MicrobesOnline Operon Predictions for Staphylococcus aureus, N315

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 102265 102266 SA0001 SA0002 dnaA dnaN TRUE 0.440 278.000 0.328 1.000 Y 0.999
 102266 102267 SA0002 SA0003 dnaN   FALSE 0.078 381.000 0.103 1.000   0.504
 102267 102268 SA0003 SA0004   recF TRUE 0.963 -3.000 0.209 1.000   NA
 102268 102269 SA0004 SA0005 recF gyrB TRUE 0.982 10.000 0.249 0.006 Y NA
 102269 102270 SA0005 SA0006 gyrB gyrA TRUE 0.978 37.000 0.306 0.002 Y 0.697
 102272 102273 SA0008 SA0009 hutH serS FALSE 0.100 379.000 0.000 0.063 N 0.878
 102273 102274 SA0009 SA0010 serS   FALSE 0.010 651.000 0.000 NA N -0.813
 102274 102275 SA0010 SAS001     TRUE 0.979 -3.000 0.338 NA   0.999
 102275 102276 SAS001 SA0011     FALSE 0.031 342.000 0.000 NA   0.638
 102276 102277 SA0011 SA0012     FALSE 0.030 236.000 0.011 NA   -0.890
 102277 102278 SA0012 SA0013     TRUE 0.811 15.000 0.039 NA   0.997
 102278 102279 SA0013 SA0014   rplI TRUE 0.871 -3.000 0.008 1.000 N -0.973
 102279 102280 SA0014 SA0015 rplI dnaC TRUE 0.585 32.000 0.064 1.000 N -0.996
 102280 102281 SA0015 SA0016 dnaC purA FALSE 0.097 278.000 0.018 1.000 N 0.986
 102281 2137100 SA0016 SAtRNA01 purA   FALSE 0.008 429.000 0.000 NA   NA
 2137100 2137101 SAtRNA01 SAtRNA02     FALSE 0.420 8.000 0.000 NA   NA
 2137101 102282 SAtRNA02 SA0017   vicR FALSE 0.007 614.000 0.000 NA   NA
 102282 102283 SA0017 SA0018 vicR vicK TRUE 0.990 13.000 0.597 0.015 Y 0.998
 102283 102284 SA0018 SA0019 vicK   TRUE 0.990 -34.000 0.575 NA   1.000
 102284 102285 SA0019 SA0020     TRUE 0.980 1.000 0.890 NA   1.000
 102285 102286 SA0020 SA0021     FALSE 0.044 389.000 0.176 NA   -0.963
 102286 102287 SA0021 SA0022     FALSE 0.091 227.000 0.000 1.000   0.969
 102287 102288 SA0022 SA0023   orfX FALSE 0.009 368.000 0.000 NA   NA
 102288 102289 SA0023 SA0024 orfX   FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 102289 102290 SA0024 SA0025     FALSE 0.032 415.000 0.000 NA   0.898
 102291 102292 SA0026 SA0027   repB FALSE 0.400 91.000 0.000 0.070   NA
 102292 102293 SA0027 SA0028 repB repB TRUE 0.944 4.000 0.000 0.004   0.983
 102293 102294 SA0028 SAS002 repB   FALSE 0.368 25.000 0.000 NA   NA
 102294 102295 SAS002 SA0029   pre FALSE 0.069 119.000 0.000 NA   NA
 102296 102297 SA0030 SA0031     FALSE 0.201 48.000 0.000 NA   NA
 102298 102299 SA0032 SA0033 bleO aadD FALSE 0.145 217.000 0.000 0.009   NA
 102299 102300 SA0033 SA0034 aadD   FALSE 0.111 193.000 0.000 1.000   1.000
 102301 2137102 SA0035 SA0036     FALSE 0.013 837.000 0.000 1.000   NA
 2137102 102303 SA0036 SA0037     TRUE 0.728 97.000 0.500 1.000 N 0.983
 102305 102306 SA0039 SA0040 mecR1 mecI TRUE 0.992 0.000 0.667 1.000 Y NA
 102306 102307 SA0040 SA0041 mecI xylR FALSE 0.178 487.000 0.000 0.047 Y -0.847
 102308 102309 SA0042 SA0043     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   -0.773
 102309 102310 SA0043 SA0044     TRUE 0.656 33.000 0.000 1.000   0.999
 102311 102312 SA0045 SA0046     TRUE 0.977 0.000 1.000 NA   NA
 102315 102316 SA0049 SA0050 ant(9) tnpC FALSE 0.046 151.000 0.000 NA   NA
 102316 102317 SA0050 SA0051 tnpC tnpB FALSE 0.429 7.000 0.000 NA   NA
 102317 102318 SA0051 SA0052 tnpB tnpA TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 102318 102319 SA0052 SA0053 tnpA radC FALSE 0.128 119.000 0.000 1.000   NA
 102319 102320 SA0053 SA0054 radC   TRUE 0.607 21.000 0.018 NA   NA
 102320 102321 SA0054 SA0055     TRUE 0.822 6.000 0.036 NA   0.700
 102321 102322 SA0055 SA0056     TRUE 0.594 87.000 0.500 NA   NA
 102322 102323 SA0056 SA0057   ccrB FALSE 0.007 518.000 0.000 NA   NA
 102323 102324 SA0057 SA0058 ccrB ccrA TRUE 0.991 22.000 1.000 0.003 Y NA
 102324 102325 SA0058 SA0059 ccrA   FALSE 0.210 234.000 0.000 NA Y -0.188
 102325 102326 SA0059 SA0060     TRUE 0.966 0.000 0.750 NA   -0.986
 102326 102327 SA0060 SA0061     FALSE 0.302 193.000 0.667 NA   NA
 102327 102328 SA0061 SA0062   tnp FALSE 0.015 251.000 0.000 NA   NA
 102328 2137103 SA0062 SA0063 tnp tnp FALSE 0.076 112.000 0.000 NA   NA
 2137103 2137104 SA0063 SA0064 tnp   TRUE 0.813 -15.000 0.000 NA   NA
 2137104 102331 SA0064 SA0065     FALSE 0.007 511.000 0.000 NA   NA
 102331 102332 SA0065 SA0066   kdpE FALSE 0.006 1064.000 0.000 1.000   -0.980
 102332 102333 SA0066 SA0067 kdpE kdpD TRUE 0.998 -25.000 1.000 1.000 Y 0.927
 2137105 102336 SA0068 SA0070 kdpA kdpB TRUE 0.975 19.000 0.012 0.003 Y -0.232
 102336 102337 SA0070 SA0071 kdpB kdpC TRUE 0.975 48.000 0.877 0.003 Y NA
 102338 102339 SA0072 SA0073     TRUE 0.943 10.000 1.000 NA   -0.572
 102341 102342 SA0074 SA0075     TRUE 0.789 63.000 1.000 NA   NA
 102342 102343 SA0075 SA0076     TRUE 0.850 45.000 1.000 NA   NA
 102344 102345 SA0077 SA0078     FALSE 0.002 599.000 0.000 NA   -0.968
 102346 102347 SA0079 SA0080     FALSE 0.039 422.000 0.000 1.000   0.998
 102347 102348 SA0080 SA0081     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   0.780
 102349 102350 SA0082 SA0083     TRUE 0.698 31.000 0.000 1.000   0.880
 102350 102351 SA0083 SA0084     TRUE 0.804 19.000 0.000 1.000   0.937
 102353 102354 SA0086 SA0087     FALSE 0.196 49.000 0.000 NA   NA
 102354 102355 SA0087 SA0088     FALSE 0.024 199.000 0.000 NA   NA
 102355 102356 SA0088 SA0089     FALSE 0.044 267.000 0.000 NA   1.000
 102356 102357 SA0089 SA0090     FALSE 0.171 57.000 0.000 NA   NA
 102357 102358 SA0090 SA0091   plc FALSE 0.023 206.000 0.000 NA   NA
 102358 102359 SA0091 SA0092 plc   FALSE 0.069 221.000 0.000 NA   0.907
 102359 102360 SA0092 SA0093     TRUE 0.460 52.000 0.000 NA   0.997
 102360 102361 SA0093 SA0094     FALSE 0.338 68.000 0.000 NA   1.000
 102361 102362 SA0094 SA0095     FALSE 0.361 65.000 0.000 NA   1.000
 102362 102363 SA0095 SA0096     FALSE 0.347 67.000 0.000 NA   1.000
 102363 102364 SA0096 SA0097     FALSE 0.243 97.000 0.000 NA   1.000
 102364 102365 SA0097 SA0098     FALSE 0.192 151.000 0.000 1.000   0.999
 102365 102366 SA0098 SA0099     TRUE 0.881 2.000 0.000 1.000   0.999
 102367 102368 SA0100 SA0101     FALSE 0.303 92.000 0.000 NA   0.952
 102368 102369 SA0101 SA0102     TRUE 0.469 57.000 0.000 NA   0.968
 102369 102370 SA0102 SA0103     FALSE 0.122 174.000 0.000 NA   0.882
 102371 102372 SA0104 SA0105     FALSE 0.028 190.000 0.000 NA   NA
 102372 102373 SA0105 SA0106   lctP FALSE 0.014 262.000 0.000 NA   NA
 102374 102375 SA0107 SA0108 spa sarH1 FALSE 0.016 421.000 0.000 1.000   NA
 102375 102376 SA0108 SA0109 sarH1 sirC FALSE 0.049 369.000 0.000 1.000   0.981
 102376 102377 SA0109 SA0110 sirC sirB TRUE 0.834 78.000 0.091 0.044 Y -0.966
 102377 102378 SA0110 SA0111 sirB sirA TRUE 0.968 16.000 0.111 1.000 Y 0.996
 102379 102380 SA0112 SA0113     TRUE 0.993 -3.000 0.333 1.000 Y -0.527
 102380 102381 SA0113 SA0114     TRUE 0.914 21.000 0.171 1.000 N 0.978
 102381 102382 SA0114 SA0115     TRUE 0.983 -7.000 0.171 1.000 N 0.959
 102382 102383 SA0115 SA0116     TRUE 0.985 -10.000 0.278 1.000 N 0.317
 102383 102384 SA0116 SA0117     TRUE 0.998 -19.000 0.172 0.001 Y 0.530
 102384 102385 SA0117 SA0118     TRUE 0.988 -28.000 0.355 1.000 N 0.133
 102385 102386 SA0118 SA0119     TRUE 0.966 0.000 0.185 1.000 N 0.615
 102386 102387 SA0119 SA0120     TRUE 0.902 4.000 0.037 1.000 N 0.916
 102387 102388 SA0120 SA0121     FALSE 0.079 196.000 0.000 NA   0.704
 102388 102389 SA0121 SA0122   butA FALSE 0.082 212.000 0.000 NA   0.961
 102391 102392 SA0123 SA0124     TRUE 0.976 -37.000 0.000 NA Y -0.997
 102392 102393 SA0124 SA0125     FALSE 0.284 210.000 0.000 NA Y 0.575
 102393 102394 SA0125 SA0126     TRUE 0.815 -19.000 0.000 NA   NA
 102394 102395 SA0126 SA0127     TRUE 0.806 -10.000 0.000 NA   NA
 102395 102396 SA0127 SA0128   sodM FALSE 0.062 268.000 0.000 1.000   0.731
 102396 102397 SA0128 SA0129 sodM   FALSE 0.046 367.000 0.000 1.000   0.876
 102399 102400 SA0131 SA0132 pnp   TRUE 0.763 7.000 0.100 1.000 N -0.995
 102400 102401 SA0132 SA0133   dra FALSE 0.227 81.000 0.013 1.000 N -0.980
 102401 102402 SA0133 SA0134 dra drm TRUE 0.741 28.000 0.000 0.061 N -0.977
 102403 102404 SA0135 SA0136     TRUE 0.998 -3.000 0.689 0.002 Y 0.611
 102404 102405 SA0136 SA0137     TRUE 0.996 2.000 0.654 0.002 Y 0.380
 102405 102406 SA0137 SA0138     TRUE 0.716 195.000 0.308 0.002 Y NA
 102407 102408 SA0139 SA0140     TRUE 0.651 51.000 0.091 NA   0.753
 102408 102409 SA0140 SA0141     FALSE 0.128 157.000 0.000 NA   1.000
 102409 102410 SA0141 SA0142     TRUE 0.905 6.000 0.182 NA   0.991
 102410 102411 SA0142 SA0143   adhE FALSE 0.049 385.000 0.000 1.000 N 0.992
 102411 102412 SA0143 SA0144 adhE capA FALSE 0.020 343.000 0.000 1.000 N -0.907
 102412 102413 SA0144 SA0145 capA capB TRUE 0.820 16.000 0.000 1.000 N 0.944
 102413 102414 SA0145 SA0146 capB capC TRUE 0.863 3.000 0.000 1.000 N 1.000
 102414 102415 SA0146 SA0147 capC capD TRUE 0.984 20.000 0.667 1.000 Y 0.997
 102415 102416 SA0147 SA0148 capD capE TRUE 0.997 -10.000 1.000 0.019   0.923
 102416 102417 SA0148 SA0149 capE capF TRUE 0.828 13.000 0.019 1.000   0.983
 102417 102418 SA0149 SA0150 capF capG TRUE 0.993 4.000 0.477 0.004 Y 0.861
 102418 102419 SA0150 SA0151 capG capH TRUE 0.894 3.000 0.005 1.000   0.931
 102419 102420 SA0151 SA0152 capH capI TRUE 0.836 5.000 0.002 1.000   0.754
 102420 102421 SA0152 SA0153 capI capJ TRUE 0.929 14.000 0.000 NA Y 0.992
 102421 102422 SA0153 SA0154 capJ capK TRUE 0.923 -7.000 0.000 NA   0.664
 102422 102423 SA0154 SA0155 capK capL TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   0.546
 102423 102424 SA0155 SA0156 capL capM TRUE 0.947 11.000 0.015 NA Y 0.950
 102424 102425 SA0156 SA0157 capM capN TRUE 0.991 0.000 0.297 NA Y 0.996
 102425 102426 SA0157 SA0158 capN capO TRUE 0.866 54.000 0.009 1.000 Y 0.981
 102426 102427 SA0158 SA0159 capO capP TRUE 0.912 47.000 0.105 1.000 Y 0.996
 102428 102429 SA0160 SA0161     TRUE 0.759 7.000 0.000 NA   0.942
 102430 102431 SA0162 SA0163 aldA   FALSE 0.029 647.000 0.000 1.000 N 0.259
 102432 102433 SAS005 SA0164     FALSE 0.321 30.000 0.000 NA   NA
 102434 102435 SA0165 SA0166     FALSE 0.012 342.000 0.000 NA   -0.818
 102435 102436 SA0166 SA0167     TRUE 0.958 14.000 0.130 NA Y 0.838
 102436 102437 SA0167 SA0168     TRUE 0.995 -3.000 0.652 NA Y 0.473
 102437 102438 SA0168 SA0169     TRUE 0.804 13.000 0.032 1.000 N 0.132
 102438 102439 SA0169 SA0170     FALSE 0.068 226.000 0.000 NA   0.927
 102439 102440 SA0170 SA0171   fdh FALSE 0.252 75.000 0.000 NA   0.206
 102440 102441 SA0171 SA0172 fdh   FALSE 0.037 386.000 0.000 1.000   0.596
 102441 102442 SA0172 SA0173     FALSE 0.019 447.000 0.049 1.000   -0.998
 102442 102443 SA0173 SA0174     TRUE 0.914 13.000 0.333 1.000 N 0.102
 102444 102445 SA0175 SA0176     FALSE 0.036 255.000 0.000 NA   0.177
 102445 102446 SA0176 SA0177   argJ TRUE 0.975 16.000 0.008 0.004 Y 0.131
 102446 102447 SA0177 SA0178 argJ argC TRUE 0.988 12.000 0.303 0.004 Y 0.989
 102447 102448 SA0178 SA0179 argC   TRUE 0.863 39.000 0.004 1.000 Y -0.591
 102448 102449 SA0179 SA0180     FALSE 0.136 259.000 0.000 1.000 Y -1.000
 102449 102450 SA0180 SA0181     FALSE 0.039 279.000 0.000 1.000 N -0.573
 102450 102451 SA0181 SA0182     FALSE 0.254 127.000 0.000 1.000 N 1.000
 102451 102452 SA0182 SA0183   glcA FALSE 0.256 273.000 0.000 1.000 Y 0.950
 102453 102454 SA0184 SA0185     TRUE 0.977 -3.000 0.234 1.000   0.590
 102454 102455 SA0185 SA0186     TRUE 0.887 12.000 0.250 1.000   -0.522
 102455 102456 SA0186 SA0187     TRUE 0.911 3.000 0.100 1.000 N -0.332
 102460 102461 SA0191 SA0192     TRUE 0.980 -3.000 0.652 NA N NA
 102461 102462 SA0192 SA0193     TRUE 0.995 -3.000 0.372 1.000 Y 0.944
 102462 102463 SA0193 SA0194     FALSE 0.022 207.000 0.000 NA   NA
 102463 102464 SA0194 SA0195     FALSE 0.247 38.000 0.000 NA   NA
 102464 102465 SA0195 SA0196     FALSE 0.370 59.000 0.000 NA   0.507
 102465 102466 SA0196 SA0197     TRUE 0.725 12.000 0.000 NA   0.906
 102466 102467 SA0197 SAS006     TRUE 0.811 -13.000 0.000 NA   NA
 102469 102470 SA0199 SA0200 oppB   TRUE 0.992 6.000 0.833 0.044 Y 0.476
 102470 102471 SA0200 SA0201   rlp TRUE 0.979 17.000 0.833 0.044   0.989
 102471 102472 SA0201 SA0202 rlp   TRUE 0.625 38.000 0.000 1.000   0.856
 102473 102474 SA0203 SA0204   acpD FALSE 0.079 189.000 0.000 NA   0.472
 102475 102476 SA0205 SA0206   msmX FALSE 0.035 384.000 0.000 1.000   0.456
 102476 102477 SA0206 SA0207 msmX   TRUE 0.921 13.000 0.000 1.000 Y -0.267
 102477 102478 SA0207 SA0208     TRUE 0.992 3.000 0.800 1.000 Y 0.882
 102478 102479 SA0208 SA0209     TRUE 0.996 2.000 0.909 0.044 Y 0.141
 102479 102480 SA0209 SA0210     FALSE 0.415 71.000 0.000 1.000   0.774
 102480 102481 SA0210 SA0211     TRUE 0.874 25.000 0.000 0.027   0.700
 102481 102482 SA0211 SA0212     TRUE 0.595 55.000 0.111 NA   0.025
 102485 102486 SA0215 SA0216     TRUE 0.989 -7.000 0.167 0.014   0.187
 102486 102487 SA0216 SA0217     TRUE 0.976 -3.000 0.167 1.000 N 0.829
 102488 102489 SA0218 SA0219 pflB pflA TRUE 0.890 23.000 0.135 1.000 N 0.996
 102489 102490 SA0219 SA0220 pflA   FALSE 0.052 322.000 0.000 1.000 N 1.000
 102493 102494 SA0223 SA0224     TRUE 0.976 30.000 0.588 1.000 Y 0.897
 102494 102495 SA0224 SA0225     TRUE 0.463 186.000 0.012 1.000 Y 0.997
 102495 102496 SA0225 SA0226     TRUE 0.733 112.000 0.046 1.000 Y 0.995
 102496 102497 SA0226 SA0227     TRUE 0.968 26.000 0.046 0.071 Y 0.835
 102499 102500 SA0229 SA0230     FALSE 0.024 198.000 0.000 NA   NA
 102500 102501 SA0230 SAS007     FALSE 0.043 157.000 0.000 NA   NA
 102501 102502 SAS007 SA0231     TRUE 0.900 26.000 0.667 NA   NA
 102505 102506 SA0234 SA0235     FALSE 0.058 337.000 0.000 1.000 N 0.928
 102506 102507 SA0235 SA0236     TRUE 0.993 -15.000 0.308 0.015 N 0.197
 102507 102508 SA0236 SA0237     TRUE 0.973 23.000 0.148 0.012 Y -0.934
 102508 102509 SA0237 SA0238   gatC TRUE 0.523 227.000 0.148 0.012 Y -0.816
 102509 102510 SA0238 SA0239 gatC   TRUE 0.901 18.000 0.103 1.000 N 0.871
 102510 102511 SA0239 SAS008     TRUE 0.920 2.000 0.103 NA   0.510
 102511 102512 SAS008 SA0240     TRUE 0.876 24.000 0.158 NA   0.969
 102512 102513 SA0240 SA0241   ispD FALSE 0.043 528.000 0.000 1.000 N 0.972
 102513 102514 SA0241 SA0242 ispD   TRUE 0.988 -7.000 0.367 1.000 N 0.986
 102514 102515 SA0242 SA0243     TRUE 0.903 22.000 0.148 1.000 N 0.929
