MicrobesOnline Operon Predictions for Staphylococcus aureus, Mu50

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 112023 112024 SAV0001 SAV0002 dnaA dnaN FALSE 0.414 278.000 0.328 1.000 Y NA
 112024 112025 SAV0002 SAV0003 dnaN   FALSE 0.060 381.000 0.103 1.000   NA
 112025 112026 SAV0003 SAV0004   recF TRUE 0.975 -3.000 0.209 1.000   NA
 112026 112027 SAV0004 SAV0005 recF gyrB TRUE 0.989 10.000 0.249 0.006 Y NA
 112027 112028 SAV0005 SAV0006 gyrB gyrA TRUE 0.975 37.000 0.306 0.002 Y NA
 112030 112031 SAV0008 SAV0009 hutH serS FALSE 0.061 379.000 0.000 0.060 N NA
 112031 112032 SAV0009 SAV0010 serS   FALSE 0.010 651.000 0.000 NA N NA
 112032 112033 SAV0010 SAV0011     TRUE 0.979 -3.000 0.338 NA   NA
 112033 112034 SAV0011 SAV0012     FALSE 0.021 343.000 0.000 NA   NA
 112034 112035 SAV0012 SAV0013     FALSE 0.062 236.000 0.011 NA   NA
 112035 112036 SAV0013 SAV0014     TRUE 0.788 15.000 0.039 NA   NA
 112036 112037 SAV0014 SAV0015   rplI TRUE 0.933 -3.000 0.008 1.000 N NA
 112037 112038 SAV0015 SAV0016 rplI dnaC TRUE 0.736 32.000 0.064 1.000 N NA
 112038 112039 SAV0016 SAV0017 dnaC purA FALSE 0.062 278.000 0.018 1.000 N NA
 112039 2136979 SAV0017 SAVtRNA01 purA   FALSE 0.015 429.000 0.000 NA   NA
 2136979 2136980 SAVtRNA01 SAVtRNA02     TRUE 0.682 11.000 0.000 NA   NA
 2136980 112040 SAVtRNA02 SAV0018   vicR FALSE 0.011 614.000 0.000 NA   NA
 112040 112041 SAV0018 SAV0019 vicR vicK TRUE 0.991 13.000 0.597 0.014 Y NA
 112041 112042 SAV0019 SAV0020 vicK   TRUE 0.987 -34.000 0.575 NA   NA
 112042 112043 SAV0020 SAV0021     TRUE 0.984 1.000 0.890 NA   NA
 112043 112044 SAV0021 SAV0022     FALSE 0.064 389.000 0.176 NA   NA
 112044 2136981 SAV0022 SAV0023     FALSE 0.063 227.000 0.000 1.000   NA
 2136981 112046 SAV0023 SAV0024     FALSE 0.019 368.000 0.000 NA   NA
 112046 112047 SAV0024 SAV0025     FALSE 0.029 283.000 0.000 NA   NA
 112047 112048 SAV0025 SAV0026     FALSE 0.016 415.000 0.000 NA   NA
 112049 112050 SAV0027 SAV0028 tnp truncated-repB TRUE 0.479 91.000 0.000 0.075   NA
 112050 112051 SAV0028 SAV0029 truncated-repB truncated-repB TRUE 0.949 4.000 0.000 0.002   NA
 112051 112052 SAV0029 SAV0030 truncated-repB   TRUE 0.578 25.000 0.000 NA   NA
 112052 112053 SAV0030 SAV0031   pre FALSE 0.165 119.000 0.000 NA   NA
 112054 112055 SAV0032 SAV0033     FALSE 0.370 48.000 0.000 NA   NA
 112056 112057 SAV0034 SAV0035 bleO aadD FALSE 0.200 217.000 0.000 0.009   NA
 112057 2136982 SAV0035 SAV0036 aadD tnp FALSE 0.092 193.000 0.000 1.000   NA
 112060 112061 SAV0038 SAV0039     FALSE 0.014 797.000 0.000 1.000   NA
 112061 112062 SAV0039 SAV0040     TRUE 0.699 97.000 0.500 1.000 N NA
 112064 112065 SAV0042 SAV0043 mecR1 mecI TRUE 0.995 0.000 0.667 1.000 Y NA
 112065 112066 SAV0043 SAV0044 mecI xylR FALSE 0.089 487.000 0.000 1.000 Y NA
 112067 112068 SAV0045 SAV0046     TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 112068 112069 SAV0046 SAV0047     TRUE 0.564 33.000 0.000 1.000   NA
 112070 112071 SAV0048 SAV0049     TRUE 0.987 0.000 1.000 NA   NA
 112072 112073 SAV0050 SAV0051     FALSE 0.020 353.000 0.000 NA   NA
 112075 112076 SAV0053 SAV0054 ant(9) tnpC FALSE 0.114 151.000 0.000 NA   NA
 112076 112077 SAV0054 SAV0055 tnpC tnpB TRUE 0.707 7.000 0.000 NA   NA
 112077 112078 SAV0055 SAV0056 tnpB tnpA TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 112078 112079 SAV0056 SAV0057 tnpA truncated-radC FALSE 0.219 119.000 0.000 1.000   NA
 112079 112080 SAV0057 SAV0058 truncated-radC   TRUE 0.730 21.000 0.018 NA   NA
 112080 112081 SAV0058 SAV0059     TRUE 0.832 6.000 0.036 NA   NA
 112081 112082 SAV0059 SAV0060     TRUE 0.689 87.000 0.500 NA   NA
 112082 112083 SAV0060 SAV0061   ccrB FALSE 0.012 518.000 0.000 NA   NA
 112083 112084 SAV0061 SAV0062 ccrB ccrA TRUE 0.993 22.000 1.000 0.003 Y NA
 112084 112085 SAV0062 SAV0063 ccrA   FALSE 0.225 234.000 0.000 NA Y NA
 112085 112086 SAV0063 SAV0064     TRUE 0.984 0.000 0.750 NA   NA
 112086 112087 SAV0064 SAV0065     FALSE 0.413 193.000 0.667 NA   NA
 112087 112088 SAV0065 SAV0066   tnp FALSE 0.037 251.000 0.000 NA   NA
 112088 112089 SAV0066 SAV0067 tnp tnp FALSE 0.177 112.000 0.000 NA   NA
 112089 112090 SAV0067 SAV0068 tnp   TRUE 0.899 -15.000 0.000 NA   NA
 112090 112091 SAV0068 SAV0069     FALSE 0.012 511.000 0.000 NA   NA
 112091 112092 SAV0069 SAV0070   kdpE FALSE 0.014 1064.000 0.000 1.000   NA
 112092 112093 SAV0070 SAV0071 kdpE kdpD TRUE 0.997 -25.000 1.000 1.000 Y NA
 112094 112095 SAV0072 SAV0073 truncated-kdpA kdpB(SCCmec) TRUE 0.975 19.000 0.012 0.003 Y NA
 112095 112096 SAV0073 SAV0074 kdpB(SCCmec) kdpC(SCCmec) TRUE 0.980 49.000 0.877 0.003 Y NA
 112097 112098 SAV0075 SAV0076     TRUE 0.967 10.000 1.000 NA   NA
 112100 112101 SAV0078 SAV0079     TRUE 0.844 63.000 1.000 NA   NA
 112101 112102 SAV0079 SAV0080     TRUE 0.890 45.000 1.000 NA   NA
 112103 112104 SAV0081 SAV0082     FALSE 0.011 599.000 0.000 NA   NA
 112105 112106 SAV0083 SAV0084     FALSE 0.022 422.000 0.000 1.000   NA
 112106 112107 SAV0084 SAV0085     TRUE 0.853 0.000 0.000 NA   NA
 112108 112109 SAV0086 SAV0087     TRUE 0.593 31.000 0.000 1.000   NA
 112109 112110 SAV0087 SAV0088     TRUE 0.720 19.000 0.000 1.000   NA
 112112 112113 SAV0090 SAV0091     FALSE 0.364 49.000 0.000 NA   NA
 112113 112114 SAV0091 SAV0092     FALSE 0.061 199.000 0.000 NA   NA
 112114 112115 SAV0092 SAV0093     FALSE 0.034 267.000 0.000 NA   NA
 112115 112116 SAV0093 SAV0094     FALSE 0.324 57.000 0.000 NA   NA
 112116 112117 SAV0094 SAV0095   plc FALSE 0.057 206.000 0.000 NA   NA
 112117 112118 SAV0095 SAV0096 plc   FALSE 0.047 221.000 0.000 NA   NA
 112118 112119 SAV0096 SAV0097     FALSE 0.348 52.000 0.000 NA   NA
 112119 112120 SAV0097 SAV0098     FALSE 0.265 68.000 0.000 NA   NA
 112120 112121 SAV0098 SAV0099     FALSE 0.283 65.000 0.000 NA   NA
 112121 112122 SAV0099 SAV0100     FALSE 0.272 67.000 0.000 NA   NA
 112122 112123 SAV0100 SAV0101     FALSE 0.199 97.000 0.000 NA   NA
 112123 112124 SAV0101 SAV0102     FALSE 0.154 151.000 0.000 1.000   NA
 112124 112125 SAV0102 SAV0103     TRUE 0.864 2.000 0.000 1.000   NA
 112126 112127 SAV0104 SAV0105     FALSE 0.205 92.000 0.000 NA   NA
 112127 112128 SAV0105 SAV0106     FALSE 0.324 57.000 0.000 NA   NA
 112128 112129 SAV0106 SAV0107     FALSE 0.086 174.000 0.000 NA   NA
 112130 112131 SAV0108 SAV0109     FALSE 0.070 190.000 0.000 NA   NA
 112131 112132 SAV0109 SAV0110   lctP FALSE 0.035 262.000 0.000 NA   NA
 112133 112134 SAV0111 SAV0112 spa sarH1 FALSE 0.022 421.000 0.000 1.000   NA
 112134 112135 SAV0112 SAV0113 sarH1 sirC FALSE 0.026 369.000 0.000 1.000   NA
 112135 112136 SAV0113 SAV0114 sirC sirB TRUE 0.870 78.000 0.091 0.048 Y NA
 112136 112137 SAV0114 SAV0115 sirB sirA TRUE 0.964 16.000 0.111 1.000 Y NA
 112138 112139 SAV0116 SAV0117     TRUE 0.994 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 112139 112140 SAV0117 SAV0118     TRUE 0.885 21.000 0.171 1.000 N NA
 112140 112141 SAV0118 SAV0119     TRUE 0.976 -7.000 0.171 1.000 N NA
 112141 112142 SAV0119 SAV0120     TRUE 0.982 -10.000 0.278 1.000 N NA
 112142 112143 SAV0120 SAV0121     TRUE 0.997 -19.000 0.172 0.001 Y NA
 112143 112144 SAV0121 SAV0122     TRUE 0.985 -28.000 0.355 1.000 N NA
 112144 112145 SAV0122 SAV0123     TRUE 0.966 0.000 0.185 1.000 N NA
 112145 112146 SAV0123 SAV0124     TRUE 0.887 4.000 0.037 1.000 N NA
 112146 112147 SAV0124 SAV0125     FALSE 0.063 196.000 0.000 NA   NA
 112147 112148 SAV0125 SAV0126   butA FALSE 0.053 212.000 0.000 NA   NA
 112150 112151 SAV0128 SAV0129     TRUE 0.982 -37.000 0.000 NA Y NA
 112151 112152 SAV0129 SAV0130     FALSE 0.273 210.000 0.000 NA Y NA
 112152 112153 SAV0130 SAV0131     TRUE 0.898 -19.000 0.000 NA   NA
 112153 112154 SAV0131 SAV0132     TRUE 0.900 -10.000 0.000 NA   NA
 112154 112155 SAV0132 SAV0133   sodM FALSE 0.047 268.000 0.000 1.000   NA
 112155 112156 SAV0133 SAV0134 sodM   FALSE 0.027 367.000 0.000 1.000   NA
 112158 112159 SAV0136 SAV0137 pnp   TRUE 0.893 7.000 0.100 1.000 N NA
 112159 112160 SAV0137 SAV0138   dra FALSE 0.368 81.000 0.013 1.000 N NA
 112160 112161 SAV0138 SAV0139 dra drm TRUE 0.814 28.000 0.000 0.058 N NA
 112162 112163 SAV0140 SAV0141     TRUE 0.998 -3.000 0.689 0.002 Y NA
 112163 112164 SAV0141 SAV0142     TRUE 0.997 2.000 0.654 0.002 Y NA
 112164 112165 SAV0142 SAV0143     TRUE 0.774 195.000 0.308 0.002 Y NA
 112166 112167 SAV0144 SAV0145     TRUE 0.599 51.000 0.091 NA   NA
 112167 112168 SAV0145 SAV0146     FALSE 0.105 157.000 0.000 NA   NA
 112168 112169 SAV0146 SAV0147     TRUE 0.912 6.000 0.182 NA   NA
 112169 112170 SAV0147 SAV0148   adhE FALSE 0.024 385.000 0.000 1.000 N NA
 112170 112171 SAV0148 SAV0149 adhE capA FALSE 0.029 343.000 0.000 1.000 N NA
 112171 112172 SAV0149 SAV0150 capA capB TRUE 0.731 16.000 0.000 1.000 N NA
 112172 112173 SAV0150 SAV0151 capB capC TRUE 0.841 3.000 0.000 1.000 N NA
 112173 112174 SAV0151 SAV0152 capC capD TRUE 0.983 20.000 0.667 1.000 Y NA
 112174 112175 SAV0152 SAV0153 capD capE TRUE 0.996 -10.000 1.000 0.018   NA
 112175 112176 SAV0153 SAV0154 capE capF TRUE 0.801 13.000 0.019 1.000   NA
 112176 112177 SAV0154 SAV0155 capF capG TRUE 0.995 4.000 0.477 0.004 Y NA
 112177 112178 SAV0155 SAV0156 capG capH TRUE 0.875 3.000 0.005 1.000   NA
 112178 112179 SAV0156 SAV0157 capH capI TRUE 0.834 5.000 0.002 1.000   NA
 112179 112180 SAV0157 SAV0158 capI capJ TRUE 0.923 14.000 0.000 NA Y NA
 112180 112181 SAV0158 SAV0159 capJ capK TRUE 0.896 -7.000 0.000 NA   NA
 112181 112182 SAV0159 SAV0160 capK capL TRUE 0.832 1.000 0.000 NA   NA
 112182 112183 SAV0160 SAV0161 capL capM TRUE 0.946 11.000 0.015 NA Y NA
 112183 112184 SAV0161 SAV0162 capM capN TRUE 0.991 0.000 0.297 NA Y NA
 112184 112185 SAV0162 SAV0163 capN capO TRUE 0.822 54.000 0.009 1.000 Y NA
 112185 112186 SAV0163 SAV0164 capO capP TRUE 0.889 47.000 0.105 1.000 Y NA
 112187 112188 SAV0165 SAV0166 isdI   TRUE 0.707 7.000 0.000 NA   NA
 112189 112190 SAV0167 SAV0168 aldA   FALSE 0.015 647.000 0.000 1.000 N NA
 112191 112192 SAV0169 SAV0170     TRUE 0.524 30.000 0.000 NA   NA
 112193 112194 SAV0171 SAV0172     FALSE 0.021 342.000 0.000 NA   NA
 112194 112195 SAV0172 SAV0173     TRUE 0.958 14.000 0.130 NA Y NA
 112195 112196 SAV0173 SAV0174     TRUE 0.995 -3.000 0.652 NA Y NA
 112196 112197 SAV0174 SAV0175     TRUE 0.816 13.000 0.032 1.000 N NA
 112197 112198 SAV0175 SAV0176     FALSE 0.046 226.000 0.000 NA   NA
 112198 112199 SAV0176 SAV0177   fdh FALSE 0.239 75.000 0.000 NA   NA
 112199 112200 SAV0177 SAV0178 fdh   FALSE 0.024 386.000 0.000 1.000   NA
 112200 112201 SAV0178 SAV0179     FALSE 0.037 447.000 0.049 1.000   NA
 112201 112202 SAV0179 SAV0180     TRUE 0.930 13.000 0.333 1.000 N NA
 112203 112204 SAV0181 SAV0182     FALSE 0.036 255.000 0.000 NA   NA
 112204 112205 SAV0182 SAV0183   argJ TRUE 0.975 16.000 0.008 0.004 Y NA
 112205 112206 SAV0183 SAV0184 argJ argC TRUE 0.989 12.000 0.303 0.004 Y NA
 112206 112207 SAV0184 SAV0185 argC   TRUE 0.864 39.000 0.004 1.000 Y NA
 112207 112208 SAV0185 SAV0186     FALSE 0.221 259.000 0.000 1.000 Y NA
 112208 112209 SAV0186 SAV0187     FALSE 0.041 279.000 0.000 1.000 N NA
 112209 112210 SAV0187 SAV0188     FALSE 0.198 127.000 0.000 1.000 N NA
 112210 112211 SAV0188 SAV0189   glcA FALSE 0.204 272.000 0.000 1.000 Y NA
 112212 112213 SAV0190 SAV0191     TRUE 0.977 -3.000 0.234 1.000   NA
 112213 112214 SAV0191 SAV0192     TRUE 0.923 12.000 0.250 1.000   NA
 112214 112215 SAV0192 SAV0193     TRUE 0.929 3.000 0.100 1.000 N NA
 112219 112220 SAV0197 SAV0198     TRUE 0.986 -3.000 0.652 NA N NA
 112220 112221 SAV0198 SAV0199     TRUE 0.994 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 112221 112222 SAV0199 SAV0200     FALSE 0.057 207.000 0.000 NA   NA
 112222 112223 SAV0200 SAV0201     FALSE 0.429 38.000 0.000 NA   NA
 112223 112224 SAV0201 SAV0202     FALSE 0.313 59.000 0.000 NA   NA
 112224 112225 SAV0202 SAV0203     TRUE 0.669 12.000 0.000 NA   NA
 112225 112226 SAV0203 SAV0204     TRUE 0.900 -13.000 0.000 NA   NA
 112228 112229 SAV0206 SAV0207 truncated-oppB   TRUE 0.994 6.000 0.833 0.047 Y NA
 112229 112230 SAV0207 SAV0208   rlp TRUE 0.978 17.000 0.833 0.047   NA
 112230 112231 SAV0208 SAV0209 rlp   TRUE 0.516 38.000 0.000 1.000   NA
 112232 112233 SAV0210 SAV0211   acpD FALSE 0.072 189.000 0.000 NA   NA
 112234 112235 SAV0212 SAV0213   msmX FALSE 0.025 384.000 0.000 1.000   NA
 112235 112236 SAV0213 SAV0214 msmX   TRUE 0.935 13.000 0.000 1.000 Y NA
 112236 112237 SAV0214 SAV0215     TRUE 0.993 3.000 0.800 1.000 Y NA
 112237 112238 SAV0215 SAV0216     TRUE 0.997 2.000 0.909 0.047 Y NA
 112238 112239 SAV0216 SAV0217     FALSE 0.327 71.000 0.000 1.000   NA
 112239 112240 SAV0217 SAV0218     TRUE 0.848 25.000 0.000 0.026   NA
 112240 112241 SAV0218 SAV0219     TRUE 0.601 55.000 0.111 NA   NA
 112243 112244 SAV0221 SAV0222 uhpT uhpT TRUE 0.925 4.000 0.000 0.047   NA
 112245 112246 SAV0223 SAV0224     TRUE 0.989 -7.000 0.167 0.014   NA
 112246 112247 SAV0224 SAV0225     TRUE 0.971 -3.000 0.167 1.000 N NA
 112248 112249 SAV0226 SAV0227 pflB pflA TRUE 0.855 23.000 0.135 1.000 N NA
 112249 112250 SAV0227 SAV0228 pflA   FALSE 0.033 322.000 0.000 1.000 N NA
 112253 112254 SAV0231 SAV0232     TRUE 0.972 30.000 0.588 1.000 Y NA
 112254 112255 SAV0232 SAV0233     FALSE 0.424 186.000 0.012 1.000 Y NA
 112255 112256 SAV0233 SAV0234     TRUE 0.701 112.000 0.046 1.000 Y NA
 112256 112257 SAV0234 SAV0235     TRUE 0.960 26.000 0.046 0.069 Y NA
 112259 112260 SAV0237 SAV0238     FALSE 0.062 198.000 0.000 NA   NA
 112260 112261 SAV0238 SAV0239     FALSE 0.105 157.000 0.000 NA   NA
 112261 112262 SAV0239 SAV0240     TRUE 0.929 26.000 0.667 NA   NA
 112265 112266 SAV0243 SAV0244     FALSE 0.030 337.000 0.000 1.000 N NA
 112266 112267 SAV0244 SAV0245     TRUE 0.992 -15.000 0.308 0.015 N NA
 112267 112268 SAV0245 SAV0246     TRUE 0.978 23.000 0.148 0.012 Y NA
 112268 112269 SAV0246 SAV0247   gatC TRUE 0.589 227.000 0.148 0.012 Y NA
 112269 112270 SAV0247 SAV0248 gatC   TRUE 0.870 18.000 0.103 1.000 N NA
 112270 112271 SAV0248 SAV0249     TRUE 0.928 2.000 0.103 NA   NA
 112271 112272 SAV0249 SAV0250     TRUE 0.842 24.000 0.158 NA   NA
