MicrobesOnline Operon Predictions for Synechocystis sp. PCC 6803

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10291 10292 slr0612 slr0613     FALSE 0.352 83.000 0.000 NA   0.210
 10293 10294 sll0558 sll1214     FALSE 0.003 319.000 0.000 NA   -0.290
 10294 10295 sll1214 sll1213     FALSE 0.401 183.000 0.000 1.000   0.490
 10295 10296 sll1213 sll1212   rfbD TRUE 0.955 145.000 0.235 0.011 Y 0.706
 10297 10298 slr1311 slr1312 psbA2 speA FALSE 0.022 181.000 0.000 1.000   -0.417
 10300 10301 slr1315 slr1316   fecC FALSE 0.291 135.000 0.000 1.000   0.240
 10301 10302 slr1316 slr1317 fecC fecD TRUE 0.952 97.000 0.169 0.031 Y 0.521
 10302 10303 slr1317 slr1318 fecD fecE TRUE 0.749 262.000 0.091 1.000 Y 0.568
 10303 10304 slr1318 slr1319 fecE fecB TRUE 0.967 -3.000 0.000 1.000 Y 0.694
 10305 10306 sll1206 sll1205 iutA pchR FALSE 0.289 207.000 0.000 1.000 N 0.505
 10306 10307 sll1205 sll1204 pchR   FALSE 0.088 243.000 0.000 NA   0.189
 10307 10308 sll1204 sll1203     TRUE 0.965 18.000 0.500 NA   0.348
 10308 10309 sll1203 sll1202     TRUE 0.909 -3.000 0.000 NA N 0.508
 10309 10310 sll1202 sll1409   fhuA TRUE 0.575 122.000 0.000 1.000 Y 0.362
 10310 10311 sll1409 sll1408 fhuA pcrR TRUE 0.883 133.000 0.500 1.000 N 0.599
 10311 10312 sll1408 sll1407 pcrR   TRUE 0.684 68.000 0.000 1.000 N 0.609
 10312 10313 sll1407 sll1406   fhuA TRUE 0.673 73.000 0.000 1.000 N 0.703
 10313 10314 sll1406 sll1405 fhuA   TRUE 0.681 70.000 0.000 1.000 N 0.656
 10314 10315 sll1405 sll1404   exbB TRUE 0.998 -40.000 0.471 0.047 Y 0.759
 10316 10317 slr1484 slr1485     TRUE 0.935 77.000 0.081 NA   0.862
 10317 10318 slr1485 slr1488     FALSE 0.473 106.000 0.000 NA   0.710
 10318 10319 slr1488 slr1489   pchR FALSE 0.430 106.000 0.000 1.000 N 0.566
 10319 10320 slr1489 slr1490 pchR fhuA FALSE 0.306 166.000 0.000 1.000 N 0.369
 10320 10321 slr1490 slr1491 fhuA fecB TRUE 0.594 42.000 0.000 1.000 Y -0.061
 10321 10322 slr1491 slr1492 fecB fecB TRUE 0.549 174.000 0.000 0.002 Y 0.051
 10322 10323 slr1492 slr1493 fecB   TRUE 0.985 -64.000 0.047 NA   -0.140
 10323 10324 slr1493 slr1494     TRUE 0.882 63.000 0.047 NA   0.021
 10325 10326 sll1401 sll1400     TRUE 0.692 50.000 0.000 NA   0.512
 10326 10327 sll1400 ssl2733     TRUE 0.980 -3.000 0.750 NA   0.013
 10327 10328 ssl2733 sll1399     FALSE 0.322 28.000 0.000 NA   0.043
 10328 10329 sll1399 sll1398   psb13 TRUE 0.559 25.000 0.000 NA   0.238
 10331 10332 sll1397 sll1396     FALSE 0.060 345.000 0.000 NA   0.347
 10334 10335 sll1395 sll1394 rfbD msrA FALSE 0.435 45.000 0.000 1.000 N 0.261
 10335 10336 sll1394 sll1393 msrA glgA FALSE 0.229 116.000 0.000 1.000 N 0.253
 10336 10337 sll1393 sll1392 glgA   FALSE 0.030 224.000 0.000 1.000 N -0.004
 10338 10339 slr1501 slr1113     TRUE 0.498 101.000 0.000 1.000   0.839
 10339 10340 slr1113 slr1114     FALSE 0.124 312.000 0.000 NA   0.587
 10340 10341 slr1114 slr1115     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   0.596
 10341 10342 slr1115 slr1116     TRUE 0.548 32.000 0.000 NA   0.307
 10342 10343 slr1116 slr1117     TRUE 0.653 73.000 0.000 NA   0.441
 10348 10349 sll1062 sll1061     TRUE 0.956 27.000 1.000 NA   0.526
 10349 10350 sll1061 sll1060     TRUE 0.684 9.000 0.000 NA   0.200
 10350 10351 sll1060 ssl2069     TRUE 0.931 -64.000 0.000 NA   0.320
 10352 10353 ssr1853 slr1120   hofD FALSE 0.302 210.000 0.000 NA   0.490
 10354 10355 sll1059 sll1058 adk dapB TRUE 0.568 80.000 0.000 1.000 N 0.460
 10355 10356 sll1058 sll1057 dapB trx FALSE 0.310 87.000 0.000 1.000 N 0.246
 10356 10357 sll1057 sll1056 trx purL FALSE 0.004 593.000 0.000 1.000 N 0.009
 10359 10360 sll1054 sll1053     TRUE 0.687 32.000 0.000 1.000 N 0.575
 10361 10362 slr1123 slr1124 gmk gpmB TRUE 0.481 79.000 0.000 1.000 N 0.357
 10362 10363 slr1124 slr1125 gpmB crtX TRUE 0.853 52.000 0.000 1.000 Y 0.732
 10364 10365 sll1052 sll1051   cpcF FALSE 0.142 107.000 0.000 1.000   0.037
 10365 10366 sll1051 sll1049 cpcF   FALSE 0.159 157.000 0.000 NA   0.099
 10367 10368 slr1127 slr1128     FALSE 0.470 106.000 0.000 NA   0.945
 10368 10369 slr1128 slr1129   rne FALSE 0.024 646.000 0.000 NA N 0.387
 10369 10370 slr1129 slr1130 rne rhnB TRUE 0.901 84.000 0.033 0.019 N 0.327
 10371 10372 sll1045 sll1043 mutT pnp FALSE 0.257 97.000 0.000 1.000 N 0.254
 10372 10373 sll1043 sll0716 pnp lepB FALSE 0.149 128.000 0.000 1.000 N 0.140
 10375 10376 sll0712 sll0711 cysM   FALSE 0.012 113.000 0.000 1.000 N -0.189
 10376 10377 sll0711 sll0710     FALSE 0.181 99.000 0.000 NA   0.114
 10377 10378 sll0710 sll0709   llaI.2 TRUE 0.922 41.000 0.138 NA   0.323
 10378 10379 sll0709 sll0708 llaI.2 ksgA FALSE 0.001 932.000 0.000 NA N -0.148
 10380 10381 slr0722 slr0723     TRUE 0.938 21.000 0.143 1.000   0.089
 10381 10382 slr0723 slr0724   sohA FALSE 0.090 79.000 0.000 NA   -0.159
 10382 10383 slr0724 slr0725 sohA   TRUE 0.886 84.000 0.167 NA   0.309
 10383 10384 slr0725 slr0727     FALSE 0.025 361.000 0.000 NA   0.145
 10384 10385 slr0727 slr0728     FALSE 0.016 466.000 0.000 NA   0.143
 10385 10386 slr0728 slr0729     FALSE 0.017 131.000 0.000 NA   -0.326
 10386 10387 slr0729 slr0730     FALSE 0.206 250.000 0.000 NA   0.551
 10387 10388 slr0730 slr0731     TRUE 0.983 -3.000 0.762 NA   0.161
 10391 10392 sll0703 sll0702     FALSE 0.395 38.000 0.000 NA   0.157
 10392 10687475 sll0702 slr1006     FALSE 0.061 336.000 0.000 NA   NA
 10396 10397 sll0700 sll0699     TRUE 0.945 -6.000 0.000 1.000   0.968
 10397 10398 sll0699 sll0698   dfr FALSE 0.056 104.000 0.000 1.000   -0.202
 10399 10400 slr0737 slr0738 psaD trpE TRUE 0.872 122.000 0.091 1.000   0.707
 10400 10401 slr0738 slr0739 trpE crtE TRUE 0.735 90.000 0.000 1.000 Y 0.575
 10401 10402 slr0739 slr0740 crtE   TRUE 0.617 81.000 0.000 NA   0.557
 10404 10405 slr0741 slr0742 phoU   FALSE 0.059 87.000 0.000 NA   -0.189
 10405 10406 slr0742 slr0743   nusA TRUE 0.945 76.000 0.759 NA   0.750
 10406 1730139 slr0743 slr0743a nusA   TRUE 0.963 64.000 0.323 NA Y NA
 1730139 10407 slr0743a slr0744   infB TRUE 0.544 260.000 0.171 NA N NA
 10407 10408 slr0744 slr0236 infB   TRUE 0.889 2.000 0.000 NA N 0.707
 10408 10409 slr0236 slr0237   glgX FALSE 0.180 183.000 0.000 NA N 0.265
 10409 10410 slr0237 slr0238 glgX   TRUE 0.649 50.000 0.000 NA   0.409
 10412 10413 slr0239 slr0240 cbiF   FALSE 0.044 117.000 0.000 1.000 N -0.052
 10413 10414 slr0240 slr0241     TRUE 0.988 0.000 0.446 1.000 N 0.614
 10414 10415 slr0241 slr0242   bcp TRUE 0.684 235.000 0.004 1.000 Y 0.321
 10415 10416 slr0242 slr0243 bcp   TRUE 0.724 11.000 0.000 NA   0.288
 10421 10422 sll0228 sll0227   ppiB TRUE 0.868 1.000 0.000 1.000 N 0.418
 10422 10423 sll0227 sll0226 ppiB ycf4 TRUE 0.795 206.000 0.220 1.000   0.461
 10423 10424 sll0226 sll0225 ycf4   FALSE 0.047 139.000 0.000 NA   -0.166
 10424 10425 sll0225 sll0224     FALSE 0.333 22.000 0.000 NA   0.001
 1730140 10426 6803s01 slr0249 rnpB   TRUE 0.930 -33.000 0.000 NA   NA
 10426 10427 slr0249 slr0250     FALSE 0.443 147.000 0.000 NA   0.450
 10427 10428 slr0250 slr0251     TRUE 0.952 24.000 0.543 NA   0.320
 10428 10429 slr0251 slr0252     TRUE 0.811 12.000 0.000 1.000   0.395
 10429 10430 slr0252 ssr0390   psaK FALSE 0.058 133.000 0.000 1.000   -0.211
 10431 10432 ssl0410 sll0223   ndhB TRUE 0.686 37.000 0.000 1.000   0.468
 10432 10433 sll0223 sll0222 ndhB phoA FALSE 0.297 142.000 0.000 1.000   0.248
 10433 10434 sll0222 sgl0002 phoA   TRUE 0.685 75.000 0.000 NA   0.683
 10434 10435 sgl0002 sml0004   ycf6 TRUE 0.944 43.000 0.091 NA   0.747
 10437 10438 sll0221 sll0220 bcp glmS FALSE 0.396 126.000 0.000 1.000 N 0.443
 10438 10439 sll0220 sll0219 glmS   FALSE 0.076 374.000 0.000 1.000 N 0.659
 10439 10440 sll0219 sll0218     TRUE 0.956 50.000 0.643 1.000   0.921
 10440 10441 sll0218 sll0217     TRUE 0.962 27.000 0.229 1.000   0.878
 10445 10446 sll1327 sll1326 atpC atpA TRUE 0.955 131.000 0.846 0.004 Y 0.825
 10446 10447 sll1326 sll1325 atpA atpD TRUE 0.983 61.000 0.864 0.004 Y 0.955
 10447 10448 sll1325 sll1324 atpD atpF TRUE 0.996 0.000 0.132 0.004 Y 0.888
 10448 10449 sll1324 sll1323 atpF atpG TRUE 0.987 26.000 0.569 0.004 Y 0.878
 10449 10450 sll1323 ssl2615 atpG atpH TRUE 0.955 117.000 0.368 0.004 Y 0.898
 10450 10451 ssl2615 sll1322 atpH atpI TRUE 0.938 192.000 0.679 0.004 Y 0.941
 10451 10452 sll1322 sll1321 atpI atp1 TRUE 0.951 69.000 0.151 1.000   0.947
 10453 10454 slr1413 slr1414     FALSE 0.471 52.000 0.000 NA   0.205
 10454 10455 slr1414 slr1415     TRUE 0.560 26.000 0.000 NA   0.255
 10455 10456 slr1415 slr1416   morR TRUE 0.784 133.000 0.047 NA   0.218
 10456 10457 slr1416 slr1417 morR   FALSE 0.008 195.000 0.000 NA   -0.606
 10458 10459 sll1319 sll1318     FALSE 0.309 44.000 0.000 NA   0.081
 10459 10460 sll1318 sll1041     FALSE 0.105 136.000 0.000 NA   -0.020
 10460 10461 sll1041 sll1040     TRUE 0.566 47.000 0.000 NA N 0.390
 10465 10466 slr1095 slr1096   phdD FALSE 0.115 87.000 0.000 1.000   -0.122
 10466 10467 slr1096 slr1097 phdD   TRUE 0.896 4.000 0.000 NA   0.777
 10467 10468 slr1097 slr1098     TRUE 0.596 58.000 0.000 NA   0.340
 10468 10469 slr1098 slr1099   ubiX FALSE 0.276 68.000 0.000 1.000 N 0.101
 10469 10470 slr1099 slr1100 ubiX   FALSE 0.050 306.000 0.000 NA   0.224
 10470 10471 slr1100 slr1101     FALSE 0.439 81.000 0.000 NA   0.300
 10471 10472 slr1101 slr1102     TRUE 0.824 67.000 0.000 1.000 Y 0.446
 10472 10473 slr1102 slr1103     TRUE 0.612 220.000 0.000 0.010 Y 0.678
 10473 10474 slr1103 slr1104     TRUE 0.911 29.000 0.000 0.010 Y 0.639
 10474 10475 slr1104 slr1105   fus FALSE 0.227 209.000 0.000 1.000 Y -0.109
 10476 10477 sll1037 sll1036     FALSE 0.082 211.000 0.000 NA   0.070
 10477 10478 sll1036 ssl2009     FALSE 0.324 100.000 0.000 NA   0.326
 10478 10479 ssl2009 sll1035   upp TRUE 0.900 70.000 0.013 NA   0.329
 10480 10481 slr1106 slr1107 phb   FALSE 0.182 105.000 0.000 NA   0.138
 10482 10483 sll1033 sll1032   ccmN FALSE 0.033 467.000 0.000 1.000   0.330
 10483 10484 sll1032 sll1031 ccmN ccmM TRUE 0.830 35.000 0.000 0.005   0.749
 10484 10485 sll1031 sll1030 ccmM ccmL TRUE 0.937 80.000 0.333 NA   0.821
 10485 10486 sll1030 sll1028 ccmL ccmK TRUE 0.840 33.000 0.000 NA Y 0.836
 10486 10487 sll1028 sll1029 ccmK ccmK TRUE 0.661 129.000 0.000 NA Y 0.853
 10487 10488 sll1029 sll1027 ccmK gltD FALSE 0.016 462.000 0.000 NA N 0.228
 10489 10490 slr1109 slr1110 ank   TRUE 0.963 -49.000 0.000 NA   0.692
 10490 10491 slr1110 slr1772     FALSE 0.371 77.000 0.000 NA   0.173
 10493 10494 ssr2972 slr1773     TRUE 0.750 25.000 0.000 NA   0.504
 10494 10495 slr1773 slr1774     TRUE 0.921 44.000 0.286 NA   0.266
 10495 10496 slr1774 slr1776     FALSE 0.145 54.000 0.000 NA   -0.137
 10498 10499 slr1777 slr1778 chlD   FALSE 0.167 267.000 0.000 NA   0.504
 10500 10501 sll1683 sll1682 cad   TRUE 0.901 0.000 0.000 1.000 Y 0.124
 10502 10503 slr1779 slr1780 pdxJ   TRUE 0.965 19.000 0.046 NA   0.567
 10504 10505 sll1681 sll1680     TRUE 0.921 -28.000 0.000 NA N 0.367
 10505 10506 sll1680 sll1679   hhoA TRUE 0.844 34.000 0.000 1.000 Y 0.691
 10507 10508 slr1783 slr1784   bvdR FALSE 0.277 64.000 0.000 1.000   -0.017
 10509 10510 sll1678 sll1677     TRUE 0.962 75.000 0.655 0.001   0.400
 10510 10511 sll1677 sll1676   malQ FALSE 0.458 66.000 0.000 1.000   0.180
 10511 10512 sll1676 sll1675 malQ   FALSE 0.298 98.000 0.000 0.014 N -0.030
 10513 10514 slr1787 slr1788     FALSE 0.024 349.000 0.000 NA   0.115
 10514 10515 slr1788 slr1789     FALSE 0.310 43.000 0.000 NA   0.080
 10516 10517 sll1673 sll1672     TRUE 0.956 9.000 0.000 0.027 Y 0.596
 10517 10518 sll1672 sll1671     FALSE 0.325 194.000 0.000 1.000   0.393
 10519 10520 slr1790 slr1791   cysH TRUE 0.491 147.000 0.000 NA   0.706
 10521 397205 sll1670 6803t02 hrcA tRNA-Ser FALSE 0.247 197.000 0.000 NA   NA
 397205 10522 6803t02 sll1669 tRNA-Ser aroK TRUE 0.595 58.000 0.000 NA   NA
 10523 10524 slr1793 ssr2998 talB   FALSE 0.091 225.000 0.000 NA   0.141
 10524 10525 ssr2998 slr1794     TRUE 0.761 117.000 0.467 NA   -0.056
 10525 10526 slr1794 slr1795   msrA TRUE 0.712 56.000 0.000 1.000 N 0.631
 10526 10527 slr1795 ssr3000 msrA   FALSE 0.187 225.000 0.000 NA   0.351
 10528 10529 sll1667 sll1666 mom72 dnaJ TRUE 0.502 98.000 0.000 1.000   0.529
 10531 10532 sll1665 sll1664     FALSE 0.007 318.000 0.000 NA   -0.160
 10532 10533 sll1664 sll1663     TRUE 0.682 46.000 0.000 NA   0.533
 10533 10534 sll1663 sll1662   pheA FALSE 0.435 41.000 0.000 1.000 N 0.255
 397166 10535 6803t03 slr1798 tRNA-Thr pleD FALSE 0.355 98.000 0.000 NA   NA
 10536 10537 sll1660 sll1659     FALSE 0.455 116.000 0.000 0.040   0.273
 10537 10538 sll1659 sll1658     FALSE 0.029 127.000 0.000 NA   -0.240
 10539 10540 slr1799 slr1800     FALSE 0.073 152.000 0.000 NA   -0.083
 10541 10542 sll1656 sll1655   birA TRUE 0.705 40.000 0.000 NA   0.697
 10542 10543 sll1655 sll1654 birA   TRUE 0.794 19.000 0.000 1.000 N 0.924
 10543 10544 sll1654 sll1653   gerCb TRUE 0.631 64.000 0.000 1.000 N 0.414
 10544 10545 sll1653 sll1652 gerCb   TRUE 0.716 67.000 0.000 1.000   0.551
 10546 10547 slr1289 slr1290 icd   FALSE 0.328 21.000 0.000 1.000   -0.061
 10551 10552 slr1293 ssr2142   ycf19 TRUE 0.871 57.000 0.034 NA   -0.074
 10552 10553 ssr2142 slr1295 ycf19 sufA FALSE 0.013 452.000 0.000 NA   0.088
 10554 10555 sll1198 ssl2384 trmD   TRUE 0.773 11.000 0.000 NA   0.352
 10555 10556 ssl2384 sll1196   pfkA FALSE 0.211 209.000 0.000 NA   0.337
 10558 10559 sll1194 sll1193 psbU   FALSE 0.239 195.000 0.000 1.000   0.297
 10560 10561 slr1299 slr1300   ubiH FALSE 0.067 227.000 0.000 0.058 N -0.649
 10562 10563 sll1192 sll1191     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   0.693
 10564 10565 ssr2153 slr1301     FALSE 0.023 318.000 0.000 NA   0.050
 10565 10566 slr1301 slr1302     FALSE 0.127 49.000 0.000 NA   -0.139
 10566 10567 slr1302 slr1303     TRUE 0.646 20.000 0.000 NA   0.278
 10569 10570 slr1305 slr1306     FALSE 0.115 87.000 0.000 NA   -0.065
 10571 10572 sll1188 sll1187   lgt FALSE 0.333 56.000 0.000 NA   0.061
 10572 10573 sll1187 sll1186 lgt   TRUE 0.674 28.000 0.000 1.000   0.378
 10573 10574 sll1186 sll1185   hemF FALSE 0.397 98.000 0.000 1.000   0.359
 10574 10575 sll1185 sll1184 hemF ho1 FALSE 0.270 223.000 0.000 1.000 N 0.697
 10576 10577 slr1307 ssr1604   rpl28 FALSE 0.358 90.000 0.000 NA   0.272
 10577 10578 ssr1604 slr0962 rpl28   FALSE 0.092 199.000 0.000 NA   0.055
 10578 397167 slr0962 6803t04   tRNA-Pro TRUE 0.594 53.000 0.000 NA   NA
