MicrobesOnline Operon Predictions for Salinibacter ruber

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10267868 10267869 SRM_00001 SRM_00002   dnaA TRUE 0.678 75.000 0.000 NA   NA
 10267869 10267870 SRM_00002 SRM_00003 dnaA dnaN TRUE 0.988 -3.000 0.328 1.000 Y NA
 10267870 10267871 SRM_00003 SRM_00004 dnaN   FALSE 0.064 332.000 0.000 NA   NA
 10267874 10267875 SRM_00007 SRM_00008   rpe TRUE 0.444 120.000 0.000 1.000 N NA
 10267876 10267877 SRM_00009 SRM_00010     TRUE 0.817 54.000 0.000 NA   NA
 10267879 10267880 SRM_00012 SRM_00013 yajC ribA TRUE 0.920 55.000 0.002 NA N NA
 10267880 10267881 SRM_00013 SRM_00014 ribA   TRUE 0.810 53.000 0.000 NA   NA
 10267883 10267884 SRM_00016 SRM_00017 nusB pphA TRUE 0.975 53.000 0.011 1.000   NA
 10267884 10267885 SRM_00017 SRM_00018 pphA   TRUE 0.600 86.000 0.000 1.000   NA
 10267885 10267886 SRM_00018 SRM_00019     FALSE 0.240 159.000 0.000 NA   NA
 10267886 10267887 SRM_00019 SRM_00020   lolC TRUE 0.660 76.000 0.000 NA   NA
 10267887 10267888 SRM_00020 SRM_00021 lolC comA TRUE 0.859 115.000 0.015 NA   NA
 10267888 10267889 SRM_00021 SRM_00022 comA rpmB TRUE 0.528 -70.000 0.002 1.000   NA
 10267889 10267890 SRM_00022 SRM_00023 rpmB rpmG TRUE 0.998 75.000 0.332 0.021 Y NA
 10267890 10267891 SRM_00023 SRM_00024 rpmG   TRUE 0.527 4.000 0.002 NA   NA
 10267891 10267892 SRM_00024 tRNA_1     FALSE 0.387 20.000 0.000 NA   NA
 10267892 10267893 tRNA_1 tRNA_2     FALSE 0.047 417.000 0.000 NA   NA
 10267894 10267895 SRM_00025 SRM_00026 dnaB dbh2 TRUE 0.932 115.000 0.044 1.000   NA
 10267895 10267896 SRM_00026 SRM_00027 dbh2 coaBC TRUE 0.924 25.000 0.027 1.000 N NA
 10267896 10267897 SRM_00027 SRM_00028 coaBC   TRUE 0.851 183.000 0.050 1.000   NA
 10267897 10267898 SRM_00028 SRM_00029   gmk TRUE 0.922 56.000 0.002 1.000   NA
 10267898 10267899 SRM_00029 SRM_00030 gmk   TRUE 0.979 19.000 0.276 NA   NA
 10267899 10267900 SRM_00030 tRNA_3     FALSE 0.375 117.000 0.000 NA   NA
 10267900 10267901 tRNA_3 SRM_00031   frr TRUE 0.764 66.000 0.000 NA   NA
 10267901 10267902 SRM_00031 SRM_00032 frr pyrH TRUE 0.998 49.000 0.626 1.000 N NA
 10267902 10267903 SRM_00032 SRM_00033 pyrH tsf TRUE 0.964 185.000 0.416 1.000 N NA
 10267903 10267904 SRM_00033 SRM_00034 tsf rpsB TRUE 0.999 68.000 0.748 1.000 Y NA
 10267904 10267905 SRM_00034 SRM_00035 rpsB rpsI TRUE 0.546 273.000 0.004 0.027 Y NA
 10267905 10267906 SRM_00035 SRM_00036 rpsI rplM TRUE 0.994 55.000 0.022 0.021 Y NA
 10267907 10267908 SRM_00037 SRM_00038   rpmF TRUE 0.977 170.000 0.599 NA   NA
 10267908 10267909 SRM_00038 SRM_00039 rpmF plsX TRUE 0.917 277.000 0.418 1.000 N NA
 10267909 10267910 SRM_00039 SRM_00040 plsX fabH TRUE 0.981 44.000 0.016 0.006 Y NA
 10267910 10267911 SRM_00040 SRM_00041 fabH fabD TRUE 0.941 3.000 0.018 0.006 Y NA
 10267911 10267912 SRM_00041 SRM_00042 fabD   TRUE 0.789 62.000 0.000 NA   NA
 10267912 10267913 SRM_00042 SRM_00043   fabG FALSE 0.184 184.000 0.000 NA   NA
 10267913 10267914 SRM_00043 SRM_00044 fabG deaD FALSE 0.168 217.000 0.000 1.000 N NA
 10267915 10267916 SRM_00045 SRM_00047     FALSE 0.034 548.000 0.000 NA   NA
 10267919 10267920 SRM_00049 SRM_00050 pepB   FALSE 0.130 240.000 0.000 1.000   NA
 10267921 10267922 tRNA_4 tRNA_5     TRUE 0.611 80.000 0.000 NA   NA
 10267923 10267924 SRM_00051 SRM_00052 rpmH   TRUE 0.991 7.000 0.787 1.000   NA
 10267924 10267925 SRM_00052 SRM_00053   oxaA TRUE 0.906 179.000 0.105 1.000   NA
 10267925 10267926 SRM_00053 SRM_00054 oxaA trmE TRUE 0.971 65.000 0.008 0.057   NA
 10267926 10267927 SRM_00054 SRM_00055 trmE   FALSE 0.203 191.000 0.000 1.000   NA
 10267927 10267928 SRM_00055 SRM_00056     TRUE 0.608 40.000 0.000 1.000   NA
 10267928 10267929 SRM_00056 SRM_00057     FALSE 0.154 198.000 0.000 NA   NA
 10267929 10267930 SRM_00057 SRM_00058     FALSE 0.094 258.000 0.000 NA   NA
 10267930 10267931 SRM_00058 SRM_00059   gidA FALSE 0.037 511.000 0.000 NA   NA
 10267931 10267932 SRM_00059 SRM_00060 gidA gidB TRUE 0.997 75.000 0.466 1.000 N NA
 10267932 10267933 SRM_00060 SRM_00061 gidB   TRUE 0.781 69.000 0.000 1.000   NA
 10267935 10267936 SRM_00063 SRM_00064     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10267937 10267938 SRM_00065 SRM_00066     TRUE 0.998 67.000 0.667 1.000   NA
 10267939 10267940 SRM_00067 SRM_00068   recF FALSE 0.026 806.000 0.000 NA   NA
 10267940 10267941 SRM_00068 SRM_00069 recF   TRUE 0.794 40.000 0.003 1.000   NA
 10267944 10267945 SRM_00072 SRM_00073 int int TRUE 0.581 116.000 0.000 0.009   NA
 10267946 10267947 SRM_00074 SRM_00075     FALSE 0.089 266.000 0.000 NA   NA
 10267947 10267948 SRM_00075 SRM_00076     FALSE 0.040 478.000 0.000 NA   NA
 10267948 10267949 SRM_00076 SRM_00077     FALSE 0.172 190.000 0.000 NA   NA
 10267949 10267950 SRM_00077 SRM_00078     FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10267953 10267954 SRM_00081 SRM_00082   merA TRUE 0.523 38.000 0.000 NA   NA
 10267954 10267955 SRM_00082 SRM_00083 merA zwf TRUE 0.832 51.000 0.000 1.000 N NA
 10267955 10267956 SRM_00083 SRM_00084 zwf gnd TRUE 0.987 76.000 0.043 1.000 Y NA
 10267956 10267957 SRM_00084 SRM_00085 gnd tal TRUE 0.986 140.000 0.208 0.004 Y NA
 10267957 10267958 SRM_00085 SRM_00087 tal   FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10267959 10267960 SRM_00086 SRM_00088     FALSE 0.041 463.000 0.000 NA   NA
 10267960 10267961 SRM_00088 SRM_00089     FALSE 0.153 219.000 0.000 1.000   NA
 10267961 10267962 SRM_00089 SRM_00090     FALSE 0.421 -67.000 0.000 1.000 N NA
 10267962 10267963 SRM_00090 SRM_00091     TRUE 0.649 -154.000 0.000 1.000 Y NA
 10267963 10267964 SRM_00091 SRM_00092   acrB TRUE 0.996 60.000 0.182 NA N NA
 10267964 10267965 SRM_00092 SRM_00093 acrB   FALSE 0.045 467.000 0.000 NA N NA
 10267966 10267967 SRM_00094 SRM_00095     FALSE 0.137 243.000 0.000 1.000 N NA
 10267967 10267968 SRM_00095 SRM_00096     TRUE 0.548 93.000 0.000 1.000 N NA
 10267969 10267970 SRM_00097 SRM_00098     TRUE 0.822 55.000 0.000 NA   NA
 10267970 10267971 SRM_00098 SRM_00099     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10267971 10267972 SRM_00099 SRM_00100   ppc FALSE 0.106 242.000 0.000 NA   NA
 10267973 10267974 SRM_00101 SRM_00102     FALSE 0.434 98.000 0.000 NA   NA
 10267975 10267976 SRM_00103 SRM_00104   lemA FALSE 0.106 242.000 0.000 NA   NA
 10267976 10267977 SRM_00104 SRM_00105 lemA   TRUE 0.971 60.000 0.010 NA   NA
 10267977 10267978 SRM_00105 SRM_00106     TRUE 0.914 18.000 0.037 NA   NA
 10267978 10267979 SRM_00106 SRM_00107   rlpA FALSE 0.417 16.000 0.000 1.000   NA
 10267979 10267980 SRM_00107 SRM_00108 rlpA   TRUE 0.511 89.000 0.000 NA   NA
 10267980 10267981 SRM_00108 SRM_00109   htpX FALSE 0.177 186.000 0.000 NA   NA
 10267981 10267982 SRM_00109 SRM_00110 htpX sco1 FALSE 0.384 5.000 0.000 1.000   NA
 10267982 10267983 SRM_00110 SRM_00111 sco1   FALSE 0.321 137.000 0.000 NA   NA
 10267983 10267984 SRM_00111 SRM_00112   zntA TRUE 0.438 25.000 0.000 NA N NA
 10267984 10267985 SRM_00112 SRM_00113 zntA   FALSE 0.166 218.000 0.000 1.000 N NA
 10267985 10267986 SRM_00113 SRM_00114     FALSE 0.120 376.000 0.000 0.010 N NA
 10267986 10267987 SRM_00114 SRM_00115   nlpC FALSE 0.137 219.000 0.000 NA N NA
 10267987 10267988 SRM_00115 SRM_00116 nlpC   FALSE 0.361 15.000 0.000 NA   NA
 10267990 10267991 SRM_00118 SRM_00119   bor FALSE 0.033 568.000 0.000 NA   NA
 10267991 10267992 SRM_00119 SRM_00120 bor   FALSE 0.359 129.000 0.000 NA   NA
 10267992 10267993 SRM_00120 SRM_00121     FALSE 0.338 7.000 0.000 NA   NA
 10267993 10267994 SRM_00121 SRM_00122     FALSE 0.237 160.000 0.000 NA   NA
 10267994 10267995 SRM_00122 SRM_00123     FALSE 0.154 198.000 0.000 NA   NA
 10267995 10267996 SRM_00123 SRM_00124     TRUE 0.768 65.000 0.000 NA   NA
 10267996 10267997 SRM_00124 SRM_00125     FALSE 0.259 153.000 0.000 NA   NA
 10267997 10267998 SRM_00125 SRM_00126   arsR FALSE 0.284 147.000 0.000 NA   NA
 10267999 10268000 SRM_00127 SRM_00128 hyuB   FALSE 0.184 184.000 0.000 NA   NA
 10268001 10268002 SRM_00129 SRM_00130     FALSE 0.025 967.000 0.000 NA   NA
 10268002 10268003 SRM_00130 SRM_00131     FALSE 0.344 -31.000 0.000 NA   NA
 10268005 10268006 SRM_00133 SRM_00134 cirA   FALSE 0.023 1154.000 0.000 NA   NA
 10268008 10268009 SRM_00136 SRM_00137     FALSE 0.209 172.000 0.000 NA   NA
 10268009 10268010 SRM_00137 SRM_00138     FALSE 0.021 2270.000 0.000 NA   NA
 10268010 10268011 SRM_00138 SRM_00139     FALSE 0.101 248.000 0.000 NA   NA
 10268011 10268012 SRM_00139 SRM_00140     TRUE 0.556 40.000 0.000 NA   NA
 10268012 10268013 SRM_00140 SRM_00141     FALSE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10268014 10268015 SRM_00142 SRM_00143     FALSE 0.113 232.000 0.000 NA   NA
 10268015 10268016 SRM_00143 SRM_00144     TRUE 0.439 97.000 0.000 NA   NA
 10268016 10268017 SRM_00144 SRM_00145     FALSE 0.430 99.000 0.000 NA   NA
 10268017 10268018 SRM_00145 SRM_00146     FALSE 0.175 187.000 0.000 NA   NA
 10268019 10268020 SRM_00147 SRM_00148     FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10268020 10268021 SRM_00148 SRM_00149     FALSE 0.284 147.000 0.000 NA   NA
 10268022 10268023 SRM_00150 SRM_00151     FALSE 0.219 167.000 0.000 NA   NA
 10268023 10268024 SRM_00151 SRM_00152     FALSE 0.166 194.000 0.000 NA   NA
 10268025 10268026 SRM_00153 SRM_00154 nrdB nrdA TRUE 0.993 104.000 0.269 0.001 Y NA
 10268026 10268027 SRM_00154 SRM_00155 nrdA ykhA TRUE 0.683 45.000 0.000 NA N NA
 10268029 10268030 SRM_00157 SRM_00158     TRUE 0.620 43.000 0.000 NA   NA
 10268030 10268031 SRM_00158 SRM_00159   hmp TRUE 0.823 57.000 0.000 NA   NA
 10268031 10268032 SRM_00159 SRM_00160 hmp   FALSE 0.059 442.000 0.000 1.000 N NA
 10268032 10268033 SRM_00160 SRM_00161     FALSE 0.029 676.000 0.000 NA   NA
 10268033 10268034 SRM_00161 SRM_00162     FALSE 0.434 98.000 0.000 NA   NA
 10268040 10268041 SRM_00168 SRM_00169   ark FALSE 0.353 131.000 0.000 NA   NA
 10268041 10268042 SRM_00169 SRM_00170 ark   FALSE 0.327 265.000 0.000 0.024 Y NA
 10268045 10268046 SRM_00173 SRM_00174     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268046 10268047 SRM_00174 SRM_00175     TRUE 0.742 69.000 0.000 NA   NA
 10268049 10268050 SRM_00177 SRM_00178     FALSE 0.026 811.000 0.000 NA   NA
 10268050 10268051 SRM_00178 SRM_00179     FALSE 0.031 625.000 0.000 NA   NA
 10268052 10268053 SRM_00180 SRM_00181     FALSE 0.365 126.000 0.000 NA   NA
 10268054 10268055 SRM_00182 SRM_00183     FALSE 0.233 162.000 0.000 NA   NA
 10268055 10268056 SRM_00183 SRM_00184     FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10268059 10268060 SRM_00187 SRM_00188     TRUE 0.603 81.000 0.000 NA   NA
 10268060 10268061 SRM_00188 SRM_00189     TRUE 0.942 67.000 0.000 0.008 Y NA
 10268061 10268062 SRM_00189 SRM_00190     FALSE 0.108 240.000 0.000 NA   NA
 10268062 10268063 SRM_00190 SRM_00191     FALSE 0.333 -10.000 0.000 NA   NA
 10268064 10268065 SRM_00192 SRM_00193     FALSE 0.039 491.000 0.000 NA   NA
 10268065 10268066 SRM_00193 SRM_00194     FALSE 0.023 1282.000 0.000 NA   NA
 10268066 10268067 SRM_00194 SRM_00195     FALSE 0.048 414.000 0.000 NA   NA
 10268067 10268068 SRM_00195 SRM_00196     TRUE 0.558 85.000 0.000 NA   NA
 10268068 10268069 SRM_00196 SRM_00197     FALSE 0.353 131.000 0.000 NA   NA
 10268069 10268070 SRM_00197 SRM_00198     TRUE 0.998 71.000 0.667 NA   NA
 10268070 10268071 SRM_00198 SRM_00199     FALSE 0.042 461.000 0.000 NA   NA
 10268073 10268074 SRM_00201 SRM_00202     FALSE 0.072 300.000 0.000 NA   NA
 10268074 10268075 SRM_00202 SRM_00203     FALSE 0.348 132.000 0.000 NA   NA
 10268076 10268077 SRM_00204 SRM_00205     FALSE 0.112 235.000 0.000 NA   NA
 10268077 10268078 SRM_00205 SRM_00206     FALSE 0.417 126.000 0.000 1.000   NA
 10268080 10268081 SRM_00208 SRM_00209     TRUE 0.547 118.000 0.000 0.066   NA
 10268082 10268083 SRM_00210 SRM_00211     FALSE 0.035 545.000 0.000 NA   NA
 10268084 10268085 SRM_00212 SRM_00213     FALSE 0.311 140.000 0.000 NA   NA
 10268085 10268086 SRM_00213 SRM_00214     FALSE 0.376 -3.000 0.000 1.000   NA
 10268086 10268087 SRM_00214 SRM_00215   asnB FALSE 0.376 -3.000 0.000 1.000   NA
 10268087 10268088 SRM_00215 SRM_00216 asnB   FALSE 0.025 1013.000 0.000 NA   NA
 10268088 10268089 SRM_00216 SRM_00217     FALSE 0.414 104.000 0.000 NA   NA
 10268089 10268090 SRM_00217 SRM_00218     FALSE 0.344 -31.000 0.000 NA   NA
 10268091 10268092 SRM_00219 SRM_00220     FALSE 0.184 198.000 0.000 1.000   NA
 10268094 10268095 SRM_00222 SRM_00223   fecR TRUE 0.823 57.000 0.000 NA   NA
 10268095 10268096 SRM_00223 SRM_00224 fecR rpoE FALSE 0.354 -10.000 0.000 NA N NA
 10268096 10268097 SRM_00224 SRM_00225 rpoE hyuA FALSE 0.299 159.000 0.000 1.000 N NA
 10268097 10268098 SRM_00225 SRM_00226 hyuA   FALSE 0.255 154.000 0.000 NA   NA
 10268098 10268099 SRM_00226 SRM_00227     FALSE 0.049 402.000 0.000 NA   NA
 10268099 10268100 SRM_00227 SRM_00228     FALSE 0.023 1157.000 0.000 NA   NA
 10268100 10268101 SRM_00228 SRM_00229     FALSE 0.359 129.000 0.000 NA   NA
 10268101 10268102 SRM_00229 SRM_00230     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10268102 10268103 SRM_00230 SRM_00231     FALSE 0.032 585.000 0.000 NA   NA
 10268103 10268104 SRM_00231 SRM_00232     FALSE 0.133 236.000 0.000 1.000   NA
 10268106 10268107 SRM_00234 SRM_00235     FALSE 0.387 20.000 0.000 NA   NA
 10268107 10268108 SRM_00235 SRM_00236     FALSE 0.366 16.000 0.000 NA   NA
 10268108 10268109 SRM_00236 SRM_00237     TRUE 0.992 53.000 0.077 NA   NA
 10268112 10268113 SRM_00240 SRM_00241     TRUE 0.558 85.000 0.000 NA   NA
 10268113 10268114 SRM_00241 SRM_00242     FALSE 0.361 128.000 0.000 NA   NA
 10268116 10268117 SRM_00244 SRM_00245   wzc FALSE 0.048 414.000 0.000 NA   NA
 10268117 10268118 SRM_00245 SRM_00246 wzc   TRUE 0.998 78.000 1.000 NA   NA
 10268118 10268119 SRM_00246 SRM_00247   wcaG FALSE 0.113 233.000 0.000 NA   NA
 10268119 10268120 SRM_00247 SRM_00248 wcaG wcaI TRUE 0.809 50.000 0.000 1.000   NA
 10268120 10268121 SRM_00248 SRM_00249 wcaI   FALSE 0.333 -10.000 0.000 NA   NA
 10268121 10268122 SRM_00249 SRM_00250     TRUE 0.714 72.000 0.000 NA   NA
 10268122 10268123 SRM_00250 SRM_00251     FALSE 0.414 104.000 0.000 NA   NA
 10268123 10268124 SRM_00251 SRM_00252   wcaA FALSE 0.253 155.000 0.000 NA   NA
 10268124 10268125 SRM_00252 SRM_00253 wcaA   FALSE 0.336 -16.000 0.000 NA   NA
 10268126 10268127 SRM_00254 SRM_00255     FALSE 0.036 517.000 0.000 NA   NA
 10268128 10268129 SRM_00256 SRM_00257 rfaG wcaA FALSE 0.022 1342.000 0.000 NA   NA
 10268129 10268130 SRM_00257 SRM_00258 wcaA rfaG FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10268130 10268131 SRM_00258 SRM_00259 rfaG   FALSE 0.417 16.000 0.000 1.000   NA
 10268131 10268132 SRM_00259 SRM_00260     TRUE 0.552 -25.000 0.000 0.005   NA
 10268132 10268133 SRM_00260 SRM_00261     TRUE 0.542 4.000 0.000 0.005   NA
 10268133 10268134 SRM_00261 SRM_00262   rfaG FALSE 0.376 -3.000 0.000 1.000   NA
 10268134 10268135 SRM_00262 SRM_00263 rfaG rfaG TRUE 0.718 -22.000 0.000 0.022 Y NA
 10268135 10268136 SRM_00263 SRM_00264 rfaG   TRUE 0.510 37.000 0.000 NA   NA
 10268136 10268137 SRM_00264 SRM_00265   rfaG FALSE 0.403 23.000 0.000 NA   NA
 10268137 10268138 SRM_00265 SRM_00266 rfaG rfaG TRUE 0.748 18.000 0.000 0.022 Y NA
 10268140 10268141 SRM_00268 SRM_00269 wcaA   FALSE 0.033 568.000 0.000 NA   NA
 10268141 10268142 SRM_00269 SRM_00270     TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10268142 10268143 SRM_00270 SRM_00271     TRUE 0.556 36.000 0.000 1.000   NA
 10268145 10268146 SRM_00273 SRM_00274     TRUE 0.844 59.000 0.000 1.000   NA
 10268146 10268147 SRM_00274 SRM_00275     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10268147 10268148 SRM_00275 SRM_00276   asnB FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268148 10268149 SRM_00276 SRM_00277 asnB   TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10268149 10268150 SRM_00277 SRM_00278     FALSE 0.026 868.000 0.000 NA   NA
 10268151 10268152 SRM_00279 SRM_00281     FALSE 0.097 252.000 0.000 NA   NA
 10268154 10268155 SRM_00282 SRM_00283     TRUE 0.444 29.000 0.000 NA   NA
 10268155 10268156 SRM_00283 SRM_00284     TRUE 0.723 71.000 0.000 NA   NA
 10268156 10268157 SRM_00284 SRM_00285     FALSE 0.044 447.000 0.000 NA   NA
 10268157 10268158 SRM_00285 SRM_00286     FALSE 0.053 376.000 0.000 NA   NA
 10268158 10268159 SRM_00286 SRM_00287     FALSE 0.024 1017.000 0.000 NA   NA
 10268159 10268160 SRM_00287 SRM_00288     FALSE 0.122 225.000 0.000 NA   NA
 10268160 10268161 SRM_00288 SRM_00289     FALSE 0.222 166.000 0.000 NA   NA
 10268162 10268163 SRM_00290 SRM_00291     FALSE 0.030 646.000 0.000 NA   NA
 10268163 10268164 SRM_00291 SRM_00292     FALSE 0.024 1105.000 0.000 NA   NA
 10268164 10268165 SRM_00292 SRM_00293     FALSE 0.355 -175.000 0.000 NA   NA
 10268165 10268166 SRM_00293 SRM_00294     FALSE 0.350 12.000 0.000 NA   NA
 10268168 10268169 SRM_00296 SRM_00297   groL TRUE 0.642 43.000 0.000 NA N NA
 10268169 10268170 SRM_00297 SRM_00298 groL phoA FALSE 0.039 660.000 0.000 1.000 N NA
 10268171 10268172 SRM_00299 SRM_00300     FALSE 0.029 683.000 0.000 NA   NA
 10268172 10268173 SRM_00300 SRM_00301   lytT FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268173 10268174 SRM_00301 SRM_00302 lytT lytS TRUE 0.964 -7.000 0.111 0.032   NA
 10268174 10268175 SRM_00302 SRM_00303 lytS insB TRUE 0.758 67.000 0.000 NA   NA
 10268175 10268176 SRM_00303 SRM_00304 insB insA FALSE 0.337 135.000 0.000 NA   NA
 10268176 10268177 SRM_00304 SRM_00306 insA   FALSE 0.338 -19.000 0.000 NA   NA
 10268178 10268179 SRM_00305 SRM_00307   ampC TRUE 0.660 76.000 0.000 NA   NA
 10268179 10268180 SRM_00307 SRM_00308 ampC   FALSE 0.028 695.000 0.000 NA   NA
 10268180 10268181 SRM_00308 SRM_00309     FALSE 0.032 590.000 0.000 NA   NA
 10268181 10268182 SRM_00309 SRM_00310     TRUE 0.450 111.000 0.000 1.000   NA
 10268182 10268183 SRM_00310 SRM_00311     FALSE 0.079 284.000 0.000 NA   NA
 10268183 10268184 SRM_00311 SRM_00312     FALSE 0.188 181.000 0.000 NA   NA
 10268185 10268186 SRM_00313 SRM_00314 lplA   FALSE 0.329 1.000 0.000 NA   NA
 10268186 10268187 SRM_00314 SRM_00315   fer FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10268187 10268188 SRM_00315 SRM_00316 fer   FALSE 0.425 100.000 0.000 NA   NA
 10268188 10268189 SRM_00316 SRM_00317   fdxA FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10268189 10268190 SRM_00317 SRM_00319 fdxA   FALSE 0.338 -19.000 0.000 NA   NA
 10268191 10268192 SRM_00318 SRM_00320     TRUE 0.494 91.000 0.000 NA   NA
 10268192 10268193 SRM_00320 SRM_00321     FALSE 0.030 769.000 0.000 NA N NA
 10268193 10268194 SRM_00321 SRM_00322     FALSE 0.063 335.000 0.000 NA   NA
 10268196 10268197 SRM_00324 SRM_00325 cirA   TRUE 0.999 63.000 1.000 NA   NA
 10268197 10268198 SRM_00325 SRM_00326     FALSE 0.098 251.000 0.000 NA   NA
 10268198 10268199 SRM_00326 SRM_00327     FALSE 0.361 15.000 0.000 NA   NA
 10268199 10268200 SRM_00327 SRM_00328     FALSE 0.425 100.000 0.000 NA   NA
 10268202 10268203 SRM_00330 SRM_00331 cirA   TRUE 0.996 36.000 1.000 NA   NA
 10268203 10268204 SRM_00331 SRM_00332     FALSE 0.233 162.000 0.000 NA   NA
 10268204 10268205 SRM_00332 SRM_00333     FALSE 0.259 153.000 0.000 NA   NA
 10268208 10268209 SRM_00336 SRM_00337     FALSE 0.033 559.000 0.000 NA   NA
 10268209 10268210 SRM_00337 SRM_00338   tonB TRUE 0.750 68.000 0.000 NA   NA
 10268210 10268211 SRM_00338 SRM_00339 tonB   FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10268211 10268212 SRM_00339 SRM_00340     FALSE 0.237 160.000 0.000 NA   NA
 10268212 10268213 SRM_00340 SRM_00341   rgpG FALSE 0.024 1065.000 0.000 NA   NA
 10268215 10268216 SRM_00343 SRM_00344   recG FALSE 0.142 228.000 0.000 1.000   NA
 10268216 10268217 SRM_00344 SRM_00345 recG   FALSE 0.359 129.000 0.000 NA   NA
 10268218 10268219 SRM_00346 SRM_00347     TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10268220 10268221 SRM_00348 SRM_00349     TRUE 0.439 97.000 0.000 NA   NA
 10268222 10268223 SRM_00350 SRM_00351 tktA tal TRUE 0.916 100.000 0.008 1.000 Y NA
 10268224 10268225 SRM_00352 SRM_00353     FALSE 0.044 447.000 0.000 NA   NA
 10268225 10268226 SRM_00353 SRM_00354     TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10268226 10268227 SRM_00354 SRM_00355     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268227 10268228 SRM_00355 SRM_00356     FALSE 0.076 289.000 0.000 NA   NA
 10268228 10268229 SRM_00356 SRM_00357     TRUE 0.452 95.000 0.000 NA   NA
 10268229 10268230 SRM_00357 SRM_00358     TRUE 0.817 54.000 0.000 NA   NA
 10268230 10268231 SRM_00358 SRM_00359     TRUE 0.746 48.000 0.000 NA   NA
 10268232 10268233 SRM_00360 SRM_00361     TRUE 0.758 67.000 0.000 NA   NA
 10268233 10268234 SRM_00361 SRM_00362     TRUE 0.620 43.000 0.000 NA   NA
 10268234 10268235 SRM_00362 SRM_00363     TRUE 0.660 76.000 0.000 NA   NA
 10268235 10268236 SRM_00363 SRM_00364     TRUE 0.503 90.000 0.000 NA   NA
 10268236 10268237 SRM_00364 SRM_00365     TRUE 0.994 37.000 0.600 NA   NA
 10268238 10268239 SRM_00366 SRM_00367 mltE mmt1 TRUE 0.463 113.000 0.000 1.000 N NA
 10268239 10268240 SRM_00367 SRM_00368 mmt1   FALSE 0.151 200.000 0.000 NA   NA
 10268240 10268241 SRM_00368 SRM_00369   znuC FALSE 0.370 122.000 0.000 NA   NA
 10268241 10268242 SRM_00369 SRM_00370 znuC   FALSE 0.091 309.000 0.000 1.000 N NA
 10268242 10268243 SRM_00370 SRM_00371     TRUE 0.770 18.000 0.000 0.002 Y NA
 10268243 10268244 SRM_00371 SRM_00372     TRUE 0.534 31.000 0.000 1.000 N NA
 10268245 10268246 SRM_00373 SRM_00374 recQ   FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10268247 10268248 SRM_00375 SRM_00376     TRUE 0.439 97.000 0.000 NA   NA
 10268249 10268250 SRM_00377 SRM_00378 nrdB dapG FALSE 0.307 157.000 0.000 1.000 N NA
 10268250 10268251 SRM_00378 SRM_00379 dapG   FALSE 0.027 745.000 0.000 NA   NA
 10268251 10268252 SRM_00379 SRM_00380   umuD FALSE 0.397 111.000 0.000 NA   NA
 10268252 10268253 SRM_00380 SRM_00381 umuD umuC TRUE 0.998 55.000 0.333 1.000   NA
 10268253 10268254 SRM_00381 SRM_00382 umuC   FALSE 0.254 160.000 0.000 NA N NA
 10268256 10268257 SRM_00384 SRM_00385 nosZ   TRUE 0.984 97.000 0.281 NA   NA
 10268257 10268258 SRM_00385 SRM_00386   nosD TRUE 0.979 91.000 0.153 NA   NA
 10268258 10268259 SRM_00386 SRM_00387 nosD nosF TRUE 0.938 -3.000 0.082 NA N NA
 10268259 10268260 SRM_00387 SRM_00388 nosF   FALSE 0.390 113.000 0.000 NA   NA
 10268260 10268261 SRM_00388 SRM_00389     FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10268263 10268264 SRM_00391 SRM_00392     FALSE 0.414 104.000 0.000 NA   NA
 10268264 10268265 SRM_00392 SRM_00393   cyoA FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10268265 10268266 SRM_00393 SRM_00394 cyoA cyoB TRUE 0.545 -3.000 0.000 0.003   NA
