSE 0.400 -3.000 0.018 NA   NA
 1294318 1198301       mfd FALSE 0.005 116.000 0.000 NA   NA
 1198301 1198300     mfd   FALSE 0.116 73.000 0.006 NA   NA
 1199133 1198299         TRUE 0.491 89.000 0.500 NA   NA
 1198299 1199132         TRUE 0.696 2.000 0.343 NA   NA
 1199132 1199131         FALSE 0.026 196.000 0.171 NA   NA
 1199131 1198298       ubiH TRUE 0.743 6.000 0.485 NA   NA
 1198298 1198297     ubiH   FALSE 0.348 23.000 0.200 NA   NA
 1198297 1198296       dapB FALSE 0.440 2.000 0.027 NA   NA
 1198294 1198293     folP tpi FALSE 0.442 -16.000 0.039 1.000 N NA
 1198293 1198292     tpi   FALSE 0.306 53.000 0.042 1.000   NA
 1198291 1199130         FALSE 0.266 31.000 0.037 NA   NA
 1198289 1198288         FALSE 0.423 -10.000 0.021 NA   NA
 1198288 1198287         FALSE 0.366 9.000 0.033 NA   NA
 1198287 1198286       ansA TRUE 0.883 1.000 0.810 NA   NA
 1198286 1309167     ansA tRNA-Met FALSE 0.018 46.000 0.000 NA   NA
 1309167 1198285     tRNA-Met   FALSE 0.000 592.000 0.000 NA   NA
 1198285 1198284         FALSE 0.240 78.000 0.055 NA   NA
 1198283 1198282         TRUE 0.644 -3.000 0.239 NA   NA
 1294342 1198281         TRUE 0.852 0.000 0.625 NA   NA
 1198281 1198280         FALSE 0.000 449.000 0.000 NA   NA
 1294331 1198278         TRUE 0.778 10.000 0.667 NA   NA
 1198277 1199127         TRUE 0.613 34.000 0.500 NA   NA
 1198276 1199125         TRUE 0.875 -9.000 0.750 NA   NA
 1199125 1198275         TRUE 0.706 2.000 0.357 NA   NA
 1198275 1198274         TRUE 0.834 -3.000 0.556 NA   NA
 1198274 1198273       rpsU FALSE 0.343 84.000 0.250 NA   NA
 1198271 1199123         FALSE 0.266 21.000 0.043 NA   NA
 1199123 1199122         TRUE 0.649 33.000 0.571 NA   NA
 1198268 1199121         TRUE 0.476 11.000 0.238 NA   NA
 1199121 1199120         FALSE 0.396 119.000 0.833 NA   NA
 1199120 1198267         TRUE 0.608 92.000 0.833 NA   NA
 1198267 1199119         TRUE 0.608 24.000 0.500 NA   NA
 1199119 1294339         TRUE 0.586 70.000 0.500 NA   NA
 1198265 1198264         FALSE 0.151 107.000 0.207 NA   NA
 1198264 1199118         FALSE 0.461 42.000 0.333 NA   NA
 1199118 1198263         FALSE 0.262 67.000 0.128 NA   NA
 1198263 1198262         FALSE 0.058 125.000 0.077 NA   NA
 1198262 1198261       pepN FALSE 0.163 51.000 0.015 NA   NA
 1198261 1199117     pepN   FALSE 0.000 377.000 0.000 NA   NA
 1199116 1198260       purT FALSE 0.148 94.000 0.038 NA   NA
 1198260 1199115     purT   FALSE 0.307 12.000 0.032 NA   NA
 1198258 1198257         TRUE 0.630 48.000 0.571 NA   NA
 1198256 1199114         FALSE 0.129 19.000 0.006 NA   NA
 1199113 1199112         TRUE 0.699 43.000 0.714 NA   NA
 1199112 1362554       pseudo FALSE 0.007 101.000 0.000 NA   NA
 1198255 1199111         FALSE 0.283 43.000 0.140 NA   NA
 1199111 1198254         TRUE 0.684 41.000 0.667 NA   NA
 1198254 1198253         FALSE 0.236 21.000 0.027 NA   NA
 1199109 1199108         FALSE 0.003 132.000 0.000 NA   NA
 1198250 1199107         FALSE 0.146 137.000 0.444 NA   NA
 1199106 1199105         FALSE 0.013 86.000 0.000 NA   NA
 1199105 1199104         TRUE 0.506 87.000 0.500 NA   NA
 1199104 1199103         TRUE 0.807 1.000 0.500 NA   NA
 1199103 1199102         FALSE 0.446 50.000 0.333 NA   NA
 1199101 1198249         TRUE 0.519 86.000 0.500 NA   NA
 1198249 1198248         FALSE 0.023 318.000 0.300 NA   NA
 1199100 1199099         TRUE 0.493 97.000 0.667 NA   NA
 1199098 1199097         FALSE 0.001 283.000 0.000 NA   NA
 1199097 1198247         FALSE 0.059 127.000 0.033 NA   NA
 1294303 1198246         FALSE 0.162 162.000 0.667 NA   NA
 1199096 1199095         TRUE 0.763 78.000 1.000 NA   NA
 1199095 1198245         TRUE 0.756 10.000 0.600 NA   NA
 1198245 1199094         TRUE 0.708 86.000 1.000 NA   NA
 1198241 1198240     lraI   FALSE 0.343 78.000 0.214 NA   NA
 1198240 1198239         TRUE 0.721 -12.000 0.357 NA   NA
 1294347 1199093         FALSE 0.001 273.000 0.000 NA   NA
 1199091 1198238         FALSE 0.453 32.000 0.308 NA   NA
 1199090 1198237         FALSE 0.039 120.000 0.011 NA   NA
 1198237 1198236         TRUE 0.876 2.000 0.805 NA   NA
 1198236 1198235         FALSE 0.295 12.000 0.075 NA   NA
 1198235 1198234         FALSE 0.049 175.000 0.256 NA   NA
 1198234 1198233         FALSE 0.318 84.000 0.222 NA   NA
 1199089 1199088         TRUE 0.870 0.000 0.714 NA   NA
 1199088 1198232         FALSE 0.270 17.000 0.109 NA   NA
