MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudomonas putida KT2440

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 215707 215708 PP0001 PP0002 parB   TRUE 0.986 10.000 0.827 1.000 N NA
 215708 215709 PP0002 PP0003   gidB TRUE 0.895 19.000 0.339 1.000 N NA
 215709 215710 PP0003 PP0004 gidB gidA TRUE 0.995 -3.000 0.466 1.000 N NA
 215710 215711 PP0004 PP0005 gidA trmE FALSE 0.032 631.000 0.266 1.000   NA
 215711 215712 PP0005 PP0006 trmE yidC TRUE 0.705 89.000 0.221 0.093   NA
 215712 215713 PP0006 PP0007 yidC   TRUE 0.989 3.000 0.461 NA   NA
 215713 215714 PP0007 PP0008   rnpA TRUE 0.992 -7.000 0.540 NA   NA
 215714 215715 PP0008 PP0009 rnpA rpmH TRUE 0.973 14.000 0.787 1.000   NA
 215716 215717 PP0010 PP0011 dnaA dnaN TRUE 0.946 41.000 0.328 1.000 Y NA
 215717 215718 PP0011 PP0012 dnaN recF TRUE 0.961 16.000 0.318 1.000 Y NA
 215718 215719 PP0012 PP0013 recF gyrB TRUE 0.994 5.000 0.249 0.004 Y NA
 215719 215720 PP0013 PP0014 gyrB   FALSE 0.002 1383.000 0.000 1.000   NA
 215720 215721 PP0014 PP0015     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 215721 215722 PP0015 PP0016     FALSE 0.135 76.000 0.000 NA   NA
 215722 215723 PP0016 PP0017     FALSE 0.215 57.000 0.000 NA   NA
 215723 215724 PP0017 PP0018     FALSE 0.002 646.000 0.000 NA   NA
 215724 215725 PP0018 PP0019     TRUE 0.660 -18.000 0.000 NA   NA
 215725 215726 PP0019 PP0020     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 215726 215727 PP0020 PP0021     FALSE 0.008 311.000 0.000 NA   NA
 215728 215729 PP0022 PP0023     FALSE 0.024 209.000 0.000 NA   NA
 215729 215730 PP0023 PP0024     FALSE 0.074 123.000 0.000 NA   NA
 215730 215731 PP0024 PP0025     FALSE 0.004 443.000 0.000 NA   NA
 215732 215733 PP0026 PP0027     FALSE 0.164 68.000 0.000 NA   NA
 215735 215736 PP0029 PP0030 czrR-1   TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 215739 215740 PP0033 PP0034     TRUE 0.968 -6.000 0.000 NA Y NA
 215740 215741 PP0034 PP0035     TRUE 0.560 -34.000 0.000 NA   NA
 215742 215743 PP0036 PP0037   oprP FALSE 0.009 229.000 0.000 NA N NA
 215743 215744 PP0037 PP0038 oprP   FALSE 0.342 20.000 0.000 NA   NA
 215744 215745 PP0038 PP0039     FALSE 0.064 145.000 0.000 NA   NA
 215745 215746 PP0039 PP0040     FALSE 0.073 128.000 0.000 NA   NA
 215747 215748 PP0041 PP0042 cadA-1   FALSE 0.028 203.000 0.000 NA   NA
 215748 215749 PP0042 PP0043     FALSE 0.012 274.000 0.000 NA   NA
 215749 215750 PP0043 PP0044     TRUE 0.906 25.000 0.421 1.000 N NA
 215750 215751 PP0044 PP0045     TRUE 0.907 69.000 0.368 1.000 Y NA
 215752 215753 PP0046 PP0047     FALSE 0.004 490.000 0.000 1.000   NA
 215753 215754 PP0047 PP0048     FALSE 0.074 118.000 0.000 NA   NA
 215755 215756 PP0049 PP0050     FALSE 0.002 1150.000 0.000 NA   NA
 215756 215757 PP0050 PP0051     FALSE 0.072 132.000 0.000 NA   NA
 215758 215759 PP0052 PP0053     TRUE 0.817 41.000 0.230 1.000   NA
 215759 215760 PP0053 PP0054     TRUE 0.876 -42.000 0.122 1.000   NA
 215762 215763 PP0056 PP0057     FALSE 0.291 98.000 0.094 1.000 N NA
 215764 215765 PP0058 PP0059     TRUE 0.828 47.000 0.310 1.000 N NA
 215765 215766 PP0059 PP0060   glyS TRUE 0.931 4.000 0.123 1.000 N NA
 215766 215767 PP0060 PP0061 glyS glyQ TRUE 1.000 -3.000 0.651 0.001 Y NA
 215768 215769 PP0062 PP0063 tag   FALSE 0.299 42.000 0.017 1.000 N NA
 215770 215771 PP0064 PP0065   trkA TRUE 0.552 12.000 0.008 1.000   NA
 215771 215772 PP0065 PP0066 trkA sun TRUE 0.714 24.000 0.122 1.000 N NA
 215772 215773 PP0066 PP0067 sun fmt TRUE 0.997 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 215773 215774 PP0067 PP0068 fmt def-1 TRUE 0.906 61.000 0.105 0.018 Y NA
 215775 215776 PP0069 PP0070     FALSE 0.315 43.000 0.023 NA N NA
 215776 215777 PP0070 PP0071     FALSE 0.003 619.000 0.000 NA   NA
 215779 215780 PP0073 PP0074 hemF aroE-1 TRUE 0.663 26.000 0.093 1.000 N NA
 215781 215782 PP0075 PP0076     TRUE 0.592 144.000 0.259 0.085 N NA
 215782 215783 PP0076 PP0077   betC TRUE 0.987 -3.000 0.218 1.000 N NA
 215784 215785 PP0078 PP0079     TRUE 0.605 9.000 0.000 NA   NA
 215788 215789 PP0082 PP0083 trpA trpB TRUE 0.999 -3.000 0.344 0.001 Y NA
 215792 215793 PP0086 PP0087     FALSE 0.449 59.000 0.049 NA   NA
 215795 215796 PP0089 PP0090 osmC   TRUE 0.600 13.000 0.026 NA   NA
 215797 215798 PP0091 PP0092     FALSE 0.220 56.000 0.000 NA   NA
 215800 215801 PP0094 PP0095     FALSE 0.118 122.000 0.016 1.000   NA
 215802 215803 PP0096 PP0097 prlC   TRUE 0.986 -3.000 0.173 NA   NA
 215803 215804 PP0097 PP0098     FALSE 0.345 19.000 0.000 NA   NA
 215804 215805 PP0098 PP0099     FALSE 0.066 140.000 0.000 NA   NA
 215805 215806 PP0099 PP0100   cynT FALSE 0.005 307.000 0.000 1.000 N NA
 215806 215807 PP0100 PP0101 cynT   TRUE 0.673 208.000 0.241 0.002 Y NA
 215807 215808 PP0101 PP0102     FALSE 0.232 136.000 0.069 NA   NA
 215808 215809 PP0102 PP0103     FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 215809 215810 PP0103 PP0104     TRUE 0.990 44.000 0.741 0.003 Y NA
 215810 215811 PP0104 PP0105     TRUE 0.939 10.000 0.268 1.000 N NA
 215811 215812 PP0105 PP0106     TRUE 0.940 17.000 0.536 1.000 N NA
 215812 215813 PP0106 PP0107     TRUE 0.574 23.000 0.041 NA   NA
 215813 215814 PP0107 PP0108     TRUE 0.985 -31.000 0.722 NA   NA
 215814 215815 PP0108 PP0109     TRUE 0.943 10.000 0.255 NA   NA
 215815 215816 PP0109 PP0110   cyoE-1 TRUE 0.989 -15.000 0.321 1.000 Y NA
 215816 215817 PP0110 PP0111 cyoE-1   TRUE 0.979 -3.000 0.099 1.000   NA
 215818 215819 PP0112 PP0113     TRUE 0.972 65.000 0.867 NA Y NA
 215819 215820 PP0113 PP0114     TRUE 0.998 0.000 0.469 1.000 Y NA
 215822 215823 PP0116 PP0117   znuB FALSE 0.169 127.000 0.037 NA   NA
 215823 215824 PP0117 PP0118 znuB znuC TRUE 0.998 -7.000 0.755 1.000 Y NA
 215824 215825 PP0118 PP0119 znuC   TRUE 0.997 -3.000 0.309 1.000 Y NA
 215827 215828 PP0121 PP0122 thrB   TRUE 0.641 70.000 0.204 NA   NA
 215831 215832 PP0125 PP0126     TRUE 0.886 32.000 0.000 0.013 Y NA
 215832 215833 PP0126 PP0127     FALSE 0.034 152.000 0.000 1.000 N NA
 215833 215834 PP0127 PP0128     TRUE 0.849 13.000 0.162 NA   NA
 215834 215835 PP0128 PP0129     TRUE 0.756 28.000 0.147 NA   NA
 215835 215836 PP0129 PP0130     TRUE 0.735 74.000 0.350 1.000 N NA
 215836 215837 PP0130 PP0131     FALSE 0.209 196.000 0.200 1.000 N NA
 215838 215839 PP0132 PP0133   algB TRUE 0.998 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 215840 215841 PP0134 PP0135     FALSE 0.003 509.000 0.000 NA   NA
 215841 215842 PP0135 PP0136     TRUE 0.958 3.000 0.140 NA   NA
 215842 215843 PP0136 PP0137   gltP FALSE 0.002 746.000 0.000 NA   NA
 215843 215844 PP0137 PP0138 gltP   FALSE 0.172 148.000 0.047 1.000   NA
 215845 215846 PP0139 PP0140     TRUE 0.988 -3.000 0.201 NA   NA
 215846 215847 PP0140 PP0141     TRUE 0.996 4.000 0.650 NA Y NA
 215847 215848 PP0141 PP0142     TRUE 0.998 -3.000 0.491 NA Y NA
 215848 215849 PP0142 PP0143     FALSE 0.257 132.000 0.075 NA   NA
 215849 215850 PP0143 PP0144     FALSE 0.372 94.000 0.109 NA   NA
 215850 215851 PP0144 PP0145     TRUE 0.943 31.000 0.600 1.000   NA
 215851 215852 PP0145 PP0146     FALSE 0.072 283.000 0.000 1.000 Y NA
 215852 215853 PP0146 PP0147     TRUE 0.771 43.000 0.085 0.092 N NA
 215855 215856 PP0149 PP0150     TRUE 0.997 -3.000 0.647 NA   NA
 215856 215857 PP0150 PP0151     TRUE 0.953 37.000 0.727 NA   NA
 215857 215858 PP0151 PP0152     TRUE 0.869 90.000 0.800 NA   NA
 215858 215859 PP0152 PP0153     FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 215859 215860 PP0153 PP0154     FALSE 0.006 374.000 0.000 NA   NA
 215860 215861 PP0154 PP0155   pntB FALSE 0.366 187.000 0.077 1.000 Y NA
 215861 10750587 PP0155 PP_0156 pntB   TRUE 0.772 3.000 0.000 NA   NA
 10750587 215862 PP_0156 PP0157     FALSE 0.004 419.000 0.000 NA   NA
 215863 215864 PP0158 PP0159 gcdH   TRUE 0.789 14.000 0.143 1.000 N NA
 215864 407995 PP0159 PP_16SA   rrs FALSE 0.003 570.000 0.000 NA   NA
 407995 2137291 PP_16SA PP_23SA rrs   FALSE 0.010 297.000 0.000 NA   NA
 2137291 406659 PP_23SA PP_5SA   rrf FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 406659 407996 PP_5SA PP_16SB rrf rrs FALSE 0.004 463.000 0.000 NA   NA
 407996 2137292 PP_16SB PP_23SB rrs   FALSE 0.010 297.000 0.000 NA   NA
 2137292 406660 PP_23SB PP_r01   rrf FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 406660 406661 PP_r01 PP_5SB rrf rrf FALSE 0.077 106.000 0.000 NA   NA
 215865 215866 PP0160 PP0161     TRUE 0.697 94.000 0.160 NA Y NA
 215866 215867 PP0161 PP0162     TRUE 0.979 5.000 0.444 NA N NA
 215867 215868 PP0162 PP0163     TRUE 0.661 89.000 0.000 0.059 Y NA
 215869 215870 PP0164 PP0165     TRUE 0.937 11.000 0.273 NA   NA
 215871 215872 PP0166 PP0167     TRUE 0.991 -10.000 0.447 0.091 N NA
 215873 215874 PP0168 PP0169     FALSE 0.011 686.000 0.000 0.071   NA
 215874 215875 PP0169 PP0170     TRUE 0.951 18.000 0.647 NA N NA
 215875 215876 PP0170 PP0171     TRUE 0.993 7.000 0.553 NA Y NA
 215876 215877 PP0171 PP0172     TRUE 0.988 15.000 0.795 1.000 Y NA
 215879 215880 PP0174 PP0175     FALSE 0.077 133.000 0.000 1.000   NA
 215880 215881 PP0175 PP0176     TRUE 0.995 -3.000 0.444 NA   NA
 215881 215882 PP0176 PP0177     TRUE 0.994 -3.000 0.353 NA   NA
 215882 215883 PP0177 PP0178     TRUE 0.996 -3.000 0.529 NA   NA
 215883 215884 PP0178 PP0179     TRUE 0.998 -3.000 0.800 1.000 N NA
 215884 215885 PP0179 PP0180     FALSE 0.037 144.000 0.000 1.000 N NA
 215886 215887 PP0181 PP0182     TRUE 0.635 70.000 0.200 NA   NA
 215890 215891 PP0185 PP0186 pprA hemC FALSE 0.123 119.000 0.032 1.000 N NA
 215891 215892 PP0186 PP0187 hemC hemD TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.002 Y NA
 215892 215893 PP0187 PP0188 hemD   TRUE 0.980 19.000 0.600 1.000 Y NA
 215893 215894 PP0188 PP0189   hemY TRUE 0.999 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 215894 215895 PP0189 PP0190 hemY   FALSE 0.044 223.000 0.042 1.000 N NA
 215895 215896 PP0190 PP0191   pfrA FALSE 0.093 232.000 0.133 1.000 N NA
 215897 215898 PP0192 PP0193 fkl   FALSE 0.360 16.000 0.000 NA   NA
 215901 215902 PP0196 PP0197     TRUE 0.971 0.000 0.108 NA   NA
 215902 215903 PP0197 PP0198     FALSE 0.291 100.000 0.075 NA   NA
 215904 215905 PP0199 PP0200     TRUE 0.985 9.000 0.330 NA Y NA
 215907 215908 PP0202 PP0203     FALSE 0.051 171.000 0.000 1.000   NA
 215908 2137293 PP0203 PP_t01     FALSE 0.051 166.000 0.000 NA   NA
 215909 215910 PP0204 PP0205     TRUE 0.992 -3.000 0.310 1.000 N NA
 215910 215911 PP0205 PP0206     TRUE 0.975 63.000 0.595 0.071 Y NA
 215911 215912 PP0206 PP0207     TRUE 0.635 120.000 0.439 1.000 N NA
 215912 215913 PP0207 PP0208     TRUE 0.992 16.000 0.732 0.084 Y NA
 215913 215914 PP0208 PP0209     TRUE 0.997 0.000 0.424 1.000 Y NA
 215914 215915 PP0209 PP0210     TRUE 0.992 -3.000 0.316 1.000 N NA
 215915 215916 PP0210 PP0211     TRUE 0.988 0.000 0.273 NA   NA
 215916 10750588 PP0211 PP_0212     FALSE 0.116 83.000 0.000 NA   NA
 10750588 215917 PP_0212 PP0213   gabD FALSE 0.012 266.000 0.000 NA   NA
 215917 215918 PP0213 PP0214 gabD gabT FALSE 0.351 183.000 0.303 1.000 N NA
 215918 215919 PP0214 PP0215 gabT   FALSE 0.343 139.000 0.182 1.000 N NA
 215920 215921 PP0216 PP0217     FALSE 0.479 142.000 0.294 1.000 N NA
 215923 215924 PP0219 PP0220     TRUE 0.988 -10.000 0.222 1.000 Y NA
 215924 215925 PP0220 PP0221     TRUE 0.998 2.000 0.800 NA Y NA
 215925 215926 PP0221 PP0222     TRUE 0.984 -7.000 0.346 NA N NA
 215926 215927 PP0222 PP0223     TRUE 0.993 0.000 0.452 NA N NA
 215927 215928 PP0223 PP0224     TRUE 0.941 97.000 0.500 0.006 Y NA
 215928 215929 PP0224 PP0225     FALSE 0.004 314.000 0.000 1.000 N NA
 215929 215930 PP0225 PP0226     TRUE 0.986 3.000 0.150 1.000 Y NA
 215930 215931 PP0226 PP0227     TRUE 0.993 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 215932 215933 PP0228 PP0229     FALSE 0.005 312.000 0.000 1.000 N NA
 215934 215935 PP0230 PP0231 tauD tauC TRUE 0.743 49.000 0.214 1.000 N NA
 215935 215936 PP0231 PP0232 tauC tauB TRUE 0.999 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 215936 215937 PP0232 PP0233 tauB tauA TRUE 0.894 14.000 0.058 1.000 Y NA
 215938 215939 PP0234 PP0235 oprE lsfA FALSE 0.056 166.000 0.000 1.000   NA
 215939 215940 PP0235 PP0236 lsfA ssuE FALSE 0.047 220.000 0.028 1.000   NA
 215940 215941 PP0236 PP0237 ssuE ssuA TRUE 0.537 86.000 0.193 1.000   NA
 215941 215942 PP0237 PP0238 ssuA ssuD TRUE 0.643 60.000 0.176 1.000 N NA
 215942 215943 PP0238 PP0239 ssuD ssuC TRUE 0.912 11.000 0.226 1.000 N NA
 215943 215944 PP0239 PP0240 ssuC ssuB TRUE 0.998 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 215944 215945 PP0240 PP0241 ssuB ssuF TRUE 0.741 28.000 0.161 1.000 N NA
 215946 215947 PP0242 PP0243   gshA TRUE 0.772 0.000 0.000 1.000 N NA
 215947 215948 PP0243 PP0244 gshA   FALSE 0.102 154.000 0.036 NA N NA
 215948 215949 PP0244 PP0245     TRUE 0.917 0.000 0.036 NA N NA
 215950 215951 PP0246 PP0247 ompR-1 envZ TRUE 0.991 14.000 0.584 0.032 Y NA
 215952 215953 PP0248 PP0249 rimK   TRUE 0.975 -3.000 0.102 1.000 N NA
 215956 10750589 PP0252 PP_0253     FALSE 0.040 180.000 0.000 NA   NA
 10750589 215957 PP_0253 PP0254     FALSE 0.061 149.000 0.000 NA   NA
 215958 215959 PP0255 PP0256     FALSE 0.034 197.000 0.000 1.000   NA
 215959 215960 PP0256 PP0257     TRUE 0.997 6.000 0.571 0.002 Y NA
 215963 215964 PP0260 PP0261 nudE cysQ TRUE 0.924 15.000 0.373 1.000   NA
 215965 215966 PP0262 PP0263     TRUE 0.937 0.000 0.035 NA   NA
 215966 215967 PP0263 PP0264     TRUE 0.998 -3.000 0.375 1.000 Y NA
 215967 215968 PP0264 PP0265     TRUE 0.643 43.000 0.111 1.000 N NA
 215972 215973 PP0269 PP0270     FALSE 0.035 150.000 0.000 1.000 N NA
 215973 215974 PP0270 PP0271   gltR-1 TRUE 0.998 2.000 0.800 1.000 Y NA
 215977 215978 PP0274 PP0275     FALSE 0.004 420.000 0.000 NA   NA
 215979 2137294 PP0276 PP_t02     FALSE 0.010 291.000 0.000 NA   NA
 2137294 215980 PP_t02 PP0277     FALSE 0.086 99.000 0.000 NA   NA