 10268266 10268267 SRM_00394 SRM_00395 cyoB   FALSE 0.338 7.000 0.000 NA   NA
 10268267 10268268 SRM_00395 SRM_00396     FALSE 0.124 223.000 0.000 NA   NA
 10268269 10268270 SRM_00397 SRM_00398 hcaD   TRUE 0.993 73.000 0.188 NA   NA
 10268270 10268271 SRM_00398 SRM_00399     FALSE 0.321 137.000 0.000 NA   NA
 10268272 10268273 SRM_00400 SRM_00401     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268273 10268274 SRM_00401 SRM_00402   ctaD TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10268274 10268275 SRM_00402 SRM_00403 ctaD cccA FALSE 0.069 698.000 0.000 0.004 N NA
 10268275 10268276 SRM_00403 SRM_00404 cccA   TRUE 0.759 46.000 0.000 1.000 N NA
 10268276 10268277 SRM_00404 SRM_00405   gloB FALSE 0.171 208.000 0.000 1.000   NA
 10268277 10268278 SRM_00405 SRM_00406 gloB   TRUE 0.974 96.000 0.133 1.000   NA
 10268278 10268279 SRM_00406 SRM_00407   gufA FALSE 0.057 435.000 0.000 1.000   NA
 10268279 10268280 SRM_00407 SRM_00408 gufA dpsA FALSE 0.402 194.000 0.000 1.000 Y NA
 10268280 10268281 SRM_00408 SRM_00409 dpsA czcA FALSE 0.282 152.000 0.000 NA N NA
 10268281 10268282 SRM_00409 SRM_00410 czcA   FALSE 0.361 15.000 0.000 NA   NA
 10268283 10268284 SRM_00411 SRM_00412 tenA   FALSE 0.106 280.000 0.000 1.000 N NA
 10268284 10268285 SRM_00412 SRM_00413     FALSE 0.218 184.000 0.000 1.000   NA
 10268285 10268286 SRM_00413 SRM_00415   zntA TRUE 0.475 101.000 0.000 1.000   NA
 10268287 10268288 SRM_00414 SRM_00416 cheB bacA FALSE 0.398 136.000 0.000 1.000 N NA
 10268288 10268289 SRM_00416 SRM_00417 bacA   FALSE 0.030 642.000 0.000 NA   NA
 10268289 10268290 SRM_00417 SRM_00418     FALSE 0.279 148.000 0.000 NA   NA
 10268290 10268291 SRM_00418 SRM_00419   pssA FALSE 0.261 166.000 0.000 1.000   NA
 10268292 10268293 SRM_00420 SRM_00421   pqiB TRUE 0.914 5.000 0.044 NA   NA
 10268293 10268294 SRM_00421 SRM_00422 pqiB   TRUE 0.997 34.000 0.854 NA Y NA
 10268294 10268295 SRM_00422 SRM_00423     TRUE 0.986 210.000 0.875 NA Y NA
 10268297 10268298 SRM_00425 SRM_00426 ompA mviM FALSE 0.393 -30.000 0.000 1.000   NA
 10268298 10268299 SRM_00426 SRM_00427 mviM pncB FALSE 0.251 171.000 0.000 1.000   NA
 10268299 10268300 SRM_00427 SRM_00428 pncB   FALSE 0.300 142.000 0.000 NA   NA
 10268300 10268301 SRM_00428 SRM_00429     FALSE 0.195 178.000 0.000 NA   NA
 10268301 10268302 SRM_00429 SRM_00430     TRUE 0.723 71.000 0.000 NA   NA
 10268302 10268303 SRM_00430 SRM_00431     FALSE 0.305 141.000 0.000 NA   NA
 10268304 10268305 SRM_00432 SRM_00433 cirA   FALSE 0.050 509.000 0.000 1.000 N NA
 10268307 10268308 SRM_00435 SRM_00436   cirA TRUE 0.824 64.000 0.000 1.000 N NA
 10268308 10268309 SRM_00436 SRM_00437 cirA   TRUE 0.981 33.000 0.188 NA   NA
 10268309 10268310 SRM_00437 SRM_00438     FALSE 0.361 15.000 0.000 NA   NA
 10268311 10268312 SRM_00439 SRM_00440     FALSE 0.375 18.000 0.000 NA   NA
 10268313 10268314 SRM_00441 SRM_00442     FALSE 0.437 126.000 0.000 1.000 N NA
 10268314 10268315 SRM_00442 SRM_00443   cirA FALSE 0.151 297.000 0.000 0.037 N NA
 10268315 10268316 SRM_00443 SRM_00444 cirA   TRUE 0.997 56.000 0.222 NA   NA
 10268316 10268317 SRM_00444 SRM_00445   chb TRUE 0.994 70.000 0.222 NA   NA
 10268317 10268318 SRM_00445 SRM_00446 chb rbsR FALSE 0.183 208.000 0.000 1.000 N NA
 10268318 10268319 SRM_00446 SRM_00447 rbsR   FALSE 0.404 131.000 0.000 1.000   NA
 10268319 10268320 SRM_00447 SRM_00448   putP FALSE 0.092 291.000 0.000 1.000   NA
 10268320 10268321 SRM_00448 SRM_00449 putP bglX TRUE 0.799 48.000 0.000 1.000 N NA
 10268321 10268322 SRM_00449 SRM_00450 bglX nagK FALSE 0.170 356.000 0.000 1.000 Y NA
 10268322 10268323 SRM_00450 SRM_00451 nagK   FALSE 0.079 347.000 0.000 1.000 N NA
 10268323 10268324 SRM_00451 SRM_00452     FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10268324 10268325 SRM_00452 SRM_00453     FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10268326 10268327 SRM_00454 SRM_00455     FALSE 0.421 26.000 0.000 NA   NA
 10268327 10268328 SRM_00455 tRNA_6     TRUE 0.645 77.000 0.000 NA   NA
 10268330 10268331 SRM_00457 SRM_00458   kbl TRUE 0.688 43.000 0.000 1.000 N NA
 10268331 10268332 SRM_00458 SRM_00459 kbl   TRUE 0.967 127.000 0.139 1.000 N NA
 10268333 10268334 SRM_00460 SRM_00461 lrp glnA TRUE 0.557 92.000 0.000 1.000 N NA
 10268334 10268335 SRM_00461 SRM_00462 glnA purB FALSE 0.087 321.000 0.000 1.000 N NA
 10268335 10268336 SRM_00462 SRM_00463 purB   FALSE 0.137 243.000 0.000 1.000 N NA
 10268336 10268337 SRM_00463 SRM_00464     TRUE 0.971 -3.000 0.250 NA   NA
 10268338 10268339 SRM_00465 SRM_00466     TRUE 0.619 79.000 0.000 NA   NA
 10268340 10268341 SRM_00467 SRM_00468   cirA FALSE 0.433 128.000 0.000 1.000 N NA
 10268341 10268342 SRM_00468 SRM_00469 cirA   FALSE 0.191 202.000 0.000 1.000 N NA
 10268342 10268343 SRM_00469 SRM_00470   nuoB TRUE 0.985 196.000 0.498 0.004 Y NA
 10268343 10268344 SRM_00470 SRM_00471 nuoB nuoC TRUE 0.998 33.000 0.691 0.004 Y NA
 10268344 10268345 SRM_00471 SRM_00472 nuoC nuoD TRUE 0.997 56.000 0.057 0.008 Y NA
 10268345 10268346 SRM_00472 SRM_00473 nuoD nuoE TRUE 0.986 98.000 0.097 0.008 Y NA
 10268346 10268347 SRM_00473 SRM_00474 nuoE nuoF TRUE 0.978 104.000 0.054 0.008 Y NA
 10268347 10268348 SRM_00474 SRM_00475 nuoF   TRUE 0.822 55.000 0.000 NA   NA
 10268348 10268349 SRM_00475 SRM_00476   nuoG FALSE 0.122 225.000 0.000 NA   NA
 10268350 10268351 SRM_00477 SRM_00479     FALSE 0.036 521.000 0.000 NA   NA
 10268352 10268353 SRM_00478 SRM_00480     TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10268353 10268354 SRM_00480 SRM_00481   nadE FALSE 0.375 117.000 0.000 NA   NA
 10268354 10268355 SRM_00481 SRM_00482 nadE lspA TRUE 0.824 64.000 0.000 1.000 N NA
 10268355 10268356 SRM_00482 SRM_00483 lspA lepA TRUE 0.820 89.000 0.002 1.000 Y NA
 10268356 10268357 SRM_00483 SRM_00484 lepA   TRUE 0.638 87.000 0.002 NA   NA
 10268357 10268358 SRM_00484 SRM_00485   lepB TRUE 0.999 55.000 1.000 NA   NA
 10268359 10268360 SRM_00486 SRM_00487   trkA TRUE 0.584 83.000 0.000 NA   NA
 10268360 10268361 SRM_00487 SRM_00488 trkA   FALSE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10268362 10268363 SRM_00489 SRM_00490   rssA FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 10268364 10268365 SRM_00491 SRM_00492 dfrA   FALSE 0.398 1.000 0.000 1.000 N NA
 10268366 10268367 SRM_00493 SRM_00494 lytS lytT TRUE 0.999 61.000 0.714 0.030 Y NA
 10268367 10268368 SRM_00494 SRM_00495 lytT   FALSE 0.170 191.000 0.000 NA   NA
 10268368 10268369 SRM_00495 SRM_00496     FALSE 0.317 138.000 0.000 NA   NA
 10268373 10268374 SRM_00499 SRM_00501 cysH korA FALSE 0.311 156.000 0.000 1.000 N NA
 10268374 10268375 SRM_00501 SRM_00502 korA porB TRUE 0.995 153.000 0.832 0.001 Y NA
 10268375 10268376 SRM_00502 SRM_00503 porB   FALSE 0.244 158.000 0.000 NA   NA
 10268376 10268377 SRM_00503 SRM_00504     FALSE 0.038 508.000 0.000 NA   NA
 10268377 10268378 SRM_00504 SRM_00505     FALSE 0.175 206.000 0.000 1.000   NA
 10268380 10268381 SRM_00506 SRM_00508     FALSE 0.345 133.000 0.000 NA   NA
 10268381 10268382 SRM_00508 SRM_00509     TRUE 0.999 64.000 0.500 1.000 Y NA
 10268382 10268383 SRM_00509 SRM_00510     TRUE 0.995 141.000 0.714 0.036 Y NA
 10268383 10268384 SRM_00510 SRM_00511     TRUE 0.601 163.000 0.000 0.018 Y NA
 10268384 10268385 SRM_00511 SRM_00512     FALSE 0.247 157.000 0.000 NA   NA
 10268385 10268386 SRM_00512 SRM_00513     FALSE 0.118 228.000 0.000 NA   NA
 10268387 10268388 SRM_00514 SRM_00515     TRUE 0.577 41.000 0.000 NA   NA
 10268389 10268390 SRM_00516 SRM_00517     TRUE 0.962 187.000 0.451 NA   NA
 10268390 10268391 SRM_00517 SRM_00518     FALSE 0.199 176.000 0.000 NA   NA
 10268391 10268392 SRM_00518 SRM_00519     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10268393 10268394 SRM_00520 SRM_00521 phoU rfaG FALSE 0.024 1385.000 0.000 NA N NA
 10268394 10268395 SRM_00521 SRM_00522 rfaG   FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10268395 10268396 SRM_00522 SRM_00523     FALSE 0.157 197.000 0.000 NA   NA
 10268396 10268397 SRM_00523 SRM_00524     TRUE 0.879 -7.000 0.025 NA   NA
 10268397 10268398 SRM_00524 SRM_00525   uvrA FALSE 0.359 129.000 0.000 NA   NA
 10268400 10268401 SRM_00527 SRM_00528     FALSE 0.266 151.000 0.000 NA   NA
 10268402 10268403 SRM_00529 SRM_00530   argE TRUE 0.992 46.000 0.143 1.000   NA
 10268403 10268404 SRM_00530 SRM_00531 argE   TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10268404 10268405 SRM_00531 SRM_00532   ileS FALSE 0.146 206.000 0.000 NA   NA
 10268405 10268406 SRM_00532 SRM_00533 ileS dksA TRUE 0.988 79.000 0.135 1.000 N NA
 10268406 10268407 SRM_00533 SRM_00534 dksA ruvA FALSE 0.278 166.000 0.000 1.000 N NA
 10268407 10268408 SRM_00534 SRM_00535 ruvA prs TRUE 0.597 38.000 0.000 1.000 N NA
 10268408 10268409 SRM_00535 SRM_00536 prs   FALSE 0.353 13.000 0.000 NA   NA
 10268409 10268410 SRM_00536 SRM_00537     FALSE 0.069 309.000 0.000 NA   NA
 10268410 10268411 SRM_00537 SRM_00538   dCTP FALSE 0.367 125.000 0.000 NA   NA
 10268411 10268412 SRM_00538 SRM_00539 dCTP   FALSE 0.051 389.000 0.000 NA   NA
 10268412 10268413 SRM_00539 SRM_00540     TRUE 0.620 43.000 0.000 NA   NA
 10268413 10268414 SRM_00540 SRM_00541   typA FALSE 0.060 413.000 0.000 1.000   NA
 10268415 10268416 SRM_00542 SRM_00543   dnaJ FALSE 0.052 457.000 0.000 1.000   NA
 10268417 10268418 SRM_00544 SRM_00545 accA   FALSE 0.340 -24.000 0.000 NA   NA
 10268419 10268420 SRM_00546 SRM_00547     FALSE 0.300 142.000 0.000 NA   NA
 10268420 10268421 SRM_00547 SRM_00548     FALSE 0.031 602.000 0.000 NA   NA
 10268421 10268422 SRM_00548 SRM_00549     FALSE 0.330 -6.000 0.000 NA   NA
 10268422 10268423 SRM_00549 SRM_00550     FALSE 0.375 117.000 0.000 NA   NA
 10268425 10268426 SRM_00552 SRM_00553   acrB FALSE 0.245 164.000 0.000 NA N NA
 10268426 10268427 SRM_00553 SRM_00554 acrB   FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268427 10268428 SRM_00554 SRM_00555   acrA TRUE 0.746 48.000 0.000 NA   NA
 10268428 10268429 SRM_00555 SRM_00556 acrA sepC TRUE 0.936 59.000 0.000 1.000 Y NA
 10268429 10268430 SRM_00556 SRM_00557 sepC acrR TRUE 0.648 41.000 0.000 1.000 N NA
 10268431 10268432 SRM_00558 SRM_00559 rot met17 FALSE 0.078 349.000 0.000 1.000 N NA
 10268432 10268433 SRM_00559 SRM_00560 met17 metX TRUE 0.923 131.000 0.017 1.000 Y NA
 10268433 10268434 SRM_00560 SRM_00561 metX lysC TRUE 0.922 132.000 0.017 1.000 Y NA
 10268434 10268435 SRM_00561 SRM_00562 lysC thrA TRUE 0.782 21.000 0.000 0.002 Y NA
 10268438 10268439 SRM_00565 SRM_00566 sdhB sdhA TRUE 0.998 87.000 0.604 0.001 Y NA
 10268439 10268440 SRM_00566 SRM_00567 sdhA sdhA TRUE 0.997 24.000 0.705 0.002 Y NA
 10268440 10268441 SRM_00567 SRM_00568 sdhA sdhD TRUE 0.993 53.000 0.018 0.002 Y NA
 10268441 10268442 SRM_00568 SRM_00569 sdhD gltA TRUE 0.496 165.000 0.000 1.000 Y NA
 10268443 10268444 SRM_00570 SRM_00571 rne   TRUE 0.882 83.000 0.006 NA   NA
 10268444 10268445 SRM_00571 SRM_00572   phnP TRUE 0.802 -10.000 0.011 NA   NA
 10268447 10268448 SRM_00574 SRM_00575 aroD   TRUE 0.521 169.000 0.004 NA   NA
 10268448 10268449 SRM_00575 SRM_00576   mviN FALSE 0.430 99.000 0.000 NA   NA
 10268449 10268450 SRM_00576 SRM_00577 mviN   FALSE 0.317 138.000 0.000 NA   NA
 10268450 10268451 SRM_00577 SRM_00578   nuoI FALSE 0.162 201.000 0.000 NA N NA
 10268451 10268452 SRM_00578 SRM_00579 nuoI   TRUE 0.941 119.000 0.069 NA   NA
 10268452 10268453 SRM_00579 SRM_00580   holA TRUE 0.745 79.000 0.002 NA   NA
 10268453 10268454 SRM_00580 SRM_00581 holA   FALSE 0.340 -22.000 0.000 NA   NA
 10268454 10268455 SRM_00581 tRNA_7     TRUE 0.645 77.000 0.000 NA   NA
 10268455 10268456 tRNA_7 SRM_00582     FALSE 0.147 205.000 0.000 NA   NA
 10268456 10268457 SRM_00582 SRM_00583   etp TRUE 0.784 63.000 0.000 NA   NA
 10268458 10268459 SRM_00584 SRM_00585   spoU TRUE 0.503 90.000 0.000 NA   NA
 10268460 10268461 SRM_00586 SRM_00587 gdhA   FALSE 0.376 -3.000 0.000 1.000   NA
 10268461 10268462 SRM_00587 SRM_00588     TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10268462 10268463 SRM_00588 SRM_00589     TRUE 0.721 34.000 0.003 NA   NA
 10268463 10268464 SRM_00589 SRM_00590   tonB TRUE 0.953 195.000 0.400 NA   NA
 10268465 10268466 SRM_00591 SRM_00592 rpiA   TRUE 0.454 110.000 0.000 1.000   NA
 10268466 10268467 SRM_00592 SRM_00593   uvrD TRUE 0.921 40.000 0.012 1.000   NA
 10268468 10268469 SRM_00594 SRM_00595 soj spo0J TRUE 0.999 67.000 0.827 1.000 N NA
 10268469 10268470 SRM_00595 SRM_00596 spo0J   TRUE 0.978 85.000 0.098 NA   NA
 10268470 10268471 SRM_00596 SRM_00597   bioF FALSE 0.065 331.000 0.000 NA   NA
 10268471 10268472 SRM_00597 SRM_00598 bioF   TRUE 0.538 34.000 0.000 1.000   NA
 10268472 10268473 SRM_00598 SRM_00599     TRUE 0.871 65.000 0.000 0.053   NA
 10268474 10268475 SRM_00600 SRM_00601 glpG purQ TRUE 0.565 89.000 0.000 1.000   NA
 10268475 10268476 SRM_00601 SRM_00602 purQ caiA TRUE 0.514 97.000 0.000 1.000 N NA
 10268476 10268477 SRM_00602 SRM_00603 caiA   TRUE 0.692 74.000 0.000 NA   NA
 10268477 10268478 SRM_00603 SRM_00604   ssb TRUE 0.558 85.000 0.000 NA   NA
 10268478 10268479 SRM_00604 SRM_00605 ssb   FALSE 0.329 1.000 0.000 NA   NA
 10268479 10268480 SRM_00605 SRM_00607   mhpC FALSE 0.065 329.000 0.000 NA   NA
 10268481 10268482 SRM_00606 SRM_00608     FALSE 0.080 282.000 0.000 NA   NA
 10268482 10268483 SRM_00608 SRM_00609     TRUE 0.603 81.000 0.000 NA   NA
 10268483 10268484 SRM_00609 SRM_00610   udk TRUE 0.951 59.000 0.004 NA   NA
 10268485 10268486 SRM_00611 SRM_00612   birA TRUE 0.947 28.000 0.044 1.000 N NA
 10268486 10268487 SRM_00612 SRM_00613 birA   TRUE 0.776 64.000 0.000 NA   NA
 10268488 10268489 SRM_00614 SRM_00615 suhB fab1 TRUE 0.949 57.000 0.003 1.000 N NA
 10268489 10268490 SRM_00615 SRM_00616 fab1   FALSE 0.395 10.000 0.000 1.000   NA
 10268490 10268491 SRM_00616 SRM_00617     FALSE 0.340 -24.000 0.000 NA   NA
 10268491 10268492 SRM_00617 SRM_00618     FALSE 0.386 114.000 0.000 NA   NA
 10268493 10268494 SRM_00619 SRM_00620 nupC   TRUE 0.668 194.000 0.014 1.000   NA
 10268495 10268496 SRM_00621 SRM_00622 uvrD   FALSE 0.353 13.000 0.000 NA   NA
 10268496 10268497 SRM_00622 SRM_00623     FALSE 0.269 150.000 0.000 NA   NA
 10268498 10268499 SRM_00624 SRM_00625     FALSE 0.063 335.000 0.000 NA   NA
 10268499 10268500 SRM_00625 SRM_00626     TRUE 0.987 53.000 0.032 1.000   NA
 10268500 10268501 SRM_00626 SRM_00627     FALSE 0.353 131.000 0.000 NA   NA
 10268501 10268502 SRM_00627 SRM_00628     FALSE 0.051 433.000 0.000 NA N NA
 10268504 10268505 SRM_00630 SRM_00631 pdxH   FALSE 0.363 127.000 0.000 NA   NA
 10268508 10268509 SRM_00634 SRM_00635 ubiG   TRUE 0.478 27.000 0.000 1.000   NA
 10268509 10268510 SRM_00635 SRM_00636   pyrG TRUE 0.809 50.000 0.000 1.000   NA
 10268512 10268513 SRM_00638 SRM_00639 mraZ mraW TRUE 0.993 33.000 0.635 NA   NA
 10268513 10268514 SRM_00639 SRM_00640 mraW   TRUE 0.688 40.000 0.002 NA   NA
 10268514 10268515 SRM_00640 SRM_00641   ftsI TRUE 0.990 61.000 0.056 NA   NA
 10268515 10268516 SRM_00641 SRM_00642 ftsI murE TRUE 0.983 -25.000 0.198 1.000 Y NA
 10268516 10268517 SRM_00642 SRM_00643 murE mraY TRUE 0.997 58.000 0.069 0.004 Y NA
 10268517 10268518 SRM_00643 SRM_00644 mraY murD TRUE 0.996 9.000 0.647 0.004 Y NA
 10268518 10268519 SRM_00644 SRM_00645 murD ftsW TRUE 0.881 115.000 0.016 1.000 N NA
 10268519 10268520 SRM_00645 SRM_00646 ftsW murC TRUE 0.688 43.000 0.000 1.000 N NA
 10268520 10268521 SRM_00646 SRM_00647 murC ftsQ TRUE 0.968 148.000 0.134 NA Y NA
 10268521 10268522 SRM_00647 SRM_00648 ftsQ ftsA TRUE 0.926 135.000 0.052 NA N NA
 10268522 10268523 SRM_00648 SRM_00649 ftsA ftsZ2 TRUE 0.890 214.000 0.070 1.000 Y NA
 10268524 10268525 SRM_00650 SRM_00651     TRUE 0.823 57.000 0.000 NA   NA
 10268525 10268526 SRM_00651 SRM_00652     TRUE 0.538 39.000 0.000 NA   NA
 10268527 10268528 SRM_00653 SRM_00654 rfaG   TRUE 0.484 34.000 0.000 NA   NA
 10268528 10268529 SRM_00654 SRM_00655   rfaG TRUE 0.452 95.000 0.000 NA   NA
 10268529 10268530 SRM_00655 SRM_00656 rfaG rfaG TRUE 0.952 52.000 0.000 0.020 Y NA
 10268530 10268531 SRM_00656 SRM_00657 rfaG wcaA FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268531 10268532 SRM_00657 SRM_00658 wcaA manC FALSE 0.348 -48.000 0.000 NA   NA
 10268533 10268534 SRM_00659 SRM_00660 otsB otsA TRUE 0.986 140.000 0.172 0.001 Y NA
 10268534 10268535 SRM_00660 SRM_00661 otsA   FALSE 0.149 202.000 0.000 NA   NA
 10268535 10268536 SRM_00661 SRM_00662   glpQ TRUE 0.813 59.000 0.000 NA   NA
 10268536 10268537 SRM_00662 SRM_00664 glpQ   FALSE 0.424 13.000 0.000 1.000 N NA
 10268538 10268539 SRM_00663 SRM_00665 alr drrA TRUE 0.629 167.000 0.005 1.000 N NA
 10268539 10268540 SRM_00665 SRM_00666 drrA   TRUE 0.995 68.000 0.109 1.000 Y NA
 10268540 10268541 SRM_00666 SRM_00667   acoA/pdhA TRUE 0.459 114.000 0.000 1.000 N NA
 10268543 10268544 SRM_00669 SRM_00670     FALSE 0.084 273.000 0.000 NA   NA
 10268544 10268545 SRM_00670 SRM_00671   cysD FALSE 0.026 844.000 0.000 NA   NA
 10268545 10268546 SRM_00671 SRM_00672 cysD   TRUE 0.603 81.000 0.000 NA   NA
 10268546 10268547 SRM_00672 SRM_00673     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268547 10268548 SRM_00673 SRM_00674   cysN FALSE 0.300 142.000 0.000 NA   NA
 10268548 10268549 SRM_00674 SRM_00675 cysN   TRUE 0.853 57.000 0.000 1.000   NA
 10268549 10268550 SRM_00675 SRM_00676     FALSE 0.049 489.000 0.000 1.000   NA
 10268550 10268551 SRM_00676 SRM_00677     FALSE 0.040 468.000 0.000 NA   NA
 10268551 10268552 SRM_00677 SRM_00678     TRUE 0.502 36.000 0.000 NA   NA
 10268552 10268553 SRM_00678 SRM_00679     TRUE 0.988 -28.000 0.571 NA   NA
 10268553 10268554 SRM_00679 SRM_00680   rfbB FALSE 0.407 24.000 0.000 NA   NA
 10268554 10268555 SRM_00680 SRM_00681 rfbB rmlA TRUE 0.973 122.000 0.051 0.006 Y NA
 10268555 10268556 SRM_00681 SRM_00682 rmlA rfbC TRUE 0.987 30.000 0.154 1.000 Y NA
 10268556 10268557 SRM_00682 SRM_00683 rfbC rfbD TRUE 0.902 47.000 0.000 1.000 Y NA
 10268557 10268558 SRM_00683 SRM_00684 rfbD wza FALSE 0.380 198.000 0.000 1.000 Y NA
 10268559 10268560 SRM_00685 SRM_00686     FALSE 0.067 319.000 0.000 NA   NA
 10268560 10268561 SRM_00686 SRM_00687     FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10268562 10268563 SRM_00688 SRM_00689     FALSE 0.022 1358.000 0.000 NA   NA
 10268563 10268564 SRM_00689 SRM_00690   xerD FALSE 0.081 321.000 0.000 1.000   NA
 10268564 10268565 SRM_00690 SRM_00691 xerD udg TRUE 0.779 71.000 0.000 1.000 N NA
 10268567 10268568 SRM_00693 SRM_00694   galE TRUE 0.824 64.000 0.000 1.000 N NA
 10268568 10268569 SRM_00694 SRM_00695 galE wecE TRUE 0.992 17.000 0.418 1.000 Y NA
 10268569 10268570 SRM_00695 SRM_00696 wecE spsE TRUE 0.705 1.000 0.000 0.029 Y NA
 10268570 10268571 SRM_00696 SRM_00697 spsE spsF TRUE 0.720 28.000 0.000 1.000 Y NA
 10268571 10268572 SRM_00697 SRM_00698 spsF   FALSE 0.329 1.000 0.000 NA   NA
 10268572 10268573 SRM_00698 SRM_00699   spsE TRUE 0.865 -3.000 0.022 NA   NA
 10268573 10268574 SRM_00699 SRM_00700 spsE   TRUE 0.990 38.000 0.292 1.000   NA
 10268574 10268575 SRM_00700 SRM_00701   manC TRUE 0.966 12.000 0.156 1.000   NA
 10268577 10268578 SRM_00703 SRM_00704 algI dltB TRUE 0.439 97.000 0.000 NA   NA
 10268578 10268579 SRM_00704 SRM_00705 dltB algI FALSE 0.370 17.000 0.000 NA   NA
 10268579 10268580 SRM_00705 SRM_00706 algI   FALSE 0.025 988.000 0.000 NA   NA
 10268580 10268581 SRM_00706 SRM_00707     FALSE 0.034 555.000 0.000 NA   NA
 10268581 10268582 SRM_00707 SRM_00708     FALSE 0.022 1807.000 0.000 NA   NA
 10268582 10268583 SRM_00708 SRM_00709   wcaA FALSE 0.041 465.000 0.000 NA   NA
 10268583 10268584 SRM_00709 SRM_00710 wcaA   FALSE 0.021 2502.000 0.000 NA   NA
 10268586 10268587 SRM_00712 SRM_00713   rfaG TRUE 0.577 38.000 0.000 1.000   NA
 10268587 10268588 SRM_00713 SRM_00714 rfaG   TRUE 0.849 58.000 0.000 1.000   NA
 10268588 10268589 SRM_00714 SRM_00715   lspL TRUE 0.736 74.000 0.000 1.000   NA
 10268589 10268590 SRM_00715 SRM_00716 lspL wcaG TRUE 0.890 80.000 0.000 0.012 Y NA
 10268592 10268593 SRM_00718 SRM_00719 tuaD   FALSE 0.369 123.000 0.000 NA   NA
 10268593 10268594 SRM_00719 SRM_00720     TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10268595 10268596 SRM_00721 SRM_00722     FALSE 0.065 328.000 0.000 NA   NA
 10268597 10268598 SRM_00723 SRM_00724     FALSE 0.032 588.000 0.000 NA   NA
 10268598 10268599 SRM_00724 SRM_00725     FALSE 0.288 146.000 0.000 NA   NA
 10268599 10268600 SRM_00725 SRM_00726     FALSE 0.128 218.000 0.000 NA   NA
 10268600 10268601 SRM_00726 SRM_00727     TRUE 0.977 -3.000 0.318 NA   NA
 10268601 10268602 SRM_00727 SRM_00728     FALSE 0.093 260.000 0.000 NA   NA
 10268602 10268603 SRM_00728 SRM_00729     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268603 10268604 SRM_00729 SRM_00730     FALSE 0.023 1152.000 0.000 NA   NA
 10268606 10268607 SRM_00732 SRM_00733     TRUE 0.943 -3.000 0.093 NA   NA
 10268610 10268611 SRM_00736 SRM_00737     FALSE 0.293 145.000 0.000 NA   NA
 10268611 10268612 SRM_00737 SRM_00738     FALSE 0.055 367.000 0.000 NA   NA
 10268612 10268613 SRM_00738 SRM_00739     TRUE 0.997 44.000 0.636 NA   NA
 10268613 10268614 SRM_00739 SRM_00740     FALSE 0.297 143.000 0.000 NA   NA
 10268614 10268615 SRM_00740 SRM_00741     FALSE 0.155 218.000 0.000 1.000   NA
 10268615 10268616 SRM_00741 SRM_00742     FALSE 0.056 365.000 0.000 NA   NA
 10268617 10268618 SRM_00743 SRM_00744     TRUE 0.571 84.000 0.000 NA   NA
 10268619 10268620 SRM_00745 SRM_00746     TRUE 0.503 90.000 0.000 NA   NA
 10268620 10268621 SRM_00746 SRM_00747     FALSE 0.039 494.000 0.000 NA   NA
 10268621 10268622 SRM_00747 SRM_00748     FALSE 0.425 100.000 0.000 NA   NA
 10268622 10268623 SRM_00748 SRM_00749     FALSE 0.026 891.000 0.000 NA   NA
 10268623 10268624 SRM_00749 SRM_00750     TRUE 0.596 4.000 0.000 NA Y NA
 10268624 10268625 SRM_00750 SRM_00751     TRUE 0.607 163.000 0.000 0.012 Y NA
 10268627 10268628 SRM_00753 SRM_00754     FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10268628 10268629 SRM_00754 SRM_00755     FALSE 0.228 164.000 0.000 NA   NA
 10268629 10268630 SRM_00755 SRM_00757     TRUE 0.824 56.000 0.000 NA   NA
 10268631 10268632 SRM_00756 SRM_00758     FALSE 0.240 159.000 0.000 NA   NA
 10268632 10268633 SRM_00758 SRM_00759     FALSE 0.337 135.000 0.000 NA   NA
 10268633 10268634 SRM_00759 SRM_00760     FALSE 0.386 114.000 0.000 NA   NA
 10268634 10268635 SRM_00760 SRM_00761     FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10268635 10268636 SRM_00761 SRM_00762     FALSE 0.405 109.000 0.000 NA   NA
 10268636 10268637 SRM_00762 SRM_00763     TRUE 0.819 58.000 0.000 NA   NA
 10268637 10268638 SRM_00763 SRM_00764     TRUE 0.990 11.000 0.667 NA   NA
