MicrobesOnline Operon Predictions for Prochlorococcus marinus str. MIT 9515

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1213680 1213679     dnaN   FALSE 0.487 2.000 0.022 NA   NA
 1213679 1213678         TRUE 0.536 4.000 0.039 NA   NA
 1213678 1213677       purF TRUE 0.756 48.000 0.019 1.000 Y NA
 1213676 1213675         FALSE 0.155 88.000 0.053 1.000 N NA
 1213675 1213674         FALSE 0.354 5.000 0.034 1.000 N NA
 1213673 1213672       nusB FALSE 0.448 4.000 0.016 NA   NA
 1213672 1213671     nusB ftsY FALSE 0.291 60.000 0.005 1.000   NA
 1213671 1213670     ftsY rsbU FALSE 0.027 143.000 0.018 1.000 N NA
 1213670 1213669     rsbU argH FALSE 0.131 61.000 0.021 1.000 N NA
 1213669 1213668     argH   FALSE 0.172 117.000 0.019 1.000   NA
 1213666 1213665       grpE TRUE 0.736 77.000 0.021 1.000 Y NA
 1213665 1213664     grpE dnaJ TRUE 0.932 32.000 0.168 0.017 Y NA
 1213664 1214516     dnaJ   TRUE 0.531 -3.000 0.067 1.000   NA
 1214516 1213663         FALSE 0.459 -10.000 0.058 1.000   NA
 1213662 1213661       murB FALSE 0.320 22.000 0.030 NA   NA
 1213661 1213660     murB murC TRUE 0.947 16.000 0.136 0.008 Y NA
 1213658 1213657     thiL   FALSE 0.245 -7.000 0.031 1.000 N NA
 1213656 1213655     efp accB FALSE 0.418 0.000 0.120 1.000 N NA
 1213654 1213653     pdxA   FALSE 0.097 93.000 0.020 1.000 N NA
 1213652 1213651         FALSE 0.125 171.000 0.250 NA   NA
 1213651 1213650         FALSE 0.360 58.000 0.091 NA   NA
 1213647 1213646     cbiD   FALSE 0.146 49.000 0.023 1.000 N NA
 1213640 1213639         TRUE 0.520 87.000 0.300 NA   NA
 1213639 1214511         FALSE 0.204 113.000 0.100 NA   NA
 1214511 1213638         FALSE 0.055 149.000 0.008 NA   NA
 1213637 1213636         TRUE 0.697 19.000 0.458 NA   NA
 1213636 1213635         TRUE 0.971 18.000 0.457 0.004 Y NA
 1213624 1213623         TRUE 0.851 1.000 0.522 NA   NA
 1213622 1213621         TRUE 0.552 88.000 0.350 NA   NA
 1213621 1213620       smc FALSE 0.396 83.000 0.150 NA   NA
 1213620 1213619     smc   FALSE 0.454 46.000 0.177 NA   NA
 1213618 1309118       tRNA-Leu FALSE 0.163 17.000 0.000 NA   NA
 1213615 1213614         TRUE 0.703 79.000 0.556 NA   NA
 1214509 1213613         TRUE 0.831 10.000 0.576 NA   NA
 1213613 1213612         FALSE 0.444 40.000 0.182 NA   NA
 1213612 1213611       hit FALSE 0.239 48.000 0.010 NA   NA
 1213611 1213610     hit def FALSE 0.097 16.000 0.013 1.000 N NA
 1213608 1213607         FALSE 0.350 0.000 0.081 1.000 N NA
 1213607 1213606       sufC TRUE 0.941 8.000 0.482 1.000 Y NA
 1213606 1213605     sufC   TRUE 0.888 20.000 0.466 1.000 Y NA
 1213604 1213603         FALSE 0.009 266.000 0.000 NA   NA
 1213603 1213602         TRUE 0.870 13.000 0.947 NA   NA
 1213602 1213601       pgm FALSE 0.239 34.000 0.017 NA   NA
 1213601 1213600     pgm mgs1 FALSE 0.058 34.000 0.009 1.000 N NA
 1213597 1213596       cysH FALSE 0.178 18.000 0.026 1.000 N NA
 1213595 1213594       citT FALSE 0.471 57.000 0.296 1.000 N NA
 1213594 1213593     citT trkG TRUE 0.982 10.000 0.500 0.005 Y NA
 1213593 1213592     trkG   TRUE 0.967 19.000 0.438 0.005 Y NA
 1213590 1213589         TRUE 0.699 36.000 0.533 NA   NA
 1213588 1214507         FALSE 0.140 142.000 0.128 NA   NA
 1213586 1213585         TRUE 0.810 32.000 1.000 NA   NA
 1213585 1213584         TRUE 0.637 72.000 0.421 NA   NA
 1214506 1213583       rbn FALSE 0.444 21.000 0.172 NA   NA
 1213583 1213582     rbn   FALSE 0.485 56.000 0.154 1.000   NA
 1213582 1213581         FALSE 0.406 3.000 0.096 1.000 N NA
 1213581 1213580         FALSE 0.348 -7.000 0.128 1.000 N NA
 1213579 1213578       nadB FALSE 0.472 0.000 0.024 NA   NA
 1214505 1213575         FALSE 0.494 67.000 0.238 NA   NA
 1213575 1213574         TRUE 0.513 53.000 0.238 NA   NA
 1213574 1213573         FALSE 0.481 13.000 0.125 NA   NA
 1213573 1213572         TRUE 0.914 -3.000 0.370 1.000 Y NA
 1213569 1214503         FALSE 0.371 27.000 0.129 NA   NA
 1213568 1213567       rbfA TRUE 0.520 6.000 0.030 NA   NA
 1213567 1213566     rbfA hemD FALSE 0.053 -13.000 0.006 1.000 N NA
 1213565 1213564       crtQ TRUE 0.897 3.000 0.800 NA   NA
 1213563 1213562         FALSE 0.460 10.000 0.050 NA   NA
 1213562 1213561         TRUE 0.574 1.000 0.111 NA   NA
 1213561 1214718         TRUE 0.896 4.000 0.778 NA   NA
 1213558 1213557         TRUE 0.547 17.000 0.190 1.000   NA
 1213556 1213555         TRUE 0.586 2.000 0.117 NA   NA
 1213555 1309137       tRNA-Asn FALSE 0.147 49.000 0.000 NA   NA
 1214502 1214501         FALSE 0.259 0.000 0.000 NA   NA
 1214501 1213554         FALSE 0.148 -72.000 0.000 NA   NA
 1213554 1214500         FALSE 0.227 -3.000 0.000 NA   NA
 1214500 1213553         FALSE 0.139 40.000 0.000 NA   NA
 1213553 1214499         FALSE 0.121 91.000 0.000 NA   NA
 1214499 1294422         FALSE 0.268 7.000 0.000 NA   NA
 1294422 1214498         FALSE 0.130 30.000 0.000 NA   NA
 1214497 1214496         FALSE 0.136 24.000 0.000 NA   NA
 1213550 1214492         FALSE 0.002 601.000 0.000 NA   NA
 1213548 1213547     holB tmk TRUE 0.637 4.000 0.254 1.000 N NA
 1213547 1213546     tmk zntA FALSE 0.243 1.000 0.020 1.000 N NA
 1213543 1213542       plsX FALSE 0.304 1.000 0.026 1.000 N NA
 1213542 1213541     plsX fabH TRUE 0.960 54.000 0.380 0.007 Y NA
 1213541 1213540     fabH fabD TRUE 0.937 19.000 0.043 0.007 Y NA
 1213540 1213539     fabD   TRUE 0.913 5.000 0.218 1.000 Y NA
 1213538 1213537       ycf34 FALSE 0.479 7.000 0.023 NA   NA
 1213536 1213535         FALSE 0.399 61.000 0.074 1.000   NA
 1213534 1213533     crtB,pys pds TRUE 0.778 23.000 0.691 1.000   NA
 1213532 1213531         TRUE 0.612 -3.000 0.205 NA   NA
 1213529 1213528       ndhF FALSE 0.305 34.000 0.041 NA   NA
 1213528 1213527     ndhF   TRUE 0.935 85.000 0.050 0.003 Y NA
 1213527 1213526         FALSE 0.174 111.000 0.009 1.000   NA
 1213526 1213525         FALSE 0.401 49.000 0.034 1.000   NA
 1294471 1213522         FALSE 0.331 75.000 0.090 NA   NA
 1213522 1213521         TRUE 0.565 1.000 0.101 NA   NA
 1213521 1213520       ndhE FALSE 0.180 26.000 0.071 1.000 N NA
 1213520 1213519     ndhE ndhG TRUE 0.987 2.000 0.506 0.005 Y NA
 1213519 1213518     ndhG ndhI TRUE 0.959 13.000 0.192 0.012 Y NA
 1213518 1213517     ndhI ndhA TRUE 0.942 70.000 0.242 0.012 Y NA
 1213517 1213516     ndhA gltA TRUE 0.773 76.000 0.137 1.000 Y NA
 1213516 1213515     gltA   FALSE 0.332 86.000 0.094 NA   NA
 1214491 1213512     sui1 cysC FALSE 0.179 43.000 0.047 1.000 N NA
 1213506 1213505     ndhH   TRUE 0.619 9.000 0.182 NA   NA
 1213504 1213503     menE menC TRUE 0.923 -3.000 0.104 0.002   NA
 1213503 1213502     menC menA TRUE 0.531 -3.000 0.066 1.000   NA
 1213500 1213499     gshB grxC FALSE 0.319 6.000 0.028 1.000 N NA
 1213498 1214490     prfB   TRUE 0.509 5.000 0.025 NA   NA
 1214490 1213497         FALSE 0.110 142.000 0.039 NA   NA
 1213497 1214489       dgkA FALSE 0.427 25.000 0.123 1.000   NA
 1214489 1213496     dgkA pabA FALSE 0.491 13.000 0.231 1.000 N NA
 1213496 1213495     pabA   FALSE 0.489 23.000 0.231 NA   NA
 1213494 1213493       argS FALSE 0.167 0.000 0.015 1.000 N NA
 1213493 1213492     argS nadC FALSE 0.077 28.000 0.014 1.000 N NA
 1213492 1213491     nadC thdF FALSE 0.298 78.000 0.014 1.000   NA
 1213487 1213486     rluD   FALSE 0.468 -3.000 0.018 1.000   NA
 1213482 1213481       pyrD FALSE 0.092 51.000 0.016 1.000 N NA
 1213481 1213480     pyrD rnhA FALSE 0.218 15.000 0.031 1.000 N NA
 1213480 1213479     rnhA rplL FALSE 0.059 48.000 0.008 1.000 N NA
 1213479 1213478     rplL rplJ TRUE 0.922 29.000 0.884 1.000 Y NA
 1213478 1213477     rplJ rplA FALSE 0.343 192.000 0.302 1.000 Y NA
 1213477 1213476     rplA rplK TRUE 0.970 67.000 0.838 0.047 Y NA
 1213476 1213475     rplK nusG TRUE 0.712 64.000 0.681 1.000 N NA
 1213475 1213474     nusG secE TRUE 0.804 78.000 0.843 1.000   NA
 1213474 1213473     secE clpB2 FALSE 0.357 63.000 0.023 1.000   NA
 1213471 1213470         TRUE 0.851 0.000 0.576 NA   NA
 1213468 1213467         TRUE 0.633 4.000 0.152 NA   NA
 1213465 1213464     hemB   FALSE 0.193 56.000 0.033 1.000 N NA
 1213464 1213463         FALSE 0.216 15.000 0.044 1.000 N NA
 1213463 1213462       obg FALSE 0.293 41.000 0.008 1.000   NA
 1213462 1213461     obg   FALSE 0.186 88.000 0.005 NA   NA
 1213460 1213459       ecm4 FALSE 0.185 133.000 0.152 NA   NA
 1213458 1213457     aspA psbA FALSE 0.043 164.000 0.000 1.000   NA
 1213455 1213454       aroC FALSE 0.119 112.000 0.000 1.000   NA
 1213453 1213452     eda   TRUE 0.631 -16.000 0.415 1.000 N NA
 1213452 1213451       met3 FALSE 0.185 47.000 0.061 1.000 N NA
 1213451 1213450     met3 psbO FALSE 0.368 75.000 0.064 1.000   NA
 1213450 1213449     psbO dfp FALSE 0.027 218.000 0.004 1.000   NA
 1213449 1214485     dfp   FALSE 0.440 11.000 0.030 NA   NA
 1213448 1213447         TRUE 0.511 29.000 0.278 NA   NA
 1213446 1213445     pyrB   FALSE 0.203 0.000 0.019 1.000 N NA
 1309138 1214484     tRNA-Leu   FALSE 0.132 84.000 0.000 NA   NA
 1214484 1213442       ileS FALSE 0.307 44.000 0.025 NA   NA
 1294452 1214483         TRUE 0.745 -40.000 0.561 NA   NA
 1213438 1213437     thy1 dcd TRUE 0.884 2.000 0.042 1.000 Y NA
 1213437 1213436     dcd   FALSE 0.390 6.000 0.091 1.000 N NA
 1213435 1213434     ntcA   TRUE 0.746 53.000 0.612 NA   NA
 1213434 1214482         TRUE 0.517 1.000 0.047 NA   NA
 1213433 1213432       pth FALSE 0.355 14.000 0.022 NA   NA