 1198228 1198227     dppB ddpA TRUE 0.968 -7.000 0.267 0.012 Y NA
 1198227 1199087     ddpA   FALSE 0.285 18.000 0.125 NA   NA
 1199087 1198226       thrA FALSE 0.250 50.000 0.119 NA   NA
 1198226 1198225     thrA   FALSE 0.322 46.000 0.180 NA   NA
 1198225 1198224         FALSE 0.135 38.000 0.008 NA   NA
 1198224 1198223       ruvC FALSE 0.201 10.000 0.016 1.000 N NA
 1198223 1198222     ruvC chlI FALSE 0.324 6.000 0.026 1.000 N NA
 1198222 1198221     chlI lasT FALSE 0.021 118.000 0.007 1.000 N NA
 1198221 1198220     lasT   TRUE 0.584 -3.000 0.041 1.000   NA
 1198218 1198217         FALSE 0.192 14.000 0.021 1.000 N NA
 1198217 1198216         FALSE 0.373 12.000 0.069 1.000   NA
 1198216 1198215       guaB FALSE 0.019 235.000 0.038 1.000   NA
 1198214 1198213         FALSE 0.140 25.000 0.017 1.000 N NA
 1198211 1198210     leuA   FALSE 0.116 83.000 0.008 NA   NA
 1198208 1198207     folD ispA TRUE 0.749 37.000 0.250 1.000 Y NA
 1198207 1198206     ispA   FALSE 0.066 140.000 0.214 NA   NA
 1198204 1198203       zwf TRUE 0.925 3.000 0.583 NA Y NA
 1198203 1198202     zwf petH FALSE 0.122 110.000 0.117 1.000   NA
 1309151 1198200     tRNA-Glu   FALSE 0.019 42.000 0.000 NA   NA
 1198199 1294297         FALSE 0.258 145.000 0.850 NA   NA
 1199084 1198196         FALSE 0.093 118.000 0.073 1.000   NA
 1198195 1198194     cad cdsA FALSE 0.222 10.000 0.019 1.000 N NA
 1198193 1198192     todF gldA TRUE 0.583 9.000 0.250 1.000   NA
 1198192 1198191     gldA clpC FALSE 0.380 16.000 0.237 1.000 N NA
 1198191 1199083     clpC   FALSE 0.034 175.000 0.032 1.000   NA
 1198190 1198189     lysA   FALSE 0.271 29.000 0.040 NA   NA
 1198189 1198188       uppS FALSE 0.451 4.000 0.043 NA   NA
 1198188 1198187     uppS bioB FALSE 0.159 69.000 0.021 1.000 N NA
 1198187 1198186     bioB   FALSE 0.454 -3.000 0.024 NA   NA
 1198186 1198185         FALSE 0.312 12.000 0.034 NA   NA
 1198184 1198183       recR FALSE 0.317 4.000 0.021 1.000 N NA
 1198181 1199082         FALSE 0.293 12.000 0.083 NA   NA
 1199082 1198180       srmB FALSE 0.235 10.000 0.011 NA   NA
 1198180 1198179     srmB recD FALSE 0.220 139.000 0.017 0.097   NA
 1198179 1198178     recD recB TRUE 0.923 2.000 0.120 0.002   NA
 1198178 1199081     recB   FALSE 0.353 13.000 0.096 1.000   NA
 1199081 1198177       recC TRUE 0.517 4.000 0.034 1.000   NA
 1198177 1198176     recC   FALSE 0.204 18.000 0.019 NA   NA
 1198176 1198175       pdxJ FALSE 0.381 9.000 0.046 NA   NA
 1198174 1198173         TRUE 0.602 45.000 0.459 1.000   NA
 1198173 1198172         FALSE 0.313 11.000 0.092 NA   NA
 1198172 1198171         FALSE 0.463 4.000 0.220 NA N NA
 1198168 1198167       crtH FALSE 0.263 16.000 0.096 NA   NA
 1198167 1198166     crtH gid TRUE 0.698 24.000 0.031 0.033 N NA
 1198166 1294292     gid   FALSE 0.397 7.000 0.018 1.000   NA
 1309168 1198165     tRNA-Lys   FALSE 0.000 513.000 0.000 NA   NA
 1198164 1198163         TRUE 0.562 154.000 1.000 0.012   NA
 1198163 1199080         FALSE 0.001 223.000 0.000 NA   NA
 1199079 1198162         FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 1198162 1309169       tRNA-Pro FALSE 0.001 277.000 0.000 NA   NA
 1198161 1199078     hupE   TRUE 0.482 -58.000 0.048 NA   NA
 1199076 1199075         FALSE 0.013 87.000 0.000 NA   NA
 1198159 1198158     gap3   TRUE 0.754 12.000 0.689 NA   NA
 1198158 1198157       chrA FALSE 0.250 31.000 0.030 NA   NA
 1198154 1199074     phoR   FALSE 0.447 -97.000 0.080 NA   NA
 1199074 1198153       phoB FALSE 0.356 -19.000 0.013 NA   NA
 1198153 1199073     phoB   FALSE 0.001 217.000 0.000 NA   NA
 1199073 1199072         FALSE 0.008 98.000 0.000 NA   NA
 1294341 1199070         FALSE 0.001 219.000 0.000 NA   NA
 1199069 1198152         FALSE 0.042 4.000 0.000 NA   NA
 1198151 1198150     phnC   TRUE 0.966 33.000 0.750 0.002 Y NA
 1198150 1198149         TRUE 0.968 38.000 0.828 0.002 Y NA
 1198149 1198148         TRUE 0.777 11.000 0.759 1.000 N NA
 1198147 1198146         TRUE 0.504 -3.000 0.049 NA   NA
 1198145 1198144         FALSE 0.004 252.000 0.000 1.000   NA
 1198144 1198143         FALSE 0.000 389.000 0.000 NA   NA
 1198143 1199066         FALSE 0.018 63.000 0.000 NA   NA
 1198141 1198140         FALSE 0.000 706.000 0.000 NA   NA
 1198138 1294340         FALSE 0.050 1.000 0.000 NA   NA
 1198137 1198136     rsuA   FALSE 0.025 152.000 0.020 NA   NA