 215982 215983 PP0279 PP0280     FALSE 0.073 129.000 0.000 NA   NA
 215983 215984 PP0280 PP0281     TRUE 0.997 0.000 0.195 0.013 Y NA
 215984 215985 PP0281 PP0282     TRUE 0.924 55.000 0.169 0.084 Y NA
 215985 215986 PP0282 PP0283     TRUE 0.993 12.000 0.824 1.000 Y NA
 2137295 215988 PP_t03 PP0285     FALSE 0.101 91.000 0.000 NA   NA
 215988 215989 PP0285 PP0286   mutY TRUE 0.981 -3.000 0.150 NA N NA
 215989 215990 PP0286 PP0287 mutY   TRUE 0.936 -3.000 0.033 NA N NA
 215991 215992 PP0288 PP0289   hisB FALSE 0.044 180.000 0.000 1.000   NA
 215992 215993 PP0289 PP0290 hisB hisH TRUE 0.995 1.000 0.111 0.003 Y NA
 215993 215994 PP0290 PP0291 hisH   TRUE 0.951 1.000 0.069 NA   NA
 215994 215995 PP0291 PP0292   hisA FALSE 0.405 28.000 0.016 NA   NA
 215995 215996 PP0292 PP0293 hisA hisF TRUE 0.994 11.000 0.433 0.003 Y NA
 215997 215998 PP0294 PP0295     TRUE 0.999 -3.000 0.844 1.000 Y NA
 215998 215999 PP0295 PP0296     TRUE 0.907 85.000 0.328 0.083 Y NA
 216000 216001 PP0297 PP0298 sda-1   FALSE 0.002 502.000 0.000 1.000 N NA
 216004 216005 PP0301 PP0302     TRUE 0.961 11.000 0.419 NA   NA
 216005 216006 PP0302 PP0303     TRUE 0.679 167.000 0.608 1.000   NA
 216006 216007 PP0303 PP0304     FALSE 0.266 124.000 0.074 1.000   NA
 216009 216010 PP0306 PP0307     FALSE 0.080 103.000 0.000 NA   NA
 216011 216012 PP0308 PP0309     TRUE 0.914 76.000 0.868 1.000   NA
 216012 216013 PP0309 PP0310     TRUE 0.976 16.000 0.912 1.000   NA
 216013 216014 PP0310 PP0311     TRUE 0.881 179.000 0.574 0.054 Y NA
 216014 216015 PP0311 PP0312     TRUE 0.778 246.000 0.667 0.023 Y NA
 216015 216016 PP0312 PP0313     TRUE 0.997 11.000 0.776 0.023 Y NA
 216016 216017 PP0313 PP0314     FALSE 0.003 602.000 0.000 NA   NA
 216021 216022 PP0318 PP0319     TRUE 0.932 -3.000 0.017 NA   NA
 216022 216023 PP0319 PP0320     FALSE 0.045 183.000 0.005 NA   NA
 216025 216026 PP0322 PP0323 glyA-1 soxB TRUE 0.966 16.000 0.357 1.000 Y NA
 216026 216027 PP0323 PP0324 soxB soxD TRUE 0.995 15.000 0.824 0.001 Y NA
 216027 216028 PP0324 PP0325 soxD soxA TRUE 0.999 -3.000 0.824 0.001   NA
 216028 216029 PP0325 PP0326 soxA soxG TRUE 0.958 75.000 0.778 0.001   NA
 216029 216030 PP0326 PP0327 soxG purU-1 TRUE 0.924 12.000 0.303 1.000 N NA
 216030 216031 PP0327 PP0328 purU-1 fdhA FALSE 0.040 302.000 0.103 1.000 N NA
 216034 216035 PP0331 PP0332     FALSE 0.024 212.000 0.000 NA   NA
 216036 216037 PP0333 PP0334     FALSE 0.035 150.000 0.000 1.000 N NA
 216038 216039 PP0335 PP0336   msrA TRUE 0.947 4.000 0.000 NA Y NA
 216039 216040 PP0336 PP0337 msrA   FALSE 0.082 169.000 0.032 1.000 N NA
 216040 216041 PP0337 PP0338   aceF FALSE 0.005 308.000 0.000 1.000 N NA
 216041 216042 PP0338 PP0339 aceF aceE TRUE 0.937 14.000 0.167 1.000 Y NA
 216043 216044 PP0340 PP0341 glnE waaF FALSE 0.027 203.000 0.014 1.000 N NA
 216044 216045 PP0341 PP0342 waaF waaC TRUE 0.997 1.000 0.205 0.001 Y NA
 216045 216046 PP0342 PP0343 waaC waaG TRUE 0.994 0.000 0.217 1.000 Y NA
 216046 216047 PP0343 PP0344 waaG waaP TRUE 0.990 -3.000 0.241 1.000   NA
 216047 216048 PP0344 PP0345 waaP   TRUE 0.992 0.000 0.133 0.002   NA
 216048 216049 PP0345 PP0346     TRUE 0.988 -3.000 0.027 0.002   NA
 216049 216050 PP0346 PP0347     TRUE 0.982 0.000 0.019 0.002   NA
 216051 216052 PP0348 PP0349     FALSE 0.015 250.000 0.000 NA   NA
 216052 216053 PP0349 PP0350     TRUE 0.829 57.000 0.333 NA   NA
 216053 216054 PP0350 PP0351     TRUE 0.574 252.000 0.600 NA Y NA
 216054 216055 PP0351 PP0352     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA N NA
 216055 216056 PP0352 PP0353     FALSE 0.119 148.000 0.039 1.000 N NA
 216056 216057 PP0353 PP0354     TRUE 0.994 -3.000 0.392 1.000 N NA
 216061 216062 PP0358 PP0359 rarD-1   FALSE 0.275 65.000 0.020 NA   NA
 216062 216063 PP0359 PP0360   modR FALSE 0.265 66.000 0.019 NA   NA
 216063 216064 PP0360 PP0361 modR   FALSE 0.311 50.000 0.009 1.000   NA
 216065 216066 PP0362 PP0363 bioB bioF TRUE 0.996 2.000 0.168 0.001 Y NA
 216066 216067 PP0363 PP0364 bioF bioH TRUE 0.952 -7.000 0.092 1.000   NA
 216067 216068 PP0364 PP0365 bioH bioC TRUE 0.967 -7.000 0.163 1.000   NA
 216068 216069 PP0365 PP0366 bioC bioD TRUE 0.977 11.000 0.063 0.001 Y NA
 216069 216070 PP0366 PP0367 bioD   FALSE 0.354 174.000 0.244 NA   NA
 216070 216071 PP0367 PP0368     FALSE 0.010 288.000 0.000 NA   NA
 216071 216072 PP0368 PP0369     FALSE 0.049 383.000 0.227 1.000 N NA
 216072 216073 PP0369 PP0370     FALSE 0.460 125.000 0.250 1.000 N NA
 216075 216076 PP0372 PP0373     FALSE 0.098 148.000 0.016 1.000   NA
 216076 216077 PP0373 PP0374     FALSE 0.002 629.000 0.000 NA   NA
 216078 216079 PP0375 PP0376   pqqE TRUE 0.867 -34.000 0.088 1.000   NA
 216079 216080 PP0376 PP0377 pqqE pqqD TRUE 0.992 2.000 0.211 0.002   NA
 216080 216081 PP0377 PP0378 pqqD pqqC TRUE 0.996 -3.000 0.246 0.002   NA
 216081 216082 PP0378 PP0379 pqqC pqqB TRUE 0.893 164.000 0.825 0.002   NA
 216082 216083 PP0379 PP0380 pqqB pqqA TRUE 0.582 79.000 0.028 0.002   NA
 216083 216084 PP0380 PP0381 pqqA pqqF FALSE 0.302 160.000 0.000 0.002   NA
 216084 216085 PP0381 PP0382 pqqF   FALSE 0.352 141.000 0.161 1.000   NA
 216085 216086 PP0382 PP0383     TRUE 0.885 15.000 0.258 1.000   NA
 216086 216087 PP0383 PP0384     FALSE 0.085 254.000 0.161 1.000 N NA
 2137296 216089 PP_t04 PP0386     FALSE 0.353 17.000 0.000 NA   NA
 216089 216090 PP0386 PP0387   rpoD FALSE 0.070 128.000 0.013 1.000 N NA
 216090 216091 PP0387 PP0388 rpoD dnaG TRUE 0.725 68.000 0.299 1.000 N NA
 216091 216092 PP0388 PP0389 dnaG rpsU FALSE 0.028 305.000 0.067 1.000 N NA
 216095 216096 PP0392 PP0393 folB folK-1 TRUE 0.996 -9.000 0.500 1.000 Y NA
 216097 216098 PP0394 PP0395     FALSE 0.394 56.000 0.032 NA   NA
 216098 216099 PP0395 PP0396     TRUE 0.998 -3.000 0.761 NA   NA
 216099 216100 PP0396 PP0397     TRUE 0.800 105.000 0.683 NA   NA
 216100 216101 PP0397 PP0398     FALSE 0.005 283.000 0.000 NA N NA
 216101 216102 PP0398 PP0399   apaH TRUE 0.641 15.000 0.045 1.000   NA
 216102 216103 PP0399 PP0400 apaH apaG TRUE 0.988 0.000 0.267 NA   NA
 216103 216104 PP0400 PP0401 apaG ksgA FALSE 0.102 198.000 0.078 NA N NA
 216104 216105 PP0401 PP0402 ksgA pdxA TRUE 0.986 -3.000 0.197 1.000 N NA
 216105 216106 PP0402 PP0403 pdxA surA TRUE 0.996 -3.000 0.561 1.000 N NA
 216106 10750590 PP0403 PP_0404 surA   TRUE 0.650 -19.000 0.000 NA   NA
 216107 216108 PP0405 PP0406     TRUE 0.997 -3.000 0.642 NA   NA
 216108 216109 PP0406 PP0407   djlA TRUE 0.946 2.000 0.091 1.000 N NA
 216111 216112 PP0409 PP0410   uhpA TRUE 0.996 11.000 0.667 0.032 Y NA
 216112 216113 PP0410 PP0411 uhpA   FALSE 0.046 296.000 0.111 1.000 N NA
 216113 216114 PP0411 PP0412     TRUE 0.970 41.000 0.556 1.000 Y NA
 216114 216115 PP0412 PP0413     TRUE 0.890 61.000 0.108 0.083 Y NA
 216115 216116 PP0413 PP0414     TRUE 0.976 11.000 0.145 0.083 Y NA
 216116 216117 PP0414 PP0415   rpe FALSE 0.168 58.000 0.007 1.000 N NA
 216117 216118 PP0415 PP0416 rpe gph TRUE 0.982 -3.000 0.120 1.000   NA
 216118 216119 PP0416 PP0417 gph trpE TRUE 0.682 70.000 0.233 1.000   NA
 216121 216122 PP0419 PP0420   trpG FALSE 0.086 136.000 0.008 NA   NA
 216122 216123 PP0420 PP0421 trpG trpD TRUE 0.959 10.000 0.105 1.000 Y NA
 216123 216124 PP0421 PP0422 trpD trpC TRUE 0.997 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 216124 216125 PP0422 PP0423 trpC   FALSE 0.059 148.000 0.013 1.000 N NA
 216128 216129 PP0426 PP0427     FALSE 0.520 11.000 0.000 NA   NA
 216129 216130 PP0427 PP0428     FALSE 0.195 66.000 0.018 1.000 N NA
 216130 216131 PP0428 PP0429     FALSE 0.237 64.000 0.008 1.000   NA
 216131 216132 PP0429 PP0430     FALSE 0.508 68.000 0.000 0.054   NA
 216132 216133 PP0430 PP0431     FALSE 0.453 29.000 0.024 NA   NA
 216134 216135 PP0432 PP0433     FALSE 0.171 100.000 0.031 NA   NA
 216136 216137 PP0434 PP0435     TRUE 0.949 4.000 0.184 NA N NA
 216138 2137297 PP0436 PP_16SC tyrS   FALSE 0.002 816.000 0.000 NA   NA
 2137297 2137298 PP_16SC PP_23SC     FALSE 0.010 297.000 0.000 NA   NA
 2137298 406662 PP_23SC PP_5SC   rrf FALSE 0.074 120.000 0.000 NA   NA
 406662 216139 PP_5SC PP0437 rrf birA FALSE 0.038 184.000 0.000 NA   NA
 216139 216140 PP0437 PP0438 birA   TRUE 0.942 -10.000 0.147 1.000 N NA
 216140 216141 PP0438 PP0439     TRUE 0.658 -31.000 0.012 NA   NA
 216141 2137299 PP0439 PP_t05     FALSE 0.059 153.000 0.000 NA   NA
 2137299 2137300 PP_t05 PP_t06     FALSE 0.308 28.000 0.000 NA   NA
 2137300 2137301 PP_t06 PP_t07     FALSE 0.296 33.000 0.000 NA   NA
 2137301 216142 PP_t07 PP0440   tuf-1 FALSE 0.118 82.000 0.000 NA   NA
 216142 2137302 PP0440 PP_t08 tuf-1   FALSE 0.225 55.000 0.000 NA   NA
 2137302 216143 PP_t08 PP0441   secE FALSE 0.250 48.000 0.000 NA   NA
 216143 216144 PP0441 PP0442 secE nusG TRUE 0.987 10.000 0.843 1.000 N NA
 216144 216145 PP0442 PP0443 nusG rplK TRUE 0.771 120.000 0.681 1.000 N NA
 216145 216146 PP0443 PP0444 rplK rplA TRUE 0.999 0.000 0.838 0.015 Y NA
 216146 216147 PP0444 PP0445 rplA rplJ TRUE 0.730 198.000 0.302 0.015 Y NA
 216147 216148 PP0445 PP0446 rplJ rplL TRUE 0.981 78.000 0.884 0.011 Y NA
 216148 216149 PP0446 PP0447 rplL rpoB FALSE 0.196 221.000 0.223 1.000   NA
 216149 216150 PP0447 PP0448 rpoB rpoC TRUE 0.973 65.000 0.851 0.001   NA
 216150 216151 PP0448 PP0449 rpoC rpsL FALSE 0.112 212.000 0.122 1.000 N NA
 216151 216152 PP0449 PP0450 rpsL rpsG TRUE 0.951 107.000 0.620 0.002 Y NA
 216152 216153 PP0450 PP0451 rpsG fusA-1 TRUE 0.975 31.000 0.579 1.000 Y NA
 216153 216154 PP0451 PP0452 fusA-1 tuf-2 TRUE 0.984 28.000 0.400 0.001 Y NA
 216154 216155 PP0452 PP0453 tuf-2 rpsJ TRUE 0.753 142.000 0.318 1.000 Y NA
 216155 216156 PP0453 PP_0454 rpsJ rplC TRUE 0.923 81.000 0.307 0.015 Y NA
 216156 216157 PP_0454 PP0455 rplC rplD TRUE 0.991 13.000 0.486 0.011 Y NA
 216157 216158 PP0455 PP0456 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.011 Y NA
 216158 216159 PP0456 PP0457 rplW rplB TRUE 0.995 15.000 0.849 0.014 Y NA
 216159 216160 PP0457 PP0458 rplB rpsS TRUE 0.994 17.000 0.820 0.015 Y NA
 216160 216161 PP0458 PP0459 rpsS rplV TRUE 0.996 12.000 0.769 0.015 Y NA
 216161 216162 PP0459 PP_0460 rplV rpsC TRUE 0.994 14.000 0.719 0.015 Y NA
 216162 216163 PP_0460 PP0461 rpsC rplP TRUE 0.996 13.000 0.828 0.015 Y NA
 216163 216164 PP0461 PP_0462 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.011 Y NA
 216164 216165 PP_0462 PP0463 rpmC rpsQ TRUE 0.999 3.000 0.828 0.011 Y NA
 216165 216166 PP0463 PP0464 rpsQ rplN TRUE 0.993 24.000 0.791 0.015 Y NA
 216166 216167 PP0464 PP0465 rplN rplX TRUE 0.996 12.000 0.810 0.015 Y NA
 216167 216168 PP0465 PP0466 rplX rplE TRUE 0.993 21.000 0.758 0.011 Y NA
 216168 216169 PP0466 PP0467 rplE rpsN TRUE 0.983 14.000 0.309 0.011 Y NA
 216169 216170 PP0467 PP0468 rpsN rpsH TRUE 0.686 209.000 0.295 0.011 Y NA
 216170 216171 PP0468 PP0469 rpsH rplF TRUE 0.996 13.000 0.808 0.011 Y NA
 216171 216172 PP0469 PP0470 rplF rplR TRUE 0.997 11.000 0.815 0.011 Y NA
 216172 216173 PP0470 PP0471 rplR rpsE TRUE 0.999 4.000 0.814 0.015 Y NA
 216173 216174 PP0471 PP0472 rpsE rpmD TRUE 0.999 3.000 0.789 0.015 Y NA
 216174 216175 PP0472 PP0473 rpmD rplO TRUE 0.998 4.000 0.653 0.002 Y NA
 216175 216176 PP0473 PP0474 rplO secY TRUE 0.995 1.000 0.730 1.000 N NA
 216176 216177 PP0474 PP0475 secY rpmJ FALSE 0.455 29.000 0.036 1.000 N NA
 216177 216178 PP0475 PP0476 rpmJ rpsM TRUE 0.743 132.000 0.086 0.011 Y NA
 216178 216179 PP0476 PP0477 rpsM rpsK TRUE 0.994 19.000 0.810 0.011 Y NA
 216179 216180 PP0477 PP0478 rpsK rpsD TRUE 0.989 16.000 0.509 0.015 Y NA
 216180 216181 PP0478 PP0479 rpsD rpoA TRUE 0.936 23.000 0.549 1.000 N NA
 216181 216182 PP0479 PP0480 rpoA rplQ TRUE 0.958 43.000 0.873 1.000 N NA
 216182 216183 PP0480 PP0481 rplQ katA FALSE 0.032 173.000 0.004 1.000 N NA
 216183 216184 PP0481 PP0482 katA   FALSE 0.412 164.000 0.052 1.000 Y NA
 216186 216187 PP0484 PP0485   ssb TRUE 0.573 10.000 0.015 1.000 N NA
 216189 216190 PP0487 PP0488     FALSE 0.357 22.000 0.000 1.000   NA
 216190 10750591 PP0488 PP_0489     FALSE 0.062 148.000 0.000 NA   NA
 10750591 216191 PP_0489 PP0490     TRUE 0.858 0.000 0.000 NA   NA
 216191 216192 PP0490 PP0491     TRUE 0.999 -3.000 0.538 0.001 Y NA
 216192 216193 PP0491 PP0492     TRUE 0.866 -25.000 0.091 NA N NA
 216193 216194 PP0492 PP0493   selA FALSE 0.204 145.000 0.083 NA N NA
 216194 216195 PP0493 PP0494 selA selB TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.001 N NA
 216196 216197 PP0495 PP0496 ansB   TRUE 0.747 73.000 0.095 1.000 Y NA
 216199 10750592 PP0498 PP_0499     TRUE 0.640 -21.000 0.000 NA   NA
 216200 216201 PP0500 PP0501     TRUE 0.985 -7.000 0.100 1.000 Y NA
 216204 216205 PP0504 PP0505 oprG   FALSE 0.228 110.000 0.060 NA   NA
 216205 216206 PP0505 PP0506     TRUE 0.965 1.000 0.114 NA   NA
 216206 216207 PP0506 PP0507     TRUE 0.998 0.000 0.605 NA Y NA
 216207 216208 PP0507 PP0508     TRUE 0.989 1.000 0.336 NA   NA
 216210 10750593 PP0510 PP_0511 trx-1   FALSE 0.297 32.000 0.000 NA   NA
 10750593 216211 PP_0511 PP0512     TRUE 0.827 1.000 0.000 NA   NA
 216212 216213 PP_0513 PP0514   ribD TRUE 0.990 -3.000 0.277 NA N NA
 216213 216214 PP0514 PP0515 ribD ribE-1 TRUE 0.961 43.000 0.456 1.000 Y NA
 216214 216215 PP0515 PP_0516 ribE-1 ribBA-1 TRUE 0.881 19.000 0.065 1.000 Y NA
 216215 216216 PP_0516 PP0517 ribBA-1 ribH TRUE 0.784 92.000 0.049 0.002 Y NA
 216216 216217 PP0517 PP0518 ribH nusB TRUE 0.993 -3.000 0.347 1.000 N NA
 216217 216218 PP0518 PP0519 nusB thiL TRUE 0.834 19.000 0.225 1.000 N NA
 216218 216219 PP0519 PP0520 thiL pgpA TRUE 0.987 -3.000 0.206 1.000 N NA
 216219 216220 PP0520 PP0521 pgpA   FALSE 0.491 17.000 0.018 1.000   NA
 216220 216221 PP0521 PP0522   ribA FALSE 0.071 181.000 0.020 1.000   NA
 216221 216222 PP0522 PP0523 ribA   TRUE 0.965 -3.000 0.050 NA   NA
 216222 216223 PP0523 PP0524     TRUE 0.960 0.000 0.066 NA   NA
