MicrobesOnline Operon Predictions for Rhodococcus sp. RHA1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1938301 1938302 RHA1_ro00002 RHA1_ro00003     FALSE 0.268 25.000 0.000 NA   NA
 1938306 1938307 RHA1_ro00007 RHA1_ro00008     FALSE 0.001 2382.000 0.000 NA   NA
 1938307 1938308 RHA1_ro00008 RHA1_ro00009     FALSE 0.164 49.000 0.000 NA   NA
 1938308 1938309 RHA1_ro00009 RHA1_ro00010     TRUE 0.590 40.000 0.000 0.018   NA
 1938309 1938310 RHA1_ro00010 RHA1_ro00011     FALSE 0.007 1498.000 0.000 0.080   NA
 1938311 1938312 RHA1_ro00012 RHA1_ro00013     FALSE 0.091 127.000 0.000 1.000 N NA
 1938312 1938313 RHA1_ro00013 RHA1_ro00014     FALSE 0.015 255.000 0.000 1.000   NA
 1938314 1938315 RHA1_ro00015 RHA1_ro00016     FALSE 0.085 75.000 0.000 NA   NA
 1938315 1938316 RHA1_ro00016 RHA1_ro00017     FALSE 0.004 374.000 0.000 NA   NA
 1938316 1938317 RHA1_ro00017 RHA1_ro00018     TRUE 0.641 2.000 0.000 NA   NA
 1938318 1938319 RHA1_ro00019 RHA1_ro00020     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1938320 1938321 RHA1_ro00021 RHA1_ro00022     FALSE 0.273 24.000 0.000 NA   NA
 1938322 1938323 RHA1_ro00023 RHA1_ro00024     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1938323 1938324 RHA1_ro00024 RHA1_ro00025     FALSE 0.115 62.000 0.000 NA   NA
 1938324 1938325 RHA1_ro00025 RHA1_ro00026     FALSE 0.046 132.000 0.000 NA   NA
 1938325 1938326 RHA1_ro00026 RHA1_ro00027     FALSE 0.160 50.000 0.000 NA   NA
 1938326 1938327 RHA1_ro00027 RHA1_ro00028     FALSE 0.024 176.000 0.000 NA   NA
 1938327 1938328 RHA1_ro00028 RHA1_ro00029     TRUE 0.606 3.000 0.000 NA   NA
 1938328 1938329 RHA1_ro00029 RHA1_ro00030     TRUE 0.946 -10.000 0.500 NA   NA
 1938331 1938332 RHA1_ro00032 RHA1_ro00033     TRUE 0.993 -3.000 0.471 1.000 Y NA
 1938332 1938333 RHA1_ro00033 RHA1_ro00034     TRUE 0.983 8.000 0.635 1.000 Y NA
 1938333 1938334 RHA1_ro00034 RHA1_ro00035     TRUE 0.991 0.000 0.470 1.000 Y NA
 1938334 1938335 RHA1_ro00035 RHA1_ro00036     TRUE 0.919 -3.000 0.030 NA N NA
 1938335 1938336 RHA1_ro00036 RHA1_ro00037     TRUE 0.920 -3.000 0.047 NA   NA
 1938336 1938337 RHA1_ro00037 RHA1_ro00038     FALSE 0.229 33.000 0.000 NA   NA
 1938337 1938338 RHA1_ro00038 RHA1_ro00039     FALSE 0.081 77.000 0.000 NA   NA
 1938338 1938339 RHA1_ro00039 RHA1_ro00040     FALSE 0.016 210.000 0.000 NA   NA
 1938341 1938342 RHA1_ro00042 RHA1_ro00043     FALSE 0.102 67.000 0.000 NA   NA
 1938343 1938344 RHA1_ro00044 RHA1_ro00045     FALSE 0.004 604.000 0.000 1.000 N NA
 1938346 1938347 RHA1_ro00047 RHA1_ro00048     FALSE 0.094 100.000 0.000 1.000   NA
 1938347 1938348 RHA1_ro00048 RHA1_ro00049     TRUE 0.781 79.000 0.091 0.012 Y NA
 1938348 1938349 RHA1_ro00049 RHA1_ro00050     FALSE 0.369 123.000 0.000 1.000 Y NA
 1938350 1938351 RHA1_ro00051 RHA1_ro00052     TRUE 0.955 -3.000 0.000 0.001   NA
 1938351 1938352 RHA1_ro00052 RHA1_ro00053     FALSE 0.063 94.000 0.000 NA   NA
 1938353 1938354 RHA1_ro00054 RHA1_ro00055     FALSE 0.542 10.000 0.000 1.000   NA
 1938354 1938355 RHA1_ro00055 RHA1_ro00056     FALSE 0.229 50.000 0.000 1.000   NA
 1938356 1938357 RHA1_ro00057 RHA1_ro00058     TRUE 0.975 -16.000 0.078 0.001 Y NA
 1938358 1938359 RHA1_ro00059 RHA1_ro00060     FALSE 0.152 52.000 0.000 NA   NA
 1938359 1938360 RHA1_ro00060 RHA1_ro00061     FALSE 0.087 74.000 0.000 NA   NA
 1938360 1938361 RHA1_ro00061 RHA1_ro00062     FALSE 0.008 336.000 0.000 1.000   NA
 1938362 1938363 RHA1_ro00063 RHA1_ro00064     FALSE 0.083 76.000 0.000 NA   NA
 1938363 1938364 RHA1_ro00064 RHA1_ro00065     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1938364 1938365 RHA1_ro00065 RHA1_ro00066     FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 1938370 1938371 RHA1_ro00071 RHA1_ro00072     FALSE 0.064 140.000 0.000 1.000   NA
 1938371 1938372 RHA1_ro00072 RHA1_ro00073     FALSE 0.259 52.000 0.000 1.000 N NA
 1938374 1938375 RHA1_ro00075 RHA1_ro00076     FALSE 0.171 47.000 0.000 NA   NA
 1938378 1938379 RHA1_ro00079 RHA1_ro00080     TRUE 0.990 -3.000 0.500 0.080   NA
 1938380 1938381 RHA1_ro00081 RHA1_ro00082     FALSE 0.477 8.000 0.000 NA   NA
 1938381 1938382 RHA1_ro00082 RHA1_ro00083     FALSE 0.455 9.000 0.000 NA   NA
 1938383 1938384 RHA1_ro00084 RHA1_ro00085     FALSE 0.229 33.000 0.000 NA   NA
 1938385 1938386 RHA1_ro00086 RHA1_ro00087     FALSE 0.054 120.000 0.000 NA   NA
 1938388 1938389 RHA1_ro00089 RHA1_ro00090     TRUE 0.989 -3.000 1.000 NA   NA
 1938389 1938390 RHA1_ro00090 RHA1_ro00091     FALSE 0.099 68.000 0.000 NA   NA
 1938390 1938391 RHA1_ro00091 RHA1_ro00092     TRUE 0.969 -3.000 0.263 NA   NA
 1938391 1938392 RHA1_ro00092 RHA1_ro00093     TRUE 0.968 -3.000 0.211 1.000   NA
 1938392 1938393 RHA1_ro00093 RHA1_ro00094     TRUE 0.974 -3.000 0.333 NA   NA
 1938394 1938395 RHA1_ro00095 RHA1_ro00096     FALSE 0.070 87.000 0.000 NA   NA
 1938397 1938398 RHA1_ro00098 RHA1_ro00099     TRUE 0.781 0.000 0.000 1.000   NA
 1938398 1938399 RHA1_ro00099 RHA1_ro00100     FALSE 0.058 147.000 0.000 1.000   NA
 1938400 1938401 RHA1_ro00101 RHA1_ro00102 dps   FALSE 0.198 40.000 0.000 NA   NA
 1938401 1938402 RHA1_ro00102 RHA1_ro00103     FALSE 0.062 101.000 0.000 NA   NA
 1938402 1938403 RHA1_ro00103 RHA1_ro00104     FALSE 0.080 78.000 0.000 NA   NA
 1938403 1938404 RHA1_ro00104 RHA1_ro00105     FALSE 0.078 80.000 0.000 NA   NA
 1938404 1938405 RHA1_ro00105 RHA1_ro00106     FALSE 0.003 436.000 0.000 NA   NA
 1938405 1938406 RHA1_ro00106 RHA1_ro00107     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1938407 1938408 RHA1_ro00108 RHA1_ro00109     FALSE 0.057 116.000 0.000 NA   NA
 1938409 1938410 RHA1_ro00110 RHA1_ro00111     FALSE 0.053 122.000 0.000 NA   NA
 1938410 1938411 RHA1_ro00111 RHA1_ro00112     FALSE 0.351 13.000 0.000 NA   NA
 1938413 1938414 RHA1_ro00114 RHA1_ro00115     TRUE 0.962 7.000 0.800 NA   NA
 1938415 1938416 RHA1_ro00116 RHA1_ro00117     FALSE 0.013 220.000 0.000 NA   NA
 1938416 1938417 RHA1_ro00117 RHA1_ro00118     FALSE 0.168 48.000 0.000 NA   NA
 1938419 1938420 RHA1_ro00120 RHA1_ro00121     FALSE 0.006 455.000 0.000 1.000 N NA
 1938425 1938426 RHA1_ro00126 RHA1_ro00127   phoU1 FALSE 0.198 40.000 0.000 NA   NA
 1938427 1938428 RHA1_ro00128 RHA1_ro00129     TRUE 0.919 -3.000 0.045 NA   NA
 1938428 1938429 RHA1_ro00129 RHA1_ro00130     TRUE 0.858 3.000 0.051 NA   NA
 1938429 1938430 RHA1_ro00130 RHA1_ro00131     TRUE 0.923 -3.000 0.051 NA   NA
 1938430 1938431 RHA1_ro00131 RHA1_ro00132     FALSE 0.136 56.000 0.000 NA   NA
 1938432 1938433 RHA1_ro00133 RHA1_ro00134 xdhC xdhB TRUE 0.994 -3.000 0.577 1.000 Y NA
 1938433 1938434 RHA1_ro00134 RHA1_ro00135 xdhB xdhA TRUE 0.996 -3.000 0.423 0.001 Y NA
 1938435 1938436 RHA1_ro00136 RHA1_ro00137     FALSE 0.523 6.000 0.000 NA   NA
 1938436 1938437 RHA1_ro00137 RHA1_ro00138     FALSE 0.016 205.000 0.000 NA   NA
 1938437 1938438 RHA1_ro00138 RHA1_ro00139     FALSE 0.083 76.000 0.000 NA   NA
 1938438 1938439 RHA1_ro00139 RHA1_ro00140     FALSE 0.054 120.000 0.000 NA   NA
 1938439 1938440 RHA1_ro00140 RHA1_ro00141     TRUE 0.641 118.000 1.000 NA   NA
 1938440 1938441 RHA1_ro00141 RHA1_ro00142     FALSE 0.014 216.000 0.000 NA   NA
 1938443 1938444 RHA1_ro00144 RHA1_ro00145     FALSE 0.030 209.000 0.000 1.000 N NA