 1213432 1213431     pth psbH FALSE 0.053 168.000 0.006 1.000   NA
 1213430 1213429     psbN psbI TRUE 0.691 132.000 0.216 0.006   NA
 1213429 1213428     psbI   TRUE 0.562 23.000 0.324 NA   NA
 1213428 1362532       pseudo FALSE 0.147 56.000 0.000 NA   NA
 1213427 1213426     leuD leuC TRUE 0.976 -3.000 0.268 0.002 Y NA
 1213426 1213425     leuC cinA FALSE 0.483 13.000 0.032 1.000   NA
 1213425 1213424     cinA glyA FALSE 0.358 -31.000 0.018 1.000   NA
 1213424 1309117     glyA tRNA-Arg FALSE 0.131 78.000 0.000 NA   NA
 1214481 1213423         TRUE 0.847 10.000 0.667 NA   NA
 1213421 1213420     sfsA amt1 FALSE 0.065 166.000 0.040 NA   NA
 1213420 1213419     amt1 lytB FALSE 0.392 94.000 0.286 1.000 N NA
 1213419 1213418     lytB   FALSE 0.354 93.000 0.143 NA   NA
 1213412 1294423     tgt psbK FALSE 0.369 34.000 0.034 1.000   NA
 1213411 1213410         FALSE 0.348 51.000 0.078 NA   NA
 1213410 1309116       tRNA-Met FALSE 0.167 16.000 0.000 NA   NA
 1213409 1213408     pyrE   FALSE 0.450 -13.000 0.034 1.000   NA
 1213406 1213405         FALSE 0.198 -3.000 0.020 1.000 N NA
 1213404 1213403         FALSE 0.112 81.000 0.020 1.000 N NA
 1213403 1213402       fabI FALSE 0.132 22.000 0.021 1.000 N NA
 1213401 1213400       degT FALSE 0.392 45.000 0.057 1.000   NA
 1213399 1213398     phrB   TRUE 0.874 0.000 0.038 1.000 Y NA
 1213398 1213397       folK FALSE 0.400 46.000 0.033 1.000   NA
 1213395 1213394         TRUE 0.955 6.000 0.690 NA Y NA
 1213392 1213391     ndhJ ndhK TRUE 0.982 0.000 0.406 0.005 Y NA
 1213391 1213390     ndhK ndhC TRUE 0.984 5.000 0.428 0.005 Y NA
 1213389 1213388     rub   TRUE 0.820 10.000 0.521 NA   NA
 1213388 1213387       psbE TRUE 0.516 124.000 0.625 NA   NA
 1213387 1213386     psbE psbF TRUE 0.979 3.000 0.837 0.004   NA
 1213386 1213385     psbF psbL TRUE 0.968 12.000 0.872 0.006   NA
 1213385 1213384     psbL psbJ TRUE 0.972 10.000 0.878 0.006   NA
 1213381 1213380       uvrD FALSE 0.274 8.000 0.025 1.000 N NA
 1213380 1214480     uvrD   FALSE 0.229 37.000 0.012 NA   NA
 1213378 1213377     cpeS   TRUE 0.562 -25.000 0.259 NA   NA
 1213377 1213376         FALSE 0.447 110.000 0.375 NA   NA
 1309115 1213374     tRNA-Phe metK FALSE 0.002 727.000 0.000 NA   NA
 1213374 1213373     metK rps1a, rpsA1 FALSE 0.141 121.000 0.008 1.000   NA
 1213373 1213372     rps1a, rpsA1   FALSE 0.201 107.000 0.025 NA   NA
 1213372 1213371       psbB FALSE 0.011 224.000 0.000 NA   NA
 1213370 1213369     fdx psbM TRUE 0.616 103.000 0.472 1.000   NA
 1213369 1213368     psbM hemK TRUE 0.526 13.000 0.111 1.000   NA
 1213368 1213367     hemK sua5 TRUE 0.874 19.000 0.444 NA Y NA
 1309114 1213366     tRNA-Thr minE FALSE 0.139 66.000 0.000 NA   NA
 1213366 1213365     minE minD TRUE 0.918 7.000 0.347 NA Y NA
 1213365 1213364     minD minC TRUE 0.752 110.000 0.368 1.000 Y NA
 1213364 1213363     minC   TRUE 0.575 0.000 0.038 1.000   NA
 1213363 1213362         FALSE 0.372 35.000 0.071 1.000   NA
 1213361 1213360     petB petD TRUE 0.894 44.000 0.471 0.072   NA
 1309392 1309139     rrs tRNA-Ile FALSE 0.059 123.000 0.000 NA   NA
 1309139 1309140     tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.195 13.000 0.000 NA   NA
 1309140 1365721     tRNA-Ala rrl FALSE 0.009 267.000 0.000 NA   NA
 1365721 1309393     rrl rrf FALSE 0.137 68.000 0.000 NA   NA
 1213358 1213357     mutM psaE TRUE 0.603 5.000 0.040 1.000   NA
 1213357 1213356     psaE   FALSE 0.449 81.000 0.152 1.000   NA
 1213356 1213355         TRUE 0.521 73.000 0.227 1.000   NA
 1214717 1213354         FALSE 0.337 88.000 0.026 1.000   NA
 1213353 1214476         FALSE 0.003 473.000 0.000 NA   NA
 1214476 1214475         TRUE 0.667 107.000 0.750 NA   NA
 1213350 1213349         FALSE 0.241 116.000 0.167 NA   NA
 1213345 1213344         TRUE 0.763 -10.000 0.500 NA   NA
 1213344 1294417         TRUE 0.726 93.000 0.714 NA   NA
 1214472 1213343         FALSE 0.007 302.000 0.000 NA   NA
 1213343 1213342         FALSE 0.336 69.000 0.086 NA   NA
 1213341 1362534       pseudo FALSE 0.012 215.000 0.000 NA   NA
 1213340 1214471         FALSE 0.123 109.000 0.005 NA   NA
 1213339 1213338         FALSE 0.347 97.000 0.150 NA   NA
 1213336 1214467         FALSE 0.476 68.000 0.222 NA   NA
 1214467 1214466         TRUE 0.724 -6.000 0.400 NA   NA
 1214466 1213335         FALSE 0.003 544.000 0.000 NA   NA
 1213334 1214465         TRUE 0.737 5.000 0.286 NA   NA
 1214465 1213333         FALSE 0.048 166.000 0.018 NA   NA
 1213333 1214464         FALSE 0.263 60.000 0.018 NA   NA
 1214464 1214463         TRUE 0.763 5.000 0.333 NA   NA
 1213332 1213331       thiD FALSE 0.405 31.000 0.263 1.000 N NA
 1213331 1214459     thiD   FALSE 0.004 425.000 0.000 NA   NA
 1214459 1213330         FALSE 0.016 348.000 0.088 NA   NA
 1213330 1213329         FALSE 0.356 32.000 0.118 NA   NA
 1213327 1213326         TRUE 0.849 0.000 0.500 1.000   NA
 1213326 1213325       solA TRUE 0.927 5.000 0.324 1.000 Y NA
 1213325 1214458     solA   FALSE 0.246 9.000 0.000 NA   NA
 1214458 1213324         FALSE 0.132 27.000 0.000 NA   NA
 1213324 1214457         FALSE 0.184 -10.000 0.000 NA   NA
 1214457 1214456         TRUE 0.879 5.000 0.667 NA   NA
 1214456 1214455         TRUE 0.865 0.000 0.667 NA   NA
 1213323 1213322         FALSE 0.420 91.000 0.200 NA   NA
 1213322 1214454         FALSE 0.084 189.000 0.200 NA   NA
 1213321 1214453         FALSE 0.103 150.000 0.105 NA   NA
 1213320 1214452         FALSE 0.004 451.000 0.000 NA   NA
 1214452 1213319       amtB FALSE 0.015 200.000 0.000 NA   NA
 1213318 1214451         FALSE 0.131 33.000 0.000 NA   NA
 1214451 1213317         FALSE 0.001 1100.000 0.000 NA   NA
 1213317 1213316         FALSE 0.143 61.000 0.000 NA   NA
 1213316 1214449         FALSE 0.004 405.000 0.000 NA   NA
 1214449 1214447         FALSE 0.010 248.000 0.000 NA   NA
 1214445 1213315         TRUE 0.801 6.000 0.400 NA   NA
 1213314 1213313         FALSE 0.131 82.000 0.000 NA   NA
 1214444 1213312         FALSE 0.334 154.000 0.600 NA   NA
 1213308 1213307         FALSE 0.227 -3.000 0.000 NA   NA
 1213307 1213306         TRUE 0.877 0.000 0.727 NA   NA
 1213306 1214443         TRUE 0.722 1.000 0.273 NA   NA
 1214443 1214442         TRUE 0.701 63.000 0.500 NA   NA
 1214442 1213305       dcm FALSE 0.018 184.000 0.000 NA   NA
 1213305 1213304     dcm   TRUE 0.723 -3.000 0.357 NA   NA
 1213304 1213303         TRUE 0.893 -3.000 1.000 NA   NA
 1213303 1213302         FALSE 0.281 3.000 0.000 NA   NA
 1213302 1213301         FALSE 0.023 166.000 0.000 NA   NA
 1213301 1309113       tRNA-Thr FALSE 0.007 300.000 0.000 NA   NA
 1309113 1309112     tRNA-Thr tRNA-Tyr FALSE 0.209 12.000 0.000 NA   NA
 1213300 1213299     aroQ miaE FALSE 0.342 1.000 0.039 1.000 N NA
 1213299 1213298     miaE cobI/cbiL FALSE 0.128 26.000 0.022 1.000 N NA
 1213298 1213297     cobI/cbiL   FALSE 0.311 -10.000 0.015 NA   NA
 1213297 1213296         FALSE 0.226 73.000 0.011 NA   NA
 1213296 1213295       cbiQ TRUE 0.565 0.000 0.029 1.000   NA
 1213295 1213294     cbiQ   TRUE 0.686 19.000 0.447 NA   NA
 1213294 1213293         TRUE 0.534 4.000 0.065 NA   NA
 1213293 1213292         FALSE 0.128 157.000 0.194 NA   NA
 1213292 1213291       proC TRUE 0.667 8.000 0.224 NA   NA
 1213290 1213289       recO FALSE 0.054 86.000 0.009 1.000 N NA
 1213289 1213288     recO deoC FALSE 0.097 1.000 0.007 1.000 N NA
 1213288 1213287     deoC lrtA FALSE 0.046 7.000 0.017 NA N NA
 1213286 1213285     lipB fadD FALSE 0.160 32.000 0.029 1.000 N NA
 1213285 1213284     fadD   TRUE 0.628 58.000 0.388 NA   NA
 1213284 1213283       pdhC FALSE 0.195 134.000 0.176 NA   NA
 1213283 1213282     pdhC queA FALSE 0.171 7.000 0.014 1.000 N NA
 1213281 1213280         TRUE 0.917 85.000 0.095 0.025 Y NA
 1213280 1213279       metB TRUE 0.960 46.000 0.250 0.001 Y NA
 1213279 1213278     metB rpsD FALSE 0.044 76.000 0.008 1.000 N NA
 1213277 1213276         TRUE 0.508 5.000 0.025 NA   NA
 1213276 1213275       murE TRUE 0.551 9.000 0.049 1.000   NA
 1213275 1213274     murE   FALSE 0.301 83.000 0.014 1.000   NA
 1213273 1213272         TRUE 0.711 33.000 0.041 0.051 N NA
 1213272 1362535       pseudo FALSE 0.133 74.000 0.000 NA   NA
 1213270 1213269     mqo lepA FALSE 0.299 57.000 0.007 1.000   NA
 1213269 1213268     lepA dppC FALSE 0.005 173.000 0.006 1.000 N NA
 1213266 1213265         FALSE 0.030 225.000 0.028 NA   NA
 1213265 1213264         TRUE 0.555 3.000 0.084 NA   NA
 1213264 1213263         FALSE 0.102 132.000 0.017 NA   NA
 1213263 1213262       sun FALSE 0.008 366.000 0.000 1.000   NA
 1213261 1213260     mrcB chlG TRUE 0.784 2.000 0.452 1.000 N NA
 1213260 1213259     chlG   TRUE 0.527 10.000 0.119 NA   NA
 1213258 1213257     hisF ubiE FALSE 0.072 33.000 0.012 1.000 N NA
 1213255 1213254     salX ndhB FALSE 0.321 15.000 0.134 1.000 N NA
 1213253 1213252     topA   FALSE 0.473 3.000 0.020 NA   NA
 1213252 1213251         TRUE 0.573 6.000 0.105 NA   NA
 1213251 1213250       cobT FALSE 0.482 15.000 0.155 NA   NA
 1213250 1213249     cobT   FALSE 0.274 1.000 0.000 NA   NA
 1213246 1213245       cyoC TRUE 0.778 97.000 1.000 NA   NA
 1213245 1213244     cyoC cyoB TRUE 0.975 16.000 0.500 0.004 Y NA
 1213244 1213243     cyoB cyoA TRUE 0.983 -3.000 0.500 0.004 Y NA
 1213242 1213241     ctaA cyoE TRUE 0.858 -3.000 0.090 1.000 Y NA
 1213241 1213240     cyoE ccmA FALSE 0.178 38.000 0.033 1.000 N NA