 216226 216227 PP_0527 PP0528 dxs ispA TRUE 0.589 178.000 0.246 1.000 Y NA
 216227 216228 PP0528 PP0529 ispA xseB TRUE 0.984 -3.000 0.177 1.000 N NA
 216228 216229 PP0529 PP0530 xseB ribB FALSE 0.029 166.000 0.000 1.000 N NA
 216231 216232 PP0532 PP0533   pfeS FALSE 0.083 101.000 0.000 NA   NA
 216232 216233 PP0533 PP0534 pfeS   TRUE 0.998 0.000 0.600 1.000 Y NA
 216235 216236 PP0536 PP0537     FALSE 0.003 525.000 0.000 NA   NA
 216236 216237 PP0537 PP0538   ppa FALSE 0.158 48.000 0.000 1.000 N NA
 216237 216238 PP0538 PP0539 ppa   FALSE 0.162 93.000 0.022 NA   NA
 216238 216239 PP0539 PP0540     TRUE 0.530 21.000 0.030 NA   NA
 216239 216240 PP0540 PP0541     FALSE 0.109 218.000 0.100 NA   NA
 216240 216241 PP0541 PP0542     FALSE 0.206 108.000 0.047 1.000   NA
 216241 216242 PP0542 PP0543   eutB TRUE 0.998 9.000 0.859 0.001 Y NA
 216242 216243 PP0543 PP0544 eutB   TRUE 0.951 47.000 0.407 1.000 Y NA
 216243 216244 PP0544 PP0545     FALSE 0.011 228.000 0.000 1.000 N NA
 216245 216246 PP0546 PP0547   mpl FALSE 0.197 67.000 0.020 1.000 N NA
 216246 216247 PP0547 PP0548 mpl ubiD TRUE 0.988 -3.000 0.235 1.000 N NA
 216247 216248 PP0548 PP0549 ubiD   TRUE 0.973 -3.000 0.070 NA   NA
 216249 216250 PP0550 PP0551     TRUE 0.568 28.000 0.043 1.000   NA
 216250 216251 PP0551 PP0552   adh FALSE 0.367 19.000 0.000 1.000   NA
 216251 216252 PP0552 PP0553 adh acoC TRUE 0.631 29.000 0.062 1.000   NA
 216252 216253 PP0553 PP0554 acoC acoB TRUE 0.994 -3.000 0.375 1.000   NA
 216253 216254 PP0554 PP0555 acoB acoA TRUE 0.993 34.000 0.804 0.001 Y NA
 216254 216255 PP0555 PP0556 acoA   TRUE 0.877 23.000 0.141 0.080   NA
 216257 216258 PP0558 PP0559 accC-1 accB TRUE 0.981 18.000 0.275 0.001 Y NA
 216258 216259 PP0559 PP0560 accB aroQ-1 FALSE 0.503 100.000 0.254 1.000 N NA
 216259 216260 PP0560 PP0561 aroQ-1 dsbD-1 FALSE 0.035 180.000 0.010 1.000 N NA
 216260 216261 PP0561 PP0562 dsbD-1 ctpL FALSE 0.490 118.000 0.273 1.000 N NA
 216261 216262 PP0562 PP0563 ctpL   FALSE 0.442 245.000 0.350 1.000 Y NA
 216263 216264 PP0564 PP0565     TRUE 0.948 3.000 0.101 NA   NA
 216264 216265 PP0565 PP0566     FALSE 0.019 240.000 0.017 1.000 N NA
 216265 216266 PP0566 PP0567   speA FALSE 0.079 151.000 0.023 1.000 N NA
 216266 216267 PP0567 PP0568 speA   FALSE 0.029 167.000 0.000 1.000 N NA
 216271 216272 PP0572 PP0573 pbpC   FALSE 0.166 33.000 0.000 NA N NA
 216273 216274 PP0574 PP0575     TRUE 0.731 119.000 0.600 1.000 N NA
 216274 216275 PP0575 PP0576     FALSE 0.009 306.000 0.000 NA   NA
 216275 216276 PP0576 PP0577     TRUE 0.931 20.000 0.455 NA   NA
 216276 216277 PP0577 PP0578     TRUE 0.853 -37.000 0.087 NA   NA
 216277 216278 PP0578 PP0579     TRUE 0.977 -3.000 0.088 NA   NA
 216278 216279 PP0579 PP0580     TRUE 0.843 -15.000 0.036 NA   NA
 216279 216280 PP0580 PP0581     TRUE 0.992 3.000 0.263 1.000 Y NA
 216281 216282 PP0582 PP0583     FALSE 0.061 90.000 0.000 1.000 N NA
 216283 216284 PP0584 PP0585     FALSE 0.029 168.000 0.000 1.000 N NA
 216284 216285 PP0585 PP0586     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.005 N NA
 216285 216286 PP0586 PP0587     TRUE 0.899 53.000 0.500 NA   NA
 216287 216288 PP0588 PP0589     FALSE 0.347 108.000 0.161 1.000 N NA
 216288 216289 PP0589 PP0590     FALSE 0.001 638.000 0.000 1.000 N NA
 216290 216291 PP0591 PP0592 add   FALSE 0.120 86.000 0.000 1.000   NA
 216291 216292 PP0592 PP0593     FALSE 0.006 369.000 0.000 1.000   NA
 216292 216293 PP0593 PP0594     TRUE 0.705 10.000 0.019 1.000   NA
 216293 216294 PP0594 PP0595     TRUE 0.966 10.000 0.045 0.090 Y NA
 216295 216296 PP0596 PP0597   mmsA-1 TRUE 0.795 74.000 0.455 1.000 N NA
 216296 407998 PP0597 PP_16SD mmsA-1 rrs FALSE 0.002 751.000 0.000 NA   NA
 407998 2137303 PP_16SD PP_t09 rrs   FALSE 0.104 90.000 0.000 NA   NA
 2137303 2137304 PP_t09 PP_t10     FALSE 0.308 28.000 0.000 NA   NA
 2137304 2137305 PP_t10 PP_23SD     FALSE 0.016 247.000 0.000 NA   NA
 2137305 406663 PP_23SD PP_5SD   rrf FALSE 0.072 132.000 0.000 NA   NA
 406663 10750594 PP_5SD PP_0598 rrf   FALSE 0.013 259.000 0.000 NA   NA
 10750594 216297 PP_0598 PP0599     TRUE 0.789 -7.000 0.000 NA   NA
 216299 216300 PP0601 PP0602   ribF FALSE 0.393 119.000 0.169 1.000   NA
 216300 216301 PP0602 PP0603 ribF ileS TRUE 0.990 -3.000 0.254 1.000 N NA
 216301 216302 PP0603 PP0604 ileS lspA TRUE 0.910 -22.000 0.147 1.000 N NA
 216302 216303 PP0604 PP0605 lspA fkpB TRUE 0.987 -7.000 0.417 1.000 N NA
 216303 216304 PP0605 PP0606 fkpB ispH TRUE 0.955 15.000 0.626 1.000 N NA
 216306 216307 PP0608 PP0609     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 216307 216308 PP0609 PP0610     TRUE 0.997 -3.000 0.615 NA   NA
 216308 216309 PP0610 PP0611   pilE TRUE 0.915 2.000 0.038 NA   NA
 216309 216310 PP0611 PP0612 pilE   FALSE 0.452 55.000 0.061 NA N NA
 216311 216312 PP0613 PP0614     TRUE 0.943 2.000 0.083 1.000 N NA
 216312 216313 PP0614 PP0615     TRUE 0.679 107.000 0.188 1.000 Y NA
 216313 216314 PP0615 PP0616     TRUE 0.999 0.000 0.571 0.018 Y NA
 216314 216315 PP0616 PP0617     TRUE 0.998 0.000 0.536 1.000 Y NA
 216315 216316 PP0617 PP0618     TRUE 0.996 2.000 0.246 0.082 Y NA
 216316 216317 PP0618 PP0619     TRUE 0.865 66.000 0.230 NA Y NA
 216317 216318 PP0619 PP0620     FALSE 0.506 91.000 0.222 NA N NA
 216318 216319 PP0620 PP0621     FALSE 0.012 267.000 0.000 NA   NA
 216319 216320 PP0621 PP0622     FALSE 0.490 14.000 0.015 NA   NA
 10750595 216321 PP_0623 PP0624     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 216321 216322 PP0624 PP0625   clpB FALSE 0.078 250.000 0.108 NA   NA
 216322 2137306 PP0625 PP_t11 clpB   FALSE 0.006 363.000 0.000 NA   NA
 2137306 2137307 PP_t11 PP_t12     TRUE 0.621 8.000 0.000 NA   NA
 2137307 2137308 PP_t12 PP_t13     TRUE 0.569 10.000 0.000 NA   NA
 2137308 2137309 PP_t13 PP_t14     FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 2137309 2137310 PP_t14 PP_t15     TRUE 0.605 9.000 0.000 NA   NA
 216323 216324 PP0626 PP0627 ndh   TRUE 0.848 85.000 0.667 NA   NA
 216324 216325 PP0627 PP0628     FALSE 0.391 133.000 0.182 NA   NA
 216327 216328 PP0630 PP0631     TRUE 0.955 -3.000 0.033 1.000   NA
 216328 216329 PP0631 PP0632   pilD TRUE 0.969 0.000 0.122 1.000 N NA
 216329 216330 PP0632 PP0633 pilD pilC TRUE 0.996 3.000 0.454 1.000 Y NA
 216331 2137311 PP0634 PP_t16 pilA   FALSE 0.151 72.000 0.000 NA   NA
 2137311 216332 PP_t16 PP0635     FALSE 0.003 503.000 0.000 NA   NA
 216333 216334 PP0636 PP0637     FALSE 0.001 631.000 0.000 NA N NA
 216334 216335 PP0637 PP0638     TRUE 0.659 19.000 0.061 NA   NA
 216335 216336 PP0638 PP0639     FALSE 0.001 2093.000 0.000 NA   NA
 216336 216337 PP0639 PP0640     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 216337 216338 PP0640 PP0641     FALSE 0.001 1593.000 0.000 NA   NA
 216340 216341 PP0643 PP0644     TRUE 0.789 -7.000 0.000 NA   NA
 216341 216342 PP0644 PP0645     FALSE 0.220 56.000 0.000 NA   NA
 216343 216344 PP0646 PP0647     TRUE 0.789 -7.000 0.000 NA   NA
 216344 216345 PP0647 PP0648     FALSE 0.033 192.000 0.000 NA   NA
 216345 216346 PP0648 PP0649     FALSE 0.118 88.000 0.000 1.000   NA
 216349 216350 PP0652 PP0653     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 216351 216352 PP0654 PP0655 mdh   FALSE 0.230 54.000 0.000 NA   NA
 216353 216354 PP0656 PP0657     TRUE 0.999 -3.000 0.394 0.081 Y NA
 216355 216356 PP0658 PP0659   metB FALSE 0.274 168.000 0.000 1.000 Y NA
 216356 216357 PP0659 PP0660 metB   FALSE 0.515 143.000 0.077 1.000 Y NA
 216357 216358 PP0660 PP0661     TRUE 0.566 46.000 0.077 1.000 N NA
 216358 216359 PP0661 PP0662     FALSE 0.244 25.000 0.003 1.000 N NA
 216359 216360 PP0662 PP0663     TRUE 0.860 -3.000 0.005 1.000 N NA
 216360 216361 PP0663 PP0664     FALSE 0.100 199.000 0.074 1.000 N NA
 216361 216362 PP0664 PP0665     TRUE 0.782 13.000 0.111 1.000 N NA
 216362 216363 PP0665 PP0666     FALSE 0.205 17.000 0.000 NA N NA
 216363 216364 PP0666 PP0667     FALSE 0.023 171.000 0.000 NA N NA
 216364 216365 PP0667 PP0668     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA N NA
 216365 216366 PP0668 PP0669     FALSE 0.440 91.000 0.000 NA Y NA
 216367 216368 PP0670 PP0671   glyA-2 FALSE 0.043 122.000 0.000 1.000 N NA
 216368 216369 PP0671 PP0672 glyA-2   FALSE 0.191 250.000 0.333 1.000 N NA
 216370 216371 PP0673 PP0674     FALSE 0.009 305.000 0.000 NA   NA
 216371 216372 PP0674 PP0675   gdhA FALSE 0.026 213.000 0.000 1.000   NA
 216373 216374 PP0676 PP0677     FALSE 0.350 68.000 0.041 NA   NA
 216374 216375 PP0677 PP0678     FALSE 0.428 102.000 0.182 NA   NA
 216375 216376 PP0678 PP0679     TRUE 0.624 63.000 0.149 NA   NA
 216377 216378 PP0680 PP0681     FALSE 0.270 163.000 0.132 NA   NA
 216378 216379 PP0681 PP0682     FALSE 0.143 190.000 0.082 NA   NA
 216379 216380 PP0682 PP0683     FALSE 0.294 77.000 0.041 NA   NA
 216380 216381 PP0683 PP0684   fklB-1 FALSE 0.262 86.000 0.043 NA   NA
 216382 216383 PP0685 PP0686   phnA FALSE 0.128 85.000 0.004 NA   NA
 216383 216384 PP0686 PP0687 phnA ispB FALSE 0.043 161.000 0.007 1.000 N NA
 216385 216386 PP_0688 PP0689 rplU rpmA TRUE 0.990 39.000 0.667 0.011 Y NA
 216386 216387 PP0689 PP0690 rpmA   FALSE 0.400 189.000 0.335 1.000   NA
 216387 216388 PP0690 PP0691   proB TRUE 0.556 86.000 0.206 1.000   NA
 216388 216389 PP0691 PP0692 proB creA TRUE 0.932 -3.000 0.017 NA   NA
 216390 216391 PP0693 PP0694     TRUE 0.998 -3.000 0.950 NA   NA
 216391 216392 PP0694 PP0695     TRUE 0.995 -10.000 0.947 NA   NA
 216393 216394 PP0696 PP0697     TRUE 0.946 -3.000 0.027 NA   NA
 2137312 216397 PP_t17 PP0700     FALSE 0.091 96.000 0.000 NA   NA
 216398 216399 PP0701 PP0702     FALSE 0.096 325.000 0.000 0.081 Y NA
 216400 216401 PP0703 PP0704     TRUE 0.639 -7.000 0.000 NA N NA
 216402 216403 PP0705 PP0706   ada TRUE 0.680 48.000 0.028 0.030 N NA
 216403 216404 PP0706 PP0707 ada   FALSE 0.290 -99.000 0.000 NA N NA
 216405 216406 PP0708 PP0709     FALSE 0.264 14.000 0.000 1.000 N NA
 216406 216407 PP0709 PP0710     FALSE 0.365 93.000 0.100 NA   NA
 216408 216409 PP0711 PP0712     FALSE 0.084 107.000 0.000 1.000   NA
 216409 216410 PP0712 PP0713     FALSE 0.309 37.000 0.000 1.000   NA
 216410 216411 PP0713 PP0714     FALSE 0.281 41.000 0.000 NA   NA
 216411 216412 PP0714 PP0715     TRUE 0.960 4.000 0.200 NA   NA
 216412 216413 PP0715 PP0716     TRUE 0.990 -3.000 0.260 1.000 N NA
 216413 216414 PP0716 PP0717     TRUE 0.984 -10.000 0.407 NA   NA
 216415 216416 PP0718 PP0719     FALSE 0.134 177.000 0.002 0.088 N NA
 216416 216417 PP0719 PP0720   pth TRUE 0.922 25.000 0.184 1.000 Y NA
 216417 216418 PP0720 PP0721 pth   TRUE 0.953 80.000 0.496 0.017 Y NA
 216418 216419 PP0721 PP0722   prsA TRUE 0.576 59.000 0.122 1.000 N NA
 216419 2137313 PP0722 PP_t18 prsA   FALSE 0.235 52.000 0.000 NA   NA
 2137313 216420 PP_t18 PP0723   ispE FALSE 0.339 21.000 0.000 NA   NA
 216420 216421 PP0723 PP0724 ispE lolB TRUE 0.881 5.000 0.072 1.000 N NA
 216421 216422 PP0724 PP0725 lolB   TRUE 0.881 5.000 0.072 1.000 N NA
 216422 216423 PP0725 PP0726     FALSE 0.002 469.000 0.000 1.000 N NA
 216423 216424 PP0726 PP0727     TRUE 0.998 -3.000 0.679 1.000   NA
 216424 216425 PP0727 PP0728     TRUE 0.997 -3.000 0.667 1.000   NA
 216425 216426 PP0728 PP0729     TRUE 0.972 1.000 0.000 0.002   NA
 216426 216427 PP0729 PP0730     FALSE 0.219 60.000 0.000 1.000   NA
 216427 216428 PP0730 PP0731     TRUE 0.857 13.000 0.011 1.000 Y NA
 216429 216430 PP0732 PP0733 hemA prfA TRUE 0.993 -3.000 0.171 0.038 N NA
 216430 216431 PP0733 PP0734 prfA hemK TRUE 0.995 0.000 0.229 1.000 Y NA
 216431 216432 PP0734 PP0735 hemK   TRUE 0.936 -6.000 0.068 1.000 N NA
 216432 216433 PP0735 PP0736   murI TRUE 0.783 -7.000 0.013 1.000 N NA
 216433 216434 PP0736 PP0737 murI   FALSE 0.111 96.000 0.004 1.000   NA
 216435 216436 PP0738 PP0739   phrB TRUE 0.918 -3.000 0.006 1.000   NA
 216436 216437 PP0739 PP0740 phrB   TRUE 0.778 -9.000 0.017 1.000 N NA
 216437 216438 PP0740 PP0741     TRUE 0.928 -10.000 0.083 NA   NA
 216438 216439 PP0741 PP0742     FALSE 0.123 104.000 0.017 NA   NA
 216440 216441 PP0743 PP0744   hemH TRUE 0.542 14.000 0.020 1.000   NA
 216442 216443 PP0745 PP0746 uraA upp TRUE 0.983 3.000 0.101 1.000 Y NA
 216444 216445 PP0747 PP0748     TRUE 0.894 3.000 0.036 NA   NA
 216445 216446 PP0748 PP0749     TRUE 0.672 52.000 0.138 NA   NA
 216446 216447 PP0749 PP0750     TRUE 0.821 45.000 0.261 NA   NA
 216449 216450 PP0752 PP0753     FALSE 0.099 92.000 0.000 NA   NA
 216454 216455 PP0757 PP0758     FALSE 0.011 276.000 0.000 NA   NA
 216455 216456 PP0758 PP0759     FALSE 0.086 159.000 0.017 NA   NA
 216457 216458 PP0760 PP0761     FALSE 0.012 269.000 0.000 NA   NA
 216458 216459 PP0761 PP0762   hprA FALSE 0.388 55.000 0.042 1.000 N NA
 216460 216461 PP0763 PP0764     FALSE 0.069 135.000 0.000 NA   NA
 216461 216462 PP0764 PP0765     TRUE 0.656 6.000 0.000 NA   NA
 216462 216463 PP0765 PP0766     TRUE 0.970 26.000 0.889 NA   NA
 216463 216464 PP0766 PP0767     FALSE 0.126 328.000 0.375 NA   NA
 216464 216465 PP0767 PP0768     FALSE 0.032 160.000 0.000 1.000 N NA
 216465 216466 PP0768 PP0769     TRUE 0.995 -3.000 0.174 1.000 Y NA
 216466 216467 PP0769 PP0770     FALSE 0.188 194.000 0.000 NA Y NA
 216467 216468 PP0770 PP0771     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 216468 216469 PP0771 PP0772     FALSE 0.367 19.000 0.000 1.000   NA
 216469 216470 PP0772 PP0773     FALSE 0.131 119.000 0.021 1.000   NA
 216471 216472 PP0774 PP0775 pta   TRUE 0.686 32.000 0.094 NA   NA
 216473 216474 PP0776 PP0777 slyD   FALSE 0.420 146.000 0.036 1.000 Y NA
 216476 216477 PP0779 PP0780     TRUE 0.635 7.000 0.000 NA   NA
 216477 216478 PP0780 PP0781     FALSE 0.089 97.000 0.000 NA   NA
 216478 216479 PP0781 PP0782     FALSE 0.004 473.000 0.000 NA   NA
 216485 216486 PP0788 PP0789   ampD FALSE 0.267 89.000 0.048 NA   NA
 216486 216487 PP0789 PP0790 ampD   TRUE 0.996 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 216488 216489 PP0791 PP0792   fruR TRUE 0.683 3.000 0.005 NA N NA
