MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus pyogenes str. Manfredo

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3811783 3811784 SpyM50001 SpyM50002 dnaA dnaN TRUE 0.634 155.000 0.328 1.000 Y NA
 3811784 3811785 SpyM50002 SpyM50003 dnaN   TRUE 0.393 75.000 0.009 NA   NA
 3811785 3811786 SpyM50003 SpyM50004     FALSE 0.086 330.000 0.064 NA   NA
 3811786 3811787 SpyM50004 SpyM50005   pth TRUE 0.787 70.000 0.184 1.000 Y NA
 3811787 3811788 SpyM50005 SpyM50006 pth trcF TRUE 0.896 3.000 0.137 1.000 N NA
 3811788 3811789 SpyM50006 SpyM50007 trcF   FALSE 0.105 162.000 0.024 1.000 N NA
 3811789 3811790 SpyM50007 SpyM50008     TRUE 0.908 -13.000 0.053 1.000 N NA
 3811790 3811791 SpyM50008 SpyM50009     TRUE 0.904 -3.000 0.011 NA   NA
 3811791 3811792 SpyM50009 SpyM50010     TRUE 0.945 13.000 0.132 NA   NA
 3811792 3811793 SpyM50010 SpyM50011     TRUE 0.833 -3.000 0.014 1.000 N NA
 3811793 3811794 SpyM50011 SpyM50012   hpt TRUE 0.952 5.000 0.067 0.065 N NA
 3811794 3811795 SpyM50012 SpyM50013 hpt ftsH TRUE 0.911 22.000 0.192 1.000 N NA
 3811795 3811796 SpyM50013 SpyM50014 ftsH   FALSE 0.032 325.000 0.009 1.000 N NA
 3811796 3811797 SpyM50014 SpyM5r01     FALSE 0.030 565.000 0.000 NA   NA
 3811797 3811798 SpyM5r01 SpyM5t01     TRUE 0.489 50.000 0.000 NA   NA
 3811798 3811799 SpyM5t01 SpyM5r02     FALSE 0.051 299.000 0.000 NA   NA
 3811799 3811800 SpyM5r02 SpyM5r03     FALSE 0.266 84.000 0.000 NA   NA
 3811800 3811801 SpyM5r03 SpyM5t02     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 3811801 3811802 SpyM5t02 SpyM5t03     TRUE 0.842 18.000 0.000 NA   NA
 3811802 3811803 SpyM5t03 SpyM5t04     TRUE 0.692 32.000 0.000 NA   NA
 3811803 3811804 SpyM5t04 SpyM5t05     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 3811804 3811805 SpyM5t05 SpyM5t06     TRUE 0.857 11.000 0.000 NA   NA
 3811805 3811806 SpyM5t06 SpyM5t07     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 3811806 3811807 SpyM5t07 SpyM5t08     TRUE 0.855 9.000 0.000 NA   NA
 3811807 3811808 SpyM5t08 SpyM5t09     TRUE 0.847 17.000 0.000 NA   NA
 3811808 3811809 SpyM5t09 SpyM5t10     TRUE 0.853 7.000 0.000 NA   NA
 3811809 3811810 SpyM5t10 SpyM5r04     FALSE 0.161 125.000 0.000 NA   NA
 3811810 3811811 SpyM5r04 SpyM5t11     TRUE 0.489 50.000 0.000 NA   NA
 3811811 3811812 SpyM5t11 SpyM5r05     FALSE 0.050 300.000 0.000 NA   NA
 3811812 3811813 SpyM5r05 SpyM5r06     FALSE 0.272 83.000 0.000 NA   NA
 3811813 3811814 SpyM5r06 SpyM5t12     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 3811814 3811815 SpyM5t12 SpyM5t13     TRUE 0.842 18.000 0.000 NA   NA
 3811815 3811816 SpyM5t13 SpyM5t14     TRUE 0.692 32.000 0.000 NA   NA
 3811816 3811817 SpyM5t14 SpyM5t15     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 3811817 3811818 SpyM5t15 SpyM5t16     TRUE 0.857 11.000 0.000 NA   NA
 3811818 3811819 SpyM5t16 SpyM5t17     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 3811819 3811820 SpyM5t17 SpyM5t18     TRUE 0.855 9.000 0.000 NA   NA
 3811820 3811821 SpyM5t18 SpyM5t19     TRUE 0.847 17.000 0.000 NA   NA
 3811821 3811822 SpyM5t19 SpyM5t20     TRUE 0.853 7.000 0.000 NA   NA
 3811822 3811823 SpyM5t20 SpyM5t21     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 3811823 3811824 SpyM5t21 SpyM5t22     TRUE 0.816 21.000 0.000 NA   NA
 3811824 3811825 SpyM5t22 SpyM5t23     TRUE 0.800 23.000 0.000 NA   NA
 3811825 3811826 SpyM5t23 SpyM5t24     TRUE 0.800 23.000 0.000 NA   NA
 3811826 3811827 SpyM5t24 SpyM5t25     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 3811827 3811828 SpyM5t25 SpyM5t26     TRUE 0.655 35.000 0.000 NA   NA
 3811828 3811829 SpyM5t26 SpyM5t27     TRUE 0.856 10.000 0.000 NA   NA
 3811829 3811830 SpyM5t27 SpyM50015     FALSE 0.027 1364.000 0.000 NA   NA
 3811830 3811831 SpyM50015 SpyM50016   prs1 FALSE 0.144 253.000 0.107 NA   NA
 3811831 3811832 SpyM50016 SpyM50017 prs1 recO FALSE 0.044 186.000 0.000 1.000 N NA
 3811832 3811833 SpyM50017 SpyM50018 recO plsX FALSE 0.155 103.000 0.011 1.000 N NA
 3811833 3811834 SpyM50018 SpyM50019 plsX   TRUE 0.990 -7.000 0.017 0.010 Y NA
 3811834 3811835 SpyM50019 SpyM50020   purC FALSE 0.128 151.000 0.000 NA   NA
 3811835 3811836 SpyM50020 SpyM50022 purC   FALSE 0.312 76.000 0.000 NA   NA
 3811836 3811837 SpyM50022 SpyM50023   purF FALSE 0.218 234.000 0.024 1.000 Y NA
 3811837 3811838 SpyM50023 SpyM50024 purF purM TRUE 0.963 28.000 0.248 1.000 Y NA
 3811838 3811839 SpyM50024 SpyM50025 purM purN TRUE 0.825 168.000 0.238 0.003 Y NA
 3811841 3811842 SpyM50029 SpyM50030 purD purE FALSE 0.180 281.000 0.044 1.000 Y NA
 3811842 3811843 SpyM50030 SpyM50031 purE purK TRUE 0.993 -13.000 0.002 0.002 Y NA
 3811843 3811844 SpyM50031 SpyM50032 purK   TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 3811844 3811845 SpyM50032 SpyM50033   purB TRUE 0.827 20.000 0.000 NA   NA
 3811845 3811846 SpyM50033 SpyM50034 purB   FALSE 0.156 131.000 0.005 1.000   NA
 3811846 3811847 SpyM50034 SpyM50035   ruvB FALSE 0.080 220.000 0.002 1.000   NA
 3811847 3811848 SpyM50035 SpyM50036 ruvB   FALSE 0.092 138.000 0.005 1.000 N NA
 3811848 3811849 SpyM50036 SpyM50037     TRUE 0.866 23.000 0.019 NA   NA
 3811849 3811850 SpyM50037 SpyM50038     TRUE 0.981 -3.000 0.351 NA   NA
 3811850 3811851 SpyM50038 SpyM50039   adhE FALSE 0.020 309.000 0.000 1.000 N NA
 3811851 3811852 SpyM50039 SpyM50040 adhE adhP FALSE 0.344 252.000 0.012 0.002   NA
 3811852 3811853 SpyM50040 SpyM50041 adhP   FALSE 0.029 388.000 0.000 1.000   NA
 3811853 3811854 SpyM50041 SpyM50042     FALSE 0.204 104.000 0.000 NA   NA
 3811854 3811855 SpyM50042 SpyM50043   rpsJ FALSE 0.109 181.000 0.000 NA   NA
 3811855 3811856 SpyM50043 SpyM50044 rpsJ rplC TRUE 0.768 248.000 0.467 0.046 Y NA
 3811856 3811857 SpyM50044 SpyM50045 rplC rplD TRUE 0.996 24.000 0.544 0.035 Y NA
 3811857 3811858 SpyM50045 SpyM50046 rplD rplW TRUE 0.994 0.000 0.307 0.035 Y NA
 3811858 3811859 SpyM50046 SpyM50047 rplW rplB TRUE 0.999 18.000 0.849 0.039 Y NA
 3811859 3811860 SpyM50047 SpyM50048 rplB rpsS TRUE 0.948 139.000 0.820 0.046 Y NA
 3811860 3811861 SpyM50048 SpyM50049 rpsS rplV TRUE 0.998 16.000 0.769 0.046 Y NA
 3811861 3811862 SpyM50049 SpyM50050 rplV rpsC TRUE 0.998 13.000 0.719 0.046 Y NA
 3811862 3811863 SpyM50050 SpyM50051 rpsC rplP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.046 Y NA
 3811863 3811864 SpyM50051 SpyM50052 rplP rpmC TRUE 0.999 10.000 0.802 0.035 Y NA
 3811864 3811865 SpyM50052 SpyM50053 rpmC rpsQ TRUE 0.998 26.000 0.828 0.035 Y NA
 3811865 3811866 SpyM50053 SpyM50054 rpsQ rplN TRUE 0.997 25.000 0.791 0.046 Y NA
 3811866 3811867 SpyM50054 SpyM50055 rplN rplX TRUE 0.979 79.000 0.810 0.046 Y NA
 3811867 3811868 SpyM50055 SpyM50056 rplX rplE TRUE 0.997 24.000 0.758 0.035 Y NA
 3811868 3811869 SpyM50056 SpyM50057 rplE rpsN TRUE 0.997 16.000 0.496 0.035 Y NA
 3811869 3811870 SpyM50057 SpyM50058 rpsN rpsH TRUE 0.882 151.000 0.473 0.035 Y NA
 3811870 3811871 SpyM50058 SpyM50059 rpsH rplF TRUE 0.922 203.000 0.808 0.035 Y NA
 3811871 3811872 SpyM50059 SpyM50060 rplF rplR TRUE 0.968 105.000 0.815 0.035 Y NA
 3811872 3811873 SpyM50060 SpyM50061 rplR rpsE TRUE 0.998 19.000 0.814 0.046 Y NA
 3811873 3811874 SpyM50061 SpyM50062 rpsE rpmD TRUE 0.998 15.000 0.789 0.046 Y NA
 3811874 3811875 SpyM50062 SpyM50063 rpmD rplO TRUE 0.906 215.000 0.653 0.006 Y NA
 3811875 3811876 SpyM50063 SpyM50064 rplO secY TRUE 0.988 17.000 0.730 1.000 N NA
 3811876 3811877 SpyM50064 SpyM50065 secY adk FALSE 0.322 150.000 0.241 1.000 N NA
 3811877 3811878 SpyM50065 SpyM50066 adk infA FALSE 0.175 118.000 0.059 1.000 N NA
 3811878 3811879 SpyM50066 SpyM50066A infA rpmJ TRUE 0.928 26.000 0.067 1.000 Y NA
 3811879 3811880 SpyM50066A SpyM50067 rpmJ rpsM TRUE 0.985 18.000 0.086 0.035 Y NA
 3811880 3811881 SpyM50067 SpyM50068 rpsM rpsK TRUE 0.998 18.000 0.810 0.035 Y NA
 3811881 3811882 SpyM50068 SpyM50069 rpsK rpoA TRUE 0.838 46.000 0.308 1.000 N NA
 3811882 3811883 SpyM50069 SpyM50070 rpoA rplQ TRUE 0.993 15.000 0.873 1.000 N NA
 3811883 3811884 SpyM50070 SpyM50071 rplQ   FALSE 0.012 624.000 0.000 1.000 N NA
 3811884 3811885 SpyM50071 SpyM5r07     FALSE 0.054 291.000 0.000 NA   NA
 3811885 3811886 SpyM5r07 SpyM5t28     TRUE 0.489 50.000 0.000 NA   NA
 3811886 3811887 SpyM5t28 SpyM5r08     FALSE 0.050 300.000 0.000 NA   NA
 3811887 3811888 SpyM5r08 SpyM5r09     FALSE 0.272 83.000 0.000 NA   NA
 3811888 3811889 SpyM5r09 SpyM5t29     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 3811889 3811890 SpyM5t29 SpyM5t30     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 3811890 3811891 SpyM5t30 SpyM5t31     TRUE 0.655 35.000 0.000 NA   NA
 3811891 3811892 SpyM5t31 SpyM5t32     TRUE 0.800 23.000 0.000 NA   NA
 3811892 3811893 SpyM5t32 SpyM5t33     TRUE 0.857 11.000 0.000 NA   NA
 3811893 3811894 SpyM5t33 SpyM5t34     TRUE 0.856 10.000 0.000 NA   NA
 3811894 3811895 SpyM5t34 SpyM5t35     TRUE 0.816 21.000 0.000 NA   NA
 3811895 3811896 SpyM5t35 SpyM5t36     TRUE 0.827 20.000 0.000 NA   NA
 3811896 3811897 SpyM5t36 SpyM5t37     TRUE 0.853 7.000 0.000 NA   NA
 3811897 3811898 SpyM5t37 SpyM5t38     TRUE 0.861 12.000 0.000 NA   NA
 3811898 3811899 SpyM5t38 SpyM5t39     TRUE 0.855 9.000 0.000 NA   NA
 3811899 3811900 SpyM5t39 SpyM5t40     TRUE 0.827 20.000 0.000 NA   NA
 3811900 3811901 SpyM5t40 SpyM50071A     FALSE 0.064 260.000 0.000 NA   NA
 3811901 3811902 SpyM50071A SpyM50075     FALSE 0.027 1323.000 0.000 NA   NA
 3811902 3811903 SpyM50075 SpyM50076     TRUE 0.929 4.000 0.192 1.000 N NA
 3811903 3811904 SpyM50076 SpyM50077     TRUE 0.996 -7.000 0.673 1.000 Y NA
 3811905 3811906 SpyM50078 SpyM50079   tyrS TRUE 0.472 51.000 0.000 NA   NA
 3811907 3811908 SpyM50080 SpyM50081 pbp1B rpoB FALSE 0.026 264.000 0.000 1.000 N NA
 3811908 3811909 SpyM50081 SpyM50082 rpoB rpoC TRUE 0.984 91.000 0.851 0.002 Y NA
 3811909 3811910 SpyM50082 SpyM50083 rpoC   FALSE 0.165 152.000 0.007 NA   NA
 3811910 3811911 SpyM50083 SpyM50084     TRUE 0.394 93.000 0.083 NA   NA
 3811911 3811912 SpyM50084 SpyM50085     TRUE 0.997 -16.000 0.639 1.000 Y NA
 3811912 3811913 SpyM50085 SpyM50086   comYC TRUE 0.999 2.000 0.861 0.002 Y NA
 3811913 3811914 SpyM50086 SpyM50087 comYC   TRUE 0.985 -25.000 0.110 NA Y NA
 3811914 3811915 SpyM50087 SpyM50088     TRUE 0.993 5.000 0.786 NA   NA
 3811915 3811916 SpyM50088 SpyM50089     TRUE 0.977 -7.000 0.250 NA   NA
 3811916 3811917 SpyM50089 SpyM50090     TRUE 0.981 -16.000 0.232 NA   NA
 3811917 3811918 SpyM50090 SpyM50091     TRUE 0.377 98.000 0.087 NA   NA
 3811918 3811919 SpyM50091 SpyM50092   ackA TRUE 0.517 59.000 0.130 1.000 N NA
 3811919 3811920 SpyM50092 SpyM50093 ackA   FALSE 0.102 187.000 0.000 NA   NA
 3811921 3811922 SpyM50094 SpyM50095 proC pepA TRUE 0.503 48.000 0.041 1.000 N NA
 3811922 3811923 SpyM50095 SpyM50095A pepA   FALSE 0.353 110.000 0.100 NA   NA
 3811924 3811925 SpyM50096 SpyM50097     TRUE 0.948 -3.000 0.140 NA   NA
 3811925 3811926 SpyM50097 SpyM50098     TRUE 0.958 18.000 0.239 1.000   NA
 3811926 3811927 SpyM50098 SpyM50099     FALSE 0.172 151.000 0.034 1.000   NA
 3811928 3811929 SpyM50100 SpyM50101     TRUE 0.748 20.000 0.005 1.000 N NA
 3811929 3811930 SpyM50101 SpyM50102   hslO TRUE 0.900 -13.000 0.034 1.000 N NA
 3811930 3811931 SpyM50102 SpyM50103 hslO rofA FALSE 0.194 126.000 0.003 NA   NA
 3811932 3811933 SpyM50104 SpyM50105     TRUE 0.939 -7.000 0.061 NA   NA
 3811933 3811934 SpyM50105 SpyM50106     TRUE 0.917 7.000 0.061 NA   NA
 3811934 3811935 SpyM50106 SpyM50107   srtB TRUE 0.985 1.000 0.500 NA   NA
 3811935 3811936 SpyM50107 SpyM50106a srtB   TRUE 0.995 17.000 1.000 NA   NA
 3811942 3811943 SpyM50114 SpyM50115 atoB1 atoD1 TRUE 0.966 12.000 0.100 1.000 Y NA
 3811943 3811944 SpyM50115 SpyM50116 atoD1 atoA1 TRUE 0.990 3.000 0.200 0.052 Y NA
 3811946 3811947 SpyM50118 SpyM50119     TRUE 0.636 37.000 0.016 NA N NA
 3811947 3811948 SpyM50119 SpyM50120     FALSE 0.033 449.000 0.000 NA   NA
 3811948 3811949 SpyM50120 SpyM50121   ntpI TRUE 0.939 -10.000 0.029 NA   NA
 3811949 3811950 SpyM50121 SpyM50122 ntpI ntpK TRUE 0.998 2.000 0.848 0.012   NA
 3811950 3811951 SpyM50122 SpyM50123 ntpK ntpE TRUE 0.781 68.000 0.045 0.012   NA
 3811951 3811952 SpyM50123 SpyM50124 ntpE ntpC TRUE 0.983 16.000 0.097 0.002   NA
 3811952 3811953 SpyM50124 SpyM50125 ntpC   TRUE 0.998 -3.000 0.487 0.002 Y NA
 3811953 3811954 SpyM50125 SpyM50126   ntpA TRUE 0.858 201.000 0.462 0.011 Y NA
 3811954 3811955 SpyM50126 SpyM50127 ntpA ntpB TRUE 0.999 1.000 0.776 0.011 Y NA
 3811955 3811956 SpyM50127 SpyM50128 ntpB ntpD TRUE 0.975 45.000 0.238 0.011 Y NA
 3811957 3811958 SpyM50129 SpyM50130     TRUE 0.994 13.000 0.818 NA   NA
 3811959 3811960 SpyM50131 SpyM50132 purA   FALSE 0.163 327.000 0.000 0.020   NA
 3811960 3811961 SpyM50132 SpyM50133   nusG FALSE 0.093 174.000 0.000 1.000   NA
 3811961 3811962 SpyM50133 SpyM50134 nusG nga FALSE 0.031 372.000 0.000 1.000   NA
 3811962 3811963 SpyM50134 SpyM50135 nga   TRUE 0.466 134.000 0.286 1.000   NA
 3811963 3811964 SpyM50135 SpyM50136   slo TRUE 0.930 15.000 0.125 1.000   NA
 3811965 3811966 SpyM50137 SpyM50138     FALSE 0.036 401.000 0.000 NA   NA
 3811966 3811967 SpyM50138 SpyM50139     FALSE 0.105 185.000 0.000 NA   NA
 3811968 3811969 SpyM50140 SpyM50141   leuS FALSE 0.036 212.000 0.000 1.000 N NA
 3811969 3811970 SpyM50141 SpyM50142 leuS   FALSE 0.038 307.000 0.000 1.000   NA
 3811970 3811971 SpyM50142 SpyM50143     TRUE 0.928 71.000 0.431 0.024   NA
 3811971 3811972 SpyM50143 SpyM50144     TRUE 0.860 123.000 0.279 0.018 Y NA
 3811972 3811973 SpyM50144 SpyM50145   ulaD TRUE 0.792 91.000 0.328 1.000 Y NA
 3811973 3811974 SpyM50145 SpyM50146 ulaD   TRUE 0.992 5.000 0.536 1.000 Y NA
 3811974 3811975 SpyM50146 SpyM50147   araD TRUE 0.995 2.000 0.700 1.000 Y NA
 3811975 3811976 SpyM50147 SpyM50147A araD   TRUE 0.417 58.000 0.000 NA   NA
 3811976 3811977 SpyM50147A SpyM50148     FALSE 0.168 121.000 0.000 NA   NA
 3811977 3811978 SpyM50148 SpyM50149     FALSE 0.252 253.000 0.231 NA   NA
 3811978 3811979 SpyM50149 SpyM50150     FALSE 0.032 488.000 0.000 NA   NA
 3811979 3811980 SpyM50150 SpyM50151     TRUE 0.989 16.000 0.177 0.088 Y NA
 3811980 3811981 SpyM50151 SpyM50152   pol FALSE 0.094 131.000 0.003 1.000 N NA
 3811981 3811982 SpyM50152 SpyM50153 pol   FALSE 0.141 178.000 0.005 NA   NA
 3811982 3811983 SpyM50153 SpyM50154     TRUE 0.551 52.000 0.010 NA   NA
 3811985 3811986 SpyM50156 SpyM50157   tgt TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3811986 3811987 SpyM50157 SpyM50158 tgt   FALSE 0.084 218.000 0.004 1.000   NA
 3811987 3811988 SpyM50158 SpyM50159     TRUE 0.903 4.000 0.039 NA   NA
 3811988 3811989 SpyM50159 SpyM50160     FALSE 0.214 140.000 0.033 NA   NA
 3811989 3811990 SpyM50160 SpyM50161     TRUE 0.968 0.000 0.013 0.020   NA
 3811992 3811993 SpyM50163 SpyM5s01     TRUE 0.489 50.000 0.000 NA   NA
 3811995 3811996 SpyM50165 SpyM50166 speG   FALSE 0.262 85.000 0.000 NA   NA
 3811996 3811997 SpyM50166 SpyM50167   pgi FALSE 0.067 252.000 0.000 NA   NA
 3811999 3812000 SpyM50169 SpyM50170     FALSE 0.175 117.000 0.000 NA   NA
 3812000 3812001 SpyM50170 SpyM50171     TRUE 0.739 28.000 0.000 NA   NA
 3812002 3812003 SpyM50172 SpyM50173 hasC2 gpsA TRUE 0.579 33.000 0.007 1.000 N NA