 112272 112273 SAV0250 SAV0251   ispD FALSE 0.016 528.000 0.000 1.000 N NA
 112273 112274 SAV0251 SAV0252 ispD   TRUE 0.985 -7.000 0.367 1.000 N NA
 112274 112275 SAV0252 SAV0253     TRUE 0.869 22.000 0.148 1.000 N NA
 112275 112276 SAV0253 SAV0254     FALSE 0.217 428.000 0.000 0.003 Y NA
 112276 112277 SAV0254 SAV0255   ispD FALSE 0.043 276.000 0.000 1.000 N NA
 112277 112278 SAV0255 SAV0256 ispD   TRUE 0.985 -7.000 0.367 1.000 N NA
 112278 112279 SAV0256 SAV0257     TRUE 0.869 22.000 0.148 1.000 N NA
 112279 112280 SAV0257 SAV0258     TRUE 0.744 33.000 0.125 NA   NA
 112280 112281 SAV0258 SAV0259   scdA FALSE 0.123 144.000 0.000 NA   NA
 112281 112282 SAV0259 SAV0260 scdA lytS FALSE 0.038 245.000 0.000 NA N NA
 112282 112283 SAV0260 SAV0261 lytS lytR TRUE 0.995 3.000 0.538 0.014 Y NA
 112283 112284 SAV0261 SAV0262 lytR lrgA TRUE 0.487 119.000 0.178 1.000   NA
 112284 112285 SAV0262 SAV0263 lrgA lrgB TRUE 0.992 -7.000 0.869 1.000   NA
 112287 112288 SAV0265 SAV0266   bglA TRUE 0.937 16.000 0.000 1.000 Y NA
 112289 112290 SAV0267 SAV0268   rbsK FALSE 0.051 251.000 0.000 1.000 N NA
 112290 112291 SAV0268 SAV0269 rbsK rbsD TRUE 0.925 28.000 0.030 1.000 Y NA
 112291 112292 SAV0269 SAV0270 rbsD   TRUE 0.980 15.000 0.045 0.002 Y NA
 112292 112293 SAV0270 SAV0271     FALSE 0.059 232.000 0.000 1.000 N NA
 112294 112295 SAV0272 SAV0273     FALSE 0.429 38.000 0.000 NA   NA
 112297 112298 SAV0275 SAV0276   lytM FALSE 0.032 326.000 0.000 1.000   NA
 112299 112300 SAV0277 SAV0278     TRUE 0.954 14.000 0.833 NA   NA
 112300 112301 SAV0278 SAV0279     TRUE 0.985 -3.000 0.571 NA   NA
 112301 112302 SAV0279 SAV0280     TRUE 0.721 68.000 0.429 NA   NA
 112302 112303 SAV0280 SAV0281     FALSE 0.023 331.000 0.000 NA   NA
 112304 112305 SAV0282 SAV0283     FALSE 0.363 83.000 0.041 NA   NA
 112305 112306 SAV0283 SAV0284     TRUE 0.969 0.000 0.286 NA   NA
 112306 112307 SAV0284 SAV0285     TRUE 0.976 -28.000 0.237 NA   NA
 112307 112308 SAV0285 SAV0286     TRUE 0.955 13.000 0.833 NA   NA
 112308 2136983 SAV0286 SAV0287     TRUE 0.936 22.000 0.623 NA   NA
 2136983 112311 SAV0287 SAV0289     TRUE 0.524 30.000 0.000 NA   NA
 112311 112312 SAV0289 SAV0290     TRUE 0.662 16.000 0.000 NA   NA
 112312 112313 SAV0290 SAV0291     TRUE 0.881 -3.000 0.000 NA   NA
 112313 112314 SAV0291 SAV0292     TRUE 0.853 0.000 0.000 NA   NA
 112314 112315 SAV0292 SAV0293     TRUE 0.691 10.000 0.000 NA   NA
 112315 112316 SAV0293 SAV0294     TRUE 0.682 11.000 0.000 NA   NA
 112316 112317 SAV0294 SAV0295     FALSE 0.059 203.000 0.000 NA   NA
 112317 112318 SAV0295 SAV0296     FALSE 0.121 146.000 0.000 NA   NA
 112318 112319 SAV0296 SAV0297     FALSE 0.137 135.000 0.000 NA   NA
 112319 112320 SAV0297 SAV0298     FALSE 0.142 132.000 0.000 NA   NA
 112320 112321 SAV0298 SAV0299     TRUE 0.921 11.000 0.286 NA   NA
 112321 112322 SAV0299 SAV0300     TRUE 0.921 11.000 0.286 NA   NA
 112322 112323 SAV0300 SAV0301     TRUE 0.756 49.000 0.286 NA   NA
 112323 112324 SAV0301 SAV0302     TRUE 0.921 11.000 0.286 NA   NA
 112324 112325 SAV0302 SAV0303     FALSE 0.011 625.000 0.000 NA   NA
 112325 112326 SAV0303 SAV0304     FALSE 0.117 150.000 0.000 NA   NA
 112327 112328 SAV0305 SAV0306     FALSE 0.056 237.000 0.000 1.000 N NA
 112329 112330 SAV0307 SAV0308     FALSE 0.053 249.000 0.000 1.000   NA
 112330 112331 SAV0308 SAV0309     TRUE 0.930 13.000 0.333 1.000 N NA
 112331 112332 SAV0309 SAV0310     FALSE 0.054 208.000 0.000 NA N NA
 112332 112333 SAV0310 SAV0311     FALSE 0.122 343.000 0.000 NA Y NA
 112333 112334 SAV0311 SAV0312     TRUE 0.958 -25.000 0.085 NA N NA
 112334 112335 SAV0312 SAV0313     TRUE 0.751 11.000 0.008 NA N NA
 112336 112337 SAV0314 SAV0315   nanA TRUE 0.911 40.000 0.130 1.000 Y NA
 112343 112344 SAV0321 SAV0322     TRUE 0.537 73.000 0.000 0.068 N NA
 112345 112346 SAV0323 SAV0324     TRUE 0.898 34.000 0.571 1.000 N NA
 112346 112347 SAV0324 SAV0325     TRUE 0.936 1.000 0.107 NA   NA
 112347 112348 SAV0325 SAV0326     TRUE 0.980 -13.000 0.286 NA   NA
 112348 112349 SAV0326 SAV0327     TRUE 0.981 -22.000 0.250 1.000 N NA
 112349 112350 SAV0327 SAV0328     FALSE 0.033 316.000 0.000 1.000 N NA
 112351 112352 SAV0329 SAV0330 ulaA   TRUE 0.954 15.000 0.182 0.012   NA
 112352 112353 SAV0330 SAV0331     TRUE 0.989 2.000 0.026 0.012 Y NA
 112353 112354 SAV0331 SAV0332     TRUE 0.968 5.000 0.182 0.015 N NA
 112355 112356 SAV0333 SAV0334     TRUE 0.739 107.000 0.800 1.000 N NA
 112356 112357 SAV0334 SAV0335     FALSE 0.189 104.000 0.000 NA   NA
 112358 112359 SAV0336 SAV0337 glpT glpT TRUE 0.875 19.000 0.000 0.046   NA
 112360 112361 SAV0338 SAV0339     TRUE 0.722 14.000 0.000 1.000   NA
 112361 112362 SAV0339 SAV0340     TRUE 0.917 14.000 0.259 1.000   NA
 112364 112365 SAV0342 SAV0343     FALSE 0.033 267.000 0.000 NA N NA
 112365 112366 SAV0343 SAV0344     TRUE 0.879 111.000 0.812 NA Y NA
 112366 112367 SAV0344 SAV0345     TRUE 0.991 -22.000 0.119 NA Y NA
 112368 112369 SAV0346 SAV0347     TRUE 0.914 56.000 0.393 NA Y NA
 112369 112370 SAV0347 SAV0348     FALSE 0.184 108.000 0.000 NA   NA
 112371 112372 SAV0349 SAV0350     TRUE 0.980 -3.000 0.362 NA   NA
 112372 112373 SAV0350 SAV0351     TRUE 0.827 25.000 0.143 NA   NA
 112373 112374 SAV0351 SAV0352     TRUE 0.978 0.000 0.371 1.000   NA
 112377 112378 SAV0355 SAV0356   metE TRUE 0.498 43.000 0.011 NA   NA
 112378 112379 SAV0356 SAV0357 metE   TRUE 0.987 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 112379 112380 SAV0357 SAV0358     TRUE 0.993 -31.000 0.162 1.000 Y NA
 112380 112381 SAV0358 SAV0359     TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.006 Y NA
 112382 112383 SAV0360 SAV0361     FALSE 0.186 154.000 0.007 1.000 N NA
 112383 112384 SAV0361 SAV0362     TRUE 0.812 30.000 0.171 NA   NA
 112384 112385 SAV0362 SAV0363     TRUE 0.828 12.000 0.064 NA   NA
 112387 112388 SAV0365 SAV0366 rpsF ssb TRUE 0.754 21.000 0.007 1.000 N NA
 112388 112389 SAV0366 SAV0367 ssb rpsR TRUE 0.497 52.000 0.007 1.000 N NA
 112390 112391 SAV0368 SAV0369     FALSE 0.348 52.000 0.000 NA   NA
 112392 112393 SAV0370 SAV0371     FALSE 0.019 369.000 0.000 NA   NA
 112393 112394 SAV0371 SAV0372     FALSE 0.079 181.000 0.000 NA   NA
 112399 112400 SAV0377 SAV0378     FALSE 0.033 270.000 0.000 NA   NA
 112400 112401 SAV0378 SAV0379     FALSE 0.248 73.000 0.000 NA   NA
 112401 112402 SAV0379 SAV0380   ahpF FALSE 0.080 180.000 0.000 NA   NA
 112402 112403 SAV0380 SAV0381 ahpF ahpC TRUE 0.983 16.000 0.551 1.000 Y NA
 112407 112408 SAV0385 SAV0386     TRUE 0.705 118.000 0.857 NA   NA
 112408 112409 SAV0386 SAV0387     TRUE 0.629 143.000 0.857 NA   NA
 112410 112411 SAV0388 SAV0389 xprT pbuX TRUE 0.984 0.000 0.037 1.000 Y NA
 112411 112412 SAV0389 SAV0390 pbuX guaB TRUE 0.918 38.000 1.000 1.000   NA
 112412 112413 SAV0390 SAV0391 guaB guaA TRUE 0.911 25.000 0.007 0.001   NA
 112414 112415 SAV0392 SAV0393 int   TRUE 0.836 27.000 0.176 NA   NA
 112415 112416 SAV0393 SAV0394     FALSE 0.013 498.000 0.000 NA   NA
 112416 112417 SAV0394 SAV0395     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 112417 112418 SAV0395 SAV0396     TRUE 0.633 129.000 0.667 NA   NA
 112420 112421 SAV0398 SAV0399 tetM   FALSE 0.018 377.000 0.000 NA   NA
 112421 112422 SAV0399 SAV0400     TRUE 0.990 -16.000 0.800 NA   NA
 112422 112423 SAV0400 SAV0401     TRUE 0.988 -3.000 0.800 NA   NA
 112423 112424 SAV0401 SAV0402     TRUE 0.985 -3.000 0.600 NA   NA
 112424 112425 SAV0402 SAV0403     TRUE 0.988 -16.000 0.600 NA   NA
 112425 112426 SAV0403 SAV0404     TRUE 0.826 30.000 0.200 NA   NA
 112426 112427 SAV0404 SAV0405     TRUE 0.679 56.000 0.200 NA   NA
 112427 112428 SAV0405 SAV0406     TRUE 0.652 61.000 0.200 NA   NA
 112428 112429 SAV0406 SAV0407     TRUE 0.746 42.000 0.200 NA   NA
 112429 112430 SAV0407 SAV0408     FALSE 0.029 283.000 0.000 NA   NA
 112430 112431 SAV0408 SAV0409     TRUE 0.513 182.000 0.800 1.000   NA
 112431 112432 SAV0409 SAV0410     TRUE 0.915 22.000 0.400 NA   NA
 112432 112433 SAV0410 SAV0411     TRUE 0.959 10.000 0.750 NA   NA
 112433 112434 SAV0411 SAV0412     TRUE 0.936 21.000 0.571 NA   NA
 112434 112435 SAV0412 SAV0413     FALSE 0.176 200.000 0.133 NA   NA
 112435 112436 SAV0413 SAV0414     TRUE 0.996 -3.000 0.341 0.070 Y NA
 112436 112437 SAV0414 SAV0415   tnp TRUE 0.679 134.000 0.000 0.070 Y NA
 112437 112438 SAV0415 SAV0416 tnp   FALSE 0.013 494.000 0.000 NA   NA
 112438 112439 SAV0416 SAV0417     FALSE 0.017 392.000 0.000 NA   NA
 112439 112440 SAV0417 SAV0418     FALSE 0.055 399.000 0.000 0.070   NA
 112440 112441 SAV0418 SAV0419     FALSE 0.041 237.000 0.000 NA   NA
 112441 112442 SAV0419 SAV0420     FALSE 0.012 532.000 0.000 NA   NA
 112442 112443 SAV0420 SAV0421     TRUE 0.645 19.000 0.000 NA   NA
 112444 112445 SAV0422 SAV0423 set6 set7 FALSE 0.109 286.000 0.000 0.020   NA
 112445 112446 SAV0423 SAV0424 set7 set8 FALSE 0.107 291.000 0.000 0.020   NA
 112446 112447 SAV0424 SAV0425 set8 set10 FALSE 0.077 364.000 0.000 0.020   NA
 112447 112448 SAV0425 SAV0426 set10 set11 FALSE 0.057 446.000 0.000 0.020   NA
 112448 112449 SAV0426 SAV0427 set11 set12 FALSE 0.085 339.000 0.000 0.020   NA
 112449 112450 SAV0427 SAV0428 set12 set13 FALSE 0.072 377.000 0.000 0.020   NA
 112450 112451 SAV0428 SAV0429 set13 set14 FALSE 0.076 366.000 0.000 0.020   NA
 112451 112452 SAV0429 SAV0430 set14   FALSE 0.342 53.000 0.000 NA   NA
 112452 112453 SAV0430 SAV0431   hsdM FALSE 0.342 53.000 0.000 NA   NA
 112453 112454 SAV0431 SAV0432 hsdM hsdS TRUE 0.996 -7.000 0.083 0.002 Y NA
 112454 112455 SAV0432 SAV0433 hsdS set15 FALSE 0.025 383.000 0.000 1.000   NA
 112455 112456 SAV0433 SAV0434 set15   TRUE 0.690 22.000 0.000 1.000   NA
 112458 112459 SAV0436 SAV0437 lpl1 lpl2 TRUE 0.507 31.000 0.000 NA   NA
 112459 112460 SAV0437 SAV0438 lpl2 lpl3 FALSE 0.384 45.000 0.000 NA   NA
 112460 112461 SAV0438 SAV0439 lpl3   FALSE 0.023 324.000 0.000 NA   NA
 112461 112462 SAV0439 SAV0440     FALSE 0.303 61.000 0.000 NA   NA
 112462 112463 SAV0440 SAV0441   lpl5 TRUE 0.645 19.000 0.000 NA   NA
 112463 112464 SAV0441 SAV0442 lpl5 lpl6 FALSE 0.324 57.000 0.000 NA   NA
 112464 112465 SAV0442 SAV0443 lpl6 lpl7 FALSE 0.348 52.000 0.000 NA   NA
 112465 112466 SAV0443 SAV0444 lpl7 lpl8 TRUE 0.645 19.000 0.000 NA   NA
 112466 112467 SAV0444 SAV0445 lpl8 lpl9 FALSE 0.082 179.000 0.000 NA   NA
 112467 112468 SAV0445 SAV0446 lpl9   TRUE 0.900 -10.000 0.000 NA   NA
 112468 112469 SAV0446 SAV0447     TRUE 0.881 -3.000 0.000 NA   NA
 112469 112470 SAV0447 SAV0448     TRUE 0.645 19.000 0.000 NA   NA
 112474 112475 SAV0452 SAV0453 ndhF   TRUE 0.914 13.000 0.303 NA   NA
 112475 112476 SAV0453 SAV0454     FALSE 0.218 162.000 0.076 NA   NA
 112478 112479 SAV0456 SAV0457     TRUE 0.830 37.000 0.273 1.000   NA
 112479 112480 SAV0457 SAV0458     FALSE 0.026 369.000 0.000 1.000   NA
 112480 112481 SAV0458 SAV0459   cysM FALSE 0.105 217.000 0.024 1.000   NA
 112481 2136985 SAV0459 SAV0460 cysM yrhB TRUE 0.998 -7.000 0.690 0.018 Y NA
 2136985 112484 SAV0460 SAV0462 yrhB   FALSE 0.037 295.000 0.000 1.000 N NA
 112484 112485 SAV0462 SAV0463     TRUE 0.989 4.000 0.487 1.000 Y NA
 112485 112486 SAV0463 SAV0464     TRUE 0.838 37.000 0.000 NA Y NA
 112486 112487 SAV0464 SAV0465     FALSE 0.022 332.000 0.000 NA   NA
 112489 112490 SAV0467 SAV0468     TRUE 0.975 -10.000 0.150 1.000   NA
 112491 112492 SAV0469 SAV0470     TRUE 0.989 -3.000 0.957 NA   NA
 112492 112493 SAV0470 SAV0471   gltC FALSE 0.359 121.000 0.106 NA   NA
 112494 112495 SAV0472 SAV0473 gltB gltD TRUE 0.989 18.000 0.222 0.001 Y NA
 112495 2136986 SAV0473 SAVtRNA03 gltD   FALSE 0.034 269.000 0.000 NA   NA
 2136986 112496 SAVtRNA03 SAV0474   treP FALSE 0.013 472.000 0.000 NA   NA
 112496 112497 SAV0474 SAV0475 treP   TRUE 0.930 64.000 0.650 1.000 Y NA
 112497 112498 SAV0475 SAV0476     TRUE 0.908 25.000 0.336 1.000 N NA
 112498 112499 SAV0476 SAV0477     FALSE 0.015 643.000 0.000 1.000   NA
 112499 112500 SAV0477 SAV0478   dnaX TRUE 0.555 69.000 0.103 1.000   NA
 112500 112501 SAV0478 SAV0479 dnaX   FALSE 0.397 90.000 0.071 NA   NA
 112501 112502 SAV0479 SAV0480   recR TRUE 0.957 7.000 0.604 NA   NA
 112502 2136987 SAV0480 SAVrRNA01 recR   FALSE 0.010 860.000 0.000 NA   NA
 2136987 2136988 SAVrRNA01 SAVrRNA02     FALSE 0.019 365.000 0.000 NA   NA
 2136988 2136989 SAVrRNA02 SAVrRNA03     FALSE 0.248 73.000 0.000 NA   NA
 2136989 112503 SAVrRNA03 SAV0481     FALSE 0.010 903.000 0.000 NA   NA
 112503 112504 SAV0481 SAV0482   tmk TRUE 0.896 2.000 0.010 1.000 N NA
 112504 112505 SAV0482 SAV0483 tmk   TRUE 0.705 28.000 0.038 NA   NA
 112505 112506 SAV0483 SAV0484   holB FALSE 0.084 214.000 0.021 NA   NA
 112506 112507 SAV0484 SAV0485 holB   FALSE 0.407 169.000 0.372 NA   NA
 112507 112508 SAV0485 SAV0486     TRUE 0.971 -4.000 0.183 NA   NA
 112508 112509 SAV0486 SAV0487     FALSE 0.122 274.000 0.193 NA   NA
 112509 112510 SAV0487 SAV0488     TRUE 0.979 -7.000 0.209 1.000   NA
 112510 112511 SAV0488 SAV0489     TRUE 0.919 2.000 0.041 1.000   NA
 112511 112512 SAV0489 SAV0490   metS FALSE 0.058 285.000 0.018 1.000   NA
 112512 112513 SAV0490 SAV0491 metS   TRUE 0.823 31.000 0.221 NA N NA
 112513 112514 SAV0491 SAV0492     TRUE 0.512 167.000 0.058 NA Y NA
 112514 2136990 SAV0492 SAV0493   ksgA TRUE 0.877 11.000 0.093 1.000 N NA
 2136990 112516 SAV0493 SAV0494 ksgA veg FALSE 0.315 100.000 0.035 NA   NA
 112516 112517 SAV0494 SAV0495 veg   FALSE 0.051 310.000 0.046 NA   NA
 112517 112518 SAV0495 SAV0496   purR TRUE 0.840 14.000 0.062 1.000 N NA
 112518 112519 SAV0496 SAV0497 purR   TRUE 0.902 17.000 0.227 NA N NA
 112519 112520 SAV0497 SAV0498   spoVG TRUE 0.523 72.000 0.131 NA N NA
 112520 112521 SAV0498 SAV0499 spoVG gcaD FALSE 0.123 407.000 0.003 1.000 Y NA
 112521 112522 SAV0499 SAV0500 gcaD prs FALSE 0.290 147.000 0.069 1.000 N NA
 112522 112523 SAV0500 SAV0501 prs rplY FALSE 0.232 150.000 0.027 1.000 N NA
 112523 112524 SAV0501 SAV0502 rplY pth TRUE 0.550 311.000 0.496 0.034 Y NA
 112524 112525 SAV0502 SAV0503 pth mfd TRUE 0.959 0.000 0.137 1.000 N NA
 112525 112526 SAV0503 SAV0504 mfd   TRUE 0.956 -10.000 0.033 1.000   NA
 112526 112527 SAV0504 SAV0505     TRUE 0.943 0.000 0.058 1.000   NA