 102515 102516 SA0243 SA0244     FALSE 0.219 428.000 0.000 0.003 Y -0.953
 102516 102517 SA0244 SA0245   ispD FALSE 0.009 276.000 0.000 1.000 N -0.999
 102517 102518 SA0245 SA0246 ispD   TRUE 0.988 -7.000 0.367 1.000 N 0.988
 102518 102519 SA0246 SA0247     TRUE 0.764 22.000 0.148 1.000 N -1.000
 102519 102520 SA0247 SA0248     TRUE 0.650 33.000 0.125 NA   -0.903
 102520 102521 SA0248 SA0249   scdA FALSE 0.150 144.000 0.000 NA   1.000
 102521 102522 SA0249 SA0250 scdA lytS FALSE 0.068 245.000 0.000 NA N 0.975
 102522 102523 SA0250 SA0251 lytS lytR TRUE 0.995 3.000 0.538 0.014 Y 0.948
 102523 102524 SA0251 SA0252 lytR lrgA TRUE 0.491 119.000 0.178 1.000   1.000
 102524 102525 SA0252 SA0253 lrgA lrgB TRUE 0.992 -7.000 0.869 1.000   0.686
 102527 102528 SA0255 SA0256   bglA TRUE 0.949 16.000 0.000 1.000 Y 0.946
 102529 102530 SA0257 SA0258   rbsK FALSE 0.086 251.000 0.000 1.000 N 0.960
 102530 102531 SA0258 SA0259 rbsK rbsD TRUE 0.944 28.000 0.030 1.000 Y 0.926
 102531 102532 SA0259 SA0260 rbsD   TRUE 0.982 15.000 0.045 0.002 Y 0.978
 102532 102533 SA0260 SA0261     FALSE 0.064 232.000 0.000 1.000 N 0.078
 102536 102537 SA0264 SA0265   lytM FALSE 0.020 326.000 0.000 1.000   NA
 102538 102539 SA0266 SA0267     TRUE 0.943 14.000 0.833 NA   1.000
 102539 102540 SA0267 SA0268     TRUE 0.985 -3.000 0.571 NA   0.995
 102540 102541 SA0268 SA0269     TRUE 0.739 68.000 0.429 NA   0.999
 102541 102542 SA0269 SA0270     FALSE 0.040 331.000 0.000 NA   0.992
 102543 102544 SA0271 SA0272     FALSE 0.133 83.000 0.041 NA   -0.997
 102544 102545 SA0272 SA0273     TRUE 0.970 0.000 0.286 NA   0.955
 102545 102546 SA0273 SA0274     TRUE 0.972 -28.000 0.237 NA   NA
 102546 102547 SA0274 SA0275     TRUE 0.919 13.000 0.833 NA   NA
 102547 102548 SA0275 SA0276     TRUE 0.908 22.000 0.623 NA   NA
 102548 102549 SA0276 SA0277     TRUE 0.657 30.000 0.000 NA   0.916
 102549 102550 SA0277 SA0278     TRUE 0.755 16.000 0.000 NA   0.938
 102550 102551 SA0278 SA0279     TRUE 0.902 -3.000 0.000 NA   0.642
 102551 102552 SA0279 SA0280     TRUE 0.898 0.000 0.000 NA   0.959
 102552 102553 SA0280 SA0281     TRUE 0.742 10.000 0.000 NA   0.924
 102553 102554 SA0281 SA0282     TRUE 0.742 11.000 0.000 NA   0.981
 102554 102555 SA0282 SA0283     FALSE 0.073 203.000 0.000 NA   1.000
 102555 102556 SA0283 SA0284     FALSE 0.147 146.000 0.000 NA   1.000
 102556 102557 SA0284 SA0285     FALSE 0.009 135.000 0.000 NA   -0.976
 102557 102558 SA0285 SA0286     FALSE 0.047 132.000 0.000 NA   -0.907
 102558 102559 SA0286 SA0287     TRUE 0.914 11.000 0.286 NA   0.988
 102559 102560 SA0287 SA0288     TRUE 0.904 11.000 0.286 NA   1.000
 102560 102561 SA0288 SA0289     TRUE 0.777 49.000 0.286 NA   0.999
 102561 102562 SA0289 SA0290     TRUE 0.916 11.000 0.286 NA   0.958
 102562 102563 SA0290 SA0291     FALSE 0.001 625.000 0.000 NA   -0.985
 102563 102564 SA0291 SA0292     FALSE 0.151 150.000 0.000 NA   0.999
 102565 102566 SA0293 SA0294     FALSE 0.037 237.000 0.000 1.000 N -0.855
 102567 102568 SA0295 SA0296     FALSE 0.020 249.000 0.000 1.000   -0.951
 102568 102569 SA0296 SA0297     TRUE 0.932 13.000 0.333 1.000 N 0.955
 102569 102570 SA0297 SA0298     FALSE 0.003 208.000 0.000 NA N -1.000
 102570 102571 SA0298 SA0299     FALSE 0.149 343.000 0.000 NA Y 0.401
 102571 102572 SA0299 SA0300     FALSE 0.074 115.000 0.000 NA   NA
 102572 102573 SA0300 SA0301     TRUE 0.949 -25.000 0.085 NA   NA
 102573 102574 SA0301 SA0302     TRUE 0.731 11.000 0.008 NA N 0.127
 102575 102576 SA0303 SA0304   nanA TRUE 0.930 40.000 0.130 1.000 Y 0.992
 102582 102583 SA0310 SA0311     TRUE 0.495 73.000 0.000 0.069 N NA
 102584 102585 SA0312 SA0313     TRUE 0.888 34.000 0.571 1.000 N -0.442
 102585 102586 SA0313 SA0314     TRUE 0.854 1.000 0.107 NA   -0.973
 102586 102587 SA0314 SA0315     TRUE 0.982 -13.000 0.286 NA   0.490
 102587 102588 SA0315 SA0316     TRUE 0.986 -22.000 0.250 1.000 N 0.556
 102588 102589 SA0316 SA0317     FALSE 0.043 316.000 0.000 1.000 N 0.131
 102590 102591 SA0318 SA0319 ulaA   TRUE 0.932 15.000 0.182 0.012   NA
 102591 102592 SA0319 SA0320     TRUE 0.985 2.000 0.026 0.012 Y NA
 102592 102593 SA0320 SA0321     TRUE 0.948 5.000 0.182 0.015 N NA
 102594 102595 SA0322 SA0323     TRUE 0.717 107.000 0.800 1.000 N 0.364
 102595 102596 SA0323 SA0324     FALSE 0.082 104.000 0.000 NA   NA
 102598 102599 SA0326 SA0327     TRUE 0.754 14.000 0.000 1.000   0.999
 102599 102600 SA0327 SA0328     TRUE 0.894 14.000 0.259 1.000   -0.077
 102602 102603 SA0330 SA0331     FALSE 0.016 267.000 0.000 NA N -0.895
 102603 102604 SA0331 SA0332     TRUE 0.878 111.000 0.812 NA Y 0.908
 102604 102605 SA0332 SA0333     TRUE 0.994 -22.000 0.119 NA Y 0.995
 102606 102607 SA0334 SA0335     TRUE 0.908 56.000 0.393 NA Y -0.288
 102607 102608 SA0335 SA0336     FALSE 0.252 108.000 0.000 NA   0.993
 102609 102610 SA0337 SA0338     TRUE 0.981 -3.000 0.362 NA   0.958
 102610 102611 SA0338 SA0339     TRUE 0.822 25.000 0.143 NA   0.082
 102611 102612 SA0339 SA0340     TRUE 0.978 0.000 0.371 1.000   0.921
 102615 102616 SA0343 SA0344   metE TRUE 0.573 43.000 0.011 NA   0.678
 102616 102617 SA0344 SA0345 metE   TRUE 0.989 -3.000 0.030 1.000 Y 0.989
 102617 102618 SA0345 SA0346     TRUE 0.995 -31.000 0.162 1.000 Y 0.930
 102618 102619 SA0346 SA0347     TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.006 Y 0.999
 102620 102621 SA0348 SA0349     FALSE 0.255 154.000 0.007 1.000 N 0.991
 102621 102622 SA0349 SA0350     TRUE 0.842 30.000 0.171 NA   0.997
 102622 102623 SA0350 SA0351     TRUE 0.825 12.000 0.064 NA   0.999
 102625 102626 SA0352 SA0353 rpsF ssb TRUE 0.695 21.000 0.007 1.000 N NA
 102626 102627 SA0353 SA0354 ssb rpsR FALSE 0.251 52.000 0.007 1.000 N -0.999
 102628 102629 SA0355 SA0356     FALSE 0.029 52.000 0.000 NA   -0.983
 102630 102631 SA0357 SA0358     FALSE 0.034 369.000 0.000 NA   0.995
 102631 102632 SA0358 SA0359     FALSE 0.119 181.000 0.000 NA   0.982
 102637 102638 SA0362 SA0363     FALSE 0.014 270.000 0.000 NA   NA
 102638 102639 SA0363 SA0364     FALSE 0.355 73.000 0.000 NA   0.993
 102639 102640 SA0364 SA0365   ahpF FALSE 0.121 180.000 0.000 NA   0.983
 102640 102641 SA0365 SA0366 ahpF ahpC TRUE 0.983 16.000 0.551 1.000 Y 0.999
 102645 102646 SA0370 SA0371     TRUE 0.662 118.000 0.857 NA   0.430
 102646 102647 SA0371 SA0372     TRUE 0.578 143.000 0.857 NA   0.306
 102648 102649 SA0373 SA0374 xprT pbuX TRUE 0.970 0.000 0.037 1.000 Y -0.998
 102649 102650 SA0374 SA0375 pbuX guaB TRUE 0.922 38.000 1.000 1.000   0.999
 102650 102651 SA0375 SA0376 guaB guaA TRUE 0.852 25.000 0.007 0.001   -1.000
 102652 102653 SA0377 SA0378     FALSE 0.019 392.000 0.000 NA   -0.120
 102653 102654 SA0378 SA0379     FALSE 0.052 399.000 0.000 0.066   NA
 102654 102655 SA0379 SAS012     FALSE 0.016 237.000 0.000 NA   NA
 102655 102656 SAS012 SA0380     FALSE 0.007 532.000 0.000 NA   NA
 102656 102657 SA0380 SA0381     FALSE 0.309 19.000 0.000 NA   -0.934
 102658 102659 SA0382 SA0383 set6 set7 FALSE 0.134 286.000 0.000 0.020   0.751
 102659 102660 SA0383 SA0384 set7 set8 FALSE 0.108 291.000 0.000 0.020   -0.163
 102660 102661 SA0384 SA0385 set8 set9 FALSE 0.092 364.000 0.000 0.020   0.197
 102661 102662 SA0385 SEt10 set9 set10 FALSE 0.090 364.000 0.000 0.020   0.074
 102662 102663 SEt10 SEt11 set10 set11 FALSE 0.067 446.000 0.000 0.020   -0.550
 102663 102664 SEt11 SEt12 set11 set12 FALSE 0.059 339.000 0.000 0.020   -0.972
 102664 102665 SEt12 SEt13 set12 set13 FALSE 0.089 377.000 0.000 0.020   0.231
 102665 102666 SEt13 SEt14 set13 set14 FALSE 0.071 366.000 0.000 0.020   -0.794
 102666 102667 SEt14 SAS013 set14   FALSE 0.190 53.000 0.000 NA   -0.852
 102667 102668 SAS013 SA0391   hsdM FALSE 0.309 53.000 0.000 NA   -0.307
 102668 102669 SA0391 SA0392 hsdM hsdS TRUE 0.997 -7.000 0.083 0.002 Y 0.963
 102669 102670 SA0392 SEt15 hsdS set15 FALSE 0.019 383.000 0.000 1.000   -0.819
 102670 102671 SEt15 SA0394 set15   TRUE 0.674 22.000 0.000 1.000   -0.269
 102673 102674 SA0396 SA0397 lpl1 lpl2 TRUE 0.467 31.000 0.000 NA   -0.314
 102674 102675 SA0397 SA0398 lpl2 lpl3 TRUE 0.512 45.000 0.000 NA   0.877
 102675 102676 SA0398 SA0399 lpl3   FALSE 0.025 324.000 0.000 NA   0.126
 102676 102677 SA0399 SA0400   lpl4 FALSE 0.423 61.000 0.000 NA   0.881
 102677 102678 SA0400 SA0401 lpl4 lpl5 TRUE 0.754 19.000 0.000 NA   0.939
 102678 102679 SA0401 SA0402 lpl5 lpl6 FALSE 0.093 57.000 0.000 NA   -0.947
 102679 102680 SA0402 SA0403 lpl6 lpl7 FALSE 0.339 52.000 0.000 NA   -0.094
 102680 102681 SA0403 SA0404 lpl7 lpl8 TRUE 0.649 19.000 0.000 NA   0.172
 102681 102682 SA0404 SA0405 lpl8 lpl9 FALSE 0.033 179.000 0.000 NA   NA
 102682 102683 SA0405 SA0406 lpl9   TRUE 0.806 -10.000 0.000 NA   NA
 102683 102684 SA0406 SA0407     TRUE 0.921 -3.000 0.000 NA   0.912
 102684 102685 SA0407 SA0408     TRUE 0.754 19.000 0.000 NA   0.983
 102689 102690 SA0411 SA0412 ndhF   TRUE 0.903 13.000 0.303 NA   0.999
 102690 102691 SA0412 SA0413     FALSE 0.232 162.000 0.076 NA   1.000
 102693 102694 SA0415 SA0416     TRUE 0.849 37.000 0.273 1.000   0.763
 102694 102695 SA0416 SA0417     FALSE 0.043 369.000 0.000 1.000   0.774
 102695 102696 SA0417 SA0418   cysM FALSE 0.029 217.000 0.024 1.000   -1.000
 102696 102697 SA0418 SA0419 cysM metB TRUE 0.998 -7.000 0.690 0.019 Y 0.995
 102697 102698 SA0419 SA0420 metB   FALSE 0.062 295.000 0.000 1.000 N 0.997
 102698 102699 SA0420 SA0421     TRUE 0.987 4.000 0.487 1.000 Y 0.995
 102699 102700 SA0421 SA0422     TRUE 0.877 37.000 0.000 NA Y 0.990
 102700 102701 SA0422 SA0423     FALSE 0.040 332.000 0.000 NA   0.989
 102703 102704 SA0425 SA0426     TRUE 0.980 -10.000 0.150 1.000   0.702
 102705 102706 SA0427 SA0428     TRUE 0.982 -3.000 0.957 NA   -0.943
 102706 102707 SA0428 SA0429   gltC FALSE 0.380 121.000 0.106 NA   0.789
 102708 102709 SA0430 SA0431 gltB gltD TRUE 0.985 18.000 0.222 0.002 Y NA
 102709 2137106 SA0431 SAtRNA03 gltD   FALSE 0.014 269.000 0.000 NA   NA
 2137106 102710 SAtRNA03 SA0432   treP FALSE 0.008 469.000 0.000 NA   NA
 102710 102711 SA0432 SA0433 treP   TRUE 0.889 64.000 0.650 1.000 Y -1.000
 102711 102712 SA0433 SA0434     TRUE 0.919 25.000 0.336 1.000 N 0.616
 102712 102713 SA0434 SA0435     FALSE 0.031 643.000 0.000 1.000   0.685
 102713 102714 SA0435 SA0436   dnaX TRUE 0.627 69.000 0.103 1.000   0.992
 102714 102715 SA0436 SA0437 dnaX   TRUE 0.441 90.000 0.071 NA   0.776
 102715 102716 SA0437 SA0438   recR TRUE 0.934 7.000 0.604 NA   -0.084
 102716 2137107 SA0438 SArRNA01 recR   FALSE 0.007 860.000 0.000 NA   NA
 2137107 2137108 SArRNA01 SAtRNA04     FALSE 0.096 90.000 0.000 NA   NA
 2137108 2137109 SAtRNA04 SAtRNA05     FALSE 0.424 19.000 0.000 NA   NA
 2137109 2137110 SAtRNA05 SArRNA02     FALSE 0.020 214.000 0.000 NA   NA
 2137110 2137111 SArRNA02 SArRNA03     FALSE 0.123 73.000 0.000 NA   NA
 2137111 102717 SArRNA03 SA0439     FALSE 0.007 903.000 0.000 NA   NA
 102717 102718 SA0439 SA0440   tmk TRUE 0.851 2.000 0.010 1.000 N -0.819
 102718 102719 SA0440 SA0441 tmk   TRUE 0.684 28.000 0.038 NA   -0.314
 102719 102720 SA0441 SA0442   holB FALSE 0.061 214.000 0.021 NA   -0.554
 102720 102721 SA0442 SA0443 holB   FALSE 0.397 169.000 0.372 NA   0.758
 102721 102722 SA0443 SA0444     TRUE 0.957 -4.000 0.183 NA   -0.866
 102722 102723 SA0444 SA0445     FALSE 0.148 274.000 0.193 NA   0.970
 102723 102724 SA0445 SA0446     TRUE 0.984 -7.000 0.209 1.000   0.964
 102724 102725 SA0446 SA0447     TRUE 0.928 2.000 0.041 1.000   0.993
 102725 102726 SA0447 SA0448   metS FALSE 0.040 285.000 0.018 1.000   NA
 102726 102727 SA0448 SA0449 metS   TRUE 0.781 31.000 0.221 NA N NA
 102727 102728 SA0449 SA0450     TRUE 0.516 167.000 0.058 NA Y 0.477
 102728 102729 SA0450 SA0451   ksgA TRUE 0.819 11.000 0.093 1.000 N -0.818
 102729 102730 SA0451 SA0452 ksgA veg FALSE 0.347 100.000 0.035 NA   1.000
 102730 102731 SA0452 SA0453 veg   FALSE 0.043 310.000 0.046 NA   -0.587
 102731 102732 SA0453 SA0454   purR TRUE 0.868 14.000 0.062 1.000 N 0.918
 102732 102733 SA0454 SA0455 purR   TRUE 0.866 17.000 0.227 NA N NA
 102733 102734 SA0455 SA0456   spoVG TRUE 0.456 72.000 0.131 NA N NA
 102734 102735 SA0456 SA0457 spoVG gcaD FALSE 0.209 365.000 0.003 1.000 Y 0.988
 102735 102736 SA0457 SA0458 gcaD prs FALSE 0.336 147.000 0.069 1.000 N 0.745
 102736 102737 SA0458 SA0459 prs rplY FALSE 0.157 150.000 0.027 1.000 N -0.929
 102737 102738 SA0459 SA0460 rplY pth TRUE 0.471 311.000 0.496 0.034 Y -0.966
 102738 102739 SA0460 SA0461 pth mfd TRUE 0.963 0.000 0.137 1.000 N 0.999
 102739 102740 SA0461 SA0462 mfd   TRUE 0.968 -10.000 0.033 1.000   1.000
 102740 102741 SA0462 SA0463     TRUE 0.949 0.000 0.058 1.000   0.998
 102741 102742 SA0463 SA0464     TRUE 0.965 -3.000 0.054 1.000   0.985
 102742 102743 SA0464 SA0465     TRUE 0.872 18.000 0.053 1.000 N 1.000
 102743 102744 SA0465 SA0466     TRUE 0.444 105.000 0.134 1.000 N -0.510
 102744 102745 SA0466 SA0467     FALSE 0.065 180.000 0.031 1.000 N -1.000
 102745 102746 SA0467 SA0468     TRUE 0.918 5.000 0.067 0.057 N -0.803
 102746 102747 SA0468 SA0469   ftsH FALSE 0.147 257.000 0.192 1.000 N -0.238
 102747 102748 SA0469 SA0470 ftsH   FALSE 0.314 228.000 0.041 1.000 Y -0.135
 102748 102749 SA0470 SA0471   cysK FALSE 0.230 179.000 0.053 1.000 N 1.000
 102749 102750 SA0471 SA0472 cysK folP FALSE 0.126 216.000 0.005 1.000 N 0.988
 102750 102751 SA0472 SA0473 folP folB TRUE 0.993 -22.000 0.024 1.000 Y 0.952
 102751 102752 SA0473 SA0474 folB folK TRUE 0.992 -3.000 0.142 1.000 Y 0.981
 102752 102753 SA0474 SA0475 folK lysS FALSE 0.036 539.000 0.000 1.000 N 0.743
 102753 2137112 SA0475 SArRNA04 lysS   FALSE 0.007 558.000 0.000 NA   NA
 2137112 2137113 SArRNA04 SAtRNA06     FALSE 0.384 13.000 0.000 NA   NA
 2137113 2137114 SAtRNA06 SAtRNA07     TRUE 0.438 17.000 0.000 NA   NA
 2137114 2137115 SAtRNA07 SAtRNA08     FALSE 0.429 7.000 0.000 NA   NA
 2137115 2137116 SAtRNA08 SAtRNA09     FALSE 0.272 34.000 0.000 NA   NA
 2137116 2137117 SAtRNA09 SAtRNA10     FALSE 0.420 8.000 0.000 NA   NA
 2137117 2137118 SAtRNA10 SAtRNA11     TRUE 0.443 6.000 0.000 NA   NA
 2137118 2137119 SAtRNA11 SAtRNA12     FALSE 0.405 21.000 0.000 NA   NA
 2137119 2137120 SAtRNA12 SAtRNA13     FALSE 0.377 24.000 0.000 NA   NA