 216490 216491 PP0793 PP0794 fruB fruK TRUE 0.988 1.000 0.101 1.000 Y NA
 216491 216492 PP0794 PP0795 fruK fruA TRUE 0.999 -3.000 0.562 1.000 Y NA
 216495 216496 PP0798 PP0799     FALSE 0.479 199.000 0.500 1.000   NA
 216496 216497 PP0799 PP0800     FALSE 0.002 621.000 0.000 NA   NA
 216497 216498 PP0800 PP0801     TRUE 0.943 -21.000 0.200 NA   NA
 216498 216499 PP0801 PP0802   chev-1 FALSE 0.144 74.000 0.000 NA   NA
 216499 216500 PP0802 PP0803 chev-1   FALSE 0.057 93.000 0.000 1.000 N NA
 216500 216501 PP0803 PP0804     TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.087 N NA
 216501 216502 PP0804 PP0805     TRUE 0.829 -3.000 0.000 1.000 N NA
 216502 216503 PP0805 PP0806     FALSE 0.185 64.000 0.000 NA   NA
 216503 216504 PP0806 PP0807     FALSE 0.034 191.000 0.000 NA   NA
 216505 216506 PP0808 PP0809 hmpA dsbB FALSE 0.015 457.000 0.000 0.068 N NA
 216506 216507 PP0809 PP0810 dsbB cyoups1 FALSE 0.175 66.000 0.000 NA   NA
 216507 216508 PP0810 PP0811 cyoups1 cyoups2 FALSE 0.451 -124.000 0.000 NA   NA
 216508 216509 PP0811 PP0812 cyoups2 cyoA FALSE 0.317 26.000 0.000 NA   NA
 216509 216510 PP0812 PP0813 cyoA cyoB TRUE 0.993 4.000 0.200 0.012 Y NA
 216510 216511 PP0813 PP0814 cyoB cyoC TRUE 0.994 4.000 0.258 0.068 Y NA
 216511 216512 PP0814 PP0815 cyoC cyoD TRUE 0.998 0.000 0.273 0.068 Y NA
 216512 216513 PP0815 PP0816 cyoD cyoE-2 TRUE 0.872 12.000 0.064 0.087 N NA
 216513 216514 PP0816 PP0817 cyoE-2   FALSE 0.004 313.000 0.000 1.000 N NA
 216514 216515 PP0817 PP0818     TRUE 0.677 6.000 0.000 1.000   NA
 216515 216516 PP0818 PP0819     FALSE 0.055 162.000 0.000 NA   NA
 216516 216517 PP0819 PP0820     FALSE 0.033 193.000 0.000 NA   NA
 216517 216518 PP0820 PP0821     FALSE 0.002 623.000 0.000 NA   NA
 216519 216520 PP0822 PP0823   selD TRUE 0.984 0.000 0.214 NA   NA
 216521 216522 PP0824 PP0825     TRUE 1.000 -3.000 0.690 0.001 Y NA
 216522 216523 PP0825 PP0826     TRUE 0.998 -6.000 0.696 1.000 Y NA
 216523 216524 PP0826 PP0827     TRUE 0.996 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 216527 216528 PP0830 PP0831     FALSE 0.055 168.000 0.000 1.000   NA
 216528 2137314 PP0831 PP_t19     FALSE 0.039 181.000 0.000 NA   NA
 216529 216530 PP0832 PP0833 queA tgt TRUE 0.987 15.000 0.360 0.001 Y NA
 216530 216531 PP0833 PP0834 tgt yajC TRUE 0.845 43.000 0.325 NA N NA
 216531 216532 PP0834 PP0835 yajC secD TRUE 0.691 64.000 0.031 NA Y NA
 216532 216533 PP0835 PP0836 secD secF TRUE 0.985 11.000 0.171 0.001 Y NA
 216533 216534 PP0836 PP0837 secF   FALSE 0.211 119.000 0.050 1.000   NA
 216536 216537 PP0839 PP0840   cysE TRUE 0.957 4.000 0.208 1.000 N NA
 216537 216538 PP0840 PP0841 cysE   FALSE 0.333 180.000 0.271 1.000 N NA
 216538 216539 PP0841 PP0842   iscS-1 TRUE 0.878 46.000 0.424 1.000 N NA
 216539 216540 PP0842 PP0843 iscS-1 iscU TRUE 0.885 47.000 0.448 1.000 N NA
 216540 216541 PP0843 PP0844 iscU iscA TRUE 0.959 29.000 0.359 0.001   NA
 216541 216542 PP0844 PP0845 iscA hscB TRUE 0.979 9.000 0.500 1.000   NA
 216542 216543 PP0845 PP0846 hscB hscA TRUE 0.974 44.000 0.634 1.000 Y NA
 216543 216544 PP0846 PP0847 hscA   TRUE 0.992 4.000 0.794 1.000 N NA
 216544 216545 PP0847 PP0848     TRUE 0.978 11.000 0.625 1.000   NA
 216545 216546 PP0848 PP0849   ndk FALSE 0.169 89.000 0.017 1.000   NA
 216546 216547 PP0849 PP0850 ndk   TRUE 0.767 29.000 0.156 1.000   NA
 216547 216548 PP0850 PP0851   pilF TRUE 0.885 9.000 0.086 1.000   NA
 216548 216549 PP0851 PP0852 pilF   TRUE 0.988 -3.000 0.204 1.000   NA
 216549 216550 PP0852 PP0853   ispG TRUE 0.968 4.000 0.233 1.000   NA
 216550 216551 PP0853 PP0854 ispG hisS TRUE 0.798 26.000 0.207 1.000 N NA
 216551 216552 PP0854 PP0855 hisS   TRUE 0.839 40.000 0.259 1.000   NA
 216552 216553 PP0855 PP0856     TRUE 0.993 1.000 0.492 1.000   NA
 216553 216554 PP0856 PP0857   engA FALSE 0.442 117.000 0.203 1.000   NA
 216554 216555 PP0857 PP0858 engA   FALSE 0.076 152.000 0.006 1.000   NA
 216555 216556 PP0858 PP0859     TRUE 0.931 -12.000 0.099 1.000   NA
 216557 216558 PP0860 PP0861     FALSE 0.372 232.000 0.068 0.020 Y NA
 216559 216560 PP0862 PP0863     TRUE 0.970 4.000 0.250 1.000   NA
 216562 216563 PP0865 PP0866     TRUE 0.997 -3.000 0.625 NA N NA
 216563 216564 PP0866 PP0867     TRUE 0.728 109.000 0.250 NA Y NA
 216565 216566 PP0868 PP0869     TRUE 0.999 -3.000 0.903 1.000 Y NA
 216566 216567 PP0869 PP0870     TRUE 0.996 -3.000 0.313 0.080 N NA
 216567 216568 PP0870 PP0871     TRUE 0.986 -16.000 0.403 0.080 N NA
 216570 216571 PP0873 PP0874     TRUE 0.937 53.000 0.714 NA   NA
 216571 216572 PP0874 PP0875     TRUE 0.940 34.000 0.600 NA   NA
 216572 216573 PP0875 PP0876     FALSE 0.180 41.000 0.000 1.000 N NA
 216573 216574 PP0876 PP0877     FALSE 0.235 52.000 0.000 NA   NA
 216574 216575 PP0877 PP0878   dppF FALSE 0.002 840.000 0.000 NA   NA
 216575 216576 PP0878 PP0879 dppF dppD TRUE 0.999 0.000 0.377 0.001 Y NA
 216576 216577 PP0879 PP0880 dppD dppC TRUE 0.989 11.000 0.560 1.000 Y NA
 216577 216578 PP0880 PP0881 dppC dppB TRUE 0.996 11.000 0.779 0.080 Y NA
 216578 216579 PP0881 PP0882 dppB dppA TRUE 0.695 92.000 0.036 0.080 Y NA
 216579 216580 PP0882 PP0883 dppA   TRUE 0.961 55.000 0.714 0.096   NA
 216580 216581 PP0883 PP0884     TRUE 0.623 229.000 0.714 0.096   NA
 216581 216582 PP0884 PP0885     FALSE 0.495 147.000 0.000 0.080 Y NA
 216582 216583 PP0885 PP0886     FALSE 0.005 381.000 0.000 NA   NA
 216584 216585 PP0887 PP0888     TRUE 0.999 0.000 0.682 1.000 Y NA
 216585 216586 PP0888 PP0889     FALSE 0.147 52.000 0.000 1.000 N NA
 216586 216587 PP0889 PP0890     TRUE 0.998 -3.000 0.833 NA   NA
 216587 216588 PP0890 PP0891     TRUE 0.830 45.000 0.273 NA   NA
 216588 216589 PP0891 PP0892     TRUE 0.989 2.000 0.412 NA   NA
 216589 216590 PP0892 PP0893     FALSE 0.416 43.000 0.021 1.000   NA
 216592 216593 PP0895 PP0896     TRUE 0.995 -3.000 0.437 1.000   NA
 216594 216595 PP0897 PP0898     FALSE 0.370 15.000 0.000 NA   NA
 216598 216599 PP0901 PP0902 colR   TRUE 0.886 -43.000 0.000 1.000 Y NA
 216599 216600 PP0902 PP0903     FALSE 0.044 108.000 0.000 1.000 N NA
 216600 216601 PP0903 PP0904     TRUE 0.994 4.000 0.833 1.000   NA
 216601 216602 PP0904 PP0905     TRUE 0.994 0.000 0.455 NA   NA
 216603 216604 PP0906 PP0907     TRUE 0.662 2.000 0.000 NA N NA
 216604 216605 PP0907 PP0908     FALSE 0.058 156.000 0.000 NA   NA
 216605 216606 PP0908 PP0909     TRUE 0.993 3.000 0.620 NA   NA
 216606 216607 PP0909 PP0910     TRUE 0.962 20.000 0.713 NA   NA
 216607 216608 PP0910 PP0911     FALSE 0.075 110.000 0.000 NA   NA
 216608 216609 PP0911 PP0912     FALSE 0.390 14.000 0.000 NA   NA
 216609 216610 PP0912 PP0913     FALSE 0.289 37.000 0.000 NA   NA
 216610 216611 PP0913 PP0914     FALSE 0.139 159.000 0.057 NA N NA
 216611 216612 PP0914 PP0915   sodB FALSE 0.015 220.000 0.004 1.000 N NA
 216612 216613 PP0915 PP0916 sodB   FALSE 0.017 267.000 0.009 1.000   NA
 216614 216615 PP0917 PP0918     FALSE 0.509 50.000 0.066 1.000 N NA
 216615 216616 PP0918 PP0919     FALSE 0.041 413.000 0.192 1.000   NA
 216617 216618 PP0920 PP0921 xenB   TRUE 0.883 18.000 0.310 1.000 N NA
 216620 216621 PP0923 PP0924     TRUE 0.989 0.000 0.286 NA   NA
 216622 216623 PP0925 PP0926     FALSE 0.039 188.000 0.000 1.000   NA
 216623 216624 PP0926 PP0927   aroP TRUE 0.536 57.000 0.000 0.087   NA
 216625 216626 PP0928 PP0929     TRUE 0.849 61.000 0.417 NA   NA
 216626 216627 PP0929 PP0930   gatB FALSE 0.094 127.000 0.010 NA   NA
 216627 216628 PP0930 PP0931 gatB gatA TRUE 0.994 12.000 0.492 0.001 Y NA
 216628 216629 PP0931 PP_0932 gatA gatC TRUE 0.993 16.000 0.643 0.001 Y NA
 216630 216631 PP_0933 PP0934 mreB mreC FALSE 0.480 221.000 0.689 1.000 N NA
 216631 216632 PP0934 PP0935 mreC mreD TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 216632 216633 PP0935 PP0936 mreD maf-1 TRUE 0.775 33.000 0.206 NA N NA
 216633 216634 PP0936 PP0937 maf-1 cafA TRUE 0.855 54.000 0.417 NA N NA
 216634 216635 PP0937 PP0938 cafA   TRUE 0.665 83.000 0.296 NA   NA
 216635 216636 PP0938 PP0939     TRUE 0.967 9.000 0.358 NA   NA
 216636 216637 PP0939 PP0940   tldD TRUE 0.977 3.000 0.259 NA   NA
 216639 216640 PP0942 PP0943 pmbA fagA FALSE 0.019 254.000 0.010 NA   NA
 216640 216641 PP0943 PP0944 fagA fumC-1 TRUE 0.906 -10.000 0.058 NA   NA
 216641 216642 PP0944 PP0945 fumC-1   FALSE 0.473 28.000 0.024 1.000   NA
 216642 216643 PP0945 PP0946   sodA TRUE 0.941 -19.000 0.179 1.000   NA
 216643 216644 PP0946 PP0947 sodA   TRUE 0.998 -3.000 0.464 1.000 Y NA
 216645 216646 PP0948 PP0949 ptsO   TRUE 0.818 19.000 0.182 NA   NA
 216646 216647 PP0949 PP0950   ptsN TRUE 0.967 3.000 0.186 NA   NA
 216647 216648 PP0950 PP0951 ptsN rpoX TRUE 0.971 13.000 0.728 NA N NA
 216648 216649 PP0951 PP0952 rpoX rpoN TRUE 0.880 80.000 0.820 NA N NA
 216649 216650 PP0952 PP0953 rpoN   FALSE 0.262 176.000 0.163 1.000   NA
 216650 216651 PP0953 PP0954     TRUE 0.994 1.000 0.543 NA   NA
 216651 216652 PP0954 PP0955     TRUE 0.983 -13.000 0.459 NA   NA
 216652 216653 PP0955 PP0956     TRUE 0.984 9.000 0.617 NA   NA
 216653 216654 PP0956 PP0957     TRUE 0.966 13.000 0.598 1.000   NA
 216655 216656 PP0958 PP0959 ttg2A ttg2B TRUE 0.999 -3.000 0.530 NA Y NA
 216656 216657 PP0959 PP0960 ttg2B ttg2C TRUE 0.995 0.000 0.562 NA   NA
 216657 216658 PP0960 PP0961 ttg2C ttg2D TRUE 0.869 10.000 0.091 NA   NA
 216658 216659 PP0961 PP0962 ttg2D ttg2E TRUE 0.994 -3.000 0.353 NA   NA
 216659 216660 PP0962 PP0963 ttg2E ttg2F FALSE 0.243 118.000 0.067 NA   NA
 216660 216661 PP0963 PP0964 ttg2F murA TRUE 0.840 24.000 0.258 NA N NA
 216661 216662 PP0964 PP0965 murA hisG FALSE 0.364 92.000 0.123 1.000 N NA
 216662 216663 PP0965 PP0966 hisG hisD FALSE 0.460 287.000 0.254 0.003 Y NA
 216663 216664 PP0966 PP0967 hisD hisC TRUE 0.993 3.000 0.087 0.003 Y NA
 216666 216667 PP0969 PP0970     TRUE 0.967 -10.000 0.250 1.000 N NA
 216667 216668 PP0970 PP0971     FALSE 0.198 110.000 0.048 NA   NA
 216668 216669 PP0971 PP0972     FALSE 0.519 17.000 0.026 NA   NA
 216671 216672 PP0974 PP0975   hupN TRUE 0.756 -9.000 0.000 NA   NA
 216673 216674 PP0976 PP0977   valS FALSE 0.051 179.000 0.003 1.000   NA
 216674 216675 PP0977 PP0978 valS   FALSE 0.144 84.000 0.009 NA   NA
 216675 216676 PP0978 PP0979   holC TRUE 0.822 6.000 0.034 NA   NA
 216676 216677 PP0979 PP0980 holC pepA TRUE 0.887 51.000 0.494 1.000 N NA
 216677 216678 PP0980 PP0981 pepA   TRUE 0.679 -15.000 0.000 NA   NA
 216679 216680 PP0982 PP0983     TRUE 0.996 -7.000 0.631 0.086   NA
 216681 216682 PP0984 PP0985     FALSE 0.104 90.000 0.000 NA   NA
 216682 216683 PP0985 PP0986   gcvT-1 FALSE 0.094 70.000 0.000 1.000 N NA
 216683 216684 PP0986 PP0987 gcvT-1 sda-2 TRUE 0.787 28.000 0.013 1.000 Y NA
 216684 216685 PP0987 PP0988 sda-2 gcvP-1 FALSE 0.333 149.000 0.006 1.000 Y NA
 216685 216686 PP0988 PP0989 gcvP-1 gcvH-1 TRUE 0.967 12.000 0.249 1.000 Y NA
 216686 216687 PP0989 PP0990 gcvH-1   FALSE 0.009 304.000 0.000 NA   NA
 216687 216688 PP0990 PP0991     TRUE 0.768 74.000 0.367 NA   NA
 216688 216689 PP0991 PP0992     TRUE 0.995 -3.000 0.450 NA   NA
 216689 216690 PP0992 PP0993     TRUE 0.716 17.000 0.080 NA   NA
 216691 216692 PP_0994 PP0995     TRUE 0.962 -10.000 0.200 NA   NA
 216693 216694 PP0996 PP0997 gltS   FALSE 0.362 128.000 0.000 1.000 Y NA
 216694 216695 PP0997 PP0998     FALSE 0.396 141.000 0.200 NA   NA
 216695 216696 PP0998 PP0999   arcC TRUE 0.981 -3.000 0.121 NA   NA
 216696 216697 PP0999 PP1000 arcC argI TRUE 0.793 165.000 0.483 1.000 Y NA
 216697 216698 PP1000 PP1001 argI arcA TRUE 0.764 70.000 0.100 1.000 Y NA
 216698 216699 PP1001 PP1002 arcA arcD TRUE 0.956 34.000 0.375 1.000 Y NA
 216701 216702 PP1004 PP1005   hemO TRUE 0.655 55.000 0.132 NA   NA
 216702 216703 PP1005 PP1006 hemO   FALSE 0.507 141.000 0.074 NA Y NA
 216703 216704 PP1006 PP1007     FALSE 0.072 436.000 0.122 NA Y NA
 216704 216705 PP1007 PP1008     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA N NA
 216705 216706 PP1008 PP1009   gap-1 FALSE 0.024 257.000 0.033 1.000 N NA
 216707 216708 PP1010 PP1011 edd glk TRUE 0.989 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 216708 216709 PP1011 PP1012 glk gltR-2 TRUE 0.712 79.000 0.364 1.000 N NA
 216709 216710 PP1012 PP1013 gltR-2   TRUE 0.997 -19.000 0.909 1.000 Y NA
 216710 216711 PP1013 PP1014     FALSE 0.032 216.000 0.026 1.000 N NA
 216711 216712 PP1014 PP1015     FALSE 0.493 105.000 0.043 1.000 Y NA
 216712 216713 PP1015 PP1016     TRUE 0.871 134.000 0.367 0.079 Y NA
 216713 216714 PP1016 PP1017     TRUE 0.999 -7.000 0.816 0.079 Y NA
 216714 216715 PP1017 PP1018     TRUE 0.998 4.000 0.723 0.079 Y NA
 216715 216716 PP1018 PP1019   oprB-1 TRUE 0.826 41.000 0.135 0.079 N NA
 216716 216717 PP1019 PP1020 oprB-1   FALSE 0.092 118.000 0.021 1.000 N NA
 216719 216720 PP1022 PP1023 zwf-1 pgl TRUE 0.971 -28.000 0.163 1.000 Y NA
 216720 216721 PP1023 PP1024 pgl eda TRUE 0.977 -9.000 0.064 1.000 Y NA
 216722 216723 PP1025 PP1026 leuA   FALSE 0.002 433.000 0.000 1.000 N NA
 216723 216724 PP1026 PP1027   xseA TRUE 0.816 4.000 0.032 1.000 N NA
 216724 216725 PP1027 PP1028 xseA   FALSE 0.071 95.000 0.006 1.000 N NA
 216726 216727 PP1029 PP1030     TRUE 0.561 48.000 0.064 NA   NA
 216727 216728 PP1030 PP1031   guaB FALSE 0.132 87.000 0.008 NA   NA
 216728 216729 PP1031 PP1032 guaB guaA TRUE 0.781 79.000 0.190 0.000 N NA
 216731 216732 PP1034 PP1035 cumA cumB FALSE 0.469 42.000 0.045 1.000 N NA
 216734 216735 PP1037 PP1038 purL   TRUE 0.810 4.000 0.016 1.000   NA
 216736 216737 PP1039 PP1040 tatC-1   TRUE 0.997 -3.000 0.314 NA Y NA
 216737 216738 PP1040 PP1041   tatA-1 TRUE 0.975 0.000 0.000 0.008   NA
 216741 216742 PP1044 PP1045 uxpA xcpP TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 216742 216743 PP1045 PP1046 xcpP xcpQ TRUE 0.720 4.000 0.000 NA   NA
 216743 216744 PP1046 PP1047 xcpQ xcpR TRUE 0.999 -3.000 0.776 1.000 Y NA