 3812004 3812005 SpyM50174 SpyM50175     TRUE 0.905 -7.000 0.080 1.000 N NA
 3812005 3812006 SpyM50175 SpyM50176     TRUE 0.998 3.000 0.720 0.008 Y NA
 3812006 3812007 SpyM50176 SpyM50177     FALSE 0.229 118.000 0.010 NA   NA
 3812007 3812008 SpyM50177 SpyM50178   dut FALSE 0.233 110.000 0.005 NA   NA
 3812008 3812009 SpyM50178 SpyM50179 dut radA FALSE 0.253 81.000 0.028 1.000 N NA
 3812009 3812010 SpyM50179 SpyM50180 radA   FALSE 0.070 188.000 0.009 1.000 N NA
 3812010 3812011 SpyM50180 SpyM50181     TRUE 0.500 131.000 0.278 NA   NA
 3812011 3812012 SpyM50181 SpyM50182   gltX FALSE 0.144 182.000 0.008 NA   NA
 3812012 3812013 SpyM50182 SpyM50183 gltX fasB FALSE 0.015 395.000 0.000 1.000 N NA
 3812013 3812014 SpyM50183 SpyM50186 fasB fasA FALSE 0.062 1283.000 0.000 1.000 Y NA
 3812014 3812015 SpyM50186 SpyM5s02 fasA   FALSE 0.184 113.000 0.000 NA   NA
 3812015 3812016 SpyM5s02 SpyM50187   rnpA FALSE 0.043 343.000 0.000 NA   NA
 3812016 3812017 SpyM50187 SpyM50188 rnpA   TRUE 0.912 -16.000 0.052 1.000 N NA
 3812017 3812018 SpyM50188 SpyM50189     TRUE 0.925 12.000 0.106 1.000   NA
 3812018 3812019 SpyM50189 SpyM50190   rpmH FALSE 0.047 315.000 0.002 1.000   NA
 3812019 3812020 SpyM50190 SpyM50191 rpmH   FALSE 0.047 274.000 0.000 1.000   NA
 3812020 3812021 SpyM50191 SpyM50192     TRUE 0.957 49.000 0.500 1.000 Y NA
 3812021 3812022 SpyM50192 SpyM50193     TRUE 0.779 105.000 0.133 0.042 Y NA
 3812022 3812023 SpyM50193 SpyM50194     TRUE 0.999 13.000 1.000 0.042 Y NA
 3812023 3812024 SpyM50194 SpyM50195     FALSE 0.124 157.000 0.000 NA   NA
 3812024 3812025 SpyM50195 SpyM50196   nanH TRUE 0.987 12.000 0.500 NA   NA
 3812025 3812026 SpyM50196 SpyM50197 nanH   TRUE 0.853 22.000 0.108 1.000 N NA
 3812028 3812029 SpyM50199 SpyM50200     TRUE 0.973 -7.000 0.058 NA Y NA
 3812029 3812030 SpyM50200 SpyM50201   ksgA FALSE 0.218 114.000 0.093 1.000 N NA
 3812030 3812031 SpyM50201 SpyM50202 ksgA engC FALSE 0.035 424.000 0.003 1.000   NA
 3812031 3812032 SpyM50202 SpyM50203 engC rpe TRUE 0.958 10.000 0.213 1.000   NA
 3812032 3812033 SpyM50203 SpyM50204 rpe thiN TRUE 0.942 -7.000 0.166 1.000 N NA
 3812033 3812034 SpyM50204 SpyM50205 thiN   TRUE 0.901 2.000 0.030 NA   NA
 3812034 3812035 SpyM50205 SpyM50206     TRUE 0.940 -10.000 0.030 NA   NA
 3812035 3812036 SpyM50206 SpyM50207   purR FALSE 0.089 267.000 0.052 1.000   NA
 3812036 3812037 SpyM50207 SpyM50208 purR   TRUE 0.933 -9.000 0.017 NA   NA
 3812037 3812038 SpyM50208 SpyM50209   rpsL FALSE 0.125 208.000 0.012 NA   NA
 3812038 3812039 SpyM50209 SpyM50210 rpsL rpsG TRUE 0.993 21.000 0.224 0.006 Y NA
 3812039 3812040 SpyM50210 SpyM50211 rpsG fus TRUE 0.470 485.000 0.579 1.000 Y NA
 3812040 3812041 SpyM50211 SpyM50212 fus gapA FALSE 0.018 341.000 0.000 1.000 N NA
 3812042 3812043 SpyM50213 SpyM50214   glnQ2 FALSE 0.208 142.000 0.032 NA   NA
 3812043 3812044 SpyM50214 SpyM50215 glnQ2   TRUE 0.997 -7.000 0.758 1.000 Y NA
 3812045 3812046 SpyM50216 SpyM50217   bacA TRUE 0.592 66.000 0.118 NA   NA
 3812046 3812047 SpyM50217 SpyM50218 bacA mecA FALSE 0.223 146.000 0.132 NA N NA
 3812047 3812048 SpyM50218 SpyM50219 mecA rgpG TRUE 0.959 7.000 0.267 NA N NA
 3812048 3812049 SpyM50219 SpyM50220 rgpG sufC FALSE 0.130 122.000 0.013 1.000 N NA
 3812049 3812050 SpyM50220 SpyM50221 sufC sufD TRUE 0.607 95.000 0.139 1.000 Y NA
 3812050 3812051 SpyM50221 SpyM50222 sufD csdB TRUE 0.963 31.000 0.606 1.000 N NA
 3812051 3812052 SpyM50222 SpyM50223 csdB iscU TRUE 0.976 -13.000 0.292 1.000 N NA
 3812052 3812053 SpyM50223 SpyM50224 iscU sufB TRUE 0.988 -7.000 0.152 0.002 N NA
 3812054 3812055 SpyM50225 SpyM50226     TRUE 0.813 168.000 0.231 0.005 Y NA
 3812056 3812057 SpyM50227 SpyM50228     TRUE 0.938 65.000 0.273 0.042 Y NA
 3812057 3812058 SpyM50228 SpyM50229     TRUE 0.997 0.000 0.556 0.042 Y NA
 3812058 3812059 SpyM50229 SpyM50230     TRUE 0.994 9.000 0.650 1.000 Y NA
 3812059 3812060 SpyM50230 SpyM50231     TRUE 0.994 -7.000 0.095 0.002 Y NA
 3812061 3812062 SpyM50231A SpyM50232     TRUE 0.907 -12.000 0.000 NA   NA
 3812062 3812063 SpyM50232 SpyM50235     TRUE 0.679 33.000 0.000 NA   NA
 3812064 3812065 SpyM5r10 SpyM5t41     TRUE 0.489 50.000 0.000 NA   NA
 3812065 3812066 SpyM5t41 SpyM5r11     FALSE 0.050 300.000 0.000 NA   NA
 3812066 3812067 SpyM5r11 SpyM5r12     FALSE 0.272 83.000 0.000 NA   NA
 3812067 3812068 SpyM5r12 SpyM5t42     TRUE 0.846 1.000 0.000 NA   NA
 3812068 3812069 SpyM5t42 SpyM5t43     FALSE 0.290 80.000 0.000 NA   NA
 3812069 3812070 SpyM5t43 SpyM50236   comX1 TRUE 0.882 -4.000 0.000 NA   NA
 3812070 3812071 SpyM50236 SpyM50237 comX1 truA FALSE 0.081 187.000 0.000 1.000   NA
 3812071 3812072 SpyM50237 SpyM50238 truA thiD TRUE 0.903 -10.000 0.058 1.000 N NA
 3812072 3812073 SpyM50238 SpyM50239 thiD   TRUE 0.981 -10.000 0.276 NA   NA
 3812073 3812074 SpyM50239 SpyM50240     TRUE 0.949 14.000 0.149 NA   NA
 3812076 3812077 SpyM50242 SpyM50243 tig rpoE FALSE 0.053 217.000 0.005 1.000 N NA
 3812077 3812078 SpyM50243 SpyM50244 rpoE pyrG FALSE 0.056 257.000 0.029 1.000 N NA
 3812078 3812079 SpyM50244 SpyM50245 pyrG   FALSE 0.117 168.000 0.002 1.000   NA
 3812079 3812080 SpyM50245 SpyM5t44     TRUE 0.449 54.000 0.000 NA   NA
 3812080 3812081 SpyM5t44 SpyM50246   fba FALSE 0.088 208.000 0.000 NA   NA
 3812081 3812082 SpyM50246 SpyM50247 fba rpmB FALSE 0.016 382.000 0.000 1.000 N NA
 3812082 3812083 SpyM50247 SpyM50248 rpmB   FALSE 0.203 152.000 0.044 NA   NA
 3812083 3812084 SpyM50248 SpyM50249     TRUE 0.988 0.000 0.567 NA   NA
 3812084 3812085 SpyM50249 SpyM50250     FALSE 0.080 237.000 0.006 1.000   NA
 3812085 3812086 SpyM50250 SpyM50251     FALSE 0.061 230.000 0.000 1.000   NA
 3812086 3812087 SpyM50251 SpyM50252   pgk FALSE 0.099 193.000 0.003 1.000   NA
 3812087 3812088 SpyM50252 SpyM50253 pgk   FALSE 0.076 263.000 0.002 NA   NA
 3812088 3812089 SpyM50253 SpyM50254   glnR TRUE 0.638 67.000 0.154 NA   NA
 3812089 3812090 SpyM50254 SpyM50255 glnR glnA TRUE 0.789 38.000 0.179 1.000 N NA
 3812091 3812092 SpyM50256 SpyM50257     TRUE 0.988 2.000 0.576 NA   NA
 3812093 3812094 SpyM50258 SpyM50259     TRUE 0.807 2.000 0.000 1.000   NA
 3812094 3812095 SpyM50259 SpyM50260     TRUE 0.878 -10.000 0.000 1.000   NA
 3812096 3812097 SpyM50261 SpyM50262 rpsN   FALSE 0.033 221.000 0.000 1.000 N NA
 3812098 3812099 SpyM50263 SpyM50264 udp   TRUE 0.936 21.000 0.015 1.000 Y NA
 3812099 3812100 SpyM50264 SpyM50265   deoC TRUE 0.970 30.000 0.333 1.000 Y NA
 3812102 3812103 SpyM50267 SpyM50268     TRUE 0.918 10.000 0.057 NA   NA
 3812103 3812104 SpyM50268 SpyM50269     FALSE 0.220 152.000 0.156 1.000 N NA
 3812105 3812106 SpyM50270 SpyM50271     FALSE 0.120 193.000 0.002 NA   NA
 3812108 3812109 SpyM50273 SpyM50274 pepXP   TRUE 0.883 22.000 0.081 1.000   NA
 3812110 3812111 SpyM50275 SpyM50276     FALSE 0.103 186.000 0.000 NA   NA
 3812111 3812112 SpyM50276 SpyM50277   gla FALSE 0.118 170.000 0.000 NA   NA
 3812114 3812115 SpyM50279 SpyM50280     TRUE 0.986 -15.000 0.326 NA   NA
 3812118 3812119 SpyM50283 SpyM50284     FALSE 0.359 91.000 0.050 NA   NA
 3812119 3812120 SpyM50284 SpyM50285   spi TRUE 0.484 58.000 0.099 1.000 N NA
 3812120 3812121 SpyM50285 SpyM50286 spi   TRUE 0.876 11.000 0.080 1.000 N NA
 3812122 3812123 SpyM50287 SpyM50288     TRUE 0.895 3.000 0.019 NA   NA
 3812123 3812124 SpyM50288 SpyM50289   mutS2 FALSE 0.203 149.000 0.070 1.000   NA
 3812124 3812125 SpyM50289 SpyM50290 mutS2   TRUE 0.851 4.000 0.005 1.000   NA
 3812125 3812126 SpyM50290 SpyM50291     TRUE 0.372 81.000 0.053 1.000   NA
 3812127 3812128 SpyM50292 SpyM50293     FALSE 0.068 177.000 0.002 1.000 N NA
 3812129 3812130 SpyM50294 SpyM50295   rpsF FALSE 0.116 173.000 0.000 NA   NA
 3812130 3812131 SpyM50295 SpyM50296 rpsF ssb TRUE 0.751 22.000 0.012 1.000 N NA
 3812131 3812132 SpyM50296 SpyM50297 ssb rpsR FALSE 0.090 165.000 0.012 1.000 N NA
 3812133 3812134 SpyM50298 SpyM50299     FALSE 0.261 133.000 0.072 NA   NA
 3812135 3812136 SpyM50300 SpyM50301 uvrA   FALSE 0.125 116.000 0.008 1.000 N NA
 3812136 3812137 SpyM50301 SpyM50302     TRUE 0.606 35.000 0.018 1.000 N NA
 3812137 3812138 SpyM50302 SpyM50303   efp FALSE 0.147 96.000 0.005 1.000 N NA
 3812138 3812139 SpyM50303 SpyM50304 efp   TRUE 0.676 46.000 0.031 NA   NA
 3812139 3812140 SpyM50304 SpyM50305   nusB TRUE 0.978 -7.000 0.265 NA   NA
 3812141 3812142 SpyM50306 SpyM50307 scrR scrB TRUE 0.982 5.000 0.571 1.000 N NA
 3812143 3812144 SpyM50308 SpyM50309 scrA   FALSE 0.060 231.000 0.000 1.000   NA
 3812144 3812145 SpyM50309 SpyM50310   scrK FALSE 0.049 264.000 0.000 1.000   NA
 3812145 3812146 SpyM50310 SpyM50311 scrK manA TRUE 0.786 95.000 0.333 1.000 Y NA
 3812146 3812147 SpyM50311 SpyM50312 manA secA FALSE 0.136 134.000 0.042 1.000 N NA
 3812147 3812148 SpyM50312 SpyM50313 secA acpS FALSE 0.126 116.000 0.008 1.000 N NA
 3812148 3812149 SpyM50313 SpyM50314 acpS alr TRUE 0.892 -3.000 0.093 1.000 N NA
 3812149 3812150 SpyM50314 SpyM50315 alr   FALSE 0.361 87.000 0.022 NA   NA
 3812150 3812151 SpyM50315 SpyM50316     FALSE 0.032 491.000 0.000 NA   NA
 3812151 3812152 SpyM50316 SpyM50317     TRUE 0.368 197.000 0.273 NA   NA
 3812152 3812153 SpyM50317 SpyM50318     TRUE 0.975 -16.000 0.182 NA   NA
 3812153 3812154 SpyM50318 SpyM50319     TRUE 0.997 2.000 0.877 1.000 Y NA
 3812154 3812155 SpyM50319 SpyM50320     TRUE 0.995 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 3812155 3812156 SpyM50320 SpyM50321     TRUE 0.861 -3.000 0.047 1.000 N NA
 3812156 3812157 SpyM50321 SpyM50322     TRUE 0.997 -7.000 0.576 0.008 N NA
 3812157 3812158 SpyM50322 SpyM50323     TRUE 0.933 -3.000 0.081 NA   NA
 3812158 3812159 SpyM50323 SpyM50324     TRUE 0.989 -3.000 0.562 NA   NA
 3812159 3812160 SpyM50324 SpyM50325     TRUE 0.982 -3.000 0.429 1.000   NA
 3812162 3812163 SpyM50326 SpyM50327 recG   FALSE 0.022 293.000 0.000 1.000 N NA
 3812163 3812164 SpyM50327 SpyM50328     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 3812168 3812169 SpyM50332 SpyM50333   codY FALSE 0.065 218.000 0.015 1.000 N NA
 3812169 3812170 SpyM50333 SpyM50334 codY   FALSE 0.155 147.000 0.083 1.000 N NA
 3812170 3812171 SpyM50334 SpyM50335     FALSE 0.033 444.000 0.000 NA   NA
 3812171 3812172 SpyM50335 SpyM50337   gatC FALSE 0.076 232.000 0.000 NA   NA
 3812172 3812173 SpyM50337 SpyM50338 gatC gatA TRUE 0.998 0.000 0.643 0.002 Y NA
 3812173 3812174 SpyM50338 SpyM50339 gatA gatB TRUE 0.998 0.000 0.492 0.002 Y NA
 3812174 3812175 SpyM50339 SpyM50340 gatB   TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812175 3812176 SpyM50340 SpyM50341     FALSE 0.087 209.000 0.000 NA   NA
 3812176 3812177 SpyM50341 SpyM50342     FALSE 0.029 392.000 0.000 1.000   NA
 3812177 3812178 SpyM50342 SpyM50343     TRUE 0.952 -10.000 0.174 1.000 N NA
 3812178 3812179 SpyM50343 SpyM50344     TRUE 0.934 -3.000 0.174 1.000 N NA
 3812179 3812180 SpyM50344 SpyM50345   hrcA FALSE 0.102 135.000 0.009 1.000 N NA
 3812180 3812181 SpyM50345 SpyM50346 hrcA grpE TRUE 0.835 3.000 0.051 1.000 N NA
 3812181 3812182 SpyM50346 SpyM50347 grpE dnaK TRUE 0.619 181.000 0.026 0.009 Y NA
 3812182 3812183 SpyM50347 SpyM50348 dnaK dnaJ TRUE 0.630 281.000 0.196 0.004 Y NA
 3812183 3812184 SpyM50348 SpyM50349 dnaJ   FALSE 0.033 221.000 0.000 1.000 N NA
 3812184 3812185 SpyM50349 SpyM50350     TRUE 0.378 74.000 0.098 1.000 N NA
 3812185 3812186 SpyM50350 SpyM50351   fabH TRUE 0.859 1.000 0.070 1.000 N NA
 3812186 3812187 SpyM50351 SpyM50352 fabH acpP TRUE 0.833 61.000 0.065 0.009   NA
 3812187 3812188 SpyM50352 SpyM50353 acpP fabK FALSE 0.283 201.000 0.216 1.000   NA
 3812188 3812189 SpyM50353 SpyM50354 fabK fabD TRUE 0.870 25.000 0.099 1.000   NA
 3812189 3812190 SpyM50354 SpyM50355 fabD fabG TRUE 0.998 -10.000 0.432 0.009 Y NA
 3812190 3812191 SpyM50355 SpyM50356 fabG fabF TRUE 0.958 15.000 0.056 1.000 Y NA
 3812191 3812192 SpyM50356 SpyM50357 fabF fabE TRUE 0.957 2.000 0.074 1.000 Y NA
 3812192 3812193 SpyM50357 SpyM50358 fabE fabZ TRUE 0.988 0.000 0.047 0.009 Y NA
 3812193 3812194 SpyM50358 SpyM50359 fabZ accC TRUE 0.891 32.000 0.045 1.000 Y NA
 3812194 3812195 SpyM50359 SpyM50360 accC accD TRUE 0.991 9.000 0.090 0.004 Y NA
 3812195 3812196 SpyM50360 SpyM50361 accD accA TRUE 0.996 -3.000 0.234 0.002 Y NA
 3812197 3812198 SpyM50362 SpyM50363 serS   FALSE 0.046 392.000 0.003 NA   NA
 3812198 3812199 SpyM50363 SpyM50364   manN TRUE 0.775 114.000 0.583 NA   NA
 3812199 3812200 SpyM50364 SpyM50365 manN manM TRUE 0.999 17.000 0.812 0.023 Y NA
 3812200 3812201 SpyM50365 SpyM50366 manM manL TRUE 0.983 89.000 0.943 0.023 Y NA
 3812201 3812202 SpyM50366 SpyM50367 manL   FALSE 0.033 352.000 0.000 1.000   NA
 3812203 3812204 SpyM50368 SpyM50369     FALSE 0.166 154.000 0.008 NA   NA
 3812204 3812205 SpyM50369 SpyM50370     TRUE 0.952 -25.000 0.033 NA   NA
 3812205 3812206 SpyM50370 SpyM50371     TRUE 0.962 9.000 0.283 NA N NA
 3812207 3812208 SpyM50372 SpyM50373     TRUE 0.928 -3.000 0.063 NA   NA
 3812209 3812210 SpyM50374 SpyM50375     TRUE 0.928 3.000 0.167 NA N NA
 3812210 3812211 SpyM50375 SpyM50376     TRUE 0.507 64.000 0.107 NA N NA
 3812211 3812212 SpyM50376 SpyM50377   trmB TRUE 0.947 0.000 0.154 NA   NA
 3812212 3812213 SpyM50377 SpyM5t45 trmB   TRUE 0.374 65.000 0.000 NA   NA
 3812213 3812214 SpyM5t45 SpyM50378     FALSE 0.196 108.000 0.000 NA   NA
 3812214 3812215 SpyM50378 SpyM50379   nusA TRUE 0.756 175.000 0.759 NA   NA
 3812215 3812216 SpyM50379 SpyM50380 nusA   TRUE 0.987 16.000 0.323 NA Y NA
 3812216 3812217 SpyM50380 SpyM50381     TRUE 0.982 -7.000 0.408 NA N NA
 3812217 3812218 SpyM50381 SpyM50382   infB TRUE 0.979 20.000 0.223 NA Y NA
 3812218 3812219 SpyM50382 SpyM50383 infB rbfA TRUE 0.691 206.000 0.530 1.000 Y NA
 3812221 3812222 SpyM50385 SpyM50386 copY copA TRUE 0.859 0.000 0.064 1.000 N NA
 3812222 3812223 SpyM50386 SpyM50387 copA copZ TRUE 0.990 14.000 0.048 0.004 Y NA
 3812225 3812226 SpyM50389 SpyM50390     TRUE 0.998 -7.000 0.429 0.017 Y NA
 3812226 3812227 SpyM50390 SpyM50391     TRUE 0.982 26.000 0.143 0.023 Y NA
 3812227 3812228 SpyM50391 SpyM50391A     FALSE 0.290 80.000 0.000 NA   NA
 3812228 3812229 SpyM50391A SpyM50392   lacA1 TRUE 0.374 65.000 0.000 NA   NA
 3812229 3812230 SpyM50392 SpyM50393 lacA1 lacB1 TRUE 0.998 15.000 0.500 0.002 Y NA
 3812230 3812231 SpyM50393 SpyM50394 lacB1 lacC1 TRUE 0.856 10.000 0.000 NA   NA
 3812231 3812232 SpyM50394 SpyM50395 lacC1 lacD1 TRUE 0.575 44.000 0.000 NA   NA
 3812232 3812233 SpyM50395 SpyM50396 lacD1   FALSE 0.145 197.000 0.019 NA   NA
 3812233 3812234 SpyM50396 SpyM50397     TRUE 0.905 2.000 0.047 NA   NA
 3812238 3812239 SpyM50401 SpyM50402     FALSE 0.205 118.000 0.090 1.000 N NA
 3812239 3812240 SpyM50402 SpyM50403     FALSE 0.225 122.000 0.045 1.000   NA
 3812240 3812241 SpyM50403 SpyM50404     FALSE 0.225 135.000 0.074 1.000   NA
 3812241 3812242 SpyM50404 SpyM50405   glyQ FALSE 0.031 372.000 0.000 1.000   NA
 3812242 3812243 SpyM50405 SpyM50406 glyQ glyS TRUE 0.832 378.000 0.651 0.001 Y NA
 3812243 3812244 SpyM50406 SpyM50407 glyS   FALSE 0.190 154.000 0.020 NA   NA
 3812244 3812245 SpyM50407 SpyM50408     FALSE 0.178 175.000 0.029 NA   NA
 3812245 3812246 SpyM50408 SpyM50409   glpK FALSE 0.032 360.000 0.000 1.000   NA
 3812246 3812247 SpyM50409 SpyM50410 glpK glpO TRUE 0.998 16.000 0.500 0.001 Y NA