 10268638 10268639 SRM_00764 SRM_00765     FALSE 0.368 124.000 0.000 NA   NA
 10268641 10268642 SRM_00767 SRM_00768     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268645 10268646 SRM_00771 SRM_00772     FALSE 0.394 -31.000 0.000 1.000   NA
 10268646 10268647 SRM_00772 SRM_00773     TRUE 0.955 -3.000 0.133 NA   NA
 10268647 10268648 SRM_00773 SRM_00774     FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10268648 10268649 SRM_00774 SRM_00776     TRUE 0.993 -36.000 0.400 0.011 Y NA
 10268650 10268651 SRM_00775 SRM_00777     FALSE 0.042 460.000 0.000 NA   NA
 10268651 10268652 SRM_00777 SRM_00778     FALSE 0.109 238.000 0.000 NA   NA
 10268654 10268655 SRM_00780 SRM_00781     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268657 10268658 SRM_00783 SRM_00784     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268659 10268660 SRM_00785 SRM_00786   xerD FALSE 0.334 5.000 0.000 NA   NA
 10268660 10268661 SRM_00786 SRM_00787 xerD   FALSE 0.096 398.000 0.000 0.058   NA
 10268664 10268665 SRM_00790 SRM_00791     FALSE 0.329 1.000 0.000 NA   NA
 10268665 10268666 SRM_00791 SRM_00792     FALSE 0.337 135.000 0.000 NA   NA
 10268666 10268667 SRM_00792 SRM_00793     FALSE 0.195 178.000 0.000 NA   NA
 10268668 10268669 SRM_00794 SRM_00795     TRUE 0.996 64.000 0.273 1.000   NA
 10268670 10268671 SRM_00796 SRM_00797     FALSE 0.336 -16.000 0.000 NA   NA
 10268672 10268673 SRM_00798 SRM_00799 nusG   FALSE 0.050 467.000 0.000 1.000   NA
 10268673 10268674 SRM_00799 SRM_00800     TRUE 0.558 85.000 0.000 NA   NA
 10268674 10268675 SRM_00800 SRM_00801     FALSE 0.180 185.000 0.000 NA   NA
 10268676 10268677 SRM_00802 SRM_00803     FALSE 0.177 186.000 0.000 NA   NA
 10268679 10268680 SRM_00804 SRM_00806     FALSE 0.157 197.000 0.000 NA   NA
 10268680 10268681 SRM_00806 SRM_00807     FALSE 0.331 -7.000 0.000 NA   NA
 10268681 10268682 SRM_00807 SRM_00808     TRUE 0.759 49.000 0.000 NA   NA
 10268682 10268683 SRM_00808 SRM_00809     FALSE 0.058 353.000 0.000 NA   NA
 10268683 10268684 SRM_00809 SRM_00810     FALSE 0.087 268.000 0.000 NA   NA
 10268684 10268685 SRM_00810 SRM_00811     TRUE 0.596 4.000 0.000 NA Y NA
 10268685 10268686 SRM_00811 SRM_00812     TRUE 0.759 49.000 0.000 NA   NA
 10268686 10268687 SRM_00812 SRM_00813     FALSE 0.097 252.000 0.000 NA   NA
 10268687 10268688 SRM_00813 SRM_00814     TRUE 0.976 123.000 0.250 NA   NA
 10268688 10268689 SRM_00814 SRM_00815     FALSE 0.204 173.000 0.000 NA   NA
 10268689 10268690 SRM_00815 SRM_00816     TRUE 0.822 55.000 0.000 NA   NA
 10268690 10268691 SRM_00816 SRM_00817     TRUE 0.968 -3.000 0.212 NA   NA
 10268691 10268692 SRM_00817 SRM_00818   galE FALSE 0.349 -58.000 0.000 NA   NA
 10268692 10268693 SRM_00818 SRM_00819 galE   FALSE 0.204 173.000 0.000 NA   NA
 10268693 10268694 SRM_00819 SRM_00820     FALSE 0.393 112.000 0.000 NA   NA
 10268694 10268695 SRM_00820 SRM_00821   pheA FALSE 0.068 367.000 0.000 1.000   NA
 10268695 10268696 SRM_00821 SRM_00822 pheA   TRUE 0.511 89.000 0.000 NA   NA
 10268698 10268699 SRM_00824 SRM_00825 strD mutS2 FALSE 0.092 307.000 0.000 1.000 N NA
 10268699 10268700 SRM_00825 SRM_00826 mutS2   TRUE 0.617 171.000 0.005 1.000 N NA
 10268700 10268701 SRM_00826 SRM_00827     TRUE 0.967 185.000 0.500 NA   NA
 10268701 10268702 SRM_00827 SRM_00828   ntrB TRUE 0.998 67.000 0.500 NA   NA
 10268704 10268705 SRM_00830 SRM_00831     TRUE 0.999 52.000 1.000 NA   NA
 10268706 10268707 SRM_00832 SRM_00833     FALSE 0.040 469.000 0.000 NA   NA
 10268707 10268708 SRM_00833 SRM_00834     TRUE 0.822 55.000 0.000 NA   NA
 10268708 10268709 SRM_00834 SRM_00835   treZ FALSE 0.108 240.000 0.000 NA   NA
 10268709 10268710 SRM_00835 SRM_00836 treZ malQ TRUE 0.789 106.000 0.000 0.005 Y NA
 10268710 10268711 SRM_00836 SRM_00837 malQ   FALSE 0.371 121.000 0.000 NA   NA
 10268711 10268712 SRM_00837 SRM_00838     FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10268712 10268713 SRM_00838 SRM_00839   aroK FALSE 0.401 110.000 0.000 NA   NA
 10268714 10268715 SRM_00840 SRM_00841 truA   FALSE 0.370 122.000 0.000 NA   NA
 10268715 10268716 SRM_00841 SRM_00842   arcA TRUE 0.742 69.000 0.000 NA   NA
 10268716 10268717 SRM_00842 SRM_00843 arcA trxB FALSE 0.263 172.000 0.000 1.000 N NA
 10268717 10268718 SRM_00843 SRM_00844 trxB   FALSE 0.047 426.000 0.000 NA   NA
 10268719 10268720 SRM_00845 SRM_00846 serA sucD TRUE 0.442 151.000 0.000 0.050 N NA
 10268720 10268721 SRM_00846 SRM_00847 sucD gatA TRUE 0.449 307.000 0.014 1.000 N NA
 10268721 10268722 SRM_00847 SRM_00848 gatA tatB TRUE 0.889 94.000 0.011 1.000 N NA
 10268723 10268724 SRM_00849 SRM_00850 add aroA FALSE 0.089 318.000 0.000 1.000 N NA
 10268727 10268728 SRM_00853 SRM_00854 usp   TRUE 0.869 45.000 0.000 1.000 Y NA
 10268728 10268729 SRM_00854 SRM_00855   fixL TRUE 0.483 196.000 0.000 0.028 Y NA
 10268730 10268731 SRM_00856 SRM_00857   ldh TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10268732 10268733 SRM_00858 SRM_00859 ispG   TRUE 0.602 133.000 0.002 1.000   NA
 10268733 10268734 SRM_00859 SRM_00860     FALSE 0.135 304.000 0.000 0.047   NA
 10268735 10268736 SRM_00861 SRM_00862   mcpA TRUE 0.958 52.000 0.005 1.000   NA
 10268736 10268737 SRM_00862 SRM_00863 mcpA sbcD TRUE 0.782 28.000 0.004 1.000 N NA
 10268737 10268738 SRM_00863 SRM_00864 sbcD   FALSE 0.421 101.000 0.000 NA   NA
 10268739 10268740 SRM_00865 SRM_00866 ispE thrB TRUE 0.862 73.000 0.000 0.003 N NA
 10268740 10268741 SRM_00866 SRM_00867 thrB metL TRUE 0.967 152.000 0.133 1.000 Y NA
 10268741 10268742 SRM_00867 SRM_00868 metL punA TRUE 0.479 109.000 0.000 1.000 N NA
 10268742 10268743 SRM_00868 SRM_00869 punA   TRUE 0.835 55.000 0.000 NA N NA
 10268743 10268744 SRM_00869 SRM_00870     FALSE 0.172 190.000 0.000 NA   NA
 10268744 10268745 SRM_00870 SRM_00871     FALSE 0.269 150.000 0.000 NA   NA
 10268745 10268746 SRM_00871 SRM_00872     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10268746 10268747 SRM_00872 SRM_00873     FALSE 0.303 147.000 0.000 NA N NA
 10268747 10268748 SRM_00873 SRM_00874     TRUE 0.750 68.000 0.000 NA   NA
 10268748 10268749 SRM_00874 SRM_00875     FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10268749 10268750 SRM_00875 SRM_00876     FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10268750 10268751 SRM_00876 SRM_00877     TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10268751 10268752 SRM_00877 SRM_00878   phnD FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268753 10268754 SRM_00879 SRM_00880     FALSE 0.104 272.000 0.000 1.000   NA
 10268754 10268755 SRM_00880 SRM_00881   trkA TRUE 0.707 76.000 0.000 1.000   NA
 10268756 10268757 SRM_00882 SRM_00883     FALSE 0.112 235.000 0.000 NA   NA
 10268757 10268758 SRM_00883 SRM_00884     TRUE 0.484 34.000 0.000 NA   NA
 10268758 10268759 SRM_00884 SRM_00885     TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10268759 10268760 SRM_00885 SRM_00886     FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10268764 10268765 SRM_00890 SRM_00891 adh   FALSE 0.288 146.000 0.000 NA   NA
 10268766 10268767 SRM_00892 SRM_00893   rpsJ FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10268767 10268768 SRM_00893 SRM_00894 rpsJ dnaQ FALSE 0.419 132.000 0.000 1.000 N NA
 10268768 10268769 SRM_00894 SRM_00895 dnaQ ssb TRUE 0.496 165.000 0.000 1.000 Y NA
 10268769 10268770 SRM_00895 SRM_00896 ssb hutH FALSE 0.238 181.000 0.000 1.000 N NA
 10268770 10268771 SRM_00896 SRM_00897 hutH pcrA TRUE 0.817 65.000 0.000 1.000 N NA
 10268772 10268773 SRM_00898 SRM_00899     FALSE 0.336 6.000 0.000 NA   NA
 10268773 10268774 SRM_00899 SRM_00900     FALSE 0.348 11.000 0.000 NA   NA
 10268777 10268778 SRM_00903 SRM_00904     TRUE 0.999 58.000 0.597 NA N NA
 10268779 10268780 SRM_00905 SRM_00906 hisG hisIE TRUE 0.979 125.000 0.081 0.004 Y NA
 10268783 10268784 SRM_00909 SRM_00910     FALSE 0.370 122.000 0.000 NA   NA
 10268787 10268788 SRM_00913 SRM_00914   xseA FALSE 0.293 145.000 0.000 NA   NA
 10268789 10268790 SRM_00915 SRM_00916 stp1   TRUE 0.868 77.000 0.003 NA N NA
 10268791 10268792 SRM_00917 SRM_00918     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10268792 10268793 SRM_00918 SRM_00919   brp TRUE 0.823 57.000 0.000 NA   NA
 10268793 10268794 SRM_00919 SRM_00920 brp crtI TRUE 0.996 39.000 0.714 1.000   NA
 10268795 10268796 SRM_00921 SRM_00922   hemN TRUE 0.776 49.000 0.000 NA N NA
 10268796 10268797 SRM_00922 SRM_00923 hemN   FALSE 0.033 783.000 0.000 1.000   NA
 10268797 10268798 SRM_00923 SRM_00924     FALSE 0.373 119.000 0.000 NA   NA
 10268799 10268800 SRM_00925 SRM_00926 lytR   TRUE 0.888 43.000 0.000 0.028 Y NA
 10268800 10268801 SRM_00926 SRM_00927     TRUE 0.706 44.000 0.000 1.000 N NA
 10268801 10268802 SRM_00927 SRM_00928     TRUE 0.705 25.000 0.000 1.000 Y NA
 10268802 10268803 SRM_00928 SRM_00929     TRUE 0.608 40.000 0.000 1.000   NA
 10268803 10268804 SRM_00929 SRM_00930     TRUE 0.998 58.000 0.422 1.000   NA
 10268804 10268805 SRM_00930 SRM_00932     FALSE 0.123 224.000 0.000 NA   NA
 10268807 10268808 SRM_00933 SRM_00934 bioB   FALSE 0.061 344.000 0.000 NA   NA
 10268809 10268810 SRM_00935 SRM_00936     FALSE 0.157 197.000 0.000 NA   NA
 10268810 10268811 SRM_00936 SRM_00937     FALSE 0.116 230.000 0.000 NA   NA
 10268811 10268812 SRM_00937 SRM_00938   orfB TRUE 0.960 99.000 0.087 NA   NA
 10268812 10268813 SRM_00938 SRM_00939 orfB   FALSE 0.392 21.000 0.000 NA   NA
 10268813 10268814 SRM_00939 SRM_00940   folB TRUE 0.821 60.000 0.000 NA N NA
 10268815 10268816 SRM_00941 SRM_00942 guaA yceF FALSE 0.416 112.000 0.000 NA N NA
 10268818 10268819 SRM_00944 SRM_00945     TRUE 0.970 4.000 0.227 NA   NA
 10268821 10268822 SRM_00947 SRM_00948     TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10268822 10268823 SRM_00948 SRM_00949     FALSE 0.035 523.000 0.000 NA   NA
 10268823 10268824 SRM_00949 SRM_00950     FALSE 0.225 165.000 0.000 NA   NA
 10268824 10268825 SRM_00950 SRM_00951     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10268826 10268827 SRM_00952 SRM_00953     TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10268827 10268828 SRM_00953 SRM_00954   glyA FALSE 0.231 163.000 0.000 NA   NA
 10268828 10268829 SRM_00954 SRM_00955 glyA pyrE TRUE 0.914 99.000 0.020 1.000 N NA
 10268829 10268830 SRM_00955 SRM_00956 pyrE tatC TRUE 0.969 58.000 0.008 NA N NA
 10268830 10268831 SRM_00956 SRM_00957 tatC prc TRUE 0.896 40.000 0.008 NA N NA
 10268831 10268832 SRM_00957 SRM_00958 prc   TRUE 0.797 61.000 0.000 NA   NA
 10268832 10268833 SRM_00958 SRM_00959   ubiE FALSE 0.353 131.000 0.000 NA   NA
 10268833 10268834 SRM_00959 SRM_00960 ubiE   TRUE 0.645 82.000 0.000 1.000   NA
 10268834 10268835 SRM_00960 tRNA_8     FALSE 0.269 150.000 0.000 NA   NA
 10268836 10268837 SRM_00961 SRM_00962 usp   FALSE 0.079 300.000 0.000 NA N NA
 10268837 10268838 SRM_00962 SRM_00963   glcK TRUE 0.878 -196.000 0.020 NA N NA
 10268838 10268839 SRM_00963 SRM_00964 glcK ftsB TRUE 0.859 85.000 0.004 1.000   NA
 10268839 10268840 SRM_00964 SRM_00965 ftsB eno2 TRUE 0.977 16.000 0.241 1.000   NA
 10268840 10268841 SRM_00965 SRM_00966 eno2   FALSE 0.112 261.000 0.000 1.000   NA
 10268841 10268842 SRM_00966 SRM_00967     FALSE 0.342 134.000 0.000 NA   NA
 10268842 10268843 SRM_00967 SRM_00968     FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10268843 10268844 SRM_00968 SRM_00969   glgA FALSE 0.356 130.000 0.000 NA   NA
 10268845 10268846 SRM_00970 SRM_00971     TRUE 0.734 70.000 0.000 NA   NA
 10268847 10268848 SRM_00972 SRM_00973     FALSE 0.425 100.000 0.000 NA   NA
 10268848 10268849 SRM_00973 SRM_00974   lipA FALSE 0.091 263.000 0.000 NA   NA
 10268849 10268850 SRM_00974 SRM_00975 lipA   FALSE 0.146 234.000 0.000 1.000 N NA
 10268851 10268852 SRM_00976 SRM_00977   argD TRUE 0.636 83.000 0.000 1.000   NA
 10268853 10268854 SRM_00978 SRM_00979 recN secA FALSE 0.378 140.000 0.000 1.000 N NA
 10268857 10268858 SRM_00982 SRM_00983   corA TRUE 0.571 84.000 0.000 NA   NA
 10268858 10268859 SRM_00983 SRM_00984 corA   FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10268859 10268860 SRM_00984 SRM_00985     FALSE 0.188 181.000 0.000 NA   NA
 10268861 10268862 SRM_00986 SRM_00987     TRUE 0.789 62.000 0.000 NA   NA
 10268862 10268863 SRM_00987 SRM_00988     TRUE 0.991 41.000 0.292 NA   NA
 10268867 10268868 SRM_00992 SRM_00993 pth rplY TRUE 0.996 101.000 0.496 0.027 Y NA
 10268868 10268869 SRM_00993 SRM_00994 rplY prs TRUE 0.937 137.000 0.074 1.000 N NA
 10268869 10268870 SRM_00994 tRNA_9 prs   FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10268870 10268871 tRNA_9 SRM_00995   eif2BA FALSE 0.274 149.000 0.000 NA   NA
 10268872 10268873 SRM_00996 SRM_00997     FALSE 0.247 172.000 0.000 1.000   NA
 10268874 10268875 SRM_00998 SRM_00999   mrp TRUE 0.912 146.000 0.050 1.000 N NA
 10268875 10268876 SRM_00999 SRM_01000 mrp   FALSE 0.109 249.000 0.000 NA N NA
 10268876 10268877 SRM_01000 SRM_01001   prmA TRUE 0.920 -39.000 0.044 NA N NA
 10268877 10268878 SRM_01001 SRM_01002 prmA ubiE TRUE 0.495 26.000 0.000 1.000 N NA
 10268880 10268881 SRM_01004 SRM_01005 pfkA   TRUE 0.851 -37.000 0.017 NA   NA
 10268881 10268882 SRM_01005 SRM_01006   aat TRUE 0.681 -7.000 0.004 NA   NA
 10268883 10268884 SRM_01007 SRM_01008 pyc dfrA TRUE 0.478 27.000 0.000 1.000   NA
 10268885 10268886 SRM_01009 SRM_01010     TRUE 0.484 34.000 0.000 NA   NA
 10268886 10268887 SRM_01010 SRM_01012     FALSE 0.154 198.000 0.000 NA   NA
 10268888 10268889 SRM_01011 SRM_01013     TRUE 0.806 60.000 0.000 NA   NA
 10268890 10268891 SRM_01014 SRM_01015 mcpA   FALSE 0.162 370.000 0.000 1.000 Y NA
 10268891 10268892 SRM_01015 SRM_01016     FALSE 0.033 577.000 0.000 NA   NA
 10268893 10268894 SRM_01017 SRM_01018     FALSE 0.303 282.000 0.000 0.020 Y NA
 10268896 10268897 SRM_01019 SRM_01021   hisS TRUE 0.978 65.000 0.018 1.000 N NA
 10268897 10268898 SRM_01021 SRM_01022 hisS   FALSE 0.348 -46.000 0.000 NA   NA
 10268898 10268899 SRM_01022 SRM_01023     TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10268900 10268901 SRM_01024 SRM_01025     FALSE 0.336 -16.000 0.000 NA   NA
 10268901 10268902 SRM_01025 SRM_01026     TRUE 0.523 38.000 0.000 NA   NA
 10268902 10268903 SRM_01026 SRM_01027     TRUE 0.619 79.000 0.000 NA   NA
 10268903 10268904 SRM_01027 SRM_01028     TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10268904 10268905 SRM_01028 SRM_01029   glgB FALSE 0.200 175.000 0.000 NA   NA
 10268905 10268906 SRM_01029 SRM_01030 glgB treS TRUE 0.996 48.000 0.075 0.005 Y NA
 10268906 10268907 SRM_01030 SRM_01031 treS   TRUE 0.995 92.000 0.544 0.005   NA
 10268908 10268909 SRM_01032 SRM_01033 glgX gfo FALSE 0.359 140.000 0.000 1.000   NA
 10268909 10268910 SRM_01033 SRM_01034 gfo   FALSE 0.092 291.000 0.000 1.000   NA
 10268910 10268911 SRM_01034 SRM_01035     FALSE 0.383 -12.000 0.000 1.000   NA
 10268912 10268913 SRM_01036 SRM_01037     FALSE 0.044 447.000 0.000 NA   NA
 10268913 10268914 SRM_01037 SRM_01038   trkA TRUE 0.640 44.000 0.000 NA   NA
 10268914 10268915 SRM_01038 SRM_01039 trkA   FALSE 0.315 139.000 0.000 NA   NA
 10268915 10268916 SRM_01039 tRNA_10     FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10268916 10268917 tRNA_10 SRM_01040     TRUE 0.523 88.000 0.000 NA   NA
 10268918 10268919 SRM_01041 SRM_01042 dnaX   TRUE 0.823 62.000 0.000 1.000   NA
 10268919 10268920 SRM_01042 SRM_01043     FALSE 0.386 114.000 0.000 NA   NA
 10268920 10268921 SRM_01043 SRM_01044     TRUE 0.996 46.000 0.357 NA   NA
 10268921 10268922 SRM_01044 SRM_01045     FALSE 0.427 18.000 0.000 1.000   NA
 10268923 10268924 SRM_01046 SRM_01047 groS   FALSE 0.244 158.000 0.000 NA   NA
 10268924 10268925 SRM_01047 SRM_01048   nagB FALSE 0.353 131.000 0.000 NA   NA
 10268925 10268926 SRM_01048 SRM_01049 nagB   TRUE 0.438 16.000 0.000 1.000 N NA
 10268926 10268927 SRM_01049 SRM_01050     FALSE 0.359 129.000 0.000 NA   NA
 10268927 10268928 SRM_01050 SRM_01051     TRUE 0.988 75.000 0.125 NA   NA
 10268928 10268929 SRM_01051 SRM_01052   btuF FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10268929 10268930 SRM_01052 SRM_01053 btuF   TRUE 0.894 22.000 0.021 NA   NA
 10268930 10268931 SRM_01053 SRM_01054     TRUE 0.824 56.000 0.000 NA   NA
 10268931 10268932 SRM_01054 SRM_01055   btuB FALSE 0.353 13.000 0.000 NA   NA
 10268932 10268933 SRM_01055 SRM_01056 btuB   FALSE 0.029 667.000 0.000 NA   NA
 10268935 10268936 SRM_01058 SRM_01059     TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10268936 10268937 SRM_01059 SRM_01060     FALSE 0.424 27.000 0.000 NA   NA
 10268937 10268938 SRM_01060 SRM_01061     FALSE 0.120 226.000 0.000 NA   NA
 10268938 10268939 SRM_01061 SRM_01062     FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10268939 10268940 SRM_01062 SRM_01063     FALSE 0.413 105.000 0.000 NA   NA
 10268940 10268941 SRM_01063 SRM_01064     FALSE 0.157 197.000 0.000 NA   NA
 10268941 10268942 SRM_01064 SRM_01065     FALSE 0.140 209.000 0.000 NA   NA
 10268945 10268946 SRM_01067 SRM_01069   sun TRUE 0.631 78.000 0.000 NA   NA
 10268946 10268947 SRM_01069 SRM_01070 sun   TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10268951 10268952 SRM_01073 SRM_01075     TRUE 0.531 -3.000 0.000 0.007   NA
 10268953 10268954 SRM_01076 SRM_01077   ligA FALSE 0.315 139.000 0.000 NA   NA
 10268955 10268956 SRM_01078 SRM_01079   smc FALSE 0.083 275.000 0.000 NA   NA
 10268956 10268957 SRM_01079 SRM_01080 smc   TRUE 0.862 55.000 0.000 1.000 N NA
 10268958 10268959 SRM_01081 SRM_01082     TRUE 0.799 52.000 0.000 NA   NA
 10268959 10268960 SRM_01082 SRM_01083     FALSE 0.132 215.000 0.000 NA   NA
 10268960 10268961 SRM_01083 SRM_01084     TRUE 0.640 44.000 0.000 NA   NA
 10268962 10268963 SRM_01085 SRM_01086     FALSE 0.348 11.000 0.000 NA   NA
 10268965 10268966 SRM_01088 SRM_01089 ggt   FALSE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10268967 10268968 SRM_01090 SRM_01091 purF   FALSE 0.036 651.000 0.000 1.000   NA
 10268968 10268969 SRM_01091 SRM_01092     TRUE 0.588 -156.000 0.000 0.001   NA
 10268969 10268970 SRM_01092 SRM_01093     FALSE 0.172 190.000 0.000 NA   NA
 10268970 10268971 SRM_01093 SRM_01094   ald FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10268972 10268973 SRM_01095 SRM_01096     TRUE 0.793 126.000 0.008 NA   NA
 10268973 10268974 SRM_01096 SRM_01097   lysS FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10268975 10268976 SRM_01098 SRM_01099   rpsT FALSE 0.080 327.000 0.000 1.000   NA
 10268977 10268978 SRM_01100 SRM_01101     TRUE 0.997 51.000 0.161 NA Y NA
 10268978 10268979 SRM_01101 SRM_01102     TRUE 0.987 52.000 0.038 NA   NA
 10268979 10268980 SRM_01102 SRM_01103     FALSE 0.138 210.000 0.000 NA   NA
 10268980 10268981 SRM_01103 SRM_01104   atpB TRUE 0.799 52.000 0.000 NA   NA
 10268981 10268982 SRM_01104 SRM_01105 atpB atpH TRUE 0.995 100.000 0.628 0.004   NA
 10268982 10268983 SRM_01105 SRM_01106 atpH atpF TRUE 0.955 231.000 0.402 0.004   NA
 10268983 10268984 SRM_01106 SRM_01107 atpF atpH TRUE 0.999 58.000 0.222 0.004 Y NA
 10268984 10268985 SRM_01107 SRM_01108 atpH atpA TRUE 1.000 60.000 0.864 0.004 Y NA
 10268985 10268986 SRM_01108 SRM_01109 atpA atpG TRUE 0.995 153.000 0.846 0.004 Y NA
 10268986 10268987 SRM_01109 tRNA_11 atpG   TRUE 0.482 92.000 0.000 NA   NA
 10268987 10268988 tRNA_11 SRM_01110     TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10268988 10268989 SRM_01110 SRM_01111   recD TRUE 0.804 65.000 0.000 1.000   NA
 10268990 10268991 SRM_01112 SRM_01113 rDP fecB TRUE 0.931 -3.000 0.056 1.000 N NA
 10268993 10268994 SRM_01115 SRM_01116 murC   TRUE 0.777 12.000 0.007 1.000   NA
 10268994 10268995 SRM_01116 SRM_01117     TRUE 0.482 92.000 0.000 NA   NA
 10268995 10268996 SRM_01117 SRM_01118   acrB FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268996 10268997 SRM_01118 SRM_01119 acrB   TRUE 0.995 -124.000 0.889 0.098   NA
 10268997 10268998 SRM_01119 SRM_01120     TRUE 0.995 57.000 0.049 1.000 Y NA
 10268998 10268999 SRM_01120 SRM_01121     TRUE 0.955 38.000 0.033 1.000 N NA
 10268999 10269000 SRM_01121 SRM_01122   ubiB FALSE 0.074 297.000 0.000 NA   NA
 10269000 10269001 SRM_01122 SRM_01123 ubiB   TRUE 0.975 156.000 0.435 NA   NA
 10269001 10269002 SRM_01123 SRM_01124   TST FALSE 0.226 180.000 0.000 1.000   NA
 10269002 10269003 SRM_01124 SRM_01125 TST   FALSE 0.349 -49.000 0.000 NA   NA
 10269004 10269005 SRM_01126 SRM_01127 leuS   TRUE 0.448 11.000 0.002 NA   NA
 10269005 10269006 SRM_01127 SRM_01128   efp FALSE 0.287 173.000 0.002 NA   NA
 10269006 10269007 SRM_01128 SRM_01129 efp accB TRUE 0.991 46.000 0.120 1.000 N NA
 10269009 10269010 SRM_01131 SRM_01132 accC aspB FALSE 0.389 137.000 0.000 1.000 N NA
 10269010 10269011 SRM_01132 SRM_01133 aspB   TRUE 0.980 64.000 0.022 1.000   NA
 10269011 10269012 SRM_01133 SRM_01134     TRUE 0.985 58.000 0.023 NA   NA
 10269012 10269013 SRM_01134 SRM_01135     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269013 10269014 SRM_01135 SRM_01136     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269015 10269016 SRM_01137 SRM_01138     TRUE 0.939 91.000 0.029 NA   NA
 10269017 10269018 SRM_01139 SRM_01140     FALSE 0.430 99.000 0.000 NA   NA
 10269018 10269019 SRM_01140 SRM_01141     TRUE 0.707 76.000 0.000 1.000   NA
 10269022 10269023 SRM_01143 SRM_01144 polC   TRUE 0.758 67.000 0.000 NA   NA
 10269023 10269024 SRM_01144 SRM_01145   soj FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10269024 10269025 SRM_01145 SRM_01146 soj   FALSE 0.110 236.000 0.000 NA   NA
 10269026 10269027 SRM_01147 SRM_01148 folK dck TRUE 0.972 86.000 0.063 1.000 N NA
 10269027 10269028 SRM_01148 SRM_01149 dck   FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10269030 10269031 SRM_01151 SRM_01152 carA carB TRUE 0.994 121.000 0.345 0.001 Y NA
 10269031 10269032 SRM_01152 SRM_01153 carB   FALSE 0.169 192.000 0.000 NA   NA
 10269032 10269033 SRM_01153 SRM_01154   psd FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10269033 10269034 SRM_01154 SRM_01155 psd pssA TRUE 0.993 17.000 0.466 1.000 Y NA
 10269034 10269035 SRM_01155 SRM_01156 pssA purL TRUE 0.990 56.000 0.040 1.000 N NA
 10269035 10269036 SRM_01156 SRM_01157 purL clpS TRUE 0.571 84.000 0.000 NA   NA
 10269043 10269044 SRM_01164 SRM_01165   guaA TRUE 0.980 46.000 0.044 NA   NA
 10269044 10269045 SRM_01165 SRM_01166 guaA   FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 10269045 10269046 SRM_01166 SRM_01167     FALSE 0.405 109.000 0.000 NA   NA
 10269046 10269047 SRM_01167 SRM_01168   guaA TRUE 0.456 23.000 0.000 1.000   NA
 10269048 10269049 SRM_01169 SRM_01170     FALSE 0.336 6.000 0.000 NA   NA
 10269049 10269050 SRM_01170 SRM_01171     FALSE 0.390 113.000 0.000 NA   NA