 1938444 1938445 RHA1_ro00145 RHA1_ro00146     TRUE 0.899 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 1938445 1938446 RHA1_ro00146 RHA1_ro00147     TRUE 0.922 -10.000 0.041 0.006   NA
 1938446 1938447 RHA1_ro00147 RHA1_ro00148     TRUE 0.697 13.000 0.037 1.000   NA
 1938452 1938453 RHA1_ro00153 RHA1_ro00154     FALSE 0.011 239.000 0.000 NA   NA
 1938454 1938455 RHA1_ro00155 RHA1_ro00156     FALSE 0.063 94.000 0.000 NA   NA
 1938456 1938457 RHA1_ro00157 RHA1_ro00158     TRUE 0.743 61.000 0.600 1.000   NA
 1938457 1938458 RHA1_ro00158 RHA1_ro00159     FALSE 0.056 117.000 0.000 NA   NA
 1938460 1938461 RHA1_ro00161 RHA1_ro00162     FALSE 0.506 23.000 0.015 NA   NA
 1938461 1938462 RHA1_ro00162 RHA1_ro00163     TRUE 0.989 -3.000 0.914 NA   NA
 1938462 1938463 RHA1_ro00163 RHA1_ro00164     FALSE 0.014 219.000 0.000 NA   NA
 1938463 1938464 RHA1_ro00164 RHA1_ro00165     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1938465 1938466 RHA1_ro00166 RHA1_ro00167     FALSE 0.523 6.000 0.000 NA   NA
 1938468 1938469 RHA1_ro00169 RHA1_ro00170     FALSE 0.041 142.000 0.000 NA   NA
 1938469 1938470 RHA1_ro00170 RHA1_ro00171     FALSE 0.317 33.000 0.000 1.000   NA
 1938471 1938472 RHA1_ro00172 RHA1_ro00173     TRUE 0.821 25.000 0.255 1.000 N NA
 1938472 1938473 RHA1_ro00173 RHA1_ro00174     TRUE 0.993 -3.000 0.096 0.006 Y NA
 1938474 1938475 RHA1_ro00175 RHA1_ro00176     TRUE 0.984 -3.000 0.500 1.000 N NA
 1938478 1938479 RHA1_ro00179 RHA1_ro00180     FALSE 0.038 147.000 0.000 NA   NA
 1938479 1938480 RHA1_ro00180 RHA1_ro00181     TRUE 0.594 60.000 0.250 NA N NA
 1938481 1938482 RHA1_ro00182 RHA1_ro00183     FALSE 0.026 171.000 0.000 NA   NA
 1938484 1938485 RHA1_ro00185 RHA1_ro00186     FALSE 0.047 131.000 0.000 NA   NA
 1938485 1938486 RHA1_ro00186 RHA1_ro00187     FALSE 0.099 68.000 0.000 NA   NA
 1938486 1938487 RHA1_ro00187 RHA1_ro00188     FALSE 0.004 483.000 0.000 1.000   NA
 1938488 1938489 RHA1_ro00189 RHA1_ro00190     FALSE 0.074 83.000 0.000 NA   NA
 1938489 1938490 RHA1_ro00190 RHA1_ro00191     FALSE 0.011 242.000 0.000 NA   NA
 1938490 1938491 RHA1_ro00191 RHA1_ro00192     FALSE 0.085 117.000 0.000 1.000   NA
 1938491 1938492 RHA1_ro00192 RHA1_ro00193     FALSE 0.181 59.000 0.000 1.000   NA
 1938495 1938496 RHA1_ro00196 RHA1_ro00197     FALSE 0.032 158.000 0.000 NA   NA
 1938496 1938497 RHA1_ro00197 RHA1_ro00198     FALSE 0.477 8.000 0.000 NA   NA
 1938497 1938498 RHA1_ro00198 RHA1_ro00199     FALSE 0.550 5.000 0.000 NA   NA
 1938499 1938500 RHA1_ro00200 RHA1_ro00201     TRUE 0.955 -3.000 0.000 0.001   NA
 1938500 1938501 RHA1_ro00201 RHA1_ro00202     FALSE 0.003 462.000 0.000 NA   NA
 1938501 1938502 RHA1_ro00202 RHA1_ro00203     FALSE 0.008 285.000 0.000 NA   NA
 1938502 1938503 RHA1_ro00203 RHA1_ro00204     FALSE 0.523 6.000 0.000 NA   NA
 1938503 1938504 RHA1_ro00204 RHA1_ro00205     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
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 1938705 1938706 RHA1_ro00406 RHA1_ro00407     FALSE 0.011 324.000 0.000 1.000 N NA
 1938707 1938708 RHA1_ro00408 RHA1_ro00409     FALSE 0.264 51.000 0.000 1.000 N NA
 1938708 1938709 RHA1_ro00409 RHA1_ro00410     FALSE 0.004 367.000 0.000 NA   NA
 1938710 1938711 RHA1_ro00411 RHA1_ro00412     TRUE 0.855 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1938711 1938712 RHA1_ro00412 RHA1_ro00413     TRUE 0.816 0.000 0.000 1.000 N NA
 1938712 1938713 RHA1_ro00413 RHA1_ro00414     TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 1938713 1938714 RHA1_ro00414 RHA1_ro00415     TRUE 0.704 5.000 0.000 1.000 N NA
 1938714 1938715 RHA1_ro00415 RHA1_ro00416     FALSE 0.123 89.000 0.000 1.000 N NA
 1938715 1938716 RHA1_ro00416 RHA1_ro00417     FALSE 0.096 194.000 0.000 0.057 N NA
 1938716 1938717 RHA1_ro00417 RHA1_ro00418     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1938717 1938718 RHA1_ro00418 RHA1_ro00419     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1938718 1938719 RHA1_ro00419 RHA1_ro00420     TRUE 0.826 -3.000 0.000 1.000   NA
 1938721 1938722 RHA1_ro00422 RHA1_ro00423     FALSE 0.037 190.000 0.000 1.000 N NA
 1938722 1938723 RHA1_ro00423 RHA1_ro00424     TRUE 0.572 7.000 0.000 NA N NA
 1938723 1938724 RHA1_ro00424 RHA1_ro00425     FALSE 0.315 16.000 0.000 NA   NA
 1938724 1938725 RHA1_ro00425 RHA1_ro00426     TRUE 0.695 0.000 0.000 NA   NA
 1938725 1938726 RHA1_ro00426 RHA1_ro00427     FALSE 0.003 426.000 0.000 NA   NA
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 1938727 1938728 RHA1_ro00428 RHA1_ro00429     FALSE 0.016 210.000 0.000 NA   NA
 1938729 1938730 RHA1_ro00430 RHA1_ro00431     FALSE 0.301 36.000 0.000 1.000   NA
 1938730 1938731 RHA1_ro00431 RHA1_ro00432     TRUE 0.653 33.000 0.000 0.006   NA
 1938733 1938734 RHA1_ro00434 RHA1_ro00435     FALSE 0.083 76.000 0.000 NA   NA
 1938736 1938737 RHA1_ro00437 RHA1_ro00438     TRUE 0.946 0.000 0.182 NA   NA
 1938738 1938739 RHA1_ro00439 RHA1_ro00440 katA   FALSE 0.108 114.000 0.000 1.000 N NA
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 1938743 1938744 RHA1_ro00444 RHA1_ro00445     FALSE 0.417 80.000 0.167 1.000   NA
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 1938745 1938746 RHA1_ro00446 RHA1_ro00447     TRUE 0.961 -3.000 0.200 NA   NA
 1938746 1938747 RHA1_ro00447 RHA1_ro00448   groL1 TRUE 0.755 47.000 0.375 1.000   NA
 1938747 1938748 RHA1_ro00448 RHA1_ro00449 groL1   FALSE 0.094 99.000 0.000 1.000   NA
 1938748 1938749 RHA1_ro00449 RHA1_ro00450     FALSE 0.224 51.000 0.000 1.000   NA
 1938749 1938750 RHA1_ro00450 RHA1_ro00451     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1938750 1938751 RHA1_ro00451 RHA1_ro00452     FALSE 0.062 103.000 0.000 NA   NA
 1938751 1938752 RHA1_ro00452 RHA1_ro00453     FALSE 0.031 161.000 0.000 NA   NA
 1938756 1938757 RHA1_ro00457 RHA1_ro00458     FALSE 0.019 192.000 0.000 NA   NA
 1938759 1938760 RHA1_ro00460 RHA1_ro00461     FALSE 0.106 65.000 0.000 NA   NA
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 1938763 1938764 RHA1_ro00464 RHA1_ro00465     FALSE 0.245 96.000 0.000 0.077   NA
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 1938770 1938771 RHA1_ro00471 RHA1_ro00472     FALSE 0.060 112.000 0.000 NA   NA
 1938773 1938774 RHA1_ro00474 RHA1_ro00475     FALSE 0.014 216.000 0.000 NA   NA
 1938774 1938775 RHA1_ro00475 RHA1_ro00476     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
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 1938776 1938777 RHA1_ro00477 RHA1_ro00478     TRUE 0.956 12.000 1.000 1.000 N NA
 1938778 1938779 RHA1_ro00479 RHA1_ro00480 hyuA hyuB TRUE 0.990 12.000 1.000 0.001 Y NA
 1938779 1938780 RHA1_ro00480 RHA1_ro00481 hyuB   TRUE 0.937 44.000 0.333 0.057 Y NA
 1938780 1938781 RHA1_ro00481 RHA1_ro00482     FALSE 0.469 164.000 0.750 1.000 N NA
 1938781 1938782 RHA1_ro00482 RHA1_ro00483     TRUE 0.984 -3.000 0.500 1.000 N NA
 1938783 1938784 RHA1_ro00484 RHA1_ro00485     FALSE 0.028 167.000 0.000 NA   NA
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 1938806 1938807 RHA1_ro00507 RHA1_ro00508     FALSE 0.011 237.000 0.000 NA   NA
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 1938812 1938813 RHA1_ro00513 RHA1_ro00514     FALSE 0.062 104.000 0.000 NA   NA
 1938813 1938814 RHA1_ro00514 RHA1_ro00515     TRUE 0.606 3.000 0.000 NA   NA