 10580 10581 slr0963 slr0964 sir   TRUE 0.538 199.000 0.000 NA Y 0.547
 10581 10582 slr0964 slr0965   dnaN FALSE 0.128 100.000 0.000 NA N 0.133
 10582 10583 slr0965 slr0966 dnaN trpA FALSE 0.450 144.000 0.000 1.000 N 0.549
 10583 10584 slr0966 slr0967 trpA   FALSE 0.012 156.000 0.000 NA   -0.400
 10585 10586 sll0939 sll0938     TRUE 0.771 25.000 0.000 NA   0.683
 10586 10587 sll0938 ssl1792     FALSE 0.464 41.000 0.000 NA   0.229
 10587 10588 ssl1792 sll0936     FALSE 0.243 34.000 0.000 NA   -0.002
 10589 10590 slr0969 slr0971 cbiH   FALSE 0.349 103.000 0.000 NA   0.358
 10591 10592 sll0934 sll0933 ccmA   TRUE 0.807 196.000 0.095 NA   0.505
 10592 10593 sll0933 ssl1784   rps15 TRUE 0.967 18.000 0.037 NA   0.715
 10593 10594 ssl1784 sll0932 rps15   FALSE 0.047 165.000 0.000 NA   -0.138
 10594 10595 sll0932 sll0931     FALSE 0.086 101.000 0.000 NA   -0.053
 10595 10596 sll0931 sll0930     FALSE 0.438 172.000 0.000 NA   0.684
 10596 10597 sll0930 sll0928   apcD TRUE 0.922 44.000 0.357 NA   0.262
 10597 10598 sll0928 sll0927 apcD metX FALSE 0.245 112.000 0.000 1.000   0.197
 10598 10599 sll0927 sll0926 metX   FALSE 0.188 136.000 0.000 1.000 N 0.180
 10599 10600 sll0926 sll0925     TRUE 0.717 12.000 0.000 1.000   0.262
 10601 10602 slr0974 slr0975 infC   FALSE 0.051 304.000 0.000 NA   0.219
 10604 10605 sll0923 sll0922 epsB   FALSE 0.003 578.000 0.000 NA   -0.161
 10606 10607 slr0976 slr0977     FALSE 0.374 39.000 0.000 1.000   0.111
 10607 10608 slr0977 slr0978     FALSE 0.187 211.000 0.000 NA   0.310
 10608 10609 slr0978 slr0980     FALSE 0.335 120.000 0.000 NA   0.345
 10609 10610 slr0980 slr0981     TRUE 0.570 71.000 0.000 NA   0.346
 10610 10611 slr0981 slr0982   rfbB FALSE 0.436 162.000 0.000 1.000   0.476
 10611 10612 slr0982 slr0983 rfbB rfbF TRUE 0.967 -3.000 0.000 1.000 Y 0.737
 10612 10613 slr0983 slr0984 rfbF rfbG TRUE 0.993 1.000 0.624 1.000 Y 0.715
 10613 10614 slr0984 slr0985 rfbG rfbC TRUE 0.966 19.000 0.139 1.000 Y 0.092
 10614 10615 slr0985 slr1610 rfbC   TRUE 0.993 -84.000 0.457 NA   0.193
 10615 10616 slr1610 slr1611     FALSE 0.422 35.000 0.000 NA   0.179
 10616 10617 slr1611 slr1612     TRUE 0.722 51.000 0.000 NA   0.753
 10617 10618 slr1612 slr1613     TRUE 0.607 152.000 0.000 0.088   0.903
 10618 10619 slr1613 slr1614     FALSE 0.124 318.000 0.000 NA   0.776
 10619 10620 slr1614 slr1615   rfbE TRUE 0.733 57.000 0.000 NA   0.623
 10620 10621 slr1615 slr1616 rfbE   TRUE 0.953 -3.000 0.000 0.039 N 0.667
 10621 10622 slr1616 slr1617     TRUE 0.931 -3.000 0.000 0.039 N 0.367
 10622 10623 slr1617 slr1618     TRUE 0.847 13.000 0.000 1.000   0.577
 10623 10624 slr1618 slr1619     TRUE 0.750 29.000 0.000 1.000   0.737
 10624 10625 slr1619 slr1062     FALSE 0.163 278.000 0.000 1.000   0.545
 10625 10626 slr1062 slr1063     TRUE 0.522 95.000 0.000 1.000   0.508
 10626 10627 slr1063 slr1064   rfbU TRUE 0.928 22.000 0.000 0.024 Y 0.612
 10627 10628 slr1064 slr1065 rfbU   FALSE 0.396 239.000 0.000 NA Y 0.617
 10628 10629 slr1065 slr1066     TRUE 0.835 66.000 0.000 NA Y 0.557
 10629 10630 slr1066 slr1067   galE TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 Y 0.364
 10630 10631 slr1067 slr1068 galE   FALSE 0.080 302.000 0.000 NA   0.346
 10631 10632 slr1068 slr1069     TRUE 0.694 64.000 0.000 NA   0.485
 10632 10633 slr1069 slr1070     TRUE 0.689 10.000 0.000 NA   0.221
 10633 10634 slr1070 slr1071     FALSE 0.422 135.000 0.000 NA N 0.506
 10634 10635 slr1071 slr1072   yefA TRUE 0.801 18.000 0.000 1.000 N 0.642
 10635 10636 slr1072 slr1073 yefA   TRUE 0.804 53.000 0.000 NA Y 0.376
 10636 10637 slr1073 slr1074     TRUE 0.948 -19.000 0.000 NA   0.470
 10637 10638 slr1074 slr1075     FALSE 0.113 114.000 0.000 NA   0.012
 10638 10639 slr1075 slr1076     FALSE 0.126 117.000 0.000 1.000 N 0.108
 10639 10640 slr1076 slr1077     TRUE 0.995 2.000 0.100 0.024 Y 0.795
 10640 10641 slr1077 ssr1765     TRUE 0.542 55.000 0.000 NA   0.270
 10641 10642 ssr1765 ssr1766     TRUE 0.987 -3.000 0.375 NA   0.339
 10642 10643 ssr1766 slr1078   galE TRUE 0.572 76.000 0.000 NA   0.371
 10643 10644 slr1078 slr1079 galE   TRUE 0.713 34.000 0.000 NA   0.683
 10644 10645 slr1079 ssr1768     FALSE 0.110 256.000 0.000 NA   0.314
 10645 10646 ssr1768 slr1081     FALSE 0.254 96.000 0.000 NA   0.186
 10646 10647 slr1081 slr1082     TRUE 0.890 5.000 0.000 NA   0.875
 10647 10648 slr1082 slr1083     TRUE 0.671 77.000 0.000 NA   0.835
 10648 10649 slr1083 slr1084     FALSE 0.447 165.000 0.000 1.000   0.531
 10649 10650 slr1084 slr1085     TRUE 0.935 64.000 0.022 1.000   0.452
 10650 10651 slr1085 slr1087     FALSE 0.350 161.000 0.000 NA   0.368
 10652 10653 sll1025 ssl1972     TRUE 0.673 0.000 0.000 NA   0.080
 10653 10654 ssl1972 sll1024     FALSE 0.012 271.000 0.000 NA   -0.148
 10654 10655 sll1024 sll1023   sucC FALSE 0.365 170.000 0.000 NA   0.403
 10655 10656 sll1023 sll1022 sucC   TRUE 0.792 17.000 0.000 1.000 N 0.523
 10656 10657 sll1022 sll1021     FALSE 0.354 147.000 0.000 NA   0.350
 10657 10658 sll1021 sll1020     TRUE 0.694 40.000 0.000 NA   0.565
 10659 10660 slr1090 ssr1789   hliA TRUE 0.671 45.000 0.000 1.000   0.451
 10661 10662 sll1019 sll1018 HAGH1 pyrC FALSE 0.458 61.000 0.000 1.000   0.167
 10662 10663 sll1018 sll1017 pyrC amt2 FALSE 0.207 120.000 0.000 1.000 N 0.221
 10664 10665 slr1400 slr0670     FALSE 0.174 120.000 0.000 1.000   0.090
 10666 10667 sll0656 sll0654 nucH   TRUE 0.500 131.000 0.000 1.000   0.618
 10668 10669 slr0676 slr0677 cysC exbB FALSE 0.387 158.000 0.000 1.000 N 0.438
 10669 10670 slr0677 slr0678 exbB   TRUE 0.948 111.000 0.810 0.045 Y 0.660
 10670 10671 slr0678 slr0679   fmu/fmv FALSE 0.030 36.000 0.000 1.000 N -0.162
 10671 10672 slr0679 slr0680 fmu/fmv   TRUE 0.708 163.000 0.011 NA   0.173
 10672 10673 slr0680 slr0681     TRUE 0.964 -163.000 0.000 NA   0.496
 10673 10674 slr0681 slr0682   hisD FALSE 0.032 238.000 0.000 1.000 N 0.038
 10675 10676 sll0651 sll0650     TRUE 0.944 -6.000 0.000 1.000   0.595
 10676 10677 sll0650 sll0649     FALSE 0.202 160.000 0.000 0.087   -0.293
 10677 10678 sll0649 sll0648   lim TRUE 0.750 -19.000 0.000 1.000 N 0.086
 10678 10679 sll0648 sll0647 lim   FALSE 0.108 128.000 0.000 1.000   -0.044
 10679 10680 sll0647 sll0646   cyaA TRUE 0.985 4.000 0.135 1.000   0.588
 10680 10681 sll0646 sll0645 cyaA   TRUE 0.664 39.000 0.000 NA   0.449
 10681 10682 sll0645 sll0644     FALSE 0.354 75.000 0.000 NA   0.142
 10686 10687 sll0641 sll0640   Sac1 TRUE 0.764 12.000 0.000 NA   0.350
 10688 10689 slr0688 ssr1155     FALSE 0.008 440.000 0.000 NA   -0.030
 10689 10690 ssr1155 slr0689     FALSE 0.255 14.000 0.000 NA   -0.122
 10691 10692 sll0639 sll0638     FALSE 0.146 173.000 0.000 1.000   0.080
 10694 10695 sll0635 sll0634 thiE btpA TRUE 0.497 117.000 0.000 0.001   0.244
 397169 10696 6803t06 slr0695 tRNA-Arg   TRUE 0.580 51.000 0.000 NA   NA
 10696 10697 slr0695 slr1590     TRUE 0.942 56.000 0.619 NA   0.335
 10697 10698 slr1590 slr1591     FALSE 0.133 137.000 0.000 NA   0.032
 10698 10699 slr1591 slr1592     FALSE 0.009 187.000 0.000 NA N -0.226
 10699 10700 slr1592 slr1593     FALSE 0.001 699.000 0.000 NA N -0.155
 10700 10701 slr1593 slr1594     TRUE 0.667 84.000 0.000 NA Y 0.337
 10701 10702 slr1594 slr1595     FALSE 0.088 292.000 0.000 1.000 N 0.377
 10707 10708 sll1514 sll1513 hsp17 ccsA FALSE 0.293 266.000 0.000 NA Y 0.461
 10708 10709 sll1513 sll1512 ccsA   FALSE 0.359 187.000 0.000 NA N 0.582
 10711 10712 sll1511 sll1510     FALSE 0.385 130.000 0.000 NA   0.379
 10712 10713 sll1510 sll1509   ycf20 FALSE 0.347 55.000 0.000 NA   0.074
 10714 10715 slr1599 slr1600     FALSE 0.332 95.000 0.000 NA   0.279
 10715 10716 slr1600 smr0005   psaM FALSE 0.330 164.000 0.000 NA   0.358
 10716 10717 smr0005 slr1601 psaM   TRUE 0.844 140.000 0.184 NA   0.342
 10718 10719 sll1508 sll1507 lpxC   FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   -0.185
 10720 10721 slr1603 slr1604   ftsH FALSE 0.448 166.000 0.000 NA   0.659
 10721 10722 slr1604 ssr2699 ftsH   FALSE 0.024 484.000 0.000 1.000   0.241
 10723 10724 ssl2923 ssl2922 vapC vapB TRUE 0.973 1.000 0.378 NA   -0.011
 10724 10725 ssl2922 ssl2920 vapB   FALSE 0.073 357.000 0.000 NA   0.411
 10725 10726 ssl2920 sll1505     FALSE 0.229 103.000 0.000 NA   0.200
 10726 10727 sll1505 sll1504     TRUE 0.993 -10.000 1.000 NA   0.743
 10727 10728 sll1504 sll1503     FALSE 0.270 130.000 0.000 1.000   0.221
 10728 10729 sll1503 sll1502   gltB FALSE 0.059 269.000 0.000 1.000 N 0.220
 10730 10731 ssr2708 ssr2711     FALSE 0.202 242.000 0.000 NA   0.441
 10731 10732 ssr2711 slr1608   gdhB FALSE 0.478 127.000 0.000 NA   0.658
 10733 10734 sll1501 sll1500 cbiA   TRUE 0.934 -3.000 0.000 0.017 Y -0.273
 10735 10736 slr1609 slr1041     FALSE 0.021 345.000 0.000 1.000 N 0.143
 10736 10737 slr1041 slr1042     TRUE 0.887 118.000 0.222 0.026 Y -0.116
 10737 10738 slr1042 slr1043     TRUE 0.949 47.000 0.857 1.000 Y 0.206
 10738 10739 slr1043 slr1044   mcpA TRUE 0.970 71.000 0.762 0.005 Y 0.229
 10739 10740 slr1044 slr1045 mcpA   TRUE 0.848 89.000 0.143 NA N 0.264
 10740 10741 slr1045 slr1046     FALSE 0.307 7.000 0.000 NA N 0.013
 10741 10742 slr1046 slr1047   pleD FALSE 0.006 444.000 0.000 1.000 N 0.015
 10742 10743 slr1047 slr1048 pleD   FALSE 0.089 232.000 0.000 1.000 N 0.209
 10745 10746 ssr1736 slr1050 rps32   FALSE 0.398 99.000 0.000 1.000   0.365
 10746 10747 slr1050 slr1051   envM FALSE 0.464 136.000 0.000 1.000   0.443
 10747 10748 slr1051 slr1052 envM   TRUE 0.721 36.000 0.000 1.000   0.840
 10748 10749 slr1052 slr1053     FALSE 0.454 89.000 0.000 NA   0.364
 10751 10752 slr1055 slr1056 chlH   FALSE 0.156 105.000 0.000 1.000 N 0.156
 10753 10754 sll1006 sll1005     FALSE 0.179 144.000 0.000 NA   0.114
 10754 10755 sll1005 sll1004     TRUE 0.481 130.000 0.000 NA   0.598
 10755 10756 sll1004 sll1003     FALSE 0.195 76.000 0.000 NA N 0.090
 10756 10757 sll1003 ssl1923     FALSE 0.028 410.000 0.000 NA   0.228
 10757 10758 ssl1923 ssl1922     FALSE 0.382 78.000 0.000 NA   0.194
 10758 10759 ssl1922 ssl1920     TRUE 0.967 -93.000 0.000 NA   0.691
 10759 10760 ssl1920 sll1002   ycf22 FALSE 0.412 126.000 0.000 NA N 0.532
 10760 10761 sll1002 sll1001 ycf22   TRUE 0.885 163.000 0.750 NA Y 0.303
 10761 10762 sll1001 ssl1918     TRUE 0.773 23.000 0.000 NA   0.553
 10763 10764 slr1753 slr1755   gpsA FALSE 0.119 101.000 0.000 1.000 N 0.092
 10766 10767 slr1756 slr1759 glnA   FALSE 0.006 219.000 0.000 1.000 N -0.512
 10767 10768 slr1759 slr1760     TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.026 Y 0.616
 10768 10769 slr1760 slr1761   ytfC FALSE 0.429 -3.000 0.000 1.000 N -0.035
 10771 10772 slr1762 slr1763     FALSE 0.097 100.000 0.000 NA   -0.030
 10776 10777 ssr2962 slr1767     TRUE 0.982 -3.000 0.385 NA   0.086
 10778 10779 sll1640 sll1639   ureD TRUE 0.920 -3.000 0.000 0.004   0.170
 10779 10780 sll1639 sll1638 ureD   FALSE 0.449 147.000 0.000 1.000   0.433
 10783 10784 slr1770 slr1771     FALSE 0.111 234.000 0.000 NA   0.223
 10785 10786 sll1635 sml0005   psbK FALSE 0.169 198.000 0.000 1.000   0.183
 10786 10787 sml0005 sll1752 psbK   FALSE 0.053 95.000 0.000 1.000   -0.275
 10788 10789 ssr3122 slr1846     TRUE 0.810 181.000 0.220 NA N 0.398
 10789 10790 slr1846 slr1847     FALSE 0.271 212.000 0.000 NA   0.423
 10790 10791 slr1847 slr1848   hisD TRUE 0.674 36.000 0.000 NA   0.466
 10791 10792 slr1848 slr1849 hisD merA FALSE 0.012 477.000 0.000 1.000 N 0.148
 10793 10794 sll1751 sll1750   ureC FALSE 0.110 111.000 0.000 NA   0.008
 10794 10795 sll1750 sll1749 ureC   TRUE 0.711 18.000 0.000 NA   0.341
 10795 1730141 sll1749 sll1749a     TRUE 0.580 51.000 0.000 NA   NA
 10796 10797 slr1851 ssr3129     TRUE 0.729 60.000 0.000 NA   0.677
 10801 10802 slr2033 slr2034 rub   TRUE 0.955 56.000 0.521 NA   0.469
 10802 10803 slr2034 ssr3451   psbE TRUE 0.922 86.000 0.625 NA   0.558
 10803 10804 ssr3451 smr0006 psbE psbF TRUE 0.970 37.000 0.837 0.002   0.858
 10804 10805 smr0006 smr0007 psbF psbL TRUE 0.988 10.000 0.872 0.003   0.894
 10805 10806 smr0007 smr0008 psbL psbJ TRUE 0.971 33.000 0.878 0.003   0.659
 10806 10807 smr0008 slr2035 psbJ proB FALSE 0.328 85.000 0.000 1.000   0.172
 10807 10808 slr2035 ssr3452 proB   FALSE 0.105 169.000 0.000 NA   0.023
 10808 10809 ssr3452 slr2036     FALSE 0.045 585.000 0.000 NA   0.592
 10809 10810 slr2036 slr2037     FALSE 0.145 52.000 0.000 1.000   -0.209
 10810 10811 slr2037 slr2038     TRUE 0.798 13.000 0.000 1.000   0.387
 10812 10813 sll1942 sll1941   gyrA FALSE 0.291 31.000 0.000 NA   0.035
 10814 10815 slr2041 slr2042 divK   TRUE 0.725 34.000 0.000 1.000   0.690
 10816 10817 sll1940 sll1939     TRUE 0.809 -7.000 0.000 NA   0.133
 10819 10820 sll1938 sll1937   fur FALSE 0.188 65.000 0.000 1.000   -0.126
 10821 10822 slr2043 slr2044 zntC   TRUE 0.996 -22.000 0.050 1.000 Y 0.479
 10822 10823 slr2044 slr2045     TRUE 0.997 -46.000 0.616 1.000 Y 0.400
 10823 10824 slr2045 ssr3467     FALSE 0.007 516.000 0.000 NA   -0.018
 10824 10825 ssr3467 slr2046     FALSE 0.282 83.000 0.000 NA   0.135
 10825 10826 slr2046 slr2047   phoH FALSE 0.375 132.000 0.000 1.000   0.352
 10826 10827 slr2047 slr2048 phoH   FALSE 0.187 211.000 0.000 1.000 N 0.346
 10827 10828 slr2048 slr2049     TRUE 0.725 83.000 0.000 0.021   0.490
 10828 10829 slr2049 slr2051   cpcG TRUE 0.806 187.000 0.115 1.000   0.381
 10829 10830 slr2051 slr2052 cpcG   FALSE 0.102 344.000 0.000 NA   0.658
 10833 10834 sll1933 sll1932 dnaJ dnaK TRUE 0.932 109.000 0.390 0.006 Y 0.294
 10834 10835 sll1932 sll1931 dnaK gylA FALSE 0.161 186.000 0.000 1.000 N 0.210
 10835 10836 sll1931 sll1930 gylA   FALSE 0.005 815.000 0.000 NA N 0.111
 10836 10837 sll1930 sll1929   comEc FALSE 0.015 430.000 0.000 NA   0.099
 10838 10839 slr1906 slr1907     TRUE 0.994 -105.000 0.400 NA   0.266
 10839 10840 slr1907 slr1908     FALSE 0.009 570.000 0.000 NA   0.075
 10840 10841 slr1908 slr1909     FALSE 0.107 270.000 0.000 1.000   0.331
 10841 10842 slr1909 slr1910   amiA FALSE 0.466 58.000 0.000 1.000 N 0.248
 10842 10843 slr1910 slr1911 amiA   TRUE 0.655 24.000 0.000 NA   0.341
 10845 10846 slr1912 slr1913     FALSE 0.281 132.000 0.000 NA   0.259
 10846 10847 slr1913 slr1914     TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   0.339
 10848 10849 sll1835 sll1834     FALSE 0.163 124.000 0.000 NA   0.106
 10850 10851 slr1915 slr1916     TRUE 0.569 89.000 0.000 NA   0.593
 10851 10852 slr1916 slr1917     TRUE 0.659 91.000 0.000 0.006   0.397