 3812247 3812248 SpyM50410 SpyM50411 glpO glpF1 TRUE 0.978 2.000 0.500 1.000 N NA
 3812248 3812249 SpyM50411 SpyM50412 glpF1   TRUE 0.623 109.000 0.364 1.000   NA
 3812249 3812250 SpyM50412 SpyM50413     TRUE 0.990 -10.000 0.462 NA   NA
 3812250 3812251 SpyM50413 SpyM50414     FALSE 0.159 126.000 0.000 NA   NA
 3812251 3812252 SpyM50414 SpyM50415   tkt FALSE 0.174 218.000 0.000 1.000 Y NA
 3812252 3812253 SpyM50415 SpyM50416 tkt   TRUE 0.407 192.000 0.300 NA   NA
 3812253 3812254 SpyM50416 SpyM50417     TRUE 0.846 34.000 0.136 NA   NA
 3812254 3812255 SpyM50417 SpyM50418     TRUE 0.977 5.000 0.341 NA   NA
 3812255 3812256 SpyM50418 SpyM50421   proA FALSE 0.028 878.000 0.000 NA   NA
 3812256 3812257 SpyM50421 SpyM50422 proA   TRUE 0.827 20.000 0.000 NA   NA
 3812257 3812258 SpyM50422 SpyM50423   mraW FALSE 0.053 293.000 0.000 NA   NA
 3812258 3812259 SpyM50423 SpyM50424 mraW ftsL TRUE 0.864 5.000 0.077 1.000 N NA
 3812259 3812260 SpyM50424 SpyM50425 ftsL pbpX TRUE 0.974 4.000 0.456 1.000 N NA
 3812260 3812261 SpyM50425 SpyM50426 pbpX mraY TRUE 0.951 2.000 0.038 1.000 Y NA
 3812261 3812262 SpyM50426 SpyM50427 mraY mraW FALSE 0.085 158.000 0.007 1.000 N NA
 3812262 3812263 SpyM50427 SpyM50428 mraW   FALSE 0.081 194.000 0.018 1.000 N NA
 3812263 3812264 SpyM50428 SpyM50429     TRUE 0.985 0.000 0.310 1.000 Y NA
 3812264 3812265 SpyM50429 SpyM50430     TRUE 0.669 104.000 0.364 NA   NA
 3812265 3812266 SpyM50430 SpyM50431     TRUE 0.609 64.000 0.117 NA   NA
 3812266 3812267 SpyM50431 SpyM50432     FALSE 0.107 169.000 0.033 1.000 N NA
 3812267 3812268 SpyM50432 SpyM50433     FALSE 0.105 171.000 0.032 1.000 N NA
 3812268 3812269 SpyM50433 SpyM50434   nadE TRUE 0.993 2.000 0.194 0.004 Y NA
 3812269 3812270 SpyM50434 SpyM50435 nadE pepC FALSE 0.085 185.000 0.017 1.000 N NA
 3812271 3812272 SpyM50436 SpyM50437 pbp1A recU TRUE 0.983 -13.000 0.319 1.000   NA
 3812273 3812274 SpyM50438 SpyM50439     TRUE 0.757 119.000 0.579 NA   NA
 3812274 3812275 SpyM50439 SpyM5s03     TRUE 0.525 48.000 0.000 NA   NA
 3812275 3812276 SpyM5s03 SpyM50440     FALSE 0.355 68.000 0.000 NA   NA
 3812276 3812277 SpyM50440 SpyM50441     TRUE 0.913 14.000 0.029 NA   NA
 3812278 3812279 SpyM50442 SpyM50443 luxS   TRUE 0.873 -16.000 0.006 1.000 N NA
 3812279 3812280 SpyM50443 SpyM50444     TRUE 0.705 71.000 0.333 1.000 N NA
 3812280 3812281 SpyM50444 SpyM50445   atoA2 TRUE 0.679 33.000 0.000 NA   NA
 3812281 3812282 SpyM50445 SpyM50446 atoA2 atoD2 TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 3812282 3812283 SpyM50446 SpyM50447 atoD2 atoB2 TRUE 0.955 24.000 0.150 1.000 Y NA
 3812284 3812285 SpyM50448 SpyM50449     FALSE 0.162 130.000 0.006 1.000   NA
 3812285 3812286 SpyM50449 SpyM50450   gmk FALSE 0.212 110.000 0.010 1.000   NA
 3812286 3812287 SpyM50450 SpyM50451 gmk rpoZ TRUE 0.977 16.000 0.471 1.000 N NA
 3812287 3812288 SpyM50451 SpyM50452 rpoZ priA TRUE 0.649 65.000 0.032 0.065 N NA
 3812288 3812289 SpyM50452 SpyM50453 priA fmt TRUE 0.388 62.000 0.052 1.000 N NA
 3812289 3812290 SpyM50453 SpyM50454 fmt   TRUE 0.991 -10.000 0.305 1.000 Y NA
 3812290 3812291 SpyM50454 SpyM50455     TRUE 0.656 38.000 0.074 1.000 N NA
 3812291 3812292 SpyM50455 SpyM50456   stk1 TRUE 0.996 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 3812292 3812293 SpyM50456 SpyM50457 stk1   FALSE 0.253 123.000 0.039 NA   NA
 3812293 3812294 SpyM50457 SpyM50458     TRUE 0.993 -3.000 0.679 NA   NA
 3812294 3812295 SpyM50458 SpyM50459     TRUE 0.999 -7.000 0.853 0.013 Y NA
 3812295 3812296 SpyM50459 SpyM50460     TRUE 0.829 37.000 0.164 1.000   NA
 3812296 3812297 SpyM50460 SpyM50461     TRUE 0.937 0.000 0.151 1.000   NA
 3812298 3812299 SpyM50462 SpyM50463 cysM   FALSE 0.205 128.000 0.033 1.000   NA
 3812300 3812301 SpyM50464 SpyM50465 comFA comFC TRUE 0.969 -28.000 0.130 NA   NA
 3812301 3812302 SpyM50465 SpyM50466 comFC   TRUE 0.463 80.000 0.080 NA   NA
 3812302 3812303 SpyM50466 SpyM5r13     FALSE 0.027 908.000 0.000 NA   NA
 3812303 3812304 SpyM5r13 SpyM5t46     TRUE 0.489 50.000 0.000 NA   NA
 3812304 3812305 SpyM5t46 SpyM5r14     FALSE 0.050 300.000 0.000 NA   NA
 3812305 3812306 SpyM5r14 SpyM5r15     FALSE 0.272 83.000 0.000 NA   NA
 3812306 3812307 SpyM5r15 SpyM5t47     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 3812307 3812308 SpyM5t47 SpyM5t48     TRUE 0.842 18.000 0.000 NA   NA
 3812308 3812309 SpyM5t48 SpyM5t49     TRUE 0.692 32.000 0.000 NA   NA
 3812309 3812310 SpyM5t49 SpyM5t50     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 3812310 3812311 SpyM5t50 SpyM5t51     TRUE 0.857 11.000 0.000 NA   NA
 3812311 3812312 SpyM5t51 SpyM5t52     TRUE 0.640 36.000 0.000 NA   NA
 3812312 3812313 SpyM5t52 SpyM5t53     TRUE 0.800 23.000 0.000 NA   NA
 3812314 3812315 SpyM50467 SpyM50468     FALSE 0.180 115.000 0.000 NA   NA
 3812315 3812316 SpyM50468 SpyM50469     FALSE 0.149 132.000 0.000 NA   NA
 3812316 3812317 SpyM50469 SpyM50470   recX TRUE 0.403 80.000 0.025 NA   NA
 3812317 3812318 SpyM50470 SpyM50471 recX   FALSE 0.077 230.000 0.003 1.000   NA
 3812318 3812319 SpyM50471 SpyM50472     FALSE 0.108 182.000 0.000 NA   NA
 3812319 3812320 SpyM50472 SpyM50473     TRUE 0.858 15.000 0.000 NA   NA
 3812320 3812321 SpyM50473 SpyM50474     TRUE 0.975 2.000 0.333 NA   NA
 3812322 3812323 SpyM50475 SpyM50476     TRUE 0.891 28.000 0.000 0.064   NA
 3812325 3812326 SpyM50478 SpyM50479     FALSE 0.284 71.000 0.000 1.000   NA
 3812326 3812327 SpyM50479 SpyM50480     TRUE 0.978 31.000 0.667 NA   NA
 3812327 3812328 SpyM50480 SpyM50481     FALSE 0.229 94.000 0.000 NA   NA
 3812328 3812329 SpyM50481 SpyM50482     TRUE 0.910 -13.000 0.000 NA   NA
 3812329 3812330 SpyM50482 SpyM50483     TRUE 0.994 -9.000 0.667 NA   NA
 3812330 3812331 SpyM50483 SpyM50484     TRUE 0.992 13.000 0.667 NA   NA
 3812331 3812332 SpyM50484 SpyM50485     TRUE 0.995 -19.000 0.667 NA   NA
 3812332 3812333 SpyM50485 SpyM50486     TRUE 0.961 22.000 0.286 NA   NA
 3812333 3812334 SpyM50486 SpyM50487     TRUE 0.846 1.000 0.000 NA   NA
 3812334 3812335 SpyM50487 SpyM50488     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 3812335 3812336 SpyM50488 SpyM50489     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 3812336 3812337 SpyM50489 SpyM50490     TRUE 0.914 -3.000 0.018 NA   NA
 3812337 3812338 SpyM50490 SpyM50491     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812338 3812339 SpyM50491 SpyM50492     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 3812339 3812340 SpyM50492 SpyM50493     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812340 3812341 SpyM50493 SpyM50494     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812341 3812342 SpyM50494 SpyM50495     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 3812342 3812343 SpyM50495 SpyM50496     TRUE 0.847 5.000 0.000 NA   NA
 3812343 3812344 SpyM50496 SpyM50497     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812344 3812345 SpyM50497 SpyM50498     FALSE 0.175 117.000 0.000 NA   NA
 3812345 3812346 SpyM50498 SpyM50499     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 3812346 3812347 SpyM50499 SpyM50500     FALSE 0.131 149.000 0.000 NA   NA
 3812347 3812348 SpyM50500 SpyM50501     FALSE 0.054 291.000 0.000 NA   NA
 3812348 3812349 SpyM50501 SpyM50504     FALSE 0.043 344.000 0.000 NA   NA
 3812349 3812350 SpyM50504 SpyM50505     TRUE 0.580 83.000 0.182 NA   NA
 3812350 3812351 SpyM50505 SpyM50506     TRUE 0.955 14.000 0.167 NA   NA
 3812351 3812352 SpyM50506 SpyM50507     TRUE 0.847 5.000 0.000 NA   NA
 3812352 3812353 SpyM50507 SpyM50509     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 3812353 3812354 SpyM50509 SpyM50510     FALSE 0.257 87.000 0.000 NA   NA
 3812354 3812355 SpyM50510 SpyM50511     FALSE 0.159 126.000 0.000 NA   NA
 3812355 3812356 SpyM50511 SpyM50512     TRUE 0.843 4.000 0.000 NA   NA
 3812356 3812357 SpyM50512 SpyM50513     TRUE 0.449 54.000 0.000 NA   NA
 3812357 3812358 SpyM50513 SpyM50514     TRUE 0.985 -10.000 0.333 NA   NA
 3812358 3812359 SpyM50514 SpyM50515     TRUE 0.983 0.000 0.438 NA   NA
 3812359 3812360 SpyM50515 SpyM50516     TRUE 0.962 -3.000 0.188 NA   NA
 3812360 3812361 SpyM50516 SpyM50517     TRUE 0.995 0.000 1.000 NA   NA
 3812361 3812362 SpyM50517 SpyM50518     TRUE 0.981 44.000 1.000 NA   NA
 3812362 3812363 SpyM50518 SpyM50519     TRUE 0.942 4.000 0.150 NA   NA
 3812363 3812364 SpyM50519 SpyM50521     TRUE 0.902 -10.000 0.000 NA   NA
 3812364 3812365 SpyM50521 SpyM50522     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812365 3812366 SpyM50522 SpyM50523     TRUE 0.964 -3.000 0.200 NA   NA
 3812366 3812367 SpyM50523 SpyM50524     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812367 3812368 SpyM50524 SpyM50525     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 3812368 3812369 SpyM50525 SpyM50527     TRUE 0.861 12.000 0.000 NA   NA
 3812369 3812370 SpyM50527 SpyM50528     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 3812370 3812371 SpyM50528 SpyM50529     TRUE 0.856 10.000 0.000 NA   NA
 3812371 3812372 SpyM50529 SpyM50530     FALSE 0.187 112.000 0.000 NA   NA
 3812372 3812373 SpyM50530 SpyM50531     FALSE 0.333 140.000 0.154 NA   NA
 3812373 3812374 SpyM50531 SpyM50532     TRUE 0.979 -12.000 0.231 NA   NA
 3812375 3812376 SpyM50533 SpyM50534     FALSE 0.060 272.000 0.000 NA   NA
 3812377 3812378 SpyM50535 SpyM50536     FALSE 0.148 191.000 0.016 NA   NA
 3812378 3812379 SpyM50536 SpyM50537     FALSE 0.017 666.000 0.000 NA N NA
 3812380 3812381 SpyM50538 SpyM50539     TRUE 0.954 15.000 0.194 1.000   NA
 3812382 3812383 SpyM50540 SpyM50541     TRUE 0.820 51.000 0.286 1.000   NA
 3812383 3812384 SpyM50541 SpyM50542     TRUE 0.916 25.000 0.182 1.000   NA
 3812385 3812386 SpyM50543 SpyM50544     TRUE 0.692 32.000 0.000 NA   NA
 3812387 3812388 SpyM50545 SpyM50546     TRUE 0.999 10.000 0.917 0.038 Y NA
 3812388 3812389 SpyM50546 SpyM50547     TRUE 0.928 81.000 0.333 0.038 Y NA
 3812389 3812390 SpyM50547 SpyM50548     FALSE 0.049 306.000 0.000 NA   NA
 3812390 3812391 SpyM50548 SpyM50549     TRUE 0.994 -10.000 0.667 NA   NA
 3812391 3812392 SpyM50549 SpyM50550     TRUE 0.992 0.000 0.167 0.013 Y NA
 3812392 3812393 SpyM50550 SpyM50551     TRUE 0.908 20.000 0.167 1.000 N NA
 3812393 3812394 SpyM50551 SpyM50552   aroE FALSE 0.145 138.000 0.061 1.000 N NA
 3812394 3812395 SpyM50552 SpyM50553 aroE   FALSE 0.028 252.000 0.000 1.000 N NA
 3812395 3812396 SpyM50553 SpyM50554     TRUE 0.583 53.000 0.026 NA   NA
 3812396 3812397 SpyM50554 SpyM50555     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 3812397 3812398 SpyM50555 SpyM50556     TRUE 0.827 20.000 0.000 NA   NA
 3812399 3812400 SpyM50557 SpyM50558 aroB   TRUE 0.907 56.000 0.003 0.003 Y NA
 3812400 3812401 SpyM50558 SpyM5t54     FALSE 0.071 241.000 0.000 NA   NA
 3812402 3812403 SpyM50559 SpyM50560     TRUE 0.735 64.000 0.214 NA   NA
 3812403 3812404 SpyM50560 SpyM50562   sag0443 FALSE 0.056 285.000 0.000 NA   NA
 3812404 3812405 SpyM50562 SpyM50563 sag0443   TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812405 3812406 SpyM50563 SpyM50564   valS TRUE 0.882 2.000 0.008 NA   NA
 3812408 3812409 SpyM50566 SpyM50567     TRUE 0.689 92.000 0.375 1.000   NA
 3812409 3812410 SpyM50567 SpyM50568     FALSE 0.149 220.000 0.000 0.079 N NA
 3812410 3812411 SpyM50568 SpyM50569     TRUE 0.993 13.000 0.500 1.000 Y NA
 3812411 3812412 SpyM50569 SpyM50570   msrAB TRUE 0.987 43.000 0.875 1.000 Y NA
 3812412 3812413 SpyM50570 SpyM50571 msrAB   TRUE 0.593 88.000 0.240 1.000   NA
 3812413 3812414 SpyM50571 SpyM50572     TRUE 0.995 -3.000 0.480 0.013   NA
 3812414 3812415 SpyM50572 SpyM50573     FALSE 0.346 73.000 0.007 1.000   NA
 3812415 3812416 SpyM50573 SpyM50574     TRUE 0.849 23.000 0.009 NA   NA
 3812418 3812419 SpyM50576 SpyM50577   arcA FALSE 0.024 274.000 0.000 1.000 N NA
 3812419 3812420 SpyM50577 SpyM50578 arcA   FALSE 0.295 100.000 0.056 1.000   NA
 3812420 3812421 SpyM50578 SpyM50579   arcB TRUE 0.758 40.000 0.104 1.000   NA
 3812421 3812422 SpyM50579 SpyM50580 arcB   FALSE 0.209 170.000 0.104 1.000   NA
 3812422 3812423 SpyM50580 SpyM50581     TRUE 0.929 17.000 0.140 1.000   NA
 3812423 3812424 SpyM50581 SpyM50582   arcC TRUE 0.944 20.000 0.035 1.000 Y NA
 3812424 3812425 SpyM50582 SpyM50584 arcC asnA FALSE 0.105 313.000 0.000 1.000 Y NA
 3812425 3812426 SpyM50584 SpyM50585 asnA   FALSE 0.112 123.000 0.006 1.000 N NA
 3812426 3812427 SpyM50585 SpyM50586   coaD TRUE 0.980 -10.000 0.367 1.000 N NA
 3812427 3812428 SpyM50586 SpyM50587 coaD   TRUE 0.907 -13.000 0.052 1.000 N NA
 3812428 3812429 SpyM50587 SpyM50588     FALSE 0.014 412.000 0.000 1.000 N NA
 3812429 3812430 SpyM50588 SpyM50590     FALSE 0.034 424.000 0.000 NA   NA
 3812430 3812431 SpyM50590 SpyM50591     TRUE 0.893 4.000 0.016 NA   NA
 3812433 3812434 SpyM50593 SpyM50594 dpr   FALSE 0.226 142.000 0.058 NA   NA
 3812434 3812435 SpyM50594 SpyM50595   glkA TRUE 0.985 5.000 0.496 NA   NA
 3812435 3812436 SpyM50595 SpyM50596 glkA   TRUE 0.887 10.000 0.064 NA N NA
 3812436 3812437 SpyM50596 SpyM50597     FALSE 0.086 183.000 0.003 NA N NA
 3812437 3812438 SpyM50597 SpyM50598     FALSE 0.235 122.000 0.015 NA   NA
 3812438 3812439 SpyM50598 SpyM50599   murD FALSE 0.055 356.000 0.006 NA   NA
 3812439 3812440 SpyM50599 SpyM50600 murD murG TRUE 0.957 0.000 0.060 1.000 Y NA
 3812440 3812441 SpyM50600 SpyM50601 murG   TRUE 0.963 1.000 0.072 NA Y NA
 3812441 3812442 SpyM50601 SpyM50602   ftsA TRUE 0.379 212.000 0.389 NA N NA
 3812442 3812443 SpyM50602 SpyM50603 ftsA ftsZ TRUE 0.985 24.000 0.460 1.000 Y NA
 3812443 3812444 SpyM50603 SpyM50604 ftsZ   TRUE 0.899 3.000 0.030 NA   NA
 3812444 3812445 SpyM50604 SpyM50605     TRUE 0.961 12.000 0.194 NA   NA
 3812445 3812446 SpyM50605 SpyM50606     TRUE 0.978 5.000 0.370 NA   NA
 3812446 3812447 SpyM50606 SpyM50607     TRUE 0.967 0.000 0.287 1.000   NA
 3812447 3812448 SpyM50607 SpyM50608     TRUE 0.989 10.000 0.579 NA   NA
 3812448 3812449 SpyM50608 SpyM50609   ileS FALSE 0.057 273.000 0.012 NA N NA
 3812450 3812451 SpyM50610 SpyM50611     TRUE 0.688 51.000 0.114 NA   NA
 3812451 3812452 SpyM50611 SpyM50612   clpE FALSE 0.176 128.000 0.079 1.000 N NA
 3812453 3812454 SpyM50613 SpyM50614     FALSE 0.247 127.000 0.044 NA   NA
 3812454 3812455 SpyM50614 SpyM50615   glnQ3 TRUE 0.994 0.000 0.640 1.000 Y NA
 3812455 3812456 SpyM50615 SpyM50616 glnQ3 phr FALSE 0.057 149.000 0.000 1.000 N NA
 3812458 3812459 SpyM50618 SpyM50619   folD FALSE 0.067 208.000 0.013 1.000 N NA
 3812459 3812460 SpyM50619 SpyM50620 folD xseA FALSE 0.118 153.000 0.045 1.000 N NA
 3812460 3812461 SpyM50620 SpyM50621 xseA xseB TRUE 0.999 -22.000 0.412 0.001 Y NA
 3812461 3812462 SpyM50621 SpyM50622 xseB fps TRUE 0.883 0.000 0.100 1.000 N NA
 3812462 3812463 SpyM50622 SpyM50623 fps   TRUE 0.891 -7.000 0.058 1.000 N NA
 3812463 3812464 SpyM50623 SpyM50624     TRUE 0.905 -13.000 0.048 1.000 N NA
 3812464 3812465 SpyM50624 SpyM50625   recN TRUE 0.800 21.000 0.037 1.000 N NA
 3812465 3812466 SpyM50625 SpyM50626 recN   FALSE 0.093 172.000 0.000 1.000   NA
 3812466 3812467 SpyM50626 SpyM50627     FALSE 0.078 228.000 0.000 NA   NA
 3812467 3812468 SpyM50627 SpyM50628     TRUE 0.972 -7.000 0.203 NA   NA
 3812468 3812469 SpyM50628 SpyM50629     TRUE 0.997 -22.000 0.828 NA   NA