 216744 216745 PP1047 PP1048 xcpR xcpS-1 TRUE 0.996 4.000 0.653 1.000 Y NA
 216745 216746 PP1048 PP1049 xcpS-1 xcpT-1 TRUE 0.999 -3.000 0.599 0.003 Y NA
 216746 216747 PP1049 PP1050 xcpT-1 xcpU TRUE 0.960 4.000 0.029 0.003   NA
 216747 216748 PP1050 PP1051 xcpU xcpV TRUE 0.885 -42.000 0.000 0.003   NA
 216748 216749 PP1051 PP1052 xcpV xcpW TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 216749 216750 PP1052 PP1053 xcpW xcpY TRUE 0.679 -15.000 0.000 NA   NA
 216750 216751 PP1053 PP1054 xcpY xcpZ TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 216751 216752 PP1054 PP1055 xcpZ gspN FALSE 0.370 15.000 0.000 NA   NA
 216753 216754 PP1056 PP1057     TRUE 0.972 -7.000 0.223 NA N NA
 216754 216755 PP1057 PP1058     FALSE 0.095 90.000 0.014 NA N NA
 216757 216758 PP1060 PP1061     FALSE 0.039 188.000 0.000 1.000   NA
 216762 216763 PP1065 PP1066     TRUE 0.700 24.000 0.085 NA   NA
 216763 216764 PP1066 PP1067     TRUE 0.999 -3.000 0.613 0.098 Y NA
 216764 216765 PP1067 PP1068     TRUE 0.701 66.000 0.129 0.098 N NA
 216765 216766 PP1068 PP1069     TRUE 0.960 -39.000 0.138 1.000 Y NA
 216766 216767 PP1069 PP1070     TRUE 0.999 1.000 0.933 0.012 Y NA
 216767 216768 PP1070 PP1071     TRUE 0.668 146.000 0.083 0.079 Y NA
 216770 216771 PP1073 PP1074 glpD glpR FALSE 0.024 217.000 0.016 1.000 N NA
 216771 216772 PP1074 PP1075 glpR glpK FALSE 0.196 102.000 0.055 1.000 N NA
 216772 216773 PP1075 PP1076 glpK glpF FALSE 0.289 52.000 0.023 1.000 N NA
 216775 216776 PP1078 PP1079   argF TRUE 0.988 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 216777 216778 PP1080 PP1081     FALSE 0.182 92.000 0.039 1.000 N NA
 216779 216780 PP1082 PP1083 bfr   TRUE 0.531 200.000 0.286 NA Y NA
 216782 216783 PP1085 PP1086 rnt pyrC FALSE 0.459 60.000 0.068 1.000 N NA
 216784 216785 PP1087 PP1088   argG FALSE 0.009 371.000 0.013 1.000   NA
 216788 216789 PP1091 PP1092   nth FALSE 0.105 105.000 0.012 NA   NA
 216789 216790 PP1092 PP1093 nth   TRUE 0.698 5.000 0.000 1.000   NA
 216790 216791 PP1093 PP1094     TRUE 0.869 -31.000 0.000 0.067   NA
 216791 216792 PP1094 PP1095     TRUE 1.000 -3.000 0.924 0.067 Y NA
 216792 216793 PP1095 PP1096     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.067 Y NA
 216793 216794 PP1096 PP1097   metG FALSE 0.110 107.000 0.027 1.000 N NA
 216797 216798 PP1100 PP1101 dcd   FALSE 0.264 62.000 0.014 NA   NA
 216799 216800 PP1102 PP1103     TRUE 0.996 -3.000 0.460 1.000   NA
 216800 216801 PP1103 PP1104     FALSE 0.173 69.000 0.000 1.000   NA
 216801 216802 PP1104 PP1105     FALSE 0.081 114.000 0.000 1.000   NA
 216802 216803 PP1105 PP1106     TRUE 0.998 -3.000 0.751 1.000 N NA
 216805 216806 PP1108 PP1109     FALSE 0.086 104.000 0.000 1.000   NA
 216807 216808 PP1110 PP1111     TRUE 0.967 -3.000 0.056 NA   NA
 216808 216809 PP1111 PP1112     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 216809 216810 PP1112 PP1113     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA N NA
 216811 216812 PP1114 PP1115     TRUE 0.926 8.000 0.163 NA   NA
 216812 216813 PP1115 PP1116     FALSE 0.002 2574.000 0.000 1.000   NA
 216813 216814 PP1116 PP1117     FALSE 0.002 1367.000 0.000 NA   NA
 216814 216815 PP1117 PP1118     FALSE 0.002 1222.000 0.000 NA   NA
 216815 216816 PP1118 PP1119     FALSE 0.345 19.000 0.000 NA   NA
 216816 216817 PP1119 PP1120     TRUE 0.993 0.000 0.407 NA   NA
 216818 216819 PP1121 PP1122     TRUE 0.987 15.000 0.400 0.004 Y NA
 216819 216820 PP1122 PP1123     FALSE 0.216 99.000 0.045 NA   NA
 216822 216823 PP1125 PP1126     TRUE 0.738 -34.000 0.029 1.000   NA
 216823 216824 PP1126 PP1127   estC TRUE 0.676 134.000 0.467 1.000   NA
 216824 216825 PP1127 PP1128 estC   TRUE 0.937 43.000 0.667 1.000 N NA
 216825 216826 PP1128 PP1129   pdxH FALSE 0.410 20.000 0.023 1.000 N NA
 216831 216832 PP1134 PP1135     FALSE 0.120 104.000 0.017 NA   NA
 216834 216835 PP1137 PP1138 braG braF TRUE 0.999 1.000 0.967 0.018 Y NA
 216835 216836 PP1138 PP1139 braF braE TRUE 0.999 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 216836 216837 PP1139 PP1140 braE braD TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.079 Y NA
 216837 216838 PP1140 PP1141 braD braC FALSE 0.214 186.000 0.000 1.000 Y NA
 216839 216840 PP1142 PP1143     FALSE 0.033 193.000 0.000 NA   NA
 216841 216842 PP1144 PP1145   hepA FALSE 0.006 278.000 0.000 1.000 N NA
 216843 216844 PP1146 PP1147     FALSE 0.185 64.000 0.000 NA   NA
 216844 216845 PP1147 PP1148     TRUE 0.776 36.000 0.182 NA   NA
 216845 216846 PP1148 PP1149     FALSE 0.383 136.000 0.182 NA   NA
 216846 216847 PP1149 PP1150     FALSE 0.026 206.000 0.000 NA   NA
 216847 216848 PP1150 PP1151     TRUE 0.951 -13.000 0.185 NA   NA
 216848 216849 PP1151 PP1152     TRUE 0.934 13.000 0.353 NA   NA
 216849 216850 PP1152 PP1153     TRUE 0.560 -34.000 0.000 NA   NA
 216851 216852 PP1154 PP1155     TRUE 0.854 52.000 0.000 0.009 Y NA
 216852 216853 PP1155 PP1156     FALSE 0.006 279.000 0.000 1.000 N NA
 2137315 2137316 PP_16SE PP_23SE     FALSE 0.010 297.000 0.000 NA   NA
 2137316 406664 PP_23SE PP_5SE   rrf FALSE 0.072 132.000 0.000 NA   NA
 406664 216854 PP_5SE PP1157 rrf   FALSE 0.008 307.000 0.000 NA   NA
 216854 10750596 PP1157 PP_1158     FALSE 0.006 350.000 0.000 NA   NA
 10750596 216855 PP_1158 PP1159     FALSE 0.520 11.000 0.000 NA   NA
 216855 216856 PP1159 PP1160     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 216856 216857 PP1160 PP1161     TRUE 0.599 -28.000 0.000 NA   NA
 216857 216858 PP1161 PP1162     FALSE 0.048 170.000 0.000 NA   NA
 216858 216859 PP1162 PP1163     TRUE 0.906 28.000 0.439 1.000 N NA
 216859 216860 PP1163 PP1164     FALSE 0.276 109.000 0.105 1.000 N NA
 216861 216862 PP1165 PP1166     FALSE 0.322 25.000 0.000 NA   NA
 216862 216863 PP1166 PP1167     FALSE 0.225 55.000 0.000 NA   NA
 216863 216864 PP1167 PP_1168     TRUE 0.999 1.000 0.905 NA Y NA
 216864 216865 PP_1168 PP1169   dctP TRUE 0.973 67.000 0.947 NA Y NA
 216865 216866 PP1169 PP1170 dctP   TRUE 0.913 65.000 0.350 NA Y NA
 216866 216867 PP1170 PP1171     TRUE 0.926 23.000 0.450 NA   NA
 216869 216870 PP1173 PP1174     FALSE 0.002 754.000 0.000 NA   NA
 216870 216871 PP1174 PP1175     FALSE 0.002 682.000 0.000 NA   NA
 216871 216872 PP1175 PP1176     FALSE 0.029 200.000 0.000 NA   NA
 216872 216873 PP1176 PP1177   nrdB TRUE 0.827 1.000 0.000 NA   NA
 216873 216874 PP1177 PP1178 nrdB   FALSE 0.004 442.000 0.000 NA   NA
 216874 216875 PP1178 PP1179   nrdA TRUE 0.621 8.000 0.000 NA   NA
 216876 216877 PP1180 PP1181     FALSE 0.005 392.000 0.000 NA   NA
 216877 216878 PP1181 PP1182     TRUE 0.996 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 216879 216880 PP1183 PP1184     TRUE 0.660 82.000 0.069 1.000 Y NA
 216881 216882 PP1185 PP1186 oprH phoP FALSE 0.215 197.000 0.180 1.000   NA
 216882 216883 PP1186 PP1187 phoP phoQ TRUE 0.999 -3.000 0.940 1.000 Y NA
 216883 216884 PP1187 PP1188 phoQ dctA FALSE 0.004 351.000 0.000 1.000 N NA
 216885 216886 PP1189 PP1190     TRUE 0.903 1.000 0.025 NA   NA
 216886 216887 PP1190 PP1191     FALSE 0.478 50.000 0.043 NA   NA
 216887 216888 PP1191 PP1192     FALSE 0.356 120.000 0.139 1.000   NA
 216889 216890 PP1193 PP1194     FALSE 0.074 123.000 0.000 NA   NA
 216890 216891 PP1194 PP1195     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 216891 216892 PP1195 PP1196     FALSE 0.247 49.000 0.000 NA   NA
 216893 216894 PP1197 PP1198     FALSE 0.043 120.000 0.000 1.000 N NA
 216894 216895 PP1198 PP1199     TRUE 0.978 -9.000 0.280 NA   NA
 216897 216898 PP1201 PP1202     TRUE 0.980 0.000 0.176 NA   NA
 216898 2137317 PP1202 PP_t20     FALSE 0.012 265.000 0.000 NA   NA
 2137317 2137318 PP_t20 PP_t21     FALSE 0.067 138.000 0.000 NA   NA
 2137318 2137319 PP_t21 PP_t22     FALSE 0.067 138.000 0.000 NA   NA
 216900 216901 PP1204 PP1205   proS FALSE 0.462 15.000 0.013 NA   NA
 216901 216902 PP1205 PP1206 proS oprD FALSE 0.060 161.000 0.000 1.000   NA
 216903 216904 PP1207 PP1208     TRUE 0.910 2.000 0.035 NA   NA
 216906 216907 PP1210 PP1211     FALSE 0.041 202.000 0.014 NA   NA
 216907 216908 PP1211 PP1212     FALSE 0.093 95.000 0.000 NA   NA
 216908 216909 PP1212 PP1213   aspS FALSE 0.154 94.000 0.020 NA   NA
 216909 216910 PP1213 PP1214 aspS   FALSE 0.174 115.000 0.039 NA   NA
 216910 216911 PP1214 PP1215   ruvC FALSE 0.347 186.000 0.277 NA   NA
 216911 216912 PP1215 PP1216 ruvC ruvA TRUE 0.919 110.000 0.451 0.010 Y NA
 216912 216913 PP1216 PP1217 ruvA ruvB TRUE 0.999 -3.000 0.549 0.001 Y NA
 216913 216914 PP1217 PP1218 ruvB   FALSE 0.279 126.000 0.082 1.000   NA
 216914 216915 PP1218 PP1219   tolQ TRUE 0.992 3.000 0.593 1.000   NA
 216915 216916 PP1219 PP1220 tolQ tolR TRUE 0.988 15.000 0.556 0.093 Y NA
 216916 216917 PP1220 PP1221 tolR tolA TRUE 0.994 0.000 0.460 1.000   NA
 216917 216918 PP1221 PP1222 tolA tolB TRUE 0.996 -3.000 0.215 0.008   NA
 216918 216919 PP1222 PP1223 tolB oprL TRUE 0.906 55.000 0.592 1.000 N NA
 216919 216920 PP1223 PP1224 oprL   TRUE 0.962 7.000 0.278 1.000   NA
 216920 216921 PP1224 PP1225     FALSE 0.162 169.000 0.059 1.000   NA
 216921 216922 PP1225 PP1226   exsB TRUE 0.881 18.000 0.270 1.000   NA
 216922 2137320 PP1226 PP_t23 exsB   FALSE 0.199 61.000 0.000 NA   NA
 216923 216924 PP1227 PP1228     FALSE 0.071 81.000 0.000 1.000 N NA
 216924 216925 PP1228 PP1229     FALSE 0.102 67.000 0.000 1.000 N NA
 216926 216927 PP1230 PP1231   nadA FALSE 0.011 275.000 0.000 NA   NA
 216929 216930 PP1233 PP1234     TRUE 0.756 21.000 0.121 NA   NA
 216931 216932 PP1235 PP1236     TRUE 0.798 12.000 0.102 NA N NA
 216933 216934 PP1237 PP1238 dapA   TRUE 0.900 16.000 0.088 NA Y NA
 216934 216935 PP1238 PP1239     TRUE 0.896 1.000 0.022 NA   NA
 216935 216936 PP1239 PP1240   purC FALSE 0.446 31.000 0.021 1.000   NA
 216936 2137321 PP1240 PP_t24 purC   FALSE 0.099 92.000 0.000 NA   NA
 216937 216938 PP1241 PP1242     FALSE 0.006 357.000 0.000 NA   NA
 216941 216942 PP1245 PP1246     TRUE 0.605 9.000 0.000 NA   NA
 216943 216944 PP1247 PP1248     FALSE 0.479 -73.000 0.000 NA   NA
 216945 216946 PP1249 PP1250     FALSE 0.003 505.000 0.000 NA   NA
 216946 216947 PP1250 PP_1251   mqo-2 FALSE 0.008 322.000 0.000 1.000   NA
 216947 216948 PP_1251 PP1252 mqo-2   FALSE 0.004 480.000 0.000 1.000   NA
 216951 216952 PP1255 PP1256     TRUE 0.937 3.000 0.097 1.000 N NA
 216952 216953 PP1256 PP1257     FALSE 0.383 153.000 0.091 0.076 N NA
 216953 216954 PP1257 PP1258     TRUE 0.916 43.000 0.215 1.000 Y NA
 216954 216955 PP1258 PP1259     TRUE 0.851 24.000 0.046 1.000 Y NA
 216957 216958 PP1261 PP1262     FALSE 0.488 176.000 0.429 1.000 N NA
 216959 216960 PP1263 PP1264     TRUE 0.998 -3.000 0.714 NA   NA
 216960 216961 PP1264 PP1265     TRUE 0.958 -10.000 0.182 NA   NA
 216961 216962 PP1265 PP1266     TRUE 0.947 11.000 0.318 NA   NA
 216963 216964 PP1267 PP1268     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 216964 216965 PP1268 PP1269     FALSE 0.302 30.000 0.000 NA   NA
 216966 216967 PP1270 PP1271     TRUE 0.637 117.000 0.400 1.000   NA
 216967 216968 PP1271 PP1272     TRUE 0.980 -13.000 0.385 1.000   NA
 216968 216969 PP1272 PP1273     TRUE 0.994 -3.000 0.423 1.000 N NA
 216970 216971 PP1274 PP1275     TRUE 0.946 32.000 0.636 NA   NA
 216973 216974 PP1277 PP1278 algA algF TRUE 0.900 33.000 0.400 NA   NA
 216974 216975 PP1278 PP1279 algF algJ TRUE 0.973 21.000 0.889 NA   NA
 216975 216976 PP1279 PP1280 algJ algI TRUE 0.996 3.000 0.889 NA   NA
 216976 216977 PP1280 PP1281 algI algL TRUE 0.628 142.000 0.438 NA   NA
 216977 216978 PP1281 PP1282 algL algX TRUE 0.997 -3.000 0.562 NA   NA
 216978 216979 PP1282 PP1283 algX   TRUE 0.950 14.000 0.500 NA   NA
 216979 216980 PP1283 PP1284   algE TRUE 0.972 -91.000 0.625 NA   NA
 216980 216981 PP1284 PP1285 algE algK TRUE 0.995 -3.000 0.417 NA   NA
 216981 216982 PP1285 PP1286 algK   TRUE 0.986 -10.000 0.455 NA   NA
 216982 216983 PP1286 PP1287     TRUE 0.791 38.000 0.200 NA   NA
 216983 216984 PP1287 PP1288   algD FALSE 0.128 78.000 0.000 NA   NA
 216984 216985 PP1288 PP1289 algD   FALSE 0.002 801.000 0.000 NA   NA
 216986 216987 PP1290 PP1291     FALSE 0.006 282.000 0.000 1.000 N NA
 216987 216988 PP1291 PP1292   moaC FALSE 0.030 196.000 0.013 1.000 N NA
 216988 216989 PP1292 PP1293 moaC moaD TRUE 0.998 -3.000 0.175 0.002 Y NA
 216989 216990 PP1293 PP1294 moaD moaE TRUE 0.998 3.000 0.501 0.002 Y NA
 216991 216992 PP_1295 PP1296 rhlB estB FALSE 0.178 101.000 0.031 1.000   NA
 216993 216994 PP1297 PP1298 aapJ aapQ TRUE 0.966 68.000 0.548 0.077 Y NA
 216994 216995 PP1298 PP1299 aapQ aapM TRUE 0.997 11.000 0.815 0.012 Y NA
 216995 216996 PP1299 PP1300 aapM aapP TRUE 0.993 11.000 0.734 1.000 Y NA
 216998 216999 PP1302 PP1303   cysD FALSE 0.058 203.000 0.030 NA   NA
 216999 217000 PP1303 PP1304 cysD cysNC TRUE 0.901 17.000 0.096 0.000 N NA
 217001 217002 PP1305 PP1306     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000   NA
 217002 217003 PP1306 PP1307     FALSE 0.101 95.000 0.000 1.000   NA
 217006 217007 PP1310 PP1311     TRUE 0.598 26.000 0.048 1.000   NA
 217007 217008 PP1311 PP1312     FALSE 0.176 162.000 0.061 NA   NA
 217009 217010 PP1313 PP1314     FALSE 0.019 191.000 0.000 1.000 N NA
 217011 217012 PP1315 PP1316 rplM rpsI TRUE 0.992 15.000 0.601 0.011 Y NA
 217012 217013 PP1316 PP1317 rpsI petA FALSE 0.009 263.000 0.006 1.000 N NA
 217013 217014 PP1317 PP1318 petA petB TRUE 0.998 0.000 0.233 0.001 Y NA
 217014 217015 PP1318 PP1319 petB petC TRUE 0.999 0.000 0.630 0.001 Y NA
 217015 217016 PP1319 PP1320 petC sspA TRUE 0.579 117.000 0.370 NA N NA
 217016 217017 PP1320 PP1321 sspA sspB TRUE 0.991 -19.000 0.831 NA   NA
 217018 217019 PP1322 PP1323   gmhA TRUE 0.997 -3.000 0.613 NA   NA
 217019 217020 PP1323 PP1324 gmhA   FALSE 0.448 93.000 0.187 1.000 N NA
 217020 217021 PP1324 PP1325     TRUE 0.986 -3.000 0.172 1.000   NA
 217023 217024 PP1328 PP1329     TRUE 0.997 -3.000 0.635 NA   NA