 10852 10853 slr1917 slr1918     TRUE 0.514 93.000 0.000 NA   0.487
 10854 10855 sll1833 sll1832 ftsI   TRUE 0.972 13.000 0.098 NA   0.441
 10855 10856 sll1832 sll1831   glcF FALSE 0.115 305.000 0.000 NA   0.476
 10856 10857 sll1831 sll1830 glcF   FALSE 0.241 68.000 0.000 NA   -0.005
 10858 10859 slr1919 slr1920     FALSE 0.228 126.000 0.000 NA   0.199
 10860 10861 sll0998 ssl1911     FALSE 0.130 304.000 0.000 NA   0.597
 10862 397170 slr1019 6803t07   tRNA-Leu FALSE 0.339 147.000 0.000 NA   NA
 10863 10864 sll0997 sll0996     TRUE 0.670 12.000 0.000 NA   0.222
 10865 10866 slr1020 ssr1698 sqdB   FALSE 0.315 143.000 0.000 NA   0.302
 10867 10868 sll0995 sll0994     FALSE 0.361 86.000 0.000 NA   0.244
 10868 10869 sll0994 sll0993     TRUE 0.872 -67.000 0.000 NA   0.133
 10870 10871 slr1022 slr1023 argD   FALSE 0.025 127.000 0.000 NA   -0.261
 10871 10872 slr1023 slr1024     TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   0.664
 10872 10873 slr1024 slr1025     FALSE 0.330 29.000 0.000 NA   0.058
 10874 10875 sll0992 sll0990     TRUE 0.983 9.000 0.327 1.000   0.817
 10875 397204 sll0990 6803t08   tRNA-Arg TRUE 0.601 29.000 0.000 NA   NA
 10876 10877 slr1028 slr1030   chlI FALSE 0.023 215.000 0.000 1.000   -0.257
 10877 10878 slr1030 slr1031 chlI tyrS TRUE 0.687 35.000 0.000 1.000 N 0.770
 10878 10879 slr1031 slr1032 tyrS   FALSE 0.040 188.000 0.000 NA   -0.139
 10879 10880 slr1032 slr1033     TRUE 0.857 -3.000 0.000 NA   0.291
 10880 10881 slr1033 ssr1720   tyrS FALSE 0.270 133.000 0.000 NA   0.239
 10881 10882 ssr1720 slr1034 tyrS   FALSE 0.069 154.000 0.000 1.000   -0.152
 10882 10883 slr1034 slr1035     TRUE 0.744 57.000 0.000 1.000   0.627
 10884 10885 sll0986 sll0985     FALSE 0.378 123.000 0.000 1.000 N 0.421
 10885 10886 sll0985 sll0984     TRUE 0.908 -88.000 0.000 NA   0.207
 10888 10889 sll0983 sll0982     FALSE 0.143 295.000 0.000 NA   0.694
 10889 10890 sll0982 sll0981     TRUE 0.534 92.000 0.000 NA   0.529
 10890 10891 sll0981 sll0980     TRUE 0.874 8.000 0.000 NA   0.741
 10892 10893 slr1039 slr1376     FALSE 0.329 205.000 0.000 NA   0.529
 10893 10894 slr1376 slr1377   lepB TRUE 0.696 47.000 0.000 NA   0.596
 10894 10895 slr1377 slr1378 lepB   TRUE 0.965 -48.000 0.000 1.000   0.656
 10895 10896 slr1378 slr1379   cydA FALSE 0.013 277.000 0.000 1.000   -0.189
 10896 10897 slr1379 slr1380 cydA cydB TRUE 0.994 4.000 0.750 0.055 Y 0.842
 10898 10899 sll1300 sll1299 trmB ackA TRUE 0.504 59.000 0.000 1.000   0.209
 10899 10900 sll1299 sll1298 ackA clcD TRUE 0.779 -3.000 0.000 1.000 N 0.202
 10901 10902 ssr2315 slr1383     FALSE 0.011 180.000 0.000 NA   -0.346
 10902 10903 slr1383 ssr2317     TRUE 0.966 -82.000 0.000 NA   0.610
 10903 10904 ssr2317 slr1384     FALSE 0.197 29.000 0.000 NA   -0.079
 10904 10905 slr1384 slr1385     FALSE 0.071 135.000 0.000 NA   -0.096
 10905 10906 slr1385 ssr2318     FALSE 0.156 179.000 0.000 NA   0.135
 10907 10908 sll1297 ssl2559 pobA   TRUE 0.884 -13.000 0.000 0.055 N 0.036
 10908 10909 ssl2559 sll1296     FALSE 0.012 121.000 0.000 1.000 N -0.196
 10909 10910 sll1296 sll1294   pilJ TRUE 0.984 57.000 0.857 0.004 Y 0.645
 10910 10911 sll1294 sll1293 pilJ   TRUE 0.954 147.000 0.833 0.004 Y 0.559
 10911 10912 sll1293 sll1292     TRUE 0.973 33.000 0.833 1.000 Y 0.769
 10912 10913 sll1292 sll1291     TRUE 0.949 107.000 0.500 0.025 Y 0.529
 10913 10914 sll1291 sll1290   rnb FALSE 0.005 635.000 0.000 1.000 N 0.046
 10914 10915 sll1290 sll1289 rnb   TRUE 0.588 79.000 0.000 1.000 N 0.490
 10916 10917 slr1390 slr1391 ftsH   TRUE 0.802 16.000 0.000 NA   0.456
 10917 10918 slr1391 ssr2333     FALSE 0.010 265.000 0.000 NA   -0.197
 10918 10919 ssr2333 slr1392   feoB TRUE 0.989 8.000 0.117 1.000 Y 0.761
 10921 10922 slr1393 slr1394     FALSE 0.212 123.000 0.000 0.099   -0.239
 10924 10925 slr1395 slr1396     FALSE 0.052 306.000 0.000 NA   0.237
 10925 10926 slr1396 slr1397     FALSE 0.425 135.000 0.000 NA   0.413
 10926 10927 slr1397 slr1398     FALSE 0.227 233.000 0.000 NA   0.447
 10928 10929 sll1285 sll1284     TRUE 0.585 4.000 0.000 NA   0.047
 10929 10930 sll1284 sll1283   spoIID TRUE 0.838 13.000 0.000 NA   0.560
 10932 10933 sll1584 sll1583   lig FALSE 0.124 287.000 0.000 NA   0.431
 10933 10934 sll1583 sll1582 lig   FALSE 0.111 156.000 0.000 1.000   -0.030
 10934 10935 sll1582 sll1581   gumB FALSE 0.247 68.000 0.000 1.000 N 0.075
 10936 10937 ssr2843 slr1702     FALSE 0.040 32.000 0.000 NA   -0.336
 10937 10938 slr1702 slr1703   serS TRUE 0.558 91.000 0.000 NA   0.615
 10939 10940 ssl3093 sll1580 cpcD cpcC TRUE 0.929 147.000 0.375 0.007   0.901
 10940 10941 sll1580 sll1579 cpcC cpcC TRUE 0.969 46.000 0.455 0.007   0.955
 10941 10942 sll1579 sll1578 cpcC cpcA TRUE 0.915 115.000 0.091 0.007   0.920
 10942 10943 sll1578 sll1577 cpcA cpcB TRUE 0.647 111.000 0.000 0.003   0.909
 10944 10945 ssr2848 slr1704     FALSE 0.126 171.000 0.000 NA   0.070
 10946 10947 sll1575 sll1574     TRUE 0.943 5.000 0.000 0.002   0.640
 10947 10948 sll1574 sll1573     TRUE 0.948 74.000 0.333 NA   0.578
 10949 10950 slr1705 slr1706 aspA dfrA FALSE 0.250 117.000 0.000 1.000 N 0.282
 10950 10951 slr1706 ssr2857 dfrA   FALSE 0.066 233.000 0.000 1.000   0.050
 10951 10952 ssr2857 slr1708     FALSE 0.254 126.000 0.000 1.000   0.209
 10953 10954 sll1572 sll1571 dnaE   TRUE 0.663 56.000 0.000 NA   0.392
 10954 10955 sll1571 sll1570     FALSE 0.018 101.000 0.000 NA   -0.308
 10957 10958 sll1568 sll1927     FALSE 0.058 92.000 0.000 1.000   -0.273
 10958 10959 sll1927 sll1926     TRUE 0.604 78.000 0.000 NA   0.429
 10962 10963 slr2006 slr2007   ndhD TRUE 0.997 -3.000 0.306 0.011 Y 0.777
 10963 10964 slr2007 slr2008 ndhD   TRUE 0.952 112.000 0.306 0.011 Y 0.598
 10964 10965 slr2008 slr2009   ndhF TRUE 0.981 50.000 0.306 0.011 Y 0.514
 10965 10966 slr2009 slr2010 ndhF   TRUE 0.991 -3.000 0.404 NA   0.531
 10966 10967 slr2010 ssr3409     TRUE 0.992 -45.000 0.913 NA   0.289
 10967 10968 ssr3409 ssr3410     TRUE 0.991 -3.000 0.605 1.000   0.506
 10968 10969 ssr3410 slr2011     TRUE 0.995 -31.000 0.605 NA   0.448
 10969 10970 slr2011 slr2012     TRUE 0.992 -3.000 0.489 NA Y 0.252
 10970 10971 slr2012 slr2013     FALSE 0.196 248.000 0.000 NA   0.471
 10973 10974 slr2015 slr2016     TRUE 0.949 49.000 0.750 NA   0.512
 10974 10975 slr2016 slr2017     TRUE 0.995 -49.000 0.500 NA   0.534
 10975 10976 slr2017 slr2018     TRUE 0.679 76.000 0.000 NA   0.801
 10976 10977 slr2018 slr2019     FALSE 0.061 254.000 0.000 NA   0.137
 10978 10979 sll1921 sll1920     FALSE 0.220 229.000 0.000 NA   0.413
 10980 10981 slr2023 slr2024 fabD   FALSE 0.081 282.000 0.000 1.000 N 0.343
 10981 10982 slr2024 slr2025     TRUE 0.692 67.000 0.000 NA   0.505
 10983 10984 sll1917 sll1916 hemN   TRUE 0.895 -3.000 0.000 1.000 Y -0.047
 10984 10985 sll1916 sll1915     FALSE 0.324 40.000 0.000 NA   0.090
 10986 10987 slr2026 slr2027 folP   TRUE 0.861 -9.000 0.000 NA N 0.293
 10988 10989 sll1913 sll1912     FALSE 0.417 61.000 0.000 NA   0.155
 10989 10990 sll1912 ssl3615     TRUE 0.926 -3.000 0.000 NA   0.541
 10990 10991 ssl3615 sll1911     FALSE 0.177 209.000 0.000 NA   0.275
 10991 10992 sll1911 sll1910   zam FALSE 0.065 129.000 0.000 NA   -0.103
 10993 10994 slr2030 slr2031     FALSE 0.035 205.000 0.000 1.000 N -0.013
 10994 10995 slr2031 slr1133   argH FALSE 0.160 368.000 0.021 1.000 N -0.158
 10995 10996 slr1133 slr1134 argH   TRUE 0.958 5.000 0.003 1.000 N 0.249
 10996 10997 slr1134 slr1135     FALSE 0.016 450.000 0.000 NA   0.133
 10999 11000 slr1136 slr1137 ctaC ctaD TRUE 0.969 89.000 0.263 0.002 Y 0.614
 11000 11001 slr1137 slr1138 ctaD ctaE TRUE 0.982 48.000 0.289 0.002 Y 0.573
 11001 11002 slr1138 slr1139 ctaE trxA FALSE 0.465 152.000 0.000 1.000 Y 0.164
 11002 11003 slr1139 slr1140 trxA   FALSE 0.217 73.000 0.000 1.000 N 0.060
 11004 11005 sll1082 sll1081 nrtD   TRUE 0.974 57.000 0.314 1.000 Y 0.494
 11005 11006 sll1081 sll1080     TRUE 0.948 103.000 0.204 0.028 Y 0.680
 11006 11007 sll1080 sll1079   hypB TRUE 0.947 54.000 0.062 1.000 N 0.741
 11007 11008 sll1079 sll1078 hypB   TRUE 0.972 61.000 0.215 0.005   0.687
 11008 11009 sll1078 sll1077   speB TRUE 0.931 76.000 0.035 1.000   0.613
 11010 11011 slr1142 slr1143     TRUE 0.779 55.000 0.000 NA Y 0.328
 11012 11013 sll1076 sll1074 ziaA leuS FALSE 0.006 332.000 0.000 1.000 N -0.058
 11015 11016 slr1147 slr1148     FALSE 0.235 235.000 0.000 NA   0.511
 11016 11017 slr1148 slr1149     FALSE 0.108 205.000 0.000 NA   0.120
 11017 11018 slr1149 slr1150     FALSE 0.254 99.000 0.000 NA   0.210
 11019 11020 sll1072 sll1071     TRUE 0.822 14.000 0.000 NA   0.506
 11020 11021 sll1071 sll1070   tktA FALSE 0.037 157.000 0.000 NA   -0.194
 11021 11022 sll1070 sll1069 tktA fabF TRUE 0.853 123.000 0.062 1.000 N 0.733
 11022 11023 sll1069 ssl2084 fabF acp TRUE 0.899 198.000 0.346 1.000 Y 0.737
 11023 11024 ssl2084 sll1068 acp   FALSE 0.056 210.000 0.000 NA   -0.013
 11024 11025 sll1068 ssl3451     TRUE 0.623 37.000 0.000 NA   0.388
 11027 11028 sll1825 sll1824     FALSE 0.024 213.000 0.000 1.000   -0.260
 11028 11029 sll1824 sll1823   purA TRUE 0.994 -201.000 0.017 1.000 N 0.785
 11029 11030 sll1823 ssl3446 purA   FALSE 0.012 155.000 0.000 NA   -0.425
 11030 11031 ssl3446 ssl3445   rpl31 FALSE 0.001 388.000 0.000 NA   -0.416
 11031 11032 ssl3445 sll1822 rpl31 rps9 TRUE 0.980 53.000 0.062 0.019 Y 0.858
 11032 11033 sll1822 sll1821 rps9 rpl13 TRUE 0.996 0.000 0.601 0.019 Y 0.948
 11033 11034 sll1821 sll1820 rpl13 truA TRUE 0.969 65.000 0.058 1.000 Y 0.938
 11034 11035 sll1820 sll1819 truA rpl17 TRUE 0.983 18.000 0.102 1.000 Y 0.880
 11035 11036 sll1819 sll1818 rpl17 rpoA TRUE 0.933 78.000 0.873 1.000 N 0.883
 11036 11037 sll1818 sll1817 rpoA rps11 TRUE 0.872 109.000 0.308 1.000 N 0.973
 11037 11038 sll1817 sll1816 rps11 rps13 TRUE 0.981 49.000 0.810 0.019 Y 0.958
 11038 11039 sll1816 sml0006 rps13 rpl36 TRUE 0.951 83.000 0.194 0.019   0.906
 11039 11040 sml0006 ssl3441 rpl36 infA TRUE 0.893 138.000 0.257 1.000   0.628
 11040 11041 ssl3441 sll1815 infA adk TRUE 0.827 120.000 0.015 1.000 N 0.640
 11041 11042 sll1815 sll1814 adk secY TRUE 0.832 126.000 0.020 1.000 N 0.836
 11042 11043 sll1814 sll1813 secY rpl15 TRUE 0.875 102.000 0.730 1.000 N 0.770
 11043 11044 sll1813 sll1812 rpl15 rps5 TRUE 0.980 69.000 0.148 0.025 Y 0.880
 11044 11045 sll1812 sll1811 rps5 rpl18 TRUE 0.980 40.000 0.814 0.025 Y 0.941
 11045 11046 sll1811 sll1810 rpl18 rpl6 TRUE 0.994 4.000 0.815 0.019 Y 0.952
 11046 11047 sll1810 sll1809 rpl6 rps8 TRUE 0.983 60.000 0.808 0.019 Y 0.854
 11047 11048 sll1809 sll1808 rps8 rpl5 TRUE 0.957 92.000 0.059 0.019 Y 0.890
 11048 11049 sll1808 sll1807 rpl5 rpl24 TRUE 0.977 47.000 0.057 0.019 Y 0.920
 11049 11050 sll1807 sll1806 rpl24 rpl14 TRUE 0.994 1.000 0.071 0.025 Y 0.931
 11050 11051 sll1806 ssl3437 rpl14 rps17 TRUE 0.986 24.000 0.791 0.025 Y 0.975
 11051 11052 ssl3437 ssl3436 rps17 rpl29 TRUE 0.993 8.000 0.828 0.019 Y 0.963
 11052 11053 ssl3436 sll1805 rpl29 rpl16 TRUE 0.995 3.000 0.802 0.019 Y 0.968
 11053 11054 sll1805 sll1804 rpl16 rps3 TRUE 0.980 41.000 0.828 0.025 Y 0.941
 11054 11055 sll1804 sll1803 rps3 rpl22 TRUE 0.983 30.000 0.719 0.025 Y 0.964
 11055 11056 sll1803 ssl3432 rpl22 rps19 TRUE 0.990 16.000 0.769 0.025 Y 0.955
 11056 11057 ssl3432 sll1802 rps19 rpl2 TRUE 0.981 33.000 0.820 0.025 Y 0.941
 11057 11058 sll1802 sll1801 rpl2 rpl23 TRUE 0.981 50.000 0.849 0.017 Y 0.960
 11058 11059 sll1801 sll1800 rpl23 rpl4 TRUE 0.997 -7.000 0.513 0.019 Y 0.952
 11059 11060 sll1800 sll1799 rpl4 rpl3 TRUE 0.981 40.000 0.361 0.019 Y 0.963
 11063 11064 slr1895 slr1896     FALSE 0.276 88.000 0.000 NA   0.161
 11066 11067 slr1897 slr1898 srrA argB FALSE 0.075 264.000 0.000 1.000 N 0.270
 11067 11068 slr1898 slr1899 argB ureF FALSE 0.040 128.000 0.000 1.000 N -0.058
 11068 11069 slr1899 slr1900 ureF   FALSE 0.173 54.000 0.000 NA   -0.102
 11069 11070 slr1900 slr1901     FALSE 0.381 60.000 0.000 NA   0.121
 11070 11071 slr1901 slr1902     FALSE 0.114 132.000 0.000 1.000   -0.039
 11071 11072 slr1902 slr1903     TRUE 0.991 -111.000 0.000 0.016 Y 0.877
 11073 11074 sll1792 sll1791     TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA Y 0.207
 11074 11075 sll1791 sll1789   rpoC2 FALSE 0.006 216.000 0.000 NA N -0.319
 11075 11076 sll1789 sll1787 rpoC2 rpoB TRUE 0.935 108.000 0.006 0.001 Y 0.879
 11076 11077 sll1787 sll1786 rpoB   TRUE 0.880 86.000 0.012 NA N 0.827
 11077 11078 sll1786 ssl2233   rps20 TRUE 0.846 136.000 0.034 NA N 0.676
 11078 11079 ssl2233 sll1124 rps20   FALSE 0.014 96.000 0.000 1.000 N -0.134
 11079 11080 sll1124 sll1123     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   0.245
 11080 11081 sll1123 sll1121     FALSE 0.174 113.000 0.000 NA   0.123
 11081 11082 sll1121 sll1120     FALSE 0.013 99.000 0.000 1.000 N -0.286
 11082 11083 sll1120 sll1119     FALSE 0.075 195.000 0.000 NA   -0.004
 11084 11085 slr1194 slr1195     FALSE 0.071 154.000 0.000 NA   -0.084
 11085 11086 slr1195 slr1196     FALSE 0.437 29.000 0.000 NA   0.161
 11086 11087 slr1196 slr1197     TRUE 0.614 28.000 0.000 1.000   0.326
 11089 11090 ssr2009 slr1198     FALSE 0.060 199.000 0.000 NA   -0.036
 11090 11091 slr1198 slr1199   mutL FALSE 0.207 104.000 0.000 1.000   0.147
 11091 11092 slr1199 slr1200 mutL livH FALSE 0.026 185.000 0.000 1.000   -0.356
 11092 11093 slr1200 slr1201 livH   TRUE 0.924 98.000 0.888 0.028   0.862
 11093 11094 slr1201 slr1202   lacF TRUE 0.569 116.000 0.000 0.028 N 0.533
 11094 11095 slr1202 slr1203 lacF   FALSE 0.092 110.000 0.000 NA   -0.028
 11095 11096 slr1203 slr1204   htrA FALSE 0.166 106.000 0.000 NA   0.115
 11096 11097 slr1204 slr1205 htrA   TRUE 0.674 48.000 0.000 1.000 N 0.602
 11097 11098 slr1205 slr1206     FALSE 0.071 274.000 0.000 NA   0.239
 11098 11099 slr1206 slr1207     TRUE 0.605 68.000 0.000 NA   0.365
 11099 11100 slr1207 ssr2016     FALSE 0.178 222.000 0.000 NA   0.330
 11100 11101 ssr2016 slr1208     FALSE 0.107 252.000 0.000 NA   0.289
 11101 11102 slr1208 slr1209     TRUE 0.818 12.000 0.000 NA   0.429
 11102 11103 slr1209 slr1210     TRUE 0.984 -7.000 0.600 NA   -0.061
 11103 11104 slr1210 slr1211   cobN TRUE 0.710 12.000 0.000 NA   0.278
 11104 11105 slr1211 slr1212 cobN ETR1 FALSE 0.167 92.000 0.000 1.000 N 0.114
 11105 11106 slr1212 slr1213 ETR1   TRUE 0.836 49.000 0.000 0.030 Y 0.320
 11106 11107 slr1213 slr1214     FALSE 0.065 535.000 0.000 0.025 Y 0.010