 3812469 3812470 SpyM50629 SpyM50630   hlpA TRUE 0.468 99.000 0.156 NA   NA
 3812471 3812472 SpyM50631 SpyM50632     FALSE 0.162 124.000 0.000 NA   NA
 3812472 3812473 SpyM50632 SpyM50633     TRUE 0.861 12.000 0.000 NA   NA
 3812473 3812474 SpyM50633 SpyM50634     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 3812475 3812476 SpyM50635 SpyM50636     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 3812476 3812477 SpyM50636 SpyM50636A     FALSE 0.041 363.000 0.000 NA   NA
 3812477 3812478 SpyM50636A SpyM50638     FALSE 0.299 79.000 0.000 NA   NA
 3812478 3812479 SpyM50638 SpyM50639     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 3812479 3812480 SpyM50639 SpyM50640     FALSE 0.193 109.000 0.000 NA   NA
 3812480 3812481 SpyM50640 SpyM50641     FALSE 0.125 155.000 0.000 NA   NA
 3812481 3812482 SpyM50641 SpyM50642     TRUE 0.947 -19.000 0.018 NA   NA
 3812482 3812483 SpyM50642 SpyM50643     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812483 3812484 SpyM50643 SpyM50644     TRUE 0.855 9.000 0.000 NA   NA
 3812484 3812485 SpyM50644 SpyM50645     TRUE 0.434 56.000 0.000 NA   NA
 3812485 3812486 SpyM50645 SpyM50646     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 3812486 3812487 SpyM50646 SpyM50647     TRUE 0.933 10.000 0.100 NA   NA
 3812487 3812488 SpyM50647 SpyM50649     FALSE 0.097 196.000 0.000 NA   NA
 3812488 3812489 SpyM50649 SpyM50650     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812489 3812490 SpyM50650 SpyM50651     TRUE 0.910 -13.000 0.000 NA   NA
 3812490 3812491 SpyM50651 SpyM50652     TRUE 0.739 28.000 0.000 NA   NA
 3812491 3812492 SpyM50652 SpyM50653     TRUE 0.902 -10.000 0.000 NA   NA
 3812492 3812493 SpyM50653 SpyM50654     TRUE 0.525 48.000 0.000 NA   NA
 3812493 3812494 SpyM50654 SpyM50655     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812494 3812495 SpyM50655 SpyM50657     FALSE 0.034 434.000 0.000 NA   NA
 3812495 3812496 SpyM50657 SpyM50658     FALSE 0.193 109.000 0.000 NA   NA
 3812496 3812497 SpyM50658 SpyM50659     FALSE 0.131 149.000 0.000 NA   NA
 3812497 3812498 SpyM50659 SpyM50660     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812498 3812499 SpyM50660 SpyM50661     TRUE 0.984 -7.000 0.353 NA   NA
 3812499 3812500 SpyM50661 SpyM50662     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 3812500 3812501 SpyM50662 SpyM50663     FALSE 0.308 77.000 0.000 NA   NA
 3812501 3812502 SpyM50663 SpyM50664     TRUE 0.890 -7.000 0.000 NA   NA
 3812502 3812503 SpyM50664 SpyM50665     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 3812503 3812504 SpyM50665 SpyM50666     FALSE 0.278 82.000 0.000 NA   NA
 3812504 3812505 SpyM50666 SpyM50667     TRUE 0.732 71.000 0.263 NA   NA
 3812505 3812506 SpyM50667 SpyM50668     TRUE 0.970 25.000 0.417 NA   NA
 3812506 3812507 SpyM50668 SpyM50669     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 3812507 3812508 SpyM50669 SpyM50670     TRUE 0.856 10.000 0.000 NA   NA
 3812508 3812509 SpyM50670 SpyM50671     TRUE 0.996 -40.000 0.667 NA   NA
 3812509 3812510 SpyM50671 SpyM50672     TRUE 0.988 -7.000 0.467 NA   NA
 3812510 3812511 SpyM50672 SpyM50673     TRUE 0.992 1.000 0.750 NA   NA
 3812511 3812512 SpyM50673 SpyM50674     TRUE 0.985 12.000 0.444 NA   NA
 3812512 3812513 SpyM50674 SpyM50675     TRUE 0.965 11.000 0.222 NA   NA
 3812513 3812514 SpyM50675 SpyM50676     TRUE 0.994 15.000 0.833 NA   NA
 3812514 3812515 SpyM50676 SpyM50677     TRUE 0.967 0.000 0.250 NA   NA
 3812515 3812516 SpyM50677 SpyM50678     TRUE 0.962 -3.000 0.188 NA   NA
 3812516 3812517 SpyM50678 SpyM50679     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812517 3812518 SpyM50679 SpyM50680     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812518 3812519 SpyM50680 SpyM50681     TRUE 0.858 15.000 0.000 NA   NA
 3812519 3812520 SpyM50681 SpyM50682     TRUE 0.861 12.000 0.000 NA   NA
 3812520 3812521 SpyM50682 SpyM50683     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 3812521 3812522 SpyM50683 SpyM50684     TRUE 0.857 11.000 0.000 NA   NA
 3812522 3812523 SpyM50684 SpyM50685     TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   NA
 3812523 3812524 SpyM50685 SpyM50686     TRUE 0.843 4.000 0.000 NA   NA
 3812524 3812525 SpyM50686 SpyM50687     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812525 3812526 SpyM50687 SpyM50688     TRUE 0.655 35.000 0.000 NA   NA
 3812526 3812527 SpyM50688 SpyM50689     FALSE 0.135 142.000 0.000 NA   NA
 3812527 3812528 SpyM50689 SpyM50690     FALSE 0.106 184.000 0.000 NA   NA
 3812528 3812529 SpyM50690 SpyM50691     FALSE 0.079 222.000 0.000 NA   NA
 3812529 3812530 SpyM50691 SpyM50692     FALSE 0.366 66.000 0.000 NA   NA
 3812530 3812531 SpyM50692 SpyM50693     FALSE 0.031 532.000 0.000 NA   NA
 3812531 3812532 SpyM50693 SpyM50694     TRUE 0.439 72.000 0.018 NA   NA
 3812534 3812535 SpyM50696 SpyM50697 gpmA   FALSE 0.226 107.000 0.012 1.000   NA
 3812535 3812536 SpyM50697 SpyM50698     FALSE 0.249 161.000 0.107 NA   NA
 3812536 3812537 SpyM50698 SpyM50699     FALSE 0.313 124.000 0.105 NA   NA
 3812537 3812538 SpyM50699 SpyM50700     FALSE 0.024 560.000 0.000 1.000   NA
 3812538 3812539 SpyM50700 SpyM50701   recR TRUE 0.475 47.000 0.000 1.000   NA
 3812539 3812540 SpyM50701 SpyM50702 recR ddl FALSE 0.158 101.000 0.010 1.000 N NA
 3812540 3812541 SpyM50702 SpyM50703 ddl murF TRUE 0.583 199.000 0.046 0.010 Y NA
 3812541 3812542 SpyM50703 SpyM50704 murF   TRUE 0.460 80.000 0.078 NA   NA
 3812542 3812543 SpyM50704 SpyM50705   prfC FALSE 0.086 248.000 0.003 NA   NA
 3812543 3812544 SpyM50705 SpyM50706 prfC   FALSE 0.108 307.000 0.000 1.000 Y NA
 3812544 3812545 SpyM50706 SpyM50707     FALSE 0.110 127.000 0.007 1.000 N NA
 3812546 3812547 SpyM50708 SpyM50709     TRUE 0.972 -10.000 0.209 1.000   NA
 3812548 3812549 SpyM50710 SpyM50711   comEA FALSE 0.072 199.000 0.014 1.000 N NA
 3812549 3812550 SpyM50711 SpyM50712 comEA comEC TRUE 0.961 -19.000 0.130 1.000   NA
 3812550 3812551 SpyM50712 SpyM50713 comEC holA TRUE 0.588 71.000 0.163 1.000   NA
 3812551 3812552 SpyM50713 SpyM50714 holA sodA FALSE 0.170 97.000 0.012 1.000 N NA
 3812552 3812553 SpyM50714 SpyM50715 sodA   FALSE 0.119 168.000 0.000 NA   NA
 3812554 3812555 SpyM50716 SpyM50717   queA TRUE 0.881 7.000 0.004 NA   NA
 3812556 3812557 SpyM50718 SpyM50719 nagB   FALSE 0.308 74.000 0.051 1.000 N NA
 3812557 3812558 SpyM50719 SpyM50721     FALSE 0.081 295.000 0.020 NA   NA
 3812558 3812559 SpyM50721 SpyM50722   pepB TRUE 0.965 13.000 0.204 NA   NA
 3812559 3812560 SpyM50722 SpyM50723 pepB   FALSE 0.016 376.000 0.000 1.000 N NA
 3812560 3812561 SpyM50723 SpyM50724     TRUE 0.406 66.000 0.012 1.000   NA
 3812561 3812562 SpyM50724 SpyM50725   prsA TRUE 0.434 63.000 0.012 1.000   NA
 3812562 3812563 SpyM50725 SpyM50726 prsA alaS FALSE 0.015 387.000 0.000 1.000 N NA
 3812563 3812564 SpyM50726 SpyM50727 alaS   FALSE 0.103 186.000 0.000 NA   NA
 3812564 3812565 SpyM50727 SpyM50728     TRUE 0.606 41.000 0.000 NA   NA
 3812565 3812566 SpyM50728 SpyM50729     TRUE 0.981 -3.000 0.362 NA   NA
 3812566 3812567 SpyM50729 SpyM50730     TRUE 0.913 19.000 0.077 NA   NA
 3812568 3812569 SpyM50732 SpyM50733     TRUE 0.679 33.000 0.000 NA   NA
 3812569 3812570 SpyM50733 SpyM50734     FALSE 0.061 138.000 0.000 1.000 N NA
 3812570 3812571 SpyM50734 SpyM50735   nrdF TRUE 0.917 -10.000 0.083 1.000 N NA
 3812571 3812572 SpyM50735 SpyM50737 nrdF   TRUE 0.788 333.000 0.500 0.003 Y NA
 3812572 3812573 SpyM50737 SpyM50738   nrdH TRUE 0.978 20.000 0.562 1.000 N NA
 3812574 3812575 SpyM50739 SpyM50740 ptsH pstI TRUE 0.994 5.000 0.240 0.015 Y NA
 3812575 3812576 SpyM50740 SpyM50741 pstI gapN FALSE 0.095 185.000 0.035 1.000 N NA
 3812576 3812577 SpyM50741 SpyM50742 gapN   FALSE 0.199 95.000 0.028 1.000 N NA
 3812579 3812580 SpyM50744 SpyM50745 udk   FALSE 0.367 80.000 0.010 NA   NA
 3812582 3812583 SpyM50747 SpyM50748   dnaH TRUE 0.864 0.000 0.030 NA N NA
 3812585 3812586 SpyM50750 SpyM50751   metK FALSE 0.024 537.000 0.000 1.000   NA
 3812586 3812587 SpyM50751 SpyM50752 metK murA2 FALSE 0.101 174.000 0.026 1.000 N NA
 3812587 3812588 SpyM50752 SpyM50753 murA2 graB FALSE 0.032 358.000 0.000 1.000   NA
 3812588 3812589 SpyM50753 SpyM50754 graB   FALSE 0.058 238.000 0.000 1.000   NA
 3812589 3812590 SpyM50754 SpyM50755     TRUE 0.967 9.000 0.342 1.000 N NA
 3812590 3812591 SpyM50755 SpyM50756     TRUE 0.947 16.000 0.235 1.000 N NA
 3812591 3812592 SpyM50756 SpyM50757     TRUE 0.974 2.000 0.373 1.000   NA
 3812592 3812593 SpyM50757 SpyM50758   aroA FALSE 0.210 102.000 0.003 1.000   NA
 3812593 3812594 SpyM50758 SpyM50759 aroA aroK TRUE 0.963 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 3812594 3812595 SpyM50759 SpyM50760 aroK   FALSE 0.119 208.000 0.111 1.000 N NA
 3812595 3812596 SpyM50760 SpyM50761     TRUE 0.566 49.000 0.093 1.000 N NA
 3812596 3812597 SpyM50761 SpyM50762     TRUE 0.620 39.000 0.000 NA   NA
 3812597 3812598 SpyM50762 SpyM50763     FALSE 0.262 85.000 0.000 NA   NA
 3812603 3812604 SpyM50770 SpyM50771     TRUE 0.679 33.000 0.000 NA   NA
 3812604 3812605 SpyM50771 SpyM50772     FALSE 0.200 78.000 0.000 NA N NA
 3812607 3812608 SpyM50774 SpyM50775     TRUE 0.966 21.000 0.000 0.059 Y NA
 3812609 3812610 SpyM50776 SpyM50777   obgE TRUE 0.516 57.000 0.011 NA   NA
 3812610 3812611 SpyM50777 SpyM50778 obgE   TRUE 0.428 69.000 0.009 NA   NA
 3812613 3812614 SpyM50780 SpyM50781     TRUE 0.985 9.000 0.500 1.000   NA
 3812614 3812615 SpyM50781 SpyM50782     FALSE 0.289 106.000 0.064 1.000   NA
 3812615 3812616 SpyM50782 SpyM50783     TRUE 0.953 23.000 0.064 0.015 N NA
 3812616 3812617 SpyM50783 SpyM50784     TRUE 0.997 3.000 0.500 0.015 Y NA
 3812617 3812618 SpyM50784 SpyM50785     TRUE 0.988 -3.000 0.500 NA   NA
 3812618 3812619 SpyM50785 SpyM50786     TRUE 0.376 193.000 0.273 NA   NA
 3812619 3812620 SpyM50786 SpyM50787     TRUE 0.961 -3.000 0.182 NA   NA
 3812621 3812622 SpyM50788 SpyM50789 glnQ1   TRUE 0.986 0.000 0.326 1.000 Y NA
 3812623 3812624 SpyM50790 SpyM50791 uvrB   FALSE 0.063 263.000 0.000 NA   NA
 3812624 3812625 SpyM50791 SpyM50792   dltA TRUE 0.988 12.000 0.549 NA   NA
 3812625 3812626 SpyM50792 SpyM50793 dltA dltB TRUE 0.980 -3.000 0.435 NA N NA
 3812626 3812627 SpyM50793 SpyM50794 dltB dltC TRUE 0.979 18.000 0.387 NA   NA
 3812627 3812628 SpyM50794 SpyM50795 dltC dltD TRUE 0.987 -7.000 0.409 NA   NA
 3812628 3812629 SpyM50795 SpyM50796 dltD   TRUE 0.733 31.000 0.042 NA N NA
 3812630 3812631 SpyM50797 SpyM50798     FALSE 0.054 291.000 0.000 NA   NA
 3812633 3812634 SpyM50800 SpyM50801 malD malC TRUE 0.998 0.000 0.793 0.036 Y NA
 3812634 3812635 SpyM50801 SpyM50802 malC malE TRUE 0.848 274.000 0.690 0.036 Y NA
 3812636 3812637 SpyM50803 SpyM50804   malM TRUE 0.665 115.000 0.538 1.000 N NA
 3812637 3812638 SpyM50804 SpyM50805 malM glgP TRUE 0.984 35.000 0.289 0.021 Y NA
 3812639 3812640 SpyM50806 SpyM5s04   ssrA FALSE 0.049 302.000 0.000 NA   NA
 3812642 3812643 SpyM50808 SpyM50809     TRUE 0.985 10.000 0.471 NA   NA
 3812643 3812644 SpyM50809 SpyM50810     TRUE 0.972 0.000 0.412 1.000 N NA
 3812645 3812646 SpyM50811 SpyM50812 dnaE pfk FALSE 0.348 80.000 0.098 1.000 N NA
 3812646 3812647 SpyM50812 SpyM50813 pfk pyk TRUE 0.958 63.000 0.261 0.006 Y NA
 3812647 3812648 SpyM50813 SpyM50814 pyk sipC FALSE 0.091 218.000 0.072 1.000 N NA
 3812648 3812649 SpyM50814 SpyM50815 sipC gcaA FALSE 0.083 176.000 0.011 1.000 N NA
 3812649 3812650 SpyM50815 SpyM50816 gcaA   FALSE 0.066 196.000 0.008 1.000 N NA
 3812650 3812651 SpyM50816 SpyM50817     FALSE 0.167 107.000 0.018 1.000 N NA
 3812651 3812652 SpyM50817 SpyM50818     TRUE 0.968 10.000 0.130 1.000 Y NA
 3812652 3812653 SpyM50818 SpyM50819     TRUE 0.972 16.000 0.154 1.000 Y NA
 3812653 3812654 SpyM50819 SpyM50820   cfa FALSE 0.039 371.000 0.000 NA   NA
 3812655 3812656 SpyM50821 SpyM50822     TRUE 0.407 120.000 0.060 0.074 N NA
 3812657 3812658 SpyM50823 SpyM50824 pcrA   FALSE 0.032 363.000 0.000 1.000   NA
 3812658 3812659 SpyM50824 SpyM50825     TRUE 0.930 37.000 0.357 NA   NA
 3812659 3812660 SpyM50825 SpyM50826     TRUE 0.945 11.000 0.143 NA   NA
 3812660 3812661 SpyM50826 SpyM50827     TRUE 0.924 13.000 0.060 NA   NA
 3812661 3812662 SpyM50827 SpyM50828     TRUE 0.960 41.000 0.600 NA   NA
 3812662 3812663 SpyM50828 SpyM50829     TRUE 0.989 8.000 0.600 NA   NA
 3812663 3812664 SpyM50829 SpyM50830     TRUE 0.403 163.000 0.238 NA   NA
 3812666 3812667 SpyM50832 SpyM50833     TRUE 0.991 15.000 0.438 1.000 Y NA
 3812667 3812668 SpyM50833 SpyM50834     TRUE 0.400 92.000 0.121 1.000   NA
 3812668 3812669 SpyM50834 SpyM50835     TRUE 0.914 11.000 0.045 NA   NA
 3812669 3812670 SpyM50835 SpyM50836     FALSE 0.331 97.000 0.045 NA   NA
 3812670 3812671 SpyM50836 SpyM50837   truB FALSE 0.248 116.000 0.014 NA   NA
 3812671 3812672 SpyM50837 SpyM50838 truB ribC TRUE 0.917 29.000 0.308 1.000 N NA
 3812672 3812673 SpyM50838 SpyM50839 ribC spxA TRUE 0.529 43.000 0.017 1.000 N NA
 3812673 3812674 SpyM50839 SpyM50840 spxA   TRUE 0.949 2.000 0.169 NA   NA
 3812674 3812675 SpyM50840 SpyM50841     TRUE 0.986 -10.000 0.337 NA   NA
 3812675 3812676 SpyM50841 SpyM50842     TRUE 0.949 3.000 0.229 NA N NA
 3812676 3812677 SpyM50842 SpyM50843   pstS TRUE 0.431 140.000 0.303 NA N NA
 3812677 3812678 SpyM50843 SpyM50844 pstS pstC TRUE 0.979 11.000 0.206 1.000 Y NA
 3812678 3812679 SpyM50844 SpyM50845 pstC   TRUE 0.999 -10.000 0.907 0.003 Y NA
 3812679 3812680 SpyM50845 SpyM50846   pstB2 TRUE 0.998 16.000 0.490 0.003 Y NA
 3812680 3812681 SpyM50846 SpyM50847 pstB2 pstB1 TRUE 0.998 13.000 0.542 0.001 Y NA
 3812681 3812682 SpyM50847 SpyM50848 pstB1 phoU TRUE 0.911 68.000 0.413 NA Y NA
 3812682 3812683 SpyM50848 SpyM50849 phoU lap FALSE 0.118 205.000 0.067 NA N NA
 3812683 3812684 SpyM50849 SpyM50850 lap ciaR FALSE 0.044 345.000 0.061 1.000 N NA
 3812684 3812685 SpyM50850 SpyM50851 ciaR ciaH TRUE 0.996 -7.000 0.606 1.000 Y NA
 3812686 3812687 SpyM50852 SpyM50853 rpsT coaA FALSE 0.289 69.000 0.014 1.000 N NA
 3812688 3812689 SpyM50854 SpyM50855   cdd FALSE 0.012 654.000 0.000 1.000 N NA
 3812689 3812690 SpyM50855 SpyM50856 cdd   TRUE 0.618 94.000 0.300 1.000   NA
 3812690 3812691 SpyM50856 SpyM50857     FALSE 0.187 139.000 0.036 1.000   NA
 3812691 3812692 SpyM50857 SpyM50858     TRUE 0.986 -7.000 0.438 1.000   NA
 3812692 3812693 SpyM50858 SpyM50859     TRUE 0.996 2.000 0.720 0.036   NA
 3812694 3812695 SpyM50860 SpyM50861 pgmA   FALSE 0.228 176.000 0.098 NA   NA
 3812695 3812696 SpyM50861 SpyM50862   coaC TRUE 0.536 58.000 0.019 NA   NA
 3812696 3812697 SpyM50862 SpyM50863 coaC dpfB TRUE 0.889 -7.000 0.002 1.000   NA
 3812698 3812699 SpyM50864 SpyM50865     TRUE 0.845 -3.000 0.019 1.000 N NA
 3812699 3812700 SpyM50865 SpyM50866     TRUE 0.972 -3.000 0.100 NA Y NA
 3812700 3812701 SpyM50866 SpyM50867     TRUE 0.943 42.000 0.571 NA N NA
 3812701 3812702 SpyM50867 SpyM50868     TRUE 0.951 -7.000 0.107 NA   NA
 3812702 3812703 SpyM50868 SpyM50869     TRUE 0.979 -7.000 0.286 NA   NA
 3812703 3812704 SpyM50869 SpyM50870   lplA TRUE 0.794 47.000 0.250 1.000 N NA
 3812704 3812705 SpyM50870 SpyM50871 lplA fhs1 FALSE 0.318 129.000 0.200 1.000 N NA
 3812705 3812706 SpyM50871 SpyM50872 fhs1   FALSE 0.310 85.000 0.094 1.000 N NA