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 1938817 1938818 RHA1_ro00518 RHA1_ro00519   ohpC FALSE 0.515 121.000 0.200 0.025   NA
 1938818 1938819 RHA1_ro00519 RHA1_ro00520 ohpC ohpB TRUE 0.946 -3.000 0.000 0.025   NA
 1938819 1938820 RHA1_ro00520 RHA1_ro00521 ohpB   TRUE 0.704 5.000 0.000 1.000 N NA
 1938820 1938821 RHA1_ro00521 RHA1_ro00522   ohpR FALSE 0.011 320.000 0.000 1.000 N NA
 1938822 1938823 RHA1_ro00523 RHA1_ro00524     FALSE 0.324 26.000 0.000 NA N NA
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 1938901 1938902 RHA1_ro00603 RHA1_ro00604     TRUE 0.965 -10.000 0.719 1.000   NA
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 1939112 1939113 RHA1_ro00814 RHA1_ro00815     TRUE 0.997 -3.000 0.444 0.001 Y NA
 1939114 1577633 RHA1_ro00816 RHA1_ro00817     FALSE 0.052 123.000 0.000 NA   NA
 1577633 1939115 RHA1_ro00817 RHA1_ro00819     FALSE 0.233 32.000 0.000 NA   NA
 1939115 1939116 RHA1_ro00819 RHA1_ro00820     TRUE 0.980 4.000 0.333 NA Y NA
 1939116 1939117 RHA1_ro00820 RHA1_ro00821     TRUE 0.986 -3.000 0.095 1.000 Y NA
 1939117 1939118 RHA1_ro00821 RHA1_ro00822   gabD2 TRUE 0.707 -7.000 0.000 1.000 N NA
 1939118 1939119 RHA1_ro00822 RHA1_ro00823 gabD2   TRUE 0.855 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1939119 1939120 RHA1_ro00823 RHA1_ro00824     FALSE 0.376 31.000 0.000 1.000 N NA
 1939120 1939121 RHA1_ro00824 RHA1_ro00825     FALSE 0.012 230.000 0.000 NA   NA
 1939122 1939123 RHA1_ro00826 RHA1_ro00827 cobK cobM TRUE 0.984 3.000 0.076 0.006 Y NA
 1939123 1939124 RHA1_ro00827 RHA1_ro00828 cobM cobL TRUE 0.992 -3.000 0.065 0.006 Y NA
 1939124 1939125 RHA1_ro00828 RHA1_ro00829 cobL   TRUE 0.975 -3.000 0.364 NA   NA
 1939127 1939128 RHA1_ro00831 RHA1_ro00832     FALSE 0.055 119.000 0.000 NA   NA
 1939130 1939131 RHA1_ro00834 RHA1_ro00835     FALSE 0.217 103.000 0.035 1.000   NA
 1939131 1939132 RHA1_ro00835 RHA1_ro00836   tatC TRUE 0.770 19.000 0.166 NA N NA
 1939132 1939133 RHA1_ro00836 RHA1_ro00837 tatC tatA FALSE 0.559 72.000 0.008 NA Y NA
 1939133 1939134 RHA1_ro00837 RHA1_ro00838 tatA   FALSE 0.159 73.000 0.000 1.000 N NA
 1939134 1939135 RHA1_ro00838 RHA1_ro00839     TRUE 0.916 -3.000 0.027 NA N NA
 1939135 1939136 RHA1_ro00839 RHA1_ro00840     TRUE 0.988 -7.000 0.767 NA Y NA
 1939136 1939137 RHA1_ro00840 RHA1_ro00841     TRUE 0.615 48.000 0.188 NA   NA
 1939139 1939140 RHA1_ro00843 RHA1_ro00844     TRUE 0.998 -3.000 0.797 0.000 Y NA
 1939140 1939141 RHA1_ro00844 RHA1_ro00845     FALSE 0.356 162.000 0.512 NA   NA
 1939141 1939142 RHA1_ro00845 RHA1_ro00846     FALSE 0.384 171.000 0.706 NA   NA
 1939142 1939143 RHA1_ro00846 RHA1_ro00847     FALSE 0.085 75.000 0.000 NA   NA
 1939148 1939149 RHA1_ro00852 RHA1_ro00853     TRUE 0.920 -3.000 0.047 NA   NA
 1939150 1939151 RHA1_ro00854 RHA1_ro00855 hisG hisI TRUE 0.897 48.000 0.081 0.002 Y NA
 1939151 1939152 RHA1_ro00855 RHA1_ro00856 hisI   FALSE 0.549 26.000 0.005 1.000 N NA
 1939152 1939153 RHA1_ro00856 RHA1_ro00857     TRUE 0.825 2.000 0.015 NA   NA
 1939153 1939154 RHA1_ro00857 RHA1_ro00858     TRUE 0.604 16.000 0.032 NA   NA
 1939154 1939155 RHA1_ro00858 RHA1_ro00859   metH TRUE 0.823 -7.000 0.024 1.000   NA
 1939156 1939157 RHA1_ro00860 RHA1_ro00861     TRUE 0.914 -3.000 0.038 NA   NA
 1939157 1939158 RHA1_ro00861 RHA1_ro00862   nasD FALSE 0.120 91.000 0.000 1.000 N NA
 1939158 1939159 RHA1_ro00862 RHA1_ro00863 nasD nasE TRUE 0.981 -3.000 0.085 0.001 N NA
 1939159 1939160 RHA1_ro00863 RHA1_ro00864 nasE   FALSE 0.094 125.000 0.000 1.000 N NA
 1939160 1939161 RHA1_ro00864 RHA1_ro00865     FALSE 0.015 212.000 0.000 NA   NA
 1939164 1939165 RHA1_ro00868 RHA1_ro00869     FALSE 0.482 12.000 0.000 1.000   NA
 1939166 1939167 RHA1_ro00870 RHA1_ro00871     FALSE 0.039 172.000 0.000 1.000   NA
 1939167 1939168 RHA1_ro00871 RHA1_ro00872     FALSE 0.022 183.000 0.000 NA   NA
 1939168 1939169 RHA1_ro00872 RHA1_ro00873     FALSE 0.007 303.000 0.000 NA   NA
 1939169 1939170 RHA1_ro00873 RHA1_ro00874     TRUE 0.958 -3.000 0.174 NA   NA
 1939170 1939171 RHA1_ro00874 RHA1_ro00875     TRUE 0.981 -3.000 0.500 NA   NA
 1939172 1939173 RHA1_ro00876 RHA1_ro00877     FALSE 0.102 118.000 0.000 1.000 N NA
 1939173 1939174 RHA1_ro00877 RHA1_ro00878     FALSE 0.508 74.000 0.247 1.000   NA
 1939174 1939175 RHA1_ro00878 RHA1_ro00879     TRUE 0.973 4.000 0.810 NA   NA
 1939175 1939176 RHA1_ro00879 RHA1_ro00880     FALSE 0.144 273.000 0.608 NA   NA
 1939176 1939177 RHA1_ro00880 RHA1_ro00881     FALSE 0.555 41.000 0.071 NA N NA
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 1939180 1939181 RHA1_ro00884 RHA1_ro00885     TRUE 0.996 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 1939181 1939182 RHA1_ro00885 RHA1_ro00886     TRUE 0.991 -3.000 0.292 1.000 Y NA
 1939184 1939185 RHA1_ro00888 RHA1_ro00889     TRUE 0.876 1.000 0.042 NA   NA
 1939185 1939186 RHA1_ro00889 RHA1_ro00890     TRUE 0.725 35.000 0.236 NA   NA
 1939187 1939188 RHA1_ro00891 RHA1_ro00892     TRUE 0.719 35.000 0.224 NA   NA
 1577708 1939189 RHA1_ro00893 RHA1_ro00894 trnL   FALSE 0.089 73.000 0.000 NA   NA
 1939189 1939190 RHA1_ro00894 RHA1_ro00895     FALSE 0.263 105.000 0.067 1.000   NA
 1939190 1939191 RHA1_ro00895 RHA1_ro00896     FALSE 0.080 78.000 0.000 NA   NA
 1939191 1939192 RHA1_ro00896 RHA1_ro00897     FALSE 0.212 37.000 0.000 NA   NA
 1939192 1939193 RHA1_ro00897 RHA1_ro00898     FALSE 0.009 263.000 0.000 NA   NA
 1939193 1939194 RHA1_ro00898 RHA1_ro00899   glcB FALSE 0.079 123.000 0.000 1.000   NA
 1939194 1939195 RHA1_ro00899 RHA1_ro00900 glcB   FALSE 0.192 137.000 0.089 NA   NA
 1939195 1939196 RHA1_ro00900 RHA1_ro00901     TRUE 0.938 -3.000 0.080 NA   NA
 1939197 1939198 RHA1_ro00902 RHA1_ro00903 gcvP1   FALSE 0.009 368.000 0.000 1.000 N NA
 1939198 1939199 RHA1_ro00903 RHA1_ro00904     FALSE 0.022 285.000 0.024 NA   NA
 1939199 1939200 RHA1_ro00904 RHA1_ro00905     FALSE 0.211 143.000 0.133 NA   NA
 1939200 1939201 RHA1_ro00905 RHA1_ro00906     TRUE 0.986 -3.000 0.707 NA   NA
 1939201 1939202 RHA1_ro00906 RHA1_ro00907   gcvH FALSE 0.057 321.000 0.242 NA N NA
 1939202 1939203 RHA1_ro00907 RHA1_ro00908 gcvH   TRUE 0.773 43.000 0.434 NA   NA
 1939203 1939204 RHA1_ro00908 RHA1_ro00909     TRUE 0.929 8.000 0.409 NA   NA
 1939204 1939205 RHA1_ro00909 RHA1_ro00910     TRUE 0.977 -3.000 0.409 NA   NA
 1939205 1939206 RHA1_ro00910 RHA1_ro00911   pgsA TRUE 0.932 0.000 0.114 NA   NA
 1939206 1939207 RHA1_ro00911 RHA1_ro00912 pgsA   FALSE 0.106 116.000 0.000 1.000 N NA
 1939207 1939208 RHA1_ro00912 RHA1_ro00913     FALSE 0.308 43.000 0.000 1.000 N NA
 1939208 1939209 RHA1_ro00913 RHA1_ro00914     FALSE 0.156 74.000 0.000 1.000 N NA
 1939209 1939210 RHA1_ro00914 RHA1_ro00915     FALSE 0.464 35.000 0.026 NA   NA
 1939210 1939211 RHA1_ro00915 RHA1_ro00916     FALSE 0.403 41.000 0.019 NA   NA
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 1939218 1939219 RHA1_ro00924 RHA1_ro00925     TRUE 0.938 -3.000 0.042 1.000 N NA
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 1939220 1939221 RHA1_ro00926 RHA1_ro00927     TRUE 0.983 -3.000 0.570 NA   NA
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 1939230 1939231 RHA1_ro00936 RHA1_ro00937     FALSE 0.110 163.000 0.019 1.000 N NA
