MicrobesOnline Operon Predictions for Salinibacter ruber

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10267868 10267869 SRM_00001 SRM_00002   dnaA TRUE 0.678 75.000 0.000 NA   NA
 10267869 10267870 SRM_00002 SRM_00003 dnaA dnaN TRUE 0.988 -3.000 0.328 1.000 Y NA
 10267870 10267871 SRM_00003 SRM_00004 dnaN   FALSE 0.064 332.000 0.000 NA   NA
 10267874 10267875 SRM_00007 SRM_00008   rpe TRUE 0.444 120.000 0.000 1.000 N NA
 10267876 10267877 SRM_00009 SRM_00010     TRUE 0.817 54.000 0.000 NA   NA
 10267879 10267880 SRM_00012 SRM_00013 yajC ribA TRUE 0.920 55.000 0.002 NA N NA
 10267880 10267881 SRM_00013 SRM_00014 ribA   TRUE 0.810 53.000 0.000 NA   NA
 10267883 10267884 SRM_00016 SRM_00017 nusB pphA TRUE 0.975 53.000 0.011 1.000   NA
 10267884 10267885 SRM_00017 SRM_00018 pphA   TRUE 0.600 86.000 0.000 1.000   NA
 10267885 10267886 SRM_00018 SRM_00019     FALSE 0.240 159.000 0.000 NA   NA
 10267886 10267887 SRM_00019 SRM_00020   lolC TRUE 0.660 76.000 0.000 NA   NA
 10267887 10267888 SRM_00020 SRM_00021 lolC comA TRUE 0.859 115.000 0.015 NA   NA
 10267888 10267889 SRM_00021 SRM_00022 comA rpmB TRUE 0.528 -70.000 0.002 1.000   NA
 10267889 10267890 SRM_00022 SRM_00023 rpmB rpmG TRUE 0.998 75.000 0.332 0.021 Y NA
 10267890 10267891 SRM_00023 SRM_00024 rpmG   TRUE 0.527 4.000 0.002 NA   NA
 10267891 10267892 SRM_00024 tRNA_1     FALSE 0.387 20.000 0.000 NA   NA
 10267892 10267893 tRNA_1 tRNA_2     FALSE 0.047 417.000 0.000 NA   NA
 10267894 10267895 SRM_00025 SRM_00026 dnaB dbh2 TRUE 0.932 115.000 0.044 1.000   NA
 10267895 10267896 SRM_00026 SRM_00027 dbh2 coaBC TRUE 0.924 25.000 0.027 1.000 N NA
 10267896 10267897 SRM_00027 SRM_00028 coaBC   TRUE 0.851 183.000 0.050 1.000   NA
 10267897 10267898 SRM_00028 SRM_00029   gmk TRUE 0.922 56.000 0.002 1.000   NA
 10267898 10267899 SRM_00029 SRM_00030 gmk   TRUE 0.979 19.000 0.276 NA   NA
 10267899 10267900 SRM_00030 tRNA_3     FALSE 0.375 117.000 0.000 NA   NA
 10267900 10267901 tRNA_3 SRM_00031   frr TRUE 0.764 66.000 0.000 NA   NA
 10267901 10267902 SRM_00031 SRM_00032 frr pyrH TRUE 0.998 49.000 0.626 1.000 N NA
 10267902 10267903 SRM_00032 SRM_00033 pyrH tsf TRUE 0.964 185.000 0.416 1.000 N NA
 10267903 10267904 SRM_00033 SRM_00034 tsf rpsB TRUE 0.999 68.000 0.748 1.000 Y NA
 10267904 10267905 SRM_00034 SRM_00035 rpsB rpsI TRUE 0.546 273.000 0.004 0.027 Y NA
 10267905 10267906 SRM_00035 SRM_00036 rpsI rplM TRUE 0.994 55.000 0.022 0.021 Y NA
 10267907 10267908 SRM_00037 SRM_00038   rpmF TRUE 0.977 170.000 0.599 NA   NA
 10267908 10267909 SRM_00038 SRM_00039 rpmF plsX TRUE 0.917 277.000 0.418 1.000 N NA
 10267909 10267910 SRM_00039 SRM_00040 plsX fabH TRUE 0.981 44.000 0.016 0.006 Y NA
 10267910 10267911 SRM_00040 SRM_00041 fabH fabD TRUE 0.941 3.000 0.018 0.006 Y NA
 10267911 10267912 SRM_00041 SRM_00042 fabD   TRUE 0.789 62.000 0.000 NA   NA
 10267912 10267913 SRM_00042 SRM_00043   fabG FALSE 0.184 184.000 0.000 NA   NA
 10267913 10267914 SRM_00043 SRM_00044 fabG deaD FALSE 0.168 217.000 0.000 1.000 N NA
 10267915 10267916 SRM_00045 SRM_00047     FALSE 0.034 548.000 0.000 NA   NA
 10267919 10267920 SRM_00049 SRM_00050 pepB   FALSE 0.130 240.000 0.000 1.000   NA
 10267921 10267922 tRNA_4 tRNA_5     TRUE 0.611 80.000 0.000 NA   NA
 10267923 10267924 SRM_00051 SRM_00052 rpmH   TRUE 0.991 7.000 0.787 1.000   NA
 10267924 10267925 SRM_00052 SRM_00053   oxaA TRUE 0.906 179.000 0.105 1.000   NA
 10267925 10267926 SRM_00053 SRM_00054 oxaA trmE TRUE 0.971 65.000 0.008 0.057   NA
 10267926 10267927 SRM_00054 SRM_00055 trmE   FALSE 0.203 191.000 0.000 1.000   NA
 10267927 10267928 SRM_00055 SRM_00056     TRUE 0.608 40.000 0.000 1.000   NA
 10267928 10267929 SRM_00056 SRM_00057     FALSE 0.154 198.000 0.000 NA   NA
 10267929 10267930 SRM_00057 SRM_00058     FALSE 0.094 258.000 0.000 NA   NA
 10267930 10267931 SRM_00058 SRM_00059   gidA FALSE 0.037 511.000 0.000 NA   NA
 10267931 10267932 SRM_00059 SRM_00060 gidA gidB TRUE 0.997 75.000 0.466 1.000 N NA
 10267932 10267933 SRM_00060 SRM_00061 gidB   TRUE 0.781 69.000 0.000 1.000   NA
 10267935 10267936 SRM_00063 SRM_00064     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10267937 10267938 SRM_00065 SRM_00066     TRUE 0.998 67.000 0.667 1.000   NA
 10267939 10267940 SRM_00067 SRM_00068   recF FALSE 0.026 806.000 0.000 NA   NA
 10267940 10267941 SRM_00068 SRM_00069 recF   TRUE 0.794 40.000 0.003 1.000   NA
 10267944 10267945 SRM_00072 SRM_00073 int int TRUE 0.581 116.000 0.000 0.009   NA
 10267946 10267947 SRM_00074 SRM_00075     FALSE 0.089 266.000 0.000 NA   NA
 10267947 10267948 SRM_00075 SRM_00076     FALSE 0.040 478.000 0.000 NA   NA
 10267948 10267949 SRM_00076 SRM_00077     FALSE 0.172 190.000 0.000 NA   NA
 10267949 10267950 SRM_00077 SRM_00078     FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10267953 10267954 SRM_00081 SRM_00082   merA TRUE 0.523 38.000 0.000 NA   NA
 10267954 10267955 SRM_00082 SRM_00083 merA zwf TRUE 0.832 51.000 0.000 1.000 N NA
 10267955 10267956 SRM_00083 SRM_00084 zwf gnd TRUE 0.987 76.000 0.043 1.000 Y NA
 10267956 10267957 SRM_00084 SRM_00085 gnd tal TRUE 0.986 140.000 0.208 0.004 Y NA
 10267957 10267958 SRM_00085 SRM_00087 tal   FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10267959 10267960 SRM_00086 SRM_00088     FALSE 0.041 463.000 0.000 NA   NA
 10267960 10267961 SRM_00088 SRM_00089     FALSE 0.153 219.000 0.000 1.000   NA
 10267961 10267962 SRM_00089 SRM_00090     FALSE 0.421 -67.000 0.000 1.000 N NA
 10267962 10267963 SRM_00090 SRM_00091     TRUE 0.649 -154.000 0.000 1.000 Y NA
 10267963 10267964 SRM_00091 SRM_00092   acrB TRUE 0.996 60.000 0.182 NA N NA
 10267964 10267965 SRM_00092 SRM_00093 acrB   FALSE 0.045 467.000 0.000 NA N NA
 10267966 10267967 SRM_00094 SRM_00095     FALSE 0.137 243.000 0.000 1.000 N NA
 10267967 10267968 SRM_00095 SRM_00096     TRUE 0.548 93.000 0.000 1.000 N NA
 10267969 10267970 SRM_00097 SRM_00098     TRUE 0.822 55.000 0.000 NA   NA
 10267970 10267971 SRM_00098 SRM_00099     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10267971 10267972 SRM_00099 SRM_00100   ppc FALSE 0.106 242.000 0.000 NA   NA
 10267973 10267974 SRM_00101 SRM_00102     FALSE 0.434 98.000 0.000 NA   NA
 10267975 10267976 SRM_00103 SRM_00104   lemA FALSE 0.106 242.000 0.000 NA   NA
 10267976 10267977 SRM_00104 SRM_00105 lemA   TRUE 0.971 60.000 0.010 NA   NA
 10267977 10267978 SRM_00105 SRM_00106     TRUE 0.914 18.000 0.037 NA   NA
 10267978 10267979 SRM_00106 SRM_00107   rlpA FALSE 0.417 16.000 0.000 1.000   NA
 10267979 10267980 SRM_00107 SRM_00108 rlpA   TRUE 0.511 89.000 0.000 NA   NA
 10267980 10267981 SRM_00108 SRM_00109   htpX FALSE 0.177 186.000 0.000 NA   NA
 10267981 10267982 SRM_00109 SRM_00110 htpX sco1 FALSE 0.384 5.000 0.000 1.000   NA
 10267982 10267983 SRM_00110 SRM_00111 sco1   FALSE 0.321 137.000 0.000 NA   NA
 10267983 10267984 SRM_00111 SRM_00112   zntA TRUE 0.438 25.000 0.000 NA N NA
 10267984 10267985 SRM_00112 SRM_00113 zntA   FALSE 0.166 218.000 0.000 1.000 N NA
 10267985 10267986 SRM_00113 SRM_00114     FALSE 0.120 376.000 0.000 0.010 N NA
 10267986 10267987 SRM_00114 SRM_00115   nlpC FALSE 0.137 219.000 0.000 NA N NA
 10267987 10267988 SRM_00115 SRM_00116 nlpC   FALSE 0.361 15.000 0.000 NA   NA
 10267990 10267991 SRM_00118 SRM_00119   bor FALSE 0.033 568.000 0.000 NA   NA
 10267991 10267992 SRM_00119 SRM_00120 bor   FALSE 0.359 129.000 0.000 NA   NA
 10267992 10267993 SRM_00120 SRM_00121     FALSE 0.338 7.000 0.000 NA   NA
 10267993 10267994 SRM_00121 SRM_00122     FALSE 0.237 160.000 0.000 NA   NA
 10267994 10267995 SRM_00122 SRM_00123     FALSE 0.154 198.000 0.000 NA   NA
 10267995 10267996 SRM_00123 SRM_00124     TRUE 0.768 65.000 0.000 NA   NA
 10267996 10267997 SRM_00124 SRM_00125     FALSE 0.259 153.000 0.000 NA   NA
 10267997 10267998 SRM_00125 SRM_00126   arsR FALSE 0.284 147.000 0.000 NA   NA
 10267999 10268000 SRM_00127 SRM_00128 hyuB   FALSE 0.184 184.000 0.000 NA   NA
 10268001 10268002 SRM_00129 SRM_00130     FALSE 0.025 967.000 0.000 NA   NA
 10268002 10268003 SRM_00130 SRM_00131     FALSE 0.344 -31.000 0.000 NA   NA
 10268005 10268006 SRM_00133 SRM_00134 cirA   FALSE 0.023 1154.000 0.000 NA   NA
 10268008 10268009 SRM_00136 SRM_00137     FALSE 0.209 172.000 0.000 NA   NA
 10268009 10268010 SRM_00137 SRM_00138     FALSE 0.021 2270.000 0.000 NA   NA
 10268010 10268011 SRM_00138 SRM_00139     FALSE 0.101 248.000 0.000 NA   NA
 10268011 10268012 SRM_00139 SRM_00140     TRUE 0.556 40.000 0.000 NA   NA
 10268012 10268013 SRM_00140 SRM_00141     FALSE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10268014 10268015 SRM_00142 SRM_00143     FALSE 0.113 232.000 0.000 NA   NA
 10268015 10268016 SRM_00143 SRM_00144     TRUE 0.439 97.000 0.000 NA   NA
 10268016 10268017 SRM_00144 SRM_00145     FALSE 0.430 99.000 0.000 NA   NA
 10268017 10268018 SRM_00145 SRM_00146     FALSE 0.175 187.000 0.000 NA   NA
 10268019 10268020 SRM_00147 SRM_00148     FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10268020 10268021 SRM_00148 SRM_00149     FALSE 0.284 147.000 0.000 NA   NA
 10268022 10268023 SRM_00150 SRM_00151     FALSE 0.219 167.000 0.000 NA   NA
 10268023 10268024 SRM_00151 SRM_00152     FALSE 0.166 194.000 0.000 NA   NA
 10268025 10268026 SRM_00153 SRM_00154 nrdB nrdA TRUE 0.993 104.000 0.269 0.001 Y NA
 10268026 10268027 SRM_00154 SRM_00155 nrdA ykhA TRUE 0.683 45.000 0.000 NA N NA
 10268029 10268030 SRM_00157 SRM_00158     TRUE 0.620 43.000 0.000 NA   NA
 10268030 10268031 SRM_00158 SRM_00159   hmp TRUE 0.823 57.000 0.000 NA   NA
 10268031 10268032 SRM_00159 SRM_00160 hmp   FALSE 0.059 442.000 0.000 1.000 N NA
 10268032 10268033 SRM_00160 SRM_00161     FALSE 0.029 676.000 0.000 NA   NA
 10268033 10268034 SRM_00161 SRM_00162     FALSE 0.434 98.000 0.000 NA   NA
 10268040 10268041 SRM_00168 SRM_00169   ark FALSE 0.353 131.000 0.000 NA   NA
 10268041 10268042 SRM_00169 SRM_00170 ark   FALSE 0.327 265.000 0.000 0.024 Y NA
 10268045 10268046 SRM_00173 SRM_00174     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268046 10268047 SRM_00174 SRM_00175     TRUE 0.742 69.000 0.000 NA   NA
 10268049 10268050 SRM_00177 SRM_00178     FALSE 0.026 811.000 0.000 NA   NA
 10268050 10268051 SRM_00178 SRM_00179     FALSE 0.031 625.000 0.000 NA   NA
 10268052 10268053 SRM_00180 SRM_00181     FALSE 0.365 126.000 0.000 NA   NA
 10268054 10268055 SRM_00182 SRM_00183     FALSE 0.233 162.000 0.000 NA   NA
 10268055 10268056 SRM_00183 SRM_00184     FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10268059 10268060 SRM_00187 SRM_00188     TRUE 0.603 81.000 0.000 NA   NA
 10268060 10268061 SRM_00188 SRM_00189     TRUE 0.942 67.000 0.000 0.008 Y NA
 10268061 10268062 SRM_00189 SRM_00190     FALSE 0.108 240.000 0.000 NA   NA
 10268062 10268063 SRM_00190 SRM_00191     FALSE 0.333 -10.000 0.000 NA   NA
 10268064 10268065 SRM_00192 SRM_00193     FALSE 0.039 491.000 0.000 NA   NA
 10268065 10268066 SRM_00193 SRM_00194     FALSE 0.023 1282.000 0.000 NA   NA
 10268066 10268067 SRM_00194 SRM_00195     FALSE 0.048 414.000 0.000 NA   NA
 10268067 10268068 SRM_00195 SRM_00196     TRUE 0.558 85.000 0.000 NA   NA
 10268068 10268069 SRM_00196 SRM_00197     FALSE 0.353 131.000 0.000 NA   NA
 10268069 10268070 SRM_00197 SRM_00198     TRUE 0.998 71.000 0.667 NA   NA
 10268070 10268071 SRM_00198 SRM_00199     FALSE 0.042 461.000 0.000 NA   NA
 10268073 10268074 SRM_00201 SRM_00202     FALSE 0.072 300.000 0.000 NA   NA
 10268074 10268075 SRM_00202 SRM_00203     FALSE 0.348 132.000 0.000 NA   NA
 10268076 10268077 SRM_00204 SRM_00205     FALSE 0.112 235.000 0.000 NA   NA
 10268077 10268078 SRM_00205 SRM_00206     FALSE 0.417 126.000 0.000 1.000   NA
 10268080 10268081 SRM_00208 SRM_00209     TRUE 0.547 118.000 0.000 0.066   NA
 10268082 10268083 SRM_00210 SRM_00211     FALSE 0.035 545.000 0.000 NA   NA
 10268084 10268085 SRM_00212 SRM_00213     FALSE 0.311 140.000 0.000 NA   NA
 10268085 10268086 SRM_00213 SRM_00214     FALSE 0.376 -3.000 0.000 1.000   NA
 10268086 10268087 SRM_00214 SRM_00215   asnB FALSE 0.376 -3.000 0.000 1.000   NA
 10268087 10268088 SRM_00215 SRM_00216 asnB   FALSE 0.025 1013.000 0.000 NA   NA
 10268088 10268089 SRM_00216 SRM_00217     FALSE 0.414 104.000 0.000 NA   NA
 10268089 10268090 SRM_00217 SRM_00218     FALSE 0.344 -31.000 0.000 NA   NA
 10268091 10268092 SRM_00219 SRM_00220     FALSE 0.184 198.000 0.000 1.000   NA
 10268094 10268095 SRM_00222 SRM_00223   fecR TRUE 0.823 57.000 0.000 NA   NA
 10268095 10268096 SRM_00223 SRM_00224 fecR rpoE FALSE 0.354 -10.000 0.000 NA N NA
 10268096 10268097 SRM_00224 SRM_00225 rpoE hyuA FALSE 0.299 159.000 0.000 1.000 N NA
 10268097 10268098 SRM_00225 SRM_00226 hyuA   FALSE 0.255 154.000 0.000 NA   NA
 10268098 10268099 SRM_00226 SRM_00227     FALSE 0.049 402.000 0.000 NA   NA
 10268099 10268100 SRM_00227 SRM_00228     FALSE 0.023 1157.000 0.000 NA   NA
 10268100 10268101 SRM_00228 SRM_00229     FALSE 0.359 129.000 0.000 NA   NA
 10268101 10268102 SRM_00229 SRM_00230     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10268102 10268103 SRM_00230 SRM_00231     FALSE 0.032 585.000 0.000 NA   NA
 10268103 10268104 SRM_00231 SRM_00232     FALSE 0.133 236.000 0.000 1.000   NA
 10268106 10268107 SRM_00234 SRM_00235     FALSE 0.387 20.000 0.000 NA   NA
 10268107 10268108 SRM_00235 SRM_00236     FALSE 0.366 16.000 0.000 NA   NA
 10268108 10268109 SRM_00236 SRM_00237     TRUE 0.992 53.000 0.077 NA   NA
 10268112 10268113 SRM_00240 SRM_00241     TRUE 0.558 85.000 0.000 NA   NA
 10268113 10268114 SRM_00241 SRM_00242     FALSE 0.361 128.000 0.000 NA   NA
 10268116 10268117 SRM_00244 SRM_00245   wzc FALSE 0.048 414.000 0.000 NA   NA
 10268117 10268118 SRM_00245 SRM_00246 wzc   TRUE 0.998 78.000 1.000 NA   NA
 10268118 10268119 SRM_00246 SRM_00247   wcaG FALSE 0.113 233.000 0.000 NA   NA
 10268119 10268120 SRM_00247 SRM_00248 wcaG wcaI TRUE 0.809 50.000 0.000 1.000   NA
 10268120 10268121 SRM_00248 SRM_00249 wcaI   FALSE 0.333 -10.000 0.000 NA   NA
 10268121 10268122 SRM_00249 SRM_00250     TRUE 0.714 72.000 0.000 NA   NA
 10268122 10268123 SRM_00250 SRM_00251     FALSE 0.414 104.000 0.000 NA   NA
 10268123 10268124 SRM_00251 SRM_00252   wcaA FALSE 0.253 155.000 0.000 NA   NA
 10268124 10268125 SRM_00252 SRM_00253 wcaA   FALSE 0.336 -16.000 0.000 NA   NA
 10268126 10268127 SRM_00254 SRM_00255     FALSE 0.036 517.000 0.000 NA   NA
 10268128 10268129 SRM_00256 SRM_00257 rfaG wcaA FALSE 0.022 1342.000 0.000 NA   NA
 10268129 10268130 SRM_00257 SRM_00258 wcaA rfaG FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10268130 10268131 SRM_00258 SRM_00259 rfaG   FALSE 0.417 16.000 0.000 1.000   NA
 10268131 10268132 SRM_00259 SRM_00260     TRUE 0.552 -25.000 0.000 0.005   NA
 10268132 10268133 SRM_00260 SRM_00261     TRUE 0.542 4.000 0.000 0.005   NA
 10268133 10268134 SRM_00261 SRM_00262   rfaG FALSE 0.376 -3.000 0.000 1.000   NA
 10268134 10268135 SRM_00262 SRM_00263 rfaG rfaG TRUE 0.718 -22.000 0.000 0.022 Y NA
 10268135 10268136 SRM_00263 SRM_00264 rfaG   TRUE 0.510 37.000 0.000 NA   NA
 10268136 10268137 SRM_00264 SRM_00265   rfaG FALSE 0.403 23.000 0.000 NA   NA
 10268137 10268138 SRM_00265 SRM_00266 rfaG rfaG TRUE 0.748 18.000 0.000 0.022 Y NA
 10268140 10268141 SRM_00268 SRM_00269 wcaA   FALSE 0.033 568.000 0.000 NA   NA
 10268141 10268142 SRM_00269 SRM_00270     TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10268142 10268143 SRM_00270 SRM_00271     TRUE 0.556 36.000 0.000 1.000   NA
 10268145 10268146 SRM_00273 SRM_00274     TRUE 0.844 59.000 0.000 1.000   NA