 1198136 1198135         FALSE 0.232 33.000 0.024 NA   NA
 1198134 1198133         FALSE 0.001 250.000 0.000 NA   NA
 1198133 1199064         FALSE 0.034 8.000 0.000 NA   NA
 1199063 1198132         FALSE 0.017 61.000 0.000 NA   NA
 1198131 1199062         FALSE 0.017 80.000 0.000 NA   NA
 1199062 1199061         TRUE 0.529 31.000 0.400 NA   NA
 1199061 1199060         FALSE 0.000 541.000 0.000 NA   NA
 1199060 1199059         TRUE 0.813 0.000 0.500 NA   NA
 1199059 1199058         TRUE 0.817 -3.000 0.500 NA   NA
 1199058 1198130         TRUE 0.657 3.000 0.300 NA   NA
 1198130 1198129         TRUE 0.503 64.000 0.400 NA   NA
 1198129 1294310         FALSE 0.394 106.000 0.600 NA   NA
 1294310 1199057         TRUE 0.807 1.000 0.500 NA   NA
 1198128 1199056         FALSE 0.385 107.000 0.600 NA   NA
 1199056 1199055         TRUE 0.695 79.000 0.750 NA   NA
 1199055 1199054         FALSE 0.001 192.000 0.000 NA   NA
 1199054 1199053         FALSE 0.001 190.000 0.000 NA   NA
 1199052 1199051         FALSE 0.099 179.000 0.500 NA   NA
 1199051 1199050         TRUE 0.807 -24.000 0.500 NA   NA
 1198127 1294304     mntH   FALSE 0.218 17.000 0.020 NA   NA
 1294304 1199049         TRUE 0.692 28.000 0.667 NA   NA
 1199049 1199048         TRUE 0.573 86.000 0.600 NA   NA
 1199048 1199047         TRUE 0.642 63.000 0.600 NA   NA
 1199047 1198126         TRUE 0.686 16.000 0.600 NA   NA
 1198125 1198124         FALSE 0.002 165.000 0.000 NA   NA
 1198123 1199046         TRUE 0.663 53.000 0.667 NA   NA
 1199046 1198122         TRUE 0.728 74.000 0.833 NA   NA
 1198121 1198120         FALSE 0.004 122.000 0.000 NA   NA
 1198120 1198119         FALSE 0.441 -3.000 0.022 NA   NA
 1198118 1198117         FALSE 0.003 135.000 0.000 NA   NA
 1198116 1198115         TRUE 0.733 19.000 0.791 NA   NA
 1198115 1198114         TRUE 0.871 -7.000 0.660 1.000   NA
 1198114 1198113         TRUE 0.931 7.000 0.623 0.040   NA
 1198113 1198112         TRUE 0.913 -6.000 0.944 1.000   NA
 1198112 1198111         FALSE 0.400 60.000 0.282 NA   NA
 1198111 1198110         FALSE 0.001 193.000 0.000 NA   NA
 1198110 1198109         TRUE 0.860 0.000 0.667 NA   NA
 1198109 1198108         FALSE 0.019 36.000 0.000 NA   NA
 1198108 1198107         TRUE 0.735 2.000 0.400 NA   NA
 1199045 1199044         TRUE 0.759 60.000 1.000 NA   NA
 1199044 1199043         TRUE 0.633 54.000 0.600 NA   NA
 1199042 1199041         TRUE 0.907 0.000 1.000 NA   NA
 1198105 1198104     acrA polA FALSE 0.320 -3.000 0.017 1.000 N NA
 1198104 1198103     polA cysS FALSE 0.130 25.000 0.014 1.000 N NA
 1198103 1198102     cysS dxr FALSE 0.036 98.000 0.007 1.000 N NA
 1198099 1198098       pntB TRUE 0.714 -19.000 0.354 NA   NA
 1198098 1198097     pntB pntA-2 TRUE 0.885 9.000 0.072 0.002   NA
 1198097 1198096     pntA-2 pntA TRUE 0.946 13.000 0.829 0.002   NA
 1198095 1198094         FALSE 0.042 155.000 0.158 NA   NA
 1198094 1198093         FALSE 0.103 79.000 0.004 NA   NA
 1198092 1199039     infA   FALSE 0.088 93.000 0.011 NA   NA
 1199039 1198091         TRUE 0.521 30.000 0.392 NA   NA
 1198091 1198090         TRUE 0.523 58.000 0.392 1.000   NA
 1198089 1198088       ilvN FALSE 0.425 4.000 0.065 NA   NA
 1198087 1198086         FALSE 0.319 48.000 0.122 1.000   NA
 1198085 1198084     psbD psbC TRUE 0.976 -16.000 0.878 0.002   NA
 1198082 1198081     cobQ   TRUE 0.551 -3.000 0.026 1.000   NA
 1199038 1199037         FALSE 0.000 497.000 0.000 NA   NA
 1199036 1199034         FALSE 0.319 89.000 0.286 NA   NA
 1198080 1199033         FALSE 0.053 -3.000 0.000 NA   NA
 1309150 1198079     tRNA-Ser afuA FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 1198078 1198077     piuC   FALSE 0.438 74.000 0.326 NA   NA
 1198076 1198075       glyQ FALSE 0.042 136.000 0.013 1.000   NA
 1198075 1198074     glyQ   FALSE 0.006 221.000 0.005 NA   NA
 1198074 1199032         FALSE 0.253 21.000 0.109 NA   NA
 1199032 1199031         FALSE 0.431 3.000 0.087 NA   NA
 1198073 1198072         FALSE 0.087 109.000 0.072 NA   NA
 1198071 1198070         TRUE 0.655 78.000 0.625 NA   NA
 1198070 1198069       isiB FALSE 0.149 145.000 0.455 1.000   NA
 1198068 1362555       pseudo FALSE 0.007 104.000 0.000 NA   NA
 1362555 1198067     pseudo   FALSE 0.009 96.000 0.000 NA   NA
 1198067 1198066         FALSE 0.017 206.000 0.105 NA   NA
 1198066 1198065         FALSE 0.254 94.000 0.263 NA   NA