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 1939232 1577754 RHA1_ro00938 RHA1_ro00939     FALSE 0.118 61.000 0.000 NA   NA
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 1577756 1939233 RHA1_ro00941 RHA1_ro00942   tyrS FALSE 0.002 602.000 0.000 NA   NA
 1939233 1939234 RHA1_ro00942 RHA1_ro00943 tyrS   TRUE 0.948 -3.000 0.067 1.000 N NA
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 1939242 1939243 RHA1_ro00951 RHA1_ro00952 argR argF TRUE 0.947 -3.000 0.088 NA N NA
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 1939244 1939245 RHA1_ro00953 RHA1_ro00954 argD argB TRUE 0.986 -3.000 0.105 1.000 Y NA
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 1939249 1939250 RHA1_ro00958 RHA1_ro00959 pheT pheS TRUE 0.929 68.000 0.574 0.000 Y NA
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 1939263 1939264 RHA1_ro00972 RHA1_ro00973     TRUE 0.925 -3.000 0.054 NA   NA
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 1939266 1939267 RHA1_ro00975 RHA1_ro00976   uvrB FALSE 0.397 31.000 0.002 NA   NA
 1939269 1939270 RHA1_ro00978 RHA1_ro00979   rpsA FALSE 0.009 540.000 0.024 1.000 N NA
 1939272 1939273 RHA1_ro00981 RHA1_ro00982     TRUE 0.991 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 1939273 1939274 RHA1_ro00982 RHA1_ro00983     TRUE 0.921 12.000 0.000 0.055 Y NA
 1939274 1939275 RHA1_ro00983 RHA1_ro00984   leuB2 FALSE 0.268 155.000 0.000 1.000 Y NA
 1939277 1939278 RHA1_ro00986 RHA1_ro00987     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1939279 1939280 RHA1_ro00988 RHA1_ro00989     FALSE 0.379 74.000 0.077 1.000 N NA
 1939282 1939283 RHA1_ro00991 RHA1_ro00992     TRUE 0.991 5.000 0.528 0.055 Y NA
 1939283 1939284 RHA1_ro00992 RHA1_ro00993     TRUE 0.981 -7.000 0.361 1.000 Y NA
 1939284 1939285 RHA1_ro00993 RHA1_ro00994     TRUE 0.997 -3.000 0.582 0.023 Y NA
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 1939292 1939293 RHA1_ro01002 RHA1_ro01003     FALSE 0.096 69.000 0.000 NA   NA
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 1939296 1939297 RHA1_ro01006 RHA1_ro01007   pyk1 TRUE 0.969 1.000 0.361 1.000 N NA
 1939297 1939298 RHA1_ro01007 RHA1_ro01008 pyk1   FALSE 0.520 38.000 0.022 1.000 N NA
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 1939300 1939301 RHA1_ro01010 RHA1_ro01011   lgt FALSE 0.554 -7.000 0.000 NA   NA
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 1939305 1939306 RHA1_ro01015 RHA1_ro01016   trpE TRUE 0.794 54.000 0.690 NA   NA
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 1939322 1939323 RHA1_ro01032 RHA1_ro01033     FALSE 0.060 112.000 0.000 NA   NA
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 1939327 1939328 RHA1_ro01037 RHA1_ro01038 nadB nadA TRUE 0.995 -3.000 0.210 0.001 Y NA
 1939332 1939333 RHA1_ro01042 RHA1_ro01043     FALSE 0.030 163.000 0.000 NA   NA
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 1939349 1939350 RHA1_ro01059 RHA1_ro01060     FALSE 0.302 92.000 0.125 NA   NA
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 1939356 1939357 RHA1_ro01066 RHA1_ro01067     FALSE 0.450 52.000 0.069 NA   NA
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 1939368 1939369 RHA1_ro01078 RHA1_ro01079 ileS   FALSE 0.009 262.000 0.000 NA   NA
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 1939376 1939377 RHA1_ro01086 RHA1_ro01087   murC FALSE 0.192 246.000 0.134 NA Y NA
 1939377 1939378 RHA1_ro01087 RHA1_ro01088 murC murG TRUE 0.991 -3.000 0.270 1.000 Y NA
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 1939379 1939380 RHA1_ro01089 RHA1_ro01090   murD TRUE 0.980 -3.000 0.081 0.002 N NA
 1939380 1939381 RHA1_ro01090 RHA1_ro01091 murD   TRUE 0.993 5.000 0.647 0.003 Y NA
 1939381 1939382 RHA1_ro01091 RHA1_ro01092   murF TRUE 0.992 -3.000 0.071 0.003 Y NA
 1939382 1939383 RHA1_ro01092 RHA1_ro01093 murF murE1 TRUE 0.996 -3.000 0.367 0.001 Y NA
 1939383 1939384 RHA1_ro01093 RHA1_ro01094 murE1   FALSE 0.530 170.000 0.333 1.000 Y NA
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 1939437 1939438 RHA1_ro01147 RHA1_ro01148 ilvE1 gcvT1 TRUE 0.844 28.000 0.025 1.000 Y NA
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 1939443 1939444 RHA1_ro01153 RHA1_ro01154     TRUE 0.969 23.000 0.319 0.000 Y NA
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 1939451 1939452 RHA1_ro01161 RHA1_ro01162     TRUE 0.957 -7.000 0.043 1.000 Y NA
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 1939453 1939454 RHA1_ro01163 RHA1_ro01164     TRUE 0.979 0.000 0.229 0.054 N NA
 1939455 1939456 RHA1_ro01165 RHA1_ro01166   glnE TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1939456 1939457 RHA1_ro01166 RHA1_ro01167 glnE glnA2 TRUE 0.832 9.000 0.065 1.000 N NA
 1939457 1939458 RHA1_ro01167 RHA1_ro01168 glnA2   FALSE 0.056 117.000 0.000 NA   NA
 1939459 1939460 RHA1_ro01169 RHA1_ro01170 panB   FALSE 0.319 46.000 0.003 NA   NA
 1939460 1939461 RHA1_ro01170 RHA1_ro01171     TRUE 0.930 8.000 0.429 NA   NA
 1939462 1939463 RHA1_ro01172 RHA1_ro01173     FALSE 0.527 31.000 0.042 NA   NA
 1939464 1939465 RHA1_ro01174 RHA1_ro01175     TRUE 0.966 -3.000 0.000 NA Y NA
 1939465 1939466 RHA1_ro01175 RHA1_ro01176     FALSE 0.429 23.000 0.000 1.000 N NA
 1939468 1939469 RHA1_ro01178 RHA1_ro01179     FALSE 0.046 132.000 0.000 NA   NA
 1939469 1939470 RHA1_ro01179 RHA1_ro01180     TRUE 0.737 8.000 0.026 NA   NA
 1939471 1939472 RHA1_ro01181 RHA1_ro01182     TRUE 0.978 -3.000 0.422 NA   NA
 1939472 1939473 RHA1_ro01182 RHA1_ro01183     FALSE 0.506 100.000 0.468 NA   NA
 1939473 1939474 RHA1_ro01183 RHA1_ro01184     TRUE 0.950 -3.000 0.121 NA   NA
 1939475 1939476 RHA1_ro01185 RHA1_ro01186     TRUE 0.785 8.000 0.029 1.000   NA
 1939476 1939477 RHA1_ro01186 RHA1_ro01187     FALSE 0.338 44.000 0.005 NA   NA
 1939481 1939482 RHA1_ro01191 RHA1_ro01192     FALSE 0.554 -7.000 0.000 NA   NA
 1578008 1939483 RHA1_ro01193 RHA1_ro01194 trnV   FALSE 0.229 33.000 0.000 NA   NA
 1939483 1939484 RHA1_ro01194 RHA1_ro01195     TRUE 0.819 41.000 0.575 NA   NA
 1939484 1939485 RHA1_ro01195 RHA1_ro01196     FALSE 0.078 169.000 0.025 NA   NA
 1939486 1939487 RHA1_ro01197 RHA1_ro01198 aceE1   FALSE 0.431 75.000 0.169 NA N NA
 1939487 1939488 RHA1_ro01198 RHA1_ro01199   fabD FALSE 0.451 128.000 0.441 NA N NA
 1939488 1939489 RHA1_ro01199 RHA1_ro01200 fabD acpM TRUE 0.623 107.000 0.127 1.000 Y NA
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 1939490 1939491 RHA1_ro01201 RHA1_ro01202 fabF pccB1 TRUE 0.652 95.000 0.167 1.000 Y NA
 1939492 1939493 RHA1_ro01203 RHA1_ro01204     FALSE 0.300 126.000 0.200 NA   NA
 1939493 1939494 RHA1_ro01204 RHA1_ro01205     FALSE 0.565 46.000 0.070 1.000 N NA
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 1939497 1578024 RHA1_ro01208 RHA1_ro01209   trnM FALSE 0.065 92.000 0.000 NA   NA
 1939499 1578027 RHA1_ro01211 RHA1_ro01212   trnN FALSE 0.050 126.000 0.000 NA   NA
 1939501 1939502 RHA1_ro01214 RHA1_ro01215 dnaG   FALSE 0.235 49.000 0.000 1.000   NA
 1939502 1939503 RHA1_ro01215 RHA1_ro01216     FALSE 0.103 88.000 0.000 1.000   NA
 1939503 1939504 RHA1_ro01216 RHA1_ro01217     TRUE 0.835 8.000 0.099 NA   NA
 1939506 1939507 RHA1_ro01219 RHA1_ro01220   glyS FALSE 0.080 78.000 0.000 NA   NA
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 1939510 1939511 RHA1_ro01223 RHA1_ro01224     TRUE 0.892 -3.000 0.017 NA   NA