 10268146 10268147 SRM_00274 SRM_00275     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10268147 10268148 SRM_00275 SRM_00276   asnB FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268148 10268149 SRM_00276 SRM_00277 asnB   TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10268149 10268150 SRM_00277 SRM_00278     FALSE 0.026 868.000 0.000 NA   NA
 10268151 10268152 SRM_00279 SRM_00281     FALSE 0.097 252.000 0.000 NA   NA
 10268154 10268155 SRM_00282 SRM_00283     TRUE 0.444 29.000 0.000 NA   NA
 10268155 10268156 SRM_00283 SRM_00284     TRUE 0.723 71.000 0.000 NA   NA
 10268156 10268157 SRM_00284 SRM_00285     FALSE 0.044 447.000 0.000 NA   NA
 10268157 10268158 SRM_00285 SRM_00286     FALSE 0.053 376.000 0.000 NA   NA
 10268158 10268159 SRM_00286 SRM_00287     FALSE 0.024 1017.000 0.000 NA   NA
 10268159 10268160 SRM_00287 SRM_00288     FALSE 0.122 225.000 0.000 NA   NA
 10268160 10268161 SRM_00288 SRM_00289     FALSE 0.222 166.000 0.000 NA   NA
 10268162 10268163 SRM_00290 SRM_00291     FALSE 0.030 646.000 0.000 NA   NA
 10268163 10268164 SRM_00291 SRM_00292     FALSE 0.024 1105.000 0.000 NA   NA
 10268164 10268165 SRM_00292 SRM_00293     FALSE 0.355 -175.000 0.000 NA   NA
 10268165 10268166 SRM_00293 SRM_00294     FALSE 0.350 12.000 0.000 NA   NA
 10268168 10268169 SRM_00296 SRM_00297   groL TRUE 0.642 43.000 0.000 NA N NA
 10268169 10268170 SRM_00297 SRM_00298 groL phoA FALSE 0.039 660.000 0.000 1.000 N NA
 10268171 10268172 SRM_00299 SRM_00300     FALSE 0.029 683.000 0.000 NA   NA
 10268172 10268173 SRM_00300 SRM_00301   lytT FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268173 10268174 SRM_00301 SRM_00302 lytT lytS TRUE 0.964 -7.000 0.111 0.032   NA
 10268174 10268175 SRM_00302 SRM_00303 lytS insB TRUE 0.758 67.000 0.000 NA   NA
 10268175 10268176 SRM_00303 SRM_00304 insB insA FALSE 0.337 135.000 0.000 NA   NA
 10268176 10268177 SRM_00304 SRM_00306 insA   FALSE 0.338 -19.000 0.000 NA   NA
 10268178 10268179 SRM_00305 SRM_00307   ampC TRUE 0.660 76.000 0.000 NA   NA
 10268179 10268180 SRM_00307 SRM_00308 ampC   FALSE 0.028 695.000 0.000 NA   NA
 10268180 10268181 SRM_00308 SRM_00309     FALSE 0.032 590.000 0.000 NA   NA
 10268181 10268182 SRM_00309 SRM_00310     TRUE 0.450 111.000 0.000 1.000   NA
 10268182 10268183 SRM_00310 SRM_00311     FALSE 0.079 284.000 0.000 NA   NA
 10268183 10268184 SRM_00311 SRM_00312     FALSE 0.188 181.000 0.000 NA   NA
 10268185 10268186 SRM_00313 SRM_00314 lplA   FALSE 0.329 1.000 0.000 NA   NA
 10268186 10268187 SRM_00314 SRM_00315   fer FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10268187 10268188 SRM_00315 SRM_00316 fer   FALSE 0.425 100.000 0.000 NA   NA
 10268188 10268189 SRM_00316 SRM_00317   fdxA FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10268189 10268190 SRM_00317 SRM_00319 fdxA   FALSE 0.338 -19.000 0.000 NA   NA
 10268191 10268192 SRM_00318 SRM_00320     TRUE 0.494 91.000 0.000 NA   NA
 10268192 10268193 SRM_00320 SRM_00321     FALSE 0.030 769.000 0.000 NA N NA
 10268193 10268194 SRM_00321 SRM_00322     FALSE 0.063 335.000 0.000 NA   NA
 10268196 10268197 SRM_00324 SRM_00325 cirA   TRUE 0.999 63.000 1.000 NA   NA
 10268197 10268198 SRM_00325 SRM_00326     FALSE 0.098 251.000 0.000 NA   NA
 10268198 10268199 SRM_00326 SRM_00327     FALSE 0.361 15.000 0.000 NA   NA
 10268199 10268200 SRM_00327 SRM_00328     FALSE 0.425 100.000 0.000 NA   NA
 10268202 10268203 SRM_00330 SRM_00331 cirA   TRUE 0.996 36.000 1.000 NA   NA
 10268203 10268204 SRM_00331 SRM_00332     FALSE 0.233 162.000 0.000 NA   NA
 10268204 10268205 SRM_00332 SRM_00333     FALSE 0.259 153.000 0.000 NA   NA
 10268208 10268209 SRM_00336 SRM_00337     FALSE 0.033 559.000 0.000 NA   NA
 10268209 10268210 SRM_00337 SRM_00338   tonB TRUE 0.750 68.000 0.000 NA   NA
 10268210 10268211 SRM_00338 SRM_00339 tonB   FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10268211 10268212 SRM_00339 SRM_00340     FALSE 0.237 160.000 0.000 NA   NA
 10268212 10268213 SRM_00340 SRM_00341   rgpG FALSE 0.024 1065.000 0.000 NA   NA
 10268215 10268216 SRM_00343 SRM_00344   recG FALSE 0.142 228.000 0.000 1.000   NA
 10268216 10268217 SRM_00344 SRM_00345 recG   FALSE 0.359 129.000 0.000 NA   NA
 10268218 10268219 SRM_00346 SRM_00347     TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10268220 10268221 SRM_00348 SRM_00349     TRUE 0.439 97.000 0.000 NA   NA
 10268222 10268223 SRM_00350 SRM_00351 tktA tal TRUE 0.916 100.000 0.008 1.000 Y NA
 10268224 10268225 SRM_00352 SRM_00353     FALSE 0.044 447.000 0.000 NA   NA
 10268225 10268226 SRM_00353 SRM_00354     TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10268226 10268227 SRM_00354 SRM_00355     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268227 10268228 SRM_00355 SRM_00356     FALSE 0.076 289.000 0.000 NA   NA
 10268228 10268229 SRM_00356 SRM_00357     TRUE 0.452 95.000 0.000 NA   NA
 10268229 10268230 SRM_00357 SRM_00358     TRUE 0.817 54.000 0.000 NA   NA
 10268230 10268231 SRM_00358 SRM_00359     TRUE 0.746 48.000 0.000 NA   NA
 10268232 10268233 SRM_00360 SRM_00361     TRUE 0.758 67.000 0.000 NA   NA
 10268233 10268234 SRM_00361 SRM_00362     TRUE 0.620 43.000 0.000 NA   NA
 10268234 10268235 SRM_00362 SRM_00363     TRUE 0.660 76.000 0.000 NA   NA
 10268235 10268236 SRM_00363 SRM_00364     TRUE 0.503 90.000 0.000 NA   NA
 10268236 10268237 SRM_00364 SRM_00365     TRUE 0.994 37.000 0.600 NA   NA
 10268238 10268239 SRM_00366 SRM_00367 mltE mmt1 TRUE 0.463 113.000 0.000 1.000 N NA
 10268239 10268240 SRM_00367 SRM_00368 mmt1   FALSE 0.151 200.000 0.000 NA   NA
 10268240 10268241 SRM_00368 SRM_00369   znuC FALSE 0.370 122.000 0.000 NA   NA
 10268241 10268242 SRM_00369 SRM_00370 znuC   FALSE 0.091 309.000 0.000 1.000 N NA
 10268242 10268243 SRM_00370 SRM_00371     TRUE 0.770 18.000 0.000 0.002 Y NA
 10268243 10268244 SRM_00371 SRM_00372     TRUE 0.534 31.000 0.000 1.000 N NA
 10268245 10268246 SRM_00373 SRM_00374 recQ   FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10268247 10268248 SRM_00375 SRM_00376     TRUE 0.439 97.000 0.000 NA   NA
 10268249 10268250 SRM_00377 SRM_00378 nrdB dapG FALSE 0.307 157.000 0.000 1.000 N NA
 10268250 10268251 SRM_00378 SRM_00379 dapG   FALSE 0.027 745.000 0.000 NA   NA
 10268251 10268252 SRM_00379 SRM_00380   umuD FALSE 0.397 111.000 0.000 NA   NA
 10268252 10268253 SRM_00380 SRM_00381 umuD umuC TRUE 0.998 55.000 0.333 1.000   NA
 10268253 10268254 SRM_00381 SRM_00382 umuC   FALSE 0.254 160.000 0.000 NA N NA
 10268256 10268257 SRM_00384 SRM_00385 nosZ   TRUE 0.984 97.000 0.281 NA   NA
 10268257 10268258 SRM_00385 SRM_00386   nosD TRUE 0.979 91.000 0.153 NA   NA
 10268258 10268259 SRM_00386 SRM_00387 nosD nosF TRUE 0.938 -3.000 0.082 NA N NA
 10268259 10268260 SRM_00387 SRM_00388 nosF   FALSE 0.390 113.000 0.000 NA   NA
 10268260 10268261 SRM_00388 SRM_00389     FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10268263 10268264 SRM_00391 SRM_00392     FALSE 0.414 104.000 0.000 NA   NA
 10268264 10268265 SRM_00392 SRM_00393   cyoA FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10268265 10268266 SRM_00393 SRM_00394 cyoA cyoB TRUE 0.545 -3.000 0.000 0.003   NA
 10268266 10268267 SRM_00394 SRM_00395 cyoB   FALSE 0.338 7.000 0.000 NA   NA
 10268267 10268268 SRM_00395 SRM_00396     FALSE 0.124 223.000 0.000 NA   NA
 10268269 10268270 SRM_00397 SRM_00398 hcaD   TRUE 0.993 73.000 0.188 NA   NA
 10268270 10268271 SRM_00398 SRM_00399     FALSE 0.321 137.000 0.000 NA   NA
 10268272 10268273 SRM_00400 SRM_00401     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268273 10268274 SRM_00401 SRM_00402   ctaD TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10268274 10268275 SRM_00402 SRM_00403 ctaD cccA FALSE 0.069 698.000 0.000 0.004 N NA
 10268275 10268276 SRM_00403 SRM_00404 cccA   TRUE 0.759 46.000 0.000 1.000 N NA
 10268276 10268277 SRM_00404 SRM_00405   gloB FALSE 0.171 208.000 0.000 1.000   NA
 10268277 10268278 SRM_00405 SRM_00406 gloB   TRUE 0.974 96.000 0.133 1.000   NA
 10268278 10268279 SRM_00406 SRM_00407   gufA FALSE 0.057 435.000 0.000 1.000   NA
 10268279 10268280 SRM_00407 SRM_00408 gufA dpsA FALSE 0.402 194.000 0.000 1.000 Y NA
 10268280 10268281 SRM_00408 SRM_00409 dpsA czcA FALSE 0.282 152.000 0.000 NA N NA
 10268281 10268282 SRM_00409 SRM_00410 czcA   FALSE 0.361 15.000 0.000 NA   NA
 10268283 10268284 SRM_00411 SRM_00412 tenA   FALSE 0.106 280.000 0.000 1.000 N NA
 10268284 10268285 SRM_00412 SRM_00413     FALSE 0.218 184.000 0.000 1.000   NA
 10268285 10268286 SRM_00413 SRM_00415   zntA TRUE 0.475 101.000 0.000 1.000   NA
 10268287 10268288 SRM_00414 SRM_00416 cheB bacA FALSE 0.398 136.000 0.000 1.000 N NA
 10268288 10268289 SRM_00416 SRM_00417 bacA   FALSE 0.030 642.000 0.000 NA   NA
 10268289 10268290 SRM_00417 SRM_00418     FALSE 0.279 148.000 0.000 NA   NA
 10268290 10268291 SRM_00418 SRM_00419   pssA FALSE 0.261 166.000 0.000 1.000   NA
 10268292 10268293 SRM_00420 SRM_00421   pqiB TRUE 0.914 5.000 0.044 NA   NA
 10268293 10268294 SRM_00421 SRM_00422 pqiB   TRUE 0.997 34.000 0.854 NA Y NA
 10268294 10268295 SRM_00422 SRM_00423     TRUE 0.986 210.000 0.875 NA Y NA
 10268297 10268298 SRM_00425 SRM_00426 ompA mviM FALSE 0.393 -30.000 0.000 1.000   NA
 10268298 10268299 SRM_00426 SRM_00427 mviM pncB FALSE 0.251 171.000 0.000 1.000   NA
 10268299 10268300 SRM_00427 SRM_00428 pncB   FALSE 0.300 142.000 0.000 NA   NA
 10268300 10268301 SRM_00428 SRM_00429     FALSE 0.195 178.000 0.000 NA   NA
 10268301 10268302 SRM_00429 SRM_00430     TRUE 0.723 71.000 0.000 NA   NA
 10268302 10268303 SRM_00430 SRM_00431     FALSE 0.305 141.000 0.000 NA   NA
 10268304 10268305 SRM_00432 SRM_00433 cirA   FALSE 0.050 509.000 0.000 1.000 N NA
 10268307 10268308 SRM_00435 SRM_00436   cirA TRUE 0.824 64.000 0.000 1.000 N NA
 10268308 10268309 SRM_00436 SRM_00437 cirA   TRUE 0.981 33.000 0.188 NA   NA
 10268309 10268310 SRM_00437 SRM_00438     FALSE 0.361 15.000 0.000 NA   NA
 10268311 10268312 SRM_00439 SRM_00440     FALSE 0.375 18.000 0.000 NA   NA
 10268313 10268314 SRM_00441 SRM_00442     FALSE 0.437 126.000 0.000 1.000 N NA
 10268314 10268315 SRM_00442 SRM_00443   cirA FALSE 0.151 297.000 0.000 0.037 N NA
 10268315 10268316 SRM_00443 SRM_00444 cirA   TRUE 0.997 56.000 0.222 NA   NA
 10268316 10268317 SRM_00444 SRM_00445   chb TRUE 0.994 70.000 0.222 NA   NA
 10268317 10268318 SRM_00445 SRM_00446 chb rbsR FALSE 0.183 208.000 0.000 1.000 N NA
 10268318 10268319 SRM_00446 SRM_00447 rbsR   FALSE 0.404 131.000 0.000 1.000   NA
 10268319 10268320 SRM_00447 SRM_00448   putP FALSE 0.092 291.000 0.000 1.000   NA
 10268320 10268321 SRM_00448 SRM_00449 putP bglX TRUE 0.799 48.000 0.000 1.000 N NA
 10268321 10268322 SRM_00449 SRM_00450 bglX nagK FALSE 0.170 356.000 0.000 1.000 Y NA
 10268322 10268323 SRM_00450 SRM_00451 nagK   FALSE 0.079 347.000 0.000 1.000 N NA
 10268323 10268324 SRM_00451 SRM_00452     FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10268324 10268325 SRM_00452 SRM_00453     FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10268326 10268327 SRM_00454 SRM_00455     FALSE 0.421 26.000 0.000 NA   NA
 10268327 10268328 SRM_00455 tRNA_6     TRUE 0.645 77.000 0.000 NA   NA
 10268330 10268331 SRM_00457 SRM_00458   kbl TRUE 0.688 43.000 0.000 1.000 N NA
 10268331 10268332 SRM_00458 SRM_00459 kbl   TRUE 0.967 127.000 0.139 1.000 N NA
 10268333 10268334 SRM_00460 SRM_00461 lrp glnA TRUE 0.557 92.000 0.000 1.000 N NA
 10268334 10268335 SRM_00461 SRM_00462 glnA purB FALSE 0.087 321.000 0.000 1.000 N NA
 10268335 10268336 SRM_00462 SRM_00463 purB   FALSE 0.137 243.000 0.000 1.000 N NA
 10268336 10268337 SRM_00463 SRM_00464     TRUE 0.971 -3.000 0.250 NA   NA
 10268338 10268339 SRM_00465 SRM_00466     TRUE 0.619 79.000 0.000 NA   NA
 10268340 10268341 SRM_00467 SRM_00468   cirA FALSE 0.433 128.000 0.000 1.000 N NA
 10268341 10268342 SRM_00468 SRM_00469 cirA   FALSE 0.191 202.000 0.000 1.000 N NA
 10268342 10268343 SRM_00469 SRM_00470   nuoB TRUE 0.985 196.000 0.498 0.004 Y NA
 10268343 10268344 SRM_00470 SRM_00471 nuoB nuoC TRUE 0.998 33.000 0.691 0.004 Y NA
 10268344 10268345 SRM_00471 SRM_00472 nuoC nuoD TRUE 0.997 56.000 0.057 0.008 Y NA
 10268345 10268346 SRM_00472 SRM_00473 nuoD nuoE TRUE 0.986 98.000 0.097 0.008 Y NA
 10268346 10268347 SRM_00473 SRM_00474 nuoE nuoF TRUE 0.978 104.000 0.054 0.008 Y NA
 10268347 10268348 SRM_00474 SRM_00475 nuoF   TRUE 0.822 55.000 0.000 NA   NA
 10268348 10268349 SRM_00475 SRM_00476   nuoG FALSE 0.122 225.000 0.000 NA   NA
 10268350 10268351 SRM_00477 SRM_00479     FALSE 0.036 521.000 0.000 NA   NA
 10268352 10268353 SRM_00478 SRM_00480     TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10268353 10268354 SRM_00480 SRM_00481   nadE FALSE 0.375 117.000 0.000 NA   NA
 10268354 10268355 SRM_00481 SRM_00482 nadE lspA TRUE 0.824 64.000 0.000 1.000 N NA
 10268355 10268356 SRM_00482 SRM_00483 lspA lepA TRUE 0.820 89.000 0.002 1.000 Y NA
 10268356 10268357 SRM_00483 SRM_00484 lepA   TRUE 0.638 87.000 0.002 NA   NA
 10268357 10268358 SRM_00484 SRM_00485   lepB TRUE 0.999 55.000 1.000 NA   NA
 10268359 10268360 SRM_00486 SRM_00487   trkA TRUE 0.584 83.000 0.000 NA   NA
 10268360 10268361 SRM_00487 SRM_00488 trkA   FALSE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10268362 10268363 SRM_00489 SRM_00490   rssA FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 10268364 10268365 SRM_00491 SRM_00492 dfrA   FALSE 0.398 1.000 0.000 1.000 N NA
 10268366 10268367 SRM_00493 SRM_00494 lytS lytT TRUE 0.999 61.000 0.714 0.030 Y NA
 10268367 10268368 SRM_00494 SRM_00495 lytT   FALSE 0.170 191.000 0.000 NA   NA
 10268368 10268369 SRM_00495 SRM_00496     FALSE 0.317 138.000 0.000 NA   NA
 10268373 10268374 SRM_00499 SRM_00501 cysH korA FALSE 0.311 156.000 0.000 1.000 N NA
 10268374 10268375 SRM_00501 SRM_00502 korA porB TRUE 0.995 153.000 0.832 0.001 Y NA
 10268375 10268376 SRM_00502 SRM_00503 porB   FALSE 0.244 158.000 0.000 NA   NA
 10268376 10268377 SRM_00503 SRM_00504     FALSE 0.038 508.000 0.000 NA   NA
 10268377 10268378 SRM_00504 SRM_00505     FALSE 0.175 206.000 0.000 1.000   NA
 10268380 10268381 SRM_00506 SRM_00508     FALSE 0.345 133.000 0.000 NA   NA
 10268381 10268382 SRM_00508 SRM_00509     TRUE 0.999 64.000 0.500 1.000 Y NA
 10268382 10268383 SRM_00509 SRM_00510     TRUE 0.995 141.000 0.714 0.036 Y NA
 10268383 10268384 SRM_00510 SRM_00511     TRUE 0.601 163.000 0.000 0.018 Y NA
 10268384 10268385 SRM_00511 SRM_00512     FALSE 0.247 157.000 0.000 NA   NA
 10268385 10268386 SRM_00512 SRM_00513     FALSE 0.118 228.000 0.000 NA   NA
 10268387 10268388 SRM_00514 SRM_00515     TRUE 0.577 41.000 0.000 NA   NA
 10268389 10268390 SRM_00516 SRM_00517     TRUE 0.962 187.000 0.451 NA   NA
 10268390 10268391 SRM_00517 SRM_00518     FALSE 0.199 176.000 0.000 NA   NA
 10268391 10268392 SRM_00518 SRM_00519     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10268393 10268394 SRM_00520 SRM_00521 phoU rfaG FALSE 0.024 1385.000 0.000 NA N NA
 10268394 10268395 SRM_00521 SRM_00522 rfaG   FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10268395 10268396 SRM_00522 SRM_00523     FALSE 0.157 197.000 0.000 NA   NA
 10268396 10268397 SRM_00523 SRM_00524     TRUE 0.879 -7.000 0.025 NA   NA
 10268397 10268398 SRM_00524 SRM_00525   uvrA FALSE 0.359 129.000 0.000 NA   NA
 10268400 10268401 SRM_00527 SRM_00528     FALSE 0.266 151.000 0.000 NA   NA
 10268402 10268403 SRM_00529 SRM_00530   argE TRUE 0.992 46.000 0.143 1.000   NA