 11107 11108 slr1214 slr1215     TRUE 0.646 72.000 0.000 NA   0.423
 11112 11113 slr2070 slr2071     FALSE 0.192 164.000 0.000 NA   0.169
 11114 11115 sll1969 sll1968   pmgA TRUE 0.653 7.000 0.000 1.000   0.120
 11115 11116 sll1968 sll1967 pmgA   TRUE 0.948 -33.000 0.000 1.000 N 0.454
 11117 11118 slr2072 slr2073 ilvA   FALSE 0.009 413.000 0.000 NA   -0.011
 11118 11119 slr2073 slr2074   manA FALSE 0.074 196.000 0.000 NA   -0.004
 11121 11122 slr2075 slr2076 groES groEL TRUE 0.957 97.000 0.905 0.009 Y 0.906
 11122 11123 slr2076 slr2077 groEL   FALSE 0.004 470.000 0.000 1.000 N -0.008
 11123 11124 slr2077 slr2078     FALSE 0.041 317.000 0.000 1.000 N 0.234
 11125 11126 ssl3712 sll1747   aroC FALSE 0.030 353.000 0.000 NA   0.172
 11126 11127 sll1747 sll1746 aroC rpl12 FALSE 0.179 207.000 0.000 1.000 N 0.326
 11127 11128 sll1746 sll1745 rpl12 rpl10 TRUE 0.966 88.000 0.884 0.019 Y 0.661
 11128 11129 sll1745 sll1744 rpl10 rpl1 TRUE 0.862 247.000 0.302 0.024 Y 0.804
 11129 11130 sll1744 sll1743 rpl1 rpl11 TRUE 0.967 87.000 0.838 0.024 Y 0.813
 11130 11131 sll1743 sll1742 rpl11 nusG TRUE 0.875 102.000 0.681 1.000 N 0.884
 11131 11132 sll1742 ssl3335 nusG secE TRUE 0.585 280.000 0.843 1.000 N 0.842
 11132 397203 ssl3335 6803t09 secE tRNA-Trp FALSE 0.327 112.000 0.000 NA   NA
 397203 11133 6803t09 sll1740 tRNA-Trp rpl19 FALSE 0.329 118.000 0.000 NA   NA
 11134 11135 slr1826 slr1827     FALSE 0.185 201.000 0.000 NA   0.254
 11136 11137 sll1739 sll1738     FALSE 0.048 263.000 0.000 NA   0.099
 11137 11138 sll1738 sll1737     TRUE 0.722 64.000 0.000 NA   0.658
 11139 11140 slr1828 slr1829 petF   FALSE 0.012 112.000 0.000 NA   -0.469
 11140 11141 slr1829 slr1830   phbC TRUE 0.904 94.000 0.210 NA   0.763
 11142 11143 sll1736 sll1735     FALSE 0.383 128.000 0.000 NA   0.382
 11143 11144 sll1735 sll1734     TRUE 0.868 173.000 0.455 NA   0.846
 11144 11145 sll1734 sll1733   ndhD3 TRUE 0.953 64.000 0.857 NA   0.910
 11145 11146 sll1733 sll1732 ndhD3 ndhF TRUE 0.954 117.000 0.714 0.004 Y 0.945
 11146 11147 sll1732 sll1730 ndhF   FALSE 0.011 398.000 0.000 1.000   -0.045
 11148 11149 slr1834 slr1835 psaA psaB TRUE 0.792 246.000 0.154 0.003   0.861
 11150 11151 sll1726 sll1725     TRUE 0.988 0.000 0.625 NA   0.453
 11151 11152 sll1725 sll1724   icsA TRUE 0.955 54.000 0.286 1.000 N 0.689
 11152 11153 sll1724 sll1723 icsA   TRUE 0.997 -3.000 0.571 0.023 Y 0.788
 11153 11154 sll1723 sll1722     TRUE 0.967 23.000 0.211 1.000   0.897
 11157 11158 slr1838 slr1839 ccmK ccmK TRUE 0.915 159.000 0.938 NA Y 0.525
 11158 11159 slr1839 slr1840 ccmK   TRUE 0.647 60.000 0.000 NA N 0.452
 11159 11160 slr1840 slr1841     FALSE 0.008 349.000 0.000 1.000   -0.181
 11160 11161 slr1841 slr1842   cysK TRUE 0.909 70.000 0.118 1.000   0.182
 11161 11162 slr1842 slr1843 cysK zwf FALSE 0.224 107.000 0.000 1.000 N 0.254
 11162 11163 slr1843 slr1844 zwf uvrA FALSE 0.136 158.000 0.000 1.000 N 0.131
 11164 11165 sll1717 sll1716     FALSE 0.227 94.000 0.000 NA   0.137
 11165 11166 sll1716 sll1715     FALSE 0.061 135.000 0.000 NA   -0.123
 11166 11167 sll1715 sll1714     TRUE 0.990 -67.000 0.429 NA   -0.047
 11167 11168 sll1714 sll1713   hisC FALSE 0.002 468.000 0.000 NA   -0.205
 11168 11169 sll1713 sll1712 hisC   TRUE 0.942 62.000 0.052 1.000 N 0.595
 11169 11170 sll1712 sll1469     FALSE 0.045 171.000 0.000 1.000   -0.231
 11171 11172 slr1535 slr1536   recQ TRUE 0.487 99.000 0.000 1.000   0.505
 11172 11173 slr1536 slr1537 recQ   FALSE 0.028 290.000 0.000 NA N 0.149
 11173 11174 slr1537 slr1538   cbiD FALSE 0.127 100.000 0.000 NA N 0.132
 11174 11175 slr1538 slr1540 cbiD   FALSE 0.359 90.000 0.000 1.000 N 0.328
 11175 11176 slr1540 slr1541     TRUE 0.677 74.000 0.000 1.000   0.492
 11176 11177 slr1541 slr1542     FALSE 0.431 112.000 0.000 1.000   0.425
 11177 11178 slr1542 slr1543     FALSE 0.159 106.000 0.000 1.000 N 0.162
 11180 11181 ssr2595 slr1544     TRUE 0.707 49.000 0.000 NA   0.920
 11181 11182 slr1544 slr1545   rpoE FALSE 0.065 264.000 0.000 NA   0.176
 11182 11183 slr1545 slr1546 rpoE   TRUE 0.746 87.000 0.000 NA Y 0.664
 11183 11184 slr1546 slr1547     FALSE 0.318 24.000 0.000 NA   0.002
 11184 397171 slr1547 6803t10   tRNA-Leu TRUE 0.537 75.000 0.000 NA   NA
 11185 11186 sll1466 ssl2823     TRUE 0.750 7.000 0.000 0.055   -0.064
 11186 11187 ssl2823 sll1464     FALSE 0.063 105.000 0.000 NA   -0.101
 11187 11188 sll1464 sll1463   ftsH FALSE 0.194 212.000 0.000 NA   0.328
 11188 11189 sll1463 sll1462 ftsH hypE TRUE 0.519 132.000 0.000 1.000 Y 0.244
 11189 11190 sll1462 sll1461 hypE   TRUE 0.664 49.000 0.000 1.000   0.419
 11190 11191 sll1461 sll1459     TRUE 0.576 53.000 0.000 1.000   0.297
 11192 11193 slr1549 ssr2611 def   TRUE 0.731 116.000 0.511 NA   -0.442
 11193 11194 ssr2611 slr1550   lysS TRUE 0.739 56.000 0.000 NA   0.708
 11195 11196 sll1457 sll1456 rfbJ   FALSE 0.350 204.000 0.000 NA   0.636
 11198 11199 sll1455 sll1454   narB FALSE 0.183 527.000 0.048 NA   0.274
 11199 11200 sll1454 sll1453 narB nrtD FALSE 0.067 404.000 0.000 1.000 N 0.843
 11200 11201 sll1453 sll1452 nrtD nrtC TRUE 0.985 55.000 0.556 0.002 Y 0.946
 11201 11202 sll1452 sll1451 nrtC nrtB TRUE 0.980 75.000 0.191 0.002 Y 0.918
 11202 11203 sll1451 sll1450 nrtB nrtA TRUE 0.950 86.000 0.915 NA Y 0.930
 11203 11204 sll1450 sll1634 nrtA   FALSE 0.302 136.000 0.000 NA N 0.346
 11206 11207 ssl3177 sll1633 repA ftsZ FALSE 0.295 157.000 0.000 NA   0.303
 11207 11208 sll1633 sll1632 ftsZ   FALSE 0.399 250.000 0.067 NA N -0.065
 11209 11210 slr1751 slr1752 prc   TRUE 0.718 48.000 0.000 1.000   0.763
 11212 11213 slr1218 slr1219   ureE TRUE 0.491 29.000 0.000 NA   0.211
 11213 11214 slr1219 slr1220 ureE   FALSE 0.072 225.000 0.000 NA   0.081
 11214 11215 slr1220 slr1222     FALSE 0.015 660.000 0.000 NA   0.211
 11216 11217 sll1143 sll1142 uvrD   FALSE 0.277 166.000 0.000 NA   0.308
 11218 11219 slr1223 slr1224 sulA malK FALSE 0.372 69.000 0.000 1.000   0.099
 11219 11220 slr1224 slr1225 malK pknA FALSE 0.126 107.000 0.000 1.000 N 0.114
 11222 11223 slr1226 slr1227 purC IAP75 FALSE 0.266 213.000 0.000 1.000 N 0.484
 11223 11224 slr1227 slr1228 IAP75 prfC FALSE 0.166 115.000 0.000 1.000 N 0.165
 11224 11225 slr1228 slr1229 prfC   TRUE 0.628 48.000 0.000 1.000 N 0.437
 11225 11226 slr1229 slr1230     TRUE 0.852 100.000 0.500 1.000 N 0.374
 11228 11229 slr1232 ssr2047     FALSE 0.094 360.000 0.000 NA   0.741
 11229 11230 ssr2047 slr1233   frdA FALSE 0.391 176.000 0.000 NA   0.457
 11230 11231 slr1233 ssr2049 frdA bchB FALSE 0.381 48.000 0.000 1.000   0.120
 11231 11232 ssr2049 slr1234 bchB   TRUE 0.639 52.000 0.000 1.000   0.365
 11232 11233 slr1234 slr1235     FALSE 0.029 46.000 0.000 1.000 N -0.405
 11233 11234 slr1235 slr1236     TRUE 0.595 37.000 0.000 NA   0.363
 11235 11236 ssl2250 sll1132     FALSE 0.038 222.000 0.000 NA   -0.064
 11236 11237 sll1132 sll1131     TRUE 0.607 36.000 0.000 NA   0.371
 11239 11240 sll1130 ssl2245     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   0.851
 11240 11241 ssl2245 sll1129   todF FALSE 0.009 501.000 0.000 NA   0.049
 11242 11243 ssr2060 ssr2061   grxC FALSE 0.303 83.000 0.000 NA   0.158
 11243 11244 ssr2061 slr1238 grxC gshB TRUE 0.864 81.000 0.023 1.000 N 0.333
 11244 11245 slr1238 ssr2062 gshB   FALSE 0.006 397.000 0.000 NA   -0.115
 11247 11248 slr1239 slr1240 pntA   TRUE 0.733 27.000 0.000 NA   0.506
 11248 11249 slr1240 slr1241     TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   0.602
 11249 11250 slr1241 ssr2067     FALSE 0.213 248.000 0.000 NA   0.554
 11250 11251 ssr2067 slr1434   pntB TRUE 0.697 41.000 0.000 NA   0.595
 11251 11252 slr1434 slr1435 pntB pmbA FALSE 0.164 110.000 0.000 NA   0.110
 11252 11253 slr1435 slr1436 pmbA   FALSE 0.325 102.000 0.000 NA   0.335
 11253 11254 slr1436 slr1437     FALSE 0.300 128.000 0.000 NA   0.301
 11254 11255 slr1437 slr1438     TRUE 0.901 3.000 0.000 NA   0.791
 11260 11261 sll1359 sll1358     TRUE 0.948 32.000 0.200 1.000 N 0.576
 11261 11262 sll1358 sll1356   glgP TRUE 0.616 162.000 0.000 1.000 Y 0.459
 11265 11266 slr1442 slr1443   pknA FALSE 0.415 45.000 0.000 1.000   0.161
 11266 11267 slr1443 slr1444 pknA   FALSE 0.069 194.000 0.000 1.000   -0.074
 11267 11268 slr1444 ssr2422     FALSE 0.400 191.000 0.000 NA   0.698
 1730143 11269 6803t11 sll1354   recJ TRUE 0.574 67.000 0.000 NA   NA
 11269 11270 sll1354 sll1353 recJ   FALSE 0.296 41.000 0.000 1.000 N 0.131
 11270 11271 sll1353 sll1352     FALSE 0.239 19.000 0.000 NA   -0.109
 11272 11273 slr1448 slr1449 cscK   FALSE 0.016 357.000 0.000 1.000 N 0.096
 11273 11274 slr1449 slr1450     TRUE 0.666 38.000 0.000 NA   0.450
 11275 11276 sll1350 sll1349   cbbZp FALSE 0.310 31.000 0.000 NA   0.052
 11276 11277 sll1349 sll1348 cbbZp   TRUE 0.859 36.000 0.061 1.000   -0.304
 11277 11278 sll1348 sll1282   ribH FALSE 0.012 154.000 0.000 1.000 N -0.249
 11278 11279 sll1282 sll1281 ribH ycf9 TRUE 0.855 105.000 0.037 1.000   0.804
 11279 397201 sll1281 6803t12 ycf9 tRNA-Leu FALSE 0.348 141.000 0.000 NA   NA
 397201 11280 6803t12 sll1280 tRNA-Leu   TRUE 0.921 -21.000 0.000 NA   NA
 11281 11282 slr1356 slr1357 rps1   FALSE 0.090 260.000 0.000 1.000   0.224
 11283 11284 sll1277 sll1276 recF   FALSE 0.336 42.000 0.000 1.000 N 0.164
 11284 11285 sll1276 sll1275   pykF FALSE 0.003 269.000 0.000 1.000 N -0.183
 11288 11289 slr1363 slr1364   bioB TRUE 0.522 74.000 0.000 NA   0.319
 11289 11290 slr1364 slr1365 bioB bioY TRUE 0.991 -16.000 0.016 NA   0.528
 11290 11291 slr1365 slr1366 bioY lspA TRUE 0.986 0.000 0.554 NA   0.392
 11292 11293 sll1273 sll1272     FALSE 0.247 141.000 0.000 NA   0.201
 11293 11294 sll1272 sll1271     FALSE 0.009 576.000 0.000 NA   0.057
 11294 11295 sll1271 sll1270   glnH/glnP TRUE 0.565 180.000 0.000 0.041   0.643
 11295 11296 sll1270 ssl2501 glnH/glnP   FALSE 0.004 339.000 0.000 NA   -0.247
 11297 11298 slr1367 slr1368 glgP cbiT FALSE 0.167 242.000 0.000 1.000 N 0.408
 11298 11299 slr1368 slr1369 cbiT cdsA TRUE 0.641 134.000 0.012 1.000 N -0.160
 11300 11301 sll1268 sll1267     FALSE 0.010 261.000 0.000 NA   -0.196
 11301 11302 sll1267 sll1265     FALSE 0.060 40.000 0.000 NA   -0.264
 11302 11303 sll1265 sll0877     FALSE 0.096 306.000 0.000 NA   0.398
 11305 11306 sll0876 sll0875 ruvA   TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   0.106
 11307 11308 slr0876 ssr1480     FALSE 0.056 229.000 0.000 1.000   -0.001
 11308 11309 ssr1480 slr0877     FALSE 0.326 128.000 0.000 1.000   0.316
 11309 11310 slr0877 slr0878     FALSE 0.048 208.000 0.000 1.000 N 0.035
 11310 11311 slr0878 slr0879   gcvH FALSE 0.013 98.000 0.000 1.000 N -0.166
 11311 11312 slr0879 slr0880 gcvH   FALSE 0.116 94.000 0.000 1.000 N 0.049
 11313 11314 sll0873 ssl1633 napC   FALSE 0.189 143.000 0.000 1.000   0.093
 11317 11318 slr0882 slr0883   psr FALSE 0.052 497.000 0.000 NA   0.549
 11320 11321 slr0884 slr0885 gap1   FALSE 0.007 624.000 0.000 1.000   -0.017
 11322 11323 sll0869 sll0868 aat lipA FALSE 0.264 55.000 0.000 1.000 N 0.071
 11323 11324 sll0868 sll0867 lipA   FALSE 0.458 106.000 0.000 1.000   0.505
 11325 11326 slr0886 slr0887 fabG   TRUE 0.640 0.000 0.000 1.000 N 0.118
 11326 11327 slr0887 slr0888     FALSE 0.060 229.000 0.000 NA   0.051
 11327 11328 slr0888 slr0889     FALSE 0.260 21.000 0.000 NA   -0.079
 11328 11329 slr0889 ssr1499     FALSE 0.277 151.000 0.000 NA   0.262
 11329 11330 ssr1499 slr0890     TRUE 0.526 77.000 0.000 NA   0.344
 11333 11334 sll0864 sll0863     FALSE 0.194 181.000 0.000 NA   0.200
 11334 11335 sll0863 sll0862     TRUE 0.547 14.000 0.000 NA   0.127
 11335 11336 sll0862 sll0861     TRUE 0.957 54.000 0.237 1.000   0.526
 11336 11337 sll0861 sll0860     TRUE 0.881 158.000 0.634 NA   0.693
 11337 11338 sll0860 sll1317   petA TRUE 0.709 70.000 0.000 NA   0.778
 11338 11339 sll1317 sll1316 petA petC TRUE 0.913 113.000 0.881 0.052   0.870
 11339 11340 sll1316 ssl2598 petC psbH FALSE 0.197 289.000 0.000 0.094   0.447
 11342 11343 ssl2595 sll1315     FALSE 0.167 182.000 0.000 NA   0.161
 11343 11344 sll1315 sll1314   dctP TRUE 0.684 59.000 0.000 NA   0.432
 11347 11348 slr1406 slr1407     FALSE 0.448 107.000 0.000 NA   0.519
 11348 11349 slr1407 slr1409     TRUE 0.621 80.000 0.000 NA   0.529
 11349 11350 slr1409 slr1410     TRUE 0.771 15.000 0.000 NA   0.386
 11351 11352 sll1307 sll1306     TRUE 0.727 62.000 0.000 NA   0.764
 11352 11353 sll1306 sll1305     TRUE 0.900 4.000 0.000 1.000   0.930
 11353 11354 sll1305 sll1304     TRUE 0.802 21.000 0.000 NA   0.870
 11354 11355 sll1304 sll1785     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   0.763
 11355 11356 sll1785 sll1784     FALSE 0.285 225.000 0.000 NA   0.908
 11356 11357 sll1784 sll1783     TRUE 0.753 27.000 0.000 NA   0.887
 11358 11359 slr1852 slr1853     TRUE 0.851 12.000 0.000 NA   0.718
 11359 11360 slr1853 slr1854     TRUE 0.708 70.000 0.000 NA   0.861
 11360 11361 slr1854 slr1855     TRUE 0.940 33.000 0.031 NA   0.904
 11361 11362 slr1855 slr1856     TRUE 0.978 6.000 0.031 1.000 N 0.679
 11362 11363 slr1856 slr1857   glgX TRUE 0.979 10.000 0.462 1.000 N 0.558
 11363 11364 slr1857 slr1859 glgX   TRUE 0.950 60.000 0.154 1.000 N 0.665
 11364 11365 slr1859 slr1860   ICFG TRUE 0.677 100.000 0.000 1.000 Y 0.761
 11365 11366 slr1860 slr1861 ICFG   TRUE 0.932 6.000 0.000 1.000 Y 0.427
 11366 11367 slr1861 slr1862     FALSE 0.322 105.000 0.000 NA   0.337
 11369 11370 slr1863 slr1864     TRUE 0.646 14.000 0.000 NA   0.220
 11370 11371 slr1864 slr1865     FALSE 0.439 178.000 0.000 1.000   0.603
 11371 11372 slr1865 slr1866     TRUE 0.823 8.000 0.000 1.000   0.368
 11372 11373 slr1866 slr1867   trpD FALSE 0.039 400.000 0.000 1.000   0.294
 11374 11375 sll1776 sll1775 deoC   FALSE 0.476 52.000 0.000 1.000 N 0.266
 11375 11376 sll1775 sll1774     FALSE 0.001 436.000 0.000 NA   -0.527
 11377 11378 slr1869 slr1870     FALSE 0.006 830.000 0.000 NA   0.008
 11381 11382 sll1772 sll1771 mutS   FALSE 0.334 30.000 0.000 1.000 N 0.135
 11382 11383 sll1771 sll1770     TRUE 0.960 55.000 0.483 1.000   0.577
 11383 11384 sll1770 sll1769     FALSE 0.047 380.000 0.000 NA   0.343
 11384 11385 sll1769 ssl3383     TRUE 0.585 10.000 0.000 NA   0.118
 11385 11386 ssl3383 ssl3382     TRUE 0.636 46.000 0.000 NA   0.415
 11386 11387 ssl3382 sll1768     FALSE 0.015 235.000 0.000 NA   -0.182
 11388 11389 slr1874 slr1875 ddlA exoD TRUE 0.573 87.000 0.000 NA   0.553
 11393 11394 slr1877 slr1878 hpcE cpcE TRUE 0.533 53.000 0.000 1.000 N 0.323