 2137120 2137121 SAtRNA13 SArRNA05     FALSE 0.067 121.000 0.000 NA   NA
 2137121 2137122 SArRNA05 SAtRNA14     FALSE 0.092 93.000 0.000 NA   NA
 2137122 2137123 SAtRNA14 SArRNA06     FALSE 0.038 168.000 0.000 NA   NA
 2137123 2137124 SArRNA06 SArRNA07     FALSE 0.123 73.000 0.000 NA   NA
 102755 102756 SA0477 SA0478     TRUE 0.985 4.000 0.488 NA Y 0.998
 102758 102759 SA0480 SA0481 ctsR   TRUE 0.946 19.000 0.681 NA   1.000
 102759 102760 SA0481 SA0482     TRUE 0.993 -10.000 0.848 1.000   0.998
 102760 102761 SA0482 SA0483   clpC TRUE 0.938 14.000 0.425 1.000 N 0.989
 102761 102762 SA0483 SA0484 clpC radA FALSE 0.331 485.000 0.062 0.012 Y 0.691
 102762 102763 SA0484 SA0485 radA   TRUE 0.782 25.000 0.056 NA   0.544
 102763 102764 SA0485 SA0486   gltX FALSE 0.016 557.000 0.021 NA   -0.865
 102764 102765 SA0486 SA0487 gltX cysE FALSE 0.044 429.000 0.008 1.000 N 0.304
 102765 102766 SA0487 SA0488 cysE cysS TRUE 0.984 -16.000 0.039 0.057 N -0.106
 102766 102767 SA0488 SA0489 cysS   TRUE 0.962 -7.000 0.129 1.000   NA
 102767 102768 SA0489 SA0490     TRUE 0.937 8.000 0.150 0.004   NA
 102768 102769 SA0490 SA0491     TRUE 0.907 0.000 0.109 NA   NA
 102769 102770 SA0491 SA0492     TRUE 0.455 81.000 0.036 NA   0.979
 102770 102771 SA0492 SA0493   secE FALSE 0.064 314.000 0.000 1.000 N 0.971
 102771 102772 SA0493 SA0494 secE nusG TRUE 0.959 13.000 0.843 1.000 N 0.971
 102772 102773 SA0494 SAS015 nusG   FALSE 0.054 138.000 0.000 NA   NA
 102773 102774 SAS015 SA0495   rplK TRUE 0.788 -7.000 0.000 NA   NA
 102774 102775 SA0495 SA0496 rplK rplA TRUE 0.729 208.000 0.838 0.029 Y NA
 102775 102776 SA0496 SA0497 rplA rplJ TRUE 0.558 272.000 0.302 0.029 Y 0.379
 102776 102777 SA0497 SA0498 rplJ rplL TRUE 0.980 43.000 0.884 0.022 Y 0.406
 102777 102778 SA0498 SA0499 rplL   TRUE 0.435 175.000 0.050 1.000 Y -0.885
 102778 102779 SA0499 SA0500   rpoB FALSE 0.049 215.000 0.008 1.000 N -0.956
 102779 102780 SA0500 SA0501 rpoB rpoC TRUE 0.930 137.000 0.851 0.002 Y 0.994
 102780 102781 SA0501 SA0502 rpoC   FALSE 0.195 137.000 0.065 NA N -0.857
 102781 102782 SA0502 SA0503   rpsL TRUE 0.777 98.000 0.239 NA Y -0.402
 102782 102783 SA0503 SA0504 rpsL rpsG TRUE 0.949 66.000 0.224 0.004 Y 0.893
 102783 102784 SA0504 SA0505 rpsG fus TRUE 0.814 123.000 0.579 1.000 Y -0.599
 102784 102785 SA0505 SA0506 fus tuf TRUE 0.677 217.000 0.400 0.002 Y NA
 102787 102788 SA0508 SA0509     FALSE 0.002 270.000 0.000 NA   -0.991
 102788 102789 SA0509 SA0510   araB FALSE 0.006 159.000 0.000 NA   -0.997
 102789 102790 SA0510 SA0511 araB   FALSE 0.110 214.000 0.000 1.000 N 0.941
 102790 102791 SA0511 SA0512   ilvE FALSE 0.027 336.000 0.000 1.000 N -0.745
 102791 102792 SA0512 SA0513 ilvE   FALSE 0.065 250.000 0.000 1.000   1.000
 102793 102794 SA0514 SA0515     TRUE 0.997 -7.000 0.255 0.001 Y -0.589
 102795 102796 SA0516 SA0517     TRUE 0.464 147.000 0.013 0.020   0.992
 102796 102797 SA0517 SA0518     TRUE 0.897 22.000 0.159 1.000   0.871
 102797 102798 SA0518 SA0519   sdrC FALSE 0.041 429.000 0.000 1.000   0.994
 102798 102799 SA0519 SA0520 sdrC sdrD FALSE 0.124 367.000 0.000 0.004   0.753
 102799 102800 SA0520 SA0521 sdrD sdrE FALSE 0.115 394.000 0.000 0.004   0.745
 102800 102801 SA0521 SA0522 sdrE   FALSE 0.124 121.000 0.000 1.000   NA
 102802 102803 SA0523 SA0524     FALSE 0.059 282.000 0.000 1.000   0.998
 102803 102804 SA0524 SA0525     TRUE 0.742 13.000 0.026 NA   0.298
 102804 102805 SA0525 SA0526     TRUE 0.938 14.000 0.644 NA   0.996
 102806 102807 SA0527 SA0528 nagB   TRUE 0.876 77.000 0.600 1.000 Y -0.919
 102807 102808 SA0528 SA0529     TRUE 0.979 2.000 0.667 1.000 N 0.995
 102808 102809 SA0529 SA0530     FALSE 0.029 113.000 0.000 1.000   -0.999
 102809 102810 SA0530 SA0531   proP FALSE 0.002 502.000 0.000 1.000   -1.000
 102810 102811 SA0531 SA0532 proP   FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 102811 102812 SA0532 SA0533   vraA TRUE 0.674 0.000 0.000 NA   NA
 102812 102813 SA0533 SA0534 vraA vraB TRUE 0.992 2.000 0.576 1.000 Y 0.931
 102813 102814 SA0534 SA0535 vraB vraC TRUE 0.968 -25.000 0.101 NA   0.162
 102814 102815 SA0535 SA0536 vraC   TRUE 0.962 3.000 0.500 NA   0.836
 102816 102817 SAS016 SA0537     FALSE 0.007 507.000 0.000 NA   NA
 102818 102819 SA0538 SA0539 ung   TRUE 0.977 1.000 0.800 NA   0.528
 102819 102820 SA0539 SA0540     FALSE 0.192 133.000 0.024 NA   -0.189
 102820 102821 SA0540 SA0541     FALSE 0.309 121.000 0.021 NA   0.977
 102822 102823 SA0542 SA0543     TRUE 0.944 13.000 1.000 NA   0.275
 102823 102824 SA0543 SA0544     FALSE 0.008 663.000 0.000 NA   -0.841
 102825 102826 SA0545 SA0546 pta   TRUE 0.938 3.000 0.123 1.000 N 0.998
 102826 102827 SA0546 SA0547   mvaK1 FALSE 0.034 668.000 0.000 1.000 N 0.702
 102827 102828 SA0547 SA0548 mvaK1 mvaD TRUE 0.987 5.000 0.281 0.004 Y -0.657
 102828 102829 SA0548 SA0549 mvaD mvaK2 TRUE 0.988 13.000 0.312 0.004 Y 0.920
 102829 102830 SA0549 SA0550 mvaK2   FALSE 0.099 177.000 0.030 NA   -0.717
 102831 102832 SA0551 SA0552     TRUE 0.970 -139.000 0.103 NA N 0.076
 102833 102834 SA0553 SA0554     TRUE 0.555 4.000 0.000 NA   -0.792
 102834 102835 SA0554 SA0555     TRUE 0.462 47.000 0.000 NA   1.000
 102835 102836 SA0555 SA0556     FALSE 0.053 140.000 0.000 NA   NA
 102836 102837 SA0556 SA0557     FALSE 0.008 448.000 0.000 NA   NA
 102837 102838 SA0557 SA0558     FALSE 0.037 446.000 0.071 NA   -0.539
 102838 102839 SA0558 SA0559     FALSE 0.227 168.000 0.051 NA   0.925
 102839 102840 SA0559 SA0560     TRUE 0.712 40.000 0.025 1.000   0.988
 102840 102841 SA0560 SA0561     TRUE 0.635 43.000 0.028 NA   0.996
 102841 102842 SA0561 SA0562   adh1 FALSE 0.027 499.000 0.000 NA   0.997
 102842 102843 SA0562 SA0563 adh1   FALSE 0.002 264.000 0.000 NA   -0.998
 102843 102844 SA0563 SA0564   argS TRUE 0.960 -3.000 0.079 NA   0.923
 102844 102845 SA0564 SA0565 argS   FALSE 0.018 270.000 0.004 1.000 N -0.999
 102845 102846 SA0565 SA0566     FALSE 0.085 252.000 0.000 1.000 N 0.956
 102846 102847 SA0566 SA0567     TRUE 0.485 149.000 0.046 1.000 Y -0.976
 102847 102848 SA0567 SA0568     TRUE 0.721 55.000 0.412 1.000   -0.958
 102848 102849 SA0568 SA0569     TRUE 0.995 -16.000 0.412 0.020   0.837
 102849 102850 SA0569 SA0570     TRUE 0.566 136.000 0.556 NA   0.997
 102850 102851 SA0570 SA0571     TRUE 0.499 162.000 0.571 NA   0.951
 102851 102852 SA0571 SA0572     FALSE 0.250 169.000 0.286 NA   -0.896
 102853 102854 SA0573 SA0574 sarA   FALSE 0.019 948.000 0.000 NA   0.468
 102854 102855 SA0574 SA0575     FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 102855 102856 SA0575 SA0576     TRUE 0.858 17.000 0.233 NA   NA
 102857 102858 SA0577 SA0578     TRUE 0.959 19.000 0.857 1.000   1.000
 102858 102859 SA0578 SA0579     TRUE 0.997 -13.000 0.636 NA Y 1.000
 102859 102860 SA0579 SA0580     TRUE 0.995 -3.000 0.636 NA Y 1.000
 102860 102861 SA0580 SA0581     TRUE 0.998 -10.000 1.000 0.003 Y -0.899
 102861 102862 SA0581 SA0582     TRUE 0.989 1.000 0.500 1.000 Y NA
 102862 102863 SA0582 SA0583     TRUE 0.996 -3.000 0.429 0.073 Y NA
 102863 102864 SA0583 SA0584     TRUE 0.996 -25.000 0.273 1.000 Y 0.957
 102864 102865 SA0584 SA0585     FALSE 0.115 340.000 0.000 1.000 Y -0.971
 102866 102867 SA0586 SA0587     FALSE 0.015 1120.000 0.000 1.000 N NA
 102867 102868 SA0587 SA0588     TRUE 0.992 -3.000 0.154 1.000 Y 0.998
 102868 102869 SA0588 SA0589     TRUE 0.997 -6.000 0.286 0.051 Y 0.999
 102874 102875 SA0594 SA0595 tagG tagB FALSE 0.093 732.000 0.138 0.090   -0.733
 102875 102876 SA0595 SA0596 tagB tagX TRUE 0.433 51.000 0.000 NA   0.661
 102876 102877 SA0596 SA0597 tagX tagD FALSE 0.391 63.000 0.000 NA   0.796
 102879 102880 SA0599 SAS017     FALSE 0.131 69.000 0.000 NA   NA
 102880 102881 SAS017 SA0600     FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 102881 102882 SA0600 SA0601     FALSE 0.026 747.000 0.000 NA   0.893
 102882 102883 SA0601 SA0602   fhuA FALSE 0.048 282.000 0.000 NA   0.909
 102883 102884 SA0602 SA0603 fhuA fhuB TRUE 0.941 36.000 0.179 1.000 Y 1.000
 102884 102885 SA0603 SA0604 fhuB fhuG TRUE 0.998 -3.000 0.857 0.041 Y 1.000
 102885 102886 SA0604 SA0605 fhuG   FALSE 0.091 237.000 0.000 1.000 N 0.979
 102886 102887 SA0605 SA0606     TRUE 0.978 42.000 0.316 0.001 Y 0.994
 102887 102888 SA0606 SA0607     TRUE 0.981 -7.000 0.155 1.000   0.942
 102888 102889 SA0607 SA0608     TRUE 0.580 116.000 0.385 NA   0.840
 102889 102890 SA0608 SA0609     FALSE 0.004 544.000 0.000 NA   -0.934
 102890 102891 SA0609 SA0610     FALSE 0.239 151.000 0.135 1.000   -0.911
 102891 102892 SA0610 SA0611     FALSE 0.019 329.000 0.000 NA   -0.459
 102894 102895 SA0613 SA0614     TRUE 0.901 16.000 0.208 NA N 1.000
 102895 102896 SA0614 SA0615     TRUE 0.996 -7.000 0.958 1.000 Y -0.930
 102896 102897 SA0615 SA0616   vraF TRUE 0.503 144.000 0.250 1.000 N 0.962
 102897 102898 SA0616 SA0617 vraF vraG TRUE 0.993 -22.000 0.714 1.000   0.992
 102898 102899 SA0617 SA0618 vraG   FALSE 0.001 723.000 0.000 NA   -0.997
 102899 102900 SA0618 SA0619     TRUE 0.953 16.000 0.033 NA Y 0.992
 102902 102903 SA0621 SA0622     FALSE 0.017 697.000 0.000 NA   0.211
 102903 102904 SA0622 SA0623     TRUE 0.795 80.000 0.875 NA   0.940
 102904 102905 SA0623 SA0624     FALSE 0.047 190.000 0.002 NA   NA
 102905 102906 SA0624 SA0625     FALSE 0.024 285.000 0.009 NA   NA
 102906 102907 SA0625 SA0626     FALSE 0.010 353.000 0.000 NA   NA
 102907 102908 SA0626 SA0627     FALSE 0.099 302.000 0.114 NA   0.994
 102908 102909 SA0627 SA0628     FALSE 0.369 138.000 0.159 NA N 0.499
 102909 102910 SA0628 SA0629     TRUE 0.916 -3.000 0.034 NA   -0.503
 102912 102913 SA0631 SA0632     FALSE 0.193 67.000 0.000 NA   -0.683
 102913 102914 SA0632 SA0633     FALSE 0.337 138.000 0.286 NA   NA
 102914 102915 SA0633 SA0634     FALSE 0.271 80.000 0.043 NA   NA
 102916 102917 SA0635 SA0636     TRUE 0.884 2.000 0.017 NA   0.704
 102917 102918 SA0636 SA0637     TRUE 0.871 3.000 0.007 NA   0.982
 102918 102919 SA0637 SA0638   uppP FALSE 0.126 172.000 0.000 NA   0.883
 102920 102921 SA0639 SA0640     TRUE 0.994 -3.000 0.222 0.005 Y -0.991
 102923 102924 SA0642 SA0643     FALSE 0.347 103.000 0.012 NA   0.954
 102924 102925 SA0643 SA0644     FALSE 0.377 35.000 0.012 NA   -0.929
 102925 102926 SA0644 SA0645     FALSE 0.032 283.000 0.000 NA   0.261
 102926 102927 SA0645 SA0646     FALSE 0.283 86.000 0.010 1.000 N NA
 102928 102929 SA0647 SA0648     TRUE 0.918 -3.000 0.069 NA   -0.849
 102929 102930 SA0648 SA0649     FALSE 0.096 183.000 0.000 NA   0.723
 102931 102932 SA0650 SA0651 norA   FALSE 0.042 293.000 0.000 NA   0.997
 102932 102933 SA0651 SA0652     FALSE 0.053 174.000 0.010 NA   -0.932
 102933 102934 SA0652 SA0653     FALSE 0.177 253.000 0.004 0.057   0.943
 102934 102935 SA0653 SA0654   fruB TRUE 0.990 -3.000 0.063 1.000 Y 0.996
 102935 102936 SA0654 SA0655 fruB fruA TRUE 0.988 6.000 0.889 1.000 Y 1.000
 102936 102937 SA0655 SA0656 fruA nagA FALSE 0.203 308.000 0.000 1.000 Y 1.000
 102937 102938 SA0656 SA0657 nagA   FALSE 0.033 221.000 0.000 1.000   -0.887
 102938 102939 SA0657 SA0658     FALSE 0.173 222.000 0.100 1.000   0.951
 102939 102940 SA0658 SA0659     FALSE 0.358 132.000 0.100 NA   0.993
 102941 102942 SA0660 SA0661 saeS saeR TRUE 0.994 0.000 0.500 1.000 Y 0.796
 102942 102943 SA0661 SA0662 saeR   TRUE 0.973 -25.000 0.250 NA   NA
 102943 102944 SA0662 SA0663     FALSE 0.007 634.000 0.000 NA   NA
 102944 102945 SA0663 SA0664     FALSE 0.044 280.000 0.000 NA   0.823
 102945 102946 SA0664 SA0665     FALSE 0.418 99.000 0.080 NA   0.752
 102946 102947 SA0665 SA0666     TRUE 0.952 4.000 0.307 1.000 N 0.996
 102947 102948 SA0666 SA0667     TRUE 0.920 2.000 0.041 1.000   1.000
 102949 102950 SA0668 SA0669     TRUE 0.996 -16.000 0.027 0.017 Y 0.993
 102950 102951 SA0669 SA0670     TRUE 0.991 0.000 0.219 1.000 Y 0.994
 102951 102952 SA0670 SA0671     FALSE 0.278 66.000 0.019 NA   NA
 102952 102953 SA0671 SA0672     TRUE 0.544 88.000 0.375 NA   NA
 102953 102954 SA0672 SA0673     TRUE 0.998 -16.000 0.194 0.002 Y 0.935
 102954 102955 SA0673 SA0674     FALSE 0.014 474.000 0.000 1.000 N -0.940
 102955 102956 SA0674 SA0675     FALSE 0.071 276.000 0.000 1.000   0.956
 102956 102957 SA0675 SA0676   recQ TRUE 0.812 12.000 0.022 1.000   0.596
 102957 102958 SA0676 SA0677 recQ   FALSE 0.108 222.000 0.029 1.000 N 0.281
 102958 102959 SA0677 SA0678     TRUE 0.988 -7.000 0.382 1.000 N 0.991
 102959 102960 SA0678 SA0679     FALSE 0.063 240.000 0.027 1.000 N NA
 102960 102961 SA0679 SA0680     FALSE 0.044 339.000 0.102 NA   NA
 102962 102963 SA0681 SA0682     FALSE 0.125 270.000 0.057 1.000 N 0.985
 102963 102964 SA0682 SA0683     FALSE 0.015 341.000 0.000 1.000   -0.929
 102964 102965 SA0683 SA0684     TRUE 0.523 20.000 0.005 1.000   -0.987
 102966 102967 SA0685 SA0686 nrdI nrdE TRUE 0.999 -88.000 0.533 0.001 Y 1.000
 102967 102968 SA0686 SA0687 nrdE nrdF TRUE 0.952 118.000 0.875 0.001 Y 0.965
 102968 102969 SA0687 SA0688 nrdF   FALSE 0.048 375.000 0.000 1.000 N 0.997
 102969 102970 SA0688 SA0689     TRUE 0.998 -13.000 0.870 0.040 Y -0.957
 102970 102971 SA0689 SA0690     TRUE 0.996 -3.000 0.870 1.000 Y 0.450
 102971 102972 SA0690 SA0691     TRUE 0.614 119.000 0.031 1.000 Y -0.801
 102973 102974 SA0692 SA0693     TRUE 0.837 18.000 0.014 1.000   0.999
 102974 102975 SA0693 SA0694     FALSE 0.226 127.000 0.014 NA   0.461
 102976 102977 SA0695 SA0696     FALSE 0.231 154.000 0.069 NA   0.461
 102977 102978 SA0696 SA0697     FALSE 0.025 424.000 0.000 NA   0.567
 102979 102980 SA0698 SA0699 pepT   TRUE 0.824 14.000 0.127 NA   0.092
 102980 102981 SA0699 SA0700     TRUE 0.956 18.000 0.875 NA   1.000
 102981 102982 SA0700 SA0701     FALSE 0.150 196.000 0.067 NA   1.000
 102985 102986 SA0704 SA0705     FALSE 0.071 544.000 0.214 NA   0.374
 102986 102987 SA0705 SA0706     TRUE 0.979 -7.000 0.130 1.000   0.935
 102987 102988 SA0706 SA0707     TRUE 0.580 61.000 0.080 NA   0.674
 102988 102989 SA0707 SA0708   secA FALSE 0.011 414.000 0.041 NA N -1.000
 102989 102990 SA0708 SA0709 secA prfB FALSE 0.027 433.000 0.052 1.000 N -0.987
 102990 102991 SA0709 SA0710 prfB   FALSE 0.044 409.000 0.000 1.000   0.984
 102991 102992 SA0710 SA0711     FALSE 0.208 174.000 0.010 1.000   0.973