 10268403 10268404 SRM_00530 SRM_00531 argE   TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10268404 10268405 SRM_00531 SRM_00532   ileS FALSE 0.146 206.000 0.000 NA   NA
 10268405 10268406 SRM_00532 SRM_00533 ileS dksA TRUE 0.988 79.000 0.135 1.000 N NA
 10268406 10268407 SRM_00533 SRM_00534 dksA ruvA FALSE 0.278 166.000 0.000 1.000 N NA
 10268407 10268408 SRM_00534 SRM_00535 ruvA prs TRUE 0.597 38.000 0.000 1.000 N NA
 10268408 10268409 SRM_00535 SRM_00536 prs   FALSE 0.353 13.000 0.000 NA   NA
 10268409 10268410 SRM_00536 SRM_00537     FALSE 0.069 309.000 0.000 NA   NA
 10268410 10268411 SRM_00537 SRM_00538   dCTP FALSE 0.367 125.000 0.000 NA   NA
 10268411 10268412 SRM_00538 SRM_00539 dCTP   FALSE 0.051 389.000 0.000 NA   NA
 10268412 10268413 SRM_00539 SRM_00540     TRUE 0.620 43.000 0.000 NA   NA
 10268413 10268414 SRM_00540 SRM_00541   typA FALSE 0.060 413.000 0.000 1.000   NA
 10268415 10268416 SRM_00542 SRM_00543   dnaJ FALSE 0.052 457.000 0.000 1.000   NA
 10268417 10268418 SRM_00544 SRM_00545 accA   FALSE 0.340 -24.000 0.000 NA   NA
 10268419 10268420 SRM_00546 SRM_00547     FALSE 0.300 142.000 0.000 NA   NA
 10268420 10268421 SRM_00547 SRM_00548     FALSE 0.031 602.000 0.000 NA   NA
 10268421 10268422 SRM_00548 SRM_00549     FALSE 0.330 -6.000 0.000 NA   NA
 10268422 10268423 SRM_00549 SRM_00550     FALSE 0.375 117.000 0.000 NA   NA
 10268425 10268426 SRM_00552 SRM_00553   acrB FALSE 0.245 164.000 0.000 NA N NA
 10268426 10268427 SRM_00553 SRM_00554 acrB   FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268427 10268428 SRM_00554 SRM_00555   acrA TRUE 0.746 48.000 0.000 NA   NA
 10268428 10268429 SRM_00555 SRM_00556 acrA sepC TRUE 0.936 59.000 0.000 1.000 Y NA
 10268429 10268430 SRM_00556 SRM_00557 sepC acrR TRUE 0.648 41.000 0.000 1.000 N NA
 10268431 10268432 SRM_00558 SRM_00559 rot met17 FALSE 0.078 349.000 0.000 1.000 N NA
 10268432 10268433 SRM_00559 SRM_00560 met17 metX TRUE 0.923 131.000 0.017 1.000 Y NA
 10268433 10268434 SRM_00560 SRM_00561 metX lysC TRUE 0.922 132.000 0.017 1.000 Y NA
 10268434 10268435 SRM_00561 SRM_00562 lysC thrA TRUE 0.782 21.000 0.000 0.002 Y NA
 10268438 10268439 SRM_00565 SRM_00566 sdhB sdhA TRUE 0.998 87.000 0.604 0.001 Y NA
 10268439 10268440 SRM_00566 SRM_00567 sdhA sdhA TRUE 0.997 24.000 0.705 0.002 Y NA
 10268440 10268441 SRM_00567 SRM_00568 sdhA sdhD TRUE 0.993 53.000 0.018 0.002 Y NA
 10268441 10268442 SRM_00568 SRM_00569 sdhD gltA TRUE 0.496 165.000 0.000 1.000 Y NA
 10268443 10268444 SRM_00570 SRM_00571 rne   TRUE 0.882 83.000 0.006 NA   NA
 10268444 10268445 SRM_00571 SRM_00572   phnP TRUE 0.802 -10.000 0.011 NA   NA
 10268447 10268448 SRM_00574 SRM_00575 aroD   TRUE 0.521 169.000 0.004 NA   NA
 10268448 10268449 SRM_00575 SRM_00576   mviN FALSE 0.430 99.000 0.000 NA   NA
 10268449 10268450 SRM_00576 SRM_00577 mviN   FALSE 0.317 138.000 0.000 NA   NA
 10268450 10268451 SRM_00577 SRM_00578   nuoI FALSE 0.162 201.000 0.000 NA N NA
 10268451 10268452 SRM_00578 SRM_00579 nuoI   TRUE 0.941 119.000 0.069 NA   NA
 10268452 10268453 SRM_00579 SRM_00580   holA TRUE 0.745 79.000 0.002 NA   NA
 10268453 10268454 SRM_00580 SRM_00581 holA   FALSE 0.340 -22.000 0.000 NA   NA
 10268454 10268455 SRM_00581 tRNA_7     TRUE 0.645 77.000 0.000 NA   NA
 10268455 10268456 tRNA_7 SRM_00582     FALSE 0.147 205.000 0.000 NA   NA
 10268456 10268457 SRM_00582 SRM_00583   etp TRUE 0.784 63.000 0.000 NA   NA
 10268458 10268459 SRM_00584 SRM_00585   spoU TRUE 0.503 90.000 0.000 NA   NA
 10268460 10268461 SRM_00586 SRM_00587 gdhA   FALSE 0.376 -3.000 0.000 1.000   NA
 10268461 10268462 SRM_00587 SRM_00588     TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10268462 10268463 SRM_00588 SRM_00589     TRUE 0.721 34.000 0.003 NA   NA
 10268463 10268464 SRM_00589 SRM_00590   tonB TRUE 0.953 195.000 0.400 NA   NA
 10268465 10268466 SRM_00591 SRM_00592 rpiA   TRUE 0.454 110.000 0.000 1.000   NA
 10268466 10268467 SRM_00592 SRM_00593   uvrD TRUE 0.921 40.000 0.012 1.000   NA
 10268468 10268469 SRM_00594 SRM_00595 soj spo0J TRUE 0.999 67.000 0.827 1.000 N NA
 10268469 10268470 SRM_00595 SRM_00596 spo0J   TRUE 0.978 85.000 0.098 NA   NA
 10268470 10268471 SRM_00596 SRM_00597   bioF FALSE 0.065 331.000 0.000 NA   NA
 10268471 10268472 SRM_00597 SRM_00598 bioF   TRUE 0.538 34.000 0.000 1.000   NA
 10268472 10268473 SRM_00598 SRM_00599     TRUE 0.871 65.000 0.000 0.053   NA
 10268474 10268475 SRM_00600 SRM_00601 glpG purQ TRUE 0.565 89.000 0.000 1.000   NA
 10268475 10268476 SRM_00601 SRM_00602 purQ caiA TRUE 0.514 97.000 0.000 1.000 N NA
 10268476 10268477 SRM_00602 SRM_00603 caiA   TRUE 0.692 74.000 0.000 NA   NA
 10268477 10268478 SRM_00603 SRM_00604   ssb TRUE 0.558 85.000 0.000 NA   NA
 10268478 10268479 SRM_00604 SRM_00605 ssb   FALSE 0.329 1.000 0.000 NA   NA
 10268479 10268480 SRM_00605 SRM_00607   mhpC FALSE 0.065 329.000 0.000 NA   NA
 10268481 10268482 SRM_00606 SRM_00608     FALSE 0.080 282.000 0.000 NA   NA
 10268482 10268483 SRM_00608 SRM_00609     TRUE 0.603 81.000 0.000 NA   NA
 10268483 10268484 SRM_00609 SRM_00610   udk TRUE 0.951 59.000 0.004 NA   NA
 10268485 10268486 SRM_00611 SRM_00612   birA TRUE 0.947 28.000 0.044 1.000 N NA
 10268486 10268487 SRM_00612 SRM_00613 birA   TRUE 0.776 64.000 0.000 NA   NA
 10268488 10268489 SRM_00614 SRM_00615 suhB fab1 TRUE 0.949 57.000 0.003 1.000 N NA
 10268489 10268490 SRM_00615 SRM_00616 fab1   FALSE 0.395 10.000 0.000 1.000   NA
 10268490 10268491 SRM_00616 SRM_00617     FALSE 0.340 -24.000 0.000 NA   NA
 10268491 10268492 SRM_00617 SRM_00618     FALSE 0.386 114.000 0.000 NA   NA
 10268493 10268494 SRM_00619 SRM_00620 nupC   TRUE 0.668 194.000 0.014 1.000   NA
 10268495 10268496 SRM_00621 SRM_00622 uvrD   FALSE 0.353 13.000 0.000 NA   NA
 10268496 10268497 SRM_00622 SRM_00623     FALSE 0.269 150.000 0.000 NA   NA
 10268498 10268499 SRM_00624 SRM_00625     FALSE 0.063 335.000 0.000 NA   NA
 10268499 10268500 SRM_00625 SRM_00626     TRUE 0.987 53.000 0.032 1.000   NA
 10268500 10268501 SRM_00626 SRM_00627     FALSE 0.353 131.000 0.000 NA   NA
 10268501 10268502 SRM_00627 SRM_00628     FALSE 0.051 433.000 0.000 NA N NA
 10268504 10268505 SRM_00630 SRM_00631 pdxH   FALSE 0.363 127.000 0.000 NA   NA
 10268508 10268509 SRM_00634 SRM_00635 ubiG   TRUE 0.478 27.000 0.000 1.000   NA
 10268509 10268510 SRM_00635 SRM_00636   pyrG TRUE 0.809 50.000 0.000 1.000   NA
 10268512 10268513 SRM_00638 SRM_00639 mraZ mraW TRUE 0.993 33.000 0.635 NA   NA
 10268513 10268514 SRM_00639 SRM_00640 mraW   TRUE 0.688 40.000 0.002 NA   NA
 10268514 10268515 SRM_00640 SRM_00641   ftsI TRUE 0.990 61.000 0.056 NA   NA
 10268515 10268516 SRM_00641 SRM_00642 ftsI murE TRUE 0.983 -25.000 0.198 1.000 Y NA
 10268516 10268517 SRM_00642 SRM_00643 murE mraY TRUE 0.997 58.000 0.069 0.004 Y NA
 10268517 10268518 SRM_00643 SRM_00644 mraY murD TRUE 0.996 9.000 0.647 0.004 Y NA
 10268518 10268519 SRM_00644 SRM_00645 murD ftsW TRUE 0.881 115.000 0.016 1.000 N NA
 10268519 10268520 SRM_00645 SRM_00646 ftsW murC TRUE 0.688 43.000 0.000 1.000 N NA
 10268520 10268521 SRM_00646 SRM_00647 murC ftsQ TRUE 0.968 148.000 0.134 NA Y NA
 10268521 10268522 SRM_00647 SRM_00648 ftsQ ftsA TRUE 0.926 135.000 0.052 NA N NA
 10268522 10268523 SRM_00648 SRM_00649 ftsA ftsZ2 TRUE 0.890 214.000 0.070 1.000 Y NA
 10268524 10268525 SRM_00650 SRM_00651     TRUE 0.823 57.000 0.000 NA   NA
 10268525 10268526 SRM_00651 SRM_00652     TRUE 0.538 39.000 0.000 NA   NA
 10268527 10268528 SRM_00653 SRM_00654 rfaG   TRUE 0.484 34.000 0.000 NA   NA
 10268528 10268529 SRM_00654 SRM_00655   rfaG TRUE 0.452 95.000 0.000 NA   NA
 10268529 10268530 SRM_00655 SRM_00656 rfaG rfaG TRUE 0.952 52.000 0.000 0.020 Y NA
 10268530 10268531 SRM_00656 SRM_00657 rfaG wcaA FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268531 10268532 SRM_00657 SRM_00658 wcaA manC FALSE 0.348 -48.000 0.000 NA   NA
 10268533 10268534 SRM_00659 SRM_00660 otsB otsA TRUE 0.986 140.000 0.172 0.001 Y NA
 10268534 10268535 SRM_00660 SRM_00661 otsA   FALSE 0.149 202.000 0.000 NA   NA
 10268535 10268536 SRM_00661 SRM_00662   glpQ TRUE 0.813 59.000 0.000 NA   NA
 10268536 10268537 SRM_00662 SRM_00664 glpQ   FALSE 0.424 13.000 0.000 1.000 N NA
 10268538 10268539 SRM_00663 SRM_00665 alr drrA TRUE 0.629 167.000 0.005 1.000 N NA
 10268539 10268540 SRM_00665 SRM_00666 drrA   TRUE 0.995 68.000 0.109 1.000 Y NA
 10268540 10268541 SRM_00666 SRM_00667   acoA/pdhA TRUE 0.459 114.000 0.000 1.000 N NA
 10268543 10268544 SRM_00669 SRM_00670     FALSE 0.084 273.000 0.000 NA   NA
 10268544 10268545 SRM_00670 SRM_00671   cysD FALSE 0.026 844.000 0.000 NA   NA
 10268545 10268546 SRM_00671 SRM_00672 cysD   TRUE 0.603 81.000 0.000 NA   NA
 10268546 10268547 SRM_00672 SRM_00673     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268547 10268548 SRM_00673 SRM_00674   cysN FALSE 0.300 142.000 0.000 NA   NA
 10268548 10268549 SRM_00674 SRM_00675 cysN   TRUE 0.853 57.000 0.000 1.000   NA
 10268549 10268550 SRM_00675 SRM_00676     FALSE 0.049 489.000 0.000 1.000   NA
 10268550 10268551 SRM_00676 SRM_00677     FALSE 0.040 468.000 0.000 NA   NA
 10268551 10268552 SRM_00677 SRM_00678     TRUE 0.502 36.000 0.000 NA   NA
 10268552 10268553 SRM_00678 SRM_00679     TRUE 0.988 -28.000 0.571 NA   NA
 10268553 10268554 SRM_00679 SRM_00680   rfbB FALSE 0.407 24.000 0.000 NA   NA
 10268554 10268555 SRM_00680 SRM_00681 rfbB rmlA TRUE 0.973 122.000 0.051 0.006 Y NA
 10268555 10268556 SRM_00681 SRM_00682 rmlA rfbC TRUE 0.987 30.000 0.154 1.000 Y NA
 10268556 10268557 SRM_00682 SRM_00683 rfbC rfbD TRUE 0.902 47.000 0.000 1.000 Y NA
 10268557 10268558 SRM_00683 SRM_00684 rfbD wza FALSE 0.380 198.000 0.000 1.000 Y NA
 10268559 10268560 SRM_00685 SRM_00686     FALSE 0.067 319.000 0.000 NA   NA
 10268560 10268561 SRM_00686 SRM_00687     FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10268562 10268563 SRM_00688 SRM_00689     FALSE 0.022 1358.000 0.000 NA   NA
 10268563 10268564 SRM_00689 SRM_00690   xerD FALSE 0.081 321.000 0.000 1.000   NA
 10268564 10268565 SRM_00690 SRM_00691 xerD udg TRUE 0.779 71.000 0.000 1.000 N NA
 10268567 10268568 SRM_00693 SRM_00694   galE TRUE 0.824 64.000 0.000 1.000 N NA
 10268568 10268569 SRM_00694 SRM_00695 galE wecE TRUE 0.992 17.000 0.418 1.000 Y NA
 10268569 10268570 SRM_00695 SRM_00696 wecE spsE TRUE 0.705 1.000 0.000 0.029 Y NA
 10268570 10268571 SRM_00696 SRM_00697 spsE spsF TRUE 0.720 28.000 0.000 1.000 Y NA
 10268571 10268572 SRM_00697 SRM_00698 spsF   FALSE 0.329 1.000 0.000 NA   NA
 10268572 10268573 SRM_00698 SRM_00699   spsE TRUE 0.865 -3.000 0.022 NA   NA
 10268573 10268574 SRM_00699 SRM_00700 spsE   TRUE 0.990 38.000 0.292 1.000   NA
 10268574 10268575 SRM_00700 SRM_00701   manC TRUE 0.966 12.000 0.156 1.000   NA
 10268577 10268578 SRM_00703 SRM_00704 algI dltB TRUE 0.439 97.000 0.000 NA   NA
 10268578 10268579 SRM_00704 SRM_00705 dltB algI FALSE 0.370 17.000 0.000 NA   NA
 10268579 10268580 SRM_00705 SRM_00706 algI   FALSE 0.025 988.000 0.000 NA   NA
 10268580 10268581 SRM_00706 SRM_00707     FALSE 0.034 555.000 0.000 NA   NA
 10268581 10268582 SRM_00707 SRM_00708     FALSE 0.022 1807.000 0.000 NA   NA
 10268582 10268583 SRM_00708 SRM_00709   wcaA FALSE 0.041 465.000 0.000 NA   NA
 10268583 10268584 SRM_00709 SRM_00710 wcaA   FALSE 0.021 2502.000 0.000 NA   NA
 10268586 10268587 SRM_00712 SRM_00713   rfaG TRUE 0.577 38.000 0.000 1.000   NA
 10268587 10268588 SRM_00713 SRM_00714 rfaG   TRUE 0.849 58.000 0.000 1.000   NA
 10268588 10268589 SRM_00714 SRM_00715   lspL TRUE 0.736 74.000 0.000 1.000   NA
 10268589 10268590 SRM_00715 SRM_00716 lspL wcaG TRUE 0.890 80.000 0.000 0.012 Y NA
 10268592 10268593 SRM_00718 SRM_00719 tuaD   FALSE 0.369 123.000 0.000 NA   NA
 10268593 10268594 SRM_00719 SRM_00720     TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10268595 10268596 SRM_00721 SRM_00722     FALSE 0.065 328.000 0.000 NA   NA
 10268597 10268598 SRM_00723 SRM_00724     FALSE 0.032 588.000 0.000 NA   NA
 10268598 10268599 SRM_00724 SRM_00725     FALSE 0.288 146.000 0.000 NA   NA
 10268599 10268600 SRM_00725 SRM_00726     FALSE 0.128 218.000 0.000 NA   NA
 10268600 10268601 SRM_00726 SRM_00727     TRUE 0.977 -3.000 0.318 NA   NA
 10268601 10268602 SRM_00727 SRM_00728     FALSE 0.093 260.000 0.000 NA   NA
 10268602 10268603 SRM_00728 SRM_00729     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268603 10268604 SRM_00729 SRM_00730     FALSE 0.023 1152.000 0.000 NA   NA
 10268606 10268607 SRM_00732 SRM_00733     TRUE 0.943 -3.000 0.093 NA   NA
 10268610 10268611 SRM_00736 SRM_00737     FALSE 0.293 145.000 0.000 NA   NA
 10268611 10268612 SRM_00737 SRM_00738     FALSE 0.055 367.000 0.000 NA   NA
 10268612 10268613 SRM_00738 SRM_00739     TRUE 0.997 44.000 0.636 NA   NA
 10268613 10268614 SRM_00739 SRM_00740     FALSE 0.297 143.000 0.000 NA   NA
 10268614 10268615 SRM_00740 SRM_00741     FALSE 0.155 218.000 0.000 1.000   NA
 10268615 10268616 SRM_00741 SRM_00742     FALSE 0.056 365.000 0.000 NA   NA
 10268617 10268618 SRM_00743 SRM_00744     TRUE 0.571 84.000 0.000 NA   NA
 10268619 10268620 SRM_00745 SRM_00746     TRUE 0.503 90.000 0.000 NA   NA
 10268620 10268621 SRM_00746 SRM_00747     FALSE 0.039 494.000 0.000 NA   NA
 10268621 10268622 SRM_00747 SRM_00748     FALSE 0.425 100.000 0.000 NA   NA
 10268622 10268623 SRM_00748 SRM_00749     FALSE 0.026 891.000 0.000 NA   NA
 10268623 10268624 SRM_00749 SRM_00750     TRUE 0.596 4.000 0.000 NA Y NA
 10268624 10268625 SRM_00750 SRM_00751     TRUE 0.607 163.000 0.000 0.012 Y NA
 10268627 10268628 SRM_00753 SRM_00754     FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10268628 10268629 SRM_00754 SRM_00755     FALSE 0.228 164.000 0.000 NA   NA
 10268629 10268630 SRM_00755 SRM_00757     TRUE 0.824 56.000 0.000 NA   NA
 10268631 10268632 SRM_00756 SRM_00758     FALSE 0.240 159.000 0.000 NA   NA
 10268632 10268633 SRM_00758 SRM_00759     FALSE 0.337 135.000 0.000 NA   NA
 10268633 10268634 SRM_00759 SRM_00760     FALSE 0.386 114.000 0.000 NA   NA
 10268634 10268635 SRM_00760 SRM_00761     FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10268635 10268636 SRM_00761 SRM_00762     FALSE 0.405 109.000 0.000 NA   NA
 10268636 10268637 SRM_00762 SRM_00763     TRUE 0.819 58.000 0.000 NA   NA
 10268637 10268638 SRM_00763 SRM_00764     TRUE 0.990 11.000 0.667 NA   NA
 10268638 10268639 SRM_00764 SRM_00765     FALSE 0.368 124.000 0.000 NA   NA
 10268641 10268642 SRM_00767 SRM_00768     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268645 10268646 SRM_00771 SRM_00772     FALSE 0.394 -31.000 0.000 1.000   NA
 10268646 10268647 SRM_00772 SRM_00773     TRUE 0.955 -3.000 0.133 NA   NA
 10268647 10268648 SRM_00773 SRM_00774     FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10268648 10268649 SRM_00774 SRM_00776     TRUE 0.993 -36.000 0.400 0.011 Y NA
 10268650 10268651 SRM_00775 SRM_00777     FALSE 0.042 460.000 0.000 NA   NA
 10268651 10268652 SRM_00777 SRM_00778     FALSE 0.109 238.000 0.000 NA   NA
 10268654 10268655 SRM_00780 SRM_00781     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268657 10268658 SRM_00783 SRM_00784     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268659 10268660 SRM_00785 SRM_00786   xerD FALSE 0.334 5.000 0.000 NA   NA
 10268660 10268661 SRM_00786 SRM_00787 xerD   FALSE 0.096 398.000 0.000 0.058   NA
 10268664 10268665 SRM_00790 SRM_00791     FALSE 0.329 1.000 0.000 NA   NA
 10268665 10268666 SRM_00791 SRM_00792     FALSE 0.337 135.000 0.000 NA   NA
 10268666 10268667 SRM_00792 SRM_00793     FALSE 0.195 178.000 0.000 NA   NA
 10268668 10268669 SRM_00794 SRM_00795     TRUE 0.996 64.000 0.273 1.000   NA