 1213240 1213239     ccmA   FALSE 0.491 54.000 0.321 1.000 N NA
 1213239 1213238         TRUE 0.811 8.000 0.455 NA   NA
 1213233 1213232       ubiA FALSE 0.127 13.000 0.043 NA N NA
 1213229 1213228     cobM lgt FALSE 0.244 -7.000 0.061 1.000 N NA
 1213228 1213227     lgt petA TRUE 0.801 12.000 0.476 1.000   NA
 1213227 1213226     petA petC TRUE 0.971 5.000 0.881 0.055   NA
 1213224 1213223     tatC   FALSE 0.290 81.000 0.027 NA   NA
 1213223 1213222         FALSE 0.256 29.000 0.020 NA   NA
 1214438 1213220     psaJ psaF TRUE 0.900 30.000 0.455 0.020   NA
 1213219 1214437     qri7   FALSE 0.422 7.000 0.015 NA   NA
 1214437 1213218       nhaP FALSE 0.075 159.000 0.034 NA   NA
 1213217 1309111     gltX tRNA-Asp FALSE 0.162 -26.000 0.000 NA   NA
 1309111 1213216     tRNA-Asp   FALSE 0.033 149.000 0.000 NA   NA
 1213216 1309110       tRNA-Trp FALSE 0.137 39.000 0.000 NA   NA
 1309110 1213215     tRNA-Trp rplS FALSE 0.147 57.000 0.000 NA   NA
 1213215 1362536     rplS pseudo FALSE 0.131 32.000 0.000 NA   NA
 1213212 1213211     pta   FALSE 0.389 26.000 0.145 NA   NA
 1213211 1213210         FALSE 0.138 67.000 0.000 NA   NA
 1213210 1213209         FALSE 0.274 25.000 0.021 NA   NA
 1213209 1213208       hflC FALSE 0.478 111.000 0.429 NA   NA
 1213207 1213206     hemL xthA FALSE 0.001 287.000 0.000 1.000 N NA
 1213205 1213204         FALSE 0.451 49.000 0.174 NA   NA
 1213204 1213203         FALSE 0.320 64.000 0.042 NA   NA
 1213203 1214716         FALSE 0.406 -9.000 0.042 NA   NA
 1213202 1213201     thiP   FALSE 0.331 20.000 0.053 NA   NA
 1213201 1213200         FALSE 0.280 45.000 0.020 NA   NA
 1213200 1213199         FALSE 0.262 37.000 0.020 NA   NA
 1213198 1213197         FALSE 0.408 63.000 0.246 1.000 N NA
 1213196 1213195     hemC   FALSE 0.049 96.000 0.009 1.000 N NA
 1213193 1213192       argB FALSE 0.498 3.000 0.023 NA   NA
 1213192 1213191     argB   FALSE 0.306 66.000 0.027 NA   NA
 1213188 1214435     cobK cutA FALSE 0.287 10.000 0.031 1.000 N NA
 1213187 1213186       purA FALSE 0.134 21.000 0.021 1.000 N NA
 1213186 1213185     purA psb27 FALSE 0.272 82.000 0.022 NA   NA
 1213185 1213184     psb27 proS FALSE 0.276 27.000 0.023 NA   NA
 1213183 1214434         FALSE 0.432 102.000 0.273 NA   NA
 1214434 1213182         FALSE 0.396 -10.000 0.041 NA   NA
 1213182 1214433       arsC FALSE 0.337 2.000 0.045 1.000 N NA
 1214433 1213181     arsC   FALSE 0.162 81.000 0.030 1.000 N NA
 1213180 1213179       gpmB FALSE 0.072 3.000 0.004 1.000 N NA
 1213178 1214432         FALSE 0.489 86.000 0.250 NA   NA
 1214432 1213177         TRUE 0.505 0.000 0.039 NA   NA
 1213177 1213176       tal FALSE 0.232 91.000 0.131 1.000 N NA
 1213175 1213174     fixC frr FALSE 0.221 -3.000 0.022 1.000 N NA
 1213174 1213173     frr pyrH TRUE 0.680 27.000 0.626 1.000 N NA
 1213173 1213172     pyrH cobO FALSE 0.023 132.000 0.010 1.000 N NA
 1213172 1213171     cobO   TRUE 0.796 20.000 0.024 0.040   NA
 1213170 1213169     hemH ilvB FALSE 0.498 134.000 0.031 1.000 Y NA
 1213169 1213168     ilvB   FALSE 0.414 62.000 0.149 NA   NA
 1213167 1213166         FALSE 0.394 11.000 0.020 NA   NA
 1213166 1213165       rps1b, rpsA2, nbp1 TRUE 0.758 -13.000 0.513 NA   NA
 1213164 1213163         FALSE 0.490 119.000 0.465 1.000   NA
 1213163 1213162         TRUE 0.850 110.000 0.659 0.035   NA
 1213162 1213161       accA TRUE 0.605 4.000 0.033 1.000   NA
 1213161 1213160     accA   FALSE 0.408 -55.000 0.033 1.000   NA
 1213160 1213159       folE FALSE 0.230 154.000 0.348 1.000   NA
 1214431 1213155         TRUE 0.605 84.000 0.395 NA   NA
 1213155 1213154         TRUE 0.544 57.000 0.274 NA   NA
 1213153 1213152     chlL chlB FALSE 0.394 192.000 0.226 0.002 N NA
 1213152 1213151     chlB chlN TRUE 0.989 4.000 0.591 0.002 Y NA
 1213151 1213150     chlN   FALSE 0.078 157.000 0.068 NA   NA
 1213147 1213146     ccmK rbcL FALSE 0.483 67.000 0.373 NA N NA
 1213146 1213145     rbcL rbcS TRUE 0.878 94.000 0.392 0.001 N NA
 1213145 1213144     rbcS csoS2 TRUE 0.636 93.000 0.474 NA   NA
 1213144 1213143     csoS2 csoS3 TRUE 0.815 65.000 0.925 NA   NA
 1213143 1213142     csoS3   TRUE 0.914 3.000 0.925 NA   NA
 1213142 1213141         TRUE 0.964 6.000 0.868 NA Y NA
 1213141 1214430         FALSE 0.325 101.000 0.147 NA   NA
 1213140 1213139       tdcF FALSE 0.300 85.000 0.051 NA   NA
 1213139 1213138     tdcF   FALSE 0.265 25.000 0.020 NA   NA
 1213137 1213136     hisG   FALSE 0.165 14.000 0.021 1.000 N NA
 1213136 1213135         TRUE 0.706 0.000 0.222 1.000   NA
 1213134 1213133         TRUE 0.604 6.000 0.135 NA   NA
 1309141 1213127     tRNA-Leu ndhL FALSE 0.131 76.000 0.000 NA   NA
 1213127 1214428     ndhL   TRUE 0.914 5.000 0.925 NA   NA
 1214428 1213126       trpA TRUE 0.607 40.000 0.375 NA   NA
 1214427 1213123         TRUE 0.854 -3.000 0.714 NA   NA
 1213123 1213122         TRUE 0.801 28.000 0.905 NA   NA
 1213122 1213121       hisI FALSE 0.009 149.000 0.006 1.000 N NA
 1213119 1213118     clpB petE FALSE 0.097 130.000 0.106 1.000 N NA
 1213118 1213117     petE   TRUE 0.581 59.000 0.404 1.000 N NA
 1213117 1213116       hemE FALSE 0.111 108.000 0.032 1.000 N NA
 1213116 1213115     hemE glgB FALSE 0.059 128.000 0.024 1.000 N NA
 1213115 1213114     glgB   TRUE 0.540 52.000 0.220 1.000   NA
 1213114 1213113         TRUE 0.875 9.000 0.760 NA   NA
 1213113 1213112         TRUE 0.768 54.000 0.684 NA   NA
 1213112 1213111         TRUE 0.726 8.000 0.317 NA   NA
 1213110 1213109       proA FALSE 0.206 67.000 0.006 NA   NA
 1213109 1213108     proA folB FALSE 0.210 12.000 0.023 1.000 N NA
 1213108 1213107     folB   TRUE 0.592 6.000 0.047 1.000   NA
 1213106 1213105     prlC   TRUE 0.631 18.000 0.444 1.000 N NA
 1213105 1213104       thrB FALSE 0.167 79.000 0.031 1.000 N NA
 1213104 1213103     thrB glk FALSE 0.219 9.000 0.020 1.000 N NA
 1213103 1213102     glk thrS FALSE 0.196 10.000 0.020 1.000 N NA
 1213102 1213101     thrS trpS TRUE 0.958 4.000 0.016 0.055 Y NA
 1213101 1213100     trpS   FALSE 0.354 -37.000 0.034 NA   NA
 1213099 1213098         FALSE 0.304 31.000 0.065 NA   NA
 1213098 1213097         TRUE 0.969 5.000 0.894 1.000 Y NA
 1213097 1213096         TRUE 0.953 12.000 0.857 1.000 Y NA
 1213096 1213095         TRUE 0.551 6.000 0.085 NA   NA
 1213094 1213093         TRUE 0.627 46.000 0.381 NA   NA
 1213092 1213091     menD menB TRUE 0.947 31.000 0.147 0.001 Y NA
 1213091 1213090     menB glgA FALSE 0.140 45.000 0.022 1.000 N NA
 1213090 1213089     glgA murF FALSE 0.452 12.000 0.182 1.000 N NA
 1213088 1213087     glmU   FALSE 0.278 41.000 0.021 NA   NA
 1213087 1213086       aroA FALSE 0.369 11.000 0.017 NA   NA
 1213085 1213084         FALSE 0.360 31.000 0.051 1.000   NA
 1213084 1213083       amiC TRUE 0.524 -3.000 0.051 1.000   NA
 1213083 1213082     amiC murI TRUE 0.846 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 1213082 1213081     murI sds FALSE 0.135 28.000 0.024 1.000 N NA
 1213081 1213080     sds acs FALSE 0.154 98.000 0.080 1.000 N NA
 1213076 1214425     hisS   FALSE 0.398 4.000 0.007 NA   NA
 1214425 1214424         TRUE 0.807 15.000 0.714 NA   NA
 1214424 1213075         TRUE 0.541 136.000 0.857 NA   NA
 1213073 1213072         FALSE 0.303 109.000 0.132 1.000   NA
 1213072 1213071         FALSE 0.465 39.000 0.211 NA   NA
 1213068 1213067         TRUE 0.702 9.000 0.235 1.000   NA
 1213065 1213064     mscS pncA FALSE 0.372 67.000 0.029 1.000   NA
 1213062 1213061       stpA FALSE 0.362 34.000 0.059 1.000   NA
 1213060 1213059         FALSE 0.370 108.000 0.250 NA   NA
 1213059 1213058       MET17 FALSE 0.398 73.000 0.149 NA   NA
 1213058 1213057     MET17 metA TRUE 0.804 15.000 0.048 1.000 Y NA
 1213056 1213055         TRUE 0.731 32.000 0.800 1.000 N NA
 1213054 1213053         FALSE 0.005 353.000 0.000 NA   NA
 1214423 1213050         TRUE 0.743 -28.000 0.538 NA   NA
 1213049 1214422         TRUE 0.807 -3.000 0.500 NA   NA
 1214422 1213048         TRUE 0.737 55.000 0.571 NA   NA
 1214421 1214420         TRUE 0.552 28.000 0.333 NA   NA
 1214420 1214419         FALSE 0.047 135.000 0.000 NA   NA
 1213047 1213046         FALSE 0.163 17.000 0.000 NA   NA
 1213046 1213045         FALSE 0.045 136.000 0.000 NA   NA
 1214415 1213044         FALSE 0.003 483.000 0.000 NA   NA
 1214414 1213043       nrdJ FALSE 0.366 87.000 0.132 NA   NA
 1213042 1213041       prfC FALSE 0.331 30.000 0.021 1.000   NA
 1213041 1213040     prfC   FALSE 0.325 52.000 0.012 1.000   NA
 1213039 1213038         FALSE 0.077 -10.000 0.009 1.000 N NA
 1213037 1213036         TRUE 0.748 10.000 0.388 NA   NA
 1213036 1213035         FALSE 0.247 85.000 0.018 NA   NA
 1213034 1213033     tesA   FALSE 0.442 50.000 0.264 1.000 N NA
 1213033 1213032         TRUE 0.960 5.000 0.696 1.000 Y NA
 1213032 1213031       phnD TRUE 0.947 -3.000 0.690 1.000 Y NA
 1213031 1213030     phnD aspC TRUE 0.617 5.000 0.238 1.000 N NA
 1213029 1213028       gcpE FALSE 0.129 35.000 0.022 1.000 N NA
 1213028 1213027     gcpE   FALSE 0.123 97.000 0.026 1.000 N NA
 1214413 1214714         FALSE 0.002 610.000 0.000 NA   NA
 1213020 1213019         TRUE 0.765 61.000 0.051 1.000 Y NA
 1213019 1213018       rfbG TRUE 0.933 -6.000 0.624 1.000 Y NA
 1213018 1213017     rfbG   TRUE 0.931 60.000 0.031 0.010 Y NA
 1213017 1214411         FALSE 0.381 136.000 0.000 NA Y NA
 1214411 1214410         FALSE 0.003 511.000 0.000 NA   NA