 112527 112528 SAV0505 SAV0506     TRUE 0.954 -3.000 0.054 1.000   NA
 112528 112529 SAV0506 SAV0507     TRUE 0.839 18.000 0.053 1.000 N NA
 112529 112530 SAV0507 SAV0508     TRUE 0.478 105.000 0.134 1.000 N NA
 112530 112531 SAV0508 SAV0509     FALSE 0.169 180.000 0.031 1.000 N NA
 112531 112532 SAV0509 SAV0510     TRUE 0.945 5.000 0.067 0.054 N NA
 112532 112533 SAV0510 SAV0511   ftsH FALSE 0.156 257.000 0.192 1.000 N NA
 112533 112534 SAV0511 SAV0512 ftsH   FALSE 0.331 228.000 0.041 1.000 Y NA
 112534 112535 SAV0512 SAV0513   cysK FALSE 0.195 179.000 0.053 1.000 N NA
 112535 112536 SAV0513 SAV0514 cysK folP FALSE 0.087 216.000 0.005 1.000 N NA
 112536 112537 SAV0514 SAV0515 folP folB TRUE 0.988 -22.000 0.024 1.000 Y NA
 112537 112538 SAV0515 SAV0516 folB folK TRUE 0.991 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 112538 112539 SAV0516 SAV0517 folK lysS FALSE 0.016 539.000 0.000 1.000 N NA
 112539 2136991 SAV0517 SAVrRNA04 lysS   FALSE 0.011 558.000 0.000 NA   NA
 2136991 2136992 SAVrRNA04 SAVtRNA04     TRUE 0.652 13.000 0.000 NA   NA
 2136992 2136993 SAVtRNA04 SAVtRNA05     TRUE 0.633 20.000 0.000 NA   NA
 2136993 2136994 SAVtRNA05 SAVtRNA06     TRUE 0.691 10.000 0.000 NA   NA
 2136994 2136995 SAVtRNA06 SAVtRNA07     TRUE 0.466 34.000 0.000 NA   NA
 2136995 2136996 SAVtRNA07 SAVtRNA08     TRUE 0.682 11.000 0.000 NA   NA
 2136996 2136997 SAVtRNA08 SAVtRNA09     TRUE 0.696 9.000 0.000 NA   NA
 2136997 2136998 SAVtRNA09 SAVtRNA10     TRUE 0.590 24.000 0.000 NA   NA
 2136998 2136999 SAVtRNA10 SAVtRNA11     TRUE 0.590 24.000 0.000 NA   NA
 2136999 2137000 SAVtRNA11 SAVrRNA05     FALSE 0.154 124.000 0.000 NA   NA
 2137000 2137001 SAVrRNA05 SAVtRNA12     FALSE 0.203 93.000 0.000 NA   NA
 2137001 2137002 SAVtRNA12 SAVrRNA06     FALSE 0.092 170.000 0.000 NA   NA
 2137002 2137003 SAVrRNA06 SAVrRNA07     FALSE 0.248 73.000 0.000 NA   NA
 112541 112542 SAV0519 SAV0520     TRUE 0.987 4.000 0.488 NA Y NA
 112544 112545 SAV0522 SAV0523 ctsR   TRUE 0.948 19.000 0.681 NA   NA
 112545 112546 SAV0523 SAV0524     TRUE 0.992 -10.000 0.848 1.000   NA
 112546 112547 SAV0524 SAV0525   clpC TRUE 0.938 14.000 0.425 1.000 N NA
 112547 112548 SAV0525 SAV0526 clpC radA FALSE 0.234 485.000 0.062 0.012 Y NA
 112548 112549 SAV0526 SAV0527 radA   TRUE 0.754 25.000 0.056 NA   NA
 112549 112550 SAV0527 SAV0528   gltX FALSE 0.019 557.000 0.021 NA   NA
 112550 112551 SAV0528 SAV0529 gltX cysE FALSE 0.028 429.000 0.008 1.000 N NA
 112551 2137004 SAV0529 SAV0530 cysE cysS TRUE 0.979 -46.000 0.039 0.054 N NA
 2137004 2137005 SAV0530 SAV0530.1 cysS cysS TRUE 0.971 -7.000 0.129 1.000   NA
 2137005 112553 SAV0530.1 SAV0531 cysS   TRUE 0.962 8.000 0.150 0.004   NA
 112553 112554 SAV0531 SAV0532     TRUE 0.945 0.000 0.109 NA   NA
 112554 112555 SAV0532 SAV0533     FALSE 0.359 81.000 0.036 NA   NA
 112555 112556 SAV0533 SAV0534   secE FALSE 0.034 314.000 0.000 1.000 N NA
 112556 112557 SAV0534 SAV0535 secE nusG TRUE 0.961 13.000 0.843 1.000 N NA
 112557 112558 SAV0535 SAV0536 nusG   FALSE 0.130 138.000 0.000 NA   NA
 112558 112559 SAV0536 SAV0537   rplK TRUE 0.896 -7.000 0.000 NA   NA
 112559 112560 SAV0537 SAV0538 rplK rplA TRUE 0.799 208.000 0.838 0.028 Y NA
 112560 112561 SAV0538 SAV0539 rplA rplJ TRUE 0.560 272.000 0.302 0.028 Y NA
 112561 112562 SAV0539 SAV0540 rplJ rplL TRUE 0.980 43.000 0.884 0.022 Y NA
 112562 112563 SAV0540 SAV0541 rplL   TRUE 0.506 175.000 0.050 1.000 Y NA
 112563 112564 SAV0541 SAV0542   rpoB FALSE 0.092 215.000 0.008 1.000 N NA
 112564 112565 SAV0542 SAV0543 rpoB rpoC TRUE 0.931 137.000 0.851 0.002 Y NA
 112565 112566 SAV0543 SAV0544 rpoC   FALSE 0.264 137.000 0.065 NA N NA
 112566 112567 SAV0544 SAV0545   rpsL TRUE 0.803 98.000 0.239 NA Y NA
 112567 112568 SAV0545 SAV0546 rpsL rpsG TRUE 0.938 66.000 0.224 0.004 Y NA
 112568 112569 SAV0546 SAV0547 rpsG fus TRUE 0.852 123.000 0.579 1.000 Y NA
 112569 112570 SAV0547 SAV0548 fus tuf TRUE 0.749 217.000 0.400 0.002 Y NA
 112572 112573 SAV0550 SAV0551     FALSE 0.033 270.000 0.000 NA   NA
 112573 112574 SAV0551 SAV0552   araB FALSE 0.102 159.000 0.000 NA   NA
 112574 112575 SAV0552 SAV0553 araB   FALSE 0.070 214.000 0.000 1.000 N NA
 112575 112576 SAV0553 SAV0554   ilvE FALSE 0.030 336.000 0.000 1.000 N NA
 112576 112577 SAV0554 SAV0555 ilvE   FALSE 0.052 250.000 0.000 1.000   NA
 112578 112579 SAV0556 SAV0557     TRUE 0.998 -7.000 0.255 0.001 Y NA
 112580 112581 SAV0558 SAV0559     FALSE 0.418 147.000 0.013 0.021   NA
 112581 112582 SAV0559 SAV0560     TRUE 0.876 22.000 0.159 1.000   NA
 112582 112583 SAV0560 SAV0561   sdrC FALSE 0.021 430.000 0.000 1.000   NA
 112583 112584 SAV0561 SAV0562 sdrC sdrD FALSE 0.090 367.000 0.000 0.004   NA
 112584 112585 SAV0562 SAV0563 sdrD sdrE FALSE 0.079 394.000 0.000 0.004   NA
 112585 112586 SAV0563 SAV0564 sdrE   FALSE 0.213 121.000 0.000 1.000   NA
 112587 112588 SAV0565 SAV0566     FALSE 0.041 282.000 0.000 1.000   NA
 112588 112589 SAV0566 SAV0567     TRUE 0.770 13.000 0.026 NA   NA
 112589 112590 SAV0567 SAV0568     TRUE 0.946 14.000 0.644 NA   NA
 112591 112592 SAV0569 SAV0570 nagB   TRUE 0.907 77.000 0.600 1.000 Y NA
 112592 112593 SAV0570 SAV0571     TRUE 0.980 2.000 0.667 1.000 N NA
 112593 112594 SAV0571 SAV0572     FALSE 0.232 113.000 0.000 1.000   NA
 112594 112595 SAV0572 SAV0573   proP FALSE 0.017 502.000 0.000 1.000   NA
 112595 112596 SAV0573 SAV0574 proP   FALSE 0.022 335.000 0.000 NA   NA
 112596 112597 SAV0574 SAV0575   vraA TRUE 0.853 0.000 0.000 NA   NA
 112597 112598 SAV0575 SAV0576 vraA vraB TRUE 0.993 2.000 0.576 1.000 Y NA
 112598 112599 SAV0576 SAV0577 vraB vraC TRUE 0.961 -25.000 0.101 NA   NA
 112599 112600 SAV0577 SAV0578 vraC   TRUE 0.969 3.000 0.500 NA   NA
 112601 112602 SAV0579 SAV0580     FALSE 0.012 507.000 0.000 NA   NA
 112603 112604 SAV0581 SAV0582 ung   TRUE 0.982 1.000 0.800 NA   NA
 112604 112605 SAV0582 SAV0583     FALSE 0.220 133.000 0.024 NA   NA
 112605 112606 SAV0583 SAV0584     FALSE 0.244 121.000 0.021 NA   NA
 112607 112608 SAV0585 SAV0586     TRUE 0.961 13.000 1.000 NA   NA
 112608 112609 SAV0586 SAV0587     FALSE 0.011 663.000 0.000 NA   NA
 112610 112611 SAV0588 SAV0589 pta   TRUE 0.935 3.000 0.123 1.000 N NA
 112611 112612 SAV0589 SAV0590   mvaK1 FALSE 0.015 668.000 0.000 1.000 N NA
 112612 112613 SAV0590 SAV0591 mvaK1 mvaD TRUE 0.992 5.000 0.281 0.004 Y NA
 112613 112614 SAV0591 SAV0592 mvaD mvaK2 TRUE 0.988 13.000 0.312 0.004 Y NA
 112614 112615 SAV0592 SAV0593 mvaK2   FALSE 0.144 177.000 0.030 NA   NA
 112616 112617 SAV0594 SAV0595     TRUE 0.960 -139.000 0.103 NA N NA
 112618 112619 SAV0596 SAV0597     TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 112619 112620 SAV0597 SAV0598     FALSE 0.376 47.000 0.000 NA   NA
 112620 112621 SAV0598 SAV0599     FALSE 0.128 140.000 0.000 NA   NA
 112621 112622 SAV0599 SAV0600     FALSE 0.014 448.000 0.000 NA   NA
 112622 112623 SAV0600 SAV0601     FALSE 0.034 446.000 0.071 NA   NA
 112623 112624 SAV0601 SAV0602     FALSE 0.185 168.000 0.051 NA   NA
 112624 112625 SAV0602 SAV0603     TRUE 0.620 40.000 0.025 1.000   NA
 112625 112626 SAV0603 SAV0604     TRUE 0.543 43.000 0.028 NA   NA
 112626 112627 SAV0604 SAV0605   adh1 FALSE 0.012 499.000 0.000 NA   NA
 112627 112628 SAV0605 SAV0606 adh1   FALSE 0.035 264.000 0.000 NA   NA
 112628 112629 SAV0606 SAV0607   argS TRUE 0.950 -3.000 0.079 NA   NA
 112629 112630 SAV0607 SAV0608 argS   FALSE 0.058 270.000 0.004 1.000 N NA
 112630 112631 SAV0608 SAV0609     FALSE 0.050 252.000 0.000 1.000 N NA
 112631 112632 SAV0609 SAV0610     TRUE 0.592 149.000 0.046 1.000 Y NA
 112632 112633 SAV0610 SAV0611     TRUE 0.804 55.000 0.412 1.000   NA
 112633 112634 SAV0611 SAV0612     TRUE 0.993 -16.000 0.412 0.020   NA
 112634 112635 SAV0612 SAV0613     TRUE 0.574 136.000 0.556 NA   NA
 112635 112636 SAV0613 SAV0614     TRUE 0.493 162.000 0.571 NA   NA
 112636 112637 SAV0614 SAV0615     FALSE 0.360 169.000 0.286 NA   NA
 112638 112639 SAV0616 SAV0617 sarA   FALSE 0.010 948.000 0.000 NA   NA
 112639 112640 SAV0617 SAV0618     FALSE 0.065 195.000 0.000 NA   NA
 112640 112641 SAV0618 SAV0619     TRUE 0.904 17.000 0.233 NA   NA
 112642 2137006 SAV0620 SAV0621     TRUE 0.961 19.000 0.857 1.000   NA
 2137006 112645 SAV0621 SAV0623     TRUE 0.996 -13.000 0.636 NA Y NA
 112645 112646 SAV0623 SAV0624     TRUE 0.995 -3.000 0.636 NA Y NA
 112646 112647 SAV0624 SAV0625     TRUE 0.999 -10.000 1.000 0.003 Y NA
 112647 112648 SAV0625 SAV0626     TRUE 0.993 1.000 0.500 1.000 Y NA
 112648 112649 SAV0626 SAV0627     TRUE 0.997 -3.000 0.429 0.074 Y NA
 112649 112650 SAV0627 SAV0628     TRUE 0.994 -25.000 0.273 1.000 Y NA
 112650 112651 SAV0628 SAV0629     FALSE 0.143 340.000 0.000 1.000 Y NA
 112652 112653 SAV0630 SAV0631 tnp   FALSE 0.013 1120.000 0.000 1.000 N NA
 112653 112654 SAV0631 SAV0632     TRUE 0.991 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 112654 112655 SAV0632 SAV0633     TRUE 0.997 -6.000 0.286 0.053 Y NA
 112660 112661 SAV0638 SAV0639 tagG tagB FALSE 0.073 732.000 0.138 0.089   NA
 112661 112662 SAV0639 SAV0640 tagB tagX FALSE 0.355 51.000 0.000 NA   NA
 112662 112663 SAV0640 SAV0641 tagX tagD FALSE 0.293 63.000 0.000 NA   NA
 112665 112666 SAV0643 SAV0644     FALSE 0.260 69.000 0.000 NA   NA
 112666 112667 SAV0644 SAV0645     FALSE 0.056 208.000 0.000 NA   NA
 112667 112668 SAV0645 SAV0646     FALSE 0.010 747.000 0.000 NA   NA
 112668 112669 SAV0646 SAV0647   fhuA FALSE 0.030 282.000 0.000 NA   NA
 112669 112670 SAV0647 SAV0648 fhuA fhuB TRUE 0.932 36.000 0.179 1.000 Y NA
 112670 112671 SAV0648 SAV0649 fhuB fhuG TRUE 0.998 -3.000 0.857 0.043 Y NA
 112671 112672 SAV0649 SAV0650 fhuG   FALSE 0.056 237.000 0.000 1.000 N NA
 112672 112673 SAV0650 SAV0651     TRUE 0.973 42.000 0.316 0.001 Y NA
 112673 112674 SAV0651 SAV0652     TRUE 0.974 -7.000 0.155 1.000   NA
 112674 112675 SAV0652 SAV0653     TRUE 0.582 116.000 0.385 NA   NA
 112675 112676 SAV0653 SAV0654     FALSE 0.012 544.000 0.000 NA   NA
 112676 112677 SAV0654 SAV0655     FALSE 0.342 151.000 0.135 1.000   NA
 112677 112678 SAV0655 SAV0656     FALSE 0.023 329.000 0.000 NA   NA
 112680 112681 SAV0658 SAV0659     TRUE 0.895 16.000 0.208 NA N NA
 112681 112682 SAV0659 SAV0660     TRUE 0.997 -7.000 0.958 1.000 Y NA
 112682 112683 SAV0660 SAV0661   vraF FALSE 0.451 144.000 0.250 1.000 N NA
 112683 112684 SAV0661 SAV0662 vraF vraG TRUE 0.990 -22.000 0.714 1.000   NA
 112684 112685 SAV0662 SAV0663 vraG   FALSE 0.010 723.000 0.000 NA   NA
 112685 112686 SAV0663 SAV0664     TRUE 0.946 16.000 0.033 NA Y NA
 112688 112689 SAV0666 SAV0667     FALSE 0.010 697.000 0.000 NA   NA
 112689 112690 SAV0667 SAV0668     TRUE 0.783 80.000 0.875 NA   NA
 112690 112691 SAV0668 SAV0669     FALSE 0.092 190.000 0.002 NA   NA
 112691 112692 SAV0669 SAV0670     FALSE 0.041 285.000 0.009 NA   NA
 112692 112693 SAV0670 SAV0671     FALSE 0.020 353.000 0.000 NA   NA
 112693 112694 SAV0671 SAV0672     FALSE 0.077 302.000 0.114 NA   NA
 112694 112695 SAV0672 SAV0673     FALSE 0.356 138.000 0.159 NA N NA
 112695 112696 SAV0673 SAV0674     TRUE 0.934 -3.000 0.034 NA   NA
 112698 112699 SAV0676 SAV0677     FALSE 0.272 67.000 0.000 NA   NA
 112699 112700 SAV0677 SAV0678     FALSE 0.448 138.000 0.286 NA   NA
 112700 112701 SAV0678 SAV0679     FALSE 0.375 80.000 0.043 NA   NA
 112702 112703 SAV0680 SAV0681     TRUE 0.879 2.000 0.017 NA   NA
 112703 112704 SAV0681 SAV0682     TRUE 0.844 3.000 0.007 NA   NA
 112704 112705 SAV0682 SAV0683   uppP FALSE 0.089 172.000 0.000 NA   NA
 112706 112707 SAV0684 SAV0685     TRUE 0.996 -3.000 0.222 0.005 Y NA
 112709 112710 SAV0687 SAV0688     FALSE 0.265 103.000 0.012 NA   NA
 112710 112711 SAV0688 SAV0689     TRUE 0.565 35.000 0.012 NA   NA
 112711 112712 SAV0689 SAV0690     FALSE 0.029 283.000 0.000 NA   NA
 112712 112713 SAV0690 SAV0691     FALSE 0.347 86.000 0.010 1.000 N NA
 112714 112715 SAV0692 SAV0693     TRUE 0.948 -3.000 0.069 NA   NA
 112715 112716 SAV0693 SAV0694     FALSE 0.076 183.000 0.000 NA   NA
 112717 112718 SAV0695 SAV0696 norA   FALSE 0.027 293.000 0.000 NA   NA
 112718 112719 SAV0696 SAV0697     FALSE 0.123 174.000 0.010 NA   NA
 112719 112720 SAV0697 SAV0698     FALSE 0.142 253.000 0.004 0.055   NA
 112720 112721 SAV0698 SAV0699   fruB TRUE 0.989 -3.000 0.063 1.000 Y NA
 112721 112722 SAV0699 SAV0700 fruB fruA TRUE 0.991 6.000 0.889 1.000 Y NA
 112722 112723 SAV0700 SAV0701 fruA nagA FALSE 0.165 308.000 0.000 1.000 Y NA
 112723 112724 SAV0701 SAV0702 nagA   FALSE 0.066 221.000 0.000 1.000   NA
 112724 112725 SAV0702 SAV0703     FALSE 0.146 222.000 0.100 1.000   NA
 112725 112726 SAV0703 SAV0704     FALSE 0.320 132.000 0.100 NA   NA
 112727 112728 SAV0705 SAV0706 saeS saeR TRUE 0.994 0.000 0.500 1.000 Y NA
 112728 112729 SAV0706 SAV0707 saeR   TRUE 0.977 -25.000 0.250 NA   NA
 112729 112730 SAV0707 SAV0708     FALSE 0.011 634.000 0.000 NA   NA
 112730 112731 SAV0708 SAV0709     FALSE 0.030 280.000 0.000 NA   NA
 112731 112732 SAV0709 SAV0710     FALSE 0.386 99.000 0.080 NA   NA
 112732 112733 SAV0710 SAV0711     TRUE 0.955 4.000 0.307 1.000 N NA
 112733 112734 SAV0711 SAV0712     TRUE 0.919 2.000 0.041 1.000   NA
 112735 112736 SAV0713 SAV0714     TRUE 0.994 -16.000 0.027 0.017 Y NA
 112736 112737 SAV0714 SAV0715     TRUE 0.991 0.000 0.219 1.000 Y NA
 112737 112738 SAV0715 SAV0716     FALSE 0.389 66.000 0.019 NA   NA
 112738 112739 SAV0716 SAV0717     TRUE 0.644 88.000 0.375 NA   NA
 112739 112740 SAV0717 SAV0718     TRUE 0.997 -16.000 0.194 0.002 Y NA
 112740 112741 SAV0718 SAV0719     FALSE 0.018 474.000 0.000 1.000 N NA
 112741 112742 SAV0719 SAV0720     FALSE 0.044 276.000 0.000 1.000   NA
 112742 112743 SAV0720 SAV0721   recQ TRUE 0.818 12.000 0.022 1.000   NA
 112743 112744 SAV0721 SAV0722 recQ   FALSE 0.101 222.000 0.029 1.000 N NA
 112744 112745 SAV0722 SAV0723     TRUE 0.985 -7.000 0.382 1.000 N NA
 112745 112746 SAV0723 SAV0724     FALSE 0.087 240.000 0.027 1.000 N NA
 112746 112747 SAV0724 SAV0725     FALSE 0.060 339.000 0.102 NA   NA
 112748 112749 SAV0726 SAV0727     FALSE 0.087 270.000 0.057 1.000 N NA
 112749 112750 SAV0727 SAV0728     FALSE 0.030 341.000 0.000 1.000   NA
 112750 112751 SAV0728 SAV0729     TRUE 0.761 20.000 0.005 1.000   NA