 3812706 3812707 SpyM50872 SpyM50873     FALSE 0.037 322.000 0.000 1.000   NA
 3812709 3812710 SpyM50875 SpyM50876     TRUE 0.970 -22.000 0.142 NA   NA
 3812710 3812711 SpyM50876 SpyM50877     FALSE 0.281 113.000 0.040 NA   NA
 3812711 3812712 SpyM50877 SpyM50878   murM FALSE 0.073 202.000 0.000 1.000   NA
 3812714 3812715 SpyM50880 SpyM50881     TRUE 0.588 56.000 0.057 NA   NA
 3812715 3812716 SpyM50881 SpyM50882     TRUE 0.609 89.000 0.032 0.042   NA
 3812716 3812717 SpyM50882 SpyM50883   ffh TRUE 0.941 15.000 0.151 1.000   NA
 3812719 3812720 SpyM50885 SpyM50886 xerS   FALSE 0.028 408.000 0.000 1.000   NA
 3812720 3812721 SpyM50886 SpyM50887   citC FALSE 0.203 89.000 0.000 1.000   NA
 3812722 3812723 SpyM50888 SpyM50889   citX TRUE 0.895 0.000 0.123 1.000 N NA
 3812723 3812724 SpyM50889 SpyM50890 citX citF TRUE 0.929 -7.000 0.138 1.000 N NA
 3812724 3812725 SpyM50890 SpyM50891 citF citE TRUE 0.979 3.000 0.119 0.001 N NA
 3812725 3812726 SpyM50891 SpyM50892 citE citD TRUE 0.994 -12.000 0.284 0.002 N NA
 3812726 3812727 SpyM50892 SpyM50893 citD   TRUE 0.857 36.000 0.192 1.000   NA
 3812727 3812728 SpyM50893 SpyM50894     TRUE 0.991 18.000 0.273 0.003   NA
 3812728 3812729 SpyM50894 SpyM50895     TRUE 0.635 45.000 0.103 1.000 N NA
 3812729 3812730 SpyM50895 SpyM50896     TRUE 0.606 57.000 0.077 NA   NA
 3812731 3812732 SpyM50897 SpyM50898     TRUE 0.453 158.000 0.400 1.000 N NA
 3812732 3812733 SpyM50898 SpyM50899   citG TRUE 0.991 -7.000 0.700 1.000 N NA
 3812734 3812735 SpyM50900 SpyM50901     TRUE 0.977 10.000 0.062 0.001 N NA
 3812735 3812736 SpyM50901 SpyM50902     TRUE 0.986 0.000 0.500 NA   NA
 3812736 3812737 SpyM50902 SpyM50903     TRUE 0.879 43.000 0.250 NA   NA
 3812737 3812738 SpyM50903 SpyM50904     FALSE 0.081 154.000 0.005 1.000 N NA
 3812738 3812739 SpyM50904 SpyM50905   topA FALSE 0.215 135.000 0.137 1.000 N NA
 3812739 3812740 SpyM50905 SpyM50906 topA   TRUE 0.689 106.000 0.238 1.000 Y NA
 3812740 3812741 SpyM50906 SpyM50907   rnhB TRUE 0.681 65.000 0.037 1.000 Y NA
 3812741 3812742 SpyM50907 SpyM50908 rnhB rbgA TRUE 0.958 -10.000 0.148 1.000   NA
 3812743 3812744 SpyM50909 SpyM50910     TRUE 0.943 -3.000 0.146 1.000   NA
 3812744 3812745 SpyM50910 SpyM50912     FALSE 0.175 117.000 0.000 NA   NA
 3812746 3812747 SpyM50913 SpyM50914     FALSE 0.029 614.000 0.000 NA   NA
 3812747 3812748 SpyM50914 SpyM50915   srtA FALSE 0.299 83.000 0.039 NA N NA
 3812748 3812749 SpyM50915 SpyM50916 srtA cafB TRUE 0.820 20.000 0.013 NA N NA
 3812751 3812752 SpyM50918 SpyM50919 nox   FALSE 0.057 240.000 0.000 1.000   NA
 3812752 3812753 SpyM50919 SpyM50920     TRUE 0.999 3.000 0.895 0.007 Y NA
 3812753 3812754 SpyM50920 SpyM50921     TRUE 0.911 10.000 0.035 NA   NA
 3812754 3812755 SpyM50921 SpyM50922     TRUE 0.846 1.000 0.000 NA   NA
 3812755 3812756 SpyM50922 SpyM50923   glyA TRUE 0.853 7.000 0.000 NA   NA
 3812756 3812757 SpyM50923 SpyM50924 glyA   TRUE 0.934 -10.000 0.056 1.000   NA
 3812757 3812758 SpyM50924 SpyM50925     TRUE 0.888 18.000 0.012 NA   NA
 3812758 3812759 SpyM50925 SpyM50926     TRUE 0.977 -16.000 0.029 NA Y NA
 3812759 3812760 SpyM50926 SpyM50927   prfA TRUE 0.961 0.000 0.084 1.000 Y NA
 3812760 3812761 SpyM50927 SpyM50928 prfA tdk TRUE 0.664 35.000 0.062 1.000 N NA
 3812762 3812763 SpyM50929 SpyM50930     TRUE 0.737 53.000 0.189 1.000   NA
 3812764 3812765 SpyM50931 SpyM50932 pbuX xpt TRUE 0.954 0.000 0.046 1.000 Y NA
 3812765 3812766 SpyM50932 SpyM5s05 xpt   FALSE 0.247 89.000 0.000 NA   NA
 3812766 3812767 SpyM5s05 SpyM50933     FALSE 0.164 123.000 0.000 NA   NA
 3812767 3812768 SpyM50933 SpyM50934     FALSE 0.024 278.000 0.000 1.000 N NA
 3812768 3812769 SpyM50934 SpyM50935     TRUE 0.978 -7.000 0.382 1.000 N NA
 3812771 3812772 SpyM50937 SpyM50938   eutD TRUE 0.461 128.000 0.031 0.043   NA
 3812772 3812773 SpyM50938 SpyM50939 eutD   TRUE 0.854 4.000 0.067 1.000 N NA
 3812773 3812774 SpyM50939 SpyM50940   ppnK TRUE 0.922 -3.000 0.150 1.000 N NA
 3812774 3812775 SpyM50940 SpyM50941 ppnK   TRUE 0.995 -16.000 0.725 1.000   NA
 3812776 3812777 SpyM50942 SpyM50943   prs2 FALSE 0.283 140.000 0.145 1.000   NA
 3812777 3812778 SpyM50943 SpyM50944 prs2   TRUE 0.966 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 3812778 3812779 SpyM50944 SpyM50945     TRUE 0.968 -10.000 0.166 NA   NA
 3812779 3812780 SpyM50945 SpyM50946   rex FALSE 0.134 252.000 0.083 NA   NA
 3812780 3812781 SpyM50946 SpyM50947 rex   TRUE 0.991 10.000 0.714 1.000   NA
 3812782 3812783 SpyM50948 SpyM50949 radC   TRUE 0.647 49.000 0.046 NA   NA
 3812783 3812784 SpyM50949 SpyM50950     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 3812784 3812785 SpyM50950 SpyM50951     TRUE 0.552 46.000 0.000 NA   NA
 3812785 3812786 SpyM50951 SpyM50952     FALSE 0.133 163.000 0.071 1.000 N NA
 3812786 3812787 SpyM50952 SpyM50953   aphA FALSE 0.089 178.000 0.000 1.000   NA
 3812789 3812790 SpyM50955 SpyM50956   malP TRUE 0.976 31.000 0.432 1.000 Y NA
 3812791 3812792 SpyM50957 SpyM50958     TRUE 0.985 -19.000 0.154 1.000 Y NA
 3812793 3812794 SpyM50959 SpyM50960 potD potC TRUE 0.995 -7.000 0.253 0.035 Y NA
 3812794 3812795 SpyM50960 SpyM50961 potC potB TRUE 0.997 -3.000 0.492 0.035 Y NA
 3812795 3812796 SpyM50961 SpyM50962 potB potA TRUE 0.999 -16.000 0.928 0.035 Y NA
 3812796 3812797 SpyM50962 SpyM50963 potA murB TRUE 0.530 46.000 0.041 1.000 N NA
 3812797 3812798 SpyM50963 SpyM50964 murB folK FALSE 0.094 150.000 0.010 1.000 N NA
 3812798 3812799 SpyM50964 SpyM50965 folK folB TRUE 0.973 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 3812799 3812800 SpyM50965 SpyM50966 folB folP TRUE 0.963 7.000 0.094 1.000 Y NA
 3812800 3812801 SpyM50966 SpyM50967 folP folE TRUE 0.961 9.000 0.073 1.000 Y NA
 3812801 3812802 SpyM50967 SpyM50968 folE folC1 TRUE 0.878 35.000 0.057 1.000 Y NA
 3812802 3812803 SpyM50968 SpyM50969 folC1   FALSE 0.247 89.000 0.000 NA   NA
 3812805 3812806 SpyM50971 SpyM50972   rplL FALSE 0.030 239.000 0.000 1.000 N NA
 3812806 3812807 SpyM50972 SpyM50973 rplL rplJ TRUE 0.989 65.000 0.884 0.028 Y NA
 3812808 3812809 SpyM50974 SpyM50975   trmE FALSE 0.199 90.000 0.000 1.000   NA
 3812810 3812811 SpyM50976 SpyM50977 pepV   FALSE 0.299 125.000 0.179 1.000 N NA
 3812811 3812812 SpyM50977 SpyM50978   uvrC FALSE 0.066 185.000 0.004 1.000 N NA
 3812812 3812813 SpyM50978 SpyM50979 uvrC   FALSE 0.095 102.000 0.000 1.000 N NA
 3812813 3812814 SpyM50979 SpyM50980     FALSE 0.080 115.000 0.000 1.000 N NA
 3812814 3812815 SpyM50980 SpyM50981     TRUE 0.987 -6.000 0.571 1.000 N NA
 3812815 3812816 SpyM50981 SpyM50982     TRUE 0.997 4.000 0.500 0.012 Y NA
 3812816 3812817 SpyM50982 SpyM50983     TRUE 0.561 136.000 0.222 0.058 N NA
 3812817 3812818 SpyM50983 SpyM50984     TRUE 0.999 -3.000 0.778 0.024 Y NA
 3812818 3812819 SpyM50984 SpyM50985     TRUE 0.998 17.000 0.778 0.024 Y NA
 3812819 3812820 SpyM50985 SpyM50986     TRUE 0.998 19.000 0.786 0.020 Y NA
 3812820 3812821 SpyM50986 SpyM50987     FALSE 0.071 207.000 0.000 1.000   NA
 3812821 3812822 SpyM50987 SpyM50988   csrA FALSE 0.123 130.000 0.000 1.000   NA
 3812822 3812823 SpyM50988 SpyM50989 csrA scl2 FALSE 0.102 187.000 0.000 NA   NA
 3812823 3812824 SpyM50989 SpyM50990 scl2 lepA FALSE 0.102 187.000 0.000 NA   NA
 3812824 3812825 SpyM50990 SpyM50991 lepA   FALSE 0.051 298.000 0.000 NA   NA
 3812825 3812826 SpyM50991 SpyM50992     TRUE 0.975 0.000 0.330 NA   NA
 3812826 3812827 SpyM50992 SpyM50993     TRUE 0.849 0.000 0.055 1.000 N NA
 3812827 3812828 SpyM50993 SpyM50994   hemN TRUE 0.859 10.000 0.060 1.000 N NA
 3812828 3812829 SpyM50994 SpyM50995 hemN   TRUE 0.513 63.000 0.021 NA   NA
 3812829 3812830 SpyM50995 SpyM50996     FALSE 0.196 124.000 0.003 NA   NA
 3812830 3812831 SpyM50996 SpyM50997     TRUE 0.712 54.000 0.150 NA   NA
 3812831 3812832 SpyM50997 SpyM50998     TRUE 0.989 -3.000 0.502 NA   NA
 3812833 3812834 SpyM50999 SpyM51000     TRUE 0.992 0.000 0.796 1.000   NA
 3812837 3812838 SpyM51003A SpyM51003B   IS861-truncation TRUE 0.751 27.000 0.000 NA   NA
 3812838 3812839 SpyM51003B SpyM51004 IS861-truncation acoL FALSE 0.131 149.000 0.000 NA   NA
 3812839 3812840 SpyM51004 SpyM51006 acoL pdhC FALSE 0.100 331.000 0.000 1.000 Y NA
 3812840 3812841 SpyM51006 SpyM51007 pdhC pdhB TRUE 0.569 185.000 0.077 0.043 Y NA
 3812841 3812842 SpyM51007 SpyM51008 pdhB pdhA TRUE 0.992 56.000 0.769 0.001 Y NA
 3812842 3812843 SpyM51008 SpyM51009 pdhA   FALSE 0.044 285.000 0.000 1.000   NA
 3812843 3812844 SpyM51009 SpyM51010     TRUE 0.673 46.000 0.029 NA   NA
 3812844 3812845 SpyM51010 SpyM51011     TRUE 0.882 30.000 0.150 NA   NA
 3812845 3812846 SpyM51011 SpyM51012     FALSE 0.331 133.000 0.143 NA   NA
 3812846 3812847 SpyM51012 SpyM51013     FALSE 0.119 204.000 0.026 1.000   NA
 3812847 3812848 SpyM51013 SpyM51014     TRUE 0.995 -3.000 0.895 1.000   NA
 3812848 3812849 SpyM51014 SpyM51015     FALSE 0.114 176.000 0.000 NA   NA
 3812849 3812850 SpyM51015 SpyM51016     TRUE 0.847 5.000 0.000 NA   NA
 3812852 3812853 SpyM51018 SpyM51019     TRUE 0.984 -10.000 0.324 NA   NA
 3812853 3812854 SpyM51019 SpyM51020   mutX TRUE 0.597 58.000 0.074 NA   NA
 3812854 3812855 SpyM51020 SpyM51021 mutX speH FALSE 0.023 604.000 0.000 1.000   NA
 3812855 3812856 SpyM51021 SpyM51024 speH speI TRUE 0.761 26.000 0.000 NA   NA
 3812856 3812857 SpyM51024 SpyM51025 speI lys FALSE 0.059 274.000 0.000 NA   NA
 3812857 3812858 SpyM51025 SpyM51026 lys   FALSE 0.187 112.000 0.000 NA   NA
 3812858 3812859 SpyM51026 SpyM51027     TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   NA
 3812859 3812860 SpyM51027 SpyM51028     TRUE 0.856 10.000 0.000 NA   NA
 3812860 3812861 SpyM51028 SpyM51029     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 3812861 3812862 SpyM51029 SpyM51030     TRUE 0.861 12.000 0.000 NA   NA
 3812862 3812863 SpyM51030 SpyM51031     TRUE 0.996 15.000 1.000 NA   NA
 3812863 3812864 SpyM51031 SpyM51032     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812864 3812865 SpyM51032 SpyM51033     TRUE 0.856 10.000 0.000 NA   NA
 3812865 3812866 SpyM51033 SpyM51034     TRUE 0.982 12.000 0.400 NA   NA
 3812866 3812867 SpyM51034 SpyM51035     TRUE 0.982 15.000 0.400 NA   NA
 3812867 3812868 SpyM51035 SpyM51036     TRUE 0.690 75.000 0.235 NA   NA
 3812868 3812869 SpyM51036 SpyM51037     TRUE 0.611 54.000 0.062 NA   NA
 3812869 3812870 SpyM51037 SpyM51038     TRUE 0.915 12.000 0.041 NA   NA
 3812870 3812871 SpyM51038 SpyM51039     TRUE 0.993 4.000 0.800 NA   NA
 3812871 3812872 SpyM51039 SpyM51040     TRUE 0.993 -3.000 0.750 NA   NA
 3812872 3812873 SpyM51040 SpyM51041     TRUE 0.991 11.000 0.667 NA   NA
 3812873 3812874 SpyM51041 SpyM51042     TRUE 0.987 12.000 0.500 NA   NA
 3812874 3812875 SpyM51042 SpyM51043     TRUE 0.962 13.000 0.192 NA   NA
 3812875 3812876 SpyM51043 SpyM51044     FALSE 0.122 162.000 0.000 NA   NA
 3812876 3812877 SpyM51044 SpyM51045     TRUE 0.847 5.000 0.000 NA   NA
 3812877 3812878 SpyM51045 SpyM51046     TRUE 0.906 28.000 0.167 NA   NA
 3812878 3812879 SpyM51046 SpyM51047     TRUE 0.984 -34.000 0.250 NA   NA
 3812879 3812880 SpyM51047 SpyM51048     TRUE 0.982 16.000 0.429 NA   NA
 3812880 3812881 SpyM51048 SpyM51049     TRUE 0.992 -10.000 0.176 0.002   NA
 3812881 3812882 SpyM51049 SpyM51050     TRUE 0.492 90.000 0.176 1.000   NA
 3812882 3812883 SpyM51050 SpyM51051     FALSE 0.148 133.000 0.000 NA   NA
 3812883 3812884 SpyM51051 SpyM51052     FALSE 0.120 164.000 0.000 NA   NA
 3812884 3812885 SpyM51052 SpyM51053     TRUE 0.975 -3.000 0.286 NA   NA
 3812885 3812886 SpyM51053 SpyM51054     FALSE 0.038 386.000 0.000 NA   NA
 3812886 3812887 SpyM51054 SpyM51055     TRUE 0.931 5.000 0.111 NA   NA
 3812887 3812888 SpyM51055 SpyM51056     TRUE 0.879 43.000 0.250 NA   NA
 3812888 3812889 SpyM51056 SpyM51057     TRUE 0.990 15.000 0.643 NA   NA
 3812889 3812890 SpyM51057 SpyM51058     TRUE 0.942 0.000 0.143 NA   NA
 3812890 3812891 SpyM51058 SpyM51059     TRUE 0.929 88.000 1.000 NA   NA
 3812891 3812892 SpyM51059 SpyM51060     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812892 3812893 SpyM51060 SpyM51061     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3812893 3812894 SpyM51061 SpyM51062     TRUE 0.991 0.000 0.667 NA   NA
 3812894 3812895 SpyM51062 SpyM51062A     TRUE 0.998 -19.000 1.000 NA   NA
 3812895 3812896 SpyM51062A SpyM51063     TRUE 0.990 2.000 0.667 NA   NA
 3812896 3812897 SpyM51063 SpyM51064     TRUE 0.778 79.000 0.375 NA   NA
 3812900 3812901 SpyM51067 SpyM51068     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 3812901 3812902 SpyM51068 SpyM51069     TRUE 0.861 12.000 0.000 NA   NA
 3812902 3812903 SpyM51069 SpyM51070     FALSE 0.155 128.000 0.000 NA   NA
 3812904 3812905 SpyM51071 SpyM51072 rmlB rmlC TRUE 0.506 244.000 0.350 1.000 Y NA
 3812905 3812906 SpyM51072 SpyM51073 rmlC rmlA TRUE 0.970 0.000 0.149 1.000 Y NA
 3812906 3812907 SpyM51073 SpyM51074 rmlA   TRUE 0.422 58.000 0.059 1.000 N NA
 3812907 3812908 SpyM51074 SpyM51075     TRUE 0.721 40.000 0.021 NA   NA
 3812908 3812909 SpyM51075 SpyM51076     TRUE 0.982 -10.000 0.283 NA   NA
 3812909 3812910 SpyM51076 SpyM51077   nth TRUE 0.398 72.000 0.006 NA   NA
 3812910 3812911 SpyM51077 SpyM51078 nth   TRUE 0.958 -3.000 0.007 NA Y NA
 3812911 3812912 SpyM51078 SpyM51079   apt FALSE 0.242 81.000 0.005 NA N NA
 3812912 3812913 SpyM51079 SpyM51080 apt   FALSE 0.184 150.000 0.128 1.000 N NA
 3812913 3812914 SpyM51080 SpyM51081     TRUE 0.894 -3.000 0.016 1.000   NA
 3812914 3812915 SpyM51081 SpyM51082   rnz TRUE 0.908 0.000 0.074 1.000   NA
 3812915 3812916 SpyM51082 SpyM51083 rnz   TRUE 0.891 15.000 0.022 1.000   NA
 3812916 3812917 SpyM51083 SpyM51084     TRUE 0.910 -7.000 0.014 1.000   NA
 3812917 3812918 SpyM51084 SpyM51085   miaA TRUE 0.396 73.000 0.027 1.000   NA
 3812920 3812921 SpyM51087 SpyM51088     FALSE 0.073 237.000 0.056 1.000 N NA
 3812921 3812922 SpyM51088 SpyM51089     TRUE 0.509 49.000 0.000 NA   NA
 3812922 3812923 SpyM51089 SpyM51090     FALSE 0.337 71.000 0.000 NA   NA
 3812925 3812926 SpyM5t55 SpyM51092   rpsA FALSE 0.184 113.000 0.000 NA   NA
 3812926 3812927 SpyM51092 SpyM5t56 rpsA   FALSE 0.158 127.000 0.000 NA   NA
 3812927 3812928 SpyM5t56 SpyM5t57     TRUE 0.472 51.000 0.000 NA   NA
 3812928 3812929 SpyM5t57 SpyM51093     TRUE 0.402 61.000 0.000 NA   NA
 3812929 3812930 SpyM51093 SpyM51094     TRUE 0.604 61.000 0.095 NA   NA
 3812930 3812931 SpyM51094 SpyM51095   parC FALSE 0.199 120.000 0.086 1.000 N NA
 3812931 3812932 SpyM51095 SpyM51096 parC   FALSE 0.142 198.000 0.018 NA   NA
 3812932 3812933 SpyM51096 SpyM51097   parE TRUE 0.482 67.000 0.025 NA   NA
 3812935 3812936 SpyM51099 SpyM51100 pyrC ung FALSE 0.107 132.000 0.009 1.000 N NA
 3812936 3812937 SpyM51100 SpyM51101 ung   FALSE 0.129 133.000 0.025 1.000 N NA
 3812937 3812938 SpyM51101 SpyM51102     TRUE 0.975 29.000 0.125 0.034 Y NA
 3812938 3812939 SpyM51102 SpyM51103     FALSE 0.322 118.000 0.182 1.000 N NA
 3812939 3812940 SpyM51103 SpyM51104   pyrE FALSE 0.040 197.000 0.000 1.000 N NA
 3812940 3812941 SpyM51104 SpyM51105 pyrE pyrF TRUE 0.788 58.000 0.133 1.000 Y NA
 3812941 3812942 SpyM51105 SpyM51106 pyrF   FALSE 0.058 277.000 0.000 NA   NA
 3812944 3812945 SpyM51108 SpyM51109   deoD TRUE 0.890 -7.000 0.000 NA   NA