 1214410 1214409         FALSE 0.005 337.000 0.000 NA   NA
 1213016 1214408         TRUE 0.518 146.000 1.000 NA   NA
 1214408 1294448         FALSE 0.026 160.000 0.000 NA   NA
 1213015 1214407         FALSE 0.004 390.000 0.000 NA   NA
 1213014 1213013     hcaE   TRUE 0.686 107.000 0.143 1.000 Y NA
 1213012 1214404         TRUE 0.727 7.000 0.294 NA   NA
 1213011 1213010       potA FALSE 0.001 245.000 0.000 1.000 N NA
 1213009 1213008     nth   FALSE 0.288 36.000 0.010 1.000   NA
 1213008 1213007         TRUE 0.503 25.000 0.256 NA   NA
 1213004 1213003     hisA   FALSE 0.223 80.000 0.011 NA   NA
 1213003 1213002         FALSE 0.450 15.000 0.131 NA   NA
 1213002 1213001         FALSE 0.350 31.000 0.111 NA   NA
 1213001 1213000         TRUE 0.831 1.000 0.467 NA   NA
 1213000 1212999         FALSE 0.459 -3.000 0.042 NA   NA
 1212999 1212998         FALSE 0.308 34.000 0.038 NA   NA
 1212998 1212997         TRUE 0.534 5.000 0.041 NA   NA
 1212997 1212996       proB FALSE 0.318 -3.000 0.005 NA   NA
 1212996 1212995     proB lpxD FALSE 0.202 16.000 0.029 1.000 N NA
 1212995 1212994     lpxD leuB FALSE 0.161 29.000 0.052 1.000 N NA
 1212994 1212993     leuB prkB TRUE 0.734 91.000 0.074 1.000 Y NA
 1212993 1212992     prkB accD FALSE 0.008 182.000 0.010 1.000 N NA
 1212992 1212991     accD   FALSE 0.410 5.000 0.009 NA   NA
 1212991 1212990         TRUE 0.535 0.000 0.092 NA   NA
 1212990 1212989         FALSE 0.281 105.000 0.042 1.000   NA
 1212989 1212988       cbbA TRUE 0.787 148.000 0.026 0.001 Y NA
 1212987 1212986       purS TRUE 0.989 1.000 0.656 0.002 Y NA
 1212986 1214401     purS   FALSE 0.219 102.000 0.008 1.000   NA
 1214401 1212985       cobW FALSE 0.288 33.000 0.026 NA   NA
 1212985 1212984     cobW   FALSE 0.469 10.000 0.033 NA   NA
 1212983 1212982     upp   FALSE 0.273 30.000 0.023 NA   NA
 1212982 1212981       ilvD FALSE 0.418 24.000 0.165 NA   NA
 1212980 1212979         TRUE 0.671 -10.000 0.358 NA   NA
 1212979 1212978         TRUE 0.541 36.000 0.321 NA   NA
 1212978 1212977       gnd TRUE 0.954 -12.000 0.046 0.003 Y NA
 1212977 1212976     gnd glgC TRUE 0.700 99.000 0.042 1.000 Y NA
 1212976 1212975     glgC hemA FALSE 0.057 134.000 0.027 1.000 N NA
 1212975 1212974     hemA glpX FALSE 0.207 18.000 0.038 1.000 N NA
 1212972 1212971     ccmC   FALSE 0.162 112.000 0.008 1.000   NA
 1212971 1212970         FALSE 0.297 -10.000 0.011 NA   NA
 1212970 1212969       typA FALSE 0.446 7.000 0.019 NA   NA
 1212969 1212968     typA vanY FALSE 0.033 115.000 0.011 1.000 N NA
 1212964 1214400         FALSE 0.406 -9.000 0.043 NA   NA
 1214400 1212963       recG FALSE 0.330 61.000 0.036 NA   NA
 1212963 1212962     recG   FALSE 0.232 30.000 0.016 NA   NA
 1212962 1212961       tsf FALSE 0.222 42.000 0.008 NA   NA
 1212961 1212960     tsf rpsB TRUE 0.794 42.000 0.748 1.000   NA
 1212960 1212959     rpsB   FALSE 0.084 138.000 0.017 NA   NA
 1212959 1212958         TRUE 0.508 56.000 0.234 NA   NA
 1212958 1212957         TRUE 0.801 19.000 0.800 NA   NA
 1212957 1212956         TRUE 0.937 14.000 0.769 1.000 Y NA
 1212956 1212955         TRUE 0.883 0.000 0.769 NA   NA
 1212955 1212954       pcyA TRUE 0.813 0.000 0.455 NA   NA
 1212953 1212952         TRUE 0.950 0.000 0.352 0.005   NA
 1212948 1214398         FALSE 0.358 41.000 0.098 NA   NA
 1214396 1214395         TRUE 0.698 87.000 0.556 NA   NA
 1214395 1212947         TRUE 0.730 57.000 0.556 NA   NA
 1212947 1214394         TRUE 0.744 11.000 0.400 NA   NA
 1212945 1212944         FALSE 0.120 139.000 0.082 NA   NA
 1212944 1214390         FALSE 0.259 105.000 0.098 NA   NA
 1214390 1214389         TRUE 0.635 85.000 0.429 NA   NA
 1214389 1212943         FALSE 0.312 37.000 0.035 NA   NA
 1212943 1212942         TRUE 0.816 -3.000 0.751 NA N NA
 1212942 1212941         TRUE 0.916 0.000 0.214 0.037   NA
 1212941 1212940         TRUE 0.846 1.000 0.460 1.000   NA
 1212940 1212939         FALSE 0.012 214.000 0.000 NA   NA
 1214388 1212938       pstB FALSE 0.004 387.000 0.000 NA   NA
 1212938 1212937     pstB pstA TRUE 0.992 1.000 0.952 0.003 Y NA
 1212937 1212936     pstA pstC TRUE 0.987 7.000 0.541 0.003 Y NA
 1212936 1212935     pstC   FALSE 0.275 164.000 0.000 1.000 Y NA
 1212935 1212934         FALSE 0.053 181.000 0.065 NA   NA
 1212934 1212933         TRUE 0.752 85.000 0.714 NA   NA
 1212933 1294428         TRUE 0.593 114.000 0.714 NA   NA
 1294428 1214385         TRUE 0.602 96.000 0.444 NA   NA
 1214385 1212932         FALSE 0.002 816.000 0.000 NA   NA
 1212932 1362538       pseudo FALSE 0.147 51.000 0.000 NA   NA
 1214382 1214381         FALSE 0.005 332.000 0.000 NA   NA
 1214381 1294439         TRUE 0.747 21.000 0.625 NA   NA
 1294439 1212931         TRUE 0.700 100.000 0.714 NA   NA
 1212931 1212930         TRUE 0.898 0.000 0.857 NA   NA
 1212930 1212929         FALSE 0.008 268.000 0.000 NA   NA
 1214380 1214379         TRUE 0.693 4.000 0.222 NA   NA
 1214379 1214378         TRUE 0.643 51.000 0.400 NA   NA
 1214378 1214377         TRUE 0.700 14.000 0.400 NA   NA
 1214377 1214376         FALSE 0.012 423.000 0.077 NA   NA
 1214376 1214375         FALSE 0.057 196.000 0.128 NA   NA
 1214375 1214374         TRUE 0.778 87.000 0.833 NA   NA
 1214374 1212927         FALSE 0.006 313.000 0.000 NA   NA
 1212926 1212925         FALSE 0.110 97.000 0.000 NA   NA
 1212925 1212924         TRUE 0.797 34.000 0.000 0.005   NA
 1212924 1212923         FALSE 0.259 0.000 0.000 NA   NA
 1212923 1212922         FALSE 0.191 -9.000 0.000 NA   NA
 1212922 1212921         FALSE 0.002 910.000 0.000 NA   NA
 1362539 1214373     pseudo   FALSE 0.147 55.000 0.000 NA   NA
 1214371 1309108       tRNA-Met FALSE 0.093 105.000 0.000 NA   NA
 1309108 1212920     tRNA-Met ansA FALSE 0.147 46.000 0.000 NA   NA
 1212920 1212919     ansA   TRUE 0.799 53.000 0.810 NA   NA
 1212919 1212918         FALSE 0.469 10.000 0.033 NA   NA
 1212918 1212917         FALSE 0.348 -10.000 0.021 NA   NA
 1212915 1212914         FALSE 0.307 30.000 0.037 NA   NA
 1212913 1212912       tpi FALSE 0.294 53.000 0.005 1.000   NA
 1212912 1212911     tpi folP FALSE 0.217 -16.000 0.039 1.000 N NA
 1212909 1212908     dapB   TRUE 0.503 1.000 0.027 NA   NA
 1212908 1212907       ubiH FALSE 0.447 26.000 0.200 NA   NA
 1212907 1214369     ubiH   TRUE 0.840 6.000 0.485 NA   NA
 1214369 1212906         FALSE 0.347 101.000 0.171 NA   NA
 1212906 1212905         TRUE 0.765 2.000 0.343 NA   NA
 1212905 1214368         TRUE 0.711 56.000 0.500 NA   NA
 1212904 1212903       mfd FALSE 0.216 61.000 0.006 NA   NA
 1212901 1212900     fmt pmbA FALSE 0.387 -3.000 0.018 NA   NA
 1212900 1212899     pmbA tldD TRUE 0.621 3.000 0.146 NA   NA
 1212899 1212898     tldD PNIL34,AT103 FALSE 0.312 37.000 0.034 NA   NA
 1212898 1212897     PNIL34,AT103   FALSE 0.427 85.000 0.181 NA   NA
 1212897 1212896         FALSE 0.131 79.000 0.000 NA   NA
 1212896 1212895       vacB FALSE 0.142 62.000 0.000 NA   NA
 1212895 1294430     vacB   TRUE 0.678 69.000 0.439 1.000   NA
 1294430 1294466         TRUE 0.771 85.000 0.065 0.059   NA
 1294466 1214367         FALSE 0.227 -3.000 0.000 NA   NA
 1212893 1212892         FALSE 0.342 20.000 0.018 1.000   NA
 1212892 1214713         TRUE 0.534 2.000 0.035 NA   NA
 1212890 1214366         FALSE 0.415 35.000 0.172 NA   NA
 1214365 1214364         FALSE 0.123 90.000 0.000 NA   NA
 1214363 1212888         TRUE 0.760 56.000 0.667 NA   NA
 1214362 1214361         TRUE 0.653 19.000 0.400 NA   NA
 1294468 1214360         FALSE 0.133 37.000 0.000 NA   NA
 1309107 1212886     tRNA-Met cspR FALSE 0.130 29.000 0.000 NA   NA
 1212886 1212885     cspR cobU FALSE 0.140 4.000 0.009 1.000 N NA
 1212885 1212884     cobU   FALSE 0.195 13.000 0.000 NA   NA
 1212882 1212881       metG FALSE 0.324 -7.000 0.013 NA   NA
 1212881 1212880     metG   FALSE 0.312 66.000 0.013 1.000   NA
 1212880 1212879       rpsR FALSE 0.378 43.000 0.027 1.000   NA
 1212879 1212878     rpsR rpmG TRUE 0.954 10.000 0.037 0.029 Y NA
 1212877 1212876     pheT   FALSE 0.148 103.000 0.005 NA   NA
 1212874 1212873     apa2   FALSE 0.337 57.000 0.035 NA   NA
 1212871 1212870     metH ilvE TRUE 0.767 22.000 0.036 1.000 Y NA
 1212868 1212867       hemG FALSE 0.465 14.000 0.037 1.000   NA
 1212867 1212866     hemG uvrC FALSE 0.018 103.000 0.002 1.000 N NA
 1212866 1212865     uvrC   FALSE 0.462 10.000 0.015 1.000   NA
 1212863 1212862     dacB, pbp   TRUE 0.642 8.000 0.195 NA   NA
 1212862 1212861         TRUE 0.734 0.000 0.324 NA   NA
 1212861 1212860       dapF FALSE 0.445 139.000 0.021 1.000 Y NA
 1212854 1212853         FALSE 0.305 37.000 0.045 NA   NA
 1212853 1212852         TRUE 0.678 37.000 0.488 NA   NA
 1212852 1212851         TRUE 0.968 -49.000 0.488 0.008 Y NA
 1212851 1309106       tRNA-Ser FALSE 0.011 230.000 0.000 NA   NA
 1212850 1212849       suhB FALSE 0.341 6.000 0.042 1.000 N NA
 1212849 1212848     suhB hisZ FALSE 0.181 23.000 0.032 1.000 N NA
 1212848 1212847     hisZ htpG FALSE 0.013 146.000 0.008 1.000 N NA
 1212847 1212846     htpG rpmB FALSE 0.109 40.000 0.019 1.000 N NA
 1212846 1212845     rpmB   FALSE 0.213 6.000 0.018 1.000 N NA
 1212845 1212844         TRUE 0.658 4.000 0.180 NA   NA
 1294456 1212843       psaK TRUE 0.572 78.000 0.357 NA   NA
 1212841 1212840     ilvA   FALSE 0.068 83.000 0.028 NA N NA
 1212840 1212839         FALSE 0.296 31.000 0.029 NA   NA