 102992 102993 SA0711 SA0712     TRUE 0.925 -3.000 0.093 NA   NA
 102993 102994 SA0712 SA0713   uvrB FALSE 0.026 263.000 0.007 NA   NA
 102994 102995 SA0713 SA0714 uvrB uvrA TRUE 0.988 8.000 0.154 0.001 Y 0.961
 102995 102996 SA0714 SA0715 uvrA hprK FALSE 0.010 664.000 0.002 1.000 N -0.998
 102996 102997 SA0715 SA0716 hprK lgt TRUE 0.954 6.000 0.494 1.000 N 0.992
 102997 102998 SA0716 SA0717 lgt   TRUE 0.868 8.000 0.045 1.000   0.943
 102998 102999 SA0717 SA0718     TRUE 0.908 8.000 0.169 1.000   0.997
 102999 103000 SA0718 SA0719   trxB TRUE 0.499 67.000 0.183 1.000   -0.990
 103000 103001 SA0719 SA0720 trxB   FALSE 0.047 945.000 0.050 NA   0.984
 103001 103002 SA0720 SA0721     TRUE 0.940 -3.000 0.214 NA   -0.986
 103002 103003 SA0721 SA0722     TRUE 0.620 111.000 0.470 NA   0.845
 103006 103007 SA0725 SA0726   gapR FALSE 0.004 925.000 0.000 NA   -0.939
 103007 103008 SA0726 SA0727 gapR gap TRUE 0.602 53.000 0.076 1.000 N -0.642
 103008 103009 SA0727 SA0728 gap pgk TRUE 0.715 139.000 0.006 0.006 Y -0.525
 103009 103010 SA0728 SA0729 pgk tpi TRUE 0.748 122.000 0.141 1.000 Y 0.999
 103010 103011 SA0729 SA0730 tpi pgm TRUE 0.973 3.000 0.138 1.000 Y -0.869
 103011 103012 SA0730 SA0731 pgm eno TRUE 0.737 130.000 0.136 1.000 Y 0.873
 103012 103013 SA0731 SA0732 eno   FALSE 0.012 339.000 0.005 NA   -0.952
 103013 103014 SA0732 SA0733   secG TRUE 0.472 67.000 0.007 NA   0.952
 103014 103015 SA0733 SA0734 secG   FALSE 0.231 116.000 0.032 1.000   -0.875
 103015 103016 SA0734 SA0735   rnr TRUE 0.776 34.000 0.060 1.000   0.876
 103016 103017 SA0735 SA0736 rnr ssrP TRUE 0.947 22.000 0.143 0.024 N 0.885
 103017 2137126 SA0736 SAtmRNA01 ssrP   FALSE 0.094 91.000 0.000 NA   NA
 2137126 103018 SAtmRNA01 SA0737     FALSE 0.009 388.000 0.000 NA   NA
 103019 103020 SA0738 SA0739     FALSE 0.001 375.000 0.000 NA   -0.987
 103021 103022 SA0740 SA0741     FALSE 0.053 139.000 0.000 NA   NA
 103022 103023 SA0741 SA0742   clfA FALSE 0.017 263.000 0.000 1.000   -0.965
 103023 103024 SA0742 SA0743 clfA   FALSE 0.070 221.000 0.000 NA   0.988
 103024 103025 SA0743 SA0744   ssp FALSE 0.017 353.000 0.000 NA   -0.497
 103025 103026 SA0744 SA0745 ssp   FALSE 0.018 335.000 0.000 NA   -0.531
 103026 103027 SA0745 SA0746     FALSE 0.010 341.000 0.000 NA   -0.857
 103027 103028 SA0746 SA0747   cspC FALSE 0.048 357.000 0.000 1.000 N 0.756
 103029 103030 SA0748 SA0749     TRUE 0.746 62.000 0.667 NA   NA
 103030 103031 SA0749 SA0750     FALSE 0.098 88.000 0.000 NA   NA
 103031 103032 SA0750 SAS018     FALSE 0.266 188.000 0.444 NA   NA
 103032 103033 SAS018 SAS019     TRUE 0.832 29.000 0.333 NA   NA
 103037 103038 SA0753 SA0754     FALSE 0.308 155.000 0.167 1.000   -0.446
 103041 103042 SA0756 SA0757     TRUE 0.490 83.000 0.022 1.000 N 0.994
 103044 103045 SA0759 SA0760     FALSE 0.398 158.000 0.170 1.000 N 0.990
 103045 103046 SA0760 SA0761   truncated-SA FALSE 0.110 179.000 0.000 NA   0.998
 103046 103047 SA0761 SA0762 truncated-SA tnpA FALSE 0.031 102.000 0.000 NA   -0.959
 103047 103048 SA0762 SA0763 tnpA tnpB TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.010 Y NA
 103048 103049 SA0763 SA0764 tnpB tnpC FALSE 0.429 7.000 0.000 NA   NA
 103049 103050 SA0764 SA0765 tnpC ant(9) FALSE 0.046 151.000 0.000 NA   NA
 103052 103053 SA0767 SAS022   truncated-SA FALSE 0.014 261.000 0.000 NA   NA
 103053 103054 SAS022 SA0768 truncated-SA   FALSE 0.019 797.000 0.000 NA   0.475
 103054 103055 SA0768 SAS023     TRUE 0.987 -7.000 0.443 NA   0.969
 103055 103056 SAS023 SA0769     FALSE 0.057 250.000 0.000 NA   0.990
 103056 103057 SA0769 SA0770     TRUE 0.997 -7.000 0.642 1.000 Y 0.997
 103057 103058 SA0770 SA0771     TRUE 0.962 18.000 0.085 NA Y 0.874
 103058 103059 SA0771 SA0772     FALSE 0.035 354.000 0.000 NA   0.852
 103061 103062 SA0774 SA0775     TRUE 0.786 98.000 0.139 1.000 Y 0.391
 103062 103063 SA0775 SA0776     TRUE 0.701 115.000 0.606 1.000 N 0.882
 103063 103064 SA0776 SA0777     TRUE 0.985 -10.000 0.292 1.000 N 0.365
 103064 103065 SA0777 SA0778     TRUE 0.604 151.000 0.152 0.002 N 0.208
 103067 103068 SA0780 SA0781     TRUE 0.843 14.000 0.085 NA   0.900
 103068 103069 SA0781 SA0782     FALSE 0.071 385.000 0.079 NA   0.961
 103069 103070 SA0782 SA0783     TRUE 0.896 13.000 0.303 NA   0.545
 103070 103071 SA0783 SA0784     TRUE 0.911 27.000 0.299 1.000   0.990
 103071 103072 SA0784 SA0785   lipA TRUE 0.451 84.000 0.012 1.000 N 0.999
 103072 103073 SA0785 SA0786 lipA   FALSE 0.159 130.000 0.021 NA   -0.688
 103073 103074 SA0786 SA0787     FALSE 0.023 206.000 0.000 NA   NA
 103076 103077 SA0789 SA0790     TRUE 0.967 0.000 0.237 NA   0.936
 103077 103078 SA0790 SA0791     TRUE 0.785 33.000 0.082 0.063 N -0.997
 103078 103079 SA0791 SA0792     FALSE 0.008 412.000 0.000 NA   NA
 103079 103080 SA0792 SA0793   dltA TRUE 0.911 16.000 0.549 NA   NA
 103080 103081 SA0793 SA0794 dltA dltB TRUE 0.982 -3.000 0.435 NA N 1.000
 103081 103082 SA0794 SA0795 dltB dltC TRUE 0.895 18.000 0.387 NA   NA
 103082 103083 SA0795 SA0796 dltC dltD TRUE 0.913 -3.000 0.064 NA   NA
 103087 103088 SA0800 SA0801     TRUE 0.768 13.000 0.012 NA   0.996
 103088 103089 SA0801 SA0802     FALSE 0.025 454.000 0.000 NA   1.000
 103089 103090 SA0802 SA0803   ampA TRUE 0.438 131.000 0.097 1.000 N 0.976
 103090 103091 SA0803 SA0804 ampA   FALSE 0.061 411.000 0.025 1.000   0.994
 103091 103092 SA0804 SA0805     TRUE 0.848 19.000 0.052 NA   0.977
 103093 103094 SA0806 SA0807   mnhG FALSE 0.212 249.000 0.364 NA N 0.785
 103094 103095 SA0807 SA0808 mnhG mnhF TRUE 0.996 -22.000 0.244 1.000 Y 0.737
 103095 103096 SA0808 SA0809 mnhF mnhE TRUE 0.996 0.000 0.829 0.070 Y NA
 103096 103097 SA0809 SA0810 mnhE mnhD TRUE 0.995 2.000 0.842 0.005 Y NA
 103097 103098 SA0810 SA0811 mnhD mnhC TRUE 0.998 -7.000 0.211 0.003 Y 0.957
 103098 103099 SA0811 SA0812 mnhC mnhB TRUE 0.988 0.000 0.195 NA Y 1.000
 103099 103100 SA0812 SA0813 mnhB mnhA TRUE 0.996 -7.000 0.439 NA Y 0.967
 103100 103101 SA0813 SA0814 mnhA   TRUE 0.438 131.000 0.206 NA   0.998
 103102 103103 SA0815 SA0816     FALSE 0.081 532.000 0.110 1.000 N 0.992
 103103 103104 SA0816 SA0817     FALSE 0.060 362.000 0.027 1.000 N 0.366
 103104 103105 SA0817 SA0818   rocD FALSE 0.047 308.000 0.000 1.000 N 0.363
 103105 103106 SA0818 SA0819 rocD gudB TRUE 0.702 109.000 0.019 1.000 Y 1.000
 103107 103108 SA0820 SA0821 glpQ argH FALSE 0.096 242.000 0.003 1.000 N 0.998
 103108 103109 SA0821 SA0822 argH argG TRUE 0.994 -10.000 0.278 1.000 Y -0.699
 103110 103111 SA0823 SA0824 pgi   FALSE 0.045 325.000 0.005 NA   0.722
 103111 103112 SA0824 SA0825   spsA TRUE 0.829 5.000 0.115 NA   -0.690
 103112 103113 SA0825 SA0826 spsA spsB TRUE 0.988 16.000 0.184 0.001 Y 0.538
 103113 103114 SA0826 SA0827 spsB   FALSE 0.218 160.000 0.057 1.000 N -0.479
 103114 103115 SA0827 SA0828     TRUE 0.993 4.000 0.408 0.002 Y 0.218
 103115 103116 SA0828 SA0829     FALSE 0.316 166.000 0.075 1.000 N 0.973
 103116 103117 SA0829 SA0830     FALSE 0.034 329.000 0.028 NA   -0.625
 103118 103119 SA0831 SA0832 cdr   TRUE 0.603 52.000 0.171 1.000   -0.967
 103122 103123 SA0834 SA0835   clpB FALSE 0.128 203.000 0.000 1.000 N 0.944
 103125 103126 SA0837 SA0838     TRUE 0.836 -16.000 0.000 NA N -0.893
 103126 103127 SA0838 SA0839     TRUE 0.788 -7.000 0.000 NA   NA
 103127 103128 SA0839 SA0840     TRUE 0.816 -22.000 0.000 NA   NA
 103128 103129 SA0840 SA0841     FALSE 0.036 311.000 0.000 NA   0.719
 103131 103132 SA0842 SA0843 FabH fab TRUE 0.910 12.000 0.000 1.000 Y NA
 103134 103135 SA0845 SA0846 oppB   TRUE 0.993 0.000 0.062 0.039 Y 0.980
 103135 103136 SA0846 SA0847   oppD TRUE 0.988 16.000 0.857 1.000 Y 0.977
 103136 103137 SA0847 SA0848 oppD oppF TRUE 0.998 -10.000 0.111 0.002 Y 0.896
 103137 103138 SA0848 SA0849 oppF   TRUE 0.962 19.000 0.074 1.000 Y 0.701
 103138 103139 SA0849 SA0850     FALSE 0.358 212.000 0.000 0.039 Y -0.945
 103139 103140 SA0850 SA0851     TRUE 0.843 51.000 0.000 1.000 Y 0.715
 103140 103141 SA0851 SA0852   appF TRUE 0.992 3.000 0.333 0.001 Y NA
 103141 103142 SA0852 SA0853 appF oppB TRUE 0.988 -7.000 0.045 1.000 Y NA
 103142 103143 SA0853 SA0854 oppB   TRUE 0.973 12.000 0.159 0.039 Y NA
 103145 103146 SA0856 SA0857 spxA   FALSE 0.055 371.000 0.063 NA N 0.225
 103146 103147 SA0857 SA0858     FALSE 0.299 121.000 0.098 NA   -0.290
 103147 103148 SA0858 SA0859     TRUE 0.597 48.000 0.075 NA   0.056
 103149 103150 SA0860 SA0861     TRUE 0.750 44.000 0.138 NA   0.967
 103150 103151 SA0861 SA0862     TRUE 0.445 104.000 0.063 1.000   0.999
 103152 103153 SA0863 SA0864     TRUE 0.917 17.000 0.283 NA   0.796
 103153 103154 SA0864 SA0865   ppnK TRUE 0.962 17.000 0.725 1.000   0.968
 103154 103155 SA0865 SA0866 ppnK   TRUE 0.987 -3.000 0.480 1.000 N 0.948
 103155 103156 SA0866 SA0867     TRUE 0.887 21.000 0.163 1.000 N 0.084
 103156 103157 SA0867 SA0868     TRUE 0.930 10.000 0.094 1.000 Y -1.000
 103157 103158 SA0868 SA0869   fabI FALSE 0.047 278.000 0.016 1.000 N NA
 103160 103161 SA0871 SA0872     FALSE 0.198 145.000 0.000 NA N 0.978
 103161 103162 SA0872 SA0873     FALSE 0.309 194.000 0.287 NA N 0.982
 103163 103164 SA0874 SA0875     TRUE 0.981 -22.000 0.239 1.000 N -0.738
 103165 103166 SA0876 SAS026 murE   TRUE 0.955 -10.000 0.012 NA   0.801
 103166 103167 SAS026 SA0877   prfC TRUE 0.904 0.000 0.009 NA   1.000
 103167 103168 SA0877 SA0878 prfC   FALSE 0.027 302.000 0.000 1.000 N -0.851
 103168 103169 SA0878 SA0879   htrA FALSE 0.104 234.000 0.095 1.000 N -0.776
 103169 103170 SA0879 SA0880 htrA   TRUE 0.877 17.000 0.096 1.000 N 0.178
 103170 103171 SA0880 SA0881     FALSE 0.302 136.000 0.068 1.000 N -0.310
 2137127 2137128 SAtRNA16 SAtRNA17     TRUE 0.553 3.000 0.000 NA   NA
 2137128 103172 SAtRNA17 SA0882     FALSE 0.052 142.000 0.000 NA   NA
 103175 103176 SAS027 SA0885     TRUE 0.809 15.000 0.167 NA   NA
 103176 103177 SA0885 SAS028     FALSE 0.021 209.000 0.000 NA   NA
 103177 103178 SAS028 SAS029     FALSE 0.007 657.000 0.000 NA   NA
 103178 103179 SAS029 SA0886     TRUE 0.487 44.000 0.000 NA   0.735
 103179 103180 SA0886 SA0887     TRUE 0.553 3.000 0.000 NA   NA
 103180 103181 SA0887 SA0888     TRUE 0.974 -3.000 0.500 NA   NA
 103182 103183 SA0889 SA0890     FALSE 0.008 412.000 0.000 NA   NA
 103188 103189 SA0895 SA0896   menD TRUE 0.995 -13.000 0.142 1.000 Y 0.773
 103189 103190 SA0896 SA0897 menD   TRUE 0.987 -13.000 0.355 NA   0.869
 103190 103191 SA0897 SA0898   menB TRUE 0.980 -7.000 0.280 NA   1.000
 103192 103193 SA0899 SA0900 sspC sspB FALSE 0.392 38.000 0.000 1.000   NA
 103193 103194 SA0900 SA0901 sspB sspA TRUE 0.533 82.000 0.000 0.030   -0.098
 103194 103195 SA0901 SA0902 sspA   FALSE 0.144 528.000 0.000 1.000 Y 0.775
 103195 103196 SA0902 SA0903     FALSE 0.271 196.000 0.158 1.000 N 0.990
 103198 103199 SA0905 SA0906 atl   FALSE 0.086 228.000 0.000 1.000   0.990
 103199 103200 SA0906 SA0907     FALSE 0.326 155.000 0.364 NA   NA
 103200 103201 SA0907 SA0908     TRUE 0.815 48.000 0.800 NA   NA
 103203 103204 SA0910 SA0911   qoxC TRUE 0.997 -3.000 0.959 1.000 Y 0.999
 103204 103205 SA0911 SA0912 qoxC qoxB TRUE 0.999 -10.000 0.957 0.029 Y 1.000
 103205 103206 SA0912 SA0913 qoxB   TRUE 0.997 0.000 0.489 0.004 Y 0.991
 103206 103207 SA0913 SA0914     FALSE 0.015 571.000 0.000 NA   -0.121
 103207 103208 SA0914 SA0915   folD FALSE 0.014 864.000 0.000 NA   -0.171
 103209 103210 SA0916 SA0917   purK TRUE 0.997 -13.000 0.008 0.001 Y 0.993
 103210 103211 SA0917 SA0918 purK purC TRUE 0.969 4.000 0.015 1.000 Y 0.971
 103211 103212 SA0918 SA0919 purC   TRUE 0.994 0.000 0.460 1.000 Y 0.991
 103212 103213 SA0919 SA0920   purQ TRUE 0.997 2.000 0.656 0.001 Y 0.982
 103213 103214 SA0920 SA0921 purQ purL TRUE 0.998 -7.000 0.346 0.001 Y 0.994
 103214 103215 SA0921 SA0922 purL purF TRUE 0.996 -21.000 0.223 1.000 Y 0.995
 103215 103216 SA0922 SA0923 purF purM TRUE 0.995 -7.000 0.248 1.000 Y 0.990
 103216 103217 SA0923 SA0924 purM purN TRUE 0.993 3.000 0.238 0.003 Y 0.940
 103217 103218 SA0924 SA0925 purN purH TRUE 0.970 12.000 0.225 1.000 Y 1.000
 103218 103219 SA0925 SA0926 purH purD TRUE 0.768 130.000 0.238 1.000 Y 1.000
 103220 103221 SA0927 SA0928     TRUE 0.989 -7.000 0.469 1.000   0.997
 103221 103222 SA0928 SA0929     TRUE 0.899 15.000 0.241 NA   0.999
 103225 103226 SA0931 SA0932     FALSE 0.047 425.000 0.050 NA   0.604
 103226 103227 SA0932 SA0933     TRUE 0.626 54.000 0.100 NA   0.585
 103227 103228 SA0933 SA0934   ptsH FALSE 0.128 154.000 0.047 NA   NA
 103228 103229 SA0934 SA0935 ptsH ptsI TRUE 0.983 3.000 0.054 0.014 Y NA
 103231 103232 SA0937 SA0938     TRUE 0.998 -3.000 0.778 0.029 Y 0.991
 103232 103233 SA0938 SA0939     TRUE 0.461 133.000 0.163 1.000 N 0.780
 103234 103235 SA0940 SA0941     TRUE 0.973 0.000 0.576 NA   -0.246
 103235 103236 SA0941 SA0942   def FALSE 0.045 482.000 0.025 NA   0.920
 103237 2137129 SA0943 SA0943-1   pdhA FALSE 0.105 171.000 0.046 NA   NA
 2137129 103238 SA0943-1 SA0944 pdhA pdhB TRUE 0.992 4.000 0.484 0.002 Y NA
 103238 103239 SA0944 SA0945 pdhB pdhC TRUE 0.926 91.000 0.883 0.062 Y NA
 103239 103240 SA0945 SA0946 pdhC pdhD TRUE 0.991 4.000 0.948 1.000 Y 0.936
 103240 103241 SA0946 SA0947 pdhD   FALSE 0.149 168.000 0.096 NA   NA
 103241 103242 SA0947 SA0949     FALSE 0.130 144.000 0.034 NA   NA
 103242 103243 SA0949 SA0950   potA TRUE 0.924 13.000 0.326 1.000 N 0.999
 103243 103244 SA0950 SA0951 potA potB TRUE 0.998 -7.000 0.928 0.038 Y 0.839
 103244 103245 SA0951 SA0952 potB potC TRUE 0.990 6.000 0.492 0.038 Y 0.896
 103245 103246 SA0952 SA0953 potC potD TRUE 0.993 0.000 0.253 0.038 Y NA
 103246 103247 SA0953 SA0954 potD   FALSE 0.364 74.000 0.089 NA   NA
 103247 103248 SA0954 SA0955     FALSE 0.040 283.000 0.000 NA   1.000
 103249 103250 SA0956 SA0957     FALSE 0.042 184.000 0.041 NA   -0.994
 103254 103255 SAS032 SA0960     TRUE 0.907 2.000 0.173 NA   NA
 103256 103257 SA0961 SA0962     FALSE 0.001 419.000 0.000 NA   -0.990
 103257 103258 SA0962 SA0963   pycA FALSE 0.042 554.000 0.000 1.000 N 0.964
 103260 103261 SA0965 SA0966 ctaB   TRUE 0.682 25.000 0.027 NA   -0.423
 103261 103262 SA0966 SA0967     FALSE 0.048 327.000 0.052 NA   -0.222
 103262 103263 SA0967 SA0968     TRUE 0.872 16.000 0.301 NA   NA
 103267 103268 SA0972 SA0973     TRUE 0.968 2.000 0.367 1.000 N 0.624