 112752 112753 SAV0730 SAV0731 nrdI nrdE TRUE 0.998 -88.000 0.533 0.001 Y NA
 112753 112754 SAV0731 SAV0732 nrdE nrdF TRUE 0.952 118.000 0.875 0.001 Y NA
 112754 112755 SAV0732 SAV0733 nrdF   FALSE 0.025 375.000 0.000 1.000 N NA
 112755 112756 SAV0733 SAV0734     TRUE 0.998 -13.000 0.870 0.043 Y NA
 112756 112757 SAV0734 SAV0735     TRUE 0.997 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 112757 112758 SAV0735 SAV0736     TRUE 0.667 119.000 0.031 1.000 Y NA
 112759 112760 SAV0737 SAV0738     TRUE 0.798 18.000 0.014 1.000   NA
 112760 112761 SAV0738 SAV0739     FALSE 0.219 127.000 0.014 NA   NA
 112762 112763 SAV0740 SAV0741     FALSE 0.231 154.000 0.069 NA   NA
 112763 112764 SAV0741 SAV0742     FALSE 0.015 424.000 0.000 NA   NA
 112765 112766 SAV0743 SAV0744 pepT   TRUE 0.855 14.000 0.127 NA   NA
 112766 112767 SAV0744 SAV0745     TRUE 0.959 18.000 0.875 NA   NA
 112767 112768 SAV0745 SAV0746     FALSE 0.140 196.000 0.067 NA   NA
 112771 112772 SAV0749 SAV0750     FALSE 0.050 544.000 0.214 NA   NA
 112772 112773 SAV0750 SAV0751     TRUE 0.972 -7.000 0.130 1.000   NA
 112773 112774 SAV0751 SAV0752     TRUE 0.529 61.000 0.080 NA   NA
 112774 112775 SAV0752 SAV0753   secA FALSE 0.030 414.000 0.041 NA N NA
 112775 112776 SAV0753 SAV0754 secA prfB FALSE 0.038 433.000 0.052 1.000 N NA
 112776 112777 SAV0754 SAV0755 prfB   FALSE 0.022 409.000 0.000 1.000   NA
 112777 112778 SAV0755 SAV0756     FALSE 0.156 174.000 0.010 1.000   NA
 112778 112779 SAV0756 SAV0757     TRUE 0.953 -3.000 0.093 NA   NA
 112779 112780 SAV0757 SAV0758   uvrB FALSE 0.049 263.000 0.007 NA   NA
 112780 112781 SAV0758 SAV0759 uvrB uvrA TRUE 0.989 8.000 0.154 0.001 Y NA
 112781 112782 SAV0759 SAV0760 uvrA hprK FALSE 0.019 664.000 0.002 1.000 N NA
 112782 112783 SAV0760 SAV0761 hprK lgt TRUE 0.959 6.000 0.494 1.000 N NA
 112783 112784 SAV0761 SAV0762 lgt   TRUE 0.859 8.000 0.045 1.000   NA
 112784 112785 SAV0762 SAV0763     TRUE 0.916 8.000 0.169 1.000   NA
 112785 112786 SAV0763 SAV0764   trxB TRUE 0.646 67.000 0.183 1.000   NA
 112786 112787 SAV0764 SAV0765 trxB   FALSE 0.021 945.000 0.050 NA   NA
 112787 112788 SAV0765 SAV0766     TRUE 0.971 -3.000 0.214 NA   NA
 112788 112789 SAV0766 SAV0767     TRUE 0.625 111.000 0.470 NA   NA
 112792 112793 SAV0770 SAV0771   gapR FALSE 0.010 925.000 0.000 NA   NA
 112793 112794 SAV0771 SAV0772 gapR gap TRUE 0.616 53.000 0.076 1.000 N NA
 112794 112795 SAV0772 SAV0773 gap pgk TRUE 0.738 139.000 0.006 0.006 Y NA
 112795 112796 SAV0773 SAV0774 pgk tpi TRUE 0.735 122.000 0.141 1.000 Y NA
 112796 112797 SAV0774 SAV0775 tpi pgm TRUE 0.982 3.000 0.138 1.000 Y NA
 112797 112798 SAV0775 SAV0776 pgm eno TRUE 0.715 130.000 0.136 1.000 Y NA
 112798 112799 SAV0776 SAV0777 eno   FALSE 0.029 339.000 0.005 NA   NA
 112799 112800 SAV0777 SAV0778   secG FALSE 0.347 67.000 0.007 NA   NA
 112800 112801 SAV0778 SAV0779 secG   FALSE 0.331 116.000 0.032 1.000   NA
 112801 2137008 SAV0779 SAV0780     TRUE 0.715 34.000 0.060 1.000   NA
 2137008 112804 SAV0780 SAV0782   ssrP TRUE 0.932 22.000 0.143 0.023 N NA
 112804 2137009 SAV0782 SAVtmRNA01 ssrP tmRNA FALSE 0.207 91.000 0.000 NA   NA
 112805 112806 SAV0783 SAV0784     TRUE 0.902 6.000 0.000 0.066   NA
 112807 112808 SAV0785 SAV0786     TRUE 0.539 36.000 0.000 1.000   NA
 112808 112809 SAV0786 SAV0787     TRUE 0.881 -3.000 0.000 NA   NA
 112809 112810 SAV0787 SAV0788     TRUE 0.896 -7.000 0.000 NA   NA
 112810 112811 SAV0788 SAV0789     TRUE 0.792 3.000 0.000 NA   NA
 112811 112812 SAV0789 SAV0790     FALSE 0.272 67.000 0.000 NA   NA
 112812 112813 SAV0790 SAV0791     TRUE 0.963 17.000 1.000 NA   NA
 112813 112814 SAV0791 SAV0792     FALSE 0.060 202.000 0.000 NA   NA
 112814 112815 SAV0792 SAV0793     TRUE 0.983 2.000 1.000 NA   NA
 112815 112816 SAV0793 SAV0794     TRUE 0.881 -3.000 0.000 NA   NA
 112816 112817 SAV0794 SAV0795     FALSE 0.014 450.000 0.000 NA   NA
 112817 112818 SAV0795 SAV0796     TRUE 0.669 12.000 0.000 NA   NA
 112818 112819 SAV0796 SAV0797     TRUE 0.657 18.000 0.000 NA   NA
 112819 112820 SAV0797 SAV0798     FALSE 0.355 51.000 0.000 NA   NA
 112820 112821 SAV0798 SAV0799     TRUE 0.896 -33.000 0.000 NA   NA
 112821 112822 SAV0799 SAV0800     TRUE 0.881 -3.000 0.000 NA   NA
 112822 112823 SAV0800 SAV0801     FALSE 0.030 277.000 0.000 NA N NA
 112823 112824 SAV0801 SAV0802     FALSE 0.046 225.000 0.000 NA   NA
 112824 112825 SAV0802 SAV0803     FALSE 0.012 545.000 0.000 NA   NA
 112825 112826 SAV0803 SAV0804     FALSE 0.312 58.000 0.000 NA N NA
 112826 112827 SAV0804 SAV0805     FALSE 0.018 376.000 0.000 NA   NA
 112827 112828 SAV0805 SAV0806     FALSE 0.287 64.000 0.000 NA   NA
 112829 112830 SAV0807 SAV0808     FALSE 0.018 375.000 0.000 NA   NA
 112831 112832 SAV0809 SAV0810     FALSE 0.129 139.000 0.000 NA   NA
 112832 112833 SAV0810 SAV0811   fnb FALSE 0.049 263.000 0.000 1.000   NA
 112833 112834 SAV0811 SAV0812 fnb   FALSE 0.047 221.000 0.000 NA   NA
 112834 112835 SAV0812 SAV0813   ssp FALSE 0.020 353.000 0.000 NA   NA
 112835 112836 SAV0813 SAV0814 ssp   FALSE 0.022 335.000 0.000 NA   NA
 112836 112837 SAV0814 SAV0815   nuc FALSE 0.021 341.000 0.000 NA   NA
 112837 112838 SAV0815 SAV0816 nuc cspC FALSE 0.027 357.000 0.000 1.000 N NA
 112839 112840 SAV0817 SAV0818     TRUE 0.806 62.000 0.667 NA   NA
 112840 112841 SAV0818 SAV0819     FALSE 0.213 88.000 0.000 NA   NA
 112841 112842 SAV0819 SAV0820     FALSE 0.367 188.000 0.444 NA   NA
 112842 112843 SAV0820 SAV0821     TRUE 0.876 29.000 0.333 NA   NA
 112847 112848 SAV0825 SAV0826     FALSE 0.359 155.000 0.167 1.000   NA
 112851 112852 SAV0829 SAV0830     FALSE 0.384 83.000 0.022 1.000 N NA
 112854 112855 SAV0832 SAV0833     FALSE 0.349 158.000 0.170 1.000 N NA
 112855 112856 SAV0833 SAV0834     FALSE 0.082 179.000 0.000 NA   NA
 112856 112857 SAV0834 SAV0835     FALSE 0.010 797.000 0.000 NA   NA
 112857 112858 SAV0835 SAV0836     TRUE 0.985 -7.000 0.443 NA   NA
 112858 112859 SAV0836 SAV0837     FALSE 0.037 250.000 0.000 NA   NA
 112859 112860 SAV0837 SAV0838     TRUE 0.996 -7.000 0.642 1.000 Y NA
 112860 112861 SAV0838 SAV0839     TRUE 0.954 18.000 0.085 NA Y NA
 112861 112862 SAV0839 SAV0840     FALSE 0.020 354.000 0.000 NA   NA
 112864 112865 SAV0842 SAV0843     TRUE 0.784 98.000 0.139 1.000 Y NA
 112865 112866 SAV0843 SAV0844     TRUE 0.689 115.000 0.606 1.000 N NA
 112866 112867 SAV0844 SAV0845     TRUE 0.983 -10.000 0.292 1.000 N NA
 112867 112868 SAV0845 SAV0846     TRUE 0.608 151.000 0.152 0.002 N NA
 112871 112872 SAV0849 SAV0850     TRUE 0.816 32.000 0.222 NA   NA
 112872 112873 SAV0850 SAV0851     TRUE 0.652 13.000 0.000 NA   NA
 112877 112878 SAV0855 SAV0856     TRUE 0.832 1.000 0.000 NA   NA
 112878 112879 SAV0856 SAV0857     FALSE 0.417 40.000 0.000 NA   NA
 112881 112882 SAV0859 SAV0860     FALSE 0.038 247.000 0.000 NA   NA
 112884 112885 SAV0862 SAV0863     TRUE 0.896 -7.000 0.000 NA   NA
 112885 112886 SAV0863 SAV0864     FALSE 0.012 502.000 0.000 NA   NA
 112886 112887 SAV0864 SAV0865     TRUE 0.953 11.000 0.500 1.000   NA
 112887 112888 SAV0865 SAV0866     TRUE 0.976 1.000 0.500 NA   NA
 112890 112891 SAV0868 SAV0869     TRUE 0.652 13.000 0.000 NA   NA
 112891 112892 SAV0869 SAV0870     TRUE 0.976 -3.000 0.286 NA   NA
 112892 112893 SAV0870 SAV0871     TRUE 0.949 13.000 0.667 NA   NA
 112893 112894 SAV0871 SAV0872     TRUE 0.691 10.000 0.000 NA   NA
 112894 112895 SAV0872 SAV0873     FALSE 0.068 192.000 0.000 NA   NA
 112895 112896 SAV0873 SAV0874     TRUE 0.832 1.000 0.000 NA   NA
 112896 112897 SAV0874 SAV0875     TRUE 0.669 12.000 0.000 NA   NA
 112897 112898 SAV0875 SAV0876     TRUE 0.896 -7.000 0.000 NA   NA
 112898 112899 SAV0876 SAV0877     FALSE 0.442 37.000 0.000 NA   NA
 112899 112900 SAV0877 SAV0878     TRUE 0.881 -3.000 0.000 NA   NA
 112900 112901 SAV0878 SAV0879     TRUE 0.881 -3.000 0.000 NA   NA
 112901 112902 SAV0879 SAV0880     TRUE 0.896 -7.000 0.000 NA   NA
 112902 112903 SAV0880 SAV0881     TRUE 0.900 -10.000 0.000 NA   NA
 112903 112904 SAV0881 SAV0882     TRUE 0.853 0.000 0.000 NA   NA
 112904 112905 SAV0882 SAV0883     FALSE 0.318 58.000 0.000 NA   NA
 112905 112906 SAV0883 SAV0884     TRUE 0.654 15.000 0.000 NA   NA
 112906 112907 SAV0884 SAV0885     FALSE 0.073 187.000 0.000 NA   NA
 112907 112908 SAV0885 SAV0886     TRUE 0.981 -13.000 0.000 0.002   NA
 112908 112909 SAV0886 SAV0887     TRUE 0.935 11.000 0.375 NA   NA
 112909 112910 SAV0887 SAV0888     TRUE 0.927 7.000 0.278 NA   NA
 112910 112911 SAV0888 SAV0889     FALSE 0.248 73.000 0.000 NA   NA
 112911 112912 SAV0889 SAV0890     FALSE 0.137 135.000 0.000 NA   NA
 112912 112913 SAV0890 SAV0891     TRUE 0.823 14.000 0.077 NA   NA
 112913 112914 SAV0891 SAV0892     FALSE 0.142 132.000 0.000 NA   NA
 112914 112915 SAV0892 SAV0893     TRUE 0.611 22.000 0.000 NA   NA
 112915 112916 SAV0893 SAV0894     TRUE 0.926 9.000 0.286 NA   NA
 112916 112917 SAV0894 SAV0895     TRUE 0.982 -3.000 0.429 NA   NA
 112917 112918 SAV0895 SAV0896     TRUE 0.967 0.000 0.250 NA   NA
 112918 112919 SAV0896 SAV0897     TRUE 0.925 12.000 0.333 NA   NA
 112919 112920 SAV0897 SAV0898     TRUE 0.785 19.000 0.041 NA   NA
 112920 112921 SAV0898 SAV0899     TRUE 0.537 62.000 0.093 NA   NA
 112921 112922 SAV0899 SAV0900     TRUE 0.532 120.000 0.312 NA   NA
 112922 112923 SAV0900 SAV0901     TRUE 0.664 17.000 0.000 NA   NA
 112923 112924 SAV0901 SAV0902     TRUE 0.652 13.000 0.000 NA   NA
 112924 112925 SAV0902 SAV0903     TRUE 0.968 9.000 1.000 NA   NA
 112925 112926 SAV0903 SAV0904     TRUE 0.884 15.000 0.182 NA   NA
 112926 112927 SAV0904 SAV0905     TRUE 0.959 0.000 0.182 NA   NA
 112927 112928 SAV0905 SAV0906     TRUE 0.853 0.000 0.000 NA   NA
 112928 112929 SAV0906 SAV0907     TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 112929 112930 SAV0907 SAV0908     FALSE 0.412 41.000 0.000 NA   NA
 112930 112931 SAV0908 SAV0909     FALSE 0.133 137.000 0.000 NA   NA
 112931 112932 SAV0909 SAV0910     TRUE 0.727 13.000 0.000 1.000   NA
 112932 112933 SAV0910 SAV0911     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 112933 112934 SAV0911 SAV0912     FALSE 0.329 56.000 0.000 NA   NA
 112934 112935 SAV0912 SAV0913     TRUE 0.986 -19.000 0.500 NA   NA
 112935 112936 SAV0913 SAV0914     FALSE 0.034 267.000 0.000 NA   NA
 112936 112937 SAV0914 SAV0915     FALSE 0.255 71.000 0.000 NA   NA
 112937 112938 SAV0915 SAV0916     FALSE 0.012 520.000 0.000 NA   NA
 112938 112939 SAV0916 SAV0917     TRUE 0.896 -7.000 0.000 NA   NA
 112941 112942 SAV0919 SAV0920     TRUE 0.829 14.000 0.085 NA   NA
 112942 112943 SAV0920 SAV0921     FALSE 0.043 385.000 0.079 NA   NA
 112943 112944 SAV0921 SAV0922     TRUE 0.914 13.000 0.303 NA   NA
 112944 112945 SAV0922 SAV0923     TRUE 0.894 27.000 0.299 1.000   NA
 112945 112946 SAV0923 SAV0924   lipA FALSE 0.357 84.000 0.012 1.000 N NA
 112946 112947 SAV0924 SAV0925 lipA   FALSE 0.224 130.000 0.021 NA   NA
 112947 112948 SAV0925 SAV0926   tnp FALSE 0.057 206.000 0.000 NA   NA
 112950 112951 SAV0928 SAV0929     TRUE 0.965 0.000 0.237 NA   NA
 112951 112952 SAV0929 SAV0930     TRUE 0.854 33.000 0.082 0.060 N NA
 112952 112953 SAV0930 SAV0931     FALSE 0.016 412.000 0.000 NA   NA
 112953 112954 SAV0931 SAV0932   dltA TRUE 0.944 16.000 0.549 NA   NA
 112954 112955 SAV0932 SAV0933 dltA dltB TRUE 0.982 -3.000 0.435 NA N NA
 112955 112956 SAV0933 SAV0934 dltB dltC TRUE 0.928 18.000 0.387 NA   NA
 112956 112957 SAV0934 SAV0935 dltC dltD TRUE 0.946 -3.000 0.064 NA   NA
 112961 112962 SAV0939 SAV0940     TRUE 0.742 13.000 0.012 NA   NA
 112962 112963 SAV0940 SAV0941     FALSE 0.014 454.000 0.000 NA   NA
 112963 112964 SAV0941 SAV0942   ampA FALSE 0.363 131.000 0.097 1.000 N NA
 112964 112965 SAV0942 SAV0943 ampA   FALSE 0.035 411.000 0.025 1.000   NA
 112965 112966 SAV0943 SAV0944     TRUE 0.798 19.000 0.052 NA   NA
 112967 112968 SAV0945 SAV0946   mnhG FALSE 0.200 249.000 0.364 NA N NA
 112968 112969 SAV0946 SAV0947 mnhG mnhF TRUE 0.994 -22.000 0.244 1.000 Y NA
 112969 112970 SAV0947 SAV0948 mnhF mnhE TRUE 0.997 0.000 0.829 0.069 Y NA
 112970 112971 SAV0948 SAV0949 mnhE mnhD TRUE 0.997 2.000 0.842 0.004 Y NA
 112971 112972 SAV0949 SAV0950 mnhD mnhC TRUE 0.997 -7.000 0.211 0.003 Y NA
 112972 112973 SAV0950 SAV0951 mnhC mnhB TRUE 0.989 0.000 0.195 NA Y NA
 112973 112974 SAV0951 SAV0952 mnhB mnhA TRUE 0.995 -7.000 0.439 NA Y NA
 112974 112975 SAV0952 SAV0953 mnhA   FALSE 0.426 131.000 0.206 NA   NA
 112976 112977 SAV0954 SAV0955     FALSE 0.041 532.000 0.110 1.000 N NA
 112977 112978 SAV0955 SAV0956     FALSE 0.043 362.000 0.027 1.000 N NA
 112978 112979 SAV0956 SAV0957   rocD FALSE 0.035 308.000 0.000 1.000 N NA
 112979 112980 SAV0957 SAV0958 rocD gudB TRUE 0.680 109.000 0.019 1.000 Y NA
 112981 112982 SAV0959 SAV0960 glpQ argH FALSE 0.068 242.000 0.003 1.000 N NA
 112982 112983 SAV0960 SAV0961 argH argG TRUE 0.995 -10.000 0.278 1.000 Y NA
 112984 112985 SAV0962 SAV0963 pgi   FALSE 0.032 325.000 0.005 NA   NA
 112985 112986 SAV0963 SAV0964   spsA TRUE 0.895 5.000 0.115 NA   NA
 112986 112987 SAV0964 SAV0965 spsA spsB TRUE 0.988 16.000 0.184 0.001 Y NA
 112987 112988 SAV0965 SAV0966 spsB   FALSE 0.238 160.000 0.057 1.000 N NA
 112988 112989 SAV0966 SAV0967     TRUE 0.994 4.000 0.408 0.003 Y NA
 112989 112990 SAV0967 SAV0968     FALSE 0.248 166.000 0.075 1.000 N NA
 112990 112991 SAV0968 SAV0969     FALSE 0.040 329.000 0.028 NA   NA
 112992 112993 SAV0970 SAV0971 cdr   TRUE 0.716 52.000 0.171 1.000   NA
 112996 112997 SAV0974 SAV0975   clpB FALSE 0.080 203.000 0.000 1.000 N NA
 112999 113000 SAV0977 SAV0978     TRUE 0.896 -16.000 0.000 NA N NA
 113000 113001 SAV0978 SAV0979     TRUE 0.896 -7.000 0.000 NA   NA
 113001 113002 SAV0979 SAV0980     TRUE 0.897 -22.000 0.000 NA   NA
 113002 113003 SAV0980 SAV0981     FALSE 0.025 311.000 0.000 NA   NA
 113005 113006 SAV0983 SAV0984 fabH   TRUE 0.939 12.000 0.000 1.000 Y NA
 113008 113009 SAV0986 SAV0987 oppB   TRUE 0.992 0.000 0.062 0.040 Y NA
 113009 113010 SAV0987 SAV0988   oppD TRUE 0.987 16.000 0.857 1.000 Y NA
 113010 113011 SAV0988 SAV0989 oppD oppF TRUE 0.997 -10.000 0.111 0.002 Y NA