 1198064 1198063         TRUE 0.889 7.000 0.432 1.000 Y NA
 1198063 1198062         FALSE 0.200 29.000 0.026 1.000 N NA
 1198061 1198060     sppA aroH TRUE 0.474 7.000 0.207 1.000 N NA
 1198060 1198059     aroH   FALSE 0.240 70.000 0.114 NA   NA
 1198059 1198058       rpl34, rpmH FALSE 0.242 31.000 0.027 NA   NA
 1198058 1198057     rpl34, rpmH rnpA TRUE 0.798 12.000 0.787 1.000   NA
 1198057 1198056     rnpA   TRUE 0.508 -3.000 0.041 NA   NA
 1198056 1198055       yidC FALSE 0.248 73.000 0.043 NA   NA
 1198055 1198054     yidC   FALSE 0.134 16.000 0.012 1.000 N NA
 1198054 1198053       serS FALSE 0.261 123.000 0.011 0.092 N NA
 1198053 1198052     serS   FALSE 0.267 10.000 0.024 1.000 N NA
 1198052 1198051       rpsN FALSE 0.150 63.000 0.020 1.000 N NA
 1198051 1198050     rpsN   FALSE 0.113 187.000 0.019 1.000 Y NA
 1198048 1199029         FALSE 0.116 19.000 0.004 NA   NA
 1309170 1208625     tRNA-Arg   FALSE 0.020 28.000 0.000 NA   NA
 1198046 1198045     ugd   TRUE 0.898 68.000 0.157 0.007 Y NA
 1198044 1199028         FALSE 0.245 1.000 0.000 1.000   NA
 1199028 1198043         FALSE 0.161 10.000 0.000 1.000   NA
 1198043 1198042       kdsB FALSE 0.437 -3.000 0.059 1.000 N NA
 1198042 1199027     kdsB   FALSE 0.049 -49.000 0.000 NA   NA
 1198041 1199026         FALSE 0.045 3.000 0.000 NA   NA
 1199026 1198040         FALSE 0.045 3.000 0.000 NA   NA
 1198040 1198039       spsE TRUE 0.937 -10.000 0.549 1.000 Y NA
 1198039 1198038     spsE   TRUE 0.716 -15.000 0.292 1.000   NA
 1198038 1198037         TRUE 0.645 0.000 0.185 1.000   NA
 1198037 1198036       rfbB TRUE 0.921 -3.000 0.418 1.000 Y NA
 1198036 1198035     rfbB   FALSE 0.429 -3.000 0.031 1.000 N NA
 1198035 1198034         FALSE 0.374 7.000 0.131 1.000 N NA
 1198034 1198033         TRUE 0.612 -3.000 0.144 1.000   NA
 1198033 1198032       galE FALSE 0.101 64.000 0.000 1.000   NA
 1198032 1198031     galE   TRUE 0.779 -24.000 0.000 NA Y NA
 1199025 1199024         FALSE 0.053 -3.000 0.000 NA   NA
 1199024 1199023         FALSE 0.032 9.000 0.000 NA   NA
 1199022 1198030         FALSE 0.053 -3.000 0.000 NA   NA
 1198030 1199021         FALSE 0.001 208.000 0.000 NA   NA
 1199021 1198029         FALSE 0.000 431.000 0.000 NA   NA
 1198027 1199020         TRUE 0.813 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1199019 1198026     rfe   TRUE 0.693 37.000 0.034 1.000 Y NA
 1198026 1198025         FALSE 0.008 97.000 0.000 1.000 N NA
 1198025 1198024         TRUE 0.751 97.000 0.000 0.006 Y NA
 1198024 1198023         FALSE 0.019 25.000 0.000 NA   NA
 1198023 1198022         FALSE 0.000 468.000 0.000 NA   NA
 1198022 1198021       manC TRUE 0.546 62.000 0.000 NA Y NA
 1198021 1198020     manC   FALSE 0.012 151.000 0.000 1.000   NA
 1198020 1199018         FALSE 0.171 167.000 0.000 0.011   NA
 1198019 1199017         FALSE 0.001 180.000 0.000 NA   NA
 1198017 1198016         TRUE 0.842 -12.000 0.000 0.039   NA
 1198016 1198015       apt FALSE 0.099 51.000 0.000 1.000   NA
 1309149 1198013     tRNA-Ala   FALSE 0.003 130.000 0.000 NA   NA
 1198012 1198011     gmd   TRUE 0.961 -7.000 0.125 0.011 Y NA
 1198010 1198009       lexA FALSE 0.017 61.000 0.000 NA   NA
 1198009 1198008     lexA argF FALSE 0.144 60.000 0.020 1.000 N NA
 1198008 1198007     argF   FALSE 0.185 29.000 0.022 1.000 N NA
 1198007 1198006         FALSE 0.376 117.000 0.010 0.012 N NA
 1198006 1198005         FALSE 0.232 16.000 0.021 NA   NA
 1198005 1199016         TRUE 0.718 -25.000 0.360 NA   NA
 1198003 1198002       pheS FALSE 0.109 71.000 0.011 1.000 N NA
 1197999 1197998     ribF thiE TRUE 0.774 8.000 0.012 1.000 Y NA
 1197998 1199015     thiE thiS TRUE 0.924 -10.000 0.452 1.000 Y NA
 1199015 1197997     thiS   FALSE 0.086 113.000 0.119 NA   NA
 1197997 1199014         FALSE 0.344 68.000 0.214 NA   NA
 1197996 1197995         TRUE 0.477 -3.000 0.070 NA   NA
 1197995 1197994       trmD FALSE 0.351 -3.000 0.011 NA   NA
 1197994 1197993     trmD era TRUE 0.876 1.000 0.010 0.023   NA
 1197991 1197990       phoH FALSE 0.212 74.000 0.024 NA   NA
 1197990 1197989     phoH rpsP FALSE 0.156 37.000 0.019 1.000 N NA
 1197989 1197988     rpsP ffh FALSE 0.435 55.000 0.361 1.000 N NA
 1197988 1197987     ffh   FALSE 0.239 48.000 0.016 1.000   NA
 1197985 1197984         FALSE 0.031 141.000 0.021 NA   NA
 1197981 1197980     fkpA   FALSE 0.287 79.000 0.096 1.000   NA