 1212837 1212836     pykF salY TRUE 0.718 -7.000 0.476 1.000 N NA
 1212836 1214357     salY   FALSE 0.476 14.000 0.140 NA   NA
 1214357 1214356       lspA TRUE 0.844 0.000 0.554 NA   NA
 1214356 1212835     lspA   TRUE 0.665 3.000 0.138 1.000   NA
 1212831 1212830     glnA   FALSE 0.076 110.000 0.022 1.000 N NA
 1212830 1212829         FALSE 0.406 21.000 0.137 NA   NA
 1212828 1212827     rsbW   FALSE 0.469 50.000 0.194 NA   NA
 1212826 1212825       psb28 FALSE 0.346 56.000 0.077 NA   NA
 1212825 1212824     psb28   TRUE 0.742 15.000 0.488 NA   NA
 1212823 1212822     secF secD TRUE 0.973 25.000 0.516 0.001 Y NA
 1212822 1212821     secD pdhB FALSE 0.396 4.000 0.091 1.000 N NA
 1212821 1214355     pdhB   FALSE 0.045 183.000 0.024 NA   NA
 1214355 1212820       ispE TRUE 0.689 23.000 0.488 NA   NA
 1212820 1212819     ispE ksgA FALSE 0.198 5.000 0.016 1.000 N NA
 1294401 1212818         FALSE 0.227 21.000 0.008 NA   NA
 1212818 1212817       umuD FALSE 0.297 72.000 0.011 1.000   NA
 1212817 1212816     umuD umuC TRUE 0.802 -3.000 0.625 1.000 N NA
 1212816 1212815     umuC   TRUE 0.687 9.000 0.267 NA   NA
 1212813 1212812         FALSE 0.426 23.000 0.113 1.000   NA
 1212812 1212811       ruvA FALSE 0.501 1.000 0.010 1.000   NA
 1212811 1212810     ruvA rpsO FALSE 0.124 33.000 0.021 1.000 N NA
 1212810 1212809     rpsO   FALSE 0.471 10.000 0.037 NA   NA
 1212808 1212807     dnaE gatA FALSE 0.100 79.000 0.019 1.000 N NA
 1212807 1212806     gatA   FALSE 0.271 34.000 0.022 NA   NA
 1212806 1212805         FALSE 0.080 152.000 0.031 NA   NA
 1212805 1212804         TRUE 0.897 13.000 0.150 0.007   NA
 1212804 1212803         FALSE 0.366 -3.000 0.013 NA   NA
 1212803 1212802       carA FALSE 0.006 325.000 0.000 NA   NA
 1212802 1212801     carA   TRUE 0.770 19.000 0.021 1.000 Y NA
 1212801 1212800         FALSE 0.233 26.000 0.014 NA   NA
 1212799 1212798         FALSE 0.109 23.000 0.019 1.000 N NA
 1212798 1309142       tRNA-Pro FALSE 0.131 28.000 0.000 NA   NA
 1212797 1212796     bacA   FALSE 0.005 344.000 0.000 NA   NA
 1212796 1212795         TRUE 0.683 33.000 0.500 NA   NA
 1212795 1212794         FALSE 0.004 389.000 0.000 NA   NA
 1212794 1214354         TRUE 0.567 0.000 0.050 1.000   NA
 1214354 1214353         TRUE 0.543 -7.000 0.126 1.000   NA
 1214351 1214712         FALSE 0.298 164.000 0.600 NA   NA
 1214712 1214711         TRUE 0.763 4.000 0.333 NA   NA
 1214710 1214350         TRUE 0.787 62.000 0.800 NA   NA
 1214350 1214349         FALSE 0.359 86.000 0.055 1.000   NA
 1214349 1214348         TRUE 0.870 1.000 0.648 NA   NA
 1214348 1214709         TRUE 0.527 -42.000 0.239 NA   NA
 1214708 1214347         TRUE 0.775 -24.000 0.625 NA   NA
 1214347 1214346         FALSE 0.003 477.000 0.000 NA   NA
 1294411 1214707         TRUE 0.847 10.000 0.667 NA   NA
 1214706 1214705         TRUE 0.682 31.000 0.500 NA   NA
 1214705 1214344         FALSE 0.011 225.000 0.000 NA   NA
 1214344 1214704         TRUE 0.759 77.000 0.750 NA   NA
 1214704 1214343         TRUE 0.775 2.000 0.357 NA   NA
 1214343 1214342         TRUE 0.822 -3.000 0.556 NA   NA
 1214342 1214341       rpsU FALSE 0.489 86.000 0.250 NA   NA
 1214339 1214701         FALSE 0.392 14.000 0.043 NA   NA
 1214336 1214700         TRUE 0.680 0.000 0.238 NA   NA
 1214700 1214699         TRUE 0.583 128.000 0.833 NA   NA
 1214699 1214335         TRUE 0.747 97.000 0.833 NA   NA
 1214334 1214333         FALSE 0.405 115.000 0.375 NA   NA
 1214332 1214696         FALSE 0.331 108.000 0.207 NA   NA
 1214696 1214695         TRUE 0.582 44.000 0.333 NA   NA
 1214695 1214331         FALSE 0.133 144.000 0.128 NA   NA
 1214331 1214694         FALSE 0.028 265.000 0.077 NA   NA
 1214694 1214330       pepN FALSE 0.239 72.000 0.015 NA   NA
 1214330 1214693     pepN   FALSE 0.004 402.000 0.000 NA   NA
 1214692 1214329       purT FALSE 0.241 103.000 0.038 NA   NA
 1214329 1214691     purT   FALSE 0.354 18.000 0.032 NA   NA
 1214327 1214326         TRUE 0.736 49.000 0.571 NA   NA
 1214325 1214690         FALSE 0.224 20.000 0.006 NA   NA
 1362540 1214324     pseudo   FALSE 0.145 59.000 0.000 NA   NA
 1214324 1362541       pseudo FALSE 0.090 106.000 0.000 NA   NA
 1214323 1214689         FALSE 0.410 58.000 0.140 NA   NA
 1214689 1214322         TRUE 0.748 40.000 0.667 NA   NA
 1214322 1214688         FALSE 0.136 24.000 0.000 NA   NA
 1214688 1214321         FALSE 0.012 213.000 0.000 NA   NA
 1214687 1214686         FALSE 0.414 151.000 0.800 NA   NA
 1214686 1214319         FALSE 0.003 573.000 0.000 NA   NA
 1214685 1214684         FALSE 0.006 320.000 0.000 NA   NA
 1214684 1214683         FALSE 0.340 122.000 0.333 NA   NA
 1214682 1214318         TRUE 0.682 79.000 0.500 NA   NA
 1214318 1214317         FALSE 0.026 450.000 0.300 NA   NA
 1294465 1214681         TRUE 0.705 94.000 0.667 NA   NA
 1214680 1294426         FALSE 0.006 324.000 0.000 NA   NA
 1214679 1294450         FALSE 0.128 87.000 0.000 NA   NA
 1294450 1214316         FALSE 0.227 194.000 0.667 NA   NA
 1214315 1214677         FALSE 0.002 647.000 0.000 NA   NA
 1214677 1214314         TRUE 0.773 9.000 0.400 NA   NA
 1214314 1214676         TRUE 0.818 69.000 1.000 NA   NA
 1214310 1214309     lraI   TRUE 0.503 82.000 0.214 1.000   NA
 1214309 1214308         TRUE 0.658 -12.000 0.357 NA   NA
 1214673 1294458         FALSE 0.061 119.000 0.000 NA   NA
 1214672 1294443         TRUE 0.854 -3.000 0.714 NA   NA
 1294443 1214306         FALSE 0.461 13.000 0.109 NA   NA
 1214302 1214301     dppB ddpA TRUE 0.951 -49.000 0.267 0.013 Y NA
 1214301 1214670     ddpA   FALSE 0.377 24.000 0.125 NA   NA
 1214670 1214300       thrA FALSE 0.378 63.000 0.119 NA   NA
 1214300 1214299     thrA   FALSE 0.426 36.000 0.180 NA   NA
 1214299 1214298         FALSE 0.211 38.000 0.008 NA   NA
 1214298 1214297       ruvC FALSE 0.153 10.000 0.016 1.000 N NA
 1214297 1214296     ruvC chlI FALSE 0.308 5.000 0.026 1.000 N NA
 1214296 1214295     chlI lasT FALSE 0.003 249.000 0.007 1.000 N NA
 1214293 1214292         FALSE 0.165 14.000 0.021 1.000 N NA
 1214292 1214291         TRUE 0.539 10.000 0.069 1.000   NA
 1214291 1214290       guaB FALSE 0.048 209.000 0.038 1.000   NA
 1214289 1214288         FALSE 0.089 26.000 0.017 1.000 N NA
 1214286 1214285     leuA   FALSE 0.208 85.000 0.008 NA   NA
 1214283 1214282     folD ispA TRUE 0.816 38.000 0.250 1.000 Y NA
 1214282 1214281     ispA   TRUE 0.537 15.000 0.214 NA   NA
 1214280 1214279     cobB   FALSE 0.250 -124.000 0.167 NA N NA
 1214279 1214278       zwf TRUE 0.944 8.000 0.583 NA Y NA
 1214278 1214277     zwf petH FALSE 0.262 112.000 0.117 1.000   NA
 1309126 1214275     tRNA-Glu   FALSE 0.142 42.000 0.000 NA   NA
 1214274 1214273         TRUE 0.796 70.000 0.850 NA   NA
 1214668 1214270         FALSE 0.008 781.000 0.073 1.000   NA
 1214269 1214268     cad cdsA FALSE 0.480 10.000 0.019 1.000   NA
 1214665 1214267       todF FALSE 0.197 -7.000 0.000 NA   NA
 1214267 1214266     todF gldA TRUE 0.746 6.000 0.250 1.000   NA
 1214266 1214265     gldA clpC FALSE 0.460 15.000 0.237 1.000 N NA
 1214265 1214264     clpC   FALSE 0.065 184.000 0.032 1.000   NA
 1214263 1214262     lysA   FALSE 0.305 28.000 0.040 NA   NA
 1214262 1214261       uppS FALSE 0.444 11.000 0.043 NA   NA
 1214261 1214260     uppS bioB FALSE 0.251 7.000 0.021 1.000 N NA
 1214260 1214259     bioB   FALSE 0.427 -3.000 0.024 NA   NA
 1214259 1214258         TRUE 0.538 4.000 0.034 NA   NA
 1214257 1214256       recR FALSE 0.260 3.000 0.021 1.000 N NA
 1214254 1214664         FALSE 0.468 11.000 0.083 NA   NA
 1214664 1214253       srmB FALSE 0.364 10.000 0.011 NA   NA
 1214253 1214252     srmB recD FALSE 0.453 138.000 0.017 0.096   NA
 1214252 1214251     recD recB TRUE 0.925 -3.000 0.120 0.002   NA
 1214251 1214663     recB   TRUE 0.513 13.000 0.096 1.000   NA
 1214663 1214250       recC TRUE 0.576 0.000 0.034 1.000   NA
 1214250 1214249     recC   FALSE 0.293 18.000 0.019 NA   NA
 1214249 1214248       pdxJ FALSE 0.430 12.000 0.046 NA   NA
 1214247 1214246         TRUE 0.715 53.000 0.459 1.000   NA
 1214246 1214245         TRUE 0.519 9.000 0.092 NA   NA
 1214245 1214244         TRUE 0.525 4.000 0.220 NA N NA
 1214662 1214241       crtH FALSE 0.347 24.000 0.096 NA   NA
 1214241 1214240     crtH gid FALSE 0.165 34.000 0.031 1.000 N NA
 1214240 1214661     gid psbY TRUE 0.523 7.000 0.018 1.000   NA
 1309127 1214659     tRNA-Lys   FALSE 0.128 87.000 0.000 NA   NA
 1214659 1214239         FALSE 0.035 148.000 0.000 NA   NA
 1214238 1214237         FALSE 0.020 173.000 0.000 NA   NA
 1214237 1214658         FALSE 0.031 151.000 0.000 NA   NA
 1309128 1214235     tRNA-Pro   FALSE 0.017 191.000 0.000 NA   NA
 1214234 1214233         FALSE 0.020 174.000 0.000 NA   NA
 1214233 1214232         FALSE 0.003 526.000 0.000 NA   NA
 1214231 1214230         FALSE 0.369 38.000 0.054 1.000   NA
 1214229 1214655         FALSE 0.141 63.000 0.000 NA   NA
 1214655 1214228         FALSE 0.227 -3.000 0.000 NA   NA
 1214228 1214654         FALSE 0.147 49.000 0.000 NA   NA
 1214654 1294455         FALSE 0.004 409.000 0.000 NA   NA
 1214653 1294453         FALSE 0.283 4.000 0.000 NA   NA
 1214227 1214226     glnQ   TRUE 0.912 11.000 0.382 1.000 Y NA
 1214226 1214225         TRUE 0.978 8.000 0.356 0.009 Y NA
 1214225 1214224         TRUE 0.962 20.000 0.424 0.012 Y NA
 1214223 1214222         FALSE 0.141 41.000 0.000 NA   NA