 113011 113012 SAV0989 SAV0990 oppF   TRUE 0.956 19.000 0.074 1.000 Y NA
 113012 113013 SAV0990 SAV0991     FALSE 0.443 212.000 0.000 0.040 Y NA
 113013 113014 SAV0991 SAV0992     TRUE 0.808 51.000 0.000 1.000 Y NA
 113014 113015 SAV0992 SAV0993   appF TRUE 0.995 3.000 0.333 0.001 Y NA
 113015 113016 SAV0993 SAV0994 appF oppB TRUE 0.989 -7.000 0.045 1.000 Y NA
 113016 113017 SAV0994 SAV0995 oppB   TRUE 0.982 12.000 0.159 0.040 Y NA
 113019 113020 SAV0997 SAV0998 spxA   FALSE 0.042 371.000 0.063 NA N NA
 113020 113021 SAV0998 SAV0999     FALSE 0.348 121.000 0.098 NA   NA
 113021 113022 SAV0999 SAV1000     TRUE 0.597 48.000 0.075 NA   NA
 2137010 113025 SAV1001 SAV1003 yjbM   TRUE 0.683 44.000 0.138 NA   NA
 113025 113026 SAV1003 SAV1004     FALSE 0.407 104.000 0.063 1.000   NA
 113027 113028 SAV1005 SAV1006     TRUE 0.913 17.000 0.283 NA   NA
 113028 113029 SAV1006 SAV1007   ppnK TRUE 0.959 17.000 0.725 1.000   NA
 113029 113030 SAV1007 SAV1008 ppnK   TRUE 0.985 -3.000 0.480 1.000 N NA
 113030 113031 SAV1008 SAV1009     TRUE 0.882 21.000 0.163 1.000 N NA
 113031 113032 SAV1009 SAV1010     TRUE 0.966 10.000 0.094 1.000 Y NA
 113032 113033 SAV1010 SAV1011   fabI FALSE 0.061 278.000 0.016 1.000 N NA
 113035 113036 SAV1013 SAV1014     FALSE 0.119 145.000 0.000 NA N NA
 113036 113037 SAV1014 SAV1015     FALSE 0.276 194.000 0.287 NA N NA
 113038 113039 SAV1016 SAV1017     TRUE 0.980 -22.000 0.239 1.000 N NA
 113040 113041 SAV1018 SAV1019 murE   TRUE 0.932 -10.000 0.012 NA   NA
 113041 2137011 SAV1019 SAV1020     TRUE 0.895 0.000 0.009 NA   NA
 2137011 2137012 SAV1020 SAV1021     FALSE 0.317 187.000 0.014 0.012   NA
 2137012 113044 SAV1021 SAV1022     FALSE 0.036 302.000 0.000 1.000 N NA
 113044 113045 SAV1022 SAV1023   htrA FALSE 0.131 234.000 0.095 1.000 N NA
 113045 113046 SAV1023 SAV1024 htrA   TRUE 0.870 17.000 0.096 1.000 N NA
 113046 113047 SAV1024 SAV1025     FALSE 0.317 136.000 0.068 1.000 N NA
 2137013 2137014 SAVtRNA14 SAVtRNA15     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 2137014 113048 SAVtRNA15 SAV1026     FALSE 0.127 141.000 0.000 NA   NA
 113051 113052 SAV1029 SAV1030     TRUE 0.880 15.000 0.167 NA   NA
 113052 113053 SAV1030 SAV1031     FALSE 0.055 209.000 0.000 NA   NA
 113053 113054 SAV1031 SAV1032     FALSE 0.011 657.000 0.000 NA   NA
 113054 113055 SAV1032 SAV1033     FALSE 0.389 44.000 0.000 NA   NA
 113055 113056 SAV1033 SAV1034     TRUE 0.792 3.000 0.000 NA   NA
 113056 113057 SAV1034 SAV1035     TRUE 0.984 -3.000 0.500 NA   NA
 113058 113059 SAV1036 SAV1037     FALSE 0.016 412.000 0.000 NA   NA
 113064 113065 SAV1042 SAV1043   menD TRUE 0.993 -13.000 0.142 1.000 Y NA
 113065 113066 SAV1043 SAV1044 menD   TRUE 0.983 -13.000 0.355 NA   NA
 113066 113067 SAV1044 SAV1045   menB TRUE 0.979 -7.000 0.280 NA   NA
 113068 113069 SAV1046 SAV1047 sspC sspB TRUE 0.516 38.000 0.000 1.000   NA
 113069 113070 SAV1047 SAV1048 sspB sspA TRUE 0.537 82.000 0.000 0.028   NA
 113070 113071 SAV1048 SAV1049 sspA   FALSE 0.084 528.000 0.000 1.000 Y NA
 113071 113072 SAV1049 SAV1050     FALSE 0.230 196.000 0.158 1.000 N NA
 2137015 113076 SAV1052 SAV1054     FALSE 0.062 228.000 0.000 1.000   NA
 113076 113077 SAV1054 SAV1055     FALSE 0.439 155.000 0.364 NA   NA
 113077 113078 SAV1055 SAV1056     TRUE 0.865 48.000 0.800 NA   NA
 113080 113081 SAV1058 SAV1059   qoxC TRUE 0.997 -3.000 0.959 1.000 Y NA
 113081 113082 SAV1059 SAV1060 qoxC qoxB TRUE 0.998 -10.000 0.957 0.028 Y NA
 113082 113083 SAV1060 SAV1061 qoxB   TRUE 0.997 0.000 0.489 0.004 Y NA
 113083 113084 SAV1061 SAV1062     FALSE 0.011 571.000 0.000 NA   NA
 113084 113085 SAV1062 SAV1063   folD FALSE 0.010 864.000 0.000 NA   NA
 113086 113087 SAV1064 SAV1065   purK TRUE 0.995 -13.000 0.008 0.001 Y NA
 113087 113088 SAV1065 SAV1066 purK purC TRUE 0.968 4.000 0.015 1.000 Y NA
 113088 113089 SAV1066 SAV1067 purC   TRUE 0.994 0.000 0.460 1.000 Y NA
 113089 113090 SAV1067 SAV1068   purQ TRUE 0.997 2.000 0.656 0.001 Y NA
 113090 113091 SAV1068 SAV1069 purQ purL TRUE 0.998 -7.000 0.346 0.001 Y NA
 113091 113092 SAV1069 SAV1070 purL purF TRUE 0.994 -21.000 0.223 1.000 Y NA
 113092 113093 SAV1070 SAV1071 purF purM TRUE 0.994 -7.000 0.248 1.000 Y NA
 113093 113094 SAV1071 SAV1072 purM purN TRUE 0.994 3.000 0.238 0.003 Y NA
 113094 113095 SAV1072 SAV1073 purN purH TRUE 0.974 12.000 0.225 1.000 Y NA
 113095 113096 SAV1073 SAV1074 purH purD TRUE 0.766 130.000 0.238 1.000 Y NA
 113097 113098 SAV1075 SAV1076     TRUE 0.987 -7.000 0.469 1.000   NA
 113098 113099 SAV1076 SAV1077     TRUE 0.903 15.000 0.241 NA   NA
 113099 113100 SAV1077 SAV1078     FALSE 0.018 381.000 0.000 NA   NA
 113100 113101 SAV1078 SAV1079     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 113102 113103 SAV1080 SAV1081     FALSE 0.032 425.000 0.050 NA   NA
 113103 113104 SAV1081 SAV1082     TRUE 0.591 54.000 0.100 NA   NA
 113104 113105 SAV1082 SAV1083   ptsH FALSE 0.205 154.000 0.047 NA   NA
 113105 113106 SAV1083 SAV1084 ptsH ptsI TRUE 0.989 3.000 0.054 0.013 Y NA
 113108 113109 SAV1086 SAV1087     TRUE 0.998 -3.000 0.778 0.028 Y NA
 113109 113110 SAV1087 SAV1088     FALSE 0.424 133.000 0.163 1.000 N NA
 113111 2137016 SAV1089 SAV1090     TRUE 0.981 0.000 0.576 NA   NA
 2137016 113113 SAV1090 SAV1091   def FALSE 0.023 482.000 0.025 NA   NA
 113114 113115 SAV1092 SAV1093   pdhA FALSE 0.171 171.000 0.046 NA   NA
 113115 113116 SAV1093 SAV1094 pdhA phdB TRUE 0.995 4.000 0.484 0.002 Y NA
 113116 113117 SAV1094 SAV1095 phdB pdhC TRUE 0.946 91.000 0.883 0.059 Y NA
 113117 113118 SAV1095 SAV1096 pdhC pdhD TRUE 0.993 4.000 0.948 1.000 Y NA
 113118 113119 SAV1096 SAV1097 pdhD   FALSE 0.227 168.000 0.096 NA   NA
 113119 113120 SAV1097 SAV1098     FALSE 0.211 144.000 0.034 NA   NA
 113120 113121 SAV1098 SAV1099   potA TRUE 0.928 13.000 0.326 1.000 N NA
 113121 113122 SAV1099 SAV1100 potA potB TRUE 0.998 -7.000 0.928 0.040 Y NA
 113122 113123 SAV1100 SAV1101 potB potC TRUE 0.992 6.000 0.492 0.040 Y NA
 113123 113124 SAV1101 SAV1102 potC potD TRUE 0.995 0.000 0.253 0.040 Y NA
 113124 113125 SAV1102 SAV1103 potD   TRUE 0.461 74.000 0.089 NA   NA
 113125 113126 SAV1103 SAV1104     FALSE 0.029 283.000 0.000 NA   NA
 113127 113128 SAV1105 SAV1106     FALSE 0.139 184.000 0.041 NA   NA
 113132 113133 SAV1110 SAV1111     TRUE 0.946 2.000 0.173 NA   NA
 113134 113135 SAV1112 SAV1113     FALSE 0.015 419.000 0.000 NA   NA
 113135 113136 SAV1113 SAV1114   pycA FALSE 0.016 554.000 0.000 1.000 N NA
 113138 113139 SAV1116 SAV1117 ctaB   TRUE 0.711 25.000 0.027 NA   NA
 113139 113140 SAV1117 SAV1118     FALSE 0.049 327.000 0.052 NA   NA
 113140 2137017 SAV1118 SAV1119     TRUE 0.917 16.000 0.301 NA   NA
 113146 113147 SAV1124 SAV1125     TRUE 0.971 2.000 0.367 1.000 N NA
 113149 113150 SAV1127 SAV1128   rpmF TRUE 0.728 80.000 0.599 NA   NA
 113151 113152 SAV1129 SAV1130     TRUE 0.511 203.000 0.000 0.009 Y NA
 113153 113154 SAV1131 SAV1132     TRUE 0.853 0.000 0.000 NA   NA
 113154 113155 SAV1132 SAV1133     TRUE 0.881 -3.000 0.000 NA   NA
 113155 113156 SAV1133 SAV1134     TRUE 0.830 157.000 0.877 1.000 Y NA
 113156 113157 SAV1134 SAV1135     FALSE 0.297 62.000 0.000 NA   NA
 113157 113158 SAV1135 SAV1136   isdG TRUE 0.804 19.000 0.058 NA   NA
 113158 113159 SAV1136 SAV1137 isdG   FALSE 0.025 384.000 0.000 1.000   NA
 113159 113160 SAV1137 SAV1138   pheS FALSE 0.137 380.000 0.006 1.000 Y NA
 113160 113161 SAV1138 SAV1139 pheS pheT TRUE 0.998 0.000 0.574 0.001 Y NA
 113163 113164 SAV1141 SAV1142     TRUE 0.931 1.000 0.091 NA   NA
 113164 113165 SAV1142 SAV1143     TRUE 0.495 73.000 0.066 1.000   NA
 113165 113166 SAV1143 SAV1144   mutS2 TRUE 0.968 10.000 0.114 1.000 Y NA
 113166 113167 SAV1144 SAV1145 mutS2 trxA FALSE 0.169 173.000 0.018 1.000   NA
 113167 113168 SAV1145 SAV1146 trxA uvrC FALSE 0.051 324.000 0.023 1.000   NA
 113168 113169 SAV1146 SAV1147 uvrC sdhC FALSE 0.032 324.000 0.000 1.000 N NA
 113169 113170 SAV1147 SAV1148 sdhC sdhA TRUE 0.957 52.000 0.184 0.001 Y NA
 113170 2137018 SAV1148 SAV1149 sdhA sdhB TRUE 0.996 0.000 0.231 0.001 Y NA
 2137018 113173 SAV1149 SAV1151 sdhB murI FALSE 0.072 236.000 0.002 1.000 N NA
 113173 113174 SAV1151 SAV1152 murI   TRUE 0.828 12.000 0.034 1.000 N NA
 113174 113175 SAV1152 SAV1153     TRUE 0.966 -7.000 0.085 1.000   NA
 113175 113176 SAV1153 SAV1154     FALSE 0.104 158.000 0.000 NA   NA
 113176 113177 SAV1154 SAV1155     FALSE 0.066 194.000 0.000 NA   NA
 113179 113180 SAV1157 SAV1158     FALSE 0.036 260.000 0.000 NA   NA
 113180 113181 SAV1158 SAV1159     FALSE 0.117 150.000 0.000 NA   NA
 113182 113183 SAV1160 SAV1161     FALSE 0.011 622.000 0.000 NA   NA
 113187 113188 SAV1165 SAV1166     FALSE 0.142 132.000 0.000 NA   NA
 113188 113189 SAV1166 SAV1167     TRUE 0.498 108.000 0.000 0.017   NA
 113189 113190 SAV1167 SAV1168     TRUE 0.527 95.000 0.000 0.017   NA
 113191 113192 SAV1169 SAV1170 argF   TRUE 0.985 23.000 1.000 1.000 Y NA
 113192 113193 SAV1170 SAV1171     FALSE 0.122 172.000 0.000 1.000   NA
 113193 113194 SAV1171 SAV1172     FALSE 0.026 307.000 0.000 NA   NA
 113199 113200 SAV1177 SAV1178     FALSE 0.198 144.000 0.025 NA   NA
 113200 113201 SAV1178 SAV1179     TRUE 0.948 16.000 0.635 NA   NA
 113201 113202 SAV1179 SAV1180   ftsL TRUE 0.850 14.000 0.077 1.000 N NA
 113202 113203 SAV1180 SAV1181 ftsL pbpA TRUE 0.987 -19.000 0.456 1.000 N NA
 113203 113204 SAV1181 SAV1182 pbpA mraY FALSE 0.227 292.000 0.038 1.000 Y NA
 113204 113205 SAV1182 SAV1183 mraY murD TRUE 0.997 2.000 0.647 0.007 Y NA
 113205 113206 SAV1183 SAV1184 murD div1b TRUE 0.938 16.000 0.008 NA Y NA
 113206 113207 SAV1184 SAV1185 div1b ftsA TRUE 0.605 106.000 0.389 NA N NA
 113207 113208 SAV1185 SAV1186 ftsA ftsZ TRUE 0.961 33.000 0.460 1.000 Y NA
 113208 113209 SAV1186 SAV1187 ftsZ   FALSE 0.088 260.000 0.082 NA   NA
 113209 113210 SAV1187 SAV1188     TRUE 0.816 18.000 0.061 NA   NA
 113210 113211 SAV1188 SAV1189     TRUE 0.969 -3.000 0.194 NA   NA
 113211 113212 SAV1189 SAV1190     TRUE 0.930 12.000 0.370 NA   NA
 113212 113213 SAV1190 SAV1191     FALSE 0.199 251.000 0.287 1.000   NA
 113213 113214 SAV1191 SAV1192     TRUE 0.928 24.000 0.579 NA   NA
 113214 113215 SAV1192 SAV1193   ileS FALSE 0.070 221.000 0.012 NA N NA
 113215 113216 SAV1193 SAV1194 ileS   FALSE 0.039 291.000 0.000 1.000   NA
 113218 113219 SAV1196 SAV1197 lsp   TRUE 0.916 0.000 0.008 1.000 N NA
 113219 113220 SAV1197 SAV1198   pyrR FALSE 0.041 400.000 0.048 1.000 N NA
 113220 113221 SAV1198 SAV1199 pyrR pyrP FALSE 0.431 218.000 0.140 1.000 Y NA
 113221 113222 SAV1199 SAV1200 pyrP pyrB TRUE 0.934 28.000 0.064 1.000 Y NA
 113222 113223 SAV1200 SAV1201 pyrB pyrC TRUE 0.981 18.000 0.452 1.000 Y NA
 113223 113224 SAV1201 SAV1202 pyrC pyrAA TRUE 0.986 2.000 0.155 1.000 Y NA
 113224 113225 SAV1202 SAV1203 pyrAA carB TRUE 0.997 -7.000 0.117 0.001 Y NA
 113225 113226 SAV1203 SAV1204 carB pyrF TRUE 0.677 110.000 0.018 1.000 Y NA
 113226 113227 SAV1204 SAV1205 pyrF pyrE TRUE 0.981 0.000 0.006 1.000 Y NA
 113227 113228 SAV1205 SAV1206 pyrE   TRUE 0.524 30.000 0.000 NA   NA
 113228 113229 SAV1206 SAV1207     FALSE 0.014 437.000 0.000 NA   NA
 113231 113232 SAV1209 SAV1210 gmk   TRUE 0.981 0.000 0.471 1.000 N NA
 113232 113233 SAV1210 SAV1211     FALSE 0.207 216.000 0.192 1.000 N NA
 113233 113234 SAV1211 SAV1212   priA TRUE 0.952 0.000 0.099 1.000 N NA
 113234 113235 SAV1212 SAV1213 priA   FALSE 0.012 506.000 0.000 NA   NA
 113237 113238 SAV1215 SAV1216     TRUE 0.994 -7.000 0.031 0.030 Y NA
 113238 113239 SAV1216 SAV1217     TRUE 0.995 -81.000 0.305 1.000 Y NA
 113239 113240 SAV1217 SAV1218     TRUE 0.939 3.000 0.135 1.000   NA
 113240 113241 SAV1218 SAV1219     TRUE 0.896 7.000 0.105 1.000   NA
 113241 113242 SAV1219 SAV1220     TRUE 0.996 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 113242 113243 SAV1220 SAV1221     FALSE 0.191 228.000 0.196 1.000   NA
 113243 113244 SAV1221 SAV1222   cfxE TRUE 0.910 1.000 0.013 1.000   NA
 113244 113245 SAV1222 SAV1223 cfxE   TRUE 0.835 7.000 0.019 1.000 N NA
 113247 113248 SAV1225 SAV1226     TRUE 0.943 15.000 0.567 NA   NA
 113248 113249 SAV1226 SAV1227   recG FALSE 0.190 190.000 0.074 1.000   NA
 113249 113250 SAV1227 SAV1228 recG   FALSE 0.114 218.000 0.078 NA N NA
 113250 113251 SAV1228 SAV1229   plsX TRUE 0.819 5.000 0.020 NA N NA
 113251 113252 SAV1229 SAV1230 plsX fabD TRUE 0.996 -7.000 0.106 0.005 Y NA
 113252 113253 SAV1230 SAV1231 fabD fabG TRUE 0.997 -13.000 0.149 0.005 Y NA
 113253 113254 SAV1231 SAV1232 fabG hmrB FALSE 0.286 435.000 0.100 0.005 Y NA
 113254 113255 SAV1232 SAV1233 hmrB rnc FALSE 0.380 116.000 0.068 1.000 N NA
 113255 113256 SAV1233 SAV1234 rnc smc FALSE 0.339 147.000 0.120 1.000 N NA
 113256 113257 SAV1234 SAV1235 smc   TRUE 0.984 0.000 0.165 0.011 N NA
 113257 113258 SAV1235 SAV1236     TRUE 0.966 -13.000 0.081 1.000   NA
 113258 113259 SAV1236 SAV1237   ffh TRUE 0.852 26.000 0.151 1.000   NA
 113259 113260 SAV1237 SAV1238 ffh rpsP FALSE 0.098 435.000 0.361 1.000 N NA
 113260 113261 SAV1238 SAV1239 rpsP rimM TRUE 0.770 188.000 0.342 0.019 Y NA
 113261 113262 SAV1239 SAV1240 rimM trmD TRUE 0.995 0.000 0.672 1.000 Y NA
 113262 113263 SAV1240 SAV1241 trmD rplS TRUE 0.877 103.000 0.567 1.000 Y NA
 113265 113266 SAV1243 SAV1244   rnhB TRUE 0.975 -16.000 0.148 1.000   NA
 113266 113267 SAV1244 SAV1245 rnhB sucC FALSE 0.313 109.000 0.015 1.000 N NA
 113267 113268 SAV1245 SAV1246 sucC sucD TRUE 0.985 22.000 0.173 0.001 Y NA
 113268 113269 SAV1246 SAV1247 sucD lytN FALSE 0.103 227.000 0.034 1.000   NA
 113269 113270 SAV1247 SAV1248 lytN fmhC(eprh) TRUE 0.920 28.000 0.500 1.000   NA
 113270 113271 SAV1248 SAV1249 fmhC(eprh)   FALSE 0.117 173.000 0.000 1.000 N NA
 113271 113272 SAV1249 SAV1250     TRUE 0.622 180.000 0.238 1.000 Y NA
 113272 113273 SAV1250 SAV1251   gid FALSE 0.325 156.000 0.137 1.000 N NA
 113273 113274 SAV1251 SAV1252 gid xerC FALSE 0.052 418.000 0.105 1.000 N NA
 113274 113275 SAV1252 SAV1253 xerC clpQ TRUE 0.964 -3.000 0.113 1.000 N NA
 113275 113276 SAV1253 SAV1254 clpQ clpY TRUE 0.933 66.000 0.752 1.000 Y NA
 113276 113277 SAV1254 SAV1255 clpY codY TRUE 0.844 25.000 0.131 1.000 N NA
 113277 113278 SAV1255 SAV1256 codY rpsB FALSE 0.037 347.000 0.006 1.000 N NA