 10269051 10269052 SRM_01172 SRM_01173   dnaE2 FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269052 10269053 SRM_01173 SRM_01174 dnaE2 xylA FALSE 0.104 272.000 0.000 1.000   NA
 10269053 10269054 SRM_01174 SRM_01175 xylA glpK TRUE 0.933 3.000 0.038 0.011   NA
 10269054 10269055 SRM_01175 SRM_01176 glpK   FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269060 10269061 SRM_01181 SRM_01182 lepB   TRUE 0.523 38.000 0.000 NA   NA
 10269061 10269062 SRM_01182 SRM_01183     FALSE 0.138 210.000 0.000 NA   NA
 10269062 10269063 SRM_01183 SRM_01184     TRUE 0.655 83.000 0.000 1.000 N NA
 10269063 10269064 SRM_01184 SRM_01185   cysA FALSE 0.045 550.000 0.000 1.000 N NA
 10269064 10269065 SRM_01185 SRM_01186 cysA   FALSE 0.198 184.000 0.000 NA N NA
 10269065 10269066 SRM_01186 SRM_01187     TRUE 0.967 187.000 0.283 NA Y NA
 10269068 10269069 SRM_01189 SRM_01190     FALSE 0.086 269.000 0.000 NA   NA
 10269070 10269071 SRM_01191 SRM_01193   ubiG FALSE 0.376 -3.000 0.000 1.000   NA
 10269072 10269073 SRM_01192 SRM_01194   rfaG TRUE 0.960 -3.000 0.158 NA   NA
 10269073 10269074 SRM_01194 SRM_01195 rfaG   FALSE 0.251 156.000 0.000 NA   NA
 10269074 10269075 SRM_01195 SRM_01196     FALSE 0.388 7.000 0.000 1.000   NA
 10269078 10269079 SRM_01199 SRM_01200     TRUE 0.768 41.000 0.000 0.004   NA
 10269080 10269081 SRM_01201 SRM_01202     FALSE 0.150 201.000 0.000 NA   NA
 10269081 10269082 SRM_01202 SRM_01203   pdxA TRUE 0.774 70.000 0.000 1.000   NA
 10269082 10269083 SRM_01203 SRM_01204 pdxA ftsE TRUE 0.903 28.000 0.017 1.000 N NA
 10269083 10269084 SRM_01204 SRM_01205 ftsE   FALSE 0.293 145.000 0.000 NA   NA
 10269086 10269087 SRM_01207 SRM_01208     FALSE 0.342 -27.000 0.000 NA   NA
 10269087 10269088 SRM_01208 SRM_01209     TRUE 0.776 64.000 0.000 NA   NA
 10269089 10269090 SRM_01210 SRM_01211   hemB TRUE 0.816 95.000 0.005 1.000   NA
 10269090 10269091 SRM_01211 SRM_01212 hemB cysS TRUE 0.763 93.000 0.003 1.000 N NA
 10269091 10269092 SRM_01212 SRM_01213 cysS   FALSE 0.378 1.000 0.000 1.000   NA
 10269092 10269093 SRM_01213 SRM_01214     FALSE 0.331 -7.000 0.000 NA   NA
 10269093 10269094 SRM_01214 SRM_01215     TRUE 0.734 70.000 0.000 NA   NA
 10269096 10269097 SRM_01217 SRM_01218 putP   FALSE 0.338 7.000 0.000 NA   NA
 10269097 10269098 SRM_01218 SRM_01219     TRUE 0.823 57.000 0.000 NA   NA
 10269098 10269099 SRM_01219 SRM_01220     TRUE 0.832 51.000 0.000 1.000 N NA
 10269102 10269103 SRM_01223 SRM_01224     TRUE 0.992 84.000 0.333 NA   NA
 10269103 10269104 SRM_01224 SRM_01225     TRUE 0.734 70.000 0.000 NA   NA
 10269104 10269105 SRM_01225 SRM_01226   SpoIVFB FALSE 0.177 186.000 0.000 NA   NA
 10269105 10269106 SRM_01226 SRM_01227 SpoIVFB pyk TRUE 0.875 146.000 0.029 1.000   NA
 10269106 10269107 SRM_01227 SRM_01228 pyk   TRUE 0.589 87.000 0.000 1.000   NA
 10269107 10269108 SRM_01228 SRM_01229   ftsH TRUE 0.995 37.000 0.667 1.000   NA
 10269108 10269109 SRM_01229 SRM_01230 ftsH rpsL FALSE 0.090 316.000 0.000 1.000 N NA
 10269111 10269112 SRM_01231 SRM_01233 fusA tufA TRUE 0.997 88.000 0.400 0.002 Y NA
 10269112 10269113 SRM_01233 SRM_01234 tufA rpsJ TRUE 0.996 83.000 0.318 1.000 Y NA
 10269113 10269114 SRM_01234 SRM_01235 rpsJ   FALSE 0.336 6.000 0.000 NA   NA
 10269114 10269115 SRM_01235 SRM_01236   rplC TRUE 0.817 54.000 0.000 NA   NA
 10269115 10269116 SRM_01236 SRM_01237 rplC rplD TRUE 0.999 74.000 0.544 0.016 Y NA
 10269116 10269117 SRM_01237 SRM_01238 rplD rplW TRUE 0.999 57.000 0.307 1.000 Y NA
 10269117 10269118 SRM_01238 SRM_01239 rplW rplB TRUE 0.999 53.000 0.849 1.000 Y NA
 10269118 10269119 SRM_01239 SRM_01240 rplB rpsS TRUE 0.999 76.000 0.820 0.021 Y NA
 10269119 10269120 SRM_01240 SRM_01241 rpsS rplV TRUE 0.996 137.000 0.769 0.021 Y NA
 10269120 10269121 SRM_01241 SRM_01242 rplV rpsC TRUE 0.999 62.000 0.719 0.021 Y NA
 10269121 10269122 SRM_01242 SRM_01243 rpsC rplP TRUE 1.000 61.000 0.828 0.021 Y NA
 10269122 10269123 SRM_01243 SRM_01244 rplP rpmC TRUE 0.994 9.000 0.802 0.016   NA
 10269123 10269124 SRM_01244 SRM_01245 rpmC rpsQ TRUE 0.999 61.000 0.828 0.016   NA
 10269124 10269125 SRM_01245 SRM_01246 rpsQ rplN TRUE 0.998 85.000 0.791 0.021 Y NA
 10269125 10269126 SRM_01246 SRM_01247 rplN rplX TRUE 1.000 54.000 0.810 0.021 Y NA
 10269126 10269127 SRM_01247 SRM_01248 rplX rplE TRUE 0.996 134.000 0.758 0.016 Y NA
 10269127 10269128 SRM_01248 SRM_01249 rplE rpsN2 TRUE 0.999 75.000 0.496 0.016 Y NA
 10269128 10269129 SRM_01249 SRM_01250 rpsN2 rpsH TRUE 0.996 94.000 0.473 0.016 Y NA
 10269129 10269130 SRM_01250 SRM_01251 rpsH rplF TRUE 0.999 68.000 0.808 0.016 Y NA
 10269130 10269131 SRM_01251 SRM_01252 rplF rplR TRUE 0.999 76.000 0.815 0.016 Y NA
 10269131 10269132 SRM_01252 SRM_01253 rplR rpsE TRUE 0.999 51.000 0.814 0.021 Y NA
 10269132 10269133 SRM_01253 SRM_01254 rpsE rplO TRUE 0.985 130.000 0.148 0.021 Y NA
 10269133 10269134 SRM_01254 SRM_01255 rplO secY TRUE 0.999 57.000 0.730 1.000 N NA
 10269134 10269135 SRM_01255 SRM_01256 secY map TRUE 0.965 28.000 0.087 1.000 N NA
 10269135 10269136 SRM_01256 SRM_01257 map infA TRUE 0.979 0.000 0.160 1.000 Y NA
 10269136 10269137 SRM_01257 SRM_01258 infA rpsM TRUE 0.987 89.000 0.075 0.014 Y NA
 10269137 10269138 SRM_01258 SRM_01259 rpsM rpsK TRUE 0.998 88.000 0.810 0.016 Y NA
 10269138 10269139 SRM_01259 SRM_01260 rpsK rpsD TRUE 0.996 110.000 0.509 0.021 Y NA
 10269139 10269140 SRM_01260 SRM_01261 rpsD rpoA TRUE 0.992 97.000 0.549 1.000 N NA
 10269140 10269141 SRM_01261 SRM_01262 rpoA rplQ TRUE 0.997 87.000 0.873 1.000 N NA
 10269141 10269142 SRM_01262 SRM_01263 rplQ spoT FALSE 0.278 196.000 0.002 1.000 N NA
 10269142 10269143 SRM_01263 SRM_01264 spoT hup TRUE 0.992 40.000 0.333 1.000 N NA
 10269143 10269144 SRM_01264 SRM_01265 hup yqgF TRUE 0.974 72.000 0.005 0.053 Y NA
 10269146 10269147 SRM_01266 SRM_01268   ribE FALSE 0.406 -183.000 0.000 1.000   NA
 10269147 10269148 SRM_01268 tRNA_13 ribE   FALSE 0.300 142.000 0.000 NA   NA
 10269149 10269150 SRM_01269 SRM_01270 rfaG   TRUE 0.976 45.000 0.044 NA   NA
 10269153 10269154 SRM_01273 SRM_01274 ndk   TRUE 0.449 -3.000 0.002 NA   NA
 10269156 10269157 SRM_01276 SRM_01277 dacB   TRUE 0.929 47.000 0.004 1.000   NA
 10269158 10269159 SRM_01278 SRM_01279 dapA dapB TRUE 0.988 57.000 0.013 1.000 Y NA
 10269160 10269161 tRNA_14 SRM_01280   phrB TRUE 0.784 63.000 0.000 NA   NA
 10269162 10269163 SRM_01281 SRM_01282     FALSE 0.058 351.000 0.000 NA   NA
 10269163 10269164 SRM_01282 SRM_01283     FALSE 0.195 178.000 0.000 NA   NA
 10269164 10269165 SRM_01283 SRM_01284     FALSE 0.033 565.000 0.000 NA   NA
 10269165 10269166 SRM_01284 SRM_01285     TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10269167 10269168 SRM_01286 SRM_01287     FALSE 0.421 101.000 0.000 NA   NA
 10269168 10269169 SRM_01287 SRM_01288     FALSE 0.067 319.000 0.000 NA   NA
 10269171 10269172 SRM_01290 SRM_01291     FALSE 0.071 303.000 0.000 NA   NA
 10269172 10269173 SRM_01291 SRM_01292     TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10269173 10269174 SRM_01292 SRM_01293     TRUE 0.482 92.000 0.000 NA   NA
 10269176 10269177 SRM_01295 SRM_01296   dpsA FALSE 0.131 249.000 0.000 1.000 N NA
 10269177 10269178 SRM_01296 SRM_01297 dpsA topA FALSE 0.099 294.000 0.000 1.000 N NA
 10269181 10269182 SRM_01300 SRM_01301   cysK TRUE 0.832 51.000 0.000 1.000 N NA
 10269182 10269183 SRM_01301 SRM_01303 cysK   TRUE 0.608 40.000 0.000 1.000   NA
 10269186 10269187 SRM_01305 SRM_01306     TRUE 0.995 -55.000 0.500 0.005 Y NA
 10269188 10269189 SRM_01307 SRM_01308 hetI   FALSE 0.361 15.000 0.000 NA   NA
 10269189 10269190 SRM_01308 SRM_01309     TRUE 0.538 39.000 0.000 NA   NA
 10269190 10269191 SRM_01309 SRM_01310   kamA TRUE 0.963 22.000 0.118 NA   NA
 10269192 10269193 SRM_01311 SRM_01312     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269195 10269196 SRM_01314 SRM_01315   nhaC FALSE 0.367 125.000 0.000 NA   NA
 10269198 10269199 SRM_01317 SRM_01318     FALSE 0.408 108.000 0.000 NA   NA
 10269199 10269200 SRM_01318 SRM_01319   ahcY FALSE 0.375 117.000 0.000 NA   NA
 10269200 10269201 SRM_01319 SRM_01320 ahcY   FALSE 0.209 172.000 0.000 NA   NA
 10269201 10269202 SRM_01320 SRM_01321   alaS FALSE 0.054 371.000 0.000 NA   NA
 10269202 10269203 SRM_01321 SRM_01322 alaS   TRUE 0.608 40.000 0.000 1.000   NA
 10269203 10269204 SRM_01322 SRM_01323     TRUE 0.522 32.000 0.000 1.000   NA
 10269204 10269205 SRM_01323 SRM_01324     FALSE 0.363 127.000 0.000 NA   NA
 10269206 10269207 SRM_01325 SRM_01326 fdxA ruvB FALSE 0.186 207.000 0.000 1.000 N NA
 10269212 10269213 SRM_01331 SRM_01332     FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10269213 10269214 SRM_01332 SRM_01333   fabG FALSE 0.259 153.000 0.000 NA   NA
 10269214 10269215 SRM_01333 SRM_01334 fabG   TRUE 0.688 43.000 0.000 1.000 N NA
 10269215 10269216 SRM_01334 SRM_01335   accD TRUE 0.609 112.000 0.002 1.000 N NA
 10269216 10269217 SRM_01335 SRM_01336 accD   FALSE 0.082 277.000 0.000 NA   NA
 10269219 10269220 SRM_01338 SRM_01339     TRUE 0.799 52.000 0.000 NA   NA
 10269224 10269225 SRM_01343 SRM_01344 rpmE deoA FALSE 0.343 148.000 0.000 1.000 N NA
 10269225 10269226 SRM_01344 SRM_01345 deoA   TRUE 0.767 68.000 0.000 NA N NA
 10269226 10269227 SRM_01345 SRM_01346     TRUE 0.991 77.000 0.200 NA   NA
 10269227 10269228 SRM_01346 SRM_01347     TRUE 0.988 20.000 0.500 NA   NA
 10269229 10269230 SRM_01348 SRM_01349   moaC TRUE 0.759 49.000 0.000 NA   NA
 10269230 10269231 SRM_01349 SRM_01350 moaC   TRUE 0.671 119.000 0.003 1.000   NA
 10269232 10269233 SRM_01351 SRM_01352 gltB gltD TRUE 0.996 74.000 0.099 0.001 Y NA
 10269234 10269235 SRM_01353 SRM_01354 dtd yggV TRUE 0.926 46.000 0.005 1.000 N NA
 10269237 10269238 SRM_01356 SRM_01358 odhA   TRUE 0.449 116.000 0.000 1.000 N NA
 10269243 10269244 SRM_01362 SRM_01363 recO lexA2 TRUE 0.475 110.000 0.000 1.000 N NA
 10269245 10269246 SRM_01364 SRM_01365   phrB FALSE 0.417 103.000 0.000 NA   NA
 10269248 10269249 SRM_01366 SRM_01367   acrF TRUE 0.556 40.000 0.000 NA   NA
 10269249 10269250 SRM_01367 SRM_01368 acrF mdtA TRUE 0.997 49.000 0.348 NA N NA
 10269253 10269254 SRM_01371 SRM_01372   smf TRUE 0.602 169.000 0.005 1.000   NA
 10269254 10269255 SRM_01372 SRM_01373 smf sufS FALSE 0.221 189.000 0.000 1.000 N NA
 10269257 10269258 SRM_01375 SRM_01376 rluD   FALSE 0.115 267.000 0.000 1.000 N NA
 10269259 10269260 SRM_01377 SRM_01378     FALSE 0.348 132.000 0.000 NA   NA
 10269262 10269263 SRM_01380 SRM_01381 tonB blaI TRUE 0.633 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 10269263 10269264 SRM_01381 SRM_01382 blaI nodC FALSE 0.421 101.000 0.000 NA   NA
 10269264 10269265 SRM_01382 SRM_01383 nodC arcA FALSE 0.253 155.000 0.000 NA   NA
 10269265 10269266 SRM_01383 SRM_01384 arcA   TRUE 0.473 93.000 0.000 NA   NA
 10269266 10269267 SRM_01384 SRM_01385     TRUE 0.952 6.000 0.114 NA   NA
 10269267 10269268 SRM_01385 SRM_01386     FALSE 0.405 6.000 0.000 1.000 N NA
 10269268 10269269 SRM_01386 SRM_01387   pgk/tpi TRUE 0.809 46.000 0.002 1.000 N NA
 10269269 10269270 SRM_01387 SRM_01388 pgk/tpi GPD TRUE 0.858 92.000 0.002 0.004 Y NA
 10269270 10269271 SRM_01388 SRM_01390 GPD fhlA FALSE 0.025 893.000 0.000 NA   NA
 10269272 10269273 SRM_01389 SRM_01391 atoC   TRUE 0.794 -16.000 0.008 1.000 N NA
 10269273 10269274 SRM_01391 SRM_01392   lon FALSE 0.124 247.000 0.000 1.000   NA
 10269274 10269275 SRM_01392 SRM_01393 lon   TRUE 0.752 13.000 0.005 1.000   NA
 10269275 10269276 SRM_01393 SRM_01394     TRUE 0.693 77.000 0.000 1.000   NA
 10269276 10269277 SRM_01394 SRM_01395     FALSE 0.052 387.000 0.000 NA   NA
 10269277 10269278 SRM_01395 SRM_01396   ttgR FALSE 0.130 217.000 0.000 NA   NA
 10269278 10269279 SRM_01396 SRM_01397 ttgR fadD TRUE 0.996 64.000 0.182 1.000 N NA
 10269279 10269280 SRM_01397 SRM_01398 fadD   TRUE 0.931 128.000 0.019 1.000 Y NA
 10269280 10269281 SRM_01398 SRM_01399   thlA TRUE 0.994 117.000 0.588 1.000 Y NA
 10269281 10269282 SRM_01399 SRM_01400 thlA   TRUE 0.830 61.000 0.000 1.000   NA
 10269282 10269283 SRM_01400 SRM_01401   fadE FALSE 0.068 367.000 0.000 1.000   NA
 10269283 10269284 SRM_01401 SRM_01402 fadE   TRUE 0.939 58.000 0.000 1.000 Y NA
 10269284 10269285 SRM_01402 SRM_01403     TRUE 0.759 49.000 0.000 NA   NA
 10269287 10269288 SRM_01405 SRM_01406     FALSE 0.334 -13.000 0.000 NA   NA
 10269288 10269289 SRM_01406 SRM_01407     FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10269289 10269290 SRM_01407 SRM_01408     TRUE 0.786 51.000 0.000 NA   NA
 10269290 10269291 SRM_01408 SRM_01409   yqjD FALSE 0.104 272.000 0.000 1.000   NA
 10269293 10269294 SRM_01411 SRM_01412     TRUE 0.678 75.000 0.000 NA   NA
 10269295 10269296 SRM_01413 SRM_01414 elaC ispB TRUE 0.687 13.000 0.004 1.000   NA
 10269296 10269297 SRM_01414 SRM_01416 ispB   TRUE 0.439 125.000 0.000 1.000 N NA
 10269298 10269299 SRM_01415 SRM_01417 atoC deoC TRUE 0.488 104.000 0.000 1.000 N NA
 10269299 10269300 SRM_01417 SRM_01418 deoC   TRUE 0.997 51.000 0.277 1.000 N NA
 10269300 10269301 SRM_01418 SRM_01419     TRUE 0.537 -99.000 0.000 0.026   NA
 10269304 10269305 SRM_01422 SRM_01424   dadA TRUE 0.902 47.000 0.000 1.000 Y NA
 10269306 10269307 SRM_01423 SRM_01425   thiS TRUE 0.989 -3.000 0.625 1.000 N NA
 10269307 10269308 SRM_01425 SRM_01426 thiS thiG TRUE 0.984 31.000 0.104 1.000 Y NA
 10269308 10269309 SRM_01426 SRM_01427 thiG thiE TRUE 0.486 350.000 0.005 0.002 Y NA
 10269309 10269310 SRM_01427 SRM_01428 thiE thiD TRUE 0.999 49.000 0.400 0.002 Y NA
 10269310 10269311 SRM_01428 tRNA_16 thiD   TRUE 0.584 83.000 0.000 NA   NA
 10269311 10269312 tRNA_16 SRM_01429     FALSE 0.200 175.000 0.000 NA   NA
 10269312 10269313 SRM_01429 SRM_01430     FALSE 0.091 264.000 0.000 NA   NA
 10269314 10269315 SRM_01431 SRM_01432     TRUE 0.523 38.000 0.000 NA   NA
 10269316 10269317 SRM_01433 SRM_01434     TRUE 0.995 62.000 0.113 0.006   NA
 10269317 10269318 SRM_01434 SRM_01435   mvaB FALSE 0.282 159.000 0.000 1.000   NA
 10269319 10269320 SRM_01436 SRM_01437     FALSE 0.387 20.000 0.000 NA   NA
 10269320 10269321 SRM_01437 SRM_01438     TRUE 0.704 73.000 0.000 NA   NA
 10269321 10269322 SRM_01438 SRM_01439     TRUE 0.941 140.000 0.098 NA   NA
 10269322 10269323 SRM_01439 SRM_01440   ccmA TRUE 0.973 110.000 0.176 NA   NA
 10269324 10269325 SRM_01441 SRM_01442 proB proA TRUE 0.988 109.000 0.281 0.002   NA
 10269328 10269329 SRM_01445 SRM_01446   gcvP FALSE 0.321 137.000 0.000 NA   NA
 10269330 10269331 SRM_01447 SRM_01448 gadB   FALSE 0.242 165.000 0.000 NA N NA
 10269331 10269332 SRM_01448 SRM_01449   dehII FALSE 0.417 103.000 0.000 NA   NA
 10269333 10269334 SRM_01450 SRM_01451   yaeT TRUE 0.810 53.000 0.000 NA   NA
 10269334 10269335 SRM_01451 SRM_01452 yaeT yihY TRUE 0.851 55.000 0.000 1.000   NA
 10269335 10269336 SRM_01452 SRM_01453 yihY   TRUE 0.493 97.000 0.000 1.000   NA
 10269336 10269337 SRM_01453 SRM_01454     TRUE 0.997 38.000 1.000 1.000   NA
 10269337 10269338 SRM_01454 SRM_01455     FALSE 0.167 193.000 0.000 NA   NA
 10269338 10269339 SRM_01455 SRM_01456     FALSE 0.160 196.000 0.000 NA   NA
 10269339 10269340 SRM_01456 SRM_01457   sufS TRUE 0.576 88.000 0.000 1.000   NA
 10269343 10269344 SRM_01460 SRM_01461     FALSE 0.192 179.000 0.000 NA   NA
 10269344 10269345 SRM_01461 SRM_01462   pulF FALSE 0.066 346.000 0.000 NA N NA
 10269345 10269346 SRM_01462 SRM_01463 pulF pulE TRUE 0.931 26.000 0.015 NA Y NA
 10269346 10269347 SRM_01463 SRM_01464 pulE   TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10269347 10269348 SRM_01464 SRM_01465     TRUE 0.999 69.000 1.000 NA   NA
 10269350 10269351 SRM_01466 SRM_01467 pilT   TRUE 0.998 67.000 0.500 NA   NA
 10269351 10269352 SRM_01467 SRM_01469     TRUE 0.999 49.000 1.000 NA   NA
 10269352 10269353 SRM_01469 SRM_01470   gspD TRUE 0.812 119.000 0.009 NA   NA
 10269353 10269354 SRM_01470 SRM_01471 gspD   TRUE 0.746 48.000 0.000 NA   NA
 10269354 10269355 SRM_01471 SRM_01472     FALSE 0.435 106.000 0.000 NA N NA
 10269355 10269356 SRM_01472 SRM_01473     TRUE 0.449 116.000 0.000 1.000 N NA
 10269356 10269357 SRM_01473 SRM_01474     FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10269358 10269359 SRM_01475 SRM_01476   galT FALSE 0.386 114.000 0.000 NA   NA
 10269359 10269360 SRM_01476 SRM_01477 galT   FALSE 0.366 16.000 0.000 NA   NA
 10269361 10269362 SRM_01478 SRM_01479   upp TRUE 0.835 79.000 0.002 1.000 N NA
 10269364 10269365 SRM_01481 SRM_01482 nhaC manA TRUE 0.641 79.000 0.000 NA N NA
 10269365 10269366 SRM_01482 SRM_01483 manA def FALSE 0.398 136.000 0.000 1.000 N NA
 10269366 10269367 SRM_01483 SRM_01484 def   TRUE 0.571 35.000 0.000 1.000 N NA
 10269367 10269368 SRM_01484 SRM_01485   hmuV TRUE 0.648 41.000 0.000 1.000 N NA
 10269368 10269369 SRM_01485 SRM_01486 hmuV   FALSE 0.030 731.000 0.000 NA N NA
 10269369 10269370 SRM_01486 SRM_01487   ansA FALSE 0.373 -79.000 0.000 NA N NA
 10269371 10269372 SRM_01488 SRM_01489   spoIID TRUE 0.912 145.000 0.049 1.000 N NA
 10269374 10269375 SRM_01491 SRM_01492   dnaK FALSE 0.069 386.000 0.000 1.000 N NA
 10269376 10269377 SRM_01493 SRM_01494 pgsA pyrE TRUE 0.889 47.000 0.002 1.000 N NA
 10269377 10269378 SRM_01494 SRM_01495 pyrE cinA TRUE 0.949 58.000 0.004 1.000   NA
 10269378 10269379 SRM_01495 SRM_01496 cinA qor FALSE 0.387 135.000 0.000 1.000   NA
 10269380 10269381 SRM_01497 SRM_01498 osmC mscS FALSE 0.428 130.000 0.000 1.000 N NA
 10269381 10269382 SRM_01498 SRM_01500 mscS   FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269386 10269387 SRM_01503 SRM_01504 trxA   FALSE 0.341 9.000 0.000 NA   NA
 10269388 10269389 SRM_01505 SRM_01506 pepF smtA TRUE 0.538 34.000 0.000 1.000   NA
 10269389 10269390 SRM_01506 SRM_01507 smtA usp FALSE 0.247 172.000 0.000 1.000   NA
 10269390 10269391 SRM_01507 SRM_01508 usp usp TRUE 0.725 -13.000 0.000 0.007 Y NA
 10269391 10269392 SRM_01508 SRM_01509 usp   TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10269393 10269394 SRM_01510 SRM_01511 clpC hesB FALSE 0.070 307.000 0.000 NA   NA
 10269396 10269397 SRM_01513 SRM_01514     FALSE 0.079 284.000 0.000 NA   NA
 10269397 10269398 SRM_01514 SRM_01515     FALSE 0.135 212.000 0.000 NA   NA
 10269398 10269399 SRM_01515 SRM_01516     FALSE 0.047 422.000 0.000 NA   NA
 10269399 10269400 SRM_01516 SRM_01518     FALSE 0.408 108.000 0.000 NA   NA
 10269402 10269403 SRM_01519 SRM_01520 rmlA hal2 TRUE 0.830 63.000 0.000 1.000 N NA
 10269403 10269404 SRM_01520 SRM_01521 hal2   TRUE 0.608 40.000 0.000 1.000   NA
 10269404 10269405 SRM_01521 SRM_01522     TRUE 0.744 46.000 0.000 1.000   NA
 10269405 10269406 SRM_01522 SRM_01523     TRUE 0.478 100.000 0.000 1.000   NA
 10269406 10269407 SRM_01523 SRM_01524     TRUE 0.482 108.000 0.000 1.000 N NA
 10269407 10269408 SRM_01524 SRM_01525   lolD TRUE 0.983 95.000 0.210 1.000 N NA
 10269408 10269409 SRM_01525 SRM_01526 lolD   FALSE 0.235 161.000 0.000 NA   NA
 10269409 10269410 SRM_01526 SRM_01527     TRUE 0.764 66.000 0.000 NA   NA
 10269410 10269411 SRM_01527 SRM_01528     FALSE 0.051 391.000 0.000 NA   NA
 10269411 10269412 SRM_01528 SRM_01529   pyrB TRUE 0.556 40.000 0.000 NA   NA
 10269412 10269413 SRM_01529 SRM_01530 pyrB upp TRUE 0.998 56.000 0.247 1.000 Y NA
 10269416 10269417 SRM_01533 SRM_01534     TRUE 0.594 82.000 0.000 NA   NA
 10269418 10269419 SRM_01535 SRM_01536     FALSE 0.404 -136.000 0.000 1.000   NA
 10269419 10269420 SRM_01536 SRM_01537   rnc TRUE 0.860 58.000 0.000 1.000 N NA
 10269421 10269422 SRM_01538 SRM_01539 ssdA   FALSE 0.177 186.000 0.000 NA   NA
 10269422 10269423 SRM_01539 SRM_01540     TRUE 0.496 35.000 0.000 NA   NA
 10269423 10269424 SRM_01540 SRM_01541     TRUE 0.759 49.000 0.000 NA   NA
 10269424 10269425 SRM_01541 SRM_01542     FALSE 0.140 209.000 0.000 NA   NA
 10269425 10269426 SRM_01542 SRM_01543   gpmB TRUE 0.980 52.000 0.019 NA   NA
 10269426 10269427 SRM_01543 SRM_01544 gpmB menF TRUE 0.839 -184.000 0.011 1.000 N NA
 10269427 10269428 SRM_01544 SRM_01545 menF menD TRUE 0.991 26.000 0.281 1.000 Y NA
 10269430 10269431 SRM_01547 SRM_01548 menA menC TRUE 0.937 -16.000 0.037 0.002 N NA
 10269431 10269432 SRM_01548 SRM_01549 menC menE TRUE 0.986 11.000 0.283 0.002 N NA
 10269432 10269433 SRM_01549 SRM_01550 menE rimL FALSE 0.311 156.000 0.000 1.000 N NA
 10269434 10269435 SRM_01551 SRM_01552     TRUE 0.634 -21.000 0.000 1.000 Y NA
 10269435 10269436 SRM_01552 SRM_01553   spoIIAA TRUE 0.914 67.000 0.000 1.000 Y NA
 10269436 10269437 SRM_01553 SRM_01554 spoIIAA   FALSE 0.333 -10.000 0.000 NA   NA
 10269438 10269439 SRM_01555 SRM_01556     TRUE 0.839 126.000 0.013 NA   NA
 10269439 10269440 SRM_01556 SRM_01557     TRUE 0.988 -342.000 0.543 NA   NA
 10269440 10269441 SRM_01557 SRM_01558   glmS FALSE 0.404 131.000 0.000 1.000   NA
 10269441 10269442 SRM_01558 SRM_01559 glmS prfA FALSE 0.269 208.000 0.000 0.035 N NA
 10269442 10269443 SRM_01559 SRM_01560 prfA rpsF FALSE 0.303 264.000 0.002 1.000 Y NA
 10269443 10269444 SRM_01560 SRM_01561 rpsF rpsR TRUE 0.999 54.000 0.319 0.016 Y NA
 10269444 10269445 SRM_01561 SRM_01562 rpsR rplI TRUE 0.999 50.000 0.499 0.016 Y NA
 10269446 10269447 SRM_01563 SRM_01564 metB dnaA TRUE 0.465 21.000 0.000 1.000 N NA
 10269447 10269448 SRM_01564 SRM_01565 dnaA hpd FALSE 0.103 285.000 0.000 1.000 N NA
 10269448 10269449 SRM_01565 SRM_01566 hpd   TRUE 0.499 100.000 0.000 1.000 N NA
 10269450 10269451 SRM_01567 SRM_01568   ordL TRUE 0.956 108.000 0.044 0.026 N NA
 10269451 10269452 SRM_01568 SRM_01569 ordL   FALSE 0.392 21.000 0.000 NA   NA
 10269454 10269455 SRM_01571 SRM_01572   himA FALSE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10269455 10269456 SRM_01572 SRM_01573 himA   TRUE 0.629 41.000 0.000 1.000   NA
 10269456 10269457 SRM_01573 SRM_01574     FALSE 0.425 100.000 0.000 NA   NA
 10269458 10269459 SRM_01575 SRM_01576   pilR TRUE 0.484 34.000 0.000 NA   NA
 10269459 10269460 SRM_01576 SRM_01577 pilR   TRUE 0.933 77.000 0.009 NA   NA
 10269460 10269461 SRM_01577 SRM_01578   sufE TRUE 0.983 94.000 0.226 NA   NA
 10269461 10269462 SRM_01578 SRM_01579 sufE sufS FALSE 0.357 -241.000 0.000 NA   NA
 10269462 10269463 SRM_01579 SRM_01580 sufS sufD FALSE 0.064 377.000 0.000 1.000   NA
 10269463 10269464 SRM_01580 SRM_01581 sufD sufC TRUE 0.992 -33.000 0.482 1.000 Y NA
 10269464 10269465 SRM_01581 SRM_01582 sufC sufB TRUE 0.989 146.000 0.466 1.000 Y NA
 10269466 10269467 SRM_01583 SRM_01584     FALSE 0.284 147.000 0.000 NA   NA
 10269468 10269469 SRM_01585 SRM_01586     TRUE 0.750 -18.000 0.007 NA   NA
 10269469 10269470 SRM_01586 SRM_01587     FALSE 0.341 9.000 0.000 NA   NA
 10269470 10269471 SRM_01587 SRM_01588   hemN TRUE 0.589 87.000 0.000 1.000   NA
 10269471 10269472 SRM_01588 SRM_01589 hemN   FALSE 0.348 11.000 0.000 NA   NA