 1214222 1214651         FALSE 0.036 146.000 0.000 NA   NA
 1214650 1214647         FALSE 0.002 976.000 0.000 NA   NA
 1214221 1214646         FALSE 0.068 114.000 0.000 NA   NA
 1214646 1214220         FALSE 0.002 806.000 0.000 NA   NA
 1214220 1214219         FALSE 0.057 126.000 0.000 NA   NA
 1214218 1294447         FALSE 0.003 577.000 0.000 NA   NA
 1294447 1214645         FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 1294421 1214217         FALSE 0.281 3.000 0.000 NA   NA
 1214644 1214643         FALSE 0.003 558.000 0.000 NA   NA
 1214641 1214640         FALSE 0.259 0.000 0.000 NA   NA
 1214640 1214216       mntH FALSE 0.032 150.000 0.000 NA   NA
 1214216 1214639     mntH   FALSE 0.131 35.000 0.000 NA   NA
 1214638 1362543       pseudo FALSE 0.010 242.000 0.000 NA   NA
 1214634 1214632         FALSE 0.002 768.000 0.000 NA   NA
 1214632 1294438         FALSE 0.107 98.000 0.000 NA   NA
 1294438 1214631         FALSE 0.006 303.000 0.000 NA   NA
 1214214 1214213         TRUE 0.839 -3.000 0.647 NA   NA
 1214213 1214212         TRUE 0.887 -3.000 0.917 NA   NA
 1214212 1214211         TRUE 0.990 9.000 0.833 0.003 Y NA
 1214211 1214210       ctaE TRUE 0.989 4.000 0.625 0.003 Y NA
 1214210 1214209     ctaE   TRUE 0.905 47.000 0.714 0.044 N NA
 1294444 1214630         FALSE 0.020 173.000 0.000 NA   NA
 1214630 1214629         FALSE 0.145 21.000 0.000 NA   NA
 1214629 1214628         FALSE 0.005 336.000 0.000 NA   NA
 1214207 1214206         FALSE 0.002 980.000 0.000 NA   NA
 1214206 1214625         FALSE 0.002 648.000 0.000 NA   NA
 1214625 1214205         TRUE 0.824 15.000 0.800 NA   NA
 1214204 1214203         FALSE 0.003 456.000 0.000 NA   NA
 1214203 1214202         FALSE 0.015 200.000 0.000 NA   NA
 1214202 1214624         FALSE 0.274 1.000 0.000 NA   NA
 1214624 1214201         FALSE 0.031 151.000 0.000 NA   NA
 1214200 1214622         FALSE 0.002 750.000 0.000 NA   NA
 1214622 1294409         FALSE 0.455 105.000 0.333 NA   NA
 1294409 1214621         TRUE 0.783 8.000 0.400 NA   NA
 1214199 1214198         FALSE 0.006 321.000 0.000 NA   NA
 1294403 1294412         TRUE 0.783 81.000 0.833 NA   NA
 1214197 1214196         FALSE 0.008 286.000 0.000 NA   NA
 1214618 1214617         TRUE 0.829 58.000 1.000 NA   NA
 1214617 1214616         FALSE 0.146 58.000 0.000 NA   NA
 1214616 1214615         FALSE 0.145 44.000 0.000 NA   NA
 1214195 1214194         FALSE 0.050 133.000 0.000 NA   NA
 1214194 1214193         FALSE 0.035 147.000 0.000 NA   NA
 1214193 1214192         FALSE 0.147 45.000 0.000 NA   NA
 1214192 1214191         TRUE 0.839 0.000 0.000 1.000 Y NA
 1214189 1214188     acrA polA FALSE 0.158 -3.000 0.017 1.000 N NA
 1214188 1214187     polA cysS FALSE 0.082 24.000 0.014 1.000 N NA
 1214187 1214186     cysS dxr FALSE 0.042 83.000 0.007 1.000 N NA
 1214186 1214185     dxr   FALSE 0.034 12.000 0.000 1.000 N NA
 1214185 1214614         FALSE 0.106 99.000 0.000 NA   NA
 1214184 1214183       pntB TRUE 0.728 12.000 0.354 1.000   NA
 1214183 1214182     pntB pntA-2 TRUE 0.922 10.000 0.072 0.002   NA
 1214182 1214181     pntA-2 pntA TRUE 0.962 16.000 0.829 0.002   NA
 1214180 1214179         FALSE 0.093 155.000 0.105 NA   NA
 1214179 1214178         FALSE 0.208 59.000 0.003 NA   NA
 1214177 1214176     infA   FALSE 0.160 105.000 0.011 NA   NA
 1214176 1214175         TRUE 0.634 54.000 0.392 NA   NA
 1214175 1214174         TRUE 0.661 59.000 0.392 1.000   NA
 1214173 1214172       ilvN TRUE 0.535 4.000 0.065 NA   NA
 1214613 1214171         FALSE 0.420 27.000 0.122 1.000   NA
 1214170 1214169     psbD psbC TRUE 0.963 -16.000 0.878 0.003   NA
 1214167 1214166     cobQ   TRUE 0.512 -3.000 0.026 1.000   NA
 1214165 1214612         FALSE 0.141 63.000 0.000 NA   NA
 1214612 1309125       tRNA-Ser FALSE 0.003 482.000 0.000 NA   NA
 1309125 1214164     tRNA-Ser afuA FALSE 0.148 53.000 0.000 NA   NA
 1214163 1214162     piuC   TRUE 0.545 78.000 0.326 NA   NA
 1214161 1214160       glyQ FALSE 0.115 136.000 0.013 1.000   NA
 1214160 1294462     glyQ   FALSE 0.125 88.000 0.000 NA   NA
 1294462 1214159         FALSE 0.173 15.000 0.000 NA   NA
 1214159 1214611         FALSE 0.102 101.000 0.000 NA   NA
 1214158 1214157         FALSE 0.293 91.000 0.072 NA   NA
 1214156 1214155         TRUE 0.722 86.000 0.625 NA   NA
 1214155 1214154       isiB FALSE 0.361 144.000 0.455 1.000   NA
 1214153 1214610         TRUE 0.596 0.000 0.147 NA   NA
 1214610 1214152         TRUE 0.524 92.000 0.333 NA   NA
 1214152 1214151         FALSE 0.051 199.000 0.105 NA   NA
 1214151 1214150         FALSE 0.330 113.000 0.263 NA   NA
 1214149 1214148         TRUE 0.935 0.000 0.432 1.000 Y NA
 1214148 1214147         TRUE 0.525 30.000 0.243 1.000   NA
 1214146 1214145     sppA aroH TRUE 0.548 8.000 0.207 1.000 N NA
 1214145 1214144     aroH   FALSE 0.367 67.000 0.114 NA   NA
 1214144 1214143       rpl34, rpmH FALSE 0.290 32.000 0.027 NA   NA
 1214143 1214142     rpl34, rpmH rnpA TRUE 0.837 15.000 0.787 1.000   NA
 1214142 1214141     rnpA   FALSE 0.417 -7.000 0.041 NA   NA
 1214141 1214140       yidC FALSE 0.308 73.000 0.043 NA   NA
 1214140 1214139     yidC   FALSE 0.077 22.000 0.012 1.000 N NA
 1214139 1214138       serS FALSE 0.432 127.000 0.011 0.091 N NA
 1214138 1214137     serS   FALSE 0.239 10.000 0.024 1.000 N NA
 1214137 1214136       rpsN FALSE 0.109 80.000 0.020 1.000 N NA
 1214136 1214135     rpsN   FALSE 0.227 193.000 0.019 1.000 Y NA
 1214133 1214609         FALSE 0.191 29.000 0.004 NA   NA
 1309129 1214131     tRNA-Arg gmd FALSE 0.002 970.000 0.000 NA   NA
 1214131 1214130     gmd   TRUE 0.952 17.000 0.169 0.005 Y NA
 1214130 1214129       manC FALSE 0.111 277.000 0.000 1.000 Y NA
 1214129 1214128     manC   TRUE 0.845 13.000 0.136 1.000 Y NA
 1214127 1214608       rfe TRUE 0.799 16.000 0.034 1.000 Y NA
 1214608 1214607     rfe   FALSE 0.478 3.000 0.020 NA   NA
 1214607 1214606         FALSE 0.227 -3.000 0.000 NA   NA
 1214606 1214126         FALSE 0.168 -16.000 0.000 NA   NA
 1214126 1214125         FALSE 0.385 66.000 0.033 1.000   NA
 1214125 1214605         FALSE 0.227 -3.000 0.000 NA   NA
 1214605 1214124         FALSE 0.191 -9.000 0.000 NA   NA
 1214124 1214123         TRUE 0.948 -3.000 0.000 0.021 Y NA
 1214123 1214122         TRUE 0.948 -3.000 0.000 0.021 Y NA
 1214122 1214121         TRUE 0.904 84.000 0.000 0.021 Y NA
 1214121 1214604         TRUE 0.812 9.000 0.000 NA Y NA
 1214118 1214603         TRUE 0.813 3.000 0.500 1.000 N NA
 1214603 1214117         FALSE 0.001 267.000 0.000 1.000 N NA
 1214117 1214116         TRUE 0.692 21.000 0.000 NA Y NA
 1214116 1214602         FALSE 0.110 97.000 0.000 NA   NA
 1214602 1214115         FALSE 0.268 7.000 0.000 NA   NA
 1214601 1214114         TRUE 0.789 42.000 0.050 0.051   NA
 1214599 1214598         FALSE 0.144 60.000 0.000 NA   NA
 1214598 1214597         FALSE 0.155 -40.000 0.000 NA   NA
 1214597 1214596         FALSE 0.164 -25.000 0.000 NA   NA
 1214596 1214113         FALSE 0.130 29.000 0.000 NA   NA
 1214112 1214111         TRUE 0.839 -3.000 0.018 1.000 Y NA
 1214110 1214109         TRUE 0.619 6.000 0.091 1.000   NA
 1214109 1214108         FALSE 0.145 212.000 0.000 NA Y NA
 1214108 1214595         TRUE 0.552 6.000 0.085 NA   NA
 1214595 1214107         TRUE 0.706 -3.000 0.333 NA   NA
 1214107 1214106         TRUE 0.581 1.000 0.118 NA   NA
 1214106 1214105         FALSE 0.128 281.000 0.000 0.039   NA
 1214105 1214104         FALSE 0.145 44.000 0.000 NA   NA
 1214104 1214594         FALSE 0.015 200.000 0.000 NA   NA
 1214102 1214101     rfbC   TRUE 0.815 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1214101 1214100         TRUE 0.951 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 1214099 1309124       tRNA-Ala FALSE 0.102 101.000 0.000 NA   NA
 1294436 1214593         FALSE 0.145 59.000 0.000 NA   NA
 1214098 1214097         TRUE 0.742 136.000 0.000 0.021 Y NA
 1214097 1294425         FALSE 0.003 481.000 0.000 NA   NA
 1214094 1214093     lexA argF FALSE 0.118 43.000 0.020 1.000 N NA
 1214093 1214092     argF   FALSE 0.129 29.000 0.022 1.000 N NA
 1214092 1214091         TRUE 0.710 94.000 0.010 0.012 N NA
 1214091 1214090         FALSE 0.317 17.000 0.021 NA   NA
 1214090 1214591         TRUE 0.640 -25.000 0.360 NA   NA
 1214088 1214087       pheS FALSE 0.071 71.000 0.011 1.000 N NA
 1214084 1214083     ribF thiE TRUE 0.839 10.000 0.012 1.000 Y NA
 1214083 1214082     thiE thiS TRUE 0.897 -16.000 0.452 1.000 Y NA
 1214082 1214590     thiS   FALSE 0.262 107.000 0.119 NA   NA
 1214590 1214589         TRUE 0.717 70.000 0.571 NA   NA
 1214081 1214080         FALSE 0.466 -3.000 0.070 NA   NA
 1214080 1214079       trmD FALSE 0.355 -3.000 0.011 NA   NA
 1214079 1214078     trmD era TRUE 0.897 1.000 0.010 0.023   NA
 1214076 1214075       phoH FALSE 0.283 74.000 0.024 NA   NA
 1214075 1214074     phoH rpsP FALSE 0.105 35.000 0.019 1.000 N NA
 1214074 1214073     rpsP ffh TRUE 0.536 56.000 0.361 1.000 N NA
 1214073 1214072     ffh   FALSE 0.332 51.000 0.016 1.000   NA
 1214070 1214069         FALSE 0.007 144.000 0.021 NA N NA
 1214066 1214065         FALSE 0.398 75.000 0.096 1.000   NA
 1214065 1214588         FALSE 0.452 82.000 0.154 1.000   NA
 1214064 1214063       trpC FALSE 0.298 60.000 0.023 NA   NA
 1214063 1214062     trpC lpd FALSE 0.264 11.000 0.057 1.000 N NA
 1214062 1214061     lpd   FALSE 0.367 -3.000 0.115 1.000 N NA