 1939511 1939512 RHA1_ro01224 RHA1_ro01225     FALSE 0.350 80.000 0.076 1.000 N NA
 1939512 1939513 RHA1_ro01225 RHA1_ro01226     FALSE 0.124 59.000 0.000 NA   NA
 1939513 1939514 RHA1_ro01226 RHA1_ro01227     FALSE 0.066 90.000 0.000 NA   NA
 1939514 1939515 RHA1_ro01227 RHA1_ro01228   kdpE FALSE 0.066 91.000 0.000 NA   NA
 1939515 1939516 RHA1_ro01228 RHA1_ro01229 kdpE kdpD TRUE 0.988 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 1939516 1939517 RHA1_ro01229 RHA1_ro01230 kdpD kdpC TRUE 0.881 8.000 0.006 0.057 N NA
 1939517 1939518 RHA1_ro01230 RHA1_ro01231 kdpC kdpB TRUE 0.994 7.000 0.877 0.001 Y NA
 1939518 1939519 RHA1_ro01231 RHA1_ro01232 kdpB kdpA TRUE 0.994 -3.000 0.124 0.001 Y NA
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 1939520 1939521 RHA1_ro01233 RHA1_ro01234     FALSE 0.094 98.000 0.000 1.000   NA
 1939522 1939523 RHA1_ro01235 RHA1_ro01236     FALSE 0.325 40.000 0.000 1.000 N NA
 1939523 1939524 RHA1_ro01236 RHA1_ro01237     TRUE 0.916 4.000 0.150 1.000   NA
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 1939528 1939529 RHA1_ro01241 RHA1_ro01242   phoH TRUE 0.805 37.000 0.457 NA   NA
 1939529 1939530 RHA1_ro01242 RHA1_ro01243 phoH   FALSE 0.061 109.000 0.000 NA   NA
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 1939533 1939534 RHA1_ro01246 RHA1_ro01247 dnaJ1 hrcA FALSE 0.266 88.000 0.064 NA N NA
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 1939538 1939539 RHA1_ro01251 RHA1_ro01252   cysH TRUE 0.938 -3.000 0.041 1.000 N NA
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 1939548 1939549 RHA1_ro01261 RHA1_ro01262     FALSE 0.053 122.000 0.000 NA   NA
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 1939602 1939603 RHA1_ro01315 RHA1_ro01316 ndkA   FALSE 0.521 19.000 0.014 NA   NA
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 1939620 1939621 RHA1_ro01333 RHA1_ro01334 pcaJ1 pcaI TRUE 0.997 -3.000 0.538 0.001 Y NA
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 1939626 1939627 RHA1_ro01339 RHA1_ro01340 pcaR pcaF TRUE 0.834 22.000 0.267 1.000 N NA
 1939628 1939629 RHA1_ro01341 RHA1_ro01342   aroE1 FALSE 0.085 117.000 0.000 1.000   NA
 1939630 1939631 RHA1_ro01343 RHA1_ro01344     FALSE 0.096 123.000 0.000 1.000 N NA
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 1939633 1939634 RHA1_ro01346 RHA1_ro01347     TRUE 0.607 140.000 0.312 NA Y NA
 1939634 1939635 RHA1_ro01347 RHA1_ro01348     FALSE 0.020 189.000 0.000 NA   NA
 1939635 1939636 RHA1_ro01348 RHA1_ro01349     FALSE 0.321 32.000 0.000 1.000   NA
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 1939644 1939645 RHA1_ro01357 RHA1_ro01358 mmsA1   FALSE 0.547 67.000 0.000 1.000 Y NA
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 1939720 1939721 RHA1_ro01439 RHA1_ro01440     TRUE 0.942 -3.000 0.093 NA   NA
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 1939723 1939724 RHA1_ro01442 RHA1_ro01443     TRUE 0.943 -3.000 0.053 1.000 N NA
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 1939791 1939792 RHA1_ro01514 RHA1_ro01515     FALSE 0.175 46.000 0.000 NA   NA
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 1939794 1939795 RHA1_ro01517 RHA1_ro01518   cysNC2 TRUE 0.956 -10.000 0.073 1.000 Y NA
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 1939796 1939797 RHA1_ro01519 RHA1_ro01520 cysD   FALSE 0.421 120.000 0.267 1.000 N NA
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 1939852 1939853 RHA1_ro01576 RHA1_ro01577 pdhA1   TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.002 Y NA
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 1940005 1940006 RHA1_ro01729 RHA1_ro01730     TRUE 0.682 77.000 0.000 0.001 Y NA
 1940006 1940007 RHA1_ro01730 RHA1_ro01731     FALSE 0.108 114.000 0.000 1.000 N NA
 1940007 1940008 RHA1_ro01731 RHA1_ro01732     FALSE 0.107 77.000 0.000 NA N NA
 1940008 1940009 RHA1_ro01732 RHA1_ro01733     FALSE 0.373 17.000 0.000 NA N NA
 1940009 1940010 RHA1_ro01733 RHA1_ro01734     FALSE 0.304 29.000 0.000 NA N NA
 1940010 1940011 RHA1_ro01734 RHA1_ro01735     FALSE 0.045 134.000 0.000 NA   NA
 1940012 1940013 RHA1_ro01736 RHA1_ro01737     FALSE 0.183 44.000 0.000 NA   NA
 1940013 1940014 RHA1_ro01737 RHA1_ro01738     FALSE 0.049 149.000 0.000 NA N NA
 1940014 1940015 RHA1_ro01738 RHA1_ro01739     TRUE 0.986 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 1940015 1940016 RHA1_ro01739 RHA1_ro01740     TRUE 0.696 40.000 0.000 NA Y NA
 1940016 1940017 RHA1_ro01740 RHA1_ro01741     TRUE 0.755 0.000 0.000 NA N NA
 1940019 1940020 RHA1_ro01743 RHA1_ro01744     FALSE 0.219 52.000 0.000 1.000   NA
 1940022 1940023 RHA1_ro01746 RHA1_ro01747     FALSE 0.056 117.000 0.000 NA   NA
 1940023 1940024 RHA1_ro01747 RHA1_ro01748     FALSE 0.112 63.000 0.000 NA   NA
 1940025 1940026 RHA1_ro01749 RHA1_ro01750     TRUE 0.583 -6.000 0.000 NA   NA
 1940026 1940027 RHA1_ro01750 RHA1_ro01751     TRUE 0.576 4.000 0.000 NA   NA
 1940027 1940028 RHA1_ro01751 RHA1_ro01752     FALSE 0.511 -10.000 0.000 NA   NA
 1940028 1940029 RHA1_ro01752 RHA1_ro01753     FALSE 0.296 19.000 0.000 NA   NA
 1940029 1940030 RHA1_ro01753 RHA1_ro01754     FALSE 0.482 12.000 0.000 1.000   NA
 1940030 1940031 RHA1_ro01754 RHA1_ro01755     TRUE 0.826 -3.000 0.000 1.000   NA
 1940032 1940033 RHA1_ro01756 RHA1_ro01757     TRUE 0.975 1.000 0.086 NA Y NA
 1940033 1940034 RHA1_ro01757 RHA1_ro01758     TRUE 0.995 -3.000 0.674 1.000 Y NA
 1940035 1940036 RHA1_ro01759 RHA1_ro01760     TRUE 0.967 -7.000 0.000 0.002 Y NA
 1940036 1940037 RHA1_ro01760 RHA1_ro01761     TRUE 0.968 -10.000 0.182 1.000 Y NA
 1940037 1940038 RHA1_ro01761 RHA1_ro01762     TRUE 0.951 7.000 0.000 0.053 Y NA
 1940038 1940039 RHA1_ro01762 RHA1_ro01763     TRUE 0.984 -3.000 0.000 0.053 Y NA
 1940039 1940040 RHA1_ro01763 RHA1_ro01764     FALSE 0.277 35.000 0.000 NA N NA
 1940040 1940041 RHA1_ro01764 RHA1_ro01765     FALSE 0.047 151.000 0.000 NA N NA
 1940041 1940042 RHA1_ro01765 RHA1_ro01766     FALSE 0.184 54.000 0.000 NA N NA
 1940043 1940044 RHA1_ro01767 RHA1_ro01768     TRUE 0.776 2.000 0.000 1.000 N NA
 1940044 1940045 RHA1_ro01768 RHA1_ro01769     FALSE 0.044 180.000 0.000 1.000 N NA
 1940046 1940047 RHA1_ro01770 RHA1_ro01771     FALSE 0.137 162.000 0.000 0.095 N NA
 1940048 1940049 RHA1_ro01772 RHA1_ro01773     FALSE 0.292 20.000 0.000 NA   NA
 1940049 1940050 RHA1_ro01773 RHA1_ro01774     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1940051 1940052 RHA1_ro01775 RHA1_ro01776 terB   FALSE 0.059 113.000 0.000 NA   NA
 1940053 1940054 RHA1_ro01777 RHA1_ro01778     FALSE 0.029 166.000 0.000 NA   NA
 1940055 1940056 RHA1_ro01779 RHA1_ro01780     TRUE 0.948 -3.000 0.116 NA   NA
 1940056 1940057 RHA1_ro01780 RHA1_ro01781     TRUE 0.933 -3.000 0.070 NA   NA
 1940057 1940058 RHA1_ro01781 RHA1_ro01782     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA N NA
 1940058 1940059 RHA1_ro01782 RHA1_ro01783     TRUE 0.933 -3.000 0.000 0.092   NA
 1940063 1940064 RHA1_ro01787 RHA1_ro01788     FALSE 0.092 87.000 0.000 NA N NA
 1940065 1940066 RHA1_ro01789 RHA1_ro01790     FALSE 0.373 12.000 0.000 NA   NA
 1940066 1940067 RHA1_ro01790 RHA1_ro01791     FALSE 0.216 36.000 0.000 NA   NA
 1940067 1940068 RHA1_ro01791 RHA1_ro01792     FALSE 0.053 153.000 0.000 1.000   NA