 10269473 10269474 SRM_01590 SRM_01591   bcsA FALSE 0.212 171.000 0.000 NA   NA
 10269475 10269476 SRM_01592 SRM_01593   amaA FALSE 0.054 368.000 0.000 NA   NA
 10269476 10269477 SRM_01593 SRM_01594 amaA   TRUE 0.438 114.000 0.000 1.000   NA
 10269477 10269478 SRM_01594 SRM_01595   aprE FALSE 0.404 13.000 0.000 1.000   NA
 10269478 10269479 SRM_01595 SRM_01596 aprE   FALSE 0.380 -7.000 0.000 1.000   NA
 10269479 10269480 SRM_01596 SRM_01597     FALSE 0.183 208.000 0.000 1.000 N NA
 10269480 10269481 SRM_01597 SRM_01598     FALSE 0.054 372.000 0.000 NA   NA
 10269483 10269484 SRM_01600 SRM_01601   emrA TRUE 0.999 50.000 0.714 NA N NA
 10269484 10269485 SRM_01601 SRM_01602 emrA   TRUE 0.990 14.000 0.351 NA Y NA
 10269486 10269487 SRM_01603 SRM_01604 panC panD TRUE 0.996 42.000 0.342 1.000 Y NA
 10269487 10269488 SRM_01604 SRM_01605 panD mmgB FALSE 0.107 279.000 0.000 1.000 N NA
 10269493 10269494 SRM_01610 SRM_01611   rpmA TRUE 0.488 104.000 0.000 1.000 N NA
 10269494 10269495 SRM_01611 SRM_01612 rpmA rplU TRUE 0.999 51.000 0.667 0.015 Y NA
 10269496 10269497 SRM_01613 SRM_01614 mhpD pdxH TRUE 0.811 64.000 0.000 1.000   NA
 10269498 10269499 SRM_01615 SRM_01616 ltaE greA TRUE 0.611 39.000 0.000 1.000 N NA
 10269499 10269500 SRM_01616 SRM_01617 greA ldcA FALSE 0.364 134.000 0.000 NA N NA
 10269500 10269501 SRM_01617 SRM_01618 ldcA   TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10269501 10269502 SRM_01618 SRM_01619   wcaA TRUE 0.871 94.000 0.010 NA   NA
 10269502 10269503 SRM_01619 SRM_01620 wcaA   TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10269503 10269504 SRM_01620 SRM_01621     FALSE 0.344 -31.000 0.000 NA   NA
 10269504 10269505 SRM_01621 SRM_01622   crtB FALSE 0.417 16.000 0.000 1.000   NA
 10269505 10269506 SRM_01622 SRM_01624 crtB   TRUE 0.946 40.000 0.023 NA   NA
 10269507 10269508 SRM_01623 SRM_01625   dcd FALSE 0.430 99.000 0.000 NA   NA
 10269508 10269509 SRM_01625 SRM_01626 dcd   TRUE 0.746 48.000 0.000 NA   NA
 10269510 10269511 SRM_01627 SRM_01628 dapA   TRUE 0.642 84.000 0.000 1.000 N NA
 10269512 10269513 SRM_01629 SRM_01630     FALSE 0.173 189.000 0.000 NA   NA
 10269515 10269516 SRM_01632 SRM_01633 aphA dnaQ FALSE 0.379 2.000 0.000 1.000   NA
 10269516 10269517 SRM_01633 SRM_01634 dnaQ ppx FALSE 0.402 -81.000 0.000 1.000   NA
 10269517 10269518 SRM_01634 SRM_01635 ppx nuoJ TRUE 0.504 199.000 0.005 1.000 N NA
 10269518 10269519 SRM_01635 SRM_01636 nuoJ nuoK TRUE 0.993 115.000 0.306 0.003 Y NA
 10269519 10269520 SRM_01636 SRM_01637 nuoK nuoL TRUE 1.000 56.000 0.790 0.007 Y NA
 10269520 10269521 SRM_01637 SRM_01638 nuoL nuoM TRUE 0.989 125.000 0.183 0.007 Y NA
 10269521 10269522 SRM_01638 SRM_01639 nuoM   TRUE 0.548 93.000 0.000 1.000 N NA
 10269522 10269523 SRM_01639 SRM_01640   nuoN TRUE 0.898 38.000 0.008 1.000 N NA
 10269523 10269524 SRM_01640 SRM_01641 nuoN   TRUE 0.819 58.000 0.000 NA   NA
 10269525 10269526 SRM_01642 SRM_01643     TRUE 0.710 4.000 0.000 0.025 Y NA
 10269527 10269528 SRM_01644 SRM_01645     FALSE 0.356 130.000 0.000 NA   NA
 10269528 10269529 SRM_01645 SRM_01646     TRUE 0.998 48.000 0.667 NA   NA
 10269530 10269531 SRM_01647 SRM_01649   aldH TRUE 0.849 60.000 0.000 1.000 N NA
 10269533 10269534 SRM_01650 SRM_01651   fadJ FALSE 0.384 5.000 0.000 1.000   NA
 10269534 10269535 SRM_01651 SRM_01652 fadJ fadA TRUE 0.998 48.000 0.430 1.000 Y NA
 10269536 10269537 SRM_01653 SRM_01654 spoU   TRUE 0.494 91.000 0.000 NA   NA
 10269537 10269538 SRM_01654 SRM_01655     FALSE 0.305 141.000 0.000 NA   NA
 10269539 10269540 SRM_01656 SRM_01657 glpA   FALSE 0.122 225.000 0.000 NA   NA
 10269540 10269541 SRM_01657 SRM_01658   ugpB FALSE 0.197 177.000 0.000 NA   NA
 10269541 10269542 SRM_01658 SRM_01659 ugpB   FALSE 0.042 460.000 0.000 NA   NA
 10269542 10269543 SRM_01659 SRM_01660   ugpE TRUE 0.999 52.000 0.854 NA   NA
 10269543 10269544 SRM_01660 SRM_01661 ugpE ugpA TRUE 0.997 -3.000 0.922 0.030 Y NA
 10269544 10269545 SRM_01661 SRM_01662 ugpA malK TRUE 0.999 46.000 0.847 0.030 Y NA
 10269545 10269546 SRM_01662 SRM_01663 malK   TRUE 0.997 16.000 0.865 0.001 Y NA
 10269546 10269547 SRM_01663 SRM_01664   glpK TRUE 0.948 61.000 0.004 1.000 N NA
 10269548 10269549 SRM_01665 SRM_01666 araC gpsA TRUE 0.672 81.000 0.000 1.000 N NA
 10269549 10269550 SRM_01666 SRM_01667 gpsA fbp TRUE 0.875 69.000 0.000 0.010 N NA
 10269550 10269551 SRM_01667 SRM_01668 fbp   FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10269551 10269552 SRM_01668 SRM_01669   fadB FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10269552 10269553 SRM_01669 SRM_01670 fadB citB FALSE 0.336 181.000 0.000 0.044 N NA
 10269553 10269554 SRM_01670 SRM_01671 citB   TRUE 0.463 113.000 0.000 1.000 N NA
 10269554 10269555 SRM_01671 SRM_01672   purM TRUE 0.793 44.000 0.002 1.000 N NA
 10269555 10269556 SRM_01672 SRM_01673 purM   TRUE 0.957 74.000 0.013 1.000   NA
 10269556 10269557 SRM_01673 SRM_01674   gpsA TRUE 0.939 6.000 0.074 1.000   NA
 10269557 10269558 SRM_01674 SRM_01675 gpsA   TRUE 0.786 116.000 0.007 NA   NA
 10269558 10269559 SRM_01675 SRM_01676   gyrA FALSE 0.064 333.000 0.000 NA   NA
 10269559 10269560 SRM_01676 SRM_01677 gyrA gyrB TRUE 0.995 57.000 0.023 0.002 Y NA
 10269560 10269561 SRM_01677 tRNA_17 gyrB   FALSE 0.204 173.000 0.000 NA   NA
 10269563 10269564 SRM_01678 SRM_01680     TRUE 0.819 58.000 0.000 NA   NA
 10269565 10269566 SRM_01681 SRM_01682     TRUE 0.810 53.000 0.000 NA   NA
 10269566 10269567 SRM_01682 SRM_01684     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10269568 10269569 SRM_01683 SRM_01685     FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10269569 10269570 SRM_01685 SRM_01686     TRUE 0.571 84.000 0.000 NA   NA
 10269571 10269572 SRM_01687 SRM_01688     FALSE 0.074 297.000 0.000 NA   NA
 10269572 10269573 SRM_01688 SRM_01689   nagD FALSE 0.053 374.000 0.000 NA   NA
 10269573 10269574 SRM_01689 SRM_01690 nagD   TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10269575 10269576 SRM_01691 SRM_01692   scpB TRUE 0.813 59.000 0.000 NA   NA
 10269576 10269577 SRM_01692 SRM_01693 scpB rluB TRUE 0.898 10.000 0.031 NA N NA
 10269577 10269578 SRM_01693 SRM_01694 rluB guaB TRUE 0.586 13.000 0.002 1.000 N NA
 10269578 10269579 SRM_01694 SRM_01695 guaB pepP TRUE 0.595 15.000 0.002 1.000 N NA
 10269579 10269580 SRM_01695 SRM_01696 pepP   FALSE 0.244 158.000 0.000 NA   NA
 10269581 10269582 SRM_01697 SRM_01698 miaA   FALSE 0.308 152.000 0.000 1.000   NA
 10269582 10269583 SRM_01698 SRM_01699     FALSE 0.118 228.000 0.000 NA   NA
 10269583 10269584 SRM_01699 SRM_01700   crtI TRUE 0.971 35.000 0.091 NA   NA
 10269585 10269586 SRM_01701 SRM_01702     FALSE 0.361 15.000 0.000 NA   NA
 10269586 10269587 SRM_01702 SRM_01703     FALSE 0.074 297.000 0.000 NA   NA
 10269587 10269588 SRM_01703 SRM_01704   xerD FALSE 0.337 135.000 0.000 NA   NA
 10269588 10269589 SRM_01704 SRM_01705 xerD   FALSE 0.098 251.000 0.000 NA   NA
 10269589 10269590 SRM_01705 SRM_01706   xerD TRUE 0.714 72.000 0.000 NA   NA
 10269591 10269592 SRM_01707 SRM_01708   ygcM TRUE 0.825 23.000 0.008 NA   NA
 10269592 10269593 SRM_01708 SRM_01709 ygcM   TRUE 0.997 46.000 0.489 1.000 N NA
 10269593 10269594 SRM_01709 SRM_01710     TRUE 0.986 53.000 0.023 1.000 N NA
 10269595 10269596 SRM_01711 SRM_01712   purR TRUE 0.620 42.000 0.000 NA N NA
 10269596 10269597 SRM_01712 SRM_01713 purR purC TRUE 0.756 112.000 0.004 1.000 N NA
 10269598 10269599 SRM_01714 SRM_01715   bcp FALSE 0.145 226.000 0.000 1.000   NA
 10269599 10269600 SRM_01715 SRM_01716 bcp   TRUE 0.852 53.000 0.000 1.000 N NA
 10269601 10269602 SRM_01717 SRM_01718 pruA   TRUE 0.973 64.000 0.016 NA   NA
 10269602 10269603 SRM_01718 SRM_01719     TRUE 0.631 78.000 0.000 NA   NA
 10269604 10269605 SRM_01720 SRM_01721     FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10269605 10269606 SRM_01721 tRNA_18     FALSE 0.279 148.000 0.000 NA   NA
 10269606 10269607 tRNA_18 SRM_01722     FALSE 0.368 124.000 0.000 NA   NA
 10269607 10269608 SRM_01722 SRM_01723     TRUE 0.910 41.000 0.009 NA   NA
 10269608 10269609 SRM_01723 SRM_01724   smtA FALSE 0.357 -205.000 0.000 NA   NA
 10269610 10269611 SRM_01725 SRM_01726 aroB   TRUE 0.668 94.000 0.002 NA   NA
 10269611 10269612 SRM_01726 SRM_01727   rnr FALSE 0.110 236.000 0.000 NA   NA
 10269613 10269614 SRM_01728 SRM_01729     FALSE 0.046 439.000 0.000 NA   NA
 10269614 10269615 SRM_01729 SRM_01730   recA TRUE 0.530 7.000 0.002 1.000 N NA
 10269615 10269616 SRM_01730 SRM_01731 recA   FALSE 0.125 221.000 0.000 NA   NA
 10269617 10269618 SRM_01732 SRM_01733     TRUE 0.974 11.000 0.254 NA   NA
 10269618 10269619 SRM_01733 SRM_01734     TRUE 0.523 38.000 0.000 NA   NA
 10269621 10269622 SRM_01736 SRM_01737   glpQ FALSE 0.040 487.000 0.000 NA   NA
 10269623 10269624 SRM_01738 SRM_01739 dinB   FALSE 0.035 523.000 0.000 NA   NA
 10269626 10269627 SRM_01741 tRNA_19     FALSE 0.057 356.000 0.000 NA   NA
 10269627 10269628 tRNA_19 SRM_01742   alaS FALSE 0.373 119.000 0.000 NA   NA
 10269628 10269629 SRM_01742 SRM_01744 alaS alkA FALSE 0.120 262.000 0.000 1.000 N NA
 10269631 10269632 SRM_01745 SRM_01746 atoB   TRUE 0.863 56.000 0.000 1.000 N NA
 10269632 10269633 SRM_01746 SRM_01747     TRUE 0.993 53.000 0.087 1.000   NA
 10269633 10269634 SRM_01747 SRM_01748   ttuD FALSE 0.379 2.000 0.000 1.000   NA
 10269635 10269636 SRM_01749 SRM_01750   thiE TRUE 0.538 39.000 0.000 NA   NA
 10269637 10269638 SRM_01751 SRM_01752 hemD hemC TRUE 0.949 46.000 0.002 0.002 Y NA
 10269638 10269639 SRM_01752 SRM_01753 hemC hemA TRUE 0.990 111.000 0.178 0.002 Y NA
 10269639 10269640 SRM_01753 SRM_01754 hemA mtnN TRUE 0.609 87.000 0.000 1.000 N NA
 10269640 10269641 SRM_01754 SRM_01755 mtnN metG FALSE 0.040 639.000 0.000 1.000 N NA
 10269641 10269642 SRM_01755 SRM_01756 metG   FALSE 0.204 173.000 0.000 NA   NA
 10269643 10269644 SRM_01757 SRM_01758 hisB proC TRUE 0.750 127.000 0.002 1.000 Y NA
 10269644 10269645 SRM_01758 SRM_01759 proC hisH TRUE 0.973 83.000 0.014 0.034 Y NA
 10269647 10269648 SRM_01761 SRM_01762 hisA hisF TRUE 0.998 41.000 0.433 0.003 Y NA
 10269648 10269649 SRM_01762 SRM_01763 hisF   TRUE 0.509 -16.000 0.002 NA   NA
 10269651 10269652 SRM_01764 SRM_01766 ligT lolA TRUE 0.782 112.000 0.005 1.000 N NA
 10269652 10269653 SRM_01766 SRM_01767 lolA   TRUE 0.985 59.000 0.025 NA   NA
 10269653 10269654 SRM_01767 SRM_01768   mdh FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10269656 10269657 SRM_01769 SRM_01771 gloA mocA TRUE 0.648 42.000 0.000 1.000   NA
 10269657 10269658 SRM_01771 SRM_01772 mocA   TRUE 0.496 35.000 0.000 NA   NA
 10269658 10269659 SRM_01772 SRM_01773   msrA FALSE 0.421 101.000 0.000 NA   NA
 10269659 10269660 SRM_01773 SRM_01774 msrA mtrF FALSE 0.043 493.000 0.000 NA N NA
 10269661 10269662 SRM_01775 SRM_01776     FALSE 0.338 7.000 0.000 NA   NA
 10269663 10269664 SRM_01777 SRM_01778 uvrC   FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10269665 10269666 SRM_01779 SRM_01780     TRUE 0.547 86.000 0.000 NA   NA
 10269666 10269667 SRM_01780 SRM_01781     TRUE 0.547 86.000 0.000 NA   NA
 10269668 10269669 SRM_01782 SRM_01783 nrfG   TRUE 0.853 57.000 0.000 1.000   NA
 10269669 10269670 SRM_01783 SRM_01784     TRUE 0.679 78.000 0.000 1.000   NA
 10269670 10269671 SRM_01784 SRM_01785     FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10269671 10269672 SRM_01785 SRM_01786   exbB TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10269672 10269673 SRM_01786 SRM_01787 exbB exbD TRUE 0.999 48.000 0.773 0.036 Y NA
 10269674 10269675 SRM_01788 SRM_01789 chlI azu FALSE 0.042 620.000 0.000 1.000 N NA
 10269677 10269678 SRM_01791 SRM_01792 ubiE   FALSE 0.348 132.000 0.000 NA   NA
 10269678 10269679 SRM_01792 SRM_01793   copA TRUE 0.584 83.000 0.000 NA   NA
 10269680 10269681 SRM_01794 SRM_01795   fixC TRUE 0.991 118.000 0.333 1.000 Y NA
 10269684 10269685 SRM_01798 SRM_01800     FALSE 0.369 137.000 0.000 1.000   NA
 10269686 10269687 SRM_01799 SRM_01801     TRUE 0.993 65.000 0.125 NA   NA
 10269687 10269688 SRM_01801 SRM_01802     TRUE 0.963 60.000 0.007 NA   NA
 10269688 10269689 SRM_01802 SRM_01803   pdhD TRUE 0.851 90.000 0.005 1.000 N NA
 10269689 10269690 SRM_01803 SRM_01804 pdhD   FALSE 0.274 149.000 0.000 NA   NA
 10269690 10269691 SRM_01804 SRM_01805     FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10269692 10269693 SRM_01806 SRM_01807 pepN   FALSE 0.376 -3.000 0.000 1.000   NA
 10269693 10269694 SRM_01807 SRM_01808   mutS TRUE 0.576 88.000 0.000 1.000   NA
 10269697 10269698 SRM_01811 tRNA_20 ppnK   TRUE 0.797 61.000 0.000 NA   NA
 10269698 10269699 tRNA_20 SRM_01812   degP FALSE 0.021 1971.000 0.000 NA   NA
 10269699 10269700 SRM_01812 SRM_01813 degP   FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10269700 10269701 SRM_01813 SRM_01814   gldA FALSE 0.105 243.000 0.000 NA   NA
 10269703 10269704 SRM_01816 SRM_01817 tyrA gcvT TRUE 0.886 127.000 0.008 1.000 Y NA
 10269704 10269705 SRM_01817 SRM_01818 gcvT comB TRUE 0.977 54.000 0.011 1.000 N NA
 10269705 10269706 SRM_01818 SRM_01819 comB ftsK TRUE 0.924 107.000 0.028 1.000 N NA
 10269706 10269707 SRM_01819 SRM_01820 ftsK purK TRUE 0.834 73.000 0.000 0.094 N NA
 10269707 10269708 SRM_01820 SRM_01821 purK purE TRUE 0.984 136.000 0.141 0.001 Y NA
 10269708 10269709 SRM_01821 SRM_01822 purE prpL TRUE 0.505 30.000 0.000 1.000   NA
 10269710 10269711 SRM_01823 SRM_01824 tyrS smpB TRUE 0.984 61.000 0.014 0.013 N NA
 10269711 10269712 SRM_01824 SRM_01825 smpB   FALSE 0.319 170.000 0.002 NA   NA
 10269712 10269713 SRM_01825 SRM_01826   rplS TRUE 0.840 67.000 0.002 NA   NA
 10269713 10269714 SRM_01826 SRM_01827 rplS trmD TRUE 0.999 62.000 0.567 1.000 Y NA
 10269714 10269715 SRM_01827 SRM_01828 trmD rimM TRUE 0.999 46.000 0.672 1.000 Y NA
 10269715 10269716 SRM_01828 SRM_01829 rimM rpsP TRUE 0.995 30.000 0.342 0.015 Y NA
 10269716 10269717 SRM_01829 SRM_01830 rpsP ffh TRUE 0.996 72.000 0.361 1.000 N NA
 10269718 10269719 SRM_01831 SRM_01832     TRUE 0.661 44.000 0.000 NA N NA
 10269720 10269721 SRM_01833 SRM_01834     TRUE 0.993 83.000 0.235 0.006   NA
 10269721 10269722 SRM_01834 SRM_01836   polA TRUE 0.487 3.000 0.002 1.000   NA
 10269723 10269724 SRM_01835 SRM_01837   gph FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269726 10269727 SRM_01839 SRM_01840   purN FALSE 0.345 -33.000 0.000 NA   NA
 10269727 10269728 SRM_01840 SRM_01841 purN purH TRUE 0.987 20.000 0.225 1.000 Y NA
 10269728 10269729 SRM_01841 SRM_01842 purH mreB FALSE 0.421 167.000 0.002 1.000 N NA
 10269729 10269730 SRM_01842 SRM_01843 mreB mreC TRUE 0.939 56.000 0.003 1.000 N NA
 10269730 10269731 SRM_01843 SRM_01844 mreC hslV FALSE 0.158 225.000 0.000 1.000 N NA
 10269731 10269732 SRM_01844 SRM_01845 hslV   TRUE 0.724 107.000 0.004 NA   NA
 10269732 10269733 SRM_01845 SRM_01846   hslU TRUE 0.935 60.000 0.003 NA   NA
 10269733 10269734 SRM_01846 SRM_01847 hslU   FALSE 0.397 22.000 0.000 NA   NA
 10269735 10269736 SRM_01848 SRM_01849   paaY FALSE 0.417 103.000 0.000 NA   NA
 10269738 10269739 tRNA_21 SRM_01851   dedA TRUE 0.776 64.000 0.000 NA   NA
 10269739 10269740 SRM_01851 SRM_01852 dedA ispF TRUE 0.729 -3.000 0.006 NA   NA
 10269740 10269741 SRM_01852 SRM_01853 ispF ispD TRUE 0.994 29.000 0.419 1.000 Y NA
 10269741 10269742 SRM_01853 SRM_01854 ispD queA TRUE 0.891 18.000 0.019 1.000 N NA
 10269742 10269743 SRM_01854 SRM_01855 queA   FALSE 0.278 166.000 0.000 1.000 N NA
 10269743 10269744 SRM_01855 SRM_01856   gatA FALSE 0.426 -174.000 0.000 1.000 N NA
 10269744 10269745 SRM_01856 SRM_01857 gatA   FALSE 0.079 347.000 0.000 1.000 N NA
 10269745 10269746 SRM_01857 SRM_01858     FALSE 0.023 1150.000 0.000 NA   NA
 10269746 10269747 SRM_01858 SRM_01859   ylnA TRUE 0.759 49.000 0.000 NA   NA
 10269747 10269748 SRM_01859 SRM_01860 ylnA   TRUE 0.563 -19.000 0.000 0.002   NA
 10269748 10269749 SRM_01860 SRM_01861   prfC FALSE 0.135 246.000 0.000 1.000 N NA
 10269749 10269750 SRM_01861 SRM_01862 prfC   FALSE 0.231 163.000 0.000 NA   NA
 10269750 10269751 SRM_01862 SRM_01863     TRUE 0.692 74.000 0.000 NA   NA
 10269751 10269752 SRM_01863 SRM_01864     FALSE 0.352 -93.000 0.000 NA   NA
 10269752 10269753 SRM_01864 SRM_01865     FALSE 0.068 318.000 0.000 NA   NA
 10269753 10269754 SRM_01865 SRM_01866     TRUE 0.704 73.000 0.000 NA   NA
 10269755 10269756 SRM_01867 SRM_01868 trpE   TRUE 0.458 109.000 0.000 1.000   NA
 10269756 10269757 SRM_01868 SRM_01869   trpS TRUE 0.809 50.000 0.000 1.000   NA
 10269757 10269758 SRM_01869 SRM_01870 trpS pabA TRUE 0.440 124.000 0.000 1.000 N NA
 10269758 10269759 SRM_01870 SRM_01871 pabA trpD TRUE 0.925 46.000 0.002 1.000 Y NA
 10269759 10269760 SRM_01871 SRM_01872 trpD trpC TRUE 0.979 61.000 0.006 1.000 Y NA
 10269760 10269761 SRM_01872 SRM_01873 trpC trpF TRUE 0.986 71.000 0.013 0.001 Y NA
 10269761 10269762 SRM_01873 SRM_01874 trpF trpB2 TRUE 0.978 61.000 0.003 0.001 Y NA
 10269762 10269763 SRM_01874 SRM_01875 trpB2 trpA TRUE 0.961 53.000 0.000 0.001 Y NA
 10269763 10269764 SRM_01875 SRM_01876 trpA   TRUE 0.799 52.000 0.000 NA   NA
 10269764 10269765 SRM_01876 SRM_01877     FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10269766 10269767 SRM_01878 SRM_01879 recQ   FALSE 0.029 1123.000 0.000 1.000   NA
 10269767 10269768 SRM_01879 SRM_01880     FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10269768 10269769 SRM_01880 SRM_01881   icd FALSE 0.334 5.000 0.000 NA   NA
 10269769 10269770 SRM_01881 SRM_01882 icd   FALSE 0.326 152.000 0.000 1.000 N NA
 10269770 10269771 SRM_01882 SRM_01883     TRUE 0.993 65.000 0.031 0.029 Y NA
 10269771 10269772 SRM_01883 SRM_01884     TRUE 0.999 55.000 1.000 NA   NA
 10269772 10269773 SRM_01884 SRM_01885     TRUE 0.918 103.000 0.029 NA   NA
 10269774 10269775 SRM_01886 SRM_01887 pol4   TRUE 0.927 39.000 0.015 1.000   NA
 10269776 10269777 SRM_01888 SRM_01889 acs pabB TRUE 0.440 124.000 0.000 1.000 N NA
 10269777 10269778 SRM_01889 SRM_01891 pabB yiaY TRUE 0.479 109.000 0.000 1.000 N NA
 10269779 10269780 SRM_01890 SRM_01892 nemA   TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10269781 10269782 SRM_01893 SRM_01894   bhbA FALSE 0.341 -25.000 0.000 NA   NA
 10269784 10269785 SRM_01896 SRM_01897 mrpE mrpD TRUE 0.995 -73.000 0.810 1.000 Y NA
 10269785 10269786 SRM_01897 SRM_01898 mrpD mrpC TRUE 0.999 44.000 0.896 0.007 Y NA
 10269786 10269787 SRM_01898 SRM_01899 mrpC mnhB TRUE 0.994 46.000 0.278 NA   NA
 10269787 10269788 SRM_01899 SRM_01900 mnhB mnhA TRUE 0.973 -3.000 0.274 NA   NA
 10269788 10269789 SRM_01900 SRM_01901 mnhA mnhG TRUE 0.916 66.000 0.000 1.000 Y NA
 10269789 10269790 SRM_01901 SRM_01902 mnhG mrpF TRUE 0.998 42.000 0.614 1.000 Y NA
 10269791 10269792 SRM_01903 SRM_01904     TRUE 0.584 83.000 0.000 NA   NA
 10269792 10269793 SRM_01904 SRM_01905     TRUE 0.806 60.000 0.000 NA   NA
 10269793 10269794 SRM_01905 SRM_01906     TRUE 0.660 76.000 0.000 NA   NA
 10269795 10269796 SRM_01907 SRM_01908 caiA hemE TRUE 0.814 66.000 0.000 1.000 N NA
 10269796 10269797 SRM_01908 SRM_01909 hemE clcD TRUE 0.568 91.000 0.000 1.000 N NA
 10269798 10269799 SRM_01910 SRM_01911 cdsA   FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10269799 10269800 SRM_01911 SRM_01912     TRUE 0.776 64.000 0.000 NA   NA
 10269800 10269801 SRM_01912 SRM_01913     TRUE 0.473 93.000 0.000 NA   NA
 10269801 10269802 SRM_01913 SRM_01914     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269802 10269803 SRM_01914 SRM_01915   tnaA TRUE 0.527 95.000 0.000 1.000 N NA
 10269804 10269805 SRM_01916 SRM_01917 ansA hpt FALSE 0.348 147.000 0.000 1.000 N NA
 10269805 10269806 SRM_01917 SRM_01918 hpt mesJ TRUE 0.890 63.000 0.000 0.033 N NA
 10269806 10269807 SRM_01918 SRM_01919 mesJ mutL TRUE 0.816 32.000 0.003 0.093 N NA
 10269807 10269808 SRM_01919 SRM_01920 mutL cdsA FALSE 0.397 0.000 0.000 1.000 N NA
 10269808 10269809 SRM_01920 SRM_01921 cdsA   TRUE 0.746 48.000 0.000 NA   NA
 10269810 10269811 tRNA_22 SRM_01922     FALSE 0.069 315.000 0.000 NA   NA
 10269811 10269812 SRM_01922 SRM_01923     FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10269815 10269816 SRM_01926 SRM_01927     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10269816 10269817 SRM_01927 SRM_01928     TRUE 0.797 61.000 0.000 NA   NA
 10269818 10269819 SRM_01929 SRM_01930   ftsX TRUE 0.656 93.000 0.000 0.088 N NA
 10269819 10269820 SRM_01930 SRM_01931 ftsX   TRUE 0.888 46.000 0.000 1.000 Y NA
 10269820 10269821 SRM_01931 SRM_01932     FALSE 0.315 226.000 0.000 1.000 Y NA
 10269824 10269825 SRM_01935 SRM_01936 sodA   FALSE 0.231 163.000 0.000 NA   NA
 10269825 10269826 SRM_01936 SRM_01937     FALSE 0.340 -22.000 0.000 NA   NA
 10269826 10269827 SRM_01937 SRM_01938     TRUE 0.522 32.000 0.000 1.000   NA
 10269829 10269830 SRM_01940 SRM_01941     FALSE 0.022 1493.000 0.000 NA   NA
 10269830 10269831 SRM_01941 SRM_01942     FALSE 0.131 216.000 0.000 NA   NA
 10269831 10269832 SRM_01942 SRM_01943   argB TRUE 0.793 150.000 0.014 1.000   NA
 10269832 10269833 SRM_01943 SRM_01944 argB mmgC FALSE 0.117 253.000 0.000 1.000   NA
 10269835 10269836 SRM_01946 SRM_01947   usp TRUE 0.444 29.000 0.000 NA   NA
 10269836 10269837 SRM_01947 SRM_01948 usp usp TRUE 0.752 16.000 0.000 0.007 Y NA
 10269838 10269839 SRM_01949 SRM_01950     FALSE 0.334 -13.000 0.000 NA   NA
 10269840 10269841 SRM_01951 SRM_01952   hemL TRUE 0.667 42.000 0.000 1.000 N NA
 10269841 10269842 SRM_01952 SRM_01953 hemL   TRUE 0.645 82.000 0.000 1.000   NA
 10269842 10269843 SRM_01953 SRM_01954   hemH TRUE 0.853 56.000 0.000 1.000   NA
 10269843 10269844 SRM_01954 SRM_01955 hemH hemF TRUE 0.652 130.000 0.000 1.000 Y NA
 10269844 10269845 SRM_01955 SRM_01956 hemF rluD TRUE 0.509 98.000 0.000 1.000 N NA
 10269845 10269846 SRM_01956 SRM_01957 rluD   TRUE 0.841 53.000 0.000 1.000   NA
 10269846 10269847 SRM_01957 SRM_01959   dapG TRUE 0.538 34.000 0.000 1.000   NA
 10269848 10269849 SRM_01958 SRM_01960 spmA spmB TRUE 0.998 50.000 0.655 NA   NA
 10269850 10269851 SRM_01961 SRM_01962 dacB   TRUE 0.642 29.000 0.000 0.028 N NA
 10269851 10269852 SRM_01962 SRM_01963     FALSE 0.140 209.000 0.000 NA   NA
 10269853 10269854 SRM_01964 SRM_01965     FALSE 0.408 108.000 0.000 NA   NA
 10269855 10269856 SRM_01966 SRM_01967   phrB FALSE 0.375 18.000 0.000 NA   NA
 10269856 10269857 SRM_01967 SRM_01968 phrB gltP TRUE 0.475 110.000 0.000 1.000 N NA
 10269857 10269858 SRM_01968 SRM_01969 gltP   FALSE 0.255 154.000 0.000 NA   NA
 10269858 10269859 SRM_01969 SRM_01970   rpoC TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10269859 10269860 SRM_01970 SRM_01971 rpoC rpoB TRUE 0.998 112.000 0.851 0.001 Y NA
 10269860 10269861 SRM_01971 SRM_01972 rpoB rplL TRUE 0.779 436.000 0.223 1.000 N NA
 10269861 10269862 SRM_01972 SRM_01973 rplL rplJ TRUE 0.997 139.000 0.884 0.015 Y NA