 1197980 1294295         FALSE 0.260 84.000 0.154 NA   NA
 1197979 1197978       trpC FALSE 0.266 56.000 0.023 1.000   NA
 1197978 1197977     trpC lpd FALSE 0.254 13.000 0.057 1.000 N NA
 1197977 1197976     lpd   FALSE 0.336 8.000 0.115 1.000 N NA
 1309171 1197974     tRNA-Leu argD FALSE 0.048 -72.000 0.000 NA   NA
 1197974 1197973     argD folC FALSE 0.363 12.000 0.181 1.000 N NA
 1197972 1197971       codA FALSE 0.359 39.000 0.246 1.000 N NA
 1309172 1197970     tRNA-His   FALSE 0.017 73.000 0.000 NA   NA
 1197970 1197969       ddlA FALSE 0.187 14.000 0.020 1.000 N NA
 1197969 1197968     ddlA   FALSE 0.343 11.000 0.046 NA   NA
 1197968 1197967       ftsQ FALSE 0.457 -3.000 0.024 NA   NA
 1197967 1197966     ftsQ ftsZ FALSE 0.010 180.000 0.067 NA N NA
 1197963 1197962         FALSE 0.234 41.000 0.084 NA   NA
 1197962 1197961         TRUE 0.961 25.000 0.745 0.004 Y NA
 1197961 1197960       ilvC FALSE 0.045 112.000 0.019 1.000 N NA
 1197960 1197959     ilvC cbiB TRUE 0.846 -12.000 0.017 1.000 Y NA
 1197959 1197958     cbiB   FALSE 0.259 56.000 0.021 1.000   NA
 1197957 1294312         TRUE 0.611 59.000 0.556 NA   NA
 1294312 1199011         TRUE 0.756 55.000 1.000 NA   NA
 1199011 1197956       himA FALSE 0.070 136.000 0.200 NA   NA
 1197954 1197953     melB   TRUE 0.796 10.000 0.833 NA N NA
 1197953 1197952         TRUE 0.734 5.000 0.452 NA   NA
 1197952 1197951         TRUE 0.723 36.000 0.762 NA   NA
 1197951 1197950         TRUE 0.664 6.000 0.369 NA   NA
 1197949 1197948     pyrF tyrS FALSE 0.317 7.000 0.027 1.000 N NA
 1197948 1197947     tyrS   FALSE 0.324 20.000 0.034 1.000   NA
 1197946 1197945       pepB FALSE 0.384 25.000 0.176 1.000   NA
 1197944 1197943       lpxB FALSE 0.232 17.000 0.034 1.000 N NA
 1197943 1197942     lpxB lpxA TRUE 0.864 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 1197942 1197941     lpxA fabZ FALSE 0.352 5.000 0.071 1.000 N NA
 1197941 1197940     fabZ lpxC FALSE 0.209 18.000 0.083 1.000 N NA
 1197940 1197939     lpxC   TRUE 0.858 1.000 0.052 1.000 Y NA
 1197939 1197938       purC FALSE 0.214 38.000 0.058 1.000 N NA
 1197937 1197936     purD nblS TRUE 0.809 5.000 0.025 0.090 N NA
 1197935 1197934     kaiC kaiB TRUE 0.771 69.000 0.927 1.000   NA
 1197933 1197932     rplU rpmA TRUE 0.968 10.000 0.667 0.023 Y NA
 1197928 1197927     elaC   FALSE 0.148 75.000 0.011 NA   NA
 1197926 1197925         TRUE 0.581 80.000 0.500 NA   NA
 1197925 1197924       prmA FALSE 0.034 135.000 0.027 1.000 N NA
 1197924 1197923     prmA serA FALSE 0.225 19.000 0.053 1.000 N NA
 1197922 1197921         TRUE 0.770 1.000 0.442 NA   NA
 1197921 1309173       tRNA-Val FALSE 0.017 51.000 0.000 NA   NA
 1309173 1197920     tRNA-Val   FALSE 0.018 68.000 0.000 NA   NA
 1197920 1197919         TRUE 0.554 -7.000 0.028 1.000   NA
 1197919 1294321         FALSE 0.224 75.000 0.028 NA   NA
 1197918 1197917         FALSE 0.041 144.000 0.043 NA   NA
 1197916 1197915         FALSE 0.068 108.000 0.003 1.000   NA
 1197913 1197912     murD   FALSE 0.102 86.000 0.008 NA   NA
 1197911 1294336         TRUE 0.556 88.000 0.600 NA   NA
 1294336 1197910         FALSE 0.204 83.000 0.027 NA   NA
 1197910 1197909         TRUE 0.508 -3.000 0.045 NA   NA
 1197909 1197908         FALSE 0.166 89.000 0.068 NA   NA
 1197908 1197907         FALSE 0.040 120.000 0.011 NA   NA
 1199009 1197906         FALSE 0.037 141.000 0.079 NA   NA
 1197906 1294315         FALSE 0.234 78.000 0.105 NA   NA
 1197905 1199007         FALSE 0.389 92.000 0.429 NA   NA
 1197904 1199005         FALSE 0.000 587.000 0.000 NA   NA
 1199005 1199004         FALSE 0.355 69.000 0.227 NA   NA
 1208623 1199002         TRUE 0.591 85.000 0.600 NA   NA
 1199002 1197903         FALSE 0.331 81.000 0.214 NA   NA
 1197901 1198998         FALSE 0.265 118.000 0.500 NA   NA
 1197900 1362556       pseudo FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 1197899 1197898         FALSE 0.052 0.000 0.000 NA   NA
 1197898 1198996         FALSE 0.001 325.000 0.000 NA   NA
 1197895 1198995         FALSE 0.197 86.000 0.038 NA   NA
 1198989 1294335         TRUE 0.653 44.000 0.600 NA   NA
 1198985 1198984         FALSE 0.001 312.000 0.000 NA   NA
 1198984 1198983         TRUE 0.499 77.000 0.400 NA   NA
 1198983 1198982         FALSE 0.143 150.000 0.500 NA   NA
 1198982 1198981         TRUE 0.838 -3.000 0.571 NA   NA
 1198981 1198980         FALSE 0.000 713.000 0.000 NA   NA