 217024 217025 PP1329 PP1330   ftsL TRUE 0.988 -3.000 0.227 1.000 N NA
 217025 217026 PP1330 PP1331 ftsL ftsI TRUE 0.981 -3.000 0.153 1.000 N NA
 217026 217027 PP1331 PP1332 ftsI murE TRUE 0.992 -3.000 0.073 1.000 Y NA
 217027 217028 PP1332 PP1333 murE murF TRUE 0.999 -7.000 0.569 0.002 Y NA
 217028 217029 PP1333 PP1334 murF mraY TRUE 0.998 0.000 0.309 0.004 Y NA
 217029 217030 PP1334 PP1335 mraY murD TRUE 0.999 1.000 0.647 0.004 Y NA
 217030 217031 PP1335 PP1336 murD ftsW TRUE 0.997 -3.000 0.297 0.002 N NA
 217031 217032 PP1336 PP1337 ftsW murG TRUE 0.990 -10.000 0.647 1.000 N NA
 217032 217033 PP1337 PP1338 murG murC TRUE 0.993 -7.000 0.283 1.000 Y NA
 217033 217034 PP1338 PP1339 murC ddlB TRUE 0.998 -3.000 0.153 0.004 Y NA
 217034 217035 PP1339 PP1340 ddlB ftsQ TRUE 0.990 6.000 0.372 NA Y NA
 217035 217036 PP1340 PP1341 ftsQ ftsA TRUE 0.947 -54.000 0.389 NA N NA
 217036 217037 PP1341 PP1342 ftsA ftsZ TRUE 0.950 56.000 0.460 1.000 Y NA
 217037 217038 PP1342 PP1343 ftsZ lpxC FALSE 0.311 113.000 0.134 1.000 N NA
 217040 217041 PP_1345 PP1346 secA argJ FALSE 0.154 183.000 0.102 1.000 N NA
 217041 217042 PP1346 PP1347 argJ   FALSE 0.051 156.000 0.011 1.000 N NA
 217042 217043 PP1347 PP1348     TRUE 0.950 -3.000 0.042 1.000 N NA
 217044 217045 PP1349 PP1350     TRUE 0.962 2.000 0.030 0.096   NA
 217045 217046 PP1350 PP1351     FALSE 0.502 38.000 0.049 1.000 N NA
 217047 217048 PP1352 PP1353     FALSE 0.127 111.000 0.021 NA   NA
 217048 217049 PP1353 PP1354     FALSE 0.036 128.000 0.000 NA N NA
 217050 217051 PP1355 PP1356 ampG   TRUE 0.696 44.000 0.120 1.000   NA
 217052 217053 PP1357 PP1358     TRUE 0.590 -55.000 0.014 NA   NA
 217053 217054 PP1358 PP1359     FALSE 0.294 66.000 0.026 NA   NA
 217054 217055 PP1359 PP1360   groES FALSE 0.033 245.000 0.028 NA   NA
 217055 217056 PP1360 PP1361 groES groEL TRUE 0.949 48.000 0.177 0.007 Y NA
 217058 217059 PP1363 PP1364     TRUE 0.569 10.000 0.000 NA   NA
 217059 217060 PP1364 PP1365   sbcB FALSE 0.211 58.000 0.000 NA   NA
 217063 217064 PP1368 PP1369     TRUE 0.973 -3.000 0.071 NA   NA
 217064 217065 PP1369 PP1370     TRUE 0.801 26.000 0.182 1.000   NA
 217065 217066 PP1370 PP1371     FALSE 0.065 169.000 0.023 1.000 N NA
 217068 217069 PP1373 PP1374     FALSE 0.008 313.000 0.000 NA   NA
 217070 217071 PP1375 PP1376 pcaR pcaK FALSE 0.004 321.000 0.000 1.000 N NA
 217071 217072 PP1376 PP1377 pcaK pcaF FALSE 0.004 327.000 0.000 1.000 N NA
 217072 217073 PP1377 PP1378 pcaF pcaT FALSE 0.086 188.000 0.051 1.000 N NA
 217073 217074 PP1378 PP1379 pcaT pcaB TRUE 0.742 10.000 0.042 1.000 N NA
 217074 217075 PP1379 PP1380 pcaB pcaD TRUE 0.781 12.000 0.063 1.000   NA
 217075 217076 PP1380 PP1381 pcaD pcaC TRUE 0.900 11.000 0.174 1.000   NA
 217077 217078 PP1382 PP1383     FALSE 0.024 210.000 0.000 NA   NA
 217078 217079 PP1383 PP1384   ttgC FALSE 0.032 313.000 0.000 0.092   NA
 217079 217080 PP1384 PP1385 ttgC ttgB TRUE 0.997 -3.000 0.385 0.077 N NA
 217080 217081 PP1385 PP1386 ttgB ttgA TRUE 0.988 4.000 0.565 1.000 N NA
 217085 217086 PP1390 PP1391     TRUE 0.861 31.000 0.286 NA   NA
 217091 217092 PP1396 PP1397     TRUE 0.941 17.000 0.500 NA   NA
 217093 217094 PP1398 PP1399     FALSE 0.203 120.000 0.050 NA   NA
 217094 217095 PP1399 PP1400     FALSE 0.030 199.000 0.000 NA   NA
 217095 217096 PP1400 PP1401   dctD FALSE 0.043 254.000 0.065 1.000 N NA
 217096 217097 PP1401 PP1402 dctD dctB TRUE 0.998 -6.000 0.419 0.096 Y NA
 217097 217098 PP1402 PP1403 dctB bglX FALSE 0.221 131.000 0.074 1.000 N NA
 217100 217101 PP1405 PP1406     FALSE 0.313 27.000 0.000 NA   NA
 217101 217102 PP1406 PP1407     FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 217102 2137322 PP1407 PP_t25     FALSE 0.023 214.000 0.000 NA   NA
 2137322 217103 PP_t25 PP1408   phaG FALSE 0.075 112.000 0.000 NA   NA
 217103 10750598 PP1408 PP_1409 phaG   FALSE 0.007 344.000 0.000 NA   NA
 10750598 217104 PP_1409 PP1410     TRUE 0.605 9.000 0.000 NA   NA
 217104 217105 PP1410 PP1411     TRUE 0.913 -28.000 0.148 NA   NA
 217105 217106 PP1411 PP1412     FALSE 0.001 707.000 0.000 1.000 N NA
 217108 217109 PP1414 PP1415 ushA   FALSE 0.101 91.000 0.000 NA   NA
 217109 217110 PP1415 PP1416     TRUE 0.989 -7.000 0.429 NA   NA
 217110 217111 PP1416 PP1417     TRUE 0.996 2.000 0.857 NA   NA
 217111 217112 PP1417 PP1418     FALSE 0.397 173.000 0.277 NA   NA
 217112 217113 PP1418 PP1419     TRUE 0.690 47.000 0.128 1.000   NA
 217114 217115 PP1420 PP1421 tctD   TRUE 0.977 -19.000 0.163 1.000 Y NA
 217116 217117 PP1422 PP1423     FALSE 0.433 50.000 0.034 NA   NA
 217118 217119 PP1424 PP1425     TRUE 0.804 -16.000 0.027 NA   NA
 217121 217122 PP1427 PP1428 algT mucA TRUE 0.946 34.000 0.705 NA N NA
 217122 217123 PP1428 PP1429 mucA algN TRUE 0.991 13.000 0.856 NA Y NA
 217123 217124 PP1429 PP1430 algN algY FALSE 0.073 132.000 0.017 NA N NA
 217124 217125 PP1430 PP1431 algY lepA FALSE 0.048 181.000 0.020 1.000 N NA
 217125 217126 PP1431 PP1432 lepA lepB TRUE 0.935 6.000 0.187 1.000 N NA
 217126 217127 PP1432 PP1433 lepB rnc FALSE 0.219 164.000 0.117 1.000 N NA
 217127 217128 PP1433 PP1434 rnc era TRUE 0.972 -13.000 0.127 0.054   NA
 217128 217129 PP1434 PP1435 era recO FALSE 0.226 170.000 0.109 1.000   NA
 217129 217130 PP1435 PP1436 recO pdxJ TRUE 0.707 44.000 0.166 1.000 N NA
 217131 217132 PP1437 PP1438   czrR-2 TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 217134 217135 PP1440 PP1441     TRUE 0.993 -3.000 0.315 NA   NA
 217135 217136 PP1441 PP1442     FALSE 0.171 90.000 0.021 NA   NA
 217136 217137 PP1442 PP1443   lon-1 TRUE 0.804 -28.000 0.041 NA   NA
 217137 217138 PP1443 PP1444 lon-1 gcd FALSE 0.015 204.000 0.000 1.000 N NA
 217138 217139 PP1444 PP1445 gcd oprB-2 TRUE 0.885 31.000 0.375 1.000 N NA
 217139 217140 PP1445 PP1446 oprB-2   FALSE 0.034 296.000 0.000 0.077 N NA
 217141 217142 PP1447 PP1448     TRUE 0.879 2.000 0.020 NA   NA
 217143 217144 PP1449 PP1450     TRUE 0.962 28.000 0.800 NA   NA
 217144 217145 PP1450 PP1451     FALSE 0.063 146.000 0.000 NA   NA
 217145 217146 PP1451 PP1452     TRUE 0.657 23.000 0.065 NA   NA
 217147 217148 PP1453 PP1454     TRUE 0.634 44.000 0.078 1.000   NA
 217148 217149 PP1454 PP1455     TRUE 0.835 -31.000 0.062 NA   NA
 217149 217150 PP1455 PP1456     FALSE 0.183 78.000 0.016 NA   NA
 217150 217151 PP1456 PP1457   purT FALSE 0.204 77.000 0.019 NA   NA
 217152 217153 PP1458 PP1459     FALSE 0.015 272.000 0.008 NA   NA
 217153 217154 PP1459 PP1460     TRUE 0.961 10.000 0.349 NA   NA
 217155 217156 PP1461 PP_1462 ffh rpsP FALSE 0.187 260.000 0.361 1.000 N NA
 217156 217157 PP_1462 PP1463 rpsP rimM TRUE 0.995 6.000 0.342 0.010 Y NA
 217157 217158 PP1463 PP1464 rimM trmD TRUE 0.997 4.000 0.672 1.000 Y NA
 217158 217159 PP1464 PP1465 trmD rplS TRUE 0.970 43.000 0.567 1.000 Y NA
 217159 217160 PP1465 PP1466 rplS   FALSE 0.058 95.000 0.004 NA N NA
 217162 217163 PP1468 PP1469 xerD dsbC FALSE 0.106 115.000 0.026 1.000 N NA
 217163 217164 PP1469 PP1470 dsbC hom FALSE 0.171 84.000 0.029 1.000 N NA
 217164 217165 PP1470 PP1471 hom thrC TRUE 0.832 60.000 0.125 1.000 Y NA
 217168 217169 PP1474 PP1475     TRUE 0.738 21.000 0.103 NA   NA
 217170 217171 PP1476 PP1477   recJ TRUE 0.694 9.000 0.011 1.000   NA
 217171 217172 PP1477 PP1478 recJ   FALSE 0.013 231.000 0.002 1.000 N NA
 217173 217174 PP1479 PP1480 hicB-1 hicA-1 TRUE 0.992 -3.000 0.286 NA   NA
 217174 217175 PP1480 PP1481 hicA-1   FALSE 0.018 232.000 0.000 NA   NA
 217175 217176 PP1481 PP1482     TRUE 0.674 18.000 0.081 1.000 N NA
 217176 217177 PP1482 PP1483     TRUE 0.999 -10.000 0.821 0.077 Y NA
 217177 217178 PP1483 PP1484     TRUE 0.999 2.000 0.643 0.077 Y NA
 217181 217182 PP1487 PP1488     FALSE 0.075 171.000 0.018 NA   NA
 217182 217183 PP1488 PP1489     TRUE 0.997 6.000 0.600 0.011 Y NA
 217183 217184 PP1489 PP1490     TRUE 0.999 -3.000 0.635 1.000 Y NA
 217184 217185 PP1490 PP1491     TRUE 0.980 15.000 0.558 1.000 Y NA
 217185 217186 PP1491 PP1492     TRUE 0.999 -3.000 0.587 0.012 Y NA
 217186 217187 PP1492 PP1493     TRUE 0.999 -3.000 0.324 0.012 Y NA
 217187 217188 PP1493 PP1494     TRUE 0.979 49.000 0.480 0.023 Y NA
 217188 10750599 PP1494 PP_1495     FALSE 0.067 138.000 0.000 NA   NA
 10750599 217189 PP_1495 PP1496   lysS FALSE 0.095 94.000 0.000 NA   NA
 217189 217190 PP1496 PP1497 lysS   FALSE 0.075 167.000 0.012 1.000   NA
 217190 217191 PP1497 PP1498     TRUE 0.869 31.000 0.304 NA   NA
 217191 217192 PP1498 PP1499     TRUE 0.732 23.000 0.104 NA   NA
 217192 217193 PP1499 PP1500     TRUE 0.854 -28.000 0.065 NA   NA
 217193 217194 PP1500 PP1501     TRUE 0.986 -3.000 0.174 NA   NA
 217195 217196 PP1502 PP1503     TRUE 0.846 51.000 0.333 NA   NA
 217196 217197 PP1503 PP1504     FALSE 0.022 220.000 0.000 NA   NA
 217198 217199 PP1505 PP1506 ppc adk FALSE 0.008 258.000 0.000 1.000 N NA
 217199 217200 PP1506 PP1507 adk   FALSE 0.076 140.000 0.019 1.000 N NA
 217200 217201 PP1507 PP1508     FALSE 0.101 102.000 0.008 NA   NA
 217201 217202 PP1508 PP1509     TRUE 0.919 4.000 0.074 NA   NA
 217202 217203 PP1509 PP1510     TRUE 0.528 29.000 0.037 NA   NA
 217203 217204 PP1510 PP1511     TRUE 0.968 0.000 0.090 NA   NA
 217206 217207 PP1513 PP1514     FALSE 0.033 193.000 0.000 NA   NA
 217209 217210 PP1516 PP1517     TRUE 0.966 7.000 0.354 NA N NA
 217211 217212 PP1518 PP1519     TRUE 0.536 34.000 0.042 NA   NA
 217212 217213 PP1519 PP1520   plsB FALSE 0.330 77.000 0.052 NA   NA
 217213 217214 PP1520 PP1521 plsB   FALSE 0.156 70.000 0.000 NA   NA
 217216 217217 PP1523 PP1524     TRUE 0.719 18.000 0.083 NA   NA
 217217 217218 PP1524 PP1525   dapE TRUE 0.914 0.000 0.033 1.000 N NA
 217218 217219 PP1525 PP1526 dapE   FALSE 0.038 191.000 0.018 1.000 N NA
 217221 217222 PP1528 PP1529   csdA TRUE 0.981 -3.000 0.116 NA   NA
 217222 217223 PP1529 PP1530 csdA   TRUE 0.813 82.000 0.244 1.000 Y NA
 217223 217224 PP1530 PP1531     TRUE 0.588 32.000 0.069 1.000 N NA
 217224 217225 PP1531 PP1532     FALSE 0.202 68.000 0.006 1.000   NA
 217225 217226 PP1532 PP1533     TRUE 0.970 -19.000 0.130 0.011   NA
 217226 217227 PP1533 PP1534     FALSE 0.294 34.000 0.000 NA   NA
 217227 217228 PP1534 PP1535     FALSE 0.215 57.000 0.000 NA   NA
 217228 217229 PP1535 PP1536     FALSE 0.370 15.000 0.000 NA   NA
 217229 217230 PP1536 PP1537     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 217230 217231 PP1537 PP1538     FALSE 0.015 251.000 0.000 NA   NA
 217231 217232 PP1538 PP1539     FALSE 0.114 84.000 0.000 NA   NA
 217232 217233 PP1539 PP1540     FALSE 0.008 320.000 0.000 NA   NA
 217233 217234 PP1540 PP1541     FALSE 0.034 191.000 0.000 NA   NA
 217234 217235 PP1541 PP1542     FALSE 0.169 67.000 0.000 NA   NA
 217235 217236 PP1542 PP1543     FALSE 0.007 341.000 0.000 NA   NA
 217236 217237 PP1543 PP1544     FALSE 0.008 319.000 0.000 NA   NA
 217237 217238 PP1544 PP1545     FALSE 0.118 82.000 0.000 NA   NA
 217238 217239 PP1545 PP1546     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 217241 217242 PP1548 PP1549     FALSE 0.001 717.000 0.000 NA N NA
 217243 217244 PP1550 PP1551     FALSE 0.071 142.000 0.000 1.000   NA
 217244 217245 PP1551 PP1552     FALSE 0.095 98.000 0.000 1.000   NA
 217245 217246 PP1552 PP1553     TRUE 0.772 3.000 0.000 NA   NA
 217246 217247 PP1553 PP1554     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 217247 217248 PP1554 PP1555     FALSE 0.393 15.000 0.000 1.000   NA
 217248 217249 PP1555 PP1556     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 217249 217250 PP1556 PP1557     TRUE 0.609 -27.000 0.000 NA   NA
 217250 217251 PP1557 PP1558     TRUE 0.543 11.000 0.000 1.000   NA
 217251 217252 PP1558 PP1559     FALSE 0.029 200.000 0.000 NA   NA
 217252 217253 PP1559 PP1560     FALSE 0.199 61.000 0.000 NA   NA
 217253 217254 PP1560 PP1561     TRUE 0.756 -9.000 0.000 NA   NA
 217254 217255 PP1561 PP1562     FALSE 0.322 128.000 0.000 0.012   NA
 217255 217256 PP1562 PP1563     TRUE 0.691 24.000 0.080 NA   NA
 217256 217257 PP1563 PP1564     FALSE 0.473 12.000 0.000 NA   NA
 217257 217258 PP1564 PP1565     TRUE 0.699 32.000 0.103 NA   NA
 217258 217259 PP1565 PP1566     TRUE 0.988 -3.000 0.207 NA   NA
 217259 217260 PP1566 PP1567     TRUE 0.813 22.000 0.185 NA   NA
 217260 217261 PP1567 PP1568     FALSE 0.277 42.000 0.000 NA   NA
 217261 217262 PP1568 PP1569     TRUE 0.720 4.000 0.000 NA   NA
 217262 217263 PP1569 PP1570     TRUE 0.919 0.000 0.023 NA   NA
 217263 217264 PP1570 PP1571     TRUE 0.970 -7.000 0.186 NA   NA
 217264 217265 PP1571 PP1572     TRUE 0.997 -3.000 0.635 NA   NA
 217265 217266 PP1572 PP1573     TRUE 0.583 66.000 0.135 NA   NA
 217266 217267 PP1573 PP1574     TRUE 0.988 9.000 0.778 NA   NA
 217267 217268 PP1574 PP1575     TRUE 0.874 63.000 0.500 NA   NA
 217268 217269 PP1575 PP1576     FALSE 0.194 62.000 0.000 NA   NA
 217269 217270 PP1576 PP1577     FALSE 0.254 47.000 0.000 NA   NA
 217270 217271 PP1577 PP1578     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 217271 217272 PP1578 PP1579     FALSE 0.006 374.000 0.000 NA   NA
 217272 217273 PP1579 PP1580     TRUE 0.569 10.000 0.000 NA   NA
 217273 217274 PP1580 PP1581     FALSE 0.083 101.000 0.000 NA   NA
 217274 217275 PP1581 PP1582     FALSE 0.473 12.000 0.000 NA   NA
 217275 217276 PP1582 PP1583     FALSE 0.308 28.000 0.000 NA   NA
 217276 217277 PP1583 PP1584     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 217278 217279 PP1585 PP1586     TRUE 0.911 9.000 0.136 NA   NA
 217281 217282 PP1588 PP1589   glnD TRUE 0.826 31.000 0.257 1.000 N NA
 217282 217283 PP1589 PP1590 glnD map TRUE 0.935 42.000 0.651 1.000 N NA
 217284 217285 PP1591 PP1592 rpsB tsf TRUE 0.827 186.000 0.748 1.000 Y NA
 217285 217286 PP1592 PP1593 tsf pyrH FALSE 0.043 182.000 0.017 1.000 N NA
 217286 217287 PP1593 PP1594 pyrH frr TRUE 0.933 -3.000 0.030 1.000 N NA
 217287 217288 PP1594 PP1595 frr uppS TRUE 0.917 16.000 0.409 1.000 N NA