 1940068 1940069 RHA1_ro01792 RHA1_ro01793     FALSE 0.321 32.000 0.000 1.000   NA
 1940069 1940070 RHA1_ro01793 RHA1_ro01794     FALSE 0.030 191.000 0.000 1.000   NA
 1940070 1940071 RHA1_ro01794 RHA1_ro01795     FALSE 0.254 45.000 0.000 1.000   NA
 1940071 1940072 RHA1_ro01795 RHA1_ro01796     FALSE 0.007 377.000 0.000 1.000   NA
 1940072 1940073 RHA1_ro01796 RHA1_ro01797   cysJ TRUE 0.936 -3.000 0.037 1.000 N NA
 1940073 1940074 RHA1_ro01797 RHA1_ro01798 cysJ   TRUE 0.653 35.000 0.000 0.012 N NA
 1940075 1940076 RHA1_ro01799 RHA1_ro01800 paaX   TRUE 0.872 -16.000 0.158 NA N NA
 1940076 1940077 RHA1_ro01800 RHA1_ro01801     TRUE 0.983 -3.000 0.050 1.000 Y NA
 1940077 1940078 RHA1_ro01801 RHA1_ro01802     FALSE 0.072 146.000 0.000 1.000 N NA
 1940079 1940080 RHA1_ro01803 RHA1_ro01804     FALSE 0.008 387.000 0.000 1.000 N NA
 1940081 1940082 RHA1_ro01805 RHA1_ro01806     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1940082 1940083 RHA1_ro01806 RHA1_ro01807     FALSE 0.222 58.000 0.000 1.000 N NA
 1940083 1578623 RHA1_ro01807 RHA1_ro01809     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1578623 1940084 RHA1_ro01809 RHA1_ro01810     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1940084 1940085 RHA1_ro01810 RHA1_ro01811     FALSE 0.008 383.000 0.000 1.000 N NA
 1940086 1940087 RHA1_ro01812 RHA1_ro01813     TRUE 0.981 -3.000 0.208 0.092   NA
 1940089 1940090 RHA1_ro01815 RHA1_ro01816     TRUE 0.989 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 1940090 1940091 RHA1_ro01816 RHA1_ro01817     TRUE 0.961 -3.000 0.128 1.000 N NA
 1940091 1940092 RHA1_ro01817 RHA1_ro01818     FALSE 0.108 114.000 0.000 1.000 N NA
 1940094 1940095 RHA1_ro01820 RHA1_ro01821 glyA1 soxB TRUE 0.992 0.000 0.500 1.000 Y NA
 1940095 1940096 RHA1_ro01821 RHA1_ro01822 soxB soxD TRUE 0.969 34.000 0.500 0.000 Y NA
 1940096 1940097 RHA1_ro01822 RHA1_ro01823 soxD soxA1 TRUE 0.992 -3.000 0.500 0.000   NA
 1940097 1940098 RHA1_ro01823 RHA1_ro01824 soxA1 soxG TRUE 0.987 -7.000 0.833 0.001   NA
 1940098 1940099 RHA1_ro01824 RHA1_ro01825 soxG   FALSE 0.153 75.000 0.000 1.000 N NA
 1940099 1940100 RHA1_ro01825 RHA1_ro01826     TRUE 0.899 9.000 0.000 1.000 Y NA
 1940100 1940101 RHA1_ro01826 RHA1_ro01827     FALSE 0.282 151.000 0.000 1.000 Y NA
 1940101 1940102 RHA1_ro01827 RHA1_ro01828     TRUE 0.929 5.000 0.000 1.000 Y NA
 1940102 1940103 RHA1_ro01828 RHA1_ro01829     TRUE 0.641 2.000 0.000 NA   NA
 1940103 1940104 RHA1_ro01829 RHA1_ro01830     FALSE 0.008 274.000 0.000 NA   NA
 1940106 1940107 RHA1_ro01832 RHA1_ro01833     FALSE 0.014 216.000 0.000 NA   NA
 1940107 1940108 RHA1_ro01833 RHA1_ro01834     FALSE 0.045 133.000 0.000 NA   NA
 1940108 1940109 RHA1_ro01834 RHA1_ro01835     FALSE 0.300 18.000 0.000 NA   NA
 1940110 1940111 RHA1_ro01836 RHA1_ro01837     TRUE 0.994 -3.000 0.120 0.000 Y NA
 1940111 1940112 RHA1_ro01837 RHA1_ro01838   recC TRUE 0.993 -3.000 0.076 0.000 Y NA
 1940112 1940113 RHA1_ro01838 RHA1_ro01839 recC   FALSE 0.055 119.000 0.000 NA   NA
 1940115 1940116 RHA1_ro01841 RHA1_ro01842     TRUE 0.865 33.000 0.667 NA   NA
 1940116 1940117 RHA1_ro01842 RHA1_ro01843     FALSE 0.061 108.000 0.000 NA   NA
 1940117 1940118 RHA1_ro01843 RHA1_ro01844     FALSE 0.050 126.000 0.000 NA   NA
 1940118 1940119 RHA1_ro01844 RHA1_ro01845     TRUE 0.595 10.000 0.000 1.000 N NA
 1940119 1940120 RHA1_ro01845 RHA1_ro01846     TRUE 0.973 2.000 0.500 1.000 N NA
 1940120 1940121 RHA1_ro01846 RHA1_ro01847     FALSE 0.405 136.000 0.400 NA N NA
 1940121 1940122 RHA1_ro01847 RHA1_ro01848     FALSE 0.336 24.000 0.000 NA N NA
 1940122 1940123 RHA1_ro01848 RHA1_ro01849     TRUE 0.946 -3.000 0.086 NA N NA
 1940123 1940124 RHA1_ro01849 RHA1_ro01850     TRUE 0.979 -3.000 0.182 0.092   NA
 1940124 1940125 RHA1_ro01850 RHA1_ro01851     TRUE 0.949 0.000 0.154 1.000   NA
 1940125 1940126 RHA1_ro01851 RHA1_ro01852     TRUE 0.961 -3.000 0.154 1.000   NA
 1940126 1940127 RHA1_ro01852 RHA1_ro01853   aroE3 TRUE 0.978 -3.000 0.333 1.000 N NA
 1940127 1940128 RHA1_ro01853 RHA1_ro01854 aroE3   TRUE 0.819 32.000 0.333 1.000 N NA
 1940128 1940129 RHA1_ro01854 RHA1_ro01855     FALSE 0.391 153.000 0.500 NA N NA
 1940131 1940132 RHA1_ro01857 RHA1_ro01858     FALSE 0.536 12.000 0.000 1.000 N NA
 1940132 1940133 RHA1_ro01858 RHA1_ro01859     TRUE 0.802 18.000 0.200 1.000   NA
 1940133 1940134 RHA1_ro01859 RHA1_ro01860     FALSE 0.283 39.000 0.000 1.000   NA
 1940135 1940136 RHA1_ro01861 RHA1_ro01862     FALSE 0.376 31.000 0.000 1.000 N NA
 1940136 1940137 RHA1_ro01862 RHA1_ro01863     FALSE 0.190 42.000 0.000 NA   NA
 1940138 1940139 RHA1_ro01864 RHA1_ro01865     TRUE 0.788 12.000 0.088 1.000   NA
 1940139 1940140 RHA1_ro01865 RHA1_ro01866     TRUE 0.966 7.000 0.176 1.000 Y NA
 1940140 1940141 RHA1_ro01866 RHA1_ro01867     FALSE 0.192 64.000 0.000 1.000 N NA
 1940142 1940143 RHA1_ro01868 RHA1_ro01869     FALSE 0.511 69.000 0.182 1.000 N NA
 1940143 1940144 RHA1_ro01869 RHA1_ro01870   corA FALSE 0.462 17.000 0.000 1.000 N NA
 1940145 1940146 RHA1_ro01871 RHA1_ro01872     FALSE 0.416 25.000 0.000 1.000 N NA
 1940147 1940148 RHA1_ro01873 RHA1_ro01874     TRUE 0.975 -3.000 0.300 1.000   NA
 1940149 1940150 RHA1_ro01875 RHA1_ro01876     TRUE 0.947 15.000 0.286 1.000 Y NA
 1940150 1940151 RHA1_ro01876 RHA1_ro01877     FALSE 0.117 93.000 0.000 1.000 N NA
 1940151 1940152 RHA1_ro01877 RHA1_ro01878     TRUE 0.996 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 1940152 1940153 RHA1_ro01878 RHA1_ro01879     TRUE 0.886 28.000 0.600 1.000 N NA
 1940156 1940157 RHA1_ro01882 RHA1_ro01883     TRUE 0.832 36.000 0.000 0.095 Y NA
 1940157 1940158 RHA1_ro01883 RHA1_ro01884     FALSE 0.489 46.000 0.000 0.095   NA
 1940158 1940159 RHA1_ro01884 RHA1_ro01885     FALSE 0.226 34.000 0.000 NA   NA
 1940162 1940163 RHA1_ro01888 RHA1_ro01889     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1940163 1940164 RHA1_ro01889 RHA1_ro01890     FALSE 0.007 295.000 0.000 NA   NA
 1940167 1940168 RHA1_ro01893 RHA1_ro01894     TRUE 0.985 11.000 0.594 0.052 Y NA
 1940168 1940169 RHA1_ro01894 RHA1_ro01895     TRUE 0.994 -3.000 0.481 1.000 Y NA
 1940172 1940173 RHA1_ro01898 RHA1_ro01899     FALSE 0.401 18.000 0.000 1.000   NA
 1940173 1940174 RHA1_ro01899 RHA1_ro01900     TRUE 0.920 -7.000 0.167 1.000 N NA
 1940175 1940176 RHA1_ro01901 RHA1_ro01902     FALSE 0.147 68.000 0.000 1.000   NA
 1940178 1940179 RHA1_ro01904 RHA1_ro01905     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1940179 1940180 RHA1_ro01905 RHA1_ro01906     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1940180 1940181 RHA1_ro01906 RHA1_ro01907     TRUE 0.984 -3.000 0.633 NA   NA
 1940181 1940182 RHA1_ro01907 RHA1_ro01908     FALSE 0.557 94.000 0.569 NA   NA
 1940183 1940184 RHA1_ro01909 RHA1_ro01910     FALSE 0.021 187.000 0.000 NA   NA
 1940184 1940185 RHA1_ro01910 RHA1_ro01911     TRUE 0.971 10.000 0.111 0.018 Y NA
 1940185 1940186 RHA1_ro01911 RHA1_ro01912     FALSE 0.410 72.000 0.111 1.000   NA
 1940186 1940187 RHA1_ro01912 RHA1_ro01913     TRUE 0.606 3.000 0.000 NA   NA
 1940187 1940188 RHA1_ro01913 RHA1_ro01914     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1940189 1940190 RHA1_ro01915 RHA1_ro01916     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1940190 1940191 RHA1_ro01916 RHA1_ro01917     TRUE 0.753 -3.000 0.000 NA   NA