 1198980 1197894         FALSE 0.005 116.000 0.000 NA   NA
 1362557 1198979     pseudo   FALSE 0.047 2.000 0.000 NA   NA
 1197892 1197891         FALSE 0.002 147.000 0.000 NA   NA
 1197891 1197890         FALSE 0.328 70.000 0.200 NA   NA
 1197890 1197889         FALSE 0.019 40.000 0.000 NA   NA
 1197889 1197888         FALSE 0.014 85.000 0.000 NA   NA
 1197888 1197887         FALSE 0.052 -9.000 0.000 NA   NA
 1197887 1197886         FALSE 0.040 5.000 0.000 NA   NA
 1197886 1197885         FALSE 0.016 83.000 0.000 NA   NA
 1197885 1197884         FALSE 0.018 48.000 0.000 NA   NA
 1198977 1197883         FALSE 0.050 1.000 0.000 NA   NA
 1197883 1294332         FALSE 0.049 -49.000 0.000 NA   NA
 1294332 1197882         FALSE 0.000 677.000 0.000 NA   NA
 1197882 1197881         FALSE 0.019 22.000 0.000 NA   NA
 1197880 1362558       pseudo FALSE 0.004 121.000 0.000 NA   NA
 1362558 1197879     pseudo   FALSE 0.001 326.000 0.000 NA   NA
 1197878 1197877         FALSE 0.001 314.000 0.000 NA   NA
 1197877 1197876       rpoZ TRUE 0.873 3.000 0.024 0.027   NA
 1197873 1197872     gpmI secG FALSE 0.328 23.000 0.041 1.000   NA
 1197871 1197870     groEL groES TRUE 0.961 51.000 0.905 0.011 Y NA
 1197869 1197868     atpD atpC TRUE 0.965 43.000 0.837 0.004 Y NA
 1197867 1197866         FALSE 0.117 108.000 0.146 NA   NA
 1197866 1197865       pepP FALSE 0.235 55.000 0.037 NA   NA
 1197864 1197863         FALSE 0.450 4.000 0.046 NA   NA
 1197863 1197862       nadD FALSE 0.299 9.000 0.006 1.000   NA
 1197862 1197861     nadD nadE TRUE 0.963 -3.000 0.023 0.004 Y NA
 1197860 1198976         FALSE 0.279 29.000 0.125 NA   NA
 1198976 1197859         TRUE 0.566 -3.000 0.158 NA   NA
 1197859 1197858         TRUE 0.657 17.000 0.003 1.000 Y NA
 1197858 1197857       atpA TRUE 0.967 19.000 0.846 0.004 Y NA
 1197857 1197856     atpA atpH TRUE 0.968 31.000 0.864 0.004 Y NA
 1197856 1197855     atpH   TRUE 0.965 0.000 0.132 0.004 Y NA
 1197855 1197854         TRUE 0.983 -3.000 0.569 0.004 Y NA
 1197854 1197853       atpE TRUE 0.928 70.000 0.368 0.004 Y NA
 1197853 1197852     atpE atpB TRUE 0.653 165.000 0.679 0.005 Y NA
 1197852 1197851     atpB atp1 FALSE 0.304 23.000 0.151 NA   NA
 1197850 1197849       ccdA FALSE 0.279 83.000 0.202 1.000 N NA
 1197849 1197848     ccdA resB TRUE 0.900 1.000 0.371 NA Y NA
 1198975 1197846       glnB TRUE 0.696 25.000 0.682 NA   NA
 1197844 1197843     purB fumC FALSE 0.110 49.000 0.011 1.000 N NA
 1197841 1198974     bioF   FALSE 0.053 -3.000 0.000 NA   NA
 1198974 1197840         FALSE 0.052 -7.000 0.000 NA   NA
 1197840 1197839       bioD TRUE 0.853 -36.000 0.030 1.000 Y NA
 1197839 1197838     bioD bioA TRUE 0.967 1.000 0.124 0.002 Y NA
 1197837 1197836         TRUE 0.729 17.000 0.744 NA   NA
 1197834 1197833       fer FALSE 0.411 11.000 0.116 1.000   NA
 1197833 1197832     fer   FALSE 0.435 10.000 0.175 NA   NA
 1197832 1197831         TRUE 0.905 -13.000 1.000 NA   NA
 1197831 1197830         FALSE 0.034 149.000 0.100 NA   NA
 1197830 1197829         FALSE 0.266 20.000 0.118 NA   NA
 1197829 1197828         FALSE 0.113 65.000 0.006 NA   NA
 1197828 1197827       hli3 FALSE 0.225 30.000 0.022 NA   NA
 1197827 1197826     hli3 rpoC2 TRUE 0.556 55.000 0.476 NA   NA
 1197826 1197825     rpoC2 rpoC1 TRUE 0.916 34.000 0.031 0.002 Y NA
 1197825 1197824     rpoC1 rpoB TRUE 0.969 41.000 0.851 0.002 Y NA
 1197824 1197823     rpoB tatD FALSE 0.001 236.000 0.012 NA N NA
 1197823 1197822     tatD rpsT FALSE 0.147 18.000 0.034 NA N NA
 1197820 1197819     rpiA   FALSE 0.195 67.000 0.030 1.000 N NA
 1197818 1197817       nusA TRUE 0.721 37.000 0.759 NA   NA
 1197817 1198973     nusA   TRUE 0.897 -3.000 0.323 NA Y NA
 1198973 1197816       infB FALSE 0.198 57.000 0.171 NA N NA
 1309174 1197814     tRNA-Thr   FALSE 0.007 101.000 0.000 NA   NA
 1197814 1197813         FALSE 0.017 59.000 0.000 NA   NA
 1197813 1197812         FALSE 0.045 107.000 0.100 NA N NA
 1197811 1197810         FALSE 0.032 154.000 0.110 NA   NA
 1197809 1197808     rne rnhB TRUE 0.876 -43.000 0.033 0.021 N NA
 1197805 1197804         TRUE 0.567 1.000 0.047 1.000   NA
 1197804 1197803       rpsJ FALSE 0.273 57.000 0.025 1.000   NA
 1197803 1197802     rpsJ tufA TRUE 0.571 99.000 0.318 1.000 Y NA
 1197802 1197801     tufA fusA TRUE 0.942 46.000 0.400 0.002 Y NA
 1197801 1197800     fusA rpsG TRUE 0.701 98.000 0.579 1.000 Y NA