 103270 103271 SA0975 SAS033   rpmF TRUE 0.645 80.000 0.599 NA   NA
 103272 103273 SA0976 SA0977 isdB isdA TRUE 0.448 203.000 0.000 0.009 Y NA
 103274 103275 SA0978 SA0979 isdC isdD TRUE 0.650 0.000 0.000 NA   -0.886
 103275 103276 SA0979 SA0980 isdD isdE TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   0.968
 103276 103277 SA0980 SA0981 isdE isdF TRUE 0.799 157.000 0.877 1.000 Y 0.053
 103277 103278 SA0981 SA0982 isdF srtB FALSE 0.336 62.000 0.000 NA   0.373
 103278 103279 SA0982 SA0983 srtB isdG TRUE 0.844 19.000 0.058 NA   0.879
 103279 103280 SA0983 SA0984 isdG   FALSE 0.026 384.000 0.000 1.000   -0.372
 103280 103281 SA0984 SA0985   pheS FALSE 0.194 380.000 0.006 1.000 Y 0.809
 103281 103282 SA0985 SA0986 pheS pheT TRUE 0.998 0.000 0.574 0.001 Y 0.979
 103284 103285 SA0988 SA0989     TRUE 0.880 1.000 0.091 NA   NA
 103285 103286 SA0989 SA0990     FALSE 0.283 73.000 0.066 1.000   -0.999
 103286 103287 SA0990 SA0991   mutS2 TRUE 0.955 10.000 0.114 1.000 Y -0.645
 103287 103288 SA0991 SA0992 mutS2 trxA FALSE 0.211 173.000 0.018 1.000   0.993
 103288 103289 SA0992 SA0993 trxA uvrC FALSE 0.061 324.000 0.023 1.000   0.372
 103289 103290 SA0993 SA0994 uvrC sdhC FALSE 0.052 324.000 0.000 1.000 N 0.719
 103290 103291 SA0994 SA0995 sdhC sdhA TRUE 0.964 52.000 0.184 0.001 Y 0.999
 103291 103292 SA0995 SA0996 sdhA sdhB TRUE 0.996 0.000 0.231 0.001 Y 0.853
 103292 103293 SA0996 SA0997 sdhB murI FALSE 0.033 236.000 0.002 1.000 N -0.975
 103293 103294 SA0997 SA0998 murI   TRUE 0.786 12.000 0.034 1.000 N -0.533
 103294 103295 SA0998 SA0999     TRUE 0.961 -7.000 0.085 1.000   -0.593
 103295 103296 SA0999 SAS034     FALSE 0.042 158.000 0.000 NA   NA
 103296 103297 SAS034 SA1000     FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 103299 103300 SA1002 SA1003     FALSE 0.032 260.000 0.000 NA   -0.061
 103300 103301 SA1003 SA1004     FALSE 0.116 150.000 0.000 NA   0.257
 103302 103303 SAS035 SA1005     FALSE 0.007 622.000 0.000 NA   NA
 103307 103308 SAS036 SA1009     FALSE 0.059 132.000 0.000 NA   NA
 103308 103309 SA1009 SA1010     FALSE 0.405 108.000 0.000 0.018   NA
 103309 103310 SA1010 SA1011     TRUE 0.440 95.000 0.000 0.018   NA
 103311 103312 SA1012 SA1013 argF   TRUE 0.980 23.000 1.000 1.000 Y NA
 103312 103313 SA1013 SA1014     FALSE 0.068 172.000 0.000 1.000   NA
 103313 103314 SA1014 SA1015     FALSE 0.011 307.000 0.000 NA   NA
 103319 103320 SA1020 SA1021     FALSE 0.258 144.000 0.025 NA   0.963
 103320 103321 SA1021 SA1022     TRUE 0.949 16.000 0.635 NA   0.942
 103321 103322 SA1022 SA1023   ftsL TRUE 0.755 14.000 0.077 1.000 N -0.953
 103322 103323 SA1023 SA1024 ftsL pbpA TRUE 0.988 -19.000 0.456 1.000 N -0.496
 103323 103324 SA1024 SA1025 pbpA mraY FALSE 0.228 292.000 0.038 1.000 Y -0.417
 103324 103325 SA1025 SA1026 mraY murD TRUE 0.996 2.000 0.647 0.008 Y 0.995
 103325 103326 SA1026 SA1027 murD div1b TRUE 0.949 16.000 0.008 NA Y 0.963
 103326 103327 SA1027 SA1028 div1b ftsA TRUE 0.617 106.000 0.389 NA N 0.999
 103327 103328 SA1028 SA1029 ftsA ftsZ TRUE 0.968 33.000 0.460 1.000 Y 0.943
 103328 103329 SA1029 SA1030 ftsZ   FALSE 0.053 260.000 0.082 NA   -0.899
 103329 103330 SA1030 SA1031     TRUE 0.827 18.000 0.061 NA   0.489
 103330 103331 SA1031 SA1032     TRUE 0.969 -3.000 0.194 NA   0.563
 103331 103332 SA1032 SA1033     TRUE 0.924 12.000 0.370 NA   0.934
 103332 103333 SA1033 SA1034     FALSE 0.187 251.000 0.287 1.000   0.337
 103333 103334 SA1034 SA1035     TRUE 0.907 24.000 0.579 NA   -0.667
 103334 103335 SA1035 SA1036   ileS FALSE 0.014 221.000 0.012 NA N -0.999
 103335 103336 SA1036 SA1037 ileS   FALSE 0.062 291.000 0.000 1.000   0.916
 103338 103339 SA1039 SA1040 lsp   TRUE 0.931 0.000 0.008 1.000 N 1.000
 103339 103340 SA1040 SA1041   pyrR FALSE 0.067 400.000 0.048 1.000 N 1.000
 103340 103341 SA1041 SA1042 pyrR pyrP TRUE 0.436 218.000 0.140 1.000 Y 1.000
 103341 103342 SA1042 SA1043 pyrP pyrB TRUE 0.946 28.000 0.064 1.000 Y 1.000
 103342 103343 SA1043 SA1044 pyrB pyrC TRUE 0.983 18.000 0.452 1.000 Y 0.995
 103343 103344 SA1044 SA1045 pyrC pyrAA TRUE 0.986 2.000 0.155 1.000 Y 0.997
 103344 103345 SA1045 SA1046 pyrAA carB TRUE 0.997 -7.000 0.117 0.001 Y 1.000
 103345 103346 SA1046 SA1047 carB pyrF TRUE 0.699 110.000 0.018 1.000 Y 1.000
 103346 103347 SA1047 SA1048 pyrF pyrE TRUE 0.982 0.000 0.006 1.000 Y 1.000
 103347 103348 SA1048 SA1049 pyrE   TRUE 0.638 30.000 0.000 NA   0.997
 103348 103349 SA1049 SA1050     FALSE 0.011 437.000 0.000 NA   -0.700
 103351 103352 SA1052 SA1053 gmk   TRUE 0.981 0.000 0.471 1.000 N 0.857
 103352 103353 SA1053 SA1054     FALSE 0.120 216.000 0.192 1.000 N -0.988
 103353 103354 SA1054 SA1055   priA TRUE 0.962 0.000 0.099 1.000 N 0.940
 103354 103355 SA1055 SA1056 priA   FALSE 0.030 506.000 0.000 NA   0.983
 103357 103358 SA1058 SA1059     TRUE 0.995 -7.000 0.031 0.030 Y 0.981
 103358 103359 SA1059 SA1060     TRUE 0.996 -81.000 0.305 1.000 Y 0.930
 103359 103360 SA1060 SA1061     TRUE 0.940 3.000 0.135 1.000   0.983
 103360 103361 SA1061 SA1062     TRUE 0.884 7.000 0.105 1.000   1.000
 103361 103362 SA1062 SA1063     TRUE 0.996 -3.000 0.704 1.000 Y 1.000
 103362 103363 SA1063 SA1064     FALSE 0.135 228.000 0.196 1.000   -0.843
 103363 103364 SA1064 SA1065   cfxE TRUE 0.912 1.000 0.013 1.000   0.580
 103364 103365 SA1065 SA1066 cfxE   TRUE 0.743 7.000 0.019 1.000 N NA
 103367 103368 SA1068 SA1069     TRUE 0.937 15.000 0.567 NA   0.998
 103368 103369 SA1069 SA1070   recG FALSE 0.198 190.000 0.074 1.000   0.521
 103369 103370 SA1070 SA1071 recG   FALSE 0.115 218.000 0.078 NA N 0.268
 103370 103371 SA1071 SA1072   plsX TRUE 0.854 5.000 0.020 NA N 0.957
 103371 103372 SA1072 SA1073 plsX fabD TRUE 0.995 -7.000 0.106 0.005 Y -0.966
 103372 103373 SA1073 SA1074 fabD fabG TRUE 0.997 -13.000 0.149 0.005 Y -0.581
 103373 103374 SA1074 SA1075 fabG hmrB FALSE 0.388 435.000 0.100 0.005 Y 0.847
 103374 103375 SA1075 SA1076 hmrB rnc TRUE 0.445 116.000 0.068 1.000 N 0.996
 103375 103376 SA1076 SA1077 rnc smc FALSE 0.261 147.000 0.120 1.000 N -0.895
 103376 103377 SA1077 SA1078 smc   TRUE 0.977 0.000 0.165 0.011 N -0.900
 103377 103378 SA1078 SA1079     TRUE 0.967 -13.000 0.081 1.000   -0.515
 103378 103379 SA1079 SA1080   ffh TRUE 0.875 26.000 0.151 1.000   0.802
 103379 103380 SA1080 SA1081 ffh rpsP FALSE 0.120 435.000 0.361 1.000 N -0.146
 103380 103381 SA1081 SA1082 rpsP rimM TRUE 0.772 188.000 0.342 0.020 Y 0.999
 103381 103382 SA1082 SA1083 rimM trmD TRUE 0.995 0.000 0.672 1.000 Y 0.968
 103382 103383 SA1083 SA1084 trmD rplS TRUE 0.835 103.000 0.567 1.000 Y NA
 103385 103386 SA1086 SA1087   rnhB TRUE 0.983 -16.000 0.148 1.000   0.995
 103386 103387 SA1087 SA1088 rnhB sucC FALSE 0.408 109.000 0.015 1.000 N 0.931
 103387 103388 SA1088 SA1089 sucC sucD TRUE 0.986 22.000 0.173 0.001 Y 0.511
 103388 103389 SA1089 SA1090 sucD lytN FALSE 0.066 227.000 0.034 1.000   NA
 103389 103390 SA1090 SA1091 lytN fmhC TRUE 0.893 28.000 0.500 1.000   NA
 103390 103391 SA1091 SA1092 fmhC   FALSE 0.078 173.000 0.000 1.000 N NA
 103391 103392 SA1092 SA1093     TRUE 0.597 180.000 0.238 1.000 Y -0.001
 103392 103393 SA1093 SA1094   gid FALSE 0.369 156.000 0.137 1.000 N 0.855
 103393 103394 SA1094 SA1095 gid xerC FALSE 0.077 418.000 0.105 1.000 N 0.433
 103394 103395 SA1095 SA1096 xerC clpQ TRUE 0.966 -3.000 0.113 1.000 N 0.243
 103395 103396 SA1096 SA1097 clpQ clpY TRUE 0.916 66.000 0.752 1.000 Y NA
 103396 103397 SA1097 SA1098 clpY codY TRUE 0.812 25.000 0.131 1.000 N NA
 103397 103398 SA1098 SA1099 codY rpsB FALSE 0.058 347.000 0.006 1.000 N 0.639
 103398 103399 SA1099 SA1100 rpsB tsf TRUE 0.685 182.000 0.748 1.000 Y -0.730
 103399 103400 SA1100 SA1101 tsf smbA TRUE 0.578 137.000 0.416 1.000 N 0.995
 103400 103401 SA1101 SA1102 smbA frr TRUE 0.955 19.000 0.626 1.000 N 0.999
 103401 103402 SA1102 SA1103 frr uppS FALSE 0.165 373.000 0.409 1.000 N 1.000
 103402 103403 SA1103 SA1104 uppS cdsA TRUE 0.970 7.000 0.113 1.000 Y 0.981
 103403 103404 SA1104 SA1105 cdsA   FALSE 0.160 212.000 0.040 1.000 N 0.993
 103404 103405 SA1105 SA1106   proS TRUE 0.889 20.000 0.095 1.000 N 0.871
 103405 103406 SA1106 SA1107 proS polC FALSE 0.183 258.000 0.070 0.052 N -0.378
 103406 103407 SA1107 SA1108 polC   FALSE 0.051 290.000 0.059 NA   -0.589
 103407 103408 SA1108 SA1109   nusA TRUE 0.897 21.000 0.759 NA   -0.998
 103408 103409 SA1109 SA1110 nusA   TRUE 0.975 21.000 0.323 NA Y 0.965
 103409 103410 SA1110 SA1111     TRUE 0.972 -3.000 0.408 NA N NA
 103410 103411 SA1111 SA1112   infB TRUE 0.964 5.000 0.223 NA Y NA
 103411 103412 SA1112 SA1113 infB rbfA FALSE 0.421 386.000 0.530 1.000 Y 0.971
 103412 103413 SA1113 SA1114 rbfA truB TRUE 0.485 169.000 0.111 1.000 Y -0.957
 103413 103414 SA1114 SA1115 truB ribC TRUE 0.926 15.000 0.308 1.000 N 1.000
 103414 103415 SA1115 SA1116 ribC rpsO FALSE 0.265 115.000 0.119 1.000 N -0.998
 103415 103416 SA1116 SA1117 rpsO pnpA FALSE 0.372 369.000 0.335 1.000 Y 0.876
 103416 103417 SA1117 SA1118 pnpA   FALSE 0.092 236.000 0.002 1.000   0.829
 103417 103418 SA1118 SA1119   spoIIIE FALSE 0.100 257.000 0.026 1.000   0.852
 103418 103419 SA1119 SA1120 spoIIIE   TRUE 0.903 5.000 0.115 1.000 N 0.529
 103419 103420 SA1120 SA1121     TRUE 0.673 31.000 0.093 1.000   -0.959
 103420 103421 SA1121 SA1122     TRUE 0.990 0.000 0.872 0.005   NA
 103421 103422 SA1122 SA1123     TRUE 0.966 0.000 0.397 1.000   NA
 103422 103423 SA1123 SA1124     TRUE 0.652 105.000 0.114 0.061   0.849
 103423 103424 SA1124 SA1125     TRUE 0.905 19.000 0.163 1.000   0.770
 103424 103425 SA1125 SA1126   pgsA TRUE 0.627 34.000 0.009 1.000   -0.240
 103425 103426 SA1126 SA1127 pgsA cinA FALSE 0.199 224.000 0.151 1.000   0.975
 103426 103427 SA1127 SA1128 cinA recA FALSE 0.289 165.000 0.083 1.000   0.998
 103427 103428 SA1128 SA1129 recA   FALSE 0.067 354.000 0.018 1.000   0.992
 103430 103431 SA1130 SA1131     FALSE 0.276 140.000 0.021 1.000   0.724
 103431 103432 SA1131 SA1132     TRUE 0.996 1.000 0.437 0.001 Y 0.724
 103432 103433 SA1132 SA1133     FALSE 0.013 94.000 0.000 NA   -0.984
 103433 103434 SA1133 SA1134     FALSE 0.242 134.000 0.002 NA   0.981
 103434 103435 SA1134 SA1135     TRUE 0.890 1.000 0.041 NA   0.038
 103435 103436 SA1135 SA1136     TRUE 0.798 27.000 0.091 NA   0.526
 103436 103437 SA1136 SA1137   mutS FALSE 0.022 303.000 0.003 NA   -0.825
 103437 103438 SA1137 SA1138 mutS mutL TRUE 0.987 13.000 0.220 0.002 Y 0.992
 103438 103439 SA1138 SA1139 mutL glpP TRUE 0.845 15.000 0.020 1.000 N 0.891
 103441 103442 SA1140 SA1141 glpF glpK FALSE 0.408 129.000 0.057 1.000 N 0.975
 103442 103443 SA1141 SA1142 glpK glpD TRUE 0.772 110.000 0.013 0.001 Y -0.997
 103443 103444 SA1142 SA1143 glpD   FALSE 0.149 150.000 0.029 1.000 N -0.950
 103444 103445 SA1143 SA1144   miaA TRUE 0.802 18.000 0.025 1.000 N -0.522
 103445 103446 SA1144 SA1145 miaA   TRUE 0.789 15.000 0.016 1.000   0.281
 103448 103449 SA1147 SA1148     TRUE 0.879 19.000 0.065 1.000   0.925
 103449 103450 SA1148 SA1149   glnR FALSE 0.107 243.000 0.046 1.000 N 0.386
 103450 103451 SA1149 SA1150 glnR glnA TRUE 0.862 19.000 0.103 1.000 N -0.249
 103451 103452 SA1150 SA1151 glnA   FALSE 0.006 1895.000 0.000 NA   NA
 103452 103453 SA1151 SA1152     FALSE 0.007 1234.000 0.000 NA   NA
 103453 103454 SA1152 SA1153     FALSE 0.007 743.000 0.000 NA   NA
 103454 103455 SA1153 SAS039     FALSE 0.007 723.000 0.000 NA   NA
 103457 103458 SAS040 SA1155     TRUE 0.907 21.000 0.571 NA   NA
 103458 103459 SA1155 SA1156     FALSE 0.139 184.000 0.057 1.000 N NA
 103459 103460 SA1156 SA1157     TRUE 0.969 -31.000 0.136 1.000   NA
 103460 103461 SA1157 SA1158     TRUE 0.955 4.000 0.500 1.000   0.226
 103461 103462 SA1158 SA1159     TRUE 0.997 -3.000 0.857 0.012 Y NA
 103468 103469 SA1164 SA1165 dhoM thrC TRUE 0.962 6.000 0.021 1.000 Y 0.956
 103469 103470 SA1165 SA1166 thrC thrB TRUE 0.982 2.000 0.221 1.000 Y NA
 103470 103471 SA1166 SA1167 thrB   FALSE 0.394 58.000 0.013 1.000   NA
 103472 103473 SA1168 SA1169     FALSE 0.194 218.000 0.667 NA   -0.986
 103474 103475 SA1170 SAS042 katA rpmG TRUE 0.442 91.000 0.006 1.000 N 0.975
 103475 103476 SAS042 SA1171 rpmG rpsN FALSE 0.251 454.000 0.052 0.020 Y NA
 103476 103477 SA1171 SA1172 rpsN   FALSE 0.143 157.000 0.015 1.000 N NA
 103477 103478 SA1172 SA1173     TRUE 0.827 22.000 0.049 NA   0.986
 103480 103481 SA1175 SA1176     FALSE 0.291 137.000 0.200 NA   NA
 103481 103482 SA1176 SA1177   tkt FALSE 0.364 121.000 0.240 NA   NA
 103482 103483 SA1177 SA1178 tkt   FALSE 0.025 278.000 0.000 1.000   NA
 103483 103484 SA1178 SA1179     FALSE 0.080 179.000 0.026 NA   NA
 103484 103485 SA1179 SA1180     FALSE 0.214 124.000 0.010 NA N 0.038
 103485 103486 SA1180 SA1181     TRUE 0.985 4.000 0.669 NA Y 0.109
 103488 103489 SA1183 SA1184 opuD citB FALSE 0.011 947.000 0.000 1.000 N -0.953
 103489 103490 SA1184 SA1185 citB   FALSE 0.141 180.000 0.015 1.000   -0.105
 103491 103492 SA1186 SA1187     FALSE 0.017 376.000 0.008 NA   NA
 103493 103494 SA1188 SA1189 parE parC TRUE 0.997 0.000 0.552 0.002 Y 0.999
 103494 103495 SA1189 SA1190 parC alsT FALSE 0.071 250.000 0.000 1.000 N 1.000
 103495 103496 SA1190 SA1191 alsT glcT FALSE 0.081 500.000 0.119 1.000   0.989
 103496 103497 SA1191 SAS043 glcT   FALSE 0.207 47.000 0.000 NA   NA
 103497 103498 SAS043 SA1192     TRUE 0.788 -7.000 0.000 NA   NA
 103498 103499 SA1192 SA1193   fmtC FALSE 0.025 481.000 0.018 NA   -0.347
 103505 103506 SA1198 SA1199     FALSE 0.017 492.000 0.000 1.000 N NA
 103506 103507 SA1199 SA1200   trpG TRUE 0.993 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 103507 103508 SA1200 SA1201 trpG trpD TRUE 0.959 6.000 0.006 1.000 Y 0.978
 103508 103509 SA1201 SA1202 trpD trpC TRUE 0.988 2.000 0.216 1.000 Y 0.978
 103509 103510 SA1202 SA1203 trpC trpF TRUE 0.996 0.000 0.264 0.002 Y 0.987
 103510 103511 SA1203 SA1204 trpF trpB TRUE 0.998 -7.000 0.375 0.002 Y 0.862
 103511 103512 SA1204 SA1205 trpB trpA TRUE 0.998 -7.000 0.248 0.001 Y 0.896
 103512 103513 SA1205 SA1206 trpA femA FALSE 0.062 322.000 0.000 1.000 N 0.985
 103513 103514 SA1206 SA1207 femA femB TRUE 0.994 19.000 1.000 0.006 Y 0.996
 103514 103515 SA1207 SA1208 femB   FALSE 0.012 289.000 0.000 NA   NA