 1940191 1940192 RHA1_ro01917 RHA1_ro01918     TRUE 0.931 -7.000 0.286 NA   NA
 1940192 1940193 RHA1_ro01918 RHA1_ro01919     TRUE 0.985 -3.000 0.667 NA   NA
 1940193 1940194 RHA1_ro01919 RHA1_ro01920     FALSE 0.221 35.000 0.000 NA   NA
 1940195 1940196 RHA1_ro01921 RHA1_ro01922 tufA   TRUE 0.867 90.000 0.400 0.001 Y NA
 1940196 1940197 RHA1_ro01922 RHA1_ro01923   rpsG TRUE 0.649 162.000 0.579 1.000 Y NA
 1940197 1940198 RHA1_ro01923 RHA1_ro01924 rpsG rpsL TRUE 0.996 0.000 0.620 0.001 Y NA
 1940198 1940199 RHA1_ro01924 RHA1_ro01925 rpsL   FALSE 0.005 363.000 0.000 NA   NA
 1940199 1940200 RHA1_ro01925 RHA1_ro01926     TRUE 0.806 12.000 0.154 NA   NA
 1940200 1940201 RHA1_ro01926 RHA1_ro01927     FALSE 0.202 39.000 0.000 NA   NA
 1940201 1940202 RHA1_ro01927 RHA1_ro01928     FALSE 0.494 60.000 0.095 1.000 N NA
 1940202 1940203 RHA1_ro01928 RHA1_ro01929     TRUE 0.986 0.000 0.203 1.000 Y NA
 1940203 1940204 RHA1_ro01929 RHA1_ro01930     TRUE 0.996 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 1940204 1940205 RHA1_ro01930 RHA1_ro01931     TRUE 0.992 9.000 0.875 0.004 Y NA
 1940205 1940206 RHA1_ro01931 RHA1_ro01932     TRUE 0.888 60.000 0.548 1.000 Y NA
 1940206 1940207 RHA1_ro01932 RHA1_ro01933     TRUE 0.983 -3.000 0.562 NA   NA
 1940207 1940208 RHA1_ro01933 RHA1_ro01934     TRUE 0.978 -3.000 0.438 NA   NA
 1940209 1940210 RHA1_ro01935 RHA1_ro01936     FALSE 0.186 58.000 0.000 1.000   NA
 1940210 1940211 RHA1_ro01936 RHA1_ro01937     TRUE 0.709 20.000 0.080 1.000   NA
 1940211 1940212 RHA1_ro01937 RHA1_ro01938     FALSE 0.289 38.000 0.000 1.000   NA
 1940215 1940216 RHA1_ro01941 RHA1_ro01942     FALSE 0.074 83.000 0.000 NA   NA
 1940217 1940218 RHA1_ro01943 RHA1_ro01944     TRUE 0.859 4.000 0.052 NA N NA
 1940218 1940219 RHA1_ro01944 RHA1_ro01945     FALSE 0.290 32.000 0.000 NA N NA
 1940220 1940221 RHA1_ro01946 RHA1_ro01947     FALSE 0.206 89.000 0.042 NA   NA
 1940221 1940222 RHA1_ro01947 RHA1_ro01948     TRUE 0.854 -16.000 0.115 NA N NA
 1940222 1940223 RHA1_ro01948 RHA1_ro01949     FALSE 0.143 143.000 0.038 NA N NA
 1940223 1940224 RHA1_ro01949 RHA1_ro01950     TRUE 0.982 -3.000 0.444 1.000 N NA
 1940224 1940225 RHA1_ro01950 RHA1_ro01951     FALSE 0.404 108.000 0.200 1.000 N NA
 1940225 1940226 RHA1_ro01951 RHA1_ro01952     FALSE 0.336 38.000 0.000 1.000 N NA
 1940229 1940230 RHA1_ro01955 RHA1_ro01956     FALSE 0.505 10.000 0.000 NA N NA
 1940232 1940233 RHA1_ro01958 RHA1_ro01959     TRUE 0.885 4.000 0.000 0.029   NA
 1940234 1940235 RHA1_ro01960 RHA1_ro01961   rpoC FALSE 0.058 147.000 0.000 1.000   NA
 1940235 1940236 RHA1_ro01961 RHA1_ro01962 rpoC rpoB TRUE 0.905 119.000 0.851 0.000 Y NA
 1940238 1940239 RHA1_ro01964 RHA1_ro01965     TRUE 0.618 80.000 0.600 NA   NA
 1940239 1940240 RHA1_ro01965 RHA1_ro01966     FALSE 0.144 54.000 0.000 NA   NA
 1940240 1940241 RHA1_ro01966 RHA1_ro01967     TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 1940241 1940242 RHA1_ro01967 RHA1_ro01968     TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.004 Y NA
 1940242 1940243 RHA1_ro01968 RHA1_ro01969     TRUE 0.997 0.000 0.800 0.004 Y NA
 1940243 1940244 RHA1_ro01969 RHA1_ro01970     TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.004 Y NA
 1940244 1940245 RHA1_ro01970 RHA1_ro01971     TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.004 Y NA
 1940245 1940246 RHA1_ro01971 RHA1_ro01972     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA Y NA
 1940246 1940247 RHA1_ro01972 RHA1_ro01973     TRUE 0.947 41.000 0.833 NA Y NA
 1940247 1940248 RHA1_ro01973 RHA1_ro01974     TRUE 0.788 10.000 0.063 NA N NA
 1940248 1940249 RHA1_ro01974 RHA1_ro01975   rplL FALSE 0.022 306.000 0.006 1.000 N NA
 1940249 1940250 RHA1_ro01975 RHA1_ro01976 rplL rplJ TRUE 0.928 79.000 0.884 0.008 Y NA
 1940252 1940253 RHA1_ro01978 RHA1_ro01979 rplA rplK TRUE 0.827 158.000 0.838 0.010 Y NA
 1940253 1940254 RHA1_ro01979 RHA1_ro01980 rplK   TRUE 0.791 60.000 0.681 1.000 N NA
 1940254 1940255 RHA1_ro01980 RHA1_ro01981     FALSE 0.087 131.000 0.000 1.000 N NA
 1940255 1578796 RHA1_ro01981 RHA1_ro01982   trnW FALSE 0.245 29.000 0.000 NA   NA
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 1940257 1940258 RHA1_ro01984 RHA1_ro01985   rpmG1 FALSE 0.122 90.000 0.000 1.000 N NA
 1940258 1578800 RHA1_ro01985 RHA1_ro01986 rpmG1 trnM FALSE 0.115 62.000 0.000 NA   NA
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 1578801 1578802 RHA1_ro01987 RHA1_ro01988 trnT trnY FALSE 0.014 216.000 0.000 NA   NA
 1940260 1940261 RHA1_ro01990 RHA1_ro01991     FALSE 0.169 144.000 0.042 1.000 N NA
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 1940264 1940265 RHA1_ro01994 RHA1_ro01995     FALSE 0.313 42.000 0.000 1.000 N NA
 1940265 1940266 RHA1_ro01995 RHA1_ro01996     FALSE 0.496 73.000 0.259 NA   NA
 1940266 1940267 RHA1_ro01996 RHA1_ro01997   menD TRUE 0.925 -3.000 0.055 NA   NA
 1940268 1940269 RHA1_ro01998 RHA1_ro01999     FALSE 0.465 62.000 0.143 NA   NA
 1940270 1940271 RHA1_ro02000 RHA1_ro02001     FALSE 0.346 46.000 0.011 NA   NA
 1940271 1940272 RHA1_ro02001 RHA1_ro02002     TRUE 0.753 5.000 0.011 NA   NA
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 1940277 1940278 RHA1_ro02007 RHA1_ro02008 pitA   TRUE 0.752 11.000 0.067 NA   NA
 1940278 1940279 RHA1_ro02008 RHA1_ro02009     FALSE 0.175 46.000 0.000 NA   NA
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 1940280 1940281 RHA1_ro02010 RHA1_ro02011     TRUE 0.875 -3.000 0.005 NA   NA
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 1940282 1940283 RHA1_ro02012 RHA1_ro02013     TRUE 0.938 -3.000 0.080 NA   NA
 1940283 1940284 RHA1_ro02013 RHA1_ro02014     TRUE 0.994 -3.000 0.920 0.081 N NA
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 1940292 1940293 RHA1_ro02022 RHA1_ro02023     FALSE 0.388 42.000 0.017 NA   NA
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 1940294 1940295 RHA1_ro02024 RHA1_ro02025     FALSE 0.321 32.000 0.000 1.000   NA
 1940297 1940298 RHA1_ro02027 RHA1_ro02028     TRUE 0.888 -3.000 0.014 NA   NA
 1940299 1940300 RHA1_ro02029 RHA1_ro02030     FALSE 0.270 137.000 0.200 NA   NA
 1940301 1940302 RHA1_ro02031 RHA1_ro02032   ccsB FALSE 0.115 96.000 0.000 1.000 N NA
 1940302 1940303 RHA1_ro02032 RHA1_ro02033 ccsB   TRUE 0.982 -3.000 0.066 NA Y NA
 1940303 1940304 RHA1_ro02033 RHA1_ro02034     TRUE 0.980 -3.000 0.049 NA Y NA
 1940304 1940305 RHA1_ro02034 RHA1_ro02035     TRUE 0.996 -3.000 1.000 1.000 Y NA
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 1940306 1940307 RHA1_ro02036 RHA1_ro02037   hemL FALSE 0.435 80.000 0.204 NA N NA
 1940307 1940308 RHA1_ro02037 RHA1_ro02038 hemL   FALSE 0.115 62.000 0.000 NA   NA
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 1940328 1940329 RHA1_ro02058 RHA1_ro02059     FALSE 0.288 161.000 0.356 NA   NA
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 1940332 1940333 RHA1_ro02062 RHA1_ro02063     FALSE 0.255 90.000 0.076 NA   NA
 1940333 1940334 RHA1_ro02063 RHA1_ro02064     TRUE 0.852 8.000 0.127 NA   NA
 1940334 1940335 RHA1_ro02064 RHA1_ro02065     TRUE 0.970 -3.000 0.286 NA   NA
 1940336 1940337 RHA1_ro02066 RHA1_ro02067     FALSE 0.094 70.000 0.000 NA   NA