 11395 11396 sll1766 sll1765 aslB   TRUE 0.690 40.000 0.000 NA   0.544
 11396 11397 sll1765 sll1764     TRUE 0.609 84.000 0.000 NA   0.822
 11397 11398 sll1764 sll1763     TRUE 0.710 67.000 0.000 NA   0.590
 11398 11399 sll1763 sll1762     FALSE 0.237 109.000 0.000 NA   0.215
 11401 11402 sll1761 sll1760   thrB TRUE 0.535 13.000 0.000 NA N 0.187
 11405 11406 ssr3184 slr1881   livF TRUE 0.782 107.000 0.114 1.000 N 0.244
 11406 11407 slr1881 slr1882 livF   FALSE 0.457 149.000 0.000 1.000 N 0.693
 11411 11412 slr1884 ssr3189 trpS   FALSE 0.013 151.000 0.000 NA   -0.355
 11412 11413 ssr3189 slr1885     FALSE 0.333 126.000 0.000 NA   0.344
 11413 11414 slr1885 slr1886     TRUE 0.918 86.000 0.149 NA   0.810
 11416 11417 slr1887 slr1888 hemC   FALSE 0.012 130.000 0.000 1.000 N -0.416
 11417 11418 slr1888 slr2132   pta FALSE 0.039 266.000 0.000 1.000   0.022
 11419 11420 sll2015 sll2014   sfsA TRUE 0.610 62.000 0.000 NA   0.358
 11420 11421 sll2014 sll2013 sfsA   TRUE 0.737 54.000 0.000 NA   0.705
 11421 11422 sll2013 sll2012   rpoD FALSE 0.465 160.000 0.000 NA   0.872
 11422 11423 sll2012 sll2011 rpoD   FALSE 0.003 386.000 0.000 1.000 N -0.090
 11423 11424 sll2011 sll2010   murD FALSE 0.069 154.000 0.000 1.000 N 0.006
 11424 11425 sll2010 sll2009 murD   FALSE 0.036 181.000 0.000 1.000   -0.272
 11425 11426 sll2009 sll2008     TRUE 0.989 9.000 0.259 0.009   0.719
 11427 11428 slr2135 slr2136 hupE gcpE TRUE 0.534 56.000 0.000 NA N 0.336
 11429 11430 sll2007 sll2006     TRUE 0.992 -7.000 0.200 NA   0.498
 11430 11431 sll2006 sll2005   gyrB FALSE 0.248 149.000 0.000 NA   0.216
 11431 11432 sll2005 ssl3829 gyrB   TRUE 0.819 129.000 0.002 NA   0.507
 11432 11433 ssl3829 sml0007   ycf32 FALSE 0.074 239.000 0.000 NA   0.138
 11438 11439 slr2144 slr1803   mbpA FALSE 0.428 39.000 0.000 NA   0.191
 11440 11441 sll1710 sll1709   gdh FALSE 0.189 79.000 0.000 1.000 N 0.070
 11441 11442 sll1709 ssl3291 gdh   FALSE 0.475 126.000 0.000 NA   0.641
 11442 11443 ssl3291 sll1708     FALSE 0.108 50.000 0.000 NA   -0.171
 11445 11446 sll1704 sll1703 csgA sppA FALSE 0.468 24.000 0.000 1.000   0.112
 11446 11447 sll1703 sll1702 sppA   TRUE 0.684 -3.000 0.000 NA   0.043
 11448 11449 slr1807 slr1808   hemA FALSE 0.027 134.000 0.000 1.000   -0.459
 11449 11450 slr1808 slr1809 hemA   FALSE 0.037 162.000 0.000 1.000   -0.299
 11451 11452 sll1699 sll1698     TRUE 0.989 -31.000 0.063 NA   0.186
 11452 11453 sll1698 sll1697     FALSE 0.143 277.000 0.000 NA   0.459
 11454 11455 slr1811 slr1812     TRUE 0.873 123.000 1.000 NA   0.676
 11455 11456 slr1812 slr1813     TRUE 0.685 75.000 0.000 NA   0.683
 11456 11457 slr1813 slr1814     FALSE 0.475 123.000 0.000 NA   0.889
 11457 11458 slr1814 slr1815     TRUE 0.499 141.000 0.000 NA   0.676
 11458 11459 slr1815 slr1816     TRUE 0.653 42.000 0.000 NA   0.433
 11460 11461 sll1696 sll1695   hofG TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   0.647
 11461 11462 sll1695 sll1694 hofG hofG TRUE 0.668 99.000 0.000 NA Y 0.577
 11462 11463 sll1694 sll1693 hofG   FALSE 0.423 144.000 0.000 1.000 N 0.467
 11465 11466 sll1692 sll1691     TRUE 0.946 -7.000 0.000 NA   0.697
 11468 11469 sll1689 sll1688 rpoD thrC FALSE 0.011 515.000 0.000 1.000 N 0.144
 11472 11473 slr1821 slr1822   nth TRUE 0.976 -7.000 0.018 1.000 N 0.039
 11473 11474 slr1822 slr1732 nth   FALSE 0.022 594.000 0.000 NA   0.308
 11475 11476 sll1631 sll1630     FALSE 0.472 40.000 0.000 NA   0.238
 11476 11477 sll1630 sll1629   phr FALSE 0.304 10.000 0.000 NA   -0.114
 11477 11478 sll1629 sll1628 phr   FALSE 0.162 270.000 0.000 1.000   0.462
 11479 11480 slr1734 slr1735 opcA   TRUE 0.634 58.000 0.000 1.000 N 0.403
 11481 11482 sll1626 sll1625 lexA sdhB FALSE 0.149 216.000 0.000 1.000 N 0.303
 11482 11483 sll1625 sll1624 sdhB   FALSE 0.035 294.000 0.000 1.000 N 0.162
 11483 11484 sll1624 sll1623     TRUE 0.550 13.000 0.000 1.000 N 0.172
 11485 11486 slr1736 slr1737     TRUE 0.885 59.000 0.069 NA   -0.045
 11490 11491 slr1739 slr1740     FALSE 0.296 119.000 0.000 1.000   0.272
 397200 11492 6803t13 sll1618 tRNA-Asp   FALSE 0.332 152.000 0.000 NA   NA
 11493 11494 slr1742 slr1743   ndh FALSE 0.198 50.000 0.000 1.000   -0.106
 11494 11495 slr1743 slr1744 ndh amiA FALSE 0.002 285.000 0.000 1.000 N -0.251
 11495 11496 slr1744 slr1746 amiA murI TRUE 0.863 144.000 0.011 1.000 Y 0.293
 11496 11497 slr1746 slr1747 murI   FALSE 0.006 210.000 0.000 1.000 N -0.148
 11497 11498 slr1747 slr0851   ndh FALSE 0.125 319.000 0.000 0.051 N 0.378
 11498 11499 slr0851 slr0852 ndh   FALSE 0.310 91.000 0.000 NA   0.218
 11499 11500 slr0852 slr0853   rimI TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   0.830
 11500 11501 slr0853 slr0854 rimI phr TRUE 0.760 25.000 0.000 1.000   0.501
 11502 11503 sll0858 sll0857     TRUE 0.960 -30.000 0.000 NA   0.844
 11503 11504 sll0857 sll0856   rpoE TRUE 0.996 -58.000 0.409 NA   0.798
 11504 11505 sll0856 sll0855 rpoE   FALSE 0.011 163.000 0.000 1.000 N -0.197
 11505 11506 sll0855 sll0854     TRUE 0.613 10.000 0.000 NA   0.145
 11506 11507 sll0854 sll0853     TRUE 0.570 51.000 0.000 NA   0.331
 11508 11509 slr0856 slr0857     TRUE 0.942 -6.000 0.000 NA   0.829
 11510 11511 sll0851 sll0849 psbC psbD TRUE 0.997 -52.000 0.878 0.003   0.803
 11511 11512 sll0849 sll0848 psbD dnaA FALSE 0.020 338.000 0.000 1.000   0.017
 11512 11513 sll0848 sll0847 dnaA   FALSE 0.074 55.000 0.000 NA   -0.256
 11516 11517 slr0862 slr0863 lmbP   FALSE 0.105 88.000 0.000 NA   -0.083
 11518 11519 sll0844 sll0843     TRUE 0.494 114.000 0.000 1.000   0.792
 11519 11520 sll0843 sll0842   nplT TRUE 0.876 9.000 0.000 1.000   0.783
 11521 11522 slr0864 slr0865     FALSE 0.477 101.000 0.000 NA   0.600
 11523 11524 sll0839 sll0838   pyrF TRUE 0.992 -21.000 0.017 NA   0.521
 11524 11525 sll0838 sll0837 pyrF   TRUE 0.638 47.000 0.000 1.000 N 0.470
 11526 11527 slr0867 slr0868     FALSE 0.095 249.000 0.000 NA   0.238
 11527 11528 slr0868 slr0869     FALSE 0.015 360.000 0.000 1.000   -0.011
 11528 11529 slr0869 slr0870     TRUE 0.914 89.000 0.267 NA   0.558
 11529 11530 slr0870 slr0871     TRUE 0.761 25.000 0.000 NA   0.554
 11530 11531 slr0871 slr0872     FALSE 0.003 742.000 0.000 NA   -0.101
 11534 11535 sll1164 sll1163     TRUE 0.733 4.000 0.000 NA   0.197
 11535 11536 sll1163 sll1162     TRUE 0.900 -37.000 0.000 NA   0.225
 11536 11537 sll1162 sll1161     FALSE 0.372 91.000 0.000 NA   0.301
 11537 11538 sll1161 sll1160     FALSE 0.268 196.000 0.000 NA   0.357
 11538 11539 sll1160 sll1159     TRUE 0.712 35.000 0.000 NA   0.759
 11539 11540 sll1159 sll1158     TRUE 0.640 80.000 0.000 NA   0.678
 11541 11542 slr1245 ssr2078     TRUE 0.538 88.000 0.000 NA N 0.733
 11542 11543 ssr2078 slr1246     TRUE 0.657 128.000 0.000 NA Y 0.652
 11544 11545 sll1157 sll1156     TRUE 0.991 -111.000 0.000 0.015 Y 0.696
 11545 11546 sll1156 sll1155     TRUE 0.513 94.000 0.000 NA   0.500
 11546 11547 sll1155 sll1154   norA FALSE 0.431 121.000 0.000 NA   0.453
 11548 11549 slr1247 slr1248 pstS pstC TRUE 0.959 146.000 0.538 0.003 Y 0.670
 11549 11550 slr1248 slr1249 pstC pstA TRUE 0.994 5.000 1.000 0.003 Y 0.582
 11550 11551 slr1249 slr1250 pstA pstB TRUE 0.984 54.000 0.500 0.003 Y 0.505
 11551 11552 slr1250 slr1251 pstB cyp FALSE 0.063 181.000 0.000 1.000 N 0.021
 11553 11554 ssl2296 sll1151 dcoH   FALSE 0.387 32.000 0.000 NA   0.134
 11557 11558 slr1253 slr1254   pds FALSE 0.063 294.000 0.000 NA   0.256
 11558 11559 slr1254 slr1255 pds pys TRUE 0.924 61.000 0.691 1.000   0.169
 11561 397172 slr1256 6803t14 ureA tRNA-Glu FALSE 0.326 156.000 0.000 NA   NA
 397172 11562 6803t14 slr1257 tRNA-Glu   FALSE 0.189 220.000 0.000 NA   NA
 11562 11563 slr1257 slr1258     FALSE 0.125 197.000 0.000 NA   0.127
 11563 11564 slr1258 slr1259     FALSE 0.419 131.000 0.000 NA   0.415
 11564 11565 slr1259 slr1260     TRUE 0.947 56.000 0.037 NA   0.642
 11565 11566 slr1260 slr1261     TRUE 0.941 64.000 0.028 NA   0.656
 11566 11567 slr1261 slr1262     TRUE 0.981 6.000 0.083 NA   0.538
 11567 11568 slr1262 slr1263     FALSE 0.051 196.000 0.000 NA   -0.082
 11569 11570 sll1961 sll1960     FALSE 0.208 81.000 0.000 NA   0.034
 11570 11571 sll1960 sll1959   suhB FALSE 0.452 35.000 0.000 NA   0.207
 11571 11572 sll1959 sll1958 suhB hisC TRUE 0.965 5.000 0.015 1.000 N 0.315
 11572 11573 sll1958 sll1957 hisC arsA FALSE 0.027 139.000 0.000 1.000 N -0.095
 11574 11575 slr2057 slr2058 apqZ topA FALSE 0.019 460.000 0.000 1.000 N 0.236
 11575 11576 slr2058 slr2059 topA   FALSE 0.138 21.000 0.000 1.000 N -0.068
 11576 11577 slr2059 slr2060     FALSE 0.456 37.000 0.000 1.000   0.191
 11578 11579 sll1956 sll1954     FALSE 0.042 333.000 0.000 NA   0.214
 11579 11580 sll1954 ssl3692     TRUE 0.515 39.000 0.000 NA   0.286
 11582 11583 sll1951 sll1950     FALSE 0.035 545.000 0.000 NA   0.389
 11583 11584 sll1950 sll1949     FALSE 0.066 399.000 0.000 NA   0.463
 11585 11586 slr2067 slr1986 apcA apcB TRUE 0.935 96.000 0.906 0.003   0.901
 11586 11587 slr1986 ssr3383 apcB apcC TRUE 0.867 213.000 0.531 0.006   0.897
 11588 11589 sll1909 sll1908 prmA serA TRUE 0.923 78.000 0.053 1.000 N 0.845
 11590 11591 slr1990 slr1991   cyaA TRUE 0.932 22.000 0.195 NA   0.066
 11591 11592 slr1991 slr1992 cyaA   FALSE 0.101 41.000 0.000 1.000 N -0.055
 11592 11593 slr1992 slr1993   thl FALSE 0.053 210.000 0.000 1.000 N 0.053
 11593 11594 slr1993 slr1994 thl fabG TRUE 0.904 102.000 0.071 1.000 Y 0.404
 11595 11596 sll1906 sll1905     FALSE 0.079 61.000 0.000 NA   -0.241
 11597 11598 slr1998 slr1999     TRUE 0.647 33.000 0.000 NA   0.403
 11598 11599 slr1999 slr2000     TRUE 0.688 39.000 0.000 NA   0.530
 11599 11600 slr2000 slr2001     FALSE 0.028 258.000 0.000 NA   -0.030
 11600 11601 slr2001 slr2002     TRUE 0.880 148.000 0.588 1.000 N 0.607
 11601 11602 slr2002 slr2003     TRUE 0.717 33.000 0.000 NA   0.699
 11604 11605 ssr3402 slr2004     TRUE 0.569 68.000 0.000 NA   0.337
 11605 11606 slr2004 slr1712     FALSE 0.009 248.000 0.000 NA   -0.245
 11607 11608 sll1615 sll1614 thdF pma1 FALSE 0.247 90.000 0.000 1.000   0.110
 11608 11609 sll1614 sll1613 pma1   FALSE 0.083 199.000 0.000 NA   0.034
 11609 11610 sll1613 sll1612   folC FALSE 0.076 249.000 0.000 NA   0.173
 11610 11611 sll1612 sll1611 folC   TRUE 0.514 35.000 0.000 1.000 N 0.330
 11612 11613 slr1715 slr1716     TRUE 0.945 -6.000 0.000 1.000   0.948
 11614 11615 sll1609 sll1608     FALSE 0.039 95.000 0.000 NA   -0.232
 11617 11618 sll1606 sll1605   fabZ TRUE 0.641 46.000 0.000 NA   0.422
 11619 11620 slr1718 slr1719   drgA TRUE 0.623 79.000 0.000 1.000 N 0.737
 11620 11621 slr1719 slr1720 drgA aspS FALSE 0.458 130.000 0.000 1.000 N 0.736
 11621 11622 slr1720 slr1721 aspS   TRUE 0.762 26.000 0.000 NA   0.675
 11622 11623 slr1721 slr1722   guaB FALSE 0.445 103.000 0.000 NA   0.495
 11623 11624 slr1722 slr1723 guaB lacG FALSE 0.288 127.000 0.000 1.000 N 0.333
 11627 11628 ssl3127 sll1600   mntB FALSE 0.057 286.000 0.000 0.039   -0.253
 11628 11629 sll1600 sll1599 mntB mntA TRUE 0.995 -3.000 0.857 1.000 Y 0.647
 11629 11630 sll1599 sll1598 mntA mntC TRUE 0.932 99.000 0.894 1.000 Y 0.668
 11632 11633 sll1596 sll1595     TRUE 0.939 21.000 0.676 1.000   0.014
 11637 11638 sll1592 sll1590     TRUE 0.715 271.000 0.889 1.000 Y 0.430
 11639 11640 slr1728 slr1729 kdpA kdpB TRUE 0.985 57.000 0.556 0.001 Y 0.573
 11640 11641 slr1729 ssr2912 kdpB   TRUE 0.906 29.000 0.030 NA   0.205
 11641 11642 ssr2912 slr1730   kdpC TRUE 0.712 190.000 0.014 NA   0.313
 11642 11643 slr1730 slr1731 kdpC kdpD TRUE 0.738 232.000 0.066 0.090   0.379
 11644 11645 sll1586 sll0254     FALSE 0.028 270.000 0.000 NA   0.002
 11645 11646 sll0254 sll0253     FALSE 0.126 106.000 0.000 NA   0.043
 11648 11649 ssl0467 sll0252     FALSE 0.126 96.000 0.000 NA   -0.001
 11650 11651 slr0261 slr0262 ndhH   TRUE 0.696 43.000 0.000 NA   0.605
 11651 11652 slr0262 slr0263     TRUE 0.621 51.000 0.000 NA   0.371
 11652 11653 slr0263 slr0264     FALSE 0.174 39.000 0.000 NA   -0.076
 11653 11654 slr0264 slr0265     FALSE 0.442 100.000 0.000 NA   0.448
 11655 11656 sll0250 ssl0461 dfp   TRUE 0.965 13.000 0.030 NA   0.405
 11656 11657 ssl0461 sll0249     TRUE 0.637 67.000 0.000 NA   0.391
 11657 11658 sll0249 sll0248   isiB TRUE 0.734 235.000 0.235 NA   0.763
 11658 11659 sll0248 sll0247 isiB isiA FALSE 0.397 405.000 0.214 1.000   0.841
 11661 11662 sll0245 sll0244   galE FALSE 0.015 110.000 0.000 1.000 N -0.122
 11663 11664 slr0269 slr0270     TRUE 0.562 91.000 0.000 NA   0.692
 11665 11666 ssl0453 ssl0452 nblA nblA TRUE 0.919 87.000 0.800 NA   0.619
 11667 11668 slr0271 slr0272     FALSE 0.480 119.000 0.000 NA   0.783
 11668 11669 slr0272 slr0273     TRUE 0.703 42.000 0.000 NA   0.731
 11670 11671 sll0243 sll0242     TRUE 0.722 51.000 0.000 NA   0.747
 11671 11672 sll0242 sll0241     TRUE 0.898 3.000 0.000 NA   0.584
 11672 11673 sll0241 sll0240     TRUE 0.833 15.000 0.000 NA   0.699
 11673 11674 sll0240 sll0238     TRUE 0.980 -13.000 0.049 1.000 N -0.019
 11674 11675 sll0238 sll0237     TRUE 0.992 0.000 0.500 0.026 Y 0.180
 11675 11676 sll0237 ssl0438     FALSE 0.206 75.000 0.000 1.000 N 0.060
 11676 11677 ssl0438 sll0236     FALSE 0.132 194.000 0.000 1.000 N 0.183
 11678 11679 slr2079 ssr3532     FALSE 0.071 105.000 0.000 NA   -0.082
 11679 11680 ssr3532 slr2080     TRUE 0.873 -13.000 0.000 NA   0.217
 11680 11681 slr2080 slr2081   tyrA TRUE 0.541 80.000 0.000 1.000 N 0.417
 11681 11682 slr2081 slr2082 tyrA ctaD FALSE 0.227 134.000 0.000 0.050 N -0.083
 11682 11683 slr2082 slr2083 ctaD ctaE TRUE 0.982 57.000 0.500 0.002 Y 0.397
 11683 11684 slr2083 slr2084 ctaE   FALSE 0.046 99.000 0.000 1.000   -0.280
 11685 11686 sll1988 sll1987   katG TRUE 0.660 49.000 0.000 1.000 N 0.516
 11687 11688 slr2087 slr2088 ycf44 ilvG FALSE 0.034 315.000 0.000 NA N 0.212
 11688 11689 slr2088 slr2089 ilvG shc FALSE 0.006 214.000 0.000 1.000 N -0.225
 11689 397173 slr2089 6803t15 shc tRNA-Pro FALSE 0.414 90.000 0.000 NA   NA
 11690 11691 sll1985 sll1984     TRUE 0.977 -31.000 0.000 0.027   0.574
 11691 11692 sll1984 sll1983     TRUE 0.945 -6.000 0.000 1.000   0.895
 11692 11693 sll1983 sll1982     FALSE 0.155 285.000 0.000 NA   0.805
 11695 11696 sll1981 ssl3769 ilvB   FALSE 0.135 300.000 0.000 NA   0.578
 11696 11697 ssl3769 sll1980   trxA FALSE 0.007 418.000 0.000 NA   -0.056
 11697 11698 sll1980 sll1979 trxA   FALSE 0.141 111.000 0.000 1.000   0.032