 103515 103516 SA1208 SA1209     FALSE 0.017 230.000 0.000 NA   NA
 103517 103518 SA1210 SA1211   opp-2F FALSE 0.071 124.000 0.000 1.000   -0.967
 103518 103519 SA1211 SA1212 opp-2F opp-2D TRUE 0.996 -7.000 0.059 0.024 Y 0.924
 103519 103520 SA1212 SA1213 opp-2D opp-2C TRUE 0.996 -13.000 0.353 1.000 Y 0.863
 103520 103521 SA1213 SA1214 opp-2C opp-2B TRUE 0.998 -7.000 0.647 0.037 Y 0.405
 103521 103522 SA1214 SA1215 opp-2B   FALSE 0.070 304.000 0.182 NA   NA
 103524 103525 SA1217 SA1218   pstB TRUE 0.968 7.000 0.182 NA Y 0.999
 103525 103526 SA1218 SA1219 pstB   TRUE 0.963 47.000 0.125 0.002 Y 0.919
 103526 103527 SA1219 SA1220     TRUE 0.995 2.000 0.485 0.002 Y -0.646
 103527 103528 SA1220 SA1221     TRUE 0.503 191.000 0.077 1.000 Y 0.786
 103531 103532 SA1224 SA1225   lysC FALSE 0.021 1062.000 0.000 1.000   -0.199
 103532 103533 SA1225 SA1226 lysC asd TRUE 0.824 64.000 0.119 1.000 Y -0.901
 103533 103534 SA1226 SA1227 asd dapA TRUE 0.976 2.000 0.015 1.000 Y 0.661
 103534 103535 SA1227 SA1228 dapA dapB TRUE 0.988 -3.000 0.014 1.000 Y 0.844
 103535 103536 SA1228 SA1229 dapB dapD TRUE 0.920 27.000 0.036 1.000 Y NA
 103536 103537 SA1229 SA1230 dapD   FALSE 0.418 143.000 0.372 1.000   NA
 103537 103538 SA1230 SA1231     TRUE 0.878 5.000 0.058 1.000   0.680
 103538 103539 SA1231 SA1232   lysA TRUE 0.947 -10.000 0.008 1.000 N -0.592
 103540 103541 SA1233 SA1234   cspA FALSE 0.024 197.000 0.000 NA   NA
 103541 103542 SA1234 SA1235 cspA   FALSE 0.149 171.000 0.105 NA   NA
 103543 103544 SA1236 SA1237     TRUE 0.684 25.000 0.067 NA   NA
 103544 103545 SA1237 SA1238     TRUE 0.880 32.000 0.373 NA   0.883
 103546 103547 SA1239 SA1240 braB   FALSE 0.062 226.000 0.136 NA N -0.997
 103547 103548 SA1240 SA1241     TRUE 0.948 14.000 0.822 NA   0.947
 103548 103549 SA1241 SA1242     FALSE 0.162 181.000 0.156 NA   NA
 103549 103550 SA1242 SA1243     TRUE 0.812 29.000 0.280 NA   NA
 103550 103551 SA1243 SA1244   odhB FALSE 0.007 580.000 0.000 NA   NA
 103551 103552 SA1244 SA1245 odhB odhA TRUE 0.983 14.000 0.667 1.000 Y 0.984
 103552 103553 SA1245 SA1246 odhA arlS FALSE 0.026 284.000 0.006 1.000 N -0.977
 103553 103554 SA1246 SA1247 arlS arlR TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000   NA
 103554 103555 SA1247 SA1248 arlR arlR TRUE 0.963 -3.000 0.000 0.008   NA
 103555 103556 SA1248 SA1249 arlR   FALSE 0.008 471.000 0.000 NA   NA
 103556 103557 SA1249 SA1250     FALSE 0.072 117.000 0.000 NA   NA
 103557 103558 SA1250 SA1251   murG TRUE 0.857 17.000 0.016 1.000 N 0.996
 103558 103559 SA1251 SA1252 murG   TRUE 0.807 12.000 0.014 1.000   1.000
 103559 103560 SA1252 SA1253   ctpA FALSE 0.036 400.000 0.046 1.000   NA
 103560 103561 SA1253 SA1254 ctpA   FALSE 0.079 192.000 0.045 NA   NA
 103561 103562 SA1254 SA1255     TRUE 0.893 0.000 0.080 NA   NA
 103562 103563 SA1255 SA1256     TRUE 0.894 12.000 0.154 1.000 N 0.667
 103563 103564 SA1256 SA1257     TRUE 0.998 -7.000 0.615 0.002 Y -0.877
 103564 103565 SA1257 SA1258     FALSE 0.300 86.000 0.000 NA   0.867
 103565 103566 SA1258 SA1259   dfrA TRUE 0.743 15.000 0.000 NA   0.969
 103566 103567 SA1259 SA1260 dfrA thyA FALSE 0.326 200.000 0.295 1.000 N 0.916
 103567 103568 SA1260 SA1261 thyA   FALSE 0.041 424.000 0.003 NA   0.984
 103568 103569 SA1261 SA1262     TRUE 0.589 16.000 0.000 NA   -0.387
 103569 103570 SA1262 SA1263     TRUE 0.745 38.000 0.000 0.008   NA
 103570 103571 SA1263 SA1264     TRUE 0.805 12.000 0.167 NA   NA
 103572 103573 SA1265 SA1266     FALSE 0.050 482.000 0.039 NA   0.979
 103574 103575 SA1267 SA1268 ebhA ebhB TRUE 0.906 61.000 0.000 0.014 Y 0.940
 103575 103576 SA1268 SA1269 ebhB   FALSE 0.023 398.000 0.000 1.000   -0.585
 103576 103577 SA1269 SA1270     FALSE 0.024 156.000 0.000 1.000   -0.996
 103577 103578 SA1270 SA1271     TRUE 0.890 31.000 0.006 1.000 Y -0.828
 103578 103579 SA1271 SA1272     TRUE 0.703 95.000 0.012 1.000 Y 0.118
 103579 103580 SA1272 SA1273     FALSE 0.020 476.000 0.000 1.000 N -0.776
 103580 103581 SA1273 SA1274     TRUE 0.607 20.000 0.000 1.000   -0.813
 103583 103584 SA1276 SA1277     FALSE 0.304 84.000 0.000 NA   0.996
 103584 103585 SA1277 SA1278     FALSE 0.008 434.000 0.000 NA   NA
 103585 103586 SA1278 SA1279     FALSE 0.084 101.000 0.000 NA   NA
 103586 103587 SA1279 SA1280     TRUE 0.902 14.000 0.579 NA   NA
 103587 103588 SA1280 SA1281     TRUE 0.976 -7.000 0.165 NA   0.997
 103589 103590 SA1282 SA1283 recU pbp2 TRUE 0.983 -3.000 0.319 1.000   0.983
 103591 103592 SA1284 SA1285   nth TRUE 0.718 5.000 0.009 NA   -0.441
 103592 103593 SA1285 SA1286 nth   TRUE 0.992 -10.000 0.075 NA Y 0.994
 103593 103594 SA1286 SA1287   asnS FALSE 0.052 328.000 0.234 NA N -1.000
 103594 103595 SA1287 SA1288 asnS dinG FALSE 0.031 322.000 0.030 1.000 N -0.982
 103595 103596 SA1288 SA1289 dinG   TRUE 0.840 24.000 0.074 1.000 N 0.336
 103596 103597 SA1289 SA1290     TRUE 0.963 -13.000 0.023 1.000 N 0.014
 103597 103598 SA1290 SA1291     TRUE 0.913 5.000 0.126 1.000 N 0.783
 103598 103599 SA1291 SA1292     FALSE 0.035 244.000 0.038 NA   -0.938
 103599 103600 SA1292 SA1293     FALSE 0.048 336.000 0.013 NA   0.740
 103600 103601 SA1293 SA1294     TRUE 0.648 54.000 0.083 NA   0.899
 103601 103602 SA1294 SA1295     TRUE 0.977 -10.000 0.127 NA   0.953
 103602 103603 SA1295 SA1296     TRUE 0.884 14.000 0.353 NA   -0.558
 103603 103604 SA1296 SA1297   aroA TRUE 0.771 7.000 0.007 1.000 N -0.449
 103604 103605 SA1297 SA1298 aroA aroB TRUE 0.961 10.000 0.051 1.000 Y 0.939
 103605 103606 SA1298 SA1299 aroB aroC TRUE 0.968 26.000 0.110 0.002 Y -0.991
 103606 103607 SA1299 SA1300 aroC   FALSE 0.009 386.000 0.000 NA   NA
 103607 103608 SA1300 SAS045     FALSE 0.332 29.000 0.000 NA   NA
 103608 103609 SAS045 SA1301   ndk FALSE 0.176 55.000 0.000 NA   NA
 103609 103610 SA1301 SA1302 ndk gerCC TRUE 0.483 92.000 0.054 1.000 N 0.764
 103610 103611 SA1302 SA1303 gerCC gerCB TRUE 0.957 2.000 0.020 1.000 Y -0.998
 103611 103612 SA1303 SA1304 gerCB   TRUE 0.840 3.000 0.008 NA   0.549
 103612 103613 SA1304 SA1305   hu FALSE 0.033 431.000 0.000 NA   0.950
 103613 103614 SA1305 SA1306 hu gpsA FALSE 0.194 171.000 0.025 1.000 N 0.209
 103614 103615 SA1306 SA1307 gpsA   TRUE 0.872 17.000 0.068 1.000   1.000
 103615 103616 SA1307 SA1308     FALSE 0.038 222.000 0.032 1.000   -0.995
 103616 103617 SA1308 SAS046     FALSE 0.007 529.000 0.000 NA   NA
 103617 103618 SAS046 SA1309   cmk FALSE 0.081 106.000 0.000 NA   NA
 103620 103621 SA1311 SA1312   ebpS FALSE 0.028 402.000 0.022 1.000   -0.879
 103621 103622 SA1312 SA1313 ebpS   FALSE 0.337 153.000 0.079 1.000   0.951
 103622 103623 SA1313 SA1314     TRUE 0.980 -10.000 0.508 NA   -0.955
 103625 103626 SA1316 SA1317     FALSE 0.008 402.000 0.000 NA   NA
 103626 103627 SA1317 SA1318     FALSE 0.008 471.000 0.000 NA   NA
 103627 103628 SA1318 SA1319     FALSE 0.167 58.000 0.000 NA   NA
 103628 103629 SA1319 SA1320     FALSE 0.162 90.000 0.000 NA   -0.497
 103629 103630 SA1320 SA1321     TRUE 0.929 -7.000 0.000 NA   0.999
 103630 103631 SA1321 SA1322   srrB FALSE 0.004 304.000 0.000 NA   -0.964
 103631 103632 SA1322 SA1323 srrB srrA TRUE 0.994 -34.000 0.111 1.000 Y 1.000
 103632 103633 SA1323 SA1324 srrA rluB FALSE 0.342 133.000 0.046 1.000 N 1.000
 103633 103634 SA1324 SA1325 rluB   TRUE 0.964 -7.000 0.224 NA N -0.944
 103634 103635 SA1325 SA1326     TRUE 0.977 -7.000 0.570 NA   -0.978
 103637 103638 SA1328 SA1329 xerD   TRUE 0.679 49.000 0.029 1.000 N 0.990
 103638 103639 SA1329 SA1330     FALSE 0.236 105.000 0.021 1.000 N -0.928
 103641 103642 SA1332 SA1333     TRUE 0.759 16.000 0.000 NA   0.961
 103645 103646 SA1336 SA1337     FALSE 0.081 230.000 0.000 1.000 N 1.000
 103647 103648 SA1338 SA1339 malA malR TRUE 0.953 16.000 0.500 1.000 N 0.928
 103648 103649 SA1339 SA1340 malR   FALSE 0.102 194.000 0.000 1.000   0.527
 103649 103650 SA1340 SA1341     FALSE 0.030 467.000 0.000 1.000   0.396
 103650 103651 SA1341 SA1342   gnd FALSE 0.127 316.000 0.000 1.000 Y -0.962
 103651 103652 SA1342 SA1343 gnd   FALSE 0.410 68.000 0.035 1.000 N NA
 103652 103653 SA1343 SA1344     FALSE 0.007 569.000 0.000 NA   NA
 103653 103654 SA1344 SA1345     TRUE 0.830 14.000 0.097 NA   0.656
 103654 103655 SA1345 SA1346   bmfBB FALSE 0.033 351.000 0.058 NA   NA
 103655 103656 SA1346 SA1347 bmfBB bfmBAB TRUE 0.987 13.000 0.882 0.059 Y NA
 103656 103657 SA1347 SA1348 bfmBAB bfmBAA TRUE 0.997 0.000 0.897 0.002 Y -0.934
 103657 103658 SA1348 SA1349 bfmBAA   TRUE 0.964 16.000 0.414 1.000 Y -1.000
 103658 103659 SA1349 SA1350   recN FALSE 0.156 151.000 0.002 1.000 N -0.694
 103659 103660 SA1350 SA1351 recN ahrC TRUE 0.881 16.000 0.056 1.000 N 0.990
 103660 103661 SA1351 SA1352 ahrC ispA FALSE 0.012 432.000 0.000 1.000 N -0.959
 103661 103662 SA1352 SA1353 ispA   TRUE 0.979 -22.000 0.100 1.000 N 1.000
 103662 103663 SA1353 SA1354     TRUE 0.997 -7.000 0.412 0.001 Y -0.979
 103663 103664 SA1354 SA1355   nusB TRUE 0.790 17.000 0.011 1.000 N -0.400
 103664 103665 SA1355 SA1356 nusB   TRUE 0.672 60.000 0.265 NA   -0.314
 103665 103666 SA1356 SA1357   accC TRUE 0.925 15.000 0.373 NA   0.903
 103666 103667 SA1357 SA1358 accC accB TRUE 0.994 0.000 0.086 0.003 Y 0.760
 103667 103668 SA1358 SA1359 accB   FALSE 0.075 474.000 0.120 1.000 N 0.497
 103668 103669 SA1359 SA1360     TRUE 0.857 26.000 0.160 1.000 N -0.242
 103670 103671 SA1361 SA1362     TRUE 0.937 14.000 1.000 NA   -0.557
 103674 103675 SA1365 SA1366     TRUE 0.997 -7.000 0.316 0.001 Y -0.922
 103675 103676 SA1366 SA1367     TRUE 0.986 20.000 0.092 0.001 Y 0.993
 103676 103677 SA1367 SA1368     TRUE 0.563 159.000 0.019 1.000 Y 0.891
 103677 103678 SA1368 SA1369     FALSE 0.049 233.000 0.029 NA N NA
 103678 103679 SA1369 SA1370     TRUE 0.938 -82.000 0.054 NA   NA
 103679 103680 SA1370 SA1371     TRUE 0.811 -13.000 0.000 NA   NA
 103680 103681 SA1371 SA1372     TRUE 0.981 -10.000 0.000 NA Y NA
 103681 103682 SA1372 SA1373     TRUE 0.978 14.000 0.861 1.000 Y NA
 103682 103683 SA1373 SA1374     TRUE 0.997 -28.000 0.639 1.000 Y -0.208
 103683 103684 SA1374 SA1375     TRUE 0.610 52.000 0.015 1.000   0.831
 103684 103685 SA1375 SA1376     TRUE 0.942 -3.000 0.015 NA   0.895
 103685 103686 SA1376 SA1377   glcK TRUE 0.921 0.000 0.024 NA   0.811
 103686 103687 SA1377 SA1378 glcK   TRUE 0.974 -3.000 0.496 NA   NA
 103687 103688 SA1378 SA1379     TRUE 0.939 -19.000 0.058 NA   NA
 103688 103689 SA1379 SA1380     TRUE 0.568 12.000 0.006 1.000   -0.965
 103689 103690 SA1380 SAS047   rpmG FALSE 0.095 209.000 0.045 1.000 N NA
 103690 103691 SAS047 SA1381 rpmG pbp3 FALSE 0.238 113.000 0.019 1.000 N NA
 103691 103692 SA1381 SA1382 pbp3 sodA FALSE 0.225 121.000 0.085 1.000 N -0.993
 103692 103693 SA1382 SA1383 sodA   FALSE 0.245 276.000 0.000 1.000 Y 0.883
 103693 103694 SA1383 SA1384     TRUE 0.996 -13.000 0.480 1.000 Y -0.331
 103694 103695 SA1384 SA1385     TRUE 0.933 42.000 0.148 1.000 Y 0.958
 103695 103696 SA1385 SA1386     FALSE 0.283 144.000 0.012 1.000 N 0.860
 103696 103697 SA1386 SA1387     TRUE 0.949 10.000 0.104 1.000 Y -0.872
 103697 103698 SA1387 SA1388     FALSE 0.200 114.000 0.032 NA   -0.756
 103698 103699 SA1388 SA1389     TRUE 0.908 3.000 0.283 NA   -0.933
 103699 103700 SA1389 SA1390   sigA FALSE 0.383 131.000 0.239 NA   -0.435
 103700 103701 SA1390 SA1391 sigA dnaG FALSE 0.192 224.000 0.209 1.000 N 0.172
 103701 103702 SA1391 SA1392 dnaG   TRUE 0.476 61.000 0.011 NA   0.733
 103702 103703 SA1392 SA1393     TRUE 0.943 11.000 0.621 NA   0.891
 103705 103706 SA1395 SA1396   era TRUE 0.876 22.000 0.108 1.000   0.820
 103706 103707 SA1396 SA1397 era cdd TRUE 0.927 1.000 0.098 1.000   -0.389
 103707 103708 SA1397 SA1398 cdd   TRUE 0.750 11.000 0.108 1.000 N -0.997
 103708 103709 SA1398 SA1399     TRUE 0.698 3.000 0.007 NA   NA
 103709 103710 SA1399 SA1400   phoH TRUE 0.954 1.000 0.457 NA   NA
 103710 103711 SA1400 SA1401 phoH   FALSE 0.031 304.000 0.000 NA   0.383
 103711 103712 SA1401 SA1402     TRUE 0.843 17.000 0.055 NA   0.801
 103712 103713 SA1402 SA1403     TRUE 0.869 18.000 0.258 NA   -0.829
 103713 103714 SA1403 SA1404   rpsU FALSE 0.036 220.000 0.011 NA   NA
 103714 103715 SA1404 SA1405 rpsU   FALSE 0.038 293.000 0.016 1.000   NA
 103715 103716 SA1405 SA1406     TRUE 0.879 7.000 0.163 NA   0.523
 103716 103717 SA1406 SA1407     TRUE 0.950 2.000 0.227 NA   0.766
 103717 103718 SA1407 SA1408   dnaJ TRUE 0.932 4.000 0.133 1.000 N 0.949
 103718 103719 SA1408 SA1409 dnaJ dnaK TRUE 0.877 136.000 0.196 0.002 Y 0.974
 103719 103720 SA1409 SA1410 dnaK grpE TRUE 0.917 69.000 0.224 0.006 Y NA
 103720 103721 SA1410 SA1411 grpE hrcA TRUE 0.827 32.000 0.286 1.000 N NA
 103721 103722 SA1411 SA1412 hrcA hemN TRUE 0.504 101.000 0.082 1.000 N 0.992
 103726 103727 SA1415 SA1416     TRUE 0.621 57.000 0.163 1.000   -0.857
 103727 103728 SA1416 SA1417   comEB TRUE 0.844 5.000 0.055 1.000   -0.306
 103728 103729 SA1417 SA1418 comEB   TRUE 0.550 92.000 0.095 1.000 N 0.983
 103729 103730 SA1418 SA1419     FALSE 0.417 49.000 0.033 1.000   -0.966
 103730 103731 SA1419 SA1420     TRUE 0.915 3.000 0.085 NA   0.988
 103731 103732 SA1420 SA1421     TRUE 0.946 1.000 0.149 NA   0.823
 103732 103733 SA1421 SA1422     TRUE 0.993 -10.000 0.199 1.000 Y -0.681
 103733 103734 SA1422 SA1423     TRUE 0.888 3.000 0.150 NA N NA
 103734 103735 SA1423 SA1424   aroE TRUE 0.825 4.000 0.089 NA N NA
 103735 103736 SA1424 SA1425 aroE   TRUE 0.889 14.000 0.336 1.000   -0.850
 103736 103737 SA1425 SA1426     TRUE 0.975 1.000 0.555 1.000   0.380
 103737 103738 SA1426 SA1427   pfs TRUE 0.708 20.000 0.019 1.000   -0.863
 103740 103741 SA1429 SA1430     FALSE 0.292 149.000 0.000 0.017   NA
 103741 103742 SA1430 SA1431     FALSE 0.030 707.000 0.000 1.000   1.000
 103742 103743 SA1431 SA1432     FALSE 0.010 289.000 0.000 1.000   -0.985
 103743 103744 SA1432 SA1433     TRUE 0.869 13.000 0.084 1.000   0.914
 103744 103745 SA1433 SA1434     TRUE 0.950 0.000 0.062 1.000   0.862
 103745 103746 SA1434 SA1435     TRUE 0.977 14.000 0.031 0.003 Y 1.000
 103746 103747 SA1435 SA1436     TRUE 0.973 2.000 0.429 1.000 N 0.994
 103747 103748 SA1436 SA1437     TRUE 0.998 -10.000 0.184 0.002 Y 0.996
 103748 103749 SA1437 SA1438   greA FALSE 0.017 326.000 0.000 1.000 N -0.957