 1940338 1940339 RHA1_ro02068 RHA1_ro02069 regX3 senX3 TRUE 0.993 -3.000 0.437 1.000 Y NA
 1940339 1940340 RHA1_ro02069 RHA1_ro02070 senX3 gpmA FALSE 0.275 150.000 0.196 1.000 N NA
 1940340 1940341 RHA1_ro02070 RHA1_ro02071 gpmA   FALSE 0.476 44.000 0.020 1.000 N NA
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 1940342 1940343 RHA1_ro02072 RHA1_ro02073     TRUE 0.982 -3.000 0.541 NA   NA
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 1940344 1940345 RHA1_ro02074 RHA1_ro02075     TRUE 0.826 -3.000 0.000 1.000   NA
 1940352 1940353 RHA1_ro02082 RHA1_ro02083     TRUE 0.603 -973.000 0.000 1.000 N NA
 1940353 1940354 RHA1_ro02083 RHA1_ro02084     FALSE 0.542 10.000 0.000 1.000   NA
 1940355 1940356 RHA1_ro02085 RHA1_ro02086     FALSE 0.504 33.000 0.036 NA   NA
 1940357 1940358 RHA1_ro02087 RHA1_ro02088     TRUE 0.730 52.000 0.444 NA   NA
 1940358 1940359 RHA1_ro02088 RHA1_ro02089     TRUE 0.726 22.000 0.143 NA   NA
 1940365 1940366 RHA1_ro02095 RHA1_ro02096     FALSE 0.494 14.000 0.000 1.000 N NA
 1940368 1940369 RHA1_ro02098 RHA1_ro02099     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1940369 1940370 RHA1_ro02099 RHA1_ro02100     TRUE 0.736 2.000 0.000 1.000   NA
 1940371 1940372 RHA1_ro02101 RHA1_ro02102     FALSE 0.177 192.000 0.250 1.000   NA
 1940372 1940373 RHA1_ro02102 RHA1_ro02103     FALSE 0.048 213.000 0.032 NA   NA
 1940373 1940374 RHA1_ro02103 RHA1_ro02104     FALSE 0.501 73.000 0.270 NA   NA
 1940374 1940375 RHA1_ro02104 RHA1_ro02105     TRUE 0.929 -7.000 0.282 NA   NA
 1940375 1940376 RHA1_ro02105 RHA1_ro02106     FALSE 0.234 104.000 0.047 1.000   NA
 1940377 1940378 RHA1_ro02107 RHA1_ro02108     FALSE 0.164 49.000 0.000 NA   NA
 1940380 1940381 RHA1_ro02110 RHA1_ro02111     FALSE 0.351 13.000 0.000 NA   NA
 1940381 1940382 RHA1_ro02111 RHA1_ro02112     FALSE 0.431 10.000 0.000 NA   NA
 1940382 1940383 RHA1_ro02112 RHA1_ro02113     FALSE 0.307 17.000 0.000 NA   NA
 1940383 1940384 RHA1_ro02113 RHA1_ro02114     FALSE 0.066 91.000 0.000 NA   NA
 1940385 1940386 RHA1_ro02115 RHA1_ro02116     FALSE 0.005 359.000 0.000 NA   NA
 1940387 1940388 RHA1_ro02117 RHA1_ro02118     TRUE 0.987 -3.000 0.667 1.000   NA
 1940389 1940390 RHA1_ro02119 RHA1_ro02120   metE1 TRUE 0.624 47.000 0.004 0.021   NA
 1940390 1940391 RHA1_ro02120 RHA1_ro02121 metE1 hbd1 FALSE 0.150 128.000 0.006 1.000 N NA
 1940391 1940392 RHA1_ro02121 RHA1_ro02122 hbd1   FALSE 0.214 120.000 0.036 1.000 N NA
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 1940394 1940395 RHA1_ro02124 RHA1_ro02125     FALSE 0.195 140.000 0.071 1.000   NA
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 1940397 1940398 RHA1_ro02127 RHA1_ro02128     TRUE 0.998 -3.000 0.888 0.052 Y NA
 1940398 1940399 RHA1_ro02128 RHA1_ro02129     TRUE 0.986 -3.000 0.639 1.000   NA
 1940399 1940400 RHA1_ro02129 RHA1_ro02130     TRUE 0.950 -13.000 0.217 0.021   NA
 1940400 1940401 RHA1_ro02130 RHA1_ro02131     TRUE 0.951 0.000 0.136 1.000 N NA
 1940401 1940402 RHA1_ro02131 RHA1_ro02132     FALSE 0.094 100.000 0.000 1.000   NA
 1940402 1940403 RHA1_ro02132 RHA1_ro02133     TRUE 0.959 -3.000 0.182 NA   NA
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 1940405 1940406 RHA1_ro02135 RHA1_ro02136     TRUE 0.945 0.000 0.107 1.000 N NA
 1940409 1940410 RHA1_ro02139 RHA1_ro02140   dldH1 FALSE 0.055 119.000 0.000 NA   NA
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 1940416 1940417 RHA1_ro02146 RHA1_ro02147 groL2   FALSE 0.018 230.000 0.000 1.000   NA
 1940417 1940418 RHA1_ro02147 RHA1_ro02148     FALSE 0.243 81.000 0.027 1.000   NA
 1940418 1940419 RHA1_ro02148 RHA1_ro02149     FALSE 0.211 60.000 0.000 1.000 N NA
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 1940421 1940422 RHA1_ro02151 RHA1_ro02152   dadA2 FALSE 0.083 95.000 0.000 NA N NA
 1940423 1940424 RHA1_ro02153 RHA1_ro02154   hutH FALSE 0.135 72.000 0.000 1.000   NA
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 1940429 1940430 RHA1_ro02159 RHA1_ro02160 psd pssA TRUE 0.993 -3.000 0.466 1.000 Y NA
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 1940442 1940443 RHA1_ro02172 RHA1_ro02173     FALSE 0.288 76.000 0.043 1.000   NA
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 1940450 1940451 RHA1_ro02180 RHA1_ro02181     FALSE 0.062 102.000 0.000 NA   NA
 1940452 1940453 RHA1_ro02182 RHA1_ro02183 thiC thiD TRUE 0.954 11.000 0.015 0.004 Y NA
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 1940457 1940458 RHA1_ro02187 RHA1_ro02188   thiG FALSE 0.182 114.000 0.008 1.000 N NA
 1940458 1940459 RHA1_ro02188 RHA1_ro02189 thiG   TRUE 0.967 -7.000 0.104 1.000 Y NA
 1940459 1940460 RHA1_ro02189 RHA1_ro02190     TRUE 0.974 3.000 0.625 1.000 N NA
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 1940464 1940465 RHA1_ro02194 RHA1_ro02195     TRUE 0.981 9.000 0.622 1.000 Y NA
 1940466 1940467 RHA1_ro02196 RHA1_ro02197 askA pta TRUE 0.965 -3.000 0.185 1.000   NA
 1940467 1940468 RHA1_ro02197 RHA1_ro02198 pta   FALSE 0.091 72.000 0.000 NA   NA
 1940468 1940469 RHA1_ro02198 RHA1_ro02199     FALSE 0.447 -22.000 0.000 NA   NA
 1940469 1940470 RHA1_ro02199 RHA1_ro02200     FALSE 0.008 279.000 0.000 NA   NA
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 1940477 1940478 RHA1_ro02207 RHA1_ro02208   hbd2 TRUE 0.648 -13.000 0.000 1.000 N NA
 1940478 1940479 RHA1_ro02208 RHA1_ro02209 hbd2   TRUE 0.855 -3.000 0.000 1.000 N NA
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 1940516 1940517 RHA1_ro02246 RHA1_ro02247     FALSE 0.451 56.000 0.047 1.000 N NA
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 1940542 1940543 RHA1_ro02273 RHA1_ro02274     FALSE 0.064 140.000 0.000 1.000   NA
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 1940545 1940546 RHA1_ro02276 RHA1_ro02277     TRUE 0.882 -3.000 0.010 NA   NA
 1940546 1940547 RHA1_ro02277 RHA1_ro02278     TRUE 0.794 3.000 0.011 NA   NA
 1940547 1940548 RHA1_ro02278 RHA1_ro02279     TRUE 0.994 -3.000 0.489 1.000 Y NA
 1940548 1940549 RHA1_ro02279 RHA1_ro02280     FALSE 0.224 51.000 0.000 1.000   NA
 1940549 1940550 RHA1_ro02280 RHA1_ro02281     FALSE 0.022 183.000 0.000 NA   NA
 1940550 1940551 RHA1_ro02281 RHA1_ro02282     FALSE 0.019 192.000 0.000 NA   NA
 1940553 1940554 RHA1_ro02284 RHA1_ro02285     TRUE 0.969 -3.000 0.222 1.000   NA
 1940554 1940555 RHA1_ro02285 RHA1_ro02286     TRUE 0.882 13.000 0.333 1.000   NA
 1940555 1940556 RHA1_ro02286 RHA1_ro02287     FALSE 0.281 48.000 0.000 1.000 N NA
 1940556 1940557 RHA1_ro02287 RHA1_ro02288     TRUE 0.982 13.000 0.667 0.100 Y NA
 1940557 1940558 RHA1_ro02288 RHA1_ro02289     FALSE 0.076 142.000 0.000 1.000 N NA
 1940559 1940560 RHA1_ro02290 RHA1_ro02291     FALSE 0.554 -7.000 0.000 NA   NA
 1940560 1940561 RHA1_ro02291 RHA1_ro02292     FALSE 0.068 88.000 0.000 NA   NA
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 1940562 1940563 RHA1_ro02293 RHA1_ro02294     TRUE 0.959 35.000 1.000 NA Y NA
 1940563 1940564 RHA1_ro02294 RHA1_ro02295     TRUE 0.714 86.000 1.000 NA N NA
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 1940572 1940573 RHA1_ro02303 RHA1_ro02304     TRUE 0.978 -3.000 0.333 1.000 N NA
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 1940619 1940620 RHA1_ro02350 RHA1_ro02351   &nbs