 10268670 10268671 SRM_00796 SRM_00797     FALSE 0.336 -16.000 0.000 NA   NA
 10268672 10268673 SRM_00798 SRM_00799 nusG   FALSE 0.050 467.000 0.000 1.000   NA
 10268673 10268674 SRM_00799 SRM_00800     TRUE 0.558 85.000 0.000 NA   NA
 10268674 10268675 SRM_00800 SRM_00801     FALSE 0.180 185.000 0.000 NA   NA
 10268676 10268677 SRM_00802 SRM_00803     FALSE 0.177 186.000 0.000 NA   NA
 10268679 10268680 SRM_00804 SRM_00806     FALSE 0.157 197.000 0.000 NA   NA
 10268680 10268681 SRM_00806 SRM_00807     FALSE 0.331 -7.000 0.000 NA   NA
 10268681 10268682 SRM_00807 SRM_00808     TRUE 0.759 49.000 0.000 NA   NA
 10268682 10268683 SRM_00808 SRM_00809     FALSE 0.058 353.000 0.000 NA   NA
 10268683 10268684 SRM_00809 SRM_00810     FALSE 0.087 268.000 0.000 NA   NA
 10268684 10268685 SRM_00810 SRM_00811     TRUE 0.596 4.000 0.000 NA Y NA
 10268685 10268686 SRM_00811 SRM_00812     TRUE 0.759 49.000 0.000 NA   NA
 10268686 10268687 SRM_00812 SRM_00813     FALSE 0.097 252.000 0.000 NA   NA
 10268687 10268688 SRM_00813 SRM_00814     TRUE 0.976 123.000 0.250 NA   NA
 10268688 10268689 SRM_00814 SRM_00815     FALSE 0.204 173.000 0.000 NA   NA
 10268689 10268690 SRM_00815 SRM_00816     TRUE 0.822 55.000 0.000 NA   NA
 10268690 10268691 SRM_00816 SRM_00817     TRUE 0.968 -3.000 0.212 NA   NA
 10268691 10268692 SRM_00817 SRM_00818   galE FALSE 0.349 -58.000 0.000 NA   NA
 10268692 10268693 SRM_00818 SRM_00819 galE   FALSE 0.204 173.000 0.000 NA   NA
 10268693 10268694 SRM_00819 SRM_00820     FALSE 0.393 112.000 0.000 NA   NA
 10268694 10268695 SRM_00820 SRM_00821   pheA FALSE 0.068 367.000 0.000 1.000   NA
 10268695 10268696 SRM_00821 SRM_00822 pheA   TRUE 0.511 89.000 0.000 NA   NA
 10268698 10268699 SRM_00824 SRM_00825 strD mutS2 FALSE 0.092 307.000 0.000 1.000 N NA
 10268699 10268700 SRM_00825 SRM_00826 mutS2   TRUE 0.617 171.000 0.005 1.000 N NA
 10268700 10268701 SRM_00826 SRM_00827     TRUE 0.967 185.000 0.500 NA   NA
 10268701 10268702 SRM_00827 SRM_00828   ntrB TRUE 0.998 67.000 0.500 NA   NA
 10268704 10268705 SRM_00830 SRM_00831     TRUE 0.999 52.000 1.000 NA   NA
 10268706 10268707 SRM_00832 SRM_00833     FALSE 0.040 469.000 0.000 NA   NA
 10268707 10268708 SRM_00833 SRM_00834     TRUE 0.822 55.000 0.000 NA   NA
 10268708 10268709 SRM_00834 SRM_00835   treZ FALSE 0.108 240.000 0.000 NA   NA
 10268709 10268710 SRM_00835 SRM_00836 treZ malQ TRUE 0.789 106.000 0.000 0.005 Y NA
 10268710 10268711 SRM_00836 SRM_00837 malQ   FALSE 0.371 121.000 0.000 NA   NA
 10268711 10268712 SRM_00837 SRM_00838     FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10268712 10268713 SRM_00838 SRM_00839   aroK FALSE 0.401 110.000 0.000 NA   NA
 10268714 10268715 SRM_00840 SRM_00841 truA   FALSE 0.370 122.000 0.000 NA   NA
 10268715 10268716 SRM_00841 SRM_00842   arcA TRUE 0.742 69.000 0.000 NA   NA
 10268716 10268717 SRM_00842 SRM_00843 arcA trxB FALSE 0.263 172.000 0.000 1.000 N NA
 10268717 10268718 SRM_00843 SRM_00844 trxB   FALSE 0.047 426.000 0.000 NA   NA
 10268719 10268720 SRM_00845 SRM_00846 serA sucD TRUE 0.442 151.000 0.000 0.050 N NA
 10268720 10268721 SRM_00846 SRM_00847 sucD gatA TRUE 0.449 307.000 0.014 1.000 N NA
 10268721 10268722 SRM_00847 SRM_00848 gatA tatB TRUE 0.889 94.000 0.011 1.000 N NA
 10268723 10268724 SRM_00849 SRM_00850 add aroA FALSE 0.089 318.000 0.000 1.000 N NA
 10268727 10268728 SRM_00853 SRM_00854 usp   TRUE 0.869 45.000 0.000 1.000 Y NA
 10268728 10268729 SRM_00854 SRM_00855   fixL TRUE 0.483 196.000 0.000 0.028 Y NA
 10268730 10268731 SRM_00856 SRM_00857   ldh TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10268732 10268733 SRM_00858 SRM_00859 ispG   TRUE 0.602 133.000 0.002 1.000   NA
 10268733 10268734 SRM_00859 SRM_00860     FALSE 0.135 304.000 0.000 0.047   NA
 10268735 10268736 SRM_00861 SRM_00862   mcpA TRUE 0.958 52.000 0.005 1.000   NA
 10268736 10268737 SRM_00862 SRM_00863 mcpA sbcD TRUE 0.782 28.000 0.004 1.000 N NA
 10268737 10268738 SRM_00863 SRM_00864 sbcD   FALSE 0.421 101.000 0.000 NA   NA
 10268739 10268740 SRM_00865 SRM_00866 ispE thrB TRUE 0.862 73.000 0.000 0.003 N NA
 10268740 10268741 SRM_00866 SRM_00867 thrB metL TRUE 0.967 152.000 0.133 1.000 Y NA
 10268741 10268742 SRM_00867 SRM_00868 metL punA TRUE 0.479 109.000 0.000 1.000 N NA
 10268742 10268743 SRM_00868 SRM_00869 punA   TRUE 0.835 55.000 0.000 NA N NA
 10268743 10268744 SRM_00869 SRM_00870     FALSE 0.172 190.000 0.000 NA   NA
 10268744 10268745 SRM_00870 SRM_00871     FALSE 0.269 150.000 0.000 NA   NA
 10268745 10268746 SRM_00871 SRM_00872     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10268746 10268747 SRM_00872 SRM_00873     FALSE 0.303 147.000 0.000 NA N NA
 10268747 10268748 SRM_00873 SRM_00874     TRUE 0.750 68.000 0.000 NA   NA
 10268748 10268749 SRM_00874 SRM_00875     FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10268749 10268750 SRM_00875 SRM_00876     FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10268750 10268751 SRM_00876 SRM_00877     TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10268751 10268752 SRM_00877 SRM_00878   phnD FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268753 10268754 SRM_00879 SRM_00880     FALSE 0.104 272.000 0.000 1.000   NA
 10268754 10268755 SRM_00880 SRM_00881   trkA TRUE 0.707 76.000 0.000 1.000   NA
 10268756 10268757 SRM_00882 SRM_00883     FALSE 0.112 235.000 0.000 NA   NA
 10268757 10268758 SRM_00883 SRM_00884     TRUE 0.484 34.000 0.000 NA   NA
 10268758 10268759 SRM_00884 SRM_00885     TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10268759 10268760 SRM_00885 SRM_00886     FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10268764 10268765 SRM_00890 SRM_00891 adh   FALSE 0.288 146.000 0.000 NA   NA
 10268766 10268767 SRM_00892 SRM_00893   rpsJ FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10268767 10268768 SRM_00893 SRM_00894 rpsJ dnaQ FALSE 0.419 132.000 0.000 1.000 N NA
 10268768 10268769 SRM_00894 SRM_00895 dnaQ ssb TRUE 0.496 165.000 0.000 1.000 Y NA
 10268769 10268770 SRM_00895 SRM_00896 ssb hutH FALSE 0.238 181.000 0.000 1.000 N NA
 10268770 10268771 SRM_00896 SRM_00897 hutH pcrA TRUE 0.817 65.000 0.000 1.000 N NA
 10268772 10268773 SRM_00898 SRM_00899     FALSE 0.336 6.000 0.000 NA   NA
 10268773 10268774 SRM_00899 SRM_00900     FALSE 0.348 11.000 0.000 NA   NA
 10268777 10268778 SRM_00903 SRM_00904     TRUE 0.999 58.000 0.597 NA N NA
 10268779 10268780 SRM_00905 SRM_00906 hisG hisIE TRUE 0.979 125.000 0.081 0.004 Y NA
 10268783 10268784 SRM_00909 SRM_00910     FALSE 0.370 122.000 0.000 NA   NA
 10268787 10268788 SRM_00913 SRM_00914   xseA FALSE 0.293 145.000 0.000 NA   NA
 10268789 10268790 SRM_00915 SRM_00916 stp1   TRUE 0.868 77.000 0.003 NA N NA
 10268791 10268792 SRM_00917 SRM_00918     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10268792 10268793 SRM_00918 SRM_00919   brp TRUE 0.823 57.000 0.000 NA   NA
 10268793 10268794 SRM_00919 SRM_00920 brp crtI TRUE 0.996 39.000 0.714 1.000   NA
 10268795 10268796 SRM_00921 SRM_00922   hemN TRUE 0.776 49.000 0.000 NA N NA
 10268796 10268797 SRM_00922 SRM_00923 hemN   FALSE 0.033 783.000 0.000 1.000   NA
 10268797 10268798 SRM_00923 SRM_00924     FALSE 0.373 119.000 0.000 NA   NA
 10268799 10268800 SRM_00925 SRM_00926 lytR   TRUE 0.888 43.000 0.000 0.028 Y NA
 10268800 10268801 SRM_00926 SRM_00927     TRUE 0.706 44.000 0.000 1.000 N NA
 10268801 10268802 SRM_00927 SRM_00928     TRUE 0.705 25.000 0.000 1.000 Y NA
 10268802 10268803 SRM_00928 SRM_00929     TRUE 0.608 40.000 0.000 1.000   NA
 10268803 10268804 SRM_00929 SRM_00930     TRUE 0.998 58.000 0.422 1.000   NA
 10268804 10268805 SRM_00930 SRM_00932     FALSE 0.123 224.000 0.000 NA   NA
 10268807 10268808 SRM_00933 SRM_00934 bioB   FALSE 0.061 344.000 0.000 NA   NA
 10268809 10268810 SRM_00935 SRM_00936     FALSE 0.157 197.000 0.000 NA   NA
 10268810 10268811 SRM_00936 SRM_00937     FALSE 0.116 230.000 0.000 NA   NA
 10268811 10268812 SRM_00937 SRM_00938   orfB TRUE 0.960 99.000 0.087 NA   NA
 10268812 10268813 SRM_00938 SRM_00939 orfB   FALSE 0.392 21.000 0.000 NA   NA
 10268813 10268814 SRM_00939 SRM_00940   folB TRUE 0.821 60.000 0.000 NA N NA
 10268815 10268816 SRM_00941 SRM_00942 guaA yceF FALSE 0.416 112.000 0.000 NA N NA
 10268818 10268819 SRM_00944 SRM_00945     TRUE 0.970 4.000 0.227 NA   NA
 10268821 10268822 SRM_00947 SRM_00948     TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10268822 10268823 SRM_00948 SRM_00949     FALSE 0.035 523.000 0.000 NA   NA
 10268823 10268824 SRM_00949 SRM_00950     FALSE 0.225 165.000 0.000 NA   NA
 10268824 10268825 SRM_00950 SRM_00951     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10268826 10268827 SRM_00952 SRM_00953     TRUE 0.732 47.000 0.000 NA   NA
 10268827 10268828 SRM_00953 SRM_00954   glyA FALSE 0.231 163.000 0.000 NA   NA
 10268828 10268829 SRM_00954 SRM_00955 glyA pyrE TRUE 0.914 99.000 0.020 1.000 N NA
 10268829 10268830 SRM_00955 SRM_00956 pyrE tatC TRUE 0.969 58.000 0.008 NA N NA
 10268830 10268831 SRM_00956 SRM_00957 tatC prc TRUE 0.896 40.000 0.008 NA N NA
 10268831 10268832 SRM_00957 SRM_00958 prc   TRUE 0.797 61.000 0.000 NA   NA
 10268832 10268833 SRM_00958 SRM_00959   ubiE FALSE 0.353 131.000 0.000 NA   NA
 10268833 10268834 SRM_00959 SRM_00960 ubiE   TRUE 0.645 82.000 0.000 1.000   NA
 10268834 10268835 SRM_00960 tRNA_8     FALSE 0.269 150.000 0.000 NA   NA
 10268836 10268837 SRM_00961 SRM_00962 usp   FALSE 0.079 300.000 0.000 NA N NA
 10268837 10268838 SRM_00962 SRM_00963   glcK TRUE 0.878 -196.000 0.020 NA N NA
 10268838 10268839 SRM_00963 SRM_00964 glcK ftsB TRUE 0.859 85.000 0.004 1.000   NA
 10268839 10268840 SRM_00964 SRM_00965 ftsB eno2 TRUE 0.977 16.000 0.241 1.000   NA
 10268840 10268841 SRM_00965 SRM_00966 eno2   FALSE 0.112 261.000 0.000 1.000   NA
 10268841 10268842 SRM_00966 SRM_00967     FALSE 0.342 134.000 0.000 NA   NA
 10268842 10268843 SRM_00967 SRM_00968     FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10268843 10268844 SRM_00968 SRM_00969   glgA FALSE 0.356 130.000 0.000 NA   NA
 10268845 10268846 SRM_00970 SRM_00971     TRUE 0.734 70.000 0.000 NA   NA
 10268847 10268848 SRM_00972 SRM_00973     FALSE 0.425 100.000 0.000 NA   NA
 10268848 10268849 SRM_00973 SRM_00974   lipA FALSE 0.091 263.000 0.000 NA   NA
 10268849 10268850 SRM_00974 SRM_00975 lipA   FALSE 0.146 234.000 0.000 1.000 N NA
 10268851 10268852 SRM_00976 SRM_00977   argD TRUE 0.636 83.000 0.000 1.000   NA
 10268853 10268854 SRM_00978 SRM_00979 recN secA FALSE 0.378 140.000 0.000 1.000 N NA
 10268857 10268858 SRM_00982 SRM_00983   corA TRUE 0.571 84.000 0.000 NA   NA
 10268858 10268859 SRM_00983 SRM_00984 corA   FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10268859 10268860 SRM_00984 SRM_00985     FALSE 0.188 181.000 0.000 NA   NA
 10268861 10268862 SRM_00986 SRM_00987     TRUE 0.789 62.000 0.000 NA   NA
 10268862 10268863 SRM_00987 SRM_00988     TRUE 0.991 41.000 0.292 NA   NA
 10268867 10268868 SRM_00992 SRM_00993 pth rplY TRUE 0.996 101.000 0.496 0.027 Y NA
 10268868 10268869 SRM_00993 SRM_00994 rplY prs TRUE 0.937 137.000 0.074 1.000 N NA
 10268869 10268870 SRM_00994 tRNA_9 prs   FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10268870 10268871 tRNA_9 SRM_00995   eif2BA FALSE 0.274 149.000 0.000 NA   NA
 10268872 10268873 SRM_00996 SRM_00997     FALSE 0.247 172.000 0.000 1.000   NA
 10268874 10268875 SRM_00998 SRM_00999   mrp TRUE 0.912 146.000 0.050 1.000 N NA
 10268875 10268876 SRM_00999 SRM_01000 mrp   FALSE 0.109 249.000 0.000 NA N NA
 10268876 10268877 SRM_01000 SRM_01001   prmA TRUE 0.920 -39.000 0.044 NA N NA
 10268877 10268878 SRM_01001 SRM_01002 prmA ubiE TRUE 0.495 26.000 0.000 1.000 N NA
 10268880 10268881 SRM_01004 SRM_01005 pfkA   TRUE 0.851 -37.000 0.017 NA   NA
 10268881 10268882 SRM_01005 SRM_01006   aat TRUE 0.681 -7.000 0.004 NA   NA
 10268883 10268884 SRM_01007 SRM_01008 pyc dfrA TRUE 0.478 27.000 0.000 1.000   NA
 10268885 10268886 SRM_01009 SRM_01010     TRUE 0.484 34.000 0.000 NA   NA
 10268886 10268887 SRM_01010 SRM_01012     FALSE 0.154 198.000 0.000 NA   NA
 10268888 10268889 SRM_01011 SRM_01013     TRUE 0.806 60.000 0.000 NA   NA
 10268890 10268891 SRM_01014 SRM_01015 mcpA   FALSE 0.162 370.000 0.000 1.000 Y NA
 10268891 10268892 SRM_01015 SRM_01016     FALSE 0.033 577.000 0.000 NA   NA
 10268893 10268894 SRM_01017 SRM_01018     FALSE 0.303 282.000 0.000 0.020 Y NA
 10268896 10268897 SRM_01019 SRM_01021   hisS TRUE 0.978 65.000 0.018 1.000 N NA
 10268897 10268898 SRM_01021 SRM_01022 hisS   FALSE 0.348 -46.000 0.000 NA   NA
 10268898 10268899 SRM_01022 SRM_01023     TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10268900 10268901 SRM_01024 SRM_01025     FALSE 0.336 -16.000 0.000 NA   NA
 10268901 10268902 SRM_01025 SRM_01026     TRUE 0.523 38.000 0.000 NA   NA
 10268902 10268903 SRM_01026 SRM_01027     TRUE 0.619 79.000 0.000 NA   NA
 10268903 10268904 SRM_01027 SRM_01028     TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10268904 10268905 SRM_01028 SRM_01029   glgB FALSE 0.200 175.000 0.000 NA   NA
 10268905 10268906 SRM_01029 SRM_01030 glgB treS TRUE 0.996 48.000 0.075 0.005 Y NA
 10268906 10268907 SRM_01030 SRM_01031 treS   TRUE 0.995 92.000 0.544 0.005   NA
 10268908 10268909 SRM_01032 SRM_01033 glgX gfo FALSE 0.359 140.000 0.000 1.000   NA
 10268909 10268910 SRM_01033 SRM_01034 gfo   FALSE 0.092 291.000 0.000 1.000   NA
 10268910 10268911 SRM_01034 SRM_01035     FALSE 0.383 -12.000 0.000 1.000   NA
 10268912 10268913 SRM_01036 SRM_01037     FALSE 0.044 447.000 0.000 NA   NA
 10268913 10268914 SRM_01037 SRM_01038   trkA TRUE 0.640 44.000 0.000 NA   NA
 10268914 10268915 SRM_01038 SRM_01039 trkA   FALSE 0.315 139.000 0.000 NA   NA
 10268915 10268916 SRM_01039 tRNA_10     FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10268916 10268917 tRNA_10 SRM_01040     TRUE 0.523 88.000 0.000 NA   NA
 10268918 10268919 SRM_01041 SRM_01042 dnaX   TRUE 0.823 62.000 0.000 1.000   NA
 10268919 10268920 SRM_01042 SRM_01043     FALSE 0.386 114.000 0.000 NA   NA
 10268920 10268921 SRM_01043 SRM_01044     TRUE 0.996 46.000 0.357 NA   NA
 10268921 10268922 SRM_01044 SRM_01045     FALSE 0.427 18.000 0.000 1.000   NA
 10268923 10268924 SRM_01046 SRM_01047 groS   FALSE 0.244 158.000 0.000 NA   NA
 10268924 10268925 SRM_01047 SRM_01048   nagB FALSE 0.353 131.000 0.000 NA   NA
 10268925 10268926 SRM_01048 SRM_01049 nagB   TRUE 0.438 16.000 0.000 1.000 N NA
 10268926 10268927 SRM_01049 SRM_01050     FALSE 0.359 129.000 0.000 NA   NA
 10268927 10268928 SRM_01050 SRM_01051     TRUE 0.988 75.000 0.125 NA   NA
 10268928 10268929 SRM_01051 SRM_01052   btuF FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10268929 10268930 SRM_01052 SRM_01053 btuF   TRUE 0.894 22.000 0.021 NA   NA
 10268930 10268931 SRM_01053 SRM_01054     TRUE 0.824 56.000 0.000 NA   NA
 10268931 10268932 SRM_01054 SRM_01055   btuB FALSE 0.353 13.000 0.000 NA   NA
 10268932 10268933 SRM_01055 SRM_01056 btuB   FALSE 0.029 667.000 0.000 NA   NA
 10268935 10268936 SRM_01058 SRM_01059     TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10268936 10268937 SRM_01059 SRM_01060     FALSE 0.424 27.000 0.000 NA   NA
 10268937 10268938 SRM_01060 SRM_01061     FALSE 0.120 226.000 0.000 NA   NA
 10268938 10268939 SRM_01061 SRM_01062     FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10268939 10268940 SRM_01062 SRM_01063     FALSE 0.413 105.000 0.000 NA   NA
 10268940 10268941 SRM_01063 SRM_01064     FALSE 0.157 197.000 0.000 NA   NA