 11699 11700 slr2094 slr2095 glpX   FALSE 0.003 269.000 0.000 1.000 N -0.615
 11700 11701 slr2095 slr2096     TRUE 0.991 -111.000 0.000 0.015 Y 0.898
 11701 11702 slr2096 slr2097   glbN TRUE 0.695 45.000 0.000 1.000   0.539
 11702 11703 slr2097 slr2098 glbN   FALSE 0.090 273.000 0.000 1.000   0.282
 11703 11704 slr2098 slr2099     TRUE 0.801 90.000 0.000 0.016 Y 0.436
 11704 11705 slr2099 slr2100     FALSE 0.326 227.000 0.000 0.023 Y -0.016
 11705 11706 slr2100 slr2101     FALSE 0.164 165.000 0.000 NA   0.130
 11706 11707 slr2101 slr2102   ftsY FALSE 0.109 190.000 0.000 NA   0.066
 11707 11708 slr2102 slr2103 ftsY   TRUE 0.511 8.000 0.000 NA N 0.132
 11708 11709 slr2103 slr2104     FALSE 0.014 234.000 0.000 NA N -0.022
 11712 11713 sll1430 sll1429 apt   FALSE 0.001 381.000 0.000 1.000 N -0.273
 11713 11714 sll1429 ssl2789     TRUE 0.674 48.000 0.000 0.076   0.272
 11714 11715 ssl2789 sll1428     FALSE 0.095 131.000 0.000 1.000   -0.084
 11717 11718 sll1427 sll1426 hhoB   TRUE 0.480 114.000 0.000 NA   0.749
 11718 11719 sll1426 sll1425   proS FALSE 0.290 126.000 0.000 NA   0.291
 11721 11722 sll1424 sll1423   ntcA TRUE 0.956 10.000 0.612 NA   -0.030
 11722 11723 sll1423 ssl2781 ntcA   TRUE 0.632 73.000 0.000 NA   0.411
 11724 11725 slr1506 slr1507     FALSE 0.045 554.000 0.000 NA   0.528
 11725 11726 slr1507 slr1508     FALSE 0.465 119.000 0.000 1.000   0.506
 11726 11727 slr1508 slr1509   ntpJ TRUE 0.988 -3.000 0.059 1.000 N 0.608
 11727 11728 slr1509 slr1510 ntpJ plsX FALSE 0.089 176.000 0.000 1.000 N 0.071
 11728 11729 slr1510 slr1511 plsX fabH TRUE 0.944 95.000 0.380 0.004 Y 0.256
 11731 11732 slr1512 slr1513     TRUE 0.925 86.000 0.444 NA   0.916
 11733 11734 sll1415 sll1414     TRUE 0.684 32.000 0.000 NA   0.457
 11735 11736 ssr2549 slr1515     FALSE 0.012 400.000 0.000 NA   0.023
 11736 11737 slr1515 ssr2551     FALSE 0.277 74.000 0.000 NA   0.053
 11737 11738 ssr2551 slr1516   sodB FALSE 0.016 708.000 0.000 NA   0.230
 11738 11739 slr1516 slr1517 sodB leuB FALSE 0.009 280.000 0.000 1.000 N -0.056
 11739 11740 slr1517 ssr2554 leuB   TRUE 0.548 219.000 0.037 NA   0.032
 11740 11741 ssr2554 slr1518   menA TRUE 0.786 21.000 0.000 NA   0.517
 11741 11742 slr1518 slr1519 menA hglK TRUE 0.754 -22.000 0.000 NA   0.011
 11742 11743 slr1519 slr1520 hglK   FALSE 0.280 110.000 0.000 NA   0.278
 11743 11744 slr1520 slr1521   hflX FALSE 0.365 168.000 0.000 1.000   0.383
 11744 11745 slr1521 slr1522 hflX   FALSE 0.417 171.000 0.000 1.000   0.473
 11745 11746 slr1522 slr1523     FALSE 0.320 221.000 0.000 0.075 Y -0.058
 11746 11747 slr1523 slr1524     FALSE 0.043 376.000 0.000 0.075   0.036
 11748 11749 sll1411 ssl2749     TRUE 0.988 -7.000 0.522 NA   0.184
 11749 11750 ssl2749 sll2001   lap FALSE 0.408 31.000 0.000 1.000   0.121
 1730144 11751 6803t16 ssr3570     FALSE 0.228 203.000 0.000 NA   NA
 11751 11752 ssr3570 ssr3571     TRUE 0.724 54.000 0.000 NA   0.548
 11752 11753 ssr3571 slr2107   kpsM FALSE 0.006 434.000 0.000 NA N 0.049
 11753 11754 slr2107 slr2108 kpsM kpsT TRUE 0.887 97.000 0.625 NA Y 0.134
 11755 11756 sll1999 sll1998     TRUE 0.787 75.000 0.000 0.075   0.757
 11756 11757 sll1998 sll1997     TRUE 0.736 57.000 0.000 NA   0.733
 11758 11759 slr2110 slr2111     TRUE 0.942 -10.000 0.000 NA   0.496
 11759 11760 slr2111 slr2112     FALSE 0.093 70.000 0.000 1.000   -0.316
 11760 11761 slr2112 slr2113     TRUE 0.945 -6.000 0.000 1.000   0.873
 11761 11762 slr2113 slr2114   spsC FALSE 0.239 -31.000 0.000 1.000 N -0.270
 11762 11763 slr2114 slr2115 spsC   TRUE 0.635 21.000 0.000 1.000   0.252
 11763 11764 slr2115 slr2116   spsA TRUE 0.916 -3.000 0.000 NA   0.438
 11764 11765 slr2116 slr2117 spsA   TRUE 0.593 26.000 0.000 NA   0.296
 11765 11766 slr2117 slr2118     FALSE 0.067 260.000 0.000 NA   0.167
 11766 11767 slr2118 slr2119     FALSE 0.443 8.000 0.000 NA   -0.025
 11767 11768 slr2119 slr2120     TRUE 0.889 48.000 0.023 NA   0.213
 11768 11769 slr2120 slr2121     TRUE 0.985 -3.000 0.023 NA   0.395
 11769 11770 slr2121 slr2122     TRUE 0.940 14.000 0.039 NA   0.105
 11770 11771 slr2122 slr2123     TRUE 0.984 -3.000 0.229 1.000 N 0.291
 11771 11772 slr2123 slr2124     TRUE 0.927 3.000 0.000 0.047 N 0.546
 11772 11773 slr2124 slr2125     TRUE 0.783 22.000 0.000 NA   0.564
 11773 11774 slr2125 slr2126     FALSE 0.059 111.000 0.000 NA   -0.114
 11774 11775 slr2126 slr2127     FALSE 0.007 697.000 0.000 NA   0.052
 11775 11776 slr2127 slr2128     FALSE 0.093 267.000 0.000 NA   0.296
 11777 11778 sll1995 sll1994   hemB TRUE 0.594 81.000 0.000 NA   0.476
 11778 1730145 sll1994 sll1994a hemB petL FALSE 0.164 231.000 0.000 NA   NA
 11779 11780 slr2130 slr2131 aroB   FALSE 0.246 138.000 0.000 1.000 N 0.256
 11781 11782 sll1241 sll1240     TRUE 0.988 2.000 0.667 NA   0.675
 11782 11783 sll1240 sll1239     TRUE 0.990 -7.000 1.000 NA   0.356
 11786 11787 slr1324 ssr2194     FALSE 0.060 279.000 0.000 NA   0.203
 11791 11792 ssr2201 slr1327     TRUE 0.993 -10.000 0.385 NA   0.424
 11793 11794 sll1233 sll1232     FALSE 0.187 99.000 0.000 NA   0.124
 11794 11795 sll1232 sll1231   mtfB FALSE 0.226 21.000 0.000 1.000   -0.174
 11795 11796 sll1231 sll1229 mtfB   FALSE 0.447 49.000 0.000 1.000 N 0.260
 11796 11797 sll1229 sll1228     TRUE 0.670 108.000 0.000 0.016 Y 0.327
 11798 11799 slr1329 slr1330 atpB atpC TRUE 0.955 148.000 0.837 0.003 Y 0.931
 11799 11800 slr1330 slr1331 atpC ymxG TRUE 0.480 160.000 0.000 1.000   0.798
 11800 11801 slr1331 slr1332 ymxG fabF FALSE 0.315 8.000 0.000 1.000   -0.197
 11802 11803 sll1226 sll1225 hoxH   FALSE 0.409 90.000 0.000 NA   0.334
 11803 11804 sll1225 ssl2420     TRUE 0.980 10.000 0.250 NA   0.533
 11804 11805 ssl2420 sll1224   hoxY FALSE 0.406 52.000 0.000 NA   0.146
 11805 11806 sll1224 sll1223 hoxY hoxU TRUE 0.965 46.000 0.404 0.010   0.442
 11806 11807 sll1223 sll1222 hoxU   TRUE 0.751 27.000 0.000 1.000   0.539
 11807 11808 sll1222 sll1221   hoxF TRUE 0.713 41.000 0.000 1.000   0.629
 11808 11809 sll1221 sll1220 hoxF   TRUE 0.979 77.000 0.667 0.006 Y 0.596
 11810 11811 ssr2227 slr1334     FALSE 0.001 858.000 0.000 NA   -0.455
 11812 11813 sll1219 sll1218   ycf39 FALSE 0.019 543.000 0.000 NA   0.226
 11813 11814 sll1218 sll1217 ycf39   FALSE 0.479 54.000 0.000 NA N 0.283
 11815 11816 ssr1375 slr0804   dacB FALSE 0.250 237.000 0.000 NA   0.703
 11816 11817 slr0804 slr0806 dacB   TRUE 0.638 27.000 0.000 1.000 N 0.382
 11818 11819 sml0008 sll0819 psaJ psaF TRUE 0.921 108.000 0.318 0.017   0.618
 11820 11821 slr0807 slr0808 gcp   FALSE 0.035 54.000 0.000 1.000 N -0.364
 11821 11822 slr0808 slr0809   rfbB FALSE 0.120 78.000 0.000 1.000 N -0.010
 11822 11823 slr0809 slr0810 rfbB   FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   0.019
 11824 11825 sll0818 ssl1520     TRUE 0.848 0.000 0.000 NA   0.334
 11825 11826 ssl1520 sll0817   miaA FALSE 0.141 68.000 0.000 NA   -0.122
 11826 11827 sll0817 sll0816 miaA   TRUE 0.860 8.000 0.000 1.000   0.457
 11827 11828 sll0816 sll0815     TRUE 0.589 56.000 0.000 1.000   0.308
 11828 11829 sll0815 sll0814     FALSE 0.037 375.000 0.000 NA   0.267
 11829 11830 sll0814 sll0813   ctaC FALSE 0.088 214.000 0.000 NA   0.095
 11831 11832 slr0812 slr0813     TRUE 0.506 45.000 0.000 1.000 N 0.335
 11834 11835 ssr1386 slr0815 ndhL   TRUE 0.955 57.000 0.925 NA   0.640
 11835 11836 slr0815 slr0816     TRUE 0.636 58.000 0.000 NA   0.371
 11837 11838 sll0811 sll0810     TRUE 0.963 22.000 0.192 0.026   0.212
 11838 11839 sll0810 sll0809     FALSE 0.184 200.000 0.000 1.000   0.220
 397175 11840 6803t17 slr0817 tRNA-Gly entC TRUE 0.574 67.000 0.000 NA   NA
 11840 11841 slr0817 slr0818 entC   FALSE 0.047 69.000 0.000 NA   -0.304
 11841 11842 slr0818 slr0819   lnt TRUE 0.663 43.000 0.000 NA   0.459
 11842 11843 slr0819 ssr1391 lnt   TRUE 0.900 -3.000 0.000 NA   0.385
 11843 11844 ssr1391 slr0820     FALSE 0.088 78.000 0.000 NA   -0.165
 11845 11846 ssl1507 sll0808     FALSE 0.426 79.000 0.000 NA   0.257
 11849 11850 slr0822 slr0823   ycf3 FALSE 0.060 109.000 0.000 1.000   -0.179
 11851 11852 sll0804 sll0803     TRUE 0.671 17.000 0.000 NA   0.278
 11852 11853 sll0803 sll0802     TRUE 0.728 31.000 0.000 NA   0.756
 11853 11854 sll0802 ssl1498     FALSE 0.089 93.000 0.000 NA   -0.090
 11854 11855 ssl1498 sll1263     FALSE 0.151 103.000 0.000 NA   0.083
 11855 11856 sll1263 sll1262     TRUE 0.917 64.000 0.006 1.000   0.376
 11856 11857 sll1262 sll1261   tsf FALSE 0.075 225.000 0.000 1.000   0.055
 11857 11858 sll1261 sll1260 tsf rps2 TRUE 0.886 154.000 0.748 1.000   0.902
 11858 397199 sll1260 6803t18 rps2 tRNA-Met FALSE 0.176 225.000 0.000 NA   NA
 11860 11861 sll1258 sll1257     FALSE 0.192 253.000 0.000 1.000 N 0.749
 11861 11862 sll1257 sll1256     TRUE 0.945 -6.000 0.000 1.000   0.919
 11863 11864 slr1338 slr1339     TRUE 0.954 -16.000 0.000 NA   0.643
 11864 11865 slr1339 slr1340     TRUE 0.560 29.000 0.000 NA   0.293
 11866 11867 sll1255 sll1254     FALSE 0.315 138.000 0.000 NA   0.300
 11868 11869 slr1342 slr1343     FALSE 0.425 161.000 0.000 NA   0.478
 11870 11871 sll1253 sll1252 pcnB   FALSE 0.377 128.000 0.000 0.016   0.084
 11873 11874 sll1251 ssl2471     FALSE 0.074 168.000 0.000 1.000   -0.104
 11874 11875 ssl2471 sll1250     TRUE 0.674 39.000 0.000 0.074   0.268
 11875 11876 sll1250 sll1249   panC/kcy TRUE 0.621 60.000 0.000 1.000   0.348
 11877 11878 slr1347 slr1348 icfA cysE FALSE 0.172 74.000 0.000 1.000 N 0.022
 11878 11879 slr1348 slr1349 cysE pgi FALSE 0.025 306.000 0.000 1.000 N 0.129
 11879 11880 slr1349 slr1350 pgi desA FALSE 0.179 215.000 0.000 1.000 N 0.347
 11883 11884 sll1245 sll1244 cytM rplI FALSE 0.102 244.000 0.000 1.000 N 0.291
 11887 11888 slr1956 slr1957     FALSE 0.018 440.000 0.000 NA   0.148
 11888 11889 slr1957 slr1958     TRUE 0.706 70.000 0.000 NA   0.646
 11890 11891 sll1900 ssl3580 act hypC TRUE 0.650 61.000 0.000 NA   0.391
 11891 11892 ssl3580 sll1899 hypC ctaB TRUE 0.705 78.000 0.000 NA Y 0.322
 11892 11893 sll1899 sll1898 ctaB   TRUE 0.922 151.000 0.090 1.000 Y 0.631
 11895 11896 sll1897 ssl3573     FALSE 0.023 461.000 0.000 NA   0.233
 11899 11900 slr1963 slr1964     TRUE 0.913 68.000 0.353 NA   0.136
 11903 11904 sll1893 sll1892 hisF   FALSE 0.285 214.000 0.000 NA   0.474
 11906 11907 sll1891 sll1890   cobN FALSE 0.065 144.000 0.000 NA   -0.113
 11908 11909 slr1969 ssr3341     FALSE 0.035 105.000 0.000 NA   -0.204
 11909 11910 ssr3341 slr1970     TRUE 0.844 186.000 0.176 NA   0.638
 11910 11911 slr1970 slr1971     FALSE 0.044 204.000 0.000 NA   -0.083
 11912 11913 sll1888 ssl3549     TRUE 0.914 87.000 0.235 NA   0.502
 11915 11916 sll1886 sll1885     FALSE 0.047 275.000 0.000 1.000   0.108
 11918 11919 sll1884 sll1883   argJ TRUE 0.505 58.000 0.000 NA   0.234
 11919 11920 sll1883 sll1882 argJ   FALSE 0.011 108.000 0.000 1.000 N -0.353
 11922 11923 sll1880 sll1879     FALSE 0.124 214.000 0.000 NA   0.184
 11923 11924 sll1879 sll1878     FALSE 0.386 86.000 0.000 1.000 N 0.329
 11925 11926 slr1977 slr1978     FALSE 0.079 70.000 0.000 1.000   -0.364
 11926 11927 slr1978 slr1979   trpE TRUE 0.995 -96.000 0.106 1.000 N 0.582
 11927 11928 slr1979 slr1980 trpE   TRUE 0.981 -57.000 0.000 1.000 Y 0.443
 11929 11930 sll1876 sll1875 hemN ho2 TRUE 0.530 261.000 0.161 1.000 N 0.302
 11930 11931 sll1875 sll1874 ho2 AT103 TRUE 0.951 65.000 0.250 1.000   0.461
 11931 11932 sll1874 sll1873 AT103   FALSE 0.013 575.000 0.000 NA   0.149
 11932 11933 sll1873 sll1872   lytR FALSE 0.114 97.000 0.000 NA   -0.013
 11933 11934 sll1872 sll1871 lytR   FALSE 0.008 198.000 0.000 NA N -0.179
 11935 11936 slr1982 slr1983     FALSE 0.277 245.000 0.000 0.022 Y -0.006
 11937 11938 sll1870 sll1869   cbaB TRUE 0.910 -3.000 0.000 1.000 Y 0.055
 11940 11941 sll1868 sll1867 dnaG psbA3 FALSE 0.100 153.000 0.000 1.000   -0.061
 11941 11942 sll1867 sll1866 psbA3   FALSE 0.024 241.000 0.000 NA   -0.093
 11942 11943 sll1866 sll1390     TRUE 0.481 52.000 0.000 NA   0.215
 11943 11944 sll1390 ssl2717     FALSE 0.212 186.000 0.000 NA   0.244
 11944 11945 ssl2717 sll1389     TRUE 0.818 18.000 0.000 NA   0.615
 11945 11946 sll1389 sll1388     TRUE 0.699 46.000 0.000 NA   0.853
 11946 397198 sll1388 6803t19   tRNA-Arg FALSE 0.152 236.000 0.000 NA   NA
 11948 11949 sll1387 sll1386     FALSE 0.289 221.000 0.000 NA   0.558
 11950 11951 slr1467 slr1468     FALSE 0.319 33.000 0.000 NA   0.072
 11951 11952 slr1468 smr0011   rpl34 FALSE 0.399 56.000 0.000 NA   0.129
 11952 11953 smr0011 slr1469 rpl34 rnpA TRUE 0.981 10.000 0.787 1.000   0.789
 11953 11954 slr1469 slr1470 rnpA   TRUE 0.993 -28.000 0.041 NA   0.619
 11954 11955 slr1470 slr1471     TRUE 0.843 101.000 0.043 NA   0.455
 11955 11956 slr1471 slr1472     TRUE 0.909 90.000 0.254 1.000   0.461
 11957 11958 sll1384 sll1383   suhB TRUE 0.819 131.000 0.003 1.000 N 0.583
 11958 11959 sll1383 sll1382 suhB petF TRUE 0.936 70.000 0.042 1.000 N 0.847
 397176 11960 6803t20 slr1474 tRNA-Ser   FALSE 0.100 273.000 0.000 NA   NA
 11961 11962 sll1381 sll1380     TRUE 0.676 66.000 0.000 NA   0.445
 397197 11964 6803t21 sll1378 tRNA-Ser   FALSE 0.339 147.000 0.000 NA   NA
 11964 11965 sll1378 sll1377     TRUE 0.502 42.000 0.000 NA   0.277
 11967 11968 sll1376 sll1374   melB FALSE 0.003 565.000 0.000 1.000   -0.214
 11968 11969 sll1374 sll1373 melB   FALSE 0.040 293.000 0.000 NA   0.132
 11969 11970 sll1373 sll1372     FALSE 0.075 76.000 0.000 NA   -0.212
 11970 11971 sll1372 sll1371     TRUE 0.838 131.000 0.083 NA   0.373
 11971 11972 sll1371 sll1370   rfbM FALSE 0.001 529.000 0.000 1.000 N -0.113
 11972 11973 sll1370 sll1369 rfbM   TRUE 0.736 51.000 0.000 1.000 Y 0.227
 11973 11974 sll1369 sll1182   petC FALSE 0.444 60.000 0.000 1.000 N 0.229
 11974 11975 sll1182 sll1181 petC hlyD FALSE 0.272 97.000 0.000 0.086 N 0.016
 11975 11976 sll1181 sll1180 hlyD hlyB TRUE 0.698 157.000 0.000 0.005 Y 0.352
 11979 11980 slr1266 slr1267   mrdB TRUE 0.785 5.000 0.000 NA   0.295
 11980 11981 slr1267 slr1269 mrdB ggt FALSE 0.442 26.000 0.000 1.000 N 0.190
 11981 11982 slr1269 slr1270 ggt   TRUE 0.882 97.000 0.333 1.000 N 0.478
 11982 11983 slr1270 slr1271   rffM TRUE 0.568 198.000 0.000 1.000 Y 0.761
 11983 11984 slr1271 slr1272 rffM   FALSE 0.188 252.000 0.000 NA   0.477
 11984 11985 slr1272 slr1273     TRUE 0.733 30.000 0.000 NA   0.803
 11985 11986 slr1273 slr1274   pilM FALSE 0.415 185.000 0.000 NA   0.663
 11986 11987 slr1274 slr1275 pilM   TRUE 0.953 82.000 0.087 NA Y 0.742