 10269862 10269863 SRM_01973 SRM_01974 rplJ rplA TRUE 0.999 52.000 0.302 0.019 Y NA
 10269863 10269864 SRM_01974 SRM_01975 rplA rplK TRUE 0.997 121.000 0.838 0.019 Y NA
 10269864 10269865 SRM_01975 SRM_01976 rplK nusG TRUE 0.992 119.000 0.681 1.000 N NA
 10269865 10269866 SRM_01976 tRNA_23 nusG   FALSE 0.060 347.000 0.000 NA   NA
 10269866 10269867 tRNA_23 SRM_01977   tuf TRUE 0.494 91.000 0.000 NA   NA
 10269868 10269869 SRM_01978 SRM_01979     TRUE 0.573 8.000 0.000 0.001   NA
 10269869 10269870 SRM_01979 SRM_01980     FALSE 0.212 171.000 0.000 NA   NA
 10269871 10269872 SRM_01981 SRM_01982     TRUE 0.511 89.000 0.000 NA   NA
 10269872 10269873 SRM_01982 SRM_01983   scpA FALSE 0.034 547.000 0.000 NA   NA
 10269873 10269874 SRM_01983 SRM_01984 scpA galE FALSE 0.093 260.000 0.000 NA   NA
 10269874 10269875 SRM_01984 SRM_01985 galE pnpA TRUE 0.441 123.000 0.000 1.000 N NA
 10269875 10269876 SRM_01985 SRM_01986 pnpA rpsO TRUE 0.997 43.000 0.335 1.000 Y NA
 10269876 10269877 SRM_01986 SRM_01987 rpsO ribF TRUE 0.860 126.000 0.014 1.000 N NA
 10269877 10269878 SRM_01987 SRM_01988 ribF rbfA FALSE 0.115 267.000 0.000 1.000 N NA
 10269878 10269879 SRM_01988 SRM_01989 rbfA infB TRUE 0.998 77.000 0.530 1.000 Y NA
 10269879 10269880 SRM_01989 SRM_01990 infB nusA TRUE 0.996 71.000 0.342 1.000 N NA
 10269880 10269881 SRM_01990 SRM_01991 nusA   TRUE 0.999 64.000 0.759 NA   NA
 10269881 10269882 SRM_01991 SRM_01992   prfB FALSE 0.095 257.000 0.000 NA   NA
 10269882 10269883 SRM_01992 SRM_01993 prfB aspC FALSE 0.433 196.000 0.003 1.000 N NA
 10269887 10269888 SRM_01997 SRM_01998     TRUE 0.819 58.000 0.000 NA   NA
 10269888 10269889 SRM_01998 SRM_01999   rpsA FALSE 0.293 161.000 0.000 1.000 N NA
 10269889 10269890 SRM_01999 SRM_02000 rpsA cmk TRUE 0.925 223.000 0.281 1.000 N NA
 10269890 10269891 SRM_02000 SRM_02002 cmk   TRUE 0.785 48.000 0.000 1.000   NA
 10269892 10269893 SRM_02001 SRM_02003   mutA TRUE 0.849 60.000 0.000 1.000 N NA
 10269893 10269894 SRM_02003 SRM_02004 mutA mutB TRUE 0.950 65.000 0.000 0.001 Y NA
 10269894 10269895 SRM_02004 SRM_02005 mutB   TRUE 0.996 45.000 0.366 1.000 N NA
 10269895 10269896 SRM_02005 SRM_02006     TRUE 0.503 90.000 0.000 NA   NA
 10269896 10269897 SRM_02006 SRM_02007   glnS TRUE 0.473 93.000 0.000 NA   NA
 10269899 10269900 SRM_02009 SRM_02010     TRUE 0.802 23.000 0.006 1.000   NA
 10269900 10269901 SRM_02010 SRM_02011   ppiD TRUE 0.999 55.000 0.530 0.006   NA
 10269901 10269902 SRM_02011 SRM_02012 ppiD moxR TRUE 0.996 75.000 0.360 1.000   NA
 10269902 10269903 SRM_02012 SRM_02013 moxR nqrF TRUE 0.871 159.000 0.043 1.000   NA
 10269903 10269904 SRM_02013 SRM_02014 nqrF fxsA TRUE 0.772 130.000 0.006 1.000   NA
 10269906 10269907 SRM_02016 SRM_02017   pepP FALSE 0.408 108.000 0.000 NA   NA
 10269908 10269909 SRM_02018 SRM_02019 RecB   TRUE 0.987 49.000 0.035 0.048   NA
 10269909 10269910 SRM_02019 SRM_02020     FALSE 0.388 7.000 0.000 1.000   NA
 10269910 10269911 SRM_02020 SRM_02022     FALSE 0.370 17.000 0.000 NA   NA
 10269912 10269913 SRM_02021 SRM_02023     TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10269916 10269917 tRNA_24 tRNA_25     FALSE 0.376 116.000 0.000 NA   NA
 10269917 10269918 tRNA_25 tRNA_26     FALSE 0.387 20.000 0.000 NA   NA
 10269918 10269919 tRNA_26 tRNA_27     TRUE 0.789 62.000 0.000 NA   NA
 10269921 10269922 SRM_02027 SRM_02028 msrAB ftsH TRUE 0.914 49.000 0.000 1.000 Y NA
 10269923 10269924 SRM_02029 SRM_02030 acs   TRUE 0.461 108.000 0.000 1.000   NA
 10269925 10269926 SRM_02031 SRM_02033     FALSE 0.420 22.000 0.000 NA N NA
 10269927 10269928 SRM_02032 SRM_02034     TRUE 0.933 46.000 0.007 NA   NA
 10269929 10269930 SRM_02035 SRM_02036 vicK purA TRUE 0.568 91.000 0.000 1.000 N NA
 10269930 10269931 SRM_02036 SRM_02037 purA secF TRUE 0.857 54.000 0.000 1.000 N NA
 10269931 10269932 SRM_02037 SRM_02038 secF secD TRUE 0.998 61.000 0.130 0.001 Y NA
 10269932 10269933 SRM_02038 SRM_02039 secD   FALSE 0.259 153.000 0.000 NA   NA
 10269935 10269936 SRM_02041 SRM_02042   asnS FALSE 0.386 114.000 0.000 NA   NA
 10269936 10269937 SRM_02042 SRM_02043 asnS   TRUE 0.812 119.000 0.009 NA   NA
 10269939 10269940 tRNA_28 SRM_02045     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10269940 10269941 SRM_02045 SRM_02046   asd TRUE 0.935 79.000 0.009 1.000 N NA
 10269942 10269943 SRM_02047 SRM_02048 folD   TRUE 0.882 37.000 0.007 1.000 N NA
 10269944 10269945 SRM_02049 SRM_02050   surE TRUE 0.872 34.000 0.009 NA   NA
 10269945 10269946 SRM_02050 SRM_02051 surE panB TRUE 0.847 75.000 0.002 1.000   NA
 10269948 10269949 SRM_02053 SRM_02054 ompH   TRUE 0.974 4.000 0.113 1.000 Y NA
 10269949 10269950 SRM_02054 SRM_02055   uppS TRUE 0.890 170.000 0.065 1.000 N NA
 10269950 10269951 SRM_02055 SRM_02056 uppS   TRUE 0.917 58.000 0.002 1.000 N NA
 10269951 10269952 SRM_02056 SRM_02057   dxr TRUE 0.998 70.000 0.568 1.000 N NA
 10269953 10269954 SRM_02058 SRM_02059     TRUE 0.989 52.000 0.051 NA   NA
 10269954 10269955 SRM_02059 SRM_02060     TRUE 0.983 52.000 0.024 NA   NA
 10269955 10269956 SRM_02060 SRM_02061     FALSE 0.334 -13.000 0.000 NA   NA
 10269956 10269957 SRM_02061 SRM_02062   rfbD FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10269957 10269958 SRM_02062 SRM_02063 rfbD serS TRUE 0.899 47.000 0.003 1.000 N NA
 10269959 10269960 SRM_02064 SRM_02065 fbp   FALSE 0.376 116.000 0.000 NA   NA
 10269960 10269961 SRM_02065 SRM_02066   iscS TRUE 0.799 52.000 0.000 NA   NA
 10269963 10269964 SRM_02068 SRM_02069     TRUE 0.547 86.000 0.000 NA   NA
 10269964 10269965 SRM_02069 SRM_02070   purD TRUE 0.499 15.000 0.002 1.000   NA
 10269966 10269967 SRM_02071 SRM_02072     TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10269967 10269968 SRM_02072 SRM_02073   nodB TRUE 0.785 48.000 0.000 1.000   NA
 10269968 10269969 SRM_02073 SRM_02074 nodB acnA FALSE 0.389 137.000 0.000 1.000 N NA
 10269970 10269971 SRM_02075 SRM_02076   sbcC FALSE 0.420 111.000 0.000 NA N NA
 10269971 10269972 SRM_02076 SRM_02077 sbcC   TRUE 0.494 91.000 0.000 NA   NA
 10269972 10269973 SRM_02077 SRM_02078   cvpA FALSE 0.405 109.000 0.000 NA   NA
 10269973 10269974 SRM_02078 SRM_02079 cvpA   TRUE 0.878 157.000 0.043 1.000   NA
 10269974 10269975 SRM_02079 SRM_02080   ptsI TRUE 0.645 82.000 0.000 1.000   NA
 10269975 10269976 SRM_02080 SRM_02081 ptsI   TRUE 0.987 7.000 0.163 0.001 Y NA
 10269976 10269977 SRM_02081 SRM_02082   idsA TRUE 0.845 96.000 0.007 1.000 N NA
 10269977 10269978 SRM_02082 SRM_02083 idsA adk TRUE 0.850 19.000 0.011 1.000 N NA
 10269978 10269979 SRM_02083 SRM_02084 adk   TRUE 0.999 58.000 1.000 1.000   NA
 10269979 10269980 SRM_02084 SRM_02085     TRUE 0.819 58.000 0.000 NA   NA
 10269983 10269984 SRM_02088 SRM_02089 ispH   TRUE 0.942 93.000 0.032 1.000   NA
 10269984 10269985 SRM_02089 SRM_02090   argE FALSE 0.231 178.000 0.000 1.000   NA
 10269985 10269986 SRM_02090 tRNA_29 argE   FALSE 0.142 208.000 0.000 NA   NA
 10269986 10269987 tRNA_29 SRM_02091     FALSE 0.034 547.000 0.000 NA   NA
 10269988 10269989 SRM_02092 SRM_02093     FALSE 0.063 340.000 0.000 NA   NA
 10269989 10269990 SRM_02093 SRM_02094     FALSE 0.344 -31.000 0.000 NA   NA
 10269990 10269991 SRM_02094 SRM_02095     FALSE 0.386 114.000 0.000 NA   NA
 10269993 10269994 SRM_02097 SRM_02098 nudH nagD TRUE 0.541 -7.000 0.000 0.015 N NA
 10269998 10269999 SRM_02102 SRM_02103     FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10269999 10270000 SRM_02103 SRM_02104     TRUE 0.482 92.000 0.000 NA   NA
 10270000 10270001 SRM_02104 SRM_02105   pepN FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10270001 10270002 SRM_02105 SRM_02106 pepN   FALSE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10270002 10270003 SRM_02106 tRNA_30     FALSE 0.024 1133.000 0.000 NA   NA
 10270003 10270004 tRNA_30 SRM_02107     FALSE 0.410 107.000 0.000 NA   NA
 10270007 10270008 SRM_02110 SRM_02111 idi   TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10270008 10270009 SRM_02111 SRM_02112     TRUE 0.452 95.000 0.000 NA   NA
 10270009 10270010 SRM_02112 SRM_02113   gatB FALSE 0.390 113.000 0.000 NA   NA
 10270010 10270011 SRM_02113 SRM_02114 gatB   TRUE 0.547 9.000 0.002 1.000   NA
 10270011 10270012 SRM_02114 SRM_02115     TRUE 0.522 32.000 0.000 1.000   NA
 10270012 10270013 SRM_02115 SRM_02116   tpiA TRUE 0.799 48.000 0.000 1.000 N NA
 10270013 10270014 SRM_02116 SRM_02117 tpiA fbaB FALSE 0.331 258.000 0.000 0.042 Y NA
 10270016 10270017 SRM_02119 SRM_02120     TRUE 0.556 36.000 0.000 1.000   NA
 10270017 10270018 SRM_02120 SRM_02121     TRUE 0.994 78.000 0.103 0.005 Y NA
 10270018 10270019 SRM_02121 SRM_02122     TRUE 1.000 50.000 0.874 0.005 Y NA
 10270020 10270021 SRM_02123 SRM_02124 nadA nadC TRUE 0.999 54.000 0.198 0.003 Y NA
 10270021 10270022 SRM_02124 SRM_02125 nadC nadB TRUE 0.950 44.000 0.005 1.000 Y NA
 10270022 10270023 SRM_02125 SRM_02126 nadB   FALSE 0.125 221.000 0.000 NA   NA
 10270023 10270024 SRM_02126 SRM_02127     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10270024 10270025 SRM_02127 SRM_02128     FALSE 0.096 254.000 0.000 NA   NA
 10270025 10270026 SRM_02128 SRM_02129     TRUE 0.603 81.000 0.000 NA   NA
 10270026 10270027 SRM_02129 SRM_02130     TRUE 0.813 59.000 0.000 NA   NA
 10270027 10270028 SRM_02130 SRM_02131     FALSE 0.057 354.000 0.000 NA   NA
 10270028 10270029 SRM_02131 SRM_02132     FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10270029 10270030 SRM_02132 SRM_02133     FALSE 0.049 406.000 0.000 NA   NA
 10270030 10270031 SRM_02133 SRM_02134     FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10270031 10270032 SRM_02134 SRM_02135     TRUE 0.974 39.000 0.087 NA   NA
 10270032 10270033 SRM_02135 SRM_02136     TRUE 0.511 89.000 0.000 NA   NA
 10270034 10270035 SRM_02137 SRM_02138     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10270037 10270038 SRM_02140 SRM_02141     TRUE 0.473 33.000 0.000 NA   NA
 10270038 10270039 SRM_02141 SRM_02142   glgC FALSE 0.279 148.000 0.000 NA   NA
 10270039 10270040 SRM_02142 SRM_02143 glgC rfaG TRUE 0.988 59.000 0.030 1.000 N NA
 10270040 10270041 SRM_02143 SRM_02144 rfaG   FALSE 0.050 395.000 0.000 NA   NA
 10270041 10270042 SRM_02144 SRM_02145     FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10270043 10270044 SRM_02146 SRM_02147     FALSE 0.219 167.000 0.000 NA   NA
 10270047 10270048 SRM_02150 SRM_02151     FALSE 0.376 116.000 0.000 NA   NA
 10270048 10270049 SRM_02151 SRM_02152     FALSE 0.371 121.000 0.000 NA   NA
 10270049 10270050 SRM_02152 SRM_02153     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10270052 10270053 SRM_02155 SRM_02156 tal   FALSE 0.344 143.000 0.000 1.000   NA
 10270053 10270054 SRM_02156 SRM_02157   glcD FALSE 0.107 267.000 0.000 1.000   NA
 10270057 10270058 SRM_02160 SRM_02161 pcm   TRUE 0.936 66.000 0.005 NA   NA
 10270058 10270059 SRM_02161 SRM_02162   folP TRUE 0.968 61.000 0.009 NA   NA
 10270060 10270061 SRM_02163 SRM_02164 GH3 rpoD TRUE 0.692 249.000 0.043 NA   NA
 10270061 10270062 SRM_02164 SRM_02165 rpoD   TRUE 0.510 37.000 0.000 NA   NA
 10270062 10270063 SRM_02165 SRM_02166   fadL FALSE 0.116 230.000 0.000 NA   NA
 10270063 10270064 SRM_02166 SRM_02167 fadL   TRUE 0.926 4.000 0.051 1.000   NA
 10270065 10270066 SRM_02168 SRM_02169   ftsX TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10270066 10270067 SRM_02169 SRM_02170 ftsX pheA FALSE 0.063 421.000 0.000 1.000 N NA
 10270067 10270068 SRM_02170 SRM_02171 pheA   FALSE 0.113 246.000 0.000 NA N NA
 10270068 10270069 SRM_02171 SRM_02172     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10270069 10270070 SRM_02172 SRM_02173     FALSE 0.353 13.000 0.000 NA   NA
 10270074 10270075 SRM_02177 SRM_02178 dut   TRUE 0.920 62.000 0.002 1.000 N NA
 10270076 10270077 SRM_02179 SRM_02180 aspS   TRUE 0.527 11.000 0.000 0.032   NA
 10270078 10270079 SRM_02181 SRM_02182   bkdA2 FALSE 0.371 121.000 0.000 NA   NA
 10270079 10270080 SRM_02182 SRM_02183 bkdA2   TRUE 0.509 98.000 0.000 1.000 N NA
 10270080 10270081 SRM_02183 SRM_02184     FALSE 0.423 121.000 0.000 1.000   NA
 10270081 10270082 SRM_02184 SRM_02185   pdhC TRUE 0.860 34.000 0.007 1.000   NA
 10270082 10270083 SRM_02185 SRM_02186 pdhC pdhB TRUE 0.993 96.000 0.254 0.041 Y NA
 10270083 10270084 SRM_02186 SRM_02187 pdhB pdhA TRUE 0.996 96.000 0.456 0.001 Y NA
 10270085 10270086 SRM_02188 SRM_02189 wcaA icd FALSE 0.288 146.000 0.000 NA   NA
 10270086 10270087 SRM_02189 SRM_02190 icd   TRUE 0.548 91.000 0.000 1.000   NA
 10270088 10270089 SRM_02191 SRM_02192     FALSE 0.336 -16.000 0.000 NA   NA
 10270090 10270091 SRM_02193 SRM_02194     TRUE 0.822 50.000 0.000 1.000 N NA
 10270091 10270092 SRM_02194 SRM_02195   mdtA TRUE 0.991 7.000 0.422 1.000 Y NA
 10270092 10270093 SRM_02195 SRM_02196 mdtA mdtB TRUE 0.997 47.000 0.449 NA N NA
 10270093 10270094 SRM_02196 SRM_02197 mdtB   TRUE 0.806 60.000 0.000 NA   NA
 10270094 10270095 SRM_02197 SRM_02198     TRUE 0.556 40.000 0.000 NA   NA
 10270095 10270096 SRM_02198 SRM_02199     TRUE 0.983 47.000 0.045 NA   NA
 10270097 10270098 SRM_02200 SRM_02201     FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10270098 10270099 SRM_02201 SRM_02202     TRUE 0.538 39.000 0.000 NA   NA
 10270100 10270101 SRM_02203 SRM_02204   usp TRUE 0.830 63.000 0.000 1.000 N NA
 10270101 10270102 SRM_02204 SRM_02205 usp   TRUE 0.465 106.000 0.000 1.000   NA
 10270103 10270104 SRM_02206 SRM_02207     TRUE 0.557 17.000 0.000 0.023   NA
 10270108 10270109 SRM_02210 SRM_02211     FALSE 0.026 792.000 0.000 NA   NA
 10270110 10270111 SRM_02212 SRM_02213 pol   FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 10270111 10270112 SRM_02213 SRM_02214     FALSE 0.144 207.000 0.000 NA   NA
 10270112 10270113 SRM_02214 SRM_02215     FALSE 0.403 23.000 0.000 NA   NA
 10270113 10270114 SRM_02215 SRM_02216   putP TRUE 0.987 44.000 0.130 NA   NA
 10270115 10270116 SRM_02217 SRM_02218 ppa   FALSE 0.084 273.000 0.000 NA   NA
 10270116 10270117 SRM_02218 SRM_02219     FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10270117 10270118 SRM_02219 SRM_02220     FALSE 0.204 173.000 0.000 NA   NA
 10270118 10270119 SRM_02220 SRM_02221     FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10270119 10270120 SRM_02221 SRM_02222     FALSE 0.209 172.000 0.000 NA   NA
 10270120 10270121 SRM_02222 SRM_02223     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10270121 10270122 SRM_02223 SRM_02224   sbcD TRUE 0.994 21.000 0.875 1.000   NA
 10270123 10270124 SRM_02225 SRM_02226     FALSE 0.274 149.000 0.000 NA   NA
 10270125 10270126 SRM_02227 SRM_02228   orfB TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10270126 10270127 SRM_02228 SRM_02229 orfB orfA TRUE 0.960 99.000 0.087 NA   NA
 10270127 10270128 SRM_02229 SRM_02230 orfA   FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10270129 10270130 SRM_02231 SRM_02232     FALSE 0.077 286.000 0.000 NA   NA
 10270130 10270131 SRM_02232 SRM_02233     TRUE 0.510 37.000 0.000 NA   NA
 10270132 10270133 SRM_02234 SRM_02235 putP   FALSE 0.382 4.000 0.000 1.000   NA
 10270133 10270134 SRM_02235 SRM_02236   glmS TRUE 0.608 40.000 0.000 1.000   NA
 10270134 10270135 SRM_02236 SRM_02237 glmS lacD TRUE 0.942 38.000 0.022 1.000   NA
 10270135 10270136 SRM_02237 SRM_02238 lacD   FALSE 0.031 624.000 0.000 NA   NA
 10270136 10270137 SRM_02238 SRM_02239     FALSE 0.036 518.000 0.000 NA   NA
 10270137 10270138 SRM_02239 SRM_02240   ppa FALSE 0.116 230.000 0.000 NA   NA
 10270139 10270140 SRM_02241 SRM_02242 cirA   TRUE 0.788 68.000 0.000 1.000   NA
 10270140 10270141 SRM_02242 SRM_02243     FALSE 0.300 142.000 0.000 NA   NA
 10270143 10270144 SRM_02245 SRM_02246     FALSE 0.240 159.000 0.000 NA   NA
 10270144 10270145 SRM_02246 SRM_02247     FALSE 0.405 109.000 0.000 NA   NA
 10270145 10270146 SRM_02247 SRM_02248     FALSE 0.038 499.000 0.000 NA   NA
 10270148 10270149 SRM_02249 tRNA_33     FALSE 0.147 205.000 0.000 NA   NA
 10270149 10270150 tRNA_33 SRM_02250     FALSE 0.114 231.000 0.000 NA   NA
 10270150 10270151 SRM_02250 SRM_02251   fabG TRUE 0.446 118.000 0.000 1.000 N NA
 10270151 10270152 SRM_02251 SRM_02252 fabG   TRUE 0.931 111.000 0.038 1.000   NA
 10270154 10270155 SRM_02254 SRM_02255 cysK   TRUE 0.921 146.000 0.076 NA   NA
 10270155 10270156 SRM_02255 SRM_02256   thiS TRUE 0.989 60.000 0.049 NA   NA
 10270156 10270157 SRM_02256 SRM_02257 thiS moeB TRUE 0.941 181.000 0.101 1.000 Y NA
 10270158 10270159 SRM_02258 SRM_02259   valS FALSE 0.038 497.000 0.000 NA   NA
 10270160 10270161 SRM_02260 SRM_02261 ideR   FALSE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10270162 10270163 SRM_02262 SRM_02263     TRUE 0.799 52.000 0.000 NA   NA
 10270163 10270164 SRM_02263 SRM_02264     FALSE 0.043 454.000 0.000 NA   NA
 10270164 10270165 SRM_02264 SRM_02265     FALSE 0.035 544.000 0.000 NA   NA
 10270165 10270166 SRM_02265 SRM_02266     TRUE 0.973 8.000 0.250 NA   NA
 10270166 10270167 SRM_02266 SRM_02267     TRUE 0.594 82.000 0.000 NA   NA
 10270169 10270170 SRM_02269 SRM_02270     TRUE 0.536 87.000 0.000 NA   NA
 10270170 10270171 SRM_02270 SRM_02271     FALSE 0.403 115.000 0.000 NA N NA
 10270171 10270172 SRM_02271 SRM_02272     TRUE 0.799 52.000 0.000 NA   NA
 10270172 10270173 SRM_02272 SRM_02273   nuoL TRUE 0.932 -10.000 0.071 NA   NA
 10270173 10270174 SRM_02273 SRM_02274 nuoL   FALSE 0.072 301.000 0.000 NA   NA
 10270174 10270175 SRM_02274 SRM_02275     TRUE 0.714 72.000 0.000 NA   NA
 10270175 10270176 SRM_02275 SRM_02276   crtI FALSE 0.395 10.000 0.000 1.000   NA
 10270176 10270177 SRM_02276 SRM_02277 crtI   TRUE 0.523 88.000 0.000 NA   NA
 10270177 10270178 SRM_02277 SRM_02278     FALSE 0.116 230.000 0.000 NA   NA
 10270178 10270179 SRM_02278 SRM_02279   aroC TRUE 0.479 109.000 0.000 1.000 N NA
 10270179 10270180 SRM_02279 SRM_02280 aroC degP FALSE 0.405 6.000 0.000 1.000 N NA
 10270180 10270181 SRM_02280 SRM_02281 degP   FALSE 0.173 213.000 0.000 1.000 N NA
 10270182 10270183 SRM_02282 SRM_02283     FALSE 0.057 357.000 0.000 NA   NA
 10270184 10270185 SRM_02284 SRM_02285 hemK yccX TRUE 0.611 39.000 0.000 1.000 N NA
 10270185 10270186 SRM_02285 SRM_02286 yccX phhA FALSE 0.282 165.000 0.000 1.000 N NA
 10270186 10270187 SRM_02286 SRM_02287 phhA   FALSE 0.184 184.000 0.000 NA   NA
 10270187 10270188 SRM_02287 SRM_02288   trxA TRUE 0.611 80.000 0.000 NA   NA
 10270188 10270189 SRM_02288 SRM_02289 trxA nadD TRUE 0.642 84.000 0.000 1.000 N NA
 10270189 10270190 SRM_02289 SRM_02290 nadD   TRUE 0.917 30.000 0.020 1.000   NA
 10270190 10270191 SRM_02290 SRM_02291     TRUE 0.639 168.000 0.004 0.013   NA
 10270191 10270192 SRM_02291 SRM_02292   guaA TRUE 0.764 -9.000 0.006 1.000 N NA
 10270192 10270193 SRM_02292 SRM_02293 guaA gcvH TRUE 0.525 118.000 0.002 1.000 N NA
 10270193 10270194 SRM_02293 SRM_02294 gcvH coaD FALSE 0.293 161.000 0.000 1.000 N NA
 10270194 10270195 SRM_02294 SRM_02295 coaD   TRUE 0.865 35.000 0.007 NA N NA
 10270195 10270196 SRM_02295 SRM_02296     TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10270197 10270198 SRM_02297 SRM_02298 pdxJ era TRUE 0.827 38.000 0.004 1.000   NA
 10270202 10270203 SRM_02302 SRM_02303   rfaG TRUE 0.678 75.000 0.000 NA   NA
 10270205 10270206 SRM_02305 SRM_02306     TRUE 0.873 49.000 0.002 1.000   NA
 10270206 10270207 SRM_02306 SRM_02307     FALSE 0.341 -25.000 0.000 NA   NA
 10270207 10270208 SRM_02307 SRM_02308     TRUE 0.584 83.000 0.000 NA   NA
 10270208 10270209 SRM_02308 SRM_02309     TRUE 0.484 34.000 0.000 NA   NA
 10270209 10270210 SRM_02309 SRM_02310   cspD FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10270210 10270211 SRM_02310 SRM_02311 cspD   TRUE 0.556 40.000 0.000 NA   NA
 10270211 10270212 SRM_02311 SRM_02312   yfiA FALSE 0.421 101.000 0.000 NA   NA
 10270215 10270216 SRM_02315 SRM_02316   ctaF TRUE 0.536 87.000 0.000 NA   NA
 10270216 10270217 SRM_02316 SRM_02317 ctaF ctaE TRUE 0.989 67.000 0.074 NA   NA
 10270217 10270218 SRM_02317 SRM_02318 ctaE ctaD TRUE 0.793 24.000 0.000 0.002 Y NA
 10270218 10270219 SRM_02318 SRM_02319 ctaD ctaC TRUE 0.987 -46.000 0.167 0.002 Y NA
 10270219 10270220 SRM_02319 SRM_02320 ctaC   FALSE 0.393 112.000 0.000 NA   NA
 10270220 10270221 SRM_02320 SRM_02321     TRUE 0.973 136.000 0.273 NA   NA
 10270221 10270222 SRM_02321 SRM_02322     TRUE 0.982 98.000 0.250 NA   NA
 10270222 10270223 SRM_02322 SRM_02323     TRUE 0.957 -3.000 0.141 NA   NA
 10270223 10270224 SRM_02323 SRM_02324     TRUE 0.999 60.000 0.730 NA   NA
 10270224 10270225 SRM_02324 SRM_02325     TRUE 0.910 50.000 0.000 NA Y NA
 10270225 10270226 SRM_02325 SRM_02326     TRUE 0.438 114.000 0.000 1.000   NA
 10270226 10270227 SRM_02326 SRM_02327     FALSE 0.029 1137.000 0.000 1.000   NA
 10270227 10270228 SRM_02327 SRM_02328     TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10270231 10270232 SRM_02331 SRM_02332   pfkA FALSE 0.333 -10.000 0.000 NA   NA
 10270232 10270233 SRM_02332 SRM_02333 pfkA   FALSE 0.352 -85.000 0.000 NA   NA
 10270233 10270234 SRM_02333 SRM_02334     FALSE 0.059 348.000 0.000 NA   NA
 10270234 10270235 SRM_02334 SRM_02335     FALSE 0.036 518.000 0.000 NA   NA
 10270238 10270239 SRM_02338 SRM_02340     TRUE 0.934 88.000 0.022 NA   NA
 10270240 10270241 SRM_02339 SRM_02341   mutY FALSE 0.195 178.000 0.000 NA   NA
 10270242 10270243 SRM_02342 SRM_02343     FALSE 0.375 18.000 0.000 NA   NA
 10270244 10270245 SRM_02344 SRM_02345 groS groL TRUE 0.974 96.000 0.039 0.087 Y NA
 10270248 10270249 SRM_02348 SRM_02349     TRUE 0.631 78.000 0.000 NA   NA
 10270249 10270250 SRM_02349 SRM_02350     FALSE 0.393 112.000 0.000 NA   NA
 10270251 10270252 SRM_02351 SRM_02352 hisD hisC TRUE 0.995 82.000 0.165 0.003 Y NA
 10270252 10270253 SRM_02352 SRM_02353 hisC   TRUE 0.645 82.000 0.000 1.000   NA
 10270253 10270254 SRM_02353 SRM_02354     TRUE 0.645 77.000 0.000 NA   NA
 10270255 10270256 SRM_02355 SRM_02356 punA   TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10270256 10270257 SRM_02356 SRM_02357   recX TRUE 0.880 73.000 0.003 NA   NA
 10270257 10270258 SRM_02357 SRM_02358 recX   TRUE 0.771 38.000 0.003 NA   NA
 10270258 10270259 SRM_02358 SRM_02359     TRUE 0.999 65.000 1.000 NA   NA
 10270259 10270260 SRM_02359 SRM_02360     TRUE 0.996 136.000 1.000 NA Y NA
 10270260 10270261 SRM_02360 SRM_02361   rpoD TRUE 0.992 139.000 1.000 NA N NA
 10270264 10270265 SRM_02364 SRM_02365 ccmF   FALSE 0.169 192.000 0.000 NA   NA
 10270265 10270266 SRM_02365 SRM_02366   ilvB FALSE 0.027 764.000 0.000 NA   NA
 10270266 10270267 SRM_02366 SRM_02367 ilvB ilvH TRUE 0.980 24.000 0.057 0.001 Y NA
 10270267 10270268 SRM_02367 SRM_02368 ilvH ilvC TRUE 0.982 84.000 0.023 0.001 Y NA
 10270268 10270269 SRM_02368 SRM_02369 ilvC leuB TRUE 0.728 -64.000 0.002 1.000 Y NA