 103749 103750 SA1438 SA1439 greA udk TRUE 0.795 28.000 0.095 1.000 N -0.604
 103750 103751 SA1439 SA1440 udk   TRUE 0.955 0.000 0.100 1.000 N 0.530
 103751 103752 SA1440 SA1441     TRUE 0.987 12.000 0.156 0.001 Y 0.945
 103752 103753 SA1441 SA1442     TRUE 0.938 3.000 0.142 1.000   0.829
 103753 103754 SA1442 SA1443     FALSE 0.021 285.000 0.000 NA   -0.522
 103754 103755 SA1443 SA1444     TRUE 0.908 15.000 0.651 NA   -0.923
 103755 103756 SA1444 SA1445     TRUE 0.810 61.000 0.537 NA   0.986
 103756 103757 SA1445 SA1446   alaS TRUE 0.549 63.000 0.110 NA   -0.022
 103757 103758 SA1446 SA1447 alaS   FALSE 0.058 343.000 0.000 1.000 N 0.974
 103758 103759 SA1447 SA1448     TRUE 0.964 2.000 0.281 1.000   0.877
 103759 103760 SA1448 SA1449     FALSE 0.028 695.000 0.038 1.000   -0.839
 103760 103761 SA1449 SA1450     TRUE 0.935 1.000 0.072 1.000 N 0.197
 103763 103764 SAS049 SA1452   csbD FALSE 0.236 40.000 0.000 NA   NA
 103764 103765 SA1452 SA1453 csbD   FALSE 0.085 100.000 0.000 NA   NA
 103767 103768 SA1455 SAS050     FALSE 0.020 214.000 0.000 NA   NA
 103768 103769 SAS050 SA1456   aspS FALSE 0.050 146.000 0.000 NA   NA
 103769 103770 SA1456 SA1457 aspS hisS TRUE 0.983 16.000 0.161 0.049 Y 0.864
 103770 103771 SA1457 SA1458 hisS lytH FALSE 0.020 461.000 0.000 1.000 N -0.785
 103771 103772 SA1458 SA1459 lytH   TRUE 0.955 -3.000 0.010 1.000 N 0.865
 103772 103773 SA1459 SA1460   relA TRUE 0.898 12.000 0.177 1.000 N 0.569
 103773 103774 SA1460 SA1461 relA apt FALSE 0.073 428.000 0.068 1.000 N 0.769
 103774 103775 SA1461 SA1462 apt   TRUE 0.896 22.000 0.128 1.000 N 0.910
 103775 103776 SA1462 SA1463   secF FALSE 0.045 203.000 0.007 1.000 N -0.988
 103776 103777 SA1463 SA1464 secF   FALSE 0.166 275.000 0.005 NA Y NA
 103777 103778 SA1464 SA1465   tgt TRUE 0.884 19.000 0.325 NA N NA
 103778 103779 SA1465 SA1466 tgt queA TRUE 0.988 23.000 0.360 0.001 Y 0.059
 103779 103780 SA1466 SA1467 queA ruvB TRUE 0.928 2.000 0.069 1.000 N 0.365
 103780 103781 SA1467 SA1468 ruvB ruvA TRUE 0.986 32.000 0.549 0.002 Y 0.792
 103781 103782 SA1468 SA1469 ruvA   TRUE 0.802 14.000 0.009 1.000   0.811
 103782 103783 SA1469 SA1470   obg TRUE 0.846 10.000 0.024 1.000   0.908
 103783 103784 SA1470 SA1471 obg rpmA FALSE 0.151 354.000 0.335 1.000   1.000
 103784 103785 SA1471 SA1472 rpmA   TRUE 0.941 12.000 0.203 NA Y -0.987
 103785 103786 SA1472 SA1473   rplU TRUE 0.958 6.000 0.208 NA Y -0.911
 103786 103787 SA1473 SA1474 rplU   FALSE 0.097 236.000 0.008 1.000 N 0.677
 103787 103788 SA1474 SA1475     TRUE 0.997 0.000 0.550 0.003 Y 0.622
 103788 103789 SA1475 SA1476     FALSE 0.008 392.000 0.000 NA   NA
 103791 103792 SA1478 SA1479     FALSE 0.008 449.000 0.000 NA   NA
 103794 103795 SA1481 SA1482 ant(9) tnpC FALSE 0.046 151.000 0.000 NA   NA
 103795 103796 SA1482 SA1483 tnpC tnpB FALSE 0.429 7.000 0.000 NA   NA
 103796 103797 SA1483 SA1484 tnpB tnpA TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.009 Y NA
 103797 103798 SA1484 SA1485 tnpA radC TRUE 0.533 119.000 0.000 1.000 Y NA
 103798 103799 SA1485 SA1486 radC   TRUE 0.947 -3.000 0.000 1.000 N 0.949
 103799 103800 SA1486 SA1487   folC FALSE 0.077 270.000 0.000 1.000 N 0.931
 103800 103801 SA1487 SA1488 folC valS TRUE 0.812 13.000 0.006 1.000 N 0.851
 103803 103804 SA1490 SAS051     FALSE 0.272 34.000 0.000 NA   NA
 103804 103805 SAS051 SA1491   hemL FALSE 0.123 73.000 0.000 NA   NA
 103805 103806 SA1491 SA1492 hemL hemB TRUE 0.958 48.000 0.126 0.003 Y 0.999
 103806 103807 SA1492 SA1493 hemB hemD TRUE 0.989 3.000 0.042 0.003 Y 1.000
 103807 103808 SA1493 SA1494 hemD hemC TRUE 0.979 22.000 0.020 0.003 Y 0.988
 103808 103809 SA1494 SA1495 hemC hemX TRUE 0.723 42.000 0.040 1.000 N 0.997
 103809 103810 SA1495 SA1496 hemX hemA TRUE 0.952 22.000 0.613 1.000 N 0.988
 103810 103811 SA1496 SA1497 hemA   FALSE 0.124 217.000 0.020 1.000   0.995
 103811 103812 SA1497 SA1498   clpX FALSE 0.165 154.000 0.043 1.000   NA
 103812 103813 SA1498 SA1499 clpX tig TRUE 0.716 151.000 0.033 0.002 Y NA
 103813 103814 SA1499 SA1500 tig   FALSE 0.055 163.000 0.012 NA   -0.956
 103814 103815 SA1500 SA1501     TRUE 0.903 19.000 0.195 NA   0.928
 103815 103816 SA1501 SA1502   rplT FALSE 0.236 142.000 0.004 1.000   0.607
 103816 103817 SA1502 SA1503 rplT rpmI TRUE 0.972 47.000 0.928 0.019 Y NA
 103817 103818 SA1503 SA1504 rpmI infC TRUE 0.968 29.000 0.652 1.000 Y NA
 103818 103819 SA1504 SA1505 infC lysP FALSE 0.090 238.000 0.004 1.000 N 0.615
 103819 103820 SA1505 SA1506 lysP thrS FALSE 0.048 426.000 0.000 1.000 N 0.952
 103820 103821 SA1506 SA1507 thrS dnaI FALSE 0.095 413.000 0.000 0.100 N 0.980
 103821 103822 SA1507 SA1508 dnaI dnaB TRUE 0.994 0.000 0.817 NA Y 0.996
 103822 103823 SA1508 SA1509 dnaB   TRUE 0.947 1.000 0.109 NA N 0.958
 103823 103824 SA1509 SA1510   gapB FALSE 0.079 211.000 0.004 NA N 0.296
 103824 103825 SA1510 SA1511 gapB   FALSE 0.235 170.000 0.020 1.000 N 0.880
 103825 103826 SA1511 SA1512     TRUE 0.890 16.000 0.066 1.000 N 0.951
 103826 103827 SA1512 SA1513   polA TRUE 0.955 16.000 0.101 1.000 Y -0.651
 103827 103828 SA1513 SA1514 polA   FALSE 0.012 294.000 0.000 NA   NA
 103828 103829 SA1514 SA1515   phoR FALSE 0.007 499.000 0.000 NA   NA
 103829 103830 SA1515 SA1516 phoR phoP TRUE 0.996 -3.000 0.159 0.051 Y 0.988
 103830 103831 SA1516 SA1517 phoP citC FALSE 0.005 390.000 0.000 1.000 N -1.000
 103831 103832 SA1517 SA1518 citC citZ TRUE 0.914 49.000 0.140 1.000 Y 0.877
 103834 103835 SA1520 SA1521 pykA pfkA TRUE 0.987 22.000 0.261 0.005 Y 0.972
 103835 103836 SA1521 SA1522 pfkA accA FALSE 0.042 314.000 0.047 1.000 N -0.958
 103836 103837 SA1522 SA1523 accA   TRUE 0.994 0.000 0.234 0.001 Y -0.975
 103837 103838 SA1523 SA1524     FALSE 0.057 195.000 0.010 1.000 N -0.980
 103838 103839 SA1524 SA1525   dnaE FALSE 0.089 450.000 0.127 1.000 N 0.997
 103839 103840 SA1525 SA1526 dnaE   TRUE 0.902 21.000 0.159 1.000   0.887
 103840 103841 SA1526 SA1527     FALSE 0.066 312.000 0.113 1.000   NA
 103847 103848 SA1533 SA1534 ackA   TRUE 0.498 88.000 0.217 1.000 N -0.937
 103848 103849 SA1534 SA1535     TRUE 0.450 123.000 0.089 1.000 N 0.980
 103849 103850 SA1535 SA1536     FALSE 0.391 98.000 0.009 1.000   0.865
 103850 103851 SA1536 SA1537     TRUE 0.610 44.000 0.016 1.000   0.330
 103851 103852 SA1537 SA1538     TRUE 0.976 0.000 0.349 1.000 N 0.594
 103852 103853 SA1538 SA1539     FALSE 0.119 373.000 0.201 1.000 N 1.000
 103854 103855 SA1540 SAS052   rpsD FALSE 0.067 244.000 0.005 NA N 0.603
 103855 103856 SAS052 SA1541 rpsD tnp FALSE 0.061 192.000 0.000 1.000 N NA
 103858 103859 SA1543 SA1544     FALSE 0.355 115.000 0.027 1.000 N 0.406
 103859 103860 SA1544 SA1545   serA TRUE 0.994 -13.000 0.113 1.000 Y 1.000
 103861 103862 SA1546 SA1547   ptaA FALSE 0.266 107.000 0.062 NA   -0.706
 103862 103863 SA1547 SA1548 ptaA   FALSE 0.228 128.000 0.025 1.000 N -0.808
 103867 103868 SA1552 SA1553   fhs FALSE 0.056 333.000 0.000 1.000   0.954
 103868 103869 SA1553 SA1554 fhs acsA FALSE 0.040 440.000 0.000 1.000 N 0.765
 103870 103871 SA1555 SA1556 acuA acuC TRUE 0.850 25.000 0.075 1.000   0.997
 103872 103873 SA1557 SA1558 ccpA   FALSE 0.013 585.000 0.017 1.000 N -0.999
 103873 103874 SA1558 SA1559     FALSE 0.026 694.000 0.000 NA   0.992
 103874 103875 SA1559 SA1560     TRUE 0.654 74.000 0.222 NA   0.964
 103875 103876 SA1560 SA1561   murC FALSE 0.051 74.000 0.014 NA   -1.000
 103876 103877 SA1561 SA1562 murC   TRUE 0.925 24.000 0.017 0.004 N 0.776
 103877 103878 SA1562 SA1563     TRUE 0.867 21.000 0.143 1.000   -0.120
 103878 103879 SA1563 SA1564     TRUE 0.844 29.000 0.511 NA   -0.985
 103879 103880 SA1564 SA1565     TRUE 0.487 100.000 0.500 NA   -0.990
 103880 103881 SA1565 SA1566     TRUE 0.596 65.000 0.081 1.000 N 0.162
 103883 103884 SA1568 SA1569     FALSE 0.070 471.000 0.117 1.000   0.474
 103884 103885 SA1569 SA1570     TRUE 0.883 15.000 0.154 1.000   0.403
 103885 103886 SA1570 SA1571     FALSE 0.035 550.000 0.000 1.000 N 1.000
 103886 103887 SA1571 SA1572     TRUE 0.961 4.000 0.143 1.000 Y -0.986
 103887 103888 SA1572 SA1573     FALSE 0.029 558.000 0.000 NA   0.970
 103888 103889 SA1573 SA1574     TRUE 0.825 17.000 0.233 NA   -0.976
 103889 103890 SA1574 SA1575     TRUE 0.961 -3.000 0.233 1.000   -0.942
 103892 103893 SA1577 SA1578     FALSE 0.014 326.000 0.000 NA N NA
 103893 103894 SA1578 SA1579   leuS TRUE 0.589 22.000 0.007 NA N NA
 103894 103895 SA1579 SA1580 leuS   FALSE 0.043 291.000 0.000 1.000 N -0.172
 103896 103897 SA1581 SA1582     TRUE 0.984 -3.000 0.408 1.000   0.999
 103898 103899 SA1583 SA1584 rot   FALSE 0.040 511.000 0.000 1.000   0.949
 103901 103902 SA1586 SA1587 ribH ribA TRUE 0.978 13.000 0.022 0.002 Y 0.873
 103902 103903 SA1587 SA1588 ribA ribB TRUE 0.954 11.000 0.026 1.000 Y 0.818
 103903 103904 SA1588 SA1589 ribB ribD TRUE 0.982 7.000 0.456 1.000 Y 0.998
 103904 103905 SA1589 SA1590 ribD   FALSE 0.027 481.000 0.000 NA   0.860
 103906 103907 SA1591 SA1592     TRUE 0.917 0.000 0.000 1.000 N 0.999
 103908 103909 SA1593 SA1594     FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 103910 103911 SA1595 SA1596     TRUE 0.440 113.000 0.150 NA   1.000
 103915 103916 SA1600 SA1601     FALSE 0.088 178.000 0.034 NA   NA
 103916 103917 SA1601 SA1602     TRUE 0.994 -3.000 0.069 0.079 Y 0.680
 103917 10750584 SA1602 SA1605     FALSE 0.031 462.000 0.000 NA   0.945
 103921 103922 SA1606 SA1607     FALSE 0.168 212.000 0.222 NA   -0.255
 103922 103923 SA1607 SA1608   metK FALSE 0.344 119.000 0.054 NA   0.859
 103924 103925 SA1609 SA1610 pckA   FALSE 0.193 124.000 0.000 NA   0.773
 103926 103927 SA1611 SA1612     TRUE 0.980 -19.000 0.182 1.000   0.036
 103929 103930 SA1614 SA1615 menC menE TRUE 0.877 5.000 0.029 1.000 N 0.834
 103930 103931 SA1615 SA1616 menE   FALSE 0.114 159.000 0.000 NA   0.516
 103932 103933 SA1617 SA1618     FALSE 0.299 81.000 0.000 NA   0.999
 103933 103934 SA1618 SA1619     FALSE 0.325 75.000 0.000 NA   0.998
 103934 103935 SA1619 SA1620     FALSE 0.232 41.000 0.000 NA   NA
 103935 103936 SA1620 SA1621     FALSE 0.084 101.000 0.000 NA   NA
 10750585 103939 SA1623 SA1624   tnp FALSE 0.008 755.000 0.000 NA   -0.827
 103939 103940 SA1624 SA1625 tnp   FALSE 0.078 452.000 0.000 0.055   1.000
 103940 103941 SA1625 SA1626     TRUE 0.995 -7.000 0.011 0.055 Y 0.963
 103941 103942 SA1626 SA1627   splF FALSE 0.022 361.000 0.000 1.000 N NA
 103942 103943 SA1627 SA1628 splF splD TRUE 0.762 158.000 0.200 0.004 Y NA
 103943 103944 SA1628 SA1629 splD splC TRUE 0.853 121.000 0.200 0.004 Y -0.567
 103944 103945 SA1629 SA1630 splC splB TRUE 0.956 58.000 0.200 0.004 Y 0.931
 103945 103946 SA1630 SA1631 splB splA TRUE 0.816 125.000 0.200 0.004 Y -0.961
 103946 103947 SA1631 SA1632 splA   FALSE 0.008 436.000 0.000 NA   NA
 103950 103951 SA1635 SA1636     TRUE 0.799 5.000 0.103 NA   NA
 103952 103953 SA1637 SA1638 lukD lukE TRUE 0.928 2.000 0.000 0.004   -0.948
 103954 103955 SA1639 SA1640     FALSE 0.013 834.000 0.000 NA   -0.431
 103955 103956 SA1640 SA1641     FALSE 0.028 335.000 0.000 NA   0.376
 103957 103958 SA1642 SA1643 seg sen FALSE 0.156 283.000 0.000 0.017   0.975
 103958 103959 SA1643 SA1644 sen yent2 TRUE 0.908 18.000 0.000 0.017   1.000
 103959 103960 SA1644 SA1645 yent2 yent1 TRUE 0.984 -40.000 0.000 0.017   0.992
 103960 103961 SA1645 SA1646 yent1 sei FALSE 0.274 154.000 0.000 0.017   NA
 103961 103962 SA1646 SA1647 sei sem TRUE 0.745 35.000 0.000 0.017   NA
 103962 103963 SA1647 SA1648 sem seo FALSE 0.153 281.000 0.000 0.017   0.900
 103963 2137131 SA1648 SAtRNA19 seo   FALSE 0.020 214.000 0.000 NA   NA
 2137131 2137132 SAtRNA19 SAtRNA20     FALSE 0.176 55.000 0.000 NA   NA
 2137132 2137133 SAtRNA20 SAtRNA21     TRUE 0.603 2.000 0.000 NA   NA
 2137133 2137134 SAtRNA21 SAtRNA22     TRUE 0.435 18.000 0.000 NA   NA
 2137134 2137135 SAtRNA22 SAtRNA23     FALSE 0.424 16.000 0.000 NA   NA
 2137135 2137136 SAtRNA23 SAtRNA24     FALSE 0.386 14.000 0.000 NA   NA
 2137136 2137137 SAtRNA24 SAtRNA25     TRUE 0.438 17.000 0.000 NA   NA
 2137137 2137138 SAtRNA25 SAtRNA26     FALSE 0.395 22.000 0.000 NA   NA
 2137138 103964 SAtRNA26 SA1649     FALSE 0.008 401.000 0.000 NA   NA
 103964 103965 SA1649 SA1650   hemY FALSE 0.069 323.000 0.057 NA   0.804
 103965 103966 SA1650 SA1651 hemY hemH TRUE 0.958 24.000 0.069 0.027 Y -0.982
 103966 103967 SA1651 SA1652 hemH hemE TRUE 0.897 58.000 0.131 1.000 Y 0.991
 103969 103970 SA1654 SA1655     TRUE 0.971 -7.000 0.083 NA N 0.893
 103971 103972 SA1656 SA1657 hit   FALSE 0.225 142.000 0.137 NA   -0.884
 103972 103973 SA1657 SA1658     FALSE 0.067 735.000 0.190 NA   0.564
 103973 103974 SA1658 SA1659   prsA FALSE 0.065 205.000 0.000 NA   0.503
 103975 103976 SA1660 SA1661 cbf1   TRUE 0.976 -3.000 0.291 NA   0.666
 103976 103977 SA1661 SA1662     TRUE 0.986 -10.000 0.330 NA   0.939
 103977 103978 SA1662 SA1663     FALSE 0.057 928.000 0.093 NA   0.968
 103978 103979 SA1663 SA1664     TRUE 0.593 69.000 0.321 NA   NA
 103979 103980 SA1664 SA1665     FALSE 0.082 179.000 0.029 NA   NA
 103980 103981 SA1665 SA1666     FALSE 0.315 356.000 0.000 0.016 Y 0.863
 103981 103982 SA1666 SA1667     TRUE 0.987 22.000 0.536 0.011 Y -0.693
 103984 103985 SA1669 SA1670 citG   FALSE 0.127 196.000 0.009 NA   0.960
 103985 103986 SA1670 SAS053     FALSE 0.093 548.000 0.571 NA   NA
 103986 103987 SAS053 SA1671     TRUE 0.582 25.000 0.021 NA   NA
 103987 103988 SA1671 SA1672     FALSE 0.270 159.000 0.021 1.000 N 0.977
 103988 103989 SA1672 SA1673     TRUE 0.813 5.000 0.077 1.000 N -0.947
 103989 103990 SA1673 SA1674     FALSE 0.288 151.000 0.044 1.000 N 0.681
 103990 103991 SA1674 SA1675     TRUE 0.994 -13.000 0.154 1.000 Y 0.121
 103991 103992 SA1675 SA1676     FALSE 0.045 390.000 0.077 1.000   -0.853
 2137139 2137140 SAtRNA27 SAtRNA28     FALSE 0.241 39.000 0.000 NA   NA
 2137140 2137141 SAtRNA28 SAtRNA29     FALSE 0.082 104.000 0.000 NA   NA
 2137141 2137142 SAtRNA29 SAtRNA30     FALSE 0.420 8.000 0.000 NA   NA
 2137142 2137143 SAtRNA30 SAtRNA31     TRUE 0.443 6.000 0.000 NA   NA
 2137143 2137144 SAtRNA31 SAtRNA32     FALSE 0.397 12.000 0.000 NA   NA
 2137144 2137145 SAtRNA32 SAtRNA33     TRUE 0.553 3.000 0.000 NA   NA
 2137145 2137146 SAtRNA33 SAtRNA34     FALSE 0.424 16.000 0.000 NA   NA