 1197800 1197799     rpsG rpsL TRUE 0.956 26.000 0.620 0.004 Y NA
 1197799 1198972     rpsL   FALSE 0.017 58.000 0.000 NA   NA
 1197798 1197797     gltB   FALSE 0.456 1.000 0.086 NA   NA
 1197795 1198971         TRUE 0.841 2.000 0.625 NA   NA
 1197792 1294313     psaL psaI TRUE 0.890 28.000 0.583 0.015   NA
 1197791 1197790       psaB FALSE 0.137 104.000 0.154 NA   NA
 1197790 1197789     psaB psaA TRUE 0.902 28.000 0.513 0.003   NA
 1197788 1197787     cobJ   FALSE 0.168 97.000 0.062 1.000   NA
 1309147 1197786     tRNA-Ser alr FALSE 0.018 62.000 0.000 NA   NA
 1197784 1197783     prfA rpmE TRUE 0.696 28.000 0.110 1.000 Y NA
 1197783 1197782     rpmE rpsI TRUE 0.902 14.000 0.062 0.021 Y NA
 1197782 1197781     rpsI rplM TRUE 0.966 10.000 0.601 0.021 Y NA
 1197781 1197780     rplM truA FALSE 0.361 116.000 0.058 1.000 Y NA
 1197780 1197779     truA rplQ TRUE 0.687 39.000 0.102 1.000 Y NA
 1197779 1197778     rplQ rpoA TRUE 0.774 15.000 0.873 1.000 N NA
 1197778 1197777     rpoA rpsK FALSE 0.399 51.000 0.308 1.000 N NA
 1197777 1197776     rpsK rpsM TRUE 0.956 45.000 0.810 0.021 Y NA
 1197776 1197775     rpsM adk FALSE 0.001 204.000 0.000 1.000 N NA
 1197775 1197774     adk secY FALSE 0.340 0.000 0.019 1.000 N NA
 1197774 1197773     secY rplO TRUE 0.704 30.000 0.730 1.000 N NA
 1197773 1197772     rplO rpsE TRUE 0.943 5.000 0.148 0.028 Y NA
 1197772 1197771     rpsE rplR TRUE 0.958 17.000 0.814 0.028 Y NA
 1197771 1197770     rplR rplF TRUE 0.963 15.000 0.815 0.021 Y NA
 1197770 1197769     rplF rpsH TRUE 0.965 13.000 0.808 0.021 Y NA
 1197769 1197768     rpsH rplE TRUE 0.927 10.000 0.059 0.021 Y NA
 1197768 1197767     rplE rplX TRUE 0.951 76.000 0.758 0.021 Y NA
 1197767 1197766     rplX rplN TRUE 0.982 1.000 0.810 0.028 Y NA
 1197766 1197765     rplN rpsQ TRUE 0.983 -3.000 0.791 0.028 Y NA
 1197765 1197764     rpsQ rpmC TRUE 0.944 10.000 0.828 0.021   NA
 1197764 1197763     rpmC rplP TRUE 0.967 -3.000 0.802 0.021   NA
 1197763 1197762     rplP rpsC TRUE 0.966 12.000 0.828 0.028 Y NA
 1197762 1197761     rpsC rplV TRUE 0.981 0.000 0.719 0.028 Y NA
 1197761 1197760     rplV rpsS TRUE 0.983 -3.000 0.769 0.028 Y NA
 1197760 1197759     rpsS rplB TRUE 0.955 38.000 0.820 0.028 Y NA
 1197759 1197758     rplB rplW TRUE 0.967 13.000 0.849 0.021 Y NA
 1197758 1197757     rplW rplD TRUE 0.978 -3.000 0.513 0.021 Y NA
 1197757 1197756     rplD rplC TRUE 0.971 -3.000 0.361 0.021 Y NA
 1197755 1197754       hycB TRUE 0.810 6.000 0.595 1.000   NA
 1197754 1309175     hycB tRNA-Gln FALSE 0.009 95.000 0.000 NA   NA
 1309175 1197753     tRNA-Gln   FALSE 0.021 17.000 0.000 NA   NA
 1197753 1197752       recA FALSE 0.062 112.000 0.019 NA   NA
 1197751 1197750       dinG FALSE 0.248 30.000 0.072 NA   NA
 1197742 1197741     speD recF FALSE 0.171 53.000 0.024 1.000 N NA
 1197740 1197739       ppc TRUE 0.780 4.000 0.500 NA   NA
 1197739 1197738     ppc   TRUE 0.579 54.000 0.457 1.000   NA
 1197738 1197737         TRUE 0.555 1.000 0.059 1.000   NA
 1197737 1197736       psaD FALSE 0.282 60.000 0.091 1.000   NA
 1197736 1197735     psaD   FALSE 0.254 111.000 0.381 1.000   NA
 1197735 1197734         TRUE 0.538 0.000 0.024 1.000   NA
 1197734 1197733       mrp TRUE 0.865 0.000 0.041 1.000 Y NA
 1198968 1197730       rnd FALSE 0.018 156.000 0.012 NA   NA
 1197729 1197728         TRUE 0.689 36.000 0.667 NA   NA
 1294305 1197727         TRUE 0.683 -25.000 0.308 NA   NA
 1197727 1197726       purM FALSE 0.034 133.000 0.018 NA   NA
 1197724 1197723     wzb pebB FALSE 0.251 33.000 0.015 1.000   NA
 1197723 1197722     pebB pebA TRUE 0.974 1.000 0.808 0.002   NA
 1197722 1197721     pebA ho1 TRUE 0.695 6.000 0.360 1.000   NA
 1197721 1197720     ho1   TRUE 0.742 58.000 0.900 NA   NA
 1197718 1197717       galM FALSE 0.272 14.000 0.096 NA   NA
 1197717 1197716     galM   TRUE 0.630 10.000 0.339 1.000   NA
 1197716 1197715       kefB FALSE 0.380 44.000 0.179 1.000   NA
 1197713 1197712         TRUE 0.775 32.000 0.950 NA   NA
 1197712 1309146       tRNA-Arg FALSE 0.017 79.000 0.000 NA   NA
 1309400 1197711     rnpB rnc FALSE 0.019 37.000 0.000 NA   NA
 1197708 1197707     glmS psaC FALSE 0.264 84.000 0.031 1.000   NA
 1197706 1197705     acpP fabF TRUE 0.869 7.000 0.346 1.000 Y NA
 1197705 1197704     fabF tktA FALSE 0.205 45.000 0.062 1.000 N NA
 1197703 1362559     thiC pseudo FALSE 0.001 213.000 0.000 NA   NA