 10270269 10270270 SRM_02369 SRM_02370 leuB leuA TRUE 0.848 176.000 0.008 0.001 Y NA
 10270270 10270271 SRM_02370 SRM_02371 leuA leuC TRUE 0.980 133.000 0.088 0.001 Y NA
 10270273 10270274 SRM_02373 SRM_02374 leuD ilvD TRUE 0.703 106.000 0.000 1.000 Y NA
 10270274 10270275 SRM_02374 SRM_02375 ilvD leuA TRUE 0.661 16.000 0.000 1.000 Y NA
 10270276 10270277 SRM_02376 SRM_02377     TRUE 0.556 40.000 0.000 NA   NA
 10270278 10270279 SRM_02378 SRM_02379     TRUE 0.527 33.000 0.000 1.000   NA
 10270280 10270281 SRM_02380 SRM_02381   mtnP FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10270281 10270282 SRM_02381 SRM_02382 mtnP   TRUE 0.521 96.000 0.000 1.000 N NA
 10270282 10270283 SRM_02382 SRM_02383     TRUE 0.910 197.000 0.176 NA   NA
 10270283 10270284 SRM_02383 SRM_02384   msbA FALSE 0.101 248.000 0.000 NA   NA
 10270284 10270285 SRM_02384 SRM_02385 msbA rnz TRUE 0.935 64.000 0.004 1.000   NA
 10270285 10270286 SRM_02385 SRM_02386 rnz   TRUE 0.714 118.000 0.004 1.000   NA
 10270286 10270287 SRM_02386 SRM_02387     FALSE 0.392 122.000 0.000 NA N NA
 10270287 10270288 SRM_02387 SRM_02388     TRUE 0.970 109.000 0.143 NA N NA
 10270288 10270289 SRM_02388 SRM_02389     TRUE 0.905 66.000 0.000 NA Y NA
 10270289 10270290 SRM_02389 SRM_02390   hprK FALSE 0.080 298.000 0.000 NA N NA
 10270290 10270291 SRM_02390 SRM_02391 hprK   TRUE 0.964 68.000 0.007 0.087   NA
 10270291 10270292 SRM_02391 SRM_02392   fmt TRUE 0.744 46.000 0.000 1.000   NA
 10270292 10270293 SRM_02392 SRM_02393 fmt ftsY TRUE 0.739 75.000 0.000 1.000 N NA
 10270293 10270294 SRM_02393 SRM_02394 ftsY pgsA TRUE 0.726 45.000 0.000 1.000 N NA
 10270294 10270295 SRM_02394 SRM_02395 pgsA   FALSE 0.103 247.000 0.000 NA   NA
 10270295 10270296 SRM_02395 SRM_02396     TRUE 0.822 55.000 0.000 NA   NA
 10270296 10270297 SRM_02396 SRM_02397     FALSE 0.192 179.000 0.000 NA   NA
 10270297 10270298 SRM_02397 SRM_02398     TRUE 0.584 83.000 0.000 NA   NA
 10270298 10270299 SRM_02398 SRM_02399     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10270299 10270300 SRM_02399 SRM_02400     FALSE 0.397 111.000 0.000 NA   NA
 10270300 10270301 SRM_02400 SRM_02401   cirA TRUE 0.956 102.000 0.083 NA   NA
 10270301 10270302 SRM_02401 SRM_02402 cirA adaB FALSE 0.060 439.000 0.000 1.000 N NA
 10270302 10270303 SRM_02402 SRM_02403 adaB   TRUE 0.502 36.000 0.000 NA   NA
 10270303 10270304 SRM_02403 SRM_02404     FALSE 0.086 271.000 0.000 NA   NA
 10270304 10270305 SRM_02404 SRM_02405     FALSE 0.413 105.000 0.000 NA   NA
 10270305 10270306 SRM_02405 SRM_02406   cirA TRUE 0.999 48.000 1.000 1.000   NA
 10270306 10270307 SRM_02406 SRM_02407 cirA   FALSE 0.047 540.000 0.000 1.000 N NA
 10270308 10270309 SRM_02408 SRM_02409 murB   FALSE 0.181 200.000 0.000 1.000   NA
 10270309 10270310 SRM_02409 SRM_02410     TRUE 0.527 1.000 0.000 0.011   NA
 10270310 10270311 SRM_02410 SRM_02411     FALSE 0.397 111.000 0.000 NA   NA
 10270311 10270312 SRM_02411 SRM_02412     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10270314 10270315 SRM_02413 SRM_02415 ccmB ccmC TRUE 0.994 10.000 0.501 0.082 Y NA
 10270315 10270316 SRM_02415 SRM_02416 ccmC   TRUE 0.817 -19.000 0.013 NA   NA
 10270316 10270317 SRM_02416 SRM_02417   ccmE TRUE 0.839 28.000 0.008 NA   NA
 10270317 10270318 SRM_02417 SRM_02418 ccmE   FALSE 0.348 11.000 0.000 NA   NA
 10270319 10270320 SRM_02419 SRM_02420 mgtE ksgA TRUE 0.985 71.000 0.047 1.000 N NA
 10270320 10270321 SRM_02420 SRM_02421 ksgA   TRUE 0.506 100.000 0.002 NA   NA
 10270321 10270322 SRM_02421 SRM_02422     TRUE 0.851 135.000 0.018 NA   NA
 10270322 10270323 SRM_02422 SRM_02423   ddlA TRUE 0.463 107.000 0.000 1.000   NA
 10270323 10270324 SRM_02423 SRM_02424 ddlA pyrC TRUE 0.889 73.000 0.003 1.000 N NA
 10270326 10270327 SRM_02426 SRM_02427     FALSE 0.110 264.000 0.000 1.000   NA
 10270329 10270330 SRM_02429 SRM_02430 lolD pntB FALSE 0.034 910.000 0.000 1.000 N NA
 10270330 10270331 SRM_02430 SRM_02431 pntB pntA TRUE 0.983 145.000 0.321 0.001   NA
 10270331 10270332 SRM_02431 SRM_02432 pntA pntA TRUE 0.989 178.000 0.829 0.001   NA
 10270332 10270333 SRM_02432 SRM_02433 pntA serC TRUE 0.798 96.000 0.004 1.000 N NA
 10270333 10270334 SRM_02433 SRM_02434 serC fklB FALSE 0.075 358.000 0.000 1.000 N NA
 10270337 10270338 SRM_02437 SRM_02438   ndh TRUE 0.822 55.000 0.000 NA   NA
 10270338 10270339 SRM_02438 SRM_02439 ndh   TRUE 0.594 82.000 0.000 NA   NA
 10270341 10270342 SRM_02441 SRM_02442 argG   TRUE 0.948 54.000 0.004 NA   NA
 10270342 10270343 SRM_02442 SRM_02443   argC FALSE 0.030 626.000 0.000 NA   NA
 10270343 10270344 SRM_02443 SRM_02444 argC argD TRUE 0.764 71.000 0.000 1.000   NA
 10270344 10270345 SRM_02444 SRM_02445 argD argF TRUE 0.997 71.000 0.221 1.000 Y NA
 10270345 10270346 SRM_02445 SRM_02446 argF argB TRUE 0.963 -85.000 0.056 1.000 Y NA
 10270346 10270347 SRM_02446 SRM_02447 argB argE TRUE 0.982 39.000 0.053 1.000 Y NA
 10270347 10270348 SRM_02447 SRM_02448 argE argH TRUE 0.991 68.000 0.039 1.000 Y NA
 10270349 10270350 SRM_02449 SRM_02450     FALSE 0.344 -31.000 0.000 NA   NA
 10270353 10270354 SRM_02452 SRM_02454     FALSE 0.083 276.000 0.000 NA   NA
 10270354 10270355 SRM_02454 SRM_02455     FALSE 0.269 150.000 0.000 NA   NA
 10270356 10270357 SRM_02456 SRM_02457     TRUE 0.999 48.000 0.952 0.082 Y NA
 10270357 10270358 SRM_02457 SRM_02458     TRUE 0.980 43.000 0.034 NA Y NA
 10270359 10270360 SRM_02459 SRM_02460     TRUE 0.536 87.000 0.000 NA   NA
 10270362 10270363 SRM_02462 SRM_02463 rho   TRUE 0.925 54.000 0.002 1.000   NA
 10270363 10270364 SRM_02463 SRM_02464     TRUE 0.824 165.000 0.025 1.000   NA
 10270365 10270366 SRM_02465 SRM_02466 motB   FALSE 0.294 156.000 0.000 1.000   NA
 10270372 10270373 SRM_02472 SRM_02473   pccB FALSE 0.061 364.000 0.000 NA N NA
 10270374 10270375 SRM_02474 SRM_02475     TRUE 0.560 0.000 0.000 0.001   NA
 10270375 10270376 SRM_02475 SRM_02476   rpoE FALSE 0.081 344.000 0.000 1.000 N NA
 10270376 10270377 SRM_02476 SRM_02477 rpoE   TRUE 0.802 51.000 0.000 NA N NA
 10270377 10270378 SRM_02477 SRM_02478     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10270378 10270379 SRM_02478 SRM_02479     FALSE 0.184 184.000 0.000 NA   NA
 10270380 10270381 SRM_02480 SRM_02481 susB   FALSE 0.032 585.000 0.000 NA   NA
 10270381 10270382 SRM_02481 SRM_02482   gdhA FALSE 0.348 132.000 0.000 NA   NA
 10270383 10270384 SRM_02483 SRM_02484 nhaP potE TRUE 0.688 43.000 0.000 1.000 N NA
 10270384 10270385 SRM_02484 SRM_02485 potE cat1 FALSE 0.221 406.000 0.000 0.003 Y NA
 10270385 10270386 SRM_02485 SRM_02486 cat1 potE TRUE 0.929 73.000 0.000 0.003 Y NA
 10270386 10270387 SRM_02486 SRM_02487 potE cat2 TRUE 0.899 79.000 0.000 0.003 Y NA
 10270387 10270388 SRM_02487 SRM_02488 cat2 uspA FALSE 0.376 -3.000 0.000 1.000   NA
 10270389 10270390 SRM_02489 SRM_02490 trkA cat3 TRUE 0.519 29.000 0.000 1.000 N NA
 10270391 10270392 SRM_02491 SRM_02492     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10270393 10270394 SRM_02493 SRM_02494 trkA2 trkA3 TRUE 0.492 198.000 0.000 0.005 Y NA
 10270394 10270395 SRM_02494 SRM_02495 trkA3 trkH1 TRUE 0.995 88.000 0.270 0.007 Y NA
 10270396 10270397 SRM_02496 SRM_02497 trkA4 trkH2 TRUE 0.718 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 10270397 10270398 SRM_02497 SRM_02498 trkH2 kefC1 FALSE 0.180 346.000 0.000 1.000 Y NA
 10270398 10270399 SRM_02498 SRM_02499 kefC1 kefC2 TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.001 Y NA
 10270399 10270400 SRM_02499 SRM_02500 kefC2 cat4 TRUE 0.459 114.000 0.000 1.000 N NA
 10270400 10270401 SRM_02500 SRM_02501 cat4 cat5 TRUE 0.928 46.000 0.000 0.003 Y NA
 10270401 10270402 SRM_02501 SRM_02502 cat5   FALSE 0.060 441.000 0.000 1.000 N NA
 10270402 10270403 SRM_02502 SRM_02503   aroE FALSE 0.282 165.000 0.000 1.000 N NA
 10270403 10270404 SRM_02503 SRM_02504 aroE   FALSE 0.209 172.000 0.000 NA   NA
 10270404 10270405 SRM_02504 SRM_02505     TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10270406 10270407 SRM_02506 SRM_02507     FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 10270407 10270408 SRM_02507 SRM_02508     FALSE 0.425 100.000 0.000 NA   NA
 10270410 10270411 SRM_02510 SRM_02511 msbA   FALSE 0.405 109.000 0.000 NA   NA
 10270411 10270412 SRM_02511 SRM_02512   nfnB FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10270412 10270413 SRM_02512 SRM_02513 nfnB   TRUE 0.488 104.000 0.000 1.000 N NA
 10270414 10270415 SRM_02514 SRM_02515 ilvA mcrA FALSE 0.068 389.000 0.000 1.000 N NA
 10270415 10270416 SRM_02515 SRM_02516 mcrA   FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10270418 10270419 SRM_02518 SRM_02519 drrA pstS TRUE 0.491 103.000 0.000 1.000 N NA
 10270419 10270420 SRM_02519 SRM_02520 pstS pstC TRUE 0.943 43.000 0.005 1.000 Y NA
 10270420 10270421 SRM_02520 SRM_02521 pstC pstA TRUE 0.996 29.000 0.485 0.002 Y NA
 10270421 10270422 SRM_02521 SRM_02522 pstA pstB TRUE 0.985 49.000 0.008 0.002 Y NA
 10270422 10270423 SRM_02522 SRM_02523 pstB phoU TRUE 0.992 46.000 0.087 NA Y NA
 10270424 10270425 SRM_02524 SRM_02525     TRUE 0.757 84.000 0.000 0.006   NA
 10270427 10270428 tRNA_34 SRM_02527   plsC TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10270429 10270430 SRM_02528 SRM_02529 ribD ribC TRUE 0.999 61.000 0.456 1.000 Y NA
 10270430 10270431 SRM_02529 SRM_02530 ribC   TRUE 0.577 41.000 0.000 NA   NA
 10270432 10270433 SRM_02531 SRM_02532     TRUE 0.776 64.000 0.000 NA   NA
 10270437 10270438 SRM_02536 SRM_02537 malS   FALSE 0.408 -19.000 0.000 1.000 N NA
 10270439 10270440 tRNA_35 tRNA_36     TRUE 0.494 91.000 0.000 NA   NA
 10270440 10270441 tRNA_36 SRM_02538   lysP FALSE 0.342 134.000 0.000 NA   NA
 10270443 10270444 SRM_02540 SRM_02541 pmc uvrD FALSE 0.431 -471.000 0.000 1.000 N NA
 10270444 10270445 SRM_02541 SRM_02542 uvrD   FALSE 0.424 27.000 0.000 NA   NA
 10270446 10270447 SRM_02543 SRM_02544 ilvE speG FALSE 0.330 147.000 0.000 1.000   NA
 10270447 10270448 SRM_02544 SRM_02545 speG chlI TRUE 0.979 52.000 0.016 1.000   NA
 10270448 10270449 SRM_02545 SRM_02546 chlI   FALSE 0.390 113.000 0.000 NA   NA
 10270449 10270450 SRM_02546 SRM_02547     FALSE 0.329 1.000 0.000 NA   NA
 10270451 10270452 SRM_02548 SRM_02549     FALSE 0.023 1296.000 0.000 NA   NA
 10270452 10270453 SRM_02549 SRM_02550     FALSE 0.307 157.000 0.000 1.000 N NA
 10270453 10270454 SRM_02550 SRM_02551   lytT TRUE 0.765 22.000 0.000 0.022 Y NA
 10270455 10270456 SRM_02552 SRM_02553   rimK TRUE 0.995 48.000 0.222 NA N NA
 10270456 10270457 SRM_02553 SRM_02554 rimK phrB FALSE 0.101 288.000 0.000 1.000 N NA
 10270461 10270462 SRM_02558 SRM_02559 glyQS   FALSE 0.392 21.000 0.000 NA   NA
 10270462 10270463 SRM_02559 SRM_02560   radC TRUE 0.797 61.000 0.000 NA   NA
 10270463 10270464 SRM_02560 SRM_02561 radC rho TRUE 0.949 129.000 0.080 1.000 N NA
 10270465 10270466 SRM_02562 SRM_02563   murF TRUE 0.864 116.000 0.015 NA N NA
 10270467 10270468 SRM_02564 SRM_02565     FALSE 0.100 277.000 0.000 1.000   NA
 10270468 10270469 SRM_02565 SRM_02566   acuC FALSE 0.058 451.000 0.000 1.000 N NA
 10270471 10270472 SRM_02568 SRM_02569   accA TRUE 0.795 39.000 0.003 1.000   NA
 10270474 10270475 SRM_02571 SRM_02572 dnaJ grpE TRUE 0.990 100.000 0.168 0.006 Y NA
 10270475 10270476 SRM_02572 SRM_02573 grpE hrcA TRUE 0.984 110.000 0.286 1.000 N NA
 10270478 10270479 SRM_02575 SRM_02577 gpmI nth TRUE 0.630 110.000 0.002 1.000 N NA
 10270481 10270482 SRM_02578 SRM_02579   hsp FALSE 0.195 178.000 0.000 NA   NA
 10270482 10270483 SRM_02579 SRM_02580 hsp fahA FALSE 0.145 214.000 0.000 NA N NA
 10270483 10270484 SRM_02580 SRM_02582 fahA   TRUE 0.964 94.000 0.085 NA   NA
 10270485 10270486 SRM_02581 SRM_02583 pilF sufS TRUE 0.774 70.000 0.000 1.000   NA
 10270487 10270488 SRM_02584 SRM_02585   acsA TRUE 0.813 59.000 0.000 NA   NA
 10270488 10270489 SRM_02585 SRM_02586 acsA   TRUE 0.797 61.000 0.000 NA   NA
 10270489 10270490 SRM_02586 SRM_02587   manB FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10270491 10270492 SRM_02588 SRM_02589 ctaA cyoE TRUE 0.997 54.000 0.112 1.000 Y NA
 10270492 10270493 SRM_02589 SRM_02590 cyoE   TRUE 0.981 68.000 0.027 1.000 N NA
 10270493 10270494 SRM_02590 SRM_02591     TRUE 0.974 24.000 0.108 0.085 N NA
 10270497 10270498 SRM_02594 SRM_02595 crtI ade TRUE 0.832 51.000 0.000 1.000 N NA
 10270498 10270499 SRM_02595 SRM_02596 ade   FALSE 0.263 152.000 0.000 NA   NA
 10270499 10270500 SRM_02596 SRM_02597   thrC TRUE 0.631 78.000 0.000 NA   NA
 10270500 10270501 SRM_02597 SRM_02598 thrC   FALSE 0.128 218.000 0.000 NA   NA
 10270501 10270502 SRM_02598 tRNA_37     FALSE 0.078 285.000 0.000 NA   NA
 10270502 10270503 tRNA_37 SRM_02599   fadD FALSE 0.134 213.000 0.000 NA   NA
 10270503 10270504 SRM_02599 SRM_02601 fadD pyrD TRUE 0.810 88.000 0.003 1.000 N NA
 10270507 10270508 SRM_02603 SRM_02604 mrdA ftsW TRUE 0.965 -3.000 0.161 1.000 N NA
 10270509 10270510 SRM_02605 SRM_02606 amt uvrA FALSE 0.361 144.000 0.000 1.000 N NA
 10270510 10270511 SRM_02606 SRM_02607 uvrA   FALSE 0.099 250.000 0.000 NA   NA
 10270511 10270512 SRM_02607 SRM_02608     FALSE 0.408 108.000 0.000 NA   NA
 10270512 10270513 SRM_02608 SRM_02609     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10270513 10270514 SRM_02609 SRM_02610     TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10270514 10270515 SRM_02610 SRM_02611   merA FALSE 0.274 149.000 0.000 NA   NA
 10270516 10270517 SRM_02612 SRM_02613 pleC   FALSE 0.433 19.000 0.000 1.000   NA
 10270519 10270520 SRM_02615 SRM_02616     FALSE 0.305 141.000 0.000 NA   NA
 10270521 10270522 SRM_02617 SRM_02618   fbpC FALSE 0.386 114.000 0.000 NA   NA
 10270522 10270523 SRM_02618 SRM_02619 fbpC fbpB TRUE 0.990 75.000 0.083 0.026 N NA
 10270523 10270524 SRM_02619 SRM_02620 fbpB fbpA TRUE 0.995 5.000 0.583 0.026 Y NA
 10270526 10270527 SRM_02622 SRM_02623 rfaG   FALSE 0.307 157.000 0.000 1.000 N NA
 10270527 10270528 SRM_02623 SRM_02624     FALSE 0.357 -199.000 0.000 NA   NA
 10270528 10270529 SRM_02624 SRM_02625   katG FALSE 0.331 -7.000 0.000 NA   NA
 10270531 10270532 SRM_02627 SRM_02628 wcaA gyrB TRUE 0.571 99.000 0.002 NA N NA
 10270534 10270535 SRM_02630 SRM_02631     FALSE 0.342 134.000 0.000 NA   NA
 10270535 10270536 SRM_02631 SRM_02632   hflX TRUE 0.555 141.000 0.002 1.000   NA
 10270536 10270537 SRM_02632 SRM_02633 hflX   FALSE 0.184 184.000 0.000 NA   NA
 10270537 10270538 SRM_02633 SRM_02634   mdmC TRUE 0.789 62.000 0.000 NA   NA
 10270538 10270539 SRM_02634 SRM_02635 mdmC   TRUE 0.786 51.000 0.000 NA   NA
 10270540 10270541 SRM_02636 SRM_02637     TRUE 0.908 124.000 0.033 NA   NA
 10270541 10270542 SRM_02637 SRM_02638   folC FALSE 0.361 128.000 0.000 NA   NA
 10270542 10270543 SRM_02638 SRM_02639 folC arsA TRUE 0.509 -3.000 0.000 0.085 N NA
 10270543 10270544 SRM_02639 SRM_02640 arsA hmgA FALSE 0.229 185.000 0.000 1.000 N NA
 10270544 10270545 SRM_02640 SRM_02641 hmgA wcaA TRUE 0.440 103.000 0.000 NA N NA
 10270545 10270546 SRM_02641 SRM_02642 wcaA   FALSE 0.295 144.000 0.000 NA   NA
 10270546 10270547 SRM_02642 SRM_02643     TRUE 0.660 76.000 0.000 NA   NA
 10270547 10270548 SRM_02643 SRM_02644   thiL TRUE 0.559 149.000 0.003 NA N NA
 10270549 10270550 SRM_02645 SRM_02646     FALSE 0.110 236.000 0.000 NA   NA
 10270551 10270552 SRM_02647 SRM_02648 atpD atpC TRUE 0.999 78.000 0.837 0.003 Y NA
 10270552 10270553 SRM_02648 SRM_02649 atpC   FALSE 0.346 212.000 0.000 1.000 Y NA
 10270555 10270556 SRM_02651 SRM_02652 alr   FALSE 0.117 229.000 0.000 NA   NA
 10270556 10270557 SRM_02652 SRM_02653     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10270557 10270558 SRM_02653 SRM_02654   cca FALSE 0.389 125.000 0.000 NA N NA
 10270559 10270560 SRM_02655 SRM_02656 ubiG   FALSE 0.415 10.000 0.000 1.000 N NA
 10270560 10270561 SRM_02656 SRM_02657   glpA FALSE 0.166 218.000 0.000 1.000 N NA
 10270562 10270563 SRM_02658 SRM_02659     FALSE 0.398 -43.000 0.000 1.000   NA
 10270564 10270565 SRM_02660 SRM_02661     FALSE 0.043 455.000 0.000 NA   NA
 10270565 10270566 SRM_02661 SRM_02662     TRUE 0.484 34.000 0.000 NA   NA
 10270566 10270567 SRM_02662 SRM_02663     TRUE 0.556 40.000 0.000 NA   NA
 10270567 10270568 SRM_02663 SRM_02664   sdhA FALSE 0.340 8.000 0.000 NA   NA
 10270568 10270569 SRM_02664 SRM_02665 sdhA icc FALSE 0.164 211.000 0.000 1.000   NA
 10270569 10270570 SRM_02665 SRM_02666 icc phoD FALSE 0.046 510.000 0.000 1.000   NA
 10270570 10270571 SRM_02666 SRM_02667 phoD   TRUE 0.998 70.000 0.333 1.000 Y NA
 10270572 10270573 SRM_02668 SRM_02669 dhrs   FALSE 0.065 597.000 0.000 0.022   NA
 10270574 10270575 SRM_02670 SRM_02671   cspC FALSE 0.424 131.000 0.000 1.000 N NA
 10270575 10270576 SRM_02671 SRM_02672 cspC phoA FALSE 0.188 206.000 0.000 1.000 N NA
 10270576 10270577 SRM_02672 SRM_02673 phoA   FALSE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10270577 10270578 SRM_02673 SRM_02674   pstB TRUE 0.978 67.000 0.025 NA   NA
 10270578 10270579 SRM_02674 SRM_02675 pstB   TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10270579 10270580 SRM_02675 SRM_02676   crcB1 TRUE 0.547 86.000 0.000 NA   NA
 10270580 10270581 SRM_02676 SRM_02677 crcB1   FALSE 0.387 20.000 0.000 NA   NA
 10270581 10270582 SRM_02677 SRM_02678     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10270582 10270583 SRM_02678 SRM_02679     TRUE 0.484 34.000 0.000 NA   NA
 10270583 10270584 SRM_02679 SRM_02680   ACR3 TRUE 0.556 40.000 0.000 NA   NA
 10270584 10270585 SRM_02680 SRM_02682 ACR3   TRUE 0.799 48.000 0.000 1.000 N NA
 10270586 10270587 SRM_02683 SRM_02684     FALSE 0.375 18.000 0.000 NA   NA
 10270587 10270588 SRM_02684 SRM_02685     FALSE 0.237 217.000 0.000 0.037   NA
 10270589 10270590 SRM_02686 SRM_02687     TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10270590 10270591 SRM_02687 SRM_02688     FALSE 0.392 21.000 0.000 NA   NA
 10270592 10270593 SRM_02689 SRM_02690     FALSE 0.338 7.000 0.000 NA   NA
 10270595 10270596 SRM_02691 SRM_02692     TRUE 0.968 4.000 0.171 1.000 N NA
 10270597 10270598 SRM_02693 SRM_02694     FALSE 0.329 1.000 0.000 NA   NA
 10270598 10270599 SRM_02694 SRM_02695     TRUE 0.806 60.000 0.000 NA   NA
 10270599 10270600 SRM_02695 SRM_02696     FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10270600 10270601 SRM_02696 SRM_02697     FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10270601 10270602 SRM_02697 SRM_02698     TRUE 0.997 46.000 0.512 NA   NA
 10270602 10270603 SRM_02698 SRM_02699     TRUE 0.989 110.000 0.512 NA   NA
 10270603 10270604 SRM_02699 SRM_02700     FALSE 0.372 120.000 0.000 NA   NA
 10270604 10270605 SRM_02700 SRM_02701     FALSE 0.305 141.000 0.000 NA   NA
 10270607 10270608 SRM_02703 SRM_02704   drrA TRUE 0.990 153.000 0.566 1.000 Y NA
 10270612 10270613 SRM_02708 SRM_02709 drrA   FALSE 0.103 247.000 0.000 NA   NA
 10270613 10270614 SRM_02709 SRM_02710   trmU FALSE 0.119 227.000 0.000 NA   NA
 10270616 10270617 SRM_02712 SRM_02713   amiB TRUE 0.558 85.000 0.000 NA   NA
 10270617 10270618 SRM_02713 SRM_02714 amiB   FALSE 0.269 150.000 0.000 NA   NA
 10270618 10270619 SRM_02714 SRM_02715   rpoE FALSE 0.358 -321.000 0.000 NA   NA
 10270619 10270620 SRM_02715 SRM_02716 rpoE radA FALSE 0.367 142.000 0.000 1.000 N NA
 10270621 10270622 SRM_02717 SRM_02718     TRUE 0.990 67.000 0.038 NA Y NA
 10270622 10270623 SRM_02718 SRM_02719     TRUE 0.997 58.000 0.133 NA Y NA
 10270623 10270624 SRM_02719 SRM_02720     TRUE 0.759 49.000 0.000 NA   NA
 10270626 10270627 SRM_02722 SRM_02723     FALSE 0.025 944.000 0.000 NA   NA
 10270627 10270628 SRM_02723 SRM_02724     FALSE 0.087 268.000 0.000 NA   NA
 10270629 10270630 SRM_02725 SRM_02726     FALSE 0.330 3.000 0.000 NA   NA
 10270630 10270631 SRM_02726 SRM_02727     FALSE 0.045 440.000 0.000 NA   NA
 10270632 10270633 SRM_02728 SRM_02729     FALSE 0.164 195.000 0.000 NA   NA
 10270633 10270634 SRM_02729 SRM_02730     FALSE 0.341 9.000 0.000 NA   NA
 10270634 10270635 SRM_02730 SRM_02731     FALSE 0.120 226.000 0.000 NA   NA
 10270636 10270637 SRM_02732 SRM_02733 mcp sop1 TRUE 0.904 57.000 0.000 0.079   NA
 10270637 10270638 SRM_02733 SRM_02734 sop1   FALSE 0.096 395.000 0.000 0.079   NA
 10270639 10270640 SRM_02735 SRM_02736     TRUE 0.602 7.000 0.000 NA Y NA
 10270641 10270642 SRM_02737 SRM_02738     TRUE 0.806 60.000 0.000 NA   NA
 10270643 10270644 SRM_02739 SRM_02740     FALSE 0.144 207.000 0.000 NA   NA
 10270646 10270647 SRM_02742 SRM_02743     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10270650 10270651 SRM_02746 SRM_02748   betA TRUE 0.992 101.000 0.652 NA   NA
 10270652 10270653 SRM_02747 SRM_02749 nagB   TRUE 0.662 111.000 0.000 NA Y NA
 10270653 10270654 SRM_02749 SRM_02750     FALSE 0.244 158.000 0.000 NA   NA
 10270654 10270655 SRM_02750 SRM_02751     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10270655 10270656 SRM_02751 SRM_02752     TRUE 0.645 77.000 0.000 NA   NA
 10270656 10270657 SRM_02752 SRM_02753     TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10270657 10270658 SRM_02753 SRM_02754     FALSE 0.387 20.000 0.000 NA   NA
 10270659 10270660 SRM_02755 SRM_02756 arsR   TRUE 0.726 45.000 0.000 1.000 N NA
 10270660 10270661 SRM_02756 SRM_02757     FALSE 0.263 152.000 0.000 NA   NA
 10270661 10270662 SRM_02757 SRM_02758     TRUE 0.510 37.000 0.000 NA   NA
 10270662 10270663 SRM_02758 SRM_02759   proS FALSE 0.255 154.000 0.000 NA   NA
 10270664 10270665 SRM_02760 SRM_02761     TRUE 0.603 81.000 0.000 NA   NA
 10270666 10270667 SRM_02762 SRM_02764   gcp FALSE 0.421 123.000 0.000 1.000   NA
 10270668 10270669 SRM_02763 SRM_02765     TRUE 0.897 61.000 0.002 NA   NA
 10270669 10270670 SRM_02765 SRM_02766     FALSE 0.350 12.000 0.000 NA   NA
 10270671 10270672 SRM_02767 SRM_02768     TRUE 0.558 85.000 0.000 NA   NA
 10270672 10270673 SRM_02768 SRM_02769     TRUE 0.481 24.000 0.000 1.000 N NA
 10270675 10270676 SRM_02771 SRM_02772 lipB   TRUE 0.914 64.000 0.003 NA   NA
 10270676 10270677 SRM_02772 SRM_02773   LYS9 FALSE 0.096 254.000 0.000 NA   NA
 10270677 10270678 SRM_02773 SRM_02774 LYS9 recR TRUE 0.593 19.000 0.002 1.000 N NA
 10270678 10270679 SRM_02774 SRM_02775 recR   TRUE 0.992 96.000 0.604 NA   NA
 10270679 10270680 SRM_02775 SRM_02776   dnaX TRUE 0.958 188.000 0.411 NA   NA
 10270680 10270681 SRM_02776 SRM_02777 dnaX   TRUE 0.645 77.000 0.000 NA   NA
 10270681 10270682 SRM_02777 SRM_02778   tdk FALSE 0.062 343.000 0.000 NA   NA
 10270682 10270683 SRM_02778 SRM_02779 tdk   FALSE 0.401 110.000 0.000 NA   NA
 10270683 10270684 SRM_02779 SRM_02780     FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10270684 10270685 SRM_02780 SRM_02781   yhgN TRUE 0.579 40.000 0.000 NA N NA
 10270687 10270688 SRM_02783 SRM_02784   batD TRUE 0.819 58.000 0.000 NA   NA