 2137146 2137147 SAtRNA34 SAtRNA35     TRUE 0.443 6.000 0.000 NA   NA
 2137147 2137148 SAtRNA35 SAtRNA36     FALSE 0.420 8.000 0.000 NA   NA
 2137148 2137149 SAtRNA36 SAtRNA37     FALSE 0.424 19.000 0.000 NA   NA
 2137149 2137150 SAtRNA37 SAtRNA38     FALSE 0.395 22.000 0.000 NA   NA
 2137150 2137151 SAtRNA38 SAtRNA39     FALSE 0.403 15.000 0.000 NA   NA
 2137151 2137152 SAtRNA39 SAtRNA40     FALSE 0.241 39.000 0.000 NA   NA
 2137152 2137153 SAtRNA40 SAtRNA41     FALSE 0.407 11.000 0.000 NA   NA
 2137153 2137154 SAtRNA41 SAtRNA42     FALSE 0.413 10.000 0.000 NA   NA
 2137154 2137155 SAtRNA42 SAtRNA43     FALSE 0.359 26.000 0.000 NA   NA
 2137155 2137156 SAtRNA43 SAtRNA44     FALSE 0.395 22.000 0.000 NA   NA
 2137156 2137157 SAtRNA44 SAtRNA45     TRUE 0.435 18.000 0.000 NA   NA
 2137157 2137158 SAtRNA45 SAtRNA46     FALSE 0.413 10.000 0.000 NA   NA
 2137158 2137159 SAtRNA46 SAtRNA47     FALSE 0.424 19.000 0.000 NA   NA
 2137159 2137160 SAtRNA47 SAtRNA48     FALSE 0.407 11.000 0.000 NA   NA
 2137160 2137161 SAtRNA48 SAtRNA49     TRUE 0.500 4.000 0.000 NA   NA
 2137161 2137162 SAtRNA49 SAtRNA50     TRUE 0.500 4.000 0.000 NA   NA
 2137162 2137163 SAtRNA50 SAtRNA51     TRUE 0.443 6.000 0.000 NA   NA
 2137163 2137164 SAtRNA51 SAtRNA52     TRUE 0.438 17.000 0.000 NA   NA
 2137164 2137165 SAtRNA52 SArRNA08     FALSE 0.397 12.000 0.000 NA   NA
 2137165 2137166 SArRNA08 SArRNA09     FALSE 0.123 73.000 0.000 NA   NA
 2137166 2137167 SArRNA09 SAtRNA53     FALSE 0.020 214.000 0.000 NA   NA
 2137167 2137168 SAtRNA53 SAtRNA54     FALSE 0.424 19.000 0.000 NA   NA
 2137168 2137169 SAtRNA54 SArRNA10     FALSE 0.096 90.000 0.000 NA   NA
 2137169 103994 SArRNA10 SA1678     FALSE 0.007 741.000 0.000 NA   NA
 103994 103995 SA1678 SA1679     TRUE 0.469 97.000 0.146 1.000 N -0.638
 103995 103996 SA1679 SA1680     TRUE 0.862 6.000 0.017 1.000 N 0.878
 103997 103998 SA1681 SA1682 gsaB   FALSE 0.101 293.000 0.102 NA   0.955
 103999 104000 SA1683 SA1684     FALSE 0.098 291.000 0.077 NA N 0.915
 104000 104001 SA1684 SA1685     FALSE 0.068 303.000 0.011 NA N 0.947
 104003 104004 SA1687 SA1688     TRUE 0.925 9.000 0.727 NA   -0.823
 104004 104005 SA1688 SA1689     TRUE 0.896 15.000 0.186 NA   0.957
 104005 104006 SA1689 SA1690     TRUE 0.925 -22.000 0.045 NA   -0.907
 104006 104007 SA1690 SA1691   sgtB FALSE 0.092 260.000 0.004 1.000   0.956
 104007 104008 SA1691 SA1692 sgtB   FALSE 0.014 340.000 0.000 1.000   -0.946
 104008 104009 SA1692 SAS054     FALSE 0.199 131.000 0.074 NA   NA
 104011 104012 SA1694 SA1695   ampS TRUE 0.698 90.000 0.545 NA N 1.000
 104012 104013 SA1695 SA1696 ampS   TRUE 0.770 12.000 0.125 NA   NA
 104014 104015 SA1697 SA1698     TRUE 0.809 7.000 0.010 NA   0.940
 104015 104016 SA1698 SA1699     FALSE 0.052 278.000 0.000 NA   0.948
 104017 104018 SA1700 SA1701 vraR vraS TRUE 0.999 -10.000 0.853 0.011 Y 0.810
 104018 104019 SA1701 SA1702 vraS   TRUE 0.986 -3.000 0.679 NA   0.832
 104019 104020 SA1702 SA1703     TRUE 0.837 15.000 0.086 NA   0.695
 104020 104021 SA1703 SA1704   map FALSE 0.067 217.000 0.051 NA   -0.726
 104023 104024 SA1706 SA1707     FALSE 0.004 186.000 0.000 NA   -0.999
 104024 104025 SA1707 SA1708     TRUE 0.969 2.000 0.796 1.000   NA
 104026 104027 SA1709 SA1710     FALSE 0.016 390.000 0.000 1.000 N -0.938
 104028 104029 SA1711 SA1712     FALSE 0.081 247.000 0.015 NA   0.921
 104029 104030 SA1712 SA1713     FALSE 0.127 170.000 0.047 NA   -0.686
 104030 104031 SA1713 SA1714     TRUE 0.698 81.000 0.299 1.000 N 0.997
 104031 104032 SA1714 SA1715     FALSE 0.054 768.000 0.034 1.000 N 0.842
 104032 104033 SA1715 SA1716     TRUE 0.991 13.000 0.492 0.001 Y 0.987
 104033 104034 SA1716 SA1717     TRUE 0.995 2.000 0.643 0.001 Y -0.939
 104036 104037 SA1719 SA1720   lig TRUE 0.800 13.000 0.030 NA   0.901
 104037 104038 SA1720 SA1721 lig pcrA TRUE 0.988 4.000 0.103 0.014 Y 0.942
 104038 104039 SA1721 SA1722 pcrA pcrB TRUE 0.965 -3.000 0.054 1.000   0.961
 104039 104040 SA1722 SA1723 pcrB   FALSE 0.139 172.000 0.031 1.000   -0.756
 104040 104041 SA1723 SA1724   purB FALSE 0.157 109.000 0.006 1.000   -0.955
 104042 104043 SA1725 SA1726     TRUE 0.705 31.000 0.000 1.000   0.909
 104044 104045 SA1727 SA1728   nadE FALSE 0.067 271.000 0.023 NA   1.000
 104045 104046 SA1728 SA1729 nadE   TRUE 0.997 -7.000 0.194 0.001 Y -0.939
 104047 104048 SA1730 SA1731     TRUE 0.950 20.000 0.022 1.000 Y 0.518
 104049 104050 SA1732 SA1733     FALSE 0.044 205.000 0.000 1.000   NA
 104051 104052 SA1734 SA1735     FALSE 0.418 53.000 0.020 1.000 N -0.946
 104052 104053 SA1735 SA1736   aldH FALSE 0.196 418.000 0.008 1.000 Y 0.952
 104056 104057 SAS055 SAS056 tnp   FALSE 0.009 385.000 0.000 NA   NA
 104059 104060 SA1740 SA1741     TRUE 0.974 -3.000 0.545 NA   -0.910
 104060 104061 SA1741 SA1742     TRUE 0.820 60.000 0.636 NA   0.998
 104063 104064 SA1744 SA1745     TRUE 0.960 0.000 0.615 NA   -0.993
 104064 104065 SA1745 SA1746     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   1.000
 104065 104066 SA1746 SA1747     TRUE 0.631 1.000 0.000 NA   NA
 104066 104067 SA1747 SA1748     TRUE 0.972 -3.000 0.292 1.000 N NA
 104067 104068 SA1748 SAS057     FALSE 0.070 258.000 0.125 NA   NA
 104070 104071 SA1750 SA1751 mapW mapW TRUE 0.813 -15.000 0.000 NA   NA
 104072 104073 SA1752 SAS058 hlb   FALSE 0.015 372.000 0.000 NA   -0.557
 104073 104074 SAS058 SA1753     FALSE 0.377 24.000 0.000 NA   NA
 104077 104078 SA1756 SA1757 lytA lytA TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   1.000
 104078 104079 SA1757 SA1758 lytA sak FALSE 0.007 515.000 0.000 NA   NA
 104079 104080 SA1758 SA1759 sak   FALSE 0.053 191.000 0.000 1.000   NA
 104080 104081 SA1759 SA1760     FALSE 0.397 12.000 0.000 NA   NA
 104081 104082 SA1760 SAS059     FALSE 0.021 212.000 0.000 NA   NA
 104082 104083 SAS059 SA1761   sep FALSE 0.015 245.000 0.000 NA   NA
 104083 104084 SA1761 SAS060 sep   FALSE 0.078 109.000 0.000 NA   NA
 104084 104085 SAS060 SA1762     FALSE 0.063 127.000 0.000 NA   NA
 104085 104086 SA1762 SA1763     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 104086 104087 SA1763 SAS061     TRUE 0.500 4.000 0.000 NA   NA
 104087 104088 SAS061 SA1764     TRUE 0.788 -7.000 0.000 NA   NA
 104088 104089 SA1764 SA1765     TRUE 0.884 16.000 0.125 NA   0.972
 104089 104090 SA1765 SA1766     TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   0.402
 104090 104091 SA1766 SA1767     FALSE 0.030 245.000 0.000 NA   -0.303
 104091 104092 SA1767 SA1768     FALSE 0.045 316.000 0.000 NA   0.967
 104092 104093 SA1768 SA1769     TRUE 0.974 1.000 0.500 NA   0.980
 104093 104094 SA1769 SA1770     TRUE 0.980 -3.000 0.333 NA   0.986
 104094 104095 SA1770 SA1771     TRUE 0.981 -3.000 0.333 NA   0.970
 104095 104096 SA1771 SA1772     TRUE 0.988 -16.000 0.400 NA   0.984
 104096 104097 SA1772 SA1773     TRUE 0.943 -10.000 0.000 NA   0.991
 104097 104098 SA1773 SA1774     TRUE 0.699 20.000 0.000 NA   1.000
 104098 104099 SA1774 SA1775     TRUE 0.924 24.000 0.444 NA   0.920
 104099 104100 SA1775 SA1776     TRUE 0.985 -16.000 0.333 NA   0.529
 104100 104101 SA1776 SA1777     TRUE 0.717 16.000 0.000 NA   0.745
 104101 104102 SA1777 SA1778     TRUE 0.922 -3.000 0.000 NA   0.986
 104102 104103 SA1778 SA1779     FALSE 0.242 132.000 0.125 NA   NA
 104103 104104 SA1779 SA1780     FALSE 0.017 232.000 0.000 NA   NA
 104104 104105 SA1780 SA1781     FALSE 0.343 28.000 0.000 NA   NA
 104105 104106 SA1781 SAS062     TRUE 0.970 -3.000 0.400 NA   NA
 104106 104107 SAS062 SA1782     TRUE 0.977 -3.000 0.600 NA   NA
 104107 104108 SA1782 SA1783     TRUE 0.920 -3.000 0.000 NA   0.903
 104108 104109 SA1783 SA1784     FALSE 0.212 46.000 0.000 NA   NA
 104109 104110 SA1784 SA1785     TRUE 0.742 -3.000 0.000 NA   NA
 104110 104111 SA1785 SA1786     TRUE 0.684 12.000 0.000 NA   1.000
 104111 104112 SA1786 SA1787     TRUE 0.922 -3.000 0.000 NA   0.987
 104112 104113 SA1787 SA1788     TRUE 0.898 0.000 0.000 NA   0.961
 104113 104114 SA1788 SA1789     FALSE 0.384 13.000 0.000 NA   NA
 104114 104115 SA1789 SA1790     FALSE 0.417 9.000 0.000 NA   NA
 104115 104116 SA1790 SA1791     FALSE 0.429 7.000 0.000 NA   NA
 104116 104117 SA1791 SA1792     TRUE 0.858 30.000 0.000 NA Y NA
 104117 104118 SA1792 SA1793     TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   0.985
 104118 104119 SA1793 SA1794     FALSE 0.074 213.000 0.011 NA   0.242
 104119 104120 SA1794 SA1795     TRUE 0.977 2.000 0.000 0.052 Y NA
 104120 104121 SA1795 SA1796     FALSE 0.417 9.000 0.000 NA   NA
 104121 104122 SA1796 SA1797     FALSE 0.417 9.000 0.000 NA   NA
 104122 104123 SA1797 SA1798     TRUE 0.464 5.000 0.000 NA   NA
 104123 104124 SA1798 SAS063     FALSE 0.186 95.000 0.000 NA   -0.026
 104124 104125 SAS063 SA1799     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   -0.361
 104127 104128 SAS064 SA1801     FALSE 0.424 16.000 0.000 NA   NA
 104130 104131 SA1803 SA1804     TRUE 0.718 16.000 0.000 NA   0.751
 104132 104133 SA1805 SA1806     TRUE 0.818 16.000 0.000 1.000 N 0.935
 104133 104134 SA1806 SA1807     FALSE 0.007 551.000 0.000 NA   NA
 104134 104135 SA1807 SA1808     FALSE 0.085 100.000 0.000 NA   NA
 104135 104136 SA1808 SA1809     FALSE 0.407 11.000 0.000 NA   NA
 104136 104137 SA1809 SA1810   int FALSE 0.152 63.000 0.000 NA   NA
 104137 104138 SA1810 SA1811 int hlb TRUE 0.767 12.000 0.000 1.000   0.998
 104139 104140 SA1812 SA1813     TRUE 0.913 22.000 0.000 0.004   0.873
 104141 104142 SA1814 SA1815     FALSE 0.015 444.000 0.000 1.000 N -0.932
 104142 104143 SA1815 SA1816   sel FALSE 0.013 1017.000 0.000 1.000   NA
 104145 104146 SA1818 SA1819   tst FALSE 0.021 879.000 0.000 NA   0.662
 104147 104148 SA1820 SA1821     TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000   NA
 104148 104149 SA1821 SA1822     TRUE 0.553 3.000 0.000 NA   NA
 104149 104150 SA1822 SA1823     FALSE 0.191 51.000 0.000 NA   NA
 104150 104151 SA1823 SA1824     TRUE 0.754 18.000 0.000 NA   0.899
 104151 104152 SA1824 SA1825     FALSE 0.089 12.000 0.000 NA   -0.976
 104152 104153 SA1825 SA1826     FALSE 0.028 450.000 0.000 NA   0.997
 104153 104154 SA1826 SA1827     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   -0.581
 104154 104155 SA1827 SA1828     FALSE 0.040 310.000 0.000 NA   0.997
 104155 104156 SA1828 SA1829     TRUE 0.628 14.000 0.000 NA   0.316
 104156 104157 SA1829 SA1830     TRUE 0.850 65.000 1.000 NA   0.984
 104157 104158 SA1830 SA1831     TRUE 0.963 3.000 1.000 NA   NA
 104158 104159 SA1831 SA1832     FALSE 0.056 136.000 0.000 NA   NA
 104159 104160 SA1832 SA1833     TRUE 0.630 5.000 0.000 1.000   NA
 104161 104162 SA1834 SA1835   int TRUE 0.553 14.000 0.000 1.000   NA
 104163 104164 SA1836 SA1837 groEL groES TRUE 0.942 76.000 0.674 0.005 Y NA
 104167 104168 SA1840 SA1841     FALSE 0.104 361.000 0.138 1.000   0.996
 104170 104171 SA1842 SAS066 agrB agrD TRUE 0.905 3.000 0.225 NA   NA
 104171 104172 SAS066 SA1843 agrD agrC FALSE 0.169 198.000 0.250 NA   NA
 104172 104173 SA1843 SA1844 agrC agrA TRUE 0.987 19.000 0.875 1.000 Y 0.744
 104174 104175 SA1845 SA1846   scrB TRUE 0.992 -3.000 0.364 1.000 Y -0.950
 104175 104176 SA1846 SA1847 scrB scrR FALSE 0.364 149.000 0.070 1.000 N 0.953
 104176 104177 SA1847 SA1848 scrR nrgA FALSE 0.210 183.000 0.070 1.000 N 0.279
 104177 104178 SA1848 SA1849 nrgA   FALSE 0.146 208.000 0.040 1.000 N 0.511
 104178 104179 SA1849 SA1850     TRUE 0.795 60.000 0.419 NA   0.971
 104179 104180 SA1850 SA1851     FALSE 0.043 304.000 0.000 NA   0.992
 104181 104182 SA1852 SA1853 vga   FALSE 0.055 362.000 0.000 0.093   NA
 104183 104184 SA1854 SA1855     TRUE 0.973 -7.000 0.090 1.000   1.000
 104184 104185 SA1855 SA1856     TRUE 0.953 -27.000 0.127 1.000   -0.994
 104185 104186 SA1856 SA1857     TRUE 0.980 -46.000 0.217 NA   0.451
 104187 104188 SA1858 SA1859 ilvD ilvB TRUE 0.981 28.000 0.089 0.001 Y 0.991
 104188 104189 SA1859 SA1860 ilvB   TRUE 0.969 0.000 0.013 0.001   NA
 104189 104190 SA1860 SA1861   ilvC FALSE 0.145 137.000 0.006 1.000   NA
 104190 104191 SA1861 SA1862 ilvC leuA TRUE 0.952 30.000 0.103 1.000 Y 0.979
 104191 104192 SA1862 SA1863 leuA leuB TRUE 0.989 3.000 0.011 0.002 Y 0.975
 104192 104193 SA1863 SA1864 leuB leuC TRUE 0.979 14.000 0.027 0.002 Y 0.891
 104193 104194 SA1864 SA1865 leuC leuD TRUE 0.997 1.000 0.477 0.001 Y 0.731
 104194 104195 SA1865 SA1866 leuD ilvA TRUE 0.964 15.000 0.100 1.000 Y 0.892
 2137170 2137171 SArRNA11 SArRNA12     FALSE 0.123 73.000 0.000 NA   NA
 2137171 2137172 SArRNA12 SArRNA13     FALSE 0.008 470.000 0.000 NA   NA
 2137172 2137173 SArRNA13 SAtRNA55     FALSE 0.071 118.000 0.000 NA   NA
 2137173 2137174 SAtRNA55 SAtRNA56     FALSE 0.424 19.000 0.000 NA   NA
 2137174 104196 SAtRNA56 SA1867     FALSE 0.007 647.000 0.000 NA   NA
 104196 104197 SA1867 SA1868     TRUE 0.980 -7.000 0.215 NA   0.990
 104197 104198 SA1868 SA1869   sigB FALSE 0.201 434.000 0.049 1.000 Y 1.000
 104198 104199 SA1869 SA1870 sigB rsbW TRUE 0.994 -25.000 0.838 1.000 N 0.996
 104199 104200 SA1870 SA1871 rsbW rsbV TRUE 0.990 2.000 0.714 1.000 Y NA
 104200 104201 SA1871 SA1872 rsbV rsbU TRUE 0.786 119.000 0.440 1.000 Y NA
 104201 104202 SA1872 SA1873 rsbU   FALSE 0.184 350.000 0.000 1.000 Y 0.999
 104202 104203 SA1873 SAS067     TRUE 0.893 -3.000 0.039 NA   NA
 104203 104204 SAS067 SA1874   alr FALSE 0.295 85.000 0.065 NA   NA
 104204 104205 SA1874 SA1875 alr dpj TRUE 0.664 66.000 0.093 1.000 N 0.987
 104205 104206 SA1875 SA1876 dpj   TRUE 0.841 4.000 0.012 NA   0.861
 104206 104207 SA1876 SA1877     TRUE 0.977 -13.000 0.137 NA   0.828
 104207 104208 SA1877 SA1878     TRUE 0.978 -7.000 0.196 NA   0.998
 104208 104209 SA1878 SA1879   kdpC FALSE 0.039 208.000 0.000 NA   -0.492
 104209 104210 SA1879 SA1880 kdpC kdpB TRUE 0.968 20.000 0.000 0.002 Y -0.651
 104210 104211 SA1880 SA1881 kdpB kdpA TRUE 0.978 19.000 0.000 0.002 Y 0.993
 104212 104213 SA1882 SA1883 kdpD kdpE TRUE 0.981 0.000 0.000 1.000 Y 0.952
 104214 104215 SA1884 SA1885 tnp   FALSE 0.375 169.000 0.000 1.000 Y NA
 104215 104216 SA1885 SA1886   murF FALSE 0.041 517.000 0.000 0.092 N -0.946
 104216 104217 SA1886 SA1887 murF ddl TRUE 0.979 15.000 0.035 0.007 Y 0.975
 104219 104220 SAS068 SA1889     FALSE 0.398 128.000 0.333