 1362559 1197702     pseudo   FALSE 0.042 4.000 0.000 NA   NA
 1197702 1197701         TRUE 0.724 4.000 0.365 1.000   NA
 1197701 1197700       ruvB TRUE 0.499 -13.000 0.019 1.000   NA
 1197698 1197697       lysS FALSE 0.240 30.000 0.026 NA   NA
 1197697 1197696     lysS   FALSE 0.184 51.000 0.027 1.000 N NA
 1197696 1198967         FALSE 0.050 177.000 0.273 NA   NA
 1198967 1197695       mreC FALSE 0.437 -30.000 0.024 NA   NA
 1197695 1197694     mreC mreB FALSE 0.388 5.000 0.043 1.000 N NA
 1197693 1197692     dedA sam1 TRUE 0.505 3.000 0.024 1.000   NA
 1197688 1197687       mgtE FALSE 0.232 68.000 0.135 1.000 N NA
 1197687 1198965     mgtE   FALSE 0.338 44.000 0.135 1.000   NA
 1198965 1362560       pseudo FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 1362560 1198964     pseudo   FALSE 0.040 5.000 0.000 NA   NA
 1198964 1197686       gyrB FALSE 0.419 -3.000 0.020 NA   NA
 1197685 1197684     miaA infC TRUE 0.644 54.000 0.020 1.000 Y NA
 1197684 1197683     infC   FALSE 0.081 78.000 0.008 1.000 N NA
 1197683 1197682       cysE TRUE 0.691 7.000 0.452 1.000 N NA
 1197679 1309145       tRNA-Gly FALSE 0.018 46.000 0.000 NA   NA
 1309145 1197678     tRNA-Gly ribH FALSE 0.018 62.000 0.000 NA   NA
 1197678 1198963     ribH   FALSE 0.305 50.000 0.037 1.000   NA
 1197675 1197674     holA lysC FALSE 0.132 40.000 0.015 1.000 N NA
 1197673 1197672     uvrB   FALSE 0.227 30.000 0.009 1.000   NA
 1197670 1197669       dapA TRUE 0.660 82.000 0.605 1.000   NA
 1197669 1197668     dapA asd TRUE 0.866 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 1197667 1197666     tig   TRUE 0.668 66.000 0.025 1.000 Y NA
 1197666 1197665       clpX FALSE 0.432 106.000 0.037 1.000 Y NA
 1197665 1197664     clpX dnaX TRUE 0.603 58.000 0.008 0.084 N NA
 1197663 1197662         FALSE 0.285 28.000 0.164 1.000 N NA
 1197661 1197660     rpmI rplT TRUE 0.964 29.000 0.928 0.021 Y NA
 1197660 1197659     rplT   FALSE 0.185 39.000 0.002 1.000   NA
 1197659 1197658       thiG FALSE 0.359 3.000 0.003 1.000   NA
 1197658 1197657     thiG sqdB FALSE 0.142 171.000 0.009 0.024 N NA
 1197657 1197656     sqdB   TRUE 0.724 40.000 0.194 1.000 Y NA
 1197655 1197654       gcvP FALSE 0.046 130.000 0.024 NA   NA
 1197654 1197653     gcvP gcvH TRUE 0.930 46.000 0.249 0.001 Y NA
 1197653 1197652     gcvH   FALSE 0.395 3.000 0.060 1.000 N NA
 1197652 1197651         FALSE 0.265 19.000 0.037 NA   NA
 1197650 1197649     ole1 rplI FALSE 0.070 21.000 0.005 1.000 N NA
 1197649 1197648     rplI dnaB FALSE 0.207 60.000 0.048 1.000 N NA
 1197648 1197647     dnaB gidA FALSE 0.146 13.000 0.012 1.000 N NA
 1197647 1197646     gidA ubiC FALSE 0.017 67.000 0.008 NA N NA
 1197645 1197644         FALSE 0.433 85.000 0.387 NA   NA
 1197643 1197642         FALSE 0.266 25.000 0.043 NA   NA
 1197642 1294349         FALSE 0.080 117.000 0.043 NA   NA
 1197641 1197640       valS FALSE 0.282 3.000 0.008 NA   NA
 1197640 1197639     valS   FALSE 0.050 98.000 0.004 NA   NA
 1197639 1309144       tRNA-Val FALSE 0.049 -29.000 0.000 NA   NA
 1197638 1197637       speE FALSE 0.468 -3.000 0.011 1.000   NA
 1197637 1197636     speE speB TRUE 0.850 2.000 0.064 1.000 Y NA
 1197636 1197635     speB gcvT TRUE 0.631 51.000 0.010 1.000 Y NA
 1197635 1197634     gcvT aspS TRUE 0.641 56.000 0.018 0.041 N NA
 1197634 1197633     aspS pyrG FALSE 0.084 76.000 0.008 1.000 N NA
 1197633 1197632     pyrG nrdG FALSE 0.137 27.000 0.016 1.000 N NA
 1197632 1197631     nrdG   TRUE 0.623 7.000 0.270 1.000   NA
 1197631 1197630         TRUE 0.578 -3.000 0.037 1.000   NA
 1197630 1197629         TRUE 0.881 -3.000 0.180 1.000 Y NA
 1197627 1197626       ppk TRUE 0.572 0.000 0.037 1.000   NA
 1197626 1197625     ppk   FALSE 0.010 202.000 0.019 1.000 N NA
 1197625 1197624         FALSE 0.048 204.000 0.292 1.000   NA
 1197622 1197621     acnB eriC FALSE 0.299 10.000 0.062 1.000 N NA
 1197617 1197616     aroE rpsF FALSE 0.029 103.000 0.006 1.000 N NA
 1197614 1197613       mraY FALSE 0.454 -16.000 0.027 NA   NA
 1197613 1362561     mraY pseudo FALSE 0.019 22.000 0.000 NA   NA
 1197612 1197611       uvrA FALSE 0.004 203.000 0.003 1.000 N NA
 1197611 1197610     uvrA recN TRUE 0.846 55.000 0.021 0.083 Y NA
 1197609 1197608         TRUE 0.777 1.000 0.452 NA   NA
 1197608 1197607       thrC FALSE 0.398 7.000 0.050 NA   NA
 1197607 1197606     thrC dnaN FALSE 0.000 338.000 0.000 1.000 N NA