 1214060 1309130     murA tRNA-Leu FALSE 0.003 525.000 0.000 NA   NA
 1309130 1214059     tRNA-Leu argD FALSE 0.148 -72.000 0.000 NA   NA
 1214059 1214058     argD folC FALSE 0.428 13.000 0.181 1.000 N NA
 1214057 1214056       codA FALSE 0.398 38.000 0.246 1.000 N NA
 1309131 1214055     tRNA-His   FALSE 0.133 74.000 0.000 NA   NA
 1214055 1214054       ddlA FALSE 0.201 10.000 0.020 1.000 N NA
 1214054 1214053     ddlA   FALSE 0.429 12.000 0.046 NA   NA
 1214053 1214052       ftsQ FALSE 0.298 30.000 0.051 NA   NA
 1214052 1214051     ftsQ ftsZ FALSE 0.019 178.000 0.000 NA   NA
 1214048 1214047         FALSE 0.341 41.000 0.084 NA   NA
 1214047 1214046         TRUE 0.974 34.000 0.745 0.004 Y NA
 1214046 1214045       ilvC FALSE 0.048 116.000 0.019 1.000 N NA
 1214045 1214044     ilvC cbiB TRUE 0.794 -12.000 0.017 1.000 Y NA
 1214044 1214043     cbiB   FALSE 0.364 56.000 0.021 1.000   NA
 1214043 1362544       pseudo FALSE 0.158 18.000 0.000 NA   NA
 1214042 1214587         TRUE 0.723 62.000 0.556 NA   NA
 1214587 1214586         TRUE 0.831 55.000 1.000 NA   NA
 1214586 1214041       himA FALSE 0.394 97.000 0.200 NA   NA
 1214039 1214038     melB   TRUE 0.839 10.000 0.833 NA N NA
 1214038 1214037         TRUE 0.828 5.000 0.452 NA   NA
 1214037 1214036         TRUE 0.762 29.000 0.762 NA   NA
 1214036 1214035         TRUE 0.783 6.000 0.369 NA   NA
 1214034 1214033     pyrF tyrS FALSE 0.304 7.000 0.027 1.000 N NA
 1214033 1214032     tyrS   FALSE 0.391 22.000 0.034 1.000   NA
 1214031 1214030       pepB FALSE 0.482 24.000 0.176 1.000   NA
 1214029 1214028       lpxB FALSE 0.213 17.000 0.034 1.000 N NA
 1214028 1214027     lpxB lpxA TRUE 0.852 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 1214027 1214026     lpxA fabZ FALSE 0.359 5.000 0.071 1.000 N NA
 1214026 1214025     fabZ lpxC FALSE 0.220 19.000 0.083 1.000 N NA
 1214025 1214024     lpxC   TRUE 0.880 1.000 0.052 1.000 Y NA
 1214024 1214023       purC FALSE 0.179 43.000 0.058 1.000 N NA
 1214022 1214021     purD nblS TRUE 0.845 1.000 0.025 0.089 N NA
 1214020 1214019     kaiC kaiB TRUE 0.834 62.000 0.927 1.000   NA
 1214018 1214017     rplU rpmA TRUE 0.982 10.000 0.667 0.025 Y NA
 1214013 1214012     elaC   FALSE 0.241 60.000 0.011 NA   NA
 1214011 1214010         TRUE 0.683 82.000 0.500 NA   NA
 1214010 1214009       prmA FALSE 0.044 144.000 0.027 1.000 N NA
 1214009 1214008     prmA serA FALSE 0.200 17.000 0.053 1.000 N NA
 1214007 1214006         TRUE 0.816 1.000 0.442 NA   NA
 1214006 1309132       tRNA-Val FALSE 0.147 56.000 0.000 NA   NA
 1309132 1214005     tRNA-Val   FALSE 0.139 66.000 0.000 NA   NA
 1214005 1214004         FALSE 0.436 -13.000 0.028 1.000   NA
 1214004 1214583         FALSE 0.293 77.000 0.028 NA   NA
 1214003 1214002         FALSE 0.094 159.000 0.043 1.000   NA
 1214001 1214000         FALSE 0.049 172.000 0.003 1.000   NA
 1214582 1294464         TRUE 0.642 46.000 0.400 NA   NA
 1294464 1214581         FALSE 0.131 79.000 0.000 NA   NA
 1214581 1294445         FALSE 0.160 -27.000 0.000 NA   NA
 1213999 1213998     murD   FALSE 0.197 90.000 0.008 NA   NA
 1213997 1214580         TRUE 0.563 97.000 0.400 NA   NA
 1214580 1214579         FALSE 0.270 50.000 0.018 NA   NA
 1214579 1213996         FALSE 0.456 -3.000 0.045 NA   NA
 1213996 1213995         FALSE 0.275 95.000 0.068 NA   NA
 1213995 1213994         FALSE 0.188 97.000 0.011 NA   NA
 1213992 1214573         TRUE 0.582 44.000 0.333 NA   NA
 1214573 1214572         FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 1214572 1213991         FALSE 0.471 85.000 0.227 NA   NA
 1214571 1213990         FALSE 0.373 130.000 0.400 NA   NA
 1214570 1213989         FALSE 0.197 149.000 0.286 NA   NA
 1213989 1213988         FALSE 0.141 178.000 0.286 1.000   NA
 1213988 1213987         FALSE 0.161 111.000 0.143 1.000 N NA
 1214569 1214568         FALSE 0.014 204.000 0.000 NA   NA
 1214568 1214567         TRUE 0.799 -7.000 0.571 NA   NA
 1214567 1362545       pseudo FALSE 0.130 86.000 0.000 NA   NA
 1213985 1213984         FALSE 0.279 30.000 0.024 NA   NA
 1213984 1213983         FALSE 0.003 464.000 0.000 NA   NA
 1213983 1213982         FALSE 0.064 117.000 0.000 NA   NA
 1213981 1362546       pseudo FALSE 0.132 84.000 0.000 NA   NA
 1213980 1213979         FALSE 0.259 0.000 0.000 NA   NA
 1213979 1214561         FALSE 0.007 295.000 0.000 NA   NA
 1214561 1214560         FALSE 0.002 676.000 0.000 NA   NA
 1214560 1214559         FALSE 0.124 89.000 0.000 NA   NA
 1214559 1294463         FALSE 0.008 282.000 0.000 NA   NA
 1213978 1213977         FALSE 0.003 876.000 0.000 1.000   NA
 1213977 1214558         FALSE 0.136 24.000 0.000 NA   NA
 1213976 1214557         FALSE 0.274 1.000 0.000 NA   NA
 1214557 1213975         FALSE 0.004 416.000 0.000 NA   NA
 1214556 1214555         FALSE 0.013 206.000 0.000 NA   NA
 1214555 1214554         FALSE 0.002 695.000 0.000 NA   NA
 1214554 1213972         FALSE 0.257 8.000 0.000 NA   NA
 1213972 1213971         FALSE 0.009 260.000 0.000 NA   NA
 1213971 1213970         FALSE 0.009 265.000 0.000 NA   NA
 1213969 1213968         TRUE 0.833 0.000 0.500 NA   NA
 1214551 1213967         FALSE 0.144 60.000 0.000 NA   NA
 1213967 1214550         TRUE 0.776 22.000 0.750 NA   NA
 1214550 1294406         TRUE 0.807 -3.000 0.500 NA   NA
 1294451 1213966         FALSE 0.386 15.000 0.071 NA   NA
 1214549 1214548         FALSE 0.336 159.000 0.667 NA   NA
 1214548 1214547         FALSE 0.002 881.000 0.000 NA   NA
 1214547 1294414         FALSE 0.147 49.000 0.000 NA   NA
 1294414 1214546         FALSE 0.259 0.000 0.000 NA   NA
 1214546 1213965         FALSE 0.002 1059.000 0.000 NA   NA
 1213965 1214543         FALSE 0.023 166.000 0.000 NA   NA
 1214543 1214542         FALSE 0.008 283.000 0.000 NA   NA
 1214542 1214541         FALSE 0.052 132.000 0.000 NA   NA
 1213960 1213959         FALSE 0.006 315.000 0.000 NA   NA
 1213959 1213958       rpoZ TRUE 0.902 3.000 0.024 0.030   NA
 1214539 1213955       gpmI FALSE 0.228 -27.000 0.003 NA   NA
 1213955 1213954     gpmI secG FALSE 0.370 26.000 0.041 1.000   NA
 1213953 1213952     groEL groES TRUE 0.979 52.000 0.905 0.010 Y NA
 1213951 1213950     atpD atpC TRUE 0.979 49.000 0.837 0.005 Y NA
 1213949 1214538         FALSE 0.278 108.000 0.146 NA   NA
 1214538 1213948       pepP FALSE 0.338 56.000 0.037 NA   NA
 1213947 1213946         TRUE 0.528 3.000 0.046 NA   NA
 1213946 1213945       nadD FALSE 0.418 -3.000 0.006 1.000   NA
 1213945 1213944     nadD nadE TRUE 0.971 5.000 0.023 0.005 Y NA
 1213943 1214537         FALSE 0.461 14.000 0.125 NA   NA
 1214537 1214536         FALSE 0.227 -3.000 0.000 NA   NA
 1214536 1213942         FALSE 0.173 15.000 0.000 NA   NA
 1213942 1213941       atpA TRUE 0.979 21.000 0.846 0.005 Y NA
 1213941 1213940     atpA atpH TRUE 0.977 32.000 0.864 0.005 Y NA
 1213940 1213939     atpH   TRUE 0.971 0.000 0.132 0.005 Y NA
 1213939 1213938         TRUE 0.983 -3.000 0.569 0.005 Y NA
 1213938 1213937       atpE TRUE 0.957 70.000 0.368 0.005 Y NA
 1213937 1213936     atpE atpB TRUE 0.855 163.000 0.679 0.005 Y NA
 1213936 1213935     atpB   FALSE 0.069 205.000 0.151 1.000   NA
 1213934 1213933       ccdA FALSE 0.343 84.000 0.202 1.000 N NA
 1213933 1213932     ccdA resB TRUE 0.925 1.000 0.371 NA Y NA
 1213930 1213929       glnB TRUE 0.747 25.000 0.682 NA   NA
 1294415 1213927       purB FALSE 0.144 60.000 0.000 NA   NA
 1213927 1213926     purB fumC FALSE 0.076 49.000 0.011 1.000 N NA
 1213924 1214535     bioF   FALSE 0.453 -3.000 0.053 NA   NA
 1214535 1213923         TRUE 0.504 -10.000 0.163 NA   NA
 1213923 1213922       bioD TRUE 0.851 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 1213922 1213921     bioD bioA TRUE 0.974 0.000 0.124 0.002 Y NA
 1213920 1213919         TRUE 0.795 18.000 0.744 NA   NA
 1213917 1213916       fer TRUE 0.682 6.000 0.163 1.000   NA
 1213916 1213915     fer   TRUE 0.859 4.000 0.550 NA   NA
 1213915 1213914         TRUE 0.857 -13.000 1.000 NA   NA
 1213914 1213913         FALSE 0.242 118.000 0.175 NA   NA
 1213913 1213912         FALSE 0.021 215.000 0.000 1.000   NA
 1213912 1213911       hli3 FALSE 0.271 31.000 0.022 NA   NA
 1213911 1213910     hli3 rpoC2 TRUE 0.698 48.000 0.476 NA   NA
 1213910 1213909     rpoC2 rpoC1 TRUE 0.941 39.000 0.031 0.002 Y NA
 1213909 1213908     rpoC1 rpoB TRUE 0.980 39.000 0.851 0.002 Y NA
 1213908 1213907     rpoB tatD FALSE 0.001 240.000 0.012 NA N NA
 1213907 1213906     tatD rpsT FALSE 0.153 11.000 0.034 NA N NA
 1213904 1213903     rpiA   FALSE 0.171 67.000 0.030 1.000 N NA
 1213902 1213901       nusA TRUE 0.768 38.000 0.759 NA   NA
 1213901 1294473     nusA   TRUE 0.559 66.000 0.323 NA   NA
 1294473 1213900       infB FALSE 0.420 72.000 0.171 NA   NA
 1309133 1213898     tRNA-Thr   FALSE 0.132 27.000 0.000 NA   NA
 1213898 1213897         TRUE 0.772 38.000 0.172 NA Y NA
 1213897 1213896         FALSE 0.096 105.000 0.100 NA N NA
 1213895 1213894         FALSE 0.360 39.000 0.110 NA   NA
 1213893 1213892     rne rnhB TRUE 0.759 -55.000 0.011 0.022 N NA
 1213889 1213888         TRUE 0.586 1.000 0.047 1.000   NA
 1213888 1213887       rpsJ FALSE 0.376 58.000 0.025 1.000   NA
 1213887 1213886     rpsJ tufA TRUE 0.738 109.000 0.318 1.000 Y NA
 1213886 1213885     tufA fusA TRUE 0.968 44.000 0.400 0.002 Y NA
 1213885 1213884     fusA rpsG TRUE 0.850 104.000 0.579 1.000 Y NA