 10268941 10268942 SRM_01064 SRM_01065     FALSE 0.140 209.000 0.000 NA   NA
 10268945 10268946 SRM_01067 SRM_01069   sun TRUE 0.631 78.000 0.000 NA   NA
 10268946 10268947 SRM_01069 SRM_01070 sun   TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10268951 10268952 SRM_01073 SRM_01075     TRUE 0.531 -3.000 0.000 0.007   NA
 10268953 10268954 SRM_01076 SRM_01077   ligA FALSE 0.315 139.000 0.000 NA   NA
 10268955 10268956 SRM_01078 SRM_01079   smc FALSE 0.083 275.000 0.000 NA   NA
 10268956 10268957 SRM_01079 SRM_01080 smc   TRUE 0.862 55.000 0.000 1.000 N NA
 10268958 10268959 SRM_01081 SRM_01082     TRUE 0.799 52.000 0.000 NA   NA
 10268959 10268960 SRM_01082 SRM_01083     FALSE 0.132 215.000 0.000 NA   NA
 10268960 10268961 SRM_01083 SRM_01084     TRUE 0.640 44.000 0.000 NA   NA
 10268962 10268963 SRM_01085 SRM_01086     FALSE 0.348 11.000 0.000 NA   NA
 10268965 10268966 SRM_01088 SRM_01089 ggt   FALSE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10268967 10268968 SRM_01090 SRM_01091 purF   FALSE 0.036 651.000 0.000 1.000   NA
 10268968 10268969 SRM_01091 SRM_01092     TRUE 0.588 -156.000 0.000 0.001   NA
 10268969 10268970 SRM_01092 SRM_01093     FALSE 0.172 190.000 0.000 NA   NA
 10268970 10268971 SRM_01093 SRM_01094   ald FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10268972 10268973 SRM_01095 SRM_01096     TRUE 0.793 126.000 0.008 NA   NA
 10268973 10268974 SRM_01096 SRM_01097   lysS FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10268975 10268976 SRM_01098 SRM_01099   rpsT FALSE 0.080 327.000 0.000 1.000   NA
 10268977 10268978 SRM_01100 SRM_01101     TRUE 0.997 51.000 0.161 NA Y NA
 10268978 10268979 SRM_01101 SRM_01102     TRUE 0.987 52.000 0.038 NA   NA
 10268979 10268980 SRM_01102 SRM_01103     FALSE 0.138 210.000 0.000 NA   NA
 10268980 10268981 SRM_01103 SRM_01104   atpB TRUE 0.799 52.000 0.000 NA   NA
 10268981 10268982 SRM_01104 SRM_01105 atpB atpH TRUE 0.995 100.000 0.628 0.004   NA
 10268982 10268983 SRM_01105 SRM_01106 atpH atpF TRUE 0.955 231.000 0.402 0.004   NA
 10268983 10268984 SRM_01106 SRM_01107 atpF atpH TRUE 0.999 58.000 0.222 0.004 Y NA
 10268984 10268985 SRM_01107 SRM_01108 atpH atpA TRUE 1.000 60.000 0.864 0.004 Y NA
 10268985 10268986 SRM_01108 SRM_01109 atpA atpG TRUE 0.995 153.000 0.846 0.004 Y NA
 10268986 10268987 SRM_01109 tRNA_11 atpG   TRUE 0.482 92.000 0.000 NA   NA
 10268987 10268988 tRNA_11 SRM_01110     TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10268988 10268989 SRM_01110 SRM_01111   recD TRUE 0.804 65.000 0.000 1.000   NA
 10268990 10268991 SRM_01112 SRM_01113 rDP fecB TRUE 0.931 -3.000 0.056 1.000 N NA
 10268993 10268994 SRM_01115 SRM_01116 murC   TRUE 0.777 12.000 0.007 1.000   NA
 10268994 10268995 SRM_01116 SRM_01117     TRUE 0.482 92.000 0.000 NA   NA
 10268995 10268996 SRM_01117 SRM_01118   acrB FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10268996 10268997 SRM_01118 SRM_01119 acrB   TRUE 0.995 -124.000 0.889 0.098   NA
 10268997 10268998 SRM_01119 SRM_01120     TRUE 0.995 57.000 0.049 1.000 Y NA
 10268998 10268999 SRM_01120 SRM_01121     TRUE 0.955 38.000 0.033 1.000 N NA
 10268999 10269000 SRM_01121 SRM_01122   ubiB FALSE 0.074 297.000 0.000 NA   NA
 10269000 10269001 SRM_01122 SRM_01123 ubiB   TRUE 0.975 156.000 0.435 NA   NA
 10269001 10269002 SRM_01123 SRM_01124   TST FALSE 0.226 180.000 0.000 1.000   NA
 10269002 10269003 SRM_01124 SRM_01125 TST   FALSE 0.349 -49.000 0.000 NA   NA
 10269004 10269005 SRM_01126 SRM_01127 leuS   TRUE 0.448 11.000 0.002 NA   NA
 10269005 10269006 SRM_01127 SRM_01128   efp FALSE 0.287 173.000 0.002 NA   NA
 10269006 10269007 SRM_01128 SRM_01129 efp accB TRUE 0.991 46.000 0.120 1.000 N NA
 10269009 10269010 SRM_01131 SRM_01132 accC aspB FALSE 0.389 137.000 0.000 1.000 N NA
 10269010 10269011 SRM_01132 SRM_01133 aspB   TRUE 0.980 64.000 0.022 1.000   NA
 10269011 10269012 SRM_01133 SRM_01134     TRUE 0.985 58.000 0.023 NA   NA
 10269012 10269013 SRM_01134 SRM_01135     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269013 10269014 SRM_01135 SRM_01136     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269015 10269016 SRM_01137 SRM_01138     TRUE 0.939 91.000 0.029 NA   NA
 10269017 10269018 SRM_01139 SRM_01140     FALSE 0.430 99.000 0.000 NA   NA
 10269018 10269019 SRM_01140 SRM_01141     TRUE 0.707 76.000 0.000 1.000   NA
 10269022 10269023 SRM_01143 SRM_01144 polC   TRUE 0.758 67.000 0.000 NA   NA
 10269023 10269024 SRM_01144 SRM_01145   soj FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10269024 10269025 SRM_01145 SRM_01146 soj   FALSE 0.110 236.000 0.000 NA   NA
 10269026 10269027 SRM_01147 SRM_01148 folK dck TRUE 0.972 86.000 0.063 1.000 N NA
 10269027 10269028 SRM_01148 SRM_01149 dck   FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10269030 10269031 SRM_01151 SRM_01152 carA carB TRUE 0.994 121.000 0.345 0.001 Y NA
 10269031 10269032 SRM_01152 SRM_01153 carB   FALSE 0.169 192.000 0.000 NA   NA
 10269032 10269033 SRM_01153 SRM_01154   psd FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10269033 10269034 SRM_01154 SRM_01155 psd pssA TRUE 0.993 17.000 0.466 1.000 Y NA
 10269034 10269035 SRM_01155 SRM_01156 pssA purL TRUE 0.990 56.000 0.040 1.000 N NA
 10269035 10269036 SRM_01156 SRM_01157 purL clpS TRUE 0.571 84.000 0.000 NA   NA
 10269043 10269044 SRM_01164 SRM_01165   guaA TRUE 0.980 46.000 0.044 NA   NA
 10269044 10269045 SRM_01165 SRM_01166 guaA   FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 10269045 10269046 SRM_01166 SRM_01167     FALSE 0.405 109.000 0.000 NA   NA
 10269046 10269047 SRM_01167 SRM_01168   guaA TRUE 0.456 23.000 0.000 1.000   NA
 10269048 10269049 SRM_01169 SRM_01170     FALSE 0.336 6.000 0.000 NA   NA
 10269049 10269050 SRM_01170 SRM_01171     FALSE 0.390 113.000 0.000 NA   NA
 10269051 10269052 SRM_01172 SRM_01173   dnaE2 FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269052 10269053 SRM_01173 SRM_01174 dnaE2 xylA FALSE 0.104 272.000 0.000 1.000   NA
 10269053 10269054 SRM_01174 SRM_01175 xylA glpK TRUE 0.933 3.000 0.038 0.011   NA
 10269054 10269055 SRM_01175 SRM_01176 glpK   FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269060 10269061 SRM_01181 SRM_01182 lepB   TRUE 0.523 38.000 0.000 NA   NA
 10269061 10269062 SRM_01182 SRM_01183     FALSE 0.138 210.000 0.000 NA   NA
 10269062 10269063 SRM_01183 SRM_01184     TRUE 0.655 83.000 0.000 1.000 N NA
 10269063 10269064 SRM_01184 SRM_01185   cysA FALSE 0.045 550.000 0.000 1.000 N NA
 10269064 10269065 SRM_01185 SRM_01186 cysA   FALSE 0.198 184.000 0.000 NA N NA
 10269065 10269066 SRM_01186 SRM_01187     TRUE 0.967 187.000 0.283 NA Y NA
 10269068 10269069 SRM_01189 SRM_01190     FALSE 0.086 269.000 0.000 NA   NA
 10269070 10269071 SRM_01191 SRM_01193   ubiG FALSE 0.376 -3.000 0.000 1.000   NA
 10269072 10269073 SRM_01192 SRM_01194   rfaG TRUE 0.960 -3.000 0.158 NA   NA
 10269073 10269074 SRM_01194 SRM_01195 rfaG   FALSE 0.251 156.000 0.000 NA   NA
 10269074 10269075 SRM_01195 SRM_01196     FALSE 0.388 7.000 0.000 1.000   NA
 10269078 10269079 SRM_01199 SRM_01200     TRUE 0.768 41.000 0.000 0.004   NA
 10269080 10269081 SRM_01201 SRM_01202     FALSE 0.150 201.000 0.000 NA   NA
 10269081 10269082 SRM_01202 SRM_01203   pdxA TRUE 0.774 70.000 0.000 1.000   NA
 10269082 10269083 SRM_01203 SRM_01204 pdxA ftsE TRUE 0.903 28.000 0.017 1.000 N NA
 10269083 10269084 SRM_01204 SRM_01205 ftsE   FALSE 0.293 145.000 0.000 NA   NA
 10269086 10269087 SRM_01207 SRM_01208     FALSE 0.342 -27.000 0.000 NA   NA
 10269087 10269088 SRM_01208 SRM_01209     TRUE 0.776 64.000 0.000 NA   NA
 10269089 10269090 SRM_01210 SRM_01211   hemB TRUE 0.816 95.000 0.005 1.000   NA
 10269090 10269091 SRM_01211 SRM_01212 hemB cysS TRUE 0.763 93.000 0.003 1.000 N NA
 10269091 10269092 SRM_01212 SRM_01213 cysS   FALSE 0.378 1.000 0.000 1.000   NA
 10269092 10269093 SRM_01213 SRM_01214     FALSE 0.331 -7.000 0.000 NA   NA
 10269093 10269094 SRM_01214 SRM_01215     TRUE 0.734 70.000 0.000 NA   NA
 10269096 10269097 SRM_01217 SRM_01218 putP   FALSE 0.338 7.000 0.000 NA   NA
 10269097 10269098 SRM_01218 SRM_01219     TRUE 0.823 57.000 0.000 NA   NA
 10269098 10269099 SRM_01219 SRM_01220     TRUE 0.832 51.000 0.000 1.000 N NA
 10269102 10269103 SRM_01223 SRM_01224     TRUE 0.992 84.000 0.333 NA   NA
 10269103 10269104 SRM_01224 SRM_01225     TRUE 0.734 70.000 0.000 NA   NA
 10269104 10269105 SRM_01225 SRM_01226   SpoIVFB FALSE 0.177 186.000 0.000 NA   NA
 10269105 10269106 SRM_01226 SRM_01227 SpoIVFB pyk TRUE 0.875 146.000 0.029 1.000   NA
 10269106 10269107 SRM_01227 SRM_01228 pyk   TRUE 0.589 87.000 0.000 1.000   NA
 10269107 10269108 SRM_01228 SRM_01229   ftsH TRUE 0.995 37.000 0.667 1.000   NA
 10269108 10269109 SRM_01229 SRM_01230 ftsH rpsL FALSE 0.090 316.000 0.000 1.000 N NA
 10269111 10269112 SRM_01231 SRM_01233 fusA tufA TRUE 0.997 88.000 0.400 0.002 Y NA
 10269112 10269113 SRM_01233 SRM_01234 tufA rpsJ TRUE 0.996 83.000 0.318 1.000 Y NA
 10269113 10269114 SRM_01234 SRM_01235 rpsJ   FALSE 0.336 6.000 0.000 NA   NA
 10269114 10269115 SRM_01235 SRM_01236   rplC TRUE 0.817 54.000 0.000 NA   NA
 10269115 10269116 SRM_01236 SRM_01237 rplC rplD TRUE 0.999 74.000 0.544 0.016 Y NA
 10269116 10269117 SRM_01237 SRM_01238 rplD rplW TRUE 0.999 57.000 0.307 1.000 Y NA
 10269117 10269118 SRM_01238 SRM_01239 rplW rplB TRUE 0.999 53.000 0.849 1.000 Y NA
 10269118 10269119 SRM_01239 SRM_01240 rplB rpsS TRUE 0.999 76.000 0.820 0.021 Y NA
 10269119 10269120 SRM_01240 SRM_01241 rpsS rplV TRUE 0.996 137.000 0.769 0.021 Y NA
 10269120 10269121 SRM_01241 SRM_01242 rplV rpsC TRUE 0.999 62.000 0.719 0.021 Y NA
 10269121 10269122 SRM_01242 SRM_01243 rpsC rplP TRUE 1.000 61.000 0.828 0.021 Y NA
 10269122 10269123 SRM_01243 SRM_01244 rplP rpmC TRUE 0.994 9.000 0.802 0.016   NA
 10269123 10269124 SRM_01244 SRM_01245 rpmC rpsQ TRUE 0.999 61.000 0.828 0.016   NA
 10269124 10269125 SRM_01245 SRM_01246 rpsQ rplN TRUE 0.998 85.000 0.791 0.021 Y NA
 10269125 10269126 SRM_01246 SRM_01247 rplN rplX TRUE 1.000 54.000 0.810 0.021 Y NA
 10269126 10269127 SRM_01247 SRM_01248 rplX rplE TRUE 0.996 134.000 0.758 0.016 Y NA
 10269127 10269128 SRM_01248 SRM_01249 rplE rpsN2 TRUE 0.999 75.000 0.496 0.016 Y NA
 10269128 10269129 SRM_01249 SRM_01250 rpsN2 rpsH TRUE 0.996 94.000 0.473 0.016 Y NA
 10269129 10269130 SRM_01250 SRM_01251 rpsH rplF TRUE 0.999 68.000 0.808 0.016 Y NA
 10269130 10269131 SRM_01251 SRM_01252 rplF rplR TRUE 0.999 76.000 0.815 0.016 Y NA
 10269131 10269132 SRM_01252 SRM_01253 rplR rpsE TRUE 0.999 51.000 0.814 0.021 Y NA
 10269132 10269133 SRM_01253 SRM_01254 rpsE rplO TRUE 0.985 130.000 0.148 0.021 Y NA
 10269133 10269134 SRM_01254 SRM_01255 rplO secY TRUE 0.999 57.000 0.730 1.000 N NA
 10269134 10269135 SRM_01255 SRM_01256 secY map TRUE 0.965 28.000 0.087 1.000 N NA
 10269135 10269136 SRM_01256 SRM_01257 map infA TRUE 0.979 0.000 0.160 1.000 Y NA
 10269136 10269137 SRM_01257 SRM_01258 infA rpsM TRUE 0.987 89.000 0.075 0.014 Y NA
 10269137 10269138 SRM_01258 SRM_01259 rpsM rpsK TRUE 0.998 88.000 0.810 0.016 Y NA
 10269138 10269139 SRM_01259 SRM_01260 rpsK rpsD TRUE 0.996 110.000 0.509 0.021 Y NA
 10269139 10269140 SRM_01260 SRM_01261 rpsD rpoA TRUE 0.992 97.000 0.549 1.000 N NA
 10269140 10269141 SRM_01261 SRM_01262 rpoA rplQ TRUE 0.997 87.000 0.873 1.000 N NA
 10269141 10269142 SRM_01262 SRM_01263 rplQ spoT FALSE 0.278 196.000 0.002 1.000 N NA
 10269142 10269143 SRM_01263 SRM_01264 spoT hup TRUE 0.992 40.000 0.333 1.000 N NA
 10269143 10269144 SRM_01264 SRM_01265 hup yqgF TRUE 0.974 72.000 0.005 0.053 Y NA
 10269146 10269147 SRM_01266 SRM_01268   ribE FALSE 0.406 -183.000 0.000 1.000   NA
 10269147 10269148 SRM_01268 tRNA_13 ribE   FALSE 0.300 142.000 0.000 NA   NA
 10269149 10269150 SRM_01269 SRM_01270 rfaG   TRUE 0.976 45.000 0.044 NA   NA
 10269153 10269154 SRM_01273 SRM_01274 ndk   TRUE 0.449 -3.000 0.002 NA   NA
 10269156 10269157 SRM_01276 SRM_01277 dacB   TRUE 0.929 47.000 0.004 1.000   NA
 10269158 10269159 SRM_01278 SRM_01279 dapA dapB TRUE 0.988 57.000 0.013 1.000 Y NA
 10269160 10269161 tRNA_14 SRM_01280   phrB TRUE 0.784 63.000 0.000 NA   NA
 10269162 10269163 SRM_01281 SRM_01282     FALSE 0.058 351.000 0.000 NA   NA
 10269163 10269164 SRM_01282 SRM_01283     FALSE 0.195 178.000 0.000 NA   NA
 10269164 10269165 SRM_01283 SRM_01284     FALSE 0.033 565.000 0.000 NA   NA
 10269165 10269166 SRM_01284 SRM_01285     TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10269167 10269168 SRM_01286 SRM_01287     FALSE 0.421 101.000 0.000 NA   NA
 10269168 10269169 SRM_01287 SRM_01288     FALSE 0.067 319.000 0.000 NA   NA
 10269171 10269172 SRM_01290 SRM_01291     FALSE 0.071 303.000 0.000 NA   NA
 10269172 10269173 SRM_01291 SRM_01292     TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10269173 10269174 SRM_01292 SRM_01293     TRUE 0.482 92.000 0.000 NA   NA
 10269176 10269177 SRM_01295 SRM_01296   dpsA FALSE 0.131 249.000 0.000 1.000 N NA
 10269177 10269178 SRM_01296 SRM_01297 dpsA topA FALSE 0.099 294.000 0.000 1.000 N NA
 10269181 10269182 SRM_01300 SRM_01301   cysK TRUE 0.832 51.000 0.000 1.000 N NA
 10269182 10269183 SRM_01301 SRM_01303 cysK   TRUE 0.608 40.000 0.000 1.000   NA
 10269186 10269187 SRM_01305 SRM_01306     TRUE 0.995 -55.000 0.500 0.005 Y NA
 10269188 10269189 SRM_01307 SRM_01308 hetI   FALSE 0.361 15.000 0.000 NA   NA
 10269189 10269190 SRM_01308 SRM_01309     TRUE 0.538 39.000 0.000 NA   NA
 10269190 10269191 SRM_01309 SRM_01310   kamA TRUE 0.963 22.000 0.118 NA   NA
 10269192 10269193 SRM_01311 SRM_01312     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269195 10269196 SRM_01314 SRM_01315   nhaC FALSE 0.367 125.000 0.000 NA   NA
 10269198 10269199 SRM_01317 SRM_01318     FALSE 0.408 108.000 0.000 NA   NA
 10269199 10269200 SRM_01318 SRM_01319   ahcY FALSE 0.375 117.000 0.000 NA   NA
 10269200 10269201 SRM_01319 SRM_01320 ahcY   FALSE 0.209 172.000 0.000 NA   NA
 10269201 10269202 SRM_01320 SRM_01321   alaS FALSE 0.054 371.000 0.000 NA   NA
 10269202 10269203 SRM_01321 SRM_01322 alaS   TRUE 0.608 40.000 0.000 1.000   NA
 10269203 10269204 SRM_01322 SRM_01323     TRUE 0.522 32.000 0.000 1.000   NA
 10269204 10269205 SRM_01323 SRM_01324     FALSE 0.363 127.000 0.000 NA   NA
 10269206 10269207 SRM_01325 SRM_01326 fdxA ruvB FALSE 0.186 207.000 0.000 1.000 N NA
 10269212 10269213 SRM_01331 SRM_01332     FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10269213 10269214 SRM_01332 SRM_01333   fabG FALSE 0.259 153.000 0.000 NA   NA
 10269214 10269215 SRM_01333 SRM_01334 fabG   TRUE 0.688 43.000 0.000 1.000 N NA
 10269215 10269216 SRM_01334 SRM_01335   accD TRUE 0.609 112.000 0.002 1.000 N NA
 10269216 10269217 SRM_01335 SRM_01336 accD   FALSE 0.082 277.000 0.000 NA   NA
 10269219 10269220 SRM_01338 SRM_01339     TRUE 0.799 52.000 0.000 NA   NA
 10269224 10269225 SRM_01343 SRM_01344 rpmE deoA FALSE 0.343 148.000 0.000 1.000 N NA
 10269225 10269226 SRM_01344 SRM_01345 deoA   TRUE 0.767 68.000 0.000 NA N NA
 10269226 10269227 SRM_01345 SRM_01346     TRUE 0.991 77.000 0.200 NA   NA
 10269227 10269228 SRM_01346 SRM_01347     TRUE 0.988 20.000 0.500 NA   NA
 10269229 10269230 SRM_01348 SRM_01349   moaC TRUE 0.759 49.000 0.000 NA   NA
 10269230 10269231 SRM_01349 SRM_01350 moaC   TRUE 0.671 119.000 0.003 1.000   NA
 10269232 10269233 SRM_01351 SRM_01352 gltB gltD TRUE 0.996 74.000 0.099 0.001 Y NA
 10269234 10269235 SRM_01353 SRM_01354 dtd yggV TRUE 0.926 46.000 0.005 1.000 N NA
 10269237 10269238 SRM_01356 SRM_01358 odhA   TRUE 0.449 116.000 0.000 1.000 N NA