 113278 113279 SAV1256 SAV1257 rpsB tsf TRUE 0.749 182.000 0.748 1.000 Y NA
 113279 113280 SAV1257 SAV1258 tsf smbA TRUE 0.554 137.000 0.416 1.000 N NA
 113280 113281 SAV1258 SAV1259 smbA frr TRUE 0.951 19.000 0.626 1.000 N NA
 113281 113282 SAV1259 SAV1260 frr uppS FALSE 0.131 373.000 0.409 1.000 N NA
 113282 113283 SAV1260 SAV1261 uppS cdsA TRUE 0.971 7.000 0.113 1.000 Y NA
 113283 113284 SAV1261 SAV1262 cdsA   FALSE 0.122 212.000 0.040 1.000 N NA
 113284 113285 SAV1262 SAV1263   proS TRUE 0.853 20.000 0.095 1.000 N NA
 113285 113286 SAV1263 SAV1264 proS polC FALSE 0.193 258.000 0.070 0.048 N NA
 113286 113287 SAV1264 SAV1265 polC   FALSE 0.062 290.000 0.059 NA   NA
 113287 113288 SAV1265 SAV1266   nusA TRUE 0.947 21.000 0.759 NA   NA
 113288 113289 SAV1266 SAV1267 nusA   TRUE 0.970 21.000 0.323 NA Y NA
 113289 113290 SAV1267 SAV1268     TRUE 0.981 -3.000 0.408 NA N NA
 113290 113291 SAV1268 SAV1269   infB TRUE 0.978 5.000 0.223 NA Y NA
 113291 113292 SAV1269 SAV1270 infB rbfA FALSE 0.339 386.000 0.530 1.000 Y NA
 113292 113293 SAV1270 SAV1271 rbfA truB TRUE 0.585 169.000 0.111 1.000 Y NA
 113293 113294 SAV1271 SAV1272 truB ribC TRUE 0.927 15.000 0.308 1.000 N NA
 113294 113295 SAV1272 SAV1273 ribC rpsO FALSE 0.439 115.000 0.119 1.000 N NA
 113295 113296 SAV1273 SAV1274 rpsO pnpA FALSE 0.305 369.000 0.335 1.000 Y NA
 113296 113297 SAV1274 SAV1275 pnpA   FALSE 0.073 236.000 0.002 1.000   NA
 113297 113298 SAV1275 SAV1276   spoIIIE FALSE 0.080 257.000 0.026 1.000   NA
 113298 113299 SAV1276 SAV1277 spoIIIE   TRUE 0.912 5.000 0.115 1.000 N NA
 113299 113300 SAV1277 SAV1278     TRUE 0.777 31.000 0.093 1.000   NA
 113300 113301 SAV1278 SAV1279     TRUE 0.994 0.000 0.872 0.004   NA
 113301 113302 SAV1279 SAV1280     TRUE 0.979 0.000 0.397 1.000   NA
 113302 113303 SAV1280 SAV1281     TRUE 0.631 105.000 0.114 0.057   NA
 113303 113304 SAV1281 SAV1282     TRUE 0.893 19.000 0.163 1.000   NA
 113304 113305 SAV1282 SAV1283   pgsA TRUE 0.630 34.000 0.009 1.000   NA
 113305 113306 SAV1283 SAV1284 pgsA cinA FALSE 0.175 224.000 0.151 1.000   NA
 113306 113307 SAV1284 SAV1285 cinA recA FALSE 0.260 165.000 0.083 1.000   NA
 113307 113308 SAV1285 SAV1286 recA   FALSE 0.042 354.000 0.018 1.000   NA
 113310 113311 SAV1288 SAV1289     FALSE 0.243 140.000 0.021 1.000   NA
 113311 113312 SAV1289 SAV1290     TRUE 0.997 1.000 0.437 0.001 Y NA
 113312 113313 SAV1290 SAV1291     FALSE 0.203 94.000 0.000 NA   NA
 113313 113314 SAV1291 SAV1292     FALSE 0.177 134.000 0.002 NA   NA
 113314 113315 SAV1292 SAV1293     TRUE 0.909 1.000 0.041 NA   NA
 113315 113316 SAV1293 SAV1294     TRUE 0.776 27.000 0.091 NA   NA
 113316 2137020 SAV1294 SAV1295   mutS FALSE 0.035 303.000 0.003 NA   NA
 2137020 113319 SAV1295 SAV1297 mutS mutL TRUE 0.988 13.000 0.220 0.002 Y NA
 113319 113320 SAV1297 SAV1298 mutL glpP TRUE 0.800 15.000 0.020 1.000 N NA
 113322 113323 SAV1300 SAV1301 glpF glpK FALSE 0.327 129.000 0.057 1.000 N NA
 113323 113324 SAV1301 SAV1302 glpK glpD TRUE 0.844 110.000 0.013 0.001 Y NA
 113324 113325 SAV1302 SAV1303 glpD   FALSE 0.233 150.000 0.029 1.000 N NA
 113325 113326 SAV1303 SAV1304   miaA TRUE 0.810 18.000 0.025 1.000 N NA
 113326 113327 SAV1304 SAV1305 miaA   TRUE 0.798 15.000 0.016 1.000   NA
 113329 113330 SAV1307 SAV1308     TRUE 0.844 19.000 0.065 1.000   NA
 113330 113331 SAV1308 SAV1309   glnR FALSE 0.096 243.000 0.046 1.000 N NA
 113331 113332 SAV1309 SAV1310 glnR glnA TRUE 0.863 19.000 0.103 1.000 N NA
 113332 113333 SAV1310 SAV1311 glnA   FALSE 0.009 1895.000 0.000 NA   NA
 113333 113334 SAV1311 SAV1312     FALSE 0.010 1234.000 0.000 NA   NA
 113334 113335 SAV1312 SAV1313     FALSE 0.010 744.000 0.000 NA   NA
 113335 113336 SAV1313 SAV1314     FALSE 0.010 723.000 0.000 NA   NA
 113338 113339 SAV1316 SAV1317     TRUE 0.936 21.000 0.571 NA   NA
 113339 113340 SAV1317 SAV1318     FALSE 0.184 184.000 0.057 1.000 N NA
 113340 2137021 SAV1318 SAV1319     FALSE 0.287 64.000 0.000 NA   NA
 2137021 113342 SAV1319 SAV1320     TRUE 0.896 -31.000 0.000 NA   NA
 113342 113343 SAV1320 SAV1321     TRUE 0.968 4.000 0.500 1.000   NA
 113343 113344 SAV1321 SAV1322     TRUE 0.998 -3.000 0.857 0.011 Y NA
 113350 113351 SAV1328 SAV1329 dhoM thrC TRUE 0.961 6.000 0.021 1.000 Y NA
 113351 113352 SAV1329 SAV1330 thrC thrB TRUE 0.988 2.000 0.221 1.000 Y NA
 113352 113353 SAV1330 SAV1331 thrB   TRUE 0.487 58.000 0.013 1.000   NA
 113354 113355 SAV1332 SAV1333     FALSE 0.334 218.000 0.667 NA   NA
 113356 113357 SAV1334 SAV1335 katA rpmG FALSE 0.321 91.000 0.006 1.000 N NA
 113357 113358 SAV1335 SAV1336 rpmG rpsN FALSE 0.228 454.000 0.052 0.019 Y NA
 113358 113359 SAV1336 SAV1337 rpsN   FALSE 0.194 157.000 0.015 1.000 N NA
 113359 113360 SAV1337 SAV1338     TRUE 0.770 22.000 0.049 NA   NA
 113362 113363 SAV1340 SAV1341     FALSE 0.397 137.000 0.200 NA   NA
 113363 113364 SAV1341 SAV1342   tkt TRUE 0.482 121.000 0.240 NA   NA
 113364 113365 SAV1342 SAV1343 tkt   FALSE 0.043 278.000 0.000 1.000   NA
 113365 113366 SAV1343 SAV1344     FALSE 0.137 179.000 0.026 NA   NA
 113366 113367 SAV1344 SAV1345     FALSE 0.209 124.000 0.010 NA N NA
 113367 113368 SAV1345 SAV1346     TRUE 0.990 4.000 0.669 NA Y NA
 2137022 113372 SAV1348 SAV1350 opuD citB FALSE 0.013 947.000 0.000 1.000 N NA
 113372 113373 SAV1350 SAV1351 citB   FALSE 0.153 180.000 0.015 1.000   NA
 113374 113375 SAV1352 SAV1353     FALSE 0.026 376.000 0.008 NA   NA
 113376 113377 SAV1354 SAV1355 parE parC TRUE 0.997 0.000 0.552 0.002 Y NA
 113377 113378 SAV1355 SAV1356 parC alsT FALSE 0.051 250.000 0.000 1.000 N NA
 113378 113379 SAV1356 SAV1357 alsT glcT FALSE 0.046 500.000 0.119 1.000   NA
 113379 113380 SAV1357 SAV1358 glcT   FALSE 0.376 47.000 0.000 NA   NA
 113380 113381 SAV1358 SAV1359     TRUE 0.896 -7.000 0.000 NA   NA
 113381 113382 SAV1359 SAV1360   fmtC FALSE 0.021 481.000 0.018 NA   NA
 113388 113389 SAV1366 SAV1367     FALSE 0.017 492.000 0.000 1.000 N NA
 113389 113390 SAV1367 SAV1368   trpG TRUE 0.995 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 113390 113391 SAV1368 SAV1369 trpG trpD TRUE 0.958 6.000 0.006 1.000 Y NA
 113391 113392 SAV1369 SAV1370 trpD trpC TRUE 0.988 2.000 0.216 1.000 Y NA
 113392 113393 SAV1370 SAV1371 trpC trpF TRUE 0.996 0.000 0.264 0.002 Y NA
 113393 113394 SAV1371 SAV1372 trpF trpB TRUE 0.998 -7.000 0.375 0.002 Y NA
 113394 113395 SAV1372 SAV1373 trpB trpA TRUE 0.998 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 113395 113396 SAV1373 SAV1374 trpA femA FALSE 0.033 322.000 0.000 1.000 N NA
 113396 113397 SAV1374 SAV1375 femA femB TRUE 0.994 19.000 1.000 0.006 Y NA
 113397 113398 SAV1375 SAV1376 femB   FALSE 0.028 289.000 0.000 NA   NA
 113398 113399 SAV1376 SAV1377     FALSE 0.044 230.000 0.000 NA   NA
 113400 113401 SAV1378 SAV1379     FALSE 0.205 124.000 0.000 1.000   NA
 113401 113402 SAV1379 SAV1380     TRUE 0.995 -7.000 0.059 0.022 Y NA
 113402 113403 SAV1380 SAV1381     TRUE 0.995 -13.000 0.353 1.000 Y NA
 113403 113404 SAV1381 SAV1382     TRUE 0.998 -7.000 0.647 0.038 Y NA
 113404 113405 SAV1382 SAV1383     FALSE 0.097 304.000 0.182 NA   NA
 113407 113408 SAV1385 SAV1386   pstB TRUE 0.972 7.000 0.182 NA Y NA
 113408 113409 SAV1386 SAV1387 pstB   TRUE 0.952 47.000 0.125 0.002 Y NA
 113409 113410 SAV1387 SAV1388     TRUE 0.996 2.000 0.485 0.002 Y NA
 113410 113411 SAV1388 SAV1389     TRUE 0.476 191.000 0.077 1.000 Y NA
 113414 113415 SAV1392 SAV1393   lysC FALSE 0.014 1062.000 0.000 1.000   NA
 113415 113416 SAV1393 SAV1394 lysC asd TRUE 0.849 64.000 0.119 1.000 Y NA
 113416 113417 SAV1394 SAV1395 asd dapA TRUE 0.977 2.000 0.015 1.000 Y NA
 113417 113418 SAV1395 SAV1396 dapA dapB TRUE 0.986 -3.000 0.014 1.000 Y NA
 113418 113419 SAV1396 SAV1397 dapB dapD TRUE 0.930 27.000 0.036 1.000 Y NA
 113419 113420 SAV1397 SAV1398 dapD   TRUE 0.525 143.000 0.372 1.000   NA
 113420 113421 SAV1398 SAV1399     TRUE 0.888 5.000 0.058 1.000   NA
 113421 113422 SAV1399 SAV1400   lysA TRUE 0.944 -10.000 0.008 1.000 N NA
 113423 113424 SAV1401 SAV1402   cspA FALSE 0.063 197.000 0.000 NA   NA
 113424 113425 SAV1402 SAV1403 cspA   FALSE 0.225 171.000 0.105 NA   NA
 113426 113427 SAV1404 SAV1405     TRUE 0.767 25.000 0.067 NA   NA
 113427 113428 SAV1405 SAV1406     TRUE 0.864 32.000 0.373 NA   NA
 113429 113430 SAV1407 SAV1408 braB   FALSE 0.136 226.000 0.136 NA N NA
 113430 113431 SAV1408 SAV1409     TRUE 0.954 14.000 0.822 NA   NA
 113431 113432 SAV1409 SAV1410     FALSE 0.239 181.000 0.156 NA   NA
 113432 113433 SAV1410 SAV1411     TRUE 0.860 29.000 0.280 NA   NA
 113433 113434 SAV1411 SAV1412   odhB FALSE 0.011 580.000 0.000 NA   NA
 113434 2137023 SAV1412 SAV1413 odhB odhA TRUE 0.984 14.000 0.667 1.000 Y NA
 2137023 113436 SAV1413 SAV1414 odhA arlS FALSE 0.051 284.000 0.006 1.000 N NA
 113436 113437 SAV1414 SAV1415 arlS truncated-arlR TRUE 0.997 -3.000 0.438 0.078 Y NA
 113437 113438 SAV1415 SAV1416 truncated-arlR   FALSE 0.013 471.000 0.000 NA   NA
 113438 113439 SAV1416 SAV1417     FALSE 0.170 117.000 0.000 NA   NA
 113439 113440 SAV1417 SAV1418   murG TRUE 0.803 17.000 0.016 1.000 N NA
 113440 113441 SAV1418 SAV1419 murG   TRUE 0.807 12.000 0.014 1.000   NA
 113441 113442 SAV1419 SAV1420   ctpA FALSE 0.041 400.000 0.046 1.000   NA
 113442 113443 SAV1420 SAV1421 ctpA   FALSE 0.131 192.000 0.045 NA   NA
 113443 113444 SAV1421 SAV1422     TRUE 0.937 0.000 0.080 NA   NA
 113444 113445 SAV1422 SAV1423     TRUE 0.898 12.000 0.154 1.000 N NA
 113445 113446 SAV1423 SAV1424     TRUE 0.998 -7.000 0.615 0.002 Y NA
 113446 113447 SAV1424 SAV1425     FALSE 0.216 86.000 0.000 NA   NA
 113447 113448 SAV1425 SAV1426   dfrA TRUE 0.654 15.000 0.000 NA   NA
 113448 113449 SAV1426 SAV1427 dfrA thyA FALSE 0.295 200.000 0.295 1.000 N NA
 113449 113450 SAV1427 SAV1428 thyA   FALSE 0.020 424.000 0.003 NA   NA
 113450 113451 SAV1428 SAV1429     TRUE 0.662 16.000 0.000 NA   NA
 113451 113452 SAV1429 SAV1430     TRUE 0.785 38.000 0.000 0.007   NA
 113452 113453 SAV1430 SAV1431     TRUE 0.887 12.000 0.167 NA   NA
 113454 113455 SAV1432 SAV1433     FALSE 0.025 483.000 0.039 NA   NA
 113456 113457 SAV1434 SAV1435 ebhA ebhB TRUE 0.875 61.000 0.000 0.014 Y NA
 113457 113458 SAV1435 SAV1436 ebhB   FALSE 0.023 398.000 0.000 1.000   NA
 113458 113459 SAV1436 SAV1437     FALSE 0.145 156.000 0.000 1.000   NA
 113459 113460 SAV1437 SAV1438     TRUE 0.900 31.000 0.006 1.000 Y NA
 113460 113461 SAV1438 SAV1439     TRUE 0.699 95.000 0.012 1.000 Y NA
 113461 113462 SAV1439 SAV1440     FALSE 0.018 476.000 0.000 1.000 N NA
 113462 113463 SAV1440 SAV1441     TRUE 0.710 20.000 0.000 1.000   NA
 113465 113466 SAV1443 SAV1444     FALSE 0.220 84.000 0.000 NA   NA
 113466 113467 SAV1444 SAV1445     FALSE 0.014 434.000 0.000 NA   NA
 113467 113468 SAV1445 SAV1446     FALSE 0.191 101.000 0.000 NA   NA
 113468 113469 SAV1446 SAV1447     TRUE 0.943 14.000 0.579 NA   NA
 113469 113470 SAV1447 SAV1448     TRUE 0.971 -7.000 0.165 NA   NA
 113471 113472 SAV1449 SAV1450 recU pbp2 TRUE 0.981 -3.000 0.319 1.000   NA
 113473 113474 SAV1451 SAV1452   nth TRUE 0.803 5.000 0.009 NA   NA
 113474 113475 SAV1452 SAV1453 nth   TRUE 0.990 -10.000 0.075 NA Y NA
 113475 113476 SAV1453 SAV1454   asnS FALSE 0.099 328.000 0.234 NA N NA
 113476 113477 SAV1454 SAV1455 asnS dinG FALSE 0.105 322.000 0.030 0.099 N NA
 113477 113478 SAV1455 SAV1456 dinG   TRUE 0.815 24.000 0.074 1.000 N NA
 113478 113479 SAV1456 SAV1457     TRUE 0.952 -13.000 0.023 1.000 N NA
 113479 113480 SAV1457 SAV1458     TRUE 0.915 5.000 0.126 1.000 N NA
 113480 113481 SAV1458 SAV1459     FALSE 0.073 244.000 0.038 NA   NA
 113481 113482 SAV1459 SAV1460     FALSE 0.034 336.000 0.013 NA   NA
 113482 113483 SAV1460 SAV1461     TRUE 0.572 54.000 0.083 NA   NA
 113483 113484 SAV1461 SAV1462     TRUE 0.967 -10.000 0.127 NA   NA
 113484 113485 SAV1462 SAV1463     TRUE 0.921 14.000 0.353 NA   NA
 113485 113486 SAV1463 SAV1464   aroA TRUE 0.816 7.000 0.007 1.000 N NA
 113486 113487 SAV1464 SAV1465 aroA aroB TRUE 0.961 10.000 0.051 1.000 Y NA
 113487 113488 SAV1465 SAV1466 aroB aroC TRUE 0.977 26.000 0.110 0.002 Y NA
 113488 113489 SAV1466 SAV1467 aroC   FALSE 0.017 386.000 0.000 NA   NA
 113489 113490 SAV1467 SAV1468     TRUE 0.537 29.000 0.000 NA   NA
 113490 113491 SAV1468 SAV1469   ndk FALSE 0.334 55.000 0.000 NA   NA
 113491 113492 SAV1469 SAV1470 ndk gerCC FALSE 0.413 92.000 0.054 1.000 N NA
 113492 113493 SAV1470 SAV1471 gerCC gerCB TRUE 0.977 2.000 0.020 1.000 Y NA
 113493 113494 SAV1471 SAV1472 gerCB   TRUE 0.846 3.000 0.008 NA   NA
 113494 113495 SAV1472 SAV1473   hu FALSE 0.015 431.000 0.000 NA   NA
 113495 113496 SAV1473 SAV1474 hu gpsA FALSE 0.181 171.000 0.025 1.000 N NA
 113496 113497 SAV1474 SAV1475 gpsA   TRUE 0.856 17.000 0.068 1.000   NA
 113497 113498 SAV1475 SAV1476     FALSE 0.105 222.000 0.032 1.000   NA
 113498 113499 SAV1476 SAV1477     FALSE 0.012 529.000 0.000 NA   NA
 113499 113500 SAV1477 SAV1478   cmk FALSE 0.187 106.000 0.000 NA   NA
 113502 113503 SAV1480 SAV1481   ebpS FALSE 0.035 402.000 0.022 1.000   NA
 113503 113504 SAV1481 SAV1482 ebpS   FALSE 0.285 153.000 0.079 1.000   NA
 113504 113505 SAV1482 SAV1483     TRUE 0.987 -10.000 0.508 NA   NA
 113507 113508 SAV1485 SAV1486     FALSE 0.016 402.000 0.000 NA   NA
 113508 113509 SAV1486 SAV1487     FALSE 0.013 471.000 0.000 NA   NA
 113509 113510 SAV1487 SAV1488     FALSE 0.318 58.000 0.000 NA   NA
 113510 113511 SAV1488 SAV1489     FALSE 0.210 90.000 0.000 NA   NA
 113511 113512 SAV1489 SAV1490     TRUE 0.896 -7.000 0.000 NA   NA
 113512 113513 SAV1490 SAV1491   srrB FALSE 0.026 304.000 0.000 NA   NA
 113513 113514 SAV1491 SAV1492 srrB srrA TRUE 0.991 -34.000 0.111 1.000 Y NA
 113514 113515 SAV1492 SAV1493 srrA rluB FALSE 0.296 133.000 0.046 1.000 N NA
 113515 113516 SAV1493 SAV1494 rluB   TRUE 0.975 -7.000 0.224 NA N NA
 113516 113517 SAV1494 SAV1495     TRUE 0.987 -7.000 0.570 NA   NA
 113519 113520 SAV1497 SAV1498 xerD   TRUE 0.568 49.000 0.029 1.000 N NA
 113520 113521 SAV1498 SAV1499     FALSE 0.333 105.000 0.021 1.000 N NA
 113523 113524 SAV1501 SAV1502     TRUE 0.662 16.000 0.000 NA   NA
 113527 113528 SAV1505 SAV1506     FALSE 0.060 230.000 0.000 1.000 N NA