 217288 217289 PP1595 PP1596 uppS cdsA TRUE 0.997 0.000 0.400 1.000 Y NA
 217289 217290 PP1596 PP1597 cdsA dxr TRUE 0.988 -27.000 0.372 1.000 Y NA
 217290 217291 PP1597 PP1598 dxr   TRUE 0.869 66.000 0.568 1.000 N NA
 217291 217292 PP1598 PP1599     TRUE 0.582 74.000 0.014 1.000 Y NA
 217292 217293 PP1599 PP1600   ompH TRUE 0.814 45.000 0.050 1.000 Y NA
 217293 217294 PP1600 PP1601 ompH lpxD TRUE 0.998 2.000 0.814 1.000 Y NA
 217294 217295 PP1601 PP1602 lpxD fabZ TRUE 0.920 64.000 0.796 1.000 N NA
 217295 217296 PP1602 PP1603 fabZ lpxA TRUE 0.998 -3.000 0.850 1.000 N NA
 217296 217297 PP1603 PP1604 lpxA lpxB TRUE 0.994 2.000 0.289 1.000 Y NA
 217297 217298 PP1604 PP1605 lpxB rnhB TRUE 0.969 2.000 0.186 1.000 N NA
 217298 217299 PP1605 PP1606 rnhB dnaE FALSE 0.398 187.000 0.104 1.000 Y NA
 217299 217300 PP1606 PP1607 dnaE accA FALSE 0.301 107.000 0.122 1.000 N NA
 217300 217301 PP1607 PP1608 accA   FALSE 0.201 172.000 0.123 1.000 N NA
 217301 217302 PP1608 PP1609     FALSE 0.258 46.000 0.000 NA   NA
 217302 217303 PP1609 PP1610   pyrG FALSE 0.118 82.000 0.000 NA   NA
 217303 217304 PP1610 PP1611 pyrG kdsA-1 TRUE 0.936 4.000 0.138 1.000 N NA
 217304 217305 PP1611 PP1612 kdsA-1 eno FALSE 0.248 155.000 0.125 1.000 N NA
 217305 217306 PP1612 PP1613 eno   FALSE 0.343 169.000 0.241 1.000 N NA
 217306 217307 PP1613 PP1614   ispD TRUE 0.985 -3.000 0.185 1.000 N NA
 217309 217310 PP1616 PP1617     TRUE 0.982 9.000 0.567 1.000   NA
 217310 217311 PP1617 PP1618     FALSE 0.110 113.000 0.012 1.000   NA
 217311 217312 PP1618 PP1619     TRUE 0.986 -3.000 0.173 1.000   NA
 217312 217313 PP1619 PP1620   surE TRUE 0.966 -12.000 0.235 1.000   NA
 217313 217314 PP1620 PP1621 surE pcm TRUE 0.972 -21.000 0.353 1.000   NA
 217314 217315 PP1621 PP1622 pcm nlpD FALSE 0.006 307.000 0.007 1.000 N NA
 217315 217316 PP1622 PP1623 nlpD rpoS FALSE 0.240 109.000 0.081 1.000 N NA
 217316 217317 PP1623 PP1624 rpoS   FALSE 0.002 475.000 0.000 1.000 N NA
 217318 217319 PP1625 PP1626   mutS FALSE 0.078 141.000 0.020 1.000 N NA
 217320 217321 PP1627 PP1628     FALSE 0.220 56.000 0.000 NA   NA
 217321 217322 PP1628 PP1629   recA FALSE 0.287 104.000 0.082 NA   NA
 217322 217323 PP1629 PP1630 recA recX TRUE 0.887 22.000 0.296 1.000   NA
 217327 217328 PP1634 PP1635     FALSE 0.071 180.000 0.022 NA   NA
 217328 217329 PP1635 PP1636   dgkA-1 TRUE 0.709 74.000 0.316 1.000 N NA
 217332 217333 PP1639 PP1640     FALSE 0.138 132.000 0.028 NA   NA
 217334 217335 PP1641 PP1642     TRUE 0.659 5.000 0.015 NA N NA
 217336 217337 PP1643 PP1644   wrbA TRUE 0.994 -7.000 0.657 NA   NA
 217337 217338 PP1644 PP1645 wrbA arsC-1 TRUE 0.992 -3.000 0.112 0.063   NA
 217340 217341 PP1647 PP1648     TRUE 0.904 -30.000 0.135 NA   NA
 217341 217342 PP1648 PP1649   ldhA FALSE 0.426 32.000 0.020 NA   NA
 217342 217343 PP1649 PP1650 ldhA gacS FALSE 0.334 38.000 0.020 1.000 N NA
 217344 217345 PP1651 PP1652     TRUE 0.992 4.000 0.333 1.000 Y NA
 217345 217346 PP1652 PP1653     FALSE 0.018 194.000 0.000 1.000 N NA
 217346 217347 PP1653 PP1654   cysM FALSE 0.004 315.000 0.000 1.000 N NA
 217347 217348 PP1654 PP1655 cysM   TRUE 0.907 1.000 0.039 1.000 N NA
 217348 217349 PP1655 PP1656   relA FALSE 0.188 97.000 0.047 1.000 N NA
 217349 217350 PP1656 PP1657 relA   FALSE 0.170 124.000 0.035 1.000   NA
 217350 217351 PP1657 PP1658     FALSE 0.393 27.000 0.013 NA   NA
 217351 217352 PP1658 PP1659     FALSE 0.008 311.000 0.000 NA   NA
 217352 217353 PP1659 PP1660     TRUE 0.940 -34.000 0.250 NA   NA
 217353 217354 PP1660 PP1661     TRUE 0.993 -3.000 0.312 NA   NA
 217355 217356 PP1662 PP1663     FALSE 0.058 156.000 0.000 NA   NA
 217356 217357 PP1663 PP1664   purN TRUE 0.856 9.000 0.065 NA   NA
 217357 217358 PP1664 PP1665 purN purM TRUE 0.998 0.000 0.230 0.002 Y NA
 217359 217360 PP1666 PP1667     TRUE 0.785 13.000 0.087 NA   NA
 217360 217361 PP1667 PP1668     FALSE 0.241 199.000 0.217 NA   NA
 217361 217362 PP1668 PP1669     FALSE 0.057 122.000 0.010 NA N NA
 217362 217363 PP1669 PP1670     TRUE 0.920 143.000 0.909 NA Y NA
 217365 217366 PP1672 PP1673 cobO cobB TRUE 0.996 -3.000 0.054 0.007 Y NA
 217366 217367 PP1673 PP1674 cobB   TRUE 0.968 -3.000 0.071 1.000 N NA
 217367 217368 PP1674 PP1675   cobD TRUE 0.839 -18.000 0.053 1.000 N NA
 217368 217369 PP1675 PP1676 cobD cobC TRUE 0.995 -7.000 0.463 0.007 N NA
 217369 217370 PP1676 PP1677 cobC cobQ TRUE 0.986 -3.000 0.033 0.007 N NA
 217370 217371 PP1677 PP1678 cobQ cobP TRUE 0.985 2.000 0.079 1.000 Y NA
 217371 217372 PP1678 PP1679 cobP cobT TRUE 0.994 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 217372 217373 PP1679 PP1680 cobT   TRUE 0.973 -3.000 0.090 1.000 N NA
 217373 217374 PP1680 PP1681   cobS TRUE 0.635 -31.000 0.021 1.000 N NA
 217374 217375 PP1681 PP1682 cobS   FALSE 0.320 31.000 0.000 1.000   NA
 217375 217376 PP1682 PP1683     FALSE 0.206 63.000 0.000 1.000   NA
 217376 217377 PP1683 PP1684     TRUE 0.766 45.000 0.220 1.000 N NA
 217377 217378 PP1684 PP1685     TRUE 0.964 -3.000 0.049 NA   NA
 217378 217379 PP1685 PP1686     TRUE 0.813 -10.000 0.017 NA   NA
 217382 217383 PP1689 PP1690     FALSE 0.357 148.000 0.182 NA   NA
 217383 217384 PP1690 PP1691     FALSE 0.015 250.000 0.000 NA   NA
 217388 217389 PP1695 PP1696     FALSE 0.264 127.000 0.000 0.075   NA
 217390 217391 PP1697 PP1698     TRUE 0.606 95.000 0.326 1.000 N NA
 217391 217392 PP1698 PP1699     TRUE 0.869 16.000 0.235 1.000   NA
 217392 217393 PP1699 PP1700     TRUE 0.596 50.000 0.000 0.073   NA
 217394 217395 PP1701 PP1702 sugE   FALSE 0.013 218.000 0.000 1.000 N NA
 2137323 2137324 PP_t26 PP_t27     FALSE 0.353 17.000 0.000 NA   NA
 2137324 2137325 PP_t27 PP_t28     FALSE 0.044 174.000 0.000 NA   NA
 2137325 2137326 PP_t28 PP_t29     FALSE 0.353 17.000 0.000 NA   NA
 2137326 217396 PP_t29 PP1703     FALSE 0.003 475.000 0.000 NA   NA
 217396 217397 PP1703 PP1704     FALSE 0.336 22.000 0.000 NA   NA
 217397 217398 PP1704 PP1705   nirB FALSE 0.074 124.000 0.000 NA   NA
 217398 217399 PP1705 PP1706 nirB nirD TRUE 0.998 0.000 0.656 0.000 N NA
 217400 217401 PP1707 PP1708     TRUE 0.746 25.000 0.024 0.073   NA
 217401 217402 PP1708 PP1709     TRUE 0.784 19.000 0.032 0.073   NA
 217402 217403 PP1709 PP1710     FALSE 0.052 221.000 0.050 1.000 N NA
 217406 217407 PP1713 PP1714 pcaQ fklB-2 FALSE 0.008 254.000 0.000 1.000 N NA
 217407 217408 PP1714 PP1715 fklB-2   FALSE 0.010 289.000 0.000 NA   NA
 217408 217409 PP1715 PP1716     TRUE 0.702 115.000 0.500 NA   NA
 217409 217410 PP1716 PP1717     TRUE 0.997 -3.000 0.562 NA   NA
 217411 217412 PP1718 PP1719   prc FALSE 0.269 61.000 0.029 NA N NA
 217414 217415 PP1721 PP1722     TRUE 0.946 15.000 0.222 1.000 Y NA
 217415 217416 PP1722 PP1723     TRUE 0.997 2.000 0.360 0.075 Y NA
 217416 217417 PP1723 PP1724     TRUE 0.996 -10.000 0.774 0.075   NA
 217417 217418 PP1724 PP1725     TRUE 0.992 -3.000 0.290 1.000   NA
 217418 217419 PP1725 PP1726     TRUE 0.735 100.000 0.500 1.000   NA
 217421 217422 PP1728 PP1729     TRUE 0.909 39.000 0.444 NA   NA
 217422 217423 PP1729 PP1730     FALSE 0.117 105.000 0.016 NA   NA
 217423 10750600 PP1730 PP_1731     FALSE 0.047 171.000 0.000 NA   NA
 10750600 217424 PP_1731 PP1732   minE FALSE 0.061 150.000 0.000 NA   NA
 217424 217425 PP1732 PP1733 minE minD TRUE 0.996 4.000 0.618 NA Y NA
 217425 217426 PP1733 PP1734 minD minC TRUE 0.847 110.000 0.466 1.000 Y NA
 217427 217428 PP1735 PP1736 htrB   TRUE 0.655 28.000 0.069 1.000   NA
 217429 217430 PP1737 PP1738     TRUE 0.619 74.000 0.204 NA   NA
 217433 217434 PP1741 PP1742     FALSE 0.027 205.000 0.000 NA   NA
 217434 217435 PP1742 PP1743     TRUE 0.998 -3.000 0.733 NA   NA
 217437 217438 PP1745 PP1746     FALSE 0.261 121.000 0.071 1.000   NA
 217439 217440 PP1747 PP1748     FALSE 0.272 84.000 0.045 NA   NA
 217440 217441 PP1748 PP1749     TRUE 0.548 170.000 0.471 1.000 N NA
 217441 217442 PP1749 PP1750   asnB TRUE 0.986 4.000 0.514 1.000 N NA
 217442 217443 PP1750 PP1751 asnB   FALSE 0.375 131.000 0.007 1.000 Y NA
 217444 217445 PP1752 PP1753     FALSE 0.033 193.000 0.000 NA   NA
 217445 217446 PP1753 PP1754     FALSE 0.139 75.000 0.000 NA   NA
 217448 217449 PP1756 PP1757   bolA TRUE 0.788 11.000 0.056 NA   NA
 217449 217450 PP1757 PP1758 bolA   FALSE 0.198 128.000 0.049 NA   NA
 217450 217451 PP1758 PP1759     FALSE 0.513 37.000 0.038 NA   NA
 217451 217452 PP1759 PP1760     TRUE 0.986 -7.000 0.407 1.000 N NA
 217452 217453 PP1760 PP1761     TRUE 0.836 -177.000 0.158 1.000 N NA
 217453 217454 PP1761 PP1762     TRUE 0.795 31.000 0.222 NA N NA
 217455 217456 PP1763 PP1764     FALSE 0.426 158.000 0.098 0.073   NA
 217456 217457 PP1764 PP1765   ubiG TRUE 0.978 3.000 0.259 1.000   NA
 217458 217459 PP1766 PP1767   gyrA FALSE 0.004 366.000 0.007 1.000 N NA
 217459 217460 PP1767 PP1768 gyrA serC FALSE 0.177 148.000 0.067 1.000 N NA
 217460 217461 PP1768 PP1769 serC pheA TRUE 0.986 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 217461 217462 PP1769 PP1770 pheA   FALSE 0.368 165.000 0.035 1.000 Y NA
 217462 217463 PP1770 PP1771   cmk TRUE 0.987 -3.000 0.209 1.000 N NA
 217463 217464 PP1771 PP_1772 cmk rpsA FALSE 0.498 125.000 0.281 1.000 N NA
 217464 217465 PP_1772 PP1773 rpsA ihfB FALSE 0.109 300.000 0.292 1.000 N NA
 217465 217466 PP1773 PP1774 ihfB   TRUE 0.849 -31.000 0.069 NA   NA
 217466 217467 PP1774 PP1775     FALSE 0.080 103.000 0.000 NA   NA
 217467 217468 PP1775 PP1776     FALSE 0.004 328.000 0.000 1.000 N NA
 217468 217469 PP1776 PP1777   xanA FALSE 0.105 130.000 0.027 1.000 N NA
 217469 217470 PP1777 PP1778 xanA   TRUE 0.961 3.000 0.000 1.000 Y NA
 217470 217471 PP1778 PP1779     TRUE 0.997 -3.000 0.450 0.093 N NA
 217471 217472 PP1779 PP1780     FALSE 0.326 -99.000 0.000 1.000 N NA
 217473 217474 PP1781 PP1782   rmlC FALSE 0.001 1291.000 0.000 1.000 N NA
 217474 217475 PP1782 PP1783 rmlC rmlA TRUE 0.994 0.000 0.208 1.000 Y NA
 217475 217476 PP1783 PP1784 rmlA rmlD TRUE 0.981 12.000 0.168 0.002 Y NA
 217476 217477 PP1784 PP1785 rmlD rmlB TRUE 0.997 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 217478 217479 PP1786 PP1787     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 217480 217481 PP1788 PP1789     FALSE 0.016 247.000 0.000 NA   NA
 217481 217482 PP1789 PP1790     TRUE 0.934 -3.000 0.015 1.000   NA
 217482 217483 PP1790 PP1791     TRUE 0.973 -3.000 0.068 1.000   NA
 217483 217484 PP1791 PP1792     FALSE 0.277 42.000 0.000 NA   NA
 217484 217485 PP1792 PP1793     TRUE 0.987 0.000 0.250 NA   NA
 217485 217486 PP1793 PP1794     TRUE 0.956 24.000 0.667 1.000   NA
 217486 217487 PP1794 PP1795     TRUE 0.886 18.000 0.286 NA   NA
 10750601 217488 PP_1796 PP1797     FALSE 0.428 13.000 0.000 NA   NA
 217488 217489 PP1797 PP1798     TRUE 0.999 -3.000 0.286 0.008 Y NA
 217489 217490 PP1798 PP1799   gmd FALSE 0.028 439.000 0.000 1.000 Y NA
 217490 217491 PP1799 PP1800 gmd rmd TRUE 0.998 0.000 0.222 0.002 Y NA
 217491 217492 PP1800 PP1801 rmd wbpY TRUE 0.992 -3.000 0.070 1.000 Y NA
 217492 217493 PP1801 PP1802 wbpY wbpZ TRUE 0.984 -108.000 0.256 0.015 Y NA
 217493 217494 PP1802 PP1803 wbpZ wbpV FALSE 0.401 133.000 0.019 1.000 Y NA
 217494 217495 PP1803 PP1804 wbpV wbpL TRUE 0.997 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 217495 217496 PP1804 PP1805 wbpL wbpM TRUE 0.797 46.000 0.041 1.000 Y NA
 217496 217497 PP1805 PP1806 wbpM   TRUE 0.710 47.000 0.000 1.000 Y NA
 217499 217500 PP1808 PP1809 pgi-1   FALSE 0.002 1073.000 0.000 NA   NA
 217500 217501 PP1809 PP1810     FALSE 0.002 1305.000 0.000 NA   NA
 217502 217503 PP1811 PP1812 wecB   FALSE 0.074 122.000 0.000 NA   NA
 217513 217514 PP1822 PP1823   folE-1 FALSE 0.516 60.000 0.090 1.000 N NA
 217514 217515 PP1823 PP1824 folE-1   FALSE 0.314 44.000 0.008 NA   NA
 217515 217516 PP1824 PP1825     FALSE 0.054 175.000 0.008 NA   NA
 217516 217517 PP1825 PP1826     TRUE 0.650 86.000 0.292 NA   NA
 217519 217520 PP1828 PP1829     TRUE 0.690 66.000 0.219 NA   NA
 217521 217522 PP1830 PP1831 aroC   FALSE 0.196 143.000 0.055 1.000   NA
 217522 217523 PP1831 PP1832     TRUE 0.928 0.000 0.026 1.000   NA
 217525 217526 PP1834 PP1835     TRUE 0.714 61.000 0.211 NA   NA
 217528 217529 PP1837 PP1838     FALSE 0.066 140.000 0.000 NA   NA
 217529 217530 PP1838 PP1839     TRUE 0.745 51.000 0.200 NA   NA
 217530 217531 PP1839 PP1840     FALSE 0.042 178.000 0.000 NA   NA
 217534 217535 PP1843 PP1844   plsC FALSE 0.198 69.000 0.022 1.000 N NA
 217535 217536 PP1844 PP1845 plsC   FALSE 0.365 121.000 0.000 1.000 Y NA
 2137327 217537 PP_t30 PP1846     FALSE 0.003 477.000 0.000 NA   NA
 217538 217539 PP1847 PP1848     TRUE 0.772 3.000 0.000 NA   NA
 217539 217540 PP1848 PP1849     FALSE 0.308 28.000 0.000 NA   NA
 217540 217541 PP1849 PP1850     FALSE 0.028 203.000 0.000 NA   NA
 217541 217542 PP1850 PP1851     FALSE 0.122 80.000 0.000 NA   NA
 217542 217543 PP1851 PP1852     TRUE 0.827 1.000 0.000 NA   NA
 217545 217546 PP1854 PP1855     TRUE 0.947 3.000 0.096 NA   NA
 217546 217547 PP1855 PP1856     TRUE 0.640 -21.000 0.000 NA   NA
 217548 217549 PP1857 PP1858   efp TRUE 0.591 49.000 0.074 NA   NA
 217550 217551 PP1859 PP1860 ohr   FALSE 0.501 141.000 0.314 1.000 N NA
 217551 217552 PP1860 PP1861     TRUE 0.887 59.000 0.086 0.081 Y NA
 217555 217556 PP1864 PP1865     FALSE 0.003 595.000 0.000 NA   NA
 217558 217559 PP1867 PP1868     FALSE 0.004 352.000 0.000 1.000 N NA
 217562 217563 PP1871 PP1872 htpX   FALSE 0.006 317.000 0.008 1.000 N NA
 217564 217565 PP1873 PP1874     TRUE 0.872 14.000 0.036 1.000 Y NA
 217567 217568 PP1876 PP1877     TRUE 0.888 1.000 0.019 NA   NA
 2137328 2137329 PP_t31 PP_t32     TRUE 0.656 6.000 0.000 NA   NA
 2137329 2137330 PP_t32 PP_t33     FALSE 0.091 96.000 0.000 NA   NA
 2137330 2137331 PP_t33 PP_t34     TRUE 0.635 7.000 0.000 NA   NA
 2137331 2137332 PP_t34 PP_t35     FALSE 0.106 89.000 0.000 NA   NA
 217570 217571 PP1879 PP1880     FALSE 0.281 41.000 0.000 NA   NA