 10269243 10269244 SRM_01362 SRM_01363 recO lexA2 TRUE 0.475 110.000 0.000 1.000 N NA
 10269245 10269246 SRM_01364 SRM_01365   phrB FALSE 0.417 103.000 0.000 NA   NA
 10269248 10269249 SRM_01366 SRM_01367   acrF TRUE 0.556 40.000 0.000 NA   NA
 10269249 10269250 SRM_01367 SRM_01368 acrF mdtA TRUE 0.997 49.000 0.348 NA N NA
 10269253 10269254 SRM_01371 SRM_01372   smf TRUE 0.602 169.000 0.005 1.000   NA
 10269254 10269255 SRM_01372 SRM_01373 smf sufS FALSE 0.221 189.000 0.000 1.000 N NA
 10269257 10269258 SRM_01375 SRM_01376 rluD   FALSE 0.115 267.000 0.000 1.000 N NA
 10269259 10269260 SRM_01377 SRM_01378     FALSE 0.348 132.000 0.000 NA   NA
 10269262 10269263 SRM_01380 SRM_01381 tonB blaI TRUE 0.633 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 10269263 10269264 SRM_01381 SRM_01382 blaI nodC FALSE 0.421 101.000 0.000 NA   NA
 10269264 10269265 SRM_01382 SRM_01383 nodC arcA FALSE 0.253 155.000 0.000 NA   NA
 10269265 10269266 SRM_01383 SRM_01384 arcA   TRUE 0.473 93.000 0.000 NA   NA
 10269266 10269267 SRM_01384 SRM_01385     TRUE 0.952 6.000 0.114 NA   NA
 10269267 10269268 SRM_01385 SRM_01386     FALSE 0.405 6.000 0.000 1.000 N NA
 10269268 10269269 SRM_01386 SRM_01387   pgk/tpi TRUE 0.809 46.000 0.002 1.000 N NA
 10269269 10269270 SRM_01387 SRM_01388 pgk/tpi GPD TRUE 0.858 92.000 0.002 0.004 Y NA
 10269270 10269271 SRM_01388 SRM_01390 GPD fhlA FALSE 0.025 893.000 0.000 NA   NA
 10269272 10269273 SRM_01389 SRM_01391 atoC   TRUE 0.794 -16.000 0.008 1.000 N NA
 10269273 10269274 SRM_01391 SRM_01392   lon FALSE 0.124 247.000 0.000 1.000   NA
 10269274 10269275 SRM_01392 SRM_01393 lon   TRUE 0.752 13.000 0.005 1.000   NA
 10269275 10269276 SRM_01393 SRM_01394     TRUE 0.693 77.000 0.000 1.000   NA
 10269276 10269277 SRM_01394 SRM_01395     FALSE 0.052 387.000 0.000 NA   NA
 10269277 10269278 SRM_01395 SRM_01396   ttgR FALSE 0.130 217.000 0.000 NA   NA
 10269278 10269279 SRM_01396 SRM_01397 ttgR fadD TRUE 0.996 64.000 0.182 1.000 N NA
 10269279 10269280 SRM_01397 SRM_01398 fadD   TRUE 0.931 128.000 0.019 1.000 Y NA
 10269280 10269281 SRM_01398 SRM_01399   thlA TRUE 0.994 117.000 0.588 1.000 Y NA
 10269281 10269282 SRM_01399 SRM_01400 thlA   TRUE 0.830 61.000 0.000 1.000   NA
 10269282 10269283 SRM_01400 SRM_01401   fadE FALSE 0.068 367.000 0.000 1.000   NA
 10269283 10269284 SRM_01401 SRM_01402 fadE   TRUE 0.939 58.000 0.000 1.000 Y NA
 10269284 10269285 SRM_01402 SRM_01403     TRUE 0.759 49.000 0.000 NA   NA
 10269287 10269288 SRM_01405 SRM_01406     FALSE 0.334 -13.000 0.000 NA   NA
 10269288 10269289 SRM_01406 SRM_01407     FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10269289 10269290 SRM_01407 SRM_01408     TRUE 0.786 51.000 0.000 NA   NA
 10269290 10269291 SRM_01408 SRM_01409   yqjD FALSE 0.104 272.000 0.000 1.000   NA
 10269293 10269294 SRM_01411 SRM_01412     TRUE 0.678 75.000 0.000 NA   NA
 10269295 10269296 SRM_01413 SRM_01414 elaC ispB TRUE 0.687 13.000 0.004 1.000   NA
 10269296 10269297 SRM_01414 SRM_01416 ispB   TRUE 0.439 125.000 0.000 1.000 N NA
 10269298 10269299 SRM_01415 SRM_01417 atoC deoC TRUE 0.488 104.000 0.000 1.000 N NA
 10269299 10269300 SRM_01417 SRM_01418 deoC   TRUE 0.997 51.000 0.277 1.000 N NA
 10269300 10269301 SRM_01418 SRM_01419     TRUE 0.537 -99.000 0.000 0.026   NA
 10269304 10269305 SRM_01422 SRM_01424   dadA TRUE 0.902 47.000 0.000 1.000 Y NA
 10269306 10269307 SRM_01423 SRM_01425   thiS TRUE 0.989 -3.000 0.625 1.000 N NA
 10269307 10269308 SRM_01425 SRM_01426 thiS thiG TRUE 0.984 31.000 0.104 1.000 Y NA
 10269308 10269309 SRM_01426 SRM_01427 thiG thiE TRUE 0.486 350.000 0.005 0.002 Y NA
 10269309 10269310 SRM_01427 SRM_01428 thiE thiD TRUE 0.999 49.000 0.400 0.002 Y NA
 10269310 10269311 SRM_01428 tRNA_16 thiD   TRUE 0.584 83.000 0.000 NA   NA
 10269311 10269312 tRNA_16 SRM_01429     FALSE 0.200 175.000 0.000 NA   NA
 10269312 10269313 SRM_01429 SRM_01430     FALSE 0.091 264.000 0.000 NA   NA
 10269314 10269315 SRM_01431 SRM_01432     TRUE 0.523 38.000 0.000 NA   NA
 10269316 10269317 SRM_01433 SRM_01434     TRUE 0.995 62.000 0.113 0.006   NA
 10269317 10269318 SRM_01434 SRM_01435   mvaB FALSE 0.282 159.000 0.000 1.000   NA
 10269319 10269320 SRM_01436 SRM_01437     FALSE 0.387 20.000 0.000 NA   NA
 10269320 10269321 SRM_01437 SRM_01438     TRUE 0.704 73.000 0.000 NA   NA
 10269321 10269322 SRM_01438 SRM_01439     TRUE 0.941 140.000 0.098 NA   NA
 10269322 10269323 SRM_01439 SRM_01440   ccmA TRUE 0.973 110.000 0.176 NA   NA
 10269324 10269325 SRM_01441 SRM_01442 proB proA TRUE 0.988 109.000 0.281 0.002   NA
 10269328 10269329 SRM_01445 SRM_01446   gcvP FALSE 0.321 137.000 0.000 NA   NA
 10269330 10269331 SRM_01447 SRM_01448 gadB   FALSE 0.242 165.000 0.000 NA N NA
 10269331 10269332 SRM_01448 SRM_01449   dehII FALSE 0.417 103.000 0.000 NA   NA
 10269333 10269334 SRM_01450 SRM_01451   yaeT TRUE 0.810 53.000 0.000 NA   NA
 10269334 10269335 SRM_01451 SRM_01452 yaeT yihY TRUE 0.851 55.000 0.000 1.000   NA
 10269335 10269336 SRM_01452 SRM_01453 yihY   TRUE 0.493 97.000 0.000 1.000   NA
 10269336 10269337 SRM_01453 SRM_01454     TRUE 0.997 38.000 1.000 1.000   NA
 10269337 10269338 SRM_01454 SRM_01455     FALSE 0.167 193.000 0.000 NA   NA
 10269338 10269339 SRM_01455 SRM_01456     FALSE 0.160 196.000 0.000 NA   NA
 10269339 10269340 SRM_01456 SRM_01457   sufS TRUE 0.576 88.000 0.000 1.000   NA
 10269343 10269344 SRM_01460 SRM_01461     FALSE 0.192 179.000 0.000 NA   NA
 10269344 10269345 SRM_01461 SRM_01462   pulF FALSE 0.066 346.000 0.000 NA N NA
 10269345 10269346 SRM_01462 SRM_01463 pulF pulE TRUE 0.931 26.000 0.015 NA Y NA
 10269346 10269347 SRM_01463 SRM_01464 pulE   TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10269347 10269348 SRM_01464 SRM_01465     TRUE 0.999 69.000 1.000 NA   NA
 10269350 10269351 SRM_01466 SRM_01467 pilT   TRUE 0.998 67.000 0.500 NA   NA
 10269351 10269352 SRM_01467 SRM_01469     TRUE 0.999 49.000 1.000 NA   NA
 10269352 10269353 SRM_01469 SRM_01470   gspD TRUE 0.812 119.000 0.009 NA   NA
 10269353 10269354 SRM_01470 SRM_01471 gspD   TRUE 0.746 48.000 0.000 NA   NA
 10269354 10269355 SRM_01471 SRM_01472     FALSE 0.435 106.000 0.000 NA N NA
 10269355 10269356 SRM_01472 SRM_01473     TRUE 0.449 116.000 0.000 1.000 N NA
 10269356 10269357 SRM_01473 SRM_01474     FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10269358 10269359 SRM_01475 SRM_01476   galT FALSE 0.386 114.000 0.000 NA   NA
 10269359 10269360 SRM_01476 SRM_01477 galT   FALSE 0.366 16.000 0.000 NA   NA
 10269361 10269362 SRM_01478 SRM_01479   upp TRUE 0.835 79.000 0.002 1.000 N NA
 10269364 10269365 SRM_01481 SRM_01482 nhaC manA TRUE 0.641 79.000 0.000 NA N NA
 10269365 10269366 SRM_01482 SRM_01483 manA def FALSE 0.398 136.000 0.000 1.000 N NA
 10269366 10269367 SRM_01483 SRM_01484 def   TRUE 0.571 35.000 0.000 1.000 N NA
 10269367 10269368 SRM_01484 SRM_01485   hmuV TRUE 0.648 41.000 0.000 1.000 N NA
 10269368 10269369 SRM_01485 SRM_01486 hmuV   FALSE 0.030 731.000 0.000 NA N NA
 10269369 10269370 SRM_01486 SRM_01487   ansA FALSE 0.373 -79.000 0.000 NA N NA
 10269371 10269372 SRM_01488 SRM_01489   spoIID TRUE 0.912 145.000 0.049 1.000 N NA
 10269374 10269375 SRM_01491 SRM_01492   dnaK FALSE 0.069 386.000 0.000 1.000 N NA
 10269376 10269377 SRM_01493 SRM_01494 pgsA pyrE TRUE 0.889 47.000 0.002 1.000 N NA
 10269377 10269378 SRM_01494 SRM_01495 pyrE cinA TRUE 0.949 58.000 0.004 1.000   NA
 10269378 10269379 SRM_01495 SRM_01496 cinA qor FALSE 0.387 135.000 0.000 1.000   NA
 10269380 10269381 SRM_01497 SRM_01498 osmC mscS FALSE 0.428 130.000 0.000 1.000 N NA
 10269381 10269382 SRM_01498 SRM_01500 mscS   FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269386 10269387 SRM_01503 SRM_01504 trxA   FALSE 0.341 9.000 0.000 NA   NA
 10269388 10269389 SRM_01505 SRM_01506 pepF smtA TRUE 0.538 34.000 0.000 1.000   NA
 10269389 10269390 SRM_01506 SRM_01507 smtA usp FALSE 0.247 172.000 0.000 1.000   NA
 10269390 10269391 SRM_01507 SRM_01508 usp usp TRUE 0.725 -13.000 0.000 0.007 Y NA
 10269391 10269392 SRM_01508 SRM_01509 usp   TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10269393 10269394 SRM_01510 SRM_01511 clpC hesB FALSE 0.070 307.000 0.000 NA   NA
 10269396 10269397 SRM_01513 SRM_01514     FALSE 0.079 284.000 0.000 NA   NA
 10269397 10269398 SRM_01514 SRM_01515     FALSE 0.135 212.000 0.000 NA   NA
 10269398 10269399 SRM_01515 SRM_01516     FALSE 0.047 422.000 0.000 NA   NA
 10269399 10269400 SRM_01516 SRM_01518     FALSE 0.408 108.000 0.000 NA   NA
 10269402 10269403 SRM_01519 SRM_01520 rmlA hal2 TRUE 0.830 63.000 0.000 1.000 N NA
 10269403 10269404 SRM_01520 SRM_01521 hal2   TRUE 0.608 40.000 0.000 1.000   NA
 10269404 10269405 SRM_01521 SRM_01522     TRUE 0.744 46.000 0.000 1.000   NA
 10269405 10269406 SRM_01522 SRM_01523     TRUE 0.478 100.000 0.000 1.000   NA
 10269406 10269407 SRM_01523 SRM_01524     TRUE 0.482 108.000 0.000 1.000 N NA
 10269407 10269408 SRM_01524 SRM_01525   lolD TRUE 0.983 95.000 0.210 1.000 N NA
 10269408 10269409 SRM_01525 SRM_01526 lolD   FALSE 0.235 161.000 0.000 NA   NA
 10269409 10269410 SRM_01526 SRM_01527     TRUE 0.764 66.000 0.000 NA   NA
 10269410 10269411 SRM_01527 SRM_01528     FALSE 0.051 391.000 0.000 NA   NA
 10269411 10269412 SRM_01528 SRM_01529   pyrB TRUE 0.556 40.000 0.000 NA   NA
 10269412 10269413 SRM_01529 SRM_01530 pyrB upp TRUE 0.998 56.000 0.247 1.000 Y NA
 10269416 10269417 SRM_01533 SRM_01534     TRUE 0.594 82.000 0.000 NA   NA
 10269418 10269419 SRM_01535 SRM_01536     FALSE 0.404 -136.000 0.000 1.000   NA
 10269419 10269420 SRM_01536 SRM_01537   rnc TRUE 0.860 58.000 0.000 1.000 N NA
 10269421 10269422 SRM_01538 SRM_01539 ssdA   FALSE 0.177 186.000 0.000 NA   NA
 10269422 10269423 SRM_01539 SRM_01540     TRUE 0.496 35.000 0.000 NA   NA
 10269423 10269424 SRM_01540 SRM_01541     TRUE 0.759 49.000 0.000 NA   NA
 10269424 10269425 SRM_01541 SRM_01542     FALSE 0.140 209.000 0.000 NA   NA
 10269425 10269426 SRM_01542 SRM_01543   gpmB TRUE 0.980 52.000 0.019 NA   NA
 10269426 10269427 SRM_01543 SRM_01544 gpmB menF TRUE 0.839 -184.000 0.011 1.000 N NA
 10269427 10269428 SRM_01544 SRM_01545 menF menD TRUE 0.991 26.000 0.281 1.000 Y NA
 10269430 10269431 SRM_01547 SRM_01548 menA menC TRUE 0.937 -16.000 0.037 0.002 N NA
 10269431 10269432 SRM_01548 SRM_01549 menC menE TRUE 0.986 11.000 0.283 0.002 N NA
 10269432 10269433 SRM_01549 SRM_01550 menE rimL FALSE 0.311 156.000 0.000 1.000 N NA
 10269434 10269435 SRM_01551 SRM_01552     TRUE 0.634 -21.000 0.000 1.000 Y NA
 10269435 10269436 SRM_01552 SRM_01553   spoIIAA TRUE 0.914 67.000 0.000 1.000 Y NA
 10269436 10269437 SRM_01553 SRM_01554 spoIIAA   FALSE 0.333 -10.000 0.000 NA   NA
 10269438 10269439 SRM_01555 SRM_01556     TRUE 0.839 126.000 0.013 NA   NA
 10269439 10269440 SRM_01556 SRM_01557     TRUE 0.988 -342.000 0.543 NA   NA
 10269440 10269441 SRM_01557 SRM_01558   glmS FALSE 0.404 131.000 0.000 1.000   NA
 10269441 10269442 SRM_01558 SRM_01559 glmS prfA FALSE 0.269 208.000 0.000 0.035 N NA
 10269442 10269443 SRM_01559 SRM_01560 prfA rpsF FALSE 0.303 264.000 0.002 1.000 Y NA
 10269443 10269444 SRM_01560 SRM_01561 rpsF rpsR TRUE 0.999 54.000 0.319 0.016 Y NA
 10269444 10269445 SRM_01561 SRM_01562 rpsR rplI TRUE 0.999 50.000 0.499 0.016 Y NA
 10269446 10269447 SRM_01563 SRM_01564 metB dnaA TRUE 0.465 21.000 0.000 1.000 N NA
 10269447 10269448 SRM_01564 SRM_01565 dnaA hpd FALSE 0.103 285.000 0.000 1.000 N NA
 10269448 10269449 SRM_01565 SRM_01566 hpd   TRUE 0.499 100.000 0.000 1.000 N NA
 10269450 10269451 SRM_01567 SRM_01568   ordL TRUE 0.956 108.000 0.044 0.026 N NA
 10269451 10269452 SRM_01568 SRM_01569 ordL   FALSE 0.392 21.000 0.000 NA   NA
 10269454 10269455 SRM_01571 SRM_01572   himA FALSE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10269455 10269456 SRM_01572 SRM_01573 himA   TRUE 0.629 41.000 0.000 1.000   NA
 10269456 10269457 SRM_01573 SRM_01574     FALSE 0.425 100.000 0.000 NA   NA
 10269458 10269459 SRM_01575 SRM_01576   pilR TRUE 0.484 34.000 0.000 NA   NA
 10269459 10269460 SRM_01576 SRM_01577 pilR   TRUE 0.933 77.000 0.009 NA   NA
 10269460 10269461 SRM_01577 SRM_01578   sufE TRUE 0.983 94.000 0.226 NA   NA
 10269461 10269462 SRM_01578 SRM_01579 sufE sufS FALSE 0.357 -241.000 0.000 NA   NA
 10269462 10269463 SRM_01579 SRM_01580 sufS sufD FALSE 0.064 377.000 0.000 1.000   NA
 10269463 10269464 SRM_01580 SRM_01581 sufD sufC TRUE 0.992 -33.000 0.482 1.000 Y NA
 10269464 10269465 SRM_01581 SRM_01582 sufC sufB TRUE 0.989 146.000 0.466 1.000 Y NA
 10269466 10269467 SRM_01583 SRM_01584     FALSE 0.284 147.000 0.000 NA   NA
 10269468 10269469 SRM_01585 SRM_01586     TRUE 0.750 -18.000 0.007 NA   NA
 10269469 10269470 SRM_01586 SRM_01587     FALSE 0.341 9.000 0.000 NA   NA
 10269470 10269471 SRM_01587 SRM_01588   hemN TRUE 0.589 87.000 0.000 1.000   NA
 10269471 10269472 SRM_01588 SRM_01589 hemN   FALSE 0.348 11.000 0.000 NA   NA
 10269473 10269474 SRM_01590 SRM_01591   bcsA FALSE 0.212 171.000 0.000 NA   NA
 10269475 10269476 SRM_01592 SRM_01593   amaA FALSE 0.054 368.000 0.000 NA   NA
 10269476 10269477 SRM_01593 SRM_01594 amaA   TRUE 0.438 114.000 0.000 1.000   NA
 10269477 10269478 SRM_01594 SRM_01595   aprE FALSE 0.404 13.000 0.000 1.000   NA
 10269478 10269479 SRM_01595 SRM_01596 aprE   FALSE 0.380 -7.000 0.000 1.000   NA
 10269479 10269480 SRM_01596 SRM_01597     FALSE 0.183 208.000 0.000 1.000 N NA
 10269480 10269481 SRM_01597 SRM_01598     FALSE 0.054 372.000 0.000 NA   NA
 10269483 10269484 SRM_01600 SRM_01601   emrA TRUE 0.999 50.000 0.714 NA N NA
 10269484 10269485 SRM_01601 SRM_01602 emrA   TRUE 0.990 14.000 0.351 NA Y NA
 10269486 10269487 SRM_01603 SRM_01604 panC panD TRUE 0.996 42.000 0.342 1.000 Y NA
 10269487 10269488 SRM_01604 SRM_01605 panD mmgB FALSE 0.107 279.000 0.000 1.000 N NA
 10269493 10269494 SRM_01610 SRM_01611   rpmA TRUE 0.488 104.000 0.000 1.000 N NA
 10269494 10269495 SRM_01611 SRM_01612 rpmA rplU TRUE 0.999 51.000 0.667 0.015 Y NA
 10269496 10269497 SRM_01613 SRM_01614 mhpD pdxH TRUE 0.811 64.000 0.000 1.000   NA
 10269498 10269499 SRM_01615 SRM_01616 ltaE greA TRUE 0.611 39.000 0.000 1.000 N NA
 10269499 10269500 SRM_01616 SRM_01617 greA ldcA FALSE 0.364 134.000 0.000 NA N NA
 10269500 10269501 SRM_01617 SRM_01618 ldcA   TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10269501 10269502 SRM_01618 SRM_01619   wcaA TRUE 0.871 94.000 0.010 NA   NA
 10269502 10269503 SRM_01619 SRM_01620 wcaA   TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10269503 10269504 SRM_01620 SRM_01621     FALSE 0.344 -31.000 0.000 NA   NA
 10269504 10269505 SRM_01621 SRM_01622   crtB FALSE 0.417 16.000 0.000 1.000   NA
 10269505 10269506 SRM_01622 SRM_01624 crtB   TRUE 0.946 40.000 0.023 NA   NA
 10269507 10269508 SRM_01623 SRM_01625   dcd FALSE 0.430 99.000 0.000 NA   NA
 10269508 10269509 SRM_01625 SRM_01626 dcd   TRUE 0.746 48.000 0.000 NA   NA
 10269510 10269511 SRM_01627 SRM_01628 dapA   TRUE 0.642 84.000 0.000 1.000 N NA
 10269512 10269513 SRM_01629 SRM_01630     FALSE 0.173 189.000 0.000 NA   NA
 10269515 10269516 SRM_01632 SRM_01633 aphA dnaQ FALSE 0.379 2.000 0.000 1.000   NA
 10269516 10269517 SRM_01633 SRM_01634 dnaQ ppx FALSE 0.402 -81.000 0.000 1.000   NA
 10269517 10269518 SRM_01634 SRM_01635 ppx nuoJ TRUE 0.504 199.000 0.005 1.000 N NA
 10269518 10269519 SRM_01635 SRM_01636 nuoJ nuoK TRUE 0.993 115.000 0.306 0.003 Y NA
 10269519 10269520 SRM_01636 SRM_01637 nuoK nuoL TRUE 1.000 56.000 0.790 0.007 Y NA
 10269520 10269521 SRM_01637 SRM_01638 nuoL nuoM TRUE 0.989 125.000 0.183 0.007 Y NA