 1213884 1213883     rpsG rpsL TRUE 0.971 27.000 0.620 0.004 Y NA
 1213882 1213881     gltB   TRUE 0.548 1.000 0.086 NA   NA
 1213879 1214532         TRUE 0.779 -16.000 0.625 NA   NA
 1213875 1213874       psaB FALSE 0.276 106.000 0.039 1.000   NA
 1213874 1213873     psaB psaA TRUE 0.927 29.000 0.513 0.003   NA
 1213872 1213871     cobJ   FALSE 0.286 104.000 0.062 1.000   NA
 1213871 1214530         FALSE 0.007 302.000 0.000 NA   NA
 1213870 1213869         FALSE 0.346 -27.000 0.029 NA   NA
 1213869 1309122       tRNA-Ser FALSE 0.007 295.000 0.000 NA   NA
 1309122 1213868     tRNA-Ser alr FALSE 0.142 62.000 0.000 NA   NA
 1213866 1213865     prfA rpmE TRUE 0.763 35.000 0.110 1.000 Y NA
 1213865 1213864     rpmE rpsI TRUE 0.946 13.000 0.062 0.023 Y NA
 1213864 1213863     rpsI rplM TRUE 0.981 10.000 0.601 0.023 Y NA
 1213863 1213862     rplM truA TRUE 0.562 119.000 0.058 1.000 Y NA
 1213862 1213861     truA rplQ TRUE 0.785 46.000 0.102 1.000 Y NA
 1213861 1213860     rplQ rpoA TRUE 0.816 15.000 0.873 1.000 N NA
 1213860 1213859     rpoA rpsK FALSE 0.480 49.000 0.308 1.000 N NA
 1213859 1213858     rpsK rpsM TRUE 0.974 47.000 0.810 0.023 Y NA
 1213858 1213857     rpsM rpmJ TRUE 0.928 46.000 0.086 0.023 Y NA
 1213857 1213856     rpmJ adk FALSE 0.086 45.000 0.013 1.000 N NA
 1213856 1213855     adk secY FALSE 0.212 0.000 0.019 1.000 N NA
 1213855 1213854     secY rplO TRUE 0.714 32.000 0.730 1.000 N NA
 1213854 1213853     rplO rpsE TRUE 0.968 5.000 0.148 0.030 Y NA
 1213853 1213852     rpsE rplR TRUE 0.976 16.000 0.814 0.030 Y NA
 1213852 1213851     rplR rplF TRUE 0.979 15.000 0.815 0.023 Y NA
 1213851 1213850     rplF rpsH TRUE 0.981 13.000 0.808 0.023 Y NA
 1213850 1213849     rpsH rplE TRUE 0.952 11.000 0.059 0.023 Y NA
 1213849 1213848     rplE rplX TRUE 0.969 76.000 0.758 0.023 Y NA
 1213848 1213847     rplX rplN TRUE 0.987 1.000 0.810 0.030 Y NA
 1213847 1213846     rplN rpsQ TRUE 0.983 -3.000 0.791 0.030 Y NA
 1213846 1214529     rpsQ rpmC TRUE 0.986 9.000 0.828 0.023 Y NA
 1214529 1213845     rpmC rplP TRUE 0.984 -3.000 0.802 0.023 Y NA
 1213845 1213844     rplP rpsC TRUE 0.982 12.000 0.828 0.030 Y NA
 1213844 1213843     rpsC rplV TRUE 0.985 0.000 0.719 0.030 Y NA
 1213843 1213842     rplV rpsS TRUE 0.987 1.000 0.769 0.030 Y NA
 1213842 1213841     rpsS rplB TRUE 0.970 39.000 0.820 0.030 Y NA
 1213841 1213840     rplB rplW TRUE 0.983 13.000 0.849 0.022 Y NA
 1213840 1213839     rplW rplD TRUE 0.979 -3.000 0.513 0.023 Y NA
 1213839 1213838     rplD rplC TRUE 0.972 -3.000 0.361 0.023 Y NA
 1213837 1213836       hycB TRUE 0.762 45.000 0.595 1.000   NA
 1213836 1309134     hycB tRNA-Gln FALSE 0.084 108.000 0.000 NA   NA
 1309134 1213835     tRNA-Gln   FALSE 0.163 17.000 0.000 NA   NA
 1213835 1213834       recA FALSE 0.158 110.000 0.019 NA   NA
 1213833 1213832         FALSE 0.274 1.000 0.000 NA   NA
 1213832 1213831         TRUE 0.807 34.000 0.000 0.004   NA
 1213831 1213830         FALSE 0.259 0.000 0.000 NA   NA
 1213830 1213829         FALSE 0.191 -9.000 0.000 NA   NA
 1213829 1213828         FALSE 0.002 803.000 0.000 NA   NA
 1213828 1213827       dinG FALSE 0.312 28.000 0.072 NA   NA
 1213819 1213818     speD recF FALSE 0.149 42.000 0.024 1.000 N NA
 1213817 1213816       ppc TRUE 0.849 4.000 0.500 NA   NA
 1213816 1213815     ppc   TRUE 0.713 54.000 0.457 1.000   NA
 1213815 1213814         TRUE 0.586 1.000 0.059 1.000   NA
 1213814 1213813       psaD FALSE 0.417 60.000 0.091 1.000   NA
 1213813 1213812     psaD   FALSE 0.473 111.000 0.381 1.000   NA
 1213812 1213811         TRUE 0.504 -3.000 0.024 1.000   NA
 1213811 1213810       mrp TRUE 0.879 7.000 0.041 1.000 Y NA
 1213806 1213805         TRUE 0.736 36.000 0.667 NA   NA
 1294404 1213804         TRUE 0.612 -13.000 0.308 NA   NA
 1213804 1213803       purM FALSE 0.095 135.000 0.018 NA   NA
 1213801 1213800     wzb pebB FALSE 0.389 14.000 0.015 1.000   NA
 1213800 1213799     pebB pebA TRUE 0.979 1.000 0.808 0.002   NA
 1213799 1213798     pebA ho1 TRUE 0.802 6.000 0.360 1.000   NA
 1213798 1213797     ho1   TRUE 0.819 58.000 0.900 NA   NA
 1213795 1213794       galM FALSE 0.449 13.000 0.096 NA   NA
 1213794 1213793     galM   TRUE 0.746 10.000 0.339 1.000   NA
 1213793 1213792       kefB FALSE 0.502 44.000 0.179 1.000   NA
 1213790 1213789         TRUE 0.806 32.000 0.950 NA   NA
 1213789 1309121       tRNA-Arg FALSE 0.131 80.000 0.000 NA   NA
 1309394 1213788     rnpB rnc FALSE 0.135 38.000 0.000 NA   NA
 1213786 1213785     glmS psaC FALSE 0.365 82.000 0.031 1.000   NA
 1213784 1213783     acpP fabF TRUE 0.925 7.000 0.346 1.000 Y NA
 1213783 1213782     fabF tktA FALSE 0.182 43.000 0.062 1.000 N NA
 1213781 1214525     thiC   FALSE 0.149 -64.000 0.000 NA   NA
 1214525 1214524         FALSE 0.121 91.000 0.000 NA   NA
 1214524 1213780         TRUE 0.625 19.000 0.365 NA   NA
 1213780 1213779         TRUE 0.808 4.000 0.365 1.000   NA
 1213779 1213778       ruvB FALSE 0.395 -13.000 0.019 1.000   NA
 1213776 1213775       lysS FALSE 0.286 28.000 0.026 NA   NA
 1213775 1213774     lysS   FALSE 0.173 51.000 0.027 1.000 N NA
 1213774 1213773         FALSE 0.133 171.000 0.273 NA   NA
 1213773 1213772       mreC FALSE 0.280 82.000 0.024 NA   NA
 1213772 1213771     mreC mreB TRUE 0.600 5.000 0.043 1.000   NA
 1213769 1213768     dedA sam1 TRUE 0.578 3.000 0.024 1.000   NA
 1213764 1213763       mgtE FALSE 0.206 101.000 0.135 1.000 N NA
 1213763 1214522     mgtE   FALSE 0.456 43.000 0.135 1.000   NA
 1214522 1294420         TRUE 0.910 -3.000 0.278 0.047   NA
 1294420 1214521         TRUE 0.619 124.000 0.900 NA   NA
 1214521 1213762       gyrB FALSE 0.401 -3.000 0.020 NA   NA
 1213761 1213760     miaA infC TRUE 0.758 55.000 0.020 1.000 Y NA
 1213760 1213759     infC   FALSE 0.045 86.000 0.008 1.000 N NA
 1213759 1213758       cysE TRUE 0.786 3.000 0.452 1.000 N NA
 1213755 1213754         FALSE 0.134 73.000 0.000 NA   NA
 1213754 1213753       galE FALSE 0.102 101.000 0.000 NA   NA
 1213753 1309120     galE tRNA-Gly FALSE 0.131 33.000 0.000 NA   NA
 1309120 1213752     tRNA-Gly ribH FALSE 0.141 63.000 0.000 NA   NA
 1213752 1214519     ribH   FALSE 0.402 49.000 0.037 1.000   NA
 1213749 1213748     holA lysC FALSE 0.086 40.000 0.015 1.000 N NA
 1213747 1213746     uvrB   FALSE 0.282 28.000 0.009 1.000   NA
 1213744 1213743       dapA TRUE 0.741 77.000 0.605 1.000   NA
 1213743 1213742     dapA asd TRUE 0.852 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 1213741 1213740     tig   TRUE 0.684 101.000 0.025 1.000 Y NA
 1213740 1213739       clpX TRUE 0.687 102.000 0.037 1.000 Y NA
 1213739 1213738     clpX dnaX TRUE 0.691 56.000 0.008 0.082 N NA
 1213737 1213736         FALSE 0.292 29.000 0.164 1.000 N NA
 1213735 1213734     rpmI rplT TRUE 0.974 31.000 0.928 0.023 Y NA
 1213734 1213733     rplT   FALSE 0.280 41.000 0.003 1.000   NA
 1213733 1213732       thiG FALSE 0.485 3.000 0.005 1.000   NA
 1213732 1213731     thiG sqdB FALSE 0.270 171.000 0.009 0.023 N NA
 1213731 1213730     sqdB   TRUE 0.792 29.000 0.194 1.000 Y NA
 1213729 1213728       gcvP FALSE 0.122 132.000 0.024 NA   NA
 1213728 1213727     gcvP gcvH TRUE 0.960 47.000 0.249 0.001 Y NA
 1213727 1213726     gcvH   FALSE 0.300 9.000 0.060 1.000 N NA
 1213726 1213725         FALSE 0.401 -10.000 0.037 NA   NA
 1213724 1213723     ole1 rplI FALSE 0.037 21.000 0.005 1.000 N NA
 1213723 1213722     rplI dnaB FALSE 0.180 59.000 0.048 1.000 N NA
 1213722 1213721     dnaB gidA FALSE 0.111 13.000 0.012 1.000 N NA
 1213721 1213720     gidA ubiC FALSE 0.046 7.000 0.008 NA N NA
 1213719 1213718         FALSE 0.307 84.000 0.040 NA   NA
 1213717 1213716         FALSE 0.187 111.000 0.043 NA   NA
 1213716 1214518         FALSE 0.221 106.000 0.043 NA   NA
 1213715 1213714       valS FALSE 0.403 2.000 0.008 NA   NA
 1213714 1213713     valS   FALSE 0.175 92.000 0.004 NA   NA
 1213713 1309119       tRNA-Val FALSE 0.158 18.000 0.000 NA   NA
 1213712 1213711       speE FALSE 0.445 -3.000 0.011 1.000   NA
 1213711 1213710     speE speB TRUE 0.884 2.000 0.064 1.000 Y NA
 1213710 1213709     speB gcvT TRUE 0.747 51.000 0.010 1.000 Y NA
 1213709 1213708     gcvT aspS TRUE 0.721 59.000 0.018 0.039 N NA
 1213708 1213707     aspS pyrG FALSE 0.048 75.000 0.008 1.000 N NA
 1213707 1213706     pyrG nrdG FALSE 0.084 27.000 0.016 1.000 N NA
 1213706 1213705     nrdG   TRUE 0.756 6.000 0.270 1.000   NA
 1213705 1213704         FALSE 0.468 -10.000 0.037 1.000   NA
 1213704 1213703         TRUE 0.879 -3.000 0.180 1.000 Y NA
 1213701 1213700       ppk FALSE 0.208 18.000 0.037 1.000 N NA
 1213700 1213699     ppk   FALSE 0.010 207.000 0.019 1.000 N NA
 1213699 1213698       SEC59 TRUE 0.623 9.000 0.292 1.000 N NA
 1213696 1213695     acnB eriC FALSE 0.284 10.000 0.062 1.000 N NA
 1213691 1213690     aroE rpsF FALSE 0.021 110.000 0.006 1.000 N NA
 1213689 1214517     argG   FALSE 0.196 38.000 0.004 NA   NA
 1213688 1213687       mraY FALSE 0.335 -31.000 0.027 NA   NA
 1213687 1362547     mraY pseudo FALSE 0.195 13.000 0.000 NA   NA
 1213686 1213685       uvrA FALSE 0.003 201.000 0.003 1.000 N NA
 1213685 1213684     uvrA recN TRUE 0.909 54.000 0.021 0.082 Y NA
 1213683 1213682         TRUE 0.821 1.000 0.452 NA   NA
 1213682 1213681       thrC TRUE 0.509 7.000 0.050 NA   NA
 1213681 1213680     thrC dnaN FALSE 0.001 343.000 0.000 1.000 N NA