 3812945 3812946 SpyM51109 SpyM51110 deoD punA FALSE 0.341 663.000 0.040 0.001 Y NA
 3812946 3812947 SpyM51110 SpyM51111 punA   TRUE 0.936 -16.000 0.108 1.000 N NA
 3812947 3812948 SpyM51111 SpyM51112   deoB TRUE 0.874 19.000 0.108 1.000 N NA
 3812948 3812949 SpyM51112 SpyM51113 deoB rpiA TRUE 0.599 77.000 0.018 1.000 Y NA
 3812951 3812952 SpyM51115 SpyM51116   engB FALSE 0.163 148.000 0.004 NA   NA
 3812952 3812953 SpyM51116 SpyM51117 engB clpX TRUE 0.896 10.000 0.043 1.000   NA
 3812953 3812954 SpyM51117 SpyM51118 clpX   FALSE 0.209 130.000 0.012 NA   NA
 3812954 3812955 SpyM51118 SpyM51119   dfrB TRUE 0.889 20.000 0.030 NA   NA
 3812955 3812956 SpyM51119 SpyM51120 dfrB thyA TRUE 0.619 80.000 0.295 1.000 N NA
 3812957 3812958 SpyM51121 SpyM51122 mvaS mvaA TRUE 0.986 -13.000 0.183 1.000 Y NA
 3812959 3812960 SpyM51123 SpyM51124 fni mvaK2 TRUE 0.929 -13.000 0.097 1.000 N NA
 3812960 3812961 SpyM51124 SpyM51125 mvaK2 mvaD TRUE 0.997 -7.000 0.312 0.004 Y NA
 3812961 3812962 SpyM51125 SpyM51126 mvaD mvaK1 TRUE 0.998 -18.000 0.281 0.003 Y NA
 3812962 3812963 SpyM51126 SpyM51127 mvaK1   FALSE 0.021 294.000 0.000 1.000 N NA
 3812963 3812964 SpyM51127 SpyM51128     TRUE 0.993 9.000 0.533 1.000 Y NA
 3812964 3812965 SpyM51128 SpyM51129     TRUE 0.992 3.000 0.800 1.000   NA
 3812967 3812968 SpyM51131 SpyM51132 fms   FALSE 0.065 256.000 0.000 NA   NA
 3812970 3812971 SpyM51133 SpyM51134   cca TRUE 0.910 -3.000 0.056 1.000   NA
 3812971 3812972 SpyM51134 SpyM51135 cca   FALSE 0.211 125.000 0.009 NA   NA
 3812972 3812973 SpyM51135 SpyM51136     TRUE 0.941 0.000 0.139 NA   NA
 3812973 3812974 SpyM51136 SpyM51138     FALSE 0.078 228.000 0.000 NA   NA
 3812974 3812975 SpyM51138 SpyM51139     FALSE 0.077 229.000 0.000 NA   NA
 3812976 3812977 SpyM51141 SpyM51142   speJ TRUE 0.863 14.000 0.000 NA   NA
 3812977 3812978 SpyM51142 SpyM51143 speJ   FALSE 0.072 240.000 0.000 NA   NA
 3812979 3812980 SpyM51144 SpyM51145   mur1.1 TRUE 0.882 151.000 0.333 0.002 Y NA
 3812980 3812981 SpyM51145 SpyM51146 mur1.1 fruA FALSE 0.204 93.000 0.022 1.000 N NA
 3812981 3812982 SpyM51146 SpyM51147 fruA fruB TRUE 0.997 -3.000 0.816 1.000 Y NA
 3812982 3812983 SpyM51147 SpyM51148 fruB   TRUE 0.996 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 3812983 3812984 SpyM51148 SpyM51149     FALSE 0.027 256.000 0.000 1.000 N NA
 3812984 3812985 SpyM51149 SpyM51150     TRUE 0.979 13.000 0.333 NA   NA
 3812985 3812986 SpyM51150 SpyM51151     FALSE 0.191 178.000 0.059 NA   NA
 3812986 3812987 SpyM51151 SpyM51152   trmD TRUE 0.787 0.000 0.007 1.000 N NA
 3812987 3812988 SpyM51152 SpyM51153 trmD rimM TRUE 0.997 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 3812988 3812989 SpyM51153 SpyM51154 rimM   FALSE 0.035 215.000 0.000 1.000 N NA
 3812991 3812992 SpyM51156 SpyM51157     TRUE 0.944 20.000 0.200 1.000   NA
 3812992 3812993 SpyM51157 SpyM51158     FALSE 0.021 932.000 0.000 1.000   NA
 3812993 3812994 SpyM51158 SpyM51159   rpsP TRUE 0.978 10.000 0.385 1.000   NA
 3812994 3812995 SpyM51159 SpyM51160 rpsP   FALSE 0.098 127.000 0.003 1.000 N NA
 3812995 3812996 SpyM51160 SpyM51161     FALSE 0.027 254.000 0.000 1.000 N NA
 3812996 3812997 SpyM51161 SpyM51162     TRUE 0.997 12.000 0.923 1.000 Y NA
 3812997 3812998 SpyM51162 SpyM51163     TRUE 0.989 24.000 0.923 1.000 N NA
 3812998 3812999 SpyM51163 SpyM51164   carB FALSE 0.072 208.000 0.017 1.000 N NA
 3812999 3813000 SpyM51164 SpyM51165 carB carA TRUE 0.631 246.000 0.117 0.001 Y NA
 3813000 3813001 SpyM51165 SpyM51166 carA pyrB TRUE 0.814 44.000 0.014 1.000 Y NA
 3813001 3813002 SpyM51166 SpyM51167 pyrB pyrP TRUE 0.728 61.000 0.064 1.000 Y NA
 3813002 3813003 SpyM51167 SpyM51168 pyrP pyrR TRUE 0.969 16.000 0.140 1.000 Y NA
 3813003 3813004 SpyM51168 SpyM51169 pyrR   FALSE 0.034 396.000 0.048 1.000 N NA
 3813004 3813005 SpyM51169 SpyM51170   lsp TRUE 0.917 -10.000 0.082 1.000 N NA
 3813005 3813006 SpyM51170 SpyM51171 lsp   TRUE 0.906 -3.000 0.119 1.000 N NA
 3813006 3813007 SpyM51171 SpyM51172   rpmA FALSE 0.017 349.000 0.000 1.000 N NA
 3813007 3813008 SpyM51172 SpyM51173 rpmA   TRUE 0.962 28.000 0.203 NA Y NA
 3813008 3813009 SpyM51173 SpyM51174   rplU TRUE 0.982 12.000 0.208 NA Y NA
 3813009 3813010 SpyM51174 SpyM51175 rplU   FALSE 0.035 214.000 0.000 1.000 N NA
 3813010 3813011 SpyM51175 SpyM51176   thiI FALSE 0.112 137.000 0.014 1.000 N NA
 3813011 3813012 SpyM51176 SpyM51177 thiI   TRUE 0.969 12.000 0.349 1.000 N NA
 3813013 3813014 SpyM51178 SpyM51179   folC2 TRUE 0.941 30.000 0.308 NA   NA
 3813015 3813016 SpyM51180 SpyM51181 gor   FALSE 0.109 221.000 0.010 NA   NA
 3813016 3813017 SpyM51181 SpyM51182   aroC TRUE 0.466 61.000 0.005 NA   NA
 3813017 3813018 SpyM51182 SpyM51183 aroC aroD TRUE 0.791 94.000 0.004 0.003 Y NA
 3813018 3813019 SpyM51183 SpyM51184 aroD   TRUE 0.935 -3.000 0.125 1.000   NA
 3813021 3813022 SpyM51186 SpyM51187 rplT rpmI TRUE 0.991 59.000 0.928 0.026 Y NA
 3813022 3813023 SpyM51187 SpyM51188 rpmI infC TRUE 0.978 42.000 0.652 1.000 Y NA
 3813023 3813024 SpyM51188 SpyM51189 infC cmk FALSE 0.087 162.000 0.010 1.000 N NA
 3813024 3813025 SpyM51189 SpyM51190 cmk   TRUE 0.878 15.000 0.012 1.000   NA
 3813027 3813028 SpyM51191 SpyM51192   pepT TRUE 0.734 41.000 0.051 NA   NA
 3813028 3813029 SpyM51192 SpyM51193 pepT   FALSE 0.229 94.000 0.000 NA   NA
 3813029 3813030 SpyM51193 SpyM51194     TRUE 0.968 -7.000 0.182 NA   NA
 3813030 3813031 SpyM51194 SpyM51195     TRUE 0.931 -7.000 0.027 NA   NA
 3813031 3813032 SpyM51195 SpyM51196     TRUE 0.987 2.000 0.568 NA   NA
 3813032 3813033 SpyM51196 SpyM51197     FALSE 0.255 179.000 0.000 NA Y NA
 3813033 3813034 SpyM51197 SpyM51198     TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA Y NA
 3813034 3813035 SpyM51198 SpyM51199     TRUE 0.982 -3.000 0.385 NA   NA
 3813035 3813036 SpyM51199 SpyM51200     TRUE 0.774 25.000 0.000 NA   NA
 3813036 3813037 SpyM51200 SpyM51201     TRUE 0.695 0.000 0.000 1.000 N NA
 3813037 3813038 SpyM51201 SpyM51202     TRUE 0.970 3.000 0.289 NA   NA
 3813038 3813039 SpyM51202 SpyM51203     TRUE 0.982 -10.000 0.289 NA   NA
 3813039 3813040 SpyM51203 SpyM51205   rmlD FALSE 0.170 119.000 0.000 NA   NA
 3813040 3813041 SpyM51205 SpyM51206 rmlD   FALSE 0.141 138.000 0.000 NA   NA
 3813041 3813042 SpyM51206 SpyM51207   rpoD FALSE 0.123 237.000 0.044 NA   NA
 3813042 3813043 SpyM51207 SpyM51208 rpoD dnaG TRUE 0.941 9.000 0.209 1.000 N NA
 3813045 3813046 SpyM51210 SpyM51211 rpsU   FALSE 0.177 141.000 0.027 1.000   NA
 3813046 3813047 SpyM51211 SpyM51212   addA FALSE 0.060 140.000 0.000 1.000 N NA
 3813047 3813048 SpyM51212 SpyM51213 addA addB TRUE 0.986 -3.000 0.070 0.054 Y NA
 3813050 3813051 SpyM51215 SpyM51216     TRUE 0.959 10.000 0.222 1.000   NA
 3813051 3813052 SpyM51216 SpyM51217     FALSE 0.324 73.000 0.000 NA   NA
 3813052 3813053 SpyM51217 SpyM51218     TRUE 0.915 -7.000 0.006 NA   NA
 3813053 3813054 SpyM51218 SpyM51219   pheT FALSE 0.117 110.000 0.002 1.000 N NA
 3813054 3813055 SpyM51219 SpyM51220 pheT pheS TRUE 0.910 210.000 0.574 0.001 Y NA
 3813055 3813056 SpyM51220 SpyM51221 pheS endA FALSE 0.056 283.000 0.000 NA   NA
 3813056 3813057 SpyM51221 SpyM51223 endA epuA TRUE 0.640 36.000 0.000 NA   NA
 3813057 3813058 SpyM51223 SpyM51224 epuA murA1 TRUE 0.929 4.000 0.110 NA   NA
 3813058 3813059 SpyM51224 SpyM51225 murA1   TRUE 0.772 65.000 0.279 NA   NA
 3813059 3813060 SpyM51225 SpyM51226   atpC FALSE 0.102 266.000 0.039 NA   NA
 3813060 3813061 SpyM51226 SpyM51227 atpC atpD TRUE 0.999 13.000 0.837 0.008 Y NA
 3813061 3813062 SpyM51227 SpyM51228 atpD atpG TRUE 0.946 163.000 0.724 0.008 Y NA
 3813062 3813063 SpyM51228 SpyM51229 atpG atpA TRUE 0.999 19.000 0.846 0.008 Y NA
 3813063 3813064 SpyM51229 SpyM51230 atpA atpH TRUE 0.999 16.000 0.864 0.008 Y NA
 3813064 3813065 SpyM51230 SpyM51231 atpH atpF TRUE 0.994 0.000 0.222 0.008 Y NA
 3813065 3813066 SpyM51231 SpyM51232 atpF atpB TRUE 0.986 18.000 0.032 0.010 Y NA
 3813066 3813067 SpyM51232 SpyM51233 atpB atpE TRUE 0.960 35.000 0.189 0.010   NA
 3813067 3813068 SpyM51233 SpyM51234 atpE   FALSE 0.029 392.000 0.000 1.000   NA
 3813068 3813069 SpyM51234 SpyM51235   ligA TRUE 0.825 14.000 0.013 1.000 N NA
 3813069 3813070 SpyM51235 SpyM51236 ligA   FALSE 0.133 194.000 0.010 NA   NA
 3813070 3813071 SpyM51236 SpyM51237     FALSE 0.058 278.000 0.000 NA   NA
 3813073 3813074 SpyM51239 SpyM51240 sagI sagH TRUE 0.993 -3.000 0.160 0.007 Y NA
 3813074 3813075 SpyM51240 SpyM51241 sagH sagG TRUE 0.980 9.000 0.500 1.000 N NA
 3813075 3813076 SpyM51241 SpyM51242 sagG sagF TRUE 0.989 23.000 0.750 NA   NA
 3813076 3813077 SpyM51242 SpyM51243 sagF sagE TRUE 0.993 -3.000 0.750 NA   NA
 3813077 3813078 SpyM51243 SpyM51244 sagE   TRUE 0.970 -25.000 0.136 NA   NA
 3813078 3813079 SpyM51244 SpyM51245   sagC TRUE 0.969 20.000 0.318 NA   NA
 3813079 3813080 SpyM51245 SpyM51246 sagC sagB TRUE 0.964 -3.000 0.200 NA   NA
 3813080 3813081 SpyM51246 SpyM51247 sagB   FALSE 0.079 222.000 0.000 NA   NA
 3813081 3813082 SpyM51247 SpyM51248   eno FALSE 0.028 770.000 0.000 NA   NA
 3813084 3813085 SpyM51250 SpyM51251 ezrA gyrB FALSE 0.029 368.000 0.011 1.000 N NA
 3813085 3813086 SpyM51251 SpyM51252 gyrB   TRUE 0.870 1.000 0.013 1.000   NA
 3813088 3813089 SpyM5t58 SpyM51253   rplS FALSE 0.070 247.000 0.000 NA   NA
 3813089 3813090 SpyM51253 SpyM51254 rplS   FALSE 0.121 115.000 0.006 1.000 N NA
 3813090 3813091 SpyM51254 SpyM51255     TRUE 0.911 -7.000 0.094 1.000 N NA
 3813091 3813092 SpyM51255 SpyM51256     FALSE 0.211 175.000 0.167 1.000 N NA
 3813093 3813094 SpyM51257 SpyM51258   rpmE2 FALSE 0.226 115.000 0.020 1.000   NA
 3813095 3813096 SpyM51259 SpyM51260 agaS   TRUE 0.913 20.000 0.178 1.000 N NA
 3813096 3813097 SpyM51260 SpyM51261   adcA FALSE 0.150 157.000 0.091 1.000 N NA
 3813097 3813098 SpyM51261 SpyM51262 adcA pepD FALSE 0.127 152.000 0.000 NA   NA
 3813099 3813100 SpyM51263 SpyM51264   speC FALSE 0.152 111.000 0.000 1.000   NA
 3813101 3813102 SpyM51265 SpyM51266     FALSE 0.177 116.000 0.000 NA   NA
 3813102 3813103 SpyM51266 SpyM51267     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3813103 3813104 SpyM51267 SpyM51268     TRUE 0.856 10.000 0.000 NA   NA
 3813104 3813105 SpyM51268 SpyM51269     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 3813105 3813106 SpyM51269 SpyM51270     TRUE 0.861 12.000 0.000 NA   NA
 3813106 3813107 SpyM51270 SpyM51271     TRUE 0.996 13.000 1.000 NA   NA
 3813107 3813108 SpyM51271 SpyM51272     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3813108 3813109 SpyM51272 SpyM51273     TRUE 0.964 -3.000 0.200 NA   NA
 3813109 3813110 SpyM51273 SpyM51274     TRUE 0.991 0.000 0.667 NA   NA
 3813110 3813111 SpyM51274 SpyM51275     TRUE 0.992 13.000 0.667 NA   NA
 3813111 3813112 SpyM51275 SpyM51276     TRUE 0.990 30.000 1.000 NA   NA
 3813112 3813113 SpyM51276 SpyM51277     TRUE 0.858 53.000 0.333 NA   NA
 3813113 3813114 SpyM51277 SpyM51278     TRUE 0.991 16.000 0.667 NA   NA
 3813114 3813115 SpyM51278 SpyM51279     TRUE 0.972 -3.000 0.250 NA   NA
 3813115 3813116 SpyM51279 SpyM51280     TRUE 0.952 -3.000 0.150 NA   NA
 3813116 3813117 SpyM51280 SpyM51281     TRUE 0.975 -3.000 0.286 NA   NA
 3813117 3813118 SpyM51281 SpyM51282     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 3813118 3813119 SpyM51282 SpyM51283     TRUE 0.863 14.000 0.000 NA   NA
 3813119 3813120 SpyM51283 SpyM51284     TRUE 0.774 25.000 0.000 NA   NA
 3813120 3813121 SpyM51284 SpyM51285     TRUE 0.920 -22.000 0.000 NA   NA
 3813121 3813122 SpyM51285 SpyM51286     TRUE 0.668 34.000 0.000 NA   NA
 3813122 3813123 SpyM51286 SpyM51286A     TRUE 0.890 -7.000 0.000 NA   NA
 3813123 3813124 SpyM51286A SpyM51287     TRUE 0.983 -3.000 0.400 NA   NA
 3813124 3813125 SpyM51287 SpyM51288     TRUE 0.846 1.000 0.000 NA   NA
 3813125 3813126 SpyM51288 SpyM51289     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 3813126 3813127 SpyM51289 SpyM51290     FALSE 0.245 171.000 0.111 NA   NA
 3813128 3813129 SpyM51292 SpyM51293     TRUE 0.841 52.000 0.294 NA   NA
 3813130 3813131 SpyM51294 SpyM51295     FALSE 0.030 583.000 0.000 NA   NA
 3813131 3813132 SpyM51295 SpyM51296     FALSE 0.061 270.000 0.000 NA   NA
 3813132 3813133 SpyM51296 SpyM51297     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 3813133 3813134 SpyM51297 SpyM51297A     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 3813134 3813135 SpyM51297A SpyM51298     TRUE 0.902 -10.000 0.000 NA   NA
 3813135 3813136 SpyM51298 SpyM51299     TRUE 0.843 4.000 0.000 NA   NA
 3813136 3813137 SpyM51299 SpyM51300     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3813137 3813138 SpyM51300 SpyM51301     TRUE 0.856 10.000 0.000 NA   NA
 3813138 3813139 SpyM51301 SpyM51302     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3813139 3813140 SpyM51302 SpyM51302A     TRUE 0.883 -6.000 0.000 NA   NA
 3813140 3813141 SpyM51302A SpyM51303     TRUE 0.910 -13.000 0.000 NA   NA
 3813141 3813142 SpyM51303 SpyM51304     TRUE 0.892 -3.000 0.002 NA   NA
 3813142 3813143 SpyM51304 SpyM51305     FALSE 0.113 177.000 0.000 NA   NA
 3813143 3813144 SpyM51305 SpyM51306     TRUE 0.890 -7.000 0.000 NA   NA
 3813144 3813145 SpyM51306 SpyM51307     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3813145 3813146 SpyM51307 SpyM51308     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 3813146 3813147 SpyM51308 SpyM51309     TRUE 0.434 56.000 0.000 NA   NA
 3813147 3813148 SpyM51309 SpyM51310     TRUE 0.855 9.000 0.000 NA   NA
 3813148 3813149 SpyM51310 SpyM51310A     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3813149 3813150 SpyM51310A SpyM51311     TRUE 0.947 -19.000 0.018 NA   NA
 3813150 3813151 SpyM51311 SpyM51312     FALSE 0.183 159.000 0.018 NA   NA
 3813151 3813152 SpyM51312 SpyM51313     FALSE 0.214 100.000 0.000 NA   NA
 3813152 3813153 SpyM51313 SpyM51313A     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 3813155 3813156 SpyM51316 SpyM51317     TRUE 0.447 49.000 0.000 1.000   NA
 3813159 3813160 SpyM51320 SpyM51321     TRUE 0.856 10.000 0.000 NA   NA
 3813160 3813161 SpyM51321 SpyM51322     FALSE 0.164 123.000 0.000 NA   NA
 3813162 3813163 SpyM51323 SpyM51324     TRUE 0.986 -3.000 0.470 NA   NA
 3813163 3813164 SpyM51324 SpyM51325     TRUE 0.967 -3.000 0.214 NA   NA
 3813164 3813165 SpyM51325 SpyM51326   asnC FALSE 0.035 414.000 0.000 NA   NA
 3813165 3813166 SpyM51326 SpyM51327 asnC aspC TRUE 0.830 21.000 0.068 1.000 N NA
 3813166 3813167 SpyM51327 SpyM51328 aspC   FALSE 0.018 335.000 0.000 1.000 N NA
 3813167 3813168 SpyM51328 SpyM51329     FALSE 0.088 108.000 0.000 1.000 N NA
 3813170 3813171 SpyM51331 SpyM51332 ftsX ftsE TRUE 0.995 -16.000 0.431 1.000 Y NA
 3813171 3813172 SpyM51332 SpyM51333 ftsE prfB TRUE 0.832 19.000 0.053 1.000 N NA
 3813172 3813173 SpyM51333 SpyM51334 prfB   FALSE 0.254 69.000 0.006 1.000 N NA
 3813173 3813174 SpyM51334 SpyM51335     FALSE 0.023 645.000 0.000 1.000   NA
 3813174 3813175 SpyM51335 SpyM51336   kgdA FALSE 0.160 291.000 0.000 0.039   NA
 3813175 3813176 SpyM51336 SpyM51337 kgdA   TRUE 0.972 5.000 0.167 1.000 Y NA
 3813176 3813177 SpyM51337 SpyM51338     TRUE 0.922 29.000 0.094 1.000 Y NA
 3813177 3813178 SpyM51338 SpyM51339   idnO TRUE 0.896 25.000 0.197 1.000 N NA