 10269521 10269522 SRM_01638 SRM_01639 nuoM   TRUE 0.548 93.000 0.000 1.000 N NA
 10269522 10269523 SRM_01639 SRM_01640   nuoN TRUE 0.898 38.000 0.008 1.000 N NA
 10269523 10269524 SRM_01640 SRM_01641 nuoN   TRUE 0.819 58.000 0.000 NA   NA
 10269525 10269526 SRM_01642 SRM_01643     TRUE 0.710 4.000 0.000 0.025 Y NA
 10269527 10269528 SRM_01644 SRM_01645     FALSE 0.356 130.000 0.000 NA   NA
 10269528 10269529 SRM_01645 SRM_01646     TRUE 0.998 48.000 0.667 NA   NA
 10269530 10269531 SRM_01647 SRM_01649   aldH TRUE 0.849 60.000 0.000 1.000 N NA
 10269533 10269534 SRM_01650 SRM_01651   fadJ FALSE 0.384 5.000 0.000 1.000   NA
 10269534 10269535 SRM_01651 SRM_01652 fadJ fadA TRUE 0.998 48.000 0.430 1.000 Y NA
 10269536 10269537 SRM_01653 SRM_01654 spoU   TRUE 0.494 91.000 0.000 NA   NA
 10269537 10269538 SRM_01654 SRM_01655     FALSE 0.305 141.000 0.000 NA   NA
 10269539 10269540 SRM_01656 SRM_01657 glpA   FALSE 0.122 225.000 0.000 NA   NA
 10269540 10269541 SRM_01657 SRM_01658   ugpB FALSE 0.197 177.000 0.000 NA   NA
 10269541 10269542 SRM_01658 SRM_01659 ugpB   FALSE 0.042 460.000 0.000 NA   NA
 10269542 10269543 SRM_01659 SRM_01660   ugpE TRUE 0.999 52.000 0.854 NA   NA
 10269543 10269544 SRM_01660 SRM_01661 ugpE ugpA TRUE 0.997 -3.000 0.922 0.030 Y NA
 10269544 10269545 SRM_01661 SRM_01662 ugpA malK TRUE 0.999 46.000 0.847 0.030 Y NA
 10269545 10269546 SRM_01662 SRM_01663 malK   TRUE 0.997 16.000 0.865 0.001 Y NA
 10269546 10269547 SRM_01663 SRM_01664   glpK TRUE 0.948 61.000 0.004 1.000 N NA
 10269548 10269549 SRM_01665 SRM_01666 araC gpsA TRUE 0.672 81.000 0.000 1.000 N NA
 10269549 10269550 SRM_01666 SRM_01667 gpsA fbp TRUE 0.875 69.000 0.000 0.010 N NA
 10269550 10269551 SRM_01667 SRM_01668 fbp   FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10269551 10269552 SRM_01668 SRM_01669   fadB FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10269552 10269553 SRM_01669 SRM_01670 fadB citB FALSE 0.336 181.000 0.000 0.044 N NA
 10269553 10269554 SRM_01670 SRM_01671 citB   TRUE 0.463 113.000 0.000 1.000 N NA
 10269554 10269555 SRM_01671 SRM_01672   purM TRUE 0.793 44.000 0.002 1.000 N NA
 10269555 10269556 SRM_01672 SRM_01673 purM   TRUE 0.957 74.000 0.013 1.000   NA
 10269556 10269557 SRM_01673 SRM_01674   gpsA TRUE 0.939 6.000 0.074 1.000   NA
 10269557 10269558 SRM_01674 SRM_01675 gpsA   TRUE 0.786 116.000 0.007 NA   NA
 10269558 10269559 SRM_01675 SRM_01676   gyrA FALSE 0.064 333.000 0.000 NA   NA
 10269559 10269560 SRM_01676 SRM_01677 gyrA gyrB TRUE 0.995 57.000 0.023 0.002 Y NA
 10269560 10269561 SRM_01677 tRNA_17 gyrB   FALSE 0.204 173.000 0.000 NA   NA
 10269563 10269564 SRM_01678 SRM_01680     TRUE 0.819 58.000 0.000 NA   NA
 10269565 10269566 SRM_01681 SRM_01682     TRUE 0.810 53.000 0.000 NA   NA
 10269566 10269567 SRM_01682 SRM_01684     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10269568 10269569 SRM_01683 SRM_01685     FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10269569 10269570 SRM_01685 SRM_01686     TRUE 0.571 84.000 0.000 NA   NA
 10269571 10269572 SRM_01687 SRM_01688     FALSE 0.074 297.000 0.000 NA   NA
 10269572 10269573 SRM_01688 SRM_01689   nagD FALSE 0.053 374.000 0.000 NA   NA
 10269573 10269574 SRM_01689 SRM_01690 nagD   TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10269575 10269576 SRM_01691 SRM_01692   scpB TRUE 0.813 59.000 0.000 NA   NA
 10269576 10269577 SRM_01692 SRM_01693 scpB rluB TRUE 0.898 10.000 0.031 NA N NA
 10269577 10269578 SRM_01693 SRM_01694 rluB guaB TRUE 0.586 13.000 0.002 1.000 N NA
 10269578 10269579 SRM_01694 SRM_01695 guaB pepP TRUE 0.595 15.000 0.002 1.000 N NA
 10269579 10269580 SRM_01695 SRM_01696 pepP   FALSE 0.244 158.000 0.000 NA   NA
 10269581 10269582 SRM_01697 SRM_01698 miaA   FALSE 0.308 152.000 0.000 1.000   NA
 10269582 10269583 SRM_01698 SRM_01699     FALSE 0.118 228.000 0.000 NA   NA
 10269583 10269584 SRM_01699 SRM_01700   crtI TRUE 0.971 35.000 0.091 NA   NA
 10269585 10269586 SRM_01701 SRM_01702     FALSE 0.361 15.000 0.000 NA   NA
 10269586 10269587 SRM_01702 SRM_01703     FALSE 0.074 297.000 0.000 NA   NA
 10269587 10269588 SRM_01703 SRM_01704   xerD FALSE 0.337 135.000 0.000 NA   NA
 10269588 10269589 SRM_01704 SRM_01705 xerD   FALSE 0.098 251.000 0.000 NA   NA
 10269589 10269590 SRM_01705 SRM_01706   xerD TRUE 0.714 72.000 0.000 NA   NA
 10269591 10269592 SRM_01707 SRM_01708   ygcM TRUE 0.825 23.000 0.008 NA   NA
 10269592 10269593 SRM_01708 SRM_01709 ygcM   TRUE 0.997 46.000 0.489 1.000 N NA
 10269593 10269594 SRM_01709 SRM_01710     TRUE 0.986 53.000 0.023 1.000 N NA
 10269595 10269596 SRM_01711 SRM_01712   purR TRUE 0.620 42.000 0.000 NA N NA
 10269596 10269597 SRM_01712 SRM_01713 purR purC TRUE 0.756 112.000 0.004 1.000 N NA
 10269598 10269599 SRM_01714 SRM_01715   bcp FALSE 0.145 226.000 0.000 1.000   NA
 10269599 10269600 SRM_01715 SRM_01716 bcp   TRUE 0.852 53.000 0.000 1.000 N NA
 10269601 10269602 SRM_01717 SRM_01718 pruA   TRUE 0.973 64.000 0.016 NA   NA
 10269602 10269603 SRM_01718 SRM_01719     TRUE 0.631 78.000 0.000 NA   NA
 10269604 10269605 SRM_01720 SRM_01721     FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10269605 10269606 SRM_01721 tRNA_18     FALSE 0.279 148.000 0.000 NA   NA
 10269606 10269607 tRNA_18 SRM_01722     FALSE 0.368 124.000 0.000 NA   NA
 10269607 10269608 SRM_01722 SRM_01723     TRUE 0.910 41.000 0.009 NA   NA
 10269608 10269609 SRM_01723 SRM_01724   smtA FALSE 0.357 -205.000 0.000 NA   NA
 10269610 10269611 SRM_01725 SRM_01726 aroB   TRUE 0.668 94.000 0.002 NA   NA
 10269611 10269612 SRM_01726 SRM_01727   rnr FALSE 0.110 236.000 0.000 NA   NA
 10269613 10269614 SRM_01728 SRM_01729     FALSE 0.046 439.000 0.000 NA   NA
 10269614 10269615 SRM_01729 SRM_01730   recA TRUE 0.530 7.000 0.002 1.000 N NA
 10269615 10269616 SRM_01730 SRM_01731 recA   FALSE 0.125 221.000 0.000 NA   NA
 10269617 10269618 SRM_01732 SRM_01733     TRUE 0.974 11.000 0.254 NA   NA
 10269618 10269619 SRM_01733 SRM_01734     TRUE 0.523 38.000 0.000 NA   NA
 10269621 10269622 SRM_01736 SRM_01737   glpQ FALSE 0.040 487.000 0.000 NA   NA
 10269623 10269624 SRM_01738 SRM_01739 dinB   FALSE 0.035 523.000 0.000 NA   NA
 10269626 10269627 SRM_01741 tRNA_19     FALSE 0.057 356.000 0.000 NA   NA
 10269627 10269628 tRNA_19 SRM_01742   alaS FALSE 0.373 119.000 0.000 NA   NA
 10269628 10269629 SRM_01742 SRM_01744 alaS alkA FALSE 0.120 262.000 0.000 1.000 N NA
 10269631 10269632 SRM_01745 SRM_01746 atoB   TRUE 0.863 56.000 0.000 1.000 N NA
 10269632 10269633 SRM_01746 SRM_01747     TRUE 0.993 53.000 0.087 1.000   NA
 10269633 10269634 SRM_01747 SRM_01748   ttuD FALSE 0.379 2.000 0.000 1.000   NA
 10269635 10269636 SRM_01749 SRM_01750   thiE TRUE 0.538 39.000 0.000 NA   NA
 10269637 10269638 SRM_01751 SRM_01752 hemD hemC TRUE 0.949 46.000 0.002 0.002 Y NA
 10269638 10269639 SRM_01752 SRM_01753 hemC hemA TRUE 0.990 111.000 0.178 0.002 Y NA
 10269639 10269640 SRM_01753 SRM_01754 hemA mtnN TRUE 0.609 87.000 0.000 1.000 N NA
 10269640 10269641 SRM_01754 SRM_01755 mtnN metG FALSE 0.040 639.000 0.000 1.000 N NA
 10269641 10269642 SRM_01755 SRM_01756 metG   FALSE 0.204 173.000 0.000 NA   NA
 10269643 10269644 SRM_01757 SRM_01758 hisB proC TRUE 0.750 127.000 0.002 1.000 Y NA
 10269644 10269645 SRM_01758 SRM_01759 proC hisH TRUE 0.973 83.000 0.014 0.034 Y NA
 10269647 10269648 SRM_01761 SRM_01762 hisA hisF TRUE 0.998 41.000 0.433 0.003 Y NA
 10269648 10269649 SRM_01762 SRM_01763 hisF   TRUE 0.509 -16.000 0.002 NA   NA
 10269651 10269652 SRM_01764 SRM_01766 ligT lolA TRUE 0.782 112.000 0.005 1.000 N NA
 10269652 10269653 SRM_01766 SRM_01767 lolA   TRUE 0.985 59.000 0.025 NA   NA
 10269653 10269654 SRM_01767 SRM_01768   mdh FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10269656 10269657 SRM_01769 SRM_01771 gloA mocA TRUE 0.648 42.000 0.000 1.000   NA
 10269657 10269658 SRM_01771 SRM_01772 mocA   TRUE 0.496 35.000 0.000 NA   NA
 10269658 10269659 SRM_01772 SRM_01773   msrA FALSE 0.421 101.000 0.000 NA   NA
 10269659 10269660 SRM_01773 SRM_01774 msrA mtrF FALSE 0.043 493.000 0.000 NA N NA
 10269661 10269662 SRM_01775 SRM_01776     FALSE 0.338 7.000 0.000 NA   NA
 10269663 10269664 SRM_01777 SRM_01778 uvrC   FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10269665 10269666 SRM_01779 SRM_01780     TRUE 0.547 86.000 0.000 NA   NA
 10269666 10269667 SRM_01780 SRM_01781     TRUE 0.547 86.000 0.000 NA   NA
 10269668 10269669 SRM_01782 SRM_01783 nrfG   TRUE 0.853 57.000 0.000 1.000   NA
 10269669 10269670 SRM_01783 SRM_01784     TRUE 0.679 78.000 0.000 1.000   NA
 10269670 10269671 SRM_01784 SRM_01785     FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10269671 10269672 SRM_01785 SRM_01786   exbB TRUE 0.459 31.000 0.000 NA   NA
 10269672 10269673 SRM_01786 SRM_01787 exbB exbD TRUE 0.999 48.000 0.773 0.036 Y NA
 10269674 10269675 SRM_01788 SRM_01789 chlI azu FALSE 0.042 620.000 0.000 1.000 N NA
 10269677 10269678 SRM_01791 SRM_01792 ubiE   FALSE 0.348 132.000 0.000 NA   NA
 10269678 10269679 SRM_01792 SRM_01793   copA TRUE 0.584 83.000 0.000 NA   NA
 10269680 10269681 SRM_01794 SRM_01795   fixC TRUE 0.991 118.000 0.333 1.000 Y NA
 10269684 10269685 SRM_01798 SRM_01800     FALSE 0.369 137.000 0.000 1.000   NA
 10269686 10269687 SRM_01799 SRM_01801     TRUE 0.993 65.000 0.125 NA   NA
 10269687 10269688 SRM_01801 SRM_01802     TRUE 0.963 60.000 0.007 NA   NA
 10269688 10269689 SRM_01802 SRM_01803   pdhD TRUE 0.851 90.000 0.005 1.000 N NA
 10269689 10269690 SRM_01803 SRM_01804 pdhD   FALSE 0.274 149.000 0.000 NA   NA
 10269690 10269691 SRM_01804 SRM_01805     FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10269692 10269693 SRM_01806 SRM_01807 pepN   FALSE 0.376 -3.000 0.000 1.000   NA
 10269693 10269694 SRM_01807 SRM_01808   mutS TRUE 0.576 88.000 0.000 1.000   NA
 10269697 10269698 SRM_01811 tRNA_20 ppnK   TRUE 0.797 61.000 0.000 NA   NA
 10269698 10269699 tRNA_20 SRM_01812   degP FALSE 0.021 1971.000 0.000 NA   NA
 10269699 10269700 SRM_01812 SRM_01813 degP   FALSE 0.380 115.000 0.000 NA   NA
 10269700 10269701 SRM_01813 SRM_01814   gldA FALSE 0.105 243.000 0.000 NA   NA
 10269703 10269704 SRM_01816 SRM_01817 tyrA gcvT TRUE 0.886 127.000 0.008 1.000 Y NA
 10269704 10269705 SRM_01817 SRM_01818 gcvT comB TRUE 0.977 54.000 0.011 1.000 N NA
 10269705 10269706 SRM_01818 SRM_01819 comB ftsK TRUE 0.924 107.000 0.028 1.000 N NA
 10269706 10269707 SRM_01819 SRM_01820 ftsK purK TRUE 0.834 73.000 0.000 0.094 N NA
 10269707 10269708 SRM_01820 SRM_01821 purK purE TRUE 0.984 136.000 0.141 0.001 Y NA
 10269708 10269709 SRM_01821 SRM_01822 purE prpL TRUE 0.505 30.000 0.000 1.000   NA
 10269710 10269711 SRM_01823 SRM_01824 tyrS smpB TRUE 0.984 61.000 0.014 0.013 N NA
 10269711 10269712 SRM_01824 SRM_01825 smpB   FALSE 0.319 170.000 0.002 NA   NA
 10269712 10269713 SRM_01825 SRM_01826   rplS TRUE 0.840 67.000 0.002 NA   NA
 10269713 10269714 SRM_01826 SRM_01827 rplS trmD TRUE 0.999 62.000 0.567 1.000 Y NA
 10269714 10269715 SRM_01827 SRM_01828 trmD rimM TRUE 0.999 46.000 0.672 1.000 Y NA
 10269715 10269716 SRM_01828 SRM_01829 rimM rpsP TRUE 0.995 30.000 0.342 0.015 Y NA
 10269716 10269717 SRM_01829 SRM_01830 rpsP ffh TRUE 0.996 72.000 0.361 1.000 N NA
 10269718 10269719 SRM_01831 SRM_01832     TRUE 0.661 44.000 0.000 NA N NA
 10269720 10269721 SRM_01833 SRM_01834     TRUE 0.993 83.000 0.235 0.006   NA
 10269721 10269722 SRM_01834 SRM_01836   polA TRUE 0.487 3.000 0.002 1.000   NA
 10269723 10269724 SRM_01835 SRM_01837   gph FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269726 10269727 SRM_01839 SRM_01840   purN FALSE 0.345 -33.000 0.000 NA   NA
 10269727 10269728 SRM_01840 SRM_01841 purN purH TRUE 0.987 20.000 0.225 1.000 Y NA
 10269728 10269729 SRM_01841 SRM_01842 purH mreB FALSE 0.421 167.000 0.002 1.000 N NA
 10269729 10269730 SRM_01842 SRM_01843 mreB mreC TRUE 0.939 56.000 0.003 1.000 N NA
 10269730 10269731 SRM_01843 SRM_01844 mreC hslV FALSE 0.158 225.000 0.000 1.000 N NA
 10269731 10269732 SRM_01844 SRM_01845 hslV   TRUE 0.724 107.000 0.004 NA   NA
 10269732 10269733 SRM_01845 SRM_01846   hslU TRUE 0.935 60.000 0.003 NA   NA
 10269733 10269734 SRM_01846 SRM_01847 hslU   FALSE 0.397 22.000 0.000 NA   NA
 10269735 10269736 SRM_01848 SRM_01849   paaY FALSE 0.417 103.000 0.000 NA   NA
 10269738 10269739 tRNA_21 SRM_01851   dedA TRUE 0.776 64.000 0.000 NA   NA
 10269739 10269740 SRM_01851 SRM_01852 dedA ispF TRUE 0.729 -3.000 0.006 NA   NA
 10269740 10269741 SRM_01852 SRM_01853 ispF ispD TRUE 0.994 29.000 0.419 1.000 Y NA
 10269741 10269742 SRM_01853 SRM_01854 ispD queA TRUE 0.891 18.000 0.019 1.000 N NA
 10269742 10269743 SRM_01854 SRM_01855 queA   FALSE 0.278 166.000 0.000 1.000 N NA
 10269743 10269744 SRM_01855 SRM_01856   gatA FALSE 0.426 -174.000 0.000 1.000 N NA
 10269744 10269745 SRM_01856 SRM_01857 gatA   FALSE 0.079 347.000 0.000 1.000 N NA
 10269745 10269746 SRM_01857 SRM_01858     FALSE 0.023 1150.000 0.000 NA   NA
 10269746 10269747 SRM_01858 SRM_01859   ylnA TRUE 0.759 49.000 0.000 NA   NA
 10269747 10269748 SRM_01859 SRM_01860 ylnA   TRUE 0.563 -19.000 0.000 0.002   NA
 10269748 10269749 SRM_01860 SRM_01861   prfC FALSE 0.135 246.000 0.000 1.000 N NA
 10269749 10269750 SRM_01861 SRM_01862 prfC   FALSE 0.231 163.000 0.000 NA   NA
 10269750 10269751 SRM_01862 SRM_01863     TRUE 0.692 74.000 0.000 NA   NA
 10269751 10269752 SRM_01863 SRM_01864     FALSE 0.352 -93.000 0.000 NA   NA
 10269752 10269753 SRM_01864 SRM_01865     FALSE 0.068 318.000 0.000 NA   NA
 10269753 10269754 SRM_01865 SRM_01866     TRUE 0.704 73.000 0.000 NA   NA
 10269755 10269756 SRM_01867 SRM_01868 trpE   TRUE 0.458 109.000 0.000 1.000   NA
 10269756 10269757 SRM_01868 SRM_01869   trpS TRUE 0.809 50.000 0.000 1.000   NA
 10269757 10269758 SRM_01869 SRM_01870 trpS pabA TRUE 0.440 124.000 0.000 1.000 N NA
 10269758 10269759 SRM_01870 SRM_01871 pabA trpD TRUE 0.925 46.000 0.002 1.000 Y NA
 10269759 10269760 SRM_01871 SRM_01872 trpD trpC TRUE 0.979 61.000 0.006 1.000 Y NA
 10269760 10269761 SRM_01872 SRM_01873 trpC trpF TRUE 0.986 71.000 0.013 0.001 Y NA
 10269761 10269762 SRM_01873 SRM_01874 trpF trpB2 TRUE 0.978 61.000 0.003 0.001 Y NA
 10269762 10269763 SRM_01874 SRM_01875 trpB2 trpA TRUE 0.961 53.000 0.000 0.001 Y NA
 10269763 10269764 SRM_01875 SRM_01876 trpA   TRUE 0.799 52.000 0.000 NA   NA
 10269764 10269765 SRM_01876 SRM_01877     FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10269766 10269767 SRM_01878 SRM_01879 recQ   FALSE 0.029 1123.000 0.000 1.000   NA
 10269767 10269768 SRM_01879 SRM_01880     FALSE 0.415 25.000 0.000 NA   NA
 10269768 10269769 SRM_01880 SRM_01881   icd FALSE 0.334 5.000 0.000 NA   NA
 10269769 10269770 SRM_01881 SRM_01882 icd   FALSE 0.326 152.000 0.000 1.000 N NA
 10269770 10269771 SRM_01882 SRM_01883     TRUE 0.993 65.000 0.031 0.029 Y NA
 10269771 10269772 SRM_01883 SRM_01884     TRUE 0.999 55.000 1.000 NA   NA
 10269772 10269773 SRM_01884 SRM_01885     TRUE 0.918 103.000 0.029 NA   NA
 10269774 10269775 SRM_01886 SRM_01887 pol4   TRUE 0.927 39.000 0.015 1.000   NA
 10269776 10269777 SRM_01888 SRM_01889 acs pabB TRUE 0.440 124.000 0.000 1.000 N NA
 10269777 10269778 SRM_01889 SRM_01891 pabB yiaY TRUE 0.479 109.000 0.000 1.000 N NA
 10269779 10269780 SRM_01890 SRM_01892 nemA   TRUE 0.662 45.000 0.000 NA   NA
 10269781 10269782 SRM_01893 SRM_01894   bhbA FALSE 0.341 -25.000 0.000 NA   NA
 10269784 10269785 SRM_01896 SRM_01897 mrpE mrpD TRUE 0.995 -73.000 0.810 1.000 Y NA
 10269785 10269786 SRM_01897 SRM_01898 mrpD mrpC TRUE 0.999 44.000 0.896 0.007 Y NA