 10270688 10270689 SRM_02784 SRM_02785 batD   FALSE 0.359 -352.000 0.000 NA   NA
 10270689 10270690 SRM_02785 SRM_02786     TRUE 0.571 84.000 0.000 NA   NA
 10270690 10270691 SRM_02786 SRM_02787     TRUE 0.523 -3.000 0.000 0.013   NA
 10270691 10270692 SRM_02787 SRM_02788   batB TRUE 0.631 78.000 0.000 NA   NA
 10270692 10270693 SRM_02788 SRM_02789 batB   TRUE 0.997 66.000 0.404 NA   NA
 10270693 10270694 SRM_02789 SRM_02790   npdA TRUE 0.463 97.000 0.000 NA N NA
 10270694 10270695 SRM_02790 SRM_02791 npdA   TRUE 0.949 83.000 0.022 NA   NA
 10270695 10270696 SRM_02791 SRM_02792     TRUE 0.989 21.000 0.541 NA   NA
 10270696 10270697 SRM_02792 SRM_02793     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10270698 10270699 SRM_02794 SRM_02795 miaB capA FALSE 0.353 4.000 0.000 NA N NA
 10270699 10270700 SRM_02795 SRM_02796 capA   FALSE 0.371 121.000 0.000 NA   NA
 10270700 10270701 SRM_02796 SRM_02797     FALSE 0.098 251.000 0.000 NA   NA
 10270701 10270702 SRM_02797 SRM_02798   sop1 FALSE 0.063 340.000 0.000 NA   NA
 10270702 10270703 SRM_02798 SRM_02799 sop1   TRUE 0.709 86.000 0.000 0.078   NA
 10270704 10270705 SRM_02800 SRM_02801 fliA   TRUE 0.907 41.000 0.008 NA   NA
 10270705 10270706 SRM_02801 SRM_02802   flhG TRUE 0.981 -3.000 0.400 NA   NA
 10270706 10270707 SRM_02802 SRM_02803 flhG flhF TRUE 0.847 34.000 0.005 1.000 N NA
 10270707 10270708 SRM_02803 SRM_02804 flhF FlhA TRUE 0.994 28.000 0.440 1.000 Y NA
 10270708 10270709 SRM_02804 SRM_02805 FlhA flhB TRUE 0.931 13.000 0.012 0.005 Y NA
 10270709 10270710 SRM_02805 SRM_02806 flhB fliR TRUE 0.938 109.000 0.017 1.000 Y NA
 10270710 10270711 SRM_02806 SRM_02807 fliR fliQ TRUE 0.995 85.000 0.181 0.002 Y NA
 10270711 10270712 SRM_02807 SRM_02808 fliQ fliP TRUE 0.998 55.000 0.162 0.005 Y NA
 10270712 10270713 SRM_02808 SRM_02809 fliP fliO TRUE 0.989 -3.000 0.386 1.000 Y NA
 10270713 10270714 SRM_02809 SRM_02810 fliO fliN TRUE 0.984 34.000 0.090 1.000 Y NA
 10270714 10270715 SRM_02810 SRM_02811 fliN fliM TRUE 0.992 158.000 0.508 0.001 Y NA
 10270715 10270716 SRM_02811 SRM_02812 fliM fliL TRUE 0.992 60.000 0.016 0.001 Y NA
 10270716 10270717 SRM_02812 SRM_02813 fliL motB TRUE 0.991 141.000 0.500 1.000 Y NA
 10270717 10270718 SRM_02813 SRM_02814 motB motA TRUE 0.963 10.000 0.058 1.000 Y NA
 10270718 10270719 SRM_02814 SRM_02815 motA fixL TRUE 0.748 127.000 0.000 0.008 Y NA
 10270719 10270720 SRM_02815 SRM_02816 fixL   FALSE 0.342 -27.000 0.000 NA   NA
 10270720 10270721 SRM_02816 SRM_02817   vicK FALSE 0.365 126.000 0.000 NA   NA
 10270721 10270722 SRM_02817 SRM_02818 vicK   TRUE 0.992 107.000 0.667 NA   NA
 10270722 10270723 SRM_02818 SRM_02819   dcrH TRUE 0.784 63.000 0.000 NA   NA
 10270723 10270724 SRM_02819 SRM_02820 dcrH mltC FALSE 0.368 124.000 0.000 NA   NA
 10270724 10270725 SRM_02820 SRM_02821 mltC cheB TRUE 0.558 85.000 0.000 NA   NA
 10270725 10270726 SRM_02821 SRM_02822 cheB cheA TRUE 0.998 47.000 0.327 0.008 Y NA
 10270726 10270727 SRM_02822 SRM_02823 cheA   TRUE 0.957 69.000 0.009 NA   NA
 10270727 10270728 SRM_02823 SRM_02824   cheY TRUE 0.994 53.000 0.125 NA   NA
 10270728 10270729 SRM_02824 SRM_02825 cheY cheR TRUE 0.927 62.000 0.000 1.000 Y NA
 10270729 10270730 SRM_02825 SRM_02826 cheR cheW TRUE 0.888 46.000 0.000 1.000 Y NA
 10270730 10270731 SRM_02826 SRM_02827 cheW flgE TRUE 0.911 136.000 0.016 1.000 Y NA
 10270731 10270732 SRM_02827 SRM_02828 flgE   TRUE 0.941 158.000 0.157 NA   NA
 10270732 10270733 SRM_02828 SRM_02829   flgD TRUE 0.991 49.000 0.098 NA   NA
 10270733 10270734 SRM_02829 SRM_02830 flgD   TRUE 0.982 22.000 0.286 NA   NA
 10270734 10270735 SRM_02830 SRM_02831     TRUE 0.577 41.000 0.000 NA   NA
 10270735 10270736 SRM_02831 SRM_02832   fliJ FALSE 0.341 9.000 0.000 NA   NA
 10270736 10270737 SRM_02832 SRM_02833 fliJ fliI TRUE 0.989 23.000 0.241 1.000 Y NA
 10270737 10270738 SRM_02833 SRM_02834 fliI   TRUE 0.939 22.000 0.018 1.000 Y NA
 10270738 10270739 SRM_02834 SRM_02835   fliG TRUE 0.998 45.000 0.320 0.002 Y NA
 10270739 10270740 SRM_02835 SRM_02836 fliG fliF TRUE 0.999 58.000 0.477 0.004 Y NA
 10270740 10270741 SRM_02836 SRM_02837 fliF FliE TRUE 0.994 87.000 0.180 0.004 Y NA
 10270741 10270742 SRM_02837 SRM_02838 FliE   TRUE 0.955 80.000 0.022 NA   NA
 10270742 10270743 SRM_02838 SRM_02839   flgC TRUE 0.786 51.000 0.000 NA   NA
 10270744 10270745 SRM_02840 SRM_02841   ntrC TRUE 0.837 88.000 0.000 0.082 Y NA
 10270746 10270747 SRM_02842 SRM_02843     FALSE 0.368 124.000 0.000 NA   NA
 10270747 10270748 SRM_02843 SRM_02844   fliD TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10270748 10270749 SRM_02844 SRM_02845 fliD fliS TRUE 0.992 51.000 0.019 0.001 Y NA
 10270751 10270752 SRM_02847 SRM_02848     TRUE 0.556 40.000 0.000 NA   NA
 10270753 10270754 SRM_02849 SRM_02850     FALSE 0.361 128.000 0.000 NA   NA
 10270754 10270755 SRM_02850 SRM_02851     TRUE 0.960 99.000 0.087 NA   NA
 10270755 10270756 SRM_02851 SRM_02852   insB TRUE 0.926 51.000 0.000 1.000 Y NA
 10270759 10270760 SRM_02855 SRM_02856   flgL TRUE 0.723 73.000 0.000 NA N NA
 10270760 10270761 SRM_02856 SRM_02857 flgL flgK TRUE 0.994 41.000 0.125 0.001 Y NA
 10270761 10270762 SRM_02857 SRM_02858 flgK   TRUE 0.946 17.000 0.038 0.001   NA
 10270762 10270763 SRM_02858 SRM_02859     TRUE 0.899 -10.000 0.038 NA   NA
 10270763 10270764 SRM_02859 SRM_02860   flgI TRUE 0.989 42.000 0.222 NA   NA
 10270764 10270765 SRM_02860 SRM_02861 flgI flgH TRUE 0.998 55.000 0.133 0.005 Y NA
 10270765 10270766 SRM_02861 SRM_02862 flgH flgA TRUE 0.996 59.000 0.085 NA Y NA
 10270766 10270767 SRM_02862 SRM_02863 flgA flgG TRUE 0.954 27.000 0.028 NA Y NA
 10270767 10270768 SRM_02863 SRM_02864 flgG flgG TRUE 0.994 40.000 0.150 0.001 Y NA
 10270769 10270770 SRM_02865 SRM_02866     FALSE 0.366 16.000 0.000 NA   NA
 10270770 10270771 SRM_02866 SRM_02867   atoC FALSE 0.160 196.000 0.000 NA   NA
 10270771 10270772 SRM_02867 SRM_02868 atoC   TRUE 0.933 92.000 0.027 NA   NA
 10270773 10270774 SRM_02869 SRM_02871     TRUE 0.799 48.000 0.000 1.000 N NA
 10270775 10270776 SRM_02870 SRM_02872     TRUE 0.822 55.000 0.000 NA   NA
 10270776 10270777 SRM_02872 SRM_02873   purL FALSE 0.359 -355.000 0.000 NA   NA
 10270777 10270778 SRM_02873 SRM_02874 purL trxA FALSE 0.115 256.000 0.000 1.000   NA
 10270778 10270779 SRM_02874 SRM_02875 trxA trxB FALSE 0.192 196.000 0.000 1.000   NA
 10270779 10270780 SRM_02875 SRM_02876 trxB lysM TRUE 0.690 23.000 0.003 1.000   NA
 10270780 10270781 SRM_02876 SRM_02877 lysM ggt TRUE 0.781 69.000 0.000 1.000   NA
 10270782 10270783 SRM_02878 SRM_02879     TRUE 0.571 84.000 0.000 NA   NA
 10270783 10270784 SRM_02879 SRM_02880     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10270785 10270786 SRM_02881 SRM_02882     TRUE 0.813 59.000 0.000 NA   NA
 10270788 10270789 SRM_02884 SRM_02885   ruvC TRUE 0.997 57.000 0.277 NA   NA
 10270791 10270792 SRM_02887 SRM_02888     TRUE 0.741 174.000 0.018 NA   NA
 10270792 10270793 SRM_02888 SRM_02889   natB TRUE 0.999 56.000 0.619 NA   NA
 10270793 10270794 SRM_02889 SRM_02890 natB tig FALSE 0.350 136.000 0.000 NA N NA
 10270794 10270795 SRM_02890 SRM_02891 tig clpP TRUE 0.675 19.000 0.000 1.000 Y NA
 10270797 10270798 SRM_02892 SRM_02893 prsA   FALSE 0.393 112.000 0.000 NA   NA
 10270798 10270799 SRM_02893 SRM_02894     FALSE 0.274 149.000 0.000 NA   NA
 10270799 10270800 SRM_02894 SRM_02895     TRUE 0.976 75.000 0.040 NA   NA
 10270800 10270801 SRM_02895 SRM_02896   fabG TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10270803 10270804 SRM_02898 SRM_02899 phaR phaF TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10270804 10270805 SRM_02899 SRM_02900 phaF rssA FALSE 0.188 181.000 0.000 NA   NA
 10270806 10750575 SRM_02901 SRM_03087 ubiB   FALSE 0.169 192.000 0.000 NA   NA
 10270808 10270809 tRNA_40 tRNA_41     FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10270810 10270811 rRNA_2 SRM_02902     FALSE 0.068 318.000 0.000 NA   NA
 10270818 10270819 SRM_02909 SRM_02910 motB   TRUE 0.538 39.000 0.000 NA   NA
 10270819 10270820 SRM_02910 SRM_02912     TRUE 0.660 76.000 0.000 NA   NA
 10270821 10270822 SRM_02911 SRM_02913 tmk fur TRUE 0.748 89.000 0.002 1.000 N NA
 10270825 10270826 SRM_02916 SRM_02917 rfbB udg TRUE 0.997 49.000 0.191 1.000 Y NA
 10270826 10270827 SRM_02917 SRM_02918 udg   FALSE 0.039 675.000 0.000 1.000 N NA
 10270827 10270828 SRM_02918 SRM_02919   dsbD TRUE 0.837 81.000 0.000 1.000 Y NA
 10270829 10270830 SRM_02920 SRM_02921     FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10270830 10270831 SRM_02921 SRM_02922     FALSE 0.062 342.000 0.000 NA   NA
 10270831 10270832 SRM_02922 SRM_02923     FALSE 0.043 456.000 0.000 NA   NA
 10270833 10270834 SRM_02924 SRM_02925     FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10270834 10270835 SRM_02925 SRM_02926   mdtK FALSE 0.417 103.000 0.000 NA   NA
 10270837 10270838 SRM_02928 SRM_02929   dap2 TRUE 0.451 30.000 0.000 NA   NA
 10270838 10270839 SRM_02929 SRM_02930 dap2 ampC FALSE 0.348 147.000 0.000 1.000 N NA
 10270839 10270840 SRM_02930 SRM_02931 ampC   FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10270840 10270841 SRM_02931 SRM_02932     TRUE 0.523 38.000 0.000 NA   NA
 10270841 10270842 SRM_02932 SRM_02933     TRUE 0.523 88.000 0.000 NA   NA
 10270843 10270844 SRM_02934 SRM_02935   lytR TRUE 0.527 -22.000 0.000 0.021   NA
 10270844 10270845 SRM_02935 SRM_02936 lytR btuB FALSE 0.419 132.000 0.000 1.000 N NA
 10270845 10270846 SRM_02936 SRM_02937 btuB btuF FALSE 0.114 513.000 0.000 1.000 Y NA
 10270846 10270847 SRM_02937 SRM_02938 btuF btuC TRUE 0.996 7.000 0.852 1.000 Y NA
 10270847 10270848 SRM_02938 SRM_02939 btuC Iap FALSE 0.412 128.000 0.000 1.000   NA
 10270848 10270849 SRM_02939 SRM_02940 Iap hmuV TRUE 0.468 104.000 0.000 1.000   NA
 10270849 10270850 SRM_02940 SRM_02941 hmuV hemS TRUE 0.690 22.000 0.000 1.000 Y NA
 10270850 10270851 SRM_02941 SRM_02942 hemS   TRUE 0.813 59.000 0.000 NA   NA
 10270851 10270852 SRM_02942 SRM_02943   smtA FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10270854 10270855 SRM_02945 SRM_02946     TRUE 0.703 29.000 0.000 NA Y NA
 10270855 10270856 SRM_02946 SRM_02947     TRUE 0.998 46.000 0.667 NA   NA
 10270858 10270859 SRM_02949 SRM_02950 fabF   TRUE 0.903 49.000 0.000 NA Y NA
 10270859 10270860 SRM_02950 SRM_02951     TRUE 0.510 37.000 0.000 NA   NA
 10270860 10270861 SRM_02951 SRM_02952   estA TRUE 0.502 36.000 0.000 NA   NA
 10270861 10270862 SRM_02952 SRM_02953 estA   FALSE 0.370 17.000 0.000 NA   NA
 10270863 10270864 SRM_02954 SRM_02955     FALSE 0.412 106.000 0.000 NA   NA
 10270864 10270865 SRM_02955 SRM_02956   priA FALSE 0.261 166.000 0.000 1.000   NA
 10270865 10270866 SRM_02956 SRM_02957 priA   TRUE 0.486 106.000 0.000 1.000 N NA
 10270866 10270867 SRM_02957 SRM_02958   hrpB FALSE 0.117 266.000 0.000 1.000 N NA
 10270867 10270868 SRM_02958 SRM_02959 hrpB yfbT FALSE 0.164 211.000 0.000 1.000   NA
 10270870 10270871 SRM_02961 SRM_02962 ttg2D tolC TRUE 0.900 109.000 0.021 NA N NA
 10270873 10270874 SRM_02964 SRM_02965 fabF acpP TRUE 0.707 152.000 0.003 1.000 Y NA
 10270875 10270876 SRM_02966 SRM_02967 metK   FALSE 0.132 215.000 0.000 NA   NA
 10270876 10270877 SRM_02967 SRM_02968   sigW FALSE 0.126 220.000 0.000 NA   NA
 10270877 10270878 SRM_02968 SRM_02969 sigW   FALSE 0.338 -19.000 0.000 NA   NA
 10270878 10270879 SRM_02969 SRM_02970     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10270879 10270880 SRM_02970 SRM_02971     FALSE 0.347 -40.000 0.000 NA   NA
 10270882 10270883 SRM_02973 SRM_02974 rpoE   FALSE 0.297 143.000 0.000 NA   NA
 10270884 10270885 SRM_02975 SRM_02976     TRUE 0.786 51.000 0.000 NA   NA
 10270885 10270886 SRM_02976 SRM_02977   DPP4 FALSE 0.176 211.000 0.000 1.000 N NA
 10270886 10270887 SRM_02977 SRM_02978 DPP4   FALSE 0.342 134.000 0.000 NA   NA
 10270887 10270888 SRM_02978 SRM_02979   menB FALSE 0.348 11.000 0.000 NA   NA
 10270889 10270890 SRM_02980 SRM_02981     FALSE 0.405 109.000 0.000 NA   NA
 10270890 10270891 SRM_02981 SRM_02982     FALSE 0.269 150.000 0.000 NA   NA
 10270891 10270892 SRM_02982 SRM_02983     TRUE 0.817 54.000 0.000 NA   NA
 10270892 10270893 SRM_02983 SRM_02984     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10270895 10270896 SRM_02986 SRM_02987   acrR FALSE 0.343 148.000 0.000 1.000 N NA
 10270896 10270897 SRM_02987 SRM_02988 acrR   FALSE 0.387 135.000 0.000 1.000   NA
 10270897 10270898 SRM_02988 SRM_02989   msrA TRUE 0.450 111.000 0.000 1.000   NA
 10270898 10270899 SRM_02989 SRM_02990 msrA msrA TRUE 0.790 23.000 0.000 0.002 Y NA
 10270900 10270901 SRM_02991 SRM_02992 nhaC   TRUE 0.523 88.000 0.000 NA   NA
 10270902 10270903 SRM_02993 SRM_02994 putP hop TRUE 0.438 148.000 0.000 0.076   NA
 10270903 10270904 SRM_02994 SRM_02995 hop   FALSE 0.415 127.000 0.000 1.000   NA
 10270904 10270905 SRM_02995 SRM_02996     TRUE 0.482 92.000 0.000 NA   NA
 10270905 10270906 SRM_02996 SRM_02997     FALSE 0.201 174.000 0.000 NA   NA
 10270907 10270908 SRM_02998 SRM_02999 nuoH   FALSE 0.329 1.000 0.000 NA   NA
 10270908 10270909 SRM_02999 SRM_03000   tetR FALSE 0.078 285.000 0.000 NA   NA
 10270911 10270912 SRM_03002 SRM_03003     FALSE 0.397 22.000 0.000 NA   NA
 10270912 10270913 SRM_03003 SRM_03004     FALSE 0.058 353.000 0.000 NA   NA
 10270913 10270914 SRM_03004 SRM_03005     TRUE 0.510 37.000 0.000 NA   NA
 10270914 10270915 SRM_03005 SRM_03006   luxR FALSE 0.072 301.000 0.000 NA   NA
 10270915 10270916 SRM_03006 SRM_03007 luxR phoR TRUE 0.803 86.000 0.000 1.000 Y NA
 10270916 10270917 SRM_03007 SRM_03008 phoR coaE FALSE 0.077 509.000 0.000 0.080 N NA
 10270917 10270918 SRM_03008 SRM_03009 coaE   TRUE 0.519 29.000 0.000 1.000 N NA
 10270919 10270920 SRM_03010 SRM_03011   folE TRUE 0.997 53.000 0.141 1.000 Y NA
 10270920 10270921 SRM_03011 SRM_03012 folE   TRUE 0.978 71.000 0.027 1.000   NA
 10270927 10270928 tRNA_42 SRM_03018   thrS TRUE 0.494 91.000 0.000 NA   NA
 10270928 10270929 SRM_03018 SRM_03019 thrS infC TRUE 0.978 98.000 0.080 1.000 Y NA
 10270929 10270930 SRM_03019 SRM_03020 infC rpmI TRUE 0.994 130.000 0.652 1.000 Y NA
 10270930 10270931 SRM_03020 SRM_03021 rpmI rplT TRUE 0.995 157.000 0.928 0.013 Y NA
 10270933 10270934 SRM_03023 SRM_03024 pheS pheT TRUE 0.995 136.000 0.574 0.001 Y NA
 10270934 10270935 SRM_03024 SRM_03025 pheT   FALSE 0.204 173.000 0.000 NA   NA
 10270935 10270936 SRM_03025 SRM_03026     TRUE 0.444 29.000 0.000 NA   NA
 10270936 10270937 SRM_03026 SRM_03027     TRUE 0.776 64.000 0.000 NA   NA
 10270937 10270938 SRM_03027 SRM_03028     FALSE 0.408 108.000 0.000 NA   NA
 10270939 10270940 SRM_03029 SRM_03030 chiA   TRUE 0.776 64.000 0.000 NA   NA
 10270940 10270941 SRM_03030 SRM_03031     FALSE 0.216 169.000 0.000 NA   NA
 10270942 10270943 SRM_03032 SRM_03033   doc TRUE 0.807 15.000 0.009 NA   NA
 10270944 10270945 SRM_03034 SRM_03035 resA dsbD TRUE 0.961 58.000 0.000 0.003 Y NA
 10270946 10270947 SRM_03036 SRM_03037     FALSE 0.363 127.000 0.000 NA   NA
 10270949 10270950 SRM_03039 SRM_03040     FALSE 0.045 553.000 0.000 1.000 N NA
 10270950 10270951 SRM_03040 SRM_03041   acrA TRUE 0.722 98.000 0.000 1.000 Y NA
 10270951 10270952 SRM_03041 SRM_03042 acrA acrB TRUE 0.752 74.000 0.000 1.000 N NA
 10270952 10270953 SRM_03042 SRM_03043 acrB glnB TRUE 0.519 29.000 0.000 1.000 N NA
 10270953 10270954 SRM_03043 SRM_03044 glnB   TRUE 0.823 57.000 0.000 NA   NA
 10270956 10270957 SRM_03045 SRM_03047 ompR   TRUE 0.958 0.000 0.056 1.000 Y NA
 10270957 10270958 SRM_03047 SRM_03048     FALSE 0.206 415.000 0.000 0.010 Y NA
 10270960 10270961 SRM_03050 SRM_03051 phaF   FALSE 0.367 125.000 0.000 NA   NA
 10270961 10270962 SRM_03051 SRM_03052     FALSE 0.332 -9.000 0.000 NA   NA
 10270964 10270965 SRM_03054 SRM_03055   rbsR FALSE 0.167 193.000 0.000 NA   NA
 10270965 10270966 SRM_03055 SRM_03056 rbsR   FALSE 0.359 140.000 0.000 1.000   NA
 10270966 10270967 SRM_03056 SRM_03057   cirA FALSE 0.199 244.000 0.000 0.025   NA
 10270967 10270968 SRM_03057 SRM_03058 cirA   TRUE 0.992 83.000 0.333 NA   NA
 10270968 10270969 SRM_03058 SRM_03059     TRUE 0.786 51.000 0.000 NA   NA
 10270969 10270970 SRM_03059 SRM_03060   bglA TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10270970 10270971 SRM_03060 SRM_03061 bglA bglX TRUE 0.499 196.000 0.000 0.008 Y NA
 10270971 10270972 SRM_03061 SRM_03062 bglX   TRUE 0.852 78.000 0.000 1.000 Y NA
 10270973 10270974 SRM_03063 SRM_03064     TRUE 0.498 29.000 0.000 1.000   NA
 10270974 10270975 SRM_03064 SRM_03065   emrA TRUE 0.985 25.000 0.291 1.000 N NA
 10270975 10270976 SRM_03065 SRM_03066 emrA tolC TRUE 0.997 52.000 0.164 1.000 Y NA
 10270976 10270977 SRM_03066 SRM_03067 tolC salY TRUE 0.810 49.000 0.000 1.000 N NA
 10270977 10270978 SRM_03067 SRM_03068 salY ybjZ TRUE 0.999 52.000 0.293 0.076 Y NA
 10270978 10270979 SRM_03068 SRM_03069 ybjZ   TRUE 0.446 96.000 0.000 NA   NA
 10270979 10270980 SRM_03069 SRM_03070     FALSE 0.097 252.000 0.000 NA   NA
 10270980 10270981 SRM_03070 SRM_03071     FALSE 0.199 176.000 0.000 NA   NA
 10270981 10270982 SRM_03071 SRM_03072   lytT TRUE 0.799 52.000 0.000 NA   NA
 10270982 10270983 SRM_03072 SRM_03073 lytT lytS TRUE 0.747 120.000 0.000 0.021 Y NA
 10270983 10270984 SRM_03073 tRNA_43 lytS   FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10270984 10270985 tRNA_43 SRM_03074     FALSE 0.348 132.000 0.000 NA   NA
 10270986 10270987 SRM_03075 SRM_03076 cirA   TRUE 0.999 55.000 0.714 NA   NA
 10270987 10270988 SRM_03076 SRM_03077     TRUE 0.640 44.000 0.000 NA   NA
 10270992 10270993 SRM_03081 SRM_03082     FALSE 0.375 18.000 0.000 NA   NA
 10270993 10270994 SRM_03082 SRM_03083     TRUE 0.817 54.000 0.000 NA   NA
 10270994 10270995 SRM_03083 SRM_03084   gloA FALSE 0.081 280.000 0.000 NA   NA
 10270995 10270996 SRM_03084 SRM_03085 gloA   FALSE 0.109 237.000 0.000 NA   NA
 10267767 10267768 PSR_56001 PSR_56002     FALSE 0.093 289.000 0.000 1.000   NA
 10267771 10267772 PSR_56005 PSR_56006     FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 10267775 10267776 PSR_56009 PSR_56010     FALSE 0.334 -13.000 0.000 NA   NA
 10267776 10267777 PSR_56010 PSR_56011     TRUE 0.704 73.000 0.000 NA   NA
 10267777 10267778 PSR_56011 PSR_56012   pcrA TRUE 0.994 80.000 0.123 0.003 Y NA
 10267778 10267779 PSR_56012 PSR_56013 pcrA   TRUE 0.961 -19.000 0.154 NA   NA
 10267779 10267780 PSR_56013 PSR_56014   recJ TRUE 0.721 110.000 0.004 NA   NA
 10267781 10267782 PSR_56015 PSR_56016     FALSE 0.030 628.000 0.000 NA   NA
 10267784 10267785 PSR_56018 PSR_56019 recQ   FALSE 0.052 385.000 0.000 NA   NA
 10267785 10267786 PSR_56019 PSR_56020     FALSE 0.191 180.000 0.000 NA   NA
 10267786 10267787 PSR_56020 PSR_56021   hsdM FALSE 0.255 154.000 0.000 NA   NA
 10267787 10267788 PSR_56021 PSR_56022 hsdM   TRUE 0.603 81.000 0.000 NA   NA
 10267788 10267789 PSR_56022 PSR_56023   hsdR TRUE 0.930 9.000 0.062 NA   NA
 10267789 10267790 PSR_56023 PSR_56024 hsdR   TRUE 0.889 52.000 0.000 0.079   NA
 10267790 10267791 PSR_56024 PSR_56025   hsdS TRUE 0.470 103.000 0.000 1.000   NA
 10267791 10267792 PSR_56025 PSR_56026 hsdS hsdM TRUE 0.706 -13.000 0.000 0.041 Y NA
 10267792 10267793 PSR_56026 PSR_56027 hsdM   FALSE 0.180 185.000 0.000 NA   NA
 10267793 10267794 PSR_56027 PSR_56028   parA FALSE 0.330 3.000 0.000 NA   NA
 10267795 10267796 PSR_56029 PSR_56030     FALSE 0.028 726.000 0.000 NA   NA
 10267796 10267797 PSR_56030 PSR_56031     FALSE 0.031 623.000 0.000 NA   NA
 10267798 10267799 PSR_56032 PSR_56033     FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10267800 10267801 PSR_56034 PSR_56035     FALSE 0.028 686.000 0.000 NA   NA
 10267801 10267802 PSR_56035 PSR_56036   dinP FALSE 0.337 135.000 0.000 NA   NA
 10267802 10267803 PSR_56036 PSR_56037 dinP   TRUE 0.629 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 10267803 10267804 PSR_56037 PSR_56038     FALSE 0.228 164.000 0.000 NA   NA
 10267804 10267767 PSR_56038 PSR_56001     FALSE 0.021 3105.000 0.000 NA   NA
 10267805 10267806 PSR_61001 PSR_61002   tnp FALSE 0.164 195.000 0.000 NA   NA
 10267807 10267808 PSR_61003 PSR_61004     FALSE 0.043 454.000 0.000 NA   NA
 10267809 10267810 PSR_61005 PSR_61006     FALSE 0.237 160.000 0.000 NA   NA
 10267813 10267814 PSR_61009 PSR_61010   pilO FALSE 0.050 394.000 0.000 NA   NA
 10267814 10267815 PSR_61010 PSR_61011 pilO   FALSE 0.305 141.000 0.000 NA   NA
 10267816 10267817 PSR_61012 PSR_61013     FALSE 0.021 2453.000 0.000 NA   NA
 10267818 10267819 PSR_61014 PSR_61015     FALSE 0.333 -12.000 0.000 NA   NA
 10267819 10267820 PSR_61015 PSR_61016     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10267821 10267822 PSR_61017 PSR_61018     FALSE 0.164 195.000 0.000 NA   NA
 10267824 10267825 PSR_61020 PSR_61021     FALSE 0.027 769.000 0.000 NA   NA
 10267825 10267826 PSR_61021 PSR_61022   parA FALSE 0.028 692.000 0.000 NA   NA
 10267826 10267827 PSR_61022 PSR_61023 parA   FALSE 0.388 7.000 0.000 1.000   NA
 10267829 10267830 PSR_61025 PSR_61026     FALSE 0.330 3.000 0.000 NA   NA
 10267830 10267831 PSR_61026 PSR_61027     FALSE 0.022 1359.000 0.000 NA   NA
 10267833 10267834 PSR_61029 PSR_61030     FALSE 0.024 1071.000 0.000 NA   NA
 10267835 10267836 PSR_61031 PSR_61032     FALSE 0.027 775.000 0.000 NA   NA
 10267836 10267837 PSR_61032 PSR_61033     FALSE 0.022 1803.000 0.000 NA   NA
 10267837 10267838 PSR_61033 PSR_61034     TRUE 0.571 84.000 0.000 NA   NA
 10267839 10267840 PSR_61035 PSR_61036     FALSE 0.204 173.000 0.000 NA   NA
 10267844 10267845 PSR_61040 PSR_61041 tolB   FALSE 0.353 13.000 0.000 NA   NA
 10267849 10267850 PSR_61045 PSR_61046     FALSE 0.412 106.000 0.000 NA   NA
 10267850 10267851 PSR_61046 PSR_61047     TRUE 0.603 81.000 0.000 NA   NA
 10267851 10267852 PSR_61047 PSR_61048     FALSE 0.397 111.000 0.000 NA   NA
 10267852 10267853 PSR_61048 PSR_61049     FALSE 0.321 137.000 0.000 NA   NA
 10267855 10267856 PSR_11001 PSR_11002     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10267856 10267857 PSR_11002 PSR_11003     FALSE 0.039 492.000 0.000 NA   NA
 10267857 10267858 PSR_11003 PSR_11004     TRUE 0.468 32.000 0.000 NA   NA
 10267858 10267859 PSR_11004 PSR_11005     TRUE 0.987 -7.000 0.556 NA   NA
 10267859 10267860 PSR_11005 PSR_11006     TRUE 0.484 34.000 0.000 NA   NA
 10267860 10267861 PSR_11006 PSR_11007     FALSE 0.346 -37.000 0.000 NA   NA
 10267861 10267862 PSR_11007 PSR_11008     FALSE 0.392 21.000 0.000 NA   NA
 10267862 10267863 PSR_11008 PSR_11009     FALSE 0.331 -7.000 0.000 NA   NA
 10267864 10267865 PSR_11010 PSR_11011   parA TRUE 0.513 31.000 0.000 1.000   NA
 10267865 10267866 PSR_11011 PSR_11012 parA   FALSE 0.073 299.000 0.000 NA   NA
 10267867 10267855 PSR_11013 PSR_11001     FALSE 0.038 502.000 0.000 NA   NA