 3813179 3813180 SpyM51340 SpyM51341   ugl TRUE 0.925 0.000 0.120 1.000   NA
 3813180 3813181 SpyM51341 SpyM51342 ugl agaV TRUE 0.863 36.000 0.200 1.000   NA
 3813181 3813182 SpyM51342 SpyM51343 agaV agaW TRUE 0.999 19.000 0.933 0.018 Y NA
 3813182 3813183 SpyM51343 SpyM51344 agaW agaD TRUE 0.999 -13.000 0.933 0.018 Y NA
 3813183 3813184 SpyM51344 SpyM51345 agaD   TRUE 0.740 87.000 0.375 NA   NA
 3813184 3813185 SpyM51345 SpyM51346     TRUE 0.898 64.000 0.562 NA   NA
 3813186 3813187 SpyM51347 SpyM51348     FALSE 0.077 230.000 0.000 NA   NA
 3813188 3813189 SpyM51349 SpyM51350     FALSE 0.330 72.000 0.000 NA   NA
 3813189 3813190 SpyM51350 SpyM51351     FALSE 0.128 151.000 0.000 NA   NA
 3813190 3813191 SpyM51351 SpyM51352   murM TRUE 0.984 0.000 0.500 1.000   NA
 3813191 3813192 SpyM51352 SpyM51353 murM murN TRUE 0.996 -13.000 0.200 0.009 Y NA
 3813193 3813194 SpyM51354 SpyM51355 tpiA tuf FALSE 0.044 240.000 0.003 1.000 N NA
 3813196 3813197 SpyM51357 SpyM51358 ftsW ppc FALSE 0.121 140.000 0.028 1.000 N NA
 3813198 3813199 SpyM51359 SpyM51360     TRUE 0.892 -7.000 0.059 1.000 N NA
 3813200 3813201 SpyM51361 SpyM51362     TRUE 0.989 -16.000 0.375 NA   NA
 3813202 3813203 SpyM51363 SpyM5s06     FALSE 0.155 128.000 0.000 NA   NA
 3813203 3813204 SpyM5s06 SpyM51364     TRUE 0.567 45.000 0.000 NA   NA
 3813204 3813205 SpyM51364 SpyM51365     FALSE 0.308 91.000 0.010 NA   NA
 3813205 3813206 SpyM51365 SpyM51366     FALSE 0.068 340.000 0.018 NA   NA
 3813208 3813209 SpyM51368 SpyM51369 lysS   FALSE 0.143 136.000 0.000 NA   NA
 3813210 3813211 SpyM51370 SpyM51371     FALSE 0.086 210.000 0.000 NA   NA
 3813211 3813212 SpyM51371 SpyM51372     TRUE 0.871 102.000 0.156 0.002 Y NA
 3813214 3813215 SpyM51374 SpyM51375     TRUE 0.972 -7.000 0.206 NA   NA
 3813215 3813216 SpyM51375 SpyM51376   lgt TRUE 0.899 22.000 0.079 NA   NA
 3813216 3813217 SpyM51376 SpyM51377 lgt hprK TRUE 0.981 -3.000 0.494 1.000 N NA
 3813217 3813218 SpyM51377 SpyM51378 hprK   FALSE 0.139 365.000 0.017 NA Y NA
 3813218 3813219 SpyM51378 SpyM51379     TRUE 0.385 64.000 0.000 NA   NA
 3813219 3813220 SpyM51379 SpyM51380     TRUE 0.910 -13.000 0.000 NA   NA
 3813221 3813222 SpyM51381 SpyM51382     FALSE 0.272 148.000 0.114 NA   NA
 3813222 3813223 SpyM51382 SpyM51383     TRUE 0.994 0.000 0.841 NA   NA
 3813224 3813225 SpyM51384 SpyM51385 bglA   TRUE 0.984 19.000 0.318 1.000 Y NA
 3813225 3813226 SpyM51385 SpyM51386   licT TRUE 0.961 2.000 0.259 1.000   NA
 3813228 3813229 SpyM51388 SpyM51389 ftsY   TRUE 0.953 0.000 0.007 0.066   NA
 3813229 3813230 SpyM51389 SpyM51390     TRUE 0.992 4.000 0.375 0.015   NA
 3813231 3813232 SpyM51392 SpyM51393     TRUE 0.971 48.000 0.333 0.051 Y NA
 3813233 3813234 SpyM51394 SpyM51397     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 3813234 3813235 SpyM51397 SpyM51398     TRUE 0.924 -75.000 0.000 NA   NA
 3813235 3813236 SpyM51398 SpyM51401     TRUE 0.920 -22.000 0.000 NA   NA
 3813236 3813237 SpyM51401 SpyM51403     FALSE 0.033 447.000 0.000 NA   NA
 3813237 3813238 SpyM51403 SpyM51404     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 3813238 3813239 SpyM51404 SpyM51405     FALSE 0.204 104.000 0.000 NA   NA
 3813239 3813240 SpyM51405 SpyM51406     TRUE 0.978 19.000 0.400 NA   NA
 3813240 3813241 SpyM51406 SpyM51407     TRUE 0.969 0.000 0.273 NA   NA
 3813242 3813243 SpyM51408 SpyM51409     TRUE 0.982 0.000 0.429 NA   NA
 3813243 3813244 SpyM51409 SpyM51410     TRUE 0.898 -9.000 0.000 NA   NA
 3813244 3813245 SpyM51410 SpyM51411     FALSE 0.262 85.000 0.000 NA   NA
 3813245 3813246 SpyM51411 SpyM51413     TRUE 0.902 -10.000 0.000 NA   NA
 3813247 3813248 SpyM51414 SpyM51415     FALSE 0.262 85.000 0.000 NA   NA
 3813248 3813249 SpyM51415 SpyM51416     TRUE 0.788 24.000 0.000 NA   NA
 3813249 3813250 SpyM51416 SpyM51417     FALSE 0.036 402.000 0.000 NA   NA
 3813250 3813251 SpyM51417 SpyM51418     TRUE 0.443 55.000 0.000 NA   NA
 3813251 3813252 SpyM51418 SpyM51419     TRUE 0.890 -7.000 0.000 NA   NA
 3813252 3813253 SpyM51419 SpyM51420     TRUE 0.856 10.000 0.000 NA   NA
 3813253 3813254 SpyM51420 SpyM51421     TRUE 0.890 -7.000 0.000 NA   NA
 3813254 3813255 SpyM51421 SpyM51422     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 3813255 3813256 SpyM51422 SpyM51423   aroE.2 TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA N NA
 3813258 3813259 SpyM51425 SpyM51426 smc rnc TRUE 0.890 1.000 0.120 1.000 N NA
 3813259 3813260 SpyM51426 SpyM51427 rnc vicX FALSE 0.033 443.000 0.002 1.000   NA
 3813260 3813261 SpyM51427 SpyM51428 vicX covS TRUE 0.885 4.000 0.038 1.000   NA
 3813261 3813262 SpyM51428 SpyM51429 covS covR TRUE 0.998 -7.000 0.597 0.046 Y NA
 3813262 3813263 SpyM51429 SpyM51430 covR   FALSE 0.171 162.000 0.013 NA   NA
 3813263 3813264 SpyM51430 SpyM51431     FALSE 0.327 95.000 0.030 NA   NA
 3813264 3813265 SpyM51431 SpyM51432     TRUE 0.997 -43.000 0.576 1.000 Y NA
 3813265 3813266 SpyM51432 SpyM51433     TRUE 0.957 -31.000 0.058 NA   NA
 3813266 3813267 SpyM51433 SpyM51434   glpF2 TRUE 0.617 135.000 0.429 NA   NA
 3813267 3813268 SpyM51434 SpyM51435 glpF2   TRUE 0.997 18.000 0.857 0.051   NA
 3813268 3813269 SpyM51435 SpyM51436     TRUE 0.917 0.000 0.099 1.000   NA
 3813269 3813270 SpyM51436 SpyM51437     TRUE 0.996 11.000 0.316 0.002 Y NA
 3813271 3813272 SpyM51438 SpyM51439     TRUE 0.985 15.000 0.625 1.000 N NA
 3813273 3813274 SpyM51440 SpyM51441     TRUE 0.904 2.000 0.042 NA   NA
 3813274 3813275 SpyM51441 SpyM51442     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 3813275 3813276 SpyM51442 SpyM51443   thrS FALSE 0.158 141.000 0.012 1.000   NA
 3813276 3813277 SpyM51443 SpyM5s07 thrS   FALSE 0.123 159.000 0.000 NA   NA
 3813277 3813278 SpyM5s07 SpyM51444     TRUE 0.627 38.000 0.000 NA   NA
 3813278 3813279 SpyM51444 SpyM51445     TRUE 0.997 2.000 0.413 0.009 Y NA
 3813279 3813280 SpyM51445 SpyM51446   alsA FALSE 0.136 131.000 0.033 1.000 N NA
 3813281 3813282 SpyM51447 SpyM51448 pepQ   TRUE 0.501 49.000 0.053 1.000 N NA
 3813282 3813283 SpyM51448 SpyM51449   gloA TRUE 0.832 11.000 0.019 1.000 N NA
 3813283 3813284 SpyM51449 SpyM51450 gloA csbB FALSE 0.128 145.000 0.012 NA N NA
 3813284 3813285 SpyM51450 SpyM51451 csbB   FALSE 0.085 211.000 0.000 NA   NA
 3813285 3813286 SpyM51451 SpyM51452     TRUE 0.995 0.000 0.939 NA   NA
 3813286 3813287 SpyM51452 SpyM51453   pcp TRUE 0.856 50.000 0.300 NA   NA
 3813288 3813289 SpyM51454 SpyM51455   smpB TRUE 0.931 6.000 0.000 1.000 Y NA
 3813289 3813290 SpyM51455 SpyM51456 smpB rnr TRUE 0.971 3.000 0.143 0.028 N NA
 3813290 3813291 SpyM51456 SpyM51457 rnr secG FALSE 0.241 94.000 0.064 1.000 N NA
 3813291 3813292 SpyM51457 SpyM51458A secG rpmG TRUE 0.468 46.000 0.012 1.000 N NA
 3813292 3813293 SpyM51458A SpyM51458 rpmG pmrA TRUE 0.827 -3.000 0.012 1.000 N NA
 3813293 3813294 SpyM51458 SpyM51459 pmrA   FALSE 0.180 122.000 0.007 1.000   NA
 3813294 3813295 SpyM51459 SpyM51460   coaE FALSE 0.080 190.000 0.000 1.000   NA
 3813295 3813296 SpyM51460 SpyM51461 coaE fpg TRUE 0.877 -3.000 0.066 1.000 N NA
 3813296 3813297 SpyM51461 SpyM51462 fpg   FALSE 0.121 172.000 0.004 1.000   NA
 3813298 3813299 SpyM51463 SpyM51464     FALSE 0.031 523.000 0.000 NA   NA
 3813300 3813301 SpyM51465 SpyM51466     TRUE 0.567 45.000 0.000 NA   NA
 3813301 3813302 SpyM51466 SpyM51467     FALSE 0.064 257.000 0.000 NA   NA
 3813302 3813303 SpyM51467 SpyM51468     FALSE 0.110 179.000 0.000 NA   NA
 3813303 3813304 SpyM51468 SpyM51469     TRUE 0.947 50.000 0.667 NA   NA
 3813304 3813305 SpyM51469 SpyM51470     FALSE 0.052 294.000 0.000 NA   NA
 3813305 3813306 SpyM51470 SpyM51471     TRUE 0.979 13.000 0.333 NA   NA
 3813308 3813309 SpyM51474 SpyM51475     TRUE 0.987 15.000 0.500 NA   NA
 3813311 3813312 SpyM51477 SpyM51478   era TRUE 0.840 20.000 0.007 1.000   NA
 3813312 3813313 SpyM51478 SpyM51479 era dgk FALSE 0.248 120.000 0.063 1.000   NA
 3813313 3813314 SpyM51479 SpyM51480 dgk   TRUE 0.950 -19.000 0.035 NA   NA
 3813314 3813315 SpyM51480 SpyM51481     FALSE 0.151 159.000 0.003 NA   NA
 3813315 3813316 SpyM51481 SpyM51482     TRUE 0.500 46.000 0.005 NA N NA
 3813316 3813317 SpyM51482 SpyM51483     FALSE 0.152 159.000 0.004 NA   NA
 3813317 3813318 SpyM51483 SpyM51484     FALSE 0.047 315.000 0.000 NA   NA
 3813318 3813319 SpyM51484 SpyM51485     FALSE 0.161 156.000 0.023 1.000   NA
 3813319 3813320 SpyM51485 SpyM51486   msrA TRUE 0.921 -3.000 0.080 1.000   NA
 3813320 3813321 SpyM51486 SpyM51487 msrA   TRUE 0.427 73.000 0.016 NA   NA
 3813321 3813322 SpyM51487 SpyM51488   frr FALSE 0.258 109.000 0.012 NA   NA
 3813322 3813323 SpyM51488 SpyM51489 frr pyrH TRUE 0.967 29.000 0.626 1.000 N NA
 3813323 3813324 SpyM51489 SpyM51490 pyrH rplA FALSE 0.026 322.000 0.002 1.000 N NA
 3813324 3813325 SpyM51490 SpyM51491 rplA rplK TRUE 0.971 106.000 0.838 0.032 Y NA
 3813329 3813330 SpyM51495 SpyM51496 mtsC mtsB TRUE 0.966 1.000 0.130 1.000 Y NA
 3813330 3813331 SpyM51496 SpyM51497 mtsB mtsA TRUE 0.765 64.000 0.135 1.000 Y NA
 3813333 3813334 SpyM51499 SpyM51500   mtn FALSE 0.128 151.000 0.000 NA   NA
 3813334 3813335 SpyM51500 SpyM51501 mtn   TRUE 0.893 20.000 0.041 NA   NA
 3813335 3813336 SpyM51501 SpyM51502     TRUE 0.904 0.000 0.025 NA   NA
 3813336 3813337 SpyM51502 SpyM51503   gcaD TRUE 0.648 31.000 0.015 1.000 N NA
 3813337 3813338 SpyM51503 SpyM51504 gcaD   FALSE 0.070 174.000 0.002 1.000 N NA
 3813338 3813339 SpyM51504 SpyM51505     FALSE 0.035 333.000 0.000 1.000   NA
 3813339 3813340 SpyM51505 SpyM51506   fabG TRUE 0.429 76.000 0.067 1.000   NA
 3813340 3813341 SpyM51506 SpyM51507 fabG   TRUE 0.994 -7.000 0.710 NA   NA
 3813343 3813344 SpyM51509 SpyM51510     TRUE 0.585 43.000 0.000 NA   NA
 3813346 3813347 SpyM51512 SpyM51513 nrdE nrdI TRUE 0.999 -33.000 1.000 NA Y NA
 3813347 3813348 SpyM51513 SpyM51514 nrdI nrdF TRUE 0.994 4.000 0.643 NA Y NA
 3813348 3813349 SpyM51514 SpyM51515 nrdF metG FALSE 0.013 495.000 0.000 1.000 N NA
 3813349 3813350 SpyM51515 SpyM51516 metG   FALSE 0.071 243.000 0.000 NA   NA
 3813350 3813351 SpyM51516 SpyM51517     FALSE 0.206 103.000 0.000 NA   NA
 3813351 3813352 SpyM51517 SpyM51518   cspA FALSE 0.032 490.000 0.000 NA   NA
 3813352 3813353 SpyM51518 SpyM51519 cspA lctO FALSE 0.049 266.000 0.000 1.000   NA
 3813357 3813358 SpyM51523 SpyM51524     TRUE 0.799 27.000 0.005 NA   NA
 3813358 3813359 SpyM51524 SpyM51525     TRUE 0.907 5.000 0.043 NA   NA
 3813359 3813360 SpyM51525 SpyM51526     TRUE 0.890 -7.000 0.000 NA   NA
 3813360 3813361 SpyM51526 SpyM51527   holB TRUE 0.835 19.000 0.000 NA   NA
 3813361 3813362 SpyM51527 SpyM51528 holB tdk TRUE 0.948 18.000 0.254 1.000 N NA
 3813362 3813363 SpyM51528 SpyM51529 tdk   FALSE 0.068 249.000 0.000 NA   NA
 3813363 3813364 SpyM51529 SpyM51530   clpP FALSE 0.061 495.000 0.065 NA   NA
 3813364 3813365 SpyM51530 SpyM51531 clpP upp FALSE 0.055 224.000 0.010 1.000 N NA
 3813365 3813366 SpyM51531 SpyM51532 upp   FALSE 0.120 167.000 0.002 1.000   NA
 3813367 3813368 SpyM51533 SpyM51534 murE fhuC FALSE 0.073 246.000 0.062 1.000 N NA
 3813368 3813369 SpyM51534 SpyM51535 fhuC fhuD TRUE 0.994 26.000 0.889 1.000 Y NA
 3813369 3813370 SpyM51535 SpyM51536 fhuD fhuB TRUE 0.976 11.000 0.179 1.000 Y NA
 3813370 3813371 SpyM51536 SpyM51537 fhuB fhuG TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.031 Y NA
 3813372 3813373 SpyM51538 SpyM51539   ppaC TRUE 0.412 76.000 0.015 NA   NA
 3813373 3813374 SpyM51539 SpyM51540 ppaC pflC FALSE 0.130 131.000 0.023 1.000 N NA
 3813374 3813375 SpyM51540 SpyM51541 pflC   TRUE 0.421 78.000 0.028 NA   NA
 3813375 3813376 SpyM51541 SpyM51542     FALSE 0.221 133.000 0.023 NA   NA
 3813376 3813377 SpyM51542 SpyM51543     TRUE 0.936 39.000 0.408 NA   NA
 3813377 3813378 SpyM51543 SpyM51544     FALSE 0.077 293.000 0.050 1.000   NA
 3813378 3813379 SpyM51544 SpyM51545     TRUE 0.988 2.000 0.600 NA   NA
 3813379 3813380 SpyM51545 SpyM5s08     FALSE 0.299 79.000 0.000 NA   NA
 3813380 3813381 SpyM5s08 SpyM51546     FALSE 0.193 109.000 0.000 NA   NA
 3813381 3813382 SpyM51546 SpyM51547     FALSE 0.136 178.000 0.002 NA   NA
 3813382 3813383 SpyM51547 SpyM51548   rluB TRUE 0.898 0.000 0.014 NA   NA
 3813383 3813384 SpyM51548 SpyM51549 rluB scpB TRUE 0.410 121.000 0.224 NA N NA
 3813384 3813385 SpyM51549 SpyM51550 scpB scpA TRUE 0.990 -3.000 0.570 NA   NA
 3813385 3813386 SpyM51550 SpyM51551 scpA xerD TRUE 0.900 0.000 0.017 NA   NA
 3813386 3813387 SpyM51551 SpyM51552 xerD   TRUE 0.931 -3.000 0.111 1.000   NA
 3813387 3813388 SpyM51552 SpyM51553     TRUE 0.916 -3.000 0.065 1.000   NA
 3813388 3813389 SpyM51553 SpyM51554     TRUE 0.954 -21.000 0.085 1.000   NA
 3813389 3813390 SpyM51554 SpyM51555   glr TRUE 0.855 -3.000 0.034 1.000 N NA
 3813390 3813391 SpyM51555 SpyM51556 glr   FALSE 0.161 178.000 0.014 NA   NA
 3813391 3813392 SpyM51556 SpyM51557     FALSE 0.112 178.000 0.000 NA   NA
 3813392 3813393 SpyM51557 SpyM51558     TRUE 0.940 15.000 0.123 NA   NA
 3813393 3813394 SpyM51558 SpyM51559     TRUE 0.703 39.000 0.043 1.000   NA
 3813395 3813396 SpyM51560 SpyM51561     TRUE 0.421 82.000 0.154 1.000 N NA
 3813397 3813398 SpyM51562 SpyM51563 greA   TRUE 0.502 73.000 0.079 NA   NA
 3813398 3813399 SpyM51563 SpyM51564     FALSE 0.347 118.000 0.120 NA   NA
 3813399 3813400 SpyM51564 SpyM51565   murC TRUE 0.605 46.000 0.014 1.000   NA
 3813400 3813401 SpyM51565 SpyM51566 murC   TRUE 0.703 40.000 0.013 NA   NA
 3813401 3813402 SpyM51566 SpyM51567     FALSE 0.191 242.000 0.151 NA   NA
 3813402 3813403 SpyM51567 SpyM51568   engA FALSE 0.092 207.000 0.004 1.000   NA
 3813403 3813404 SpyM51568 SpyM51569 engA dnaI TRUE 0.420 63.000 0.008 1.000   NA
 3813404 3813405 SpyM51569 SpyM51570 dnaI   TRUE 0.997 1.000 0.817 NA Y NA
 3813405 3813406 SpyM51570 SpyM51571     TRUE 0.944 -13.000 0.109 NA N NA
 3813406 3813407 SpyM51571 SpyM51572   csrS FALSE 0.072 215.000 0.007 NA N NA
 3813407 3813408 SpyM51572 SpyM51573 csrS csrR TRUE 0.996 6.000 0.438 0.063 Y NA
 3813408 3813409 SpyM51573 SpyM51574 csrR   FALSE 0.089 267.000 0.014 NA   NA
 3813409 3813410 SpyM51574 SpyM51575   htpX FALSE 0.092 234.000 0.002 NA   NA
 3813410 3813411 SpyM51575 SpyM51576 htpX   TRUE 0.839 47.000 0.222 NA   NA
 3813412 3813413 SpyM51577 SpyM51578 gidB   FALSE 0.249 70.000 0.006 1.000 N NA
 3813413 3813414 SpyM51578 SpyM51579     TRUE 0.998 10.000 0.490 0.003 Y NA
 3813417 3813418 SpyM51582 SpyM51583     TRUE 0.997 1.000 0.938 1.000 Y NA
 3813418 3813419 SpyM51583 SpyM51584     FALSE 0.168 250.000 0.000 NA Y NA
 3813419 3813420 SpyM51584 SpyM51585     FALSE 0.027 328.000 0.000 NA N NA
 3813420 3813421 SpyM51585 SpyM51586     FALSE 0.091 203.000 0.000 NA   NA
 3813421 3813422 SpyM51586 SpyM51587     FALSE 0.041 482.000 0.003 NA   NA
 3813422 3813423 SpyM51587 SpyM51588     FALSE 0.136 254.000 0.094 NA   NA
 3813423 3813424 SpyM51588 SpyM51589     TRUE 0.706 48.000 0.085 NA   NA
 3813424 3813425 SpyM51589 SpyM51590     TRUE 0.917 24.000 0.149 NA   NA
 3813425 3813426 SpyM51590 SpyM51591   nadD TRUE 0.980 -3.000 0.199 1.000 Y NA
 3813426 3813427 SpyM51591 SpyM51592 nadD   TRUE 0.538 69.000 0.150 NA N NA
 3813427 3813428 SpyM51592 SpyM51593     TRUE 0.864 26.000 0.068 NA   NA