 11987 11988 slr1275 slr1276     TRUE 0.951 40.000 0.760 NA   0.756
 11988 11989 slr1276 slr1277   gspD TRUE 0.932 81.000 0.240 NA   0.771
 11990 11991 sll1174 sll1173     TRUE 0.756 20.000 0.000 NA   0.407
 11994 11995 slr1279 slr1280 ndhC ndhK TRUE 0.982 72.000 0.428 0.003 Y 0.825
 11995 11996 slr1280 slr1281 ndhK ndhJ TRUE 0.998 -7.000 0.406 0.003 Y 0.910
 11996 11997 slr1281 slr1282 ndhJ   FALSE 0.082 367.000 0.000 1.000   0.467
 11997 11998 slr1282 slr1283     TRUE 0.832 15.000 0.000 NA   0.666
 11999 12000 sll1170 sll1169     FALSE 0.240 301.000 0.000 NA Y 0.556
 12003 12004 ssr2130 slr1287     TRUE 0.645 209.000 0.250 NA   0.034
 12004 12005 slr1287 slr1288     TRUE 0.976 7.000 0.292 NA   0.331
 12006 12007 sll1166 sll1447     FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   0.040
 12007 12008 sll1447 sll1446     TRUE 0.628 0.000 0.000 NA   0.038
 12008 12009 sll1446 sll1444   leuD FALSE 0.158 132.000 0.000 NA   0.081
 12009 12010 sll1444 sll1443 leuD pyrG TRUE 0.917 -13.000 0.000 1.000 N 0.377
 12010 12011 sll1443 sll1442 pyrG   FALSE 0.005 359.000 0.000 NA   -0.170
 12013 12014 sll1441 sll1440 desB pdxH FALSE 0.100 270.000 0.000 1.000 N 0.361
 12018 12019 sll1437 sll1436     TRUE 0.945 -6.000 0.000 1.000   0.813
 12019 12020 sll1436 sll1435   pet112 FALSE 0.138 205.000 0.000 1.000   0.155
 12020 12021 sll1435 sll1434 pet112 mrcA FALSE 0.233 29.000 0.000 1.000 N 0.045
 12021 12022 sll1434 sll1433 mrcA   FALSE 0.142 193.000 0.000 NA N 0.222
 12022 12023 sll1433 sll1432   hypB TRUE 0.712 20.000 0.000 NA N 0.401
 12024 12025 slr1533 slr1534     FALSE 0.206 39.000 0.000 NA   -0.034
 12025 12026 slr1534 slr1152     FALSE 0.004 404.000 0.000 NA   -0.153
 12027 12028 ssl2162 sll1104   glnH FALSE 0.164 111.000 0.000 NA   0.109
 12028 12029 sll1104 sll1103 glnH   TRUE 0.854 -10.000 0.000 1.000 N 0.247
 12029 12030 sll1103 sll1102     TRUE 0.993 0.000 0.202 NA Y 0.549
 12030 12031 sll1102 sll1101   rps10 FALSE 0.102 166.000 0.000 NA N 0.121
 12031 12032 sll1101 sll1099 rps10 tufA TRUE 0.936 139.000 0.318 1.000 Y 0.775
 12032 12033 sll1099 sll1098 tufA fus TRUE 0.985 60.000 0.400 0.001 Y 0.832
 12033 12034 sll1098 sll1097 fus rps7 TRUE 0.884 207.000 0.579 1.000 Y 0.626
 12034 12035 sll1097 sll1096 rps7 rps12 TRUE 0.957 151.000 0.620 0.003 Y 0.922
 12035 12036 sll1096 sll1095 rps12   TRUE 0.492 97.000 0.000 NA   0.519
 12037 12038 slr1159 slr1160 purD   FALSE 0.303 205.000 0.000 1.000   0.420
 12039 12040 ssl2153 sll1094 rpiB   TRUE 0.522 83.000 0.000 1.000 N 0.425
 12041 12042 slr1161 slr1162     TRUE 0.481 149.000 0.000 NA   0.604
 12042 12043 slr1162 slr1163     FALSE 0.076 87.000 0.000 NA   -0.146
 12045 12046 slr1164 slr1165 nrdA met3 FALSE 0.024 513.000 0.000 1.000 N 0.333
 12046 12047 slr1165 slr1166 met3   TRUE 0.676 43.000 0.000 1.000 N 0.709
 12048 12049 sll1092 ssl2138     TRUE 0.902 0.000 0.000 NA   0.478
 12049 12050 ssl2138 sll1091     FALSE 0.225 247.000 0.000 NA   0.656
 12051 12052 slr1167 slr1168 gldA   TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   0.704
 12052 12053 slr1168 slr1169     TRUE 0.631 77.000 0.000 NA   0.461
 12053 12054 slr1169 slr1170     FALSE 0.036 119.000 0.000 NA   -0.202
 12054 12055 slr1170 slr1171     FALSE 0.208 203.000 0.000 1.000   0.282
 12056 12057 sll1089 sll1087     TRUE 0.688 43.000 0.000 NA   0.552
 12057 12058 sll1087 sll1086     FALSE 0.469 147.000 0.000 NA   0.528
 12059 12060 slr1173 ssr1951     FALSE 0.323 31.000 0.000 NA   0.064
 12060 12061 ssr1951 slr1174     FALSE 0.167 65.000 0.000 NA   -0.095
 12062 12063 sll1085 sll1566 glpD otsA TRUE 0.866 146.000 0.094 1.000 N 0.653
 12064 12065 slr1670 slr1672   glpK TRUE 0.965 53.000 0.200 0.011   0.386
 12065 12066 slr1672 slr1673 glpK spoU TRUE 0.685 -19.000 0.000 1.000 N 0.037
 12066 12067 slr1673 slr1674 spoU   FALSE 0.034 106.000 0.000 NA   -0.207
 12067 12068 slr1674 slr1675   hypA TRUE 0.485 150.000 0.000 NA   0.876
 12068 12069 slr1675 slr1676 hypA   FALSE 0.479 128.000 0.000 NA   0.620
 12069 12070 slr1676 slr1677     TRUE 0.597 79.000 0.000 NA   0.434
 12070 12071 slr1677 slr1678   rpl21 FALSE 0.094 272.000 0.000 1.000   0.299
 12071 12072 slr1678 ssr2799 rpl21 rpl27 TRUE 0.952 108.000 0.667 0.017 Y 0.762
 12072 12073 ssr2799 slr1679 rpl27   TRUE 0.485 79.000 0.000 1.000 N 0.359
 12075 12076 ssr2802 ssr2803     FALSE 0.429 25.000 0.000 NA   0.115
 12076 12077 ssr2803 ssr2806     FALSE 0.017 490.000 0.000 NA   0.170
 12078 12079 sll1563 sll1562     TRUE 0.992 -39.000 0.833 NA   0.245
 12079 12080 sll1562 sll1561   putA FALSE 0.055 197.000 0.000 NA   -0.060
 12081 12082 slr1681 slr1682     FALSE 0.447 151.000 0.000 NA   0.479
 12084 12085 slr1683 slr1684     FALSE 0.210 60.000 0.000 NA   -0.055
 12090 12091 sll1558 sll1557   sucD FALSE 0.323 166.000 0.000 1.000 N 0.386
 12091 12092 sll1557 sll1556 sucD   FALSE 0.473 105.000 0.000 1.000 Y 0.193
 12092 12093 sll1556 sll1555     FALSE 0.201 172.000 0.000 1.000 N 0.253
 12094 12095 ssr2831 slr1689 psaE mutM TRUE 0.925 35.000 0.040 1.000   0.370
 12095 12096 slr1689 slr1690 mutM   FALSE 0.225 -24.000 0.000 1.000 N -0.330
 12096 12097 slr1690 slr1691   nadE TRUE 0.898 50.000 0.050 1.000   0.154
 12097 12098 slr1691 slr1692 nadE   FALSE 0.112 216.000 0.000 NA   0.165
 12098 12099 slr1692 slr1693     FALSE 0.292 228.000 0.000 NA Y 0.255
 12099 12100 slr1693 slr1694     FALSE 0.425 143.000 0.000 1.000   0.392
 12103 12104 sll0921 sll0920   ppc FALSE 0.193 102.000 0.000 1.000 N 0.201
 12104 10687476 sll0920 slr1004 ppc   FALSE 0.136 246.000 0.000 NA   NA
 12105 12106 slr0935 slr0936   nadC TRUE 0.827 9.000 0.000 NA N 0.491
 12106 12107 slr0936 slr0937 nadC   FALSE 0.282 130.000 0.000 NA   0.266
 12107 12108 slr0937 slr0938     FALSE 0.119 85.000 0.000 NA   -0.070
 12109 12110 sll0916 sll0915 cbiC pqqE TRUE 0.888 -3.000 0.000 1.000   0.345
 12111 12112 slr0940 slr0941 crtQ   TRUE 0.955 25.000 0.800 NA   0.383
 12112 12113 slr0941 slr0942     FALSE 0.010 261.000 0.000 NA   -0.199
 12113 12114 slr0942 slr0943   fda TRUE 0.714 43.000 0.000 1.000   0.750
 12116 12117 slr0944 slr0945     TRUE 0.881 152.000 0.214 NA   0.836
 12117 12118 slr0945 slr0946   arsC TRUE 0.918 90.000 0.438 NA   0.792
 12118 12119 slr0946 slr0947 arsC   TRUE 0.606 128.000 0.000 1.000 Y 0.392
 12119 12120 slr0947 slr0948     TRUE 0.947 53.000 0.195 NA   0.416
 12121 12122 sll0913 sll0912     FALSE 0.177 121.000 0.000 1.000   0.094
 12123 12124 slr0949 slr0950 livH   TRUE 0.738 0.000 0.000 1.000 N 0.202
 12125 12126 sll0911 sll0910     TRUE 0.565 16.000 0.000 NA   0.155
 12126 12127 sll0910 sll0909     TRUE 0.839 5.000 0.000 1.000   0.361
 12128 12129 slr0951 slr0952   fbp FALSE 0.168 84.000 0.000 1.000 N 0.074
 12129 12130 slr0952 slr0953 fbp   FALSE 0.171 207.000 0.000 1.000   0.227
 12130 12131 slr0953 ssr1600     FALSE 0.123 63.000 0.000 1.000   -0.252
 12131 12132 ssr1600 slr0954     TRUE 0.933 73.000 0.017 1.000   0.771
 12132 12133 slr0954 slr0955     TRUE 0.986 13.000 0.150 0.004   0.836
 12133 12134 slr0955 slr0957     TRUE 0.801 80.000 0.031 NA   -0.150
 12134 12135 slr0957 slr0958   cysS FALSE 0.410 137.000 0.000 NA   0.391
 12137 12138 slr0959 slr0960     FALSE 0.413 113.000 0.000 NA   0.422
 12142 12143 slr1622 slr1623 ppa   TRUE 0.583 264.000 0.028 1.000   0.522
 12143 12144 slr1623 slr1624     TRUE 0.698 42.000 0.000 NA   0.601
 12145 12146 sll1538 sll1537 bgl   FALSE 0.083 117.000 0.000 1.000 N 0.032
 12147 12148 slr1626 slr1627     TRUE 0.547 11.000 0.000 1.000 N 0.155
 12150 12151 slr1628 slr1629     TRUE 0.837 1.000 0.000 NA   0.332
 12152 12153 sll1535 sll1534 rfbP   TRUE 0.881 100.000 0.375 1.000 Y 0.134
 12153 12154 sll1534 sll1533   pilT TRUE 0.880 4.000 0.000 1.000 N 0.586
 12156 12157 sll1532 ssl2982     TRUE 0.967 14.000 0.021 NA   0.566
 12158 12159 slr1635 slr1636     TRUE 0.706 -3.000 0.000 NA   0.064
 12159 397177 slr1636 6803t22   tRNA-His TRUE 0.599 54.000 0.000 NA   NA
 397177 12160 6803t22 slr1638 tRNA-His   FALSE 0.145 240.000 0.000 NA   NA
 12160 12161 slr1638 slr1639   smpB FALSE 0.386 129.000 0.000 NA   0.382
 12162 12163 sll1531 sll1530     TRUE 0.978 14.000 0.417 NA   0.663
 12163 12164 sll1530 sll1528     TRUE 0.986 3.000 0.138 1.000   0.839
 12164 12165 sll1528 sll1527     TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.020 Y 0.566
 12165 12166 sll1527 sll1526     FALSE 0.293 126.000 0.000 1.000 N 0.339
 12168 12169 ssl2971 sll1525   prk TRUE 0.624 193.000 0.091 NA   -0.272
 12172 12173 slr1644 slr1645   psbZ TRUE 0.608 84.000 0.000 NA   0.684
 12173 12174 slr1645 slr1646 psbZ rnc TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   0.753
 12174 12175 slr1646 slr1647 rnc   TRUE 0.709 34.000 0.000 NA   0.605
 12175 12176 slr1647 slr1648     FALSE 0.030 274.000 0.000 NA   0.025
 12176 12177 slr1648 ssr2754     FALSE 0.291 91.000 0.000 NA N 0.277
 12177 12178 ssr2754 slr1649     FALSE 0.004 424.000 0.000 NA   -0.137
 12179 12180 sll1522 sll1521 pgsA   FALSE 0.149 40.000 0.000 1.000 N -0.006
 12180 12181 sll1521 sll1520   recN FALSE 0.080 26.000 0.000 1.000 N -0.096
 12184 10687477 ssr0756 slr1005     FALSE 0.034 451.000 0.000 NA   NA
 10687477 12185 slr1005 ssr0759     TRUE 0.611 28.000 0.000 NA   NA
 12185 12186 ssr0759 ssr0761     TRUE 0.496 142.000 0.000 NA   0.634
 397196 12189 6803t23 sll0426 tRNA-Gln   FALSE 0.122 255.000 0.000 NA   NA
 12191 12192 sll0424 sll0423     FALSE 0.436 81.000 0.000 NA   0.295
 12193 12194 sll0422 sll0421   purB FALSE 0.442 121.000 0.000 1.000 N 0.614
 12196 12197 sll0420 sll0419 ureB   FALSE 0.350 36.000 0.000 NA   0.114
 12197 12198 sll0419 sll0418     FALSE 0.320 78.000 0.000 NA   0.133
 12199 12200 slr0446 slr0447 dnaX and dnaZ amiC FALSE 0.015 319.000 0.000 1.000 N 0.046
 12200 12201 slr0447 slr0448 amiC sms FALSE 0.007 202.000 0.000 1.000 N -0.190
 12202 12203 sll0274 sll0273     FALSE 0.036 202.000 0.000 NA   -0.121
 12203 12204 sll0273 sll0272     FALSE 0.241 48.000 0.000 NA   0.003
 12204 12205 sll0272 sll0271   nusB TRUE 0.673 31.000 0.000 NA   0.423
 12207 12208 sll0270 sll0269 priA   TRUE 0.727 7.000 0.000 NA   0.229
 12208 12209 sll0269 sll0268     TRUE 0.769 118.000 0.215 NA   0.058
 12209 12210 sll0268 sll0267     FALSE 0.030 37.000 0.000 NA   -0.374
 12210 12211 sll0267 sll0266     FALSE 0.037 206.000 0.000 NA   -0.106
 12211 12212 sll0266 sll0265     TRUE 0.630 -12.000 0.000 NA   -0.069
 12212 12213 sll0265 sll0264     TRUE 0.955 -16.000 0.000 0.032   0.319
 12213 12214 sll0264 sll0263     TRUE 0.794 -87.000 0.000 NA   0.001
 12214 12215 sll0263 sll0262   desD(des6) TRUE 0.701 47.000 0.000 NA   0.863
 12215 12216 sll0262 sll0261 desD(des6)   FALSE 0.004 495.000 0.000 1.000 N -0.017
 12217 12218 slr0284 slr0285     FALSE 0.010 300.000 0.000 NA   -0.127
 12218 12219 slr0285 slr0286     TRUE 0.772 -7.000 0.000 NA   0.082
 12221 12222 ssr0482 slr0287 rps16   TRUE 0.943 41.000 0.385 NA   0.415
 12222 12223 slr0287 slr0288   glnN FALSE 0.057 243.000 0.000 NA   0.084
 12223 12224 slr0288 slr0291 glnN   FALSE 0.223 164.000 0.000 NA   0.213
 12225 12226 sll0258 ssl0483 psbV   TRUE 0.877 159.000 0.273 NA   0.814
 12229 12230 slr0293 slr0294 gcvP   FALSE 0.417 106.000 0.000 NA   0.434
 12230 12231 slr0294 slr0392     TRUE 0.995 -52.000 1.000 NA   0.491
 12231 12232 slr0392 slr0393     TRUE 0.985 -7.000 0.500 NA   0.044
 12234 12235 slr0394 slr0395 pgk ntcB FALSE 0.029 269.000 0.000 1.000 N 0.081
 12236 12237 sll0362 sll0361 alaS   FALSE 0.121 181.000 0.000 NA   0.072
 12237 12238 sll0361 sll0360     FALSE 0.337 82.000 0.000 NA   0.187
 12238 12239 sll0360 sll0359     TRUE 0.649 188.000 0.154 NA   -0.351
 12240 12241 slr0397 slr0398     FALSE 0.216 172.000 0.000 NA   0.221
 12241 12242 slr0398 slr0399   ycf39 FALSE 0.167 220.000 0.000 NA   0.300
 12242 12243 slr0399 slr0400 ycf39   TRUE 0.930 100.000 0.314 1.000 Y 0.532
 12243 12244 slr0400 slr0401     TRUE 0.981 -3.000 0.045 1.000 N 0.285
 12247 12248 slr0404 ssr0657     FALSE 0.140 272.000 0.000 NA   0.424
 12249 12250 sll0356 sll0355 trpF   TRUE 0.621 101.000 0.000 1.000 Y 0.417
 12250 12251 sll0355 sll0354     FALSE 0.024 232.000 0.000 NA   -0.117
 12252 12253 slr0406 slr0407 pyrC   FALSE 0.229 73.000 0.000 1.000 N 0.072
 12253 12254 slr0407 slr0408     FALSE 0.044 265.000 0.000 1.000   0.054
 12254 12255 slr0408 slr0142     FALSE 0.315 146.000 0.000 NA   0.309
 12255 12256 slr0142 slr0143     FALSE 0.181 98.000 0.000 NA   0.105
 12256 12257 slr0143 slr0144     FALSE 0.063 343.000 0.000 NA   0.356
 12257 12258 slr0144 slr0145     TRUE 0.991 -3.000 0.273 NA   0.763
 12258 12259 slr0145 slr0146     TRUE 0.976 15.000 0.786 NA   0.776
 12259 12260 slr0146 slr0147     TRUE 0.996 -210.000 0.800 1.000   0.875
 12260 12261 slr0147 slr0148     TRUE 0.996 -46.000 0.667 1.000   0.780
 12261 12262 slr0148 slr0149     TRUE 0.972 54.000 0.667 0.046   0.827
 12262 12263 slr0149 slr0150   petF TRUE 0.812 34.000 0.000 0.046   0.744
 12263 12264 slr0150 slr0151 petF   TRUE 0.492 125.000 0.000 1.000   0.778
 12264 12265 slr0151 slr0152     FALSE 0.174 88.000 0.000 1.000   -0.009
 12266 12267 sll0149 sll0148     TRUE 0.814 86.000 0.292 NA   -0.276
 12267 12268 sll0148 sll0147     FALSE 0.200 153.000 0.000 NA   0.157
 12268 12269 sll0147 sll0146     FALSE 0.007 697.000 0.000 NA N 0.143
 12269 12270 sll0146 sll0145   frr TRUE 0.594 82.000 0.000 1.000 N 0.662
 12270 12271 sll0145 sll0144 frr pyrH TRUE 0.927 -13.000 0.000 1.000 N 0.412
 12271 12272 sll0144 ssl0259 pyrH   FALSE 0.164 201.000 0.000 NA   0.211
 12273 12274 slr0156 slr0157 clpB   TRUE 0.549 31.000 0.000 NA   0.299
 12275 12276 sll0142 sll0141     TRUE 0.807 188.000 0.132 0.083 N 0.278
 12277 12278 slr0161 slr0162 pilT gspF TRUE 0.882 104.000 0.218 1.000   0.813
 12278 12279 slr0162 slr0163 gspF pilC TRUE 0.996 -178.000 0.014 0.083   0.834
 12279 12280 slr0163 slr0164 pilC clpP FALSE 0.082 402.000 0.000 1.000 Y 0.230
 12280 12281 slr0164 slr0165 clpP clpP TRUE 0.958 100.000 0.745 0.002 Y 0.700
 12282 12283 sll0136 sll0135 pepP   TRUE 0.519 83.000 0.000 1.000 N 0.422
 12283 12284 sll0135 ssl0242     TRUE 0.962 -55.000 0.000 NA   0.534
 12284 10687478 ssl0242 slr1001     TRUE 0.574 67.000 0.000 NA   NA
 12285 12286 ssr0256 slr0166     TRUE 0.966 -79.000 0.000 NA   0.719
 12286 12287 slr0166 slr1923     FALSE 0.101 355.000 0.000 1.000   0.640
 12287 12288 slr1923 slr1924     TRUE 0.702 26.000 0.000 1.000 N 0.455
 12288 12289 slr1924 slr1925   cbiB TRUE 0.878 0.000 0.000 1.000 N 0.421