 113529 113530 SAV1507 SAV1508 malA malR TRUE 0.948 16.000 0.500 1.000 N NA
 113530 113531 SAV1508 SAV1509 malR   FALSE 0.091 194.000 0.000 1.000   NA
 113531 113532 SAV1509 SAV1510     FALSE 0.019 467.000 0.000 1.000   NA
 113532 113533 SAV1510 SAV1511   gnd FALSE 0.159 316.000 0.000 1.000 Y NA
 113533 113534 SAV1511 SAV1512 gnd   TRUE 0.464 68.000 0.035 1.000 N NA
 113534 113535 SAV1512 SAV1513     FALSE 0.011 569.000 0.000 NA   NA
 113535 113536 SAV1513 SAV1514     TRUE 0.837 14.000 0.097 NA   NA
 113536 113537 SAV1514 SAV1515   bmfBB FALSE 0.045 351.000 0.058 NA   NA
 113537 113538 SAV1515 SAV1516 bmfBB bfmBAB TRUE 0.992 13.000 0.882 0.056 Y NA
 113538 113539 SAV1516 SAV1517 bfmBAB bfmBAA TRUE 0.998 0.000 0.897 0.002 Y NA
 113539 113540 SAV1517 SAV1518 bfmBAA   TRUE 0.980 16.000 0.414 1.000 Y NA
 113540 113541 SAV1518 SAV1519   recN FALSE 0.186 151.000 0.002 1.000 N NA
 113541 113542 SAV1519 SAV1520 recN ahrC TRUE 0.844 16.000 0.056 1.000 N NA
 113542 113543 SAV1520 SAV1521 ahrC ispA FALSE 0.020 432.000 0.000 1.000 N NA
 113543 113544 SAV1521 SAV1522 ispA   TRUE 0.968 -22.000 0.100 1.000 N NA
 113544 113545 SAV1522 SAV1523     TRUE 0.998 -7.000 0.412 0.001 Y NA
 113545 113546 SAV1523 SAV1524   nusB TRUE 0.794 17.000 0.011 1.000 N NA
 113546 113547 SAV1524 SAV1525 nusB   TRUE 0.698 60.000 0.265 NA   NA
 113547 113548 SAV1525 SAV1526   accC TRUE 0.926 15.000 0.373 NA   NA
 113548 113549 SAV1526 SAV1527 accC accB TRUE 0.994 0.000 0.086 0.003 Y NA
 113549 113550 SAV1527 SAV1528 accB   FALSE 0.048 474.000 0.120 1.000 N NA
 113550 2137024 SAV1528 SAV1529     TRUE 0.855 26.000 0.160 1.000 N NA
 113553 113554 SAV1531 SAV1532     TRUE 0.960 14.000 1.000 NA   NA
 113557 113558 SAV1535 SAV1536     TRUE 0.998 -7.000 0.316 0.001 Y NA
 113558 113559 SAV1536 SAV1537     TRUE 0.982 20.000 0.092 0.001 Y NA
 113559 113560 SAV1537 SAV1538     TRUE 0.520 159.000 0.019 1.000 Y NA
 113560 113561 SAV1538 SAV1539     FALSE 0.074 233.000 0.029 NA N NA
 113561 113562 SAV1539 SAV1540     TRUE 0.949 -82.000 0.054 NA   NA
 113562 113563 SAV1540 SAV1541     TRUE 0.900 -13.000 0.000 NA   NA
 113563 113564 SAV1541 SAV1542     TRUE 0.983 -10.000 0.000 NA Y NA
 113564 113565 SAV1542 SAV1543     TRUE 0.987 14.000 0.861 1.000 Y NA
 113565 113566 SAV1543 SAV1544     TRUE 0.996 -28.000 0.639 1.000 Y NA
 113566 113567 SAV1544 SAV1545     TRUE 0.525 52.000 0.015 1.000   NA
 113567 113568 SAV1545 SAV1546     TRUE 0.921 -3.000 0.015 NA   NA
 113568 113569 SAV1546 SAV1547   glcK TRUE 0.910 0.000 0.024 NA   NA
 113569 113570 SAV1547 SAV1548 glcK   TRUE 0.983 -3.000 0.496 NA   NA
 113570 113571 SAV1548 SAV1549     TRUE 0.952 -19.000 0.058 NA   NA
 113571 113572 SAV1549 SAV1550     TRUE 0.790 12.000 0.006 1.000   NA
 113572 113573 SAV1550 SAV1551   rpmG FALSE 0.130 209.000 0.045 1.000 N NA
 113573 113574 SAV1551 SAV1552 rpmG pbp3 FALSE 0.309 113.000 0.019 1.000 N NA
 113574 113575 SAV1552 SAV1553 pbp3 sodA FALSE 0.380 121.000 0.085 1.000 N NA
 113575 113576 SAV1553 SAV1554 sodA   FALSE 0.199 276.000 0.000 1.000 Y NA
 113576 113577 SAV1554 SAV1555     TRUE 0.996 -13.000 0.480 1.000 Y NA
 113577 113578 SAV1555 SAV1556     TRUE 0.943 42.000 0.148 0.098 Y NA
 113578 113579 SAV1556 SAV1557     FALSE 0.217 144.000 0.012 1.000 N NA
 113579 113580 SAV1557 SAV1558     TRUE 0.967 10.000 0.104 1.000 Y NA
 113580 113581 SAV1558 SAV1559     FALSE 0.283 114.000 0.032 NA   NA
 113581 113582 SAV1559 SAV1560     TRUE 0.953 3.000 0.283 NA   NA
 113582 113583 SAV1560 SAV1561   sigA FALSE 0.450 131.000 0.239 NA   NA
 113583 113584 SAV1561 SAV1562 sigA dnaG FALSE 0.202 224.000 0.209 1.000 N NA
 113584 113585 SAV1562 SAV1563 dnaG   FALSE 0.397 61.000 0.011 NA   NA
 113585 113586 SAV1563 SAV1564     TRUE 0.952 11.000 0.621 NA   NA
 113588 113589 SAV1566 SAV1567   bex TRUE 0.850 22.000 0.108 1.000   NA
 113589 113590 SAV1567 SAV1568 bex cdd TRUE 0.945 1.000 0.098 1.000   NA
 113590 113591 SAV1568 SAV1569 cdd   TRUE 0.885 11.000 0.108 1.000 N NA
 113591 113592 SAV1569 SAV1570     TRUE 0.844 3.000 0.007 NA   NA
 113592 113593 SAV1570 SAV1571   phoH TRUE 0.974 1.000 0.457 NA   NA
 113593 113594 SAV1571 SAV1572 phoH   FALSE 0.026 304.000 0.000 NA   NA
 113594 113595 SAV1572 SAV1573     TRUE 0.815 17.000 0.055 NA   NA
 113595 113596 SAV1573 SAV1574     TRUE 0.907 18.000 0.258 NA   NA
 113596 113597 SAV1574 SAV1575   rpsU FALSE 0.070 220.000 0.011 NA   NA
 113597 113598 SAV1575 SAV1576 rpsU   FALSE 0.055 293.000 0.016 1.000   NA
 113598 113599 SAV1576 SAV1577     TRUE 0.902 7.000 0.163 NA   NA
 113599 113600 SAV1577 SAV1578     TRUE 0.955 2.000 0.227 NA   NA
 113600 113601 SAV1578 SAV1579   dnaJ TRUE 0.927 4.000 0.133 1.000 N NA
 113601 113602 SAV1579 SAV1580 dnaJ dnaK TRUE 0.862 136.000 0.196 0.002 Y NA
 113602 113603 SAV1580 SAV1581 dnaK grpE TRUE 0.931 69.000 0.224 0.005 Y NA
 113603 113604 SAV1581 SAV1582 grpE hrcA TRUE 0.857 32.000 0.286 1.000 N NA
 113604 113605 SAV1582 SAV1583 hrcA hemN FALSE 0.431 100.000 0.082 1.000 N NA
 113609 113610 SAV1587 SAV1588     TRUE 0.687 57.000 0.163 1.000   NA
 113610 113611 SAV1588 SAV1589   comEB TRUE 0.887 5.000 0.055 1.000   NA
 113611 113612 SAV1589 SAV1590 comEB   TRUE 0.463 92.000 0.095 1.000 N NA
 113612 113613 SAV1590 SAV1591     TRUE 0.580 49.000 0.033 1.000   NA
 113613 113614 SAV1591 SAV1592     TRUE 0.910 3.000 0.085 NA   NA
 113614 113615 SAV1592 SAV1593     TRUE 0.946 1.000 0.149 NA   NA
 113615 113616 SAV1593 SAV1594     TRUE 0.994 -10.000 0.199 1.000 Y NA
 113616 113617 SAV1594 SAV1595     TRUE 0.931 3.000 0.150 NA N NA
 113617 113618 SAV1595 SAV1596   aroE TRUE 0.895 4.000 0.089 NA N NA
 113618 113619 SAV1596 SAV1597 aroE   TRUE 0.931 14.000 0.336 1.000   NA
 113619 113620 SAV1597 SAV1598     TRUE 0.980 1.000 0.555 1.000   NA
 113620 113621 SAV1598 SAV1599   pfs TRUE 0.787 20.000 0.019 1.000   NA
 113623 113624 SAV1601 SAV1602     FALSE 0.377 149.000 0.000 0.016   NA
 113624 113625 SAV1602 SAV1603     FALSE 0.015 707.000 0.000 1.000   NA
 113625 113626 SAV1603 SAV1604     FALSE 0.039 289.000 0.000 1.000   NA
 113626 113627 SAV1604 SAV1605     TRUE 0.859 13.000 0.084 1.000   NA
 113627 113628 SAV1605 SAV1606     TRUE 0.944 0.000 0.062 1.000   NA
 113628 113629 SAV1606 SAV1607     TRUE 0.978 14.000 0.031 0.002 Y NA
 113629 113630 SAV1607 SAV1608     TRUE 0.974 2.000 0.429 1.000 N NA
 113630 113631 SAV1608 SAV1609     TRUE 0.997 -10.000 0.184 0.002 Y NA
 113631 113632 SAV1609 SAV1610   greA FALSE 0.032 326.000 0.000 1.000 N NA
 113632 113633 SAV1610 SAV1611 greA udk TRUE 0.804 28.000 0.095 1.000 N NA
 113633 113634 SAV1611 SAV1612 udk   TRUE 0.952 0.000 0.100 1.000 N NA
 113634 113635 SAV1612 SAV1613     TRUE 0.987 12.000 0.156 0.001 Y NA
 113635 113636 SAV1613 SAV1614     TRUE 0.941 3.000 0.142 1.000   NA
 113636 113637 SAV1614 SAV1615     FALSE 0.028 285.000 0.000 NA   NA
 113637 113638 SAV1615 SAV1616     TRUE 0.948 15.000 0.651 NA   NA
 113638 113639 SAV1616 SAV1617     TRUE 0.786 61.000 0.537 NA   NA
 113639 113640 SAV1617 SAV1618   alaS TRUE 0.553 63.000 0.110 NA   NA
 113640 113641 SAV1618 SAV1619 alaS   FALSE 0.029 343.000 0.000 1.000 N NA
 113641 113642 SAV1619 SAV1620     TRUE 0.966 2.000 0.281 1.000   NA
 113642 113643 SAV1620 SAV1621     FALSE 0.026 695.000 0.038 1.000   NA
 113643 113644 SAV1621 SAV1622     TRUE 0.938 1.000 0.072 1.000 N NA
 113646 113647 SAV1624 SAV1625   csbD FALSE 0.417 40.000 0.000 NA   NA
 113647 113648 SAV1625 SAV1626 csbD   FALSE 0.193 100.000 0.000 NA   NA
 113650 113651 SAV1628 SAV1629     FALSE 0.052 214.000 0.000 NA   NA
 113651 113652 SAV1629 SAV1630   aspS FALSE 0.121 146.000 0.000 NA   NA
 113652 113653 SAV1630 SAV1631 aspS hisS TRUE 0.982 16.000 0.161 0.046 Y NA
 113653 113654 SAV1631 SAV1632 hisS lytH FALSE 0.019 462.000 0.000 1.000 N NA
 113654 113655 SAV1632 SAV1633 lytH   TRUE 0.935 -3.000 0.010 1.000 N NA
 113655 113656 SAV1633 SAV1634   relA TRUE 0.905 12.000 0.177 1.000 N NA
 113656 113657 SAV1634 SAV1635 relA apt FALSE 0.043 428.000 0.068 1.000 N NA
 113657 113658 SAV1635 SAV1636 apt   TRUE 0.859 22.000 0.128 1.000 N NA
 113658 113659 SAV1636 SAV1637   secF FALSE 0.105 203.000 0.007 1.000 N NA
 113659 113660 SAV1637 SAV1638 secF   FALSE 0.199 275.000 0.005 NA Y NA
 113660 113661 SAV1638 SAV1639   tgt TRUE 0.914 19.000 0.325 NA N NA
 113661 113662 SAV1639 SAV1640 tgt queA TRUE 0.988 23.000 0.360 0.001 Y NA
 113662 113663 SAV1640 SAV1641 queA ruvB TRUE 0.930 2.000 0.069 1.000 N NA
 113663 113664 SAV1641 SAV1642 ruvB ruvA TRUE 0.985 32.000 0.549 0.002 Y NA
 113664 113665 SAV1642 SAV1643 ruvA   TRUE 0.781 14.000 0.009 1.000   NA
 113665 113666 SAV1643 SAV1644   obg TRUE 0.834 10.000 0.024 1.000   NA
 113666 2137026 SAV1644 SAV1645 obg rpmA FALSE 0.129 354.000 0.335 1.000   NA
 2137026 2137027 SAV1645 SAV1646 rpmA   TRUE 0.969 12.000 0.203 NA Y NA
 2137027 113669 SAV1646 SAV1647   rplU TRUE 0.976 6.000 0.208 NA Y NA
 113669 113670 SAV1647 SAV1648 rplU   FALSE 0.076 236.000 0.008 1.000 N NA
 113670 113671 SAV1648 SAV1649     TRUE 0.997 0.000 0.550 0.002 Y NA
 113671 113672 SAV1649 SAV1650     FALSE 0.017 392.000 0.000 NA   NA
 113674 113675 SAV1652 SAV1653     FALSE 0.015 429.000 0.000 NA   NA
 113675 113676 SAV1653 SAV1654     FALSE 0.020 359.000 0.000 NA   NA
 113678 113679 SAV1656 SAV1657 ant(9) tnpC FALSE 0.114 151.000 0.000 NA   NA
 113679 113680 SAV1657 SAV1658 tnpC tnpB TRUE 0.707 7.000 0.000 NA   NA
 113680 113681 SAV1658 SAV1659 tnpB tnpA TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.009 Y NA
 113681 113682 SAV1659 SAV1660 tnpA truncated-radC TRUE 0.601 119.000 0.000 1.000 Y NA
 113682 113683 SAV1660 SAV1661 truncated-radC   TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000 N NA
 113683 113684 SAV1661 SAV1662   folC FALSE 0.045 270.000 0.000 1.000 N NA
 113684 113685 SAV1662 SAV1663 folC valS TRUE 0.884 13.000 0.006 0.097 N NA
 113687 113688 SAV1665 SAV1666     TRUE 0.466 34.000 0.000 NA   NA
 113688 113689 SAV1666 SAV1667   hemL FALSE 0.248 73.000 0.000 NA   NA
 113689 113690 SAV1667 SAV1668 hemL hemB TRUE 0.951 48.000 0.126 0.002 Y NA
 113690 113691 SAV1668 SAV1669 hemB hemD TRUE 0.990 3.000 0.042 0.002 Y NA
 113691 113692 SAV1669 SAV1670 hemD hemC TRUE 0.974 22.000 0.020 0.002 Y NA
 113692 113693 SAV1670 SAV1671 hemC hemX TRUE 0.627 42.000 0.040 1.000 N NA
 113693 113694 SAV1671 SAV1672 hemX hemA TRUE 0.943 22.000 0.613 1.000 N NA
 113694 113695 SAV1672 SAV1673 hemA   FALSE 0.101 217.000 0.020 1.000   NA
 113695 113696 SAV1673 SAV1674   clpX FALSE 0.240 154.000 0.043 1.000   NA
 113696 113697 SAV1674 SAV1675 clpX tig TRUE 0.762 151.000 0.033 0.002 Y NA
 113697 113698 SAV1675 SAV1676 tig   FALSE 0.144 163.000 0.012 NA   NA
 113698 113699 SAV1676 SAV1677     TRUE 0.885 19.000 0.195 NA   NA
 113699 113700 SAV1677 SAV1678   rplT FALSE 0.209 142.000 0.004 1.000   NA
 113700 113701 SAV1678 SAV1679 rplT rpmI TRUE 0.979 47.000 0.928 0.018 Y NA
 113701 113702 SAV1679 SAV1680 rpmI infC TRUE 0.975 29.000 0.652 1.000 Y NA
 113702 2137028 SAV1680 SAV1681 infC   FALSE 0.070 238.000 0.004 1.000 N NA
 2137028 113705 SAV1681 SAV1683   thrS FALSE 0.021 426.000 0.000 1.000 N NA
 113705 113706 SAV1683 SAV1684 thrS dnaI FALSE 0.051 413.000 0.000 0.097 N NA
 113706 113707 SAV1684 SAV1685 dnaI dnaB TRUE 0.995 0.000 0.817 NA Y NA
 113707 113708 SAV1685 SAV1686 dnaB   TRUE 0.935 1.000 0.109 NA N NA
 113708 113709 SAV1686 SAV1687   gapB FALSE 0.071 211.000 0.004 NA N NA
 113709 113710 SAV1687 SAV1688 gapB   FALSE 0.177 170.000 0.020 1.000 N NA
 113710 113711 SAV1688 SAV1689     TRUE 0.852 16.000 0.066 1.000 N NA
 113711 113712 SAV1689 SAV1690   polA TRUE 0.963 16.000 0.101 1.000 Y NA
 113712 113713 SAV1690 SAV1691 polA   FALSE 0.027 294.000 0.000 NA   NA
 113713 113714 SAV1691 SAV1692   phoR FALSE 0.012 499.000 0.000 NA   NA
 113714 113715 SAV1692 SAV1693 phoR phoP TRUE 0.995 -3.000 0.159 0.048 Y NA
 113715 113716 SAV1693 SAV1694 phoP citC FALSE 0.023 390.000 0.000 1.000 N NA
 113716 113717 SAV1694 SAV1695 citC citZ TRUE 0.895 49.000 0.140 1.000 Y NA
 113719 113720 SAV1697 SAV1698 pykA pfkA TRUE 0.985 22.000 0.261 0.005 Y NA
 113722 113723 SAV1700 SAV1701 accA   TRUE 0.996 0.000 0.234 0.001 Y NA
 113723 113724 SAV1701 SAV1702     FALSE 0.118 195.000 0.010 1.000 N NA
 113724 113725 SAV1702 SAV1703   dnaE FALSE 0.051 450.000 0.127 1.000 N NA
 113725 113726 SAV1703 SAV1704 dnaE   TRUE 0.882 21.000 0.159 1.000   NA
 113726 113727 SAV1704 SAV1705     FALSE 0.086 312.000 0.113 1.000   NA
 113733 113734 SAV1711 SAV1712 ackA   TRUE 0.592 88.000 0.217 1.000 N NA
 113734 113735 SAV1712 SAV1713     FALSE 0.377 123.000 0.089 1.000 N NA
 113735 113736 SAV1713 SAV1714     FALSE 0.323 98.000 0.009 1.000   NA
 113736 113737 SAV1714 SAV1715     TRUE 0.572 44.000 0.016 1.000   NA
 113737 113738 SAV1715 SAV1716     TRUE 0.977 0.000 0.349 1.000 N NA
 113738 113739 SAV1716 SAV1717     FALSE 0.088 373.000 0.201 1.000 N NA
 113740 113741 SAV1718 SAV1719   rpsD FALSE 0.052 244.000 0.005 NA N NA
 113741 113742 SAV1719 SAV1720 rpsD tnp FALSE 0.092 192.000 0.000 1.000 N NA
 113744 113745 SAV1722 SAV1723     FALSE 0.323 115.000 0.027 1.000 N NA
 113745 113746 SAV1723 SAV1724   serA TRUE 0.992 -13.000 0.113 1.000 Y NA
 113747 113748 SAV1725 SAV1726   ptaA FALSE 0.347 107.000 0.062 NA   NA
 113748 113749 SAV1726 SAV1727 ptaA   FALSE 0.284 128.000 0.025 1.000 N NA
 113753 113754 SAV1731 SAV1732   fhs FALSE 0.031 333.000 0.000 1.000   NA
 113754 113755 SAV1732 SAV1733 fhs acsA FALSE 0.020 440.000 0.000 1.000 N NA
 113756 113757 SAV1734 SAV1735 acuA acuC TRUE 0.811 25.000 0.075 1.000   NA
 113758 113759 SAV1736 SAV1737 ccpA   FALSE 0.023 585.000 0.017 1.000 N NA
 113759 113760 SAV1737 SAV1738     FALSE 0.010 694.000 0.000 NA   NA
 113760 113761 SAV1738 SAV1739     TRUE 0.596 74.000 0.222 NA   NA
 113761 113762 SAV1739 SAV1740   murC FALSE 0.334 74.000 0.014 NA   NA
 113762 113763 SAV1740 SAV1741 murC   TRUE 0.899 24.000 0.017 0.005 N NA
 113763 113764 SAV1741 SAV1742     TRUE 0.875 21.000 0.143 1.000   NA
 113764 113765 SAV1742 SAV1743     TRUE 0.906 29.000 0.511 NA   NA
 113765 113766 SAV1743 SAV1744     TRUE 0.660 100.000 0.500 NA   NA