 3813428 3813429 SpyM51593 SpyM51594     TRUE 0.986 0.000 0.555 1.000   NA
 3813429 3813430 SpyM51594 SpyM51595   comX2 FALSE 0.024 559.000 0.000 1.000   NA
 3813430 3813431 SpyM51595 SpyM5t59 comX2   TRUE 0.882 -4.000 0.000 NA   NA
 3813431 3813432 SpyM5t59 SpyM5t60     FALSE 0.290 80.000 0.000 NA   NA
 3813432 3813433 SpyM5t60 SpyM5r16     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 3813433 3813434 SpyM5r16 SpyM5r17     FALSE 0.272 83.000 0.000 NA   NA
 3813434 3813435 SpyM5r17 SpyM5t61     FALSE 0.051 298.000 0.000 NA   NA
 3813435 3813436 SpyM5t61 SpyM5r18     TRUE 0.489 50.000 0.000 NA   NA
 3813436 3813437 SpyM5r18 SpyM51596     FALSE 0.038 386.000 0.000 NA   NA
 3813438 3813439 SpyM51597 SpyM51598     TRUE 0.993 13.000 0.087 0.001 Y NA
 3813439 3813440 SpyM51598 SpyM51599     TRUE 0.983 13.000 0.022 0.049 Y NA
 3813441 3813442 SpyM51600A SpyM51601   salR FALSE 0.100 190.000 0.000 NA   NA
 3813442 3813443 SpyM51601 SpyM51602 salR salK TRUE 0.998 -19.000 0.704 NA Y NA
 3813443 3813444 SpyM51602 SpyM51603 salK salY TRUE 0.613 40.000 0.000 NA   NA
 3813444 3813445 SpyM51603 SpyM51604 salY salX TRUE 0.807 2.000 0.000 1.000   NA
 3813445 3813446 SpyM51604 SpyM51605 salX   TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 3813446 3813447 SpyM51605 SpyM51606   salA FALSE 0.266 84.000 0.000 NA   NA
 3813447 3813448 SpyM51606 SpyM51607 salA lacG FALSE 0.025 504.000 0.000 1.000   NA
 3813448 3813449 SpyM51607 SpyM51608 lacG lacE TRUE 0.443 88.000 0.000 1.000 Y NA
 3813449 3813450 SpyM51608 SpyM51609 lacE lacF TRUE 0.991 0.000 0.150 0.013 Y NA
 3813450 3813451 SpyM51609 SpyM51610 lacF lacD2 TRUE 0.992 24.000 0.667 1.000 Y NA
 3813451 3813452 SpyM51610 SpyM51611 lacD2 lacC2 TRUE 0.984 4.000 0.000 0.002 Y NA
 3813452 3813453 SpyM51611 SpyM51612 lacC2 lacB2 TRUE 0.723 48.000 0.000 1.000 Y NA
 3813453 3813454 SpyM51612 SpyM51613 lacB2 lacA2 TRUE 0.954 35.000 0.000 0.003 Y NA
 3813457 3813458 SpyM51615 SpyM51616     TRUE 0.902 -10.000 0.000 NA   NA
 3813458 3813459 SpyM51616 SpyM51617     FALSE 0.216 98.000 0.000 NA   NA
 3813460 3813461 SpyM51619 SpyM51620 rpsI rplM TRUE 0.997 21.000 0.601 0.024 Y NA
 3813461 3813462 SpyM51620 SpyM51621 rplM   FALSE 0.034 218.000 0.000 1.000 N NA
 3813462 3813463 SpyM51621 SpyM51622     TRUE 0.922 -3.000 0.051 NA   NA
 3813463 3813464 SpyM51622 SpyM51623     FALSE 0.143 136.000 0.000 NA   NA
 3813464 3813465 SpyM51623 SpyM51624     FALSE 0.325 97.000 0.036 NA   NA
 3813465 3813466 SpyM51624 SpyM51625     TRUE 0.929 4.000 0.109 NA   NA
 3813466 3813467 SpyM51625 SpyM51626     TRUE 0.595 47.000 0.003 NA   NA
 3813467 3813468 SpyM51626 SpyM51627     FALSE 0.097 196.000 0.000 NA   NA
 3813468 3813469 SpyM51627 SpyM51628   cysS TRUE 0.947 -7.000 0.129 1.000   NA
 3813469 3813470 SpyM51628 SpyM51629 cysS   TRUE 0.778 28.000 0.002 NA   NA
 3813470 3813471 SpyM51629 SpyM51630     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 3813471 3813472 SpyM51630 SpyM51631   cysE FALSE 0.075 236.000 0.000 NA   NA
 3813472 3813473 SpyM51631 SpyM51632 cysE   TRUE 0.931 9.000 0.097 NA   NA
 3813473 3813474 SpyM51632 SpyM51633   comR TRUE 0.919 -7.000 0.009 NA   NA
 3813474 3813475 SpyM51633 SpyM51634 comR   FALSE 0.024 280.000 0.000 1.000 N NA
 3813475 3813476 SpyM51634 SpyM51635   ulaA TRUE 0.908 13.000 0.056 1.000   NA
 3813476 3813477 SpyM51635 SpyM51636 ulaA   TRUE 0.977 27.000 0.241 0.021   NA
 3813477 3813478 SpyM51636 SpyM51637     TRUE 0.975 -7.000 0.048 0.013 N NA
 3813478 3813479 SpyM51637 SpyM51638   rpsO FALSE 0.017 352.000 0.000 1.000 N NA
 3813479 3813480 SpyM51638 SpyM51639 rpsO   FALSE 0.124 158.000 0.000 NA   NA
 3813481 3813482 SpyM51640 SpyM51641   def FALSE 0.211 101.000 0.000 NA   NA
 3813483 3813484 SpyM51642 SpyM51643     TRUE 0.593 131.000 0.414 1.000   NA
 3813484 3813485 SpyM51643 SpyM51644   polC FALSE 0.163 110.000 0.020 1.000 N NA
 3813485 3813486 SpyM51644 SpyM51645 polC drpA FALSE 0.219 254.000 0.070 0.043 N NA
 3813486 3813487 SpyM51645 SpyM51646 drpA eep FALSE 0.117 198.000 0.095 1.000 N NA
 3813487 3813488 SpyM51646 SpyM51647 eep   FALSE 0.304 73.000 0.040 1.000 N NA
 3813488 3813489 SpyM51647 SpyM51648   uppS TRUE 0.969 13.000 0.113 1.000 Y NA
 3813489 3813490 SpyM51648 SpyM51649 uppS yajC FALSE 0.071 219.000 0.007 NA N NA
 3813490 3813491 SpyM51649 SpyM51650 yajC   FALSE 0.151 116.000 0.006 NA N NA
 3813491 3813492 SpyM51650 SpyM51651     FALSE 0.082 142.000 0.000 NA N NA
 3813492 3813493 SpyM51651 SpyM51652   dexB TRUE 0.603 198.000 0.049 0.007 Y NA
 3813493 3813494 SpyM51652 SpyM51653 dexB msmK TRUE 0.542 129.000 0.171 1.000 Y NA
 3813494 3813495 SpyM51653 SpyM51654 msmK lrp FALSE 0.057 298.000 0.071 1.000 N NA
 3813497 3813498 SpyM51657 SpyM51658   relA TRUE 0.930 15.000 0.177 1.000 N NA
 3813498 3813499 SpyM51658 SpyM51659 relA scl FALSE 0.057 240.000 0.000 1.000   NA
 3813501 3813502 SpyM51661 SpyM51662     TRUE 0.842 83.000 0.610 1.000   NA
 3813502 3813503 SpyM51662 SpyM51663     FALSE 0.042 355.000 0.000 NA   NA
 3813503 3813504 SpyM51663 SpyM51664   prmA TRUE 0.964 0.000 0.227 NA   NA
 3813504 3813505 SpyM51664 SpyM51665 prmA   TRUE 0.434 71.000 0.013 NA   NA
 3813506 3813507 SpyM51666 SpyM51667     FALSE 0.045 185.000 0.000 1.000 N NA
 3813507 3813508 SpyM51667 SpyM51668   trpG TRUE 0.865 33.000 0.009 1.000 Y NA
 3813508 3813509 SpyM51668 SpyM51669 trpG   TRUE 0.654 33.000 0.035 1.000 N NA
 3813509 3813510 SpyM51669 SpyM5t62     FALSE 0.055 286.000 0.000 NA   NA
 3813510 3813511 SpyM5t62 SpyM51670     FALSE 0.136 141.000 0.000 NA   NA
 3813511 3813512 SpyM51670 SpyM51671     TRUE 0.382 55.000 0.000 1.000   NA
 3813512 3813513 SpyM51671 SpyM51672   smeZ FALSE 0.054 249.000 0.000 1.000   NA
 3813513 3813514 SpyM51672 SpyM51673 smeZ dppA FALSE 0.022 729.000 0.000 1.000   NA
 3813514 3813515 SpyM51673 SpyM51674 dppA dppB TRUE 0.642 113.000 0.000 0.030 Y NA
 3813515 3813516 SpyM51674 SpyM51675 dppB dppC TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.030 Y NA
 3813516 3813517 SpyM51675 SpyM51676 dppC dppD TRUE 0.987 12.000 0.333 1.000 Y NA
 3813517 3813518 SpyM51676 SpyM51677 dppD dppE TRUE 0.999 -16.000 0.750 0.023 Y NA
 3813519 3813520 SpyM51678 SpyM51679     FALSE 0.118 169.000 0.000 NA   NA
 3813520 3813521 SpyM51679 SpyM51680   lmb TRUE 0.994 13.000 0.800 NA   NA
 3813521 3813522 SpyM51680 SpyM51681 lmb scpA FALSE 0.050 263.000 0.000 1.000   NA
 3813522 3813523 SpyM51681 SpyM51682 scpA emm5 FALSE 0.171 369.000 0.000 0.006   NA
 3813523 3813524 SpyM51682 SpyM51683 emm5 mga FALSE 0.106 184.000 0.000 NA   NA
 3813526 3813527 SpyM51685 SpyM51686   isp TRUE 0.944 78.000 1.000 NA   NA
 3813527 3813528 SpyM51686 SpyM51687 isp   TRUE 0.483 102.000 0.200 1.000   NA
 3813528 3813529 SpyM51687 SpyM51688     TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3813529 3813530 SpyM51688 SpyM51689     TRUE 0.510 94.000 0.267 1.000 N NA
 3813530 3813531 SpyM51689 SpyM51690     TRUE 0.992 13.000 0.467 1.000 Y NA
 3813531 3813532 SpyM51690 SpyM51691     TRUE 0.985 -13.000 0.385 NA N NA
 3813532 3813533 SpyM51691 SpyM51692     FALSE 0.202 424.000 0.333 NA   NA
 3813533 3813534 SpyM51692 SpyM51693     FALSE 0.132 147.000 0.000 NA   NA
 3813536 3813537 SpyM51695 SpyM51696 prsA2   TRUE 0.434 56.000 0.000 NA   NA
 3813537 3813538 SpyM51696 SpyM51697     FALSE 0.198 107.000 0.000 NA   NA
 3813538 3813539 SpyM51697 SpyM51698   speB TRUE 0.971 2.000 0.000 0.001   NA
 3813539 3813540 SpyM51698 SpyM51699 speB   FALSE 0.060 272.000 0.000 NA   NA
 3813541 3813542 SpyM51700 SpyM51701   ropB FALSE 0.056 284.000 0.000 NA   NA
 3813545 3813546 SpyM51704 SpyM51705 gldA fsa TRUE 0.671 57.000 0.211 1.000 N NA
 3813546 3813547 SpyM51705 SpyM51706 fsa pflD TRUE 0.971 13.000 0.368 1.000 N NA
 3813547 3813548 SpyM51706 SpyM51707 pflD   FALSE 0.127 211.000 0.132 1.000 N NA
 3813548 3813549 SpyM51707 SpyM51708     TRUE 0.999 10.000 0.889 0.012 Y NA
 3813549 3813550 SpyM51708 SpyM51709     TRUE 0.998 28.000 0.889 0.012 Y NA
 3813550 3813551 SpyM51709 SpyM51710     FALSE 0.067 287.000 0.091 1.000 N NA
 3813551 3813552 SpyM51710 SpyM51711     TRUE 0.976 16.000 0.188 1.000 Y NA
 3813554 3813555 SpyM51713 SpyM51714 secE rpmG TRUE 0.881 14.000 0.080 1.000 N NA
 3813555 3813556 SpyM51714 SpyM51715 rpmG pbp2A TRUE 0.592 49.000 0.111 1.000 N NA
 3813556 3813557 SpyM51715 SpyM51716 pbp2A   TRUE 0.681 39.000 0.062 NA N NA
 3813558 3813559 SpyM51716A SpyM51717     TRUE 0.450 77.000 0.056 NA   NA
 3813561 3813562 SpyM51719 SpyM51719A     FALSE 0.056 282.000 0.000 NA   NA
 3813563 3813564 SpyM51720 SpyM51721   groEL FALSE 0.069 248.000 0.000 NA   NA
 3813564 3813565 SpyM51721 SpyM51722 groEL groES TRUE 0.976 36.000 0.160 0.006 Y NA
 3813565 3813566 SpyM51722 SpyM51723 groES clpC FALSE 0.309 178.000 0.036 1.000 Y NA
 3813566 3813567 SpyM51723 SpyM51724 clpC ctsR TRUE 0.941 0.000 0.188 NA N NA
 3813567 3813568 SpyM51724 SpyM51725 ctsR csp FALSE 0.285 196.000 0.013 NA Y NA
 3813568 3813569 SpyM51725 SpyM5t63 csp   FALSE 0.031 509.000 0.000 NA   NA
 3813570 3813571 SpyM51726 SpyM51727 ahpC ahpF TRUE 0.991 21.000 0.551 1.000 Y NA
 3813573 3813574 SpyM51729 SpyM51730 hutU   TRUE 0.595 88.000 0.086 1.000 Y NA
 3813574 3813575 SpyM51730 SpyM51731     TRUE 0.971 11.000 0.143 1.000 Y NA
 3813575 3813576 SpyM51731 SpyM51732   fhs2 TRUE 0.828 18.000 0.038 1.000 N NA
 3813576 3813577 SpyM51732 SpyM51733 fhs2   TRUE 0.880 22.000 0.038 NA   NA
 3813577 3813578 SpyM51733 SpyM51734     FALSE 0.145 220.000 0.062 NA   NA
 3813578 3813579 SpyM51734 SpyM51735   hutH TRUE 0.947 12.000 0.006 1.000 Y NA
 3813579 3813580 SpyM51735 SpyM51736 hutH hutG TRUE 0.574 186.000 0.000 0.002 Y NA
 3813581 3813582 SpyM51737 SpyM51738     TRUE 0.842 18.000 0.000 NA   NA
 3813583 3813584 SpyM51739 SpyM51740 rpsB tsf TRUE 0.869 134.000 0.748 1.000 Y NA
 3813585 3813586 SpyM51741 SpyM51742 pepO treA FALSE 0.037 208.000 0.000 1.000 N NA
 3813586 3813587 SpyM51742 SpyM51743 treA   TRUE 0.944 67.000 0.650 1.000 Y NA
 3813590 3813591 SpyM51746 SpyM51747     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 3813592 3813593 SpyM51748 SpyM51749 nrdG   TRUE 0.941 0.000 0.159 1.000   NA
 3813593 3813594 SpyM51749 SpyM51750     TRUE 0.895 9.000 0.041 1.000   NA
 3813594 3813595 SpyM51750 SpyM51751     TRUE 0.821 29.000 0.041 NA   NA
 3813595 3813596 SpyM51751 SpyM51752   nrdD FALSE 0.190 182.000 0.062 NA   NA
 3813596 3813597 SpyM51752 SpyM51753 nrdD   FALSE 0.343 97.000 0.057 NA   NA
 3813597 3813598 SpyM51753 SpyM51754     FALSE 0.035 413.000 0.000 NA   NA
 3813598 3813599 SpyM51754 SpyM51755     TRUE 0.991 12.000 0.651 NA   NA
 3813599 3813600 SpyM51755 SpyM51756     TRUE 0.989 -3.000 0.537 NA   NA
 3813600 3813601 SpyM51756 SpyM51757   spxA FALSE 0.276 113.000 0.032 NA   NA
 3813601 3813602 SpyM51757 SpyM51758 spxA recA FALSE 0.033 291.000 0.004 1.000 N NA
 3813602 3813603 SpyM51758 SpyM51759 recA cinA TRUE 0.370 89.000 0.083 1.000   NA
 3813603 3813604 SpyM51759 SpyM51760 cinA tag TRUE 0.384 69.000 0.011 1.000   NA
 3813604 3813605 SpyM51760 SpyM51761 tag ruvA TRUE 0.949 10.000 0.012 1.000 Y NA
 3813605 3813606 SpyM51761 SpyM51762 ruvA lmrP TRUE 0.851 2.000 0.005 1.000   NA
 3813606 3813607 SpyM51762 SpyM51763 lmrP mutL TRUE 0.866 11.000 0.006 1.000   NA
 3813607 3813608 SpyM51763 SpyM51764 mutL   FALSE 0.224 95.000 0.000 NA   NA
 3813608 3813609 SpyM51764 SpyM51765     FALSE 0.044 338.000 0.000 NA   NA
 3813609 3813610 SpyM51765 SpyM51766     TRUE 0.761 26.000 0.000 NA   NA
 3813610 3813611 SpyM51766 SpyM51767     FALSE 0.033 351.000 0.000 1.000   NA
 3813612 3813613 SpyM51768 SpyM51769     FALSE 0.052 294.000 0.000 NA   NA
 3813613 3813614 SpyM51769 SpyM51770     TRUE 0.991 0.000 0.667 NA   NA
 3813614 3813615 SpyM51770 SpyM51771     TRUE 0.861 12.000 0.000 NA   NA
 3813615 3813616 SpyM51771 SpyM51772     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 3813616 3813617 SpyM51772 SpyM51773     TRUE 0.992 1.000 0.714 NA   NA
 3813617 3813618 SpyM51773 SpyM51774     TRUE 0.986 20.000 0.571 NA   NA
 3813618 3813619 SpyM51774 SpyM51774A     FALSE 0.047 314.000 0.000 NA   NA
 3813619 3813620 SpyM51774A SpyM51774B     TRUE 0.995 6.000 1.000 NA   NA
 3813620 3813621 SpyM51774B SpyM51775     FALSE 0.211 101.000 0.000 NA   NA
 3813621 3813622 SpyM51775 SpyM51776     FALSE 0.318 74.000 0.000 NA   NA
 3813622 3813623 SpyM51776 SpyM51777     FALSE 0.035 404.000 0.000 NA   NA
 3813623 3813624 SpyM51777 SpyM51778     TRUE 0.922 -25.000 0.000 NA   NA
 3813624 3813625 SpyM51778 SpyM51779     FALSE 0.092 202.000 0.000 NA   NA
 3813626 3813627 SpyM51780 SpyM51781 mutS   TRUE 0.945 -13.000 0.031 NA   NA
 3813627 3813628 SpyM51781 SpyM51782   argR FALSE 0.220 143.000 0.054 NA   NA
 3813629 3813630 SpyM51783 SpyM51784 argS   FALSE 0.363 88.000 0.032 NA   NA
 3813631 3813632 SpyM51785 SpyM51786     TRUE 0.964 43.000 0.667 NA   NA
 3813632 3813633 SpyM51786 SpyM51787     TRUE 0.939 20.000 0.156 NA   NA
 3813633 3813634 SpyM51787 SpyM51788   aspS TRUE 0.927 -7.000 0.016 NA   NA
 3813634 3813635 SpyM51788 SpyM51789 aspS hisS TRUE 0.432 338.000 0.161 0.041 Y NA
 3813636 3813637 SpyM51790 SpyM51791 rpmF rpmG TRUE 0.983 16.000 0.012 0.030 Y NA
 3813637 3813638 SpyM51791 SpyM51792 rpmG cadD FALSE 0.033 281.000 0.000 NA N NA
 3813638 3813639 SpyM51792 SpyM51793 cadD cadC TRUE 0.994 12.000 0.875 NA N NA
 3813639 3813640 SpyM51793 SpyM51794 cadC   TRUE 0.800 23.000 0.000 NA   NA
 3813640 3813641 SpyM51794 SpyM51795     FALSE 0.366 66.000 0.000 NA   NA
 3813641 3813642 SpyM51795 SpyM51796     TRUE 0.997 -10.000 1.000 NA   NA
 3813643 3813644 SpyM51797 SpyM51798     FALSE 0.355 68.000 0.000 NA   NA
 3813647 3813648 SpyM51800A SpyM51801     TRUE 0.984 -13.000 0.300 NA   NA
 3813648 3813649 SpyM51801 SpyM51802     TRUE 0.981 -3.000 0.350 NA   NA
 3813652 3813653 SpyM51805 SpyM51806 rpsD veg FALSE 0.028 729.000 0.000 NA   NA
 3813653 3813654 SpyM51806 SpyM51807 veg dnaC TRUE 0.903 17.000 0.030 NA   NA
 3813654 3813655 SpyM51807 SpyM51808 dnaC rplI TRUE 0.767 30.000 0.100 1.000 N NA
 3813655 3813656 SpyM51808 SpyM51809 rplI   TRUE 0.906 -3.000 0.119 1.000 N NA
 3813656 3813657 SpyM51809 SpyM51810   gidA FALSE 0.183 90.000 0.011 1.000 N NA
 3813657 3813658 SpyM51810 SpyM51811 gidA   TRUE 0.458 53.000 0.000 NA   NA
 3813658 3813659 SpyM51811 SpyM51812   trmU FALSE 0.028 707.000 0.000 NA   NA
 3813660 3813661 SpyM51813 SpyM51814 sdhB sdhA TRUE 0.996 12.000 0.221 0.001 Y NA
 3813662 3813663 SpyM51815 SpyM51816     FALSE 0.031 371.000 0.000 1.000   NA
 3813663 3813664 SpyM51816 SpyM51817     TRUE 0.977 -7.000 0.136 1.000 Y NA
 3813664 3813665 SpyM51817 SpyM51818     TRUE 0.999 -24.000 0.713 0.022 Y NA
 3813665 3813666 SpyM51818 SpyM51819   pgsA TRUE 0.807 2.000 0.015 1.000 N NA
 3813666 3813667 SpyM51819 SpyM51820 pgsA   TRUE 0.916 14.000 0.077 1.000   NA
 3813667 3813668 SpyM51820 SpyM51821     TRUE 0.721 50.000 0.156 1.000   NA
 3813668 3813669 SpyM51821 SpyM51822     TRUE 0.998 2.000 0.872 0.004   NA
 3813669 3813670 SpyM51822 SpyM51823     FALSE 0.062 265.000 0.000 NA   NA
 3813671 3813672 SpyM51824 SpyM51825 hasA hasB TRUE 0.867 36.000 0.048 1.000 Y NA
 3813672 3813673 SpyM51825 SpyM51826 hasB hasC1 FALSE 0.222 182.000 0.000 1.000 Y NA
 3813673 3813674 SpyM51826 SpyM51827 hasC1   FALSE 0.038 308.000 0.000 1.000   NA