 12290 12291 sll1865 sll1864 prfB   FALSE 0.012 925.000 0.000 1.000 N 0.228
 12292 12293 slr1926 slr1927     TRUE 0.960 -52.000 0.000 NA   0.510
 12293 12294 slr1927 slr1928     FALSE 0.019 86.000 0.000 NA   -0.436
 12294 12295 slr1928 slr1929     TRUE 0.972 17.000 0.100 NA   0.934
 12295 12296 slr1929 slr1930     TRUE 0.657 117.000 0.000 NA Y 0.815
 12296 12297 slr1930 slr1931     TRUE 0.792 22.000 0.000 NA   0.775
 12297 12298 slr1931 slr1932     TRUE 0.734 58.000 0.000 NA   0.832
 12299 12300 sll1863 sll1862     TRUE 0.866 166.000 0.214 NA   0.797
 12300 12301 sll1862 sll1861     TRUE 0.523 57.000 0.000 NA   0.254
 12301 12302 sll1861 sll1860     TRUE 0.830 89.000 0.000 0.013 Y 0.756
 12305 12306 slr1934 slr1935     FALSE 0.012 124.000 0.000 NA N -0.420
 12307 12308 sll1854 sll1853 xthA   TRUE 0.737 -55.000 0.000 NA   -0.043
 12308 12309 sll1853 sll1852   ndkR FALSE 0.376 31.000 0.000 NA   0.120
 12311 12312 slr1936 slr1937     TRUE 0.945 -6.000 0.000 1.000   0.852
 12316 12317 slr1939 slr1940     FALSE 0.155 92.000 0.000 NA   0.022
 12317 12318 slr1940 ssr3300     FALSE 0.112 98.000 0.000 NA   -0.011
 12320 12321 slr1942 ssr3304     TRUE 0.911 39.000 0.125 1.000   0.200
 12321 12322 ssr3304 slr1943   dpm1 FALSE 0.315 53.000 0.000 NA   0.050
 12322 12323 slr1943 slr1944 dpm1   FALSE 0.138 236.000 0.000 NA   0.312
 12323 12324 slr1944 slr1945   yibO FALSE 0.178 95.000 0.000 NA   0.074
 12324 12325 slr1945 ssr3307 yibO ycf47 TRUE 0.942 65.000 0.041 1.000   0.518
 12325 12326 ssr3307 slr1946 ycf47   FALSE 0.461 237.000 0.014 1.000   0.051
 12328 12329 slr1949 slr1950     FALSE 0.053 305.000 0.000 NA   0.232
 12329 12330 slr1950 slr1951     FALSE 0.476 243.000 0.111 NA N 0.062
 12330 12331 slr1951 slr0989     TRUE 0.678 33.000 0.000 NA   0.455
 12331 12332 slr0989 slr0990     FALSE 0.387 110.000 0.000 NA   0.392
 12332 12333 slr0990 slr0992     TRUE 0.753 159.000 0.008 1.000   0.277
 12333 12334 slr0992 slr0993   nlpD FALSE 0.001 566.000 0.000 1.000 N -0.147
 12337 397194 ssl1807 6803t27   tRNA-Lys FALSE 0.235 201.000 0.000 NA   NA
 397194 12338 6803t27 sll0945 tRNA-Lys glgA FALSE 0.317 160.000 0.000 NA   NA
 12338 12339 sll0945 sll0944 glgA   FALSE 0.081 204.000 0.000 1.000   0.004
 12342 12343 slr0321 slr0322 Era   TRUE 0.933 10.000 0.007 1.000   -0.035
 12343 12344 slr0322 slr0323   ams1 TRUE 0.722 0.000 0.000 1.000 N 0.187
 12344 12345 slr0323 slr0324 ams1   TRUE 0.931 -7.000 0.000 1.000 N 0.496
 12345 12346 slr0324 slr0325     TRUE 0.676 48.000 0.000 NA   0.488
 12347 12348 sll0301 sll0300   ribC FALSE 0.049 261.000 0.000 NA   0.098
 12349 12350 slr0326 slr0327   hitB TRUE 0.519 68.000 0.000 NA   0.279
 12350 12351 slr0327 slr0328 hitB   FALSE 0.032 50.000 0.000 1.000 N -0.131
 12351 12352 slr0328 slr0329   xylR FALSE 0.099 89.000 0.000 1.000 N 0.006
 12353 12354 sll0298 sll0297     TRUE 0.952 -13.000 0.000 NA   0.681
 12354 12355 sll0297 sll0296     FALSE 0.023 189.000 0.000 NA   -0.232
 12355 12356 sll0296 ssl0564     TRUE 0.715 52.000 0.000 1.000   0.497
 12356 12357 ssl0564 ssl0563   psaC FALSE 0.027 267.000 0.000 1.000   -0.060
 12358 12359 slr0331 slr0333 ndhD   FALSE 0.267 179.000 0.000 NA   0.319
 12359 12360 slr0333 slr0334     TRUE 0.713 65.000 0.000 NA   0.581
 12360 12361 slr0334 ssr0536     FALSE 0.041 284.000 0.000 NA   0.123
 12363 12364 slr0335 slr0337 apcE   FALSE 0.005 274.000 0.000 1.000   -0.523
 12365 12366 sll0294 sll0293     TRUE 0.700 36.000 0.000 NA   0.571
 12367 12368 slr0338 slr0168     FALSE 0.454 74.000 0.000 NA   0.231
 12368 12369 slr0168 slr0169     FALSE 0.069 192.000 0.000 NA   -0.028
 12369 12370 slr0169 slr0171   ycf37 FALSE 0.261 228.000 0.000 NA   0.531
 12370 12371 slr0171 slr0172 ycf37 guaB FALSE 0.428 60.000 0.000 1.000   0.136
 12372 12373 sll0177 sll0176     FALSE 0.456 21.000 0.000 NA   0.094
 12373 12374 sll0176 ssl0312     FALSE 0.332 190.000 0.000 NA   0.408
 12374 12375 ssl0312 sll0175     FALSE 0.032 50.000 0.000 NA   -0.358
 12375 12376 sll0175 sll0174     FALSE 0.103 45.000 0.000 1.000   -0.272
 12376 12377 sll0174 sll0173     TRUE 0.530 42.000 0.000 NA N 0.362
 12377 12378 sll0173 sll0172     TRUE 0.698 62.000 0.000 NA   0.488
 12378 12379 sll0172 sll0171   gcvT FALSE 0.005 386.000 0.000 1.000   -0.251
 12379 12380 sll0171 sll0170 gcvT dnaK FALSE 0.263 169.000 0.000 1.000 N 0.337
 12380 12381 sll0170 sll0169 dnaK   FALSE 0.347 206.000 0.000 1.000   0.573
 12381 12382 sll0169 sll0168     FALSE 0.108 188.000 0.000 NA   0.059
 12382 12383 sll0168 sll0167     FALSE 0.150 89.000 0.000 NA   -0.002
 12383 12384 sll0167 sll0166   hemD TRUE 0.696 -19.000 0.000 NA   -0.038
 12384 12385 sll0166 sll0163 hemD   TRUE 0.946 -72.000 0.000 1.000   0.351
 12385 12386 sll0163 sll0162     FALSE 0.028 409.000 0.000 NA   0.226
 12387 12388 slr0179 slr0180     FALSE 0.243 76.000 0.000 1.000   -0.008
 12389 12390 sll0161 ssl0296     TRUE 0.588 -79.000 0.000 NA   -0.165
 12392 12393 ssl0294 sll0160     FALSE 0.001 429.000 0.000 NA   -0.357
 12393 12394 sll0160 sll0158   glgB TRUE 0.707 43.000 0.000 1.000   0.598
 12394 12395 sll0158 sll0157 glgB   FALSE 0.008 225.000 0.000 NA   -0.315
 12395 12396 sll0157 sll0156     TRUE 0.721 65.000 0.000 NA   0.859
 12397 12398 slr0184 slr0185   umpS FALSE 0.016 101.000 0.000 NA   -0.327
 12400 12401 slr0186 slr0359 leuA   FALSE 0.061 85.000 0.000 1.000 N -0.062
 12401 12402 slr0359 slr0360     FALSE 0.328 96.000 0.000 1.000   0.260
 12402 12403 slr0360 slr0361     FALSE 0.328 38.000 0.000 1.000   0.058
 12403 12404 slr0361 slr0362     FALSE 0.463 27.000 0.000 NA   0.166
 12405 12406 sll0350 sml0001   psbI TRUE 0.542 229.000 0.107 NA   0.007
 12407 12408 slr0363 slr0364     FALSE 0.011 340.000 0.000 NA   -0.060
 12408 12409 slr0364 slr0366     TRUE 0.709 45.000 0.000 1.000   0.673
 12409 12410 slr0366 slr0369     FALSE 0.215 245.000 0.000 1.000   0.477
 12410 12411 slr0369 slr0370   gabD FALSE 0.012 101.000 0.000 1.000 N -0.378
 12412 12413 sll0337 sll0336 sphS accD FALSE 0.013 139.000 0.000 1.000 N -0.208
 12413 12414 sll0336 sll0335 accD   FALSE 0.052 114.000 0.000 NA   -0.138
 12415 12416 slr0373 slr0374     TRUE 0.918 91.000 0.404 1.000   0.802
 12416 12417 slr0374 slr0376     TRUE 0.892 133.000 0.423 NA   0.677
 12417 12418 slr0376 slr0377     FALSE 0.352 182.000 0.000 NA   0.412
 12418 12419 slr0377 slr0378     TRUE 0.486 43.000 0.000 NA   0.260
 12419 12420 slr0378 slr0379     TRUE 0.954 -54.000 0.000 1.000   0.406
 12420 12421 slr0379 slr0380     TRUE 0.926 -3.000 0.000 NA   0.540
 12421 12422 slr0380 slr0381     FALSE 0.455 114.000 0.000 NA   0.523
 12424 12425 slr0383 slr0384     TRUE 0.684 28.000 0.000 1.000 N 0.457
 12426 12427 sll0329 sll0328 gnd   FALSE 0.023 190.000 0.000 NA   -0.235
 12427 12428 sll0328 sll0327     TRUE 0.811 0.000 0.000 NA   0.258
 12429 12430 slr0386 slr0387   nifS FALSE 0.111 93.000 0.000 1.000   -0.097
 12430 12431 slr0387 slr0388 nifS   TRUE 0.742 22.000 0.000 1.000   0.397
 12431 12432 slr0388 slr0769     FALSE 0.332 90.000 0.000 NA   0.238
 12432 12433 slr0769 slr0770     FALSE 0.359 125.000 0.000 NA   0.365
 12433 12434 slr0770 slr0771     TRUE 0.993 -16.000 0.429 NA   0.397
 12434 12435 slr0771 slr0772   chlB FALSE 0.017 232.000 0.000 NA   -0.171
 12435 12436 slr0772 slr0773 chlB   FALSE 0.326 132.000 0.000 1.000 N 0.355
 12437 12438 sll0772 sll0771   glcP TRUE 0.667 92.000 0.000 0.046   0.526
 12439 12440 slr0774 slr0775 secD secF TRUE 0.985 61.000 0.516 0.001 Y 0.685
 12440 12441 slr0775 slr0776 secF lpxD FALSE 0.350 133.000 0.000 1.000 N 0.373
 12442 12443 sll0767 ssl1426 rpl20 rpl35 TRUE 0.953 141.000 0.928 0.016 Y 0.906
 12443 12444 ssl1426 sll0766 rpl35 radC FALSE 0.015 97.000 0.000 1.000 N -0.128
 12444 12445 sll0766 sll0765 radC   TRUE 0.936 -10.000 0.000 1.000   0.410
 397180 10687479 6803t28 slr1003 tRNA-Ala   FALSE 0.323 106.000 0.000 NA   NA
 12446 12447 sll0764 sll0763 livG   FALSE 0.173 183.000 0.000 NA   0.173
 12447 12448 sll0763 sll0762     TRUE 0.962 -34.000 0.000 NA   0.717
 12448 12449 sll0762 sll0761     TRUE 0.747 28.000 0.000 NA   0.729
 12449 12450 sll0761 sll0760   ycf38 TRUE 0.823 99.000 0.074 NA   0.320
 12450 12451 sll0760 sll0759 ycf38   TRUE 0.936 153.000 0.107 0.098 Y 0.449
 12454 12455 smr0001 slr0780 psbT   TRUE 0.734 154.000 0.028 NA   0.137
 12456 12457 sll0756 sll0755     TRUE 0.509 73.000 0.000 NA   0.291
 12457 12458 sll0755 sll0754     TRUE 0.758 23.000 0.000 1.000 N 0.598
 12458 12459 sll0754 ssl1417   ycf33 TRUE 0.933 59.000 0.030 NA   0.419
 12459 12460 ssl1417 sll0753 ycf33 folD FALSE 0.133 111.000 0.000 NA   0.052
 12460 12461 sll0753 sll0752 folD   FALSE 0.145 74.000 0.000 NA N 0.037
 12461 12462 sll0752 sll0751   ycf22 TRUE 0.880 -13.000 0.000 NA   0.236
 12464 12465 sll0750 sll0749 sarA   FALSE 0.289 146.000 0.000 NA   0.269
 12466 12467 slr0783 slr0784 tpi   TRUE 0.791 19.000 0.000 NA   0.480
 12467 12468 slr0784 slr0341     TRUE 0.983 -3.000 0.800 NA   0.188
 12470 12471 slr0342 slr0343 petB petD TRUE 0.921 131.000 0.471 0.081   0.838
 12471 12472 slr0343 slr0344 petD rfbW FALSE 0.043 252.000 0.000 1.000   0.011
 12472 12473 slr0344 slr0345 rfbW   FALSE 0.055 128.000 0.000 NA   -0.131
 12473 12474 slr0345 slr0346   rnc FALSE 0.054 205.000 0.000 NA   -0.039
 12475 12476 sll0322 sll0321 hypF   FALSE 0.392 46.000 0.000 1.000 N 0.215
 12478 12479 sll0320 sll0319 rnd   TRUE 0.713 34.000 0.000 NA   0.676
 12482 12483 slr0350 slr0351     FALSE 0.269 175.000 0.000 0.069   0.019
 12490 406863 ssl0601 6803r01 rps21 rrn5Sa FALSE 0.140 244.000 0.000 NA   NA
 406863 407157 6803r01 6803r02 rrn5Sa rrn23Sa TRUE 0.552 73.000 0.000 NA   NA
 407157 1730146 6803r02 6803t29 rrn23Sa   FALSE 0.128 250.000 0.000 NA   NA
 1730146 407890 6803t29 6803r03   rrn16Sa FALSE 0.346 143.000 0.000 NA   NA
 12491 12492 slr0355 slr0356     TRUE 0.622 39.000 0.000 NA   0.389
 12494 12495 slr0357 slr0358 hisS   TRUE 0.981 -25.000 0.018 NA   -0.101
 12496 12497 sll0310 sll0309     FALSE 0.062 78.000 0.000 NA   -0.235
 12497 12498 sll0309 sll0024     FALSE 0.017 300.000 0.000 NA   -0.040
 12498 12499 sll0024 sll0023     FALSE 0.297 33.000 0.000 NA   0.050
 12499 12500 sll0023 sll0022     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   0.413
 12502 12503 sll0021 sll0020   clpC TRUE 0.603 81.000 0.000 1.000 N 0.776
 12503 12504 sll0020 sll0019 clpC   FALSE 0.001 373.000 0.000 1.000 N -0.721
 12504 12505 sll0019 sll0018   cbbA FALSE 0.168 162.000 0.000 1.000 N 0.183
 12505 12506 sll0018 sll0017 cbbA hemL FALSE 0.061 284.000 0.000 1.000 N 0.273
 12506 12507 sll0017 sll0016 hemL mltA FALSE 0.004 390.000 0.000 1.000 N -0.053
 12508 12509 slr0006 slr0007     TRUE 0.618 172.000 0.000 NA Y 0.856
 12509 12510 slr0007 slr0008   ctpA TRUE 0.732 72.000 0.000 1.000 Y 0.263
 12510 12511 slr0008 slr0009 ctpA rbcL FALSE 0.003 278.000 0.000 1.000 N -0.398
 12511 12512 slr0009 slr0011 rbcL rbcX TRUE 0.820 202.000 0.792 NA   0.866
 12512 12513 slr0011 slr0012 rbcX rbcS TRUE 0.951 33.000 0.913 NA   0.865
 12513 12514 slr0012 slr0013 rbcS   FALSE 0.044 543.000 0.000 NA   0.479
 12514 12515 slr0013 slr0014   mgtC FALSE 0.391 96.000 0.000 NA   0.353
 12519 12520 slr0016 slr0017   murZ FALSE 0.002 413.000 0.000 NA   -0.262
 12520 12521 slr0017 slr0018 murZ fumC FALSE 0.244 105.000 0.000 1.000 N 0.280
 397181 12523 6803t30 slr0019 tRNA-Gly   FALSE 0.240 199.000 0.000 NA   NA
 12524 12525 sll0008 sll0007     FALSE 0.419 36.000 0.000 NA   0.178
 12525 12526 sll0007 sll0006   aspC FALSE 0.130 52.000 0.000 1.000   -0.244
 12526 12527 sll0006 sll0005 aspC   FALSE 0.063 104.000 0.000 1.000   -0.164
 12528 12529 slr0020 slr0021 recG sppA FALSE 0.012 101.000 0.000 1.000 N -0.250
 12530 397192 sll0002 6803t31 ponA tRNA-Ser FALSE 0.171 227.000 0.000 NA   NA
 12531 12532 slr0213 slr0214 guaA   FALSE 0.296 88.000 0.000 1.000 N 0.236
 12534 12535 slr0216 slr0217 cobU   TRUE 0.806 128.000 0.025 1.000   0.350
 12535 12536 slr0217 ssr0349     FALSE 0.171 239.000 0.000 NA   0.375
 12537 12538 sll0209 sll0208     TRUE 0.846 219.000 0.659 0.031   0.653
 12538 12539 sll0208 sll0207   rfbA FALSE 0.186 258.000 0.000 1.000   0.459
 12541 10687480 sll0205 slr1000     TRUE 0.841 1.000 0.000 NA   NA
 10687480 12542 slr1000 sll0204   gidA TRUE 0.579 65.000 0.000 NA   NA
 12546 12547 sll0201 sll0200     TRUE 0.945 -6.000 0.000 1.000   0.855
 12547 12548 sll0200 sll0199   petE FALSE 0.069 407.000 0.000 1.000   0.496
 12552 12553 sll0195 sll0194   ycf43 TRUE 0.664 54.000 0.000 NA   0.394
 12554 12555 slr0229 slr0230 mmsB   FALSE 0.002 411.000 0.000 1.000 N -0.088
 12555 12556 slr0230 slr0231     FALSE 0.064 43.000 0.000 1.000   -0.433
 12558 12559 slr0232 slr0233   trxM TRUE 0.700 41.000 0.000 NA   0.619
 12560 12561 sll0191 sll0416   groEL-2 FALSE 0.374 193.000 0.000 1.000 Y 0.157
 12561 12562 sll0416 sll0415 groEL-2   TRUE 0.512 163.000 0.000 0.097 N 0.483
 12562 12563 sll0415 sll0414     TRUE 0.895 -21.000 0.000 NA   0.250
 12565 12566 ssl0788 ssl0787     TRUE 0.682 6.000 0.000 NA   0.165
 12566 12567 ssl0787 sll0413     TRUE 0.955 51.000 0.286 NA   0.657
 12567 12568 sll0413 sll0412     FALSE 0.232 125.000 0.000 NA   0.204
 12568 12569 sll0412 sll0410     FALSE 0.238 146.000 0.000 NA   0.197
 12569 12570 sll0410 sll0409     FALSE 0.404 40.000 0.000 1.000   0.144
 12570 12571 sll0409 sll0408     FALSE 0.068 104.000 0.000 1.000 N 0.006
 12572 12573 slr0434 slr0435 efp accB TRUE 0.860 108.000 0.120 1.000 N 0.749
 12573 12574 slr0435 slr0436 accB ccmK FALSE 0.005 230.000 0.000 NA N -0.521
 12575 12576 sll0406 sll0405     TRUE 0.686 10.000 0.000 NA   0.218
 12576 12577 sll0405 sll0404   glcD FALSE 0.001 999.000 0.000 NA   -0.307
 12581 12582 ssl0769 sll0402   aspC FALSE 0.007 203.000 0.000 NA   -0.574
 12582 12583 sll0402 sll0401 aspC gltA FALSE 0.398 123.000 0.000 1.000 N 0.451
 12583 12584 sll0401 sll0400 gltA   TRUE 0.689 194.000 0.171 1.000 N 0.115
 12585 12586 slr0440 slr0049     FALSE 0.117 94.000 0.000 1.000   -0.082
 12586 12587 slr0049 ssr0102   ycf40 FALSE 0.097 26.000 0.000 1.000 N -0.084
 12587 12588 ssr0102 slr0050 ycf40   TRUE 0.491 75.000 0.000 1.000   0.261
 12589 12590 sll0072 sll0071     FALSE 0.156 32.000 0.000 1.000   -0.179
 12590 12591 sll0071 sll0070   purU FALSE 0.426 94.000 0.000 1.000   0.354
 12593 12594 sll0069 sll0068     TRUE 0.650 27.000 0.000 NA N 0.413
 12594 12595 sll0068 sll0067   gst FALSE 0.399 158.000 0.000 1.000 N 0.469
 12595<