 113766 113767 SAV1744 SAV1745     TRUE 0.555 65.000 0.081 1.000 N NA
 113769 113770 SAV1747 SAV1748     FALSE 0.048 471.000 0.117 1.000   NA
 113770 113771 SAV1748 SAV1749     TRUE 0.893 15.000 0.154 1.000   NA
 113771 113772 SAV1749 SAV1750     FALSE 0.016 550.000 0.000 1.000 N NA
 113772 113773 SAV1750 SAV1751     TRUE 0.980 4.000 0.143 1.000 Y NA
 113773 113774 SAV1751 SAV1752     FALSE 0.011 558.000 0.000 NA   NA
 113774 113775 SAV1752 SAV1753     TRUE 0.904 17.000 0.233 NA   NA
 113775 113776 SAV1753 SAV1754     TRUE 0.977 -3.000 0.233 1.000   NA
 2137029 113778 SAV1755 SAV1756     TRUE 0.944 -25.000 0.037 NA   NA
 2137030 113780 SAV1757 SAV1758 mrp mrp TRUE 0.892 0.000 0.000 1.000   NA
 113780 113781 SAV1758 SAV1759 mrp   FALSE 0.022 326.000 0.000 NA N NA
 113781 113782 SAV1759 SAV1760   leuS TRUE 0.683 22.000 0.007 NA N NA
 113782 113783 SAV1760 SAV1761 leuS   FALSE 0.038 291.000 0.000 1.000 N NA
 113784 113785 SAV1762 SAV1763     TRUE 0.984 -3.000 0.408 1.000   NA
 113786 113787 SAV1764 SAV1765 rot   FALSE 0.017 510.000 0.000 1.000   NA
 2137031 113791 SAV1767 SAV1769   ribA TRUE 0.978 13.000 0.022 0.002 Y NA
 113791 113792 SAV1769 SAV1770 ribA ribB TRUE 0.955 11.000 0.026 1.000 Y NA
 113792 113793 SAV1770 SAV1771 ribB ribD TRUE 0.985 7.000 0.456 1.000 Y NA
 113793 113794 SAV1771 SAV1772 ribD   FALSE 0.013 481.000 0.000 NA   NA
 113795 113796 SAV1773 SAV1774     TRUE 0.890 0.000 0.000 1.000 N NA
 113797 113798 SAV1775 SAV1776     FALSE 0.032 276.000 0.000 NA   NA
 113799 113800 SAV1777 SAV1778     FALSE 0.433 113.000 0.150 NA   NA
 113804 113805 SAV1782 SAV1783     FALSE 0.147 178.000 0.034 NA   NA
 113805 113806 SAV1783 SAV1784     TRUE 0.993 -3.000 0.069 0.076 Y NA
 113806 113807 SAV1784 SAV1785     FALSE 0.013 462.000 0.000 NA N NA
 113807 113808 SAV1785 SAV1786     FALSE 0.084 176.000 0.000 NA   NA
 113808 113809 SAV1786 SAV1787     TRUE 0.895 -81.000 0.000 NA   NA
 113810 113811 SAV1788 SAV1789     FALSE 0.206 212.000 0.222 NA   NA
 113811 113812 SAV1789 SAV1790   metK FALSE 0.304 119.000 0.054 NA   NA
 113813 113814 SAV1791 SAV1792 pckA   FALSE 0.154 124.000 0.000 NA   NA
 113815 113816 SAV1793 SAV1794     TRUE 0.977 -19.000 0.182 1.000   NA
 113818 113819 SAV1796 SAV1797 menC menE TRUE 0.866 5.000 0.029 1.000 N NA
 113819 113820 SAV1797 SAV1798 menE   FALSE 0.102 159.000 0.000 NA   NA
 113821 113822 SAV1799 SAV1800     FALSE 0.225 81.000 0.000 NA   NA
 113822 113823 SAV1800 SAV1801     FALSE 0.239 75.000 0.000 NA   NA
 113823 113824 SAV1801 SAV1802     FALSE 0.412 41.000 0.000 NA   NA
 113824 113825 SAV1802 SAV1803     FALSE 0.191 101.000 0.000 NA   NA
 113826 113827 SAV1804 SAV1805     TRUE 0.611 22.000 0.000 NA   NA
 113827 113828 SAV1805 SAV1806   tnp FALSE 0.010 755.000 0.000 NA   NA
 113828 113829 SAV1806 SAV1807 tnp   FALSE 0.049 452.000 0.000 0.057   NA
 113829 113830 SAV1807 SAV1808     TRUE 0.993 -7.000 0.011 0.057 Y NA
 113830 113831 SAV1808 SAV1809   splF FALSE 0.027 361.000 0.000 1.000 N NA
 113831 113832 SAV1809 SAV1810 splF splD TRUE 0.810 158.000 0.200 0.004 Y NA
 113832 113833 SAV1810 SAV1811 splD splC TRUE 0.876 121.000 0.200 0.004 Y NA
 113833 113834 SAV1811 SAV1812 splC splB TRUE 0.945 58.000 0.200 0.004 Y NA
 113834 113835 SAV1812 SAV1813 splB splA TRUE 0.869 125.000 0.200 0.004 Y NA
 113835 113836 SAV1813 SAV1814 splA   FALSE 0.014 436.000 0.000 NA   NA
 113839 113840 SAV1817 SAV1818     TRUE 0.890 5.000 0.103 NA   NA
 2137032 113842 SAV1819 SAV1820 lukD lukE TRUE 0.958 2.000 0.000 0.004   NA
 113843 113844 SAV1821 SAV1822     FALSE 0.010 834.000 0.000 NA   NA
 113844 113845 SAV1822 SAV1823     FALSE 0.022 335.000 0.000 NA   NA
 113846 113847 SAV1824 SAV1825 seg sen FALSE 0.119 283.000 0.000 0.016   NA
 113847 113848 SAV1825 SAV1826 sen yent2 TRUE 0.896 18.000 0.000 0.016   NA
 113848 113849 SAV1826 SAV1827 yent2 yent1 TRUE 0.975 -40.000 0.000 0.016   NA
 113849 113850 SAV1827 SAV1828 yent1 sei FALSE 0.357 154.000 0.000 0.016   NA
 113850 113851 SAV1828 SAV1829 sei sem TRUE 0.792 35.000 0.000 0.016   NA
 113851 113852 SAV1829 SAV1830 sem seo FALSE 0.121 281.000 0.000 0.016   NA
 113852 2137033 SAV1830 SAVtRNA17 seo   FALSE 0.052 214.000 0.000 NA   NA
 2137033 2137034 SAVtRNA17 SAVtRNA18     FALSE 0.334 55.000 0.000 NA   NA
 2137034 2137035 SAVtRNA18 SAVtRNA19     TRUE 0.736 5.000 0.000 NA   NA
 2137035 2137036 SAVtRNA19 SAVtRNA20     TRUE 0.624 21.000 0.000 NA   NA
 2137036 2137037 SAVtRNA20 SAVtRNA21     TRUE 0.645 19.000 0.000 NA   NA
 2137037 2137038 SAVtRNA21 SAVtRNA22     TRUE 0.647 14.000 0.000 NA   NA
 2137038 2137039 SAVtRNA22 SAVtRNA23     TRUE 0.633 20.000 0.000 NA   NA
 2137039 2137040 SAVtRNA23 SAVtRNA24     TRUE 0.611 22.000 0.000 NA   NA
 2137040 113853 SAVtRNA24 SAV1831     FALSE 0.016 401.000 0.000 NA   NA
 113853 113854 SAV1831 SAV1832   hemY FALSE 0.052 323.000 0.057 NA   NA
 113854 113855 SAV1832 SAV1833 hemY hemH TRUE 0.969 24.000 0.069 0.026 Y NA
 113855 113856 SAV1833 SAV1834 hemH hemE TRUE 0.870 58.000 0.131 1.000 Y NA
 113858 113859 SAV1836 SAV1837     TRUE 0.957 -7.000 0.083 NA N NA
 113860 113861 SAV1838 SAV1839 hit   FALSE 0.327 142.000 0.137 NA   NA
 113861 113862 SAV1839 SAV1840     FALSE 0.041 735.000 0.190 NA   NA
 113862 113863 SAV1840 SAV1841   prsA FALSE 0.058 205.000 0.000 NA   NA
 113864 113865 SAV1842 SAV1843 cbf1   TRUE 0.976 -3.000 0.291 NA   NA
 113865 113866 SAV1843 SAV1844     TRUE 0.982 -10.000 0.330 NA   NA
 113866 113867 SAV1844 SAV1845     FALSE 0.026 928.000 0.093 NA   NA
 113867 113868 SAV1845 SAV1846     TRUE 0.675 69.000 0.321 NA   NA
 113868 113869 SAV1846 SAV1847     FALSE 0.140 179.000 0.029 NA   NA
 113869 113870 SAV1847 SAV1848     FALSE 0.236 356.000 0.000 0.018 Y NA
 113870 113871 SAV1848 SAV1849     TRUE 0.989 22.000 0.536 0.011 Y NA
 113873 113874 SAV1851 SAV1852 citG   FALSE 0.090 196.000 0.009 NA   NA
 113874 113875 SAV1852 SAV1853     FALSE 0.093 548.000 0.571 NA   NA
 113875 113876 SAV1853 SAV1854     TRUE 0.700 25.000 0.021 NA   NA
 113876 113877 SAV1854 SAV1855     FALSE 0.198 159.000 0.021 1.000 N NA
 113877 113878 SAV1855 SAV1856     TRUE 0.897 5.000 0.077 1.000 N NA
 113878 113879 SAV1856 SAV1857     FALSE 0.247 151.000 0.044 1.000 N NA
 113879 113880 SAV1857 SAV1858     TRUE 0.993 -13.000 0.154 1.000 Y NA
 113880 113881 SAV1858 SAV1859     FALSE 0.051 390.000 0.077 1.000   NA
 2137041 2137042 SAVtRNA25 SAVtRNA26     FALSE 0.405 42.000 0.000 NA   NA
 2137042 2137043 SAVtRNA26 SAVtRNA27     FALSE 0.185 107.000 0.000 NA   NA
 2137043 2137044 SAVtRNA27 SAVtRNA28     TRUE 0.682 11.000 0.000 NA   NA
 2137044 2137045 SAVtRNA28 SAVtRNA29     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 2137045 2137046 SAVtRNA29 SAVtRNA30     TRUE 0.669 12.000 0.000 NA   NA
 2137046 2137047 SAVtRNA30 SAVtRNA31     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 2137047 2137048 SAVtRNA31 SAVtRNA32     TRUE 0.662 16.000 0.000 NA   NA
 2137048 2137049 SAVtRNA32 SAVtRNA33     TRUE 0.696 9.000 0.000 NA   NA
 2137049 2137050 SAVtRNA33 SAVtRNA34     TRUE 0.700 8.000 0.000 NA   NA
 2137050 2137051 SAVtRNA34 SAVtRNA35     TRUE 0.611 22.000 0.000 NA   NA
 2137051 2137052 SAVtRNA35 SAVtRNA36     TRUE 0.611 22.000 0.000 NA   NA
 2137052 2137053 SAVtRNA36 SAVtRNA37     TRUE 0.657 18.000 0.000 NA   NA
 2137053 2137054 SAVtRNA37 SAVtRNA38     FALSE 0.405 42.000 0.000 NA   NA
 2137054 2137055 SAVtRNA38 SAVtRNA39     TRUE 0.682 11.000 0.000 NA   NA
 2137055 2137056 SAVtRNA39 SAVtRNA40     TRUE 0.691 10.000 0.000 NA   NA
 2137056 2137057 SAVtRNA40 SAVtRNA41     TRUE 0.537 29.000 0.000 NA   NA
 2137057 2137058 SAVtRNA41 SAVtRNA42     TRUE 0.578 25.000 0.000 NA   NA
 2137058 2137059 SAVtRNA42 SAVtRNA43     TRUE 0.657 18.000 0.000 NA   NA
 2137059 2137060 SAVtRNA43 SAVtRNA44     TRUE 0.691 10.000 0.000 NA   NA
 2137060 2137061 SAVtRNA44 SAVtRNA45     TRUE 0.611 22.000 0.000 NA   NA
 2137061 2137062 SAVtRNA45 SAVtRNA46     TRUE 0.647 14.000 0.000 NA   NA
 2137062 2137063 SAVtRNA46 SAVtRNA47     TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 2137063 2137064 SAVtRNA47 SAVtRNA48     TRUE 0.707 7.000 0.000 NA   NA
 2137064 2137065 SAVtRNA48 SAVtRNA49     TRUE 0.696 9.000 0.000 NA   NA
 2137065 2137066 SAVtRNA49 SAVtRNA50     TRUE 0.633 20.000 0.000 NA   NA
 2137066 2137067 SAVtRNA50 SAVrRNA08     TRUE 0.669 12.000 0.000 NA   NA
 2137067 2137068 SAVrRNA08 SAVrRNA09     FALSE 0.248 73.000 0.000 NA   NA
 2137068 2137069 SAVrRNA09 SAVtRNA51     FALSE 0.049 217.000 0.000 NA   NA
 2137069 2137070 SAVtRNA51 SAVtRNA52     TRUE 0.611 22.000 0.000 NA   NA
 2137070 2137071 SAVtRNA52 SAVrRNA10     FALSE 0.210 90.000 0.000 NA   NA
 2137071 113883 SAVrRNA10 SAV1861     FALSE 0.010 741.000 0.000 NA   NA
 113883 113884 SAV1861 SAV1862     TRUE 0.511 97.000 0.146 1.000 N NA
 113884 113885 SAV1862 SAV1863     TRUE 0.841 6.000 0.017 1.000 N NA
 113886 113887 SAV1864 SAV1865 gsaB   FALSE 0.074 293.000 0.102 NA   NA
 113888 113889 SAV1866 SAV1867     FALSE 0.067 291.000 0.077 NA N NA
 113889 113890 SAV1867 SAV1868     FALSE 0.039 303.000 0.011 NA N NA
 113892 113893 SAV1870 SAV1871     TRUE 0.960 9.000 0.727 NA   NA
 113893 113894 SAV1871 SAV1872     TRUE 0.887 15.000 0.186 NA   NA
 113894 113895 SAV1872 SAV1873     TRUE 0.947 -22.000 0.045 NA   NA
 113895 113896 SAV1873 SAV1874     FALSE 0.063 260.000 0.004 1.000   NA
 113896 113897 SAV1874 SAV1875     FALSE 0.030 340.000 0.000 1.000   NA
 113897 113898 SAV1875 SAV1876     FALSE 0.296 131.000 0.074 NA   NA
 113900 113901 SAV1878 SAV1879   ampS TRUE 0.692 90.000 0.545 NA N NA
 113901 113902 SAV1879 SAV1880 ampS   TRUE 0.866 12.000 0.125 NA   NA
 113903 113904 SAV1881 SAV1882     TRUE 0.782 7.000 0.010 NA   NA
 113904 113905 SAV1882 SAV1883     FALSE 0.031 278.000 0.000 NA   NA
 113906 113907 SAV1884 SAV1885 vraR vraS TRUE 0.999 -10.000 0.853 0.010 Y NA
 113907 113908 SAV1885 SAV1886 vraS   TRUE 0.987 -3.000 0.679 NA   NA
 113908 113909 SAV1886 SAV1887     TRUE 0.835 15.000 0.086 NA   NA
 113909 113910 SAV1887 SAV1888   map FALSE 0.101 217.000 0.051 NA   NA
 113912 113913 SAV1890 SAV1891     FALSE 0.074 186.000 0.000 NA   NA
 113913 113914 SAV1891 SAV1892     TRUE 0.982 2.000 0.796 1.000   NA
 113915 113916 SAV1893 SAV1894     FALSE 0.023 390.000 0.000 1.000 N NA
 113917 113918 SAV1895 SAV1896     FALSE 0.059 247.000 0.015 NA   NA
 113918 113919 SAV1896 SAV1897     FALSE 0.176 170.000 0.047 NA   NA
 113919 113920 SAV1897 SAV1898     TRUE 0.654 81.000 0.299 1.000 N NA
 113920 113921 SAV1898 SAV1899     FALSE 0.024 768.000 0.034 1.000 N NA
 113921 113922 SAV1899 SAV1900     TRUE 0.992 13.000 0.492 0.001 Y NA
 113922 113923 SAV1900 SAV1901     TRUE 0.997 2.000 0.643 0.001 Y NA
 113925 113926 SAV1903 SAV1904   dnlJ TRUE 0.776 13.000 0.030 NA   NA
 113926 113927 SAV1904 SAV1905 dnlJ pcrA TRUE 0.988 4.000 0.103 0.014 Y NA
 113927 113928 SAV1905 SAV1906 pcrA pcrB TRUE 0.954 -3.000 0.054 1.000   NA
 113928 113929 SAV1906 SAV1907 pcrB   FALSE 0.189 172.000 0.031 1.000   NA
 113929 113930 SAV1907 SAV1908   purB FALSE 0.295 109.000 0.006 1.000   NA
 113931 113932 SAV1909 SAV1910     TRUE 0.593 31.000 0.000 1.000   NA
 113933 113934 SAV1911 SAV1912   nadE FALSE 0.055 271.000 0.023 NA   NA
 113934 113935 SAV1912 SAV1913 nadE   TRUE 0.997 -7.000 0.194 0.001 Y NA
 113936 113937 SAV1914 SAV1915     TRUE 0.944 20.000 0.022 1.000 Y NA
 113938 113939 SAV1916 SAV1917     FALSE 0.081 205.000 0.000 1.000   NA
 113940 113941 SAV1918 SAV1919     TRUE 0.525 53.000 0.020 1.000 N NA
 113941 113942 SAV1919 SAV1920   aldH FALSE 0.123 418.000 0.008 1.000 Y NA
 113945 113946 SAV1923 SAV1924     FALSE 0.017 385.000 0.000 NA   NA
 113948 113949 SAV1926 SAV1927     TRUE 0.984 -3.000 0.545 NA   NA
 113949 113950 SAV1927 SAV1928     TRUE 0.808 60.000 0.636 NA   NA
 113952 113953 SAV1930 SAV1931     TRUE 0.982 0.000 0.615 NA   NA
 113953 113954 SAV1931 SAV1932     TRUE 0.881 -3.000 0.000 NA   NA
 113954 113955 SAV1932 SAV1933     TRUE 0.832 1.000 0.000 NA   NA
 113955 113956 SAV1933 SAV1934     TRUE 0.979 -3.000 0.292 1.000 N NA
 113956 113957 SAV1934 SAV1935     FALSE 0.106 258.000 0.125 NA   NA
 113959 113960 SAV1937 SAV1938 truncated-mapW truncated-mapW TRUE 0.899 -15.000 0.000 NA   NA
 2137072 113962 SAV1939 SAV1940     FALSE 0.018 372.000 0.000 NA   NA
 113962 2137073 SAV1940 SAV1941     TRUE 0.590 24.000 0.000 NA   NA
 113964 10750583 SAV1942 SAV1943     FALSE 0.012 511.000 0.000 NA   NA
 10750583 113966 SAV1943 SAV1944   sak FALSE 0.014 447.000 0.000 NA   NA
 113966 113967 SAV1944 SAV1945 sak   FALSE 0.071 215.000 0.000 1.000   NA
 113967 113968 SAV1945 SAV1946     TRUE 0.669 12.000 0.000 NA   NA
 113968 113969 SAV1946 SAV1947     FALSE 0.053 212.000 0.000 NA   NA
 113969 113970 SAV1947 SAV1948   sep FALSE 0.114 151.000 0.000 NA   NA
 113972 113973 SAV1950 SAV1951     FALSE 0.329 56.000 0.000 NA   NA
 113973 113974 SAV1951 SAV1952     TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 113974 113975 SAV1952 SAV1953     TRUE 0.896 -7.000 0.000 NA   NA
 113975 113976 SAV1953 SAV1954     TRUE 0.862 16.000 0.125 NA   NA
 113976 113977 SAV1954 SAV1955     TRUE 0.881 -3.000 0.000 NA   NA
 113977 113978 SAV1955 SAV1956     FALSE 0.039 245.000 0.000 NA   NA
 113978 113979 SAV1956 SAV1957     FALSE 0.024 316.000 0.000 NA   NA
 113979 113980 SAV1957 SAV1958     TRUE 0.976 1.000 0.500 NA   NA
 113980 113981 SAV1958 SAV1959     TRUE 0.978 -3.000 0.333 NA   NA
 113981 113982 SAV1959 SAV1960     TRUE 0.978 -3.000 0.333 NA   NA
 113982 113983 SAV1960 SAV1961     TRUE 0.984 -16.000 0.400 NA   NA
 113983 113984 SAV1961 SAV1962     TRUE 0.900 -10.000 0.000 NA   NA
 113984 113985 SAV1962 SAV1963     TRUE 0.633 20.000 0.000 NA   NA
 113985 113986 SAV1963 SAV1964     TRUE 0.914 24.000 0.444 NA   NA
 113986 113987 SAV1964 SAV1965     TRUE 0.982 -16.000 0.333 NA   NA
 113987 113988 SAV1965 SAV1966     TRUE 0.662 16.000 0.000 NA   NA
 113988 113989 SAV1966 SAV1967     TRUE 0.881 -3.000 0.000 NA   NA
 113989 113990 SAV1967 SAV1968     FALSE 0.354 130.000 0.125 NA   NA
 113990 113991 SAV1968 SAV1969     FALSE 0.043 232.000 0.000 NA   NA
 113991 113992 SAV1969 SAV1970     TRUE 0.549 28.000 0.000 NA   NA
 113992 2137074 SAV1970 SAV1971     TRUE 0.950 5.000 0.400 NA