 217571 217572 PP1880 PP1881     FALSE 0.035 189.000 0.000 NA   NA
 217572 217573 PP1881 PP1882     FALSE 0.211 58.000 0.000 NA   NA
 217574 217575 PP1883 PP1884     FALSE 0.286 39.000 0.000 NA   NA
 217575 217576 PP1884 PP1885     FALSE 0.204 60.000 0.000 NA   NA
 217576 217577 PP1885 PP1886     TRUE 0.576 -31.000 0.000 NA   NA
 217577 217578 PP1886 PP1887     FALSE 0.003 530.000 0.000 NA   NA
 217579 217580 PP1888 PP1889   fimD TRUE 0.833 57.000 0.111 1.000 Y NA
 217580 217581 PP1889 PP1890 fimD   TRUE 0.987 34.000 1.000 1.000 Y NA
 217581 217582 PP1890 PP1891   fimI TRUE 0.982 54.000 1.000 1.000 Y NA
 217582 217583 PP1891 PP1892 fimI   FALSE 0.022 220.000 0.000 NA   NA
 217583 217584 PP1892 PP1893     FALSE 0.488 69.000 0.090 NA   NA
 217585 217586 PP1894 PP1895     FALSE 0.132 134.000 0.039 1.000 N NA
 217586 217587 PP1895 PP1896     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.092 Y NA
 217587 217588 PP1896 PP1897     FALSE 0.003 659.000 0.000 1.000   NA
 217588 217589 PP1897 PP1898     FALSE 0.352 72.000 0.045 1.000   NA
 217589 217590 PP1898 PP1899     TRUE 0.999 -3.000 0.746 0.088 Y NA
 217590 217591 PP1899 PP1900   lpxK TRUE 0.974 -3.000 0.096 1.000 N NA
 217591 217592 PP1900 PP1901 lpxK   TRUE 0.822 45.000 0.263 NA   NA
 217592 217593 PP1901 PP1902   kdsB TRUE 0.991 -3.000 0.265 NA   NA
 217593 217594 PP1902 PP1903 kdsB   TRUE 0.939 0.000 0.050 1.000 N NA
 217594 217595 PP1903 PP1904   murB TRUE 0.747 -39.000 0.050 1.000 N NA
 10750602 217597 PP_1906 PP1907     TRUE 0.720 4.000 0.000 NA   NA
 217597 217598 PP1907 PP1908     TRUE 0.922 7.000 0.134 1.000   NA
 217600 217601 PP1910 PP1911   rpmF TRUE 0.960 14.000 0.599 NA   NA
 217601 217602 PP1911 PP1912 rpmF plsX TRUE 0.981 4.000 0.418 1.000 N NA
 217602 217603 PP1912 PP1913 plsX fabD TRUE 0.778 128.000 0.106 0.003 Y NA
 217603 217604 PP1913 PP1914 fabD fabG TRUE 0.988 16.000 0.432 0.003 Y NA
 217604 217605 PP1914 PP1915 fabG acpP TRUE 0.742 204.000 0.321 0.003 Y NA
 217605 217606 PP1915 PP1916 acpP fabF TRUE 0.639 188.000 0.346 1.000 Y NA
 217606 217607 PP1916 PP1917 fabF pabC TRUE 0.979 0.000 0.187 1.000 N NA
 217607 217608 PP1917 PP1918 pabC   TRUE 0.939 -25.000 0.204 NA   NA
 217608 10750603 PP1918 PP_1919     TRUE 0.569 10.000 0.000 NA   NA
 217611 217612 PP1922 PP1923     FALSE 0.079 104.000 0.000 NA   NA
 217612 217613 PP1923 PP1924     FALSE 0.002 1127.000 0.000 NA   NA
 217613 217614 PP1924 PP1925     TRUE 0.678 -7.000 0.000 1.000 N NA
 217614 217615 PP1925 PP1926     FALSE 0.206 26.000 0.000 1.000 N NA
 217615 217616 PP1926 PP1927     TRUE 0.678 5.000 0.000 NA   NA
 217616 217617 PP1927 PP1928   arsC-2 TRUE 0.964 12.000 0.500 NA   NA
 217617 217618 PP1928 PP1929 arsC-2 arsB-1 TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 N NA
 217618 217619 PP1929 PP1930 arsB-1 arsR-1 FALSE 0.195 30.000 0.000 1.000 N NA
 217621 217622 PP1932 PP1933     FALSE 0.004 459.000 0.000 NA   NA
 217624 217625 PP1935 PP1936     FALSE 0.001 2637.000 0.000 1.000   NA
 217626 217627 PP1937 PP1938     FALSE 0.027 204.000 0.000 NA   NA
 217627 10750604 PP1938 PP_1939     FALSE 0.004 423.000 0.000 NA   NA
 217628 217629 PP1940 PP1941     FALSE 0.001 723.000 0.000 1.000 N NA
 217629 217630 PP1941 PP1942     TRUE 0.856 37.000 0.000 0.081 Y NA
 217631 217632 PP1943 PP1944 purU-3   FALSE 0.190 34.000 0.000 1.000 N NA
 217632 217633 PP1944 PP1945   folD-1 FALSE 0.248 15.000 0.000 1.000 N NA
 217633 217634 PP1945 PP1946 folD-1   FALSE 0.145 53.000 0.000 1.000 N NA
 217634 217635 PP1946 PP1947     FALSE 0.043 181.000 0.000 1.000   NA
 217635 217636 PP1947 PP1948     TRUE 0.543 11.000 0.000 1.000   NA
 217636 217637 PP1948 PP1949     FALSE 0.221 22.000 0.000 1.000 N NA
 217637 217638 PP1949 PP1950     FALSE 0.298 94.000 0.000 0.062 N NA
 217638 217639 PP1950 PP1951     TRUE 0.737 41.000 0.000 1.000 Y NA
 217639 217640 PP1951 PP1952     FALSE 0.173 69.000 0.000 1.000   NA
 217640 217641 PP1952 PP1953     FALSE 0.081 124.000 0.000 1.000   NA
 217641 217642 PP1953 PP1954     FALSE 0.167 45.000 0.000 1.000 N NA
 217642 217643 PP1954 PP1955     FALSE 0.057 93.000 0.000 1.000 N NA
 217643 217644 PP1955 PP1956     FALSE 0.079 71.000 0.000 NA N NA
 217644 217645 PP1956 PP1957     FALSE 0.446 90.000 0.000 NA Y NA
 217646 217647 PP1958 PP1959     FALSE 0.002 747.000 0.000 NA   NA
 217647 217648 PP1959 PP1960     FALSE 0.021 222.000 0.000 NA   NA
 217648 217649 PP1960 PP1961     TRUE 0.987 4.000 0.500 1.000   NA
 217649 217650 PP1961 PP1962     TRUE 0.998 0.000 1.000 1.000   NA
 217650 217651 PP1962 PP1963     TRUE 0.794 83.000 0.500 NA   NA
 217651 217652 PP1963 PP1964     TRUE 0.560 -34.000 0.000 NA   NA
 10750605 217653 PP_1965 PP1966   holB TRUE 0.789 -7.000 0.000 NA   NA
 217653 217654 PP1966 PP1967 holB   TRUE 0.883 31.000 0.110 NA Y NA
 217654 217655 PP1967 PP1968     FALSE 0.002 390.000 0.000 NA N NA
 217655 217656 PP1968 PP1969     TRUE 0.579 112.000 0.357 1.000 N NA
 217656 217657 PP1969 PP1970     TRUE 0.747 67.000 0.286 NA   NA
 217657 217658 PP1970 PP1971     TRUE 0.933 -7.000 0.062 NA   NA
 2137333 217659 PP_t36 PP1972   tyrB-1 FALSE 0.191 63.000 0.000 NA   NA
 217659 217660 PP1972 PP1973 tyrB-1   FALSE 0.070 134.000 0.000 NA   NA
 217662 217663 PP1975 PP1976     TRUE 0.972 -10.000 0.250 1.000   NA
 217664 2137334 PP1977 PP_t37 gltX   FALSE 0.011 281.000 0.000 NA   NA
 2137334 2137335 PP_t37 PP_t38     FALSE 0.135 76.000 0.000 NA   NA
 2137335 2137336 PP_t38 PP_t39     FALSE 0.225 55.000 0.000 NA   NA
 2137336 2137337 PP_t39 PP_t40     FALSE 0.258 46.000 0.000 NA   NA
 2137337 2137338 PP_t40 PP_t41     FALSE 0.180 65.000 0.000 NA   NA
 2137338 2137339 PP_t41 PP_t42     FALSE 0.258 46.000 0.000 NA   NA
 2137339 217665 PP_t42 PP1978     FALSE 0.044 174.000 0.000 NA   NA
 217665 217666 PP1978 PP1979     TRUE 0.580 16.000 0.035 NA   NA
 217666 217667 PP1979 PP1980     FALSE 0.263 105.000 0.070 NA   NA
 217667 217668 PP1980 PP1981     FALSE 0.410 52.000 0.029 1.000   NA
 217668 217669 PP1981 PP1982   ibpA FALSE 0.008 336.000 0.021 1.000 N NA
 217670 217671 PP1983 PP1984     TRUE 0.869 -52.000 0.163 1.000 N NA
 217672 217673 PP1985 PP1986 leuC leuD TRUE 0.999 -3.000 0.463 0.000 Y NA
 217673 217674 PP1986 PP1987 leuD   FALSE 0.190 119.000 0.060 1.000 N NA
 217674 217675 PP1987 PP1988   leuB FALSE 0.296 55.000 0.026 1.000 N NA
 217675 217676 PP1988 PP1989 leuB asd TRUE 0.925 64.000 0.196 0.034 Y NA
 217676 217677 PP1989 PP1990 asd   FALSE 0.002 704.000 0.000 1.000   NA
 217679 217680 PP1992 PP1993     FALSE 0.163 72.000 0.017 1.000 N NA
 217680 10750606 PP1993 PP_1994     FALSE 0.067 138.000 0.000 NA   NA
 10750606 217681 PP_1994 PP1995   trpF FALSE 0.194 62.000 0.000 NA   NA
 217681 217682 PP1995 PP1996 trpF accD FALSE 0.016 223.000 0.007 1.000 N NA
 217682 217683 PP1996 PP1997 accD folC TRUE 0.994 -3.000 0.383 1.000 N NA
 217683 217684 PP1997 PP1998 folC   TRUE 0.954 -16.000 0.216 NA   NA
 217684 217685 PP1998 PP1999     FALSE 0.158 197.000 0.116 NA   NA
 217685 217686 PP1999 PP2000   purF TRUE 0.833 43.000 0.262 1.000   NA
 217686 217687 PP2000 PP2001 purF metZ TRUE 0.770 17.000 0.153 1.000 N NA
 217687 217688 PP2001 PP2002 metZ   TRUE 0.939 -3.000 0.033 1.000 N NA
 217688 2137340 PP2002 PP_t43     FALSE 0.022 220.000 0.000 NA   NA
 2137340 2137341 PP_t43 PP_t44     FALSE 0.160 69.000 0.000 NA   NA
 2137341 2137342 PP_t44 PP_t45     FALSE 0.080 103.000 0.000 NA   NA
 2137342 2137343 PP_t45 PP_t46     FALSE 0.064 145.000 0.000 NA   NA
 2137343 217689 PP_t46 PP2003     FALSE 0.109 87.000 0.000 NA   NA
 217690 217691 PP2004 PP2005     TRUE 0.940 5.000 0.154 1.000   NA
 217691 217692 PP2005 PP2006     FALSE 0.035 189.000 0.000 NA   NA
 217692 217693 PP2006 PP2007     FALSE 0.457 -109.000 0.000 NA   NA
 217694 217695 PP2008 PP2009 fadH   FALSE 0.100 237.000 0.040 0.071 N NA
 217696 217697 PP2010 PP2011     FALSE 0.019 229.000 0.000 NA   NA
 217698 217699 PP2012 PP2013     TRUE 0.949 0.000 0.045 1.000   NA
 217699 217700 PP2013 PP2014     TRUE 0.983 -3.000 0.131 1.000   NA
 217700 217701 PP2014 PP2015     TRUE 0.799 14.000 0.124 NA   NA
 217701 217702 PP2015 PP2016     TRUE 0.985 -3.000 0.168 NA   NA
 217702 217703 PP2016 PP2017   pepN TRUE 0.696 14.000 0.059 NA   NA
 217703 217704 PP2017 PP2018 pepN   FALSE 0.013 275.000 0.000 1.000   NA
 217704 217705 PP2018 PP2019     TRUE 0.997 -3.000 0.409 0.079   NA
 217705 217706 PP2019 PP2020     TRUE 0.827 1.000 0.000 NA   NA
 217706 217707 PP2020 PP2021     TRUE 0.888 -34.000 0.125 NA   NA
 217708 217709 PP2022 PP2023     FALSE 0.024 209.000 0.000 NA   NA
 217709 217710 PP2023 PP2024   sbcC TRUE 0.697 -9.000 0.009 NA N NA
 217710 217711 PP2024 PP2025 sbcC sbcD TRUE 0.999 -3.000 0.669 0.002 N NA
 217711 217712 PP2025 PP2026 sbcD   FALSE 0.002 1149.000 0.000 NA   NA
 217712 217713 PP2026 PP2027     FALSE 0.004 439.000 0.000 NA   NA
 217713 217714 PP2027 PP2028     TRUE 0.991 -3.000 0.258 NA   NA
 217714 217715 PP2028 PP2029     TRUE 0.990 -3.000 0.233 NA   NA
 217715 217716 PP2029 PP2030     TRUE 0.977 -7.000 0.233 NA   NA
 217716 217717 PP2030 PP2031     TRUE 0.996 -3.000 0.484 NA   NA
 217717 217718 PP2031 PP2032     TRUE 0.969 -7.000 0.179 NA   NA
 217720 217721 PP2034 PP2035   benE-1 TRUE 0.652 18.000 0.000 0.079 N NA
 217721 217722 PP2035 PP2036 benE-1   FALSE 0.035 150.000 0.000 1.000 N NA
 217722 217723 PP2036 PP2037     TRUE 0.847 45.000 0.333 1.000 N NA
 217724 217725 PP2038 PP2039     TRUE 0.970 15.000 0.400 1.000 Y NA
 217725 217726 PP2039 PP2040     TRUE 0.688 63.000 0.222 1.000 N NA
 217728 217729 PP2042 PP2043     TRUE 0.994 5.000 1.000 NA   NA
 217729 217730 PP2043 PP2044     TRUE 0.965 0.000 0.080 NA   NA
 217731 217732 PP2045 PP2046     FALSE 0.047 102.000 0.000 1.000 N NA
 217733 217734 PP2047 PP2048     TRUE 0.985 -78.000 0.500 1.000 Y NA
 217734 217735 PP2048 PP2049     TRUE 0.643 34.000 0.094 1.000 N NA
 217735 217736 PP2049 PP2050     TRUE 0.981 0.000 0.185 NA   NA
 217736 217737 PP2050 PP2051   atoB TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 217741 217742 PP2055 PP2056   dctM TRUE 0.841 60.000 0.385 NA   NA
 217742 217743 PP2056 PP2057 dctM   TRUE 0.811 115.000 0.385 1.000 Y NA
 217743 217744 PP2057 PP2058     TRUE 0.884 64.000 0.333 0.079   NA
 217745 217746 PP2059 PP2060   soxR FALSE 0.063 147.000 0.000 NA   NA
 217746 217747 PP2060 PP2061 soxR   FALSE 0.072 132.000 0.000 NA   NA
 217747 217748 PP2061 PP2062     FALSE 0.139 75.000 0.000 NA   NA
 217749 217750 PP2063 PP2064     FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 217750 217751 PP2064 PP2065     TRUE 0.995 -3.000 0.435 1.000 N NA
 217752 217753 PP2066 PP2067     FALSE 0.242 55.000 0.000 1.000   NA
 217753 217754 PP2067 PP2068     TRUE 0.956 -79.000 0.429 1.000   NA
 217754 217755 PP2068 PP2069     TRUE 0.901 58.000 0.600 1.000 N NA
 217755 217756 PP2069 PP2070     FALSE 0.048 101.000 0.000 1.000 N NA
 217756 217757 PP2070 PP2071     FALSE 0.027 170.000 0.000 1.000 N NA
 217757 217758 PP2071 PP2072     FALSE 0.260 109.000 0.094 1.000 N NA
 217758 217759 PP2072 PP2073     FALSE 0.363 20.000 0.000 1.000   NA
 217761 217762 PP2075 PP2076     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 217762 217763 PP2076 PP2077   lysA-1 FALSE 0.007 333.000 0.000 NA   NA
 217768 217769 PP2082 PP2083 ppsA   FALSE 0.117 102.000 0.029 NA N NA
 217769 217770 PP2083 PP2084   menG FALSE 0.113 205.000 0.113 NA N NA
 217770 217771 PP2084 PP2085 menG cmaX TRUE 0.661 25.000 0.093 NA N NA
 217771 217772 PP2085 PP2086 cmaX crfX FALSE 0.383 88.000 0.093 NA   NA
 217772 217773 PP2086 PP2087 crfX cmpX TRUE 0.977 3.000 0.256 NA   NA
 217773 217774 PP2087 PP2088 cmpX sigX TRUE 0.620 90.000 0.279 NA   NA
 217774 217775 PP2088 PP2089 sigX oprF FALSE 0.236 112.000 0.080 1.000 N NA
 217776 217777 PP2090 PP2091 cobA-1   TRUE 0.557 28.000 0.057 1.000 N NA
 217777 217778 PP2091 PP2092   nasA TRUE 0.955 10.000 0.337 1.000 N NA
 217778 217779 PP2092 PP2093 nasA nasT FALSE 0.032 161.000 0.000 1.000 N NA
 217779 217780 PP2093 PP2094 nasT   TRUE 0.888 12.000 0.218 NA N NA
 217781 217782 PP2095 PP_2096 pyrD rlmL FALSE 0.001 922.000 0.006 1.000 N NA
 217782 217783 PP_2096 PP2097 rlmL   FALSE 0.081 95.000 0.010 1.000 N NA
 217784 217785 PP2098 PP2099 dacB   FALSE 0.025 243.000 0.016 NA   NA
 217785 217786 PP2099 PP2100     FALSE 0.277 42.000 0.000 NA   NA
 217786 217787 PP2100 PP2101     TRUE 0.998 3.000 0.600 0.022 Y NA
 217787 217788 PP2101 PP2102     FALSE 0.006 275.000 0.000 1.000 N NA
 217788 217789 PP2102 PP2103     FALSE 0.110 149.000 0.024 NA   NA
 217789 217790 PP2103 PP2104     TRUE 0.971 -3.000 0.065 NA   NA
 217790 217791 PP2104 PP2105     TRUE 0.781 10.000 0.040 NA   NA
 217792 217793 PP2106 PP2107     FALSE 0.144 74.000 0.000 NA   NA
 217793 217794 PP2107 PP2108     FALSE 0.076 109.000 0.000 NA   NA
 217794 217795 PP2108 PP2109     FALSE 0.175 66.000 0.000 NA   NA
 217795 10750607 PP2109 PP_2110     FALSE 0.300 31.000 0.000 NA   NA
 217796 217797 PP2111 PP2112 aer-2 acnA FALSE 0.046 142.000 0.004 1.000 N NA
 217798 217799 PP2113 PP2114     FALSE 0.004 421.000 0.000 NA   NA
 217799 217800 PP2114 PP2115     FALSE 0.006 345.000 0.000 NA   NA
 217800 217801 PP2115 PP2116     FALSE 0.336 22.000 0.000 NA   NA
 217801 217802 PP2116 PP2117   pdxB FALSE 0.168 61.000 0.009 1.000 N NA
 217804 217805 PP2119 PP2120     FALSE 0.043 121.000 0.000 1.000 N NA
 2137344 217806 PP_t47 PP2121     FALSE 0.121 81.000 0.000 NA   NA
 217807 217808 PP2122 PP2123 moaB-1 moeA TRUE 0.988 -16.000 0.073 0.002 Y NA
 217811 217812 PP2126 PP2127     TRUE 0.993 -10.000 0.190 0.028 Y NA
 217813 217814 PP2128 PP2129 chev-2   TRUE 0.632 56.000 0.116 1.000   NA
 217818 217819 PP2133 PP2134     FALSE 0.009 304.000 0.000 NA   NA
 217821 217822 PP2136 PP2137 fadB fadA TRUE 0.976 32.000 0.607 1.000 Y NA
 217822 217823 PP2137 PP2138 fadA   FALSE 0.396 76.000 0.070 NA