 10269786 10269787 SRM_01898 SRM_01899 mrpC mnhB TRUE 0.994 46.000 0.278 NA   NA
 10269787 10269788 SRM_01899 SRM_01900 mnhB mnhA TRUE 0.973 -3.000 0.274 NA   NA
 10269788 10269789 SRM_01900 SRM_01901 mnhA mnhG TRUE 0.916 66.000 0.000 1.000 Y NA
 10269789 10269790 SRM_01901 SRM_01902 mnhG mrpF TRUE 0.998 42.000 0.614 1.000 Y NA
 10269791 10269792 SRM_01903 SRM_01904     TRUE 0.584 83.000 0.000 NA   NA
 10269792 10269793 SRM_01904 SRM_01905     TRUE 0.806 60.000 0.000 NA   NA
 10269793 10269794 SRM_01905 SRM_01906     TRUE 0.660 76.000 0.000 NA   NA
 10269795 10269796 SRM_01907 SRM_01908 caiA hemE TRUE 0.814 66.000 0.000 1.000 N NA
 10269796 10269797 SRM_01908 SRM_01909 hemE clcD TRUE 0.568 91.000 0.000 1.000 N NA
 10269798 10269799 SRM_01910 SRM_01911 cdsA   FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10269799 10269800 SRM_01911 SRM_01912     TRUE 0.776 64.000 0.000 NA   NA
 10269800 10269801 SRM_01912 SRM_01913     TRUE 0.473 93.000 0.000 NA   NA
 10269801 10269802 SRM_01913 SRM_01914     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10269802 10269803 SRM_01914 SRM_01915   tnaA TRUE 0.527 95.000 0.000 1.000 N NA
 10269804 10269805 SRM_01916 SRM_01917 ansA hpt FALSE 0.348 147.000 0.000 1.000 N NA
 10269805 10269806 SRM_01917 SRM_01918 hpt mesJ TRUE 0.890 63.000 0.000 0.033 N NA
 10269806 10269807 SRM_01918 SRM_01919 mesJ mutL TRUE 0.816 32.000 0.003 0.093 N NA
 10269807 10269808 SRM_01919 SRM_01920 mutL cdsA FALSE 0.397 0.000 0.000 1.000 N NA
 10269808 10269809 SRM_01920 SRM_01921 cdsA   TRUE 0.746 48.000 0.000 NA   NA
 10269810 10269811 tRNA_22 SRM_01922     FALSE 0.069 315.000 0.000 NA   NA
 10269811 10269812 SRM_01922 SRM_01923     FALSE 0.328 0.000 0.000 NA   NA
 10269815 10269816 SRM_01926 SRM_01927     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10269816 10269817 SRM_01927 SRM_01928     TRUE 0.797 61.000 0.000 NA   NA
 10269818 10269819 SRM_01929 SRM_01930   ftsX TRUE 0.656 93.000 0.000 0.088 N NA
 10269819 10269820 SRM_01930 SRM_01931 ftsX   TRUE 0.888 46.000 0.000 1.000 Y NA
 10269820 10269821 SRM_01931 SRM_01932     FALSE 0.315 226.000 0.000 1.000 Y NA
 10269824 10269825 SRM_01935 SRM_01936 sodA   FALSE 0.231 163.000 0.000 NA   NA
 10269825 10269826 SRM_01936 SRM_01937     FALSE 0.340 -22.000 0.000 NA   NA
 10269826 10269827 SRM_01937 SRM_01938     TRUE 0.522 32.000 0.000 1.000   NA
 10269829 10269830 SRM_01940 SRM_01941     FALSE 0.022 1493.000 0.000 NA   NA
 10269830 10269831 SRM_01941 SRM_01942     FALSE 0.131 216.000 0.000 NA   NA
 10269831 10269832 SRM_01942 SRM_01943   argB TRUE 0.793 150.000 0.014 1.000   NA
 10269832 10269833 SRM_01943 SRM_01944 argB mmgC FALSE 0.117 253.000 0.000 1.000   NA
 10269835 10269836 SRM_01946 SRM_01947   usp TRUE 0.444 29.000 0.000 NA   NA
 10269836 10269837 SRM_01947 SRM_01948 usp usp TRUE 0.752 16.000 0.000 0.007 Y NA
 10269838 10269839 SRM_01949 SRM_01950     FALSE 0.334 -13.000 0.000 NA   NA
 10269840 10269841 SRM_01951 SRM_01952   hemL TRUE 0.667 42.000 0.000 1.000 N NA
 10269841 10269842 SRM_01952 SRM_01953 hemL   TRUE 0.645 82.000 0.000 1.000   NA
 10269842 10269843 SRM_01953 SRM_01954   hemH TRUE 0.853 56.000 0.000 1.000   NA
 10269843 10269844 SRM_01954 SRM_01955 hemH hemF TRUE 0.652 130.000 0.000 1.000 Y NA
 10269844 10269845 SRM_01955 SRM_01956 hemF rluD TRUE 0.509 98.000 0.000 1.000 N NA
 10269845 10269846 SRM_01956 SRM_01957 rluD   TRUE 0.841 53.000 0.000 1.000   NA
 10269846 10269847 SRM_01957 SRM_01959   dapG TRUE 0.538 34.000 0.000 1.000   NA
 10269848 10269849 SRM_01958 SRM_01960 spmA spmB TRUE 0.998 50.000 0.655 NA   NA
 10269850 10269851 SRM_01961 SRM_01962 dacB   TRUE 0.642 29.000 0.000 0.028 N NA
 10269851 10269852 SRM_01962 SRM_01963     FALSE 0.140 209.000 0.000 NA   NA
 10269853 10269854 SRM_01964 SRM_01965     FALSE 0.408 108.000 0.000 NA   NA
 10269855 10269856 SRM_01966 SRM_01967   phrB FALSE 0.375 18.000 0.000 NA   NA
 10269856 10269857 SRM_01967 SRM_01968 phrB gltP TRUE 0.475 110.000 0.000 1.000 N NA
 10269857 10269858 SRM_01968 SRM_01969 gltP   FALSE 0.255 154.000 0.000 NA   NA
 10269858 10269859 SRM_01969 SRM_01970   rpoC TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10269859 10269860 SRM_01970 SRM_01971 rpoC rpoB TRUE 0.998 112.000 0.851 0.001 Y NA
 10269860 10269861 SRM_01971 SRM_01972 rpoB rplL TRUE 0.779 436.000 0.223 1.000 N NA
 10269861 10269862 SRM_01972 SRM_01973 rplL rplJ TRUE 0.997 139.000 0.884 0.015 Y NA
 10269862 10269863 SRM_01973 SRM_01974 rplJ rplA TRUE 0.999 52.000 0.302 0.019 Y NA
 10269863 10269864 SRM_01974 SRM_01975 rplA rplK TRUE 0.997 121.000 0.838 0.019 Y NA
 10269864 10269865 SRM_01975 SRM_01976 rplK nusG TRUE 0.992 119.000 0.681 1.000 N NA
 10269865 10269866 SRM_01976 tRNA_23 nusG   FALSE 0.060 347.000 0.000 NA   NA
 10269866 10269867 tRNA_23 SRM_01977   tuf TRUE 0.494 91.000 0.000 NA   NA
 10269868 10269869 SRM_01978 SRM_01979     TRUE 0.573 8.000 0.000 0.001   NA
 10269869 10269870 SRM_01979 SRM_01980     FALSE 0.212 171.000 0.000 NA   NA
 10269871 10269872 SRM_01981 SRM_01982     TRUE 0.511 89.000 0.000 NA   NA
 10269872 10269873 SRM_01982 SRM_01983   scpA FALSE 0.034 547.000 0.000 NA   NA
 10269873 10269874 SRM_01983 SRM_01984 scpA galE FALSE 0.093 260.000 0.000 NA   NA
 10269874 10269875 SRM_01984 SRM_01985 galE pnpA TRUE 0.441 123.000 0.000 1.000 N NA
 10269875 10269876 SRM_01985 SRM_01986 pnpA rpsO TRUE 0.997 43.000 0.335 1.000 Y NA
 10269876 10269877 SRM_01986 SRM_01987 rpsO ribF TRUE 0.860 126.000 0.014 1.000 N NA
 10269877 10269878 SRM_01987 SRM_01988 ribF rbfA FALSE 0.115 267.000 0.000 1.000 N NA
 10269878 10269879 SRM_01988 SRM_01989 rbfA infB TRUE 0.998 77.000 0.530 1.000 Y NA
 10269879 10269880 SRM_01989 SRM_01990 infB nusA TRUE 0.996 71.000 0.342 1.000 N NA
 10269880 10269881 SRM_01990 SRM_01991 nusA   TRUE 0.999 64.000 0.759 NA   NA
 10269881 10269882 SRM_01991 SRM_01992   prfB FALSE 0.095 257.000 0.000 NA   NA
 10269882 10269883 SRM_01992 SRM_01993 prfB aspC FALSE 0.433 196.000 0.003 1.000 N NA
 10269887 10269888 SRM_01997 SRM_01998     TRUE 0.819 58.000 0.000 NA   NA
 10269888 10269889 SRM_01998 SRM_01999   rpsA FALSE 0.293 161.000 0.000 1.000 N NA
 10269889 10269890 SRM_01999 SRM_02000 rpsA cmk TRUE 0.925 223.000 0.281 1.000 N NA
 10269890 10269891 SRM_02000 SRM_02002 cmk   TRUE 0.785 48.000 0.000 1.000   NA
 10269892 10269893 SRM_02001 SRM_02003   mutA TRUE 0.849 60.000 0.000 1.000 N NA
 10269893 10269894 SRM_02003 SRM_02004 mutA mutB TRUE 0.950 65.000 0.000 0.001 Y NA
 10269894 10269895 SRM_02004 SRM_02005 mutB   TRUE 0.996 45.000 0.366 1.000 N NA
 10269895 10269896 SRM_02005 SRM_02006     TRUE 0.503 90.000 0.000 NA   NA
 10269896 10269897 SRM_02006 SRM_02007   glnS TRUE 0.473 93.000 0.000 NA   NA
 10269899 10269900 SRM_02009 SRM_02010     TRUE 0.802 23.000 0.006 1.000   NA
 10269900 10269901 SRM_02010 SRM_02011   ppiD TRUE 0.999 55.000 0.530 0.006   NA
 10269901 10269902 SRM_02011 SRM_02012 ppiD moxR TRUE 0.996 75.000 0.360 1.000   NA
 10269902 10269903 SRM_02012 SRM_02013 moxR nqrF TRUE 0.871 159.000 0.043 1.000   NA
 10269903 10269904 SRM_02013 SRM_02014 nqrF fxsA TRUE 0.772 130.000 0.006 1.000   NA
 10269906 10269907 SRM_02016 SRM_02017   pepP FALSE 0.408 108.000 0.000 NA   NA
 10269908 10269909 SRM_02018 SRM_02019 RecB   TRUE 0.987 49.000 0.035 0.048   NA
 10269909 10269910 SRM_02019 SRM_02020     FALSE 0.388 7.000 0.000 1.000   NA
 10269910 10269911 SRM_02020 SRM_02022     FALSE 0.370 17.000 0.000 NA   NA
 10269912 10269913 SRM_02021 SRM_02023     TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10269916 10269917 tRNA_24 tRNA_25     FALSE 0.376 116.000 0.000 NA   NA
 10269917 10269918 tRNA_25 tRNA_26     FALSE 0.387 20.000 0.000 NA   NA
 10269918 10269919 tRNA_26 tRNA_27     TRUE 0.789 62.000 0.000 NA   NA
 10269921 10269922 SRM_02027 SRM_02028 msrAB ftsH TRUE 0.914 49.000 0.000 1.000 Y NA
 10269923 10269924 SRM_02029 SRM_02030 acs   TRUE 0.461 108.000 0.000 1.000   NA
 10269925 10269926 SRM_02031 SRM_02033     FALSE 0.420 22.000 0.000 NA N NA
 10269927 10269928 SRM_02032 SRM_02034     TRUE 0.933 46.000 0.007 NA   NA
 10269929 10269930 SRM_02035 SRM_02036 vicK purA TRUE 0.568 91.000 0.000 1.000 N NA
 10269930 10269931 SRM_02036 SRM_02037 purA secF TRUE 0.857 54.000 0.000 1.000 N NA
 10269931 10269932 SRM_02037 SRM_02038 secF secD TRUE 0.998 61.000 0.130 0.001 Y NA
 10269932 10269933 SRM_02038 SRM_02039 secD   FALSE 0.259 153.000 0.000 NA   NA
 10269935 10269936 SRM_02041 SRM_02042   asnS FALSE 0.386 114.000 0.000 NA   NA
 10269936 10269937 SRM_02042 SRM_02043 asnS   TRUE 0.812 119.000 0.009 NA   NA
 10269939 10269940 tRNA_28 SRM_02045     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10269940 10269941 SRM_02045 SRM_02046   asd TRUE 0.935 79.000 0.009 1.000 N NA
 10269942 10269943 SRM_02047 SRM_02048 folD   TRUE 0.882 37.000 0.007 1.000 N NA
 10269944 10269945 SRM_02049 SRM_02050   surE TRUE 0.872 34.000 0.009 NA   NA
 10269945 10269946 SRM_02050 SRM_02051 surE panB TRUE 0.847 75.000 0.002 1.000   NA
 10269948 10269949 SRM_02053 SRM_02054 ompH   TRUE 0.974 4.000 0.113 1.000 Y NA
 10269949 10269950 SRM_02054 SRM_02055   uppS TRUE 0.890 170.000 0.065 1.000 N NA
 10269950 10269951 SRM_02055 SRM_02056 uppS   TRUE 0.917 58.000 0.002 1.000 N NA
 10269951 10269952 SRM_02056 SRM_02057   dxr TRUE 0.998 70.000 0.568 1.000 N NA
 10269953 10269954 SRM_02058 SRM_02059     TRUE 0.989 52.000 0.051 NA   NA
 10269954 10269955 SRM_02059 SRM_02060     TRUE 0.983 52.000 0.024 NA   NA
 10269955 10269956 SRM_02060 SRM_02061     FALSE 0.334 -13.000 0.000 NA   NA
 10269956 10269957 SRM_02061 SRM_02062   rfbD FALSE 0.432 28.000 0.000 NA   NA
 10269957 10269958 SRM_02062 SRM_02063 rfbD serS TRUE 0.899 47.000 0.003 1.000 N NA
 10269959 10269960 SRM_02064 SRM_02065 fbp   FALSE 0.376 116.000 0.000 NA   NA
 10269960 10269961 SRM_02065 SRM_02066   iscS TRUE 0.799 52.000 0.000 NA   NA
 10269963 10269964 SRM_02068 SRM_02069     TRUE 0.547 86.000 0.000 NA   NA
 10269964 10269965 SRM_02069 SRM_02070   purD TRUE 0.499 15.000 0.002 1.000   NA
 10269966 10269967 SRM_02071 SRM_02072     TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA
 10269967 10269968 SRM_02072 SRM_02073   nodB TRUE 0.785 48.000 0.000 1.000   NA
 10269968 10269969 SRM_02073 SRM_02074 nodB acnA FALSE 0.389 137.000 0.000 1.000 N NA
 10269970 10269971 SRM_02075 SRM_02076   sbcC FALSE 0.420 111.000 0.000 NA N NA
 10269971 10269972 SRM_02076 SRM_02077 sbcC   TRUE 0.494 91.000 0.000 NA   NA
 10269972 10269973 SRM_02077 SRM_02078   cvpA FALSE 0.405 109.000 0.000 NA   NA
 10269973 10269974 SRM_02078 SRM_02079 cvpA   TRUE 0.878 157.000 0.043 1.000   NA
 10269974 10269975 SRM_02079 SRM_02080   ptsI TRUE 0.645 82.000 0.000 1.000   NA
 10269975 10269976 SRM_02080 SRM_02081 ptsI   TRUE 0.987 7.000 0.163 0.001 Y NA
 10269976 10269977 SRM_02081 SRM_02082   idsA TRUE 0.845 96.000 0.007 1.000 N NA
 10269977 10269978 SRM_02082 SRM_02083 idsA adk TRUE 0.850 19.000 0.011 1.000 N NA
 10269978 10269979 SRM_02083 SRM_02084 adk   TRUE 0.999 58.000 1.000 1.000   NA
 10269979 10269980 SRM_02084 SRM_02085     TRUE 0.819 58.000 0.000 NA   NA
 10269983 10269984 SRM_02088 SRM_02089 ispH   TRUE 0.942 93.000 0.032 1.000   NA
 10269984 10269985 SRM_02089 SRM_02090   argE FALSE 0.231 178.000 0.000 1.000   NA
 10269985 10269986 SRM_02090 tRNA_29 argE   FALSE 0.142 208.000 0.000 NA   NA
 10269986 10269987 tRNA_29 SRM_02091     FALSE 0.034 547.000 0.000 NA   NA
 10269988 10269989 SRM_02092 SRM_02093     FALSE 0.063 340.000 0.000 NA   NA
 10269989 10269990 SRM_02093 SRM_02094     FALSE 0.344 -31.000 0.000 NA   NA
 10269990 10269991 SRM_02094 SRM_02095     FALSE 0.386 114.000 0.000 NA   NA
 10269993 10269994 SRM_02097 SRM_02098 nudH nagD TRUE 0.541 -7.000 0.000 0.015 N NA
 10269998 10269999 SRM_02102 SRM_02103     FALSE 0.329 136.000 0.000 NA   NA
 10269999 10270000 SRM_02103 SRM_02104     TRUE 0.482 92.000 0.000 NA   NA
 10270000 10270001 SRM_02104 SRM_02105   pepN FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10270001 10270002 SRM_02105 SRM_02106 pepN   FALSE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10270002 10270003 SRM_02106 tRNA_30     FALSE 0.024 1133.000 0.000 NA   NA
 10270003 10270004 tRNA_30 SRM_02107     FALSE 0.410 107.000 0.000 NA   NA
 10270007 10270008 SRM_02110 SRM_02111 idi   TRUE 0.462 94.000 0.000 NA   NA
 10270008 10270009 SRM_02111 SRM_02112     TRUE 0.452 95.000 0.000 NA   NA
 10270009 10270010 SRM_02112 SRM_02113   gatB FALSE 0.390 113.000 0.000 NA   NA
 10270010 10270011 SRM_02113 SRM_02114 gatB   TRUE 0.547 9.000 0.002 1.000   NA
 10270011 10270012 SRM_02114 SRM_02115     TRUE 0.522 32.000 0.000 1.000   NA
 10270012 10270013 SRM_02115 SRM_02116   tpiA TRUE 0.799 48.000 0.000 1.000 N NA
 10270013 10270014 SRM_02116 SRM_02117 tpiA fbaB FALSE 0.331 258.000 0.000 0.042 Y NA
 10270016 10270017 SRM_02119 SRM_02120     TRUE 0.556 36.000 0.000 1.000   NA
 10270017 10270018 SRM_02120 SRM_02121     TRUE 0.994 78.000 0.103 0.005 Y NA
 10270018 10270019 SRM_02121 SRM_02122     TRUE 1.000 50.000 0.874 0.005 Y NA
 10270020 10270021 SRM_02123 SRM_02124 nadA nadC TRUE 0.999 54.000 0.198 0.003 Y NA
 10270021 10270022 SRM_02124 SRM_02125 nadC nadB TRUE 0.950 44.000 0.005 1.000 Y NA
 10270022 10270023 SRM_02125 SRM_02126 nadB   FALSE 0.125 221.000 0.000 NA   NA
 10270023 10270024 SRM_02126 SRM_02127     TRUE 0.700 46.000 0.000 NA   NA
 10270024 10270025 SRM_02127 SRM_02128     FALSE 0.096 254.000 0.000 NA   NA
 10270025 10270026 SRM_02128 SRM_02129     TRUE 0.603 81.000 0.000 NA   NA
 10270026 10270027 SRM_02129 SRM_02130     TRUE 0.813 59.000 0.000 NA   NA
 10270027 10270028 SRM_02130 SRM_02131     FALSE 0.057 354.000 0.000 NA   NA
 10270028 10270029 SRM_02131 SRM_02132     FALSE 0.357 14.000 0.000 NA   NA
 10270029 10270030 SRM_02132 SRM_02133     FALSE 0.049 406.000 0.000 NA   NA
 10270030 10270031 SRM_02133 SRM_02134     FALSE 0.344 10.000 0.000 NA   NA
 10270031 10270032 SRM_02134 SRM_02135     TRUE 0.974 39.000 0.087 NA   NA
 10270032 10270033 SRM_02135 SRM_02136     TRUE 0.511 89.000 0.000 NA   NA
 10270034 10270035 SRM_02137 SRM_02138     TRUE 0.597 42.000 0.000 NA   NA
 10270037 10270038 SRM_02140 SRM_02141     TRUE 0.473 33.000 0.000 NA   NA
 10270038 10270039 SRM_02141 SRM_02142   glgC FALSE 0.279 148.000 0.000 NA   NA
 10270039 10270040 SRM_02142 SRM_02143 glgC rfaG TRUE 0.988 59.000 0.030 1.000 N NA
 10270040 10270041 SRM_02143 SRM_02144 rfaG   FALSE 0.050 395.000 0.000 NA   NA
 10270041 10270042 SRM_02144 SRM_02145     FALSE 0.332 4.000 0.000 NA   NA
 10270043 10270044 SRM_02146 SRM_02147     FALSE 0.219 167.000 0.000 NA   NA
 10270047 10270048 SRM_02150 SRM_02151     FALSE 0.376 116.000 0.000 NA   NA
 10270048 10270049 SRM_02151 SRM_02152     FALSE 0.371 121.000 0.000 NA   NA
 10270049 10270050 SRM_02152 SRM_02153     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 10270052 10270053 SRM_02155 SRM_02156 tal   FALSE 0.344 143.000 0.000 1.000   NA
 10270053 10270054 SRM_02156 SRM_02157   glcD FALSE 0.107 267.000 0.000 1.000   NA
 10270057 10270058 SRM_02160 SRM_02161 pcm   TRUE 0.936 66.000 0.005 NA   NA
 10270058 10270059 SRM_02161 SRM_02162   folP TRUE 0.968 61.000 0.009 NA   NA
 10270060 10270061 SRM_02163 SRM_02164 GH3 rpoD TRUE 0.692 249.000 0.043 NA   NA
 10270061 10270062 SRM_02164 SRM_02165 rpoD   TRUE 0.510 37.000 0.000 NA   NA
 10270062 10270063 SRM_02165 SRM_02166   fadL FALSE 0.116 230.000 0.000 NA   NA
 10270063 10270064 SRM_02166 SRM_02167 fadL   TRUE 0.926 4.000 0.051 1.000   NA
 10270065 10270066 SRM_02168 SRM_02169   ftsX TRUE 0.773 50.000 0.000 NA   NA